(57)【要約】本出願は、ＨＮＳＣＣ患者などのＨＰＶ陽性およびＨＰＶ陰性癌患者の、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を含む薬物への応答を予測する方法に関する。本出願はまた、ＨＮＳＣＣを含む癌治療での、ＨＰＶ陽性および陰性患者におけるＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤の有用性を予測する方法およびキットに関する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
腫瘍を有する患者に対し、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を含む治療が有効であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍がＨＰＶ陽性またはＨＰＶ陰性であるかを判定することを含み、前記患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤による治療が前記患者に有効であることが予測される、方法。
【請求項２】
前記判定が、前記患者から得た腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定をすることを含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在する場合、前記患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在しない場合、前記患者がＨＰＶ陰性であることを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する前記薬剤がＥＧＦｒ抗体である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ＥＧＦｒ抗体がパニツムマブである、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む、請求項２に記載の方法。
【請求項６】
前記腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記腫瘍が口腔咽頭腫瘍である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記腫瘍が喉頭腫瘍である、請求項６に記載の方法。
【請求項９】
前記腫瘍が口腔腫瘍である、請求項６に記載の方法。
【請求項１０】
前記腫瘍が下咽頭腫瘍である、請求項６に記載の方法。
【請求項１１】
前記腫瘍が局所進行性腫瘍である、請求項１および６に記載の方法。
【請求項１２】
前記腫瘍が再発転移性腫瘍である、請求項１および６に記載の方法。
【請求項１３】
ＨＰＶ陰性と判定された腫瘍を有する患者の無憎悪生存期間および／または全生存期間を延長させる方法であって、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を前記患者に投与することを含み、それにより前記患者の無憎悪生存期間および／または全生存期間が延長する、方法。
【請求項１４】
前記患者から得た腫瘍においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を判定することにより前記腫瘍がＨＰＶ陰性であると判定される方法であって、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在しない場合、前記患者がＨＰＶ陰性であることを示す、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する前記薬剤がＥＧＦｒ抗体である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】
前記ＥＧＦｒ抗体がパニツムマブである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１８】
前記腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１９】
前記腫瘍が口腔咽頭腫瘍である、請求項１３に記載の方法。
【請求項２０】
前記腫瘍が喉頭腫瘍である、請求項１３に記載の方法。
【請求項２１】
前記腫瘍が口腔腫瘍である、請求項１３に記載の方法。
【請求項２２】
前記腫瘍が下咽頭腫瘍である、請求項１３に記載の方法。
【請求項２３】
前記腫瘍が局所進行性腫瘍である、請求項１３および１８に記載の方法。
【請求項２４】
前記腫瘍が再発転移性腫瘍である、請求項１３および１８に記載の方法。
【請求項２５】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項２６】
腫瘍を有する患者群を階層化する方法であって、
（ａ）腫瘍を有する患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定すること；および
（ｂ）ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を含む治療剤による治療のために、腫瘍がＨＰＶ陰性である患者を選択すること、
を含む、方法。
【請求項２７】
請求項２６に記載の方法であって、前記判定が、前記患者から得た腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定をすることを含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在する場合、前記患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在しない場合、前記患者がＨＰＶ陰性であることを示す、方法。
【請求項２８】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する前記薬剤がＥＧＦｒ抗体である、請求項２６に記載の方法。
【請求項２９】
前記ＥＧＦｒ抗体がパニツムマブである、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項３１】
前記腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍である、請求項２６に記載の方法。
【請求項３２】
前記腫瘍が口腔咽頭腫瘍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記腫瘍が喉頭腫瘍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】
前記腫瘍が口腔腫瘍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３５】
前記腫瘍が下咽頭腫瘍である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３６】
前記腫瘍が局所進行性腫瘍である、請求項２６および３１に記載の方法。
【請求項３７】
前記腫瘍が再発転移性腫瘍である、請求項２６および３１に記載の方法。
【請求項３８】
腫瘍を有する患者を治療する方法であって、
（ａ）腫瘍を有する患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定すること；および
（ｂ）前記患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合に、前記患者にＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を投与すること、
を含む、方法。
【請求項３９】
前記判定が、前記患者から得た腫瘍においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定をすることを含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在する場合、前記患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在しない場合、前記患者がＨＰＶ陰性であることを示す、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する前記薬剤がＥＧＦｒ抗体である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４１】
前記ＥＧＦｒ抗体がパニツムマブである、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む、請求項３８に記載の方法。
【請求項４３】
前記腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４４】
前記腫瘍が口腔咽頭腫瘍である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記腫瘍が喉頭腫瘍である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４６】
前記腫瘍が口腔腫瘍である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
前記腫瘍が下咽頭腫瘍である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４８】
前記腫瘍が局所進行性腫瘍である、請求項３８および４３に記載の方法。
【請求項４９】
前記腫瘍が再発転移性腫瘍である、請求項３８および４３に記載の方法。
【請求項５０】
前記方法が、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む、請求項３８に記載の方法。
【請求項５１】
患者に、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を投与することを含む、ＨＰＶ陰性と判定された腫瘍を有する患者を治療する方法。
【請求項５２】
前記判定が、前記患者から得た腫瘍においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定をすることを含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在する場合、前記患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在しない場合、前記患者がＨＰＶ陰性であることを示す、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する前記薬剤がＥＧＦｒ抗体である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５４】
前記ＥＧＦｒ抗体がパニツムマブまたはセツキシマブである、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項５６】
前記腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５７】
前記腫瘍が口腔咽頭腫瘍である、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記腫瘍が喉頭腫瘍である、請求項５６に記載の方法。
【請求項５９】
前記腫瘍が口腔腫瘍である、請求項５６に記載の方法。
【請求項６０】
前記腫瘍が下咽頭腫瘍である、請求項５６に記載の方法。
【請求項６１】
前記腫瘍が局所進行性腫瘍である、請求項５１および５６に記載の方法。
【請求項６２】
前記腫瘍が再発転移性腫瘍である、請求項５１および５６に記載の方法。
【請求項６３】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む、請求項５１に記載の方法。
【請求項６４】
腫瘍を有する患者の無憎悪生存期間および／または全生存期間を延長させる方法であって、
（ａ）腫瘍を有する患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定すること；および
（ｂ）前記患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合に、前記患者にＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を投与すること、
を含む、方法。
【請求項６５】
前記判定が、前記患者から得た腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定をすることを含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在する場合、前記患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａが存在しない場合、前記患者がＨＰＶ陰性であることを示す、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する前記薬剤がＥＧＦｒ抗体である、請求項６４に記載の方法。
【請求項６７】
前記ＥＧＦｒ抗体がパニツムマブである、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
腫瘍におけるｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料においてｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む、請求項６４に記載の方法。
【請求項６９】
前記腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍である、請求項６４に記載の方法。
【請求項７０】
前記腫瘍が口腔咽頭腫瘍である、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
前記腫瘍が喉頭腫瘍である、請求項６９に記載の方法。
【請求項７２】
前記腫瘍が口腔腫瘍である、請求項６９に記載の方法。
【請求項７３】
前記腫瘍が下咽頭腫瘍である、請求項６９に記載の方法。
【請求項７４】
前記腫瘍が局所進行性腫瘍である、請求項６４および６９に記載の方法。
【請求項７５】
前記腫瘍が再発転移性腫瘍である、請求項６４および６９に記載の方法。
【請求項７６】
ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む、請求項６４に記載の方法。
【請求項７７】
腫瘍を有する患者の腫瘍がＨＰＶ陰性であるかを判定することを含む、ＥＧＦｒ阻害剤による治療が前記患者に有効であるかどうかを予測する方法。
【請求項７８】
腫瘍を有する患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかを判定することを含む、ＥＧＦｒ阻害剤による治療が前記患者に有効であるかどうかを予測する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１１年９月９日に出願された米国特許仮出願第６１／５３３，０８２号の利益を主張するものであり、該特許仮出願は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
発明の分野
本開示は、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）に関し、また、頭頸部扁平上皮癌（ＨＮＳＣＣ）腫瘍などの腫瘍の存在を特徴とする癌を含む少なくとも１種類の癌を有する患者での予後指標としてＨＰＶステータスを使用する方法、具体的には、抗上皮成長因子受容体（ＥＧＦｒ）特異的結合剤を含む治療計画に関連した方法に関する。本開示はまた、ＨＮＳＣＣ腫瘍などの腫瘍を有する患者を、抗ＥＧＦｒ特異的結合剤を用いて治療する方法、また、当該患者を、ＨＰＶステータスに基づいて階層化する方法に関する。抗ＥＧＦＲ特異的結合剤は、例えばモノクローナル抗体などの抗体であり得る。
【背景技術】
【０００３】
癌治療でのモノクローナル抗体のある応用は、抗体が、免疫増強アイソタイプ、毒素、または薬物などの細胞傷害性エフェクタ機能を、癌組織に特異的に送達する能力に依存する。別の代替手法は、モノクローナル抗体を利用して、腫瘍細胞から必須の細胞外増殖シグナル、例えば成長因子がその細胞受容体を通して介在するシグナルなどを取り除くことにより、腫瘍細胞の生存に直接影響を及ぼすものである。この手法での格好の標的の１つは、上皮成長因子受容体（ＥＧＦｒ）であり、これはＥＧＦに結合し、かつ形質転換成長因子α（ＴＧＦα）とも結合することができる（例えば、Ullrich  et  al.,  Cell  61:203-212,  1990;  Baselga  et  al.,  Pharmacol.  Ther.  64:  127-154,  1994;  Mendelsohn  et  al.,  in  Biologic  Therapy  of  Cancer  607-623,  Philadelphia:  J.B.  Lippincott  Co.,  1995;およびFan  et  al.,  Curr.  Opin.  Oncol.  10:  67-73,  1998を参照のこと）。ＥＧＦまたはＴＧＦαのＥＧＦｒ（１７０ｋＤａである膜貫通型の細胞表面糖タンパク質）への結合が、細胞増殖に至る細胞での生化学的事象（例えば、ＥＧＦｒの自己リン酸化および内在化など）の連鎖を引き起こす（例えば、Ullrich  et  al.,  Cell  61:203-212,  1990を参照のこと）。
【０００４】
ヒトＥＧＦｒに特異的なモノクローナル抗体が、マウスおよびラットで生成されている（例えば、Baselga  et  al.,  Pharmacol.  Ther.  64:  127-154,  1994;  Mendelsohn  et  al.,  in  Biologic  Therapy  of  Cancer  pp.  607-623,  Philadelphia:  J.B.  Lippincott  Co.,  1995;  Fan  et  al.,  Curr.  Opin.  Oncol.  10:  67-73,  1998;  Modjtahedi  et  al.,  Intl.  J.  Oncology  4:  277-296,  1994を参照のこと）。これらの抗体のいくつか（例えばマウス抗体１０８、２２５（例えば、Aboud-Pirak  et  al.,  J.  Natl.  Cancer  Inst.  80:  1605-1611,  1988を参照のこと）および５２８（例えば、Baselga  et  al.,  Pharmacol.  Ther.  64:  127-154,  1994;  Mendelsohn  et  al.,  in  Biologic  Therapy  of  Cancer  pp.  607-623,  Philadelphia:  J.B.  Lippincott  Co.,  1995を参照のこと）またはラットＩＣＲ１６、ＩＣＲ６２およびＩＣＲ６４（例えば、Modjtajedi  et  al.,  Intl.  J.  Oncology  4:  277-296,  1994;  Modjtahedi  et  al.,  Br.  J.  Cancer  67:247-253,  1993;  Modjtahedi  et  al.,  Br.  J.  Cancer  67:  254-261,  1993を参照のこと）モノクローナル抗体など）が、異種移植マウスモデルでの腫瘍成長に影響を与える能力について大規模に評価された。マウス抗体の可変領域がヒト定常領域に結合する２２５モノクローナル抗体のキメラ型（Ｃ２２５）は、高用量においてのみであるが、向上したｉｎ  ｖｉｖｏ抗腫瘍活性を示した（例えば、Goldstein  et  al.,  Clinical  Cancer  Res.  1:  1311-1318,  1995;  Prewett  et  al.,  J.  Immunother.  Emphasis  Tumor  Immunol.  19:  419-427,  1996を参照のこと）。この抗体は、最終的にセツキシマブ（Ｅｒｂｉｔｕｘ（登録商標）、Ｅｌｉ  Ｌｉｌｌｙ）となった。
【０００５】
生物学的技術分野（biological  art）でのある特定の進歩により、完全ヒト型抗ＥＧＦｒ抗体の生成が可能となった。ヒト免疫グロブリン遺伝子導入マウス（Ｘｅｎｏｍｏｕｓｅ（登録商標）ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、  Ａｂｇｅｎｉｘ、  Ｉｎｃ．）を使用して、ヒトＥＧＦｒに特異的なヒト抗体が開発された（例えば、Mendez,  Nature  Genetics,  15:  146-156,  1997;  Jakobovits,  Adv.  Drug  Deliv.  Rev.,  31(1-2):  33-42,  1998;  Jakobovits,  Expert  Opin.  Invest.  Drugs,  7(4):  607-614,  1998;  Yang  et  al.,  Crit.  Rev.  Oncol.  Hematol.  38(1):17-23,  2001;  国際公開第９８／２４８９３号；国際公開第９８／５０４３３号を参照のこと）。そのような抗体の一種であるパニツムマブ（Ｖｅｃｔｉｂｉｘ（登録商標）、Ａｍｇｅｎ  Ｉｎｃ）は、ヒトＥＧＦｒに対して５×１０−１１Ｍの親和性をもつヒトＩｇＧ２モノクローナル抗体であり、ＥＧＦのＥＧＦｒへの結合を遮断、受容体シグナル伝達を遮断、および腫瘍細胞の活性化および増殖をｉｎ  ｖｉｔｒｏで阻害することが示されている（例えば、国際公開第９８／５０４３３号を参照のこと;例えば、米国特許第６，２３５，８８３号参照のこと）。無胸腺マウスでの研究により、パニツムマブはまた、ｉｎ  ｖｉｖｏ活性を有し、無胸腺マウスでのヒト類表皮癌Ａ４３１異種移植片の形成を抑制するだけでなく、既に認められた大型のＡ４３１腫瘍異種移植片を根絶させることも実証されている（例えば、Yang  et  al.,  Crit.  Rev.  Oncol.  Hematol.  38(1):17-23,  2001;  Yang  et  al.,  Cancer  Res.  59(6):1236-43,  1999を参照のこと）。パニツムマブは、他の癌のなかでも、腎癌、結腸直腸腺癌、前立腺癌、および非小細胞扁平上皮肺癌の治療用に検討されている（例えば、米国特許公報第２００４／００３３５４３号を参照のこと）。パニツムマブは、転移性結腸直腸癌をもつある患者の治療のために、米国食品医薬品局により承認済みである。
【０００６】
パピローマウイルスは、皮膚および粘膜上皮の良性、異形成、および悪性の過剰増殖を誘発する（パピローマウイルスの分子、細胞、および臨床の側面の考察については、例えば、Mansur  and  Androphy,  (1993)  Biochim  Biophys  Acta  1155:323-345;  Pfister  (1984)  Rev.  Physiol.  Biochem.  Pharmacol.  99:111-181;  およびBroker  et  al.  (1986)  Cancer  Cells  4:17-36を参照のこと）。大部分のＨＰＶ誘発型上皮性病変は、良性であるが、あるパピローマウイルス型、例えばＨＰＶ−１６およびＨＰＶ−１８から誘発される病変は、悪性進行を起こす可能性がある。
【０００７】
様々な癌（例えば頭頸部癌など）の発症および自然経過でのＨＰＶの役割が研究されている。例えば、Joseph  &  Pai,  (2011)  ASCO;  Lassen  et  al.,  (2009)  J  Clin  Onc.  27:1992-98;  Perrone  et  al.,  (2006)  Human  Cancer  Biol.  12:6643-6651;  Stetlow  et  al.,  (2010)  Am  J  Surg.  Path.  34:e15-e24;  Ihloff  et  al.,  (2010)  Oral  Onc.  46:705-11;  Klussman  et  al,  (2003)  Am  J  Path.  162:747-53を参照のこと。より具体的には、Ｌａｓｓｅｎらは、ｐ１６ＩＮＫ４ＡがＨＰＶ感染と相関があり、したがって、ｐ１６ＩＮＫ４ＡはＨＰＶ陽性のＨＮＳＣＣ患者で予後効果を示すことを実証している。Ｐｅｒｒｏｎｅらは、ＨＮＳＣＣには様々な形態（例えばＨＰＶ関連ＨＮＳＣＣおよび環境誘発型（environmentally-driven）ＨＮＳＣＣなど）があり；ＨＮＳＣＣのこれらの形態のそれぞれがｐ５３ステータスおよびＥＧＦｒ遺伝子増幅に顕著な違いが示されることを実証した。Ｓｔｅｔｌｏｗらは、ＨＰＶ陽性のＨＮＳＣＣ患者の組織病理学的指標について記載している。Ｋｌｕｓｓｍａｎらは、ＨＰＶ陽性のＨＮＳＣＣ患者とＨＰＶ陰性のＨＮＳＣＣ患者との間の分子的および組織病理学的分類を実証した。最後に、Ｉｌｈｏｆｆらは、ＨＰＶ陽性の腫瘍状態が、ＨＮＳＣＣ患者に、関連する予後因子としての役割をもち得るという発想を裏付ける最近の臨床研究を考察している。
【０００８】
ＨＰＶ陽性の局所進行性ＨＮＳＣＣ患者は、ＨＰＶ陰性のＨＮＳＣＣ患者に比べて、ＤＮＡ変異の異なる範囲を有し、良好な予後であることが認められている。引用される研究が、ＨＮＳＣＣ患者でのＨＰＶステータスの予後的役割を集約して指摘しているかどうか定かではないが、ＨＰＶステータスが信頼性のある予後指標であるかどうかに関わらず、本開示までに、薬物、例えばパニツムマブまたはセツキシマブに関するＨＮＳＣＣ患者の予後指標としてのＨＰＶステータスの議論は存在せず、ＨＰＶ陰性のＨＮＳＣＣ患者の全生存期間および／または無憎悪生存期間に対する、薬物例えばパニツムマブまたはセツキシマブの増強効果のいかなる実証もなされていなかった。
【０００９】
いくつかの試験で、ＥＧＦｒ阻害剤は、任意抽出集団でさえも有意な生存率の向上が得られることが示されているが、他方では、実質的な有効性は存在しなかった。認可されたＥＧＦｒ阻害剤のいくつかの場合においてさえも、効率的かつ信頼性のある試験が、ＥＧＦＲ阻害剤による治療が重要な有効性を有し得る患者およびそのような治療が重要な有効性を有する可能性が低い患者を特定する場合に、有効であることがいっそう明らかになってきた。例えば、Ladanyi  et  al.,  Mod  Pathol.  2008  May;  21  Suppl  2:S16-22を参照のこと。本明細書に記載のように、ＨＮＳＣＣ患者での腫瘍のＨＰＶステータスは、そのような指標としての役割をもち得る。本開示によれば、ＥＧＦｒ阻害剤（パニツムマブなど）は、ＨＰＶ陰性の腫瘍、具体的にはＨＮＳＣＣ腫瘍をもつ患者の無憎悪生存期間および全生存期間を改善することを見いだした。このデータと一致して、本開示はまた、ＥＧＦｒ阻害剤の患者への投与が治療的有用性をもたらすかを判定するための、患者のスクリーニングに関する。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１０】
【特許文献１】国際公開第９８／２４８９３号
【特許文献２】国際公開第９８／５０４３３号
【特許文献３】米国特許第６，２３５，８８３号明細書
【特許文献４】米国特許出願公開第２００４／００３３５４３号明細書
【非特許文献】
【００１１】
【非特許文献１】Ullrich  et  al.,  Cell  61:203-212,  1990
【非特許文献２】Baselga  et  al.,  Pharmacol.  Ther.  64:  127-154,  1994
【非特許文献３】Mendelsohn  et  al.,  in  Biologic  Therapy  of  Cancer  pp.  607-623,  Philadelphia:  J.B.  Lippincott  Co.,  1995
【非特許文献４】Fan  et  al.,  Curr.  Opin.  Oncol.  10:  67-73,  1998
【非特許文献５】Modjtahedi  et  al.,  Intl.  J.  Oncology  4:  277-296,  1994
【非特許文献６】Aboud-Pirak  et  al.,  J.  Natl.  Cancer  Inst.  80:  1605-1611,  1988
【非特許文献７】Modjtahedi  et  al.,  Br.  J.  Cancer  67:247-253,  1993
【非特許文献８】Modjtahedi  et  al.,  Br.  J.  Cancer  67:  254-261,  1993
【非特許文献９】Goldstein  et  al.,  Clinical  Cancer  Res.  1:  1311-1318,  1995
【非特許文献１０】Prewett  et  al.,  J.  Immunother.  Emphasis  Tumor  Immunol.  19:  419-427,  1996
【非特許文献１１】Mendez,  Nature  Genetics,  15:  146-156,  1997
【非特許文献１２】Jakobovits,  Adv.  Drug  Deliv.  Rev.,  31(1-2):  33-42,  1998
【非特許文献１３】Jakobovits,  Expert  Opin.  Invest.  Drugs,  7(4):  607-614,  1998
【非特許文献１４】Yang  et  al.,  Crit.  Rev.  Oncol.  Hematol.  38(1):17-23,  2001
【非特許文献１５】Yang  et  al.,  Cancer  Res.  59(6):1236-43,  1999
【非特許文献１６】Mansur  and  Androphy,  (1993)  Biochim  Biophys  Acta  1155:323-345
【非特許文献１７】Pfister  (1984)  Rev.  Physiol.  Biochem.  Pharmacol.  99:111-181
【非特許文献１８】Broker  et  al.  (1986)  Cancer  Cells  4:17-36
【非特許文献１９】Joseph  &  Pai,  (2011)  ASCO;  Lassen  et  al.,  (2009)  J  Clin  Onc.  27:1992-98
【非特許文献２０】Perrone  et  al.,  (2006)  ヒト  Cancer  Biol.  12:6643-6651
【非特許文献２１】Stetlow  et  al.,  (2010)  Am  J  Surg.  Path.  34:e15-e24
【非特許文献２２】Ihloff  et  al.,  (2010)  Oral  Onc.  46:705-11
【非特許文献２３】Klussman  et  al,  (2003)  Am  J  Path.  162:747-53
【非特許文献２４】Ladanyi  et  al.,  Mod  Pathol.  2008  May;  21  Suppl  2:S16-22
【発明の概要】
【００１２】
１つの態様では、腫瘍を有する患者に対する、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を含む治療の有効性を予測する方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定することを含み、本方法では、患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合、患者に対してＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤による治療が有効であることが予測される。
【００１３】
１つの実施形態では、判定は、患者から得られた腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定を含み、判定において、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在が患者がＨＰＶ陽性であることを示し、また、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの不在が患者がＨＰＶ陰性であることを示す。１つの実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤は、ＥＧＦｒ抗体であり得る。１つの実施形態では、ＥＧＦｒ抗体はパニツムマブである。さらなる実施形態では、腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定は、腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む。さらなる実施形態では、腫瘍は局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍であり、なおさらなる実施形態では、腫瘍は口腔咽頭腫瘍または喉頭腫瘍、または、口腔腫瘍、または下咽頭腫瘍である。種々の実施形態では、腫瘍は局所進行性腫瘍である。他の実施形態では、腫瘍は再発転移性腫瘍である。
【００１４】
別の態様では、ＨＰＶ陰性と判定された腫瘍を有する患者の無憎悪生存期間および／または全生存期間を延長させる方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を患者に投与することを含み、これにより、患者の無憎悪生存期間および／または全生存期間を延長させる。１つの実施形態では、判定は、患者から得られた腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を判定することを含み、この判定より、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在は患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの不在は患者がＨＰＶ陰性であることを示す。１つの実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤は、ＥＧＦｒ抗体であり得る。１つの実施形態では、ＥＧＦｒ抗体はパニツムマブである。さらなる実施形態では、腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定は、腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む。さらなる実施形態では、腫瘍は局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍であり、なおさらなる実施形態では、腫瘍は口腔咽頭腫瘍または喉頭腫瘍、または口腔腫瘍、または下咽頭腫瘍である。種々の実施形態では、腫瘍は局所進行性腫瘍である。他の実施形態では、腫瘍は再発転移性腫瘍である。なお他の実施形態では、方法は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む。
【００１５】
別の態様では、腫瘍を有する患者群を階層化する方法を提供する。１つの態様では、方法は、（ａ）患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定すること；および、（ｂ）ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を含む治療剤による治療のために、腫瘍がＨＰＶ陰性である患者を選択することを含む。１つの実施形態では、判定が、患者から得られた腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定を含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在が患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの不在が患者がＨＰＶ陰性であることを示す。１つの実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤はＥＧＦｒ抗体であり得る。１つの実施形態では、ＥＧＦｒ抗体はパニツムマブである。さらなる実施形態では、腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定は、腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む。さらなる実施形態では、腫瘍は局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍であり、なおさらなる実施形態では、腫瘍は口腔咽頭腫瘍または喉頭腫瘍、または口腔腫瘍、または下咽頭腫瘍である。種々の実施形態では、腫瘍は局所進行性腫瘍である。他の実施形態では、腫瘍は再発転移性腫瘍である。
【００１６】
さらなる態様では、腫瘍を有する患者を治療する方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、（ａ）患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定すること；および、（ｂ）患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合に、患者にＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を投与することを含む。１つの実施形態では、判定は、患者から得られた腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定を含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在が患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの不在が患者がＨＰＶ陰性であることを示す。１つの実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤はＥＧＦｒ抗体であり得る。１つの実施形態では、ＥＧＦｒ抗体はパニツムマブである。さらなる実施形態では、腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定は、腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む。さらなる実施形態では、腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍であり、なおさらなる実施形態では、腫瘍は口腔咽頭腫瘍または喉頭腫瘍、または口腔腫瘍、または下咽頭腫瘍である。種々の実施形態では、腫瘍は局所進行性腫瘍である。他の実施形態では、腫瘍は再発転移性腫瘍である。別の実施形態では、方法は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む。
【００１７】
なおさらなる態様では、ＨＰＶ陰性と判定された腫瘍を有する患者を治療する方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、患者に、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を投与することを含む。１つの実施形態では、判定は、患者から得られた腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定を含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在が患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの不在が患者がＨＰＶ陰性であることを示す。１つの実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤はＥＧＦｒ抗体であり得る。１つの実施形態では、ＥＧＦｒ抗体はパニツムマブである。さらなる実施形態では、腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む。さらなる実施形態では、腫瘍が局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍であり、なおさらなる実施形態では、腫瘍は、口腔咽頭腫瘍または喉頭腫瘍、または口腔腫瘍、または下咽頭腫瘍である。種々の実施形態では、腫瘍は局所進行性腫瘍である。他の実施形態では、腫瘍は再発転移性腫瘍である。別の実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む。
【００１８】
さらなる態様では、腫瘍を有する患者の無憎悪生存期間および／または全生存期間を延長させる方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、（ａ）患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかまたはＨＰＶ陰性であるかを判定すること；および（ｂ）患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合に、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を患者に投与すること、を含む。１つの実施形態では、判定は、患者から得られた腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定を含み、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在が患者がＨＰＶ陽性であることを示し、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの不在が患者がＨＰＶ陰性であることを示す。１つの実施形態では、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤はＥＧＦｒ抗体であり得る。１つの実施形態では、ＥＧＦｒ抗体はパニツムマブである。さらなる実施形態では、腫瘍でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無の判定が、腫瘍試料でのｐ１６ＩＮＫ４Ａの有無を特定する免疫組織化学（ＩＨＣ）分析を実施することを含む。さらなる実施形態では、腫瘍は局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍であり、なおさらなる実施形態では、腫瘍は、口腔咽頭腫瘍または喉頭腫瘍、または口腔腫瘍、または下咽頭腫瘍である。種々の実施形態では、腫瘍は局所進行性腫瘍である。他の実施形態では、腫瘍は再発転移性腫瘍である。１つの実施形態では、方法は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤に加えて、さらに化学療法剤を投与することを含む。
【００１９】
別の態様では腫瘍を有する患者に対するＥＧＦｒ阻害剤による治療の有効性を予測する方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、患者の腫瘍がＨＰＶ陰性であるかを判定することを含む。
【００２０】
さらなる態様では、腫瘍を有する患者に対するＥＧＦｒ阻害剤による治療の有効性を予測する方法を提供する。１つの実施形態では、方法は、患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるかを判定することを含む。
【図面の簡単な説明】
【００２１】
【図１】ＨＰＶ陰性対象での、パニツムマブおよび化学療法剤を投与された患者と、化学療法剤を単独投与された患者とを比較した全生存期間に対する効果を示すＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ生存率曲線である。
【図２】ＨＰＶ陽性対象での、パニツムマブおよび化学療法剤を投与された患者と、化学療法剤を単独投与された患者とを比較した全生存期間に対する効果を示すＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ生存率曲線である。
【図３】ＨＰＶ陰性対象での、パニツムマブおよび化学療法剤を投与された患者と、化学療法剤を単独投与された患者とを比較した無憎悪生存期間に対する効果を示すＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ生存率曲線である。
【図４】ＨＰＶ陽性対象での、パニツムマブおよび化学療法剤を投与された患者と、化学療法剤を単独投与された患者とを比較した無憎悪生存期間に対する効果を示すＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ生存率曲線である。
【図５】全生存期間に対するＨＰＶステータスの効果を示すプロットである。
【図６】無憎悪生存期間に対するＨＰＶステータスの効果を示すプロットである。
【発明を実施するための形態】
【００２２】
本明細書に引用される全ての参考文献（特許、特許出願、論文、教科書等を含む）、およびそれらにおいて引用される参考文献は、それらがまだ引用されていない範囲まで、任意の目的に対し、その全体で、ここに参照により本明細書に援用される。参照により援用される一つ以上の書面が用語を定義し、本開示におけるその用語の定義と矛盾する場合、本開示が優先されるものとする。本明細書に使用される項目の見出しは、構成目的のためのみであり、記述される本主題を限定するものとは解釈されない。
【００２３】
定義
別様に定義されない限り、本発明に関連して使用される科学的用語および技術的用語は、当分野の当業者により一般に理解される意味を有するものとする。さらに、別様に文脈から必要とされない限り、単数形の用語は、複数形を含むものとし、複数形の用語は、単数形を含むものとする。
【００２４】
一般に、本明細書に記述される、細胞および組織培養物、分子生物学、ならびにタンパク質化学およびオリゴ化学またはポリヌクレオチド化学ならびにハイブリダイゼーション関連して使用される用語、ならびにそれらの技術は、当分野に公知であり、一般に使用されているものである。組み換えＤＮＡ、オリゴヌクレオチド合成、ならびに組織培養および形質転換（たとえば、エレクトロポレーション、リポフェクション）に対し、標準的な技術が用いられる。酵素反応、精製、および分析技術は、メーカーの仕様書もしくはサービス業者の仕様書に従い、または当分野ににおいて通常達成されるように、または本明細書に記述されているように、実施される。前述の技術および手順は、概して、当分野に良く知られ、本明細書全体を通じて引用および考察される様々な一般およびより具体的な参考文献に記述される従来法に従って、実施される。たとえば、Sambrook  et  al.,  Molecular  Cloning:  A  Laboratory  Manual  (2d  ed.,  Cold  Spring  Harbor  Laboratory  Press,  Cold  Spring  Harbor,  N.Y.  (1989))（参照により本明細書に援用される）を参照のこと。本明細書に記述される、分析化学、有機合成化学ならびに医科学および薬化学に関連して用いられる用語、ならびにそれらの検査法および実験技術は、当分野に公知であり、一般的に用いられているものである。化学合成、化学分析、医薬品の調製、製剤および送達、ならびに患者の治療のために、標準法が用いられている。
【００２５】
標準的な慣例に従い、本明細書において、「一つの（ａ、ａｎ）」という用語は、別様に文脈上、または明確な言葉の用法が要求しない限り、「一つ以上（ｏｎｅ  ｏｒ  ｍｏｒｅ）」を意味する。
【００２６】
本開示において、「または」という用語は、別様に述べられない限り、「および／または」を意味する。多数従属項との関連での「または」の使用は、選択的に、一つより前の従属項または独立項へと戻ることを指す。さらに、「含むこと（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに他の形態（たとえば、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅ）」および「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」）は、限定的なものではない。また、「要素（ｅｌｅｍｅｎｔ）」または「成分（ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）」等の用語は、別様に具体的に明言されない限り、一つより多い副次単位を含有する一単位および要素および成分を含有する要素および成分の両方を包含する。
【００２７】
本明細書において、「特異的結合剤」という用語は、標的に特異的に結合する天然または非天然分子を指す。特異的結合剤の例としては、限定されないが、タンパク質、ペプチド、核酸、炭水化物、脂質および小分子化合物が挙げられる。ある特定の実施形態において、特異的結合剤は抗体であり、ヒト抗体、ヒト化抗体または他の形態の抗体（たとえば、キメラ抗体）であってもよい。他の実施形態において、特異的結合剤はペプチボディ（ｐｅｐｔｉｂｏｄｙ）である。ある特定の実施形態において、特異的結合剤は、抗原結合領域であり、それは必ずしもそうである必要はないが、抗体から誘導されるものであってもよい。
【００２８】
本明細書において、「ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質」という用語は、ＥＧＦｒポリペプチドの任意の部分に特異的に結合する特異的結合剤を指す。ある特定の実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤は、ＥＧＦｒポリペプチドに対する抗体であり、ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体の他の形態であってもよい。ある特定の実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤は、抗原結合領域であり、必ずしもそうである必要はないが、抗体から誘導されるものであってもよい。ある特定の実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤は、ＥＧＦｒに対する抗体である。ある特定の実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤は、Ｖｅｃｔｉｂｉｘ（登録商標）（パニツムマブ）およびその変異体および同等物である。他の例において、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤は、セツキシマブ（アービタックス（登録商標））、イレッサ（登録商標）（ゲフィチニブ）、タルセバ（登録商標）（エルロチニブ）、タイカーブ（登録商標）（ラパチニブ）、カプレルサ（Ｃａｐｒｅｌｓａ）（登録商標）（バンデタニブ）、ザルツムマブ（ＧｅｎＭａｂ）、ニモツズマブ（ＹＭ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、および、マツズマブ（Ｍｅｒｃｋ  Ｓｅｒｏｎｏ／Ｔａｋｅｄａ）、アファチニブ（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ−Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ）、ネラチニブ（Ｐｆｉｚｅｒ）、カネルチニブ（ＰＤ１８３８０５、Ｐｆｉｚｅｒ）、ＡＰ２６１１３（Ａｒｉａｄ）、ＡＥＥ７８８（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＢＭＳ−５９９６２６（ＡＣ４８０、Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ  Ｓｑｕｉｂｂ）、ＸＬ−６４７（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ）、たとえばジャガイモカルボキシペプチダーゼ阻害剤（ＰＣＩ）等の天然ＥＧＦｒ阻害剤、ならびにこれら分子の任意の変異体および同等物である。ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質には、ＥＧＦｒおよび少なくとも一つの付加的な所望される標的への特異性を有する二重阻害剤（たとえば、本明細書に列挙されるもの）が含まれても良いことが認識される。
【００２９】
本明細書において、「特異的に結合する」という用語は、非標的への結合よりも大きな親和性と共に、標的に結合する特異的結合剤の能力を指す。ある特定の実施形態において、特異的結合とは、非標的に対する親和性より少なくとも１０、５０、１００、２５０、５００、または１０００倍大きい親和性で標的に結合することを指す。ある特定の実施形態において、親和性は親和性ＥＬＩＳＡ分析により測定される。ある特定の実施形態において、親和性はＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）分析により測定される。ある特定の実施形態において、親和性は反応速度論的方法により測定される。ある特定の実施形態において、親和性は平衡／溶液法により測定される。ある特定の実施形態において、抗体は、その抗体および一つ以上のその認識エピトープとの間の解離定数が１μＭ以下、好ましくは１００ｎＭ以下、およびもっとも好ましくは１０ｎＭ以下の際に、抗原に特異的に結合すると言われる。
【００３０】
本明細書において、「抗体」とは、完全抗体、および標的への特異的結合について完全抗体と競合する、その抗原結合断片の両方を指す。「その抗原結合断片」とは、抗体に関する文脈において用いられた場合、抗原結合機能を保有している完全抗体分子の部分または断片を意味する。結合断片は、組換えＤＮＡ技術により、または、たとえばパパインでの開裂等の天然抗体の酵素的もしくは化学的開裂により産生することができる。結合断片としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ´、Ｆ（ａｂ´）２、Ｆｖ、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）、Ｆｄ´、Ｆｄ断片、および抗体の可変領域を含有する断片が挙げられる。モノクローナル抗体から様々な断片を作製する方法は当分野の当業者に公知である（たとえば、Pluckthun,  (1992)  Immunol.  Rev.  130:151-188を参照のこと）。本開示に関連し、抗体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでの競合結合分析で測定された際に、少なくとも約２０％、４０％、６０％または８０％、より好ましくは少なくとも約８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％で、過剰量の抗体が、対抗受容体へ結合される受容体の量を減少させる時、「対抗受容体への受容体接着（たとえば、ＥＧＦｒへのＥＧＦ）を実質的に阻害するもの」とされる。
【００３１】
「単離された」抗体またはＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質は、抗体、または、合成された環境（たとえば、ＣＨＯ細胞）の成分から単離および／または回収され、特定されたＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質である。合成された環境の混合成分には、抗体を用いる診断または治療に干渉しうる物質を含み、酵素、ホルモン、および他のタンパク質性の溶質または非タンパク質性の溶質を含み得る。好ましい実施形態において、抗体は、（１）Ｌｏｗｒｙ法、およびスピニングカップシーケネーター（ｓｐｉｎｎｉｎｇ  ｃｕｐ  ｓｅｑｕｅｎａｔｏｒ）の使用による末端または内部アミノ酸のシークエンシングにより測定して、抗体の９５重量％超まで精製され、または、（２）クマシーブルー染色もしくは好ましくは銀染色を用いた、還元条件下または非還元条件下で、ＳＤＳ−ＰＡＧＥによる均質性にまで精製される。少なくとも一つの抗体の天然環境成分が存在しないため、単離抗体には、組換え細胞内でのｉｎ  ｓｉｔｕの抗体が含まれる。必ずしもそうとは限らないが、通常、単離された抗体は、少なくとも一つの精製ステップにより調製される。
【００３２】
抗体の「Ｆｖ」または「Ｆｖ断片」（ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含む）は、完全抗原認識部位および結合部位を含有する抗体の最小断片である。二鎖Ｆｖ類では、この領域は、密接な、非共有結合性会合での、一つの重鎖および一つの軽鎖可変ドメインの二量体が含有される。単鎖Ｆｖ類では、軽鎖および重鎖が二鎖Ｆｖ類でのものと類似の「二量体の」構造で結び付けられるような、可塑性のあるペプチドリンカーにより、一つの重鎖および一つの軽鎖可変ドメインが、共有結合性に結合され得る。それは、各可変領域の３つのＣＤＲが、ＶＨ−ＶＬ二量体の表面上の抗原結合部位を定義づけるように相互作用するこの構造にある。まとめると、６つのＣＤＲが、抗体の抗原結合特異性を付与する。しかしながら、単一の可変ドメイン（または抗原特異的な３つのＣＤＲのみを含有するＦｖの半分）でさえ、結合部位全体よりは低い親和性ではあるが、抗原を認識し、結合する能力を有する。
【００３３】
抗体の「超可変領域」という用語（ＥＧＦｒポリペプチドに対し特異的に結合する物質を含む）は、抗原結合に関与する抗体のアミノ酸残基を意味する。超可変領域は通常、「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」由来のアミノ酸残基（たとえば、Ｋａｂａｔら（Sequences  of  Proteins  of  Immunological  Interest,  5th  Ed.  Public  Health  Service,  National  Institutes  of  Health,  Bethesda,  MD.  (1991)）により定義される、軽鎖可変ドメインの２４−３４（Ｌ１）、５０−６２（Ｌ２）、および８９−９７（Ｌ３）、および重鎖可変ドメインの３１−５５（Ｈ１）、５０−６５（Ｈ２）、および９５−１０２（Ｈ３）の残基）、および／または、超可変ループ由来のアミノ酸残基（たとえば、Ｃｈｏｔｈｉａ＆Ｌｅｓｋ（J.  Mol.  Biol  196:901-917  (1987)）により定義される、軽鎖可変ドメインの２６−３２（Ｌ１）、５０−５２（Ｌ２）、および９１−９６（Ｌ３）、および重鎖可変ドメインの２６−３２（Ｈ１）、５３−５５（Ｈ２）、および９６−１０１（Ｈ３））を含有する。「フレームワーク領域」または「ＦＲ」残基は、本明細書で定義される超可変領域以外の、可変ドメイン残基である。ＣＤＲおよび超可変ループを定義するとして列記される残基は、Ｋａｂａｔら、およびＣｈｏｔｈｉａ＆Ｌｅｓｋの付番方式を用いて、上述のように提示され、ＣＤＲおよび様々な他の抗体の特性を定義づけるために、これらおよび他の方式（たとえば、ＡＨｏ方式、Honegger  &  Pluckthun,  (2001)  J.  Mol.  Biol.  309:657-70）を、相互交換可能に用いることができる。
【００３４】
「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」という用語は、本明細書において用いられる場合、特定のリガンドとの接触、およびその特異性を決定する抗体（ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含む）の部分を指す。抗体のＣＤＲは、タンパク質のもっとも変化する部分であり、抗体に多様性を与え、抗体の可変ドメインの遠位末端で６つのループ上にあり、３つのループは抗体の２つの可変ドメインそれぞれに由来する。
【００３５】
「エピトープ」という用語には、イムノグロブリンおよび／またはＴ細胞受容体に特異的に結合することができる任意のタンパク質決定基が含まれる。エピトープの決定基は、通常、たとえばアミノ酸または糖鎖等の分子の化学的に活性な表面集団からなり、多くの場合、特定の３次元構造特性ならびに特定の電荷特性を有する。
【００３６】
「物質」という用語は、本明細書において、化学的な化合物、化学的な化合物の混合物、生物学的な高分子（たとえば、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する抗体または他の物質等）または、生物学的材料から作製された抽出物を表すために用いられる。
【００３７】
本明細書において、「標識」または「標識された」という用語は、検出可能なマーカー（たとえば、放射性標識アミノ酸の取り込みにより、または、標識アビジンにより検出することができるビオチニル部分（たとえば、光学法または比色法により検出することができる蛍光マーカーまたは酵素活性を有するストレプトアビジン）のポリペプチドの付加により、または、試験されるマーカー（たとえば、ｐ１６ＩＮＫ４Ａ）に対する特異的な抗体の付着により、検出可能であるマーカー）の取り込みを指す。ある特定の場合において、標識またはマーカーはまた、治療剤であっても良い。様々なポリペプチド標識法および糖タンパク質標識法が当分野に公知であり、用いられても良い。ポリペプチドの標識の例としては、限定されないが、以下が挙げられる：放射性同位体または放射性核種（たとえば、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、３５Ｓ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎ、１２５Ｉ、１３１Ｉ）、蛍光標識（たとえば、ＦＩＴＣ、ローダミン、ランタニド、蛍光物質）、酵素標識（たとえば、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ）、化学発光基、ビオチニル基、および第二のレポーターにより認識される所定のポリペプチドエピトープ（たとえば、ロイシンジッパー対配列、２次抗体に対する結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ）。いくつかの実施形態において、標識は、潜在的な立体障害を低下させるために様々な長さのスペーサーアームにより付着される。
【００３８】
本明細書において、「薬学的な物質または薬物」という用語は、患者に適切に投与された際に治療効果（好ましくは、望ましい治療効果）を誘導することができる化学的な化合物または組成物を指す。本明細書において、他の化学的な用語は、The  McGraw-Hill  Dictionary  of  Chemical  Terms（Parker,  S.,  Ed.,  McGraw-Hill,  San  Francisco  (1985))、参照により本明細書に援用される）により例示されるような、当分野における従来的な用法に従う。
【００３９】
本明細書において、「抗新生物剤」という用語は、ヒトにおける新生物、特に悪性（癌性）病変部位（たとえば、癌腫、肉腫、リンパ腫または白血病）の発生または進行を阻害する機能的な性質を有する物質を指すために用いられる。転移抑制が、抗新生物剤の特性であることが多い。ある特定の実施形態において、抗新生物剤は、パニツムマブである。
【００４０】
本明細書において用いられる「実質的に純粋な」とは、対象の種類が、主要な存在する種類であり（すなわち、モル基準で、組成物中の任意の他の個々の種類よりも、より豊富であること）、好ましくは、実質的に純粋な分画が、存在するすべての高分子種類の中で、対象の種類が少なくとも（モル基準で）約５０％を構成する組成物であることを意味する。一般的に、実質的に純粋な組成物は、その組成物中に存在する全ての高分子種類の約８０％超、より好ましくは、約８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％を構成する。最も好ましくは、対象の種類が、本質的に均質（従来的な検出法で組成物中の混合種類が検出できない）にまで精製され、組成物は、本質的に単一の高分子種類からなる。
【００４１】
本明細書において、「患者」という用語には、ヒトおよび動物の対象が含まれる。
【００４２】
治療の目的に対し、「哺乳類」および「動物」という用語は、哺乳類に分類される任意の動物（ヒト、家畜、および動物園動物、競技用動物または愛玩動物（たとえば、イヌ、ウマ、ネコ、ウシ等））を指す。好ましくは、哺乳類はヒトである。
【００４３】
「疾患状態」という用語は、細胞機能もしくは身体機能、細胞システムもしくは身体システム、または器官の、遮断、停止、または障害が発生している、細胞の生理学的な状態、または哺乳類全体の生理学的な状態を指す。
【００４４】
「治療する」または「治療」という用語は、治療的処置および予防的手段の両方を指し、目的は、たとえば癌の発症または拡散等の望ましくない生理学的な変化もしくは障害を防止または減速（減少）することである。本発明の目的のために、有益なまたは所望される臨床結果とは、限定されないが、検出可能または検出不可能のいずれにかかわらず、症状の緩和、疾患の度合いの縮小、疾患状態の安定化（すなわち、悪化しない）、疾患進行の遅延または減速、疾患状態の改善または緩和、および、寛解（部分的または完全のいずれも）が挙げられる。「治療」はまた、治療を受けなかった場合に予期される生存期間と比較して、生存期間が延長することを意味し得る。治療を必要とするものには、疾患または障害を既に有するもの、ならびに疾患または障害を有する傾向があるもの、または疾患または障害を予防すべきものが含まれる。
【００４５】
本明細書において、「反応性の」という用語は、ＲＥＣＩＳＴ（Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  Ｃｒｉｔｅｒｉａ  ｉｎ  Ｓｏｌｉｄ  Ｔｕｍｏｒｓ）スケジュールに従い、物質の投与の後に反応性を示す患者または腫瘍を意味する。反応性は、完全反応であってもよく、または部分反応であってもよい。「非反応性の」という用語は、本明細書において、ＲＥＣＩＳＴに従い、物質の投与の後にも疾患の安定または疾患の進行を示す患者または腫瘍を意味する。ＲＥＣＩＳＴは、たとえば、Therasse  et  al.,  (2000)  J.  Natl.  Cancer  Inst.  92(3):  205-216（参照により本明細書にその全体が援用される）に記述されている。例示的な物質としては、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤（限定されないが、ＥＧＦｒに特異的に結合する抗体が含まれる）が挙げられる。
【００４６】
「障害」は、一つ以上の治療から利益を得る任意の状態である。これには、問題となっている障害に哺乳類を罹りやすくさせる病理学的な状態を含む、慢性障害および急性障害、または、慢性疾患および急性疾患が含まれる。本明細書において、治療される障害の非限定的な例示としては、良性腫瘍および悪性腫瘍、白血病、ならびにリンパ性悪性疾患が挙げられる。本発明に基づいて治療される好ましい障害は、悪性腫瘍（口腔腫瘍、咽頭腫瘍、喉頭腫瘍または下咽頭腫瘍）である。
【００４７】
「ＥＧＦｒポリペプチドに関連した疾患または状態」には、以下の一つ以上が含まれる：ＥＧＦｒポリペプチドにより引き起こされる疾患または状態；ＥＧＦｒポリペプチドが一因となっている疾患または状態；および、ＥＧＦｒポリペプチドの存在に関連する疾患または状態。ある特定の実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに関連した疾患または状態は、癌である。例示的な癌としては、限定されないが、口腔腫瘍、咽頭腫瘍、喉頭腫瘍、または下咽頭腫瘍が挙げられる。
【００４８】
「組み合わせ療法」において、患者は、化学療法剤もしくは抗新生物剤および／または放射線治療と組み合わせて、標的抗原に対する特異的結合剤で治療される。ある特定の実施形態において、特異的結合剤はパニツムマブである。プロトコールデザインは、腫瘍質量の減少により評価される有効性、ならびに標準的な化学療法の常用量を減少させる能力を検討する。用量に関連した化学療法剤の毒性を減少させることによって、これら投薬量の減少は、さらなる治療および／または治療の延長を可能とする。
【００４９】
「単剤療法（Ｍｏｎｏｔｈｅｒａｐｙ）」とは、化学療法剤または抗新生物剤の併用を伴わずに、患者に免疫療法を投与することにより、疾患を治療することを指す。ある特定の実施形態において、単剤療法には、化学療法剤もしくは抗新生物剤および／または放射線療法を行わずにパニツムマブを投与することが含有される。
【００５０】
本明細書において、「ＨＰＶ陽性」という用語は、ｐ１６ＩＮＫ４Ａに特異的に結合するモノクローナル抗体試薬を含有するＩＨＣアッセイにおいて、ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者から採取された試料中の１０％以上の腫瘍細胞が、均一に染色されることを意味する。たとえば、Klussmann  ら(2003)、および、Belgum  ら  (2005)を参照のこと。特定の実施形態の背景において、その用語は、ドイツ、ハイデルベルグのｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓにより作製、販売されているＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットにより測定された、患者から採取されたホルマリン固定パラフィン包埋（ＦＦＰＥ）試料において、．１０パーセント陽性で均質に染色されるスコアを意味する。他の様々なＨＰＶ検出キットが市販されており、当業者により認識されている。
【００５１】
本明細書において、「ＨＰＶ陰性」という用語は、ｐ１６ＩＮＫ４Ａに特異的に結合する試薬を含有するＩＨＣアッセイにおいて、ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者から採取された試料中の１０％未満のＨＮＳＣＣ腫瘍細胞が、まれに限局性染色を示す、またはびまん性染色を示すことを意味する。特定の実施形態において、その用語は、ドイツ、ハイデルベルグのｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓにより作製、販売されているＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットにより測定された、患者から採取された試料において、１０％未満が染色されることを意味する。
【００５２】
本明細書において、「ＨＮＳＣＣ腫瘍」という用語は、頭頸部領域に起源する、扁平上皮細胞腫瘍または類基底腫瘍を意味し、鼻腔、副鼻腔、唇、口および口腔、唾液腺、咽頭または喉頭の腫瘍を含む。
【００５３】
本明細書において、「ＥＧＦｒポリペプチド」という用語は、１７０ｋＤａの膜貫通細胞表面糖タンパク質を含有する、ポリペプチド、またはその変異体を意味し、ＥＧＦｒの自己リン酸化および内在化（それらは、最終的には細胞増殖に至る）を含む、細胞生化学的事象のカスケードを引き起こす（Ullrich  et  al.,  Cell  61:203-212,  1990）。
【００５４】
本明細書において、「ｐ１６ＩＮＫ４Ａ」という用語は、Ｇｅｎｂａｎｋ受け入れ番号（ＧＩ）：４５０２７４９のアミノ酸配列を含有するポリペプチド、またはその変異体を意味する。
【００５５】
本明細書において、「癌」という用語は、望ましくない細胞増殖に起因する疾患を意味し、望ましくない腫瘍の存在により特徴付けられる。「癌」という用語には、望ましくない細胞増殖が腫瘍を形成する状態、ならびに、腫瘍が無いまたは未だ発生していない望ましくない細胞増殖の状態を包含することに注意されたい。その用語は、具体的には、良性および悪性腫瘍、白血病、ならびにリンパ性悪性疾患を含み、特に、乳癌、直腸癌、卵巣癌、胃癌、子宮内膜癌、唾液腺癌、腎癌、大腸癌、甲状腺癌、膵臓癌、前立腺癌または膀胱癌を含む。ある特定の実施形態において、癌は、ＥＧＦｒポリペプチドにより引き起こされた疾患もしくは状態であり、ならびに／または、ＥＧＦｒポリペプチドが一因となっている疾患もしくは状態であり、ならびに／または、ＥＧＦｒポリペプチドの存在に関連する疾患または状態である。ある実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに関連する疾患または状態は癌であり、たとえば、非小細胞性肺癌、乳癌、大腸癌、直腸癌、胃癌、脳腫瘍、膀胱癌、頭頸部癌、卵巣癌、前立腺癌、またはＨＮＳＣＣ腫瘍（たとえば、喉頭腫瘍、中咽頭腫瘍、咽頭腫瘍または口腔腫瘍等）である。
【００５６】
最初の考慮事項
本明細書において、腫瘍を有する患者を目的とする方法、および、特定の態様において、ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者、特に局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者を目的とする方法が提示される。そのような腫瘍としては、口腔咽頭腫瘍、喉頭腫瘍、口腔腫瘍、および下咽頭腫瘍が挙げられる。そのような腫瘍は、日常的に、腫瘍分野の実践者（たとえば、医師、腫瘍内科医、組織病理学者および腫瘍科の臨床医等）により特定されている。これらの腫瘍型の発生は、多くの場合、喫煙、特に巻きたばこの喫煙と関連しているが、本開示方法においては、患者が喫煙していたことは必要条件ではなく、ゆえに、ＨＰＶ陰性である腫瘍（たとえば、ＨＮＳＣＣ腫瘍）を有する任意の患者が、本開示方法により利益を得る可能性がある。患者の腫瘍病期についても必須条件ではなく、腫瘍は、たとえばＴ２、Ｔ３またはＴ４等の増殖の任意の病期にあってもよい。腫瘍はまた、たとえばＮ０、Ｎ１、Ｎ２ａ、Ｎ２ｂ、Ｎ２ｃまたはＮ３等の任意のリンパ節病期にあってもよい。さらに、腫瘍は、たとえばＡＪＣＣシステムまたはＴＮＭ病期分類システム等の任意のシステムにより、そのように病期分類されることができる。
【００５７】
本明細書において記述されるように、「患者」という用語は、腫瘍を有する患部を有する任意の生物を指し、特定の態様において、局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者を指す。好ましくは、患者は哺乳類であり、より好ましくは、患者はヒトである。「患者」という用語に年齢制限は無く、ゆえに、患者は、任意の年齢の成人男性もしくは成人女性、または、幼児を含む男子もしくは女子であってもよい。さらに、患者は任意の人種であってもよい。
【００５８】
本開示方法はまた、そのような患者を、ＥＧＦ受容体ポリペプチドに特異的に結合する物質で治療する処置に関する。ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質という条件で、任意のタイプの物質を用いることができる。そのような物質は、生物製剤であってもよく、多くの物質がそのような腫瘍を目的とした治療計画において普遍的に用いられている。そのような物質の非限定的なリストには、パニツムマブ（Ｖｅｃｔｉｂｉｘ）（登録商標））、セツキシマブ（アービタックス（登録商標））、イレッサ（登録商標）（ゲフィチニブ）、タルセバ（登録商標）（エルロチニブ）、タイカーブ（登録商標）（ラパチニブ）、カプレルサ（Ｃａｐｒｅｌｓａ）（登録商標）（バンデタニブ）、ザルツムマブ（ＧｅｎＭａｂ）、ニモツズマブ（ＹＭ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、および、マツズマブ（Ｍｅｒｃｋ  Ｓｅｒｏｎｏ／Ｔａｋｅｄａ）、アファチニブ（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ−Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ）、ネラチニブ（Ｐｆｉｚｅｒ）、カネルチニブ（ＰＤ１８３８０５、Ｐｆｉｚｅｒ）、ＡＰ２６１１３（Ａｒｉａｄ）、ＡＥＥ７８８（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＢＭＳ−５９９６２６（ＡＣ４８０、Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ  Ｓｑｕｉｂｂ）、ＸＬ−６４７（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ）、たとえばジャガイモカルボキシペプチダーゼ阻害剤（ＰＣＩ）等の天然ＥＧＦｒ阻害剤が含まれる。
【００５９】
ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤での治療に対する反応性または非反応性は、任意の確立された基準を用いて測定することができる。特定の例において、反応性または非反応性は、広く採用されているＲＥＣＩＳＴ（Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  Ｃｒｉｔｅｒｉａ  ｉｎ  Ｓｏｌｉｄ  Ｔｕｍｏｒｓ）基準を用いて測定することができる。たとえば、上述の、Therasseら（任意の目的に対し、本明細書に参照により援用される）を参照のこと。ＲＥＣＩＳＴに従う、完全反応および部分的反応は、両方とも、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤を用いる治療に対し、反応性があるものとみなされる。安定性疾患および進行性疾患は、両方とも、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤を用いる治療に対し、非反応性であるものとみなされる。
【００６０】
本開示方法のすべては、所望されるように補完されることができる。たとば、本開示方法は、任意選択的に、付加的に、腫瘍を有する患部を有する患者の反応性の測定実施を含有することができ、そして特定の態様において、局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者の、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含む治療への反応性の測定実施を含有することができる。そのような測定は、本明細書に記述されるように、ＲＥＣＩＳＴ基準を用いて行うことができる。
【００６１】
他の態様において、本開示方法は、本方法の結果の評価に基づき、腫瘍を有する患部を有する患者の治療を調節することにより、補完することができ、そして特定の態様において、局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者の治療を調節することにより、補完することができる。一つの実施形態において、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する治療を受けていない患者に、その患者の腫瘍がＨＰＶ陰性であることが確立されたことに基づき、そのような治療計画を施すことができる。一つの実施形態において、治療は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質（たとえば、Ｖｅｃｔｉｂｉｘ（登録商標））を、６ｍｇ／ｋｇで、１４日毎に、静脈内注射として、投与される物質の量に基づき、６０分または９０分にわたり、投与することを含むことができる。
【００６２】
さらに他の態様において、腫瘍のＨＰＶステータスの状態の評価に基づき、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する剤を含有する治療を受けている、腫瘍を有する患部を有する患者、特定の態様においては、局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者は、患者の現在の治療計画に加えて、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質の治療を含有する治療剤の投与計画から、利益を得る。
【００６３】
ＨＮＳＣＣ腫瘍には異なる形態があり、それらは多くの場合、口腔咽頭腫瘍、喉頭腫瘍、口腔腫瘍、および下咽頭腫瘍を含み、これら腫瘍が発生する上部気道消化管内の部位により分類される。本明細書において、「ＨＮＳＣＣ腫瘍」という用語には、腫瘍のこれらの型のすべてが包含される。このことは、ケルチニン化（ｋｅｒｔｉｎｉｎｚｉｎｇ）形態、混合形態、非ケルチニン化形態の変異体を含む。ゆえに、局所進行性または再発転移性ＨＮＳＣＣが陽性または陰性であるかどうかを測定する際、その測定は、局所進行性または再発転移性ＨＮＳＣＣ腫瘍の任意の型で実施することができる。
【００６４】
腫瘍（たとえば、ＨＮＳＣＣ腫瘍）を有する患者が、ＥＧＦｒポリペプチドに対する特異的結合剤を含有する治療から利益を得られるかどうかを予測する方法。
【００６５】
タンパク質ｐ１６ｉｎｋ４Ａの発現上昇により特徴付けられるＨＮＳＣＣのＨＰＶ感染が、局所進行性ＮＨＳＣＣにおける可能性のある予測マーカーとして特定されている（たとえば、Ang  et  al.,  (2010)  N.  Engl.  J.  Med.  363:24-35を参照のこと）。しかしながら、本開示まで、ＨＰＶは、特に、ＥＧＦｒ阻害剤をベースとした治療の領域における、治療反応性予測の役割を果たすとはみなされていなかった。ゆえに、本開示の一つの態様において、腫瘍を有する患者、特定の態様においては、ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者が、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する治療から利益を得られるかどうかを予測する方法が開示される。一つの実施形態において、当該方法は、患者の腫瘍がＨＰＶ陽性またはＨＰＶ陰性であるかどうかを判定することを含み、その患者の腫瘍がＨＰＶ陰性であった場合、その患者は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を伴う治療から利益を得ると予測される。
【００６６】
最初に、患者の腫瘍がＨＰＶ陽性またはＨＰＶ陰性であることが判定される。判定のために、任意の都合の良い方法を用いることができる。たとえば、ＩＨＣ、ＦＩＳＨ、ｑＰＣＲまたは質量分析法を基にした手法といった多様な技術を用いることができる。ほとんどの場合、患者の腫瘍の試料を採取し、たとえばホルマリン固定パラフィン包埋（ＦＦＰＥ）試料を用いる検証のための試料調整の後、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのセッティングで測定を実施する必要がある。
【００６７】
本開示方法の様々な実施形態において、患者の腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、またはＨＰＶ陰性であるかの判定は、腫瘍に関連するＨＰＶマーカーの任意の一つまたは組み合わせの評価に基づき実施することができる。一つの特にな有用マーカーは、ｐ１６ＩＮＫ４Ａである。このマーカーは、ＨＰＶの存在を示唆するものであり、様々な手法を用いて容易に検出することができる。ＨＰＶの存在または非存在を示唆するために使用できる他のマーカーとしては、ＨＰＶ  Ｅ７が挙げられる。
【００６８】
一つの特定の実施形態において、ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在を用いて、患者の腫瘍がＨＰＶ陽性または陰性であるかどうかを判定することができる。もし患者がｐ１６ＩＮＫ４Ａを発現していた場合、その患者は、ＨＰＶ陽性であると指定され、もし患者がｐ１６ＩＮＫ４Ａを発現していなかった場合、その患者は、ＨＰＶ陰性であると指定される。ｐ１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在は、市販のキットまたは、必要な特異性を有するモノクローナル抗体もしくはポリクローナル抗体を用いて容易に判定することができる。たとえば、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキット（ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ，  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，  Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、Ｐ１６ＩＮＫ４Ａを特定することができる。ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットは、子宮頸癌との関連でｐ１６ＩＮＫ４Ａの検出のために設計され、標識されたＩＨＣキットである。そのようなキットを用いた場合、単独の実験室によるＨＮＳＣＣ腫瘍での使用について検証を行うことができる。あるいは、患者腫瘍の試料を、ＩＨＣ分析を実施し、結果を報告することができる業者に供給することができる。さらに他の例において、抗ｐ１６ＩＮＫ４Ａ抗体を作製し、ＩＨＣ法の構成要素として用いることができる。
【００６９】
ｐ１６ＩＮＫ４Ａタンパク質のパターンおよび分布に基づく、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、陰性であるかの判定は、スコアリングガイドラインに基づいて実施することができる。ガイドラインは、定量、半定量または定性的であってもよい。一つの例において、ｐ１６ＩＮＫ４Ａがマーカーとして用いられ、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットを用いてマーカーの存在が判定される場合、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ（ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）ｐ１６ＩＮＫ４Ａ  Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ、Ｔｒｕｎｋ  ｅｔ  ａｌ．、ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ、Ｈｅｉｄｌｅｂｅｒｇ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、ＨＰＶ陽性およびＨＰＶ陰性腫瘍を特定することができる。あるいは、スコアリングガイドラインのセットを、ＨＰＶ遺伝子Ｅ６およびＥ７から転写されたｍＲＮＡ発現に対する分子プローブまたは従来的な組織学的手法により評価されたＳＣＣＨＮの参照集団において観察される、ｐ１６ｉｎｋ４ａ染色パターンを用いて確立することができる。
【００７０】
実施例において示されるデータにより明らかにされたように、腫瘍がＨＰＶ陰性であり、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する治療を受けた患者は、無進行生存期間および全生存期間の延長を示した。ゆえに、患者の腫瘍（たとえば、ＨＮＳＣＣ腫瘍）がＨＰＶ陰性であれば、患者は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を伴う治療から利益を得ることができると予測される。
【００７１】
たとえばＨＮＳＣＣ腫瘍等の、腫瘍を有する患者の全生存期間の延長方法
【００７２】
本明細書に提示される実施例において示されるデータにより明らかにされたように、腫瘍がＨＰＶ陰性であり、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する薬剤を含有する治療を受けた患者は、全生存期間ならびに無進行生存期間の延長を示した。ゆえに、本開示の他の態様において、腫瘍を有する患者の全生存期間の延長方法、および特定の態様においては、局所進行性ＨＮＳＣＣまたは再発腫瘍または転移腫瘍を有する患者の全生存期間の延長方法が提示される。一つの実施形態において、当該方法は、患者腫瘍がＨＰＶ陽性またはＨＰＶ陰性であるかどうかを判定すること、および、もし患者腫瘍がＨＰＶ陰性である場合、患者にＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を投与することを含み、これにより、患者の全生存期間および／または無進行生存期間は延長される。
【００７３】
当該方法を実施する場合、患者の腫瘍状態が、ＨＰＶ陽性またはＨＰＶ陰性であることが判定される。本開示方法のすべてと同様、測定実施のために、任意の都合の良い当業者公知の方法を用いることができる。たとえば、ＩＨＣ、ＦＩＳＨ、ｑＰＣＲまたは質量分析法を基にした手法といった多様な技術を用いることができる。ほとんどの場合、患者腫瘍の試料を得て、ｉｎ  ｖｉｔｒｏの設定で判定を実施することが望ましい。
【００７４】
本開示方法の様々な実施形態において、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるかＨＰＶ陰性であるかの判定は、腫瘍に関連するＨＰＶマーカーの任意の一つ、または組み合わせの評価に基づき、実施することができる。一つの特に有用なマーカーは、１６ｉｎｋ４ａである。このマーカーは、ＨＰＶの存在、およびウイルス性癌遺伝子Ｅ６およびＥ７と記述される２つの発現の指標であり、様々な手法を用いて容易に検出できる。ＨＰＶの存在または非存在を示すために用いることができる他のマーカーとしては、ＨＰＶ  Ｅ７が挙げられる。
【００７５】
一つの特定の実施形態において、１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在を用いて、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、または陰性であるかを判定することができる。もし患者が、腫瘍細胞の識別に要求される染色度合および分布で１６ＩＮＫ４Ａを発現している場合、その患者はＨＰＶ陽性であると指定され、もし患者が１６ＩＮＫ４Ａを発現していない場合、その患者はＨＰＶ陰性であると指定される。１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在は、市販のキットまたはサービス業者を用いて容易に判定することができる。たとえば、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキット（ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ，  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，  Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、Ｐ１６ＩＮＫ４Ａを特定することができる。ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットは、子宮頸癌との関連でｐ１６ＩＮＫ４Ａの検出のために設計され、標識されたＩＨＣキットである。そのようなキットを用いた場合、単独の実験室で、検証を行うことができる。あるいは、患者腫瘍の試料を、ＩＨＣ分析を実施し、結果を報告することができる業者に供給することができる。さらに他の例において、抗ｐ１６ＩＮＫ４Ａ抗体を作製し、ＩＨＣ法の構成要素として用いることができる。
【００７６】
患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、陰性であるかの決定は、スコアリングガイドラインに基づいて実施することができる。ガイドラインは、定量、半定量または定性的であってもよい。一つの例において、ｐ１６ＩＮＫ４Ａがマーカーとして用いられ、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットを用いてマーカーの存在が判定される場合、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ（ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）ｐ１６ＩＮＫ４Ａ  Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ、Ｔｒｕｎｋ  ｅｔ  ａｌ．、ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ、Ｈｅｉｄｌｅｂｅｒｇ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、ＨＰＶ陽性腫瘍およびＨＰＶ陰性腫瘍を特定することができる。あるいは、スコアリングガイドラインのセットは、従来的な組織学的手法を用いて確立することができる。
【００７７】
引き続き、もし腫瘍がＨＰＶ陰性である場合、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質が患者に投与される。本明細書において記述されるように、実施例で提示されるデータにより、患者の腫瘍がＨＰＶ陰性であり、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質が投与される場合、患者の全生存期間および／または無進行生存期間が延長されることが示されている。
【００７８】
たとえばＨＮＳＣＣ腫瘍等の腫瘍を有する患者群の階層化方法
【００７９】
実施例に示されるデータにより明らかであるように、腫瘍を有する患者、および特定の態様においてはＨＰＶ陰性の局所進行性または再発転移性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する治療から利益を得る。従って、ＨＰＶステータスを指標として使用して、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を伴う治療に対して、そのような患者を特定または階層化することが望ましいであろう。ゆえに、本開示の他の態様において、局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者群を、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する治療から利益を得る群、および、より利益を得る群に階層化する方法が開示される。
【００８０】
本方法を実施する際、患者の腫瘍状態が、ＨＰＶ陽性またはＨＰＶ陰性であると判定される。本開示方法のすべてと同様、判定を実施するために、任意の都合の良い方法を用いることができる。たとえば、ＩＨＣ、ＦＩＳＨ、ｑＰＣＲまたは質量分析に基にした手法といった多様な技術を用いることができる。ほとんどの場合、患者腫瘍の試料を得て、ｉｎ  ｖｉｔｒｏの設定で測定を実施することが望ましい。
【００８１】
様々な実施形態において、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるかＨＰＶ陰性であるかの判定は、腫瘍に関連するＨＰＶマーカーの任意の一つ、または組み合わせの評価に基づき、実施することができる。一つの特に有用なマーカーは、１６ＩＮＫ４Ａである。このマーカーは、ＨＰＶの存在の指標であり、様々な手法を用いて容易に検出できる。ＨＰＶの存在または非存在を示すために用いることができる他のマーカーとしては、ＨＰＶ  Ｅ７が挙げられる。
【００８２】
一つの特定の実施形態において、１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在を用いて、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、または陰性であるかを判定することができる。もし患者が、１６ＩＮＫ４Ａを発現している場合、その患者はＨＰＶ陽性であると指定され、もし患者が１６ＩＮＫ４Ａを発現していない場合、その患者はＨＰＶ陰性であると指定される。１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在は、市販のキットまたはサービス業者を用いて容易に判定することができる。たとえば、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキット（ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ，  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，  Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、Ｐ１６ＩＮＫ４Ａを特定することができる。ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットは、子宮頸癌との関連でｐ１６ＩＮＫ４Ａの検出のために設計されたＩＨＣキットである。そのようなキットを用いた場合、単独の実験室で、検証を行うことができる。あるいは、患者腫瘍の試料を、ＩＨＣ分析を実施し、結果を報告することができる業者に供給することができる。さらに他の例において、抗ｐ１６ＩＮＫ４Ａ抗体を作製し、ＩＨＣ法の構成要素として用いることができる。
【００８３】
患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、陰性であるかの判定は、スコアリングガイドラインに基づいて実施することができる。ガイドラインは、定量、半定量または定性的であってもよい。一つの例において、ｐ１６ＩＮＫ４Ａがマーカーとして用いられ、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットを用いてマーカーの存在が測定される場合、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ（ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）ｐ１６ＩＮＫ４Ａ  Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ、Ｔｒｕｎｋ  ｅｔ  ａｌ．、ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ、Ｈｅｉｄｌｅｂｅｒｇ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、ＨＰＶ陽性腫瘍およびＨＰＶ陰性腫瘍を特定することができる。あるいは、スコアリングガイドラインのセットは、従来的な組織学的手法を用いて確立することができる。
【００８４】
引き続き、腫瘍がＨＰＶ陰性である患者が、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する療法を伴う治療に対し選択される。これらの患者は、ＨＰＶ陽性の患者よりも、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を含有する療法において、より利益を得ることができることが期待される。腫瘍を有する患者群、および特定の態様においては、局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者群の階層化により、医療専門家は、患者の特定のニーズに対する療法を調整し、患者が治療に良く応答する可能性を高めることができる。
【００８５】
腫瘍（たとえば局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍）を有する患者の治療方法
【００８６】
本明細書および実施例に記述されるように、腫瘍を有する患者、および特定の態様においては、ＨＰＶ陰性の局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質と共に治療された場合、全生存期間および／または無進行生存期間の延長を示すことが見出されている。従って、そのような患者を治療する方法が提示される。局所進行性ＨＮＳＣＣ腫瘍を有する患者を治療する方法の一つの実施形態において、患者の腫瘍状態を、ＨＰＶ陽性である、またはＨＰＶ陰性であることを判定することが含まれる。本開示方法の全てと同様、判定のために、任意の都合の良い方法を用いることができる。たとえば、ＩＨＣ、ＦＩＳＨ、ｑＰＣＲまたは質量分析に基にした手法といった多様な技術を用いることができる。ほとんどの場合、患者腫瘍の試料を得て、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのセッティングで測定を実施することが望ましい。
【００８７】
様々な実施形態において、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、またはＨＰＶ陰性であるかの判定は、腫瘍と関連しているＨＰＶマーカーの任意の一つ、または組み合わせの評価を基にして実施することができる。一つの特に有用なマーカーは、１６ＩＮＫ４Ａである。このマーカーは、ＨＰＶの存在の指標であり、様々な手法を用いて容易に検出できる。ＨＰＶの存在または非存在を示すために用いることができる他のマーカーとしては、ＨＰＶ  Ｅ７が挙げられる。
【００８８】
一つの特定の実施形態において、１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在を用いて、患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、または陰性であるかを判定することができる。もし患者が、１６ＩＮＫ４Ａを発現している場合、その患者はＨＰＶ陽性であると指定され、もし患者が１６ＩＮＫ４Ａを発現していない場合、その患者はＨＰＶ陰性であると指定される。１６ＩＮＫ４Ａの存在または非存在は、市販のキットまたはサービス業者を用いて容易に判定することができる。たとえば、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキット（ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ，  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，  Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、Ｐ１６ＩＮＫ４Ａを特定することができる。ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットは、子宮頸癌との関連でｐ１６ＩＮＫ４Ａの検出のために設計されたＩＨＣキットである。あるいは、患者腫瘍の試料を、ＩＨＣ分析を実施し、結果を報告することができる業者に供給することができる。さらに他の例において、抗ｐ１６ＩＮＫ４Ａ抗体を作製し、ＩＨＣ法の構成要素として用いることができる。
【００８９】
患者腫瘍がＨＰＶ陽性であるか、陰性であるかの判定は、スコアリングガイドラインに基づいて実施することができる。ガイドラインは、定量、半定量または定性的であってもよい。一つの例において、ｐ１６ＩＮＫ４Ａがマーカーとして用いられ、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙキットを用いてマーカーの存在が判定される場合、ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ（ＣＩＮｔｅｃ（登録商標）ｐ１６ＩＮＫ４Ａ  Ｓｔａｉｎｉｎｇ  Ａｔｌａｓ、Ｔｒｕｎｋ  ｅｔ  ａｌ．、ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  ＡＧ、Ｈｅｉｄｌｅｂｅｒｇ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、ＨＰＶ陽性腫瘍およびＨＰＶ陰性腫瘍を特定することができる。あるいは、スコアリングガイドラインのセットを、従来的な組織学的手法を用いて確立することができる。
【００９０】
本方法に引き続き、もし患者の腫瘍がＨＰＶ陰性である場合、その患者はＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を投与される。本明細書に提示されるデータにおいて示されるように、ＨＰＶ陰性である腫瘍を有する患者は、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する物質を投与された場合、全生存期間および／または無進行生存期間の延長を示す。本開示方法を実施することにより、医療専門家は、この疾患に罹患している患者に対し、より効果的な治療計画を提供することができるようになる。
【００９１】
本方法はさらに、ＥＧＦｒポリペプチドに特異的に結合する特定の物質に有効であると知られている治療計画を含有する。たとえば、パニツムマブの場合においては、そのような治療計画は、以下を含有することができる。
実施例
【００９２】
実施した実験および成し得た結果を含む以下の実施例は、例証目的のみに提供されるものであり、特許請求の範囲を限定するものと解釈されない。開示された方法のさらなる実施形態は、本開示および以下の実施例を考慮すると、当業者には明白であろう。したがって、以下の実施例を含む本開示は、開示された方法の具体的ではあるが、非限定の実施形態を提供するものとみなされることが意図される。
【実施例１】
【００９３】
ＨＰＶ陽性／陰性ステータスの特定
試験に参加する対象のＨＰＶステータスを特定するために、ＨＮＳＣＣ腫瘍試料を、パニツムマブを含む、および含まない全身性の細胞傷害性化学療法に関するＨＮＳＣＣ臨床試験に参加した対象から採取した。臨床試験での６５７対象のうち、６７％または４１１対象により、少なくとも１０％の腫瘍細胞試料を含む評価可能な永久記録保存用のＦＦＰＥ腫瘍試料が得られた。
【００９４】
臨床試験に参加した患者の人口学的特徴および疾病特性を表１に要約する。
【００９５】
【表１】
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2014528066.tif 000003
【００９６】
病理評価および腫瘍マイクロアレイ作製のため、腫瘍標本を独立研究所に送った。頭頸部の扁平上皮癌のリーディングにかなりの経験をもつ一病理学者が、提出されたすべての試料毎に標準的なヘマトキシリン（hemotoxylin）・エオシンで染色した５μｍ組織片を調査した。病理学的評価には以下が含まれた：診断結果（ＨＮＳＣＣの有無）；標本型（腫瘍切除／リンパ節／転移（例えば肺、肝臓））；組織型（腺扁平上皮癌を含むＨＮＳＣＣ（ＮＯＳ）、対、乳頭、対、紡錘細胞（sarcomatoid）、対、類基底、対、その他；分化状態（高分化、中分化、低分化、未分化または検出不能）；腫瘍境界（浸潤性、対、pushing）；炎症応答；壊死（面皰壊死など）；および、適宜、他の所見。この分析の結果として、臨床試験での６５７対象のうち、６７％が、１０％超の残存腫瘍を有する試料を有することが判明した。各１ｍｍの１０８３コアを含む腫瘍マイクロアレイセットを、ＩＨＣ分析の標準化を進めるため、また、腫瘍組織と認められる複数のレプリカを得るために作製した。
【００９７】
市販のＣＩＮｔｅｃ（商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙ  ｋｉｔ（ｍｔｍ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ、  Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用して、ＨＰＶステータスを測定した。ＣＩＮｔｅｃ（商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙ  ｋｉｔは、ホルマリン固定されたパラフィン包理組織片での、過剰発現されたサイクリン依存性キナーゼ阻害因子、ｐ１６ＩＮＫ４Ａタンパク質の評価に関する半定量的な免疫細胞化学的分析である。ｐ１６ＩＮＫ４Ａタンパク質の有無は、試料がＨＰＶ陽性かまたはＨＰＶ陰性であることを示す。抗体クローンはＥ６Ｈ４である。市販のキットは、ＦＤＡ認可済で、子宮頸癌組織用に分類されている。
【００９８】
より詳細には、対象の腫瘍標本は、予め設定されたＩＨＣスコアリングガイドラインに準じ、陽性、陰性、判定不能に評点された。基本的には、一様なｐ１６ＩＮＫ４Ａタンパク質発現が腫瘍細胞で少なくとも１０％検出された場合、対象は、ＨＰＶ陽性腫瘍（ＨＰＶ＋）をもつと判定された。ｐ１６ＩＮＫ４Ａタンパク質が存在しなかった、または腫瘍細胞で１０％未満しか認められなかった場合、対象はＨＰＶ陰性腫瘍（ＨＰＶ−）をもつと判定された。
【００９９】
臨床試験で対象から採取した試料の分析を行う前に、ホルマリン固定されたパラフィン包理（ＦＦＰＥ）ＨＮＳＣＣ腫瘍標本でのＣＩＮｔｅｃ（商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙ  ｋｉｔの性能検証を、臨床検査室改善法（Clinical  Laboratory  Improvement  Amendments（ＣＬＩＡ））に準じて実施した。独立研究所（independent  testing  laboratory）が、ＣＩＮｔｅｃ（商標）Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙ  ｋｉｔの分析的検証をＨＮＳＣＣでの使用のために実施し、これにより検証パッケージが得られた。さらに、免疫組織化学的スコアリングガイドラインを策定し、試料検査中はこれを順守した。試料を、確認された分析結果に基づき、陽性または陰性に二分に評点した。
【０１００】
ＨＰＶの有無に関する試料解析により、表２に示すデータが得られた。
【０１０１】
【表２】
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【実施例２】
【０１０２】
全生存期間に対するパニツムマブ治療法でのＨＰＶステータスの効果
臨床試験でのＨＰＶ陽性およびＨＰＶ陰性対象の全生存期間について検討を行った。図１および図２は、試験結果を要約するＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ生存率曲線である。図１および図２の比較から、ＨＮＳＣＣ腫瘍がＨＰＶ陰性でありパニツムマブおよび化学療法剤により治療された対象は、ＨＮＳＣＣ腫瘍がＨＰＶ陽性であった対象より、全生存期間の増加（enhancement）が見られたことが示された。
【０１０３】
より具体的には、腫瘍がＨＰＶ陽性でありパニツムマブおよび化学療法剤により治療された対象は、全生存期間中央値は１０．９ヶ月を示したのに対して、腫瘍がＨＰＶ陰性でありパニツムマブおよび化学療法剤により治療された対象は、全生存期間中央値は１１．８ヶ月を示した。腫瘍がＨＰＶ陰性でありパニツムマブおよび化学療法剤により治療された対象は、化学療法剤単独の投与を受けた対象より、３．１ヶ月の全生存期間中央値の増加が見られたことも、留意されたい。
【０１０４】
全生存期間の独立予後因子を表３に要約する。
【０１０５】
【表３】
2014528066.tif 000005
【実施例３】
【０１０６】
無憎悪生存期間に対するパニツムマブ治療法でのＨＰＶステータスの効果
臨床試験でのＨＰＶ陽性およびＨＰＶ陰性対象の全生存期間について検討を行った。図３および図４は、試験結果を要約するＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ生存率曲線である。図３および図４の比較から、ＨＮＳＣＣ腫瘍がＨＰＶ陰性でありパニツムマブおよび化学療法剤により治療された対象は、ＨＮＳＣＣ腫瘍がＨＰＶ陽性であった対象より、無憎悪生存期間の増加（enhancement）が見られたことが示された。
【０１０７】
より具体的には、腫瘍がＨＰＶ陽性でかつパニツムマブおよび化学療法剤で治療された対象は、５．５ヶ月の無憎悪生存期間中央値を示したが、腫瘍がＨＰＶ陰性でかつパニツムマブおよび化学療法剤で治療した対象は、６．３ヶ月の全生存期間中央値を示した。腫瘍がＨＰＶ陰性でありパニツムマブおよび化学療法剤により治療された対象は、化学療法剤単独の投与を受けた対象より、１．２ヶ月の全生存期間中央値の増加が見られたことも、留意されたい。
【０１０８】
実施例１〜３の総括
ＨＰＶステータスが、臨床試験に参加した６５７対象のうち５７％で判定された。ＨＰＶステータスを判定したＨＮＳＣＣ対象の２１％が、ＨＰＶ陽性と認められることが判定された。本データにより、パニツムマブおよび化学療法剤による治療は、腫瘍がＨＰＶ陰性と判定された対象での全生存期間が、腫瘍がＨＰＶ陽性と判定された対象に比べて、平均０．９ヶ月改善したことが示される。本データにより、パニツムマブおよび化学療法剤による治療は、腫瘍がＨＰＶ陰性と判定された対象での無憎悪生存期間が、腫瘍がＨＰＶ陽性と判定された対象に比べて、平均０．８ヶ月改善したことが示される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【国際調査報告】
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