(57)【要約】本発明は被験体から取得した試料において癌を検出する方法に関する。本発明はまた、癌を検出するためのキットおよび試薬ならびに癌を治療する治療物および方法を提供する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記を含む、試料において癌を検出する方法であって：ａ）前記試料を、ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される遺伝子によりコードされる少なくとも１つのマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）前記試料におけるＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルを、非癌性細胞における、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される１つ以上のマーカーの発現レベルと比較すること、ここで、前記非癌性細胞に比べて、前記試料における、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、前記試料が癌細胞を有することを示す、方法。
【請求項２】
前記試料は被験体から取得される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記被験体はヒトである、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記試料は体液である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記体液は血清である、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記作用物質はタンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記作用物質は抗体である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記作用物質は核酸である、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記核酸はＤＮＡ分子である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記核酸分子は約１０−５００ヌクレオチドの長さである、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
前記作用物質は、それに連結された検出可能な物質を有する、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記癌は、肺癌、乳癌、結腸癌、膀胱癌、腎臓癌および膵臓癌から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
下記を含み、ａ）前記試料を、遺伝子ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０によりコードされるマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）前記試料における遺伝子ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３  ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０によりコードされるマーカーの発現レベルを、前記非癌性細胞における、マーカーＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３  ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０の発現レベルと比較すること、ここで、前記非癌性細胞に比べて、前記試料における、少なくとも１つのマーカーの発現レベルが高いと、前記試料が癌細胞を有することを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
遺伝子ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０によりコードされる分子に特異的に結合する複数の作用物質を含む、試料において癌を検出するためのキット。
【請求項１５】
前記作用物質は核酸分子である、請求項１４に記載のキット。
【請求項１６】
前記核酸分子はＤＮＡ分子である、請求項１５に記載のキット。
【請求項１７】
前記作用物質はタンパク質である、請求項１４に記載のキット。
【請求項１８】
前記タンパク質は抗体である、請求項１７に記載のキット。
【請求項１９】
前記作用物質は、検出可能な物質で標識される、請求項１４に記載のキット。
【請求項２０】
下記を含む、被験体において癌を検出する方法であって：ａ）被験体から試料を取得すること；ｂ）前記被験体から取得された前記試料を下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結���因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモ��ピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中
間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスマイクロＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファ���リーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）前記非癌性細胞における下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルを比較すること：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、
ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスマイクロＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー���（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体、ここで、前記非癌性細胞に比べて、前記被験体から取得された前記試料における、下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、前記被験体が癌を有することを示す、方法：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ
、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（���ＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスマイクロＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２０１１年８月３１日に出願された米国仮特許出願第６１／５２９，５００号（全内容は本明細書で参照により組み込まれる）の優先権を主張する。
【０００２】
発明の分野
本発明の分野は癌ならびに癌の診断および治療に関する。
【背景技術】
【０００３】
癌の早期発見は、治療成績および疾患進行に影響し得る。典型的には、癌発見は生検、Ｘ線、ＣＡＴスキャン、ＮＭＲなどから得られた診断情報に依存する。これらの手順は侵襲性で、時間がかかり、高価であり得る。その上、それらは、感度および特異性に関して限界がある。癌診断の分野では、高特異性で、高感度で、迅速で、安価で、および比較的非侵襲性の、癌を診断する方法が必要とされる。以下で記載される本発明の様々な実施形態は、この要求ならびに癌を診断し、治療する分野に既存の他の要求を満たす。
【発明の概要】
【０００４】
本開示の実施形態は癌の診断、予後および治療の方法を提供する。他の実施形態は癌の診断、予後および治療に関する組成物を提供する。
【０００５】
ある一定の実施形態では、本発明は、下記を含む、被験体において癌を検出する方法を提供し：ａ）被験体から試料を取得すること；ｂ）被験体から取得された試料を、癌細胞により発現される１つ以上のマーカーを検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）被験体から取得された試料におけるマーカーの発現レベルを非癌性細胞における発現レベルと比較すること、ここで、非癌性細胞に比べて、試料におけるマーカーの発現レベルが高いと、被験体が癌を有することを示す。
【０００６】
ある一定の実施形態では本発明は、下記を含む、被験体において癌を検出する方法を提供し：ａ）被験体から試料を取得すること；ｂ）被験体から取得された試料を表１で列挙される少なくとも１つのマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）被験体から取得された試料における、表１で列挙される１つ以上のマーカーの発現レベルを、非癌性細胞における、表１で列挙される１つ以上のマーカーの発現レベルと比較すること、ここで、非癌性細胞に比べて、被験体から取得された試料における、表１で列挙される１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、被験体が癌を有することを示す。
【０００７】
いくつかの実施形態では本発明は、下記を含む、被験体において癌を検出する方法を提供し：ａ）被験体から試料を取得すること；ｂ）被験体から取得された試料を、下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｅｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ  ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｉｎ  ｍｅｌａｎｏｍａ）（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ａｎｔｉ−Ｍｕｌｌｅｒｉａｎ  ｈｏｒｍｏｎｅ）（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  １２  ｏｐｅｎ  ｒｅａｄｉｎｇ  ｆｒａｍｅ  ５６）（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｄｏｗｎ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ  ｃｒｉｔｉｃａｌ  ｒｅｇｉｏｎ  ｇｅｎｅ  ６）（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｇｕａｎｉｎｅ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  （Ｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ），  ｇａｍｍａ  ｔｒａｎｓｄｕｃｉｎｇ  ａｃｔｉｖｉｔｙ  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ  １）（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｏｌｕｔｅ  ｃａｒｒｉｅｒ  ｆａｍｉｌｙ  ３５，  ｍｅｍｂｅｒ  Ｄ３）（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ２  ｏｐｅｎ  ｒｅａｄｉｎｇ  ｆｒａｍｅ  ７０）（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｄｈｅｒｉｎ，  ＥＧＦ  ＬＡＧ  ｓｅｖｅｎ−ｐａｓｓ  Ｇ−ｔｙｐｅ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ３）（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｏｌｌａｇｅｎ，  ｔｙｐｅ  Ｘ，  ａｌｐｈａ  １）（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｄｏｗｎ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ  ｃｒｉｔｉｃａｌ  ｒｅｇｉｏｎ  ｇｅｎｅ  ８）（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｌｉｎ−２８  ｈｏｍｏｌｏｇ  Ｂ）（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｓｏｄｅｒｍ  ｓｐｅｃｉｆｉｃ  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ  ｈｏｍｏｌｏｇ）（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍａｔｒｉｘ  ｍｅｔａｌｌｏｐｅｐｔｉｄａｓｅ  １２）（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＳＨ３−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｄｏｍａｉｎ  ｋｉｎａｓｅ  １）（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピ��ンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ  ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ  １，  ｑ  ｓｕｂｃｏｍｐｏｎｅｎｔ−ｌｉｋｅ  ４）（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ９  ｏｐｅｎ  ｒｅａｄｉｎｇ  ｆｒａｍｅ  １４０）（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｎｃｅｒ／ｔｅｓｔｉｓ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  ４５，  ｍｅｍｂｅｒ  Ａ４）（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ  （Ｃ−Ｘ−Ｃ  ｍｏｔｉｆ）  ｌｉｇａｎｄ  １０）（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｄｅｌｔａ−ｌｉｋｅ  ３）（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｏｔａｓｓｉｕｍ  ｖｏｌｔａｇｅ−ｇａｔｅｄ  ｃｈａｎｎｅｌ，  ＫＱＴ−ｌｉｋｅ  ｓｕｂｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ２）（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＬＥＭ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  １）（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｉｍｉｌａｒ  ｔｏ  ＧＡＧＥ−２  ｐｒｏｔｅｉｎ）（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｉｍｉｌａｒ  ｔｏ  ｍｉｃｒｏｔｕｂｕｌｅ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ６  ｉｓｏｆｏｒｍ  １）（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍａｔｒｉｘ  ｍｅｔａｌｌｏｐｅｐｔｉｄａｓｅ  １１）（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＫ２  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  ｆａｃｔｏｒ  ｒｅｌａｔｅｄ，  ｌｏｃｕｓ  ５）（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐａｒａｔｈｙｒｏｉｄ  ｈｏｒｍｏｎｅ−ｌｉｋｅ  ｈｏｒｍｏｎｅ）（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓａｌ−ｌｉｋｅ  ４）（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｍａｌｌ  ｎｕｃｌｅｏｌａｒ  ＲＮＡ，  Ｃ／Ｄ  ｂｏｘ  ５６）（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＣＳＡＧ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ３Ａ）（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｆａｍｉｌｙ  ｗｉｔｈ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ  ８３，  ｍｅｍｂｅｒ  Ａ）（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｉｍｉｌａｒ  ｔｏ  ｈＣＧ１８１２０７４）（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ６４２４７７，  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ  ｖａｒｉａｎｔ  ２）（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ６４５０９９，  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ  ｖａｒｉａｎｔ  １）（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｉｍｉｌａｒ  ｔｏ  ＴＰ５３ＴＧ３  ｐｒｏｔｅｉｎ，  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ  ｖａｒｉａｎｔ  ２）（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｏｔｏｃａｄｈｅｒｉｎ  ｂｅｔａ  ２）（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｅｐｔｉｄａｓｅ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ  ３，  ｓｋｉｎ−ｄｅｒｉｖｅｄ）（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＴＰ５３  ｔａｒｇｅｔ  ３）（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｔｈｅｐｓｉｎ  Ｌ２）（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｇｒｅｍｌｉｎ  １，  ｃｙｓｔｅｉｎｅ  ｋｎｏｔ  ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ，  ｈｏｍｏｌｏｇ）（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｏｔａｓｓｉｕｍ  ｃｈａｎｎｅｌ，  ｓｕｂｆａｍｉｌｙ  Ｋ，  ｍｅｍｂｅｒ  １７）（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｋｒｉｎｇｌｅ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ２）（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ１００１３００８２）、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ＬＯＣ６４５６８２）（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｏｌｆａｃｔｏｍｅｄｉｎ  ４）（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｏｎｅ  ｃｕｔ  ｈｏｍｅｏｂｏｘ  ２）（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅ，  ＥＦ−ｈａｎｄ  ｃａｌｃｉｕｍ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｄｏｍａｉｎ  １）（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（Ｈｏｍｏ  ��ａｐｉｅｎｓ  ｒｅｐｒｉｍｏ−ｌｉｋｅ）（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｗｉｎｇｌｅｓｓ−ｔｙｐｅ  ＭＭＴＶ  ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ  ｓｉｔｅ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  １０Ａ）（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ａｎｎｅｘｉｎ  Ａ１３）（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＦＬＪ２２１８４）（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｌａｍｉｎｉｎ，  ｇａｍｍａ  ２）（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｉｔｏｇｅｎ−ａｃｔｉｖａｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｋｉｎａｓｅ  １５）（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｎｕｃｌｅｏｐｏｒｉｎ  ２１０ｋＤａ）（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ａｓｐａｒａｇｉｎｅ−ｌｉｎｋｅｄ  ｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ  １−ｌｉｋｅ）（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｇｕａｎｉｎｅ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  （Ｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ），  ｇａｍｍａ  ４）（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈａｒａｋｉｒｉ，  ＢＣＬ２  ｉｎｔｅｒａｃｔｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ）（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｎｕｃｌｅａｒ  ｆａｃｔｏｒ  （ｅｒｙｔｈｒｏｉｄ−ｄｅｒｉｖｅｄ  ２）−ｌｉｋｅ  ３）（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｅｔ  ｏｎｃｏｇｅｎｅ  １）（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｅｐｔｉｎ  ３）（ＳＥ
ＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ  ｃｏｍｐｌｅｘ  ｈｏｍｏｌｏｇ  １）（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＢＣＬ２−ｉｎｔｅｒａｃｔｉｎｇ  ｋｉｌｌｅｒ）（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ２１  ｏｐｅｎ  ｒｅａｄｉｎｇ  ｆｒａｍｅ  １２９）（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｌｐａｉｎ  １２）（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｂｏｘ  ｈｏｍｏｌｏｇ  ８）（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ  （Ｃ−Ｃ  ｍｏｔｉｆ）  ｌｉｇａｎｄ  ２０）（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｏｒｉｏｎｉｃ  ｇｏｎａｄｏｔｒｏｐｉｎ，  ｂｅｔａ  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ  ５）（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｌａｕｄｉｎ  ９）（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｏｎｄｒｏｓａｒｃｏｍａ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｇｅｎｅ  １）（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＣＳＡＧ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ３Ｂ）（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｎｃｅｒ／ｔｅｓｔｉｓ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  ４５，  ｍｅｍｂｅｒ  Ａ１）（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｎｃｅｒ／ｔｅｓｔｉｓ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  ４５，  ｍｅｍｂｅｒ  Ａ５）（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃａｎｃｅｒ／ｔｅｓｔｉｓ  ａｎｔｉｇｅｎ  ２）（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＣＣＣＴＣ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ  （ｚｉｎｃ  ｆｉｎｇｅｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ）−ｌｉｋｅ）（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｅｎｄｏｇｅｎｏｕｓ  ｒｅｔｒｏｖｉｒａｌ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｋ，  ６）（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｆａｍｉｌｙ  ｗｉｔｈ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ  １３３，  ｍｅｍｂｅｒ  Ａ）（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｉｓｔｏｎｅ  ｃｌｕｓｔｅｒ  １，  Ｈ３ｈ）（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｉｓｔｏｎｅ  ｃｌｕｓｔｅｒ  １，  Ｈ４ｈ）（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＫＩＡＡ１１９９）（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＬＩＮＥ−１  ｔｙｐｅ  ｔｒａｎｓｐｏｓａｓｅ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  １）（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＬＩＭ  ｈｏｍｅｏｂｏｘ  ２）（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ１００１３２５６４）（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ＬＯＣ４００８７９）、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ６４３２７２）（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｉｍｉｌａｒ  ｔｏ  ＣＳＡＧ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ２）（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ＬＯＣ７２９６６９）（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｓｏｔｈｅｌｉｎ）（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＬＲ  ｆａｍｉｌｙ，  ｐｙｒｉｎ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ７）（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｏｎｅ  ｃｕｔ  ｈｏｍｅｏｂｏｘ  ２）（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｃｏｎｖｅｒｔａｓｅ  ｓｕｂｔｉｌｉｓｉｎ／ｋｅｘｉｎ  ｔｙｐｅ  １）（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐａｎｃｒｅａｔｉｃ  ａｎｄ  ｄｕｏｄｅｎａｌ  ｈｏｍｅｏｂｏｘ  １）（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｅｇｎａｎｃｙ  ｓｐｅｃｉｆｉｃ  ｂｅｔａ−１−ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ  １）（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｅｒｐｉｎ  ｐｅｐｔｉｄａｓｅ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ，  ｃｌａｄｅ  Ａ  （ａｌｐｈａ−１  ａｎｔｉｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ，  ａｎｔｉｔｒｙｐｓｉｎ），  ｍｅｍｂｅｒ  １）（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｙｎａｐｔｏｎｅｍａｌ  ｃｏｍｐｌｅｘ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ２）（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｕｄｏｒ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ５）（ＴＤＲＤ５）���ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｕｒｏｔｅｎｓｉｎ  ２  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＷＤ  ｒｅｐｅａｔ  ｄｏｍａｉｎ  ６６）（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｘ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  １Ｂ）（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｕｔＳ  ｈｏｍｏｌｏｇ  ５）（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｍｄｍ２，  ｔｒａｎｓｆｏｒｍｅｄ  ３Ｔ３  ｃｅｌｌ  ｄｏｕｂｌｅ  ｍｉｎｕｔｅ  ２，  ｐ５３  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  （ｍｏｕｓｅ）  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ，  １０４ｋＤａ）（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｏｌｌａｇｅｎ，  ｔｙｐｅ  ＸＩ，  ａｌｐｈａ  １）（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｄｏｃｋｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ７）（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｆｉｂｒｏｂｌａｓｔ  ｇｒｏｗｔｈ  ｆａｃｔｏｒ  １１）（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｇｌｕｔａｍａｔｅ  ｄｅｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ  １）（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＨＯＲＭＡ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  １）（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ａ，  １２）（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍａｔｒｉｘ  ｍｅｔａｌｌｏｐｅｐｔｉｄａｓｅ  ７）（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＬＲ  ｆａｍｉｌｙ，  ｐｙｒｉｎ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ７）（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎ  ｄｏｍａｉｎ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ５）（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｔ−ｂｏｘ  １）（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｕｍｏｒ  ｎｅｃｒｏｓｉｓ  ｆａｃｔｏｒ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ６ｂ，  ｄｅｃｏｙ）（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＵＤＰ  ｇｌｕ���ｕｒｏｎｏｓｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ  １  ｆａｍｉｌｙ，  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ  Ａ６）（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｚｉｎｃ  ｆｉｎｇｅｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ２８０Ａ）（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｅｐｉｐｈｙｃａｎ）（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｎｅｕｒｏｍｅｄｉｎ  Ｕ）（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＳＰＲＹ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ５）（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｖａｒｉａｂｌｅ  ｃｈａｒｇｅ，  Ｘ−ｌｉｎｋｅｄ  ２）（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ６５１９５７）（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｖａｒｉａｂｌｅ  ｃｈａｒｇｅ，  Ｘ−ｌｉｎｋｅｄ  ３Ａ）（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ  （Ｃ−Ｘ−Ｃ  ｍｏｔｉｆ）  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ３）（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｉｓｔｏｎｅ  ｃｌｕｓｔｅｒ  １，  Ｈ２ａｍ）（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｋｉｎｅｓｉｎ  ｆａｍｉｌｙ  ｍｅｍｂｅｒ  ２４）（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ３  ｏｐｅｎ  ｒｅａｄｉｎｇ  ｆｒａｍｅ  ３２）（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ  ８）（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｍａｌｌ  ｎ
ｕｃｌｅｏｌａｒ  ＲＮＡ，  Ｈ／ＡＣＡ  ｂｏｘ  ７２）（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｎｅｕｒｏｔｅｎｓｉｎ）（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅ  １Ｅ）（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ  ４  Ｌ  ｓｉｘ  ｆａｍｉｌｙ  ｍｅｍｂｅｒ  １９，  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ  ｖａｒｉａｎｔ  ２）（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｂａｃｕｌｏｖｉｒａｌ  ＩＡＰ  ｒｅｐｅａｔ−ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ７）（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｎｅｕｒｅｘｏｐｈｉｌｉｎ  ４）（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ａｎｎｅｘｉｎ  Ａ１３）（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｂ  ｍＲＮＡ  ｅｄｉｔｉｎｇ  ｅｎｚｙｍｅ，  ｃａｔａｌｙｔｉｃ  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ  １）（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  １  ｏｐｅｎ  ｒｅａｄｉｎｇ  ｆｒａｍｅ  １１０）（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｃ１ｑ  ａｎｄ  ｔｕｍｏｒ  ｎｅｃｒｏｓｉｓ  ｆａｃｔｏｒ  ｒｅｌａｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ３）（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＣＤ７０  ｍｏｌｅｃｕｌｅ）（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ  ｃ  ｏｘｉｄａｓｅ  ｓｕｂｕｎｉｔ  ＶＩＩｂ２）（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｇ  ａｎｔｉｇｅｎ  １２Ｂ）（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｇ  ａｎｔｉｇｅｎ  １２Ｇ）（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｇｌｙｃｅｒａｌｄｅｈｙｄｅ−３−ｐｈｏｓｐｈａｔｅ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ，  ｓｐｅｒｍａｔｏｇｅｎｉｃ）（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｇａｍｅｔｏｃｙｔｅ  ｓｐｅｃｉｆｉｃ  ｆａｃｔｏｒ  １）（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｉｓｔｏｎｅ  ｃｌｕｓｔｅｒ  １，  Ｈ２ｂｊ）（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｉｓｔｏｎｅ  ｃｌｕｓｔｅｒ  ２，  Ｈ４ａ）（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｉｎｔｅｒｎｅｘｉ���  ｎｅｕｒｏｎａｌ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａｔｅ  ｆｉｌａｍｅｎｔ  ｐｒｏｔｅｉｎ，  ａｌｐｈａ）（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｏｔａｓｓｉｕｍ  ｖｏｌｔａｇｅ−ｇａｔｅｄ  ｃｈａｎｎｅｌ，  ｓｕｂｆａｍｉｌｙ  Ｈ  （ｅａｇ−ｒｅｌａｔｅｄ），  ｍｅｍｂｅｒ  ６）（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｏｔａｓｓｉｕｍ  ｌａｒｇｅ  ｃｏｎｄｕｃｔａｎｃｅ  ｃａｌｃｉｕｍ−ａｃｔｉｖａｔｅｄ  ｃｈａｎｎｅｌ，  ｓｕｂｆａｍｉｌｙ  Ｍ，  ｂｅｔａ  ｍｅｍｂｅｒ  ２）（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＫＩＡＡ１６８８  ｐｒｏｔｅｉｎ）（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＬＩＭ  ｈｏｍｅｏｂｏｘ  ８）（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＬＯＣ１００１３３５４２）（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｉｍｉｌａｒ  ｔｏ  ｋｅｒａｔｉｎ  ８）（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ａ，  １）（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ａ，  ４）（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ａ，  ６）（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ｂ，  ２）（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ｃ，  １）（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｌａｎｏｍａ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ  Ｃ，  ２）（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｉｃｒｏｔｕｂｕｌｅ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  １  ｌｉｇｈｔ  ｃｈａｉｎ  ３  ａｌｐｈａ）（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｉｔｏｇｅｎ−ａｃｔｉｖａｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｋｉｎａｓｅ  ｋｉｎａｓｅ  ｋｉｎａｓｅ  ｋｉｎａｓｅ  １）（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｍｅｔａｌｌｏｔｈｉｏｎｅｉｎ−ｌｉｋｅ  ５，  ｔｅｓｔｉｓ−ｓｐｅｃｉｆｉｃ）（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＡＤＨ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ  （ｕｂｉｑｕｉｎｏｎｅ）  １  ａｌｐｈａ  ｓｕｂｃｏｍｐｌｅｘ，  ４−ｌｉｋｅ  ２）（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＬＲ  ｆａｍｉｌｙ，  ｐｙｒｉｎ  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ７）（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＮＯＰ２／Ｓｕｎ  ｄｏｍａｉｎ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ５Ｃ）（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｏｄｏｒａｎｔ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ２Ｂ）（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｐ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ２）（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｐ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  ５）（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｉｃｃｏｌｏ）（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｉｗｉ−ｌｉｋｅ  １）（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｏｄｏｃａｌｙｘｉｎ−ｌｉｋｅ  ２）（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｐｒｉｏｎ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ２）（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｏｌｕｔｅ  ｃａｒｒｉｅｒ  ｆａｍｉｌｙ  ４５，  ｍｅｍｂｅｒ  ２）（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｍａｌｌ  ｎｕｃｌｅｏｌａｒ  ＲＮＡ，  Ｃ／Ｄ  ｂｏｘ  ３Ａ）（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｍａｌｌ  ｎｕｃｌｅｏｌａｒ  ＲＮＡ，  Ｃ／Ｄ  ｂｏｘ  ３Ｃ）（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｍａｌｌ  ｎｕｃｌｅｏｌａｒ  ＲＮＡ，  Ｃ／Ｄ  ｂｏｘ  ３Ｄ）（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｓａｄ１  ａｎｄ  ＵＮＣ８４  ｄｏｍａｉｎ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  １）（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｓｙｎａｐｔｏｔａｇｍｉｎ  ＸＩＩＩ）（ＳＹＴ１３）、ホモ���ピエンス三者間モチーフファミリー様２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｒｉｐａｒｔｉｔｅ  ｍｏｔｉｆ  ｆａｍｉｌｙ−ｌｉｋｅ  ２）（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｒａｎｓｉｅｎｔ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｐｏｔｅｎｔｉａｌ  ｃａｔｉｏｎ  ｃｈａｎｎｅｌ，  ｓｕｂｆａｍｉｌｙ  Ｍ，  ｍｅｍｂｅｒ  ２）（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｔｕｂｕｌｉｎ，  ｂｅｔａ  ３）（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｕｒｏｔｈｅｌｉａｌ  ｃａｎｃｅｒ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  １）（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｖａｒｉａｂｌｅ  ｃｈａｒｇｅ，  Ｘ−ｌｉｎｋｅｄ）（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｖａｒｉａｂｌｙ  ｃｈａｒｇｅｄ  Ｘ−Ｃ）（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｖａｒｉａｂｌｅ  ｃｈａｒｇｅ，  Ｘ−ｌｉｎｋｅｄ  ２）（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｖａｒｉａｂｌｅ  ｃｈａｒｇｅ，  Ｙ−ｌｉｎｋｅｄ）（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ＶＧＦ  ｎｅｒｖｅ  ｇｒｏｗｔｈ  ｆａｃｔｏｒ  ｉｎｄｕｃｉｂｌｅ）（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  Ｘ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｆａｍｉｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒ  １）（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５（ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６  Ｈｕｍａｎ  ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ  ｓｔｅｍ  ｃｅｌｌｓ  Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ  ｃＤＮＡ  ｃｌｏｎｅ  ＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５）またはその相補体；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）非癌性細胞における下記から選択される遺伝子に
よりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルを比較すること：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡ���１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエン��エピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタ
ンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、���結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体、ここで、非癌性細胞に比べて、被験体から取得された試料における、下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、被験体が癌を有することを示す：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３��（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−
ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（���ＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体。
【０００８】
他の実施形態では、本発明は、下記を含む、被験体において癌を検出する方法を提供し：ａ）被験体から試料を取得すること；ｂ）被験体から取得された試料を、遺伝子ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体によりコードされるマーカーのパネルの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）被験体から取得された試料における、遺伝子ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体によりコードされるマーカーのパネルの発現レベルを、非癌性細胞における、遺伝子ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体によりコードされるマーカーのパネルの発現レベルと比較すること、ここで、非癌性細胞に比べて、試料における、遺伝子ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体によりコードされるマーカーのパネルの発現レベルが高いと、被験体が癌を有することを示す。
【０００９】
いくつかの実施形態では、本発明は、下記を含む、被験体において癌を検出する方法を提供し：ａ）被験体から試料を取得すること；ｂ）被験体から取得された試料を、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）被験体から取得された試料における、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルを、非癌性細胞における、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルと比較すること、ここで非癌性細胞に比べて、被験体から取得された試料におけるＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、被験体が癌を有することを示す。
【００１０】
さらなる実施形態では本発明は、下記を含む、試料において癌細胞を検出する方法を提供し：ａ）試料を取得すること；ｂ）ａ）で取得された試料を、下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンス���ＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ��Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシン
ニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャ���ル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）ａ）で取得された試料における下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルを：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲ
Ｄ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５���メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体、非癌性細胞における下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルと比較すること：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ
様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプト���リアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体、ここで、非癌性細胞に比べて、試料における、下記から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、試料が癌細胞を含むことを示す：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（Ｓ
ＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンス���ストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４
７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体。試料はインビトロ試料またはインビボ試料であってもよ���、あるいはインビボ試料に由来してもよい。
【００１１】
ある一定の実施形態では、本発明は、下記を含む、試料において癌を検出する方法を提供し：ａ）試料を、ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される少なくとも１つのマーカーの発現を検出する１つ以上の作用物質と接触させること；ｃ）非癌性細胞を１つ以上のｂ）の作用物質と接触させること；ならびにｄ）試料におけるＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３ＳＬＣ３５Ｄ，ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される１つ以上のマーカーの発現レベルを、非癌性細胞における、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される１つ以上のマーカーの発現レベルと比較すること、ここで、非癌性細胞に比べて、試料における、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０から選択される１つ以上のマーカーの発現レベルが高いと、試料が癌細胞を有することを示す。癌細胞は、例えば、肺、膀胱、乳、腎臓、および／または膵臓癌由来であってもよい。
【００１２】
前段落で記載される実施形態に関しては、試料は以下に記載される任意の試料、例えば、体液、例として血液、血清または尿であってもよい。試料は細胞試料または細胞試料の抽出物であってもよい。試料は組織試料であってもよい。核酸および／またはタンパク質は、試料から単離され得る。核酸、例えばＲＮＡは、ｃＤＮＡへ転写され得る。作用物質は癌細胞により発現される１つ以上のタンパク質または細胞により発現される１つ以上の核酸に特異的に結合する１つ以上の分子であってもよい。例えば、作用物質はタンパク質、例えば以下で同定されるマーカー遺伝子の１つにより発現されるタンパク質に特異的に結合する抗体であってもよい。作用物質は癌細胞により発現される核酸にハイブリダイズする１つ以上の核酸であってもよい。癌細胞により発現される核酸はＲＮＡ分子、例えばｍＲＮＡ分子であってもよい。癌細胞により発現される核酸にハイブリダイズする核酸分子はＤＮＡ分子、例えばＤＮＡプローブであってもよい。
【００１３】
さらに他の実施形態では、本発明は、非癌細胞に比べて、癌細胞上でより高いレベルで発現される分子に特異的に結合する１つ以上の分子を含む、癌細胞を非癌性細胞から区別するのに有用な物質の組成物を提供する。一例として、組成物は、非癌細胞に比べて、癌細胞により、より高いレベルで発現される１つ以上の分子に結合するタンパク質を含み得る。別の例として、組成物は、非癌細胞に比べて、癌細胞により、より高いレベルで発現される１つ以上の分子に結合する核酸を含み得る。
【００１４】
いくつかの実施形態では、本発明は、表１に列挙される配列によりコードされるマーカーから選択される、癌細胞により発現される分子に特異的に結合するタンパク質、例えば抗体を含む物質の組成物を提供する。癌細胞により発現される分子は、非癌性細胞により発現されるレベルよりも高いレベルで、癌細胞により発現され得る。
【００１５】
さらなる実施形態では、本発明は、癌細胞により発現される分子のパネルに特異的に結合する複数のタンパク質、例えば複数の抗体を含む物質の組成物を提供し、ここで、マーカーのパネルは、遺伝子ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体によりコードされる分子を含む。マーカーのパネルは、非癌性細胞におけるマーカーのパネルのレベルよりも高いレベルで発現され得る。
【００１６】
ある一定の実施形態では、本発明は、下記から選択される１つ以上の遺伝子によりコードされる分子から選択される、癌細胞により発現される分子に特異的に結合するタンパク質、例えば抗体を含む物質の組成物を提供し：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様���ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）、ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトラン��フェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（ＴＭ４ＳＦ１９）、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮ
Ａ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩＩＩ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５またはその相補体。癌細胞により発現される分子は、非癌性細胞により発現されるレベルより高いレベルで、癌細胞により発現され得る。
【００１７】
他の実施形態では、本発明は、癌細胞により発現される分子、例えばｍＲＮＡ分子に特異的に結合する核酸を含む物質の組成物を提供し、ここで、分子は表１に列挙される遺伝子によりコードされるマーカーから選択される。癌細胞により発現される分子は、非癌性細胞により発現されるレベルより高いレベルで癌細胞により発現され得る。
【００１８】
他の実施形態では、本発明は、癌細胞により発現される分子、例えばｍＲＮＡ分子に特異的に結合する核酸を含む物質の組成物を提供し、ここで、分子は以下に開示される遺伝子、例えば、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子、またはその相補体によりコードされる。癌細胞により発現される分子は、非癌性細胞により発現されるレベルより高いレベルで癌細胞により発現され得る。
【００１９】
さらに別の実施形態では、本発明は、下記を含む、被験体における癌が進行性かどうかを決定する方法を提供し：ａ）第１の時間点で癌と関連する１つ以上のマーカーの発現レベルを測定すること；ｂ）第２の時間点でａ）で測定された１つ以上のマーカーの発現レベルを測定すること（第２の時間点は第１の時間点の後である）；ならびにｃ）ａ）およびｂ）で測定された発現レベルを比較すること、ここで、ａ）に比べてｂ）における１つ以上のマーカーの発現レベルが増加すると被験体の癌が進行性であることを示す。
【００２０】
いくつかの実施形態では、本発明は、下記を含む、被験体における癌が進行性かどうかを決定する方法を提供し：ａ）第１の時間点で表１に列挙される１つ以上のマーカーの発現レベルを測定すること；ｂ）第２の時間点で、ａ）で測定された１つ以上のマーカーの発現レベルを測定すること（第２の時間点は第１の時間点の後である）；ならびにｃ）ａ）およびｂ）で測定された発現レベルを比較すること、ここで、第１の時間点に比べ第２の時間点で１つ以上のマーカーの発現レベルが増加すると、被験体の癌が進行性であることを示す。
【００２１】
他の実施形態では、本発明は、下記を含む、被験体における癌が進行性かどうかを決定する方法を提供し：ａ）第１の時間点で、以下に開示される遺伝子、例えば、以下に、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子、またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーの発現レベルを測定すること；ｂ）第２の時間点で、ａ）で測定された１つ以上のマーカーの発現レベルを測定すること（第２の時間点は第１の時間点の後である）；ならびにｃ）ａ）およびｂ）で測定された発現レベルを比較すること、ここで、第１の時間点に比べ第２の時間点で１つ以上のマーカーの発現レベルが増加すると被験体の癌が進行性であることを示す。
【００２２】
いくつかの実施形態では、本発明は、診断および／または治療抗体のための標的としての癌と関連する抗原（すなわち癌関連ポリペプチド）を提供する。いくつかの実施形態では、抗原は、表１に列挙される遺伝子、その断片によりコードされるタンパク質、または表１に列挙される遺伝子によりコードされるタンパク質の組み合わせから選択され得る。
【００２３】
いくつかの実施形態では、本発明は、診断および／または治療抗体のための標的としての癌と関連する抗原（すなわち癌関連ポリペプチド）を提供する。いくつかの実施形態では、抗原は、以下に、例えば見出し癌関連遺伝子下で開示される遺伝子から選択される遺伝子、その断片によりコードされるタンパク質、または以下に開示される遺伝子、例えば見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される遺伝子（またはその断片）によりコードされるタンパク質の組み合わせから選択され得る。
【００２４】
さらに別の実施形態では、本発明は、被験体を癌細胞により発現されるタンパク質またはタンパク質断片と接触させ、よって、癌細胞に対する免疫応答を誘発することを含む、癌細胞に対する免疫応答を誘発する方法を提供する。一例として被験体は、静脈内または筋肉内で、タンパク質またはタンパク質断片と接触され得る。
【００２５】
さらなる実施形態では本発明は、被験体を表１に列挙される遺伝子から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のタンパク質またはタンパク質断片と接触させ、よって癌細胞に対する免疫応答を誘発することを含む、癌細胞に対する免疫応答を誘発する方法を提供する。一例として、被験体はタンパク質またはタンパク質断片と静脈内または筋肉内で接触され得る。
【００２６】
さらに他の実施形態では、本発明は、被験体を、以下に開示される遺伝子、例えば、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のタンパク質またはタンパク質断片と接触させ、よって癌細胞に対する免疫応答を誘発することを含む、癌細胞に対する免疫応答を誘発する方法を提供する。一例として、被験体はタンパク質またはタンパク質断片と静脈内または筋肉内で接触され得る。
【００２７】
さらに別の実施形態では、本発明は試料において癌細胞を検出するためのキットを提供する。キットは、以下に開示される癌関連配列のいずれかの発現を検出する１つ以上の作用物質を含み得る。キットは、例えば、タンパク質および／または核酸である作用物質を含み得る。１つの実施形態ではキットは複数の作用物質を提供する。作用物質は、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体を含む遺伝子によりコードされるマーカーのパネルを検出することができ得る。
【００２８】
さらに他の実施形態では、本発明は、遺伝子ＳＬＣ３５Ｄ、ＮＭＵ、ＭＭＰ１２、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ７、ＤＳＣＲ８、ＣＯＬ１０Ａ、Ｃ２ｏｒｆ７０、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＡＳＣＬ１、ＷＮＴ１０Ａ、ＯＬＦＭ４、ＰＩ３、ＩＬ８、ＥＰＹＣ、およびＣＸＣＬ１０によりコードされる分子に特異的に結合する複数の作用物質を含む、試料において癌を検出するためのキットを提供する。
【００２９】
他の実施形態では、本発明は、被験体から取得した試料において癌を検出するためのキットを提供する。キットは癌細胞により特異的に発現される分子に特異的に結合する１つ以上の作用物質を含み得る。キットは１つ以上の容器および試料が癌に対して陽性かどうかを決定するための説明書を含み得る。キットは、任意で１つ以上のマルチウェルプレート、検出可能な物質、例えば染料、放射性標識分子、化学ルミネセンス標識分子などを含み得る。キットはさらに、陽性対照（例えば、１つ以上の癌性細胞；または特定の公知の量の癌細胞により発現される分子）および陰性対照（例えば、非癌性である組織または細胞試料）を含み得る。
【００３０】
いくつかの実施形態では、本発明は、以下に開示される遺伝子、例えば、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される遺伝子によりコードされる１つ以上のマーカーに特異的に結合する１つ以上の作用物質を含む、癌を検出するためのキットを提供する。作用物質はタンパク質、例えば抗体であってもよい。また、作用物質は、核例えば、ＤＮＡ分子またはＲＮＡ分子であってもよい。キットは１つ以上の容器および試料が癌に対して陽性かどうかを決定するための説明書を含み得る。キットは任意で、１つ以上のマルチウェルプレート、検出可能な物質、例えば染料、放射性標識分子、化学ルミネセンス標識分子などを含み得る。キットはさらに、陽性対照（例えば、１つ以上の癌性細胞；または特定の公知の量の癌細胞により発現される分子）および陰性対照（例えば、非癌性である組織または細胞試料）を含み得る。一例として、キットはＥＬＩＳＡまたはＤＮＡマイクロアレイの形態をとり得る。
【００３１】
いくつかの実施形態は被験体において癌を治療する方法に関し、方法は、治療の必要な被験体に癌関連タンパク質の活性を調節する治療薬を投与することを含み、ここで、癌関連タンパク質は表１に列挙される遺伝子、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片によりコードされる。いくつかの実施形態では、治療薬は癌関連タンパク質に結合する。いくつかの実施形態では、治療薬は抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体であってもよい。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化またはヒト抗体である。
【００３２】
本明細書におけるいくつかの実施形態は、被験体において癌を治療する方法に関し、方法は、治療の必要な被験体に癌関連タンパク質の活性を調節する治療薬を投与することを含み、ここで、癌関連タンパク質は以下に開示される遺伝子、例えば見出し癌関連配列下で開示される遺伝子、および／またはそのホモログ、および／またはそれらの組み合わせ、および／またはその断片から選択される遺伝子によりコードされる。いくつかの実施形態では、治療薬は癌関連タンパク質に結合する。いくつかの実施形態では、治療薬は抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体であってもよい。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化またはヒト抗体である。
【００３３】
いくつかの実施形態では、被験体において癌を治療する方法は、治療の必要な被験体に、表１に列挙されるもの、その断片、そのホモログ、および／またはその相補体から選択される１つ以上の遺伝子の発現を調節する治療薬を投与することを含み得る。
【００３４】
いくつかの実施形態では、被験体において癌を治療する方法は、治療の必要な被験体に、以下に開示される遺伝子、例えば見出し癌関連配列下で開示される遺伝子、その断片、そのホモログ、およびまたはその相補体から選択される１つ以上の遺伝子の発現を調節する治療薬を投与することを含み得る。
【００３５】
さらなる実施形態では、本発明は、表１に列挙される１つ以上の遺伝子、その断片、そのホモログ、およびまたはその相補体の遺伝子ノックダウンを含む、癌を治療する方法を提供する。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、表１で列挙されるもの、その断片、そのホモログ、およびまたはその相補体から選択される１つ以上の遺伝子のｍＲＮＡをコードする遺伝子の発現をノックダウンまたは抑制するように細胞を処理することを含み得る。
【００３６】
他の実施形態では、癌を治療する方法は、以下に開示される遺伝子、例えば、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される１つ以上の遺伝子の遺伝子ノックダウンを含み得る。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、以下に開示される遺伝子、例えば見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される１つ以上の遺伝子のｍＲＮＡをコードする遺伝子の発現をノックダウンまたは抑制するように細胞を処理することを含み得る。
【００３７】
さらに他の実施形態では、本発明は癌に対する活性について薬物候補をスクリーニングする方法を提供し、方法は下記を含み：（ａ）表１に列挙されるものから選択される１つ以上の癌関連遺伝子を発現する細胞を、薬物候補と接触させること；（ｂ）ａ）の細胞における、１つ以上の癌関連遺伝子の発現に対する薬物候補の効果を検出すること；ならびに（ｃ）薬物候補なしでの、ａ）で列挙した１つ以上の遺伝子の発現レベルを、薬物候補の存在下での１つ以上の遺伝子の発現レベルと比較すること；ここで、薬物候補の存在下での癌関連遺伝子の発現の減少は、候補が癌に対して活性を有することを示す。
【００３８】
さらなる実施形態では、本発明は癌に対する活性について薬物候補をスクリーニングする方法を提供し、方法は下記を含み：（ａ）以下に開示される遺伝子、例えば、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される１つ以上の癌関連遺伝子を発現する細胞を、薬物候補と接触させること；（ｂ）ａ）の細胞における、１つ以上の癌関連遺伝子の発現に対する薬物候補の効果を検出すること；ならびに（ｃ）薬物候補なしでの、ａ）で列挙した１つ以上の遺伝子の発現レベルを、薬物候補の存在下での発現レベルと比較すること；ここで、薬物候補の存在下での癌関連遺伝子の発現の減少は、候補が癌に対して活性を有することを示す。
【００３９】
いくつかの実施形態では、本発明は下記を含む、被験体において癌腫瘍を可視化する方法を提供し：ａ）１つ以上の癌関連タンパク質を、癌腫瘍に特異的に結合する標識分子で標的にすること（癌関連タンパク質は、表１に列挙されるものから選択される１つ以上の遺伝子によりコードされるタンパク質から選択される）；ならびにｂ）標識分子を検出すること（標識分子は、被験体内の腫瘍を可視化する）。可視化はインビボ、またはインビトロで実施され得る。
【００４０】
さらに他の実施形態では、本発明は下記を含む、被験体において癌腫瘍を可視化する方法を提供する：ａ）１つ以上の癌関連タンパク質を癌腫瘍に特異的に結合する標識分子で標的にすること（癌関連タンパク質は、以下に開示される遺伝子、例えば、見出し癌関連配列下で開示される遺伝子から選択される１つ以上の遺伝子によりコードされるタンパク質から選択される）；ならびにｂ）標識分子を検出すること（標識分子被験体内の腫瘍を可視化する）。可視化はインビボ、またはインビトロで実施され得る。
【００４１】
本発明の性質および利点をより完全に理解するために、添付の図面と関連してなされる下記詳細な説明を参照すべきである:
【図面の簡単な説明】
【００４２】
【図１】正常細胞および組織対腫瘍におけるＧＮＧＴ１の発現を示す図である。
【図２】正常細胞および組織対腫瘍におけるＣ１２ｏｒｆ５６の発現を示す図である。
【図３】正常細胞および組織対腫瘍におけるＣＯＬ１０Ａ１の発現を示す図である。
【図４】正常細胞および組織対腫瘍におけるＳＬＣ３５Ｄ３の発現を示す図である。
【図５】正常細胞および組織対腫瘍におけるｓｎａＲ−Ａの発現を示す図である。
【図６】正常細胞および組織対腫瘍におけるＳＢＫ１の発現を示す図である。
【図７】正常細胞および組織対腫瘍におけるＤＳＣＲ８の発現を示す図である。
【図８】正常細胞および組織対腫瘍におけるＣＥＬＳＲ３の発現を示す図である。
【図９】正常細胞および組織対腫瘍におけるＰＰＥＦ１の発現を示す図である。
【図１０】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＣＯＬ１０Ａ１の血清発現レベルを示すを示す図である。
【図１１】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＣＯＬ１０Ａ１の血清発現レベルを示す。
【図１２】正常ドナー血清と比較した腎臓癌被験体由来の血清中のＣＯＬ１０Ａ１の血清発現レベルを示す。
【図１３】正常ドナー血清と比較した肺癌被験体由来の血清中のＣＯＬ１０Ａ１の血清発現レベルを示す。
【図１４】正常ドナー血清と比較した膀胱癌被験体由来の血清中のＣＯＬ１０Ａ１の血清発現レベルを示す。
【図１５】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＣＸＣＬ１０の血清発現レベルを示す。
【図１６】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＥＰＹＣの血清発現レベルを示す。
【図１７】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＩＬ８の血清発現レベルを示す。
【図１８】正常ドナー血清と比較した膵臓癌被験体由来の血清中のＬＡＭＣ２の血清発現レベルを示す。
【図１９】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＰＩ３の血清発現レベルを示す。
【図２０】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＭＭＰ７の血清発現レベルを示す。
【図２１】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＭＭＰ７の血清発現レベルを示す。
【図２２】正常ドナー血清と比較した膵臓癌被験体由来の血清中のＭＭＰ７の血清発現レベルを示す。
【図２３】正常ドナー血清および良性腫瘍を有する被験体と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１１の血清発現レベルを示す。
【図２４】正常ドナー血清と比較した膵臓癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１１の血清発現レベルを示す。
【図２５】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１１の血清発現レベルを示す。
【図２６】正常ドナー血清と比較した膀胱癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１１の血清発現レベルを示す。
【図２７】正常ドナー血清および良性乳腺腫瘍を有する被験体と比較した乳癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１２の血清発現レベルを示す。
【図２８】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１２の血清発現レベルを示す。
【図２９】正常ドナー血清と比較した膵臓癌被験体由来の血清中のＭＭＰ１２の血清発現レベルを示す。
【図３０】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＮＭＵの血清発現レベルを示す。
【図３１】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＮＭＵの血清発現レベルを示す。
【図３２】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＯＬＦＭ４の血清発現レベルを示す。
【図３３】正常ドナー血清と比較した乳癌被験体由来の血清中のＷＮＴ１０Ａの血清発現レベルを示す。
【図３４】正常ドナー血清と比較した結腸癌被験体由来の血清中のＷＮＴ１０Ａの血清発現レベルを示す。
【図３５】様々な正常組織および癌組織におけるＡＭＨ＿１０３８の発現レベルを示す。
【図３６】乳腺腫瘍、乳腺腫瘍に隣接する組織、および正常乳房組織におけるＡＳＣＬ１＿１０９５の発現レベルを示す。
【図３７】様々な正常組織および癌組織におけるＣ１２ｏｒｆ５６の発現レベルを示す。
【図３８】様々な正常組織および癌組織におけるＣ２ｏｒｆ７０＿１０１０の発現レベルを示す。
【図３９】様々な正常組織および癌組織におけるＣＯＬ１０Ａの発現レベルを示す。
【図４０】様々な正常組織および癌組織におけるＣＯＬ１０Ａの発現レベルを示す。
【図４１】様々な正常組織および癌組織におけるＣＯＬ１０Ａの発現レベルを示す。
【図４２】様々な正常組織および癌組織におけるＣＯＬ１０Ａの発現レベルを示す。
【図４３】乳腺腫瘍、乳腺腫瘍に隣接する組織、および正常乳房組織におけるＣＯＬ１０Ａの発現レベルを示す。
【図４４】乳腺腫瘍、乳腺腫瘍に隣接する組織、および正常乳房組織におけるＤＳＣＲ＿１０６６の発現レベルを示す。
【図４５】様々な正常組織および癌組織におけるＤＳＣＲ８の発現レベルを示す。
【図４６】乳腺腫瘍、乳腺腫瘍に隣接する組織、および正常乳房組織におけるＭＭＰ１１の発現レベルを示す。
【図４７】膀胱腫瘍、乳腺腫瘍に隣接する組織、および正常膀胱組織におけるＭＭＰ１２の発現レベルを示す。
【図４８】甲状腺腫瘍、乳腺腫瘍に隣接する組織、および正常甲状腺組織におけるＮＭＵの発現レベルを示す。
【図４９】結腸腫瘍および正常結腸組織におけるＳＬＣ３５Ｄの発現レベルを示す。
【図５０】免疫細胞化学により測定される乳腺腫瘍および正常乳房組織におけるＰＯＴＥの発現を示す。
【図５１】免疫細胞化学により測定される乳腺腫瘍および正常乳房組織におけるＭＭＰ１１の発現を示す。
【図５２】結腸腫瘍および正常結腸組織におけるＬ１ＴＤ１の発現レベルを示す。
【図５３】結腸腫瘍および正常結腸組織におけるＡＰＯＢＥＣ１の発現レベルを示す。
【発明を実施するための形態】
【００４３】
本組成物および方法を記載する前に、この発明は記載される特定のプロセス、組成物、または方法に限定されないことが理解されるべきであり、というのは、これらは変動し得るからである。説明で使用される専門用語は、特定のバージョンまたは実施形態を説明するためのものにすぎず、本発明の範囲を制限することは意図されず、これは添付の特許請求の範囲によってのみ制限されることもまた理解されるべきである。別に規定されない限り、本明細書で使用される全ての技術および科学用語は、当業者により普通に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書で記載されるものと類似または等価のいずれの方法および材料も、本開示の実施形態の実行または試験において使用することができるが、好ましい方法、装置、および材料は以下に記載される。本明細書で言及される全ての刊行物は、その全体が参照により組み込まれる。本明細書のいずれも、先行発明のために、本発明はそのような開示に先行する権利がないことを認めるものと解釈すべきではない。
【００４４】
本明細書では、単数形「１つの（ａ、ａｎ）」および「その（ｔｈｅ）」は文脈で明確に別記されない限り複数の言及を含む。よって、例えば、「治療物」への言及は、１つ以上の治療物および当業者に知られているその等価物、などへの言及である。
【００４５】
本明細書では、「約」という用語は、これと共に使用される数の数値のプラスまたはマイナス１０％を意味する。そのため、約５０％は４５％〜５５％の範囲にあることを意味する。
【００４６】
「作用物質」は、本明細書では癌関連配列または癌関連配列によりコードされる分子に特異的に結合する分子を示す。作用物質の例としては、核酸分子、例えばＤＮＡおよびタンパク質、例えば抗体が挙げられる。作用物質は、以下に記載されるように標識または検出可能な物質と連結され得る。
【００４７】
「投与すること」は、治療物と共に使用される場合、治療物を直接標的組織内または上に投与すること、あるいは治療物を患者に投与することを意味し、よって、治療物は、標的とする組織にプラスの影響を与える。このように、本明細書では、「投与すること」という用語は、治療物と共に使用される場合、標的組織内または上に治療物を提供すること；例えば、静脈内注射により患者に治療物を全身的に提供すること（よって、治療物は標的組織に到達する）；治療物をそのコード配列の形態で標的組織に提供すること（例えば、いわゆる遺伝子治療技術）を含むことができるが、それらに限定されない。組成物を「投与すること」は、下記により達成され得る：経口投与、静脈内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、経皮拡散または電気泳動、局所注射、持続放出送達装置、例えば局所埋め込み持続放出装置、例として生体内分解性またはリザーバ系インプラント、タンパク質治療物または遺伝子治療ベクターを介する核酸治療物として、局所投与、または他の公知の技術と組み合わせたこれらの方法のいずれか。そのような併用技術としては、加熱、放射線および超音波が挙げられるが、それらに限定されない。
【００４８】
「増幅する」という用語は、増幅産物を生成することを意味するために使用され、それとしては、例えば、追加の標的分子、または標的様分子または標的分子に相補的な分子が挙げられ、その分子は試料中の標的分子の存在によって、生成される。標的が核酸である状況では、増幅産物は、ＤＮＡもしくはＲＮＡポリメラーゼまたは逆転写酵素、またはそれらの任意の組み合わせにより酵素的に製造することができる。
【００４９】
「動物」「患者」または「被験体」という用語は、本明細書では、ヒト、非ヒト霊長類および非ヒト脊椎動物、例えば野生、飼育および農場動物、例えば任意の哺乳類、例としてネコ、イヌ、雌ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ウサギ、齧歯類、例としてマウスおよびラットを含むが、それらに限定されない。いくつかの実施形態では、「被験体」「患者」または「動物」という用語は雄を示す。いくつかの実施形態では、「被験体」「患者」または「動物」という用語は雌を示す。
【００５０】
「生物源」という用語は本明細書では、標的ポリヌクレオチドおよび／またはタンパク質もしくはペプチドが由来し得る源を示す。源は上記で記載される「試料」の任意の形態をとることができ、限定はされないが、細胞、組織または流体が挙げられる。「異なる生物源」は同じ個体の異なる細胞／組織／器官、または同じ種の異なる個体由来の細胞／組織／器官、あるいは異なる種由来の細胞／組織／器官を示すことができる。
【００５１】
「捕捉試薬」という用語は、試料中の検出されるべき標的分子または分析物に結合することができる試薬、例えば抗体または抗原結合タンパク質を示す。
【００５２】
「遺伝子発現結果」という用語は、遺伝子あるいは遺伝子産物の発現に関する質的および／または量的結果を示す。遺伝子発現結果は、遺伝子、遺伝子によりコードされるＲＮＡ、遺伝子によりコードされるｍＲＮＡ、遺伝子によりコードされるタンパク質産物、またはそれらの任意の組み合わせの量またはコピー数とすることができる。遺伝子発現結果はまた、標準に対し正規化し、または比較することができる。遺伝子発現結果は、例えば、遺伝子が発現され、過剰発現され、または２つ以上の試料において差次的に発現されるかどうかを決定するために使用することができる。
【００５３】
「相同性」という用語は本明細書では、相補性度を示す。部分相同性または完全相同性が存在し得る。「同一性」という単語は、「相同性」という単語の代わりとなり得る。同一配列が標的核酸にハイブリダイズするのを少なくとも部分的に抑制する部分的に相補的な核酸配列は、「実質的に相同」と呼ばれる。完全に相補的な核酸配列の標的配列へのハイブリダイゼーションの抑制は、ハイブリダイゼーションアッセイ（サザンまたはノーザンブロット、溶液ハイブリダイゼーション、など）を用いて、ストリンジェンシーを低減させた条件下で調査され得る。実質的に相同な配列またはハイブリダイゼーションプローブは、ストリンジェンシーを低減させた条件下で、完全に相同な配列の標的配列への結合に対し競争し、これを抑制する。ストリンジェンシーを低減させた条件は、非特異的結合を許可するものであると言っているわけではなく、というのも、ストリンジェンシーを低減させた条件は、２つの配列の互いへの結合が特異的（すなわち、選択的）相互作用であることを要求するからである。非特異的結合がないことは、部分相補性度さえも欠く（例えば、約３０％未満の相同性または同一性）第２の標的配列の使用により試験され得る。非特異的結合がない場合、実質的に相同な配列またはプローブは、第２の非相補的標的配列にハイブリダイズしない。
【００５４】
本明細書では、「ハイブリダイゼーション」または「ハイブリダイズする」という用語は、相補的ヌクレオシドまたはヌクレオチド塩基間の水素結合（Ｗａｔｓｏｎ−Ｃｒｉｃｋ、フーグスティーンまたは逆フーグスティーン水素結合であってもよい）を示す。例えば、アデニンおよびチミンは相補的核酸塩基であり、これらは水素結合の形成を介して対形成する。核酸分子に関して本明細書で使用される「相補的」は、２つのヌクレオチド間の正確な対形成の能力を示す。例えば、オリゴヌクレオチドのある位置にあるヌクレオチドがＤＮＡまたはＲＮＡ分子の同じ位置にあるヌクレオチドと水素結合することができる場合、オリゴヌクレオチドおよびＤＮＡまたはＲＮＡは、その位置で互いに相補的であると考えられる。オリゴヌクレオチドおよびＤＮＡまたはＲＮＡは、各分子内の十分な数の対応する位置が、互いに水素結合することができるヌクレオチドにより占められる場合に互いに相補的である。よって、「特異的にハイブリダイズ可能」および「相補的」は、オリゴヌクレオチドとＤＮＡまたはＲＮＡ標的の間で安定な特異的結合が起こるような、十分な相補性度または正確な対形成を示すために使用される用語である。核酸配列は、特異的にハイブリダイズ可能であるその標的核酸に１００％相補的である必要はないことが当技術分野においては理解される。核酸化合物は、特異的結合が望ましい条件下、すなわち、インビボアッセイまたは治療的処置の場合生理的条件下、およびインビトロアッセイの場合アッセイが実施される条件下で、分子の標的への結合が存在し、かつ、分子の非標的配列への非特異的結合を回避するのに十分な相補性度が存在する場合に、特異的にハイブリダイズ可能である。
【００５５】
「抑制する」という用語は、症状の発症を防止する、症状を軽減する、または疾患、病状または障害を排除するための本開示の化合物の投与を含む。「抑制する」という用語はまた、遺伝子、例えば癌関連配列をコードする遺伝子の発現レベルを低下させることを示し得る。ＲＮＡおよび／またはタンパク質の発現レベルは低下され得る。
【００５６】
「標識」および／または検出可能な物質という用語は、アッセイ試料中の標的ポリヌクレオチドの存在を示す検出可能なシグナルを生成することができる組成物を示す。好適な標識としては、放射性同位体、ヌクレオチド発色団、酵素、基質、蛍光分子、化学発光部分、磁性粒子、生物発光部分、などが挙げられる。そのようなものとして、標識は装置または方法、例えば、限定はされないが、分光、光化学、生化学、免疫化学、電気、光学、化学検出装置または任意の他の適切な装置により検出可能な任意の組成物である。いくつかの実施形態では、標識は、装置に頼らないで視覚的に検出可能であってもよい。「標識」という用語は、検出可能な物理的特性を有する任意の化学基または部分、あるいは化学基または部分に、検出可能な物理的特性を表させることができる任意の化合物、例えば基質の検出可能な生成物への変換を触媒する酵素を示すために使用される。「標識」という用語はまた、特定の物理的特性の発現を抑制する化合物を含む。標識はまた、結合対の１つのメンバーである化合物であってもよく、それの他のメンバーは検出可能な物理的特性を有する。
【００５７】
本明細書では、「マイクロアレイ」は、固体サポートの表面上で形成される、例えば、別々の領域（それぞれが規定された面積を有する）の直線または二次元アレイを示す。マイクロアレイ上の別々の領域の密度は、単一の固相サポートの表面上で検出される標的ポリヌクレオチドの総数により決定され、好ましくは少なくとも約５０／ｃｍ２、より好ましくは少なくとも約１００／ｃｍ２、さらにより好ましくは少なくとも約５００／ｃｍ２、およびいっそうより好ましくは少なくとも約１，０００／ｃｍ２である。本明細書では、ＤＮＡマイクロアレイは、標的ポリヌクレオチドを同定する、増幅する、検出する、またはクローン化するために使用される、チップまたは他の表面上に配置されたオリゴヌクレオチドプライマーのアレイである。アレイ内のプライマーの各特定の基の位置は知られているので、標的ポリヌクレオチドの同一性は、マイクロアレイ内の特定の位置へのそれらの結合に基づき決定することができる。
【００５８】
本明細書では、「自然発生」という用語は、自然で通常見出される形態であってもよい配列または構造を示す。「自然発生」は、任意の動物で通常見出される形態の配列を含み得る。
【００５９】
本明細書では、「核酸」「ポリヌクレオチド」もしくは「オリゴヌクレオチド」または本明細書における等価物の使用は、共に共有結合された少なくとも２つのヌクレオチドを意味する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは６、８、１０、１２、２０、３０または１００までのヌクレオチドのオリゴマである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも６、８、１０、１２、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、３００、４００、または５００のヌクレオチドのオリゴマである。「ポリヌクレオチド」または「オリゴヌクレオチド」は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ＰＮＡまたはリン酸ジエステルおよび／または任意の別の結合により連結されたヌクレオチドのポリマを含み得る。
【００６０】
「パーセント相同性」「％相同性」「パーセント同一性」または「％同一性」という句は、２つ以上のアミノ酸または核酸配列の比較において見出される配列類似性のパーセンテージを示す。パーセント同一性は、電子的に、例えば、ＭＥＧＡＬＩＧＮプログラム（ＬＡＳＥＲＧＥＮＥソフトウェアパッケージ、ＤＮＡＳＴＡＲ）を使用して決定することができる。ＭＥＧＡＬＩＧＮプログラムは、異なる方法、例えば、Ｃｌｕｓｔａｌ方法により、２つ以上の配列間でアラインメントを生成させることができる。（Ｈｉｇｇｉｎｓ，  Ｄ．  Ｇ．  ａｎｄ  Ｐ．  Ｍ．  Ｓｈａｒｐ  （１９８８）  Ｇｅｎｅ  ７３：２３７−２４４）。Ｃｌｕｓｔａｌアルゴリズムは、全ての対間の距離を調べることにより、配列をクラスターに分類する。クラスターは、ペアワイズで、その後、群で整列される。２つのアミノ酸配列、例えば、配列Ａと配列Ｂの間のパーセンテージ類似性は、配列Ａの長さ、−配列Ａにおけるギャップ残基の数、−配列Ｂにおけるギャップ残基の数を、配列Ａと配列Ｂの間での残基一致の合計で割り、１００倍することにより計算される。２つのアミノ酸配列間の相同性が低いまたはないギャップはパーセンテージ類似性の決定に含めない。核酸配列間のパーセント同一性はまた、Ｃｌｕｓｔａｌ方法、または当技術分野で知られている他の方法、例えばＪｏｔｕｎ  Ｈｅｉｎ方法により計算することができる（例えば、Ｈｅｉｎ，  Ｊ．  （１９９０）  Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．  １８３：６２６−６４５を参照されたい）。配列間の同一性はまた、当技術分野で知られている他の方法により、例えば、ハイブリダイゼーション条件を変動させることにより決定することができる。
【００６１】
「薬学的に許容される」により、担体、希釈剤または賦形剤は製剤の他の成分と適合しなければならず、そのレシピエントに有害であってはならいことが意味される。
【００６２】
本明細書では、指定された配列「に由来する」ポリヌクレオチドは、指定されたヌクレオチド配列のある領域に対応するおよそ少なくとも約６のヌクレオチド、好ましくは少なくとも約８のヌクレオチド、より好ましくは少なくとも約１０−１２のヌクレオチド、さらにより好ましくは少なくとも約１５−２０のヌクレオチドの配列から構成されるポリヌクレオチド配列を示す。「対応する」は、指定された配列に相同または相補的であることを意味する。好ましくは、ポリヌクレオチドが由来する領域の配列は、癌関連遺伝子に特有の配列に相同または相補的である。
【００６３】
本明細書では、「試料」という用語は、試薬、例えば限定はされないが、治療物、薬物、または候補作用物質で試験または処理される組成物を示す。試料は被験体から取得され得る。いくつかの実施形態では、試料は血液、血漿、血清、またはそれらの任意の組み合わせであってもよい。試料は、血液、血漿、血清、またはそれらの任意の組み合わせに由来してもよい。他の典型的な試料としては、哺乳類被験体から取得される任意の体液、組織生検、痰、リンパ流体、血液細胞（例えば、末梢血単核球）、組織または細針生検試料、尿、腹水、初乳、母乳、胎児流体、糞便物質、涙、胸水、またはそれら由来の細胞が挙げられるが、それらに限定されない。試料は本明細書で記載される方法で使用される前に何らかの形で加工処理してもよく、例えば、特定の構成成分が、以下に記載される方法のいずれかにより分析または試験される。１つ以上の分子が試料から単離されてもよい。
【００６４】
「特異的結合」「特異的に結合する」などの用語は、２つ以上の分子が、生理的またはアッセイ条件下で測定可能であり、選択的である複合体を形成する場合を示す。抗体または抗原結合タンパク質あるいは他の分子は、適切に選択された条件下で、そのような結合が実質的に抑制されず、同時に非特異的結合が抑制される場合、タンパク質、抗原、またはエピトープに「特異的に結合する」と言われる。特異的結合は、高親和性により特徴付けられ、化合物、タンパク質、エピトープ、または抗原に選択的である。非特異的結合は、通常低親和性を有する。
【００６５】
本明細書では、「組換えタンパク質」は、組換え技術を用いて、例えば、限定はされないが、上記で表される組換え核酸の発現により生成されるタンパク質である。組換えタンパク質は、少なくとも１つ以上の特徴により自然発生タンパク質から区別され得る。例えば、タンパク質は、その野生型宿主において通常関連するタンパク質および化合物のいくつかまたは全てから単離または精製することができ、よって実質的に純粋であり得る。例えば、単離されたタンパク質は、その天然状態で通常関連する材料の少なくともいくらかを伴わず、好ましくはある試料中の総タンパク質の少なくとも約０．５重量％、より好ましくは少なくとも約５重量％を構成する。実質的に純粋なタンパク質は約５０−７５％、約８０％、または約９０％を占める。いくつかの実施形態では、実質的に純粋なタンパク質は、総タンパク質の約８０−９９重量％、８５−９９重量％、９０−９９重量％、９５−９９重量％、または９７−９９重量％を占める。組換えタンパク質はまた、１つの生物（例えばヒト）からの異なる生物（例えば酵母、大腸菌、など）または宿主細胞における癌関連タンパク質の生成を含むことができる。また、タンパク質は、誘導性プロモーターまたは高発現プロモーターの使用により、通常見られるものよりも著しく高い濃度で生成させることができ、そのため、タンパク質は増加した濃度レベルで生成される。また、タンパク質は、自然で通常見出されない形態で、本明細書で記載されるように、エピトープタグの付加またはアミノ酸置換、挿入および欠失などで存在し得る。
【００６６】
「サポート」という用語は、従来のサポート、例えばビーズ、粒子、ディップスティック、繊維、フィルタ、膜、およびシランまたはシリケートサポート、例えばガラススライドを示す。
【００６７】
本明細書では、「タグ」「配列タグ」または「プライマータグ配列」という用語は、その中にそのようなタグを有するポリヌクレオチドのバッチを同定するように機能する特定核酸配列を有するオリゴヌクレオチドを示す。同じ生物源由来のポリヌクレオチドは、特定配列タグで共有結合によりタグがつけられ、よってその後の分析では、ポリヌクレオチドは、その起源により同定することができる。配列タグはまた、核酸増幅反応のためのプライマーとして機能する。
【００６８】
本明細書では、「治療物」または「治療薬」という用語は、患者の望まれない病状または疾患を治療する、闘う、寛解する、防止するまたは改善するために使用することができる作用物質を意味する。一部において、本開示の実施形態は、癌の治療または細胞の増殖の減少に関する。いくつかの実施形態では、「治療物」または「治療薬」という用語は、標的マーカー、その発現またはその機能と関連する、またはこれに影響する任意の分子を示し得る。様々な実施形態では、そのような治療物としては、標的マーカー、その発現またはその機能と関連する、またはこれに影響する分子、例えば、例として、治療細胞、治療ペプチド、治療遺伝子、治療化合物、などが挙げられる。
【００６９】
組成物の「治療的有効量」または「有効量」は、所望の効果を達成する、すなわち、細胞の活性化、移動、または増殖を抑制する、ブロックする、または逆転させるように計算された、あらかじめ決められた量である。いくつかの実施形態では、有効量は予防量である。いくつかの実施形態では、有効量は、疾患または病状を医学的に治療するために使用される量である。治療および／または予防的効果を得るために、この発明により投与される組成物の特定用量はもちろん、症例を取り巻く特定の状況、例えば、例として、投与される組成物、投与経路、および治療される病状により決定されるであろう。投与される有効量は医師により、関連する状況、例えば治療される病状、投与される組成物の選択、および選択した投与経路を考慮して決定されることが理解されるであろう。この発明の組成物の治療的有効量は、典型的には、生理的に耐容される賦形剤組成物で投与された場合、標的組織において有効な全身濃度または局所濃度を達成するのに十分なものとなる量である。
【００７０】
「治療する」「治療された」または「治療すること」という用語は、本明細書では治療的処置または予防的もしくは防止的手段の両方を示すことができ、ここで、目的は、望ましくない生理的状態、障害または疾患を防止するまたは減速させる（低下させる）、あるいは有益なまたは望ましい臨床結果を得ることである。いくつかの実施形態では、この用語は、治療することおよび防止することの両方を示し得る。この開示の目的のために、有益なまたは望ましい臨床結果としては下記が挙げられるが、それらに限定されない：症状の軽減；病状、障害または疾患の程度の減少；病状、障害または疾患の様子の安定化（すなわち、悪化なし）；病状、障害または疾患の発症の遅延または進行の減速；病状、障害または病態の寛解；ならびに病状、障害または疾患の緩解（部分的か全体的かに関係なく）、検出可能か検出不能かに関係なく、あるいは増強または改善。治療は、過剰レベルの副作用なしで臨床的に有意な応答を誘発することを含む。治療はまた、治療を受けない場合に予想される生存時間と比べて生存時間を長くすることを含む。
【００７１】
「組織」という用語は、本明細書では、特定の機能の実行で一致する同様に特殊化した細胞の任意の集合を示す。
【００７２】
本明細書では、「任意的な」または「任意で」という用語は、その後に記載される構造、事象または状況が起こっても、起こらなくてもよい実施形態を示し、その記載は、事象が起きる場合および事象が起こらない場合を含む。
【００７３】
癌
本明細書で記載される様々な実施形態は、癌を治療、診断、予後、可視化および検出する方法、組成物およびキットを提供する。本明細書で記載される実施形態は、下記を含む任意の癌に関する：アプドーマ、分離腫、鰓腫、悪性カルチノイド症候群、カルチノイド心疾患、癌腫（例えば、Ｗａｌｋｅｒ、基底細胞、基底扁平細胞、Ｂｒｏｗｎ−Ｐｅａｒｃｅ、腺管、Ｅｈｒｌｉｃｈ腫瘍、上皮内、Ｋｒｅｂｓ２、メルケル細胞、粘液性、非小細胞肺、燕麦細胞、乳頭、スキルス、細気管支、気管支原性、扁平細胞および移行細胞）、組織球性障害、白血病（例えば、ｂ細胞、混合細胞、ヌル細胞、Ｔ細胞、Ｔ細胞性慢性、ＨＴＬＶ−ＩＩ関連、リンパ球性急性、リンパ球性慢性、マスト細胞、および骨髄）、悪性組織球増殖症、ホジキン病、免疫増殖性小、非ホジキンリンパ腫、形質細胞腫、細網内皮症、メラノーマ、軟骨芽細胞腫、軟骨腫、軟骨肉腫、線維腫、線維肉腫、巨細胞腫、組織球腫、脂肪腫、脂肪肉腫、中皮腫、粘液腫、粘液肉腫、骨腫、骨肉腫、ユーイング肉腫、滑膜腫、腺線維腫、腺リンパ腫、癌肉腫、脊索腫、頭蓋咽頭腫、未分化胚細胞腫、過誤腫、間葉腫、中腎腫、筋肉腫、エナメル上皮腫、セメント質腫、歯牙腫、奇形腫、胸腺腫、絨毛性腫瘍、腺癌、腺腫、胆管腫、真珠腫、円柱腫、嚢胞腺癌、嚢胞腺腫、顆粒膜細胞腫、卵巣男性胚細胞腫、肝細胞腫、汗腺腫、膵島腫瘍、ライディッヒ細胞腫、乳頭腫、セルトリ細胞腫、莢膜細胞腫、平滑筋腫、平滑筋肉腫、筋芽細胞腫、筋腫、筋肉腫、横紋筋腫、横紋筋肉腫、上衣腫、神経節腫、神経膠腫、髄芽腫、髄膜腫、神経鞘腫、神経芽細胞腫、神経上皮腫、神経線維腫、神経腫、傍神経節腫、非クロム親和性傍神経節腫、被角血管腫、好酸球性血管リンパ球増殖症、硬化性血管腫、血管腫症、グロムス血管腫、血管内皮腫、血管腫、血管外皮腫、血管肉腫、リンパ管腫、リンパ管筋腫、リンパ管肉腫、松果体腫、癌肉腫、軟骨肉腫、葉状嚢胞性肉腫、線維肉腫、血管肉腫、平滑筋肉腫、白血肉腫、脂肪肉腫、リンパ管肉腫、筋肉腫、粘液肉腫、骨肉腫、横紋筋肉腫、肉腫（例えば、ユーイング、実験的、カポジ、およびマスト細胞）、骨、乳房、消化器系、結腸直腸、肝臓、膵臓、下垂体、精巣、眼窩、頭頸部、中枢神経系、内耳、骨盤、気道、および尿生殖路の新生物、神経線維腫症、子宮頚部異形成、またはその組み合わせ。本明細書で開示される方法はまた、細胞が不死となった他の病状の診断および治療のために使用され得る。いくつかの実施形態では、癌は下記から選択され得る：乳腺腫瘍浸潤性乳管癌、乳腺腫瘍小葉癌、結腸の腺癌、子宮頸部腫瘍扁平上皮癌、子宮頸部腫瘍腺癌、卵巣腫瘍癌、卵巣腫瘍漿液性嚢胞腺癌、肺扁平細胞の肺癌、肺の肺腺癌、肺大細胞の肺癌、肺腫瘍非小細胞癌腺癌、胸膜中皮腫、食道腫瘍扁平上皮癌、膀胱移行細胞の膀胱癌、膵管の膵臓腺癌、膵臓腺腫瘍神経内分泌癌大細胞、精巣の精巣精上皮腫、胆管の胆管細胞癌、胃腫瘍腺癌、腸型胃腫瘍腺癌、乳房原発腫瘍、結腸原発腫瘍、ＭＰ肺原発腫瘍、直腸原発腫瘍、乳房の転移性乳腺癌、結腸の転移性結腸腺癌、卵巣の漿液性転移性卵巣腺癌、腎臓細胞の転移性腎癌、食道胃接合部の転移性食道胃接合部腺癌、頸部扁平細胞の転移性頸部癌、甲状腺乳頭の転移性甲状腺癌、膀胱小細胞の転移性膀胱癌、前立腺の転移性前立腺腺癌、ＭＰ２結腸転移性腫瘍、直腸転移性腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌漿液性嚢胞腺癌、肝臓腫瘍転移性新生物腺癌、軟部の悪性結合組織腫瘍巨細胞腫、軟骨の軟骨肉腫、骨の転移性骨肉腫、原発性平滑筋肉腫と一致する転移性平滑筋肉腫、および子宮内膜の転移性子宮内膜間質肉腫。他の癌としては、骨、乳房、消化器系、結腸直腸、肝臓、膵臓、下垂体、精巣、眼窩、頭頸部、中枢神経系、内耳、骨盤、気道、および尿生殖路の新生物、神経線維腫症、子宮頚部異形成が挙げられる。
【００７４】
部位により分類される癌としては、下記が挙げられるが、それらに限定されない：口腔および咽頭の癌（唇、舌、唾液腺、口腔底、歯肉および他の口、上咽頭、扁桃、中咽頭、下咽頭、他の口腔／咽頭）；消化器系の癌（食道；胃；小腸；結腸および直腸；肛門、肛門管、および肛門直腸；肝臓；肝内胆管；胆嚢；他の胆管；膵臓；後腹膜；腹膜、網、および腸間膜；他の消化器）；呼吸器系の癌（鼻腔、中耳、および洞；喉頭；肺および気管支；胸膜；気管、縦隔、および他の呼吸器）；中皮腫の癌；骨および関節；ならびに軟部組織（心臓を含む）；皮膚癌、例えばメラノーマおよび他の非上皮性皮膚癌；カポジ肉腫および乳癌；女性生殖器系の癌（子宮頸部；子宮体；子宮、ｎｏｓ；卵巣；腟；外陰；および他の女性生殖器）；男性生殖器系の癌（前立腺；精巣；陰茎；および他の男性生殖器）；泌尿器系の癌（膀胱；腎臓および腎盂；尿管；および他の泌尿器）；目および眼窩の癌；脳および神経系の癌（脳；および他の神経系）；内分泌系の癌（甲状腺および他の内分泌、胸腺を含む）；リンパ腫（ホジキン病および非ホジキンリンパ腫）、多発性骨髄腫、および白血病（リンパ球性白血病；骨髄性白血病；単球性白血病；および他の白血病）。
【００７５】
本明細書で開示される癌の診断、予後、検出、治療に関するいくつかの実施形態では、癌は乳、膀胱、肺、結腸、膵臓、腎臓および結腸癌から選択され得る。物質の組成物、例えば単離されたタンパク質、ペプチド、核酸、キットおよびキットの構成成分に関するいくつかの実施形態では、癌は乳、膀胱、肺、結腸、膵臓、腎臓および結腸癌から選択され得る。
【００７６】
癌関連配列
いくつかの実施形態では、本開示は、癌と関連する核酸およびタンパク質配列を提供し、これらは、本明細書では「癌関連」または「ＣＡ」配列と呼ばれる。核酸および／またはタンパク質は、下記で提供される遺伝子のいずれかによりコードされ得る。癌関連配列は、以下に開示される癌のいずれかと関連し得る。したがって、癌関連配列は以下に開示される癌のいずれかの腫瘍において見出される癌細胞において発現され得る。いくつかの実施形態では、癌関連配列は腫瘍において見出される癌細胞では、非癌細胞、例えば、癌において見出される同じ組織型の非癌細胞に比べて、高いレベルで発現される。
【００７７】
いくつかの実施形態では、「癌関連配列」という用語は、ヌクレオチドまたはタンパク質配列は、正常組織と比べて癌では、差次的に発現され、活性化され、不活性化されまたは変化されることを示し得る。癌関連配列は、癌において、上方制御され（すなわち、より高いレベルで発現され）るもの、ならびに下方制御され（すなわちより低いレベルで発現され）るものを含み得る。癌関連配列はまた、変化された配列（すなわち、転座、切断配列または置換、欠失または挿入、例えば、限定はされないが、点変異を有する配列）を含み、同じ発現プロファイルかまたは変化されたプロファイルのいずれかを示すことができる。いくつかの実施形態では、癌関連配列はヒト由来であり；しかしながら、当業者に認識されるように、任意の被験体を含む他の生物由来の癌関連配列が、疾患および薬物評価の動物モデルにおいて有用である可能性があり；したがって、他の癌関連配列、例えば、限定はしないが、脊椎動物、例えば哺乳類、例えば齧歯類（ラット、マウス、ハムスター、モルモット、など）、霊長類、および農場動物（例えば、ヒツジ、ヤギ、ブタ、雌ウシ、ウマ、など）由来の配列は有用であり得る。他の生物由来の癌関連配列は、本明細書で概略が示される技術を用いて得ることができる。
【００７８】
癌関連配列は癌の診断、予後および治療と関連する１つ以上のマーカーをコードする核酸配列およびその断片を含む。配列は、ＤＮＡ配列、例えば単離されたＤＮＡ配列およびＲＮＡ、例えばｍＲＮＡ配列、例として単離されたＲＮＡ配列とすることができる。癌関連配列はまた、癌関連配列由来のＤＮＡ、例えば下記遺伝子の１つ以上をコードするＤＮＡ配列によりコードされるタンパク質およびペプチド断片を含む：ホモサピエンスメラノーマ優先発現抗原（ＰＲＡＭＥ）、ホモサピエンス抗ミュラー管ホルモン（ＡＭＨ）、ホモサピエンス１２番染色体翻訳領域５６（Ｃ１２ｏｒｆ５６）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子６（ＤＳＣＲ６）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ誘導活性ポリペプチド１（ＧＮＧＴ１）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー３５、メンバーＤ３（ＳＬＣ３５Ｄ３）、ホモサピエンス２番染色体翻訳領域７０（Ｃ２ｏｒｆ７０）、ホモサピエンスカドヘリン、ＥＧＦ  ＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３（フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＥＬＳＲ３）、ホモサピエンスコラーゲン、Ｘ型、α１（ＣＯＬ１０Ａ１）、ホモサピエンスダウン症候群責任領域遺伝子８（ＤＳＣＲ８）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスｌｉｎ−２８ホモログＢ（線虫）（ＬＩＮ２８Ｂ）、ホモサピエンス中胚葉特異的トランスクリプトホモログ（マウス）（ＭＥＳＴ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１２（マクロファージエラスターゼ）（ＭＭＰ１２）、ホモサピエンスＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１（ＳＢＫ１）、ＡＧＥＮＣＯＵＲＴ＿１０２２９５９６  ＮＩＨ＿ＭＧＣ＿１４１ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：６５６３９２３  ５、ホモサピエンス補体第１成分、ｑ小成分様４（Ｃ１ＱＬ４）、ｍＲＮＡ、ホモサピエンス９番染色体翻訳領域１４０（Ｃ９ｏｒｆ１４０）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ４（ＣＴ４５Ａ４）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）、ホモサピエンスδ様３（ショウジョウバエ）（ＤＬＬ３）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、ＫＱＴ様サブファミリー、メンバー２（ＫＣＮＱ２）、ホモサピエンスＬＥＭドメイン含有１（ＬＥＭＤ１）、ホモサピエンス類似ＧＡＧＥ−２タンパク質（Ｇ抗原２）（ＬＯＣ６４５０３７）、ホモサピエンス類似微小管結合タンパク質６アイソフォーム１（ＬＯＣ６４７３１５）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ１１（ストロメライシン３）（ＭＭＰ１１）、ホモサピエンスＮＫ２転写因子関連、座位５（ショウジョウバエ）（ＮＫＸ２−５）、ホモサピエンス副甲状腺ホルモン様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）、ホモサピエンスｓａｌ様４（ショウジョウバエ）（ＳＡＬＬ４）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス５６（ＳＮＯＲＤ５６）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ａ（ＣＳＡＧ３Ａ）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー８３、メンバーＡ（ＦＡＭ８３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス類似ｈＣＧ１８１２０７４（ＬＯＣ１００１３４３３１）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４２４７７、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ６４２４７７）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４５０９９、トランスクリプトバリアント１（ＬＯＣ６４５０９９）、ホモサピエンス類似ＴＰ５３ＴＧ３タンパク質、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ７２９２６４）、ホモサピエンスプロトカドヘリンβ２（ＰＣＤＨＢ２）、ホモサピエンスペプチダーゼインヒビター３、皮膚誘導（ＳＫＡＬＰ）（ＰＩ３）、ホモサピエンスＴＰ５３標的３（ＴＰ５３ＴＧ３）、ホモサピエンスカテプシンＬ２（ＣＴＳＬ２）、ホモサピエンスグレムリン１、システインノットスーパーファミリー、ホモログ（アフリカツメガエル）（ＧＲＥＭ１）、ホモサピエンスカリウムチャネル、サブファミリーＫ、メンバー１７（ＫＣＮＫ１７）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスクリングル含有膜貫通タンパク質２（ＫＲＥＭＥＮ２）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３００８２、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ１００１３００８２）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ６４５６８２（ＬＯＣ６４５６８２）、ホモサピエンスオルファクトメジン４（ＯＬＦＭ４）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１（ＰＰＥＦ１）、ホモサピエンスｒｅｐｒｉｍｏ様（ＲＰＲＭＬ）、ホモサピエンス無翅型ＭＭＴＶ組込み部位ファミリー、メンバー１０Ａ（ＷＮＴ１０Ａ）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＦＬＪ２２１８４（ＦＬＪ２２１８４）、ホモサピエンスラミニン、γ２（ＬＡＭＣ２）、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼ１５（ＭＡＰＫ１５）、ホモサピエンスヌクレオポリン２１０ｋＤａ（ＮＵＰ２１０）、ホモサピエンスアスパラギン結合グリコシル化１様（ＡＬＧ１Ｌ）、ホモサピエンスグアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）、γ４（ＧＮＧ４）、ホモサピエンスハラキリ、ＢＣＬ２相互作用タンパク質（ＢＨ３ドメインのみを含む）（ＨＲＫ）、ホモサピエンス核内因子（赤血球由来２）様３（ＮＦＥ２Ｌ３）、ホモサピエンスｔｅｔ癌遺伝子１（ＴＥＴ１）、ホモサピエンスセプチン３（ＳＥＰＴ３）、ホモサピエンスａｃｈａｅｔｅ−ｓｃｕｔｅ複合体ホモログ１（ショウジョウバエ）（ＡＳＣＬ１）、ホモサピエンスＢＣＬ２相互作用キラー（アポトーシス誘導）（ＢＩＫ）、ホモサピエンス２１番染色体翻訳領域１２９（Ｃ２１ｏｒｆ１２９）、ホモサピエンスカルパイン１２（ＣＡＰＮ１２）、ホモサピエンスクロモボックスホモログ８（Ｐｃクラスホモログ、ショウジョウバエ）（ＣＢＸ８）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｃモチーフ）リガンド２０（ＣＣＬ２０）、ホモサピエンス絨毛性ゴナドトロピン、βポリペプチド５（ＣＧＢ５）、ホモサピエンスクローディン９（ＣＬＤＮ９）、ホモサピエンス軟骨肉腫関連遺伝子１（ＣＳＡＧ１）、ホモサピエンスＣＳＡＧファミリー、メンバー３Ｂ（ＣＳＡＧ３Ｂ）、ホモサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ１（ＣＴ４５Ａ１）、���モサピエンス癌／精巣抗原ファミリー４５、メンバーＡ５（ＣＴ４５Ａ５）、ホモサピエンス癌／精巣抗原２（ＣＴＡＧ２）、ホモサピエンスＣＣＣＴＣ結合因子（亜鉛フィンガータンパク質）様（ＣＴＣＦＬ）、ホモサピエンス内在性レトロウイルス配列Ｋ、６（ＥＲＶＫ６）、ホモサピエンス配列類似性保有ファミリー１３３、メンバーＡ（ＦＡＭ１３３Ａ）、予想：ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＦＬＪ３９６３２）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ３ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ３Ｈ）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ４ｈ（ＨＩＳＴ１Ｈ４Ｈ）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１１９９（ＫＩＡＡ１１９９）、ホモサピエンスＬＩＮＥ−１型トランスポサーゼドメイン含有１（Ｌ１ＴＤ１）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス２（ＬＨＸ２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３２５６４（ＬＯＣ１００１３２５６４）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ４００８７９、トランスクリプトバリアント２（ＬＯＣ４００８７９）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６４３２７２（ＬＯＣ６４３２７２）、ホモサピエンス類似ＣＳＡＧファミリー、メンバー２（ＬＯＣ６５３２９７）、ホモサピエンス仮定ＬＯＣ７２９６６９（ＬＯＣ７２９６６９）、ホモサピエンスメソテリン（ＭＳＬＮ）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスワンカットホメオボックス２（ＯＮＥＣＵＴ２）、ホモサピエンスプロタンパク質転換酵素スブチリシン／ケキシン型１（ＰＣＳＫ１）、ホモサピエンス膵臓および十二指腸ホメオボックス１（ＰＤＸ１）、ホモサピエンス妊娠特異β１糖タンパク質１（ＰＳＧ１）、ホモサピエンスセルピンペプチダーゼインヒビター、クレードＡ（α−１抗プロテイナーゼ、アンチトリプシン）、メンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ホモサピエンスシナプトネマ複合体タンパク質２（ＳＹＣＰ２）、ホモサピエンスチューダードメイン含有５（ＴＤＲＤ５）、ホモサピエンスウロテンシン２ドメイン含有（ＵＴＳ２Ｄ）、ホモサピエンスＷＤリピートドメイン６６（ＷＤＲ６６）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１Ｂ（ＸＡＧＥ１Ｂ）、ＲＣ２−ＣＴ０３２１−１１０１００−０１３−ｃ０８  ＣＴ０３２１ホモサピエンスｃＤＮＡ、ホモサピエンスｍｕｔＳホモログ５（大腸菌）（ＭＳＨ５）、ホモサピエンスＭｄｍ２、トランスフォーム３Ｔ３細胞二重微小染色体２、ｐ５３結合タンパク質（マウス）結合タンパク質、１０４ｋＤａ（ＭＴＢＰ）、ホモサピエンスコラーゲン、ＸＩ型、α１（ＣＯＬ１１Ａ１）、ホモサピエンスドッキングタンパク質７（ＤＯＫ７）、ホモサピエンス線維芽細胞成長因子１１（ＦＧＦ１１）、ホモサピエンスグルタミン酸デカルボキシラーゼ１（脳、６７ｋＤａ）（ＧＡＤ１）、ホモサピエンスＨＯＲＭＡドメイン含有１（ＨＯＲＭＡＤ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１２（ＭＡＧＥＡ１２）、ホモサピエンスマトリクスメタロペプチダーゼ７（マトリライシン、子宮）（ＭＭＰ７）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＬ１／ＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５（ＮＳＵＮ５）��ホモサピエンスＴ−ボックス１（ＴＢＸ１）、ホモサピエンス腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー６ｂ、デコイ（ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ）、ホモサピエンスＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼ１ファミリー、ポリペプチドＡ６（ＵＧＴ１Ａ６）、ホモサピエンス亜鉛フィンガータンパク質２８０Ａ（ＺＮＦ２８０Ａ）、ホモサピエンスエピフィカン（ＥＰＹＣ）、ホモサピエンスニューロメジンＵ（ＮＭＵ）、ホモサピエンスＳＰＲＹドメイン含有５（ＳＰＲＹＤ５）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、１７０００５３２６４０９９５ＧＲＮ＿ＥＳホモサピエンスｃＤＮＡ５、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ６５１９５７（ＬＯＣ６５１９５７）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合３Ａ（ＶＣＸ３Ａ）、ホモサピエンスケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃモチーフ）受容体３（ＣＸＣＲ３）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２ａｍ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＡＭ）、ホモサピエンスキネシンファミリーメンバー２４（ＫＩＦ２４）、ホモサピエンス３番染色体翻訳領域３２（Ｃ３ｏｒｆ３２）、ホモサピエンスインターロイキン８（ＩＬ８）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｈ／ＡＣＡボックス７２（ＳＮＯＲＡ７２）、ホモサピエンスニューロテンシン（ＮＴＳ）、ホモサピエンスタンパク質ホスファターゼ１Ｅ（ＰＰ２Ｃドメイン含有）（ＰＰＭ１Ｅ）、ホモサピエンス膜貫通４Ｌ６ファミリーメンバー１９、トランスクリプトバリアント２（TM4SF19)、ホモサピエンスバキュロウイルスＩＡＰリピート含有７（ＢＩＲＣ７）、ホモサピエンスニューレキソフィリン４（ＮＸＰＨ４）、ホモサピエンスアネキシンＡ１３（ＡＮＸＡ１３）、ホモサピエンスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ編集酵素、触媒ポリペプチド１（ＡＰＯＢＥＣ１）、ホモサピエンス１番染色体翻訳領域１１０（Ｃ１ｏｒｆ１１０）、ホモサピエンスＣ１ｑおよび腫瘍壊死因子関連タンパク質３（Ｃ１ＱＴＮＦ３）、ホモサピエンスＣＤ７０分子（ＣＤ７０）、ホモサピエンスチトクロムｃオキシダーゼサブユニットＶＩＩｂ２（ＣＯＸ７Ｂ２）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｂ（ＧＡＧＥ１２Ｂ）、ホモサピエンスＧ抗原１２Ｇ（ＧＡＧＥ１２Ｇ）、ホモサピエンスグリセルアルデヒド‐３‐リン酸デヒドロゲナーゼ、精子形成（ＧＡＰＤＨＳ）、ホモサピエンスガメトサイト特異因子１（ＧＴＳＦ１）、ホモサピエンスヒストンクラスター１、Ｈ２
ｂｊ（ＨＩＳＴ１Ｈ２ＢＪ）、ホモサピエンスヒストンクラスター２、Ｈ４ａ（ＨＩＳＴ２Ｈ４Ａ）、ホモサピエンスインターネキシンニューロン中間径フィラメントタンパク質、α（ＩＮＡ）、ホモサピエンスカリウム電位依存性チャネル、サブファミリーＨ（ｅａｇ関連）、メンバー６（ＫＣＮＨ６）、ホモサピエンスカリウム大コンダクタンスカルシウム活性化チャネル、サブファミリーＭ、βメンバー２（ＫＣＮＭＢ２）、ホモサピエンスＫＩＡＡ１６８８タンパク質（ＫＩＡＡ１６８８）、ホモサピエンスＬＩＭホメオボックス８（ＬＨＸ８）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３１７０７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ１００１３３３１２）、ホモサピエンス仮定タンパク質ＬＯＣ１００１３３５４２（ＬＯＣ１００１３３５４２）、ホモサピエンス類似ケラチン８（ＬＯＣ１００１３４７９４）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ６５１３９７）、ホモサピエンスｍｉｓｃ＿ＲＮＡ（ＬＯＣ７２８１７８）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、１（抗原ＭＺ２−Ｅの発現を指揮する）（ＭＡＧＥＡ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、４（ＭＡＧＥＡ４）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＡ、６（ＭＡＧＥＡ６）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＢ、２（ＭＡＧＥＢ２）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、１（ＭＡＧＥＣ１）、ホモサピエンスメラノーマ抗原ファミリーＣ、２（ＭＡＧＥＣ２）、ホモサピエンス微小管結合タンパク質１軽鎖３α（ＭＡＰ１ＬＣ３Ａ）、トランスクリプトバリアント２、ホモサピエンスマイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１（ＭＡＰ４Ｋ１）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンスｍｉｃｒｏＲＮＡ２５（ＭＩＲ２５）、ホモサピエンスメタロチオネイン様５、精巣特異（テスミン）（ＭＴＬ５）、ホモサピエンスＮＡＤＨデヒドロゲナーゼ（ユビキノン）１αサブ複合体、４様２（ＮＤＵＦＡ４Ｌ２）、ホモサピエンスＮＬＲファミリー、パイリンドメイン含有７（ＮＬＲＰ７）、ホモサピエンスＮＯＰ２／Ｓｕｎドメインファミリー、メンバー５Ｃ（ＮＳＵＮ５Ｃ）、ホモサピエンス匂い分子結合タンパク質２Ｂ（ＯＢＰ２Ｂ）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー２（前立腺関連）（ＰＡＧＥ２）、ホモサピエンスＰ抗原ファミリー、メンバー５（前立腺関連）（ＰＡＧＥ５）、ホモサピエンスピッコロ（シナプス前サイトマトリクスタンパク質）（ＰＣＬＯ）、ホモサピエンスｐｉｗｉ様１（ショウジョウバエ）（ＰＩＷＩＬ１）、ホモサピエンスポドカリキシン様２（ＰＯＤＸＬ２）、ホモサピエンスプリオンタンパク質２（ｄｕｂｌｅｔ）（ＰＲＮＤ）、ホモサピエンス溶質輸送体ファミリー４５、メンバー２（ＳＬＣ４５Ａ２）、トランスクリプトバリアント１、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ａ（ＳＮＯＲＤ３Ａ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｃ（ＳＮＯＲＤ３Ｃ）、ホモサピエンス核小体低分子ＲＮＡ、Ｃ／Ｄボックス３Ｄ（ＳＮＯＲＤ３Ｄ）、ホモサピエンスＳａｄ１およびＵＮＣ８４ドメイン含有１（ＳＵＮＣ１）、ホモサピエンスシナプトタグミンＸＩ���Ｉ（ＳＹＴ１３）、ホモサピエンス三者間モチーフファミリー様２（ＴＲＩＭＬ２）、ホモサピエンス一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリーＭ、メンバー２（ＴＲＰＭ２）、ホモサピエンスチューブリン、β３（ＴＵＢＢ３）、ホモサピエンス尿路上皮癌関連１（非タンパク質コード）（ＵＣＡ１）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合（ＶＣＸ）、ホモサピエンス可変荷電Ｘ−Ｃ（ＶＣＸ−Ｃ）、ホモサピエンス変異荷電、Ｘ結合２（ＶＣＸ２）、ホモサピエンス変異荷電、Ｙ結合（ＶＣＹ）、ホモサピエンスＶＧＦ神経成長因子誘導性（ＶＧＦ）、ホモサピエンスＸ抗原ファミリー、メンバー１（ＸＡＧＥ１）、ＨＥＳＣ３＿１６＿Ｃ０５．ｇ１＿Ａ０３６ヒト胚性幹細胞ホモサピエンスｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：７４７６８７６  ５。前記癌関連配列のいずれか１つまたは２つ以上の組み合わせが、以下に記載される、癌を診断、検出、可視化および治療する方法、ならびに癌の治療、検出、可視化および診断に関連する組成物およびキットを含む、本明細書で開示される実施形態のいずれかで使用され得る。
【００７９】
いくつかの実施形態では、癌関連配列は核酸およびアミノ酸配列の両方を含み得る。いくつかの実施形態では、癌関連配列は、開示される配列と少なくとも約６０％の相同性を有する配列を含み得る。いくつかの実施形態では、癌関連配列は、開示される配列と少なくとも約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％、約９９．８％の相同性を有し得る。いくつかの実施形態では、癌関連配列は、「変異核酸」であってもよい。本明細書では、「変異核酸」は、欠失変異、挿入、点変異、置換、転座を示す。
【００８０】
いくつかの実施形態では、癌関連配列は核酸である。当業者により認識され、本明細書で記載されるように、本明細書における実施形態の癌関連配列は、様々な適用、例えば被験体において核酸またはそれらの発現レベル検出する診断適用、治療適用またはその組み合わせにおいて有用であり得る。さらに、本明細書における実施形態の癌関連配列は、スクリーニング適用；例えば、癌関連配列に対する核酸プローブを含むバイオチップの作製において使用され得る。
【００８１】
いくつかの実施形態では、癌関連配列は組換え核酸であってもよい。「組換え核酸」という用語により、本明細書では、一般に、ポリメラーゼおよびエンドヌクレアーゼによる核酸の操作により、自然で通常見出されない形態で、元々インビトロで形成された核酸分子を示す。したがって、組換え核酸はまた直線形態の単離された核酸であってもよく、または、通常連結されないＤＮＡ分子をライゲートすることによりインビトロで形成されるベクターでクローン化されてもよく、どちらも、この発明の目的のためには組換えと考えられる。組換え核酸が作製され、宿主細胞または生物に再導入されるとすぐに、インビトロ操作ではなく、宿主細胞のインビボ細胞機構を使用して複製することができるが；しかしながら、そのような核酸は、いったん組換えで生成されると、その後に、インビボで複製されても、依然として、本発明の目的のために、組換えまたは単離されたと考えられることが理解される。本明細書では、「ポリヌクレオチド」または「核酸」は任意の長さのヌクレオチド、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれかのポリマ形態である。この用語は、二本および一本鎖ＤＮＡおよびＲＮＡを含む。それはまた、下記を含む：公知の型の修飾、例えば、当技術分野で知られている標識、メチル化、「キャップ」、１つ以上の自然発生ヌクレオチドの類似体との置換、ヌクレオチド間修飾−例えば、例として、非荷電結合を有するもの（例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、など）、ペンダント部分を含むもの、例えば、例としてタンパク質（例えば、ヌクレアーゼ、毒素、抗体、シグナルペプチド、ポリ−Ｌ−リジン、などを含む）、インターカレーターを有するもの（例えば、アクリジン、ソラレン、など）、キレーターを含むもの（例えば、金属、放射性金属、など）、アルキル化剤を含むもの、修飾された結合を有するもの（例えば、αアノマー核酸、など）、ならびにポリヌクレオチドの未修飾形態。
【００８２】
本開示の核酸はリン酸ジエステル結合を含み得るが、場合によっては、下記で概略が示されるように（例えば、アンチセンス適用において、または核酸が候補薬物作用物質である場合）、核酸類似体は別のバックボーンを含むことができ、例えば、ホスホルアミデート(Bｅａｕｃａｇｅ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  ４９（１０）：１９２５  （１９９３）およびその中の参考文献；  Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ，  Ｊ．  Ｏｒｇ．  Ｃｈｅｍ．  ３５：３８００  （１９７０）；  Ｓｐｒｉｎｚｌ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｅｕｒ．    Ｊ．  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  ８１：５７９  （１９７７）；  Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  １４：３４８７  （１９８６）；  Ｓａｗａｉ  ｅｔ  ａｌ，  Ｃｈｅｍ．    Ｌｅｔｔ．  ８０５  （１９８４），  Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．    Ｓｏｃ．  １１０：４４７０  （１９８８）；およびＰａｕｗｅｌｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｃｈｅｍｉｃａ  Ｓｃｒｉｐｔａ  ２６：１４１  ９１９８６））、ホスホロチオエート（Ｍａｇ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  １９：１４３７  （１９９１）；  および米国特許第５，６４４，０４８号）、ホスホロジチオエート（Ｂｒｉｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．    Ｓｏｃ．  １１１：２３２１  （１９８９）、Ｏ−メチルホスホロアミダイト結合（Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ａｎａｌｏｇｕｅｓ：  Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，  Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓを参照されたい）、ならびにペプチド核酸バックボーンおよび結合（Ｅｇｈｏｌｍ，  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．  Ｓｏｃ．  １１４：１８９５  （１９９２）；  Ｍｅｉｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｃｈｅｍ．  Ｉｎｔ．  Ｅｄ．  Ｅｎｇｌ．  ３１：１００８  （１９９２）；  Ｎｉｅｌｓｅｎ，  Ｎａｔｕｒｅ，  ３６５：５６６  （１９９３）；  Ｃａｒｌｓｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  ３８０：２０７  （１９９６）を参照されたい、これらの全ては参照により組み込まれる）を含む。他の類似核酸としては、正バックボーン（Ｄｅｎｐｃｙ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ９２：６０９７  （１９９５）；非イオン性バックボーン（米国特許第５，３８６，０２３号、５，６３７，６８４号、５，６０２，２４０号、５，２１６，１４１号および４，４６９，８６３号；  Ｋｉｅｄｒｏｗｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｎｇｅｗ．  Ｃｈｅｍ．  Ｉｎｔｌ．  Ｅｄ．  Ｅｎｇｌｉｓｈ  ３０：４２３  （１９９１）；  Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．  Ｓｏｃ．  １１０：４４７０  （１９８８）；  Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ  ＆  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  １３：１５９７  （１９９４）；  Ｃｈａｐｔｅｒｓ  ２  ａｎｄ  ３，  ＡＳＣ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ  ５８０，  “Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ”，  Ｅｄ．  Ｙ．  Ｓ．  Ｓａｎｇｈｕｉ  ａｎｄ  Ｐ．  Ｄａｎ  Ｃｏｏｋ；  Ｍｅｓｍａｅｋｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅ��ｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍ．  Ｌｅｔｔ．  ４：３９５  （１９９４）；  Ｊｅｆｆｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｂｉｏｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ＮＭＲ  ３４：１７  （１９９４）；  Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．  ３７：７４３  （１９９６））および非リボースバックボーンを有するものが挙げられ、米国特許第５，２３５，０３３号および５，０３４，５０６号、および  Ｃｈａｐｔｅｒｓ  ６  ａｎｄ  ７，  ＡＳＣ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ  ５８０，  “Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ”，  Ｅｄ．    Ｙ．  Ｓ．  Ｓａｎｇｈｕｉ  ａｎｄ  Ｐ．  Ｄａｎ  Ｃｏｏｋに記載されるものが含まれる。１つ以上の炭素環状糖類を含む核酸もまた、核酸の１つの定義に含まれる（Ｊｅｎｋｉｎｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｃｈｅｍ．    Ｓｏｃ．    Ｒｅｖ．  （１９９５）  ｐｐ  １６９−１７６を参照されたい）。いくつかの核酸類似体がＲａｗｌｓ，  Ｃ  ＆  Ｅ  Ｎｅｗｓ  Ｊｕｎ．  ２，  １９９７  ｐａｇｅ  ３５において記載される。これらの参考文献は全て、本明細書で明確に参照により組み込まれる。リボースリン酸バックボーンのこれらの修飾は、様々な理由のために、例えば、アンチセンス適用における、またはバイオチップ上のプローブとしての使用のための生理環境でのそのような分子の安定性および半減期を増加させるために、実施され得る。
【００８３】
当業者により認識されるように、そのような核酸類似体は、本開示のいくつかの実施形態で使用され得る。加えて、自然発生核酸および類似体の混合物を生成させることができ；また、異なる核酸類似体の混合物、および自然発生核酸および類似体の混合物もまた作製され得る。
【００８４】
いくつかの実施形態では、核酸は一本鎖かまたは二本鎖であってもよく、あるいは、二本鎖または一本鎖配列の両方の部分を含み得る。当業者により認識されるように、一本鎖の描写はまた、もう一方の鎖の配列を規定し；したがって、本明細書で記載される配列はまた、配列の相補体を含む。核酸はＤＮＡ、ゲノムおよびｃＤＮＡの両方、ＲＮＡ、またはハイブリッドであってもよく、ここで、核酸はデオキシリボおよびリボヌクレオチドの任意の組み合わせ、ならびに塩基、例えばウラシル、アデニン、チミン、シトシン、グアニン、イノシン、キサンチン、ヒポキサンチン、イソシトシン、イソグアニン、などの任意の組み合わせを含む。本明細書では、「ヌクレオシド」という用語は、ヌクレオチドおよびヌクレオシドおよびヌクレオチド類似体、ならびに修飾ヌクレオシド、例えばアミノ修飾ヌクレオシドを含む。加えて、「ヌクレオシド」は非自然発生類似体構造を含む。したがって、例えば、それぞれ、塩基を含むペプチド核酸の対象単位は本明細書では、ヌクレオシドと呼ばれる。
【００８５】
いくつかの実施形態では、単離された核酸は、表１で開示される癌関連ポリヌクレオチド配列からなる群より選択される配列の、少なくとも１０、１２、１５、２０または３０の近接ヌクレオチドを含む。
【００８６】
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド、またはその相補体またはその断片はさらに検出可能な標識を含み、固体サポートに付着され、少なくとも一部は化学合成により調製され、アンチセンス断片であり、一本鎖であり、二本鎖であり、またはマイクロアレイを構成する。
【００８７】
いくつかの実施形態では、本発明は、表１で示されるポリヌクレオチド配列から選択される癌関連配列、またはその相補体の翻訳領域内でコードされる、単離されたポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、単離されたポリペプチドを提供し、ここで、前記ポリペプチドは、表１で開示される配列からなる群より選択されるポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、本発明は単離されたポリペプチドを提供し、ここで前記ポリペプチドは癌関連ポリペプチドによりコードされるアミノ酸配列を含む。
【００８８】
いくつかの実施形態では、本発明はさらに、癌関連ポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドを提供し、ここで、ポリペプチドまたはその断片は固体サポートに付着され得る。いくつかの実施形態では、本発明は、そのようなポリペプチドに結合する、単離された抗体（モノクローナルもしくはポリクローナル）またはその抗原結合断片を提供する。単離された抗体またはその抗原結合断片は固体サポートに付着することができ、またはさらに検出可能な標識を含む。
【００８９】
本明細書におけるいくつかの実施形態は、例えば、以下に開示されるいずれかの癌を含む癌と関連する１つ以上の配列に関する。本明細書で開示される配列はまた、細胞が不死となった他の病状の診断および治療のためにも使用され得る。遺伝子発現のマイクロアレイ分析の使用は、癌と関連する宿主配列の同定を可能にする。これらの配列はその後、多くの異なる方法、例えば診断、予後、モジュレーターのためのスクリーニング（アゴニストおよびアンタゴニストの両方を含む）、抗体産生（免疫療法およびイメージングのため）、などで使用され得る。しかしながら、当業者により認識されるように、癌の１つの型で同定された配列は、同様に、他の型の癌に関与する強い可能性を有し得る。したがって、本明細書で概略が示される配列は、最初に１つ以上の型の癌と相関するものと同定され得るが、それらはまた、同様に他の型の癌においても見出され得る。
【００９０】
本明細書で記載されるいくつかの実施形態は癌の診断、予後、可視化および治療のための癌関連配列の使用に関し得る。本明細書で開示される癌関連配列のいずれも使用され得る。癌型は、以下に開示される癌のいずれも含む。本明細書で開示されるマーカーはまた、細胞が不死となった他の病状の診断および治療のために使用され得る。
【００９１】
癌を診断および検出する方法
いくつかの実施形態では、試料において癌を診断および／または検出する方法は、試料において癌関連タンパク質のレベルを検出することを含み得る。いくつかの実施形態では、癌のスクリーニング法は、癌関連タンパク質のレベルを検出することを含み得る。いくつかの実施形態では、癌関連タンパク質は、表１で開示される配列、その断片もしくはその相補的配列または以下に開示される癌関連配列から選択されるヌクレオチド配列によりコードされる。いくつかの実施形態では、ＥＬＩＳＡなどの技術、ならびに他の検出方法が使用され得る。
【００９２】
癌細胞の存在に対し、試料をアッセイするために当技術分野で知られているいずれの技術も使用され得る。いくつかの実施形態では、癌関連配列のレベルを検出することは、技術、例えば、限定はされないが、ＰＣＲ、質量分析、マイクロアレイまたは本明細書で記載される他の検出技術を含み得る。他の好適な技術としては、ゲル電気泳動、ゲルシフトアッセイ、核ランオンアッセイ、ＥＬＩＳＡラジオイムノアッセイ、フローサイトメトリーアッセイ、顕微鏡法、例えば蛍光顕微鏡法、アフィニティークロマトグラフィー、免疫沈降、分枝ＲＮＡなどが挙げられる。受容体の発現に関する情報もまた、アゴニストまたはアンタゴニストを使用して癌関連配列のシグナル伝達を上方または下方制御することを目的とする療法を決定するのに有用であり得る。
【００９３】
いくつかの実施形態では、癌は、核酸を試料から単離することにより、試料中で検出することができる。核酸はＲＮＡ分子、例えばｍＲＮＡ分子であってもよい。ＲＮＡ分子は、ｃＤＮＡに転写され得る。ｃＤＮＡはゲル電気泳動により分析することができる。ｃＤＮＡはゲルからサポート、例えば膜上に転写させることができる。ｃＤＮＡは、それに特異的に結合するプローブとハイブリダイズさせることができる。プローブは検出可能な物質で標識することができる。検出可能な物質から得られたシグナルは測定することができ、試料中に存在する癌関連配列の量は、例えば、得られたシグナルを、既知量の癌関連配列から得られたシグナルと比較することにより、決定することができる。また、ｃＤＮＡ分子は、ＰＣＲを用いてゲル電気泳動前に増幅させることができる。別の実施形態では、ｒｔＰＣＲまたはｑＰＣＲが、試料において癌関連配列の量を分析および定量するために使用され得る。
【００９４】
他の実施形態では、癌関連配列によりコードされるタンパク質は試料から単離し、タンパク質に特異的に結合する抗体と接触させることができる。抗体は、検出可能な物質で標識することができる。検出可能な物質からのシグナルを測定することにより、癌関連配列によりコードされるタンパク質の量は、例えば既知量のタンパク質上の同じ抗体を使用して得られるシグナルを比較することにより決定することができる。
【００９５】
いくつかの実施形態では、被験体は、表１で開示される配列から選択される癌関連配列の存在を検出することにより癌と診断することができる。いくつかの実施形態では、被験体を癌と診断する方法は、表１で開示される配列から選択される癌関連配列の存在を検出することを含み、ここで、癌関連配列の存在は被験体が癌を有することを示す。いくつかの実施形態では、方法は、表１で開示される配列から選択される癌関連配列の有無を検出することを含み、ここで、癌関連配列がないことは癌がないことを示す。いくつかの実施形態では、方法はさらに、癌と診断された被験体を、表１で開示される配列から選択される癌関連配列に結合し、癌の増殖または進行を抑制する抗体で治療することを含む。記載されるように、癌はいずれの型の試料、例えば、限定はされないが、血清、血液、腫瘍などにおいても検出され得る。試料は本明細書で記載されるように、いずれの型の試料であってもよい。
【００９６】
いくつかの実施形態では、被験体を癌と診断する方法は、試料を取得することおよび表１で開示される配列から選択される癌関連配列の存在を検出することを含み、ここで、癌関連配列の存在は被験体が癌を有することを示す。いくつかの実施形態では、表１で開示される配列から選択される癌関連配列の存在を検出することは、試料を癌関連配列のタンパク質に特異的に結合する抗体または他の型の捕捉試薬と接触させること、試料において癌関連配列のタンパク質への結合の有無を検出することを含む。使用することができるアッセイの例としては、ＥＬＩＳＡが挙げられるが、それに限定されない。
【００９７】
いくつかの実施形態では、本開示は被験体において癌、または新生物状態を診断する方法を提供し、この方法は、被験体に由来する試料から、表１で開示される配列から選択される癌関連配列の癌関連配列遺伝子発現結果を得ること；ならびに、癌関連配列遺伝子発現結果に基づき、被験体における癌または新生物状態を診断することを含み、ここで、癌関連配列が過剰発現されている場合、被験体は、癌または新生物状態を有すると診断される。
【００９８】
いくつかの実施形態では、被験体は、癌関連配列が過剰発現されていない場合、癌、癌、または新生物状態を有さないと診断される。本明細書で、全体を通して記載される方法のいくつかの実施形態では、癌は、癌関連配列遺伝子発現結果または癌関連配列またはタンパク質の有無に基づき診断される。以下に開示されるいずれの癌関連配列も使用され得る。
【００９９】
いくつかの実施形態では、被験体を癌と診断する方法は、試料を取得すること、ならびに表１で開示される配列から選択される癌関連配列の存在を検出することを含み、ここで、癌関連配列の存在は被験体が癌を有することを示す。いくつかの実施形態では、表１で開示される配列から選択される癌関連配列の存在を検出することは、試料を癌関連配列のタンパク質に特異的に結合する抗体または他の型の捕捉試薬と接触させること、ならびに試料において癌関連配列のタンパク質への結合の有無を検出することを含む。
【０１００】
本明細書におけるいくつかの実施形態は、癌関連配列に対する抗体を被験体に投与することを含む、癌または新生物状態を診断する方法を記載する。いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナルまたはポリクローナルであってもよい。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化されてもよく、または組換え型であってもよい。いくつかの実施形態では、抗体は、癌関連配列の受容体に結合する、および／またはこれを妨害することにより、癌関連配列の生物活性を中和し得る。いくつかの実施形態では、抗体は、生物流体または組織、例えば、限定はしないが、血液、尿、血清、腫瘍組織、などに投与され得る。本明細書におけるいくつかの実施形態は、生物学的試料において癌関連配列の存在を検出することを含む、癌のスクリーニング法に関し得る。いくつかの実施形態では、生物学的試料は、被験体由来の任意の生物流体または組織、例えば、限定はしないが、血液、尿、血清、腫瘍組織、などであってもよい。
【０１０１】
いくつかの実施形態では、本開示は、被験体において癌または新生物状態を診断する方法を提供し、この方法は、以下に開示される、癌関連配列の遺伝子発現結果を得ることを含む。
【０１０２】
いくつかの実施形態では、本発明は、試料をＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体から選択される１つ以上の遺伝子の発現レベルに対し分析することを含む、試料において癌を検出する方法を提供する。これらの遺伝子の１つ以上の発現の上昇したレベル（非癌性細胞試料に比べて）は癌細胞が試料中に存在することを示す。
【０１０３】
いくつかの実施形態は、癌関連タンパク質をコードする核酸セグメントを含むバイオチップに関する。いくつかの実施形態では、バイオチップは癌関連タンパク質の少なくとも一部をコードする核酸分子を含む。いくつかの実施形態では、癌関連タンパク質は、表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される配列によりコードされる。いくつかの実施形態では、核酸分子は表１で開示される配列から選択される核酸配列と特異的にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、バイオチップは、第１および第２の核分子を含み、ここで、第１の核酸分子は、表１で開示される配列から選択される第１の配列と特異的にハイブリダイズし、第２の核酸分子は表１で開示される配列から選択される第２の配列と特異的にハイブリダイズし、ここで、第１および第２の配列は同じ配列ではない。いくつかの実施形態では、本発明は、表１で開示される配列から選択される核酸配列の発現を検出することを含む、癌を検出または診断する方法を提供し、ここで、試料は、表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される配列を含むバイオチップと接触させられる。
【０１０４】
いくつかの実施形態では、本発明は、少なくとも１つのポリペプチド、例えば、限定はしないが、癌関連タンパク質、またはその断片の発現レベルを検出することを含む、試験試料においてポリペプチドの発現を用いて癌関連配列を検出するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、試験試料におけるポリペプチドの発現レベルを、正常試料におけるポリペプチドの発現レベルと比較することを含み、ここで、正常試料におけるポリペプチドの発現レベルに対する試験試料におけるポリペプチドの発現レベルの変化は、試験試料における癌の存在を示す。いくつかの実施形態では、ポリペプチド発現は、癌試料と比較され、この場合、発現レベルが、癌と少なくとも同じであることは試験試料における癌の存在を示す。いくつかの実施形態では、試料は細胞試料である。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、本発明は、試験血清試料において抗体の存在を検出することにより癌を検出するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、抗体は本明細書で開示されるポリペプチドまたはそのエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、抗体は、本明細書で開示される核酸配列によりコードされるポリペプチドまたはそのエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、方法は、抗原ポリペプチド、例えば、限定はしないが、癌関連タンパク質、またはその抗原断片に対する抗体のレベル検出することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、試験試料における抗体のレベルを対照試料における抗体のレベルと比較することを含み、ここで、対照試料における抗体のレベルに対する、前記試験試料における抗体のレベルの変化は、試験試料における癌の存在を示す。いくつかの実施形態では、対照試料は、正常細胞または非癌性細胞試料に由来する試料である。いくつかの実施形態では、対照は、癌試料に由来し、そのため、いくつかの実施形態では、方法は試料において抗体の結合レベルおよび／または量を比較すること含み、ここで、レベルまたは量が癌対照試料と同じである場合、試験試料における癌の存在を示す。
【０１０６】
いくつかの実施形態では、癌または新生物状態を診断するための方法は、下記を含み：ａ）第１の個体の第１の試料型（例えば組織）において、表１に記載されるヒトゲノムおよびｍＲＮＡ配列からなる群より選択される核酸配列を含む１つ以上の遺伝子の発現を決定すること；ならびにｂ）前記第１の個体または第２の無影響個体由来の第２の正常試料型由来の前記遺伝子（複数可）の前記発現を比較すること；ここで、前記発現の差は、第１の個体が癌を有することを示す。いくつかの実施形態では、発現は正常試料と比べて増加する。いくつかの実施形態では、発現は正常試料と比べて減少する。
【０１０７】
いくつかの実施形態では、本発明はまた、被験体由来の試料において癌細胞の有無を検出するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、被験体由来の１つ以上の細胞を本明細書で記載される抗体と接触させることを含む。いくつかの実施形態では、方法は、癌関連タンパク質と抗体の複合体を検出することを含み、ここで、複合体の検出は、被験体における癌細胞の存在を示す。いくつかの実施形態では、本発明は被験体において癌細胞の増殖を抑制するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、被験体に有効量の、本明細書で記載される医薬組成物を投与することを含む。いくつかの実施形態では、本発明は治療薬を被験体内の癌細胞に送達するための方法を提供し、方法は被験体に有効量の、本発明による医薬組成物を投与することを含む。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、本開示は、被験体において癌または新生物状態を診断する方法を提供し、方法は：ａ）１つ以上の遺伝子または遺伝子産物またはそのホモログの発現を決定すること；ならびにｂ）前記第１の被験体または第２の無影響被験体由来の第２の正常試料由来の１つ以上の核酸配列の前記発現を比較することを含み、ここで、前記発現おける差は第１の被験体が癌を有することを示す。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、本開示は試験試料において癌を検出する方法を提供し、この方法は（ｉ）遺伝子産物である少なくとも１つのポリペプチドの活性のレベルを検出すること；ならびに（ｉｉ）試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルを正常試料におけるポリペプチドの活性のレベルと比較することを含み、ここで、正常試料におけるポリペプチド活性のレベルに対する試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルの変化は試験試料における癌の存在を示す。
【０１１０】
癌治療物および癌抑制剤のためのスクリーニング
いくつかの実施形態では、抗癌作用物質を同定する方法が提供され、ここで、方法は候補作用物質を試料と接触させること；ならびに、試料において癌関連配列の活性を決定することを含む。いくつかの実施形態では、候補作用物質は、癌関連配列の活性が、接触後、試料において低減された場合、抗癌作用物質として同定される。いくつかの実施形態では、候補作用物質は候補抗体である。いくつかの実施形態では、方法は、癌関連配列に結合する候補抗体を試料と接触させること、ならびに癌関連配列の活性に対してアッセイすることを含み、ここで、候補抗体は、癌関連配列活性が接触後、試料において低減された場合、抗癌作用物質として同定される。癌関連配列の活性は癌関連配列の任意の活性とすることができる。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、本開示は抗癌（例えば癌）作用物質を同定する方法を提供し、方法は、候補作用物質を細胞試料に接触させること；ならびに、以下に開示される１つ以上の癌関連配列の活性を決定することを含む。活性は、当技術分野で知られている任意の方法により測定することができる。
【０１１２】
いくつかの実施形態では、薬物候補をスクリーニングする方法は、薬物候補なしでの癌関連配列の発現レベルを、薬物候補の存在下での発現レベルと比較することを含む。
【０１１３】
いくつかの実施形態は、癌関連配列（核酸またはタンパク質）に結合することができる治療薬をスクリーニングする方法に関し、方法は、癌関連配列と候補治療薬を組み合わせること、ならびに候補作用物質の癌関連配列への結合を決定することを含む。
【０１１４】
さらに、癌関連配列の活性を調節することができる治療薬をスクリーニングするための方法が本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、方法は、癌関連配列と候補治療薬を組み合わせること、候補作用物質の癌関連配列の生理活性に対する効果を決定することを含む。癌関連配列の生理活性を調節する作用物質は癌関連配列の活性を調節することができる治療薬として使用され得る。
【０１１５】
抗癌活性をスクリーニングする方法は、（ａ）表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される癌関連配列を転写する癌関連遺伝子を発現する細胞を抗癌薬物候補と接触させること；（ｂ）抗癌薬物候補の細胞における癌関連ポリヌクレオチドの発現に対する効果を検出すること；ならびに（ｃ）薬物候補なしでの発現レベルを薬物候補の存在下での発現レベルと比較することを含み；ここで、癌関連ポリヌクレオチドの発現に対する効果は、候補が抗癌活性を有することを示す。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、候補癌薬物の効果を評価する方法は、薬物を患者に投与すること、ならびに細胞試料を患者から除去することを含み得る。その後、細胞の発現プロファイルが決定される。いくつかの実施形態では、方法はさらに患者の発現プロファイルを健康な個体の発現プロファイルと比較することを含み得る。いくつかの実施形態では、発現プロファイルは本明細書で開示される配列の１つ以上またはそれらの任意の組み合わせの発現を測定することを含む。いくつかの実施形態では、本明細書で開示される配列の１つ以上またはそれらの任意の組み合わせの発現プロファイルが変更（増加または減少）された場合、候補癌薬物は有効であると言われる。
【０１１７】
いくつかの実施形態では、本発明は抗癌活性をスクリーニングする方法を提供し、この方法は、（ａ）表１で示される癌関連配列、またはその断片からなる群より選択される核酸配列をコードする癌関連遺伝子を発現する細胞を提供すること；（ｂ）癌細胞に由来し得る細胞を抗癌薬物候補と接触させること；（ｃ）細胞試料において癌関連配列の発現に対する抗癌薬物候補の効果をモニタすること、ならびに任意で（ｄ）前記薬物候補がない場合の発現レベルを薬物候補の存在下での発現レベルと比較することを含む。薬物候補は転写抑制剤、Ｇタンパク質共役受容体アンタゴニスト、成長因子アンタゴニスト、セリン−スレオニンキナーゼアンタゴニスト、チロシンキナーゼアンタゴニストであってもよい。いくつかの実施形態では、候補が癌関連配列の発現を調節する場合、候補は抗癌活性を有すると言われる。いくつかの実施形態では、抗癌活性は、細胞増殖を測定することにより決定される。いくつかの実施形態では、候補は、細胞増殖を抑制または遅延させ、抗癌活性を有すると言われる。いくつかの実施形態では、候補は細胞死を引き起こし、したがって、候補は抗癌活性を有すると言われる。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、本発明は癌に対する活性をスクリーニングする方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される癌関連配列に相補的な、癌関連遺伝子を過剰発現する細胞を癌薬物候補と接触させることを含む。いくつかの実施形態では、方法は、癌薬物候補の細胞における癌関連ポリヌクレオチドの発現に対する効果または細胞の増殖もしくは生存率に対する効果を検出することを含む。いくつかの実施形態では、方法は薬物候補なしでの発現レベル、細胞増殖、または生存率を薬物候補の存在下での発現レベル、細胞増殖、または生存率と比較することを含み；ここで、癌関連ポリヌクレオチドの発現、細胞増殖、または生存率に対する効果は、候補が癌関連遺伝子を過剰発現する癌細胞に対し活性を有することを示し、ここで、前記遺伝子は、表１で開示される配列、またはそれに相補的である配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される配列である配列を含む。いくつかの実施形態では、薬物候補は、転写抑制剤、Ｇタンパク質共役受容体アンタゴニスト、成長因子アンタゴニスト、セリン−スレオニンキナーゼアンタゴニスト、またはチロシンキナーゼアンタゴニストから選択される。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、本発明は癌関連配列の活性を調節することができる治療薬をスクリーニングするための方法を提供し、ここで、前記配列は、表１で示されるポリヌクレオチド配列からなる群より選択される核酸配列を含む核酸によりコードすることができ、前記方法は：ａ）前記癌関連配列および候補治療薬を組み合わせること；ならびにｂ）候補作用物質の前記癌関連配列の生理活性に対する効果を決定することを含む。いくつかの実施形態では、治療薬は、癌関連配列の発現に影響し；癌関連配列の活性に影響する。いくつかの実施形態では、癌関連配列は癌関連タンパク質である。いくつかの実施形態では、癌関連配列は癌関連核酸分子である。
【０１２０】
癌マーカーを同定するための方法
本発明のいくつかの実施形態は、癌マーカー、例えば癌関連配列に対し試料をスクリーニングする方法を含む。細胞は、当技術分野で知られている任意の技術を使用してスクリーニングすることができる。例えばマイクロアレイを使用することができる。遺伝子発現は、試料由来の細胞において分析することができる。癌細胞を含むことがわかっている試料と癌細胞を含まないことがわかっている試料の間で比較することができる。癌細胞を含む試料および癌を含まないものは同じ組織型の細胞から構成され得る。
【０１２１】
本発明のいくつかの実施形態は、癌の診断および治療において有用な新規標的マーカーを同定する方法に関し、ここで、ｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、タンパク質、またはタンパク質翻訳後修飾、例えば、限定はされないが、リン酸化およびＳＵＭＯ化の発現レベルが５つのカテゴリの細胞型の間で比較される：（１）不死多能性幹細胞（例えば胚性幹（「ＥＳ」）細胞、人工多能性幹（「ｉＰＳ」）細胞、および生殖系列細胞、例えば胚性癌腫（「ＥＣ」）細胞）または性腺組織；（２）ＥＳ、ｉＰＳ、またはＥＣ由来クローン胚性前駆（「ＥＰ」）細胞系、（３）有核血液細胞、例えば、限定はされないが、ＣＤ３４＋細胞およびＣＤ１３３＋細胞；（４）正常致死体細胞成体由来組織および培養細胞、例えば：皮膚線維芽細胞、血管内皮細胞、正常非リンパおよび非癌性細胞組織、など、ならびに（５）悪性癌細胞、例えば培養された癌細胞系またはヒト腫瘍組織。カテゴリ１、３、および５、またはカテゴリ１および５において一般に発現される（または発現されない）が、カテゴリ２および４で発現されない（または発現される）ｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、またはタンパク質は、癌診断および療法のための候補標的である。本明細書におけるいくつかの実施形態は、ヒト適用、非ヒト獣医学適用、またはその組み合わせに関する。
【０１２２】
いくつかの実施形態では、標的マーカーを同定する方法は、１）不死多能性幹細胞（例えば胚性幹（「ＥＳ」）細胞、人工多能性幹（「ｉＰＳ」）細胞、および生殖系列細胞、例えば胚性癌腫（「ＥＣ」）細胞）のｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、タンパク質、またはタンパク質修飾の分子プロファイルを得る工程；２）ＥＳ、ｉＰＳ、またはＥＣ由来クローン胚性前駆（「ＥＰ」）細胞系悪性癌細胞、例えば癌細胞系またはヒト腫瘍組織、ならびにそれらの分子を、致死体細胞型、例えば培養されたクローンヒト胚性前駆細胞、胎児または成体源由来の培養された体細胞、または悪性癌細胞に対する正常組織対応物中に存在するものと比較する工程を含む。多能性幹細胞、例えばｈＥＳ細胞と悪性癌細胞の間で共有されるが、大多数の体細胞型には存在しない標的マーカーは、候補診断マーカーおよび治療標的となり得る。
【０１２３】
本明細書における実施形態の癌関連配列は例えば、表１に開示される。これらの配列は、フォールドチェンジおよびフィルタ分析ＫＣ１１０７２９．５から抽出した。正常および腫瘍組織におけるこれらの癌関連配列の発現は、表２に開示される。発現がいったん決定されると、遺伝子配列結果はさらに、癌細胞系対正常組織におけるフォールドチェンジ；一般特異性；分泌されたか否か、癌細胞系における発現レベル；ならびに信号雑音比を考慮することによりフィルタリングされた。癌関連ポリヌクレオチド配列は、表１で開示される配列またはそのホモログを含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド配列は表１で開示される配列、その相補体またはそのホモログから選択されるｍＲＮＡ配列であってもよい。いくつかの実施形態では、癌関連配列は上記ｍＲＮＡをコードするＤＮＡ配列または上記ｍＲＮＡまたはそのホモログにより発現される癌関連タンパク質または癌関連ポリペプチドであってもよい。いくつかの実施形態では、癌関連配列は、上記で開示される配列の変異核酸であってもよい。いくつかの実施形態では、ホモログは、開示されるポリペプチド配列と少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、少なくとも約９９．５％の同一性を有し得る。
【０１２４】
癌の診断および／または検出マーカーおよびそれに対する治療標的を同定するための開示される方法は、全てではないがいくつかの場合においてテロメラーゼ活性と重なる。開示される方法は、限定はしないが下記を含む任意の癌に対するマーカーをスクリーニングするために：アプドーマ、分離腫、鰓腫、悪性カルチノイド症候群、カルチノイド心疾患、癌腫（例えば、Ｗａｌｋｅｒ、基底細胞、基底扁平細胞、Ｂｒｏｗｎ−Ｐｅａｒｃｅ、腺管、Ｅｈｒｌｉｃｈ腫瘍、上皮内、Ｋｒｅｂｓ２、メルケル細胞、粘液性、非小細胞肺、燕麦細胞、乳頭、スキルス、細気管支、気管支原性、扁平細胞、および移行細胞）、組織球性障害、白血病（例えば、ｂ細胞、混合細胞、ヌル細胞、Ｔ細胞、Ｔ細胞性慢性、ＨＴＬＶ−ＩＩ関連、リンパ球性急性、リンパ球性慢性、マスト細胞、および骨髄）、悪性組織球増殖症、ホジキン病、免疫増殖性小、非ホジキンリンパ腫、形質細胞腫、細網内皮症、メラノーマ、軟骨芽細胞腫、軟骨腫、軟骨肉腫、線維腫、線維肉腫、巨細胞腫、組織球腫、脂肪腫、脂肪肉腫、中皮腫、粘液腫、粘液肉腫、骨腫、骨肉腫、ユーイング肉腫、滑膜腫、腺線維腫、腺リンパ腫、癌肉腫、脊索腫、頭蓋咽頭腫、未分化胚細胞腫、過誤腫、間葉腫、中腎腫、筋肉腫、エナメル上皮腫、セメント質腫、歯牙腫、奇形腫、胸腺腫、絨毛性腫瘍、腺癌、腺腫、胆管腫、真珠腫、円柱腫、嚢胞腺癌、嚢胞腺腫、顆粒膜細胞腫、卵巣男性胚細胞腫、肝細胞腫、汗腺腫、膵島腫瘍、ライディッヒ細胞腫、乳頭腫、セルトリ細胞腫、莢膜細胞腫、平滑筋腫、平滑筋肉腫、筋芽細胞腫、筋腫、筋肉腫、横紋筋腫、横紋筋肉腫、上衣腫、神経節腫、神経膠腫、髄芽腫、髄膜腫、神経鞘腫、神経芽細胞腫、神経上皮腫、神経線維腫、神経腫、傍神経節腫、非クロム親和性傍神経節腫、被角血管腫、好酸球性血管リンパ球増殖症、硬化性血管腫、血管腫症、グロムス血管腫、血管内皮腫、血管腫、血管外皮腫、血管肉腫、リンパ管腫、リンパ管筋腫、リンパ管肉腫、松果体腫、癌肉腫、軟骨肉腫、葉状嚢胞性肉腫、線維肉腫、血管肉腫、平滑筋肉腫、白血肉腫、脂肪肉腫、リンパ管肉腫、筋肉腫、粘液肉腫、骨肉腫、横紋筋肉腫、肉腫（例えば、ユーイング、実験的、カポジ、およびマスト細胞）、骨、乳房、消化器系、結腸直腸、肝臓、膵臓、下垂体、精巣、眼窩、頭頸部、中枢神経系、内耳、骨盤、気道、および尿生殖路の新生物、神経線維腫症、および子宮頚部異形成、ならびに細胞が不死となった他の病状の治療のために使用され得る。
【０１２５】
特定の生細胞における遺伝子発現のパターンは、その現在の状態の特徴を示し得る。細胞の状態または型のほとんど全ての差は、１つ以上の遺伝子のＲＮＡレベルの差に反映される。特徴付けられていない遺伝子の発現パターンの比較は、それらの機能への手掛かりを提供し得る。何百または何千もの遺伝子の発現のハイスループット分析は、下記を助けることができる：（ａ）複雑な遺伝性疾患の同定、（ｂ）組織と疾患状態の間での、時間経過に伴う差次的遺伝子発現の分析、および（ｃ）創薬および毒性研究。ある一定の遺伝子の発現のレベルの増加または減少は、癌生物学と相関する。例えば、発癌遺伝子は、腫瘍形成の正調節因子であり、一方、腫瘍抑制遺伝子は腫瘍形成の負調節因子である。（Ｍａｒｓｈａｌｌ，  Ｃｅｌｌ，  ６４：  ３１３−３２６  （１９９１）；  Ｗｅｉｎｂｅｒｇ，  Ｓｃｉｅｎｃｅ，  ２５４：  １１３８−１１４６  （１９９１））。したがって、本明細書におけるいくつかの実施形態は癌、特に、発癌に関与するポリヌクレオチドおよびポリペプチド配列を提供する。
【０１２６】
発癌遺伝子は癌を引き起こし得る遺伝子である。発癌現象は多種多様のメカニズム、例えば、発癌遺伝子を含むウイルスによる細胞の感染、宿主ゲノムにおける原癌遺伝子の活性化、ならびに原癌遺伝子および腫瘍抑制遺伝子の変異により起こる可能性がある。発癌現象は、基本的には体細胞進化（すなわち、増殖制御の進行性消失による変異およびバリアントの自然選択）により駆動される。これらの体細胞変異のための標的として機能する遺伝子は、それらの変異表現型が、それぞれ優性か、または劣性かによって、原癌遺伝子または腫瘍抑制遺伝子のいずれかとして分類される。
【０１２７】
発現データを得る様々な方法および発現データの使用が存在することが認識されるであろう。例えば、癌を有する被験体を検出または診断するために使用することができる発現データは実験的に取得することができる。いくつかの実施形態では、発現データを取得することは、試料を取得すること、試料を処理して、実験的に発現データを決定することを含む。発現データは、本明細書で記載される１つ以上の癌関連配列に対する発現データを含むことができる。発現データは、例えば、マイクロアレイまたは量的増幅方法、例えば、限定はされないが、本明細書で記載されるものを使用することにより実験的に決定することができる。いくつかの実施形態では、試料と関連する発現データを取得することは、発現データを、試料を処理して、実験的に発現データを決定した第三者から受理することを含む。
【０１２８】
発現レベルを検出すること、または本明細書で記載される同様の工程は、実験的に実施することができ、または本明細書で記載されるように第三者から提供され得る。よって、例えば、「発現レベルを検出すること」は、データを実験的に測定することおよび／またはデータを、試料を処理して、発現レベルデータを決定および検出した別の関係者により提供してもらうことを示し得る。いくつかの実施形態では、発現データは実験的に検出することができ、第三者により提供され得る。
【０１２９】
下記多様なカテゴリの細胞型から調製したＲＮＡプローブ配列（表１に示される）にハイブリダイズされたＩｌｌｕｍｉｎａ遺伝子発現マイクロアレイを用いたｍＲＮＡレベルに関する遺伝子発現の比較：１）ヒト胚性幹（「ＥＳ」）細胞、または性腺組織；２）ＥＳ、ｉＰＳ、またはＥＣ由来クローン胚性前駆（「ＥＰ」）細胞系、３）有核血液細胞例えば、限定はされないが、ＣＤ３４＋細胞およびＣＤ１３３＋細胞；４）正常致死体細胞成体由来組織および培養細胞、下記を含む：皮膚線維芽細胞、血管内皮細胞、正常非リンパおよび非癌性細胞組織、など、ならびに５）悪性癌細胞、例えば培養された癌細胞系またはヒト腫瘍組織およびフィルタリングを実施し、カテゴリ１、３、および５、またはカテゴリ１および５において一般に発現される（または発現されない）が、カテゴリ２および４で発現されない（または発現される）遺伝子を検出した。この所見に基づくこれらの癌における療法は、癌で上方制御された上記参照トランスクリプトの発現の低減、またはそうでなければ、遺伝子産物の発現の低減に基づくであろう。
【０１３０】
遺伝子発現アッセイ：遺伝子発現レベルの測定は、当技術分野において知られている任意の方法、例えば、限定はされないが、定量的ＰＣＲ、またはマイクロアレイ遺伝子発現分析、ビーズアレイ遺伝子発現分析およびノーザン分析により実施され得る。遺伝子発現レベルは、ＡＤＰＲＴ（受入番号ＮＭ＿００１６１８．２）、ＧＡＰＤ（受入番号ＮＭ＿００２０４６．２）、または当技術分野で知られている他のハウスキーピング遺伝子に対して正規化された相対発現として表され得る。ｍＲＮＡ発現のマイクロアレイプローブの場合、遺伝子発現データはまた、中央値の中央値方法により正規化され得る。この方法では、各アレイは異なる全強度を与える。中央値を使用することは、実験で細胞系（アレイ）を比較するロバストな方法である。一例として、中央値が各細胞系に対し見出され、その後、それらの中央値の中央値が正規化のための値となる。各細胞系由来のシグナルは他の細胞系の各々に対するものとした。
【０１３１】
ＲＮＡ抽出：本開示の細胞は０．０５％トリプシンおよび０．５ｍＭ  ＥＤＴＡと共にインキュベートすることができ、その後、０．５％ＢＳＡを有するＤＭＥＭ（Ｇｉｂｃｏ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）中に収集され得る。全ＲＮＡは、ＲＮｅａｓｙ  Ｍｉｎｉキット（Ｑｉａｇｅｎ、Ｈｉｌｄｅｎ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて細胞から精製され得る。
【０１３２】
ヒト胚性幹細胞および分化子孫細胞からの全ＲＮＡおよびｍｉＲＮＡの単離：全ＲＮＡまたは小型ＲＮＡ種に対し濃縮された試料は、多くの成熟組織において観察される細胞増殖停止に近づけるために、ＲＮＡを収穫する前に血清飢餓を受けた細胞培養物から単離され得る。細胞増殖停止は、０．５％血清を含む培地に５日間変えることにより、低血清培地の最初の付加後２−３日に１培地変更を用いて実施され得る。ＲＮＡは、全ＲＮＡを単離するためのＱｉａｇｅｎ  ＲＮＥａｓｙキットまたは小型ＲＮＡ種に対して濃縮されたＲＮＡを単離するためのＡｍｂｉｏｎ  ｍｉｒＶａｎａキットに対するベンダーの指示に従い収穫され得る。ＲＮＡ濃度は、分光光度法により決定することができ、ＲＮＡ品質は２８Ｓおよび１８Ｓ  ＲＮＡを可視化するための変性アガロースゲル電気泳動により決定され得る。明確に視認できる２８Ｓおよび１８Ｓバンドを有し、分解の徴候がなく、およそ２：１の２８Ｓ：１８Ｓ比である試料がその後のｍｉＲＮＡ分析に使用され得る。
【０１３３】
ヒト胚性幹細胞および分化子孫細胞から単離された試料中のｍｉＲＮＡに対するアッセイ：ｍｉＲＮＡはＡｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ製のヒトパネルＴａｑＭａｎマイクロＲＮＡアッセイを使用して定量化され得る。これは、逆転写（ＲＴ）のためにステムループプライマーを使用し、続いてリアルタイムＴａｑＭａｎ（登録商標）を使用する２段階アッセイである。総数３３０のｍｉＲＮＡアッセイを実施することができ、Ｈ９ヒト胚性幹細胞系、分化線維芽細胞細胞系、およびヒト胚性幹細胞から分化した９の細胞系におけるｍｉＲＮＡのレベルが定量化され得る。アッセイは２段階、逆転写（ＲＴ）および定量的ＰＣＲを含む。リアルタイムＰＣＲはＡｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ７５００リアルタイムＰＣＲシステム上で実施され得る。１細胞あたりのコピー数は、合成ｍｉｒ−１６  ｍｉＲＮＡの標準曲線に基づき、およそ１５ｐｇ／細胞の全ＲＮＡ質量を推定して推定され得る。
【０１３４】
逆転写反応は、１ｘｃＤＮＡアーカイビングバッファ、３．３５単位のＭＭＬＶ逆転写酵素、それぞれ５ｍＭのｄＮＴＰ、１．３単位のＡＢ  ＲＮａｓｅ抑制剤、２．５ｎＭの３３０−プレックスリバースプライマー（ＲＰ）、３ｎｇの細胞ＲＮＡを用い、５μｌの最終体積で実施され得る。逆転写反応は、ＢｉｏＲａｄまたはＭＪ熱サイクラ上で、２０℃で３０ｓｅｃ；４２℃で３０ｓｅｃ；５０℃で１ｓｅｃのサイクリングプロファイルを６０サイクル、続いて、１サイクルの８５℃で５ｍｉｎを用いて実施され得る。
【０１３５】
リアルタイムＰＣＲ．２マイクロリットルの１：４００希釈ＰＣＲ前産物が２０ｕｌ反応に使用され得る。全ての反応は２回実施され得る。方法は非常にロバストであるので、２つ組試料は十分な量であり、ｍｉＲＮＡ発現レベルに対する値を得るのに十分正確であり得る。ＡＢＩのＴａｑＭａｎ  ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  ＰＣＲ  ｍａｓｔｅｒ  ｍｉｘが、製造者の提案に従い使用され得る。簡単に言うと、１ｘＴａｑＭａｎ  Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  Ｍａｓｔｅｒ  Ｍｉｘ  （ＡＢＩ）、１ｕＭのフォワードプライマー、１ｕＭのＵｎｉｖｅｒｓａｌリバースプライマーおよび０．２ｕＭのＴａｑＭａｎプローブが、各リアルタイムＰＣＲで使用され得る。使用される条件は下記の通りとすることができる：９５℃で１０ｍｉｎ、続いて９５℃で１５ｓ、および６０℃で１ｍｉｎの４０サイクル。反応は全て、ＡＢＩ  Ｐｒｉｓｍ７０００配列検出システム上で実施され得る。
【０１３６】
マイクロアレイハイブリダイゼーションおよびデータ処理．ｃＤＮＡ試料および細胞全ＲＮＡ（８つの個々の管の各々中に５μｇ）は、ビオチン標識のためにインビトロ転写（ＩＶＴ）により（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ、ＣＡ）またはＩｌｌｕｍｉｎａ  Ｔｏｔａｌ  Ｐｒｅｐ  ＲＮＡ標識キットを使用して、Ｏｎｅ−Ｃｙｃｌｅ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｌａｂｅｌｉｎｇ手順に供することができる。Ａｆｆｙｍｅｔｉｘ遺伝子チップ上での分析では、ｃＲＮＡはその後、製造者の指示に従い、断片化され、ヒトゲノムＵ１３３Ｐｌｕｓ２．０アレイ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）にハイブリダイズさせることができる。マイクロアレイ画像データは、遺伝子チップスキャナ３０００（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）を用いて処理することができ、ＣＥＬデータが生成される。ＣＥＬデータはその後、ｄＣｈｉｐフトウェアによる分析に供することができ、これは複数のデータセットを同時に正規化し、処理する利点を有する。細胞由来の８の無増幅対照、希釈細胞ＲＮＡ由来の８の独立して増幅させた試料、および２０の単一細胞由来の増幅させたｃＤＮＡ試料から得られたデータは、別々に個々の群内で、プログラムのデフォルト設定に従い正規化することができる。モデルに基づく発現指数（ＭＢＥＩ）は、ＰＭ／ＭＭ差モードを使用し、シグナル強度のｌｏｇ−２変換および低い値の零へのトランケーションを用いて計算することができる。絶対的コール（Ｐｒｅｓｅｎｔ、ＭａｒｇｉｎａｌおよびＡｂｓｅｎｔ）は、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘマイクロアレイソフトウェア５．０（ＭＡＳ５．０）アルゴリズムにより、ｄＣｈｉｐデフォルト設定を使用して計算することができる。Ｐｒｅｓｅｎｔプローブのみの発現レベルは以下で記載される全ての量的分析に対し考慮され得る。マイクロアレイデータに対するＧＥＯ受入番号はＧＳＥ４３０９である。ＩｌｌｕｍｉｎａヒトＨＴ−１２ｖ４発現ビーズチップ上での分析では、標識されたｃＲＮＡは、製造者の指示に従いハイブリダイズさせてもよい。
【０１３７】
カバレージおよび正確さの計算．真陽性は、８の無増幅対照のうち少なくとも６においてＰｒｅｓｅｎｔと呼ばれるプローブとして規定され、真の発現レベルはＰｒｅｓｅｎｔプローブのｌｏｇ平均化された発現レベルとして規定される。カバレージの定義は（増幅試料中で検出される真陽性プローブの数）／（真陽性プローブの数）である。正確さの定義は（増幅試料中で検出される真陽性プローブの数）／（増幅試料中で検出されるプローブの数）である。増幅および無増幅試料の発現レベルは、２０．５（２０、２０．５、２１、２１．５．．．）のクラス間隔で割ることができ、ここで正確さおよびカバレージが計算される。これらの発現レベルビンはまた、検出されるプローブの度数分布を分析するために使用することができる。
【０１３８】
細胞の遺伝子発現プロファイルの分析：細胞由来のマイクロアレイデータの教師なしクラスタリングおよびクラス近傍分析は、ＧｅｎｅＰａｔｔｅｒｎソフトウェアを用いて実施することができ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｂｒｏａｄ．ｍｉｔ．ｅｄｕ／ｃａｎｃｅｒ／ｓｏｆｔｗａｒｅ／ｇｅｎｅｐａｔｔｅｒｎ／）、これは、シグナル・ノイズ比分析／Ｔ検定を並べ替え検定と組み合わせて実施し、いずれの試料可変性（方法論および／または生検から得られたものを含む）の寄与も、高い信頼度で防止する。分析は、１４，１２８プローブ上で実施することができ、２０の単一細胞のうち少なくとも６がＰｒｅｓｅｎｔコールを提供し、２０試料のうち少なくとも１が＞２０コピー／細胞の発現レベルを提供した。Ａｂｓｅｎｔ／Ｍａｒｇｉｎａｌコールを有するプローブに対して計算された発現レベルは、零に切り捨てられ得る。相対遺伝子発現レベルを計算するために、Ｑ−ＰＣＲ分析で得られたＣｔ値は、全ヒトゲノム（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）または遺伝子断片を含むプラスミドのいずれかを用いて定量された、個々のプライマー対の効率を用いて較正することができる。相対発現レベルは、さらに、反応混合物に含まれるスパイクＲＮＡを用いて計算された検定線を使用してコピー数に変換することができる（ｌｏｇ１０［発現レベル］＝１．０５ｘｌｏｇ１０［コピー数］＋４．６５）。独立性のためのカイ二乗検定は、遺伝子発現のＧａｔａ４との関連を評価するために実施することができ、これは、教師なしクラスタリングにより決定されたクラスター１とクラスター２の間の差を表し、これは後の段階でＰＥに限定されている。Ｑ−ＰＣＲを用いて測定された個々の遺伝子の発現レベルは、３つのカテゴリに分類することができる：高（＞１００コピー／細胞）、中（１０−１００コピー／細胞）、および低（＜１０コピー／細胞）。Ｇａｔａ４発現からの独立性のためのカイ二乗およびＰ−値は、この分類に基づき計算され得る。カイ二乗は下記の通りに規定される：ｘ２＝ΣΣ（ｎ  ｆｉｊ−ｆｉ  ｆｊ）２／ｎ  ｆｉ  ｆｊ、式中、ｉおよびｊは、それぞれ、参照（Ｇａｔａ４）および標的遺伝子の発現レベルカテゴリ（高、中または低）を表し；ｆｉ、ｆｊ、およびｆｉｊは、それぞれ、カテゴリｉ、ｊおよびｉｊの観察された度数を表し；ならびにｎは試料数を表す（ｎ＝２４）。自由度は（ｒ−１）ｘ（ｃ−１）として規定することができ、ここで、ｒおよびｃは、それぞれ、Ｇａｔａ４および標的遺伝子の発現レベルカテゴリの有効数を表す。
【０１３９】
癌細胞に対する免疫応答を刺激すること
いくつかの実施形態では、抗原提示細胞（ＡＰＣ）が、インビボまたはエクスビボでTリンパ球を活性化するために、癌関連配列を発現する細胞に対する免疫応答を誘発するために使用され得る。ＡＰＣは高度に特殊化した細胞であり、限定はしないが、マクロファージ、単球、および樹状細胞（ＤＣ）が挙げられる。ＡＰＣは、抗原を処理し、それらのペプチド断片を細胞表面上にリンパ球活性化に必要とされる分子と共に提示し得る。いくつかの実施形態では、ＡＰＣは樹状細胞であってもよい。ＤＣは、サブグループ、例えば、例として濾胞性樹状細胞、Ｌａｎｇｅｒｈａｎｓ樹状細胞、および上皮樹状細胞に分類され得る。
【０１４０】
いくつかの実施形態は、被験体において、癌関連ポリペプチド配列を発現する細胞、例えば、限定はしないが、癌細胞に対する免疫応答を誘発するための、癌関連配列、その断片、またはその変異体をコードする癌関連ポリペプチドおよびポリヌクレオチド、ならびに抗原提示細胞（例えば、限定はしないが、樹状細胞）の使用に関する。いくつかの実施形態では、癌関連配列を発現する細胞に対する免疫応答を誘発する方法は、（１）造血幹細胞を単離すること、（２）細胞を遺伝子改変し、癌関連配列を発現させること、（３）細胞をＤＣに分化させること；ならびに（４）ＤＣを被験体（例えば、ヒト患者）に投与することを含む。いくつかの実施形態では、免疫応答を誘発する方法は、（１）ＤＣを単離すること（またはＤＣ前駆体細胞の単離および分化）（２）細胞を癌関連配列でパルスすること、ならびに；（３）ＤＣを被験体に投与することを含む。これらのアプローチは、以下により詳細に記載される。いくつかの実施形態では、パルスまたは発現ＤＣは、エクスビボでTリンパ球を活性化するために使用され得る。これらの一般的技術およびそのバリエーションは、当業者の技術の範囲内にある可能性があり（例えば、ＷＯ９７／２９１８２号；ＷＯ９７／０４８０２号；ＷＯ９７／２２３４９号；ＷＯ９６／２３０６０号；ＷＯ９８／０１５３８号； Hsu et al., 1996, Nature Med. 2:52-58を参照されたい）、そのさらに他のバリエーションが将来発見される可能性がある。いくつかの実施形態では、癌関連配列は、被験体と接触させられ、免疫応答が刺激される。いくつかの実施形態では、免疫応答は治療免疫応答である。いくつかの実施形態では、免疫応答は予防的免疫応答である。例えば、癌関連配列は被験体と、免疫応答を刺激するのに有効な条件下で接触させることができる。癌関連配列は、例えば、ＤＮＡ分子（例えばＤＮＡワクチン）、ＲＮＡ分子、またはポリペプチド、またはそれらの任意の組み合わせとして投与することができる。免疫応答を刺激するために配列を投与することは知られているが、使用するその配列のアイデンティテイは本開示の前には知られていなかった。本明細書で開示される配列またはそのホモログのいずれの配列または組み合わせも、免疫応答を刺激するために被験体に投与することができる。
【０１４１】
いくつかの実施形態では、樹状細胞前駆細胞は、癌関連配列による導入のために単離され、樹状細胞に分化するように誘導される。遺伝子改変されたＤＣは、癌関連配列を発現し、ペプチド断片を細胞表面上に提示し得る。
【０１４２】
いくつかの実施形態では、発現された癌関連配列は、自然発生タンパク質の配列を含む。いくつかの実施形態では、癌関連配列は、自然発生配列を含まない。すでに言及してきたように、自然発生タンパク質の断片を使用してもよく；加えて、発現されたポリペプチドは、自然発生ポリペプチドと比較した場合、少なくとも１つのペプチドエピトープがＤＣにより処理され、ＭＨＣクラスＩまたはＩＩ表面分子上に提示され得る限り、変異、例えば欠失、挿入、またはアミノ酸置換を含み得る。いくつかの実施形態では、例えば、ペプチドの抗原性を増加させる、またはペプチド発現レベルを増加させるために、「野生型」以外の配列を使用することが望ましい可能性がある。いくつかの実施形態では、導入された癌関連配列は、バリアント、例えば多形バリアント（例えば、特定のヒト患者により発現されるバリアント）または特定の癌の特徴を示すバリアント（例えば、特定の被験体における癌）をコードし得る。
【０１４３】
いくつかの実施形態では、癌関連発現配列は、ＤＣまたは幹細胞に、様々な標準方法、例えばトランスフェクション、組換えワクチニアウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、レトロウイルス、などのいずれかにおいて導入（形質導入）され得る。
【０１４４】
いくつかの実施形態では、本発明のトランスフォームされたＤＣは、被験体（例えば、限定はしないが、ヒト患者）に導入することができ、ここで、ＤＣは免疫応答を誘導し得る。典型的には、免疫応答は抗原ペプチドを有する標的細胞に対する細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答を含む（例えば、ＭＨＣクラスＩ／ペプチド複合体において）。これらの標的細胞は典型的には癌細胞である。
【０１４５】
いくつかの実施形態では、ＤＣが被験体に投与される場合、それらは好ましくは、その被験体由来の前駆細胞から単離され、またはこれに由来することができる（すなわち、ＤＣは、自己被験体に投与され得る）。しかしながら、細胞は、ＨＬＡ適合同種またはＨＬＡ不適合同種被験体に注入され得る。後者の場合、免疫抑制薬が被験体に投与され得る。
【０１４６】
いくつかの実施形態では、細胞は任意の好適な方法で投与され得る。いくつかの実施形態では、細胞は薬学的に許容される担体（例えば、生理食塩水）と共に投与され得る。いくつかの実施形態では、細胞は、静脈内、関節内、筋肉内、皮内、腹腔内、皮下経路を介して投与され得る。投与（すなわち、免疫化）は時間間隔で繰り返すことができる。ＤＣの注入は、ＤＣ数および活性を維持するように作用するサイトカインの投与と組み合わせることができる（例えば、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−１２）。
【０１４７】
いくつかの実施形態では、被験体に投与される用量は、Ｔ細胞増殖、Ｔリンパ球細胞毒性を測定するアッセイにより検出される免疫応答を誘導する、および／または、時間経過に伴い、患者において有益な治療応答を達成する、例えば、癌細胞の増殖を抑制する、または癌細胞の数または腫瘍のサイズを低減させるのに十分な用量とすることができる。
【０１４８】
いくつかの実施形態では、ＤＣは（患者から、または前駆細胞のインビトロ分化により）得られ、癌関連配列を有する抗原ペプチドでパルスされる。パルスにより、細胞の表面ＭＨＣ分子へのペプチドの提示が得られる。細胞表面上で提示されるペプチド／ＭＨＣ複合体は、癌関連ポリペプチドを発現する標的細胞（例えば、限定はしないが、癌細胞）に対するＭＨＣ拘束性細胞傷害性Ｔリンパ球応答を誘導することができ得る。
【０１４９】
いくつかの実施形態では、パルスに使用される癌関連配列は、少なくとも約６または８のアミノ酸および約３０未満のアミノ酸または約５０未満のアミノ酸残基の長さを有し得る。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド配列は約８〜約１２のアミノ酸を有し得る。いくつかの実施形態では、ヒトタンパク質断片の混合物が使用され得；また、規定された配列の特定のペプチドが使用され得る。ペプチド抗原は、デノボペプチド合成、精製または組換えヒトペプチドの酵素消化、自然源（例えば、被験体または被験体由来の腫瘍細胞）からのペプチド配列の精製、またはヒトペプチド断片をコードする組換えポリヌクレオチドの発現により生成され得る。
【０１５０】
いくつかの実施形態では、ＤＣをパルスするために使用されるペプチドの量は、ペプチドまたはポリペプチドの性質、サイズおよび純度に依存し得る。いくつかの実施形態では、約０．０５ｕｇ／ｍｌ〜約１ｍｇ／ｍｌ、約０．０５ｕｇ／ｍｌ〜約５００ｕｇ／ｍｌ、約０．０５ｕｇ／ｍｌ〜約２５０ｕｇ／ｍｌ、約０．５ｕｇ／ｍｌ〜約１ｍｇ／ｍｌ、約０．５ｕｇ／ｍｌ〜約５００ｕｇ／ｍｌ、約０．５ｕｇ／ｍｌ〜約２５０ｕｇ／ｍｌ、または約１ｕｇ／ｍｌ〜約１００ｕｇ／ｍｌの量のペプチドが使用され得る。ペプチド抗原（複数可）を培養されるＤＣに付加した後、細胞はその後、十分な時間、抗原を取り込み、処理し、抗原ペプチドを、クラスＩまたはクラスＩＩ  ＭＨＣのいずれかと関連させて細胞表面上に発現させることができる。いくつかの実施形態では、抗原を取り込み、処理する時間は約１８〜約３０時間、約２０〜約３０時間、または約２４時間とすることができる。
【０１５１】
異なるＭＨＣクラスＩおよびＩＩ分子に対するペプチド結合モチーフを予想するためのシステムおよび方法の多くの例が説明されている。そのような予想は、望ましいＭＨＣクラスＩまたはＩＩ分子に結合するペプチドモチーフを予想するために使用することができる。当業者がそのような目的のために調べるそのような方法、システム、およびデータベースの例としては下記が挙げられる：
１．  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｂｉｎｄｉｎｇ  Ｍｏｔｉｆｓ  ｆｏｒ  ＭＨＣ  Ｃｌａｓｓ  Ｉ  ａｎｄ  ＩＩ  Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ；  Ｗｉｌｌｉａｍ  Ｅ．  Ｂｉｄｄｉｓｏｎ，  Ｒｏｌａｎｄ  Ｍａｒｔｉｎ，  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，  Ｕｎｉｔ  １Ｉ  （ＤＯＩ：  １０．１００２／０４７１１４２７３５．ｉｍａ０１ｉｓ３６；  Ｏｎｌｉｎｅ  Ｐｏｓｔｉｎｇ  Ｄａｔｅ：  Ｍａｙ，  ２００１）。
【０１５２】
上記参考文献１は、特定のＭＨＣクラスＩまたはＩＩアレルとの相互作用を予想するためのペプチド結合モチーフの使用の概観を提供し、Ｔ細胞認識を予想するためのＭＨＣ結合モチーフの使用に対する例を提供する。
【０１５３】
表３は、ＮＩＨセンターでの、Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙウェブサイト、ＢｉｏＩｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ａｎａｌｙｓｉｓセクションに対する、ＨＬＡペプチドモチーフ検索に対する例示的な結果を提供する。全長ＧＮＧＴ１ペプチド配列を検索クエリーとして使用した。
【表１】
2014525584.tif 000002
2014525584.tif 000003
2014525584.tif 000004
【０１５４】
ペプチド系ワクチン接種の技術分野における当業者は、個体において、それらのＨＬＡアレルに基づき、どのペプチドが最もよく作用するかを決定することができる（例えば、「ＭＨＣ拘束」による）。異なるＨＬＡアレルは、特定のペプチドモチーフ（通常、８−１０のうちの２または３の高保存位置）に、異なるエネルギーで結合し、それは、理論的に予想することができ、または解離速度として測定することができる。したがって、当業者は、被験体のＨＬＡプロファイルに対してペプチドを調整することができ得る。
【０１５５】
癌関連配列の細胞への導入
いくつかの実施形態は診断および／または治療抗体のための標的として様々な癌と関連する抗原（例えば、癌関連ポリペプチド）を提供する。これらの抗原はまた、創薬（例えば、小分子）および細胞制御、増殖、および分化のさらなる特徴付けに有用であり得る。
【０１５６】
いくつかの実施形態では、細胞は本明細書で開示される１つ以上の癌関連配列でトランスフェクトされ得る。いくつかの実施形態では、細胞は樹状細胞であってもよい。１つ以上の癌関連配列でトランスフェクトされた樹状細胞は、以下に開示される１つ以上の癌関連配列に対し免疫応答を刺激する抗原提示細胞として使用され得る。
【０１５７】
細胞を以下に開示される１つ以上の癌関連配列でトランスフェクトするために、当技術分野で知られているいずれの方法を使用してもよい。電気穿孔は本明細書で記載される癌関連核酸を哺乳類細胞に（Ｎｅｕｍａｎｎ，  Ｅ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９８２）  ＥＭＢＯ  Ｊ．  １，  ８４１−８４５）、植物および細菌細胞に導入するために使用することができ、これはまたタンパク質を導入するためにも使用することができる（Ｍａｒｒｅｒｏ，  Ｍ．Ｂ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９９５）    Ｊ．  Ｂｉｏｌ．    Ｃｈｅｍ．  ２７０，  １５７３４−１５７３８；  Ｎｏｌｋｒａｎｔｚ，  Ｋ．  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  Ａｎａｌ．  Ｃｈｅｍ．  ７４，  ４３００−４３０５；  Ｒｕｉ，  Ｍ．    ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉ．  ７１，  １７７１−１７７８）。対象となる精製タンパク質の緩衝液中に懸濁させた細胞（例えば、この発明の細胞）が、パルス電場内に置かれる。簡単に言うと、高電圧電気パルスにより、細胞膜内に小さな（ナノメートルサイズの）細孔が形成する。タンパク質は、細胞にこれらの小さな細孔を介して、または膜再編成過程中に、細孔が閉じ、細胞がその正常状態に戻るにつれ、細胞に入る。送達効率は、印加電場の強度、パルスの長さ、温度および緩衝培地の組成に依存し得る。電気穿孔は様々な細胞型で、他の送達方法に抵抗性があるいくつかの細胞系でさえも、成功しているが、全体の効率はしばしばかなり低い。いくつかの細胞系は、部分的に活性化されない限り、電気穿孔に対してさえも抵抗性のままであり得る。
【０１５８】
マイクロインジェクションは、フェムトリットル体積のＤＮＡを直接、細胞の核内に導入するために使用することができ（Ｃａｐｅｃｃｈｉ，  Ｍ．Ｒ．  （１９８０）  Ｃｅｌｌ  ２２、４７０−４８８）、この場合、それは、直接宿主細胞ゲノムに組み込まれることができ、したがって対象となる配列を有する樹立細胞系が生成する。タンパク質、例えば抗体（（Ａｂａｒｚｕａ，  Ｐ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９９５）  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．  ５５，  ３４９０−３４９４；  Ｔｈｅｉｓｓ，  Ｃ．  ａｎｄ  Ｍｅｌｌｅｒ，  Ｋ．  （２００２）  Ｅｘｐ．  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｓ．  ２８１，  １９７−２０４）および変異タンパク質（Ｎａｒｙａｎａｎ，  Ａ．  ｅｔ  ａｌ．  （２００３）  Ｊ．  Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉ．  １１６，  １７７−１８６）もまた、直接細胞内にマイクロインジェクションにより送達することができ、直接、細胞過程へのそれらの効果が決定される。マイクロインジェクションは、巨大分子を直接細胞内に導入するという利点を有し、よって、潜在的に望ましくない細胞区画例えば低−ｐＨエンドソームへの曝露が回避される。
【０１５９】
いくつかのタンパク質および小ペプチドは、古典的受容体介在性またはエンドサイトーシス介在経路とは独立して、生物学的膜を介して、形質導入または移動する能力を有する。これらのタンパク質の例としては、ＨＩＶ−１ＴＡＴタンパク質、単純ヘルペスウイルス１（ＨＳＶ−１）ＤＮＡ−結合タンパク質ＶＰ２２、およびショウジョウバエアンテナペディア（Ａｎｔｐ）ホメオティック転写因子が挙げられる。いくつかの実施形態では、これらのタンパク質由来のタンパク質形質導入ドメイン（ＰＴＤ）は、他の巨大分子、ペプチドまたはタンパク質、例えば、限定はしないが、癌関連ポリペプチドに融合することができ、ポリペプチドはうまく細胞内に輸送される（Ｓｃｈｗａｒｚｅ，  Ｓ．Ｒ．  ｅｔ  ａｌ．  （２０００）  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．  １０，  ２９０−２９５）。これらの形質導入ドメインの融合を使用する例示的な利点は、タンパク質移行が迅速で、濃度依存性であり、困難な細胞型と共に働くようであることである（Ｆｅｎｔｏｎ，  Ｍ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９９８）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２１２，  ４１−４８）。
【０１６０】
いくつかの実施形態では、リポソームが、オリゴヌクレオチド、ＤＮＡ（遺伝子）コンストラクトおよび小薬物分子を細胞内に送達させるためにビヒクルとして使用され得る（Ｚａｂｎｅｒ，  Ｊ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９９５）  Ｊ．  Ｂｉｏｌ．  Ｃｈｅｍ．  ２７０，  １８９９７−１９００７；  Ｆｅｌｇｎｅｒ，  Ｐ．Ｌ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９８７）  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ８４，  ７４１３−７４１７）。ある一定の脂質は、水溶液に入れられ、超音波処理されると、水性区画を取り囲む環状化脂質二重層から構成される閉じられた小胞を形成する。本明細書における実施形態の小胞またはリポソームは、送達される分子を含む溶液中で形成され得る。ＤＮＡを水溶液中に封入することに加えて、カチオン性リポソームは、自然にかつ効率的にＤＮＡと複合体を形成することができ、脂質上の正電荷を持つヘッド基は、ＤＮＡの負電荷を持つバックボーンと相互作用する。使用されるカチオン性脂質の的確な組成物および／または混合物は、対象となる巨大分子および使用される細胞型によって変化させることができる（Ｆｅｌｇｎｅｒ，  Ｊ．Ｈ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９９４）  Ｊ．  Ｂｉｏｌ．  Ｃｈｅｍ．  ２６９，  ２５５０−２５６１）。カチオン性リポソーム戦略はまた、タンパク質送達にうまく適用されている（Ｚｅｌｐｈａｔｉ，  Ｏ．  ｅｔ  ａｌ．  （２００１）  Ｊ．  Ｂｉｏｌ．  Ｃｈｅｍ．  ２７６，  ３５１０３−３５１１０）。タンパク質はＤＮＡよりも不均一であるので、タンパク質の物理的特性、例えばその電荷および疎水性は、そのカチオン性脂質との相互作用の程度に影響し得る。
【０１６１】
捕捉試薬および結合パートナー
本発明のある一定の実施形態は、以下に開示される癌関連配列によりコードされる分子に対する捕捉試薬および特異的結合パートナーを提供する。捕捉試薬および特異的結合パートナーは、分子、例えば、以下に開示される癌関連配列をコードする核酸、または以下に開示される癌関連配列によりコードされるタンパク質もしくはタンパク質断片を単離するために使用され得る。捕捉試薬および特異的結合パートナーは、試料において癌を診断および／または検出するために使用され得る。捕捉試薬または結合パートナーは癌を治療するための治療物として使用することができ、ここで、癌は以下に開示される１つ以上の癌関連配列の発現と関連する。
【０１６２】
捕捉試薬および特異的結合パートナーは以下に開示される癌関連配列によりコードされる分子に特異的に結合する任意の分子であってもよい。タンパク質、ペプチド、核酸、例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ＰＮＡなど、脂質、炭水化物、小分子、例えば無機および有機分子および複数の前記分子の組み合わせであってもよい。
【０１６３】
捕捉試薬および結合パートナーは、例えば、核酸、例としてＤＮＡ分子またはＰＮＡ分子であってもよい。核酸は、癌関連配列によりコードされる配列、例えばＤＮＡ分子、またはＲＮＡ分子に結合してもよい。捕捉試薬または結合パートナーは例えば５−５００ヌクレオチド長、１０−２００ヌクレオチド長、２０−１００ヌクレオチド長であってもよい。捕捉試薬または結合パートナーは約５、約１０、約１５、約２０、約２５、約３０、約３５、約４０ヌクレオチド長であってもよい。
【０１６４】
捕捉試薬および特異的結合パートナーは、例えば、癌関連配列によりコードされる分子に特異的に結合する任意のタンパク質を含むタンパク質であってもよい。一例として、捕捉試薬および特異的結合パートナーは抗体であってもよい。抗体は、例えば、癌関連配列によりコードされるタンパク質またはタンパク質断片に結合し得る。
【０１６５】
例えば、ＩｇＧ抗体、における結合は、一般に、少なくとも約１０−７Ｍ以上、例えば少なくとも約１０−８Ｍ以上、または少なくとも約１０−９Ｍ以上、または少なくとも約１０−１０以上、または少なくとも約１０−１１Ｍ以上、または少なくとも約１０−１２Ｍ以上の親和性により特徴付けられる。この用語はまた、例えば抗原結合ドメインが、多くの抗原に有されていない特定のエピトープに特異的である場合に適用可能であり、この場合、抗体または抗原結合ドメインを有する抗原結合タンパク質は一般に他の抗原に結合しない。いくつかの実施形態では、捕捉試薬は、その結合パートナー（例えば抗原）に対し、１０−９Ｍ、１０−１０Ｍ、または１０−１１Ｍ以下のＫｄを有する。いくつかの実施形態では、捕捉試薬は、その結合パートナーに対し１０９Ｍ−１以上のＫａを有する。捕捉試薬はまた、例えば、抗体を示すことができる。免疫グロブリンとしても知られている無傷の抗体は典型的には、それぞれおよそ２５ｋＤａの２つの軽（Ｌ）鎖、およびそれぞれおよそ５０ｋＤａの２つの重（Ｈ）鎖から構成される四量体グリコシル化タンパク質である。２つの型の軽鎖は、λおよびκと呼ばれ、抗体中に存在する。重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列によって、免疫グロブリンには５つの主要なクラスが割り当てられ：Ａ、Ｄ、Ｅ、Ｇ、およびＭ、これらのいくつかはさらにサブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２に分けられる。各軽鎖はＮ末端可変（Ｖ）ドメイン（ＶＬ）および定常（Ｃ）ドメイン（ＣＬ）から構成される。各重鎖はＮ末端Ｖドメイン（ＶＨ）、３つまたは４つのＣドメイン（ＣＨ）、およびヒンジ領域から構成される。ＶＨに最も近接するＣＨドメインはＣＨ１と指定される。ＶＨおよびＶＬドメインは、フレームワーク領域（ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、およびＦＲ４）と名付けられた比較的保存された配列の４つの領域から構成され、これらは、超可変配列（相補性決定領域、ＣＤＲ）の３つの領域に対する足場を形成する。ＣＤＲは、抗体または抗原結合タンパク質の抗原との特異的相互作用に関与する残基のほとんどを含む。ＣＤＲは、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３と呼ばれる。したがって、重鎖上のＣＤＲ構成物はＨ１、Ｈ２、およびＨ３と呼ばれ、一方、軽鎖上のＣＤＲ構成物は、Ｌ１、Ｌ２、およびＬ３と呼ばれる。ＣＤＲ３は、抗体または抗原結合タンパク質−結合部位内の分子多様性の最も大きな源である。例えば、Ｈ３は、２つという短いアミノ酸残基または２６超のアミノ酸とすることができる。異なるクラスの免疫グロブリンのサブユニット構造および３次元立体配置は当技術分野でよく知られている。抗体構造の見直しのためには、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，  Ｅｄｓ．  Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８８を参照されたい。当業者は、各サブユニット構造、例えば、ＣＨ、ＶＨ、ＣＬ、ＶＬ、ＣＤＲ、および／またはＦＲ構造は活性断片を含むことを認識するであろう。例えば、活性断片は、抗原に結合するＶＨ、ＶＬ、またはＣＤＲサブユニットの部分、すなわち、抗��結合断片、またはＦｃ受容体および／または補体に結合する、および／またはこれを活性化するＣＨサブユニットの部分から構成され得る。
【０１６６】
本明細書で使用される「抗原特異抗体」という用語内に含まれる結合断片の非限定的な例としては下記が挙げられる：（ｉ）Ｆａｂ断片、ＶＬ、ＶＨ、ＣＬおよびＣＨ１ドメインから構成される一価断片；（ｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片、ヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結された２つのＦａｂ断片を含む二価断片；（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインから構成されるＦｄ断片；（ｉｖ）抗体の単一アームのＶＬおよびＶＨドメインから構成されるＦｖ断片、（ｖ）ＶＨドメインから構成されるｄＡｂ断片；ならびに（ｖｉ）単離されたＣＤＲ。さらに、Ｆｖ断片の２つのドメイン、ＶＬおよびＶＨは、別々の遺伝子によりコードされるが、それらは、合成リンカーにより組換えで連結することができ、単一タンパク質鎖が生成され、この場合、ＶＬおよびＶＨドメインが対となり一価分子を形成する（単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られている）。最も普通に使用されるリンカーは１５残基（Ｇｌｙ４Ｓｅｒ）３ペプチドであるが、他のリンカーもまた、当技術分野で知られている。単鎖抗体はまた、「抗体または抗原結合タンパク質」あるいは抗体の「抗原結合断片」という用語に含まれることが意図される。抗体はまた、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、抗原結合断片、Ｆｃ断片、単鎖抗体、またはその任意の誘導体とすることができる。
【０１６７】
抗体は、当業者に知られている従来の技術を用いて得ることができ、断片は、無傷の抗体と同じように有用性に対しスクリーニングされる。抗体多様性は可変ドメインをコードする複数の生殖系列遺伝子および様々な体細胞事象により生成される。体細胞事象としては、完全ＶＨドメインを生成するための可変遺伝子セグメントの多様性（Ｄ）および連結（Ｊ）遺伝子セグメントによる組換え、ならびに完全ＶＬドメインを生成させるための可変および連結遺伝子セグメントの組換えが挙げられる。組換え過程はそれ自体、不正確であり、Ｖ（Ｄ）Ｊ連結部でのアミノ酸の損失または付加が起こる。これらの多様性メカニズムは、抗原暴露前の分化Ｂ細胞において起こる。抗原刺激後、Ｂ細胞において発現された抗体遺伝子は体細胞変異を受ける。生殖系列遺伝子セグメントの推定数、これらのセグメントのランダム組換え、およびランダムＶＨ−ＶＬ対形成に基づき、１．６Ｘ１０７までの異なる抗体が生成され得る（Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，  ３ｒｄ  ｅｄ．  （１９９３），  ｅｄ．  Ｐａｕｌ，  Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎ．Ｙ．）。抗体多様性に寄与する他の過程（例えば体細胞変異）が考慮される場合、１Ｘ１０１０を超える異なる抗体が生成され得ると考えられる（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ  Ｇｅｎｅｓ，  ２ｎｄ  ｅｄ．  （１９９５），  ｅｄｓ．  Ｊｏｎｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，  Ｃａｌｉｆ．）。抗体多様性の生成には多くの過程が関与するので、同じ抗原特異性を有する独立して誘導されたモノクローナル抗体が同一アミノ酸配列を有する可能性は低い。
【０１６８】
抗原、エピトープ、または本明細書で記載される他の分子と特異的に相互作用することができる抗体または抗原結合タンパク質分子は、当業者によく知られている方法により生成され得る。例えば、モノクローナル抗体は公知の方法に従いハイブリドーマの作製により生成させることができる。このように形成されたハイブリドーマはその後、標準方法、例えば酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）およびＢｉａｃｏｒｅ分析を用いてスクリーニングすることができ、対象となる分子または化合物と特異的に相互作用する抗体を生成する１つ以上のハイブリドーマが同定される。モノクローナル抗体分泌ハイブリドーマを調製する代わりとして、本開示のポリペプチドに対するモノクローナル抗体は、組換えコンビナトリアル免疫グロブリンライブラリ（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリ）を、本開示のポリペプチドでスクリーニングし、よって、ポリペプチドに結合する免疫グロブリンライブラリメンバーを単離することにより、同定され、単離され得る。ファージディスプレイライブラリを生成させ、スクリーニングするための技術および市販キットは当業者によく知られている。加えて、抗体または抗原結合タンパク質ディスプレイライブラリを生成させ、スクリーニングするのに使用するために特に適した方法および試薬の例は、文献で見出すことができる。
【０１６９】
キメラ抗体の例としては、ヒト化抗体が挙げられるが、それらに限定されない。本明細書で記載される抗体はまたヒト抗体とすることができる。いくつかの実施形態では、捕捉試薬は検出試薬を含む。検出試薬は、その特異的結合パートナーへ結合する捕捉試薬の存在を検出するために使用することができる任意の試薬とすることができる。捕捉試薬は、直接検出試薬を含むことができ、または捕捉試薬は、検出試薬を含む粒子を含むことができる。いくつかの実施形態では、捕捉試薬および／または粒子は顔料、コロイド金、放射性タグ、蛍光タグ、または化学発光基質を含む。粒子は、例えば、ウイルス粒子、ラテックス粒子、脂質粒子、または蛍光粒子とすることができる。
【０１７０】
本開示の捕捉試薬（例えば抗体）はまた、抗抗体、すなわち別の抗体を認識するが、抗原に特異的でない抗体、例えば、限定はされないが、抗ＩｇＧ、抗ＩｇＭ、または抗ＩｇＥ抗体を含むことができる。この非特異抗体は抗原特異抗体が試料中に存在するかどうかを検出するための陽性対照として使用することができる。いくつかの実施形態では、抗体は表１で開示されるヌクレオチド配列によりコードされるタンパク質由来のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、エピトープは、表１で開示される配列のヌクレオチド配列によりコードされるタンパク質配列の断片であり、これは本明細書で記載される。いくつかの実施形態では、エピトープは癌関連配列の約１−１０、１−２０、１−３０、３−１０、または３−１５残基を含む。いくつかの実施形態では、エピトープは直線ではない。
【０１７１】
いくつかの実施形態では、抗体は、本明細書で記載される領域またはその領域に対し少なくとも９０、９５、または９９％の相同性もしくは同一性を有するペプチドに結合する。いくつかの実施形態では、本明細書で記載される領域の断片は５−１０残基の長さである。いくつかの実施形態では、本明細書で記載される領域の断片（例えばエピトープ）は３−５残基の長さである。断片は、提供される長さに基づき記載される。いくつかの実施形態では、エピトープは約３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または２０残基の長さである。
【０１７２】
いくつかの実施形態では、抗体が結合する配列は核酸およびアミノ酸配列の両方を含み得る。いくつかの実施形態では、抗体が結合する配列は開示される配列と少なくとも約６０％の相同性を有する配列を含み得る。いくつかの実施形態では、抗体が結合する配列は、開示される配列と少なくとも約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％、約９９．８％の相同性を有し得る。いくつかの実施形態では、配列は、「変異核酸」または「変異ペプチド配列」と呼んでもよい。
【０１７３】
癌の治療
いくつかの実施形態では、１つ以上の癌関連配列を発現する癌は、癌関連配列の活性をアンタゴナイズすることにより治療され得る。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、治療物、例えば、限定はしないが、癌関連配列に結合するリガンドをアンタゴナイズする抗体、癌関連配列の発現または活性を抑制する小分子、癌関連配列に対するｓｉＲＮＡ、などを投与することを含み得る。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、タンパク質に対する抗体を治療の必要な被験体に投与することを含み得る。いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体であってもよい。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化または組換え抗体であってもよい。この領域に特異的に結合する抗体は、公知の方法を用いて作製することができ、いずれの方法も好適である。いくつかの実施形態では、抗体は表１で開示される配列またはその断片に特異的に結合する。
【０１７４】
いくつかの実施形態では、癌（例えば腺癌または他の型の癌）を治療する方法は、癌関連配列の受容体の存在を検出すること、および癌治療を投与することを含む。癌治療は任意の癌治療または癌関連配列の作用の抑制に特異的であるものであってもよい。例えば、様々な癌は、癌治療を提供する前に試験され、特定の分子が存在するかどうか決定される。そのため、いくつかの実施形態では、試料が患者から取得され、本明細書で記載される癌関連配列の存在または癌関連配列の過剰発現について試験される。いくつかの実施形態では、癌関連配列が過剰発現されていることが見出された場合、癌治療または治療物が被験体に投与される。癌治療は従来の非特異的治療、例えば化学療法であってもよく、または治療は癌関連配列の活性または癌関連配列が結合する受容体のみを標的とする特異的治療から構成されてもよい。これらの治療は、例えば、癌関連配列に特異的に結合し、その活性を抑制する抗体とすることができる。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、本開示は、被験体において癌を治療する方法を提供し、方法は癌を有する被験体に、以下に開示される任意の癌関連配列の活性を抑制する作用物質を投与することを含む。いくつかの実施形態では本発明は被験体において癌を治療する方法を提供し、方法は癌を有する被験体に、ＧＮＧＴ１、Ｃ１２ｏｒｆ５６、ＣＯＬ１０Ａ１、ＳＬＣ３５Ｄ３、ｓｎａＲ−Ａ、ＳＢＫ１、ＤＳＣＲ８、ＣＥＬＳＲ３またはその相補体によりコードされる１つ以上の遺伝子発現およびまたはタンパク質発現の活性を抑制する作用物質を投与することを含む。
【０１７６】
いくつかの実施形態では、癌細胞は、差次的に発現される遺伝子または遺伝子産物に基づく治療物により特異的に標的とされ得る。例えば、いくつかの実施形態では、差次的に発現される遺伝子産物は酵素であってもよく、これは抗癌プロドラッグをその活性形態に変換することができる。そのため、正常細胞では、差次的に発現される遺伝子産物は発現されず、または著しく低いレベルで発現され、プロドラッグは、活性化されないかまたはより少ない量で活性化される可能性があり、そのため、正常細胞にはより毒性が低くなり得る。そのため、癌プロドラッグは、いくつかの実施形態では、より高い用量で投与することができ、よって、癌細胞はプロドラッグを代謝することができ、これは、例えば、癌細胞を死滅させ、正常細胞はプロドラッグを代謝せず、または同様に代謝せず、よって、患者にはより毒性が低くなる。この一例は腫瘍細胞がメタロプロテアーゼを過剰発現する場合であり、これはＡｔｋｉｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｒｉｔｉｓｈ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ  （２００８）  １５３，  １３４４‐１３５２（その全体が本明細書で参照により、癌細胞を特異的に標的とする方法に対して組み込まれる）に記載される。癌細胞を標的とするためにプロテアーゼを使用することはまた、Ｃａｒｌ  ｅｔ  ａｌ．，  ＰＮＡＳ，  Ｖｏｌ．  ７７，  Ｎｏ．  ４，  ｐｐ．  ２２２４−２２２８，  Ａｐｒｉｌ  １９８０（その全体が本明細書で参照により、癌細胞を特異的に標的とする方法に対して組み込まれる）に記載される。例えば、ドキソルビシンまたは他の型の化学治療物は、差次的に発現される遺伝子産物により特異的に切断され、または認識されるペプチド配列に連結させることができる。ドキソルビシンまたは他の型の化学治療物はその後、ペプチド配列から切断され、活性化され、細胞を死滅させ、またはその増殖を抑制することができ、一方、正常細胞では、化学治療物は決して細胞内部に取り入れられることはなく、効率的に代謝されることはなく、そのため、毒性が低い。
【０１７７】
いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、本明細書で記載される１つ以上の癌関連配列の遺伝子ノックダウンを含み得る。遺伝子ノックダウンは、遺伝子改変（生物の染色体、例えば、限定はしないが、癌関連配列をコードする染色体の１つのＤＮＡにおける変化）により、あるいは試薬、例えばｍＲＮＡトランスクリプトまたは遺伝子のいずれかに相補的な配列を有する短いＤＮＡまたはＲＮＡオリゴヌクレオチドを用いた処理により、生物の遺伝子の１つ以上の発現が低減される技術を示す。いくつかの実施形態では、使用されるオリゴヌクレオチドは下記から選択され得る：ＲＮａｓｅ−Ｈコンピテントアンチセンス、例えば、限定はしないが、ｓｓＤＮＡオリゴヌクレオチド、ｓｓＲＮＡオリゴヌクレオチド、ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド、またはキメラオリゴヌクレオチド；ＲＮａｓｅ非依存性アンチセンス、例えばモルホリノオリゴヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルホスホロチオエートオリゴヌクレオチド、ロックド核酸オリゴヌクレオチド、またはペプチド核酸オリゴヌクレオチド；ＲＮＡｉオリゴヌクレオチド、例えば、限定はしないが、ｓｉＲＮＡ二本鎖オリゴヌクレオチド、またはｓｈＲＮＡオリゴヌクレオチド；またはそれらの任意の組み合わせ。いくつかの実施形態では、プラスミドを細胞内に導入させることができ、この場合、プラスミドはアンチセンスＲＮＡトランスクリプトまたはｓｈＲＮＡトランスクリプトのいずれかを発現する。導入されたオリゴまたは発現されたトランスクリプトは、標的ｍＲＮＡ（例えば、表１で開示される配列）と、相補的塩基対形成により相互作用し得る（センス−アンチセンス相互作用）。
【０１７８】
特定のサイレンシングメカニズムはオリゴ化学により変動し得る。いくつかの実施形態では、本明細書で記載されるオリゴヌクレオチドの活性遺伝子またはそのトランスクリプトへの結合は、転写のブロッキング、ｍＲＮＡトランスクリプトの分解（例えば、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）またはＲＮａｓｅ−Ｈ依存性アンチセンスによる）またはｍＲＮＡ翻訳、ｍＲＮＡ前駆体スプライシング部位または、他の機能的ＲＮＡ、例えばｍｉＲＮＡの成熟のために使用されるヌクレアーゼ切断部位のいずれかのブロッキング（例えば、モルホリノオリゴヌクレオチドまたは他のＲＮａｓｅ−Ｈ非依存性アンチセンスによる）により、発現の減少を引き起こし得る。例えば、ＲＮａｓｅ−Ｈコンピテントアンチセンスオリゴヌクレオチド（およびアンチセンスＲＮＡトランスクリプト）は、酵素ＲＮａｓｅ−Ｈ（ＲＮＡ鎖を切断する）により認識されるＲＮＡと二本鎖を形成し得る。別の例として、ＲＮａｓｅ非依存性オリゴヌクレオチドはｍＲＮＡに結合し、翻訳過程をブロックし得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは５’−ＵＴＲで結合し、５’−キャップから開始コドンまで移動する開始複合体を停止させることができ、リボソーム構築を防止する。ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの一本鎖は、ＲＩＳＣ複合体にロードさせることができ、これは、触媒的に相補的配列を切断し、部分的に相補的な配列を有するいくつかのｍＲＮＡの翻訳を抑制する。オリゴヌクレオチドは、任意の技術、例えば、限定はしないが、下記により細胞に導入され得る：電気穿孔、マイクロインジェクション、塩ショック方法、例えば、例として、ＣａＣｌ２ショック；アニオン性オリゴのカチオン性脂質、例えば、例として、リポフェクタミンによるトランスフェクション；無電荷オリゴヌクレオチドのエンドソーム放出剤、例えば、例として、Ｅｎｄｏ−Ｐｏｒｔｅｒによるトランスフェクション；またはそれらの任意の組み合わせ。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは血液からサイトゾルに、ナノ粒子複合体、ウイルス介在トランスフェクション、オクタグアニジウムデンドリマーに連結されたオリゴヌクレオチド（モルホリノオリゴヌクレオチド）、またはそれらの任意の組み合わせから選択される技術を用いて送達され得る。
【０１７９】
いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、表１で開示されるｍＲＮＡをコードする遺伝子の発現をノックダウンまたは抑制するように細胞を処理することを含み得る。方法は、ｈＥＳ細胞由来クローン胚性前駆細胞系ＣＭ０２およびＥＮ１３（“Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｔｏ  ａｃｃｅｌｅｒａｔｅ  ｔｈｅ  ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｎｏｖｅｌ  ｃｅｌｌ  ｓｔｒａｉｎｓ  ｆｒｏｍ  ｐｌｕｒｉｐｏｔｅｎｔ  ｓｔｅｍ  ｃｅｌｌｓ  ａｎｄ  ｃｅｌｌｓ  ｏｂｔａｉｎｅｄ  ｔｈｅｒｅｂｙ”と題する米国特許公開２００８／００７０３０３号；および２００９年７月１６日に出願され、“Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｔｏ  Ａｃｃｅｌｅｒａｔｅ  ｔｈｅ  Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｏｖｅｌ  Ｃｅｌｌ  Ｓｔｒａｉｎｓ  ｆｒｏｍ  Ｐｌｕｒｉｐｏｔｅｎｔ  Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌｓ  Ｏｂｔａｉｎｅｄ  Ｔｈｅｒｅｂｙ”と題する米国特許出願番号第１２／５０４，６３０号（それぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）を癌関連配列に対するサイレンシングＲＮＡを発現するレトロウイルスと共に培養することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法はさらに、ｑＰＣＲによる下方制御を確認することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法はさらに細胞を凍結保存することを含む。いくつかの実施形態では、方法さらに細胞を再プログラミングすることを含む。いくつかの実施形態では、方法はＯＣＴ４、ＭＹＣ、ＫＬＦ４、およびＳＯＸ２の外因性投与により（Ｔａｋａｈａｓｈｉ  ａｎｄ  Ｙａｍａｎａｋａ  ２００６  Ａｕｇ  ２５；１２６（４）：６６３−７６；ＵＳ２００９／００６８７４２として公開され、“Ｎｕｃｌｅａｒ  Ｒｅｐｒｏｇｒａｍｍｉｎｇ  Ｆａｃｔｏｒ”と題する米国特許出願番号第１２／０８６，４７９号（その各々が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）、およびＷＯ／２００７／０１９３９８として公開され、“Ｉｍｐｒｏｖｅｄ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｏｆ  Ｒｅｐｒｏｇｒａｍｍｉｎｇ  Ａｎｉｍａｌ  Ｓｏｍａｔｉｃ  Ｃｅｌｌｓ”と題するＰＣＴ／ＵＳ０６／３０６３２（参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載される方法により、２日以内に細胞を凍結保存するまたは再プログラミングすることを含む。いくつかの実施形態では、方法は哺乳類分化細胞を、ＥＳ細胞の伝播を促進する条件下で培養することを含み得る。いくつかの実施形態では、任意の好都合なＥＳ細胞伝播条件が、例えば、フィーダー上で、またはＥＳ細胞を伝播することができるフィーダーのない培地中で使用され得る。いくつかの実施形態では、方法は、培養中のＥＳコロニーから細胞を同定することを含む。同定されたＥＳコロニー由来の細胞はその後、ＥＳマーカー、例えば、Ｏｃｔ４、ＴＲＡ１−６０、ＴＲＡ１−８１、ＳＳＥＡ４、などに対し評価することができ、ＥＳ細胞表現型を有するものは拡大され得る。ノックダウンによりプレコンディショニングされていない対照系が、並行して再プログラミングされ、プレコンディショニングの有効性が証明され得る。
【０１８０】
本明細書におけるいくつかの実施形態は被験体において癌を治療する方法に関し、方法は治療の必要な被験体に癌関連タンパク質の活性を調節する治療薬を投与することを含み、ここで、癌関連タンパク質は、表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される核酸配列を含む核酸によりコードされる。いくつかの実施形態では、治療薬は癌関連タンパク質に結合する。いくつかの実施形態では、治療薬は抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体であってもよい。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化またはヒト抗体である。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、表１で開示される遺伝子の遺伝子ノックダウンを含み得る。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、表１で開示されるｍＲＮＡをコードする遺伝子の発現をノックダウンまたは抑制するように細胞を処理することを含み得る。
【０１８１】
いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、癌関連タンパク質（例えば、以下に開示される１つ以上の癌関連配列によりコードされるタンパク質）の合成、分泌、受容体結合もしくは受容体シグナル伝達またはその受容体を妨害する作用物質を投与することを含み得る。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、表１で開示される遺伝子またはその遺伝子産物の活性または発現を調節することにより治療される癌は部位または組織学的型により分類される癌である。
【０１８３】
いくつかの実施形態では、癌または新生物を治療し、その症状を低減させ、これを防止するための免疫療法戦略の実行は（例えば、ワクチン）は、当業者が利用できる多くの異なる技術を用いて達成され得る。
【０１８４】
免疫療法または治療目的での抗体の使用は、近年、癌を治療するするために使用されている。受動免疫療法は癌治療におけるモノクローナル抗体の使用を含む。例えば、Ｃａｎｃｅｒ：  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ，  ６  ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ  （２００１）  Ｃｈａｐｔ．  ２０  ｐｐ．  ４９５−５０８を参照されたい。これらの抗体の固有の治療的生物活性は、腫瘍細胞増殖または生存の直接抑制、および身体の免疫系の自然細胞死滅活性を補充する能力を含む。これらの作用物質は、単独で、または放射線もしくは化学療法薬と共に投与され得る。また、抗体は抗体コンジュゲートを作製するために使用することができ、この場合、抗体は毒性作用物質に連結され、腫瘍に特異的に結合することにより、その作用物質を腫瘍に向かわせる。
【０１８５】
いくつかの実施形態では、癌を治療するための方法は、治療の必要な被験体に癌関連タンパク質の活性を調節する治療薬を投与することを含み、ここで、癌関連タンパク質は、表１におけるヒト核酸配列からなる群より選択される核酸配列を含む核酸によりコードされ、さらに治療薬は癌関連タンパク質に結合する。
【０１８６】
いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、細胞表面上で発現される癌関連タンパク質に特異的に結合する抗体（例えばモノクローナル抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、など）を投与することを含む。いくつかの実施形態では、抗体は、癌関連タンパク質の細胞外ドメインに結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、正常細胞表面に対し、癌細胞表面上で差次的に発現される癌関連タンパク質に、あるいは、いくつかの実施形態では、少なくとも１つのヒト癌細胞系に結合する。いくつかの実施形態では、抗体は治療薬に連結する。被験体における癌細胞の有無を検出するための、そのような抗体を含むキットおよび医薬組成物もまた、提供される。
【０１８７】
治療物および医薬組成物の投与
治療物（単独でまたは他の医薬品と組み合わされて）のための投与様式は、舌下、注射用（皮下または筋肉内に注射される短時間作用、デポー、インプラントおよびペレット形態を含む）、または腟内クリーム、坐薬、ペッサリー、腟内リング、直腸坐薬、子宮内装置、および経皮形態、例えばパッチおよびクリームの使用によるものとすることができるが、それらに限定されない。
【０１８８】
特定の投与様式は、適応症に依存する。特定の投与経路および用量レジメンの選択は、臨床医により、臨床医に知られている方法に従い、最適臨床反応を得るために調整され、または用量設定されることになる。投与される治療物の量は、治療的に有効な量である。投与される用量は治療される被験体の特徴、例えば、治療される特定の動物、年齢、体重、健康、併用治療の型（もしあれば）、および治療頻度に依存し、当業者により（例えば、臨床医により）容易に決定することができる。
【０１８９】
本開示の治療物および好適な担体を含む医薬製剤は固体剤形とすることができ、これらとしては下記が挙げられるが、それらに限定されず：錠剤、カプセル、カシェ剤、ペレット、丸薬、粉末および顆粒；局所剤形、例えば、限定はされないが、溶液、粉末、流体エマルジョン、流体懸濁液、半固体、軟膏剤、ペースト、クリーム、ゲルおよびゼリー、および泡；非経口剤形、限定はされないが、溶液、懸濁液、エマルジョン、および乾燥粉末；有効量の、本開示のポリマまたはコポリマを含む。活性成分は、そのような製剤中に、薬学的に許容される希釈剤、フィラー、崩壊剤、バインダ、潤滑剤、界面活性剤、疎水性ビヒクル、水溶性ビヒクル、乳化剤、緩衝剤、保水剤、保湿剤、可溶化剤、保存剤などと共に含ませることができることもまた、当技術分野で知られている。投与のための手段および方法は当技術分野で知られており、当業者は指針として様々な薬理参考文献を参照することができる。例えば、Ｍｏｄｅｒｎ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃｓ，  Ｂａｎｋｅｒ  ＆  Ｒｈｏｄｅｓ，  Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，  Ｉｎｃ．  （１９７９）；  ａｎｄ  Ｇｏｏｄｍａｎ  ＆  Ｇｉｌｍａｎ’ｓ  Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，  ６ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，  ＭａｃＭｉｌｌａｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  （１９８０）を参考にすることができる。
【０１９０】
本開示の組成物は注射による、例えば、ボーラス注射または持続注入による非経口投与のために製剤化することができる。組成物は持続注入により皮下で約１５分〜約２４時間の期間にわたって投与することができる。注射用の製剤は単位剤形、例えば、アンプルまたは複数回投与容器中で、保存剤を追加して、提供することができる。組成物は、油性または水性ビヒクル中の懸濁液、溶液またはエマルジョンのような形態をとることができ、調合剤、例えば懸濁、安定および／または分散剤を含むことができる。
【０１９１】
経口投与のために、組成物は、治療物を、当技術分野でよく知られた薬学的に許容される担体と組み合わせることにより容易に製剤化させることができる。そのような担体により、本発明の治療物を治療される患者による経口摂取のための錠剤、丸薬、糖衣錠、カプセル、液体、ゲル、シロップ、スラリー、懸濁液などとして製剤化することができる。経口用途のための医薬調製物は、錠剤または糖衣錠コアを得るために、所望であれば、好適な助剤を添加した後に、固体賦形剤を添加し、任意で得られた混合物を粉砕し、顆粒混合物を処理することにより得ることができる。好適な賦形剤としては下記が挙げられるが、それらに限定されない：フィラー、例えば糖類、例えば、限定はされないが、ラクトース、スクロース、マンニトール、およびソルビトール；セルロース調製物、例えば、限定はされないが、トウモロコシデンプン、コムギデンプン、コメデンプン、ジャガイモデンプン、ゼラチン、トラガントガム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチル−セルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、およびポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）。所望であれば、崩壊剤、例えば、限定はされないが、架橋ポリビニルピロリドン、寒天、またはアルギン酸あるいはそれらの塩、例えばアルギン酸ナトリウムを添加することができる。
【０１９２】
糖衣錠コアには好適なコーティングを提供することができる。このために、濃縮糖溶液を使用することができ、これは、任意でアラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カーボポールゲル、ポリエチレングリコール、および／または二酸化チタン、ラッカー溶液、および好適な有機溶媒または溶媒混合物を含むことができる。色素または顔料を、識別のために、または活性治療量の異なる組み合わせを特徴付けるために、錠剤または糖衣錠コーティングに添加することができる。
【０１９３】
経口的に使用することができる医薬調製物としては下記が挙げられるが、それらに限定されない：ゼラチンで作られたプッシュフィットカプセル、ならびにゼラチンおよび可塑剤、例えばグリセロールまたはソルビトールで作られたソフト密封カプセル。プッシュフィットカプセルはフィラー、例えば、例として、ラクトース、バインダ、例えば、例として、デンプン、および／または潤滑剤例えば、例として、タルクまたはステアリン酸マグネシウムおよび、任意で、安定剤と混合された活性成分を含むことができる。ソフトカプセルでは、活性治療物が好適な液体、例えば脂肪油、液体パラフィン、または液体ポリエチレングリコール中に溶解または懸濁され得る。加えて、安定剤を添加することができる。経口投与のための全ての製剤はそのような投与のために好適な用量であるべきである。
【０１９４】
バッカル錠投与では、医薬組成物は、例えば、従来通りに製剤化された錠剤またはロゼンジの形態をとることができる。
【０１９５】
吸入による投与では、本開示により使用するための治療物は、便宜上、好適な噴射剤、例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素または他の好適なガスの使用による、加圧パックまたはネブライザーからの、エアロゾルスプレー提示の形態で送達される。加圧エアロゾルの場合、用量単位は、計量された量を送達するためにバルブを提供することにより決定することができる。吸入器または吹送器において使用するための、治療物および好適な粉末ベース、例えばラクトースまたはデンプンの粉末混合物を含む、例えば、ゼラチンのカプセルおよびカートリッジは、製剤化することができる。
【０１９６】
本開示の組成物はまた、例えば、従来の坐薬ベース、例えばカカオバターまたは他のグリセリドを含む、直腸組成物、例えば坐薬または保持浣腸で製剤化することができる。
【０１９７】
前に記載される製剤に加えて、本開示の治療物はまた、デポー調製物として製剤化することができる。そのような長時間作用製剤は、埋め込み（例えば、皮下または筋肉内）あるいは筋肉内注射により投与することができる。
【０１９８】
デポー注射は、約１〜約６ヶ月以上の間隔で投与することができる。したがって、例えば、組成物は好適なポリマまたは疎水性材料（例えば、許容される油中のエマルジョンとして）またはイオン交換樹脂と共に、または難溶性誘導体として、例えば、または難溶性塩として製剤化することができる。
【０１９９】
経皮投与では、本開示の組成物は、例えば、硬膏剤に適用することができ、または結果的に生物に供給される経皮治療系により適用することができる。
【０２００】
医薬組成物は、好適な固体もしくはゲル相担体または賦形剤を含むことができる。そのような担体または賦形剤の例としては、下記が挙げられるが、それらに限定されない：炭酸カルシウム、リン酸カルシウム、様々な糖類、デンプン、セルロース誘導体、ゼラチン、およびポリマ、例えば、例として、ポリエチレングリコール。
【０２０１】
本開示の組成物はまた、他の活性成分、例えば、例として、アジュバント、プロテアーゼ抑制剤、または他の適合性薬物または化合物と組み合わせて投与することができ、ここで、そのような組み合わせは、本明細書で記載される方法の所望の効果を達成するのに望ましく、または有利であることがわかる。
【０２０２】
いくつかの実施形態では、崩壊剤構成成分は、クロスカルメロースナトリウム、カルメロースカルシウム、クロスポビドン、アルギン酸、アルギン酸ナトリウム、カリウムアルギナート、アルギン酸カルシウム、イオン交換樹脂、食物酸および炭酸アルカリ構成成分に基づく発泡系、粘土、タルク、デンプン、アルファ化デンプン、デンプングリコール酸ナトリウム、セルロースフロック、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、ケイ酸カルシウム、金属炭酸塩、重炭酸ナトリウム、クエン酸カルシウム、またはリン酸カルシウムの１つ以上を含む。
【０２０３】
いくつかの実施形態では、希釈剤構成成分は、マンニトール、ラクトース、スクロース、マルトデキストリン、ソルビトール、キシリトール、粉末セルロース、微結晶セルロース、カルボキシメチルセルロース、カルボキシエチルセルロース、メチルセルロース、エチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、メチルヒドロキシエチルセルロース、デンプン、デンプングリコール酸ナトリウム、アルファ化デンプン、リン酸カルシウム、金属炭酸塩、金属酸化物、または金属アルミノケイ酸塩の１つ以上を含み得る。
【０２０４】
いくつかの実施形態では、任意的な潤滑剤構成成分は、存在する場合、ステアリン酸、ステアリン酸金属塩、ステアリルフマル酸ナトリウム、脂肪酸、脂肪アルコール、脂肪酸エステル、ベヘン酸グリセリル、鉱物油、植物油、パラフィン、ロイシン、シリカ、ケイ酸、タルク、プロピレングリコール脂肪酸エステル、ポリエトキシル化ヒマシ油、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、ポリアルキレングリコール、ポリオキシエチレン−グリセロール脂肪酸エステル、ポリオキシエチレン脂肪アルコールエーテル、ポリエトキシル化ステロール、ポリエトキシル化ヒマシ油、ポリエトキシル化植物油、または塩化ナトリウムの１つ以上を含む。
【０２０５】
キット
被験体において癌を診断する、被験体において癌を治療する、あるいは癌細胞（例えば、インビトロまたはエクスビボで増殖された被験体から、または癌の動物モデルから直接誘導される）について基本的な調査実験を実施するように構成された、上記で記載される対象の方法を実施するためのキットおよびシステム、そのような構成成分もまた、対象の発明により提供される。要望通り、キットの様々な構成成分は、別々の容器内に存在してもよく、または、ある一定の適合性構成成分は、予め組み合わされて単一の容器に入れられてもよい。
【０２０６】
いくつかの実施形態では、本発明は、試験試料において癌の存在を診断するためのキットを提供し、前記キットは、表１に示される癌関連ポリヌクレオチド配列、またはその相補体に選択的にハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチドを含む。別の実施形態では、本発明は、表１に示される癌関連ポリヌクレオチド、癌関連ポリペプチド、またはその断片を含むエレクトロニックライブラリを提供する。
【０２０７】
対象システムおよびキットはまた、対象の方法のいずれかを実施するための１つ以上の他の試薬を含み得る。試薬は、１つ以上のマトリクス、溶媒、試料調製試薬、緩衝剤、脱塩試薬、酵素試薬、変性試薬、プローブ、ポリヌクレオチド、ベクター（例えば、プラスミドまたはウイルスベクター）、などを含んでもよく、ここで、較正標準、例えば陽性および陰性対照が同様に提供され得る。そのようなものとして、キットは、１つ以上の容器、例えばバイアルまたはビンを含むことができ、各容器は、試料処理または調製工程を実施するため、および／または本開示により正規化された試料を生成するための１つ以上の工程を実施するための別々の構成成分を含む。
【０２０８】
上記構成成分に加えて、対象キットは典型的にはさらに、対象の方法を実施するためにキットの構成成分を使用するための説明書を含む。対象の方法を実施するための説明書は一般に好適な記録媒体上に記録される。例えば、説明書は基材、例えば紙またはプラスチック、など上に印刷され得る。そのようなものとして、説明書はキット内に添付文書として、キットまたはその構成成分の容器のラベリング（すなわち、パッケージングまたはサブパッケージングと関連させて）においてなどで存在し得る。他の実施形態では、説明書は、好適なコンピュータ可読記憶媒体、例えばＣＤ−ＲＯＭ、ディスケット、など上に存在する電子記憶データファイルとして存在する。さらに別の実施形態では、実際の説明書はキット内に存在しないが、遠隔源から、例えばインターネットを介して説明書を入手するための手段が提供される。この実施形態の一例は、説明書を見ることができる、および／または説明書をダウンロードすることができるウェブアドレスを含むキットである。説明書と同様に、説明書を入手するためのこの手段は、好適な基材上に記録される。
【０２０９】
対象データベース、プログラミングおよび説明書に加えて、キットはまた、１つ以上の対照試料および試薬、例えば、キットを試験する際に使用するための２つ以上の対照試料を含み得る。
【０２１０】
発明の追加の実施形態
以下に提供される表２は、Ｉｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイスクリーンからの生データを示す。
【０２１１】
本開示の実施形態は癌の診断、予後および治療の方法に関する。本明細書で記載される方法、組成物およびキットは、本明細書で開示される任意の癌を含む癌の治療、診断および予後のために使用され得る。
【０２１２】
いくつかの実施形態では、方法は正常体細胞組織に比べ、腫瘍組織において異常レベルで発現されるマーカーを標的にすることを含む。いくつかの実施形態では、マーカーは、表１で開示される配列、その相補体、またはそれらの組み合わせから選択される配列を含み得る。いくつかの実施形態では、癌の治療のための方法ならびに関連する医薬調製物およびキットが提供される。いくつかの実施形態は、標的マーカーの発現、存在量または活性に影響する治療物を含む組成物を投与することを含む、癌を治療する方法に関する。いくつかの実施形態では、標的マーカーは表１に記載される配列、その相補体、またはそれらの任意の組み合わせを含み得る。
【０２１３】
いくつかの実施形態は、癌と関連する標的マーカーのレベルを検出することを含む、癌を検出する方法に関する。いくつかの実施形態では、標的マーカーは、表１に記載される配列、その相補体またはそれらの任意の組み合わせを含み得る。
【０２１４】
本明細書におけるいくつかの実施形態は診断および／または治療抗体のための標的として癌と関連する抗原（すなわち癌関連ポリペプチド）を提供する。いくつかの実施形態では、これらの抗原は、創薬（例えば、小分子）ならびに細胞制御、増殖、および分化のさらなる特徴付けに有用であり得る。
【０２１５】
いくつかの実施形態は被験体において癌を診断する方法を記載し、方法は下記を含み：（ａ）以下に開示される、例えば表１および／または以下に見出し癌関連配列下で開示される１つ以上の遺伝子または遺伝子産物またはそのホモログの発現を決定すること；ならびに（ｂ）第１の被験体または第２の無影響被験体由来の第２の正常試料由来の１つ以上の核酸配列の発現を比較すること、ここで、発現の差は第１の被験体が癌を有することを示す。いくつかの実施形態は、癌関連配列を発現する細胞に対して免疫応答を誘発する方法を記載し、この方法は、被験体を癌関連配列と、被験体において免疫応答を誘発するのに有効な条件下で接触させることを含み、ここで、癌関連配列は表１に記載される遺伝子またはそれらの組み合わせから選択される遺伝子の配列またはその断片を含む。
【０２１６】
いくつかの実施形態は試験試料において癌を検出する方法を記載し、この方法は下記を含み：（ｉ）遺伝子産物である少なくとも１つのポリペプチドの活性のレベルを検出すること；ならびに（ｉｉ）試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルを正常試料におけるポリペプチドの活性のレベルと比較すること、ここで、正常試料におけるポリペプチド活性のレベルに対する、試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルの変化は、試験試料における癌の存在を示し、遺伝子産物は、表１に記載される遺伝子またはそれらの組み合わせから選択される遺伝子の産物である。
【０２１７】
本明細書におけるいくつかの実施形態は被験体において癌を治療する方法に関し、方法は治療の必要な被験体に癌関連タンパク質の活性を調節する治療薬を投与することを含み、ここで、癌関連タンパク質は、表１に記載される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片から選択される核酸配列を含む核酸によりコードされる。いくつかの実施形態では、治療薬は癌関連タンパク質に結合する。いくつかの実施形態では、治療薬は抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体であってもよい。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化またはヒト抗体である。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は、表１に記載される遺伝子の遺伝子ノックダウンを含み得る。いくつかの実施形態では、癌を治療する方法は表１で開示されるｍＲＮＡをコードする遺伝子の発現をノックダウンまたは抑制するように細胞を処理することを含み得る。本明細書で開示される方法はまた、細胞が不死となった他の病状の診断および治療のために使用され得る。
【０２１８】
いくつかの実施形態では、被験体を癌と診断する方法は、試料を取得すること、および表１に記載される配列、その断片またはその相補体から選択される癌関連配列の存在を検出することを含み、ここで、癌関連配列の存在は、被験体が癌を有することを示す。いくつかの実施形態では、癌関連配列の存在を検出することは、試料を癌関連配列のタンパク質に特異的に結合する抗体または他の型の捕捉試薬と接触させること、ならびに試料において癌関連配列のタンパク質への結合の有無を検出することを含む。本明細書で開示される方法はまた、細胞が不死となった他の病状の診断および治療のために使用され得る。
【０２１９】
いくつかの実施形態では、本発明は、被験体において癌を治療する方法を提供し、方法は、治療の必要な被験体に、表１で開示される配列またはそのホモログの活性を調節する治療薬を投与することを含み、ここで、治療薬は被験体において癌を治療する。
【０２２０】
いくつかの実施形態では、本発明は被験体において癌を診断する方法を提供し、方法は試料から、表１で開示される遺伝子の発現を決定すること；ならびに、発現に基づき被験体において癌を診断することを含み、ここで、表１で開示される遺伝子が過剰発現されている場合、被験体は癌を有すると診断される。
【０２２１】
いくつかの実施形態では、本発明は試験試料において癌を検出する方法を提供し、方法は下記を含み：（ｉ）抗体のレベルを検出すること（ここで、抗体は、表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む核酸配列によりコードされる抗原ポリペプチドに結合する）；ならびに（ｉｉ）試験試料における抗体のレベルを対照試料における抗体のレベルと比較すること、ここで、対照試料における抗体のレベルに対する試験試料における抗体のレベルの変化は、試験試料における癌の存在を示す。
【０２２２】
いくつかの実施形態では、本発明は試験試料において癌を検出する方法を提供し、この方法は下記を含み：（ｉ）表１で開示される核酸配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む核酸によりコードされる、少なくとも１つのポリペプチドの活性のレベルを検出すること；ならびに（ｉｉ）試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルを正常試料におけるポリペプチドの活性のレベルと比較すること、ここで、正常試料におけるポリペプチド活性のレベルに対する試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルの変化は試験試料における癌の存在を示す。
【０２２３】
いくつかの実施形態では、本発明は試験試料において癌を検出する方法を提供し、方法は下記を含み：（ｉ）表１で開示される核酸配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む核酸によりコードされる、少なくとも１つのポリペプチドの発現レベルを検出すること；ならびに（ｉｉ）試験試料におけるポリペプチドの発現レベルを正常試料におけるポリペプチドの発現レベルと比較すること、ここで、正常試料におけるポリペプチド発現のレベルに対する試験試料におけるポリペプチドの発現レベルの変化は試験試料における癌の存在を示す。
【０２２４】
いくつかの実施形態では、本発明は試験試料において癌を検出する方法を提供し、方法は下記を含み：（ｉ）表１で開示される核酸配列、そのホモログ、その変異核酸、それらの組み合わせ、またはその断片を含む核酸配列の発現レベルを検出すること；ならびに（ｉｉ）試験試料における核酸配列の発現レベルを正常試料における核酸配列の発現レベルと比較すること、ここで、正常試料中の核酸配列発現のレベルに対する、試験試料における核酸配列の発現レベルの変化は試験試料における癌の存在を示す。
【０２２５】
いくつかの実施形態では、本発明は癌に対する活性をスクリーニングする方法を提供し、方法は下記を含み：（ａ）表１で開示される配列、その相補体、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む癌関連遺伝子を発現する細胞を癌薬物候補と接触させること；（ｂ）癌薬物候補の、細胞における癌関連ポリヌクレオチドの発現に対する効果を検出すること；ならびに（ｃ）薬物候補なしでの発現レベルを薬物候補の存在下での発現レベルと比較すること；ここで、癌関連ポリヌクレオチドの発現に対する効果は、候補が癌に対して活性を有することを示す。
【０２２６】
いくつかの実施形態では、本発明は癌に対する活性をスクリーニングする方法を提供し、方法は下記を含み：（ａ）表１で開示される配列、その相補体、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む癌関連遺伝子を過剰発現する細胞を癌薬物候補と接触させること；（ｂ）癌薬物候補の細胞における癌関連ポリヌクレオチドの発現に対する効果、あるいは細胞増殖または生存率に対する効果を検出すること；ならびに（ｃ）薬物候補なしでの発現レベル、細胞増殖、または生存率を、薬物候補の存在下での発現レベル、細胞増殖、または生存率と比較すること；ここで、癌関連ポリヌクレオチドの発現、細胞増殖、または生存率に対する効果は、候補が、表１で開示される配列、その相補体、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む癌関連遺伝子を過剰発現する癌細胞に対して活性を有することを示す。
【０２２７】
いくつかの実施形態では、本発明は被験体において癌を診断する方法を提供し、方法は下記を含み：ａ）第１の被験体の第１の試料において１つ以上の核酸配列の発現を決定すること（１つ以上の核酸配列は、表１で開示される配列、そのホモログ、それらの組み合わせ、またはその断片を含む）；ならびにｂ）第１の被験体または第２の無影響被験体由来の第２の正常試料からの１つ以上の核酸配列の発現を比較すること、ここで、表１で開示される配列の発現の差は第１の被験体が癌を有することを示す。
【０２２８】
いくつかの実施形態では、本発明は被験体において癌を診断する方法を提供し、方法は下記を含み：ａ）被験体において１つ以上の遺伝子または遺伝子産物またはそのホモログの発現を決定すること；ならびにｂ）被験体における１つ以上の遺伝子または遺伝子産物またはそのホモログの発現を、被験体由来の正常試料または無影響被験体由来の正常試料からの１つ以上の遺伝子または遺伝子産物またはそのホモログの発現と比較すること、ここで、発現の差は被験体が癌を有することを示し、ここで１つ以上の遺伝子または遺伝子産物は表１で開示される配列を含む。
【０２２９】
いくつかの実施形態では、本発明は試験試料において癌を検出する方法を提供し、この方法は下記を含み：（ｉ）少なくとも１つのポリペプチドの活性のレベルを検出すること；ならびに（ｉｉ）試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルを正常試料におけるポリペプチドの活性のレベルと比較すること、ここで、正常試料におけるポリペプチド活性のレベルに対する試験試料におけるポリペプチドの活性のレベルの変化は試験試料における癌の存在を示し、ここで、ポリペプチドは表１で開示される配列の遺伝子産物である。
【０２３０】
いくつかの実施形態では、本発明は被験体において癌を診断する方法を提供し、方法は下記を含み：被験体に由来する試料から、１つ以上の配列に対し１つ以上の遺伝子発現結果を取得すること（１つ以上の配列は表１で開示される配列を含む）；ならびに、１つ以上の遺伝子発現結果に基づき、被験体において癌を診断すること、ここで、１つ以上の遺伝子が過剰発現されている場合、被験体は癌を有すると診断される。
【０２３１】
使用される方法および材料を説明する実施形態は、下記非限定的な例を参照することによりさらに理解され得る。
【０２３２】
実施例
下記実施例は当業者に、本発明をどのように製造し使用するかについての完全な開示および説明を提供するために提示され、発明者らが彼等の発明と見なすものの範囲を制限することを意図せず、下記実験は、実施された実験全てまたは唯一の実験であることを表すことも意図されない。使用される数字（例えば、量、温度、など）に関しては正確さを確保するために努力がなされているが、いくらかの実験誤差および逸脱が含まれているはずである。別記されない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度はセ氏温度であり、圧力は大気圧、またはその付近である。
【０２３３】
実施例１
ＧＮＧＴ１：ＧＮＧＴ１（受入番号ＮＭ＿０２１９５５．３）は「グアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）γ誘導活性ポリペプチド１」、杆体外節で特異的に見出されるＧ−タンパク質を導入するγサブユニットをコードし、ここで、これは、サイクリックＧＴＰ特異ホスホジエステラーゼのロドプシンによる活性化を媒介する（Ｈｕｒｌｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８４  ［ＰｕｂＭｅｄ  ６４３８６２６］；  Ｓｃｈｅｒｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  １９９６  ［ＰｕｂＭｅｄ  ８６６１１２８］）。驚いたことに、本明細書で含まれるデータは、ＧＮＧＴ１が、源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、腎臓、子宮頸部、子宮内膜、卵巣、肺、膀胱、肝臓、乳、軟部組織、結合組織、胃、食道、子宮、および筋肉の腫瘍のための新規マーカーとなることを示す。そのため、本明細書で、全体を通して記載されるように、ＧＮＧＴ１は、被験体において診断マーカーとして使用することができる。ＧＮＧＴ１は被験体において癌を診断するために使用することができる。
【０２３４】
図１に示されるように、ＧＮＧＴ１発現を、Ｉｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＧＮＧＴ１に特異的なプローブによりアッセイした（プローブ配列ＧＴＴＧＡＡＧＡＡＣＧＡＴＣＴＧＧＣＧＡＧＧＡＴＣＣＡＣＴＧＧＴＡＡＡＧＧＧＣＡＴＣＣＣＡＧＡＧＧＡ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１９）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿２０９１１００）。アッセイは、下記において強い遺伝子発現を検出した（＞７５ｒｆｕ）：腎臓腫瘍、腎細胞癌、子宮頸部腫瘍、扁平上皮癌、子宮内膜類内膜の子宮内膜腺癌、漿液性の卵巣の卵巣腺癌、卵巣腫瘍漿液性嚢胞腺癌、肺腫瘍小細胞癌、肺腫瘍非小細胞癌、扁平上皮癌、腎盂乳頭移行細胞の腎臓上皮内癌、膀胱腫瘍移行上皮内癌、膀胱腫瘍移行上皮癌、肝臓腫瘍肝細胞癌、胃腫瘍腺癌、乳房原発腫瘍、腎臓原発腫瘍腎芽腫、肝臓原発腫瘍肝細胞癌、肺原発腫瘍、胃原発腫瘍、転移性子宮頸部腺癌、卵巣の漿液性転移性卵巣腺癌、食道胃接合部の転移性腺癌、転移性乳腺腫瘍、移行上皮癌からの転移性腎臓腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌漿液性嚢胞腺癌、軟部の悪性結合組織腫瘍巨細胞腫、子宮内膜腫瘍子宮内膜間質肉腫、および転移性平滑筋肉腫。対照的に、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵巣、卵管、骨、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、脳、精巣、甲状腺、唾液腺および有核血液細胞を含む多種多様の正常組織におけるＧＮＧＴ１の発現は一般に低かった（＜６０ｒｆｕ）。
【０２３５】
図１に示されるように、ＧＮＧＴ１の発現はまた、多種多様の正常初代ヒト細胞培養物、例えば、限定はされないが、乳腺上皮細胞、ニューロン、皮膚線維芽細胞および間葉系幹細胞において低かった。本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＧＮＧＴ１発現の上昇の特異性は、ＧＮＧＴ１が転移性疾患を含む多くの型の癌の診断のためのマーカーとなることを証明する。ＧＮＧＴ１はまた多くの癌における治療介入のための標的として使用され得る。ＧＮＧＴ１を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＧＮＧＴ１を標的にする治療物としては、ＧＮＧＴ１の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。
【０２３６】
実施例２
Ｃ１２ＯＲＦ５６：Ｃ１２ＯＲＦ５６（受入番号ＮＭ＿００１０９９６７６．１）は、未知機能の特徴づけられていない翻訳領域をコードする。驚いたことに、Ｃ１２ＯＲＦ５６は源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、子宮、直腸、子宮頸部、卵巣、肺、腎臓、食道、膀胱、精巣、前立腺、肝臓、軟部組織、軟骨、子宮内膜の腫瘍および転移性腫瘍のための新規マーカーとなることが、本明細書で示される。
【０２３７】
図２に示されるように、Ｃ１２ＯＲＦ５６発現を、Ｉｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、Ｃ１２ＯＲＦ５６に特異的なプローブによりアッセイした（プローブ配列ＴＧＣＣＡＧＣＣＴＴＧＣＡＧＡＡＡＡＧＧＣＴＣＣＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＣＣＣＣＡＴＣＡＣＴＣＡＡＣＣＴ；（ＳＥＱＩＤＮＯ：２０）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１７７０６１６）。アッセイは下記において、強い遺伝子発現を検出した（＞８０ｒｆｕ）：子宮腫瘍腺癌、大腸直腸腫瘍腺癌、子宮頸部扁平細胞の子宮頸部癌、子宮内膜類内膜の子宮内膜腺癌、漿液性の卵巣の卵巣腺癌、卵巣腫瘍漿液性嚢胞腺癌、肺扁平細胞の肺癌、肺の肺腺癌、肺大細胞の肺癌、肺小細胞の肺：左上葉癌、肺腫瘍扁平上皮癌、肺腫瘍非小細胞癌腺癌、肺腫瘍小細胞癌、腎盂乳頭移行細胞の腎臓上皮内癌、食道腫瘍扁平上皮癌、膀胱移行細胞の膀胱癌、精巣の精巣精上皮腫、前立腺腺腫瘍腺癌、肝臓腫瘍肝細胞癌、胆管の胆管細胞癌、胃腫瘍腺癌、腎臓原発腫瘍腎芽腫、肺原発腫瘍、胃原発腫瘍、原発性子宮頸部と一致する転移性子宮頸部腺癌、卵巣の漿液性転移性卵巣腺癌、食道胃接合部の転移性食道胃接合部腺癌、扁桃扁平細胞の転移性扁桃癌、前立腺の転移性前立腺腺癌、移行上皮癌からの転移性腎臓腫瘍、肺転移性腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌、漿液性嚢胞腺癌、胸壁腫瘍転移性新生物、精上皮腫、軟部の悪性結合組織腫瘍巨細胞腫、軟骨の軟骨肉腫、子宮腫瘍子宮内膜間質肉腫。
【０２３８】
精巣を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵巣、卵管、骨、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、脳、精巣、甲状腺、唾液腺および有核血液細胞を含む多種多様の正常組織におけるＣ１２ＯＲＦ５６の発現は一般に低かった（＜８０ｒｆｕ）。
【０２３９】
図２に示されるように、Ｃ１２ＯＲＦ５６の発現はまた、多種多様の正常初代ヒト細胞培養物、例えば、限定はされないが、乳腺上皮細胞、ニューロン、皮膚線維芽細胞および間葉系幹細胞において低い。本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＣ１２ＯＲＦ５６発現の上昇の特異性は、Ｃ１２ＯＲＦ５６が癌、例えば、限定はされないが、この実施例で記載されるものの診断のためのマーカーとなることを証明する。
【０２４０】
Ｃ１２ＯＲＦ５６を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、Ｃ１２ＯＲＦ５６を標的にする治療物としては、Ｃ１２ＯＲＦ５６の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。
【０２４１】
実施例３
ＣＯＬ１０Ａ１：ＣＯＬ１０Ａ１（受入番号ＮＭ＿０００４９３．３）はコラーゲンＸ型α１、軟骨内骨化中に肥大軟骨細胞により発現されるコラーゲンをコードする。驚いたことに、本明細書におけるデータは、ＣＯＬ１０Ａ１が源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、腎臓、子宮頸部、子宮内膜、卵巣、肺、胸膜、膀胱、膵臓、精巣、結腸、直腸、肝臓、乳、軟部組織、結合組織、胃、食道、子宮筋肉の腫瘍および転移性腫瘍のための新規マーカーとなることを証明する。
【０２４２】
図３に示されるように、ＧＮＧＴ１発現をＩｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＣＯＬ１０Ａ１に特異的なプローブ（プローブ配列ＣＣＣＣＴＡＡＡＡＴＡＴＴＴＣＴＧＡＴＧＧＴＧＣＡＣＴ  ＡＣＴＣＴＧＡＧＧＣＣＴＧＴＡＴＧＧＣＣＣＣＴ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２１）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１６７２７７６）によりアッセイし、下記において強い遺伝子発現を検出した（＞１００ＲＦＵ）：乳腺腫瘍浸潤性乳管癌、乳腺腫瘍小葉癌、結腸の腺癌、子宮頸部腫瘍扁平上皮癌、子宮頸部腫瘍腺癌、卵巣腫瘍癌、卵巣腫瘍漿液性嚢胞腺癌、肺扁平細胞の肺癌、肺の肺腺癌、肺大細胞の肺癌、肺腫瘍非小細胞癌腺癌、胸膜中皮腫、食道腫瘍扁平上皮癌、膀胱移行細胞の膀胱癌、膵管の膵臓腺癌、膵臓腺腫瘍神経内分泌癌大細胞、精巣の精巣精上皮腫、胆管の胆管細胞癌、胃腫瘍腺癌、腸型胃腫瘍腺癌、乳房原発腫瘍、結腸原発腫瘍、ＭＰ肺原発腫瘍、直腸原発腫瘍、乳房の転移性乳腺癌、結腸の転移性結腸腺癌、卵巣の漿液性転移性卵巣腺癌、腎臓細胞の転移性腎癌、食道胃接合部の転移性食道胃接合部腺癌、頸部扁平細胞の転移性頸部癌、甲状腺乳頭の転移性甲状腺癌、膀胱小細胞の転移性膀胱癌、前立腺の転移性前立腺腺癌、ＭＰ２結腸転移性腫瘍、直腸転移性腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌漿液性嚢胞腺癌、肝臓腫瘍転移性新生物腺癌、軟部の悪性結合組織腫瘍巨細胞腫、軟骨の軟骨肉腫、骨の転移性骨肉腫、原発性平滑筋肉腫と一致する転移性平滑筋肉腫、および子宮内膜の転移性子宮内膜間質肉腫。対照的に、正常骨を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵巣、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、脳、精巣、甲状腺、唾液腺および有核血液細胞を含む多種多様の正常組織におけるＣＯＬ１０Ａ１の発現は一般に低かった（＜６０ＲＦＵ）。
【０２４３】
図３に示されるように、ＣＯＬ１０Ａ１の発現はまた、多種多様の正常初代ヒト細胞培養物、例えば、限定はされないが、乳腺上皮細胞、ニューロン、皮膚線維芽細胞および間葉系幹細胞において低い。本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＣＯＬ１０Ａ１発現の上昇の特異性はＣＯＬ１０Ａ１が、転移性疾患を含む多くの型の癌の診断のためのマーカーおよび多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。
【０２４４】
ＣＯＬ１０Ａ１を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＣＯＬ１０Ａ１を標的にする治療物としては、ＣＯＬ１０Ａ１の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。例えば、治療物は、ＣＯＬ１との相互作用を調節する（例えば、抑制する）ために使用することができる。
【０２４５】
実施例４
ＳＬＣ３５Ｄ３：ＳＬＣ３５Ｄ３（受入番号ＮＭ＿００１００８７８３．１）は、ＳＬＣ３５Ｄ３、オーファンヌクレオチド糖トランスポーターをコードする。驚いたことに、我々はここで、ＳＬＣ３５Ｄ３が源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、結腸、直腸、肝臓、胃、肺、胸膜、膀胱、子宮頸部および卵巣の腫瘍のための新規マーカーとなることを開示する。
【０２４６】
図４に示されるように、ＳＬＣ３５Ｄ３発現をＩｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＳＬＣ３５Ｄ３に特異的なプローブによりアッセイし（プローブ配列ＡＣＴＧＡＡＡＣＣＣＡＧＣＣＡＧＡＡＧＡＧ  ＧＧＡＣＣＡＣＣＴＧＴＡＡＡＧＣＡＡＧＴＣＣＴＴＴＣＡＡＧ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１７０２４１９）下記において強い遺伝子発現を検出した（＞７０ＲＦＵ）：結腸の腺癌、肺腫瘍小細胞癌、胸膜の混合胸膜中皮腫、膀胱腫瘍移行上皮癌、直腸の直腸腺癌、胆管の胆管細胞癌、胃腫瘍腺癌、結腸原発腫瘍、直腸原発腫瘍、結腸の転移性結腸腺癌、原発性子宮頸部と一致する転移性子宮頸部腺癌、卵巣の漿液性転移性卵巣腺癌、結腸転移性腫瘍、直腸転移性腫瘍、胃転移性腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌漿液性嚢胞腺癌、肝臓腫瘍転移性新生物腺癌、子宮内膜の転移性子宮内膜間質肉腫。結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵巣、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、脳、骨、精巣、甲状腺、唾液腺および有核血液細胞を含む多種多様の正常組織におけるＳＬＣ３５Ｄ３の発現は一般に低かった（＜６０ＲＦＵ）。
【０２４７】
図４に示されるように、ＳＬＣ３５Ｄ３の発現はまた、多種多様の正常初代ヒト細胞培養物、例えば、限定はされないが、乳腺上皮細胞、ニューロン、皮膚線維芽細胞および間葉系幹細胞において低い。本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＳＬＣ３５Ｄ３発現の上昇の特異性は、ＳＬＣ３５Ｄ３が、転移性疾患を含む多くの型の癌（例えば、この実施例で記載されるものが挙げられるが、それらに限定されない）の診断のためのマーカー、および多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。
【０２４８】
ＳＬＣ３５Ｄ３を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＳＬＣ３５Ｄ３を標的にする治療物としては、ＳＬＣ３５Ｄ３の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。例えば、治療物はＳＬＣ３５Ｄ３の輸送機能を調節する（例えば、抑制または増強する）ために使用することができる。アッセイはまた、ＳＬＣ３５Ｄ３の機能を抑制することができる新しい治療物を同定するために使用することができる。新しい抑制剤を同定するために、任意の輸送アッセイを使用することができる。
【０２４９】
実施例５
ｓｎａＲ−Ａ：ＳＮＡＲ−Ａ（受入番号ＢＵ５３６０６５）はＳＮＡＲ−Ａ、未知機能の小型非翻訳ＲＮＡをコードする。ｓｎａＲ−Ａは、インビトロでの細胞不死化において上方制御されたことが示された（Ｐａｒｒｏｔｔ，ｅｔａｌ，ＮＡＲ２０１１，Ｖｏｌ３９，Ｎｏ．４）が、インビボでの癌におけるその発現は報告されていない。驚いたことに、ＳＮＡＲ−Ａが源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、腎臓、子宮頸部、子宮内膜、卵巣、肺、胸膜、膀胱、膵臓、精巣、結腸、直腸、肝臓、乳、軟部組織、結合組織、胃、食道、前立腺、骨、子宮筋肉の腫瘍および転移性腫瘍のための新規マーカーとなることが、本明細書で開示される。
【０２５０】
図５に示されるように、ＳＮＡＲ−Ａ発現をＩｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイＳＮＡＲ−Ａに特異的なプローブによりアッセイし（プローブ配列ＴＴＣＣＡＧＧＧＣＡＣＧＡＧＴＴＣＧＡＧＧ  ＣＣＡＧＣＣＴＧＧＴＣＣＡＣＡＴＧＧＧＴＣＧＧａａａａａａ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１８８１９０９）下記において強い遺伝子発現を検出した（＞１５００ＲＦＵ）：子宮腫瘍腺癌、腎臓腫瘍腎細胞癌、大腸結腸腫瘍腺癌、子宮内膜腺癌、卵巣腫瘍、肺腫瘍小細胞、肺腫瘍扁平上皮癌、食道腫瘍扁平上皮癌、膵臓の神経内分泌膵臓腫瘍、精巣精上皮腫、前立腺腺腫瘍腺癌、直腸の直腸腺癌、肝臓腫瘍肝細胞癌、胃腫瘍腺癌、肺原発腫瘍、直腸原発腫瘍、胃原発腫瘍、原発性子宮頸部と一致する転移性子宮頸部腺癌、転移性皮膚悪性メラノーマ、膵臓の神経内分泌転移性膵臓腫瘍、転移性乳腺腫瘍、肺転移性腫瘍、胃転移性腫瘍、胸壁腫瘍転移性新生物精上皮腫、軟部の悪性結合組織腫瘍巨細胞腫、子宮腫瘍子宮内膜間質肉腫、骨の転移性骨肉腫、子宮内膜の転移性子宮内膜間質肉腫。対照的に、生殖組織、卵巣および精巣を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、脳、骨、甲状腺、唾液腺および有核血液細胞を含む多種多様の正常組織におけるＳＮＡＲ−Ａの発現は一般に低かった（＜５００ＲＦＵ）。
【０２５１】
図５に示されるように、ＳＮＡＲ−Ａの発現はまた、多種多様の正常初代ヒト細胞培養物、例えば、限定はされないが、ニューロン、皮膚線維芽細胞および間葉系幹細胞において低い。本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＳＮＡＲ−Ａ発現の上昇の特異性は、ＳＮＡＲ−Ａが、転移性疾患を含む多くの型の癌（例えば、この実施例で記載される癌が挙げられるが、それらに限定されない）の診断のためのマーカー、および多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。ＳＮＡＲ−Ａは本明細書で記載される一般または特異型の癌における癌の診断マーカーとして使用することができる。
【０２５２】
ＳＮＡＲ−Ａを標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＳＮＡＲ−Ａを標的にする治療物としては、ＳＮＡＲ−Ａの活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。
【０２５３】
実施例６
ＳＢＫ１：ＳＢＫ１（受入番号ＮＭ＿００１０２４４０１．２）はＳＨ３−結合ドメインキナーゼ１をコードする。驚いたことに、ＳＢＫ１が源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、リンパ節、腎臓、子宮頸部、子宮内膜、卵巣、肺、胸膜、膀胱、膵臓、精巣、結腸、直腸、肝臓、乳、軟部組織、膀胱、脳、扁桃、甲状腺、結合組織、胃、食道、前立腺、骨、子宮筋肉の腫瘍および転移性腫瘍のための新規マーカーとなることが本明細書で開示される。
【０２５４】
図６に示されるように、ＳＢＫ１発現をＩｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＳＢＫ１に特異的なプローブ（プローブ配列ＣＡＧＡＧＣＣＣＣＡＧＣＣＣＣＴＣＡＴＧＴＣＴＴＧＣＣＧＣＣＣＴＴ  ＣＣＴＣＣＡＴＧＴＧＴＴＴＧＴＡＡ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２４）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１７２８２９８）によりアッセイし、下記において強い遺伝子発現を検出した（＞２４０ＲＦＵ）：濾胞性リンパ腫、子宮腫瘍腺癌悪性腫瘍、腎臓腫瘍腎細胞癌、乳腺腫瘍侵襲性乳管癌、乳腺腫瘍浸潤性乳管癌、乳腺腫瘍小葉癌非浸潤性小葉癌、大腸結腸腫瘍腺癌、子宮頸部腫瘍扁平上皮癌、子宮内膜類内膜の子宮内膜腺癌、漿液性の卵巣の卵巣腺癌、卵巣腫瘍漿液性嚢胞腺癌、肺扁平細胞の肺癌、肺の肺腺癌、肺小細胞の肺：左上葉癌、肺腫瘍非小細胞癌腺癌、肺腫瘍小細胞癌、胸膜の混合胸膜中皮腫、食道胃接合部の食道胃接合部腺癌、膀胱腫瘍移行上皮癌、膀胱腫瘍移行上皮癌、精巣の精巣精上皮腫、精巣精上皮腫、前立腺の前立腺腺癌、肝臓の肝臓胆管細胞癌、脳退形成乏突起神経膠腫、脳未分化星状細胞腫、乳房原発腫瘍、腎臓原発腫瘍、直腸原発腫瘍、胃原発腫瘍、原発性子宮頸部と一致する転移性子宮頸部腺癌、卵巣の漿液性転移性卵巣腺癌、扁桃扁平細胞の転移性扁桃癌、甲状腺乳頭の転移性甲状腺癌、膀胱小細胞の転移性膀胱癌、前立腺の転移性前立腺腺癌、転移性乳腺腫瘍、移行上皮癌からの転移性腎臓腫瘍、胃転移性腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌漿液性嚢胞腺癌、肝臓腫瘍転移性新生物腺癌、胸壁腫瘍転移性新生物精上皮腫、軟骨の軟骨肉腫、子宮腫瘍子宮内膜間質肉腫、子宮内膜腫瘍子宮内膜間質肉腫、骨の転移性骨肉腫、子宮内膜の転移性子宮内膜間質肉腫。対照的に、胎児脳を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、骨、甲状腺、および唾液腺を含む多種多様の正常組織におけるＳＢＫ１の発現は一般に低かった（＜５００ＲＦＵ）。
【０２５５】
本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＳＢＫ１発現の上昇の特異性は、ＳＢＫ１が転移性疾患を含む多くの型の癌の診断のためのマーカー（例えば、この実施例で記載される癌が挙げられるが、それらに限定されない）、および多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。
【０２５６】
ＳＢＫ１を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＳＢＫ１を標的にする治療物としては、ＳＢＫ１の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。
【０２５７】
実施例７
ＤＳＣＲ８：ＤＳＣＲ８（受入番号ＮＭ＿２０３４２８．１）はダウン症候群責任領域８をコードする。驚いたことに、ＤＳＣＲ８が、源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、子宮内膜、卵巣、肺、膀胱、精巣、膀胱、胃、食道の腫瘍、皮膚メラノーマおよび転移性腫瘍のための新規マーカーとなることが、本明細書で開示される。
【０２５８】
図７に示されるように、ＤＳＣＲ８発現をＩｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＤＳＣＲ８に特異的なプローブ（プローブ配列ＴＣＣＣＡＣＴＴＧＧＣＡＧＧＧＧＣＣＧＴＣＴＴＧＴＣＣＡＣＴＣ  ＧＴＴＴＣＴＧＴＡＡＡＣＡＴＧＧＧＴＧ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２５）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１７６３９０１）によりアッセイし、下記において強い遺伝子発現を検出した（＞１４５ＲＦＵ）：子宮内膜腺癌、卵巣腫瘍癌、卵巣腫瘍漿液性嚢胞腺癌、肺小細胞癌、食道腫瘍扁平上皮癌、膀胱癌移行細胞、精巣の精上皮腫、胃腫瘍腺癌、転移性皮膚悪性メラノーマ、膀胱小細胞の転移性膀胱癌、胸壁腫瘍転移性新生物精上皮腫。対照的に、精巣を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、脊髄、骨、甲状腺、および唾液腺を含む多種多様の正常組織におけるＤＳＣＲ８の発現は一般に低かった（＜８０ＲＦＵ）。
【０２５９】
本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＤＳＣＲ８発現の上昇の特異性はＤＳＣＲ８が転移性疾患を含む多くの型の癌（例えば、この実施例で記載される癌が挙げられるが、それらに限定されない）の診断のためのマーカーおよび多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。
【０２６０】
ＤＳＣＲ８を標的にする治療物は、本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＤＳＣＲ８を標的にする治療物としては、ＤＳＣＲ８の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。
【０２６１】
実施例８
ＣＥＬＳＲ３：ＣＥＬＳＲ３（受入番号ＮＭ＿００１４０７．２）はカドヘリン、ＥＧＦＬＡＧ７回貫通Ｇ型受容体３をコードする。驚いたことに、ＣＥＬＳＲ３が源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、リンパ節、腎臓、子宮頸部、子宮内膜、卵巣、肺、胸膜、膀胱、膵臓、精巣、結腸、直腸、肝臓、乳、軟部組織、膀胱、脳、扁桃、甲状腺、結合組織、胃、食道、前立腺、骨、子宮、精巣、筋肉の腫瘍および転移性腫瘍のための新規マーカーとなることが、本明細書で開示される。
【０２６２】
図８に示されるように、ＣＥＬＳＲ３発現をＩｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＣＥＬＳＲ３に特異的なプローブ（プローブ配列ＣＣＣＡＧＣＧＧＣＣＣＴＣＴＴＴＣＣＴＧＴＣＴＧＴＧＴＡＡＡＴ  ＴＧＴＴＣＣＧＴＧＡＡＧＣＣＧＣＧＣＴ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１６９１２９０）によりアッセイし、下記において強い遺伝子発現を検出した（＞１００ＲＦＵ）：濾胞性リンパ腫、腎臓腫瘍腎細胞癌、乳腺腫瘍侵襲性乳管癌、乳腺腫瘍小葉癌、大腸結腸腫瘍腺癌、大腸直腸腫瘍腺癌、子宮頸部扁平細胞の子宮頸部癌、子宮内膜腺癌、卵巣腫瘍癌、肺小細胞癌、肺腫瘍小細胞癌、胸膜の混合胸膜中皮腫、食道胃接合部の食道胃接合部腺癌、食道腫瘍腺癌、食道腫瘍扁平上皮癌、膀胱腫瘍移行上皮癌、膵臓の神経内分泌膵臓腫瘍、精巣精上皮腫、肝臓肝細胞の肝臓：左葉癌、胆管の胆管細胞癌、胃腫瘍腺癌、脳退形成乏突起神経膠腫、脳未分化星状細胞腫、結腸原発腫瘍、肝臓原発腫瘍肝細胞癌、肺原発腫瘍、直腸原発腫瘍、胃原発腫瘍、乳房の転移性乳腺癌、結腸の転移性結腸腺癌、原発性子宮頸部と一致する転移性子宮頸部腺癌、食道胃接合部の転移性食道胃接合部腺癌、扁桃扁平細胞の転移性扁桃癌、膀胱小細胞の転移性膀胱癌、膵臓の神経内分泌転移性膵臓腫瘍、転移性乳腺腫瘍、結腸転移性腫瘍、肺転移性腫瘍、直腸転移性腫瘍、胃転移性腫瘍、軟部組織腫瘍転移性新生物腺癌漿液性嚢胞腺癌、肝臓腫瘍転移性新生物腺癌、胸壁腫瘍転移性新生物精上皮腫、子宮腫瘍子宮内膜間質肉腫、子宮内膜腫瘍子宮内膜間質肉腫、胸膜腫瘍悪性新生物肉腫、骨の転移性骨肉腫、子宮内膜の転移性子宮内膜間質肉腫。対照的に、胎児脳および脊髄を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、骨、甲状腺、および唾液腺を含む多種多様の正常組織におけるＣＥＬＳＲ３の発現は、一般に低かった（＜９５ＲＦＵ）。
【０２６３】
本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＣＥＬＳＲ３発現の上昇の特異性は、ＣＥＬＳＲ３が転移性疾患を含む多くの型の癌（例えば、この実施例で記載される癌が挙げられるが、それらに限定されない）の診断のためのマーカー、および多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。
【０２６４】
ＣＥＬＳＲ３を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＣＥＬＳＲ３を標的にする治療物としては、ＣＥＬＳＲ３の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用は本明細書で記載される。
【０２６５】
実施例９
ＰＰＥＦ１：ＰＰＥＦ１（受入番号ＮＭ＿１５２２２４．１）はタンパク質ホスファターゼ、ＥＦハンドカルシウム結合ドメイン１をコードする。驚いたことに、ＰＰＥＦ１が、源の多様な組織由来の多くの型の悪性腫瘍、例えば、限定はされないが、乳房、膀胱、膵臓、結合組織、軟骨、皮膚、骨、平滑筋の腫瘍および転移性腫瘍のための新規マーカーとなることが、本明細書で開示される。
【０２６６】
図９に示されるように、ＰＰＥＦ１発現を、Ｉｌｌｕｍｉｎａマイクロアレイ、ＰＰＥＦ１に特異的なプローブ（プローブ配列ＴＧＧＧＴＴＧＧＡＣＣＴＡＧＴＧＧＴＧＴＴＧＴＣＧＴＧＡＧＴＧＣ  ＣＡＣＣＴＡＡＣＣＡＧＧＡＧＧＣＣＡ；（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７）ＩｌｌｕｍｉｎａプローブＩＤ  ＩＬＭＮ＿１６５２０１７）によりアッセイし、下記において強い遺伝子発現を検出した（＞１００ＲＦＵ）：乳腺腫瘍小葉癌、膀胱小細胞の転移性癌、膵臓の神経内分泌転移性膵臓腫瘍、軟部の悪性結合組織腫瘍巨細胞腫、軟骨の軟骨肉腫、皮膚腫瘍肉腫線維肉腫、骨の転移性骨肉腫および転移性平滑筋肉腫。対照的に、精巣ならびにニューロン組織、例えば脳および脊髄を除いて、結腸、子宮頸部、子宮内膜、子宮筋、卵管、骨格筋、皮膚、脂肪組織、軟部組織、肺、腎臓、食道、リンパ節、甲状腺、膀胱、膵臓、前立腺、直腸、肝臓、脾臓、胃、骨、甲状腺、および唾液腺を含む多種多様の正常組織におけるＰＰＥＦ１の発現は一般に低かった（＜８０ＲＦＵ）。
【０２６７】
本明細書で示される多様な源の悪性腫瘍におけるＰＰＥＦ１発現の上昇の特異性は、ＰＰＥＦ１が転移性疾患を含む多くの型の癌（例えば、この実施例で記載される癌が挙げられるが、それらに限定されない）の診断のためのマーカー、および多くの癌における治療介入のための標的となることを証明する。
【０２６８】
ＰＰＥＦ１を標的にする治療物は本明細書で記載される方法を使用して同定することができ、ＰＰＥＦ１を標的にする治療物としては、ＰＰＥＦ１の活性を調節する抗体が挙げられるが、それらに限定されない。抗体の製造および使用はこの開示で記載される。
【０２６９】
実施例１０
下記タンパク質ＣＯＬ１０Ａ１、ＣＸＣＬ１０、ＥＰＹＣ、ＩＬ８、ＬＡＭＣ２、ＰＩ３、ＭＭＰ７、ＭＭＰ１１、ＭＭＰ１２、ＮＭＵ、ＯＬＦＭ４、およびＷＮＴ１０Ａのレベルを、血清中で、ＵＳＣＮ  ＥＬＩＳＡキット（ＵＳＣＮ）を使用して製造者の指示に従いアッセイした。試料は癌患者ならびに癌を有さない患者（正常試料）由来とした。手短に述べると、１００μＬのブランク、標準、および特定の希釈を有する試料を９６ウェルプレートの適切なウェルに添加し、続いて、２時間、３７℃でインキュベートした。液体を除去した後、１００ｕｌの検出試薬Ａを各ウェルに添加し、１時間、３７℃でインキュベートした。試薬Ａを除去した後、各ウェルを３回、３５０ｕＬの洗浄溶液で洗浄した。１００ｕＬの検出試薬Ｂを各ウェルに添加し、その後、３０分、３７℃でインキュベートした。試薬Ｂを除去した後、各ウェルを５回、３５０ｕＬの洗浄溶液で洗浄した。９０ｕＬの基質溶液を各ウェルに添加し、１５−２５分、３７℃でインキュベートした。５０ｕＬの停止液を各ウェルに添加した。プレートをＭｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ  ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ２５０またはＢｉｏＴｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  Ｈ１プレートリーダーの上のいずれかで４５０ｎｍにて読み取った。標準曲線は、キットで供給された標準に由来し、試料値をこの曲線から外挿した。
【０２７０】
図１０−３４で示される結果は、分析したマーカーの各々が、癌を有さない被験体から得られた正常試料に比べて、様々な癌患者の血清中で上昇したことが見出されたことを示した。
【０２７１】
実施例１１
ｑＰＣＲを使用して、下記遺伝子の発現レベルを様々な癌、良性腫瘍および正常組織において調査した：ＡＭＨ＿１０３８；ＡＳＣＬ１＿１０９５；Ｃ１２ｏｒｆ５６；Ｃ２ｏｒｆ７０＿１０１０；ＣＯＬ１０Ａ、ＤＳＣＲ６＿１０６６；ＤＳＣＲ８＿１０３６；ＬＨＸ８＿１２８３；ＭＭＰ１１；ＭＭＰ１２；ＮＭＵ；ＳＬＣ３５Ｄ。
【０２７２】
ＰＣＲプライマーは、標準ヌクレオチドＢＬＡＳＴプログラム（ＮＣＢＩ）を用いて対象となる遺伝子トランスクリプトに特異的となるように、ならびに少なくとも１つのエキソンジャンクションに及ぶように設計した。プライマーは、Ｏｌｉｇｏ  Ｃａｌｃソフトウェアを使用して、Ｂｒｅｓｌａｕｅｒ式を用いて計算した５８−６３℃のＴｍ、δＧ値＞２５Ｋｃａｌ／ｍｏｌを有し、および自己相補性を示さないように選択された。プライマーは、製造者から塩を含まずに精製されて注文した（ＥｕｒｏｆｉｎｓＭＷＧ）。
【０２７３】
ＲＮＡは、商業的供給源（Ａｓｔｅｒａｎｄ；ＯｒｉＧｅｎｅ）に由来し、ｃＤＮＡは、ランダム六量体プロトコルに従い、ＲＴ−ＰＣＲためのＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔＩＩＩファーストストランド合成システム（ＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎＣａｔ．Ｎｏ．１８０８０−０５１）を用いて調製された。プライマーの初期妥当性確認は、３つの主な基準を評価した：ロバスト性、直線性および特異性。絶対値ロバスト性に対する許容基準は、ハウスキーピング遺伝子（ＧＡＰＤＨおよびＧＵＳＢ）Ｃｔ値を減算した後の最終２＾δＣｔ値＞１であった。疾患を良性または正常試料から区別する観点でのロバスト性は、マイクロアレイ分析（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）により前に決定されるように、陰性試料よりも陽性であることがわかっている＞２Ｃｔ差を要求した。直線性を評価するために、プライマーを使用して、１０倍希釈のｃＤＮＡを増幅した。鋳型の１０倍希釈時に予想された３．３Ｃｔシフトまたはその付近で示したプライマーのみがさらなる試験に進んだ。特異性を、ゲル電気泳動により、ならびに機器上での融解曲線分析から生成された単一のＴｍを観察することから決定した。ＰＣＲ産物を２％アガロースゲル上で移動させ、予想されたサイズの単一バンドを生成するもののみが妥当性確認をパスした。
【０２７４】
初期プライマー妥当性確認のプロトコルは、ＯｒｉＧｅｎｅ  ＴｉｓｓｕｅＳｃａｎ  ｑＰＣＲアレイで実施される外部妥当性確認とは主に体積およびｃＤＮＡ標的の観点で異なった。
【０２７５】
初期プライマー妥当性確認のためのＰＣＲプロトコル：
【表２】
2014525584.tif 000005
【０２７６】
使用したプライマーは、下記表４（フォワードプライマー）および表５（リバースプライマー）で提供される：
【０２７７】
表４
【表３】
2014525584.tif 000006
【表４】
2014525584.tif 000007
【０２７８】
ＯｒｉＧｅｎｅ  ＴｉｓｓｕｅＳｃａｎアレイに対するＰＣＲプロトコル：
【表５】
2014525584.tif 000008
【表６】
2014525584.tif 000009
【０２７９】
初期妥当性確認実験を商業的供給源（Ａｓｔｅｒａｎｄ、Ｄｅｔｒｏｉｔ、ＭＩ；ＯｒｉＧｅｎｅ、Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ、ＭＤ）に由来し、ランダム六量体プロトコルに従い、ＲＴ−ＰＣＲのためのＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔＩＩＩファーストストランド合成システム（ＬｉｆｅＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）を用いて、ｃＤＮＡに調製したＲＮＡを用いて実施した。試料を定量逆転写ＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）反応において、１ｕＭ最終濃度のフォワードおよびリバースプライマーの各々（Ｅｕｒｏｆｉｎｓ  ＭＷＧ  Ｈｕｎｔｓｖｉｌｌｅ、ＡＬ）を用いて、Ｐｏｗｅｒ  ＳＹＢＲ  ＧｒｅｅｎＭａｓｔｅｒ  Ｍｉｘキット（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）を使用して、製造者の指示に従い増幅させた。試料入力は、２０ｕＬの最終反応体積において３〜１０ｎｇのｃＤＮＡとした。使用したリアルタイムＰＣＲ機器はＡＢＩ７５００リアルタイムＰＣＲシステムまたはＡＢＩ  ７９００ＨＴ配列検出システムとし、サーモプログラムは５０℃で２分、その後９５℃で１０分、続いて、４０サイクルの９５℃で１５秒および６０℃で１分にて設定した。解離分析を、９５℃で１５秒、６０℃で１５秒および９５℃で１５秒を用いてすぐに実施した。
【０２８０】
癌に対する良好な相関および特異性を証明し、ならびにロバスト性および試料入力に対する直線用量応答を示すプライマーは、さらなる試験に進んだ。ＴｉｓｓｕｅＳｃａｎ  ｑＰＣＲアレイ（ＯｒｉＧｅｎｅ、Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ、ＭＤ）を使用して、多数のｃＤＮＡ試料を使用した。アレイの各ウェル内の凍結乾燥したｃＤＮＡを、１ｕＭ最終濃度の、フォワードおよびリバースプライマーの各々と、Ｐｏｗｅｒ  ＳＹＢＲ  Ｇｒｅｅｎ  Ｍａｓｔｅｒ  Ｍｉｘキット（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）を使用して、３０ｕＬの最終反応体積で混合した。使用したリアルタイムＰＣＲ機器はＡＢＩ７５００リアルタイムＰＣＲシステムとし、サーモプログラムは、５０℃で２分、その後９５℃で１０分、続いて４０サイクルの９５℃で１５秒および６０℃で１分にて設定した。解離分析を９５℃で１５秒、６０℃で１５秒および９５℃で１５秒を用いてすぐに実施した。
【０２８１】
結果を図３５−５０で提示し、マーカーＡＭＨ＿１０３８；ＡＳＣＬ１＿１０９５；Ｃ１２ｏｒｆ５６；Ｃ２ｏｒｆ７０＿１０１０；ＣＯＬ１０Ａ、ＤＳＣＲ６＿１０６６；ＤＳＣＲ８＿１０３６；ＬＨＸ８＿１２８３；ＭＭＰ１１；ＭＭＰ１２；ＮＭＵ；ＳＬＣ３５Ｄは様々な癌型で上昇することを示す。
【０２８２】
実施例１２
ＰＯＴＥの発現を免疫蛍光法により、乳癌乳管癌、線維腺腫および正常乳房組織から取得した組織を使用して調べた。
【０２８３】
パラフィン包埋組織切片を、Ａｓｔｅｒａｎｄ（Ｄｅｔｒｏｉｔ、ＭＩ）から取得した。これらの標本は下記を含んだ：正常乳房組織（癌歴のないドナー）、乳房の線維腺腫、乳管細胞癌、正常甲状腺組織（癌歴のないドナー）、甲状腺濾胞性腺腫および甲状腺濾胞性癌。抗体で染色する前に、切片をキシレン中で脱蝋し、エタノールのサイクル（１００％、９５％、７０％）で再水和させ、続いて蒸留水中で洗浄した。抗原賦活化をエピトープ賦活化緩衝液（ＩＨＣＷｏｒｌｄ＃ＩＷ−１１００）中で、スライドを９５℃で４０分、ＩＨＣ−Ｓｔｅａｍｅｒセット（ＩＨＣ  Ｗｏｒｌｄ  ＃ＩＷ−１１０２）を使用してインキュベートすることにより実施した。免疫染色をモノクローナルマウス抗ヒトＰＯＴＥ抗体（Ｄｒ．Ｉｒａ  Ｐａｓｔａｎより好意により供与）を１：１００希釈で使用して実施した。一次抗体をＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ５９４ヤギ抗マウスＩｇＧ（Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＃Ａ１１０３２）を１：２００希釈で使用して検出した。
【０２８４】
ＤＡＰＩを有するＶｅｃｔａｓｈｉｅｌｄマウンティング培地を使用して、染色試料（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＃Ｈ−１２００）を保存した。４００ミリ秒の露光時間を用い、１０，０００倍拡大のＮｉｋｏｎ  Ｅｃｌｉｐｓｅ  ＴＥ２０００−ＵおよびＸ−Ｃｉｔｅ１２０蛍光照明システム（Ｌｕｍｅｎ  Ｄｙｎａｍｉｃｓ）を使用して画像を撮像した。
【０２８５】
結果は図５０に示され、ＰＯＴＥが乳癌組織で発現されることを証明する。
実施例１３
【０２８６】
ＭＭＰ１１の発現を免疫蛍光法により、乳癌乳管癌、線維腺腫および正常乳房組織から取得した組織を使用して調べた。
【０２８７】
パラフィン包埋組織切片をＡｓｔｅｒａｎｄ（Ｄｅｔｒｏｉｔ、ＭＩ）から取得した。これらの標本は下記を含んだ：正常乳房組織（癌歴のないドナー）、乳房の線維腺腫、および乳管細胞癌。抗体で染色する前に、切片をキシレン中で脱蝋し、エタノールのサイクル（１００％、９５％、７０％）で再水和させ、続いて蒸留水中で洗浄した。抗原賦活化をエピトープ賦活化緩衝液（ＩＨＣ  Ｗｏｒｌｄ  ＃ＩＷ−１１００）中で、スライドを９５℃で４０分、ＩＨＣ−Ｓｔｅａｍｅｒセット（ＩＨＣ  Ｗｏｒｌｄ  ＃ＩＷ−１１０２）  を使用してインキュベートすることにより実施した。免疫染色をポリクローナルウサギ抗ヒトＭＭＰ１１抗体（Ａｂｃａｍ  ＃ａｂ５２９０４）を１：１００希釈で使用して実施した。一次抗体をＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ５９４ロバ抗ウサギＩｇＧ（Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  ＃Ａ２１２０７）を１：２００希釈で使用して検出した。
【０２８８】
ＤＡＰＩを有するＶｅｃｔａｓｈｉｅｌｄマウンティング培地を使用して、染色試料（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＃Ｈ−１２００）を保存した。４００ミリ秒の露光時間を用い、１０，０００倍拡大のＮｉｋｏｎ  Ｅｃｌｉｐｓｅ  ＴＥ２０００−ＵおよびＸ−Ｃｉｔｅ１２０蛍光照明システム（Ｌｕｍｅｎ  Ｄｙｎａｍｉｃｓ）を使用して画像を撮像した。
【０２８９】
結果を図５１に示し、ＭＭＰ１１が乳癌組織で発現されることを証明する。
【０２９０】
実施例１４
定量逆転写−ポリメラーゼ連鎖反応（ｑＲＴ−ＰＣＲ）を使用して結腸癌組織および正常結腸組織におけるＬ１ＴＤ１およびＡＰＯＢＥＣ１遺伝子の発現を調べた。
【０２９１】
全ＲＮＡをＲＮｅａｓｙ  Ｍｉｎｉキット（Ｑｉａｇｅｎ）を用いて抽出し、ｃＤＮＡをＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩＩ逆転写酵素を、ランダム六量体プライマー単独と組み合わせて、またはオリゴ−ｄＴプライマー（全ての逆転写構成成分はＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから）と組み合わせて生成させた。ＰＣＲを７９００ＨＴ配列検出システムまたは７５００リアルタイムＰＣＲシステム（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）上で、ＳＹＢＲ（登録商標）ＧｒｅｅｎＩ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）またはＴａｑＭａｎ化学を用いて実施した。ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲは、Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  Ｐｒｏｂｅ  Ｌｉｂｒａｒｙ（ＵＰＬ）（Ｒｏｃｈｅ）からのプローブを、それに応じて設計されたプライマーと組み合わせて使用して実施した。バックグラウンド：ＵＰＬシステムは、ヒトｍＲＮＡトランスクリプトームの広範な割合をカバーする比較的少数の短い加水分解プローブを含む。ＵＰＬプローブはロックド核酸（ＬＮＡ）を含み、それらは、プローブの融解温度を増加させる。これにより、プローブおよびより長い未修飾プライマーは、同じ温度でアニールすることができる。
【０２９２】
結果を図５２−５３に示し、Ｌ１ＴＤ１およびＡＰＯＢＥＣ１はどちらも、正常結腸組織に比べ結腸癌組織において高レベルで発現されることを証明する。
【表７】
2014525584.tif 000010
【表８】
2014525584.tif 000011
【表９】
2014525584.tif 000012
【表１０】
2014525584.tif 000013
【表１１】
2014525584.tif 000014
【表１２】
2014525584.tif 000015
【表１３】
2014525584.tif 000016
【図１】
2014525584.tif 000017
【図２】
2014525584.tif 000018
【図３】
2014525584.tif 000019
【図４】
2014525584.tif 000020
【図５】
2014525584.tif 000021
【図６】
2014525584.tif 000022
【図７】
2014525584.tif 000023
【図８】
2014525584.tif 000024
【図９】
2014525584.tif 000025
【図１０】
2014525584.tif 000026
【図１１】
2014525584.tif 000027
【図１２】
2014525584.tif 000028
【図１３】
2014525584.tif 000029
【図１４】
2014525584.tif 000030
【図１５】
2014525584.tif 000031
【図１６】
2014525584.tif 000032
【図１７】
2014525584.tif 000033
【図１８】
2014525584.tif 000034
【図１９】
2014525584.tif 000035
【図２０】
2014525584.tif 000036
【図２１】
2014525584.tif 000037
【図２２】
2014525584.tif 000038
【図２３】
2014525584.tif 000039
【図２４】
2014525584.tif 000040
【図２５】
2014525584.tif 000041
【図２６】
2014525584.tif 000042
【図２７】
2014525584.tif 000043
【図２８】
2014525584.tif 000044
【図２９】
2014525584.tif 000045
【図３０】
2014525584.tif 000046
【図３１】
2014525584.tif 000047
【図３２】
2014525584.tif 000048
【図３３】
2014525584.tif 000049
【図３４】
2014525584.tif 000050
【図３５】
2014525584.tif 000051
【図３６】
2014525584.tif 000052
【図３７】
2014525584.tif 000053
【図３８】
2014525584.tif 000054
【図３９】
2014525584.tif 000055
【図４０】
2014525584.tif 000056
【図４１】
2014525584.tif 000057
【図４２】
2014525584.tif 000058
【図４３】
2014525584.tif 000059
【図４４】
2014525584.tif 000060
【図４５】
2014525584.tif 000061
【図４６】
2014525584.tif 000062
【図４７】
2014525584.tif 000063
【図４８】
2014525584.tif 000064
【図４９】
2014525584.tif 000065
【図５０】
2014525584.tif 000066
【図５１】
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【図５２】
2014525584.tif 000068
【図５３】
2014525584.tif 000069
【国際調査報告】
2014525584.tif 000070
2014525584.tif 000071
2014525584.tif 000072
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