(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
標的をコードする核酸分子およびビオチンリガーゼを共発現可能に組み込んだカイコ。
【請求項２】
前記ビオチンリガーゼはＢｉｒＡである、請求項１に記載のカイコ。
【請求項３】
前記標的は、Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ１４）または終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）あるいはその改変体である、請求項１または２に記載のカイコ。
【請求項４】
前記ＣＴＬＤ１４は配列番号８５によってコードされ、前記ｓＲＡＧＥは配列番号９６によってコードされる、請求項３に記載のカイコ。
【請求項５】
前記カイコは、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のカイコ。
【請求項６】
前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、請求項５に記載のカイコ。
【請求項７】
ビオチン化タンパク質の製造方法であって、
Ａ）カイコに、ビオチンリガーゼおよびタンパク質をコードする核酸分子を共発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコを配置し、該ビオチンリガーゼおよび該タンパク質を発現させる工程；および
Ｃ）該カイコにビオチンを投与し、ビオチン化された該タンパク質を得る工程
を包含する、方法。
【請求項８】
前記発現は、前記カイコの中部絹糸腺において行われる、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記タンパク質は、ビオチン化された状態で発現される、請求項７または８に記載の方法。
【請求項１０】
前記Ａ）工程は、前記タンパク質をコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される、請求項７〜９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記タンパク質は、Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ１４）または終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）または配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列もしくはその改変体を含む一本鎖抗体もしくはそのフラグメントあるいはその改変体である、請求項７〜１０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
前記カイコは、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、請求項７から１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメント。
【請求項１５】
請求項１４に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントを含む、ＬＤＬおよび変性ＬＤＬを検出するための検出剤であって、該ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、アセチル化ＬＤＬおよび部分酸化ＬＤＬからなる群より選択される少なくとも１つの分子を含む、検出剤。
【請求項１６】
請求項１４に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントを生産する方法であって、該方法は：
Ａ）該一本鎖抗体またはそのフラグメントのアミノ酸配列をコードする核酸を、該核酸が発現される細胞に導入する工程；
Ｂ）該細胞を培養し、該細胞から封入体を取り出す工程；
Ｃ）該封入体をリフォールディングする工程；
Ｄ）リフォールディングで得られた溶液を精製用カラムに接触させ、溶出溶液で溶出する工程；
Ｅ）溶出した該一本鎖抗体またはそのフラグメントを透析溶液で透析する工程
を包含する、方法。
【請求項１７】
請求項１４に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントの製造方法であって、
Ａ）カイコに、該一本鎖抗体またはそのフラグメントをコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコを配置し、該一本鎖抗体またはそのフラグメントを発現させる工程；および
Ｃ）該一本鎖抗体またはそのフラグメントを得る工程
を包含する、方法。
【請求項１８】
請求項１４に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とを用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬを検出または定量するためのシステム。
【請求項１９】
抗変性ＬＤＬ抗体、その改変体またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、変性ＬＤＬに関連する疾患の検診のためのシステム。
【請求項２０】
抗変性ＬＤＬ抗体、その改変体またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、食品摂取による変性ＬＤＬに関連する疾患の予防効果の評価のためのシステム。
【請求項２１】
カイコ型糖鎖を有する、配列番号８６に示すアミノ酸配列またはその改変体を含むＣ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）１４。
【請求項２２】
請求項２１に記載のＣＴＬＤ１４を含む、変性ＬＤＬを検出するための組成物。
【請求項２３】
Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）１４の製造方法であって、
Ａ）カイコに、ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコを配置し、該ＣＴＬＤ１４を発現させる工程；および
Ｃ）該ＣＴＬＤ１４を得る工程
を包含する、方法。
【請求項２４】
ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を発現可能に組み込んだカイコ。
【請求項２５】
抗ＬＤＬニワトリ抗体およびＣＴＬＤ１４を含む、変性ＬＤＬを検出するための組み合わせ物。
【請求項２６】
抗ＬＤＬニワトリ抗体と、ＣＴＬＤ１４とを含む、変性ＬＤＬを検出するためのキット。
【請求項２７】
カイコ型糖鎖を有する、配列番号９７に示すアミノ酸配列またはその改変体を含む再構築終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）。
【請求項２８】
前記ｓＲＡＧＥは、ビオチン化されたものである、請求項２７に記載のｓＲＡＧＥ。
【請求項２９】
前記ビオチンを介して前記ｓＲＡＧＥが基板に固定化されている、請求項２８に記載のｓＲＡＧＥが固定化された試薬。
【請求項３０】
請求項２７または２８に記載のｓＲＡＧＥあるいは請求項２９に記載の試薬を含む、終末期糖化生成物（ＡＧＥｓ）を検出するための組成物。
【請求項３１】
前記ｓＲＡＧＥを試料に接触させ、ＡＧＥｓを検出する工程を包含する、ＡＧＥｓを検出する方法。
【請求項３２】
ｓＲＡＧＥの製造方法であって、
Ａ）カイコに、ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該遺伝子が発現する条件下に該カイコを配置し、該ｓＲＡＧＥを発現させる工程；および
Ｃ）該ｓＲＡＧＥを得る工程
を包含する、方法。
【請求項３３】
ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を発現可能に組み込んだカイコ。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、動脈硬化に関連する酸化ＬＤＬ様分子（変性ＬＤＬ）の検出、および食品摂取による酸化ＬＤＬ様分子生成抑制効果の評価に関する。また、本発明は、新規終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ；ｓｏｌｕｂｌｅ  Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｆｏｒ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｇｌｙｃａｔｉｏｎ  Ｅｎｄ  ｐｒｏｄｕｃｔｓ）に関する。より詳細には糖尿病血管障害の発症に関わる終末糖化産物受容体（ａｄｖａｎｃｅｄ  ｇｌｙｃａｔｉｏｎ  ｅｎｄ  ｐｒｏｄｕｃｔｓ：ＡＧＥｓ）の検出、および、食品摂取によるＡＧＥｓ生成、蓄積抑制効果の評価に関する。
【背景技術】
【０００２】
近年、生活習慣の欧米化が、循環器疾患の増加とともに疾患による死亡率も増加させている。血管障害の中でも、最大のリスクとして動脈硬化が挙げられており、国民の健康への関心の高さ、高齢化社会における医療費の増大を背景に、発症前診断の構築に対する社会的要望は極めて大きい。酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬはヒトおよび高脂血症モデル動物の病変部位に局限して検出されることなどにより（非特許文献１）、粥状動脈硬化の発生に重要な役割を担う可能性が強く示唆されている。血中の酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬの濃度と動脈硬化の発症に相関関係があることが報告されている（非特許文献２）ことから、酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬを測定するシステムの構築は社会的意義が大きい。【０００３】
酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬが、動脈硬化の初期に重要な役割を担っていることは明らかである。そのため、生体内の酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬの量は、食生活などの生活習慣改善効果の指標となりえる。一方、酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬとは、ＬＤＬの酸化的修飾により生じる分子の総称であり、構造が不均一な集合体である（図１）。そのため、様々なモノクローナル抗体が開発されているが、いずれも一部の分子を検出するに過ぎず、生体内酸化ＬＤＬ等の変性ＬＤＬの量の正確な測定は困難であり、広範な分子種の検出が可能な技術の開発が求められている。【０００４】
これに関連して、ＬＤＬが酸化的修飾を受けた際に生じる特徴的な分子（マロンジアルデヒド：ＭＤＡ、ホスファチジルコリン：酸化ＰＣなど）に対するモノクローナル抗体による検出系が開発されている（非特許文献３〜５）。【０００５】
また、ＬＤＬに共通に存在するＡｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｂ（ＡｐｏＢ）による検出系が開発されている。特に、ＡｐｏＢは哺乳動物では相同性が高く、優れたモノクローナル抗体の作出が困難であることから、近年、ニワトリを宿主としたモノクローナル抗体が作出され、実用化されている（非特許文献６）。この抗体と酸化ＬＤＬ受容体を組み合わせた検出技術が開発されている。【０００６】
さらに特許文献１〜５および非特許文献７〜２０では、一本鎖抗体とＬＤＬについて開示されているが、いずれも酸化ＬＤＬ様分子の検出を可能にする一本鎖抗体の作出に関する記載はない。【０００７】
本発明者らは、変性ＬＤＬに対する一本鎖抗体を作製したが、分析・評価を行うレベルでは作製できていない。他にもＬＤＬに関する技術は多数（特許文献６〜１５）公開されているがその感度は不十分である。【０００８】
また、本発明の発明者らにより、酸化的修飾を受けた広範なＬＤＬ分子種を認識する受容体（ＬＯＸ−１）の認識領域（ＣＴＬＤ１４）を大腸菌で封入体として大量発現させた後にｒｅｆｏｌｄｉｎｇし、酸化ＬＤＬを認識する分子として活用する簡便法（非特許文献２２）と精密法（非特許文献２３）とが開発されている。【０００９】
さらに、ＬＯＸ−１の細胞外領域を動物細胞で分泌型蛋白質として生産し、酸化ＬＤＬを認識する分子として活用する手法が開発されている。【００１０】
一方で、生活習慣病の代表である糖尿病に由来する糖尿病血管障害（腎症、網膜症、神経症など）は、食生活と密接に関係し、生体内に生じる終末糖化産物（ＡＧＥｓ）が、発症・進展因子である。しかし、生体内のＡＧＥｓは多種多様な形態を取るため測定が困難である。さらに、農林水産物にはＡＧＥｓ生成抑制効果が報告されているものが多いが、生体にとって意味のあるＡＧＥｓの検出・評価技術は確立されていない。そのため、食品による糖尿病血管障害予防に関する客観的な情報の提供が困難であり、有効な評価手法の確立が求められている。一方、ＡＧＥｓを認識する受容体として、ＲＡＧＥ（ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｆｏｒ  ＡＧＥｓ）が知られている。ＲＡＧＥは多様な構造のＡＧＥｓを認識し、ＡＧＥｓはＲＡＧＥに認識されることが発症につながる。そのためＲＡＧＥに認識されるＡＧＥｓが、生体にとって意味のあるＡＧＥｓであると考えられている（図４２）。【００１１】
このような状況の下、ＡＧＥｓの代表的な構造（カルボキシメチルリジンなど）に対する抗体を作製し、酵素抗体反応法などでＡＧＥｓの一部を検出する手法が開発されている。ＡＧＥｓのうち、構造が明らかな一部の分子に関して、ＨＰＬＣ、ＭＳなどにより、検出・定量する手法が開発されている。蛍光性のＡＧＥｓ（ペントシジンなど）に関しては、蛍光により検出する手法が開発されている。ＡＧＥｓを広く認識する抗体を作製し、酵素抗体反応などで検出する手法が報告されているが、データの再現性が悪い。ＲＡＧＥの認識能に着目し、その機能を再構築したＡＧＥｓ検出手法が確立されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１２】
【特許文献１】特開２０１４−５１１３７８号公報
【特許文献２】特開２００９−５２５０４８号公報
【特許文献３】特開２００６−５１７１３８号公報
【特許文献４】特開２００５−５３１５００号公報
【特許文献５】国際公開０１／０９５９３８号パンフレット
【特許文献６】特開２０１２−１００５８５号公報
【特許文献７】特開２００８−００８８９４号公報
【特許文献８】特開２００５−０９７２０３号公報
【特許文献９】特開２００４−１７５７５４号公報
【特許文献１０】特開２００３−２２７８３７号公報
【特許文献１１】特開２００２−０１７３５３号公報
【特許文献１２】特開２００１−０９１５１７号公報
【特許文献１３】特開平０９−２８８１０６号公報
【特許文献１４】特開平０８−３０４３９６号公報
【特許文献１５】国際公開２０１１／１３６３３２パンフレット
【特許文献１６】特開２００９−１０８０３７公報
【特許文献１７】特開２００４−３２５４４４公報
【特許文献１８】特開２００３−５３５３３９公報
【特許文献１９】特開２００３−３６４９９公報
【特許文献２０】特開２００３−２３８４０４公報
【特許文献２１】特開２００３−１２５７８６公報
【特許文献２２】特開２００２−３２０４８９公報
【特許文献２３】特開２００２−１８１８２０公報
【非特許文献】
【００１３】
【非特許文献１】Ｋｉｔａ  ｅｔ  ａｌ．、Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ８４：５９２８−５９３１（１９８７）
【非特許文献２】Ｅｈａｒａ  ｅｔ  ａｌ．、Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ  １０３：１９５５−１９６０（２００１）
【非特許文献３】Ｋｏｔａｎｉ  Ｋ．  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍ．  Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ａｃｔａ  １２１５：１２１−１２５（１９９４）
【非特許文献４】Ｉｔａｂｅ  Ｈ．  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．  ２７１：３３２０８−１７（１９９６）
【非特許文献５】Ｉｔａｂｅ  Ｈ．  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．３７：４５−５３（１９９６）
【非特許文献６】Ｓａｔｏ  Ｙ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ，２００：３０３−３０９（２００８）
【非特許文献７】Ｃａｓｔｒｏ  ＪＭＡ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｔｏｘｉｃｏｎ，８７（１）：８１−９１（２０１４）
【非特許文献８】Ａｍｍａｙａｐｐａｎ  Ａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ８７（２４）：１３５４３−１３５５５（２０１３）
【非特許文献９】Ｋｕｒａｓａｗａ  ＪＨ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８８（３０）：２２０３３−２２０４１（２０１３）
【非特許文献１０】Ｅｘｔｅｂａｒｒｉａ  Ａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｈｕｍａｎ  Ｍｕｔａｔｉｏｎ，３３（１）：２３２−２４３（２０１２）
【非特許文献１１】Ｆａｎｇ  Ｌ．  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎ  １２１（１２）：４８６１−４８６９（２０１１）
【非特許文献１２】Ｔｓｉｍｉｋａｓ  Ｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃｏｌｌ．Ｃａｒｄｉｏｌ．５８（１６）：１７１５−１７２７（２０１１）
【非特許文献１３】Ｈｅｒｍａｎｓｓｏｎ  Ａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐｅｒｉ．Ｍｅｄ．２０７（５）：１０８１−１０９３（２０１０）
【非特許文献１４】Ｔａｓｈｉｒｏ  Ｊ．  ｅｔ  ａｌ．，  Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｉｎｖｅｓｔ．２８（９）：７１２−７１９（１９９８）
【非特許文献１５】Ｌｉａｏ  Ｗ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍ．３７３（２）：２３５−２４０（２００８）
【非特許文献１６】Ｓｃｈｉｏｐｕ  Ａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ  １００（１４）：２０４７−２０５２（２００４）
【非特許文献１７】Ｒｉｔｓｃｈ  Ａ．  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｃｈｅｍ．Ｌａｂ．Ｍｅｄ．４２（３）：２４７−２５５（２００４）
【非特許文献１８】Ｎｉｓｋａｎｅｎ  Ｌ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ−Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ，５２（２）：２１３−２１７（２００３）
【非特許文献１９】Ｎａｇａｔａ  Ｎ．  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｌｃｏｈｏｌ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｒｅｓ．２３（４  Ｓｕｐｐｌ）：２４Ｓ−２８Ｓ（１９９９）
【非特許文献２０】Ｍａｇｒａｎｅ  Ｊ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．３９（１１）：２１７２−２１８１（１９９８）
【非特許文献２１】藤村崇ら、日本農芸化学会大会講演要旨集  ２Ａ０４ｐ１４（２００７）
【非特許文献２２】Ｘｉｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｘｐｒｅｓｓ．  Ｐｕｒｉｆ．  ３２，  ６８−７４  （２００３）
【非特許文献２３】Ｋｕｍａｎｏ−Ｋｕｒａｍｏｃｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔｈｅ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｊｏｕｒｎａｌ，  ４４２，  １７１−１８０（２０１２）
【非特許文献２４】Ｏｈｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，  １３：９０５−９１７  （２００５）
【非特許文献２５】ＡＴＨＲＯＳＣＬＥＲＯＳＩＳ  ２００，  ３０３−３０９  （２００８）
【非特許文献２６】Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，  ４６，  ６９７３−６９７０（２００７）
【非特許文献２７】Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，  ２８２，  ４２１８−４２３１  （２００７）
【非特許文献２８】Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．，  ３３（４），  ２４３−２５３  （２０００）
【非特許文献２９】Ｎａｔ．  Ｍｅｄ．，  ４，  １０２５−１０３１（１９９８）
【非特許文献３０】Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．，  ３７，  ４５−５３（１９９６）
【非特許文献３１】Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，  ２６７，  ５１３３−５１３８（１９９２）
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１４】
本発明者らは、目的のタンパク質（例えば、ＣＴＬＤ１４、ｓＲＡＧＥ）とビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）とを共発現させるカイコを作出し、ビオチンの経口投与により、高い効率でビオチン化されたタンパク質を製造した。このようなカイコにより得られたビオチン化ＣＴＬＤ１４は、優れたｐＨ安定性の特性を有していた。さらに金属コロイド修飾されたＣＴＬＤ１４を用いて、抗ＬＤＬニワトリ抗体、一本鎖抗体、ビオチン化されていないＣＴＬＤ１４、およびストレプトアビジンを組み込んだラテラルフローアッセイにより、酸化的修飾を受けた多様な構造のＬＤＬを２０分以内に検出可能なことを見出した。また、糖鎖付加を受けないＥ．ｃｏｌｉ型のｓＲＡＧＥは、約１．５ヵ月で断片化されて活性を失うところ、上記カイコから得られたｓＲＡＧＥは糖鎖が付加されており、１年近く保存しても安定して活性を維持することが明らかにした。得られたカイコ型ビオチン化ｓＲＡＧＥのビオチンを介して方向性を維持して工程化することにより、多様な構造のＡＧＥｓを検出することが可能であることを見出した。【００１５】
本発明者らは、鋭意工夫の結果、特定の分子に対する抗体では、特定の分子の検出が可能なだけであったところ、広範な酸化ＬＤＬ様分子の検出を可能にした。抗ＡｐｏＢ抗体の場合、未変性ＬＤＬとの区別が困難であり、またＡｐｏＢに修飾が生じている場合、検出が困難であったが、本発明では、未変性ＬＤＬとの区別を可能にし、ＡｐｏＢに修飾が生じている場合でも、その検出を可能にした。【００１６】
さらに、本発明者らは、鋭意工夫した結果、終末糖化産物（ＡＧＥｓ）受容体（ＲＡＧＥ）のリガンド認識領域（ｓＲＡＧＥ）を中部絹糸腺に生産する遺伝子組換えカイコを作出し、効率的な精製方法を確立し、改良型ｓＲＡＧＥを製造した。さらに、得られた改良型ｓＲＡＧＥは、糖鎖付加をうけており、非常に安定な分子であり、微量なＡＧＥｓの濃縮、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能なことを見出し、本発明を完成させた。本発明では、改良型ｓＲＡＧＥ（図３４）は、ｓＲＡＧＥを中部絹糸腺に生産する遺伝子組換えカイコを作出し、絹糸腺抽出物から効率的にｓＲＡＧＥを大量に精製する手法を確立した（図３６）。【００１７】
別の局面では、本発明は、動脈硬化の危険因子である酸化ＬＤＬ（酸化的修飾により生じる構造体の総称）構造が多様なため抗体や機器分析により全分子種を検出するのは不可能であったという問題を解決するための技術を提供する。本発明のこの局面では、ＬＯＸ−１（ｌｅｃｔｉｎ  ｌｉｋｅ  ｏｘｉｄｉｚｅｄ  ＬＤＬ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ−１；血管内皮上の酸化ＬＤＬ受容体であり、ＬＤＬは認識しないが、広範な酸化ＬＤＬを認識する）が酸化ＬＤＬを認識することにより、動脈硬化の最も初期に生じる血管内皮機能不全が誘導されるため、ＬＯＸ−１によって認識される酸化ＬＤＬこそが、動脈硬化の危険因子として真に重要な分子であることを念頭に、このＬＯＸ−１の認識能を活用した酸化ＬＤＬ検出系の開発を進めた（図１）。【００１８】
したがって、この局面では、本発明は生体内酸化ＬＤＬ量の正確な測定を行えるよう、広範な分子種の検出が可能な技術を提供する。なぜなら、特定の分子に対する抗体では、特定の分子の検出が可能なだけであり、広範な酸化ＬＤＬ様分子の検出は不可能であるが、これを解決しようとして開発されたＣＴＬＤ１４をｒｅｆｏｌｄｉｎｇにより調製する手法は、簡便法の場合、数ヶ月で凝集するなど安定性の問題あり、精密法の場合、全工程の所要日数が１０日以上であり、さらに、手法が複雑である等の問題があった。さらに、ＬＯＸ−１を動物細胞で分泌生産させる手法は、細胞の無菌培養などの特殊施設必要、培養コストが高く、しかも生産性も大腸菌による手法に劣るという欠点もあり、抗ＡｐｏＢ抗体の場合、未変性ＬＤＬとの区別が困難であり、測定精度に問題がある。また、ＡｐｏＢに修飾が生じている場合、検出が困難である等の問題があり、これらを解決する技術を本発明は提供する。【００１９】
すなわち、本発明は、改良型ＣＴＬＤ１４（カイコ型）；中部絹糸腺にＣＴＬＤ１４を発現させる遺伝子組換えカイコを作出し、ＣＴＬＤ１４を可溶性蛋白質として大量発現させ精製した改良型ＣＴＬＤ１４の製造方法；抗ＬＤＬニワトリポリクローナルおよびその組合せを提供する。【００２０】
したがって、詳細には、本発明は、以下を提供する。
＜一本鎖抗体関連（配列、抗体の特性）＞
（１）配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメント。
（２）項目１に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントを含む、ＬＤＬおよび変性ＬＤＬ（ＬＤＬ修飾物ともいう）を検出するための検出剤であって、該ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、アセチル化ＬＤＬおよび部分酸化ＬＤＬからなる群より選択される少なくとも１つの分子を含む、検出剤。
（３）前記ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、アセチル化ＬＤＬおよび部分酸化ＬＤＬを含む、項目２に記載の検出剤。
（４）前記ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、ＬＤＬ、完全酸化ＬＤＬ、アルデヒド修飾ＬＤＬ（例えば、マロンジアルデヒド修飾ＬＤＬ）、アセチル化ＬＤＬおよび部分酸化ＬＤＬを含む、項目２または３に記載の検出剤。
（５）前記ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、１００ｎｇ／１００μｌウェル以下の感度で検出可能である、項目２〜４のいずれか１項に記載の検出剤。
（６）前記ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、２０ｎｇ／１００μｌウェル以下の感度で検出可能である、項目２〜５のいずれか１項に記載の検出剤。
（７）前記ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬおよび完全酸化ＬＤＬであり、１０ｎｇ／１００μｌウェル以下の感度で検出可能である、項目２〜６のいずれか１項に記載の検出剤。
（８）前記ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、ＬＤＬおよび完全酸化ＬＤＬであり、５ｎｇ／１００μｌウェル以下の感度で検出可能である、項目２〜７のいずれか１項に記載の検出剤。
＜安定供給系＞
（Ａ１）項目１に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントを生産する方法であって、該方法は：
Ａ）該一本鎖抗体またはそのフラグメントのアミノ酸配列をコードする核酸を、該核酸が発現される細胞に導入する工程；
Ｂ）該細胞を培養し、該細胞から封入体を取り出す工程；
Ｃ）該封入体をリフォールディングする工程；
Ｄ）リフォールディングで得られた溶液を精製用カラムに接触させ、溶出溶液で溶出する工程；
Ｅ）溶出した該一本鎖抗体またはそのフラグメントを透析溶液で透析する工程
を包含する、方法。
（Ａ２）前記リフォールディングは、封入体の量をタンパク質あたり２ｍｇ〜１０ｍｇ（例えば、８．６ｍｇ）で行うことを特徴とする、項目Ａ１に記載の方法。
（Ａ３）前記アガロースカラムは、Ｎｉ−ＮＴＡスラリーである、項目Ａ１またはＡ２に記載の方法。
（Ａ４）前記溶出溶液はイミダゾールを含む溶液である、項目Ａ１〜Ａ３のいずれか１項に記載の方法。
（Ａ５）前記溶出溶液はイミダゾールを含むリン酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）である、項目Ａ１〜Ａ４のいずれか１項に記載の方法。
（Ａ６）前記透析溶液は、ＰＢＳ（−）である、項目Ａ１〜Ａ５のいずれか１項に記載の方法。
（Ａ７）前記透析は、セルロースエステル膜チューブを用いて行われる、項目Ａ１〜Ａ６のいずれか１項に記載の方法。
（Ａ８）前記透析は、セルロースエステル膜チューブを用い、前記透析溶液としてサンプル容量の４００倍のＰＢＳ（−）を用いて行われる、項目Ａ１〜Ａ７のいずれか１項に記載の方法。
（Ａ９）項目１に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントの製造方法であって、
Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、該一本鎖抗体またはそのフラグメントをコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該一本鎖抗体またはそのフラグメントを発現させる工程；および
Ｃ）該一本鎖抗体またはそのフラグメントを得る工程
を包含する、方法。
＜ＬＯＸ−１との複合・間接・サンドイッチ系＞
（Ｂ１）項目１に記載の一本鎖抗体またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とを用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬを検出または定量するためのシステム。
（Ｂ２）前記システムは、抗原抗体反応を用いる、項目Ｂ１に記載のシステム。
（Ｂ３）前記システムは、ＥＬＩＳＡを行うためのものである、項目Ｂ１またはＢ２に記載のシステム。
（Ｂ４）前記システムは、サンドイッチＥＬＩＳＡを行うためのものである、項目Ｂ１〜Ｂ３のいずれか１項に記載のシステム。
（Ｂ５）前記システムは、ラテラルフローアッセイを行うためのものである、項目Ｂ１〜Ｂ４のいずれか１項に記載のシステム。
（Ｂ６）前記システムは、毛管現象による試料の展開を行うメンブレンを備え、前記メンブレンは、サンプルと金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識された酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域か、または金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識された項目１に記載の一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含むコンジュゲート部；酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域か、または項目１に記載の一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含む検出部；ならびに該酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域に対する結合分子もしくは一本鎖抗体に対する結合分子を含むコントロール部を含む、項目Ｂ５に記載のシステム。
（Ｂ７）前記システムは、毛管現象による試料の展開を行うメンブレンを備え、前記メンブレンは、サンプルと金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識されたＣＴＬＤ１４か、または金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識された項目１に記載の一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含むコンジュゲート部；ＣＴＬＤ１４か、または項目１に記載の一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含む検出部；ならびに該ＣＴＬＤ１４に対する結合分子を含むコントロール部を含む、項目Ｂ５またはＢ６に記載のシステム。
（Ｂ８）前記ＣＴＬＤ１４は、ビオチン化、Ｈｉｓタグ付加、Ｍｙｃタグ付加、Ｆｌａｇタグ付加、Ｅタグ付加、またはＳｔｒｅｐタグ付加なされており、それぞれの場合において、前記結合分子は、ストレプトアビジン、抗Ｈｉｓ抗体、抗Ｍｙｃ抗体、抗Ｆｌａｇ抗体、抗Ｅタグ抗体、またはＳｔｒｅｐ−Ｔａｃｔｉｎである、項目Ｂ７に記載のシステム。
＜ニワトリ抗酸化LDL抗体を用いるシステム＞
（Ｃ１）抗変性ＬＤＬ抗体、修飾物またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬを検出または定量するためのシステム。
（Ｃ２）抗変性ＬＤＬ抗体、修飾物またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、変性ＬＤＬに関連する疾患（例えば、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害）の検診のためのシステム。
（Ｃ３）前記変性ＬＤＬに関連する疾患は、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患および脳血管障害からなる群より選択される、項目Ｃ２に記載のシステム。
（Ｃ４）抗変性ＬＤＬ抗体、修飾物またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、食品摂取による変性ＬＤＬに関連する疾患（例えば、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害）の予防効果の評価のためのシステム。
（Ｃ５）前記変性ＬＤＬに関連する疾患は、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患および脳血管障害からなる群より選択される、項目Ｃ４に記載のシステム。
＜Ｄ．改良型ＣＴＬＤ１４（カイコ型）＞
（Ｄ１）カイコ型糖鎖を有する、配列番号８６に示すアミノ酸配列またはその改変体を含むＣ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）１４。
（Ｄ２）前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア、複合型糖鎖、オリゴマンノース型糖鎖またはハイブリッド型糖鎖の１または複数の種類の糖鎖を含む、項目Ｄ１に記載のＣＴＬＤ１４。
（Ｄ３）前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、２分子あたりＧｌｃＮＡｃ２分子およびＭａｎ２分子のうちの０〜４分子が結合した糖鎖を含む、項目Ｄ１またはＤ２に記載のＣＴＬＤ１４。
（Ｄ４）前記カイコ型糖鎖は、アスパラギン残基からみて以下の組合せ
１）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃとの組み合わせ、
２）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎとの組み合わせ、
３）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃとの組み合わせ、
の１つまたは複数の組合せを含む、項目Ｄ１〜Ｄ３のいずれか１項に記載のＣＴＬＤ１４。
（Ｄ５）前記カイコ型糖鎖は、配列番号８６の１１１位のアスパラギンおよび／または１５５位のアスパラギンに結合する、項目Ｄ１〜Ｄ４のいずれか１項に記載のＣＴＬＤ１４。
（Ｄ６）前記ＣＴＬＤ１４は、ビオチン化されたものである、項目Ｄ１〜Ｄ５のいずれか１項に記載のＣＴＬＤ１４。
（Ｄ７）項目Ｄ１〜Ｄ６のいずれか１項に記載のＣＴＬＤ１４を含む、変性ＬＤＬを検出するための組成物。
（Ｄ８）前記組成物は、非変性ＬＤＬと変性ＬＤＬとを識別して変性ＬＤＬを検出するためのものである、項目Ｄ７に記載の組成物。
（Ｄ９）前記非変性ＬＤＬおよび変性ＬＤＬはＬＤＬおよび酸化ＬＤＬを含む、項目Ｄ８に記載の組成物。
（Ｄ１０）前記非変性ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは複数種の哺乳動物のＬＤＬおよび酸化ＬＤＬである、項目Ｄ８またはＤ９に記載の組成物。
（Ｄ１１）前記哺乳動物は、マウスおよびヒトを含む、項目Ｄ１０に記載の組成物。
＜Ｅ．中部絹糸腺にＣＴＬＤ１４を発現させる遺伝子組換えカイコを作出し、ＣＴＬＤ１４を可溶性蛋白質として大量発現させ精製した改良型ＣＴＬＤ１４の製造方法＞
（Ｅ１）Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）１４の製造方法であって、
Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該遺伝子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該ＣＴＬＤ１４を発現させる工程；および
Ｃ）該ＣＴＬＤ１４を得る工程
を包含する、方法。
（Ｅ２）前記発現は、前記カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の後部絹糸腺、中部絹糸腺または全身において行われる、項目Ｅ１に記載の方法。
（Ｅ３）前記発現は、前記カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の中部絹糸腺において行われる、項目Ｅ１またはＥ２に記載の方法。
（Ｅ４）前記ＣＴＬＤ１４は、ビオチン化された状態またはビオチン化可能な状態で発現される、項目Ｅ１〜Ｅ３のいずれか１項に記載の方法。
（Ｅ５）前記生物は、ビオチンリガーゼをコードする核酸配列を含み、前記C)工程において、ビオチンをカイコに経口投与することを含む、項目Ｅ１〜Ｅ４のいずれか１項に記載の方法。
（Ｅ６）前記ＣＴＬＤ１４は、ビオチン化された状態で発現される、項目Ｅ１〜Ｅ５のいずれか１項に記載の方法。
（Ｅ７）前記生物は、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、項目Ｅ１〜Ｅ６のいずれかに記載の方法。
（Ｅ８）前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、項目Ｅ７に記載の方法。
（Ｅ９）前記Ａ）工程は、前記ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される、項目Ｅ１〜Ｅ８のいずれか１項に記載の方法。
（Ｅ１０）前記核酸分子は、配列番号８５に示す核酸配列またはその改変体を含む、項目Ｅ１〜Ｅ９のいずれか１項に記載の方法。
（Ｅ１０−１）前記ＣＴＬＤ１４は、項目Ｄ１〜Ｄ６のいずれか１項または複数に記載の特徴を有する、項目Ｅ１〜Ｅ１０のいずれか１項に記載の方法。
（Ｅ１１）ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を発現可能に組み込んだカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物。
（Ｅ１２）前記核酸分子は、配列番号８５に示す核酸配列またはその改変体を含む、項目Ｅ１１に記載のカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物。
（Ｅ１３）前記生物は、ビオチンリガーゼをコードする配列を含む、項目Ｅ１１またはＥ１２に記載の生物。
（Ｅ１４）前記ビオチンリガーゼはＢｉｒＡ（配列番号１１６）である、項目Ｅ１３に記載の生物。
（Ｅ１５）前記ビオチンリガーゼと前記ＣＴＬＤ１４とは中部絹糸腺において共発現される、項目Ｅ１３またはＥ１４に記載の生物。
（Ｅ１６）前記生物は、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、項目Ｅ１１〜１５のいずれかに記載の生物。
（Ｅ１７）前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、項目Ｅ１６に記載の生物。
＜Ｆ．抗ＬＤＬニワトリポリクローナルおよびその組合せ＞
（Ｆ１）抗ＬＤＬニワトリ抗体を含む、変性ＬＤＬを検出するための組成物。
（Ｆ２）前記抗ＬＤＬニワトリ抗体は、ポリクローナル抗体である、項目Ｆ１に記載の組成物。
（Ｆ３）さらに、ＣＴＬＤ１４を含む、項目Ｆ１またはＦ２に記載の組成物。
（Ｆ４）前記ＣＴＬＤ１４は、カイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４である、項目Ｆ１〜Ｆ３のいずれかに記載の組成物。
（Ｆ５）前記カイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４は、項目Ｄ１〜Ｄ６のいずれかに記載のＣＴＬＤ１４である、項目Ｆ４に記載の組成物。
（Ｆ６）前記組成物は、ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬを検出するためのものである、項目Ｆ１〜Ｆ５のいずれかに記載の組成物。
（Ｆ７）前記ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬは、複数種の哺乳動物のＬＤＬおよび酸化ＬＤＬである、項目Ｆ６に記載の組成物。
（Ｆ８）前記哺乳動物は、マウスおよびヒトを含む、項目Ｆ７に記載の組成物。
（Ｆ９）抗ＬＤＬニワトリ抗体と、ＣＴＬＤ１４とを含む、変性ＬＤＬを検出するためのキット。
（Ｆ１０）抗ＬＤＬニワトリ抗体はポリクローナル抗体である、項目Ｆ９に記載の変性ＬＤＬを検出するためのキット。
（Ｆ１１）抗ＬＤＬニワトリ抗体は抗酸化ＬＤＬニワトリ抗体または抗酸化一本鎖抗体である、項目Ｆ８またはＦ９に記載の変性ＬＤＬを検出するためのキット。
（Ｆ１２）前記ＣＴＬＤ１４は、項目Ｄ１に記載のＣＴＬＤ１４である、項目Ｆ９〜Ｆ１１のいずれか１項に記載のキット。
（Ｆ１３）ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬを検出するためのものである、項目Ｆ１０〜Ｆ１２のいずれか１項に記載の組成物。
（Ｆ１４）前記ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬは、複数種の哺乳動物のＬＤＬおよび酸化ＬＤＬである、項目Ｆ１３に記載のキット。
（Ｆ１５）前記哺乳動物は、マウスおよびヒトを含む、項目Ｆ１４に記載のキット。【００２１】
＜改良型ｓＲＡＧＥ（カイコ型）＞
（Ｇ１）カイコ型糖鎖を有する、配列番号９７に示すアミノ酸配列またはその改変体を含む再構築終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）。
（Ｇ２）前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア、複合型糖鎖、オリゴマンノース型糖鎖またはハイブリッド型糖鎖の１または複数の種類の糖鎖を含む、項目Ｇ１に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ３−１）前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、１分子あたりＧｌｃＮＡｃ０〜２分子およびＭａｎ０〜４分子のうちの０〜４分子が結合した糖鎖を含む、項目Ｇ１またはＧ２に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ３−２）前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、２分子あたりＧｌｃＮＡｃ０〜４分子およびＭａｎ０〜８分子のうちの０〜８分子が結合した糖鎖を含む、項目Ｇ１〜Ｇ２またはＧ３−１に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ４−１）前記カイコ型糖鎖の組成比が、オリゴマンノース型：８７〜９７％、複合型：２〜８％、ハイブリッド型：１〜５％である、項目Ｇ１〜Ｇ２またはＧ３−１〜Ｇ３−２のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ４−２）前記カイコ型糖鎖の組成比が、オリゴマンノース型：９０〜９４％、複合型：３〜６％、ハイブリッド型：２〜４％である、項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２またはＧ４−１のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ４−３）前記カイコ型糖鎖の組成比が、オリゴマンノース型：９２．５％、複合型：４．６％、ハイブリッド型：２．５％である、項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２またはＧ４−１〜Ｇ４−２のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ５−１）前記オリゴマンノース型は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２および（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２を含む、項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２またはＧ４−１〜Ｇ４−３のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ５−２）前記オリゴマンノース型の糖鎖全体における組成比が、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２：４５〜５６％、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２：２３〜３３％、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２：７〜１５％、および（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２：１〜５％である、項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３またはＧ５−１のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ５−３）前記オリゴマンノース型の糖鎖全体における組成比が、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２：４８〜５４％、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２：２５〜３１％、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２：９〜１３％、および（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２：２〜４％である、項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３またはＧ５−１〜Ｇ５−２のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ５−４）前記オリゴマンノース型の糖鎖全体における組成比が、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２：５１％、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２：２７．５％、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２：１０．８％、および（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２：２．８％である、項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３またはＧ５−１〜Ｇ５−３のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ６−１）前記複合型が、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３を含む項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３またはＧ５−１〜Ｇ５−４のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ６−２）前記複合型の糖鎖全体における組成比が、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３：２〜８％である項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４またはＧ６−１のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ６−３）前記複合型の糖鎖全体における組成比が、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３：３〜６％である項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４またはＧ６−１〜Ｇ６−２のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ６−４）前記複合型の糖鎖全体における組成比が、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３：４．６％である項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４またはＧ６−１〜Ｇ６−３のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ７）前記ハイブリッド型が、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３である項目Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４またはＧ６−１〜Ｇ６−４のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ８）前記カイコ型糖鎖は、配列番号９７の３位のアスパラギンおよび／または５９位のアスパラギンに結合する、項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４、Ｇ６−１〜Ｇ６−４またはＧ７のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ９）前記ｓＲＡＧＥは、ビオチン化されたものである、項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４、Ｇ６−１〜Ｇ６−４またはＧ７〜Ｇ８のいずれか１項のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥ。
（Ｇ１０）前記ビオチンを介して前記ｓＲＡＧＥが基板に固定化されている、項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４、Ｇ６−１〜Ｇ６−４またはＧ７〜Ｇ９に記載のｓＲＡＧＥが固定化された試薬。
（Ｇ１１）項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４、Ｇ６−１〜Ｇ６−４またはＧ７〜Ｇ９のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥを含む、終末期糖化生成物（ＡＧＥｓ）を検出するための組成物。
（Ｇ１２）項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４、Ｇ６−１〜Ｇ６−４またはＧ７〜Ｇ９のいずれか１項に記載のｓＲＡＧＥを試料に接触させ、ＡＧＥｓを検出する工程を包含する、ＡＧＥｓを検出する方法。
（Ｇ１３）ｓＲＡＧＥの製造方法であって、
Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該遺伝子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該ｓＲＡＧＥを発現させる工程；および
Ｃ）該ｓＲＡＧＥを得る工程
を包含する、方法。
（Ｇ１４）前記発現は、前記カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の後部絹糸腺、中部絹糸腺または全身において行われる、項目Ｇ１３に記載の方法。
（Ｇ１５）前記発現は、前記カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の中部絹糸腺において行われる、項目Ｇ１３またはＧ１４に記載の方法。
（Ｇ１６）前記ｓＲＡＧＥは、ビオチン化された状態またはビオチン化可能な状態で発現される、項目Ｇ１３〜Ｇ１５のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ１７）前記ｓＲＡＧＥは、ビオチン化された状態で発現される、項目Ｇ１３〜Ｇ１６のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ１８）前記生物は、ビオチンリガーゼをコードする核酸配列を含み、前記Ｃ）工程において、ビオチンをカイコに経口投与することを含む、項目Ｇ１３〜Ｇ１７のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ１９）前記生物は、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、項目Ｇ１３〜Ｇ１８のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ２０）前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、項目Ｇ１９に記載の方法。
（Ｇ２１）前記Ａ）工程は、前記ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される、項目Ｇ１３〜Ｇ２０のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ２２）前記核酸分子は、配列番号９６に示す核酸配列またはその改変体を含む、項目Ｇ１３〜２１のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ２２−１）前記ｓＲＡＧＥは、項目Ｇ１〜Ｇ２、Ｇ３−１〜Ｇ３−２、Ｇ４−１〜Ｇ４−３、Ｇ５−１〜Ｇ５−４、Ｇ６−１〜Ｇ６−４またはＧ７〜Ｇ９のいずれか１項または複数に記載される特徴を有する、項目Ｇ１３〜２２のいずれか１項に記載の方法。
（Ｇ２３）ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を発現可能に組み込んだカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物。
（Ｇ２４）前記核酸分子は、配列番号９６に示す核酸配列またはその改変体を含む、項目Ｇ２３に記載のカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物。
（Ｇ２５）前記生物は、ビオチンリガーゼをコードする配列を含む、項目Ｇ２３またはＧ２４に記載の生物。
（Ｇ２６）前記ビオチンリガーゼはＢｉｒＡ（配列番号１０６）である、項目Ｇ２５に記載の生物。
（Ｇ２７）前記ビオチンリガーゼと前記ｓＲＡＧＥとは中部絹糸腺において共発現される、項目Ｇ２５または２６に記載の生物。
（Ｇ２８）前記生物は、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、項目Ｇ２３〜Ｇ２７のいずれか１項に記載の生物。
（Ｇ２９）前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、項目Ｇ２８に記載の生物。【００２２】
＜改変カイコ生物＞
（Ｈ１）標的をコードする核酸分子およびビオチンリガーゼを共発現可能に組み込んだカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物。
（Ｈ２）前記ビオチンリガーゼはＢｉｒＡである、項目Ｈ１に記載の生物。
（Ｈ３）前記標的は、Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ１４）または終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）あるいはその改変体である、項目Ｈ１またはＨ２に記載の生物。
（Ｈ４）前記ＣＴＬＤ１４は配列番号８５によってコードされ、前記ｓＲＡＧＥは配列番号９６によってコードされる、項目Ｈ３に記載の生物。
（Ｈ５）前記生物は、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、項目Ｈ１〜Ｈ４のいずれか１項に記載の生物。
（Ｈ６）前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、項目Ｈ５に記載の生物。
（Ｈ７）ビオチン化タンパク質の製造方法であって、
Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、ビオチンリガーゼおよびタンパク質をコードする核酸分子を共発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該ビオチンリガーゼおよび該タンパク質を発現させる工程；および
Ｃ）該生物にビオチンを投与し、ビオチン化された該タンパク質を得る工程
を包含する、方法。
（Ｈ８）前記発現は、前記カイコの中部絹糸腺において行われる、項目Ｈ７に記載の方法。
（Ｈ９）前記タンパク質は、ビオチン化された状態で発現される、項目Ｈ７またはＨ８に記載の方法。
（Ｈ１０）前記Ａ）工程は、前記タンパク質をコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される、項目Ｈ７〜Ｈ９のいずれか１項に記載の方法。
（Ｈ１１）前記タンパク質は、Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ１４）または終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）または配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列もしくはその改変体を含む一本鎖抗体もしくはそのフラグメントあるいはその改変体である、項目Ｈ７〜Ｈ１０のいずれか１項に記載の方法。
（Ｈ１２）前記生物は、ビオチン化を受けるタグ配列を含む、項目Ｈ７〜Ｈ１１のいずれか1項に記載の方法。
（Ｈ１３）前記ビオチン化を受けるタグ配列は、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇおよびＡｖｉ．ｔａｇのいずれかである、項目Ｈ１２に記載の方法。【００２３】
本発明において、上記１または複数の特徴は、明示された組み合わせに加え、さらに組み合わせて提供され得ることが意図される。本発明のなおさらなる実施形態および利点は、必要に応じて以下の詳細な説明を読んで理解すれば、当業者に認識される。
【発明の効果】
【００２４】
本発明において、ビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）とＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥとを共発現するカイコを構築した。このカイコにビオチンを経口投与することによって、発現されるタンパク質は、高い効率でビオチン化されるという優れた効果を有する。さらに得られたタンパク質は、カイコ型糖鎖が付加されており、安定性（例えば、ｐＨに対する安定性や、１年近く安定である長期安定性）に優れていることが明らかになった。【００２５】
高い効率でビオチン化されたＣＴＬＤ１４を使用すれば、ラテラルフローアッセイ検出系において、ビオチンに結合することができるストレプトアビジンを利用することが可能になり、このような検出系では、酸化的修飾を受けた多様な構造のＬＤＬを２０分以内に検出することができる。【００２６】
また、本発明のカイコ型ビオチン化ｓＲＡＧＥのビオチンを介した方向性を維持した固定化により、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能である。【００２７】
本発明において、ヒト一本鎖抗体ライブラリーが構築され、バイオパニングによりγ＋κ鎖からなる一本鎖抗体ライブラリーから酸化ＬＤＬなどの認識が可能な一本鎖抗体を取得され、その遺伝子配列が明らかにされた。本発明において、５つのクローンを取得した。本発明で選択した５つの一本鎖抗体のアミノ酸配列は、全て他のグループでは報告のない配列であるが、そのＶＬ領域において抗酸化ＬＤＬ抗体の軽鎖Ｆａｂ断片と相同性（５７−８６％）があった。γ＋κ１９のＶＬ領域は、Ｊａｎｇらのグループによって登録された酸化ＬＤＬ抗体の軽鎖Ｆａｂ領域のアミノ酸配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ：ＡＡＯ４９７３８）と８６％の相同性を示した。また同グループによって登録されたマロンジアルデヒド化ＬＤＬに対する 抗体の軽鎖Ｆａｂ断片（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ：ＡＡＸ５７５５９）とγ+κ１２のＶＬ領域が８３％の相同性を示した。また、γ＋κ５のＶＬ領域は、近年報告されたPCSCK9 に対する抗体（Schiele,2014）にもまた相同性があることが分かった。PCSK9はLDLRの分解を誘発する分子として知られている（Maxwell,  2004）。そしてSchieleらによる抗PCSK9抗体は、PCSK9のC-terminal  領域に結合しPCSK9がLDLRと相互作用するのを阻害することで、結果的にLDLの血中レベルを下げる機能を持つ（Schiele,  F.,  Park,  J.,  Redemann,  N.,  Luippold,  G.,  and  Nar,  H.  (2014)  An  antibody  against  the  C-terminal  domain  of  PCSK9  lowers  LDL  cholesterol  levels  in  vivo.  J.  Mol.  Biol.426,  843-852；およびMaxwell,  K.  N.,  and  Breslow,  J.  L.  (2004)  Adenoviral-mediated  expression  of  Pcsk9  in  mice  results  in  a  low-density  lipoprotein  receptor  knockout  phenotype.  Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  U.  S.  A.  101,  7100-7105.参照）。【００２８】
本発明では、生成したライブラリー中、クローンＮｏ５，１９（配列番号７６および７８）の大腸菌による発現が可能であることを明らかにした。さらに、クローンＮｏ５は大量発現が可能であることを見出した。本発明ではさらに、得られた一本鎖抗体（γ＋κ５）の安定供給系を確立した。このような一本鎖抗体の安定供給系の確立は従前は不可能であったので、本発明はこの点でも顕著な効果を奏する。【００２９】
本発明ではさらに、結合特性を評価したところ、完全酸化ＬＤＬ、ＬＤＬの他、部分酸化ＬＤＬおよびアセチル化ＬＤＬなど広範な修飾ＬＤＬ認識能が確認されることが見出された。本発明では、低濃度領域での酸化ＬＤＬ認識能が優れており、特に、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）と組み合わせたサンドイッチＥＬＩＳＡなどで酸化的修飾を受けたＬＤＬの定量評価が可能であった。さらに、本発明は、ヒト、マウスなど広範な生物種由来の酸化ＬＤＬ様分子の検出が可能である。【００３０】
本発明の抗体は、配列が明らかな一本鎖抗体であるため、各種の発現系による効率的な生産系開発、糖鎖付加などの修飾が可能であり、変異の導入などによる機能改変も可能である。【００３１】
したがって、本発明は、酸化ＬＤＬなどを認識する一本鎖抗体、一本鎖抗体の安定供給系、一本鎖抗体を活用した変性ＬＤＬの検出方法、および酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）と組み合わせた酸化ＬＤＬ様分子の特異的検出方法を提供する。【００３２】
別の局面では、本発明では、遺伝子組換えカイコを活用することにより、簡便な手法で数日内に大量の精製ＣＴＬＤ１４を得られる（図２３）。ＬＯＸ−１の認識領域を提供する手法の中で、コスト、簡便さ、生産性の３点で従来法に対して優位である。【００３３】
本発明のカイコ型糖鎖が付加された改良型ＣＴＬＤ１４は、未変性ＬＤＬは認識しないが、変性ＬＤＬを広く認識し、かつ、検出のダイナミックレンジが、従来の大腸菌から調製したＣＴＬＤ１４よりも広いことが明らかとなった（図２７および２８）。【００３４】
本発明で得られた抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体は、未変性ＬＤＬ，  様々な修飾状態の変性ＬＤＬを認識可能なことが明らかとなり、抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体が認識しないタイプの変性ＬＤＬの検出も可能であった（図２６）。【００３５】
本発明で示されるように、抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体とＣＴＬＤ１４の組合せにより、従来法では検出が困難であった変性ＬＤＬの検出が可能となった（図２８）。【００３６】
他方で、本発明は、機器分析の対象となるＡＧＥｓはＡＧＥｓ全体の１割にも満たないという現状を打開することができたという点で顕著な特徴を有する。また、従来の再構築ＲＡＧＥ（ｓＲＡＧＥ）による検出方法でも、広範なＡＧＥｓを検出可能であるが、ｓＲＡＧＥは一ヶ月半程度で断片化し、認識能を失うなどの実用化上の問題があった（図３８参照）が、これをも克服し得たという点でも顕著である。特に、本発明の改良型ｓ  ＲＡＧＥは、糖鎖付加をうけており、非常に安定な分子であり、４℃での保存で長期にわたり（出願時点で約１年まで確認）認識活性を維持していた（図３８、４０および図５３）。また、本発明の改良型ｓＲＡＧＥにより微量なＡＧＥｓの濃縮、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能であった（図４０）。
【図面の簡単な説明】
【００３７】
【図１】図１は、ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬの模式図を示す。示されるように、酸化LDL(変性LDL)は多様な構造体の総称であり、生活習慣病の発症の初期から関係しているとされている。従来、得られているモノクローナル抗体は分子内の1つの構造を認識するに過ぎなかった。共通な分子(ApoB)に対する抗体として抗原の相同性の問題があり有用なマウスモノクローナル抗体の作製が困難であり、ニワトリモノクローナル抗体の活用が考慮される。
【図２】図２は、一本鎖抗体の模式図および作製手順の例示的概要を示す。一本鎖抗体作製は、実施例に示されるように一本鎖遺伝子抗体ライブラリーを開発し（例えば、ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅ）、ファージに提示し、バイオパニングにより一本鎖抗体を選抜し、γ＋κからなるライブラリーから有望なクローンを取得し遺伝子配列を決定した。μ＋λからなるライブラリーからは有望なクローンは得られなかった。一本鎖抗体は、ライブラリー構築後は動物を免疫することなく短期間で抗体の選抜が可能であり、各種発現系を活用した糖鎖付加等の就職が可能であり、変異導入等による改変も容易である等の利点がある。
【図３Ａ】図３Ａは、γ＋κからなるライブラリーにおける、調製したファージ提示型一本鎖抗体のＥＬＩＳＡによる評価を示す。左から各クローンＮｏ．を示す（５、１２、１４、１５、１９、３１、４０、７９、９６）。最も右側はＰＢＳを示す。
【図３Ｂ】図３Ｂは、γ＋κからなるライブラリーにおける、調製した可溶型一本鎖抗体のＥＬＩＳＡによる評価を示す。左から各クローンＮｏ．を示す（５、１２、１４、１５、１９、３１、４０、７９、９６）。最も右側はＰＢＳを示す。
【図４Ａ】図４Ａは、μ＋λからなるライブラリーにおける、調製したファージ提示型一本鎖抗体のＥＬＩＳＡによる評価を示す。左から各クローンＮｏ．を示す（１、２、３、４、１１、１３、１５、９３、９４）。最も右側はＰＢＳを示す。
【図４Ｂ】図４Ｂは、μ＋λからなるライブラリーにおける、調製した可溶型一本鎖抗体のＥＬＩＳＡによる評価を示す。左から各クローンＮｏ．を示す（１、２、３、４、１１、１３、１５、９３、９４）。最も右側はＰＢＳを示す。
【図５】図５は、上段からγ＋κ５、γ＋κ１２、γ＋κ１９、γ＋κ４０、およびγ＋κ９６のアミノ酸配列を示す（アミノ酸配列は１文字表記による。）。ＦＷＲ１はフレームワーク領域１を示し、ＦＷＲ２はフレームワーク領域２を示し、ＦＷＲ３はフレームワーク領域３を示し、ＦＷＲ４はフレームワーク領域４を示し、ＣＤＲ１は相補性決定領域１を示し、ＣＤＲ２は相補性決定領域２を示し、ＣＤＲ３は相補性決定領域３を示す。リンカー配列はリンカーとして結合させた配列を示す。
【図６】図６は、ＴＧ１、ＨＢ２１５１およびＢＬＲを用いて培養した場合の培養物上清および菌体のＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。最も左は分子量マーカー、その左４つのバンドはＴＧ１を示し（その中の左２つが誘導なし（そのうち左が菌体、右が上清を示す）、右２つが誘導あり（そのうち左が菌体、右が上清を示す）を示す）、さらに左にある４つのバンドはＨＢ２１５１を示し（その中の左２つが誘導なし（そのうち左が菌体、右が上清を示す）、右２つが誘導あり（そのうち左が菌体、右が上清を示す）を示す）、右４つのバンドはＢＬＲを示す（その中の左２つが誘導なし（そのうち左が菌体、右が上清を示す）、右２つが誘導あり（そのうち左が菌体、右が上清を示す）を示す）。
【図７】図７は、抗Ｅ抗体を一次抗体として用いたウェスタンブロットの結果を示す。各バンドは、左から分子量マーカー、γ＋κ５の誘導なし、γ＋κ５の誘導ありを示す。３０．８ｋＤａ付近にあるのがγ＋κ５（Ｇ３シグナル＋Ｅタグつき）のバンドである。
【図８】図８は、抗Ｅ抗体固定セファロースを用いた精製を評価するために行ったＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。各バンドは、左から分子量マーカー、γ＋κ５の誘導なし、γ＋κ５の誘導ありを示す。３０．８ｋＤａ付近にあるのがγ＋κ５（Ｇ３シグナル＋Ｅタグつき）のバンドである。
【図９Ａ】図９Ａは、ｐＥＴ−２２ｂ（＋）を発現ベクターとして用いて培養した場合の、不溶性画分および可溶性画分のＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。
【図９Ｂ】図９Ｂは、ｐＥＴ−２２ｂ（＋）を発現ベクターとして用いて培養した場合の、誘導区および非誘導区のａｎｔｉ−Ｈｉｓ  ｔａｇ  ａｎｔｉｂｏｄｙを一次抗体として用いたウェスタンブロットの結果を示す。
【図１０】図１０は、γ＋κ５のＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。右側のデータのうち、上パネルは、γ＋κ５を示し、左から、マーカー、誘導前、誘導後、菌体破砕液全画分、可溶性画分、不溶性画分を示す。下パネルは、γ＋κ５  精製後、マーカー、精製試料（泳動量が左から０．４μｇ／レーン、０．８μｇ／レーン）を示す。
【図１１】図１１は、一本鎖抗体（γ＋κ５）の抗原認識活性をダイレクトＥＬＩＳＡにより評価した結果を示す。抗原として、ＬＤＬ（左上パネル）、アセチル化ＬＤＬ（右上パネル）、部分酸化ＬＤＬ（左下パネル）、および完全酸化ＬＤＬ（右下パネル）を用いた。各パネルは、縦軸が、それぞれ、４５０ｎｍにおける吸光度（Ａ４５０）のＢ／Ｂ０（相対比）を示す。横軸は、各試料の量（μｇ／ウェル）を示す。
【図１２】図１２は、一本鎖抗体（γ+κ５）を用いたダイレクトＥＬＩＳＡによるＬＤＬおよび酸化ＬＤＬの検出を示す。縦軸が、４５０ｎｍにおける吸光度（Ａ４５０）を示す。横軸は、各試料の量（μｇ／ウェル）を示す。
【図１３】図１３は、一本鎖抗体（γ＋κ５）の抗原認識活性をサンドイッチＥＬＩＳＡにより評価した結果を示す。抗原として、ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬを用いた。縦軸が、４５０ｎｍにおける吸光度（Ａ４５０）を示す。横軸は、各試料の量（μｇ／ウェル）を示す。
【図１４】図１４は、ラテラルフローアッセイの原理に基づく検出系の概要を示す。
【図１５】図１５は、ラテラルフローアッセイの原理に基づく検出系の概要を示す。この例では、サンプルパッド、コンジュゲートパッド、テストラインを含むパッド、および吸収パッドが用いられ、サンプルパッドとコンジュゲートパッドとではそれぞれサンプルが添加され、コンジュゲート生成反応がなされる。サンプルパッドで加えられたサンプルは、毛管現象で移動し、コンジュゲートパッドに移動する。ここでは、例えば金属コロイド結合したＣＴＬＤ１４または本発明の一本鎖抗体が含まれており、コンジュゲートが生成する。そして、コンジュゲートパッドからテストラインを含むパッドにおいて、テストラインおよびコントロールラインが含まれ、ここでは、テストラインには、ＣＴＬＤ１４または一本鎖抗体が含まれ、サンプル中に標的がある場合に結合がなされ検出される。コントロールラインではストレプトアビジンまたは二次抗体などにより検出がされ、定量も可能となる。
【図１６】図１６は、ラテラルフローアッセイの原理に基づく検出系の概要例を示す。ここでは、ＣＴＬＤ１４を金属コロイド（またはラテックス粒子）で標識した場合は、テストラインに一本鎖抗体をコントロールラインにＣＴＬＤ１４のタグに合わせた分子（ビオチン化ＣＴＬＤ１４の場合はストレプトアビジン、Ｈｉｓ−Ｔａｇの場合は抗Ｈｉｓ抗体等）、或いは二次抗体を塗布しておく。他方、一本鎖抗体を金属コロイド（ラテックス粒子で標識した場合は、テストラインにＣＴＬＤ１４、コントロールラインに抗Ｈｉｓ抗体または二次抗体を塗布しておくことができる。
【図１７】図１７は、大腸菌で発現させた後、精製後に精密法によりリフォールドしたＥ．  ｃｏｌｉ型ＣＴＬＤ１４をβメルカプトエタノール（２ＭＥ）を含むＳＤＳ−ＰＡＧＥ用サンプルバッファー（＋）、あるいは、２ＭＥを含まないＳＤＳ−ＰＡＧＥ用サンプルバッファー（−）で処理後に、ＳＤＳ−ＰＡＧＥに供し、クマシー染色した結果を示す。２ＭＥ非存在下で処理した場合、ダイマーの分子量位置にＣＴＬＤ１４が検出されるのに対し、２ＭＥ存在下で処理した場合、モノマーの分子量位置に検出される。このことは、精密法でリフォールドされＥ．ｃｏｌｉ型ＣＴＬＤ１４が、細胞膜上での基本単位の４次構造であるダイマーを正しく形成していることを示している。正しくダイマーを形成したＣＴＬＤ１４の収量は、１Ｌ培養当たり１２ｍｇであった。
【図１８】図１８は、遺伝子組換えカイコによる生産の模式図を示す。
【図１９】図１９には、改良型ＣＴＬＤ１４  （カイコ型糖鎖付加ビオチン化ＣＴＬＤ１４）のアミノ酸情報、糖鎖情報および右にはダイマー化の模式図を示す。
【図２０】図２０には、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥのカイコ型糖鎖（Ｎ結合型糖鎖）の構造の例を示す（カイコ中部絹糸腺に発現する糖タンパク質にみられる代表的なＮ結合型糖鎖の構造（Ｉｉｚｕｋａ  ｅｔ  ａｌ．，  ＦＥＢＳＪ．，  ２７７，  ５８０６−５８２０））。ＣＴＬＤ１４で推定される糖鎖の組合せは、２（オリゴマンノース型の一つ）と４の複合型との組み合わせ、３（オリゴマンノース型の一つ）と、ハイブリッド型（５または６）の組合せであるが、これらに限定されない。図中四角はＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）を示し、丸はマンノース（Ｍａｎ）を示す。
【図２１】図２１は、ＣＴＬＤ１４の遺伝子組換えカイコの系統毎の発現を示す。１→は、Ｂｉｏｔｉｎ＿ＣＴＬＤ１４（ＢｉｏＥａｓｅ  ｔａｇ付き）のバンドを示し、２→はｍｙｃタグ付きＣＴＬＤ１４を示す。Ａはクマシーブルー（ＣＢＢ）染色を示し、Ｂはウェスタブロット（抗Ｈｉｓタグ抗体）の結果を示す。それぞれ、左からネガティブコントロール、Ｂｉｏｔｉｎ−ＣＴＬＤ１４の１〜４系統、Ｍｙｃ−ＣＴＬＤ１４の１〜３系統を示す。左端は分子量（ｋＤａ）を示す。
【図２２】図２２は、Ｂｉｏｔｉｎ−ＣＴＬＤ１４がカイコ体内でビオチン化されているかを確認した図を示す。ウェスタンブロットを行った後、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）標識ストレプトアビジンと結合後に、ＨＲＰの基質と反応させた化学発光をＥＣＬにより検出したものである。Ａは、抗ＬＯＸ−１による検出結果の比較を示す。左からＢｉｏｔｉｎ−ＣＴＬＤ１４の１〜４系統、Ｍｙｃ−ＣＴＬＤ１４の１〜３系統を示す。右端はネガティブコントロールである。ＢはＢｉｏＥａｓｅ−ＣＴＬＤ１４のビオチン化を確認したものである。ストレプトアビジン−ＨＲＰと結合後、ＨＲＰの基質と反応させた化学発光をＥＣＬにより検出した結果を示す。右端はネガティブコントロールである。
【図２３】図２３は、遺伝子組換えカイコで生産したＣＴＬＤ１４の精製過程を示す。中部絹糸腺抽出物から凍結融解処理によりセリシンを除去後Ｎｉ−ａｇａｒｏｓｅに吸着させ、イミダゾールで溶出後に、さらに精製度を上げるためにＴＡＬＯＮ（Ｎｉの代わりにＣｏを用いた金属キレートクロマト用担体）に結合させた。レーン１：Ｎｉ−ａｇａｒｏｓｅ溶出画分、２：ＴＡＬＯＮ非吸着画分、３：５ｍＭ  イミダゾール洗浄時の溶出画分、４：ＴＡＬＯＮ吸着画分、５：５０ｍＭイミダゾール溶出画分、６：１００ｍＭ、７：２００ｍＭ，８，９：５００ｍＭ、１０：１Ｍ  イミダゾール溶出画分、１１：イミダゾール非溶出画分、１２：２００ｍＭ−５００ｍＭイミダゾール溶出画分を回収後にＰＢＳ（−）に透析した精製カイコ型ＣＴＬＤ１４を示す。
【図２４】図２４は、カイコ由来ＣＴＬＤ１４の糖鎖付加を確認した結果を示す。精製後のカイコ型ＣＴＬＤ１４，２０μｇをＰＮＧａｓｅＦ処理し、１５％  ＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した。（＋）はＰＮＧａｓｅＦ処理試料、（−）は、ＰＮＧａｓｅＦを非存在下で全く同一の反応を行った試料を意味する。左：ＣＢＢＲ染色の結果であり、試料添加量は６．７μｇ／ｌａｎｅである。ＰＮＧａｓｅＦ処理による糖鎖除去により分子量シフトが確認された。中：Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｔａｉｎｉｎｇ（Ｐｉｅｒｃｅ  ２４５６２）によるＰＮＧａｓｅＦ処理前後での糖タンパク質染色の結果を示す。ＰＮＧａｓｅＦ処理により糖鎖が除去され糖タンパク質として検出されなくなった。右：ＰＮＧａｓｅＦ処理後も抗ＬＯＸ−１抗体との反応性に変化がないことを確認した図である。ＰＮＧａｓｅＦ未処理、および処理後の試料を１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥにて展開後にＰＶＤＦ膜に転写し、一次抗体として抗ＬＯＸ−１ウサギ抗体と反応させ、続いて二次抗体であるＨＲＰ修飾抗ウサギＩｇＧ抗体と反応させ、最終的にはＥＣＬによりＬＯＸ−１を検出した。ＰＮＧａｓｅＦ処理前後のいずれもＬＯＸ−１抗体で検出された。
【図２５】図２５は、２−メルカプトエタノール（β−Ｍｅ）処理によりダイマー位置の蛋白質バンドがモノマー位置にシフトすることを確認したものである。左はＥ．ｃｏｌｉ型  ＣＴＬＤ１４を示し、右はカイコ型ＣＴＬＤ１４を示す。ＣＴＬＤ１４はカイコ体内でも正しい４次構造であるダイマーを形成することが確認された。
【図２６】図２６は、抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体の特徴を解析したものである。検出対象として、ＬＤＬ、アセチル化（Ａｃ）ＬＤＬ、マロンジアルデヒド化（ＭＤＡ）ＬＤＬ、完全酸化（ｆｕＯｘ）ＬＤＬ、を用いた。ＬＤＬ（バイオメディカルテクノロジーズ、ＢＴ−９０３）とＡｃＬＤＬ（バイオメディカルテクノロジーズ、ＢＴ−９０６）は市販されているものを使用した。ＭＤＡ−ＬＤＬは、市販のＬＤＬをマロンジ化アルデヒドと反応させて調整した。酸化ＬＤＬは、市販のＬＤＬを酸化銅と反応させて調製した。３７℃で４時間反応させたものを部分酸化とし、３７℃で２０時間反応させたものを完全酸化とした。抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体は市販のもの（ファーマフーズ、ＨＵＣ２０）を用いた。二次抗体にはＨＲＰ標識抗ニワトリＩｇＹ（プロメガ、Ｇ１３５１）を用いた。抗ＡｐｏＢマウスモノクローナル抗体は市販のもの（Ａｃｒｉｓ  ＢＭ２１４９）を用いた。二次抗体にはＨＰＲ標識抗マウスＩｇＧ（ミリポア、ＡＰ１９２Ｐ）を用いた。左：抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体によるＬＤＬの検出を示す。左から完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、未修飾ＬＤＬ、ＰＢＳを示し、数字は検出対象の濃度を示す。完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、未修飾ＬＤＬの全てを認識可能なことを示す。中：抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体ＬＤＬの検出を示す。左から完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、未修飾ＬＤＬ、ＰＢＳを示し、数字は検出対象の濃度を示す。完全酸化ＬＤＬ（ＦｏｘＬＤＬ）認識能は高いが、修飾の種類によって認識強度が一定しない。右：抗ＡｐｏＢマウスモノクローナル抗体による検出を示す。左から完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、未修飾ＬＤＬ、ＰＢＳを示し、数字は検出対象の濃度を示す。全般に認識能が低く、酸化ＬＤＬと未修飾ＬＤＬの認識能に大差がないことがわかる。以上の結果から、抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体とＣＴＬＤ１４の組合せにより、動脈硬化発症の真の危険因子の検出系が開発可能であることがわかる。
【図２７】図２７は、大腸菌型ＣＴＬＤ１４と、本出願抗ＬＤＬニワトリ抗体の組み合わせでの結果を示す。白四角は未変性ＬＤＬ、黒四角はＡｃＬＤＬ，黒三角はＭＤＡ  ＬＤＬ，白丸はｍｏ（部分酸化ＬＤＬ）、黒丸はｆｕ（完全酸化ＬＤＬ）を示す。左：大腸菌由来のＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリポリクロによるサンドイッチ法によるＬＤＬ、修飾ＬＤＬの検出を示す。低濃度領域（１０nｇ／ｗｅｌｌ、溶液濃度にして０．１μｇ／ｍｌ以下）では、酸化的修飾を受けたＬＤＬの特異的な検出が可能（ｍｏＬＤＬ：部分酸化ＬＤＬに関しては、ＬＤＬとの有意差無し）右：大腸菌由来のＣＴＬＤ１４と抗ａｐｏＢニワトリモノクロによるサンドイッチ法によるによるＬＤＬ、修飾ＬＤＬの検出を示す。ｆｕＬＤＬ：完全酸化ＬＤＬの検出は良好であるが、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、ｍｏＬＤＬの認識が弱い。代表的なＬＤＬであるＭＤＡ−ＬＤＬの検出も困難であることが分かった。
【図２８】図２８は、カイコ型ＣＴＬＤ１４と、本発明の抗ＬＤＬニワトリ抗体の組み合わせでの結果を示す。白四角は未変性ＬＤＬ、黒四角はＡｃＬＤＬ，黒三角はＭＤＡ−ＬＤＬ，白丸はｍｏ（部分酸化ＬＤＬ）、黒丸はｆｕ（完全酸化ＬＤＬ）を示す。左：遺伝子組換えカイコ型ＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリポリクロによるサンドイッチ法によるＬＤＬ、修飾ＬＤＬの検出を示す。全ての修飾ＬＤＬの検出が可能である。（ｍｏＬＤＬ：部分酸化ＬＤＬの認識は弱い）。大腸菌型ＣＴＬＤ１４と組み合わせた場合に比べて、ＬＤＬと反応せずに修飾ＬＤＬを検出する濃度範囲が極めて広い。右：遺伝子組換えカイコ型ＣＴＬＤ１４と抗ａｐｏＢニワトリモノクロによるサンドイッチ法によるＬＤＬ、修飾ＬＤＬの検出を示す。ｆｕＯｘＬＤＬ：完全酸化ＬＤＬの検出は良好であるが、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬは検出が困難である。
【図２９】図２９は、カイコ型ＣＴＬＤ１４をＰＮＧaseF処理無しと処理後のカイコ型ＣＴＬＤ１４のトリプシン消化物のＬＣ―ＥＳＩＭＳの結果である。糖鎖付加が予想されるＮ−Ｘ―Ｓ／Ｔを含むペプチド断片（１，２，３）、および、鎖長の近いペプチド断片（４，５，６）に着目し、ＰＮＧaseF処理の有無によるスペクトルの比較を行ったところ、ＮＣＳ，ＮＳＴを含むペプチド１，２は、ＰＮaseF処理無しでは、ペプチドが観測されず、ＰＮＧaseF処理後にシグナルが観察されたことから、糖鎖が付加されていることが示された。一方、ペプチド３は、ＰＮＧaseF処理の有無に関わらず同一の位置にシグナルが観測され、糖鎖は付加されていないことが示された。さらに、鎖長が近いが糖鎖付加部位を保たないペプチド４〜６は、ＰＮＧaseF処理の有無に関わらず同一の溶出位置にシグナルが観測され、本手法による観測と糖鎖付加の有無の決定が有効であることが確認された。
【図３０】図３０は、ＣＴＬＤ１４のＰＮＧaseF処理無し試料のトリプシン消化物のＬＣ−ＥＳＩＭＳの結果を示す。予想されるカイコ型糖鎖がＮＣＳ、および、ＮＳＴを含むペプチドに付加した場合のイオンが検出されるか確認したところ、ＮＣＳを含むペプチドに［化２］（２）に相当する糖鎖が付加したイオン（２）、［化５］（５）に相当する糖鎖が付加したイオン（３）が観測され、糖鎖構造として［化２］（２）、［化５］（５）が明らかになった。
【図３１】図３１は、付加が予想される糖鎖構造をさらに詳細に観測するために図３０の溶出位置１３．１分近傍のマススペクトルを拡大した図である。
【図３２】図３２は、図３１に拡大して示した１３．１分近傍のマススペクトルに観測されるイオンとペプチドの質量差をまとめた表であり、付加が予想される糖鎖構造を詳細に検討した結果である。試料調製に伴い糖の一部が外れたと思われる質量差を示すイオンも認められたが、［化１］（１）（左列、８９２．３４）、［化２］（２）（１２９８．５）、［化３］（３）または［化４］（４）（１０９５．４２）に示される糖鎖が存在することが確認された。以上から、カイコ型ＣＴＬＤ１４では、ＮＣＳ（１１１Ｎ）、ＮＳＴ（１５５Ｎ）に糖鎖が結合している可能性がある。さらに、糖鎖の質量数は〜２５００と予想されるが、図２９−３２の結果から、（トリマンノシルコア８９２）ｘ２＋（ＧｌｃＮＡｃ２０３）ｘ２＋（Ｍａｎ１６２）ｘ２または（トリマンノシルコア８９２）ｘ２＋（ＧｌｃＮＡｃ  ２０３）ｘ１＋（Ｍａｎ１６２）ｘ３の組合せが推定される。
【図３３】図３３は、本発明で利用されるカイコによる生産の模式図である。
【図３４】図３４は、遺伝子組換えカイコで発現させたＲＡＧＥのアミノ酸配列を示す。
【図３５】図３５は、遺伝子組換えカイコの中部絹糸腺抽出物の電気泳動結を示す。サンプルは、遺伝子組換えカイコ４系統（１−４）、および、ネガティブコントロール（中部絹糸腺ＧＡＬＡ４のみ、ＵＡＳ無し：ｓＲＡＧＥを発現していない）から中部絹糸腺を取り出し、続いて、中部絹糸腺１本に１％  Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００を含むＰＢＳ  １ｍｌを添加し４℃で２時間転倒混和し調製した。左は、４〜１２％グラジエントのＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲルにより試料を電気泳動後に、クマシー・ブリリアント・ブルーによる蛋白質染色した結果である。各レーンへの試料の添加量は左側が５μｌ／ｌａｎｅ、右側が、１０μｌ／ｌａｎｅである。Ｍ：分子量マーカー（ベンチマーク：インビトロジェン）、１−４は、作出された遺伝子組換えカイコの系統番号を、Ｎｅｇａ：ネガティブコントロールを示す。右はＳＤウェスタンブロットの結果であり、４〜１２％のグラジエントのＳＤＳ−ＰＡＧＥにより試料を展開後にＰＶＤＦ膜に転写し、一次抗体として抗Ｈｉｓウサギ抗体（１０００倍希釈）＋抗Ｈｉｓマウス抗体（３０００倍希釈）を用い、続いて二次抗体であるＨＲＰ標識抗ウサギ＆マウス抗体（２００，０００倍希釈）と反応させ、最後にＥＣＬ  Ｐｒｉｍｅと反応させ生じる発光を検出し、ｓＲＡＧＥの発現を確認した。
【図３６】３６は、ＲＡＧＥの精製過程を示す。左図：凍結融解処理により中部絹糸腺抽出物からセリシンを除去した溶解液をＰＢＳで平衡化したＮｉ−Ａｇａｒｏｓｅに結合させ、ＰＢＳ中のイミダゾール濃度を段階的に上げることによりｓＲＡＧＥを溶出した。各段階の試料をＳＤＳ−ＰＡＧＥに供し、クマシー染色した結果を示す。レーン１：溶解液、２：Ｎｉ−Ａｇａｒｏｓｅ非吸着画分、３：Ｎｉ−Ａｇａｒｏｓｅ吸着画分、４：２０ｍＭイミダゾール溶出画分、５：１００ｍＭイミダゾール溶出画分、６：２５０ｍＭイミダゾール溶出画分、７：５００ｍＭイミダゾール溶出画分、８：１Ｍイミダゾール溶出画分、９：非溶出画分。２５０ｍＭ−１Ｍイミダゾールで溶出画分を収集しＰＢＳで透析し、必要な場合ＴＡＬＯＮによる精製に供した。右図：Ｎｉ−Ａｇａｒｏｓｅ２５０ｍＭ−１Ｍ溶出画分の精製度を上げるためにＴＡＬＯＮに結合させ、イミダゾール濃度を段階的に上げｓＲＡＧＥを溶出させた。一方、ｓＲＡＧＥはビオチン化のためのタグであるＢｉｏＥａｓｅ  ｔａｇを付加している。このビオチン化を確認するため、Ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ  Ｍｕｔｅｉｎ  ｍａｔｒｉｘへの結合を確認した。格段階の試料をＳＤＳ−ＰＡＧＥに供し、クマシー染色した結果を示す。レーン１：Ｎｉ−Ａｇａｒｏｓｅ精製後（この段階でも十分な精製度であることが確認された）、２：Ｍｕｔｅｉｎ結合画分、３：Ｍｕｔｅｉｎ非吸着画分、４：ＴＡＬＯＮ吸着画分、５：ＴＡＬＯＮ非吸着画分、６：５０ｍＭイミダゾール溶出画分、７：１００ｍＭイミダゾール溶出画分、８：２５０ｍＭイミダゾール溶出画分、９：５００ｍＭイミダゾール溶出画分、１０：１Ｍイミダゾール溶出画分、１１：ＴＡＬＯＮ非溶出画分。１００ｍＭ−１Ｍイミダゾール溶出画分を収集しＰＢＳ（−）で透析後に精製ｓＲＡＧＥとした。この方法により１３ｍｌ溶解液から１．８ｍｇ精製タンパク質が得られた（カイコ当たりに換算すると約０．３ｍｇ／１頭）。ＴＡＬＯＮへの結合・溶出の過程は省略しても精製度９５％程度の十分に使用可能なｓＲＡＧＥが得られ、この場合、収率は３倍以上になる。
【図３７】図３７は、カイコ型ｓＲＡＧＥのビオチン化の確認した図を示す。左図は、ビオチン化を検出した結果である。遺伝子組換えカイコの各系統から調製した溶解液を１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥにて展開後にＰＶＤＦ膜に転写しＨＲＰ標識ストレプトアビジンと反応させた後、ＥＣＬにてストレプトアビジンの結合を検出した結果を示す。ストレプトアビジンはビオチンに特異的に結合することから、ストレプトアビジンの結合を検出することにより、ビオチン化が確認される。レーン１−４は、ｓＲＡＧＥを中部絹糸腺に発現している１，２，３，４系統から調製した溶解液を各レーンに供している。レーン５：ネガティブコントロールｓＲＡＧＥを発現していない）である。レーン５ではシグナルが観察されないのに対し、ｓＲＡＧＥを発現している遺伝子組換えカイコの中部絹糸腺から調製した試料を添加したレーン１〜４ではいずれも強いシグナルが観察され、ＢｉｏＥａｓｅ  ｔａｇを付加してカイコ体内で発現させることにより、対象タンパク質のビオチン化が可能なことが示された。右図は、ビオチン化が確認されたタンパク質が、ＲＡＧＥであることを確認した結果である。遺伝子組換えカイコの各系統から調製した溶解液を１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥにて展開後にＰＶＤＦ膜に転写し、一次抗体として抗ＲＡＧＥウサギ抗体と反応させ、続いて二次抗体であるＨＲＰ修飾抗ウサギＩｇＧ抗体と反応させ、最終的にはＥＣＬによりｓＲＡＧＥを検出した。レーン１−４は、ｓＲＡＧＥを中部絹糸腺に発現している１，２，３，４系統から調製した溶解液を各レーンに供している。レーン５：ネガティブコントロールｓＲＡＧＥを発現していない）である。レーン５はシグナルが観察されないのに対し、レーン１〜４は、シグナルが観察され、さらに、シグナルの位置が左図のビオチン化を確認した図と一致していることが確認された。このことは、左図でビオチン化が確認された蛋白質がｓＡＲＧＥであることを示している。
【図３８】図３８は、カイコ型ｓＲＡＧＥの安定性を示す。左はＥ．ｃｏｌｉ型を示し、右は本発明のカイコ型を示す。それぞれ、精製直後（１日）、４℃保存４０日後、および精製直後（１日）、９０日保存後の試料を１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥに供し、クマシー染色した結果を示す。矢印が断片化したｓＲＡＧＥであり、カイコ型では９０日を経過しても断片化が認められず、安定性が著しく向上したことが確認された。
【図３９】図３９は、カイコ型ＲＡＧＥの糖鎖付加の確認を示す。精製後のカイコ型ｓＲＡＧＥ  ２０μｇをＰＮＧａｓｅＦ処理し、１２％  ＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した。（＋）はＰＮＧａｓｅＦ処理試料、（−）は、ＰＮＧａｓｅＦを非存在下で全く同一の反応を行った試料を意味する。左：ＣＢＢＲ染色の結果であり、試料添加量は６．７μｇ／ｌａｎｅである。ＰＮＧａｓｅＦ処理による糖鎖除去により分子量シフトが確認された。中：Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｔａｉｎｉｎｇ（Ｐｉｅｒｃｅ  ２４５６２）によるＰＮＧａｓｅＦ処理前後での糖タンパク質染色の結果を示す。ＰＮＧａｓｅＦ処理により糖鎖が除去され糖タンパク質として検出されなくなった。右：ＰＮＧａｓｅＦ処理後も抗ＲＡＧＥ抗体との反応性に変化がないことを確認した図である。ＰＮＧａｓｅＦ未処理、および処理後の試料を１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥにて展開後にＰＶＤＦ膜に転写し、一次抗体として抗ＲＡＧＥウサギ抗体と反応させ、続いて二次抗体であるＨＲＰ修飾抗ウサギＩｇＧ抗体と反応させ、最終的にはＥＣＬによりｓＲＡＧＥを検出した。いずれもＲＡＧＥ抗体で検出された。
【図４０】図４０は、カイコ型ｓＲＡＧＥ、および、大腸菌型ｓＲＡＧＥを用いたサンドイッチＥＬＩＳＡ様の手法による各種ＡＧＥｓの検出結果を示す。●（黒丸）：ＢＳＡのリボース処理により調製したＡＧＥｓであるＲ−ＡＧＥｓ、▲（黒三角）：フルクトース処理により調製したＡＧＥｓであるＦ−ＡＧＥｓ、■（黒四角）：グルコース処理により調製したＡＧＥｓであるＧ−ＡＧＥｓ、□（白四角）：糖非存在下で処理をしたコントロールであるＣｔｌ−ＡＧＥｓを示す。左は、精製後１週間４℃で保存したＥ．ｃｏｌｉ型ｓＲＡＧＥを用いた結果である。図６で示したように、Ｅ．ｃｏｌｉ型は４０日程度で断片化するため、４０日後には、ＡＧＥｓ認識能が失われ、本図で観察されるＡＧＥｓ検出は不可能になる。右図は、精製後９０日後のカイコ型ｓＲＡＧＥによるＡＧＥｓ検出結果である。９０日を経過しても認識能を維持しており、精製後１週間目のＥ．ｃｏｌｉ型と変わらない検出が可能であることが確認された。
【図４１】図４１は、カイコ型ｓＲＡＧＥの質量分析結果を示す。ゲル片に含まれるカイコを用いて作成したｓＲＡＧＥを、アセトアミド化後トリプシン消化し、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦＭＳとＬＣ−ＥＳＩＭＳで測定したものである。ＰＮＧａｓｅＦ処理したものとしないものについてマススペクトルを比較した。Ｎ結合型糖鎖が付加すると想定される配列（ＮＩＴ，ＮＧＳ）を含む２つのアミノ酸配列を含むイオンは、ＰＮＧａｓｅＦ処理前には観測されず、処理後に観測されたことから、ＮＩＴ，ＮＧＳのいずれのＮにも糖鎖付加があると考えられた。
【図４２】図４２は、ＲＡＧＥとＡＧＥｓの模式図を示す。示されるようにＡＧＥｓは分子形態が多様であり、抗体による検出、化学分析による検出に限界がある。このような多様な形態を有するＡＧＥｓを検出するには、ＲＡＧＥのようなマルチ認識能が重要である。
【図４３】図４３は、カイコ型ビオチン化タンパク質の作製の概要を示す。示される通り３つのコンストラクトを１個体に導入した。ＢｉｒＡに関しては、４つのｌｉｎｅを試した。目的タンパク質およびビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）を共発現するカイコにビオチン添加餌を与えた。
【図４４】図４４は、ＣＴＬＤ１４およびｓＲＡＧＥのＳＤＳ−ＰＡＧＥ後のクマシー染色の結果を示す。「−」は、ＢｉｒＡを発現しない系統を示す。サンプルＮｏ．７２はＳｅｒ１−ＧＡＬ４のみを導入しているネガティブコントロールである。
【図４５】図４５は、ビオチン化を確認するためのウェスタンブロットの結果を示す。白抜けしているバンドは、シグナルが強すぎることに起因する。「−」は、ＢｉｒＡを発現しない系統を示す。サンプルＮｏ．７２はＳｅｒ１−ＧＡＬ４のみを導入しているネガティブコントロールである。
【図４６】図４６は、ビオチン化効率を確認するための実験の概要およびその結果を示す。右図のＬは、処理前のＬｙｓａｔｅ、Ｆは、処理後のｆｌｏｗ  ｔｈｒｏｕｇｈ画分、Ｒは、Ｒｅｓｉｎ  ｂｉｎｄｉｎｇ画分を表す。サンプルＮｏ．７２はＳｅｒ１−ＧＡＬ４のみを導入しているネガティブコントロールである。
【図４７】図４７は、ＴＡＬＯＮ及びＭｕｔｅｉｎカラム精製に供したＣＴＬＤ１４およびsＲＡＧＥの収量、ビオチン化効率の概要を示す。
【図４８】図４８は、Ｅ．ｃｏｌｉ型ＣＴＬＤ１４およびカイコ型ＣＴＬＤ１４の安定性についてまとめた表を示す。Ｅ．ｃｏｌｉ型は、使用可能な緩衝液が限られているため、用途が限定されていたが、カイコ型は、塩非存在下、ｐＨ７〜９．５で安定な上、Ｔｒｉｓ系緩衝液中でも安定であり、検出・評価系に活用する際の選択の幅が広いことが明らかとなった。
【図４９】図４９は、１／１０００に希釈されたヒト血漿中の酸化ＬＤＬの検出の結果を示す。左のグラフにおいて、左から試料１（ＯｘＬＤＬ添加なし）、試料２（１μｇ  ＯｘＬＤＬ／ｍｌ添加）、試料３（３μｇ  ＯｘＬＤＬ／ｍｌ添加）、試料４（６μｇ  ＯｘＬＤＬ／ｍｌ添加）、試料５（１２μｇ  ＯｘＬＤＬ／ｍｌ添加）を示す。右のグラフは、試料１（ＯｘＬＤＬ／ｍｌ添加なし）を１とした場合の相対吸光度を示す。
【図５０】図５０は、カイコ型ビオチン化ＣＴＬＤ１４を用いた簡易ハーフストリップによるイムノクロマト検出系の概要を示す。
【図５１】図５１は、簡易ハーフストリップによるイムノクロマトの結果を示す。レーン１：０μｇ／ウェル、レーン２：０．０３μｇ／ウェル、レーン３：０．３μｇ／ウェル、レーン４：３μｇ／ウェル。
【図５２】図５２は、一本鎖抗体γ＋κ５を遺伝子組換えカイコの中部絹糸腺に発現させた結果を示す。ｍｙｃタグをＮ末に付加した系統とＣ末に付加した系統の各４クローンに関して、中部絹糸腺抽出液を調製し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した結果である。左図は、クマシー染色の結果を、右図は、抗Ｈｉｓ抗体で検出した結果を示す。
【図５３】図５３は、Ｅ．ｃｏｌｉ型およびカイコ型のｓＲＡＧＥのＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を示す。左のレーンから、Ｅ．ｃｏｌｉ型、保存１日目；Ｅ．ｃｏｌｉ型、保存４０日目；カイコ型、保存１日目；カイコ型、保存１．５ヵ月目；カイコ型、保存１１ヵ月目を示す。
【図５４】図５４は、カイコ型ｓＲＡＧＥの糖鎖構造を示す。Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３およびＮ４−１は、オリゴマンノース型、Ｎ４−２は、複合型、Ｎ４−３は、ハイブリッド型の糖鎖である。
【図５５】図５５は、実施例２２で同定された各糖鎖の組成比、定量値、糖組成を示す。
【図５６】図５６は、ビオチン化無しのｓＲＡＧＥ、若しくは、ビオチン化ｓＲＡＧＥのＡＧＥｓとの相互作用を表面プラズモン共鳴により計測した結果を示す。左図は、ビオチン化無しのカイコ型ｓＲＡＧＥをアミンカップリングによりセンサーチップＣＭ５に固定化し、代表的ＡＧＥｓであるフルクトース処理ＢＳＡ（Ｆ−ＡＧＥ）との相互作用をシングルサイクルカイネティクスにより解析した結果である。右図は、Ｃ末側に1分子のビオチンが付加されたビオチン化ｓＲＡＧＥを、該ビオチンを介してセンサーチップＳＡに固定化し、代表的ＡＧＥｓであるＦ−ＡＧＥとの相互作用をシングルサイクルカイネティクスにより解析した結果である。右上はＥ．ｃｏｌｉ型ビオチン化カイコ型ｓＲＡＧＥとＦ−ＡＧＥとの相互作用の解析結果を、右下図は、カイコ型ビオチン化ｓＲＡＧＥとＡＧＥｓとの相互作用の解析結果を示す。バッファーはＰＢＳ（−）を使用し、流速は３０μｌ／ｍｉｎとした。図中の矢印の点で、０．２５，０．５，１，２，４μＭのＦ−ＡＧＥを添加し、添加時間は６０秒、解離時間は１２０秒として相互作用を計測した。また各濃度のＦ−ＡＧＥの添加時間間隔は６０秒とした。各グラフにおいて、縦軸は、Ｒｅｓｏｎａｎｃｅ  Ｕｎｉｔ（ＲＵ）を示し、横軸は、時間（秒）を示す。
【発明を実施するための形態】
【００３８】
以下、本発明を説明する。本明細書の全体にわたり、単数形の表現は、特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。従って、単数形の冠詞（例えば、英語の場合は「a」、「an」、「the」など）は、特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。また、本明細書において使用される用語は、特に言及しない限り、当該分野で通常用いられる意味で用いられることが理解されるべきである。したがって、他に定義されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学技術用語は、本発明の属する分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。矛盾する場合、本明細書（定義を含めて）が優先する。
【００３９】
（用語の定義）
以下に本明細書において特に使用される用語の定義を列挙する。
【００４０】
本明細書において「抗体」は、広義には、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、多重特異性抗体、キメラ抗体、および抗イディオタイプ抗体、ならびにそれらの機能性フラグメント（例えば、Ｆ（ａｂ’）２、およびＦａｂフラグメント）、ならびにその他の組換えにより生産された結合体または機能的等価物（例えば、キメラ抗体、ヒト化抗体、多機能抗体、二重特異性またはオリゴ特異性（oligospecific）抗体、単鎖抗体、一本鎖抗体（scFV）、ダイアボディー（diabody）、sc（Fv）2（single  chain  （Fv）2）、scFv−Fc）を含む。さらにこのような抗体を、酵素、例えばアルカリホスファターゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、αガラクトシダーゼなど、に共有結合させまたは組換えにより融合させてよい。さらにこのような抗体を、酵素、例えばアルカリホスファターゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、αガラクトシダーゼなど、に共有結合させまたは組換えにより融合させてよい。例えば、本明細書において「抗変性ＬＤＬ抗体」という場合変性ＬＤＬに対する任意の抗体をいう。狭義に使用する場合は、抗体は、全長抗体（例えば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体等）を指し、その他は改変体またはフラグメントと称することがある。本発明で用いられる抗体は、その標的（ＬＤＬまたは、酸化ＬＤＬ様分子等）に結合すればよく、その由来、種類、形状などは問われない。具体的には、非ヒト動物の抗体（例えば、マウス抗体、ラット抗体、ラクダ抗体）、ヒト抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体などの公知の抗体をもとに製造することができる。本発明においては、一本鎖抗体が使用される。抗体の標的への結合は識別的なあるいは特異的な結合であることが好ましい。抗体の改変体は、抗体と、例えばポリエチレングリコール等の各種分子が結合していてもよい。抗体の改変体は、抗体に公知の手法を用いて化学的な修飾を施すことによって得ることができる。
【００４１】
本明細書において「一本鎖抗体」とは、「ｓｃＦｖ（ｓｉｎｇｌｅ  ｃｈａｉｎ  Ｆｖ）」ともいい、抗体の重鎖および軽鎖の可変部領域（ＶＨおよびＶＬ）を適当なリンカーペプチドで連結させたものに相当する。このようなコンストラクトを遺伝子レベルで構築し、タンパク質発現用ベクターを用いて大腸菌に導入することで一本鎖抗体タンパク質を発現させることができる。
【００４２】
本明細書において、「フラグメント」とは、全長のポリペプチドまたはポリヌクレオチド（長さがｎ）に対して、１〜ｎ−１までの配列長を有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドをいう。フラグメントの長さは、その目的に応じて、適宜変更することができ、例えば、その長さの下限としては、ポリペプチドの場合、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、４０、５０、およびそれ以上のアミノ酸が挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。また、ポリヌクレオチドの場合、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、４０、５０、７５、１００およびそれ以上のヌクレオチドが挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。本明細書において、ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの長さは、上述のようにそれぞれアミノ酸または核酸の個数で表すことができるが、上述の個数は絶対的なものではなく、同じ機能を有する限り、上限または下限としての上述の個数は、その個数の上下数個（または例えば上下１０％）のものも含むことが意図される。そのような意図を表現するために、本明細書では、個数の前に「約」を付けて表現することがある。しかし、本明細書では、「約」のあるなしはその数値の解釈に影響を与えないことが理解されるべきである。本明細書において有用なフラグメントの長さは、そのフラグメントの基準となる全長タンパク質の機能のうち少なくとも１つの機能が保持されているかどうかによって決定され得る。
【００４３】
本明細書において遺伝子の「相同性」とは、２以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。従って、ある２つの遺伝子の相同性が高いほど、それらの配列の同一性または類似性は高い。２種類の遺伝子が相同性を有するか否かは、配列の直接の比較、または核酸の場合ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーション法によって調べられ得る。２つの遺伝子配列を直接比較する場合、その遺伝子配列間でＤＮＡ配列が、代表的には少なくとも５０％同一である場合、好ましくは少なくとも７０％同一である場合、より好ましくは少なくとも８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一である場合、それらの遺伝子は相同性を有する。
【００４４】
本明細書では、アミノ酸配列および塩基配列の類似性、同一性および相同性の比較は、配列分析用ツールであるＢＬＡＳＴを用いてデフォルトパラメータを用いて算出される。同一性の検索は例えば、ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴ  ２．２．９（２００４．５．１２  発行）を用いて行うことができる。本明細書における同一性の値は通常は上記ＢＬＡＳＴを用い、デフォルトの条件でアラインした際の値をいう。ただし、パラメータの変更により、より高い値が出る場合は、最も高い値を同一性の値とする。複数の領域で同一性が評価される場合はそのうちの最も高い値を同一性の値とする。
【００４５】
本明細書において、「対応する」アミノ酸とは、あるタンパク質分子またはポリペプチド分子において、比較の基準となるタンパク質またはポリペプチドにおける所定のアミノ酸と同様の作用を有するか、または有することが予測されるアミノ酸をいう。例えば、ＬＯＸ−１においては、２３２位および２４９位におけるアミノ酸である。
【００４６】
本明細書において、「対応する」遺伝子とは、ある種において、比較の基準となる種における所定の遺伝子と同様の作用を有するか、または有することが予測される遺伝子をいい、そのような作用を有する遺伝子が複数存在する場合、進化学的に同じ起源を有するものをいう。従って、ある遺伝子（例えば、ＬＯＸ−１）に対応する遺伝子は、その遺伝子のオルソログであり得る。したがって、ヒトの遺伝子に対応する遺伝子は、他の動物（マウス、ラット、ブタ、ウサギ、モルモット、ウシ、ヒツジなど）においても見出すことができる。そのような対応する遺伝子は、当該分野において周知の技術を用いて同定することができる。したがって、例えば、ある動物における対応する遺伝子は、対応する遺伝子の基準となる遺伝子の配列をクエリ配列として用いてその動物（例えば、マウス、ラット、ブタ、ウサギ、モルモット、ウシ、ヒツジなど）の配列データベースを検索することによって見出すことができる。
【００４７】
本明細書において、「改変体」とは、もとのポリペプチドまたはポリヌクレオチドなどの物質に対して、一部が変更されているものをいう。そのような改変体としては、置換改変体、付加改変体、欠失改変体、短縮（ｔｒｕｎｃａｔｅｄ）改変体、対立遺伝子変異体などが挙げられる。対立遺伝子（ａｌｌｅｌｅ）とは、  同一遺伝子座に属し、互いに区別される遺伝的改変体のことをいう。従って、「対立遺伝子変異体」とは、ある遺伝子に対して、対立遺伝子の関係にある改変体をいう。「種相同体またはホモログ（ｈｏｍｏｌｏｇ）」とは、ある種の中で、ある遺伝子とアミノ酸レベルまたはヌクレオチドレベルで、相同性（好ましくは、６０％以上の相同性、より好ましくは、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９５％以上の相同性）を有するものをいう。そのような種相同体を取得する  方法は、本明細書の記載から明らかである。「オルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）」とは、オルソロガス遺伝子（ｏｒｔｈｏｌｏｇｏｕｓ  ｇｅｎｅ）ともいい、二つの遺伝子がある共通祖先からの種分化に由来する遺伝子をいう。例えば、多重遺伝子構造をもつヘモグロビン遺伝子ファミリーを例にとると、ヒトとマウスのαヘモグロビン遺伝子はオルソログであるが，ヒトのαヘモグロビン遺伝子とβヘモグロビン遺伝子はパラログ（遺伝子重複で生じた遺伝子）である。オルソログは、分子系統樹の推定に有用であることから、オルソログもまた、本発明において有用であり得る。
【００４８】
本明細書において「保存的（に改変された）改変体」は、アミノ酸配列および核酸配列の両方に適用される。特定の核酸配列に関して、保存的に改変された改変体とは、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸をいい、核酸がアミノ酸配列をコードしない場合には、本質的に同一な配列をいう。このような塩基配列の改変法としては、制限酵素などによる切断、ＤＮＡポリメラーゼ、Ｋｌｅｎｏｗフラグメント、ＤＮＡリガーゼなどによる処理等による連結等の処理、合成オリゴヌクレオチドなどを用いた部位特異的塩基置換法（特定部位指向突然変異法；ＭａｒｋＺｏｌｌｅｒａｎｄＭｉｃｈａｅｌ Ｓｍｉｔｈ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１００，４６８−５００（１９８３））が挙げられるが、この他にも通常分子生物学の分野で用いられる方法によって改変を行うこともできる。遺伝コードの縮重のため、多数の機能的に同一な核酸が任意の所定のタンパク質をコードする。例えば、コドンＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、およびＧＣＵはすべて、アミノ酸アラニンをコードする。したがって、アラニンがコドンにより特定される全ての位置で、そのコドンは、コードされたポリペプチドを変更することなく、記載された対応するコドンの任意のものに変更され得る。このような核酸の変動は、保存的に改変された変異の１つの種である「サイレント改変（変異）」である。ポリペプチドをコードする本明細書中のすべての核酸配列はまた、その核酸の可能なすべてのサイレント変異を記載する。当該分野において、核酸中の各コドン（通常メチオニンのための唯一のコドンであるＡＵＧ、および通常トリプトファンのための唯一のコドンであるＴＧＧを除く）が、機能的に同一な分子を産生するために改変され得ることが理解される。したがって、ポリペプチドをコードする核酸の各サイレント変異は、記載された各配列において暗黙に含まれる。好ましくは、そのような改変は、ポリペプチドの高次構造に多大な影響を与えるアミノ酸であるシステインの置換を回避するようになされ得る。
【００４９】
あるアミノ酸は、相互作用結合能力の明らかな低下または消失なしに、例えば、リガンド分子の結合部位のようなタンパク質構造において他のアミノ酸に置換され得る。あるタンパク質の生物学的機能を規定するのは、タンパク質の相互作用能力および性質である。従って、特定のアミノ酸の置換がアミノ酸配列において、またはそのＤＮＡコード配列のレベルにおいて行われ得、置換後もなお、もとの性質を維持するタンパク質が生じ得る。従って、生物学的有用性の明らかな損失なしに、種々の改変が、本明細書において開示されたペプチドまたはこのペプチドをコードする対応するＤＮＡにおいて行われ得る。
【００５０】
このような核酸は、周知のＰＣＲ法により得ることができ、化学的に合成することもできる。これらの方法に、例えば、部位特異的変位誘発法、ハイブリダイゼーション法などを組み合わせてもよい。
【００５１】
上記のような改変を設計する際に、アミノ酸の疎水性指数が考慮され得る。タンパク質における相互作用的な生物学的機能を与える際の疎水性アミノ酸指数の重要性は、一般に当該分野で認められている（Ｋｙｔｅ．ＪおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅ，Ｒ．Ｆ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５７（１）：１０５−１３２，１９８２）。アミノ酸の疎水的性質は、生成したタンパク質の二次構造に寄与し、次いでそのタンパク質と他の分子（例えば、酵素、基質、受容体、ＤＮＡ、抗体、抗原など）との相互作用を規定する。各アミノ酸は、それらの疎水性および電荷の性質に基づく疎水性指数を割り当てられる。それらは：イソロイシン（＋４．５）；バリン（＋４．２）；ロイシン（＋３．８）；フェニルアラニン（＋２．８）；システイン／シスチン（＋２．５）；メチオニン（＋１．９）；アラニン（＋１．８）；グリシン（−０．４）；スレオニン（−０．７）；セリン（−０．８）；トリプトファン（−０．９）；チロシン（−１．３）；プロリン（−１．６）；ヒスチジン（−３．２）；グルタミン酸（−３．５）；グルタミン（−３．５）；アスパラギン酸（−３．５）；アスパラギン（−３．５）；リジン（−３．９）；およびアルギニン（−４．５））である。
【００５２】
あるアミノ酸を、同様の疎水性指数を有する他のアミノ酸により置換して、そして依然として同様の生物学的機能を有するタンパク質（例えば、リガンド結合能において等価なタンパク質）を生じさせ得ることが当該分野で周知である。このようなアミノ酸置換において、疎水性指数が±２以内であることが好ましく、±１以内であることがより好ましく、および±０．５以内であることがさらにより好ましい。疎水性に基づくこのようなアミノ酸の置換は効率的であることが当該分野において理解される。米国特許第４，５５４，１０１号に記載されるように、以下の親水性指数がアミノ酸残基に割り当てられている：アルギニン（＋３．０）；リジン（＋３．０）；アスパラギン酸（＋３．０±１）；グルタミン酸（＋３．０±１）；セリン（＋０．３）；アスパラギン（＋０．２）；グルタミン（＋０．２）；グリシン（０）；スレオニン（−０．４）；プロリン（−０．５±１）；アラニン（−０．５）；ヒスチジン（−０．５）；システイン（−１．０）；メチオニン（−１．３）；バリン（−１．５）；ロイシン（−１．８）；イソロイシン（−１．８）；チロシン（−２．３）；フェニルアラニン（−２．５）；およびトリプトファン（−３．４）。アミノ酸が同様の親水性指数を有しかつ依然として生物学的等価体を与え得る別のものに置換され得ることが理解される。このようなアミノ酸置換において、親水性指数が±２以内であることが好ましく、±１以内であることがより好ましく、および±０．５以内であることがさらにより好ましい。
【００５３】
本発明において、「保存的置換」とは、アミノ酸置換において、元のアミノ酸と置換されるアミノ酸との親水性指数または／および疎水性指数が上記のように類似している置換をいう。保存的置換の例は、当業者に周知であり、例えば、次の各グループ内での置換：アルギニンおよびリジン；グルタミン酸およびアスパラギン酸；セリンおよびスレオニン；グルタミンおよびアスパラギン；ならびにバリン、ロイシン、およびイソロイシン、などが挙げられるがこれらに限定されない。
【００５４】
本明細書中において、機能的に等価なポリペプチドを作製するために、アミノ酸の置換のほかに、アミノ酸の付加、欠失、または修飾もまた行うことができる。アミノ酸の置換とは、もとのペプチドを１つ以上、例えば、１〜１０個、好ましくは１〜５個、より好ましくは１〜３個のアミノ酸で置換することをいう。アミノ酸の付加とは、もとのペプチド鎖に１つ以上、例えば、１〜１０個、好ましくは１〜５個、より好ましくは１〜３個のアミノ酸を付加することをいう。アミノ酸の欠失とは、もとのペプチドから１つ以上、例えば、１〜１０個、好ましくは１〜５個、より好ましくは１〜３個のアミノ酸を欠失させることをいう。アミノ酸修飾は、アミド化、カルボキシル化、硫酸化、ハロゲン化、アルキル化、リン酸化、水酸化、アシル化（例えば、アセチル化）などを含むが、これらに限定されない。置換、または付加されるアミノ酸は、天然のアミノ酸であってもよく、非天然のアミノ酸、またはアミノ酸アナログでもよい。天然のアミノ酸が好ましい。
【００５５】
本明細書において、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドの「置換、付加および／または欠失」とは、もとのポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して、それぞれアミノ酸もしくはその代替物、またはヌクレオチドもしくはその代替物が、置き換わること、付け加わること、または取り除かれることをいう。このような置換、付加および／または欠失の技術は、当該分野において周知であり、そのような技術の例としては、部位特異的変異誘発技術などが挙げられる。基準となる核酸分子またはポリペプチドにおけるこれらの変化は、目的とする機能（例えば、ＬＯＸ−１の認識能など）が保持される限り、この核酸分子の５’末端もしくは３’末端で生じ得るか、またはこのポリペプチドを示すアミノ酸配列のアミノ末端部位もしくはカルボキシ末端部位で生じ得るか、またはそれらの末端部位の間のどこにでも生じ得、基準配列中の残基間で個々に散在する。置換、付加または欠失は、１つ以上であれば任意の数でよく、そのような数は、その置換、付加または欠失を有する改変体において目的とする機能（例えば、ＬＯＸ−１の認識能など）が保持される限り、多くすることができる。例えば、そのような数は、１または数個であり得、そして好ましくは、全体の長さの２０％以内、１５％以内、１０％以内、５％以内、または１５０個以下、１００個以下、５０個以下、２５個以下などであり得る。
【００５６】
本明細書において使用される場合、用語「タグ配列」とは、受容体−リガンドのような特異的認識機構により分子を選別するための物質、より具体的には、特定の物質を結合するための結合パートナーの役割を果たす物質（例えば、ビオチン−アビジン、ビオチン−ストレプトアビジンのような関係を有する）をいう。よって、例えば、タグ配列が結合した特定の物質は、タグ配列の結合パートナーを結合させた基材を接触させることで、この特定の物質を選別することができる。このようなタグ配列は、当該分野で周知である。代表的なタグ配列としては、ｍｙｃタグ、Ｈｉｓタグ、ＨＡ、Ａｖｉタグなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【００５７】
本明細書において、「検出剤」とは、広義には、目的の物質または状態（例えば、変性ＬＤＬ、ＬＯＸ−１、ＡＧＥｓ、細胞、組織、病態など）を検出できるあらゆる因子をいう。
【００５８】
本明細書において「タンパク質」、「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」は、本明細書において同じ意味で使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーをいう。このポリマーは、直鎖であっても分岐していてもよく、環状であってもよい。アミノ酸は、天然のものであっても非天然のものであってもよく、改変されたアミノ酸であってもよい。この用語はまた、複数のポリペプチド鎖の複合体へとアセンブルされたものを包含し得る。この用語はまた、天然または人工的に改変されたアミノ酸ポリマーも包含する。そのような改変としては、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化または任意の他の操作もしくは改変（例えば、標識成分との結合体化）。この定義にはまた、例えば、アミノ酸の１または２以上のアナログを含むポリペプチド（例えば、非天然アミノ酸などを含む）、ペプチド様化合物（例えば、ペプトイド）および当該分野において公知の他の改変が包含される。
【００５９】
本明細書において、「アミノ酸」は、本発明の目的を満たす限り、天然のものでも非天然のものでもよい。本明細書において「アミノ酸誘導体」または「アミノ酸アナログ」とは、天然に存在するアミノ酸とは異なるがもとのアミノ酸と同様の機能を有するものをいう。そのようなアミノ酸誘導体およびアミノ酸アナログは、当該分野において周知である。本明細書では、アミノ酸誘導体およびアミノ酸アナログは、アミノ酸と同じ生物学的機能を提供し得る限り代替として使用され得ることが理解される。本明細書において「天然のアミノ酸」とは、天然のアミノ酸のＬ−異性体を意味する。天然のアミノ酸は、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、メチオニン、トレオニン、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、システイン、プロリン、ヒスチジン、アスパラギン酸、アスパラギン、グルタミン酸、グルタミン、γ−カルボキシグルタミン酸、アルギニン、オルニチン、およびリジンである。特に示されない限り、本明細書でいう全てのアミノ酸はＬ体であるが、Ｄ体のアミノ酸を用いた形態もまた本発明の範囲内にある。本明細書において「非天然アミノ酸」とは、タンパク質中で通常は天然に見出されないアミノ酸を意味する。非天然アミノ酸の例として、ノルロイシン、パラ−ニトロフェニルアラニン、ホモフェニルアラニン、パラ−フルオロフェニルアラニン、３−アミノ−２−ベンジルプロピオン酸、ホモアルギニンのＤ体またはＬ体およびＤ−フェニルアラニンが挙げられる。本明細書において「アミノ酸アナログ」とは、アミノ酸ではないが、アミノ酸の物性および／または機能に類似する分子をいう。アミノ酸アナログとしては、例えば、エチオニン、カナバニン、２−メチルグルタミンなどが挙げられる。アミノ酸模倣物とは、アミノ酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然に存在するアミノ酸と同様な様式で機能する化合物をいう。
【００６０】
アミノ酸は、その一般に公知の３文字記号か、またはＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎにより推奨される１文字記号のいずれかにより、本明細書中で言及され得る。ヌクレオチドも同様に、一般に認知された１文字コードにより言及され得る。
【００６１】
本明細書において「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」は、本明細書において同じ意味で使用され、任意の長さのヌクレオチドのポリマーをいう。この用語はまた、「オリゴヌクレオチド誘導体」または「ポリヌクレオチド誘導体」を含む。「オリゴヌクレオチド誘導体」または「ポリヌクレオチド誘導体」とは、ヌクレオチドの誘導体を含むか、またはヌクレオチド間の結合が通常とは異なるオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドをいい、互換的に使用される。そのようなオリゴヌクレオチドとして具体的には、例えば、２’−Ｏ−メチル−リボヌクレオチド、オリゴヌクレオチド中のリン酸ジエステル結合がホスホロチオエート結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のリン酸ジエステル結合がＮ３’−Ｐ５’ホスホロアミデート結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のリボースとリン酸ジエステル結合とがペプチド核酸結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のウラシルがＣ−５プロピニルウラシルで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のウラシルがＣ−５チアゾールウラシルで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のシトシンがＣ−５プロピニルシトシンで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のシトシンがフェノキサジン修飾シトシン（ｐｈｅｎｏｘａｚｉｎｅ−ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ｃｙｔｏｓｉｎｅ）で置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、ＤＮＡ中のリボースが２’−Ｏ−プロピルリボースで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体およびオリゴヌクレオチド中のリボースが２’−メトキシエトキシリボースで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体などが例示される。他にそうではないと示されなければ、特定の核酸配列はまた、明示的に示された配列と同様に、その保存的に改変された改変体（例えば、縮重コドン置換体）および相補配列を包含することが企図される。具体的には、縮重コドン置換体は、１またはそれ以上の選択された（または、すべての）コドンの３番目の位置が混合塩基および／またはデオキシイノシン残基で置換された配列を作成することにより達成され得る（Ｂａｔｚｅｒら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１９：５０８１（１９９１）；Ｏｈｔｓｕｋａら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６０：２６０５−２６０８（１９８５）；Ｒｏｓｓｏｌｉｎｉら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ  ８：９１−９８（１９９４））。
【００６２】
本明細書において「ヌクレオチド」は、天然のものでも非天然のものでもよい。「ヌクレオチド誘導体」または「ヌクレオチドアナログ」とは、天然に存在するヌクレオチドとは異なるがもとのヌクレオチドと同様の機能を有するものをいう。そのようなヌクレオチド誘導体およびヌクレオチドアナログは、当該分野において周知である。そのようなヌクレオチド誘導体およびヌクレオチドアナログの例としては、ホスホロチオエート、ホスホルアミデート、メチルホスホネート、キラルメチルホスホネート、２’−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、ペプチド型核酸（ＰＮＡ）が含まれるが、これらに限定されない。
【００６３】
本明細書において「複合分子」とは、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、脂質、糖、低分子などの分子が複数種連結してできた分子をいう。そのような複合分子としては、例えば、糖脂質、糖ペプチドなどが挙げられるがそれらに限定されない。本明細書では、配列番号９７等で例示されるアミノ酸を有するポリペプチドまたはその改変体もしくはフラグメントであって、診断に関与する生物学的な活性性を有する限り、それぞれの改変体もしくはフラグメントなどをコードする核酸分子も使用することができる。また、そのような核酸分子を含む複合分子も使用することができる。
【００６４】
本明細書において「核酸」はまた、遺伝子、ｃＤＮＡ、ｍＲＮＡ、オリゴヌクレオチド、およびポリヌクレオチドと互換可能に使用される。特定の核酸配列はまた、「スプライス改変体」を包含する。同様に、核酸によりコードされた特定のタンパク質は、その核酸のスプライス改変体によりコードされる任意のタンパク質を暗黙に包含する。その名が示唆するように「スプライス改変体」は、遺伝子のオルタナティブスプライシングの産物である。転写後、最初の核酸転写物は、異なる（別の）核酸スプライス産物が異なるポリペプチドをコードするようにスプライスされ得る。スプライス改変体の産生機構は変化するが、エキソンのオルタナティブスプライシングを含む。読み過し転写により同じ核酸に由来する別のポリペプチドもまた、この定義に包含される。スプライシング反応の任意の産物（組換え形態のスプライス産物を含む）がこの定義に含まれる。
【００６５】
本明細書において「遺伝子」とは、遺伝形質を規定する因子をいう。通常染色体上に一定の順序に配列している。タンパク質の一次構造を規定する遺伝子を構造遺伝子といい、その発現を左右する遺伝子を調節遺伝子という。本明細書では、「遺伝子」は、「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」ならびに／あるいは「タンパク質」「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」をさすことがある。
【００６６】
本明細書において遺伝子の「相同性」とは、２以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。従って、ある２つの遺伝子の相同性が高いほど、それらの配列の同一性または類似性は高い。２種類の遺伝子が相同性を有するか否かは、配列の直接の比較、または核酸の場合ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーション法によって調べられ得る。２つの遺伝子配列を直接比較する場合、その遺伝子配列間でＤＮＡ配列が、代表的には少なくとも５０％同一である場合、好ましくは少なくとも７０％同一である場合、より好ましくは少なくとも８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一である場合、それらの遺伝子は相同性を有する。
【００６７】
アミノ酸は、その一般に公知の３文字記号か、またはＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎにより推奨される１文字記号のいずれかにより、本明細書中で言及され得る。ヌクレオチドも同様に、一般に認知された１文字コードにより言及され得る。
【００６８】
本明細書では、アミノ酸配列および塩基配列の類似性、同一性および相同性の比較は、配列分析用ツールであるＢＬＡＳＴを用いてデフォルトパラメータを用いて算出される。同一性の検索は例えば、ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴ  ２．２．９（２００４．５．１２  発行）を用いて行うことができる。本明細書における同一性の値は通常は上記ＢＬＡＳＴを用い、デフォルトの条件でアラインした際の値をいう。ただし、パラメータの変更により、より高い値が出る場合は、最も高い値を同一性の値とする。複数の領域で同一性が評価される場合はそのうちの最も高い値を同一性の値とする。
【００６９】
本明細書において「ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド」とは、当該分野で慣用される周知の条件をいう。本発明のポリヌクレオチド中から選択されたポリヌクレオチドをプローブとして、コロニー・ハイブリダイゼーション法、プラーク・ハイブリダイゼーション法あるいはサザンブロットハイブリダイゼーション法などを用いることにより、そのようなポリヌクレオチドを得ることができる。具体的には、コロニーあるいはプラーク由来のＤＮＡを固定化したフィルターを用いて、０．７〜１．０ＭのＮａＣｌ存在下、６５℃でハイブリダイゼーションを行った後、０．１〜２倍濃度のＳＳＣ（ｓａｌｉｎｅ−ｓｏｄｉｕｍ  ｃｉｔｒａｔｅ）溶液（１倍濃度のＳＳＣ溶液の組成は、１５０ｍＭ  塩化ナトリウム、１５ｍＭ  クエン酸ナトリウムである）を用い、６５℃条件下でフィルターを洗浄することにより同定できるポリヌクレオチドを意味する。ハイブリダイゼーションは、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  ｅｄ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ  １〜３８、ＤＮＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  １：Ｃｏｒｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａ  ＰＲａｃ１ｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｓｅｃｏｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９５）などの実験書に記載されている方法に準じて行うことができる。ここで、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列からは、好ましくは、Ａ配列のみまたはＴ配列のみを含む配列が除外される。従って、本発明において使用されるポリペプチド（例えば、ＲＡＧＥなど）には、本発明で特に記載されたポリペプチドをコードする核酸分子に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされるポリペプチドも包含される。
【００７０】
本明細書において「ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチド」とは、上記ハイブリダイズ条件下で別のポリヌクレオチドにハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドをいう。ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとして具体的には、配列番号９７などで表されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするＤＮＡの塩基配列と少なくとも６０％以上の相同性を有するポリヌクレオチド、好ましくは８０％以上の相同性を有するポリヌクレオチド、さらに好ましくは９５％以上の相同性を有するポリヌクレオチドを挙げることができる。
【００７１】
ＤＮＡ二重鎖の安定性に影響を与える因子としては、塩基の組成、長さおよび塩基対不一致の程度が挙げられる。ハイブリダイゼーション条件は、当業者によって調整され得、これらの変数を適用させ、そして異なる配列関連性のＤＮＡがハイブリッドを形成するのを可能にする。完全に一致したＤＮＡ二重鎖の融解温度は、以下の式によって概算され得る。
Ｔｍ（℃）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ［Ｎａ＋］）＋０．４１（％Ｇ＋Ｃ）−６００／Ｎ−０．７２（％ホルムアミド）
ここで、Ｎは、形成される二重鎖の長さであり、［Ｎａ＋］は、ハイブリダイゼーション溶液または洗浄溶液中のナトリウムイオンのモル濃度であり、％Ｇ＋Ｃは、ハイブリッド中の（グアニン＋シトシン）塩基のパーセンテージである。不完全に一致したハイブリッドに関して、融解温度は、各１％不一致（ミスマッチ）に対して約１℃ずつ減少する。
【００７２】
本明細書において、「リフォールディング」とは、異常な折り畳みを有するためにその本来有する機能を失っているポリペプチドの異常な構造を解きほぐし、界面活性剤により再凝集を防ぎつつ、シクロアミロースの包接能を活用したり、あるいは、酸化還元電位制御下での希釈透析により、そのポリペプチドの本来の正しい構造に再折りたたみすることをいう。
【００７３】
本明細書において、「精製用カラム」とは、タンパク質などの分子（例えば、抗体）と親和性を有するか、または結合することができる固体または半固体の支持体をいい、例えば、金属キレートアガロースカラム等を挙げることができる。分子ごとの親和性または結合力の違いにより、各分子を分離することができる。精製する分子の特性に応じて、当業者であれば適切な支持体が選択される。たとえば、Ｎｉ−ＮＴＡアガロースカラムでは、Ｈｉｓタグ等を付加したタンパク質を効率よく精製することができる。
【００７４】
本明細書において、「Ｎｉ−ＮＴＡスラリー」とは、アガロースに固定化したニトリロトリ酢酸（ＮＴＡ）にニッケルイオンをキレートさせたレジンをいう。
【００７５】
本明細書において、「リン酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）とは、ＮａＣｌ、ＫＣｌ、Ｎａ２ＨＰＯ４、およびＫＨ２ＰＯ４を含むｐＨ７〜８の水溶液である。各成分の濃度およびｐＨは、用途に応じて好適に調節することができる。本明細書において、「ＰＢＳ（＋）」は、カルシウムイオンおよびマグネシウムイオンを含むことを意味しており、「ＰＢＳ（−）」は、カルシウムイオンおよびマグネシウムイオンを含まないことを意味しているが、本明細書では、明示的に記載しない限り、「ＰＢＳ」は「ＰＢＳ（−）」を意味するものとする。本明細書では、代表的には、Ｄｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ  ＰＢＳ（−）を使用することができる。Ｄｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ  ＰＢＳ（−）の組成は、ＮａＣｌ  ８ｇ，ＫＣｌ  ０．２ｇ，Ｎａ２ＨＰＯ４  １．１５ｇ，ＫＨ２ＰＯ４  ０．２ｇ／Ｌ、（ｐＨ  ７．４）である。
【００７６】
本明細書において、「セルロースエステル膜チューブ」とは、酢酸セルロースの高分子混合物を押し出し成型することにより製造された透析チューブをいう。
【００７７】
本明細書において使用される場合、用語「受容体」（「レセプター」とも称する）とは、１個以上のリガンドと可逆的、かつ特異的に複合体化する１個以上の結合ドメインを備える生物学的な構造であって、ここで、この複合体化は生物学的な構造を有する。受容体は、完全に細胞の外部（細胞外の受容体）、細胞膜の中（しかし、受容体の部分を細胞外部の環境および細胞質ゾルに向けている）、または完全に細胞の中（細胞内の受容体）に存在し得る。これらはまた、細胞と独立的に機能し得る。細胞膜中の受容体は、細胞を、その境界の外部の空間と連絡（例えば、シグナル伝達）させ、そして細胞の内側および外側への分子およびイオンの輸送において機能させることを可能とする。本明細書において使用する場合、受容体は、受容体全長であっても、受容体のフラグメントであってもよい。
【００７８】
本明細書において「酸化ＬＤＬ受容体」とは、酸化ＬＤＬを受容する任意の受容体を言う。酸化ＬＤＬ受容体には、たとえば、本明細書において説明するＬＯＸ−１のほか、ＳＲ−Ａ，ＳＲ−Ｂ，ＣＤ３６のようなスカベンジャー受容体、等が含まれるがこれらに限定されない。当該分野では、ときに「変性ＬＤＬ受容体」と称されることがあるが「酸化ＬＤＬ受容体」と同一である。
【００７９】
本明細書において使用される場合、「変性ＬＤＬ」は、「ＬＤＬ修飾物」「修飾ＬＤＬ」（これらは、同じ意味で用いられる）とも呼ばれ、ＬＤＬが体内で活性酸素、酸化的酵素、Ｆｅ３＋などと接触すること、あるいは、血管内皮細胞やマクロファージなどによる細胞依存性化学変化によって発生する種々の分子修飾を有する任意のＬＤＬ修飾物である。生体内に存在するＬＤＬ修飾物としては、代表的には、酸化ＬＤＬ（本明細書中、ＯｘＬＤＬといい、例としては完全酸化ＬＤＬ（本明細書中ｆｕ  ＯｘＬＤＬともいう）および部分酸化ＬＤＬ（本明細書中ｍｏ  ＯｘＬＤＬともいう）が挙げられる）、マロンジアルデヒド化ＬＤＬ（ＭＤＡ−ＬＤＬ）、クロトンアルデヒド（ＣＲＡ）修飾ＬＤＬ、等のアルデヒド修飾ＬＤＬ、アクロレイン修飾ＬＤＬ、ノネナール修飾ＬＤＬ、４−ヒドロキシノネナール（ＨＮＥ）修飾ＬＤＬ、ヘキサノイル（ＨＥＬ）修飾ＬＤＬ、小粒子ＬＤＬ（直径２５５ｎｍ以下のＬＤＬ）、糖化ＬＤＬ、アセチル化ＬＤＬ（ＡｃＬＤＬ）などが挙げられるが、これらに限定されない。酸化ＬＤＬが異常値を示す場合、動脈硬化症、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、高脂血症などのような疾患が予想されるがこれらに限定されない（「今日の臨床検査  ２００７−２００８」発行所  株式会社  南江堂、参照）。一般に使用される検査方法では、基準物質としては、ＭＤＡ−ＬＤＬ（正常範囲：１０〜８０ΜＬ）および酸化ホスファチジルコリン（正常範囲：８．４Ｕ／ｍＬ〜１７．６Ｕ／ｍＬ）が使用されている。
【００８０】
本明細書において使用される場合、用語「レクチン様酸化低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）受容体１（Ｌｅｃｔｉｎ−ｌｉｋｅ  Ｏｘｉｄｉｚｅｄ  ＬＤＬ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ）」とは、ＬＯＸ−１ともいわれ、（１）配列番号８２に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド；（２）上記配列番号８２に示されるアミノ酸配列において１または数個のアミノ酸の置換、付加および／または欠失を含むアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；（３）上記配列番号８２に示されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；（４）上記配列番号８２に示されるアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列相同性を有するアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；（５）配列番号８１に示される核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチド；（６）上記配列番号８１に示される核酸配列に対して相補的な核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；（７）上記配列番号８１に示される核酸配列において１または数個のヌクレオチドの置換、付加および／または欠失を有する核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；（８）上記配列番号８１に示される核酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；および（９）上記配列番号８１に示される核酸配列と少なくとも８０％の配列相同性を有する核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド、のうちの１つである。上記の同一性または相同性は、配列分析用ツールであるＢＬＡＳＴ（ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴ  ２．２．９（２００４．５．１２  発行））を用いてデフォルトパラメータを用いて算出される。ストリンジェントな条件は配列に依存して変化し、このような条件の決定は、当業者の技術範囲内である。また、ＬＯＸ−１としては、ヒトＬＯＸ−１（ｈＬＯＸ−１ともいう）、ウシＬＯＸ−１（ｂ−ＬＯＸ１ともいう）、ブタＬＯＸ−１、マウスＬＯＸ−１、ウサギＬＯＸ−１のような哺乳動物のＬＯＸ−１が挙げられるが、これらに限定されない。ｂＬＯＸ−１は、Ｃ型レクチンファミリーに属する２７３アミノ酸残基からなる分子量約５０ｋＤａの糖タンパク質であり、Ｎ末端が細胞質内にあり、Ｃ末端が細胞外に出ている細胞膜１回貫通型のＩＩ型膜タンパク質である。ｈＬＯＸ−１はまた、Ｃ型レクチンファミリーに属する２７３アミノ酸残基からなる分子量約５０ｋＤａの糖タンパク質であり、Ｎ末端が細胞質内にあり、Ｃ末端が細胞外に出ている細胞膜１回貫通型のＩＩ型膜タンパク質である。ＬＯＸ−１は、構造的には、以下の４つのドメイン：Ｎ末端側の細胞質ドメイン、疎水性膜貫通ドメイン、ネックドメイン、およびＣ型レクチン様ドメインからなる。
【００８１】
ウシＬＯＸ−１（ｂＬＯＸ−１）は、Ｃ型レクチンファミリーに属する２７３アミノ酸残基からなる分子量約５０ｋＤａの糖タンパク質であり、Ｎ末端が細胞質内にあり、Ｃ末端が細胞外に出ている細胞膜１回貫通型のＩＩ型膜タンパク質である。ヒトＬＯＸ−１（ｈＬＯＸ−１）はまた、Ｃ型レクチンファミリーに属する２７３アミノ酸残基からなる約３０ｋＤａ（１３９位および１８３位の糖鎖付加により、分子量約４０ｋＤａ）のＩＩ型膜タンパク質である。この受容体は、構造的には、以下の４つのドメイン：Ｎ末端側の細胞質ドメイン、疎水性膜貫通ドメイン、ネックドメイン、およびＣ型レクチン様ドメイン（本明細書中、ＣＴＬＤもという）からなる。このＣＴＬＤは、種間で、特に、６個のシステイン残基の位置で高度に保存されており、ＬＯＸ−１のリガンドを認識するための機能的ドメインである。このＣＴＬＤ中の６個のシステイン残基は、ｈＬＯＸ−１の分子内ジスルフィド結合に関与している。この保存されたＣＴＬＤに加えて、ｈＬＯＸ−１および他の既知の種におけるネックドメインは、高い配列同一性を有している。また、Ｘｉｅら（Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ａｎｄ  Ｐｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ３２：６８−７４（２００３））によれば、ＣＴＬＤが変性ＬＤＬを結合するのに十分な最小ドメインであり、たとえＣＴＬＤがグリコシル化されていなくても、変性ＬＤＬを認識および結合できることが明らかにされている。ＬＯＸ−１は、血管内皮細胞のみならず、マクロファージおよび活性化血管平滑筋細胞において発現されており、構造的に関連性のない種々の高分子（変性ＬＤＬ、細菌、老化赤血球、アポトーシスを受けた細胞、および血小板があげられる）を認識し、生体防御機構や炎症性機転などの種々の生命現象において重要な役割を果たしていること、そしてその発現は種々の条件下で、高脂血症、糖尿病、高血糖、高血圧症、高血圧性腎硬化症、動脈硬化、虚血再灌流傷害、血管バルーン傷害後のような病態；ならびに酸化ＬＤＬ、アンジオテンシンＩＩ、エンドセリン、ＴＮＦ−α、後期糖化反応生成物（ＡＧＥｓ）、ＴＧＦ−β、８−イソ−プロスタグランジンＦ２α、ズリ応力のような刺激によって、調節されていることが分かっている（Ｆｏｌｉａ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｊｐｎ．１２７，１０３−１０７（２００６））。
【００８２】
本明細書において使用される場合、用語「Ｃ型レクチン様ドメイン」とは、「ＣＴＬＤ」ともいい、Ｃ型レクチンファミリーに属するメンバーの糖鎖認識部位と相同性を有する。ＣＴＬＤは、このメンバー間で、種間で非常によく保存されており、６個のシステイン残基の位置は、完全に保存されている。また、ＣＴＬＤは、ＬＯＸ−１のリガンドを認識するための機能的ドメインであり、この中の６個のシステイン残基は、ｈＬＯＸ−１の３カ所の分子内ジスルフィド結合に関与している。従って、変異ＬＯＸ−１−界面活性剤複合体は、配列番号８２のアミノ酸配列において、１４４位、１５５位、１７２位、２４３位、２５６位、２６４位におけるシステインが保持されていることが好ましい。同様に、本発明のＣＴＬＤ−界面活性剤複合体においても、配列番号８２のアミノ酸配列における１４４位、１５５位、１７２位、２４３位、２５６位、２６４位におけるシステインに対応するアミノ酸が保持されていることが好ましい。この保存されたＣＴＬＤに加えて、ｈＬＯＸ−１および他の既知の種におけるネックドメインは、高い配列同一性を有している。また、ｈＬＯＸ−１における１４０位のシステインは、分子間ジスルフィド結合に関与し、ｈＬＯＸ−１の二量体を形成する。しかし、この１４０位のシステインは、変性ＬＤＬの認識に必須ではないので、発現された場合に、必ずしもこの１４０位のシステインが保持されている必要はなく、変異されていてもよい。さらに、ｈＬＯＸ−１では、１８３位のＮと１３９位のＮにおいて糖鎖が付加されている。糖鎖が付加されたｈＬＯＸ−１の分子量は、５０ｋＤａである。通常ｈＬＯＸ−１はグリコシル化されているが、たとえグリコシル化されていなくても、グリコシル化された通常のｈＬＯＸ−１と同様に、変性ＬＤＬを認識および結合できる。上記ＣＴＬＤは、変性ＬＤＬを結合するのに必要十分な最小ドメインである。このＬＯＸ−１のＣ末端の４残基（ＬＲＡＱ）は、リガンドの認識と取り込みに必須であり、Ｃ末端の７残基（ＫＡＮＬＲＡＱ）がｈＬＯＸ−１のフォールディングと輸送に必須である。ｈＬＯＸ−１のＷ１５０、Ｒ２０８、Ｒ２２９、Ｒ２３１、Ｒ２４８等がリガンド認識と取り込みに必須のアミノ酸である。ＬＯＸ−１はまた、細胞膜から切断され、可溶性形態として放出され、健常者の血中にも存在することが報告されている。
【００８３】
本明細書において使用される場合、用語「ＣＴＬＤ様ポリペプチド」とは、「ＣＴＬＤ」、「ＰＲ（Ｐｒｏｔｅａｓｅ−Ｒｅｓｉｓｔａｎｔ（プロテアーゼ耐性））−ＣＴＬＤ」、「ＣＴＬＤ１４」（ＣＴＬＤ＋ネックドメインのＣ末端側の１４アミノ酸を有するポリペプチド）、「ＰＲ−ＣＴＬＤ１４」、「ＣＴＬＤ＋ネック」（ＣＴＬＤ＋ネックドメインを有するポリペプチド）、または「ＰＲ−ＣＴＬＤ＋ネック」に包含される全てのポリペプチドまたはその変異体を包含する。
【００８４】
本明細書において使用される場合、用語「ＣＴＬＤ分子」とは、ＣＴＬＤ様ポリペプチドの他、それらの任意の複合体を含むことが理解される。したがって、ＣＴＬＤ分子には、ＬＯＸ−１全長、ＬＯＸ−１細胞外領域全長（Ｓ６１〜Ｑ２７３）、ＣＴＬＤ１４（１２９−１４３）、ＣＴＬＤ（１４３−２７３）等も包含されることが理解される。本明細書において使用される場合、用語「ＣＴＬＤ１４」および「ＰＲ−ＣＴＬＤ１４」とは、（１）配列番号８４に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド；（２）上記配列番号８４に示されるアミノ酸配列において１または数個のアミノ酸の置換、付加および／または欠失を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド；（３）上記配列番号８４に示されるアミノ酸配列において１０４位および１２１位以外のアミノ酸位置で１または数個の置換、付加および／または欠失を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド；（４）上記配列番号８４に示されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド；（５）上記配列番号８４に示されるアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列相同性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド；（６）配列番号８３に示される核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチド；（７）上記配列番号８３に示される核酸配列に対して相補的な核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチド；（８）配列番号８３に示される核酸配列と相補的な核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされるアミノ酸配列であって、該コードされるアミノ酸配列において１０４位および１２１位のアミノ酸は、配列番号８４における対応するアミノ酸を保持し、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すアミノ酸配列を含むポリペプチド；（９）上記配列番号８３に示される核酸配列において１または数個の置換、付加および／または欠失を有する核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＬＯＸ−１の活性を示すポリペプチド；（１０）上記配列番号８３に示される核酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチド；（１１）上記配列番号８３に示される核酸配列と少なくとも８０％の配列相同性を有する核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチド、のうちの１つによって示される。上記の同一性または相同性は、配列分析用ツールであるＢＬＡＳＴ（ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴ２．２．９（２００４．５．１２発行））を用いてデフォルトパラメータを用いて算出される。ストリンジェントな条件は配列に依存して変化し、このような条件の決定は、当業者の技術範囲内である。
【００８５】
なお、ＣＴＬＤ１４を含め上記ＣＴＬＤ様ポリペプチドは、天然型ＬＯＸ−１の活性が保持されている限り、非天然アミノ酸を含んでいてもよいし、アミノ酸アナログ、アミノ酸誘導体などを含んでいてもよい。
【００８６】
本明細書において使用される場合、用語「終末糖化産物」または「後期糖化反応生成物」（いずれも英文では、Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｇｌｙｃａｔｉｏｎ  Ｅｎｄ  Ｐｒｏｄｕｃｔｓ）とは、ＡＧＥｓともいわれ、糖尿病患者の生活の質を損ねる元凶である血管合併症として知られる糖尿病性血管障害の発症・進展に関与している。血管合併症による眼、神経、腎臓の障害は、それぞれ糖尿病網膜症、神経症、腎症（あわせて三大合併症）とよばれており、糖尿病患者に特徴的な病態である。グルコースに代表される還元糖は、タンパク質、アミノ酸のアミノ基と非酵素的に反応して、シッフ塩基またはアマドリ転位化合物などの糖化生成物を形成する。ここまでの反応は可逆的であり、前期反応とよばれている。その後、さらに縮合、開裂、架橋形成などの複雑かつ不可逆的な反応を経て、終末糖化産物を形成する。このような一連の反応は、グリケーションと称される。ＡＧＥｓはまた、このような過程を経て生成された構造物の総称である。生体中に存在するＡＧＥｓ構造としては、カルボキシメチルリジン(ＣＭＬ)、カルボキエチルリジン(ＣＥＬ)、ペントシジン、ピラリン、イミダゾリン、メチルグリオキサール、クロスリンなどが挙げられるが、これに限定されない。血漿中に存在するアルブミン、イムノグロブリン、オボアルブミンなどが上記の糖化を受けた産物もＡＧＥであり、ＡＧＥとして実験系に汎用されている。さらに、インビトロ実験系では、ＢＳＡ（ウシ血清アルブミン）に糖化処理を施したもの、例えば、Ｒ−ＡＧＥ（リボースにより糖化処理をしたＢＳＡ）、Ｆ−ＡＧＥ（フルクトースにより処理をしたＢＳＡ）；Ｇ−ＡＧＥ（グルコースにより糖化処理をしたＢＳＡ）なども汎用されている。血糖コントロールの指標として用いられているヘモグロビンＡ１ｃはアマドリ転移化合物であるが、ＡＧＥｓに包含される。また、任意のタンパク質も、ＡＧＥｓに変換可能である。例えば、ＡＧＥｓに包含されるＣＭＬアルブミンおよびＣＥＬアルブミンは、いずれもアルブミンが糖化を受けたＡＧＥｓである。このようなＡＧＥｓ生成反応は、生体内において循環血液中、細胞外マトリクス、細胞内のいずれでも起こり得る。例えば、糖尿病患者の血管に存在するＡＧＥｓとしては、：蛍光性で架橋構造を有するもの（ペントシジン、クロスリンなど）および蛍光も架橋もないもの（カルボキシメチルリジン、ピラリン、メチルグリオキサール（ＭＧ）−イミダゾロンなど）の２つに大別できる。ＡＧＥｓが異常値を示す場合、細小血管症（腎症、網膜症、神経症など）、大血管障害（虚血性心疾患、脳血管疾患、閉塞性動脈硬化症のような疾患が予想される。一般に使用される検査方法では、基準物質としては、ピラリン（正常範囲：血漿中２３ｐｍｏｌ／ｍＬ未満）、ペントシジン（正常範囲：血漿中０．００９１５〜０．０４３１μｇ／ｍＬ（ＥＬＩＳＡで測定した場合））などが使用される（「今日の臨床検査  ２００７−２００８」発行所  株式会社  南江堂、参照）。
【００８７】
本明細書において使用される場合、「複合体」とは、２以上の部分を含む任意の構成体を意味する。例えば、一方の部分がポリペプチドである場合は、他方の部分は、ポリペプチドであってもよく、それ以外の物質（例えば、糖、脂質、核酸、他の炭化水素等）であってもよい。本明細書において複合体を構成する２以上の部分は、共有結合で結合されていてもよくそれ以外の結合（例えば、水素結合、イオン結合、疎水性相互作用、ファンデルワールス力等）で結合されていてもよい。２以上の部分がポリペプチドの場合は、キメラポリペプチドとも称しうる。したがって、本明細書において「複合体」は、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、脂質、糖、低分子などの分子が複数種連結してできた分子を含む。
【００８８】
本明細書において使用される場合、用語「リガンド」とは、特異的な受容体または受容体のファミリーに対する結合パートナーである。リガンドは、受容体に対する内因性のリガンドであるか、またはその代わりに、薬剤、薬剤候補、もしくは薬理学的手段のような受容体に対する合成リガンドであり得る。
【００８９】
本明細書において「ＡＧＥｓ分子」とは、上記ＡＧＥに含まれる任意の分子をいう。例えば、ＡＧＥｓとしては、Ｌｙｓ−ＡＧＥ（グルタルアルデヒド修飾リジン修飾ＡＧＥ）、グルコース修飾ＡＧＥ（Ｇ−ＡＧＥ）、リボース修飾ＡＧＥ（Ｒ−ＡＧＥ）、フルクトース修飾ＡＧＥ（Ｆ−ＡＧＥ）またはそれらの改変体あるいはそれらの複合体を挙げることができるがそれらに限定されない。
【００９０】
本明細書において「ＡＧＥｓ様活性を示す分子」とは、少なくとも上述のＡＧＥｓの活性（本明細書において「ＡＧＥｓ様活性」という。）の一つを有する分子をいう。そのようなＡＧＥｓ様活性としては、ＲＡＧＥに対する結合活性（リガンド活性）を挙げることができるが、それに限定されない。
【００９１】
本明細書において使用される場合、用語「ＡＧＥ受容体（Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｆｏｒ  ＡＧＥ）」とは、ＲＡＧＥともいわれ、（１）配列番号８に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド；（２）上記配列番号１０２に示されるアミノ酸配列において１または数個のアミノ酸の置換、付加および／または欠失を含むアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド；（３）上記配列番号１０２に示されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド；（４）上記配列番号１０２に示されるアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列相同性を有するアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド；（５）配列番号１０１に示される核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチド；（６）上記配列番号１０１に示される核酸配列に対して相補的な核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド；（７）上記配列番号１０１に示される核酸配列において１または数個のヌクレオチドの置換、付加および／または欠失を有する核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド；（８）上記配列番号１０１に示される核酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド；および（９）上記配列番号１０１に示される核酸配列と少なくとも８０％の配列相同性を有する核酸分子によってコードされるアミノ酸配列を含み、かつ天然型ＲＡＧＥの活性を示すポリペプチド、のうちの１つである。上記の同一性または相同性は、配列分析用ツールであるＢＬＡＳＴ（ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴ  ２．２．９（２００４．５．１２  発行））を用いてデフォルトパラメータを用いて算出される。ストリンジェントな条件は配列に依存して変化し、このような条件の決定は、当業者の技術範囲内である。ＲＡＧＥはまた、１９９２年に、ウシ肺から同定され、ＡＧＥと結合するイムノグロブリンスーパーファミリーに属する、分子量約３５ｋＤａのＩ型膜タンパク質（糖鎖修飾を受けた完全なＲＡＧＥは、分子量５５ｋＤａ）である。ＲＡＧＥｓの細胞外ドメインは、１つのＶ型イムノグロブリンドメイン、続いて、２つのＣ型イムノグロブリンドメイン（Ｃ１領域およびＣ２領域）の、３つのイムノグロブリンフォールド構造を取るドメインが結合した構造を取っている。ＲＡＧＥはまた、細胞膜１回貫通型のドメインおよび４３アミノ酸の細胞質ドメインを含む。ＲＡＧＥは、多様なクラスのリガンド（ＡＧＥｓ、Ｓ１００／カルグラニュリン、アンフォテリンおよびアミロイド−βペプチド）と相互作用する。Ｖドメインは、リガンド結合に必須の部位であり、細胞質ドメインは、ＲＡＧＥ媒介性細胞内シグナル伝達に必須である。ＲＡＧＥはまた、各ドメイン内でジスルフィド結合を有するので、本発明の変異ＲＡＧＥ−界面活性剤複合体は、配列番号９７のアミノ酸配列における３８位、９９位、１４４位、２０８位、２５９位および３０１位に��応するシステイン残基を保持していることが好ましい。ＲＡＧＥは、正常組織および血管系においては低レベルでしか発現されない。しかし、この受容体は、そのリガンドが蓄積した場所においてアップレギュレートされる。ＲＡＧＥの発現は、糖尿病血管系において内皮細胞、平滑筋細胞、周皮細胞、腎メサンギウム細胞および浸潤性単核食細胞で増加している。また、ＡＧＥｓが蓄積している動脈硬化巣のような病的部位においても、ＲＡＧＥの発現が増加している。ＡＧＥｓ−ＲＡＧＥ相互作用は、血管系ホメオスタシスにおいて重要な細胞の特性を変化させる。例えば、ＲＡＧＥがＡＧＥｓと結合した後、血管内皮細胞は、ＶＣＡＭ−１、組織因子、およびＩＬ−６の発現、ならびに高分子へのそれらの透過性を増加させる。単核食細胞において、ＲＡＧＥは、サイトカインおよび増殖因子の発現を活性化し、可溶性ＡＧＥｓに応じて細胞移動を誘導するのに対して、走触性は、固定リガンドで起こる。
【００９２】
本明細書では、「ＲＡＧＥリガンド認識領域」または「ｓＲＡＧＥ（ｓｏｌｕｂｌｅ  Ｒｅｃｅｐｔｏｒｆｏｒ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｇｌｙｃａｔｉｏｎ  Ｅｎｄ  ｐｒｏｄｕｃｔｓ）」とは、交換可能に使用され、ＲＡＧＥリガンドが認識する領域をいう。詳細には、ｓＲＡＧＥすなわちＲＡＧＥリガンド認識領域は、ＲＡＧＥの細胞外領域の全部または一部をいう。ｓＲＡＧＥは、代表的には、配列番号９７または配列番号１０２の２２〜３３２位で構成されるがこれに限定されない。
【００９３】
本明細書において使用される場合、用語「ＲＡＧＥ様ポリペプチド」とは、「ＲＡＧＥ８」、「ｍＲＡＧＥ８」、「ＲＡＧＥ１」、「ｍＲＡＧＥ１」、「ＲＡＧＥ２」、「ｍＲＡＧＥ２」、「ＲＡＧＥ３」、「ｍＲＡＧＥ３」、「ＲＡＧＥ４」、「ｍＲＡＧＥ４」、「ＲＡＧＥ７」、「ｍＲＡＧＥ７」、「ＲＡＧＥ１４３」、「ｍＲＡＧＥ１４３」、「ＲＡＧＥ２２３」、「ｍＲＡＧＥ２２３」、「ＲＡＧＥ２２６」および「ｍＲＡＧＥ２２６」と称されるポリペプチドまたはこれらの変異体を包含する。これらの説明は、特開２０１３−２０９３３０等に開示されており、適宜本明細書において参考としてその内容を援用する。
【００９４】
本明細書において使用される場合、用語「ＲＡＧＥ分子」とは、ＲＡＧＥ様ポリペプチドの他、それらの任意の複合体を含むことが理解される。したがって、ＲＡＧＥ分子には、ＲＡＧＥ様ポリペプチド等、例えば、ＲＡＧＥ（全長）、ＲＡＧＥ細胞外領域（配列番号１０２の２２−３３２位）、ＲＡＧＥ１４３、ＲＡＧＥ２２３、ＲＡＧＥ２２６等が包含されることが理解される。
【００９５】
本明細書では、「ＲＡＧＥリガンド認識領域」を含む分子は、「ＲＡＧＥ分子」のうち全長ＲＡＧＥ以外のもの（「ＲＡＧＥ様ポリペプチド」を含む）、例えば、「ＲＡＧＥ８」、「ｍＲＡＧＥ８」、「ＲＡＧＥ１」、「ｍＲＡＧＥ１」、「ＲＡＧＥ２」、「ｍＲＡＧＥ２」、「ＲＡＧＥ３」、「ｍＲＡＧＥ３」、「ＲＡＧＥ４」、「ｍＲＡＧＥ４」、「ＲＡＧＥ７」、「ｍＲＡＧＥ７」、「ＲＡＧＥ１４３」、「ｍＲＡＧＥ１４３」、「ＲＡＧＥ２２３」、「ｍＲＡＧＥ２２３」、「ＲＡＧＥ２２６」および「ｍＲＡＧＥ２２６」、ＲＡＧＥ細胞外領域（配列番号１０２の２２−３３２位）、などを挙げることができる。
【００９６】
なお、上記ＲＡＧＥ様ポリペプチドは、天然型ＲＡＧＥの活性が保持されている限り、非天然アミノ酸を含んでいてもよいし、アミノ酸アナログ、アミノ酸誘導体などを含んでいてもよい。
【００９７】
上記のＲＡＧＥ様ポリペプチドにおいても、分子内ジスルフィド結合を形成することは重要であるので、配列番号１０２のアミノ酸配列の３８位、９９位、１４４位、２０８位、２５９位および３０１位に対応するシステインは保持されていることが好ましい。          
【００９８】
本明細書において、「リガンド」とは、特異的な受容体または受容体のファミリーに対する結合パートナーである。リガンドは、受容体に対する内因性のリガンドであるか、またはその代わりに、薬剤、薬剤候補、もしくは薬理学的手段のような受容体に対する合成リガンドであり得る。
【００９９】
本明細書において、「抗原抗体反応」とは、当該分野で使用される最も広い意味で用いられ、特に、抗原と抗体との間の特異的結合に基づく反応をいう。検出系としてイムノブロット（ウェスタンブロット）形式を用いることによって、試料中の抗原（例えばＬＤＬ）を検出し、そして定量化するための試薬および方法も提供する。
【０１００】
本明細書中で使用される用語「結合」は、２つのタンパク質もしくは化合物または関連するタンパク質もしくは化合物の間、あるいはそれらの組み合わせの間での、物理的相互作用または化学的相互作用を意味する。結合には、イオン結合、非イオン結合、水素結合、ファンデルワールス結合、疎水性相互作用などが含まれる。物理的相互作用（結合）は、直接的または間接的であり得、間接的なものは、別のタンパク質または化合物の効果を介するかまたは起因する。直接的な結合とは、別のタンパク質または化合物の効果を介してもまたはそれらに起因しても起こらず、他の実質的な化学中間体を伴わない、相互作用をいう。
【０１０１】
本明細書において第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」とは、第一の物質または因子が、第二の物質または因子に対して、第二の物質または因子以外の物質または因子（特に、第二の物質または因子を含むサンプル中に存在する他の物質または因子）に対するよりも高い親和性で相互作用することをいう。物質または因子について特異的な相互作用としては、例えば、核酸におけるハイブリダイゼーション、タンパク質における抗原抗体反応、リガンド−レセプター反応、酵素−基質反応など、核酸およびタンパク質の両方が関係する場合、転写因子とその転写因子の結合部位との反応など、タンパク質−脂質相互作用、核酸−脂質相互作用などが挙げられるがそれらに限定されない。従って、物質または因子がともに核酸である場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」ことには、第一の物質または因子が、第二の物質または因子に対して少なくとも一部に相補性を有することが包含される。また例えば、物質または因子がともにタンパク質である場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」こととしては、例えば、抗原抗体反応による相互作用、レセプター−リガンド反応による相互作用、酵素−基質相互作用などが挙げられるがそれらに限定されない。２種類の物質または因子がタンパク質および核酸を含む場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」ことには、転写因子と、その転写因子が対象とする核酸分子の結合領域との間の相互作用が包含される。したがって、本明細書においてポリヌクレオチドまたはポリペプチドなどの生物学的因子に対して「特異的に相互作用する因子」とは、そのポリヌクレオチドまたはそのポリペプチドなどの生物学的因子に対する親和性が、他の無関連の（特に、同一性が３０％未満の）ポリヌクレオチドまたはポリペプチドに対する親和性よりも、代表的には同等またはより高いか、好ましくは有意に（例えば、統計学的に有意に）高いものを包含する。そのような親和性は、例えば、ハイブリダイゼーションアッセイ、結合アッセイなどによって測定することができる。
【０１０２】
本明細書中で使用される「接触（させる）」とは、化合物を、直接的または間接的のいずれかで、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して物理的に近接させることを意味する。ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、多くの緩衝液、塩、溶液などに存在し得る。接触とは、核酸分子またはそのフラグメントをコードするポリペプチドを含む、例えば、ビーカー、マイクロタイタープレート、細胞培養フラスコまたはマイクロアレイ（例えば、遺伝子チップ）などに化合物を置くことが挙げられる。
【０１０３】
本発明において酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）のような機構を使用する場合、一般に、固相（基材）としては、マイクロタイタープレートが使用される。本明細書において使用される場合、用語「固相」とは、本明細書中において「基板」および「基材」と互換的に使用され、本発明のデバイスが構築される材料をいう。抗体のような分子が固定され得る平面状の支持体をいう。基板の材料としては、共有結合かまたは非共有結合のいずれかで、本発明において使用される生体分子に結合する特性を有するかまたはそのような特性を有するように誘導体化され得る、任意の固体材料が挙げられる。適切な基材としては、ビーズ、金粒子、プレート（例えば、マイクロタイタープレート）、試験管、チップ、磁性粒子、膜、繊維、スライドガラス、金属薄膜、フィルター、チューブ、ボール、ダイアモンド様炭素被膜ステンレスなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０４】
固相および基板として使用するためのそのような材料としては、固体表面を形成し得る任意の材料が使用され得るが、例えば、ガラス、シリカ、シリコーン、セラミック、二酸化珪素、プラスチック、金属（合金も含まれる）、天然および合成のポリマー（例えば、ポリスチレン、セルロース、アミロース、キトサン、デキストラン、およびナイロン）以下が挙げられるがそれらに限定されない。基板は、複数の異なる材料の層から形成されていてもよい。例えば、ガラス、石英ガラス、アルミナ、サファイア、フォルステライト、炭化珪素、酸化珪素、窒化珪素などの無機絶縁材料を使用できる。また、ポリエチレン、エチレン、ポリプロピレン、ポリイソブチレン、ポリエチレンテレフタレート、不飽和ポリエステル、含フッ素樹脂、ポリ塩化ビニル、ポリ塩化ビニリデン、ポリ酢酸ビニル、ポリビニルアルコール、ポリビニルアセタール、アクリル樹脂、ポリアクリロニトリル、ポリスチレン、アセタール樹脂、ポリカーボネート、ポリアミド、フェノール樹脂、ユリア樹脂、エポキシ樹脂、メラミン樹脂、スチレン・アクリロニトリル共重合体、アクリロニトリルブタジエンスチレン共重合体、シリコーン樹脂、ポリフェニレンオキサイド、ポリスルホン等の有機材料を用いることができる。本発明においてはまた、ナイロン膜、ニトロセルロース膜、ＰＶＤＦ膜など、ブロッティングに使用される膜を用いることもできる。高密度のものを解析する場合は、ガラスなど硬度のあるものを材料として使用することが好ましい。基板として好ましい材質は、測定機器などの種々のパラメータによって変動し、当業者は、上述のような種々の材料から適切なものを適宜選択することができる。
【０１０５】
「サンドイッチＥＬＩＳＡ」とは、ＥＬＩＳＡの特定の形式を言い、抗体または抗原に特異的に結合できる分子（例えばＬＯＸ−１）が固体材料に結合され、抗原を含有する試料に供され、その後、非結合抗原を取り除くべく、その固体材料表面が洗われその後、標識抗体（例えば、酵素が連結された標識抗体）が、結合している状態の抗原（存在する場合）に結合され、抗体−抗原−抗体のサンドイッチを形成するような形式をいう。抗体に連結され得る酵素の例は、アルカリホスファターゼ、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、ルシフェラーゼ、ウレアーゼおよびβ−ガラクトシダーゼである。酵素が連結された抗体は、基質と反応し、測定され得る呈色反応生成物を発生させる。標識抗体の代わりに、標識されていない抗体もまた使用することができる。この場合、標識されていない抗体に、標識された二次抗体を結合させることによって、検出することができる。
【０１０６】
「ラテラルフローアッセイ」とは、免疫アッセイの一種であり、非競合型および競合型が存在する。ここでは、試料が、例えば毛管現象によって、支持体を横切って移動し、そして可動標識抗体と出合い、該抗体が分析物に結合してコンジュゲートを形成し、次いで、コンジュゲートが支持体を横切り、そして固定された第二の抗体と出会い、この抗体が分析物と結合することにより、標識抗体を検出することによって、固定された分析物が検出される形式をいう。ラテラルフローアッセイの競合型では、分析物の標識型が、支持体を横切って移動し、そして固定された抗体との結合に関して、非標識分析物と競合する形式である。試料中により多量の分析物があれば、標識分析物による結合はより少なくなるため、シグナルはより弱くなる。例えばＭａｙら、米国特許第５，６２２，８７１号およびＲｏｓｅｎｓｔｅｉｎ、米国特許第５，５９１，６４５号を参照することができる。
【０１０７】
本明細書では、「ＬＯＸ−１リガンド認識領域」とは、酸化ＬＤＬ受容体であるＣ  ｔｙｐｅ  Ｌｅｃｔｉｎ−ｌｉｋｅ  ＬＤＬ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＬＯＸ−１）のリガンドを認識する領域をいう。詳細には、ＬＯＸリガンド認識領域は、認識に必須な最小領域であるＣ−ｔｙｐｅ  Ｌｅｃｔｉｎ様領域（ＣＴＬＤ）を含むことが想定され、認識に必須な最小領域であるＣ−ｔｙｐｅ  Ｌｅｃｔｉｎ様領域（ＣＴＬＤ）のみではなく、ネック領域に存在しているＣｙｓ１４０（ＬＯＸ−１の分子間Ｓ−Ｓ結合に必須）を含むＣＴＬＤ１４として再構築することにより、溶液中で８０％以上が自然にダイマーを形成し、安定に存在することが知られている。ＣＴＬＤ１４はＮ末端ビオチン化ＣＴＬＤ１４として発現させることにより、基板上への高密度集積が可能なことが確認され、基板上に固定化した検出系に適用する際には、ビオチン化ＣＴＬＤ１４が好ましいことも知られている。
【０１０８】
本明細書において、「カイコ」とは、通常の意味のカイコ（蚕）を意味し、チョウ目（鱗翅目）・カイコガ科に属する昆虫の一種であるものとする。正式和名はカイコガ（学名：Ｂｏｍｂｉｘ  ｍｏｒｉ）で、カイコはこの幼虫の名称だが、一般的にはこの種全般をも指す。クワ（桑）を食餌とし、絹を産生して蛹の繭を作る。カイコは家蚕（かさん）とも呼ばれ、野生に生息する昆虫ではない。カイコの祖先は東アジアに生息するクワコ（Ｂｏｍｂｙｘｍａｎｄａｒｉｎａ）であると考えられている。カイコとクワコは学問的には別種とされるが、これらの雑種は生殖能力をもつ。本明細書では、カイコには、クワコが含まれるものとする。本明細書において「カイコと同様の糖鎖を付与する生物」とは、カイコと同様の糖鎖を付加する能力を有する生物をいい、カイコと同様の糖鎖を付加する酵素をコードする遺伝子等でトランスジェニック生物等を含みうる。
【０１０９】
本明細書において、「絹糸腺」とは、熟蚕の体内に存在する左右１対の器官であり、クワの葉から摂取した多量のタンパク質（アミノ酸）を２種類の絹タンパク質（フィブロイン、セリシン）に変える器官を意味する。絹糸腺は左右一対となっており、マユ糸の原料となる液状絹を分泌する。絹糸腺は、後部絹糸腺、中部絹糸腺、前部絹糸腺の３つの部分に分けられる。本発明では、いずれの絹糸腺を用いても合成可能であるが、合成後の取り扱いを考慮し、後部絹糸腺、中部絹糸腺が通常使用され、好ましくは中部絹糸腺が使用されるが、それに限定されるものではない。また、全身に発現させて全身から回収することも可能である。
【０１１０】
後部絹糸腺とは、最後部にある細長い部分で、伸ばすと約２０ｃｍになる。ここでは後にマユ糸の中心となるフィブロインタンパク質を合成する。
【０１１１】
中部絹糸腺とは、中央部分にあるＳ字に曲がった太い部分で、伸ばすと約６ｃｍになる。後部絹糸腺から送られてきたフィブロインタンパク質を濃縮して蓄え、繊維にしやすい形に整える。またもうひとつの絹タンパク質であるセリシンも分泌する。マユ糸を吐きだすとき、フィブロインタンパク質をまとめる接着剤の役割をする。
【０１１２】
前部絹糸腺とは、長さは約４ｃｍの吐糸口につながる細い管で、先に行くほど細くなる。液状のフィブロインタンパク質の分子が引き伸ばされて一定方向に揃えられ、互いに集合することでさらに水分が除かれる。管の先端でもう一対の管と一本に合流し、吐糸口から吐きだされて一本のマユ糸になる。
【０１１３】
カイコは５齢の終わり頃にクワを食べるのをやめる（熟蚕）。熟蚕の体の中は、マユ糸の原料となる水飴のような液（液状絹）をため込んだ一対の器官（絹糸腺）でいっぱいになっている。絹糸腺は、細い吐糸管をつうじてカイコの口元にある吐糸口につながっている。液状絹は細い吐糸管を通ることで引き伸ばされて固まり、マユ糸となる。さらには、幼虫が吐糸管から吐きだした糸を近くのものに貼りつけ、頭と胸を８の字状に動かし、引っぱるという一連の運動で、マユ糸は次々と絹糸腺から引きだされるのである。
【０１１４】
本明細書において「カイコ型糖鎖」とは、カイコで生産される糖タンパク質において特有の糖鎖構造をいい、代表的にはトリマンノシルコア（自体）、オリゴマンノース型糖鎖および複合型糖鎖、あるいはそのハイブリッド型がある（図１９、図２０を参照）。本発明では、中部絹糸腺を用いてカイコ型糖タンパク質を生産していることから、特に断らない限り、「カイコ型糖鎖」とは、この中部絹糸腺で生産される特有の糖鎖型をいう。このようなカイコ型糖鎖としては、例えば、アスパラギン（Ａｓｎ）に結合したＮアセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）が２個結合した後、マンノース（Ｍａｎ）が３分子結合したもの（トリマンノシルコアといい、下記（１）式で示される）をコアとして、そこから分岐した構造をとり、さらに種々の糖鎖が結合している。
【０１１５】
＜糖鎖の構造＞
糖鎖は、糖鎖の結合様式により、アスパラギンと結合する糖鎖（Ｎ−グリコシド結合糖鎖という）ならびに、セリン、スレオニンなどと結合する糖鎖（０−グリコシド結合糖鎖という）の２種類に大別される。上述のＮ−グリコシド結合糖鎖は、様々な構造を有しているが［生物化学実験法２３−糖タンパク質糖鎖研究法（学会出版センター）高橋禮子編（１９８９年）］、いずれの場合も下記に示す基本となる共通のコア構造を有することが好ましい。もっとも、この点は、上述の糖タンパク質が抗体ではない場合にも、同様である。
【０１１６】
カイコ型のものでは以下のとおりである（Ｉｉｚｕｋａ  ｅｔ  ａｌ．  ＦＥＢＳ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ２７６（２００９）５８０６−５８２０）。すなわち、上述の生産方法において、上述のカイコ型糖タンパク質には、下記化学式（１）で示される糖鎖構造（トリマンノシルコアとも呼ばれる。）
【０１１７】
【化１】
0006617110.tif 000002
【０１１８】
を含むＮ−グリコシド結合糖鎖（トリマンノシルコア）を有する糖タンパク質が含まれることが好ましい。理論に束縛されることを望まないが、上記糖鎖構造はカイコ型糖鎖に共通の特徴であるところ、実施例等で示されるように、安定性に優れていること、および変性ＬＤＬまたはＡＧＥｓを広く感度よく検出することができることが判明していることから、この糖鎖が一定の役割を果たしているものと推測されるからである。本明細書において、糖鎖（１）は、Ｎ４−１または糖鎖０００．１とも表示される。
【０１１９】
そして、上記の構造において、アスパラギンと結合する糖鎖の末端を還元末端、反対側を非還元末端という。還元末端のＮ−アセチルグルコサミンへのフコースの結合としては、α１，３結合、α１，６結合などがあげられる。
【０１２０】
Ｎ−グリコシド結合糖鎖には、コア構造の非還元末端にマンノースのみが結合するハイマンノース型（オリゴマンノース型）、コア構造の非還元末端側にガラクトース−Ｎ−アセチルグルコサミン（以下、Ｇａｌ−ＧｌｃＮＡｃと称す。）の枝を並行して１ないしは複数本有し、更にＧａｌ−ＧｌｃＮＡｃの非還元末端側にシアル酸、バイセクティングのＮ−アセチルグルコサミンなどの構造を有する複合型（コンプレックス型ともいい、両者は同義である。）、コア構造の非還元末端側にハイマンノース型（オリゴマンノース型）と複合型（コンプレックス型）の両方の枝を持つハイブリッド型などがあげられる。
【０１２１】
本実施形態では、上述の糖タンパク質には、下記化学式（２）、（３）または（４）で示される糖鎖構造
【０１２２】
【化２】
0006617110.tif 000003
【０１２３】
この型は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ」とも記載される。本明細書において、糖鎖（２）は、糖鎖２００．１とも表示される。
【０１２４】
【化３】
0006617110.tif 000004
【０１２５】
（この型は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎ」とも記載され、複合型に分類されることもある。）本明細書において、糖鎖（３）は、糖鎖１００．１とも表示される。
【０１２６】
【化４】
0006617110.tif 000005
【０１２７】
（この型は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ」とも記載され、複合型に分類されることもある。）
を含むＮ−グリコシド結合糖鎖を有する糖タンパク質が含まれることが好ましい。カイコ型の糖鎖では、上述のような複合型糖鎖が含まれていることが知られているからである。本明細書において、糖鎖（４）は、Ｎ４−２または糖鎖１００．２とも表示される。
【０１２８】
そして、本発明では、（２）が代表的に認められるものである。上述の糖タンパク質のうち、化学式（３）または（４）で示される糖鎖構造を含むＮ−グリコシド結合糖鎖を有する糖タンパク質を含んでいてもよい。
【０１２９】
化学式（２）、（３）または（４）で示される糖鎖構造を含むＮ−グリコシド結合糖鎖を有する糖タンパク質の割合が１０モル％以上、２０モル％以上、または３０モル％以上であれば、その糖タンパク質のＮ−グリコシド結合糖鎖は、カイコ型を生産しない一般の細胞によって生産される糖タンパク質のＮ−グリコシド結合糖鎖に比べて、カイコ型の糖鎖により付与される特徴が強化されるからである。
【０１３０】
（オリゴマンノース型）
【０１３１】
【化５】
0006617110.tif 000006
【０１３２】
この構造は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ」とも記載される。本明細書において、糖鎖（５）は、Ｎ３または糖鎖Ｍ５．１とも表示される。本発明では、（２）のほかこの（５）も代表的に認められるものである。
【０１３３】
【化６】
0006617110.tif 000007
【０１３４】
この構造は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ」とも記載される。本明細書において、糖鎖（６）は、Ｎ２または糖鎖Ｍ６．１とも表示される。本発明では、（２）のほかこの（６）も代表的に認められるものである。
【０１３５】
もちろん、これらのオリゴマンノース型に加え、さらなる糖が付加したものも本発明の糖鎖として含まれ得ることが理解される。
【０１３６】
（ＣＴＬＤ１４の糖鎖の特定の組合せ）
本発明のＣＴＬＤ１４が含む前記カイコ型糖鎖は、アスパラギン残基からみて以下の組合せ
１）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃとの組み合わせ（上記式（５）と（２））、
２）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎとの組み合わせ（上記式（６）と（３））、
３）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃとの組み合わせ（上記式（６）と（４））、
の１つまたは複数の組合せを含む。
【０１３７】
（ｓＲＡＧＥの糖鎖）
ｓＲＡＧＥの糖鎖型として、上記（１）〜（６）（［化１］〜［化６］）に加えて以下のものも挙げられる。
【０１３８】
【化７】
0006617110.tif 000008
【０１３９】
（この型は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−α１，３−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ」とも記載され、ハイブリッド型に分類されることもある。）本明細書において、糖鎖（７）は、Ｎ４−３または糖鎖Ｈ４．１１とも表示される。
【０１４０】
【化８】
0006617110.tif 000009
【０１４１】
（この構造は、アスパラギン残基からみて「ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎ」とも記載され、オリゴマンノース型に分類されることもある。）本明細書において、糖鎖（８）は、Ｎ１または糖鎖Ｍ７．２とも表示される。
【０１４２】
ｓＲＡＧＥの糖鎖構造解析により、約９０％以上がオリゴマンノース型糖鎖であり、数％の複合型およびハイブリッド型糖鎖を含むことを明らかにした。さらに、糖鎖付加により安定性が向上するという優れた効果を有する。
【０１４３】
本発明に含まれ得るｓＲＡＧＥの糖鎖型としては、図２０および図５４を参照することができる。
【０１４４】
１つの実施形態では、本発明のＲＡＧＥの前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、１分子あたりＧｌｃＮＡｃ０〜２分子およびＭａｎ０〜４分子のうちの０〜４分子が結合した糖鎖を含む。別の実施形態では、本発明のＲＡＧＥの前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、２分子あたりＧｌｃＮＡｃ０〜４分子およびＭａｎ０〜８分子のうちの０〜８分子が結合した糖鎖を含む。
【０１４５】
本発明のｓＲＡＧＥは、糖鎖付加を受け得る部位が２か所存在し、糖鎖は、２か所のうち一方にのみ付加されていてもよいし、両方に付加されていてもよい。好ましい実施形態において、２か所の糖鎖付加を受け得る部位のうち両方に糖鎖が付加されている。２か所両方に糖鎖が付加されている場合、付加される糖鎖は同一の糖鎖であってもよいし、異なっていてもよい。付加される糖鎖は、上記（１）〜（８）（［化１］〜［化８］）の構造を有する糖鎖が挙げられる。
【０１４６】
上述の通り、カイコ型の糖鎖は、オリゴマンノース型、複合型、ハイブリッド型に分類される。ｓＲＡＧＥの糖鎖構造は、８７％〜９７％がオリゴマンノース型であり、２％〜８％が複合型であり、１％〜５％がハイブリッド型である。好ましくは、９０％〜９４％がオリゴマンノース型であり、３％〜６％が複合型であり、２％〜４％がハイブリッド型である。最も好ましくは、９２．５％がオリゴマンノース型であり、４．６％が複合型であり、２．５％がハイブリッド型である。
【０１４７】
１つの実施形態において、カイコ型ｓＲＡＧＥの糖組成は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ３）は、４６％〜５６％であり、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ１）は、２３％〜３３％であり、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ２）は、７％〜１５％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ４−１）は、１％〜５％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３（図５４のＮ４−２）は、２％〜８％であり、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３（図５４のＮ４−３）は、１％〜５％である。好ましくは、糖組成は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２は、４８％〜５４％であり、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２５％〜３１％であり、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２は、９％〜１３％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２％〜４％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３は、３％〜６％であり、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３は、２％〜４％である。最も好ましくは、糖組成は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２は、５１．４％であり、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２７．５％であり、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２は、１０．８％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２．８％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３は、４．６％であり、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３は、２．５％である。
【０１４８】
糖タンパク質に結合している糖鎖を成す糖の種類はそれほど多くなく、よく見られるものは、グルコース、ガラクトース、マンノース、フコース、Ｎ−アセチルグルコサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎ−アセチルノイラミン酸、キシロースなど７〜８種程度である。構造様式もある程度限られており、その中のわずかな構造の違いが識別され、精密に認識されて様々な生命現象が制御されている。
【０１４９】
本明細書では、「フコース」とは、通常のフコース（ｆｕｃｏｓｅ）を意味し、デオキシ糖の一種である６−デオキシ−ガラクトースで、化学式はＣ６Ｈ１２Ｏ５、分子量１６４．１６、融点１６３℃、比旋光度−７６゜で六炭糖、単糖に分類される。天然にはＬ型がＬ−フコシドの形で、動植物に幅広く存在する。哺乳動物および植物では細胞表面のＮ結合糖鎖上で見つかる。
【０１５０】
本明細書では、「Ｎ−アセチルグルコサミン」と は、通常のＮ−アセチルグルコサミン（Ｎ−アセチル−Ｄ−グルコサミン、ＧｌｃＮＡｃ、ＮＡＧ）を意味し、グルコースから誘導された単糖で、いくつかの生化学的機構にとって重要な物質である。化学的にはこの物質はグルコサミンと酢酸の間のアミドである。Ｎ−アセチルグルコサミンは、哺乳動物においては、糖タンパク質、ヒアルロン酸などグリコサミノグリカン（ムコ多糖）の成分となっている。Ｎ−アセチルグルコサミンは、アスパラギンにマンノースを中心とするオリゴ糖鎖が結合するＮ結合型糖タンパク質の骨格をなすほか（キトビオース構造）、更に複雑構造を持つ糖鎖の主要構成糖である。
【０１５１】
本明細書では、「ガラクトース」とは、通常のガラクトース（Ｇａｌａｃｔｏｓｅ）を意味し、分子式、分子量はグルコースと同じＣ６Ｈ１２Ｏ６、１８０である。立体配置は２位（Ｆｉｓｃｈｅｒ投影式で上から２番目）、５位の−ＯＨが同じ方向３位、４位が反対方向であり、Ｄ−ガラクトースは５位Ｄ−グリセルアルデヒドと同じ配向をもっている。グルコースの４−エピマーである。天然ではＤ−ガラクトースがほとんどである。
【０１５２】
本明細書では、「マンノース」とは、通常のマンノース（Ｍａｎｎｏｓｅ）を意味し、アルドヘキソースに分類される単糖の一種であり、分子式、分子量はグルコースと同じＣ６Ｈ１２Ｏ６、１８０である。立体配置は２位（Ｆｉｓｃｈｅｒ投影式で上から２番目）、３位の−ＯＨが同じ方向４位、５位が反対方向であり、Ｄ−マンノースは５位Ｄ−グリセルアルデヒドと同じ配向をもっている。グルコースの２−エピマーである。天然ではＤ−マンノースがほとんどである。
【０１５３】
＜糖鎖の分析方法＞
中性糖・アミノ糖組成分析
糖鎖は、代表的に、ガラクトース、マンノース、フコースなどの中性糖、Ｎ−アセチルグルコサミンなどのアミノ糖、シアル酸などの酸性糖から構成されている。糖鎖の組成分析は、トリフルオロ酢酸等で、糖鎖の酸加水分解を行うことにより、中性糖またはアミノ糖を遊離し、その組成比を分析することができる。具体的な方法として、Ｄｉｏｎｅｘ社製糖組成分析装置（ＢｉｏＬＣ）を用いる方法が挙げられる。ＢｉｏＬＣはＨＰＡＥＣ−ＰＡＤ（ｈｉｇｈ  ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ  ａｎｉｏｎ−ｅｘｃｈａｎｇｅ  ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ−ｐｕｌｓｅｄ  ａｍｐｅｒｏｍｅｔｒｉｃ  ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ）法［Ｊ．Ｌｉｑ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．，６，１５７７（１９８３）］によって糖組成を分析する装置である。
【０１５４】
また、２−アミノピリジンによる蛍光標識化法でも組成比を分析することができる。具体的には、公知の方法［Ａｇｒｉｃ.Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，５５（１），２８３−２８４（１９９１）］に従って酸加水分解した試料を２−アミノピリジル化で蛍光標識し、ＨＰＬＣ分析して組成比を算出することができる。
【０１５５】
糖鎖構造解析
糖鎖の構造解析は、２次元糖鎖マップ法［Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１７１，７３（１９８８）、生物化学実験法２３−糖タンパク質糖鎖研究法（学会出版センター）高橋禮子編（１９８９年）］により行うことができる。２次元糖鎖マップ法は、例えば、Ｘ軸には逆相クロマトグラフィー糖鎖の保持時間または溶出位置を、Ｙ軸には順相クロマトグラフィーによる糖鎖の保持時間または溶出位置を、それぞれプロットし、既知糖鎖のそれらの結果と比較することにより、糖鎖構造を推定する方法である。
【０１５６】
具体的には、糖タンパク質をヒドラジン分解して、糖タンパク質から糖鎖を遊離し、２−アミノピリジン（以下、ＰＡと略記する）による糖鎖の蛍光標識［Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，９５，１９７（１９８４）］を行った後、ゲルろ過により糖鎖を過剰のＰＡ化試薬などと分離し、逆相クロマトグラフィーを行う。次いで、分取した糖鎖の各ピークについて順相クロマトグラフィーを行う。これらの結果をもとに、２次元糖鎖マップ上にプロットし、糖鎖スタンダード（ＴａＫａＲａ社製）、文献［Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１７１，７３（１９８８）］とのスポットの比較より糖鎖構造を推定することができる。さらに各糖鎖のＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳなどの質量分析を行い、２次元糖鎖マップ法により推定される構造を確認することができる。
【０１５７】
＜糖タンパク質の生産方法＞
本実施形態では、カイコ等の鱗翅目に分類される昆虫の絹糸腺細胞において、糖タンパク質を発現させる。
【０１５８】
その際、上述の昆虫は、カイコであることが好ましい。なぜなら、カイコの場合には、養蚕業において飼育方法が確立しており、さらに絹糸腺から繭をはき出す能力が優れているため、上述の糖タンパク質を大量に効率よく得ることができるからである。
【０１５９】
カイコは、代表的に一頭あたり０．３〜０．５ｇの繭を作るが、このほとんどは、後部絹糸腺で合成されるフィブロインや、中部絹糸腺で合成されるセリシンなどの絹タンパク質である。このように、カイコは優れたタンパク質合成能力を有した生物であり、この能力を利用すれば、分析・評価用の組換えタンパク質等を大量に、かつ、安価に生産することができるからである。
【０１６０】
さらに、上述の絹糸腺細胞は、中部絹糸腺細胞であることが好ましい。なぜなら、中部絹糸腺ではセリシンが合成されるため、セリシン中に上述の糖タンパク質を発現させれば、フィブロインの周りに存在し、比較的水に溶けやすいセリシン層に、組換えタンパク質を局在させるために、中部絹糸腺で効率良く組換えタンパク質を発現させることができ、繭に含まれる組換えタンパク質を、その立体構造を変性させることなく容易に抽出することが可能となるからである。
【０１６１】
すなわち、本実施形態における糖タンパク質の生産方法は、糖タンパク質を発現させる工程が、本発明の糖タンパク質を発現するように遺伝的に改変されてなる上述の昆虫（例えば、カイコ）個体の絹糸腺において本発明の糖タンパク質を含む繭を生成させる工程を含むことが好ましい。ここで、通常は、昆虫個体の絹糸腺において上述の糖タンパク質を含む繭を生成させるということは、代表的に、昆虫の絹糸腺細胞において上述の糖タンパク質を発現させることになる。
【０１６２】
そして、目的の糖タンパク質を抽出する工程は、上述の絹糸腺から前記糖タンパク質を含む繭を吐出させる工程と、上述の吐出された繭から上述の糖タンパク質を抽出する工程と、を含むことが好ましい。なぜなら、絹糸腺ではフィブロインまたはセリシンが合成されるため、フィブロインまたはセリシン中に上述の糖タンパク質を発現させれば、フィブロイン層またはセリシン層に、組換えタンパク質を局在させるために、絹糸腺で効率良く組換えタンパク質を発現させることができ、繭に含まれる組換えタンパク質を抽出することが可能となるからである。
【０１６３】
１つの実施形態では、上述の糖タンパク質を発現させる工程は、上述の昆虫個体において、上述の糖タンパク質をコードする遺伝子が上述の昆虫のゲノムにおいてセリシンプロモーターの下流に発現可能に設けられている昆虫個体を用いる工程と、上述の繭として、セリシン部に上述の糖タンパク質を含む繭を生成させる工程と、を含むことが好ましい。そして、この場合には、上述の糖タンパク質を抽出する工程が、上述の繭を抽出液に浸して、上述の繭の上述のセリシン部から上述の抽出液中に上述の糖タンパク質を抽出する工程を含むことが好ましい。なぜなら、繭を構成する絹糸は、中心に存在するフィブロイン層の周りにセリシン層が存在する構造をしている。絹タンパク質を合成している絹糸腺は、機能的および形態的に、後部絹糸腺、中部絹糸腺、および前部絹糸腺に区別されるが、セリシン層を構成するセリシンは中部絹糸腺で合成され、フィブロイン層を構成するフィブロインは後部絹糸腺で合成される。糖タンパク質を発現する組織が中部絹糸腺であった場合、糖タンパク質は絹糸のセリシン層へ分泌される。一方、糖タンパク質を発現する組織が後部絹糸腺であった場合、糖タンパク質は絹糸のフィブロイン層へ分泌される。そして、セリシン層に糖タンパク質を分泌するトランスジェニックカイコを作製するためには、ベクターにおいて、中部絹糸腺で糖タンパク質を発現させるために、糖タンパク質の構造遺伝子に加えて、例えばそれぞれの構造遺伝子の上流に、中部絹糸腺細胞で遺伝子発現を引き起こすプロモーターを組めばよい。中部絹糸腺細胞で遺伝子発現を引き起こすプロモーターとしては、例えば、セリシン１遺伝子またはセリシン２遺伝子のプロモーターをあげることができる。中部絹糸腺または後部絹糸腺は通常使用される合成経路であり、本発明でも同様に利用することができる。あるいは、全身に発現させてもよい。なお、絹糸腺で発現させた場合、中部（および後部）絹糸腺を摘出して抽出する方法と、繭から抽出する方法がある。また、全身で発現させた場合、全身を磨砕したり、体液を絞ったりする方法がある。
【０１６４】
このような発現ベクターを用いると、一回の遺伝子導入操作で、セリシン層に糖タンパク質を分泌するトランスジェニックカイコを作製することができる。一方、セリシン層に糖タンパク質を分泌するトランスジェニックカイコは複数回の遺伝子導入操作によって作製することもできる。
【０１６５】
もっとも、フィブロイン層に糖タンパク質を分泌するトランスジェニックカイコを作製するという方法を排除する趣旨ではない。後部絹糸腺で糖タンパク質を発現させるために、糖タンパク質の構造遺伝子に加えて、それぞれの構造遺伝子の上流に、例えば後部絹糸腺細胞で遺伝子発現を引き起こすプロモーターが組み込まれているベクターを用いてフィブロイン層に抗体を分泌するトランスジェニックカイコを作製してもかまわない。後部絹糸腺細胞で遺伝子発現を引き起こすプロモーターとしては、例えば、フィブロインＬ鎖、フィブロインＨ鎖、またはフィブロヘキサマリンなどの遺伝子のプロモーターをあげることができる。
【０１６６】
セリシン層に糖タンパク質を分泌するトランスジェニックカイコを作製する場合と同様に、フィブロイン層に糖タンパク質を分泌するトランスジェニックカイコを作製する場合においても、上述の発現ベクターセットを用いて、複数回の遺伝子導入操作によりトランスジェニックカイコを作製しても良い。
【０１６７】
これらの発現ベクターは、カイコ染色体へ遺伝子を導入するための機能を有している。例えば、昆虫由来のＤＮＡ型トランスポゾンの部分配列が組み込まれていれば、遺伝子をカイコ染色体に導入することが可能である。具体的には、ＤＮＡ型トランスポゾンの末端に存在する一対の逆向き反復配列を有したプラスミドベクターであり、一対の逆向き反復配列に挟まれた領域に、染色体に挿入される遺伝子配列、すなわち、糖タンパク質の遺伝子とプロモーターが組み込まれている発現ベクターである。昆虫由来ＤＮＡ型トランスポゾンとしては、ｐｉｇｇｙＢａｃ、ｍａｒｉｎｅｒ（Ｉｎｓｅｃｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．９，１４５−１５５，２０００）、およびＭｉｎｏｓ（Ｉｎｓｅｃｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．９，２７７−２８１，２０００）などが知られているが、この中でもｐｉｇｇｙＢａｃ由来の配列は、最も頻繁に利用されている。トランスジェニックカイコを作製するためには、このプラスミドを、ｐｉｇｇｙＢａｃのトランスポゼース発現ベクター（ヘルパープラスミド）と共にカイコ卵へ微量注入する。このヘルパープラスミドは、ｐｉｇｇｙＢａｃの逆向き反復配列の片方または両方を欠いた、実質的にはｐｉｇｇｙＢａｃのトランスポゼース遺伝子領域のみが組み込まれている組換えプラスミドベクターである。ヘルパープラスミドにおいて、トランスポゼースを発現させるためのプロモーターは、内在性のトランスポゼースプロモーターをそのまま利用しても良いし、あるいは、カイコ・アクチンプロモーターやショウジョウバエＨＳＰ７０プロモーター等を利用してもよい。次世代カイコのスクリーニングを容易にするために、挿入するポリヌクレオチドを組み込んだベクター内に同時にマーカー遺伝子を組み込んでおくこともできる。
【０１６８】
本明細書において、プロモーターに転写制御因子が結合することにより、プロモーターの下流に存在する構造遺伝子の核酸配列の発現が誘導されるように、該プロモーターと該核酸配列とが結合させることもできる。上記転写制御因子と標的配列の組み合わせとしては、ＧＡＬ４とＵＡＳ、ＴｅｔＲとＴＲＥなどが挙げられる。ＧＡＬ４とＵＡＳ、又はＴｅｔＲとＴＲＥを用いることにより、目的とする遺伝子の発現部位や時期、量を正確に制御でき、多くの組織で容易に発現させることができる。また、発現させる遺伝子が致死性の遺伝子でも系統の作出が可能である。
【０１６９】
１つの実施形態において、本発明の方法によって製造される糖タンパク質は、本発明の方法によって製造される限りなんら限定されず、シグナル配列（例えば、フィブロインＨシグナルペプチド）、エンテロキナーセ認識部位（例えば、ＤＤＤＤＫ（配列番号８９））、ビオチン化部位（例えばＢｉｏＥａｓｅタグ）、またはタグ配列（例えば、ＢｉｏＥａｓｅタグ、Ｈｉｓタグ等）を有していても、有していなくてもよい。即ち、本発明の糖タンパク質の製造方法によって製造される糖タンパク質には、シグナル配列を有している糖タンパク質、シグナル配列を有していない糖タンパク質の両方が含まれる。
【０１７０】
本発明における絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって直接的に発現制御される糖タンパク質をコードする核酸配列を有するカイコ卵としては、例えば、絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターの下流に、目的とする糖タンパク質をコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列を有するカイコ卵が挙げられる。このようなカイコ卵は、絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターの下流に、目的とする糖タンパク質をコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列をカイコ卵に導入することで製造できる。
【０１７１】
また、本発明における絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって間接的に発現制御される組換え糖タンパク質をコードする核酸配列を有するカイコ卵としては、例えば、（ｉ）絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターの下流に、転写制御因子をコードする核酸配列が機能的に結合した核酸配列、および（ｉｉ）該転写制御因子の標的プロモーターの下流に、組換え抗体をコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列、を有するカイコ卵が挙げられる。なお本発明においては、絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターによって直接的又は間接的に発現制御される組換え抗体をコードする核酸配列は、抗体の分泌を促進し回収量を多くするためシグナル配列を有するものが好ましい。シグナル配列の具体的な態様は、本明細書において他の場所において説明しており、任意の公知のものを使用することができる。
【０１７２】
１つの例示的な製法として、ベクターを微量注入したカイコ卵から孵化した幼虫（Ｆ０世代）を飼育する。得られた全Ｆ０世代のカイコを野生型カイコと、あるいはＦ０カイコ同士で交配し、次世代（Ｆ１世代）のカイコからトランスジェニックカイコを選抜する。トランスジェニックカイコの選抜は、例えばＰＣＲ法やサザンブロット法を用いて行う。また、マーカー遺伝子を組み込んだ場合には、その表現形質を利用して選抜することも可能である。例えばマーカー遺伝子としてＧＦＰ等の蛍光タンパク質遺伝子を利用した場合には、Ｆ１世代のカイコ卵や幼虫に励起光を照射し、蛍光タンパク質の発する蛍光を検出することにより行うことができる。以上のような方法によりトランスジェニックカイコを作出することができる。
【０１７３】
トランスジェニックカイコの繭から、目的とする糖タンパク質を回収する際には、糖タンパク質がセリシン層に局在する場合はセリシン層から、フィブロイン層に含まれている場合はフィブロイン層から回収する。セリシン層からの糖タンパク質の回収は、特に容易に実施することができる。セリシン層を構成するセリシンは親水性であるため、この層に局在する組換えタンパク質は、タンパク質を変性させてしまう溶液を用いることなく抽出することが可能である。セリシン層から目的の糖タンパク質を抽出するための抽出液は、その糖タンパク質の抽出が可能であるものならば特段の制限はない。例えば、中性の塩類溶液であっても良いし、界面活性剤や、その他、抽出を効率的に行うための試薬などが含まれる溶液であっても良い。これらの抽出液を使って繭から糖タンパク質を抽出するには、例えば、断片化した繭を抽出液に浸し攪拌するなどの方法を用いることができる。また、抽出の前に、繭を微粉末化する処理を行っても良いし、抽出の際に超音波処理を行うなどの機械的処理を併用しても良い。また、上述のカイコの絹糸腺細胞は、さらなる糖鎖付加がされるように適宜転移酵素（例えば、βガラクトース転移酵素、Ｎ−アセチルグルコサミン転移酵素等）を発現させるように形質転換されていてもよい。
【０１７４】
本発明の実施において、発現を確認するためにレポーター遺伝子を組み込んでもよい。このようなレポーター遺伝子としては、その発現が検出可能なものであれば特に制限されず、例えば、当業者において一般的に使用されるＣＡＴ遺伝子、ｌａｃＺ遺伝  子、ルシフェラーゼ遺伝子、β−グルクロニダーゼ遺伝子（ＧＵＳ）およびＧＦＰ遺伝子等を挙げることができる。レポーター遺伝子の発現レベルは、該レポーター遺伝子の種類に応じて、当業者に公知の方法により測定することができる。例えば、レポーター遺伝子がＣＡＴ遺伝子である場合には、該遺伝子産物によるクロラムフェニコールのアセチル化を検出することによって、レポーター遺伝子の発現レベルを測定することができる。レポーター遺伝子がｌａｃＺ遺伝子である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用による色素化合物の発色を検出することにより、また、ルシフェラーゼ遺伝子である場合には、該遺伝子発現産物の触  媒作用による蛍光化合物の蛍光を検出することにより、また、β−クロニダーゼ遺伝子（ＧＵＳ）である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用によるＧｌｕｃｕｒｏｎ（ＩＣＮ社）の発光や５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−グルクロニド（Ｘ−Ｇｌｕｃ）の発色を検出することにより、さらに、ＧＦＰ遺伝子である場合には、ＧＦＰタンパク質による蛍光を検出することにより、レポーター遺伝子の発現レベルを測定することができる。
【０１７５】
本発明の組換え糖タンパク質の製造方法は、カイコ体内で合成された目的の糖タンパク質を回収する工程を含む。合成された目的の糖タンパク質は、不溶化せずに、活性のある状態で、中部絹糸腺又は後部絹糸腺に分泌される。従って、目的の糖タンパク質は、中部絹糸腺又は後部絹糸腺から回収することが可能である。目的の糖タンパク質を中部絹糸腺又は後部絹糸腺から回収する方法としては、例えば、吐糸期になったカイコを解剖し、中部絹糸腺又は後部絹糸腺を２０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ  ｐＨ７．４中に摘出し、絹糸腺をピンセットやメスで傷をいれることにより絹糸腺中の目的の糖タンパク質を回収できる。
【０１７６】
また、本発明の目的の糖タンパク質は、例えば、トランスジェニックカイコが吐糸した繭から回収することも可能である。回収方法としては、当業者に周知の方法、例えば、繭を６０％ＬｉＳＣＮで溶かし、２０ｍＭＴｒｉｓ、５Ｍ尿素で透析することによって回収する方法（Ｉｎｏｕｅ，Ｓ．，Ｔｓｕｄａ，Ｈ．，Ｔａｎａｋａ，Ｈ．，Ｍａｇｏｓｈｉ，Ｙ  ａｎｄ  Ｍｉｚｕｎｏ（２００１）Ｓｅｒｉｃｏｌｏｇｉａ  ４，１５７−１６３．）を使用することができる。また、その他のタンパク質回収法としては、例えば界面活性剤を用いる方法や水溶液で溶かす方法等が可能である。
【０１７７】
また、本発明におけるカイコとしては、特に制限はないが、目的の糖タンパク質の大量生産のためには、フィブロインタンパク質などの絹糸を構成するタンパク質をコードする核酸配列領域（コード領域、プロモーター領域、非翻訳領域を含む）の変異によって、絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されているカイコを用いることが好ましい。このようなカイコとしては、絹糸を構成するタンパク質をコードする核酸配列領域の変異によって絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されている変異系統のカイコ、好ましくは該変異によって絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されている裸蛹系統のカイコ、より好ましくはNd-sDが挙げられるが、絹糸を構成するタンパク質の生産抑制の原因が、人為的か否か、また、自然界において生じた変異に依存するか否かに関わらず、絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されているカイコであればよい。
【０１７８】
このようなカイコの１つの態様は、セリシンカイコとして当業者には周知のカイコである。セリシンカイコを利用することによって、中部絹糸腺における目的の糖タンパク質の大量生産が可能となり、染色体に導入された組み換え抗体をコードする核酸配列から合成されるタンパク質の精製も容易になる。また、後部絹糸腺において組換え抗体を産生させる際にも、生産量の点でセリシンカイコを用いることが好ましい。
【０１７９】
また、本発明におけるカイコとしては、非休眠卵を産下する性質を有するカイコ、休眠卵を産下する性質を有するカイコ（例えば実用品種であるぐんま、２００、春嶺、鐘月、錦秋、鐘和等）を使用することができる。ここで、休眠卵とは産卵後胚発生が一時的に停止する卵を言い、非休眠卵とは産卵後胚発生が停止せず、幼虫が孵化する卵を言う。休眠卵を産下する性質を有するカイコを用いる場合は、非休眠卵を産下させ、該非休眠卵にＤＮＡを導入する。非休眠卵を産下させる方法としては、例えばぐんまにおいては、休眠卵を１５℃〜２１℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、好ましくは休眠卵を１６℃〜２０℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、より好ましくは休眠卵を１８℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、最も好ましくは休眠卵を１８℃で培養することで該休眠卵から生じた幼虫を全明で飼育し、生育した成虫に非休眠卵を産下させる方法を挙げることができる。また、２００においては、休眠卵を１５℃〜２１℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、好ましくは休眠卵を１６℃〜２０℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、より好ましくは休眠卵を１８℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、又は休眠卵から生じた幼虫を全明で飼育し、生育した成虫に非休眠卵を産下させる方法、最も好ましくは休眠卵を２５℃で培養することで該休眠卵から生じた幼虫を全明で飼育し、生育した成虫に非休眠卵を産下させる方法が挙げられる。
【０１８０】
卵の培養は、例えば、１８℃〜２５℃のインキュベーター、又は定温の部屋に入れることによって行うことができ、幼虫の飼育は２０℃〜２９℃の飼育室で人工飼料を用いて行うことができる。
【０１８１】
本発明の上記休眠卵の培養は、当業者においては、一般的なカイコ卵の培養法に従って行うことができる。例えば、「文部省（１９７８）蚕種製造．ｐｐ１９３、実教出版社、東京」に記載の方法に従って培養を行う。また、本発明におけるカイコ幼虫の飼育は、当業者においては、周知の方法によって行うことができる。例えば、「文部省（１９７８）蚕種製造．ｐｐ１９３、実教出版社、東京」に記載の方法に従って飼育を行う。
【０１８２】
本発明において、産卵された卵が非休眠卵であるか否かは、卵の色で判定することができる。一般に、休眠卵は濃い茶褐色に着色し、非休眠卵は黄白色であることが知られている。よって、本発明においては、濃い茶褐色ではないこと、より好ましくは黄白色であることをもって産卵された卵が非休眠卵であると判定する。
【０１８３】
以下、カイコ卵への核酸分子の導入方法の具体例を記すが、本発明におけるカイコ卵への核酸分子の導入方法は、この方法に限定されるものでない。例えば、カイコ卵へ核酸分子注入用の管を使用して直接卵内へ核酸分子を導入することが可能であるが、好ましい態様としては、前もって物理的又は化学的に卵殻に穴を空け、該穴から核酸分子を導入する。この際、核酸分子注入用の管を挿入角度が該卵の腹側の側面に対してほぼ垂直となるように該穴から卵内に挿入することができる。
【０１８４】
本発明において、物理的に卵殻に穴を空ける方法としては、例えば針、微小レーザー等を用いて穴を空ける方法が挙げられる。好適には針を用いた方法によって卵殻に穴を空けることができる。該針は、カイコの卵殻に穴を空けることができるものであれば、その針の材質、強度等は、特に制限されない。なお、本発明における針とは、通常、先端が尖った棒状の針を指すが、この形状に限定されず、卵殻に穴を空けることができるものであれば、全体の形状は特に制限されない。例えば、先端の尖ったピラミッド型の物質、又は先端の尖った三角錐の形状の物質もまた、本発明の「針」に含まれる。本発明においては、タングステン針を好適に使用することができる。本発明の針の太さ（直径）は、後述のキャピラリーが通過可能な穴を空けることができる程度の太さであればよく、通常２〜２０μｍ、好ましくは５〜１０μｍである。一方、化学的に卵殻に穴を空ける方法としては、例えば薬品（次亜塩素酸等）等を用いて穴を空ける方法が挙げられる。
【０１８５】
本発明において、穴を空ける位置としては、該穴から核酸分子注入用の管を挿入した場合に卵の腹側の側面に対する挿入角度を、ほぼ垂直にできる位置ならば特に制限はないが、好ましくは腹側の側面又はその反対側であり、より好ましくは腹側の側面であり、よりさらに好ましくは卵の腹側側面のやや後端よりの中央部である。
【０１８６】
本発明において、「ほぼ垂直」とは、７０°〜１２０°を意味し、好ましくは８０°〜１００°を意味する。本発明において、「将来的に生殖細胞になる位置」と  しては、通常、卵の腹側の卵表に近い位置（通常、卵表から０．０１ｍｍ〜０．０５ｍｍの位置）であり、好ましくは、卵の腹側中央の卵表に近い位置でやや後極よりの位置である。
【０１８７】
本発明の核酸分子注入用の管は、その管の材質、強度、内径等は特に制限されないが、核酸分子注入用の管を挿入する前に、物理的又は化学的に卵殻に穴を空ける場合は、空けられた穴を通過できる太さ（外径）であることが好ましい。本発明の核酸分子注入用の管としては、例えば、ガラスキャピラリー等を挙げることができる。
【０１８８】
本発明の核酸分子の導入方法において、好ましい態様としては、上記のカイコ卵に物理的又は化学的に穴を空け、核酸分子入用の管を挿入角度が該卵の腹側の側面に対してほぼ垂直となるように該穴から卵内に挿入し、核酸分子を注入する工程を、針と核酸分子注入用の管が一体型となったマニュピュレーターを使用して行う。好ましい実施形態では、本発明は、通常、該マニュピュレーターを構成要素の１つとする装置を使用して実施される。
【０１８９】
このような装置としては、解剖顕微鏡、照明装置、可動式のステージ、顕微鏡に金具で固定した粗動マニュピュレーター、このマニュピュレーターに付けたマイクロマニュピュレーター、核酸分子を注射するための空気圧を調整するインジェクターから構成されている。インジェクターに用いる圧力は窒素ボンベから供給され、圧力のスイッチはフットスイッチによっていれることができる。注射はガラススライド等の基板上に固定した卵に対して行い、卵の位置は移動式のステージによって決める。また、マイクロマニュピュレーターのガラスキャピラリーは４本のチューブで繋がれた操作部によって操作する。実際の手順は、卵に対するタングステン針の位置を粗動マニュピュレーターで決め、ステージのレバーで水平方向に卵を動かし穴を空ける。続いて、マイクロマニュピュレーターの操作部のレバーを操作して、穴の位置にガラスキャピラリーの先端を誘導し、再びステージのレバーによりキャピラリーを卵に挿入する。この場合、卵の腹側の側面に対し垂直にガラスキャピラリーが挿入される必要がある。フットスイッチを入れ核酸分子を注射し、レバーを操作して卵からキャピラリーを抜く。空けた穴を瞬間接着剤等でふさぎ、一定の温度および、一定の湿度のインキュベーターで保護する。本発明に使用される装置としては、好適には、特許第１６５４０５０号に記載の装置又は該装置を改良した装置が挙げられる。
【０１９０】
また、本発明の１つの実施形態においては、核酸分子の導入に用いるカイコ卵が基板に固定されていてもよい。本発明の基板として、例えば、スライドグラス、プラスチック板等を用いることができるが、これらに特に制限されない。本発明の上記態様においては、カイコ卵内の将来的に生殖細胞になる位置に正確に核酸分子を注射するために、卵の方向を揃えて固定することが望ましい。また、上記態様においては、基板へ固定するカイコ卵の数には、特に制限はない。また、複数個のカイコ卵を用いる場合、カイコ卵を基板へ固定する方向性としては、好ましくは背腹の向きが一定となるような方向である。本発明の上記カイコ卵の基板への固定は、例えば、水性の糊をあらかじめ塗布した市販の台紙（バラ種台紙）の上に産卵させ、台紙に水を加えて卵をはがし、次いで濡れた状態の卵を基板に整列させ、風乾することによって行う。卵はスライドグラス上に卵の方向を揃えて固定することが好ましい。また、卵の基盤への固定は両面テープや接着剤等を用いることによっても可能である。
【０１９１】
カイコ卵に核酸分子が導入されたか否かは、例えば、注射した核酸分子を卵から再度抽出して測定する方法（Nagaraju,  J.,  Kanda,  T.,  Yukuhiro,  K.,  Chavancy,  G.,  Tamura,  T.  and  Couble,  P.（1996）Attempt  of  transgenesis  of  the  silkworm（Bombyx  mori  L）  by  egg-injection  of  foreign  DNA.  Appl.  Entomol.  Zool.,  31,  589-598）や、注射した核酸分子の卵内での発現を見る方法（Tamura,  T.,  Kanda,  T.,  Takiya,  S.,  Okano,  K.  and  Maekawa,  H.  （1990）.  Transient  expression  of  chimeric  CAT  genes  injected  into  early  embryos  of  the  domesticated  silkworm,  Bombyx  mori.  Jpn.  J.  Genet.,  65,  401-410）等によって確認することができる。
【０１９２】
本明細書において「精製された」生物学的因子（例えば、核酸またはタンパク質など）とは、その生物学的因子に天然に随伴する因子の少なくとも一部が除去されたものをいう。したがって、通常、精製された生物学的因子におけるその生物学的因子の純度は、その生物学的因子が通常存在する状態よりも高い（すなわち濃縮されている）。
【０１９３】
本明細書中で使用される用語「精製された」は、好ましくは少なくとも７５重量％、より好ましくは少なくとも８５重量％、よりさらに好ましくは少なくとも９５重量％、そして最も好ましくは少なくとも９８重量％の、同型の生物学的因子が存在することを意味する。
【０１９４】
本明細書において「対応する」アミノ酸または核酸とは、あるポリペプチド分子またはポリヌクレオチド分子において、比較の基準となるポリペプチドまたはポリヌクレオチドにおける所定のアミノ酸またはヌクレオチドと同様の作用を有するか、または有することが予測されるアミノ酸またはヌクレオチドをいい、特に酵素分子にあっては、活性部位中の同様の位置に存在し触媒活性に同様の寄与をするアミノ酸をいう。例えば、アンチセンス分子であれば、そのアンチセンス分子の特定の部分に対応するオルソログにおける同様の部分であり得る。対応するアミノ酸は、例えば、システイン化、グルタチオン化、Ｓ−Ｓ結合形成、酸化（例えば、メチオニン側鎖の酸化）、ホルミル化、アセチル化、リン酸化、糖鎖付加、ミリスチル化などがされる特定のアミノ酸であり得る。あるいは、対応するアミノ酸は、二量体化を担うアミノ酸であり得る。このような「対応する」アミノ酸または核酸は、一定範囲にわたる領域またはドメインであってもよい。従って、そのような場合、本明細書において「対応する」領域またはドメインと称される。
【０１９５】
本明細書において「対応する」遺伝子（例えば、ポリペプチド分子またはポリヌクレオチド分子）とは、ある種において、比較の基準となる種における所定の遺伝子と同様の作用を有するか、または有することが予測される遺伝子（例えば、ポリペプチド分子またはポリヌクレオチド分子）をいい、そのような作用を有する遺伝子が複数存在する場合、進化学的に同じ起源を有するものをいう。従って、ある遺伝子に対応する遺伝子は、その遺伝子のオルソログであり得る。従って、マウス、ラットのＣＴＬＤ１４またはＬＯＸ−１あるいはＲＡＧＥ（または可溶性形態のｓＲＡＧＥ）は、それぞれ、ヒトにおいて、対応するＣＴＬＤ１４またはＬＯＸ−１あるいはＲＡＧＥ（ｓＲＡＧＥまたは可溶性形態のｓＲＡＧＥ）を見出すことができる。そのような対応する遺伝子は、当該分野において周知の技術を用いて同定することができる。したがって、例えば、ある動物（例えば、マウス）における対応する遺伝子は、対応する遺伝子の基準となる遺伝子（例えば、ＣＴＬＤ１４またはＬＯＸ−１あるいはＲＡＧＥまたは可溶性形態のｓＲＡＧＥ））は、ある動物の配列をクエリ配列として用いてその動物（例えばヒト、ラット）の配列データベースを検索することによって見出すことができる。
【０１９６】
本明細書において「フラグメント」とは、全長のポリペプチドまたはポリヌクレオチド（長さがｎ）に対して、１〜ｎ−１までの配列長さを有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドをいう。フラグメントの長さは、その目的に応じて、適宜変更することができ、例えば、その長さの下限としては、ポリペプチドの場合、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、４０、５０およびそれ以上のアミノ酸が挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。また、ポリヌクレオチドの場合、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、４０、５０、７５、１００およびそれ以上のヌクレオチドが挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。本明細書において、このようなフラグメントは、例えば、全長のものがマーカーとして機能する場合、そのフラグメント自体もまたマーカーとしての機能を有する限り、本発明の範囲内に入ることが理解される。
【０１９７】
本明細書中で使用される「異種」とは、異なる配列または対応しない配列、あるいは異なる種由来の配列である、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列をいう。例えば、ヒトのヌクレオチド配列またはアミノ酸配列は、マウスのヌクレオチド配列またはアミノ酸配列に対して異種であり、そしてヒトＬＯＸ−１またはＲＡＧＥの核酸配列またはアミノ酸配列は、ヒトアルブミンのヌクレオチド配列またはアミノ酸配列に対して異種である。
【０１９８】
本明細書において「フラグメント」とは、全長のポリペプチドまたはポリヌクレオチド（長さがｎ）に対して、１〜ｎ−１までの配列長さを有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドをいう。フラグメントの長さは、その目的に応じて、適宜変更することができ、例えば、その長さの下限としては、ポリペプチドの場合、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５，２０、２５、３０、４０、５０およびそれ以上のアミノ酸が挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。また、ポリヌクレオチドの場合、５、６、７、８、９、１０、１５，２０、２５、３０、４０、５０、７５、１００およびそれ以上のヌクレオチドが挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。本明細書において、ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの長さは、上述のようにそれぞれアミノ酸または核酸の個数で表すことができるが、上述の個数は絶対的なものではなく、同じ機能を有する限り、上限または下限としての上述の個数は、その個数の上下数個（または例えば上下１０％）のものも含むことが意図される。そのような意図を表現するために、本明細書では、個数の前に「約」を付けて表現することがある。しかし、本明細書では、「約」のあるなしはその数値の解釈に影響を与えないことが理解されるべきである。本明細書において有用なフラグメントの長さは、そのフラグメントの基準となる全長タンパク質の機能のうち少なくとも１つの機能が保持されているかどうかによって決定され得る。
【０１９９】
本明細書において「生物学的機能」とは、ある遺伝子またはそれに関する核酸分子もしくはポリペプチドについて言及するとき、その遺伝子、核酸分子またはポリペプチドが生体内において有し得る特定の機能をいい、これには、例えば、特異的な抗体の生成、酵素活性、抵抗性の付与等を挙げることができるがそれらに限定されない。本発明においては、例えば、ＬＯＸ−１が酸化ＬＤＬ等を認識する機能、ＲＡＧＥがヘモペキシン等のマーカーを認識する機能などを挙げることができるがそれらに限定されない。本明細書において、生物学的機能は、「生物学的活性」によって発揮され得る。本明細書において「生物学的活性」とは、ある因子（例えば、ポリヌクレオチド、タンパク質など）が、生体内において有し得る活性のことをいい、種々の機能（例えば、転写促進活性）を発揮する活性が包含され、例えば、ある分子との相互作用によって別の分子が活性化または不活化される活性も包含される。２つの因子が相互作用する場合、その生物学的活性は、その二分子との間の結合およびそれによって生じる生物学的変化、例えば、一つの分子を抗体を用いて沈降させたときに他の分子も共沈するとき、２分子は結合していると考えられる。したがって、そのような共沈を見ることが一つの判断手法として挙げられる。例えば、ある因子が酵素である場合、その生物学的活性は、その酵素活性を包含する。別の例では、ある因子がリガンドである場合、そのリガンドが対応するレセプターへの結合を包含する。そのような生物学的活性は、当該分野において周知の技術によって測定することができる。
【０２００】
したがって、「活性」は、結合（直接的または間接的のいずれか）を示すかまたは明らかにするか；応答に影響する（すなわち、いくらかの曝露または刺激に応答する測定可能な影響を有する）、種々の測定可能な指標をいい、例えば、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに直接結合する化合物の親和性、または例えば、いくつかの刺激後または事象後の上流または下流のタンパク質の量あるいは他の類似の機能の尺度が、挙げられる。
【０２０１】
本明細書において「マーカー（物質）」とは、ある状態（変性ＬＤＬに関連する疾患、あるいはＡＧＥｓに関連する糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症などの疾患）に罹患しているかまたはその危険性があるかどうかを追跡する示標となる物質をいう。このようなマーカーとしては、遺伝子、遺伝子産物、代謝物質、酵素などを挙げることができる。本発明において、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、等の変性ＬＤＬに関連する疾患、高脂血症等の脂質異常、糖尿病、高血糖、高血圧症、高血圧性腎硬化症、動脈硬化、虚血再灌流傷害、血管バルーン傷害後のような病態についての診断、予備的検出、予測または事前診断は、その状態に関連するマーカーに特異的な薬剤、剤、因子または手段、あるいはそれらを含む組成物、キットまたはシステム等を用いて実現することができる。さらに、本発明において、ある状態（例えば、糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症などの疾患）についての診断、予備的検出、予測または事前診断は、その状態に関連するマーカーに特異的な薬剤、剤、因子または手段、あるいはそれらを含む組成物、キットまたはシステム等を用いて実現することもできる。
【０２０２】
本明細書において、「遺伝子産物」とは、遺伝子によってコードされるタンパク質またはｍＲＮＡをいう。本明細書では、糖代謝に直接関連しない遺伝子産物（すなわち、インスリンなどの糖代謝に関連しないタンパク質など）が糖尿病の指標として使用可能であることが見出された。
【０２０３】
本明細書において「被験体」とは、本発明の診断または検出等の対象となる生物（例えば、ヒト）をいう。
【０２０４】
本明細書において「サンプル」とは、被験体等から得られた任意の物質をいい、例えば、体液（血液、唾液、尿、涙液等）が含まれる。好ましくは血液、尿、涙液が使用され、マーカーによって、特異性に相違があるが、当業者は本明細書の記載をもとに適宜好ましいサンプルを選択することができる。
【０２０５】
本明細書において「薬剤」、「剤」または「因子」（いずれも英語ではａｇｅｎｔに相当する）は、広義には、交換可能に使用され、意図する目的を達成することができる限りどのような物質または他の要素（例えば、光、放射能、熱、電気などのエネルギー）でもあってもよい。そのような物質としては、例えば、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、ペプチド、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、ヌクレオチド、核酸（例えば、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡのようなＤＮＡ、ｍＲＮＡのようなＲＮＡを含む）、ポリサッカリド、オリゴサッカリド、脂質、有機低分子（例えば、ホルモン、リガンド、情報伝達物質、有機低分子、コンビナトリアルケミストリで合成された分子、医薬品として利用され得る低分子（例えば、低分子リガンドなど）など）、これらの複合分子が挙げられるがそれらに限定されない。ポリヌクレオチドに対して特異的な因子としては、代表的には、そのポリヌクレオチドの配列に対して一定の配列相同性を（例えば、７０％以上の配列同一性）もって相補性を有するポリヌクレオチド、プロモーター領域に結合する転写因子のようなポリペプチドなどが挙げられるがそれらに限定されない。ポリペプチドに対して特異的な因子としては、代表的には、そのポリペプチドに対して特異的に指向された抗体またはその誘導体あるいはその類似物（例えば、単鎖抗体）、そのポリペプチドがレセプターまたはリガンドである場合の特異的なリガンドまたはレセプター、そのポリペプチドが酵素である場合、その基質などが挙げられるがそれらに限定されない。
【０２０６】
本明細書において「相互作用」とは、２つの物質についていうとき、一方の物質と他方の物質との間で力（例えば、分子間力（ファンデルワールス力）、水素結合、疎水性相互作用など）を及ぼしあうこという。通常、相互作用をした２つの物質は、会合または結合している状態にある。
【０２０７】
したがって、本明細書においてポリヌクレオチドまたはポリペプチドなどの生物学的因子に対して「特異的に相互作用する因子」とは、そのポリヌクレオチドまたはそのポリペプチドなどの生物学的因子に対する親和性が、他の無関連の（特に、同一性が３０％未満の）ポリヌクレオチドまたはポリペプチドに対する親和性よりも、代表的には同等またはより高いか、好ましくは有意に（例えば、統計学的に有意に）高いものを包含する。そのような親和性は、例えば、ハイブリダイゼーションアッセイ、結合アッセイなどによって測定することができる。
【０２０８】
本明細書において第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」とは、第一の物質または因子が、第二の物質または因子に対して、第二の物質または因子以外の物質または因子（特に、第二の物質または因子を含むサンプル中に存在する他の物質または因子）に対するよりも高い親和性で相互作用することをいう。物質または因子について特異的な相互作用としては、例えば、リガンド−レセプター反応、核酸におけるハイブリダイゼーション、タンパク質における抗原抗体反応、酵素−基質反応など、核酸およびタンパク質の両方が関係する場合、転写因子とその転写因子の結合部位との反応など、タンパク質−脂質相互作用、核酸−脂質相互作用などが挙げられるがそれらに限定されない。従って、物質または因子がともに核酸である場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」ことには、第一の物質または因子が、第二の物質または因子に対して少なくとも一部に相補性を有することが包含される。また例えば、物質または因子がともにタンパク質である場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」こととしては、例えば、抗原抗体反応による相互作用、レセプター−リガンド反応による相互作用、酵素−基質相互作用などが挙げられるがそれらに限定されない。２種類の物質または因子がタンパク質および核酸を含む場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」ことには、転写因子と、その転写因子が対象とする核酸分子の結合領域との間の相互作用が包含される。
【０２０９】
本明細書において「手段」とは、ある目的を達成する任意の道具となり得るものをいい、特に、本明細書では、「選択的に認識する手段」とは、ある対象を他のものとは異なって認識することができる手段をいう。
【０２１０】
本明細書中で使用される用語「結合」は、２つのタンパク質もしくは化合物または関連するタンパク質もしくは化合物の間、あるいはそれらの組み合わせの間での、物理的相互作用または化学的相互作用を意味する。結合には、イオン結合、非イオン結合、水素結合、ファンデルワールス結合、疎水性相互作用などが含まれる。物理的相互作用（結合）は、直接的または間接的であり得、間接的なものは、別のタンパク質または化合物の効果を介するかまたは起因する。直接的な結合とは、別のタンパク質または化合物の効果を介してもまたはそれらに起因しても起こらず、他の実質的な化学中間体を伴わない、相互作用をいう。
【０２１１】
本明細書中で使用される「接触（させる）」とは、化合物を、直接的または間接的のいずれかで、本発明のマーカー、リガント等として機能しうるポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して物理的に近接させることを意味する。ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、多くの緩衝液、塩、溶液などに存在させることができる。接触とは、核酸分子またはそのフラグメントをコードするポリペプチドを含む、例えば、ビーカー、マイクロタイタープレート、細胞培養フラスコまたはマイクロアレイ（例えば、遺伝子チップ）などに化合物を置くことが挙げられる。
【０２１２】
本明細書において「標識」とは、目的となる分子または物質を他から識別するための存在（たとえば、物質、エネルギー、電磁波など）をいう。そのような標識方法としては、ＲＩ（ラジオアイソトープ）法、蛍光法、ビオチン法、化学発光法等を挙げることができる。本発明のマーカーまたはそれを捕捉する因子または手段を複数、蛍光法によって標識する場合には、蛍光発光極大波長が互いに異なる蛍光物質によって標識を行う。蛍光発光極大波長の差は、１０ｎｍ以上であることが好ましい。リガンドを標識する場合、機能に影響を与えないものならば何れも用いることができるが、ＬＤＬ標識用の蛍光物質としては、ＤｉＩ，ＤｉＤ、ＤｉＯなどが望ましい。ＤｉＩは、脂溶性の蛍光色素であり、ＬＤＬや酸化ＬＤＬの脂質二重層に挿入され、分子の特徴を損なうことなく、蛍光標識を導入することが可能である。ＡＧＥｓを標識する場合は、蛍光物質としては、Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒが望ましい。Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒは、クマリン、ローダミン、フルオレセイン、シアニンなどを修飾して得られた水溶性の蛍光色素であり、広範囲の蛍光波長に対応したシリーズであり、他の該当波長の蛍光色素に比べ、非常に安定で、明るく、またｐＨ感受性が低い。蛍光極大波長が１０ｎｍ以上ある蛍光色素の組み合わせとしては、Ａｌｅｘａ５５５とＡｌｅｘａ６３３の組み合わせ、Ａｌｅｘａ４８８とＡｌｅｘａ５５５の組み合わせ等を挙げることができる。核酸を標識する場合は、その塩基部分と結合できるものであれば何れも用いることができるが、シアニン色素（例えば、ＣｙＤｙｅＴＭシリーズのＣｙ３、Ｃｙ５等）、ローダミン６Ｇ試薬、Ｎ−アセトキシ−Ｎ2−アセチルアミノフルオレン（ＡＡＦ）、ＡＡＩＦ（ＡＡＦのヨウ素誘導体）等を使用することが好ましい。蛍光発光極大波長の差が１０ｎｍ以上である蛍光物質としては、例えば、Ｃｙ５とローダミン６Ｇ試薬との組み合わせ、Ｃｙ３とフルオレセインとの組み合わせ、ローダミン６Ｇ試薬とフルオレセインとの組み合わせ等を挙げることができる。本発明では、このような標識を利用して、使用される検出手段に検出され得るように目的とする対象を改変することができる。そのような改変は、当該分野において公知であり、当業者は標識におよび目的とする対象に応じて適宜そのような方法を実施することができる。
【０２１３】
本明細書において「診断」とは、被験体における疾患、障害、状態などに関連する種々のパラメータを同定し、そのような疾患、障害、状態の現状または未来を判定することをいう。本発明の方法、装置、システムを用いることによって、体内の状態を調べることができ、そのような情報を用いて、被験体における疾患、障害、状態、投与すべき処置または予防のための処方物または方法などの種々のパラメータを選定することができる。本明細書において、狭義には、「診断」は、現状を診断することをいうが、広義には「予測診断」「事前診断」等を含む。早期の診断は「早期診断」ということもある。
【０２１４】
本明細書において特に、「予測診断」または「事前診断」とは、交換可能に使用され、ＣＴＬＤ１４、修飾ＬＤＬを認識することができる分子等を用いて、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、等の変性ＬＤＬに関連する疾患、高脂血症等の脂質異常、糖尿病、高血糖、高血圧症、高血圧性腎硬化症、動脈硬化、虚血再灌流傷害、血管バルーン傷害後のような病態の発症前の段階を検出することをいい、将来の発症リスクを判定すること、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、等の変性ＬＤＬに関連する疾患、高脂血症等の脂質異常、糖尿病、高血糖、高血圧症、高血圧性腎硬化症、動脈硬化、虚血再灌流傷害、血管バルーン傷害後のような病態についての診断、の予防を目的として糖尿病に罹患するおそれの有無を判定することを含み、さらに、ｓＲＡＧＥ、ＡＧＥｓを認識することができる分子等を用いて、糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等について言及する場合、糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等の発症前の段階を検出することをいい、将来の発症リスクを判定すること、糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等の予防を目的として糖尿病に罹患するおそれの有無を判定することを含む。本発明の方法、キット、組成物、検出剤、診断剤、システム等を用いることによって、体内の状態を事前に調べることができ、そのような情報を用いて、被験体における疾患、障害、状態、投与すべき処置または予防のための処方物または方法などの種々のパラメータを選定することができる。本明細書では、「予測診断」または「事前診断」は、他の従来の方法では診断できない段階での診断をも包含することから、「早期診断」の概念と一部重なって用いられる。
【０２１５】
本発明の診断方法は、原則として、身体から出たものを利用することができることから、医師などの医療従事者の手を離れて実施することができることから、産業上有用である。本明細書において、医師などの医療従事者の手を離れて実施することができることを明確にするために、特に「予測診断、事前診断もしくは診断」を「支援」すると称することがある。
【０２１６】
本明細書において使用される場合、用語「検出剤」とは、広義には、目的の物質（例えば、変性ＬＤＬ、ＡＧＥｓなど）を検出できるあらゆる因子をいう。
【０２１７】
本明細書において使用される場合、用語「診断剤」とは、広義には、目的の状態（例えば、疾患など）を診断できるあらゆる因子をいう。
【０２１８】
本明細書において「治療」とは、ある疾患または障害について、そのような状態になった場合に、そのような疾患または障害の悪化を防止、好ましくは、現状維持、より好ましくは、軽減、さらに好ましくは消退させることをいう。
【０２１９】
本明細書において「予防」とは、ある疾患または障害について、そのような状態になる前に、そのような状態にならないようにすることをいう。本発明の予測診断または事前診断を行うことによって、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、等の変性ＬＤＬに関連する疾患、高脂血症等の脂質異常、糖尿病、高血糖、高血圧症、高血圧性腎硬化症、動脈硬化、虚血再灌流傷害、血管バルーン傷害後のような病態等の予防をするか、あるいは予防のための対策を講じることができる。本発明の予測診断または事前診断を行うことによって、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等の予防をするか、あるいは予防のための対策を講じることもできる。
【０２２０】
（好ましい実施形態の説明）
以下に好ましい実施形態の説明を記載するが、この実施形態は本発明の例示であり、本発明の範囲はそのような好ましい実施形態に限定されないことが理解されるべきである。当業者はまた、以下のような好ましい実施例を参考にして、本発明の範囲内にある改変、変更などを容易に行うことができることが理解されるべきである。これらの実施形態について、当業者は適宜、任意の実施形態を組み合わせ得る。
【０２２１】
（一本鎖抗体またはそのフラグメント）
本発明の１つの局面において、本発明は、配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体を提供する。好ましくは、前記一本鎖抗体は、配列番号７６または配列番号７８のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む。さらに好ましくは、前記一本鎖抗体は、配列番号７６に記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む。本発明の一本鎖抗体またはそのフラグメントは、ＬＤＬおよび／またはその修飾物に特異的に結合することができる。
【０２２２】
１つの実施形態において、配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列の改変体としては、アミノ酸の変異、挿入、および欠失を含む改変体が挙げられる。この改変体は、少なくとも５０、少なくとも１００、少なくとも１５０、少なくとも２００、少なくとも２５０の隣接するアミノ酸配列にわたって、配列番号１〜５のいずれかに記載のアミノ酸配列と、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％のアミノ酸の相同性または同一性を有する。
【０２２３】
（一本鎖抗体またはそのフラグメントを含む検出剤および検出方法）
他の局面において、本発明は、配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体を、ＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）を検出する検出剤を提供する。この検出剤は、一本鎖抗体またはそのフラグメントの他に、酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子をさらに含んでもよい。酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子としては、ＣＴＬＤ１４、抗ＬＤＬニワトリ抗体、およびこれらの組み合わせなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０２２４】
本発明の検出剤は、高感度でＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）を検出することができる。本発明の検出剤は、ＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）を、少なくとも１００ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも９０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも８０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも７０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも６０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも５０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも４０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも３０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも２９ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも２５ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも２０ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも１５ｎｇ／１００μｌウェル以下、少なくとも１０ｎｇ／１００μｌウェル以下、または最も好ましくは少なくとも５ｎｇ／１００μｌウェル以下の感度で検出可能である。
【０２２５】
１つの実施形態では、本発明は、ＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）の検出または定量方法であって、（Ａ）検出または定量の対象となるサンプルを、配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体に接触させる工程、および（Ｂ）該配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体の標的への結合を検出する工程であって、該結合の存否またはレベルは、該サンプルにおけるＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）の存在もしくは存在レベルを示す、工程を包含する、方法を提供する。
【０２２６】
本発明において、本発明のサンプルを上記一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体に接触させる手法としては、当該分野において公知の任意の手法を用いることができ、例えば、両者を溶液中で混合すること、あるいはその後インキュベートすることなど手法を用いることができるがこれらに限定されない。
【０２２７】
本発明において、ＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）に対する上記一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体の結合を検出する手法としては、当該分野において公知の任意の手法を用いることができ、例えば、いずれかの分子を標識（例えば、蛍光標識）した場合に、その標識を検出する任意の手法を利用することができることが理解される。ここで、上記結合の存否またはレベルは、該サンプルにおけるＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）の存在もしくは存在レベルを示すものである。
【０２２８】
本発明において、ＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）に対する上記一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体の結合の定量は、上記検出において、数値化する任意の手法によって、実現することができる。このような定量は相対的（レベル）でもよく、絶対量で表示してもよい。例えば、そのような手法としては、既知量のＬＤＬおよび／またはその修飾物（変性ＬＤＬ）について、検出対象となる標識の強度をプロットし、検量線を作成し、サンプルの検出データから外挿する手法が挙げられるがそれに限定されない。
【０２２９】
１つの実施形態において、本発明の検出方法において用いられる固相としては、固定される分子、例えば、ＣＴＬＤ分子、変性ＬＤＬが固定されうる限り任意のものを利用することができる。１つの実施形態では、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）のような機構を使用する場合、一般に、固相（基材）としては、マイクロタイタープレートが使用される。基板の材料としては、共有結合かまたは非共有結合のいずれかで、本発明において使用される生体分子に結合する特性を有するかまたはそのような特性を有するように誘導体化され得る、任意の固体材料が挙げられる。その材料としては、例えば、ポリエチレン、エチレン、ポリプロピレン、ポリイソブチレン、ポリエチレンテレフタレート、不飽和ポリエステル、含フッ素樹脂、ポリ塩化ビニル、ポリ塩化ビニリデン、ポリ酢酸ビニル、ポリビニルアルコール、ポリビニルアセタール、アクリル樹脂、ポリアクリロニトリル、ポリスチレン、アセタール樹脂、ポリカーボネート、ポリアミド、フェノール樹脂、ユリア樹脂、エポキシ樹脂、メラミン樹脂、スチレン・アクリロニトリル共重合体、アクリロニトリルブタジエンスチレン共重合体、シリコーン樹脂、ポリフェニレンオキサイド、ポリスルホン等の有機材料を用いることができる。
【０２３０】
固相への固定方法は、当該分野において任意の公知の方法で実施することができる。例えば、好ましくは、固相表面上のシラノール基（ＳｉＯＨ）による結合、素材のマトリックスによる疎水性結合および修飾官能基によるイオン結合、マトリックスに含まれている芳香族環を介した結合を用いることができる。固相への固定後は、その固相は、乾燥させてもよく、湿潤状態で利用しても良い。乾燥させることによって保存がしやすくなる。
【０２３１】
本明細書において使用される場合、用語「固相」とは、本明細書中において「基板」および「基材」と互換的に使用され、本発明のデバイスが構築される材料をいう。抗体のような分子が固定され得る平面状の支持体をいう。本発明において表面プラズモン共鳴の原理を用いて検出する場合、固相は、金、銀またはアルミニウムを含む金属薄膜を片面に持つガラス基板の基材であることが好ましい。本発明において酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）のような機構を使用する場合、一般に、固相（基材）としては、マイクロタイタープレートが使用される。本発明において水晶発振子マイクロバランスの原理を用いて検出する場合は、周波数変換素子（例えば水晶発振子、表面弾性波素子）を固相として用い、直接受容体を結合させる。水晶板の片面はシリコーンで被覆し、もう一方の面は金電極を施したものを固相として用いる。基板の材料としては、共有結合かまたは非共有結合のいずれかで、本発明において使用される生体分子に結合する特性を有するかまたはそのような特性を有するように誘導体化され得る、任意の固体材料が挙げられる。適切な基材としては、ビーズ、金粒子、半導体ナノ粒子（例えば、ＣｄＴｅナノ粒子、ＣｄＳｅナノ粒子、ＧａＮナノ粒子、ＺｎＳナノ粒子、ＩｎＰナノ粒子など）、シリカナノ粒子、ポリスチレンナノ粒子、アクリル系ナノ粒子、ラテックスナノ粒子、カーボンナノ粒子、プレート（例えば、マイクロタイタープレート）、試験管、チップ、磁性粒子、膜、繊維、スライドガラス、金属薄膜、フィルター、チューブ、ボール、ダイアモンド様炭素被膜ステンレスなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０２３２】
固相および基板として使用するためのそのような材料としては、固体表面を形成し得る任意の材料が使用され得るが、例えば、ガラス、シリカ、シリコーン、セラミック、二酸化珪素、プラスチック、金属（合金も含まれる）、天然および合成のポリマー（例えば、ポリスチレン、セルロース、アミロース、キトサン、デキストラン、およびナイロン）以下が挙げられるがそれらに限定されない。基板は、複数の異なる材料の層から形成されていてもよい。例えば、ガラス、石英ガラス、アルミナ、サファイア、フォルステライト、炭化珪素、酸化珪素、窒化珪素などの無機絶縁材料を使用できる。また、ポリエチレン、エチレン、ポリプロピレン、ポリイソブチレン、ポリエチレンテレフタレート、不飽和ポリエステル、含フッ素樹脂、ポリ塩化ビニル、ポリ塩化ビニリデン、ポリ酢酸ビニル、ポリビニルアルコール、ポリビニルアセタール、アクリル樹脂、ポリアクリロニトリル、ポリスチレン、アセタール樹脂、ポリカーボネート、ポリアミド、フェノール樹脂、ユリア樹脂、エポキシ樹脂、メラミン樹脂、スチレン・アクリロニトリル共重合体、アクリロニトリルブタジエンスチレン共重合体、シリコーン樹脂、ポリフェニレンオキサイド、ポリスルホン等の有機材料を用いることができる。本発明においてはまた、ナイロン膜、ニトロセルロース膜、ＰＶＤＦ膜など、ブロッティングに使用される膜を用いることもできる。高密度のものを解析する場合は、ガラスなど硬度のあるものを材料として使用することが好ましい。基板として好ましい材質は、測定機器などの種々のパラメータによって変動し、当業者は、上述のような種々の材料から適切なものを適宜選択することができる。
【０２３３】
本明細書において「チップ」は、多様の機能をもち、システムの一部となる超小型集積回路をいう。本明細書において、受容体を固定化した固相を、受容体チップおよび／または受容体マイクロチップと呼ぶ。
【０２３４】
本明細書においてポリヌクレオチドまたはポリペプチド発現の「検出」または「定量」は、例えば、ｍＲＮＡの測定および免疫学的測定方法を含む適切な方法を用いて達成され得る。分子生物学的測定方法としては、例えば、ノーザンブロット法、ドットブロット法またはＰＣＲ法などが例示される。免疫学的測定方法としては、例えば、方法としては、マイクロタイタープレートを用いるＥＬＩＳＡ法、ＲＩＡ法、蛍光抗体法、ウェスタンブロット法、免疫組織染色法などが例示される。また、定量方法としては、ＥＬＩＳＡ法またはＲＩＡ法などが例示される。アレイ（例えば、ＤＮＡアレイ、プロテインアレイ）を用いた遺伝子解析方法によっても行われ得る。ＤＮＡアレイについては、（秀潤社編、細胞工学別冊「ＤＮＡマイクロアレイと最新ＰＣＲ法」）に広く概説されている。プロテインアレイについては、ＮａｔＧｅｎｅｔ．２００２Ｄｅｃ；３２ Ｓｕｐｐｌ：５２６−３２に詳述されている。遺伝子発現の分析法としては、上述に加えて、ＲＴ−ＰＣＲ、ＲＡＣＥ法、ＳＳＣＰ法、免疫沈降法、ｔｗｏ−ｈｙｂｒｉｄシステム、インビトロ翻訳などが挙げられるがそれらに限定されない。そのようなさらなる分析方法は、例えば、ゲノム解析実験法・中村祐輔ラボ・マニュアル、編集・中村祐輔羊土社（２００２）などに記載されており、本明細書においてそれらの記載はすべて参考として援用される。
【０２３５】
本明細書において「プローブ」とは、インビトロおよび／またはインビボなどのスクリーニングなどの生物学的実験において用いられる、検索の手段となる物質をいい、例えば、特定の塩基配列を含む核酸分子または特定のアミノ酸配列を含むペプチド、特異的抗体またはその断片などが挙げられるがそれに限定されない。本明細書においてプローブは、マーカー検出手段としてもちいられる。
【０２３６】
通常プローブとして用いられる核酸分子としては、目的とする遺伝子の核酸配列と相同なまたは相補的な、少なくとも８の連続するヌクレオチド長の核酸配列を有するものが挙げられる。そのような核酸配列は、好ましくは、少なくとも９の連続するヌクレオチド長の、より好ましくは少なくとも１０の連続するヌクレオチド長の、さらに好ましくは少なくとも１１の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１２の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１３の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１４の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１５の連続するヌクレオチド長の、少なくとも２０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも２５の連続するヌクレオチド長の、少なくとも３０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも４０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも５０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも核酸配列であり得る。プローブとして使用される核酸配列には、上述の配列に対して、少なくとも７０％相同な、より好ましくは、少なくとも８０％相同な、さらに好ましくは、少なくとも９０％相同な、少なくとも９５％相同な核酸配列が含まれる。
【０２３７】
本明細書において「検索」とは、電子的にまたは生物学的あるいは他の方法により、ある核酸塩基配列を利用して、特定の機能および／または性質を有する他の核酸塩基配列を見出すことをいう。電子的な検索としては、ＢＬＡＳＴ（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０（１９９０））、ＦＡＳＴＡ（Ｐｅａｒｓｏｎ  ＆  Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，ＵＳＡ  ８５：２４４４−２４４８（１９８８））、Ｓｍｉｔｈ  ａｎｄ  Ｗａｔｅｒｍａｎ法（Ｓｍｉｔｈ  ａｎｄ  Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１４７：１９５−１９７（１９８１））、およびＮｅｅｄｌｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｗｕｎｓｃｈ法（Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３−４５３（１９７０））などが挙げられるがそれらに限定されない。生物学的な検索としては、ストリンジェントハイブリダイゼーション、ゲノムＤＮＡをナイロンメンブレン等に貼り付けたマクロアレイまたはガラス板に貼り付けたマイクロアレイ（マイクロアレイアッセイ）、ＰＣＲおよびｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションなどが挙げられるがそれらに限定されない。本明細書において、本発明において使用される遺伝子には、このような電子的検索、生物学的検索によって同定された対応遺伝子も含まれるべきであることが意図される。
【０２３８】
本明細書における「プライマー」とは、高分子合成酵素反応において、合成される高分子化合物の反応の開始に必要な物質をいう。核酸分子の合成反応では、合成されるべき高分子化合物の一部の配列に相補的な核酸分子（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡなど）が用いられ得る。本明細書においてプライマーはマーカー検出手段として使用され得る。
【０２３９】
通常プライマーとして用いられる核酸分子としては、目的とする遺伝子の核酸配列と相補的な、少なくとも８の連続するヌクレオチド長の核酸配列を有するものが挙げられる。そのような核酸配列は、好ましくは、少なくとも９の連続するヌクレオチド長の、より好ましくは少なくとも１０の連続するヌクレオチド長の、さらに好ましくは少なくとも１１の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１２の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１３の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１４の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１５の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１６の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１７の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１８の連続するヌクレオチド長の、少なくとも１９の連続するヌクレオチド長の、少なくとも２０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも２５の連続するヌクレオチド長の、少なくとも３０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも４０の連続するヌクレオチド長の、少なくとも５０の連続するヌクレオチド長の、核酸配列であり得る。プローブとして使用される核酸配列には、上述の配列に対して、少なくとも７０％相同な、より好ましくは、少なくとも８０％相同な、さらに好ましくは、少なくとも９０％相同な、少なくとも９５％相同な核酸配列が含まれる。プライマーとして適切な配列は、合成（増幅）が意図される配列の性質によって変動し得るが、当業者は、意図される配列に応じて適宜プライマーを設計することができる。そのようなプライマーの設計は当該分野において周知であり、手動でおこなってもよくコンピュータプログラム（例えば、ＬＡＳＥＲＧＥＮＥ，ＰｒｉｍｅｒＳｅｌｅｃｔ，ＤＮＡＳｔａｒ）を用いて行ってもよい。
【０２４０】
本明細書において「キット」とは、通常２つ以上の区画に分けて、提供されるべき部分（例えば、抗体、標識など）が提供されるユニットをいう。混合されて提供されるべきでなく、使用直前に混合して使用することが好ましいような組成物の提供を目的とするときに、このキットの形態は好ましい。そのようなキットは、好ましくは、提供される部分（例えば、試薬をどのように処理すべきかを記載する指示書または説明書を備えていることが有利である。本明細書においてキットが試薬キットとして使用される場合、キットには、通常、抗体の使い方などを記載した指示書などが含まれる。
【０２４１】
本明細書において「指示書」は、本発明を使用する方法を医師または他の使用者に対する説明を記載したものである。この指示書は、本発明の検出方法、診断薬の使い方、または医薬などを投与することを指示する文言が記載されている。また、指示書には、投与部位として、骨格筋に投与（例えば、注射などによる）することを指示する文言が記載されていてもよい。この指示書は、本発明が実施される国の監督官庁（例えば、日本であれば厚生労働省、米国であれば食品医薬品局（ＦＤＡ）など）が規定した様式に従って作成され、その監督官庁により承認を受けた旨が明記される。指示書は、いわゆる添付文書（ｐａｃｋａｇｅ  ｉｎｓｅｒｔ）であり、通常は紙媒体で提供されるが、それに限定されず、例えば、電子媒体（例えば、インターネットで提供されるホームページ、電子メール）のような形態でも提供され得る。
【０２４２】
本明細書において「生体内」または「インビボ」（ｉｎ  ｖｉｖｏ）とは、生体の内部をいう。特定の文脈において、「生体内」は、目的とする物質が配置されるべき位置をいう。
【０２４３】
本明細書において「インビトロ」とは、種々の研究目的のために生体の一部分が「生体外に」（例えば、試験管内に）摘出または遊離されている状態をいう。インビボと対照をなす用語である。
【０２４４】
本明細書において「エキソビボ」とは、ある処置について、体外で行われるがその後体内に戻されることが意図される場合、一連の動作をエキソビボという。
【０２４５】
本発明の体外診断薬等の医薬等としての処方手順は、当該分野において公知であり、例えば、日本薬局方、米国薬局方、他の国の薬局方などに記載されている。従って、当業者は、本明細書の記載があれば、過度な実験を行うことなく、使用すべき量を決定することができる。
【０２４６】
１つの実施形態では、本発明において用いられる変性ＬＤＬは、酸化ＬＤＬ（ＯｘＬＤＬ）、マロンジアルデヒド化ＬＤＬ（ＭＤＡ−ＬＤＬ）、アクロレイン修飾ＬＤＬ、ノネナール修飾ＬＤＬ、クロトンアルデヒド（ＣＲＡ）修飾ＬＤＬ、４−ヒドロキシノネナール（ＨＮＥ）修飾ＬＤＬ、ヘキサノイル（ＨＥＬ）修飾ＬＤＬ、小粒子ＬＤＬ、糖化ＬＤＬ、アセチル化ＬＤＬまたはその改変体でありうる。
【０２４７】
（一本鎖抗体またはそのフラグメントの安定供給系）
本発明の他の局面において、前記一本鎖抗体またはそのフラグメントを生産する方法を提供する。この方法は、（Ａ）前記一本鎖抗体またはそのフラグメントのアミノ酸配列をコードする核酸を、前記核酸が発現される大腸菌に導入する工程；（Ｂ）前記大腸菌を培養し、前記大腸菌から封入体を取り出す工程；（Ｃ）前記一本鎖抗体またはそのフラグメントを前記封入体から抽出し、リフォールディングする工程；（Ｄ）リフォールディングで得られた溶液をＮｉ−ＮＴＡスラリーに接触させ、イミダゾールを含む溶出溶液で溶出する工程；および（Ｅ）溶出した前記一本鎖抗体またはそのフラグメントを透析溶液で透析する工程を包含する。
【０２４８】
本発明で用いられる大腸菌は、好ましくは、ＤＨ５α株、ＢＬ２１（ＤＥ３）株、ＨＢ２１５１株、ＢＬＲ株、およびＴＧ１株からなる群より選択される。最も好ましくは、前記大腸菌は、ＢＬ２１（ＤＥ３）株である。発現ベクターとしては、Ｔ７プロモーター系E.coliタンパク質発現ベクター（ｐＥＴ−２２ｂ（＋）等）が挙げられるが、これらに限定されない。最も好ましくは、発現ベクターは、ｐＥＴ−２２ｂ（＋）である。
【０２４９】
封入体は、当該分野で公知の技術を用いて取り出すことができる。例えば、超音波処理、フレンチプレス、またはホモジナイズの後に遠心分離することによって取り出すことができる。封入体は主としてペレット中に認められる。封入体懸濁液にＤＴＴなどの還元剤およびグアニジン、グアニジン誘導体、尿素、または尿素誘導体などの変性剤を混合することによって封入体を可溶化し、一本鎖抗体またはそのフラグメントを抽出することができる。本明細書では、リフォールディングの条件を、一回の精製（５０ｍｌリフォールディング）に供する封入体の量をBCA法により測定したタンパク質濃度に換算した値で表し、これを、「タンパク質あたり」の量として表現する。例えば、「タンパク質あたり２〜１０ｍｇ（例えば、８．６ｍｇ）」とは、一回の精製（５０ｍｌリフォールディング）に供する封入体の量をBCA法により測定したタンパク質濃度に換算した値が２〜１０ｍｇ（例えば、８．６ｍｇ）であることを意味する。本発明では、「タンパク質あたり２〜１０ｍｇ（例えば、８．６ｍｇ）」とするのが、良好な収量を得るのに重要である。
【０２５０】
本発明の１つの実施形態において、使用され得る一本鎖抗体またはそのフラグメントのリフォールディングは、シクロアミロース（ＣＡ）法（Ｍａｃｈｉｄａ  ｅｔ  ａｌ．、ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．４８６  （２０００）：  １３１−１３５）を用いるのが好ましいが、当該分野で公知の他の方法を用いてもよい。ＣＡ法によりリフォールディングを行う場合は、シクロアミロースおよびＤＬ−シスチンを含むイオン性界面活性剤を含有する溶液中で行われる。シクロアミロースの重合度の下限は１７以上、好ましくは２５以上、より好ましくは４０以上であり、重合度の上限は１５０以下、好ましくは１００以下、より好ましくは４０以下である。
【０２５１】
本発明の１つの実施形態において、使用され得るイオン性界面活性剤としては、セチルトリメチルアンモニウムブロミド、ドデシル硫酸ナトリウム、デオキシコール酸ナトリウム、３−[(３−コラミドプロピル）ジメチルアンモニオ]−１−プロパンスルホン酸、ヘキサデシルトリメチルアンモニウムブロマイド（以下、ＣＴＡＢと略記することもある。）、ミリスチルサルフォベタイン（以下、ＳＢ３−１４と略記することもある。）などが挙げられるが、これらに限定されない。好ましくはＳＢ３−１４であり、さらに好ましくはＣＴＡＢである。
【０２５２】
透析は、セルロースエステル膜チューブ（Ｓｐｅｃｔｒａ／Ｐｏｒ（登録商標）Ｂｉｏｔｅｃｈ  ＣＥ、分画分子量８０００、１０ｍｍ幅）を用いて1回または複数回（例えば、２〜４回）行われる。前記透析溶液は、例えばリン酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）であり、ＰＢＳとしては、代表的に、Ｄｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ  ＰＢＳ（−）を使用することができる（Ｄｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ  ＰＢＳ（−）の組成は、ＮａＣｌ  ８ｇ，ＫＣｌ  ０．２ｇ，Ｎａ２ＨＰＯ４  １．１５ｇ，ＫＨ２ＰＯ４  ０．２ｇ／Ｌ、（ｐＨ  ７．４）である）。サンプル容量の少なくとも２０倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、少なくとも２００倍、少なくとも３００倍、または好ましくは少なくとも４００倍の容量が用いられる。透析溶液としてＰＢＳを使用する場合、ＰＢＳ（−）が好ましい。このＰＢＳ（−）は、カルシウムイオンおよびマグネシウムイオンを含まない。
【０２５３】
（ＬＤＬおよびその修飾物（変性ＬＤＬ）の検出／定量システムまたはキット）
別の局面において、本発明は、本発明の一本鎖抗体またはそのフラグメントを用いる、ＬＤＬまたはその修飾物（変性ＬＤＬ）を検出または定量するためのシステムまたはキットを提供する。この局面で用いられ得る一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体、検出または定量の手法およびそれに用いる手段、キット、システム等としては、上述の（一本鎖抗体またはそのフラグメント）の節、（一本鎖抗体またはそのフラグメントを含む検出剤）の節、（一本鎖抗体またはそのフラグメントの安定供給系）の節および他の節において説明された任意の形態を用いることができる。
【０２５４】
１つの代表的な実施形態では、このキットまたはシステムは、直接（ダイレクト）ＥＬＩＳＡを実現するためのキットまたはシステムであり得る。
【０２５５】
別の局面において、本発明は、本発明の一本鎖抗体またはそのフラグメントと、酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域等の酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子とを用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬ等の変性ＬＤＬを検出または定量するためのシステムを提供する。この局面で用いられ得る一本鎖抗体またはそのフラグメントとしては、上述の（一本鎖抗体またはそのフラグメント）の節、（一本鎖抗体またはそのフラグメントを含む検出剤）の節、（一本鎖抗体またはそのフラグメントの安定供給系）の節および他の節において説明された任意の形態を用いることができる。
【０２５６】
１つの代表的な実施形態において、本発明は、酸化的修飾を受けたＬＤＬ等の変性ＬＤＬの検出または定量のためのキットまたはシステムを提供し、このキットまたはシステムにおいて、（Ａ）固定されたＬＯＸ−１のリガンド認識領域（例えば、ＣＴＬＤ１４）等の酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子を有する固相および標識した本発明の一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体、または固定された本発明の一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体を有する固相および標識したＬＯＸ−１のリガンド認識領域（例えば、ＣＴＬＤ１４）等の酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子；および（Ｂ）該標識を検出する手段を備える。ここで、該標識の存否またはレベルは、酸化的修飾を受けたＬＤＬの存在もしくは存在レベルを示す。本発明のこのキットにおいて使用されうる変性ＬＤＬ，ＣＴＬＤ分子、固相、標識、接触、結合の検出技術または手段等は、結合のレベルの算出等は、（一本鎖抗体またはそのフラグメントを含む検出剤および検出方法）において説明される任意の実施形態が利用されうることが理解される。これらの形式としては、間接的なＥＬＩＳＡ（サンドイッチＥＬＩＳＡ）の形式を用いることが代表的であるがこれに限定されない。
【０２５７】
用いられ得る酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子は、代表的に酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）、ＣＴＬＤ１４、および抗ＬＤＬニワトリ抗体、本発明の一本鎖抗体（配列番号７６、７７、７８、７９または８０）またはその改変体などが挙げられる。さらに詳細には、代表的に、ＬＯＸ−１の４つのドメイン：Ｎ末端側の細胞質ドメイン、疎水性膜貫通ドメイン、ネックドメイン、およびＣ型レクチン様ドメイン（本明細書ではＣＴＬＤともいう）うち、ＣＴＬＤを含む分子であってもよく、ＣＴＬＤ１４、ＬＯＸ−１全長、ＬＯＸ−１細胞外領域全長またはそれらの改変体であり得、好ましくはＣＴＬＤ１４が用いられる。長期保存に対して安定性が高いからであるが、これに限定されない。
【０２５８】
本発明の別の実施形態において、前記システムは抗原抗体反応を用いるもの、例えば、ＥＬＩＳＡ、サンドイッチＥＬＩＳＡ、またはラテラルフローアッセイを行うためのものである。
【０２５９】
本発明の好ましい実施形態において、毛管現象による試料の展開を行うメンブレンを備え、前記メンブレンは、サンプルと金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識された酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域か、または金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識された前記一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含むコンジュゲート部；酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域か、または前記記載の一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含む検出部；ならびに前記酸化ＬＤＬ受容体（ＬＯＸ−１）のリガンド認識領域に対する結合分子もしくは一本鎖抗体に対する結合分子を含むコントロール部を含む、ラテラルフローアッセイを行うためのシステムを提供する。
【０２６０】
本発明の好ましい実施形態において、毛管現象による試料の展開を行うメンブレンを備え、前記メンブレンは、サンプルと金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識されたＣＴＬＤ１４か、または金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識された前記一本鎖抗体もしくはそのフラグメントを含むコンジュゲート部；ならびにＣＴＬＤ１４に対する結合分子を含むコントロール部を含む、ラテラルフローアッセイを行うためのシステムを提供する。
【０２６１】
金属コロイドとしては、例えば、金コロイド、白金コロイド、パラジウムコロイド、銀コロイド等が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２６２】
ラテックス粒子としては、例えば、ポリスチレン系ポリマー、カルボキシ変性系、蛍光ラテックス粒子、磁気性ラテックス粒子等を挙げることができる。また、シリカ系粒子としてシリカ粒子、蛍光シリカ粒子が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２６３】
一本鎖抗体のＣ末端は、ＨｉｓタグまたはＥタグが付加されているため、抗Ｈｉｓ抗体または抗Ｅタグ抗体が結合分子として用いられる。さらに、ＣＴＬＴＤ１４は、ビオチン化、Ｈｉｓタグ付加、Ｍｙｃタグ付加、Ｆｌａｇタグ付加、Ｅタグ付加、またはＳｔｒｅｐタグ付加されており、それぞれの場合において、ストレプトアビジン、抗Ｈｉｓ抗体、抗Ｍｙｃ抗体、抗Ｆｌａｇ抗体、抗Ｅタグ抗体、またはＳｔｒｅｐ−Ｔａｃｔｉｎ等が結合分子として用いられるがこれらに限定されない。
【０２６４】
別の局面において、本発明はまた、抗変性ＬＤＬ抗体、その改変体またはこれらのフラグメントと、ＬＯＸ−１のリガンド認識領域（例えば、ＣＴＬＤ１４）等の酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬ等の変性ＬＤＬを検出または定量するためのシステムを提供する。このようなラテラルフローアッセイ形式のシステムは、従来変性ＬＤＬの検出には提供されておらず、従来のアッセイ系では検出することができなかった事例も検出することができるため、有利であるといえる。また、理論に束縛されることを望まないが、本発明の優位な点としては、（１）反応時間が、代表的には30分以内と短時間であること、（２）特殊な機器を用いず目視での検出が可能であること、（３）検出用の試薬を添加する必要が無く、測定対象試料を添加するのみで反応が終了すること等を挙げることができる。
【０２６５】
本発明はまた、抗変性ＬＤＬ抗体、その改変体またはこれらのフラグメントと、ＬＯＸ−１のリガンド認識領域（例えば、ＣＴＬＤ１４）等の酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害等の変性ＬＤＬに関連する疾患の評価のためのシステムを提供する。酸化的修飾を受けたＬＤＬの発現は種々の条件下で、高脂血症等の脂質異常、糖尿病、高血糖、高血圧症、高血圧性腎硬化症、動脈硬化、虚血再灌流傷害、血管バルーン傷害後のような病態；ならびに酸化ＬＤＬ、アンジオテンシンＩＩ、エンドセリン、ＴＮＦ−α、後期糖化反応生成物（ＡＧＥｓ）、ＴＧＦ−β、８−イソ−プロスタグランジンＦ２α、ズリ応力のような刺激によって、調節されていることが分かっている（Ｆｏｌｉａ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｊｐｎ．１２７，１０３−１０７（２００６）、特開2009-082076）ため、これらの情報は本発明による評価に用いることができる。例えば、生体内に存在する変性ＬＤＬとしては、酸化ＬＤＬ、マロンジアルデヒド化ＬＤＬ（ＭＤＡ−ＬＤＬ）、アクロレイン修飾ＬＤＬ、ノネナール修飾ＬＤＬ、小粒子ＬＤＬ（直径２５５ｎｍ以下のＬＤＬ）、糖化ＬＤＬなどが挙げられるが、これらに限定されない。酸化ＬＤＬが異常値を示す場合、動脈硬化症、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、高脂血症などのような疾患が予想されるがこれらに限定されない（「今日の臨床検査２００７−２００８」発行所：株式会社南江堂、参照）。基準物質としては、ＭＤＡ−ＬＤＬ（正常範囲：１０〜８０Ｕ／Ｌ）および酸化ホスファチジルコリン（正常範囲：８．４Ｕ／ｍＬ〜１７．６Ｕ／ｍＬ）が使用される。
【０２６６】
本発明の変性ＬＤＬによって引き起こされる疾患の診断を支援する方法においては、上記疾患に罹患していない被験体（例えば、健常者）サンプルと、上記疾患に罹患していることが疑われる被験体（患者）サンプルの両方で変性ＬＤＬが検出され、これらのサンプル間で本発明のポリペプチドと変性ＬＤＬとの複合体の量が比較されて、上記疾患が疑われている被験体中の変性ＬＤＬのコントロール被験体に対する相対値が算出される。基準物質としては、ＭＤＡ−ＬＤＬ（正常範囲：１０〜８０Ｕ／Ｌ）および酸化ホスファチジルコリン（正常範囲：８．４Ｕ／ｍＬ〜１７．６Ｕ／ｍＬ）が使用される。これらの正常範囲を参考にすることもできる。この相対値が異常値である場合、上記疾患に罹患していると診断される。変性ＬＤＬによって引き起こされる疾患は、代表的には、動脈硬化症、冠動脈疾患、動脈炎、動脈硬化症に基づく冠攣縮性狭心症、拡張型心筋症、虚血性心疾患（心筋梗塞、狭心症など）、脳血管障害（脳梗塞、脳出血、くも膜下出血、一過性脳虚血発作など）、大動脈瘤、腎梗塞、高脂血症などなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０２６７】
本発明はまた、抗変性ＬＤＬ抗体、その改変体またはそのフラグメントと、ＬＯＸ−１のリガンド認識領域（例えば、ＣＴＬＤ１４）等の酸化的修飾を受けたＬＤＬを認識することができる分子とをラテラルフローアッセイ形式で用いる、食品摂取による脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害等の変性ＬＤＬに関連する疾患の予防効果の評価のためのシステムを提供する。
【０２６８】
前記抗変性ＬＤＬ抗体としては、変性ＬＤＬに対する任意の抗体をいい、本明細書に記載される配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列またはその改変体を含む一本鎖抗体またはそのフラグメントあるいはその改変体のほか、抗ＬＤＬニワトリ抗体が挙げられるが、これらに限定されない。ここで使用され得るニワトリ抗ＬＤＬ抗体は、例えば、抗原（ＬＤＬ）０．３ｍｇ（アジュバンドＦＣＡ）２週間毎に、６回、ニワトリ皮内に接種後、力価の上昇を５回目以降にチェックし、６回目の追加免疫後に全採血したものから採取することができる。この場合、抗体活性測定は、抗原（ＬＤＬ）１μｇ／ｍｌを１００μｌ／ｗｅｌｌで固相し、通常のＥＬＩＳＡに準じて行うことができる（標識２次抗体として、ＨＲＰ標識抗ニワトリＩｇＹを使用する。）。
【０２６９】
本実施形態において抗原の検出方法にイムノアッセイを用いる場合は、抗体を固定化した担体を用いることが好ましい。このようにすれば、担体に固定化された抗体を１次抗体としたイムノアッセイの系を簡単に構築することができる。例えば、抗原に特異的でエピトープの異なる２種類の抗体を用意し、一方を１次抗体として担体に固定化し、他方を２次抗体として酵素標識し、サンドイッチＥＩＡの系を構築することができる。その他、結合阻止法や競合法によるイムノアッセイの系も構築可能である。さらに、担体として基板を用いる場合は、抗体チップによるイムノアッセイが可能である。抗体チップによれば、複数のマーカーの濃度を同時に測定でき、迅速な測定が可能である。
【０２７０】
＜改良型ＣＴＬＤ１４（カイコ型）およびその製造法＞
１つの局面において、本発明は、カイコ型糖鎖を有する、配列番号８６に示すアミノ酸配列またはその改変体を含むＣ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）１４を提供する。
【０２７１】
好ましい実施形態では、本発明において前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア、複合型糖鎖、オリゴマンノース型糖鎖またはハイブリッド型糖鎖の１または複数の種類の糖鎖を含む。
【０２７２】
１つの実施形態では、前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、２分子あたりＧｌｃＮＡｃ２分子およびＭａｎ２分子のうちの０〜４分子が結合した糖鎖を含む。
【０２７３】
特定の実施形態では、前記カイコ型糖鎖は、アスパラギン残基からみて以下の組合せ
１）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃとの組み合わせ、
２）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃ）−α１，３−Ｍａｎとの組み合わせ、
３）ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ（−α１，３−Ｍａｎ）−α１，６−Ｍａｎ−α１，２−Ｍａｎと、ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ−β）−α１，３−Ｍａｎ−β１，２−ＧｌｃＮＡｃとの組み合わせ、
の１つまたは複数の組合せを含む（図２０を参照）。
【０２７４】
１つの実施形態では、前記カイコ型糖鎖は、配列番号８６の１１１位のアスパラギンおよび／または１５５位のアスパラギンに結合する。
【０２７５】
別の実施形態では、本発明のＣＴＬＤ１４は、ビオチン化されたものである。ビオチン化を行うことによって、バイオアッセイにおいて、高感度で測定結果を得ることができたり、ストレプトアビジンを介してビーズや膜上に一定の方向で高密度の集積が可能になる。
【０２７６】
１つの実施形態において、本発明のＣＴＬＤ１４は、変性ＬＤＬを検出するための組成物として用いることができる。したがって、本発明は、本発明のカイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４を含む変性ＬＤＬを検出するための組成物を提供する。
【０２７７】
本発明の変性ＬＤＬを検出するための組成物は、非変性ＬＤＬと変性ＬＤＬとを識別して変性ＬＤＬを検出するためのものである。理論に束縛されることは望まないが、本発明のカイコ型糖鎖を含む改良型ＣＴＬＤ１４は、変性ＬＤＬを広く認識するが、非変性ＬＤＬに対しては特異性が高い特徴を有しており、これによって、糖尿病、動脈硬化等の診断に使用される変性ＬＤＬの判定を高感度に行うことができる。従来技術に比べると、その普遍性、感度、測定精度とも群を抜くものがあり、生体内において発症の要因となる構造の分子を広く検出可能であるという点で特に優れている。また、製造が簡便であり、大量生産も比較的可能であるという利点も奏する。
【０２７８】
したがって、本発明は、Ｃ型レクチン様ドメイン（ＣＴＬＤ）１４の製造方法であって、Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；
Ｂ）該遺伝子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該ＣＴＬＤ１４を発現させる工程；およびＣ）該ＣＴＬＤ１４を得る工程を包含する、方法を提供する。
【０２７９】
本発明は、カイコで製造されるものであるが、カイコ型糖鎖を付与することができる限り、どのような生物を用いてもよく、カイコと同様の糖鎖を付与する任意の生物が使用されることができることが理解される。
【０２８０】
１つの実施形態では、前記発現は、前記カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の中部絹糸腺において行われる。
【０２８１】
別の実施形態では、前記ＣＴＬＤ１４は、ビオチン化された状態またはビオチン化可能な状態で発現される。このようなビオチン化は、ビオチンが結合し得る配列を組み込むことによって達成することができる。例えば、リジン（Ｋ）を組換えにより付与することによって達成することができる。
【０２８２】
本発明の好ましい実施形態では、前記Ａ）工程は、前記ＣＴＬＤ１４をコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される。もちろん、マイクロインジェクション以外でも、本明細書において説明し、あるいは他の公知の任意の手法で発現ベクターを導入することができることが理解される。
【０２８３】
１つの実施形態では、前記核酸分子は、配列番号８５に示す核酸配列またはその改変体を含む。
【０２８４】
＜改良型ｓＲＡＧＥ（カイコ型）およびその製造法＞
1つの局面において、本発明は、カイコ型糖鎖を有する、配列番号９７に示すアミノ酸配列またはその改変体を含む再構築終末糖化産物受容体（ｓＲＡＧＥ）を提供する。
【０２８５】
好ましい実施形態では、本発明において前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア、複合型糖鎖、オリゴマンノース型糖鎖またはハイブリッド型糖鎖の糖鎖を含む。
【０２８６】
１つの実施形態では、前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、１分子あたりＧｌｃＮＡｃ０〜２分子およびＭａｎ０〜４分子のうちの０〜４分子が結合した糖鎖を含む。別の実施形態では、本発明のＲＡＧＥの前記カイコ型糖鎖は、トリマンノシルコア（アスパラギン残基からＧｌｃＮＡｃ−β１，４−ＧｌｃＮＡｃ−β１，４−Ｍａｎ（−α１，６−Ｍａｎ）−α１，３−Ｍａｎ）の構造に加え、２分子あたりＧｌｃＮＡｃ０〜４分子およびＭａｎ０〜８分子のうちの０〜８分子が結合した糖鎖を含む。別の実施形態では、ｓＲＡＧＥのカイコ型糖鎖としては、上記（１）〜（８）（［化１］〜［化８］）の構造を有する糖鎖が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２８７】
１つの実施形態では、カイコ型ｓＲＡＧＥの糖鎖の組成比が、オリゴマンノース型が９０％以上を占め、複合型およびハイブリッド型が５％未満である。カイコ型ｓＲＡＧＥの糖組成は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ３）は、４６％〜５６％であり、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ１）は、２３％〜３３％であり、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ２）は、７％〜１５％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２（図５４のＮ４−１）は、１％〜５％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３（図５４のＮ４−２）は、２％〜８％であり、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３（図５４のＮ４−３）は、１％〜５％である。好ましい実施形態において、糖組成は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２は、４８％〜５４％であり、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２５％〜３１％であり、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２は、９％〜１３％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２％〜４％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３は、３％〜６％であり、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３は、２％〜４％である。より好ましい実施形態において、糖組成は、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２は、５１．４％であり、（Ｍａｎ）７（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２７．５％であり、（Ｍａｎ）６（ＧｌｃＮＡｃ）２は、１０．８％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）２は、２．８％であり、（Ｍａｎ）３（ＧｌｃＮＡｃ）３は、４．６％であり、（Ｍａｎ）４（ＧｌｃＮＡｃ）３は、２．５％である。
【０２８８】
上記糖鎖または上記糖鎖にさらなる糖が付加した糖鎖の付加を受けたｓＲＡＧＥは、安定性に優れ、かつ多様な構造のＡＧＥｓに対する認識能を有する。
【０２８９】
１つの実施形態では、前記カイコ型糖鎖は、配列番号９７の３位のアスパラギンおよび／または５９位のアスパラギンに結合する。
【０２９０】
別の実施形態では、本発明のｓＲＡＧＥは、ビオチン化されたものである。ビオチン化を行うことによって、バイオアッセイにおいて、高感度で測定結果を得ることができたり、ストレプトアビジンを介してビーズや膜上に一定の方向で高密度の集積が可能になる。
【０２９１】
１つの実施形態において、本発明のｓＲＡＧＥは、終末期糖化生成物（ＡＧＥｓ）を検出するための組成物として用いることができる。したがって、本発明は、本発明のカイコ型糖鎖を含むｓＲＡＧＥを含む、ＡＧＥｓを検出するための組成物を提供する。
【０２９２】
理論に束縛されることを望まないが、本発明のｓＲＡＧＥを用いることによって、分析の対象となるＡＧＥｓを従来の1割程度からほぼすべてに該当するレベルにまで引き上げることができ、より正確な診断をできるようになったという点で顕著な効果を奏するものである。また、従来の再構築ＲＡＧＥ（ｓＲＡＧＥ）による検出方法でも、広範なＡＧＥｓを検出可能であるが、ｓＲＡＧＥは一ヶ月半程度で断片化し、認識能を失うなどの実用化上の問題があったが、本発明のｓＲＡＧＥを用いることによって、これをも克服し得たという点でも顕著である。本発明の改良型ｓＲＡＧＥは、糖鎖付加をうけており、非常に安定な分子であり、４℃での保存で長期にわたり、約１年間認識活性を維持していた。また、本発明の改良型ｓＲＡＧＥにより微量なＡＧＥｓの濃縮、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能であった。
【０２９３】
したがって、別の局面において、本発明はまた、ｓＲＡＧＥの製造方法であって、Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；Ｂ）該遺伝子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該ｓＲＡＧＥを発現させる工程；およびＣ）該ｓＲＡＧＥを得る工程を包含する、方法を提供する。
【０２９４】
本発明は、カイコで製造されるものであるが、カイコ型糖鎖を付与することができる限り、どのような生物を用いてもよく、カイコと同様の糖鎖を付与する任意の生物が使用されることができることが理解される。
【０２９５】
１つの実施形態では、前記発現は、前記カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の中部絹糸腺において行われる。
【０２９６】
本発明の好ましい実施形態では、前記Ａ）工程は、前記ｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される。もちろん、マイクロインジェクション以外でも、本明細書において説明し、あるいは他の公知の任意の手法で発現ベクターを導入することができることが理解される。
【０２９７】
１つの実施形態では、前記核酸分子は、配列番号９６に示す核酸配列またはその改変体を含む。
【０２９８】
１つの実施形態では、本発明のタンパク質の製造方法では、中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって直接的または間接的に発現制御される任意のタンパク質をコードする核酸配列を有するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物であって、該任意のタンパク質を絹糸腺で発現するあるいは繭糸に分泌するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を製造する工程；および（ｂ）製造されたトランスジェニックカイコカイコと同様の糖鎖を付与する生物から、該任意のタンパク質を回収する工程によって達成されてもよい。
【０２９９】
１つの例示的な実施形態では、本発明のカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を生産する工程では、まず、中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって直接的または間接的に発現制御される任意のタンパク質をコードする核酸配列を有するカイコ卵を生産する。次いで、製造されたカイコ卵から生じたカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の中から、任意のタンパク質を発現するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を選択することによって実現することができる。
【０３００】
１つの例示的な実施形態では、トランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を選択するには、例えば、選択マーカーを用いて行うことができる。本発明における選択マーカーとしては、当業者において一般的に使用されるマーカー、例えば、ＣＦＰ、ＧＦＰ、ＹＦＰ、ＤｓＲｅｄ等の蛍光タンパク質を使用することができる。これらのマーカーを用いることにより、実体蛍光顕微鏡で観察するだけでトランスジェニックカイコを検出することができる。また、蛍光色が異なるので、複数のマーカーを同時に使用することもできる。
【０３０１】
さらに別の実施形態では、製造されたトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物から、任意のタンパク質を回収する方法としては、例えば、トランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物が  吐糸した繭から、任意のタンパク質を回収する方法が挙げられる。回収方法としては、当業者に周知の方法、例えば、繭を６０％ＬｉＳＣＮで溶かし、２０ｍＭＴｒｉｓ、５Ｍ  ｕｒｅａで透析することによって回収する方法（Ｉｎｏｕｅ，Ｓ．，Ｔｓｕｄａ，Ｈ．，Ｔａｎａｋａ，Ｈ．，Ｍａｇｏｓｈｉ，Ｙ  ａｎｄ  Ｍｉｚｕｎｏ（２００１）Ｓｅｒｉｃｏｌｏｇｉａ  ４，１５７−１６３．）を使用することができる。また、その他のタンパク質回収法としては、例えば界面活性剤を用いる方法や水溶液で溶かす方法等が可能である。
【０３０２】
また、中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって間接的に発現制御される任意のタンパク質をコードする核酸配列を有するカイコ卵またはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の卵としては、例えば、（ｉ）中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターの下流に、転写制御因子をコードする核酸配列が機能的に結合した核酸配列、および（ｉｉ）該転写制御因子の標的プロモーターの下流に、任意のタンパク質をコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列を有するカイコ卵またはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の卵が挙げられる。
【０３０３】
中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって直接的に発現制御される任意のタンパク質をコードする核酸配列を有するカイコ卵またはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の卵としては、例えば、中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターの下流に、任意のタンパク質をコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列を有するカイコ卵またはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の卵が挙げられる。このようなカイコ卵は、中部絹糸腺特異的に発現するタンパク質をコードする核酸配列のプロモーターの下流に、任意のタンパク質をコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列を卵に導入することで製造できる。
【０３０４】
本明細書において「作動可能に連結される」とは、目的のタンパク質の発現が実現されるように連結されていることをいい、代表的に、プロモーターに転写制御因子が結合することにより、プロモーターの下流に存在する核酸配列の発現が誘導されるように、該プロモーターと該核酸配列とが結合していることをいう。転写制御因子と標的配列の組み合わせとしては、ＧＡＬ４とＵＡＳ、ＴｅｔＲとＴＲＥなどが挙げられる。ＧＡＬ４とＵＡＳ、またはＴｅｔＲとＴＲＥを用いることにより、目的とする遺伝子の発現部位や時期、量を正確に制御でき、多くの組織で容易に発現させることができる。また、発現させる遺伝子が致死性の遺伝子でも系統の作出が可能である。本発明で使用される核酸配列は、ハイブリダイゼーション技術やポリメラーゼ連鎖反応（PCR）技術、site-directed  mutagenesis法、DNA合成等の方法により調製することが可能である。調製された核酸配列がプロモーター活性を有するか否かは、当業者においてはレポーター遺伝子を用いた周知のレポーターアッセイ等により検討することが可能である。使用され得るレポーター遺伝子は本明細書の別の箇所において説明されており、任意の公知のものを使用することができる。
【０３０５】
本発明の糖タンパク質としては、絹糸中で不可逆的な変性が生じないタンパク質であることが好ましい。また、このようなタンパク質としては、絹糸腺細胞から絹糸腺内腔への分泌シグナルを有さないタンパク質を例示することができる。
【０３０６】
カイコ卵またはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の卵へのDNAの導入は、例えば、発生初期卵へ、トランスポゾンをベクターとして注射する方法（Tamura,  T.,  Thibert,  C.,  Royer  ,C.,  Kanda,  T.,  Abraham,  E.,  Kamba,  M.,  Komoto,  N.,  Thomas,  J.-L.,  Mauchamp,  B.,  Chavancy,  G.,  Shirk,  P.,  Fraser,  M.,  Prudhomme,  J.-C.  and  Couble,  P.,  2000,  Nature  Biotechnology  18,  81-84）に従って行うことができる。
【０３０７】
また、例えば、トランスポゾンの逆位末端反復配列（Handler  AM,  McCombs  SD,  Fraser  MJ,  Saul  SH.（1998）  Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  U.S.A.  95（13）:7520-5）の間に上記DNAを挿入したベクターとともに、トランスポゾン転移酵素をコードする核酸配列を有するベクター（ヘルパーベクター）をカイコ卵またはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の卵に導入することもできる。ヘルパーベクターとしては、pHA3PIG  （Tamura,  T.,  Thibert,  C.,  Royer  ,C.,  Kanda,  T.,  Abraham,  E.,  Kamba,  M.,  Komoto,  N.,  Thomas,  J.-L.,  Mauchamp,  B.,  Chavancy,  G.,  Shirk,  P.,  Fraser,  M.,  Prudhomme,  J.-C.  and  Couble,  P.,  2000,  Nature  Biotechnology  18,  81-84）が挙げられるが、これに限定されるものではない。
【０３０８】
本発明におけるトランスポゾンとしては、piggyBacが好ましいが、これに限定されるものではなく、マリーナ（mariner）、ミノス（minos）等を用いることもできる（Shimizu,  K.,  Kamba,  M.,  Sonobe,  H.,  Kanda,  T.,  Klinakis,  A.  G.,  Savakis,  C.  and  Tamura,  T.  （2000）  Insect  Mol.  Biol.,  9,  277-281；Wang  W,  Swevers  L,  Iatrou  K.（2000）  Insect  Mol  Biol  9（2）:145-55）。
【０３０９】
また、本発明では、バキュロウイルスベクターを使用することによりトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を作出することも可能である（Yamao,  M.,  N.  Katayama,  H.  Nakazawa,  M.  Yamakawa,  Y.  Hayashi  et  al.,  1999,  Genes  Dev  13:  511-516）。
【０３１０】
また、本発明におけるカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物としては、特に制限はないが、また、目的の糖タンパク質の大量生産のためには、フィブロインタンパク質などの絹糸を構成するタンパク質をコードする遺伝子領域（コード領域、プロモーター領域、非翻訳領域を含む）の変異によって、絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されているカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を用いることが好ましい。このようなカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物としては、絹糸を構成するタンパク質をコードする遺伝子領域の変異によって絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されている変異系統のカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物、好ましくは該変異によって絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されている裸蛹系統のカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物、より好ましくはNd-sDが挙げられるが、絹糸を構成するタンパク質の生産抑制の原因が、人為的か否か、また、自然界において生じた変異に依存するか否かに関わらず、絹糸を構成するタンパク質の生産が抑制されているカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物であればよい。このようなカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物は、セリシンカイコとして当業者には周知のカイコである。セリシンカイコを利用することによって、染色体に導入された任意の遺伝子から合成されるタンパク質の精製がさらに容易になる。
【０３１１】
また、本発明におけるカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物としては、非休眠卵を産下する性質を有するカイコだけでなく、休眠卵を産下する性質を有するカイコ（例えば実用品種であるぐんま、２００、春嶺、鐘月、錦秋、鐘和等）も使用することができる。ここで、休眠卵とは産卵後胚発生が一時的に停止する卵を言い、非休眠卵とは産卵後胚発生が停止せず、幼虫が孵化する卵を言う。
【０３１２】
休眠卵を産下する性質を有するカイコを用いる場合は、非休眠卵を産下させ、該非休眠卵にＤＮＡを導入する。非休眠卵を産下させる方法としては、例えばぐんまにおいては、休眠卵を１５℃〜２１℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、好ましくは休眠卵を１６℃〜２０℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、より好ましくは休眠卵を１８℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、最も好ましくは休眠卵を１８℃で培養することで該休眠卵から生じた幼虫を全明で飼育し、生育した成虫に非休眠卵を産下させる方法を挙げることができる。また、２００においては、休眠卵を１５℃〜２１℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、好ましくは休眠卵を１６℃〜２０℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、より好ましくは休眠卵を１８℃で培養することで該休眠卵から生じた成虫に非休眠卵を産下させる方法、または休眠卵から生じた幼虫を全明で飼育し、生育した成虫に非休眠卵を産下させる方法、最も好ましくは休眠卵を２５℃で培養することで該休眠卵から生じた幼虫を全明で飼育し、生育した成虫に非休眠卵を産下させる方法が挙げられる。卵の培養は、例えば、１８℃〜２５℃のインキュベーター、または定温の部屋に入れることによって行うことができ、幼虫の飼育は２０℃〜２９℃の飼育室で人工飼料を用いて行うことができる。
【０３１３】
本発明において、日長条件とは卵の培養、または幼虫の飼育中における一日毎の明暗サイクルを意味する。このような条件としては明条件と暗条件があり、特に全明条件とは暗の無い２４時間明の条件を意味する。日長条件は、品種に応じて変化させることができる。本発明の上記休眠卵の培養は、当業者においては、一般的なカイコ卵の培養法に従って行うことができる。例えば、「文部省（１９７８）蚕種製造．ｐｐ１９３、実教出版社、東京」に記載の方法に従って培養を行う。また、本発明におけるカイコ幼虫の飼育は、当業者においては、周知の方法によって行うことができる。例えば、「文部省（１９７８）蚕種製造．ｐｐ１９３、実教出版社、東京」に記載の方法に従って飼育を行う。
【０３１４】
本発明において、産卵された卵が非休眠卵であるか否かは、卵の色で判定することができる。一般に、休眠卵は濃い茶褐色に着色し、非休眠卵は黄白色であることが知られている。よって、本発明においては、濃い茶褐色ではないこと、より好ましくは黄白色であることをもって産卵された卵が非休眠卵であると判定する。
【０３１５】
別の局面では、本発明は、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸分子を発現可能に組み込んだカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を提供する。
【０３１６】
この局面の実施形態では、本発明で用いられる前記核酸分子は、配列番号８５または配列番号９６に示す核酸配列またはその改変体を含む。
【０３１７】
１つの実施形態では、本発明のカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物は、中部絹糸腺特異的に発現するＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸配列のプロモーター、および該プロモーターによって直接的または間接的に発現制御される任意のタンパク質をコードする核酸配列を有するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物であって、該ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥを絹糸腺で発現するあるいは繭糸に分泌するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を提供する。本発明のトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物の状態に特に制限はなく、例えば卵の状態であってもよい。本発明のトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を使用することで、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥを大量に生産することができる。
【０３１８】
本発明のトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物としては、好ましくは、（ｉ）中部絹糸腺特異的に発現するＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸配列のプロモーターの下流に、作動可能に連結される転写制御因子をコードする核酸配列、および（ｉｉ）該転写制御因子の標的プロモーターの下流に、作動可能に連結されるＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸配列を有するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物、または中部絹糸腺特異的に発現するＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸配列のプロモーターの下流に、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列を有するトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物である。
【０３１９】
さらに、１つの別の実施形態では、本発明は、本発明のトランスジェニックカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物（絹糸腺または繭を生産するもの）の絹糸腺または繭を提供する。このような絹糸腺または繭は、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥを大量に含有する絹糸腺または繭として有用である。
【０３２０】
また、本発明は、本発明の方法に用いるための核酸配列または核酸分子（例えば、ＤＮＡ）を提供する。このような核酸配列または核酸分子としては、（ａ）セリシンをコードする核酸配列のプロモーターの下流に、作動可能に連結される転写制御因子をコードする核酸配列、（ｂ）該転写制御因子の標的プロモーターの下流に、作動可能に連結される任意のタンパク質をコードする核酸配列、（ｃ）セリシンをコードする核酸配列のプロモーターの下流に、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥをコードする核酸配列が作動可能に連結される核酸配列、などが挙げられ、これらの組み合わせからなるキットとして提供してもよい。また、本発明は、トランスポゾンの逆位末端反復配列の間に、（ａ）〜（ｃ）の核酸配列を挿入したベクターを提供する。さらに、該ベクターとトランスポゾン転移酵素をコードする核酸配列を有するベクター（ヘルパーベクター）を含むキットを提供する。
【０３２１】
＜ＡＧＥｓ関連の疾患、障害等の検出、予測、予備的な検出または診断＞
１つの局面において、本発明は、終末期糖化生成物（ＡＧＥｓ）を検出することによって、ＡＧＥ関連の疾患、障害等の検出、予測、予備的な検出または診断を行う方法、キットおよび組成物を提供する。本発明のマーカーについては本明細書上記＜改良型ｓＲＡＧＥ（カイコ型）およびその製造法＞の節を参酌することができ、この節に記載された任意の実施形態を採用することができることが理解される。これらの疾患には、糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症、アルツハイマー症などの神経変性疾患、関節リュウマチ、後縦靱帯骨化症、骨粗鬆症、非アルコール性脂肪肝炎、歯周症、筋萎縮、加齢黄斑変性、皮膚疾患、皮膚老化、動脈硬化などが挙げられるがそれらに限定されない。なお、理論に束縛されないが、糖尿病性腎症は微小血管系の障害であるが、糖尿病は微小血管障害のみではなく、動脈硬化のような大血管障害の発症にもつながることが知られている。この原因の一つが大動脈血管内皮にも発現しているＲＡＧＥを介した血管内皮機能不全誘導にあると考えられる。よって、ＲＡＧＥの本来機能を抑制することによる血管内皮機能不全誘導（＝血管障害）の調整関連に結びつけることができる。ここで、サンプルの取得は、どのような手段で行っても良い。通常、医師以外の担当者が測定に従事する場合は、何らかの形で医師が取得したものであり得る。測定結果から、糖尿病またはその可能性があるかどうかを決定する工程は、正常値と比べて、各々のマーカーに比較して異常であるかどうかを判定することによって実施することができる。理論に束縛されることを望まないが、１つの例示的な実施例に基づいて説明すると、糖尿病モデルとコントロールとの対比実験を行うことによって、これらの疾患等の診断を行うことができる。
【０３２２】
別の実施形態では、ＲＡＧＥ固定化ビーズと検体を接触させ、次に検出したい分子に対応する蛍光標識した抗体と反応させ、蛍光強度を測定する手法も可能である。
【０３２３】
本発明のＡＧＥ関連疾患または障害の診断用キットには他の試薬類を含めてもよく、例えばＥＩＡを行うためのキットであれば、ビーズ等の担体、ブロッキング液、ＰＢＳ等の緩衝液、発色基質等を含むものでもよい。この方法またはキットでは、従来のマーカーでは検出、診断等ができない早期の段階で糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症の検出、診断を行うことができる。したがって、その意味では、早期診断ということもできる。もちろんのこと、従来のｓＲＡＧＥで診断ができる時期においても同様に診断が可能であるから、従来のｓＲＡＧＥと同じ意味での検出および診断ができる。本発明のｓＲＡＧＥについては本明細書上記＜改良型ｓＲＡＧＥ（カイコ型）およびその製造法＞の節を参酌することができ、この節に記載された任意の実施形態を採用することができることが理解される。
【０３２４】
本発明の疾病の診断方法で使用する健常値は、例えば、糖尿病を発症していないと確定診断された健常人における体液中のＡＧＥｓの濃度データを収集し、その濃度値を元に設定することができる。糖尿病の将来の発症リスクを判定する場合も、当該健常人における濃度値を元に健常値を設定することができる。なお、健常値を段階的に複数設定し、糖尿病の有無または将来の発症リスクを定量的に判定することもできる。
【０３２５】
本発明の疾病の診断方法において使用するサンプルについて、体液としては、尿または血液が好ましく用いられる。特に、被検者から採取した尿、血液から調製した血清または血漿（体液成分）を測定サンプルとすることが好ましい。血清または血漿は遠心分離等の公知の方法で血液から調製することができる。
【０３２６】
特定の実施形態では、前記ＲＡＧＥリガンド認識領域は、ＲＡＧＥ細胞外領域（配列番号１０２の２２−３３２位）、ＲＡＧＥ８、ｍＲＡＧＥ８、ＲＡＧＥ１、ｍＲＡＧＥ１、ＲＡＧＥ２、ｍＲＡＧＥ２、ＲＡＧＥ３、ｍＲＡＧＥ３、ＲＡＧＥ４、ｍＲＡＧＥ４、ＲＡＧＥ７、ｍＲＡＧＥ７、ＲＡＧＥ１４３、ｍＲＡＧＥ１４３、ＲＡＧＥ２２３、ｍＲＡＧＥ２２３、ＲＡＧＥ２２６およびｍＲＡＧＥ２２６、これらの少なくとも１つを含む分子、またはそれらの改変体あるいはそれらの複合体からなる群より選択される。
【０３２７】
さらに別の実施形態では、血清、血漿、尿等のサンプルとｓＲＡＧＥ固定化ビーズとを混和した後にビーズを回収し、蛍光標識した複数の抗体（抗体毎に蛍光標識の蛍光波長を変える）と反応後に蛍光測定し、複数のマーカーを同時に、迅速に検出することができる。より具体的なプロトコールは以下のとおりである。
【０３２８】
１．ｓＲＡＧＥビーズの作製：アガロース、シリカ、磁気性等のビーズ上にｓＲＡＧＥを固定化する。固定化はビーズ上のアビジンにｓＲＡＧＥのビオチンタグを介して固定化することにより簡便かつ強固な固定が可能である。
【０３２９】
２．ｓＲＡＧＥビーズとの反応：サンプルにｓＲＡＧＥビーズを添加し、低温で30分間転倒混和することにより、サンプル中のｓＲＡＧＥリガンドを結合させる。遠心分離（磁気性ビーズの場合、磁石を使用）によりｓＲＡＧＥビーズを回収し、ＴＢＳで洗浄する。
【０３３０】
３．２での反応物に、蛍光色素で標識した検出対象分子に対する抗体を添加する。吸収波長の異なる蛍光色素の組み合わせにより2種類以上の分子の同時検出が可能である（例えば、Ａｌｅｘａ  ４８８、５５５，６３３のＡｌｅｘａ系の組み合わせ、あるいは、Ｃｙ３，Ｃｙ５の組み合わせ等）。1時間反応させた後、ビーズを回収し洗浄する。
【０３３１】
４．検出：回収したビーズの蛍光を蛍光検出器で測定する。励起波長と吸収は長の選択により複数の分子の同時検出が可能である。
【０３３２】
また、高感度イムノクロマト法により簡便かつ迅速な分析に発展させることができる。これらの技術については、例えば、古河電工時報１２１，１７−２２（２００８）を参照することができる。例示的には、ラテラルフローアッセイを行うためのものであり、毛管現象による試料の展開を行うメンブレンを備え、前記メンブレンは、サンプルと金属コロイド、シリカ粒子もしくはラテックス粒子で標識されたＲＡＧＥのリガンド認識領域もしくはそのフラグメントを含むコンジュゲート部；ＲＡＧＥのリガンド認識領域もしくはそのフラグメントを含む検出部を含免疫クロマト法のシステムを想定することができるがこれに限定されない。
【０３３３】
また、Ｌａｂ−ｏｎ−ａ  Ｃｈｉｐを血球中のＡＧＥの発現を検出することによりタンパク質レベルで発現する前の段階での検出が可能になる。検出には、ＰＡＮＡＳＯＮＩＣのセンシングチップなどが活用可能である（例えば、参考文献としてＰＡＮＡＳＯＮＩＣ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ５７、２１−２６（２０１１）を挙げることができる）。
【０３３４】
血球中の遺伝子レベルでの発現に関しては、ＤＮＡマイクロアレイによる白血球における遺伝子発現レベルを指標に２型糖尿病の診断に関する文献（例えば、特許公開2010-261920公報）を参考に、実施することができる。また、ＰＡＮＡＳＯＮＩＣ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ５７、２１−２６（２０１１）に記載されるように、センシングチップの活用により、血液からワンステップで目的の遺伝子の検出が可能になることが期待されることから、ワンステップでの遺伝子検出も実施することができる。基本的には、ＰＡＮＡＳＯＮＩＣのセンサーチップの手順で、ＳＮＰセンサの部分が、該当遺伝子を検出するように特化された設計を行うことによって、実施することができる。
【０３３５】
１つの実施形態では、サンプルは涙液である。この実施形態では涙液のみで簡易測定可能であれば、たとえば、涙液を郵送してもらって簡易判定をし、その後眼底検査等をする、ということが本発明において想定されうる。
【０３３６】
本発明の糖尿病または糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等のＡＧＥ関連疾患または傷害の診断方法等においては、サンプル（血液、尿等）中のＡＧＥの存否または濃度を測定する。そして、その測定値を健常値と比較することにより、糖尿病または糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等の疾患または傷害の診断等を行う。
【０３３７】
本発明の疾病の診断方法では、被検者のサンプル（例えば、血液、尿等の体液）中における上記マーカーの少なくとも１つの濃度を健常値と比較し、疾患または障害の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができる。ある疾患または障害の「予測診断」および「事前診断」ならびに疾患または障害の「将来の発症リスクを判定する」とは、交換可能に使用され、疾患または障害を発症していない時点において、将来、その疾患または障害に罹患する可能性（危険性）の有無またはその可能性（危険性）の程度を判定することをいう。
【０３３８】
１つの局面では、本発明は、本発明の方法を実現するために、システムを構築することができる。
【０３３９】
本明細書において、「システム」とは、検出、予測診断、事前診断、診断等を行うための任意の系をいい、一般に、１または複数の構成要素からなり、複数の構成要素がある場合それらの要素は互いに作用・関連し合っており、全体として調和のとれた挙動・機能を示すという３条件を満足する系をいう。システムは、装置、組成物、診断薬など任意の形態であり得る。従って、システムは、例えば、測定装置を備える大掛かりなシステムから、クロマトグラフィーを備えるシステム、免疫反応を利用したキット、抗体を含む組成物（すなわち、マーカーのモノクローナル抗体を含む、体外医薬品である診断薬）などを包含することが理解される。
【０３４０】
１つの実施形態では、本発明は、被験体由来のサンプル中のＡＧＥｓを検出するためのｓＲＡＧＥを含む、被験体がＡＧＥｓに関連する疾患（例えば、糖尿病、糖尿病性腎症、糖尿病性網膜症、糖尿病性神経症等の糖尿病合併症等）であるかどうか事前診断または診断するためのシステムまたは組成物を提供する。これらの組成物またはシステムは、上記ＡＧＥｓを同定することができる限り、任意の因子または手段を用いることができることが理解され得る。従って、本明細書において具体的に記載された因子または手段のみならず、当該分野において公知の任意の等価の因子または手段を用いることができることが理解される。
【０３４１】
１つの実施形態では、本発明において使用される因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合分子からなる群より選択され、好ましくは、因子は、タンパク質または複合分子（例えば、糖タンパク質、脂質タンパク質など）である。好ましくは、因子は、抗体（例えば、ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体）である。このような因子は、標識されるか、または標識可能であることが好ましい。なぜなら、診断することが容易となるからである。
【０３４２】
本発明の好ましい実施形態において、使用される手段は、質量分析装置、核磁気共鳴測定装置、Ｘ線解析装置、ＳＰＲ、クロマトグラフィー（例えば、ＨＰＬＣ、薄層クロマトグラフィー、ガスクロマトグラフィー）、免疫学的手段（例えば、ウェスタンブロッティング、ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ）、生化学的手段（例えば、ｐＩ電気泳動、サザンブロッティング、二次元電気泳動）、電気泳動機器、化学的分析機器、蛍光二次元ディファレンシャル電気泳動法（２ＤＥ−ＤＩＧＥ）、同位体標識法（ＩＣＡＴ）、タンデムアフィニティ精製法（ＴＡＰ法）、物理学的手段、レーザーマイクロダイセクションおよびこれらの組み合わせからなる群より選択される。
【０３４３】
本発明の好ましい実施形態では、本発明のシステムは、さらに、ＡＧＥｓの標準を含む。このような標準は、ＡＧＥｓの検出手段が正常に機能しているかどうかを確認するために用いることが好ましい。
【０３４４】
好ましい実施形態では、本発明では、対象となるサンプルを精製する手段をさらに備え得る。このような精製手段としては、例えば、クロマトグラフィーなどを挙げることができる。精製することによって、診断の精度を上げることができることから、好ましい実施形態において使用され得るが、これは必須ではない。
【０３４５】
本発明において、被験体は、哺乳動物を含み、１つの実施形態では、被験体は、齧歯類を含む。このような齧歯類（例えば、ラット、マウスなど）は、モデル動物、特に、糖尿病または糖尿病性腎症のモデル動物（例えば、ストレプトゾシン（Ｓｔｚ）マウス等）が作製されていることから好ましい。別の好ましい実施形態では、被験体は、ヒトを含む。
【０３４６】
１つの実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、本発明のＡＧＥの定量をする能力を有する。このような定量は、標準曲線を描いたときに、検量線がきちんと描ける手段または因子であるものがよい。好ましくは、例えば、抗体、質量分析、クロマトグラフィー分析などを挙げることができる。従って、ある実施形態では、本発明のシステムは、ＡＧＥｓの定量を行うための定量手段をさらに備える。
【０３４７】
１つの実施形態では、定量手段は、標準曲線と測定結果とを比較して前記ＡＧＥｓが正常値の範囲内かどうかを判定する判定手段を含む。このような判定手段は、コンピュータを用いて実現することができる。本発明の検出または診断において、ＡＧＥｓの濃度を測定する方法は、そのＡＧＥｓの濃度を特異的に測定できる方法であれば、タンパク質の定量に一般に用いられている方法をそのまま用いることができる。例えば、各種のイムノアッセイ、質量分析（ＭＳ）、クロマトグラフィー、電気泳動等を用いることができる。
【０３４８】
本発明の検出または診断における好ましい実施形態の一つは、ＡＧＥｓを担体上に捕捉し、その捕捉されたＡＧＥｓの濃度を測定することである。すなわち、ＡＧＥｓに対する親和性を有する物質を担体に固定化し、その親和性を有する物質を介してＡＧＥｓを担体上に捕捉する。本実施形態によれば、サンプル中に含まれる夾雑物質の影響を低減させることができ、より高感度かつ高精度でＡＧＥｓの濃度を測定することができる。検出の方法としては、公知技術、例えばＥＩＡ（エンザイムイムノアッセイ）、ＲＩＡ（ラジオイムノアッセイ）、ＥＬＩＳＡ（酵素連結イムノソルベントアッセイ）等が挙げられる。
【０３４９】
本実施形態においてＡＧＥｓの測定方法にイムノアッセイを用いる場合は、抗体を固定化した担体を用いることが好ましい。このようにすれば、担体に固定化された抗体を１次抗体としたイムノアッセイの系を簡単に構築することができる。例えば、ＡＧＥｓまたはｓＲＡＧＥに特異的でエピトープの異なる２種類の抗体を用意し、一方を１次抗体として担体に固定化し、他方を２次抗体として酵素標識し、サンドイッチＥＩＡの系を構築することができる。その他、結合阻止法や競合法によるイムノアッセイの系も構築可能である。さらに、担体として基板を用いる場合は、抗体チップによるイムノアッセイが可能である。抗体チップによれば、複数のマーカーの濃度を同時に測定でき、迅速な測定が可能である。したがって、本発明は、ｓＲＡＧＥが基板に固定化されている試薬を提供することができる。このような試薬を用いて、ＡＧＥｓを検出するための組成物も提供することができる。
【０３５０】
一方、本実施形態においてＡＧＥｓの測定方法に質量分析を用いる場合は、抗体の他、イオン結合や疎水性相互作用によってＡＧＥを担体に捕捉することもできる。イオン結合や疎水性相互作用は抗原と抗体等のバイオアフィニティほどの特異性がなく、ＡＧＥｓ以外の物質も捕捉されるが、質量分析によれば分子量を反映した質量分析計スペクトルによって定量するので、問題はない。特に、担体として基板を使用したプロテインチップを用い、表面エンハンス型レーザー脱離イオン化（ｓｕｒｆａｃｅ−ｅｎｈａｎｃｅｄ  ｌａｓｅｒ  ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ）−飛行時間質量分析（ｔｉｍｅ−ｏｆ−ｆｌｉｇｈｔ  ｍａｓｓ  ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）（以下、「ＳＥＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳ」と称する）を行えば、ＡＧＥｓの濃度をより正確に測定することができる。使用できる基板の種類としては、陽イオン交換基板、陰イオン交換基板、順相基板、逆相基板、金属イオン基板、抗体基板等を用いることができるが、陽イオン交換基板、特に弱陽イオン交換基板と、金属イオン基板が好ましく用いられる。
【０３５１】
＜ニワトリ抗体およびその組み合わせ＞
１つの局面では、本発明は、抗ＬＤＬニワトリ抗体を含む、変性ＬＤＬを検出するための組成物を提供する。本発明では、他の動物種（例えば、マウス等）で生産した抗体に比較して、酸化ＬＤＬ（変性ＬＤＬ）と未変性ＬＤＬとの識別能が格段に上がることが理解される。
【０３５２】
好ましい実施形態では、本発明の抗ＬＤＬニワトリ抗体は、ポリクローナル抗体である。抗ＬＤＬニワトリ抗体としてポリクローナル抗体を用いることによって、完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、未変性ＬＤＬのすべてを同程度に認識可能であることが示された。
【０３５３】
１つの実施形態では、本発明の組成物は、さらに、ＣＴＬＤ１４を含むことができる。
【０３５４】
別の局面では、本発明は、抗ＬＤＬニワトリ抗体と、ＣＴＬＤ１４とを含む、変性ＬＤＬを検出するための組成物を提供する。このような変性ＬＤＬをすべて網羅的に安定的に検出することができるため、動脈硬化発症等の真の危険因子の検出を行うことができる。
【０３５５】
本発明の組成物で用いられるＣＴＬＤ１４は、カイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４であってもよい。
【０３５６】
このようなカイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４としては、カイコ型糖鎖を含む限りどのような種類のものを用いてもよく、不均一のものであってもよいが、本発明の、カイコ型糖鎖を有する、配列番号８６に示すアミノ酸配列またはその改変体を含むＣＴＬＤ１４を用いることもできる。
【０３５７】
好ましい実施形態では、本発明の組成物は、ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬを検出するためのものである。理論に束縛されることを望まないが、従来の抗体を用いた場合は、検出可能な構造が限られていたり、ＬＤＬ〜修飾ＬＤＬまで広く認識する場合でも、非特異的、反応性が低いという問題があり、実用的ではなかった。実験動物〜ヒトまで共通して使用できるものもなかった。そこで、本発明の抗体は、マウスからヒトまで哺乳類のＬＤＬ、酸化ＬＤＬを広く認識することができるものであり、それゆえ、ＬＤＬ〜修飾ＬＤＬまで広く認識でき、かつ、非変性ＬＤＬに比較しての特異性が高く、反応性も高いものであるため、分析・評価に利用できるものである。このようなことは従来知られておらず、本発明で初めて提供されるものである。
【０３５８】
本発明の変性ＬＤＬを検出するための組成物は、非変性ＬＤＬと変性ＬＤＬとを識別して変性ＬＤＬを検出するためのものである。１つの実施形態において、非変性ＬＤＬおよび変性ＬＤＬは、それぞれＬＤＬおよび酸化ＬＤＬである。１つの好ましい実施形態では、本発明を用いることによって峻別できるＬＤＬおよび酸化ＬＤＬは、複数種の哺乳動物のＬＤＬおよび酸化ＬＤＬである。理論に束縛されることを望まないが、従来は、せいぜい１種程度の哺乳動物のものが識別できるにすぎなかったところ、本発明の抗体は、マウスからヒトまで哺乳類のＬＤＬ、酸化ＬＤＬを広く認識することができるものであり、複数種の哺乳動物のＬＤＬおよび酸化ＬＤＬの峻別が可能になったことは特筆すべきである。したがって、前記複数種の哺乳動物は、マウスおよびヒトを含む。
【０３５９】
別の局面では、本発明は、抗ＬＤＬニワトリ抗体と、ＣＴＬＤ１４とを含む、変性ＬＤＬを検出するためのキットを提供する。
【０３６０】
好ましい実施形態では、抗ＬＤＬニワトリ抗体はポリクローナル抗体である。
【０３６１】
好ましい実施形態では、前記ＣＴＬＤ１４は、本発明で提供されるＣＴＬＤ１４であり、カイコ型糖鎖を含むものであり得る。
【０３６２】
好ましい実施形態では、本発明のキットに含まれる、抗ＬＤＬニワトリ抗体はポリクローナル抗体であり、ＣＴＬＤ１４は、本発明で提供されるＣＴＬＤ１４であり、カイコ型糖鎖を含むものである。
【０３６３】
１つの実施形態では、本発明は、ＬＤＬおよび酸化ＬＤＬを検出するためのものである。好ましい実施形態では、このＬＤＬおよび酸化ＬＤＬは、複数種の哺乳動物のＬＤＬおよび酸化ＬＤＬであり、好ましくは、この複数種の哺乳動物は、マウスおよびヒトを含む。このようなキットを提供することにより、他の動物種（例えば、マウス等）で生産した抗体に比較して、酸化ＬＤＬ（変性ＬＤＬ）と未変性ＬＤＬとの識別能が格段に上がる評価系が提供されることが理解される。また、ニワトリ抗酸化ＬＤＬ抗体としてポリクローナル抗体を用いることによって、完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、糖化ＬＤＬ，未変性ＬＤＬのすべてを同程度に認識可能であることが示されている。
【０３６４】
このように、本発明では、本発明のカイコ型糖鎖を有するＣＴＬＤ１４と、抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体とを用いることで、顕著に感度が高く、安定で、かつ広く変性ＬＤＬを検出できる効果が奏される。
【０３６５】
＜ビオチン化タンパク質の製造＞
（ビオチンリガーゼを共発現するカイコ）
本発明の１つの局面において、標的タンパク質をコードする核酸分子およびビオチンリガーゼを共発現可能に組み込んだカイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を提供する。
【０３６６】
標的タンパク質、例えばＣＴＬＤ１４、ｓＲＡＧＥをコードする核酸配列には、ビオチン化タグ配列が含まれているため、ビオチンリガーゼを共発現させることによって、標的タンパク質がビオチン化を受ける。１つの実施形態において、ビオチンリガーゼは、ＢｉｒＡ（配列番号１０６）である。ビオチン化を受けるタグ配列としては、ＢｉｏＥａｓｅ．ｔａｇ、Ａｖｉ．ｔａｇ、ビオチン化を受け得る任意の配列が挙げられるが、これらに限定されない。これらのカイコはビオチンの経口投与によりビオチン化ＣＴＬＤ１４、ビオチン化ｓＲＡＧＥを効率的に製造することができる。得られたビオチン化ＣＴＬＤ１４はｐＨ安定性に優れ、金属コロイド修飾し、抗ＬＤＬニワトリ抗体、一本鎖抗体、ストレプトアビジンを組み込んだラテラルフローアッセイにより、酸化的修飾を受けた多様な構造のＬＤＬを２０分以内に検出可能である。また、得られたｓＲＡＧＥの糖鎖構造解析により、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２を主とするオリゴマンノース型糖鎖が９０％以上を占め、数％のコンプレックス型、および、ハイブリッド型の糖鎖を含むことを明らかにした。さらに糖鎖付加により安定性が向上し（１年近く安定）、ビオチンを介した方向性を維持した固定化により、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能である。
【０３６７】
（ビオチンリガーゼを共発現するカイコよるビオチン化タンパク質の製造）
本発明の別の局面において、ビオチン化タンパク質の製造方法であって、Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、ビオチンリガーゼおよびタンパク質をコードする核酸分子を共発現可能に組み込む工程；Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該ビオチンリガーゼおよび該タンパク質を発現させる工程；およびＣ）該生物にビオチンを投与し、ビオチン化された該タンパク質を得る工程を包含する、方法を提供する。本発明のカイコ型ビオチン化タンパク質の製造方法は、目的のタンパク質（例えば、ＣＴＬＤ１４、ｓＲＡＧＥなど）を可溶性タンパク質として、高いビオチン化効率でビオチン化された状態で、数日以内に大量に発現させることが可能であるという優れた効果を有する。さらに、カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を用いて発現された糖鎖付加タンパク質は、糖鎖付加が行われない大腸菌発現系を用いたタンパク質よりも、ｐＨ安定性に優れ、脱塩処理によって凝集する率が低く、種々の緩衝液を適用することができるため、活用範囲が広い。得られたビオチン化ＣＴＬＤ１４はｐＨ安定性に優れ、金属コロイド修飾し、抗ＬＤＬニワトリ抗体、一本鎖抗体、ストレプトアビジンを組み込んだラテラルフローアッセイにより、酸化的修飾を受けた多様な構造のＬＤＬを２０分以内に検出可能である。また、得られたｓＲＡＧＥの糖鎖構造解析により、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２を主とするオリゴマンノース型糖鎖が９０％以上を占め、数％のコンプレックス型、および、ハイブリッド型の糖鎖を含むことを明らかにした。さらに糖鎖付加により安定性が向上し（１年近く安定）、ビオチンを介した方向性を維持した固定化により、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能である。
【０３６８】
カイコへのビオチンの投与は、ビオチンを添加した餌の経口投与が好ましいが、注射などの方法により投与することも可能である。
【０３６９】
本発明の好ましい実施形態では、前記Ａ）工程は、ビオチンリガーゼおよびタンパク質をコードする核酸分子を含む発現ベクターをマイクロインジェクションすることで達成される。もちろん、マイクロインジェクション以外でも、本明細書において説明し、あるいは他の公知の任意の手法で発現ベクターを導入することができることが理解される。
【０３７０】
（カイコ型ビオチン化ＣＴＬＤ１４）
１つの局面において、本発明は、高い効率でビオチン化されたＣＴＬＤ１４を提供する。高効率のビオチン化に起因して、ストレプトアビジンを組み込んだラテラルフローアッセイにより、酸化的修飾を受けた多様な構造のＬＤＬを２０分以内という短時間で検出することが可能である。１つの実施形態において、本発明のＣＴＬＤ１４のビオチン化効率は、約１０％以上、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、または約５０％以上である。好ましい実施形態では、本発明のＣＴＬＤ１４のビオチン化効率は、約３０％〜約４０％である。得られたビオチン化ＣＴＬＤ１４はｐＨ安定性に優れ、金属コロイド修飾し、抗ＬＤＬニワトリ抗体、一本鎖抗体、ストレプトアビジンを組み込んだラテラルフローアッセイにより、酸化的修飾を受けた多様な構造のＬＤＬを２０分以内に検出可能である。
【０３７１】
１つの実施形態において、本発明のＣＴＬＤ１４はカイコ型糖鎖付加を受けている。本発明のＣＴＬＤ１４の糖鎖構造は、上記（１）〜（６）（［化１］〜［化６］）の糖鎖構造に加え、上記（１）〜（６）（［化１］〜［化６］）の糖鎖にさらなる糖が付加された糖鎖も含まれる。本発明の特定の実施形態では、本発明のＣＴＬＤ１４は、糖鎖付加を受け得る部位が２か所存在する配列番号８６のアミノ酸配列を有する。これらの糖鎖付加部位に付加される糖鎖は同一であってもよいし、異なってもよい。糖鎖が異なる場合は、付加される糖鎖は、上記（１）〜（６）（［化１］〜［化６］）の糖鎖の任意の組み合わせであり得る。
【０３７２】
（カイコ型ビオチン化ｓＲＡＧＥ）
別の局面において、本発明は、高い効率でビオチン化されたｓＲＡＧＥを提供する。高効率のビオチン化に起因して、ビオチンを介した方向性を維持した基板等への固定が可能であり、多様な構造のＡＧＥｓの検出が可能である。１つの実施形態において、本発明のｓＲＡＧＥのビオチン化効率は、約１０％以上、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、または約６０％以上である。好ましい実施形態では、本発明のｓＲＡＧＥのビオチン化効率は、約６０％以上である。得られたｓＲＡＧＥの糖鎖構造解析により、（Ｍａｎ）５（ＧｌｃＮＡｃ）２を主とするオリゴマンノース型糖鎖が９０％以上を占め、数％のコンプレックス型、および、ハイブリッド型の糖鎖を含むことを明らかにした。さらに糖鎖付加により安定性が向上し（１年近く安定）、ビオチンを介した方向性を維持した固定化により、多様な構造のＡＧＥｓなどの検出が可能である。
【０３７３】
１つの実施形態において、本発明のｓＲＡＧＥは、カイコ型糖鎖付加を受けている。本発明のＣＴＬＤ１４の糖鎖構造は、上記（１）〜（８）（［化１］〜［化８］）の糖鎖構造に加え、上記（１）〜（８）（［化１］〜［化８］）の糖鎖にさらなる糖が付加された糖鎖も含まれる。本発明の特定の実施形態では、本発明のｓＲＡＧＥは、糖鎖付加を受け得る部位が２か所存在する配列番号１００のアミノ酸配列を有する。これらの糖鎖付加部位に付加される糖鎖は同一であってもよいし、異なってもよい。糖鎖が異なる場合は、付加される糖鎖は、上記（１）〜（８）（［化１］〜［化８］）の糖鎖の任意の組み合わせであり得る。
【０３７４】
＜カイコによる一本鎖抗体の生産＞
別の局面において、本発明は、一本鎖抗体またはそのフラグメントの製造方法であって、（Ａ）カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物に、該一本鎖抗体またはそのフラグメントをコードする核酸分子を発現可能に組み込む工程；（Ｂ）該核酸分子が発現する条件下に該カイコまたはカイコと同様の糖鎖を付与する生物を配置し、該一本鎖抗体またはそのフラグメントを発現させる工程；および（Ｃ）該一本鎖抗体またはそのフラグメントを得る工程を包含する、方法を提供する。大腸菌により一本鎖抗体を産生する場合は、発現されたタンパク質が封入体を形成し、リフォールディングの過程を必要としたが、本発明のカイコによる産生においては、可溶性タンパク質として発現されるため、リフォールディングの過程を必要としない。
【０３７５】
１つの実施形態において、本発明によって製造されたタンパク質は、カイコ型糖鎖の付加を受け得る。付加される糖鎖としては、上記トリマンノシルコア、複合型、オリゴマンノース型およびハイブリッド型が挙げられ、好ましくは、上記（１）〜（８）（［化１］〜［化８］）の構造のいずれかを有する糖鎖である。  
【０３７６】
１つの実施形態において、前記一本鎖抗体もしくはそのフラグメントは、配列番号７６〜８０のいずれかに記載のアミノ酸配列もしくはその改変体を含む。
【０３７７】
（一般技術）
本明細書において用いられる分子生物学的手法、生化学的手法、微生物学的手法は、当該分野において周知であり慣用されるものであり、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（１９８９）．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒおよびその３ｒｄ  Ｅｄ．（２００１）；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９８７）．Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９８９）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：  Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ；Ｉｎｎｉｓ，Ｍ．Ａ．（１９９０）．ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：  Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９９２）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：  Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９９５）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：  Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ；Ｉｎｎｉｓ，Ｍ．Ａ．ｅｔ  ａｌ．（１９９５）．ＰＣＲ  Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９９９）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：  Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ，ａｎｄ  ａｎｎｕａｌ  ｕｐｄａｔｅｓ；Ｓｎｉｎｓｋｙ，Ｊ．Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（１９９９）．ＰＣＲ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ：  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｆｏｒ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、別冊実験医学「遺伝子導入＆発現解析実験法」羊土社、１９９７などに記載されており、これらは本明細書において関連する部分（全部であり得る）が参考として援用される。
【０３７８】
人工的に合成した遺伝子を作製するためのＤＮＡ合成技術および核酸化学については、例えば、Ｇａｉｔ，Ｍ．Ｊ．（１９８５）．Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，ＩＲＬＰｒｅｓｓ；Ｇａｉｔ，Ｍ．Ｊ．（１９９０）．Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ；Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，Ｆ．（１９９１）．Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ａｎａｌｏｇｕｅｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃ，ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ；Ａｄａｍｓ，Ｒ．Ｌ．ｅｔ  ａｌ．（１９９２）．Ｔｈｅ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ，Ｃｈａｐｍａｎ＆Ｈａｌｌ；Ｓｈａｂａｒｏｖａ，Ｚ．ｅｔ  ａｌ．（１９９４）．Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ，Ｗｅｉｎｈｅｉｍ；Ｂｌａｃｋｂｕｒｎ，Ｇ．Ｍ．ｅｔ  ａｌ．（１９９６）．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  ｉｎ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ；Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ，Ｇ．Ｔ．（Ｉ９９６）．Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓなどに記載されており、これらは本明細書において関連する部分が参考として援用される。
【０３７９】
本明細書において引用された、科学文献、特許、特許出願などの参考文献は、その全体が、各々具体的に記載されたのと同じ程度に本明細書において参考として援用される。
【０３８０】
以上、本発明を、理解の容易のために好ましい実施形態を示して説明してきた。以下に、実施例に基づいて本発明を説明するが、上述の説明および以下の実施例は、例示の目的のみに提供され、本発明を限定する目的で提供したものではない。したがって、本発明の範囲は、本明細書に具体的に記載された実施形態にも実施例にも限定されず、特許請求の範囲によってのみ限定される。
【実施例】
【０３８１】
以下の実施例で用いた生物材料の取り扱いは、食品総合研究所において規定される基準を遵守した。なお、以下に製造例を記載するが、ＣＴＬＤ等については、さらに特開２０１２−１２２９９４を参酌することができることが理解される。また、試薬類は具体的には実施例中に記載した製品を使用したが、他メーカー（Ｓｉｇｍａ，和光純薬、ナカライ、ａｂｃａｍ，Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，  Ｒ  ＆  Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，  Ａｂｎｏｖａ，  ＡｓｓａｙＰｒｏ，  Ｏｒｉｇｅｎｅ，Ｂｉｏｂｙｔ，  Ｂｉｏｒａｄ，Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ，ＩＢＬ等）の同等品でも代用可能である。【０３８２】
（実施例１：一本鎖抗体遺伝子ライブラリーの作製）
ＭａｒｋｓらとＨａｗｋｉｎｓらの方法を改変し、一本鎖抗体遺伝子ライブラリーを作成した（Ｍａｒｋｓら、Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．２２２：５８１−５９７（１９９１）；Ｈａｗｋｉｎｓら、Ｂｌｏｏｄ  ８３：３２７９−３２８８（１９９４））。配列決定反応は、Ｂｉｇｄｙｅ（登録商標）ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ  ｖ１．１  ｃｙｃｌｅ  ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ  ｋｉｔ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用い、プロトコールに従った。また、プラスミドＤＮＡの種類によって表１のプライマーを用いた。本明細書では、プライマーの順向きはフォワード（ｆｏｒｗａｒｄ、ＦＯＲＷＡＲＤ、またはＦＯＲ）と称し、逆向きはリバース（ｒｅｖｅｒｓｅ、ＲＥＶＥＲＳＥ、またはＲＥＶ）またはバック（ＢＡＣＫ）と称する。リバース（ｒｅｖｅｒｓｅ、ＲＥＶＥＲＳＥ、またはＲＥＶ）とバック（ＢＡＣＫ）とは本明細書においてプライマーに関しては同じ意味を示す。【０３８３】
【表１】
0006617110.tif 000010
【０３８４】
（１．ｃＤＮＡの合成）
ｈｕｍａｎ  ｓｐｌｅｅｎ  ｐｏｌｙ  Ａ＋  ＲＮＡ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）から、Ｆｉｒｓｔ−ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ  ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  Ｋｉｔ（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて、Ｆｉｒｓｔ−ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡを合成した。抗体遺伝子の種類（γ鎖、μ鎖、κ鎖、λ鎖）に応じて表２のプライマーを用いた。【０３８５】
【表２】
0006617110.tif 000011
【０３８６】
（２．重鎖可変領域遺伝子（γ鎖、μ鎖）および軽鎖可変領域（κ鎖、λ鎖）の増幅）
γ鎖およびμ鎖を、Ｈｕｍａｎ  ＶＨ  リバースプライマー（表３）およびＨｕｍａｎ  ＪＨ  フォワードプライマー（表３）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で増幅させた。【０３８７】
【表３】
0006617110.tif 000012
【０３８８】
κ鎖を、Ｈｕｍａｎ  ＶΚ  リバースプライマー（表４）およびＨｕｍａｎ  ＪΚ  フォワードプライマー（表４）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で増幅させた。【０３８９】
【表４−１】
0006617110.tif 000013
【０３９０】
【表４−２】
0006617110.tif 000014
【０３９１】
λ鎖を、Ｈｕｍａｎ  Ｖλ  リバースプライマー（表５）およびＨｕｍａｎ  Ｊλ  フォワードプライマー（表５）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で増幅させた。【０３９２】
【表５】
0006617110.tif 000015
【０３９３】
ＰＣＲは、９４℃  ３分間、次に９４℃  １分間、６０℃  １分間、７２℃  １分間のサイクルを２５サイクル、次に７２℃で１０分間とした。【０３９４】
【表５Ａ】
0006617110.tif 000016
【０３９５】
（３．重鎖可変領域遺伝子、軽鎖可変領域遺伝子との間のリンカー配列付加）
γ鎖およびμ鎖にリンカー配列を付加するために、Ｈｕｍａｎ  ＶＨ  リバースプライマー（表３）およびＨｕｍａｎ  ＪＨ  ｆｏｒｗａｒｄ  ｌｉｎｋｅｒ  ｐｒｉｍｅｒｓ（表６）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で増幅させた。κ鎖にリンカー配列を付加するために、Ｈｕｍａｎ  ＶΚ  ｂａｃｋ  ｌｉｎｋｅｒ  ｐｒｉｍｅｒｓ（表６）およびＨｕｍａｎ  ＪΚ  フォワードプライマー（表４）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で増幅させた。λ鎖にリンカー配列を付加するために、Ｈｕｍａｎ  Ｖλ  リバースリンカープライマー（表６）およびＨｕｍａｎ  Ｊλ  フォワードプライマー（表５）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で増幅させた。ＰＣＲは、９４℃  ３分間、次に９４℃  １分間、６０℃  １分間、７２℃  １分間のサイクルを２５サイクル、次に７２℃  １０分間で反応させた。【０３９６】
【表６−１】
0006617110.tif 000017
【０３９７】
【表６−２】
0006617110.tif 000018
【０３９８】
（４．重鎖可変領域遺伝子と軽鎖可変領域遺伝子との結合）
プライマリーＰＣＲおよびセカンダリーＰＣＲの二段階からなるアッセンブリＰＣＲを行った。プライマリーＰＣＲの反応溶液は、表７Ａに示すとおりである。反応条件は、９４℃  ５分間、次に９４℃  １分間、６０℃  １分間、７２℃  １分間のサイクルを７サイクルとした。【０３９９】
【表７Ａ】
0006617110.tif 000019
【０４００】
その後、プライマリーＰＣＲ反応溶液に、Ｈｕｍａｎ  ＶＨ  リバースプライマー（表３）およびＨｕｍａｎ  ＪΚ  フォワードプライマー（表４）またはＨｕｍａｎ  Ｊλ  フォワードプライマー（表５）を添加し、９４℃  １分間、６０℃  １分間、７２℃  １分間のサイクルを２５サイクル、次に７２℃  １０分間で反応させた（表７Ｂ）。【０４０１】
【表７Ｂ】
0006617110.tif 000020
【０４０２】
（５．一本鎖抗体遺伝子への制限酵素サイト付加）
一本鎖抗体遺伝子（γ＋κ、μ＋λ）に制限酵素サイト（ＳｆｉＩ、ＮｏｔＩ）を付加するため、Ｈｕｍａｎ  リバースＳｆｉＩプライマー（表７）およびＨｕｍａｎ  ＪΚ  フォワードＮｏｔＩプライマー（表７）またはＨｕｍａｎ  Ｊλ  フォワードＮｏｔプライマー（表７）を混合プライマーとし、ＰＣＲ法で別々に増幅させた。反応条件は、９４℃  ３分間、次に９４℃  １分間、７２℃  ２分間のサイクルを２５サイクル、次に７２℃  １０分間とした。【０４０３】
【表７−１】
0006617110.tif 000021
【０４０４】
【表７−２】
0006617110.tif 000022
【０４０５】
（６．制限酵素処理（ＳｆｉＩ、ＮｏｔＩ）とｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅへの結合）
Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  Ｐｈａｇｅ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）のプロトコールを改変して、二段階からなる制限酵素処理を行った。【０４０６】
まず、ＳｆｉＩ用反応溶液で５０℃、２時間反応させ、ＳｆｉＩで切断した。室温に戻した後、ＮｏｔＩ用添加溶液を加え、３７℃で１時間反応させＮｏｔＩにより切断した。次に、フェノール：クロロホルム：＝１：１を１００μｌ加え、１分間ボルテックスした後、遠心（１５，０００ｒｐｍ、２分）し、上清を回収した。回収した産物をアガロースゲルで電気泳動後、Ｗｉｚａｒｄ（登録商標）ＳＶ  Ｇｅｌ  ａｎｄ  ＰＣＲ  Ｃｌｅａｎ−Ｕｐ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｐｒｏｍｅｇａ）で精製および脱塩した。【０４０７】
次に、精製した産物を、ファージミドＤＮＡ  ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅにライゲーションさせた。１６℃で１２時間反応させ、フェノール：クロロホルム＝１：１を等量加え、１分間ボルテックス後、遠心（１５，０００ｒｐｍ、２分）し、上清を回収した。得られたファージミドＤＮＡを一本鎖抗体遺伝子ライブラリーとして、エタノール沈殿を行った後、適当量の滅菌水で溶解させ、エレクトロポレーションに用いた。【０４０８】
（実施例２：ＬＤＬに結合する一本鎖抗体のスクリーニング）
（１．ＬＤＬの調製）
調製済みのＬＤＬを定法に従い完全酸化し（Ｓｔｅｉｎｂｒｅｃｈｅｒ、１９８４）、抗原となる酸化ＬＤＬを調製した。すなわち、１ｍｇ／ｍｌ  ＬＤＬ（ＰＢＳで透析）に最終濃度５μＭとなるようにＣｕＳＯ４を添加して、３７℃において無菌条件下で２０時間反応させた後、最終濃度が１ｍＭとなるようにＥＤＴＡを加えた。次に、ＰＢＳで透析し、濾過滅菌した後にＮａＮ３が０．０２％となるように加え、４℃で保存した。【０４０９】
（２．バイオパニング）
調製した、酸化ＬＤＬを用いてバイオパニングと呼ばれるスクリーニングを行った。スラントネック培養細胞フラスコ（２５ｍｌ、ＢＤ  Ｆａｌｃｏｎ）に１μｇ／ｍｌ酸化ＬＤＬ（ＰＢＳで希釈）５ｍｌを添加し、室温で２時間反応後、ＰＢＳ（３０ｍｌ）で洗浄した。次に、ブロッキングバッファー（０．２５％ＢＳＡを含むＰＢＳ）を添加し、室温で１時間反応後、ＰＢＳ（３０ｍｌ）で３回洗浄した。調製した一本鎖抗体提示ファージ４．５ｍｌに０．０１％アジ化ナトリウム含有ブロッキングバッファー４ｍｌを添加し、室温で１５分間反応後、スラントネック培養細胞フラスコに添加した。３７℃で２時間反応後、４０回洗浄し、Ａ６００＝０．３の大腸菌ＴＧ１株２ｍｌを添加して、３７℃で１時間振とう培養した。ＳＯＢＡＧ寒天培地に菌液１００μｌを塗布し、３０℃で１４時間培養後、１ｍｌの２ｘＹＴをプレートに加え、スプレッダーで掻き取り菌体を回収した。【０４１０】
（３．ＬＤＬ結合型クローンの選択）
ライブラリーごとにコロニーを９５個取得し、ＥＬＩＳＡを用いて酸化ＬＤＬへ結合する一本鎖抗体を有するコロニーを選択した。【０４１１】
ＥＬＩＳＡによる評価では、γ＋κからなるライブラリーでは、９４個のコロニーから調製したファージ提示型一本鎖抗体の全てが、ネガティブコントロールとして用いたＰＢＳよりも高い値を示した（図３Ａ）。そこで、ポジティブコントロールとして、使用した市販の酸化ＬＤＬモノクローナル抗体（ＬＤ１Ａ−２）が示すＡ４５０＝０．６を参考値とし、それ以上の値を示したクローン５、１２、１５、１９、３１、４０、および９６を選択し、次の評価に供した。ファージに提示されていないタンパク質部分のみで結合能を有するかを確かめるために、可溶型一本鎖抗体を調製してＥＬＩＳＡを行った。ネガティブコントロールであるクローン１９および７９のＡ４５０値以上であったクローン５、１２、１９、４０、および９６を酸化ＬＤＬ認識一本鎖として、さらなる評価対象とした（図３Ｂ）。μ＋λからなるライブラリーでは、９２個のコロニーから調製したファージ提示型一本鎖抗体の全てが、ＰＢＳよりも高い値を示した（図４Ａ）。ＰＢＳ由来の値が高いことから、Ａ４５０＝１を参考値とし、それ以上の値を示した５２クローン選択し、可溶型一本鎖抗体を調製して結合能を評価したが、陽性を示すクローンは得られなかった（図４Ｂ）。【０４１２】
γ＋κからなるライブラリーより取得した５個の一本鎖抗体のそれぞれのクローン名をγ＋κ５、γ＋κ１２、γ＋κ１９、γ＋κ４０、およびγ＋κ９６とし、各アミノ酸配列を図５に示した。【０４１３】
（実施例３：一本鎖抗体の発現）
（１．使用菌株、プラスミドＤＮＡおよびファージミドＤＮＡ）【０４１４】
【表８Ａ】
0006617110.tif 000023
【０４１５】
（２．大腸菌の培養）
培養には２×ＹＴ培地、ＬＢ培地、およびＳＯＢＡＧ培地を用い、固形培地には１．５％の寒天を添加した寒天培地を使用した。薬剤を添加する場合は、終濃度をアンピシリン１００μｇ／ｍｌ、カナマイシン１５μｇ／ｍｌ、テトラサイクリン１２．５μｇ／ｍｌ、ナリジクス酸１００μｇ／ｍｌ、およびＸ−ｇａｌ３０μｇ／ｍｌとした。またカタボライトリプレッションの目的でグルコースを添加する場合は、終濃度が５％になるよう添加した。【０４１６】
【表８Ｂ】
0006617110.tif 000024
【０４１７】
【表８Ｃ】
0006617110.tif 000025
【０４１８】
【表８Ｄ】
0006617110.tif 000026
【０４１９】
（３．大腸菌からのプラスミドＤＮＡおよびファージミドＤＮＡの調製）
少量調製の場合は、シングルコロニーを２ｍｌ  ＬＢ培地に植菌し、ＦｌｅｘｉＰｒｅｐ  ｋｉｔ（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いてプラスミドＤＮＡ、ファージミドＤＮＡを調製した。【０４２０】
大量調製の場合は、シングルコロニーを２ｍｌ  ＬＢ培地に植菌し、８時間前培養した。培養液を２５ｍｌ  ＬＢ培地に１％植菌し１４時間振とう培養後、ＱＩＡＧＥＮ  ｍｉｄｉ（ＱＩＡＧＥＮ）を用いてファージミドＤＮＡを調製した。【０４２１】
（４．アガロースゲル電気泳動）
ＤＮＡのバンドを確認する場合、泳動槽はＭｕｐｉｄ（登録商標）−３（コスモ・バイオ）を、バッファーは、１×ＴＡＥを用いて１００Ｖ、３０分間室温で泳動しエチヂウムブロマイドで染色後、ＵＶで確認した。サイズマーカーはＤＮＡ  Ｍａｓｓ  Ｌａｄｄｅｒ（ＴＯＹＯＢＯ）を用いた。【０４２２】
ＤＮＡをアガロースから回収する場合、より分離をよくするために、分離に影響を与える泳動距離および発熱について考慮した。泳動槽は、Ｍｕｐｉｄ（登録商標）−ＥＸｕ（ＡＤＶＡＮＣＥ）を、バッファーは緩衝作用がＴＡＥよりも強いＴＢＥを用い、泳動温度は４℃、電圧は５０Ｖとして４時間以上泳動し、エチヂウムブロマイドで染色後、目的のＤＮＡを含むフラグメントを切り出した。【０４２３】
（５．大腸菌の形質転換）
ＤＨ５α（ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ＢＬ２１（ＤＥ３）（Ｎｏｖａｇｅｎ）、ＨＢ２１５１（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）およびＢＬＲ（Ｎｏｖａｇｅｎ）を形質転換させる場合は、５０μｌのコンピテントセルに適当量のプラスミドＤＡＮを混合し、氷中で３０分間静置後、４２℃で４５秒間ヒートショックを与えた。さらに氷中で２分間静置し、４５０μｌのＳＯＣを加え３７℃で１時間培養後、適当な薬剤を含む寒天培地に塗布し形質転換体を得た。【０４２４】
ＴＧ１（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を形質転換する場合は、４０μｌのコンピテントセルに脱塩したＤＮＡを２５ｎｇ加え、１分間氷上に静置後、２ｍｍのキュベットに移し２．５ｋＶ、２００Ω、２５μＦの設定でエレクトロポレーションを行った。直ちに９６０μｌのＳＯＣを加え３７℃１時間培養後、ＳＯＢＡＧ寒天培地に塗布し形質転換体を得た。【０４２５】
（６．ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）
ミニプロテインＩＩ−Ｄセル（ＢＩＯＲＡＤ）を用いて行った。分子量マーカーは、タンパク質分子量マーカー「第一」・ＩＩＩ（第一化学薬品）を用いた。【０４２６】
（７．ウェスタンブロット）
ＳＤＳ−ＰＡＧＥによりタンパク質を分離後、ミニトランスブロットセル（ＢＩＯＲＡＤ）を用いてニトロセルロース膜（ＢｉｏＴｒａｃｅ（登録商標）ＮＴ）に転写した。分子量マーカーはｐｒｅｃｉｓｉｏｎ  ｐｌｕｓ  ｐｒｏｔｅｉｎＴＭ  ｓｔａｎｄａｒｄｓ（ＢＩＯＲＡＤ）を用いた。【０４２７】
検出は、ＥＣＬ  ｐｌｕｓ  Ｗｅｓｔｅｒｎ  Ｂｌｏｔｔｉｎｇ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて行った。一次抗体には抗Ｅ抗体または抗Ｈｉｓ抗体を、二次抗体にはＨＲＰ標識抗マウスＩｇＧ（Ｆｃ特異的）を用いた。【０４２８】
（８．タンパク質の定量）
可溶性タンパク質の定量は、標準タンパク質としてＢＳＡ（Ａｌｂｕｍｉｎ  ｓｔａｎｄａｒｄ、ＰＩＥＲＣＥ）を用い、ＢＣＡ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ａｓｓａｙ  Ｒｅａｇｅｎｔ  Ｋｉｔにより行った。不溶性タンパク質の定量は、ローリーの変法（Ｐｅｔｅｒｓｏｎら、Ａｎａｌ．  Ｂｉｏｃｈｅｍ．８３：６６５４−６６５９（１９７７））を用いた。【０４２９】
（実施例４：抗Ｅ抗体固定化セファロースを用いた一本鎖抗体の精製）
ＮＨＳ−ａｃｔｉｖａｔｅｄ  ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４  Ｆａｓｔ  Ｆｌｏｗ（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）のプロトコールを参考に抗Ｅ抗体をセファロースに固定化した。５００μｌのＮＨＳ−ａｃｔｉｖａｔｅｄ  ｓｅｐｈａｒｏｓｅに７．５ｍｌの氷冷１ｍＭ  ＨＣｌを加え混合した後、遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分、４℃）、氷中で５分間静置後、５０％スラリーとなるように情勢を除き洗浄した。抗Ｅ抗体溶液をｍｉｃｒｏｃｏｎ（登録商標）ＹＭ−３０（ＭＩＬＬＩＰＯＲＥ）により限外ろ過（１５，０００ｒｐｍ、２４分、４℃）し、２４０μｌの０．２Ｍ  ＮａＨＣＯ３、０．５Ｍ  ＮａＣｌ（ｐＨ８．３）を加えることによりバッファー交換を行った。精製した抗Ｅ抗体を洗浄したＮＨＳ−ａｃｔｉｖａｔｅｄ  ｓｅｐｈａｒｏｓｅと混合し、ローテーターに取り付け室温で３時間撹拌させた。次に、遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分、４℃）、氷中で、５分間静置し上清を除いた。さらに、７５０μｌの０．１Ｍ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．５）を加え、ローテーターに取り付け室温で２時間撹拌した後、遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分、４℃）、氷中で５分間静置し上清を除いた。１．５ｍｌの０．５Ｍ  ＮａＣｌを含む０．５Ｍ酢酸バッファー（ｐＨ４．５）を加え混合後、遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分、４℃）、氷中で５分間静置し上清を除いた。さらに、１．５ｍｌの０．１Ｍ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．５）を加え、遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分間、４℃）、氷中で５分間静置し上清を除いた。二つのバッファーからなる洗浄操作を３回繰り返した後に０．５ｍｌとなるようＴＢＳを加えた。【０４３０】
ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅを用いて一本鎖抗体を発現させると、ＥタグがＣ末端に付加し、ペリプラズム画分に輸送されることから、ペリプラズム画分を以下の方法によって調製した。２５ｍｌの培養液から回収した菌体を０．５ｍｌ氷冷１×ＴＥＳで再懸濁し、０．７５ｍｌ氷冷１／５×ＴＥＳを加え、ボルテックス撹拌した。氷中に３０分間静置し遠心（１５，０００ｒｐｍ、１０分）して上清をペリプラズム画分として回収した。【０４３１】
さらに、調製したペリプラズム画分へ抗Ｅ抗体固定化セファロース２０μｌを加え、ローテーターに取り付け４℃で１２時間撹拌した。スイングローターを用いて遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分間、４℃）、セファロース吸着画分と素通り画分を分離した。回収したセファロースへ１ｍｌ  ＴＢＳを加え洗浄（３，０００ｒｐｍ、５分間、４℃）する操作３回繰り返し、可溶性一本鎖抗体が結合したセファロースを回収した。【０４３２】
得られた５種類の一本鎖抗体の発現および精製を試みた。Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  Ｐｈａｇｅ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＧＥ  ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）のプロトコールに従って、ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅ−γ＋κ５、１２、１９、４０、および９６を保持する各大腸菌ＴＧ１からＭ１３ファージを溶出させた。さらに、そのファージを感染されることによって、ＴＧ１よりも効率的に一本鎖抗体を発現することが可能な大腸菌ＨＢ２１５１を形質転換させた。【０４３３】
２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｎａｌ、Ｇｌｕｃｏｓｅ）寒天培地からｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅ−γ＋κ５、１２、１９、４０、および９６を保持する各大腸菌ＨＢ２１５１のシングルコロニーを２ｍｌ  ２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｇｌｕｃｏｓｅ）に植菌して３７℃で１２時間前培養した。２ｍｌの２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｇｌｕｃｏｓｅ）に２００μｌを植菌し３０℃で１時間培養後、１ｍｌ×２本に分け、遠心（３，９００ｒｐｍ、１０分）し、菌体を回収した。一方は、１ｍｌ  ２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｇｌｕｃｏｓｅ、非誘導区）に、他方は１ｍｌ  ２×ＹＴ（Ａｍｐ、１ｍＭ  ＩＰＴＧ、誘導区）に再懸濁し、３０℃で３時間培養後、集菌（３，９００ｒｐｍ、１０分）し、上清と菌体を分離して、それぞれＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した。【０４３４】
結果：
いずれのクローンでも誘導区の上清画分にタンパク質が検出され、結果として一本鎖抗体の種類に関わらず、溶菌していることが明らかとなった。【０４３５】
低濃度のＩＰＴＧ存在下で長時間培養することで、大腸菌への負荷が低減する可能性が考えられた。そこで、同様な操作でＩＰＴＧの濃度と培養時間をそれぞれ０．０２ｍＭ、９時間、０．０５ｍＭ、９時間、および０．２ｍＭ、３時間で検討したが、全てにおいて溶菌することが明らかとなった。【０４３６】
一本鎖抗体タンパク質の発現条件を確立するため、以後、γ＋κ５に焦点を絞り実験を行った。ＨＢ２１５１はプロテアーゼを保持し、外来タンパク質である一本鎖抗体が分解されている可能性があることから、タンパク質量を確保するため２種類のプロテアーゼが欠損した大腸菌ＢＬＲを形質転換することにした。ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅ−γ＋κ５を用いてＢＬＲを形質転換し、２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｔｅｔ、Ｇｌｕｃｏｓｅ）寒天培地に塗布して３７℃で１２時間培養した。寒天培地よりシングルコロニーを２．５ｍｌ  ２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｇｌｕｃｏｓｅ）へ植菌し、３７℃で１２時間前培養した。１０ｍｌ  ２×ＹＴ（Ａｍｐ、Ｇｌｕｃｏｓｅ）に１ｍｌ植菌し３０℃で１時間培養後５ｍｌ×２本に分け菌体を回収した後、ＨＢ２１５１の時と同様に非誘導区、誘導区を設けて（培養スケールは、各５ｍｌとした）３０℃で３時間培養し、培養上清と菌体に分離した。各々をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより、分析したところクマシー染色では一本鎖抗体の分子量に相当する位置にバンドが確認できないこと、および培養上清にもタンパク質が存在することが明らかとなった（図６、ＢＬＲ誘導区菌体および上清）。これらの結果から、ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅを発現ベクターとしてγ＋κ５を発現させた菌株３種（ＴＧ１、ＨＢ２１５１、およびＢＬＲ）は全て溶菌すること、さらに、顕著なγ＋κ５の誘導発現が認められないことが明らかとなった（図６）。【０４３７】
ｐＣＡＮＴＡＢ５Ｅを発現ベクターとした場合、発現した一本鎖抗体のＣ末端にＥ−ｔａｇが付加される。抗Ｅ抗体を用いたアフィニティ精製は特異的、かつ結合力が高いため溶菌した菌体からの目的タンパク質の濃縮が可能であると考えた。そこで、まずは、抗Ｅ抗体を一次抗体として用いたウェスタンブロットにより目的のタンパク質のＢＬＲにおける生産を確認した。その結果、予想される分子量の位置にシグナルが検出され、目的タンパク質は分解されることなく存在していることが示された（図７）。次に、抗Ｅ抗体固定セファロースを用いて精製を試みたが、クマシー染色ではバンドが確認できず評価可能な量のタンパク質は回収できないと判断した（図８）。【０４３８】
（実施例５：ｐＥＴ−２２ｂ（＋）を用いた一本鎖抗体の発現）
（ｐＥＴ−２２ｂ（＋）γ＋κの構築）
十分量の一本鎖抗体タンパク質を得るために、宿主・ベクター系にｐＥＴシステムを用いた。γ＋κ５には、ｇ＋ｋ  リバースプライマー（表８）とｇ＋ｋ  ａＦＯＲプライマー（表８）を用いてＰＣＲ法にて５’側にＳａｌＩとＮｄｅＩ、３‘側にＸｈｏＩ制限酵素サイトを付加した。反応条件は、９４℃、３分間、次に９４℃、３０秒間、５５℃、３０秒間、７２℃、３０秒間のサイクルを２５サイクルとした。１．５％アガロースゲルで電気泳動後、精製してからＮｄｅＩとＸｈｏＩを用いて消化した。ｐＥＴ−２２ｂ（＋）も同様に消化しライゲーションさせ、ｐＥＴ−２２ｂ（＋）−γ＋κ５とｐＥＴ−２２ｂ（＋）−γ＋κ１９を構築した。得られたプラスミドＤＮＡを用いて大腸菌ＤＨ５αを形質転換後、２×ＹＴ（Ａｍｐ）寒天培地に塗布し、３７℃で１６時間培養した。目的の遺伝子が含まれているかコロニーＰＣＲにより確認し、陽性コロニーからプラスミドＤＮＡを調製した。さらに挿入フラグメントのＤＮＡ塩基配列を確認した。【０４３９】
【表８】
0006617110.tif 000027
【０４４０】
ｐＥＴ−２２ｂ（＋）−γ＋κ５およびｐＥＴ−２２ｂ（＋）−γ＋κ１９を用いて発現宿主であるＢＬ２１（ＤＥ３）を形質転換した。寒天培地からｐＥＴ−２２ｂ（＋）−γ＋κ５を保持するＢＬ２１（ＤＥ３）を２ｍｌ  ＬＢ（Ａｍｐ）に植菌し、３７℃で１２時間前培養した。培養液１ｍｌを１００ｍｌ  ＬＢ（Ａｍｐ）に植菌し、３７℃でＡ６００が約０．６となるように培養後、最終濃度が１ｍＭとなるようにＩＰＴＧを添加し、さらに３７℃で４時間培養した。集菌（８，０００ｒｐｍ、５分）し、１０ｍｌ  ＰＢＳで３回洗浄した。湿重量の３倍量のＰＢＳを加え、超音波破砕した。遠心（１５，０００ｒｐｍ、１５分）し、回収した上清を可溶性画分、沈殿を不溶性画分としＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した。またγ＋κ１９も同様の操作を行った。【０４４１】
γ＋κ５とγ＋κ１９はともに、予想される分子量の位置にクマシー染色で発現が確認できた（図９Ａ、誘導後）。ｐＥＴ−２２ｂ（＋）を、ＸｈｏＩ制限酵素サイトを用いてクローニングすると、Ｃ末端側にＨｉｓ  ｔａｇが付加される。ａｎｔｉ−Ｈｉｓ  ｔａｇ  ａｎｔｉｂｏｄｙを一次抗体として用いたウェスタンブロットによって誘導が確認されたタンパク質が、目的とする一本鎖抗体であることを検証した（図９Ｂ）。【０４４２】
（ニッケルアガロースを用いた、リフォールディングした一本鎖抗体の精製）
ＣＡ法（Ｍａｃｈｉｄａ、２０００）を用いて、封入体として発現した一本鎖抗体のリフォールディングを行った。封入体懸濁液２８８μｌ（タンパク質濃度２５ｍｇ／ｍｌ）を８Ｍグアニジン塩酸塩９００μｌおよび４Ｍ  ＤＴＴ  １２μｌと混合して、室温で１時間反応させた。反応産物５７０μｌを２本に分け、７０倍容量の最終濃度２ｍＭのＤＬ−シスチンを含む０．１％ＳＢ３−１４／ＰＢＳ、または０．１％ＣＴＡＢ／ＰＢＳと混合し、室温で１時間反応させた。それぞれに３％シクロアミロース１０ｍｌを加え室温で一晩反応させた。反応産物を遠心し（１２，０００ｒｐｍ、５分）、上清を回収し、リフォールディング溶液とした。【０４４３】
次に、リフォールディング溶液に１／２５容量のニッケルアガロース５０％スラリーを加え、ローテーターに取り付け、３０分間４℃で撹拌した。スイングローターを用いて遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分、４℃）、この洗浄操作を３回繰り返した後、一本鎖抗体が結合したニッケルアガロースを回収した。回収したニッケルアガロースに１Ｍイミダゾールを含むＰＢＳ５００μｌを加え、ローテーターに取り付け３０分間４℃で撹拌した。スイングローターを用いて遠心し（３，０００ｒｐｍ、５分、４℃）、イミダゾール溶出画分を回収し、精製した一本鎖抗体を取得した。しかしながら、溶出後の凝集が著しい収量の低下をもたらした。【０４４４】
（１．培養）
ｐＥＴ−２２ｂ（＋）−γ＋κ５を用いてＢＬ２１（ＤＥ３）を形質転換した。得られた形質転換体をＬＢ液体培地（５０μｇ／ｍｌ  Ａｍｐｉｃｉｌｌｉｎ）中にて３７℃で一晩培養し、新たな培地に１％になるように植菌した。３７℃で培養し、Ａ６００が、０．５〜０．６の時に終濃度１ｍＭになるようＩＰＴＧを添加後、さらに４時間培養した。培養液を６，０００×ｇで１０分遠心し、得られた菌体をリン酸バッファー（ＰＢＳ）で３回洗浄した。菌体をＰＢＳに再懸濁し、超音波破砕後１０，０００×ｇで１０分遠心し、沈殿をγ＋κ５の封入体として得た。【０４４５】
（２．一本鎖抗体のリフォールディング）
γ＋κ５の封入体湿重量５０ｍｇを１５０μｌのＰＢＳに懸濁し、８Ｍグアニジン塩酸塩溶液４５０μｌと４Ｍジチオスレイトール溶液６μｌを加えて混合し室温で１時間以上静置した。次に２ｍＭのＤＬ−シスチン（終濃度）を含む０．１％ＣＴＡＢ／ＰＢＳ溶液を４０ｍｌ加えて混合し、室温で１時間静置した。その後３％シクロアミロースを１０ｍｌ加えて混合し、室温で一晩静置した。反応溶液を１２，０００ｒｐｍで５分遠心し、上清を回収してリフォ−ルディング溶液とした。【０４４６】
（３．一本鎖抗体の精製）
溶出後の再凝集を防ぐために、透析速度および効率の条件を最適化した。リフォールディング溶液の１／２５量の５０％ニッケルアガローススラリーを加え、ローテーターで３０分間、４℃で穏やかに撹拌した。その後１，０００×ｇで５分間遠心し、ニッケルアガロースを回収した。ニッケルアガロースは当量のＰＢＳで２−３回洗浄し、２Ｍイミダゾールを含むＰＢＳを５００μｌ加えて溶出し、１Ｍイミダゾールを含むＰＢＳでさらに数回溶出した。溶出した画分を、セルロースエステル膜チューブを用いてサンプル容量の４００倍のＰＢＳで透析し、精製された一本鎖抗体を得た。得られた一本鎖抗体の純度と濃度はＳＤＳ−ＰＡＧＥにより評価した（図１０）。収量は、培養液１Ｌあたり３〜５ｍｇだった。【０４４７】
（実施例６：一本鎖抗体の検出）
（１．ダイレクトＥＬＩＳＡ）
直接ＥＬＩＳＡ法により、精製した一本鎖抗体の抗原認識活性を評価した。抗原として、ＬＤＬ、アセチル化ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬ、完全酸化ＬＤＬを用いた。ポリスチレン製９６穴マイクロウェルプレートに０．０５−１０μｇ／ｍｌの抗原溶液を１００μｌ／ｗｅｌｌ添加し４℃で一晩吸着させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、ブロッキングバッファー（０．２５％ＢＳＡ／ＰＢＳ）２００μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で２時間静置した。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄した後、２．５μｇ／ｍｌ／ＰＢＳの一本鎖抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で１時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、ブロッキングバッファーで１，０００倍に希釈した抗Ｈｉｓ−ＨＲＰ抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄した後、３，３’，５，５’−テトラメチル−ベンジジン（ＴＭＢ）を５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し発色状態を確認し、１ＮＨＣｌ５０μ／ｗｅｌｌを添加して反応を停止した。その後プレートの各ウェルの４５０ｎｍにおける吸光度を測定した（図１１）。【０４４８】
結果：
図１１が示すように、一本鎖抗体γ＋κ５は、抗原として用いたＬＤＬ、アセチル化ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬおよび完全酸化ＬＤＬの全てを認識するが、各抗原に対する特異性が異なることが明らかになった（図１２）。γ＋κ５は、酸化ＬＤＬを低濃度でＬＤＬよりも強く認識する特徴を持つと考えられる。また各抗原の検出限界は、ＬＤＬが５ｎｇ／１００μｌウェル、アセチル化ＬＤＬが１０ｎｇ／１００μｌウェル、部分酸化ＬＤＬが１０ｎｇ／１００μｌウェル、および完全酸化ＬＤＬが２０ｎｇ／１００μｌウェルであった。（図１１）。検出限界は、希釈段階の異なる測定試料の内、検出が可能であった最低濃度を検出限界として算出した。【０４４９】
（２．サンドイッチＥＬＩＳＡ）
また酸化ＬＤＬ受容体であるＬＯＸ−１のリガンド認識領域（ＣＴＬＤ１４）を用いて、サンドイッチＥＬＩＳＡ法により酸化ＬＤＬの認識能を評価し、間接ＥＬＩＳＡ法（ＣＴＬＤ１４（Ｈｉｓタグを除去したもの）と一本鎖抗体によるサンドイッチＥＬＩＳＡ）によりアセチル化ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬ、完全酸化ＬＤＬの認識評価を行った。ポリスチレン製９６穴マイクロウェルプレートに２０μｇ／ｍｌ／ＰＢＳのＣＴＬＤ１４を５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し、一晩吸着させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、ブロッキングバッファー（０．２５％ＢＳＡ／ＰＢＳ）２５０μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で２時間静置した。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、０．０５−１０μｇ／ｍｌの抗原溶液（ＬＤＬまたは酸化ＬＤＬ）を１００μｌ／ｗｅｌｌ添加して室温で２時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、２．５μｇ／ｍｌ／ＰＢＳの一本鎖抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で１時間反応させた。その後は直接法と同様にプレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で洗浄し、抗Ｈｉｓ−ＨＲＰ抗体反応の後、ＴＭＢ反応を行い、反応停止後４５０ｎｍにおける吸光度を測定した（図１３）。【０４５０】
結果：ＬＯＸ−１を用いたサンドイッチＥＬＩＳＡにおいては、ＬＤＬに対しては弱い検出シグナルを示し、他方で完全酸化ＬＤＬに対しては濃度依存的なシグナルを示した（図１３）。これは、ＬＯＸ−１との組み合わせにより、ＬＤＬおよび酸化的修飾を受けたＬＤＬが共存する場合において、酸化的修飾を受けたＬＤＬのみを認識することができることを示す。アセチル化ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬに関しても検出が可能なことが示された。【０４５１】
（実施例７：マロンジアルデヒド修飾ＬＤＬの検出システム）
次に別の変性ＬＤＬの検出が可能であるかどうかを確認するために、他の種類の変性ＬＤＬを用いて、同様の実験を行う。【０４５２】
（方法）
実施例６に準じ、対象として酸化ＬＤＬ等の代わりにマロンジアルデヒド修飾ＬＤＬを用いて同様の実験を行う。【０４５３】
（結果）
２０ｎｇ／ウェル程度のマロンジアルデヒド修飾ＬＤＬ（ＭＤＡ−ＬＤＬ）の存在を検出可能であると期待される。【０４５４】
（実施例８：ラテラルフローアッセイの原理に基づく検出系）
本実施例では、ＬＤＬをより簡便に検出するために、ラテラルフローアッセイの原理を用いた検出系を構築する（図１４〜図１６）。【０４５５】
（材料および方法）
検出試薬として、金属コロイドで標識されたＣＴＬＤ１４または一本鎖抗体を用いた。検出部に、ＣＴＬＤ１４または一本鎖抗体を塗布し、コントロール部に、ストレプトアビジン（ＣＴＬＤ１４がビオチン化されている場合）、抗Ｈｉｓ抗体（ＣＴＬＤ１４がＨｉｓタグを含む場合）を塗布したラテラルフロー用メンブレンを用いる。血清、血漿または全血などの試料をサンプルパッドに添加し、テストランの発色、またはテストライン／コントロールラインの発色の比により、試料中の変性ＬＤＬ活性を評価する。【０４５６】
（結果）
代表的に、３０分以内に目視で変性ＬＤＬの存在を検出できる。【０４５７】
（実施例９：ニワトリ抗ＬＤＬ抗体およびＬＯＸ−１をラテラルフロー形式で用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬ検出および定量システム）
次に、本実施例では、抗ＬＤＬニワトリ抗体およびＬＯＸ−１をラテラルフロー形式で用いる、酸化的修飾を受けたＬＤＬ検出および定量システムを開発する。【０４５８】
（材料および方法）
抗ＬＤＬニワトリ抗体はジャパン・ラム株式会社に依頼して製造した。詳細には以下のとおりである。抗ＬＤＬニワトリ抗体は、抗原（ＬＤＬ）０．３ｍｇ（アジュバンドＦＣＡ）２週間毎に、６回、ニワトリ皮内に接種後、力価の上昇を５回目以降にチェックし、６回目の追加免疫後に全採血したものから採取した。抗体活性測定は、抗原（ＬＤＬ）１μｇ／ｍｌを１００μｌ／ｗｅｌｌで固相し、通常のＥＬＩＳＡに準じて行った。ここでは、標識２次抗体として、ＨＲＰ標識抗ニワトリＩｇＹ（例えば、Ｐｒｏｍｅｇａ等から入手可能）を使用した。【０４５９】
検出試薬として、金属コロイドで標識されたＣＴＬＤ１４または一本鎖抗体を用いた。検出部に、ＣＴＬＤ１４または一本鎖抗体を塗布し、コントロール部に、ニ抗ＬＤＬニワトリ抗体を塗布したラテラルフロー用メンブレンを用いた。血清、血漿または全血などの試料をサンプルパッドに添加し、テストランの発色、またはテストライン／コントロールラインの発色の比により、試料中の変性ＬＤＬ活性を評価した。【０４６０】
（結果）
本実施例により、３０分以内に目視で変性ＬＤＬの存在を検出できることが示される。【０４６１】
（実施例１０：抗ＬＤＬニワトリ抗体およびＬＯＸ−１をラテラルフローアッセイ形式で用いる、脂質異常、動脈硬化、糖尿病の検診のためのシステム）
次に、本実施例では、抗ＬＤＬニワトリ抗体およびＬＯＸ−１をラテラルフローアッセイ形式で用いる、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害等の変性ＬＤＬに関連する疾患の検診のためのシステムを開発する。【０４６２】
（材料および方法）
実施例９に準じて行うことができる。【０４６３】
（結果）
本実施例により、３０分以内に目視で変性ＬＤＬの存在を検出でき、それに基づいて、脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害等の変性ＬＤＬに関連する疾患の検診を短時間で行いうることが示される。【０４６４】
（実施例１１：抗ＬＤＬニワトリ抗体およびＬＯＸ−１をラテラルフローアッセイ形式で用いる、食品摂取による予防効果の評価システム）
本実施例では、抗ＬＤＬニワトリ抗体およびＬＯＸ−１をラテラルフローアッセイ形式で用いる、食品摂取による脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害等の変性ＬＤＬに関連する疾患の予防効果の評価システムを開発する。【０４６５】
（材料および方法）
実施例９に準じて行うことができる。【０４６６】
（結果）
本実施例により、３０分以内に目視で変性ＬＤＬの存在を検出でき、それに基づいて、食品摂取による脂質異常、動脈硬化、糖尿病、虚血性心疾患、脳血管障害等の変性ＬＤＬに関連する疾患の予防効果を短時間で評価しうることが示される。【０４６７】
（比較例１；従来法でのＣＴＬＤ１４の調製）
本発明の比較として、従来法である大腸菌発現系を用いて封入体を還元条件下で変性する条件でＣＴＬＤ１４を合成した。以下にそのプロトコールを示す。【０４６８】
精密法：希釈透析法によるrefolding法を実施した。【０４６９】
（リフォールディングのための段階希釈）
（透析緩衝液  （１〜５）  ＊ａの準備）（＊ａ：透析緩衝液１−５とは下記の緩衝液１から５を示し、プレミックスとは、緩衝液１−５の各成分のうちグルタチオン以外のすべての試薬を混合した状態のものを示す。）
・グルタチオン（還元、酸化）以外すべての試薬を混合した。
・ｐＨを各々の緩衝液のために適切なものに調整した
・４℃で貯蔵した。【０４７０】
（サンプル調製）
・タンパク質濃度を１ｍｇ／ｍｌに調整した（希釈緩衝液：緩衝液Ｃ：緩衝液Ｃ：  ６Ｍ  グアニジンＨＣｌ，  ５０ｍＭ  トリス，  ｐＨ８．０）
・チューブ（透析チューブ、Ｓｐｅｃｔｒａ／Ｐｏｒ  ７，  ＲＣ，  ＭＷＣＯ  ８，０００）を使用した。各々の潮汐緩衝液（１−５）（１〜５は下記参照）は、使用前に調製した。
・必要な容積のグルタチオン（還元、酸化）溶液を解凍した。
・透析緩衝液プレミックスおよびグルタチオン溶液を混合した。
・適切な容積に合わせ、十分に混合した。【０４７１】
（透析）
・タンパク質濃度を１ｍｇ／ｍｌに調整した（透析緩衝液：緩衝液Ｃ）
・緩衝液１（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ，  ｐＨ  ８．５，  ４Ｍ  グアニジンＨＣｌ，  ０．４Ｍ  Ｌ−アルギニン，  ０．４Ｍ  ＮａＣｌ，  １０％グリセロール、  ０．５ｍＭ  酸化グルタチオン、５ｍＭ還元グルタチオン）に対して４℃で１２時間透析した。・緩衝液２（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ，  ｐＨ  ８．５，  ３Ｍ  グアニジンＨＣｌ，  ０．４Ｍ  Ｌ−アルギニン，  ０．４Ｍ  ＮａＣｌ，  １０％  Ｇｌｙｃｅｒｏｌ，  ０．５  ｍＭ酸化グルタチオン，  ５  ｍＭ還元グルタチオン）に対して４℃で１２時間透析した。
・緩衝液３（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ，  ｐＨ  ８．０，  ２Ｍ  グアニジンＨＣｌ，  ０．４Ｍ  Ｌ−アルギニン，  ０．４Ｍ  ＮａＣｌ，  １０％  Ｇｌｙｃｅｒｏｌ，  ０．５ｍＭ酸化グルタチオン，  ５ｍＭ還元グルタチオン）に対して４℃で１２時間透析した。
・緩衝液４（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ，  ｐＨ  ８．０，  １Ｍ  グアニジンＨＣｌ，  ０．４Ｍ  Ｌ−アルギニン，  ０．４Ｍ  ＮａＣｌ，  １０％  Ｇｌｙｃｅｒｏｌ，  ０．５ｍＭ酸化グルタチオン，  ５ｍＭ還元グルタチオン）  に対して４℃で１２時間透析した。（この時点で凝集し始めた）
・緩衝液５（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ，  ｐＨ  ８．０，  ０．４Ｍ  Ｌ−アルギニン，  ０．４Ｍ  ＮａＣｌ，  １０％  グリセロール，  ０．５ｍＭ酸化グルタチオン，  ５ｍＭ還元グルタチオン）に対して４℃で１２時間透析した。
・ＴＢＳ（ｐＨ７．６）（２０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ，  ｐＨ  ７．６，  １５０ｍＭ  ＮａＣｌ）に対して４℃で４８〜９６時間（３回緩衝液交換する。１回の緩衝液交換は１２時間以上間隔をあけた。）透析した。
・チューブ内のタンパク質溶液を収集した。
・これを超遠心分離（１００，０００×ｇ、６０分、４℃）で行い、リフォールドしたタンパク質を収集した。【０４７２】
（結果）
精密法による精製結果を、図１７に示す。【０４７３】
（実施例１２：遺伝子組換えカイコによる生産）
本実施例では、遺伝子組換えカイコによる生産を試みた。【０４７４】
ＣＴＬＤ１４＿ベクターをカイコ卵にマイクロインジェクションをおこない、CTLD14発現カイコを得た。さらに、中部絹糸腺で発現可能な系統と交配し、中部絹糸腺（抽出が容易で純度も高い）にCTLD14を発現する遺伝子組換えカイコを作出した。その模式図を図１８に示す。また詳細なプロトコールは以下に示す。【０４７５】
（材料および方法）
（系統作製、発現等）
ビオチン化タグ（ＢｉｏＥａｓｅＴＭ）が付加されたＣＴＬＤ１４のプラスミド構築は、ライフテクノロジーズ社のｐｃＤＮＡＴＭ６  ＢｉｏＥａｓｅＴＭＧａｔｅｗａｙ（登録商標）Ｂｉｏｔｉｎｙｌａｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍを用い、基本的にメーカーのマニュアルに従って行った。【０４７６】
ＰＣＲプライマー（ＣＴＬＤ１４−Ｆ：５’−ＡＡＴＣＴＣＣＡＡＧＡＡＡＣＡＣＴＧＡＡＧ−３’（配列番号８７）、ＣＴＬＤ１４ｓ−Ｒ：５’−ＴＣＡＣＴＧＴＧＣＴＣＴＴＡＧＧＴＴＴＧＣ−３’（配列番号８８））を用いて、ＬＯＸ−１遺伝子を含むプラスミド（ｈＬＯＸ−１／ｐＢＳ）よりＣＴＬＤ１４領域をＰＣＲ増幅した。増幅したＣＴＬＤ１４領域をｐＣＲTM８／ＧＷ（登録商標）ＴＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ（登録商標）Ｋｉｔを用いて、ｐＣＲ８／ＧＷ／ＴＯＰＯプラスミドに挿入し、大腸菌ＤＨ５αに形質転換させた。挿入したＣＴＬＤ１４はＤＮＡシーケンスにより配列を確認した。次にＬＲ反応により、ｐＣＲ８が持つＣＴＬＤ１４配列を、ｐＣＤＮＡTM６  ＢｉｏＥａｓｅTM−ＤＥＳＴに導入し、大腸菌ＤＨ５αに形質転換させた。導入したＣＴＬＤ１４  の配列をＤＮＡ、シーケンスによって確認し、ビオチン化タグ（ＢｉｏＥａｓｅTM）が付加されたＣＴＬＤ１４を持つプラスミドを構築した。【０４７７】
pBac[Ser-UAS/3xP3EGFP]（Ken-ichiro  Tatematsu,  Isao  Kobayashi,  Keiro  Uchino,  Hideki  Sezutsu,  Tetsuya  Iizuka,  Naoyuki  Yonemura,  Toshiki  Tamura,  Transgenic  Research,  19,  473  (2010)）のUAS（Upstream  Activation  Sequence）配列の下流に、ＰＣＲで増幅したフィブロインＨ鎖のシグナルペプチドをコードする断片およびＣＴＬＤ１４をコードする断片を挿入することによりＵＡＳベクターを構築した。この発現ベクターを用いて遺伝子組換えカイコを作出した。農業生物資源研究所で維持されている白眼・白卵・非休眠系統のｗ１−ｐｎｄ系統を宿主系統として用いた。得られた遺伝子組換えカイコを中部絹糸腺でＧＡＬ４を発現する系統（Ken-ichiro  Tatematsu,  Isao  Kobayashi,  Keiro  Uchino,  Hideki  Sezutsu  Tetsuya  Iizuka,  Naoyuki  Yonemura,  Toshiki  Tamura,  Transgenic  Research,  19,  473  (2010)）のUAS（Upstream  Activation  Sequence）と交配した。得られた次世代カイコのうち、ＧＡＬ４コンストラクトとＵＡＳコンストラクトを共に持つ個体を選抜マーカーにより選抜した。５齢６日目の幼虫を解剖し、中部絹糸腺を摘出した。１本当たり１ｍＬのＰＢＳ＋１％  Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００の抽出液で、４℃、２時間振とうすることにより、タンパク質を抽出した。【０４７８】
（精製）
凍結融解処理により中部絹糸腺抽出物からセリシンを除去した溶解液をＰＢＳで平衡化したＮｉ−Ａｇａｒｏｓｅに結合させ、ＰＢＳ中のイミダゾール濃度を段階的に上げることによりＣＴＬＤ１４を溶出した。２５０ｍＭ−１Ｍイミダゾール溶出画分を収集しＰＢＳで透析し、さらに精製度をあげる必要がある場合は、ＴＡＬＯＮ（Ｎｉの代わりにＣｏを使用した金属キレートアフィニティー）による精製に供した。２００−５００ｍＭイミダゾール溶出画分を収集しＰＢＳ（−）で透析後に精製ＣＴＬＤ１４とした。（図２３参照）
（糖ペプチド分析）
ＰＮＧａｓｅＦ処理、無処理の試料を１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥで泳動後、クマシー染色し、蛋白質バンドを切り出した。切り出したゲル片に含まれるカイコ型ＣＴＬＤ１４をアセトアミド化後トリプシン消化し、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦＭＳＬＣ−ＥＳＭＳで測定した。ＰＮＧａｓｅＦ処理区および無処理区のマススペクトルを比較し、Ｎ結合型糖鎖が付加されると想定される領域を含むアミノ酸配列を観測した。【０４７９】
（ダイマー形成）
精製後のＣＴＬＤ１４をβメルカプトエタノール（２ＭＥ）を含むＳＤＳ−ＰＡＧＥ用サンプルバッファー（＋）、あるいは、２ＭＥを含まないＳＤＳ−ＰＡＧＥ用サンプルバッファー（−）で処理後に、ＳＤＳ−ＰＡＧＥに供し、クマシー染色し、ダイマー形成を確認した。【０４８０】
（結果）
発現したものの解析結果を図２１および２２に示す。図２１に示されるように、タグの異なるＣＴＬＤ１４（ｂｉｏｔｉｎタグ、ｍｙｃタグ；精製用の共通タグとしてＨｉｓタグ）を発現する複数の系統を樹立した。各系統の発現を確認した。図２１に示されるように、左：クマシー染色、右：ウェスタンブロットにおいてＨｉｓタグによる検出がなされた。図中「←１」で示されるように、Ｂｉｏｔｉｎ＿ＣＴＬＤ１４（ＢｉｏＥａｓｅ  タグ付き）の明瞭な発現が観察される。また、分子量も推定分子量（蛋白質部分のみで２９ｋＤａ、糖鎖が付加されて２９ｋＤａ以上となる）に一致していた。【０４８１】
図２２に示されるように、Ｂｉｏｔｉｎ-ＣＴＬＤ１４がカイコ体内でビオチン化されているかの確認を行った。ここでは、ウェスタンブロット後、ＨＲＰ標識ストレプトアビジンと結合させ、ＨＲＰの基質と反応後に化学発光をＥＣＬで検出した。いずれの系統由来のＣＴＬＤ１４もビオチン化されていることが確認された。【０４８２】
（精製）
中部絹糸腺を１本／１ｍｌ（一頭／２ｍｌ）のＰＢＳ＋１％  Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００で抽出後、Ｎｉ−ＮＴＡ，ＴＡＬＯＮの２種類のカラム処理により容易に精製することができた（およそ４日程度以内で可能であった）。また、量的にも０．３ｍｇ／頭の供給が可能であった。（図２３）
（配列）
本実施例で製造した改良型ＣＴＬＤ１４（カイコ型糖鎖付加  ビオチン化ＣＴＬＤ１４）のアミノ酸配列および糖鎖修飾に関する情報を図１９に示す。【０４８３】
カイコの中部絹糸腺発現タンパク質のＮ結合型糖鎖の構造は、以下の通りであり、ＣＴＬＤ１４はカイコ中部絹糸腺に特異的に発現させている。中部絹糸腺に発現させた糖タンパク質の糖鎖は、中部絹糸腺以外では認められるバウチマンノース型（フコースあり）糖鎖や高マンノース型糖鎖は殆ど無く、末端がＧｌｃＮＡｃである複合型糖鎖、もしくは、オリゴマンノース型糖鎖である。糖ペプチドの解析の結果、糖鎖付加部位は、ＮＣＳとＮＳＴの２箇所のアスパラギン酸であり、２つの糖鎖の質量数の合計は約２５００であると決定された。したがって、これと同様のものが含まれると推測される。カイコの中部絹糸腺発現タンパク質のＮ結合型糖鎖の構造は、図２０に示す。【０４８４】
（糖鎖分析）
糖鎖については、上記のような分析を行い、カイコ由来ＣＴＬＤ１４の糖鎖付加の確認を行い、図２４に示されるような結果を得た。図２４に示されるように、ＰＮＧａｓｅＦ処理による糖鎖除去により分子量シフトが確認された（図２４左）。また、ＮＧａｓｅＦ処理前後での糖タンパク質染色の結果をみると、ＰＮＧａｓｅＦ処理により糖タンパク質として検出されなくなっていた（図２４中）。加えて、ＰＮＧａｓｅＦ処理前後の試料をウェスタンブロット後に抗ＬＯＸ−１抗体で検出した結果、いずれも抗ＬＯＸ−１抗体で検出された（図２４右）。【０４８５】
（糖鎖結合位置の推定）
電気泳動ゲル片に含まれるカイコ型ＣＴＬＤ１４を用いて作成した試料を、還元アルキル化後トリプシン消化し、得られたペプチドをマトリクス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析装置と液体クロマトグラフ（ＬＣ）−エレクトロスプレーイオン化キングドントラップ型（ＥＳＩ）質量分析装置で測定した。ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦＭＳでは、ＡＢ  ＳＣＩＥＸ社製４８００  ｐｌｕｓ  ＴＯＦ／ＴＯＦ  Ａｎａｌｙｚｅｒにおいて、マトリクスとしてα−シアノ−４−ヒドロキシ桂皮酸を用い、窒素ガスレーザー３３７ｎｍを試料に照射してイオン化させ、強度の大きいイオンから順にＭＳ／ＭＳスペクトルを採取した。ＬＣ−ＥＳＩＭＳでは、Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｃｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製Ｏｒｂｉｔｒａｐ  Ｖｅｒｏｓ  Ｐｒｏを用い、Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｃｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製ナノＬＣ（ＥＡＳＹ  ｎＬＣ）によりＥＡＳＹ  Ｓｐｒａｙカラム（ＰｅｐＭａｐＣ１８，３μｍ，  ７５μｍｘ１５ｃｍ，Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で分離（３００ｎＬ／ｍｉｎ，０．１％ギ酸を含むアセトニトリルの濃度を０％から１００％に３０分で上昇、１０分維持するグラジエントプログラム）したペプチドをイオン化し、それぞれのＭＳ／ＭＳスペクトルを取得した。いずれの手法においても正イオンモードでイオンを検出した。【０４８６】
ＰＮＧａｓｅ処理したもの（ＰＮＧａｓｅ−ｐｌｕｓ）としないもの（ＰＮＧａｓｅ−ｍｉｎｕｓ）についてマススペクトルならびにＭＳ／ＭＳスペクトルを比較した。【０４８７】
ＣＴＬＤ：Ｎ結合型糖鎖が付加すると想定される領域を含む２つのアミノ酸配列１０９−１３９、１５４−１８０に該当するイオンは、ＰＮＧａｓｅ−ｐｌｕｓとＰＮＧａｓｅ−ｍｉｎｕｓのどちらの試料でも観測されなかった。しかしながら、ＰＮＧａｓｅ−ｐｌｕｓにのみ、アミノ酸配列１０９−１３９、１５４−１８０に該当するイオンの質量より１大きいｍ／ｚにイオン化が観測された。これは酵素によりＮ結合型糖鎖が切断され、アスパラギンがアスパラギン酸に変化するためであり（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK56012/）、糖鎖がアスパラギンに結合している証拠と言える。【０４８８】
これらのことから、カイコ型ＣＴＬＤでは111N、155Nに糖鎖が結合している可能性が示唆された。結果を図２９〜３２に示す。図２９〜３２は、カイコ型ＣＴＬＤ１４の質量分析結果のまとめである。図２９は、カイコ型ＣＴＬＤ１４をＰＮＧaseF処理無しと処理後のカイコ型ＣＴＬＤ１４のトリプシン消化物のＬＣ―ＥＳＩＭＳの結果である。糖鎖付加が予想されるＮ−Ｘ―Ｓ／Ｔを含むペプチド断片（１，２，３）、および、鎖長の近いペプチド断片（４，５，６）に着目し、ＰＮＧaseF処理の有無によるスペクトルの比較を行ったところ、ＮＣＳ，ＮＳＴを含むペプチド１，２は、ＰＮaseF処理無しでは、ペプチドが観測されず、ＰＮＧaseF処理後にシグナルが観察されたことから、糖鎖が付加されていることが示された。一方、ペプチド３は、ＰＮＧaseF処理の有無に関わらず同一の位置にシグナルが観測され、糖鎖は付加されていないことが示された。さらに、鎖長が近いが糖鎖付加部位を保たないペプチド４−６は、ＰＮＧaseF処理の有無に関わらず同一の溶出位置にシグナルが観測され、本手法による観測と糖鎖付加の有無の決定が有効であることが確認された。図３０は、ＣＴＬＤ１４のＰＮＧaseF処理無し試料のトリプシン消化物のＬＣ−ＥＳＩＭＳの結果を示す。予想されるカイコ型糖鎖がＮＣＳ、および、ＮＳＴを含むペプチドに付加した場合のイオンが検出されるか確認したところ、ＮＣＳを含むペプチドに［化２］（２）に相当する糖鎖が付加したイオン（２）、［化５］（５）に相当する糖鎖が付加したイオン（３）が観測され、糖鎖構造として［化２］（２）、［化５］（５）が明らかになった。図３１は、付加が予想される糖鎖構造をさらに詳細に観測するために図３０の溶出位置１３．１分近傍のマススペクトルを拡大した図である。図３２は、図３１に拡大して示した１３．１分近傍のマススペクトルに観測されるイオンとペプチドの質量差をまとめた表であり、付加が予想される糖鎖構造を詳細に検討した結果である。試料調製に伴い糖の一部が外れたと思われる質量差を示すイオンも認められたが、［化１］（１）（左列、８９２．３４）、［化２］（２）（１２９８．５）、［化３］（３）または［化４］（４）（１０９５．４２）に示される糖鎖が存在することが確認された。以上から、カイコ型ＣＴＬＤ１４では、ＮＣＳ（１１１Ｎ）、ＮＳＴ（１５５Ｎ）に糖鎖が結合している可能性がある。さらに、糖鎖の質量数は〜２５００と予想されるが、図２９−３２の結果から、（トリマンノシルコア８９２）ｘ２＋（ＧｌｃＮＡｃ２０３）ｘ２＋（Ｍａｎ１６２）ｘ２または（トリマンノシルコア８９２）ｘ２＋（ＧｌｃＮＡｃ  ２０３）ｘ１＋（Ｍａｎ１６２）ｘ３の組合せが推定される。【０４８９】
（ダイマー形成）
２−メルカプトエタノール（β−ＭＥ）処理によりダイマー位置の蛋白質バンドがモノマー位置にシフトすることが確認されたＣＴＬＤ１４はカイコ体内でもダイマーを形成することが確認された（図２５）。【０４９０】
（実施例１３：カイコ型ＣＴＬＤ１４を用いた評価に向けた抗体の検討）
本実施例では、カイコ型ＣＴＬＤ１４を用いた評価系の開発を行った。この場合、CTLD14と組み合わせる抗体が必要である。【０４９１】
従来の抗体としては、抗ＭＤＡ−ＬＤＬ、抗酸化ＰＣ等があるが、特定の構造を認識する抗体にすぎず、問題点として検出可能な構造が限られるという点が難点であった。【０４９２】
他方、ＬＤＬ〜修飾ＬＤＬまで広く認識する抗体もあるが、問題点として、非特異的、反応性が低いという点があった。このような抗体としては、抗酸化ＬＤＬ、抗ＡｐｏＢ（ＬＤＬを構成する巨大蛋白質）、マウスモノクローナル抗体、ウサギポリクローナル抗体等がある。哺乳類を免役して得られる抗体の難点としては、ＬＤＬ（ＡｐｏＢ）は哺乳動物間でホモロジーが高いため、良い抗体が得られないという欠点があった。それゆえ、実験動物〜ヒトまで共通に使える抗体がなかった。【０４９３】
そこで、実施例９で製造したニワトリ抗体に着目して、今般開発を進めた。なお、ニワトリのモノクローナル抗体自体はすでに存在するが、ポリクローナル抗体はまだ開発が進んでいない。実施例でも示されるように、モノクローナル抗体では、ＬＤＬの修飾の程度によって認識強度が異なるため、その開発には限界があったため、本実施例では、ニワトリポリクローナル抗体を使用することとした。これにより、マウスからヒトまで哺乳類のＬＤＬ、酸化ＬＤＬを広く認識する抗体の製造を検討した。【０４９４】
（材料および方法）
（抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体）
本実施例で使用した抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体の作製方法は実施例９と同じである。【０４９５】
（抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体）
市販の抗体（ファーマフーズ，  ＨＵＣ２０）を購入して使用した。【０４９６】
（抗ＡｐｏＢマウスモノクローナル抗体）
市販の抗体（Ａｃｒｉｓ  ＢＭ２１４９）を購入して使用した。【０４９７】
（ＬＤＬの検出プロトコール）
検出対象として、ＬＤＬ、アセチル化（Ａｃ）ＬＤＬ、マロンジアルデヒド化（ＭＤＡ）ＬＤＬ、部分酸化（ｍｏＯｘ）ＬＤＬ、完全酸化（ｆｕＯｘ）ＬＤＬ、を用いた。ＬＤＬ（バイオメディカルテクノロジーズ，ＢＴ−９０３）とＡｃＬＤＬ（バイオメディカルテクノロジーズ，ＢＴ−９０６）は市販されているものを使用した。ＭＤＡ−ＬＤＬは、市販のＬＤＬをマロンジ化アルデヒドと反応させて調製した。酸化ＬＤＬは、市販のＬＤＬを酸化銅と反応させて調製した。３７℃で４時間反応させたものを部分酸化とし、３７℃で２０時間反応させたものを完全酸化とした。抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体は市販のもの（ファーマフーズ、ＨＵＣ２０）を用いた。二次抗体には抗ニワトリ  ＩｇＹ−ＨＲＰ  コンジュゲート（プロメガ、Ｇ１３５１）を用いた。抗ＡｐｏＢマウスモノクローナル抗体は市販のもの（Ａｃｒｉｓ、ＢＭ２１４９）を用いた。二次抗体にはHRP標識抗マウスＩｇＧ（ミリポア、ＡＰ１９２Ｐ）を用いた。【０４９８】
（ニワトリ抗ＬＤＬ抗体を用いたダイレクト検出法）
検出対象のＬＤＬ類（ＬＤＬ、アセチル化ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬ、完全酸化ＬＤＬ）をポリスチレン製９６穴マイクロウェルプレートに０．２，１，５μｇ／ｍｌの濃度で１００μｌ／ｗｅｌｌ添加し４℃で一晩吸着させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、ブロッキングバッファー（０．２５％ＢＳＡ／ＰＢＳ）２５０μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で２時間静置した。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄した後、ブロッキングバッファーで３，０００倍希釈した抗ＡｐｏＢニワトリポリクローナル抗体、またはブロッキングバッファーで８，０００倍希釈した抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、ブロッキングバッファーで２，０００倍希釈したＨＲＰ標識抗ニワトリＩｇＹ（プロメガ，Ｇ１３５１）１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄した後、３，３’，５，５’−Ｔｅｔｒａｍｅｔｈｙｌ−ｂｅｎｚｉｄｉｎｅ（ＴＭＢ）を５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し発色状態を確認し、１ＮＨＣｌ５０μ／ｗｅｌｌを添加して反応を停止した。その後プレートの各ウェルの４５０ｎｍにおける吸光度を測定した。【０４９９】
（結果）
結果を図２６に示す。左には、抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体によるＬＤＬの検出を示す。完全酸化ＬＤＬ（ｆｕＯｘＬＤＬ）、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、未変性ＬＤＬの全てを認識可能であることがわかる。図２６中では、抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体によるＬＤＬの検出を示す。完全酸化ＬＤＬ（ＦｏｘＬＤＬ）認識化能は高いが、修飾の種類によって認識強度が一定しないことがわかる。図２６右には、抗ＡｐｏＢマウスモノクローナル抗体によるＬＤＬの検出を示す。全般に認識能が低く、酸化ＬＤＬと未変性ＬＤＬの認識能に大差がないことがわかる。【０５００】
本実施例では、抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体とＣＴＬＤ１４の組合せにより、動脈硬化発症等の真の危険因子の検出系が開発可能であることが証明された。【０５０１】
ＬＤＬは哺乳動物間での相同性が高くマウスを免役した場合、優れた抗体が得にくいが、鳥類であるニワトリを免役して得られた  ニワトリポリクローナル抗体は、広く哺乳動物試料の検出に活用可能であり、ＣＴＬＤ１４との組合せにより動物実験（マウス、ラット、ウサギなど）における検出からヒトにおける検出まで広範に活用可能と思われる。【０５０２】
（実施例１４：カイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４を用いたアッセイ開発）
次に、実施例１３の結果を踏まえ、抗LDLニワトリポリクローナル抗体とＣＴＬＤ１４の組合せにより、動脈硬化発症の真の危険因子の検出系の開発を試みた。【０５０３】
本実施例では、カイコ型ＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリ抗体による酸化ＬＤＬ検出手法を実施した。比較例として、大腸菌型ＣＴＬＤ１４と、本発明の抗ＬＤＬニワトリ抗体の組み合わせと用いた。【０５０４】
（材料および方法）
大腸菌型ＣＴＬＤ１４は比較例１に記載のように製造した。【０５０５】
カイコ型ＣＴＬＤ１４は、実施例１２に記載のように製造した。【０５０６】
抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体は、実施例９のように製造した。【０５０７】
抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体は市販のもの（ファーマフーズ，  ＨＵＣ２０）を用いた。【０５０８】
（サンドイッチ法）
（材料）
ダイレクト検出法に加え、上述のように比較例１および実施例１２に記載される方法に基づき、カイコ及び大腸菌で発現・精製したＣＴＬＤ１４を用いた。【０５０９】
（方法）
（ＣＴＬＤ１４とニワトリ抗体のサンドイッチ法）
ポリスチレン製９６穴マイクロウェルプレートに２０μｇ／ｍｌ／ＰＢＳのＣＴＬＤ１４（カイコ発現、大腸菌発現）を５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し、一晩吸着させた。プレートをＰＢＳ（２００  μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、ブロッキングバッファー（０．２５％  ＢＳＡ／ＰＢＳ）２５０μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で２時間静置した。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、０．０５−８μｇ／ｍｌのＬＤＬ類（ＬＤＬ、アセチル化ＬＤＬ、部分酸化ＬＤＬ、完全酸化ＬＤＬ）を１００μｌ／ｗｅｌｌ添加して室温で２時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、ブロッキングバッファーで６，０００倍希釈した抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体、またはブロッキングバッファーで８，０００倍希釈した抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、ブロッキングバッファーで２，０００倍希釈したＨＲＰ標識抗ニワトリＩｇＹ（プロメガ，Ｇ１３５１）１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＰＢＳ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄した後ＴＭＢを５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し発色状態を確認し、１ＮＨＣｌ  ５０μｌ／ｗｅｌｌを添加して反応を停止した。その後プレートの各ウェルの４５０ｎｍにおける吸光度を測定した。【０５１０】
（結果）
大腸菌型ＣＴＬＤ１４と、本出願抗ＬＤＬニワトリ抗体の組み合わせの結果を図２７に示す。図２７左には、大腸菌型ＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体によるサンドイッチ法による検出を示す。低濃度領域（０．１μｇ／ｗｅｌｌ、溶液濃度にして１μｇ／ｍｌ以下）では、酸化的修飾を受けたＬＤＬの特異的な検出が可能であることがわかる（ｍｏＬＤＬ：部分酸化ＬＤＬに関しては、ＬＤＬとの有意差無し）。図２７右には大腸菌型ＣＴＬＤ１４と抗ａｐｏＢニワトリモノクローナル抗体によるサンドイッチ法による検出を示す。ｆｕＯｘＬＤＬ：完全酸化ＬＤＬの検出は良好であるが、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬ、ｍｏＯｘＬＤＬの認識が弱い。代表的なＬＤＬであるＭＤＡ−ＬＤＬの検出も困難であることがわかる。【０５１１】
カイコ型ＣＴＬＤ１４と、本発明の抗ＬＤＬニワトリ抗体の組み合わせの結果を図２８に示す。図２８左には、カイコ型ＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体によるサンドイッチ法による検出を示す。全ての修飾ＬＤＬの検出が可能である。（ｍｏＯｘＬＤＬ：部分酸化ＬＤＬの認識は弱い）。大腸菌型ＣＴＬＤ１４と組み合わせた場合に比べて、ＬＤＬと反応せずに修飾ＬＤＬを検出する濃度範囲が極めて広い。図２８右には遺伝子組換えカイコ型ＣＴＬＤ１４と抗ａｐｏＢニワトリモノクロによるサンドイッチ法による検出を示す。ｆｕＯｘＬＤＬ：完全酸化ＬＤＬの検出は良好であるが、ＭＤＡ−ＬＤＬ、ＡｃＬＤＬは検出が困難であることが示される。【０５１２】
また、データは示さないが、糖化ＬＤＬもまた、検出可能であると予想される。【０５１３】
（実施例１５：カイコ型糖鎖を含むＣＴＬＤ１４を用いたさらなる評価系開発）
実施例１４と同様の手法を用いて、対象として、糖化ＬＤＬを用いた実験を行う。【０５１４】
その結果、実施例１４と同様に、カイコ型ＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体を用いたサンドイッチ法により、糖化ＬＤＬもまた、検出可能であることが示されることが予想される。【０５１５】
（比較例２：ｓＲＡＧＥの大腸菌での発現）
比較対象として、従来の技術であるＥ．ｃｏｌｉ発現系でｓＲＡＧＥの発現を行った。以下の詳細を示す。【０５１６】
（方法および材料）
宿主細菌細胞としてＯｒｉｇａｍｉＢ（ＤＥ３）を用いた。目的ＲＡＧＥ遺伝子クローニングサイトとして、５’側はＮｄｅＩ，３’側にはＸｈｏＩ（ＢａｍＨＩ，ＳｍａＩ，ＨｉｎｄＩＩＩもまた使用可能）を使用する。その結果、目的タンパク質のＣ末側にビオチンリガーゼによって認識されるビオチン化アミノ酸配列が付加される。ＲＡＧＥの場合、Ｎ末側が細胞外領域でありＡＧＥの認識に必須な領域であるため、チップ化などに際してＣ末側で固定化が可能なように、Ｃ末側にビオチン化アミノ酸配列を付加した。この手順を用いて、配列番号９７のアミノ酸配列のＣ末端側にビオチン化アミノ酸配列「ＧＬＮＤＩＦＥＡＱＫＩＥＷＨＥ」（配列番号９８）をコードする核酸配列を連結し、Ｔ７プロモーターの制御下に配置したプラスミドを作製した。このプラスミドと、ビオチンリガーゼ遺伝子を発現するプラスミド（ＣｏｌＥ１系であるｐＥＴベクターと不和合性グループが異なるため同一細胞内で安定に共存しうるｐ１５Ａ系プラスミドであるｐＡＣベクターにビオチンリガーゼ遺伝子を挿入したプラスミド）の両方を用いて宿主細菌細胞を形質転換した。この形質転換した宿主細胞の培養に使用した培地は、５０μｇ／ｍｌアンピシリン、３４μｇ／ｍｌクロラムフェニコール、１５μｇ／ｍｌカナマイシン、１２．５μｇ／ｍｌテトラサイクリンを添加した、改変ＬＢ培地（０．５％ＮａＣｌ、０．５％酵母エキス、１％トリプトン）である。２５℃で一晩培養した前培養液を、５％の最終濃度になるように培地に添加し、２５℃で攪拌培養した。なお、本培養への添加量を５％以上にして、誘導開始までの培養時間を短縮することも可能である。また、前培養を３７℃で行なった場合、添加量が５％を越えると可溶性として得られる割合が減少した。培養後に、Ａ６００での吸光度が０．５〜０．７に達した段階で、１ｍＭＩＰＴＧ、５０μＭ ｄ−ｂｉｏｔｉｎ（Ｄ型［（＋）−ｃｉｓ−ヘキサヒドロ−２−オキソ−１Ｈ−チエノ−（３，４）−イミダゾール−４−吉草酸）］（いずれも最終濃度）を添加し、目的タンパク質の誘導とビオチン化を開始し、さらに１８時間攪拌培養をすることにより、目的とするタンパク質を可溶性ビオチン化タンパク質として発現させることができた。なお、培養温度３７℃では、目的タンパク質は、１００％近く不溶性となるが、培養温度を２５℃に下げることにより、発現した目的タンパク質の内、８０％程度を可溶性タンパク質として発現させることが可能であった。【０５１７】
（培養液よりのＲＡＧＥの調製）
菌体を収菌後、溶解緩衝液（プロテアーゼ阻害剤を添加した２０ｍＭ  Ｔｒｉｓ，１５０ｍＭ  ＮａＣｌ，１０ｍＭイミダゾール、ｐＨ７．６）に懸濁し、超音波破砕した後、遠心した上清を租溶解液（可溶性画分）とした。Ｎ末端に存在するＨｉｓタグを利用しＮｉアガロースカラムに結合させ、ＦＰＬＣシステムによるイミダゾール濃度勾配により溶出を行なった。可溶性ビオチン化ＲＡＧＥを含む画分を回収し溶解緩衝液にて透析後、ＡｖｉＴａｇ（Ｃ末）（「ＧＬＮＤＩＦＥＡＱＫＩＥＷＨＥ」（配列番号９８）を利用しストレプトアビジンムテインマトリックス（Ｒｏｃｈｅ社製）カラムに結合させた。３ｍＭ ｄ−ｂｉｏｔｉｎにて溶出することにより精製可溶性ビオチン化ＲＡＧＥを得た。１Ｌ当りの培養から、最終的に５ｍｇの精製可溶性ビオチン化ＲＡＧＥを得ることが可能であった。【０５１８】
（結果）
Ｅ．ｃｏｌｉ発現系でｓＲＡＧＥの発現は可能だが、非常に不安定で、１．５ヶ月程度で１００％近くが断片化し、認識能を失う。断片化部位のアミノ酸変異、認識に必須な部位のみを安定化したｍｉｎｉＲＡＧＥの作出にも行ったが、細胞外領域全長（ｓＲＡＧＥ）に比べ、発現量が低く、また認識能も劣る。（図３８）。【０５１９】
（実施例１６：糖鎖付加による安定性の向上）
そこで、本実施例では、本発明において着目した遺伝子組換えカイコによるｓＲＡＧＥの生産を試みた。手短に述べると、ｓＲＡＧＥベクターをカイコ卵にマイクロインジェクションを行い、ＲＡＧＥ発現カイコを得た。さらに、中部絹糸腺で発現可能な系統と交配し、中部絹糸腺（抽出が容易で純度も高い）にＲＡＧＥを発現する遺伝子組換えカイコを作出した。模式図を図３３に示し、以下に詳細なプロトコールを提示する。【０５２０】
（材料および方法）
（系統作製、発現等）
pBac[Ser-UAS/3xP3EGFP]（Ken-ichiro  Tatematsu，  Isao  Kobayashi，  Keiro  Uchino，  Hideki  Sezutsu，  Tetsuya  Iizuka，  Naoyuki  Yonemura，  Toshiki  Tamura,  Transgenic  Research,  19,  473  (2010)）のUAS（Upstream  Activation  Sequence）配列の下流に、ＰＣＲで増幅したフィブロインＨ鎖のシグナルペプチドをコードする断片およびｓＲＡＧＥをコードする断片を挿入することによりＵＡＳベクターを構築した。この発現ベクターを用いて遺伝子組換えカイコを作出した。農業生物資源研究所で維持されている白眼・白卵・非休眠系統のw1-pnd系統を宿主系統として用いた。得られた遺伝子組換えカイコを中部絹糸腺でＧＡＬ４を発現する系統（Ken-ichiro  Tatematsu，  Isao  Kobayashi，  Keiro  Uchino，  Hideki  Sezutsu，  Tetsuya  Iizuka，  Naoyuki  Yonemura，  Toshiki  Tamura,  Transgenic  Research,  19,  473  (2010)）のUAS（Upstream  Activation  Sequence）と交配した。得られた次世代カイコのうち、ＧＡＬ４コンストラクトとＵＡＳコンストラクトを共に持つ個体を選抜マーカーにより選抜した。５齢６日目の幼虫を解剖し、中部絹糸腺を摘出した。１本当たり1ｍＬのPBS+1%  Triton  X-100の抽出液で、4℃、2時間振とうすることにより、タンパク質を抽出した。【０５２１】
（精製）
凍結融解処理により中部絹糸腺抽出物からセリシンを除去した溶解液をＰＢＳで平衡化したＮｉ−Ａｇａｒｏｓｅに結合させ、ＰＢＳ中のイミダゾール濃度を段階的に上げることによりｓＲＡＧＥを溶出した。２５０ｍＭ  −１Ｍイミダゾール溶出画分を収集しＰＢＳで透析し、さらに精製度をあげる必要がある場合は、ＴＡＬＯＮ（Ｎｉの代わりにＣｏを使用した金属キレートアフィニティー）による精製に供した。１００ｍＭ−１Ｍイミダゾール溶出画分を収集しＰＢＳ（−）で透析後に精製ｓＲＡＧＥとした（図３６参照）。【０５２２】
（糖ペプチド分析）
ＰＮＧａｓｅＦ処理、無処理の試料を１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥで泳動後、クマシー染色し、蛋白質バンドを切り出した。切り出したゲル片に含まれるカイコ型ｓＲＡＧＥをアセトアミド化後トリプシン消化し、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦＭＳ  ＬＣ−ＥＳＭＳで測定した。ＰＮＧａｓｅＦ処理区および無処理区のマススペクトルを比較し、Ｎ結合型糖鎖が付加されると想定される領域を含むアミノ酸配列を観測した。【０５２３】
（結果）
発現したものの解析結果を図３５に示した。遺伝子組換えカイコ４系統（１−４）、および、ネガティブコントロール（中部絹糸腺ＧＡＬＡ４のみ、ＵＡＳ無し：ｓＲＡＧＥを発現していない）から中部絹糸腺を取り出し、続いて、中部絹糸腺１本に１％Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００を含むＰＢＳ  １ｍｌを添加し４℃で２時間転倒混和し調製した。左は、４〜１２％グラジエントのＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲルにより試料を電気泳動後に、クマシー・ブリリアント・ブルーによる蛋白質染色した結果である。各レーンへの試料の添加量は左側が５μｌ／ｌａｎｅ，  右側が、１０μｌ／ｌａｎｅである。Ｍ分子量マーカー（ベンチマーク：インビトロジェン）、１−４は、作出された遺伝子組換えカイコの系統番号を、Ｎｅｇａ：ネガティブコントロールを示す。右はウェスタンブロットの結果であり、４〜１２％グラジエントのＳＤＳ−ＰＡＧＥにより試料を展開後にＰＶＤＦ膜に転写し、一次抗体として抗Ｈｉｓウサギ抗体（１０００倍希釈）＋抗Ｈｉｓマウス抗体（３０００倍希釈）を用い、続いて二次抗体であるＨＲＰ標識抗ウサギＩｇＧ＆抗マウスＩｇＧ抗体（２００，０００倍希釈）と反応させ、最後にＥＣＬ  Ｐｒｉｍｅと反応させ生じる発光を検出し、ｓＲＡＧＥの発現を確認した。また、分子量も推定分子量（タンパク質部分のみで４４ｋＤａ、糖鎖が付加されて、４４ｋＤａ以上の分子量となる）に一致していた。【０５２４】
図３６に示されるように、カイコ型ｓＲＡＧＥの精製を行った。１３ｍｌ  溶解液から１．８  ｍｇ  精製タンパク質が得られた（カイコ当たりに換算すると約０．３ｍｇ／１頭）。ＴＡＬＯＮへの結合・溶出の過程は省略しても精製度９５％程度の十分に使用可能なｓＲＡＧＥが得られ、この場合、収率は３倍以上になる。（図３６）図３７に示されるように、カイコ型ｓＲＡＧＥのビオチン化を確認した。Ｗｅｓｔｅｒｎ  ｂｌｏｔ後に抗ＲＡＧＥ抗体および、ＨＲＰ標識ストレプトアビジンで確認したところ、いずれも系統由来のｓＲＡＧＥもビオチン化されていることが確認された。図３４も参照されたい。【０５２５】
（配列）
本実施例で製造したｓＲＡＧＥの配列を図３４に示す。カイコの中部絹糸腺発現タンパク質のＮ結合型糖鎖の構造は、以下の通りであり、ｓＲＡＧＥはカイコ中部絹糸腺に特異的に発現させている。中部絹糸腺に発現させた糖タンパク質の糖鎖は、中部絹糸腺以外では認められるバウチマンノース型（フコースあり）糖鎖や高マンノース型糖鎖は殆ど無く、複合型糖鎖、ハイブリッド型糖鎖もしくは、オリゴマンノース型糖鎖である。糖鎖解析の結果、糖鎖付加部位は、Ｎ−Ｉ−Ｔ、および、Ｎ−Ｇ−Ｓのアスパラギン酸であると決定された。カイコの中部絹糸腺発現タンパク質のＮ結合型糖鎖の構造の例を、図２０および図５４に示す。【０５２６】
（糖鎖分析）
糖鎖については、上記のような分析を行い、カイコ由来ｓＲＡＧＥの糖鎖付加の確認を行い、図３９に示されるような結果を得た。図３９に示されるように、ＰＮＧａｓｅＦ処理による糖鎖除去により分子量シフトが確認された（図３９左）。また、ＮＧａｓｅＦ処理前後での糖蛋白染色の結果。ＰＮＧａｓｅＦ処理により糖蛋白として検出されなくなっていた（図３９中央）。加えて、ＰＮＧａｓｅＦ処理前後の試料をｗｅｓｔｅｒｎ  ｂｌｏｔ後に抗ＲＡＧＥ抗体で検出した結果。いずれも抗ＲＡＧＥ抗体で検出された（図３９右）。【０５２７】
（糖鎖質量分析）
電気泳動ゲル片に含まれる、カイコ型糖鎖を有するｓＲＡＧＥをＰＮＧａｓｅＦ処理したものとしないものについて、還元アルキル化後トリプシン消化した。得られたペプチドをマトリクス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析装置と液体クロマトグラフ（ＬＣ）−エレクトロスプレーイオン化キングドントラップ型（ＥＳＩ）質量分析装置で測定した。【０５２８】
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦＭＳは以下を使用した。
装置：AB  SCIEX社製4800  plus  TOF/TOF  Analyzer
マトリクス：α−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸
レーザー：窒素ガスレーザー337 nm
MS/MS：強度の大きいイオンから順にMS/MSスペクトルを採取した。【０５２９】
LC-ESIMSは以下を使用した。
装置（MS)：  Thermo  Fischer  Scientific社製Orbitrap  Veros  Pro
装置（LC)：  Thermo  Fischer  Scientific社製ナノLC（EASY  nLC）
カラム：EASY  Sprayカラム（PepMapC18,  3μm,  75μmx15cm,  Thermo  Fisher  Scientific）
溶離液：300  nL/min,  Ａ）  ０．１％  ギ酸、Ｂ）０．１％ギ酸を含むアセトニトリル、Ｂの濃度を  ０％から１００％に３０分で上昇、１０分間維持するグラジエントプログラムを使用した。【０５３０】
その後、ＰＮＧａｓｅＦ処理したものとしないものについてマススペクトルを比較した。Ｎ結合型糖鎖が付加すると想定される領域を含む２つのアミノ酸配列に該当するイオンは、ＰＮＧａｓｅ処理をしない試料では観測されないか、観測されてもごくわずかであった。したがって、ｓＲＡＧＥでは２か所に糖鎖が結合していると考えられた。その後、カイコ型ｓＲＡＧＥから糖鎖を切り出しＯＤＳカラムにて分離後、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳにより、６種類の糖鎖の推定糖組成を決定した。さらに、糖組成を推定した各糖鎖のピークを、順相Ａｍｉｄｏカラムにより分離した。さらに、ＯＤＳカラムとＡｍｉｄｅカラムにより求めたＧｌｕｃｏｓｅ  ｕｎｉｔ（ＧＵ）値と分子量から、ＧＡＬＡＸＹ検索により候補糖鎖を絞り込んだ。最終的に、候補とされた糖鎖の標準品と試料を共打ちし、ＯＤＳカラムによる分離を行い、候補糖鎖と試料の一致を確認し、図５４に示すような糖鎖が結合していることが判明している。  【０５３１】
（実施例１７：図３８の実験  カイコ型糖鎖を含むｓＲＡＧＥの安定性）
次に、比較例で製造した、Ｅ．ｃｏｌｉ型のｓＲＡＧＥおよび実施例１６で製造したカイコ型糖鎖を含むｓＲＡＧＥの安定性を確認した。以下に手順を示す。【０５３２】
（材料および方法）
（材料）
精製直後のＥ．ｃｏｌｉ型、および、カイコ型ｓＲＡＧＥ、並びに、精製後４℃に４０日間保存したＥ．ｃｏｌｉ型ｓＲＡＧＥ，精製後４℃に９０日間保存したカイコ型ｓＲＡＧＥを用いた。【０５３３】
（方法）
精製直後のＥ．ｃｏｌｉ型、および、カイコ型ｓＲＡＧＥ  １０μｇ（１０μｌ）をＳＤＳ−ＰＡＧＥ用サンプルバッファー５μｌで処理し、マイナス２０℃で保管した。精製後４℃に４０日間保存したＥ．ｃｏｌｉ型ｓＲＡＧＥ，精製後４℃に９０日間保存したカイコ型ｓＲＡＧＥも同様に処理し、１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥにて試料を泳動後にクマシー染色を行った。【０５３４】
（結果）
結果を図３８に示す。カイコ型ｓＲＡＧＥの安定性が示されている。左はＥ．ｃｏｌｉ型を示し、右は本発明のカイコ型を示す。それぞれ、１日、４０日保存および１日、９０日保存を示す。カイコ型糖鎖を含むｓＲＡＧＥは非常に安定な分子であり、Ｅ．ｃｏｌｉ型が４０日で断片化するのに対して、４℃での保存で長期にわたり（出願時点で半年まで確認）完全長を維持していた。【０５３５】
この分子を用いて、認識能の維持について、以下の実施例１８で確認する。【０５３６】
（実施例１８：サンドイッチＥＬＩＳＡ様検出）
次に、本発明のｓＲＡＧＥを用いて各種ＡＧＥｓの検出が可能かどうかをサンドイッチＥＬＩＳＡを用いて確認した。以下にその手順を示す。【０５３７】
（材料および方法）
（材料）
検出対象であるＡＧＥｓは、リボース（Ｒ），フルクトース（Ｆ），グルコース（Ｇ）存在下でＢＳＡを無菌的にｐＨを一定に保ちつつ３７℃で１２週間保温することで調製した。コントロールとなるＢＳＡ（ｃｔｌＢＳＡ）は、糖非存在下で同様に反応させることで調製した。サンドイッチ様の検出システムに使用する抗体として、抗ＢＳＡマウスモノクローナル抗体（アブカム  ａｂ３７８１）を用い、二次抗体としてＨＲＰ標識抗マウスＩｇＧ抗体（メルクミリポア  ＡＰ１９２Ｐ）を用いた。【０５３８】
（方法）
ポリスチレン製９６穴マイクロウェルプレートに５μｇ／ｍｌ／ＴＢＳのｓＲＡＧＥ（カイコ型、もしくは、Ｅ．ｃｏｌｉ型）を５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し、一晩吸着させた。プレートを２００μｌ／ｗｅｌｌのＴＢＳＴ（ＴＢＳ，０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）で３回洗浄し、Ｐｒｏｔｅｉｎ  ｆｒｅｅ  ｂｌｏｃｋｉｎｇ  ｂｕｆｆｅｒ（サーモサイエンティフィック）２５０μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で２時間静置した。プレートをＴＢＳＴ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、０．０１−８μｇ／ｍｌのＡＧＥｓ類（Ｒ−ＡＧＥｓ、Ｆ−ＡＧＥｓ、Ｇ−ＡＧＥｓ、Ｃｔｌ−ＡＧＥｓ）を１００μｌ／ｗｅｌｌ添加して室温で２時間反応させた。プレートをＴＢＳＴ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、Ｐｒｏｔｅｉｎ  ｆｒｅｅ  ｂｌｏｃｋｉｎｇ  ｂｕｆｆｅｒで６，０００倍希釈した抗ＢＳＡマウスモノクローナル抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＴＢＳＴ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、Ｐｒｏｔｅｉｎ  ｆｒｅｅ  ｂｌｏｃｋｉｎｇ  ｂｕｆｆｅｒで５，０００倍希釈したＨＲＰ標識抗マウスＩｇＧ抗体１００μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応させた。プレートをＴＢＳＴ（２００μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄した後ＴＭＢを５０μｌ／ｗｅｌｌ添加し発色状態を確認し、１Ｎ  ＨＣｌ５０μ／ｗｅｌｌを添加して反応を停止した。その後プレートの各ウェルの４５０ｎｍにおける吸光度を測定した。【０５３９】
（結果）
結果を図４０に示す。左は、精製後１週間保存後のＥ．ｃｏｌｉ型ｓＲＡＧＥの認識活性を示し、右は精製後３ヶ月保存後のカイコ型ｓＲＡＧＥの認識活性を示す。Ｅ．ｃｏｌｉ型は４０日程度で断片化するため、４０日後には、ＡＧＥｓ認識能が失われ、左図で観察されるＡＧＥｓ検出は不可能になる。他方、右図は、精製後９０日後のカイコ型ｓＲＡＧＥによるＡＧＥｓ検出結果である。９０日を経過しても認識能を維持しており、精製後１週間目のＥ．ｃｏｌｉ型と変わらない検出が可能であることが確認された。このように、本発明のｓＲＡＧＥは、きわめて安定に維持することができ、かつ、感度よく検出することもできることが理解される。【０５４０】
（実施例１９：ビオチンリガーゼを共発現するカイコによるカイコ型ＣＴＬＤ１４およびカイコ型ｓＲＡＧＥの産生）
本実施例では、中部絹糸腺特異的に、ビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）を発現するカイコによるカイコ型ＣＴＬＤ１４およびカイコ型ｓＲＡＧＥの産生を試みた。【０５４１】
（材料および方法）
標的配列ＵＳＡ下流にＢｉｏＥａｓｅ  ｔａｇ  ＣＴＬＤ１４（またはＢｉｏＥａｓｅ  ｔａｇ  ｓＲＡＧＥ）を挿入したＵＳＡ−Ｂｉｏｔｉｎ  ｔａｇ  ＣＴＬＤ１４（またはＵＳＡ−Ｂｉｏｔｉｎ  ｔａｇ  ｓＲＡＧＥ）、標的配列ＵＳＡ下流にビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）を挿入したＵＳＡ−ＢｉｒＡ、ならびにＧＡＬ４を中部絹糸腺特異的に発現させるセリシン１プロモーター（Ｓｅｒ１）−ＧＡＬの３つのコンストラクトを導入した遺伝子組換えカイコを作出した。このカイコは、中部絹糸腺特異的に、Ｂｉｏｔｉｎ  ｔａｇ  ＣＴＬＤ１４（またはＢｉｏｔｉｎ  ｔａｇ  ｓＲＡＧＥ）およびＢｉｒＡを発現する。さらに、５令幼虫に１ｇ当たり２０μｇのビオチンを添加した餌を与え、ＣＴＬＤ１４またはｓＲＡＧＥのビオチン化に必要なビオチンを供給した。繭を作る直前に中部絹糸腺を摘出し、Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００／ＰＢＳ（−）によりタンパク質を抽出した（図４３を参照のこと）。【０５４２】
（ＣＴＬＤ１４およびｓＲＡＧＥの発現の確認）
図４４に、ＣＴＬＤ１４およびｓＲＡＧＥの発現をＳＤＳ−ＰＡＧＥ後のクマシー染色にて確認した結果を示す。「−」は、ＢｉｒＡを発現しない系統であり、各系統について、普通餌とビオチン餌の実験区を設け、ビオチン餌区では１ｇ当たり２０μｇのビオチンを添加した餌を与えた。繭を作る直前に中部絹糸腺を摘出し、Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００／ＰＢＳ（−）により処理した抽出液を調製しＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した。Ｌｉｎｅ  ７２は、Ｓｅｒ１−ＧＡＬ４のみを導入してあり、ＵＳＢ−ＣＴＬＤ１４（またはＵＳＢ−ｓＲＡＧＥ）を導入していないネガティブコントロールである。ｓＲＡＧＥに関しては、ｌｉｎｅ  ７２に対して、ｓＲＡＧＥを導入した系統では、ｓＲＡＧＥの分子量（約５０ｋＤａ）の位置に発現が確認された。ＣＴＬＤ１４は、ｓＲＡＧＥほど発現量が高くなかった。【０５４３】
（ビオチン化の確認）
次に、ウェスタンブロットにより各系統のビオチン化を確認した（図４５）。ＳＤＳ−ＰＡＧＥにて抽出液を展開後にＰＶＤＦ膜に転写し、ＨＲＰ標識ストレプトアビジンと反応後に、ＥＣＬによる発光により、ビオチン化を確認した。通常、シグナルは黒で得られるが、白く抜けて見えるのは発光シグナルが強すぎる（すなわち、ビオチン化が大過剰である）ためである。ネガティブコントロール（ｌｉｎｅ  ７２）ではシグナル検出できないが、（−）ＢｉｒＡのｌｉｎｅでは極めて弱いシグナルであるが、ＢｉｒＡの共発現（ｌｉｎｅ  １〜４）でシグナルが確認可能になる。分子量の大きなシグナルも同時に検出されるが、これは、ＣＴＬＤ１４のダイマーであると思われる。さらに、ビオチン餌の投与により、極めて強いシグナルが観察された。ＢｉｒＡ共発現とビオチン添加により、ビオチン化効率が劇的に向上することが確認された。【０５４４】
（ｓＲＡＧＥのビオチン化効率の確認）
ビオチンと特異的に結合するＭｕｔｅｉｎ  ｍａｔｒｉｘと抽出液とを反応させ、処理前のＬｙｓａｔｅ（Ｌ）、処理後のｆｌｏｗ  ｔｈｒｏｕｇｈ画分（Ｆ）、Ｒｅｓｉｎ  ｂｉｎｄｉｎｇ画分（Ｒ）をＳＤＳ−ＰＡＧＥに供し、クマシー染色によるタンパク質バンド（矢印がｓＲＡＧＥの位置）の濃さから、ビオチン化効率を見積もった（図４６）。ｓＲＡＧＥのビオチン化効率は６０％であると判断される（ＢｉｒＡの共発現無しでは、１％未満）。ビオチン化効率は、ｆｌｏｗ  ｔｈｒｏｕｇｈ画分（Ｆ）／Ｒｅｓｉｎ  ｂｉｎｄｉｎｇ画分（Ｒ）比により計算した。【０５４５】
（ＣＴＬＤ１４のビオチン化効率の確認）
ｌｙｓａｔｅをＴＡＬＯＮによる精製を行った（図４７左）。続いて、ＴＡＬＯＮにより精製されたＣＴＬＤ１４をＭｕｔｅｉｎ  ｍａｔｒｉｘに吸着させた後、３ｍＭｄ−Ｂｉｏｔｉｎで溶出した。（ｓＲＡＧＥでも同様の処理を行った）。ＭＵＴＥＩＮ処理後のｆｌｏｗ  ｔｈｒｏｕｇｈ画分（Ｆ）、Ｒｅｓｉｎ  ｂｉｎｄｉｎｇ画分（Ｒ）の比からビオチン化効率は、３０〜４０％と見積もられた。さらに、ＴＡＬＯＮ，ＭＵＴＥＩＮカラム処理により、カイコ1頭当たり０．０４ｍｇのビオチン化ＣＴＬＤ１４が、０．１ｍｇのビオチン化ｓＲＡＧＥが得られることが明らかとなった。右図は、得られた精製タンパク質のウェスタンブロットの結果である。ＳＤＳ−ＰＡＧＥで展開後に、ＰＶＤＦ膜に転写し、抗ＬＯＸ−１抗体（右上）、または、抗ＲＡＧＥ抗体（右下）と反応させた後、２次抗体であるＨＲＰ標識抗ウサギＩｇＧ抗体と反応させ、ＥＣＬによる化学発光により、得られたタンパク質が、ＣＴＬＤ１４、ＲＡＧＥで間違いないことを確認した。さらに、ＣＴＬＤ１４に関しては、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで安定して検出されていたダイマー位置の分子量に観察されるタンパク質がＣＴＬＤ１４のダイマーであることが確認され、カイコ型ＣＴＬＤ１４はダイマーとして安定に存在することも示された。【０５４６】
（カイコ型ＣＴＬＤ１４の安定性）
Ｅ．ｃｏｌｉ型ＣＴＬＤ１４は、脱塩処理により沈殿する、ｐＨ変化により沈殿するなど、金属コロイド修飾を困難にする特性を有している。一方、カイコ型ＣＴＬＤ１４は、ＰＢＳ（−）から塩を含まないリン酸バッファー（ＰＢ）に変換しても沈殿せずに活性を維持していた。さらに、カイコ型ＣＴＬＤ１４は、Ｅ．ｃｏｌｉ型では沈殿を生じやすいＴｒｉｓバッファーでも安定であった。また、使用可能なｐＨ範囲も７．４〜９．２と広かった。Ｅ．ｃｏｌｉ型ＣＴＬＤ１４は、Ｔｒｉｓバッファー（７．４〜９．０）では安定した活性が得られなかった。したがって、カイコ型ＣＴＬＤ１４は、塩の存在／非存在、ｐＨの範囲、バッファーの種類にかかわらず安定であり（図４８）、検出・評価系に活用する際の選択の幅が広いことが明らかになった。【０５４７】
（カイコ型ｓＲＡＧＥの安定性）
図５３に示す通り、Ｅ．ｃｏｌｉ型ｓＲＡＧＥは、１．５ヶ月以内に断片化し認識能を失うが、カイコ型は、４℃で１年近く保存しても安定であった。【０５４８】
（実施例２０：カイコ型ＣＴＬＤ１４によるヒト血漿中の酸化ＬＤＬの検出）
本実施例では、カイコ型ＣＴＬＤ１４により、ヒト血漿中の微量酸化ＬＤＬの検出が可能かどうかを検討した。【０５４９】
検出は、ＣＴＬＤ１４と抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体を用いたサンドイッチＥＬＩＳＡにより、以下の通り行った。【０５５０】
（１）ポリスチレン製９６穴マイクロウェルプレートに５０  μｇ／ｍｌ／ＰＢＳのＣＴＬＤ１４を５０  μｌ／ｗｅｌｌ添加、一晩吸着。【０５５１】
（２）プレートをＰＢＳ（２００  μｌ／ｗｅｌｌ）で３回洗浄し、ブロッキングバッファー（０．２５％  ＢＳＡ／ＰＢＳ）２５０  μｌ／ｗｅｌｌを添加し室温で２時間静置。【０５５２】
（３）プレートをＰＢＳ（２００  μｌ／ｗｅｌｌ）で３  回洗浄し、試料を１００  μｌ／ｗｅｌｌ添加し室温で２時間反応。【０５５３】
（４）プレートをＰＢＳ（２００  μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、ブロッキングバッファーで６，０００倍希釈した抗ＡｐｏＢニワトリポリクローナル抗体、またはブロッキングバッファーで８，０００倍希釈した抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体を１００  μｌ／ｗｅｌｌ添加し、室温で１時間反応。【０５５４】
（５）プレートをＰＢＳ（２００  μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄し、ブロッキングバッファーで２，０００倍希釈した抗ニワトリＩｇＹ−ＨＲＰコンジュゲート（プロメガ、Ｇ１３５１）１００  μｌ／ｗｅｌｌを添加し、室温で１時間反応。【０５５５】
（６）プレートをＰＢＳ（２００  μｌ／ｗｅｌｌ）で５回洗浄。【０５５６】
（７）ＴＭＢを５０  μｌ／ｗｅｌｌ添加し発色状態を確認し、１Ｎ  ＨＣｌ  ５０  μ／ｗｅｌｌを添加して反応を停止。【０５５７】
（８）４５０ｎｍにおける吸光度を測定。【０５５８】
検出において、健常なアジア人由来の血漿に酸化ＬＤＬを下記の濃度で添加した試料（試料１〜５）を使用した。【０５５９】
試料１：ＯｘＬＤＬ添加なし
試料２：１  ｕｇ／ｍｌ  ＯｘＬＤＬ
試料３：３  ｕｇ／ｍｌ  ＯｘＬＤＬ
試料４：６  ｕｇ／ｍｌ  ＯｘＬＤＬ
試料５：１２  μｇ／ｍｌ  ＯｘＬＤＬ
それぞれ、ＰＢＳ（−）で１／１０００に希釈した。【０５６０】
検出の結果を図４９に示す。１０００倍希釈し、検出系に供した際の試料に対する有意差から、カイコ型ＣＴＬＤ１４を活用したサンドイッチＥＬＩＳＡにより、ヒト血漿中の１ｕｇ／ｍｌないし３ｕｇ／ｍｌを検出限界とする低濃度の酸化ＬＤＬの検出が可能なことが明らかとなった。ヒト試料において、健常者の場合、大過剰のＬＤＬ（６００〜１１００μｇ／ｍｌ）に対し、酸化ＬＤＬ濃度は、ＬＤＬの０．２％程度（１．２〜２．２μｇ）であり、脂質異常、虚血性心疾患などにより、酸化ＬＤＬの比率が上昇する。本手法により、ヒト試料中の１〜３ｕｇ／ｍｌの酸化ＬＤＬの検出が可能であったことから、健常者より僅かに上昇した酸化ＬＤＬの検出・定量が可能なことが示された。【０５６１】
（実施例２１：ビオチン化ＣＴＬＤ１４を用いたラテラルフローアッセイの原理に基づくイムノクロマトによる酸化ＬＤＬ検出系）
本実施例では、ビオチン化ＣＴＬＤ１４を用いたラテラルフローアッセイの原理に基づく検出系の検討を行った（図５０）。【０５６２】
（材料および方法）
検出試薬として、白金コロイド標識ビオチン化ＣＴＬＤ１４を使用した。ハーフストリップは、ニトロセルロース膜の一方に濾紙を貼付して作製した。さらに、テストラインに抗ＡｐｏＢニワトリモノクローナル抗体、または抗ＬＤＬニワトリポリクローナル抗体を塗布し、コントロールラインにストレプトアビジンを塗布し、３７℃で２時間乾燥して常温保存した。【０５６３】
金属コロイドとして汎用されている金コロイドに加え、白金コロイド、パラジウムコロイドについても検討した。その結果、白金コロイド標識ＣＴＬＤ１４が標識ＣＴＬＤ１４の安定性、検出感度などの点から、最も優れていた。また、白金コロイド標識ＣＴＬＤ１４は４℃で数ヶ月安定であった。白金コロイドは、密集し黒色を呈するため、イムノクロマトでも黒色で検出された。【０５６４】
９６ウェルプレートを使用し、試料（酸化ＬＤＬ／ＰＢＳ（−））に直前に超音波処理で分散させた白金コロイド標識ビオチン化ＣＴＬＤ１４を添加し混合）をウェルに入れ、ハーフストリップを立て、毛管現象により展開した（図５１の中央部の写真）。１０〜２０分で反応を終了させた。テストラインのスポットは、酸化ＬＤＬが３０ｎｇでも目視可能であった。このことは、２０分以内の短時間で、３０ｎｇ／ｗｅｌｌの酸化ＬＤＬの検出が可能であることを示す。さらに、コントロールラインは、展開が正常であったことを示すと同時に、テストラインのスポット強度が試料濃度に依存して増大するのに対して、コントロールラインのスポット強度は減少しており、テストラインの比色／コントロールラインの比色である程度の定量評価も可能になことが期待される。【０５６５】
（実施例２２：糖鎖構造の同定）
本実施例では、カイコ型ｓＲＡＧＥの糖鎖構造の同定を行った。【０５６６】
カイコ型ｓＲＡＧＥから糖鎖を切り出しＯＤＳカラムにて分離後、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳにより、６種類の糖鎖の推定糖組成を決定した。糖組成を推定した各糖鎖のピークを、順相Ａｍｉｄｏカラムにより分離し、糖鎖Ｎ１、Ｎ２、Ｎ３、Ｎ４−１、Ｎ４−２、およびＮ４−３を得た（図５４）。ＯＤＳカラムとＡｍｉｄｅカラムにより求めたＧｌｕｃｏｓｅ  ｕｎｉｔ（ＧＵ）値と分子量から、ＧＡＬＡＸＹ検索により候補糖鎖を絞り込んだ。最終的に、候補とされた糖鎖の標準品と試料を共打ちし、ＯＤＳカラムによる分離を行い、候補糖鎖と試料の一致を確認し、糖鎖を同定した。【０５６７】
図５５に同定された各糖鎖の組成比、定量値、糖組成を示す。Ｎ１、Ｎ２およびＮ３のオリゴマンノース型は、それぞれ２７．５％、１０．８％および５１．４％の組成比で存在することがわかり、オリゴマンノース型が９０％以上を占めることが明らかになった。【０５６８】
（実施例２３：ビオチン化ｓＲＡＧＥによるＡＧＥｓとの相互作用解析）
（シングルサイクルカイネティックスを用いた表面プラズモン共鳴による反応速度論解析）
ビオチン化されていない場合、アミンカップリングによる固定化が一般的であるが、認識に重要なＬｙｓが修飾される可能性、固定化の過程で失活する可能性、方向性を維持した固定化は不可能などの問題により、認識能を維持できず、ＡＧＥｓを添加しても結合が確認できないことがある。図５６の左図は、アミンカップリングによりＣＭ５チップ上に固定化した場合の、カイコ型ｓＲＡＧＥとＡＧＥｓ（Ｆ−ＡＧＥ）との相互作用解析を示す。矢印で示した時点でＦ−ＡＧＥｓを添加しているが、結合（縦軸：ＲＵの増大）が弱く、解離速度も速かった。本来の結合能を維持しているのか不明であり、相互作用解析は不可能であった。一方、ビオチン化ｓＲＡＧＥのビオチンを介してストレプトアビジンチップに固定する場合、ビオチンは、Ｃ末端側の１箇所のみに導入されているため、方向性を維持したまま固定化が可能である。また、固定化は中性条件下でｓＲＡＧＥ溶液を添加するのみでｓＲＡＧＥの活性を維持したまま行える。図５６の右図に示す通り、ＡＧＥｓ添加（添加濃度は０．２５μｇ、０．５μｇ、１μｇ、２μｇ、４μｇのように徐々に上げている）により、結合−解離のサイクルが観察された。得られたセンサーグラムからＢＩＡ  ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  Ｓｏｆｔｗａｒｅにより速度論的解析を行った。その結果、カイコ型ｓＲＡＧＥ＿Ｆ−ＡＧＥｓに関して、結合速度定数：７.２５Ｅ＋０３、解離速度定数：１．６４Ｅ−０３、解離定数：２．２ｅ−７であった。一方、Ｅ．ｃoli型の場合、結合速度定数：８．６１Ｅ＋０３、解離速度定数：２．４１Ｅ−０３、解離定数：２．８ｅ−７であり、ＡＧＥｓとの相互作用においてカイコ型とＥ．ｃｏｌｉ型に大きな差は無いことが示された。さらに、この解離定数は、動物細胞上でのＲＡＧＥ＿Ｆ−ＡＧＥの解離定数とも近く、細胞上でのＲＡＧＥの認識能をカイコ型ｓＡＲＧＥも再現していることが示された。【０５６９】
（実施例２４：カイコによる一本鎖抗体の産生）
本実施例では、一本鎖抗体γ＋κ５のカイコにおける生産を行った。【０５７０】
結果を図５２に示す。一本鎖抗体γ＋κ５を遺伝子組換えカイコの中部絹糸腺に発現させた。ｍｙｃタグをＮ末に付加した系統とＣ末に付加した系統の各４クローンに関して、部絹糸腺を摘出し、Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００／ＰＢＳ（−）により処理した抽出液を調製し、２μl/レーンでＳＤＳ−ＰＡＧＥに供した。図５２の左図は、クマシー染色の結果を示す。左端のレーンがγ＋κ５を発現していないネガティブコントロールであるが、クマシー染色で明確に確認可能な量のγ＋κ５は発現している系統は確認できなかった。一方、右図は、抗Ｈｉｓ抗体で検出した結果であるが、全ての系統で目的のγ＋κ５の発現が確認された。ｍｙｃタグをＣ末に付加した系統の方が、発現量が多いことが示された。Ｈｉｓタグとｍｙｃタグを活用した精製により、可溶性のγ＋κ５が得られた。大腸菌で発現させたγ＋κ５は、全量が封入体を形成し、複雑なリフォールディングの過程を必要とし、さらに、精製物が再凝集し易い等の問題点があったが、カイコ発現系により、可溶性タンパク質として、γ＋κ５を生産することが可能となった。【０５７１】
以上のように、本発明の好ましい実施形態を用いて本発明を例示してきたが、本発明は、特許請求の範囲によってのみその範囲が解釈されるべきであることが理解される。本明細書において引用した特許、特許出願および文献は、その内容自体が具体的に本明細書に記載されているのと同様にその内容が本明細書に対する参考として援用されるべきであることが理解される。
【産業上の利用可能性】
【０５７２】
利用分野として健康産業（医療、製薬等）、食品産業などの分野が想定される。産業上の利用可能性として食品・農林水産物の動脈硬化予防効果などの評価および予防効果が期待される食品開発が意図される。
【配列表フリーテキスト】
【０５７３】
配列番号１：プラスミドｐＣＲ２．１−ＴＯＰＯに用いる配列決定用プライマーＭ１３ｆｏｒｗａｒｄ
配列番号２：プラスミドｐＣＲ２．１−ＴＯＰＯに用いる配列決定用プライマーＭ１３ｒｅｖｅｒｓｅ
配列番号３：プラスミドｐＣＡＮＴＡＢ−５Ｅに用いる配列決定用プライマーｐＣＡＮＴＡＢ５−Ｓ１
配列番号４：プラスミドｐＣＡＮＴＡＢ−５Ｅに用いる配列決定用プライマーｐＣＡＮＴＡＢ５−Ｓ６
配列番号５：プラスミドｐＥＴ−２２ｂ（＋）に用いる配列決定用プライマーＴ７ｐｒｏｍｏｔｅｒ
配列番号６：プラスミドｐＥＴ−２２ｂ（＋）に用いる配列決定用プライマーＴ７ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ
配列番号７：Ｆｉｒｓｔ−ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ合成用プライマーＨＩｇＧ（ｇａｍｍａ）
配列番号８：Ｆｉｒｓｔ−ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ合成用プライマーＨｌｇＭ（ｍｕ）
配列番号９：Ｆｉｒｓｔ−ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ合成用プライマーＨｋａｐｐａ
配列番号１０：Ｆｉｒｓｔ−ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ合成用プライマーＨｌａｍｂｄａ
配列番号１１：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶＨ１ＲＥＶ
配列番号１２：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶＨ２ＲＥＶ
配列番号１３：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶＨ３ＲＥＶ
配列番号１４：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶＨ４ＲＥＶ
配列番号１５：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶＨ５ＲＥＶ
配列番号１６：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶＨ６ＲＥＶ
配列番号１７：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪＨ１２ＦＯＲ配列番号１８：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪＨ３
配列番号１９：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪＨ４５ＦＯＲ配列番号２０：γ鎖およびμ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪＨ６  ＦＯＲ配列番号２１：κ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶΚ１ＲＥＶ
配列番号２２：κ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶΚ２ＲＥＶ
配列番号２３：κ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶΚ３ＲＥＶ
配列番号２４：κ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶΚ４ＲＥＶ
配列番号２５：κ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶΚ５ＲＥＶ
配列番号２６：κ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶΚ６ＲＥＶ
配列番号２７：κ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪΚ１ＦＯＲ
配列番号２８：κ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪΚ２ＦＯＲ
配列番号２９：κ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪΚ３ＦＯＲ
配列番号３０：κ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪΚ４ＦＯＲ
配列番号３１：κ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪΚ５ＦＯＲ
配列番号３２：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ１ＲＥＶ
配列番号３３：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ２ＲＥＶ
配列番号３４：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ３ａＲＥＶ
配列番号３５：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ３ｂＲＥＶ
配列番号３６：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ４ＲＥＶ
配列番号３７：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ５ＲＥＶ
配列番号３８：λ鎖を増幅するためのリバースプライマーＨＶλ６ＲＥＶ
配列番号３９：λ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪλ１ＦＯＲ
配列番号４０：λ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪλ２−３ＦＯＲ
配列番号４１：λ鎖を増幅するためのフォワードプライマーＨＪλ４−５ＦＯＲ
配列番号４２：γ鎖およびμ鎖にリンカー配列を付加するためのフォワードプライマーＨＪＨ１２ＦＯＲＬＫ
配列番号４３：γ鎖およびμ鎖にリンカー配列を付加するためのフォワードプライマーＨＪＨ３  ＦＯＲＬＫ
配列番号４４：γ鎖およびμ鎖にリンカー配列を付加するためのフォワードプライマーＨＪＨ４５ＦＯＲＬＫ
配列番号４５：γ鎖およびμ鎖にリンカー配列を付加するためのフォワードプライマーＨＪＨ６  ＦＯＲＬＫ
配列番号４６：κ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶΚ１ＲＥＶＬＫ
配列番号４７：κ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶΚ２ＲＥＶＬＫ
配列番号４８：κ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶΚ３ＲＥＶＬＫ
配列番号４９：κ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶΚ４ＲＥＶＬＫ
配列番号５０：κ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶΚ５ＲＥＶＬＫ
配列番号５１：κ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶΚ６ＲＥＶＬＫ
配列番号５２：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ１ＲＥＶＬＫ
配列番号５３：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ２ＲＥＶＬＫ
配列番号５４：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ３ａＲＥＶＬＫ
配列番号５５：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ３ｂＲＥＶＬＫ
配列番号５６：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ４ＲＥＶＬＫ
配列番号５７：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ５ＲＥＶＬＫ
配列番号５８：λ鎖にリンカー配列を付加するためのリバースプライマーＨＶλ６ＲＥＶＬＫ
配列番号５９：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎリバースＳｆｉＩプライマーＨＶＨ１ＲＥＶＳｆｉＩ
配列番号６０：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎリバースＳｆｉＩプライマーＨＶＨ２ＲＥＶＳｆｉＩ
配列番号６１：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎリバースＳｆｉＩプライマーＨＶＨ３ＲＥＶＳｆｉＩ
配列番号６２：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎリバースＳｆｉＩプライマーＨＶＨ４ＲＥＶＳｆｉＩ
配列番号６３：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎリバースＳｆｉＩプライマーＨＶＨ５ＲＥＶＳｆｉＩ
配列番号６４：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎリバースＳｆｉＩプライマーＨＶＨ６ＲＥＶＳｆｉＩ
配列番号６５：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪΚフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪΚ１ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号６６：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪΚフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪΚ２ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号６７：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪΚフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪΚ３ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号６８：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪΚフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪΚ４ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号６９：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪΚフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪΚ５ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号７０：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪλフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪλ１ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号７１：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪλフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪλ２−３ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号７２：制限酵素サイトを付加するためのＨｕｍａｎ  ＪλフォワードＮｏｔＩプライマーＨＪλ４−５ＦＯＲＮｏｔＩ
配列番号７３：ｇ＋ｋ  ａリバースプライマー
配列番号７４：ｇ＋ｋ  ｂリバースプライマー
配列番号７５：ｇ＋ｋ  ａフォワードプライマー
配列番号７６：一本鎖抗体γ＋κ５のアミノ酸配列
配列番号７７：一本鎖抗体γ＋κ１２のアミノ酸配列
配列番号７８：一本鎖抗体γ＋κ１９のアミノ酸配列
配列番号７９：一本鎖抗体γ＋κ４０のアミノ酸配列
配列番号８０：一本鎖抗体γ＋κ９６のアミノ酸配列
配列番号８１：ＬＯＸ−１またはＬＯＸ−１をコードする核酸配列
配列番号８２：ＬＯＸ−１またはＬＯＸ−１のアミノ酸配列
配列番号８３：ＣＴＬＤ１４をコードする核酸配列
配列番号８４：ＣＴＬＤ１４をコードするアミノ酸配列
配列番号８５：カイコ型に用いたＣＴＬＤ１４をコードする核酸配列
配列番号８６：カイコ型に用いたＣＴＬＤ１４をコードするアミノ酸配列
配列番号８７：プライマーCTLD14-F: 5’- AATCTCCAAGAAACACTGAAG -3’
配列番号８８：プライマーCTLD14s-R: 5’- TCACTGTGCTCTTAGGTTTGC -3’
配列番号８９：エンテロキナーセ認識部位（ＤＤＤＤＫ）
配列番号９０：図２９の部分配列１
配列番号９１：図２９の部分配列２
配列番号９２：図２９の部分配列３
配列番号９３：図２９の部分配列４
配列番号９４：図２９の部分配列５
配列番号９５：図２９の部分配列６
配列番号９６：本発明で使用されるｓＲＡＧＥの核酸配列
配列番号９７：本発明で使用されるｓＲＡＧＥのアミノ核酸配列
配列番号９８：ビオチン化アミノ酸配列「ＧＬＮＤＩＦＥＡＱＫＩＥＷＨＥ」
配列番号９９：<Biotin-RAGE>の核酸配列（フィブロインH鎖イントロン、シグナルペプチド、BioEASE-tag&linker & FLAGおよびRAGEを含む）
配列番号１００：<Biotin-RAGE>のアミノ酸配列
配列番号１０１：ＲＡＧＥの核酸配列
配列番号１０２：ＲＡＧＥのアミノ核酸配列
配列番号１０３：図４１下段説明の１つ目の部分配列
配列番号１０４：図４１下段説明の２つ目の部分配列
配列番号１０５：図４１下段説明の３つ目の部分配列
配列番号１０６：ビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）の核酸配列
配列番号１０７：ビオチンリガーゼ（ＢｉｒＡ）のアミノ酸配列
配列番号１０８：Ｎ末端側にＭｙｃタグが導入されているγ＋κ５のアミノ酸配列
配列番号１０９：Ｃ末端側にＭｙｃタグが導入されているγ＋κ５のアミノ酸配列
【図１】
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【図２】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【図３３】
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【図３４】
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【図３５】
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【図３６】
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【図３７】
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【図３８】
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【図３９】
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【図４０】
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【図４１】
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【図４２】
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【図４３】
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【図４４】
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【図４５】
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【図４６】
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【図４７】
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【図４８】
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【図４９】
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【図５０】
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【図５１】
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【図５２】
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【図５３】
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【図５４】
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【図５５】
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【図５６】
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【配列表】
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