(57)【要約】  本明細書には、二重特異性抗体等のヘテロ多量体タンパク質の効率的な産生方法が記載されている。ヘテロ多量体タンパク質は、複数の標的分子又は単一の標的分子上の異なるエピトープに特異的に結合する能力を有することができる。これらの方法では、ヘテロ多量体タンパク質の構築を他に可能なものに比べて高収率及び高効率に改善するようにパラメータを調整する。また、半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドを含む組成物が記載されている。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ．第１の可溶化剤の存在下においてｐＨ５〜９で第１のヒンジ含有ポリペプチドを提供するステップであって、第１のヒンジ含有ポリペプチドがヘテロ多量体化ドメインを含むステップ、
ｂ．第２の可溶化剤の存在下においてｐＨ５〜９で第２のヒンジ含有ポリペプチドを提供するステップであって、第２のヒンジ含有ポリペプチドがヘテロ多量体化ドメインを含むステップ、
ｃ．還元条件下で第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して構築用混合物を形成するステップ、並びに
ｄ．構築用混合物をインキュベートして、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を産生するステップであって、ヘテロ多量体化ドメインで第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとが相互作用するステップ
を含む、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法。
【請求項２】
第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤が、アルギニン、ヒスチジン及びスクロースからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
第１の可溶化剤と第２の可溶化剤とが同じである、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤がアルギニン又はヒスチジンである、請求項１から３の何れか一項に記載の方法。
【請求項５】
アルギニンがアルギニン塩であり、及び／又はヒスチジンがヒスチジン塩である、請求項２から４の何れか一項に記載の方法。
【請求項６】
アルギニンがアルギニン誘導体であり、及び／又はヒスチジンがヒスチジン誘導体である、請求項２から４の何れか一項に記載の方法。
【請求項７】
アルギニンがアルギニンＨＣｌであり、及び／又はヒスチジンがヒスチジンＨＣｌである、請求項２から４の何れか一項に記載の方法。
【請求項８】
アルギニン又はヒスチジンが２０ｍＭ〜１Ｍの濃度で存在する、請求項２から７の何れか一項に記載の方法。
【請求項９】
アルギニン又はヒスチジンが２０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項２から８の何れか一項に記載の方法。
【請求項１０】
アルギニン又はヒスチジンが５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項２から９の何れか一項に記載の方法。
【請求項１１】
ステップａの第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又はステップｂの第２のヒンジ含有ポリペプチドがアルギニン及びヒスチジンの両方の存在下にある、請求項１から１０の何れか一項に記載の方法。
【請求項１２】
アルギニン及びヒスチジンがそれぞれ５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤がアルギニンである、請求項１から１０の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを混合前に精製する、請求項１から１３の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを共精製する、請求項１から１３の何れか一項に記載の方法。
【請求項１６】
ステップａの前に第１のヒンジ含有ポリペプチドを精製するステップがあり、及び／又はステップｂの前に第２のヒンジ含有ポリペプチドを精製するステップがある、請求項１から１３の何れか一項に記載の方法。
【請求項１７】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドをプロテインＡにより精製する、請求項１４から１６の何れか一項に記載の方法。
【請求項１８】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを細菌細胞、酵母細胞、バキュロウイルス又は哺乳動物細胞により産生する、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項１９】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを哺乳動物細胞により産生する、請求項１から１８の何れか一項に記載の方法。
【請求項２０】
哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドが、半抗体、イムノアドヘシン又はこれらの機能的断片を含む、請求項１から２０の何れか一項に記載の方法。
【請求項２２】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドが半抗体を含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
半抗体がＩｇＧ半抗体である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
ＩｇＧ半抗体がＩｇＧ１アイソタイプ、ＩｇＧ２アイソタイプ又はＩｇＧ４アイソタイプである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドがＦｃ成分を含む、請求項１から２４の何れか一項に記載の方法。
【請求項２６】
半抗体がＶＬドメイン、ＶＨドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む、請求項２１から２５の何れか一項に記載の方法。
【請求項２７】
半抗体が、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドを含み、該単鎖ポリペプチドが、以下：ＶＬ−テザー−ＶＨ−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
半抗体がＣＬドメイン及びＣＨ１ドメインを更に含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２９】
半抗体が、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドを含み、前記単鎖ポリペプチドが、以下：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
ａ〜ｄのうちの一又は複数のステップを２５℃〜４２℃の温度で加熱する、請求項１から２９の何れか一項に記載の方法。
【請求項３１】
ａ〜ｄのうちの一又は複数のステップを３５℃〜３７℃の温度で加熱する、請求項１から３０の何れか一項に記載の方法。
【請求項３２】
ステップａの第１のヒンジ含有ポリペプチド及びステップｂの第２のヒンジ含有ポリペプチドを加熱する、請求項３０又は３１に記載の方法。
【請求項３３】
ステップｄの構築用混合物を加熱する、請求項３０から３２の何れか一項に記載の方法。
【請求項３４】
全ステップａ〜ｄを加熱する、請求項３０から３３の何れか一項に記載の方法。
【請求項３５】
全ステップａ〜ｄを３５℃〜３７℃の温度で加熱する、請求項３０から３４の何れか一項に記載の方法。
【請求項３６】
還元条件の酸化電位が−２００〜−６００ｍＶ、より好ましくは−３００〜−５００ｍＶ、最も好ましくは−約４００ｍＶである、請求項１から３５の何れか一項に記載の方法。
【請求項３７】
ステップｃにおける混合物に還元剤を添加する、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
還元剤が、グルタチオン（ＧＳＨ）、ベータ−メルカプトエチルアミン、グルタチオン（ＧＳＨ）／グルタチオンジスルフィド（ＧＳＳＧ）、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールからなる群から選択される、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
構築用混合物に還元剤を５０〜６００倍モル過剰で添加する、請求項３７又は３８に記載の方法。
【請求項４０】
構築用混合物に還元剤を２００倍モル過剰で添加する、請求項３７から３９の何れか一項に記載の方法。
【請求項４１】
還元剤がＧＳＨである、請求項３７から４０の何れか一項に記載の方法。
【請求項４２】
第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとの間の相互作用が疎水的相互作用及び／又は静電気的相互作用である、請求項１から４１の何れか一項に記載の方法。
【請求項４３】
ヘテロ多量体化ドメインが、ノブ（例えば突起）、ホール（例えば空洞）、ロイシンジッパー、コイルドコイル又は静電的相互作用を生じさせる能力を有する極性アミノ酸残基のうちの１つ又は複数含む、請求項１から４２の何れか一項に記載の方法。
【請求項４４】
第１のヒンジ含有ポリペプチドがノブを含み、第２のヒンジ含有ポリペプチドがホールを含む、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
ステップａ〜ｄのうちの１つ又は複数において安定化剤を添加することを更に含む、請求項１から４４の何れか一項に記載の方法。
【請求項４６】
ステップｃ又はステップｄに安定化剤を添加する、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
安定化剤がアルギニン及び／又はＰＶＰである、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
ステップａ及び／又はステップｂに安定化剤を添加する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４９】
安定化剤がアルギニン及び／又はヒスチジンである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
ステップｄの後にヘテロ多量体タンパク質を回収するステップを更に含む、請求項１から４９の何れか一項に記載の方法。
【請求項５１】
ヘテロ多量体タンパク質を回収するステップがヘテロ多量体タンパク質の精製を含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
ａ．第１の可溶化剤の存在下においてｐＨ５〜９で第１の半抗体を提供するステップであって、第１の半抗体がヘテロ多量体化ドメインを含むステップ、
ｂ．第２の可溶化剤の存在下においてｐＨ５〜９で第２の半抗体を提供するステップであって、第２の半抗体がヘテロ多量体化ドメインを含むステップ、
ｃ．還元条件下で第１の半抗体と第２の半抗体とを混合して構築用混合物を形成するステップ、並びに
ｄ．構築用混合物をインキュベートして、第１の半抗体及び第２の半抗体を含む二重特異性抗体を形成するステップであって、ヘテロ多量体化ドメインで第１の半抗体と第２の半抗体とが相互作用するステップ
を含む、二重特異性抗体の産生方法。
【請求項５３】
第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤が、アルギニン、ヒスチジン及びスクロースからなる群から選択される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
第１の可溶化剤と第２の可溶化剤とが同じである、請求項５２又は５３に記載の方法。
【請求項５５】
第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤がアルギニン又はヒスチジンである、請求項５２から５４の何れか一項に記載の方法。
【請求項５６】
アルギニンがアルギニン塩であり、及び／又はヒスチジンがヒスチジン塩である、請求項５２から５４の何れか一項に記載の方法。
【請求項５７】
アルギニンがアルギニン誘導体であり、及び／又はヒスチジンがヒスチジン誘導体である、請求項５２から５４の何れか一項に記載の方法。
【請求項５８】
アルギニンがアルギニンＨＣｌであり、及び／又はヒスチジンがヒスチジンＨＣｌである、請求項５２から５４の何れか一項に記載の方法。
【請求項５９】
アルギニン又はヒスチジンが２０ｍＭ〜１Ｍの濃度で存在する、請求項５３から５８の何れか一項に記載の方法。
【請求項６０】
アルギニン又はヒスチジンが２０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項５３から５９の何れか一項に記載の方法。
【請求項６１】
アルギニン又はヒスチジンが５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項５３から６０の何れか一項に記載の方法。
【請求項６２】
可溶化剤がアルギニンである、請求項５３から６１の何れか一項に記載の方法。
【請求項６３】
ステップａの第１の半抗体及び／又はステップｂの第２の半抗体がアルギニン及びヒスチジンの両方の存在下にある、請求項５３から６１の何れか一項に記載の方法。
【請求項６４】
アルギニン及びヒスチジンがそれぞれ５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
第１の半抗体及び第２の半抗体を混合前に精製する、請求項５２から６４の何れか一項に記載の方法。
【請求項６６】
第１の半抗体及び第２の半抗体を共精製する、請求項５２から６４の何れか一項に記載の方法。
【請求項６７】
ステップａの前に第１の半抗体を精製するステップがあり、及び／又はステップｂの前に第２の半抗体を精製するステップがある、請求項５２から６６の何れか一項に記載の方法。
【請求項６８】
第１の半抗体及び第２の半抗体をプロテインＡにより精製する、請求項６５から６７の何れか一項に記載の方法。
【請求項６９】
第１の半抗体及び第２の半抗体を細菌細胞、酵母細胞、バキュロウイルス又は哺乳動物細胞により産生する、請求項５２から６８の何れか一項に記載の方法。
【請求項７０】
第１の半抗体及び第２の半抗体を哺乳動物細胞により産生する、請求項５２から６９の何れか一項に記載の方法。
【請求項７１】
哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、請求項７０に記載の方法。
【請求項７２】
半抗体がＩｇＧ半抗体である、請求項５２から７１の何れか一項に記載の方法。
【請求項７３】
ＩｇＧ半抗体がＩｇＧ１アイソタイプ、ＩｇＧ２アイソタイプ又はＩｇＧ４アイソタイプである、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
第１の半抗体及び／又は第２の半抗体がＦｃ成分を含む、請求項５２から７３の何れか一項に記載の方法。
【請求項７５】
半抗体がＶＬドメイン、ＶＨドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む、請求項５２から７４の何れか一項に記載の方法。
【請求項７６】
半抗体が、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドを含み、前記単鎖ポリペプチドが、以下：ＶＬ−テザー−ＶＨ−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む、請求項７５に記載の方法。
【請求項７７】
半抗体がＣＬドメイン及びＣＨ１ドメインを更に含む、請求項７５に記載の方法。
【請求項７８】
半抗体が、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドを含み、前記単鎖ポリペプチドが、以下：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
ａ〜ｄのうちの一又は複数のステップを２５℃〜４２℃の温度で加熱する、請求項５２から７８の何れか一項に記載の方法。
【請求項８０】
ａ〜ｄのうちの一又は複数のステップを３５℃〜３７℃の温度で加熱する、請求項５２から７９の何れか一項に記載の方法。
【請求項８１】
ステップａの第１の半抗体及びステップｂの第２の半抗体を加熱する、請求項７９又は８０に記載の方法。
【請求項８２】
ステップｄの構築用混合物を加熱する、請求項７９から８１の何れか一項に記載の方法。
【請求項８３】
全ステップａ〜ｄを加熱する、請求項７９から８２の何れか一項に記載の方法。
【請求項８４】
全ステップａ〜ｄを３５℃〜３７℃の温度で加熱する、請求項７９から８３の何れか一項に記載の方法。
【請求項８５】
還元条件の酸化電位が−２００〜−６００ｍＶ、より好ましくは−３００〜−５００ｍＶ、最も好ましくは−約４００ｍＶである、請求項５２から８４の何れか一項に記載の方法。
【請求項８６】
ステップｃにおける混合物に還元剤を添加する、請求項５２から８５の何れか一項に記載の方法。
【請求項８７】
還元剤が、グルタチオン（ＧＳＨ）、ベータ−メルカプトエチルアミン、グルタチオン（ＧＳＨ）／グルタチオンジスルフィド（ＧＳＳＧ）、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールからなる群から選択される、請求項８６に記載の方法。
【請求項８８】
構築用混合物に還元剤を５０〜６００倍モル過剰で添加する、請求項８６又は８７に記載の方法。
【請求項８９】
構築用混合物に還元剤を２００倍モル過剰で添加する、請求項８６から８８の何れか一項に記載の方法。
【請求項９０】
還元剤がＧＳＨである、請求項８６から８９の何れか一項に記載の方法。
【請求項９１】
第１の半抗体と第２の半抗体との間の相互作用が疎水的相互作用及び／又は静電気的相互作用である、請求項５２から９０の何れか一項に記載の方法。
【請求項９２】
ヘテロ多量体化ドメインが、ノブ（例えば突起）、ホール（例えば空洞）、ロイシンジッパー、コイルドコイル又は静電気的相互作用を生じさせる能力を有する極性アミノ酸残基のうちの１つ又は複数含む、請求項５２から９１の何れか一項に記載の方法。
【請求項９３】
第１の半抗体がノブを含み、第２の半抗体がホールを含む、請求項９２に記載の方法。
【請求項９４】
ステップａ〜ｄのうちの１つ又は複数において安定化剤を添加することを更に含む、請求項５２から９３の何れか一項に記載の方法。
【請求項９５】
ステップｃ又はステップｄに安定化剤を添加する、請求項９４に記載の方法。
【請求項９６】
安定化剤がアルギニン及び／又はＰＶＰである、請求項９５に記載の方法。
【請求項９７】
ステップａ又はステップｂに安定化剤を添加する、請求項９４に記載の方法。
【請求項９８】
安定化剤がアルギニン及び／又はヒスチジンである、請求項９７に記載の方法。
【請求項９９】
ステップｄの後に二重特異性抗体を回収するステップを更に含む、請求項５２から９８の何れか一項に記載の方法。
【請求項１００】
二重特異性抗体を回収するステップが二重特異性抗体の精製を含む、請求項９９に記載の方法。
【請求項１０１】
ヒンジ含有ポリペプチド及び可溶化剤を含む組成物であって、組成物のｐＨがｐＨ５〜ｐＨ９である組成物。
【請求項１０２】
可溶化剤が、アルギニン、ヒスチジン及びスクロースからなる群から選択される、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０３】
可溶化剤がアルギニン又はヒスチジンである、請求項１０２に記載の組成物。
【請求項１０４】
アルギニンがアルギニン塩であり、及び／又はヒスチジンがヒスチジン塩である、請求１０２又は１０３に記載の組成物。
【請求項１０５】
アルギニンがアルギニン誘導体であり、及び／又はヒスチジンがヒスチジン誘導体である、請求項１０２又は１０３に記載の組成物。
【請求項１０６】
アルギニンがアルギニンＨＣｌであり、及び／又はヒスチジンがヒスチジンＨＣｌである、請求項１０２又は１０３に記載の組成物。
【請求項１０７】
アルギニン又はヒスチジンが２０ｍＭ〜１Ｍの濃度で存在する、請求項１０２から１０６の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１０８】
アルギニン又はヒスチジンが２０ｍＭ〜２００ｍＭ又は５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項１０２から１０７の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１０９】
アルギニン及びヒスチジンの両方を更に含む、請求項１０２から１０８の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１１０】
アルギニン及びヒスチジンがそれぞれ２０ｍＭ〜２００ｍＭ又は５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項１０９に記載の組成物。
【請求項１１１】
アルギニンが５０ｍＭの濃度で存在し、ヒスチジンが２００ｍＭの濃度で存在する、請求項１０９又は１１０に記載の組成物。
【請求項１１２】
ヒンジ含有ポリペプチドが半抗体又はイムノアドヘシンを含む、請求項１０１から１１１の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１１３】
ヒンジ含有ポリペプチドが半抗体を含む、請求項１１２に記載の組成物。
【請求項１１４】
半抗体がＩｇＧ半抗体である、請求項１１３に記載の組成物。
【請求項１１５】
ＩｇＧ半抗体がＩｇＧ１アイソタイプ又はＩｇＧ４アイソタイプである、請求項１１４に記載の組成物。
【請求項１１６】
ヒンジ含有ポリペプチドがＦｃ成分を含む、請求項１０１から１１５の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１１７】
半抗体がＶＬドメイン、ＶＨドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む、請求項１１２から１１６の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１１８】
半抗体が、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドを含み、前記単鎖ポリペプチドが、以下：ＶＬ−テザー−ＶＨ−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む、請求項１１７に記載の組成物。
【請求項１１９】
半抗体がＣＬドメイン及びＣＨ１ドメインを更に含む、請求項１１７に記載の組成物。
【請求項１２０】
半抗体が、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドを含み、前記単鎖ポリペプチドが、以下：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む、請求項１１９に記載の組成物。
【請求項１２１】
ヒンジ含有ポリペプチド又は半抗体がノブ又はホールを含む、請求項１０１から１２０の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１２２】
第２のヒンジ含有ポリペプチドを更に含む、請求項１０１から１２１の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１２３】
第１のヒンジ含有ポリペプチドがノブを含み、第２のヒンジ含有ポリペプチドがホールを含む、請求項１２２に記載の組成物。
【請求項１２４】
ａ．プロテインＡで精製した第１のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｂ．プロテインＡで精製した第２のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｃ．各ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを４〜９に調整すること、
ｄ．第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して構築用混合物を得ること、
ｅ．モル過剰の弱還元剤を構築用混合物に添加すること、並びに
ｆ．構築用混合物をインキュベートして、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成すること
を含む、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法。
【請求項１２５】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドが、半抗体、イムノアドヘシン及びこれらの断片から選択される、請求項１２４に記載の方法。
【請求項１２６】
第１のヒンジ含有ポリペプチドが半抗体である、請求項１２４又は１２５に記載の方法。
【請求項１２７】
第２のヒンジ含有ポリペプチドがＦｃ成分を含む、請求項１２４から１２６の何れか一項に記載の方法。
【請求項１２８】
半抗体がＶＬドメイン、ＣＬドメイン、ＶＨドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む、請求項１２５から１２７の何れか一項に記載の方法。
【請求項１２９】
半抗体が、テザーを更に含む単一ポリペプチド鎖であり、前記複数のドメインは、以下：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３の通りにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている、請求項１２８に記載の方法。
【請求項１３０】
プロテインＡ精製前に第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合し、プロテインＡ上で共精製する、請求項１２４から１２９の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３１】
第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドがヘテロ多量体化ドメインを含む、請求項１２４から１３０の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３２】
ヘテロ多量体化ドメインが、ノブイントゥホール変異、ロイシンジッパー、静電気的等から選択される、請求項１３１に記載の方法。
【請求項１３３】
第１のヒンジ含有ポリペプチドがノブを含み、第２のヒンジ含有ポリペプチドがホールを含む、請求項１３２に記載の方法。
【請求項１３４】
混合後にｐＨを調整する、請求項１２４から１３３の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３５】
ｐＨの調整前に、Ｌ−アルギニンを２０ｍＭ〜１Ｍの最終濃度まで添加することを更に含む、請求項１２４から１３４の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３６】
混合プールを１５℃〜３９℃の温度で３０分以上にわたってインキュベートすることを更に含む、請求項１２４から１３５の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３７】
ステップｆにおける構築用混合物の酸化電位が−２００〜−６００ｍＶであり、より好ましくは−３００〜−５００ｍＶであり、最も好ましくは−約４００ｍＶである、請求項１２４から１３６の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３８】
弱還元剤が、ＧＳＨ、ベータ−メルカプトエチルアミン、ＧＳＨ／ＧＳＳＧ、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールから選択される、請求項１２４から１３７の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３９】
弱還元剤を５０〜６００倍モル過剰で添加する、請求項１２４から１３８の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４０】
弱還元剤がＧＳＨである、請求項１２４から１３９の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４１】
構築用混合物のインキュベートをポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）の存在下において１５℃〜３９℃の温度で行なう、請求項１２４から１４０の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４２】
ＰＶＰの前に、ＰＶＰと同時に、又はＰＶＰの後にヒスチジンを添加する、請求項１４１に記載の方法。
【請求項１４３】
ＰＶＰを最大４０％（重量／体積）まで添加する、請求項１４１又は１４２に記載の方法。
【請求項１４４】
ａ．プロテインＡで精製した第１のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｂ．プロテインＡで精製した第２のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｃ．アルギニンの存在下において各ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを４〜９に調整すること、
ｄ．第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して混合ヒンジ含有ポリペプチドプールを得ること、並びに
ｅ．ヒンジ含有ポリペプチドプールをインキュベートして、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成すること
を含む、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法。
【請求項１４５】
ヒンジ含有ポリペプチドが、半抗体、イムノアドヘシン又はこれらの機能的断片を含む、請求項１４４に記載の方法。
【請求項１４６】
ヒンジ含有ポリペプチドプールを還元条件下でインキュベートする請求項１４４又は１４５に記載の方法。
【請求項１４７】
５０〜６００倍モル過剰の還元剤の存在下でヒンジ含有ポリペプチドプールをインキュベートする請求項１４４から１４６の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４８】
２００倍モル過剰のＧＳＨの存在下でヒンジ含有ポリペプチドプールをインキュベートする請求項１４４から１４７の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４９】
アルギニンが２０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する、請求項１４４から１４８の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５０】
ステップｄ又はステップｅにＰＶＰを添加する請求項１４４から１４９の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５１】
混合後にｐＨを調整する、請求項１４４から１５０の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５２】
ヒンジ含有ポリペプチドを細菌細胞、酵母細胞、バキュロウイルス又は哺乳動物細胞により産生する、請求項１４４から１５１の何れか一項に記載の方法。
【請求項１５３】
ヒンジ含有ポリペプチドを哺乳動物細胞により、好ましくはＣＨＯ細胞により産生する、請求項１５２に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、２０１１年１０月１１日に出願された米国仮出願番号第６１／５４５８６３号、２０１１年１０月１２日に出願された米国仮出願番号第６１／５４６５０３号、２０１１年１１月１６日に出願された米国仮出願番号第６１／５６０７０４号及び２０１２年７月２７日に出願された米国仮出願番号第６１／６７６８３７号と関連しており、それらの優先権の利益を主張する。上記各仮出願の開示の全体が出典明示により本明細書に援用される。
【０００２】
本開示は、二重特異性抗体等のヘテロ多量体タンパク質の組成物及び改善された構築方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
ＩｇＧ型モノクローナル抗体は、２本の同じ抗原結合アームと定常ドメイン（Ｆｃ）を含んでいる。その結合アーム中に異なる特異性を有する抗体は、通常は天然には存在せず、従って、化学工学（例えば化学的架橋等）、組換えＤＮＡ及び／又は細胞融合技術の助けを借りて、作製されなければならない。
【０００４】
二重特異性抗体は２種の異なる抗原に同時に結合することができる。この特性により、従来のモノクローナル抗体では不可能である治療戦略の開発が可能になる。開発された想像上の二重特異性抗体フォーマットの大型パネルは、これらの分子への強い関心を反映する。Ｂｅｒｇ  Ｊ、Ｌｏｔｓｃｈｅｒ  Ｅ、Ｓｔｅｉｍｅｒ  ＫＳ他、「Ｂｉｓｐｅｃｉｆｉｃ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ｔｈａｔ  ｍｅｄｉａｔｅ  ｋｉｌｌｉｎｇ  ｏｆ  ｃｅｌｌｓ  ｉｎｆｅｃｔｅｄ  ｗｉｔｈ  ｈｕｍａｎ  ｉｍｍｕｎｏｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ  ｖｉｒｕｓ  ｏｆ  ａｎｙ  ｓｔｒａｉｎ」、Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ（１９９１）８８（１１）：４７２３〜４７２７並びにＦｉｓｃｈｅｒ  Ｎ及びＬｅｇｅｒ  Ｏ．、「Ｂｉｏｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ  Ｔｈａｔ  Ｅｎａｂｌｅ  Ｎｏｖｅｌ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ」、Ｐａｔｈｏｂｉｏｌｏｇｙ（２００７）７４：３〜１４参照。
【０００５】
別の種類の多重特異性分子は組換え融合タンパク質である。免疫調節タンパク質の細胞外ドメインと免疫グロブリン（Ｉｇ）の定常（Ｆｃ）ドメインとからなる組換え融合タンパク質は、ヒトの治療法における成長分野である。イムノアドヘシンでは、タンパク質配列の結合領域と抗体のエフェクタードメインとが所望の特異性と共に組み合わされている。イムノアドヘシンは、治療薬としてのイムノアドヘシンの可能性にとって意義深い２つの重要な特性、即ち標的特異性及び薬物動態学的安定性（抗体の半減期と同程度であるインビボでの半減期）を有する。有害な相互作用を阻害するもしくは遮断するためのアンタゴニストとして、又は生理学的反応を模倣するもしくは増強するためのアゴニストとして、イムノアドヘシンを使用することができる。Ｃｈａｍｏｗ  ＳＭ、Ｚｈａｎｇ  ＤＺ、Ｔａｎ  ＸＹ他、「Ａ  ｈｕｍａｎｉｚｅｄ，ｂｉｓｐｅｃｉｆｉｃ  ｉｍｍｕｎｏａｄｈｅｓｉｎ−ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｔｈａｔ  ｒｅｔａｒｇｅｔｓ  ＣＤ３＋  ｅｆｆｅｃｔｏｒｓ  ｔｏ  ｋｉｌｌ  ＨＩＶ−１−ｉｎｆｅｃｔｅｄ  ｃｅｌｌｓ」、Ｊ  Ｈｅｍａｔｏｔｈｅｒ  １９９５；４（５）：４３９〜４４６参照。
【０００６】
他の多重特異性分子が他で議論されてきた。例として、Ｆｉｓｈｅｒ他、Ｐａｔｈｏｂｉｏｌｏｇｙ（２００７）７４：３〜１４（様々な二重特異性フォーマットの総説）；Ｆｅｉｇｅ他が２００３年１２月９日に取得した米国特許第６，６６０，８４３号（ペプチボディ）；２００２年１月１０日に公開された米国特許出願公開第２００２−００４５８７号（多重特異性抗体）；Ｗｕ他が２００９年１１月３日に取得した米国特許第７６１２１８１号（二重可変ドメインフォーマット）；米国特許第６，５３４，６２８号、Ｎｏｒｄ  Ｋ他、Ｐｒｏｔ  Ｅｎｇ（１９９５）８：６０１〜６０８、Ｎｏｒｄ  Ｋ他、Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈ（１９９７）１５：７７２〜７７７及びＧｒｏｎｗａｌｌ他、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  Ａｐｐｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．（２００８）Ｊｕｎ；５０（Ｐｔ２）：９７〜１１２（アフィボディ）；Ｍａｒｔｅｎｓ他、Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ（２００６）、１２：６１４４〜６１５２及びＪｉｎ他、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ（２００８）６８（１１）：４３６０〜４３６８（ワンアームド抗体（one armed antibody））；Ｂｏｓｔｒｏｍ他、Ｓｃｉｅｎｃｅ（２００９）３２３：１６１０〜１６１４（二重作用Ｆａｂ、別名は混合原子価抗体（mixed valency antibody））が挙げられるがこれらに限定されない。他のフォーマットが当業者に知られている。
【０００７】
臨床等級の材料の製造は、抗体に関して一般的に依然として困難であり、特に上記多重特異性分子に関しては依然として困難である。前述したように、混合結合アーム、即ち互いに同一ではない結合アームを有する分子の産生には多くの経路がある。しかし、これらの方法はそれぞれ欠点を有する。
【０００８】
適切な種をホモ二量体及び他の望ましくない副産物から精製する必要が更にあるかもしれないことから、化学的架橋は労働集約的である。加えて、化学修飾ステップはタンパク質の完全性を変えて安定性の低下をもたらす可能性がある。そのため、この方法は非効率であることが多く、抗体の活性の喪失をもたらす可能性がある。
【０００９】
細胞融合技術（例えばハイブリッドハイブリドーマ）は、ランダムに集合して１０種の抗体の組合せの形成をもたらす２本の重鎖及び２本の軽鎖を発現させる。所望のヘテロ多量体抗体は、そのように産生される抗体のほんの一部でしかない。所望のヘテロ多量体タンパク質の精製は、産生収率が激減させ、製造コストを増加させる。
【００１０】
組換えＤＮＡ技術は、様々なヘテロ多量体フォーマット、例えばＦｃドメインを含まない単鎖Ｆｖ（ダイアボディ等）を生成するために使用されている。このタイプの抗体分子の主な欠点はＦｃドメインの欠如であり、そのためエフェクター機能をトリガーする抗体の能力（例えば補体活性化、Ｆｃ受容体結合等）の欠如である。そのため、機能的Ｆｃドメインを含む二重特異性抗体が望まれている。
【００１１】
組換えＤＮＡ技術はまた、「ノブイントゥホール（knob into hole）」二重特異性抗体を生成するためにも使用されている。米国特許出願第２００３００７８３８５号（Ａｒａｔｈｏｏｎ他−Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）参照。この戦略の１つの制約は、同じ細胞中での発現時に望ましくない及び／又は不活性な分子の誤対合及び形成を防止するために、２種の親抗体の軽鎖が同一でなければならないということである。
【００１２】
加えて、アニーリング及び精製中の制限事象のうちの１つが酸化還元効率である。酸化したヘテロ二量体は概して、このステップ後にタンパク質の７０〜８０％を占めるのみである（ＢｉｏＡｎａｌｙｚｅｒ及びＭＳ−ＴＯＦ）。抗体の残り２０〜３０％は二量体であり、共有結合を欠いている（ＳＥＣ−ＬＬＳ）。これを除去することはできるが、全収率に大きな影響を及ぼす。そのため、抗体の産生、特にヘテロ二量体の産生における全収率を改善する必要性が残る。本明細書に記載されているのは、二重特異性抗体、ヘテロ二量体等の全収率を改善することができる方法である。本発明のこれらの及び他の態様及び利点は、本明細書に記載された本発明の説明から明らかになるだろう。
【発明の概要】
【００１３】
最新技術を使用する、２種以上のヒンジ含有ポリペプチドから構築されたヘテロ多量体タンパク質、例えば２種以上の半抗体に由来する多重特異性抗体の産生は、特に産物の混合物の産生、低下した収率及びエフェクター機能の低下／消失等の欠点を有する。加えて、各ヒンジ含有ポリペプチドの調製中及びヘテロ多量体の構築又はアニーリング中に、凝集及び沈殿が生じることが多い。凝集及び沈殿により、所望のヘテロ多量体の収率が大幅に低下する可能性がある。そのため、ヘテロ多量体タンパク質をより効率的に及びより高いレベルで産生することが望ましい。
【００１４】
本明細書に開示されているのは、以下のもの：安定化剤、可溶化剤、還元条件、選択的ｐＨ及び選択的温度等が挙げられるがこれらに限定されない１つ又は複数を使用することによる又は調整することによる、ヘテロ多量体タンパク質、例えば多重特異性抗体の効率的な産生プロセス／経済的な産生方法である。本明細書に記載された本発明の方法により、沈殿及び／又は凝集によるタンパク質の減少が低下し、二重特異性抗体の産生等のヘテロ多量体タンパク質産生の全収率が改善した。
【００１５】
一態様において、ヘテロ多量体タンパク質の形成又は産生方法であって、
ａ．第１の可溶化剤の存在下において４〜９、好ましくは５〜９のｐＨで第１のヒンジ含有ポリペプチドを準備することであって、第１のヒンジ含有ポリペプチドがヘテロ多量体化ドメインを含むこと、
ｂ．第２の可溶化剤の存在下において４〜９、好ましくは５〜９のｐＨで第２のヒンジ含有ポリペプチドを準備することであって、第２のヒンジ含有ポリペプチドがヘテロ多量体化ドメインを含むこと、
ｃ．還元条件下で第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して構築用混合物を形成すること、並びに
ｄ．構築用混合物をインキュベートして、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成する又は産生することであって、ヘテロ多量体化ドメインで第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとが相互作用することを含む方法が提供される。
【００１６】
この態様のある実施態様において、ステップａ及び／又はステップｂの前に第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドを精製するステップがある。ある特定の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドをプロテインＡにより精製する。
【００１７】
別の態様において、二重特異性抗体の形成又は産生方法であって、
ａ．第１の可溶化剤の存在下において４〜９、好ましくは５〜９のｐＨで第１の半抗体を準備することであって、第１の半抗体がヘテロ多量体化ドメインを含むこと、
ｂ．第２の可溶化剤の存在下において４〜９、好ましくは５〜９のｐＨで第２の半抗体を準備することであって、第２の半抗体がヘテロ多量体化ドメインを含むこと、
ｃ．還元条件下で第１の半抗体と第２の半抗体とを混合して構築用混合物を形成すること、並びに
ｄ．構築用混合物をインキュベートして、第１の半抗体及び第２の半抗体を含む二重特異性抗体を形成する又は産生することであって、ヘテロ多量体化ドメインで第１の半抗体と第２の半抗体とが相互作用することを含む方法が提供される。
【００１８】
この態様のある実施態様において、ステップａ及び／又はステップｂの前に第１の半抗体及び／又は第２の半抗体を精製するステップがある。ある特定の実施態様において、第１の半抗体及び／又は第２の半抗体をプロテインＡにより精製する。
【００１９】
更なる態様において、ヘテロ多量体の産生方法であって、ヒンジ含有ポリペプチドの混合物を含有するアルギニンを準備することであって前記混合物が４〜９、好ましくは５〜９のｐＨを有すること、弱還元剤を添加すること、及びヘテロ多量体を産生するための条件下でインキュベートすることを含む方法が提供される。
【００２０】
更に別の態様において、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法であって、
ａ．プロテインＡで精製した第１のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｂ．プロテインＡで精製した第２のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｃ．各ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを４〜９に調整すること、
ｄ．第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して構築用混合物を得ること、
ｅ．モル過剰の弱還元剤を構築用混合物に添加すること、並びに
ｆ．構築用混合物をインキュベートして、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成することを含む方法が提供される。
【００２１】
別の態様において、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法であって、
ａ．プロテインＡで精製した第１のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｂ．プロテインＡで精製した第２のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、
ｃ．Ｌ−アルギニンの存在下において各ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを４〜９に調整すること、
ｄ．第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して混合ヒンジ含有ポリペプチドプールを得ること、並びに
ｅ．インキュベートして、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成することを含む方法が提供される。
【００２２】
この態様のある実施態様において、混合ヒンジ含有ポリペプチドプールを還元条件下でインキュベートする。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは、半抗体、イムノアドヘシン又はこれらの機能的断片を含む。ある他の実施態様において、アルギニンは、２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜２００ｍＭ又は５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する。ある他の実施態様において、ＰＶＰをステップｄ又はステップｅに添加する。ある実施態様において、混合後にｐＨを調整する。
【００２３】
本出願人は、半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドの中間ｐＨの保持により、その後のヒンジ含有ポリペプチドの構築を増強するコンフォメーションシフトを促進することができることを予想外にも発見した。ある実施態様において、中間ｐＨはｐＨ４〜９であり、好ましくは５〜９であり、又はｐＨ５以上であり、ｐＨ５．５以上であり、ｐＨ５．７以上であり、ｐＨ５より高く、ｐＨ５．５より高く、ｐＨ５．７より高く、５〜９であり、５〜８であり、５．５〜８であり、５．５〜９であり、５．７〜８であり、５．７〜９であり、６〜８であり、６〜９であり、７〜８であり、７．５〜８．５であり、又は７〜８．５である。可溶化剤を添加して、ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨにより誘発される沈殿を防止する又は最小化することができる。ある特定の実施態様において、中間ｐＨの保持前に可溶化剤を添加する。ある実施態様において、第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤はそれぞれ、アルギニン、ヒスチジン及びスクロースからなる群から選択され、好ましくはアルギニン及び／又はヒスチジンである。ある他の実施態様において、アルギニンはアルギニン塩であり、及び／又はヒスチジンはヒスチジン塩である。ある他の実施態様において、アルギニンはアルギニン誘導体であり、及び／又はヒスチジンはヒスチジン誘導体である。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはＬ−アルギニン又はＬ−ヒスチジンである。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニンＨＣｌ又はヒスチジンＨＣｌである。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニンリン酸又はヒスチジンリン酸である。ある実施態様において、第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤は異なるが、他の実施態様において、第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤は同じである。ある好ましい実施態様において、第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤の両方はアルギニンを含む。更に他の実施態様において、アルギニンは２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜３００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１５０ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜２５０ｍＭ又は５０ｍＭ〜３００ｍＭの濃度で存在し、好ましくは２０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する。更に他の実施態様において、可溶化剤はアルギニン誘導体を含み、アルギニン誘導体としてアセチルアルギニンが挙げられるがこれに限定されない。他の実施態様において、第１の可溶化剤及び第２の可溶化剤の両方はヒスチジンを含み、ヒスチジンは２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜５００ｍＭ未満、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜３００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１５０ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜２５０ｍＭ、５０ｍＭ〜３００ｍＭ、５０ｍＭ〜４００ｍＭ、５０ｍＭ〜５００ｍＭ又は５０ｍＭ〜６００ｍＭの濃度で存在する。ある好ましい実施態様において、可溶化剤を５０ｍＭの濃度で添加する。ある他の実施態様において、可溶化剤を２００ｍＭの濃度で添加する。ある特定の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンを２０ｍＭ、５０ｍＭ、１００ｍＭ又は２００ｍＭの濃度で添加する。ある他の特定の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドを、アルギニン及びヒスチジンの両方の存在下で準備する。他の実施態様において、アルギニン及びヒスチジンはそれぞれ、２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜３００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１５０ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜２５０ｍＭ又は５０ｍＭ〜３００ｍＭの濃度で存在し、好ましくは５０ｍＭ〜２００ｍＭの濃度で存在する。
【００２４】
ある実施態様において、中間ｐＨの保持（即ちｐＨ調整）前に、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合する。ある他の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチドのｐＨ及び第２のヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを別々に調整した後に、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合する。ある実施態様において、ｐＨ調整前に可溶化剤を添加する。
【００２５】
ある実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを混合前に別々に精製するが、他の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを混合後に共精製する。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。ある実施態様において、構築したヘテロ多量体タンパク質を更なる精製にかけることができる。
【００２６】
任意の適切な方法を精製に使用することができ、任意の適切な方法として、プロテインＡクロマトグラフィー、プロテインＧクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）による精製、免疫親和性カラムによる分画、エタノール沈殿、シリカ又はＤＥＡＥ等のイオン交換樹脂による逆相クロマトグラフィー、等電点電気泳動、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈殿、及び例えばＳｅｐｈａｄｅｘ  Ｇ−７５を使用するゲルろ過、並びに他の類似の精製方法、並びにこれらの組み合わせが挙げられるがこれらに限定されない。
【００２７】
ある実施態様において、プロテインＡクロマトグラフィー又はプロテインＧクロマトグラフィーにより、半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドを精製する。別の実施態様において、プロテインＡ精製前に第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合し、プロテインＡ上で共精製する。ある実施態様において、プロテインＡで精製したポリペプチドの混合後にｐＨを調整する。他の実施態様において、プロテインＡで精製したポリペプチドの混合前にｐＨを調整する。ある実施態様において、ｐＨ調整前に可溶化剤を添加する。
【００２８】
ある他の実施態様において、ＨＩＣ又はイオン交換カラムによりヒンジ含有ポリペプチドを精製する。それは、当業者の好適な精製方法を選択する能力の範囲内である。例えば、プロテインＡカラム、続いてイオン交換カラムによりヒンジ含有ポリペプチドを精製することができ、プロテインＡカラム、続いてゲルろ過カラム及び／又はＨＩＣによりヒンジ含有ポリペプチドを精製することもできる。他の例において、プロテインＡカラムによる精製前に、１種又は複数種のイオン交換カラムによりヒンジ含有ポリペプチドを精製することができる。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドのいずれかの精製ステップ中に使用した洗浄緩衝液及び／又は溶出緩衝液は、アルギニン及び／又はヒスチジンを含有しない。
【００２９】
更に他の実施態様において、酸性ｐＨでプロテインＡマトリックス又は他のカラムマトリックスから溶出した半抗体を中間ｐＨに調整する。このその後のｐＨ調整（又は中間ｐＨの保持とも称される）により、半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドの沈殿が生じ、構築したヘテロ多量体タンパク質の収率の低下をもたらす可能性がある。そのため、ある実施態様において、ｐＨ調整前に、酸性ｐＨでプロテインＡカラム又はプロテインＧカラムから溶出した半抗体を可溶化剤の存在下に準備する。ｐＨ調整ステップが必要ではない場合には、ある実施態様では精製したヒンジ含有ポリペプチドに可溶化剤を好ましくは添加して沈殿及び／又は凝集を防止する、又は低下させる。
【００３０】
中間ｐＨの保持に加えて、本出願人は、加熱によりコンフォメーションシフト及び／又は半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドの構築を増強することができることを予想外にも発見した。従って、ある実施態様において、本発明の方法のステップａ〜ｄのうちの１つ、複数又は全てを１５℃〜３９℃、１５℃〜４２℃、１８℃〜３７℃、２０℃〜４２℃、２０℃〜２５℃、２５℃〜４２℃、２５℃〜３５℃、２５℃〜３９℃、３０℃〜３５℃、３２℃〜３５℃又は３２℃〜３７℃の温度で、好ましくは３５℃〜３７℃の温度で３０分以上にわたって加熱する。ある実施態様において、インキュベーション時間は７２時間以下であり、特に室温で７２時間以下である。いくつかの実施態様において、インキュベーション時間は３５℃で３時間である。ある他の実施態様において、温度は約３０℃、３５℃又は３７℃である。
【００３１】
しかしながら、加熱により凝集及び／又は沈殿が増加する可能性もある。従って、ある特定の実施態様において、加熱前に、プロテインＡカラム又はプロテインＧカラムから溶出した半抗体に可溶化剤を添加する。
【００３２】
ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは、半抗体、イムノアドヘシン又はこれらの機能的断片を含む。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドはＦｃ成分を含む。
【００３３】
ある特定の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び／又は第２のヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。ある実施態様において、半抗体はＩｇＧ半抗体である。ある特定の実施態様において、ＩｇＧ半抗体は、ＩｇＧ１アイソタイプ、ＩｇＧ４アイソタイプ又はＩｇＧ２アイソタイプである。ある有利な実施態様において、特に哺乳動物細胞中で産生する場合に、免疫グロブリン分子のシグナルペプチドを保持して半抗体の分泌を促進する。ある実施態様において、本発明の方法は、約５０ｍＭの濃度でのアルギニン、及び代替としての又は追加としての約２００ｍＭの濃度でのヒスチジンの存在下においてｐＨ５〜９で第１の半抗体及び第２の半抗体を準備することを含む。ある実施態様において、第１の半抗体及び／又は第２の半抗体はそれぞれ、異なる抗原又は同じ抗原上の異なるエピトープに特異的な抗原結合ドメインを含み、構築した完全抗体は二重特異性抗体である。ある他の実施態様において第１の半抗体及び第２の半抗体は同じアイソタイプであるが、他の実施態様において第１の半抗体及び第２の半抗体は異なるアイソタイプである。
【００３４】
半抗体は、ＶＬドメイン、ＶＨドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン、及び／又はＣＨ３ドメインを含むことができる。半抗体は、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドであることもでき、前記単鎖ポリペプチドは、以下のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む：ＶＬ−テザー−ＶＨ−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３。ある他の実施態様において、半抗体はＣＬドメイン及びＣＨ１ドメインを更に含み、更なる実施態様において、半抗体は、テザーを更に含む単鎖ポリペプチドであることができ、前記単鎖ポリペプチドは、以下のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされているドメインを含む：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３。
【００３５】
テザーは、１個又は複数個のグリシン（Ｇ）残基及びセリン（Ｓ）残基を含むことができる。他の実施態様において、テザーはＧＧＳの繰り返しを含む。例えば、テザーは１５〜５０個のアミノ酸長である。特定の実施態様において、テザーは２０〜３２個のアミノ酸長であり、例えば２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、２８個、２９個、３０個、３１個又は３２個のアミノ酸長である。ある実施態様において、テザーは切断可能である。他の実施態様において、テザーはタンパク質から切断可能であっても、なくてもよい。ある好ましい実施態様において、同じ酵素により、テザーのＮ末端及びＣ末端での、又はＮ末端及びＣ末端付近での２箇所の部位においてテザーは切断可能である。一実施態様において、テザーはフューリン等のプロテアーゼ用の切断部位を含む。更なる実施態様において、テザーは切断部位ＲＸＲＸＲＲ（配列番号１）でフューリンにより切断され、Ｘは任意のアミノ酸である。いくつかの実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチドは半抗体であり、第２のヒンジ含有ポリペプチドは単鎖半抗体である。
【００３６】
別の実施態様において、本発明は、テザー及びＦｃ成分複合体を含むタンパク質を提供し、テザーはタンパク質から切断可能であっても、なくてもよい。
【００３７】
更なる実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドはヘテロ多量体化ドメインを含む。ヘテロ多量体化ドメインは、ノブイントゥホール変異、ロイシンジッパー、静電気的等であることができる。第１のヒンジ含有ポリペプチドはノブを含むことができ、第２のヒンジ含有ポリペプチドはホールを含むことができる。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含み、第１の半抗体はノブを含み、及び第２の半抗体はホールを含む。
【００３８】
いくつかの実施態様において、上記方法は、ｐＨの調製前に２０ｍＭ〜１Ｍの最終濃度までアルギニンを添加することを含む。いくつかの実施態様において、５０ｍＭ〜６００ｍＭの最終濃度までアルギニンを添加する。いくつかの実施態様において、５０ｍＭ〜１００ｍＭの最終濃度までアルギニンを添加する。
【００３９】
ある実施態様において、上記方法は、第１の半抗体と第２の半抗体との混合前に、各ヒンジ含有ポリペプチドプロテインＡプールを５〜８のｐＨでインキュベートすることを含む。他の実施態様において、プロテインＡプールを混合し、次いでｐＨを５〜８に調整する。
【００４０】
いくつかの実施態様において、本明細書に記載した方法は、混合半抗体又は混合ヒンジ含有ポリペプチドプールを１５℃〜３９℃の温度で、好ましくは１８℃〜３７℃の温度で、より好ましくは２０℃〜２５℃の温度で、より好ましくは３２℃〜３７℃の温度で３０分以上にわたってインキュベートすることを含む。
【００４１】
ヒンジ含有ポリペプチドを例えば細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞中のバキュロウイルス、又は哺乳動物細胞により産生することができる。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドを細菌細胞、特に大腸菌（E. coli）により産生する。ある他の特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドを哺乳動物細胞により、特にＣＨＯ細胞により産生する。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。
【００４２】
複数のヒンジ含有ポリペプチドは相互作用し、ヘテロ二量体化ドメインを介して二量体又は多量体を形成することができる。ある実施態様において、ヘテロ二量体化ドメインの界面での第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとの間の相互作用は、突起イントゥ空洞相互作用（protuberance-into-cavity interaction）、疎水的相互作用及び／又は静電気的相互作用である。ある他の実施態様において、ヘテロ多量体化ドメインは、ノブ（例えば突起）、ホール（例えば空洞）、ロイシンジッパー、コイルドコイル、もしくは静電気的相互作用を生じさせる能力を有する極性アミノ酸残基、又はこれらの組合せを含む。ある実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチドはノブを含み、第２のヒンジ含有ポリペプチドはホールを含む。ある他の実施態様において、相互作用は、疎水的相互作用と静電気的相互作用との両方を含む。ある例示的実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドそれぞれのヘテロ多量体化ドメインは、ノブ又はホールのいずれかと、静電気的相互作用を生じさせる能力を有するアミノ酸残基とを含む。ヘテロ二量体化ドメインは複数の相互作用の様式、例えばノブ及びホール（Ｋ＆Ｈ）並びに疎水的相互作用、Ｋ＆Ｈ及びロイシンジッパー等を含むことができることを当業者は理解する。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドはテザーを更に含む。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。
【００４３】
ある特定の実施態様において、ヘテロ多量体タンパク質の構築を促進する条件下において、例えばｐＨが７〜９であり温度が１５℃〜３９℃である場合に、構築用混合物は、酸化電位が−５０〜−６００ｍＶ、−１００〜−６００ｍＶ、−２００〜−６００ｍＶ、−１００〜−５００ｍＶ、−１５０〜−３００ｍＶである、より好ましくは−３００〜−５００ｍＶである、最も好ましくは−約４００ｍＶである還元条件下で、好ましくは弱還元条件下で存在する。ある実施態様において、ステップｃ又はステップｄに還元剤を添加し、構築中において所望の還元条件を調える。ある他の実施態様において、還元剤は、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）、トリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）、チオグリコール酸、アスコルビン酸、チオール酢酸、グルタチオン（ＧＳＨ）、ベータ−メルカプトエチルアミン、システイン／シスチン、グルタチオン（ＧＳＨ）、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールからなる群から選択され、好ましくはＧＳＨである。ある好ましい実施態様において、還元剤は、好ましくは弱還元剤は、グルタチオン（ＧＳＨ）、ベータ−メルカプトエチルアミン、システイン／シスチン、グルタチオン（ＧＳＨ）／グルタチオンジスルフィド（ＧＳＳＧ）、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールからなる群から選択され、好ましくはＧＳＨである。ある実施態様において、還元剤はＤＴＴではない。
【００４４】
ある他の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドの全量に対して２〜６００倍、２〜２００倍、２〜３００倍、２〜４００倍、２〜５００倍、２〜２０倍、２〜８倍、２０〜５０倍、５０〜６００倍、５０〜２００倍又は１００〜３００倍モル過剰で、好ましくは５０〜４００倍モル過剰で、より好ましくは１００〜３００倍モル過剰で、最も好ましくは２００倍モル過剰で還元剤を構築用混合物に添加する。ある実施態様において、構築用混合物のｐＨは７〜９であり、好ましくは８．５である。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体である。
【００４５】
いくつかの実施態様において、混合前に還元剤を第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドに添加する。好ましくは、添加は混合前１時間未満であり、より好ましくは１５分未満であり、最も好ましくは５分未満である。
【００４６】
ある実施態様において、上記方法は、中間ｐＨの保持ステップ及び加熱する又は加熱しない構築ステップを含むがこれらの限定されないステップのうちの１つ又は複数において、安定化剤を反応に添加することを更に含む。例えば、安定化剤をヒンジ含有ポリペプチドに添加して凝集を予防する又は低減することができる。他の例において、安定化剤を構築用混合物に添加してヘテロ多量体タンパク質の構築中に凝集を予防する又は低減することができる。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。
【００４７】
ある特定の実施態様において、安定化剤は、アルギニン、ヒスチジン及びポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）からなる群から選択される。ある実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニン塩又はヒスチジン塩である。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニン誘導体又はヒスチジン誘導体である。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニンＨＣｌ又はヒスチジンＨＣｌである。ある実施態様において、アルギニンはアルギニンリン酸ではない。
【００４８】
ある他の実施態様において、上記方法は、構築用混合物をＰＶＰの存在下でインキュベートするステップを更に含む。関連する実施態様において、ＰＶＰを４０％（重量／体積）以下添加する。ある他の実施態様において、ＰＶＰは、２％〜６％（重量／体積）、１０％〜２０％、２％〜１０％、１％、１．３％、１．７％、２％、２．３％、２．７％、３％、３．３％、３．７％又は４％の濃度で、好ましくは０．１％〜１０％の濃度で、より好ましくは２％〜６％の濃度で、最も好ましくは４％の濃度で構築用混合物中に存在する。ある実施態様において、ＰＶＰは１００ＫＤ以下であり、３０ＫＤ以下であり、好ましくは１０ＫＤである。ある他の実施態様において、ＰＶＰは１０％（重量／体積）未満で存在し、又は５％（重量／体積）未満で存在する。
【００４９】
いくつかの実施態様において、安定化剤は、２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜３００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、２０ｍＭ〜５０ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１５０ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜２５０ｍＭ又は５０ｍＭ〜３００ｍＭの濃度で存在するアルギニンである。他の実施態様において、安定化剤は、２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜３００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、２０ｍＭ〜５０ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１５０ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜２５０ｍＭ又は５０ｍＭ〜３００ｍＭの濃度で存在するヒスチジンである。ある好ましい実施態様において、アルギニン又はヒスチジンを５０ｍＭ又は２００ｍＭの濃度で添加する。ある他の実施態様において、アルギニン及び／又はヒスチジンを２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ又は５０ｍＭ〜１００ｍＭの濃度で添加する。ある他の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。
【００５０】
更に別の態様において、本発明は、ヒンジ含有ポリペプチドを発現する宿主細胞を提供する。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。
【００５１】
更なる態様において、本発明は、（ａ）第１の抗原又は抗原の第１のエピトープに特異的な第１の半抗体を発現するように操作した第１の宿主細胞を培養するステップ、（ｂ）第２の抗原又は同じ抗原の第２のエピトープに特異的な第２の半抗体を発現するように操作した第２の宿主細胞を培養するステップ、（ｃ）第１の可溶化剤の存在下において４〜９、好ましくは５〜９のｐＨでステップａの培養物から第１の半抗体を得るステップ、（ｄ）第２の可溶化剤の存在下において４〜９、好ましくは５〜９のｐＨでステップｂの培養物から第２の半抗体を得るステップ、（ｅ）還元条件下で第１の半抗体と第２の半抗体とを混合して構築用混合物を形成するステップ、並びに（ｆ）構築用混合物をインキュベートし、第１の半抗体及び第２の半抗体を含む二重特異性抗体を形成するステップを含む、二重特異性抗体の産生方法を提供する。
【００５２】
いくつかの実施態様において、第１の宿主細胞及び第２の宿主細胞を別々の培養液中で培養し、混合前に第１の半抗体及び第２の半抗体を第１の宿主細胞及び第２の宿主細胞の培養物から別々に精製する。ある実施態様において、第１の宿主細胞及び第２の宿主細胞を別々の培養液中で培養し、培養物を組み合わせ、細胞をペレット状にし、任意選択でホモジナイズし、及び／又は溶解させ、並びに任意の好適な方法により第１の半抗体及び第２の半抗体を共精製する。ある実施態様において、プロテインＡ精製により第１の半抗体及び第２の半抗体を共精製する。更なる実施態様において、混合培養液中で第１の宿主細胞及び第２の宿主細胞を共培養し、第１の半抗体及び第２の半抗体を共精製する。
【００５３】
宿主細胞は、例えば細菌細胞、酵母細胞、植物細胞、昆虫細胞又は哺乳動物細胞であることができる。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチド又は半抗体をＣＨＯ細胞等の哺乳動物細胞により産生する。ある他の実施態様において、宿主細胞は細菌細胞であり、特に大腸菌である。
【００５４】
ある追加の実施態様において、本発明の方法は、ステップ（ｄ）で形成したヘテロ多量体タンパク質又は二重特異性抗体を回収するステップを更に含む。構築したヘテロ多量体タンパク質を、本出願全体にわたって記載した方法により、又は当分野で既知の好適な方法により更に精製することができる。
【００５５】
更なる態様において、本発明は、ヒンジ含有ポリペプチド及び可溶化剤を含む組成物を提供し、組成物のｐＨはｐＨ４〜ｐＨ９であり、好ましくはｐＨ５〜９である。ある実施態様において、組成物のｐＨはｐＨ５以上であり、ｐＨ５．５以上であり、ｐＨ５．７以上であり、ｐＨ５より高く、ｐＨ５．５より高く、ｐＨ５．７より高く、５〜９であり、５〜８であり、５．５〜８であり、５．５〜９であり、５．７〜８であり、５．７〜９であり、６〜８であり、６〜９であり、７〜８であり、７．５〜８．５であり、又は７〜８．５である。ある実施態様において、可溶化剤は、アルギニン、ヒスチジン及びスクロースからなる群から選択され、好ましくはアルギニン及び／又はヒスチジンである。ある他の実施態様において、アルギニンはアルギニン塩であり、及び／又はヒスチジンはヒスチジン塩である。ある他の実施態様において、アルギニンはアルギニン誘導体であり、及び／又はヒスチジンはヒスチジン誘導体である。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはＬ−アルギニン又はＬ−ヒスチジンである。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニンＨＣｌ又はヒスチジンＨＣｌである。
【００５６】
ある特定の実施態様において、可溶化剤はアルギニン又はヒスチジンである。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンは、２０ｍＭ、５０ｍＭ、２００ｍＭ、４００ｍＭ、２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜３００ｍＭ又は５０ｍＭ〜４００ｍＭの濃度で存在する。ある特定の実施態様において、組成物はアルギニン及びヒスチジンの両方を含み、それぞれ２０ｍＭ、５０ｍＭ、２００ｍＭ、４００ｍＭ、２０ｍＭ〜１Ｍ、２０ｍＭ〜１Ｍ未満、２０ｍＭ〜２００ｍＭ、２０ｍＭ〜４００ｍＭ、２０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜１００ｍＭ、５０ｍＭ〜２００ｍＭ、５０ｍＭ〜３００ｍＭ又は５０ｍＭ〜４００ｍＭの濃度で存在する。ある他の実施態様において、組成物はグアニジンＨＣｌ又は尿素を含まない。ある実施態様において、組成物は、安定化剤を代替として又は追加として含む。
【００５７】
ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。ある他の特定の実施態様において、組成物は１種のみのヒンジ含有ポリペプチド又は半抗体を含む。ある実施態様において、組成物は、ノブ半抗体である１種のみの半抗体を含む。ある他の実施態様において、組成物は、ホール半抗体である１種のみの半抗体を含む。
【００５８】
ある特定の実施態様において、組成物は第２のヒンジ含有ポリペプチドを更に含み、第１のヒンジ含有ポリペプチドはノブを含み、及び第２のヒンジ含有ポリペプチドはホールを含む。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体を含む。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは半抗体である。ある他の実施態様において、半抗体はＩｇＧ１アイソタイプ、ＩｇＧ２アイソタイプ又はＩｇＧ４アイソタイプである。
【００５９】
他に文脈が明確な指示をしていない限り、本明細書に開示した全実施態様を組み合わせることができる。加えて、上述した任意の及び全ての実施態様は、他に文脈が明確な指示をしていない限り、本発明の任意の及び全ての態様に適用される。
【００６０】
本発明の他の目的、特徴及び利点は、以下の詳細な説明から明らかになるだろう。しかしながら、詳細な説明及び具体的な例は本発明の好ましい実施態様を示しているが、本発明の範囲及び趣旨内の様々な変更及び修正がこの詳細な説明から当業者に明らかになるであろうことから、単に例として与えられていることを理解しなくてはならない。
【図面の簡単な説明】
【００６１】
【図１Ａ】完全に酸化した半抗体を説明する図である。「ノブ」もしくは「ホール」又は他のヘテロ二量体化ドメインは示されていない。この図に描写する半抗体はＩｇＧ１アイソタイプである。他の免疫グロブリンのアイソタイプを、対応する鎖間結合及び鎖内結合を有する半抗体として予想することができることを当業者は認識しよう。インタクトな抗体では、ヒンジのシステインは鎖間ジスルフィド結合を形成することになる。
【図１Ｂ】ヘテロ多量体化ドメインを有する完全長の二重特異性抗体を説明する図である。ヒンジ領域における重鎖間ジスルフィド結合は描写されていない。示したヘテロ多量体化ドメインはノブイントゥホール方式である。
【図１Ｃ】ヘテロ多量体化ドメイン（ノブイントゥホール）、フューリンで切断可能なテザー及び任意選択で追加のジスルフィド結合を含む二重特異性抗体（Ｓ３５４）を表現する図である。ヒンジ領域における重鎖間ジスルフィド結合も示す。フューリン切断部位を三角形で示す。フューリンで切断可能なテザーを、ノブを含む半抗体上に示すが、ホール半抗体上で、又はノブ半抗体及びホール半抗体の両方上で利用することもできる。
【図２Ａ】半抗体のコンフォメーションシフトへのｐＨの影響を実証する複合的なサイズ排除クロマトグラムを示すグラフである。上昇したｐＨによりホール半抗体コンフォメーションシフトが誘発され、より大きな流体力学的半径がもたらされることを示す。そのようなコンフォメーションシフトは、構築中にヘテロ二量体化を増強した。実施例２を参照。
【図２Ｂ】半抗体のコンフォメーションシフトへのｐＨの影響を実証する複合的なサイズ排除クロマトグラムを示すグラフである。上昇したｐＨにより非共有結合的なノブ半抗体ホモ二量体の形成が促進されたことを示す。そのようなコンフォメーションシフトは、構築中に二重特異性の形成を支持した。実施例２を参照。
【図３Ａ】アルギニン等の可溶化剤が、中間ｐＨにより誘発されるノブ半抗体の沈殿を低減したことを示す結果を示す図である。
【図３Ｂ】アルギニン又はヒスチジン塩酸塩等の可溶化剤が、中間ｐＨにより誘発されるノブ半抗体の沈殿を低減したことを示す結果を示す図である。
【図４Ａ】凝集及び二重特異性抗体の構築へのグルタチオン等の還元剤の影響を実証する複合的なクロマトグラムを示すグラフである。グルタチオンを２〜２００倍モル過剰で添加する。実施例３を参照。
【図４Ｂ】凝集及び二重特異性抗体の構築へのグルタチオン等の還元剤の影響を実証する複合的なクロマトグラムを示すグラフである。グルタチオンを２〜２００倍モル過剰で添加する。実施例３を参照。
【図５Ａ】ＩｇＧ１二重特異性抗体の形成（構築）速度への温度の影響を説明するグラフである。
【図５Ｂ】逆相クロマトグラフィーで分析した、温度の上昇により、ｐＨの保持を含む又は含まない２００倍モル過剰のグルタチオンの存在下でのノブイントゥホール二重特異性ＩｇＧ１抗体の構築が促進されたことを示すグラフである。図５Ｂはまた、構築前にコンフォメーションシフトを駆動するための半抗体プールのｐＨの保持の最適化により構築の速度及び効率が改善されたことも説明する。実施例４を参照。
【図６Ａ】形成された二重特異性抗体の安定化及び凝集体形成の低減へのＰＶＰ等の安定化剤の影響を説明するグラフである。
【図６Ｂ】逆相クロマトグラフィーで分析した、高温でＰＶＰ及びヒスチジンがノブイントゥホール二重特異性ＩｇＧ４抗体の構築を促進したことを示すグラフである。下の曲線：３００倍グルタチオン：抗体比（ｐＨ８．５）、約４００ｍＭのアルギニンによる室温構築；上の曲線：３５℃での２００倍グルタチオン：抗体比（ｐＨ８．０）、４％のＰＶＰ、５０ｍＭのアルギニン、１００ｍＭのヒスチジンによる加熱構築。
【図６Ｃ】３７℃及びｐＨ８で６時間にわたる加熱構築中でのＩｇＧ４ノブイントゥホール二重特異性抗体の凝集をＰＶＰが低減したことを実証するグラフである。実施例５を参照。
【図７】３７℃及びｐＨ８で３時間にわたり、ＩｇＧ４ホール半抗体の加熱により誘発される凝集をヒスチジンが低減したことを説明するグラフである。
【発明を実施するための形態】
【００６２】
これより、本発明は以下の定義及び例を使用するのみの参照によって詳細に説明される。本明細書で言及した全ての特許及び刊行物（そのような特許及び刊行物に開示された全ての配列を含む）を、出典明示により明示的に本明細書に援用する。
【００６３】
本明細書において他に定義しない限り、本明細書で使用した全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎ他、Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  Ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、第２版、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９９４）及びＨａｌｅ＆Ｍａｒｈａｍ、Ｔｈｅ  Ｈａｒｐｅｒ  Ｃｏｌｌｉｎｓ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ＯＦ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｈａｒｐｅｒ  Ｐｅｒｅｎｎｉａｌ、ＮＹ（１９９１）は、本発明で使用する多くの用語についての一般的な辞書を使うスキルの一種を提供する。本明細書に記載したものと類似の又は等価の任意の方法及び材料を本発明の実行又は試験で使用することができ、好ましい方法及び材料が記載されている。数値範囲は範囲を規定する数字を包含する。他に指示がない限りそれぞれ、核酸は５’から３’の方向へ左から右に記載されており、アミノ酸配列はアミノからカルボキシルの方向へ左から右に記載されている。実行者は、定義及び専門用語に関してＳａｍｂｒｏｏｋ他、１９８９及びＡｕｓｕｂｅｌ  ＦＭ他、１９９３を特に対象とする。特定の方法論、プロトコル及び記載した試薬を変更することができることから、本発明はこれらに限定されないことを理解すべきである。
【００６４】
数値範囲は範囲を規定する数字を包含する。
【００６５】
他に指示がない限りそれぞれ、核酸は５’から３’の方向へ左から右に記載されており、アミノ酸配列はアミノからカルボキシルの方向へ左から右に記載されている。
【００６６】
本明細書で使用する場合、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、他に文脈が明確な指示をしていない限り複数の指示対象を含む。例えば、「宿主細胞」への言及は１個又は複数個の宿主細胞を意味する。
【００６７】
本明細書に記載した表題は、本明細書を全体として参照することにより有することができる発明の様々な態様又は実施態様を限定するものではない。従って、すぐ下に定義する用語は、本明細書を全体として参照することにより、より完全に定義される。
【００６８】
他に文脈が明確な指示をしていない限り、本明細書に開示した全ての実施態様を組み合わせることができる。加えて、他に文脈が明確な指示をしていない限り、以下に記載した任意の及び全ての実施態様は、本発明の任意の及び全ての態様に適用される。
【００６９】
Ｉ．定義
本発明は、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質の産生方法を提供する。用語「ヒンジ含有ポリペプチド」は本明細書で使用する場合、少なくとも１個のヒンジ領域を含有するポリペプチドを指す。ある実施態様において、ヒンジ領域は複数のドメイン、例えば結合ドメインとエフェクタードメインとを接続し、二量体化又は多量体化のためにポリペプチドにある程度の構造的柔軟性を付与する。例として、結合ドメインは抗体の抗原結合ドメイン又は受容体のリガンド結合ドメインであることができ、エフェクタードメインは抗体のＦｃ成分であることができる。ある実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチドは第２のヒンジ含有ポリペプチドとは異なり、得られる二量体又は多量体はヘテロ二量体又はヘテロ多量体である。ある特定の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドは、同じ標的タンパク質上の２種の異なるエピトープに結合する。ある他の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチドは第２のヒンジ含有ポリペプチドの標的結合特異性とは異なる標的結合特異性を有し、得られるヘテロ二量体又はヘテロ多量体は２種以上の異なる標的タンパク質に結合する。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは、天然に生じるヘテロ二量体化ドメイン又は操作したヘテロ二量体化ドメインのいずれかを含む。ある特定の実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドはヒンジ領域中に、別のヒンジ含有ポリペプチドと１個又は複数個のジスルフィド結合を形成する能力を有する１個又は複数個のシステイン残基を含む。
【００７０】
ヒンジ含有ポリペプチドとして、半抗体、イムノアドヘシン及びこれらの機能的断片が挙げられるがこれらに限定されない。用語「機能的断片」は本明細書で使用する場合、ヒンジ含有ポリペプチドの断片、即ち完全長未満の断片を指し、該断片は所望の機能を依然として保持しており、例えば標的もしくは抗原結合活性、Ｆｃエフェクター活性及び／又は二量体化／多量体化能力を保持する。ある特定の実施態様において、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドはそれぞれ、異なる抗原結合特異性を有する半抗体であり、得られる二量体又は多量体は二重特異性抗体又は多重特異性抗体である。ある実施態様において、得られるヘテロ多量体タンパク質は半抗体及びイムノアドヘシンを含む。
【００７１】
用語「多重特異性抗体」は最も広い意味で使用され、具体的にはポリエプトープ特異性を有する抗体を包含する。そのような多重特異性抗体として、重鎖可変ドメイン（ＶＨ）及び軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含みＶＨＶＬユニットがポリエピトープ特異性を有する抗体、２個以上のＶＬドメイン及びＶＨドメインを有し各ＶＨＶＬユニットが異なるエピトープに結合する抗体、２個以上の単一可変ドメインを有し各単一可変ドメインが異なるエピトープに結合する抗体、完全長抗体、抗体断片、例えばＦａｂ、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、ｓｃＦｖ、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ及びトリアボディ、共有結合的に又は非共有結合的に連結されている抗体断片が挙げられるがこれらに限定されない。「ポリエピトープ特異性」は、同じ又は異なる標的（単数又は複数）上の２種以上の異なるエピトープに特異的に結合する能力を指す。「単一特異性」は、１種のエピトープのみに結合する能力を指す。一実施態様によれば、多重特異性抗体は、５μＭ〜０．００１ｐＭ、３μＭ〜０．００１ｐＭ、１μＭ〜０．００１ｐＭ、０．５μＭ〜０．００１ｐＭ又は０．１μＭ〜０．００１ｐＭの親和性で各エピトープに結合するＩｇＧ抗体である。
【００７２】
天然に生じる塩基性４鎖抗体ユニットは、２本の同一軽（Ｌ）鎖及び２本の同一重（Ｈ）鎖から構成されるヘテロ四量体糖タンパク質である（ＩｇＭ抗体は、Ｊ鎖と呼ばれる追加のポリペプチドと共に５個の塩基性ヘテロ四量体ユニットから成り、従って１０個の抗原結合部位を含有するが、分泌されたＩｇＡ抗体は、Ｊ鎖と共に２〜５個の塩基性４鎖ユニットを含む多価構築物を形成するように重合することができる）。ＩｇＧの場合には、４鎖ユニットは一般的に約１５０，０００ダルトンである。各Ｌ鎖は１個の共有ジスルフィド結合によりＨ鎖に連結されるが、２本のＨ鎖はＨ鎖のアイソタイプに応じて１個又は複数個のジスルフィド結合により互いに連結される。各Ｈ鎖及びＬ鎖はまた、規則正しく間隔が開いた鎖内ジスルフィド架橋も有する。各Ｈ鎖は、Ｎ末端において、可変ドメイン（ＶＨ）、続いてα鎖及びγ鎖のそれぞれに関する３個の定常ドメイン（ＣＨ）並びにμアイソタイプ及びεアイソタイプに関する４個のＣＨドメインを有する。各Ｌ鎖は、Ｎ末端に可変ドメイン（ＶＬ）、続いてＣ末端に定常ドメイン（ＣＬ）を有する。ＶＬはＶＨとアライメントされ、ＣＬは重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ１）とアライメントされる。特定のアミノ酸残基は軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとの間に界面を形成すると考えられている。ＶＨ及びＶＬの対合は、単一の抗原結合部位を共に形成する。様々なクラスの抗体の構造及び特性に関して、例えばＢａｓｉｃ  ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第８版、Ｄａｎｉｅｌ  Ｐ．Ｓｔｉｔｅｓ、Ａｂｂａ  Ｉ．Ｔｅｒｒ及びＴｒｉｓｔｒａｍ  Ｇ．Ｐａｒｓｌｏｗ（編）、Ａｐｐｌｅｔｏｎ＆Ｌａｎｇｅ、Ｎｏｒｗａｌｋ、ＣＴ、１９９４、７１頁及び第６章を参照。
【００７３】
任意の脊椎動物種に由来するＬ鎖を、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ及びラムダと呼ばれる２種の明確に異なるタイプのうちの一方に帰属させることができる。免疫グロブリンの重鎖（ＣＨ）の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンを様々なクラス又はアイソタイプに帰属させることができる。５つのクラスの免疫グロブリン：それぞれα、δ、ε、γ及びμと命名された重鎖を有するＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭが存在する。γクラス及びαクラスは、ＣＨ配列及び機能における比較的小さな相違に基づいてサブクラスに更に分類されており、例えば、ヒトは以下のサブクラス：ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２を発現する。
【００７４】
用語「可変」は、可変ドメインのあるセグメントの配列が抗体間で広範囲にわたって異なる事実を指す。Ｖドメインは抗原結合を媒介し、その特定の抗原に対する特定の抗体の特異性を定義する。しかしながら、可変性は、可変ドメインの１１０個のアミノ酸の範囲にわたって均等に分布していない。その代わりに、Ｖ領域は、それぞれ９〜１２個のアミノ酸長である「超可変領域」と呼ばれる極度に可変なより短い領域によって分けられている１５〜３０個のアミノ酸のフレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる相対的に不変なストレッチからなる。天然の重鎖及び軽鎖の可変ドメインはそれぞれ４個のＦＲを含み、３個の超可変領域によって接続されたベータシート配置を主に採用しており、ベータシート構造を接続し場合によってはベータシート構造の一部を形成するループを形成する。各鎖における複数の超可変領域は、ＦＲによって近接してまとめて保持されており、他の鎖に由来する超可変領域と共に抗体の抗原結合部位の形成に寄与する（Ｋａｂａｔ他、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ、第５版、Ｐｕｂｌｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ、Ｂｅｔｈｅｓｄａ、ＭＤ（１９９１）参照）。定常ドメインは、抗体の抗原への結合に直接関与はしないが、抗体依存性細胞傷害（ＡＤＣＣ）における抗体の関与等の様々なエフェクター機能を示す。
【００７５】
用語「超可変領域」、「ＨＶＲ］又は「ＨＶ」は本明細書で使用する場合、配列中において超可変である及び／又は構造的に定義されたループを形成する抗体可変ドメインの領域を指す。一般的に、抗体は６個のＨＶＲ、即ちＶＨ中に３個（Ｈ１、Ｈ２、Ｈ３）及びＶＬ中に３個（Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３）を含む。天然の抗体において、Ｈ３及びＬ３は６個のＨＶＲのうちで最も多くの多様性を示し、Ｈ３は特に、抗体に微細特異性をもたらす独特な役割を果たすと考えられる。例えばＸｕ他、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ１３：３７〜４５（２０００）；Ｊｏｈｎｓｏｎ及びＷｕ、ｉｎ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ２４８：１〜２５（Ｌｏ編、Ｈｕｍａｎ  Ｐｒｅｓｓ、Ｔｏｔｏｗａ、ＮＪ、２００３）参照。実際には、重鎖のみからなる天然に生じるラクダ科の抗体は、軽鎖無しで機能的であり安定している。例えばＨａｍｅｒｓ−Ｃａｓｔｅｒｍａｎ他、Ｎａｔｕｒｅ３６３：４４６〜４４８（１９９３）；Ｓｈｅｒｉｆｆ他、Ｎａｔｕｒｅ  Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．３：７３３〜７３６（１９９６）参照。
【００７６】
ＨＶＲの多くの描写が使用されており、本明細書に包含される。Ｋａｂａｔの相補性決定領域（ＣＤＲ）は配列の可変性に基づいており、最も一般的使用される（Ｋａｂａｔ他、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ、第５版、Ｐｕｂｌｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ、Ｂｅｔｈｅｓｄａ、ＭＤ．（１９９１））。Ｃｈｏｔｈｉａは、代わりに構造的ループの位置に言及している（Ｃｈｏｔｈｉａ及びＬｅｓｋ  Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１〜９１７（１９８７））。ＡｂＭ  ＨＶＲはＫａｂａｔのＨＶＲとＣｈｏｔｈｉａの構造的ループとの間の妥協を表しており、Ｏｘｆｏｒｄ  ＭｏｌｅｃｕｌａｒのＡｂＭ抗体モデリングソフトウェアにより使用される。「接触」ＨＶＲは、利用可能な複合体結晶構造の分析に基づく。これらのＨＶＲのそれぞれに由来する残基を以下に記載する。
ループ  Ｋａｂａｔ        ＡｂＭ            Ｃｈｏｔｈｉａ    接触

Ｌ１    Ｌ２４〜Ｌ３４    Ｌ２４〜L３４    Ｌ２６〜L３２    Ｌ３０〜L３６
Ｌ２    Ｌ５０〜L５６    Ｌ５０〜L５６    Ｌ５０〜L５２    Ｌ４６〜L５５
Ｌ３    Ｌ８９〜L９７    Ｌ８９〜L９７    Ｌ９１〜L９６    Ｌ８９〜L９６
Ｈ１    Ｈ３１〜Ｈ３５Ｂ  Ｈ２６〜Ｈ３５Ｂ  Ｈ２６〜Ｈ３２    Ｈ３０〜Ｈ３５Ｂ
（Ｋａｂａｔ番号付け）
Ｈ１    Ｈ３１〜Ｈ３５    Ｈ２６〜Ｈ３５    Ｈ２６〜Ｈ３２    Ｈ３０〜Ｈ３５
（Ｃｈｏｔｈｉａ番号付け）
Ｈ２    Ｈ５０〜Ｈ６５    Ｈ５０〜Ｈ５８    Ｈ５３〜Ｈ５５    Ｈ４７〜Ｈ５８
Ｈ３    Ｈ９５〜Ｈ１０２  Ｈ９５〜Ｈ１０２  Ｈ９６〜Ｈ１０１  Ｈ９３〜Ｈ１０１
【００７７】
ＨＶＲは、以下の「拡大ＨＶＲ」を含むことができる：ＶＬにおける２４〜３６位又は２４〜３４位（Ｌ１）、４６〜５６位又は５０〜５６位（Ｌ２）及び８９〜９７位又は８９〜９６位（Ｌ３）、並びにＶＨにおける２６〜３５位（Ｈ１）、５０〜６５位又は４９〜６５位（Ｈ２）及び９３〜１０２位、９４〜１０２位又は９５〜１０２位（Ｈ３）。可変ドメイン残基は、これらの各々を定義するためにＫａｂａｔ他、上記に従って番号付けられる。
【００７８】
「フレームワーク領域」（ＦＲ）は、ＣＤＲ残基以外の可変ドメイン残基である。各可変ドメインは概して、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４として特定される４個のＦＲを有する。ＣＤＲがＫａｂａｔに従って定義される場合、軽鎖のＦＲ残基は残基１〜２３位（ＬＣＦＲ１）、３５〜４９位（ＬＣＦＲ２）、５７〜８８位（ＬＣＦＲ３）及び９８〜１０７位（ＬＣＦＲ４）にほぼ位置しており、重鎖のＦＲ残基は重鎖残基における残基１〜３０位（ＨＣＦＲ１）、３６〜４９位（ＨＣＦＲ２）、６６〜９４位（ＨＣＦＲ３）及び１０３〜１１３位（ＨＣＦＲ４）にほぼ位置する。ＣＤＲが超可変ループに由来するアミノ酸残基を含む場合、軽鎖のＦＲ残基は軽鎖における残基１〜２５位（ＬＣＦＲ１）、３３〜４９位（ＬＣＦＲ２）、５３〜９０位（ＬＣＦＲ３）及び９７〜１０７位（ＬＣＦＲ４）にほぼ位置しており、重鎖のＦＲ残基は重鎖残基における残基１〜２５位（ＨＣＦＲ１）、３３〜５２位（ＨＣＦＲ２）、５６〜９５位（ＨＣＦＲ３）及び１０２〜１１３位（ＨＣＦＲ４）にほぼ位置する。場合によっては、ＣＤＲがＫａｂａｔにより定義されたＣＤＲと超可変ループのＣＤＲとの両方に由来するアミノ酸を含むとき、それに応じてＦＲ残基を調整することになる。例えば、ＣＤＲＨ１がアミノ酸Ｈ２６〜Ｈ３５位を含む場合、重鎖のＦＲ１残基は１〜２５位に存在し、ＦＲ２残基は３６〜４９位に存在する。
【００７９】
「ヒトコンセンサスフレームワーク」は、ヒト免疫グロブリンのＶＬフレームワーク配列又はＶＨフレームワーク配列の選択において最も一般的に生じるアミノ酸残基を表すフレームワークである。一般的に、ヒト免疫グロブリンのＶＬ配列又はＶＨ配列の選択は、可変ドメイン配列のサブグループから行なわれる。一般的に、配列のサブグループはＫａｂｏｔ等でのサブグループである。一実施態様において、ＶＬに関してサブグループはＫａｂａｔ等でのサブグループカッパＩである。一実施態様において、ＶＨに関してサブグループはＫａｂａｔ等でのサブグループＩＩＩである。
【００８０】
「インタクトな」抗体な一例として、抗原結合部位と、ＣＬ並びに少なくとも重鎖定常ドメイン、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３とを含む抗体が挙げられる。定常ドメインは、天然配列の定常ドメイン（例えばヒトの天然配列の定常ドメイン）又はそのアミノ酸配列多様体であることができる。
【００８１】
「抗体断片」はインタクトな抗体の一部を含み、好ましくはインタクトな抗体の抗原結合領域又は可変領域を含む。抗体断片の例として、Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２断片及びＦｖ断片；ダイアボディ（Ｄｂ）；タンデムダイアボディ（ｔａＤｂ）；線状抗体（例えば米国特許第５，６４１，８７０号、実施例２；Ｚａｐａｔａ他、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．８（１０）：１０５７〜１０６２（１９９５））；ワンアームド抗体；単一可変ドメイン抗体；ミニボディ；単鎖抗体分子；及び抗体断片から形成された多重特異性抗体（例えばＤｂ−Ｆｃ、ｔａＤｂ−Ｆｃ、ｔａＤｂ−ＣＨ３及び（ｓｃＦＶ）４−Ｆｃが挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられる。
【００８２】
用語「半抗体」は本明細書で使用する場合、１本の免疫グロブリン軽鎖を伴う１本の免疫グロブリン重鎖を指す。例示的な半抗体を図１Ａに描写する。半抗体はその断片を包含することができ、単一の可変ドメインからなる抗原結合ドメイン、例えばラクダ科を起源とする単一の可変ドメインからなる抗原結合ドメインを有することもできることを当業者は容易に認識するだろう。
【００８３】
本発明者らは、低いｐＨでプロテインＡカラム又は他のマトリックスから溶出した半抗体のｐＨの最適化又は調整により、半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドのコンフォメーションシフトが誘発されることを予想外にも発見した。本開示全体にわたってｐＨの保持又は中間ｐＨの保持と称されることがある中間ｐＨへのｐＨ最適化により、半抗体の沈殿又は凝集が生じる可能性がある。そのため、ある実施態様において、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法は、第１のヒンジ含有ポリペプチド又は第２のヒンジ含有ポリペプチドをそれぞれ第１の可溶化剤又は第２の可溶化剤の存在下においてｐＨ５〜９で提供するステップを含む。
【００８４】
可溶化剤は本明細書で使用する場合、半抗体等のヒンジ含有ポリペプチドの沈殿を予防する又は低減する試薬として定義される。好適な可溶化剤として、アルギニン及びヒスチジン又はこれらの塩もしくは誘導体、並びにスクロースが挙げられるがこれらに限定されない。ある実施態様において、可溶化剤はアルギニン及び／又はヒスチジンである。ある実施態様において、可溶化剤は、中間ｐＨの保持及び／又は加熱により誘発される沈殿を予防する、又は低減する。ある特定の実施態様において、可溶化剤を中間ｐＨの保持前（即ち中間ｐＨへの調整前）及び／又は加熱前に添加する。ある実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニン塩又はヒスチジン塩である。ある他の実施態様において、アルギニン又はヒスチジンはアルギニン誘導体又はヒスチジン誘導体である。沈殿の低減により、所望の構築最終産物の収率の増加をもたらすことができる。
【００８５】
一般的なタンパク質の調製及び精製のためにタンパク質を可溶化すべく、イミダゾール及びグアニジンが使用されている。しかしながら、イミダゾール及びグアニジンがヒスチジン又はアルギニンと関連してではなく単独ではそれぞれ、二重特異性抗体等の本明細書に記載した、構築したヘテロ多量体タンパク質の全収率を改善するには不十分であったことが予想外にも発見された。ある実施態様において、イミダゾール及びグアノシンはタンパク質を変性させる可能性がある。
【００８６】
同様に、グアニジンＨＣｌ等の界面活性剤及び尿素は通常、一般的な凝集／沈殿を低減するために使用されるが、それらはタンパク質を完全に変性させる可能性がある。そのため、ある実施態様において、可溶化剤は、目的のタンパク質を変性させることなく沈殿を予防する、又は低減する。そのため、ある特定の実施態様において、可溶化剤はグアニジンＨＣｌ、グアニジン、イミダゾール又は尿素ではない。及びある他の実施態様において、本発明の組成物はグアニジンＨＣｌ又は尿素を含まない。ある他の実施態様において、可溶化剤はＴｗｅｅｎ又はＰＥＧではない。
【００８７】
加えて、例えば各半抗体の中間ｐＨの保持中に、又はヒンジ含有ポリペプチドもしくは半抗体の混合時のもしくは混合直後の構築中に安定化剤を添加することができる。安定化剤を、本発明の方法の複数のステップのうちの１つもしくは複数の又は全ての反応に添加し、構築前、構築中及び／又は構築後にヒンジ含有ポリペプチド又は半抗体の凝集を予防する又は低減することができる。
【００８８】
凝集体を、高分子量種として、及び半抗体と関連して１５０ｋＤａを超える分子量を有する高分子量種として検出することができる。例えばサイズ排除クロマトグラフィー又は他の好適な方法により凝集体を検出して定量化することができる。ある他の実施態様において、サイズ排除クロマトグラフィーで検出した凝集体を０．２μｍの無菌フィルタに通すことができる。一方、沈殿したタンパク質は、非常に大きな複合体を形成する可能性がある変性タンパク質又は凝集タンパク質から構成されている可能性がある。いくつかの試薬、例えばイミダゾール、３−（Ｎ−モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、２−（Ｎ−モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）、シクロデキストリン、ＣｕＳＯ４及びＮＡＯＡｃが試験されており、安定化剤としての使用に効果的でない又は適していないと判断された。そのため、ある実施態様において、安定化剤は無機塩又は遷移金属を含まない。好適な安定化剤としてＰＶＰ、ヒスチジン及びアルギニンが挙げられるがこれらに限定されない。凝集の低減により、所望の構築最終産物の収率の増加をもたらすことができる。
【００８９】
ＰＶＰは、ピロリドン基を有する水溶性の非荷電ポリマーである。ある実施態様において、他の非荷電極性ポリマー、他の試薬又は化合物、特に本明細書に記載した好適な安定化剤と類似の構造及び特性を有する化合物が本発明での使用に好適な安定化剤であることができる。それは、本明細書に記載した方法等の当分野で既知の方法により凝集のレベルへの化合物の影響を分析することで好適な安定化剤を決定する当業者の能力の範囲内である。
【００９０】
試薬を可溶化剤及び安定化剤の両方として特徴付けることができる。例えば、アルギニンを、中間ｐＨの保持中及び／又は加熱中における半抗体の沈殿を低減するための可溶化剤として、並びに構築ステップ中における凝集を低減するための安定化剤として使用することができる。同様に、ヒスチジンを、中間ｐＨの保持中及び／又は加熱中における沈殿を低減するための可溶化剤として、並びに半抗体の凝集を低減するための安定化剤として使用することができる。任意の特定のメカニズムに限定することなく、ある実施態様において、可溶化剤及び安定化剤の両方は、凝集をもたらす可能性があるタンパク質の界面上の疎水性パッチの相互作用を防止することによって作用することができる。他の実施態様において、可溶化剤及び安定化剤の両方は、タンパク質の望ましくない相互作用を防止するために包接体を形成することによって機能することができる。
【００９１】
用語「単鎖半抗体」は本明細書で使用する場合、ＶＬドメイン、任意選択でＣＬドメイン、テザー、ＶＨドメイン、任意選択でＣＨ１ドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む単鎖ポリペプチドを指し、前記ドメインは、以下：ＶＬ−テザー−ＶＨ−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３又はＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている。
【００９２】
語句「単一ドメイン抗体」（ｓｄＡｂ）又は「単一可変ドメイン（ＳＶＤ）抗体」は、単一可変ドメイン（ＶＨ又はＶＬ）が抗原結合を付与することができる抗体を一般的に指す。換言すると、単一可変ドメインは、標的抗原を認識するために別の可変ドメインと相互作用する必要がない。単一ドメイン抗体の例として、ラクダ科（ラマ及びラクダ）及び軟骨魚類（例えばテンジクザメ）に由来するもの、並びにヒト及びマウスの抗体からの組換え法により得られるものが挙げられる（Ｎａｔｕｒｅ（１９８９）３４１：５４４〜５４６；Ｄｅｖ  Ｃｏｍｐ  Ｉｍｍｕｎｏｌ（２００６）３０：４３〜５６；Ｔｒｅｎｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｓｃｉ（２００１）２６：２３０〜２３５；Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ（２００３）：２１：４８４〜４９０；ＷＯ２００５／０３５５７２；ＷＯ０３／０３５６９４；Ｆｅｂｓ  Ｌｅｔｔ（１９９４）３３９：２８５〜２９０；ＷＯ００／２９００４；ＷＯ０２／０５１８７０）。
【００９３】
語句「線状抗体」は、Ｚａｐａｔａ他、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．８（１０）：１０５７〜１０６２（１９９５）に記載されている抗体を一般的に指す。簡潔に言うと、これらの抗体は、相補的軽鎖ポリペプチドと共に一対の抗原結合領域を形成する一対のタンデムＦｄセグメント（ＶＨ−ＣＨ１−ＶＨ−ＣＨ１）を含む。線状抗体は、二重特異性又は単一特異性であることができる。
【００９４】
本明細書で述べる用語「ノブイントゥホール」又は「ＫｎＨ」技術は、２個のポリペプチドが相互作用する界面において一方のポリペプチドに突起（ノブ）を導入し他方のポリペプチドに空洞（ホール）を導入することにより、インビトロ又はインビボで２個のポリペプチドを合わせて対合を導く技術を指す。例えば、ＫｎＨは、抗体のＦｃ：Ｆｃ結合界面、ＣＬ：ＣＨ１界面又はＶＨ／ＶＬ界面に導入されている（例えばＵＳ２００７／０１７８５５２、ＷＯ９６／０２７０１１、ＷＯ９８／０５０４３１及びＺｈｕ他（１９９７）Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ６：７８１〜７８８）。このことは、多重特異性抗体の製造中に２本の異なる重鎖を合わせて対合を駆動するのに特に有用である。例えば、Ｆｃ領域にＫｎＨを有する多重特異性抗体は、各Ｆｃ領域に連結された単一可変ドメインを更に含むことができ、又は類似したもしくは異なる軽鎖可変ドメインと対合する様々な重鎖可変ドメインを更に含むことができる。ＫｎＨ技術を使用して、２個の異なる受容体細胞外ドメインを合わせて対合させることができ、又は異なる標的認識配列を含む任意の他のポリペプチド配列（例えばアフィボディ、ペプチボディ及び他のＦｃ融合体等）を対合させることもできる。
【００９５】
抗体のパパイン消化により、「Ｆａｂ」断片と呼ばれる２個の同一の抗原結合断片及び残りの「Ｆｃ」断片（名称は容易に結晶化する能力を反映する）が産生される。Ｆａｂ断片は、Ｈ鎖の可変領域ドメイン（ＶＨ）に加えてＬ鎖全体と、１本の重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ１）とからなる。抗体のペプシン処理により、二価抗原結合活性を有する２個のジスルフィド連結Ｆａｂ断片にほぼ相当し、依然として抗原に架橋することができる単一の大きなＦ（ａｂ’）２断片が得られる。Ｆａｂ’断片は、抗体のヒンジ領域に由来する１個又は複数個のシステインを含むＣＨ１ドメインのカルボキシル末端において追加の残基をほとんど有しないことにより、Ｆａｂ断片と異なる。Ｆａｂ’−ＳＨは本明細書では、定常ドメインのシステイン残基（単数又は複数）が遊離チオール基を有するＦａｂ’に関する名称である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、間にヒンジのシステインを有するＦａｂ’断片の対としてもともと産生された。抗体断片の他の化学的カップリングも知られている。
【００９６】
Ｆｃ断片は、ジスルフィドにより結合した両Ｈ鎖のカルボキシ末端部分を含む。抗体のエフェクター機能はＦｃ領域の配列により決定され、この領域はまた、特定のタイプの細胞で見られるＦｃ受容体（ＦｃＲ）により認識される部分でもある。
【００９７】
「Ｆｖ」は、密接に及び非共有結合的に会合した１個の重鎖可変領域ドメイン及び１個の軽鎖可変領域ドメインの二量体からなる。これらの２個のドメインの折り畳みにより、抗原結合のためのアミノ酸残基に寄与する及び抗体に抗原結合特異性を付与する６個の超可変ループ（それぞれＨ鎖及びＬ鎖に由来する３個のループ）が生じる。しかしながら、単一可変ドメイン（又は抗原に特異的な３個のＣＤＲのみを含む半分のＦｖ）でさえ抗原を認識して結合する能力を有するが、結合部位全体よりも低い親和性であることが多い。
【００９８】
「ｓＦｖ」又は「ｓｃＦｖ」とも略される「単鎖Ｆｖ」は、単一のポリペプチド鎖中に接続されたＶＨ抗体ドメイン及びＶＬ抗体ドメインを含む抗体断片である。好ましくは、ｓＦｖポリペプチドは、ＶＨドメインとＶＬドメインとの間にポリペプチドリンカーを更に含み、ポリペプチドリンカーによりｓＦｖが抗原結合のための所望の構造を形成することが可能になる。ｓＦｖの総説に関して、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ、Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ、第１１３巻、Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ及びＭｏｏｒｅ編、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、２６９〜３１５頁（１９９４）；Ｍａｌｍｂｏｒｇ他、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ１８３：７〜１３、１９９５参照。
【００９９】
用語「ダイアボディ」は、ｓＦｖ断片（前段落を参照）をＶＨドメインとＶＬドメインとの間の短いリンカー（約５〜１０個の残基）と共に構築することにより調製され、その結果、Ｖドメインの鎖内対合ではなく鎖間対合が得られ、二価断片、即ち２個の抗原結合部位を有する断片が生じる小抗体断片を指す。二重特異性ダイアボディは、２個の抗体のＶＨドメイン及びＶＬドメインが異なるポリペプチド鎖上に存在する２個の「交差」ｓＦｖ断片のヘテロ二量体である。ダイアボディは、例えばＥＰ４０４，０９７；ＷＯ９３／１１１６１；及びＨｏｌｌｉｎｇｅｒ他、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９０：６４４４〜６４４８（１９９３）により詳細に記載されている。
【０１００】
用語「ワンアームド抗体」又は「複数のワンアームド抗体」は、（１）ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン又はＣＨ２−ＣＨ３ドメインを含むポリペプチドにペプチド結合により連結された可変ドメイン、及び（２）第２のＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン又はＣＨ２−ＣＨ３ドメインを含む抗体を指し、可変ドメインは第２のＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン又はＣＨ２−ＣＨ３ドメインを含むポリペプチドにペプチド結合により連結されていない。一実施態様において、ワンアームド抗体は３種のポリペプチド、即ち（１）可変ドメイン（例えばＶＨ）、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３を含む第１のポリペプチド、（２）可変ドメイン（例えばＶＬ）及びＣＬドメインを含む第２のポリペプチド、並びに（３）ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む第３のポリペプチドを含む。ある実施態様において、第３のポリペプチドは可変ドメインを含まない。別の実施態様において、ワンアームド抗体は、複数の定常重鎖を連結するジスルフィド結合を形成する２個のシステイン残基を含有する部分的ヒンジ領域を有する。一実施態様において、ワンアームド抗体の可変ドメインは抗原結合領域を形成する。別の実施態様において、ワンアームド抗体の可変ドメインは単一可変ドメインであり、各単一可変ドメインは抗原結合領域である。
【０１０１】
本発明の抗体は、重鎖及び／又は軽鎖の一部が特定の種に由来する又は特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一である又は相同であるが、鎖（単数又は複数）の残余が別の種に由来する又は別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一である又は相同である「キメラ」抗体、並びにそのような抗体の断片（但し、それらは所望の生物学的活性を示す）であることができる（米国特許第４，８１６，５６７号；及びＭｏｒｒｉｓｏｎ他、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ８１：６８５１〜６８５５（１９８４））。本明細書における目的のキメラ抗体として、非ヒト霊長類（例えば旧世界ザル、類人猿等）及びヒトの定常領域配列に由来する可変ドメイン抗原結合配列を含む霊長類化抗体が挙げられる。
【０１０２】
非ヒト（例えば齧歯動物）抗体の「ヒト化」形は、非ヒト抗体に由来する最小配列を含有するキメラ抗体である。ほとんどの場合、ヒト化抗体は、レシピエントの超可変領域に由来する残基が、所望の抗体特異性、親和性及び能力を有する、マウス、ラット、ウサギ又は非ヒト霊長類等の非ヒト種（ドナー抗体）の超可変領域に由来する残基に置き換えられているヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）である。いくつかの例において、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域（ＦＲ）残基は、対応する非ヒト残基に置き換えられる。更に、ヒト化抗体は、レシピエント抗体中又はドナー抗体中には見られない残基を含むことができる。これらの修飾は、抗体の性能を更に改良するために行なわれる。一般的に、ヒト化抗体は、超可変ループの全て又は実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンの超可変ループに対応するとともにＦＲの全て又は実質的に全てがヒト免疫グロブリン配列のＦＲである少なくとも１個の、典型的には２個の可変ドメインの実質的に全てを含む。ヒト化抗体は、免疫グロブリンの定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンのものを任意選択で含む。更なる詳細に関して、Ｊｏｎｅｓ他、Ｎａｔｕｒｅ３２１：５２２〜５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ他、Ｎａｔｕｒｅ３３２：３２３〜３２９（１９８８）；及びＰｒｅｓｔａ、Ｃｕｒｒ．Ｏｐ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．２：５９３〜５９６（１９９２）参照。
【０１０３】
「複合体」又は「複合体化」は本明細書で使用する場合、ペプチド結合ではない結合及び／又は力（例えばファンデルワールス力、疎水性力、親水性力）により互いに相互作用する２個以上の分子の会合体を指す。一実施態様において、複合体はヘテロ多量体である。用語「タンパク質複合体」又は「ポリペプチド複合体」は本明細書で使用する場合、タンパク質複合体中のタンパク質にコンジュゲートした非タンパク質エンティティ（例えば毒素又は検出剤等の化学分子が挙げられるがこれらに限定されない）を有する複合体を含むことを理解しなければならない。
【０１０４】
用語「ヘテロ多量体（heteromultimer）」又は「ヘテロ多量体（heteromultimeric）」は本明細書で使用する場合、非ペプチド性、共有結合（例えばジスルフィド結合）及び／又は非共有結合性相互作用（例えば水素結合、イオン結合、ファンデルワールス力及び疎水性相互作用）により互いに相互作用する２個以上のポリペプチドを表し、少なくとも２個の分子は互いに異なる配列を有する。
【０１０５】
本明細書で使用する場合、「ヘテロ多量体化ドメイン」は、生体分子に対する、ヘテロ多量体形成を促進してホモ多量体形成を阻害するための改変又は追加を指す。ホモ二量体よりもヘテロ二量体の形成への強い優先度を有する任意のヘテロ二量体化ドメインは本発明の範囲内である。実例として、例えば米国特許出願第２００３００７８３８５号（Ａｒａｔｈｏｏｎ他、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ；ノブイントゥホールを説明する）；ＷＯ２００７１４７９０１（Ｋｊａｅｒｇａａｒｄ他、Ｎｏｖｏ  Ｎｏｒｄｉｓｋ：イオン性相互作用を説明する）；ＷＯ２００９０８９００４（Ｋａｎｎａｎ他、Ａｍｇｅｎ：静電気的ステアリング効果を説明する）；ＷＯ２０１０／０３４６０５（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎ他、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ；コイルドコイルを説明する）が挙げられるがこれらに限定されない。また、例えば、ロイシンジッパーを説明するＰａｃｋ、Ｐ．＆Ｐｌｕｅｃｋｔｈｕｎ、Ａ．、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ３１、１５７９〜１５８４（１９９２）又はヘリックス−ターン−ヘリックスモチーフを説明するＰａｃｋ他、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ１１、１２７１〜１２７７（１９９３）も参照。語句「ヘテロ多量体化ドメイン」及び「ヘテロ二量体化ドメイン」は本明細書において同じ意味で使用される。ある実施態様において、ヒンジ含有ポリペプチドは、１個又は複数個のヘテロ二量体化ドメインを含む。
【０１０６】
本明細書で使用する場合、用語「イムノアドヘシン」は、異種タンパク質（「アドヘシン」）の結合特異性と免疫グロブリン定常ドメインのエフェクター機能とを組み合わせる分子を指す。構造的には、イムノアドヘシンは、所望の結合特異性を有するアミノ酸配列と免疫グロブリン定常ドメイン配列（例えばＩｇＧのＣＨ２配列及び／又はＣＨ３配列）との融合体を含み、アミノ酸配列は抗体の抗原認識結合部位以外である（即ち、抗体の定常領域と比べて「異種」である）。例示的アドヘシン配列として、目的のタンパク質に結合する受容体又はリガンドの一部を含む隣接アミノ酸配列が挙げられる。アドヘシン配列はまた、目的のタンパク質に結合するが受容体配列又はリガンド配列ではない配列（例えばペプチボディにおけるアドヘシン配列）であることもできる。そのようなポリペプチド配列を、ファージディスプレイ技術及びハイスループット選別法等の様々な方法により選択する又は同定することができる。イムノアドヘシンにおける免疫グロブリン定常ドメイン配列を、任意の免疫グロブリン、例えばＩｇＧ−１サブタイプ、ＩｇＧ−２サブタイプ、ＩｇＧ−３サブタイプもしくはＩｇＧ−４サブタイプ、ＩｇＡ（ＩｇＡ−１及びＩｇＡ−２等）、ＩｇＥ、ＩｇＤ又はＩｇＭから得ることができる。
【０１０７】
目的の抗原に「結合する」本発明の抗体は、十分な親和性で抗原に結合し、その結果タンパク質又は抗原を発現する細胞もしくは組織を標的とする診断及び／又は治療薬として有用であり、他のタンパク質と有意に交差反応しない抗体である。そのような実施態様において、「非標的」タンパク質への抗体の結合の程度は、蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）分析又は放射性免疫沈降法（ＲＩＡ）もしくはＥＬＩＳＡで測定した、その特定の標的タンパク質への抗体の結合の約１０％未満となる。抗体の標的分子への結合に関して、特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド標的上のエピトープ「への特異的結合」又は「に特異的に結合する」又は「に特異的である」という用語は、非特異的な相互作用とは適度に異なる結合を意味する（例えば非特異的な相互作用はウシ血清アルブミン又はカゼインへの結合であることができる）。例えば分子の結合を対照分子の結合と比較して測定することにより、特異的結合を測定することができる。例えば、標的、例えば過剰な非標識標的に類似する対照分子との競合により、特異的結合を測定することができる。この場合には、プローブへの標識標的の結合が過剰な非標識標的により競合的に阻害される場合に特異的結合が示される。本明細書で使用する場合、特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド標的上のエピトープ「への特異的結合」又は「に特異的に結合する」又は「に特異的である」という用語を、例えば標的に対して約２００ｎＭ以上、あるいは約１５０ｎＭ以上、あるいは約１００ｎＭ以上、あるいは約６０ｎＭ以上、あるいは約５０ｎＭ以上、あるいは約４０ｎＭ以上、あるいは約３０ｎＭ以上、あるいは約２０ｎＭ以上、あるいは約１０ｎＭ以上、あるいは約８ｎＭ以上、あるいは約６ｎＭ以上、あるいは約４ｎＭ以上、あるいは約２ｎＭ以上、あるいは約１ｎＭ以上又はより高いＫｄを有する分子で示すことができる。一実施態様において、用語「特異的結合」は、分子がいかなる他のポリペプチド又はポリペプチドエピトープに実質的に結合することなく特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド上のエピトープに結合する結合を指す。
【０１０８】
「結合親和性」は一般的に、分子（例えば抗体）の単一結合部位とその結合パートナー（例えば抗原）との間の非共有結合的な相互作用の総計の強度を指す。他に指示がない限り本明細書で使用する場合、「結合親和性」は、結合対（例えば抗体及び抗原）のメンバー間の１：１の相互作用を反映する固有の結合親和性を指す。パートナーＹに対する分子Ｘの親和性を解離定数（Ｋｄ）で一般的に表すことができる。例えば、Ｋｄは約２００ｎＭ、１５０ｎＭ、１００ｎＭ、６０ｎＭ、５０ｎＭ、４０ｎＭ、３０ｎＭ、２０ｎＭ、１０ｎＭ、８ｎＭ、６ｎＭ、４ｎＭ、２ｎＭ、１ｎＭ又はより強力であることができる。本明細書に記載したもの等の当分野で既知の一般的な方法により親和性を測定することができる。低親和性抗体は一般的に、抗原に緩やかに結合して速やかに解離する傾向があるが、高親和性抗体は一般的に、抗原により早く結合してより長く結合し続ける傾向がある。結合親和性の様々な測定方法が当分野で知られており、それらのいずれかを本発明の目的のために使用することができる。
【０１０９】
一実施態様において、本発明に係る「Ｋｄ」又は「Ｋｄ値」を、約１０反応単位（ＲＵ）で固定した抗原ＣＭ５チップによる２５℃でのＢＩＡｃｏｒｅ（商標）−２０００又はＢＩＡｃｏｒｅ（商標）−３０００（ＢＩＡｃｏｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）を使用する表面プラズモン共鳴アッセイを使用することにより測定する。簡潔に言うと、提供業者の説明書に従って、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ（ＣＭ５、ＢＩＡｃｏｒｅ  Ｉｎｃ．）をＮ−エチル−Ｎ’−（３−ジメチルアミノプロピル）−カルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣ）及びＮ−ヒドロキシスクシンイミド（ＮＨＳ）で活性化する。５μｌ／分の流速で注入して約１０反応単位（ＲＵ）の結合タンパク質を得る前に、抗原を１０ｍＭの酢酸ナトリウム（ｐＨ４．８）で５μｇ／ｍｌ（約０．２μＭ）に希釈する。抗原の注入後、１Ｍのエタノールアミンを注入して未反応群を遮断する。動力学的測定のために、Ｆａｂの２倍段階希釈液（例えば０．７８ｎＭ〜５００ｎＭ）を、約２５μｌ／分の流速にて２５℃で０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０を含むＰＢＳ（ＰＢＳＴ）中に注入する。会合及び解離センサーグラムを同時に適合させることによる単純１対１Ｌａｎｇｍｕｉｒ結合モデル（simple one-to-one Langmuir binding model）（ＢＩＡｃｏｒｅ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  Ｓｏｆｔｗａｒｅバージョン３．２）を使用して、会合速度（ｋｏｎ）及び解離速度（ｋｏｆｆ）を算出する。平衡解離定数（Ｋｄ）をｋｏｆｆ／ｋｏｎ比として算出する。例えばＣｈｅｎ他、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９３：８６５〜８８１（１９９９）参照。オン速度が上記表面プラズモン共鳴アッセイにより１０６Ｍ−１秒−１を超える場合、次に、分光計、例えば流動停止を備えた分光光度計（stop-flow equipped spectrophometer）（Ａｖｉｖ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）又は撹拌キュベットを備えた８０００シリーズＳＬＭ−Ａｍｉｎｃｏ分光光度計（ＴｈｅｒｍｏＳｐｅｃｔｒｏｎｉｃ）で測定した抗原の濃度の上昇下でのＰＢＳ（ｐＨ７．２）中における２０ｎＭの抗抗原抗体（Ｆａｂ型）の２５℃での蛍光発光強度（励起＝２９５ｎｍ、発光＝３４０ｎｍ、１６ｎｍ帯域通過）の増減を測定する蛍光消光技術を使用してオン速度を測定することができる。
【０１１０】
本発明に係る「オン速度」又は「会合の速度」又は「会合速度」又は「ｋｏｎ」を、約１０反応単位（ＲＵ）で固定した抗原ＣＭ５チップによる２５℃でのＢＩＡｃｏｒｅ（商標）−２０００又はＢＩＡｃｏｒｅ（商標）−３０００（ＢＩＡｃｏｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）を使用する上記と同じ表面プラズモン共鳴技術により測定することもできる。簡潔に言うと、提供業者の説明書に従って、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ（ＣＭ５、ＢＩＡｃｏｒｅ  Ｉｎｃ．）をＮ−エチル−Ｎ’−（３−ジメチルアミノプロピル）−カルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣ）及びＮ−ヒドロキシスクシンイミド（ＮＨＳ）で活性化する。５μｌ／分の流速で注入して約１０反応単位（ＲＵ）の結合タンパク質を得る前に、抗原を１０ｍＭの酢酸ナトリウム（ｐＨ４．８）で５μｇ／ｍｌ（約０．２μＭ）に希釈する。抗原の注入後、１Ｍのエタノールアミンを注入して未反応群を遮断する。動力学的測定のために、Ｆａｂの２倍段階希釈液（例えば０．７８ｎＭ〜５００ｎＭ）を、約２５μｌ／分の流速にて２５℃で０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０を含むＰＢＳ（ＰＢＳＴ）中に注入する。会合及び解離センサーグラムを同時に適合させることによる単純１対１Ｌａｎｇｍｕｉｒ結合モデル（ＢＩＡｃｏｒｅ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  Ｓｏｆｔｗａｒｅバージョン３．２）を使用して、会合速度（ｋｏｎ）及び解離速度（ｋｏｆｆ）を算出する。平衡解離定数（Ｋｄ）をｋｏｆｆ／ｋｏｎ比として算出する。例えばＣｈｅｎ他、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９３：８６５〜８８１（１９９９）参照。しかしながら、オン速度が上記表面プラズモン共鳴アッセイにより１０６Ｍ−１秒−１を超える場合、次に、分光計、例えば流動停止を備えた分光光度計（Ａｖｉｖ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）又は撹拌キュベットを備えた８０００シリーズＳＬＭ−Ａｍｉｎｃｏ分光光度計（ＴｈｅｒｍｏＳｐｅｃｔｒｏｎｉｃ）で測定した抗原の濃度の上昇下でのＰＢＳ（ｐＨ７．２）中における２０ｎＭの抗抗原抗体（Ｆａｂ型）の２５℃での蛍光発光強度（励起＝２９５ｎｍ、発光＝３４０ｎｍ、１６ｎｍ帯域通過）の増減を測定する蛍光消光技術を使用してオン速度を好ましくは測定する。
【０１１１】
本発明のポリペプチド、例えば抗体、断片又はこれらの誘導体に関する「生物学的に活性な」及び「生物学的活性」及び「生物学的特徴」は、他に規定さている場合を除き、生物学的分子に結合する能力を有することを意味する。
【０１１２】
「ペプチボディ（単数）」又は「ペプチボディ（複数）」は、ランダムに生成されたペプチドとＦｃドメインとの融合体を指す。２００３年１２月９日にＦｅｉｇｅ他に付与された米国特許第６，６６０，８４３号参照（出典明示によりその全体が援用される）。ペプチボディは、Ｎ末端、Ｃ末端、アミノ酸側鎖又はこれらの部位のうちの複数に連結された１個又は複数個のペプチドを含む。ペプチボディ技術により、１個又は複数個のリガンド又は受容体を標的とするペプチド、腫瘍ホーミングペプチド、膜輸送ペプチド等を包含する治療薬の設計が可能になる。ペプチボディ技術は、線状の及びジスルフィドで拘束されたペプチド、「タンデムペプチド多量体」（即ち、Ｆｃドメインの単鎖上の複数個のペプチド）等の多くのそのような分子の設計において有用であることが証明されている。例えば、米国特許第６，６６０，８４３号；２００３年１０月１６日に公開された米国特許出願第２００３／０１９５１５６号（２００２年１１月２１日に公開されたＷＯ０２／０９２６２０に対応する）；２００３年９月１８日に公開された米国特許出願第２００３／０１７６３５２号（２００３年４月１７日に公開されたＷＯ０３／０３１５８９に対応する）；１９９９年１０月２２日出願された米国特許出願第０９／４２２，８３８号（２０００年５月４日に公開されたＷＯ００／２４７７０に対応する）；２００３年１２月１１日に公開された米国特許出願第２００３／０２２９０２３号；２００３年７月１７日に公開されたＷＯ０３／０５７１３４；２００３年１２月２５日に公開された米国特許出願第２００３／０２３６１９３号（２００４年４月８日に出願されたＰＣＴ／ＵＳ０４／０１０９８９に対応する）；２００３年９月１８日に出願された米国特許出願第１０／６６６，４８０号（２００４年４月１日に公開されたＷＯ０４／０２６３２９に対応する）を参照し、これらの各々は出典明示によりその全体が本明細書に援用される。
【０１１３】
「アフィボディ（複数）」又は「アフィボディ（単数）」は、ペプチド結合によりＦｃ領域に連結されたタンパク質の用途を指し、タンパク質は、標的分子用の結合表面を設けるために足場として使用される。タンパク質は、天然に生じるタンパク質、例えばブドウ球菌プロテインＡもしくはＩｇＧ結合Ｂドメイン、又はこれらに由来するＺタンパク質（Ｎｉｌｓｓｏｎ他（１９８７）、Ｐｒｏｔ  Ｅｎｇ１、１０７〜１３３及び米国特許第５，１４３，８４４号参照）、又はこれらの断片もしくは誘導体であることが多い。例えば、標的分子（単数又は複数）に対する結合親和性が改変されているＺタンパク質多様体からアフィボディを作成することができ、Ｚタンパク質のセグメントは、標的分子に結合することができる多様体のライブラリを作成するランダム変異誘発によって変異されている。アフィボディの例として、米国特許第６，５３４，６２８号、Ｎｏｒｄ  Ｋ他、Ｐｒｏｔ  Ｅｎｇ８：６０１〜６０８（１９９５）及びＮｏｒｄ  Ｋ他、Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈ１５：７７２〜７７７（１９９７）．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  Ａｐｐｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．２００８  Ｊｕｎ；５０（Ｐｔ２）：９７〜１１２が挙げられる。
【０１１４】
「単離された」ヘテロ多量体また複合体は、その天然の細胞培養環境の成分から分離されている及び／又は回収されているヘテロ多量体又は複合体を意味する。その天然の環境の混入成分は、ヘテロ多量体に関する診断又は治療の用途に支障をきたすであろう物質であり、混入成分として酵素、ホルモン及び他のタンパク質性もしくは非タンパク質性の溶質を挙げることができる。好ましい実施態様において、（１）Ｌｏｗｒｙ法で測定した場合にタンパク質の９５重量％を超えるように、最も好ましくは９９重量％を超えるように、（２）スピニングカップ配列決定装置の使用によりＮ末端もしくは内部のアミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度に、又は（３）クーマシーブルーもしくは好ましくは銀染色を使用する還元条件下もしくは非還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥにより均一になるまで、ヘテロ多量体を精製する。
【０１１５】
本発明のヘテロ多量体は一般的に、実質的に均一に精製される。語句「実質的に均一な」、「実質的に均一な形態」及び「実質的に均一」は、産物が望ましくないポリペプチドの組合せ（例えばホモ多量体）を起源とする副産物を実質的に含まないことを示すために使用される。
【０１１６】
純度に関して表現される実質的に均一は、副産物の量が１０重量％、９重量％、８重量％、７重量％、６重量％、４重量％、３重量％、２重量％もしくは１重量％を超えない又は１重量％未満であることを意味する。一実施態様において、副産物は５％未満である。
【０１１７】
「生物学的分子」は、核酸、タンパク質、炭水化物、脂質及びこれらの組合せを指す。一実施態様において、生物学的分子は天然に存在する。
【０１１８】
「単離された」は、本明細書に開示した様々な抗体を記載するために使用する場合、同定されている、並びにそれが発現した細胞又は細胞培養液から分離されている及び／又は回収されている抗体を意味する。その天然の環境の混入成分は、ポリペプチドに関する診断又は治療の用途に概して支障をきたすであろう物質であり、混入成分として酵素、ホルモン及び他のタンパク質性もしくは非タンパク質性の溶質を挙げることができる。好ましい実施態様において、（１）スピニングカップ配列決定装置の使用によりＮ末端もしくは内部のアミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度まで、又は（２）クーマシーブルーもしくは好ましくは銀染色を使用する非還元条件下又は還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥにより均一になるまで、抗体を精製する。単離された抗体として組換え細胞内でのインサイチュの抗体が挙げられるが、これはポリペプチドの天然の環境の少なくとも１種の成分が存在しないからである。しかしながら通常は、単離されたポリペプチドは、少なくとも１つの精製ステップにより調製される。
【０１１９】
「連結された」又は「連結する」は本明細書で使用する場合、第１のアミノ酸配列と第２のアミノ酸配列との間の直接的なペプチド結合連結、又は第１のアミノ酸配列と第２のアミノ酸配列とに結合する及びそれらの間にあるペプチドである第３のアミノ酸配列を含む連結のいずれかを意味する。例えば、一方のアミノ酸配列のＣ末端に結合し、他方のアミノ酸配列のＮ末端に結合するリンカーペプチド。
【０１２０】
「リンカー」は本明細書で使用する場合、２個以上のアミノ酸長のアミノ酸配列を意味する。リンカーは、中性の極性アミノ酸又は非極性アミノ酸からなることができる。リンカーは、例えば２〜１００個のアミノ酸長、例えば２〜５０個のアミノ酸長、例えば３個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個又は５０個のアミノ酸長であることができる。リンカーは、例えば自己切断又は酵素的なもしくは化学的な切断により「切断可能」であることができる。アミノ酸配列中の切断部位並びにそのような部位で切断する酵素及び化学物質は当分野で公知であり、本明細書にも記載されている。
【０１２１】
「テザー」は本明細書で使用する場合、２個の他のアミノ酸配列を連結するアミノ酸リンカーを意味する。本明細書に記載したテザーは、免疫グロブリン重鎖可変ドメインのＮ末端と免疫グロブリン軽鎖定常ドメインのＣ末端とを連結することができる。特定の実施態様において、テザーは約１５〜５０個のアミノ酸長であり、例えば２０〜２６個のアミノ酸長（例えば２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個又は２６個のアミノ酸長）である。テザーは、例えば当分野で標準的な方法及び試薬を使用する自己切断又は酵素的なもしくは化学的な切断により「切断可能」であることができる。ある特定の実施態様において、テザーはＧｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒの繰り返しを含む。
【０１２２】
「リンカー」又は「テザー」の酵素的切断として、例えばＬｙｓ−Ｃ、Ａｓｐ−Ｎ、Ａｒｇ−Ｃ、Ｖ８、Ｇｌｕ−Ｃ、キモトリプシン、トリプシン、ペプシン、パパイン、トロンビン、ゲネナーゼ、第Ｘａ因子、ＴＥＶ（タバコエッチウイルスシステインプロテアーゼ）、エンテロキナーゼ、ＨＲＶ  Ｃ３（ヒトライノウイルスＣ３プロテアーゼ）、キニノゲナーゼ及びスブチリシン様プロタンパク質変換酵素（例えばフューリン（ＰＣ１）、ＰＣ２もしくはＰＣ３）又はＮ−アルギニン二塩基性変換酵素等のエンドペプチダーゼの使用を挙げることができる。化学的切断として、例えばヒドロキシルアミン、Ｎ−クロロスクシンイミド、Ｎ−ブロモスクシンイミド又は臭化シアンの使用を挙げることができる。
【０１２３】
「Ｌｙｓ−Ｃエンドペプチダーゼ切断部位」は本明細書で使用する場合、Ｌｙｓ−ＣエンドペプチダーゼによってＣ末端側で切断することができるアミノ酸配列におけるリシン残基である。Ｌｙｓ−Ｃエンドペプチダーゼはリシン残基のＣ末端側で切断する。ある実施態様において、半抗体は、Ｌｙｓ−Ｃエンドペプチダーゼによるテザーの切断時に半抗体又は構築した二重特異性抗体の構造を保持するために内因性のＬｙｓ−Ｃエンドペプチダーゼ切断部位を除去すべく、ヒンジ領域にＫ２２２Ａ変異を更に含む。
【０１２４】
「ヒンジ領域」は一般的に、ヒトＩｇＧ１のＧｌｕ２１６からＰｒｏ２３０までの伸長と定義される（Ｂｕｒｔｏｎ，Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２２：１６１〜２０６（１９８５））。重鎖間Ｓ−Ｓ結合を形成する最初の及び最後のシステイン残基を同じ位置に配置することにより、他のＩｇＧアイソタイプのヒンジ領域をＩｇＧ１配列とアライメントさせることができる。
【０１２５】
Ｆｃ領域の「下流ヒンジ領域」は通常、ヒンジ領域に近いＣ末端の残基の伸長、即ちＦｃ領域の残基２３３〜２３９の伸長として定義される。本発明以前には、ＦｃγＲ結合は一般的に、ＩｇＧ  Ｆｃ領域の下流ヒンジ領域中のアミノ酸残基に起因するものであった。
【０１２６】
ヒトＩｇＧ  Ｆｃ領域の「ＣＨ２ドメイン」は通常、ＩｇＧの約２３１残基から約３４０残基に伸長する。ＣＨ２ドメインは、別のドメインと密接に対形成しない点でユニークである。むしろ、インタクトな天然ＩｇＧ分子の２個のＣＨ２ドメインの間に２本のＮ連結型分岐炭水化物鎖が挿入されている。炭水化物がドメイン−ドメイン対合の代替を提供することができ、ＣＨ２ドメインの安定化を促進することができることが推測されている。Ｂｕｒｔｏｎ，Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２２：１６１〜２０６（１９８５）。
【０１２７】
「ＣＨ３ドメイン」は、Ｆｃ領域中のＣ末端からＣＨ２ドメインへの残基の伸長（即ち、ＩｇＧの約３４１アミノ酸残基から約４４７アミノ酸残基）を含む。
【０１２８】
用語「Ｆｃ領域」は本明細書において免疫グロブリン重鎖のＣ末端領域を定義するために使用され、Ｆｃ領域として天然配列のＦｃ領域及び多様体のＦｃ領域が挙げられる。免疫グロブリン重鎖のＦｃ領域の境界は変化するかもしれないが、ヒトＩｇＧ重鎖のＦｃ領域は通常、Ｆｃ領域のＣｙｓ２２６の位置でのアミノ酸残基から又はＰｒｏ２３０からカルボキシル末端への伸長と定義される。例えば、抗体の産生もしくは精製中に、又は抗体の重鎖をコードする核酸を組換え操作することにより、Ｆｃ領域のＣ末端リシン（ＥＵ番号付けシステムによる残基４４７）を除去することができる。従って、インタクトな抗体の組成物は、除去される全てのＫ４４７残基を有する抗体集団、除去されるＫ４４７残基がない抗体集団、及びＫ４４７残基を有する又は有さない抗体の混合物を有する抗体集団を含むことができる。
【０１２９】
「機能的Ｆｃ領域」は天然配列Ｆｃ領域の「エフェクター機能」を持つ。例示的な「エフェクター機能」として、Ｃ１ｑ結合；ＣＤＣ；Ｆｃ受容体結合；ＡＤＣＣ；食作用；細胞表面受容体（例えばＢ細胞受容体；ＢＣＲ）の下方制御等が挙げられる。そのようなエフェクター機能は一般的に、結合ドメイン（例えば抗体可変ドメイン）と組み合わせるためにＦｃ領域を必要としており、例えば本明細書における定義に開示した様々なアッセイを使用してエフェクター機能を評価することができる。
【０１３０】
「天然配列Ｆｃ領域」は、天然に見られるＦｃ領域のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含む。天然配列ヒトＦｃ領域として、天然配列ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域（非Ａアロタイプ及びＡアロタイプ）；天然配列ヒトＩｇＧ２  Ｆｃ領域；天然配列ヒトＩｇＧ３  Ｆｃ領域；及び天然配列ヒトＩｇＧ４  Ｆｃ領域並びにこれらの天然に生じる多様体が挙げられる。
【０１３１】
「多様体Ｆｃ領域」は、少なくとも１個のアミノ酸修飾によって、好ましくは１個又は複数個のアミノ酸置換（単数又は複数）によって、天然配列Ｆｃ領域のアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を含む。好ましくは、多様体Ｆｃ領域は、天然配列Ｆｃ領域又は親ポリペプチドのＦｃ領域と比べて少なくとも１個のアミノ酸置換、例えば天然配列Ｆｃ領域中の又は親ポリペプチドのＦｃ領域中の約１個〜約１０個のアミノ酸置換、好ましくは約１個〜約５個のアミノ酸置換を有する。本明細書における多様体Ｆｃ領域は、天然配列Ｆｃ領域及び／又は親ポリペプチドのＦｃ領域と約８０％以上の相同性を好ましくは有し、最も好ましくはそれらとの約９０％以上の相同性を有し、より好ましくはそれらと約９５％以上の相同性を有する。
【０１３２】
「Ｆｃ複合体」は本明細書で使用する場合、相互作用するＦｃ領域の２個のＣＨ２ドメイン及び／又は相互作用するＦｃ領域の２個のＣＨ３ドメインを指し、ＣＨ２ドメイン及び／又はＣＨ３ドメインは、ペプチド結合ではない結合及び／又は力（例えばファンデルワールス力、疎水性力、親水性力）によって相互作用する。
【０１３３】
「Ｆｃ成分」は本明細書で使用する場合、Ｆｃ領域のヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン又はＣＨ３ドメインを指す。
【０１３４】
「Ｆｃ  ＣＨ成分」又は「ＦｃＣＨ」は本明細書で使用する場合、Ｆｃ領域のＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、又はＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含むポリペプチドを指す。
【０１３５】
抗体の「エフェクター機能」は、抗体のＦｃ領域（天然配列Ｆｃ領域又はアミノ酸配列多様体Ｆｃ領域）に起因する抗体の生物学的活性を指し、抗体のアイソタイプにより変化する。抗体のエフェクター機能の例として、Ｃ１ｑ結合及び補体依存性細胞障害；Ｆｃ受容体結合；抗体依存性細胞介在細胞障害（ＡＤＣＣ）；食作用；細胞表面受容体（例えばＢ細胞受容体）の下方制御；並びにＢ細胞活性化が挙げられる。
【０１３６】
本発明において、「還元条件」は、反応における（例えば構築用混合物中の）酸化還元電位に基づいて、反応の酸化還元電位がマイナス（−）であることを意味すると定義される。還元条件下での反応の酸化還元電位は、好ましくは−約５０〜−６００ｍＶ、−１００〜−６００ｍＶ、−２００〜−６００ｍＶ、−１００〜−５００ｍＶ、−１５０〜−３００ｍＶであり、より好ましくは−約３００〜−５００ｍＶであり、最も好ましくは−約４００ｍＶである。
【０１３７】
所望の還元条件を調えるために任意の好適な方法を使用することができる。例えば、還元剤／還元薬を反応（本発明の構築用混合物等）に添加することにより、所望の還元条件を調えることができる。好適な還元剤として、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）、トリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）、チオグリコール酸、アスコルビン酸、チオール酢酸、グルタチオン（ＧＳＨ）、ベータ−メルカプトエチルアミン、システイン／シスチン、ＧＳＨ／グルタチオンジスルフィド（ＧＳＳＧ）、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールが挙げられるがこれらに限定されず、好ましくはＧＳＨである。ある特定の実施態様において、還元剤は弱還元剤であり、弱還元剤としてＧＳＨ、ベータ−メルカプトエチルアミン、システイン／シスチン、ＧＳＨ／ＧＳＳＧ、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールが挙げられるがこれらに限定されず、好ましくはＧＳＨである。ある好ましい実施態様において、還元剤はＧＳＨである。それは、反応中に所望の還元条件を得るように好適な濃度で及び好適な実験条件下で好適な還元剤を選択する当業者の能力の範囲内である。例えば、２０℃で１０ｇ／Ｌの二重特異性抗体タンパク質濃度を有する溶液中における１０ｍＭのＬ−還元グルタチオンにより、−約４００ｍＶの開始酸化還元電位を得る。当業者は、所定の反応における酸化還元電位を測定するために任意の好適な方法を使用することができる。
【０１３８】
当分野で既知である任意の好適な方法を使用して、反応の還元条件を推定する及び測定することができる。例えば、レサズリン指示薬（還元条件では青色から無色への脱色）を使用して還元条件を測定することができる。より正確に測定するために、酸化還元電位計（ＢＲＯＡＤＬＥＹ  ＪＡＭＥＳ（登録商標）製のＯＲＰ  Ｅｌｅｃｔｒｏｄｅ等）を使用することができる。
【０１３９】
あるいは、約１０ｍｍＨｇ以下の減圧下で、好ましくは約５ｍｍＨｇ以下の減圧下で、より好ましくは約３ｍｍＨｇ以下の減圧下で、約１〜６０分にわたって、好ましくは約５〜４０分にわたって溶存ガス、特に溶存酸素を除去することにより、還元条件を調えることができる。
【０１４０】
本発明において、構築ステップ全体にわたって第１の及び第２のヒンジ含有ポリペプチド（半抗体等）の混合直後から還元条件が維持されることが好ましい。ある実施態様において、反応時間の好ましくは約５０％以上にわたって、より好ましくは約７０％以上にわたって、更により好ましくは約９０％以上にわたって、反応又は構築用混合物は還元条件に維持される。反応時間の約５０％以上にわたって、より好ましくは約７０％以上にわたって、更により好ましくは約９０％以上にわたって反応媒体の酸化還元電位が−約２００〜−６００ｍＶに、より好ましくは−３００〜−５００ｍＶに、最も好ましくは−約４００ｍＶに維持されることが特に好ましい。
【０１４１】
ある特定の実施態様において、還元条件は弱還元条件である。用語「弱還元剤」又は「弱還元条件」は本明細書で使用する場合、還元薬、又は２５℃でマイナスの酸化電位を有する還元薬で調えた還元条件を指す。ｐＨが７〜９であり温度が１５℃〜３９℃である場合には、還元剤の酸化電位は、好ましくは−５０〜−６００ｍＶ、−１００〜−６００ｍＶ、−２００〜−６００ｍＶ、−１００〜−５００ｍＶ、−１５０〜−３００ｍＶであり、より好ましくは−約３００〜−５００ｍＶであり、最も好ましくは−約４００ｍＶである。当業者は、所望の還元条件を調えるのに好適な還元剤を選択することができるだろう。熟練した研究者は、強還元剤、即ち同じ濃度、ｐＨ及び温度に関して前述した還元剤よりもマイナスの酸化電位を有する還元剤を低濃度で使用することができることを認識するだろう。好ましい実施態様において、上記に列挙した条件下でインキュベートする場合には、還元剤の存在下でタンパク質はジスルフィド結合を形成することができるだろう。弱還元剤の例として、グルタチオン、ベータ−メルカプトエチルアミン、シスチン／システイン、ＧＳＨ／ＧＳＳＧ、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールが挙げられるがこれらに限定されない。ある実施態様において、予期され得る他の還元剤を使用して効率的に構築される弱還元条件に関する参照の観点として、２００倍モル比のＧＳＨ：抗体の酸化電位と同様の酸化電位を使用することができる。
【０１４２】
「構築用混合物」は、第１のヒンジ含有ポリペプチド、第２のヒンジ含有ポリペプチドを含む溶液である。ある実施態様において、構築用混合物は還元条件下で存在する。いくつかの実施態様において、構築用混合物は弱還元条件下で存在する。ある他の実施態様において、構築用混合物は弱還元剤を更に含む。ｐＨが７〜９であり温度が１５℃〜３９℃である場合には、構築用混合物の酸化電位は−５０〜−６００ｍＶ、−１００〜−６００ｍＶ、−２００〜−６００ｍＶ、−１００〜−５００ｍＶ、−１５０〜−３００ｍＶであり、より好ましくは−約３００〜−５００ｍＶであり、最も好ましくは−約４００ｍＶである。
【０１４３】
他に指示がない限り、実施例で言及した市販の試薬を製造業者の説明書に従って使用した。以下の実施例及び明細書全体にわたってＡＴＣＣ受託番号によって識別される細胞の供給源は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡである。特に断りがない限り、本発明は、組換えＤＮＡ技術の標準的な手順、例えば前述したもの及び以下のテキストブックに記載されたもの：Ｓａｍｂｒｏｏｋ他、上記；Ａｕｓｕｂｅｌ他、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ  Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ、ＮＹ、１９８９）；Ｉｎｎｉｓ他、ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．、ＮＹ、１９９０）；Ｈａｒｌｏｗ他、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、１９８８）；Ｇａｉｔ、Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ、Ｏｘｆｏｒｄ、１９８４）；Ｆｒｅｓｈｎｅｙ，  Ａｎｉｍａｌ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅ、１９８７；Ｃｏｌｉｇａｎ他、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、１９９１を使用する。
【０１４４】
本明細書及び特許請求の範囲全体にわたって、単語「含む（comprise）」又は「含む（comprises）」もしくは「含む（comprising）」等の変形は、定めた完全体又は完全体の群を包含することを示唆するが、いかなる他の完全体又は完全体の群を排除するものではないことが理解されるだろう。
【０１４５】
ＩＩ．ヘテロ多量体タンパク質の構築
典型的には、本明細書に記載したヘテロ多量体タンパク質は、抗体のＦｃ領域の大部分を含む。しかしながら、他の態様において、重鎖は、ＣＨ１ドメイン、ＣＨ２ドメイン及び／又はＣＨ３ドメインの一部のみを含む。
【０１４６】
ヘテロ多量体化ドメイン
ヘテロ多量体タンパク質はヘテロ多量体化ドメインを含む。ヘテロ二量体分子の実質的に均一な集団を生成するために、ヘテロ二量体化ドメインは、ホモ二量体を超えるヘテロ二量体の形成に関する強い優先度を有する必要がある。本明細書に例示したヘテロ多量体タンパク質は、ヘテロ多量体化を促進するためにノブイントゥホール技術を使用するが、当業者は、本発明において有用な他のヘテロ多量体化ドメインを認識しよう。
【０１４７】
ノブイントゥホール
多重特異性抗体の産生方法としてのノブイントゥホールの使用は当分野で公知である。１９９８年３月２４日に取得され、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈに譲渡された米国特許第５，７３１，１６８号、２００９年７月１６日に公開され、Ａｍｇｅｎに譲渡されたＰＣＴ公開番号ＷＯ２００９０８９００４、及び２００９年７月１６日に公開され、Ｎｏｖｏ  Ｎｏｒｄｉｓｋ  Ａ／Ｓに譲渡された米国特許出願公開第２００９０１８２１２７号参照。Ｍａｒｖｉｎ及びＺｈｕ、Ａｃｔａ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａ  Ｓｉｎｃｉａ（２００５）２６（６）：６４９〜６５８並びにＫｏｎｔｅｒｍａｎｎ（２００５）Ａｃｔａ  Ｐｈａｒａｃｏｌ．Ｓｉｎ．，２６：１〜９も参照。簡潔な考察を本明細書に記載する。
【０１４８】
「突起」は、ヘテロ多量体を安定化させ、それによって例えばホモ多量体の形成を超えるヘテロ多量体の形成を支持するように第１のポリペプチドの界面から突出し、それ故に隣接する界面（即ち、第二のポリペプチドの界面）における代償的な空洞中に配置可能である少なくとも１本のアミノ酸側鎖を指す。突起はオリジナルの界面に存在することができ、又は（例えば界面をコードする核酸を改変することにより）該突起を合成的に導入することができる。通常、第１のポリペプチドの界面をコードする核酸は、突起をコードするために改変される。このことを達成するために、第１のポリペプチドの界面において少なくとも１個の「オリジナルの」アミノ酸残基をコードする核酸は、オリジナルのアミノ酸残基よりも大きい側鎖量を有する少なくとも１個の「移入」アミノ酸残基をコードする核酸に置き換えられる。複数のオリジナルの残基及び対応する移入残基が存在することができることが認識されるだろう。置き換えられるオリジナルの残基の数の上限は、第１のポリペプチドの界面における残基の総数である。様々なアミノ残基の側鎖量を以下の表に示す。
【０１４９】
2014534198.tif 000002
a水を引いたアミノ酸の分子量。Handbook of Chemistry and Physics、第43版、Cleveland Chemical Rubber Publishing Co.、1961からの値。
bA.A.Zamyatnin、Prog.Biophys.Mol.Biol.24:107〜123,1972からの値。
cC.Chothia、J Mol.Biol.105:1〜14、1975からの値。接触可能な表面積は、この参考文献の図6〜20に定義されている。
【０１５０】
突起の形成に好ましい移入残基は一般的に、天然に生じるアミノ酸残基であり、好ましくはアルギニン（Ｒ）、フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）及びトリプトファン（Ｗ）から選択される。最も好ましいのはトリプトファン及びチロシンである。一実施態様において、突起の形成用のオリジナルの残基は、アラニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、セリン、スレオニン又はバリン等の小さな側鎖量を有する。突起を形成するためのＣＨ３ドメインにおける例示的アミノ酸置換としてＴ３６６Ｗ置換が挙げられるがこれに限定されない。
【０１５１】
「空洞」は、第２のポリペプチドの界面から窪んでおり、それ故に第１のポリペプチドの隣接する界面上の対応する突起を収容する少なくとも１本のアミノ酸側鎖を指す。空洞はオリジナルの界面に存在することができ、又は（例えば界面をコードする核酸を改変することにより）該空洞を合成的に導入することができる。通常、第２のポリペプチドの界面をコードする核酸は、空洞をコードするために改変される。このことを達成するために、第２のポリペプチドの界面において少なくとも１個の「オリジナルの」アミノ酸残基をコードする核酸は、オリジナルのアミノ酸残基よりも小さい側鎖量を有する少なくとも１個の「移入」アミノ酸残基をコードするＤＮＡに置き換えられる。複数のオリジナルの残基及び対応する移入残基が存在することができることが認識されるだろう。置き換えられるオリジナルの残基の数の上限は、第２のポリペプチドの界面における残基の総数である。様々なアミノ残基の側鎖量を上記表１に示す。空洞の形成に好ましい移入残基は通常、天然に生じるアミノ酸残基であり、好ましくはアラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）及びバリン（Ｖ）から選択される。最も好ましいのはセリン、アラニン又はスレオニンである。一実施態様において、空洞の形成用のオリジナルの残基は、チロシン、アルギニン、フェニルアラニン又はトリプトファン等の大きな側鎖量を有する。空洞を生成するためのＣＨ３ドメインにおける例示的アミノ酸置換として、Ｔ３６６Ｓ置換、Ｌ３６８Ａ置換、Ｙ４０７Ａ置換、Ｙ４０７Ｔ置換及びＹ４０７Ｖ置換が挙げられるがこれらに限定されない。ある実施態様において、ノブ半抗体はＴ３６６Ｗ置換を含み、ホール半抗体はＴ３６６Ｓ／Ｌ３６８Ａ／Ｙ４０７Ｖ置換を含む。
【０１５２】
「オリジナルの」アミノ酸残基は、オリジナルの残基よりも小さい又は大きい側鎖量を有することができる「移入」残基に置き換えられているものである。移入アミノ酸残基は、天然に生じるアミノ酸残基又は天然には生じないアミノ酸残基であることができるが、好ましくは前者である。「天然に生じる」アミノ酸残基は、遺伝子コードによりコードされ、上記表１に列挙されている残基である。「天然には生じない」アミノ酸残基は、遺伝子コードによりコードされていないが、ポリペプチド鎖中において隣接するアミノ酸残基（単数又は複数）に共有結合することができる残基を意味する。天然には生じないアミノ酸残基の例として、ノルロイシン、オルニチン、ノルバリン、ホモセリン及び他のアミノ酸残基類似体、例えばＥｌｌｍａｎ他、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍ．２０２：３０１〜３３６（１９９１）に記載されたもの等が挙げられる。そのような天然には生じないアミノ酸残基を生成するために、Ｎｏｒｅｎ他、Ｓｃｉｅｎｃｅ２４４：１８２（１９８９）及びＥｌｌｍａｎ他、上記の手順を使用することができる。簡潔に言うと、これは、天然には生じないアミノ酸残基を含むサプレッサーｔＲＮＡの化学的活性化、続いてインビトロでのＲＮＡの転写及び翻訳を含む。本発明の方法は、少なくとも１個のオリジナルのアミノ酸残基を置き換えることを含むが、複数個のオリジナルの残基を置き換えることができる。通常、第１のポリペプチド又は第２のポリペプチドの界面における全残基のみが、置き換えられるオリジナルのアミノ酸残基を含む。典型的には、置き換えられるオリジナルの残基は「埋没」されている。「埋没」は、残基が溶媒に本質的に接触不能であることを意味する。一般的に、移入残基は、酸化の可能性又はジスルフィド結合の誤対合を防止するために、システインではない。
【０１５３】
突起は空洞内に「配置可能」であり、このことは、第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドのそれぞれの界面上の突起及び空洞の空間的位置、並びに突起及び空洞の大きさが、界面での第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドの正常な会合を著しく乱すことなく突起が空洞中に位置することができるようなものであることを意味する。Ｔｙｒ、Ｐｈｅ及びＴｒｐ等の突起は概して、界面の軸から垂直に延びておらず、好ましい高次構造を有していないことから、突起と対応する空洞とのアライメントは、Ｘ線結晶構造解析又は核磁気共鳴（ＮＭＲ）により得られたもの等の三次元構造に基づく突起／空洞対のモデリングに依存する。このことを、当分野で広く受け入れられている技術を使用して達成することができる。
【０１５４】
「オリジナルの又は鋳型の核酸」は、突起又は空洞をコードするために「改変」することができる（即ち、遺伝子操作すること又は変異させることができる）目的のポリペプチドをコードする核酸を意味する。オリジナルの又は出発の核酸は、天然に生じる核酸であることができ、又は事前に改変されている核酸（例えばヒト化抗体断片）を含むことができる。核酸の「改変」は、目的のアミノ酸残基をコードする少なくとも１個のコドンの挿入、欠失又は置き換えにより、オリジナルの核酸が変異されていることを意味する。通常、オリジナルの残基をコードするコドンは、移入残基をコードするコドンに置き換えられる。このようにＤＮＡを遺伝子的に修飾するための技術がＭｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ：ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ、Ｍ．Ｊ．ＭｃＰｈｅｒｓｏｎ編、（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ、Ｏｘｆｏｒｄ、ＵＫ．（１９９１）に概説されており、該技術として、例えば、部位特異的変異誘発、カセット変異誘発及びポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）変異誘発が挙げられる。そのため、オリジナルの／鋳型の核酸を変異させることにより、オリジナルの／鋳型の核酸によってコードされたオリジナルの／鋳型のポリペプチドが、それに応じて改変される。
【０１５５】
合成手段により、例えば組換え技術、インビトロでのペプチド合成、前述した天然には生じないアミノ酸残基を導入するための技術、ペプチドの酵素的もしくは化学的カップリングにより、又はこれらの技術のいくつかの組合せにより、突起又は空洞を第１のポリペプチド又は第２のポリペプチドの界面に「導入する」ことができる。従って、「導入された」突起又は空洞は「天然には生じておらず」又は「非天然」であり、このことは、天然において、又はオリジナルのポリペプチドにおいて存在しないことを意味する（例えばヒト化モノクローナル抗体）。
【０１５６】
一般的に、突起を形成するための移入アミノ酸残基は、比較的少数の「回転異性体」を有する（例えば約３〜６個）。「回転異性体」は、アミノ酸側鎖のエネルギー的に好都合な高次構造体である。様々なアミノ酸残基の回転異性体の数がＰｏｎｄｅｒｓ及びＲｉｃｈａｒｄｓ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９３：７７５〜７９１（１９８７）に概説されている。
【０１５７】
ＩＩＩ．ベクター、宿主細胞及び組換え法
本発明のヘテロ多量体タンパク質（例えば二重特異性抗体）の組換え産生のために、本発明のヘテロ多量体タンパク質をコードする核酸が単離され、更なるクローニング（ＤＮＡの増幅）のために又は発現のために複製可能なベクターに挿入される。抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を使用して（例えば、抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することにより）容易に単離されて配列決定される。多くのベクターが利用可能である。ベクターの選択は、使用される宿主細胞にある程度は依存する。一般的に、好ましい宿主細胞は、原核生物又は真核生物（一般的には哺乳動物であるが、真菌（例えば酵母）、昆虫、植物及び他の多細胞生物に由来する有核細胞も含む）のいずれかである。ＩｇＧ定常領域、ＩｇＭ定常領域、ＩｇＡ定常領域、ＩｇＤ定常領域及びＩｇＥ定常領域等の任意のアイソタイプの定常領域をこの目的のために使用することができ、そのような定常領域を任意のヒト又は動物種から得ることができることが認識されるだろう。ある実施態様において、定常領域はＩｇＧに由来し、特にＩｇＧ１、ＩｇＧ２又はＩｇＧ４に由来する。
【０１５８】
宿主細胞はヘテロ二量体化ドメインを含むヒンジ含有ポリペプチドを発現するように操作されており、宿主細胞は第２のヘテロ二量体化ドメインを含むヒンジ含有ポリペプチドを発現しない。
【０１５９】
ａ．原核宿主細胞を使用するヘテロ多量体タンパク質の生成
ｉ．ベクターの構築
標準的な組換え技術を使用して、本発明のヘテロ多量体タンパク質（例えば抗体）のポリペプチド成分をコードするポリヌクレオチド配列を得ることができる。所望のポリヌクレオチド配列を、例えばハイブリドーマ細胞等の抗体産生細胞から単離して配列決定することができる。あるいは、ヌクレオチド合成機又はＰＣＲ技術を使用してポリヌクレオチドを合成することができる。ポリペプチドをコードする配列を得ると、それを原核宿主中で異種ポリヌクレオチドを複製する及び発現することができる組換えベクターに挿入する。当分野で利用可能であるとともに既知である多くのベクターを本発明の目的のために使用することができる。適切なベクターの選択は、ベクターに挿入される核酸の大きさと、ベクターによって形質転換される特定の宿主細胞とに主に依存するだろう。各ベクターは、その機能（異種ポリヌクレオチドの増幅もしくは発現又はその両方）及びベクターが存在する特定の宿主細胞とのベクターの適合性に応じて、様々な成分を含有する。ベクター成分として一般的に、複製開始点、選択マーカー遺伝子、プロモーター、リボゾーム結合部位（ＲＢＳ）、シグナル配列、異種核酸挿入及び転写終結配列が挙げられるがこれらに限定されない。
【０１６０】
一般的に、宿主細胞に適合する種に由来するレプリコン配列及びコントロール配列を含有するプラスミドベクターがその宿主細胞と関連して使用される。ベクターは通常、複製部位と、形質転換細胞における表現型の選択を提供することができるマーキング配列とを保有する。例えば、大腸菌は概して、大腸菌種に由来するプラスミドであるｐＢＲ３２２を使用して形質転換される。ｐＢＲ３２２は、アンピシリン（Ａｍｐ）及びテトラサイクリン（Ｔｅｔ）耐性をコードする遺伝子を含有し、そのため形質転換細胞の同定方法を容易に提供する。ｐＢＲ３２２、その誘導体、又は他の微生物プラスミドもしくはバクテリオファージはまた、内因性タンパク質の発現用の微生物で使用することができるプロモーターも含む、又は該プロモーターを含むように修飾することができる。特定の抗体の発現に使用されるｐＢＲ３２２誘導体の例がＣａｒｔｅｒ他の米国特許第５，６４８，２３７号に詳細に記載されている。
【０１６１】
加えて、宿主微生物に適合するレプリコン配列及びコントロール配列を含有するファージベクターを、この宿主と関連する形質転換ベクターとして使用することができる。例えば、λＧＥＭ．ＴＭ．−１１等のバクテリオファージを、大腸菌ＬＥ３９２等の感受性宿主細胞を形質転換させるために使用することができる組換えベクターの作製に利用することができる。
【０１６２】
本発明の発現ベクターは、各ポリペプチド成分をコードする２個以上のプロモーター−シストロン対を含むことができる。プロモーターは、その発現を調節するシストロンの上流（５’）に位置する非翻訳制御配列である。原核生物のプロモーターは概して、誘導性と構造性との２種のクラスに別れる。誘導性プロモーターは、栄養の有無又は温度の変化等の培養条件の変化に応答してその制御下でシストロンの転写レベルの増大を引き起こすプロモーターである。
【０１６３】
様々な潜在的宿主細胞によって認識される多くのプロモーターが公知である。制限酵素消化によって供給源のＤＮＡからプロモーターを取り出し、単離したプロモーター配列を本発明のベクター中に挿入することにより、選択したプロモーターを、例えば軽鎖又は重鎖をコードするシストロンＤＮＡに作動可能に連結することができる。天然プロモーター配列及び多くの異種プロモーターの両方を、標的遺伝子の増幅及び／又は発現を誘導するのに使用することができる。いくつかの実施態様において、異種プロモーターは有用であり、それは、異種プロモーターにより一般的に、天然の標的ポリペプチドプロモーターと比べて発現した標的遺伝子がより多く転写される及び発現した標的遺伝子の収率がより高くなるからである。
【０１６４】
原核宿主での使用に好適なプロモーターとして、ＰｈｏＡプロモーター、β−ガラクタマーゼ及びラクトースプロモーター系、トリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系並びにハイブリッドプロモーター、例えばｔａｃプロモーター又はｔｒｃプロモーターが挙げられる。しかしながら、細菌中において機能的である他のプロモーター（例えば他の既知の細菌又はファージのプロモーター）も同様に好適である。それらのヌクレオチド配列は公開されており、従って当業者は、任意の必要な制限部位を供給するためにリンカー又はアダプターを使用して、ヘテロ多量体タンパク質、例えば標的の軽鎖及び重鎖（Ｓｉｅｂｅｎｌｉｓｔ他、（１９８０）、Ｃｅｌｌ２０：２６９）の遺伝子をコードするシストロンにそれらを作動可能にライゲーションさせることができる。
【０１６５】
本発明の一態様において、組換えベクター内の各シストロンは、膜を貫通して発現したポリペプチドの転移を誘導する分泌シグナル配列成分を含む。一般的に、シグナル配列はベクターの成分であることができ、又はベクターに挿入される標的ポリペプチドＤＮＡの一部であることができる。本発明の目的のために選択されるシグナル配列は、宿主細胞によって認識されてプロセシングされる（即ち、シグナルペプチダーゼにより切断される）ものでなければならない。異種ポリペプチドを起源とするシグナル配列を認識せず及びプロセシングしない原核宿主細胞に関して、シグナル配列は、例えばアルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、ｌｐｐ又は熱安定性エンテロトキシンＩＩ（ＳＴＩＩ）リーダー、ＬａｍＢ、ＰｈｏＥ、ＰｅｌＢ、ＯｍｐＡ及びＭＢＰからなる群から選択される原核生物のシグナル配列に置換される。本発明の一実施態様において、発現系の両方のシストロンに使用されるシグナル配列は、ＳＴＩＩシグナル配列又はその多様体である。
【０１６６】
他の態様において、本発明に係る免疫グロブリンの産生は宿主細胞の細胞質中で生じることができ、それ故に各シストロン内に分泌シグナル配列が存在することを必要としない。この点に関して、免疫グロブリンの軽鎖及び重鎖が発現され、折り畳まれ、及び集合して細胞質内で機能的免疫グロブリンを形成する。ある宿主株（例えば大腸菌ｔｒｘＢ−株）は、ジスルフィド結合の形成に有利な細胞質条件を備えており、従って、発現したタンパク質サブユニットを適切に折り畳んで集合させることができる。Ｐｒｏｂａ及びＰｌｕｃｋｔｈｕｎ  Ｇｅｎｅ、１５９：２０３（１９９５）参照。
【０１６７】
本発明のヘテロ多量体タンパク質（例えば抗体）を発現するのに好適な原核宿主細胞として、古細菌及び真正細菌、例えばグラム陰性生物又はグラム陽性生物が挙げられる。有用な細菌の例として、大腸菌属（Escherichia）（例えば大腸菌）、桿菌（Bacilli）（例えば枯草菌（B. subtilis））、腸内細菌（Enterobacteria）、シュードモナス（Pseudomonas）種（例えば緑膿菌（P. aeruginosa））、ネズミチフス菌（Salmonella typhimurium）、霊菌（Serratia marcescans）、クレブシエラ（Klebsiella）、プロテウス（Proteus）、赤痢菌（Shigella）、根粒菌（Rhizobia）、ビトレオシラ（Vitreoscilla）又はパラカッコス（Paracoccus）が挙げられる。一実施態様において、グラム陰性細胞が使用される。一実施態様において、大腸菌細胞が本発明用の宿主として使用される。大腸菌株の例として、遺伝子型Ｗ３１１０  ΔｆｈｕＡ（ΔｔｏｎＡ）ｐｔｒ３  ｌａｃ  ｌｑ  ｌａｃＬ８  ΔｏｍｐＴΔ（ｎｍｐｃ−ｆｅｐＥ）ｄｅｇＰ４１  ｋａｎＲ（米国特許第５，６３９，６３５号）を有する株３３Ｄ３等の、株Ｗ３１１０（Ｂａｃｈｍａｎｎ、Ｃｅｌｌｕｌａｒ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、第２巻（Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｄ．Ｃ．：Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｆｏｒ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ、１９８７）、１１９０〜１２１９頁；ＡＴＣＣ寄託番号２７，３２５）及びその誘導体が挙げられる。大腸菌２９４（ＡＴＣＣ３１，４４６）、大腸菌Ｂ、大腸菌λ１７７６（ＡＴＣＣ３１，５３７）及び大腸菌ＲＶ３０８（ＡＴＣＣ３１，６０８）等の他の株及びその誘導体も好適である。一実施態様において、大腸菌Δｌｐｐは特定の用途を見出している。これらの例は限定的なものではなく例示的なものである。定義された遺伝子型を有する上記細菌のいずれかの誘導体の構築方法は当分野で既知であり、例えばＢａｓｓ他、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ、８：３０９〜３１４（１９９０）に記載されている。一般的に、細菌の細胞中におけるレプリコンの複製能力を考慮して適切な細菌を選択することが必要である。ｐＢＲ３２２、ｐＢＲ３２５、ｐＡＣＹＣ１７７又はｐＫＮ４１０等の公知のプラスミドを使用してレプリコンを供給する場合、例えば、大腸菌種、セラチア（Serratia）種又はサルモネア（Salmonella）種を宿主として好適に使用することができる。典型的には、宿主細胞は、タンパク質分解酵素の分泌が最小量でなければならず、望ましくは、追加のプロテアーゼ阻害剤を細胞培養に組み入れることができる。
【０１６８】
ｉｉ．ポリペプチドの産生
前述した発現ベクターで宿主細胞を形質転換し、プロモーターを誘導するのに、形質転換体を選択するのに又は所望の配列をコードする遺伝子を増幅するのに適するように改変した通常の栄養培地中で培養する。
【０１６９】
形質転換は、ＤＮＡが染色体外要素として又は染色体組み込み体により複製可能であるように、ＤＮＡを原核宿主中に導入することを意味する。使用される宿主細胞に応じて、形質転換はそのような細胞に適した標準的技術を使用して行なわれる。実質的な細胞壁障壁を含有する細菌細胞用に、塩化カルシウムを用いるカルシウム処理が一般的に使用される。別の形質転換方法はポリエチレングリコール／ＤＭＳＯを用いる。一般に使用される更に別の技術は電気穿孔である。
【０１７０】
本発明のポリペプチドの産生に使用される原核細胞を、当分野で既知であり選択された宿主細胞の培養に好適な培地中で増殖させる。好適な培地の例として、ルリアブロス（ＬＢ）プラス必須栄養素サプリメントが挙げられる。いくつかの実施態様において、培地はまた、発現ベクターを含有する原核細胞の増殖を選択的に可能にするために、発現ベクターの構築に基づいて選択される選択剤も含有する。例えば、アンピシリン耐性遺伝子を発現する細胞の増殖のために、培地にアンピシリンを添加する。
【０１７１】
炭素源、窒素源及び無機リン酸塩源に加えて任意の必須サプリメントを適切な濃度で含むこともでき、及び単独で導入し又は複合窒素源等の別のサプリメント又は培地との混合物として導入することもできる。任意選択で、培地は、グルタチオン、システイン、シスタミン、チオグリコレート、ジチオエリトリトール及びジチオトレイトールからなる群から選択される１種又は複数種の還元剤を含有することができる。
【０１７２】
原核宿主細胞を好適な温度で培養する。例えば、大腸菌の増殖に関して、好ましい温度は約２０℃〜約３９℃の範囲であり、より好ましくは約２５℃〜約３７℃の範囲であり、更により好ましくは約３０℃である。培地のｐＨは、主に宿主生物に応じて約５〜約９の範囲の任意のｐＨであることができる。大腸菌に関して、ｐＨは好ましくは約６．８〜約７．４であり、より好ましくは約７．０である。
【０１７３】
本発明の発現ベクター中において誘導性プロモーターを使用する場合、プロモーターの活性化に好適な条件下でタンパク質発現を誘導する。本発明の一態様において、ポリペプチドの転写を制御するためにＰｈｏＡプロモーターを使用する。従って、形質転換した宿主細胞を、誘導用のリン酸塩制限培地で培養する。好ましくは、リン酸塩制限培地はＣ．Ｒ．Ａ．Ｐ培地である（例えばＳｉｍｍｏｎｓ他、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ（２００２）、２６３：１３３〜１４７参照）。当分野で知られているように、用いるベクター構築物に従って様々な他の誘導物質を使用することができる。
【０１７４】
一実施態様において、第１のヒンジ含有宿主細胞及び第２のヒンジ含有宿主細胞を別々に培養し、本発明の発現したポリペプチドが宿主細胞のペリプラズム中にそれぞれ分泌され、該ペリプラズムからポリペプチドをそれぞれ回収する。第２の実施態様において、第１のヒンジ含有宿主細胞及び第２のヒンジ含有宿主細胞を別々に培養し、ヒンジ含有ポリペプチドの単離前に２つの宿主細胞培養物を一緒に混合し、細胞をペレット化する。第３の実施態様において、第１のヒンジ含有宿主細胞及び第２のヒンジ含有宿主細胞を別々に培養し、遠心分離し、及び別々に再懸濁し、次いでヒンジ含有ポリペプチドの単離前に一緒に混合する。第４の実施態様において、第１のヒンジ含有宿主細胞及び第２のヒンジ含有宿主細胞を同じ培養容器中で一緒に培養する。タンパク質の回収は概して、一般的には浸透圧ショック、超音波処理又は溶解等の手段により微生物の細胞膜を破壊することを含む。細胞が破壊されると、細胞残屑又は細胞全体を遠心分離又はろ過により除去することができる。例えば親和性樹脂クロマトグラフィーによりタンパク質を更に精製することができる。あるいは、タンパク質を培地中に輸送し、又は培地中で分泌させ、該培地中で単離することができる。外因性配列タグ（又はエピトープタグ）により発現した組換えタンパク質は、精製ステップを促進することができる。外因性配列タグ（Ｈｉｓタグ及びＧＳＴタグが挙げられるがこれらに限定されない）を含有するタンパク質のクローニング及び精製の技術は当分野で公知である。細胞を培養物から除去することができ、培養上清をろ過し、産生したタンパク質の更なる精製のために濃縮する。ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＰＡＧＥ）及びウェスタンブロットアッセイ等の一般に知られている方法を使用して、発現したポリペプチドを更に単離して同定することができる。単離したポリペプチドは、ヘテロ多量体タンパク質の産生に使用する。
【０１７５】
本発明の一態様において、ヘテロ多量体タンパク質（例えば抗体）の産生は、発酵プロセスにより大量に行なわれる。様々な大規模流加発酵手順が組換えタンパク質の産生に利用可能である。大規模発酵は１０００リットル以上の容量、好ましくは約１，０００〜１００，０００リットルの容量を有する。この発酵槽は、酸素及び栄養素、特にグルコース（好ましくは炭素／エネルギー源）を分散させるためにアジテータインペラ（agitator impeller）を使用する。小規模発酵は、約１００リットル以下の容積であり及び約１リットル〜約１００リットルの範囲であることができる発酵槽における発酵を一般的に指す。
【０１７６】
発酵プロセスにおいて、タンパク質発現の誘導は概して、好適な条件下で、細胞が初期の定常期にある段階で所望の密度まで、例えば約１８０〜２２０のＯＤ５００まで細胞が増殖した後に開始される。当分野で知られている及び前述されているように、用いられるベクター構築物に従って様々な誘導物質を使用することができる。誘導前のより短い時間にわたって細胞を増殖させることができる。通常、細胞を約１２〜５０時間にわたって誘導するが、より長い又はより短い誘導時間を使用することができる。
【０１７７】
本発明のポリペプチドの産生収率及び品質を改善するために、様々な発酵条件を変更することができる。例えば、分泌されるヘテロ多量体タンパク質（例えば抗体）の適切な構築及び折り畳みを改善するために、Ｄｓｂタンパク質（ＤｓｂＡ、ＤｓｂＢ、ＤｓｂＣ、ＤｓｂＤ及び／もしくはＤｓｂＧ）又はＦｋｐＡ（シャペロン活性を有するペプチジルプロピルシス，トランス−イソメラーゼ）等のシャペロンタンパク質を過剰発現する追加のベクターを使用して、宿主原核細胞を共形質転換させることができる。細菌宿主細胞中で産生される異種タンパク質の適切な折り畳み及び溶解性をシャペロンタンパク質が促進することが実証されている。Ｃｈｅｎ他（１９９９）Ｊ  Ｂｉｏ  Ｃｈｅｍ２７４：１９６０１〜１９６０５；Ｇｅｏｒｇｉｏｕ他、米国特許第６，０８３，７１５号；Ｇｅｏｒｇｉｏｕ他、米国特許第６，０２７，８８８号；Ｂｏｔｈｍａｎｎ及びＰｌｕｃｋｔｈｕｎ（２０００）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７５：１７１００〜１７１０５；Ｒａｍｍ及びＰｌｕｃｋｔｈｕｎ（２０００）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７５：１７１０６〜１７１１３；Ａｒｉｅ他（２００１）Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３９：１９９〜２１０。
【０１７８】
発現した異種タンパク質（特にタンパク質分解に敏感なもの）のタンパク質分解を最小限に抑えるために、タンパク質分解酵素を欠損する特定の宿主株を本発明のために使用することができる。例えば、宿主細胞株を修飾して、プロテアーゼＩＩＩ、ＯｍｐＴ、ＤｅｇＰ、Ｔｓｐ、プロテアーゼＩ、プロテアーゼＭｉ、プロテアーゼＶ、プロテアーゼＶＩ及びこれらの組合せ等の既知の細菌プロテアーゼをコードする遺伝子に遺伝子変異（単数又は複数）を生じさせることができる。いくつかの大腸菌プロテアーゼ欠損株が利用可能であり、例えばＪｏｌｙ他（１９９８）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９５：２７７３〜２７７７；Ｇｅｏｒｇｉｏｕ他、米国特許第５，２６４，３６５号；Ｇｅｏｒｇｉｏｕ他、米国特許第５，５０８，１９２号；Ｈａｒａ他、Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｄｒｕｇ  Ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ、２：６３〜７２（１９９６）に記載されている。
【０１７９】
一実施態様において、タンパク質分解酵素を欠損しており、及び１種又は複数種のシャペロンタンパク質を過剰発現するプラスミドで形質転換した大腸菌株を、本発明の発現系における宿主細胞として使用することができる。第２の実施態様において、大腸菌株は外膜のリポタンパク質を欠損している（Δｌｐｐ）。
【０１８０】
ｉｉｉ．ヘテロ多量体タンパク質の精製
一実施態様において、本明細書で産生したヘテロ多量体タンパク質を、更なるアッセイ及び用途のために実質的に均一である調製物を得るべく更に精製する。当分野で既知の標準的なタンパク質精製方法を用いることができる。以下の手順は好適な精製手順の例である：免疫親和性カラム又はイオン交換カラムによる分画、エタノール沈殿、逆相ＨＰＬＣ、シリカによる又はＤＥＡＥ等のイオン交換樹脂によるクロマトグラフィー、等電点電気泳動、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、硫酸アンモニウム沈殿、及び例えばＳｅｐｈａｄｅｘ  Ｇ−７５を使用するゲルろ過。
【０１８１】
一態様において、固相上に固定したプロテインＡを、例えば本発明の半抗体又は完全長抗体の産物の免疫親和性精製に使用する。プロテインＡは、抗体のＦｃ領域に高い親和性で結合する黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）に由来する４１ｋＤの細胞壁タンパク質である。Ｌｉｎｄｍａｒｋ他（１９８３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．６２：１〜１３。プロテインＡが固定された固相は、好ましくは、ガラス又はシリカ表面、より好ましくは孔が制御されたガラスカラム又はケイ酸カラムを含むカラムである。いくつかの用途において、カラムは、混入物の非特異的な付着を防止するためにグリセロール等の試薬でコーティングされている。
【０１８２】
精製の最初のステップとして、前述した細胞培養に由来する調製物をプロテインＡが固定された固相上にアプライし、プロテインＡに目的の抗体を特異的に結合させる。次いで、固相を洗浄して固相に非特異的に結合した混入物を除去する。ヘテロ多量体タンパク質（例えば抗体）を、溶出により固相から回収する。
【０１８３】
ｂ．真核宿主細胞を使用するヘテロ多量体タンパク質の生成：
ベクター成分として一般的に以下のもののうちの１つ又は複数が挙げられるがこれらに限定されない：シグナル配列、複製開始点、一又は複数のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター及び転写終結配列。
【０１８４】
ｉ．シグナル配列成分
真核宿主細胞において使用するベクターはまた、シグナル配列又は成熟タンパク質もしくは目的のポリペプチドのＮ末端で特定の切断部位を有する他のポリペプチドも含有することができる。好ましくは、選択された異種シグナル配列は、宿主細胞によって認識されてプロセシングされる（即ち、シグナルペプチダーゼにより切断される）ものである。哺乳動物細胞の発現において、哺乳動物のシグナル配列及びウイルス分泌リーダー、例えば単純ヘルペスｇＤシグナルが利用可能である。そのような前駆体領域に関するＤＮＡは、リーディングフレームにおいて、所望のヘテロ多量体タンパク質（単数又は複数）（例えば抗体）をコードするＤＮＡにライゲーションされる。
【０１８５】
ｉｉ．複製開始点
一般的に、哺乳動物の発現ベクターには複製開始点成分は不要である。例えば、ＳＶ４０開始点を概して使用することできるが、これは該ＳＶ４０開始点が初期プロモーターを含有しているという理由からだけである。
【０１８６】
ｉｉｉ．選択遺伝子成分
発現ベクター及びクローニングベクターは、選択可能マーカーとも称される選択遺伝子を含有することができる。典型的な選択遺伝子は、（ａ）抗生物質もしくは他の毒素、例えばアンピシリン、ネオマイシン、メトトレキサートもしくはテトラサイクリンに対する耐性を与える、（ｂ）必要に応じて栄養要求性欠乏を補う又は（ｃ）複合培地から得ることができない重要な栄養素を供給するタンパク質をコードする。
【０１８７】
選択スキームの一例では、薬物を利用して宿主細胞の増殖が抑止される。異種遺伝子での形質転換に成功している細胞は、薬物耐性を付与するタンパク質を産生し、そのため選択レジメンを生き延びる。そのような優性選択の例では、薬物ネオマイシン、ミコフェノール酸及びハイグロマイシンが使用される。
【０１８８】
哺乳動物細胞に好適な選択可能マーカーの別の例として、抗体核酸を取り込む能力がある細胞を同定することができるもの、例えばＤＨＦＲ、チミジンキナーゼ、メタロチオネイン−Ｉ及びＩＩ、好ましくは霊長類メタロチオネイン遺伝子、アデノシンデアミナーゼ、オルニチンデカルボキシラーゼ等が挙げられる。
【０１８９】
例えば、ＤＨＦＲ選択遺伝子で形質転換した細胞を最初に、ＤＨＦＲの競合的アンタゴニストであるメトトレキサート（Ｍｔｘ）を含有する培地において形質転換体の全てを培養することにより同定する。野生型ＤＨＦＲを用いた場合の適切な宿主細胞は、ＤＨＦＲ活性が欠損しているチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞株（例えばＡＴＣＣ  ＣＲＬ−９０９６）である。
【０１９０】
あるいは、抗体、野生型ＤＨＦＲタンパク質及び別の選択可能マーカー、例えばアミノグリコシド３’−ホスホトランスフェラーゼ（ＡＰＨ）をコードするＤＮＡ配列で形質転換した又は共形質転換した宿主細胞（特に、内因性ＤＨＦＲを含有する野生型宿主）を、アミノグリコシド抗生物質、例えばカナマイシン、ネオマイシン又はＧ４１８等の選択可能マーカー用の選択剤を含有する培地における細胞増殖により選択することができる。例えば、米国特許第４，９６５，１９９号参照。
【０１９１】
ｉｖ．プロモーター成分
発現ベクター及びクローニングベクターは通常、宿主生物によって認識され、所望のヒンジ含有ポリペプチド（単数又は複数）（例えば抗体）核酸に作動可能に連結されるプロモーターを含有する。プロモーター配列は真核生物に関して知られている。実質的に全ての真核遺伝子は、転写が開始される部位から約２５〜３０塩基上流に位置するＡＴリッチ領域を有する。多くの遺伝子の転写開始から７０〜８０塩基上流に見出される別の配列はＣＮＣＡＡＴ領域であり、Ｎは任意のヌクレオチドであることができる。大部分の真核遺伝子の３’末端には、コード配列の３’末端へのポリＡ尾部の付加に関するシグナルであることができるＡＡＴＡＡＡ配列が存在する。これらの配列は全て、真核発現ベクターに適切に挿入される。
【０１９２】
哺乳動物宿主細胞におけるベクターからの所望のヒンジ含有ポリペプチド（単数又は複数）（例えば半抗体）の転写は、例えばプロモーター、例えばポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス（アデノウイルス２等）、ウシ乳頭腫ウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス及びシミアンウイルス４０（ＳＶ４０）等のウイルスのゲノムから得られるプロモーターによって、異種哺乳動物のプロモーターから、例えばアクチンプロモーターもしくは免疫グロブリンプロモーターから、又は熱ショックプロモーターから、そのようなプロモーターが宿主細胞系と適合するという条件で制御される。
【０１９３】
ＳＶ４０ウイルスの初期及び後期のプロモーターは、ＳＶ４０ウイルスの複製開始点も含有するＳＶ４０制限断片として好都合に得られる。ヒトサイトメガロウイルスの前初期のプロモーターは、ＨｉｎｄＩＩＩ  Ｅ制限断片として好都合に得られる。ベクターとしてウシ乳頭腫ウイルスを使用して哺乳動物宿主中でＤＮＡを発現させる系が米国特許第４，４１９，４４６号に開示されている。この系の改変が米国特許第４，６０１，９７８号に記載されている。単純ヘルペスウイルスに由来するチミジンキナーゼプロモーターの制御下でのマウス細胞におけるヒトβ−インターフェロンｃＤＮＡの発現に関してＲｅｙｅｓ他、Ｎａｔｕｒｅ２９７：５９８〜６０１（１９８２）も参照。あるいは、ラウス肉腫ウイルスの長い末端反復をプロモーターとして使用することができる。
【０１９４】
ｖ．エンハンサーエレメント成分
高等真核生物による所望のヒンジ含有ポリペプチド（単数又は複数）（例えば抗体）をコードするＤＮＡの転写を、ベクター中にエンハンサー配列を挿入することによって増大させることができる。多くのエンハンサー配列が哺乳動物遺伝子（例えばグロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテイン及びインスリンの遺伝子）から現在知られている。また、真核細胞ウイルスに由来するエンハンサーを使用することもできる。例として、複製開始点の後ろ側にあるＳＶ４０エンハンサー（１００〜２７０塩基対）、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製開始点の後ろ側にあるポリオーマエンハンサー及びアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。真核プロモーターの活性化を増強するためのエレメントの記載に関してＹａｎｉｖ、Ｎａｔｕｒｅ２９７：１７〜１８（１９８２）も参照。抗体ポリペプチドをコードする配列に対して５’位又は３’位でベクター中にエンハンサーをスプライシングすることができるが、増強が達成されるという条件で一般的にプロモーターから５’位に位置している。
【０１９５】
ｖｉ．転写終結成分
真核宿主細胞で使用される発現ベクターは概して、転写の終結及びｍＲＮＡの安定化に必要な配列も含有するものとなる。そのような配列は、真核生物又はウイルスのＤＮＡ又はｃＤＮＡの５’非翻訳領域、及び場合により３’非翻訳領域から一般的に得ることができる。これらの領域は、抗体をコードするｍＲＮＡの非翻訳部分においてポリアデニル化断片として転写されるヌクレオチドセグメントを含有する。１つの有用な転写終結成分としてウシ成長ホルモンポリアデニル化領域が挙げられる。ＷＯ９４／１１０２６及びそれに開示された発現ベクターを参照。
【０１９６】
ｖｉｉ．宿主細胞の選択及び形質転換
本明細書におけるベクターでのＤＮＡのクローニング又は発現に好適な宿主細胞として、脊椎動物宿主細胞を含む本明細書に記載した高等真核細胞が挙げられる。培養（組織培養）における脊椎動物細胞の増殖はルーチン的な手順となっている。有用な哺乳動物宿主細胞株の例として、ＳＶ４０により形質転換したサル腎臓ＣＶ１株（ＣＯＳ−７、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １６５１）；ヒト胚腎臓株（２９３個、又は懸濁培養での増殖のためにサブクローニングした２９３個の細胞、Ｇｒａｈａｍ他、Ｊ．Ｇｅｎ  Ｖｉｒｏｌ．３６：５９（１９７７））；仔ハムスター腎臓細胞（ＢＨＫ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  １０）；チャイニーズハムスター卵巣細胞／−ＤＨＦＲ（ＣＨＯ、Ｕｒｌａｕｂ他、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ７７：４２１６（１９８０））；マウスセルトリ細胞（ＴＭ４、Ｍａｔｈｅｒ、Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ．２３：２４３〜２５１（１９８０））；サル腎臓細胞（ＣＶ１  ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ７０）；アフリカミドリザル腎臓細胞（ＶＥＲＯ−７６、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−１５８７）；ヒト子宮頸癌細胞（ＨＥＬＡ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ２）；イヌ腎臓細胞（ＭＤＣＫ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ３４）；バッファローラット肝臓細胞（ＢＲＬ  ３Ａ、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １４４２）；ヒト肺細胞（Ｗ１３８、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ７５）；ヒト肝臓細胞（Ｈｅｐ  Ｇ２、ＨＢ  ８０６５）；マウス乳腺腫瘍（ＭＭＴ  ０６０５６２、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ５１）；ＴＲＩ細胞（Ｍａｔｈｅｒ他、Ａｎｎａｌｓ  Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．３８３：４４〜６８（１９８２））；ＭＲＣ  ５細胞；ＦＳ４細胞；及びヒト肝細胞癌株（Ｈｅｐ  Ｇ２）が挙げられる。
【０１９７】
宿主細胞を、所望のヒンジ含有ポリペプチド（単数又は複数）（例えば抗体）の産生用の上記発現ベクター又はクローニングベクターで形質転換し、プロモーターを誘導するのに、形質転換体を選択するのに又は所望の配列をコードする遺伝子を増幅するのに適するように改変した従来の栄養培地で培養する。
【０１９８】
ｖｉｉｉ．宿主細胞の培養
本発明の所望のヒンジ含有ポリペプチド（単数又は複数）（例えば抗体）の産生に使用する宿主細胞を様々な培地で培養することができる。ハムＦ１０（Ｓｉｇｍａ）、最小必須培地（（ＭＥＭ）、Ｓｉｇｍａ）、ＲＰＭＩ−１６４０（Ｓｉｇｍａ）及びダルベッコ変法イーグル培地（（ＤＭＥＭ）、Ｓｉｇｍａ）等の市販の培地が宿主細胞の培養に好適である。加えて、Ｈａｍ他、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．５８：４４（１９７９）、Ｂａｒｎｅｓ他、Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１０２：２５５（１９８０）、米国特許第４，７６７，７０４号；米国特許第４，６５７，８６６号；米国特許第４，９２７，７６２号；米国特許第４，５６０，６５５号；もしくは米国特許第５，１２２，４６９号；ＷＯ９０／０３４３０；ＷＯ８７／００１９５；又は米国再発行特許第３０，９８５号に記載された培地のいずれも宿主細胞用の培地として使用することができる。これらの培地のいずれにも、ホルモン及び／又は他の成長因子（例えばインスリン、トランスフェリン又は上皮成長因子）、塩類（例えば塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム及びリン酸塩）、緩衝液（例えばＨＥＰＥＳ）、ヌクレオチド（例えばアデノシン及びチミジン）、抗生物質（例えばＧＥＮＴＡＭＹＣＩＮ（商標）薬）、微量元素（マイクロモル濃度範囲の最終濃度で通常は存在する無機化合物として定義される）及びグルコース又は等価のエネルギー源を必要に応じて補充することができる。任意の他の必要なサプリメントを当業者に既知である適切な濃度で含むこともできる。温度、ｐＨ等の培養条件は、発現用に選択した宿主で以前に使用されたものであり、当業者には明らかであるだろう。
【０１９９】
ｉｘ．ヘテロ多量体タンパク質の精製
組換え技術を使用する場合、ヒンジ含有ポリペプチドを細胞内で産生することができ、又は培地中に直接分泌させることができる。ヒンジ含有ポリペプチドが細胞内で産生される場合、第１のステップとして、粒子状の残屑、即ち宿主細胞又は溶解断片のいずれかを例えば遠心分離又は限外ろ過により除去する。ヒンジ含有ポリペプチドが培地中に分泌される場合、そのような発現系からの上清を一般的に、市販のタンパク質濃縮フィルタ、例えばＡｍｉｃｏｎ又はＭｉｌｌｉｐｏｒｅ  Ｐｅｌｌｉｃｏｎ限外ろ過装置を使用して最初に濃縮する。ＰＭＳＦ等のプロテアーゼ阻害剤を以前のステップのいずれかに含ませてタンパク質分解を阻害することができ、抗生物質を含ませて外来性の汚染菌の増殖を防止することができる。
【０２００】
細胞から調製したヘテロ多量体組成物を、例えばイオン交換、疎水性相互作用クロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析及びアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製することができ、アフィニティークロマトグラフィーが好ましい精製技術である。前述した技術の組合せも考慮される。アフィニティーリガンドとしてのプロテインＡの適合性は、抗体中に存在する任意の免疫グロブリンＦｃドメインの種類及びアイソタイプに依存する。プロテインＡをヒトγ１重鎖、γ２重鎖又はγ４重鎖に基づく抗体の精製に使用することができる（Ｌｉｎｄｍａｒｋ他、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．６２：１〜１３（１９８３））。プロテインＧは、全てのマウスのアイソタイプ及びヒトγ３に推奨されている（Ｇｕｓｓ他、ＥＭＢＯ  Ｊ．５：１５６７１５７５（１９８６））。アフィニティーリガンドが付着するマトリックスはアガロースであることが最も多いが、他のマトリックスも使用することができる。孔が制御されたガラス又はポリ（スチレンジビニル）ベンゼン等の機械的に安定なマトリックスは、アガロースにより達成することができる場合よりも早い流速及び短い処理時間を可能にする。抗体がＣＨ３ドメインを含む場合、Ｂａｋｅｒｂｏｎｄ  ＡＢＸ（商標）樹脂（Ｊ.Ｔ.Ｂａｋｅｒ，Ｐｈｉｌｌｉｐｓｂｕｒｇ，ＮＪ）が精製に有用である。タンパク質精製用の他の技術、例えばイオン交換カラムによる分画、エタノール沈殿、逆相ＨＰＬＣ、シリカによるクロマトグラフィー、ヘパリンＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（商標）によるクロマトグラフィー、アニオン交換樹脂又はカチオン交換樹脂によるクロマトグラフィー（例えばポリアスパラギン酸カラム）、等電点電気泳動、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ及び硫酸アンモニウム沈殿も、回収する抗体に応じて利用可能である。
【０２０１】
任意の予備的精製ステップ（単数又は複数）に続いて、目的の抗体及び混入物を含む混合物を、好ましくは低塩濃度（例えば約０〜０．２５Ｍの塩）で行なわれる約２．５〜４．５のｐＨで溶出緩衝液を使用する低ｐＨ疎水性相互作用クロマトグラフィーにかけることができる。ヘテロ多量体タンパク質の産生は、（上記特定の方法のいずれかの）代替として又は追加としてポリペプチドの混合物を含む溶液を透析すること含むことができる。
【０２０２】
ｘ．バキュロウイルスを使用する抗体産生
例えばリポフェクチン（ＧＩＢＣＯ−ＢＲＬから市販されている）を使用する、抗体又は抗体断片をコードするプラスミドとＢａｃｕｌｏＧｏｌｄ（商標）ウイルスＤＮＡ（Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）との昆虫細胞への、例えばスポドプテラ・フルギペルダ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ  ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ）細胞（例えばＳｆ９細胞；ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １７１１）又はキイロショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ  ｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ）Ｓ２細胞への共遺伝子導入により、組換えバキュロウイルスを生成することができる。特定の例において、抗体配列は、バキュロウイルス発現ベクター内に含有されるエピトープタグの上流に融合する。そのようなエピトープタグとしてポリＨｉｓタグが挙げられる。市販のプラスミド、例えばｐＶＬ１３９３（Ｎｏｖａｇｅｎ）又はｐＡｃＧＰ６７Ｂ（Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）に由来するプラスミド等の様々なプラスミドを用いることができる。簡潔に言うと、抗体又はその断片をコードする配列を、５’領域及び３’領域に相補的なプライマーによるＰＣＲにより増幅することができる。５’プライマーは、隣接する（選択した）制限酵素部位を包含することができる。次いで、選択した制限酵素で産物を消化し、発現ベクターにサブクローニングすることができる。
【０２０３】
発現ベクターによる遺伝子導入後、宿主細胞（例えばＳｆ９細胞）を２８℃で４〜５日にわたってインキュベートし、放出されたウイルスを収集して更なる増幅に使用する。ウイルス感染及びタンパク質発現を、例えばＯ’Ｒｅｉｌｌｅｙ他（Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ  ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｖｅｃｔｏｒｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．Ｏｘｆｏｒｄ：Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９４））に記載されているように行なうことができる。
【０２０４】
次いで、発現したポリＨｉｓタグ化抗体を、例えば以下のようにＮｉ２＋−キレートアフィニティークロマトグラフィーにより精製することができる。Ｒｕｐｅｒｔ他（Ｎａｔｕｒｅ３６２：１７５〜１７９（１９９３））に記載されているように、組換えウイルス感染Ｓｆ９細胞から抽出物を調製することができる。簡潔に言うと、Ｓｆ９細胞を洗浄し、超音波処理緩衝液（２５ｍＬのＨＥＰＥＳ  ｐＨ７．９；１２．５ｍＭのＭｇＣｌ２；０．１ｍＭのＥＤＴＡ；１０％グリセロール；０．１％ＮＰ−４０；０．４ＭのＫＣｌ）中に再懸濁し、氷上で２０秒にわたって２回超音波処理する。超音波処理物を遠心分離により清澄化し、上清をローディング緩衝液（５０ｍＭのリン酸塩；３００ｍＭのＮａＣｌ；１０％グリセロールｐＨ７．８）中に５０倍に希釈し、０．４５μｍフィルタを通してろ過する。Ｎｉ２＋−ＮＴＡアガロースカラム（Ｑｉａｇｅｎから市販されている）を５ｍＬの総容積で調製し、２５ｍＬの水で洗浄し、２５ｍＬのローディング緩衝液で平衡化する。ろ過した細胞抽出物を毎分０．５ｍＬでカラム上に負荷する。ローディング緩衝液でベースラインＡ２８０までカラムを洗浄し、その時点で画分収集を開始する。次に、二次洗浄緩衝液（５０ｍＭのリン酸塩；３００ｍＭのＮａＣｌ；１０％グリセロールｐＨ６．０）でカラムを洗浄し、非特異的に結合したタンパク質を溶出させる。Ａ２８０ベースラインに再度達した後、二次洗浄緩衝液中の０〜５００ｍＭのイミダゾール勾配でカラムを展開する。１ｍＬ画分を収集し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ及び銀染色又はアルカリホスファターゼ（Ｑｉａｇｅｎ）にコンジュゲートしたＮｉ２＋−ＮＴＡによるウエスタンブロットにより分析する。溶出したＨｉｓ１０タグ化抗体を含有する画分をプールし、ローディング緩衝液に対して透析する。
【０２０５】
あるいは、例えばプロテインＡ又はプロテインＧのカラムクロマトグラフィー等の既知のクロマトグラフィー技術を使用して抗体の精製を行なうことができる。一実施態様において、カオトロピック剤又は中性界面活性剤を含有する溶液中への溶出により、目的の抗体をカラムの固相から回収することができる。例示的なカオトロピック剤及び中性界面活性剤として、グアニジン−ＨＣｌ、尿素、過塩素酸リチウム（lithium perclorate）、アルギニン、ヒスチジン、ＳＤＳ（ドデシル硫酸ナトリウム）、Ｔｗｅｅｎ、Ｔｒｉｔｏｎ及びＮＰ−４０が挙げられるがこれらに限定されず、これら全ては市販されている。
【０２０６】
ＩＶ．標的分子
本発明のヘテロ多量体タンパク質により標的化することができる分子の例として、可溶性血清タンパク質及びその受容体並びに他の膜結合タンパク質（例えばアドヘシン）が挙げられるがこれらに限定されない。ＷＯ２０１１／１３３８８６を参照し、これは出典明示によりその全体が本明細書に援用される。
【０２０７】
別の実施態様において、本発明のヘテロ多量体タンパク質は、ＢＭＰＩ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ３Ｂ（ＧＤＦＩＯ）、ＢＭＰ４、ＢＭＰ６、ＢＭＰ８、ＣＳＦＩ（Ｍ−ＣＳＦ）、ＣＳＦ２（ＧＭ−ＣＳＦ）、ＣＳＦ３（Ｇ−ＣＳＦ）、ＥＰＯ、ＦＧＦＩ（ａＦＧＦ）、ＦＧＦ２（ｂＦＧＦ）、ＦＧＦ３（ｉｎｔ−２）、ＦＧＦ４（ＨＳＴ）、ＦＧＦ５、ＦＧＦ６（ＨＳＴ−２）、ＦＧＦ７（ＫＧＦ）、ＦＧＦ９、ＦＧＦ１０、ＦＧＦ１１、ＦＧＦ１２、ＦＧＦ１２Ｂ、ＦＧＦ１４、ＦＧＦ１６、ＦＧＦ１７、ＦＧＦ１９、ＦＧＦ２０、ＦＧＦ２１、ＦＧＦ２３、ＩＧＦ１、ＩＧＦ２、ＩＦＮＡＩ、ＩＦＮＡ２、ＩＦＮＡ４、ＩＦＮＡ５、ＩＦＮＡ６、ＩＦＮＡ７、ＩＦＮＢＩ、ＩＦＮＧ、ＩＦＮＷＩ、ＦＥＬＩ、ＦＥＬＩ（ＥＰＳＥＬＯＮ）、ＦＥＬＩ（ＺＥＴＡ）、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１Ｂ、ＩＬ２、ＩＬ３、ＩＬ４、ＩＬ５、ＩＬ６、ＩＬ７、ＩＬ８、ＩＬ９、ＩＬ１０、ＩＬ１１、ＩＬ１２Ａ、ＩＬ１２Ｂ、ＩＬ１３、ＩＬ１４、ＩＬ１５、ＩＬ１６、ＩＬ１７、ＩＬ１７Ｂ、ＩＬ１８、ＩＬ１９、ＩＬ２０、ＩＬ２２、ＩＬ２３、ＩＬ２４、ＩＬ２５、ＩＬ２６、ＩＬ２７、ＩＬ２８Ａ、ＩＬ２８Ｂ、ＩＬ２９、ＩＬ３０、ＰＤＧＦＡ、ＰＤＧＦＢ、ＴＧＦＡ、ＴＧＦＢ１、ＴＧＦＢ２、ＴＧＦＢ３、ＬＴＡ（ＴＮＦ−ｂ）、ＬＴＢ、ＴＮＦ（ＴＮＦ−ａ）、ＴＮＦＳＦ４（ＯＸ４０リガンド）、ＴＮＦＳＦ５（ＣＤ４０リガンド）、ＴＮＦＳＦ６（ＦａｓＬ）、ＴＮＦＳＦ７（ＣＤ２７リガンド）、ＴＮＦＳＦ８（ＣＤ３０リガンド）、ＴＮＦＳＦ９（４−１ＢＢリガンド）、ＴＮＦＳＦＩＯ（ＴＲＡＩＬ）、ＴＮＦＳＦ１Ｉ（ＴＲＡＮＣＥ）、ＴＮＦＳＦ１２（ＡＰＯ３Ｌ）、ＴＮＦＳＦ１３（Ａｐｒｉｌ）、ＴＮＦＳＦ１３Ｂ、ＴＮＦＳＦ１４（ＨＶＥＭ−Ｌ）、ＴＮＦＳＦ１５（ＶＥＧＩ）、ＴＮＦＳＦ１８、ＨＧＦ（ＶＥＧＦＤ）、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＢ、ＶＥＧＦＣ、ＩＬＩＲ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ１ＲＬ１、ＩＬ１ＲＬ２、ＩＬ２ＲＡ、ＩＬ２ＲＢ、ＩＬ２ＲＧ、ＩＬ３ＲＡ、ＩＬ４Ｒ、ＩＬ５ＲＡ、ＩＬ６Ｒ、ＩＬ７Ｒ、ＩＬ８ＲＡ、ＩＬ８ＲＢ、ＩＬ９Ｒ、ＩＬＩ０ＲＡ、ＩＬＩ０ＲＢ、ＩＬ１１ＲＡ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＩＬ１２ＲＢ２、ＩＬ１３ＲＡ１、ＩＬ１３ＲＡ２、ＩＬ１５ＲＡ、ＩＬ１７Ｒ、ＩＬ１８Ｒ１、ＩＬ２０ＲＡ、ＩＬ２１Ｒ、ＩＬ２２Ｒ、ＩＬ１ＨＹ１、ＩＬ１ＲＡＰ、ＩＬ１ＲＡＰＬ１、ＩＬ１ＲＡＰＬ２、ＩＬ１ＲＮ、ＩＬ６ＳＴ、ＩＬ１８ＢＰ、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＬ２２ＲＡ２、ＡＩＦＩ、ＨＧＦ、ＬＥＰ（レプチン）、ＰＴＮ及びＴＨＰＯからなる群から選択される１種、２種、又はそれ以上のサイトカイン、サイトカイン関連タンパク質及びサイトカイン受容体に結合することができる。
【０２０８】
別の実施態様において、標的分子は、ＣＣＬＩ（Ｉ−３０９）、ＣＣＬ２（ＭＣＰ−１／ＭＣＡＦ）、ＣＣＬ３（ＭＩＰ−ｌａ）、ＣＣＬ４（ＭＩＰ−ｌｂ）、ＣＣＬ５（ＲＡＮＴＥＳ）、ＣＣＬ７（ＭＣＰ−３）、ＣＣＬ８（ｍｃｐ−２）、ＣＣＬＨ（エオタキシン）、ＣＣＬ１３（ＭＣＰ−４）、ＣＣＬ１５（ＭＩＰ−ｌｄ）、ＣＣＬ１６（ＨＣＣ−４）、ＣＣＬ１７（ＴＡＲＣ）、ＣＣＬ１８（ＰＡＲＣ）、ＣＣＬ１９（ＭＤＰ−３ｂ）、ＣＣＬ２０（ＭＩＰ−３ａ）、ＣＣＬ２１（ＳＬＣ／エクソダス−２）、ＣＣＬ２２（ＭＤＣ／ＳＴＣ−Ｉ）、ＣＣＬ２３（ＭＰＩＦ−Ｉ）、ＣＣＬ２４（ＭＰＩＦ−２／エオタキシン−２）、ＣＣＬ２５（ＴＥＣＫ）、ＣＣＬ２６（エオタキシン−３）、ＣＣＬ２７（ＣＴＡＣＫ／ＩＬＣ）、ＣＣＬ２８、ＣＸＣＬＩ（ＧＲＯＩ）、ＣＸＣＬ２（ＧＲＯ２）、ＣＸＣＬ３（ＧＲ０３）、ＣＸＣＬ５（ＥＮＡ−７８）、ＣＸＣＬ６（ＧＣＰ−２）、ＣＸＣＬ９（ＭＩＧ）、ＣＸＣＬ１０（ＩＰ１０）、ＣＸＣＬ１１（Ｉ−ＴＡＣ）、ＣＸＣＬ１２（ＳＤＦＩ）、ＣＸＣＬ１３、ＣＸＣＬ１４、ＣＸＣＬ１６、ＰＦ４（ＣＸＣＬ４）、ＰＰＢＰ（ＣＸＣＬ７）、ＣＸ３ＣＬ１（ＳＣＹＤＩ）、ＳＣＹＥＩ、ＸＣＬＩ（リンホタクチン）、ＸＣＬ２（ＳＣＭ−ｌｂ）、ＢＬＲＩ（ＭＤＲ１５）、ＣＣＢＰ２（Ｄ６／ＪＡＢ６１）、ＣＣＲ１（ＣＫＲＩ／ＨＭ１４５）、ＣＣＲ２（ｍｃｐ−ＩＲＢ／ＲＡ）、ＣＣＲ３（ＣＫＲ３／ＣＭＫＢＲ３）、ＣＣＲ４、ＣＣＲ５（ＣＭＫＢＲ５／ＣｈｅｍＲ１３）、ＣＣＲ６（ＣＭＫＢＲ６／ＣＫＲ−Ｌ３／ＳＴＲＬ２２／ＤＲＹ６）、ＣＣＲ７（ＣＫＲ７／ＥＢＩＩ）、ＣＣＲ８（ＣＭＫＢＲ８／ＴＥＲＩ／ＣＫＲ−ＬＩ）、ＣＣＲ９（ＧＰＲ−９−６）、ＣＣＲＬＩ（ＶＳＨＫＩ）、ＣＣＲＬ２（Ｌ−ＣＣＲ）、ＸＣＲＩ（ＧＰＲ５／ＣＣＸＣＲＩ）、ＣＭＫＬＲＩ、ＣＭＫＯＲＩ（ＲＤＣＩ）、ＣＸ３ＣＲ１（Ｖ２８）、ＣＸＣＲ４、ＧＰＲ２（ＣＣＲＩＯ）、ＧＰＲ３１、ＧＰＲ８１（ＦＫＳＧ８０）、ＣＸＣＲ３（ＧＰＲ９／ＣＫＲ−Ｌ２）、ＣＸＣＲ６（ＴＹＭＳＴＲ／ＳＴＲＬ３３／Ｂｏｎｚｏ）、ＨＭ７４、ＩＬ８ＲＡ（ＩＬ８Ｒａ）、ＩＬ８ＲＢ（ＩＬ８Ｒｂ）、ＬＴＢ４Ｒ（ＧＰＲ１６）、ＴＣＰＩＯ、ＣＫＬＦＳＦ２、ＣＫＬＦＳＦ３、ＣＫＬＦＳＦ４、ＣＫＬＦＳＦ５、ＣＫＬＦＳＦ６、ＣＫＬＦＳＦ７、ＣＫＬＦＳＦ８、ＢＤＮＦ、Ｃ５Ｒ１、ＣＳＦ３、ＧＲＣＣＩＯ（ＣＩＯ）、ＥＰＯ、ＦＹ（ＤＡＲＣ）、ＧＤＦ５、ＨＤＦＩＡ、ＤＬ８、ＰＲＬ、ＲＧＳ３、ＲＧＳ１３、ＳＤＦ２、ＳＬＩＴ２、ＴＬＲ２、ＴＬＲ４、ＴＲＥＭＩ、ＴＲＥＭ２及びＶＨＬからなる群から選択されるケモカイン、ケモカイン受容体又はケモカイン関連タンパク質である。
【０２０９】
別の実施態様において、本発明のヘテロ多量体タンパク質は、ＡＢＣＦＩ；ＡＣＶＲＩ；ＡＣＶＲＩＢ；ＡＣＶＲ２；ＡＣＶＲ２Ｂ；ＡＣＶＲＬＩ；ＡＤ０ＲＡ２Ａ；アグリカン；ＡＧＲ２；ＡＩＣＤＡ；ＡＩＦＩ；ＡＩＧＩ；ＡＫＡＰＩ；ＡＫＡＰ２；ＡＭＨ；ＡＭＨＲ２；ＡＮＧＰＴＩ；ＡＮＧＰＴ２；ＡＮＧＰＴＬ３；ＡＮＧＰＴＬ４；ＡＮＰＥＰ；ＡＰＣ；ＡＰＯＣＩ；ＡＲ；ＡＺＧＰＩ（亜鉛−ａ−糖タンパク質）；Ｂ７．１；Ｂ７．２；ＢＡＤ；ＢＡＦＦ（ＢＬｙｓ）；ＢＡＧＩ；ＢＡＨ；ＢＣＬ２；ＢＣＬ６；ＢＤＮＦ；ＢＬＮＫ；ＢＬＲＩ（ＭＤＲ１５）；ＢＭＰＩ；ＢＭＰ２；ＢＭＰ３Ｂ（ＧＤＦＩＯ）；ＢＭＰ４；ＢＭＰ６；ＢＭＰ８；ＢＭＰＲＩＡ；ＢＭＰＲＩＢ；ＢＭＰＲ２；ＢＰＡＧＩ（プレクチン）；ＢＲＣＡＩ；Ｃ１９ｏｒｆｌＯ（ＩＬ２７ｗ）；Ｃ３；Ｃ４Ａ；Ｃ５；Ｃ５Ｒ１；ＣＡＮＴＩ；ＣＡＳＰ１；ＣＡＳＰ４；ＣＡＶＩ；ＣＣＢＰ２（Ｄ６／ＪＡＢ６１）；ＣＣＬＩ（１−３０９）；ＣＣＬＩＩ（エオタキシン）；ＣＣＬ１３（ＭＣＰ−４）；ＣＣＬ１５（ＭＩＰ−Ｉｄ）；ＣＣＬ１６（ＨＣＣ−４）；ＣＣＬ１７（ＴＡＲＣ）；ＣＣＬ１８（ＰＡＲＣ）；ＣＣＬ１９（ＭＩＰ−３ｂ）；ＣＣＬ２（ＭＣＰ−１）；ＭＣＡＦ；ＣＣＬ２０（ＭＩＰ−３ａ）；ＣＣＬ２１（ＭＴＰ−２）；ＳＬＣ；エクソダス−２；ＣＣＬ２２（ＭＤＣ／ＳＴＣ−Ｉ）；ＣＣＬ２３（ＭＰＩＦ−１）；ＣＣＬ２４（ＭＰＩＦ−２／エオタキシン−２）；ＣＣＬ２５（ＴＥＣＫ）；ＣＣＬ２６（エオタキシン−３）；ＣＣＬ２７（ＣＴＡＣＫ／ＩＬＣ）；ＣＣＬ２８；ＣＣＬ３（ＭＴＰ−ｌａ）；ＣＣＬ４（ＭＤＰ−ｌｂ）；ＣＣＬ５（ＲＡＮＴＥＳ）；ＣＣＬ７（ＭＣＰ−３）；ＣＣＬ８（ｍｃｐ−２）；ＣＣＮＡＩ；ＣＣＮＡ２；ＣＣＮＤＩ；ＣＣＮＥＩ；ＣＣＮＥ２；ＣＣＲＩ（ＣＫＲＩ／ＨＭ１４５）；ＣＣＲ２（ｍｃｐ−ＩＲＢ／ＲＡ）；ＣＣＲ３（ＣＫＲ３／ＣＭＫＢＲ３）；ＣＣＲ４；ＣＣＲ５（ＣＭＫＢＲ５／ＣｈｅｍＲ１３）；ＣＣＲ６（ＣＭＫＢＲ６／ＣＫＲ−Ｌ３／ＳＴＲＬ２２／ＤＲＹ６）；ＣＣＲ７（ＣＫＲ７／ＥＢＩＩ）；ＣＣＲ８（ＣＭＫＢＲ８／ＴＥＲＩ／ＣＫＲ−ＬＩ）；ＣＣＲ９（ＧＰＲ−９−６）；ＣＣＲＬＩ（ＶＳＨＫＩ）；ＣＣＲＬ２（Ｌ−ＣＣＲ）；ＣＤ１６４；ＣＤ１９；ＣＤＩＣ；ＣＤ２０；ＣＤ２００；ＣＤ２２；ＣＤ２４；ＣＤ２８；ＣＤ３；ＣＤ３７；ＣＤ３８；ＣＤ３Ｅ；ＣＤ３Ｇ；ＣＤ３Ｚ；ＣＤ４；ＣＤ４０；ＣＤ４０Ｌ；ＣＤ４４；ＣＤ４５ＲＢ；ＣＤ５２；ＣＤ６９；ＣＤ７２；ＣＤ７４；ＣＤ７９Ａ；ＣＤ７９Ｂ；ＣＤ８；ＣＤ８０；ＣＤ８１；ＣＤ８３；ＣＤ８６；ＣＤＨＩ（Ｅ−カドヘリン）；ＣＤＨ１０；ＣＤＨ１２；ＣＤＨ１３；ＣＤＨ１８；ＣＤＨ１９；ＣＤＨ２０；ＣＤＨ５；ＣＤＨ７；ＣＤＨ８；ＣＤＨ９；ＣＤＫ２；ＣＤＫ３；ＣＤＫ４；ＣＤＫ５；ＣＤＫ６；ＣＤＫ７；ＣＤＫ９；ＣＤＫＮＩＡ（ｐ２１Ｗａｐｌ／Ｃｉｐｌ）；ＣＤＫＮＩＢ（ｐ２７Ｋｉｐｌ）；ＣＤＫＮＩＣ；ＣＤＫＮ２Ａ（Ｐ１６ＩＮＫ４ａ）；ＣＤＫＮ２Ｂ；ＣＤＫＮ２Ｃ；ＣＤＫＮ３；ＣＥＢＰＢ；ＣＥＲＩ；ＣＨＧＡ；ＣＨＧＢ；キチナーゼ；ＣＨＳＴ１０；ＣＫＬＦＳＦ２；ＣＫＬＦＳＦ３；ＣＫＬＦＳＦ４；ＣＫＬＦＳＦ５；ＣＫＬＦＳＦ６；ＣＫＬＦＳＦ７；ＣＫＬＦＳＦ８；ＣＬＤＮ３；ＣＬＤＮ７（クローディン−７）；ＣＬＮ３；ＣＬＵ（クラステリン）；ＣＭＫＬＲＩ；ＣＭＫＯＲＩ（ＲＤＣＩ）；ＣＮＲＩ；ＣＯＬ１８Ａ１；ＣＯＬＩＡＩ；ＣＯＬ４Ａ３；ＣＯＬ６Ａ１；ＣＲ２；ＣＲＰ；ＣＳＦＩ（Ｍ−ＣＳＦ）；ＣＳＦ２（ＧＭ−ＣＳＦ）；ＣＳＦ３（ＧＣＳＦ）；ＣＴＬＡ４；ＣＴＮＮＢＩ（ｂ−カテニン）；ＣＴＳＢ（カテプシンＢ）；ＣＸ３ＣＬ１（ＳＣＹＤＩ）；ＣＸ３ＣＲ１（Ｖ２８）；ＣＸＣＬＩ（ＧＲＯＩ）；ＣＸＣＬ１０（ＩＰ−１０）；ＣＸＣＬＩＩ（ｌ−ＴＡＣ／ＩＰ−９）；ＣＸＣＬ１２（ＳＤＦＩ）；ＣＸＣＬ１３；ＣＸＣＬ１４；ＣＸＣＬ１６；ＣＸＣＬ２（ＧＲＯ２）；ＣＸＣＬ３（ＧＲＯ３）；ＣＸＣＬ５（ＥＮＡ−７８／ＬＩＸ）；ＣＸＣＬ６（ＧＣＰ−２）；ＣＸＣＬ９（ＭＩＧ）；ＣＸＣＲ３（ＧＰＲ９／ＣＫＲ−Ｌ２）；ＣＸＣＲ４；ＣＸＣＲ６（ＴＹＭＳＴＲ／ＳＴＲＬ３３／Ｂｏｎｚｏ）；ＣＹＢ５；ＣＹＣＩ；ＣＹＳＬＴＲＩ；ＤＡＢ２ＩＰ；ＤＥＳ；ＤＫＦＺｐ４５１  Ｊ０１  １８；ＤＮＣＬＩ；ＤＰＰ４；Ｅ２Ｆ１；ＥＣＧＦＩ；ＥＤＧＩ；ＥＦＮＡＩ；ＥＦＮＡ３；ＥＦＮＢ２；ＥＧＦ；ＥＧＦＲ；ＥＬＡＣ２；ＥＮＧ；ＥＮＯ１；ＥＮＯ２；ＥＮＯ３；ＥＰＨＢ４；ＥＰＯ；ＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ−２）；ＥＲＥＧ；ＥＲＫ８；ＥＳＲＩ；ＥＳＲ２；Ｆ３（ＴＦ）；ＦＡＤＤ；ＦａｓＬ；ＦＡＳＮ；ＦＣＥＲＩＡ；ＦＣＥＲ２；ＦＣＧＲ３Ａ；ＦＧＦ；ＦＧＦＩ（ａＦＧＦ）；ＦＧＦ１０；ＦＧＦ１１；ＦＧＦ１２；ＦＧＦ１２Ｂ；ＦＧＦ１３；ＦＧＦ１４；ＦＧＦ１６；ＦＧＦ１７；ＦＧＦ１８；ＦＧＦ１９；ＦＧＦ２（ｂＦＧＦ）；ＦＧＦ２０；ＦＧＦ２１；ＦＧＦ２２；ＦＧＦ２３；ＦＧＦ３（ｉｎｔ−２）；ＦＧＦ４（ＨＳＴ）；ＦＧＦ５；ＦＧＦ６（ＨＳＴ−２）；ＦＧＦ７（ＫＧＦ）；ＦＧＦ８；ＦＧＦ９；ＦＧＦＲ３；ＦＩＧＦ（ＶＥＧＦＤ）；ＦＥＬＩ（ＥＰＳＩＬＯＮ）；ＦＩＬＩ（ＺＥＴＡ）；ＦＬＪ１２５８４；ＦＬＪ２５５３０；ＦＬＲＴＩ（フィブロネクチン）；ＦＬＴＩ；ＦＯＳ；ＦＯＳＬＩ（ＦＲＡ−Ｉ）；ＦＹ（ＤＡＲＣ）；ＧＡＢＲＰ（ＧＡＢＡａ）；ＧＡＧＥＢＩ；ＧＡＧＥＣＩ；ＧＡＬＮＡＣ４Ｓ−６ＳＴ；ＧＡＴＡ３；ＧＤＦ５；ＧＦＩ１；ＧＧＴ１；ＧＭ−ＣＳＦ；ＧＮＡＳＩ；ＧＮＲＨＩ；ＧＰＲ２（ＣＣＲＩＯ）；ＧＰＲ３１；ＧＰＲ４４；ＧＰＲ８１（ＦＫＳＧ８０）；ＧＲＣＣＩＯ（ＣＩＯ）；ＧＲＰ；ＧＳＮ（ゲルゾリン）；ＧＳＴＰＩ；ＨＡＶＣＲ２；ＨＤＡＣ４；ＨＤＡＣ５；ＨＤＡＣ７Ａ；ＨＤＡＣ９；ＨＧＦ；ＨＩＦＩＡ；ＨＤＰＩ；ヒスタミン及びヒスタミン受容体；ＨＬＡ−Ａ；ＨＬＡ−ＤＲＡ；ＨＭ７４；ＨＭＯＸＩ；ＨＵＭＣＹＴ２Ａ；ＩＣＥＢＥＲＧ；ＩＣＯＳＬ；ＩＤ２；ＩＦＮ−ａ；ＩＦＮＡＩ；ＩＦＮＡ２；ＩＦＮＡ４；ＩＦＮＡ５；ＩＦＮＡ６；ＩＦＮＡ７；ＩＦＮＢ１；ＩＦＮガンマ；ＤＦＮＷＩ；ＩＧＢＰＩ；ＩＧＦＩ；ＩＧＦＩＲ；ＩＧＦ２；ＩＧＦＢＰ２；ＩＧＦＢＰ３；ＩＧＦＢＰ６；ＩＬ−Ｉ；ＩＬ１０；ＩＬ１０ＲＡ；ＩＬ１０ＲＢ；ＩＬ１１；ＩＬ１１ＲＡ；ＩＬ−１２；ＩＬ１２Ａ；ＩＬ１２Ｂ；ＩＬ１２ＲＢ１；ＩＬ１２ＲＢ２；ＩＬ１３；ＩＬ１３ＲＡ１；ＩＬ１３ＲＡ２；ＩＬ１４��ＩＬ１５；ＩＬ１５ＲＡ；ＩＬ１６；ＩＬ１７；ＩＬ１７Ｂ；ＩＬ１７Ｃ；ＩＬ１７Ｒ；ＩＬ１８；ＩＬ１８ＢＰ；ＩＬ１８Ｒ１；ＩＬ１８ＲＡＰ；ＩＬ１９；ＩＬ１Ａ；ＩＬ１Ｂ；ＩＬＩＦ１０；ＩＬ１Ｆ５；ＩＬ１Ｆ６；ＩＬ１Ｆ７；ＩＬ１Ｆ８；ＩＬ１Ｆ９；ＩＬ１ＨＹＩ；ＩＬ１ＲＩ；ＩＬ１Ｒ２；ＩＬ１ＲＡＰ；ＩＬ１ＲＡＰＬ１；ＩＬ１ＲＡＰＬ２；ＩＬ１ＲＬ１；ＩＬ１ＲＬ２，ＩＬＩＲＮ；ＩＬ２；ＩＬ２０；ＩＬ２０ＲＡ；ＩＬ２１Ｒ；ＩＬ２２；ＩＬ２２Ｒ；ＩＬ２２ＲＡ２；ＩＬ２３；ＩＬ２４；ＩＬ２５；ＩＬ２６；ＩＬ２７；ＩＬ２８Ａ；ＩＬ２８Ｂ；ＩＬ２９；ＩＬ２ＲＡ；ＩＬ２ＲＢ；ＩＬ２ＲＧ；ＩＬ３；ＩＬ３０；ＩＬ３ＲＡ；ＩＬ４；ＩＬ４Ｒ；ＩＬ５；ＩＬ５ＲＡ；ＩＬ６；ＩＬ６Ｒ；ＩＬ６ＳＴ（糖タンパク質１３０）；ＥＬ７；ＥＬ７Ｒ；ＥＬ８；ＩＬ８ＲＡ；ＤＬ８ＲＢ；ＩＬ８ＲＢ；ＤＬ９；ＤＬ９Ｒ；ＤＬＫ；ＩＮＨＡ；ＩＮＨＢＡ；ＩＮＳＬ３；ＩＮＳＬ４；ＩＲＡＫＩ；ＥＲＡＫ２；ＩＴＧＡＩ；ＩＴＧＡ２；ＩＴＧＡ３；ＩＴＧＡ６（ａ６インテグリン）；ＩＴＧＡＶ；ＩＴＧＢ３；ＩＴＧＢ４（ｂ４インテグリン）；ＪＡＧＩ；ＪＡＫＩ；ＪＡＫ３；ＪＵＮ；Ｋ６ＨＦ；ＫＡＩＩ；ＫＤＲ；ＫＩＴＬＧ；ＫＬＦ５（ＧＣボックスＢＰ）；ＫＬＦ６；ＫＬＫＩＯ；ＫＬＫ１２；ＫＬＫ１３；ＫＬＫ１４；ＫＬＫ１５；ＫＬＫ３；ＫＬＫ４；ＫＬＫ５；ＫＬＫ６；ＫＬＫ９；ＫＲＴ１；ＫＲＴ１９（ケラチン１９）；ＫＲＴ２Ａ；ＫＨＴＨＢ６（毛特異的タイプＨケラチン）；ＬＡＭＡＳ；ＬＥＰ（レプチン）；Ｌｉｎｇｏ−ｐ７５；Ｌｉｎｇｏ−Ｔｒｏｙ；ＬＰＳ；ＬＴＡ（ＴＮＦ−ｂ）；ＬＴＢ；ＬＴＢ４Ｒ（ＧＰＲ１６）；ＬＴＢ４Ｒ２；ＬＴＢＲ；ＭＡＣＭＡＲＣＫＳ；ＭＡＧ又はＯｍｇｐ；ＭＡＰ２Ｋ７（ｃ−Ｊｕｎ）；ＭＤＫ；ＭＩＢＩ；ミドカイン；ＭＥＦ；ＭＩＰ−２；ＭＫＩ６７；（Ｋｉ−６７）；ＭＭＰ２；ＭＭＰ９；ＭＳ４Ａ１；ＭＳＭＢ；ＭＴ３（メタロチオネクチン−ＩＩＩ）；ＭＴＳＳＩ；ＭＵＣＩ（ムチン）；ＭＹＣ；ＭＹＤ８８；ＮＣＫ２；ニューロカン；ＮＦＫＢＩ；ＮＦＫＢ２；ＮＧＦＢ（ＮＧＦ）；ＮＧＦＲ；ＮｇＲ−Ｌｉｎｇｏ；ＮｇＲ−Ｎｏｇｏ６６（Ｎｏｇｏ）；ＮｇＲ−ｐ７５；ＮｇＲ−Ｔｒｏｙ；ＮＭＥＩ（ＮＭ２３Ａ）；Ｎ０Ｘ５；ＮＰＰＢ；ＮＲＯＢＩ；ＮＲ０Ｂ２；ＮＲＩＤＩ；ＮＲ１Ｄ２；ＮＲ１Ｈ２；ＮＲ１Ｈ３；ＮＲ１Ｈ４；ＮＲ１Ｉ２；ＮＲ１Ｉ３；ＮＲ２Ｃ１；ＮＲ２Ｃ２；ＮＲ２Ｅ１；ＮＲ２Ｅ３；ＮＲ２Ｆ１；ＮＲ２Ｆ２；ＮＲ２Ｆ６；ＮＲ３Ｃ１；ＮＲ３Ｃ２；ＮＲ４Ａ１；ＮＲ４Ａ２；ＮＲ４Ａ３；ＮＲ５Ａ１；ＮＲ５Ａ２；ＮＲ６Ａ１；ＮＲＰＩ；ＮＲＰ２；ＮＴ５Ｅ；ＮＴＮ４；ＯＤＺＩ；ＯＰＲＤＩ；Ｐ２ＲＸ７；ＰＡＰ；ＰＡＲＴＩ；ＰＡＴＥ；ＰＡＷＲ；ＰＣＡ３；ＰＣＮＡ；ＰＤＧＦＡ；ＰＤＧＦＢ；ＰＥＣＡＭＩ；ＰＦ４（ＣＸＣＬ４）；ＰＧＦ；ＰＧＲ；ホスファカン；ＰＩＡＳ２；ＰＩＫ３ＣＧ；ＰＬＡＵ（ｕＰＡ）；ＰＬＧ；ＰＬＸＤＣＩ；ＰＰＢＰ（ＣＸＣＬ７）；ＰＰＩＤ；ＰＲＩ；ＰＲＫＣＱ；ＰＲＫＤＩ；ＰＲＬ；ＰＲＯＣ；ＰＲＯＫ２；ＰＳＡＰ；ＰＳＣＡ；ＰＴＡＦＲ；ＰＴＥＮ；ＰＴＧＳ２（ＣＯＸ−２）；ＰＴＮ；ＲＡＣ２（ｐ２１Ｒａｃ２）；ＲＡＲＢ��ＲＧＳＩ；ＲＧＳ１３；ＲＧＳ３；ＲＮＦＩＩＯ（ＺＮＦ１４４）；ＲＯＢＯ２；Ｓ１００Ａ２；ＳＣＧＢ１Ｄ２（リポフィリンＢ）；ＳＣＧＢ２Ａ１（マンマグロビン２）；ＳＣＧＢ２Ａ２（マンマグロビン１）；ＳＣＹＥＩ（内皮性単球活性化サイトカイン）；ＳＤＦ２；ＳＥＲＰＩＮＡＩ；ＳＥＲＰＩＮＡ３；ＳＥＲＰ１ＮＢ５（マスピン）；ＳＥＲＰＩＮＥＩ（ＰＡＩ−Ｉ）；ＳＥＲＰＤＭＦ１；ＳＨＢＧ；ＳＬＡ２；ＳＬＣ２Ａ２；ＳＬＣ３３Ａ１；ＳＬＣ４３Ａ１；ＳＬＩＴ２；ＳＰＰＩ；ＳＰＲＲＩＢ（Ｓｐｒｌ）；ＳＴ６ＧＡＬ１；ＳＴＡＢＩ；ＳＴＡＴ６；ＳＴＥＡＰ；ＳＴＥＡＰ２；ＴＢ４Ｒ２；ＴＢＸ２１；ＴＣＰＩＯ；ＴＤＧＦＩ；ＴＥＫ；ＴＧＦＡ；ＴＧＦＢＩ；ＴＧＦＢＩＩＩ；ＴＧＦＢ２；ＴＧＦＢ３；ＴＧＦＢＩ；ＴＧＦＢＲＩ；ＴＧＦＢＲ２；ＴＧＦＢＲ３；ＴＨＩＬ；ＴＨＢＳＩ（トロンボスポンジン−１）；ＴＨＢＳ２；ＴＨＢＳ４；ＴＨＰＯ；ＴＩＥ（Ｔｉｅ−１）；ＴＭＰ３；組織因子；ＴＬＲＩＯ；ＴＬＲ２；ＴＬＲ３；ＴＬＲ４；ＴＬＲ５；ＴＬＲ６；ＴＬＲ７；ＴＬＲ８；ＴＬＲ９；ＴＮＦ；ＴＮＦ−ａ；ＴＮＦＡＥＰ２（Ｂ９４）；ＴＮＦＡＩＰ３；ＴＮＦＲＳＦＩＩＡ；ＴＮＦＲＳＦＩＡ；ＴＮＦＲＳＦＩＢ；ＴＮＦＲＳＦ２１；ＴＮＦＲＳＦ５；ＴＮＦＲＳＦ６（Ｆａｓ）；ＴＮＦＲＳＦ７；ＴＮＦＲＳＦ８；ＴＮＦＲＳＦ９；ＴＮＦＳＦＩＯ（ＴＲＡＩＬ）；ＴＮＦＳＦＩ１（ＴＲＡＮＣＥ）；ＴＮＦＳＦ１２（ＡＰＯ３Ｌ）；ＴＮＦＳＦ１３（Ａｐｒｉｌ）；ＴＮＦＳＦ１３Ｂ；ＴＮＦＳＦ１４（ＨＶＥＭ−Ｌ）；ＴＮＦＳＦ１５（ＶＥＧＩ）；ＴＮＦＳＦ１８；ＴＮＦＳＦ４（ＯＸ４０リガンド）；ＴＮＦＳＦ５（ＣＤ４０リガンド）；ＴＮＦＳＦ６（ＦａｓＬ）；ＴＮＦＳＦ７（ＣＤ２７リガンド）；ＴＮＦＳＦ８（ＣＤ３０リガンド）；ＴＮＦＳＦ９（４−１ＢＢリガンド）；ＴＯＬＬＩＰ；Ｔｏｌｌ様受容体；ＴＯＰ２Ａ（トポイソメラーゼＥａ）；ＴＰ５３；ＴＰＭＩ；ＴＰＭ２；ＴＲＡＤＤ；ＴＲＡＦＩ；ＴＲＡＦ２；ＴＲＡＦ３；ＴＲＡＦ４；ＴＲＡＦ５；ＴＲＡＦ６；ＴＲＥＭＩ；ＴＲＥＭ２；ＴＲＰＣ６；ＴＳＬＰ；ＴＷＥＡＫ；ＶＥＧＦ；ＶＥＧＦＢ；ＶＥＧＦＣ；バーシカン；ＶＨＬＣ５；ＶＬＡ−４；ＸＣＬＩ（リンホタクチン）；ＸＣＬ２（ＳＣＭ−ｌｂ）；ＸＣＲＩ（ＧＰＲ５／ＣＣＸＣＲＩ）；ＹＹＩ；及びＺＦＰＭ２からなる群から選択される１個又は複数個の標的に結合する
ことができる。
【０２１０】
本発明に包含される抗体に関する好ましい分子標的分子として、ＣＤタンパク質、例えばＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３４；ＣＤ６４、ＥＧＦレセプター、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３又はＨＥＲ４受容体等のＥｒｂＢ受容体ファミリーのＣＤ２００メンバー；細胞接着分子、例えばＬＦＡ−１、Ｍａｄ、ｐ１５０．９５、ＶＬＡ−４、ＩＣＡＭ−１、ＶＣＡＭ、アルファ４／ベータ７インテグリン、及びそのアルファサブユニット又はベータサブユニットのいずれかを含むアルファｖ／ベータ３インテグリン（例えば抗ＣＤ１１ａ、抗ＣＤ１８又は抗ＣＤ１１ｂ抗体）；成長因子、例えばＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｃ；組織因子（ＴＦ）；アルファインターフェロン（アルファＩＦＮ）；ＴＮＦアルファ、インターロイキン、例えばＩＬ−１ベータ、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１３、ＩＬ１７Ａ／Ｆ、ＩＬ−１８、ＩＬ−１３Ｒアルファ１、ＩＬ１３Ｒアルファ２、ＩＬ−４Ｒ、ＩＬ−５Ｒ、ＩＬ−９Ｒ、ＩｇＥ；血液群抗原；ｆｌｋ２／ｆｌｔ３受容体；肥満（ＯＢ）受容体；ｍｐｌ受容体；ＣＴＬＡ−４；ＲＡＮＫＬ、ＲＡＮＫ、ＲＳＶ  Ｆタンパク質、プロテインＣ等が挙げられる。
【０２１１】
一実施態様において、本発明のヘテロ多量体タンパク質は、低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質（ＬＲＰ）−１もしくはＬＲＰ−８又はトランスフェリン受容体と、１）ベータ−セクレターゼ（ＢＡＣＥ１又はＢＡＣＥ２）、２）アルファ−セクレターゼ、３）ガンマ−セクレターゼ、４）タウ−セクレターゼ、５）アミロイド前駆体タンパク質（ＡＰＰ）、６）細胞死受容体６（ＤＲ６）、７）アミロイドベータペプチド、８）アルファ−シヌクレイン、９）パーキン、１０）ハンチンチン、１１）ｐ７５ＮＴＲ及び１２）カスパーゼ−６からなる群から選択される少なくとも１つの標的とに結合する。
【０２１２】
一実施態様において、本発明のヘテロ多量体タンパク質は、ＩＬ−１アルファ及びＩＬ−１ベータ、ＩＬ−１２及びＩＬ−１８；ＩＬ−１３及びＩＬ−９；ＩＬ−１３及びＩＬ−４；ＩＬ−１３及びＩＬ−５；ＩＬ−５及びＩＬ−４；ＩＬ−１３及びＩＬ−１ベータ；ＩＬ−１３及びＩＬ−２５；ＩＬ−１３及びＴＡＲＣ；ＩＬ−１３及びＭＤＣ；ＩＬ−１３及びＭＥＦ；ＩＬ−１３及びＴＧＦ−β；ＩＬ−１３及びＬＨＲアゴニスト；ＩＬ−１２及びＴＷＥＡＫ、ＩＬ−１３及びＣＬ２５；ＩＬ−１３及びＳＰＲＲ２ａ；ＩＬ−１３及びＳＰＲＲ２ｂ；ＩＬ−１３及びＡＤＡＭ８、ＩＬ−１３及びＰＥＤ２、ＩＬ１７Ａ及びＩＬ１７Ｆ、ＣＤ３及びＣＤ１９、ＣＤ１３８及びＣＤ２０；ＣＤ１３８及びＣＤ４０；ＣＤ１９及びＣＤ２０；ＣＤ２０及びＣＤ３；ＣＤ３８及びＣＤ１３８；ＣＤ３８及びＣＤ２０；ＣＤ３８及びＣＤ４０；ＣＤ４０及びＣＤ２０；ＣＤ−８及びＩＬ−６；ＣＤ２０及びＢＲ３、ＴＮＦアルファ及びＴＧＦ−ベータ、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１ベータ；ＴＮＦアルファ及びＩＬ−２、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−３、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−４、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−５、ＴＮＦアルファ及びＩＬ６、ＴＮＦアルファ及びＩＬ８、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−９、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１０、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１１、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１２、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１３、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１４、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１５、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１６、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１７、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１８、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１９、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−２０、ＴＮＦアルファ及びＩＬ−２３、ＴＮＦアルファ及びＩＦＮアルファ、ＴＮＦアルファ及びＣＤ４、ＴＮＦアルファ及びＶＥＧＦ、ＴＮＦアルファ及びＭＩＦ、ＴＮＦアルファ及びＩＣＡＭ−１、ＴＮＦアルファ及びＰＧＥ４、ＴＮＦアルファ及びＰＥＧ２、ＴＮＦアルファ及びＲＡＮＫリガンド、ＴＮＦアルファ及びＴｅ３８；ＴＮＦアルファ及びＢＡＦＦ；ＴＮＦアルファ及びＣＤ２２；ＴＮＦアルファ及びＣＴＬＡ−４；ＴＮＦアルファ及びＧＰ１３０；ＴＮＦアルファ及びＩＬ−１２ｐ４０；ＶＥＧＦ及びＨＥＲ２、ＶＥＧＦ−Ａ及びＨＥＲ２、ＶＥＧＦ−Ａ及びＰＤＧＦ、ＨＥＲ１及びＨＥＲ２、ＶＥＧＦ−Ａ及びＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｃ及びＶＥＧＦ−Ｄ、ＨＥＲ２及びＤＲ５、ＶＥＧＦ及びＩＬ−８、ＶＥＧＦ及びＭＥＴ、ＶＥＧＦＲ及びＭＥＴ受容体、ＶＥＧＦＲ及びＥＧＦＲ、ＨＥＲ２及びＣＤ６４、ＨＥＲ２及びＣＤ３、ＨＥＲ２及びＣＤ１６、ＨＥＲ２及びＨＥＲ３；ＥＧＦＲ（ＨＥＲＩ）及びＨＥＲ２、ＥＧＦＲ及びＨＥＲ３、ＥＧＦＲ及びＨＥＲ４、ＩＬ−１３及びＣＤ４０Ｌ、ＩＬ４及びＣＤ４０Ｌ、ＴＮＦＲ１及びＩＬ−１Ｒ、ＴＮＦＲ１及びＩＬ−６Ｒ及びＴＮＦＲ１及びＩＬ−１８Ｒ、ＥｐＣＡＭ及びＣＤ３、ＭＡＰＧ及びＣＤ２８、ＥＧＦＲ及びＣＤ６４、ＣＳＰＧｓ及びＲＧＭ  Ａ；ＣＴＬＡ−４及びＢＴＮＯ２；ＩＧＦ１及びＩＧＦ２；ＩＧＦ１／２及びＥｒｂ２Ｂ；ＭＡＧ及びＲＧＭ  Ａ；ＮｇＲ及びＲＧＭ  Ａ；ＮｏｇｏＡ及びＲＧＭ  Ａ；ＯＭＧｐ及びＲＧＭ  Ａ；ＰＤＬ−Ｉ及びＣＴＬＡ−４；並びにＲＧＭ  Ａ及びＲ���Ｍ  Ｂからなる群から選択される少なくとも２つの標的分子に結合する。
【０２１３】
任意選択で他の分子にコンジュゲートした可溶性抗原又はその断片を、抗体を生成するための免疫原として使用することができる。受容体等の膜貫通分子に関して、その断片（例えば受容体の細胞外ドメイン）を免疫原として使用することができる。あるいは、膜貫通分子を発現する細胞を免疫原として使用することができる。そのような細胞は天然の供給源（例えば癌細胞株）に由来することができ、又は膜貫通分子を発現するように組換え技術により形質転換されている細胞であることができる。抗体を調製するのに有用な他の抗原及びその形態は当業者に明らかだろう。
【０２１４】
Ｖ．実施態様
本発明は、以下に記載する追加の実施態様を提供する。第１の実施態様において、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法が提供され、前記方法は、プロテインＡで精製した第１のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、プロテインＡで精製した第２のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、各ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを４〜９に調整すること、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して混合ヒンジ含有ポリペプチドプールを得ること、モル過剰の弱還元剤を混合ヒンジ含有ポリペプチドプールに添加すること、並びに混合ヒンジ含有ポリペプチドプールを弱還元剤と共にインキュベートし、第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成することを含む。
【０２１５】
第２の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドを、半抗体、イムノアドヘシン及びこれらの断片から選択することができる。第３の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、第１のヒンジ含有ポリペプチドは半抗体である。第４の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、第２のヒンジ含有ポリペプチドはＦｃ成分である。第５の実施態様において、及び第３の実施態様によれば、半抗体は、ＶＬドメイン、ＣＬドメイン、ＶＨドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む。第６の実施態様において、及び第５の実施態様によれば、半抗体は、テザーを更に含む単一のポリペプチド鎖であり、前記ドメインは、以下：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている。第７の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、プロテインＡ精製前に第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合し、プロテインＡ上で共精製する。第８の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、第１のヒンジ含有ポリペプチド及び第２のヒンジ含有ポリペプチドはヘテロ多量体化ドメインを含む。第９の実施態様において、及び第８の実施態様によれば、ヘテロ多量体化ドメインは、ノブイントゥホール変異、ロイシンジッパー、静電気的等から選択される。第１０の実施態様において、及び第９の実施態様によれば、第１のヒンジ含有ポリペプチドがノブを含み、第２のヒンジ含有ポリペプチドがホールを含む。第１１の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、混合後にｐＨを調整する。第１２の実施態様において、及び第１の又は第１１の実施態様によれば、上記方法は、ｐＨの調整前に、Ｌ−アルギニンを２０ｍＭ〜１Ｍの最終濃度まで添加することを更に含む。第１３の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、上記方法は、混合プールを１５℃〜３９℃の温度で３０分以上にわたってインキュベートすることを更に含む。第１４の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、構築用混合物の酸化電位は−２００〜−６００ｍＶであり、より好ましくは−３００〜−５００ｍＶであり、最も好ましくは−約４００ｍＶである。第１５の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、弱還元剤は、ＧＳＨ、ベータ−メルカプトエチルアミン、システイン／システイン、ＧＳＨ／ＧＳＳＧ、システアミン／シスタミン、グリシルシステイン及びベータ−メルカプトエタノールから選択される。第１６の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、弱還元剤を５０〜６００モル過剰で添加する。第１７の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、混合前に弱還元剤を添加する。第１８の実施態様において、及び第１７の実施態様によれば、混合の１時間未満前に添加を行なう。第１９の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、構築用混合物をインキュベートするステップをポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）の存在下において１５℃〜３９℃の温度で行なう。第２０の実施態様において、及び第１９の実施態様によれば、ＰＶＰの前に、ＰＶＰと同時に、又はＰＶＰの後にヒスチジンを添加する。第２１の実施態様において、及び第１９の実施態様によれば、ＰＶＰを４０％（重量／体積）以下で添加する。
【０２１６】
第２２の実施態様において、本発明は、二重特異性抗体の産生方法であって、
ａ．プロテインＡで精製した第１の半抗体を得ること、
ｂ．プロテインＡで精製した第２の半抗体を得ること、
ｃ．各半抗体にＬ−アルギニン溶液を添加すること、
ｄ．各半抗体のｐＨを４〜９に調整すること、
ｅ．第１の半抗体プールと第２の半抗体プールとを混合して混合半抗体プールを得ること、
ｆ．モル過剰の弱還元剤を混合半抗体プールに添加すること、
ｇ．混合半抗体プールをＰＶＰの存在下において１５℃〜３９℃の温度でインキュベートすることを含む方法を提供し、それにより、第１の半抗体及び第２の半抗体を含む二重特異性抗体が産生される。
【０２１７】
第２３の実施態様において、本発明は、ヘテロ多量体の産生方法であって、（ａ）少なくとも２種の異なるヒンジ含有ポリペプチドのＬ−アルギニン含有混合物を準備することであって前記混合物のｐＨが７〜９であること、（ｂ）モル過剰の弱還元剤を添加すること、及び（ｃ）ヘテロ多量体が産生される条件下で混合物をインキュベートすることを含む方法を提供する。
【０２１８】
第２４の実施態様において、及び第２２の実施態様によれば、第１の半抗体は、（ａ）ＶＬドメイン及びＣＬドメインを含む完全長の軽鎖と、（ｂ）テザーと、（ｃ）ＶＨドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む完全長の重鎖とを含む単鎖ポリペプチドであり、前記ポリペプチドは、以下：ＶＬ−ＣＬ−ＣＬ／ＶＨテザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている軽鎖のドメイン及び重鎖のドメインを含む。第２５の実施態様において、及び第２４の実施態様によれば、単鎖ポリペプチドはヘテロ多量体化ドメインを更に含む。第２６の実施態様において、及び第２５の実施態様によれば、ヘテロ多量体化ドメインはホール（例えば空洞）又はノブ（例えば突起）のいずれかである。第２７の実施態様において、及び第２６の実施態様によれば、第１の半抗体がノブを含む場合には第２の半抗体がホールを含む。第２８の実施態様において、及び第２６の実施態様によれば、第１の半抗体がホールを含む場合には第２の半抗体がノブを含む。第２９の実施態様において、及び第２４の実施態様によれば、テザーはＧＧＳの繰り返しを含む。第３０の実施態様において、及び第２４の実施態様によれば、テザーは１５〜５０個のアミノ酸である。
【０２１９】
第３１の実施態様において、本発明は、ヘテロ多量体タンパク質の産生方法であって、（ａ）プロテインＡで精製した第１のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、（ｂ）プロテインＡで精製した第２のヒンジ含有ポリペプチドを得ること、（ｃ）Ｌ−アルギニンの存在下において各ヒンジ含有ポリペプチドのｐＨを４〜９に調整すること、（ｄ）第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドとを混合して混合半抗体プールを得ること、並びにインキュベートして第１のヒンジ含有ポリペプチドと第２のヒンジ含有ポリペプチドを含むヘテロ多量体タンパク質を形成することを含む方法を提供する。
【０２２０】
第３２の実施態様において、及び第１の又は第３１の実施態様によれば、少なくとも一方の半抗体は、（ａ）ＶＬドメイン及びＣＬドメインを含む完全長の軽鎖と、（ｂ）テザーと、（ｃ）ＶＨドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む完全長の重鎖とを含む単鎖ポリペプチドである。
【０２２１】
第３３の実施態様において、及び第１の実施態様によれば、第１のヒンジ含有ポリペプチドは、以下：ＶＬ−ＣＬ−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている軽鎖のドメイン及び重鎖のドメインを含む単鎖ポリペプチドである。第３４の実施態様において、及び第３３の実施態様によれば、単一のポリペプチド鎖はテザーを更に含み、前記ドメインは、以下：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている。
【０２２２】
第３５の実施態様において、本発明は、ヘテロ多量体の産生方法であって、ヒンジ含有ポリペプチドの混合物を含有するＬ−アルギニンを準備することであって前記混合物のｐＨが４〜９であること、弱還元剤を添加すること、及びヘテロ多量体を産生するための条件下でインキュベートすることを含む方法を提供する。
【０２２３】
第３６の実施態様において、本発明は、半抗体を発現するように操作した宿主細胞を提供し、前記半抗体がテザー、ＶＬドメイン、ＣＬドメイン、ＶＨドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含む単鎖ポリペプチドであり、前記ドメインが以下のようにＮ末端からＣ末端の方向に向かって互いに位置決めされている：ＶＬ−ＣＬ−テザー−ＶＨ−ＣＨ１−ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３。第３７の実施態様において、及び第３６の実施態様によれば、単一のポリペプチド鎖はヘテロ二量体化ドメインを更に含む。第３８の実施態様において、及び第３６の又は第３７の実施態様によれば、宿主細胞は、原核細胞、真核細胞、哺乳動物細胞又は植物細胞から選択される。第３９の実施態様において、及び第３８の実施態様によれば、宿主細胞は原核細胞である。第４０の実施態様において、及び第３９の実施態様によれば、原核細胞は大腸菌細胞である。第４１の実施態様において、及び第４０の実施態様によれば、大腸菌細胞はｌｐｐ欠損である。第４２の実施態様において、及び第３８の実施態様によれば、宿主細胞は哺乳動物細胞である。第４３の実施態様において、及び第４１の実施態様によれば、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。第４４の実施態様において、及び第３６の又は第３７の実施態様によれば、宿主細胞は、単鎖半抗体をコードするベクターを含む。第４５の実施態様において、及び第３６の又は第３７の実施態様によれば、半抗体はヘテロ二量体化ドメインを更に含む。第４６の実施態様において、及び第４５の実施態様によれば、ヘテロ二量体化ドメインは、ノブ、ホール、ホモ二量体の形成に対して静電気的に有利ではないがヘテロ二量体の形成に対して静電気的に有利である界面内の１種又は複数種の荷電アミノ酸、分子内イオン相互作用を増強するために改変されている１種又は複数種のアミノ酸、コロイドコイル及びロイシンジッパーから選択される。
【０２２４】
第４７の実施態様において、本発明は、第１の単鎖半抗体を発現するように操作した第１の宿主細胞、及びＦｃ成分を発現するように操作した第２の宿主細胞を含む宿主細胞の混合物を提供する。第４８の実施態様において、及び第３６の実施態様によれば、宿主細胞によって産生された半抗体はヘテロ二量体化ドメインを含む。
【０２２５】
続く実験的開示においては以下の略語が適用される：ｅｑ（当量）；Ｍ（モル濃度）；μＭ（マイクロモル濃度）；Ｎ（規定度）；ｍｏｌ（モル）；ｍｍｏｌ（ミリモル）；μｍｏｌ（マイクロモル）；ｎｍｏｌ（ナノモル）；ｇ（グラム）；ｍｇ（ミリグラム）；ｋｇ（キログラム）；μｇ（マイクログラム）；Ｌ（リットル）；ｍｌ（ミリリットル）；μｌ（マイクロリットル）；ｃｍ（センチメートル）；ｍｍ（ミリメートル）；μｍ（マイクロメートル）；ｎｍ（ナノメートル）；℃（摂氏温度）；ｈ（時間）；ｍｉｎ（分）；ｓｅｃ（秒）；ｍｓｅｃ（ミリ秒）。
【実施例】
【０２２６】
本発明を、特許請求される本発明の範囲を限定することを決して意図しない以下の実施例に更に詳細に記載する。添付図面は、本発明の明細書及び説明の不可欠な部分と見なされることを意図されている。全ての参考文献を、その中に記載された全てのものについて、出典明示により本明細書に具体的に援用する。
【実施例１】
【０２２７】
発現及び精製
この実施例は半抗体の発現及び精製を説明する。
【０２２８】
大腸菌中における半抗体の構築及び発現の例示的方法を例えば同時係属出願のＵＳ２０１１／０２８７００９中に見出すことができ、ＵＳ２０１１／０２８７００９は、その全体を出典明示により本明細書に援用する。培養条件及び発現条件の変更及び調整は当業者の能力の範囲内である。
【０２２９】
大腸菌細胞中での半抗体の発現
発現プラスミドの構築
重鎖ＤＮＡをコードする配列及び軽鎖ＤＮＡをコードする配列の両方を、各配列用の別々のプロモーター要素と、発現プラスミドを含有する細菌細胞を選択するための抗生物質耐性とを含有する発現プラスミド中にクローニングした。ベクター構築物はまた、細菌細胞のペリプラズム空間中に抗体ポリペプチドを搬出するために、熱安定性エンテロトキシンＩＩ（ＳＴＩＩ）分泌シグナルもコードする（Ｐｉｃｋｅｎ他、１９８３、Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．４２：２６９〜２７５及びＬｅｅ他、１９８３、Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．４２：２６４〜２６８）。各鎖の転写はｐｈｏＡプロモーターによって制御されており（Ｋｉｋｕｃｈｉ他、１９８１、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、９：５６７１〜５６７８）、翻訳の制御は、相対的翻訳強度を測定した、既に記載したＳＴＩＩシグナル配列の多様体によってもたらされており、該多様体は、翻訳開始領域（ＴＩＲ）におけるサイレントコドン変化を含む（Ｓｉｍｍｏｎｓ及びＹａｎｓｕｒａ、１９９６、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１４：６２９〜６３４並びにＳｉｍｍｏｎｓ他、２００２、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ、２６３：１３３〜１４７）。
【０２３０】
各半抗体は、米国特許第７，６４２，２２８号に記載されているように、重鎖に組み込まれたノブ（突起）又はホール（空洞）のいずれかを有した。簡潔に言うと、ＣＨ３ノブ変異体を最初に生成した。次いで、パートナーのＣＨ３ドメイン上のノブに近接する残基３６６、３６８、及び４０７をランダム化することにより、ＣＨ３ホール変異体のライブラリを作成した。以下の実施例において、ノブ変異はＴ３６６Ｗであり、ホールは、ＩｇＧ１バックボーン又はＩｇＧ４バックボーン中において変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ及びＹ４０７Ｖを有した。当業者は、他の免疫グロブリンのアイソタイプにおける等価の変異を行なうことができる。更に、当業者は、二重特異性のために使用する２種の半抗体が同じアイソタイプであることが好ましいことを容易に認識するだろう。
【０２３１】
発現及び精製
細菌宿主細胞中で、例えば大腸菌中で重鎖構築物及び軽鎖構築物を発現させることにより、ノブ変異又はホール変異のいずれかを含有する半抗体を別々の培養液中で生成した。発現プラスミドを大腸菌宿主株３３Ｄ３（Ｒｉｄｇｗａｙ他（１９９９）５９（１１）：２７１８）中に又は６４Ｂ４（Ｗ３１１０ΔｆｈｕＡΔｐｈｏＡ  ｉｌｖＧ＋Δｐｒｃ  ｓｐｒ４３Ｈ１ΔｄｅｇＰΔｍａｎＡ  ｌａｃIｑΔｏｍｐＴ）中に導入し、カルベニシリン含有ＬＢプレート上で形質転換体を選択した。次いで、形質転換体を使用してカルベニシリンを含有するＬＢ種培養液を播種し、これを３０℃で振とうしつつ一晩増殖させた。カルベニシリンを含有するリン酸塩制限培地Ｃ．Ｒ．Ａ．Ｐ．（Ｓｉｍｍｏｎｓ他、２００２、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ、２６３：１３３〜１４７）中に種培養液を１００倍に希釈し、培養液を３０℃で振とうしつつ２４時間にわたって増殖させた。培養液を遠心分離し、細胞ペレットを抗体精製の開始まで凍結した。ペレットを解凍し、塩酸でｐＨ７．５に調整した２５ｍＭのトリス塩基、１２５ｍＭのＮａＣｌ及び５ｍＭのＥＤＴＡ（ＴＥＢ又はトリス抽出緩衝液）を含有する並びに体積対重量比が１００ｍＬのＴＥＢ／５グラムの細胞ペレットである抽出緩衝液中に再懸濁させ、再懸濁した混合物をＭｉｃｒｏｆｌｕｉｄｉｃｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎモデル１１０Ｆマイクロフルイダイザー（Ｎｅｗｔｏｎ，Ｍａｓｓ．）に３回通すことにより、マイクロ流体工学を使用して細胞を破壊することによって抽出した。次いで、細菌細胞抽出液を１５，０００×ｇで２０分にわたって遠心分離することにより清澄化し、上清を回収して精製前に０．２２ミクロンアセテートフィルタに通してろ過した。
【０２３２】
プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーにより各半抗体を別々に精製した。ノブ半抗体に由来する清澄化細胞抽出液を、ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ（Ｐｉｓｔｃａｔａｗａｙ，  Ｎ．Ｊ．）の１ｍＬ  ＨｉＴｒａｐ  ＭＡＢＳＥＬＥＣＴ  ＳＵＲＥ（商標）カラム上に２ｍＬ／分で負荷した。負荷後、カラムを、１０カラム容積（ＣＶ）の４０ｍＭクエン酸ナトリウム（ｐＨ６．０）、１２５ｍＭの塩化ナトリウム及び５ｍＭのＥＤＴＡで洗浄し、続いてｐＨ６．０において５カラム容積の２０ｍＭのクエン酸ナトリウムで洗浄し、カチオン交換カラムによる捕捉を容易にした。アフィニティー捕捉した半抗体を、１０カラム容積（ＣＶ）の０．２ｍＭ酢酸（ｐＨ２〜３）で溶出させた。
【０２３３】
ＣＨＯ細胞中での半抗体の発現
発現プラスミドの構築
重鎖ｃＤＮＡ及び軽鎖ｃＤＮＡの両方は、サイトメガロウイルス前初期遺伝子プロモーター及びエンハンサー（ＣＭＶ）の制御下にあった。各ＣＭＶ転写開始部位の後にスプライスドナー配列及びスプライスアクセプター配列が続いており、これらは、最終転写産物から除去されるイントロンを定義する（Ｌｕｃａｓ他、Ｈｉｇｈ−ｌｅｖｅｌ  ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｉｎ  ＣＨＯ  ｃｅｌｌｓ  ｕｓｉｎｇ  ａ  ｄｉｃｉｓｔｒｏｎｉｃ  ＤＨＦＲ  ｉｎｔｒｏｎ  ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｖｅｃｔｏｒ．Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．（１９９６）２４：１７７４〜９）。安定した細胞株を開発するための選択マーカーとしてグルタミンシンテターゼ（ＧＳ）酵素を使用し（Ｓａｎｄｅｒｓ他、Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｃｌｏｎｉｎｇ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｃｈｉｎｅｓｅ  ｈａｍｓｔｅｒ  ｇｌｕｔａｍｉｎｅ  ｓｙｎｔｈｅｔａｓｅ  ｇｅｎｅ．Ｔｈｅ  ＥＭＢＯ  Ｊ（１９８４）３：６５〜７１）、グルタミンシンテターゼ（ＧＳ）酵素はＳＶ４０初期プロモーター及びエンハンサーの制御下にあった。
【０２３４】
細胞培養
３７℃及び５％ＣＯ２での振とうフラスコ容器中において専用のＤＭＥＭ／Ｆ１２ベース培地中でＣＨＯ細胞を培養した。３日〜４日ごとに３×１０５個／ｍＬの播種密度で細胞を継代させた。
【０２３５】
安定的遺伝子導入
製造業者の推奨（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）に従いリポフェクタミン２０００ＣＤを使用してＣＨＯ細胞に遺伝子導入した。遺伝子導入した細胞を遠心分離し、様々な濃度のメチオニンスルホキシイミン（ＭＳＸ）を含むＤＭＥＭ／Ｆ−１２ベース選択（グルタミンフリー）培地中に播種した。播種の約３週間後、個々のコロニーを９６ウェルプレート中に採取した。ＥＬＩＳＡ分析用に上清を取ることにより、採取したコロニーを抗体産生に関して評価した。最上位のクローンをスケールアップし、抗体力価、好ましい代謝（主に乳酸塩消費）及び許容される産物の品質特性に基づいて評価した。
【０２３６】
発現
各半抗体をＣＨＯ細胞中で発現させた。２Ｌの培養液を増殖させて採取した。
半抗体の精製
各半抗体をＭＡＢＳＥＬＥＣＴ  ＳＵＲＥ（商標）カラム上に捕捉した。次いで、カラムを４カラム容積（ＣＶ）の以下の緩衝液で洗浄した：５０ｍＭのトリスｐＨ８．０、１５０ｍＭのＮａＣｌからなる平衡緩衝液、及び０．４Ｍのリン酸カリウムｐＨ７．０からなる洗浄緩衝液。各群をｐＨ２．９で０．１５Ｍの酢酸ナトリウム中に溶出させた。
【０２３７】
半抗体の発現及び精製の前記方法は一般的に、様々なアイソタイプのＩｇＧに適用可能である。
【実施例２】
【０２３８】
可溶化剤及びｐＨの保持
以下の実施例は、中間ｐＨでの半抗体のインキュベーションにより、どのようにしてコンフォメーションシフトが駆動して構築効率が向上したか、並びにアルギニン及びヒスチジン等の可溶化剤の添加により、どのようにして中間ｐＨにより誘発される半抗体の沈殿が減少したかを詳述する。
【０２３９】
通常は抗体の溶媒に露出しない表面内にある疎水性パッチを含有することができるＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインの露出した内表面に起因して、半抗体プロテインＡプールは本質的に不安定である。そのため、ｐＨを４よりも高く調整した場合には半抗体プロテインＡプールが沈殿する傾向がある。本発明者らは、最小濃度のＬ−アルギニンの存在（ある例において５０ｍＭ以上）により半抗体がｐＨ調整時に安定化されて溶液中に残存することを発見した。アルギニン等の可溶化剤のこの添加により、半抗体が溶液中に維持され、ｐＨ調整時の濁度が低下し、二重特異性の構築収率が増加した。図３参照。アルギニンはまた、二重特異性半抗体を保護し、精製した二重特異性半抗体を凍結中における凝集の形成から保護した。同様の沈殿減少効果はまた、ヒスチジンおいても見られた。
【０２４０】
実施例１におけるプロテインＡカラムから回収したタンパク質をこの実施例の出発物質として使用した。
【０２４１】
プロテインＡで精製したタンパク質にＬ−アルギニン（１Ｍ、ｐＨ９）を５０〜６００ｍＭの最終濃度まで添加した。その後に必要に応じて、１．５Ｍのトリス塩基（ｐＨ１１）を使用して溶液をより高いｐＨに滴定した。プロテインＡカラムからの酸性溶出後に中間ｐＨに上昇させるステップを中間ｐＨの保持と称する。
【０２４２】
ＣＨ３ドメインにおけるノブ変異及びホール変異に起因して、二重特異性抗体は、標準的な抗体と比べて異なる程度の柔軟性を有する。この独特な柔軟性とＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインの露出した内表面との結果、半抗体は、ｐＨの調整時にコンフォメーションシフトを起こすように思われた。図２参照。この実験において、ｐＨを４よりも高いｐＨに調整した場合、ノブはモノマーから非共有結合的に連結されたホモ二量体へのシフトを起こした。図２Ｂ参照。サイズ排除クロマトグラフィーの保持時間によると、ホールは、より小さい流体力学半径からより大きい流体力学半径へのコンフォメーションシフトを起こした。シフトはｐＨ５で起こり始めており、７以上のｐＨでシフトが完了した。図２Ａ参照。
【０２４３】
抗体の凝集及びオリゴマー状態を測定するためのサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）をＨＰＬＣクロマトグラフィーにより行なった。簡潔に言うと、プロテインＡで精製した抗体を、Ａｇｉｌｅｎｔ  ＨＰＬＣ１２００システム上のＴｏｓｏｈ  ＴＳＫｇｅｌ  ＳＷ２０００カラムにアプライした。タンパク質（大腸菌中で産生したＩｇＧ１半抗体）を、０．２ＭのＫ３ＰＯ４  ０．２５ＭのＫＣｌ  ｐＨ６．２により０．５ｍＬ／分の流速で溶出させた。溶出したタンパク質を、ＵＶ吸光度及びピーク面積の積分により定量化した。図２Ａ及び図２Ｂ参照。このシフトは、半抗体、特にＣＨ３ドメイン中に変異を有するノブ半抗体及びホール半抗体のより高い柔軟性に起因するｐＨ変化によって誘発された折り畳み中間物を示すことができる。
【０２４４】
しかしながら、中間ｐＨの保持により半抗体の沈殿が生じる可能性がある。図３Ａに示すように、アルギニンの存在により、プロテインＡで精製したＩｇＧ１ノブ半抗体のｐＨにより誘発される濁度が低下した。この実験において、１Ｍのアルギニンを使用して、大腸菌で産生したＩｇＧ１半抗体プロテインＡプールのｐＨを滴定した。ｐＨを５．５に滴定した場合のアルギニンの最終濃度は約５０ｍＭであり、ｐＨ７．５で約２００ｍＭであり、ｐＨ８．５で約４００ｍＭであった（図３Ａ参照）。アルギニンの存在により、ノブイントゥホール二重特異性抗体の構築収率も１５％向上した（データは示さない）。
【０２４５】
同様に、ヒスチジンは、沈殿に起因するｐＨにより誘発される濁度を低下させることができた。ＭＡＢＳＥＬＥＣＴ  ＳＵＲＥ（商標）カラムにより「ノブ」ＩｇＧ１半抗体を大腸菌破砕物から精製し、１２ｇ／Ｌの濃度の半抗体を含むプロテインＡプールを得た。４分の１の体積のアルギニン塩酸塩又はヒスチジン塩酸塩を２００ｍＭの最終添加濃度まで添加し、「未処理」対照用に等しい体積の精製水を添加した。濃縮水酸化ナトリウム（５０重量／体積％ＮａＯＨ溶液、又は１９．１Ｎ）滴加を使用して試料のｐＨを上昇させ、データ点を記録した。Ｏｒｉｏｎ  Ｒｏｓｓ８１−０３マイクロプローブを使用してｐＨを測定した。Ｈａｃｈ  ２１００実験室濁度計を使用して溶液の濁度を測定した。
【０２４６】
図３Ｂにおけるデータは、アルギニン（２００ｍＭ）及びヒスチジン（２００ｍＭ）の両方により、大腸菌から単離したＩｇＧ１においてｐＨにより誘発される沈殿が低減することを示した。要約すると、中間ｐＨにより、二重特異性の構築に有利な半抗体のコンフォメーションシフトが誘発され、中間ｐＨの保持ステップへの可溶化剤の添加により、ｐＨにより誘発される沈殿が低減した。
【実施例３】
【０２４７】
還元
以下の実施例は、還元条件の使用により、どのようにして凝集が低減して所望のヘテロ多量体、例えば二重特異性抗体のより多くの形成がもたらされるかを詳述する。例えば構築用混合物にグルタチオンを添加することにより、ノブイントゥホール二重特異性の構築に有利である弱還元条件が作られる。ＢＭＥＡ（ベータ−メルカプトエチルアミン）等の同様の種類における他の還元剤は同様の効果を有することができる。
【０２４８】
凝集は、ノブ半抗体及びホール半抗体を構築して二重特異性を形成する最中に生じる可能性がある。グルタチオンレベルの増加により、構築中の凝集量が最小化される。これに対して、高濃度でのＤＴＴ等の強還元剤は、ときには凝集を増加させる可能性がある。特定のメカニズムに限定することなく、グルタチオンは、恒久的にジスルフィド結合を低減するのではなく、適切なジスルフィド形成の促進剤として作用するジスルフィドを組換えると考えられる。グルタチオンの構築により、目的の二重特異性産物におけるヒンジ領域のジスルフィドを形成するために緩衝液を交換する必要はないが、強還元剤を使用する場合には再酸化のために必要である。グルタチオン等の弱還元剤を使用する場合も化学的再酸化剤を添加する必要はない。
【０２４９】
グルタチオン濃度をモル濃度で、又は構築用混合物中に存在するヒンジ含有ポリペプチドもしくは半抗体の量に対するモル比で表すことができる。構築用混合物中におけるタンパク質濃度に対する還元剤対照の標的モル比を使用することにより、タンパク質濃度の変化による過度の還元又は還元の不足を予防する。
【０２５０】
この実施例において、グルタチオンを混合半抗体に２〜２００倍モル過剰で添加した。試料を室温で４６時間にわたってインキュベートした。ＲＰ−ＨＰＬＣ（逆相高速液体クロマトグラフィー）において、全ての試料を０．１％トリフルオロ酢酸で１．０ｍｇ／ｍｌの最大濃度まで希釈した。２８０ｎｍでの光度測定によりタンパク質濃度を測定した。０．１％トリフルオロ酢酸からなる４つの試料を試料分析前に注入した。このことにより、カラムが完全に平衡化されることが保証された。プロテインＡで精製した大腸菌産生ＩｇＧ１半抗体を、Ａｇｉｌｅｎｔ  ＨＰＬＣ１２００システム上のＰｏｒｏｓ  Ｒ２／２０  直径２．１ｍｍ×長さ２０ｍｍにアプライした。３８〜４９％緩衝液Ａの直線勾配により、タンパク質を０．５ｍＬ／分の流速において２０分で０．０９％トリフルオロ酢酸８０％アセトニトリル（緩衝液Ｂ）に溶出させた。溶出したタンパク質をＵＶ吸光度及びピーク面積の積分により定量化した。図４Ａに示すように、二重特異性形成のレベルはグルタチオン：Ａｂのモル比の増加に伴い増加した。図４Ａ参照。
【０２５１】
抗体の凝集及びオリゴマー状態を測定するためにサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を行なった。簡潔に言うと、プロテインＡで精製した大腸菌産生ＩｇＧ１半抗体を、Ａｇｉｌｅｎｔ  ＨＰＬＣ１２００システム上のＴｏｓｏｈ  ＴＳＫゲル  ＳＷ２０００カラムにアプライした。タンパク質を、０．２ＭのＫ３ＰＯ４  ０．２５ＭのＫＣｌ  ｐＨ６．２により０．５ｍＬ／分の流速で溶出させた。溶出したタンパク質を、ＵＶ吸光度及びピーク面積の積分により定量化した。観察した１５０ｋＤのピークは二重特異性抗体の形成によるものであることを確認した。図４Ｂ参照。
【０２５２】
図に示すように、不必要なモノマー（即ち、半抗体、ノブ又はホールのいずれか）及びホモ二量体からヘテロ多量体、即ち二重特異性抗体へのピークのシフトが存在する（図４Ａ及び図４Ｂ）。要約すると、データは、半抗体に対するグルタチオンのモル比の増加により、凝集が低減して二重特異性の形成が向上したことを示す（図４Ｂ）。
【実施例４】
【０２５３】
温度
この実施例は、半抗体の安定性及びヘテロ多量体の構築への温度の影響を説明する。
【０２５４】
半抗体の溶液の温度は、構築速度への劇的な影響を及ぼした。高温における大腸菌産生ＩｇＧ１半抗体の構築の増強の一例を図５Ａに示す。
【０２５５】
二重特異性の構築への温度の影響を示す別の例を図５Ｂに示す。この実験において、実施例１に記載したように、２種のＩｇＧ１半抗体を大腸菌中で産生してプロテインＡ上で精製した。半抗体を組み合わせ、並びに加熱及び／又は中間ｐＨの保持を含む又は含まない様々な条件下で二重特異性の構築を試験するために４つのアリコートに分けた。
【０２５６】
図５Ｂに示すように、２００モル過剰のグルタチオンは、変動条件下で二重特異性ＩｇＧ１抗体の形成速度を高めた。対照条件（室温、約２０℃、半抗体をｐＨ４に維持し、中間ｐＨの保持がなかった）では、より遅い速度ではあるが二重特異性の構築が可能であった。プロテインＡで精製した半抗体を中間ｐＨ（ノブ半抗体に関してはｐＨ５；ホール半抗体に関してはｐＨ７）で１６時間にわたって室温において保持することにより、高温になることなく二重特異性抗体の形成速度が改善された（図５Ｂにおいて、構築用混合物はｐＨ８．５で「ｐＨ最適化」された）。中間ｐＨの保持ステップを行なうことなく温度を３７℃まで高めることにより、二重特異性抗体の構築速度が対照よりも増加し、構築速度はｐＨ保持ステップ及び室温で行なった構築と比べて速かった。しかしながら、最速の構築速度は、プロテインＡで精製した半抗体を（前記のように）中間ｐＨで保持し、次いで、ｐＨ８．５及び昇温（即ち３７℃）で構築した場合に見られた。この条件下では、わずか約６時間で約８０％の二重特異性の構築が達成された（図５Ｂ）。要約すると、加熱により全体的に構築速度が増加し、ｐＨの保持及び加熱は構築への相乗効果を有していた。
【０２５７】
加熱により増強された構築はまた、ＩｇＧ４二重特異性抗体においても見られた。図６Ｂの結果は、ＰＶＰ及びヒスチジンの存在下において、大腸菌培養により産生して加熱したＩｇＧ４半抗体が大腸菌産生ＩｇＧ１半抗体の構築と同様の構築結果を達成したことを示す。上述した逆相ＨＰＬＣを使用して二重特異性の量を分析した。まとめると、データは、加熱により二重特異性の形成が促進されたことを示す。
【実施例５】
【０２５８】
安定化剤
以下の実施例は、構築中及び／又は中間ｐＨの保持中での加熱及び／又はｐＨの上昇による凝集を安定化剤がどのようにして低減することができるかを詳述する。
【０２５９】
ポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）は、ピロリドン基を有する水溶性の非荷電ポリマーである。ＰＶＰは加熱構築中に凝集を低減した。特定のメカニズムに限定することなく、ＰＶＰは、二重特異性の折り畳み中間体を安定化させるように作用することができ、又はおそらく二重特異性の疎水性パッチとの相互作用による凝集から半抗体を保護することができる。
【０２６０】
実施例３に記載した条件下でＳＥＣを使用して凝集体形成へのＰＶＰの影響を分析した。ＰＶＰの添加により、構築されたプール中に存在する高分子量種（ＨＭＷＳ）を、ＰＶＰを添加しない４％ＮＭＷＳと比べて４％ＰＶＰ（重量／体積）を有する１２％ＨＭＷＳまで最小化した。図６Ａ参照。全ての試料は、２００ｍＭのアルギニンの存在下で加熱した大腸菌産生ＩｇＧ１であった。
【０２６１】
次に、ＩｇＧ４二重特異性抗体の構築を試験した。図６Ｂに示すように、ＰＶＰ及びヒスチジンの存在下での加熱構築により、大腸菌産生ＩｇＧ４二重特異性の構築が図５Ａに示す大腸菌により産生したＩｇＧ１の加熱構築と同様のレベルまで大きく改善された。アルギニンは、可溶化剤及びｐＨ滴定剤として加熱試料及び室温試料の両方に存在した。ＰＶＰに加えて別の安定化剤であるヒスチジンを、加熱した中間ｐＨの保持ステップ前に添加し、このステップ中に半抗体を安定化させた。結果は、ＰＶＰ及びヒスチジンの両方がＩｇＧ４二重特異性の構築をＩｇＧ１二重特異性の構築と同様のレベルまで改善したことを示す（図６Ｂと図５Ｂとの比較）。
【０２６２】
図６Ｃは、ＩｇＧ４二重特異性抗体の加熱構築中においてＰＶＰがＨＭＷＳの形成を最小化した別の実施例を示す。
【０２６３】
半抗体プロテインＡプールの加熱により、中間ｐＨでのインキュベーション時に半抗体のコンフォメーションシフトが促進された。しかし、加熱により、特に大腸菌中で産生したＩｇＧ４半抗体に由来するＩｇＧ４ノブ二重特異性抗体の構築及びＩｇＧ４ホール二重特異性抗体の構築に関して凝集が起こる可能性がある。そのため、構築中にＩｇＧ４半抗体を加熱した場合に追加的な可溶化剤及び／又は安定化剤を添加した。
【０２６４】
室温でのインキュベーションの４８時間後に、大腸菌ＩｇＧ４ホール半抗体のコンフォメーションシフトを検出した。ＩｇＧ４ホール半抗体を３７℃でインキュベートした場合には、約３時間内にコンフォメーションシフトを検出した（データは示さない）。しかしながら、ＳＥＣにより測定したように加熱により凝集の増加がもたらされた。図７の左側のパネルを参照。この実験では、加熱した中間ｐＨの保持ステップ中にヒスチジンを添加し、半抗体の凝集の低減へのヒスチジンの影響を試験した。図７に示すように、加熱中におけるヒスチジンの存在により、半抗体のコンフォメーションシフトに影響を及ぼすことなく、凝集のレベルが１１％高分子量種（ＨＭＷＳ、ヒスチジンなし）から６％ＨＭＷＳ（２００ｍＭのヒスチジン）へと最小化された。そのため、結果は、二重特異性抗体の構築及び半抗体の中間ｐＨの保持の両方の最中で安定化剤が凝集体形成を低減したことを示す。
【実施例６】
【０２６５】
構築
この実施例は、２種の例示的免疫グロブリンのアイソタイプ、即ちＩｇＧ１及びＩｇＧ４に関するプロトコルを提供する。半抗体を２種の異なる宿主細胞、即ち大腸菌又はＣＨＯのうちのいずれか一方で産生した。本明細書に記載した方法を同じ又は他の供給源中で産生した他の抗体のアイソタイプに適用することができることが理解される。当分野における知識及び本出願で開示した教示に基づくルーチン的な実験によりプロトコルを変更することは当業者の能力の範囲内である。
【０２６６】
更に、第１の宿主細胞（例えばＣＨＯ）中で産生した半抗体を含む抗体の形成を、第２の宿主細胞（例えば大腸菌）中で産生した相補的な半抗体と共に構築することができることが理解される（データは示さない）。そのため、例えばＣＨＯ中で産生したノブ半抗体を大腸菌中で産生したホール半抗体と共に構築することができ、その逆を行なうこともできる。
【０２６７】
この実施例に記載した４種全ての構築手順により、４時間後に定常となり、生じる凝集体が１０％未満であり、及び構築中に生じる凝集が最小である構築が得られた。
【０２６８】
Ａ．大腸菌に由来するＩｇＧ１
半抗体のコンフォメーション変化：プロテインＡプールのｐＨが７未満であった場合、１Ｍのアルギニン（ｐＨ９）を使用して両方の半抗体プールのｐＨをｐＨ７に調整し、両方のプールを３７℃で３時間にわたってインキュベートした。あるいは、プールを室温で４８時間にわたってインキュベートした。プールが４８時間以上にわたって既にｐＨ７であった場合、このステップを省略する。溶液をｐＨ７にするために添加したアルギニンの量を定量化した。
【０２６９】
（まだ暖かい）プールを組み合わせ、１Ｍのアルギニン（ｐＨ９）を使用してｐＨをｐＨ８．５に調整した。この段階で添加したアルギニンの量を定量化した。
【０２７０】
アルギニンの最終濃度が０．５Ｍとなるまで２Ｍのアルギニン（ｐＨ８．５）を添加した。
【０２７１】
０．５Ｍのアルギニン（最終ｐＨ８．５）中の２００ｍＭの還元グルタチオン（ＧＳＨ）をＧＳＨ：抗体比が２００倍になるまで添加した（例：各ｍｇの半抗体に対して６．８８μＬのグルタチオン溶液を添加する）。
【０２７２】
グルタチオン半抗体溶液を３７℃で４時間にわたってインキュベートし、半抗体を二重特異性抗体に構築させた。
【０２７３】
Ｂ．ＣＨＯに由来するＩｇＧ１
大腸菌に関して上述したように構築した。中間ｐＨの保持に関してｐＨをｐＨ７以上に上昇させる必要はない可能性がある。グルタチオンの添加後の構築時間は２時間後に終了することができる。
【０２７４】
Ｃ．ＣＨＯに由来するＩｇＧ４
上記（ＣＨＯに由来するＩｇＧ１）と同じ条件下で構築した。ヒスチジン及びＰＶＰは必要ない可能性がある。
【０２７５】
Ｄ．大腸菌に由来するＩｇＧ４
上記プロトコルを使用する大腸菌に由来するＩｇＧ４の構築は高い凝集レベル、即ち約３５％の凝集レベルという結果となった。このことにより、構築条件の変更が必要であった。
【０２７６】
０．２Ｍのヒスチジン及び５０ｍＭのアルギニンを含有するプロテインＡプール組成物により、許容される結果が得られることを確認した（データは示さない）。そのため、最終結果を得るためのいくつかの方法を精査し、許容される結果が得られることを確認した。
【０２７７】
第１の方法では、プロテインＡ精製中に、変更した溶出緩衝液（ｐＨ３）及び洗浄緩衝液（ｐＨ７）を使用し、０．２Ｍのヒスチジン及び５０ｍＭのアルギニンを含有させた。これにより、０．２Ｍのヒスチジン及び５０ｍＭのアルギニンを含有し、ｐＨ４である最終プロテインＡプールが得られ、次いで、１．５Ｍのトリス塩基（ｐＨ１１）を使用してｐＨ４をｐＨ８に滴定した。
【０２７８】
第２の代替方法では、ヒスチジンＨＣｌ（溶解度は０．８Ｍである）の０．８Ｍ溶液を利用した。３分の１の体積のヒスチジンＨＣｌをプロテインＡプール（単数又は複数）に添加し、０．２Ｍヒスチジンである最終濃度に達した。次いで、４０分の１の体積の２Ｍアルギニンを添加した。
【０２７９】
第３の代替方法では、（好ましくはｐＨ８で）プロテインＡプールを０．２Ｍのヒスチジン及び５０ｍＭのアルギニン緩衝液に緩衝液交換した。
【０２８０】
最後の代替方法では、ヒスチジンをプロテインＡプール（単数又は複数）（３１．０３ｇ／Ｌ）に直接添加し、次いで４０分の１の体積の２Ｍアルギニンを添加した。
【０２８１】
４分の１の体積の、Ｓｐｅｃｔｒｕｍ  ＰＶＰ  Ｋ−１５の０．２Ｍヒスチジン及び５０ｍＭアルギニン溶液（２０重量／体積％）をプロテインＡプール（単数又は複数）に添加した。
【０２８２】
低グルタチオン条件下でＩｇＧ１に関する構築中にＰＶＰが凝集を最小化することも留意された。
【０２８３】
半抗体のコンファメーション変化：０．２Ｍのヒスチジン及び５０ｍＭのアルギニンを含む１．５Ｍのトリス塩基と４％ＰＶＰ  Ｋ−１５（ｐＨ１１）とを使用してプロテインＡプール（単数又は複数）のｐＨをｐＨ８．０に調整し、３７℃で３時間にわたってインキュベートした。あるいは、プール（単数又は複数）を室温で４８時間にわたってインキュベートすることができた。
【０２８４】
０．２Ｍのヒスチジン、４％ＰＶＰ、５０ｍＭのアルギニン（最終ｐＨ８．０）中の２００ｍＭの還元グルタチオン（ＧＳＨ）をＧＳＨ：抗体比が２００倍になるまで添加した（例：各ｍｇの半抗体に対して６．８８μＬのグルタチオン溶液を添加する）。半抗体プールを組み合わせなかった場合には、この時点で半抗体プールを組み合わせた。
【０２８５】
プールした半抗体を３７℃で４時間にわたってインキュベートし、二重特異性抗体の形成を可能にした。この時点で二重特異性抗体の割合は定常となっている。
【０２８６】
二重特異性抗体の量が定常になると、溶液を低温で保存することができ、又はその後のクロマトグラフィーステップによる処理のためにより低いｐＨに調整することができる。
【０２８７】
本明細書に開示した方法は、二重特異性抗体等の治療用タンパク質の製造における用途を見出す。
【０２８８】
本明細書に記載した実施例及び実施態様は例示のみを目的としており、様々な変更又はそれを考慮した改変を当業者に示唆し、これらは本出願の趣旨及び範囲並びに添付した特許請求の範囲の範囲に含まれることが理解される。本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願を、全ての目的のために出典明示により全体として本明細書に援用する。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図６Ｃ】
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【図７】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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