(57)【要約】  本発明は、個体から得られた生物学的試料のゲノムまたはエピゲノムの完全な、部分的なまたは標的化した配列決定を実施するステップと、前記試料のゲノムまたはエピゲノム中に存在する遺伝的変化全てを遺伝子関連の眼障害または疾患に冒されていない個体の配列決定したゲノムと比較することによって遺伝子分析結果を得るステップと、既に行った前記遺伝子分析結果から、前記個体のために、検出した障害または疾患に関連した症状を予防、修正または軽減することができる光学的手段を得るステップとを含む方法に関する。
2014501525.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
個体から得られた生物学的試料のゲノムまたはエピゲノムの完全な、部分的なまたは標的化した配列決定を実施するステップと、
前記試料のゲノムまたはエピゲノムに存在する遺伝的変化全てを、遺伝子関連の眼障害または疾患に冒されていない個体の配列決定したゲノムと比較することによって遺伝子分析結果を得るステップと、
既に行った前記遺伝子分析結果から、前記個体のために、検出した障害または疾患に関連した症状を予防、修正または軽減することができる光学的手段を得るステップと
を含む、ヒトの視力に影響を及ぼす1種または複数の遺伝子関連の眼障害または疾患に罹患しているまたは罹患しやすいヒト個体に特に適合する光学的手段を得る方法。
【請求項２】
前記光学的手段が、6ヵ月超、好ましくは1年超、3年超、5年超または10年超の期間にわたって検出された障害または疾患に関連した症状を予防、修正または軽減するために選択される、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
前記期間が、前記個体の成人期全体である、請求項2に記載の方法。
【請求項４】
前記光学的手段が、眼鏡またはレンズからなる群から選択される、請求項1から3のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記レンズが眼内レンズである、請求項4に記載の方法。
【請求項６】
前記レンズまたは眼鏡が1種または複数のフィルターを含む、請求項4または5に記載の方法。
【請求項７】
前記フィルターが、前記個体の目の光に対する曝露を軽減する着色を含む、請求項6に記載の方法。
【請求項８】
前記着色の色または濃度が、ヒト個体の目の光に対する曝露に応じて、および/または前記個体が存在する地理的位置に応じて変更できる、請求項7に記載の方法。
【請求項９】
前記光が青色光および/またはUV光であり、前記着色が黄色の着色である、請求項7または8に記載の方法。
【請求項１０】
前記疾患または障害が、急性黄斑変性(AMD)、緑内障、網膜分離症(RS)、屈曲不同、円錐角膜(網膜色素変性症)、マルファン症候群または個体によるフィブリリンの産生に影響を及ぼす染色体15q 21.1の欠損が関与する遺伝的結合組織障害からなる群から選択される、請求項1から9のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記比較ステップが、SNP遺伝子型同定、配列メチル化、マッピング、配列決定、高密度もしくは低密度マイクロアレイの使用、ピロシーケンス、遺伝子発現分析または定量的遺伝子増幅および/またはDNAフィンガープリントのような遺伝的またはエピジェネティック変化のあらゆる種類の検出からなる群から選択された1種または複数の方法および手段の使用を含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
比較ステップが、複数遺伝子変異の遺伝的変化または一遺伝子多型の遺伝的変化に基づいて実施される、請求項1から11のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記遺伝的変化が、補体系タンパク質因子H(CFH)、因子B(CFB)、因子3(C3)およびフィブリン-5遺伝子の1個または複数の突然変異からなる群から選択される、請求項1から12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記遺伝的変化が、ATP合成酵素遺伝子における1個または複数の突然変異である、請求項1から13のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
生物学的試料が、ヒト個体のゲノムを含む細胞、細胞抽出物、組織または組織抽出物からなる群から選択される、請求項1から14のいずれか一項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、早期に、好ましくはヒト個体を冒す疾患または症候群の症状の出る前の段階で、1種または複数の遺伝子関連の眼障害または疾患、特にヒトの視力に影響を及ぼす障害または疾患、好ましくは長期間にわたる障害または疾患に罹患している、または罹患しやすいこのヒト個体に適合する光学的手段(すなわち、レンズ)を得る(設計、選択または製造する)方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
遺伝性または遺伝的眼障害には、目に限定した状態ならびに眼の徴候またはその他の遺伝性の障害および複合症候群が含まれる。
【０００３】
先天性白内障(出生時に存在する白内障)および網膜変性は、失明の多くの遺伝的原因の中でも上位を占めている。遺伝性網膜変性の中でも、網膜色素変性症(RP)は、合衆国において5000人に1人が罹患している。網膜色素変性症の症状は20歳以下で発現し、進行性に悪化し、通常4、50歳までに重度の視力喪失となってしまう。この障害の重症度はサブタイプによって変化し、2種類の常染色体遺伝またはX染色体連鎖劣性遺伝のいずれかの様式によって遺伝し得る。
【０００４】
さらに、高齢者の視力喪失の重要な原因は、黄斑変性(急性黄斑変性またはAMD)で、毎年数百万の成人が影響を受ける可能性がある。この変性は、網膜の損傷のため、視野の中心(黄斑)における視力の喪失(または低下)を引き起こす可能性がある。黄斑変性によって、読んだり、顔を認識したり、運転したりすることが困難または不可能になり得るが、周辺の視力は十分残存しており、日常生活のその他の活動は可能である。黄斑が損傷を受けると、目は細部を見る能力を失い、黄斑の損傷を受けた部分は、暗点または局所領域の視力喪失を引き起こすことが多い。
【０００５】
これらの疾患の多くは、遺伝的に予め決定されており(遺伝性)、ヒト患者においては、早期の段階でこれらの疾患または障害の症状を検出および治療または予防(修正または軽減)することが必要である。
【０００６】
これらの疾患または障害に罹患している、または将来罹患しやすい患者にとっては、これらの疾患または障害によって生じる視力喪失を予防または治療(修正または軽減)することができ、その上その個体およびその疾患または障害の進度(すなわち、症状または結果(視力喪失)の進度)およびおそらくこの個体が存在している地理的位置にも適合することが可能な改善された手段を、一生の中でできる限り早期に提案することが必要である。
【０００７】
補体系タンパク質因子H(CFH)、因子B(CFB)、因子3(C3)およびフィブリン-5における突然変異のようないくつかの遺伝的変化には、人が黄斑変性を発症する危険性が伴うと考えられる。同様に、以下の酵素遺伝子、脱水素酵素、酸化酵素、アシルトランスフェラーゼまたはジスムターゼにおける1個または複数の突然変異には、黄斑変性が関連し得る可能性がある。
【０００８】
ATP合成酵素遺伝子における突然変異はまた、網膜色素変性症(RP)のような遺伝的に決定された疾患の発症に関与するものと考えられる。
【０００９】
疾患を有する人々に症状が存在する可能性がある場合もない場合もあるので、通常の目の検査が黄斑変性の早期検出に欠かせない。この疾患は通常長期間かけて発症し、進行期に達して明白になる。
【００１０】
さらに、日光に対する曝露が高いオーストラリアまたはアフリカのような国々において特に、エネルギーの高い可視光は、年齢に関連した黄斑変性およびその他の視力喪失障害の一因となる可能性があり、これらの遺伝的障害または疾患のいくつかは特定の国々(アフリカ、アラブおよび南アジアの国々)においてより多く発症するようである。
【００１１】
米国特許出願公開第2003/0054347号は、患者の遺伝子多型を決定および比較し、その後患者の目に、検出された眼疾患を治癒しやすい局所的眼用組成物を投与することによって、眼疾患の危険性のある患者を診断および治療する方法を開示している。
【００１２】
米国特許第4617299号は、患者の目に局所的に投与する眼用組成物について記載している。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１３】
【特許文献１】米国特許出願公開第2003/0054347号
【特許文献２】米国特許第4617299号
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１４】
本発明の目的は、ヒトの視力に影響を及ぼす遺伝子関連の眼障害または疾患、特に、長期間にわたって、おそらくこの個体が世界で存在している地理的位置によって、ヒトの視力に影響を及ぼす障害または疾患の治療および予防を改善することである。
【００１５】
本発明の目的は特に、光学的手段、特に改善された手段を、早期に、好ましくはヒトに影響を及ぼす疾患または症候群の症状の出る前の段階に得る(設計、選択または製造する)ことであり、これらの手段はこれらの遺伝子関連の(遺伝性または非遺伝性の)眼障害または疾患に罹患しているヒト個体に適合しており、好ましくは長期にわたって、おそらくこのヒト個体の成人期全体にわたって、(日)光、特に、青色光もしくはU.V.光に対する曝露などの可能性のある関連因子を含む、これらの疾患または障害の不利益(症状または結果)を予防または治療(修正または軽減)するために使用することが可能である。
【課題を解決するための手段】
【００１６】
本発明の第1の態様は、特許請求の範囲に記載したように、1種または複数の遺伝子関連の眼障害または疾患(ヒトの視力に影響を及ぼす)に罹患している、または罹患しやすいヒト個体に特に適合する光学的手段(すなわち、ヒトの視力に影響を及ぼす1種または複数の障害または疾患に関連した症状を予防、修正または軽減することができるレンズ)を得る(設計、選択または製造する)方法に関する。
【図面の簡単な説明】
【００１７】
【図１】生物学的試料のこのような適切な遺伝子分析のために当業者によって選択することができるこれらの技術の例を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００１８】
本発明による(これらの光学的手段を得るための)方法は、
この個体から得られた生物学的試料中に存在するゲノムまたはエピゲノムの完全なまたは標的化した配列決定を実施するステップと、
この試料ゲノムまたはエピゲノム中に存在する遺伝子改変全てをこれらの遺伝的に関連する眼障害または疾患に冒されていない1人または複数の(健康な)個体(好ましくは、少なくとも2、4、8、10、20、30、50もしくは100人)のゲノムまたはエピゲノムと比較することによって遺伝子分析結果を得るステップと、
障害または疾患に関連した症状または結果(視力喪失の少なくとも一部および日光(好ましくは青色光およびU.V.光)などのおそらく関連のある因子)を予防、修正または軽減することができる(好ましくは、既に行ったこの遺伝子分析結果によって特異的に選択された)適切な光学的手段を得る(選択、設計または製造する)ステップとを含む。
【００１９】
好ましくは、個体によるこれらの光学的手段の使用は、長期間(すなわち、数ヵ月から数年まで(6ヵ月超、1年超、3年超、5年超、8年超または10年超など))またはおそらく個人の成人期全体にわたって適用することができる。
【００２０】
「遺伝子関連の眼障害または疾患」という用語は、おそらく先天的な原因(遺伝性または非遺伝性)を有し、ヒトの視力に影響を及ぼすヒト個体のゲノムにおける1種または複数の遺伝的(またはエピジェネティック)改変、突然変異および/または挿入/欠失によって生じる可能性がある1種または複数の前記の好ましい記載された疾患または病変ならびに免疫系に関与しているその他の疾患もおそらく意味する。「適切な光学的手段」という用語はレンズ、場合により眼鏡に存在するレンズ、および日光に対する(特に、U.V.光および/または青色光などの特定の波長を有する放射光に対する)レンズの修正層またはフィルターのためのその他の防御要素または電子的装置を意味し、眼鏡に結合し(または眼鏡の一部である)(日光に対して)目を覆い保護する防御要素が含まれる。
【００２１】
これらのレンズまたは眼鏡は、これらの疾患または障害に罹患している、または将来罹患しやすいヒト個体に特に適合し、日常生活を改善し、この個体に生じた不利益および結果(すなわち、視力喪失の少なくとも一部)を軽減することができる。
【００２２】
「ゲノムの配列決定」という用語は、99.999%を上回る精度、好ましくは99.9999%を上回る精度での、得られた試料の全コードまたは非コードゲノム(配列決定によって検出されやすいいかなるエピジェネティック改変も含む)に行われるハイスループット配列決定を意味する。この配列決定ステップは、遺伝的またはエピジェネティック分析に有用な配列を生じることができる任意の技術を使用して実施することができる。
【００２３】
「遺伝子関連の眼障害または疾患」には、遺伝性または非遺伝性の、年齢に関連したまたは関連しない、急性黄斑変性(AMD)またはその他のAMD関連障害(年齢に関連したまたは関連しない)、緑内障、網膜分離症(RS)、屈曲不同、円錐角膜(網膜色素変性症)、マルファン症候群またはフィブリリンの合成に影響を及ぼす染色体15q 21.1の欠損が関与する遺伝的結合組織障害または個体の視力に影響を及ぼす遺伝的原因のあるその他の疾患からなる群から有利に選択された、ヒトの視力に影響を及ぼす障害および疾患が少なくとも含まれる。
【００２４】
本発明の方法では、検出された障害または疾患に関連した症状または結果を予防、修正または軽減することができる光学的手段は、好ましくは眼鏡、または眼内レンズを含むレンズからなる群から選択される。
【００２５】
有利には、遺伝的変化は、補体系タンパク質因子H(CFH)、因子B(CFB)、因子3(C3)、フィブリン-5またはATP合成酵素遺伝子における突然変異からなる群から好ましくは選択された、(個体の)ゲノム(またはエピゲノム)における任意の遺伝子多型または複数遺伝子変異である。
【００２６】
遺伝子関連の眼障害または疾患の症状および結果とは、個体による視力の喪失(または低下)および青色光および/またはU.V.光などの光に対する曝露などのその他の因子によって誘導される可能性のある関連のある副作用を意味する。
【００２７】
有利には、これらの眼鏡またはレンズは、検出時にまだ現れていなくても(例えば、AMDまたは別の障害もしくは疾患に影響を受けた患者による視力障害が出現する前に)、障害または疾患およびおそらくそれらの症状の進度に応じて個体の視力を修正するために適合している。
【００２８】
さらに、本発明の方法では、これらの光学的手段、特にこれらの眼鏡またはレンズは、メラニン層などの1種または複数のフィルターまたはレンズ上またはレンズ内または眼鏡内に存在するいかなる電子的装置を含んでいてもよく、青色をブロックする眼鏡または黄色の着色を含有するレンズを使用することによって、特にU.V.光および/または青色光に対する、層またはフィルターの特性の可能な変化によって、試験した個体の目(ヒト患者の目)による光(日光)に対する曝露を軽減する。
【００２９】
好ましくは、これらのフィルターおよび/または層は、個体の網膜および/またはこの個体が存在している地理的位置によって受ける日常的な光に応じて適応できる(濃度および/または色を変更する)。
【００３０】
これらの光学的手段(すなわち、レンズ)の使用は、個体および検出された障害もしくは疾患に適合した適切な食事、特に、抗酸化剤、カロテノイド、ビタミン、特にビタミンCおよびビタミンEまたは無機質(銅、セレンおよび亜鉛)、オメガ-3脂肪酸(DHAおよびEPA)に富んだ食事、あるいは試験した個体の検出された遺伝的障害または疾患の症状(または結果)を修正または軽減するために適応することができるその他の薬剤または治療法の選択と有利に組み合わせることができる。
【００３１】
本発明による方法の比較(分析または解釈)ステップは、当業者に周知で、試験した個体から得られた試料ゲノムにおける1個または複数の遺伝的(エピジェネティック)改変の同定のために使用される方法および手段によって実施される。
【００３２】
さらに、健康な個体のゲノムに関する遺伝情報、臨床データおよびヒトの視力に関する遺伝子の可能性のある位置に関する情報は、比較(分析または解析)ステップのために使用したデータベースに保持され得る。アルゴリズム(ソフトウェア)は、この比較(分析または解釈)ステップを実施し、年齢に応じて、およびこの個体が存在する地理的位置に応じて、選択された個体のために最も適切な光学的手段を選択するため、または選択(製造)を補助するために使用することができる。
【００３３】
好ましくは、この生物学的試料は、ゲノム(またはそれらの一部)を含むか、あるいは試験した個体のゲノムまたはエピゲノム(またはそれらの一部)から構成される細胞、細胞抽出物、組織または組織抽出物である。
【００３４】
好ましくは、遺伝子分析のために使用した比較ステップは、NextGenSequencing、マイクロアレイ、ピロシーケンス分析、遺伝子発現分析または定量的遺伝子増幅(QRT-PCR、DNAフィンガープリントなど)のような、核酸に関連した細胞ゲノム(またはエピゲノム)の任意の改変の検出の使用、それらの改変を同定することができる任意の技術を使用した同定に基づいた方法および手段である。
【００３５】
これらの技術のいずれも、検出する遺伝的変化の数および分析する試料の数に応じて、当業者によって選択または組み合わせることができる。
【００３６】
図１は、生物学的試料のこのような適切な遺伝子分析のために当業者によって選択することができるこれらの技術の例を示す図である。
【図１】
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【国際調査報告】
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