(57)【要約】  本発明は概して、統合失調症などの精神障害を検出又は治療するための、方法及び組成物に関する。本発明はより詳細には、統合失調症及び関連障害の診断、予防及び治療、並びに治療上活性がある薬剤のスクリーニングに使用することができる、ヒト遺伝子の同定を開示する。本発明はさらに、統合失調症と関係があるＣＮＴＦＲ遺伝子の特異的な多型又は対立遺伝子、並びにこれらのマーカーに基づく診断ツール及びキットを開示する。統合失調症及び関連障害の素因の診断、検出、予防及び／又は治療において、本発明を使用することができる。【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を検出する方法であって、対象由来のサンプル中のＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの感受性の改変の存在を検出することを含み、そのような改変の存在が前記対象中の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を示す方法。
【請求項２】
統合失調症又は関連障害の治療に対する対象の応答性を評価する方法であって、対象由来のサンプル中のＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの感受性の改変の存在を検出することを含み、そのような改変の存在が応答性対象を示す方法。
【請求項３】
前記感受性の改変が一塩基変異である、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記感受性の改変がＣＮＴＦＲ遺伝子の３’又は５’領域内に局在する、請求項１から３までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
感受性マーカーが表２に列挙したＭ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９マーカー、又はこれらの組合せから選択される、請求項１から４までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
ＣＮＴＦＲ遺伝子の改変の存在をシークエンシング、選択的ハイブリダイゼーション及び／又は選択的増幅によって検出する、請求項１から５までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
配列番号５〜１６から選択される１個又は数個のプライマーを使用する選択的増幅を含む、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための医薬組成物を製造するための、機能性ＣＮＴＦＲポリペプチド又はそれをコードする核酸の使用。
【請求項９】
対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための医薬組成物を製造するための、ＣＮＴＦＲのアゴニストの使用。
【請求項１０】
アゴニストがＣＮＴＦＲの天然リガンドである、請求項９に記載の使用。
【請求項１１】
アゴニストがＣＮＴＦＲと選択的に結合する抗体である、請求項９に記載の使用。
【請求項１２】
ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの感受性の改変を示す対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための医薬組成物を製造するための、請求項８から１１までのいずれか一項に記載の使用。
【請求項１３】
前記感受性の改変が表２に列挙したＭ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９マーカー、又はこれらの組合せから選択されるマーカーである、請求項１２に記載の使用。
【請求項１４】
統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための、候補薬剤をスクリーニングするための標的としてのＣＮＴＦＲポリペプチドの使用。
【請求項１５】
生物学的活性がある化合物を選択する方法であって、候補化合物とＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドとを接触させること、及び前記遺伝子又はポリペプチドと結合する化合物を選択することを含む方法。
【請求項１６】
生物学的活性がある化合物を選択する方法であって、候補化合物と、ＣＮＴＦＲポリペプチドを候補化合物と共に発現する組換え宿主細胞とを接触させること、及び前記細胞の表面で前記ＣＮＴＦＲポリペプチドと結合する並びに／或いは前記ＣＮＴＦＲポリペプチドの活性を調節する化合物を選択することを含む方法。
【請求項１７】
統合失調症又は関連障害のモデルにおいて選択した化合物の活性をアッセイするステップをさらに含む、請求項１５又は１６に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は概して、統合失調症などの精神障害を検出又は治療するための、方法及び組成物に関する。本発明はより詳細には、統合失調症及び関連障害の診断、予防及び治療、並びに治療上活性がある薬剤のスクリーニングに使用することができる、ヒトのＣＮＴＦＲ遺伝子の同定を開示する。本発明はさらに、統合失調症と関係があるＣＮＴＦＲ遺伝子の特異的な多型又は対立遺伝子、並びにこれらのマーカーに基づく診断ツール及びキットを開示する。統合失調症及び関連障害の存在、危険又は素因の診断又は検出、並びに予防及び／又は治療において、本発明を使用することができる。
【背景技術】
【０００２】
世界には統合失調症を有する推定４千５百万人の人が存在し、その中の３千３百万人を超える人は発展途上国に存在する。先進国では統合失調症は、成人人口の約１％でその人生のいずれかの地点において発生する。統合失調症を有する一の祖父母が存在する場合、この病気になる危険は約３％に増大し、一方の親が統合失調症を有する場合は約１０％に増大する。両親が統合失調症を有する場合、この危険は約４０％に上昇する。大部分の統合失調症患者は決して働くことができない。統合失調症患者の標準化死亡率（ＳＭＲ）は、一般群より２〜４倍高いと推定され、統合失調症患者の寿命は一般群より全体的に２０％短い。統合失調症患者における最も一般的な死因は自殺であり（患者の１０％）、これは一般群より２０倍高い危険を表す。心臓疾患並びに呼吸系及び消化系疾患による死も、統合失調症患者において増大している。
【０００３】
統合失調症は、「陽性」及び／又は「陰性」症状を伴う一群の精神病を含む。陽性症状は幻覚、妄想及び思考障害からなり、陰性症状には感情の平坦化、意欲欠如及び運動活動の低下がある。抗精神治療が最も一般的であり、統合失調症に有用な治療である。一般に統合失調症に処方される、４つの主なクラスの抗精神薬が存在する。クロルプロマジン（ソラジン）によって例示される第一の神経弛緩薬は、陽性（精神病）症状を低下させその再発を防止することによって、統合失調症患者の治療を根本から変えた。クロルプロマジンを与えた患者は精神病院を去り、地域社会のプログラム又はその故郷で生活することができている。しかしながら、これらの薬は理想とほど遠い。約２０％〜３０％の患者はこれらの薬に全く反応せず、他の患者は結局再発する。これらの薬は神経弛緩薬と名付けられた。なぜならそれらは、腕及び脚の硬直及び震え、筋痙攣、異常な身体の動き、並びに静座不能（不安定なペース及び落ち着きのなさ）を含めた重大な神経副作用を生み出すからである。これらの副作用は非常に厄介なので、多くの患者はこれらの薬を摂取するのを単に拒絶する。さらに、神経弛緩薬は統合失調症のいわゆる陰性症状を改善せず、副作用はこれらの症状をさらに悪化させる可能性がある。したがって、神経弛緩薬の明らかな有益な影響にもかかわらず、充分な短期の応答性を有する何人かの患者でさえ、全体機能が最終的に低下すると思われる。
【０００４】
標準的な神経弛緩薬のよく知られている欠陥が新たな治療の探究を刺激し、非定型神経弛緩薬と呼ばれる新たなクラスの薬剤をもたらしている。第一の非定型神経弛緩薬であるクロザピンは、標準的な神経弛緩薬に反応しない約３分の１の患者に有効である。クロザピンは陰性症状及び陽性症状を低下させるようであり、或いは標準的な神経弛緩薬より少なくとも陰性症状を悪化させる。さらに、クロザピンは全体機能に対する有益な影響を有し、統合失調症患者の自殺の機会を減らすことができる。クロザピンは標準的な神経弛緩薬の厄介な神経症状を引き起こさず、或いは過剰なそれは女性の月経異常及び不妊症、男性のインポテンス又は胸部増大を引き起こす可能性があるホルモンプロラクチンの血中レベルを上昇させる。標準的な神経弛緩薬に耐えることができない多くの患者は、クロザピンを摂取することが可能となっている。しかしながら、クロザピンには重大な制約がある。当初クロザピンは市場から撤去された。なぜならそれは、おそらく致死的な白血球の生成不能を引き起こす顆粒球減少症を引き起こす可能性があるからである。顆粒球減少症は依然として、注意深い観察及び定期的な血液試験を必要とする脅威である。クロザピンは発作及び他の有害な副作用（例えば嗜眠状態、低い血圧、流唾、おねしょ、及び体重増加）を引き起こす可能性もある。したがって、他の薬剤に反応しない患者のみが通常クロザピンを摂取する。
【０００５】
クロザピンの効能を有しその欠点を含まない第３のクラスの抗精神薬を、研究者は開発した。これらの薬剤の１つはリスペリドン（リスペルダル）である。初期の試験は、リスペリドンは陽性症状に関して標準的な神経弛緩薬と同程度に有効であり、陰性症状に関して多少有効である可能性があることを示唆する。リスペリドンはクロザピンより神経副作用を生み出すが、標準的な神経弛緩薬より少ない。しかしながら、リスペリドンはプロラクチンのレベルを上昇させる。現在リスペリドンは広範囲の精神病患者に処方されており、多くの臨床医はクロザピンの前に、標準的な薬剤に反応しない患者にリスペリドンを使用するようである。なぜなら臨床医はリスペリドンをより安全であるとみなしているからである。他の新たな薬剤は、陽性症状に関して標準的な神経弛緩薬と少なくとも同程度に有効であり、陰性症状に関してさらに有効であるオランザピン（ジプレキサ）である。オランザピンは通常の臨床用量において少ない神経副作用を有し、オランザピンがプロラクチンのレベルを有意に上昇させることはない。オランザピンが顆粒球減少症を含めた大部分のクロザピンの大部分の厄介な副作用を生み出すことはないが、オランザピンを摂取する何人かの患者は鎮静状態又は幻惑状態になり、ドライマウスが進行し、或いは体重が増大する可能性がある。稀な場合、肝機能試験の結果が一時的に異常になる。
【０００６】
幾つかの生化学的異常が、統合失調症患者において同定されてきている。結果として、幾つかの神経伝達物質に基づく仮説が近年進展してきており、最も一般的な仮説は「ドーパミン仮説」となっており、その１つの変形は、Ｄ２受容体のレベルで中脳辺縁系ドーパミン経路の過剰活性が存在することを述べている。しかしながら研究者は、ドーパミン作用系のさまざまな受容体と統合失調症の間の関係を見つけることが一貫してできていない。
【０００７】
したがって、統合失調症の治療のために使用する分子には副作用があり、この疾患の症状に対してのみ作用する。したがって、このような障害の原因機構と関係がある標的を特異的に対象とする、付随する副作用がない新しい分子に関する強い必要性が存在する。したがって、このような疾患と関係があるタンパク質を同定する必要があり、それによって薬剤の新たなスクリーニングを可能にする新しい標的がもたらされ、その結果、この重大な精神障害及び関連障害の治療において有効な新しい薬剤が得られる。
【０００８】
さらに、診断ツールに関する必要性も存在する。疾患の過程の初期に長期間、統合失調症を未治療状態で放置することは、結果に悪影響を与える可能性があるというさらなる証拠が存在する。しかしながら、薬剤の使用は患者が疾患の初期症状を経験するのを遅らせることが多い。患者は自身が病気であることを理解していない可能性があり、或いは患者は助けを求めることを恐れる可能性があり、家族のメンバーはこの問題が単に消失することを時折望み、治療を探すように患者を説得することができず、考えられる副作用のために診断が確かではないとき、臨床医は抗精神薬を処方するのを躊躇する可能性がある。実際、疾患の最初の発現時には、統合失調症を例えば薬剤関連障害及びストレス関連障害と区別するのは困難である可能性がある。したがって、統合失調症及び関連障害に対する感受性を検出するための新しい方法に関する必要性が存在する。
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明はここで、統合失調症及び関連障害を診断及び治療するため、並びに治療上活性がある薬剤をスクリーニングするための新規の手法を開示する。本発明はより詳細には、ＣＮＴＦＲ遺伝子の改変は統合失調症の進行と関係があることを実証する。ＣＮＴＦＲ、及び特にＣＮＴＦＲの改変形は前記疾患及び関連病状に対する治療介入の新規の標的となる。
【００１０】
したがって本発明の第一の態様は、候補薬剤調節物質、特に統合失調症及び関連障害に対して活性がある候補薬剤のスクリーニングの標的としての、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの使用に在る。
【００１１】
本発明の他の態様は、統合失調症又は関連障害を治療するための化合物をスクリーニングする方法であって、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチド、又はその断片、特に統合失調症又は関連障害と関係がある前記遺伝子又はポリペプチドの対立遺伝子、又はその断片と結合する化合物の能力を決定することを含む方法に在る。
【００１２】
本発明の他の態様は、統合失調症、又は関連障害を治療するための化合物をスクリーニングする方法であって、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチド、又はその断片、特に統合失調症、双極性障害又は関連障害と関係がある前記遺伝子又はポリペプチドの対立遺伝子、又はその断片の活性の調節を試験することを含む方法に在る。
【００１３】
本発明の他の態様は、対象の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を評価する方法であって、対象由来のサンプル中のＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ又はｅｘ  ｖｉｖｏでの）改変（例えば、感受性突然変異体又は対立遺伝子）の存在を判定することを含み、そのような改変の存在が前記対象中の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を示す方法に在る。
【００１４】
本発明の他の態様は、対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための医薬品を調製するためのＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチド、好ましくはそのアゴニストの調節物質の使用、並びに対応する治療法に関する。
【００１５】
本発明はより詳細には、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの発現又は活性の調節によって、好ましくはその活性化又は回復によって、対象の統合失調症又は関連障害を治療する方法を含む。このような治療は、例えばＣＮＴＦＲポリペプチド、ＣＮＴＦＲのＤＮＡ配列（アンチセンス配列、ＲＮＡｉを含む）、ＣＮＴＦＲポリペプチドに対する抗体、ＣＮＴＦＲのリガンド、又はＣＮＴＦＲの発現又は活性を調節、好ましくは模倣又は刺激する薬剤を使用する。本発明は特に、ＣＮＴＦＲ遺伝子の疾患関連対立遺伝子を有する個体を治療する方法に関する。
【００１６】
本発明はさらに、患者のＣＮＴＦＲ遺伝子座における統合失調症又は関連障害と関係がある改変のスクリーニングに関する。このようなスクリーニングは統合失調症及び関連障害の存在、危険若しくは素因を診断する、且つ／又はこのような障害の治療の有効性を評価するのに有用である。
【００１７】
本発明の他の態様は、選択的ハイブリダイゼーション又は増幅によってＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡ中の感受性マーカーの特異的検出を可能にする、核酸プローブ及びプライマーを含む。本発明はさらに、前述の検出、スクリーニング又は治療法を実施するのに適した、特定の核酸、ベクター及び組換え細胞、並びにキット又は固相結合核酸若しくはタンパク質、例えばＤＮＡ若しくはタンパク質アレイ又はチップを含む。特に本発明は、統合失調症及び関連障害と関係があるＣＮＴＦＲ核酸及びポリペプチド中のマーカーも開示し、且つそれらを含む。このようなマーカーの例はより詳細には、表２に列挙したＭ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９マーカー、又はこれらの組合せから選択される。
【００１８】
任意の哺乳動物対象、特にヒト患者における、統合失調症及び関連障害の素因の診断、検出、予防及び／又は治療において、本発明を使用することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１９】
本発明は、幾つかのランダムなマーカーを使用して異なる統合失調症群に実施された関連試験に由来する。実験の項に示すこれらの試験の結果は、ＣＮＴＦＲ遺伝子は統合失調症と強く関係があること、及び前記遺伝子又は対応するＲＮＡに局在する新たな、及び確認済みの（二対立遺伝子）マーカーは、統合失調症及び関連障害と関係があることを示す。
【００２０】
したがって本発明は、統合失調症及び関連障害の治療において有用な化合物を同定するための新規の手段及び方法を提供する。本発明はさらに、対象の統合失調症又は関連障害を検出、診断及びモニタリングするため、及び統合失調症患者の遺伝子型を決定するための新規の手法を提供する。
【００２１】
定義
用語「統合失調症」は、ＤＳＭ−ＩＶ分類（「精神障害の診断及び統計マニュアル（Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ  ａｎｄ  Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ  Ｍａｎｕａｌ  ｏｆ  Ｍｅｎｔａｌ  Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ）」、第４版、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ、ワシントンＤ．Ｃ．、１９９４）中の統合失調症として特徴付けられる状態を指す。
【００２２】
統合失調症関連障害には精神病性障害、例えば分裂情動性障害、分裂病様障害、軽い精神病性障害、妄想障害及び共通型精神病性障害など、並びに気分障害及び鬱病などの他の精神障害がある。統合失調症関連障害はより詳細には、前に列挙した精神病性障害を示す。
【００２３】
用語「精神障害」は、より一般的に、ＤＳＭ−ＩＶ分類（「精神障害の診断及び統計マニュアル（Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ  ａｎｄ  Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ  Ｍａｎｕａｌ  ｏｆ  Ｍｅｎｔａｌ  Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ）」、第４版、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ、ワシントンＤ．Ｃ．、１９９４）において気分障害、精神病性障害、不安障害、小児期障害、摂食障害、人格障害、適応障害、自閉症、譫妄、認知症、多発梗塞性認知症及びトゥーレット障害として特徴付けられる疾患を指す。用語「双極性障害」は、ＤＳＭ−ＩＶ中の双極性障害として特徴付けられる状態をより詳細には指す。双極性障害は、ＤＳＭ−ＩＶ中に記載された双極性障害Ｉ及び双極性障害ＩＩであってよい。この用語は、循環気質障害をさらに含む。循環気質障害は、鬱病症状と軽躁病症状の交互の反復を指す。当業者は病心理的状態の他の命名、薬量学、及び分類系が存在すること、及びこれらの系は医科学的進歩と共に発展することを理解していると思われる。
【００２４】
本出願中で使用する用語「ＣＮＴＦＲ」は、ヒトＣＮＴＦ−α受容体、及びその変異体、類似体及び断片を示す。ＣＮＴＦＲ遺伝子の核酸配列及びポリペプチドのアミノ酸配列は文献から入手可能であり、例えば以下の受託番号：ＥＭＢＬ：Ｍ７３２３８（それぞれ配列番号１及び２）；ＲＥＦｓｅｑｎ：ＮＭ＿１４７１６４の下にある。ＣＮＴＦＲの構造及びシグナルは、例えばＳｃｈｕｓｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ（２００３）中及びＭａｎ  ｅｔ  ａｌ（２００３）中で論じられている。これらの参照文献は、ＣＮＴＦは多発性硬化症又は筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）において神経保護効果を有することを示す。しかしながら、統合失調症又は関連障害と関係があるこの遺伝子の多型は記載されておらず、本発明はヒト対象における前記遺伝子とこれらの疾患の間の関係の最初の証拠を提供する。
【００２５】
用語「遺伝子」は、ゲノムＤＮＡ（ｇＤＮＡ）、相補的ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）、合成又は半合成ＤＮＡ、任意の形の対応するＲＮＡ（例えばｍＲＮＡ）など、並びに非コード配列、例えばイントロン、５’又は３’非翻訳配列又は制御配列（例えばプロモーター又はエンハンサー）などを含めた任意の型のコード核酸領域を含むと解釈されたい。用語遺伝子は特に、組換え核酸、即ち例えば配列の構築、切断、連結又は増幅によって人工的に作製された任意の非天然核酸分子を含む。遺伝子は典型的には二本鎖であるが、一本鎖などの他の形を企図することもできる。ＤＮＡライブラリーのスクリーニング又はさまざまな天然源からの増幅などによって、当技術分野で知られているさまざまな技法に従い、さまざまな供給源から遺伝子を得ることができる。化学合成、遺伝的工学処理、酵素技法、又はこれらの組合せを含めた従来の技法によって、組換え核酸を調製することができる。
【００２６】
遺伝子の断片は、前記遺伝子の少なくとも約８個の連続したヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１５個、より好ましくは少なくとも約２５個のヌクレオチド、さらに好ましくは少なくとも３５、５０、７５、１００、１５０、２００又は３００個のヌクレオチドの配列の任意の部分を示す。断片は８〜５００ヌクレオチド、好ましくは１５〜３００ヌクレオチド、より好ましくは２５〜２００ヌクレオチドの全ての考えられるヌクレオチド長をより詳細には含む。
【００２７】
ＣＮＴＦＲポリペプチドは、それぞれ前に開示したＣＮＴＦＲ遺伝子によってコードされる任意のタンパク質又はポリペプチドを示す。この点において用語「ポリペプチド」は、本発明の文脈内で、ポリマーの長さとは無関係にアミノ酸のポリマーを示す、したがってペプチド、オリゴペプチド、及びタンパク質はポリペプチドの定義内に含まれる。特にＣＮＴＦＲポリペプチドは、少なくとも８、１５、２０、５０、１００、２５０、３００又は３５０アミノ酸長のＣＮＴＦＲの特異的断片であるポリペプチドも示す。この用語はさらに、ポリペプチドの翻訳後又は発現後修飾を特定又は排除するわけではなく、例えばグリコシル基、アセチル基、リン酸基、脂質基などの共有結合を含むポリペプチドは、用語ポリペプチドによって明らかに含まれる。（例えば非天然アミノ酸、無関係な生物系中の天然のみに存在するアミノ酸、哺乳動物由来の修飾アミノ酸などを含めた）１つ又は複数のアミノ酸の類似体を含むポリペプチド、置換結合、並びに当技術分野で知られている他の修飾を有する天然及び非天然のポリペプチドも定義内に含まれる。
【００２８】
融合タンパク質はＣＮＴＦＲポリペプチドに対する抗体を作製する、且つさまざまなアッセイ系において使用するのに有用である。例えば融合タンパク質を使用して、ＣＮＴＦＲポリペプチドの一部分と相互作用するタンパク質を同定することができる。タンパク質親和性クロマトグラフィー又はタンパク質間相互作用のライブラリー系アッセイ、例えば、酵母菌ツーハイブリッド又はファージディスプレイ系などを、この目的のために使用することができる。このような方法は当技術分野でよく知られており、薬剤スクリーニング法として使用することもできる。
【００２９】
ＣＮＴＦＲポリペプチド融合タンパク質は、ペプチド結合によって１つに融合した２つのポリペプチドセグメントを含む。第一のポリペプチドセグメントは、配列番号２の少なくとも２５、５０、７５、１００、１５０、２００、３００、３５０又は３７２個の連続したアミノ酸を含む。第二のポリペプチドセグメントは、完全長タンパク質又はタンパク質断片であってよい。融合タンパク質構築体中に一般的に使用されるタンパク質には、β−ガラクトシダーゼ、β−グルクロニダーゼ、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、青色蛍光タンパク質（ＢＦＰ）を含めた自己蛍光タンパク質、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、ルシフェラーゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、及びクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ（ＣＡＴ）がある。さらに、ヒスチジン（Ｈｉｓ）タグ、ＦＬＡＧタグ、インフルエンザヘマグルチニン（ＨＡ）タグ、Ｍｙｃタグ、ＶＳＶ−Ｇタグ、及びチオレドキシン（Ｔｒｘ）タグを含めたエピトープタグが、融合タンパク質構築体中で使用される。他の融合構築体は、マルトース結合タンパク質（ＭＢＰ）、Ｓ−タグ、ＬｅｘＡ  ＤＮＡ結合ドメイン（ＤＢＤ）融合体、ＧＡＬ４  ＤＮＡ結合ドメイン融合体、及び単純疱疹ウイルス（ＨＳＶ）ＢＰ１６タンパク質融合体を含むことができる。融合タンパク質を工学処理して、ＣＮＴＦＲポリペプチドを異種部分から切断及び精製することができるように、ＣＮＴＦＲポリペプチドコード配列と異種タンパク質配列の間に位置する切断部位を含ませることもできる。
【００３０】
当技術分野で知られているように、融合タンパク質は化学的に合成することができる。２つのポリペプチドセグメントを共有結合させることによって、或いは分子生物学の分野における標準的手順によって、融合タンパク質を生成することが好ましい。当技術分野で知られているように、組換えＤＮＡ法を使用して、例えば正しいリーディングフレームのＣＮＴＦＲのコード配列を第二のポリペプチドセグメントをコードするヌクレオチドと共に含むＤＮＡ構築体を作製し、宿主細胞中でＤＮＡ構築体を発現させることによって、融合タンパク質を調製することができる。
【００３１】
本明細書で使用する用語「治療」又は「治療する」は、症状を改善、緩和すること、一時的又は永続的に症状の原因を排除すること、或いは指定の障害又は状態の症状の出現を予防するか遅延させることを意味する。本明細書で使用する用語「治療」は、用語「障害の予防」も含み、これは例えば医学的に有意な程度で障害の発症を遅延させることによって表される。障害の治療は、例えば障害に関する症状の低下、又は障害の症状の再発の改善によって表される。
【００３２】
本明細書で使用する用語「調節された」又は「調節」、或いは「制御された」又は「制御」は、上方制御［即ち、活性化又は刺激（例えば、アゴナイズ又は増強することによって）］と下方制御［即ち、阻害又は抑制（例えば、アンタゴナイズ、低下又は阻害することによって）］の両方を指す。
【００３３】
用語「含む」、「からなる」、又は「から本質的になる」は異なる意味を有する。しかしながら、それぞれの用語を本明細書において互いに置換して、本発明の範囲を変えることができる。
【００３４】
本明細書で同義的に使用される用語「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」は、一本鎖又は二本鎖の形の２個以上のヌクレオチドのＲＮＡ、ＤＮＡ、又はＲＮＡ／ＤＮＡハイブリッド配列を含む。化合物を記載するための形容詞としての、本明細書で使用する用語「ヌクレオチド」は、任意の長さの一本鎖又は二本鎖の形のＲＮＡ、ＤＮＡ、又はＲＮＡ／ＤＮＡハイブリッド配列を含む。用語「ヌクレオチド」はさらに、個々のヌクレオチド又はさまざまなヌクレオチドを指すための名詞として本明細書において使用し、プリン又はピリミジン、リボース又はデオキシリボース糖部分を含む化合物、又は大きな核酸化合物中の個々の単位、及びオリゴヌクレオチド又はポリヌクレオチド内のヌクレオチドの場合はリン酸基、又はホスホジエステル結合を意味する。しかしながら用語「ヌクレオチド」をさらに本明細書で使用して、少なくとも１つの修飾（ａ）他の結合基、（ｂ）プリンの類似形、（ｃ）ピリミジンの類似形、又は（ｄ）例えば類似の結合基、プリン、ピリミジン、及び糖の類似の糖類を含む「修飾ヌクレオチド」を含める。例えばその開示が参照として本明細書に組み込まれる、ＰＣＴ公開Ｎｏ．ＷＯ９５／０４０６４を参照のこと。しかしながら、本発明のポリヌクレオチドは好ましくは５０％を超える従来型デオキシリボースヌクレオチド、及び最も好ましくは９０％を超える従来型デオキシリボースヌクレオチドからなる。本発明のポリヌクレオチド配列は、合成、組換え、ｅｘ  ｖｉｖｏ生成、又はこれらの組合せを含めた任意の知られている方法によって、並びに当技術分野で知られている任意の精製法を利用することによって調製することができる。
【００３５】
用語「単離」は、その本来の環境（例えば、物質が天然に存在する場合は天然環境）から物質を除去することを必要とする。例えば、生きている動物中に存在する天然のポリヌクレオチド又はポリペプチドは単離されていないが、自然系中に共存する物質の一部分又は全体から分離した、同じポリヌクレオチド又はＤＮＡ又はポリペプチドは単離されている。このようなポリヌクレオチドはベクターの一部分であってよく、且つ／或いは、このようなポリヌクレオチド又はポリペプチドは組成物の一部分であってよく、さらにそのベクターに単離されているか、或いは組成物はその天然環境の一部分ではない。
【００３６】
用語「プライマー」は、標的ヌクレオチド配列と相補的であり標的ヌクレオチド配列とハイブリダイズさせるために使用する、特異的なオリゴヌクレオチド配列を示す。ＤＮＡポリメラーゼ、ＲＮＡポリメラーゼ又は逆転写酵素のいずれかによって触媒されるヌクレオチド重合の開始地点としてプライマーは働く。本発明の典型的なプライマーは、約６〜５０ヌクレオチド長、より好ましくは約８〜約４０ヌクレオチド長、典型的には約１６〜２５ヌクレオチド長の一本鎖核酸分子である。Ｔｍは典型的には約６０℃以上である。プライマーの配列は、標的遺伝子の配列に直接由来するものであってよい。高い特異性を保証するために、プライマー配列と標的遺伝子の間の完全な相補性が好ましい。しかしながら、ある程度のミスマッチは許容することができる。
【００３７】
用語「プローブ」は、サンプル中に存在する特異的なポリヌクレオチド配列を同定するために使用することができる、明確な核酸セグメント（又はヌクレオチド類似体セグメント、例えば本明細書で定義するポリヌクレオチド）を示し、前記核酸セグメントは、同定すべき特異的なポリヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列を含む。本発明のプローブは典型的には、１０〜１０００ヌクレオチド長、例えば１０〜７５０、より好ましくは１５〜６００、典型的には２０〜４００ヌクレオチド長の一本鎖核酸を含む。プローブの配列は、ＣＮＴＦＲ遺伝子配列の配列に由来するものであってよい。例えばハイブリッドの安定性を増大させるため、或いはプローブを標識するために、プローブはヌクレオチド置換及び／又は化学修飾を含むことができる。標識の典型例には、非制限的に放射活性、蛍光、発光標識などがある。
【００３８】
用語「相補的」又は「その相補体」を本明細書で使用して、相補領域の全体中で他の特異的なポリヌクレオチドとワトソン＆クリック塩基対を形成することができる、ポリヌクレオチドの配列を指す。この用語は、２つのポリヌクレオチドが実際に結合するであろう如何なる特定の組の条件にも基づかず、ポリヌクレオチドの配列のみに基づいてポリヌクレオチド対に適用される。
【００３９】
本明細書中で使用する用語「非ヒト動物」は、任意の非ヒト脊椎動物、鳥類及びより通常は哺乳動物、好ましくは霊長類、家畜動物、例えばブタ、ヤギ、ヒツジ、ロバ、及びウマ、ウサギ又はげっ歯類、より好ましくはラット又はマウスを指す。本明細書中で使用する用語「動物」は、任意の脊椎動物、好ましくは哺乳動物を指すために使用する。用語「非ヒト」が先行しない限り、用語「動物」と「哺乳動物」の両方はヒト対象を明らかに含む。
【００４０】
用語「形質」及び「表現型」を本明細書で同義的に使用して、例えば疾患の症状、疾患に対する感受性などの、任意の臨床上区別可能、検出可能、或いは他の場合測定可能な生物の性質を指す。典型的には用語「形質」又は「表現型」を本明細書で使用して、双極性障害の症状、又は双極性障害に対する感受性を指し、或いは双極性障害に作用する物質に対する個体の応答性を指し、或いは双極性障害の症状、又は双極性障害に作用する物質の副作用に対する感受性を指す。
【００４１】
本明細書中で使用する用語「対立遺伝子」は、他の形とそのヌクレオチド配列が異なる、二対立遺伝子又は多対立遺伝子マーカーの変形の１つを指す。典型的には、最初に同定した対立遺伝子を原型対立遺伝子として表し、一方で他の対立遺伝子は他の対立遺伝子として表す。二倍体生物は、対立遺伝子形に関して同質又は異質であってよい。
【００４２】
本明細書中で使用する用語「多型」は、異なるゲノム又は個体間或いはその中の２個以上の他のゲノム配列又は対立遺伝子の出現を指す。「多型」は、特定のゲノム配列の２個以上の変異体を群中に見ることができる状態を指す。「多型部位」は、変化が起こる遺伝子座である。多型は１つ又は複数のヌクレオチドの置換、欠失又は挿入を含む可能性がある。単一ヌクレオチド多型は、１つの塩基対の変化である。典型的には単一ヌクレオチド多型は、多型部位における他のヌクレオチドによる１つのヌクレオチドの置換である。「単一ヌクレオチド多型」（ＳＮＰ）は、１つの塩基対が異なる配列多型を指す。
【００４３】
検出及び診断
本発明は、ヒト対象の統合失調症及び関連障害を検出又は診断するための、新規の手段及び方法を提供する。本発明の方法は、初期、前症状段階、及び後期段階、成人、小児及び生前段階を含めた前記病状のさまざまな進行段階で実施することができる。さらに、本発明は予後を判定し、病状の進行の素因又は危険を評価し、疾患の状態を特徴付け、或いは患者に最も適した治療養生法を定義するのに適している。
【００４４】
本発明の特定の目的は、対象の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を検出する方法であって、対象由来のサンプル中のＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの改変の存在を検出することを含み、そのような改変の存在が前記対象中の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を示す方法に在る。
【００４５】
本発明の他の目的は、統合失調症又は関連障害の治療に対する対象の応答性を評価する方法であって、対象由来のサンプル中のＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの改変の存在を検出することを含み、そのような改変の存在が応答性対象を示す方法に関する。
【００４６】
以下でさらに詳細に論じるように、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの改変は前記遺伝子又はポリペプチド中の任意の感受性マーカー、即ち統合失調症又は関連障害と関係がある任意のヌクレオチド又はアミノ酸改変であってよい。
【００４７】
ＣＮＴＦＲ遺伝子の改変は、遺伝子のコード及び／又は非コード領域における、個別の又はさまざまな組合せの任意の形の突然変異、欠失、再編成、及び／又は挿入であってよい。突然変異は、より詳細には点突然変異を含む。欠失は、遺伝子のコード又は非コード部分中の任意の領域の２個以上の残基を含む可能性がある。典型的な欠失は、約５０連続塩基対未満のドメイン（イントロン）又は反復配列又は断片などの小さな領域に影響を与えるが、大きな欠失が起こる可能性もある。挿入は、遺伝子のコード又は非コード部分中の１個又は数個の残基の付加を含む可能性がある。挿入は典型的には、遺伝子中に１〜５０塩基対の付加を含むことができる。再編成は、例えば配列反転を含む。ＣＮＴＦＲ遺伝子の改変はポリヌクレオチド配列の異常な修飾、ゲノムＤＮＡのメチル化パターン、遺伝子の対立遺伝子の消失又は遺伝子の対立遺伝子の獲得などであってもよい。改変はサイレントであってよく（即ち、タンパク質のアミノ酸配列の修飾を生み出さない）、或いは例えばアミノ酸置換、フレームシフト突然変異、停止コドン、ＲＮＡスプライシング、例えば非野生型スプライシング型のメッセンジャーＲＮＡ転写産物の存在、或いはＲＮＡ又はタンパク質の不安定性又は非野生型レベルのＣＮＴＦＲポリヌクレオチドをもたらす可能性がある。さらにこの改変は、改変された機能又は安定性を有するポリヌクレオチドの生成をもたらす可能性があり、タンパク質発現レベルの低下又は増大を引き起こす可能性がある。
【００４８】
本発明の特定の改変は、前記ＣＮＴＦＲ遺伝子の５’又は３’領域中に局在する。典型的な改変は１ヌクレオチドの置換である。
【００４９】
この点において、本発明はここで、統合失調症と関係がある、ＣＮＴＦＲ遺伝子中の数個のマーカー又は突然変異を開示する。これらの突然変異は表２中に報告する。
【００５０】
最も好ましい遺伝的改変は、以下の表２ａ中に開示する：
表２ａ
【表１】
2008525000.tif 000002
【００５１】
本発明の好ましい実施形態は、対象のＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡ配列の表２中に開示したマーカーの存在の検出、より詳細には表２ａ中に開示した少なくとも１つのマーカー、又はこれらの任意の組合せの検出を含む。より詳細には本発明は、表２ａに列挙したＭ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９から選択される少なくとも１つのマーカー、統合失調症又は関連障害の存在、危険又は素因を示す統合失調症関連対立遺伝子の存在の検出を含む。
【００５２】
本発明の好ましい目的は、対象の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を検出する方法であって、対象由来のサンプル中のマーカーＭ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９の１つ又は複数の表２ａに記載の関連対立遺伝子の存在又は不在を検出することを含み、関連対立遺伝子の存在が前記対象中の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を示す方法である。
【００５３】
ＣＮＴＦＲと統合失調症又は関連障害の間の関係が本発明者によって確定されたからには、例えば実施例中に開示する方法の後に、他の感受性マーカーを前記遺伝子又はポリペプチド内で同定することができることは理解されるはずである。
【００５４】
ＣＮＴＦＲ遺伝子の改変の存在は、シークエンシング、ピロシークエンシング、選択的ハイブリダイゼーション、選択的増幅及び／又は、マトリクス支援レーザー脱離／イオン化飛行時間型質量分析法（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ  ＭＳ）（Ｇｕｔ  ｅｔ  ａｌ．、２００４）を含む質量分析法を含めた、当業者に本質的に知られている任意の技法によって検出することができる（Ｋｗｏｋ  ｅｔ  ａｌ．、２００３によって総説された）。特定の実施形態では、以下の表２ｂ中に開示するように、１個又は数個の特異的プライマーを使用する選択的な核酸増幅によって改変を検出する。他の特定の実施形態では、１個又は数個の特異的プローブを使用する選択的ハイブリダイゼーションによって改変を検出する。
【００５５】
他の技法には、ゲル電気泳動系遺伝子型決定法、例えば制限断片長多型分析と結び付けたＰＣＲ、マルチプレックスＰＣＲ、オリゴヌクレオチド結合アッセイ、及びミニシークエンシングなど；蛍光色素系遺伝子型決定技術、例えばオリゴヌクレオチド結合アッセイ、ピロシークエンシング、蛍光検出による１塩基伸長、ＴａｑＭａｎなどの均質溶液ハイブリダイゼーション、及び分子ビーコン方式遺伝子型決定など；ローリングサークル増幅及びインベーダーアッセイ、並びにＤＮＡチップ系マイクロアレイ及び質量分析遺伝子型決定技術（Ｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．、２００１）がある。
【００５６】
さらに、サブトラクティブハイブリダイゼーション、定量ＰＣＲ、ＴａｑＭａｎ、ディファレンシャルディスプレイ逆転写ＰＣＲ、ｃＤＮＡの連続的、部分的シークエンシング（発現配列タグ（ＥＳＴ）のシークエンシング及び遺伝子発現の連続的分析（ＳＡＧＥ））、グリッド（マクロ−及びマイクロアレイ及びＤＮＡチップ）上に固定した標識ｃＤＮＡと特異的プローブの並行ハイブリダイゼーションなどの当技術分野で知られている方法によって、改変型遺伝子のＲＮＡ発現を定量化することができる。個々の方法には対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）、対立遺伝子特異的増幅、蛍光ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、サザン及びノーザンブロット、及び固定変性ゲル電気泳動がある。
【００５７】
タンパク質発現分析法は当技術分野で知られており、２次元ゲル電気泳動、質量分析法及び抗体マイクロアレイを含む（Ｆｒｅｅｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．、２００４及びＺｈｕ  ｅｔ  ａｌ．、２００３）。
【００５８】
当技術分野でよく知られている技法を使用して、自動シークエンサーを使用して、シークエンシングを実施することができる。完全な遺伝子、或いはより好ましくはその特定のドメイン、典型的には有害突然変異又は他の改変を担うことが知られているか或いはその疑いがあるドメインに関して、シークエンシングを実施することができる。
【００５９】
当技術分野で知られているさまざまな技法に従い、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）及び鎖置換型増幅（ＳＤＡ）などによって増幅を実施することができる。これらの技法は市販の試薬及びプロトコルを使用して実施することができる。好ましい技法は対立遺伝子特異的ＰＣＲである。
【００６０】
ＣＮＴＦＲ遺伝子から配列を増幅させるのに有用な核酸プライマーは、改変体に隣接するか或いはそれと重複するＣＮＴＦＲ遺伝子の一部分、感受性マーカーなどと特異的にハイブリダイズすることができる。前記改変体が、プライマーがハイブリダイズするＣＮＴＦＲ遺伝子の配列内に含まれるとき、プライマー配列は改変体と重複する。好ましくは前記改変体の３００ｂｐ以内の距離、さらにより好ましくは前記改変体から２５０、２００、１５０、１００、５０、４０、３０又は２０ｂｐ以内の距離に位置するＣＮＴＦＲ遺伝子の一部分とプライマーがハイブリダイズするとき、プライマー配列は改変体に隣接する。プライマーは、５、４、３、２、１ｂｐの距離或いは前記改変体のすぐ隣であるＣＮＴＦＲ遺伝子の一部分とハイブリダイズすることが好ましい。
【００６１】
最も好ましいプライマーは、表２、より好ましくは表２ａ中に記載したように、改変体に隣接するか或いは重複するＣＮＴＦＲ遺伝子の一部分と特異的にハイブリダイズすることができる。このようなプライマー配列の例は、以下の表２ｂ中（配列番号５〜１６）に開示する。このようなプライマーは、本発明の特定の目的となる。
表２ｂ
【表２】
2008525000.tif 000003
＊Ａはミスプライマーがセンスプライマーであることを意味し；Ｂはミスプライマーが逆方向プライマーであることを意味する。
【００６２】
本発明の他のプライマーは、表７中に開示する（配列番号１７〜３１）。
【００６３】
本発明はさらに、対象の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を検出する方法中、或いは統合失調症又は関連障害の治療に対する対象の応答性を評価する方法中の、前に記載した核酸プライマー又は核酸プライマーの対の使用に関する。
【００６４】
本発明の他の実施形態によれば、方法はＣＮＴＦＲ又は改変型ＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡに特異的な核酸プローブの使用、次にハイブリッドの存在の検出を含む。プローブは懸濁液中で使用することができ、或いは支持層又は支持体に固定することができる。プローブは典型的には標識して、ハイブリッドの検出を容易にする。
【００６５】
この点において、本発明の具体的な目的は、表２、より好ましくは表２ａ中に記載した改変を有するＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡの領域と相補的であるか或いはそれに特異的である核酸プローブである。本発明のプローブは、改変型ＣＮＴＦＲ遺伝子と非改変型ＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡ配列を区別することができる、即ち本発明のプローブは、前に記載した特定の改変を有する前記ＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡと特異的にハイブリダイズし、且つ同じハイブリダイゼーション条件下或いは前記改変がないＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡと同じ安定性で、本質的にハイブリダイズしないことがより好ましい。
【００６６】
本発明はさらに、対象の統合失調症又は関連障害の存在又は素因を検出する方法中、或いは統合失調症又は関連障害の治療に対する対象の応答性を評価する方法中の、前に記載した核酸プローブの使用に関する。
【００６７】
検出法はｉｎ  ｖｉｔｒｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ又はｉｎ  ｖｉｖｏで実施することができ、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ又はｅｘ  ｖｉｖｏで実施することが好ましい。典型的には検出法は、対象由来のサンプル、核酸又はポリペプチドを含む任意の生物サンプルなどに実施する。このようなサンプルの例には流体、組織、細胞サンプル、臓器、バイオプシーなどがある。最も好ましいサンプルは血液、血漿、唾液、尿、精液などである。サンプルは従来の技法に従い収集し、診断用に直接使用し、或いは保存することができる。特に、非侵襲的方法によって、組織収集場などからサンプルを得ることができる。方法を実施する前にサンプルを処理して、試験用に核酸又はポリペプチドの利用性を得るか或いは改善することができる。処理には例えば溶解（例えば機械的、物理的、化学的など）、遠心分離などがある。さらに、核酸及び／又はポリペプチドは従来の技法によって事前に精製又は増大することができ、且つ／或いは複雑性を低下させることができる。核酸及びポリペプチドを酵素又は他の化学的又は物理的処理で処理して、その断片を生成することもできる。特許請求する方法の高い感度を考慮すると、非常に少量のサンプルがアッセイを実施するのに充分である。
【００６８】
前に開示したように、サンプルは典型的にはプローブ又はプライマーと接触させる。このような接触は任意の適切なデバイス、例えばプレート、チューブ、ウエル、グラスなどで実施することができる。核酸アレイなど、前記特異的試薬でコーティングされた支持層上で接触を実施することができる。支持層はガラス、プラスチック、ナイロン、紙、金属、ポリマーなどを含む任意の支持体などの、固体又は半固体支持層であってよい。支持層は例えばスライド、膜、ビーズ、カラム、ゲルなどの、さまざまな形及び大きさのものであってよい。試薬とサンプルの核酸の間で複合体を形成するのに適した任意の条件下で、接触を実施することができる。
【００６９】
サンプル中の改変型ＣＮＴＦＲ遺伝子又はＲＮＡ又はポリペプチドの発見は、対象の統合失調症又は関連障害の存在、素因又は進行段階の指標である。典型的には、前に開示したマーカーの１つのみ、或いはその幾つかを組合せて評価する。
【００７０】
薬剤のスクリーニング
前に示したように本発明は、薬剤候補又はリード化合物をスクリーニングするための新規な標的及び方法も提供する。これらのスクリーニング法は結合アッセイ及び／又は機能アッセイを含み、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ、細胞系又は動物において実施することができる。
【００７１】
この点において、本発明の特定の目的は、統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための候補薬剤のスクリーニングの標的物質としてのＣＮＴＦＲポリペプチドの使用に在る。
【００７２】
本発明の他の目的は、生物学的活性がある化合物を選択する方法に在り、前記方法は、候補化合物とＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドとを接触させること、及び前記遺伝子又はポリペプチドと結合する化合物を選択することを含む。
【００７３】
本発明のさらに他の目的は、生物学的活性がある化合物を選択する方法に在り、前記方法は、候補化合物と、ＣＮＴＦＲポリペプチドを候補化合物と共に発現する組換え宿主細胞とを接触させること、及び前記細胞の表面において前記ＣＮＴＦＲポリペプチドと結合し、且つ／或いは前記ＣＮＴＦＲポリペプチドの活性を調節する化合物を選択することを含む。
【００７４】
「生物学的活性がある」化合物は、対象中で生物学的活性、好ましくは治療活性を有する任意の化合物、より好ましくは神経活性化合物、及びさらに好ましくは統合失調症又は関連障害を治療するために、或いは統合失調症又は関連障害を治療するための薬剤を開発するためのリード化合物として使用することができる化合物を示す。「生物学的活性がある」化合物は、ＣＮＴＦＲの活性を調節する化合物であることが好ましい。
【００７５】
前述の方法は、固定試薬を含めたさまざまなデバイス及び条件を使用してｉｎ  ｖｉｔｒｏで実施することができ、動物モデルなどの統合失調症又は関連障害のモデルにおいて選択した化合物の活性をアッセイする他のステップをさらに含むことができる。
【００７６】
特定のスクリーニング法は、ＣＮＴＦＲポリペプチドのＣＢＤ（サイトカイン結合ドメイン）ドメイン、特にＣＮＴＦＲポリペプチドのＢＮ又はＢＣドメインを含む領域と（ｉｎ  ｖｉｔｒｏで）結合する候補化合物の能力を決定することを含む。
【００７７】
他の特定のスクリーニング法は、細胞の表面で発現されるＣＮＴＦ受容体と結合する候補化合物の能力を決定することを含み、前記ＣＮＴＦ受容体は少なくとも１つのＣＮＴＦＲポリペプチドを含む。ＣＮＴＦ受容体は３個までのサブユニットを含むことができる。特定の実施形態ではＣＮＴＦ受容体は、ＣＮＴＦＲポリペプチド及びβ−受容体ｇｐ１３０ポリペプチド及び／又は白血病阻害因子受容体（ＬＩＦＲ）を含む。
【００７８】
標的遺伝子又はポリペプチドとの結合は、前記標的の活性を調節する、したがって対象の統合失調症又は関連障害につながる経路に影響を与える化合物の能力に関する指標を与える。さまざまな技法、例えば候補化合物を標識すること、標識した参照リガンドとの競合などによって、結合の測定を実施することができる。ｉｎ  ｖｉｔｒｏ結合アッセイ用に、ポリペプチドは懸濁液中でほぼ純粋な形で使用することができ、支持体に固定することができ、膜（完全細胞、膜調製物、リポソームなど）内で発現させることができる。
【００７９】
活性の調節には、非制限的にＣＮＴＦＲ受容体の表面発現の刺激、前記受容体のマルチマー化（例えば、他のサブユニットとのマルチマー複合体の形成）の調節などがある。アッセイ中で使用する細胞は、任意の組換え細胞（即ち、ＣＮＴＦＲポリペプチドをコードする組換え核酸を含む任意の細胞）、又は内因性ＣＮＴＦＲポリペプチドを発現する任意の細胞であってよい。このような細胞の例には、非制限的に、原核細胞（細菌など）、及び真核細胞（例えば酵母菌細胞、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞など）がある。具体例には大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、ピチアパストリス（Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ）、ハンゼヌラポリモルファ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ）、シゾサッカロミセスポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）、クルイベロミセス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）又はサッカロミセス酵母菌（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｙｅａｓｔｓ）、哺乳動物細胞系（例えばＶｅｒｏ細胞、ＣＨＯ細胞、３Ｔ３細胞、ＣＯＳ細胞など）、並びに（例えば線維芽細胞、胚細胞、上皮細胞、神経細胞、脂肪細胞などから生成した）初代又は樹立哺乳動物細胞培養物がある。
【００８０】
好ましい選択化合物はＣＮＴＦＲのアゴニスト、即ちＣＮＴＦＲと結合することができ、且つその内因性リガンドの活性を模倣することができる化合物、ＣＮＴＦなどである。
【００８１】
特定の実施形態では、本発明のスクリーニングアッセイは、単独或いは他のＣＮＴＦＲ配列に加えて、改変型ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチド、特に表２に列挙した突然変異、より好ましくは表２ａに列挙した突然変異を有するＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドを使用する。
【００８２】
本発明の他の目的は、生物学的活性がある化合物を選択する方法に在り、前記方法は本発明によるＣＮＴＦＲポリペプチドと試験化合物をｉｎ  ｖｉｔｒｏで接触させること、及び前記ＣＮＴＦＲポリペプチドの活性を調節する前記試験化合物の能力を測定することを含む。
【００８３】
本発明の他の目的は、生物学的活性がある化合物を選択する方法に在り、前記方法は本発明によるＣＮＴＦＲ遺伝子と試験化合物をｉｎ  ｖｉｔｒｏで接触させること、及び前記ＣＮＴＦＲ遺伝子の発現を調節する、好ましくはその発現を刺激する前記試験化合物の能力を測定することを含む。
【００８４】
他の実施形態では本発明は、活性化合物、特に統合失調症又は関連障害に対して活性がある化合物をスクリーニング、選択又は同定する方法に関するものであり、この方法はＣＮＴＦＲ遺伝子プロモーターの制御下でレポーター遺伝子を含むレポーター構築体を含む組換え宿主細胞と試験化合物を接触させること、及びレポーター遺伝子の発現を調節する（例えば、刺激する或いは低下させる、好ましくは刺激する）試験化合物を選択することを含む。
【００８５】
他の実施形態では本発明は、ＣＮＴＦＲポリペプチド又はその断片の使用に関するものであり、断片は統合失調症又は関連障害を治療するためのＣＮＴＦＲポリペプチドのアンタゴニスト又は阻害剤を単離又は作製するためのＣＮＴＦＲ遺伝子特異的断片であることが好ましく、前記アゴニスト又は刺激物質は、
１．ａ）キメラ抗体、
ｂ）ヒト化抗体又は
ｃ）完全ヒト抗体を含む特異的抗体又はその断片、並びに
２．二重特異性抗体又は多重特異性抗体、
３．単鎖抗体（例えばｓｃＦｖ）又は
４．単鎖ドメイン抗体、又は
５．前記抗体由来のペプチド又は非ペプチド模倣体、又は
６．ａ）アンチカリン又は
ｂ）フィブロネクチン系結合分子（例えば、トリネクチン又はアドネクチン）などの抗体模倣体からなる群から選択される。
【００８６】
抗体由来のペプチド又は非ペプチド模倣体の作製は当技術分野で知られている（Ｓａｒａｇｏｖｉ  ｅｔ  ａｌ．、１９９１及びＳａｒａｇｏｖｉ  ｅｔ  ａｌ．、１９９２）。
【００８７】
アンチカリンも当技術分野で知られている（Ｖｏｇｔ  ｅｔ  ａｌ．、２００４）。フィブロネクチン系結合分子は、ＵＳ６８１８４１８及びＷＯ２００４０２９２２４中に記載されている。
【００８８】
さらに試験化合物は、さまざまな起源、性質及び組成、例えばキメラ抗体、ヒト化抗体又は完全ヒト抗体などの抗体或いは抗体断片を含む任意の小分子、核酸、脂質、ペプチド、ポリペプチド、抗体由来のペプチド又は非ペプチド模倣体、並びに二重特異性抗体又は多重特異性抗体、単鎖抗体（例えばｓｃＦｖ）、又は単鎖ドメイン抗体、或いはアンチカリン又はフィブロネクチン系結合分子（例えば、トリネクチン又はアドネクチン）などの抗体模倣体など、個別の形又は混合物又は組合せであってよい。
【００８９】
医薬組成物及び療法
本発明はここで、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの活性又は発現を調節することによって、統合失調症及び関連障害を治療するための新規の手法を開示する。より詳細には本発明は、ヒト対象における前記遺伝子と前記疾患の間の関係の最初の証拠を提供し、ＣＮＴＦＲ活性の調節、好ましくは刺激又は増大に基づく新規の治療手法の設計を可能にする。
【００９０】
この点において、本発明の特定の目的は対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための医薬組成物を製造するための、ＣＮＴＦＲポリペプチド、又はそれをコードする核酸の使用に在る。
【００９１】
本発明の他の目的は、対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するための医薬組成物を製造するための、ＣＮＴＦＲの調節物質の使用に在る。調節物質は、ＣＮＴＦＲポリペプチドのアゴニスト又は活性化物質であることが最も好ましい。
【００９２】
ＣＮＴＦＲのアゴニストには、非制限的に、ＣＮＴＦＲポリペプチドを含むＣＮＴＦ受容体の活性化を引き起こすか或いはその活性を模倣した任意の化合物又は分子又は状態、及び機能性ＣＮＴＦＲポリペプチドの表面発現を引き起こすか或いは刺激する任意の化合物又は分子又は状態がある。このような化合物の例には、例えば野生型ＣＮＴＦＲポリペプチド又はコード核酸、ＣＮＴＦＲ遺伝子プロモーターの活性化物質、及びＣＮＴＦＲポリペプチドを含むＣＮＴＦ受容体と結合し前記受容体からのシグナル変換を引き起こす任意のリガンド又は薬剤がある。このような薬剤の具体例には、例えばＣＮＴＦ、ＩＬ−６、並びにそれらの変異体及び誘導体、並びにＣＮＴＦＲと選択的に結合する抗体、或いはほぼ同じ抗原特異性を有するこのような抗体の断片又は誘導体がある。
【００９３】
好ましい実施形態ではアゴニストは、ＣＮＴＦＲと選択的に結合する、ＣＮＴＦＲの天然リガンド、或いはキメラ抗体、ヒト化抗体又は完全ヒト抗体又は抗体断片、これらに由来するペプチド又は非ペプチド模倣体、及び二重特異性抗体又は多重特異性抗体、単鎖抗体（例えばｓｃＦｖ）又は単鎖ドメイン抗体、又はアンチカリン又はフィブロネクチン系結合分子（例えば、トリネクチン又はアドネクチン）などの抗体模倣体などの抗体である。
【００９４】
他の実施形態では、調節物質はＣＮＴＦＲポリペプチドの阻害剤又はアンタゴニストである。
【００９５】
本発明の他の目的は、ＣＮＴＦＲポリペプチドをコードする核酸又はそれをコードするベクター、及び薬剤として許容可能な担体又は賦形剤を含む医薬組成物に在る。
【００９６】
前述の使用又は組成物は、ＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの改変を示す対象、特に前の表２、より詳細には表２ａ中に記載したマーカーを示す対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防するのに非常に適している。
【００９７】
本発明の他の目的は、単離又は組換えＣＮＴＦＲ遺伝子又はそれらの断片であり、前記遺伝子又は断片はＭ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９、又はこれらの組合せから選択されるマーカーを含む。
【００９８】
本発明はさらに、前に定義した核酸を含む任意のベクターに関する。ベクターは任意のプラスミド、ファージ、ウイルス、エピソーム、人工染色体などであってよい。特定の実施形態では、ベクターは組換えウイルスである。ウイルスベクターは、当技術分野で知られている組換えＤＮＡ技法に従い、バキュロウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、ＡＡＶなどを非制限的に含めた異なる型のウイルスから生成することができる。組換えウイルスは典型的には複製欠損型であり、Ｅ１−及び／又はＥ４−欠損型アデノウイルス、Ｇａｇ−、ｐｏｉ−及び／又はｅｎｖ欠損型レトロウイルス及びＲｅｐ−及び／又はＣａｐ−欠損型ＡＡＶから選択されることがさらにより好ましい。このような組換えウイルスは、当技術分野で知られている技法によって、例えばパッケージ細胞のトランスフェクト、又はヘルパープラスミド又はウイルスを用いた一過性のトランスフェクトなどによって生成することができる。ウイルスパッケージ細胞の典型例には、ＰＡ３１７細胞、ＰｓｉＣＲＩＰ細胞、ＧＰｅｎｖ＋細胞、２９３細胞などがある。このような複製欠損型組換えウイルスを生成するための詳細なプロトコルは、例えばＷＯ９５／１４７８５、ＷＯ９６／２２３７８、米国特許第５，８８２，８７７号、米国特許第６，０１３，５１６号、米国特許第４，８６１，７１９号、米国特許第５，２７８，０５６号及びＷＯ９４／１９４７８中で見ることができる。
【００９９】
本発明の他の態様は、前に定義したベクター又は核酸を含む組換え宿主細胞である。組換え細胞は、前に論じた任意の原核細胞又は真核細胞であってよい。組換え細胞は、その表面で組換えＣＮＴＦＲポリペプチドを発現することが好ましい。
【０１００】
本発明の好ましい実施形態は、統合失調症又は関連障害を治療するための医薬品の調製における、ＣＮＴＦＲ又はＣＮＴＦＲを含む受容体の活性化物質又はアゴニストの使用である。
【０１０１】
本発明の特に好ましい実施形態は、統合失調症又は関連障害を治療するための医薬品の調製における、ＣＮＴＦＲ又はＣＮＴＦＲを含む受容体の活性化物質又はアゴニストの使用であって、活性化物質又はアゴニストがキメラ抗体、ヒト化抗体又は完全ヒト抗体又は抗体断片、これらに由来するペプチド又は非ペプチド模倣体、及び二重特異性抗体又は多重特異性抗体、単鎖抗体（例えばｓｃＦｖ）又は単鎖ドメイン抗体、又はアンチカリン又はフィブロネクチン系結合分子（例えば、トリネクチン又はアドネクチン）などの抗体模倣体などの抗体である使用である。
【０１０２】
本発明はさらに、対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防する方法であって、前に定義したＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの発現又は活性を調節、好ましくは活性化又は模倣する化合物を、前記対象に投与することを含む方法に関する。
【０１０３】
本発明の特定の実施形態は、対象の統合失調症又は関連障害を治療又は予防する方法であって、（ｉ）対象由来のサンプル中で、前に定義したＣＮＴＦＲ遺伝子又はポリペプチドの改変の存在を検出すること、及び（ｉｉ）ＣＮＴＦＲのアゴニストを前記対象に投与することを含む方法に在る。前記改変は、表２中、より好ましくは表２ａ中に開示した改変からなる群から選択されることが好ましい。
【０１０４】
本発明の他の態様及び利点を以下の実験の項中に開示し、これらは本出願の範囲を制限するものとしてではなく、例示的なものとしてみなすべきである。
【実施例】
【０１０５】
１−候補遺伝子の分析に使用した統合失調症患者の集合の記載
関連性試験を４つの異なる群に実施した。サンプルの１つの集合はモスクワ、ロシア由来であった（「Ｒｏｇａｅｖ」集合）。他の集合は英国由来であり、ロンドン大学（「ＵＣＬ」集合）によって、ロンドン精神医学会（「ＩＯＰ」集合）によって、及びＢｕｒｎｌｅｙ病院（「Ｂｕｒｎｌｅｙ」集合）によって与えられた。
【０１０６】
全ての集合は、統合失調症に冒されている個体（患者又は「症例」）或いは冒されていない個体（「対照」）を含む。
【０１０７】
この疾患と無関連及び無関係であった６７のランダムなマーカーを使用して、分類試験を実施しＦｓｔ値を計算した。
表１：４つの異なる集合の記載及び分類試験
【表３】
2008525000.tif 000004
【０１０８】
各集合に関して見出した全てのＦｓｔ値は、これらのサンプルは遺伝的に均質であり、したがってそれらを関連性分析において使用することができることを示す。
【０１０９】
２−統合失調症とＣＮＴＦＲ遺伝子の間の関連性試験
ａ−症例と対照の遺伝子型の決定
関連性試験を実施するための一般戦略は、前に記載した各群中の全個体由来のＤＮＡサンプルを個別にスキャンして、二対立遺伝子マーカーの対立遺伝子の頻度を確定することであった。
【０１１０】
スキャン手順は、同種正常、異種突然変異及び同種突然変異サンプルの区別を可能にする対立遺伝子特異的プライマー伸長反応に基づく。この反応を使用して、欠失、挿入及び置換を含めた遺伝的変化を特徴付けることができる。
【０１１１】
簡単に言うと、多型部位を含む当該の領域を、２つのＰＣＲプライマー（プライマーＰＵ及びＲＰ）を使用してＰＣＲによって増幅させる。アルカリホスファターゼ（ＳＡＰ）による処理を施して、取り込まれなかったｄＮＴＰを除去する。オリゴＭＩＳプライマーは多型部位の近くにアニーリングし、多型性に応じて伸長する。異なる伸長産物とＯＬＩＧＯ  ＭＩＳプライマーは、質量スペクトルにおいて明らかに区別することができる。
【０１１２】
典型的には、マイクロシークエンシング（ＭＩＳ）反応中に、対立遺伝子及びアッセイの設計に応じて、プライマーは特定ヌクレオチド数伸長する。反応混合物中には、全４個のヌクレオチドＡ、Ｔ、Ｃ、及びＧがｄＮＴＰ又はｄｄＮＴＰのいずれかとして存在する（正常のＳＮＰアッセイに関しては、通常は３個のヌクレオチドがｄｄＮＴＰとして、１個がｄＮＴＰとして存在する）。ｄｄＮＴＰの取り込みによって、ＭＩＳプライマーの伸長が終了する。ｄｄＮＴＰとｄＮＴＰの両方を同じ割合で取り込ませるＤＮＡポリメラーゼを使用して、ＭＩＳ反応は分析する配列に応じて異なる質量の対立遺伝子特異的伸長産物を生成する。質量分析法の前に、ＭＩＳ反応の生成物をＳｐｅｃｔｒｏＣＬＥＡＮ溶液及びＳｐｅｃｔｒｏＣＬＥＡＮプレート（ＳＥＱＵＥＮＯＭ）を用いて脱塩し、ＳＥＱＵＥＮＯＭからＳｐｅｃｔｒｏＣＨＩＰマイクロアレイに移す。ＳｐｅｃｔｒｏＣＨＩＰを次いでＳｐｅｃｔｒｏＲＥＡＤＥＲ（ＳＥＱＵＥＮＯＭ）質量分析器によって分析する。
【０１１３】
各群（症例と対照）中のそれぞれの二対立遺伝子マーカーの頻度を、各個体由来のＤＮＡサンプルで実施したゲノムＰＣＲによって得た増幅断片において、マイクロシークエンシング反応によって測定した。
【０１１４】
実験は以下に詳細に記載するように実施した：
１．）ＰＣＲ
【表４】
2008525000.tif 000005
９５℃  １５分
９５℃  ２０秒
５６℃  ３０秒
７２℃  １分
７２℃  ３分
１０℃  待機
【０１１５】
２．）ＳＡＰ精製
【表５】
2008525000.tif 000006
３７℃  ２０分
８５℃  ５分
１０℃  待機
【０１１６】
３）マイクロシークエンシング反応（ＭＩＳ）
【表６】
2008525000.tif 000007
９４℃  ２分
９４℃  ５秒
５２℃  ５秒
７２℃  ５秒
１０℃  待機
【０１１７】
４．）洗浄−脱塩
質量分析法の前に、ＭＩＳ反応の生成物をＳｐｅｃｔｒｏＣＬＥＡＮ溶液及びＳｐｅｃｔｒｏＣＬＥＡＮプレート（ＳＥＱＵＥＮＯＭ）を用いて脱塩し、ＳＥＱＵＥＮＯＭからＳｐｅｃｔｒｏＣＨＩＰマイクロアレイに移す。
【０１１８】
ＳｐｅｃｔｒｏＣＨＩＰを次いでＳｐｅｃｔｒｏＲＥＡＤＥＲ（ＳＥＱＵＥＮＯＭ）質量分析器によって分析する。
【０１１９】
結果は以下の表２に示す。
表２：ＣＮＴＦＲ上に位置する二対立遺伝子マーカーのリスト
【表７】
2008525000.tif 000008
【０１２０】
ｂ−ＳＮＰ頻度の分析
●方法
マーカーは個別に分析した。ピアルソンのχ２検定（２×２）を使用して、症例と対照の間の対立遺伝子の頻度を比較した。３×２χ２検定を使用して、症例と対照の間の遺伝子型頻度の全体的な差異に関してデータを分析した。条件がピアルソンのχ２検定に関するものでなかったとき、正確なフィッシャー検定を実施した。
【０１２１】
次いで我々は、症例と対照の間の対立遺伝子の頻度の差異を計算した：所与のＳＮＰに関する対立遺伝子の頻度の差異が大きくなるほど、そのＳＮＰを含むゲノム領域と障害の間の関係が確実になる。
【０１２２】
「選択した」対立遺伝子は、対照と比較して症例において頻度が増大している対立遺伝子である。
【０１２３】
ハーディ−ワインベルクの平衡統計値を症例と対照のデータに関して別々に計算し、観察した遺伝子型頻度と予想した遺伝子型頻度をピアルソンのχ２検定を使用して比較した。症例群におけるハーディ−ワインベルクの平衡（ＨＷＥ）からの逸脱は、統合失調症に関する危険の増大の原因である可能性がある突然変異が起こったことを示すことができる。
【０１２４】
●結果
表３中のｐ値は、二対立遺伝子マーカーと統合失調症の間の関係の確率を示す。５ｅ−０２より下のｐ値は、二対立遺伝子マーカーと統合失調症の間の有意な関係を示唆する［有意なｐ値のみ示す］。
表３：ＣＮＴＦＲ遺伝子内に位置するＳＮＰに関する有意なｐ値及び関連データ
【表８】
2008525000.tif 000009
【０１２５】
対立遺伝子のオッズ比（ＯＲ）を推定することによって、所与の対立遺伝子を有さないときと比較したそれ（＝選択した［又は「危険」］対立遺伝子）を有するときの、この疾患を有する確率を我々は評価する。
【０１２６】
１より大きいＯＲは、他の対立遺伝子を有するときより「危険」対立遺伝子［或いは遺伝子型又はハプロタイプ］を有するとき、統合失調症を有する確率がより高いことを示す。
【０１２７】
遺伝子型のＯＲによって、関連二対立遺伝子マーカーの「危険な」遺伝子型を同定することができる。遺伝子型のオッズ比を計算した。表４は有意な結果を示す。
表４：ＣＮＴＦＲ上に位置するＳＮＰに関する遺伝子型のＯＲ
【表９】
2008525000.tif 000010
【０１２８】
ＣＮＴＦＲ遺伝子に局在する４個の二対立遺伝子マーカー（Ｍ２、Ｍ３、Ｍ４及びＭ９）は、統合失調症と関係がある。マーカーＭ２、Ｍ３及びＭ４はＲｏｇａｅｖ及びＢｕｒｎｌｅｙ集合において非常に関係がある（有意な対立遺伝子及び遺伝子型のｐ値、或いは有意な遺伝子型のＨＷＥ症例のｐ値）。
【０１２９】
Ｂｕｒｎｌｅｙ集合では、Ｍ２に関する危険遺伝子型はＣＣ及びＣＴであり、「Ｃ」は危険対立遺伝子である。Ｍ３マーカーに関しては、危険遺伝子型はＡＧ及びＧＧであり、したがってＧが危険対立遺伝子である。Ｍ４に関する危険遺伝子型はＣＧ及びＧＧであり、Ｇが危険対立遺伝子である。Ｒｏｇａｅｖ集合に関しては、対立遺伝子の関係が存在せず、したがって我々はＢｕｒｎｌｅｙ集合中と同様に危険対立遺伝子を定義することができない。遺伝子型のＯＲの表中では、遺伝子型の関係は同型遺伝子型、Ｍ２に関しては（ＣＣ＋ＴＴ）、Ｍ３に関しては（ＧＧ＋ＡＡ）、及びＭ４に関しては（ＧＧ＋ＣＣ）によるものである。Ｂｕｒｎｌｅｙ及びＲｏｇａｅｖサンプルの個々の群の進化の違いによって、これらの違いを説明することができると思われる。
【０１３０】
第３群［ＵＣＬ］によって、他の２サンプルからの発見を確認する。
【０１３１】
要約すると、１つの二対立遺伝子マーカーの頻度分析の関連結果は、ＣＮＴＦＲ遺伝子が統合失調症と関係があることを示す。
【０１３２】
ｃ−ハプロタイプ頻度の分析
個々のマーカーの統計指数を増大させる１つの方法は、ハプロタイプ関連性分析を実施することである。
【０１３３】
ＣＮＴＦＲマーカーと統合失調症の関係に関するハプロタイプ分析は、症例及び対照群中の有意な二対立遺伝子マーカーを含めたハプロタイプの頻度を推定すること、及びカイ二乗検定によってこれらの頻度を比較することによって実施した。ハプロタイプの推定は、期待値−最大値（ＥＭ）アルゴリズムによって実施した。より詳細には、ハプロタイプの頻度の概略を比較するオムニバスＬＲ検定を実施した。
【０１３４】
これらの結果は以下の表中に示す：
表５：ＣＮＴＦＲ遺伝子の有意なＳＮＰのハプロタイプ分析
【表１０】
2008525000.tif 000011
【０１３５】
このハプロタイプ分析は、１ＳＮＰ分析によって得た結果をさらに強固なものにする。
【０１３６】
３−候補遺伝子の分析に使用した統合失調症患者の集合の記載
関連性試験を２つの異なる群に実施した。サンプルの１つの集合はアルゼンチン由来であった（「Ｌａｂｉｍｏ」集合）。他の集合は英国由来であり、ロンドン大学によって与えられた（「ＵＣＬｂｉｐ」集合）。
【０１３７】
全ての集合は、双極性障害に冒されている個体（患者又は「症例」）或いは冒されていない個体（「対照」）を含む。
【０１３８】
この疾患と無関連及び無関係であった６７のランダムなマーカーを使用して、層別試験を実施し、Ｆｓｔ値を計算した。
表６：４つの異なる集合の記載及び分類試験
【表１１】
2008525000.tif 000012
【０１３９】
それぞれの集合に関して発見したＦｓｔ値は、これらのサンプルは遺伝的に均質であり、したがって関連性分析においてそれらを使用することができることを示す。
表７−プライマー
【表１２】
2008525000.tif 000013
（参考資料）
2008525000.tif 000014
【配列表】
2008525000000001.xml
【国際調査報告】
2008525000.tif 000057
2008525000.tif 000058
2008525000.tif 000059
2008525000.tif 000060
2008525000.tif 000061