(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
電気泳動用ゲル緩衝液であって、
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；
グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６＜ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに
少なくとも１種類の酸；
を含み、電気泳動用ゲル緩衝液のｐＨが５．５〜７．５の間であり、
前記双性イオンはアラニン、システイン、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される、電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項２】
電気泳動用ゲル緩衝液であって、
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；
グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６＜ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに
塩酸、酢酸、硫酸、若しくは酢酸と塩酸の組み合わせである少なくとも１種類の酸；
を含み、電気泳動用ゲル緩衝液のｐＨが５．５〜７．５の間であり、
前記双性イオンはアラニン、システイン、アスパラギン酸、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される、電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項３】
前記緩衝剤の濃度が５０ｍＭ〜３００ｍＭであり、前記グリシンの濃度が１０ｍＭ〜１０００ｍＭであり、前記少なくとも１種類の双性イオンの濃度が１０〜２００ｍＭである請求項１又は２に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項４】
前記双性イオンはアラニン、プロリン、γ−アミノ酪酸、および６−アミノカプロン酸から選択される請求項１〜３のいずれか一項に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項５】
糖、多価アルコール、および塩から選択される１または複数の添加物をさらに含む請求項１〜４のいずれか一項に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項６】
前記双性イオンはシステイン、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される少なくとも一種である請求項１に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項７】
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンを含む緩衝剤；
１０ｍＭ〜１０００ｍＭのグリシンおよび１０ｍＭ〜２００ｍＭのアラニン；
１０ｍＭ〜３００ｍＭの酢酸、硫酸及び塩酸から選択される少なくとも１種類の酸；ならびに
グリセロール；
を含み、電気泳動用ゲル緩衝液のｐＨが５．５〜７．５の間である、電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項８】
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンを含む緩衝剤；
１０ｍＭ〜１０００ｍＭのグリシンおよび１０ｍＭ〜２００ｍＭのアスパラギン酸；
１０ｍＭ〜３００ｍＭの酢酸、硫酸及び塩酸から選択される少なくとも１種類の酸；ならびに
グリセロール；
を含み、電気泳動用ゲル緩衝液のｐＨが５．５〜７．５の間である、電気泳動用ゲル緩衝液。
【請求項９】
請求項１〜８のいずれか一項に記載の電気泳動用ゲル緩衝液を用いて製造される電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。
【請求項１０】
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６＜ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに少なくとも１種類の酸；を含み、前記双性イオンはアラニン、システイン、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される、電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。
【請求項１１】
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６＜ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに塩酸、酢酸、硫酸、若しくは酢酸と塩酸の組み合わせである少なくとも１種類の酸；を含み、前記双性イオンはアラニン、システイン、アスパラギン酸、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される、電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。
【請求項１２】
プレキャストゲルである請求項１０または１１に記載の電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。
【請求項１３】
請求項１０〜１２のいずれか一項に記載の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルを用いたポリペプチド、タンパク質または核酸の分離方法。
【請求項１４】
請求項１０〜１２のいずれか一項に記載の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルを、ゲルの電極間の単位長さ当たり電圧２０Ｖ／ｃｍ以上８０Ｖ／ｃｍ以下および／またはゲルの通電面の単位断面積当たり電流４０ｍＡ／ｃｍ2以上２５０ｍＡ／ｃｍ2以下の条件下で電気泳動する、ポリペプチド、タンパク質または核酸の分離方法。
【請求項１５】
アクリルアミド；架橋剤；トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６＜ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに少なくとも１種類の酸；を含む混合物を、ｐＨが５．５〜７．５の範囲にある条件で重合開始剤の存在下で重合することを特徴とし、前記双性イオンはアラニン、システイン、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される、電気泳動用ポリアクリルアミドゲルの製造方法。
【請求項１６】
アクリルアミド；架橋剤；トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６＜ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに塩酸、酢酸、硫酸、若しくは酢酸と塩酸の組み合わせである少なくとも１種類の酸；を含む混合物を、ｐＨが５．５〜７．５の範囲にある条件で重合開始剤の存在下で重合することを特徴とし、前記双性イオンはアラニン、システイン、アスパラギン酸、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される、電気泳動用ポリアクリルアミドゲルの製造方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連分野の相互参照）
本願は、2014年7月4日に出願した特願2014-139196号明細書（その全体が参照により本明細書中に援用される）の優先権の利益を主張するものである。
（技術分野）
本発明は、電気泳動用ゲル緩衝液及び電気泳動用ポリアクリルアミドゲルに関する。
【背景技術】
【０００２】
ポリペプチド、タンパク質または核酸などの分子をポリアクリルアミドゲル電気泳動で分離する手法は、当該分子を分子量の大きさに応じて分離する基本的なシステムであり、生命科学研究に欠かせない基盤技術である。電気泳動システムは１９６０年代にOrnstein（非特許文献１）やDavis（非特許文献２）により発明され、その後Laemmliにより改良され（非特許文献３）、Laemmli法は現在最も使用されるＳＤＳ（ドデシル硫酸ナトリウム）−ポリアクリルアミドゲル電気泳動システムになった。しかしLaemmli法のゲルは分離ゲルが３７５ｍＭ  Ｔｒｉｓ／ｐＨ８．８の塩基性のゲル緩衝液から成り、ゲルの主成分であるアクリルアミドが塩基性条件下では不安定で加水分解されてしまうため長期保存には適さなかった。【０００３】
近年になってUpdykeらにより発明されたビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン（Ｂｉｓ−Ｔｒｉｓ）ゲルは中性のゲル緩衝液であり、中性の電気泳動緩衝液（Ｔｒｉｓ−ＭＯＰＳ緩衝液あるいはＴｒｉｓ−ＭＥＳ緩衝液）と組み合わせたシステムであるため、ゲルの長期保存が可能になった上に泳動中の環境を中性に保つことが可能になった（特許文献１）。一方、Laemmli法のゲル緩衝液（Ｔｒｉｓ）のｐＨをただ中性にしただけで長期保存が可能になった電気泳動ゲルも開発されたが（特許文献２）、泳動緩衝液にはＴｒｉｓ−ＨＥＰＥＳ緩衝液を使用する必要があった。このように、いずれのシステムも従来使用されてきたLaemmli法の泳動用緩衝液を用いて分子を分離することはできず、泳動中の環境が中性なため、還元処理したタンパク質が再酸化されないように還元剤を添加する必要がある。またタンパク質の移動度や分画分子量範囲に関してはLaemmli法のシステムとは一致しないため、これまで蓄積されてきたデータとの相関性を容易にとることができない。【０００４】
そこで、Laemmli法の泳動用緩衝液を使用できる弱酸性ゲルとして、トリス、グリシンと塩基解離定数ｐＫｂが８．３＜ｐＫｂ＜９．６の範囲の共存両性電解質とから成る両性電解質を含む電気泳動用ポリアクリルアミドプレキャストゲルが特許文献３に開示されており、このプレキャストゲルは、半年から１年以上ゲルの形状、泳動像に変化が無いとある。しかし、高電圧および／または高電流条件下での高速泳動分離に関する技術は開示されていない。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】米国特許第５５７８１８０号
【特許文献２】米国特許第６７３３６４７号
【特許文献３】特許第３９４２００１号
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】Ann. NY Acad. Sci. 121, 321-349（1964）
【非特許文献２】Ann. NY Acad. Sci. 121, 404-427（1964）
【非特許文献３】Nature 227, 680-685（1970）
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
実際に特許文献３に記載のゲルを使用して高電圧条件下で高速泳動を行ったところ、ゲル上に界面が生じ、バンドの形状が乱れることが判明した。高電圧および／または高電流条件下での高速泳動分離技術は、泳動中にゲルおよび泳動緩衝液が高温下にさらされるため、バンドの形状と移動度を維持した高い分離能を得ることは決して容易ではない。【０００８】
そこで本発明では、冷蔵で半年以上という長期間にわたり品質が安定に保持できると共に、電気泳動にLaemmli法の泳動緩衝液およびその他の緩衝液（Ｔｒｉｓ−ＭＯＰＳ等）を含む種々の泳動緩衝液を用いることができ、かつ高電圧および／または高電流泳動条件下でゲル上に界面を生じさせずに高い分離能が得られるゲル緩衝液および該ゲル緩衝液を使用して作製した電気泳動用ゲルを提供する。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明者らは、上記課題を解決するために鋭意検討し、グリシンを電気泳動用ゲル緩衝液の両性電解質として用い、それと組み合わせて酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオンを用いた場合に、高電圧および／または高電流条件下での高速泳動を行った場合でもゲル上に界面を生じさせることなく、高い分離能が得られることを見出した。
なお、本明細書における双性イオンの酸解離定数ｐＫａの数値はCRC handbook of Chemistry and Physics, 90th edition, internet version 2010の記載に基づいて定めている。
本発明は以下の通りである。【００１０】
［１］電気泳動用ゲル緩衝液であって、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに少なくとも１種類の酸；を含み、電気泳動用ゲル緩衝液のｐＨが５．５〜７．５の間である、電気泳動用ゲル緩衝液。【００１１】
［２］前記緩衝剤の濃度が５０ｍＭ〜３００ｍＭであり、前記グリシンの濃度が１０ｍＭ〜１０００ｍＭであり、前記少なくとも１種類の双性イオンの濃度が１０ｍＭ〜２００ｍＭである項１に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。【００１２】
［３］前記双性イオンはアラニン、アルギニン、システイン、アスパラギン酸、グルタミン酸、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸、およびＣＡＰＳから選択される項１または２に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。【００１３】
［４］糖、多価アルコール、および塩から選択される１または複数の添加物をさらに含む項１〜３のいずれか一項に記載の電気泳動用ゲル緩衝液。【００１４】
［５］項１〜４のいずれか一項に記載の電気泳動用ゲル緩衝液を用いて製造される電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。【００１５】
［６］トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに少なくとも１種類の酸；を含む、電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。【００１６】
［７］プレキャストゲルである項５または６に記載の電気泳動用ポリアクリルアミドゲル。【００１７】
［８］項５〜７のいずれか一項に記載の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルを用いたポリペプチド、タンパク質または核酸の分離方法。【００１８】
［９］アクリルアミド；架橋剤；トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに少なくとも１種類の酸；を含む混合物を、ｐＨが５．５〜７．５の範囲にある条件で重合開始剤の存在下で重合することを特徴とする電気泳動用ポリアクリルアミドゲルの製造方法。
【発明の効果】
【００１９】
本発明のゲル緩衝液および該ゲル緩衝液を使用して作製した電気泳動用ゲルは長期間安定であるため、均一で長期間安定した品質を保つプレキャストゲルを、大量に生産し保存しておくことが出来る。よって、プレキャストゲルを必要時に迅速に供給することが可能である。【００２０】
また、本発明のゲル緩衝液を用いれば、従来使用されてきたLaemmli法の泳動緩衝液を使用できるため、Laemmli法においてこれまで蓄積されてきたデータ（同様の分画分子量範囲、分子の移動度、泳動パターン）との相関性もとれるため、データの信頼性が向上する。また、Laemmli法以外の泳動緩衝液をも使用できるため、汎用性にも優れている。【００２１】
さらには、本発明のゲル緩衝液を用いて作成されたポリアクリルアミドゲルは、高電圧および／または高電流条件下でも、電気泳動のバンドの形状および／またはパターンが乱れず、ゲル上に界面を生じさせずに高い分離能が得られる。
【図面の簡単な説明】
【００２２】
【図１】酸解離定数が異なる双性イオン含有ゲルの電気泳動パターンを示す。Ａ：Laemmli法に準拠したゲル、Ｂ：双性イオン不含ゲル、Ｃ：セリン含有ゲル、Ｄ：タウリン含有ゲル、Ｅ：アラニン含有ゲル、Ｆ：プロリン含有ゲル、Ｇ：６−アミノカプロン酸含有ゲル。ｃ：ニワトリ筋肉抽出液、ｐ：ヒト血漿サンプル、ｍ：分子量マーカー。矢印：界面を示す。
【図２】ｐＫａ＜９．６の双性イオン含有ゲルを使用した電気泳動で生じるゲル上の界面を示す。Ｃ′：セリン含有ゲル、Ｄ′：タウリン含有ゲル、Ｅ′：アラニン含有ゲル。四角（破線）：Ｃ′及びＤ′では界面を示す。Ｅ′には界面がない。
【図３】１５０Ｖ、３００Ｖ、５００Ｖの定電圧条件で泳動した電気泳動パターンを示す。Ａは１５０Ｖで８０分間、Ｂは３００Ｖで３０分間、Ｃは５００Ｖで１５分間通電。ｃ：ニワトリ筋肉抽出液、ｍ：分子量マーカー、ｐ：ヒト血漿サンプル。
【発明を実施するための形態】
【００２３】
以下、本発明の電気泳動用ゲル緩衝液の組成および使用方法、ならびにかかる電気泳動用ゲル緩衝液を用いて製造される電気泳動用ポリアクリルアミドゲルの組成および使用方法について、その好ましい態様を説明する。
【００２４】
本発明の電気泳動用ゲル緩衝液は、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、  ビス（２−ヒドロキシエチル）イミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン、モノエタノールアミン、ジエタノールアミン、及びトリエタノールアミンから選択される緩衝剤；グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン；ならびに少なくとも１種類の酸；を含み、電気泳動用ゲル緩衝液のｐＨが５．５〜７．５の間である。
【００２５】
緩衝剤としてはトリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンが好ましい。トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンの濃度はゲル緩衝液中で通常５０ｍＭ〜３００ｍＭの間であれば良く、好ましくは７０ｍＭ〜１５０ｍＭ、より好ましくは８０ｍＭ〜１００ｍＭの間である。ゲル緩衝液に含有されるトリス濃度が高いと低分子領域が検出できなくなり、電流が多くなるため泳動中のゲルが高温になり、バンドの形状が乱れる結果となる。
【００２６】
グリシンと酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオンとは、いずれも両性電解質である。両性電解質は、分子内に酸性の官能基と塩基性の官能基を有するものであり、ｐＨ＝ｐＫａ値では官能基が解離して正と負の荷電量が等しくなり電気的に中性になる。またｐＫａ値より低いｐＨでは酸性の官能基が正に荷電して陽イオンとして、ｐＫａ値より高いｐＨでは塩基性の官能基が負に荷電して陰イオンとして挙動する双性イオンである。通電開始後、電気泳動ゲル内に含まれる酸が電離して陽極側に移動し、ゲルから泳動緩衝液に抜けるとゲルのｐＨが高くなる。すると、両性電解質は自身のｐＫａ値より高いｐＨでは負に荷電するため陽極へ移動を開始する。ｐＫａ値が低い両性電解質ほど、早く陽極側への移動を開始する。本発明のゲル内に含有されるグリシンのｐＫａ値は９．６であるため、共存する双性イオンのｐＫａ値が９．６よりも大きければ、グリシンよりも遅れて陽極側に移動するようになり、ゲル内の電位勾配が平衡に達することもなく界面を生じない電気泳動が可能になると考えられる。
【００２７】
グリシンの濃度はゲル緩衝液中で通常１０ｍＭ〜１０００ｍＭの間であれば良く、好ましくは１００ｍＭ〜５００ｍＭ、より好ましくは１８０ｍＭ〜３００ｍＭの間である。ゲル緩衝液に含有されるグリシン濃度が極端に低いと分画範囲が狭くなり、高分子量領域の分離は良くなるが、低分子量領域の分離が悪くなる結果となる。グリシンの濃度はモル比でゲル緩衝液中の両性電解質のうちの１０％以上、好ましくは５０％以上、より好ましくは７０％以上、特に好ましくは８０％以上を占める。
【００２８】
少なくとも１種類の双性イオンは酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である化合物及びそれらの誘導体であればよく、具体的には、アラニン、アルギニン、システイン、アスパラギン酸、グルタミン酸、プロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、γ−アミノ酪酸、２−アミノイソ酪酸、６−アミノカプロン酸などのアミノ酸、ＣＡＰＳ（３−（シクロヘキシルアミノ）−１−プロパンスルホン酸）、ならびにそれらの組み合わせなどが挙げられるがこれらに限定されない。少なくとも１種類の双性イオンの濃度はゲル緩衝液中で通常１０ｍＭ〜２００ｍＭ、好ましくは２０ｍＭ〜１００ｍＭ、より好ましくは２０ｍＭ〜５０ｍＭの間である。本発明によれば、双性イオンの酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である場合に、高電圧および／または高電流条件下での高速泳動による分離において、ゲル上に両性電解質に起因する界面を生じさせずに高い分離能が得られる。双性イオンの酸解離定数ｐＫａは好ましくは９．６＜ｐＫａ＜１１である。
【００２９】
本発明のゲル緩衝液に含まれる少なくとも１種類の酸は、ゲル緩衝液のｐＨを弱酸性から中性領域に保つと同時にバンドの形状をシャープにし、泳動速度のコントロールおよびバンドの分離を良くする働きがある。酸にはクエン酸、グリコール酸、マレイン酸、リン酸、酢酸、ホウ酸などの弱酸や、塩酸、硫酸、硝酸などの強酸が挙げられるが、これらに限定されない。１種または２種以上の弱酸と弱酸、弱酸と強酸および強酸と強酸の組み合わせでもよい。特に酢酸、硫酸、塩酸が好ましく、酢酸と塩酸の組合せが最も好ましい。また、少なくとも１種類の酸は上記緩衝剤の塩として添加されてもよい。酸はゲル緩衝液のｐＨ調製のために使用されるため、濃度は特に限定されないが、ゲル緩衝液中で通常１０ｍＭ〜３００ｍＭである。共存する濃度は、例えば酢酸が１０ｍＭ〜５０ｍＭで塩酸が１０ｍＭ〜１００ｍＭの範囲内であることが好ましい。
【００３０】
ゲル緩衝液を酸で中和した際のｐＨは５．５〜７．５の範囲内であればよく、好ましくはｐＨ５．５〜７．０、より好ましくはｐＨ６．０〜６．５の範囲内に合わせる。ｐＨ７ ．５よりも高い場合、ポリアクリルアミドゲルの加水分解が進行し易くなり、保存期限を長くのばすことが出来ない。ｐＨ５．５より低い場合、ポリアクリルアミドゲルの加水分解は進行しにくいが、分子の泳動像が不鮮明となる。ｐＨを５．５〜７．５にすることにより、アクリルアミドの加水分解速度が減少し、冷蔵で半年以上、特には１年以上の長期間ゲルの性能および形状は安定である。
【００３１】
また、緩衝剤と少なくとも１種類の酸の含有量比は、重量比で、好ましくは１５：１〜１：３である。グリシンおよび９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオンの総和と少なくとも１種類の酸の含有量比は、重量比で、好ましくは２５：１〜２．５：１である。
【００３２】
本発明のゲル緩衝液は、糖（例：スクロース、グルコース、ガラクトース、フルクトース、ソルビトール、トレハロース、デキストラン）、多価アルコール（例：グリセロール、エチレングリコール、プロピレングリコール）、有機塩および無機塩を含む塩（例：塩化ナトリウム、硫酸ナトリウム、リン酸ナトリウム、塩化カリウム、及びリン酸カリウム、クエン酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、硫酸マグネシウム、塩化カルシウム、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム）、等の１または複数の添加物をさらに含んでもよい。
【００３３】
本発明には、上記の本発明の電気泳動用ゲル緩衝液を用いて作製される電気泳動用ポリアクリルアミドゲルも包含される。電気泳動用ポリアクリルアミドゲルには、成形済みゲルの形でユーザーに提供されるプレキャストゲルが含まれる。
【００３４】
かかる電気泳動用ポリアクリルアミドゲルは、上記緩衝剤、グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン、ならびに少なくとも１種類の酸を含む。
【００３５】
本発明の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルの製造方法は、本発明のゲル緩衝液を用いて、従来公知の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルの製造方法に従って製造することができる。
【００３６】
一つの実施形態において、電気泳動用ポリアクリルアミドゲルは、アクリルアミド、架橋剤、緩衝剤、グリシンおよび酸解離定数ｐＫａが９．６≦ｐＫａ≦１１である少なくとも１種類の双性イオン、ならびに少なくとも１種類の酸を含む混合物を、ｐＨが５．５〜７．５の範囲にある条件で重合開始剤の存在下で重合することにより製造される。
【００３７】
架橋剤は、アクリルアミドの架橋を目的として添加されるが、例えばＮ ， Ｎ ' − メチレンビスアクリルアミド（ＢＩＳ）、Ｎ，Ｎ '− アリル酒石酸アミド（ＤＡＴＤ）、ジヒロドキシエチレン−ビスアクリルアミド（ＤＨＥＢＡ)等の水溶性ジビニル化合物を使用することができる。
【００３８】
緩衝剤、グリシンおよび少なくとも１種類の双性イオン、ならびに少なくとも１種類の酸については上述した電気泳動用ゲル緩衝液の説明の通りである。
【００３９】
ゲルを重合する際の触媒である重合開始剤には、過硫酸アンモニウム（ＡＰＳ）や過硫酸カリウム(ＫＰＳ)などの酸化剤とＮ，Ｎ，Ｎ'，Ｎ'−テトラメチルエチレンジアミン（ＴＥＭＥＤ）などの還元剤が併用できるが、これらに限定されない。また、重合開始剤による重合とともにリボフラビンなどを使用した光重合を行っても良い。酸化剤及び還元剤は重合される全モノマーに対し、通常０．０５％〜５％（重量／ 容量）が使用される。
【００４０】
なお、上記混合物は、ゲルに弾力性や強度を持たせることを目的として添加される担体である水溶性ポリマーを含んでもよく、そのような水溶性ポリマーには例えばアガロースやポリビニルアルコール、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、ポリメチルビニルエーテル等が含まれる。
【００４１】
ゲルを作製する際の支持体の種類は、特に限定されない。ガラス、プラスチック、セラミックなどが挙げられる。ゲルを作製する支持体としては様々な種類のゲル作製用プレートが市販されており、材質および表面の化学修飾は多様である。最適なゲル溶液の組成はしばしばゲル作製用プレートの種類により異なるが、本発明のゲル緩衝液は、いずれのゲル作製用プレートにおいても使用可能で、汎用性が高いものである。
【００４２】
泳動用緩衝液はアミン緩衝剤と両性電解質の組合せから成り、そこに界面活性剤が含有されていても良い。Laemmli法のトリス−グリシン−ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）緩衝液のほかに、トリス、トリエタノールアミン、トリシン、３−モルホリノプロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、２−モルホリノエタンスルホン酸（ＭＥＳ）、Ｎ−（２−アセトアミド）−２−アミノエタンスルホン酸（ＡＣＥＳ） 、２−ヒドロキシ−３−モルホリノプロパンスルホン酸（ＭＯＰＳＯ） 、Ｎ−〔トリス（ヒドロキシメチル）メチル〕−２−アミノエタンスルホン酸（ＴＥＳ）、２−〔４−（２−ヒドロキシエチル）−１−ピペラジニル〕エタンスルホン酸（ＨＥＰＥＳ）、２−ヒドロキシ−Ｎ−トリス（ヒドロキシメチル）メチル−３−アミノプロパンスルホン酸（ＴＡＰＳＯ）、酢酸、ホウ酸およびこれらの組合せを含む緩衝液、ならびにこれらに界面活性剤がさらに添加された緩衝液などが使用できるがこれらに限定されない。泳動用緩衝液を構成する両性電解質としては、グリシンや上記の双性イオンを初めとして、公知の両性電解質を用いることが可能である。
【００４３】
本発明には、上記の本発明の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルを用いたポリペプチド、タンパク質または核酸の分離方法も包含される。本明細書では、２個以上５０個以下のアミノ酸が結合したものをポリペプチドと称し、５１個以上のアミノ酸が結合したものをタンパク質と称する。核酸にはＤＮＡおよびＲＮＡが含まれる。
【００４４】
本発明の電気泳動用ポリアクリルアミドゲルは長期保存が可能であり、またポリペプチド、タンパク質または核酸の分離に適している。また、高電圧および／または高電流条件下で行う電気泳動では、従来よりも高速で分子が移動するが、この場合でも電気泳動のバンドの形状および／またはパターンが乱れず、ゲル上に界面を生じさせずに高い分離能が得られる。なお、「高電圧条件」とは、ゲルの電極間の単位長さあたり、電気泳動の電圧が２０Ｖ／ｃｍ以上であることを指す。電圧の上限は特に限定されないが、通常８０Ｖ／ｃｍ以下である。「高電流条件」とは、ゲルの通電面の単位断面積当たり、電気泳動の電流が４０ｍＡ／ｃｍ2以上であることを指す。電流の上限は特に限定されないが、通常２５０ｍＡ／ｃｍ2以下である。
【００４５】
以下に実施例を挙げて本発明をより具体的に説明するが、本発明はこれらに限定されない。
【実施例】
【００４６】
実施例１
酸解離定数 ｐＫａがタンパク質の移動度や電気泳動パターンに与える影響を調べるために、ｐＫａが９〜１１の双性イオンを含有する電気泳動用ゲルを作製して電気泳動を行い、Laemmli法のゲルと比較した。【００４７】
分離ゲルは表１に示したゲル緩衝液とアクリルアミドとビス−アクリルアミド（１０％Ｔ／３％Ｃ、Ｔ＝アクリルアミドとＮ ， Ｎ ' − メチレンビスアクリルアミド（ＢＩＳ）の質量の合計％、Ｃ＝アクリルアミドとＢＩＳの合計に対するＢＩＳの割合、以下同じ）とから成り、０．０８％ＡＰＳおよび０．０３％ＴＥＭＥＤの添加により重合を開始して作製した。濃縮ゲルは表１に示したゲル緩衝液とアクリルアミドとビス−アクリルアミド（４．５％Ｔ／３％Ｃ）から成り、０．０８％ＡＰＳおよび０．０３％ＴＥＭＥＤの添加により重合させて作製した。また泳動用緩衝液は２５ｍＭ トリス、１９２ｍＭ  グリシン、０．１％ＳＤＳ（Laemmli法に準拠）を使用した。電気泳動はアトー株式会社製の電気泳動装置（ＡＥ６５３０）を使用し、３００Ｖの定電圧で３０〜３５分間通電して行った（ゲルの電極間の単位長さあたり、電気泳動の電圧が３４Ｖ／ｃｍ、ゲルの通電面の単位断面積当たり、電気泳動の電流が４０〜７５ｍＡ／ｃｍ2に相当）。【００４８】
タンパク質サンプルはＥｚＬａｂｅｌ  ＦｌｕｏｒｏＮｅｏ（アトー株式会社、ＷＳＥ−７０１０）で処理し、蛍光ラベルしたタンパク質と未ラベルのタンパク質を作製した。電気泳動後のゲルは青色ＬＥＤ で励起した蛍光画像を取得した後に、ＥｚＳｔａｉｎ  ＡＱＵＡ（アトー株式会社、ＡＥ−１３４０）で染色した。染色後のゲルはスキャナーで画像を取り込んだ後にＣＳ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（アトー株式会社）で解析した。相対移動度Ｒｆ (％）は（分離ゲル上端から各バンド位置までの距離)／(分離ゲル上端から泳動先端までの距離)×１００で計算した。【００４９】
電気泳動した結果を図１に、また分子量マーカーのタンパク質の相対移動度(％）を表２に示す。図１ＡからＤはコントロールとしてのLaemmli法のゲル（Ａ）、双性イオンを含有しないトリスグリシンゲル（Ｂ）、ｐＫａが９．６未満のセリン（ｐＫａ：９．１５）含有ゲル（Ｃ）、およびタウリン（ｐＫａ：９．０６）含有ゲル（Ｄ）の結果を示している。（Ｅ）から（Ｇ）はｐＫａが９．６〜１１の双性イオン含有ゲルであり、それぞれ（Ｅ）はアラニン（ｐＫａ：９．６）、（Ｆ）はプロリン（ｐＫａ：１０．６）、（Ｇ）は６−アミノカプロン酸（ｐＫａ：１０．８）を３０ｍＭの濃度で含有したゲルの泳動結果である。【００５０】
またサンプルはニワトリ筋肉抽出液（ｃ）、ヒト血漿（ｐ）、および分子量マーカー（ｍ）（ニワトリ筋由来ミオシン：２２０ｋＤａ、大腸菌由来β−ガラクトシダーゼ：１１６ｋＤａ、ウサギ筋由来ホスホリラーゼＢ：９７ｋＤａ、ウシ血清由来アルブミン：６６ｋＤａ、ニワトリ卵由来オボアルブミン：４５ｋＤａ、ウシ血球由来カルボニルアンヒドラーゼ：３０ｋＤａ、大豆由来トリプシンインヒビター：２０ｋＤａ、ウシミルク由来α−ラクトアルブミン：１４．４ｋＤａ）を使用した。【００５１】
双性イオンを含有しない（Ｂ）のゲルは低分子領域が分離できなかった。セリン（ｐＫａ：９．１５）含有ゲル（Ｃ）とタウリン（ｐＫａ：９．０６）含有ゲル（Ｄ）では、Laemmli法のゲルと同様の電気泳動パターンを示しはしたが、ゲル上の４５ｋＤａ付近に界面が生じ（図１の矢印部分、図２のＣ′とＤ′）、その前後のタンパク質の分離ができず、分離されたバンドの確認が困難な領域があった。【００５２】
ｐＫａが９．６〜１１の双性イオンを含有するゲル（Ｅ）−（Ｇ）はLaemmli法のゲルと同等の電気泳動パターンを示し、分画分子量範囲およびタンパク質の移動度が同等であることが示された上、双性イオンに起因する界面がゲル上に生じず（図２のＥ′）、高電圧での電気泳動による分離が良好であった。【００５３】
【表１】
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【００５４】
【表２】
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【００５５】
実施例２
双性イオンの一つであるアラニンの濃度依存的なタンパク質の移動度の変化を検証するために、表３に記載されたゲル緩衝液を使用してゲルを作製し、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。表４の分子量マーカーの相対移動度（％）と電気泳動パターン(写真は非図示)に示されるように、アラニンの濃度を２５ｍＭから１００ｍＭ まで変化させても電気泳動パターンは影響されず、Laemmli法のゲルと同等の分画分子量範囲とタンパク質の移動度を示し、良好な分離が観察された。【００５６】
【表３】
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【００５７】
【表４】
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【００５８】
実施例３
トリス濃度依存的なタンパク質の移動度の変化を検証するために、表５および表７に記載されたゲル緩衝液を使用してゲルを作製し、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。表６はトリス濃度を５０ｍＭから８０ｍＭまで変化させたときの結果、表８はトリス濃度を８０ｍＭ以上にしたときの結果を示している。表６および表８の相対移動度ならびに電気泳動パターン(写真は非図示) に示されるように、いずれも良好な分離が観察されたが、トリス濃度が７０ｍＭ以下の場合には低分子側の分画範囲が広がるため、分子量マーカーの４５ｋＤａのバンドが２本に分かれる結果となった（Ａ〜Ｃ）。４５ｋＤａのバンドはオボアルブミンでリン酸化タンパク質であるため、高濃度のアクリルアミドゲル等で低分子側の分離をよくすると、リン酸化状態と脱リン酸化状態のバンドが分かれる場合がある。８０ｍＭ以上のトリスではLaemmli法のゲルと同等の分画分子量範囲とタンパク質の移動度を示した（Ｅ〜Ｈ）が、トリス濃度が上がる（Ｇ，Ｈ）と徐々に高分子側の分離がよくなり、３０ｋＤａ以下の低分子側の分画領域が狭くなる傾向がみられた。一方、酢酸以外の酸として硫酸を添加しても（Ｅ〜Ｈ）、電気泳動パターンに顕著な影響を与えることはなかった。【００５９】
【表５】
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【００６０】
【表６】
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【００６１】
【表７】
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【００６２】
【表８】
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【００６３】
実施例４
グリシン濃度依存的なタンパク質の移動度の変化を検証するために、表９に記載されたゲル緩衝液を使用してゲルを作製し、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。表１０の相対移動度と図５の電気泳動パターン(ゲルの写真は非図示)に示されたように、グリシン濃度が高いときは高分子領域の分離がよくなり、グリシン濃度が低いときは低分子側領域の分離がよくなることが判明した。このようにグリシン濃度依存的にタンパク質の移動度が変化するため、ターゲットの分子領域に合わせたグリシン濃度を選択することにより、より詳細にターゲット分子領域のバンドを分離して検出することが可能である。また１００ｍＭ以上の濃度のグリシンを含有するゲル（Ｃ〜Ｆ）では、タンパク質の電気泳動パターンや相対移動度はLaemmli法のゲルと同等であり、良好な分離が観察された。【００６４】
【表９】
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【００６５】
【表１０】
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【００６６】
実施例５
酢酸濃度依存的なタンパク質の移動度の変化を検証するために、表１１に記載されたゲル緩衝液を使用してゲルを作製し、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。その結果、表１２の相対移動度および電気泳動パターン(ゲルの写真は非図示)に示されるように、タンパク質の泳動パターンや相対移動度はLaemmli法のゲルと同等であり、良好な分離が観察された。また、酢酸濃度が上がるにつれて、高分子側の分離が若干よくなるとともにバンドがシャープになり、泳動速度が徐々に遅くなることが示された。【００６７】
【表１１】
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【００６８】
【表１２】
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【００６９】
実施例６
トリス、グリシン、双性イオン、酸から成るゲルに添加物を添加したときの影響を検証するために、表１３に記載されたようにトリエタノールアミン（ＴＥＡ、ｐＫａ:７．７６） 、γ−アミノ酪酸 (ＧＡＢＡ、ｐＫａ: １０．４３)を添加したゲル緩衝液を使用してゲルを作製し、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。その結果、表１４ならびに電気泳動パターン(ゲルの写真は非図示)に示されるように、いずれも良好な分離が観察された。ＧＡＢＡの添加による電気泳動パターンや移動度への影響はほとんどなかった（Ｃ）が、ＴＥＡの添加により、若干ではあるが低分子側の分画領域が狭くなることが示された（Ｂ，Ｄ）。【００７０】
【表１３】
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【００７１】
【表１４】
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【００７２】
実施例７
さらにゲルに添加物としてよく使用されるスクロース（sucrose）やグリセロールの影響を検証するために表１５に記載されたゲル緩衝液を使用してゲルを作製し、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。表１６の相対移動度および電気泳動パターン(ゲルの写真は非図示)に示されるように、いずれも良好な分離が観察され、グリセロールおよびスクロースの添加による影響はほとんどなく、Laemmli法のゲルと同等の分画分子量範囲とタンパク質の移動度を示した。【００７３】
【表１５】
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【００７４】
【表１６】
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【００７５】
実施例８
長期保存性に関して検証するために４℃、３７℃、５０℃で加温処理し、ゲルの加速安定性試験を行った。３７℃で１日間の加温処理は典型的な保存温度である４℃で１ヶ月加温処理した場合と同等であることが示されている。表１７に記載されたゲル緩衝液を使用して１０％Ｔ３％Ｃのアクリルアミドおよび１０％Ｔ３．３％Ｃのアクリルアミドゲルを作製し、４℃、３７℃、５０℃で１週間加温処理をした後に(表１８)、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。分子量マーカーの相対移動度（表１９）および電気泳動パターン(ゲルの写真は非図示)に示されるように、各タンパク質の相対移動度はほとんど変わらず、また電気泳動パターンも高い分離能であり、加温処理による顕著な差は観察されなかった。【００７６】
【表１７】
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【００７７】
【表１８】
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【００７８】
【表１９】
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【００７９】
実施例９
実施例８と同様に、長期保存性に関して検証するために４℃、３７℃、５０℃で加温処理し、ゲルの加速安定性試験を行った（３７℃で１日間の加温処理は４℃で１ヶ月に相当）。表２０に記載されたゲル緩衝液を使用して１０％Ｔ３．３％Ｃのアクリルアミドゲルを作製し、４℃、３７℃、５０℃で９日間および１４日間加温処理をした後に(表２１)、実施例１と同様の方法で電気泳動を行った。分子量マーカーの相対移動度（表２２）および電気泳動パターン(ゲルの写真は非図示)に示されるように、各タンパク質の相対移動度はほとんど変わらず、また電気泳動パターンも高い分離能であり、加温処理による顕著な差は観察されなかった。【００８０】
【表２０】
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【００８１】
【表２１】
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【００８２】
【表２２】
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【００８３】
実施例１０
電気泳動を行う際の電圧の影響を調べるために、表２３の組成でゲルを作製し、１５０Ｖ、３００Ｖ、５００Ｖの定電圧条件下で、上述と同様の方法で電気泳動を行った。図３に示したように、通常使用される電圧の１５０Ｖで８０分間および高電圧条件の３００Ｖで３０分間電気泳動したパターンには違いがなく、バンドの形状や移動度も同じであることが示された。さらに高い電圧の５００Ｖで泳動した場合は、移動度に若干の影響が見られるが、バンドの形状やパターンは同様であった。したがって、高電圧条件でも通常電圧と同様の明瞭でシャープなバンドに分離できることが示された。【００８４】
【表２３】
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【産業上の利用可能性】
【００８５】
本発明のゲル緩衝液を使用して作製することにより、電気泳動用ゲルを長期間安定に保存可能であるため、均一で品質の優れたプレキャストゲルを製造でき、かつ、そのようなプレキャストゲルを大量に生産することができる。大量生産と長期保存が可能になるため、同一ロットの提供が可能になり、精度・再現性の高いデータ取得が可能になる。さらに作製したゲルを用いれば、高電圧および／または高電流条件下で高速泳動が可能になり、かつ高い分離能でバンドの分離を行えるようになるため、分析時間の短縮化につながる。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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