(57)【要約】本明細書に記載される発明は、患者が医薬的に許容される量の免疫システム（例えばＴ細胞）のアクチベーターの投与に対する有益な応答を示す可能性を予測するのに有用な診断方法および治療方法および組成物に関する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
癌患者が共刺激経路モジュレーターを用いる療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）  該療法の投与後に、および任意にその投与前に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定すること；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算すること、
を含み、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、方法。
【請求項２】
該癌が固形腫瘍である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
該癌がメラノーマ、前立腺癌、肺癌、非小細胞肺癌、および小細胞肺癌からなる群から選択される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
該共刺激経路モジュレーターがＣＴＬＡ−４アンタゴニストである、請求項１、２、または３に記載の方法。
【請求項５】
該ＣＴＬＡ−４アンタゴニストがイピリムマブおよびトレメリムマブはからなる群から選択される、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
共刺激経路モジュレーターを用いる療法で癌患者を治療する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）  該療法の投与後に、および任意にその投与前に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定すること；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算すること、
を含み、負の勾配を持つ患者は、該癌を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうることを特徴とする、治療方法。
【請求項７】
該癌が固形腫瘍である、請求項６に記載の治療方法。
【請求項８】
該癌が、メラノーマ、前立腺癌、肺癌、非小細胞肺癌、および小細胞肺癌からなる群から選択される、請求項７に記載の治療方法。
【請求項９】
該共刺激経路モジュレーターがＣＴＬＡ−４アンタゴニストである、請求項６、７、または８に記載の治療方法。
【請求項１０】
該ＣＴＬＡ−４アンタゴニストがイピリムマブおよびトレメリムマブからなる群から選択される、請求項９に記載の治療方法。
【請求項１１】
該共刺激経路モジュレーターのための推奨投与量は約０．１〜１５ｍｇ／ｋｇの投与量にて３週間に１回投与されることであり、および該より積極的な投与計画は、推奨投与量より多い投与量にて、または約１０ｍｇ／ｋｇより多い投与量にて、３週間に１回投与されることである、請求項１０に記載の治療方法。
【請求項１２】
他の薬剤が、チューブリン安定化剤、第二の共刺激経路モジュレーター、タキサン、パクリタキセル、エポチロン、イグゼンプラ（商標）、プロベンジ（登録商標）、ベバシズマブ、ダカルバジン、パラプラチン；ブデソニド；ＣＤ１３７の阻害剤；およびステロイドからなる群から選択される、請求項１０に記載の治療方法。
【請求項１３】
癌患者のための治療レジメンの決定において使用するためのキットであって、該キットは、
（ｉ）  リンパ球絶対数を経時的に測定するための手段、および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算するための手段；
ならびに、任意に使用説明および該キット結果の解説、
を含み、該治療戦略は共刺激経路モジュレーターの治療的有効量の投与を含むことを特徴とする、キット。
【請求項１４】
該治療レジメンが、イピリムマブおよびトレメリムマブからなる群から選択される療法の治療的有効量の投与を含むことを特徴とする、請求項１３に記載のキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本願は、35 U.S.C. 119(e)の下、米国仮出願第61/057,018号（2008年5月29出願）の利益を主張する。関連出願の全ての教示は、参照することにより、本明細書に組み込まれる。
本発明の分野
本明細書に記載される本発明は、患者が、医薬的に許容される量の免疫システム(例えばＴ細胞)のアクチベーターの投与に対する有益な応答を示す可能性を予測するのに有用な診断方法、治療方法および組成物に関連する。
【背景技術】
【０００２】
国立癌研究所は、米国国内だけで、３人に１人が生涯で癌に襲われると予測している。さらに、癌にかかった人のおおよそ５０％〜６０％が最終的にはその疾患で亡くなるであろう。この疾患の広範な発生は悪性腫瘍の治療用の抗癌レジメンが改良される必要があることを強調する。
【０００３】
現在認められている癌は様々であるため、多くの抗癌剤が、体内の癌を破壊するために開発されている。これらの化合物は、正常で健康な細胞を残しつつ悪性細胞の増殖を破壊する、またはそうでなければ阻害するという目的で、癌患者に投与される。抗癌剤はそれらの作用機構に基づいて分類されていて、また、しばしば、化学療法剤と称される。化学療法剤と免疫調節剤との組み合わせは、腫瘍学の分野で受け入れが増えつつある。
【０００４】
脊椎動物の免疫システムは、最適な免疫活性化を達成するために多重のシグナルを必要とする；例えば、Janeway, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 54:1-14 (1989); Paul, W.E., ed., Fundamental Immunology, 4th edition Raven Press, N.Y. (1998)、とりわけ12章および13章、pp. 411−478を参照。Ｔリンパ球(Ｔ細胞)と抗原提示細胞 (ＡＰＣ)の間の相互作用は免疫応答にとって不可欠である。Ｔ細胞およびＡＰＣ上に見られる多くの凝集した分子のレベルが、免疫応答中に増加する (Springer et al., Ann. Rev. Immunol., 5:223-252 (1987); Shaw et al., Curr. Opin. Immunol., Kindt and Long, eds., 1:92-97 (1988)); および Hemler, Immunology Today, 9:109-113 (1988))。これらの分子のレベルの増加は、なぜ、活性化したＡＰＣが、休止しているＡＰＣよりも、抗原特異的Ｔ細胞増殖を刺激するのに有効であるのかを説明するのに役立つかもしれない(Kaiuchi et al., J. Immunol., 131:109-114 (1983); Kreiger et al., J. Immunol., 135:2937-2945 (1985); McKenzie, J. Immunol., 141:2907-2911 (1988); およびHawrylowicz et al., J. Immunol., 141:4083-4088 (1988))。
【０００５】
Ｔ細胞免疫応答は、細胞間相互作用 (Springer et al., Ann. Rev. Immunol., 5:223-252 (1987))、とりわけＴ細胞とアクセサリー細胞（例えばＡＰＣ）間の細胞間相互作用、および可溶性の免疫メディエーター (サイトカインまたはリンホカイン)の産生(Dinarello, New Engl. J. Med., 317:940-945 (1987); Sallusto, J. Exp. Med., 179:11094118 (1997))を伴う、複雑なプロセスである。この応答は、Ｔ細胞受容体複合体(Weiss, Ann. Rev. Immunol., 4:593-619 (1986))、および他の「アクセサリー」表面分子(Allison, Curr. Opin. Immunol., 6:414-419 (1994); Springer (1987), supra)を含む、いくつかのＴ細胞表面受容体によって制御されている。これらのアクセサリー分子の多くは、細胞の表面上の、モノクローナル抗体の反応性によって定義される自然発生的な細胞表面分化（ＣＤ）抗原である。(McMichael, ed., Leukocyte Typing Iff, Oxford Univ. Press, Oxford, N.Y. (1987)).
【０００６】
初期の研究は、Ｂリンパ球活性化には２つのシグナルを必要とすることを示唆し、(Bretscher、Science、169:1042−1049 (1970))、現在では、全てのリンパ球はそれらの最適な活性化のために２つのシグナル、抗原特異的シグナルまたはクローナルシグナル、ならびに第二の、抗原非特異的シグナルを必要とすると考えられている。(Janeway、supra)。Freeman (J. Immunol., 143:2714-2722 (1989))は、ＭＡｂ  Ｂ７によって認識されるＢ細胞活性化抗原をコードするｃＤＮＡクローンを単離し、その配列決定をした(Freeman, J. Immunol., 13 8:3260 (1987))。このｃＤＮＡでトランスフェクトされたＣＯＳ細胞は、標識ＭＡｂ  Ｂ７および標識ＭＡｂ  ＢＢ−１の両者により染まることが示されている(Clark, Human Immunol., 16:100-113 (1986); Yokochi, J. Immunol., 128:823 (1981); Freeman et al. (1989), supra; Freeman et al. (1987), supra)。加えて、この抗原の発現は、他の系列の細胞（例えば単球）で検出されている(Freeman et al., (1989) supra)。
【０００７】
Ｔヘルパー細胞(Th)抗原反応は、ＡＰＣによって提供されるシグナルを必要とする。第一のシグナルは、Ｔ細胞受容体複合体(Weiss, J. Clin. Invest., 86:1015 (1990))とＡＰＣ上のクラス１Ｉ主要組織適合複合体（ＭＨＣ）分子との関連で提示された抗原との相互作用によって開始する(Allen, Immunol. Today, 8:270 (1987))。この抗原特異的シグナルは、完全な応答を生じるのに十分ではなく、第二のシグナルを欠く場合では、実際にはクローン不活性化またはクローンアネルギーを引き起こし得る(Schwartz, Science, 248:1349 (1990))。ＭＨＣによって提供される第二の「共刺激」シグナルの要求は、多数の実験系で実証されてきた(Schwartz, supra; Weaver et al., Immunol. Today, 11:49 (1990))。
【０００８】
ＣＤ２８抗原、免疫グロブリンスーパーファミリーのホモ二量体糖タンパク質(Aruffo et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 84:8573-8577 (1987))は、大抵の成熟ヒトＴ細胞に見られるアクセサリー分子である(Damle et al., J. Immunol., 131:2296-2300 (1983))。最近のエビデンスはＴ細胞受容体複合体によって始められるものとは異なる、別のＴ細胞活性化経路におけるこの分子機能を示唆する(June et al., Mol. Cell. Biol., 7:4472-4481 (1987))。ＣＤ２８抗原と反応するモノクローナル抗体（ＭＡｂ）は、様々なポリクローナル性刺激によって始められるＴ細胞応答を増大することができる(上記のJune et al.により再検討された)。これらの刺激作用は、ｍＲＮＡ安定化の増大の結果として(Lindsten et al. (1989), supra)、ＭＡｂ誘導サイトカイン産生(Thompson et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 86:1333-1337 (1989)；およびLindsten et al., Science, 244:339-343 (1989))に起因しうる。抗ＣＤ２８ｍＡｂはまた阻害作用を持ち得、すなわち、それらは自己混合リンパ球反応(Damle et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 78:5096-6001 (1981))および抗原特異的Ｔ細胞クローンの活性化(Lesslauer et al., Eur. J. Immunol., 16:1289-1296 (1986))をブロックすることができる。
【０００９】
いくつかの研究は、ＣＤ２８がＢ細胞活性化抗原、Ｂ７／ＢＢ−１の対抗受容体であることを示している(Linsley et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:5031-5035 (1990))。Ｂ７／ＢＢ−Ｉ抗原を、以後「Ｂ７抗原」と呼ぶ。Ｂ７リガンドはまた、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであるが、ＣＤ２８とは対照的に、それらの細胞外領域に２つのＩｇ領域、Ｎ末端可変（Ｖ）様領域、続いて定常（Ｃ）様領域を有する。
【００１０】
Ｔ細胞への非特異的共刺激シグナルの運搬は、ＡＰＣに見られる少なくとも２つの相同なＢ７ファミリーメンバー、Ｂ７−１(Ｂ７、Ｂ７．１、またはＣＤ８０とも呼ばれる)およびＢ７−２ (Ｂ７．２またはＣＤ８６とも呼ばれる)を必要とし、これらはともに、共刺激シグナルをＣＤ２８を通してＴ細胞に伝達することができる。ＣＤ２８を通した共刺激はＴ細胞活性化を促進する。
【００１１】
ＣＤ２８は単一の細胞外可変領域（Ｖ）様領域を有する (AruffoおよびSeed、supra)。相同な分子、ＣＴＬＡ−４は、マウス細胞傷害性Ｔ細胞ｃＤＮＡライブラリーのディファレンシャルスクリーニングによって同定されている(Brunet, Nature, 328:267-270 (1987))。
【００１２】
ＣＴＬＡ−４（ＣＤ１５２）は、もともとマウス細胞傷害性Ｔ細胞ｃＤＮＡライブラリーのディファレンシャルスクリーニングによって同定された、Ｔ細胞表面分子である(Brunet et al., Nature, 328:267-270(1987))。ＣＴＬＡ−４はまた、免疫グロブリン（Ｉｇ）スーパーファミリーの一員であり、；ＣＴＬＡ−４は単一の細胞外Ｉｇ領域を含む。研究者らは、ＣＤ２８と同一の染色体領域(2q33−34) (Lafage-Pochitaloff et al., Immunogenetics, 31:198-201 (1990))に対する、ＣＴＬＡ−４のヒト対応物の遺伝子のクローニングおよびマッピング(Dariavach et al., Eur. J. Immunol., 18:1901-1905 (1988))を報告している。このヒトＣＴＬＡ−４ＤＮＡとＣＤ２８タンパク質をコードするＤＮＡとの配列比較は、膜近傍領域および細胞質領域に最も大きな相同性がある有意な配列の相同性を明かにする(Brunet et al. (1988), supra; Dariavach et al. (1988), supra)。
【００１３】
ＣＴＬＡ−４はＴ細胞によって誘導的に発現される。それは、抗原提示細胞上のＢ７ファミリーの分子(主としてＣＤ８０およびＣＤ８６) に結合する(Chambers et al., Ann. Rev Immunol., 19:565-594 (2001))。引き起こされると、それは、Ｔ細胞増殖およびＴ細胞機能を阻害する。ＣＴＬＡ−４が遺伝子的に欠損しているマウスは、リンパ球増殖性疾患および自己免疫を引き起こす (Tivol et al., Immunity., 3:541-547 (1995))。前臨床モデルにおいて、ＣＴＬＡ−４遮断はまた、抗腫瘍免疫を増加する (Leach et al., Science, 271:1734-1736 (1996); van Elsas et al., J. Exp. Med., 190:355-366 (1999))。これらの知見は、ＣＴＬＡ−４をブロックする癌免疫療法用の抗体の発展をもたらした。
【００１４】
モノクローナル抗体によるＣＴＬＡ−４の遮断は、全てのＴ細胞集団の増殖をもたらし、腫瘍細胞破壊を媒介する活性化したＣＤ４+およびＣＤ８+Ｔ細胞を伴う(Melero et al.,. Nat Rev Cancer 2007;7:95-106; Wolchok et al., The Oncologist 2008;13 (suppl. 4):2-9)。抗ＣＴＬＡ−４抗体の投与に由来する抗腫瘍反応は、単に末梢血中のＴ細胞集団の変化からよりもむしろ、腫瘍内微小環境内のエフェクターＴ細胞の制御性Ｔ細胞に対する比率の増加に起因すると考えられている(Quezada et al., J Clin Invest 2006;116:1935-45)。臨床試験下にあるそのような薬剤はイピリムマブである。
【００１５】
イピリムマブ(以前はMDX−010；Medarex Inc.)は、ＣＴＬＡ−４が、抗原提示細胞上に発現されたＣＤ８０およびＣＤ８６に結合するのをブロックし、それにより、これらの分子の相互作用によって誘発される免疫応答の負のダウンレギュレーションをブロックする、完全なヒト抗ヒトＣＴＬＡ−４モノクローナル抗体である。メラノーマ患者における初期の研究ではイピリムマブが対象に永続的な腫瘍退縮を引き起こすことができることが示された(Phan et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100:8372-8377 (2003))。また、血清腫瘍マーカーの減少が、卵巣癌または前立腺癌の患者で認められた(Hodi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100:4712-4717 (2003))。最近では、イピリムマブは進行性メラノーマ患者で抗腫瘍活性を示した(Weber et al., J Clin Oncol 2008;26:5950-56; Weber, Cancer Immunol. Immunother 2009;58:823-30)。しかしながら、イピリムマブによる初期免疫活性化のマーカーは、未だ特定されていない。従って、当該技術分野において、抗ＣＴＬＡ−４療法にたいして好ましい応答を有しうる患者を特定する要求がある。
【００１６】
有力な候補の１つはリンパ球絶対数(ＡＬＣ)である。ＡＬＣは、特定の白血病およびリンパ腫の治療処置に先立って、医師により日常的に測定される、標準的で、臨床的に受け入れられている血液細胞パラメターである。最近では、ＡＬＣは白血病およびリンパ腫のいくつかのタイプについての臨床病理学に関係している。具体的には、Porrata et al.は、リンパ腫およびミエローマ患者の自家移植の後のＡＬＣの回復が再発を予測することを示した(Blood, 98:579-585 (2001))。加えて、診断時、および抗ＣＤ−２０標的療法の前のＡＬＣは、濾胞性リンパ腫の有用な予後マーカーであり得るといういくつかの証拠もある(Siddiqui et al., Br. J. Haematology, 134:596-601 (2006); Behl et al., Br. J. Haematology, 137:409-415 (2007))。しかしながら、リンパ球絶対数 (ＡＬＣ)の予測値は、非ホジキンリンパ腫において最近の議論となっている (Leukemia, 21:2227-2230 (2007))。
【００１７】
それにもかかわらず、白血病についてのＡＬＣの予測値は、徐々に受け入れられてきた。例えば、De Angulo et al.は、ＡＬＣは、急性骨髄芽球性白血病（ＡＭＬ）および急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）における再発および生存の重要な非依存的な予測因子であることを示し(Cancer, 112(2):407-415 (2008))、それはBehl et al.によっても調べられた(Leukemia, 20(1):29-34 (2006))。
【００１８】
より最近では、診断時および／または治療後の特定の時期での低いＡＬＣは、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫 (Cox et al., Leuk Lymphoma 2008;49: 1745-51)、ハイリスクなユーイング肉腫(De Angulo et al., J Pediatr Hematol Oncol 2007;29:48-52)、急性リンパ性白血病および急性骨髄芽球性白血病 (De Angulo et al., Cancer 2008;112:407-15)、多発性骨髄腫 (Ege et al., Br J Haematol 2008;141:792-98)、および乳癌からの脳転移(Claude et al., Radiother Oncol 2005;76:334-39)を含む、多くの血液学的悪性疾患および固形腫瘍における生存に関する負のファクターであると認められている。
【００１９】
しかしながら、ＡＬＣの使用は、患者生存を予測することに限定されているが、これまで、特定の免疫調節療法はもちろん、特定の療法に対する患者応答を予測するための指標であることは示されていない。
【００２０】
本願発明者らは、初めて、非血液癌（例えばメラノーマ）のための抗ＣＴＬＡ−４療法を受ける患者における経時的なリンパ球絶対数の変化が、該患者が免疫療法に対する好ましい応答を獲得する可能性を予測するのに有用であるを見出した。
【発明の概要】
【００２１】
本発明の概要
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＴ細胞を活性化する療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は正の勾配を持ち、および、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い正の勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、好ましい応答を獲得するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２２】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＣＴＬＡ−４の阻害を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は正の勾配を持ち、および、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い正の勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、好ましい応答を獲得するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２３】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＴ細胞を活性化する療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は正の勾配を持ち、および、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い正の勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、好ましい応答を獲得するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２４】
本発明は、患者が癌を含む疾患のための抗ＣＴＬＡ−４抗体の投与を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、
負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は正の勾配を持ち、および、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い正の勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、好ましい応答を獲得するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２５】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのイピリムマブの投与を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は正の勾配を持ち、および、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い正の勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、好ましい応答を獲得するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２６】
本発明は、患者が癌を含む疾患のための共刺激経路の調節を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は正の勾配を持ち、および、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い正の勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、好ましい応答を獲得するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２７】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＴ細胞を活性化する療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２８】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＣＴＬＡ−４の阻害を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００２９】
本発明は、患者が癌を含む疾患のための抗ＣＴＬＡ−４抗体の投与を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３０】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのイピリムマブの投与を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３１】
本発明は、患者が癌を含む疾患のための共刺激経路の調節を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３２】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＣＴＬＡ−４の阻害を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３３】
本発明は、患者が癌を含む疾患のための抗ＣＴＬＡ−４抗体の投与を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３４】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのイピリムマブの投与を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３５】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＣＴＬＡ−４の阻害を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。ここで、該他の薬剤は：化学療法、チューブリン安定化剤；パクリタキセル（pacitaxel）；エポチロン；タキサン；ダカルバジン；パラプラチン（登録商標）；ドセタキセル；１またはそれ以上のペプチドワクチン；ＭＤＸ−１３７９メラノーマペプチドワクチン；１またはそれ以上のｇｐ１００ペプチドワクチン；鶏痘−ＰＳＡ−ＴＲＩＣＯＭ（商標）ワクチン；ワクシニア−ＰＳＡ−ＴＲＩＣＯＭ（商標）ワクチン；ＭＡＲＴ−１抗原；サルグラモスチム；チシリムマブ；および／または併用アンドロゲン除去療法からなる群から選択される。
【００３６】
本発明は、患者が癌を含む疾患のためのＣＴＬＡ−４の阻害を伴う療法に対して好ましい応答を示す可能性を予測する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、該方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要とし得、ここで前記のより積極的な投与計画は、該療法の規定投与量より１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、もしくは９５％上回る投与を伴うか、または該療法の規定投与量の１．５×、２×、２．５×、３×、３．５×、４×、４．５×、または５×上回る投与を伴い、および別法としては前記の増大した投与の頻度は別の薬剤との併用である。
【００３７】
本発明は、共刺激経路の調節を伴う療法によって、癌を含む疾患の患者を治療する方法であって、該治療方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、該疾患を治療するために、正の勾配を持つ患者は該療法の推奨投与量を単独で投与され得、それに対して負の勾配を持つ患者は単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうることを特徴とする、治療方法を提供する。
【００３８】
本発明は、ＣＴＬＡ−４の阻害を伴う療法によって、癌を含む疾患の患者を治療する方法であって、該治療方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、治療方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００３９】
本発明は、抗ＣＴＬＡ−４抗体の投与を伴う療法によって、癌を含む疾患の患者を治療する方法であって、該治療方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、治療方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００４０】
本発明は、イピリムマブの投与を含む療法によって、癌を含む疾患の患者を治療する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低いことを特徴とする、治療方法を提供する。
好ましい応答を獲得した患者は、平均すると、好ましい応答を獲得しなかった患者と比較してより高い勾配を有した。従って、負の勾配を持つ患者は、該疾患（ここで該疾患はメラノーマである）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうる。
【００４１】
本発明は、化学療法レジメンの投与を含む療法によって、癌を含む疾患の患者を治療する方法であって、該方法は、下記の工程：
（ｉ）該療法の投与の前、それとほとんど同時、および／または、その後に、経時的に採取した患者サンプルのリンパ球絶対数を測定する；および
（ｉｉ）該リンパ球絶対数の勾配を計算する、
を含み、正の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が高く、それに対して、負の勾配を持つ患者は該療法に対して好ましい応答を獲得する可能性が低く、該患者は該疾患（ここで該疾患はメラノーマおよび／または肺癌である）を治療するために、単独でまたは他の薬剤と組み合わせて、該療法の治療的に許容される量のより積極的な投与計画を必要としうることを特徴とする、治療方法を提供する。
【００４２】
本発明はまた、癌を含む疾患を有する個体のための治療戦略決定用のキットであって、リンパ球絶対数を経時的に測定し、該リンパ球絶対数の勾配を計算するための手段；ならびに、任意に使用説明および該キット結果の解説を含み、該治療戦略は共刺激経路モジュレーター、またはその医薬的に許容される塩、水和物もしくは溶媒和物の治療的有効量の投与を含むことを特徴とする、キットを対象とする。
【００４３】
本発明はまた、癌を含む疾患を有する個体のための治療戦略決定用のキットであって、リンパ球絶対数を経時的に測定し、該リンパ球絶対数の勾配を計算するための手段；ならびに、任意に使用説明および該キット結果の解説を含み、該治療戦略はＣＴＬＡ−４阻害剤、またはその医薬的に許容される塩、水和物もしくは溶媒和物の治療的有効量の投与を含むことを特徴とする、キットを対象とする。
【００４４】
本発明はまた、癌を含む疾患を有する個体のための治療戦略決定用のキットであって、リンパ球絶対数を経時的に測定し、該リンパ球絶対数の勾配を計算するための手段；ならびに、任意に使用説明および該キット結果の解説を含み、該治療戦略は抗ＣＴＬＡ−４抗体、またはその医薬的に許容される塩、水和物もしくは溶媒和物の治療的有効量の投与を含むことを特徴とする、キットを対象とする。
【００４５】
本発明はまた、癌を含む疾患を有する個体のための治療戦略決定用のキットであって、リンパ球絶対数を経時的に測定し、該リンパ球絶対数の勾配を計算するための手段；ならびに、任意に使用説明および該キット結果の解説を含み、該治療戦略はイピリムマブ、またはその医薬的に許容される塩、水和物もしくは溶媒和物の治療的有効量の投与を含むことを特徴とする、キットを対象とする。
【図面の簡単な説明】
【００４６】
【図１】適合平均（Fitted Mean）ＡＬＣ対最初の投与からの週。  適合平均ＡＬＣ対最初の投与からの週、投与量ごと、が示される。濃い曲線は適合平均（fitted mean）を示す。細い曲線は該平均値の９５％信頼帯の境界である。名目の投与日は０、３、６、および９週であった（垂直破線）。試験ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２の全ての患者が含まれるが、実施例１に記載したとおり２名の患者が除かれる（ｎ＝４８２名の患者、計２７１５データ点）。最初の投与の前４週と後１２週の間の全ての時点を含んだ。拡張線形モデルは、空間的指数関数患者内相関構造（spatial exponential within−patient correlation structure）(ユークリッド距離)、および所定の日のＡＬＣ測定の数に反比例する患者内変動で、ＲＥＭＬによる適合であった。ＡＬＣの経時的な変化は、０ノット（knot at 0）: ０前線形（linear before 0）およびキュービックアフター（cubic after）でのスプラインを用いてモデル化された。示されるとおり、１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを投与された患者の該平均ＡＬＣ勾配は、３．０ｍｇ／ｋｇまたは０．３ｍｇ／ｋｇを投与された患者のそれよりも大きく、統計的にも有意に違いがあった。
【００４７】
【図２】ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２についての、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ。  試験ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２についての、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ（切片）、投与量ごと、が示される。各点は１名の患者である。各患者について、勾配および切片を単回帰（simple linear regression）により推定した。各パネルの横実線は、該パネルにおける該勾配の２５、５０、および７５パーセンタイルを示す。最初の投与日、少なくとも１つの最初の投与後ＡＬＣ値、および試験−２８日から試験８４日（−４週および１２週）までの間の少なくとも２つのＡＬＣ値が分かる全ての患者（ｎ＝４６２）を含む。包括的な、試験−２８日と試験８４日の間のＡＬＣ値のみが該解析に含まれる。示されるとおり、１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを投与された患者の週あたりのＡＬＣの平均変化（勾配）は、３．０ｍｇ／ｋｇまたは０．３ｍｇ／ｋｇを投与された患者のものより大きく、統計的にも有意に違いがあった。
【００４８】
【図３】試験ＣＡ１８４−０２２のみについての、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ。  試験ＣＡ１８４−０２２のみについての、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ（切片）、投与量ごと、が示される。各点は１名の患者である。各患者について、勾配および切片を単回帰によって推定した。各パネルの横実線は、該パネルにおける該勾配の２５、５０、および７５パーセンタイルを示す。最初の投与日、少なくとも１つの最初の投与後ＡＬＣ値、および試験−２８日から試験８４日（−４週および１２週）までの間の少なくとも２つのＡＬＣ値が分かっている全ての患者（ｎ＝２０１）を含む。試験−２８日から試験８４日までの間のＡＬＣ値のみが該解析に含まれた。この単一試験に制限されたときでさえ、ＡＬＣ勾配と投与量の間の関連性が明かであった。
【００４９】
【図４】ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２についての、投与量および応答カテゴリーごとの、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ。  試験ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２についての、投与量および応答カテゴリーごとの、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ（切片）、が示される。各点は１名の患者である。各患者について、勾配および切片を単回帰によって推定した。各パネルの横実線は、該パネルにおける該勾配の２５、５０、および７５パーセンタイルを示す。最初の投与日、少なくとも１つの最初の投与後ＡＬＣ値、および試験−２８日から試験８４日（−４週および１２週）までの間の少なくとも２つのＡＬＣ値が分かっている全ての応答評価可能な患者（ｎ＝３７９）を含む。試験−２８日から試験８４日までの間のＡＬＣ値が該解析に含まれた。示されるとおり、１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを受けた患者の有益性群と非有益性群の間の平均勾配の違いは、極めて、統計的に有意であった。
【００５０】
【図５】ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２についての、投与量およびｉｒ応答カテゴリーごとの、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ。  試験ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２についての、投与量およびｉｒ応答カテゴリーごとの、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ（切片）が示される。各点は１名の患者である。各患者について、勾配および切片を単回帰によって推定した。各パネルの横実線は、該パネルにおける該勾配の２５、５０、および７５パーセンタイルを示す。最初の投与日、少なくとも１つの最初の投与後ＡＬＣ値、および試験−２８日から試験８４日（−４週および１２週）までの間の少なくとも２つのＡＬＣ値が分かっている全ての応答評価可能な患者（ｎ＝３７９）を含む。試験−２８日から試験８４日までの間のＡＬＣ値のみが、該解析に含まれた。示されるとおり、１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを受けた患者のｉｒ応答カテゴリー間の平均勾配の違いは、極めて、統計的に有意であった。
【００５１】
【図６】試験ＣＡ１８４−００４のみについての、投与量および応答カテゴリーごとの、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ。  試験ＣＡ１８４−００４のみについての、投与量および応答カテゴリーごとの、週あたりのＡＬＣの推定変化（勾配）対最初の投与日の推定ＡＬＣ（切片）が示される。各点は１名の患者である。各患者について、勾配および切片を単回帰によって推定した。各パネルの横実線は、該パネルにおける該勾配の２５、５０、および７５パーセンタイルを示す。最初の投与日、少なくとも１つの最初の投与後ＡＬＣ値、および試験−２８日から試験８４日（−４週および１２週）までの間の少なくとも２つのＡＬＣ値が分かっている全ての患者（ｎ＝６５）を含む。試験−２８日から試験８４日までの間のＡＬＣ値が該解析に含まれた。ＡＬＣ勾配と投与量、およびＡＬＣ勾配と応答カテゴリーの間の明確な関連性がこの試験で認められ、試験ＣＡ１８４−００７、ＣＡ１８４−００８およびＣＡ１８４−０２２の合わせた解析で認められたものと同様であった。
【００５２】
【図７】抗腫瘍反応とイピリムマブ定常状態トラフ濃度（Ｃｍｉｎss）間の関係。  （Ａ）および（Ｂ）の両方において、実線および網掛け部分は、モデル予測の中央値および９０％ブートストラップＣＩ（ｎ＝５００）を示す。水平方向のボックスプロットは、各投与群のＣｍｉｎssの分布を示す：ボックス（２５、５０、および７５パーセンタイル）およびウィスカー（whisker）（５および９５パーセンタイル）。  （Ａ）ＢＯＲ（ＣＲまたはＰＲ）のモデル予測可能性（９０％ＣＩ）対Ｃｍｉｎss。ＢＯＲの可能性は、Ｃｍｉｎssの５および９５パーセンタイルで、４．９％から１９．５％に増加した。予測チェックの結果は、ＢＯＲ応答者の該モデル−予測可能性とＢＯＲ応答者の観測された割合（データは示されていない）との間の良好な一致を示した。  （Ｂ）ｉｒＣＡのモデル予測可能性（９０％ＣＩ）対Ｃｍｉｎss。ｉｒＣＡを達成する可能性は、Ｃｍｉｎssの２５よび７５パーセンタイルでのＢＯＲの２倍以上であった。
【発明を実施するための形態】
【００５３】
本発明の詳細な説明
本発明は、部分的には、抗ＣＴＬＡ−４抗体であるイピリムマブの投与後の時間に応じたリンパ球絶対数(本明細書において「ＡＬＣ」と表す)を含む測定に関し、正の勾配を示した患者は、臨床的有益性および／または免疫関連応答を獲得する可能性が高いことを実証した４つの第二相臨床試験のデータに基づく。概して、イピリムマブの投与後の時間に応じたリンパ球絶対数について負の勾配を示した患者は、臨床的有益性を獲得しなかった。しかしながら、負の勾配を示した９１人の患者中１人は臨床的有益性を獲得した。
【００５４】
従って、ＡＬＣの勾配は、共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）の投与を受ける患者の臨床的有益性および／または免疫関連応答に確実に関係があり、従って、その臨床的有益性および／または免疫関連応答の予測指標として有用である。加えて、ＡＬＣの勾配は免疫賦活薬および／またはＴ細胞アクチベーター（例えばイピリムマブ）の投与を受ける患者の臨床的有益性および／または免疫関連応答に確実に関係があり、従って、臨床的有益性および／または免疫関連応答の予測指標として有用である。
【００５５】
本発明の目的として、語句「確実に関係がある」とは、ある患者の高いＡＬＣ勾配値が、それに応じて該患者の臨床的有益性を獲得する可能性が、ＡＬＣ勾配値が低い患者と比較してより高いであろうことを示唆する、一般的な状態を意味する。
【００５６】
加えて、ＡＬＣの負の勾配は、共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）の投与に対して、応答する可能性、または臨床的有益性および／または免疫関連応答を獲得する可能性が低い患者を特定するための予測指標として有用である。加えて、ＡＬＣの負の勾配は、共刺激経路モジュレーター療法に対する、臨床的有益性および／または免疫関連応答を獲得するために、共刺激経路モジュレーター、またはそれを使用する組み合わせの、より積極的な投与計画を必要としうる患者を特定するのに有用であり得る。
【００５７】
ＡＬＣの勾配（正および負ともに）の測定は、単に共刺激経路モジュレーターを超えて、これらに限定されないが、例えば化学療法を含む他のタイプの療法に対して応答しうる患者を特定するための予測指標として有用であり得る。
【００５８】
診断としてのＡＬＣ勾配の使用はまた、ヘルスケアの専門家が、本明細書に示された疾患、とりわけメラノーマの治療に適しているオーダーメイド治療レジメンを発展させるのを支援するのに、とりわけ有用である。
【００５９】
本発明の教示は、ＡＬＣの勾配と、特定の療法に対する患者応答、一般におよび具体的には共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）に対する応答との間の最初の関連性であると考える。選ばれおよび限定された癌（例えば、特定の血液学的悪性疾患、ＡＬＬ、ＡＭＬ、ハイリスクのユーイング肉腫、多発性骨髄腫、および乳癌からの脳転移）に関する全生存を予測するための指標として、ＡＬＣの使用(しかし勾配ではない)は知られているものの、そのような疾患の治療的介入に対する患者応答を予測するための予測指標として使用されたことはなく−むしろ、それは単に生存を予測するために使用されてきた。加えて、免疫調節剤に対する患者応答の予測指標としてのＡＬＣ勾配の使用は、これまで記載されたことはない。
【００６０】
これらの癌に関する全生存を予測するための指標としてのＡＬＣの使用は、治療前の基線ＡＬＣを測定することに限られてきたようであり、治療的介入の期間中に時間に応じてＡＬＣを測定すること(例えば、勾配)、ましてや、本明細書に記載されるように、該勾配が正であるかまたは負であるかに基づいて、患者が臨床的有益性を獲得する可能性を予測するために、勾配の値を適用することは伴わなかった。治療的投与の後でのＡＬＣ（勾配ではない）の使用は、患者生存を予想するために使用されてきた(参照：DeAngelo et al., J. Pediatr. Hemat. Oncol., 29(1):48-52 (2007); DeAngelo et al., Cancer, 112(2):407-415 (2007), and Behl et al., Br. J. Haematology, 137:409-415 (2007))が、そのようなＡＬＣの適用は、閾値としての測定時のＡＬＣの値(すなわち、ＡＬＣが、ある数値的境界より上であるかまたは下であるか)に依存しており、ＡＬＣの経時的な変化(例えば、勾配)は、これまで記載されたことはない。本発明は、免疫調節療法に対する患者応答の予測指標としてのＡＬＣ勾配の使用を対象とする。
【００６１】
本発明の目的のために、本明細書に概説されるように、またはヘルスケアの専門家による要請に応じて、患者のＡＬＣの値は、最初の治療的投与の日またはその前後に始まって、測定され、一定の頻度で一定期間継続される。さらに、最初の治療的投与に先立って、患者のＡＬＣを任意に測定してもよい。本発明の態様において、患者のＡＬＣの値は、月１回、２週間に１回、週１回、１週間内に、または毎日測定しても良い(本明細書において、「ＡＬＣ測定頻度」と呼ぶ)。所定の時間間隔 (本明細書において、「ＡＬＣ勾配間隔」と呼ぶ)の後、該勾配は、個々の患者の治療反応に関する予知的予測において使用するために、ＡＬＣ勾配間隔内に存在する２またはそれ以上の時点を用いて計算されうる。
【００６２】
ＡＬＣ勾配間隔の長さは、一部において、より短い間隔を可能とするより短い頻度でもって、一般に、ＡＬＣ測定頻度に依存し得る。本発明の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約２４週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約２０週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約１８週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約１５週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約１２週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約１１週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約１０週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約９週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約８週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約７週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約６週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約５週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約４週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約３週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約２週間であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配間隔は、約１週間であり得る。これに関連して、用語「約」とは、記載されたＡＬＣ勾配間隔の±１、２、３、４、５、６、または７日間を意味すると解釈される。
【００６３】
一つの態様において、正であるかまたは負であるかの勾配の帰属は、関心あるＡＬＣ勾配間隔についてのＡＬＣ勾配を、勾配の値が、変化率の閾値（threshold rate of change）(本明細書において「ＡＬＣ勾配閾値」と呼ぶ)の上であるか、または下であるかに基づいて計算した後に、作成され得る。本発明の目的について、正である勾配の帰属についてのＡＬＣ勾配閾値はゼロである。例えば、所定のＡＬＣ勾配間隔におけるある患者の勾配がゼロである場合、またはそれがゼロより大きい場合、その患者は、正の勾配を有するとして、指定されるであろう。同様に、所定のＡＬＣ勾配間隔におけるある患者の勾配がゼロより小さい場合、その患者は負の勾配を有するとして、指定されるであろう。本発明の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．００１であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．００５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０１であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０１５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０２０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０２５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０３０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０３５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０４０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０４５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０５０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０５５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０６０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０６５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０７０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０７５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０８０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０８５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０９０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．０９５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．１０であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．１５であり得る。本発明の別の態様において、ＡＬＣ勾配閾値は、約０．２であり得る。これに関連して、用語「約」とは、記載されたＡＬＣ勾配閾値の±０．００１、±０．００２、±０．００３、±０．００４、±０．００５、±０．００６、±０．００７、±０．００８、±０．００９、±０．０１、±０．０１５、±０．０２、±０．０２５、または±０．０３を意味すると解釈される。
【００６４】
別の態様において、臨床的有益性の可能性の推定は、ＡＬＣ勾配閾値を考慮せずに、むしろ正のまたは負の勾配の値の規模（magnitude）を用いて、継続的な測定としてのＡＬＣ勾配に基づくことができる。例えば、高いＡＬＣ勾配値を持つ患者は、平均すると、それに応じて、低いＡＬＣ勾配値を持つ患者と比較して、臨床的有益性を獲得する高い可能性を持ちうる。従って、ＡＬＣ勾配値約２．０を持つ患者は、ＡＬＣ勾配約１．８０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約１．６０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約１．４０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約１．２０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約１．０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約０．８０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約０．６０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約０．４０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約０．２０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約０．０を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．０２を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．０４を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．０６を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．０８を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．１を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．２を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．４を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．６を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−０．８を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持ち；ＡＬＣ勾配約−１．００を持つ患者と比べて、臨床的有益性を獲得するより高い可能性を持つ。これに関連して、用語「約」とは、記載されたＡＬＣ勾配値の±０．０１、±０．０２、±０．０３、±０．０４、±０．０５、±０．０６、±０．０７、±０．０８、±０．０９、±０．１、±０．１５、±０．２、±０．２５、±０．３、±０．３５、±０．４、±０．４５、または±０．５を意味するものと解釈される。
【００６５】
本発明は、療法に対するいかなる患者応答も複雑であり、および、おそらく多くのファクター（これらに限定されないが、例えば、患者の遺伝的背景、食生活、生活様式）に依存し、または、複雑化する患者の状態の有無（例えば、該療法が投与される時点での他の疾患の存在、または治療の投与の過程において起こりうる他の疾患など）に依存さえしうることを意図する。そのようなファクターは、該ファクターが無い場合には正であろう場合に、ＡＬＣ勾配間隔内で、該ファクターの存在が０であるか、またはわずかに負でさえある勾配の値を引き起こし得るといった、真には正であるＡＬＣ勾配の提示を曖昧にまたは遅らせうる。従って、本発明の目的に関し、正のＡＬＣ勾配の定義はまた、０もしくは約０である勾配、または負ではあるが、約０の約±１０％、約±５％、もしくは約±１％の範囲内である勾配を含み得る。
【００６６】
さらに、ＡＬＣ測定頻度が非常に低い状況では、またはヘルスケアの専門家が、該ＡＬＣ勾配間隔内に存在する１またはそれ以上のＡＬＣ値を使用することは好ましくないといった、複雑化する患者ファクターまたは状況が、ＡＬＣの値に影響すると認める期間では、適用可能なＡＬＣ勾配間隔の間、限られた数のＡＬＣ値が、ＡＬＣ勾配の計算に使用されうる。
【００６７】
患者のＡＬＣ勾配の患者応答を予測するための可能性への変換は、多くのファクター（これらに限定されないが例えば、患者の健康、処置されている患者の状態、患者が受けてきた療法、投与された療法の用量、投与計画の頻度、またはヘルスケアの専門家が配慮しうる他の考慮）に依存しうる。それにもかかわらず、大きいＡＬＣ勾配値は、患者が臨床的有益性を獲得する可能性が高いこと予想する見込みに変換され得；一方、小さいＡＬＣ勾配値は、患者が臨床的有益性を獲得する可能性が低いことを予想する見込みに変換され得る。
【００６８】
本発明は、本発明は多くの様々な様式で行われえることを意図する。例えば、一つの様式において、本発明は、コンピューターにより行われる診断方法の、少なくとも１またはそれ以上の工程を意図する。例えば、任意にＡＬＣ勾配間隔の範囲内における、患者のＡＬＣ勾配の計算は、コンピューターによって行われうる。加えて、ＡＬＣ勾配が正または負であるかの決定、および任意に、それがＡＬＣ勾配閾値の上であるか下であるかは、コンピューターによって行われうる。加えて、任意にＡＬＣ勾配閾値と併せたＡＬＣ勾配の、療法に対する臨床的有益性を獲得する患者の見込みへの変換は、コンピューターによって行われうる。コンピュータープログラミング分野の当業者は、本発明の工程をアルゴリズムに行うためのソフトウェアを、容易に起案できるであろう。
【００６９】
本発明の一つの様式を行うコンピューターは、ＣＰＵ、ＲＯＭ、指示および応答を受けおよびアウトプットするための標準的なＩ／Ｏ、本発明の特定の工程を行うためのアルゴリズム、およびオペレーティングシステムソフトウェア等を含みうる。コンピューターはまた、Ｉ／Ｏ情報を使用者に伝達するための表示手段（例えば、モニター、ＬＣＤ、ＣＲＴ等）を含み得、およびまた、使用者インターアクションを許可するために、入力手段（例えば、キーボード、マウス、トラックボール、タッチパッド等）を含みうる。
【００７０】
語句「臨床的有益性」または「有益性」は、患者が完全応答；部分応答；安定な疾患を獲得する；または本明細書で別に記載するような状態をいう。
【００７１】
語句「リンパ球絶対数」は、患者サンプル中の白血球の総数からのリンパ球のパーセンテージに白血球の総数を乗じてリンパ球「絶対」数に達することから計算された患者サンプル中のリンパ球の数をいう。いずれのサンプルにおいても絶対数および／またはリンパ球のパーセンテージは、血球計数器、フローサイトメトリー、または当該技術分野において知られる他の方法を用いて、決定されうる。
【００７２】
語句「正の勾配」または「正のＡＬＣ勾配」は、左から右に水平に移動する線（Ｘ軸）の単位の数に対する、垂直に上昇または下降する線（Ｙ軸）の単位の数の比であって、ゼロの値または正の値（０より大きい値）を意味し、ここでＹ軸値は患者サンプルのリンパ球絶対数を意味し、およびＸ軸値は時点を意味する。勾配の計算には、少なくとも２つの時点のＡＬＣ測定を要する。最初の投与の際またはその前後に始まり、および投与の後の継続的な時間間隔の時点を含むことが好ましいが、時点は共刺激経路モジュレーターの投与の前、間、および／または後のＡＬＣ値を含みうる。
【００７３】
語句「負の勾配」または「負のＡＬＣ勾配」は、左から右に水平に移動する線の単位の数に対する、垂直に上昇または下降する線の単位の数の比であって、負の値（ゼロより小さい値）を意味し、ここでＹ軸値は患者サンプルのリンパ球絶対数を意味し、およびＸ軸値は時点を意味する。最初の投与の際またはその前後に始まり、および投与の後の継続的な時間間隔の時点を含むことが好ましいが、時点は共刺激経路モジュレーターの投与の前、間、および／または後のＡＬＣ値を含みうる。
【００７４】
概して、当業者はいずれかの線の勾配の計算方法を、当該技術分野においてよく知られた方法を用いて理解するであろう。その非常に単純な形態では、２点ＡＬＣ勾配は、下式に従って計算されうる:
2011525616.tif 000002
［式中ｙ1はデカルト座標に沿った第１時点のＹ軸値を示し、ｙ2はデカルト座標に沿った第２時点のＹ軸値を示し、ｘ1はデカルト座標に沿った第１時点のＸ軸値を示し、ｘ2はデカルト座標に沿った第２時点のＸ軸値を示す］。２つ以上の個々の時点を含有するいずれかの線の勾配の計算は、十分に数学および基礎科学の当業者の知識の範囲内である。
【００７５】
語句「共刺激経路モジュレーター」とは通常、免疫賦活薬またはＴ細胞アクチベーターを意味し、また、ＣＤ２８抗原のその同種（cognate）リガンドに結合する能力を崩壊することができ、ＣＴＬＡ−４のその同種リガンドに結合する能力を阻害し、共刺激経路を介したＴ細胞応答を増大させ、Ｂ７のＣＤ２８および／またはＣＴＬＡ−４に結合する能力を崩壊し、Ｂ７の共刺激経路を活性化する能力を崩壊し、ＣＤ８０のＣＤ２８および／またはＣＴＬＡ−４に結合する能力を崩壊し、ＣＤ８０の共刺激経路を活性化する能力を崩壊し、ＣＤ８６のＣＤ２８および／またはＣＴＬＡ−４に結合する能力を崩壊し、ＣＤ８６の共刺激経路を活性化する能力を崩壊し、および、一般に活性化からの共刺激経路を崩壊する、いずれかの薬剤を包含する。これは、必然的に共刺激経路の他のメンバーの中でＣＤ２８、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＴＬＡ−４の低分子阻害剤；共刺激経路の他のメンバーの中でＣＤ２８、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＴＬＡ−４に対する抗体；共刺激経路の他のメンバーの中でＣＤ２８、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＴＬＡ−４に対するアンチセンス分子；共刺激経路の他のメンバーの中でＣＤ２８、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＴＬＡ−４に対するアドネクチン（adnectin）；他の抗ＣＴＬＡ−４アンタゴニストの中、共刺激経路の他のメンバーの中で、ＣＤ２８、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＴＬＡ−４のＲＮＡｉ阻害剤 (１本鎖および２本鎖共) を含む。
【００７６】
本発明の方法に使用するための適当な抗ＣＴＬＡ−４アンタゴニスト剤には、これらには限定されないが、例えば、抗ＣＴＬＡ−４抗体、ヒト抗ＣＴＬＡ−４抗体、マウス抗ＣＴＬＡ−４抗体、哺乳類抗ＣＴＬＡ−４抗体、ヒト化抗ＣＴＬＡ−４抗体、モノクローナル抗ＣＴＬＡ−４抗体、ポリクローナル性抗ＣＴＬＡ−４抗体、キメラ抗ＣＴＬＡ−４抗体、ＭＤＸ−０１０ (イピリムマブ)、トレメリムマブ（tremelimumab）、抗ＣＤ２８抗体、抗ＣＴＬＡ−４アドネクチン、抗ＣＴＬＡ−４領域抗体、単鎖抗ＣＴＬＡ−４フラグメント、重鎖抗ＣＴＬＡ−４フラグメント、軽鎖抗ＣＴＬＡ−４フラグメント、共刺激経路のモジュレーター、ＰＣＴ公開ＷＯ２００１／０１４４２４に開示される抗体、ＰＣＴ公開ＷＯ２００４／０３５６０７に開示される抗体、米国出願公開第ＵＳ２００５／０２０１９９４号に開示される抗体、および欧州特許第ＥＰ１２１２４２２Ｂ１号に開示される抗体が挙げられる。さらなるＣＴＬＡ−４抗体は、米国特許第５，８１１，０９７号、第５，８５５，８８７号、第６，０５１，２２７号、および第６，９８４，７２０号；ＰＣＴ公開ＷＯ０１／１４４２４およびＷＯ００／３７５０４；および米国公開第２００２／００３９５８１号および第２００２／０８６０１４号に記載される。本発明の方法に使用されうる他の抗ＣＴＬＡ−４抗体には、例えば：ＷＯ９８／４２７５２；米国特許第６，６８２，７３６号および第６，２０７，１５６号；Hurwitz et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95(17):10067-10071 (1998)；Camacho et al., J. Clin. Oncology, 22(145):abstract no. 2505 (2004) (抗体CP−675206)；Mokyr et al., Cancer Res., 58:5301-5304 (1998)、米国特許第５，９７７，３１８号、米国特許第６，６８２，７３６号、米国特許第７，１０９，００３号、および米国特許第７，１３２，２８１号に開示されるものが挙げられる。これらの引用文献の各々は、ＣＴＬＡ−４抗体の説明のために、参照することにより具体的に本明細書に組み込まれる。好ましい臨床用ＣＴＬＡ−４抗体は、ヒトモノクローナル抗体１０Ｄｌ（ＭＤＸ−０１０およびイピリムマブとも呼ばれる。Medarex, Inc., Bloomsbury, NJより入手可能）であり、ＷＯ０１／１４４２４に開示される。
【００７７】
当該技術分野で知られるとおり、イピリムマブは抗ＣＴＬＡ−４抗体と呼ばれ、機能的ヒトレパートリーを生じるための重鎖および軽鎖をコードするヒト遺伝子を有するトランスジェニックマウス由来の完全なヒトＩｇＧ1κ抗体である。イピリムマブはまた、そのＣＡＳ登録番号４７７２０２−００−９とも呼ばれ、およびＰＣＴ公開ＷＯ０１／１４４２４では抗体１０ＤＩとして開示され、その全ては参照することにより、全ての目的のために、本明細書に組み込まれる。具体的には、イピリムマブは、特にＣＴＬＡ−４に結合するヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合部分を表し、軽鎖可変領域および重鎖可変領域を含み、配列番号５から成る軽鎖可変領域を持ち、および配列番号６から成る重鎖領域を含む。イピリムマブの医薬組成物には、イピリムマブおよび１またはそれ以上の希釈剤、ビヒクルおよび／または賦形剤を含む、全ての医薬的に許容される組成物が含まれる。イピリムマブを含む医薬組成物の例は、ＰＣＴ公開ＷＯ２００７／６７９５９に記載される。イピリムマブは、点滴（Ｉ．Ｖ．）により投与されうる。
イピリムマブの軽鎖可変領域:
【化１】
2011525616.tif 000003
イピリムマブの重鎖可変領域:
【化２】
2011525616.tif 000004
【００７８】
本明細書の他の箇所に記載したとおり、ＡＬＣ勾配は、１またはそれ以上の抗ＣＴＬＡ−４アンタゴニストを、単独で、またはペプチド抗原（例えば、ｇｐ１００）と組み合わせて、本明細書に開示される抗増殖剤に加えてまたはこれと併用して投与したときの係る投与に対する患者応答の予測指標として有用であり得る。ペプチド抗原の非限定的な実施例は、ＩＭＤＱＶＰＦＳＶ（配列番号３）、およびＹＬＥＰＧＰＶＴＶ（配列番号４）からなる群から選択される配列を含む、あるいは、該配列から成る、ｇｐ１００ペプチドである。このようなペプチドは、経口的に投与され得、または好ましくは、１ｍｇをフロイント不完全アジュバント（ＩＦＡ）中に乳化して体肢の１つに皮下（Ｓ．Ｃ．）注射され得、そして、同一または異なるペプチド１ｍｇはＩＦＡに乳化して別の体肢に注射され得る。
【００７９】
本発明が免疫療法および／または共刺激経路調節（例えばイピリムマブの投与を介する）に対する患者応答を予測するのに有用であり得る疾患には、これらに限定去れないが例えば、メラノーマ、原発性メラノーマ、切除不能ステージIIIまたはIV悪性メラノーマ、肺癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、および前立腺癌が挙げられる。
【００８０】
本発明が免疫療法および／または共刺激経路調節（例えばイピリムマブの投与を介する）に対する患者応答を予測するのに有用であり得る更なる疾患には、これらに限定去れないが例えば、神経膠腫、胃腸癌、腎癌、卵巣癌、肝癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、腎癌、甲状腺癌、神経芽細胞腫、膵臓癌、多形性膠芽腫、子宮頸癌、胃癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、大腸癌、および頭頸部癌、胃癌、胚細胞腫瘍、骨癌、骨腫瘍、骨の成人悪性線維性組織球腫；骨の小児悪性線維性組織球腫、肉腫、小児肉腫、副鼻腔のナチュラルキラー、新生物、形質細胞腫瘍；骨髄異形成症候群；神経芽細胞腫；精巣胚細胞腫瘍、眼内メラノーマ、骨髄異形成症候群；骨髄異形成/骨髄増殖性疾患、滑膜肉腫、慢性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、フィラデルフィア染色体陽性急性リンパ性白血病（Ｐｈ＋ＡＬＬ）、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、肥満細胞症および肥満細胞症に伴う症状、およびそれらの転移が挙げられる。加えて、疾患には、色素性じんま疹、肥満細胞症（例えばびまん性皮膚肥満細胞症、ヒトの単発性肥満細胞腫、ならびにイヌ肥満細胞腫、および水疱性のような希なサブタイプ、紅皮症性肥満細胞症、末梢血管拡張（teleangiectatic）肥満細胞症、関連血液疾患を伴う肥満細胞症（例えば骨髄増殖性症候群、骨髄異形成症候群、または急性白血病、肥満細胞症に関連する骨髄増殖性疾患、肥満細胞白血病）が、他の癌に加えて含まれる。他の癌はまた、疾患の範囲内に含まれ、限定去れないが、例えば、下記のものが挙げられる：膀胱癌、尿路上皮癌、乳癌、結腸癌、腎臓癌、肝臓癌、肺癌、卵巣癌、膵臓癌、胃癌、子宮頸癌、甲状腺癌、精巣癌（とりわけ精巣セミノーマ）、および皮膚癌（扁平上皮癌を含む）を含む癌；消化管間葉性腫瘍(「GIST」)；リンパ系の造血器腫瘍（例えば白血病、急性リンパ性白血病、急性リンパ性白血病、Ｂ細胞リンパ腫、Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ヘアリー細胞リンパ腫およびバーケットリンパ腫）；骨髄系の造血器腫瘍（例えば急性および慢性骨髄性白血病および前骨髄球性白血病）；間葉オリジンの腫瘍（例えば、線維肉腫および横紋筋肉腫（rhabdomyoscarcoma））；他の腫瘍（例えば、メラノーマ、セミノーマ、テラトカルシノーマ（tetratocarcinoma）、神経芽細胞腫および神経膠腫）；中枢および末梢神経系の腫瘍（例えば、星状細胞腫、神経芽細胞腫、神経膠腫、およびシュワン腫）；間葉オリジンの腫瘍（例えば、線維肉腫、横紋筋肉腫（rhabdomyoscaroma）、および骨肉腫）；および他の腫瘍（例えば、メラノーマ、色素性乾皮症（xenoderma pigmentosum）、ケラトアカントーマ（keratoactanthoma）、セミノーマ、甲状腺濾胞癌、テラトカルシノーマ、化学療法難治性非セミノーマ（non−seminomatous）胚細胞腫瘍、およびカポジ肉腫）、およびそれらの転移。
【００８１】
本明細書で使用される用語「処置」、「治療」および「療法」は、治療的療法、予防的療法、防止的療法、および疾患緩和療法をいう。
【００８２】
本明細書で使用される語句「より積極的な投与計画」または「投薬頻度増加レジメン」は、投薬頻度の増加(約１週間に１回、約１週間に２回、約１日１回、約１日２回等)、増加または(段階的に)増大した投与量（約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３５、約４０ｍｇ／ｍｌ）、または共刺激モジュレーターの生物学的に利用可能な値の増加をもたらし得る投与方法のいずれかに起因して、必然的に、共刺激経路モジュレーター（好ましくはイピリムマブ）の基本のおよび／または規定の投与計画を超える投与計画を意味する。
【００８３】
本発明は特定の方法、試薬、化合物、組成物、または生物システムに限定されず、当然ながら、それらの変体／変形でありうることが理解される。本明細書で使用される専門用語は、単に特定の態様を示すためのものであって、限定することを意図はしないこともまた、理解される。この明細書および特許請求の範囲で使用されるとおり、単数形「a」、「an」、および「the」には、明らかに別の内容を指示する記載がない限り、複数の指示対象が含まれる。従って、例えば、「ペプチド」との言及には、２またはそれ以上のペプチド等の組み合わせが含まれる。
【００８４】
本明細書で使用される「約」は、測定可能な値（例えば継続時間等）について言及されているとき、特定された値の±２０％または±１０％、好ましくは±５％、もしくは±１％、または±０．１％程の変動を包含することが意図され、該変動は、開示される方法を行うのに適合する。
【００８５】
治療レジメンは、共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）または本明細書に記載される他の療法（例えば化学療法）の投与の後、患者は正のまたは負のＡＬＣ勾配のいずれを示すかを決定することに基づいて確立することができる。正のまたは負のＡＬＣ勾配が該患者のサンプルで検出された場合、治療レジメンを適当に作成することができる。例えば、正のＡＬＣ勾配の存在は、該患者が該共刺激経路モジュレーター療法に対して臨床的有益性および／または免疫関連応答を獲得する高い可能性を持ち、従って、規定の治療のレジメンの継続を是認することを示し得る。あるいは、負のＡＬＣ勾配が検出された場合、それは、該患者が、該共刺激経路モジュレーター療法に対する臨床的有益性および／または免疫関連応答を獲得する低い可能性を持つことを示し得、従って、より高い投与量の共刺激経路モジュレーター療法を投与すべきであるか、または、より積極的な投与計画または組み合わせ療法が支持されることを示唆しうる。１つの態様において、共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）の増加される投与量のレベルは、特定の適用または個体についての典型的な共刺激経路モジュレーター投与量（例えば、約０．３ｍｇ／ｋｇ、約３ｍｇ／ｋｇ、約１０ｍｇ／ｋｇ、約１５ｍｇ／ｋｇ、約２０ｍｇ／ｋｇ、約２５ｍｇ／ｋｇ、約３０ｍｇ／ｋｇ）と比べて、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、または９５％多く、または、特定の適用または個体についての典型的な共刺激経路モジュレーター投与量と比べて、約１．５ｘ、２ｘ、２．５ｘ、３ｘ、３．５ｘ、４ｘ、４．５ｘ、５ｘ、６ｘ、７ｘ、８ｘ、９ｘ、または１０ｘ多い共刺激経路モジュレーターであろう。
【００８６】
共刺激経路モジュレーター（好ましくはイピリムマブ）の治療的有効量は患者に経口投与され得、それが低分子モジュレーターであるときは、例えばまたは好ましくは注射投与され得る。用いられる実際の投与量は、患者の必要性および治療される疾患の重症度に依存して、ＡＬＣ勾配に対する考慮を含みながら変えることができる。治療レジメンの決定はＡＬＣ勾配を考慮に入れることによって利益を受けものの、所定の状況の適当な開始投与量の決定は、当該技術分野の範囲内である。それでもなお、特定の患者についての特定の投与量値および投与頻度は、変えられ得、および様々なファクター（例えば、使用した特定の化合物の活性、その化合物の代謝的安定性および作用の長さ、患者の人種、年齢、体重、全体的な健康、性別および食生活、投与の様式および時間、排泄率、薬物組み合わせ、ならびに特定の疾患の重症度）に依存することが理解されるであろう。治療のための好ましい患者には、動物、より好ましくは哺乳類種（例えばヒト）、および家庭内の動物（例えばイヌ、ネコ等）、癌患者を含む。
【００８７】
本明細書で使用される用語「組み合わせ」および「併用」は、共刺激経路モジュレーター（好ましくはアゴニスト）と、他の共刺激経路モジュレーター（好ましくはアゴニスト）（すなわち、免疫賦活薬）、ＰＲＯＶＥＮＧＥ（登録商標）、チューブリン安定化剤（例えば、パシタソール（pacitaxol）、エポチロン、タキサン等）、ベバシズマブ、イグゼンプラ（商標）、ダカルバジン、パラプラチン（登録商標）、ドセタキセル、１またはそれ以上のペプチドワクチン、ＭＤＸ−１３７９メラノーマペプチドワクチン、１またはそれ以上のｇｐ１００ペプチドワクチン、鶏痘−ＰＳＡ−ＴＲＩＣＯＭ（商標）ワクチン、ワクシニア−ＰＳＡ−ＴＲＩＣＯＭ（商標）ワクチン、ＭＡＲＴ−１抗原、サルグラモスチム、チシリムマブ、併用アンドロゲン除去療法との組み合わせ；イピリムマブおよび別の共刺激経路モジュレーターの組み合わせ；イピリムマブおよびチューブリン安定化剤（例えば、パシタソール、エポチロン、タキサン等）の組み合わせ；イピリムマブおよびイグゼンプラ（商標）の組み合わせ、イピリムマブとダカルバジンの組み合わせ、イピリムマブとパラプラチン（登録商標）の組み合わせ、イピリムマブとドセタキセルの組み合わせ、イピリムマブと１またはそれ以上のペプチドワクチンの組み合わせ、イピリムマブとＭＤＸ−１３７９メラノーマペプチドワクチンの組み合わせ、イピリムマブと１またはそれ以上のｇｐ１００ペプチドワクチンの組み合わせ、イピリムマブと鶏痘−ＰＳＡ−ＴＲＩＣＯＭ（商標）ワクチンの組み合わせ、イピリムマブとワクシニア−ＰＳＡ−ＴＲＩＣＯＭ（商標）ワクチンの組み合わせ、イピリムマブとＭＡＲＴ−１抗原の組み合わせ、イピリムマブとサルグラモスチムの組み合わせ、イピリムマブとチシリムマブの組み合わせ、および／またはイピリムマブと併用アンドロゲン除去療法の組み合わせをいう。本発明の組み合わせは、治療される疾患に対して特定の実用性があるために選ばれた、良く知られた他の療法と併せて使用されうる。該組み合わせは、ＡＬＣ勾配間隔で負のＡＬＣ勾配を示す患者に治療的選択肢を提供しうる。
【００８８】
本発明の別の態様において、共刺激経路モジュレーターおよび少なくとも１つの他の薬剤との間の組み合わせは、下記組み合わせの１またはそれ以上を含み得る: イピリムマブおよびタキソールおよびパラプラチン(同時投与)；イピリムマブおよびタキソールおよびパラプラチン(連続投与)；イピリムマブおよびダカルバジン；イピリムマブおよびベバシズマブ；イピリムマブおよびブデソニド；イピリムマブおよびＣＤ１３７の阻害剤；およびイピリムマブおよびステロイド(コルチコステロイド等)。
【００８９】
ＡＬＣ勾配は、他の共刺激経路モジュレーター単独に対する患者応答、または本明細書に開示される他の共刺激経路モジュレーターと組み合わた共刺激経路モジュレーターに対する応答、または本明細書に開示される他の化合物（これらに限定されないが、例えば、下記のものが挙げられる：アガトリモド（agatolimod）、ベラタセプト（belatacept）、ブリナツモマブ（blinatumomab）、ＣＤ４０リガンド、抗Ｂ７−１抗体、抗Ｂ７−２抗体、抗Ｂ７−Ｈ４抗体、ＡＧ４２６３、エリトラン（eritoran）、抗ＣＤ１３７モノクローナル抗体、抗ＯＸ４０抗体、ＩＳＦ−１５４、およびＳＧＮ−７０）との組み合わせに対する応答：の予測指標として有用であり得る。
【００９０】
様々な化学療法剤が当該技術分野において知られており、そのいくつかは本明細書に記載される。化学療法剤の１つのタイプは、金属配位複合体と呼ばれる。このタイプの化学療法剤は、主に細胞の核内で鎖間ＤＮＡ架橋を形成し、これにより細胞複製を防ぐと考えられている。結果として、腫瘍増殖は最初抑制され、ついで回復する。化学療法剤の別のタイプはアルキル化剤である。これらの化合物は、分裂癌細胞のＤＮＡに外来性の組成物または分子を挿入することによって機能する。これらの外来性部分の結果として、癌細胞の通常機能は崩壊され、増殖は阻止される。別のタイプ化学療法剤は抗腫瘍薬である。この薬のタイプは、癌細胞の増殖および拡張を阻止し、殺し、またはブロックする。さらに他のタイプの抗癌剤には、非ステロイド系アロマターゼ（aromastase）阻害剤、二機能のアルキル化剤等が挙げられる。
【００９１】
化学療法と組み合わせた免疫療法は、直接に腫瘍細胞を攻撃して腫瘍細胞ネクローシスまたはアポトーシスを引き起こす薬剤と、腫瘍に対する宿主免疫応答を調節する薬剤の効果とを組み合わせた、癌治療のための新規なアプローチである。化学療法剤は、「多価」腫瘍細胞ワクチンを作り出す抗原提示細胞によって提示される腫瘍抗原を産生することによって、および腫瘍構造を変形し、そうして、免疫治療剤の浸透ならびに拡大された免疫集団を促進することによって、免疫療法の効果を増強するであろう。
【００９２】
ＡＬＣ勾配は微小管安定化剤（例えばイクサベピロン(イグゼンプラ（商標）)およびパクリタキセル(タキソール（登録商標）)）に対する患者応答の予測指標として有用であり得、それらは、一般に多くの癌タイプの治療のために使用され、ＣＴＬＡ−４遮断と組み合わせるのために魅力的な薬剤のクラスである。
【００９３】
語句「ミクロチューブリン調節剤」は、ミクロチューブリンを安定化する、またはミクロチューブリン合成および／または重合を不安定化する薬剤を意味する。
【００９４】
１つのミクロチューブリン調節剤は、パクリタキセル(販売名タキソール（登録商標）)であり、これは、有糸分裂異常および有糸分裂停止を引き起こし、およびカルシウム安定凝集構造への微小管重合を促進して細胞複製の阻害をもたらすとして知られている。
【００９５】
エポチロンは、タキソール（登録商標）の生物学的作用を模倣し(Bollag et al., Cancer Res., 55:2325-2333 (1995)、および競争試験においては、微小管に結合するタキソール（登録商標）競合的阻害剤として作用する。しかしながら、エポチロンは、タキソール（登録商標）を超えて有意に有利であり、タキソール（登録商標）と比べて、複数の薬剤耐性細胞系に対して、エポチロンははるかに低い有効性の低下を示すからである(Bollag et al. (1995))。さらに、エポチロンは、Ｐ−糖タンパク質によって細胞から排出される効率は、タキソール（登録商標）よりかなり低い(Gerth et al. (1996))。エポチロンの更なる例は、共通して所有された、ＰＣＴ出願ＰＣＴ／ＵＳ２００９／０３０２９１（２００９年１月７日）に記載されており、その文献の全ては参照することにより、全ての目的のために、本明細書に組み込まれる。
【００９６】
イクサベピロンは、パツピロンの半合成ラクタム類似体であって、チューブリンに結合して、チューブリン重合および微小管安定化を促進し、それにより細胞を細胞周期のＧ２／Ｍフェーズで停止させ、腫瘍細胞アポトーシスを誘導するある。
【００９７】
免疫療法との組み合わせに有用な微小管調節剤の更なる例には、これらに限定されないが下記のものが挙げられる：
アロコルヒチン（ＮＳＣ ４０６０４２）、ハリコンドリンＢ（Halichondrin B）（ＮＳＣ ６０９３９５）、コルヒチン（ＮＳＣ ７５７）、コルヒチン誘導体（例えば、ＮＳＣ ３３４１０）、ドラスタチン１０（ＮＳＣ ３７６１２８）、マイタンシン（ＮＳＣ １５３８５８）、リゾキシン（rhizoxin）（ＮＳＣ ３３２５９８）、パクリタキセル（タキソール（登録商標）、ＮＳＣ １２５９７３）、タキソール（登録商標）誘導体（例えば、誘導体（例えば、ＮＳＣ ６０８８３２）、チオコルヒチンＮＳＣ ３６１７９２）、トリチルシステイン（ＮＳＣ ８３２６５）、硫酸ビンブラスチン（ＮＳＣ ４９８４２）、硫酸ビンクリスチン（ＮＳＣ ６７５７４）、天然および合成エポチロン：これらに限定されないが、例えば、エポチロンＡ、エポチロンＢ、エポチロンＣ、エポチロンＤ、デスオキシエポチロンＡ、デスオキシエポチロンＢ、［１Ｓ−［１Ｒ*，３Ｒ*（Ｅ），７Ｒ*，１０Ｓ*，１１Ｒ*，１２Ｒ*，１６Ｓ*］］−７−１１−ジヒドロキシ−８，８，１０，１２，１６−ペンタメチル−３−［１−メチル−２−（２−メチル−４−チアゾリル）エテニル］−４−アザ−１７  オキサビシクロ［１４．１．０］ヘプタデカン−５，９−ジオン（米国特許第６，２６２，０９４号（２００１年７月１７日発行）に開示される）、［１Ｓ−［１Ｒ*，３Ｒ*（Ｅ），７Ｒ*，１０Ｓ*，１１Ｒ*，１２Ｒ*，１６Ｓ*］］−３−［２−［２−（アミノメチル）−４−チアゾリル］−１−メチルエテニル］−７，１１−ジヒドロキシ−８，８，１０，１２，１６−ペンタメチル−４−１７−ジオキサビシクロ［１４．１．０］−ヘプタデカン−５，９−ジオン（ＵＳＳＮ０９／５０６，４８１（２０００年２月１７日出願）および実施例７および８に開示される）、およびその誘導体；ならびに他の微小管を崩壊剤（disruptor）。更なる抗腫瘍薬には、ディスコデルモリド（Service, Science, 274:2009(1996)を参照）エストラムスチン、ノコダゾール、およびＭＡＰ４等が挙げられる。該薬剤の例はまた、科学文献または特許文献に記載され、例えば下記の文献が挙げられる：Bulinski, J. Cell Sci., 110:3055-3064 (1997); Panda, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94:10560-10564 (1997); Muhlradt, Cancer Res., 57:3344-3346 (1997); Nicolaou, Nature, 387:268-272 (1997); Vasquez, Mol. Biol. Cell., 8:973-985 (1997); Panda, J. Biol. Chem., 271:29807-29812 (1996)。
【００９８】
下記に、本発明の方法で使用するための好ましい治療組み合わせおよび投与量の例示を説明する。
【表１】
2011525616.tif 000005
【００９９】
この表は、本発明の共刺激経路モジュレーターおよび特定の抗癌剤投与量範囲の例示を提供するが、本発明の医薬組成物を処方するとき、臨床医は、治療される患者の状態によって認められる、好ましい投与量を使用することができる。例えば、イクサベピロンは、好ましくは、３週間毎に約４０ｍｇ／ｍ2にて投与され得る。パクリタキセルは、好ましくは、３週間毎に約１３５−１７５ｍｇ／ｍ2にて投与され得る。
【０１００】
抗ＣＴＬＡ−４抗体は、好ましくは、約０．３−１０ｍｇ／ｋｇ、または最大耐量にて投与され得る。本発明の態様において、ＣＴＬＡ−４抗体の投与量は、約３週間毎に投与される。あるいは、ＣＴＬＡ−４抗体は、第一のＣＴＬＡ−４抗体の投与量：約３ｍｇ／ｋｇ、第二のＣＴＬＡ−４抗体の投与量：約５ｍｇ／ｋｇ、および第三のＣＴＬＡ−４抗体の投与量：約９ｍｇ／ｋｇを投与することを含む、漸増投与量レジメンによって投与され得る。
【０１０１】
別の具体的な態様において、漸増投与量レジメンは、第一のＣＴＬＡ−４抗体の投与量：約５ｍｇ／ｋｇ、および第二のＣＴＬＡ−４抗体の投与量：約９ｍｇ／ｋｇを投与することを含む。
【０１０２】
さらに、本発明は、漸増投与量レジメンを提供し、それは約６週間毎にＣＴＬＡ−４抗体の漸増投与量を投与することを含む。
【０１０３】
本発明の態様において、段階的漸増投与量レジメンが提供され、それは、第一のＣＴＬＡ−４抗体投与量：約３ｍｇ／ｋｇ、第二のＣＴＬＡ−４抗体投与量：約３ｍｇ／ｋｇ、第三のＣＴＬＡ−４抗体投与量：約５ｍｇ／ｋｇ、第四のＣＴＬＡ−４抗体投与量：約５ｍｇ／ｋｇ、および第五のＣＴＬＡ−４抗体投与量：約９ｍｇ／ｋｇを投与することを含む。本発明の別の態様において、段階的漸増投与量レジメンが提供され、これは第一の投与量：５ｍｇ／ｋｇ、第二の投与量：５ｍｇ／ｋｇ、および第三の投与量：９ｍｇ／ｋｇを投与することを含む。
【０１０４】
使用される実際の投与量は、患者の必要性および治療される疾患の重症度に依存して異なってもよく、本発明に従ってＡＬＣ勾配を考慮することによって決定され得る。概して、治療は、化合物の至適投与量より少ない、少量の投与量で始められる。従って、その情況下での最適な効果が達成されるまで、投与量は少量ずつ増量される。便宜上、必要に応じ、一日総投与量を、その一日の間で分けて投与することができる。間欠療法（例えば３週間の内の１週間または４週間の内の３週間）もまた、用いられ得る。
【０１０５】
本明細書における多くの本発明の態様を実施する場合、生物試料は、好ましくは血液、血液細胞（赤血球または白血球）から選択されることができる。サンプルからの細胞を使用することができ、または細胞サンプル溶解液を使用するできる。特定の態様において、生物試料は、血液細胞を含む。
【０１０６】
本発明で使用するための医薬組成物は、１つまたは組み合わせの共刺激経路モジュレーターを使用目的を達成する有効量にて含有する組成物を含むことができる。治療的に有効な投与量は、症状または疾患を改善する有効成分の量をいい、および本発明に従ってＡＬＣ勾配が考慮される。ヒトの治療効果および治療毒性は、細胞培養または実験動物における標準的な医薬手段、例えば、ＥＤ50（集団の５０％に治療的に有効な投与量）およびＬＤ50（集団の５０％に致死的な投与量）によって、予測することができる。
【０１０７】
共刺激経路のモジュレーターの「治療的に有効な量」とは、患者が正のまたは負のＡＬＣ勾配を示すかどうかの機能であり得る。負のＡＬＣ勾配を持つ患者について、共刺激経路モジュレーターの治療的に関連のある投与量とは、例えば、通常の投与量と比べて１〜１４倍またはそれ以上高い範囲に及び得る。従って、本明細書に開示されるいずれの疾患（好ましくはメラノーマ）について、共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）の治療的に関連のある投与量は、例えば、規定投与量または標準的な投与量と比べて、約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２２５、２５０、または３００倍高い投与量であり得る。あるいは、共刺激経路モジュレーター（例えばイピリムマブ）の治療的に関連のある投与量は、正のＡＬＣ勾配を示す個体について、例えば、規定投与量の約１．０ｘ、約０．９ｘ、０．８ｘ、０．７ｘ、０．６ｘ、０．５ｘ、０．４ｘ、０．３ｘ、０．２ｘ、０．１ｘ、０．０９ｘ、０．０８ｘ、０．０７ｘ、０．０６ｘ、０．０５ｘ、０．０４ｘ、０．０３ｘ、０．０２ｘ、または０．０１ｘであり得る。
【０１０８】
本発明は、所定の時間間隔で、特定の治療レジメンの投与の後、患者が正のまたは負のＡＬＣ勾配を示すかを決定することに基づいて、疾患をもつ個体の該治療レジメンに対する応答性を決定する方法、および、疾患を持つ個体を治療する方法を提供する。
【０１０９】
単なるメラノーマ、前立腺癌、および肺癌を超えて、ＡＬＣ勾配が患者応答の予測指標として有用であり得る疾患はまた、例えば、白血病（例えば、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性リンパ性白血病、およびフィラデルフィア染色体陽性急性リンパ性白血病（Ｐｈ＋ＡＬＬ））、扁平上皮癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、神経膠腫、胃腸癌、腎癌、卵巣癌、肝癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、腎癌、前立腺癌、甲状腺癌、神経芽細胞腫、膵臓癌、多形性膠芽腫、子宮頸癌、胃癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、大腸癌、および頭頸部癌、胃癌、胚細胞腫瘍、小児肉腫、副鼻腔のナチュラルキラー、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、肥満細胞症および肥満細胞症に伴う症状が含まれる。加えて、疾患には、色素性じんま疹、肥満細胞症(例えばびまん性皮膚肥満細胞症）、ヒトの孤立性肥満細胞腫、ならびにイヌ肥満細胞腫、および水疱性のようないくつかの希なサブタイプ、紅皮症性および末梢血管拡張（teleangiectatic）肥満細胞症、関連血液疾患（例えば骨髄増殖性症候群、骨髄異形成症候群、または急性白血病）を伴う肥満細胞症、肥満細胞症に関連する骨髄増殖性疾患、および肥満細胞白血病が含まれる。更なる様々な癌がまた、タンパク質チロシンキナーゼ関連疾患の範囲内に含まれ、例えば、下記のものが挙げられる：癌（例えば膀胱癌、乳癌、結腸癌、腎臓癌、肝臓癌、肺癌、卵巣癌、膵臓癌、胃癌、子宮頸癌、甲状腺癌、精巣癌（とりわけ精巣セミノーマ、および皮膚癌）；扁平上皮癌を含む；消化管間葉性腫瘍（「ＧＩＳＴ」）；リンパ系の造血器腫瘍（例えば、白血病、急性リンパ性白血病、急性リンパ性白血病、Ｂ細胞リンパ腫、Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ヘアリー細胞リンパ腫およびバーケットリンパ腫）；骨髄性細胞系の造血器腫瘍（例えば、急性および慢性骨髄性白血病および前骨髄球性白血病）；間葉オリジンの腫瘍（例えば、線維肉腫および横紋筋肉腫（rhabdomyoscarcoma））；他の腫瘍（例えば、メラノーマ、セミノーマ、テラトカルシノーマ（tetratocarcinoma）、神経芽細胞腫および神経膠腫）；中枢および末梢神経系の腫瘍（例えば、星状細胞腫、神経芽細胞腫、神経膠腫、およびシュワン腫）；間葉オリジンの腫瘍（例えば、線維肉腫、横紋筋肉腫（rhabdomyoscaroma）、および骨肉腫）；および他の腫瘍（例えば、メラノーマ、色素性乾皮症（xenoderma pigmentosum）、ケラトアカントーマ（keratoactanthoma）、セミノーマ、甲状腺濾胞癌、テラトカルシノーマ、化学療法難治性非セミノーマ（non-seminomatous）胚細胞腫瘍、およびカポジ肉腫）。特定の好ましい態様において、疾患は、白血病、乳癌、前立腺癌、肺癌、結腸癌、メラノーマ、または固形腫瘍である。特定の好ましい態様において、白血病は、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、Ｐｈ＋ＡＬＬ、ＡＭＬ、イマチニブ耐性ＣＭＬ、イマチニブ不耐症ＣＭＬ、加速化ＣＭＬ、リンパ性急性転化期ＣＭＬである。
【０１１０】
用語「癌」、「癌性」、または「悪性」とは、哺乳類または他の生物の無秩序な細胞増殖を通常特徴とする生理学的状態を意味または示す。癌の例には、例えば、固形腫瘍、メラノーマ、白血病、リンパ腫、芽細胞腫、カルシノーマおよび肉腫が挙げられる。上記癌のより特定した例には、慢性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、フィラデルフィア染色体陽性急性リンパ性白血病（Ｐｈ＋ＡＬＬ）、扁平上皮癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、神経膠腫、胃腸癌、腎癌、卵巣癌、肝癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、腎癌、前立腺癌、甲状腺癌、神経芽細胞腫、膵臓癌、多形性膠芽腫、子宮頸癌、胃癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、大腸癌、および頭頸部癌、胃癌、胚細胞腫瘍、小児肉腫、副鼻腔のナチュラルキラー、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、および慢性リンパ性白血病（ＣＭＬ）が挙げられる。
【０１１１】
「固形腫瘍」には、例えば、肉腫、メラノーマ、大腸癌、乳房癌、前立腺癌、または他の固形腫瘍癌が含まれる。
【０１１２】
「白血病」とは、造血臓器の進行性悪性疾患をいい、および、通常、血液および骨髄における白血球およびそれらの前駆体の歪んだ増殖および発生を特徴とする。白血病は下記（１）〜（３）に基づいて通常臨床的に分類される：（１）該疾患の継続時間および性質−急性または慢性；（２）関与する細胞のタイプ；骨髄性（骨髄性）、リンパ性（リンパ行性）、または単球性；および（３）血中異常細胞数の増加または非増加−−白血病性または非白血性（亜白血性）。白血病には、例えば、急性非リンパ球性白血病、慢性リンパ性白血病、急性顆粒球性白血病、慢性顆粒球白血病、急性前骨髄球性白血病、成人Ｔ細胞白血病、非白血性白血病、白血性（leukocythemic）白血病、バソフィリック（basophylic）白血病、芽細胞白血病、ウシ白血病、慢性骨髄性白血病、皮膚白血病、胎児性（embryonal）白血病、好酸球性白血病、グロス（Gross）白血病、ヘアリー細胞白血病、血球母細胞（hemoblastic）白血病、血球芽細胞（hemocytoblastic）白血病、組織球性白血病、幹細胞性白血病、急性単球性白血病、白血球減少白血病、リンパ性白血病、リンパ芽球性白血病、リンパ性白血病、リンパ向性白血病、リンパ性白血病、リンパ肉腫細胞白血病、肥満細胞白血病、巨核球性白血病、ミクロ骨髄芽球性白血病、単球性白血病、骨髄芽球性白血病、骨髄性白血病、骨髄性顆粒球白血病、骨髄単球性白血病、ネーゲリ白血病、形質細胞性白血病、形質細胞性白血病、前骨髄球性白血病、リーダー（Rieder）細胞白血病、シリング白血病、幹細胞性白血病、亜白血性白血病、および未分化細胞白血病が含まれる。特定の態様において、本発明は、慢性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、および／またはフィラデルフィア染色体陽性急性リンパ性白血病（Ｐｈ＋ＡＬＬ）のための治療を提供する。
【０１１３】
抗体
ＡＬＣ勾配は、共刺激経路ポリペプチド（例えばＣＴＬＡ−４、ＣＤ２８、ＣＤ８０、およびＣＤ８６）に特異的に結合することができる抗体に対する患者応答の予測指標として有用であり得る。用語「抗体」は、最も広い意味で使用され、および具体的には、モノクローナル抗体、ポリクローナル性抗体、ポリエピトープ特異性の抗体組成物、二重特異性抗体、二重特異性抗体、キメラ、一本鎖、およびヒト化抗体、ならびに抗体フラグメント（例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）2、およびＦｖ）が、それらが所望の生物学的活性を示す限り含まれる。生物学的アッセイに使用するために、抗体の検出に役立つよう、抗体を標識することができる（例えば、放射性同位元素標識、蛍光標識）。
【０１１４】
共刺激経路ポリペプチドに結合する抗体は、例えば、インタクトなポリペプチドまたは目的の小ペプチドを含有するフラグメントを使用して調製することができ、免疫抗原として使用するために、これらは組み換え的に調製することができる。動物を免疫化するために使用されるポリペプチドまたはオリゴペプチドは、ＲＮＡの翻訳から得られるか、または化学的に合成され得、そして、必要に応じて、キャリアタンパク質と結合され得る。通常使用されるペプチドと化学的に結合したキャリアには、例えば、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）、およびサイログロブリンが挙げられる。結合したペプチドを、次いで、動物（例えば、マウス、ラット、またはウサギ）を免疫化するために使用する。
【０１１５】
用語「抗原決定基」は、特定の抗体に接触する分子の部分（すなわちエピトープ）をいう。タンパク質またはタンパク質のフラグメントを、宿主動物を免疫化するために使用するとき、該タンパク質の多くの領域は、タンパク質の所定の領域または３次元構造に特異的に結合する抗体の産生を誘導することができ；これらの領域または構造の各々は抗原決定基と呼ばれる。抗原決定基は、インタクトな抗原（すなわち免疫応答を引き起こすために使用した免疫原）と、抗体との結合を巡って、競争しうる。
【０１１６】
語句「特異的に結合する」とは、他の生物製剤の不均一集団が存在するなか、標的の存在を決定する結合反応をいう。従って、指定されたアッセイ条件下、特定の結合領域が、優先的に特定の標的と結合し、かつ、試験サンプルに含まれる他の構成成分には、有意な量には結合しない。該条件下、標的との特異的な結合は、特定の標的に対するその特異性のために選択される結合部分を必要としうる。様々なアッセイ形式が、特定の被分析物と特異的に反応する結合領域を選択するために使用されうる。概して、特異的または選択的反応は、少なくともバックグラウンドシグナルまたはノイズの２倍、より典型的にはバックグラウンドの１０倍を超えるであろう。本発明の目的のために、化合物（例えば低分子）は、本明細書に記載の共刺激経路ポリペプチドに特異的に結合するそれらの能力が検討され得る。
【０１１７】
キット
上記に示されたまたは提案されている診断および治療的適用に使用するために、キットもまた本発明により提供される。該キットは、例えば、１またはそれ以上の容器手段（例えばバイアル、およびチューブ等）を厳重に閉じこめて受けいれるために区分化されている運搬手段（carrier means）を含むことができ、容器手段の各々は、該方法で使用される別々の要素の一つを含みうる。例えば、容器手段の１つは、患者サンプルについてリンパ球絶対数を行うための手段、および／または得られたＡＬＣ値を解釈するための説明を含みうる。容器手段の別の例には、医薬的に許容される量の共刺激経路モジュレーターをいれた１またはそれ以上のバイアルを含み得る。
【０１１８】
本発明のキットは、典型的には、上述の容器、および商業的および使用者の観点から望ましい構成物（例えばバッファー、希釈剤、フィルター、針、シリンジ、および使用説明の添付文書）を含む１またはそれ以上の他の容器を含みうる。ラベルは、該組成物が特定の療法または非治療的適用ために使用されることを示すために容器上にあっても良く、また、該ラベルは、例えば上述のようなインビボまたはインビトロ使用のいずれかの使用説明を示すことができる。
【０１１９】
本明細書に開示される治療的方法の実施に有用なキットはまた、共刺激経路を阻害することができる化合物を含み得る。具体的には、本発明は、抗ＣＴＬＡ−４抗体を単独で、または別の免疫療法剤（例えばPROVENGE（登録商標）；チューブリン安定化剤(例えばパシタソール（pacitaxol）、エポチロン、タキサン等)）；および／または第二の共刺激経路モジュレーター(例えばトレメリムマブ））と組み合わせて含む、キットを意図する。加えて、本発明は、共刺激経路モジュレーターの投与量および／または投薬頻度を増加したレジメン、ならびに、チューブリン安定化剤(例えばパシタソール（pacitaxol）、エポチロン、タキサン等)；および／または第二の共刺激経路モジュレーター(例えばトレメリムマブ）を含む他の組み合わせまたは投与レジメンを含むキットを意図する。
【０１２０】
加えて、キットは、本発明の方法を行うための説明（すなわちプロトコル）を含有する説明用の構成物を含み得る。説明用の構成物は概して、記載または印刷されたものを含むが、これらに限定されない。該説明を保存できおよびエンドユーザーにそれらを伝達することができるいずれの媒体も、本発明により意図される。該媒体には、これらに限定されないが、例えば、電子記憶装置媒体（例えば、磁気ディスク、テープ、カートリッジ、およびチップ等）、および光学媒体（例えば、ＣＤ  ＲＯＭ）などが挙げられる。該媒体には、上記説明用の構成物を提供するインターネットサイトのアドレスが含まれうる。
【０１２１】
キットはまた、例えば、個体から生物試料を入手するための手段を含み得る。生物試料を個体から入手するための手段は当該技術分野において良く知られており、例えば、カテーテル、およびシリンジ等があるが、本明細書においては詳細には論じない。
【０１２２】
本発明は本明細書に開示される態様の範囲には限定されず、それらは、個々の本発明の態様の１つの説明であると意図され、および、機能的に同等なものは本発明の範囲に含まれる。本明細書に記載されているものに加えて、本発明の様式および方法に対する様々な修正は、上述の説明および教示から当業者に明かとなるであろうし、また、同様に本発明の範囲内に含まれることが意図される。該修正または他の態様は、本発明の真の範囲および精神から逸脱することなく実施されうる。
【０１２３】
下記の代表的な実施例は、その様々な態様およびその同等物において本発明の実施に適用され得る重要な追加の情報、例示および助言を含む。これら実施例は、本発明を説明するのを助けることを意図し、および、その範囲を限定することを意図せず、また限定するよう解釈されるべきでない。
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【実施例】
【０１２４】
実施例１
３つのフェーズＩＩ試験に関し、リンパ球絶対数と共刺激経路阻害に対する有益な応答を関連付けるために使用された方法
試験
ＣＴＬＡ−４は、Ｔ細胞リンパ球の活性化の負の制御因子である。ＣＴＬＡ−４をブロックすることにより、イピリムマブは、抗腫瘍活性およびＴ細胞増殖の増大をもたらす、Ｔ細胞リンパ球を活性化する。メラノーマ患者の３つのフェーズＩＩ試験の間、ベースライン時と、イピリムマブの初回投与後の最初の１２週にわたって（誘導期間投薬（induction period dosing））、循環リンパ球（リンパ球絶対数、ＡＬＣ）を測定した。経時的なＡＬＣの変化（ＡＬＣ勾配）を測定した。イピリムマブは、１０ｍｇ／ｋｇでは、３または０．３ｍｇ／ｋｇを投与したときと比較して、より大きな平均増加率（勾配）を誘導し、循環リンパ球の用量依存的な増加を誘導した。ＡＬＣは、日常のおよび臨床的に受け入れられた血液細胞パラメターであり、癌専門医および研究室によって療法投与の前に測定される。本発明は、ＡＬＣ勾配を治療のレジメンに対する臨床的有益性を予測するファクターとして使用する、最初の適用であると考えられる。
【０１２５】
結果は、誘導（induction）投与期間にＡＬＣが低下した患者で、臨床的有益性を獲得した（他覚的反応または安定な疾患の持続により定義される）患者はいないということを示す。臨床的有益性を持った患者は、平均すると、臨床的有益性のない患者と比べて、ＡＬＣの経時的な増加の割合が高かった。従って、本発明者は、循環免疫細胞の経時的な変化（すなわちイピリムマブまたは他のリンパ球アクチベーターについてのＡＬＣ）が、臨床的有益性および生存が増加する可能性を予測するために使用されうることを提案する。ＡＬＣの経時的な変化の閾値割合は、臨床的有益性を獲得しそうな、または、獲得しそうにない患者を特定するために使用されうる。このようなバイオマーカーは、負のエンリッチメント（すなわち、該患者が有益な応答を獲得する可能性が低いことを理由に可能な治療休止を勧める）または正のエンリッチメント（すなわち、該患者が有益な応答を獲得する可能性が高いことを理由に治療継続を勧める）ために使用されうる。
【０１２６】
方法
３つのフェーズＩＩ臨床試験：ＣＡ１８４−００８（ＮＣＴ００２８９６２７）は、予め治療された患者の、イピリムマブ単剤療法の多施設、シングルアーム試験であり；ＣＡ１８４−０２２（ＮＣＴ００２８９６４０）は、予め治療された患者の、イピリムマブ単剤療法の複数回投与の、無作為、二重盲検、多施設、一定投与量試験であり；ＣＡ１８４−００７（ＮＣＴ００１３５４０８）は、予防的な経口ブデソニドと共にまたは無しに投与されたイピリムマブの安全性を比較する、未治療患者および予め治療された患者の、無作為、二重盲検、プラセボ対照試験である；に参加した、切除不能ステージＩＩＩまたはＩＶメラノーマの患者からデータを集めた。これらの臨床上の詳細についての全詳細は米国政府の臨床試験ウェブサイトで入手できる。全プロトコルは施設内治験審査委員会または医療機関内倫理委員会の承認を受け；全ての試験は、ヘルシンキ宣言および「the International Conference on Harmonization of Good Clinical Practice」の倫理原則に従って行われた。
【０１２７】
イピリムマブを、０．３、３、または１０ｍｇ／ｋｇにて、９０分間の外来、静脈内注入として、誘導期の間、３週間毎に、４回の別々の投与（１週、４週、７週、および１０週）として、投与した。１２週より前に、進行性疾患（ＰＤ）患者（修正された世界保健機関クライテリア（従来、ｍＷＨＯクライテリアと呼ばれる）に従って）は、それらが急激に臨床的悪化をしないという条件で、イピリムマブの投与を継続した。適格な患者は、２４週から始まる（維持期）、１２週間毎のイピリムマブの投与を継続できた。
【０１２８】
臨床試験におけるイピリムマブの抗腫瘍反応は、独立した審査委員会（ＩＲＣ）により、ｍＷＨＯクライテリアを用いて評価された。予定された最初の腫瘍評価は、１２週目であり、および、ＣＲまたはＰＲのいずれの評価も、応答クライテリアが初めて適合した後、少なくとも４週間で確認される予定とした。応答の評価可能な患者を、臨床的有益性の有無によって応答カテゴリーに分類した。ｍＷＨＯクライテリアに従って、応答カテゴリー（RESPONSE）を下記のように決定した：ＢＯＲＩＲＣ＝独立した審査委員会（ＩＲＣ）によって評価された最良総合効果；ＣＲ＝完全寛解（Complete Response）；ＰＲ＝部分寛解（Partial Response）；ＳＤ＝安定な疾患；および、ＰＤ＝進行性疾患。ＢＯＲＩＲＣがＣＲ、ＰＲ、ＳＤ、またはＰＤカテゴリーのいずれの値とも等しくないとき、応答＝「不明」。ＢＯＲＩＲＣがＣＲまたはＰＲと等しいとき、応答＝「有益性」。ＢＯＲＩＲＣがＰＤと等しいとき、応答＝「非有益性」。ＢＯＲＩＲＣがＳＤと等しいとき、応答は、下記クライテリアの１つに基づいて割り当てられる：
（ｉ）    ＳＤの終わりの試験日が不明であるとき、応答＝「不明」；
（ｉｉ）  ＳＤの終わりの試験日が＞＝１６８であるとき、応答＝「有益性」（すなわち、長期のＳＤ）；
（ｉｉｉ）ＳＤの終わりの試験日が＜１６８であり、およびＳＤ持続期間の検閲状況は不明であるとき、応答＝「不明」；
（ｉｖ）  ＳＤの終わりの試験日が＜１６８であり、およびＳＤ持続期間が検閲されなかったとき、応答＝「非有益性」；
（ｖ）ＳＤの終わりの試験日が＜１６８であり、およびＳＤ持続期間が検閲され、および死亡日は不明でなく、および死亡日＜１６８であるのとき、応答＝「非有益性」であり；
および
（ｖｉ）  ＳＤの終わりの試験日が＜１６８であり、およびＳＤ持続期間は検閲され、および死亡日は不明であるか、または＞＝１６８のとき、応答＝「不明」である。
【０１２９】
新規な免疫関連応答クライテリア（ｉｒＲＣ）もまた、抗腫瘍反応を評価するために使用され、それは臨床試験においてイピリムマブで認められた独特な抗腫瘍反応パターンを捕らえる（Hodi et al., J Clin Oncol 2008;26(19s):abstr 3008）。ｉｒＲＣは、ＩＲＣ測定（Wolchok et al., manuscript in preparation）に基づいて、測定可能な指標（ベースライン）病変と測定可能な新しい病変の最も大きな２つの垂直方向の直径の積（product）の合計として、総腫瘍量を決定する。従って、ｍＷＨＯクライテリアでは患者をＰＤと特徴づける得る、腫瘍量の初期増加および／または新しい病変の出現に関わらず、ｉｒＢＯＲの決定は、総腫瘍量の減少に基づく。
【０１３０】
ｉｒＲＣエンドポイントは、下記のように定義される：ベースラインから総腫瘍量１００％の減少、ｉｒＣＲ；ベースラインから総腫瘍量≧５０％の減少、ｉｒＰＲ；総腫瘍量≧２５％、５０％未満の減少、ｉｒＳＤ。存在する指標病変の大きさの減少を上回る新しい病変ができ、結果として総腫瘍量が≧２５％増加した患者は、ｉｒＰＤとみなされた。複合的有効性エンドポイントである免疫関連臨床活性（ｉｒＣＡ）を、イピリムマブの測定可能な総抗腫瘍活性（ｉｒＣＲ、ｉｒＰＲ、またはｉｒＳＤ）を示すために使用した。
【０１３１】
薬物動態解析のための血清サンプルを下記のスケジュールに従って採取した：試験１日目および４３日目の投与前；試験１日目および４３日目の注入９０分後；４５−４９日目の投与後３〜７日の間、および５２−５７日目投与後１０〜１５日の間。３つ全てのフェーズＩＩ試験において、Bristol-Myers Squibbによって開発された定量的酵素結合免疫吸着法を用いて、イピリムマブ血清濃度を測定した。イピリムマブの非コンパートメント血清薬物動態解析を、有効な薬物動態解析プログラム（KineticaTM Basic Version 4.02, InnaPhase Corporation, 2002）によって、血清濃度対時間データから導いた。
【０１３２】
日常的な安全性研究からの末梢ＡＬＣは、３つのフェーズＩＩ試験にわたり４８２名の患者から採取された。空間的指数関数患者内相関構造（spatial exponential within-patient correlation structure）（ユークリッド距離）、および所定の日のＡＬＣ測定の数に反比例する患者内変動で、ＲＥＭＬよる拡張線形モデル適合から、推定平均ＡＬＣを得た。固定効果（Fixed effect）は、投与（dose）、時間、および投与と時間の間の追加の相互作用であった。ＡＬＣの経時的な変化は、０ノット（knot at 0）：０前線形（linear before 0）およびキュービックアフター（cubic after）でのスプラインを用いてモデル化された。これは、最初の投与前の勾配が最初の投与後の勾配とはおそらく異なることを容認するものであった。
【０１３３】
２名の患者が、ここに示される全ての解析から排除された：一人の患者は最初の投与日が不明確であり、およびもう一人の患者は、ＡＬＣが経時的に極めて大きく増加した。
【０１３４】
モデリングの詳細は、図１、２、３、４、５および６の説明に概説される。
【０１３５】
ＣＲまたはＰＲのＢＯＲおよびｉｒＣＡに関する、曝露−応答（Ｅ−Ｒ）解析
進行性メラノーマ患者におけるイピリムマブ曝露を非線形混合効果コンパートメント薬動力学モデル（集団ＰＫモデル）によって特徴付けた。イピリムマブ血清濃度−時間データを線形、２コンパートメント、ゼロ次ＩＶ注入モデルにより、一次除去（first-order elimination）で、特徴付けた。
【０１３６】
Ｃｍｉｎssの個々の推定は、注入後２１日目（３週）の定常状態濃度と定義され、全てのＰＫパラメターのＭＡＰベイジアン推定を用いて定常状態観察の予測から得られた。Ｅ−Ｒ関係は、ｍＷＨＯクライテリアによるＣＲまたはＰＲのＩＲＣ決定ＢＯＲおよびｉｒＣＡに関して、特徴づけられた。後者はｉｒＲＣに由来する複合的有効性エンドポイントであり、ｉｒＣＡ応答者は、ｉｒＣＲ、ｉｒＰＲ、または遅い応答（腫瘍進行後のｉｒＣＲまたはｉｒＰＲまたはｉｒＳＤ）、または≧２５％の総腫瘍量の減少であるｉｒＳＤの最良総合ｉｒ−応答を達成した患者である。
【０１３７】
ＢＯＲおよびｉｒＣＡの両者に関するＥ−Ｒ関係を、イピリムマブＣｍｉｎssをＢＯＲまたはｉｒＣＡの可能性と関連づけるロジスティック回帰モデルにより特徴づけた。Ｅ−Ｒ関係の存在および関数形式（functional form）を、ベースモデルによって確立し、および下記の共変数（covariate）の影響を評価した：体重、年齢、性別、ＬＤＨ、ＥＣＯＧステータス、併用のブデソニド、転移期、ＨＬＡ．Ａ２*２０１遺伝子型、先行の免疫療法、先行のＩＬ−２療法、および先行の全身性抗癌療法。共変数それぞれの大きさおよび統計的有意性を、前含有および後除去方法（forward inclusion and backward elimination method）によって評価した。
【０１３８】
スクリーニング工程において、対数尤度比検定（log-likelihood ratio test）（ＬＲＴ）により０．０５水準で有意である共変数は、共変数モデルに含まれ、それは、後除去方法（backward elimination）により単純化され、ＬＲＴによる０．００１水準で有意である共変数は単に保持した（Dai et al., J. Clin. Pharmacol. 48, 1254-1269 (2008)）。モデル予測可能性の信頼区間をブートストラップ（ｎ＝５００）によって得、およびモデル評価を予測的チェック（predictive check）で行った。Ｅ−Ｒデータセットの各投与群について、ＢＯＲまたはｉｒＣＡを達成する患者の観測された割合を該割合の９０％予測区間と比較することによって、最終モデルを評価した。該９０％予測区間は最終のＥ−Ｒモデルでの５００シミュレーションによって得られた。ＬｉｎｕｘのＮＯＮＭＥＭコンピュータープログラム（Version VI, GloboMax, Hanover, MD）を用いて、全ての解析を行った。
【０１３９】
結果
試験ＣＡ１８４−００７、−００８、および−０２２にわたって合わされた患者について、１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブは、３．０ｍｇ／ｋｇまたは０．３ｍｇ／ｋｇと比較して、ＡＬＣのより大きな平均増加率を誘導した（図１および２、テーブル１）。０．３ｍｇ／ｋｇ群と１０ｍｇ／ｋｇ群の間の平均勾配の違いは、統計的に有意であった（図２に示される拡張線形スプラインモデル（extended linear spline model）からの時間−バイ−投与量の相互作用のテスト：ｔ＝２．１０、ｐ＝０．０３６；スプライン無しのキュービック時間効果（cubic time effect）での、拡張線形モデルからの同様のテストは、ｔ＝４．０９、ｐ＝４．４ｘ１０ｅ−５であった）。
【０１４０】
０．３ｍｇ／ｋｇ群および３ｍｇ／ｋｇ群の全患者は試験ＣＡ１８４−０２２からである。従って、投与量の増加に伴ってＡＬＣ勾配が増加する傾向は、投与量自体よりもむしろ、潜在的に該試験の間の未知の違いを反映する可能性があった。しかしながら、この傾向はまた、試験ＣＡ１８４−０２２のみの患者にも認められた（図３）。これは、併せた３つ試験について見られたＡＬＣ勾配とイピリムマブ投与量との間の関連性が試験の間の投与量の分布の違いからは生じないことを示唆し、先の可能性ある別の説明に反論する。
【０１４１】
抗腫瘍活性の主要エンドポイントは、修正されたＷＨＯ（ｍＷＨＯ）クライテリアを用いる臨床的有益性の定義に基づいた。負のＡＬＣ勾配−すなわち誘導投与期間にわたるＡＬＣの減少−を持つ患者で、臨床的有益性を獲得したものはいなかった（図４、テーブル１）。臨床的有益性を示した患者は、平均すると、臨床的有益性の無い患者と比べて、より高い経時的な増加率（勾配）を有した（図４、テーブル１）。１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを受けた患者に関する有益性群および非有益性群間の平均勾配における違いは、極めて統計的に有意であった（患者あたりの勾配推定のウェルチ修正２−サンプルｔ−テスト：ｔ＝３．５２、ｄｆ＝１１０、ｐ＝６ｘ１０ｅ−０４）。３ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを受けた患者に関する同様の違いは統計的に有意でなかった。
【０１４２】
ｉｒ応答は、イピリムマブの抗腫瘍活性の診査的測定であるが、まだ検証されていない。臨床的有益性に見られるように、ｉｒ応答を持つ患者は、平均すると、そうでない患者と比べて、高い経時的な増加率（勾配）を有した（図５、テーブル１）。１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブの投与を受けた患者についてのｉｒ応答カテゴリー間の平均勾配の違いは、極めて統計的に有意であった（患者あたりの勾配推定のウェルチ修正２−サンプルｔ−テスト：ｔ＝３．６９、ｄｆ＝１３８、ｐ＝３ｘ１０ｅ−０４）。３ｍｇ／ｋｇのイピリムマブを受けた患者についての同様の違いは、統計的に有意でなかった。負のＡＬＣ勾配−すなわち、誘導投与期間にわたるＡＬＣの減少−をもつ患者で、免疫関連応答（ｉｒ応答）を獲得した者は少ししかいなかった（７／８９）（図５、テーブル１）。これらの患者は、正の勾配を獲得したかもしれないし、または、まさに正の勾配を達成しようとしており、該解析は１２週間の間に限られていたため、該勾配の正の傾きは、認められなかったことが考えられる。より長い解析期間が、該患者が実際に正の勾配を獲得したかどうかを決定するために評価されるであろう。
【０１４３】
テーブル１
最初の投与日、最初の投与後の少なくとも１つのＡＬＣ値、および試験−２８日目から試験８４日目までの間の少なくとも２つのＡＬＣ値が分かっている全患者（ｎ＝４６２）に関する、誘導投与期間の、週ごとの患者あたりのリンパ球絶対数（ＡＬＣ）変化（勾配）の概要を提供する。
Ｎ＝群中の患者の数、
ＳＤ＝標準偏差、
トータル＝データセットにおける全患者、
有益性＝ＣＲまたはＰＲのＩＲＣ  ＢＯＲ、または、長期ＳＤ（最初の投与日から少なくとも２４週の持続期間）の患者；
非有益性＝ＰＤのＩＲＣ  ＢＯＲ、または非長期ＳＤの患者；
不明＝有益性または非有益性群に含まれない患者。
「トータル」を除く全ての群には、応答評価可能な患者のみが含まれる。
【表２】
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【０１４４】
実施例２  −  試験ＣＡ１８４−００４について、リンパ球絶対数を共刺激経路阻害に対する有益な応答と関連づけるために使用された方法
ＡＬＣ勾配とイピリムマブに対する患者応答との間の関係は、更なるフェーズＩＩ試験、ＣＡ１８４−００４においてさらに評価された。
【０１４５】
フェーズＩＩ臨床試験：ＣＡ１８４−００４に参加する切除不能ステージＩＩＩまたはＩＶメラノーマの患者からデータを集めた。ＣＡ１８４−００４（ＮＣＴ００２６１３６５）は、これまでに治療された患者における、無作為、二重盲検、多施設、イピリムマブ単剤療法の複数の投与の一定投与量試験であった。これらの臨床上の詳細の全ては、米国政府の臨床試験ウェブサイトから入手可能である。全プロトコルは、施設内治験審査委員会または医療機関内倫理委員会の承認を受け；全ての試験は、ヘルシンキ宣言および優良臨床試験基準協調国際会議（International Conference on Harmonization of Good Clinical Practice）の倫理原則に従って実施された。
【０１４６】
方法
用いた方法は、本明細書実施例１で概説した方法に従って行った。
【０１４７】
００４の結果および全体的に併合された試験結果
試験ＣＡ１８４−００４（ｎ＝６５）からの独自データの解析において、発明者は、ＡＬＣ勾配が臨床的有益性と関連することを確認した（図６）。全４つの試験にわたり、負のＡＬＣ勾配を持つ患者のパーセントは、０．３ｍｇ／ｋｇで５８％（３７／６４）［試験ＣＡ１８４−０２２］、３ｍｇ／ｋｇで２８％（２９／１０４）［試験ＣＡ１８４−０２２および−００４］、および１０ｍｇ／ｋｇで１９％（７１／３６５）［試験ＣＡ１８４−００７、−００８、−０２２、および−００４］であった。０．３ｍｇ／ｋｇ群および３ｍｇ／ｋｇ群において、負のＡＬＣ勾配を持つ患者の比較的高いパーセンテージは、イピリムマブ曝露が不十分であったことがおそらく原因であった。
【０１４８】
ＣＡ１８４−００４試験の解析について、得られた結果の概要を、テーブル２に示す。テーブル１および２に示される併せた結果の解析は、正のＡＬＣ勾配を持つ患者のパーセントの用量依存的な増加（１０ｍｇ／ｋｇ投与が好ましい）を示し、およびこの投与量で治療された９０％を超える患者が、ＣＴＬＡ−４の遮断のための規定された標的値より高いＣｍｉｎssを有したという観察と一致する。試験００７、００８、および０２２にわたって、臨床的有益性を持つ患者は、臨床的有益性のない患者と比べて、より大きな平均ＡＬＣ変化率（勾配）を有した（Ｐ＝０．００１３）。重要なことは、これらの３つの試験において、誘導投与期間にわたって負のＡＬＣ勾配を持つ患者で臨床的有益性を持つ者はいなかった。これらの関連性が、独立の試験、ＣＡ１８４−００４で確認された：有益性を持つ患者は、より大きな平均勾配を有し（Ｐ＝０．０００４２）、および負（わずかに）のＡＬＣ勾配を持つ患者の１名のみが、臨床的有益性を有した。ベースラインＡＬＣはいずれの解析でも臨床的有益性と関係なかった。
【０１４９】
結論
イピリムマブは、第二相臨床試験において、進行性メラノーマ患者に対し、抗腫瘍効果を示した（Hamid et al., J Clin Oncol 2008;26(19s):abstr 9025; O'Day et al., J Clin Oncol 2008;26(19s):abstr 9021）。ＢＯＲ率および全生存のエンドポイントで、試験ＣＡ１８４−０２２の結果は、イピリムマブ投与量（１０ｍｇ／ｋｇ）が最も高い有益性対リスク比を提供するという証拠を提供する（Hamid et al., J Clin Oncol 2008;26(19s):abstr 9025;）。この報告に示された母集団薬物動態学解析は、さらに、標的トラフ濃度に基づいて、１０ｍｇ／ｋｇが効果的なイピリムマブ投与量であることを確実にする。高いＣｍｉｎssでの応答イベントの数は少ないが、該曲線の形は、１０ｍｇ／ｋｇより高い投与量は、ＢＯＲの可能性における増分増加のみをもたらしうることを示唆する（図７を参照）。全体として、これらの結果は、フェーズＩＩＩ臨床試験の投与量として１０ｍｇ／ｋｇのイピリムマブの選択することを支持する。
【０１５０】
免疫活性化の末梢のバイオマーカーは測定し易いが、それらが、腫瘍内微小環境を代表し、それにより、イピリムマブまたは他の免疫治療剤での臨床的有益性を予測するために使用することができるかどうかは不明である。例えば、末梢の腫瘍抗原特異的ＣＤ８+Ｔ細胞の高い値は、メラノーマ患者における癌ワクチン接種後の抗腫瘍反応を予測しない（Rosenberg et al., J Immunol 2005;175:6169-76）。ベースラインでのより高いＡＬＣが非ホジキンリンパ腫における抗ＣＤ２０抗体（rituximab）療法からの有益性を予測するかどうかに関して矛盾した結果が報告されたが（Behl et al., Br J Haematol 2007;137:409-15,  Oki et al., Eur J Haematol 2008;81:448-53）、より高いＡＬＣは、病巣内免疫療法後の抗腫瘍反応を示した進行性メラノーマ患者に認められた（Ridolfi et al., Hepatogastroenterology 2002;49, 335-39）。末梢血ＡＬＣにおけるイピリムマブ誘導の変化が腫瘍内微小環境におけるＴ細胞の頻度の変化にどのように関係するかは、今回の研究の範囲を超える。
【０１５１】
末梢のバイオマーカーを患者が免疫療法から利益を得るかを予測するために使用することができるかどうかについては疑問視されていたが、我々の結果は、ＡＬＣの変化はメラノーマにおけるイピリムマブ臨床的活性と関係があるという証拠を提供する。進行性メラノーマ患者における３つの多国間第二相臨床試験のクロス試験解析（cross-study analysis）から、発明者は、下記：（ｉ）イピリムマブ曝露（例えば、Ｃｍｉｎ）が増加するのに従った、抗腫瘍反応の可能性の増加、および（ｉｉ）ＡＬＣの変化率とイピリムマブ（１０ｍｇ／ｋｇ）からの臨床的有益性との間の明かな（positive）な関連性を示した。薬物動態パラメターは、第４の試験、ＣＡ１８４−００４については評価されなかったが、ＡＬＣと臨床的有益性との間の関連性は確認された。
【０１５２】
我々の結果は、負のＡＬＣ勾配を持つ患者は臨床的有益性を獲得しそうにないことをさらに示す。従って、負のＡＬＣ勾配は、負のエンリッチメント（enrichment）のために、すなわち、イピリムマブ療法を継続しても有益性の見込めない患者を特定するために（そして治療は終えうる）、または、イピリムマブの高い投与量または他の療法とイピリムマブの組み合わせから利益を得うる患者を同定するために使用され得る。この結果は、進行癌の患者中の低いリンパ球数は、生存に関し負のファクターであることを示す別の研究（Vigano et al., Arch Intern Med 2000;160:861-68）と一致する。更なる研究は、ＡＬＣの変化とイピリムマブ治療した進行性メラノーマ患者の生存の間の関連性があるかどうかを決定するであろう。要約すれば、ＡＬＣは、ルーチンな安全性研究から導かれる測定であり、従って、イピリムマブによる治療プログラムに容易に組み込むことができ、および免疫治療剤のための予測バイオマーカーとして、さらに探索されるであろう。
【表３】
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【０１５３】
実施例３−患者中のリンパ球絶対数を測定する方法
当該技術分野において、リンパ球絶対数を測定するための多くの方法が知られている。１つの実施例を提供するが、これに限定されない。簡潔に言えば、患者血液サンプルを採取し、および１マイクロリットル当たりの白血球の総数を数える。白血球の総数からのリンパ球のパーセンテージを（血球計数器、フローサイトメトリー、または当該技術分野において知られた他の方法を用いて）決定し、白血球の総数を乗じると、リンパ球「絶対」数に達する。
【０１５４】
本発明の背景、詳細な説明、図面の簡単な説明、および実施例に記載される各文献（特許、特許出願、学術論文、概要、実験マニュアル、書籍、ＧＥＮＢＡＮＫ（登録商標）受け入れ番号、ＳＷＩＳＳ−ＰＲＯＴ（登録商標）受け入れ番号、または他の公開を含む）の開示内容の全ては、参照することにより、本願明細書に組み込まれる。さらに、本明細書と共に提出された配列表のハードコピーは、その対応するコンピューターに読み込み可能な形式に加えて、その全体は参照することにより、本明細書に組み込まれる。
【０１５５】
本発明の範囲は本明細書に開示される態様よって制限されることはなく、それらは本発明の個々の態様のそれぞれの説明であることを意図し、および機能的に同等であるいずれもが本発明の範囲に含まれる。本発明のモデルおよび方法に対する様々な改変は、本明細書に記載されるものに加えて、前述の説明および教示から当業者に明らかになるであろうし、それらは、同様に、本発明の範囲内に入ることを意図する。そのような改変または他の態様は、本発明の真の範囲および精神から逸脱することなく、実施されることができる。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【手続補正書】
【提出日】平成23年2月2日(2011.2.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
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【国際調査報告】
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