(57)【要約】  本発明は、哺乳動物のＮｏｔｃｈ受容体の４つのメンバー（Ｎｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２、Ｎｏｔｃｈ−３、Ｎｏｔｃｈ−４、以下「Ｎｏｔｃｈ受容体」ともいう）、及び哺乳動物のＮｏｔｃｈリガンドの５つのメンバー［Ｄｅｌｔａ様ファミリーである「ＤＬＬ１」、「ＤＬＬ３」、「ＤＬＬ４」（ここで「ＤＬＬ」はＤｅｌｔａ様リガンドを表す）、およびＪａｇｇｅｄファミリーである「Ｊａｇｇｅｄ−１」、「Ｊａｇｇｅｄ−２」、以下「Ｎｏｔｃｈリガンド」ともいう）］等のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー（本明細書中で規定）に指向性を有するアミノ酸配列（本明細書中で「本発明の単一可変ドメイン」、「本発明のナノボディ（商標）」、「本発明のポリペプチド」ともいう）、並びに１つ又は複数のこのような単一可変ドメイン（本明細書中でそれぞれ「本発明の構築物」、「本発明のナノボディ（商標）」ともいう）を含むか、又は本質的にこれから成る構築物に関する。特に本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達を下方制御又は上方制御するＮｏｔｃｈ経路干渉単一可変ドメイン（本明細書中で「Ｎｏｔｃｈアンタゴニスト」又は「Ｎｏｔｃｈアゴニスト」ともいう）に関する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
【請求項２】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトのＮｏｔｃｈ経路のメンバーから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項３】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがＮｏｔｃｈ受容体及びＮｏｔｃｈリガンドから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項４】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトＮｏｔｃｈ受容体及びヒトＮｏｔｃｈリガンドから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項５】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがＪａｇｇｅｄ−１、Ｊａｇｇｅｄ−２、ＤＬＬ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４、Ｎｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２、Ｎｏｔｃｈ−３及びＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項６】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１、ヒトＪａｇｇｅｄ−２、ヒトＤＬＬ１、ヒトＤＬＬ３、ヒトＤＬＬ４、ヒトＮｏｔｃｈ−１、ヒトＮｏｔｃｈ−２、ヒトＮｏｔｃｈ−３及びヒトＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項７】
Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１、ヒトＤＬＬ４、ヒトＮｏｔｃｈ−１及びヒトＮｏｔｃｈ−２から成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項８】
Ｎｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと、Ｎｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項９】
Ｎｏｔｃｈリガンド及びＮｏｔｃｈ受容体から成る群のメンバーの少なくとも１つと、配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項１０】
ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項１１】
ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、前記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項１２】
ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、前記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項１３】
ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、前記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項１４】
ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、前記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【請求項１５】
ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つと、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から前記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、請求項１に記載の単一可変ドメイン。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、哺乳動物の４つのＮｏｔｃｈ受容体のメンバー（Ｎｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２、Ｎｏｔｃｈ−３、Ｎｏｔｃｈ−４、以下「Ｎｏｔｃｈ受容体」とも称される）、及び哺乳動物の５つのＮｏｔｃｈリガンド［Ｄｅｌｔａ様ファミリーのメンバー（「ＤＬＬ１」、「ＤＬＬ３」、「ＤＬＬ４」（ここで「ＤＬＬ」はＤｅｌｔａ様リガンドを表す）及びＪａｇｇｅｄファミリーのメンバー「Ｊａｇｇｅｄ−１」、「Ｊａｇｇｅｄ−２」、以下「Ｎｏｔｃｈリガンド」とも称される）］等のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー（本明細書中で規定）に指向性を有するアミノ酸配列（本明細書中で「本発明の単一可変ドメイン（複数可）」、「本発明のナノボディ（商標）」、「本発明のポリペプチド（複数可）」とも称される）、並びに１つ又は複数のこのような単一可変ドメイン（本明細書中でそれぞれ「本発明の構築物」、「本発明のナノボディ（商標）」とも称される）を含むか、又は本質的にこれから成る構築物に関する。特に本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達を下方制御する又は上方制御するＮｏｔｃｈ経路干渉単一可変ドメイン（本明細書中で「Ｎｏｔｃｈアンタゴニスト」又は「Ｎｏｔｃｈアゴニスト」とも称される）に関する。
【０００２】
本発明は、このような単一可変ドメイン又は構築物（本明細書中で「本発明の核酸」又は「本発明のヌクレオチド配列」とも称される）をコードする核酸；このような単一可変ドメイン又は構築物を調製する方法；このような単一可変ドメイン又は構築物を発現するか、又は発現することが可能な宿主細胞；このような単一可変ドメイン又は構築物を含む組成物、特に薬学的組成物；並びに特に予防目的、治療目的又は診断目的の、例えば癌、免疫調節疾患及び神経変性疾患における使用、特に本明細書で言及する予防目的、治療目的又は診断目的のこのような単一可変ドメイン、構築物、核酸、宿主細胞及び／又は組成物の使用にも関する。
【０００３】
本発明の他の態様、実施の形態、利点及び用途は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【背景技術】
【０００４】
Ｎｏｔｃｈ経路は発生及び分化中の多くの組織で細胞運命選択を制御することが知られている。癌に関して、数多くの観察結果は、慢性的に活性のあるＮｏｔｃｈシグナル伝達が多くの細胞において表現型の形質転換に関連することを示唆している。外見上全長のＮｏｔｃｈ受容体及びリガンドの過剰発現が幾つかの一般的な上皮性悪性腫瘍及び腫瘍細胞株において観察される。他の場合では、活性化Ｎｏｔｃｈシグナル伝達は構造的に活性のあるＮｏｔｃｈ受容体を産生する欠失に起因する（Miele et al、同上）。癌における本発明のポリペプチドの好適となり得る使用例は主にＮｏｔｃｈアンタゴニスト形態におけるものであり、その癌は例えば、子宮頸癌、頸部上皮における前癌病変部、子宮内膜癌、Ｔ細胞急性リンパ芽球性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）、急性前骨髄球白血病、赤白血病、多形性膠芽腫、神経芽細胞腫及び髄芽腫から胸膜中皮腫（Miele et al、同上）、過剰血管形成を伴う疾患（非特許文献１）である。ＤＬＬ４の遮断が非生産的な血管形成を促進することにより腫瘍成長を阻害する（特許文献１）。
【０００５】
長年、神経変性障害に関して、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達が中枢神経系の発生において、また最近になって神経病理においても極めて重要な役割を果たすことが知られてきた。神経変性疾患における本発明のポリペプチドの好適となり得る使用例は主にＮｏｔｃｈアゴニスト形態におけるものであり、その神経変性疾患は例えば、ＣＡＤＡＳＩＬ、アルツハイマー病、家族性アルツハイマー病、多発性硬化症等の脱髄障害、脊髄損傷等の神経学的病変、脳卒中である（Miele et al.、同上）。
【０００６】
免疫修飾に関して、かなりの証拠により免疫系におけるＮｏｔｃｈシグナル伝達の複合的な役割が指摘されている。Ｎｏｔｃｈシグナル伝達は、特に類似の相互作用によるＴ細胞の活性化の後に誘発される「分化」プログラムを阻害することによりＴ細胞成熟における役割を果たすことが確立されている。したがって、Ｎｏｔｃｈアゴニストは免疫抑制性又は寛容誘導性の干渉に使用することができ（移植／移植片対宿主疾患（transplantation/graft versus host diseases）における使用）、Ｎｏｔｃｈアンタゴニストは免疫応答を増幅することができる。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】国際公開第２００７／０７０６７１号パンフレット
【非特許文献】
【０００８】
【非特許文献１】Thurston G. et. Al, 2007, Nature 7, 327-331
【発明の概要】
【０００９】
概して本発明の単一可変ドメイン及び構築物を、ＮｏｔｃｈリガンドとＮｏｔｃｈ受容体との結合を調整、特に阻害及び／又は予防するのに、またこのようにしてＮｏｔｃｈリガンド及び／又はＮｏｔｃｈ受容体により媒介されるシグナル伝達を調整、特に阻害又は予防するのに、Ｎｏｔｃｈリガンド及び／又はＮｏｔｃｈ受容体が関与する生物学的経路を調整するのに、及び／又はこのようなシグナル伝達又はこれらの経路に関連する生物学的な機構、応答及び効果を調整するのに使用することができる。
【００１０】
このため、本発明の単一可変ドメイン及び構築物を、（本明細書中で規定のように）癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の予防及び治療に使用することができる。一般的に、癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患は、本発明のポリペプチド又は組成物のいずれかを（特にその薬学的に活性のある量）、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する生物学的な経路若しくは機構に対して活性のある既知の活性成分を（特にその薬学的に活性のある量）、それを必要とする（即ち疾患若しくは障害、又はそれらの症状の少なくとも１つを有する、及び／又は疾患又は障害を誘発又は発症する危険性がある）被験体に好適に投与することにより、それぞれ予防及び／又は治療することができる疾患及び障害として定義することができる。このような癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の例は本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかであり、例えば以下の疾患及び障害が挙げられる：アルツハイマー病、子宮頸癌、頸部上皮における前癌病変部、子宮内膜癌、Ｔ細胞急性リンパ芽球性白血病（Ｔ−ＡＬＬ）、急性前骨髄球白血病、赤白血病、多形性膠芽腫、神経芽細胞腫及び髄芽腫から胸膜中皮腫（Miele et al、同上）、過剰血管形成を伴う疾患（非特許文献１）、ＣＡＤＡＳＩＬ、アルツハイマー病、家族性アルツハイマー病、多発性硬化症等の脱髄障害、脊髄損傷等の神経学的病変、脳卒中（Miele et al.、同上）、移植／移植片対宿主疾患。
【００１１】
特に、本発明の単一可変ドメイン及び構築物を、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーにより、又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する経路（複数可）により媒介される過剰な及び／又は不要なシグナル伝達を特徴とする、癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の予防及び治療に使用することができる。このような癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の例も同様に、本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかである。
【００１２】
したがってこれらに限定されないが、本発明の単一可変ドメインを、例えば現在Ｎｏｔｃｈ経路媒介性シグナル伝達を調整することができる活性成分により予防又は治療されている疾患及び障害、例えば上記で引用された従来技術で言及されるものを全て予防及び／又は治療するのに使用することができる。また本発明の単一可変ドメインを、このような活性成分による治療が現在開発されている、提案されている、又は将来提案若しくは展開される疾患及び障害を全て予防及び／又は治療するのに使用することができることも予測される。さらに、本明細書中にさらに記載のそれらの有利な特性のために、本発明の単一可変ドメインを、これらの既知の活性成分が使用されているか、又は従来提案若しくは開発される疾患及び障害以外の他の疾患及び障害の予防及び治療にも使用してもよいこと、及び／又は本発明の単一可変ドメインが本明細書に記載の疾患及び障害を治療するのに新規の方法及びレジメンを提供し得ることが予測される。
【００１３】
本発明の単一可変ドメインの他の用途及び使用は、本明細書のさらなる開示から当業者にとって明らかになる。
【発明が解決しようとする課題】
【００１４】
概して、本発明の目的は、癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患、並びに本明細書で言及されるさらなる疾患及び障害の診断、予防及び／又は治療に使用することができる、薬理学的に活性な作用物質、及びこれを含む構築物を提供すること、並びにこのような作用物質及び構築物の投与及び／又は使用を伴う、このような疾患及び障害を診断、予防及び／又は治療する方法を提供することである。
【００１５】
具体的には本発明の目的は、現在当該技術分野で使用されている、及び／又は当該技術分野で既知の作用物質、構築物及び／又は方法に比べて或る特定の利点を有するような薬理学的に活性な作用物質、構築物及び／又は方法を提供することである。これらの利点は、以下のさらなる記載から明らかになる。
【００１６】
より具体的には本発明の目的は、癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患、並びに本明細書で言及されるさらなる疾患及び障害の診断、予防及び／又は治療に、薬理学的に活性な作用物質、及びこれを含む構築物として使用することができる治療タンパク質を提供すること、並びにこのような治療タンパク質及び構築物の投与及び／又は使用を伴うこのような疾患及び障害を診断、予防及び／又は治療する方法を提供することである。
【００１７】
したがって本発明の特定の目的は、（本明細書に規定のように）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、具体的には温血動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、より具体的には哺乳動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、特にヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性がある単一可変ドメインを提供すること、並びに少なくとも１つのこのようなアミノ酸配列を含むか、又は本質的にこれから成る単一可変ドメインを提供することである。
【００１８】
具体的には本発明の特定の目的は、温血動物、具体的に哺乳動物、より具体的にヒトにおいて予防的用途、治療的用途及び／又は診断的用途に好適であるこのような単一可変ドメインを提供することである。
【００１９】
より具体的には本発明の特定の目的は、温血動物、具体的に哺乳動物、より具体的にヒトにおいてＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに関連する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーで媒介される１つ又は複数の疾患、障害又は症状（本明細書中で言及される疾患、障害及び症状等）の予防、治療、緩和及び／又は診断に使用することができるこのような単一可変ドメインを提供することである。
【００２０】
本発明の特定の目的は、温血動物、具体的に哺乳動物、より具体的にヒトにおいてＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに関連する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーで媒介される１つ又は複数の疾患、障害又は症状（本明細書中で言及される疾患、障害及び症状等）の予防及び／又は治療のための薬学的組成物又は獣医学的組成物の調製に使用することができるこのような単一可変ドメインを提供することでもある。
【課題を解決するための手段】
【００２１】
本発明において概して、これらの目的は、本明細書に記載のアミノ酸配列、タンパク質、単一可変ドメイン及び構築物の使用によって達成される。
【００２２】
概して本発明は、（本明細書に規定のように）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する、及び／又は（本明細書に規定のように）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと特異的に結合することができる単一可変ドメイン、並びに少なくとも１つのこのようなアミノ酸配列を含む化合物及び構築物、特にタンパク質及び単一可変ドメインを提供する。
【００２３】
より具体的には本発明は、本明細書に規定の（さらに本明細書に記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる単一可変ドメイン、並びに少なくとも１つのこのようなアミノ酸配列を含む化合物及び構築物、特にタンパク質及び単一可変ドメインを提供する。
【００２４】
特に、本発明の単一可変ドメインが、１０−５モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、好ましくは及びより好ましくは１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌの解離定数（ＫＤ）で（即ち１０５Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及び好ましくは１０７Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及びより好ましくは１０８Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モルの結合定数（ＫＡ）で）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなもの、及び／又は
１０２Ｍ−１ｓ−１〜約１０７Ｍ−１ｓ−１、好ましくは１０３Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１、より好ましくは１０４Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１（１０５Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１等）のｋｏｎ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなもの、及び／又は
１ｓ−１（ｔ１／２＝０．６９ｓ）〜１０−６ｓ−１（ｔ１／２が数日である略不可逆的な複合体の場合）、好ましくは１０−２ｓ−１〜１０−６ｓ−１、より好ましくは１０−３ｓ−１〜１０−６ｓ−１（１０−４ｓ−１〜１０−６ｓ−１等）のｋｏｆｆ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなものであるのが好ましい。
【００２５】
好ましくは、本発明の一価のアミノ酸配列（又は本発明のアミノ酸配列を１つだけ含有するポリペプチド）が、５００ｎＭ未満、好ましくは２００ｎＭ未満、より好ましくは１０ｎＭ未満（５００ｐＭ未満等）の親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなものであるのが好ましい。
【００２６】
本発明の単一可変ドメイン又は単一可変ドメインとＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する幾つかの好ましい及びＩＣ５０値は、本明細書のさらなる記載及び実施例から明らかになる。
【００２７】
Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合のために、本発明のアミノ酸配列は通常、そのアミノ酸配列内に１つ又は複数のアミノ酸残基若しくは１つ又は複数のアミノ酸残基のストレッチ（即ちそれぞれの「ストレッチ」が、（即ちアミノ酸配列の一次構造又は三次構造で）互いに隣接しているか、又は互いに密接している２つ以上のアミノ酸残基を含む）を含有し、これを介して本発明の単一可変ドメインはＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができ、このようにしてアミノ酸残基又はアミノ酸残基のストレッチは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合する「部位」（本明細書で「抗原結合部位」とも称される）を形成する。
【００２８】
本発明で与えられる単一可変ドメインは、（本明細書で規定のように）本質的に単離形態であるか、又は（本明細書で規定のように）本発明のタンパク質若しくはポリペプチド（１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインを含むか、又は本質的にこれから成ってもよく、任意でさらに１つ又は複数のさらなる単一可変ドメイン（全て任意で１つ又は複数の好適なリンカーを介して連結される）を含んでもよい）の一部を形成するのが好ましい。例えば、これに限定されないが、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインは、全て本明細書に記載される本発明の一価、多価、又は多重特異性のポリペプチドをそれぞれ提供するように、このようなタンパク質又はポリペプチドにおける結合単位として使用してもよい（任意で（即ちＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー以外の１つ又は複数の他の標的に対する）結合単位としての役割を果たし得る１つ又は複数のさらなる単一可変ドメインを含有してもよい）。このようなタンパク質又はポリペプチドは、（本明細書に規定のように）本質的に単離形態でもあり得る。
【００２９】
本発明の単一可変ドメイン自体が、ジスルフィド架橋を介して任意の他のアミノ酸配列又はアミノ酸鎖と連結しない（が、１つ又は複数の分子内ジスルフィド架橋を含有しても又は含有しなくてもよい。例えば本明細書中に記載のナノボディは、ＣＤＲ３とＣＤＲ１又はＦＲ２との間にジスルフィド架橋を含有し得ることもあることが知られている）単一のアミノ酸鎖から本質的に成るのが好ましい。しかしながら、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインは、互いに及び／又は他の単一可変ドメインと（例えばジスルフィド架橋を介して）連結し、本発明に有用でもあり得るペプチド構築物（例えばＦａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、ＳｃＦｖ構築物、「ダイアボディ」及び他の多重特異性の構築物、例えばHolliger and Hudson, Nat Biotechnol. 2005 Sep; 23（9）: 1126-36による概説を参照されたい）を提供し得ることに留意されたい。
【００３０】
概して、本発明のアミノ酸配列（又はこれを含む化合物、構築物若しくはポリペプチド）は、（例えば本明細書に記載の治療目的及び／又は診断目的のための）被験体への投与を目的とする場合、上記被験体において自然発生しないアミノ酸配列であるか、又は上記被験体において自然発生する場合は、（本明細書に規定のように）本質的に単離形態であるのが好ましい。
【００３１】
薬学的用途の場合、本発明の単一可変ドメイン（並びにこれを含む化合物、構築物及び単一可変ドメイン）はヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するのが好ましく、一方で獣医学目的の場合は、本発明の単一可変ドメインは治療する種由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するか、又は治療する種由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと少なくとも交差反応性を有するのが好ましいことも、当業者にとって明らかである。
【００３２】
さらに、本発明のアミノ酸配列は、任意でかつＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合のための少なくとも１つの結合部位の他に、他の抗原、タンパク質又は標的との結合のための１つ又は複数のさらなる結合部位を含有し得る。
【００３３】
発症する特定の疾患又は障害に応じて、任意の好適なｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ、細胞ベースのアッセイ、ｉｎ  ｖｉｖｏアッセイ及び／又はそれ自体が既知の動物モデル、又はこれらの任意の組合せを使用して、本発明の単一可変ドメイン、及びこれを含む構築物の有効性を試験することができる。好適なアッセイ及び動物モデルは当業者に明らかであり、例えば、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関連する様々な疾患に対して開発されたマウスモデル（T. Gridley, HumanMolecular Genetics, 2003, Vol., 12, Review Issue 1, R9-R13）、並びに下記実験部及び本明細書中で引用される従来技術において使用されるアッセイ及び動物モデルが挙げられる。
【００３４】
また本発明によれば、第１の種の温血動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する単一可変ドメインは、１つ又は複数の他の種の温血動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと交差反応性を示しても又は示さなくてもよい。例えば、ヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する単一可変ドメインは、１つ又は複数の他の種の霊長類（例えば、これらに限定されないが、マカク属のサル（例えば特にカニクイザル（マカク・ファシクラリス（Macaca fascicularis））及び／又はアカゲザル（マカク・ムラット（Macacamulatta）））及びヒヒ（パピオ・ウルジヌス（Papio ursinus））由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、及び／又は疾患のための動物モデル（例えばマウス、ラット、ウサギ、ブタ又はイヌ）、特にＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに関連がある疾患及び障害のための動物モデルで使用されることが多い、１種又は複数種の動物（例えば本明細書で言及される種及び動物モデル）由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと交差反応性を示しても又は示さなくてもよい。この観点では、このような疾患モデルでヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する単一可変ドメインを試験することが可能であるので、存在する場合、このような交差反応性は薬剤開発の観点から都合がよいことがあることが当業者にとって明らかである。
【００３５】
より一般的には、複数種の哺乳動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと交差反応性を有する本発明の単一可変ドメインは、同じアミノ酸配列又はポリペプチドを複数種にわたって使用することが可能であるので、通常、獣医学用途に使用するのに有利である。したがって、或る種の動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する単一可変ドメイン（例えばヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する単一可変ドメイン）は、単一可変ドメインの使用によって治療する種において所望の効果が提供されれば、別の種の動物の治療に使用することができることも本発明の範囲内に包含される。
【００３６】
本発明は最も広範な意味でも、本発明の単一可変ドメインが指向性を有するＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの特定の抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニット又は立体構造（適用可能な場合）に特に限定されないか、又はこれらによって規定されない。例えば、単一可変ドメインは、（本明細書で規定される）「相互作用部位」に指向性を有していても又は有していなくてもよい。しかしながら概して、本発明の単一可変ドメインが好ましくは、（本明細書で規定される）相互作用部位に、及び特にリガンド−受容体相互作用部位のリガンド部位又は受容体部位のいずれかに少なくとも部分的に指向性を有することが推測されると共に好ましい）。このため、１つの好ましいが、非限定的な態様では、本発明の単一可変ドメインは、Ｎｏｔｃｈリガンド（同上）のリガンド−受容体相互作用部位、及び／又はＮｏｔｃｈ受容体（同上）のリガンド−受容体相互作用部位に指向性を有し、本明細書中でさらに規定されるようなものである。
【００３７】
本明細書でさらに記載されるように、本発明のポリペプチドは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する２つ以上の本発明の単一可変ドメインを含有し得る。概して、このような単一可変ドメインは、本発明の単一のアミノ酸配列に比べて、増大した結合活性（avidity：親和力）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合する。このようなポリペプチドは例えば、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの同じ抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニット又は立体構造（適用可能な場合）に指向性を有する本発明の単一可変ドメイン（相互作用部位であっても、又はなくてもよい）を２つ含み得るか、又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの第１の同じ抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニット又は立体構造（適用可能な場合）に指向性を有する本発明の少なくとも１つの「第１の」アミノ酸配列（相互作用部位であっても、又はなくてもよい）と、第１のものとは異なる第２の抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニット又は立体構造（適用可能な場合）に指向性を有する本発明の少なくとも１つの「第２の」アミノ酸配列（これも相互作用部位であっても、又はなくてもよい）とを含み得る。好ましくは、本発明のこのような「二重パラトピック」単一可変ドメインでは、少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列が、相互作用部位（本明細書中に規定）に指向性を有するが、本発明はその最も広範な意味ではこれに限定されない。
【００３８】
また、標的が結合対部分（例えば、受容体−リガンド結合対）である場合、単一可変ドメインは、標的と結合する同族結合パートナー（例えば適用可能な場合、リガンド、受容体又は他の結合パートナー）と競合するようなもの、及び／又は結合パートナーと標的との結合を（完全に又は部分的に）中和するようなものであり得る。
【００３９】
また適用可能な場合、本発明のアミノ酸配列が、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの２つ以上の抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニット又は立体構造と結合することができることは、本発明の範囲内である。このような場合、本発明の単一可変ドメインが結合する、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、又はサブユニットは、本質的に同じであり得るか（例えば、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが反復構造モチーフを含有するか、又は多量体形態で生じる場合）、又は異なり得る（後者の場合、本発明の単一可変ドメインが、同じであり得るか、若しくは異なり得る親和性及び／又は特異性で、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーのこのような異なる抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニットと結合し得る）。また、例えば、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが活性な立体構造及び不活性な立体構造で存在する場合、本発明の単一可変ドメインは、これらの立体構造のいずれか一方に結合しても、又はこれらの立体構造の両方に結合してもよい（即ち、親和性及び／又は特異性が同じであっても、又は異なっていてもよい）。また、例えば、本発明の単一可変ドメインは、付属リガンドと結合するＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの立体構造と結合しても、付属リガンドと結合していないＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの立体構造と結合しても、又はこのような立体構造の両方と（また同じであり得る又は異なり得る親和性及び／又は特異性で）結合してもよい。
【００４０】
また本発明の単一可変ドメインは概して、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの天然又は合成の類似体、変異体、突然変異体、対立遺伝子、部分及び断片全て；又は本発明の単一可変ドメインがＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー（例えば野生型のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー）で結合する抗原決定基（複数可）又はエピトープ（複数可）と本質的に同じである１つ又は複数の抗原決定基又はエピトープを含有する、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーのこれらの類似体、変異体、突然変異体、対立遺伝子、部分及び断片と少なくとも結合することが期待される。また、このような場合、本発明の単一可変ドメインは、本発明の単一可変ドメインが（野生型）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合する親和性及び特異性と同じか、又は異なる（即ちこれより高いか、又は低い）親和性及び／又は特異性で、このような類似体、変異体、突然変異体、対立遺伝子、部分及び断片と結合し得る。本発明の単一可変ドメインは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの類似体、変異体、突然変異体、対立遺伝子、部分及び断片によっては結合するものもあれば、結合しないものもあることも本発明の範囲内に含まれる。
【００４１】
Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが単量体形態及び１つ又は複数の多量体形態で存在する場合、本発明の単一可変ドメインは、単量体形態でのみＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するか、多量体形態でのみＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するか、又は単量体及び多量体形態の両方でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することが本発明の範囲内である。同様に、このような場合、本発明の単一可変ドメインは、本発明の単一可変ドメインが多量体形態のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合する親和性及び特異性と同じか、又は異なる（即ちこれより高いか、又は低い）親和性及び／又は特異性で単量体形態のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合し得る。
【００４２】
また、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが、タンパク質複合体を形成するように他のタンパク質又は単一可変ドメインと（例えば複合サブユニットと）結び付くことができる場合、本発明の単一可変ドメインが、結び付いていない状態でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するか、結び付いた状態でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するか、又はその両方でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することが本発明の範囲内である。これら全ての場合で、本発明の単一可変ドメインは、本発明の単一可変ドメインが単量体で結び付いていない状態でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合する親和性及び／又は特異性と同じか、又は異なり得る（即ちこれより高いか、又は低い）親和性及び／又は特異性でこのような多量体又は結び付いたタンパク質複合体と結合し得る。
【００４３】
また、当業者にとって明らかなように、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する単一可変ドメインを２つ以上含有するタンパク質又は単一可変ドメインは、対応する単量体アミノ酸配列（複数可）よりも高い結合活性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合し得る。例えば、これらに限定されないが、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの異なるエピトープに指向性を有する単一可変ドメインを２つ以上含有するタンパク質又は単一可変ドメインは、異なる単量体それぞれよりも高い結合活性で結合することができ（通常結合し）、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する単一可変ドメインを２つ以上含有するタンパク質又は単一可変ドメインも、より高い結合活性で結合することができる（通常結合する）。
【００４４】
概して、本発明の単一可変ドメインは、当業者にとって明らかなように、生物学的及び／又は治療的観点から最も関連がある形態のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー（単量体、多量体及び結び付いている形態を含む）と少なくとも結合する。
【００４５】
本明細書で想定される使用に好適である限り、本発明の単一可変ドメインの部分、断片、類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子及び／又は誘導体を使用すること、及び／又はこのような部分、断片、類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子及び／又は誘導体を１つ又は複数含むか、又は本質的にこれから成るタンパク質又は単一可変ドメインを使用することも本発明の範囲内である。このような部分、断片、類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子及び／又は誘導体は通常、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に機能的な抗原結合部位（の少なくとも一部）を含有し、より好ましくはＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと特異的に結合することができ、さらにより好ましくは本明細書に規定のように（さらに本明細書に記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる。このような部分、断片、類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子、誘導体、タンパク質及び／又は単一可変ドメインの幾つかの非限定的な例は、本明細書のさらなる記載から明らかになる。また本発明のさらなる断片又は単一可変ドメインは、本明細書に記載の１つ又は複数の（より小さい）部分又は断片を好適に組み合わせることによって（即ち連結又は遺伝子融合によって）提供され得る。
【００４６】
本明細書でさらに記載される、本発明の具体的であるが非限定的な一態様において、このような類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子、誘導体は、これらが由来する元となるアミノ酸配列に比べて（本明細書にさらに記載されるように）増大した血清半減期を有する。例えば、本発明のアミノ酸配列は、本発明のアミノ酸配列の誘導体の半減期が増大するように、半減期を延長する１つ又は複数の基又は部分（例えばＰＥＧ）と（化学的に又は別の方法で）連結し得る。
【００４７】
具体的ではあるが非限定的な一態様では、本発明のアミノ酸配列は、免疫グロブリンフォールドを含むアミノ酸配列であり得るか、又は好適な条件（例えば生理的条件）下で（即ちフォールディングによって）免疫グロブリンフォールドを形成することができるアミノ酸配列であり得る。特にHalaby et al., J. （1999） Protein Eng. 12, 563-71による概説を参照する。好ましくは、免疫グロブリンフォールドを形成するように適切にフォールディングする場合、このようなアミノ酸配列は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと（本明細書に規定のように）特異的に結合することができ、より好ましくは本明細書に規定のように（さらに本明細書に記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる。また、このような単一可変ドメインの部分、断片、類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子及び／又は誘導体は、免疫グロブリンフォールドを含むか、又は好適な条件下で免疫グロブリンフォールドを形成することができるようなものであるのが好ましい。
【００４８】
具体的であるが、非限定的に、本発明の単一可変ドメインは、本質的に４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と、３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成る単一可変ドメイン、又はこのようなアミノ酸配列の任意の好適な断片（したがって通常、本明細書でさらに記載されるように、ＣＤＲの少なくとも１つを形成するアミノ酸残基の少なくとも幾つかを含有する）であり得る。
【００４９】
本発明の単一可変ドメインは、具体的に免疫グロブリン配列又はその好適な断片、より具体的には免疫グロブリン可変ドメイン配列又はその好適な断片（例えば軽鎖可変ドメイン配列（例えばＶＬ配列）若しくはその好適な断片、又は重鎖可変ドメイン配列（例えばＶＨ配列）若しくはその好適な断片）であり得る。本発明のアミノ酸配列が重鎖可変ドメイン配列である場合、従来の四本鎖抗体由来の重鎖可変ドメイン配列（例えば、これに限定されないが、ヒト抗体由来のＶＨ配列）又はいわゆる（本明細書に規定の）「重鎖抗体」由来のいわゆる（本明細書に規定の）ＶＨＨ配列であり得る。
【００５０】
しかし本発明が、本発明のアミノ酸配列（又はこれを発現するのに使用される本発明のヌクレオチド配列）の起源に関しても、また本発明のアミノ酸配列又はヌクレオチド配列を生成又は入手する（又は生成若しくは入手している）方法に関しても限定されないことに留意すべきである。したがって本発明の単一可変ドメインは、（任意の好適な種由来の）天然単一可変ドメイン、又は合成若しくは半合成のアミノ酸配列であり得る。本発明の具体的ではあるが非限定的な態様では、アミノ酸配列は（任意の好適な種由来の）天然免疫グロブリン配列、又は合成若しくは半合成の免疫グロブリン配列であり、これにはこれらに限定されないが、（本明細書に規定の）「ヒト化」免疫グロブリン配列（例えば部分又は完全ヒト化マウス又はウサギ免疫グロブリン配列、特に部分又は完全ヒト化ＶＨＨ配列又はナノボディ）、（本明細書に規定の）「ラクダ化（camelized）」免疫グロブリン配列、並びに親和性成熟（例えば、合成、ランダム又は天然免疫グロブリン配列から開始する）、ＣＤＲグラフト化、ベニヤリング（veneering）、異なる免疫グロブリン配列由来の断片の結合（combining）、重複プライマーを使用したＰＣＲアセンブリ、及び当業者に既知の免疫グロブリン配列を遺伝子操作する（engineering）同様の技法、又は上記のいずれかの任意の好適な組合せ等の技法によって得られる免疫グロブリン配列が含まれる。例えば標準的なハンドブック、並びに本明細書に言及されるさらなる記載及び従来技術を参照する。
【００５１】
同様に、本発明のヌクレオチド配列は、天然ヌクレオチド配列、又は合成若しくは半合成の配列であってもよく、例えばＰＣＲによって好適な天然鋳型から単離される配列（例えば細胞から単離されるＤＮＡ又はＲＮＡ）、ライブラリ（特に発現ライブラリ）から単離されたヌクレオチド配列、（それ自体が既知の任意の好適な技法（例えばミスマッチＰＣＲ）を使用して）天然ヌクレオチド配列に突然変異を導入することによって調製されたヌクレオチド配列、重複プライマーを使用してＰＣＲによって調製されたヌクレオチド配列、又はそれ自体が既知のＤＮＡ合成のための技法を使用して調製されたヌクレオチド配列であり得る。
【００５２】
本発明のアミノ酸配列は特に、ドメイン抗体（又はドメイン抗体としての使用に好適なアミノ酸配列）、単一ドメイン抗体（又は単一ドメイン抗体としての使用に好適なアミノ酸配列）、「ｄＡｂ」（又はｄＡｂとしての使用に好適なアミノ酸配列）、又はナノボディ（商標）（本明細書に規定のように、ＶＨＨ配列を含むが、これに限定されない）、他の単一可変ドメイン、又はこれらのいずれか１つの任意の好適な断片であり得る。（単一）ドメイン抗体の概説に関しては、上記で言及された従来技術、及び欧州特許第０３６８６８４号明細書も参照する。「ｄＡｂ」という用語に関しては、例えばWard et al.（Nature 1989 Oct 12; 341 （6242）: 544-6）、Holtet al.（Trends Biotechnol., 2003, 21（11）:484-490）、例えば国際公開第０６／０３０２２０号パンフレット、国際公開第０６／００３３８８号パンフレット、及びDomantis Ltd.の他の公開特許出願を参照する。哺乳動物起源ではないため、本発明に関してあまり好ましくはないが、単一ドメイン抗体又は単一可変ドメインは、或る特定種のサメ由来である可能性があることにも留意すべきである（例えばいわゆる「ＩｇＮＡＲドメイン」、例えば国際公開第０５／１８６２９号パンフレットを参照されたい）。
【００５３】
特に本発明のアミノ酸配列又は単一可変ドメイン（複数可）は、（本明細書で規定の）ナノボディ（登録商標）又はその好適な断片（備考：ナノボディ（登録商標）及びナノクローン（登録商標）は、Ablynx N. V.の登録商標である）であり得る。Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するこのようなナノボディは、本明細書中で「本発明のナノボディ」とも称される。
【００５４】
ナノボディの概説に関しては、以下のさらなる記載、及び本明細書で言及される従来技術を参照する。しかしこれに関して、本明細書及び従来技術は主に、いわゆる「ＶＨ３群」のナノボディ（即ちＤＰ−４７、ＤＰ−５１又はＤＰ−２９等のＶＨ３群のヒト生殖細胞系列の配列との高度な配列相同性を有するナノボディ）を説明し、このナノボディは本発明の好ましい態様を形成することに留意すべきである。しかし概して、本発明は最も広範な意味で、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する任意種のナノボディを包含し、例えば２００６年４月１４日付けでAblynxN. V. により出願された「ＤＰ−７８様ナノボディ（DP-78-like Nanobodies）」と題する米国仮特許出願第６０／７９２，２７９号明細書（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／００３２５９号明細書も参照されたい）に記載されるように、例えばいわゆる「ＶＨ４群」に属するナノボディ（即ちＤＰ−７８等のＶＨ４群のヒト生殖細胞系列の配列との高度な配列相同性を有するナノボディ）も包含することに留意すべきである。
【００５５】
概して、ナノボディ（特にＶＨＨ配列及び部分ヒト化ナノボディ）は特に、（また本明細書にさらに記載される）１つ又は複数のフレームワーク配列において（本明細書に記載される）１つ又は複数の「特徴的な（Hallmark：ホールマーク）残基」の存在を特徴とし得る。
【００５６】
したがって概して、ナノボディは、（一般）構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を表し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を表し、１つ又は複数の特徴的な残基は本明細書にさらに規定されるようなものである）を有するアミノ酸配列として定義することができる。
【００５７】
特にナノボディは、（一般）構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を表し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を表し、フレームワーク配列は本明細書にさらに規定されるようなものである）を有するアミノ酸配列であり得る。
【００５８】
より具体的に、ナノボディは、（一般）構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有するアミノ酸配列であり得る；ここで
ｉ）好ましくは、カバットナンバリング（Kabat numbering）による１１位、３７位、４４位、４５位、４７位、８３位、８４位、１０３位、１０４位及び１０８位のアミノ酸残基の１つ又は複数は、以下の表Ａ−３で言及する特徴的な残基から選択され、
ｉｉ）上記アミノ酸配列は、配列番号１〜配列番号２２の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有し、ここでアミノ酸同一性の程度を決定するためにＣＤＲ配列を形成するアミノ酸残基（配列番号１〜配列番号２２の配列においてＸで示す）は無視する。
【００５９】
これらのナノボディにおいて、ＣＤＲ配列は概して、本明細書中にさらに規定されるようなものである。
【００６０】
したがって、本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと（本明細書に規定のように）結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するこのようなナノボディ、その好適な断片、及びこのようなナノボディ及び／又は好適な断片を１つ又は複数含むか、又は本質的にこれらから成る単一可変ドメインにも関する。
【００６１】
配列番号２５５〜配列番号２６９はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する（raised against）多くのＶＨＨ配列の単一可変ドメインを与える。
【００６２】
特に幾つかの特定の態様において本発明は以下のものを提供する：
（本明細書で記載されるように）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有し、かつ配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも８５％、例えば９０％又は９５％以上の配列同一性を有する単一可変ドメイン（配列に対する言及に関しては表Ａ−１Ａを参照されたい、表Ａ−１Ａで言及されていないとしても、本明細書全体を通して配列番号２５５〜配列番号２６９に対しては同じ言及を適用する）。これらの単一可変ドメインはさらに、同族リガンドとＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合を中和する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関して同族リガンドと競合する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー上の（本明細書で記載されるような）相互作用部位（例えばリガンド結合部位）に指向性を有するようなものであり得る；
配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つとＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合を（本明細書で記載されるように）交差遮断する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関して配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つと競合する単一可変ドメイン。同様に、これらの単一可変ドメインはさらに、同族リガンドとＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合を中和する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関して同族リガンドと競合する、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー上の（本明細書で記載されるような）相互作用部位（例えばリガンド結合部位）に指向性を有するようなものであり得る；
これらの単一可変ドメインは本明細書でさらに記載されるようなものであってもよく（例えばナノボディであり得る）、本発明の単一可変ドメインはこのような単一可変ドメイン（本明細書でさらに記載されるようなものであってもよく、例えば本明細書で記載されるような二重特異性及び／又は二重パラトピックの単一可変ドメインであり得る）、及びこのような単一可変ドメインをコードする核酸配列のうちの１つ又は複数を含む。このような単一可変ドメインには天然リガンドは全く含まれない。
【００６３】
幾つかの他の特定の態様において、本発明は以下のものを提供する：
（本明細書で記載されるような）ＦｃｇＲ３、ＦｃｇＲ１、ＦｃｇＲ２及びｐＩｇＲに特異的な本発明の単一可変ドメイン；
これらの本発明の単一可変ドメインは本明細書でさらに記載されるようなものであってもよく（例えばナノボディであり得る）、本発明の単一可変ドメインはこのような単一可変ドメイン（本明細書でさらに記載されるようなものであってもよく、例えば本明細書で記載されるような二重特異性及び／又は二重パラトピックの単一可変ドメインであり得る）、及びこのような単一可変ドメインをコードする核酸配列のうちの１つ又は複数を含む。このような単一可変ドメインには天然リガンドは全く含まれない。
【００６４】
したがって本発明の特に好ましいナノボディの幾つかが、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと（本明細書でさらに規定されるように）結合することができ、及び／又はそれらに指向性を有し、
ｉ）配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有し（ここでアミノ酸同一性の程度を決定するためにＣＤＲ配列を形成するアミノ酸残基は無視する）（またこれに関しては、表Ａ−１Ｂを参照し（表Ａ−１Ｂで言及されていないとしても、本願全体を通してフレームワークの配列番号に対しては同じ言及を適用する）、この図は配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディのフレームワーク１配列（配列番号１２６〜配列番号１４３）、フレームワーク２配列（配列番号１６２〜配列番号１７９）、フレームワーク３配列（配列番号１９８〜配列番号２１５）及びフレームワーク４配列（配列番号２３４〜配列番号２５１）を列挙する）（フレームワーク１配列の１位〜４位及び２７位〜３０位のアミノ酸残基に関しては、以下で為されるコメントも参照する。したがって、アミノ酸同一性の程度を決定するためにこれらのアミノ酸残基は無視するのが好ましい）、また
ｉｉ）好ましくはカバットナンバリングによる１１位、３７位、４４位、４５位、４７位、８３位、８４位、１０３位、１０４位及び１０８位のアミノ酸残基の１つ又は複数が、以下の表Ａ−３で言及される特徴的な残基から選択される、ナノボディである。
【００６５】
これらのナノボディにおいて、概してＣＤＲ配列は本明細書にさらに規定されるようなものである。
【００６６】
またこのようなナノボディは、任意で好適な方法で任意の好適な供給源から誘導されてもよく、例えば（即ち好適な種のラクダ科動物由来の）天然ＶＨＨ配列、又は合成若しくは半合成のアミノ酸配列であってもよく、これにはこれらに限定されないが、（本明細書に規定の）「ヒト化」ナノボディ、（本明細書に規定の）「ラクダ化」免疫グロブリン配列（特にラクダ化重鎖可変ドメイン配列）、並びに本明細書にさらに記載されるように、親和性成熟（例えば、合成、ランダム又は天然免疫グロブリン配列から開始する）、ＣＤＲグラフト化、ベニヤリング、異なる免疫グロブリン配列由来の断片の結合、重複プライマーを使用したＰＣＲアセンブリ、及び当業者に既知の免疫グロブリン配列を遺伝子操作する同様の技法、又は上記のいずれかの任意の好適な組合せ等の技法によって得られるナノボディが含まれる。また、ナノボディがＶＨＨ配列を含む場合、上記ナノボディは、１つ又は複数の本発明のさらなる（部分又は完全）ヒト化ナノボディを提供するように、本明細書でさらに記載されるように好適にヒト化され得る。同様に、ナノボディが合成又は半合成の配列（例えば部分ヒト化配列）を含む場合、上記ナノボディは、同様に１つ又は複数の本発明のさらなる（部分又は完全）ヒト化ナノボディを提供するように、同様に本明細書で記載されるように任意でさらに好適にヒト化され得る。
【００６７】
特にヒト化ナノボディは、概してこれまでの段落でナノボディに関して規定されたような単一可変ドメインであり得るが、この中に（本明細書に規定の）ヒト化置換である、及び／又はヒト化置換に対応する少なくとも１つのアミノ酸残基が（特にフレームワーク残基の少なくとも１つに）存在する。本明細書中の開示に基づいて、当業者にとって、幾つかの好ましいが非限定的なヒト化置換（及びその好適な組合せ）は明らかになる。付加的に又は代替的に、天然ＶＨＨ配列のフレームワーク領域の配列を、１つ又は複数の密接に関連したヒトＶＨ配列の対応するフレームワーク配列と比較することによって、他の潜在的に有用なヒト化置換を確認することができ、その後このようにして決定した潜在的に有用なヒト化置換（又はその組合せ）の１つ又は複数を上記ＶＨＨ配列に（それ自体が既知の任意の方法で、本明細書にさらに記載のように）導入することができ、得られたヒト化ＶＨＨ配列を、標的に対する親和性、安定性、発現の容易さ及びレベル、及び／又は他の所望の特性に関して試験することができる。このように、或る程度の試行錯誤によって、本明細書中の開示に基づき、当業者は、他の好適なヒト化置換（又はその好適な組合せ）を決定することができる。また上記に基づいて、ナノボディ（のフレームワーク領域）を部分ヒト化又は完全ヒト化してもよい。
【００６８】
幾つかの特に好ましい本発明のヒト化ナノボディは配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディのヒト化変異型である。
【００６９】
したがって本発明の他の好ましいナノボディの幾つかが、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと（本明細書でさらに規定されるように）結合することができ、
ｉ）配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの１つのヒト化変異型であり、及び／又は
ｉｉ）配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つと少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有し（ここでアミノ酸同一性の程度を決定するためにＣＤＲ配列を形成するアミノ酸残基は無視する）、また
ｉ）好ましくはカバットナンバリングによる１１位、３７位、４４位、４５位、４７位、８３位、８４位、１０３位、１０４位及び１０８位のアミノ酸残基の１つ又は複数が、以下の表Ａ−３で言及される特徴的な残基から選択される、ナノボディである。
【００７０】
本発明の別の特定の態様によれば、本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に特に適する多くのアミノ酸残基のストレッチ（即ち低分子ペプチド）を提供する。これらのアミノ酸残基のストレッチは、特に本発明のアミノ酸配列の抗原結合部位の（一部）を形成するように、本発明のアミノ酸配列に存在し得る、及び／又は組み込まれ得る。初めに、これらのアミノ酸残基のストレッチを重鎖抗体のＣＤＲ配列、又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するＶＨＨ配列として生成した（又は本明細書でさらに記載されるように、このようなＣＤＲ配列に基づき得る、及び／又はこれに由来し得る）ので、これらのアミノ酸残基のストレッチは概して、本明細書で「ＣＤＲ配列」（即ちそれぞれＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列及びＣＤＲ３配列）とも称される。しかし、本発明が最も広範な意味で、これらのアミノ酸残基のストレッチによる本発明のアミノ酸配列とＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合が可能である限り、これらのアミノ酸残基のストレッチを本発明のアミノ酸配列中に有し得る特定の構造的役割又は機能に限定されないことに留意すべきである。したがって概して、本発明は最も広範な意味で、全アミノ酸配列が、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる結合ドメイン及び／又は結合単位を形成するように、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができ、本明細書に記載の１つ又は複数のＣＤＲ配列、特に２つ以上のこのようなＣＤＲ配列の好適な組合せを含み、１つ又は複数のさらなるアミノ酸配列を介して互いに好適に連結する、任意のアミノ酸配列を含む。しかし、本発明のアミノ酸配列における１つだけのこのようなＣＤＲ配列の存在は、それ自体で既にＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる本発明のアミノ酸配列を提供するのに十分であり得ることにも留意すべきである。例えばここでもまた、国際公開第０３／０５０５３１号パンフレットに記載される、いわゆる「促進断片（Expedite fragments）」を参照する。
【００７１】
したがって別の具体的ではあるが非限定的な態様において、本発明のアミノ酸配列は、表Ａ−１Ｂにおいて本明細書に記載のＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列及びＣＤＲ３配列から成る群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含むアミノ酸配列であり得る（表Ａ−１Ｂで言及が与えられていなかったとしても、本願全体を通してＣＤＲの配列番号に対しては同じ言及を適用する）。特に、本発明のアミノ酸配列は、少なくとも１つの抗原結合部位（上記抗原結合部位は、本明細書に記載のＣＤＲ１配列、ＣＤＲ２配列及びＣＤＲ３配列（又はこれらの任意の好適な組合せ）から成る群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む）を含むアミノ酸配列であり得る。
【００７２】
概して本発明のこの態様において、本発明のアミノ酸配列は、少なくとも１つのアミノ酸残基のストレッチ（該アミノ酸残基のストレッチは、本明細書に記載のＣＤＲ配列の少なくとも１つの配列に対応するアミノ酸配列を有する）を含む任意のアミノ酸配列であり得る。このようなアミノ酸配列は、免疫グロブリンフォールドを含んでも、又は含んでいなくてもよい。例えば、これに限定されないが、このようなアミノ酸配列は、少なくとも１つのこのようなＣＤＲ配列を含むが、（完全）免疫グロブリンフォールドを形成するのに十分な大きさではない好適な免疫グロブリン配列の断片であり得る（例えば同様に、国際公開第０３／０５０５３１号パンフレットに記載される、「促進断片」を参照する）。代替的に、このようなアミノ酸配列は、このようなＣＤＲ配列に対応する（即ちその抗原結合部位の一部として）少なくとも１つのアミノ酸残基のストレッチを含む、好適な「タンパク質骨格」であり得る。単一可変ドメインを提示するのに好適な骨格が当業者にとって明らかであり、例えばこれらに限定されないが、（即ち本明細書に既に記載の免疫グロブリン配列以外の）免疫グロブリンに基づく若しくはこれに由来する結合骨格、プロテインＡドメイン由来のタンパク質骨格（例えばアフィボディ（Affibodies）（商標））、テンダミスタット、フィブロネクチン、リポカリン、ＣＴＬＡ−４、Ｔ細胞受容体、設計アンキリン反復、アビマー（avimers）及びＰＤＺドメイン（Binz et al., Nat. Biotech2005, Vol 23:1257）、並びにＤＮＡ又はＲＮＡに基づく結合部分（ＤＮＡアプタマー又はＲＮＡアプタマーを含むが、これに限定されない）（Ulrich et al., Comb Chem High Throughput Screen 2006 9（8）: 619-32）が含まれる。
【００７３】
同様に、これらのＣＤＲ配列を１つ又は複数含む、任意の本発明のアミノ酸配列は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと（本明細書に規定のように）特異的に結合することができるようなもの、及びより具体的には本明細書に規定のように（さらに本明細書に記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができるようなものであるのが好ましい。
【００７４】
より具体的には、本発明のこの態様による単一可変ドメインは、抗原結合部位を少なくとも１つ含む任意のアミノ酸配列であって、上記抗原結合部位が、（ｉ）第１のアミノ酸配列が本明細書に記載のＣＤＲ１から選択される場合、第２のアミノ酸配列は本明細書に記載のＣＤＲ２若しくは本明細書に記載のＣＤＲ３から選択される；（ｉｉ）第１のアミノ酸配列が本明細書に記載のＣＤＲ２から選択される場合、第２のアミノ酸配列は本明細書に記載のＣＤＲ１若しくは本明細書に記載のＣＤＲ３から選択される；又は（ｉｉｉ）第１のアミノ酸配列が本明細書に記載のＣＤＲ２から選択される場合、第２のアミノ酸配列は本明細書に記載のＣＤＲ１若しくは本明細書に記載のＣＤＲ３から選択されるように、本明細書に記載のＣＤＲ１、本明細書に記載のＣＤＲ２及び本明細書に記載のＣＤＲ３から成る群から選択される単一可変ドメインを少なくとも２つ含む、任意のアミノ酸配列であり得る。
【００７５】
さらにより具体的には、本発明の単一可変ドメインは、抗原結合部位を少なくとも１つ含む単一可変ドメインであって、上記抗原結合部位が、第１のアミノ酸配列が本明細書に記載のＣＤＲ１から選択され、第２のアミノ酸配列が本明細書に記載のＣＤＲ２から選択され、第３のアミノ酸配列が本明細書に記載のＣＤＲ３から選択されるように、本明細書に記載のＣＤＲ１、本明細書に記載のＣＤＲ２及び本明細書に記載のＣＤＲ３から成る群から選択される単一可変ドメインを少なくとも３つ含む、単一可変ドメインであり得る。ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の好ましい組合せは本明細書のさらなる記載から明らかになる。当業者にとって明らかなように、このようなアミノ酸配列は（本明細書でさらに記載のように）免疫グロブリン配列であるのが好ましいが、例えば上記ＣＤＲ配列を提示するのに好適な骨格を含む任の他のアミノ酸配列でもあり得る。
【００７６】
したがって１つの具体的であるが非限定的な態様において、本発明はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するアミノ酸配列に関し、該アミノ酸配列は以下のものから成る群から選択されるアミノ酸残基のストレッチを１つ又は複数含む：
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメイン；
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメイン；
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメイン；又は
それらの任意の好適な組合せ。
【００７７】
本発明のアミノ酸配列がｂ）及び／又はｃ）による単一可変ドメインを１つ又は複数含有する場合、
ｉ）ｂ）及び／又はｃ）によるこのようなアミノ酸配列において任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応するａ）によるアミノ酸配列と比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）ｂ）及び／又はｃ）によるアミノ酸配列は、対応するａ）によるアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ｂ）及び／又はｃ）によるアミノ酸配列は、それ自体が既知の１つ又は複数の親和性成熟技法を用いる親和性成熟によってａ）によるアミノ酸配列から誘導されるアミノ酸配列であり得る。
【００７８】
同様に、本発明のアミノ酸配列がｅ）及び／又はｆ）による単一可変ドメインを１つ又は複数含有する場合、
ｉ）ｅ）及び／又はｆ）によるこのようなアミノ酸配列において任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応するｄ）によるアミノ酸配列と比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）ｅ）及び／又はｆ）によるアミノ酸配列は、対応するｄ）によるアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ｅ）及び／又はｆ）によるアミノ酸配列は、それ自体が既知の１つ又は複数の親和性成熟技法を用いる親和性成熟によってｄ）によるアミノ酸配列から誘導されるアミノ酸配列であり得る。
【００７９】
また同様に、本発明のアミノ酸配列がｈ）及び／又はｉ）による単一可変ドメインを１つ又は複数含有する場合、
ｉ）ｈ）及び／又はｉ）によるこのようなアミノ酸配列において任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応するｇ）によるアミノ酸配列と比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）ｈ）及び／又はｉ）によるアミノ酸配列は、対応するｇ）によるアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ｈ）及び／又はｉ）によるアミノ酸配列は、それ自体が既知の１つ又は複数の親和性成熟技法を用いる親和性成熟によってｇ）によるアミノ酸配列から誘導されるアミノ酸配列であり得る。
【００８０】
直前の（last preceding）段落は概して、それぞれｂ）、ｃ）、ｅ）、ｆ）、ｈ）又はｉ）による単一可変ドメインを１つ又は複数含む、任意の本発明の単一可変ドメインにも適用されることを理解されたい。
【００８１】
この特定の態様において、アミノ酸配列は以下のものから成る群から選択されるアミノ酸残基のストレッチを１つ又は複数含むのが好ましい：
ｉ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｉｉ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；及び
ｉｉｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；又は
それらの任意の好適な組合せ。
【００８２】
また好ましくは、このようなアミノ酸配列において、少なくとも１つの上記アミノ酸配列のストレッチがＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する抗原結合部位の一部分を形成する。
【００８３】
より具体的ではあるが、同様に非限定的な態様において、本発明は、（ｉ）アミノ酸残基の第１のストレッチがａ）、ｂ）若しくはｃ）による単一可変ドメインの１つに対応する場合、アミノ酸残基の第２のストレッチはｄ）、ｅ）、ｆ）、ｇ）、ｈ）若しくはｉ）による単一可変ドメインの１つに対応し；（ｉｉ）アミノ酸残基の第１のストレッチがｄ)、ｅ）若しくはｆ）による単一可変ドメインの１つに対応する場合、アミノ酸残基の第２のストレッチはａ）、ｂ）、ｃ）、ｇ）、ｈ）若しくはｉ）による単一可変ドメインの１つに対応し；又は（ｉｉｉ）アミノ酸残基の第１のストレッチがｇ)、ｈ）若しくはｉ）による単一可変ドメインの１つに対応する場合、アミノ酸残基の第２のストレッチはａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）若しくはｆ）による単一可変ドメインの１つに対応するように、以下のものから成る群から選択されるアミノ酸残基のストレッチを２つ以上含むＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するアミノ酸配列に関する：
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメイン；
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメイン；
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメイン。
【００８４】
この特定の態様において、アミノ酸配列は、（ｉ）アミノ酸残基の第１のストレッチが配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの１つに対応する場合、アミノ酸残基の第２のストレッチは配列番号１８０〜配列番号１９７若しくは配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの１つに対応し；（ｉｉ）アミノ酸残基の第１のストレッチが配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの１つに対応する場合、アミノ酸残基の第２のストレッチは配列番号１４４〜配列番号１６１若しくは配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの１つに対応し；又は（ｉｉｉ）アミノ酸残基の第１のストレッチが配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの１つに対応する場合、アミノ酸残基の第２のストレッチは配列番号１４４〜配列番号１６１若しくは配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの１つに対応するように、以下のものから成る群から選択されるアミノ酸残基のストレッチを２つ以上含むのが好ましい：
ｉ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｉｉ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；及び
ｉｉｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン。
【００８５】
また同様に好ましくは、このようなアミノ酸配列において、少なくとも２つのアミノ酸配列のストレッチがＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する抗原結合部位の一部分を形成する。
【００８６】
さらにより具体的であるが、非限定的な態様において、本発明は、アミノ酸残基のストレッチを３つ以上含む、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するアミノ酸配列であって、アミノ酸残基の第１のストレッチが、
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；
アミノ酸残基の第２のストレッチが、
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；
アミノ酸残基の第３のストレッチが、
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、アミノ酸配列に関する。
【００８７】
好ましくはこの特定の態様において、アミノ酸残基の第１のストレッチが配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインから成る群から選択され；アミノ酸残基の第２のストレッチが配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインから成る群から選択され；アミノ酸残基の第３のストレッチが配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインから成る群から選択される。
【００８８】
同様に好ましくは、このようなアミノ酸配列において、少なくとも３つのアミノ酸残基のストレッチがＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する抗原結合部位の一部分を形成する。
【００８９】
単一可変ドメインのこのようなストレッチの好ましい組合せは本明細書のさらなる開示から明らかになる。
【００９０】
好ましくはこのような単一可変ドメインにおいて、ＣＤＲ配列が、配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインのうちの少なくとも１つのＣＤＲ配列との少なくとも７０％のアミノ酸同一性、好ましくは少なくとも８０％のアミノ酸同一性、より好ましくは少なくとも９０％のアミノ酸同一性（９５％以上のアミノ酸同一性等）、又はさらに本質的に１００％のアミノ酸同一性を有する。例えば、（本明細書中に記載の方法で）上記アミノ酸配列と、配列番号２５５〜配列番号２６９の配列の１つ又は複数とのアミノ酸同一性の程度を求めることによって、このアミノ酸同一性の程度を決定することができ、ここではフレームワーク領域を形成するアミノ酸残基は無視する。また、このような本発明の単一可変ドメインは、本明細書中でさらに記載するようなものであり得る。
【００９１】
またこの単一可変ドメインは、（本明細書に規定のように）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと特異的に結合することができるようなもの、及びより具体的には本明細書に規定のように（本明細書にさらに記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができるようなものであるのが好ましい。
【００９２】
本発明のアミノ酸配列が、本質的に４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と、３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成る場合、本発明のアミノ酸配列は、ＣＤＲ１が、
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、及び／又は
ＣＤＲ２が、
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、及び／又は
ＣＤＲ３が、
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるようなものであるのが好ましい。
【００９３】
特にこのような本発明のアミノ酸配列は、ＣＤＲ１が配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインから成る群から選択され、及び／又はＣＤＲ２が配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインから成る群から選択され、及び／又はＣＤＲ３が配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインから成る群から選択されるようなものであり得る。
【００９４】
特に本発明のアミノ酸配列が、本質的に４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と、３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成る場合、本発明のアミノ酸配列は、ＣＤＲ１が、
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、かつ
ＣＤＲ２が、
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、かつ
ＣＤＲ３が、
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるようなもの、又はこのようなアミノ酸配列の任意の好適な断片であるのが好ましい。
【００９５】
特にこのような本発明のアミノ酸配列は、ＣＤＲ１が配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインから成る群から選択され、かつＣＤＲ２が配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインから成る群から選択され、かつＣＤＲ３が配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインから成る群から選択されるようなものであり得る。
【００９６】
同様に、ＣＤＲ配列の好ましい組合せは、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【００９７】
またこのような単一可変ドメインは、（本明細書に規定のように）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと特異的に結合することができるようなもの、及びより具体的には本明細書に規定のように（本明細書にさらに記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができるようなものであるのが好ましい。
【００９８】
好ましいが非限定的な一態様において本発明は、本質的に４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と、３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成るアミノ酸配列であって、上記アミノ酸配列のＣＤＲ配列が、配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインのうちの少なくとも１つのＣＤＲ配列との少なくとも７０％のアミノ酸同一性、好ましくは少なくとも８０％のアミノ酸同一性、より好ましくは少なくとも９０％のアミノ酸同一性（９５％以上のアミノ酸同一性等）、又はさらに本質的に１００％のアミノ酸同一性を有する、アミノ酸配列に関する。このアミノ酸同一性の程度は例えば、上記アミノ酸配列と、配列番号２５５〜配列番号２６９の配列の１つ又は複数との間のアミノ酸同一性の程度を（本明細書に記載の方法で）求めることによって決定することができる（フレームワーク領域を形成するアミノ酸残基は無視する）。このような本発明の単一可変ドメインは、本明細書にさらに記載されるようなものであり得る。
【００９９】
本発明のこのようなアミノ酸配列において、フレームワーク配列は任意の好適なフレームワーク配列であり得るが、好適なフレームワーク配列の例は、例えば標準的なハンドブック、並びに本明細書において言及されるさらなる開示及び従来技術に基づき、当業者に明らかとなる。
【０１００】
フレームワーク配列は、免疫グロブリンフレームワーク配列、又は（例えばヒト化又はラクダ化によって）免疫グロブリンフレームワーク配列から誘導されているフレームワーク配列（の好適な組合せ）であるのが好ましい。例えば、フレームワーク配列は、軽鎖可変ドメイン（例えばＶＬ配列）及び／又は重鎖可変ドメイン（例えばＶＨ配列）から誘導されているフレームワーク配列であり得る。特に好ましい一態様では、フレームワーク配列は、ＶＨＨ配列（該フレームワーク配列は任意で、部分又は完全ヒト化し得る）から誘導されているか、又は（本明細書に規定のように）ラクダ化した従来のＶＨ配列であるいずれかのフレームワーク配列である。
【０１０１】
フレームワーク配列は、本発明のアミノ酸配列が、ドメイン抗体（又はドメイン抗体としての使用に好適なアミノ酸配列）、単一ドメイン抗体（又は単一ドメイン抗体としての使用に好適なアミノ酸配列）、「ｄＡｂ」（又はｄＡｂとしての使用に好適なアミノ酸配列）、又はナノボディ（商標）（ＶＨＨ配列を含むが、これに限定されない）であるようなものであるのが好ましい。同様に、好適なフレームワーク配列は、例えば標準的なハンドブック、並びに本明細書に言及されるさらなる開示及び従来技術に基づいて当業者にとって明らかである。
【０１０２】
特に、本発明の単一可変ドメインに存在するフレームワーク配列は、本発明のアミノ酸配列がナノボディ（商標）であるように、（本明細書に規定の）特徴的な残基を１つ又は複数含有し得る。このようなフレームワーク配列（の好適な組合せ）の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる開示から明らかになる。
【０１０３】
同様に概して、本発明の単一可変ドメインに関して本明細書に記載のように、上記のいずれかの好適な断片（又は断片の組合せ）（例えば１つ又は複数のフレームワーク配列に好適に隣接した、及び／又はこれを介して連結した、１つ又は複数のＣＤＲ配列を含有する断片）を使用することも可能である（例えば、これらのＣＤＲ配列及びフレームワーク配列が、断片が誘導された完全長の免疫グロブリン配列で発生し得るのと同じ配列で）。またこのような断片は、免疫グロブリンフォールドを含むか、若しくは形成することができるようなもの、又は代替的に免疫グロブリンフォールドを含まないか、若しくは形成することができないようなものであってもよい。
【０１０４】
特定の一態様において、このような断片は、本明細書に記載の単一ＣＤＲ配列（特にＣＤＲ３配列）を含み、フレームワーク配列（の一部）（特に断片が誘導される免疫グロブリン配列において該ＣＤＲ配列に隣接するフレームワーク配列（複数可）の一部）が両側に位置する。例えば、ＣＤＲ３配列は、ＦＲ３配列（の一部）の後にあり、ＦＲ４配列（の一部）の前にあり得る）。このような断片はまた、ジスルフィド架橋、特にそれぞれＣＤＲ配列の前後にある２つのフレームワーク領域と連結するジスルフィド架橋を含有してもよい（このようなジスルフィド架橋を形成するために、上記フレームワーク領域で自然発生するシステイン残基を使用するか、又は代替的にシステイン残基を上記フレームワーク領域に合成的に付加若しくは導入してもよい）。これらの「促進断片」のさらなる説明に関しては、同様に国際公開第０３／０５０５３１号パンフレット、及び２００６年１２月５日に出願されたAblynx N. V.の"Peptides capable of binding to serum proteins"と題するAblynx N. V.の米国仮特許出願（発明者：Revets, Hilde Adi Pierrette; Kolkman, Joost Alexander;及びHoogenboom, Hendricus Renerus Jacobus Mattheus）（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６３３４８号明細書も参照されたい）を参照する。
【０１０５】
別の態様において本発明は、化合物又は構築物、特にタンパク質又はポリペプチド（それぞれ本明細書で「本発明の化合物」又は「本発明のポリペプチド」とも称される）であって、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメイン（又はその好適な断片）を含むか、又は本質的にこれから成り、任意で１つ又は複数の他の基、残基、部分又は結合単位をさらに含む、化合物又は構築物、特にタンパク質又はポリペプチドに関する。本明細書中のさらなる開示から当業者にとって明らかになるように、このようなさらなる基、残基、部分、結合単位又は単一可変ドメインは、本発明のアミノ酸配列（及び／又はこれが存在する化合物又は構築物）に対しさらなる機能性を与えても、又は与えなくてもよく、本発明のアミノ酸配列の特性を変えても、又は変えなくてもよい。
【０１０６】
例えば、このようなさらなる基、残基、部分又は結合単位は、化合物又は構築物が（融合）タンパク質又は（融合）ポリペプチドになるように、１つ又は複数のさらなるアミノ酸配列であり得る。好ましいが非限定的な態様において、上記１つ又は複数の他の基、残基、部分又は結合単位は免疫グロブリン配列である。さらにより好ましくは、上記１つ又は複数の他の基、残基、部分又は結合単位は、ドメイン抗体、ドメイン抗体としての使用に好適な単一可変ドメイン、単一ドメイン抗体、単一ドメイン抗体としての使用に好適な単一可変ドメイン、「ｄＡｂ」、ｄＡｂとしての使用に好適な単一可変ドメイン、又はナノボディから成る群から選択される。
【０１０７】
代替的に、このような基、残基、部分又は結合単位は例えば、化学的な基、残基、部分（それ自体が生物学的に及び／又は薬理学的に活性であっても、又は活性でなくてもよい）であり得る。例えば、これに限定されないが、このような基は、本明細書にさらに記載されるように、本発明のアミノ酸配列又はポリペプチドの「誘導体」を提供するように、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインと連結し得る。
【０１０８】
本明細書に記載の１つ又は複数の誘導体を含むか、又は本質的にこれから成り、任意で１つ又は複数のリンカーを介して連結した、１つ又は複数の他の基、残基、部分又は結合単位を任意でさらに含む、化合物又は構築物も本発明の範囲内である。好ましくは、上記１つ又は複数の他の基、残基、部分又は結合単位はアミノ酸配列である。
【０１０９】
上記の化合物又は構築物において、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメイン、及び１つ又は複数の基、残基、部分又は結合単位は、互いに直接、及び／又は１つ又は複数の好適なリンカー又はスペーサを介して連結してもよい。例えば、１つ又は複数の基、残基、部分又は結合単位がアミノ酸配列である場合、リンカーは、得られる化合物又は構築物が融合（タンパク質）又は融合（ポリペプチド）になるようにアミノ酸配列であってもよい。
【０１１０】
上記及び本明細書中のさらなる記載から明らかであるように、このことは、本発明の単一可変ドメインが、一分子内に１つ又は複数の所望の特性又は生物学的機能を組み合わせた本明細書に記載の化合物又は構築物（例えばこれらに限定されないが、本明細書に記載の二重パラトピック、二価／多価、及び二重特異性／多重特異性の本発明の単一可変ドメイン）を形成するために、本発明の単一可変ドメインを形成するための、即ちこれらを他の基、残基、部分又は結合単位と組み合わせることによる「構成要素」として使用することができることを意味する。
【０１１１】
概して本発明の化合物又は単一可変ドメインは、本発明の化合物又はポリペプチドを提供するように、任意で１つ又は複数の好適なリンカーを介して、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインと、１つ又は複数のさらなる基、残基、部分又は結合単位とを好適に連結する工程を少なくとも１つ含む方法で調製することができる。本発明の単一可変ドメインは、概して少なくとも本発明のポリペプチドをコードする核酸を準備する工程と、好適な方法で上記核酸を発現する工程と、発現した本発明のポリペプチドを回収する工程とを含む方法で調製することもできる。このような方法は、例えば本明細書にさらに記載の方法及び技法に基づいて、当業者にとって明らかな、それ自体が既知の方法で行うことができる。
【０１１２】
本発明のアミノ酸配列から開始して本発明の化合物又はポリペプチドを設計／選択、及び／又は調製する方法は、本明細書では上記本発明のアミノ酸配列を「フォーマットする（formatting）」とも称され、本発明の化合物又はポリペプチドの一部を構成する本発明のアミノ酸は、「フォーマットされた（formatted）」、又は上記本発明の化合物又はポリペプチド「のフォーマット形態（in the format of）」であるといわれる。本発明のアミノ酸配列をフォーマットすることができる方法の例及びこのようなフォーマットの例が、本明細書中の開示に基づいて当業者にとって明らかであり、このようなフォーマットされた単一可変ドメインは、本発明のさらなる態様を形成する。
【０１１３】
本発明の特定の一態様において、本発明の化合物、又は本発明のポリペプチドは、対応する本発明のアミノ酸配列に比べて増大した半減期を有し得る。このような化合物及び単一可変ドメインの幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる開示に基づいて当業者にとって明らかとなり、例えば半減期が増大するように（例えばペグ化によって）化学修飾された本発明の単一可変ドメイン又は単一可変ドメイン；血清タンパク質（例えば血清アルブミン）と結合するための少なくとも１つのさらなる結合部位を含む本発明の単一可変ドメイン；又は本発明のアミノ酸配列の半減期を増大させる少なくとも１つの部分（特に少なくとも１つのアミノ酸配列）と連結する少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列を含む本発明の単一可変ドメインが含まれる。このような半減期が延長した部分又は単一可変ドメインを含む本発明の単一可変ドメインの例は、本明細書中のさらなる開示に基づいて当業者にとって明らかとなり、例えばこれらに限定されないが、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインが、１つ又は複数の血清タンパク質若しくはその断片（例えば（ヒト）血清アルブミン又はその好適な断片）、又は血清タンパク質と結合することができる１つ又は複数の結合単位と好適に連結する単一可変ドメイン（例えばドメイン抗体、ドメイン抗体としての使用に好適な単一可変ドメイン、単一ドメイン抗体、単一ドメイン抗体としての使用に好適な単一可変ドメイン、「ｄＡｂ」、ｄＡｂとしての使用に好適な単一可変ドメイン、又は血清アルブミン（例えばヒト血清アルブミン）、血清免疫グロブリン（例えばＩｇＧ）等の血清タンパク質又はトランスフェリンと結合することができるナノボディ、さらなる記載及び本明細書で言及される参考文献を参照する）；本発明のアミノ酸配列がＦｃ部分（例えばヒトＦｃ）又はその好適な部分若しくは断片と連結する単一可変ドメイン；又は１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインが、血清タンパク質と結合することができる１つ又は複数の低分子タンパク質又はペプチドと好適に連結する単一可変ドメインが含まれる（例えば、これに限定されないが、国際公開第９１／０１７４３号パンフレット、国際公開第０１／４５７４６号パンフレット、国際公開第０２／０７６４８９号パンフレット、及び２００６年１２月５日に出願されたAblynx N. V.の"Peptides capable of binding to serum proteins"と題するAblynx N. V.の米国仮特許出願（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６３３４８号明細書も参照されたい）に記載のタンパク質及びペプチド）。
【０１１４】
概して、半減期が増大した、本発明の化合物又は単一可変ドメインは、対応する本発明のアミノ酸配列自体の半減期よりも少なくとも１．５倍、好ましくは少なくとも２倍（少なくとも５倍等）、例えば少なくとも１０倍、又は２０倍を超えて大きい半減期を有するのが好ましい。例えば、半減期が増大した、本発明の化合物又は単一可変ドメインは、対応する本発明のアミノ酸配列自体に比べて、１時間を超えて、好ましくは２時間を超えて、より好ましくは６時間を超えて（１２時間等を超えて）、又はさらに２４時間、４８時間若しくは７２時間を超えて増大した半減期を有し得る。
【０１１５】
本発明の好ましいが非限定的な態様において、このような本発明の化合物又は単一可変ドメインは、対応する本発明のアミノ酸配列自体に比べて、１時間を超えて、好ましくは２時間を超えて、より好ましくは６時間を超えて（１２時間等を超えて）、又はさらに２４時間、４８時間若しくは７２時間を超えて増大した血清半減期を有する。
【０１１６】
本発明の好ましいが非限定的な別の態様において、このような本発明の化合物又は単一可変ドメインは、少なくとも約１２時間、好ましくは少なくとも２４時間、より好ましくは少なくとも４８時間、さらにより好ましくは少なくとも７２時間以上のヒトにおける血清半減期を示す。例えば本発明の化合物又は単一可変ドメインは、少なくとも５日（約５日〜１０日等）、好ましくは少なくとも９日（約９日〜１４日等）、より好ましくは少なくとも約１０日（約１０日〜１５日等）、若しくは少なくとも約１１日（約１１日〜１６日等）、より好ましくは少なくとも約１２日（約１２日〜１８日以上等）、又は１４日超（約１４日〜１９日等）の半減期を有し得る。
【０１１７】
別の態様において、本発明は、本発明のアミノ酸配列又は本発明のポリペプチド（又はその好適な断片）をコードする核酸に関する。このような核酸は、本明細書中で「本発明の核酸」とも称され、例えば本明細書中でさらに記載されるように遺伝子構築物の形態であり得る。
【０１１８】
別の態様において、本発明は、本発明のアミノ酸配列及び／又は本発明のポリペプチドを発現する（又は好適な状況下で発現することができる）；及び／又は本発明の核酸を含有する、宿主又は宿主細胞に関する。このような宿主又は宿主細胞の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０１１９】
本発明は、産物又は組成物であって、少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列と、少なくとも１つの本発明のポリペプチド（又はその好適な断片）及び／又は少なくとも１つの本発明の核酸と、任意で（即ち組成物の使用目的に応じて）それ自体が既知のこのような組成物の１つ又は複数のさらなる成分とを含有するか又は含む産物又は組成物にさらに関する。このような産物又は組成物は例えば、（本明細書に記載の）薬学的組成物、獣医学的組成物又は（同様に本明細書に記載の）診断用途のための産物若しくは組成物であり得る。このような産物又は構築物の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０１２０】
本発明は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ（例えばｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ又は細胞アッセイ）又はｉｎ  ｖｉｖｏ（例えば単細胞又は多細胞生物、具体的には哺乳動物、より具体的にはヒト、例えば癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の危険性があるか、又はこれを患うヒト）のいずれかでのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの調節（のための方法又は組成物）における本発明のアミノ酸配列、ナノボディ若しくはポリペプチド、又はこれを含む組成物の使用にも関する。
【０１２１】
本発明は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ（例えばｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ又は細胞アッセイ）又はｉｎ  ｖｉｖｏ（例えば単細胞又は多細胞生物、具体的には哺乳動物、より具体的にはヒト、例えば癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の危険性があるか、又はこれを患うヒト）のいずれかでＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーを調節する方法であって、少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列、ナノボディ若しくはポリペプチド、又はこれを含む組成物を用いてＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーを調節するのに適した方法及び量で、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーを、少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列、ナノボディ若しくはポリペプチドに接触させる工程を少なくとも含む、方法にも関する。
【０１２２】
本発明は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ（例えばｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ又は細胞アッセイ）又はｉｎ  ｖｉｖｏ（例えば単細胞又は多細胞生物、具体的には哺乳動物、より具体的にはヒト、例えば癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の危険性があるか、又はこれを患うヒト）のいずれかでＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーを調節するための組成物（例えば、これらに限定されないが、本明細書中でさらに記載されるような医薬組成物又は医薬調製物）の調製における本発明の１つのアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドの使用にも関する。
【０１２３】
本発明に関して、「調節（"modulating" or "to modulate"）」は一般的に、好適なｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ、細胞アッセイ又はｉｎ  ｖｉｖｏアッセイ（本明細書で言及されるもの等）を使用して測定するようなＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの活性の低減若しくは阻害のいずれか、又は代替的に活性の増大を意味する。特に「調節」は、好適なｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ、細胞アッセイ、又はｉｎ  ｖｉｖｏアッセイ（本明細書で言及されるもの等）を用いて測定するような、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドが存在しない以外は同じ条件下での同じアッセイにおけるＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの活性に比べて、少なくとも１％、好ましくは少なくとも５％、例えば少なくとも１０％若しくは少なくとも２５％、例えば少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、又は９０％以上Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの活性を低減又は阻害すること、又は代替的に活性を増大させることを意味し得る。
【０１２４】
当業者にとって明らかなように、「調節」は、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドが存在しない以外は同じ条件下に比べて、その標的、リガンド又は基質の１つ又は複数に対するＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの親和性、結合活性、特異性及び／又は選択性を変化させること（増大又は減少のいずれであってもよい）；及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが存在する媒体又は環境における１つ又は複数の条件（ｐＨ、イオン強度、補因子の存在等）に対するＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの感受性を変化させること（増大又は減少のいずれであってもよい）も伴い得る。当業者にとって明らかなように、それ自体が既知の任意の好適な方法で及び／又は任意の好適なアッセイ、例えば本明細書に記載のアッセイ、又は本明細書で言及された従来技術に記載のアッセイを用いて同様にこれを求めてもよい。
【０１２５】
「調節」は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する（又はその基質（複数可）、リガンド（複数可）若しくは経路（複数可）が関与する、シグナル伝達経路若しくは代謝経路及び関連の生物学的作用若しくは生理学的作用のような）１つ又は複数の生物学的な若しくは生理学的な機構、作用、反応、機能、経路又は活性に関して変化させる（即ちそれぞれ、アゴニスト又はアンタゴニストとしての活性を与える）ことも意味し得る。同様に、当業者にとって明らかなように、任意の好適な方法で、及び／又はそれ自体が既知の任意の好適な（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び通常は細胞又はアッセイ内）アッセイ、例えば本明細書若しくは本明細書で言及された従来技術に記載のアッセイを用いて、アゴニスト又はアンタゴニストとしてのこのような作用を求めてもよい。特に、アゴニスト又はアンタゴニストとしての作用は、対象の生物学的活性又は生理学的活性をそれぞれ、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドが存在しない以外は同じ条件下での同じアッセイにおける生物学的活性又は生理学的活性に比べて少なくとも１％、好ましくは少なくとも５％、例えば少なくとも１０％若しくは少なくとも２５％、例えば少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、又は９０％以上増大又は低減させるようなものであり得る。
【０１２６】
調節は例えば、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとその基質又はリガンドの１つとの結合の低減又は阻害及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に対する基質である天然リガンドとの競合も伴い得る。調節は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれが関与する機構若しくは経路を活性化することも伴い得る。調節は、可逆であっても又は不可逆であってもよいが、薬学的及び薬理学的目的では通常、可逆的である。
【０１２７】
本発明はさらに、本明細書中に記載のアミノ酸配列、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、産物及び構築物を調製又は生成する方法に関する。このような方法の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０１２８】
概してこれらの方法は、
ａ）アミノ酸配列のセット、コレクション又はライブラリを準備する工程と、
ｂ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有する単一可変ドメインに関して、単一可変ドメインの上記のセット、コレクション又はライブラリをスクリーニングする工程と、
ｃ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有するアミノ酸配列（複数可）を単離する工程とを含み得る。
【０１２９】
このような方法では、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、任意の好適なアミノ酸配列のセット、コレクション又はライブラリであり得る。例えば、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、（本明細書に記載の）免疫グロブリン配列のセット、コレクション又はライブラリ（例えば免疫グロブリン配列のナイーブセット、ナイーブコレクション又はナイーブライブラリ；免疫グロブリン配列の合成又は半合成のセット、コレクション又はライブラリ；及び／又は親和性成熟を受けている免疫グロブリン配列のセット、コレクション又はライブラリ）であり得る。
【０１３０】
またこのような方法では、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、重鎖可変ドメイン（例えばＶＨドメイン又はＶＨＨドメイン）又は軽鎖可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリであり得る。例えば、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、ドメイン抗体若しくは単一ドメイン抗体のセット、コレクション若しくはライブラリであり得るか、又はドメイン抗体若しくは単一ドメイン抗体として機能することができる単一可変ドメインのセット、コレクション若しくはライブラリであり得る。
【０１３１】
この方法の好ましい態様では、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、例えばＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれに基づく若しくはこれに由来する好適な抗原決定基（例えばその抗原の部分、断片、領域、ドメイン、ループ又は他のエピトープ）を好適に免疫付与した哺乳動物由来の免疫グロブリン配列の免疫セット、免疫コレクション又は免疫ライブラリであり得る。特定の一態様では、上記抗原決定基は、細胞外の部分、領域、ドメイン、ループ又は他の細胞外エピトープ（複数可）であり得る。
【０１３２】
上記の方法において、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、スクリーニングを容易にするように、ファージ、ファージミド、リボソーム又は好適な微生物（例えば酵母）上に提示してもよい。単一可変ドメイン（のセット、コレクション又はライブラリ）を提示及びスクリーニングするのに好適な方法、技法及び宿主生物は、例えば本明細書中のさらなる開示に基づいて当業者にとって明らかである。Nature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116（2005）におけるHoogenboomによる総説も参照する。
【０１３３】
別の態様において、単一可変ドメインを生成する方法は、少なくとも
ａ）アミノ酸配列を発現する細胞のコレクション又は試料を準備する工程と、
ｂ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有するアミノ酸配列を発現する細胞に関して上記細胞のコレクション又は試料をスクリーニングする工程と、
ｃ）（ｉ）上記アミノ酸配列を単離する工程、又は（ｉｉ）上記アミノ酸配列をコードする核酸配列を上記細胞から単離し、その後上記アミノ酸配列を発現する、単離する工程のいずれかとを含む。
【０１３４】
例えば、所望のアミノ酸配列が免疫グロブリン配列である場合、細胞のコレクション又は試料は例えば、Ｂ細胞のコレクション又は試料であり得る。また、この方法では、細胞の試料は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれに基づく若しくはこれに由来する好適な抗原決定基（例えばその抗原の部分、断片、領域、ドメイン、ループ又は他のエピトープ）を好適に免疫付与した哺乳動物に由来し得る。特定の一態様では、上記抗原決定基は、細胞外の部分、領域、ドメイン、ループ又は他の細胞外エピトープ（複数可）であり得る。
【０１３５】
上記の方法は、当業者にとって明らかなように、任意の好適な方法で行われ得る。例えば欧州特許第０５４２８１０号明細書、国際公開第０５／１９８２４号パンフレット、国際公開第０４／０５１２６８号パンフレット及び国際公開第０４／１０６３７７号パンフレットを参照する。工程ｂ）のスクリーニングは、ＦＡＣＳ等のフローサイトメトリ技法を使用して行うのが好ましい。これに関しては、例えばLieby et al., Blood, Vol. 97, No. 12, 3820 （2001）を参照する。
【０１３６】
別の態様において、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するアミノ酸配列を生成する方法は、少なくとも
ａ）アミノ酸配列をコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリを準備する工程と、
ｂ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列に関して、上記の核酸配列のセット、コレクション又はライブラリをスクリーニングする工程と、
ｃ）上記核酸配列を単離した後、上記アミノ酸配列を発現する工程とを含み得る。
【０１３７】
このような方法では、単一可変ドメインをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリは例えば、免疫グロブリン配列のナイーブセット、ナイーブコレクション又はナイーブライブラリをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリ；免疫グロブリン配列の合成又は半合成のセット、コレクション又はライブラリをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリ；及び／又は親和性成熟を受けている免疫グロブリン配列のセット、コレクション又はライブラリをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリであり得る。
【０１３８】
またこのような方法では、核酸配列のセット、コレクション又はライブラリは、重鎖可変ドメイン（例えばＶＨドメイン又はＶＨＨドメイン）又は軽鎖可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリをコードし得る。例えば、核酸配列のセット、コレクション又はライブラリは、ドメイン抗体若しくは単一ドメイン抗体のセット、コレクション若しくはライブラリ、又はドメイン抗体若しくは単一ドメイン抗体として機能することができる単一可変ドメインのセット、コレクション若しくはライブラリをコードし得る。
【０１３９】
この方法の好ましい態様では、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、例えばＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれに基づく若しくはこれに由来する好適な抗原決定基（例えばその抗原の部分、断片、領域、ドメイン、ループ又は他のエピトープ）を好適に免疫付与した哺乳動物由来の核酸配列の免疫セット、免疫コレクション又は免疫ライブラリであり得る。特定の一態様では、上記抗原決定基は、細胞外の部分、領域、ドメイン、ループ又は他の細胞外エピトープ（複数可）であり得る。
【０１４０】
核酸配列のセット、コレクション又はライブラリは例えば、重鎖可変ドメイン又は軽鎖可変ドメインの免疫セット、免疫コレクション又は免疫ライブラリをコードし得る。特定の一態様では、ヌクレオチド配列のセット、コレクション又はライブラリは、配列番号２５５〜配列番号２６９のセット、コレクション又はライブラリをコードし得る。
【０１４１】
上記の方法において、ヌクレオチド配列のセット、コレクション又はライブラリは、スクリーニングを容易にするように、ファージ、ファージミド、リボソーム又は好適な微生物（例えば酵母）上に提示してもよい。単一可変ドメインをコードするヌクレオチド配列（のセット、コレクション又はライブラリ）を提示及びスクリーニングするのに好適な方法、技法及び宿主生物は、例えば本明細書中のさらなる開示に基づいて当業者にとって明らかである。Nature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116（2005）におけるHoogenboomによる総説も参照する。
【０１４２】
本発明は、上記の方法、又は代替的に上記の方法のうちの１つと、さらに少なくとも上記免疫グロブリン配列のヌクレオチド配列又はアミノ酸配列を決定する工程と、それ自体が既知の方法で、例えば好適な宿主細胞若しくは宿主生物における発現又は化学合成により上記アミノ酸配列を発現又は合成する工程とを含む方法により得られる単一可変ドメインにも関する。
【０１４３】
また上記の工程の後に、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインを好適にヒト化（又は代替的にラクダ化）してもよく、及び／又はこのようにして得られたアミノ酸配列（複数可）を、本発明のポリペプチドを提供するように（任意で１つ又は複数の好適なリンカーを介して）互いに又は１つ若しくは複数の他の好適な単一可変ドメインと連結してもよい。また、本発明のアミノ酸配列をコードする核酸配列を、好適にヒト化（又は代替的にはラクダ化）し、かつ好適に発現してもよく、及び／又は１つ又は複数の、本発明のアミノ酸配列をコードする核酸配列を（任意で１つ又は複数の好適なリンカーをコードするヌクレオチド配列を介して）互いに又は１つ若しくは複数の、他の好適な単一可変ドメインをコードする核酸配列と連結してもよく、その後でこのようにして得られたヌクレオチド配列を本発明のポリペプチドを提供するように好適に発現してもよい。
【０１４４】
本発明はさらに、本明細書中に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、生成物及び組成物の用途及び使用、並びにＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに関連する疾患及び障害を予防及び／又は治療する方法に関する。幾つかの好ましいが非限定的な用途及び使用は、本明細書中のさらなる記載より明らかになる。
【０１４５】
本発明は、治療法に使用される、本明細書に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、生成物及び組成物にも関する。
【０１４６】
具体的には本発明は、本明細書に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物又はポリペプチドを（薬学的に有効な量）それを必要とする被験体に投与することにより予防又は治療することができる疾患又は障害の治療に使用される、本明細書に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、生成物及び組成物にも関する。
【０１４７】
より具体的には本発明は、癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患の治療に使用される、本明細書に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、生成物及び組成物に関する。
【０１４８】
また本発明の他の態様、実施形態、利点及び用途は、本明細書中のさらなる記載から明らかになり、その中で本発明は、これを含む本発明のナノボディ及びこれを含む本発明の単一可変ドメイン（これらは本発明の好ましい態様の幾つかを形成する）に関してより詳細に説明及び考察する。
【０１４９】
本明細書中のさらなる記載から明らかになるように、一般的にナノボディは、「ｄＡｂ」又は同様の（単一）ドメイン抗体又は免疫グロブリン配列に比べて（本明細書で概説される）或る特定の利点があり、この利点は本発明のナノボディでも与えられる。しかし、以下の教示のより一般的な態様を、（直接又は同じように）他の本発明の単一可変ドメインに適用することもできることは、当業者にとって明らかである。
【図面の簡単な説明】
【０１５０】
【図１】図１の結果は濃度依存的に表Ｂ−１のほとんどのナノボディがヒトＮｏｔｃｈ−１と結合することができたことを示す。
【図２】Ｊａｇｇｅｄ−１に対して選択されたナノボディの結合アッセイを示す。全てのナノボディが濃度依存的に結合することができた。無関係の（irrelevant）ナノボディはＪａｇｇｅｄ−１と結合することができない。
【図３】Ｊａｇｇｅｄ−１に対して選択されたナノボディの競合アッセイを示す。ナノボディ１７８Ｃ４は濃度依存的にＮｏｔｃｈ−１とのＪａｇｇｅｄ−１の結合に対して競合することができる。無関係のナノボディはＮｏｔｃｈ−１とのＪａｇｇｅｄ−１の結合に対して競合することはできない。非ビオチン化Ｊａｇｇｅｄ−１もＮｏｔｃｈ−１とのビオチン化Ｊａｇｇｅｄ−１（biot-Jagged-1）の結合に対して競合することができる。
【図４】ＤＬＬ４に対して選択されたナノボディの結合アッセイを示す。全てのナノボディが濃度依存的に結合することができる。無関係のナノボディはＤＬＬ４と結合することができない。
【図５】ＤＬＬ４に対して選択されたナノボディの競合アッセイを示す。幾つかのナノボディは濃度依存的にＮｏｔｃｈ−１とのＤＬＬ４の結合に対して競合することができる。無関係のナノボディはＮｏｔｃｈ−１とのＤＬＬ４の結合に対して競合することはできない。
【図６ａ】ＣＤ３６−Ｆｃとの結合アッセイを示す。
【図６ｂ】ヒトＮｏｔｃｈ−２との結合アッセイを示す。
【図６ｃ】ヒトＮｏｔｃｈ−１との結合アッセイを示す。
【図６ｄ】ヒトＮｏｔｃｈ−３との結合アッセイを示す。
【発明を実施するための形態】
【０１５１】
発明の詳細な説明
本明細書、実施例及び特許請求の範囲において：
ａ）特に他に指示又は規定がなければ、使用される全ての用語は、当業者にとって明らかな、当該技術分野における通常の意味を有する。例えば標準的なハンドブック（例えばSambrook et al, "Molecular Cloning: A Laboratory Manual"（2nd.Ed.）, Vols. 1-3, Cold Spring HarborLaboratory Press（1989）、F.Ausubel et al, eds., "Current protocols in molecular biology", GreenPublishing and Wiley Interscience, New York（1987）、Lewin, "Genes II", John Wiley & Sons, New York, N.Y.,（1985）、Old et al., "Principles of GeneManipulation: An Introduction to Genetic Engineering", 2nd edition,University of California Press, Berkeley, CA（1981）、Roitt et al., "Immunology"（6th.Ed.）, Mosby/Elsevier, Edinburgh（2001）、Roitt et al., Roitt's EssentialImmunology, 10th Ed. Blackwell Publishing, UK（2001）、及びJaneway et al.,"Immunobiology"（6th Ed.）, Garland Science Publishing/Churchill Livingstone, New York（2005））、並びに本明細書で言及される一般的な背景技術を参照する。
【０１５２】
ｂ）特に他に指示がなければ、「免疫グロブリン配列」という用語は、本明細書で重鎖抗体に言及するのに使用されるのか又は従来の四本鎖抗体に言及するのに使用されるかに関係なく、全長抗体、その個々の鎖、及びその全ての部分、ドメイン又は断片（これらに限定されないが、それぞれＶＨＨドメイン又はＶＨ／ＶＬドメイン等の抗原結合ドメイン又は断片を含む）の両方を含む一般的な用語として使用される。さらに（例えば「免疫グロブリン配列」、「抗体配列」、「可変ドメイン配列」、「ＶＨＨ配列」又は「タンパク質配列」等の用語で）本明細書で使用される「配列」という用語は一般的に、文脈上さらなる限定的な解釈が要求される場合を除き、関連のアミノ酸配列と、これをコードする核酸配列又はヌクレオチド配列との両方を含むと理解されるべきである。また本明細書で使用される「ヌクレオチド配列」という用語は上記ヌクレオチド配列を有する核酸分子も包含し、そのため「ヌクレオチド配列」及び「核酸」という用語は本明細書中で同等であるとみなされ、区別なく使用される。
【０１５３】
ｃ）特に他に指示がなければ、具体的に詳しく説明されていない全ての方法、工程、技法及び操作を実施することができ、当業者にとって明らかなそれ自体が既知の方法で実施する。同様に例えば、標準的なハンドブック及び本明細書で言及される一般的な背景技術、並びに本明細書で言及されるさらなる参考文献並びに例えば以下の総説、Presta, Adv. Drug Deliv. Rev. 2006, 58 （5-6）: 640-56、Levin and Weiss, Mol. Biosyst.2006, 2（1）: 49-57、Irving et al., J.Immunol. Methods, 2001, 248（1-2）, 31-45、Schmitzet al., Placenta, 2000, 21 Suppl. A, S106-12、Gonzaleset al., Tumour Biol., 2005, 26（1）, 31-43（これらは、親和性成熟等のタンパク質工学技法及び免疫グロブリン等のタンパク質の特異性及び他の所望の特性を改善する他の技法を記載している）を参照する。
【０１５４】
ｄ）アミノ酸残基は、表Ａ−２に言及されるように標準的な３文字アミノ酸コード又は１文字アミノ酸コードに従って示す。
【０１５５】
表Ａ−２：１文字アミノ酸コード及び３文字アミノ酸コード
【表１】
2011516520.tif 000002
【０１５６】
ｅ）２つ以上のヌクレオチド配列を比較するために、［第２のヌクレオチド配列における対応する位置のヌクレオチドと同一な第１のヌクレオチド配列におけるヌクレオチドの数］を［第１のヌクレオチド配列におけるヌクレオチド総数］で除算し、［１００％］で乗算することによって、第１のヌクレオチド配列と第２のヌクレオチド配列との間の「配列同一性」のパーセントを算出することができ、第１のヌクレオチド配列に比べて、第２のヌクレオチド配列におけるヌクレオチドの欠失、挿入、置換又は付加のそれぞれは、単一ヌクレオチド（位置）での差異と考えられる。
【０１５７】
代替的に、標準的な設定を用いて、ＮＣＢＩ  Ｂｌａｓｔ  ｖ２．０等の配列アラインメント用の既知のコンピュータアルゴリズムを使用して、２つ以上のヌクレオチド配列間の配列同一性の程度を算出することができる。
【０１５８】
配列同一性の程度を決定するための幾つかの他の技法、コンピュータアルゴリズム及び設定は例えば、国際公開第０４／０３７９９９号パンフレット、欧州特許第０９６７２８４号明細書、欧州特許第１０８５０８９号明細書、国際公開第００／５５３１８号パンフレット、国際公開第００／７８９７２号パンフレット、国際公開第９８／４９１８５号パンフレット及び英国特許出願公開第２３５７７６８号明細書に記載されている。
【０１５９】
通常、上述で概説された算出方法に従って、２つのヌクレオチド配列間の「配列同一性」のパーセントを決定するために、最も多くのヌクレオチドを有するヌクレオチド配列を「第１の」ヌクレオチド配列とし、他のヌクレオチド配列を「第２の」ヌクレオチド配列とする。
【０１６０】
ｆ）２つ以上のアミノ酸配列を比較するために、［第２のアミノ酸配列における対応する位置のアミノ酸残基と同一な第１のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基の数］を［第１のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基総数］で除算し、［１００％］で乗算することによって、第１のアミノ酸配列と第２のアミノ酸配列との間の「配列同一性」（本明細書で「アミノ酸同一性」と称される）のパーセントを算出することができ、第１のアミノ酸配列に比べて、第２のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基の欠失、挿入、置換又は付加のそれぞれは、単一アミノ酸残基（位置）での差異、即ち本明細書に規定の「アミノ酸差異」と考えられる。
【０１６１】
代替的に、同様に標準的な設定を用いて、既知のコンピュータアルゴリズム（例えばヌクレオチド配列に関する配列同一性の程度を決定するのに上記で言及されるもの）を使用して、２つの単一可変ドメイン間の配列同一性の程度を算出することができる。
【０１６２】
通常、上述で概説された算出方法に従って、２つの単一可変ドメイン間の「配列同一性」のパーセントを決定するために、最も多くのアミノ酸残基を有するアミノ酸配列を「第１の」アミノ酸配列とし、他のアミノ酸配列を「第２の」アミノ酸配列とする。
【０１６３】
また、２つのアミノ酸配列間の配列同一性の程度を決定する際、当業者は、いわゆる「保存的な」アミノ酸置換を考慮してもよく、これは一般的に、アミノ酸残基が同様の化学構造を有する別のアミノ酸残基に置き換わり、かつポリペプチドの機能、活性又は他の生物学的特性への影響がほとんど、又は本質的に全くないアミノ酸置換と説明することができる。このような保存的なアミノ酸置換は、例えば国際公開第０４／０３７９９９号パンフレット、英国特許出願公開第３３５７７６８号明細書、国際公開第９８／４９１８５号パンフレット、国際公開第００／４６３８３号パンフレット及び国際公開第０１／０９３００号パンフレットから当該技術分野において既知であり、このような置換の（好ましい）種類及び／又は組合せは、国際公開第０４／０３７９９９号パンフレット及び国際公開第９８／４９１８５号パンフレット、並びに本明細書で言及されるさらなる参考文献の関連の教示に基づいて選択することができる。
【０１６４】
このような保存的な置換は、好ましくは以下の（ａ）群〜（ｅ）群内の或るアミノ酸が、同じ群内の別のアミノ酸残基に置換される置換である：（ａ）低分子脂肪族で非極性又はわずかに極性の残基：Ａｌａ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｐｒｏ及びＧｌｙ、（ｂ）極性で負に荷電した残基及びこの（非荷電）アミド：Ａｓｐ、Ａｓｎ、Ｇｌｕ及びＧｌｎ、（ｃ）極性で正に荷電した残基：Ｈｉｓ、Ａｒｇ及びＬｙｓ、（ｄ）巨大な脂肪族で非極性の残基：Ｍｅｔ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｖａｌ及びＣｙｓ、並びに（ｅ）芳香族残基：Ｐｈｅ、Ｔｙｒ及びＴｒｐ。
【０１６５】
特に好ましい保存的置換は以下のようなものである：ＡｌａをＧｌｙに又はＳｅｒに、ＡｒｇをＬｙｓに、ＡｓｎをＧｌｎに又はＨｉｓに、ＡｓｐをＧｌｕに、ＣｙｓをＳｅｒに、ＧｌｎをＡｓｎに、ＧｌｕをＡｓｐに、ＧｌｙをＡｌａに又はＰｒｏに、ＨｉｓをＡｓｎ又はＧｌｎに、ＩｌｅをＬｅｕに又はＶａｌに、ＬｅｕをＩｌｅに又はＶａｌに、ＬｙｓをＡｒｇに、Ｇｌｎに又はＧｌｕに、ＭｅｔをＬｅｕに、Ｔｙｒに又はＩｌｅに、ＰｈｅをＭｅｔに、Ｌｅｕに又はＴｙｒに、ＳｅｒをＴｈｒに、ＴｈｒをＳｅｒに、ＴｒｐをＴｙｒに、ＴｙｒをＴｒｐに、及び／又はＰｈｅをＶａｌに、Ｉｌｅに又はＬｅｕに。
【０１６６】
本明細書に記載の単一可変ドメインに適用される任意のアミノ酸置換はまた、Schulz et al., Principles of Protein Structure, Springer-Verlag,1978によって開発された異なる種の相同タンパク質間のアミノ酸変異頻度の解析、Chou and Fasman,Biochemistry 13: 211, 1974及びAdv. Enzymol., 47: 45-149,1978によって開発された構造形成能（structure forming potentials）の解析、並びにEisenberg et al., Proc. Natl. Acad Sci. USA 81: 140-144, 1984、Kyte & Doolittle; J Molec. Biol. 157: 105-132, 1981、及びGoldman et al., Ann. Rev. Biophys. Chem. 15: 321-353, 1986によって開発されたタンパク質における疎水性パターンの解析に基づき得る（全て全体が参照により本明細書に援用される）。ナノボディの一次構造、二次構造、及び三次構造に関する情報は、本明細書中の記載及び上記で言及された一般的な背景技術で与えられる。またこのため、ラマ由来のＶＨＨドメインの結晶構造は例えば、Desmyter et al., Nature Structural Biology, Vol. 3, 9, 803（1996）、Spinelli et al., Natural StructuralBiology（1996）; 3, 752-757、及びDecanniere et al., Structure, Vol. 7, 4, 361（1999）によって与えられる。従来のＶＨドメインにおいてこれらの位置でＶＨ／ＶＬ界面及び潜在的なラクダ化置換を形成する幾つかのアミノ酸残基に関するさらなる情報は、上記で言及された従来技術で見出すことができる。
【０１６７】
ｇ）核酸配列は、その全長にわたって（本明細書に規定のように）１００％の配列同一性を有する場合、「全く同じ」であるといえる。
【０１６８】
ｈ）２つのアミノ酸配列を比較するとき、「アミノ酸差異」という用語は、第２の配列に比べて第１の配列の位置での単一アミノ酸残基の挿入、欠失又は置換を表し、２つの単一可変ドメインは、１つ、２つ又はそれ以上のこのようなアミノ酸差異を含有し得ることが理解される。
【０１６９】
ｉ）ヌクレオチド配列又はアミノ酸配列が、それぞれ別のヌクレオチド配列又はアミノ酸配列を「含む」、又は別のヌクレオチド配列又はアミノ酸配列「から本質的に成る」というとき、これは、後者のヌクレオチド配列又はアミノ酸配列がそれぞれ、初めに言及されたヌクレオチド配列又はアミノ酸配列に組み込まれていることを意味し得るが、より一般的に概してこれは、初めに言及されたヌクレオチド配列又はアミノ酸配列がそれぞれ、（例えば本明細書に記載の任意の好適な方法によるものであり得る）実際にどのように初めに言及された配列を生成又は入手するかに関係なく、その配列内にそれぞれ後者の配列と同じヌクレオチド配列又はアミノ酸配列を有するヌクレオチド又はアミノ酸残基のストレッチを含むことを意味する。非限定的な例によって、本発明のナノボディがＣＤＲ配列を含むというとき、これは、上記ＣＤＲ配列が、本発明のナノボディに組み込まれていることを意味し得るが、より一般的に概してこれは、本発明のナノボディが、どのように上記本発明のナノボディを生成又は入手するかに関係なく、その配列内に上記ＣＤＲ配列と同じアミノ酸配列を有するアミノ酸残基のストレッチを含有することを意味する。後者のアミノ酸配列は、特異的な生物学的又は構造的な機能を有する場合、初めに言及されたアミノ酸配列において本質的に同じ、類似の又は同等の生物学的又は構造的な機能を有するのが好ましい（言い換えれば、初めに言及されたアミノ酸配列は、後者の配列が本質的に同じ、類似の又は同等の生物学的又は構造的な機能を果たすことができるようなものであるのが好ましい）ということにも留意すべきである。例えば、本発明のナノボディがそれぞれ、ＣＤＲ配列又はフレームワーク配列を含むというとき、ＣＤＲ配列及びフレームワークはそれぞれ、上記ナノボディでＣＤＲ配列又はフレームワーク配列として機能することができるのが好ましい。また、ヌクレオチド配列が別のヌクレオチド配列を含むというとき、初めに言及されたヌクレオチド配列は、発現産物（例えばポリペプチド）で発現する場合、後者のヌクレオチド配列でコードされるアミノ酸配列が上記発現産物の一部を形成するようなもの（言い換えれば後者のヌクレオチド配列が、初めに言及されたより大きなヌクレオチド配列と同じリーディングフレーム内にあるようなもの）であるのが好ましい。
【０１７０】
ｊ）核酸配列又はアミノ酸配列は、通常上記供給源又は媒体に関連がある少なくとも１つの他の成分（例えば別の核酸、別のタンパク質／ポリペプチド、別の生物学的成分、又は巨大分子）、又は少なくとも１つの汚染物質、不純物若しくは微量成分から分離されている場合、（例えばその天然の生物学的供給源及び／又はこれが得られる反応媒体又は培養媒体に比べて）「本質的な単離（形態）」であると見なされる。特に、核酸配列又はアミノ酸配列は、少なくとも２倍、具体的に少なくとも１０倍、より具体的に少なくとも１００倍、及び最大１０００倍以上精製されている場合に、「本質的に単離された」と考えられる。「本質的に単離形態である」核酸配列又はアミノ酸配列は、好適な技法、例えば好適なクロマトグラフィ技法（例えばポリアクリルアミドゲル電気泳動法）を使用して決定されたものと、本質的に相同であるのが好ましい。
【０１７１】
ｋ）本明細書で使用される「ドメイン」という用語は概して、アミノ酸配列の球状領域（例えば抗体鎖、特に重鎖抗体の球状領域）又は本質的にこのような球状領域から成るポリペプチドを表す。通常、このようなドメインは、例えばシートとして、又はジスルフィド結合によって安定化したペプチドループ（例えば３つ又は４つのペプチドループ）を含む。「結合ドメイン」という用語は（本明細書で規定されるように）抗原決定基に指向性を有するようなドメインを表す。
【０１７２】
ｌ）「抗原決定基」という用語は、抗原結合分子（例えば本発明のナノボディ又はポリペプチド）によって、及びより具体的には上記分子の抗原結合部位によって認識される抗原上のエピトープを表す。「抗原決定基」及び「エピトープ」という用語は、本明細書で区別なく使用することもできる。
【０１７３】
ｍ）特定の抗原決定基、エピトープ、抗原又はタンパク質（又はその少なくとも１つの部分、断片若しくはエピトープに関して）と（特異的に）結合することができる、特定の抗原決定基、エピトープ、抗原又はタンパク質に対する親和性を有する、及び／又は特定の抗原決定基、エピトープ、抗原又はタンパク質に対する特異性を有するアミノ酸配列（例えば本発明のナノボディ、抗体、ポリペプチド、又は概して抗原結合タンパク質若しくはポリペプチド、又はその断片）は、上記抗原決定基、エピトープ、抗原又はタンパク質「に対する」、又は「に指向性を有する」（"against" or "directed against"）と言われる。
【０１７４】
ｎ）「特異性」という用語は、特定の抗原結合分子又は抗原結合タンパク質（例えば本発明のナノボディ又はポリペプチド）分子が結合することができる、様々な種類の抗原又は抗原決定基の数を表す。抗原結合タンパク質の特異性は、親和性及び／又は結合活性に基づき決定することができる。親和性（抗原と抗原結合タンパク質との解離に関する平衡定数（ＫＤ）によって表される）は、抗原結合タンパク質上の抗原決定基と抗原結合部位との間の結合力の評価基準であり、ＫＤ値が小さくなれば、抗原決定基と抗原結合分子との間の結合力が大きくなる（代替的に、親和性は、１／ＫＤである親和定数（ＫＡ）としても表すことができる）。（例えば本明細書中のさらなる開示に基づき）当業者にとって明らかなように、対象となる特異的な抗原に応じて、それ自体が既知の方法で親和性を決定することができる。結合活性は、抗原結合分子（例えば本発明のナノボディ又はポリペプチド）と関連抗原との間の結合力の評価基準である。結合活性は、抗原結合分子上での抗原決定基とその抗原結合部位との間の親和性、及び抗原結合分子上に存在する関連結合部位の数の両方に関係する。典型的には、抗原結合タンパク質（例えば本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又は単一可変ドメイン）は、１０−５モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、及び好ましくは１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、及びより好ましくは１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌの解離定数（ＫＤ）で（即ち１０５Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及び好ましくは１０７Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及びより好ましくは１０８Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モルの結合定数（ＫＡ）で）これらの抗原と結合する。１０−４モル／Ｌより大きい任意のＫＤ値（即ち１０４Ｍ−１（Ｌ／モル）よりも小さい任意のＫＡ値）は一般的に非特異的な結合を示すと考えられる。好ましくは、本発明の一価の免疫グロブリン配列は、５００ｎＭ未満、好ましくは２００ｎＭ未満、より好ましくは１０ｎＭ未満（５００ｐＭ未満等）の親和性で所望の抗原と結合する。抗原結合タンパク質と抗原又は抗原決定基との特異的な結合は、それ自体が既知の任意の好適な方法（例えばスキャッチャード解析及び／又は競合的結合アッセイ（例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）及びサンドイッチ競合アッセイ）を含む）及び当該技術分野でそれ自体が既知の様々なその変更方法、並びに本明細書で言及される他の技法で求めることができる。
【０１７５】
当業者にとって明らかなように、解離定数は実際又は見掛けの解離定数であってもよい。解離定数を決定する方法は、当業者にとって明らかであり、例えば本明細書で言及される技法が含まれる。これに関して、１０−４モル／Ｌ又は１０−３モル／Ｌより大きい（例えば１０−２モル／Ｌの）解離定数を測定することが不可能であり得ることも明らかである。任意で、また当業者にとって明らかなように、（実際又は見掛けの）解離定数は、その関係性（ＫＤ＝１／ＫＡ）から（実際又は見掛けの）結合定数（ＫＡ）に基づき算出することができる。
【０１７６】
親和性は、分子相互作用の強さ又は安定性を示す。一般的に親和性はＫＤ即ち解離定数として与えられ、その単位はモル／Ｌ（又はＭ）である。親和性は、１／ＫＤに等しい結合定数ＫＡとも表すことができ、その単位は（モル／Ｌ）−１（又はＭ−１）である。本明細書では、２つの分子（例えば本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドと、その目的標的との）間の相互作用の安定性は主に、これらの相互作用のＫＤ値で表され、ＫＡ＝１／ＫＤの関係性を考慮して、ＫＤ値で分子相互作用の強さを特定することを、対応するＫＡ値を算出するのに利用することもできることは、当業者にとって明らかである。ＫＤ値は、ＤＧ＝ＲＴ．ｌｎ（ＫＤ）（等しくはＤＧ＝−ＲＴ．ｌｎ（ＫＡ））（式中、Ｒは気体定数に等しく、Ｔは絶対温度に等しく、ｌｎは自然対数を示す）の既知の関係性から、結合の自由エネルギー（ＤＧ）と関連するので、熱力学的意味でも分子相互作用の強さを特徴付ける。
【０１７７】
有意（例えば特異的）と見なされる、生物学的相互作用に関するＫＤは典型的に、１０−１０Ｍ（０．１ｎＭ）〜１０−５Ｍ（１００００ｎＭ）の範囲内である。相互作用が強くなれば、ＫＤは低くなる。
【０１７８】
ＫＤは、（ＫＤ＝ｋｏｆｆ／ｋｏｎ及びＫＡ＝ｋｏｎ／ｋｏｆｆのように）複合体の解離速度定数（ｋｏｆｆと称される）と、その結合速度（ｋｏｎと称される）との比としても表すことができる。解離速度（off-rate）ｋｏｆｆの単位は、ｓ−１（ｓは秒のＳＩ単位表記である）である。結合速度ｋｏｎの単位は、Ｍ−１ｓ−１である。結合速度は、二分子相互作用に関する拡散律速結合速度定数に近づきながら１０２Ｍ−１ｓ−１〜約１０７Ｍ−１ｓ−１の間で変化し得る。解離速度は、ｔ１／２＝ｌｎ（２）／ｋｏｆｆの関係性から所定の分子相互作用の半減期に関連する。解離速度は、１０−６ｓ−１（ｔ１／２が数日である略不可逆的な複合体）〜１ｓ−１（ｔ１／２＝０．６９ｓ）の間で変化し得る。
【０１７９】
２つの分子間の分子相互作用の親和性は、それ自体が既知の様々な技法（例えば既知の表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）バイオセンサ技法（例えばOber et al., Intern. Immunology, 13, 1551-1559, 2001を参照されたい）（ここで、１つの分子がバイオセンサーチップ上に固定され、もう１つの分子が、ｋｏｎ、ｋｏｆｆ測定値、及びしたがってＫＤ（又はＫＡ）値が得られるフロー条件下で固定分子上を通る）で測定することができる。例えば、既知のビアコアの機器を使用してこれを実施することができる。
【０１８０】
測定プロセスが、例えば１つの分子のバイオセンサ上でのコーティングに関するアーチファクトによって、示唆した分子の固有の結合親和性に幾らか影響を与える場合、測定されたＫＤは見掛けのＫＤに対応し得ることも、当業者にとって明らかである。また、１つの分子が、もう１つの分子に対して２つ以上の認識部位を含有する場合、見掛けのＫＤを測定することができる。このような状況下で、測定された親和性は、２つの分子による相互作用の結合活性により影響され得る。
【０１８１】
親和性を評価するのに使用することができる別のアプローチは、Friguet et al.（J. Immunol. Methods, 77,305-19, 1985）の２段階ＥＬＩＳＡ（酵素免疫吸着アッセイ）法である。この方法によって、溶液相の結合平衡測定が確立され、プラスチック等の支持体上での分子の１つの吸着に関連すると考えられ得るアーチファクトが避けられる。
【０１８２】
しかし、ＫＤの正確な測定はかなりの労働集約型である可能性があり、結果として２つの分子の結合力を評価するのに、見掛けのＫＤ値を求めることが多い。全ての測定が一貫して（例えばアッセイ条件を一定にして）行われていれば、見掛けのＫＤ測定値は真のＫＤの近似値として使用することができ、したがって本明細書で、ＫＤ及び見掛けのＫＤは、等しい重要性又は関連性があるとして処理されるべきであることに留意すべきである。
【０１８３】
最後に、多くの状況下で経験豊かな科学者は、幾つかの参照分子に関して結合親和性を決定するのに都合がよいと判断することができることに留意すべきである。例えば、分子Ａと分子Ｂとの間の結合力を評価するために、例えば分子Ｂと結合することが知られており、かつＥＬＩＳＡ又はＦＡＣＳ（蛍光活性化細胞選別）での検出を容易にするためのフルオロフォア若しくはクロモフォア群、又は他の化学部分（例えばビオチン）、又は他のフォーマット（蛍光検出用フルオロフォア、吸光検出用クロモフォア、ストレプトアビジン媒介性ＥＬＩＳＡ検出用ビオチン）で好適に標識される参照分子Ｃを使用することができる。典型的に、参照分子Ｃは固定濃度に維持し、分子Ａの濃度は、分子Ｂの所定の濃度又は量に対して変化する。結果として、分子Ａの非存在下で分子Ｃについて測定されたシグナルが半分になる分子Ａの濃度に対応して、ＩＣ５０値が得られる。参照分子のＫＤであるＫＤｒｅｆ及び参照分子の総濃度ｃｒｅｆが既知であれば、以下の式：ＫＤ＝ＩＣ５０／（１＋ｃｒｅｆ／ＫＤｒｅｆ）からＡ−Ｂ相互作用に対する見掛けのＫＤを得ることができる。ｃｒｅｆ＜＜ＫＤｒｅｆの場合、ＫＤ≒ＩＣ５０であることに留意されたい。ＩＣ５０の測定が、比較用の結合因子に関して一貫して（例えばｃｒｅｆを固定して）実施されれば、ＩＣ５０によって分子相互作用の強さ又は安定性を評価することができ、この測定値は、本明細書を通してＫＤ又は見掛けのＫＤと同等であると判断される。
【０１８４】
ｏ）本発明のアミノ酸配列、化合物又はポリペプチドの半減期は概して、例えば自然機構による配列若しくは化合物の分解及び／又は配列若しくは化合物のクリアランス（clearance）若しくは捕捉（sequestration）のために、ｉｎ  ｖｉｖｏでアミノ酸配列、化合物又はポリペプチドの血清濃度が５０％低減するのにかかる時間と定義することができる。本発明のアミノ酸配列、化合物又はポリペプチドのｉｎ  ｖｉｖｏ半減期は、それ自体が既知の任意の方法（例えば薬物動態解析）で求めることができる。好適な技法は当業者にとって明らかであり、例えば概して、好適な用量の本発明のアミノ酸配列、化合物又はポリペプチドを温血動物（即ち、ヒト又は別の好適な哺乳動物、例えばマウス、ウサギ、ラット、ブタ、イヌ又は霊長類（例えばマカク属のサル（例えば特にカニクイザル（マカク・ファシクラリス）及び／又はアカゲザル（マカク・ムラット））及びヒヒ（パピオ・ウルジヌス））に好適に投与する工程と、血液試料又は他の試料を上記動物から採取する工程と、上記血液試料中の本発明のアミノ酸配列、化合物又はポリペプチドのレベル又は濃度を求める工程と、このようにして得られたデータ（のプロット）から本発明のアミノ酸配列、化合物又はポリペプチドのレベル又は濃度が投与時の最初のレベルに比べて５０％低減するまでの時間を算出する工程とを伴い得る。例えば、以下の実験部部分、及び標準的なハンドブック（例えばKenneth, A et al: Chemical Stability of Pharmaceuticals: A Handbookfor Pharmacists及びPeters et al, Pharmacokinete analysis:A Practical Approach（1996））を参照する。"Pharmacokinetics",M Gibaldi & D Perron, published by Marcel Dekker, 2nd Rev. edition（1982）も参照する。
【０１８５】
また当業者にとって明らかなように（例えば国際公開第０４／００３０１９号パンフレットの６頁及び７頁とそこに言及されたさらなる参考文献とを参照されたい）、半減期は、ｔ１／２−α、ｔ１／２−β及び曲線下面積（ＡＵＣ）等のパラメータを利用して表すことができる。本明細書において、「半減期の増大」は、これらのパラメータのいずれか１つ、例えばこれらのパラメータのいずれか２つ、又は本質的に３つ全てのこれらのパラメータの増大を表す。本明細書で使用される「半減期の増大」又は「増大した半減期」は特にｔ１／２−βの増大を表し、ｔ１／２−α及び／又はＡＵＣのいずれか又は両方は増大しても又は増大しなくてもよい。
【０１８６】
ｐ）本発明に関して、「調節（"modulating" or "to modulate"）」は一般的に、好適なｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ、細胞アッセイ又はｉｎ  ｖｉｖｏアッセイを使用して測定するような標的又は抗原の活性の低減若しくは阻害のいずれか、又は代替的に活性の増大を意味する。特に「調節」は、好適なｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ、細胞アッセイ、又はｉｎ  ｖｉｖｏアッセイ（通常関与する標的又は抗原によって変わる）を用いて測定するような、本発明の構築物が存在しない以外は同じ条件下での同じアッセイにおける標的又は抗原の活性に比べて、少なくとも１％、好ましくは少なくとも５％、例えば少なくとも１０％若しくは少なくとも２５％、例えば少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、又は９０％以上標的又は抗原の活性を低減又は阻害すること、又は代替的に（関連又は対象の）生物学的活性を増大させることを意味し得る。
【０１８７】
当業者にとって明らかなように、「調節」は、本発明の構築物が存在しない以外は同じ条件下に比べて、そのリガンド、結合パートナー、ホモ多量体形態若しくはヘテロ多量体形態で結び付くパートナー又は基質の１つ又は複数に対する標的又は抗原の親和性、結合活性、特異性及び／又は選択性を変化させること（増大又は減少のいずれであってもよい）、及び／又は標的又は抗原が存在する媒体又は環境における１つ又は複数の条件（ｐＨ、イオン強度、補因子の存在等）に対する標的又は抗原の感受性を変化させること（増大又は減少のいずれであってもよい）も伴い得る。当業者にとって明らかなように、関与する標的又は抗原に応じて、任意の好適な方法で、及び／又はそれ自体が既知の任意の好適なアッセイを用いてさらにこれを求めてもよい。
【０１８８】
「調節」は、標的又は抗原が関与する（又はその基質（複数可）、リガンド（複数可）若しくは経路（複数可）が関与する、シグナル伝達経路若しくは代謝経路及び関連の生物学的作用若しくは生理学的作用のような）１つ又は複数の生物学的な若しくは生理学的な機構、作用、反応、機能、経路又は活性に関して変化させる（即ち標的又は抗原及び所望の生物学的作用若しくは生理学的作用に応じて、それぞれ、アゴニスト、アンタゴニスト、又は逆アゴニストとしての活性を与える）ことも意味し得る。同様に、当業者にとって明らかなように、関与する標的又は抗原に応じて、任意の好適な方法で、及び／又はそれ自体が既知の任意の好適な（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び通常は細胞又はアッセイ内）アッセイを使用して、アゴニスト又はアンタゴニストとしてのこのような作用を求めてもよい。特に、アゴニスト又はアンタゴニストとしての作用は、対象の生物学的活性又は生理学的活性をそれぞれ、本発明の構築物が存在しない以外は同じ条件下での同じアッセイにおける生物学的活性又は生理学的活性に比べて少なくとも１％、好ましくは少なくとも５％、例えば少なくとも１０％若しくは少なくとも２５％、例えば少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、又は９０％以上増大又は低減させるようなものであり得る。
【０１８９】
調節は例えば、標的又は抗原のアロステリック調節、及び／又は標的又は抗原とその基質又はリガンドの１つとの結合の低減又は阻害及び／又は標的又は抗原との結合に対する基質である天然リガンドとの競合も伴い得る。調節は、標的若しくは抗原、又はこれが関与する機構若しくは経路を活性化することも伴い得る。調節は、標的若しくは抗原のフォールディング若しくは立体構造に関して、又は標的若しくは抗原がフォールディングする能力、（例えばリガンドの結合の際に）その立体構造を変更する能力、他の（サブ）ユニットと結び付く能力、又は解離する能力に関して変化させることも伴い得る。調節は例えば、標的若しくは抗原が、他の化合物を移動させる能力、又は他の化合物（イオン等）に対するチャネルとして働く能力を変化させることも伴い得る。
【０１９０】
調節は、可逆であっても又は不可逆であってもよいが、薬学的及び薬理学的目的では通常、可逆的である。
【０１９１】
ｑ）標的又は抗原に関して、標的又は抗原上の「相互作用部位」という用語は、リガンド、受容体若しくは他の結合パートナーとの結合に関する部位、触媒部位、切断部位、アロステリック相互作用に関する部位、標的又は抗原の多量体化（ホモマー化又はヘテロ二量体化等）に関与する部位である、標的又は抗原上のアミノ酸残基の部位、エピトープ、抗原決定部位、部分、ドメイン若しくはストレッチ；又は標的若しくは抗原の生物学的作用又は機構に関与する標的又は抗原上のアミノ酸残基の任意の他の部位、エピトープ、抗原決定基、部分、ドメイン又はストレッチを意味する。より一般的には、「相互作用部位」は、本発明のアミノ酸配列又はポリペプチドが、（本明細書中に規定のように）標的又は抗原（及び／又は標的又は抗原が関与する任意の経路、相互作用、シグナル伝達、生物学的機構又は生物学的作用）を調節するように結合することができる、標的又は抗原上のアミノ酸残基の任意の部位、エピトープ、抗原決定基、部分、ドメイン又はストレッチであり得る。
【０１９２】
ｒ）アミノ酸配列又はポリペプチドは、上記アミノ酸配列又はポリペプチドが第２の標的又はポリペプチドと結合する親和性よりも少なくとも１０倍、例えば少なくとも１００倍、好ましくは少なくとも１０００倍、及び最大１００００倍以上良好な親和性（上記のように、好適にＫＤ値、ＫＡ値、Ｋｏｆｆ速度及び／又はＫｏｎ速度と表す）で第１の抗原と結合する場合、第２の標的又は抗原と比べて、第１の標的又は抗原「に特異的」であるといえる。例えば、第１の抗原は、上記アミノ酸配列又はポリペプチドが第２の標的又はポリペプチドと結合するＫＤよりも少なくとも１０分の１、例えば少なくとも１００分の１、及び好ましくは少なくとも１０００分の１、例えば１００００分の１以下のＫＤ値で標的又は抗原と結合し得る。好ましくは、アミノ酸配列又はポリペプチドが、第２の標的又は抗原に比べて第１の標的又は抗原「に特異的」である場合、そのアミノ酸配列又はポリペプチドは、（本明細書中に規定のように）上記第１の標的又は抗原に指向性を有するが、上記第２の標的又は抗原に対しては指向性を有しない。
【０１９３】
ｓ）「交差遮断（"cross-block", "cross-blocked" and "cross-blocking"）」という用語は、本明細書中で区別なく使用し、アミノ酸配列又は他の結合剤（本発明のポリペプチド等）が、他の本発明の単一可変ドメイン又は結合剤と所定の標的（本明細書ではＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー）との結合を妨げる能力を意味する。本発明のアミノ酸配列又は他の結合剤が別のアミノ酸配列とＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合を妨げることができる範囲、ひいては本発明に従って交差遮断するということができるか否かを、競合結合アッセイを使用して求めることができる。１つの特に好ましい定量的なアッセイは、表面プラズモン共鳴技術を用いて相互作用の程度を測定することができるビアコア機器を使用する。別の好適な定量的な交差遮断アッセイは、標的とのこれらの結合に関して、アミノ酸配列又は他の結合剤間の競合を測定するＥＬＩＳＡに基づくアプローチを使用する。
【０１９４】
概して以下に、アミノ酸配列又は他の結合剤が、本発明に従って交差遮断するか、又は交差遮断することができるか否かを求めるのに適したビアコアアッセイを説明している。このアッセイは、本明細書中に記載のアミノ酸配列又は他の結合剤のいずれかと共に使用することができることが理解されよう。ビアコア機器（例えばビアコア３０００）は、製造元の推奨に沿って操作する。このように、１つの交差遮断アッセイでは、標的でコーティングされた表面を作製するのに、標準的なアミンカップリングケミストリを用いて、標的タンパク質をＣＭ５ビアコアチップと結合させる。典型的に２００個〜８００個の標的の共鳴単位をチップに結合させる（容易に測定可能なレベルの結合を与えるが、使用する試験試薬の濃度によって容易に飽和することができる量）。互いに交差遮断する能力を評価する、２つの試験単一可変ドメイン（Ａ＊及びＢ＊と呼ばれる）を、好適なバッファー中で、１：１の結合部位のモル比で混合し、試験混合物を作製する。結合部位ベースの濃度を算出する場合、アミノ酸配列の分子量は、アミノ酸配列の全分子量を、このアミノ酸配列上の標的結合部位の数で除算したものであるとみなす。試験混合物中の各アミノ酸配列の濃度は、ビアコアチップ上に捕捉された標的分子上のこのアミノ酸配列に対する結合部位を容易に飽和するのに十分高いものとする。混合物中の単一可変ドメインは、典型的に（結合部位ベースで）１．００マイクロモル〜１．５マイクロモルである（結合部位ベースの）モル濃度と同じである。Ａ＊及びＢ＊を単独で含有する分離溶液も調製する。これらの溶液中のＡ＊及びＢ＊は、試験混合物と同じバッファー中で、かつ試験混合物と同じ濃度であるとする。試験混合物を標的コーティングビアコアチップ上に通し、結合総量を記録する。それから、チップ結合標的を損なうことなく、結合した単一可変ドメインを取り除くようにチップを処理する。典型的に、チップを３０ｍＭのＨＣｌで６０秒処理することによってこれを行う。その後、Ａ＊単独の溶液を標的コーティング表面上に通し、結合量を記録する。同様に、チップを処理し、チップ結合標的を損なうことなく、結合した単一可変ドメインを全て取り除く。それから、Ｂ＊単独の溶液を標的コーティング表面上に通し、結合量を記録する。次に、Ａ＊とＢ＊との混合物の理論最大結合を算出し、これは単独で標的表面上を通した際の各アミノ酸配列の結合の合計である。実際に記録された混合物の結合がこの理論最大よりも小さい場合、２つの単一可変ドメインは互いに交差遮断している。このように概して、交差遮断する本発明のアミノ酸配列又は他の結合剤は、アッセイ中、及び本発明の第２のアミノ酸配列又は他の結合剤の存在下で、記録された結合が、組合せた２つの単一可変ドメイン又は結合剤の最大理論結合（直前に規定）の８０％〜０．１％（例えば８０％〜４％）、具体的に最大理論結合の７５％〜０．１％（例えば７５％〜４％）、及びより具体的に最大理論結合の７０％〜０．１％（例えば７０％〜４％）であるように、上記のビアコア交差遮断アッセイで標的と結合するものである。上記のビアコアアッセイは、単一可変ドメイン又は他の結合剤が本発明に従って互いに交差遮断するかどうかを求めるのに使用する主なアッセイである。稀に、特定の単一可変ドメイン又は他の結合剤が、ＣＭ５ビアコアチップとアミンケミストリを介して結合した標的と結合しないことがある（通常、標的上の関連の結合部位がチップとの連結によって塞がれるか、又は破壊される場合にこれが起こる）。このような場合、標識型、例えばＮ末端Ｈｉｓ標識型の標的（R & D Systems, Minneapolis, MN, USA、２００５年カタログ番号１４０６−ＳＴ−０２５）を用いて交差遮断を求めることができる。この特定のフォーマットで、抗Ｈｉｓアミノ酸配列をビアコアチップに結合させた後、Ｈｉｓ標識した標的をチップの表面上に通し、抗Ｈｉｓアミノ酸配列で捕捉する。各チップ再生サイクル後に、抗Ｈｉｓアミノ酸配列コーティング表面上に、新たなＨｉｓ標識した標的を充填し戻すことを除いて、本質的に上記のように、交差遮断解析を行う。Ｎ末端Ｈｉｓ標識した［標的］を使用するとして与えられた例の他に、代替的にＣ末端Ｈｉｓ標識した標的を使用することができる。さらに、当該技術分野で既知の様々な他の標識及び標識結合タンパク質の組合せをこのような交差遮断解析に使用することができる（例えば、抗ＨＡ抗体によるＨＡ標識；抗ＦＬＡＧ抗体によるＦＬＡＧ標識；ストレプトアビジンによるビオチン標識）。
【０１９５】
概して以下に、標的に指向性を有するアミノ酸配列又は他の結合剤が、本明細書中に規定のように、交差遮断するか、又は交差遮断することができるか否か求めるＥＬＩＳＡアッセイを説明している。このアッセイは、本明細書中に記載の単一可変ドメイン（又は本発明の単一可変ドメイン等の他の結合剤）のいずれかと共に使用することができることが理解されよう。このアッセイの一般原理は、ＥＬＩＳＡプレートのウェル上にコーティングした標的に指向性を有するアミノ酸配列又は結合剤を有することである。過剰量の第２の、潜在的に交差遮断する抗標的アミノ酸配列を溶液中に添加する（即ちＥＬＩＳＡプレートと結合しない）。それから、限定量の標的をウェルに添加する。コーティングしたアミノ酸配列と溶液中のアミノ酸配列とは、限定数の標的分子の結合に対して競合する。プレートを洗浄し、コーティングしたアミノ酸配列と結合していない過剰な標的を取り除き、また第２の溶液相のアミノ酸配列及び第２の溶液相のアミノ酸配列と標的との間に形成される任意の複合体を取り除く。その後、標的を検出するのに適切な試薬を使用して、結合標的の量を測定する。コーティングしたアミノ酸配列を交差遮断することができる溶液中のアミノ酸配列によって、第２の溶液相のアミノ酸配列の非存在下でコーティングしたアミノ酸配列と結合することができる標的分子の数に比べて、コーティングしたアミノ酸配列と結合することができる標的分子の数を低減させることができる。アミノ酸配列を固定化させるように、第１のアミノ酸配列、例えばＡｂ−Ｘを選択する場合、第１のアミノ酸配列をＥＬＩＳＡプレートのウェル上にコーティングし、その後、プレートを好適な遮断溶液で遮断し、その後添加する試薬の非特異的な結合を最小にする。第２のアミノ酸配列、即ちＡｂ−Ｙ標的結合部位の１つのウェル当たりのモルが、ＥＬＩＳＡプレートのコーティング中に使用したＡｂ−Ｘ標的結合部位の１つのウェル当たりのモルの少なくとも１０倍になるように、過剰量のＡｂ−ＹをＥＬＩＳＡプレートに添加する。それから、添加した標的の１つのウェル当たりのモルが、各ウェルをコーティングするのに使用したＡｂ−Ｘ標的結合部位のモルの少なくとも２５分の１になるように、標的を添加する。好適なインキュベート期間の後、ＥＬＩＳＡプレートを洗浄し、標的を検出する試薬を添加し、コーティングした抗標的アミノ酸配列（この場合、Ａｂ−Ｘ）と特異的に結合した標的の量を測定する。アッセイに関するバックグラウンドシグナルは、コーティングしたアミノ酸配列（この場合、Ａｂ−Ｘ）、第２の溶液相のアミノ酸配列（この場合、Ａｂ−Ｙ）、標的バッファーのみ（即ち標的が存在しない）及び標的検出試薬を用いてウェル中で得られたシグナルと定義する。アッセイに関する陽性対照シグナルは、コーティングしたアミノ酸配列（この場合、Ａｂ−Ｘ）、第２の溶液相のアミノ酸配列バッファーのみ（即ち第２の溶液相のアミノ酸配列が存在しない）、標的及び標的検出試薬を用いてウェル中で得られたシグナルと定義する。陽性対照シグナルがバックグラウンドシグナルの少なくとも６倍になるように、ＥＬＩＳＡアッセイを行い得る。どのアミノ酸配列をコーティングアミノ酸配列として使用し、どのアミノ酸配列を第２の（競合）アミノ酸配列として使用するかという選択に起因する任意のアーチファクト（例えば有意に異なる、［標的］に対するＡｂ−ＸとＡｂ−Ｙとの親和性）を避けるために、交差遮断アッセイを２つのフォーマットで行い得る：１）フォーマット１は、Ａｂ−Ｘが、ＥＬＩＳＡプレート上にコーティングするアミノ酸配列であり、かつＡｂ−Ｙが、溶液中にある競合アミノ酸配列である場合であり、また２）フォーマット２は、Ａｂ−Ｙが、ＥＬＩＳＡプレート上にコーティングするアミノ酸配列であり、かつＡｂ−Ｘが、溶液中にある競合アミノ酸配列である場合である。Ａｂ−Ｘ及びＡｂ−Ｙは、フォーマット１又はフォーマット２のいずれかで、溶液相の抗標的アミノ酸配列が、溶液相の抗標的アミノ酸配列の非存在下で得られた標的検出シグナル（即ち陽性対照ウェル）に比べて、標的検出シグナル（即ちコーティングしたアミノ酸配列で結合した標的の量）の６０％〜１００％、具体的に７０％〜１００％、及びより具体的に８０％〜１００％の低減を引き起こすことができる場合、交差遮断すると定義する。
【０１９６】
ｔ）本明細書でさらに記載されるように、ナノボディにおけるアミノ酸残基の総数は、１１０〜１２０、好ましくは１１２〜１１５の範囲内、及び最も好ましくは１１３であり得る。しかし、ナノボディの部分、断片、類似体又は誘導体（本明細書中にさらに記載されたように）は、本明細書に概説されるさらなる要求を満たし、また好ましくは本明細書に記載の目的に好適であれば、その長さ及び／又はサイズに特に限定されないことに留意すべきである。
【０１９７】
ｕ）ナノボディのアミノ酸残基は、Riechmann and Muyldermans, J. Immunol. Methods 2000 Jun 23; 240 （1-2）:185-195の論文（例えばこの論文の図２を参照されたい）においてラクダ科動物由来のＶＨＨドメインに適用されるように、又は本明細書に言及されるようにKabat et al. （"Sequence of proteins ofimmunological interest", US Public Health Services, NIH Bethesda, MD,Publication No. 91）によって与えられたＶＨドメインに関する一般的なナンバリングに従って数字が付けられる。このナンバリングに従うと、ナノボディのＦＲ１は１位〜３０位のアミノ酸残基を含み、ナノボディのＣＤＲ１は３１位〜３５位のアミノ酸残基を含み、ナノボディのＦＲ２は３６位〜４９位のアミノ酸残基を含み、ナノボディのＣＤＲ２は５０位〜６５位のアミノ酸残基を含み、ナノボディのＦＲ３は６６位〜９４位のアミノ酸残基を含み、ナノボディのＣＤＲ３は９５位〜１０２位のアミノ酸残基を含み、ナノボディのＦＲ４は１０３位〜１１３位のアミノ酸残基を含む。［これに関して、ＶＨドメイン及びＶＨＨドメインに関して当該技術分野で既知のように、ＣＤＲそれぞれにおけるアミノ酸残基の総数は変わる可能性があり、カバットナンバリングで示されるアミノ酸残基の総数に対応していなくてもよい（即ちカバットナンバリングによる１つ又は複数の位置が実際の配列で占められていなくてもよく、又は実際の配列が、カバットナンバリングで可能な数より多くのアミノ酸残基を含んでいてもよい）ことに留意すべきである。このことは、概してカバットによるナンバリングは、実際の配列におけるアミノ酸残基の実際のナンバリングに対応していても、又は対応していなくてもよいことを意味する。しかし一般的に、ＣＤＲにおけるアミノ酸残基の数に関係なく、カバットナンバリングに従うと、カバットナンバリングによる１位は、ＦＲ１の出発点に対応し（逆もまた同様）、カバットナンバリングによる３６位は、ＦＲ２の出発点に対応し（逆もまた同様）、カバットナンバリングによる６６位は、ＦＲ３の出発点に対応し（逆もまた同様）、カバットナンバリングによる１０３位は、ＦＲ４の出発点に対応する（逆もまた同様）ということができる］。
【０１９８】
ＶＨドメインのアミノ酸残基の数字を付ける代替方法（この方法は、類似の方法でラクダ科動物由来のＶＨＨドメイン及びナノボディに適用することができる）は、Chothia et al.（Nature 342, 877-883（1989））によって説明される方法、いわゆる「ＡｂＭ定義」及びいわゆる「接触定義」である。しかし本明細書、特許請求の範囲及び図面では、特に他に指示がなければ、Riechmann及びMuyldermansによってＶＨＨドメインに適用されるようなカバットによるナンバリングに従う。
【０１９９】
ｖ）図面、配列表及び実験部部分／実施例は、本発明をさらに説明するためだけに与えられ、特に他にはっきりと本明細書中に指示がなければ、本発明の範囲及び／又は添付の特許請求の範囲を限定するものとしては決して解釈すべきではない。
【０２００】
重鎖抗体及びその可変ドメインの概要に関しては、特に本明細書で言及される従来技術、Reviews in Molecular Biotechnology 74（2001）, 277-302におけるMuyldermansによる総説、及び一般的な背景技術として言及される以下の特許出願：Vrije Universiteit Brusselの国際公開第９４／０４６７８号パンフレット、国際公開第９５／０４０７９号パンフレット、及び国際公開第９６／３４１０３号パンフレット；Unileverの国際公開第９４／２５５９１号パンフレット、国際公開第９９／３７６８１号パンフレット、国際公開第００／４０９６８号パンフレット、国際公開第００／４３５０７号パンフレット、国際公開第００／６５０５７号パンフレット、国際公開第０１／４０３１０号パンフレット、国際公開第０１／４４３０１号パンフレット、欧州特許第１１３４２３１号明細書及び国際公開第０２／４８１９３号パンフレット；Vlaams Instituut voor Biotechnologie（VIB）の国際公開第９７／４９８０５号パンフレット、国際公開第０１／２１８１７号パンフレット、国際公開第０３／０３５６９４号パンフレット、国際公開第０３／０５４０１６号パンフレット及び国際公開第０３／０５５５２７号パンフレット；Algonomics N.V.及びAblynx N. V.の国際公開第０３／０５０５３１号パンフレット；カナダのNational Research Councilによる国際公開第０１／９０１９０号パンフレット；Institute of Antibodiesによる国際公開第０３／０２５０２０号パンフレット（＝欧州特許第１４３３７９３号明細書）；並びにAblynx N.V.による国際公開第０４／０４１８６７号パンフレット、国際公開第０４／０４１８６２号パンフレット、国際公開第０４／０４１８６５号パンフレット、国際公開第０４／０４１８６３号パンフレット、国際公開第０４／０６２５５１号パンフレット、国際公開第０５／０４４８５８号パンフレット、国際公開第０６／４０１５３号パンフレット、国際公開第０６／０７９３７２号パンフレット、国際公開第０６／１２２７８６号パンフレット、国際公開第０６／１２２７８７号パンフレット及び国際公開第０６／１２２８２５号パンフレット、並びにAblynx N.V.によってさらに公開された特許出願を参照する。これらの出願で言及されるさらなる従来技術、特に国際出願の国際公開第０６／０４０１５３号パンフレットの４１頁〜４３頁で言及される参考リストも参照する（このリスト及び参考文献は参照により本明細書に援用される）。
【０２０１】
当該技術分野で使用される専門用語（上記の参考文献を参照されたい）に従って、天然重鎖抗体に存在する可変ドメインは、この可変ドメインを従来の四本鎖抗体に存在する重鎖可変ドメイン（以下「ＶＨドメイン」と表す）と、及び従来の四本鎖抗体に存在する軽鎖可変ドメイン（以下、「ＶＬドメイン」と表す）と区別するために、「ＶＨＨドメイン」とも表される。
【０２０２】
上記で表された従来技術で言及されるように、ＶＨＨドメインは、単離ＶＨＨドメイン（並びにこれに基づくナノボディ、これは天然ＶＨＨドメインと、これらの構造的特徴及び機能的性質を共有する）及び機能的な抗原結合ドメイン又はタンパク質としての使用に非常に有利である、これを含有するタンパク質を作製する、多くの特有の構造的特徴及び機能的性質を有する。特に、以下に限定されないが、（軽鎖可変ドメインの非存在下で、及びこれとの相互作用が全くなく、自然に抗原と機能的に結合するように「設計」された）ＶＨＨドメイン及びナノボディは、単一で比較的低分子の機能的な抗原結合構造単位、ドメイン又はタンパク質としても機能することができる。このことは、ＶＨＨドメインを従来の四本鎖抗体のＶＨドメイン及びＶＬドメインと区別し、概してこれら自体は単一抗原結合タンパク質又はドメインとしての実際の適用に適しておらず、幾つかの形態又は機能的な抗原結合単位を与えるような別の形態で（例えばＦａｂ断片等の従来の抗体断片、ＶＬドメインと共有結合するＶＨドメインから成るＳｃＦｖ断片等で）組合せる必要がある。
【０２０３】
これらの特有の性質のために、単一抗原結合タンパク質又は抗原結合ドメインとして（即ちより大きなタンパク質又はポリペプチド部分として）のＶＨＨドメイン及びナノボディの使用によって、従来のＶＨドメイン及びＶＬドメイン、ｓｃＦｖ又はその従来の抗体断片（例えばＦａｂ断片又はＦ（ａｂ’）２断片）の使用に対する多くの有意な利点が与えられる：
単一ドメインだけが、高い親和性及び高い選択性で抗原と結合することが要求されるので、２つの分離ドメインを存在させる必要もなく、これらの２つのドメインが正しい空間配座及び構造で存在することを（即ち特別に設計されたリンカー（ｓｃＦｖ等）の使用によって）確認する必要もない。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは単一遺伝子から発現することができ、翻訳後フォールディング又は修飾の必要はない。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは、（本明細書でさらに考察されるように）容易に多価及び多重特異性のフォーマットに遺伝子操作することができる。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは、高溶解性であり、凝集しにくい（Ward et al., Nature, Vol. 341, 1989, p. 544で記載されるマウス由来の「ｄＡｂ」等）。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは、熱、ｐＨ、プロテアーゼ及び他の変性剤又は条件に対する安定性が高い（例えばEwert et al（同上）を参照されたい）。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは、製造で要求される規模であっても調製するのが容易であり、かつ比較的安価である。例えば、ＶＨＨドメイン、ナノボディ、及びこれを含有するタンパク質／単一可変ドメインは、微生物発酵を使用して（例えば以下でさらに記載されるように）製造することができ、哺乳動物の発現系（例えば従来の抗体断片）を使用する必要がない。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは、従来の四本鎖抗体及びその抗原結合断片に比べて比較的低分子（約１５ｋＤａ、即ち従来のＩｇＧの１０分の１）であるため、このような従来の四本鎖抗体及びその抗原結合断片よりも高い組織（充実性腫瘍及び他の高密度組織を含むが、これらに限定されない）への浸透性を示す。
ＶＨＨドメイン及びナノボディは、（特に従来のＶＨドメインに比べてＣＤＲ３ループが伸長するため）いわゆるキャビティ結合性を示すことができ、したがって従来の四本鎖抗体及びその抗原結合断片には接近することができない標的及びエピトープに接近することもできる。例えば、ＶＨＨドメイン及びナノボディは酵素を阻害することができることが分かっている（例えば国際公開第９７／４９８０５号パンフレット、Transue et al., Proteins 1998 Sep 1; 32（4）: 515-22、Lauwereys et al., EMBO J. 1998 Jul1; 17（13）: 3512-20を参照されたい）。
【０２０４】
特定の好ましい態様において、本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するナノボディ、及び詳細には温血動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するナノボディ、及びより詳細には哺乳動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するナノボディ、及び具体的にヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するナノボディ、並びに少なくとも１つのこのようなナノボディを含むタンパク質及び／又は単一可変ドメインを提供する。
【０２０５】
特に、本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する従来の抗体又はその断片に比べて、このような従来の抗体又は抗体断片（Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、ＳｃＦｖ構築物、「ダイアボディ」及び他の多重特異性構築物（例えばHolliger and Hudson, Nat Biotechnol. 2005 Sep; 23（9）: 1126-36による総説を参照されたい）等）に基づき得る構築物に比べて、及びまた従来の抗体の可変ドメインに由来し得るいわゆる「ｄＡｂ」又は同様の（単一）ドメイン抗体に比べて、改善した治療特性及び／又は薬理学的特性、及び／又は他の有益な特性（例えば調製の簡便性の向上、及び／又は製品のコスト低減等）を有するＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するナノボディ、及びこれを含むタンパク質及び／又は単一可変ドメインを提供する。これらの改善した有益な特性は、本明細書中のさらなる記載から明らかになり、例えばこれらに限定されないが、
一価フォーマット、多価フォーマット（例えば二価フォーマット）及び／又は多重特異性のフォーマット（例えば本明細書中の以下で記載の多重特異性のフォーマットの１つ）のいずれかでのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性及び／又は結合活性の増大、
多価フォーマット（例えば二価フォーマット）でフォーマットするのにより良好な適合性、
多重特異性フォーマット（例えば本明細書中の以下で記載の多重特異性のフォーマットの１つ）でフォーマットするのにより良好な適合性、
「ヒト化」置換（本明細書中で規定）に対する適合性又は感受性の改善、
一価フォーマット、多価フォーマット（例えば二価フォーマット）及び／又は多重特異性のフォーマット（例えば本明細書中の以下で記載の多重特異性のフォーマットの１つ）のいずれかでの免疫原性の低下、
一価フォーマット、多価フォーマット（例えば二価フォーマット）及び／又は多重特異性のフォーマット（例えば本明細書中の以下で記載の多重特異性のフォーマットの１つ）のいずれかでの安定性の増大、
一価フォーマット、多価フォーマット（例えば二価フォーマット）及び／又は多重特異性のフォーマット（例えば本明細書中の以下で記載の多重特異性のフォーマットの１つ）のいずれかでのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する特異性の増大、
異なる種由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの交差反応性の低減又は所望の場合には増大、及び／又は
一価フォーマット、多価フォーマット（例えば二価フォーマット）及び／又は多重特異性のフォーマット（例えば本明細書中の以下で記載の多重特異性のフォーマットの１つ）のいずれかでの薬学的用途（予防的用途及び／又は治療的用途を含む）及び／又は診断的用途（画像化目的への使用を含むが、これに限定されない）に望ましい、１つ又は複数の他の特性の改善の１つ又は複数が含まれる。
【０２０６】
概して本発明の単一可変ドメインに対して本明細書中に記載するように、本発明のナノボディは、（本明細書中に規定のように）本質的に単離形態であるか、又は（本明細書中に規定のように）本発明のタンパク質若しくはポリペプチドの一部を形成するのが好ましく、１つ又は複数の本発明のナノボディを含むか、又は本質的にこれから成っていてもよく、任意で１つ又は複数のさらなる単一可変ドメイン（任意で全て１つ又は複数の好適なリンカーを介して）をさらに含んでいてもよい。例えば、限定はしないが、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインは、このようなタンパク質又はポリペプチドにおける結合単位として使用してもよく、全て本明細書中に記載の本発明の一価、多価又は多重特異性のポリペプチドをそれぞれ提供するように、任意で結合単位として（即ちＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー以外の１つ又は複数の標的に対して）有用であり得る１つ又は複数のさらなる単一可変ドメインを含有し得る。特に、このようなタンパク質又はポリペプチドは、本明細書中にさらに記載の一価、多価又は多重特異性のナノボディ構築物をそれぞれ提供するように、任意で全て１つ又は複数の好適なリンカーを介して連結した、１つ又は複数の本発明のナノボディと、任意で１つ又は複数の（他の）（即ちＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー以外の標的に指向性を有する）ナノボディとを含み得るか、又は本質的にこれから成り得る。このようなタンパク質又は単一可変ドメインは、（本明細書中に規定のように）本質的に単離形態であってもよい。
【０２０７】
本発明のナノボディにおいて、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する結合部位は、ＣＤＲ配列によって形成されるのが好ましい。任意で、本発明のナノボディは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する少なくとも１つの結合部位の他に、他の抗原、タンパク質又は標的との結合に関する１つ又は複数のさらなる結合部位を含有してもよい。このような第２の結合部位を導入する方法及び位置に関しては、例えばKeck and Huston, Biophysical Journal, 71, October 1996, 2002-2011、欧州特許第０６４０１３０号明細書、国際公開第０６／０７２６０号パンフレットを参照する。
【０２０８】
本発明の単一可変ドメインに関して本明細書中に概して記載するように、本発明のナノボディ（又はこれを含む本発明のポリペプチド）が、被験体への投与を目的とする場合（例えば本明細書中に記載の治療目的及び／又は診断目的）、本発明のナノボディは、ヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するのが好ましいが、獣医学的目的では、治療する種由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するのが好ましい。また、本発明の単一可変ドメインと同様に、本発明のナノボディは交差反応性（即ち、ヒトのＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー及び本明細書中で言及した種の少なくとも１種の哺乳動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーのような２種以上の哺乳動物由来のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する指向性）を有していても又は有しなくてもよい。
【０２０９】
また同様に、本発明の単一可変ドメインに関して本明細書中に概して記載するように、本発明のナノボディは概して、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの抗原決定基、エピトープ、部分、ドメイン、サブユニット又は立体構造（適用可能な場合）のいずれかに指向性を有し得る。しかし、本発明のナノボディ（及びこれを含む単一可変ドメイン）は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの受容体−リガンド結合エピトープに指向性を有することが推測され、また好ましい。
【０２１０】
本明細書中で既に記載のように、ナノボディのアミノ酸配列及び構造は、これらに限定されないが、４つのフレームワーク領域即ち「ＦＲ」（又は「ＦＷ」と呼ばれることもある）から構成されていると考えることができ、当該技術分野及び本明細書中でそれぞれ、「フレームワーク領域１」即ち「ＦＲ１」、「フレームワーク領域２」即ち「ＦＲ２」、「フレームワーク領域３」即ち「ＦＲ３」及び「フレームワーク領域４」即ち「ＦＲ４」と称され、このフレーム領域の間には、３つの相補性決定領域即ち「ＣＤＲ」が挿入され、これは当該技術分野でそれぞれ、「相補性決定領域１」即ち「ＣＤＲ１」、「相補性決定領域２」即ち「ＣＤＲ２」及び「相補性決定領域３」即ち「ＣＤＲ３」と称される。本発明のナノボディに存在する、幾つかの好ましいフレームワーク配列及びＣＤＲ（及びこれらの組合せ）を本明細書中に記載している。他の好適なＣＤＲ配列は、本明細書中に記載の方法によって得ることができる。
【０２１１】
本発明の非限定的であるが、好ましい態様によれば、本発明のナノボディ（に存在するＣＤＲ配列）は、
ナノボディが、１０−５モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、及び好ましくは１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、及びより好ましくは１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌの解離定数（ＫＤ）で（即ち１０５Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及び好ましくは１０７Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及びより好ましくは１０８Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モルの結合定数（ＫＡ）で）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合し得るようなもの、及び／又は
ナノボディが、１０２Ｍ−１ｓ−１〜約１０７Ｍ−１ｓ−１、好ましくは１０３Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１、より好ましくは１０４Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１（１０５Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１等）のｋｏｎ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合し得るようなもの、及び／又は
ナノボディが、１ｓ−１（ｔ１／２＝０．６９ｓ）〜１０−６ｓ−１（ｔ１／２が数日である略不可逆的な複合体の場合）、好ましくは１０−２ｓ−１〜１０−６ｓ−１、より好ましくは１０−３ｓ−１〜１０−６ｓ−１（１０−４ｓ−１〜１０−６ｓ−１等）のｋｏｆｆ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合し得るようなものである。
【０２１２】
好ましくは、本発明のナノボディ（に存在するＣＤＲ配列）は、本発明の一価ナノボディ（又は本発明のナノボディを１つだけ含有するポリペプチド）が、５００ｎＭ未満、好ましくは２００ｎＭ未満、より好ましくは１０ｎＭ未満（５００ｐＭ未満等）の親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなものであることが好ましい。
【０２１３】
例えば本明細書中で言及した、ＫＤ、ＫＡ、ｋｏｆｆ又はｋｏｎを測定する一般的技法、及び本明細書中に記載の特定のアッセイの幾つかを使用するそれ自体が既知の方法で、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する本発明のナノボディの親和性を求めることができる。
【０２１４】
本発明のナノボディ（及びこれを含む単一可変ドメイン）とＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する幾つかの好ましいＩＣ５０値は、本明細書中のさらなる記載及び実施例から明らかになる。
【０２１５】
好ましいが非限定的な態様において、本発明は、４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成る、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する（本明細書中に規定の）ナノボディであって、
ＣＤＲ１が、
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、及び／又は
ＣＤＲ２が、
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、及び／又は
ＣＤＲ３が、
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるか、又はこのようなアミノ酸配列の任意の好適な断片であるナノボディに関する。
【０２１６】
特に、好ましいが非限定的なこの態様において、本発明は、４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成る、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する（本明細書中に規定の）ナノボディであって、
ＣＤＲ１が、
ａ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメイン；
ｂ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｃ）配列番号１４４〜配列番号１６１の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、かつ
ＣＤＲ２が、
ｄ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメイン；
ｅ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｆ）配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択され、かつ
ＣＤＲ３が、
ｇ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメイン；
ｈ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有する単一可変ドメイン；
ｉ）配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるか、又はこのようなアミノ酸配列の任意の好適な断片である、ナノボディに関する。
【０２１７】
本発明の単一可変ドメインに関して本明細書で包括的に言及するように本発明のナノボディがｂ）及び／又はｃ）による配列番号１４４〜配列番号１６６の単一可変ドメインを１つ又は複数含有する場合、
ｉ）ｂ）及び／又はｃ）によるこのようなＣＤＲにおいて任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応するａ）によるＣＤＲと比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）ｂ）及び／又はｃ）によるＣＤＲは、対応するａ）によるＣＤＲと比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ｂ）及び／又はｃ）によるＣＤＲは、それ自体が既知の１つ又は複数の親和性成熟技法を用いる親和性成熟によってａ）によるＣＤＲから誘導されるＣＤＲであり得る。
【０２１８】
同様に、本発明のナノボディがｅ）及び／又はｆ）による配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインを１つ又は複数含有する場合、
ｉ）ｅ）及び／又はｆ）によるこのようなＣＤＲにおいて任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応するｄ）によるＣＤＲと比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）ｅ）及び／又はｆ）によるＣＤＲは、対応するｄ）によるＣＤＲと比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ｅ）及び／又はｆ）によるＣＤＲは、それ自体が既知の１つ又は複数の親和性成熟技法を用いる親和性成熟によってｄ）によるＣＤＲから誘導されるＣＤＲであり得る。
【０２１９】
また同様に、本発明のナノボディがｈ）及び／又はｉ）による配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインを１つ又は複数含有する場合、
ｉ）ｈ）及び／又はｉ）によるこのようなＣＤＲにおいて任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応するｇ）によるＣＤＲと比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）ｈ）及び／又はｉ）によるＣＤＲは、対応するｇ）によるＣＤＲと比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ｈ）及び／又はｉ）によるＣＤＲは、それ自体が既知の１つ又は複数の親和性成熟技法を用いる親和性成熟によってｇ）によるＣＤＲから誘導されるＣＤＲであり得る。
【０２２０】
直前の３段落は概して、それぞれｂ）、ｃ）、ｅ）、ｆ）、ｈ）又はｉ）による配列番号１４４〜配列番号１６１、配列番号１８０〜配列番号１９７及び／又は配列番号２１６〜配列番号２３３の単一可変ドメインを１つ又は複数含む、任意の本発明のナノボディに適用されることを理解されたい。
【０２２１】
本発明のナノボディのうち、具体的には上記で明示的に挙げられるＣＤＲを１つ又は複数含むナノボディが好ましい。より具体的には上記で明示的に挙げられるＣＤＲを２つ以上含むナノボディが好ましい。最も具体的には上記で明示的に挙げられるＣＤＲを３つ含むナノボディが好ましい。
【０２２２】
幾つかの特に好ましいが非限定的なＣＤＲ配列の組合せ、及びＣＤＲ配列とフレームワーク配列との好ましい組合せが以下の表Ａ−１Ｂで言及され、これは多くの好ましい（が非限定的な）本発明のナノボディに存在するＣＤＲ配列及びフレームワーク配列を挙げている。当業者にとって明らかなように、同じクローンで現れるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の組合せ（即ち表Ａ−１Ｂの同じ行で言及されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）が通常好ましい（が、本発明はその最も広範な意味ではこれに限定されず、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ配列の他の好適な組合せも含む）。また、同じクローンで現れるＣＤＲ配列とフレームワーク配列との組合せ（即ち表Ａ−１Ｂの同じ行で言及されるＣＤＲ配列及びフレームワーク配列）が通常好ましい（が、本発明はその最も広範な意味ではこれに限定されず、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ配列及びフレームワーク配列の他の好適な組合せ、並びに例えば本明細書でさらに記載されるようなこのようなＣＤＲ配列と他の好適なフレームワーク配列との組合せも含む）。
【０２２３】
また、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲの組合せを含む本発明のナノボディにおいて、それぞれのＣＤＲを、言及されるＣＤＲとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性（本明細書中で規定）を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるＣＤＲに置き換えることができ、ここで
ｉ）このようなＣＤＲにおいて任意のアミノ酸置換は、（本明細書で規定されるように）対応する表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ配列と比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）任意のこのようなＣＤＲ配列は、対応する表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲと比較して、アミノ酸置換だけを含有し、アミノ酸欠失又は挿入は含有しないのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）任意のこのようなＣＤＲ配列は、特に対応する表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ配列から、それ自体が既知の親和性成熟技法によって誘導されるＣＤＲである。
【０２２４】
しかし、当業者にとって明らかなように、表Ａ−１Ｂで言及される、ＣＤＲ配列（の組合せ）、並びにＣＤＲ配列及びフレームワーク配列（の組合せ）が一般的に好ましい。
【０２２５】
表Ａ−１Ａ：好ましい単一可変ドメイン（ナノボディ（商標））
（「クローン名」（最初の列）及び「配列番号ＸＸＸ」は対応する好ましい単一可変ドメイン配列自体を言及するのにも使用され、３つの用語は全て区別なく使用することができる、例えば「１７８Ｃ４」、「配列番号２５２」及び「ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＡＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＲＴＦＳＤＹＡＭＡＷＦＲＱＡＰＧＫＥＲＥＦＶＡＡＩＳＷＳＧＤＳＴＳＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＨＮＡＥＮＴＶＦＬＱＭＮＳＬＫＰＥＤＴＡＶＹＹＣＡＡＤＲＲＶＲＶＨＧＳＷＹＧＳＥＹＷＧＱＧＴＱ5ＴＶＳＳ」という用語は区別なく使用することができる）
【表２】
2011516520.tif 000003
2011516520.tif 000004
【０２２６】
表Ａ−１Ｂ：ＣＤＲ配列の好ましい組合せ、フレームワーク配列の好ましい組合せ、及びフレームワーク配列とＣＤＲ配列との好ましい組合せ
（「ＩＤ」は配列番号を表し、例えば以下で言及され、配列の右側にある「ＩＤ」／「ＩＤ配列番号」の数は対応する配列を表す）
【表３】
2011516520.tif 000005
2011516520.tif 000006
2011516520.tif 000007
2011516520.tif 000008
【０２２７】
このため、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３から成る群から；又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の「配列同一性」（本明細書で規定）を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３それぞれから成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみの「アミノ酸差異」（本明細書で規定）を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３それぞれから成る群から好適に選択される。
【０２２８】
これに関して、「好適に選択される」とは、規定通りに、それぞれＣＤＲ１配列が好適なＣＤＲ１から（即ち本明細書で規定のように）選択され、ＣＤＲ２配列が好適なＣＤＲ２から（即ち本明細書で規定のように）選択され、ＣＤＲ３配列が好適なＣＤＲ３から（即ち本明細書で規定のように）選択されることを意味する。より具体的には、ＣＤＲ配列は、本発明のナノボディが本明細書に規定のように（さらに本明細書に記載されるような（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度、又は代替的にＩＣ５０値として好適に測定される、及び／又は表される）親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するように選択されるのが好ましい。
【０２２９】
特に、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ３配列が少なくとも、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３から成る群から；又は表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ３から成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ３から成る群から好適に選択される。
【０２３０】
好ましくは、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも２つが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３から成る群から；又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３それぞれから成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみの「アミノ酸差異」を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３それぞれから成る群から好適に選択される。
【０２３１】
特に、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ３配列が少なくとも、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３から成る群から；又はそれぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ３から成る群から好適に選択され；存在するＣＤＲ１及びＣＤＲ２の少なくとも１つが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１及び配列番号１８０〜配列番号１９７の単一可変ドメインから成る群から；又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１及びＣＤＲ２の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ１及びＣＤＲ２それぞれから成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１及びＣＤＲ２の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ１及びＣＤＲ２それぞれから成る群から好適に選択される。
【０２３２】
最も好ましくは、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の３つ全てが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３から成る群から；又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３それぞれから成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３それぞれから成る群から好適に選択される。
【０２３３】
さらにより好ましくは、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも１つが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３から成る群から好適に選択される。好ましくはこの態様では、存在する他の２つのＣＤＲ配列の少なくとも１つ、又は好ましくは両方が、表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられる対応するＣＤＲ配列の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ配列から；及び／又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられる対応する配列の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ配列から成る群から好適に選択される。
【０２３４】
特に、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ３配列が少なくとも、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３から成る群から好適に選択される。好ましくはこの態様では、存在するＣＤＲ１及びＣＤＲ２の少なくとも１つ、好ましくは両方が、表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１及びＣＤＲ２の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ１及びＣＤＲ２それぞれから成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂでそれぞれ挙げられるＣＤＲ１及びＣＤＲ２の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ１及びＣＤＲ２それぞれから成る群から好適に選択される。
【０２３５】
さらにより好ましくは、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の少なくとも２つが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３から成る群から好適に選択される。好ましくはこの態様では、存在する残りのＣＤＲ配列が、表Ａ−１Ｂで挙げられる対応するＣＤＲ配列の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ配列から成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂで挙げられる対応する配列の少なくとも１つとの、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ配列から成る群から好適に選択される。
【０２３６】
特に、本発明のナノボディにおいて、ＣＤＲ３配列が少なくとも、表Ａ−１Ｂで挙げられる配列番号２１６〜配列番号２３３から成る群から好適に選択され、ＣＤＲ１配列又はＣＤＲ２配列のいずれかが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１及びＣＤＲ２から成る群から好適に選択される。好ましくは、この態様において、存在する残りのＣＤＲ配列が、表Ａ−１Ｂで挙げられる対応するＣＤＲ配列の少なくとも１つとの、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ配列から成る群から；及び／又は表Ａ−１Ｂで挙げられる対応するＣＤＲ配列との、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ配列から成る群から好適に選択される。
【０２３７】
さらにより好ましくは、本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の３つ全てが、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３から成る群から好適に選択される。
【０２３８】
また概して、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲの組合せ（即ち表Ａ−１Ｂの同じ行で言及されるもの）が好ましい。このため概して、本発明のナノボディにおけるＣＤＲが、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ配列であるか、又は表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ配列との、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ配列の群から；及び／又は表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ配列との、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ配列から成る群から好適に選択される場合、他のＣＤＲの少なくとも１つ、好ましくは両方が、表Ａ−１Ｂにおける同じ組合せ（即ち表Ａ−１Ｂの同じ行で言及されるもの）に属するＣＤＲ配列から好適に選択されるか、又は同じ組合せに属するＣＤＲ配列（複数可）との、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９９％の配列同一性を有するＣＤＲ配列から成る群から；及び／又は同じ組合せに属するＣＤＲ配列（複数可）との、３つ、２つ若しくは１つのみのアミノ酸差異を有するＣＤＲ配列から成る群から好適に選択されることが好ましい。上記の段落で示される他の優先事項（preferences）は、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲの組合せにも適用される。
【０２３９】
このため、非限定的な例により、本発明のナノボディは例えば、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ１配列と、表Ａ−１Ｂで言及される（が、異なる組合せに属する）ＣＤＲ２の１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有するＣＤＲ２配列と、ＣＤＲ３配列とを含むことができる。
【０２４０】
幾つかの好ましい本発明のナノボディは例えば、（１）表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ１配列と、表Ａ−１Ｂで言及される（が、異なる組合せに属する）ＣＤＲ２の１つとの、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有するＣＤＲ２配列と、表Ａ−１Ｂで言及される（が、異なる組合せに属する）ＣＤＲ３の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ３配列と；又は（２）表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ１配列と、ＣＤＲ２配列と、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３の１つと；又は（３）ＣＤＲ１配列と、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ２配列の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ２配列と、ＣＤＲ２配列と同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ３配列との、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有するＣＤＲ３配列とを含み得る。
【０２４１】
幾つかの特に好ましい本発明のナノボディは例えば以下のものを含み得る：
（１）表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ１配列；同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ２配列との、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有するＣＤＲ２配列；及び同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ３配列との８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ３配列；又は（２）ＣＤＲ１配列、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ２、及び表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３配列（ここでＣＤＲ２配列とＣＤＲ３配列とは異なる組合せに属し得る）。
【０２４２】
幾つかのさらにより好ましい本発明のナノボディは例えば以下のものを含み得る：
（１）表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１の１つとの８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ１配列；同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ２配列；及び異なる組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ３配列；又は（２）表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１配列；同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ２配列との、３つ、２つ若しくは１つのアミノ酸差異を有するＣＤＲ２配列；及び同じ若しくは異なる組合せに属する、表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ３配列との８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ３配列。
【０２４３】
特に好ましい本発明のナノボディは例えば、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ１配列と、同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ２配列との８０％を超える配列同一性を有するＣＤＲ２配列と、同じ組合せに属する、表Ａ−１Ｂで言及されるＣＤＲ３配列とを含み得る。
【０２４４】
最も好ましい本発明のナノボディにおいて、存在するＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、それぞれ表Ａ−１Ｂで挙げられるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３の組合せの１つから好適に選択される。
【０２４５】
別の好ましいが非限定的な本発明の態様によれば、（ａ）ＣＤＲ１は１個〜１２個のアミノ酸残基、通常２個〜９個のアミノ酸残基、例えば５個、６個又は７個のアミノ酸残基の長さを有し、及び／又は（ｂ）ＣＤＲ２は１３個〜２４個のアミノ酸残基、通常１５個〜２１個のアミノ酸残基、例えば１６個及び１７個のアミノ酸残基の長さを有し、及び／又は（ｃ）ＣＤＲ３は２個〜３５個のアミノ酸残基、通常３個〜３０個のアミノ酸残基、例えば６個〜２３個のアミノ酸残基の長さを有する。
【０２４６】
別の好ましいが非限定的な態様では、本発明は、ＣＤＲ配列（本明細書で規定）が、配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つのＣＤＲ配列との、８０％超、好ましくは９０％超、より好ましくは９５％超、例えば９９％以上の配列同一性（本明細書で規定）を有するナノボディに関する。
【０２４７】
概して、上記のＣＤＲ配列を有するナノボディが、本明細書でさらに記載されるようなものであり、好ましくは同様に本明細書でさらに記載されるようなものであるフレームワーク配列を有し得る。このため、例えば本明細書で言及されるようにこのようなナノボディは、（任意の好適な種由来の）天然のナノボディ、天然の（即ち好適なラクダ科動物種由来の）ＶＨＨ配列、又は合成若しくは半合成の単一可変ドメイン若しくはナノボディ（部分ヒト化ナノボディ又はＶＨＨ配列、完全ヒト化ナノボディ又はＶＨＨ配列、ラクダ化重鎖可変ドメイン配列が挙げられるが、これらに限定されない）、及び本明細書で言及される技法により得られたナノボディであり得る。
【０２４８】
このため、具体的であるが非限定的な一態様において、本発明は、４つのフレームワーク領域（それぞれ、ＦＲ１〜ＦＲ４）と、３つの相補性決定領域（それぞれ、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３）とから成るヒト化ナノボディであって、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、上記ヒト化ナノボディは、少なくとも１つのヒト化置換（本明細書で規定）、具体的にはそのフレームワーク配列（本明細書で規定）の少なくとも１つに少なくとも１つのヒト化置換を含む、ヒト化ナノボディに関する。
【０２４９】
別の好ましいが非限定的な態様において、本発明は、ＣＤＲ配列が、配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインのうちの少なくとも１つのＣＤＲ配列との、少なくとも７０％のアミノ酸同一性、好ましくは少なくとも８０％のアミノ酸同一性、より好ましくは少なくとも９０％のアミノ酸同一性、例えば９５％若しくはそれ以上のアミノ酸同一性、又はさらに本質的に１００％のアミノ酸同一性を有するナノボディに関する。このアミノ酸同一性の程度は例えば、上記のナノボディと配列番号２５５〜配列番号２６９の配列の１つ又は複数との間のアミノ酸同一性の程度を（本明細書で記載のように）求めることにより決定することができ、ここでフレームワーク領域を形成するアミノ酸残基は無視する。このようなナノボディが本明細書でさらに説明され得る。
【０２５０】
別の好ましいが非限定的な態様において、本発明は、配列番号２５５〜配列番号２６９から成る群から、又は配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、８０％超、好ましくは９０％超、より好ましくは９５％超、例えば９９％以上の配列同一性（本明細書で規定）を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるアミノ酸配列を有するナノボディに関する。
【０２５１】
別の好ましいが非限定的な本発明の態様は、対応する天然ＶＨＨ配列と比較して、少なくとも１つのヒト化置換（本明細書で規定）、具体的にはそのフレームワーク配列（本明細書で規定）の少なくとも１つに少なくとも１つのヒト化置換を含む、配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディのヒト化変異型に関する。
【０２５２】
本発明の単一可変ドメインは少なくとも１つの本発明のナノボディを含むか、又は本質的にこれから成る。本発明の単一可変ドメインの幾つかの好ましいが非限定的な例は配列番号２５５〜配列番号２６９で与えられる。
【０２５３】
「好ましい」（又は「より好ましい」、「さらにより好ましい」等）と本明細書中で言及されるナノボディが、本明細書中に記載の単一可変ドメインで使用するのにも好ましい（又はより好ましい、又はさらにより好ましい等）ことは、当業者にとって明らかである。このように概して、１つ又は複数の「好ましい」本発明のナノボディを含むか、又は本質的にこれから成る単一可変ドメインが好ましく、概して１つ又は複数の「より好ましい」本発明のナノボディを含むか、又は本質的にこれから成る単一可変ドメインがより好ましく、他も同様である。
【０２５４】
概して、単一のナノボディ（本発明の単一のナノボディ等）を含むか、又は本質的にこれから成るタンパク質又は単一可変ドメインは、本明細書で「一価」タンパク質若しくは単一可変ドメイン、又は「一価構築物」と呼ばれる。２つ以上のナノボディ（少なくとも２つの本発明のナノボディ、又は少なくとも１つの本発明のナノボディ及び少なくとも１つの他のナノボディ等）を含むか、又は本質的にこれから成るタンパク質及び単一可変ドメインは、本明細書で「多価」タンパク質若しくは単一可変ドメイン、又は「多価構築物」と呼ばれ、これらは、対応する本発明の一価のナノボディに比べて或る特定の利点を与え得る。このような多価構築物の幾つかの非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２５５】
具体的であるが、非限定的な一態様によれば、本発明のポリペプチドは、少なくとも２つの本発明のナノボディ、例えば２つ又は３つの本発明のナノボディを含むか、又は本質的にこれから成る。本明細書中にさらに記載のように、このような多価構築物は、本発明の単一ナノボディを含むか、又は本質的にこれから成るタンパク質又はポリペプチドに比べて、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する結合活性が大きく改善するというような、或る特定の利点を与えることができる。このような多価構築物は、本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかである。
【０２５６】
具体的であるが、非限定的な別の態様によれば、本発明のポリペプチドは、少なくとも１つの本発明のナノボディと、少なくとも１つの他の結合単位（即ち別のエピトープ、抗原、標的、タンパク質又はポリペプチドに指向性を有する）とを含むか、又は本質的にこれから成り、これは好ましくはナノボディでもある。このようなタンパク質又は単一可変ドメインは、本明細書中で「多重特異性」タンパク質若しくは単一可変ドメイン、又は「多重特異性構築物」とも称され、これらは、（好ましいが非限定的な幾つかの多重特異性構築物の本明細書中のさらなる考察から明らかになるように）対応する本発明の一価ナノボディに比べて或る特定の利点を与え得る。このような多重特異性構築物は、本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかである。
【０２５７】
具体的であるが、非限定的なさらに別の態様によれば、本発明のポリペプチドは、少なくとも１つの本発明のナノボディと、任意で１つ又は複数のさらなるナノボディと、本発明のナノボディに及び／又は得られた融合タンパク質に少なくとも１つの所望の特性を与える少なくとも１つの他のアミノ酸配列（タンパク質又はポリペプチド等）とを含むか、又は本質的にこれから成る。ここでも同様に、このような融合タンパク質は、対応する本発明の一価ナノボディに比べて或る特定の利点を与え得る。このような融合構築物の幾つかの非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２５８】
例えば２つ以上の上記の態様を組合せて、２つの本発明のナノボディと、１つの他のナノボディと、任意で１つ又は複数の他のアミノ酸配列とを含む三価の二重特異性構築物を提供することも可能である。このような構築物、及び本発明の文脈内で特に好ましい幾つかの構築物のさらなる非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２５９】
上記の構築物において、１つ又は複数のナノボディ及び／又は他の単一可変ドメインは、互いに直接連結しても、及び／又は１つ又は複数のリンカー配列を介して互いに好適に連結してもよい。このようなリンカーの幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２６０】
具体的な本発明の一態様において、本発明のナノボディ、又は少なくとも１つの本発明のナノボディを含む、本発明の化合物、構築物若しくはポリペプチドの半減期は、対応する本発明のアミノ酸配列に比べて増大し得る。このようなナノボディ、化合物及び単一可変ドメインの幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる開示に基づき、当業者にとって明らかになり、例えば（例えばペグ化によって）半減期が増大するように化学修飾した本発明のナノボディ配列又は単一可変ドメイン；血清タンパク質（血清アルブミン等、例えば欧州特許第０３６８６８４号明細書の４頁を参照されたい）との結合に関する、少なくとも１つのさらなる結合部位を含む本発明の単一可変ドメイン；又は本発明のナノボディの半減期を増大させる、少なくとも１つの部位（特に少なくとも１つのアミノ酸配列）と連結する、少なくとも１つの本発明のナノボディを含む本発明の単一可変ドメインを含む。このような半減期が延びた部位又は単一可変ドメインを含む本発明の単一可変ドメインの例は、本明細書中のさらなる開示に基づき、当業者にとって明らかになり、例えば１つ又は複数の本発明のナノボディが、１つ又は複数の血清タンパク質若しくはその断片（血清アルブミン又はその好適な断片等）、又は血清タンパク質と結合することができる、１つ又は複数の結合単位（例えば血清アルブミン等の血清タンパク質、ＩｇＧ等の血清免疫グロブリン、又はトランスフェリンと結合することができるナノボディ又は（単一）ドメイン抗体等）と好適に連結する単一可変ドメイン；本発明のナノボディがＦｃ部分（ヒトＦｃ等）又はその好適な部分若しくは断片と連結する単一可変ドメイン；又は１つ又は複数の本発明のナノボディが、血清タンパク質と結合することができる、１つ又は複数の小さいタンパク質又はペプチドと好適に連結する単一可変ドメインが挙げられるが、これらに限定されない（例えば国際公開第９１／０１７４３号パンフレット、国際公開第０１／４５７４６号パンフレット、国際公開第０２／０７６４８９号パンフレット、及び２００６年１２月５日付で出願したAblynx N.V.の"Peptides capable ofbinding to serum proteins"と題したAblynx N.V.の米国仮特許出願（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ／２００７／０６３３４８号明細書も参照されたい）に記載のタンパク質及びペプチドであるが、これに限定されない）。
【０２６１】
さらに、当業者にとって明らかなように、このようなナノボディ、化合物、構築物又は単一可変ドメインは、三重特異性又は多重特異性ナノボディ構築物を提供するように、１つ又は複数のさらなる基、残基、部位、又は結合単位（例えば１つ又は複数のさらなる特に１つ又は複数のさらなるナノボディ（即ちＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有しない））を含有し得る。
【０２６２】
概して、半減期が増大した本発明のナノボディ（又はこれを含む化合物、構築物若しくは単一可変ドメイン）は、対応する本発明のアミノ酸配列自体の半減期の少なくとも１．５倍、好ましくは少なくとも２倍（少なくとも５倍等）、例えば少なくとも１０倍又は２０倍を超える半減期を有するのが好ましい。例えば、半減期が増大した本発明のナノボディ、化合物、構築物又は単一可変ドメインは、対応する本発明のアミノ酸配列自体に比べて、半減期が１時間を超えて、好ましくは２時間を超えて、より好ましくは６時間を超えて（１２時間等を超えて）、又はさらに２４時間、４８時間若しくは７２時間を超えて増大し得る。
【０２６３】
好ましいが非限定的な本発明の態様において、このような本発明のナノボディ、化合物、構築物又は単一可変ドメインは、少なくとも約１２時間、好ましくは少なくとも２４時間、より好ましくは少なくとも４８時間、さらにより好ましくは少なくとも７２時間以上のヒトにおける血清半減期を示す。例えば本発明の化合物又は単一可変ドメインは、少なくとも５日（約５日〜１０日等）、好ましくは少なくとも９日（約９日〜１４日等）、より好ましくは少なくとも約１０日（約１０日〜１５日等）、若しくは少なくとも約１１日（約１１日〜１６日等）、より好ましくは少なくとも約１２日（約１２日〜１８日以上等）、又は１４日超（約１４日〜１９日等）の半減期を有し得る。
【０２６４】
本発明の別の一態様では、本発明のポリペプチドは、得られた本発明のポリペプチドが血液脳関門を横断するのを可能にする（任意で１つ又は複数の好適なリンカー配列を介して）１つ又は複数（例えば２つ及び好ましくは１つ）の単一可変ドメインに連結する、１つ又は複数（例えば２つ又は好ましくは１つ）の本発明のナノボディを含む。特に、得られた本発明の単一可変ドメインが血液脳関門を横断するのを可能にする上記１つ又は複数の単一可変ドメインは、１つ又は複数の（例えば２つ及び好ましくは１つ）ナノボディ、例えば、国際公開第０２／０５７４４５号パンフレットに記載のナノボディ（好ましい例は、ＦＣ４４（国際公開第０６／０４０１５３号パンフレットの配列番号１８９）及びＦＣ５（国際公開第０６／０４０１５４号パンフレットの配列番号１９０）である）であり得る。
【０２６５】
特に、１つ又は複数の本発明のナノボディを含む単一可変ドメインは、
１０−５モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、及び好ましくは１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、及びより好ましくは１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌの解離定数（ＫＤ）で（即ち１０５Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及び好ましくは１０７Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、及びより好ましくは１０８Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モルの結合定数（ＫＡ）で）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなもの、及び／又は
１０２Ｍ−１ｓ−１〜約１０７Ｍ−１ｓ−１、好ましくは１０３Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１、より好ましくは１０４Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１（１０５Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１等）のｋｏｎ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなもの、及び／又は
１ｓ−１（ｔ１／２＝０．６９ｓ）〜１０−６ｓ−１（ｔ１／２が数日である略不可逆的な複合体の場合）、好ましくは１０−２ｓ−１〜１０−６ｓ−１、より好ましくは１０−３ｓ−１〜１０−６ｓ−１（１０−４ｓ−１〜１０−６ｓ−１等）のｋｏｆｆ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなものであるのが好ましい。
【０２６６】
好ましくは、本発明のアミノ酸配列を１つだけ含有するポリペプチドが、５００ｎＭ未満、好ましくは２００ｎＭ未満、より好ましくは１０ｎＭ未満（５００ｐＭ未満等）の親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなものであるのが好ましい。これに対して、本発明のナノボディを２つ以上含有するポリペプチドは、本発明のアミノ酸配列を１つだけ含有するポリペプチドに比べて、増大した結合活性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができることが当業者には明らかである。
【０２６７】
単一可変ドメイン、即ち本発明の単一可変ドメインとＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーとの結合に関する幾つかの好ましいＩＣ５０値は、本明細書のさらなる記載及び実施例から明らかになる。
【０２６８】
本発明のこの好ましい態様による他の単一可変ドメインは例えば、配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの１つ又は複数との、８０％超、好ましくは９０％超、より好ましくは９５％超、例えば９９％以上の「配列同一性」（本明細書で規定）を有する単一可変ドメインから成る群から選択され得る。ここで上記単一可変ドメイン内に含まれるナノボディは本明細書でさらに規定されるようなものであるのが好ましい。
【０２６９】
本発明の別の態様は、本発明のアミノ酸配列（本発明のナノボディ等）をコードする核酸、又はこれを含む本発明のポリペプチドに関する。さらに、本発明の核酸に関して本明細書中に概して記載するように、このような核酸は、本明細書中に規定のように遺伝子構築物の形態であり得る。
【０２７０】
別の態様において、本発明は、本発明のアミノ酸配列（本発明のナノボディ等）及び／又はこれを含む本発明のポリペプチドを発現するか、又は発現することができる、及び／又は本発明の核酸を含有する宿主又は宿主細胞に関する。このような宿主又は宿主細胞の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２７１】
本発明の別の態様は、少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列と、少なくとも１つの本発明のポリペプチド及び／又は少なくとも１つの本発明の核酸と、任意で（即ち組成物の使用目的に応じて）それ自体が既知のこのような組成物の１つ又は複数のさらなる構成要素とを含有するか又は含む産物又は組成物に関する。このような産物又は組成物は例えば、（本明細書に記載の）薬学的組成物、獣医学的組成物又は（同様に本明細書に記載の）診断用途のための産物若しくは組成物であり得る。このような産物又は組成物の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２７２】
本発明はさらに、本明細書中に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、産物及び組成物を調製又は生成する方法に関する。このような方法の幾つかの好ましいが非限定的な例は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２７３】
本発明はさらに、本明細書中に記載のアミノ酸配列、化合物、構築物、単一可変ドメイン、核酸、宿主細胞、産物及び組成物の適用及び使用、並びにＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに関連する疾患及び障害を予防及び／又は治療する方法に関する。幾つかの好ましいが非限定的な適用及び使用は、本明細書中のさらなる記載から明らかになる。
【０２７４】
また本発明の他の態様、実施形態、利点及び用途は、本明細書中の以下のさらなる記載から明らかになる。
【０２７５】
概して、最も広範な意味で本明細書で使用される用語ナノボディは、特定の生物学的供給源又は特定の調製方法に限定されないことに留意すべきである。例えば、以下でより詳細に考察されるように、本発明のナノボディは概して、（１）天然の重鎖抗体のＶＨＨドメインを単離すること、（２）天然のＶＨＨドメインをコードするヌクレオチド配列の発現、（３）天然ＶＨＨドメインの（本明細書に記載の）「ヒト化」、又はこのようなヒト化ＶＨＨドメインをコードする核酸の発現、（４）任意の動物種、特に哺乳動物種（例えばヒト）由来の天然ＶＨドメインの（本明細書に記載の）「ラクダ化」、又はこのようなラクダ化ＶＨドメインをコードする核酸の発現、（５）Ward et al（同上）によって記載されるような「ドメイン抗体」若しくは「Ｄａｂ」の「ラクダ化」、又はこのようなラクダ化ＶＨドメインをコードする核酸の発現、（６）それ自体が既知である、タンパク質、単一可変ドメイン又は他の単一可変ドメインを調製するのに合成技法又は半合成技法を使用すること、（７）それ自体が既知である核酸合成技法を使用して、ナノボディをコードする核酸を調製した後、このようにして得られた核酸を発現すること、及び／又は（８）上記の任意の組合せの１つ又は複数によって得ることができることに留意すべきである。上記を実施するのに好適な方法及び技法は、本明細書中の開示に基づいて当業者にとって明らかであり、例えば本明細書でより詳細に記載される方法及び技法を含む。
【０２７６】
１つの好ましい群のナノボディは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する天然重鎖抗体のＶＨＨドメインに対応する。本明細書にさらに記載されるように、このようなＶＨＨ配列は概して、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーをラクダ科動物種に好適に（即ち免疫応答及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する重鎖抗体を生じるように）免疫付与すること、上記ラクダ科動物由来の好適な生体試料（例えば血液試料、血清試料又はＢ細胞の試料）を得ること、及びそれ自体が既知の任意の好適な技法を使用して、上記試料からＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するＶＨＨ配列を生成することによって、生成又は入手することができる。このような技法は、当業者にとって明らかであり、及び／又は本明細書でさらに記載される。
【０２７７】
代替的に、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するこのような天然ＶＨＨドメインは、例えばそれ自体が既知の１つ又は複数のスクリーニング技法を用いて、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又は少なくとも１つのその部分、断片、抗原決定基若しくはエピトープを使用して、このようなライブラリをスクリーニングすることによってラクダ科動物のＶＨＨ配列のナイーブライブラリから得ることができる。このようなライブラリ及び技法は例えば、国際公開第９９／３７６８１号パンフレット、国際公開第０１／９０１９０号パンフレット、国際公開第０３／０２５０２０号パンフレット及び国際公開第０３／０３５６９４号パンフレットに記載されている。代替的に、ナイーブＶＨＨライブラリ由来の改良型の合成ライブラリ又は半合成ライブラリ（例えばランダム突然変異法及び／又はＣＤＲシャッフリング（例えば国際公開第００／４３５０７号パンフレットに記載されているようなもの）等の技法によって、ナイーブＶＨＨライブラリから得られるＶＨＨライブラリ）を使用してもよい。
【０２７８】
このように、別の態様において、本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するナノボディを生成する方法に関する。一態様では、上記方法は少なくとも、
ａ）ナノボディ配列のセット、コレクション又はライブラリを準備する工程と、
ｂ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有するナノボディ配列に関して、上記のナノボディ配列のセット、コレクション又はライブラリをスクリーニングする工程と、
ｃ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有するアミノ酸配列（複数可）を単離する工程とを含む。
【０２７９】
このような方法では、ナノボディ配列のセット、コレクション又はライブラリは、ナノボディ配列のナイーブセット、ナイーブコレクション又はナイーブライブラリ、ナノボディ配列の合成又は半合成のセット、コレクション又はライブラリ、及び／又は親和性成熟を受けているナノボディ配列のセット、コレクション又はライブラリであり得る。
【０２８０】
この方法の好ましい態様では、ナノボディ配列のセット、コレクション又はライブラリは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれに基づく若しくはこれに由来する好適な抗原決定基（例えばその抗原の部分、断片、領域、ドメイン、ループ又は他のエピトープ）を好適に免疫付与したラクダ科動物種に由来している、ナノボディ配列の免疫セット、免疫コレクション又は免疫ライブラリ、特にＶＨＨ配列の免疫セット、免疫コレクション又は免疫ライブラリであり得る。特定の一態様では、上記抗原決定基は、細胞外の部分、領域、ドメイン、ループ又は他の細胞外エピトープ（複数可）であり得る。
【０２８１】
上記の方法において、ナノボディ配列又はＶＨＨ配列のセット、コレクション又はライブラリは、スクリーニングを容易にするように、ファージ、ファージミド、リボソーム又は好適な微生物（酵母等）上に提示してもよい。ナノボディ配列（のセット、コレクション又はライブラリ）を提示及びスクリーニングするのに好適な方法、技法及び宿主生物は、例えば本明細書中のさらなる開示に基づいて当業者にとって明らかである。国際公開第０３／０５４０１６号パンフレット及びNature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116（2005）におけるHoogenboomによる総説も参照されたい。
【０２８２】
別の態様において、ナノボディ配列を生成する方法は、少なくとも
ａ）免疫グロブリン配列を発現するラクダ科動物種由来の細胞のコレクション又は試料を準備する工程と、
ｂ）（ｉ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有する免疫グロブリン配列を発現する細胞、（ｉｉ）重鎖抗体を発現する細胞に関して上記細胞のコレクション又は試料をスクリーニングする工程であって、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対して親和性を有する重鎖抗体を発現する細胞を少なくとも１つ提供するように、本質的に単一のスクリーニング工程として、又は２つの別々のスクリーニング工程として任意の好適な順番で下位工程（ｉ）及び（ｉｉ）を実施することができる、スクリーニングする工程と、
ｃ）（ｉ）上記重鎖抗体に存在するＶＨＨ配列を上記細胞から単離する工程、又は（ｉｉ）上記重鎖抗体に存在するＶＨＨ配列をコードする核酸配列を上記細胞から単離し、その後上記ＶＨＨドメインを発現する、単離する工程のいずれかとを含む。
【０２８３】
この態様による方法において、細胞のコレクション又は試料は例えば、Ｂ細胞のコレクション又は試料であり得る。また、この方法では、細胞の試料は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれに基づく若しくはこれに由来する好適な抗原決定基（例えばその抗原の部分、断片、領域、ドメイン、ループ又は他のエピトープ）を好適に免疫付与したラクダ科動物に由来し得る。特定の一態様では、上記抗原決定基は、細胞外の部分、領域、ドメイン、ループ又は他の細胞外エピトープ（複数可）であり得る。
【０２８４】
上記の方法は、当業者にとって明らかなように、任意の好適な方法で行われ得る。例えば欧州特許第０５４２８１０号明細書、国際公開第０５／１９８２４号パンフレット、国際公開第０４／０５１２６８号パンフレット及び国際公開第０４／１０６３７７号パンフレットを参照されたい。工程ｂ）のスクリーニングは、ＦＡＣＳ等のフローサイトメトリ法を使用して行うのが好ましい。これに関しては、例えばLieby et al., Blood, Vol. 97, No. 12, 3820を参照されたい。特に、Ablynx N.V.による国際出願である国際公開第０６／０７９３７２号で記載のいわゆる「ナノクローン（商標）」法を参照されたい。
【０２８５】
別の態様において、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するアミノ酸配列を生成する方法は、少なくとも
ａ）重鎖抗体又はナノボディ配列をコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリを準備する工程と、
ｂ）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合することができる、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する親和性を有する重鎖抗体又はナノボディ配列をコードする核酸配列に関して、上記核酸配列のセット、コレクション又はライブラリをスクリーニングする工程と、
ｃ）上記核酸配列を単離し、その後それぞれ上記重鎖抗体に存在するＶＨＨ配列を発現するか、又は上記ナノボディ配列を発現する、単離する工程とを含み得る。
【０２８６】
このような方法では、重鎖抗体又はナノボディ配列をコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリは例えば、重鎖抗体又はＶＨＨ配列のナイーブセット、ナイーブコレクション又はナイーブライブラリをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリ；ナノボディ配列の合成又は半合成のセット、コレクション又はライブラリをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリ；及び／又は親和性成熟を受けているナノボディ配列のセット、コレクション又はライブラリをコードする核酸配列のセット、コレクション又はライブラリであり得る。
【０２８７】
この方法の好ましい態様では、単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、又はこれに基づく若しくはこれに由来する好適な抗原決定基（例えばその抗原の部分、断片、領域、ドメイン、ループ又は他のエピトープ）を好適に免疫付与したラクダ科動物由来の重鎖抗体又はＶＨＨ配列をコードする核酸配列の免疫セット、免疫コレクション又は免疫ライブラリであり得る。特定の一態様では、上記抗原決定基は、細胞外の部分、領域、ドメイン、ループ又は他の細胞外エピトープ（複数可）であり得る。
【０２８８】
上記の方法において、ヌクレオチド配列のセット、コレクション又はライブラリは、スクリーニングを容易にするように、ファージ、ファージミド、リボソーム又は好適な微生物（例えば酵母）上に提示してもよい。単一可変ドメインをコードするヌクレオチド配列（のセット、コレクション又はライブラリ）を提示及びスクリーニングするのに好適な方法、技法及び宿主生物は、例えば本明細書中のさらなる開示に基づいて当業者にとって明らかである。国際公開第０３／０５４０１６号パンフレット及びNature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116（2005）におけるHoogenboomによる総説も参照されたい。
【０２８９】
当業者にとって明らかなように、本明細書中に記載の方法のスクリーニング工程を選択工程として実施することもできる。したがって、本明細書で使用する「スクリーニング」という用語は、選択、スクリーニング、又は選択法及び／又はスクリーニング法の任意の好適な組合せを含むことができる。また、配列のセット、コレクション又はライブラリを使用する場合、これは、１個、２個、３個又は約５個、１０個、５０個、１００個、５００個、１０００個、５０００個、１０４個、１０５個、１０６個、１０７個、１０８個以上の配列等の任意の好適な数の配列を含有し得る。
【０２９０】
また、上記の単一可変ドメインのセット、コレクション又はライブラリにおける配列の１つ又は複数又は全ては、コンピュータモデリング法又は生物静力学法又はデータマイニング法等の合理的又は半経験的なアプローチで入手又は規定され得る。
【０２９１】
さらに、このようなセット、コレクション又はライブラリは、自然に多様化した配列（例えば免疫ライブラリ））の多様なセットに由来する複数の配列を含む、（例えば、指定の点突然変異又はランダム化した位置で）互いの変異体である１つ、２つ以上の配列、又は任意の他の多様な配列源（例えばHoogenboom et al, Nat Biotechnol 23: 1105, 2005及びBinz et al, Nat Biotechnol 2005, 23: 1247に記載）を含み得る。配列のこのようなセット、コレクション又はライブラリは、ファージ粒子、リボソーム、細菌、酵母細胞、哺乳動物細胞の表面上に提示し、これらの担体内でアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列に連結することができる。このことが、このようなセット、コレクション又はライブラリを、所望の本発明の単一可変ドメインを単離する選択法に従わせる。より一般的には、配列が好適な宿主又は宿主細胞上に提示される場合、初めに上記宿主又は宿主細胞から所望の配列をコードするヌクレオチド配列を単離した後、好適な宿主生物で上記ヌクレオチド配列を好適に発現することによって所望の配列を得ることも可能である（慣習になっている）。さらに、当業者にとって明らかなように、それ自体が既知の任意の好適な方法でこれを実施することができる。
【０２９２】
Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するＶＨＨ配列又はナノボディ配列を得るためのさらに別の技法は、（即ち免疫応答及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する重鎖抗体を生じるように）重鎖抗体を発現することができるトランスジェニック哺乳動物に好適に免疫付与すること、上記ＶＨＨ配列又はナノボディ配列（をコードする核酸配列）を含有する上記トランスジェニック哺乳動物由来の好適な生体試料（例えば血液試料、血清試料又はＢ細胞の試料）を得ること、及びこれからそれ自体が既知の任意の好適な技法（本明細書で記載の方法又はハイブリドーマ法のいずれか等）を使用して、上記試料からＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するＶＨＨ配列を生成することを伴う。例えばこのために、国際公開第０２／０８５９４５号パンフレット、国際公開第０４／０４９７９４号パンフレット、国際公開第０６／００８５４８号パンフレット及びJanssens et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006 Oct 10;103（41）:15130-5に記載されている重鎖抗体発現マウス、並びにさらなる方法及び技法を使用することができる。例えば、このような重鎖抗体発現マウスは、天然源由来の（単一）可変ドメイン（例えばヒト（単一）可変ドメイン、ラクダ科動物（単一）可変ドメイン又はサメ（単一）可変ドメイン）及び例えば合成又は半合成の（単一）可変ドメイン等の任意の好適な（単一）可変ドメインを有する重鎖抗体を発現することができる。
【０２９３】
本発明は、上記方法、又は代替的に上記の方法の１つと、さらに少なくとも上記ＶＨＨ配列又はナノボディ配列のヌクレオチド配列又はアミノ酸配列を決定する工程と、好適な宿主細胞若しくは宿主生物における発現又は化学合成のようなそれ自体が既知の方法で上記ＶＨＨ配列又はナノボディ配列を発現又は合成する工程とを含む方法によって得られるＶＨＨ配列又はナノボディ配列にも関する。
【０２９４】
本明細書で言及されるように、特に好ましい群の本発明のナノボディは、天然ＶＨＨドメインのアミノ酸配列に対応するが、即ち上記天然ＶＨＨ配列（特にフレームワーク配列）のアミノ酸配列における１つ又は複数のアミノ酸残基を、（例えば上記の）ヒトの従来の四本鎖抗体由来のＶＨドメインの対応する位置（複数可）で発生する１つ又は複数のアミノ酸残基に置き換えることによって「ヒト化」したアミノ酸配列を有するナノボディを含む。例えば本明細書中のさらなる記載及び本明細書で言及されたヒト化に関する従来技術に基づいて、当業者にとって明らかなそれ自体が既知の方法で、これを実施することができる。また、このような本発明のヒト化ナノボディは、それ自体が既知の任意の好適な方法で（即ち上記の（１）〜（８）で示されたように）得ることができ、このため出発材料として天然ＶＨＨドメインを含むポリペプチドを使用して得られた単一可変ドメインに厳密に限定されないことに留意すべきである。
【０２９５】
別の特に好ましい群の本発明のナノボディは、天然ＶＨドメインのアミノ酸配列に対応するが、即ち従来の四本鎖抗体由来の天然ＶＨドメインのアミノ酸配列における１つ又は複数のアミノ酸残基を、重鎖抗体のＶＨＨドメインの対応する位置（複数可）で発生する１つ又は複数のアミノ酸残基に置き換えることによって「ラクダ化」したアミノ酸配列を有するナノボディを含む。例えば本明細書中のさらなる記載に基づいて、当業者にとって明らかなそれ自体が既知の方法で、これを実施することができる。このような「ラクダ化」置換は、本明細書に規定のように、ＶＨ−ＶＬ界面及び／又はいわゆるラクダ科動物の特徴的な残基を形成し、及び／又はＶＨ−ＶＬ界面及び／又はいわゆるラクダ科動物の特徴的な残基に存在するアミノ酸位置に挿入するのが好ましい（例えば国際公開第９４／０４６７８号パンフレット及びDavies and Riechmann（1994 and 1996）（同上）を参照されたい）。好ましくは、出発材料又はラクダ化ナノボディを生成若しくは設計するための出発点として使用されるＶＨ配列は、好ましくは哺乳動物由来のＶＨ配列、より好ましくはヒトのＶＨ配列（例えばＶＨ３配列）である。しかし、このような本発明のラクダ化ナノボディは、それ自体が既知の任意の好適な方法で（即ち上記の（１）〜（８）で示されたように）得ることができ、このため出発材料として天然ＶＨドメインを含むポリペプチドを使用して得られた単一可変ドメインに厳密に限定されないことに留意すべきである。
【０２９６】
例えば同様に、本明細書にさらに記載されるように、それぞれ天然のＶＨＨドメイン又はＶＨドメインをコードするヌクレオチド配列を準備した後、それ自体が既知の方法で、新規のヌクレオチド配列がそれぞれ、本発明の「ヒト化」又は「ラクダ化」ナノボディをコードするように、上記ヌクレオチド配列における１つ又は複数のコドンを変えることによって、「ヒト化」及び「ラクダ化」の両方を行うことができる。次にこの核酸は、所望の本発明のナノボディを提供するようにそれ自体が既知の方法で発現することができる。代替的に、それぞれ天然のＶＨＨドメイン又はＶＨドメインのアミノ酸配列に基づき、それぞれ所望の本発明のヒト化又はラクダ化ナノボディのアミノ酸配列を設計した後、それ自体が既知のペプチド合成技法を使用してｄｅ  ｎｏｖｏで合成することができる。また、それぞれ天然のＶＨＨドメイン又はＶＨドメインのアミノ酸配列又はヌクレオチド配列に基づき、それぞれ所望の本発明のヒト化又はラクダ化ナノボディをコードするヌクレオチド配列を設計した後、それ自体が既知の核酸合成技法を使用してｄｅ  ｎｏｖｏで合成することができ、その後所望の本発明のナノボディを提供するように、それ自体が既知の方法で、このようにして得られた核酸を発現することができる。
【０２９７】
天然ＶＨ配列又は好ましくはＶＨＨ配列から、本発明のナノボディ及び／又はこれをコードする核酸を得るのに好適な他の方法及び技法は、当業者にとって明らかであり、例えば本発明のナノボディ、又はこれをコードするヌクレオチド配列若しくは核酸を提供するように好適な方法で、１つ又は複数の天然ＶＨ配列（例えば１つ又は複数のＦＲ配列及び／又はＣＤＲ配列）の一部分又は複数部分、１つ又は複数の天然ＶＨＨ配列（例えば１つ又は複数のＦＲ配列又はＣＤＲ配列）の一部分又は複数部分、及び／又は１つ又は複数の合成又は半合成の配列を組み合わせることを含み得る（したがって適切に発現することができる）。ＶＨＨ配列又はナノボディのフレームワーク配列をコードするヌクレオチド配列は、本明細書中の開示及び／又は本明細書中で言及したさらなる従来技術に基づき、当業者にとって明らかであり（及び／又は代替的に本明細書中に記載の方法を使用して得られたヌクレオチド配列から始めるＰＣＲによって入手され得る）、本発明のナノボディをコードする核酸を提供するように、（例えば重複プライマーを使用したＰＣＲアセンブリによって）所望のＣＤＲをコードするヌクレオチド配列と好適に組合せ得る。
【０２９８】
本明細書中に言及されるように、ナノボディは特に、１つ又は複数のフレームワーク配列における１つ又は複数の「特徴的な残基」（本明細書中に記載）の存在を特徴とし得る。
【０２９９】
したがって、好ましいが、本発明の非限定的な一態様によれば、ナノボディは概して、最も広範な意味で
ａ）３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列（カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱである）、及び／又は
ｂ）３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列（カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、（本明細書に規定の）荷電アミノ酸又はシステイン残基であり、４４位のアミノ酸残基はＥであるのが好ましい）、及び／又は
ｃ）３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列（カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＰ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択される）を含む、ポリペプチドと定義することができる。
【０３００】
したがって好ましいが非限定的な第１の態様において、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ａ）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱであり、及び／又は
ｂ）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、荷電アミノ酸又はシステインであり、カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基はＥであるのが好ましく、及び／又は
ｃ）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＰ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択され、
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０１】
特に、ナノボディは概して、最も広範な意味で
ａ）３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列（カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱである）、及び／又は
ｂ）３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列（カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基はＥであり、カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基はＲである）、及び／又は
ｃ）３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列（カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＰ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択される）を含む、ポリペプチドと定義することができる。
【０３０２】
したがって好ましいが非限定的な一態様によれば、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ａ）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱであり、及び／又は
ｂ）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基はＥであり、カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基はＲであり、及び／又は
ｃ）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＰ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択され、
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０３】
特に本発明によるＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対するナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ａ）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱであり、及び／又は
ｂ）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基はＥであり、カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基はＲであり、及び／又は
ｃ）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＰ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択され、
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０４】
特に、好ましいが、本発明の非限定的な一態様によれば、ナノボディは、３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から成るアミノ酸配列を含むポリペプチドと定義することができ、
ａ−１）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基は、Ａ、Ｇ、Ｅ、Ｄ、Ｇ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、Ｌから成る群から選択され、好ましくはＧ、Ｅ若しくはＱから成る群から選択され、
ａ−２）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、Ｌ、Ｒ若しくはＣから成る群から選択され、好ましくはＬ若しくはＲから成る群から選択され、
ａ−３）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｗ、Ｒ若しくはＳから成る群から選択され、好ましくはＷ若しくはＲであり、最も好ましくはＷであり、
ａ−４）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱであるか、又は
ｂ−１）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基は、Ｅ及びＱから成る群から選択され、
ｂ−２）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基はＲであり、
ｂ−３）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｗ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、好ましくはＷであり、
ｂ−４）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱ及びＬから成る群から選択され、好ましくはＱであるか、又は
ｃ−１）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基は、Ａ、Ｇ、Ｅ、Ｄ、Ｑ、Ｒ、Ｓ及びＬから成る群から選択され、好ましくはＧ、Ｅ及びＱから成る群から選択され、
ｃ−２）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、Ｌ、Ｒ及びＣから成る群から選択され、好ましくはＬ及びＲから成る群から選択され、
ｃ−３）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｐ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択され、
ｃ−４）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱ及びＬから成る群から選択され、好ましくはＱであり、かつ
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０５】
したがって、本発明の好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ａ−１）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基は、Ａ、Ｇ、Ｅ、Ｄ、Ｇ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、Ｌから成る群から選択され、好ましくはＧ、Ｅ若しくはＱから成る群から選択され、
ａ−２）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、Ｌ、Ｒ若しくはＣから成る群から選択され、好ましくはＬ若しくはＲから成る群から選択され、
ａ−３）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｗ、Ｒ若しくはＳから成る群から選択され、好ましくはＷ若しくはＲであり、最も好ましくはＷであり、
ａ−４）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱであり、かつ
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０６】
好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ｂ−１）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基は、Ｅ及びＱから成る群から選択され、
ｂ−２）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基はＲであり、
ｂ−３）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｗ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、好ましくはＷであり、
ｂ−４）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱ及びＬから成る群から選択され、好ましくはＱであり、かつ
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０７】
好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ｃ−１）カバットナンバリングによる４４位のアミノ酸残基は、Ａ、Ｇ、Ｅ、Ｄ、Ｑ、Ｒ、Ｓ及びＬから成る群から選択され、好ましくはＧ、Ｅ及びＱから成る群から選択され、
ｃ−２）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、Ｌ、Ｒ及びＣから成る群から選択され、好ましくはＬ及びＲから成る群から選択され、
ｃ−３）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｐ、Ｒ及びＳから成る群から選択され、特にＲ及びＳから成る群から選択され、
ｃ−４）カバットナンバリングによる１０８位のアミノ酸残基はＱ及びＬから成る群から選択され、好ましくはＱであり、かつ
ｄ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３０８】
２つの特に好ましいが、本発明の非限定的なナノボディ群は、上記のａ）、上記の（ａ−１）〜（ａ−４）、上記のｂ）、上記の（ｂ−１）〜（ｂ−４）、上記の（ｃ）、及び／又は上記の（ｃ−１）〜（ｃ−４）によるものであり、
ｉ）カバットナンバリングによる４４位〜４７位のアミノ酸残基は、配列ＧＬＥＷ（又は本明細書に記載のＧＬＥＷ様配列）を形成し、１０８位のアミノ酸残基はＱであるか、又は
ｉｉ）カバットナンバリングによる４３位〜４６位のアミノ酸残基は、配列ＫＥＲＥ又は配列ＫＱＲＥ（又は記載されるようなＫＥＲＥ様配列）を形成し、１０８位のアミノ酸残基はＱ又はＬであり、好ましくはＱである。
【０３０９】
したがって、好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ｉ）カバットナンバリングによる４４位〜４７位のアミノ酸残基は、配列ＧＬＥＷ（又は本明細書に記載のＧＬＥＷ様配列）を形成し、１０８位のアミノ酸残基はＱであり、かつ
ｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３１０】
好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有し得る；ここで
ｉ）カバットナンバリングによる４３位〜４６位のアミノ酸残基は、配列ＫＥＲＥ又は配列ＫＱＲＥ（又はＫＥＲＥ様配列）を形成し、１０８位のアミノ酸残基はＱ又はＬであり、好ましくはＱであり、かつ
ｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３１１】
カバットナンバリングによる４３位〜４６位のアミノ酸残基が、配列ＫＥＲＥ又は配列ＫＱＲＥを形成する、本発明のナノボディにおいて、３７位のアミノ酸残基がＦであるのが最も好ましい。カバットナンバリングによる４４位〜４７位のアミノ酸残基が、配列ＧＬＥＷを形成する、本発明のナノボディにおいて、３７位のアミノ酸残基は、Ｙ、Ｈ、Ｉ、Ｌ、Ｖ又はＦから成る群から選択され、Ｖであるのが最も好ましい。
【０３１２】
したがって、決してこれらには限定されないが、上記で言及された位置に存在するアミノ酸残基に基づき、概して本発明のナノボディを以下の３つの群に基づいて分類することができる：
ｉ）「ＧＬＥＷ群」：カバットナンバリングによる４４位〜４７位にアミノ酸配列ＧＬＥＷ、及びカバットナンバリングによる１０８位にＱを有するナノボディ。本明細書でさらに記載されるように、この群内のナノボディは通常、３７位にＶを有し、１０３位にＷ、Ｐ、Ｒ又はＳを有することができ、好ましくは１０３位にＷを有する。ＧＬＥＷ群は、以下の表Ａ−３で言及されるもののような幾つかのＧＬＥＷ様配列も含む。より一般的には、これに限定されないが、ＧＬＥＷ群に属するナノボディは、４４位にＧ、及び／又は４７位にＷを有し、４６位は通常Ｅであり、好ましくは４５位が荷電アミノ酸残基でもシステインでもないナノボディと定義することができる。
ｉｉ）「ＫＥＲＥ群」：カバットナンバリングによる４３位〜４６位にアミノ酸配列ＫＥＲＥ又はＫＱＲＥ（又は別のＫＥＲＥ様配列）、及びカバットナンバリングによる１０８位にＱ又はＬを有するナノボディ。本明細書でさらに記載されるように、この群内のナノボディは通常、３７位にＦ、及び４７位にＬ又はＦを有し、１０３位にＷ、Ｐ、Ｒ又はＳを有することができ、好ましくは１０３位にＷを有する。より一般的には、これに限定されないが、ＫＥＲＥ群に属するナノボディは、４４位にＫ、Ｑ又はＲ（通常Ｋ）を有し、４５位が荷電アミノ酸残基又はシステインであり、４７位が本明細書でさらに規定されるようなものであるナノボディと定義することができる。
ｉｉｉ）「１０３Ｐ、Ｒ、Ｓ群」：１０３位にＰ、Ｒ又はＳを有するナノボディ。これらのナノボディは、カバットナンバリングによる４４位〜４７位にアミノ酸配列ＧＬＥＷ、又はカバットナンバリングによる４３位〜４６位にアミノ酸配列ＫＥＲＥ又はアミノ酸配列ＫＱＲＥのいずれかを有することができ（後者は、（ＫＥＲＥ群に関して規定のように）３７位のＦと、４７位のＬ又はＦと組合せるのが最も好ましい）、カバットナンバリングによる１０８位にＱ又はＬを有することができ、Ｑを有するのが好ましい。
【０３１３】
また必要に応じて、ナノボディは、２つ以上のこれらの群に属し得る（即ちこれらの特徴を有し得る）。例えば、１つの特に好ましいナノボディ群は、４４位〜４７位にＧＬＥＷ又はＧＬＥＷ様配列、１０３位にＰ、Ｒ又はＳ（特にＲ）、及び１０８位にＱ（Ｌへとヒト化してもよい）を有する。
【０３１４】
より一般的には、上記に言及される定義が、天然（即ち非ヒト化）ＶＨＨ配列の形態のナノボディを説明し、またこれに当てはまること、及びこれらのナノボディのヒト化変異体は、上記のもの以外のアミノ酸残基（即ち本明細書中に規定の１つ又は複数のヒト化置換）を含有し得ることに留意されたい。例えばこれに限定されないが、ＧＬＥＷ群又は１０３Ｐ、Ｒ、Ｓ群の幾つかのヒト化ナノボディにおいて、１０８位のＱは、１０８Ｌにヒト化し得る。本明細書中に既に言及されたように、他のヒト化置換（及びその好適な組合せ）は、本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかであろう。付加的に又は代替的に、天然のＶＨＨ配列のフレームワーク領域の配列を、１つ又は複数の密接に関連するヒトＶＨ配列の対応するフレームワーク配列と比較することによって、他の潜在的に有用なヒト化置換を確認することができ、その後（本明細書中にさらに記載のように、それ自体が既知の任意の方法で）このようにして求めた、潜在的に有用なヒト化置換（又はその組合せ）の１つ又は複数を上記ＶＨＨ配列に導入することができ、標的に対する親和性、安定性、発現の容易さ及びレベル、及び／又は他の所望の特性に関して、得られたヒト化ＶＨＨ配列を試験することができる。このようにして、限定的な試行錯誤によって、本明細書中の開示に基づき当業者によって、他の好適なヒト化置換（又はその好適な組合せ）を求めることができる。また、上記に基づき、ナノボディ（のフレームワーク領域）を部分ヒト化又は完全ヒト化してもよい。
【０３１５】
したがって、好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、（本明細書に規定のように）ＧＬＥＷ群に属するナノボディであってもよく、その中のＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３１６】
好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、（本明細書に規定のように）ＫＥＲＥ群に属するナノボディであってもよく、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３１７】
したがって、好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、（本明細書に規定のように）１０３Ｐ、Ｒ、Ｓ群に属するナノボディであってもよく、その中のＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は本明細書で規定されるようなものであり、好ましくは本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであり、より好ましくは本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものである。
【０３１８】
また、より一般的には、上記で言及された１０８Ｑ、４３Ｅ／４４Ｒ及び１０３Ｐ、Ｒ、Ｓ残基の他に、本発明のナノボディは、従来のＶＨドメインでＶＨ／ＶＬ界面（の一部）が形成される１つ又は複数の位置で、対応する天然ＶＨ配列における同じ位置（複数可）で自然発生するアミノ酸残基よりも強く荷電する、１つ又は複数のアミノ酸残基、特に（表Ａ−２で言及される）１つ又は複数の荷電アミノ酸残基を含有することができる。このような置換としては、これらに限定されないが、以下の表Ａ−３で言及されるＧＬＥＷ様配列、及び例えば４４位〜４７位のＫＬＥＷと共に１０８位にＱを有するナノボディを得るために、いわゆる「ミクロボディ」に関して国際出願の国際公開第００／２９００４号パンフレットで説明される置換が挙げられる。これらの位置での他の可能性のある置換は、本明細書中の開示に基づいて当業者にとって明らかである。
【０３１９】
本発明のナノボディの一態様において、８３位のアミノ酸残基は、Ｌ、Ｍ、Ｓ、Ｖ及びＷから成る群から選択され、Ｌであるのが好ましい。
【０３２０】
また、本発明のナノボディの一態様において、８３位のアミノ酸残基は、Ｒ、Ｋ、Ｎ、Ｅ、Ｇ、Ｉ、Ｔ及びＱから成る群から選択され、（天然ＶＨＨドメインに対応するナノボディに関しては）Ｋ若しくはＥ、又は（本明細書に記載の「ヒト化」ナノボディに関しては）Ｒのいずれかであるのが最も好ましい。一態様では、８４位のアミノ酸残基は、Ｐ、Ａ、Ｒ、Ｓ、Ｄ、Ｔ及びＶから成る群から選択され、（天然ＶＨＨドメインに対応するナノボディに関しては）Ｐ、又は（本明細書に記載の「ヒト化」ナノボディに関しては）Ｒのいずれかであるのが最も好ましい。
【０３２１】
さらに本発明のナノボディの一態様において、１０４位のアミノ酸残基は、Ｇ及びＤから成る群から選択され、Ｇであるのが最も好ましい。
【０３２２】
まとめると、ナノボディにおいて上記で言及される、１１位、３７位、４４位、４５位、４７位、８３位、８４位、１０３位、１０４位及び１０８位のアミノ酸残基は、本明細書で「特徴的な残基」とも称される。特徴的な残基及び最も密接に関連したヒトＶＨドメイン（ＶＨ３）の対応する位置のアミノ酸残基を表Ａ−３に要約する。
【０３２３】
幾つかの特に好ましいが非限定的な天然ＶＨＨドメインで生じるこれらの特徴的な残基の組合せを表Ａ−４で言及する。比較のために、ＤＰ−４７と呼ばれるヒトＶＨ３の対応するアミノ酸残基をイタリック体で示している。
【０３２４】
表Ａ−３：ナノボディにおける特徴的な残基
【表４】
2011516520.tif 000009
【０３２５】
表Ａ−４：天然ナノボディにおける特徴的な残基の幾つかの好ましいが非限定的な組合せ
これらの組合せのヒト化に関しては、明細書を参照する。
【表５】
2011516520.tif 000010
【０３２６】
ナノボディにおいて、特徴的な残基以外の任意の位置の各アミノ酸残基は、天然ＶＨＨドメインの（カバットナンバリングによる）対応する位置で自然発生する任意のアミノ酸残基であり得る。
【０３２７】
このようなアミノ酸残基は当業者にとって明らかである。表Ａ−５〜表Ａ−８は、天然ＶＨＨドメインのＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４の（カバットナンバリングによる）それぞれの位置に存在し得る幾つかの非限定的な残基を表す。それぞれの位置に関しては、天然ＶＨＨドメインのそれぞれの位置で最も頻繁に発生する（ナノボディにおける上記位置に最も好ましいアミノ酸残基である）アミノ酸残基を太字で示し、それぞれの位置に好ましい他のアミノ酸残基を下線処理する（備考：天然ＶＨＨドメインの２６位〜３０位で見られるアミノ酸残基の数字は、これらの位置の残基が既にＣＤＲ１部分を形成するというChothia（同上）によるナンバリングの基礎をなす仮説を支持する）。
【０３２８】
表Ａ−５〜表Ａ−８では、ヒトＶＨ３ドメインのそれぞれの位置に存在し得る非限定的な残基の幾つかも表している。また、それぞれの位置に関しては、天然ヒトＶＨ３ドメインのそれぞれの位置で最も頻繁に発生するアミノ酸残基を太字で示し、他の好ましいアミノ酸残基を下線処理する。
【０３２９】
参考のみのために、表Ａ−５〜表Ａ−８は、１１１８ＶＨＨ配列の代表的な試料におけるそれぞれのアミノ酸位置でＶＨＨエントロピー（「ＶＨＨ  Ｅｎｔ．」）及びＶＨＨ変動性（「ＶＨＨ  Ｖａｒ．」）に関するデータ（Utrecht UniversityのDavid Lutje Hulsing及びProf. Theo Verripsによって無償（kindly）提供されたデータ）も含有する。ＶＨＨエントロピー及びＶＨＨ変動性の値は、解析する１１１８ＶＨＨ配列間のアミノ酸残基の変動性及び保存度に対する評価基準を与え、低い値（即ち１未満、例えば０．５未満）は、アミノ酸残基が、ＶＨＨ配列間で強く保存される（即ちほとんど変動性がない）ことを示す。例えば、８位のＧ及び９位のＧはそれぞれ、０．１及び０のＶＨＨエントロピー値を有し、これは（解析する全ての１１１８配列において９位がＧである場合）これらの残基が強く保存され、ほとんど変動しないことを示す一方で、ＣＤＲ部分を形成する残基に関しては概して、１．５以上の値が見られる（データ図示せず）。（１）表Ａ−５〜表Ａ−８の２列目に列挙されるアミノ酸残基は、後の２列で言及されるＶＨＨエントロピー及びＶＨＨ変動性を決定するのに解析された１１１８ＶＨＨ配列よりも大きい試料に基づいており、（２）以下で表すデータは、２７位〜３０位のアミノ酸残基、並びにおそらく９３位及び９４位のアミノ酸残基でさえも既にＣＤＲ部分を形成しているという仮説を支持することに留意されたい（しかしながら、本発明は任意の特定の仮説又は説明に限定されず、上記のように、本明細書ではカバットによるナンバリングを使用する）。配列エントロピー、配列変動性及びこれを決定する方法の一般的説明に関しては、Oliveira et al., PROTEINS: Structure, Function and Genetics, 52:544-552（2003）を参照されたい。
【０３３０】
表Ａ−５：ＦＲ１におけるアミノ酸残基の非限定的な例（脚注に関しては、表Ａ−３の脚注を参照する）
【表６】
2011516520.tif 000011
【０３３１】
表Ａ−６：ＦＲ２におけるアミノ酸残基の非限定的な例（脚注に関しては、表Ａ−３の脚注を参照する）
【表７】
2011516520.tif 000012
【０３３２】
表Ａ−７：ＦＲ３におけるアミノ酸残基の非限定的な例（脚注に関しては、表Ａ−３の脚注を参照する）
【表８】
2011516520.tif 000013
【０３３３】
表Ａ−８：ＦＲ４におけるアミノ酸残基の非限定的な例（脚注に関しては、表Ａ−３の脚注を参照する）
【表９】
2011516520.tif 000014
【０３３４】
このように、好ましいが非限定的な別の態様において、本発明のナノボディは、（一般）構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有するアミノ酸配列として規定することができ、ここで
ｉ）カバットナンバリングによる１１位、３７位、４４位、４５位、４７位、８３位、８４位、１０３位、１０４位及び１０８位のアミノ酸残基の１つ又は複数が、表Ａ−３で言及される特徴的な残基から選択され、
ｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３３５】
上記ナノボディは例えば、ＶＨＨ配列であっても、又はヒト化ナノボディであってもよい。上記ナノボディ配列がＶＨＨ配列である場合、これらは、本明細書中にさらに記載のように、好適にヒト化されていてもよい。ナノボディが部分ヒト化ナノボディである場合、これらは任意で、さらに本明細書中に記載のようにさらに好適にヒト化してもよい。
【０３３６】
特に、本発明のナノボディは、（一般）構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
（ここで、ＦＲ１〜ＦＲ４はそれぞれフレームワーク領域１〜フレームワーク領域４を指し、ＣＤＲ１〜ＣＤＲ３はそれぞれ相補性決定領域１〜相補性決定領域３を指す）を有するアミノ酸配列である可能性があり、ここで
ｉ）カバットナンバリングによる１１位、３７位、４４位、４５位、４７位、８３位、８４位、１０３位、１０４位及び１０８位の（好ましくは）アミノ酸残基の１つ又は複数が、表Ａ−３で言及される特徴的な残基から選択され（ＶＨＨ配列が１つ又は複数の特徴的な残基を含有すること、並びに部分ヒト化ナノボディが通常及び好ましくは［依然として］１つ又は複数の特徴的な残基を含有すること［しかしながら、本発明に応じて好適であれば、１つ又は複数の他のアミノ酸残基ではなく、全ての特徴的な残基がヒト化した部分ヒト化ナノボディを提供することも本発明の範囲内である］、並びに本発明に応じて好適であれば、完全ヒト化ナノボディにおいて特徴的な残基の位置の全てのアミノ酸残基がヒトＶＨ３配列で発生するアミノ酸残基であることが理解される。本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかなように、このようなＶＨＨ配列、少なくとも１つの特徴的な残基を有するこのような部分ヒト化ナノボディ、特徴的な残基を有しないこのような部分ヒト化ナノボディ及びこのような完全ヒト化ナノボディは全て、本発明の態様を形成する）、
ｉｉ）上記アミノ酸配列が、配列番号１〜配列番号２２の単一可変ドメインの少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有し（アミノ酸同一性の程度を求めるために、ＣＤＲ配列を形成するアミノ酸残基（配列番号１〜配列番号２２の配列においてＸで示す）は無視する）、
ｉｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３３７】
上記ナノボディは例えば、ＶＨＨ配列であっても、又はヒト化ナノボディであってもよい。上記ナノボディ配列がＶＨＨ配列である場合、これらは、本明細書中にさらに記載のように、好適にヒト化されていてもよい。ナノボディが部分ヒト化ナノボディである場合、これらは任意で、さらに本明細書中に記載のようにさらに好適にヒト化してもよい。
【０３３８】
表Ａ−９：ＫＥＲＥ、ＧＬＥＷ及びＰ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディの代表的な単一可変ドメイン
ＣＤＲはＸＸＸＸで示す
【表１０】
2011516520.tif 000015
2011516520.tif 000016
【０３３９】
特に、ＫＥＲＥ群の本発明のナノボディは、（一般）構造：
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
を有するアミノ酸配列である可能性があり、ここで
ｉ）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、荷電アミノ酸（本明細書中に規定）又はシステイン残基であり、４４位のアミノ酸残基は好ましくはＥであり、
ｉｉ）ＦＲ１は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３４０】
表Ａ−１０：ＫＥＲＥ群のナノボディの代表的なＦＷ１配列
【表１１】
2011516520.tif 000017
【０３４１】
ｉｉｉ）ＦＲ２は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３４２】
表Ａ−１１：ＫＥＲＥ群のナノボディの代表的なＦＷ２配列
【表１２】
2011516520.tif 000018
【０３４３】
ｉｖ）ＦＲ３は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３４４】
表Ａ−１２：ＫＥＲＥ群のナノボディの代表的なＦＷ３配列
【表１３】
2011516520.tif 000019
【０３４５】
ｖ）ＦＲ４は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３４６】
表Ａ−１３：ＫＥＲＥ群のナノボディの代表的なＦＷ４配列
【表１４】
2011516520.tif 000020
【０３４７】
ｖｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３４８】
上記ナノボディにおいて、１つ又は複数のさらなる特徴的な残基は、（例えばこれらがＶＨＨ配列又は部分ヒト化ナノボディである場合）本明細書中に記載のようなものが好ましい。
【０３４９】
また、上記ナノボディは例えば、ＶＨＨ配列であっても、又はヒト化ナノボディであってもよい。上記ナノボディ配列がＶＨＨ配列である場合、これらは、本明細書中にさらに記載のように、好適にヒト化されていてもよい。ナノボディが部分ヒト化ナノボディである場合、これらは任意で、さらに本明細書中に記載のようにさらに好適にヒト化してもよい。
【０３５０】
フレームワーク１に関して、上記で概説のアミノ酸配列がヌクレオチド配列の発現によって生成する場合、上記核酸を生成するのに使用されているプライマー（複数可）によって、始めの４つの単一可変ドメイン（即ちカバットナンバリングによる１位〜４位のアミノ酸残基）を求め得ることが多いことは、当業者にとって明らかである。このように、アミノ酸同一性の程度を求めるために、始めの４つのアミノ酸残基を無視するのが好ましい。
【０３５１】
また、フレームワーク１に関して、カバットナンバリングによる２７位〜３０位のアミノ酸位置は（ＣＤＲではなく）フレームワーク領域の一部であると考えられるが、１０００個を超えるＶＨＨ配列のデータベースの解析によって、２７位〜３０位のアミノ酸が、１位〜２６位のアミノ酸に対する変動性よりも非常に大きい変動性（ＶＨＨエントロピー及びＶＨＨ変動性に関して表される、表Ａ−５〜表Ａ−８を参照されたい）を有することが見出されている。このため、アミノ酸同一性の程度を求めるために、２７位〜３０位のアミノ酸残基も無視するのが好ましい。
【０３５２】
これを考慮して、ＫＥＲＥ群のナノボディは、３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から構成されるアミノ酸配列であり得る；
ｉ）カバットナンバリングによる４５位のアミノ酸残基は、荷電アミノ酸（本明細書中に規定）又はシステイン残基であり、４４位のアミノ酸残基は好ましくはＥであり、
ｉｉ）ＦＲ１は、カバットナンバリングによる５位〜２６位で、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３５３】
表Ａ−１４：ＫＥＲＥ群のナノボディの代表的なＦＷ１配列（５位〜２６位のアミノ酸残基）
【表１５】
2011516520.tif 000021
【０３５４】
ｉｉｉ）ＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４は、ＫＥＲＥ群のナノボディのＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４に関して本明細書中に言及されるようなものであり、
ｉｖ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３５５】
上記ナノボディは例えば、ＶＨＨ配列であっても、又はヒト化ナノボディであってもよい。上記ナノボディ配列がＶＨＨ配列である場合、これらは、本明細書中にさらに記載のように、好適にヒト化されていてもよい。ナノボディが部分ヒト化ナノボディである場合、これらは任意で、さらに本明細書中に記載のようにさらに好適にヒト化してもよい。
【０３５６】
ＧＬＥＷ群のナノボディは、３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から構成されるアミノ酸配列であり得る；
ｉ）好ましくは、ＧＬＥＷ群のナノボディが非ヒト化ナノボディである場合、１０８位のアミノ酸残基はＱであり、
ｉｉ）ＦＲ１は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３５７】
表Ａ−１５：ＧＬＥＷ群のナノボディの代表的なＦＷ１配列
【表１６】
2011516520.tif 000022
【０３５８】
ｉｉｉ）ＦＲ２は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３５９】
表Ａ−１６：ＧＬＥＷ群のナノボディの代表的なＦＷ２配列
【表１７】
2011516520.tif 000023
【０３６０】
ｉｖ）ＦＲ３は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３６１】
表Ａ−１７：ＧＬＥＷ群のナノボディの代表的なＦＷ３配列
【表１８】
2011516520.tif 000024
【０３６２】
ｖ）ＦＲ４は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３６３】
表Ａ−１８：ＧＬＥＷ群のナノボディの代表的なＦＷ４配列
【表１９】
2011516520.tif 000025
【０３６４】
ｖｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３６５】
上記ナノボディにおいて、１つ又は複数のさらなる特徴的な残基は、（例えばこれらがＶＨＨ配列又は部分ヒト化ナノボディである場合）本明細書中に記載のようなものが好ましい。
【０３６６】
さらにフレームワーク１に関して、アミノ酸同一性の程度を求めるために、１位〜４位及び２７位〜３０位のアミノ酸残基を無視するのが好ましいことは当業者にとって明らかである。
【０３６７】
これを考慮して、ＧＬＥＷ群のナノボディは、３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から構成されるアミノ酸配列であり得る；
ｉ）好ましくは、ＧＬＥＷ群のナノボディが非ヒト化ナノボディである場合、１０８位のアミノ酸残基はＱであり、
ｉｉ）ＦＲ１は、カバットナンバリングによる５位〜２６位で、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３６８】
表Ａ−１９：ＫＥＲＥ群のナノボディの代表的なＦＷ１配列（５位〜２６位のアミノ酸残基）
【表２０】
2011516520.tif 000026
【０３６９】
ｉｉｉ）ＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４は、ＧＬＥＷ群のナノボディのＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４に関して本明細書中に言及されるようなものであり、
ｉｖ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３７０】
上記ナノボディは例えば、ＶＨＨ配列であっても、又はヒト化ナノボディであってもよい。上記ナノボディ配列がＶＨＨ配列である場合、これらは、本明細書中にさらに記載のように、好適にヒト化されていてもよい。ナノボディが部分ヒト化ナノボディである場合、これらは任意で、さらに本明細書中に記載のようにさらに好適にヒト化してもよい。上記ナノボディにおいて、１つ又は複数のさらなる特徴的な残基は、（例えばこれらがＶＨＨ配列又は部分ヒト化ナノボディである場合）本明細書中に記載のようなものが好ましい。
【０３７１】
Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディは、３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から構成されるアミノ酸配列であり得る；
ｉ）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＷではなく、
ｉｉ）好ましくは、カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｐ、Ｒ又はＳであり、より好ましくはＲであり、
ｉｉｉ）ＦＲ１は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３７２】
表Ａ−２０：Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディの代表的なＦＷ１配列
【表２１】
2011516520.tif 000027
【０３７３】
ｉｖ）ＦＲ２は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３７４】
表Ａ−２１：Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディの代表的なＦＷ２配列
【表２２】
2011516520.tif 000028
【０３７５】
ｖ）ＦＲ３は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３７６】
表Ａ−２２：Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディの代表的なＦＷ３配列
【表２３】
2011516520.tif 000029
【０３７７】
ｖｉ）ＦＲ４は、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３７８】
表Ａ−２３：Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディの代表的なＦＷ４配列
【表２４】
2011516520.tif 000030
【０３７９】
ｖｉｉ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３８０】
上記ナノボディにおいて、１つ又は複数のさらなる特徴的な残基は、（例えばこれらがＶＨＨ配列又は部分ヒト化ナノボディである場合）本明細書中に記載のようなものが好ましい。
【０３８１】
フレームワーク１に関して、アミノ酸同一性の程度を求めるために、１位〜４位及び２７位〜３０位のアミノ酸残基を無視するのが好ましいことはここでもまた当業者にとって明らかである。
【０３８２】
これを考慮して、Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディは、３つの相補性決定領域／配列が間に挿入された４つのフレームワーク領域／配列から構成されるアミノ酸配列であり得る；
ｉ）カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基はＷではなく、
ｉｉ）好ましくは、カバットナンバリングによる１０３位のアミノ酸残基は、Ｐ、Ｒ又はＳであり、より好ましくはＲであり、
ｉｉｉ）ＦＲ１は、カバットナンバリングによる５位〜２６位で、以下のアミノ酸配列の少なくとも１つとの少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するアミノ酸配列であり、
【０３８３】
表Ａ−２４：Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディの代表的なＦＷ１配列（５位〜２６位のアミノ酸残基）
【表２５】
2011516520.tif 000031
【０３８４】
ｉｖ）ＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４は、Ｐ、Ｒ、Ｓ  １０３群のナノボディのＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４に関して本明細書中に言及されるようなものであり、
ｖ）ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３が、本明細書中で規定されるようなものであり、本明細書中の好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのものが好ましく、本明細書中のより好ましい態様の１つに従って規定されるようなものであるのがより好ましい。
【０３８５】
上記ナノボディは例えば、ＶＨＨ配列であっても、又はヒト化ナノボディであってもよい。上記ナノボディ配列がＶＨＨ配列である場合、これらは、本明細書中にさらに記載のように、好適にヒト化されていてもよい。ナノボディが部分ヒト化ナノボディである場合、これらは任意で、さらに本明細書中に記載のようにさらに好適にヒト化してもよい。
【０３８６】
上記ナノボディにおいて、１つ又は複数のさらなる特徴的な残基は、（例えばこれらがＶＨＨ配列又は部分ヒト化ナノボディである場合）本明細書中に記載のようなものが好ましい。
【０３８７】
別の好ましいが非限定的な態様において本発明は、上記のようなナノボディであって、ＣＤＲ配列が、配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインのうちの少なくとも１つのＣＤＲ配列との少なくとも７０％のアミノ酸同一性、好ましくは少なくとも８０％のアミノ酸同一性、より好ましくは少なくとも９０％のアミノ酸同一性（９５％以上のアミノ酸同一性等）、又はさらに本質的に１００％のアミノ酸同一性を有する、ナノボディに関する。このアミノ酸同一性の程度は例えば、上記ナノボディと、配列番号２５５〜配列番号２６９の配列の１つ又は複数との間のアミノ酸同一性の程度を（本明細書に記載の方法で）求めることによって決定することができる（フレームワーク領域を形成するアミノ酸残基は無視する）。このようなナノボディは、本明細書にさらに記載されるようなものであり得る。
【０３８８】
本明細書で既に言及されているように、別の好ましいが非限定的な本発明の態様は、配列番号２５５〜配列番号２６９から成る群から、又は配列番号２５５〜配列番号２６９の単一可変ドメインの少なくとも１つとの、８０％超、好ましくは９０％超、より好ましくは９５％超、例えば９９％以上の配列同一性（本明細書で規定）を有する単一可変ドメインから成る群から選択されるアミノ酸配列を有するナノボディに関する。
【０３８９】
また上記のナノボディにおいて、
ｉ）任意のアミノ酸置換（本明細書で規定のようにヒト化置換でない場合）は、（本明細書で規定されるように）対応する配列番号２５５〜配列番号２６９のアミノ酸配列と比較して、保存的なアミノ酸置換であるのが好ましく；及び／又は
ｉｉ）そのアミノ酸配列は、対応する配列番号２５５〜配列番号２６９のアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換だけ、又はそうでなければ好ましくはわずか５つ、好ましくはわずか３つ、より好ましくは１つ又は２つだけのアミノ酸欠失又は挿入を含有するのが好ましく；及び／又は
ｉｉｉ）ＣＤＲは、親和性成熟によって、例えば配列番号２５５〜配列番号２６９の対応するアミノ酸配列のＣＤＲから誘導されるＣＤＲであり得る。
【０３９０】
好ましくは、本発明のナノボディにおけるＣＤＲ配列及びＦＲ配列は、本発明のナノボディ（及びこれを含む本発明の単一可変ドメイン）が、
１０−５モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、好ましくは１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下、より好ましくは１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌの解離定数（ＫＤ）で（即ち、１０５Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、好ましくは１０７Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モル以上、より好ましくは１０８Ｌ／モル〜１０１２Ｌ／モルの結合定数（ＫＡ）で）Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに結合するようなものであり、及び／又は
１０２Ｍ−１ｓ−１〜約１０７Ｍ−１ｓ−１、好ましくは１０３Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１、より好ましくは１０４Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１（１０５Ｍ−１ｓ−１〜１０７Ｍ−１ｓ−１等）のｋｏｎ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに結合するようなものであり、及び／又は
１ｓ−１（ｔ１／２＝０．６９ｓ）〜１０−６ｓ−１（ｔ１／２が数日のほぼ非可逆的な複合体の場合）、好ましくは１０−２ｓ−１〜１０−６ｓ−１、より好ましくは１０−３ｓ−１〜１０−６ｓ−１（１０−４ｓ−１〜１０−６ｓ−１等）のｋｏｆｆ速度でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに結合するようなものである。
【０３９１】
好ましくは、本発明のナノボディに存在するＣＤＲ配列及びＦＲ配列は、本発明のナノボディが、５００ｎＭ未満、好ましくは２００ｎＭ未満、より好ましくは１０ｎＭ未満（５００ｐＭ未満等）の親和性でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するようなものである。
【０３９２】
本発明の非限定的な一態様によれば、ナノボディは本明細書で規定されるようなものであり得るが、天然のヒトＶＨドメインの対応するフレームワーク領域と比較して、特にＤＰ−４７の対応するフレームワーク領域と比較して、フレームワーク領域の少なくとも１つに少なくとも「１つのアミノ酸差異」（本明細書で規定される）を有することが条件である。より具体的には、本発明の非限定的な一態様によれば、ナノボディは本明細書で規定されるようなものであり得るが、天然のヒトＶＨドメインの対応するフレームワーク領域と比較して、特にＤＰ−４７の対応するフレームワーク領域と比較して、特徴的な残基（例えば１０８位、１０３位及び／又は４５位のもの）の少なくとも１つに少なくとも「１つのアミノ酸差異」（本明細書で規定）を有することが条件である。通常、ナノボディは、ＦＲ２及び／又はＦＲ４の少なくとも１つにおいて、特にＦＲ２及び／又はＦＲ４の特徴的な残基の少なくとも１つ（同様に、例えば１０８位、１０３位及び／又は４５位のもの）において、天然のＶＨドメインとの少なくとも１つのこのようなアミノ酸差異を有する。
【０３９３】
また、本発明のヒト化ナノボディは本明細書で規定されるようなものであり得るが、天然のＶＨＨドメインの対応するフレームワーク領域と比較して、フレームワーク領域の少なくとも１つに少なくとも「１つのアミノ酸差異」（本明細書で規定）を有することが条件である。より具体的には、本発明の非限定的な一態様によれば、ヒト化ナノボディは本明細書で規定されるようなものであり得るが、天然のＶＨＨドメインの対応するフレームワーク領域と比較して、特徴的な残基（例えば１０８位、１０３位及び／又は４５位のもの）の少なくとも１つに少なくとも「１つのアミノ酸差異」（本明細書で規定）を有することが条件である。通常、ヒト化ナノボディは、ＦＲ２及び／又はＦＲ４の少なくとも１つにおいて、特にＦＲ２及び／又はＦＲ４の特徴的な残基の少なくとも１つ（同様に、例えば１０８位、１０３位及び／又は４５位のもの）において、天然のＶＨＨドメインとの少なくとも１つのこのようなアミノ酸差異を有する。
【０３９４】
本明細書における開示より明らかなように、本明細書で規定されるような本発明のナノボディの天然又は合成の類似体、突然変異体、変異体、対立遺伝子、ホモログ及びオーソログ（本明細書中で集合的に「類似体」と称される）、特に配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディの類似体の使用も本発明の範囲内である。したがって、本発明の一態様によれば、「本発明のナノボディ」という用語は最も広範な意味ではこのような類似体も包含する。
【０３９５】
概して、このような類似体では、本明細書で規定されるような本発明のナノボディと比較して、１つ又は複数のアミノ酸残基が置換、欠失及び／又は付加されていてもよい。このような置換、挿入又は欠失はフレームワーク領域の１つ又は複数、及び／又はＣＤＲの１つ又は複数において起こってもよい。このような置換、挿入又は欠失がフレームワーク領域の１つ又は複数において起こる場合、特徴的な残基の１つ又は複数、及び／又はフレームワーク残基中の他の位置の１つ又は複数において起こってもよいが、特徴的な残基での置換、挿入又は欠失は（これらが本明細書中で説明されるような適切なヒト化置換でない限り）一般にあまり好適ではない。
【０３９６】
非限定的な例によると、置換は例えば保存的置換（本明細書中で説明される）であってもよく、及び／又はアミノ酸残基は、別のＶＨＨドメインの同じ位置に自然発生する別のアミノ酸残基により置換されてもよいが（このような置換の幾つかの非限定的な例については表Ａ−５〜表Ａ−８を参照）、本発明は概してこれに限定されない。したがって、本発明のナノボディの特性を改善するか、又は少なくとも本発明のナノボディの所望の特性又は所望の特性のバランス若しくは組合せを過度に（即ち、ナノボディがもはやその使用目的に適さなくなる程度まで）損なわない任意の１つ又は複数の置換、欠失又は挿入、又はその任意の組合せは本発明の範囲内に含まれる。当業者は一般に、本明細書における開示に基づいて、また任意に、例えば限られた数の可能な置換を導入すること、及びそのようにして得られるナノボディの特性に対するその影響を求めることを含み得る限られた日常実験の後、適切な置換、欠失又は挿入、又はその適切な組合せを決定及び選択することが可能である。
【０３９７】
例えば当業者の能力の範囲内で、本発明のナノボディ又はポリペプチドを発現するために使用される宿主生物に応じて、このような欠失及び／又は置換を、翻訳後修飾される１つ又は複数の部位（例えば１つ又は複数のグリコシル化部位）を除去するように設計してもよい。代替的には、置換又は挿入を官能基（本明細書中で説明される）が結合する１つ又は複数の部位を導入する、例えば部位特異的ペグ化（同様に本明細書中で説明される）を可能にするように設計してもよい。
【０３９８】
上記の表Ａ−５〜表Ａ−８に示すＶＨＨエントロピー及びＶＨＨ変動性に関するデータから明らかなように、フレームワーク領域内の幾つかのアミノ酸残基は他よりも保存されている。一般に、任意の置換、欠失又は挿入は好ましくは保存されにくい位置で起こるが、本発明は最も広範な意味ではこれに限定されない。また、一般に、アミノ酸置換はアミノ酸欠失又はアミノ酸挿入よりも好適である。
【０３９９】
類似体は好ましくは、本発明のナノボディに関して本明細書で規定されるような親和性（本明細書中でさらに説明されるように、（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度として、又は代替的にはＩＣ５０値として適切に測定されるか、及び／又は表される）をもってＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに結合することができるものである。
【０４００】
類似体は好ましくは、本明細書中で説明されるようなナノボディの有利な特性を保持するものでもある。
【０４０１】
また、好適な一態様によれば、類似体は、配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディの１つとの少なくとも７０％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％（少なくとも９５％等）又は９９％以上の程度の配列同一性を有し、及び／又は好ましくは多くとも２０個、好ましくは多くとも１０個、さらにより好ましくは多くとも５個、例えば４個、３個、２個又はただ１個のアミノ酸差異（本明細書で規定される）を有する。
【０４０２】
また、類似体のフレームワーク配列及びＣＤＲは好ましくは、本明細書で規定される好適な態様に従うものである。より一般には、本明細書中で説明されるように、類似体は（ａ）１０８位にＱ、及び／又は（ｂ）４５位に荷電アミノ酸又はシステイン残基、好ましくは４４位にＥ、より好ましくは４４位にＥ及び４５位にＲ、及び／又は（ｃ）１０３位にＰ、Ｒ又はＳを有する。
【０４０３】
本発明のナノボディの１つの好適な種類の類似体は、ヒト化された（即ち、本発明の天然のナノボディの配列と比較して）ナノボディを含む。本明細書中で引用される背景技術で述べられたように、このようなヒト化は一般に、ヒトＶＨドメインでの同じ位置、例えばヒトＶＨ３ドメインに起こるアミノ酸残基での、天然のＶＨＨの配列における１つ又は複数のアミノ酸残基の置換を含む。可能なヒト化置換又はヒト化置換の組合せの例は、例えば本明細書中の表から、本明細書中で引用される背景技術で述べられた可能なヒト化置換から、及び／又はナノボディの配列と天然のヒトＶＨドメインの配列との比較から当業者に明らかである。
【０４０４】
ヒト化置換は、得られるヒト化ナノボディが、本明細書で規定されるようなナノボディの有利な特性を依然として保持するように、より好ましくは類似体に関して前述の段落に説明されるようなものであるように選択されるべきである。当業者は一般に、本明細書における開示に基づいて、また任意に、例えば限られた数の可能なヒト化置換を導入すること、及びそのようにして得られるナノボディの特性に対するその影響を求めることを含み得る限られた日常実験の後、適切なヒト化置換又は適切なヒト化置換の組合せを決定及び選択することが可能である。
【０４０５】
概して、ヒト化の結果として、本発明のナノボディは、本明細書中で説明されるような本発明のナノボディの有利な特性を依然として保持すると同時に、より「ヒト様」と成り得る。結果として、このようなヒト化ナノボディは幾つかの利点、例えば対応する天然のＶＨＨドメインと比較して低減された免疫原性を有し得る。同様に、当業者は、本明細書における開示に基づいて、また任意に限られた日常実験の後、一方ではヒト化置換によりもたらされる有利な特性、他方では天然のＶＨＨドメインの有利な特性の間の所望の又は適切なバランスを最適化又は達成するヒト化置換又は適切なヒト化置換の組合せを選択することが可能である。
【０４０６】
本発明のナノボディは任意のフレームワーク残基（複数可）、例えば１つ又は複数の特徴的な残基（本明細書で規定される）又は１つ又は複数の他のフレームワーク残基（即ち、非特徴的な残基）又はこれらの任意の適切な組合せで適切にヒト化され得る。「Ｐ、Ｒ、Ｓ−１０３群」又は「ＫＥＲＥ群」のナノボディに関する１つの好適なヒト化置換は、Ｑ１０８からＬ１０８への置換である。「ＧＬＥＷ群」のナノボディもまた、他の特徴的な残基の少なくとも１つがラクダ化（camelid（camelizing））置換（本明細書で規定される）を含有するという条件で、Ｑ１０８からＬ１０８への置換によりヒト化され得る。例えば、上述したように、１つの特に好適な種類のヒト化ナノボディは、ＧＬＥＷ又はＧＬＥＷ様配列を４４位〜４７位に、Ｐ、Ｒ又はＳ（特にＲ）を１０３位に、Ｌを１０８位に有する。
【０４０７】
ヒト化及び他の類似体、並びにこれをコードする核酸配列は、それ自体が既知の任意の方法で準備することができる。例えば、類似体は、天然のＶＨＨドメインをコードする核酸を準備すること、（例えば部位特異的突然変異誘発法、又は適切なミスマッチプライマーを使用するＰＣＲによって）置換を受ける１つ又は複数のアミノ酸残基に対するコドンを、対応する所望のアミノ酸残基に対するコドンに変えること、このようにして得られる核酸／ヌクレオチド配列を適切な宿主又は発現システムにおいて発現させること、及び任意に、このようにして得られる類似体を（例えば本明細書中でさらに説明されるように）単離及び／又は精製して、本質的に単離された形の該類似体を提供する、単離及び／又は精製することにより得ることができる。これは概して、例えば本明細書中で引用されるハンドブック及び参考文献、本明細書中で引用される背景技術及び／又は本明細書中のさらなる記載から当業者に明らかな、それ自体が既知の方法及び技法を用いて実行することができる。代替的には、所望の類似体をコードする核酸は、それ自体が既知の方法で（例えば所定のアミノ酸配列を有する核酸配列を合成する自動装置を用いて）合成することができ、次に本明細書中で説明されるように発現させることができる。さらに別の技法は、各々が所望の類似体の一部をコードする１つ又は複数の天然及び／又は合成の核酸配列を組み合わせること、及び次に組み合わせた核酸配列を本明細書中で説明されるように発現させることを含み得る。また、類似体は、例えば本明細書中で述べたような、それ自体が既知のペプチド合成技法を用いた関連アミノ酸配列の化学合成を利用して準備することができる。
【０４０８】
これに関して、本発明のナノボディの配列を提供するために及び／又はこのようにして得られる配列にナノボディの有利な特性を付与するために、本発明のナノボディ（例えばその類似体）を、例えばヒトＶＨ３配列、例えばＤＰ−４７、ＤＰ−５１又はＤＰ−２９等のヒトＶＨ配列（即ち、単一可変ドメイン又は対応するヌクレオチド配列）から設計及び／又は準備すること、即ち、１つ又は複数のラクダ化置換を導入する（即ち、上記ヒトＶＨドメインのアミノ酸配列中の１つ又は複数のアミノ酸残基を、ＶＨＨドメインの対応する位置で生じるアミノ酸残基に変化させる）ことが可能であることも、当業者には明らかである。同様に、これは一般に、開始点としてヒトＶＨドメインに対するアミノ酸配列及び／又はヌクレオチド配列を使用し、前の段落で言及される多様な方法及び技法を用いて実行することができる。
【０４０９】
幾つかの好ましいが非限定的なラクダ化置換は、表Ａ−５〜表Ａ−８から導くことができる。特徴的な残基の１つ又は複数でのラクダ化置換は一般に、所望の特性に他のアミノ酸位置の１つ又は複数での置換よりも大きな影響を与えるが、その両方及び任意の適切な組合せが本発明の範囲内に含まれることも明らかである。例えば、既に少なくとも幾つかの所望の特性を付与している１つ又は複数のラクダ化置換を導入すること、及び次に上記特性をさらに改善するか、及び／又はさらなる有利な特性を付与するさらなるラクダ化置換を導入することが可能である。また、当業者は一般に、本明細書における開示に基づいて、また任意に、例えば限られた数の可能なラクダ化置換を導入すること、及びナノボディの有利な特性が得られたか又は（即ち、本来のＶＨドメインと比較して）改善されたか否かを求めることを含み得る限られた日常実験の後、適切なラクダ化置換又は適切なラクダ化置換の組合せを決定及び選択することが可能である。
【０４１０】
しかしながら、一般にこのようなラクダ化置換は好ましくは、得られるアミノ酸配列が少なくとも（ａ）１０８位にＱ、及び／又は（ｂ）４５位に荷電アミノ酸又はシステイン残基、好ましくは４４位にＥ、より好ましくは４４位にＥ及び４５位にＲ、及び／又は（ｃ）１０３位にＰ、Ｒ又はＳ、並びに任意に１つ又は複数のさらなるラクダ化置換を含有するようなものである。より好ましくは、ラクダ化置換は、本発明のナノボディ及び／又はその類似体（本明細書で規定される）、例えばヒト化類似体及び／又は好ましくは前述の段落に規定されるような類似体をもたらすようなものである。
【０４１１】
本明細書における開示から同様に明らかなように、本明細書で規定されるような本発明のナノボディの部分又は断片、又は２つ以上の部分又は断片の組合せ、特に配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディの部分又は断片の使用もまた本発明の範囲内である。したがって、本発明の一態様によれば、「本発明のナノボディ」という用語は最も広範な意味ではこのような部分又は断片も包含する。
【０４１２】
概して、本発明のナノボディ（例えばその類似体）のこのような部分又は断片は、対応する本発明の全長ナノボディ（又はその類似体）のアミノ酸配列と比較して、Ｎ末端の１つ又は複数のアミノ酸残基、Ｃ末端の１つ又は複数のアミノ酸残基、１つ又は複数の連続内部アミノ酸残基、又はその任意の組合せが欠失しているか、及び／又は除去された単一可変ドメインを有する。
【０４１３】
部分又は断片は好ましくは、本発明のナノボディに対して、本明細書で規定されるような親和性（本明細書中でさらに規定されるように、（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度として、又は代替的にはＩＣ５０値として適切に測定されるか、及び／又は表される）をもってＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに結合することができるようなものである。
【０４１４】
任意の部分又は断片は好ましくは、対応する本発明の全長ナノボディのアミノ酸配列の少なくとも１０個の連続アミノ酸残基、好ましくは少なくとも２０個の連続アミノ酸残基、より好ましくは少なくとも３０個の連続アミノ酸残基、例えば少なくとも４０個の連続アミノ酸残基を含むようなものである。
【０４１５】
また、任意の部分又は断片は好ましくは、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及び／又はＣＤＲ３の少なくとも１つ又は少なくともその一部（特に少なくともＣＤＲ３又は少なくともその一部）を含むようなものである。より好ましくは、任意の部分又は断片は、好ましくは適切なフレームワーク配列（複数可）又は少なくともその一部により連結した、ＣＤＲの少なくとも１つ（好ましくは少なくともＣＤＲ３又はその一部）及び少なくとも１つの他のＣＤＲ（即ち、ＣＤＲ１又はＣＤＲ２）又は少なくともその一部を含むようなものである。より好ましくは、任意の部分又は断片は、好ましくは同様に適切なフレームワーク配列（複数可）又は少なくともその一部により連結した、ＣＤＲの少なくとも１つ（好ましくは少なくともＣＤＲ３又はその一部）及び残り２つのＣＤＲの少なくとも一部を含むようなものである。
【０４１６】
別の特に好ましいが非限定的な態様によれば、このような部分又は断片は、対応する本発明の全長ナノボディの少なくともＣＤＲ３、例えばＦＲ３、ＣＤＲ３及びＦＲ４を含む（即ち、例えば国際出願の国際公開第０３／０５０５３１号パンフレット（Lasters et al.）に説明される）。
【０４１７】
上記で既に述べたように、２つ以上のこのような部分又は断片（即ち、同一又は別個の本発明のナノボディに由来する）を組み合わせる、即ち、本発明のナノボディの類似体（本明細書で規定される）を提供する及び／又はさらなる部分又は断片（本明細書で規定される）を提供することも可能である。例えば、本発明のナノボディの１つ又は複数の部分又は断片を、ヒトＶＨドメインの１つ又は複数の部分又は断片と組み合わせることもまた可能である。
【０４１８】
好適な一態様によれば、部分又は断片は、配列番号２５５〜配列番号２６９のナノボディの１つとの少なくとも５０％、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも７０％、さらにより好ましくは少なくとも８０％（少なくとも９０％等）、９５％又は９９％以上の程度の配列同一性を有する。
【０４１９】
部分及び断片、並びにこれをコードする核酸配列は、任意のそれ自体が既知の方法で準備して任意に組み合わせることができる。例えば、このような部分又は断片は、完全長の本発明のナノボディをコードする核酸中に終止コドンを挿入すること、及び次にこのようにして得られる核酸をそれ自体が既知の方法（例えば本明細書中で説明される）で発現させることで得ることができる。代替的には、このような部分又は断片をコードする核酸は、完全長の本発明のナノボディをコードする核酸を適切に制限すること、又はこのような核酸をそれ自体が既知の方法で合成することにより得ることができる。部分又は断片はまた、それ自体が既知のペプチド合成技法を用いて準備してもよい。
【０４２０】
本発明は最も広範な意味では本発明のナノボディの誘導体も含む。このような誘導体は概して、本発明のナノボディ及び／又は本発明のナノボディを形成するアミノ酸残基の１つ又は複数の修飾、特に化学的及び／又は生物学的（例えば酵素的）修飾により得ることができる。
【０４２１】
このような修飾の例、並びにこのような形（即ち、タンパク質骨格、又は好ましくは側鎖のいずれか）で修飾することができるナノボディ配列中のアミノ酸残基の例、このような修飾の導入のために使用することができる方法及び技法、並びにこのような修飾の潜在的使用及び利点は当業者に明らかである。
【０４２２】
例えば、このような修飾は、１つ又は複数の官能基、残基又は部分、特に１つ又は複数の所望の特性又は官能性を本発明のナノボディに付与する１つ又は複数の官能基、残基又は部分を本発明のナノボディ中又はナノボディ上に（例えば共有結合によるか、又は他の適切な形で）導入することを含み得る。このような官能基の例は当業者に明らかである。
【０４２３】
例えば、このような修飾は、本発明のナノボディの半減期、溶解性及び／又は吸収性を増大する、本発明のナノボディの免疫原性及び／又は毒性を低減する、本発明のナノボディの任意の望ましくない副作用を排除若しくは減衰する、及び／又は本発明のナノボディ及び／又は単一可変ドメインに他の有益な特性を付与するか、及び／又は本発明のナノボディ及び／又は単一可変ドメインの不要な特性を減らす、又は上記の２つ以上の任意の組合せである１つ又は複数の官能基を（例えば共有結合によるか、又は他の適切な形で）導入することを含み得る。このような官能基及びこれらを導入する技法の例は当業者に明らかであり、一般に、上記で引用される一般的背景技術で述べた全ての官能基及び技法、並びに医薬用タンパク質の修飾、特に抗体又は抗体断片（例えばＳｃＦｖ及び単一ドメイン抗体）の修飾に関するそれ自体が既知の官能基及び技法を含み得る；これに関しては例えばRemington's Pharmaceutical Sciences, 16th ed., Mack Publishing Co., Easton,PA （1980）を参照する。同様に当業者に明らかなように、このような官能基は、例えば本発明のナノボディに直接（例えば共有結合的に）結合するか、又は任意に適切なリンカー又はスペーサーを介して結合する。
【０４２４】
半減期を増大するか、及び／又は医薬用タンパク質の免疫原性を低減するために最も広く使用される技法の１つは、適切な薬理学的に許容可能なポリマー、例えばポリ（エチレングリコール）（ＰＥＧ）又はその誘導体（例えばメトキシポリ（エチレングリコール）又はｍＰＥＧ）の結合を含む。概して、任意の適切な形のペグ化、例えば当該技術分野で抗体及び抗体断片（例えば、限定されるものではないが、（単一）ドメイン抗体及びＳｃＦｖ）に対して使用されるペグ化を使用することができる；例えばChapman, Nat. Biotechnol., 54, 531-545 （2002）、Veronese and Harris, Adv. Drug Deliv. Rev. 54, 453-456 （2003）、Harris and Chess, Nat. Rev. Drug. Discov.,2, （2003）及び国際公開第０４／０６０９６５号パンフレットを参照する。タンパク質のペグ化に関する多様な試薬も、例えばNektar Therapeutics, USAより市販されている。
【０４２５】
好ましくは、特にシステイン残基を介した部位特異的ペグ化を使用する（例えばYang et al., Protein Engineering, 16, 10, 761-770 （2003）を参照）。例えば、そのために、本発明のナノボディにおいて天然のシステイン残基にＰＥＧを結合してもよく、本発明のナノボディを、ＰＥＧに結合する１つ又は複数のシステイン残基を適切に導入するように修飾してもよく、又はＰＥＧに結合する１つ又は複数のシステイン残基を含むアミノ酸配列を、本発明のナノボディのＮ末端及び／又はＣ末端と融合してもよい（全て、それ自体が当業者に既知であるタンパク質工学の技法を使用する）。
【０４２６】
好ましくは、ＰＥＧは、本発明のナノボディ及びタンパク質に対して５０００を超える（例えば１００００を超える）かつ２０００００未満（例えば１０００００未満）の分子量、例えば２００００〜８００００の範囲の分子量で使用する。
【０４２７】
さらに、通常あまり好ましくない修飾は、一般的に翻訳時及び／又は翻訳後の修飾の一部として、本発明のナノボディ又はポリペプチドを発現するのに用いられる宿主細胞に応
じてＮ結合型又はＯ結合型のグリコシル化を含む。
【０４２８】
さらに別の修飾は、標識したナノボディの用途に応じて、１つ又は複数の検出可能な標識、又は他のシグナル生成基若しくはシグナル生成部分の導入を含んでいてもよい。これらを結合、使用及び検出するのに好適な標識及び技法は当業者にとって明らかであり、例としては、蛍光標識（例えば、フルオレセイン、イソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、ｏ−フタアルデヒド、及びフルオレサミン、並びに１５２Ｅｕ等の蛍光金属、又はランタニド系列からの他の金属）、リン光標識、化学発光標識又は生物発光標識（例えば、ルミナール、イソルミナール、セロマティックアクリジニウムエステル（theromatic acridinium ester）、イミダゾール、アクリジニウム塩、シュウ酸エステル、ジオキセタン又はＧＦＰ、及びその類似体）、放射性同位体（例えば、３Ｈ、１２５Ｉ、３２Ｐ、３５Ｓ、１４Ｃ、５１Ｃｒ、３６Ｃｌ、５７Ｃｏ、５８Ｃｏ、５９Ｆｅ、及び７５Ｓｅ）、金属、金属キレート又は金属カチオン（例えば、９９ｍＴｃ、１２３Ｉ、１１１Ｉｎ、１３１Ｉ、９７Ｒｕ、６７Ｃｕ、６７Ｇａ、及び６８Ｇａ等の金属カチオン、又はｉｎ  ｖｉｖｏ、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ又はｉｎ  ｓｉｔｕ診断及びイメージングにおける使用に特に適した他の金属若しくは金属カチオン、例えば（１５７Ｇｄ、５５Ｍｎ、１６２Ｄｙ、５２Ｃｒ、及び５６Ｆｅ）、並びに、発色団及び酵素（例えば、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、スタフィロコッカスヌクレアーゼ、δ−Ｖ−ステロイドイソメラーゼ、酵母アルコールデヒドロゲナーゼ、α−グリセロリン酸デヒドロゲナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、ビオチンアビジンペルオキシダーゼ、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラーゼ、グルコース−ＶＩ−リン酸デヒドロゲナーゼ、グルコアミラーゼ、及びアセチルコリンエステラーゼ）が挙げられるが、これらに限定されない。他の好適な標識は当業者にとって明らかであり、例としては、ＮＭＲ分光法又はＥＳＲ分光法を用いて検出することができる部分が挙げられる。
【０４２９】
本発明のこのような標識したナノボディ及び単一可変ドメインは、例えば、特異的標識の選択に応じて、（ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ、ＥＩＡ及び他の「サンドイッチアッセイ」等の既知のイムノアッセイを含む）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ、ｉｎ  ｖｉｖｏ又はｉｎ  ｓｉｔｕアッセイに、並びにｉｎ  ｖｉｖｏ診断及びイメージングの目的で使用され得る。
【０４３０】
当業者にとって明らかであるように、別の修飾は、例えば、上記の金属又は金属カチオンの１つをキレート化するキレート基（chelating group）の導入を含んでいてもよい。例えば好適なキレート基としては、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）又はエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０４３１】
さらに別の修飾は、ビオチン−（ストレプト）アビジン結合対等の特異的結合対の一部である官能基の導入を含んでいてもよい。このような官能基は、本発明のナノボディを別のタンパク質、ポリペプチド、又は結合対の残り半分と結合する化合物に連結させるのに（即ち、結合対の形成を介して）使用され得る。例えば、本発明のナノボディは、ビオチンと結合し、アビジン又はストレプトアビジンと結合した別のタンパク質、ポリペプチド、化合物又は担体に連結し得る。例えば、このような結合ナノボディは、例えば、検出可能なシグナル生成剤がアビジン又はストレプトアビジンに結合する診断系のレポーターとして使用され得る。このような結合対は、例えば、本発明のナノボディを、医薬目的に好適な担体を含む担体に結合させるのにも使用することができる。非限定的な一例は、Cao and Suresh, Journal of Drug Targetting, 8, 4, 257 （2000）によって記載のリポソーム製剤である。このような結合対はまた、本発明のナノボディと治療に有効な作用物質とを連結させるのに使用することができる。
【０４３２】
用途によっては、特に、（例えば、癌の治療において）本発明のナノボディが指向性を有する標的を発現する細胞を死滅させること、又はこのような細胞の成長及び／又は増殖を低減するか若しくは遅延させることを意図する用途では、本発明のナノボディは、毒素又は毒素残基若しくは毒素部分にも連結し得る。本発明のナノボディに連結して、例えば細胞毒性化合物をもたらし得る毒素部分、化合物又は残基の例は当業者にとって明らかであり、例えば、上記の従来技術に及び／又は本明細書中のさらなる説明に見ることができる。一例はいわゆるＡＤＥＰＴ（商標）技術である（国際公開第０３／０５５５２７号パンフレットに記載）。
【０４３３】
他の可能な化学修飾及び酵素修飾は当業者にとって明らかであろう。このような修飾を、（例えば、機能−活性関係を研究するために）調査目的で導入してもよい。例えば、Lundblad and Bradshaw, Biotechnol. Appl. Biochem., 26, 143-151 （1997）を参照する。
【０４３４】
好ましくは、この誘導体は、本発明のナノボディに関して本明細書中に規定される（（実際又は見掛けの）ＫＤ値、（実際又は見掛けの）ＫＡ値、ｋｏｎ速度及び／又はｋｏｆｆ速度として、又は代替的に本明細書中にさらに記載のＩＣ５０値として好適に測定及び／又は表される）親和性で、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合するような誘導体である。
【０４３５】
上述のように、本発明はまた、少なくとも１つの本発明のナノボディから本質的に成るか又はこれを含む、タンパク質又は単一可変ドメインに関する。「から本質的に成る」とは、本発明のポリペプチドのアミノ酸配列が、本発明のナノボディのアミノ酸配列と厳密に同じであるか、又は、１個〜２０個のアミノ酸残基、例えば、１個〜１０個のアミノ酸残基、及び好ましくは１個〜６個のアミノ酸残基（例えば、１個、２個、３個、４個、５個又は６個のアミノ酸残基）等の限定数のアミノ酸残基をナノボディのアミノ酸配列のアミノ末端、カルボキシ末端、又はアミノ末端及びカルボキシ末端の両方に付加させた本発明のナノボディのアミノ酸配列に対応するかどちらかであることを意味する。
【０４３６】
上記のアミノ酸残基は、ナノボディの（生物学的）特性を変更するか、改質するか、又はさもなければこれに影響を与える場合もあり又は与えない場合もあり、ナノボディにさらなる官能性を付加する場合もあり又は付加しない場合もある。例えば、このようなアミノ酸残基は、
例えば、異種宿主細胞又は異種宿主生物において発現した結果得られるＮ末端Ｍｅｔ残基を含み得る。
合成の際に宿主細胞からのナノボディの分泌を導く、シグナル配列又はリーダー配列を形成してもよい。好適な分泌リーダーペプチドは当業者にとって明らかであり、本明細書中にさらに記載される通りであり得る。通常、本発明は最も広範な意味では、限定されるものではないが、このようなリーダー配列は、ナノボディのＮ末端に連結されるであろう。
ナノボディを、特定の器官、組織、細胞、又は細胞の一部若しくはコンパートメントに指向性を有し、及び／又はこれらに侵入させるか若しくは入り込ませ、及び／又はナノボディを、細胞膜、上皮細胞の層等の細胞層、固形腫瘍を含む腫瘍、又は血液脳関門のような生物学的障壁に侵入させるか若しくはこれらに対して横断させる、配列又はシグナルを形成し得る。このような単一可変ドメインの例は当業者にとって明らかであろう。幾つかの非限定的な例は、国際公開第０３／０２６７００号パンフレット、並びにTemsamani et al., Expert Opin. Biol. Ther., 1, 773 （2001）、Temsamani and Vidal, Drug Discov.Today, 9, 1012 （004）及びRousselle,J. Pharmacol. Exp. Ther., 296, 124-131 （2001）に記載されている小ペプチドベクター（「Ｐｅｐ−トランスベクター」）、並びにZhao et al., Apoptosis, 8, 631-637 （2003）によって記載されている膜輸送体配列である。抗体断片の細胞内標的化のためのＣ末端アミノ酸配列及びＮ末端単一可変ドメインは、例えば、Cardinale et al., Methods, 34, 171 （2004）によって記載されている。細胞内標的化の他の好適な技法は、以下に記述されるような、本発明のナノボディを含むいわゆる「細胞内抗体（intrabodies）」の発現及び／又は使用を伴う。
「標識」、例えば、上記の配列又は残基を対象とする親和性技法等を用いてナノボディの精製を可能にするか又は容易にする、アミノ酸配列又は残基を形成し得る。その後、（例えば、化学的又は酵素学的な切断によって）上記の配列又は残基を除去して、ナノボディ配列をもたらし得る（この目的のために、標識は任意で、切断可能なリンカー配列を介してナノボディ配列に連結されてもよく、又は切断可能なモチーフを含有していてもよい）。このような残基の好ましいが非限定的な幾つかの例は、複数のヒスチジン残基、グルタチオン残基、及びｍｙｃ標識（例えば国際公開第０６／１２２８２号パンフレットの配列番号３１を参照）であり、
官能基の結合のために官能化し及び／又は部位として機能することができる１つ又は複数のアミノ酸残基であり得る。好適なアミノ酸残基及び官能基は当業者にとって明らかであり、本発明のナノボディの誘導体について本明細書中に記述されたアミノ酸残基及び官能基が挙げられるが、これらに限定されない。
【０４３７】
別の態様によれば、本発明のポリペプチドは、そのアミノ末端で、そのカルボキシ末端で、又はそのアミノ末端及びカルボキシ末端の両方で、少なくとも１つのさらなるアミノ酸配列と融合する、即ち上記本発明のナノボディと１つ又は複数のさらなるアミノ酸配列とを含む融合タンパク質がもたらされるように本発明のナノボディを含む。このような融合は本明細書中で「ナノボディ融合」とも呼ばれる。
【０４３８】
１つ又は複数のさらなるアミノ酸配列は、任意の好適及び／又は所望のアミノ酸配列であり得る。さらなる単一可変ドメインは、ナノボディの（生物学的）特性を変更するか、改質するか、又はさもなければこれに影響を与える場合もあり又は与えない場合もあり、本発明のナノボディ又はポリペプチドにさらなる官能性を付加する場合もあり又は付加しない場合もある。好ましくは、さらなるアミノ酸配列は、本発明のナノボディ又はポリペプチドに、１つ又は複数の所望の特性又は官能性を付与するようなものである。
【０４３９】
例えば、さらなるアミノ酸配列はまた、任意の所望のタンパク質、ポリペプチド、抗原、抗原決定基又はエピトープ（本発明のナノボディが指向性を有する同様のタンパク質、ポリペプチド、抗原、抗原決定基若しくはエピトープ、又は異なるタンパク質、ポリペプチド、抗原、抗原決定基若しくはエピトープが挙げられるが、これらに限定されない）のいずれかに指向性を有し得る第２の結合部位をもたらし得る。
【０４４０】
このような単一可変ドメインの例は当業者にとって明らかであり、概して、従来の抗体及びその断片に基づきペプチド融合に用いられる全ての単一可変ドメインを含み得る（ＳｃＦｖ及び単一ドメイン抗体が挙げられるが、これらに限定されない）。例えば、Holliger and Hudson, Nature Biotechnology, 23, 9, 1126-1136 （2005）による総説を参照する。
【０４４１】
例えば、このようなアミノ酸配列は、本発明のナノボディ自体に比べて、半減期、溶解性若しくは吸着を増大させる、免疫原性若しくは毒性を低減させる、望ましくない副作用を排除若しくは減衰させる、及び／又は他の有益な特性を本発明の単一可変ドメインに付与するか、及び／又は本発明の単一可変ドメインの望ましくない特性を減らすアミノ酸配列であり得る。このような単一可変ドメインの幾つかの非限定的な例は、血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミン（例えば国際公開第００／２７４３５号パンフレットを参照）又はハプテン分子（例えば、循環抗体として認識されるハプテン（例えば国際公開第９８／２２１４１号パンフレットを参照））である。
【０４４２】
特に、血清アルブミン又はその断片に対する免疫グロブリンの連結断片（例えば、ＶＨドメイン）を使用して半減期を増大させることができることは、当該技術分野において記載されている。国際公開第００／２７４３５号パンフレット及び国際公開第０１／０７７１３７号パンフレットを参照する）。本発明によれば、本発明のナノボディは好ましくは、血清アルブミン（又はその好適な断片）に直接連結するか、又は好適なリンカーを介して、特に好適なペプチドを介して連結することにより、本発明のポリペプチドを遺伝子融合（タンパク質）として発現することができる。具体的な一態様によれば、本発明のナノボディは、少なくとも血清アルブミンのドメインＩＩＩ又はその一部を含む、血清アルブミンの断片に連結し得る。例えば、２００６年３月３１日に出願された、“Albumin derived amino acid sequence, use thereof for increasing the half-life of therapeutic proteins and of other therapeutic proteins and entities, and constructs comprising the same”と題された、Ablynx N.V.の米国仮特許出願第６０／７８８，２５６号明細書を参照されたい（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／００２８１７号明細書も参照されたい）。
【０４４３】
代替的に、さらなるアミノ酸配列は、血清中の半減期を増大させるように、血清タンパク質（例えば、ＩｇＧ等のヒト血清アルブミン又は別の血清タンパク質等）に指向性を有する、第２の結合部位又は結合単位を付与し得る。このような単一可変ドメインは例えば、下記のナノボディ、並びに、国際公開第９１／０１７４３号パンフレット、国際公開第０１／４５７４６号パンフレット及び国際公開第０２／０７６４８９号パンフレットに記載の小ペプチド及び結合タンパク質、及び国際公開第０３／００２６０９号パンフレット及び国際公開第０４／００３０１９号パンフレットに記載のｄＡｂを含む。Harmsen et al., Vaccine, 23 （41）; 4926-42, 2005、並びに欧州特許第０３６８６８４号明細書、並びに、本明細書中に記載のAblynx N.V.による以下の米国仮特許出願第６０／８４３，３４９号明細書（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０５９４７５号明細書も参照されたい）、同第６０／８５０，７７４号明細書（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６０８４９号明細書も参照されたい）、同第６０／８５０，７７５号明細書（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６０８５０号明細書も参照されたい）、及び"Peptides capable of binding to serum proteins"と題されたAblynx N.V.による米国仮特許出願（２００６年１２月５日出願）（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６３３４８号明細書も参照されたい））も参照する。
【０４４４】
このような単一可変ドメインは特に、血清アルブミン（及びより詳細にはヒト血清アルブミン）及び／又はＩｇＧ（及びより詳細にはヒトＩｇＧ）に指向性を有し得る。例えば、このような単一可変ドメインは、（ヒト）血清アルブミンに指向性を有する単一可変ドメイン、及びＦｃＲｎへの血清アルブミンの結合に関与しない（ヒト）血清アルブミン上のアミノ酸残基に結合し得る単一可変ドメイン（例えば、国際公開第０６／０１２２７８７号パンフレットを参照）、及び／又は血清アルブミンのドメインＩＩＩの一部を形成しない血清アルブミン上のアミノ酸残基に結合し得る単一可変ドメイン（例えば、同様に国際公開第０６／０１２２７８７号パンフレットを参照）；増大した半減期を有するか又は半減期を増大させ得る単一可変ドメイン（例えば、“Serum albumin binding proteins with long half-lives”と題されたAblynx N.V.の米国仮特許出願第６０／８４３，３４９号明細書（２００６年９月８日出願）、並びに国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０５９４７５号明細書も参照されたい）；哺乳動物の少なくとも１種に由来の血清アルブミンと、特に霊長類の少なくとも１種（例えば、限定されるものではないが、マカク属のサル（例えば、特に、カニクイザル（マカク・ファシクラリス）及び／又はアカゲザル（マカク・ムラット））及びヒヒ（パピオ・ウルジヌス））と交差反応性であるヒト血清アルブミンに対する単一可変ドメイン（同様に米国仮特許出願第６０／８４３，３４９号明細書及び国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０５９４７５号明細書も参照）；ｐＨ非依存的に血清アルブミンに結合し得る単一可変ドメイン（例えば、"Single variable domains that bind to serum proteins in a manner that is essentially independent of the pH, compounds comprising the same, and uses thereof"と題されたAblynx N.V.による米国仮特許出願第６０／８５０，７７４号明細書（２００６年１０月１１日出願）（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０５９４７５号明細書も参照されたい）を参照）、及び／又は条件付き結合剤（conditional binder）である単一可変ドメイン（例えば、"Single variable domains that bind to a desired molecule in a conditional manner"と題されたAblynx N.V.による米国仮特許出願第６０／８５０，７７５号明細書（２００６年１０月１１日出願（国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６０８５０号明細書も参照されたい））を参照）であり得る。
【０４４５】
別の態様によれば、１つ又は複数のさらなる単一可変ドメインは、従来の四本鎖抗体（及び、特にヒト抗体）及び／又は重鎖抗体の１つ又は複数の部分、断片、又はドメインを含み得る。例えば、通常はあまり好ましくないが、本発明のナノボディは、従来の（好ましくはヒト）ＶＨドメイン若しくはＶＬドメインに、又はＶＨドメイン若しくはＶＬドメインの天然型類似体若しくは合成類似体に、同様に任意でリンカー配列（Ward et al.によって記載されているｄＡｂ抗体等の他の（単一）ドメイン抗体が挙げられるが、これらに限定されない）を介して連結され得る。
【０４４６】
また、少なくとも１つのナノボディは、任意でリンカー配列を介して、１つ又は複数の（好ましくはヒト）ＣＨ１、ＣＨ２及び／又はＣＨ３ドメインと連結してもよい。例えば、好適なＣＨ１ドメインと連結するナノボディは、例えば従来のＦａｂ断片又はＦ（ａｂ’）２断片に類似するが、従来のＶＨドメインの１つ、又は（Ｆ（ａｂ’）２断片の場合）１つ若しくは両方を本発明のナノボディで置換した抗体断片／構造体を生成するように（好適な軽鎖と共に）使用することができる。また、２つのナノボディは、（任意でリンカーを介して）ＣＨ３ドメインと連結してｉｎ  ｖｉｖｏで半減期が増大した構築物をもたらすことができる。
【０４４７】
本発明のポリペプチドの具体的な一態様によれば、１つ又は複数の本発明のナノボディは、１つ又は複数の定常ドメイン（例えば、Ｆｃ部分の一部として使用する／Ｆｃ部分を形成することができる２つ又は３つの定常ドメイン）と、Ｆｃ部分と、及び／又は１つ又は複数のエフェクタ機能を本発明のポリペプチドに付与し及び／又は１つ又は複数のＦｃ受容体に結合する能力を付与し得る１つ又は複数の抗体部、断片又はドメインと（任意で好適なリンカー又はヒンジ領域を介して）連結し得る。例えば、この目的で、及びこれらに限定されるものではないが、１つ又は複数のさらなる単一可変ドメインは、重鎖抗体（本明細書中に記載）及びより好ましくは従来のヒト四本鎖抗体等に由来する抗体の１つ又は複数のＣＨ２及び／又はＣＨ３ドメインを含んでいてもよく、及び／又は例えばＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３又はＩｇＧ４）、ＩｇＥ、又はＩｇＡ、ＩｇＤ若しくはＩｇＭ等の別のヒトＩｇに由来するＦｃ領域（の一部）を形成してもよい。例えば、国際公開第９４／０４６７８号パンフレットは、ラクダ科動物ＶＨＨドメイン又はそのヒト化誘導体（即ち、ナノボディ）を含む重鎖抗体を記載しており、ここでは、ラクダＣＨ２及び／又はＣＨ３ドメインが、ヒトＣＨ２及びＣＨ３ドメインで置換されている。それによりナノボディと（ＣＨ１ドメインは含まないが）ヒトＣＨ２及びＣＨ３ドメインとをそれぞれ含む２つの重鎖から成る免疫グロブリンがもたらされるが、その免疫グロブリンは、ＣＨ２及びＣＨ３ドメインによって付与されるエフェクタ機能を有し、如何なる軽鎖の非存在下でも機能することができる。本発明のナノボディと好適に連結してエフェクタ機能を付与し得る他の単一可変ドメインは当業者にとって明らかであり、所望のエフェクタ機能（複数可）に基づき選択され得る。例えば、国際公開第０４／０５８８２０号パンフレット、国際公開第９９／４２０７７号パンフレット、国際公開第０２／０５６９１０号パンフレット、及び国際公開第０５／０１７１４８号パンフレット、上記のHolliger and Hudsonの概説、並びに"Constructs comprising single variable domains and an Fc portion derived from IgE"と題されたAblynx N. V.による早期公開されていない（non-prepublished）非公開の米国仮出願（２００７年１２月４日出願）を参照する。本発明のナノボディとＦｃ部分とのカップリングによっても、対応する本発明のナノボディに比べて半減期の増大が生じ得る。用途によっては、如何なる生物学的に重要なエフェクタ機能も含まない半減期の増大を与えるＦｃ部分及び／又は定常ドメイン（即ち、ＣＨ２及び／又はＣＨ３ドメイン）の使用も好適であるか、又は一層好ましい。１つ又は複数のナノボディと、ｉｎ  ｖｉｖｏで半減期が増大した１つ又は複数の定常ドメインとを含む他の好適な構築物は当業者にとって明らかであり、例えば、任意でリンカー配列を介してＣＨ３ドメインに連結する２つのナノボディを含み得る。一般に、半減期が増大した任意の融合タンパク質又は誘導体は好ましくは、５０ｋＤを超える分子量、即ち腎臓吸収のカットオフ値を有する。
【０４４８】
別の具体的であるが、非限定的な一態様において、本発明のポリペプチドを形成するために、１つ又は複数の本発明の単一可変ドメインは、（即ち従来の四本鎖抗体で自然発生する定常ドメインに比べて）二量体に自己会合する傾向が低減した（又は本質的にその傾向がない）天然、合成又は半合成の定常ドメイン（又はその類似体、変異体、突然変異体、部分又は断片）と（任意で好適なリンカー又はヒンジ領域を介して）連結し得る。このような単量体の（即ち自己会合していない）Ｆｃ鎖変異体又はその断片は、当業者にとって明らかである。例えば、Helm et al.（J Biol Chem 1996 271 7494）は、本発明のポリペプチド鎖で使用することができる単量体Ｆｃε鎖変異体を説明している。
【０４４９】
また、このような単量体Ｆｃ鎖変異体は、依然として（これらが由来するＦｃ部分に応じて）補体又は関連のＦｃ受容体（複数可）に結合することができるようなもの、及び／又は依然としてこれらが由来するＦｃ部分のエフェクタ機能を幾らか又は全て（又は依然として使用目的に適した低減レベルで）有するようなものであるのが好ましい。代替的に、このような本発明のポリペプチド鎖では、単量体Ｆｃ鎖を使用して、ポリペプチド鎖の半減期を増大させることができ、この場合、単量体Ｆｃ鎖はエフェクタ機能を有しなくても、又は本質的に有しなくてもよい。
【０４５０】
二価／多価、二重特異性／多重特異性又は二重パラトピック／多重パラトピックの本発明の単一可変ドメインは、２００７年１２月４日に出願された表題"immunoglobulin constructs"の早期公開されていない米国仮特許出願に記載される種類のポリペプチド構築物を提供するためにＦｃ部分と連結してもよい。
【０４５１】
また、さらなる単一可変ドメインは、（例えば、本発明のポリペプチドを発現するのに用いられる宿主細胞に応じて、本発明のポリペプチドのプレフォーム、プロフォーム又はプレプロフォームをもたらすように）合成の際に宿主細胞から本発明のナノボディ又はポリペプチドの分泌を導くシグナル配列又はリーダー配列を形成し得る。
【０４５２】
また、さらなるアミノ酸配列は、本発明のナノボディ又はポリペプチドを、特定の器官、組織、細胞、又は細胞の一部若しくはコンパートメントに誘導し、及び／又はこれらに侵入させるか若しくは入り込ませ、及び／又は本発明のナノボディ又はポリペプチドを、細胞膜、上皮細胞の層等の細胞層、固形腫瘍等の腫瘍、又は血液脳関門のような生物学的障壁に侵入させるか若しくはこれらに対して横断させる配列又はシグナルを形成し得る。このような単一可変ドメインの好適な例は当業者にとって明らかであり、例えば、国際公開第９４／０２６１０号パンフレット、国際公開第９５／２２６１８号パンフレット、米国特許第７００４９４０号明細書、国際公開第０３／０１４９６０号パンフレット、国際公開第９９／０７４１４号パンフレット；国際公開第０５／０１６９０号パンフレット；欧州特許第１５１２６９６号明細書；及びCattaneo, A. & Biocca, S. （1997） Intracellular Antibodies：Development and Applications. Landes and Springer-Verlag；及びKontermann, Methods 34, （2004）, 163-170、並びに本明細書中に記載のさらなる参照文献に記載されるような、上記の「Ｐｅｐｔｒａｎｓ」のベクター、Cardinale et al.によって記載される配列、並びにいわゆる「細胞内抗体」として本発明のナノボディ及び単一可変ドメインを発現又は産生するのに使用することができる、それ自体が既知の抗体断片が挙げられるが、これらに限定されない。
【０４５３】
用途によっては、特に（例えば癌の治療において）本発明のナノボディが指向性を有する標的を発現する細胞を死滅させること、又はこのような細胞の成長及び／又は増殖を抑えるか若しくは遅延させることを意図する用途では、本発明のナノボディはまた、（細胞）毒性タンパク質又はポリペプチドと連結し得る。本発明のナノボディと連結して、例えば、本発明の細胞毒性ポリペプチドをもたらし得るこのような毒性タンパク質及び単一可変ドメインの例は当業者にとって明らかであり、例えば、上記従来技術及び／又は本明細書中のさらなる記載に見出すことができる。一例は、国際公開第０３／０５５５２７号パンフレットに記載のいわゆるＡＤＥＰＴ（商標）技術である。
【０４５４】
好ましいが非限定的な一態様によれば、上記１つ又は複数のさらなる単一可変ドメインは、少なくとも１つのさらなるナノボディを含み、これにより、少なくとも２つ、例えば３つ、４つ、５つ以上のナノボディを含む本発明のポリペプチドをもたらし、上記ナノボディは任意で、１つ又は複数のリンカー配列（本明細書中に規定）を介して連結され得る。少なくとも１つが本発明のナノボディである２つ以上のナノボディを含む本発明の単一可変ドメインは、本明細書中で本発明の「多価」単一可変ドメインとも呼ばれ、このような単一可変ドメイン中に存在するナノボディは、本明細書中で「多価フォーマット」であるとも称される。例えば、本発明の「二価」ポリペプチドは、任意でリンカー配列を介して連結される２つのナノボディを含み、本発明の「三価」ポリペプチドは、任意で２つのリンカー配列等を介して連結される３つのナノボディ等を含む。ポリペプチド中に存在するナノボディの少なくとも１つ、及びポリペプチド中に存在するナノボディの最大で全てが、本発明のナノボディである。
【０４５５】
本発明の多価ポリペプチドでは、２つ以上のナノボディは、同じであっても異なっていてもよく、同じ抗原又は抗原決定基（例えば、同じ部分（複数可）若しくはエピトープ（複数可）、又は異なる部分若しくはエピトープ）に指向性を有するものであってもよく、又は代替的に異なる抗原若しくは抗原決定基又はこれらの任意の好適な組合せに指向性を有するものであってもよい。例えば、本発明の二価ポリペプチドは、（ａ）２つの同一のナノボディ、（ｂ）タンパク質若しくは抗原の第１の抗原決定基に指向性を有する第１のナノボディ、及び第１のナノボディと異なる上記タンパク質若しくは抗原の同一抗原決定基に指向性を有する第２のナノボディ、（ｃ）タンパク質若しくは抗原の第１の抗原決定基に指向性を有する第１のナノボディ、及び上記タンパク質若しくは抗原の別の抗原決定基に指向性を有する第２のナノボディ、又は（ｄ）第１のタンパク質若しくは抗原に指向性を有する第１のナノボディ、及び第２のタンパク質若しくは抗原（即ち、上記第１の抗原と異なる）に指向性を有する第２のナノボディを含み得る。同様に、本発明の三価ポリペプチドは例えば、これらに限定されるものではないが、（ａ）３つの同一のナノボディ、（ｂ）抗原の第１の抗原決定基に対する２つの同一のナノボディ、及び同一抗原の異なる抗原決定基に指向性を有する第３のナノボディ、（ｃ）抗原の第１の抗原決定基に対する２つの同一のナノボディ、及び上記第１の抗原と異なる第２の抗原に指向性を有する第３のナノボディ、（ｄ）第１の抗原の第１の抗原決定基に指向性を有する第１のナノボディ、上記第１の抗原の第２の抗原決定基に指向性を有する第２のナノボディ、及び上記第１の抗原と異なる第２の抗原に指向性を有する第３のナノボディ、又は（ｅ）第１の抗原に指向性を有する第１のナノボディ、上記第１の抗原と異なる第２の抗原に指向性を有する第２のナノボディ、及び上記第１の抗原及び上記第２の抗原と異なる第３の抗原に指向性を有する第３のナノボディを含み得る。
【０４５６】
少なくとも１つのナノボディが第１の抗原に指向性を有する（即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する）ものであり、少なくとも１つのナノボディが第２の（即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと異なる）抗原に指向性を有するものである、少なくとも２つのナノボディを含有する本発明の単一可変ドメインは、本発明の「多重特異性」単一可変ドメインとも呼ばれており、このような単一可変ドメイン中に存在するナノボディは、本明細書中で「多重特異性フォーマット」であるとも称される。このため例えば、本発明の「二重特異性」ポリペプチドは、第１の抗原（即ちＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー）に指向性を有する少なくとも１つのナノボディ及び第２の（即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと異なる）抗原に指向性を有する少なくとも１つのさらなるナノボディを含むポリペプチドであり、本発明の「三重特異性」ポリペプチドは、第１の抗原（即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー）に指向性を有する少なくとも１つのナノボディ、第２の（即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと異なる）抗原に指向性を有する少なくとも１つのさらなるナノボディ、及び第３の（即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー及び第２の抗原の両方と異なる）抗原に指向性を有する少なくとも１つのさらなるナノボディを含むポリペプチド等である。
【０４５７】
したがって、その最も単純な別の形態において、本発明の二重特異性ポリペプチドは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する第１のナノボディと、第２の抗原に指向性を有する第２のナノボディとを含み、上記第１のナノボディ及び上記第２のナノボディが任意でリンカー配列（本明細書中に規定）を介して連結され得る本発明の二価ポリペプチド（本明細書中に規定）であるのに対し、その最も単純な形態の本発明の三重特異性ポリペプチドは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する第１のナノボディと、第２の抗原に指向性を有する第２のナノボディと、第３の抗原に指向性を有する第３のナノボディとを含み、上記第１のナノボディ、第２のナノボディ及び第３のナノボディが、任意で１つ又は複数、特に１つ及び複数、特に２つのリンカー配列を介して連結され得る本発明の三価ポリペプチド（本明細書中に規定）である。
【０４５８】
しかしながら、上述から明らかであるように、本発明は、本発明の多重特異性ポリペプチドが、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する少なくとも１つのナノボディと、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと異なる１つ又は複数の抗原に指向性を有する任意の数のナノボディとを含み得るという意味において、これらに限定されない。
【０４５９】
さらに、本発明の単一可変ドメイン中における種々のナノボディの特定の順序又は配置が、最終的に得られる本発明のポリペプチドの性質（Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに関する、又は１つ若しくは複数の他の抗原に対する、親和性、特異性、又は結合活性が挙げられるが、これらに限定されない）に何らかの影響を及ぼし得る点は、本発明の範囲内に包含されるが、通常、上記順序又は配置は重要なものでなく、任意で本明細書中の開示に基づく限定された日常実験を幾つか実施した後に、当業者であれば好適に選択することができるであろう。したがって、特定の本発明の多価又は多重特異性のポリペプチドについて述べられる場合、明示的に指示がない限り、これは関連するナノボディの任意の順序又は配置を包含するものであることに留意されたい。
【０４６０】
最終的に、本発明の単一可変ドメインが、２つ以上のナノボディと、１つ又は複数のさらなる単一可変ドメイン（本明細書中に記述）とを含有することも、本発明の範囲内である。
【０４６１】
１つ又は複数のＶＨＨドメインを含有する多価及び多重特異性の単一可変ドメイン、及びこれらの調製に関して、Conrath et al., J. Biol. Chem., Vol. 276, 10. 7346-7350, 2001、Muyldermans, Reviews in Molecular Biotechnology 74 （2001）,277-302、並びに、例えば国際公開第９６／３４１０３号パンフレット及び国際公開第９９／２３２２１号パンフレットも参照する。本発明の幾つかの特定の多重特異性及び／又は多価のポリペプチドの幾つかの他の例は、本明細書中で参照されるAblynx N.V.による出願に見ることができる。
【０４６２】
本発明の多重特異性ポリペプチドの好ましいが非限定的な一例は、少なくとも１つの本発明のナノボディと、少なくとも１つの半減期の増大をもたらすナノボディとを含む。このようなナノボディは例えば、血清タンパク質、特にヒト血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミン、チロキシン結合タンパク質、（ヒト）トランスフェリン、フィブリノゲン、ＩｇＧ、ＩｇＥ若しくはＩｇＭ等の免疫グロブリン、又は国際公開第０４／００３０１９号パンフレットに列挙された血清タンパク質の１つに指向性を有するナノボディであり得る。これらの内で、血清アルブミン（特にヒト血清アルブミン）又はＩｇＧ（特にヒトＩｇＧ、例えば上記のMuyldermansによる総説に記載されているナノボディＶＨ−１を参照されたい）と結合することができるナノボディが特に好ましい（が、例えばマウス又は霊長類での実験に関しては、それぞれマウス血清アルブミン（ＭＳＡ）又は上記霊長類由来の血清アルブミンに対する、又はこれと交差反応性のナノボディを使用することができる。しかしながら、薬学的使用に関しては、通常ヒト血清アルブミン又はヒトＩｇＧに対するナノボディが好ましい）。半減期を増大させ、本発明の単一可変ドメインで使用することができるナノボディには、上記で言及されたようなもの等の国際公開第０４／０４１８６５号パンフレット、国際公開第０６／１２２７８７号パンフレット及びAblynx N. V.によるさらなる特許出願で記載されている血清アルブミンに指向性を有するナノボディが含まれる。
【０４６３】
例えば、本発明で使用する半減期を増大させる、幾つかの好ましいナノボディには、血清アルブミンとＦｃＲｎとの結合に関与しない（ヒト）血清アルブミン上のアミノ酸残基と結合することができるナノボディ（例えば国際公開第０６／０１２２７８７号パンフレットを参照されたい）；血清アルブミンのドメインＩＩＩ部分を形成しない血清アルブミン上のアミノ酸残基と結合することができるナノボディ（例えば国際公開第０６／０１２２７８７号パンフレットを参照されたい）；半減期を増大させたか又は増大させることができるナノボディ（例えば本明細書中に言及されるAblynx N.Vによる米国仮特許出願第６０／８４３，３４９号明細書を参照されたい、また国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０５９４７５号明細書を参照されたい）；少なくとも１種の哺乳動物由来の血清アルブミンと、特に少なくとも１種の霊長類（例えば、限定されるものではないが、マカク属のサル（例えば、特に、カニクイザル（マカク・ファシクラリス）及び／又はアカゲザル（マカク・ムラット））及びヒヒ（パピオ・ウルジヌス））と交差反応性であるヒト血清アルブミンに対するナノボディ（例えばAblynxN.Vによる米国仮特許出願第６０／８４３，３４９号明細書を参照されたい、また国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０５９４７５号明細書を参照されたい）；ｐＨ非依存的に血清アルブミンと結合することができるナノボディ（例えば本明細書に言及されるAblynx N.V.による米国仮特許出願第６０／８５０，７７４号を参照されたい）及び／又は条件付き結合剤であるナノボディ（例えばAblynx N.V.による米国仮特許出願第６０／８５０，７７５号を参照されたい、また国際出願ＰＣＴ／ＥＰ２００７／０６０８５０号明細書を参照されたい）が含まれる。
【０４６４】
半減期を増大させ、本発明の単一可変ドメインで使用することができる、幾つかの特に好ましいナノボディには、国際公開第０６／１２２７８７号パンフレット（表ＩＩ及び表ＩＩＩを参照されたい）に開示のナノボディＡＬＢ−１〜ＡＬＢ−１０が含まれ、その中でもＡＬＢ−８（国際公開第０６／１２２７８７号パンフレットにおける配列番号６２）が特に好ましい。
【０４６５】
具体的であるが非限定的な本発明の態様によれば、本発明の単一可変ドメインは、１つ又は複数の本発明のナノボディ以外に、少なくとも１つのヒト血清アルブミンに対するナノボディを含有する。
【０４６６】
概して、１つ又は複数の本発明のナノボディを含有する、半減期が増大した任意の本発明の単一可変ドメイン、及び本発明のナノボディ又は半減期が増大したこのような単一可変ドメインの任意の誘導体は好ましくは、対応する本発明のナノボディ自体の少なくとも１．５倍、好ましくは少なくとも２倍（少なくとも５倍等）、例えば少なくとも１０倍又は２０倍を超える半減期を有する。例えば、このような半減期を増大させた誘導体又は単一可変ドメインは、対応する本発明のナノボディ自体に比べて、半減期が１時間を超えて、好ましくは２時間を超えて、より好ましくは６時間を超えて（１２時間等を超えて）、又はさらに２４時間、４８時間若しくは７２時間を超えて増大し得る。
【０４６７】
好ましいが非限定的な本発明の態様において、このような誘導体又は単一可変ドメインは、少なくとも約１２時間、好ましくは少なくとも２４時間、より好ましくは少なくとも４８時間、さらにより好ましくは少なくとも７２時間以上のヒトにおける血清半減期を示し得る。例えばこのような誘導体又は単一可変ドメインは、少なくとも５日（約５日〜１０日等）、好ましくは少なくとも９日（約９日〜１４日等）、より好ましくは少なくとも約１０日（約１０日〜１５日等）、若しくは少なくとも約１１日（約１１日〜１６日等）、より好ましくは少なくとも約１２日（約１２日〜１８日以上等）、又は１４日超（約１４日〜１９日等）の半減期を有し得る。
【０４６８】
本発明の一態様によれば、単一可変ドメインは、ｉｎ  ｖｉｖｏにおいてポリペプチドの半減期を増大させることができる１又は複数の分子と結合することができる。
【０４６９】
本発明の単一可変ドメインは、ｉｎ  ｖｉｖｏにおいて安定化され、これらの半減期は、分解耐性及び／又はクリアランス耐性若しくは捕捉耐性のある分子への結合により増大する。通常、このような分子は、それ自体がｉｎ  ｖｉｖｏにおいて長い半減期を有する天然タンパク質である。
【０４７０】
本発明の多重特異性ポリペプチドの好ましいが非限定的な別の例は、少なくとも１つの本発明のナノボディ、及び本発明のポリペプチドを特定の器官、組織、細胞、又は細胞の一部若しくはコンパートメントに誘導し、及び／又は本発明のポリペプチドを特定の器官、組織、細胞、又は細胞の一部若しくはコンパートメントに侵入させるか若しくは入り込ませ、及び／又はナノボディを細胞膜、上皮細胞層等の細胞層、固形腫瘍を含む腫瘍、又は血液脳関門のような生物学的障壁に侵入させるか若しくはこれらに対して横断させる、少なくとも１つのナノボディを含む。このようなナノボディの例としては、所望の器官、組織又は細胞（例えば、腫瘍細胞に関連する細胞表面マーカー）に特異的な細胞表面タンパク質、マーカー又はエピトープ、並びに国際公開第０２／０５７４４５号パンフレット及び国際公開第０６／０４０１５３号パンフレットに記載の単一ドメイン脳標的化抗体断片に指向性を有するナノボディが挙げられ、このうち、ＦＣ４４（国際公開第０６／０４０１５３号パンフレットの配列番号１８９）及びＦＣ５（国際公開第０６／０４０１５４号パンフレットの配列番号１９０）が好ましい例である。
【０４７１】
本発明の単一可変ドメインにおいて、１つ又は複数のナノボディ、及び１つ又は複数の単一可変ドメインは、（例えば、国際公開第９９／２３２２１号パンフレットに記載のように）互いに直接連結していてもよく、及び／又は１つ又は複数の好適なスペーサー若しくはリンカー、又はこれらの任意の組合せを介して互いに連結していてもよい。
【０４７２】
多価及び多重特異性の単一可変ドメインに使用するのに好適なスペーサー又はリンカーは当業者にとって明らかであり、一般に、アミノ酸配列を連結させるのに当該技術分野で使用する任意のリンカー又はスペーサーであってよい。好ましくは、上記リンカー又はスペーサーは、医薬用途で意図されるタンパク質又は単一可変ドメインを構築する上での使用に好適である。
【０４７３】
幾つかの特に好ましいスペーサーとしては、抗体断片又は抗体ドメインを連結させるのに当該技術分野で使用されるスペーサー及びリンカーが挙げられる。これらは、上記で引用した包括的な背景技術に記載したリンカーと共に、例えば、ダイアボディ又はＳｃＦｖ断片を構築するのに当該技術分野で使用するリンカーを含む（しかし、この点で、ダイアボディ及びＳｃＦｖ断片では、使用するリンカー配列が、関連するＶＨドメイン及びＶＬドメインが一体となって、完全な抗原結合部位を形成することができるような長さ、柔軟性の程度、及び他の性質を有している必要があるが、それぞれのナノボディは単独で完全な抗原結合部位を形成するため、本発明のポリペプチドに使用するリンカーの長さ又は柔軟性に関しては特に制限が存在しないことに留意されたい）。
【０４７４】
例えば、リンカーは、好適なアミノ酸配列、具体的には１個〜５０個、好ましくは１個〜３０個、例えば１個〜１０個のアミノ酸残基の単一可変ドメインであってもよい。このような単一可変ドメインの幾つかの好ましい例としては、（国際公開第９９／４２０７７号パンフレットに記載の例えば（ｇｌｙ４ｓｅｒ）３又は（ｇｌｙ３ｓｅｒ２）３）等の（ｇｌｙｘｓｅｒｙ）ｚ型のｇｌｙ−ｓｅｒリンカー、本明細書で上述したAblynxによる出願に記載のＧＳ３０リンカー、ＧＳ１５リンカー、ＧＳ９リンカー及びＧＳ７リンカー（例えば国際公開第０６／０４０１５３号パンフレット及び国際公開第０６／１２２８２５号パンフレットを参照）、並びに天然型重鎖抗体のヒンジ領域等のヒンジ類似領域、又は（国際公開第９４／０４６７８号パンフレットに記載のもの等の）類似配列が挙げられる。
【０４７５】
幾つかの他の特に好ましいリンカーは、ポリアラニン（ＡＡＡ等）、並びにＧＳ３０リンカー（国際公開第０６／１２２８２５号パンフレットの配列番号８５）及びＧＳ９リンカー（国際公開第０６／１２２８２５号パンフレットの配列番号８４）である。
【０４７６】
他の好適なリンカーは一般に、有機化合物又はポリマー、特に医薬用途のタンパク質に使用するのに好適な有機化合物又はポリマーを含む。例えば、ポリ（エチレングリコール）部分が、抗体ドメインを連結させるのに使用されており、例えば、国際公開第０４／０８１０２６号パンフレットを参照されたい。
【０４７７】
使用するリンカー（複数可）の長さ、柔軟性の程度及び／又は他の性質（重要ではないが、ＳｃＦｖ断片に使用されるリンカーにおいて一般的なもの）は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー又は１つ又は複数の他の抗原に対する親和性、特異性又は結合活性を含むがこれらに限定されない、最終的に得られる本発明のポリペプチドの性質に何らかの影響を及ぼし得る点が、本発明の範囲内に包含される。本明細書中での開示に基づき、任意で、限定された日常実験を幾つか実施した後に、当業者であれば本発明の特定のポリペプチドに使用するために最適なリンカー（複数可）を決定することができるであろう。
【０４７８】
例えば、（多量体受容体又は他のタンパク質等の）多量体抗原に指向性を有するナノボディを含む本発明の多価の単一可変ドメインにおいて、リンカーは、好ましくは、ポリペプチド中に存在する本発明のそれぞれのナノボディを、多量体のそれぞれのサブユニット上の抗原決定基に結合させるような長さ及び柔軟性を有している。同様に、同一の抗原上の２つ以上の異なる抗原決定基（例えば、抗原の異なるエピトープ、及び／又は多量体受容体、チャネル若しくはタンパク質の異なるサブユニット）に指向性を有するナノボディを含む本発明の多重特異性ポリペプチドにおいて、リンカーは、好ましくは、それぞれのナノボディを、目的の抗原決定基に結合させるような長さ及び柔軟性を有している。この場合にも、本明細書中での開示に基づき、任意で、限定された日常実験を幾つか実施した後に、当業者であれば本発明の特定のポリペプチドに使用するために最適なリンカー（複数可）を決定することができるであろう。
【０４７９】
使用するリンカー（複数可）が、本発明の単一可変ドメインに、１つ又は複数の他の望ましい性質又は機能を付与し、及び／又は（例えば本発明のナノボディの誘導体について本明細書中に記載の）誘導体の形成及び／又は官能基の結合のための１つ又は複数の部位をもたらすことも本発明の範囲内に包含される。例えば、１つ又は複数の荷電アミノ酸残基（上記の表Ａ−２を参照）を含有するリンカーは、高められた親水性をもたらすことができるのに対し、低分子量のエピトープ又は標識を形成するか又はこれらを含有するリンカーは、検出、同定及び／又は精製の目的で使用することができる。同様に、本明細書中での開示に基づき、任意で、限定された日常実験を幾つか実施した後に、当業者であれば本発明の特定のポリペプチドに使用するために最適なリンカーを決定することができるであろう。
【０４８０】
最終的に、本発明の単一可変ドメインに２つ以上のリンカーを使用する場合、これらのリンカーは同一であっても異なっていてもよい。この場合でも、本明細書中での開示に基づき、任意で、限定された日常実験を幾つか実施した後に、当業者であれば本発明の特定のポリペプチドに使用するのに最適なリンカーを決定することができるであろう。
【０４８１】
通常、発現及び産生を容易にするため、本発明のポリペプチドは直鎖ポリペプチドである。しかしながら、本発明は、最も広範な意味ではこれらに限定されない。例えば、本発明のポリペプチドが３つ以上のナノボディを含む場合、「星型」の構築物を得るために、各「アーム」がナノボディに結合する３つ以上の「アーム」を有するリンカーを使用することによってこれらを結合させることも可能である。通常あまり好ましくないが、環状の構築物を使用することも可能である。
【０４８２】
また、本発明には、本発明の単一可変ドメインの誘導体が含まれ、これは本発明の、即ち本明細書中に記載のナノボディの誘導体に本質的に類似するものであり得る。
【０４８３】
また、本発明には、本発明のポリペプチドから「本質的に成る」タンパク質又は単一可変ドメインが含まれる（「から本質的に成る」という語句は、上記で示したものと本質的に同じ意味を有する）。
【０４８４】
本発明の一態様によれば、本発明のポリペプチドは、本明細書中に規定したように、本質的に単離形態である。
【０４８５】
本明細書中のさらなる説明により当業者にとって明らかであるように、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ、単一可変ドメイン及び核酸は、それ自体が既知の方法で調製することができる。例えば、本発明のナノボディ及びポリペプチドは、抗体の調製、特に抗体断片（（単一）ドメイン抗体及びＳｃＦｖ断片が挙げられるが、これらに限定されない）の調製のためのそれ自体が既知の任意の方法で調製することができる。アミノ酸配列、ナノボディ、単一可変ドメイン及び核酸を調製するための、好ましいが非限定的な幾つかの方法としては、本明細書中に記載の方法及び技法が挙げられる。
【０４８６】
当業者にとって明らかであるように、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又はポリペプチドの調製に特に有用な一方法は通常、
ｉ）好適な宿主細胞又は宿主生物（本明細書中では「本発明の宿主」とも呼ぶ）において、又は本発明の上記アミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドをコードする核酸（本明細書中では「本発明の核酸」とも呼ぶ）に適切な別の発現系において、発現する工程と、場合によってはその後、
ｉｉ）このようにして得られる本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを単離及び／又は精製する工程とを含む。
【０４８７】
特に、このような方法は、
ｉ）本発明の上記宿主が少なくとも１つの本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又はポリペプチドを発現及び／又は産生するような条件下で、本発明の宿主を培養及び／又は維持する工程と、場合によってはその後、
ｉｉ）このようにして得られる本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを単離及び／又は精製する工程とを含み得る。
【０４８８】
本発明の核酸は、一本鎖又は二本鎖のＤＮＡ又はＲＮＡの形態を取ることができ、好ましくは二本鎖ＤＮＡの形態をとる。例えば、本発明のヌクレオチド配列はゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ又は合成ＤＮＡ（目的とする宿主細胞又は宿主生物内の発現に特異的に適合しているコドンの使用によるＤＮＡ等）であってもよい。
【０４８９】
本発明の一態様によれば、本発明の核酸は、本明細書中に記載したように、本質的に単離形態である。
【０４９０】
本発明の核酸は、例えば、プラスミド、コスミド又はＹＡＣ等のベクターの形態をとり、ベクター中に存在し、及び／又はその一部であってもよく、また本質的に単離形態であってもよい。
【０４９１】
本発明の核酸は、本明細書中に記載の本発明の単一可変ドメインの単一可変ドメインに関する情報に基づき、それ自体が既知の方法で調製されるか又は得ることができ、及び／又は好適な天然資源から単離することができる。類似体を得るためには、天然型ＶＨＨドメインをコードするヌクレオチド配列に、例えば、部位特異的な突然変異誘発を起こして、上記類似体をコードする本発明の核酸を得ることができる。また、当業者にとって明らかであるように、本発明の核酸を調製するために、例えば、ナノボディをコードする少なくとも１つのヌクレオチド配列、及び例えば、１つ又は複数のリンカーをコードする核酸等の幾つかのヌクレオチド配列を好適な方法で連結することができる。
【０４９２】
本発明の核酸を生成するための技法は当業者にとって明らかであり、例えば、自動ＤＮＡ合成、部位特異的突然変異誘発、２つ以上の天然型配列及び／又は合成型配列（又はこれらの２つ以上の部分）の結合（combining）、切断された発現産物を発現させる突然変異の導入、（例えば、好適な制限酵素を用いて容易に消化及び／又はライゲーションすることができるカセット及び／又は領域を生成するための）１つ又は複数の制限部位の導入、及び／又は例えば、天然形態のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー配列を鋳型として使用する１つ又は複数の「ミスマッチ」プライマーを使用するＰＣＲ反応による突然変異の導入が挙げられ得るが、これらに限定されない。これらの技法及び他の技法は当業者にとって明らかであり、同様に上記のSambrook et al.及びAusubel et al.の文献等の標準的なハンドブック、及び以下の実施例を参照する。
【０４９３】
本発明の核酸はまた、当業者にとって明らかであるように、遺伝子構築物の形態をとり、遺伝子構築物中に存在し、及び／又はその一部であってもよい。このような遺伝子構築物は一般に、例えば、１つ又は複数の好適な調節要素（好適なプロモーター（複数可）、エンハンサー（複数可）、ターミネーター（複数可）等）、及び本明細書中に述べられている遺伝子構築物のさらなる要素等）といった、１つ又は複数のそれ自体が既知の遺伝子構築物の要素に、場合によっては連結する少なくとも１つの本発明の核酸を含む。少なくとも１つの本発明の核酸を含むこのような遺伝子構築物は、本明細書中において「本発明の遺伝子構築物」とも呼ばれる。
【０４９４】
本発明の遺伝子構築物は、ＤＮＡであってもＲＮＡであってもよく、好ましくは二本鎖ＤＮＡである。また、本発明の遺伝子構築物は、目的とする宿主細胞又は宿主生物の形質転換に好適な形態、目的とする宿主細胞のゲノムＤＮＡへの組込みに好適な形態、又は目的とする宿主生物における単独での複製、維持及び／又は継代に好適な形態をとり得る。例えば、本発明の遺伝子構築物は、例えば、プラスミド、コスミド、ＹＡＣ、ウイルスベクター又はトランスポゾン等のベクターの形態をとることができる。特に、ベクターは、発現ベクター、即ち、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏ（例えば、好適な宿主細胞、宿主生物及び／又は発現系）での発現を提供し得るベクターであってもよい。
【０４９５】
好ましいが非限定的な一態様では、本発明の遺伝子構築物は、
ｉ）ｉｉ）と作動可能に連結している少なくとも１つの本発明の核酸と、
ｉｉ）プロモーター、及び場合によっては好適なターミネーター等の、１つ又は複数の調節要素と、場合によってはさらに
ｉｉｉ）それ自体が既知の遺伝子構築物の１つ又は複数のさらなる要素とを含み、ここで、「調節要素」、「プロモーター」、「ターミネーター」、及び「作動可能に連結した」という用語は、当該技術分野における（本明細書中に詳述するような）通常の意味を有しており、遺伝子構築物中に存在する上記「さらなる要素」とは、例えば、３’−又は５’−ＵＴＲ配列、リーダー配列、選択マーカー、発現マーカー／レポーター遺伝子、及び／又は形質転換若しくは組込み（の効率）を促進又は増大させ得る要素であってもよい。このような遺伝子構築物に好適なこれら及び他の要素は当業者にとって明らかであり、例えば、使用する構築物の種類、目的とする宿主細胞又は宿主生物、対象となる本発明のヌクレオチド配列を発現させる方法（例えば、構成的発現、一時的発現、又は誘導性発現等を介するもの）、及び／又は使用する形質転換法に応じて決定することができる。例えば、抗体及び抗体断片（（単一）ドメイン抗体及びＳｃＦｖ断片が挙げられるが、これらに限定されない）の発現及び産生のための、それ自体が既知の制御配列、プロモーター、及びターミネーターを、ほぼ同様の方法で使用してもよい。
【０４９６】
好ましくは、本発明の遺伝子構築物において、上記少なくとも１つの本発明の核酸、及び上記調節要素、及び場合によっては上記１つ又は複数のさらなる要素は、互いに「作動可能に連結」しており、これにより、これらは通常互いに機能的な関係にあることが意図されている。例えば、プロモーターが、コーディング配列の転写及び／又は発現を、開始又は他の方法により制御／調節することができる場合（上記コーディング配列は、上記プロモーター「に制御されている」ものとして理解されたい）、コーディング配列に「作動可能に連結」していると考えられる。一般に、２つのヌクレオチド配列が作動可能に連結している場合、これらは同一の配向を有し、通常、同一リーディングフレーム内にもある。必ずしも必要ではないが、通常、これらは本質的に隣接している。
【０４９７】
好ましくは、本発明の遺伝子構築物の調節要素及びさらなる要素は、目的とする宿主細胞又は宿主生物において意図される生物学的機能を付与することができるほどのものである。
【０４９８】
例えば、プロモーター、エンハンサー又はターミネーターは、目的とする宿主細胞又は宿主生物において「作動可能」でなければならず、このため（例えば）、上記プロモーターは、（本明細書で規定したように）作動可能に連結したヌクレオチド配列（例えばコーディング配列）の転写及び／又は発現を、開始、又は他の方法により制御／調節することができるものであると意図される。
【０４９９】
特に好ましい幾つかのプロモーターとしては、本明細書中に述べた宿主細胞における発現のためのそれ自体が既知のプロモーター、特に、本明細書中に述べたもの及び／又は実施例において使用されるもの等の、細菌細胞における発現のためのプロモーターが挙げられるが、これらに限定されない。
【０５００】
選択マーカーは、（即ち、適切な選択条件下で）本発明のヌクレオチド配列による形質転換が（首尾良く）起こった宿主細胞及び／又は宿主生物を、形質転換が（首尾良く）起こらなかった宿主細胞及び／又は宿主生物と区別できるようなものでなければならない。このようなマーカーの好ましいが非限定的な幾つかの例は、抗生物質（カナマイシン若しくはアンピシリン等）に対する耐性を付与する遺伝子、温度耐性を付与する遺伝子、又は形質転換されていない細胞若しくは生物が生存する上で不可欠な、培地中の或る種の因子、化合物及び／又は（食品）成分がない状態で宿主細胞若しくは宿主生物を維持させる遺伝子である。
【０５０１】
リーダー配列は、（目的とする宿主細胞又は宿主生物において）所望の翻訳後修飾を可能にし、及び／又は転写されたｍＲＮＡを細胞の所望の部分又はオルガネラに配向させるようなものでなければならない。また、リーダー配列は、上記細胞から発現生成物を分泌させてもよい。そのようなものとして、リーダー配列は、宿主細胞又は宿主生物中で作動可能な任意のプロ配列、プレ配列、又はプレプロ配列であってもよい。リーダー配列は、細菌細胞中で発現しなくてもよい。例えば、抗体及び抗体断片（単一ドメイン抗体及びＳｃＦｖ断片が挙げられるが、これらに限定されない）の発現及び産生のための、それ自体が既知であるリーダー配列を、ほぼ同様の方法で使用することができる。
【０５０２】
発現マーカー又はレポーター遺伝子は、（宿主細胞又は宿主生物中で）遺伝子構築物（に存在する遺伝子又はヌクレオチド配列）の発現を検出できるようなものでなければならない。発現マーカーは、場合によっては、発現産物を、例えば、細胞の特定の部分又はオルガネラ、及び／又は多細胞生物の特定の細胞（複数可）、組織（複数可）、器官（複数可）、又は部分（複数可）に局在化させてもよい。このようなレポーター遺伝子は、本発明のアミノ酸配列とのタンパク質融合として発現させてもよい。好ましいが非限定的な幾つかの例としては、ＧＦＰ等の蛍光タンパク質が挙げられる。
【０５０３】
好適なプロモーター、ターミネーター、及びさらなる要素の好ましいが非限定的な幾つかの例としては、本明細書で言及した宿主細胞における発現に使用することができるもの、及び具体的には本明細書で言及され、及び／又は下記の実施例で用いられているもの等の細菌細胞における発現に好適であるものが挙げられる。ターミネーター、転写及び／又は翻訳エンハンサー、及び／又は組込み因子等の、本発明の遺伝子構築物中に存在／使用し得るプロモーター、選択マーカー、リーダー配列、発現マーカー、及びさらなる要素についての（さらなる）非限定的な幾つかの例については、上記のSambrook et al.、及びAusubel et al.文献等の概説ハンドブック、並びに国際公開第９５／０７４６３号パンフレット、国際公開第９６／２３８１０号パンフレット、国際公開第９５／０７４６３号パンフレット、国際公開第９５／２１１９１号パンフレット、国際公開第９７／１１０９４号パンフレット、国際公開第９７／４２３２０号パンフレット、国際公開第９８／０６７３７号パンフレット、国際公開第９８／２１３５５号パンフレット、米国特許第７，２０７，４１０号明細書、米国特許第５，６９３，４９２号明細書、及び欧州特許第１０８５０８９号明細書に示された例を参照する。他の例は当業者にとって明らかであろう。上記の包括的な背景技術及び本明細書中にさらに引用した参考文献も参照する。
【０５０４】
本発明の遺伝子構築物は、通常、例えば、上記のSambrook et al.及びAusubel et al. 文献等の概説ハンドブックに記載の技法を用いて、本発明のヌクレオチド配列（複数可）を、１つ又は複数の上記さらなる要素と適切に連結させることにより得ることができる。
【０５０５】
多くの場合、本発明の遺伝子構築物は、本発明のヌクレオチド配列を、それ自体が既知の好適な（発現）ベクターに挿入することによって得られる。好適な発現ベクターの好ましいが非限定的な幾つかの例は、以下の実施例において使用されるもの、及び本明細書中に記載したものである。
【０５０６】
本発明の核酸及び／又は本発明の遺伝子構築物は、即ち本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを発現及び／又は産生させるための、宿主細胞又は宿主生物の形質転換に使用することができる。好適な宿主又は宿主細胞は当業者にとって明らかであり、例えば、任意の好適な真菌、原核、又は真核細胞若しくは細胞株、又は任意の好適な真菌、原核、又は真核生物、例えば：
大腸菌の菌株、ミラビリス変形菌（Proteus mirabilis）等のプロテウス属の菌株、蛍光菌（Pseudomonas fluorescens）等のシュードモナス属の菌株等のグラム陰性菌株、及び、枯草菌（Bacillus subtilis）又はブレビス菌（Bacillus brevis）等のバチルス属の菌株、ストレプトミセス・リビダンス（Streptomyces lividans）等のストレプトミセス属の菌株、スタフィロコッカス・カルノサス（Staphylococcus carnosus）等のスタフィロコッカス属の菌株、及び乳酸連鎖球菌（Lactococcus lactis）等のラクトコッカス属の菌株等のグラム陽性菌株が挙げられるがこれらに限定されない細菌株、
トリコデルマ・リーゼイ（Trichoderma reesei）等のトリコデルマ属の種、アカパンカビ（Neurospora crassa）等のニューロスポラ属の種、ソルダリア・マクロスポラ（Sordaria macrospora）等のソルダリア属の種、アスペルギルス・ニゲル（Aspergillusniger）又はショウユコウジカビ（Aspergillus sojae）等のアスペルギルス属の種、又は別の糸状菌（filamentous fungi）由来の細胞が挙げられるがこれらに限定されない真菌細胞、
出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）等のサッカロミセス属の種、シゾサッカロミセス・ポンベ（Schizosaccharomyces pombe）等のシゾサッカロミセス属の種、ピキア・パストリス（Pichia pastoris）又はピキア・メタノリカ（Pichia methanolica）等のピキア属の種、ハンセヌラ・ポリモルファ（Hansenula polymorpha）等のハンセヌラ属の種、クルイベロミセス・ラクティス（Kluyveromyces lactis）等のクルイベロミセス属の種、アークスラ・アデニニボランス（Arxula adeninivorans）等のアークスラ属の種、ヤロウィア・リポリチカ（Yarrowialipolytica）等のヤロウィア属の種由来の細胞が挙げられるがこれらに限定されない酵母細胞、
アフリカツメガエル卵母細胞等の両生類細胞又は細胞株、
シロイチモンジヨトウＳＦ９及びＳｆ２１細胞を含むがこれらに限定されない鱗翅目に由来する細胞／細胞株、又はシュナイダー細胞及びＫｃ細胞等のショウジョウバエに由来する細胞／細胞株等の昆虫に由来する細胞又は細胞株、
タバコ植物等の植物又は植物細胞、及び／又は
ＣＨＯ細胞、ＢＨＫ細胞（ＢＨＫ−２１細胞等）、及びＨｅＬａ細胞、ＣＯＳ細胞（ＣＯＳ−７細胞等）、及びＰＥＲ．Ｃ６細胞等のヒト細胞又は細胞株が挙げられるがこれらに限定されない、ヒトに由来する細胞又は細胞株、哺乳動物に由来する細胞又は細胞株等の哺乳動物細胞又は細胞株、及び、
抗体及び抗体断片（（単一）ドメイン抗体及びＳｃＦｖ断片が挙げられるがこれらに限定されない）を発現及び産生するそれ自体が既知の他の全ての宿主又は宿主細胞であってもよく、これらは当業者に明らかであろう。上記で引用した包括的な背景技術及び、例えば、国際公開第９４／２９４５７号パンフレット、国際公開第９６／３４１０３号パンフレット、国際公開第９９／４２０７７号パンフレット、Frenken et al.（1998）（同上）、Riechmann and Muyldermans （1999）（同上）、van der Linden （2000）（同上）、Thomassen et al.（2002）（同上）、Joosten et al.（2003）（同上）、Joosten et al.（2005）（同上）及び本明細書中にさらに引用した文献を参照する。
【０５０７】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインはまた、例えば予防目的及び／又は治療目的（遺伝子治療等）のために、多細胞生物の１つ又は複数の細胞、組織、又は器官に導入し、発現させることができる。このために、本発明のヌクレオチド配列を、例えば、このように（例えば、リポソームを用いて）、又は好適な（例えば、アデノウイルス、又はアデノ随伴ウイルス等のパルボウイルス等のレトロウイルスに由来する）遺伝子治療用ベクターに挿入後、任意の好適な方法で細胞又は組織に導入することができる。当業者にとって明らかであるように、このような遺伝子治療は、本発明の核酸又は本発明の核酸をコードする好適な遺伝子治療用ベクターを、患者又は患者の特定の細胞又は特定の組織若しくは器官に投与することにより患者の体内において、ｉｎ  ｖｉｖｏ及び／又はｉｎ  ｓｉｔｕで行うことができ、又は好適な（多くの場合、外植リンパ球、骨髄吸引物又は組織生検試料等の、治療対象となる患者の体内から採取された）細胞は、本発明のヌクレオチド配列を用いてｉｎ  ｖｉｔｒｏで治療した後、患者の体内に好適に（再）導入することができる。これらは全て、例えばCulver, K. W., "Gene Therapy", 1994, p. xii, Mary AnnLiebert, Inc., Publishers, New York, N.Y）、Giordano,Nature F Medicine 2 （1996）,534-539、Schaper, Circ. Res. 79 （1996）, 911-919、Anderson,Science 256 （1992）, 808-813、Verma, Nature 389 （1994）, 239、Isner, Lancet 348 （1996）, 370-374、Muhlhauser,Circ. Res. 77 （1995）, 1077-1086、Onodera, Blood 91; （1998）, 30-36、Verma, Gene Ther. 5 （1998）, 692-699、Nabel,Ann. N.Y. Acad. Sci.: 811 （1997）, 289-292、Verzeletti, Hum. Gene Ther. 9 （1998）, 2243-51、Wang,Nature Medicine 2 （1996）, 714-716、国際公開第９４／２９４６９号パンフレット、国際公開第９７／００９５７号パンフレット、米国特許第５，５８０，８５９号明細書、米国特許第５，５８９５４６６号明細書、又はSchaper, CurrentOpinion in Biotechnology 7 （1996）, 635-640に記載の当業者に既知の遺伝子治療用ベクター、技法、及びデリバリーシステムを用いて行うことができる。例えば、ＳｃＦｖ断片（Afanasieva et al., Gene Ther., 10, 1850-1859 （2003））及びダイアボディ（Blanco et al., J. Immunol,171, 1070-1077 （2003））のｉｎ  ｓｉｔｕ発現は当該技術分野で説明されている。
【０５０８】
細胞中でのナノボディの発現のために、これらは、例えば、国際公開第９４／０２６１０号パンフレット、国際公開第９５／２２６１８号パンフレット、及び米国特許第７００４９４０号明細書、国際公開第０３／０１４９６０号パンフレット、Cattaneo, A. & Biocca, S. （1997） Intracellular Antibodies: Development and Applications. Landes andSpringer-Verlag、並びにKontermann, Methods 34, （2004）, 163-170に記載の、いわゆる「細胞内抗体」として発現させることができる。
【０５０９】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又は単一可変ドメインを、例えば、ウサギ、ウシ、ヤギ又はヒツジの母乳中のようなトランスジェニック哺乳動物の母乳中（トランス遺伝子を哺乳動物に導入する一般的な技法については、例えば、米国特許第６，７４１，９５７号明細書、米国特許第６，３０４，４８９号明細書、及び米国特許第６，８４９，９９２号明細書を参照）、植物、又は葉、花、果実、種、根、塊茎を含むがこれらに限定されない植物の一部中（例えば、タバコ、トウモロコシ、大豆、又はアルファルファ）、又は、例えば、カイコガの蛹中で産生することもできる。
【０５１０】
さらに、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインを、細胞を含まない発現系で発現及び／又は産生してもよく、このような系の好適な例は当業者にとって明らかであろう。好ましいが非限定的な幾つかの例としては、小麦麦芽系、ウサギ網状赤血球溶解物、又はZubayの方法による大腸菌を用いた系での発現が挙げられる。
【０５１１】
上記のように、ナノボディを使用する利点の１つは、これに基づく単一可変ドメインを、好適な細菌系における発現によって調製することができる点であり、及び好適な細菌発現系、ベクター、宿主細胞、調節要素等は、例えば上記で引用した参考文献によって当業者にとって明らかであろう。しかしながら、本発明は、最も広範な意味では細菌系における発現に限定されないことに留意されたい。
【０５１２】
好ましくは、本発明では、本発明の単一可変ドメインを医薬用途に適した形態で提供する細菌発現系等の（ｉｎ  ｖｉｖｏ又はｉｎ  ｖｉｔｒｏ）発現系を使用し、このような発現系も当業者にとって明らかであろう。さらに当業者にとって明らかであるように、医薬用途に適した本発明の単一可変ドメインは、ペプチド合成法を用いて調製することができる。
【０５１３】
工業的スケールでの製造において、ナノボディ又はナノボディを含有するタンパク質治療剤の（工業的）製造のために好ましい異種宿主としては、大規模スケールでの発現／産生／発酵、特に大規模スケール（即ち、ＧＭＰグレード）での医薬用途発現／産生／発酵に適した大腸菌、ピキア・パストリス、出芽酵母の菌株が挙げられる。このような菌株の好適な例は、当業者にとって明らかであろう。このような菌株及び産生／発現系も、Biovitrum社（Uppsala, Sweden）等の企業から入手可能である。
【０５１４】
代替的には、哺乳動物細胞株、特にチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を、大規模スケールでの発現／産生／発酵、特に大規模スケールでの医薬用途発現／産生／発酵のために用いることができる。このような発現／産生系も、上記の幾つかの企業から入手可能である。
【０５１５】
特定の発現系の選択は、或る特定の翻訳後修飾、より具体的にはグリコシル化の必要条件に一部依存している。グリコシル化が望ましいか又は必要とされるナノボディを含有する組換えタンパク質の産生には、発現したタンパク質をグリコシル化する能力を有する哺乳動物発現用宿主の使用が必要である。これに関連して、得られるグリコシル化パターン（即ち、種類、数、及び残基が結合する位置）が、発現に用いられる細胞又は細胞株に依存することは、当業者にとって明らかであろう。好ましくは、ヒト細胞若しくは細胞株が用いられる（即ち、本質的にヒトのグリコシル化パターンを有するタンパク質を与える）か、又は、本質的に及び／又は機能的にヒトのグリコシル化と同一であるか、又は少なくともヒトのグリコシル化を模倣したグリコシル化パターンを与えることができる別の哺乳動物の細胞株が用いられる。一般に、大腸菌等の原核宿主はタンパク質をグリコシル化する能力を有しておらず、酵母等の下等原核細胞を使用すると、通常、ヒトのグリコシル化と異なるグリコシル化パターンがもたらされる。それにもかかわらず、上記宿主細胞及び発現系の全てを、得ようとする所望のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドに応じて、本発明に用いることができることを理解されたい。
【０５１６】
したがって、本発明の非限定的な一態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドはグリコシル化される。本発明の別の非限定的な態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドはグリコシル化されない。
【０５１７】
本発明の好ましいが非限定的な一態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、細菌細胞中、具体的には大規模スケールでの医薬品製造に適した上記の株の細胞等の細菌細胞中で産生する。
【０５１８】
本発明の好ましいが非限定的な別の態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、酵母細胞中、具体的には大規模スケールでの医薬品製造に適した上記の種の細胞等の酵母細胞中で産生する。
【０５１９】
本発明のさらに好ましいが非限定的な別の態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、哺乳動物細胞中、具体的にはヒト細胞又はヒト細胞株の細胞中で、さらに具体的には大規模スケールでの医薬品製造に適した上記の細胞株等のヒト細胞又はヒト細胞株の細胞中で産生する。
【０５２０】
宿主細胞中での発現が、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインの製造に用いられる場合、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、細胞内（例えば、細胞質中、ペリプラズム中、又は封入体中）で産生し、次いで宿主細胞から単離し、場合によってはさらに精製してもよく、又は細胞外（例えば、宿主細胞を培養する培地中）で産生し、次いで培地から単離し、場合によってはさらに精製してもよい。真核宿主細胞を使用する場合、得られるナノボディ及びタンパク質のさらなる単離及び下流工程での処理が大幅に容易になるため、通常、細胞外で産生されることが好ましい。通常、大腸菌の菌株等の上記細菌細胞は、毒素及び血液毒等の数種のタンパク質を除き、タンパク質を細胞外に分泌せず、大腸菌において分泌物を産生することは、内膜を通してペリプラズム空間へタンパク質を転移させることを意味する。ペリプラズムでの産生は、細胞質での産生に対して、幾つかの利点がある。例えば、分泌産物のＮ末端のアミノ酸配列は、特異的シグナルペプチダーゼによる分泌シグナル配列の切断後の天然遺伝子産物と同一であってもよい。また、ペリプラズム中では、細胞質中よりもプロテアーゼ活性がはるかに低いと思われる。さらに、ペリプラズム中では、混入するタンパク質が少ないため、タンパク質の精製がより容易である。別の利点は、ペリプラズムが細胞質よりも酸化的な環境をもたらすため、正しいジスルフィド結合が形成される可能性があるという点である。大腸菌中で過剰発現されたタンパク質は、封入体と呼ばれる不溶性の凝集物中に見られることが多い。これらの封入体は、細胞質中又はペリプラズム中に存在させることができ、これらの封入体からの生理活性タンパク質の回収は、変性／リフォールディングプロセスを必要とする。治療効果を有するタンパク質を含む多くの組換えタンパク質は、封入体から回収される。代替的には、当業者に明らかであるように、所望のタンパク質、特に本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを分泌するように遺伝的に修飾された細菌の組換え菌株を用いることができる。
【０５２１】
したがって、本発明の非限定的な一態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、細胞内で産生され、宿主細胞から、特に細菌細胞又は細菌細胞中の封入体から単離したアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドである。本発明の別の非限定的な態様によれば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、細胞外で産生され、宿主細胞を培養する培地から単離されたアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドである。
【０５２２】
好ましいが非限定的な幾つかの、これらの宿主細胞で用いるためのプロモーターとしては、
大腸菌における発現のための：ｌａｃプロモーター（及び、ｌａｃＵＶ５プロモーター等のこれらの誘導体）；アラビノースプロモーター；λファージの左側（ＰＬ）及び右側（ＰＲ）プロモーター；ｔｒｐオペロンのプロモーター；ハイブリッドｌａｃ／ｔｒｐプロモーター（ｔａｃ及びｔｒｃ）；Ｔ７−プロモーター（より具体的にはＴ７−ファージ遺伝子１０のプロモーター）；及び他のＴ−ファージプロモーター；Ｔｎ１０テトラサイクリン耐性遺伝子のプロモーター；外来制御オペレーター配列の１つ又は複数の複製を含む上記プロモーターの組換え変異体；
出芽酵母における発現のための：ＡＤＨ１（アルコール脱水素酵素１）、ＥＮＯ（エノラーゼ）、ＣＹＣ１（チトクロームｃ異性化酵素１）、ＧＡＰＤＨ（グリセルアルデヒド−３−リン酸脱水素酵素）、ＰＧＫ１（ホスホグリセリン酸キナーゼ）、ＰＹＫ１（ピルビン酸キナーゼ）の構成的プロモーター；ＧＡＬ１、ＧＡＬ１０、ＧＡＬ７（ガラクトース代謝酵素）、ＡＤＨ２（アルコール脱水素酵素２）、ＰＨＯ５（酸ホスファターゼ）、ＣＵＰ１（銅メタロチオネイン）の制御的プロモーター；ＣａＭＶ（カリフラワーモザイクウイルス３５Ｓプロモーター）の異種プロモーター；
ピキア・パストリスにおける発現のための：ＡＯＸ１プロモーター（アルコール酸化酵素Ｉ）；
哺乳動物細胞における発現のための：ヒトサイトメガロウイルス（ｈＣＭＶ）前初期エンハンサー／プロモーター；プロモーターがＴｅｔリプレッサーによって制御可能なように２個のテトラサイクリンオペレーター配列を含有するヒトサイトメガロウイルス（ｈＣＭＶ）前初期プロモーター変異体；単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ＴＫ）プロモーター；ラウス肉腫ウイルスの長末端反復配列（ＲＳＶ  ＬＴＲ）エンハンサー／プロモーター；ヒト、チンパンジー、マウス、又はラット由来の伸長因子１α（ｈＥＦ−１α）プロモーター；ＳＶ４０初期プロモーター；ＨＩＶ−１の長末端反復配列プロモーター；βアクチンプロモーターが挙げられる。
【０５２３】
好ましいが非限定的な幾つかの、これらの宿主細胞で用いるためのベクターとしては、
哺乳動物細胞における発現のためのベクター：ｐＭＡＭｎｅｏ（Clontech）、ｐｃＤＮＡ３（Invitrogen）、ｐＭＣ１ｎｅｏ（Stratagene）、ｐＳＧ５（Stratagene）、ＥＢＯ−ｐＳＶ２−ｎｅｏ（ＡＴＣＣ  ３７５９３）、ｐＢＰＶ−１（８−２）（ＡＴＣＣ  ３７１１０）、ｐｄＢＰＶ−ＭＭＴｎｅｏ（３４２−１２）（ＡＴＣＣ  ３７２２４）、ｐＲＳＶｇｐｔ（ＡＴＣＣ  ３７１９９）、ｐＲＳＶｎｅｏ（ＡＴＣＣ  ３７１９８）、ｐＳＶ２−ｄｈｆｒ（ＡＴＣＣ  ３７１４６）、ｐＵＣＴａｇ（ＡＴＣＣ  ３７４６０）及びｌＺＤ３５（ＡＴＣＣ  ３７５６５）、並びにアデノウイルスに基づくもの等のウイルスに基づく発現系；
細菌細胞における発現のためのベクター：ｐＥＴベクター（Novagen）及びｐＱＥベクター（Qiagen）；
酵母又は他の真菌細胞における発現のためのベクター：ｐＹＥＳ２（Invitrogen）及びピキア発現ベクター（Invitrogen）；
昆虫細胞における発現のためのベクター：ｐＢｌｕｅＢａｃＩＩ（Invitrogen）及び他のバキュロウイルスベクター；
植物又は植物細胞における発現のためのベクター：例えば、カリフラワーモザイクウイルス又はタバコモザイクウイルス、アグロバクテリウムの好適な菌株又はＴｉ−プラスミドに基づくベクターが挙げられる。
【０５２４】
好ましいが非限定的な幾つかの、これらの宿主細胞で使用するための分泌配列としては、
大腸菌等の細菌細胞における使用のための：ＰｅｌＢ、Ｂｌａ、ＯｍｐＡ、ＯｍｐＣ、ＯｍｐＦ、ＯｍｐＴ、ＳｔＩＩ、ＰｈｏＡ、ＰｈｏＥ、ＭａｌＥ、Ｌｐｐ、ＬａｍＢ等；ＴＡＴシグナルペプチド、ヘモリシンＣ末端分泌シグナル；
酵母における使用のための：α−接合因子プレプロ配列、ホスファターゼ（ｐｈｏ１）、インベルターゼ（Ｓｕｃ）等；
哺乳動物細胞における使用のための：標的タンパク質が真核細胞由来である場合には、固有シグナル、マウスＩｇ  κ鎖Ｖ−Ｊ２−Ｃシグナルペプチド等が挙げられる。
【０５２５】
本発明の宿主又は宿主細胞を形質転換するのに好適な技法は、当業者にとって明らかであり、目的とする宿主細胞／宿主生物及び使用する遺伝子構築物に依存することもある。同様に、上記ハンドブック及び特許出願を参照する。
【０５２６】
形質転換後、本発明のヌクレオチド配列／遺伝子構築物によって首尾よく形質転換された宿主細胞又は宿主生物を検出及び選択する工程を実行することができる。この工程は、例えば、本発明の遺伝子構築物中にある選択可能なマーカーに基づいて選択する工程、又は、例えば、特異的抗体を使用する本発明のアミノ酸配列の検出を含む工程であってもよい。
【０５２７】
形質転換された宿主細胞（安定な細胞株の形態を取ることができる）又は宿主生物（安定な変異体系列又は株の形態を取ることができる）は、本発明のさらなる態様をなす。
【０５２８】
好ましくは、これらの宿主細胞又は宿主生物は、（宿主生物の場合には、その少なくとも１つの細胞、部分、組織又は器官において）本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを発現し、又は（少なくとも）（例えば、好適な条件下で）発現することができるようなものである。本発明はまた、本発明の宿主細胞又は宿主生物のさらなる世代、後代及び／又は子孫を含んでおり、これらは、例えば、細胞分裂又は有性若しくは無性生殖により得られるものであってよい。
【０５２９】
本発明の単一可変ドメインを生成し／その発現を得るために、形質転換された宿主細胞又は形質転換された宿主生物は一般に、（所望の）本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドが発現／産生されるような条件下で保持、維持及び／又は培養され得る。好適な条件は当業者にとって明らかであり、通常、使用する宿主細胞／宿主生物に、及び（関連する）本発明のヌクレオチド配列の発現を制御する調節因子に依存する。この場合にも、本発明の遺伝子構築物に関する上記の段落に記載したハンドブック及び特許出願を参照する。
【０５３０】
一般に、好適な条件には、好適な培地の使用、好適な食餌及び／又は好適な栄養源の存在、好適な温度の使用、及び場合によっては好適な誘導因子又は化合物の存在（例えば、本発明のヌクレオチド配列が誘導性プロモーターにより制御される場合）が含まれていてもよく、これらは全て当業者が選択することができる。この場合にも、このような条件下で、本発明の単一可変ドメインは、構成的に、一時的に、又は適切に誘導された場合にのみ発現することができる。
【０５３１】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドが、（まず）未成熟型（同上）で産生され、次いで、使用する宿主細胞／宿主生物に応じて翻訳後修飾されてもよいことも、当業者にとって明らかであろう。また、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、この場合にも、使用する宿主細胞／宿主生物に応じてグリコシル化されてもよい。
【０５３２】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドは、次いで、宿主細胞／宿主生物から、及び／又は上記宿主細胞若しくは宿主生物を培養した培地から、（分取）クロマトグラフィ法、及び／又は電気泳動法、分別沈殿法、アフィニティ法（例えば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドと融合した特定の切断可能なアミノ酸配列を用いる）、及び／又は分取免疫法（即ち、単離対象のアミノ酸配列に対する抗体を用いる）等の、それ自体が既知のタンパク質の単離技法及び／又は精製技法を用いて単離することができる。
【０５３３】
一般に、医薬用途のために、本発明の単一可変ドメインは、少なくとも１つの本発明のポリペプチドと、少なくとも１つの薬学的に許容可能な担体、希釈剤又は賦形剤、及び／又はアジュバントとを含み、場合によっては１つ又は複数のさらなる薬理活性単一可変ドメイン及び／又は化合物を含む薬学的調製剤又は薬学的組成物として製剤化することができる。非限定的な例により、このような製剤は、経口投与のため、非経口投与（静脈内、筋内若しくは皮下注射、又は静脈内点滴等による）のため、局所投与のため、吸入、経皮パッチ、インプラント、座剤等による投与のために適した形態を取ることができる。このような好適な投与形態は、投与の方法、及びその調製剤で用いるための方法及び担体に応じて、固体、半固体又は液体であってよく、当業者にとって明らかであり、本明細書にさらに記載する。
【０５３４】
したがって、さらなる一態様において、本発明は、少なくとも１つの本発明のアミノ酸、少なくとも１つの本発明のナノボディ又は少なくとも１つの本発明のポリペプチド、及び少なくとも１つの好適な（即ち、医薬用途に好適な）担体、希釈剤又は賦形剤を含み、場合によっては１つ又は複数のさらなる活性物質を含有する薬学的組成物に関する。
【０５３５】
概して、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、それ自体が既知の任意の好適な方法により製剤化及び投与することができ、これらについては、例えば、上記で引用した包括的な背景技術（特に、国際公開第０４／０４１８６２号パンフレット、国際公開第０４／０４１８６３号パンフレット、国際公開第０４／０４１８６５号パンフレット、国際公開第０４／０４１８６７号パンフレット）、及びRemington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., MackPublishing Company, USA （1990）若しくはRemington, the Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition,Lippincott Williams and Wilkins （2005）等の標準的なハンドブックを参照する。
【０５３６】
例えば、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、従来の抗体及び抗体断片（例えばＳｃＦｖ及びダイアボディ）及び他の薬理活性タンパク質のための、それ自体が既知の任意の方法で製剤化及び投与することができる。このような製剤及びこれを調製する方法は当業者にとって明らかであり、例えば、非経口（例えば、静脈内、腹腔内、皮下、筋内、管腔内、動脈内若しくは髄腔内投与）又は局所（即ち、経皮若しくは皮内）投与に好適な調製剤が挙げられる。
【０５３７】
非経口投与のための調製剤は、例えば、点滴又は注射に好適な滅菌液、懸濁液、分散液又は乳化液であってもよい。このような調製剤に好適な担体又は希釈剤としては、例えば、限定するものではないが、滅菌水及び緩衝水溶液、並びにリン酸緩衝生理食塩水、リンゲル液、デキストロース溶液、及びハンクス液等の溶液、水性油、グリセロール、エタノール、プロピレングリコール等のグリコール、又は鉱物油、動物油、及び植物油、例えば、落花生油、大豆油、並びに好適なこれらの混合物が挙げられる。通常、水溶液又は懸濁液が好ましい。
【０５３８】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、遺伝子治療の送達方法を使用して投与することもできる。例えば、その全文が参照により本明細書中に援用される米国特許第５，３９９，３４６号明細書を参照されたい。遺伝子治療の送達方法を使用して、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドをコードする遺伝子によりトランスフェクトされた初代細胞を、特定の器官、組織、移植片、腫瘍又は細胞を標的とするための組織特異的プロモーターによりさらにトランスフェクトすることができ、かつ細胞内に局在化した発現のためのシグナル及び安定化配列によりさらにトランスフェクトすることもできる。
【０５３９】
このように、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、不活性希釈剤又は吸収可能な食用の担体等の薬学的に許容可能な溶媒と組み合わせて、例えば、経口的に全身投与することができる。これらを、ハード又はソフトシェルゼラチンカプセルに封入してもよく、錠剤として打錠してもよく、又は患者の食事中の食品に直接組み込んでもよい。経口治療用の投与のために、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインを１つ又は複数の賦形剤と組み合わせ、摂取可能な錠剤、口腔錠、トローチ剤、カプセル剤、エリキシル剤、懸濁液、シロップ剤、ウェハー剤等の形態で使用することができる。このような組成物及び調製剤は、少なくとも０．１％の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを含有していなければならない。組成物及び調製剤中のこれらの割合は、当然ながら変えることができ、便宜的には所定の単位投薬形態の重量の約２％〜約６０％であろう。このような治療上有用な組成物中の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドの量は、有効な用量レベルが得られるような量である。
【０５４０】
また、錠剤、トローチ剤、丸剤、カプセル剤等は、トラガカントガム、アラビアゴム、コーンスターチ又はゼラチン等の結着剤；リン酸二カルシウム等の賦形剤；コーンスターチ、ジャガイモデンプン、アルギン酸等の崩壊剤；ステアリン酸マグネシウム等の滑沢剤；及びスクロース、フルクトース、ラクトース又はアスパルテーム等の甘味料を含有していてもよく、又はペパーミント、冬緑油、若しくはチェリー香料等の香料を加えてもよい。単位投薬形態がカプセル剤である場合、上記のような種類の物質以外に、植物油又はポリエチレングリコール等の液体担体を含有していてもよい。種々の他の物質が、コーティングとして、又は固体状の単位投薬形態の物理的形態を他の方法により変化させるために存在していてもよい。例えば、錠剤、丸剤又はカプセル剤は、ゼラチン、ロウ、シェラック又は砂糖等でコーティングされていてもよい。シロップ剤又はエリキシル剤は、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメイン、甘味料としてのスクロース又はフルクトース、保存料としてのメチルパラベン又はプロピルパラベン、色素、及びチェリー又はオレンジ香料等の香料を含有していてもよい。当然ながら、単位投薬形態の調製に使用される全ての物質は、薬学的に許容され、使用する量において実質的に無毒でなければならない。さらに、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、徐放剤及び徐放デバイス中に組み込まれていてもよい。
【０５４１】
経口投与のための調製剤及び製剤にはまた、本発明の構築物が胃内環境に耐性を有しかつ腸内まで通過することを可能にする腸溶コーティングが付与される。より包括的には、経口投与のための調製剤及び製剤は、消化管のいずれかの所望部分に送達するのに好適に製剤化され得る。また、消化管に送達するのに好適な坐薬を使用してもよい。
【０５４２】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインはまた、点滴又は注射によって静脈内投与又は腹腔内投与してもよい。本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメイン、又はこれらの塩の溶液は、水中で調製することがき、任意で無毒性界面活性剤と混合することができる。分散剤液は、グリセロール、液体ポリエチレングリコール、トリアセチン、及びこれらの混合物中、並びに油中で調製することができる。通常の保存及び使用条件下において、これらの調製剤は、微生物の増殖を防ぐための保存料を含有している。
【０５４３】
注射又は点滴に好適な薬剤投薬形態としては、滅菌注射又は滅菌点滴可能な溶液又は分散液の即時調製に適合し、場合によってはリポソームに封入された活性成分を含む、滅菌水溶液又は分散液又は滅菌粉末が挙げられ得る。全ての場合において、最終的な投薬形態は、滅菌されており、流体であり、製造及び保存条件下で安定でなければならない。液体の担体又は溶媒は、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコール等）、植物油、非毒性グリセリルエステル、及びこれらの好適な混合物を含む溶媒又は液体の分散媒であってもよい。例えば、リポソームの形成により、分散液の場合には必要な粒子サイズを維持することにより、又は界面活性剤の使用により、適切な流動性を維持することができる。例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサール等の種々の抗菌剤及び抗真菌剤により微生物の作用を妨害することができる。多くの場合において、等張剤、例えば、砂糖、緩衝剤、又は塩化ナトリウムを含んでいることが好ましい。組成物において、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンを使用することにより、注射可能な組成物の長時間にわたる吸収をもたらすことができる。
【０５４４】
滅菌注射可能な溶液は、所要の量の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインを、必要に応じて、上記に列挙した種々の他の成分を含む適切な溶媒中に混合させた後、滅菌濾過することにより調製される。滅菌注射可能な溶液を調製するための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、減圧乾燥法及び凍結乾燥法であり、活性成分の粉末、及び先に滅菌濾過された溶液中に存在する任意のさらなる望ましい成分が得られる。
【０５４５】
局所投与のためには、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、液体の場合には、純粋な形態で適用することができる。しかし、概して、これらは、固体であっても液体であってもよい皮膚科学的に許容可能な担体と共に、組成物又は製剤として皮膚に投与されることが望ましい。
【０５４６】
有用な固体担体としては、タルク、粘土、微結晶セルロース、シリカ、アルミナ等の微粉砕された固体が挙げられる。有用な液体担体としては、水、ヒドロキシアルキル又はグリコール又は水−アルコール／グリコール配合物が挙げられ、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、場合によっては非毒性の界面活性剤の作用により、有効なレベルで溶解又は分散することができる。所定用途のための性質を最適化するために、芳香剤及び他の抗菌剤等のアジュバントを加えてもよい。得られる液体組成物は、絆創膏及び他の包帯に含浸させるのに用いられる吸収パッドによって塗布することができ、又はポンプ型若しくはエアロゾルスプレーを使用して患部の上に噴霧することができる。
【０５４７】
使用者の皮膚に直接塗布するための塗布用ペースト、ゲル、軟膏及び石鹸等を形成するために、合成ポリマー、脂肪酸、脂肪酸塩及びエステル、脂肪アルコール、修飾セルロース又は修飾無機物質等の増粘剤を液体担体と共に使用することができる。
【０５４８】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインを皮膚に送達するために使用することができる有用な皮膚科用組成物の例は当該技術分野で既知であり、例えば、Jacquet et al.（米国特許第４，６０８，３９２号明細書）、Geria（米国特許第４，９９２，４７８号明細書）、Smith et al.（米国特許第４，５５９，１５７号明細書）及びWortzman（米国特許第４，８２０，５０８号明細書）を参照されたい。
【０５４９】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインの有用な用量は、これらのｉｎ  ｖｉｔｒｏ活性、及び動物モデルにおけるｉｎ  ｖｉｖｏ活性を比較することにより決定することができる。マウス及び他の動物における有効用量をヒトに外挿するための方法は当該技術分野で既知であり、例えば、米国特許第４，９３８，９４９号明細書を参照されたい。
【０５５０】
概して、ローション等の液体組成物中の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインの濃度は、約０．１重量％〜２５重量％、好ましくは、約０．５重量％〜１０重量％である。ゲル又は粉末等の半固形又は固形組成物中の濃度は、約０．１重量％〜５重量％、好ましくは約０．５重量％〜２．５重量％である。
【０５５１】
治療における使用に必要な本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインの量は、選択される特定のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドだけでなく、投与経路、治療する症状の性質、並びに患者の年齢及び状態によっても変動し、最終的には担当する医師又は臨床医の判断に委ねられる。また、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインの用量は、標的となる細胞、腫瘍、組織、移植片又は器官によっても変動する。
【０５５２】
望ましい用量は便宜上、単回用量で、又は例えば、１日２回、３回、４回以上の部分用量として、適切な間隔での分割投与で示され得る。部分用量自体を、例えば、吸入器からの複数回の吸入又は複数滴の点眼投与等の、個別で、大まかな間隔の数多くの投与にさらに分割してもよい。
【０５５３】
投与計画には、長期間の毎日の処置が含まれ得る。「長期間」とは、少なくとも２週間、好ましくは数週間、数ヶ月、又は数年の期間を意味する。この用量範囲における必要な改変は、本明細書中で教示される通常の実験のみを使用して当業者によって決定され得る。Remington's Pharmaceutical Sciences （Martin,E. W., ed. 4）, Mack Publishing Co., Easton, PAを参照されたい。用量は、何らかの合併症の場合には、個々の医師が調節することもできる。
【０５５４】
別の態様において、本発明は、少なくとも１つの癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患を予防及び／又は治療する方法であって、これを必要とする患者に、薬学的に活性のある量の本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチド、及び／又はこれを含む薬学的組成物を投与することを含む、予防及び／又は治療する方法に関する。
【０５５５】
本発明の文脈において、「予防及び／又は治療」という用語とは、疾患を予防及び／又は治療することを含むだけでなく、概して、疾患の発症を予防すること、疾患の進行を遅延又は退行させること、疾患に関連する１つ又は複数の症状の発症を予防又は遅延させること、疾患に関連する１つ又は複数の症状を低減及び／又は軽減すること、疾患及び／又はこれに関連するあらゆる症状の重症度及び／又は期間を低減すること、及び／又は疾患及び／又はこれに関連するあらゆる症状の重症度のさらなる増大を予防すること、疾患によって生じるあらゆる生理学的損傷を予防、低減又は退行させること、及び概して治療すべき患者に有益なあらゆる薬理作用も含む。
【０５５６】
治療すべき被験体とは、任意の温血動物であり得るが、具体的には哺乳動物、より具体的にはヒトである。当業者にとって明らかであるように、治療すべき被験体は、特に本明細書中に記載の疾患及び障害を患っているか又はこれらの危険性のあるヒトであり得る。
【０５５７】
本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに、その生物活性若しくは薬理活性に、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する生物学的経路若しくはシグナル伝達に関連がある少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療する方法であって、これを必要とする被験体に薬学的に活性のある量の本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチド、及び／又はこれらを含む薬学的組成物を投与することを含む、方法に関する。特に、本発明は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、その生物活性若しくは薬理活性、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する生物学的経路若しくはシグナル伝達を調節することによって治療することができる少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療する方法であって、これを必要とする被験体に薬学的に活性のある量の本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチド、及び／又はこれらを含む薬学的組成物を投与することを含む、方法に関する。特に、上記の薬学的に有効な量とは、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、その生物活性若しくは薬理活性、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する生物学的経路又はシグナル伝達を調節するのに十分な量とすることができ、かつ／又は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバー、その生物学的活性又は薬理活性、及び／又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーが関与する生物学的経路又はシグナル伝達を調節するのに十分な、循環血液中で本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチドのレベルを与える量とすることができる。
【０５５８】
本発明はさらに、本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、又は本発明のポリペプチドを患者に投与することによって予防及び／又は治療することができる少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療する方法であって、これを必要とする被験体に薬学的に活性のある量の本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチド、及び／又はこれらを含む薬学的組成物を投与することを含む、方法に関する。
【０５５９】
より具体的には、本発明は、本明細書中に列挙される疾患及び障害から成る群から選択される少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療する方法であって、これを必要とする被験体に薬学的に活性のある量の本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチド、及び／又はこれらを含む薬学的組成物を投与することを含む、方法に関する。
【０５６０】
別の態様では、本発明は、免疫療法、特に受動免疫療法に関する方法であって、本明細書中に記載の疾患及び障害を患っているか又はこれらの危険性のある被験体に、薬学的に活性のある量の本発明のアミノ酸配列、本発明のナノボディ、本発明のポリペプチド、及び／又はこれらを含む薬学的組成物を投与することを含む、方法に関する。
【０５６１】
上記の方法において、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又は単一可変ドメイン、及び／又はこれらを含む組成物は、使用される特定の薬学的製剤又は薬学的組成物に応じて任意の好適な方法で投与することができる。したがって、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又は単一可変ドメイン、及び／又はこれらを含む組成物は、例えば、この場合にも使用される特定の薬学的製剤又は薬学的組成物に応じて経口的、腹腔内（例えば、静脈内、皮下、筋内、又は消化管を回避した投与の任意の他の経路を介して）、鼻腔内、経皮、局所的に、座薬を用いて、吸入によって投与することができる。臨床医は、予防又は治療すべき疾患又は障害、及び臨床医に既知の他の因子に応じて、好適な投与経路、及びこのような投与に使用される好適な薬学的製剤又は薬学的組成物を選択することができるであろう。
【０５６２】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又は単一可変ドメイン、及び／又はこれらを含む組成物は、予防又は治療すべき疾患又は障害の予防及び／又は治療に好適な治療計画に従って投与される。臨床医は一般的に、予防又は治療すべき疾患又は障害、治療すべき疾患の重症度及び／又はその症状の重症度、使用される本発明の特定のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチド、特定の投与経路、及び使用される薬学的製剤又は薬学的組成物、患者の年齢、性別、体重、食事、全身状態、並びに臨床医に既知の同様の因子等に応じて、好適な治療計画を決定することができるであろう。
【０５６３】
通常、治療計画には、１つ又は複数の薬学的に有効な量又は用量における１つ又は複数の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又は単一可変ドメイン、又はこれらを含む１つ又は複数の組成物の投与が含まれるであろう。投与される具体的な量（複数可）又は用量はこの場合でも上記の因子に基づき臨床医によって決定することができる。
【０５６４】
通常、本明細書中に記載した疾患及び障害の予防及び／又は治療に関して、また治療すべき特定の疾患又は障害、使用される本発明の特定のアミノ酸配列、ナノボディ及びポリペプチドの効力、特定の投与経路、及び使用される特定の薬学的製剤又は薬学的組成物に応じて、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは概して、１ｇ／ｋｇ（体重）／日〜０．０１μｇ／ｋｇ（体重）／日、好ましくは、０．１ｇ／ｋｇ（体重）／日〜０．１μｇ／ｋｇ（体重）／日、例えば、約１μｇ／ｋｇ（体重）／日、１０μｇ／ｋｇ（体重）／日、１００μｇ／ｋｇ（体重）／日又は１０００μｇ／ｋｇ（体重）／日の量で、連続して（例えば、点滴によって）、日々の単回用量として、又は１日の中の複数回の分割用量として投与されるであろう。臨床医は一般的に、本明細書中に記載の因子に応じて好適な日用量を決定することができるであろう。特定の場合には、例えば、上記の因子及び臨床医の専門的判断に基づきこれらの量から外れるように臨床医が選択することもあることが明らかであろう。一般的に、親和性／結合活性、有効性、体内分布、半減期及び当業者に既知の同様の因子の差異は考慮するものの、本質的に同様の経路を介して投与される、同様の標的に対する類似の従来の抗体又は抗体断片に関して通常投与される量から、投与量に関する指針を幾らか得ることができる。
【０５６５】
通常上記の方法では、本発明の単一アミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを使用するであろう。しかしながら、２つ以上の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び／又は単一可変ドメインを組み合わせて使用することも本発明の範囲内である。
【０５６６】
本発明のナノボディ、単一可変ドメインは、１つ又は複数のさらなる薬学的に活性のある化合物又は成分と組み合わせて、即ち、相乗効果をもたらすことも又はもたらさないこともある複合治療計画として使用することもできる。この場合でも、臨床医は、上記の因子及び臨床医の専門的判断に基づき、このようなさらなる化合物又は成分、並びに好適な複合治療計画を選択することができるであろう。
【０５６７】
特に、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ及び単一可変ドメインは、本明細書中に記載の疾患及び障害の予防及び／又は治療に用いられるか又は用いることができる他の薬学的に活性のある化合物又は成分と組み合わせて使用してもよく、その結果、相乗効果が得られることも又は得られないこともある。このような化合物及び成分、並びにこれらを投与するための経路、方法及び薬学的製剤又は薬学的組成物の例は臨床医にとって明らかであろう。
【０５６８】
２つ以上の物質又は成分を複合治療計画の一環として使用する場合、これらは、同じ投与経路を介して又は異なる投与経路を介して、本質的に同じ時間で又は異なる時間で（例えば、本質的に同時に、連続して、又は交互に）投与することができる。物質又は成分を、同じ投与経路を介して同時に投与しようとする場合、当業者にとって明らかであるような、種々の薬学的製剤又は薬学的組成物、又は併せた薬学的製剤又は薬学的組成物の一部として投与してもよい。
【０５６９】
また、２つ以上の活性のある物質又は成分を複合治療計画の一環として使用する場合、化合物又は成分を単独で使用する場合に用いられるものと同様の量で、また同様の計画に従って、物質又は成分の各々を投与してもよく、このような併用によって、相乗効果がもたらされることも又はもたらされないこともある。しかしながら、２つ以上の活性のある物質又は成分の併用によって相乗効果がもたらされる場合には、所望の治療作用を達成しつつも、投与される物質又は成分の１つ、複数又は全ての量を低減することも可能である。これは、例えば、所望の薬学的効果又は治療効果を依然として得ると共に、一般的な量で使用される場合の物質又は成分の１つ又は複数の使用に関連するあらゆる望ましくない副作用を回避、制限又は低減するのに有用であり得る。
【０５７０】
本発明に従って使用される治療計画の有効性は、臨床医にとって明らかであるように、関与する疾患又は障害についてそれ自体が既知の任意の方法で決定及び／又は追跡され得る。臨床医はまた、必要に応じて及びケースバイケースで、特定の治療計画を変更又は修正し、それにより、所望の治療効果を達成し、望ましくない副作用を回避、制限又は低減し、及び／又は一方で所望の治療効果を達成することと、他方で望ましくない副作用を回避、制限又は低減することとの適切な均衡を達成することができる。
【０５７１】
通常、所望の治療効果が達成されるまで、及び／又は所望の治療効果を維持されている限りは、治療計画は続けられる。また、これは臨床医が決定することができるものである。
【０５７２】
別の態様において、本発明は、少なくとも１つの癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患を予防及び／又は治療するため；及び／又は本明細書中に言及される１つ又は複数の治療方法に使用するための薬学的組成物の調製における本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドの使用に関する。
【０５７３】
治療すべき被験体とは、任意の温血動物であり得るが、具体的には哺乳動物、より具体的にはヒトである。当業者にとって明らかであるように、治療すべき被験体は、特に本明細書中に記載の疾患及び障害を患っているか又はこれらの危険性のあるヒトである。
【０５７４】
本発明はまた、本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドを患者に投与することによって予防及び／又は治療することができる少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療するための薬学的組成物の調製における本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドの使用に関する。
【０５７５】
より具体的には、本発明は、癌、神経変性疾患及び免疫調節疾患を予防及び／又は治療するための、並びに特に本明細書中に列挙した疾患及び障害の１つ又は複数を予防及び治療するための薬学的組成物の調製における本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又はポリペプチドの使用に関する。
【０５７６】
また、このような薬学的組成物では、１つ又は複数の本発明のアミノ酸配列、ナノボディ又は単一可変ドメインを、本明細書中に記載したもの等の１つ又は複数の他の活性のある成分と好適に組み合わせてもよい。
【０５７７】
最終的に、本発明のナノボディ（本明細書中に規定）及び本発明の単一可変ドメインの使用がはるかに好ましいが、本明細書中の記載に基づき、当業者であれば、同様の方法で、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する他の特定の（単一）ドメイン抗体、並びにこのような（単一）ドメイン抗体を含む単一可変ドメインを設計及び／又は生成することもできることは明らかであろう。
【０５７８】
例えば、本発明のナノボディに関して上記で記載されるＣＤＲの１つ又は複数をヒトの骨格又は非免疫グロブリン骨格を含むがこれらに限定されないこのような（単一）ドメイン抗体又は他のタンパク質骨格上に「グラフト化（graft）」することが可能であり得ることは、当業者にとって明らかであろう。このようなＣＤＲグラフト化の好適な骨格及び技法は当業者にとって明らかであり、当該技術分野において既知である。例えば、米国特許第７，１８０，３７０号明細書、国際公開第０１／２７１６０号パンフレット、欧州特許第０６０５５２２号明細書、欧州特許第０４６０１６７号明細書、米国特許第７，０５４，２９７号明細書、Nicaise et al., Protein Science （2004）, 13: 1882-1891、Ewert et al., Methods, 2004 Oct; 34 （2）: 184-199、Kettleborough et al., Protein Eng. 1991 Oct; 4（7）: 773-783、O'Brienand Jones, Methods Mol. Biol. 2003: 207: 81-100、Skerra,J. Mol. Recognit. 2000: 13: 167-187、及びSaerens et al.,J. Mol. Biol. 2005 Sep 23; 352（3）: 597-607、及び本明細書中に引用したさらなる参考文献を参照されたい。例えば、マウス又はラットのＣＤＲをヒトのフレームワーク及び骨格上にグラフト化するそれ自体が既知の技法は、本発明のナノボディのＣＤＲの１つ又は複数と、１つ又は複数のヒトフレームワーク領域又は配列とを含むキメラタンパク質をもたらすために同様に使用することができる。
【０５７９】
本発明のナノボディが、上記の好ましいＣＤＲ配列以外の１つ又は複数の他のＣＤＲ配列を含有する場合、これらのＣＤＲ配列は、それ自体が既知の任意の方法で、例えば、（好ましい）ナノボディ、従来の抗体由来の（特にヒト抗体由来の）ＶＨドメイン、重鎖抗体、従来の四本鎖抗体（例えば、従来のヒト四本鎖抗体）、又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有する他の免疫グロブリン配列から得ることができることにも留意されたい。Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに指向性を有するこのような免疫グロブリン配列は、当業者にとって明らかであるようにそれ自体が既知の任意の方法で、即ち、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーによる免疫化によって、又はＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーを有する免疫グロブリン配列の好適なライブラリをスクリーニングすることによって、又は任意の好適なこれらの組合せによって生成することができる。任意で、この後、ランダム又は部位特異的突然変異誘発のような技法、及び／又はそれ自体が既知の親和性成熟のための他の技法を続けてもよい。このような免疫グロブリン配列を生成する好適な技法は当業者にとって明らかであり、例えば、Hoogenboom, Nature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116（2005）に概説されるスクリーニング法が挙げられる。特定の標的に対する免疫グロブリンを生成する他の技法としては、例えば、ナノクローン技術（例えば、公開米国特許出願第２００６−０２１１０８８号明細書に記載）、いわゆるＳＬＡＭ技術（例えば、欧州特許出願第０５４２８１０号明細書に記載）、ヒト免疫グロブリンを発現するトランスジェニックマウスの使用、又は既知のハイブリドーマ技法（例えば、Larrick et al., Biotechnology, Vol.7, 1989, p.934を参照）が挙げられる。全てのこれらの技法は、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーに対する免疫グロブリンを生成するのに使用することができ、かつこのような免疫グロブリンのＣＤＲは、即ち上記で概説されるように、本発明のナノボディにおいて使用することができる。例えば、このようなＣＤＲの配列は、本明細書中に記載されるもの等のそれ自体が既知の技法を全て用いて、決定、合成及び／又は単離して、本発明のナノボディの配列（例えば、対応する天然のＣＤＲに取って代わるように）に挿入することができ、又は、ここでも同様に、本明細書中に記載の技法を用いて、このようなＣＤＲ（又はこのようなＣＤＲをコードする核酸）を含有する本発明のナノボディをデノボ合成することができる。
【０５８０】
本発明のアミノ酸配列、ナノボディ、単一可変ドメイン、核酸、遺伝子構築物、並びに宿主及び宿主細胞のさらなる使用は、本明細書中の開示に基づき当業者にとって明らかであろう。例えば、限定するものではないが、本発明の単一可変ドメインは、好適な担体又は固体支持体と連結することができ、組成物及び組成物を含む調製剤からＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーを精製するそれ自体が既知の方法で使用することができる培地をもたらす。好適な検出可能な標識を含む本発明の単一可変ドメインの誘導体はまた、組成物若しくは調製剤中のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの存在を（定性的に又は定量的に）確定するマーカーとして、又は（例えば、好適な細胞選別技法と組み合わせて）細胞若しくは組織の表面上のＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの存在を選択的に検出するマーカーとして使用することができる。
【０５８１】
これより本発明は、以下の非限定的な実施例及び図面によりさらに説明される。
【実施例】
【０５８２】
実験部：
実施例１：ヒトＮｏｔｃｈ−１と特異的に結合するナノボディの生成
１．１．動物の免疫付与
２頭のラマ（ラマ属（lama glama）（「ラマ１６１」及び「ラマ１６６」と称する））に、筋肉内注射により、０日目及び７日目に頸部の２つの異なる箇所に４０μｇの組換えヒトＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃキメラ（R&D Systems、カタログ番号３６４７−ＴＫ）を含む抗原カクテル調製物を２回追加免疫し、１４日目、２１日目、２８日目及び３５日目に２０μｇの組換えヒトＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃキメラを含む同様のカクテルを４回追加免疫することで免疫付与した。抗原カクテルは、ａ）総量２ｍｌのＰＢＳ中で上記の量の組換えヒトＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃキメラを混合すること、及びｂ）この混合物を２．５ｍｌのアジュバントＳｔｉｍｕｎｅ（Ｓｔｉｍｕｎｅは以前はＳｐｅｃｏｌとして知られていた；Cedi-diagnostics, Lelystad, The Netherlands）にゆっくりと添加すること、及びｃ）１分間しっかりと混合することにより調製した。血液を６回目の追加免疫の４日後及び８日後、これらの動物から採取した。さらに、およそ１ｇのリンパ節を６回目の追加免疫の５日後それぞれの動物から採取した。
【０５８３】
１．２．ライブラリ構築
ライブラリを当業者に既知の標準的なプロトコルに従って調製した。要するに、製造業者の取扱説明書に従ってフィコール・ハイパークを使用して、末梢血単核細胞を血液試料から調製する。次に、全ＲＮＡをこれらの細胞及びリンパ節組織から抽出し、ＲＴ−ＰＣＲの出発材料として使用し、ＶＨＨ断片をコードする遺伝子断片を増幅した。それから、免疫付与動物から調製したＶＨＨ断片（１つのライブラリ当たり３３０ｎｇのｃＤＮＡ）とＢｓｔＥＩＩ／ＳｆｉＩ／ＸｈｏＩで消化したｐＡＸ５０ベクター（発現ベクターであるｐＡＸ５０は、ＬａｃＺプロモーター、大腸菌ファージｐＩＩＩタンパク質コーディング配列、アンピシリン又はカルベニシリンに対する耐性遺伝子、マルチクローニング部位及びｇｅｎ３リーダー配列を含有するｐＵＣ１１９から誘導されるものが使用される。ナノボディコーディング配列を有するフレーム内では、ベクターはＣ末端ｃ−ｍｙｃ標識及びＨｉｓ６ｘ標識をコードする）との間でライゲーションを作製した。それから、エレクトロコンピテント大腸菌ＴＧ１細胞をエレクトロポレーションにより、様々なＶＨＨ配列を含有するライゲーションしたベクターで形質転換し、好適な条件で成長させ、保存のために調製した。ファージ粒子を含むこのようにして得られたライブラリを−８０℃で保存した。
【０５８４】
１．３．  ヒトＮｏｔｃｈ−１結合ナノボディの選択
１回目の選択：
上記で調製したライブラリを回復させた（rescued）。即ち上記で調製した、ＶＨＨ配列を含有するファージ粒子は、感染多重度１０（即ちそれぞれの細菌細胞にはわずか１０個のヘルパーファージ粒子が感染する）でヘルパーファージＶＣＳＭ１３（Stratagene）に感染させることにより、ＴＧ１  大腸菌細胞の成熟時に放出した。「ライブラリ１６１」（「ラマ１６１」由来）及び「ライブラリ１６６」（「ラマ１６６」由来）と称する回復したファージライブラリを、組換えヒトＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃキメラ（R&D Systemsカタログ番号３６４７−ＴＫ）、以下「Ｎｏｔｃｈ−１／Ｆｃ」での選択に使用した。Ｎｏｔｃｈ−１／Ｆｃを５μｇ／ｍｌ及び０．５μｇ／ｍｌでＭａｘｉｓｏｒｐ  ９６ウェルマイクロタイタープレート（Nunc）上に直接固定化した。さらに、Ｎｏｔｃｈ−１／Ｆｃを用いない対照をＮｏｔｃｈ／Ｆｃとインキュベートしたウェルと並行して処理した。Ｎｏｔｃｈ−１／ＦｃのＦｃ部分とのファージ結合数を最小にするために、ファージを室温（以下、「ＲＴ」）で１時間１５０μｇ／ｍｌのヒトＩｇＧと共にプレインキュベートした。回復したファージライブラリ１６１及び１６６とのインキュベートの後（ＲＴで２時間、１０μｌのライブラリの２％ｍａｒｖｅｌ  ＰＢＳ溶液  １００μｌ）、広範囲にわたり洗浄し（０．０５％のＴｗｅｅｎ  ２０の入ったＰＢＳ）、結合ファージを１ｍｇ／ｍｌの新たに調製したトリプシンのＰＢＳ溶液で非特異的に（aspecific）溶出した。ライブラリ１６１及びライブラリ１６６の溶出ファージを増幅し、両方のライブラリの５μｇ／ｍｌのＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃ画分をプールし、５μｇ／ｍｌ、０．５μｇ／ｍｌ、０μｇ／ｍｌ（対照）の固定化Ｎｏｔｃｈ−１／Ｆｃでの２回目の選択に適用した。Ｎｏｔｃｈ−１／ＦｃのＦｃ部分と結合するファージの数を最小限にするために、ファージを１５０μｇ／ｍｌのヒトＩｇＧとプレインキュベートする。溶出ファージプールで得られた（４つの条件、即ち両方のライブラリ及び両方の濃度のＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃ全てで得られた）個々のコロニーを成長させ、標準的な方法に従い、ナノボディ発現及び抽出（ペリプラズム抽出物）のためにＩＰＴＧで誘導した。
【０５８５】
１．４．ヒトＮｏｔｃｈ−１結合ナノボディに関するスクリーニング
ナノボディをヒトＮｏｔｃｈ−１との結合特異性で同定するために、上記で選択されたナノボディから選別した個々のクローンをＥＬＩＳＡ結合アッセイ構成でさらに試験する。要するに、２μｇ／ｍｌのヒトＮｏｔｃｈ−１／Ｆｃを４℃で一晩（Ｏ／Ｎ）、ＰＢＳ中でＭａｘｉｓｏｒｐ  ＥＬＩＳＡプレート（Nunc）上に固定化した。洗浄後、プレートを４％Ｍａｒｖｅｌ脱脂粉乳のＰＢＳ溶液を使用して、３０分間振盪器で遮断した。濃度系列のナノボディ（１ｎＭ〜１０００ｎＭ）を１００μｌの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。洗浄後、ヒトＮｏｔｃｈ−１結合ナノボディを、５０００倍希釈のマウス抗ＭｙｃＴａｇの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ及び５０００倍希釈のＤＡＭＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌを用いて振盪器で１時間検出した。ＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。図１の結果は濃度依存的に表Ｂ−１のほとんどのナノボディがヒトＮｏｔｃｈ−１と結合することができたことを示す。
【０５８６】
表Ｂ−１：ヒトＮｏｔｃｈ−１に対して選択されたナノボディ
【表２６】
2011516520.tif 000032
【０５８７】
選択された単一可変ドメイン（ナノボディ（商標））の上記のセットは５つのファミリーから成る：
ファミリー１：１８０Ｂ１、１８０Ｂ３、１８０Ｆ１０
ファミリー２：１８０Ａ４
ファミリー３：１８０Ｆ４
ファミリー４：１８０Ｃ１１
ファミリー５：１８０Ｃ１、１８０Ｆ８、１８０Ｃ７
【０５８８】
１．５．Ｎｏｔｃｈ−１特異的な結合因子に関する選択
Ｎｏｔｃｈ−２及びＮｏｔｃｈ−３と交差反応しないＮｏｔｃｈ−１結合因子に関して選択するために、２回の選択を、Ｎｏｔｃｈ−２及びＮｏｔｃｈ−３を用いて溶液中で対抗選択（counterselection）によって行った。結合アッセイを行った。要するに、Ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを２μｇ／ｍｌのｒｈＮｏｔｃｈ−１又はＮｏｔｃｈ−２（R&D systems）のＰＢＳ溶液１００μｌを用いて４℃で一晩コーティングした。洗浄後、プレートを４％ＭＰＢＳを使用して、３０分／時間振盪器で遮断した。ペリプラズム抽出物由来のナノボディ１０μｌを２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。洗浄後、ナノボディを、５０００倍希釈のマウス抗ＭｙｃＴａｇの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ及び５０００倍希釈のＤＡＭＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌを用いて振盪器で１時間検出した。ＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。この結果は、試験した９６個のクローンから、ナノボディの８５％がＮｏｔｃｈ−１と結合することができ、２％だけがＮｏｔｃｈ−２と交差反応性であったことを示しており、このことが選択されたクローンのほとんどがＮｏｔｃｈ−１に特異的であったことを示している。
【０５８９】
実施例２：ヒトＮｏｔｃｈ−２と特異的に結合するナノボディの生成
２．１．免疫付与
２頭のラマに、標準的なプロトコルに従い、例えば上記のように、ヒトＮｏｔｃｈ−２の外部ドメインであるR&D Systemsのカタログ番号３７３５−ＮＴ−０５０を６回追加免疫することで免疫付与した。
【０５９０】
２．２．ライブラリ構築
製造業者の取扱説明書に従ってフィコール・ハイパークを使用して、末梢血単核細胞を血液試料から調製した。次に、全ＲＮＡをこれらの細胞から抽出し、ＲＴ−ＰＣＲの出発材料として使用し、ナノボディをコードする遺伝子断片を増幅した。これらの断片をファージミドベクターｐＡＸ５０にクローニングした。ファージを標準的な方法に従って調製し（例えば従来技術、及び本明細書中で言及された出願人によって提出された出願を参照されたい）、さらなる使用のために４℃で滅菌濾過した後保存した。
【０５９１】
２．３．選択
２回のファージ提示選択を標準的なプロトコルに従って行った。上記を参照されたい。結合アッセイ（スクリーニング）を上記のように行った。要するに、Ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを２μｇ／ｍｌのＮｏｔｃｈ−２（R&D systems）１００μｌ又は全ヒトＩｇＧのＰＢＳ溶液を用いて４℃で一晩コーティングした。ＰＢＳで４回プレートを洗浄した後、プレートを４％ＭａｒｖｅｌのＰＢＳ溶液を使用して、３０分間振盪器で遮断した。ナノボディのペリプラズム抽出物１０μｌを２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。ＰＢＳで４回プレートを洗浄した後、ナノボディを、５０００倍希釈のマウス抗ＭｙｃＴａｇの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌで１時間及び５０００倍希釈のＤＡＭＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌで１時間検出した。洗浄後、ＤＡＭＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。この結果は、ナノボディの９０％がＮｏｔｃｈ−２−Ｆｃ融合体と結合することを示していた（以下の表を参照されたい）。同様に、２つのクローンがＩｇＧと結合することも示していた。１８１Ｃ１０、１８１Ｃ１１及び１８１Ｄ１１は１つの群に属する。
【０５９２】
表Ｂ−２：ヒトＮｏｔｃｈ−２に対して選択されたナノボディ
【表２７】
2011516520.tif 000033
【０５９３】
実施例３：Ｊａｇｇｅｄ−１と特異的に結合するナノボディの生成
３．１．免疫付与
２頭のラマに、標準的なプロトコルに従い、ラットＪａｇｇｅｄ−１の外部ドメインであるR&D Systemsのカタログ番号５９９−ＪＧを６回追加免疫することで免疫付与した。
【０５９４】
３．２．ライブラリ構築
製造業者の取扱説明書に従ってフィコール・ハイパークを使用して、末梢血単核細胞を血液試料から調製した。次に、全ＲＮＡをこれらの細胞から抽出し、ＲＴ−ＰＣＲの出発材料として使用し、ナノボディをコードする遺伝子断片を増幅した。これらの断片をファージミドベクターｐＡＸ５０にクローニングした。ファージを標準的な方法に従って調製し（例えば従来技術、及び本明細書中で言及された出願人によって提出された出願を参照されたい）、さらなる使用のために４℃で滅菌濾過した後保存した。
【０５９５】
３．３．選択
２回のファージ提示選択を上記と同じように行った。結合アッセイを行った。要するに、Ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを２μｇ／ｍｌのｒｒＪａｇｇｅｄ−１（R&D systems）のＰＢＳ溶液１００μｌを用いて４℃で一晩コーティングした。ＰＢＳで４回プレートを洗浄した後、プレートを４％ＭａｒｖｅｌのＰＢＳ溶液を使用して、３０分間振盪器で遮断した。濃度系列のナノボディ（１ｎＭ〜１０００ｎＭ）を２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。ＰＢＳで４回プレートを洗浄した後、ナノボディを、５０００倍希釈のマウス抗ＭｙｃＴａｇの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌで１時間及び５０００倍希釈のＤＡＭＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌで１時間検出した。洗浄後、ＤＡＭＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。結果を図２に示し、４つのナノボディ（表Ｂ−３）がラットＪａｇｇｅｄ−１と結合することを示し、１７８Ｃ４が他のものに比べてＪａｇｇｅｄ−１に対する親和性が低いと考えられる。
【０５９６】
表Ｂ−３：ラットＪａｇｇｅｄ−１に対して選択されたナノボディ
【表２８】
2011516520.tif 000034
【０５９７】
上記で選択された単一可変ドメイン（ナノボディ（商標））は３つのファミリーから成る：
ファミリー１：１つの競合結合因子：１７８Ｃ４
ファミリー２：１つの結合因子：１７８Ｄ９
ファミリー３：２つの結合因子：１７８Ａ７及び１７８Ｃ１１
【０５９８】
３．４．競合アッセイ
競合ＥＬＩＳＡアッセイを行い、ナノボディによるヒトＮｏｔｃｈ−１とのＪａｇｇｅｄ−１の結合の競合を確認した。要するに、Ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを５μｇ／ｍｌのｒｈＮｏｔｃｈ−１／ｈＦｃ（R&D systems）のＰＢＳ溶液１００μｌを用いて４℃で一晩コーティングした。ＰＢＳで４回プレートを洗浄した後、プレートを４％Ｍａｒｖｅｌ  ＰＢＳを用いて３０分／時間振盪器で遮断した。濃度系列のナノボディ（１ｎＭ〜１０００ｎＭ）及び０．３μｇ／ｍｌのビオチン化ｒｒＪａｇｇｅｄ−１（R&D systems、社内で（in-house）ビオチン化した）を２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした（０．３μｇ／ｍｌのビオチン化ｒｒＪａｇｇｅｄ−１〜２．１ｎＭ）。洗浄後、ビオチンを、５０００倍希釈のストレプトアビジン−ＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌを用いて振盪器で１時間検出した。ＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。結果を図３に示し、１７８Ｃ４が濃度依存的にＮｏｔｃｈ−１と結合するＪａｇｇｅｄ−１と競合することができることを示している。１７８Ｃ４の競合は、非ビオチン化Ｊａｇｇｅｄ−１（ｃｏｌｄ−ｊａｇｇｅｄ１）を添加することによる競合と同程度である。
【０５９９】
実施例４：ヒトＤＬＬ４と特異的に結合するナノボディの生成
４．１．免疫付与
２頭のラマに、標準的なプロトコルに従い、ヒトＤＬＬ４の細胞外ドメインであるR&D Systemsのカタログ番号１５０６−Ｄ４−０５０を６回追加免疫することで免疫付与した。
【０６００】
４．２．ライブラリ構築
製造業者の取扱説明書に従ってフィコール・ハイパークを使用して、末梢血単核細胞を血液試料から調製した。次に、全ＲＮＡをこれらの細胞から抽出し、ＲＴ−ＰＣＲの出発材料として使用し、ナノボディをコードする遺伝子断片を増幅した。これらの断片をファージミドベクターｐＡＸ５０にクローニングした。ファージを標準的な方法に従って調製し（例えば本明細書中で言及された従来技術及び出願人によって提出された出願を参照されたい）、さらなる使用のために４℃で滅菌濾過した後保存した。
【０６０１】
４．３．選択
２回のファージ提示選択を上記と同様に行った。結合アッセイを行った。要するに、Ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを５μｇ／ｍｌのｒｈＤＬＬ４（R&D systems）のＰＢＳ溶液１００μｌを用いて４℃で一晩コーティングした。洗浄後、プレートを４％ＭＰＢＳを使用して、３０分／時間振盪器で遮断した。濃度系列のナノボディ（１ｎＭ〜１０００ｎＭ）を１００μｌの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。ナノボディを、５０００倍希釈のマウス抗ＭｙｃＴａｇ（９Ｅ１０）の２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ及び５０００倍希釈のＤＡＭＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌを用いて振盪器で１時間検出した。洗浄後、ＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。結果を図４に示し、全てののナノボディがＤＬＬ４との濃度依存的な結合を示し、１７９Ｆ７は最も高い濃度でもほんのわずかしか結合を示さない。
【０６０２】
表Ｂ−４：ヒトＤＬＬ４に対して選択されたナノボディ
【表２９】
2011516520.tif 000035
【０６０３】
上記で選択された単一可変ドメイン（ナノボディ（商標））は４つのファミリーから成る：
４つのファミリー
ファミリー１：競合結合因子：１７９Ａ１０、１７９Ｄ１２、１７９Ｅ６
ファミリー２：競合結合因子：１７９Ｈ９
ファミリー３：競合結合因子：１７９Ｆ６
ファミリー４：結合因子：１７９Ｆ７
【０６０４】
４．４．競合アッセイ
競合ＥＬＩＳＡアッセイを行い、ナノボディによるヒトＮｏｔｃｈ−１とのＤＬＬ４の結合の競合を確認した。要するに、Ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを５μｇ／ｍｌのｒｈＤＬＬ４（R&D systems）のＰＢＳ溶液１００μｌを用いて４℃で一晩コーティングした。ＰＢＳで４回プレートを洗浄した後、プレートを４％ＭａｒｖｅｌのＰＢＳ溶液を用いて３０分／時間振盪器で遮断した。濃度系列のナノボディ（１ｎＭ〜１０００ｎＭ）及び０．２μｇ／ｍｌのｒｈＮｏｔｃｈ−１／ｈＦｃ（R&D systems）を１００μｌの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。洗浄後、Ｎｏｔｃｈ−Ｆｃ結合を、５０００倍希釈の抗ｈＦｃ−ＨＲＰ（Jackson）の２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌを用いて振盪器で１時間検出した。ＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。結果を図５に示し、１７９Ｆ７を除いた全てのナノボディが濃度依存的にＮｏｔｃｈ−１と結合するＤＤＬ４と競合することができることを示している。ナノボディの競合は、非ビオチン化Ｊａｇｇｅｄ−１（ｃｏｌｄ−ｊａｇｇｅｄ１）を添加することによる競合と同程度である。
【０６０５】
実施例５：ほとんどのナノボディがＮｏｔｃｈファミリーの１つのメンバーとだけ結合する 
様々なナノボディをヒトＮｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２及びＮｏｔｃｈ−３に対して上記のように生成した（表Ｂ−５を参照されたい）。
【０６０６】
表Ｂ−５：ヒトＮｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２及びＮｏｔｃｈ−３に対して選択されたナノボディ
【表３０】
2011516520.tif 000036
【０６０７】
ヒトＮｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２又はＮｏｔｃｈ−３との結合特異性を有するナノボディがＮｏｔｃｈファミリーの他のメンバーと交差反応性を有するか否かを試験するために、上記で選択されたナノボディから選別された個々のクローンをＥＬＩＳＡ結合アッセイ構成でさらに試験する。要するに、２μｇ／ｍｌのヒトＮｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２、Ｎｏｔｃｈ−３及びＣＤ３６−Ｆｃを４℃で１時間、ｍａｒｖｅｌｌ  ＰＢＳＴ中でＭａｘｉｓｏｒｐ  ＥＬＩＳＡプレート（Nunc）上に固定化した。洗浄後、プレートを４％Ｍａｒｖｅｌ脱脂粉乳のＰＢＳ溶液を使用して、３０分間振盪器で遮断した。表Ｂ−５における濃度系列のナノボディ（２５ｐＭ〜２０００ｎＭ）を２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ中に添加し、振盪器で１時間インキュベートした。洗浄後、ナノボディを、２５００倍希釈のラット抗ＶＨＨ（１：２５００）の２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌ及び５０００倍希釈のＤＡＭＰＯの２％Ｍａｒｖｅｌｌ／ＰＢＳ溶液１００μｌを用いて振盪器で１時間検出した。ＰＯを１００μｌのＯＰＤで検出し、５０μｌのＨ２ＳＯ４で停止させた。プレートリーダにおいて４９０ｎｍで定量化を行った。図６における結果は以下のことを示している：
Ｎｏｔｃｈクローンは全くＦｃと結合しない（図６ａ）
５０Ｈ９（Ｎｏｔｃｈ−３結合因子）がＮｏｔｃｈ−１との幾らかの交差反応性を示す（図６ｃ及び図６ｄ）
他のクローン全てが特異的であると考えられる（図６ｂ、図６ｃ、図６ｄ）
結合（ＩＣ５０）は低いナノモル範囲内にある。
【０６０８】
実施例６：一般的なｉｎ  ｖｉｔｒｏで細胞ベースのアッセイ又はｉｎ  ｖｉｖｏアッセイのリスト：
ｉｎ  ｖｉｔｒｏ結合アッセイ：ＥＬＩＳＡ、ビアコア
ｉｎ  ｖｉｖｏ結合アッセイ：フローサイトメトリ
ｉｎ  ｖｉｖｏ機能アッセイ：Ｎｏｔｃｈが関与する幾つかの疾患に関するマウスモデルが開発されている（Gridley T., 2003, Human Molecular Genetics, Vol 12, Review Issue 1,R9-R13）。
【０６０９】
実施例７：本発明の標的タンパク質のリスト（核酸及びアミノ酸配列へのリンク）：
【０６１０】
【表３１】
2011516520.tif 000037
【０６１１】
当業者は、単に日常的な実験を用いて本明細書に記載の本発明の特定の実施形態に対する多くの同等物を認識するか、又は確かめることができるであろう。このような同等物は添付の特許請求の範囲に包含されることが意図される。
【０６１２】
本明細書で開示される参考文献は全てその全体が参照により援用される。
【０６１３】
好ましい態様
１．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
２．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトのＮｏｔｃｈ経路のメンバーから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
３．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがＮｏｔｃｈ受容体及びＮｏｔｃｈリガンドから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
４．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトＮｏｔｃｈ受容体及びヒトＮｏｔｃｈリガンドから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
５．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがＪａｇｇｅｄ−１、Ｊａｇｇｅｄ−２、ＤＬＬ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４、Ｎｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２、Ｎｏｔｃｈ−３及びＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
６．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１、ヒトＪａｇｇｅｄ−２、ヒトＤＬＬ１、ヒトＤＬＬ３、ヒトＤＬＬ４、ヒトＮｏｔｃｈ−１、ヒトＮｏｔｃｈ−２、ヒトＮｏｔｃｈ−３及びヒトＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
７．Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１、ヒトＤＬＬ４、ヒトＮｏｔｃｈ−１及びヒトＮｏｔｃｈ−２から成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
８．Ｎｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと、Ｎｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
９．Ｎｏｔｃｈリガンド及びＮｏｔｃｈ受容体から成る群のメンバーの少なくとも１つと、配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１０．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１１．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１２．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１３．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１４．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１５．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１６．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１７．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１８．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
１９．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
２０．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
２１．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
２２．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
２３．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
２４．ａ）配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様１に記載の単一可変ドメイン。
２５．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
２６．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがヒトのＮｏｔｃｈ受容体のメンバーから成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
２７．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがＮｏｔｃｈ−１、Ｎｏｔｃｈ−２、Ｎｏｔｃｈ−３及びＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
２８．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがヒトＮｏｔｃｈ−１、ヒトＮｏｔｃｈ−２、ヒトＮｏｔｃｈ−３及びヒトＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
２９．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがヒトＮｏｔｃｈ−１及びヒトＮｏｔｃｈ−２から成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３０．Ｎｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと、Ｎｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３１．Ｎｏｔｃｈ受容体から成る群のメンバーの少なくとも１つと、配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３２．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３３．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３４．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３５．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３６．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３７．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３３９〜配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３８．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
３９．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４０．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４１．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４２．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３３９〜配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈシグナル伝達経路のメンバーと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４３．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４４．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４５．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４６．ａ）配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈ受容体のメンバーの少なくとも１つと結合する、態様２５に記載の単一可変ドメイン。
４７．Ｎｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
４８．ＮｏｔｃｈリガンドのメンバーがヒトのＮｏｔｃｈリガンドのメンバーから成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
４９．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがＪａｇｇｅｄ−１、Ｊａｇｇｅｄ−２、ＤＬＬ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４から成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５０．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１、ヒトＪａｇｇｅｄ−２、ヒトＤＬＬ１、ヒトＤＬＬ３及びヒトＤＬＬ４から成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５１．Ｎｏｔｃｈ受容体のメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１及びヒトＤＬＬ４から成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５２．Ｎｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと、Ｎｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５３．Ｎｏｔｃｈリガンドから成る群のメンバーの少なくとも１つと、配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５４．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５５．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５６．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５７．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５８．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
５９．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３３８を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６０．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６１．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６２．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６３．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６４．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３３８を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６５．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６６．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６７．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６８．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でＮｏｔｃｈリガンドのメンバーの少なくとも１つと結合する、態様４７に記載の単一可変ドメイン。
６９．ＤＬＬ４ファミリーのメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
７０．ＤＬＬ４ファミリーのメンバーがヒトＤＬＬ４から選択される、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７１．ヒトＤＬＬ４とＤＬＬ４ファミリーのメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７２．ヒトＤＬＬ４と配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７３．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７４．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７５．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７６．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７７．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７８．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３３４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
７９．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８０．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８１．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８２．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８３．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３２９〜配列番号３３４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８４．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８５．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８６．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８７．ａ）配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３２９〜配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＤＬＬ４と結合する、態様６９に記載の単一可変ドメイン。
８８．Ｊａｇｇｅｄ−１ファミリーのメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
８９．Ｊａｇｇｅｄ−１ファミリーのメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−１から選択される、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９０．ヒトＪａｇｇｅｄ−１とＪａｇｇｅｄ−１ファミリーの他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９１．ヒトＪａｇｇｅｄ−１と配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９２．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９３．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９４．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９５．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９６．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９７．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３３５〜配列番号３３８を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９８．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
９９．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１００．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０１．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０２．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３３５〜配列番号３３８を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０３．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０４．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０５．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０６．ａ）配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３５〜配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＪａｇｇｅｄ−１と結合する、態様８８に記載の単一可変ドメイン。
１０７．Ｎｏｔｃｈ−１ファミリーのメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
１０８．Ｎｏｔｃｈ−１ファミリーのメンバーがヒトＮｏｔｃｈ−１から選択される、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１０９．ヒトＮｏｔｃｈ−１とＮｏｔｃｈリガンドの他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１０．ヒトＮｏｔｃｈ−１と配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１１．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１２．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１３．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１４．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１５．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１６．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１７．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１８．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１１９．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２０．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２１．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２２．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２３．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２４．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２５．ａ）配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３３９〜配列番号３４７及び配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−１と結合する、態様１０７に記載の単一可変ドメイン。
１２６．Ｎｏｔｃｈ−２ファミリーのメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
１２７．Ｎｏｔｃｈ−２ファミリーのメンバーがヒトＮｏｔｃｈ−２から選択される、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１２８．ヒトＮｏｔｃｈ−２とＮｏｔｃｈリガンドの他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１２９．ヒトＮｏｔｃｈ−２と配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３０．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３１．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３２．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３３．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３４．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３５．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３４８〜配列番号３６１を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３６．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３７．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３８．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１３９．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１４０．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）配列番号３４８〜配列番号３６１を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１４１．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１４２．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１４３．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１４４．ａ）配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン；及びｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１４５．Ｊａｇｇｅｄ−２と特異的に結合する単一可変ドメイン。
１４６．Ｊａｇｇｅｄ−２ファミリーのメンバーがヒトＪａｇｇｅｄ−２から成る群から選択される、態様１４５に記載の単一可変ドメイン。
１４７．ヒトＪａｇｇｅｄ−２とＮｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１４５に記載の単一可変ドメイン。
１４８．ＤＬＬ１と特異的に結合する単一可変ドメイン。
１４９．ＤＬＬ１ファミリーのメンバーがヒトＤＬＬ１から成る群から選択される、態様１４８に記載の単一可変ドメイン。
１５０．ヒトＤＬＬ１とＮｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１４８に記載の単一可変ドメイン。
１５１．ＤＬＬ３と特異的に結合する単一可変ドメイン。
１５２．ＤＬＬ３ファミリーのメンバーがヒトＤＬＬ３から成る群から選択される、態様１５１に記載の単一可変ドメイン。
１５３．ヒトＤＬＬ３とＮｏｔｃｈ受容体の他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１５１に記載の単一可変ドメイン。
１５４．Ｎｏｔｃｈ−３ファミリーのメンバーの少なくとも１つと特異的に結合する単一可変ドメイン。
１５５．Ｎｏｔｃｈ−２ファミリーのメンバーがヒトＮｏｔｃｈ−３から選択される、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１５６．ヒトＮｏｔｃｈ−３とＮｏｔｃｈリガンドの他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１５７．ヒトＮｏｔｃｈ−３と配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１５８．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１５９．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６０．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６１．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６２．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択される、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６３．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）配列番号３６２及び配列番号３６３を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６４．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３４８〜配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６５．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６６．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６７．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−７モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６８．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）配列番号３６２及び配列番号３６３を有する配列から成る群から選択される配列の少なくとも１つとの、８０％の配列同一性を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１６９．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大１０個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−２と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１７０．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大８個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１７１．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大５個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１２６に記載の単一可変ドメイン。
１７２．ａ）配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン；並びにｂ）最大３個のアミノ酸残基が天然アミノ酸に置き換わり、上記置き換わったアミノ酸がフレームワーク領域内に位置している配列番号３６２及び配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメインから成る群から選択され；ａ）群及びｂ）群から上記選択された単一可変ドメインが、１０−８モル／Ｌ〜１０−１２モル／Ｌ以下の解離定数（ＫＤ）でヒトＮｏｔｃｈ−３と結合する、態様１５４に記載の単一可変ドメイン。
１７３．Ｎｏｔｃｈ−４と特異的に結合する単一可変ドメイン。
１７４．Ｎｏｔｃｈ−４ファミリーのメンバーがヒトＮｏｔｃｈ−４から成る群から選択される、態様１７３に記載の単一可変ドメイン。
１７５．ヒトＮｏｔｃｈ−４とＮｏｔｃｈリガンドの他のメンバーの少なくとも１つとの間の相互作用をさらに遮断する、態様１７３に記載の単一可変ドメイン。
１７６．配列番号３２９の配列を有する単一可変ドメイン。
１７７．配列番号３３０の配列を有する単一可変ドメイン。
１７８．配列番号３３１の配列を有する単一可変ドメイン。
１７９．配列番号３３２の配列を有する単一可変ドメイン。
１８０．配列番号３３３の配列を有する単一可変ドメイン。
１８１．配列番号３３４の配列を有する単一可変ドメイン。
１８２．配列番号３３５の配列を有する単一可変ドメイン。
１８３．配列番号３３６の配列を有する単一可変ドメイン。
１８４．配列番号３３７の配列を有する単一可変ドメイン。
１８５．配列番号３３８の配列を有する単一可変ドメイン。
１８６．配列番号３３９の配列を有する単一可変ドメイン。
１８７．配列番号３４０の配列を有する単一可変ドメイン。
１８８．配列番号３４１の配列を有する単一可変ドメイン。
１８９．配列番号３４２の配列を有する単一可変ドメイン。
１９０．配列番号３４３の配列を有する単一可変ドメイン。
１９１．配列番号３４４の配列を有する単一可変ドメイン。
１９２．配列番号３４５の配列を有する単一可変ドメイン。
１９３．配列番号３４６の配列を有する単一可変ドメイン。
１９４．配列番号３４７の配列を有する単一可変ドメイン。
１９５．配列番号３４８の配列を有する単一可変ドメイン。
１９６．配列番号３４９の配列を有する単一可変ドメイン。
１９７．配列番号３５０の配列を有する単一可変ドメイン。
１９８．配列番号３５１の配列を有する単一可変ドメイン。
１９９．配列番号３５２の配列を有する単一可変ドメイン。
２００．配列番号３５３の配列を有する単一可変ドメイン。
２０１．配列番号３５４の配列を有する単一可変ドメイン。
２０２．配列番号３５５の配列を有する単一可変ドメイン。
２０３．配列番号３５６の配列を有する単一可変ドメイン。
２０４．配列番号３５６の配列を有する単一可変ドメイン。
２０５．配列番号３５７の配列を有する単一可変ドメイン。
２０６．配列番号３５８の配列を有する単一可変ドメイン。
２０７．配列番号３５９の配列を有する単一可変ドメイン。
２０８．配列番号３６０の配列を有する単一可変ドメイン。
２０９．配列番号３６１の配列を有する単一可変ドメイン。
２１０．配列番号３６２の配列を有する単一可変ドメイン。
２１１．配列番号３６３の配列を有する単一可変ドメイン。
２１２．配列番号３６４の配列を有する単一可変ドメイン。
２１３．配列番号３６５の配列を有する単一可変ドメイン。
２１４．態様１〜２４に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２１５．態様２５〜４６に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２１６．態様４７〜６８に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２１７．態様６９〜８７に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２１８．態様８８〜１０６に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２１９．態様１０７〜１２５に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２０．態様１２６〜１４４に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２１．態様１４５〜１４７に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２２．態様１４８〜１５０に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２３．態様１５１〜１５３に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２４．態様１５４〜１７２に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２５．態様１７３〜１７５に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２６．態様１０７〜１２５に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２７．態様１７６に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２８．態様１７７に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２２９．態様１７８に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３０．態様１７９に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３１．態様１８０に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３２．態様１８１に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３３．態様１８２に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３４．態様１８３に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３５．態様１８４に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３６．態様１８５に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３７．態様１８６に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３８．態様１８７に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２３９．態様１８８に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４０．態様１８９に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４１．態様１９０に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４２．態様１９１に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４３．態様１９２に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４４．態様１９３に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４５．態様１９４に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４６．態様１９５に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４７．態様１９６に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４８．態様１９７に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２４９．態様１９８に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５０．態様１９９に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５１．態様２００に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５２．態様２０１に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５３．態様２０２に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５４．態様２０３に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５５．態様２０４に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５６．態様２０５に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５７．態様２０６に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５８．態様２０７に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２５９．態様２０８に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２６０．態様２０９に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２６１．態様２１０に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２６２．態様２１１に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２６３．態様２１２に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２６４．態様２１３に記載の単一可変ドメインを少なくとも１つ含む構築物。
２６５．態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン及び／又は態様２１４〜２６４に記載の構築物を含む医薬組成物。
２６６．態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン及び／又は態様２１４〜２６４に記載の構築物をコードするヌクレオチド配列。
２６７．態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン及び／又は態様２１４〜２６４に記載の構築物、及び／又は態様２３４に記載のヌクレオチド配列を発現することができる、及び／又は含む宿主細胞。
２６８．態様１〜２１３のいずれか一項に記載の単一可変ドメインを作製する方法、態様２１４〜２６４に記載の構築物を作製する方法；態様２６５に記載の医薬組成物を作製する方法；態様２６６に記載のヌクレオチド配列を作製する方法；及び／又は態様２６７に記載の宿主細胞を作製する方法。
２６９．態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン又は態様２１４〜２６４に記載の構築物、態様２６５に記載の医薬組成物、態様２６６に記載のヌクレオチド配列、及び／又は態様２６７に記載の宿主細胞を使用して、Ｎｏｔｃｈ経路のメンバーと特異的に結合する分子をスクリーニングする方法。
２７０．Ｎｏｔｃｈ経路から成る群から選択されるメンバーが役割を果たすか又は関与する、少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療する方法であって、少なくとも１つの態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン、１つの態様２１４〜２６４に記載の構築物、又は１つの態様２６５に記載の医薬組成物を、それを必要とする被験体に薬学的に活性のある量投与することを含む、方法。
２７１．癌、自己免疫疾患又は神経変性疾患から成る疾患の群から選択される、少なくとも１つの疾患又は障害を予防及び／又は治療する方法であって、少なくとも１つの態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン、１つの態様２１４〜２６４に記載の構築物、又は１つの態様２６５に記載の医薬組成物を、それを必要とする被験体に薬学的に活性のある量投与することを含む、方法。
２７２．Ｎｏｔｃｈ経路から成る群から選択されるメンバーが役割を果たすか又は関与する、少なくとも１つの疾患又は障害の予防及び／又は治療のための薬学的に活性のある量の、少なくとも１つの態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン、１つの態様２１４〜２６４に記載の構築物、又は１つの態様２６５に記載の医薬組成物の使用。
２７３．癌、自己免疫疾患又は神経変性疾患から成る疾患群から選択される、少なくとも１つの疾患又は障害の予防及び／又は治療のための薬学的に活性のある量の、少なくとも１つの態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン、１つの態様２１４〜２６４に記載の構築物、又は１つの態様２６５に記載の医薬組成物の使用。
２７４．Ｎｏｔｃｈ経路から成る群から選択されるメンバーが役割を果たすか又は関与する、少なくとも１つの疾患又は障害の予防及び／又は治療用の薬物の製造のための薬学的に活性のある量の、少なくとも１つの態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン、１つの態様２１４〜２６４に記載の構築物、又は１つの態様２６５に記載の医薬組成物の使用。
２７５．癌、自己免疫疾患又は神経変性疾患から成る疾患群から選択される、少なくとも１つの疾患又は障害の予防及び／又は治療用の薬物の製造のための薬学的に活性のある量の、少なくとも１つの態様１〜２１３に記載の単一可変ドメイン、１つの態様２１４〜２６４に記載の構築物、又は１つの態様２６５に記載の医薬組成物の使用。
【図１】
2011516520.tif 000038
【図２】
2011516520.tif 000039
【図３】
2011516520.tif 000040
【図４】
2011516520.tif 000041
【図５】
2011516520.tif 000042
【図６ａ】
2011516520.tif 000043
【図６ｂ】
2011516520.tif 000044
【図６ｃ】
2011516520.tif 000045
【図６ｄ】
2011516520.tif 000046
【配列表】
2011516520000001.app
【国際調査報告】
2011516520.tif 000047
2011516520.tif 000048
2011516520.tif 000049
2011516520.tif 000050
2011516520.tif 000051