(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
流体媒質中に浮遊する希少細胞を光学的に分析する改良された方法であって、
ａ．癌を有することが疑われる患者からの血液サンプルを、上皮細胞の表面上のＥｐＣＡＭ抗原に特異的な抗体と結合した磁性流体粒子と混合することと、
ｂ．結合した磁性流体から未結合磁性流体を除去することと、
ｃ．前記未結合磁性流体が除去された前記血液サンプルを観察チャンバに移動することと、
ｄ．前記観察チャンバ内で時間遅延積分を用いて前記血液サンプル中の磁気応答成分を観察することと、
を含み、
前記成分が、前記チャンバの光学的に透明な面の内側表面上の画像観察表面および整列表面を有するＶ形溝を含む、予備成型された整列構造内にて均一に分布されており、
前記整列表面は、前記Ｖ形溝の傾斜表面であり、前記溝の頂部に前記観察表面が設けられていて、前記画像観察表面を介して前記磁気応答成分が観察される、方法。
【請求項２】
前記整列構造が、前記傾斜表面を前記観察表面に連結する対向表面をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記画像観察表面が８０μｍである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記未結合磁性流体の除去が、
ａ．磁性流体粒子を有する前記血液サンプルを、円錐管内にて９００ｒｐｍで回転させることと、
ｂ．前記サンプルを前記円錐管の底から吸引することと、
ｃ．工程（ａ）及び（ｂ）を５回繰り返すことと、
を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記観察が、ＣＴＣとしての結合上皮細胞を確認することを更に含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記確認が、
ａ．核にＤＡＰＩで陽性の第１標識を行うことと、
ｂ．細胞骨格にサイトケラチン−ＰＥで陽性の第２標識を行うことと、
ｃ．白血球にＣＤ４５−ＡＰＣで陽性の第３標識を行うことと、
を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
捕捉したＣＴＣの明視野検査を行うことを更に含む、請求項６に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願の相互参照）
本出願は、同時係属中の米国特許仮出願第６１／０５４，２１９号（２００８年５月１９日）に対して優先権及び利益を主張し、この出願は全体が参考として本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
本発明は、微細な生物試料の定性分析及び定量分析を行うための改良された装置及び方法に関する。より詳細には、本発明は、結合剤を有する磁気応答粒子と免疫特異的又は非特異的に結合して、流体媒質中で磁気標識種を生成しやすい微細な生物試料又は物質を単離、収集、固定化及び／又は分析するための装置及び方法に関する。本明細書で使用されるとき、「磁気標識試料」等の用語は、そのような磁気標識を受けやすい、研究上の関心対象であるそのような生物試料又は物質を指すものとする。
【０００３】
米国特許第５，９８５，１５３号には、収集チャンバ内に存在する磁気標識標的試料を外部磁気勾配によりチャンバの１つの表面に引き付け、内部磁気勾配によりそれらの試料をその表面上に精密に整列する装置及び方法が記載されている。磁気標識生物試料の収集表面への移動は、垂直磁気勾配を印可して、磁気標識生物試料を収集表面に移動させることにより行われる。収集表面には、例えば複数の強磁性ライン等の強磁性捕捉構造が設けられ、該構造は、サンプルチャンバの光学的に透明な（観察）面上に支持されている。
【０００４】
磁気標識生物試料が外部から印可された磁気勾配により表面に十分近接して引かれると、試料は強磁性収集構造により生成された強力な局部勾配の影響下に置かれ、横方向にて隣接する位置に固定化される。この局部勾配は、生物試料が表面に衝突した後に、生物試料を透明な表面に保持し得る接着力を上回ることが好ましい。あるいは、この表面の接着性は、水平方向の磁気力が磁気標識生物試料を強磁性構造に向かって移動させるように十分弱い必要がある。表面の滑らかさ、及び疎水性又は親水性の性質は、収集表面用に選択される材料、又は滑りやすい表面を得るためのこの表面の処理に影響を与え得る因子である。
【０００５】
米国特許第１０／７３３８２９号及び同第６，７９０，３６６号には、上述した外部から印可される勾配の原理を組み込み、更に透明収集壁上に高い内部勾配を有する磁気捕捉構造を組み込んだ流体サンプル中の生物学的物質を分離、固定化及び定量するための方法及び装置が記載されている。捕捉構造は、自動計数技術を用いた定量分析のために、捕捉した生物学的物質の均一な整列を促す。
【０００６】
米国特許第１１／４４７５６２号には、自動光学分析用に標識試料を整列させる、チャンバの光学的に透明な（観察）面の流体側上の小Ｖ形の溝が記載されている。チャンバの光学的に透明な（観察）面の流体側上の小Ｖ形の溝と、磁気標識試料の最適な希釈とにより、自動光学分析用の整列表面が提供される。磁気標識試料及び未結合磁気粒子は、外部から印可された磁気勾配の影響下、チャンバの観察面の内側表面に向かって移動する。磁気標識試料及び未結合磁気粒子が表面に接近する際、それらはＶ形溝の傾斜と接触し、該傾斜は磁気標識試料及び未結合磁気粒子を溝の頂部に強制的に移動させる。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
米国特許第１１／３４４７５７号には、検出可能に標識された希少標的細胞の自動収集及び画像分析のためのデバイス及び方法が記載されている。それらの磁気標識希少細胞はＣｅｌｌＴｒａｃｋｓプラットホーム内で時間遅延積分イメージング（Time Delay Integration Imaging）（ＴＤＩ）に供される。しかしながら、癌患者の血液中の循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）を評価して疾患活動性と相関付ける際、免疫磁気分離により残留された未結合磁気粒子が画像を歪め、ＣＴＣとして捕捉した標的の確認を妨げる。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明は、ＣｅｌｌＴｒａｃｋｓプラットホーム内でのＴＤＩを用いた標識希少細胞の分析において、未結合磁気粒子の完全な除去を可能にする小溝設計を提供する。
【図面の簡単な説明】
【０００９】
【図１】細胞整列構造の概略図。
【図２】滑らかな整列表面（すなわち、整合表面）及びイメージング表面を有する、走査型電子顕微鏡を使用したＰＤＭＳインプリントの写真。
【図３】厚さ１．０ｍｍの典型的なガラス顕微鏡スライドと比較した、厚さ１．３ｍｍのＰＤＭＳスラブ及び厚さ０．５ｍｍのＰＭＭＡスラブの透過スペクトル。
【図４】過剰な未結合磁気粒子の画像上の強度における影響を示す図。ＥｐＣＡＭ磁性流体レベルの上昇は画像強度の低下を招き、強度評価におけるばらつきが増大する。
【図５】４０μｇ／ｍｌの磁性流体の存在及び不在下での全強度における差異を示す図。磁性流体が存在する場合、分布が悪化する。
【図６】整列されたＳＫＢＲ−３細胞を示す、明視野、ＤＡＰＩ及びＰＥ画像の組み合わせ。
【発明を実施するための形態】
【００１０】
癌患者の血液中の循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）は、疾患活動性と相関することが公知である。ＣｅｌｌＴｒａｃｋｓプラットホームは、疑わしい標的細胞を計数し、疾患活動性と相関付ける磁気濃縮及び画像分析を提供する。細胞、細胞片及び細胞成分等の標的を容器の収集表面と接触させて収集し、その後の強磁性収集構造に隣接させる整列を行わない。これらの細胞は、白血球細胞、上皮起源の細胞、内皮細胞、真菌細胞及び細菌細胞を含む。収集表面は、外部磁石により生成される磁場勾配に直交して配向されている。得られる像は、チャンバ上の光学的に透明な面上に実質的に均質に分布するように収集された磁気ナノ粒子及び磁気標識生物試料を含む一方、選択されない実体は、流体媒質中にて下方に残留する。
【００１１】
ＣＴＣを迅速に検出し特徴付けるために、希少細胞分析においてＣｅｌｌＴｒａｃｋｓプラットホーム内に組み込んだ時間遅延積分（米国特許第１１／３４４７５７号）を用いる。標的希少細胞（ＣＴＣ）の免疫磁気分離法は、ＥｐＣＡＭの陽性の選択により達成される。ＥｐＣＡＭに特異的であり、かつ磁気ナノ粒子に共有結合したモノクローナル抗体により、上皮細胞接着分子（ＥｐＣＡＭ）に関する抗原を発現している循環細胞が選択される。この複合体が磁場に暴露された際に、残りの血液成分から分離される。
【００１２】
その後、捕捉された標的は、細胞内構成成分の一連の蛍光標識を介して分析される。蛍光染料ＤＡＰＩを使用して、ＣＴＣと、非特異的に選択された白血球との核を標識し、ＣＴＣの細胞骨格はサイトケラチン−ＰＥで標識され、白血球はＣＤ４５−ＡＰＣで標識される。標識細胞は、分析表面に沿って整列するよう磁気的に操作される。しかしながら、このシステムでは、免疫磁気分離により残留された未結合磁気粒子が画像の歪みを生じ、ＣＴＣの存在を確認する能力を低減させるであろう。
【００１３】
空間的にパターン化された標的試料の収集を提供して、微細な生物サンプルの定性及び定量分析を行うために、本発明は、イメージングチャンバの内側表面上に予備成型された構造を形成し及び使用することに関する。一般に、予備成型された溝は、イメージングチャンバの観察表面の内側部分内に予備成型された長いＶ形の溝である。これらの構造は、以前報告されたＮｉラインと同様の又はそれ以上に良好な細胞の整列を提供する。また、それらの構造は、細胞全体をイメージングするのに光学的に適した、高度に透明な材料から形成される。
【００１４】
図１は、本発明の溝を用いた細胞整列の原理を示す。チャンバ内で磁気的に誘導される細胞の移動は、磁気勾配の存在により生じる。ここで、磁気標識細胞は構造の傾斜表面（整列表面）と衝突して溝の頂部（指示したイメージング表面）内に滑落するか、又はイメージング表面の頂部に直接当たるであろう。いずれの状況においても、細胞は溝内に整列し、続くイメージングを可能にする。
【００１５】
溝の傾斜表面に沿った移動を十分にするために、表面は平坦であり、細胞の壁への付着が防止されなければならない。滑らかで精密な構造を達成するために、公知のウェハエッチング技術が用いられる。しかしながら、費用及び光学的要件により、シリコンウェハは適切ではなく、ポリジメチルシロキサン（ＰＤＭＳ）レプリカ成型がこれらの要件を満たす構成を提供する。本発明において、この基準を満たすであろう構成も考慮される。シリコンウェハ上にエッチングされた構造は、最終的な構造の逆であり、シリコン鋳型上に注がれた際、正確な形状を有するＰＤＭＳ鋳物が提供される。硬化後、この形状はイメージングチャンバのガラス表面を代替できる寸法に切断される。
【００１６】
エッチングは、チャンバの製造に使用できる光学的に透明な任意の材料に関して達成することができる。例として、精密加工の容易さ、微細な細部、及び容易に再現可能であることから、エッチングにシリコンウェハを使用してもよい。本発明では、同様の特性を有し、当技術分野で公知の任意の材料が考えられる。構造のエッチングには、２つの通常のエッチング技術を用いる。最初に、溝のエッチングに必要なエッチマスクを形成する。このマスクは、ＢＨＦ（緩衝フッ化水素酸）エッチングを用いて形成される。ＢＨＦエッチングが完了した後、溝がエッチングされるべきでないシリコンウェハ上の場所に、ＳｉＯ２の薄い層が残留する。溝のエッチングには、異方性エッチングも用いられる。ここでは、エッチャントとしてＫＯＨが使用される。このプロセスを適切に配向されたウェハに適用する場合、シリコンウェハの結晶面により制限されたＶ溝がエッチングされる。したがって、高度に再現可能な、一定のエッチ角度が生成される。角度は、図１に示す一実施形態では、７０．５度であるウェハの配向に依存する。他の技術は、深い反応性イオンエッチング（ＤＲＩＥ）である。この技術を用いることにより、高いアスペクト比（構造の長さと幅との比）を有する構造をエッチングすることができる。ＤＲＩＥはエッチング工程と堆積工程との間を周期的に交代して、帆立貝状の側壁を形成する。
【００１７】
ＰＤＭＳ成型により、加工ウェハ上に陽性のインプリントを得る。ＰＤＭＳ、即ちポリジメチルシロキサン（Ｄｏｗ  Ｃｏｒｎｉｎｇ（Ｓｙｌｇａｒｄ  １８４，Ｄｏｗ  Ｃｏｒｎｉｎｇ，Ｍｉｄｌａｎｄ，ＭＩ，ＵＳＡ）は、Ｓｉ（ケイ素）とＯ（酸素）との間にシロキサン結合を含むポリマーである。このポリマー分子は一緒に結合して、約５０〜１００の平均数を有する、より長いポリマーを形成する。
【００１８】
最終的なＰＤＭＳは、架橋剤を添加して得られる。架橋剤はポリマーと接続して、ポリマーの長いネットワークを形成し、透明な、弾性を有する、化学的に不活性かつ熱的に安定な材料を生じる。重合後、ＰＤＭＳは、接着する物質が殆ど存在しない、吸湿性でない透明な可撓性物質を形成し、かくしてＰＤＭＳが接着する物質は殆ど存在しない事実により、側部に対する細胞のいずれの付着も防止される。更に、ＰＤＭＳは熱的に安定であり、約３００〜９００ｎｍ透明である。これらの特性は全て、蛍光イメージングシステムにおけるその用途及び可視光の透過において重要である。形成後、溝をチャンバの観察面の寸法に切断する。
【００１９】
最小限の細胞損失で殆どの過剰な磁気粒子を除去するために、図１に示す観察面用の細胞整列構造を開発した。図１に、細胞整列構造の概観を提供する。図１に示すＰＤＭＳミクロ構造は、所定の領域内で細胞を整列させ、イメージング時間を短縮するよう開発された。この構造は、幅８０μｍ、長さ３０ｍｍの６つのチャネルを含む３０×２．７ｍｍ２のＰＤＭＳチップから構成されている。これらのＰＤＭＳチップは、ウェハ鋳型からインプリントされる。本発明者らは、ＰＤＭＳをその卓越した透過特性、再現能力、及び使用の容易さにより選択した。この形態は、サンプルのイメージング時間を３２分間から１２分間へと短縮する。
【００２０】
図２は、本発明で使用される構造を有するＰＤＭＳインプリントの走査型電子顕微鏡写真を示す。この写真は、観察表面上の滑らかな整列表面及びイメージング表面を示す。
【００２１】
図３は、本発明で使用されるＰＤＭＳの厚さの透過スペクトルを、典型的なガラス顕微鏡スライドと比較する。厚さ０．５ｍｍを有するＰＭＭＡは、波長４００ｎｍ〜８００ｎｍにおいてガラス顕微鏡スライドの透過率を追跡する。
【００２２】
最大のＣＴＣ回収を確実にするために、過剰な結合磁気粒子（ＥｐＣＡＭ−磁性流体）が使用される。しかしながら、イメージング中、過剰な磁性流体はイメージング表面上に細長い凝集体を形成し、これは細胞の定量及び定性イメージングに影響を与える。図４は、イメージングにおける過剰な未結合磁気粒子の影響を示す。総核強度は、磁性流体の濃度が２μｇ／ｍｌ（円形）を越えると急に落下する一方、ＣＶは、患者サンプル中に通常見出される濃度、例えば４０μｇ／ｍｌ（三角形）等において４０％に上昇する。
【００２３】
過剰な未結合磁気粒子のイメージングに対する影響と、除去方法の結果とを図５に示す。ＳＫＢＲ−３細胞は、磁性流体濃度４０μｇ／ｍｌ及び０μｇ／ｍｌにより画像化された。総強度の分布は、過剰な磁性流体を有するサンプルにおいて有意に悪化している。
【００２４】
本発明はこの問題を回避し、円錐管内でサンプルを９００ｒｐｍで回転させる方法を提供する。これは全細胞を管内で外方向に強制的に移動させる。磁性流体粒子は遙かに小さく（直径１７５ｎｍ以下）、サンプル中にランダムに分布したまま残留する。数分後、回転管の底から６０％のサンプルを自動的に吸引する。このプロセスを５回繰り返し、ＳＫＢＲ−３細胞は、本発明のＰＤＭＳ構造により観察表面に沿って整列した。図６は、観察表面に沿って整列した、捕捉されたＳＫＢＲ−３細胞の明視野、ＤＡＰＩ及びＰＥ画像の組み合わせを示す。
【００２５】
本発明の方法を用いて９５％〜９７％の過剰な磁性流体を除去して、患者サンプル中の最終濃度を２μｇ／ｍｌ未満まで低下させることができる。それにより、十分な過剰な磁性流体が除去されて、定量測定が最適化され、画質がかなり改善される。また、ＣＴＣの回収は９５％〜９９％と評価された（ranted）。したがって、本発明の方法による磁性流体除去は、最適な定量測定のために、過剰な磁性流体の十分な除去を提供する。画質が改善され、個々のＣＴＣの更なる形態学的データを得るための明視野イメージングが可能となる。
【００２６】
本発明の好ましい実施形態の特定のものは、上記の記述で具体的に例示されているが、本発明がこれらの実施形態に限定されることを意図するものではない。本発明の本質から逸脱することなく、さまざまな修正をこれに行うことが可能であり、この改良の全範囲が、下記の請求項に明確に記述されている。
【００２７】
〔実施の態様〕
（１）  流体媒質中に浮遊する希少細胞を光学的に分析する改良された方法であって、
ａ．癌を有することが疑われる患者から血液サンプルを獲得することと、
ｂ．前記血液サンプルを、上皮細胞の表面上のＥｐＣＡＭ抗原に特異的な抗体と結合した磁性流体粒子と混合することと、
ｃ．結合した磁性流体から未結合磁性流体を除去することと、
ｄ．観察チャンバ内で時間遅延積分を用いて前記血液サンプル中の磁気応答成分を観察することと、を含み、
前記成分が、前記チャンバの光学的に透明な面の内側表面上の観察表面に沿って、予備成型された整列構造内にて均一に分布されている、方法。
（２）  前記整列構造が壕形状の溝（foxhole-shaped grooves）である、実施態様１に記載の方法。
（３）  前記整列構造が、画像観察表面及び整列表面を有する溝を含む、実施態様１に記載の方法。
（４）  前記画像観察表面が８０μｍである、実施態様１に記載の方法。
（５）  前記未結合磁性流体の除去が、
ａ．磁性流体粒子を有する前記血液サンプルを、円錐管内にて９００ｒｐｍで回転させることと、
ｂ．前記サンプルを前記円錐管の底から吸引することと、
ｃ．工程（ａ）及び（ｂ）を５回繰り返すことと、
を含む、実施態様１に記載の方法。
（６）  前記観察が、ＣＴＣとしての結合上皮細胞を確認することを更に含む、実施態様１に記載の方法。
（７）  前記確認が、
ａ．核にＤＡＰＩで陽性の第１標識を行うことと、
ｂ．細胞骨格にサイトケラチン−ＰＥで陽性の第２標識を行うことと、
ｃ．白血球にＣＤ４５−ＡＰＣで陽性の第３標識を行うことと、
を含む、実施態様６に記載の方法。
（８）  捕捉したＣＴＣの明視野検査を行うことを更に含む、実施態様７に記載の方法。
【図１】
0005701749.tif 000002
【図２】
0005701749.tif 000003
【図３】
0005701749.tif 000004
【図４】
0005701749.tif 000005
【図５】
0005701749.tif 000006
【図６】
0005701749.tif 000007