(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
コレステロール恒常性を必要とする被験体におけるＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させる組成物であって、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を含む、前記組成物。
【請求項２】
被験体の肝臓における細胞内コレステロールの流出及び／又はＨＤＬの産生を増加させる組成物であって、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を含む、前記組成物。
【請求項３】
被験体の血液を循環するコレステロールの量を減少させる組成物であって、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を含む、前記組成物。
【請求項４】
配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項１、２又は３に記載の組成物。
【請求項５】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号３である、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号４である、請求項４に記載の組成物。
【請求項７】
配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、干渉ＲＮＡである、請求項１、２又は３に記載の組成物。
【請求項８】
干渉ＲＮＡは、ｓｈＲＮＡ又はｓｉＲＮＡである、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】
配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、アンタゴマーである、請求項１、２又は３に記載の組成物。
【請求項１０】
配列番号１と相補的である核酸配列は、配列番号１の転写後プロセシングを阻害する、請求項１、２又は３に記載の組成物。
【請求項１１】
配列番号２と相補的である核酸配列は、配列番号２の転写後プロセシングを阻害する、請求項１、２又は３に記載の組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願／特許
本出願は、代理人整理番号ＭＧＨ２００２３として２００９年３月３１日に出願した米国仮出願第６１／１６５，０４１号の利益を主張し、その内容は本明細書に参照として組み込まれている。
【０００２】
連邦支援研究下でなされた発明に対する権利の声明
本研究は、国立衛生研究所助成番号Ｒ０１ＧＭ７１４４９及びＲ２１ＤＫ０８４４５９により援助された。米国政府は本発明に一定の権利を有し得る。
【背景技術】
【０００３】
異常なコレステロール及び脂質ホメオスタシスは、メタボリックシンドローム、アテローム性動脈硬化症／心血管疾患、及び２型糖尿病などの蔓延している疾患と関連している。コレステロール及び脂質は、それらの脂肪性のカーゴを異なる細胞及び組織に運ぶ、低比重リポタンパク質（ＬＤＬ）及び高比重リポタンパク質（ＨＤＬ）などのリポタンパク質粒子として血液中で輸送される。過剰な循環ＬＤＬは、酸化され、動脈内のマクロファージにより取り込まれる可能性があり、それらのマクロファージは、動脈硬化性プラークの形成に関与するコレステロール／脂質に満ちた「泡沫細胞」に変化する。反対に、ＨＤＬ−コレステロールは、マクロファージを含む、末梢細胞から運び出され、コレステロールの逆輸送経路によって分解するために肝臓に輸送されるが、しかしながら、心臓疾患を患っている患者は、多くの場合、循環ＨＤＬが低く、コレステロールクリアランスが低下している。したがって、心血管疾患を寛解させるための治療努力は、コレステロール生合成及びＬＤＬ産生を低下させること（例えばスタチン治療による）、並びにＨＤＬを介したコレステロールの逆輸送を増加させること（例えばナイアシン添加による）に重点を置かれている。これらの治療はかなりの効果を示しているが、心血管疾患は、米国において主要な死亡原因のままである。コレステロール及び脂質調節の分子機構の詳細な理解により、心血管疾患を治療するための新規治療戦略の開発が促進する可能性がある。
【０００４】
ＡＴＰ結合カセット輸送体ＡＢＣＡ１は、ＨＤＬ合成及びマクロファージ／泡沫細胞を含む、末梢組織からのコレステロールの逆輸送に重要である。ＡＢＣＡ１遺伝子における変異／ＳＮＰがアテローム性動脈硬化に関係している。例えば、ＡＢＣＡ１レベル、ＨＤＬ産生及び／又はコレステロールの逆輸送を増加できる新規の治療は、調節を改善でき、心血管疾患を寛解させる可能性がある。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００５】
ステロール調節要素結合タンパク質（ＳＲＥＢＰ）転写因子は、コレステロール及び脂質の生合成及び取り込みの両方に関与する、公知の遺伝子調節因子である。現在、ヒトＳＲＥＢＰ−２及びヒトＳＲＥＢＰ−１遺伝子におけるイントロン配列内に埋め込まれている保存されたマイクロＲＮＡをコードする配列の存在は発見されている。本明細書の以下に記載している予備研究により、本明細書において配列番号１及び２としてそれぞれ示しているｍｉＲ−３３ａ及びｍｉＲ−３３ｂは、翻訳抑制のためにＡＴＰ結合カセット輸送体ＡＢＣＡ１を標的とするという驚くべき知見が得られた。哺乳動物におけるコレステロール恒常性の調節において、ｍｉＲ−３３とＳＲＥＢＰ宿主遺伝子産物との協調した役割は、今まで知られていなかった。更に、ｍｉＲ−３３の阻害が、ＡＢＣＡ１レベル、ＨＤＬ産生、及びコレステロールの逆輸送を増加させる新規の治療手段を表すことが、ここで発見された。
【０００６】
一態様において、本発明は、配列番号１又は２と相補的である単離された核酸配列を含む組成物であって、その核酸配列は、哺乳動物細胞におけるＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させるのに有効である、組成物を提供する。一部の実施形態において、組成物は、コレステロール恒常性を必要とするヒト被験体におけるＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させるのに有効な量で核酸を含む。
【０００７】
一部の実施形態において、配列は配列番号７又は９と相補的である。
【０００８】
一実施形態において、配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、限定されないが、本明細書に記載されるアンチセンスオリゴヌクレオチド、例えば配列番号３、４、６、又は８を含む、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり得る。一部の実施形態において、核酸は修飾され、例えば、１つ又は複数の天然に存在しないヌクレオシドを含有する。一部の実施形態において、核酸はロックされている。
【０００９】
別の実施形態において、配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、限定されないが、ｓｈＲＮＡ又はｓｉＲＮＡを含む、干渉ＲＮＡであり得る。
【００１０】
更に別の実施形態において、配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、アンタゴマー（antagomir）である。
【００１１】
更に別の実施形態において、配列番号１と相補的である核酸配列は、配列番号１の転写後プロセシングを阻害する。
【００１２】
更に別の実施形態において、配列番号２と相補的である核酸配列は、配列番号２の転写後プロセシングを阻害する。
【００１３】
別の態様において、本発明は、コレステロール恒常性を必要とするヒト被験体におけるＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させるのに有効な量で、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を発現できるベクターを含む組成物を提供する。
【００１４】
一実施形態において、ベクターは、プラスミドベクター又はウイルスベクターである。
【００１５】
更に別の態様において、本発明は、細胞、例えば、コレステロール恒常性を必要とする被験体の細胞におけるＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させる方法であって、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を細胞又は被験体に投与することによって、細胞又は被験体におけるＡＢＣＡ１タンパク質の発現を増加させることを含む、方法を提供する。
【００１６】
更に別の態様において、本発明は、被験体の肝臓における細胞内コレステロールの流出及び／又はＨＤＬの産生を増加させる方法であって、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を被験体に投与することによって、被験体の肝臓における細胞内コレステロールの流出及び／又はＨＤＬの産生を増加させることを含む、方法を提供する。
【００１７】
更に別の態様において、本発明は、被験体の血液を循環するコレステロールの量を減少させる方法であって、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を被験体に投与することによって、被験体の血液を循環するコレステロールの量を減少させることを含む、方法を提供する。
【００１８】
本発明の他の特徴及び利点は、詳細な説明、及び特許請求の範囲から明らかとなろう。したがって、本発明の他の態様は以下の開示に説明され、それらは本発明の範囲内である。
【００１９】
以下の詳細な図面は例として与えられ、記載される特定の実施形態に本発明を限定することを意図せず、本明細書に参照として組み込まれる添付の図面と併せて理解され得る。
【図面の簡単な説明】
【００２０】
【図１】ＳＲＥＢＰによって調節される遺伝子を示す。この図は、コレステロール、脂肪酸、及びトリグリセリドの合成経路における主要な代謝中間体を示す。インビボにおいて、ＳＲＥＢＰ−２は、コレステロール代謝の遺伝子を選択的に活性化するのに対して、ＳＲＥＢＰ−１ｃは、脂肪酸及びトリグリセリド代謝の遺伝子を選択的に活性化する。ＤＨＣＲ、７−デヒドロコレステロールレダクターゼ；ＦＰＰ、ファルネシル二リン酸；ＧＰＰ、ゲラニルゲラニルピロリン酸シンターゼ；ＣＹＰ５１、ラノステロール１４α−デメチラーゼ；Ｇ６ＰＤ、グルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ；ＰＧＤＨ、６−ホスホグルコン酸デヒドロゲナーゼ；ＧＰＡＴ、グリセロール−３−リン酸アシルトランスフェラーゼ。出典Ｈｏｒｔｏｎら，Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ．２００２．１０９：１１２５−３１。
【図２】ＣＢＰ／ｐ３００ヒストンアセチルトランスフェラーゼ及びＡＲＣ／メディエーター共活性化因子複合体のＡＲＣ１０５／ＭＥＤ１５サブユニットに存在する構造保存性のＫＩＸ領域（青色楕円形）と相互作用することによる標的遺伝子の転写のＳＲＥＢＰ活性化を示す。ＣＢＰ／ｐ３００の動員により、ヒストン／クロマチンの増加したアセチル化が生じるのに対して、ＡＲＣ／メディエーター相互作用により、その大きさサブユニットでＣ末端領域（ＣＴＤ）を経由するＲＮＡポリメラーゼＩＩ（Ｐｏｌ  ＩＩ）の動員が生じる。ＴＦＩＩＤ及び他の基本転写因子（ＧＴＦ）もまた、転写開始を促進する、プロモーターに動員される。
【図３】イントロンに位置するｍｉＲＮＡ（それぞれ、ｍｉＲ−３３ｂ及びｍｉＲ−３３ａ）をコードする配列を保有する、ヒトＳＲＥＢＰ−１及びＳＲＥＢＰ−２遺伝子を示す。特に、マウスのみが、マウスＳＲＥＢＰ−２遺伝子においてｍｉＲ−３３ａ  ｍｉＲＮＡを保有するのに対して、対応するマウスＳＲＥＢＰ−１イントロンはヒトＳＲＥＢＰ−１遺伝子との相同性を欠き、ｍｉＲＮＡコード配列を欠いている。
【図４】ｍｉＲＮＡプロセシング酵素のドローシャによって認識されるヘアピン構造を形成する一次ｍｉＲＮＡ転写産物（ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡ）の合成を生じる、ｍｉＲＮＡコード配列を介するＰｏｌ  ＩＩによる転写を示す。ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡは、ドローシャ（Ｄｒｏｓｈａ）によってｐｒｅ−ｍｉＲＮＡにプロセシングされ、次いで細胞質に送り出され、細胞質において、それらのｐｒｅ−ｍｉＲＮＡはダイサー（Ｄｉｃｅｒ）によって成熟ｍｉＲＮＡ二本鎖までのプロセシングを更に受ける。それらの成熟ｍｉＲＮＡ二本鎖はＲＩＳＣ複合体によって損傷を受けず、ｍＲＮＡ標的鎖がＲＩＳＣに組み込まれ、次いでそのｍＲＮＡ標的鎖は、ｍｉＲＮＡ−ｍＲＮＡ配列相補性に応じて翻訳抑制又はｍＲＮＡ分解のいずれかによってｍＲＮＡを標的とする。出典ｖａｎ  ｄｅｎ  Ｂｅｒｇら，Ｂｉｏｃｈｉｍ．ｅｔ  Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ  ２００８。
【図５】マクロファージ及びアテローム生成泡沫細胞などの末梢細胞からＡｐｏＡ−Ｉ及び高比重リポタンパク質（ＨＤＬ）に遊離コレステロールを送り出す、ＡＢＣ輸送体ＡＢＣＡ１（及び関連ＡＢＣＧ１）を示す。ＨＤＬは、肝細胞においてスカベンジャー受容体−Ｂ１（ＳＲ−Ｂ１）に結合し、それらの付随したコレステロール及びコレステロールエステル（ＣＥ）を肝臓に移す。コレステロールは、遊離コレステロールとして、又は胆汁塩に変換後のいずれかで胆汁に排出される。出典Ｍａｘｆｉｅｌｄ及びＴａｂａｓ．Ｎａｔｕｒｅ  ２００５．４３８：６１２−２１。
【図６】ｍｉＲ−３３及びその宿主遺伝子産物ＳＲＥＢＰによるコレステロール恒常性の協調した調節についてのモデルを示す。ｍｉＲ−３３は、その３’ＵＴＲを標的化することによりＡＢＣＡ１翻訳を抑制する。このステップは、コレステロール産生遺伝子（cholesterogenic gene）のトランス活性化を介するコレステロール生合成及び取り込みを活性化する、ＳＲＥＢＰの発現と協調するように提案される。コレステロール蓄積は、ＳＲＥＢＰ経路を阻害し、ＡＢＣＡ１の発現を活性化する。そのＡＢＣＡ１は、細胞膜へ移行し、ＡｐｏＡ−Ｉ及びＨＤＬへのコレステロール流出を媒介する。
【図７Ａ】ｍｉＲＮＡによるＡＢＣＡ１発現の調節を示す。図７Ａにおいて、３つの細胞株（Ｊ７７４マウスマクロファージ、ヒトＨｅｐＧ２肝細胞癌細胞、及び正常なヒトＩＭＲ−９０線維芽細胞）においてｓｉＲＮＡを用いるｍｉＲＮＡプロセシング酵素のドローシャ及びダイサーのＲＮＡｉに向けられたノックダウンにより、ＡＢＣＡ１タンパク質レベルの増加が生じた。タンパク質レベルはブラッドフォード分析により正規化した。β−チューブリンを負荷対照として使用した。
【図７Ｂ】ｍｉＲＮＡによるＡＢＣＡ１発現の調節を示す。図７Ｂにおいて、抗ｍｉＲ−３３アンチセンスオリゴヌクレオチドによるｍｉＲ−３３機能の拮抗により、ＡＢＣＡ１のより高い発現が生じることが示される。
【図７Ｃ】ｍｉＲＮＡ前駆体Ｐｒｅ−ｍｉＲ−３３でトランスフェクトした細胞によって模倣される、ｍｉＲ−３３の効果を示す。予想されるように、ＡＢＣＡ１発現は、増加したレベルのｍｉＲ−３３による翻訳抑制を介して阻害される。
【図８Ａ】ＨＥＫ２９３細胞におけるルシフェラーゼレポーター構築物によるＡＢＣＡ１  ３’−ＵＴＲにおけるｍｉＲ−３３についての予測標的部位の評価を示す。（Ａ）２つの潜在的標的部位が、ＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲ（配列番号５）の最初の１６０塩基内に存在するｍｉＲ−３３について予測される。ルシフェラーゼＯＲＦのＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲ下流の対応する配列（塩基１８〜２０５）の挿入により、ルシフェラーゼ活性の下方調節が生じる（右のグラフ）。
【図８Ｂ】ＨＥＫ２９３細胞におけるルシフェラーゼレポーター構築物によるＡＢＣＡ１  ３’−ＵＴＲにおけるｍｉＲ−３３についての予測標的部位の評価を示す。（Ｂ）（Ａ）において観察された下方調節は、３０ｎＭの濃度にて抗マイクロＲＮＡオリゴヌクレオチド（Ａｍｂｉｏｎ）Ａ３３ａ及びＡ３３ｂ（配列番号６及び８）を用いるｍｉＲ−３３ａ／ｂアイソフォーム（配列番号７及び９）の配列特異的喪失により遮断される（ＡＣ：陰性対照としての関係のない抗ｍｉＲ）。
【図８Ｃ】ＨＥＫ２９３細胞におけるルシフェラーゼレポーター構築物によるＡＢＣＡ１  ３’−ＵＴＲにおけるｍｉＲ−３３についての予測標的部位の評価を示す。（Ｃ）変異したｍｉＲ−３３前駆体（３０ｎＭにおけるｍ３３ａ（配列番号１０）及びｍ３３ｂ（配列番号１１））ではなく、過剰な外因性野生型ｍｉＲ−３３前駆体（３０ｎＭにおける３３ａ及び３３ｂ）の添加は、予想されるようにルシフェラーゼ活性を更に阻害した。
【図９Ａ】コレステロール及びＳＲＥＢＰ／ｍｉＲ−３３による相互調節を示す。Ｊ７７４マウスマクロファージにおけるコレステロールのロバスタチン及びβ−シクロデキストリンを介する喪失により、（Ａ）ＳＲＥＢＰ−２の増加した発現が生じる。エラーバーはｓ．ｄを表す。＊＊はｐ＜０．０１を示す。
【図９Ｂ】コレステロール及びＳＲＥＢＰ／ｍｉＲ−３３による相互調節を示す。Ｊ７７４マウスマクロファージにおけるコレステロールのロバスタチン及びβ−シクロデキストリンを介する喪失により、（Ｂ）ｍｉＲ−３３ａの増加した発現が生じる。エラーバーはｓ．ｄを表す。＊＊はｐ＜０．０１を示す。
【図９Ｃ】コレステロール及びＳＲＥＢＰ／ｍｉＲ−３３による相互調節を示す。Ｊ７７４マウスマクロファージにおけるコレステロールのロバスタチン及びβ−シクロデキストリンを介する喪失により、（Ｃ）ＡＢＣＡ１タンパク質レベルの減少が生じる。
【図９Ｄ】コレステロール及びＳＲＥＢＰ／ｍｉＲ−３３による相互調節を示す。（Ｄ）コレステロールが喪失したＪ７７４マウスマクロファージは、偽トランスフェクション（ＵＴ）又はアンチセンス対照（ＡＣ）オリゴヌクレオチドと比較して、ｍｉＲ−３３ｂアンチセンスオリゴヌクレオチドでのトランスフェクションに応答してＡＢＣＡ１タンパク質の上方調節を示す。β−チューブリンは、この免疫ブロット法において負荷対照としての機能を果たした。
【図９Ｅ】コレステロール及びＳＲＥＢＰ／ｍｉＲ−３３による相互調節を示す。（Ｅ）ｍｉＲ−３３ａ前駆体を有する血清／コレステロールの存在下で培養したＪ７７４マクロファージのトランスフェクションにより、前駆体対照（ＰＣ）と比較して、減少したレベルのＡＢＣＡ１が生じた。
【図９Ｆ】コレステロール及びＳＲＥＢＰ／ｍｉＲ−３３による相互調節を示す。（Ｆ）放射性標識したコレステロールを負荷したＪ７７５マクロファージへのｍｉＲ−３３ａアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ａ）の導入により、増加したコレステロール流出が生じるのに対して、ｍｉＲ−３３ａ前駆体（Ｐ）は、トランスフェクション対照（ＵＴ）又はスクランブルアンチセンス対照（ＡＣ）又は前駆体対照（ＰＣ）オリゴヌクレオチドと比較して、コレステロール流出を阻害する。エラーバーはｓ．ｄを表す。＊＊はＰ＜０．０１を示す。
【図１０Ａ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。（Ａ）マウスｍｉＲ−３３ａに対して向けられるロックド核酸（ＬＮＡ）−アンチセンスオリゴヌクレオチドを有する西洋型食餌を与えたマウスの尾静脈注射により、ビヒクル（ＰＢＳ）及びスクランブルＬＮＡ対照（ＬＣ）オリゴヌクレオチドと比較して、増大した総血清コレステロールが生じる。
【図１０Ｂ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。（Ｂ）ＬＮＡ−ｍｉＲ−３３ａアンチセンス（ＬＮＡ）及びＬＮＡ（対照）（ＬＣ）で処置した西洋型食餌を与えた５匹のマウス由来のプールされた血清のＦＰＬＣ分析により、ｍｉＲ−３３ａアンチセンスで処置した動物においてＨＤＬ−コレステロールピークの大きさの増加が明らかにされた。リポタンパク質標準物の溶出は標識により示される。
【図１０Ｃ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。血漿トリグリセリド（Ｃ）は処置に影響を与えなかった。
【図１０Ｄ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。グルコース（Ｄ）は処置に影響を与えなかった。
【図１０Ｅ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。ＡＳＴ（Ｅ）は処置に影響を与えなかった。
【図１０Ｆ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。ＡＬＴは処置に影響を与えなかった。
【図１０Ｇ】インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＨＤＬの調節を示す。（Ｇ）は、ｍｉＲ−３３及びその宿主遺伝子産物ＳＲＥＢＰによるコレステロール恒常性の協調した調節についてのモデルを表す。
【図１１Ａ】ヒト及びマウス組織におけるＳＲＥＢＰの同時発現を示す。ヒトＳＲＥＢＰ−１（Ａ；配列番号１２）遺伝子は、関連するイントロンｍｉＲＮＡ（ｍｉＲ−３３ｂ）を保有する。ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡをコードする配列を、成熟ｍｉＲＮＡ配列に下線を引いて示す。
【図１１Ｂ】ヒト及びマウス組織におけるＳＲＥＢＰの同時発現を示す。ヒトＳＲＥＢＰ−２（Ｂ；配列番号１３）遺伝子は、関連するイントロンｍｉＲＮＡ（ｍｉＲ−３３ａ）を保有する。ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡをコードする配列を、成熟ｍｉＲＮＡ配列に下線を引いて示す。
【図１１Ｃ】ヒト及びマウス組織におけるＳＲＥＢＰの同時発現を示す。選択されたヒト及びマウス組織におけるｍｉＲ−３３ａ／ｂ及びＳＲＥＢＰ宿主遺伝子の発現の相関関係：（Ｃ）ｈＳＲＥＢＰ−１／−ｈｓａ−ｍｉＲ−３３ｂ。エラーバーはｓ．ｅ．ｍを表す。
【図１１Ｄ】ヒト及びマウス組織におけるＳＲＥＢＰの同時発現を示す。選択されたヒト及びマウス組織におけるｍｉＲ−３３ａ／ｂ及びＳＲＥＢＰ宿主遺伝子の発現の相関関係：（Ｄ）ｈＳＲＥＢＰ−２／ｈｓａ−ｍｉＲ−３３ａ。エラーバーはｓ．ｅ．ｍを表す。
【図１１Ｅ】ヒト及びマウス組織におけるＳＲＥＢＰの同時発現を示す。選択されたヒト及びマウス組織におけるｍｉＲ−３３ａ／ｂ及びＳＲＥＢＰ宿主遺伝子の発現の相関関係：（Ｅ）ｍＳＲＥＢＰ−１／ｍｍｕ−ｍｉＲ−３３ｂ。エラーバーはｓ．ｅ．ｍを表す。
【図１２Ａ】選択された種におけるｍｉＲ−３３ａ（Ａ）アイソフォーム（ヒトにおけるｍｉｒ−３３ａ、配列番号１４；マウスにおけるｍｉｒ−３３ａ、配列番号１５；ニワトリにおけるｍｉｒ−３３ａ、配列番号１６；推測上カエルにおけるｍｉｒ−３３ａ、配列番号１７、及びショウジョウバエにおけるｍｉｒ−３３ａ、配列番号１８）の配列及びゲノム構成を示す。ｍｉＲＮＡステムループを示し、それらが存在するＳＲＥＢＰ遺伝子に従って分類する。アスタリスクは完全に保存された残基の位置を表す。
【図１２Ｂ】選択された種におけるｍｉＲ−３３ｂ（Ｂ）アイソフォーム（ヒトにおけるｍｉｒ−３３ｂ、配列番号１９、マウスにおけるｍｉｒ−３３ｂ、配列番号２０）の配列及びゲノム構成を示す。ｍｉＲＮＡステムループを示し、それらが存在するＳＲＥＢＰ遺伝子に従って分類する。アスタリスクは完全に保存された残基の位置を表す。
【図１３Ａ】ヒト組織におけるＳＲＥＢＰ−１の相対的発現を示す。β−アクチンを組織間の発現を正規化するために使用した。各組織から使用した全ＲＮＡは、男性及び女性の患者を含む少なくとも３体のドナーからプールした。
【図１３Ｂ】ヒト組織におけるｈｓａ−ｍｉＲ−３３ｂの相対的発現を示す。Ｕ６を組織間の発現を正規化するために使用した。各組織から使用した全ＲＮＡは、男性及び女性の患者を含む少なくとも３体のドナーからプールした。
【図１４Ａ】ヒト組織におけるＳＲＥＢＰ−２の相対的発現を示す。β−アクチンを組織間の発現を正規化するために使用した。低い相対的発現を有する組織をグラフの左側において比較し、高い相対的発現を有する組織をグラフの右側において比較する。各組織から使用した全ＲＮＡは、男性及び女性の患者を含む少なくとも３体のドナーからプールした。
【図１４Ｂ】ヒト組織におけるｈｓａ−ｍｉＲ−３３ａの相対的発現を示す。Ｕ６を組織間の発現を正規化するために使用した。低い相対的発現を有する組織をグラフの左側において比較し、高い相対的発現を有する組織をグラフの右側において比較する。各組織から使用した全ＲＮＡは、男性及び女性の患者を含む少なくとも３体のドナーからプールした。
【図１５Ａ】マウス組織におけるＳＲＥＢＰ−２の相対的発現を示す。β−アクチンを組織間の発現を正規化するために使用した。
【図１５Ｂ】マウス組織におけるｍｍｕ−ｍｉＲ−３３ａの相対的発現を示す。Ｕ６を組織間の発現を正規化するために使用した。
【図１６】ヒトＮＰＣ１  ３’ＵＴＲにおいて予測されるｍｉＲＮＡ標的部位を示す（ＴａｒｇｅｔＳｃａｎ  ４．２）。ｍｉＲ−３３標的部位は矢印によって示される。
【図１７】配列番号１及び２として、それぞれ、ｍｉＲ−３３ａ及びｍｉｒ−３３ｂを示す。また、配列番号３及び４として、それぞれ、抗ｍｉＲ−３３ａ及び抗ｍｉＲ−３３ｂを示す。
【発明を実施するための形態】
【００２１】
定義
他に定義されない限り、本明細書に使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野における当業者によって一般的に理解されているものと同じ意味を有する。矛盾する場合には、定義を含む本出願が適用される。
【００２２】
本明細書で言及する場合、「相補的核酸配列」は、相補的ヌクレオチド塩基対からなる別の核酸配列とハイブリダイズできる核酸配列である。「ハイブリダイズする」とは、ストリンジェンシーの適切な条件下で、相補的ヌクレオチド塩基間で二本鎖分子を形成する対を意味する（例えば、ＤＮＡにおいて、アデニン（Ａ）はチミン（Ｔ）と塩基対を形成し、同様にグアニン（Ｇ）はシトシン（Ｃ）と塩基対を形成する）（例えば、Ｗａｈｌ，Ｇ．Ｍ．及びＳ．Ｌ．Ｂｅｒｇｅｒ（１９８７）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５２：３９９；Ｋｉｍｍｅｌ，Ａ．Ｒ．（１９８７）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５２：５０７を参照のこと）。
【００２３】
本明細書で使用する場合、「アンチセンスオリゴヌクレオチド」とは、マイクロＲＮＡの配列などのＤＮＡ又はｍＲＮＡ配列と相補的である合成核酸配列をいう。
【００２４】
「ＲＮＡ」は、少なくとも１つ又は複数のリボヌクレオチド残基を含む分子である。「リボヌクレオチド」は、ベータ−Ｄ−リボフラノース部分の２’位にヒドロキシル基を有するヌクレオチドである。本明細書で使用する場合、用語ＲＮＡは、二本鎖ＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、部分的に精製されたＲＮＡなどの単離されたＲＮＡ、実質的に純粋なＲＮＡ、合成ＲＮＡ、組換えで生成されたＲＮＡ、並びに１つ若しくは複数のヌクレオチドの付加、欠失、置換及び／又は変更によって天然に存在するＲＮＡとは異なった改変ＲＮＡを含む。ＲＮＡ分子のヌクレオチドはまた、天然に存在しないヌクレオチド又は化学的に合成されたヌクレオチド若しくはデオキシヌクレオチドなどの非標準的ヌクレオチドを含んでもよい。
【００２５】
「マイクロＲＮＡ」（ｍｉＲＮＡ）は、典型的に、遺伝子発現を調節する、長さが約２１〜２３ヌクレオチドの一本鎖ＲＮＡ分子をいう。ｍｉＲＮＡは遺伝子によってコードされ、その遺伝子のＤＮＡからｍｉＲＮＡは転写されるが、ｍｉＲＮＡはタンパク質に翻訳されず、代わりに、各々の一次転写産物は短いステムループ構造にプロセシングされ、その後、機能的ｍｉＲＮＡへの更なるプロセシングを受ける。成熟ｍｉＲＮＡ分子は、１つ又は複数のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）分子と部分的に相補的であり、それらの主な機能は遺伝子発現を下方調節することである。
【００２６】
本明細書で使用する場合、「干渉ＲＮＡ」とは、直接又は間接（すなわち変換の際に）のいずれかで、ＲＮＡ干渉を介することによって遺伝子発現を阻害又は下方調節できる、任意の二本鎖又は一本鎖ＲＮＡ配列をいう。干渉ＲＮＡには、限定されないが、低分子干渉ＲＮＡ（「ｓｉＲＮＡ」）及び低分子ヘアピン型ＲＮＡ（「ｓｈＲＮＡ」）が含まれる。「ＲＮＡ干渉」とは、配列適合性のメッセンジャーＲＮＡ転写産物の選択的分解をいう。
【００２７】
本明細書で使用する場合、「ｓｈＲＮＡ」（低分子ヘアピン型ＲＮＡ）とは、アンチセンス領域、ループ部分及びセンス領域を含むＲＮＡ分子であって、そのセンス領域が、二重ステムを形成するためにアンチセンス領域と塩基対合する相補的ヌクレオチドを有する、ＲＮＡ分子をいう。転写後プロセシング後、低分子ヘアピン型ＲＮＡは、ＲＮａｓｅ  ＩＩＩファミリーのメンバーである、酵素のダイサーを介して行われる切断事象によって低分子干渉ＲＮＡに変換される。
【００２８】
本明細書で使用する場合、「低分子干渉ＲＮＡ」又は「ｓｉＲＮＡ」とは、配列特異的にＲＮＡ干渉を介することによって遺伝子発現を阻害又は下方調節できる、任意の低分子ＲＮＡ分子をいう。低分子ＲＮＡは、例えば、約１８〜２１ヌクレオチド長であり得る。
【００２９】
本明細書で使用する場合、「アンタゴマー」とは、切断を阻害するために切断部位又は１つ若しくは複数の塩基修飾部位のいずれかに誤対合を有する、特定のマイクロＲＮＡ標的と相補性を有する低分子合成ＲＮＡをいう。
【００３０】
本明細書で使用する場合、「転写後プロセシング」という語句は、転写後に起こり、例えば、酵素のダイサー及び／又はドローシャを介して行われる、ｍＲＮＡプロセシングをいう。
【００３１】
本明細書で使用する場合、「ＡＢＣＡ１」という用語は、例えば、Ｒｅｍａｌｅｙ，Ａ．Ｔ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９６：１２６８５−１２６９０，１９９９に記載されている、ＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、タンパク質輸送体をいう。
【００３２】
本明細書で使用する場合、「ＡＢＣＡ１タンパク質発現の増加」とは、本明細書に記載される方法による治療の前の被験体におけるＡＢＣＡ１タンパク質の量より少なくとも約１倍以上（例えば１、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１０００、１０，０００倍又はそれ以上）のＡＢＣＡ１タンパク質の量をいう。被験体におけるＡＢＣＡ１タンパク質発現の量をいう場合、「増加」とは、また、本明細書に記載される方法による治療の前の被験体におけるＡＢＣＡ１タンパク質の量より少なくとも約５％以上（例えば５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、９９又は１００％）であることを意味する。タンパク質量は、当該技術分野において公知の方法によって測定できる。
【００３３】
「有効量」とは、未治療の患者に対して疾患の症状を寛解させるのに必要とされる薬剤又は薬剤を含む組成物の量を意味する。疾患の治療的処置のために本発明を実施するのに使用される組成物（複数可）の有効量は、投与様式、被験体の年齢、体重、及び全体的な健康に応じて変わる。最終的に、主治医又は獣医が、適した量及び投薬レジメンを決定するだろう。かかる量を「有効」量」という。
【００３４】
本明細書で使用する場合、「コレステロール恒常性」とは、コレステロール取り込み、コレステロール生合成、胆汁酸へのコレステロールの変換及び胆汁酸の排泄のような、健康レベルの血中のＬＤＬ、ＨＤＬ及びコレステロール（例えば、本明細書においてかかる健康レベルは「参照基準」ともいわれる）を有する被験体において起こるプロセスの調節をいう。したがって、コレステロール恒常性を必要とする被験体は、健康レベルの血中のＬＤＬ、ＨＤＬ及び／又はコレステロールへの回復を生じる、改善された調節を必要とする。
【００３５】
「被験体」は、ヒト、家庭用家畜及び飼育場用家畜、並びに動物園の動物、スポーツ用の動物又はペット用の動物、例えばマウス、ウサギ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウシ及び高等霊長類を含む、哺乳網の任意のメンバーを含む、脊椎動物である。
【００３６】
本明細書で使用する場合、「ベクター」又は「発現ベクター」は、所望の調節配列及び遺伝子を含む、核酸ベースの送達ビヒクルであり、その内容物を細胞に移動させるために使用され得る。
【００３７】
本明細書の開示において、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」、「含んでいる（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含有している」及び「有している」などは、米国特許法でみなされている意味を有することができ、「包含する（ｉｎｃｌｕｄｅ）」、「包含している（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」などを意味することができ、同様に「から実質的になる」又は「実質的になる」は、米国特許法でみなされている意味を有していて、この用語には制約がなく、列挙されている基本的又は新規な特徴が、列挙されているものよりも多くの存在によって変えられない限り、列挙されているものより多くのものの存在を許容しているが、先行技術の実施形態は除外する。
【００３８】
本開示全体にわたって状況に応じて、他の定義が現れる。
【００３９】
本発明の組成物及び方法
マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）は、哺乳動物を含む、種々の生物に存在し、進化において保存されている低分子（例えば、１８〜２４ヌクレオチド）の非コードＲＮＡのクラスである。ｍｉＲＮＡは、ＲＮＡｓｅ  ＩＩＩ酵素のドローシャ及びダイサーによる配列切断を介する一次転写産物に由来する約７０ヌクレオチドのヘアピン前駆体からプロセシングされる。多くのマイクロＲＮＡは、プレｍＲＮＡのイントロン内又はｎｃＲＮＡ遺伝子内に受け入れられる、遺伝子間領域においてコードされ得る。多くのｍｉＲＮＡはまた、クラスター化され、ポリシストロンとして転写される傾向があり、多くの場合、類似した時空間的発現パターンを有する。ｍｉＲＮＡは、発生のタイミング、分化、アポトーシス、細胞増殖、臓器発生、及び代謝を含む、種々の生物学的プロセスにおいて役割を有することが見出されている。
【００４０】
本明細書において配列番号１及び２とそれぞれ称する、マイクロＲＮＡ−３３ａ及びマイクロＲＮＡ−３３ｂ（ｍｉＲ−３３ａ及びｍｉＲ−３３ｂ）は、翻訳抑制のためにＡＴＰ結合カセット輸送体ＡＢＣＡ１を標的とする。したがって、ｍｉＲ−３３の阻害は、ＡＢＣＡ１レベル、ＨＤＬ産生、及びコレステロールの逆輸送を増加させるための新規の治療手段を表す。
【００４１】
本発明の組成物及び方法は、コレステロール恒常性を必要とする被験体においてｍｉＲ−３３ａ及び／又はｍｉＲ−３３ｂを阻害するように設計される。一態様において、本発明は、コレステロール恒常性を必要とするヒト被験体におけるＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させるのに有効な量で、配列番号１又は２と相補的である核酸配列を含む組成物を提供する。これは、例えば、限定されないが、配列番号３又は配列番号４のアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、ｍｉＲ−３３ａ又はｍｉＲ−３３ｂと相補的であるアンチセンスオリゴヌクレオチドを投与することによって達成され得る。本発明の方法を実施するのに使用するため、及びｍｉＲ−３３ａ又はｍｉＲ−３３ｂと相補的である、他の核酸配列は、限定されないが、ｓｈＲＮＡ若しくはｓｉＲＮＡを含む干渉ＲＮＡ、又はアンタゴマーなどのｍｉＲ−３３ａ又はｍｉＲ−３３ｂの転写後プロセシングを阻害するものであり得る。
【００４２】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、通常、標的に結合し、転写、翻訳、又はスプライシングのレベルで発現を停止することによってＤＮＡ又はＲＮＡ標的の発現を遮断するように設計される。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ストリンジェントな条件下で、ｍｉＲ−３３ａ及び／又はｍｉＲ−３３ｂとハイブリダイズするように設計されている相補的核酸配列である。したがって、オリゴヌクレオチドは、標的と十分に相補的であるように、すなわち、所望の効果を与えるのに非常に十分に、かつ、十分な特異性でハイブリダイズするように選択される。
【００４３】
本発明の文脈において、ハイブリダイゼーションとは、相補的ヌクレオシド又はヌクレオチド塩基間のワトソン−クリック水素結合、フーグスティーン水素結合、又は逆フーグスティーン水素結合であり得る、水素結合を意味する。例えば、アデニン及びチミンは、水素結合の形成を介して対になる相補的核酸塩基である。本明細書で使用する場合、相補的とは、２つのヌクレオチド間の正確な対合のための能力をいう。例えば、オリゴヌクレオチドの特定の位置におけるヌクレオチドが、ＤＮＡ又はＲＮＡ分子の同じ位置におけるヌクレオチドと水素結合できる場合、オリゴヌクレオチド及びＤＮＡ又はＲＮＡは、その位置において互いに相補的であるとみなされる。各分子における十分な数の対応する位置が、互いに水素結合できるヌクレオチドによって占められている場合、オリゴヌクレオチド及びＤＮＡ又はＲＮＡは互いに相補的である。したがって、「特異的にハイブリダイズできる」及び「相補的」は、安定及び特異的な結合が、オリゴヌクレオチドと、ＤＮＡ又はＲＮＡ標的との間で起こるような十分な程度の相補性又は正確な対合を示すために使用される用語である。
【００４４】
相補的核酸配列は、特異的にハイブリダイズできるその標的核酸の配列と１００％相補的であることを必要としないことは、当該技術分野において理解されている。標的ＤＮＡ又はＲＮＡ分子に対する配列の結合が、活性を喪失させるために標的ＤＮＡ又はＲＮＡの正常な機能を妨げる場合、並びに特異的結合が所望される条件下、すなわち、インビボアッセイ又は治療的処置の場合、及びインビトロアッセイの場合における生理学的条件下、アッセイが適切なストリンジェンシーの条件下で実施される条件下で、非標的配列に対する配列の非特異的結合を回避するために十分な程度の相補性が存在する場合、本発明の相補的核酸配列は特定的にハイブリダイズできる。例えば、ストリンジェント塩濃度は、通常、約７５０ｍＭのＮａＣｌ及び７５ｍＭのクエン酸三ナトリウムより少なく、好ましくは約５００ｍＭのＮａＣｌ及び５０ｍＭのクエン酸三ナトリウムより少なく、より好ましくは約２５０ｍＭのＮａＣｌ及び２５ｍＭのクエン酸三ナトリウムより少ない。低ストリンジェンシーハイブリダイゼーションは、有機溶媒、例えばホルムアミドの非存在下で得ることができるのに対して、高ストリンジェンシーハイブリダイゼーションは、少なくとも約３５％のホルムアミド、より好ましくは少なくとも約５０％のホルムアミドの存在下で得ることができる。ストリンジェント温度条件としては、通常、少なくとも約３０℃、より好ましくは少なくとも約３７℃、最も好ましくは少なくとも約４２℃の温度が挙げられる。ハイブリダイゼーション時間、界面活性剤、例えば、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）の濃度、及びキャリアＤＮＡの包含又は排除などの付加パラメーターを変化させることは、当業者に周知である。必要に応じて、これらの種々の条件を組み合わせることで種々のレベルのストリンジェンシーが達成される。好ましい実施形態において、７５０ｍＭのＮａＣｌ、７５ｍＭのクエン酸三ナトリウム、及び１％のＳＤＳ中で３０℃にてハイブリダイゼーションが起こる。より好ましい実施形態において、５００ｍＭのＮａＣｌ、５０ｍＭのクエン酸三ナトリウム、１％のＳＤＳ、３５％のホルムアミド、及び１００μｇ／ｍｌの変性サケ精子ＤＮＡ（ｓｓＤＮＡ）中で３７℃にてハイブリダイゼーションが起こる。最も好ましい実施形態において、２５０ｍＭのＮａＣｌ、２５ｍＭのクエン酸三ナトリウム、１％のＳＤＳ、５０％のホルムアミド、及び２００μｇ／ｍｌのｓｓＤＮＡ中で４２℃にてハイブリダイゼーションが起こる。これらの条件における有用な変化は、当業者であれば容易に明らかとなる。
【００４５】
ほとんどの用途において、ハイブリダイゼーション後の洗浄工程もストリンジェンシーを変化させる。洗浄ストリンジェンシー条件は、塩濃度及び温度で定義できる。前述のように、塩濃度を低下させるか又は温度を上昇させることで洗浄ストリンジェンシーを増加させることができる。例えば、洗浄工程用のストリンジェント塩濃度は、好ましくは約３０ｍＭのＮａＣｌ及び３ｍＭのクエン酸三ナトリウムより少なく、最も好ましくは約１５ｍＭのＮａＣｌ及び１．５ｍＭのクエン酸三ナトリウムより少ない。洗浄工程用のストリンジェント温度条件としては、通常、少なくとも約２５℃、より好ましくは少なくとも約４２℃、更により好ましくは少なくとも約６８℃の温度が挙げられる。好ましい実施形態において、洗浄工程は、３０ｍＭのＮａＣｌ、３ｍＭのクエン酸三ナトリウム、及び０．１％のＳＤＳ中で２５℃にて起こる。より好ましい実施形態において、洗浄工程は、１５ｍＭのＮａＣｌ、１．５ｍＭのクエン酸三ナトリウム、及び０．１％のＳＤＳ中で４２℃にて起こる。より好ましい実施形態において、洗浄工程は、１５ｍＭのＮａＣｌ、１．５ｍＭのクエン酸三ナトリウム、及び０．１％のＳＤＳ中で６８℃にて起こる。これらの条件における更なる変化は、当業者であれば容易に明らかとなる。ハイブリダイゼーション技術は、当業者に周知であり、例えば、Ｂｅｎｔｏｎ及びＤａｖｉｓ（Ｓｃｉｅｎｃｅ  １９６：１８０，１９７７）；Ｇｒｕｎｓｔｅｉｎ及びＨｏｇｎｅｓｓ（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，ＵＳＡ  ７２：３９６１，１９７５）；Ａｕｓｕｂｅｌら，（Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ  Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，２００１）；Ｂｅｒｇｅｒ及びＫｉｍｍｅｌ（Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，１９８７，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）；並びにＳａｍｂｒｏｏｋら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋに記載されている。
【００４６】
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的核酸内の標的領域と少なくとも８０％の配列相補性を含むことが好ましく、更にそれらは９０％の配列相補性を含むことが好ましく、標的とされる標的核酸配列内の標的領域と９５％の配列相補性を含むことが更により好ましい。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドの２０核酸塩基のうちの１８が相補的であると、標的領域と特異的にハイブリダイズするアンチセンス化合物は９０パーセントの相補性を表す。標的核酸領域を有するアンチセンス化合物の相補性パーセントは、基本ローカルアラインメント検索ツール（ＢＬＡＳＴプログラム）を用いて慣例的に決定することができる（Ａｌｔｓｃｈｕｌら，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９９０，２１５，４０３−４１０：Ｚｈａｎｇ及びＭａｄｄｅｎ，Ｇｅｎｏｍｅ  Ｒｅｓ．，１９９７，７，６４９−６５６）。ｍｉＲ−３３ａ又はｍｉＲ−３３ｂとハイブリダイズする、本発明のアンチセンス及び他の化合物は実験により確認され、それらの化合物の代表的な配列は、本発明の好ましい実施形態として本明細書の以下で確認される（例えば、限定されないが、配列番号３又は配列番号４のアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む）。
【００４７】
別の実施形態において、配列番号１又は２と相補的である核酸配列は、限定されないが、ｓｈＲＮＡ又はｓｉＲＮＡを含む、干渉ＲＮＡであり得る。干渉ＲＮＡとしては、限定されないが、低分子干渉ＲＮＡ（「ｓｉＲＮＡ」）及び低分子ヘアピン型ＲＮＡ（「ｓｈＲＮＡ」）が挙げられる。干渉ＲＮＡを構築するための方法は当該技術分野において周知である。例えば、干渉ＲＮＡは、２つの別のオリゴヌクレオチドから構築することができ、一方の鎖はセンス鎖であり、他方の鎖はアンチセンス鎖であり、アンチセンス鎖及びセンス鎖は自己相補的であり（すなわち、例えばアンチセンス鎖及びセンス鎖が二本鎖又は二本鎖構造を形成する場合などに、各々の鎖は他方の鎖におけるヌクレオチド配列と相補的であるヌクレオチド配列を含む）、アンチセンス鎖は、標的核酸分子又はその一部（すなわち望まれていない遺伝子）におけるヌクレオチド配列と相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス鎖は、標的核酸配列又はその一部に対応するヌクレオチド配列を含む。代替として、干渉ＲＮＡは単一のオリゴヌクレオチドから構築され、自己相補的センス領域及びアンチセンス領域は、核酸ベース又は非核酸ベースのリンカー（複数可）によって連結される。干渉ＲＮＡは、自己相補的センス領域及びアンチセンス領域を有する、二本鎖、非対称二本鎖、ヘアピン又は非対称ヘアピン二次構造を有するポリヌクレオチドであってもよく、アンチセンス領域は、別の標的核酸分子又はその一部におけるヌクレオチド配列と相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス領域は、標的核酸配列又はその一部に対応するヌクレオチド配列を有する。干渉は、自己相補的センス領域及びアンチセンス領域を含む２つ以上のループ構造及び１つのステムを有する環状の一本鎖ポリヌクレオチドであってもよく、アンチセンス領域は、標的核酸分子又はその一部におけるヌクレオチド配列と相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス領域は、標的核酸配列又はその一部に対応するヌクレオチド配列を有し、環状ポリヌクレオチドは、ＲＮＡ干渉を介することができる活性ｓｉＲＮＡ分子を生成するためにインビボ又はインビトロのいずれかでプロセシングされ得る。
【００４８】
本発明の特定の実施形態において、干渉ＲＮＡコード領域は、センス領域、アンチセンス領域及びループ領域を有する自己相補的ＲＮＡ分子をコードする。望ましく発現される場合、かかるＲＮＡ分子は「ヘアピン」構造を形成し、本明細書で「ｓｈＲＮＡ」という。ループ領域は、通常、長さが約２から約１０の間のヌクレオチドである。好ましい実施形態において、ループ領域は、長さが約６から約９のヌクレオチドである。本発明の１つのかかる実施形態において、センス領域及びアンチセンス領域は、長さが約１５から約２０の間のヌクレオチドである。転写後プロセシング後、低分子ヘアピン型ＲＮＡは、ＲＮａｓｅ  ＩＩＩファミリーのメンバーである、酵素のダイサーを介して行われる切断事象によってｓｉＲＮＡに変換される。次いで、ｓｉＲＮＡは、相同性を共有する遺伝子の発現を阻害できる。詳細については、Ｂｒｕｍｍｅｌｋａｍｐら，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２９６：５５０−５５３，（２００２）；Ｌｅｅら，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０，５００−５０５，（２００２）；Ｍｉｙａｇｉｓｈｉ及びＴａｉｒａ，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  ２０：４９７−５００，（２００２）；Ｐａｄｄｉｓｏｎら，Ｇｅｎｅｓ  ＆  Ｄｅｖ．１６：９４８−９５８，（２００２）；Ｐａｕｌ，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ，２０，５０５−５０８，（２００２）；Ｓｕｉ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｄ．ＵＳＡ，９９（６），５５１５−５５２０，（２００２）；Ｙｕら，Ｐｒｏｃ  ＮａｔｌＡｃａｄＳｃｉ  ＵＳＡ  ９９：６０４７−６０５２，（２００２）を参照のこと。
【００４９】
ｓｉＲＮＡによって誘導される標的ＲＮＡ切断反応は高度に配列特異的である。一般に、標的遺伝子（すなわち、ｍｉＲ−３３ａ及び／又はｍｉＲ−３３ｂ）の一部と同一であるヌクレオチド配列を含有するｓｉＲＮＡが阻害のために好ましい。しかしながら、ｓｉＲＮＡと標的遺伝子との間の１００％の配列同一性は、本発明を実施するのに必要とされない。したがって、本発明は、遺伝子変異、株多型性、又は進化的分岐に起因して予測され得る配列変異を耐容できる利点を有する。例えば、標的配列に対する挿入、欠失、及び単一点突然変異を有するｓｉＲＮＡ配列もまた、阻害に効果的であることが見出されている。代替として、ヌクレオチド類似体置換又は挿入を有するｓｉＲＮＡ配列が阻害に効果的であってもよい。
【００５０】
更に別の実施形態において、配列番号１又は２と相補的である核酸配列はアンタゴマーである。アンタゴマーは、マイクロＲＮＡを標的とする一本鎖、二本鎖、部分的に二本鎖及びヘアピン構造化された化学的に修飾されたオリゴヌクレオチドである。好ましくは、本発明において特徴付けられたアンタゴマーは、約１２〜２５ヌクレオチド、好ましくは約１５〜２３ヌクレオチドのｍｉＲＮＡ標的配列とハイブリダイズするのに十分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
【００５１】
特定の実施形態において、アンタゴマーは、ＲＮａｓｅプロテクション並びに増大した組織及び細胞取り込みなどの薬理学的特性についての種々の修飾を保有するＲＮＡ様オリゴヌクレオチドである。アンタゴマーは、糖の完全な２’−Ｏ−メチル化、ホスホロチオエート骨格及び３’末端におけるコレステロール部分を有することによって正常なＲＮＡとは異なり得る。ホスホロチオエート修飾は、増大した組織取り込みの一因となるＲＮａｓｅ活性及びそれらの親油性に対する保護を与える。好ましい実施形態において、アンタゴマーは６つのホスホロチオエート骨格修飾を含み、２つのホスホロチオエートは５’末端に位置し、４つは３’末端に位置する。本発明のアンタゴマーはまた、それらの長さ又はアンタゴマーを構成するヌクレオチドの数に関して修飾されてもよい。本発明のアンタゴマーは、最適機能のために長さが約２０〜２１ヌクレオチドであることが好ましい。なぜならこのサイズはｍｉＲ−３３ａ及びｍｉＲ−３３ｂについての成熟マイクロＲＮＡのサイズと一致するからである。
【００５２】
ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ベクター、ウイルス又はそのハイブリッドであろうとなかろうと、本発明を実施するために使用される核酸配列は、種々の源から単離でき、遺伝子操作でき、増幅でき、及び／又は発現／組換え的に生成できる。組換え核酸配列は、個々に単離又はクローニングでき、所望の活性について試験できる。例えばインビトロ、細菌、真菌、哺乳動物、酵母、昆虫又は植物細胞発現系を含む、任意の組換え発現系が使用されてもよい。
【００５３】
本発明の核酸配列は、送達ベクターに挿入でき、そのベクター内の転写ユニットから発現できる。組換えベクターは、ＤＮＡプラスミド又はウイルスベクターであってもよい。ベクター構築物の生成は、限定されないが、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．（１９８９）），Ｃｏｆｆｉｎら，（Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ．（１９９７））及び「ＲＮＡ  Ｖｉｒｕｓｅｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ」（Ａｌａｎ  Ｊ．Ｃａｎｎ，Ｅｄ．，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ，（２０００））に記載されているようなＰＣＲ、オリゴヌクレオチド合成、制限エンドヌクレアーゼ消化、ライゲーション、形質転換、プラスミド精製、及びＤＮＡシークエンシングの標準的技術を含む、当該技術分野において周知の任意の適切な遺伝子操作技術を用いて成され得る。当業者に明らかであるように、種々の適切なベクターが、本発明の核酸を細胞に移すのに利用可能である。核酸を送達するのに適したベクターの選択及び選択された発現ベクターの細胞への挿入のための条件の最適化は、過度の実験を必要とせずに、当業者の想定の範囲内である。ウイルスベクターは、パッケージング細胞において組換えウイルスの産生のための配列を有するヌクレオチド配列を含む。本発明の核酸を発現するウイルスベクターは、限定されないが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ポックスウイルス又はアルファウイルスを含む、ウイルス骨格に基づいて構築できる。本発明の核酸を発現できる組換えベクターは本明細書に記載されるように送達でき、標的細胞（例えば、安定な形質転換体）に存続する。
【００５４】
本発明を実施するために使用される核酸配列は、例えば、Ａｄａｍｓ（１９８３）Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１０５：６６１；Ｂｅｌｏｕｓｏｖ（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３４４０−３４４４；Ｆｒｅｎｋｅｌ（１９９５）Ｆｒｅｅ  Ｒａｄｉｃ．Ｂｉｏｌ．Ｍｅｄ．１９：３７３−３８０；Ｂｌｏｍｍｅｒｓ（１９９４）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３３：７８８６−７８９６；Ｎａｒａｎｇ（１９７９）Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．６８：９０；Ｂｒｏｗｎ（１９７９）Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．６８：１０９；Ｂｅａｕｃａｇｅ（１９８１）Ｔｅｔｒａ．Ｌｅｔｔ．２２：１８５９；米国特許第４，４５８，０６６号に記載されているような周知の化学合成技術によってインビトロで合成できる。
【００５５】
本発明の核酸配列は、修飾、例えばヌクレオチド修飾の導入などによって核酸分解に対して安定化できる。例えば、本発明の核酸配列は、ヌクレオチド配列の５’又は３’末端においてホスホロチオエートの少なくとも第１、第２又は第３のヌクレオチド間結合を含む。別の例として、核酸配列は、２’修飾ヌクレオチド、例えば、２’−デオキシ、２’−デオキシ−２’−フルオロ、２’−Ｏ−メチル、２’−Ｏ−メトキシエチル（２’−Ｏ−ＭＯＥ）、２’−Ｏ−アミノプロピル（２’−Ｏ−ＡＰ）、２’−Ｏ−ジメチルアミノエチル（２’−Ｏ−ＤＭＡＯＥ）、２’−Ｏ−ジメチルアミノプロピル（２’−Ｏ−ＤＭＡＰ）、２’−Ｏ−ジメチルアミノエチルオキシエチル（２’−Ｏ−ＤＭＡＥＯＥ）、又は２’−Ｏ−Ｎ−メチルアセトアミド（２’−Ｏ−ＮＭＡ）を含んでもよい。別の例として、核酸配列は、少なくとも１つの２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチド含んでもよく、一部の実施形態において、ヌクレオチドの全ては２’−Ｏ−メチル修飾を含む。一部の実施形態において、核酸は「ロック」されている。すなわち、核酸は、２’−Ｏ原子及び４’−Ｃ原子を結合するメチレン架橋によってリボース環が「ロック」されている核酸類似体を含む（例えば、Ｋａｕｐｉｎｎｅｎら，Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃ．Ｔｏｄａｙ  ２（３）：２８７−２９０（２００５）；Ｋｏｓｈｋｉｎら，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，１２０（５０）：１３２５２−１３２５３（１９９８）を参照のこと）。
【００５６】
例えば、サブクローニング、ラベリングプローブ（例えば、クレノウポリメラーゼを用いるランダムプライマーラベリング、ニックトランスレーション、増幅）、シークエンシング、ハイブリダイゼーションなどの本発明を実施するために使用される核酸操作のための技術は、科学文献及び特許文献に十分に記載されている。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，ｅｄ．，ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ  ＣＬＯＮＩＮＧ：Ａ  ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ  ＭＡＮＵＡＬ（２ＮＤ  ＥＤ．），Ｖｏｌｓ．１−３，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，（１９８９）；ＣＵＲＲＥＮＴ  ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ  ＩＮ  ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ  ＢＩＯＬＯＧＹ，Ａｕｓｕｂｅｌ，ｅｄ．ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９９７）；ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ  ＴＥＣＨＮＩＱＵＥＳ  ＩＮ  ＢＩＯＣＨＥＭＩＳＴＲＹ  ＡＮＤ  ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ  ＢＩＯＬＯＧＹ：ＨＹＢＲＩＤＩＺＡＴＩＯＮ  ＷＩＴＨ  ＮＵＣＬＥＩＣ  ＡＣＩＤ  ＰＲＯＢＥＳ，Ｐａｒｔ  Ｉ．Ｔｈｅｏｒｙ  ａｎｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ，Ｔｉｊｓｓｅｎ，ｅｄ．Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．（１９９３）を参照のこと。
【００５７】
本発明は、翻訳抑制のためにＡＴＰ結合カセット輸送体ＡＢＣＡ１を標的とし、それによって、ＡＢＣＡ１レベル、ＨＤＬ産生、及びコレステロールの逆輸送を増加させるように設計される核酸配列を含む医薬組成物及び製剤を提供する。
【００５８】
代替の実施形態において、本発明の組成物は薬学的に許容される担体と共に製剤化される。代替の実施形態において、本発明の医薬組成物及び製剤は、非経口、局所的、経口、又はエアゾール若しくは経皮などによる局所投与によって投与できる。医薬組成物は任意の方法で製剤化でき、状態又は疾患（例えば、心血管障害の種類）及び病気の程度、各患者の全身の医学的状態、もたらされる好ましい投与方法に応じて、種々の単位剤形で投与できる。製剤化及び薬剤の投与についての技術に関する詳細は、科学文献及び特許文献に十分に記載されている。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ，Ｅａｓｔｏｎ  ＰＡ（「Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ」）の最新版を参照のこと。
【００５９】
本発明の核酸配列は、単独で、又は医薬製剤（組成物）の成分として投与できる。化合物は、ヒト又は獣医用の医薬に使用するための任意の簡便な方法で投与のために製剤化できる。湿潤剤、乳化剤及びラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤、並びに着色剤、離型剤、コーティング剤、甘味剤、香味剤及び芳香剤、防腐剤及び酸化防止剤も組成物中に存在してもよい。
【００６０】
本発明の組成物の製剤は、皮内、吸入、経口／経鼻、局所、非経口、直腸、及び／又は膣内投与に適切なものを含む。製剤は簡便に単位剤形で存在してもよく、薬学の分野で周知の任意の方法によって調製されてもよい。単一の剤形を生成するために担体物質と組み合わされ得る活性成分（例えば、本発明の核酸配列）の量は、治療される宿主、特定の投与様式、例えば皮内又は吸入に応じて変更されるだろう。単一の剤形を生成するために担体物質と組み合わされ得る活性成分の量は、通常、治療的効果、例えば、抗原特異的Ｔ細胞又は体液性応答を生じる化合物の量である。
【００６１】
本発明の医薬製剤は、製薬に関する分野で知られている任意の方法に従って調製できる。かかる薬物は、甘味剤、香味剤、着色剤及び保存剤を含有してもよい。製剤は、製造に適切である非毒性の薬学的に許容される添加剤と混合されてもよい。製剤は、１つ以上の賦形剤、乳化剤、防腐剤、緩衝剤、添加剤などを含んでもよく、液体剤、散剤、乳剤、凍結乾燥粉末、スプレー剤、クリーム剤、ローション剤、放出制御製剤、錠剤、丸剤、ゲル剤、パッチ剤上、インプラントにおいてなどの形態で提供されてもよい。
【００６２】
経口投与のための医薬製剤は、適した及び適切な用量で、当該技術分野において周知の薬学的に許容される担体を用いて製剤化されてよい。かかる担体は、薬剤が、患者による摂取に適切な錠剤、丸剤、散剤、糖衣錠、カプセル剤、液体剤、ロゼンジ剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤などとして単位剤形で製剤化されることを可能にする。経口使用のための医薬調製物は固形添加剤として製剤化でき、所望の場合、錠剤又は糖衣錠コアを得るために、適切な付加化合物を加えた後で、任意選択に、得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を加工する。適切な固形添加剤は、例えば、ラクトース、スクロース、マンニトール、又はソルビトールを含む糖；トウモロコシ、コムギ、コメ、ジャガイモ、又は他の植物由来のデンプン；メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチル−セルロース、又はナトリウムカルボキシ−メチルセルロースなどのセルロース；並びにアラビア及びトラガントを含むガム；並びにタンパク質、例えばゼラチン及びコラーゲンを含む、糖質又はタンパク質の充填剤である。架橋ポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸、又はアルギン酸ナトリウムなどのその塩などの崩壊剤又は可溶化剤が加えられてもよい。押し込み式カプセル剤は、ラクトース又はデンプンなどの充填剤又は結合剤、タルク又はステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤、及び任意選択に安定剤と混合した活性剤を含有してもよい。軟カプセル剤において、活性剤は、安定剤を含んでも含まなくてもよく、脂肪油、液体パラフィン、又は液体ポリエチレングリコールなどの適切な液体に溶解又は懸濁されてもよい。
【００６３】
水性懸濁剤は、例えば、水性皮内注射用の水性懸濁剤の製造に適切な添加剤と混合して活性剤（例えば、本発明の核酸配列）を含有してもよい。かかる添加剤としては、ナトリウムカルボキシメチルセルロース、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン、トラガントガム及びアカシアガムなどの懸濁化剤、天然に存在するリン脂質（例えば、レシチン）などの分散化剤又は湿潤剤、アルキレンオキシドと脂肪酸との縮合生成物（例えば、ポリオキシエチレンステアレート）、エチレンオキシドと長鎖脂肪族アルコールとの縮合生成物（例えば、ヘプタデカエチレンオキシセタノール（heptadecaethylene oxycetanol））、エチレンオキシドと脂肪酸及びヘキシトールから得られる部分エステルとの縮合生成物（例えば、ポリオキシエチレンソルビトールモノ−オレエート）、又はエチレンオキシドと脂肪酸及びヘキシトール無水物から得られる部分エステルとの縮合生成物（例えば、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート）が挙げられる。また、水性懸濁剤は、ｐ−ヒドロキシ安息香酸エチル又はｐ−ヒドロキシ安息香酸−ｎ−プロピルなどの１つ又は複数の防腐剤、１つ又は複数の着色剤、１つ又は複数の香味剤、及びスクロース、アスパルテーム又はサッカリンなどの１つ又は複数の甘味剤を含有してもよい。製剤はオスモル濃度で調整できる。
【００６４】
一実施形態において、油ベースの薬剤が、本発明の核酸配列を投与するために使用される。油ベースの懸濁剤は、ラッカセイ油、オリーブ油、ゴマ油若しくはココナッツ油などの植物油中、又は流動パラフィンなどの鉱油中、或いはそれらの混合物中で活性剤を懸濁することにより製剤化できる。例えば、生物学的利用能を増加させ、経口投与した疎水性医薬化合物の個体間変動及び個体内変動を減少させるための精油又は精油成分を用いることを記載している米国特許第５，７１６，９２８号を参照のこと（米国特許第５，８５８，４０１号も参照のこと）。油懸濁剤は、蜜ろう、固形パラフィン又はセチルアルコールなどの増粘剤を含有してもよい。甘味剤が、グリセロール、ソルビトール又はスクロースなどの味の良い経口用調製物を提供するために加えられてもよい。これらの製剤は、アスコルビン酸などの酸化防止剤を加えることによって保存されてもよい。注射用油ビヒクルの例としては、Ｍｉｎｔｏ（１９９７）Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．２８１：９３−１０２を参照のこと。
【００６５】
本発明の医薬製剤はまた、水中油型エマルションの形態であってもよい。油性相は、上記の植物油若しくは鉱油又はそれらの混合物であってもよい。適切な乳化剤としては、アカシアガム及びトラガントガムなどの天然に存在するガム、大豆レシチンなどの天然に存在するリン脂質、ソルビタンモノオレエートなどの、脂肪酸及びヘキシトール無水物に由来するエステル又は部分エステル、並びにポリオキシエチレンソルビタンモノオレエートなどの、上記部分エステルとエチレンオキシドとの縮合生成物が挙げられる。エマルションはまた、シロップ剤及びエリキシル剤の製剤などで甘味剤及び香味剤を含有してもよい。かかる製剤はまた、鎮痛剤、防腐剤、又は着色剤を含有してもよい。代替の実施形態において、本発明のこれらの注射用水中油型エマルションは、パラフィン油、ソルビタンモノオレエート、エトキシ化ソルビタンモノオレエート及び／又はエトキシ化ソルビタントリオレートを含む。
【００６６】
本発明を実施する際に、医薬化合物はまた、坐剤、インサフレーション、粉末及びエアゾール製剤（例えばステロイド吸入剤、例えば、Ｒｏｈａｔａｇｉ（１９９５）Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．３５：１１８７−１１９３；Ｔｊｗａ（１９９５）Ａｎｎ．Ａｌｌｅｒｇｙ  Ａｓｔｈｍａ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．７５：１０７−１１１を参照のこと）を含み、経鼻、眼内及び膣内経路により投与できる。坐剤製剤は、常温で固体であるが、体温で液体になるので、身体で溶解して薬物を放出する適切な非刺激性の添加剤と、薬物とを混合することにより調製できる。かかる物質はココアバター及びポリエチレングリコールである。
【００６７】
本発明を実施する際に、医薬化合物は、塗布棒、溶液剤、懸濁剤、乳剤、ゲル剤、クリーム剤、軟膏剤、ペースト剤、ゼリー剤、塗布剤、粉末剤、及びエアゾール剤として製剤化され、局所経路により経皮的に送達できる。
【００６８】
本発明を実施する際に、医薬化合物はまた、身体における持続放出のためにミクロスフェアとして送達できる。例えば、ミクロスフェアは、皮下に持続放出される薬物の皮内注射により投与できる；Ｒａｏ（１９９５）Ｊ．Ｂｉｏｍａｔｅｒ  Ｓｃｉ．Ｐｏｌｙｍ．Ｅｄ．７：６２３−６４５を参照のこと；生分解性及び注射用ゲル製剤として、例えば、Ｇａｏ（１９９５）Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．１２：８５７−８６３（１９９５）を参照のこと；又は経口投与のためのミクロスフェアとして、例えば、Ｅｙｌｅｓ（１９９７）Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．４９：６６９−６７４を参照のこと。
【００６９】
本発明を実施する際に、医薬化合物は、静脈内（ＩＶ）投与又は体腔若しくは器官の内腔への投与などにより非経口で投与できる。それらの製剤は、薬学的に許容される担体に溶解される活性剤の溶液を含んでもよい。利用され得る許容されるビヒクル及び溶媒は、水及びリンガー溶液、等張食塩水である。加えて、滅菌不揮発性油が、溶媒又は懸濁媒として利用されてもよい。この目的のために、合成モノグリセリド又はジグリセリドを含む、任意の無菌不揮発性油が利用されてもよい。加えて、オレイン酸などの脂肪酸が、同様に、注射用調製物に使用されてもよい。それらの溶液は滅菌され、通常、望ましくない物質を含まない。それらの製剤は、従来の周知の滅菌技術により滅菌されてもよい。製剤は、ｐＨ調整剤及び緩衝剤、毒性調整剤、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウムなどのほぼ生理的条件に必要とされる薬学的に許容される補助物質を含有してもよい。それらの製剤中の活性剤の濃度は、広範に変化されてもよく、選択される特定の投与様式及び患者の必要性に従って、液量、粘性、体重などに主に基づいて選択される。ＩＶ投与のために、製剤は、滅菌注射用水溶液又は油性懸濁液などの滅菌注射用調製物であってもよい。この懸濁液は、上記の適切な分散化剤又は湿潤剤及び懸濁化剤を用いて製剤化されてもよい。滅菌注射用調製物はまた、１，３−ブタンジオール溶液などの非毒性の非経口的に許容される賦形剤又は溶媒中の懸濁液であってもよい。投与は、ボーラス又は持続注入（例えば、特定期間、血管内への実質的に連続導入）によってなされてもよい。
【００７０】
本発明の医薬化合物及び製剤は凍結乾燥されてもよい。本発明は、本発明の薬剤及び充填剤、例えば、マンニトール、トレハロース、ラフィノース、及びスクロース又はそれらの混合物を含む溶液を凍結乾燥することによって作製され得る、本発明の組成物を含む安定な凍結乾燥製剤を提供する。安定な凍結乾燥製剤を調製するためのプロセスは、約２．５ｍｇ／ｍＬのタンパク質、約１５ｍｇ／ｍＬのスクロース、約１９ｍｇ／ｍＬのＮａＣｌ、及び５．５より高いが、６．５未満のｐＨを有するクエン酸ナトリウム緩衝剤の溶液を凍結乾燥することを含んでもよい。例えば、米国特許出願公開第２００４００２８６７０号を参照のこと。
【００７１】
本発明の組成物及び製剤は、リポソームを使用することにより送達できる。リポソームを使用することにより、特に、リポソーム表面が、標的細胞に特異的なリガンドを保持するか、又はそうでなければ特定の器官に選択的に向けられている場合、インビボにおける標的細胞への活性剤の送達に集中することができる。例えば、米国特許第６，０６３，４００号；米国特許第６，００７，８３９号；Ａｌ−Ｍｕｈａｍｍｅｄ（１９９６）Ｊ．Ｍｉｃｒｏｅｎｃａｐｓｕｌ．１３：２９３−３０６；Ｃｈｏｎｎ（１９９５）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．６：６９８−７０８；Ｏｓｔｒｏ（１９８９）Ａｍ．Ｊ．Ｈｏｓｐ．Ｐｈａｒｍ．４６：１５７６−１５８７を参照のこと。
【００７２】
本発明の製剤は、予防的及び／又は治療的処置のために投与できる。代替の実施形態において、治療的用途のために、組成物は、障害又はその合併症、例えば、心臓血管異常の臨床症状を治療、緩和又は部分的に停止するのに十分な量（これは治療有効量と呼ばれ得る）で、コレステロール恒常性を必要とする被験体に投与される。例えば、代替の実施形態において、本発明の医薬組成物は、ＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー１、（ＡＢＣＡ１）タンパク質の発現を増加させ、細胞内コレステロールの流出及び／若しくは肝臓におけるＨＤＬの産生を増加させ、並びに／又はコレステロール恒常性を必要とする被験体の血液を循環するコレステロールの量を減少させるのに十分な量で投与される。
【００７３】
これを達成するのに適切な医薬組成物の量が治療有効量である。これに使用するための投薬スケジュール及び有効量、すなわち投与レジメンは、疾患又は状態の段階、疾患又は状態の重症度、患者の健康の一般状態、患者の身体状況、年齢などを含む、種々の要因に依存するだろう。患者のための投薬レジメンを判断する際に、投与様式も考慮される。
【００７４】
投薬レジメンはまた、当該技術分野において周知の薬物動態パラメーター、すなわち、活性剤の吸収率、生物学的利用能、代謝、クリアランスなども考慮される（例えば、Ｈｉｄａｌｇｏ−Ａｒａｇｏｎｅｓ（１９９６）Ｊ．Ｓｔｅｒｏｉｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．５８：６１１−６１７；Ｇｒｏｎｉｎｇ（１９９６）Ｐｈａｒｍａｚｉｅ  ５１：３３７−３４１；Ｆｏｔｈｅｒｂｙ（１９９６）Ｃｏｎｔｒａｃｅｐｔｉｏｎ  ５４：５９−６９；Ｊｏｈｎｓｏｎ（１９９５）Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｓｃｉ．８４：１１４４−１１４６；Ｒｏｈａｔａｇｉ（１９９５）Ｐｈａｒｍａｚｉｅ  ５０：６１０−６１３；Ｂｒｏｐｈｙ（１９８３）Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２４：１０３−１０８；最新のＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ，前出を参照のこと）。現在の技術水準により、臨床医は、個々の患者、活性剤及び治療される疾患又は状態の各々についての投薬レジメンを決定することができる。薬剤として使用される類似組成物のために提供されるガイドラインは、投薬レジメン、すなわち、投与スケジュール及び投薬レベルを決定するための指針として使用され、本発明の方法を正確かつ適正に実施することができる。
【００７５】
製剤の単回又は多回投与は、例えば、患者に必要とされ、忍容される用量及び頻度、各投与後に生じるコレステロール恒常性の程度及び量などに応じて与えることができる。製剤は、状態、疾患又は症状を有効に治療、予防又は寛解する（例えば、ＡＢＣＡ１の発現を増加させ、細胞内コレステロールの流出及び／若しくは肝臓におけるＨＤＬの産生を増加させ、並びに／又はコレステロール恒常性を必要とする被験体の血液を循環するコレステロールの量を減少させる）のに十分な量の活性剤を与えるべきである。
【００７６】
代替の実施形態において、経口投与のための医薬製剤は、約１〜１００ｍｇ／ｋｇ体重／日又はそれ以上の日用量である。経口投与と対照的に、血流、体腔又は器官の内腔内へのより低い用量が使用されてもよい。十分に高い用量が、局所若しくは経口投与又は粉末、スプレー若しくは吸入による投与において使用されてもよい。非経口又は経口投与可能な製剤を調製するための実際の方法は、当業者に公知であるか、又は明らかであり、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ、前出などの文献により詳細に記載されている。
【００７７】
種々の研究により、相補的核酸配列を用いた成功している哺乳動物の投薬が報告されている。例えば、Ｅｓａｕ  Ｃ．ら，（２００６）Ｃｅｌｌ  Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，３（２）：８７−９８は、４週間、週に２回の１２．５〜７５ｍｇ／ｋｇの範囲のｍｉＲ−１２２アンチセンスオリゴヌクレオチドの腹腔内投与による正常なマウスの投薬を報告している。マウスは、体重を損失せず、又は食物摂取を減少せずに、治療の終わりに健康で、正常なように見えた。血漿アミノ基転移酵素レベルは、ＡＬＴ及びＡＳＴレベルの非常に穏やかな増加を示した、７５ｍｇ／ｋｇ用量のｍｉＲ−１２２  ＡＳＯを除いて、全ての用量について正常な範囲（ＡＳＴ３／４  ４５、ＡＬＴ３／４  ３５）であった。これらにより、５０ｍｇ／ｋｇが有効で非毒性の用量であることが結論付けられた。Ｋｒｕｔｚｆｅｌｄｔ  Ｊら，（２００５）Ｎａｔｕｒｅ  ４３８，６８５−６８９による別の研究は、８０、１６０又は２４０ｍｇ／ｋｇ体重の総量を用いてマウスにおいｔｍｉＲ−１２２をサイレンシングするためにアンタゴマーを注入した。最も高い用量はｍｉＲ−１２２シグナルの完全な損失を生じた。更に別の研究において、ロックド核酸（「ＬＮＡ」）が、ｍｉＲ−１２２をサイレンシングするために霊長類において首尾よく適用された。Ｅｌｍｅｎ  Ｊ．ら，（２００８）Ｎａｔｕｒｅ  ４５２，８９６−８９９は、ｍｉＲ−１２２の効果的なサイレンシングを、３用量の１０ｍｇ／ｋｇのＬＮＡ−抗ｍｉＲによって霊長類において達成し、研究動物においてＬＮＡ関連毒性又は組織病理学的変化についてのいかなる形跡もなく、総血漿コレステロールの長期間存続し、可逆的な減少を導いたことを報告している。
【００７８】
本発明の方法は、他の薬物又は薬剤、例えば、コレステロール恒常性を提供するための組成物との同時投与を更に含んでもよい。例えば、本発明の方法並びに／又は組成物及び製剤は、ＨＭＧ  ＣｏＡ還元酵素阻害剤、例えば、アトルバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、プラバスタチン、ロスバスタチン及びシンバスタチン、胆汁酸捕捉剤、例えば、コレセベラム、コレスチラミン及びコレスチポール、並びにニコチン酸（ナイアシン）などの増大したＬＤＬコレステロールを治療するための薬物と同時投与できる。
【００７９】
本発明は、本発明のより十分な理解及びその多くの利点を与える、以下に示す、非限定的な実施例によって更に説明される。
【実施例】
【００８０】
本明細書中で、ＳＲＥＢＰと協調してコレステロール恒常性を制御する際にｍｉＲ−３３の役割を更に詳細に説明するための一連のインビトロ及びインビボでの研究を記載する。以下の実施例は例示の目的のみのために提示し、発明者らが彼らの発明とみなす発明の範囲を限定することを意図しない。
【実施例１】
【００８１】
ヒト及びマウスにおけるｍｉＲ−３３の予測される標的
ｍｉＲＮＡによるｍＲＮＡ標的の識別に対する利用可能なアプローチの中で、計算による予測研究が、ｍｉＲＮＡ標的の実験検証に対する第１のステップを確立する際の有用な方法を表すことが示された。ｍｉＲＮＡ標的を予測する際に考慮される最も重要なパラメーターは、「種対合」として知られている、その同種標的との特定の塩基対合を受けるｍｉＲＮＡ配列の能力である（Ｂａｒｔｅｌ  ＤＰ（２００４）Ｃｅｌｌ  １１６：２８１−２９７；ｖａｎ  ｄｅｎ  Ｂｅｒｇ  Ａ，Ｍｏｌｓ  Ｊ，Ｈａｎ  Ｊ（２００８）Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ａｃｔａ）。これは、ｍｉＲＮＡ５’末端の７〜８塩基に関する。この文脈において、Ｍｉｒａｎｄａ及びＴａｒｇｅｔＳｃａｎ  ４．２標的予測データベース（ｍｉｃｒｏｒｎａ．ｓａｎｇｅｒ．ａｃ．ｕｋ；ｗｗｗ．ｔａｒｇｅｔｓｃａｎ．ｏｒｇ／ｖｅｒｔ＿４２／）の両方から導かれた１００より多い予測される標的の記載の中で、ヒト及びマウスの両方におけるｍｉＲ−３３についての最も関連のある保存された標的はＡＢＣＡ１である（表１及び図７）。興味深いことに、これらの研究は、コレステロール輸送ネットワーク又は脂質ホメオスタシスにおける役割を果たし、ＡＢＣＡ１と機能的に関連することが知られている付加的タンパク質はまた、ヒト及びマウスの両方における標的として役立つことを明らかにした。それらとしては、ニーマンピック病Ｃ１型（ＮＰＣ１）が挙げられる（表１）。
【００８２】
【表１】
0005753838.tif 000002
【実施例２】
【００８３】
ヒト及びマウス細胞株におけるｍｉＲ−３３によるＡＢＣＡ１の下方調節
バイオインフォマティクス予測研究からの結果を検証するために、一連の実験を、モデル系として、ヒトＨｅｐＧ２肝細胞癌細胞、ＩＭＲ−９０初代ヒト線維芽細胞、及びマウスマクロファージ細胞株Ｊ７７４を含む、ヒト及びマウス細胞株を用いて実施した。それらの細胞株は、低細胞密度でＡＢＣＡ１タンパク質の低い発現を示す。ｍｉＲ−３３によるＡＢＣＡ１の翻訳阻害は、この低いレベルの発現に起因すると予測された。したがって、ｍｉＲＮＡ生物発生経路の成分のｓｉＲＮＡノックダウンを、ＡＢＣＡ１タンパク質発現がｍｉＲＮＡにより調節されるか否かを決定するために実施した。実際に、ドローシャ及びダイサーｍｉＲＮＡプロセシング酵素に向けられたｓｉＲＮＡでのトランスフェクションにより、試験した３つ全ての細胞株において（特にドローシャｓｉＲＮＡでの）ＡＢＣＡ１タンパク質発現の十分な増加が生じた（図７Ａ）。これらの結果はｍｉＲＮＡによるＡＢＣＡ１の調節と一致している。
【００８４】
この上方調節が、ｍｉＲ−３３プロセシングの欠如から特異的に生じることを決定するために、３つの異なる細胞株を、抗ｍｉＲ−３３ａ／ｂオリゴヌクレオチド（Ａｍｂｉｏｎ）でトランスフェクトした。抗ｍｉＲは、塩基対合による配列特異的に内因性ｍｉＲＮＡの機能を遮断する修飾したｍｉＲＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチドである。抗ｍｉＲ−３３ａ及び抗ｍｉＲ−３３ｂの両方のトランスフェクションは、ヒト細胞株において、及びＪ７７４マウスマクロファージの抗ｍｉＲ−３３ａ処置の際に、ＡＢＣＡ１タンパク質のかなり高い発現を生じた（図７Ｂ）。
【００８５】
これらのデータは、内因性ｍｉＲ−３３によるＡＢＣＡ１  ｍＲＮＡの翻訳又は安定性の調節を示す。ＡＢＣＡ１発現に対するｍｉＲ−３３の効果を更に評価するために、ｍｉＲ−３３ａ及びｍｉＲ−３３ｂのそれぞれの細胞内レベルを増加させるために、細胞を合成Ｐｒｅ−ｍｉＲ−３３（Ａｍｂｉｏｎ）でトランスフェクトした。ＡＢＣＡ１タンパク質レベルは、細胞播種の２４時間後に検出することが困難であるため、Ｐｒｅ−ｍｉＲ３３の効果を、トランスフェクション及び播種の４８時間後に評価した。この実験により、ＡＢＣＡ１発現が、特にマウスＪ７７４マクロファージ及びヒトＩＭＲ−９０線維芽細胞において、ｍｉＲ−３３により特異的に抑制され得ることが明確に示される（図７Ｃ）。
【００８６】
最近の研究により、ＡＢＣＡ１が、効果的なコレステロール流出及びＨＤＬ生合成を促進するためにマクロファージにおいて、別のコレステロール輸送体、ＡＢＣＧ１と共に作用することが示された（図５）（Ｔａｌｌ  ＡＲら（２００８）Ｃｅｌｌ  Ｍｅｔａｂ  ７：３６５−３７５；Ｗａｎｇ  Ｘら（２００７）Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ  １１７：２２１６−２２２４）。実際に、データは、一方の輸送体が欠損して、他方が誘導される場合、代償的調節を示唆することを示した（Ｙｖａｎ−Ｃｈａｒｖｅｔ  Ｌら（２００７）Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ  １１７：３９００−３９０８；Ｒａｎａｌｌｅｔｔａ  Ｍら（２００６）Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｖａｓｃ  Ｂｉｏｌ  ２６：２３０８−２３１５）。したがって、ＡＢＣＧ１発現が、ｍｉＲＮＡ経路及びｍｉＲ−３３ａの操作後、ＡＢＣＡ１レベルの変化の際に変わるか否かを調べた。興味深いことに、マウスマクロファージ細胞株Ｊ７７４において、ダイサー及びドローシャのＲＮＡｉによるＡＢＣＧ１発現、抗ｍｉＲ−３３ａトランスフェクション、又はＰｒｅ−ｍｉＲ−３３ａ発現に対する有意な効果は観察されなかった。これらの知見により、少なくともこれらの予備実験条件下で、ＡＢＣＡ１及びＡＢＣＧ１の発現がｍｉＲ−３３操作に応答して相互に関連しないことが示唆される。
【実施例３】
【００８７】
ｍｉＲ−３３によるＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲの標的化
ｍｉＲ−３３が、ＡＢＣＡ１  ｍＲＮＡ及び／又はタンパク質レベルに影響を与えるか否かを決定するために、Ｐｒｅ−ｍｉＲ−３３ａ／ｂを、ｍｉＲ−３３のレベルを増加させるために、いくつかの細胞株（すなわち、ＩＭＲ−９０、ＨｅｐＧ２、及びＪ７７４）において発現させ、ｍｉＲ−３３を拮抗するために抗ｍｉＲ−３３オリゴヌクレオチドをトランスフェクトし、続いて、定量的ＲＴ−ＰＣＲ及び免疫ブロット法のそれぞれによってＡＢＣＡ１  ｍＲＮＡ及びタンパク質レベルを分析する。アクチンｍＲＮＡ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）及びチューブリンタンパク質（免疫ブロット法）を対照として使用する。
【００８８】
ｍｉＲ−３３が、３’ＵＴＲの標的化を介してＡＢＣＡ１レベルに影響を与えるか否かを規定するために、予測されるｍｉＲ−３３標的配列を保有するヒト及びマウスＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲの断片を単離し、ルシフェラーゼレポータープラスミド（ｐＭＩＲ−ＲＥＰＯＲＴ、Ａｍｂｉｏｎ）の３’ＵＴＲクローニング部位にクローニングした。得られたＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲルシフェラーゼレポーターを、ｍｉＲ−３３ａ／ｂ抗ｍｉＲ、前駆体、又は対照オリゴヌクレオチドの存在下で、ヒトＨＥＫ２９３細胞にトランスフェクトした。図８Ａに示すように、ルシフェラーゼレポーターベクター内に予測されるｍｉＲ−３３標的部位を保有するＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲの断片の挿入により、挿入しないベクターと比較してレポーター活性の著しい減少が生じ、挿入された断片（例えばｍｉＲ−３３認識部位）内の阻害配列の存在と一致する。重要なことに、ヒトｍｉＲ−３３ａ／ｂと相補的である抗ｍｉＲオリゴヌクレオチドでの同時トランスフェクションはレポーターの高い発現を引き起こし、内因性ｍｉＲ−３３ａ／ｂが、実際に、ヒトＨＥＫ２９３細胞におけるＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲ断片を標的とすることを示唆する（図８Ｂ）。反対に、野生型ヒトｍｉＲ−３３ａ／ｂ前駆体オリゴヌクレオチド（Ａｍｂｉｏｎ）での同時トランスフェクションは、レポーター活性の更なる抑制を引き起こし、一方、種塩基対合領域において変異した前駆体オリゴヌクレオチドは、前駆体対照オリゴヌクレオチドと比較して効果を有さなかった（図８Ｃ）。相対ルシフェラーゼ活性を、ウミシイタケルシフェラーゼ活性によって正規化した絶対ルシフェラーゼ活性から測定した（ＰＣ：陰性対照として非関連マイクロＲＮＡ前駆体）。
【００８９】
一緒に、これらのデータは、ｍｉＲ−３３ａ／ｂが、翻訳抑制又はｍＲＮＡ分解のためのＡＢＣＡ１  ３’ＵＴＲを標的化することによりヒトＡＢＣＡ１の発現を阻害するという見解についての重要な支持を与える。
【実施例４】
【００９０】
マウスにおけるマクロファージからのコレステロール輸送におけるｍｉＲ−３３についての役割
ＳＲＥＢＰは、コレステロールによって古典的な負のフィードバック形式で調節される（Ｂｒｏｗｎ  ＭＳ，Ｇｏｌｄｓｔｅｉｎ  ＪＬ（１９９７）Ｃｅｌｌ  ８９：３３１−３４０）。ｍｉＲ−３３／ＳＲＥＢＰ／ＡＢＣＡ１コレステロール調節回路の生物医学及び生理学関連を、マウスＪ７７４マクロファージモデルを用いて調べた（ｄｅ  ｌａ  Ｌｌｅｒａ−Ｍｏｙａ  Ｍら（２０１０，Ｅｐｕｂ  ａｈｅａｄ  ｏｆ  ｐｒｉｎｔ）Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ．Ｔｈｒｏｍｂ．Ｖａｓｃ．Ｂｉｏｌ）。Ｊ７７４マウスマクロファージを、以下のようにＳＲＥＢＰ発現モジュレーションに関してコレステロール処置に供した：１５０Ｋ細胞を、２４ウェルプレートフォーマットにおいてウェルごとに播種し、４８時間、１０μｇ／ｍｌのコレステロール及び１μｇ／ｍｌの２５−ヒドロキシコレステロール（Ｓｉｇｍａ）で処理した。ＳＲＥＢＰ発現を活性化するために、次いで細胞をＰＢＳで２回洗浄し、培地を、１０％の脂質を含まないＦＢＳ、５ｍＭの（２−ヒドロキシプロピル）−β−シクロデキストリン（Ｓｉｇｍａ）及び５０μＭのロバスタチン（Ｍｅｖｉｎｏｌｉｎ，Ｓｉｇｍａ）を含有するＤＭＥＭに置き換え、示した時点で収集する。コレステロールで処理した細胞及びコレステロールを含まない細胞の両方を同じ時点で収集した。ロバスタチン／β−シクロデキストリン処理によるコレステロールの喪失は、Ｊ７７４マクロファージにおいてｍｉＲ−３３ａ及びｍＳＲＥＢＰ−２宿主遺伝子の両方の増加した発現を生じ、ＡＢＣＡ１タンパク質発現の減少と一致した（図９Ａ〜Ｃ）。コレステロール喪失に応答するＡＢＣＡ１タンパク質レベルの強力な抑制は、ｍｉＲ−３３ａアンチセンスオリゴヌクレオチドによって少なくとも部分的に反転し（図９Ｄ）、ｍｉＲ−３３が、マウスマクロファージにおけるＡＢＣＡ１レベルのコレステロールにより調節される転写後制御を介するという考えと一致した。血清／コレステロールの存在下で培養したＪ７７４マクロファージにおいて観察されたＡＢＣＡ１の高いタンパク質レベルは、更なるｍｉＲ−３３ａ前駆体によって十分に抑制され（図９Ｅ）、ＡＢＣＡ１のｍｉＲ−３３調節と一致する。加えて、コレステロールによるＡＢＣＡ１調節のｍｉＲＮＡを介して行われるこの機構は、以前に記載した肝臓Ｘ受容体（ＬＸＲ）を介するオキシステロールによるＡＢＣＡ１発現の転写制御であり（Ｔｏｎｔｏｎｏｚ  Ｐ，Ｍａｎｇｅｌｓｄｏｒｆ  Ｄ，（２００３）Ｍｏｌ．Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．１７：９８５）、複数レベルのコレステロールによるＡＢＣＡ１の細胞調節を示す。したがって、マウスｍｉＲ−３３ａ及びＳＲＥＢＰ−２宿主遺伝子は、コレステロールにより同時調節され、マクロファージにおけるＳＲＥＢＰ、ｍｉＲ−３３、ＡＢＣＡ１、及びコレステロールの逆調節ネットワークの存在を示唆する。
【００９１】
次に、Ｊ７７４マクロファージからのコレステロール流出に対するｍｉＲ−３３操作の効果を試験した。まず、細胞を［３Ｈ］−コレステロールで標識し、次いでｍｉＲ−３３ａ前駆体、ｍｉＲ−３３ａアンチセンス、又は対照オリゴヌクレオチドでトランスフェクトし、続いて血清／ａｐｏＡ−Ｉに対する［３Ｈ］−コレステロール流出のレベルを測定する。手短に述べると、低い継代のＪ７７４細胞を、抗ｍｉＲ又はＰｒｅ−マイクロＲＮＡ二本鎖によりトランスフェクトし、３００Ｋ細胞／ウェルにて２４ウェルプレートに播種し、［３Ｈ］−コレステロールを加えた。インキュベーションの２０時間後、細胞を、室温にてＰＢＳで２回洗浄し、培地を、１５μｇ／ｍｌの遊離ａｐｏ−Ａ−Ｉを含有する新鮮な培地と置き換えた。２又は４時間後、培地のアリコートを除去し、［３Ｈ］−コレステロールを、液体シンチレーション計数により測定した。細胞に存在する［３Ｈ］−コレステロールを、水酸化ナトリウム中で細胞を抽出することにより決定し、続いて液体シンチレーション計数により測定した。図９Ｆに示すように、ｍｉＲ−３３ａアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ａ）のマウスマクロファージへの導入により、［３Ｈ］−コレステロール流出の著しい（２倍）増加が生じたが、ｍｉＲ−３３ａ前駆体（Ｐ）処理は、対照オリゴヌクレオチド（ＡＣ／ＰＣ）又は偽トランスフェクト細胞（ＵＴ）と比較して、［３Ｈ］−コレステロール流出の著しい減少を生じた。これらの知見により、ＡＢＣＡ１のｍｉＲ−３３転写後抑制が、マクロファージにおいて細胞内コレステロールの保持を生じ、ＡＢＣＡ１レベルの制御を介するコレステロール輸送のｍｉＲ−３３調節と一致することが実証される。
【実施例５】
【００９２】
インビボモデルでの哺乳動物におけるｍｉＲ−３３アンチセンスによるＡＢＣＡ１レベルの操作
ｍｉＲ−３３アンチセンスアプローチによるＡＢＣＡ１レベルの操作もまた、インビボモデルでの哺乳動物において増大したＨＤＬコレステロールレベルを生じる。尾静脈注射を、ＰＢＳ（ビヒクル）、ＬＮＡ−ｍｉＲ−３３ａアンチセンス、又はＬＮＡ対照オリゴヌクレオチドを用いる処置の６週間前の間、及び処置の間、西洋型食餌（すなわち、乳脂肪から４２％ｋｃａｌを補足した）を与えたマウスに実施した。血液を、治療の開始前にコレステロール／トリグリセリドプロファイルのために実験用マウスから顎下腺出血により得た。注射を行うために、２０ｍｇ／ｋｇ／日のｍｉＲ−３３−ＬＮＡ又は対照ＬＮＡをＰＢＳ（全体積２００μｌ）に溶解し、各日、同時間に毎日の尾静脈注射を介して３日連続投与した。マウスを、最後の尾静脈注射から４８時間後に屠殺した。５日にわたる注射後、マウスを屠殺し、血清を以下のように回収した。屠殺の際に、総量１ｍＬの血液を右側脳質穿刺によってマウスから得た。血液を５分間８，０００ｒｐｍにて遠心分離して血清を得、−８０℃にて凍結した。血清コレステロール、トリグリセリド、グルコース、アラニンアミノトランスフェラーゼ（ＡＬＴ）及びアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ（ＡＳＴ）の全てを、マサチューセッツジェネラルホスピタル、比較医学のためのセンター、診断研究所においてＨｅｓｋａ  Ｄｒｉ−Ｃｈｅｍ  ４０００  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｈｅｓｋａ，Ｌｏｖｅｌａｎｄ，ＣＯ）によってｍｉＲ−３３−ＬＮＡ又は対照−ＬＮＡでの処置前後に測定した。プールした血清のＦＰＬＣ分析を記載（Ｈｙｏｇｏ  Ｈら，（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７７：３４１１７）されるように実施した。血漿ＨＤＬ−コレステロール濃度は、ＬＮＡ−対照で処置したマウスと比較して、ＬＮＡ−ｍｉＲ−３３ａアンチセンスで処置した動物において著しく増加した（図１０Ａ、Ｂ及び表２）。対照的に、ＬＤＬ−コレステロール、トリグリセリド、又はグルコースレベルの血漿濃度で有意な効果は存在しなかった（図１０Ｂ〜Ｄ及び表２）。これらの実験において、肝毒性（血漿ＡＳＴ／ＡＬＴ）も見られなかった（図１０Ｅ、Ｆ及び表２）。ＬＮＡ−ｍｉＲ−３３ａアンチセンス処置に応答して血漿ＨＤＬ−コレステロールにおいて観察された増加は、インビボでのｍｉＲ−３３ａによるＡＢＣＡ１依存性コレステロール流出の調節と一致する。
【００９３】
これらの結果により更に、コレステロール生成及び脂肪合成遺伝子の重要な調節因子である、哺乳動物のＳＲＥＢＰファミリーの転写因子が、脊椎動物において細胞内コレステロールレベル及びコレステロール恒常性を決定するＳＲＥＢＰ宿主遺伝子産物と協調して機能する、保存されたｍｉＲＮＡ（ｍｉＲ−３３ａ／ｂ）に対する宿主であることが確認される。図１０は、ｍｉＲ−３３及びその宿主遺伝子産物ＳＲＥＢＰによるコレステロール恒常性の協調した調節についてのモデルを示す。ｍｉＲ−３３は、その３’ＵＴＲを標的とすることによってＡＢＣＡ１翻訳を抑制する。このステップは、コレステロール産生遺伝子のトランス活性化を介してコレステロール生合成及び取り込みを活性化する、ＳＲＥＢＰの発現と協調する。コレステロール蓄積は、ＳＲＥＢＰ経路を阻害し、ＡＢＣＡ１の発現を活性化する。そのＡＢＣＡ１は、細胞膜に移行し、ａｐｏＡ−Ｉ及びＨＤＬへのコレステロール流出を媒介する。
【００９４】
【表２】
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表２．ロックド核酸（ＬＮＡ）−ｍｉＲ−３３ａアンチマー（antimer）を有する西洋型食餌を与えたマウスの処置。血清コレステロール（Ａ）、血漿トリグリセリド（Ｂ）、グルコース（Ｃ）、ＡＳＴ（Ｄ）、及びＡＬＴ（Ｅ）の全てを、ＰＢＳ（ビヒクル）、マウスｍｉＲ−３３ａに向けられたＬＮＡ−アンチセンスオリゴヌクレオチド、及びスクランブルＬＮＡ対照（ＬＣ）オリゴヌクレオチドの注入前後に西洋型食餌を与えたマウスにおいて測定した。
【００９５】
これらの実施例に示すように、コレステロール生成及び脂肪合成遺伝子の重要な調節因子である、哺乳動物のＳＲＥＢＰファミリーのメンバーの転写因子は、脊椎動物において細胞内コレステロールレベル及びコレステロール恒常性を決定するＳＲＥＢＰ宿主遺伝子産物と協調して機能する、保存されたｍｉＲＮＡ（ｍｉＲ−３３ａ／ｂ）に対する宿主である。ｍｉＲ−３３は、インビトロでのコレステロール輸送及びインビボでのＨＤＬ合成にとって重要な結果を有する、ＡＢＣＡ１コレステロール輸送体の転写後制御に影響を及ぼす。
【００９６】
（予測実施例６）
ｍｉＲ−３３によるＮＰＣ１の標的化
ニーマンピックＣＩ型タンパク質（ＮＰＣ１）は、トランス−ゴルジネットワーク（ＴＧＮ）を介して、後期のエンドソーム／リソソームから形質膜までのコレステロール／脂質の動員において重要な役割を果たす。このプロセスは、発生期のＨＤＬを生成するためにＡＢＣＡ１を介して行われる細胞表面におけるａｐｏＡ−Ｉ及び他のアポリポタンパク質に対するリン脂質及びコレステロールの動因と協調すると考えられる。ＮＰＣ１の３’ＵＴＲは、１つの予測されるｍｉＲ−３３標的部位を保有する（７−ｍｅｒ；ＴａｒｇｅｔＳｃａｎ  ４．２）。細胞内コレステロール輸送のその既知の役割並びに最近のＡＢＣＡ１及びコレステロール流出に対する機能的関連のために、そのＮＰＣ１の３’ＵＴＲはｍｉＲ−３３に対する候補標的である。
【００９７】
第１に、ｍｉＲＮＡプロセシング酵素のドローシャ及びダイサーを標的とするｓｉＲＮＡの使用によって、ｍｉＲＮＡが、上記の３つの細胞株においてＮＰＣ１レベルを制御するか否かを決定する。第２に、Ｐｒｅ−ｍｉＲ−３３及び抗ｍｉＲ−３３オリゴヌクレオチドを、ＮＰＣ１調節におけるｍｉＲ−３３の特定の役割を扱うためにこれらの細胞株に導入する。ＮＰＣ１タンパク質レベルを、対照としてβ−チューブリンを用いる免疫ブロット法によって決定する。ＮＰＣ１  ｍＲＮＡレベルに対するｍｉＲ−３３操作の何らかの効果をｑＲＴ−ＰＣＲにより評価する。ＮＣＰ１タンパク質及び／又はｍＲＮＡレベルに対する効果をｍｉＲ−３３操作後に観察した場合、予測されるｍｉＲ−３３標的配列を保有するＮＰＣ１  ３’ＵＴＲを、ｐＭＩＲ−ＲＥＰＯＲＴベクター内にクローニングし、その後、ＡＢＣＡ１に関して本明細書で上記したようにｍｉＲ−３３標的部位を変異し、ルシフェラーゼ発現分析を行う。コレステロール輸送／流出におけるＮＰＣ１の潜在的な役割を確立するために、Ｊ７７４マウスマクロファージ細胞株におけるＮＰＣ１のｓｉＲＮＡ標的化の効果を、ＡＢＣＡ１に関して上記した方法を用いて試験する。
【００９８】
前述の説明から、変更及び修飾が種々の用途及び状態を採用するために本明細書に記載される本発明に対してなされ得ることは明らかである。かかる実施形態はまた、添付の特許請求の範囲内である。本明細書の可変物の任意の定義における要素の記載の列挙は、記載した要素の任意の単一の要素又は組合せ（又は部分的組合せ）として可変のものの定義を含む。本明細書の実施形態の列挙は、任意の単一の実施形態又は任意の他の実施形態若しくはその一部と組み合わせた実施形態を含む。
【００９９】
参考文献
本出願に記載した全ての特許、特許出願、データベース登録、及び刊行物は、各々の独立した特許、データベース登録、及び刊行物が、参照として組み込まれている具体的かつ個々に示されるものと同程度まで本明細書に参照として組み込まれている。本明細書に参照として組み込まれるものとしては、限定されないが、以下のものが挙げられる。
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【０１００】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７Ａ】
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【図７Ｂ】
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【図７Ｃ】
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【図８Ａ】
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【図８Ｂ】
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【図８Ｃ】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図９Ｃ】
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【図９Ｄ】
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【図９Ｅ】
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【図９Ｆ】
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【図１０Ａ】
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【図１０Ｂ】
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【図１０Ｃ】
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【図１０Ｄ】
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【図１０Ｅ】
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【図１０Ｆ】
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【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１１Ｃ】
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【図１１Ｄ】
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【図１１Ｅ】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１３Ａ】
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【図１３Ｂ】
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【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１５Ａ】
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【図１５Ｂ】
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【図１６】
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【図１７】
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【配列表】
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