(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬であって、前記蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子のうちの少なくとも１が、配列番号８に示されるアミノ酸配列の４６５〜７０８番目までのアミノ酸配列からなるＣＦＰ変異体である前記試薬。
【請求項２】
蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬であって、前記基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の１〜２２２番目までのアミノ酸配列からなるペプチド断片である前記試薬。
【請求項３】
前記基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片のＮ末端とＣ末端がそれぞれ蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、請求項１又は２に記載の試薬。
【請求項４】
前記蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子が、前記タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片のＮ末端及びＣ末端に融合タンパク質として連結された蛍光タンパク質である、請求項１〜３の何れかに記載の試薬。
【請求項５】
前記蛍光タンパク質が、ＧＦＰ、ｅＧＦＰ、ＹＦＰ、ＣＦＰ、ＤｓＲｅｄ及びそれらの変異体よりなる群から選ばれる蛍光タンパク質である、請求項４に記載の試薬。
【請求項６】
前記蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片が、配列番号８に示されるアミノ酸配列からなる融合タンパク質である、請求項１に記載の試薬。
【請求項７】
前記蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片が、配列番号６又は配列番号８に示されるアミノ酸配列からなる融合タンパク質である、請求項２に記載の試薬。
【請求項８】
チロシンキナーゼ阻害剤と請求項１〜７の何れかに記載の試薬と患者から採取された検体とをインキュベートする工程、及び前記試薬からの蛍光発光を検出する工程を含む、前記検体に含まれるチロシンキナーゼの前記チロシンキナーゼ阻害剤に対する抵抗性を確認する方法。
【請求項９】
蛍光発光が、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子間における蛍光共鳴エネルギー移動により生ずる蛍光発光である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
検体が腫瘍細胞であり、インキュベートが当該腫瘍細胞の内部で行われる、請求項８又は９に記載の方法。
【請求項１１】
試験化合物の存在下で請求項１〜７の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程、及び前記試薬からの蛍光発光を測定する工程を含む、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性に対する阻害剤をスクリーニングする方法。
【請求項１２】
試験化合物の存在下で請求項１〜７の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程がＢＣＲ−ＡＢＬを発現することのできる細胞の内部で行われる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
ＳＨ２ドメインを含むペプチドとＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むペプチドの２種のペプチドからなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬であって、前記２種のペプチドがそれぞれ蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子により修飾されており、前記蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子のうちの１が、配列番号８に示されるアミノ酸配列の４６５〜７０８番目までのアミノ酸配列からなるＣＦＰ変異体である前記試薬。
【請求項１４】
前記ＳＨ２ドメインを含むペプチドが配列番号９に示されるアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項１３に記載の試薬。
【請求項１５】
前記ＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位が配列番号２に示されるアミノ酸配列の２０４〜２１１番目のアミノ酸配列である、請求項１３又は１４に記載の試薬。
【請求項１６】
ＳＨ２ドメインを含むペプチドとＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むペプチドの２種のペプチドからなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬であって、前記２種のペプチドがそれぞれ蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子により修飾されており、前記２種のペプチドのうちの少なくともいずれかが、配列番号２に示されるアミノ酸配列の１〜２２２番目までのアミノ酸配列からなるペプチド断片である前記試薬。
【請求項１７】
前記蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子が、前記ＳＨ２ドメインを含むペプチドのＮ末端と前記ＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むペプチドのＣ末端に融合タンパク質として連結された異なる蛍光タンパク質である、請求項１３〜１６の何れかに記載の試薬。
【請求項１８】
前記蛍光タンパク質が、ＧＦＰ、ｅＧＦＰ、ＹＦＰ、ＣＦＰ、ＤｓＲｅｄ及びそれらの変異体よりなる群から互いに異なって選ばれる蛍光タンパク質である、請求項１７に記載の試薬。
【請求項１９】
チロシンキナーゼ阻害剤と請求項１３〜１８の何れかに記載の試薬と患者から採取された検体とをインキュベートする工程、及び前記試薬からの蛍光発光を検出する工程を含む、前記検体に含まれるチロシンキナーゼの前記阻害剤に対する抵抗性を確認する方法。
【請求項２０】
蛍光発光が、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子間における蛍光共鳴エネルギー移動により生ずる蛍光発光である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
検体が腫瘍細胞であり、インキュベートが当該腫瘍細胞の内部で行われる、請求項１９又は２０に記載の方法。
【請求項２２】
試験化合物の存在下で請求項１３〜１８の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程、及び前記試薬からの蛍光発光を測定する工程を含む、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性に対する阻害剤をスクリーニングする方法。
【請求項２３】
試験化合物の存在下で請求項１３〜１８の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程が、ＢＣＲ−ＡＢＬを発現することのできる細胞の内部で行われる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
下記（ｉ）または（ｉｉ）をコードするＤＮＡ；
（ｉ）請求項１〜７の何れかに記載の基質タンパク質もしくはペプチド断片、
（ｉｉ）請求項１３〜１８の何れかに記載の２種のペプチド。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の化合物により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬と、それを用いた慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）及び一部の急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）患者からの検体に含まれるチロシンキナーゼの薬物感受性を確認する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
白血病は、これを放置すると重大な合併症により死に至る血液腫瘍性疾患である。白血病の一種である慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）および一部の急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）においては、９・２２番染色体の相互転座により生じる特徴的なフィラデルフィア（Ｐｈ１）染色体転座によりｂｃｒ−ａｂｌ融合遺伝子が形成され、この遺伝子から恒常的なチロシンキナーゼ活性をもつ細胞質タンパク質（ＢＣＲ−ＡＢＬ）が発現されること、そしてこのＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性によって種々のタンパク質がリン酸化されることが発症に関連していること、等が知られている。
【０００３】
白血病の治療法としては、一般に、抗癌剤等の投与による薬学的治療又は造血幹細胞移植等の移植治療のいずれか、あるいはその両方が選択される。特に、ＣＭＬの薬学的治療は、２−フェニルアミノピリミジン系化合物であるチロシンキナーゼ阻害剤の投与を中心に行われており、現在では、登録商標名「イマニチブ」（ｉｍａｔｉｎｉｂ、ＳＴＩ−５７１又は登録商標名グリーベック（Ｇｌｅｅｖｅｃ）とも呼ばれる）の投与が標準的な薬学的治療法となりつつある。
【０００４】
イマニチブは、ＢＣＲ−ＡＢＬのキナーゼドメインにおけるＡＴＰ結合部位を標的とする、選択性の高い分子標的薬物の一種である。一般に、分子標的薬物の使用は、その特異性から高い安全性と効果が期待される、理想の治療法の一つである。しかし同時に、分子標的薬物の使用は、突然変異を有する標的分子を持つ患者に対してはその期待される薬効が発揮され難いという問題を伴うことが多く、イマニチブを代表とするＢＣＲ−ＡＢＬを標的分子とした２−フェニルアミノピリミジン系化合物であるチロシンキナーゼ阻害剤もその例外ではない。
【０００５】
標準的な治療法であるイマチニブの投与によっても症状の改善を期待することが出来ない白血病患者にとって、イマニチブ以外の白血病治療薬の投与へと治療方針を速やかに変更すること、或いは白血病と診断された初期の段階から治療効果が望まれるイマニチブ以外の適切な薬物を選択して投与することは極めて重要であり、それは当該患者のイマニチブ耐性を検査することの重要性に通ずる。
【０００６】
現在、白血病患者のイマニチブ耐性の検査は、主に、患者のｂｃｒ−ａｂｌ遺伝子の塩基配列を決定してＢＣＲ−ＡＢＬの変異の種類を確認する方法（例えば非特許文献１）又はＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質であるＣｒｋＬのリン酸化をイムノブロッティングで検出する方法（例えば非特許文献２）によって、行われている。
【０００７】
しかし、前記２つの方法は何れも比較的多量の検体（腫瘍細胞）を必要とする他に、感度やダイナミックレンジの点で十分とは言えないこと、さらにイムノブロッティングでは細胞の可溶化が必要であることから、再解析のためには採血や骨髄穿刺を繰り返す必要があること、などの問題が指摘されている。
【非特許文献１】Ｓｈａｈら、Ｃａｎｃｅｒ ｃｅｌｌ、２００２年、第２巻、第２号、第１１７−１２５頁
【非特許文献２】ｔｅｎ Ｈｏｅｖｅら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ.、１９９４年、第５４巻、第１０号、第２５６３−２５６７頁
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
本発明は、ＣＭＬ患者におけるＢＣＲ−ＡＢＬの薬剤抵抗性を調べる際に有用な、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬と、それを用いたＢＣＲ−ＡＢＬの薬剤抵抗性の確認方法を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明者らは、２種の蛍光マーカーで修飾したＣｒｋＬを基質としてＢＣＲ−ＡＢＬに作用させることによって、高感度かつ広いダイナミックレンジを伴って、ＢＣＲ−ＡＢＬ  のチロシンキナーゼ活性を検出できることを見いだし、下記の各発明を完成した。
【００１０】
（１）蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬。
【００１１】
（２）前記基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片が、配列番号２に示されるアミノ酸配列からなる基質タンパク質又はその１〜２２２番目までのアミノ酸配列からなるペプチド断片である、（１）に記載の試薬。  
【００１２】
（３）前記タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片のＮ末端とＣ末端がそれぞれ蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、（１）又は（２）に記載の試薬。
【００１３】
（４）蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子が、前記タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片のＮ末端及びＣ末端に融合タンパク質として連結された蛍光タンパク質である、（１）〜（３）に記載の試薬。
【００１４】
（５）蛍光タンパク質が、ＧＦＰ、ｅＧＦＰ、ＹＦＰ、ＣＦＰ、ＤｓＲｅｄ及びそれらの変異体よりなる群から選ばれる蛍光タンパクである、（４）に記載の試薬。
【００１５】
（６）前記融合タンパク質が、配列番号４、配列番号６又は配列番号８に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質である、（４）又は（５）に記載の試薬。
【００１６】
（７）チロシンキナーゼ阻害剤と請求項１〜６の何れかに記載の試薬と患者から採取された検体とをインキュベートする工程、及び前記試薬からの蛍光発光を検出する工程を含む、前記検体に含まれるチロシンキナーゼの前記阻害剤に対する抵抗性を確認する方法。
【００１７】
（８）蛍光発光が、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子間における蛍光共鳴エネルギー移動により生ずる蛍光発光である、（７）に記載の方法。
【００１８】
（９）検体が腫瘍細胞であり、インキュベートが当該腫瘍細胞の内部で行われる、（７）又は（８）に記載の方法。
【００１９】
（１０）試験化合物の存在下で請求項１〜６の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程、及び前記試薬からの蛍光発光を測定する工程を含む、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性に対する阻害剤をスクリーニングする方法。
【００２０】
（１１）試験化合物の存在下で請求項１〜６の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程が、ＢＣＲ−ＡＢＬを発現することのできる細胞の内部で行われる、（１０）に記載の方法。
【００２１】
（１２）ＳＨ２ドメインを含むタンパク質とＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むタンパク質の２種のタンパク質からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬であって、前記２種のペプチドがそれぞれ蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子により修飾されていることを特徴とする、前記試薬。
【００２２】
（１３）前記ＳＨ２ドメインを含むタンパク質及び前記被リン酸化部位を含むタンパク質がいずれも配列番号２に示されるアミノ酸配列を含む、（１２）に記載の試薬。  
【００２３】
（１４）前記ＳＨ２ドメインを含むタンパク質が配列番号９に示されるアミノ酸配列からなる、（１２）に記載の試薬。
【００２４】
（１５）前記被リン酸化部位が配列番号２に示されるアミノ酸配列の２０４〜２１１番目のアミノ酸配列である、（１２）〜（１４）の何れかに記載の試薬。
【００２５】
（１６）蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子が、前記ＳＨ２ドメインを含むタンパク質のＮ末端と前記被リン酸化部位を含むペプチドのＣ末端に融合タンパク質として連結された異なる蛍光タンパク質である、（１２）〜（１５）の何れかに記載の試薬。
【００２６】
（１７）蛍光タンパク質が、ＧＦＰ、ｅＧＦＰ、ＹＦＰ、ＣＦＰ、ＤｓＲｅｄ及びそれらの変異体よりなる群から互いに異なって選ばれる蛍光タンパクである、（１６）に記載の試薬。
【００２７】
（１８）チロシンキナーゼ阻害剤と請求項１２〜１７の何れかに記載の試薬と患者から採取された検体とをインキュベートする工程、及び前記試薬からの蛍光発光を検出する工程を含む、前記検体に含まれるチロシンキナーゼの前記阻害剤に対する抵抗性を確認する方法。
【００２８】
（１９）蛍光発光が、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子間における蛍光共鳴エネルギー移動により生ずる蛍光発光である、（１８）に記載の方法。
【００２９】
（２０）検体が腫瘍細胞であり、インキュベートが当該腫瘍細胞の内部で行われる、（１８）又は（１９）に記載の方法。
【００３０】
（２１）試験化合物の存在下で（１２）〜（１７）の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程、及び前記試薬からの蛍光発光を測定する工程を含む、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性に対する阻害剤をスクリーニングする方法。
【００３１】
（２２）試験化合物の存在下で（１２）〜（１７）の何れかに記載の試薬とＢＣＲ−ＡＢＬとを反応させる工程が、ＢＣＲ−ＡＢＬを発現することのできる細胞の内部で行われる、（２１）に記載の方法。
【発明の効果】
【００３２】
本発明の試薬は、患者から採取される血液検体に含まれる微量の腫瘍細胞を用いてＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出することができる。またその検出は核酸の塩基配列決定やイムノブロッティングなどのような多段各かつ複雑な工程を必要とせず簡便迅速であり、かつ高感度で広いダイナミックレンジにおいて行うことができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００３３】
本発明は、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬に関する。
【００３４】
本発明の試薬は、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする２種以上の分子により修飾されている。蛍光共鳴エネルギー移動（Ｆｌｕｏｒｅａｃｅｎｓｅ Ｒｅｓｏｎａｎｃｅ Ｅｎｅｒｇｙ Ｔｒａｎｓｆｅｒ、以下ＦＲＥＴと表す）は、電子励起状態の異なる２種以上の分子間の相互作用であり、一方の分子（ドナー分子）が外部の光源による励起の後、他方の分子（アクセプター分子）にそのエネルギーが転移される現象である。
【００３５】
一般的に、ＦＲＥＴを利用する場合、ドナー分子とアクセプター分子は互いに異なる分子が使用される。この場合において、ＦＲＥＴはアクセプターの増感蛍光の出現によって、またはドナー分子からの蛍光消光によって検出され得る。また、ＦＲＥＴを達成するためには、ドナー分子は、光を吸収するとともにアクセプター分子に対して励起された電子の共鳴を通じて転移させることのできる分子であることが必要である。さらに、ＦＲＥＴを生じさせるために、ドナー分子の発光波長はアクセプター分子の励起波長よりも低いことが必要である。
【００３６】
本発明における２種以上の分子は、上記の条件を満たすＦＲＥＴを可能とするドナー分とアクセプター分子の組合せとして選択され、使用される。かかるドナー分子とアクセプター分子としては、一般的にはいずれも蛍光色素が選択される。
【００３７】
本発明における好適なドナー分子とアクセプター分子は、例えばカルボキシフルオレセイン、６−(フルオレセイン)−５，６−カルボキサミドヘキサン酸又はフルオレセインイソチオシアネート等のフルオレセイン、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８又はＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５９４等のＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ色素、Ｃｙ２、Ｃｙ３、Ｃｙ５又はＣｙ７などのシアニン色素、クマリン、Ｒ−フィコエリトリン、アロフィコエリトリン、ＸＬ６６５などの修飾アロフィコシアニン、テキサスレッド、プリンストンレッド、フィコビリプロテイン、ユーロピウムクリプテート、ＸＬ６６５、アビジン、ストレプトアビジン、ローダミン、エオシン、エリスロシン、ナフタレン、ピレン、ピリジルオキサゾール、ベンゾオキサジアゾールおよびスルホインドシアニン、それらの誘導体又はそれらの複合体等を挙げることができる。本発明においては、これらに代表されるドナー分子とアクセプター分子の中からＦＲＥＴを可能とする上記の要件を満たす組合せを選択して使用すればよい。
【００３８】
本発明で使用される前記分子の適当な組合せの例としては、ローダミンＢスルホニルクロリドおよびフルオレセインマレイミド、Ｎ−ヨードアセチル−Ｎ′−（５−スルホ−１−ナフチル）エチル−エンジアミン（１，５−ＩＡＥＤＡＮＳ）又はヨードアセトアミドとスシンイミジル６−（Ｎ−（７−ニトロベンゾ−２−オキサ−１，３−ジアゾール−４−イル）アミノ）ヘキサノエート（ＮＢＤ−Ｘ，ＳＥ）、（ジエチルアミノ）クマリン（ＤＥＡＣ）又はＮ−メチル−アントラニロイルデオキシグアニンヌクレオチド（例えばＭａｎｔｄＧＤＰ又はＭａｎｔｄＧＴＰ）とｓＮＢＤ（スクシンイミジル６−［（７−ニトロベンゾ−２−オキサ−１，３−ジアゾール−４−イル）アミノ］ヘキサノエート）などを挙げることができる。
【００３９】
また、基質タンパク質を効率的に修飾するために、前記分子はアミンまたはチオール反応性試薬、例えばイソチオシアネート、スクシンイミジルエステル、アルデヒド、ハロゲン化スルホニル、ハロゲン化アルキル、ハロアセトアミド、マレイミド、アジリジン、またはエポキシドの形態を有することが好ましく、それぞれによるＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質の修飾は、分子毎に当業者に知られたタンパク質の化学修飾法に従って行えばよい。
【００４０】
また本発明では、ＦＲＥＴを可能とする２種以上の分子として、いわゆる蛍光タンパク質を使用することができる。本発明においては種々の生物由来の蛍光タンパク質を利用することができるが、特に発光クラゲの一種であるイクオレア・ビクトリア（Ａｅｑｕｏｒｅａ ｖｉｃｔｏｒｉａ）に由来する蛍光タンパク質、いわゆるＧＦＰ（Ｇｒｅｅｎ  Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ  Ｐｒｏｔｅｉｎ）とその変異体の使用が好ましい。
【００４１】
ＧＦＰは、３９５ｎｍに励起極大を示す励起スペクトルと５０９ｎｍに発光極大を示す発光スペクトルを有し、緑色に発光するタンパク質である（Ｃｈａｌｆｉｅら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、１９９４年、第２６３巻、第８０２−８０５頁）が、特定のアミノ酸残基を他のアミノ酸に置換させた、ＧＦＰとは異なる励起・発光極大を有する人為的変異体であるＢＦＰ（Ｈｅｉｍら、１９９４年、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ１．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、第９１巻、第１２５０１−１２５０４頁）、ＣＦＰ（Ｈｅｉｍら、Ｃｕｒｒ. Ｂｉｏｌ．、１９９６年、第６巻、第１７８−１８２頁）、ＹＦＰ（Ｏｒｍｏら、１９９４年、Ｓｃｉｅｎｃｅ、第２７３巻、第１３９２−１３９５）などが開発されている。また、それぞれの蛍光強度が高められたさらなる変異体も開発されている。さらに、発光クラゲとは異なる種由来の蛍光タンパク質としてＤｓＲｅｄ（Ｔｅｒｓｋｉｋｈら、２０００年、Ｓｃｉｅｎｃｅ、第２９０巻、第１５８５−１５８８頁）も単離されている。
【００４２】
本発明の試薬においては、上記に例示される蛍光タンパク質の中から、前記のＦＲＥＴを可能とする要件を満たす組合せを選択して使用することが好ましい。本発明の試薬において好ましい蛍光タンパク質の組合せは、ＣＦＰ（ドナー分子）とＹＦＰ（アクセプター分子）である。
【００４３】
ＦＲＥＴを生じさせるもう一つの条件は、ドナー分子とアクセプター分子の間の距離である。ＦＲＥＴの効率、つまりアクセプター分子からの発光強度乃至ドナー分子の蛍光消失の程度は、両分子間の距離の６乗に反比例し、一般的に１００オングストローム以下、好ましくは５０オングストローム以下であることが必要と考えられている。本発明では、この「距離」の問題は、ＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質にＦＲＥＴを可能とする２種以上の分子を結合させる、つまりＦＲＥＴを可能とする２種以上の分子で修飾された、ＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質を使用することで解決される。
【００４４】
ＢＣＲ−ＡＢＬは、先に述べたように、フィラデルフィア（Ｐｈ１）染色体転座の結果として得られるｂｃｒ−ａｂｌ融合遺伝子にコードされる、恒常的なチロシンキナーゼ活性をもつ細胞質タンパク質であり、生体内の種々のタンパク質を基質として認識してそのチロシン残基をリン酸化する、チロシンキナーゼ活性を有する。このＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される基質タンパク質の代表的な例が、ＣｒｋＬ（配列番号２）である。
【００４５】
ＣｒｋＬは、シグナル伝達タンパク質に多く見られるドメインの代表例であるＳＨ２（Ｓｒｃ相同性２）ドメインとＳＨ３（Ｓｒｃ相同性３）ドメインとを有するアダプタータンパク質である。ＳＨ２ドメインはリン酸化チロシンを含む配列を、ＳＨ３ドメインはプロリンに富む配列を認識する機能を有すると理解されている。また、ＣｒｋＬの２０７番目のチロシン残基がＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化される。
【００４６】
意外なことに、ＦＲＥＴを可能とする２種以上の分子である２種の蛍光タンパク質（前記ＹＦＰとＣＦＰ）を融合させたＣｒｋＬをＢＣＲ−ＡＢＬでリン酸化し、これに励起光を照射することで、蛍光タンパク質間のＦＲＥＴが観測されることが見いだされた。
【００４７】
推論ではあるが、ＢＣＲ−ＡＢＬによってリン酸化されたＣｒｋＬの２０７番目のチロシン残基をＣｒｋＬのＳＨ２ドメインが認識して結合することで、ＣｒｋＬのＮ末端とＣ末端に位置する２つの蛍光タンパク質が、ＦＲＥＴが可能となる距離内に近接するようになる結果、ＦＲＥＴが観察されるものと考えられる。
【００４８】
さらに、ＣｒｋＬをＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質として利用する場合において、被リン酸化部位である２０７番目のチロシン残基のＣ末端側のアミノ酸残基の殆どがトランケートされたペプチド断片、具体的にはＣｒｋＬの１〜２２２番目のアミノ酸残基からなるペプチド断片を用いることが好ましい。このペプチド断片の両末端に上記の蛍光タンパク質を融合させた融合タンパク質を用いた場合のＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性の検出感度は、ＣｒｋＬ全長の両末端に上記の蛍光タンパク質を融合させた融合タンパク質を用いた場合と比較して、３３％程上昇する。
【００４９】
また、ＣｒｋＬ全長又は前記ペプチド断片のＣ末端側に融合させる蛍光タンパク質のアミノ酸配列の順序を変更することでも、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性の検出感度が上昇することが見いだされた。具体的には、ＣＦＰ（前記Ｈｅｉｍら）の１〜１７２番目までのアミノ酸配列と１７３〜２３８番目までのアミノ酸配列を前後するように入れ替えた、すなわちＣＦＰの１７３番目のアミノ酸が新たにＮ末端となり、１７２番目のアミノ酸が新たにＣ末端となる様にアミノ酸配列が入れ替えたＣＦＰの変異体（以下、ＣＦＰ変異体とする）を、ＣｒｋＬ全長又は前記ペプチド断片のＣ末端側に連結させた融合タンパク質とすることで、ＣｒｋＬ全長の両末端に上記の蛍光タンパク質を融合させた融合タンパク質を用いた場合と比較して検出感度が５７％上昇する。
【００５０】
この様に、本発明においてＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質としてＣｒｋＬを選択し、さらにＦＲＥＴを可能とする２種以上の分子として蛍光タンパク質を選択して前記基質タンパク質に融合させた融合タンパク質を使用する場合の好ましい態様は、Ｎ末端から順に、ＹＦＰ−ＣｒｋＬ−ＣＦＰ（配列番号４）、ＹＦＰ−ＣｒｋＬ−ＣＦＰ変異体、ＹＦＰ−ＣｒｋＬの１〜２２２アミノ酸残基からなるペプチド断片−ＣＦＰ（配列番号６）、及びＹＦＰ−ＣｒｋＬの１〜２２２アミノ酸残基からなるペプチド断片−ＣＦＰ変異体（配列番号８）という構成を有する融合タンパク質である。特に好ましい態様は、ＹＦＰ−ＣｒｋＬの１〜２２２アミノ酸残基からなるペプチド断片−ＣＦＰ変異体（配列番号８）という構成を有する融合タンパク質である。なお、Ｎ末端とＣ末端に連結させる蛍光タンパク質は、相互に位置を入れ替えて使用してもよい。
【００５１】
また本発明は、上記とは異なる別態様として、ＳＨ２ドメインを含むタンパク質とＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むタンパク質の２種のタンパク質からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬であって、前記２種のタンパク質がそれぞれ蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子により修飾されていることを特徴とする、前記試薬を提供する。ここで、ＳＨ２ドメイン、ＢＣＲ−ＡＢＬ、及び蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）を可能とする分子については、先に説明したとおりである。
【００５２】
上記別態様におけるＳＨ２ドメインを含むペプチドとＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むタンパク質は、いずれも配列番号２で示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、すなわちＣｒｋＬか、又はその被リン酸化部位である２０７番目のチロシン残基のＣ末端側のアミノ酸残基の殆どがトランケートされたペプチド断片、具体的にはＣｒｋＬの１〜２２２番目のアミノ酸残基からなるペプチド断片であってよい。
【００５３】
すなわち、上記別態様は、アミノ酸配列レベルでは同一であるが、蛍光共鳴エネルギー移動を可能とする異なる分子により修飾された点で相違する２種のタンパク質からなる、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬に関する。
【００５４】
この態様における好ましい例は、上記に説明したＦＲＥＴのドナー分子で修飾されたＣｒｋＬとアクセプター分子で修飾されたＣｒｋＬからなる試薬、ＦＲＥＴのドナー分子で修飾された前記ペプチド断片とアクセプター分子で修飾された前記ペプチド断片とからなる試薬である。特に、ＹＦＰとＣｒｋＬとの融合タンパク質とＣｒｋＬとＣＦＰとの融合タンパク質とからなる試薬、又はＹＦＰと前記ペプチド断片との融合タンパク質と前記ペプチド断片とＣＦＰとの融合タンパク質とからなる試薬が好ましい。
【００５５】
さらに上記別態様は、実質的にＳＨ２ドメインからなるタンパク質と、実質的にＢＣＲ−ＡＢＬによって認識されリン酸化される最小単位を構成するアミノ酸配列とからなるタンパク質の２種類のタンパク質からなり、前記タンパク質がそれぞれＦＲＥＴを可能にする異なる分子で修飾されている、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を検出するための試薬も提供する。
【００５６】
この別態様における好ましい例は、上記に説明したＦＲＥＴのアクセプター分子で修飾されたＳＨ２ドメインからなるタンパク質とドナー分子で修飾されたＢＣＲ−ＡＢＬによって認識されリン酸化される最小単位を構成するアミノ酸配列からなるタンパク質とからなる試薬である。ここで実質的にＳＨ２ドメインからなるタンパク質は、例えば配列番号９に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質であり得、またＢＣＲ−ＡＢＬによって認識されリン酸化される最小単位を構成するアミノ酸配列は、ＣｒｋＬの２０４〜２１１番目のアミノ酸配列であり得る。
【００５７】
上記の別態様における特に好ましい態様は、ＹＦＰとＳＨ２ドメインからなるタンパク質との融合タンパク質とＣｒｋＬの２０４〜２１１番目のアミノ酸配列からなるタンパク質とＣＦＰとの融合タンパク質とからなる試薬、及びＹＦＰとＳＨ２ドメインからなるタンパク質との融合タンパク質とＣｒｋＬの２０４〜２１１番目のアミノ酸配列からなるタンパク質と前記ＣＦＰ変異体との融合タンパク質である。
【００５８】
上記に述べた本発明における試薬はいずれも、ＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片、ＳＨ２ドメインを含むタンパク質、又はＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むタンパク質を、遺伝子組み換え技術により作製し、これらを先に説明したＦＲＥＴを可能とする分子を用いて修飾することにより製造することができる。あるいは、ＦＲＥＴを可能とする分子として蛍光タンパク質が選択される本発明の好ましい態様は、ＢＣＲ−ＡＢＬの基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片、ＳＨ２ドメインを含むタンパク質、又はＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むタンパク質と蛍光タンパク質との融合タンパク質を、当業者に広く知られた一般的な融合タンパク質の製造方法に従って作ることができる。
【００５９】
基質タンパク質又は被リン酸化部位を含むそのペプチド断片、ＳＨ２ドメインを含むタンパク質、又はＢＣＲ−ＡＢＬによって認識される被リン酸化部位を含むタンパク質、あるいは本発明の好ましい態様である融合タンパク質（以下、本発明に係るタンパク質と表す）は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ（Ｍａｎｉａｔｉｓ  Ｔ．ら、ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８２年）その他の、遺伝子工学に関する実験操作法を紹介したマニュアルに記載された種々の方法を用いて、いわゆる組み換えタンパク質として製造することができる。
【００６０】
典型的には、本発明に係るタンパク質をコードする核酸を含む発現ベクターを構築し、適当な宿主に当該ベクターを組み込んで形質転換細胞を作製し、この細胞に本発明に係るタンパク質を発現させ、公知の方法によって本発明に係るタンパク質を回収し、さらに必要に応じて精製して使用すればよい。
【００６１】
前記本発明に係るタンパク質をコードする核酸は、本願配列表に記載された塩基配列情報を基に、ホスホアミダイト法などの化学合成的手法により、あるいは市販のＤＮＡシンセサイザー等を用いて製造することができる。また、ＣｒｋＬや蛍光タンパク質は何れも公知のタンパク質であることから、これらタンパク質をコードする当業者が入手可能な核酸又はその核酸を含むベクター等から、ＰＣＲその他の方法によって適宜増幅して利用してもよい。
【００６２】
前記本発明に係るタンパク質をコードする核酸を含む発現ベクターは、環状、直鎖状等いかなる形態のものであってもよい。かかる発現ベクターは、前記本発明に係るタンパク質をコードする核酸の塩基配列の他に、必要ならば他の塩基配列を有していてもよい。他の塩基配列とは、エンハンサー配列、プロモーター配列、リボゾーム結合配列、コピー数の増幅を目的として使用される塩基配列、シグナルペプチドをコードする塩基配列、他のポリペプチドをコードする塩基配列、ポリＡ付加配列、スプライシング配列、複製開始点、選択マーカーとなる遺伝子の塩基配列等のことである。
【００６３】
遺伝子組み換えに際しては、適当な合成ＤＮＡアダプターを用いて翻訳開始コドンや翻訳終止コドンを本発明に係るタンパク質をコードする核酸に付加したり、あるいは塩基配列内に適当な制限酵素切断配列を新たに発生させたりあるいは消失させたりすることも可能である。これらは当業者が通常行う作業の範囲内であり、当業者は本発明に係るタンパク質をコードする核酸を基に任意かつ容易に加工することができる。
【００６４】
また本発明に係るタンパク質をコードする核酸を保持するベクターは、使用する宿主に応じた適当なベクターを選択して使用すればよく、プラスミドの他にバクテリオファージ、バキュロウイルス、レトロウィルス、ワクシニアウィルス等の種々のウイルスを用いることが可能であるが、利用可能な市販の発現ベクターとしては、ｐＥＴ―２３ｄ（Ｎｏｖａｇｅｎ社製）、ｐＥＴ―２８ａ（Ｎｏｖａｇｅｎ社製）、等を例示することができる。
【００６５】
本発明に係るタンパク質をコードする核酸は、適当な発現プロモーターに連結させて使用することが好ましい。その様な発現プロモーターは、宿主及び発現の目的に応じて適宜選択すればよく、例えば宿主がエシェリヒア属細菌、好ましくは大腸菌である場合にはＴ７プロモーター、ｌａｃプロモーター、ｔｒｐプロモーター、λＰＬプロモーターなどが、宿主がバチルス属細菌、好ましくはＢ．ｓｕｂｔｉｌｌｉｓである場合にはＰ４３プロモーター，ｖｅｇＩプロモーター、ｘｙｌｏｓｅ―ｉｎｄｕｃｉｂｌｅ プロモーター、ｔｅｔｒａｃｙｃｌｉｎｅ ｉｎｄｕｃｉｂｌｅ プロモーター等を挙げることができる。また、宿主が酵母である場合にはＰＨＯ５プロモーター、ＧＡＰプロモーター、ＡＤＨプロモーター等が、宿主が動物細胞である場合にはＳＶ４０由来プロモーター、レトロウィルスプロモーター、サイトメガロウイルス（ヒトＣＭＶ）のＩＥ（ｉｍｍｅｄｉａｔｅ ｅａｒｌｙ）遺伝子のプロモーター、メタロチオネインプロモーター、ヒートショックプロモーター、ＳＲαプロモーター等を挙げることができる。
【００６６】
本発明に係るタンパク質は、例えばＦｍｏｃ法（フルオレニルメチルオキシカルボニル法）やｔＢｏｃ法（ｔ−ブチルオキシカルボニル法)等の、有機化学的合成方法、あるいは市販されている適当なペプチド合成機を用いて製造することもできるが、遺伝子組換え技術によって、前記の核酸、特に発現ベクターに組み込まれたＤＮＡを原核生物もしくは真核生物から選択される適当な宿主細胞を用いた好適な発現系に導入することによって製造することが好ましい。
【００６７】
宿主細胞の例としては、エシェリヒア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）属細菌、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）属細菌の他に、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属細菌、ブレビバクテリウム（Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属細菌、セラチア（Ｓｅｒｒａｔｉａ）属細菌、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属細菌、アースロバクター（Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ）属細菌、エルウニア（Ｅｒｗｉｎｉａ）属細菌、メチロバクテリウム（Ｍｅｔｈｙｌｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属細菌、ロドバクター（Ｒｈｏｄｏｂａｃｔｅｒ）属細菌、ストレプトミセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）属微生物、ザイモモナス（Ｚｙｍｏｍｏｎａｓ）属微生物、サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）属酵母等の微生物を挙げることができる。またカイコなどの昆虫細胞、ＨＥＫ２９３細胞、ＭＥＦ細胞、Ｖｅｒｏ細胞、Ｈｅｌａ細胞、ＣＨＯ細胞、ＷＩ３８細胞、ＢＨＫ細胞、ＣＯＳ−７細胞、ＭＤＣＫ細胞、Ｃ１２７細胞、ＨＫＧ細胞、ヒト腎細胞株等の動物細胞も利用可能である。
【００６８】
宿主細胞に発現ベクターを導入する方法としては、前記のＭａｎｉａｔｉｓ  Ｔ．らを初めとする実験操作マニュアル書に記載されている方法、例えば、エレクトロポレーション法、プロトプラスト法、アルカリ金属法、リン酸カルシウム沈澱法、ＤＥＡＥデキストラン法、マイクロインジェクション法、パーティクルガン法等により行うことができる。Ｓｆ９やＳｆ２１等の昆虫細胞の利用については、バキュロウイルス・エクスプレッション・ベクターズ、ア・ラボラトリー・マニュアル、ダブリュー・エイチ・フリーマン・アンド・カンパニー（Ｗ． Ｈ． Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ）、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９２年）やＢｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、１９８８年、第６巻、第４７頁等に記載されている。
【００６９】
本発明に係るタンパク質は、前記の発現ベクターを上記の宿主細胞内で発現させ、宿主細胞或いは培地から目的とするタンパク質を回収し、精製することによって得ることができる。タンパク質を精製する方法としては、蛋白質の精製に通常使用されている方法の中から適切な方法を適宜選択して行うことができる。すなわち、塩析法、限外濾過法、等電点沈澱法、ゲル濾過法、電気泳動法、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィーや抗体クロマトグラフィー等の各種アフィニティークロマトグラフィー、クロマトフォーカシング法、吸着クロマトグラフィーおよび逆相クロマトグラフィー等、通常使用され得る方法の中から適切な方法を適宜選択し、必要によりＨＰＬＣシステム等を使用して適当な順序で精製を行えば良い。
【００７０】
なお、本発明におけるタンパク質は、そのＮ末端及び／又はＣ末端に、さらにＣｒｋＬ以外の機能性タンパク質又はポリペプチドを付加させて作製してもよい。特にＦＬＡＧタグ、ヒスチジンタグ又はキチン結合配列のように、組み換えタンパク質の製造、特に組み換えタンパク質の精製を容易にする機能性ポリペプチドの利用が好ましい。
【００７１】
本発明に係るタンパク質を他の機能性タンパク質やタグ等との融合タンパク質として発現させた場合には、その機能性タンパク質やポリペプチドに特徴的な精製法を採用することが好ましい。融合タンパク質は、適当なプロテアーゼ（トロンビン、トリプシン等）を用いて切断し、本発明のタンパク質を回収することができる。また、組換えＤＮＡ分子を利用して無細胞系の合成方法で得る方法も、遺伝子工学的に生産する方法の１つである。
【００７２】
さらに本発明は、上記のいずれかの試薬とチロシンキナーゼ阻害剤と患者から採取された検体とをインキュベーションする工程、及び前記試薬からの蛍光発光を検出する工程を含む、前記検体に含まれるチロシンキナーゼの前記阻害剤に対する抵抗性を確認する方法を提供する。
【００７３】
本発明の試薬は、先に説明した様に、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性により所定のチロシン残基がリン酸化されると、試薬に含まれる２種以上の分子は蛍光共鳴エネルギー移動が可能となる距離に接近する。ここに前記分子の一方（ドナー分子）に対する励起波長の光を照射することによってＦＲＥＴが生じ、もう一方の分子（アクセプター分子）からの蛍光発光が観察される。例えば、本発明に係る好適な試薬である配列番号８に示されるアミノ酸配列からなる融合タンパク質を用いる場合、ドナー分子であるＣＦＰの励起波長である４４０ｎｍの光を照射することによって、アクセプター分子であるＹＦＰから５３０ｎｍの発光を測定する。
【００７４】
この反応系において、ＢＣＲ−ＡＢＬが含まれると想定される患者から採取された検体とチロシンキナーゼ阻害剤とを共存させると、チロシンキナーゼ阻害剤がＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を阻害し得るものである場合には、所定のチロシン残基のリン酸化が阻害される結果、ＦＲＥＴによる蛍光強度が減少あるいは観測されなくなる。したがって、このＦＲＥＴを測定することで、患者から採取された検体に含まれると想定されるＢＣＲ−ＡＢＬが当該チロシンキナーゼ阻害剤に抵抗性を示すか否かを確認することができる。
【００７５】
本発明の方法は、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を直接測定することでＢＣＲ−ＡＢＬの薬剤への抵抗性を確認するため、任意の変異が生じたＢＣＲ−ＡＢＬであっても薬剤抵抗性の評価を行うことができる。また、ｂｃｒ−ａｂｌ遺伝子の塩基配列を解析する方法やイムノブロッティングを用いた方法では、それらの実施に際して１０４個又はそれ以上の腫瘍細胞が必要となるのに対して、本発明の方法の実施に必要とされる腫瘍細胞の数はわずかに１０個程度で足り、よりも少ない検体量（細胞数）で実施可能である。
また、既存の方法、例えばイムノブロッティングを用いた方法におけるＢＣＲ−ＡＢＬの薬剤抵抗性を判定する際の、当該薬剤の有効濃度は、概ね１μＭ以上、特に１０μＭ以上であるのに対して、本発明の方法は、薬剤の濃度が０．１μＭ以下であっても、また１０μＭ以上であっても、その薬剤に対するＢＣＲ−ＡＢＬの抵抗性を判定することができる。このことは本発明の方法は、既存の方法よりも広いダイナミックレンジを有する方法として、既存の方法よりも定量的な情報を取得することが可能である点で有利な方法であることを意味する。
【００７６】
本発明の方法は、患者から採取された検体中の腫瘍細胞から適当な方法によって細胞抽出液を調製し、これをＢＣＲ−ＡＢＬとして使用してもよい。また、細胞抽出液を調製する代わりに、本発明の試薬を検体中の腫瘍細胞に導入し、生きた腫瘍細胞内でＢＣＲ−ＡＢＬと反応させて、腫瘍細胞内でのＦＲＥＴを観測ないし測定することもできる。本発明の試薬として好適な例として先に説明した融合タンパク質を使用する場合には、前記融合タンパク質をコードする核酸を含み、前記融合タンパク質を適当な条件下で発現することのできる発現ベクターを用いて腫瘍細胞を形質転換させ、前記融合タンパク質の発現を誘導することで、腫瘍細胞内でのＦＲＥＴを観測ないし測定することができる。
【００７７】
また本発明の試薬を用いることで、蛍光強度の変化からＢＣＲ−ＡＢＬの当該チロシンキナーゼ阻害剤に対する抵抗性を定量化することができる。このことは、チロシンキナーゼ阻害剤又はチロシンキナーゼ活性を阻害すると期待される物質のＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性に対する阻害作用を検出し、さらにはその阻害作用を定量化することもできることを意味する。この様に、本発明は、本発明に係る試薬を用いて、ＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性に対する阻害剤をスクリーニングする方法も提供するものである。
【００７８】
本発明のスクリーニング方法は、必要とされる構成物が少なく、また反応も比較的単純な工程で終了するため、ハイスループットスクリーニング（ＨＴＰ）への応用が可能であり、ＣＭＬやＡＬＬに対する治療薬の探索や開発に利用することができる。
【００７９】
以下、非限定的な実施例を示して、本発明をさらに詳細に説明する。
【実施例】
【００８０】
＜実施例１＞
（１）発現カセットを有するベクターの構築
ＥＹＦＰの変異体であるＶｅｎｕｓをコードする塩基配列を含むＤＮＡ（理化学研究所  宮脇敦史博士から譲渡を受けた）に対して、増幅後のＤＮＡ断片が、当該塩基配列の終止コドンが欠失され、かつ増幅後のｃＤＮＡの５’及び３’末端にそれぞれ制限酵素ＥｃｏＲＩとＸｈｏＩの認識配列が導入された塩基配列を有するように設計・合成されたプライマーＤＮＡを用いて、前記ＶｅｎｕｓをコードするＤＮＡに対してＰＣＲ反応を行い、増幅ＤＮＡ断片１を得た。
【００８１】
また、ベクターｐＥＣＦＰ−Ｃ１（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ社）のＥＣＦＰをコードする領域に対して、増幅後のｃＤＮＡが、その５’及び３’末端にそれぞれ制限酵素ＮｏｔＩとＢｇｌＩＩの認識配列が導入された塩基配列を有するように設計・合成されたプライマーＤＮＡを用いて、前記ベクターｐＥＣＦＰ−Ｃ１に対してＰＣＲ反応を行い、増幅ＤＮＡ断片２を得た。
【００８２】
前記増幅ＤＮＡ断片１を、制限酵素ＥｃｏＲＩとＸｈｏＩで開環させた真核生物発現ベクターｐＣＡＧＧＳ（Ｍｉｙａｚａｋｉら、Ｇｅｎｅ、１９８９年、第７９巻、第２号、第２６９‐２７７頁）に組み換えて、ｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓを得た。さらにこのｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓを制限酵素ＮｏｔＩとＢｇｌＩＩで開環させ、上記増幅ＤＮＡ断片２を組み換えて、ｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓ−ＥＣＦＰを得た。
【００８３】
（２）ＹＦＰ−ＣｒｋＬ−ＣＦＹ用発現ベクターの構築
ＣｒｋＬの全長アミノ酸配列をコードする塩基配列を含むベクターｐＣＸＮ２−ＦＬＡＧ−ＣｒｋＬ（ロックフェラー大学Ｋｎｕｄｓｅｎ博士から分与を受けた）に対して、増幅後のｃＤＮＡが、当該塩基配列の終止コドンが欠失され、かつ５’及び３’末端にそれぞれ制限酵素ＸｈｏＩとＮｏｔＩの認識配列が導入された塩基配列を有するように設計・合成されたプライマーＤＮＡを用いてＰＣＲ反応を行い、増幅ＤＮＡ断片３を得た。
【００８４】
この増幅ＤＮＡ断片３を、制限酵素ＸｈｏＩとＮｏｔＩで開環させたｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓ−ＥＣＦＰに組み換えて、ＥＹＦＰとＣＦＰがそれぞれＣｒｋＬのＮ末端とＣ末端に連結された融合タンパク質を発現することのできるベクターｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓ−ＣｒｋＬ−ＥＣＦＰを得た。以下、このベクターをｐＰｉｃｋｌｅ＿１．０と、またこれにコードされる融合タンパク質をＰｉｃｋｌｅｓ１．０と表す。
【００８５】
（３）ＹＦＰ−ＣｒｋＬ１〜２２２−ＣＦＰ用発現ベクターの構築  
ＣｒｋＬの全長アミノ酸配列をコードする塩基配列を含むベクターｐＣＸＮ２−ＦＬＡＧ−ＣｒｋＬに対して、増幅後のｃＤＮＡがＣｒｋＬの１〜２２２番目までのアミノ酸配列をコードし、かつ５’及び３’末端にそれぞれ制限酵素ＸｈｏＩとＮｏｔＩの認識配列が導入された塩基配列を有するように設計・合成されたプライマーＤＮＡを用いてＰＣＲ反応を行い、増幅ＤＮＡ断片４を得た。
【００８６】
この増幅ＤＮＡ断片４を、制限酵素ＸｈｏＩとＮｏｔＩで開環させたｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓ−ＥＣＦＰに組み換えて、ＥＹＦＰとＣＦＰがそれぞれＣｒｋＬの１〜２２２番目までのアミノ酸配列のＮ末端とＣ末端に連結された融合タンパク質を発現することのできるベクターｐＣＡＧＧＳ−Ｖｅｎｕｓ−ＣｒｋＬ２２２−ＥＣＦＰを得た。以下、このベクターをｐＰｉｃｋｌｅ＿２．０と、またこれにコードされる融合タンパク質をＰｉｃｋｌｅｓ２．０と表す。
【００８７】
（４）ＹＦＰ−Ｃｒｋｌ２２２−ＣＦＰ変異体用発現ベクターの構築
ベクターｐＥＣＦＰ−Ｃ１（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ社）のＥＣＦＰをコードする領域に対して、増幅後のｃＤＮＡが、当該領域の終止コドンが欠失され、かつ５’及び３’末端にそれぞれ制限酵素ＮｏｔＩとＢｇｌＩＩの認識配列が導入された塩基配列を有するように設計・合成されたプライマーＤＮＡを用いてＰＣＲ反応を行って増幅ＤＮＡ断片５を得た。
【００８８】
この増幅ＤＮＡ断片５を、制限酵素ＮｏｔＩとＢａｍＨＩで開環させた市販のクローニングベクターｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫＩＩ（＋）（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ社）に組み換えて、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ−ＥＣＦＰを得た。
【００８９】
同様に、増幅後のｃＤＮＡが、その５’および３’末端にそれぞれ制限酵素ＢａｍＨＩとＢｇｌＩＩの認識配列が挿入された塩基配列を有するように設計合成されたプライマーＤＮＡを用いてＰＣＲ反応を行い、増幅ＤＮＡ断片６を得、制限酵素ＢａｍＨＩとＢｇｌＩＩで開環させたｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ−ＥＣＦＰに組み換えて、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ−ＥＣＦＰ−ＥＣＦＰを得た。
【００９０】
さらに、ＹＦＰの変異体であるＶｅｎｕｓに対して行われたＮａｇａｉらの方法（Ｎａｇａｉ ｅｔ ａｌ．、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，２００４年、第１０１巻、第２９号、第１０５５４−９頁）に従い、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ−ＥＣＦＰ−ＥＣＦＰを鋳型として、ＣＦＰ変異体をコードする塩基配列及び５’並びに３’末端に制限酵素ＮｏｔＩとＢｇｌＩＩの認識配列が挿入された塩基配列を有するように設計・合成されたプライマーＤＮＡを用いてＰＣＲ反応を行った。
【００９１】
この方法により得られる塩基配列がコードするＣＦＰ変異体は、全２３８アミノ酸残基からなる変異前のＣＦＰをＣＦＰ１−２３８と表すと、下記の通りとなる。
【００９２】
Ｐｉｃｋｌｅ２．１：ＣＦＰ４９−２３８・１−４８
Ｐｉｃｋｌｅ２．２：ＣＦＰ１５７−２３８・１−１５６
Ｐｉｃｋｌｅ２．３：ＣＦＰ１７３−２３８・１−１７２
Ｐｉｃｋｌｅ２．４：ＣＦＰ１９５−２３８・１−１９４
Ｐｉｃｋｌｅ２．５：ＣＦＰ２２９−２３８・１−２２８
【００９３】
なお、ＣＦＰ４９−２３８・１−４８は、そのＣＦＰ変異体のアミノ酸配列が、変異前のＥＣＦＰの４９番目のアミノ酸から２３８番目のアミノ酸がＮ末端側となり、これに続いて変異前のＥＣＦＰの１−４８番目のアミノ酸配列がＣ末端部分のアミノ酸配列として連結されたアミノ酸配列であることを示す。その他のＣＦＰ変異体も、この表記に倣う。
【００９４】
このようにして得たＰｉｃｋｌｅ２．１〜２．５をコードする増幅ＤＮＡ断片を、制限酵素ＮｏｔＩとＢｇｌＩＩで開環させた発現ベクターｐＰｉｃｋｌｅ２．０に組み換えて、それぞれｐＰｉｃｋｌｅ２．１〜２．５を作製した。
【００９５】
（５）ＢＣＲ−ＡＢＬ発現ベクターの構築
ＢＣＲ−ＡＢＬ全長の翻訳領域を含むｃＤＮＡ（カリフォルニア工科大学Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ博士より分与を受けた）には、ｂｃｒ−ａｂｌの開始コドンの５’側にＥｃｏＲＩの認識配列、８７０−８７１番目のアミノ酸に相当する部位にＨｉｎｄＩＩＩの認識配列、及び終止コドンの３’側にＳｐｅＩの認識配列が存在する。このｃＤＮＡをＳｐｅＩで消化し、ｄＮＴＰ存在下でＤＮＡポリメラーゼＩ（Ｋｌｅｎｏｗ酵素、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）を反応させて平滑末端化した後、ＨｉｎｄＩＩＩで消化して、ｃＤＮＡ断片（ＢＣＲ−ＡＢＬ（３’））を調製した。
【００９６】
市販の発現ベクターｐＣＭＶ−３Ｍｙｃ−２Ａ（ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎｅ社）をＸｈｏＩによる消化し、ｄＮＴＰ存在下でＤＮＡポリメラーゼＩによる平滑末端化を行い、さらにＨｉｎｄＩＩＩによる消化を行って開環させた。この開環させた発現ベクターにＢＣＲ−ＡＢＬ（３’）を組み換えて、ｐＣＭＶ−Ｍｙｃ−ＢＣＲ−ＡＢＬ（３’）を作製した。
【００９７】
次に、ＢＣＲ−ＡＢＬ全長の翻訳領域を含むｃＤＮＡをＥｃｏＲＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化して、ＢＣＲ−ＡＢＬの翻訳領域の５’末端側の一部を含むｃＤＮＡ断片（ＢＣＲ−ＡＢＬ（５’））を得た。このｃＤＮＡ断片を、ＥｃｏＲＩとＨｉｎｄＩＩＩで開環させたｐＣＭＶ−Ｍｙｃ−ＢＣＲ−ＡＢＬ（３’）に組み換えて、ｐＣＭＶ−Ｍｙｃ−ＢＣＲ−ＡＢＬを作製した。
【００９８】
（６）遺伝子導入
２９３Ｆ細胞（Ｉｎｖｉｒｔｏｇｅｎ社）をＦｒｅｅ ｓｔｙｌｅ ２９３ ｍｅｄｉｕｍ（同社）中で培養し、２９３ｆｅｃｔｉｏｎ（同社）に添付されたプロトコールに従って、ｐＣＭＶ−Ｍｙｃ−ＢＣＲ−ＡＢＬとｐＰｉｃｋｌｅ１．０〜２．５を導入し、前記培地中で２４〜３６時間インキュベーション後、遠心分離で細胞を回収した。細胞を可溶化バッファー（１５ｍＭ ＮａＣｌ、０．５％ ＴｒｉｔｏｎＸ−１００を含む２０ｍＭトリス塩酸緩衝液ｐＨ７．５）で溶解し、遠心分離後の上清をサンプルとして、分光光度計ＦＰ−７５０（日本分光社）を用いて、４２０ｎｍの励起光により生じる蛍光発光（５３０ｎｍ）を測定した。蛍光強度の比較は、ｐＰｉｃｋｌｅ１．０〜２．５のみを導入した各コントロールとの間で行った。
【００９９】
この結果、Ｐｉｃｋｌｅ１．０、２．０及び２．３において、各コントロール細胞に対してＢＣＲ−ＡＢＬ依存的な蛍光発光の上昇が確認された（図１）。特に、Ｐｉｃｋｌｅ２．０ではコントロールに対して４０％、Ｐｉｃｌｅ２．３ではコントロールに対して７７％の上昇が見られた。また、Ｐｉｃｋｌｅ１．０に対してＰｉｃｋｌｅ２．０は１．２４倍、Ｐｉｃｋｌｅ１．０に対してＰｉｃｋｌｅ２．３は１．５７倍、それぞれ強度が上昇した。
【０１００】
＜実施例２＞
実施例１の（６）と同様にして２９３Ｆ細胞にｐＣＭＶ−Ｍｙｃ−ＢＣＲ−ＡＢＬとｐＰｉｃｋｌｅ２．０を導入して、前記培地中で２４〜３６時間培養した。ＢＣＲ−ＡＢＬの発現量を導入するベクター量の調整を行うことによって段階的に調節し、それぞれのロットにおける蛍光発光を、（６）と同様にして測定した。また、各ロットの細胞抽出物を、ＳＤＳゲルを用いて電気泳動した後、抗ＣｒｋＬ抗体、抗リン酸化ＣｒｋＬ抗体（いずれもＣｅｌｌ Ｓｉｇｎａｌｌｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社）及び抗ｃ−Ａｂｌ抗体（Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社）を用いてウエスタンブロッティングを行った。
【０１０１】
その結果、Ｐｉｃｋｌｅ２．０からの蛍光発光は、ＢＣＲ−ＡＢＬの容量に依存して上昇することが確認された（図２）。またこの蛍光発光の上昇とＰｉｃｋｌｅのリン酸化に正の相関があることも確認された（図３）。
【０１０２】
＜実施例３＞
実施例１の（６）と同様にして２９３Ｆ細胞にｐＣＭＶ−Ｍｙｃ−ＢＣＲ−ＡＢＬとｐＰｉｃｋｌｅ２．０を導入して、さらに所定量（０．０１〜１０μＭ）のイマニチブ（ノバルティス社から供与を受けた）を培地に添加して、２４〜４８時間培養を行った。各ロットにおける蛍光発光を、実施例１の（６）と同様にして測定した。また、実施例２と同様にしてウエスタンブロッティングを行った。
【０１０３】
その結果、Ｐｉｃｋｌｅ２．０からの蛍光発光は、イマニチブの添加に対して時間依存的に抑制されること（図４）、イマニチブの容量依存的に抑制されること（図５）が確認された。一方、イムノブロッティングによるリン酸化されたＰｉｃｋｌｅの量の検出では、高濃度（１〜１０μＭ以上）のイマニチブにおいて確認可能であり（図６）、本発明の試薬を用いた検出がイムノブロッティング方よりも高感度であることが確認された。
【０１０４】
＜実施例４＞
ＢＣＲ−ＡＢＬ陽性であるヒト慢性骨髄性白血病由来Ｋ５６２細胞を、１０％牛胎児血清を添加したＲＰＭＩ１６４０培地（Ｓｉｇｍａ社）中で、３７℃、５％ＣＯ２下で２４時間培養した後、ＮｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒＴ−０２０ ＳｏｌｕｔｉｏｎＶ（Ａｍａｘａ社）を用いてｐＰｉｃｋｌｅ２．０を導入した。細胞を１μＭのイマニチブを含む前記培地／ポリＬリジンコートした３５ｍｍガラス底培養皿に移し、提示毎にタイムラプス顕微鏡で観察を行いながら、４８時間インキュベートした。観察法およびＦＲＥＴの計算は、Ｏｈｂａらの方法（ＥＭＢＯ Ｊ．、２００３年、第２２巻、第４号、第８５９−８６９頁）に従って行った。
【０１０５】
その結果、腫瘍細胞の内部におけるＢＣＲ−ＡＢＬ、イマニチブ及びＰｉｃｋｌｅ２．０のインキュベーションにより、時間依存的にＰｉｃｋｌｅ２．０からの蛍光発光が低下することが確認された（図７）
【０１０６】
また、イマニチブの投与量を０．０１〜１０μＭの範囲で段階的に変化させて上記と同様にしてインキュベーションした細胞から、（６）と同様にして細胞抽出液を調製し、抗ＣｒｋＬ抗体と抗リン酸化ＣｒｋＬ抗体を用いてウエスタンブロッティングを行ったところ、リン酸化されたＰｉｃｋｌｅ２．０の検出量の低下は、イマニチブの濃度が１０μＭの場合において観察された（図８）。
【図面の簡単な説明】
【０１０７】
【図１】Ｐｉｃｋｌｅ１．０、２．０及び２．３を用いてＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性を測定したときの、各コントロール細胞に対する蛍光発光の上昇を示すグラフである。左図が蛍光スペクトルチャートを、右図が上昇率を数値化したグラフを示す。
【図２】Ｐｉｃｋｌｅ２．０を用いたＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性測定における蛍光発光が、ＢＣＲ−ＡＢＬの用量依存的に上昇することを示すグラフである。左図が蛍光スペクトルチャートを、右図が上昇率を数値化したグラフを示す。
【図３】Ｐｉｃｋｌｅ２．０を用いたＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性測定において、ＢＣＲ−ＡＢＬの用量依存的にリン酸化されたＰｉｃｋｌｅが増加することを示す、ウエスタンブロッティングの結果である。
【図４】Ｐｉｃｋｌｅ２．０を用いたＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性測定において、イマニチブの存在により時間依存的に蛍光発光が減少することを示すグラフである。左図が蛍光スペクトルチャートを、右図が減少率を数値化したグラフを示す。
【図５】Ｐｉｃｋｌｅ２．０を用いたＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性測定において、イマニチブの用量依存的に蛍光発光が減少することを示すグラフである。左図が蛍光スペクトルチャートを、右図が減少率を数値化したグラフを示す。
【図６】Ｐｉｃｋｌｅ２．０を用いたＢＣＲ−ＡＢＬのチロシンキナーゼ活性測定において、イマニチブの用量依存的にリン酸化されたＰｉｃｋｌｅおよび内在性のＣｒｋＬが減少することを示す、ウエスタンブロッティングの結果である。
【図７】ヒト腫瘍細胞内にＰｉｃｋｌｅ２．０を発現させ、さらにイマニチブ投与したときに、イマニチブの用量依存的に蛍光発光が減少することを示す、タイムラプス顕微鏡による観察結果を示す写真（左図）と、減少率を数値化したグラフ（右図）である。
【図８】ヒト腫瘍細胞内にＰｉｃｋｌｅ２．０を発現させ、さらにイマニチブ投与したときに、イマニチブの用量依存的にリン酸化された内在性ＣｒｋＬ量が減少することを示す写真である。
【図１】
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【図２】
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【図４】
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【図５】
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【図３】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【配列表】
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