(57)【要約】  本発明は、フラジェリンアジュバントおよびＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原を含む融合タンパク質を提供する。また、フラジェリンアジュバントおよびＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原を含む組成物も提供される。本発明はまたフラジェリンアジュバントおよびＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原を含む融合タンパク質を作製する方法を開示する。本発明はさらに、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を誘導するための薬学的処方物および方法を提供する。
2008523819.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）（ｉ）フラジェリンＮ末端定常領域と
（ｉｉ）フラジェリンＣ末端定常領域と
を含むフラジェリンアジュバントと、
（ｂ）前記Ｎ末端定常領域と前記Ｃ末端定常領域との間のＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原と
を含む、融合タンパク質。
【請求項２】
前記フラジェリンアジュバントが削られたフラジェリン超可変領域を含むか、または前記フラジェリンアジュバントから前記フラジェリン超可変領域が欠失している、請求項１に記載の融合タンパク質。
【請求項３】
前記Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原が、（ｉ）前記超可変領域内か、（ｉｉ）前記フラジェリンＮ末端定常領域と超可変領域との間か、または（ｉｉｉ）前記フラジェリンＣ末端定常領域と前記超可変領域との間か、に挿入される、請求項１に記載の融合タンパク質。
【請求項４】
前記Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原が、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＶ抗原、およびその融合ペプチドからなる群より選択される、請求項１に記載の融合タンパク質。
【請求項５】
請求項１に記載の融合タンパク質をコードする核酸。
【請求項６】
請求項５に記載の核酸を含むベクター。
【請求項７】
請求項５に記載の核酸または請求項６に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項８】
請求項１に記載の融合タンパク質を作製する方法であって、前記融合タンパク質が生成されるのに十分な条件下で培養培地中において請求項７に記載の宿主細胞を培養するステップを含む、方法。
【請求項９】
前記融合タンパク質が、宿主細胞から、または培養培地から収集される、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
薬学的に受容可能な担体中に請求項１に記載の融合タンパク質を含む免疫原性組成物。
【請求項１１】
哺乳動物被験体においてＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を生じる方法であって、請求項１に記載の融合タンパク質または請求項１０に記載の免疫原性組成物を、前記哺乳動物被験体においてＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を生じるのに有効な量で前記被験体に対して投与するステップを含む、方法。
【請求項１２】
Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ感染の影響から哺乳動物被験体を防御する方法であって、請求項１に記載の融合タンパク質または請求項１０に記載の免疫原性組成物を、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ感染の影響に対して前記哺乳動物被験体を防御するのに有効な量で前記哺乳動物被験体に対して投与するステップを含む、方法。
【請求項１３】
前記投与ステップが粘膜表面に対して融合タンパク質または免疫原性組成物を送達することによって行われる、請求項１１または請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記投与ステップが鼻腔内投与または吸入投与によって行われる、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記被験体が少なくとも５０歳齢のヒト被験体である、請求項１１または請求項１２に記載の方法。
【請求項１６】
薬学的に受容可能な担体中に、
（ａ）フラジェリンアジュバントと、
（ｂ）Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原と
を含む、粘膜投与のための免疫原性組成物。
【請求項１７】
前記Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原が、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＶ抗原、およびその融合ペプチドからなる群より選択される、請求項１６に記載の免疫原性組成物。
【請求項１８】
前記Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原が、フラジェリンアジュバントに結合される、請求項１６に記載の免疫原性組成物。
【請求項１９】
フラジェリンアジュバントに結合されていない第二のＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原をさらに含む、請求項１８に記載の免疫原性組成物。
【請求項２０】
ヒト被験体においてＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を生じる方法であって、請求項１６に記載の組成物を、前記ヒト被験体においてＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を生じるのに有効な量で前記ヒト被験体に対して粘膜的に投与するステップを含む、方法。
【請求項２１】
Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ感染の影響からヒト被験体を防御する方法であって、請求項１６に記載の組成物を、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ感染の影響に対して前記ヒト被験体を防御するのに有効な量で前記ヒト被験体に対して粘膜的に投与するステップを含む、方法。
【請求項２２】
前記投与ステップが鼻腔内投与または吸入投与によって行われる、請求項２０または請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記被験体が少なくとも５０歳齢のヒト被験体である、請求項２０または請求項２１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
［関連出願の情報］
本出願は、２００４年１２月１６日出願の米国仮出願第６０／６３６，６３５号、および２００５年８月１９日出願の米国仮出願第６０／７０９，６０９号の利点を主張するものであり、その開示は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
【０００２】
［連邦政府支援の声明］
本発明は、国立衛生研究所（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ）から、認可番号Ｐ０１−ＡＩ０６０６４２として政府の支持を得ている。米国政府は、本発明に特定の権利を有する。
【０００３】
［発明の分野］
本発明は、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を生成するためのフラジェリンアジュバント、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（エルシニア・ペスチス）由来の抗原およびその融合タンパク質の（例えば、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ感染の予防的な治療における）使用に関する。
【背景技術】
【０００４】
ワクチン開発における完全な病原体から個々の抗原へのシフトは、より安全なワクチンをもたらすが、有効性が顕著に減少されている。ワクチンアジュバントは、可溶性の組換えタンパク質抗原に対する強力な適応性応答を促進する。グラム陰性ＬＰＳおよび細菌のＣｐＧ  ＤＮＡのようなトール様レセプター（ＴＬＲ）アゴニストの炎症誘発効果によって、樹状細胞に対するそのアジュバント特性および影響の評価がもたらされている（Ｊａｅｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２００２）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４：１７８−１８２；Ｋｏ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ  ｒｅｓ．９：３２２２−３２３４；Ｍｅｄｚｈｉｔｏｖ（２００１）Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１：１３５−１４５）。ほとんどのＴＬＲアゴニストは、サイトカインの産生および樹状細胞の成長を刺激することによってアジュバントとして機能し、これによって先天性および適応性の免疫が連関する。
【０００５】
疫病の原因因子であるＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓは、３回の主要な流行の間で約２億例の死亡の原因となったグラム陰性の生物体である。ヒトでは、疫病は、感染の性質によって指定された３つの形態（横痃の形態、肺炎の形態および敗血症の形態）を有する。横痃の疫病は、感染したノミの咬傷を介して伝播するが、肺炎の形態は、人と人の間で伝達され得る。医学的な治療なしでは、肺炎の疫病は急速に進行する疾患であって、死亡率はほぼ１００％である（ＭｃＳｏｒｌｅｙ  ｅｔ  ａｌ．（２００２）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：３９１４−３９１９；Ｍｅａｎｓ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７０：５１６５−５１７５）。
【０００６】
疫病のための全細胞ワクチンの使用は、安全性の懸念が大きくなっている。Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原および適切なアジュバントでの免疫は、抗Ｆ１  ＩｇＧ抗体の力価と相関する防御的応答を惹起する（Ｄａｖｉｌａ  ａｎｄ  Ｃｅｌｉｓ（２０００）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６５：５３９−５４７；Ｂｒｕｎｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６５：６２７８−６２８６）。相乗的な防御効果は、動物をＦ１抗原およびＶ抗原の両方、または組換えのＦ１／Ｖ融合タンパク質で免疫する場合に得られる（Ｃｉａｃｃｉ−Ｗｏｏｌｗｉｎｅ  ｅｔ  ａｌ．（１９９８）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．６６：１１２７−１１３４；Ｍｏｏｒｓ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．６９：４４２４−４４２９；Ｇｅｗｉｒｔｚ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１０７：９９−１０９；Ｓｔｅｉｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１０５：１７６９−１７７７）。高度に可変の応答が観察されたが、第１相臨床試験によって、Ｆ１およびＶを含有するワクチンでの筋肉内免疫は、ヒトで免疫原性であることが実証された（Ｅａｖｅｓ−Ｐｙｌｅｓ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６６６：１２４８−１２６０）。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのような病原体に対する免疫応答を生成するための改善された試薬、薬学的処方物および方法を提供することが所望される。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明の第一の態様は、融合タンパク質であり、この融合タンパク質は、以下を含むか、以下からなるか、または本質的に以下からなる。（ａ）（ｉ）フラジェリンＮ末端定常領域と（ｉｉ）フラジェリンＣ末端定常領域とを含むか、それからなるか、もしくは本質的にそれからなる、フラジェリンアジュバントと、（ｂ）このＮ末端定常領域とこのＣ末端定常領域との間のＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原（例えば、フラジェリン超可変領域に挿入されるか、またはその一部もしくは全部と置き換えられ、この超可変領域は必要に応じて部分的にまたは全体的に欠失される）。
【０００９】
本発明のさらなる態様は、上記のような融合タンパク質をコードする核酸である。いくつかの実施形態では、この核酸は、プロモーターと必要に応じて連結される。
【００１０】
本発明のさらなる態様は、上記のような核酸を含むベクターである。
【００１１】
本発明のさらなる態様は、上記のような核酸またはベクターを含む宿主細胞である。いくつかの実施形態では、この宿主細胞は、コードされた融合タンパク質を発現する。
【００１２】
本発明のさらなる態様は、上記のような融合タンパク質を作成する方法であって、本方法は、この融合タンパク質が生成されるのに十分な条件下で適切な培養培地中において上記の融合タンパク質をコードする核酸を含む宿主細胞を培養するステップを含む。必要に応じて、この融合タンパク質は、宿主細胞から、または培養培地から収集される。
【００１３】
本発明のさらなる態様は、組成物（例えば粘膜送達のため）であって、（ａ）フラジェリンアジュバントと、（ｂ）Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原とを含むか、それからなるか、または本質的にそれからなる（このＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原およびフラジェリンアジュバントは、別々であるか互いにカップリングされ、すなわち、融合タンパク質、例えば、本明細書において記載されるような融合タンパク質の形態である）組成物である。
【００１４】
本発明のさらなる態様は、薬学的に受容可能な担体中に上記のような融合タンパク質または組成物を含む薬学的処方物である。
【００１５】
本発明のさらなる態様は、被験体においてＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対する免疫応答を誘導する（例えば、抗体を生成するか、および／または細胞媒介性免疫応答を誘導する）方法であり、この方法は、上記のような、融合タンパク質、組成物または薬学的処方物を、この被験体においてＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対する免疫応答を誘導するのに有効な量でこの被験体に投与するステップを含む。
【００１６】
本発明のなおさらなる態様は、被験体をＹ．ｐｅｓｔｉｓ感染について治療する方法（例えば、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ感染に対して患者をワクチン接種する）であって、この方法は、上記のような、融合タンパク質、組成物または薬学的処方物を、この被験体に対して、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ感染を治療するのに有効な量で投与するステップを含む（例えば、被験体において、予防的な防御免疫応答を生成するか、および／またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ感染に対する防御的な免疫応答を生成する）。
【００１７】
本発明の方法の特定の実施形態では、この被験体は、哺乳動物被験体、霊長類被験体、またはヒト被験体である。
【００１８】
本発明のさらなる態様は、本明細書において記載されるような治療の方法を行うための医薬の調製のための、本明細書に記載のような融合タンパク質または組成物の使用である。
【００１９】
本発明のこれらの態様および他の態様は、下の本発明の説明に示される。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２０】
本発明は、フラジェリンおよびその断片が、粘膜アジュバントを含むアジュバントとして機能して、被験体において惹起されたＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を増強し得るという発見に一部基づく。
【００２１】
他に規定しない限り、本明細書に用いられる全ての技術的および科学的用語は、本発明が属する当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書における本発明の説明で用いられる専門用語は、特定の実施形態を描写する目的のためだけであって、本発明を限定する意図ではない。本明細書において言及される全ての刊行物、特許出願、特許および他の引用文献は、その全体が参照によって組み込まれる。
【００２２】
本発明の説明および添付の特許請求の範囲において用いられる場合、単数形「１つの、（ａ）、（ａｎ）」、および「この、その（ｔｈｅ）」とは、文脈が明らかに他を示すのでない限り、複数形を同様に含むものとする。
【００２３】
本明細書において用いられる場合「本質的に〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ  ｏｆ）」とは、示されるペプチド、タンパク質、融合タンパク質、核、化合物、組成物などがいかなる他の物質的要素（すなわち、ペプチド、タンパク質、融合タンパク質、核酸、化合物または組成物の構造および／または機能に実質的に影響する要素）も含まないということを意味する。
【００２４】
本発明の代表的な実施形態では、本発明のペプチド、タンパク質、融合タンパク質、核酸および／または細胞が「単離される（ｉｓｏｌａｔｅｄ）」。「単離される」とは、ペプチド、タンパク質、融合タンパク質、核酸および／または細胞が、他の成分から離れて少なくとも部分的に精製されることを意味する。
【００２５】
１．Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原
「免疫原（ｉｍｍｕｎｏｇｅｎ）」および「抗原（ａｎｔｉｇｅｎ）」という用語は、本明細書において交換可能に用いられて、任意の化合物（ペプチドおよびタンパク質を含む）であって、それに対して細胞性免疫応答および／または体液性免疫応答が指向され得る化合物を意味する。
【００２６】
本発明は、任意の適切なＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原で実施され得る。本発明を行うために用いられ得る、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓから得られる抗原は、公知であって、例えば、米国特許第６，７０６，５２２号；同第６，６３８，５１０号；および同第５，９８５，２８５号に記載されている。特定の実施形態では、この抗原は、米国特許第５，９８５，２８５号に記載されるようなＹ．ｐｅｓｔｉｓのＶ抗原および／またはＹ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原（これらの用語は、このタンパク質全体およびその断片を含み、これは、少なくとも約１０、１５、２０、３０、または５０連続するアミノ酸長であり得る）；またはＹ．ｐｅｓｔｉｓのＶ抗原およびＦ１抗原（ここでも、これらの用語は、このタンパク質全体およびその断片を含み、これは、少なくとも約１０、１５、２０、３０、または５０連続するアミノ酸長であり得る）の融合物である。いくつかの実施形態では、この抗原は、成熟Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＶタンパク質および／またはＦ１タンパク質の全てまたは１つの断片を含み、あるいは、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＶおよび／またはＦ１前駆体の全てまたは１つの断片を含んでもよい。適切な断片は、免疫応答を誘導し、必要に応じてタンパク質を供与する１つ以上のエピトープを含む。代表的な実施形態では、この断片は、このタンパク質の細胞外部分の全てまたは一部を含む。さらに、本明細書において用いる場合、「Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ  ａｎｔｉｇｅｎ）」または「Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ由来の抗原（ａｎｔｉｇｅｎ  ｆｒｏｍ  Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）」などの用語は、限定はしないが、被験体において免疫応答を、必要に応じて防御免疫応答を誘導する、天然に存在するＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原およびその改変型を含む。例えば、天然の抗原は、安全性および／または免疫原性を増大するように改変され得る。
【００２７】
Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、融合ペプチド、例えば、Ｆ１／Ｖ融合ペプチドまたはＶ／Ｆ１融合ペプチドの形態であってもよく、これには、限定はしないが、Ｔｉｔｂａｌｌ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第５，９８５，２８５号およびＳ．Ｌｅａｒｙ  ｅｔ  ａｌ．，（１９９７）Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓ  ２３：１６７−１７９に記載される融合ペプチドが挙げられる。２つの抗原が融合ペプチドとして結合される場合、それらは、互いに対して直接結合されてもよいし、またはペプチド結合もしくは「ヒンジ（ｈｉｎｇｅ）」セグメント（例えば、２、３、４、６、８、１０、１５、２０、３０、５０以上のアミノ酸のセグメント）によって結合されてもよい。
【００２８】
２．フラジェリン
本発明者は、フラジェリンが、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対して宿主によって惹起される能動的な免疫応答を増強するための、粘膜アジュバントとして作用することを含む、アジュバントとして機能し得ることを確認した。本明細書において用いる場合、「アジュバント」という用語は、当業者によって理解されるその通常の意味を有する。例えば、アジュバントとは、被験体において抗原に対する免疫応答を刺激するその抗原の能力を増大する物質として規定され得る。特定の実施形態では、このアジュバントは、抗原に対する免疫応答を少なくとも約２、３、４、５、１０、１５、２０、３０、４０、５０、６０、７５、１００、１５０、５００、１０００倍以上増大する。他の実施形態では、このアジュバントは、特定のレベルの免疫応答（細胞性および／または体液性および／または粘膜の）を達成するのに必要な抗原の量、例えば、少なくとも約１５％、２５％、３５％、５０％、６５％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％以上を減少させる。あるアジュバントはさらに、免疫応答、必要に応じて防御的免疫応答が維持される時間を延長する物質であってもよい（例えば、少なくとも約２倍、３倍、５倍、１０倍、２０倍以上の時間）。ある場合には、アジュバントの非存在では、宿主において有意な免疫応答は惹起されないかもしれない。
【００２９】
フラジェリンタンパク質は、公知であって、例えば、米国特許第６，５８５，９８０号、同第６１３０，０８２号；同第５，８８８，８１０号；同第５，６１８，５３３号；同第４，８８６，７４８号および米国特許出願第ＵＳ２００３／００４４４２９号Ａ１；ならびにＤｏｎｎｅｌｌｙ  ｅｔ  ａｌ．，（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．４３：４０４５６に記載されている。ほとんどのグラム陰性の細菌は、運動性をもたらす表面構造である鞭毛を発現する。この鞭毛は、基底小体、フィラメントおよびこの２つをつなぐフックから形成される。このフィラメントは、単一のタンパク質フラジェリンの長いポリマーから形成され、末端に小型のキャップタンパク質を有する。フラジェリンの重合化は、Ｎ末端およびＣ末端の保存領域によって媒介されるが、このフラジェリンタンパク質の介在領域は種の間で極めて多様である。
【００３０】
本発明の例示的な実施形態では、フラジェリンアジュバントおよび１つ以上のＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原を含む融合タンパク質が提供される。一般には本発明の融合タンパク質は、以下を含むか、以下からなるか、または本質的に以下からなる。（ａ）（ｉ）フラジェリンＮ末端定常領域および（ｉｉ）フラジェリンＣ末端定常領域を含むフラジェリンアジュバントと、（ｂ）このＮ末端定常領域とこのＣ末端定常領域との間にあるＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原。いくつかの実施形態では、この定常領域の間のフラジェリン超可変領域は、（全体または一部が）欠失され、他の実施形態では、超可変領域が存在する。この超可変領域の（全体または一部）が存在する場合、この抗原は、（ｉ）超可変領域内に挿入されても、（ｉｉ）フラジェリンＮ末端定常領域と超可変領域との間に挿入されても、または（ｉｉｉ）フラジェリンＣ末端定常領域と超可変領域との間に挿入されてもよい。
【００３１】
さらに、Ｎ末端定常領域およびＣ末端定常領域は、ヒンジ領域によって連結され得る。この超可変領域またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、ヒンジ領域として機能し得る。さらに、あるいは、約２、３、４、６、８、１０、１５、２０、３０、５０以上のアミノ酸のセグメントがヒンジ領域として機能し得る。
【００３２】
フラジェリンの保存領域は、当分野で周知であり、そして例えば、Ｍｉｍｏｒｉ−Ｋｉｙｏｓｕｅ  ｅｔ  ａｌ．，（１９９７）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｖｉｒｏｌ．２７０：２２２−２３７；Ｉｉｎｏ  ｅｔ  ａｌ．，（１９７７）Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｇｅｎｅｔ．１１：１６１−１８２；およびＳｃｈｏｅｎｈａｌｓ  ｅｔ  ａｌ，（１９９３）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１７５：５３９５−５４０２に記載されている。当業者によって理解されるとおり、定常領域のサイズは、フラジェリンタンパク質の供給源に依存していくらか変化するだろう。一般には、Ｎ末端定常ドメインは、タンパク質の約１７０または１８０のＮ末端アミノ酸を含むが、Ｃ末端定常ドメインは代表的には、約８５〜１００のＣ末端アミノ酸にまたがる。中央の超可変領域は、細菌ごとにサイズおよび配列がかなり変化し、分子量の相違のほとんどを占める。種々の細菌由来のフラジェリンタンパク質のＮ末端およびＣ末端定常領域は公知であって、他は、公知のアラインメント技術を用いて当業者によって容易に同定され得、この技術は、フラジェリン単量体の結晶構造の解明によって容易になる（Ｓａｍａｔｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，（２００１）Ｎａｔｕｒｅ  ４１：３３１）。
【００３３】
「フラジェリンＮ末端定常領域（ｆｌａｇｅｌｌｉｎ  Ｎ−ｔｅｒｍｉｎａｌ  ｃｏｎｓｔａｎｔ  ｒｅｇｉｏｎ）」および「フラジェリンＣ末端定常領域（ｆｌａｇｅｌｌｉｎ  Ｃ−ｔｅｒｍｉｎａｌ  ｃｏｎｓｔａｎｔ  ｒｅｇｉｏｎ）」という用語は、本明細書において用いる場合、活性な断片（例えば、少なくとも約５０、１００または１２０のアミノ酸長の断片）およびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対する免疫応答を増強する（例えば、ＴＬＲ５経路を活性化することによる）任意の前述の改変を含む。例えば、天然のフラジェリン領域は、安全性および／または免疫応答を増大するために改変され得る。いくつかの実施形態では、フラジェリンのＮ末端および／またはＣ末端の定常領域は、全長領域を含み、あるいは、１つの領域の断片のみまたは両方の領域の断片を含んでもよい。
【００３４】
特定の実施形態では、Ｎ末端および／またはＣ末端の定常領域は、ＴＬＲ５認識部位を含み、そしてＴＬＲ５経路を活性化できる。
【００３５】
代表的な実施形態では、Ｎ末端定常領域はＥａｖｅｓ−Ｐｙｌｅｓ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １６７：７００９−７０１６に記載されるようにＮ末端ＲＩＮＳＡドメイン（Ｓ．ｄｕｂｌｉｎのフラジェリンのアミノ酸３１〜５２）、またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の免疫原性を増強するその相同体もしくは改変型を含む。他の実施形態では、Ｎ末端定常領域はＤ１およびＤ２ドメインを含み、そしてＣ末端定常領域は、Ｄ１およびＤ２ドメイン（Ｅａｖｅｓ−Ｐｙｌｅｓ  ｅｔ  ａｌ．（２００１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １６７：７００９−７０１６）またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の免疫原性を増強するその改変型を含む。
【００３６】
他の実施形態では、フラジェリンのＮ末端および／またはＣ末端の定常領域は、Ａｌｄｅｒｅｍ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許公開第ＵＳ２００３／００４４４２９号Ａ１によって記載されるような、ペプチドＧＡＶＱＮＲＦＮＳＡＩＴ（配列番号４）、またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の免疫原性を増強するその相同体もしくは改変型を含むか、それらからなるか、または本質的にそれらからなる。
【００３７】
さらに他の実施形態では、このＮ末端定常ドメインは、「モチーフＮ（ｍｏｔｉｆ  Ｎ）」（例えば、Ｓ．ｍｕｅｎｃｈｅｎのフラジェリンのアミノ酸９８〜１０８）を含み、そして／あるいはＣ末端定常ドメインは、Ｋａｎｎｅｇａｎｔｉ  ｅｔ  ａｌ．，（２００４）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７９：５６６７−５６７６によって同定される「モチーフＣ（ｍｏｔｉｆ  Ｃ）」（例えば、Ｓ．ｍｕｅｎｃｈｅｎのフラジェリンのアミノ酸４４１〜４４９）またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の免疫応答を増強するその相同体もしくは改変型を含む。
【００３８】
他の例示的な実施形態では、Ｎ末端定常ドメインは、Ｐ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａのフラジェリンのアミノ酸８８〜９７（例えば、Ｖｅｒｍａ  ｅｔ  ａｌ．，（２００５）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７３：８２３７−８２４６を参照のこと）またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の免疫応答を増強するその相同体もしくは改変型を含む。
【００３９】
ＴＬＲ５シグナル伝達に関与するフラジェリンタンパク質の領域は、Ｓｍｉｔｈ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４：１２４７−１２５３によって同定されている（例えば、Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍのフラジェリンのアミノ酸７８〜１２９、１３５〜１７３および３９４〜４４４、またはその相同体もしくは改変型）。
【００４０】
フラジェリンのＮ末端定常領域、Ｃ末端定常領域および超可変領域は、任意の適切な供給源由来のフラジェリン由来であってもよく、これらの領域のいくつかまたは全ては、同じ生物体由来または異なる生物体由来である。多数のフラジェリン遺伝子がクローニングされて配列決定されている（例えば、Ｋｕｗａｊｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８６）Ｊ．Ｂａｃｔ．１６８：１４７９；Ｗｅｉ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８５）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８６：７９１−８０３；およびＧｉｌｌ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５８：７３９５−７４０１を参照のこと）。フラジェリンの非限定的な供給源としては、限定はしないが、Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ、Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓ．ｄｕｂｌｉｎ、Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ、Ｖ．ｃｈｏｌｅｒａ、Ｓ．ｍａｒｃｅｓｅｎｓ、Ｓ．ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｃａ、Ｔ．ｐａｌｌｉｄｕｍ、Ｌ．ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｂ．ｂｕｒｇｄｏｒｆｅｒｅｉ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ａ．ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓ、Ｒ．ｍｅｌｉｌｏｔｉ、Ｂ．ｃｌａｒｒｉｄｇｅｉａｅ、Ｒ．ｌｕｐｉｎｅ、Ｐ．ｍｉｒａｂｉｌｉｓ、Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｐ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、および大腸菌が挙げられる。
【００４１】
本発明の融合タンパク質の非限定的な例は、本明細書の実施例に提供される。
【００４２】
必要に応じて、融合タンパク質は、任意の他のペプチドまたはタンパク質を含んでもよい。例えば、この融合タンパク質は、他の生物体由来の１つ以上の抗原をさらに含み得る。代表的な実施形態では、この融合タンパク質はさらに、免疫調節性化合物を含む。例えば、免疫応答は、免疫調節性サイトカインまたはケモカイン（例えば、α−インターフェロン、β−インターフェロン、γ−インターフェロン、ω−インターフェロン、τ−インターフェロン、インターロイキン−１α、インターロイキン−１β、インターロイキン−２、インターロイキン−３、インターロイキン−４、インターロイキン５、インターロイキン−６、インターロイキン−７、インターロイキン−８、インターロイキン−９、インターロイキン−１０、インターロイキン−１１、インターロイキン１２、インターロイキン−１３、インターロイキン−１４、インターロイキン−１８、Ｂ細胞増殖因子、ＣＤ４０リガンド、腫瘍壊死因子α、腫瘍壊死因子β、単球化学誘引物質タンパク質−１、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子、リンホトキシン、ＣＣＬ２５［ＭＥＣＫ］、およびＣＣＬ２８［ＴＥＣＨ］）によって増強され得ることが当分野で公知である。
【００４３】
本発明はまた、フラジェリンアジュバントおよびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原を含む組成物を提供する。この実施形態によれば、フラジェリンアジュバントは、全長フラジェリンであってもよいし、または上記により詳細に記載されるようなＮ末端定常領域および／またはＣ末端定常領域を含むフラジェリンペプチドであってもよい。さらに、これも上記のように、フラジェリンアジュバントをＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対してカップリング（すなわち融合）して融合タンパク質を形成してもよい。例示的な実施形態では、このＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１タンパク質、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＶタンパク質またはその融合物である。この組成物は、フラジェリンアジュバントに融合された１つ以上のＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原を含んでもよく、そして必要に応じて、この組成物中に存在する１つ以上のＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、フラジェリンアジュバントには融合されない。他の実施形態では、このフラジェリンアジュバントは、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原には結合されない。
【００４４】
他に示されない限り、融合タンパク質は、タンパク質（またはこのタンパク質をコードする核酸）それ自体として投与され、生きているか、不活化されているか、または組み換えられている細菌またはウイルスのベクターによって誘導されるワクチンの一部としてではない。
【００４５】
４．組換え核酸および融合タンパク質の生成
他を示す場合を除いて、当業者に公知の標準的な方法が、遺伝子をクローニングするため、核酸を増幅して検出するため、融合構築物を生成するため、宿主の細胞または生物体においてペプチドを発現するためなどに用いられ得る。このような技術は、当業者に公知である。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ」Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ  ２ｎｄ  Ｅｄ．（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９）；Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ，Ｉｎｃ．およびＪｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）を参照のこと。
【００４６】
本明細書において用いる場合、「核酸（ｎｕｃｌｅｉｃ  ａｃｉｄ）」とは、ＲＮＡおよびＤＮＡの両方を包含し、これには、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、合成（例えば、化学的合成）ＤＮＡ、ならびにＲＮＡおよびＤＮＡのキメラが挙げられる。核酸は、二本鎖であってもまたは一本鎖であってもよい。核酸は、オリゴヌクレオチドアナログまたは誘導体（例えば、イノシンまたはホスホロチオエートヌクレオチド）を用いて合成されてもよい。このようなオリゴヌクレオチドは、例えば、変更された塩基対形成力またはヌクレアーゼに対する耐性を増大させた核酸を調製するために用いられ得る。
【００４７】
本発明の融合タンパク質は、種々の目的のための（例えば、診断または研究の試薬などとして、免疫原性組成物を生成するために）融合タンパク質をコードする異種核酸を発現する、培養された細胞または生物体中で生成されて、必要に応じてそれから精製され得る。
【００４８】
いくつかの実施形態では、この融合タンパク質は、収集されてもよく、そして必要に応じて精製されてもよい。例えば、融合タンパク質は、馴化培地から収集され得る。本実施形態によれば、分泌シグナル配列と作動可能に連結された融合タンパク質を発現することが有利であり得る。あるいは、融合タンパク質は、宿主細胞から単離されてもよい（例えば、宿主細胞を溶解し、それから融合タンパク質が単離されてもよい）。
【００４９】
他の実施形態では、宿主細胞は収集され、そして融合タンパク質はそれから単離されない。
【００５０】
一般には、異種核酸は、発現ベクター（ウイルスまたは非ウイルス）中に組み込まれる。適切な発現ベクターとしては限定はしないが、プラスミド、バクテリオファージ、細菌の人工染色体（ｂａｃｓ）、酵母人工染色体（ｙａｃｓ）、コスミド、ウイルスベクターなどが挙げられる。種々の宿主細胞と適合する発現ベクターは当分野で周知であって、核酸の転写および翻訳のために適切な要素を含む。代表的には、発現ベクターは、「発現カセット（ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｃａｓｓｅｔｔｅ）」を含有し、これは、５’から３’の方向へ、プロモーター、このプロモーターと作動可能に連結された融合タンパク質をコードするコード配列、および必要に応じて、末端配列を含み、これには、ＲＮＡポリメラーゼの終止シグナル、およびポリアデニラーゼのポリアデニル化シグナルを含む。
【００５１】
発現ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞におけるポリペプチドの発現のために設計され得る。例えば、ポリペプチドは、例えば大腸菌などの細菌細胞、昆虫細胞（例えばバキュロウイルス発現系）、酵母細胞、哺乳動物細胞、または植物細胞中で発現され得る。酵母Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ中での発現のためのベクターの例としては、ｐＹｅｐＳｅｃｌ（Ｂａｌｄａｒｉ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８７）ＥＭＢＯ  Ｊ．６：２２９−２３４）、ｐＭＦａ（Ｋｕｒｊａｎ  ａｎｄ  Ｈｅｒｓｋｏｗｉｔｚ，（１９８２）Ｃｅｌｌ  ３０：９３３−９４３）、ｐＪＲＹ８８（Ｓｃｈｕｌｔｚ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８７）Ｇｅｎｅ  ５４：１１３−１２３）、およびｐＹＥＳ２（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．）が挙げられる。培養された昆虫細胞（例えば、Ｓｆ９細胞）中でタンパク質を産生するための核酸の発現に利用可能なバキュロウイルスベクターとしては、ｐＡｃシリーズ（Ｓｍｉｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８３）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．３：２１５６−２１６５）およびｐＶＬシリーズ（Ｌｕｃｋｌｏｗ，Ｖ．Ａ．，およびＳｕｍｍｅｒｓ，Ｍ．ｄ．（１９８９）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  １７０：３１−３９）が挙げられる。
【００５２】
さらに、発現ベクターは一般に、発現制御配列（例えば、転写／翻訳制御シグナル、およびポリアデニル化シグナル）を含み、これが、本発明の融合タンパク質をコードする核酸配列と作動可能に連結される。所望のレベルおよび組織特異的な発現に依存して、種々のプロモーター／エンハンサーエレメントが用いられてもよいことが理解される。プロモーターは、所望の発現のパターンに依存して、構成的であっても誘導性であってもよい（例えば、メタロチオネインプロモーターまたはホルモン誘導性プロモーター）。プロモーターは、天然であってもまたは外来であってもよく、そして天然の配列であっても合成の配列であってもよい。外来とは、そのプロモーターが野性型宿主では見出されず、そこへそのプロモーターが導入されているということを意図する。このプロモーターは、目的の標的細胞において機能するように選択される。さらに、特異的な開始シグナルが一般に、挿入されたタンパク質コード配列の効率的な翻訳のために提供される。これらの翻訳制御配列は、ＡＴＧ開始コドンおよび隣接配列を含んでもよく、天然および合成の両方の種々の起源のものであってもよい。発現ベクターが転写されるべき２つのオープンリーディングフレームを含む本発明の実施形態では、このオープンリーディングフレームは、別のプロモーターと、または単一の上流のプロモーターおよび１つ以上の下流の内部リボソーム侵入部位（ＩＲＥＳ）配列（例えば、ピコルナウイルスＥＭＣ  ＩＲＥＳ配列）と作動可能に連結されてもよい。
【００５３】
哺乳動物発現ベクターの例としては、ｐＣＤＭ８（Ｓｅｅｄ，（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ  ３２９：８４０）およびｐＭＴ２ＰＣ（Ｋａｕｆｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７），ＥＭＢＯ  Ｊ．６：１８７−１９５）が挙げられる。哺乳動物細胞で用いられる場合、発現ベクターの制御機能はしばしば、ウイルスの調節性エレメントによって提供される。例えば、一般に用いられるプロモーターは、ポリオーマ、アデノウイルス２、サイトメガロウイルスおよびシミアンウイルス（Ｓｉｍｉａｎ  Ｖｉｒｕｓ）４０由来である。
【００５４】
本発明はさらに、本発明の融合タンパク質をコードする核酸を（一過性にまたは安定的に）含む宿主細胞を提供する。適切な宿主細胞は、当分野で周知であって、これには原核生物細胞および真核生物細胞が挙げられる。例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ，Ｇｅｎｅ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．（１９９０）を参照のこと。タンパク質は、例えば大腸菌などの細菌細胞、昆虫細胞（例えばバキュロウイルス発現系）、酵母細胞、植物細胞、または哺乳動物細胞（例えば、ヒト、ラット、マウス、ハムスター、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、ネコ、イヌ、ウサギ、サルなど）において発現され得る。宿主細胞は、培養された細胞、例えば、初代細胞または不死化細胞株であってもよい。宿主細胞は、本質的にバイオリアクターとして用いられている、微生物、動物または植物における細胞であってもよい。本発明の特定の実施形態では、宿主細胞は、発現ベクターの複製を可能にする昆虫細胞である。例えば、宿主細胞は、Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ  ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ由来、例えば、Ｓｆ９またはＳｆ２１細胞株、ショウジョウバエ細胞株、または蚊の細胞株、例えば、Ａｅｄｅｓ  ａｌｂｏｐｉｃｔｕｓ由来細胞株であってもよい。異種タンパク質の発現のための昆虫細胞の使用は十分証明され、このような細胞中に核酸、例えば、ベクター、例えば、昆虫細胞適合性ベクター（例えば、バキュロウイルスベクター）を導入する方法、および培養物中でこのような細胞を維持する方法も同様である。例えば、Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｒｉｃｈａｒｄ，Ｈｕｍａｎａ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＪ（１９９５）；Ｏ’Ｒｅｉｌｌｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  Ｖｅｃｔｏｒｓ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖ．Ｐｒｅｓｓ（１９９４）；Ｓａｍｕｌｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒ．６３：３８２２−８（１９８９）；Ｋａｊｉｇａｙａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：４６４６−５０（１９９１）；Ｒｕｆｆｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒ．６６：６９２２−３０（１９９２）；Ｋｉｍｂａｕｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｖｉｒ．２１９：３７−４４（１９９６）；Ｚｈａｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｖｉｒ．２７２：３８２−９３（２０００）；ならびにＳａｍｕｌｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第６，２０４，０５９号を参照のこと。本発明の特定の実施形態では、昆虫細胞はＳｆ９細胞である。
【００５５】
ベクターは、従来の形質転換またはトランスフェクション技術を介して原核生物細胞または真核生物細胞に導入され得る。本明細書において用いる場合、「形質転換（ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ）」および「トランスフェクション（ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ）」という用語は、宿主細胞に外来の核酸（例えば、ＤＮＡ）を導入するための当分野で認識される種々の技術を指し、これには、リン酸カルシウムまたは塩化カルシウム共沈殿、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介性トランスフェクション、リポフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、ＤＮＡをロードされた（ＤＮＡ−ｌｏａｄｅｄ）リポソーム、リポフェクタミン−ＤＮＡ複合体、細胞超音波処理、高速マイクロプロジェクタイルを用いる高速遺伝子微粒子銃（ｇｅｎｅ  ｂｏｍｂａｒｄｍｅｎｔ  ｕｓｉｎｇ  ｈｉｇｈ  ｖｅｌｏｃｉｔｙ  ｍｉｃｒｏｐｒｏｊｅｃｔｉｌｅｓ）およびウイルス媒介性トランスフェクションが挙げられる。宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトする適切な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ  ｅｄ．，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｐｒｅｓｓ（１９８９））および他の実験室マニュアルに見出され得る。
【００５６】
本発明のさらなる実施形態では、宿主細胞は、融合タンパク質をコードする異種核酸配列で安定に形質転換され得る。「安定な形質転換（ｓｔａｂｌｅ  ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ）」とは、本明細書において用いる場合一般には、宿主細胞に導入された異種核酸配列が、宿主細胞のゲノムに組み込んでいない「一過性の形質転換（ｔｒａｎｓｉｅｎｔ  ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ）」と対照的に、宿主細胞のゲノムへの異種核酸配列の組み込みをいう。「安定な形質転換体（ｓｔａｂｌｅ  ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｎｔ）」という用語はさらに、細胞におけるエピソーム（例えば、エプスタイン・バー・ウイルス（Ｅｐｓｔｅｉｎ−Ｂａｒｒ  Ｖｉｒｕｓ）（ＥＢＶ））の安定な維持を指してもよい。
【００５７】
安定に形質転換された細胞が生成される場合、しばしば細胞（詳細には哺乳動物細胞）のうち、わずかな画分しかそのゲノムに外来核酸を組み込まない。これらの構成要素を同定して選択するためには、選択マーカー（例えば、抗生物質に対する耐性）をコードする核酸を、目的の核酸とともに宿主細胞に導入してもよい。好ましい選択マーカーとしては、薬物、例えば、Ｇ４１８、ハイグロマイシンおよびメトトレキサートに対する耐性を付与するマーカーが挙げられる。選択マーカーをコードする核酸は、目的の核酸を含むのと同じベクター上で宿主細胞に導入されてもよいし、または別々のベクター上に導入されてもよい。導入された核酸で安定に形質転換された細胞は、薬物選択によって同定され得る（例えば、選択マーカー遺伝子を組み込んでいる細胞は生存するが、他の細胞は死ぬ）。
【００５８】
融合タンパク質はまた、トランスジェニック植物において生成され得、ここではこの融合タンパク質をコードする単離された核酸は、核または色素体ゲノムに挿入される。植物の形質転換は、当分野で公知である。一般的には、Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  Ｖｏｌ．１５３（「Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ＤＮＡ  Ｐａｒｔ  Ｄ」）１９８７，ｅｄ．Ｗｕ  ａｎｄ  Ｇｒｏｓｓｍａｎ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、および欧州特許出願第ＥＰ６９３５５４号を参照のこと。
【００５９】
外来核酸は、いくつかの方法によって植物細胞またはプロトプラストに導入され得る。例えば、核酸は、マイクロピペットの使用による植物細胞への直接マイクロインジェクションによって機械的に移入されてもよい。外来核酸はまた、細胞によって採取される遺伝的物質との沈殿複合体を形成するポリエチレングリコールを用いることによって植物細胞中に移入されてもよい（Ｐａｓｚｋｏｗｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．（１９８４）ＥＭＢＯ  Ｊ．３：２７１２−２２）。外来核酸は、エレクトロポレーションによって植物細胞中に導入されてもよい（Ｆｒｏｍｍ  ｅｔ  ａｌ．（１９８５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８２：５８２４）。この技術では、植物プロトプラストは、関連の遺伝子構築物を含有するプラスミドまたは核酸の存在下でエレクトロポレーションされる。高電界強度の電気インパルスは、生体膜に可逆性に透過して、プラスミドの導入を可能にする。エレクトロポレーションされた植物のプロトプラストは、細胞壁を再生し、分裂して、植物カルスを形成する。外来核酸を含む形質転換された植物細胞の選択は、表現型マーカーを用いて達成され得る。
【００６０】
カリフラワーモザイクウイルス（ＣａＭＶ）は、植物細胞へ外来核酸を導入するためのベクターとして用いられ得る（Ｈｏｈｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９８２）「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ｐｌａｎｔ  Ｔｕｍｏｒｓ」Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ｐｐ．５４９−５６０；Ｈｏｗｅｌｌ，米国特許第４，４０７，９５６号）。ＣａＭＶウイルスＤＮＡゲノムは、細菌中で増殖され得る組換えＤＮＡ分子を作製する親の細菌プラスミドに挿入される。組換えプラスミドは、所望のＤＮＡ配列の導入によってさらに改変され得る。次いで、組換えプラスミドの改変されたウイルス部分を、親の細菌プラスミドから切り出して、これを用いて植物細胞または植物に接種する。
【００６１】
小粒子による高速弾道論的浸透（ｈｉｇｈ  ｖｅｌｏｃｉｔｙ  ｂａｌｌｉｓｔｉｃ  ｐｅｎｅｔｒａｔｉｏｎ）が、植物細胞へ外来核酸を導入するために用いられてもよい。核酸は、小型のビーズまたは粒子のマトリックス内で、または表面上で処分される（Ｋｌｅｉｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ  ３２７：７０−７３）。代表的には新規な核酸セグメントの単一の導入しか必要としないが、本方法ではまた、複数の導入を提供する。
【００６２】
核酸は、この核酸で形質転換されたＡｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓを用いる植物細胞、外植体、成長点または種子の感染によって植物細胞に導入されてもよい。適切な条件下では、形質転換された植物細胞が成長して、苗条、根が形成され、そしてさらに植物に発達する。この核酸は、例えば、Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓのＴｉプラスミドによって植物細胞に導入され得る。Ｔｉプラスミドは、Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓによる感染の際に植物細胞に伝達され、そして植物ゲノムに安定に組み込まれる（Ｈｏｒｓｃｈ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２７：１２２９−１２３１；Ｆｒａｌｅｙ  ｅｔ  ａｌ．（１９８３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８０：４８０３）。
【００６３】
融合タンパク質は、他のペプチドまたはタンパク質と作動可能に連結された、例えば、精製シグナル（例えば、ポリＨｉｓ）と作動可能に連結された核酸から発現されてもよいし、または他のタンパク質（例えば、サイトカイン）とのキメラとして発現されてもよい。
【００６４】
５．本発明の融合タンパク質、フラジェリンアジュバントおよび組成物を投与する方法
本発明は、公知の技術に従って、治療目的および予防目的のために行われ得る（例えば、Ｐｉｚｚｏ  ｅｔ  ａｌ．のＰＣＴ出願第ＷＯ２００４／１０１７３７号を参照のこと）。
【００６５】
一般には、本発明は、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓによる感染を予防するために、ならびに／またはＹ．ｐｅｓｔｉｓによる感染の影響を軽減および／もしくは寛解させるために予防的に行われる。しかし、他の実施形態では、本発明の方法は、既にＹ．ｐｅｓｔｉｓによって感染されている被験体を治療するために行われる。本発明の方法における使用のための免疫原性組成物は、下に記載される。追加免疫投与はさらに、数週、数ヶ月または数年の時間経過にまたがって投与され得る。慢性の感染においては、最初の高用量に続く追加免疫用量が有利であり得る。
【００６６】
「治療する（ｔｒｅａｔ）」、「治療すること、治療するステップ（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」または「〜の治療（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ  ｏｆ）」という用語（または文法的に等価な用語）とは、被験体の状態の重篤度が、軽減されるか、または少なくとも部分的に改善もしくは緩和されること、ならびに／あるいは少なくとも１つの臨床的な症状のある程度の軽減、緩和または減少が達成されるか、そして／または状態の進行の遅延および／もしくは疾患もしくは障害の発現の予防もしくは遅延が存在するということを意味する。「治療する（ｔｒｅａｔ）」、「治療する（ｔｒｅａｔｓ）」、「治療すること、治療するステップ（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」または「〜の治療（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ  ｏｆ）」などという用語はまた、被験体の予防的治療（例えば、感染または癌の発現を予防する）を含む。本明細書において用いる場合、「予防する（ｐｒｅｖｅｎｔ）」、「予防する（ｐｒｅｖｅｎｔｓ）」または「予防、防止（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」という用語（およびその文法的な等価物）は、疾患の完全な阻止を意味するのではなく、状態の頻度を軽減し、状態の発現および／もしくは進行を遅らせ、そして／または状態に伴う症状を軽減する、任意のタイプの予防的治療を包含する。従って、「治療する」、「治療すること、治療するステップ」または「〜の治療」という用語（または文法的に等価な用語）とは、予防的処方および治療的処方の両方をいう。
【００６７】
「ワクチン接種（ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ）」または「免疫（ｉｍｍｕｎｉｚａｔｉｏｎ）」という用語は、当分野で周知であり、そして他に示さない限り、本明細書において交換可能に用いられる。例えば、ワクチン接種または免疫という用語は、抗原に対する生物体の免疫応答を増大して、それによって感染に抵抗するかまたは感染を克服するプロセスであることが理解され得る。本発明の場合には、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓに対するワクチン接種または免疫は、生物体のＹ．ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答および耐性を増大する。
【００６８】
本明細書において用いる場合、「治療有効量（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ  ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ  ａｍｏｕｎｔ）」とは、被験体を（本明細書において規定されるように）治療するのに十分な量である。
【００６９】
「能動的な免疫応答（ａｃｔｉｖｅ  ｉｍｍｕｎｅ  ｒｅｓｐｏｎｓｅ）」または「能動免疫（ａｃｔｉｖｅ  ｉｍｍｕｎｉｔｙ）」とは、免疫原との遭遇後の宿主の組織および細胞の関与によって特徴付けられる。これは、抗体の合成、もしくは細胞媒介性反応の発生、またはその両方をもたらす、リンパ細網組織における免疫適格性細胞の分化および増殖に関与する。Ｈｅｒｂｅｒｔ  Ｂ．Ｈｅｒｓｃｏｗｉｔｚ、Ｉｍｍｕｎｏｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ：Ｃｅｌｌ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌｕｌａｒ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｆｏｒｍａｔｉｏｎ，ｉｎ  ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ：ＢＡＳＩＣ  ＰＲＯＣＥＳＳＥＳ  １１７（Ｊｏｓｅｐｈ  Ａ．Ｂｅｌｌａｎｔｉ  ｅｄ．，１９８５）。別の言い方をすれば、能動免疫応答は、感染による、またはワクチン接種による、免疫原に対する曝露後に宿主によって惹起される。能動免疫は、「能動的に免疫された宿主から免疫されていない宿主への事前形成された物質（抗体、伝達因子、胸腺移植、インターロイキン２）の移動」（同書）を通じて達成される、受動免疫と対比され得る。
【００７０】
「防御的、予防的（ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ）」免疫応答、または「防御的、予防的（ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ）」免疫とは、本明細書において用いる場合、この免疫応答が、疾患の頻度および／または重篤度を予防または軽減するという点で被験体に対していくつかの利点を付与するということを示す。あるいは、防御的免疫応答または防御的免疫は、既存の疾患の治療的な治療において有用であり得る。
【００７１】
本発明は、医学的目的および獣医の目的の両方のために行われ得る。本発明の方法によって治療されるべき被験体としては、鳥類および哺乳動物の被験体の両方が挙げられ、哺乳動物被験体としては、限定はしないが、ヒト、非ヒト霊長類（例えば、サル、類人猿、ヒヒ、およびチンパンジー）、イヌ、ネコ、ウサギ、ヤギ、ウマ、ブタ、ウシ、ヒツジなど（これには、雄性および雌性の両方の被験体、ならびに、幼年、若年、青年および成体の被験体を含む全ての年齢の被験体を含む）が挙げられる。被験体は、任意の目的のために、例えば、防御免疫応答を惹起するために；その被験体（代表的には動物被験体）における抗体の産生を惹起するために治療され得、その抗体は、診断目的、または他の被験体において受動免疫を生じるためにその被験体に対して投与するなどのような他の目的のために収集されて用いられ得る。特定の実施形態では、この被験体はＹ．ｐｅｓｔｉｓ感染のリスクを有するかまたはリスクがあるとみなされる。
【００７２】
ある実施形態では、この被験体は、高齢の被験体、例えば、５０または６０歳齢以上のヒト被験体であって、ここでは、例えばミョウバンなどの他のアジュバントは一般に有効性が低い。
【００７３】
従って、特定の実施形態では、本発明は、被験体（例えば、哺乳動物被験体、例えば、ヒトまたは霊長類）においてＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対する免疫応答を誘導する方法を提供し、本方法は、本発明の融合タンパク質またはその薬学的組成物を被験体に対して免疫学的に有効な量で投与するステップを含む。代表的な実施形態では、本方法は、被験体（例えば、哺乳動物被験体、例えば、ヒトまたは霊長類）をＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ感染の影響から防御するために行われ、本方法は、本発明の融合タンパク質またはその薬学的組成物を、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ感染の影響からこの被験体を防御するのに有効な量でその被験体に対して投与するステップを含む。必要に応じてこれらの方法は、融合タンパク質または薬学的組成物を粘膜表面に対して（例えば、鼻腔内投与または吸入投与によって）送達することによって行われる。
【００７４】
本発明はさらに、被験体（例えば、哺乳動物被験体、例えば、ヒトまたは霊長類）においてＹ．ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を誘導する方法を提供し、本方法は、フラジェリンアジュバントおよびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原、またはその薬学的組成物を被験体に対して免疫学的に有効な量で投与するステップを含む。代表的な実施形態では、本方法は、被験体（例えば、哺乳動物被験体、例えば、ヒトまたは霊長類）をＹ．ｐｅｓｔｉｓ感染の影響から防御するために行われ、本方法は、フラジェリンアジュバントおよびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原、またはその薬学的組成物を被験体に対して、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ感染の影響からこの被験体を防御するのに有効な量で投与するステップを含む。必要に応じて本方法は、この融合タンパク質または薬学的組成物を粘膜表面に対して（例えば、鼻腔内投与または吸入投与によって）送達することによって行われる。このフラジェリンアジュバントおよびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、同じ組成物または別の組成物として投与されてもよい。別々の組成物として投与される場合、それらは必要に応じて同時に投与されてもよい。本明細書において用いる場合、「同時に（ｃｏｎｃｕｒｒｅｎｔｌｙ）」という用語は、併用効果を生じるために時間内で十分に近接していることを意味する（すなわち、同時に（ｃｏｎｃｕｒｒｅｎｔｌｙ）とは、同時に（ｓｉｍｕｌｔａｎｅｏｕｓｌｙ）であってもよいし、またはそれは、互いの前後の短時間［例えば、数分または数時間］内に生じる２つ以上の事象であってもよい）。
【００７５】
投与は、当分野で公知の任意の経路によるものであってもよい。非限定的な例として、投与の経路は、吸入（例えば、経口および／または経鼻の吸入）、経口、口腔内（例えば、舌下）、直腸、膣、局所（気道への投与を含む）、眼内、経皮、非経口的（例えば、筋肉内［骨格筋、心筋および／または横隔膜筋への投与を含む］、静脈内、皮下、皮内、胸膜内、脳内および動脈内、およびくも膜下腔内）経路、ならびに直接の組織または器官注射によっても、または中枢神経系への投与（例えば、脳への定位的な投与）によってもよい。
【００７６】
特定の実施形態では、投与は、例えば、鼻腔内、吸入、気管内、経口、直腸、または膣の投与などによる、粘膜表面に対してである。一般には、粘膜投与は、気道、胃腸管、尿路、生殖器官などの表面のような粘膜表面に対する送達をいう。
【００７７】
気道への投与の方法としては限定はしないが、経粘膜、鼻腔内、吸入または気管内の投与または肺への投与が挙げられる。粘膜投与の他の方法としては、経口、口腔内（例えば、舌下）、気管内、直腸、膣および眼内の投与が挙げられる。
【００７８】
本発明のタンパク質は、Ｆｅｌｇｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第５，５８９，４６６号に記載されるように、それ自体で送達されてもよいし、またはそのタンパク質をコードする核酸中間体を送達し、これが被験体で発現されてこのタンパク質を産生することによって送達されてもよい。
【００７９】
免疫調節性化合物、例えば、免疫調節性ケモカインおよびサイトカイン（好ましくは、ＣＴＬ誘導性サイトカイン）が被験体に同時投与されてもよい。サイトカインは、当分野で公知の任意の方法によって投与され得る。外因性サイトカインが被験体に投与されてもよいし、あるいは、サイトカインをコードするヌクレオチド配列が、適切なベクターを用いて被験体に送達されて、そのサイトカインがインビボで産生されてもよい。特定の実施形態では、サイトカインは、フラジェリンアジュバントおよび／またはＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原を有する融合タンパク質として提供される。例えば、フラジェリンアジュバント、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原、および免疫調節性サイトカイン（例えば、インターフェロン−γ）を含む融合タンパク質が投与されてもよい。あるいは、サイトカインおよびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原またはフラジェリンアジュバントを含む融合タンパク質が投与されてもよい。
【００８０】
予防または治療目的のためのその用途に加えて、本発明の融合タンパク質および組成物は、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対する抗体であって、次にヒトおよび動物の被験体における診断または治療／予防の目的のために有用である抗体を産生する目的のために被験体に投与されてもよい。
【００８１】
６．薬学的組成物
本発明はさらに、薬学的に受容可能な担体中に本発明の融合タンパク質を含む薬学的組成物（例えば、免疫原性組成物）を提供する。特定の実施形態では、この薬学的組成物は、粘膜送達のために処方される。「薬学的に受容可能な（ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｌｙ  ａｃｃｅｐｔａｂｌｅ）」とは、毒性のない物質か、あるいは好ましくない物質ではないものを意味する。
【００８２】
代表的な実施形態では、融合タンパク質は、「免疫学的に有効な（ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃａｌｌｙ  ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ）」量で薬学的組成物中に存在する。「免疫学的に有効な量（ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃａｌｌｙ  ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ  ａｍｏｕｎｔ）」とは、この薬学的組成物が投与される被験体において能動的な免疫応答（すなわち細胞性および／または体液性）を誘発するのに十分である量である。必要に応じて、この用量は、防御的免疫応答（感染の発生後の予防的または治療的免疫応答）を生じるのに十分である。付与される防御の程度は、この薬学的組成物を投与する利点がそのなんらかの不利益を上回るのであれば、完全である必要も永続的である必要もない。免疫学的に有効な量は、タンパク質、投与の様式、治療される疾患の段階および重篤度、被験体の体重および全身健康状態、ならびに処方する医師の判断に依存する。
【００８３】
薬学的に活性な化合物の投与量は、当分野で公知の方法によって決定され得る。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｍａａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ）を参照のこと。特定の実施形態では、本発明の融合タンパク質の投与量は、代表的な（例えば、７０ｋｇの）被験体について、約０．１、０．５、１、１０、２５、２５０、１００、１５０または２５０μｇから、約３００、５００、１０００、２５００、５０００または１０，０００μｇまでの融合タンパク質に及ぶ。特定の実施形態では、投薬量は、代表的な被験体について約５０〜２０００μｇ、約１００〜１５００μｇ、または約２５０〜１０００μｇの範囲である。最初の用量の後に、その最初の用量に対する被験体の応答に依存して約１μｇ〜２５０、５００または１０００μｇの数週、数ヶ月または数年に及ぶ追加投与が続けられてもよい。
【００８４】
本発明はまた、（ａ）フラジェリンアジュバントと（ｂ）Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ抗原とを含む薬学的組成物を提供する。特定の実施形態では、この薬学的組成物は、粘膜投与のために処方される。本明細書においてさらに詳細に記載されるとおり、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＶ抗原、またはその融合ペプチドであってもよい。必要に応じて、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、フラジェリンアジュバントに結合され、すなわち、フラジェリン抗原を有する融合タンパク質の形態である。この実施形態によれば、この組成物はさらに、フラジェリンアジュバントに結合されていない（すなわち、フラジェリンアジュバントを有する融合タンパク質の一部ではない）１つ以上のさらなるＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原を含んでもよい。
【００８５】
必要に応じて、このＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原は、本明細書に規定されるように、免疫学的に有効な量で存在する。さらに、ある実施形態では、このフラジェリンアジュバントは、「アジュバント有効量（ａｄｊｕｖａｎｔ  ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ  ａｍｏｕｎｔ）」で存在する。「アジュバント有効量」とは、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原に対して宿主によって惹起された能動的な免疫応答（細胞性および／または体液性）、必要に応じて能動的な粘膜免疫応答を増強または刺激するのに十分なフラジェリンアジュバントの量である。特定の実施形態では、この宿主による能動的な免疫応答（例えば、粘膜の免疫応答）は、少なくとも約２、３、４、５、１０、１５、２０、３０、４０、５０、６０、７５、１００、１５０、５００、１０００倍以上まで増強される。他の実施形態では、「アジュバント有効量」とは、特定のレベルの免疫（細胞性および／または体液性）、必要に応じて粘膜免疫を達成するのに必要である抗原の量を、例えば、少なくとも約１５％、２５％、３５％、５０％、６５％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％以上減少させるフラジェリンアジュバントの量である。さらなる選択肢として、「アジュバント有効量」とは、宿主における免疫応答の誘導を加速するか、および／または防御を達成するためのブースター免疫の必要性を減少させるフラジェリンアジュバントの量を指してもよい。さらに別の代替として、「アジュバント有効量」とは、免疫応答、必要に応じて防御免疫応答が維持される期間を（例えば、少なくとも約２倍、３倍、５倍、１０倍、２０倍以上長い期間まで）延長する量であってもよい。
【００８６】
フラジェリンアジュバントおよびＹ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の投与量（融合タンパク質の形態でない場合）は、当業者によって決定され得る。特定の実施形態では、フラジェリンアジュバントの投与量は、代表的な（例えば、７０ｋｇ）の被験体について約０．１、０．５、１、１０、２５、５０、１００または１５０μｇから約２００、２５０、３００、５００、１０００、または２５００μｇという範囲である。特定の実施形態では、投薬量は、代表的な被験体について約１０〜１０００μｇ、または約５０〜５００μｇ、または約１５０〜３００μｇである。Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の適切な投薬量は、代表的な（例えば、７０ｋｇ）の被験体について、約０．１、０．５、１、１０、２５、５０、１００または１５０μｇから約２００、３００、５００、１０００、１５００、２０００、２５００、または５０００μｇの範囲にわたってもよい。特定の実施形態では、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ抗原の投薬量は、代表的な被験体について、約５０〜２０００μｇ、約１５０〜約１５００μｇ、または約３００〜約１０００μｇである。この最初の用量の後に、最初の投与量に対する被験体の応答に依存して、約１μｇ〜約１０００μｇの、数週、数ヶ月または数年にわたる追加投与量が続いてもよい。
【００８７】
本発明の薬学的組成物は、必要に応じて、他の医薬、薬剤、安定化剤、緩衝液、担体、希釈剤、塩、張度調節剤、保湿剤など、例えば、酢酸ナトリウム、乳酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、モノラウリン酸ソルビタン、オレイン酸トリエタノールアミンなどを含んでもよい。
【００８８】
注射のためには、担体は代表的には液体である。投与の他の方法のためには、この担体は固体であっても液体であってもよい。吸入投与のためには、この担体は呼吸に適し、そして代表的には、固体または液体の粒子型である。
【００８９】
フラジェリンを超えるアジュバントは一般には必要ではないが、この組成物は必要に応じて、さらなるアジュバント、例えば、完全または不完全なフロイントアジュバント、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、ミョウバン、サイトカイン、ＴＬＲリガンドなどを含んでもよい。
【００９０】
薬学的組成物中のタンパク質の濃度は、広範に、例えば、約０．０１重量％未満または０．１重量％から、最大で少なくとも約２重量％〜２０重量％程度の量〜５０重量％以上まで変化し得、そして選択される投与の特定の様式に従って、液体の容積、粘度などによって主に選択される。
【００９１】
タンパク質は、公知の技術に従って薬学的な担体中における投与のために処方され得る。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ，Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ（９th  Ｅｄ．１９９５）を参照のこと。本発明による薬学的組成物の製造では、タンパク質（その生理学的に受容可能な塩を含む）が代表的には、特に、受容可能な担体とともに混合される。この担体は、固体であっても、または液体であっても、またはその両方であってもよく、そして必要に応じて、単位用量の処方物、例えば、錠剤として化合物とともに処方される。種々の薬学的に受容可能な水性の担体、例えば、水、緩衝化水、０．９％生理食塩水、０．３％グリシン、ヒアルロン酸、パイロジェンフリー水、パイロジェンフリーのリン酸緩衝化生理食塩水、静菌性水、またはＣｒｅｍｏｐｈｏｒ  ＥＬ［Ｒ］（ＢＡＳＦ，Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ，Ｎ．Ｊ．）などが用いられてもよい。これらの組成物は、従来の技術によって滅菌され得る。１つ以上のタンパク質が本発明の処方物に組み込まれてもよく、これは、薬学の任意の周知の技術によって調製され得る。
【００９２】
薬学的組成物は、使用のために、そのまま、または凍結乾燥された状態でパッケージされることができ、凍結乾燥調製物は一般的には投与の前に滅菌水溶液と組み合わされる。この組成物はさらに、単位／用量または複数用量の容器に、例えば、密閉アンプルおよびバイアル中にパッケージされてもよい。
【００９３】
この薬学的組成物は、薬学の従来の技術に従う当分野で公知の任意の方法での投与のために処方され得る。例えば、この組成物は、鼻腔内に、吸入（例えば経口吸入）によって、経口的に、口腔内（例えば舌下）に、直腸に、膣に、局所に、くも膜下腔内に、眼内に、経皮的に、非経口（例えば、筋肉内［骨格筋、心筋および／または横隔膜筋への投与を含む］、静脈内、皮下、皮内、胸膜内、脳内および動脈内、くも膜下腔内）投与によって、局所的に（例えば、気道表面を含む、皮膚および粘膜表面の両方に対して）、ならびに直接の組織または器官注射によって、そして中枢神経系への投与（例えば、脳への定位的な投与）によって、投与されるように処方されてもよい。
【００９４】
特定の実施形態では、この薬学的組成物は、粘膜表面に対して、例えば、鼻腔内、吸入、気管内、経口、直腸または膣の投与などによって投与される。
【００９５】
鼻腔内または吸入投与のために、この薬学的組成物は、エアロゾル（この用語は、液体および乾燥粉末エアロゾルの両方を含む）として処方されてもよい。例えば、この薬学的組成物は、微細に分割された形態で界面活性剤および噴霧剤とともに提供されてもよい。組成物の代表的な割合は、０．０１〜２０重量％、好ましくは１〜１０％である。この界面活性剤は一般には、毒性でなく、噴霧剤中で可溶性である。このような因子のうち代表的なのは、６〜２２個の炭素原子を含有する、脂肪酸のエステルまたは部分的エステル、例えば、カプロン酸、オクタン酸、ラウリル酸、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸、リノレン酸、オレステリン酸（ｏｌｅｓｔｅｒｉｃ）およびオレイン酸と脂肪族多価アルコールまたはその環状無水物とのエステルである。混合されたエステル、例えば、混合または天然のグリセリドが使用され得る。この界面活性剤は、組成物の０．１〜２０重量％、好ましくは０．２５〜５％を構成し得る。この組成物のバランスは通常は噴霧剤である。担体も、必要に応じて、鼻腔内送達のためのレシチンと同様に含まれてもよい。液体粒子のエアロゾルは、当業者に公知であるように、任意の適切な手段によって、例えば、圧力駆動エアロゾルネブライザーまたは超音波ネブライザーによって生成されてもよい。米国特許第４，５０１，７２９号も参照のこと。固体粒子のエアロゾルは同様に、薬学の分野で公知の技術によって、任意の固体の微粒子性の医薬エアロゾル発生器で生成され得る。鼻腔内投与はまた、鼻の表面に対する点滴投与によってもよい。
【００９６】
注射可能な処方物は、従来の形態で、液体溶液もしくは懸濁物として、注射前の液体中での溶液もしくは懸濁物に適切な固体型で、またはエマルジョンとして調製され得る。あるいは、当業者は、例えば、持続性または徐放性処方物として、全身的な様式ではなく、局所の薬学的組成物を投与し得る。
【００９７】
用時調製の注射溶液および懸濁液は、前に記載された種類の滅菌の粉末、顆粒および錠剤から調製され得る。例えば、本発明の注射可能な、安定な、滅菌の組成物は、単位剤形で、密閉容器中に提供され得る。この組成物は、凍結乾燥の形態で提供されてもよく、これは、薬学的に受容可能な適切な担体と再構成されて、被験体への注射に適切な液体組成物を形成し得る。この単位剤形は、本発明の組成物の約１μｇ〜約１０ｇであり得る。この組成物が実質的に水不溶性である場合、薬学的に受容可能である十分な量の乳化剤が、水性担体中でこの組成物を乳化するために十分な量で含まれてもよい。このような有用な乳化剤の１つはホスファチジルコリンである。
【００９８】
経口投与のために適切な薬学的組成物は、別個の単位で、例えば、カプセル、カシェ剤、トローチ剤もしくは錠剤中に、粉末もしくは顆粒として、水性もしくは非水性の液体中に溶液もしくは懸濁液として、または水中油型もしくは油中水型のエマルジョンとして存在してもよい。経口送達は、動物の腸における消化酵素による分解に抵抗し得る担体に対して本発明の化合物を複合体化することによって行われ得る。このような担体の例としては、当分野で公知のように、プラスチックのカプセルまたは錠剤が挙げられる。このような処方物は、薬学の任意の適切な方法によって調製され、この方法は、この化合物と適切な担体（上で注記されるような１つ以上の補助成分を含み得る）とを連結させるステップを含む。一般には、この薬学的組成物は、まず最初にこの化合物と液体もしくは微細に分割された固体担体、またはその両方とを均一に混合すること、次いで、必要に応じてこの得られた混合物を成形することによって調製される。例えば、錠剤は、この化合物を含む粉末または顆粒を、必要に応じて１つ以上の補助成分とともに圧縮または成型することによって調製され得る。圧縮錠剤は、適切な機械中で、この組成物を自由流動型で、例えば、粉末または顆粒を、必要に応じて結合剤、潤滑剤、不活性な希釈剤、および／または界面活性／分散剤とともに圧縮することによって調製される。成型された錠剤は、適切な機械中で、不活性な液体の結合剤で湿された粉末化合物を成型することによって作成される。
【００９９】
口腔内（舌下）投与に適切な薬学的組成物としては、香味の基剤、通常はスクロースおよびアカシアまたはトラガカント中に化合物を含むトローチ剤（ｌｏｚｅｎｇｅ）、ならびに不活性な基剤、例えば、ゼラチンおよびグリセリンまたはスクロースおよびアカシア中に化合物を含むトローチ（ｐａｓｔｉｌｌｅ）が挙げられる。
【０１００】
非経口投与に適切な本発明の薬学的組成物は、本発明の化合物の無菌の水性および非水性の注射溶液を含んでもよく、この調製物は好ましくは、意図されるレシピエントの血液と等張性である。これらの調製物は、抗酸化剤、緩衝液、静菌剤および溶質を含有してもよく、これによって意図されるレシピエントの血液と等張の組成物にされる。水性および非水性の無菌の懸濁液、溶液およびエマルジョンは、懸濁剤および増粘剤を含んでもよい。非水性の溶媒の例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、植物油、例えば、オリーブオイル、および注射用有機エステル、例えば、オレイン酸エチルである。水性の担体としては、水、アルコール溶液／水溶液、エマルジョンまたは懸濁液が挙げられ、これには生理食塩水および緩衝化媒体が含まれる。非経口的な媒体としては、塩化ナトリウム溶液、リンゲルのデキストロース、デキストロースおよび塩化ナトリウム、乳酸リンゲルまたは不揮発性油が挙げられる。静脈内媒体としては、液体および栄養補充液、電解質補充液（例えば、リンゲルデキストロースに基づく補充液）などが挙げられる。防腐剤および他の添加物、例えば、抗菌剤、抗酸化剤、キレート剤および不活性ガスなども存在してもよい。
【０１０１】
直腸投与のために適切な薬学的組成物は好ましくは、単位用量坐剤として存在する。これらは、この化合物と１つ以上の従来の固体担体、例えば、ココアバターなどと混合すること、次いで得られた混合物を成形することによって調製され得る。
【０１０２】
皮膚への局所適用に適切な本発明の薬学的組成物は好ましくは、軟膏、クリーム、ローション、ペースト、ゲル、スプレー、エアロゾルまたはオイルの形態をとってもよい。用いられ得る担体としては、限定はしないが、ワセリン、ラノリン、ポリエチレングリコール、アルコール、経皮エンハンサーおよびそれらの２つ以上の組み合わせが挙げられる。いくつかの実施形態では、例えば、局所送達は、本発明の薬学的組成物と皮膚に通過し得る親油性試薬（例えば、ＤＭＳＯ）とを混合することによって行われ得る。
【０１０３】
経皮投与のために適切な薬学的組成物は、長期間にわたって被験体の表皮と密接に接触したままであるように適合された別個のパッチの形態であってもよい。経皮投与に適切な組成物はまた、イオン泳動によって送達され得（例えば、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ３：３１８（１９８６）を参照のこと）、そして代表的には、化合物の必要に応じて緩衝化された水溶液の形態をとり得る。適切な処方物は、クエン酸塩またはｂｉｓ／ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ６）またはエタノール／水を含んでもよく、そして０．１〜０．２Ｍの活性成分を含有してもよい。
【０１０４】
さらに、この化合物は、リポソーム処方物として処方されてもよい。リポソーム懸濁物を形成するための技術は当分野で周知である。この化合物またはその塩が水溶性の塩である場合、従来のリポソーム技術を用いて、これらを脂質小胞に組み込んでもよい。このような場合、この化合物または塩の水溶性に起因して、この化合物または塩は実質的に、リポソームの親水性の中心またはコア内に捕捉される。使用される脂質層は、任意の従来の組成物であってもよく、そしてコレステロールを含んでもよいし、またはコレステロールを含まなくてもよい。目的の化合物または塩が水不溶性である場合、ここでも従来のリポソーム形成技術を使用して、この塩は実質的に、リポソームの構造を形成する疎水性脂質二重層内に捕捉され得る。いずれの場合でも、生成されるリポソームは、標準的な超音波および均一化技術の使用によって、サイズを小さくできる。
【０１０５】
リポソーム処方物は、リポソーム懸濁物を再生するために、水のような薬学的に受容可能な担体で再構成され得る凍結乾燥物が凍結乾燥されて生成されてもよい。
【０１０６】
本発明を記載してきたが、これは以下の実施例にさらに詳細に説明され、この実施例は、例示的な目的のためにのみ本明細書に含まれ、そして本発明を限定することは意図しない。本明細書に用いられる略号は、以下のとおりである。ＧＭ−ＣＳＦ、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子；ＩＬ、インターロイキン；ｉ．ｎ．，鼻腔内；ｉ．ｔ．気管内；ＮＫ、ナチュラルキラー細胞；ＮＯ、一酸化窒素；ｓ．ｃ．皮下；ＴＬＲ、トール様受容体；ＴＧＦ−β、トランスフォーミング成長因子β。
【実施例１】
【０１０７】
がん抗原およびそのワクチン
マウスの肺における先天性免疫に対するフラジェリンの効果。１μｇのフラジェリンの非外科的な気管内（ｉ．ｔ．）滴下は、約４時間後にＴＮＦαの最大産生を誘導するのに十分である（図１）。１２〜２４時間までに、気管支肺胞浸出液のサイトカインレベルは、ベースラインレベルに戻る。ＴＬＲ５に結合せず、従ってシグナル伝達活性を欠く変異フラジェリンは、サイトカイン産生を誘導しないことに留意のこと。ＴＮＦαに加えて、ＩＬ−６、Ｇ−ＣＳＦを含むいくつかの他のサイトカイン、ならびにケモカイン、ＭＩＰ−２およびＫＣは、比較的高レベルに誘導された。サイトカイン発現の増大の後に、好中球の一過性の浸潤（最大１２〜２４時間）が続く。フラジェリンによって開始される先天的な免疫応答は、重篤な組織障害性の炎症を生じないということを強調することが重要である。誘導された炎症性応答は、実際には比較的中度でかつ急性である。これらの知見を、他の研究者らの知見と組み合わせて、先天性免疫の活性化因子としてのフラジェリンのインビボの力価が確立される。
【０１０８】
マウスの肺におけるフラジェリンのアジュバント効果。フラジェリンによって誘発される先天性の応答を分析することに加えて、抗体応答に対するフラジェリンの効果を検討した。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、１０μｇのＦ１抗原と１μｇのフラジェリン、または不活性なフラジェリン変異体タンパク質を用いて、非外科的な気管内（ｉ．ｔ．）または鼻腔内（ｉ．ｎ．）滴下によって免疫した。４週後、マウスを同じ処方で追加免疫し、次いで抗Ｆ１  ＩｇＧの血清レベルを２週後に確認した。フラジェリンは、血清抗Ｆ１  ＩｇＧレベルによって測定した場合、異常に強力なアジュバント活性を示したが、フラジェリンの不活性な変異体はアジュバント活性を示さなかった。ｉ．ｔ．で免疫した動物では、抗体の力価は、２０，０００〜１００，０００より多くに、そしてｉ．ｎ．で免疫した動物の場合は９０，０００〜３００，０００より多くに及んだ。ｉ．ｎ．での免疫の結果は表１に示す。ノックアウトマウスを用いるこの応答についてのサイトカイン要件の分析によって、ＩＬ−６もＩＬ−１２もＴＮＦ−αもフラジェリンのアジュバント効果には必要がないことが示される（図５）。さらに、フラジェリンの最大アジュバント効果は、マウスの気道における先天性免疫応答の最大誘導に必要であるよりも５〜１０倍低いフラジェリンの用量（１μｇ）で達成される。従って最大のアジュバント活性は、限られた炎症を生じるフラジェリンの用量で達成される。
【０１０９】
【表１】
2008523819.tif 000003
【実施例２】
【０１１０】
抗原特異的な乳がん応答を生成するためのアジュバントとしてのフラジェリン
インビボでの乳房腫瘍の治療。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、多くの乳房腫瘍によって過剰発現される抗原であるＦｒａ−１抗原、そしてフラジェリンまたはフラジェリンの不活性型のいずれかで免疫した。このマウスは、乳がん腫瘍であるＤ２Ｆ２細胞の皮下注射の前に１回追加免疫した。マウスを腫瘍の増殖についてモニターして、腫瘍容積を決定した。データを図２に示す。白抜きの丸は、Ｆｒａ−１抗原およびフラジェリンの不活性型を与えられたマウスを示す。黒塗りの丸は、Ｆｒａ−１抗原およびフラジェリンの活性型を与えられたマウスを示す。容易に理解されるとおり、フラジェリン＋Ｆｒａ−１抗原は、腫瘍の増殖に有意な影響を有した。
【０１１１】
フラジェリンがマウスモデルにおいてＤ２Ｆ２乳がん細胞に対する防御免疫応答を促進し得るか否かの評価。フラジェリンがＤ２Ｆ２乳がん細胞に対する免疫の防御状態を促進する能力は、抗原として、これらのがん細胞によって過剰発現されるタンパク質であるＦｒａ−１を用いて評価される。これらの実験は、免疫と、次いでＤ２Ｆ２細胞でのチャレンジと、ならびにチャレンジ後の免疫を含む。さらに、誘導されたエフェクター−抗体、対細胞溶解性Ｔ細胞および／またはＮＫ細胞の性質を決定する。
【０１１２】
Ａ．精製された組換えＦｒａ−１抗原の調製。マウスＦｒａ−１をコードするｃＤＮＡをコードするｐＥＴ２２発現ベクター（Ｔｈｅ  Ｓｃｒｉｐｐｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ＩｎｓｔｉｔｕｔｅのＲｏｎｇ  Ｘｉａｎｇ博士によって寄贈される）を用いて、Ｒｏｓｅｔｔａ−ｇａｍｉ−ｐＬｙｓＳ細菌においてＦｒａ−１タンパク質を発現する。このタンパク質は、Ｔａｌｏｎ親和性樹脂を用いて（Ｆｒａ−１上のＨｉｓ−ｔａｇの認識を介する）精製し、そして混入する内毒素を、Ｄｅｔｏｘｉ−ゲルカラムを通じた精製タンパク質の通過によって除去する（ＭｃＤｅｒｍｏｔｔ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．６８：５５２５−５５２９）。この手順を用いて、いくつかのタンパク質（例えば、フラジェリン、Ｆ１抗原、およびＩＲＡＫ−４［真核生物のタンパク質］）のｍｇ量が事前に得られている。
【０１１３】
Ｂ．Ｆｒａ−１抗原およびフラジェリンで免疫されたＢＡＬＢ／ｃマウスにおけるＤ２Ｆ２乳がん細胞に対してフラジェリンが防御的な免疫を促進するか否かの評価。７匹のマウスの群を、１０μｇのＦｒａ−１タンパク質を用いて、１μｇのフラジェリンまたは変異体フラジェリン２２９の有無において、腹腔内（ｉ．ｐ．）または筋肉内（ｉ．ｍ．）で免疫する。２週後には、マウスを追加免疫し、次いで１×１０６個のＤ２Ｆ２細胞でチャレンジする（皮下的に（ｓ．ｃ．）与える）。腫瘍量およびマウスの生存は、約３ヶ月の期間にわたって追跡する。免疫の非存在下では、マウスのうち約５０％がチャレンジ後４週間内に死んだ。ｓ．ｃ．腫瘍は、腫瘍容積が算出できるように、幅および長さについて測定する。フラジェリンの有意な効果が観察される場合、最大応答を生じるフラジェリンの用量を決定する。フラジェリンの最適用量が一旦確立されれば、フラジェリンが既存の腫瘍の排除を促進し得るか否かが決定される。７匹のマウスの群にＤ２Ｆ２細胞をｓ．ｃ．注射によってチャレンジし、次いで、チャレンジの時点または１、３、７および２１日後に、フラジェリンの有無においてＦｒａ−１を用いて免疫する。各々の場合に、マウスは２週後に追加免疫する。腫瘍量およびマウスの生存を決定する。
【０１１４】
Ｃ．Ｆｒａ−１発現Ｄ２Ｆ２細胞に対するフラジェリン促進応答における潜在的なエフェクターの同定。フラジェリン促進応答において誘導されたエフェクターを同定するために、循環している抗Ｆｒａ−１抗体のレベルならびにＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）およびＮＫ細胞の相対的な数を決定する。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、上に示したプロトコルに従って、Ｆｒａ−１およびフラジェリンまたは変異体フラジェリンで免疫する。
【０１１５】
１．抗Ｆｒａ−１抗体。Ｄ２Ｆ２細胞でのチャレンジの２週後、マウスを安楽死させて、血清サンプルを、ＥＬＩＳＡによる循環している抗Ｆｒａ−１抗体の分析のために採取する。適切な抗アイソタイプの抗体を用いて、循環している総ＩｇＧおよびＩｇＭのレベル、ならびにＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａサブ−アイソタイプを評価する。
【０１１６】
２．抗−Ｆｒａ−１特異的なＣＤ８＋ＣＴＬ。抗Ｆｒａ−１特異的なＣＤ８＋ＣＴＬを、脾細胞を単離し、それらの細胞傷害性活性を標準的な51Ｃｒ放出アッセイで評価することによって測定する。ＣＤ８＋ＣＴＬによって媒介される溶解は、抗ＭＨＣクラスＩ抗体によってブロックされるはずである。従って、細胞サンプルを、この抗体の有無において分析する。エフェクター対標的の比を変化させることによって、Ｆｒａ−１およびフラジェリンまたは変異体フラジェリンで免疫したマウスにおけるＣＤ８＋ＣＴＬの増大の相対的な評価が得られる。活性化されたＣＤ８＋ＣＴＬの数はまた、インターフェロンγ（ＩＦＮ−γ）産生のＥＬＩＳＰＯＴアッセイを用いて決定され得る。抗ＣＤ８  ＭＡＣＳ  ＭｉｃｒｏＢｅａｄｓ（Ｍｉｌｔｅｎｙｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）を用いて、免疫されたマウス由来のＣＤ８＋脾細胞を単離し、その細胞を、放射線照射されたＤ２Ｆ２細胞とともに２４時間インキュベートする。その細胞をＩＦＮ−γ産生についてＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって分析する。十分な数の細胞が存在する場合、細胞内サイトカイン染色（ＩＣＳ）を第二の方法として用いる。
【０１１７】
３．ＮＫ細胞。標的としてＹＡＣ−１細胞を用いた51Ｃｒ放出アッセイにより、活性化されたＮＫ細胞の相対的な数を評価する。免疫してＤ２Ｆ２チャレンジしたマウスから脾細胞を得て、ＹＡＣ−１細胞に対する細胞溶解活性について評価する。ＤＸ５の発現はＮＫ細胞と関連するので、市販のＰＥ標識抗体を用いて、このマーカーの発現をフローサイトメトリーにより測定する。ＮＫ細胞の増殖に対するフラジェリンの刺激効果は、ＤＸ５発現の増大と相関しているはずである。
【０１１８】
Ｄ２Ｆ２乳がん細胞に対する防御的応答における、Ｆｒａ−１エピトープを含有する組換えフラジェリンタンパク質の有効性。フラジェリンがワクチンベクターおよびアジュバントとして機能し得るか否かをさらに決定する。この場合には、種々の腫瘍抗原由来の多数のエピトープをコードする組換えフラジェリンタンパク質が生成される。
【０１１９】
ヒト乳がんは、それらが発現する腫瘍特異的抗原において実質的な異質性を示すことが、有効な証拠により示される。例えば、ＭＡＧＥ−３は、乳がんのうちほぼ１４％で発現されるが、Ｈｅｒ２／ｎｅｕは４０％で、ＮＹ−ＢＲ−６２は６０％で、そしてＮＹ−ＢＲ−８５は約９０％で発現される（Ｓｃａｎｌａｎ  ａｎｄ  Ｊａｅｇｅｒ（２００１）Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．３：９５−９８）。全長Ｆｒａ−１抗原を含む組換えフラジェリンタンパク質が、２つのタンパク質として機能し得るか否かを決定する。この場合には、防御的応答の誘導に関与するＦｒａ−１内のエピトープをマッピングする。他の主要な乳がん抗原標的に対して同じことを行うのは正攻法の試みであろう。様々な標的抗原由来のエピトープを発現するフラジェリンタンパク質が生成され得る。あるいは、標的エピトープのサブセットを発現する各フラジェリンには、フラジェリンタンパク質のカクテルが用いられ得る。さらに、導入することによって、外来エピトープがこのタンパク質の超可変領域（フラジェリンとＴＬＲ５との相互作用に関与しない領域）に導入され（ＤｏｎｎｅｌｌｙおよびＳｔｅｉｎｅｒ（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７７：４０４５６−４０４６１；Ｓｍｉｔｈ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４：１２４７−１２５３；Ｍｕｒｔｈｙ  ｅｔ  ａｌ．（２００４）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７９：５６６７−５６７５）、フラジェリンの生物学的活性はいかなる有意な方法によっても影響される可能性は低い。
【０１２０】
フラジェリン／Ｆｒａ−１キメラの生成。Ｆｒａ−１の全長配列を、フラジェリンの超可変領域に挿入して、その得られた構築物をｐＥＴ２２ａ発現ベクターにクローニングして、そのタンパク質をＲｏｓｅｔｔａ−ｇａｍｉ−ｐＬｙｓＳ細菌中で発現する。内毒素をＤｅｔｏｘｉ−ゲルカラムを用いて除去する。このキメラタンパク質の生物学的活性は、ＲＡＷ２６４．７細胞によるＴＮＦα産生を用いて評価する。このキメラの力価を判定し、その力価を野性型フラジェリンと比較する。
【０１２１】
Ｄ２Ｆ２細胞に対する防御に必要なＦｒａ−１エピトープのマッピング。Ｄ２Ｆ２細胞でのチャレンジに対し、このキメラがＢＡＬＢ／ｃマウスを防御する能力を評価する。このキメラが防御免疫を誘導した場合には、Ｆｒａ−１配列から重複短縮物を生成し、フラジェリンとしての有効性について試験される。構築物の数を減少させるために、Ｆｒａ−１の全配列をカバーするように重複する３つの断片を調製する。これらの短縮物のうちの１つが活性である場合、さらなる短縮物を生成して、防御に必要な最小配列を規定する。この３つの短縮物の中にそれ自体が機能的であるものがない場合、それらを対で試験して、必要な配列がこのタンパク質の異なる部分にあるか否かを決定する。このアプローチを用いて、必要な最小配列を規定し得る。
【実施例３】
【０１２２】
フラジェリンは、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓによる致死性の呼吸器チャレンジに対する免疫のための有効な粘膜アジュバントである
方法
プラスミドおよび細胞培養。Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原ｃａｆ１のコード配列（ｃａｆオペロン全体を含有するプラスミドは、Ｓｔａｔｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｓｔｏｎｙ  ＢｒｏｏｋのＪ．Ｂ．Ｂｌｉｓｋａ博士によって寄贈された）を、Ｎｏｖａｇｅｎ（ＥＭＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）のｐＥＴ２９ａ発現ベクターのＮｄｅＩおよびＸｈｏＩ部位にサブクローニングした。組換えのＦ１／Ｖ融合構築物（Ｈｅａｔ  ｅｔ  ａｌ．（１９９８）Ｖａｃｃｉｎｅ  １６：１１３１−１１３７）（Ｇ．Ａｎｄｒｅｗｓ博士およびＰ．Ｗｏｒｓｈａｍ博士，ＵＳＡＭＲＩＩＤが提供）を配列決定して、ｐＥＴ１６ｂにサブクローニングした。配列決定によって、Ｆ１のシグナル配列に相当する２１個のアミノ酸の非存在が明らかになった。
【０１２３】
試薬および抗体。Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ由来の精製された組換えＨｉｓタグ化フラジェリンは以前に記載されたように調製された（Ｈｏｎｋｏ  ａｎｄ  Ｍｉｚｅｌ（２００４）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７２：６６７６−６６７９；ＭｃＤｅｒｍｏｔｔ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．６８：５５２５−５５２９）。２２９変異フラジェリン、ならびにＦ１およびＦ１／Ｖ抗原を、同一の様式で精製した。内毒素のレベルは、Ｃａｍｂｒｅｘ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（Ｅａｓｔ  Ｒｕｔｈｅｒｆｏｒｄ，ＮＪ）のＱＣＬ−１０００（登録商標）Ｃｈｒｏｍｏｇｅｎｉｃ  ＬＡＬ  Ｔｅｓｔ  Ｋｉｔによって測定した場合１ｐｇ／μｇ以下であった。ＴＮＦ−αは、製造業者（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）の指示に従って、ＢＤ  ＯｐｔＥＩＡ  ＥＬＩＳＡキット（モノ／モノ）を用いて検出した。Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．（Ｆｌａｎｄｅｒｓ，ＮＪ）から入手した抗Ｆ１マウスモノクローナルＩｇＧ１（クローンＹＰＦ１９）を、抗Ｆ１のＥＬＩＳＡにおいてコントロールとして用いた。ヤギ抗マウスＩｇＧ−ＨＲＰは、ＳｏｕｔｈｅｒｎＢｉｏｔｅｃｈ（Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ，ＡＬ）から購入した。ヤギ抗サルＩｇＧ−ＨＲＰは、Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．（Ｆｌａｎｄｅｒｓ，ＮＪ）から購入した。
【０１２４】
マウス。雌性ＢＡＬＢ／ｃＡｎＮＣｒマウスは、Ｆｒｅｄｅｒｉｃｋ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  Ｃｅｎｔｅｒ（Ｆｒｅｄｅｒｉｃｋ，ＭＤ）から購入した。雌性ＩＬ−６−／−マウス（Ｂ６；１２９Ｓ２−Ｉｌ６／Ｊ）、ＴＮＦＲ１マウス（ｔｍ１Ｋｏｐｆ−／−Ｂ６；１２９Ｓ−Ｔｎｆｒｓｆ１ａ  Ｔｎｆｒｓｆ１ｂ／Ｊ）、ＩＦＮγ（ｔｍ１Ｉｍｘ  ｔｍ１Ｉｍｘ−／−Ｂ６．１２９Ｓ７−Ｉｆｎｇｔｍ１Ｔｓ／Ｊ）およびコントロールのマウス（Ｃ５７ＢＬ／６Ｊ，Ｂ６；１２９ＳＦ２／Ｊおよび１２９／ＳｖＪ）は、Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ（Ｂａｒ  Ｈａｒｂｏｒ，ＭＥ）から購入した。ＩＦＮα／βＲ−／−マウスは、Ｃ．Ｓｃｈｉｎｄｌｅｒ博士，Ｃｏｌｕｍｂｉａ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（Ｍｕｅｌｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（１９９４）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６４：１９１８−１９２１）から提供された。マウスは、特別な病原体のない施設で飼育して、全ての研究は、連邦のガイドラインおよびＷａｋｅ  Ｆｏｒｅｓｔ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって示される施設のガイドラインに従った。
【０１２５】
マウスの非外科的な気管内および鼻腔内免疫。気管内免疫のために、マウスを、アベルチン（Ａｖｅｒｔｉｎ）（２，２，２−トリブロモエタノール、Ｓｉｇｍａ；ｔｅｒｔ−アミルアルコール，Ｆｉｓｈｅｒ）を用いて、腹腔内注射によって麻酔し、門歯によってワイヤで吊るした。気管に穏やかに挿入された滅菌のゲルローディングチップを用いて、１０μｇのＦ１抗原および示した量のフラジェリンまたはフラジェリン変異体２２９を、全部で５０μＬの発熱物質なしのＰＢＳにより投与した。鼻腔内免疫のために、抗原およびアジュバントをＰＢＳに含有する小容積（全部で９〜１２μＬ）を、麻酔されたマウスの鼻孔に投与した。マウスを４週で追加免疫して、追加免疫の２〜３週後に抗体力価の分析のために血漿を収集した。
【０１２６】
サルの免疫。１５例の健常な成体雌性カニクイザル（Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）を、連邦のガイドラインおよびＷａｋｅ  Ｆｏｒｅｓｔ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって示される施設のガイドラインに従って維持した。動物は、免疫および血液採取のために７〜１０ｍｇ／ｋｇのケタミンを用いて筋肉内に麻酔した。鼻腔内免疫のために、１５０μｇのＦ１／Ｖ融合タンパク質および５０μｇのフラジェリンを、横臥位の動物に滴下して与えた（鼻孔あたり１００μＬ）。筋肉内免疫を四頭筋に対して１ｍＬの容積で投与した。コントロールの動物には鼻腔内および筋肉内にＰＢＳを与えた。
【０１２７】
酵素結合免疫吸着アッセイ（ｅｎｚｙｍｅ−ｌｉｎｋｅｄ  ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂａｎｔ  ａｓｓａｙ）（ＥＬＩＳＡ）による血漿抗体力価の分析。ヘパリン処理した試験管（ＳｔａｔＳｐｉｎ；Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）またはＢＤ  Ｖａｃｕｔａｉｎｅｒ  ＰＳＴ試験管を、血漿の採取に用いた。次いで、血漿をアリコートにして、分析するまで−７０℃で凍結させた。ＥＬＩＳＡプレートは、１００μＬの抗原が１０μｇ／ｍＬで含まれる滅菌ＰＢＳを用いて４℃で一晩コーティングして、１０％ＦＣＳを含むＰＢＳでブロックした。二倍または三倍の血漿希釈物を添加して、そのプレートを４℃で一晩インキュベートし、その後に二次抗Ｉｇ抗体と室温で２時間インキュベートした。ペルオキシダーゼ活性は、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）Ｌｉｑｕｉｄ  Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）を用いて検出し、そして２ＭのＨ2ＳＯ4で停止させた。終点希釈の力価は、未感作の血漿の吸光度よりも０．１より大きい吸光値（ＯＤ450）を生じる、最大希釈の逆数として規定した。
【０１２８】
Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２での呼吸器のチャレンジ。Ｃｅｎｔｅｒｓ  ｆｏｒ  Ｄｉｓｅａｓｅ  Ｃｏｎｔｒｏｌ（ＣＤＣ）のＤｉｖｉｓｉｏｎ  ｏｆ  Ｖｅｃｔｏｒ−Ｂｏｒｎｅ  Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ  Ｄｉｓｅａｓｅｓ（Ｆｏｒｔ  Ｃｏｌｌｉｎｓ，ＣＯ）によって、ヒト初代肺ペスト（ｐｎｅｕｍｏｎｉｃ  ｐｌａｇｕｅ）の死亡例から単離した株である、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２  ｂｉｏｖａｒ  ｏｒｉｅｎｔａｌｉｓのストック培養物が提供された（Ｄｏｌｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９９４）Ａｍ．Ｊ．Ｔｒｏｐ．Ｍｅｄ．Ｈｙｇ．５１：１０９−１１４）。心臓注入ブロス（ｈｅａｒｔ  ｉｎｆｕｓｉｏｎ  ｂｒｏｔｈ）に、継代培養プレートからの単一のコロニーを接種して、２８℃で、１×１０9のコロニー形成単位（ｃｆｕ）／ｍＬという適切な密度まで増殖させた。マウスにＰＢＳ中で約１．８×１０7ｃｆｕ／ｍＬに希釈した１０μＬの培養物を鼻腔内にチャレンジし、これは１．２×１０4ｃｆｕという５０％致死用量（ＬＤ５０）の１５０倍に等しい用量である（データ示さず）。実際のｃｆｕ／ｍＬの値は、トリプトース血液寒天プレート上に連続希釈をプレートすることによって測定した。生存は、チャレンジ後１４〜３０日間モニターした。全ての実験は、Ｖｉｒｇｉｎｉａ  ＴｅｃｈのＩｎｆｅｃｔｉｏｕｓ  Ｄｉｓｅａｓｅ  Ｕｎｉｔ（ＣＤＣ承認＃Ｃ２００３１１２０−００１６）のＢＳＬ３およびＡＢＳＬ３の施設について、ＣＤＣの承認した標準操作手順に従って行った。
【０１２９】
統計学的分析。データは、個々の値に平均および標準誤差をつけて示す。分散の均等についてのＦ検定およびスチューデントの片側ｔ検定を用いてｐ＜０．０５またはｐ＜０．０１で統計学的有意差を割り当てた。ＳｉｇｍａＳｔａｔ３．１（Ｓｙｓｔａｔ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．，Ｒｉｃｈｍｏｎｄ，ＣＡ）を用いて、非線形回帰によってＬＤ50値を決定した。
【０１３０】
結果
フラジェリンでの免疫は、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原に対して強力な適応性の応答を促進する。フラジェリンがＹ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原に対する体液性免疫応答を促進する能力を決定するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスを、１０μｇのＦ１抗原および１μｇの組換えフラジェリン（ＦｌｉＣ）を用いて、気管内（ｉ．ｔ．）または鼻腔内（ｉ．ｎ．）で免疫した。コントロールの動物を、ＰＢＳに含まれるＦ１抗原、またはＦ１および２２９と命名されるフラジェリンの変異型で免疫した。４週後、マウスを同一の方式で追加免疫して、追加免疫後種々の時点での循環している抗体力価の分析のために血漿を収集した。コントロールのマウスの群ではＦ１特異的なＩｇＧは検出されなかった。しかし、Ｆ１およびフラジェリンを含有するワクチンは、総ＩｇＧ力価の劇的な増大を刺激し（図３、パネルａ）、高レベルのＦ１特異的ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａをともなった。フラジェリンおよびＦ１がｉ．ｔ．で投与された場合、ＩｇＧ１対ＩｇＧ２ａの平均の比（バーの中に示される）は、３０〜１７０に及び、ｉ．ｎ．で与えられた場合は約３であった。ｉ．ｎ．およびｉ．ｔ．での免疫は、混合Ｔｈ応答を生じたが、気管内免疫後は、Ｔｈ２応答への偏りが明確であった。フラジェリンは有意なＦ１特異的ＩｇＥ産生を促進しなかったことに注意することが重要である。Ｆ１およびフラジェリンで免疫したマウスが示す抗Ｆ１ＩｇＧの力価は、２回の免疫後、維持されていた（図３、パネルｂ）。１６週での３回の免疫によって、最初の力価が低かった２匹のマウスでの抗体応答は改善された。
【０１３１】
以前の研究では、肺におけるフラジェリンに対する先天性の応答は、５〜１５μｇの範囲のフラジェリンの用量で最大であることが実証された（ＨｏｎｋｏおよびＭｉｚｅｌ（２００４）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７２：６６７６−６６７９）。フラジェリンによって促進されるサイトカイン応答と抗体応答との大きさの間に線形の関係が存在するか否かを決定するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスをＦ１抗原、および１μｇ、５μｇおよび１５μｇのフラジェリンで免疫した（図３、パネルｃ）。抗Ｆ１ＩｇＧ力価は、これらの用量では有意に異なることはなく、これによって、このアジュバント効果が、１μｇのフラジェリンで最大であることが示される。しかし、本発明者らは、フラジェリンの用量が増大するにつれてより大きいＩｇＧ１／ＩｇＧ２ａ比に向かう傾向であることに注目した。従って、最大の適応性応答は、最大の先天性応答を要する必要はないと考えられる。
【０１３２】
フラジェリンに対する既存の免疫は、アジュバントとしてのその使用を考慮した場合に明らかな懸念である。従って、本発明者らは、高力価の抗フラジェリン抗体の存在下でフラジェリンおよびＦ１を用いる免疫の有効性を評価した。雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスを、５μｇのフラジェリンをｉ．ｎ．で用いて免疫して、追加免疫し、そして抗フラジェリン抗体の力価を決定した。フラジェリン特異的なＩｇＧ力価は、免疫の前の検出のレベルより低く、そして８．５×１０5という平均の抗ＦｌｉＣ  ＩｇＧ力価で有意に増大した。次いで、これらのマウスを、１０μｇのＦ１および１μｇのＦｌｉＣを用いてｉ．ｎ．で免疫して追加免疫した。追加免疫の２週後、抗Ｆ１  ＩｇＧ力価は、未感作のマウスとＦｌｉＣ−免疫マウスとの間で同様であり（図３、パネルｄ）、このことは、循環している抗フラジェリン抗体が、フラジェリンに対する応答を正にも負にも変更しないことを示した。本発明者らの結果によって、フラジェリンが、フラジェリンに対する前の免疫の存在下で有効なアジュバントであるという結論が支持される。
【０１３３】
フラジェリンのアジュバント効果は、抗原特異的な応答を刺激し、そしてそれはＴリンパ球に依存性である。免疫学的記憶の発達は、有効なワクチンの本質的な特徴であり、これによって感染の間、抗原に対する引き続く曝露に対して迅速に応答するための免疫系が準備される。二次免疫におけるフラジェリンの刺激についての要件を評価するために、４つの群のＢＡＬＢ／ｃマウスをＦ１抗原およびフラジェリンで免疫して、引き続き、ＰＢＳ、フラジェリン単独、Ｆ１抗原単独、またはフラジェリンおよびＦ１で追加免疫した（図４、パネルａ）。ＰＢＳまたはフラジェリン単独で追加免疫されたマウスでのＦ１特異的ＩｇＧの力価は５００〜１１００の間にとどまり、これは一次応答後に代表的な値である。しかし、二次免疫でＦ１抗原のみを投与されたマウスは、抗Ｆ１  ＩｇＧ力価が劇的に増大していた。フラジェリンは追加免疫には必要でなかったが、フラジェリンが存在する場合、抗Ｆ１抗体の有意な増大が存在した。これらの知見は、アジュバントとしてＬＰＳを用いて、Ｐａｓａｒｅ  ａｎｄ  Ｍｅｄｚｈｉｔｏｖ（２００４）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ  ２１：７３３−７４１に報告された知見と同様である。この著者らは、一旦ＣＤ４+の記憶がアジュバントとしてＬＰＳを用いて確立されれば、ＴＬＲ刺激は、これらのリンパ球の活性化にはもはや必要ではないということを示唆した。本発明者らの系における記憶応答は、完全に特徴づけられたままであるが、フラジェリンおよびＦ１で免疫した無胸腺ヌードマウス（ＢＡＬＢ／ｃＡｎＮＣｒ−ｎｕ／ｎｕ）におけるＦ１特異的ＩｇＧ応答の欠失（図４、パネルｂ）は、このワクチンに対する体液性応答でのＴ細胞の必要性を実証している。
【０１３４】
ＴＮＦ−α、ＩＬ−６およびインターフェロンは、フラジェリンのアジュバント効果には必要ない。以前に、フラジェリンは、肺で高レベルのＴＮＦ−αおよびＩＬ−６を誘導するということが確認された（実施例１；Ｈｏｎｋｏ  ａｎｄ  Ｍｉｚｅｌ（２００４）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７２，６６７６−６６７９）。従って、フラジェリンのアジュバント活性におけるこれらのサイトカインの役割を評価した。ＴＮＦ−αは、樹状細胞成熟を促進する多面的なサイトカインである（Ｂａｎｃｈｅｒｅａｕ  ｅｔ  ａｌ．（２０００）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８，７６７−８１１）。図５、パネルａに示されるとおり、抗Ｆ１抗体応答は、これらのマウスでは極めて高く維持され、これによって、ＴＮＦ−αは、フラジェリンのアジュバント効果には必要ないということが示される。しかし、フラジェリン刺激されたＴＮＦ−α産生は、Ｆ１抗原に対する抗体応答を増強すると考えられる。なぜならＴＮＦＲ-/-マウスでの力価は、野性型Ｂ６；１２９マウスに対して約２分の一に低下していたからである。フラジェリンのアジュバント活性において、Ｂ細胞増殖および分化を促進するサイトカインである（Ｋａｍｉｎｕｒａ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｒｅｖ．Ｐｈｙｓｉｏｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．１４９：１−３８）ＩＬ−６の役割は、ＩＬ−６-/-マウスを用いて評価された。これらのマウスでは、Ｆ１およびＦｌｉＣでの免疫後に抗Ｆ１  ＩｇＧの産生の欠失があり（図５、パネルｂ）、このことは、このサイトカインも、フラジェリンのアジュバント効果には必須でないことを示している。
【０１３５】
インビトロでは、フラジェリンは、機能的なＴＬＲ５／４ヘテロマー複合体を通じたシグナル伝達を介して一酸化窒素およびインターフェロンβ（ＩＦＮ−β）の産生を刺激する（Ｍｉｚｅｌ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７０：６２１７−６２２３）。非機能的な変異体ＴＬＲ４を保有するＣ３Ｈ／ＨｅＪマウス（Ｐｏｌｔｏｒａｋ  ｅｔ  ａｌ．（１９９８）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８２：２０８５−２０８８）によってインビボにおけるＴＬＲ５／４ヘテロマーおよびＴＬＲ５／５ホモマーのシグナル伝達の影響を分けるモデルが得られる。肺では、ＴＮＦ−α、ＩＬ−６、Ｇ−ＣＳＦ（顆粒球コロニー刺激因子）、ケラチノサイト由来ケモカイン（ＫＣ）、マクロファージ炎症性タンパク質２（ＭＩＰ−２）およびＭＩＰ−１αのフラジェリン刺激産生は、Ｃ３Ｈ／ＨｅＪマウスでは崩壊されなかった（実施例１；ＨｏｎｋｏおよびＭｉｚｅｌ（２００４）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７２：６６７６−６６７９）が、一方、インターフェロン産生は評価されなかった。Ｉ型のＩＦＮは、抗原提示細胞上でのＭＨＣおよび同時刺激分子の上方制御を刺激することによって先天性および適応性の免疫応答と関連すると提示される（Ｌｅ  Ｂｏｎ  ａｎｄ  Ｔｏｕｇｈ（２００２）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４：４３２−４３６）。フラジェリンのアジュバント効果に対するＴＬＲ５／４のシグナル伝達の役割を決定するために、Ｃ３Ｈ／ＨｅＪマウスでの抗Ｆ１抗体の力価を、その野性型の対応物であるＣ３Ｈ／ＨｅＮマウスと、Ｆ１抗原およびフラジェリンでの免疫後に比較した（図５、パネルｃ）。抗体産生の欠損がなかったので、ＴＬＲ５／４複合体を介するシグナル伝達は、フラジェリンのアジュバント効果には必要ない。フラジェリンのアジュバント活性におけるインターフェロンの役割は、Ｉ型インターフェロンシグナル伝達（ＩＦＮα／βＲ-/-）またはインターフェロン−γを産生する能力（ＩＦＮγ-/-）のいずれかを欠くマウスにおける抗体応答を決定することによって直接評価された（図５、パネルｄおよびｅ）。両方のマウスの株とも、Ｆ１抗原およびフラジェリンで免疫された野性型のマウスと類似の方式で応答したので、インターフェロンも、フラジェリンのアジュバント効果には必要でない。
【０１３６】
フラジェリンは、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２による鼻腔内チャレンジの防御応答を促進する。ワクチンの基礎的な試験は、病原体でのチャレンジに対する防御を提供する能力である。呼吸器感染のモデルとして、免疫されたマウスおよびコントロールのマウスを病原性のＹ．ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２を用いて鼻腔内にチャレンジした。ワクチン接種が適切な防御を誘発することを確実にするために、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓでのｉ．ｎ．感染についての５０％致死用量（ＬＤ50）の約１５０倍のチャレンジ用量を、ＮＩＡＩＤおよびＦＤＡによって支援される近年のＰｌａｇｕｅ  Ｖａｃｃｉｎｅ  Ｗｏｒｋｓｈｏｐ（２００４年、１０月１３日〜１４日）からの推奨に基づいて選択した。フラジェリンおよびＦ１を用いてｉ．ｎ．で免疫されて追加免疫されたＢＡＬＢ／ｃマウスは、１００×ＬＤ50に等しい用量でのチャレンジ後に、コントロール群でのわずか７％に対して、９３％の生存率を有した（図６、パネルｂ）。Ｂ細胞欠損ＩｇＨ-/-マウスを用いて、防御的な応答のＢ細胞／抗体依存性を評価した（図６、パネルｂ）。約１５０×ＬＤ50の用量のＹ．ｐｅｓｔｉｓ感染で全てのコントロールのマウスおよび免疫されたマウスは死亡し、このことにより、このチャレンジ用量での防御は、Ｂ細胞媒介性であって、従っておそらく抗体媒介性であることが示された。以前には、Ｅｌｖｉｎ  ｅｔ  ａｌ．は、ＩＬ−１２およびＩＦＮ−γ−媒介性免疫応答を欠くＳｔａｔ４-/-動物を用いるＹ．ｐｅｓｔｉｓ感染からの防御における１型エフェクターの機能の役割を検討した（Ｅｌｖｉｎ  ａｎｄ  Ｗｉｌｌｉａｍｓｏｎ（２００４）Ｍｉｃｒｏｂ．Ｐａｔｈｏ．３７：１７７−１８４）。免疫されたＳｔａｔ４-/-マウスは、その野性型対応物と同様のレベルの抗Ｆ１および抗ＶのＩｇＧを産生するが、これらの動物は、高用量のチャレンジからは保護が劣った。本発明者らの系において鼻腔内チャレンジ後のＩＦＮ−γ媒介性防御の役割に取り組むため、ＩＦＮ−γ-/-および野性型のＣ５７ＢＬ／６マウスの群を、Ｆ１抗原およびフラジェリンを用いて１５０×ＬＤ50のＹ．ｐｅｓｔｉｓを用いるチャレンジの前に免疫して、追加免疫した。野性型Ｃ５７ＢＬ／６マウスは、コントロールのわずか１０％に対して、フラジェリンおよびＦ１を用いるｉ．ｎ．免疫によって完全に防御された（図６、パネルｃ）。免疫されたＩＦＮ−γ-/-マウスは、チャレンジ後に８０％の生存を有し（図６、パネルｄ）、このことは、ＩＦＮ−γ媒介性の応答が防御には必要ないことを示す。これらの動物は高い力価の抗Ｆ１  ＩｇＧを有するので、これらの結果によって、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ感染からの防御におけるＦ１特異的抗体の重要性が確認され、そして循環中のＩｇＧ力価の有用性が防御効率の相関として支持される。２匹のＩＦＮγ-/-マウスが感染に対して死んだという観察によって、ＩＦＮ−γは、おそらく食細胞における呼吸バーストの促進を通じて、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓからの抗体媒介性防御を増強し得るということが示唆される。
【０１３７】
フラジェリンは非ヒト霊長類における有効なアジュバントである。マウスモデルにおいて防御的な適応性免疫応答を促進するフラジェリンの能力に照らして、本発明者らは次に、非ヒト霊長類におけるアジュバントとしてフラジェリンの有効性を評価した。Ｙ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原およびＶ抗原からなる組換え融合タンパク質を、雌性カニクイザルの免疫に用いた。６匹のマウスの群は、１５０μｇのＦ１／Ｖ融合および５０μｇのフラジェリンを用いて、ｉ．ｎ．または筋肉内（ｉ．ｍ．）で免疫した。さらなるコントロール動物（ｎ＝３）は、両方の経路によってＰＢＳを投与された。免疫の前に、サルは、約９．８×１０4という抗フラジェリン抗体力価を示した。フラジェリンで免疫されたサルは、免疫後の最初の２４時間の間に体温または血漿のＴＮＦ−αレベルで変化を示さず、そして注射の部位で観察可能な炎症は生じなかった。動物には、４週で同一の様式で追加免疫して、血漿の抗Ｆ１／Ｖ  ＩｇＧ力価を２週後に測定した（図７）。免疫されたサルは、Ｆ１／Ｖ−特異的抗体力価の顕著な増大を示した。抗原特異的なＩｇＥは検出されなかった。これらの結果によって、フラジェリンは、循環している抗フラジェリン抗体の存在下でさえ、非ヒト霊長類における抗体応答の発達のための有効なアジュバントであることが明確に確認された。
【実施例４】
【０１３８】
Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓの抗原およびワクチン
Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓに対する免疫応答を誘導する融合タンパク質は、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ  Ｖ抗原、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ  Ｆ１抗原、またはその融合ペプチドを用いて、実施例２に記載されるのと同様の様式で生成する。このような融合タンパク質を用いて、免疫応答を、必要に応じて防御免疫応答を、本明細書に記載されるように誘導し得る。必要に応じて、この応答は、粘膜の免疫応答である。適切な融合タンパク質の特異的な非限定的な例は以下である。
【０１３９】
実施例Ａ：ＦｌｉＣ／Ｆ１／Ｖのアミノ酸配列（配列番号１）
【化１】
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【０１４０】
実施例Ｂ：ＦｌｉＣ／Ｆ１のアミノ酸配列（配列番号２）
【化２】
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【０１４１】
実施例Ｃ：ＦｌｉＣ／Ｖのアミノ酸配列（配列番号３）
【化３】
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注：Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓから得たＦｌｉＣ。これらの融合タンパク質の各々では、ＦｌｉＣ末端のＮ末端定常領域はアミノ酸残基１９８で、そしてＣ末端定常領域（その最初の７つのアミノ酸は太字で下線で示される）は、実施例Ａ（配列番号１）ではアミノ酸残基６７９で、実施例Ｂ（配列番号２）ではアミノ酸残基３４８で、そして実施例Ｃ（配列番号３）ではアミノ酸残基５２４で開始する。
【実施例５】
【０１４２】
フラジェリンならびにＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶ抗原を含有する融合ペプチドの生物学的活性
フラジェリンならびにＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶ抗原を単独のタンパク質としてコードする発現プラスミドを調製するために、Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓのフラジェリンの超可変領域をコードするヌクレオチド配列のほとんどを、６アミノ酸をコードする１８のヌクレオチドブリッジによって分けられるＦ１およびＶ配列を連続して置換して取り替えた（上記の実施例Ａ、配列番号１を参照のこと）。組換えタンパク質をＢＬ２１細胞で生成して、金属親和性樹脂上でのアフィニティークロマトグラフィーによって精製した。内毒素および混入する核酸を、Ａｃｒｏｄｉｓｃクロマトグラフィーフィルターを用いて除去した。得られたタンパク質がフラジェリンの生物活性を保持するか否かを決定するために、ＴＬＲ５−陰性およびＴＬＲ５−陽性のＲＡＷ２６４．７細胞を、三融合タンパク質とともにインキュベートして、腫瘍壊死因子ａ産生の程度を決定した。ＴＬＲ５−陰性のＲＡＷ細胞を用いて、このアッセイにおける影響を有し得る任意の混入する因子を制御した。図８に示されるとおり、フラジェリンならびにＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶタンパク質を含有する融合タンパク質は、ＴＬＲ５−陽性細胞においてフラジェリンの生物学的活性を保持する。このタンパク質は、ＴＬＲ５−陰性のＲＡＷ２６４．７細胞においてはシグナル伝達しなかった。
【０１４３】
トール様受容体５（ＴＬＲ５）陰性ＲＡＷ２６４．７細胞またはＴＬＲ５陽性ＲＡＷ２６４．７細胞（ＴＬＲ５強化黄色蛍光タンパク質をコードする構築物を用いてＲＡＷ２６４．７細胞を安定にトランスフェクトすることによって作成された細胞株）を、フラジェリンならびにＹ．ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶタンパク質をコードする融合タンパク質の漸増濃度とともに、４時間インキュベートし、次いで培養培地を、ＴＮＦ−αの含量についてＥＬＩＳＡによってアッセイした。
【０１４４】
フラジェリン＋Ｆ１＋Ｖまたは３つの全てを含有する単一のタンパク質が、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２での致死チャレンジに対して防御するか否かを決定するために、Ｃ３Ｈ／ＨｅＪマウスを、リン酸緩衝化生理食塩水のみ（ＰＢＳ）または３つのタンパク質を含むワクチン（１ｍｇのフラジェリン＋各々５ｍｇのＦ１およびＶ、またはフラジェリン、Ｆ１およびＶ（フラジェリン／Ｆ１／Ｖ；１０ｍｇ）を含有する単一のタンパク質を含有するワクチン）を用いて免疫して、追加免疫した。同じ処方で４週後にマウスを追加免疫し、次いで、Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２のほぼ１５０のＬＤ50を用いてチャレンジした。このマウスを、チャレンジの前に採血して、抗−Ｆ１  ＩｇＧ力価をＥＬＩＳＡによって決定した。表２に示されるように、フラジェリン＋Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶ抗原、またはフラジェリンならびにＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶ抗原を含有する融合タンパク質は、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓでの致死の呼吸器チャレンジに対して完全な防御を与える。
【０１４５】
【表２】
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【０１４６】
前述は本発明の例示であって、その限定と解釈されるべきではない。本発明は、特許請求の範囲によって規定され、これはそこに含まれる特許請求の範囲と等価である。
【図面の簡単な説明】
【０１４７】
【図１】ｉ．ｔ．での滴下によってフラジェリンまたは変異フラジェリン２２９を投与されたＢＡＬＢ／ｃマウスの肺におけるＴＮＦα発現を示す。
【図２】腫瘍増殖に対するフラジェリンの効果を示す。白抜きの丸はＦｒａ−１抗原およびフラジェリンの不活性型を与えられたマウスを示す。黒塗りの丸は、Ｆｒａ−１抗原およびフラジェリンの活性型を与えられたマウスを示す。
【図３】フラジェリンおよびＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１抗原での免疫が、かなりの抗Ｆ１抗体生成を生じることを示す。（パネルＡ）雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスに、１０μｇのＦ１＋１μｇのフラジェリン（ＦｌｉＣ）を用いて気管内に（ｉ．ｔ．）または鼻腔内に（ｉ．ｎ．）免疫した。コントロールの動物には、ｉ．ｔ．で１０μｇのＦ１単独を用いて、または１μｇの２２９変異体断片を用いて免疫した。マウスには、４週で同一の方式で追加免疫して、血漿を２週後にＥＬＩＳＡによる分析のために収集した。バーの中の数は、ＩｇＧ１／ＩｇＧ２ａアイソタイプの比を示す。*は、コントロールに対する統計的な有意差を示し、そして**は、ｉ．ｎ．の力価がｉ．ｔ．よりも統計的に大きい（ｐ＜０．００７）ことを示す。（パネルｂ）１０μｇのＦ１＋１μｇのフラジェリンを用いてｉ．ｎ．で免疫したマウス由来の抗Ｆ１抗体の力価。各々のラインは、１つのマウスを示し、そして矢印は、ブースター（追加）免疫を示す。（パネルｃ）雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスを、１０μｇのＦ１および漸増量のＦｌｉＣまたは５μｇの２２９を用いてｉ．ｔ．で免疫して、４週で追加免疫した。血漿抗Ｆ１  ＩｇＧ力価は、追加免疫後２週で測定した。（パネルｄ）雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスの群を、５μｇのフラジェリン単独を用いてｉ．ｎ．で免疫して、同一の方式で４週で追加免疫した。抗ＦｌｉＣ抗体の力価は、２週後に測定し（平均の抗ＦｌｉＣ力価＝８．５×１０5）、次いでフラジェリン免疫マウスを１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣを用いてｉ．ｎ．で免疫して追加免疫した。追加免疫の２週後、抗Ｆ１力価を測定して、１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣまたは２２９を用いて免疫したフラジェリンに未感作の動物の力価と比較した。バーは、平均抗体力価±ｓ．ｅ．ｍ．を示す。１つの免疫群あたり７匹の雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスを用いた。
【図４】フラジェリンが抗原特異的応答を刺激して、Ｔ細胞を要することを示す。（パネルａ）７匹の雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスの群を、１０μｇのＦ１抗原＋１μｇのフラジェリン（ＦｌｉＣ）で免疫して、ＰＢＳ、１μｇのＦｌｉＣ単独、１０μｇのＦ１単独、または１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣを用いて４週で追加免疫した。血漿を、ＥＬＩＳＡによる分析のために追加免疫後３週で収集した。*は、ＰＢＳまたはＦｌｉＣ単独で追加免疫した動物に対する統計的な有意差を示し、そして**は、Ｆ１＋ＦｌｉＣを用いる追加免疫が、Ｆ１抗原単独よりも統計学的に大きい抗体力価を生じることを示す（ｐ＜０．０１）。バーは、平均抗体力価±ｓ．ｅ．ｍ．を示す。（パネルｂ）７匹の無胸腺ヌードマウス（ＢＡＬＢ／ｃＡｎＮＣｒ−ｎｕ／ｎｕ）の群を、１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣを用いてｉ．ｎ．で免疫して、追加免疫した。血漿は、ＥＬＩＳＡによる抗Ｆ１  ＩｇＧ力価の分析のために、追加免疫の２週後に収集した。*は、同一の方式で免疫した正常なＢＡＬＢ／ｃマウスに比較して統計的な有意差を示す（ｐ＜０．００１）。
【図５】フラジェリンのアジュバント効果の必要性を示す。ＴＮＦＲ-/-（パネルａ）またはＩＬ６-/-（パネルｂ）および野性型Ｂ６；１２９コントロールマウスを、１０μｇのＦ１抗原＋１μｇのフラジェリン（ＦｌｉＣ）または変異体フラジェリン（２２９）を用いてｉ．ｔ．で免疫した。*は、ＴＮＦＲ-/-の力価が、Ｂ６；１２９コントロールよりも統計学的に小さい（ｐ＜０．００１）ことを示す。Ｃ３Ｈ／ＨｅＪ（Ｔｌｒ４Ｐ７１２Ｈ変異体）および野性型Ｃ３Ｈ／ＨｅＮマウスを１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣまたは２２９で免疫した（パネルｃ）。ＩＦＮα／βＲ-/-（パネルｄ）およびＩＦＮγ-/-（パネルｅ）のマウスおよび対応する野性型コントロールを１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣまたは２２９で免疫した。各々の免疫群で７匹の雌性マウスを用いた。マウスは、４週で同じ様式で追加免疫して、血漿をＥＬＩＳＡによる抗Ｆ１  ＩｇＧ力価の分析のために、２週後に収集した。バーは、平均抗体力価±ｓ．ｅ．ｍ．を示す。
【図６】フラジェリンが、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２による鼻腔内感染の防御応答を促進することを示す。１５匹の雌性ＢＡＬＢ／ｃマウスの群（パネルａ）を、１０μｇのＦ１抗原＋１μｇのフラジェリン（ＦｌｉＣ）またはＰＢＳ単独を用いてｉ．ｎ．で免疫して、同一の方式で４週で追加免疫した。血漿はＥＬＩＳＡによる抗体力価の分析のために、追加免疫２週後に収集した（平均抗Ｆ１力価＝９．４×１０5）。１週後にマウスに、１００×ＬＤ50に匹敵する用量のＹ．ｐｅｓｔｉｓ  ＣＯ９２を用いてｉ．ｎ．でチャレンジした。マウスはチャレンジ後の３０日間モニターした。１０匹の抗体欠損ＩｇＨ-/-マウスの群（パネルｂ）を、１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣまたはＰＢＳ単独を用いてｉ．ｎ．で免疫して、同一の方式で４週で追加免疫した。マウスを、１５５×ＬＤ50に匹敵する用量のＹ．ｐｅｓｔｉｓを用いて２週後にｉ．ｎ．でチャレンジした。１０匹の野性型Ｃ５７ＢＬ／６マウス（パネルｃ）および雌性ＩＦＮγ-/-マウス（パネルｄ）の群を、１０μｇのＦ１＋１μｇのＦｌｉＣを用いてｉ．ｎ．で免疫して、追加免疫した。血漿はＥＬＩＳＡによる抗体力価の分析のために、追加免疫２週後に収集した（抗Ｆ１力価≧１×１０6）。１週後にマウスに、１５０×ＬＤ50に匹敵する用量のＹ．ｐｅｓｔｉｓを用いてｉ．ｎ．でチャレンジして、チャレンジ後１６日間モニターした。
【図７】フラジェリンが非ヒト霊長類における有効なアジュバントであることを示す。雌性カニクイザル（Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）を、１５０μｇのＦ１／Ｖ融合タンパク質＋５０μｇのフラジェリンを用いて鼻腔内に（ｎ＝６）または筋肉内に（ｎ＝６）免疫した。コントロールの動物（ｎ＝３）を、ＰＢＳ単独を用いてｉ．ｎ．およびｉ．ｍ．免疫した。１２時間にわたって体温に有意な変化は生じず、そしてＴＮＦ−αは、免疫後４時間、１２時間および２４時間で収集した血漿では検出されなかった。動物を同一の方式で４週で追加免疫して、血漿は、ＥＬＩＳＡによる分析のために、２週後に収集した。バーは、平均抗Ｆ１／Ｖ抗体力価±ｓ．ｅ．ｍ．を示し、そして*は、鼻腔内免疫に対する統計学的な有意差を示す（ｐ＜０．００６）。
【図８】フラジェリンおよびＹｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓのＦ１およびＶタンパク質を含む融合タンパク質が、フラジェリンの生物学的活性を保持することを示す。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【国際調査報告】
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