(57)【要約】【課題】複数のマイクロウェルを有する細胞培養容器において、画像取得手段でマイクロウェルの拡大画像を取得するだけで、そのマイクロウェルの位置と拡大画像とを対応付けることが可能な検体画像管理システム及び検体画像管理プログラムを提供することを目的とする。【解決手段】本発明は、複数のマイクロウェルと、マイクロウェルごとに対になって付された複数の第１識別子とを有する細胞培養容器を用いる検体画像管理システムである。検体画像管理システムは、第１識別子とマイクロウェルの対を含む拡大検体画像内のマイクロウェルおよび第１識別子を解析し、マイクロウェルの位置に関する情報と拡大検体画像とを少なくとも対応付ける。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数のマイクロウェルと、前記マイクロウェルごとに対になって付された複数の第１識別子とを有する細胞培養容器と、
前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記第１識別子に関する情報とが関連付けられた第１情報を格納する記憶手段と、
前記第１識別子と前記マイクロウェルの対を含む拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析し、前記第１情報に基づいて前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と前記拡大検体画像とを少なくとも対応付ける検体画像管理手段と、
を備える検体画像管理システム。
【請求項２】
前記細胞培養容器は、第２識別子を更に有し、
前記検体画像管理手段は、前記細胞培養容器から読み取られた前記第２識別子と、前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記拡大検体画像とを対応付ける、請求項１に記載の検体画像管理システム。
【請求項３】
前記検体画像管理手段は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する際に、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルの外周輪郭および前記第１識別子の輪郭を抽出する、請求項１または２に記載の検体画像管理システム。
【請求項４】
前記検体画像管理手段は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する際に、前記拡大検体画像内の前記第１識別子の向きを解析し、前記拡大検体画像の回転補正を行う、請求項１〜３のいずれか１項に記載の検体画像管理システム。
【請求項５】
前記第１情報の前記第１識別子に関する情報は、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置の情報、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを含み、
前記検体画像管理手段は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する際に、前記拡大検体画像内において、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを認識する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の検体画像管理システム。
【請求項６】
複数のマイクロウェルと、前記マイクロウェルごとに対になって付された複数の第１識別子とを有する細胞培養容器用の検体画像管理処理を、演算手段及び記憶手段を少なくとも備える情報処理装置に実行させるためのプログラムであって、
前記演算手段に、
前記第１識別子と前記マイクロウェルの対を含む拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する処理と、
前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記第１識別子に関する情報とが関連付けられた第１情報に基づいて前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と前記拡大検体画像とを少なくとも対応付ける処理と、
を実行させるためのプログラム。
【請求項７】
前記細胞培養容器は、第２識別子を更に有し、
前記演算手段に、
前記細胞培養容器から読み取られた前記第２識別子と、前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記拡大検体画像とを対応付ける処理を更に実行させる、請求項６に記載のプログラム。
【請求項８】
前記解析する処理は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルの外周輪郭および前記第１識別子の輪郭を抽出することを含む、請求項６または７に記載のプログラム。
【請求項９】
前記解析する処理は、前記拡大検体画像内の前記第１識別子の向きを解析し、前記拡大検体画像の回転補正を行うことを含む、請求項６〜８のいずれか１項に記載のプログラム。
【請求項１０】
前記第１情報の前記第１識別子に関する情報は、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置の情報、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを含み、
前記解析する処理は、前記拡大検体画像内において、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを認識することを含む、請求項６〜９のいずれか１項に記載のプログラム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、細胞培養容器内の細胞（受精卵などの個別管理が必要な細胞）の拡大検体画像の管理システム及びプログラムに関する。
【背景技術】
【０００２】
培養系で精子と卵子とを体外受精させて受精卵（接合子）を作製して、さらに受精卵を卵割、桑実胚、胚盤胞の段階を経て、透明帯から孵化した脱出胚盤胞の段階まで培養することが可能となり、この卵割から胚盤胞の段階にある受精卵を子宮に移植して産子を得る補助的生殖技術（ＡＲＴ）が、家畜領域のみならずヒトの不妊医療でも確立されている。
【０００３】
しかし、体外受精による妊娠成功率は必ずしも高くはなく、たとえばヒトにおいては、その妊娠成功率は、依然として２５〜３５％程度に留まっている。その原因の一つとして、培養において子宮への移植に適した良質な受精卵を得られる確率が高くないことが挙げられる。培養された受精卵は、専門家が顕微鏡で個別に観察することにより、子宮への移植に適した良質な受精卵であるか否か判別されている。
【０００４】
体外受精においては、容器中に培養液のドロップを作り、この中に受精卵を入れて体外培養するマイクロドロップ法が用いられることが多い。従来、このマイクロドロップ法には、細胞培養容器として、底面が単一平面であり、直径が３０〜６０ｍｍのシャーレが使用され、シャーレの底面に、培養液のドロップを、間隔をあけて複数個作製し、その中で細胞を培養する方法が使用されてきた。
【０００５】
通常のシャーレでドロップを作成すると、受精卵自身の細胞運動やドロップ内の対流によって受精卵の位置が変わってしまい、その中で培養して観察していた受精卵の特定が難しくなるという問題があった。したがって、受精卵の位置を制御できる手段が求められていた。
【０００６】
受精卵の培養効果をより効率的にするためには受精卵同士の相互作用（パラクライン効果）を利用することが好ましいとされている。これらの効果を利用しつつ、受精卵の位置を制御する目的で、シャーレの底面に受精卵のサイズと同程度のマイクロウェルを形成し、複数個のマイクロウェルを覆うように培養液のドロップを添加し、培養液で満たされたマイクロウェルに受精卵を配置して培養を行うシステムが知られている。それにより複数の受精卵の位置を制御して個別観察を可能としつつ、少量の培養液の中で複数の受精卵の培養を行うことができ、パラクライン効果を利用できる。
【０００７】
一方、個々の受精卵を区別するためには、個々のマイクロウェルを識別する必要がある。マイクロウェルは顕微鏡で観察するため、顕微鏡の視野だけから多くの情報を推測する必要があるが、倍率が高いとどのマイクロウェルを見ているか判断できない。マイクロウェルの識別には、マイクロウェルアレイの最外周に数字や文字の情報を付加し、マトリクス的にマイクロウェルを識別できるようにすることが知られている。
【０００８】
しかし、上記の方法では、顕微鏡下、高倍率で観察する際に、マイクロウェルから観察位置を大きくずらして、識別情報を読み取る必要があり、作業性の観点で問題があった。また、顕微鏡で細胞を撮影した際に、写真にはマイクロウェルの識別情報がないため、写真データに対して手作業で情報を付与する必要が生じ、作業が煩雑であり、また作業者のミスによる関連付けの誤りが発生する危険性があった。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００９】
【特許文献１】特許第４７２４８５４号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
本発明は、複数のマイクロウェルを有する細胞培養容器において、マイクロウェルの拡大画像から、そのマイクロウェルの位置と拡大画像とを対応付けることが可能な検体画像管理システム及び検体画像管理プログラムを提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明者らは、複数のマイクロウェルと、これらのマイクロウェルごとに対になって付された複数の第１識別子とを有する細胞培養容器において、第１識別子とマイクロウェルの対を含む拡大検体画像を取得し、拡大検体画像内のマイクロウェルおよび第１識別子を解析することによって、上記課題が解決できることを見出した。
すなわち、本発明は以下の発明を包含する。
【００１２】
（１）複数のマイクロウェルと、前記マイクロウェルごとに対になって付された複数の第１識別子とを有する細胞培養容器と、
前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記第１識別子に関する情報とが関連付けられた第１情報を格納する記憶手段と、
前記第１識別子と前記マイクロウェルの対を含む拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析し、前記第１情報に基づいて前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と前記拡大検体画像とを少なくとも対応付ける検体画像管理手段と、
を備える検体画像管理システム。
【００１３】
（２）前記細胞培養容器は、第２識別子を更に有し、
前記検体画像管理手段は、前記細胞培養容器から読み取られた前記第２識別子と、前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記拡大検体画像とを対応付ける、（１）記載の検体画像管理システム。
【００１４】
（３）前記検体画像管理手段は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する際に、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルの外周輪郭および前記第１識別子の輪郭を抽出する、（１）または（２）記載の検体画像管理システム。
【００１５】
（４）前記検体画像管理手段は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する際に、前記拡大検体画像内の前記第１識別子の向きを解析し、前記拡大検体画像の回転補正を行う、（１）〜（３）のいずれかに記載の検体画像管理システム。
【００１６】
（５）前記第１情報の前記第１識別子に関する情報は、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置の情報、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを含み、
前記検体画像管理手段は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する際に、前記拡大検体画像内において、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを認識する、（１）〜（４）のいずれか１項に記載の検体画像管理システム。
【００１７】
（６）複数のマイクロウェルと、前記マイクロウェルごとに対になって付された複数の第１識別子とを有する細胞培養容器用の検体画像管理処理を、演算手段及び記憶手段を少なくとも備える情報処理装置に実行させるためのプログラムであって、
前記演算手段に、
前記第１識別子と前記マイクロウェルの対を含む拡大検体画像内の前記マイクロウェルおよび前記第１識別子を解析する処理と、
前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記第１識別子に関する情報とが関連付けられた第１情報に基づいて前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と前記拡大検体画像とを少なくとも対応付ける処理と、
を実行させるためのプログラム。
【００１８】
（７）前記細胞培養容器は、第２識別子を更に有し、
前記演算手段に、
前記細胞培養容器から読み取られた前記第２識別子と、前記第１情報の前記マイクロウェルの位置に関する情報と、前記拡大検体画像とを対応付ける処理を更に実行させる、（６）に記載のプログラム。
【００１９】
（８）前記解析する処理は、前記拡大検体画像内の前記マイクロウェルの外周輪郭および前記第１識別子の輪郭を抽出することを含む、（６）または（７）に記載のプログラム。
【００２０】
（９）前記解析する処理は、前記拡大検体画像内の前記第１識別子の向きを解析し、前記拡大検体画像の回転補正を行うことを含む、（６）〜（８）のいずれかに記載のプログラム。
【００２１】
（１０）前記第１情報の前記第１識別子に関する情報は、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置の情報、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを含み、
前記解析する処理は、前記拡大検体画像内において、前記第１識別子のその対となる前記マイクロウェルに対する相対位置、および、前記第１識別子自体が有する情報の少なくとも１つを認識することを含む、（６）〜（９）のいずれかに記載のプログラム。
【発明の効果】
【００２２】
本発明により、複数のマイクロウェルを有する細胞培養容器において、マイクロウェルの拡大画像から、そのマイクロウェルの位置と拡大画像とを対応付けることができる。
【００２３】
本発明に関連する更なる特徴は、本明細書の記述、添付図面から明らかになるものである。また、上記した以外の、課題、構成および効果は、以下の実施形態の説明により明らかにされる。
【図面の簡単な説明】
【００２４】
【図１】本発明の検体画像管理システムの一実施形態の構成図である。
【図２】本発明の細胞培養容器の一実施形態の上面図を示す概略図である。
【図３】本発明の細胞培養容器の一実施形態の垂直断面図を示す概略図である。
【図４】本発明の細胞培養容器の一実施形態の細胞収容部の拡大上面図を示す概略図である。
【図５】本発明の細胞培養容器の一実施形態の細胞収容部の拡大上面図を示す概略図である。
【図６】本発明の細胞培養容器の一実施形態の細胞収容部の拡大上面図を示す概略図である。
【図７】マイクロウェルと識別子の対を顕微鏡で撮影した拡大画像の概念図である。
【図８】マイクロウェルと識別子の対を顕微鏡で撮影した拡大画像の概念図である。
【図９】本発明の検体情報データベースの一実施形態を示す概略図である。
【図１０】本発明の第１識別子対応テーブルの一実施形態を示す概略図である。
【図１１】本発明の第２識別子対応テーブルの一実施形態を示す概略図である。
【図１２】本発明の画像データベースの一実施形態を示す概略図である。
【図１３】本発明の輪郭線抽出処理部の一実施形態の処理内容を説明する概念図である。
【図１４】本発明の画像補正処理部の一実施形態の処理内容を説明する概念図である。
【図１５】本発明の第１識別子認識処理部の一実施形態の処理内容を説明する概念図である。
【図１６】本発明の第１識別子認識処理部の一実施形態の処理内容を説明する概念図である。
【図１７】本発明の検体画像管理装置の一実施形態の処理の流れを説明するフローチャートである。
【図１８】本発明の検体画像管理装置の一実施形態の処理の流れを説明するフローチャートである。
【発明を実施するための形態】
【００２５】
以下、本発明について説明する。図１は、本発明の検体画像管理システムの一実施形態の構成図を示す。検体画像管理システム１は、細胞培養容器１００と、画像取得装置１１０と、第２識別子読取装置１２０と、検体画像管理装置１３０とから構成される。以下、検体画像管理システム１の各構成要素について説明する。
【００２６】
図１に示すように、細胞培養容器１００は、第１識別子１０１と、第２識別子１０２とを有する。図２及び図３は、細胞培養容器１００の具体的な構成を示す。本実施形態の細胞培養容器１００は、底部１０３と側壁１０４とを有し、底部１０３に、細胞を収容するための複数のマイクロウェル１０５が配置されてなる細胞収容部１０６を有する。底部１０３の形状は特に制限されず、三角形および四角形等の多角形の形状でもよく、円（円形、略円形、楕円形および略楕円形を含む）の形状でもよく、側壁１０４は底部１０３の外縁を囲うように形成される。
【００２７】
通常、底部１０３と反対側は開口しており、開口部の形状は好ましくは底部１０３の形状と同一である。好ましくは、開口部が円形で、開口幅（例えば、図３のｒ）が、好ましくは３０〜６０ｍｍ、特に３５ｍｍのものが用いられる。これは従来の細胞培養に用いられているシャーレと同等のサイズであり、汎用のシャーレから簡便に作製できること、および既存の培養装置等に適合しやすいことから、上記のようなサイズのものが好ましい。なお、細胞培養容器１００は、通常のシャーレと同様に蓋を有していてもよい。
【００２８】
図４及び図５は、本発明の細胞培養容器の一実施形態の細胞収容部の拡大上面図を示す概略図である。複数のマイクロウェル１０５の近傍には、それぞれ、第１識別子１０１がマイクロウェル１０５ごとに対になって付されており、第１識別子１０１のその対となるマイクロウェル１０５に対する相対位置が、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５の対ごとに異なることを特徴とする。第１識別子１０１のマイクロウェル１０５に対する相対位置が、マイクロウェル１０５ごとに異なることによって、マイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対を１組観察するだけで、複数のマイクロウェル１０５における当該マイクロウェルの位置を特定することができる。第１識別子１０１は、各マイクロウェル１０５の近傍に付されていることから、高倍率で観察する際に、マイクロウェル１０５から観察位置を大きくずらす必要はなく、迅速な観察が可能になる。さらに、高倍率で細胞を撮影した際も、拡大検体画像には、マイクロウェル１０５とともに第１識別子１０１が撮影されることから、拡大検体画像に対して手作業で情報を付与する必要がなく、煩雑な作業を回避でき、作業者のミスによる関連付けの誤りが発生するリスクも回避できる。
【００２９】
マイクロウェル１０５は、好ましくは受精卵等の細胞を個別に収容するために好適な凹部を形成し、そのサイズは微小であり、本発明はそのような微小なマイクロウェル１０５ごとに微小な第１識別子１０１を付すことを特徴とする。具体的には、細胞培養容器１００の上面視における各マイクロウェル１０５の開口部の面積は、好ましくは３ｍｍ２以下、より好ましくは１ｍｍ２以下、さらに好ましくは０．５ｍｍ２以下であり、好ましくは０．０３ｍｍ２以上である。
【００３０】
マイクロウェル１０５は、壁面と開口部を有する凹部を形成し、細胞培養容器１００の底部１０３に直接窪みとして設けられた凹部でもよいし、底部１０３から突出した部材により形成される凹部でもよい。したがって、上面視における各マイクロウェル１０５の開口部の面積は、換言すれば、マイクロウェル１０５の開口部の外縁が形成する図形の面積である。マイクロウェル１０５の開口部の外縁が形成する図形は特に制限されず、三角形および四角形等の多角形の形状でもよく、円（円形、略円形、楕円形および略楕円形を含む）の形状でもよいが、好ましくは円形である。マイクロウェル１０５の開口部の外縁が円形である場合、開口幅は円の直径に等しく（図４のＲ）、その直径は、培養する細胞の最大寸法より大きいものとなる。
【００３１】
また、マイクロウェル１０５の開口部の外縁が円形である場合、開口幅は、マイクロウェル１０５間のピッチより小さい。したがって、マイクロウェル１０５の開口部の開口幅（マイクロウェル１０５の開口部の外縁が円形である場合はその直径）は、好ましくは０．１ｍｍ以上、より好ましくは０．１５ｍｍ以上、さらに好ましくは０．２ｍｍ以上であり、好ましくは０．６ｍｍ未満、さらに好ましくは０．４ｍｍ未満である。また、上記マイクロウェル１０５の開口部の開口幅は、Ｘ＋ｍ（ここでＸは細胞の最大径を表す）と規定することもできる。ここで、ｍは、好ましくは０．０１ｍｍ以上、さらに好ましくは０．０２ｍｍ以上である。
【００３２】
本発明の細胞培養容器１００の底部１０３には、マイクロウェル１０５が、好ましくは４個以上、さらに好ましくは８個以上、例えば１０個以上で、好ましくは５０個以下、より好ましくは３０個以下の個数で配置されており、したがって、受精卵等の細胞を、１のマイクロウェル１０５に１個ずつ配置して、複数の細胞を培養することができる。
【００３３】
マイクロウェル１０５間のピッチは好ましくは１ｍｍ以下、より好ましくは０．８ｍｍ以下、さらに好ましくは０．６ｍｍ以下である。画像取得装置１１０として、１／２インチのＣＣＤ素子、４、１０、２０倍の対物レンズを備えたものがよく用いられる。このような画像取得装置１１０で、４倍の対物レンズを選択した場合の観察可能な視野はおよそ１．６ｍｍ×１．２ｍｍであり、この観察視野内に４個以上のマイクロウェル１０５が含まれるように設計することが好ましい。
【００３４】
マイクロウェル１０５間のピッチは近接するマイクロウェル１０５の中心間の距離である（例えば、図４のａ）。マイクロウェル１０５の中心は、マイクロウェルの開口部の外縁が形成する図形の重心とし、外縁が円形であればその円の中心をさす。マイクロウェル１０５間のピッチは通常平均ピッチをさし、平均ピッチは、あるマイクロウェル１０５に関しては、近接する全てのマイクロウェル１０５とのピッチから平均値を算出したものをさす。マイクロウェル１０５間のピッチは、マイクロウェル１０５の開口部の外縁の寸法より大きい。マイクロウェル１０５の開口部の外縁の寸法は、開口部の外縁が円形であればその直径をさし、そうでなければ開口部の外縁が形成する図形の最小径とする。
【００３５】
近接する複数のマイクロウェル１０５は、正方格子状又は最密充填状に配置されていることが好ましい。例えば、２５個のマイクロウェルを５×５の正方格子状に配置する場合を挙げることができる。正方格子状又は最密充填状に配置することにより、細胞培養容器１００の底部１０３における各マイクロウェル１０５の位置の特定が、第１識別子１０１との組み合わせでさらに容易になり、自動化処理に適用しやすい。また、マイクロウェル１０５間ピッチの情報等のウェル設計情報として予め登録しておくことにより、観察視野に複数のマイクロウェル１０５が含まれた場合に、その情報を用いて、マイクロウェル１０５及び第１識別子１０１のそれぞれの対の切り出し処理なども可能となる。
【００３６】
複数のマイクロウェル１０５の配置は、正方格子又は最密充填の配置から、一部が欠落したような配置でもよい。例えば、８個以上のマイクロウェルが、平行四辺形の辺上および頂点上に等しいピッチで配置され、細胞収容部を構成している場合が挙げられる。平行四辺形には、正方形、長方形、菱形およびそれ以外の平行四辺形が包含される。マイクロウェル１０５が平行四辺形の辺上および頂点上に配置されるとは、マイクロウェル１０５の開口部の外縁が形成する図形の重心が平行四辺形の辺上および頂点上に配置されることをさす。例えば、図４に示す実施形態では、８個のマイクロウェルが、正方形の４つの頂点に１つずつ配置され、かつ４つの辺の中点に１つずつ配置されている。
【００３７】
各マイクロウェル１０５と対になって付される第１識別子１０１の位置は、マイクロウェル１０５の内部、外部を問わないが、好ましくはマイクロウェル１０５の外部に配置される。マイクロウェル１０５の内部に設けると受精卵の観察を阻害する可能性や、受精卵の培養性能に影響を及ぼす可能性があるためである。好ましくは上記のように複数配置されたマイクロウェル１０５同士の隙間に付される。第１識別子１０１は、そのような隙間に配置可能なように十分微小なものである。第１識別子１０１のサイズは、好ましくはマイクロウェル１０５のサイズより小さい。したがって、細胞培養容器１００の上面視において、第１識別子１０１は、好ましくはマイクロウェル１０５の開口部が形成する図形の内部に収まるサイズである。より具体的には、細胞培養容器１００の上面視における第１識別子１０１の面積は、３００００μｍ２以下、好ましくは１５０００μｍ２以下、より好ましくは８０００μｍ２以下であり、好ましくは１００μｍ２以上である。
【００３８】
また、第１識別子１０１は、どのマイクロウェル１０５と対になっているかが明らかなように、対となるマイクロウェル１０５の十分近傍に付されることとなる。したがって、各第１識別子１０１は、好ましくは、すべてのマイクロウェル１０５の中で、対となるマイクロウェル１０５との距離が最も小さくなるように付される。第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との距離は、マイクロウェル１０５の開口部が形成する図形の重心と第１識別子１０１が形成する図形の重心との距離として定義される。したがって、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との距離は、好ましくはマイクロウェル１０５の開口幅の１／２より大きく、マイクロウェル１０５間のピッチよりも小さい。具体的には、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との距離は、好ましくは５００μｍ以下、より好ましくは４００μｍ以下、さらに好ましくは３００μｍ以下である。
【００３９】
第１識別子１０１は、好ましくは細胞収容部１０６内のマイクロウェル１０５のすべてに付されるが、第１識別子１０１が付されていないマイクロウェル１０５が数個（例えば、細胞収容部１０６に含まれるマイクウェル全体の個数の１０％以下で）含まれていても、本発明に包含される。細胞が収容されず、観察対象でないマイクロウェル１０５が存在する場合に、そのようなマイクロウェル１０５には第１識別子１０１は必要ないからである。第１識別子１０１は、対となるマイクロウェル１０５に好ましくは１つ付されるが、２つ以上の識別子が付されていてもよい。
【００４０】
第１識別子１０１の形状、すなわち第１識別子１０１が形成する図形の形状は、特に制限されない。図形の例として、文字、数字、多角形などの図形、矢印、線（バー）、ドット、ＱＲコード（登録商標）、バーコードおよびこれらの組合せが挙げられる。受精卵等の細胞を個別に収容するのに好適な微小なマイクロウェル１０５の近傍に、好ましくは当該マイクロウェル１０５よりサイズの小さい第１識別子１０１を付すことから、第１識別子１０１の形状は、成形が容易な単純な形状であることが好ましい。細胞培養容器１００は、射出成型で製造される場合が多いため、あまり複雑な形状を微小なサイズで成形することが困難だからである。第１識別子１０１の形状は単純であっても、すなわち第１識別子１０１自体が持つ情報が少なくても、マイクロウェル１０５との相対位置という情報を付加することによって、各マイクロウェル１０５の位置を特定することができる。また、第１識別子１０１を複雑な形状とすると、細胞培養容器１００の製造時における歩留りが低下するおそれがあるが、単純な形状とすることで、歩留りの低下を回避でき、製造コストを下げることができる。
【００４１】
したがって、第１識別子１０１は、好ましくはドット状または線状（バー状）の形状を有する。図４及び図５は、ドット状の第１識別子１０１の例である。この例では、８個のマイクロウェル１０５が、正方形の４つの頂点に１つずつ配置され、かつ４つの辺の中点に１つずつ配置され、細胞収容部１０６を構成している。そして、ドット状の第１識別子１０１が、各マイクロウェル１０５の近傍に１つずつ付されている。第１識別子１０１のその対となるマイクロウェル１０５に対する相対位置が、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５の対ごとに異なることを特徴とする。
【００４２】
第１識別子１０１のその対となるマイクロウェル１０５に対する相対位置が、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５の対ごとに異なることには、第１識別子１０１とその対となるマイクロウェル１０５との距離が、対ごとに異なること、ならびに第１識別子１０１のその対となるマイクロウェル１０５に対する角度が異なることが包含される。
【００４３】
第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との距離については上述のとおりであるが、第１識別子のマイクロウェル１０５に対する角度αについては、以下のように定義することができる。例えば図４及び図５に示す実施形態において、角度αは、上面視において細胞培養容器１００の底部１０３に一本の直線Ｘを引いた場合に、当該直線Ｘに平行な直線と、マイクロウェル１０５の重心と第１識別子１０１の重心とを通る直線Ｙとがなす角度と定義することができる（図５）。そして、角度αを、マイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対ごとに異なるよう配置することで、複数のマイクロウェル１０５における特定のマイクロウェル１０５の位置を特定することができる。距離と角度を組み合わせて情報量を増大させることもできる。この実施形態では、第１識別子１０１のマイクロウェル１０５に対する角度αが、対ごとに異なることから、一対のマイクロウェル１０５と第１識別子１０１を観察するだけで、各マイクロウェル１０５の位置を特定することができる。
【００４４】
また、図６及び図７は、線状の第１識別子１０１の例である。この例では、８個のマイクロウェル１０５が、正方形の４つの頂点に１つずつ配置され、かつ４つの辺の中点に１つずつ配置され、細胞収容部１０６を構成している。そして、線状の第１識別子１０１が、各マイクロウェル１０５の近傍に１つずつ付されている。
【００４５】
図７は、それぞれ図６における位置Ａ、Ｅ、Ｈのマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対の顕微鏡画像を表す。この実施形態では、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との距離は、いずれの対についてもほぼ同一であるが、第１識別子１０１のマイクロウェル１０５に対する角度α及び／又は線（バー）の長さが、対ごとに異なることから、一対のマイクロウェル１０５と第１識別子１０１を観察するだけで、各マイクロウェル１０５の位置を特定することができる。さらに、いずれの第１識別子１０１も、同方向を向いた線状であり、かつマイクロウェル１０５に対して右側に付されていることから、高倍率で撮影されたマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の一対の拡大画像においても、第１識別子１０１の位置と線（バー）の向きに基づいて、撮影時の細胞培養容器の向きを特定できる。ここでいう「向き」は自転角度であって、角度αとは異なる。例えば、図４の実施形態においてドットを線（バー）に置き換えた場合、線がドットの位置で直線Ｘに対して回転（自転）する角度、すなわち直線Ｘと識別子の線がなす角度をさす。この向きの情報量を使って、培養容器の向きを特定することができる。さらに、第１識別子１０１の向きを変化させることによっても、第１識別子１０１自体が有する情報量を増大させることができる。
【００４６】
なお、１の細胞培養容器１００および１の細胞収容部１０６には、ドット状の第１識別子１０１と線状の第１識別子１０１が混在していてもよく、混在させることにより、情報量を増大させることができる。さらに、線状の第１識別子１０１は、その長さを変化させることにより、第１識別子１０１自体が有する情報量を増大させることができる。
【００４７】
また、複数のマイクロウェル１０５にそれぞれ付される複数の第１識別子１０１が、同一軸上に配置されることが好ましい場合もある。ここで複数のマイクロウェル１０５とは、細胞収容部１０６内のすべてのマイクロウェル１０５である必要はなく、好ましくはそのうちの２以上、より好ましくは３以上、さらに好ましくは４以上の、その重心が同一軸上にある複数のマイクロウェルをさす。重心が同一軸上にある複数のマイクロウェル１０５に、それぞれ付される複数の第１識別子１０１が、同一軸上に配置されることで、高倍率観察において、観察対象となるマイクロウェル１０５を変更する場合に、細胞培養容器１００をレンズに対してＸ軸またはＹ軸方向にのみ動かすことで、マイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対を捕えることができるため、迅速な観察が可能となる。
【００４８】
また、顕微鏡観察では、視野が一般的に横長となるため、横軸上に並んだ複数の第１識別子１０１を一度に観察することができる。また、顕微鏡視野の長辺方向と、第１識別子１０１の軸方向をそろえることで、より高倍率の観察時にも全ての第１識別子１０１を観察することができる。例えば、視野の短辺距離がマイクロウェル１０５の直径ギリギリである場合などに特に有利である。複数の第１識別子１０１が、同一軸上に配置されるとは、第１識別子１０１の重心が正確に同一軸上に配置されることを意図するものではなく、高倍率観察における迅速化が達成される限り、多少のずれがあってもよい。
【００４９】
次に、第２識別子１０２について説明する。細胞培養容器１００には、第２識別子１０２が付されている。第２識別子１０２の例として、文字、数字、多角形などの図形、ＱＲコード、バーコード、ＩＣタグ、ドットパターン（コード化パターン）およびこれらの組合せが挙げられる。ここで、ドットパターン（コード化パターン）の技術について簡単に説明する。ドットパターンは、例えば、電子ペン用の専用ペーパーの表面に印刷される。ドットパターンは、約０．３ｍｍ間隔の格子状の上に配置された縦横６×６＝３６ドットの組合せである。縦横６×６個のドットが、専用ペーパー上のどの部分から６×６ドットを取ってもユニークなパターンとなるように配置されている。これら３６個のドットにより形成されるドットパターンは位置座標（例えば、そのドットパターンがその専用ペーパー上のどの位置にあるのか）と専用ペーパー毎に固有の識別子であるドットパターンアドレスを保持している。各ドットは、格子の基準位置からのシフト方向によって、予め決められた情報に対応付けられる。すなわち、この技術によれば、各ドットの格子の基準位置からのシフト方向を、文字、数字などに対応させることにより、ドットパターンを第２識別子１０２に対応させることが可能となる。なお、ドットパターンの撮影は、カメラを内蔵した電子ペン等の読取手段によって行うことができる。ここで説明したドットパターンの技術については、特開２００４−２５２６０７号公報や特開２００４−０５４３７５号公報にも記載されており、これらの文献に記載の技術を利用することができる。第２識別子１０２は、細胞培養容器１００の側壁１０４あるいは底部１０３に付されてもよい。また、細胞培養容器１００が蓋を備える場合には、第２識別子１０２は蓋に付されてもよい。第２識別子１０２は、細胞培養容器１００毎に異なり、第２識別子１０２を認識することにより、細胞培養容器１００を特定することができる。
【００５０】
高倍率でマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対を１つ撮影し、これを繰り返して複数の対を撮影する場合、撮影する際の細胞培養容器１００の向きを常に一定とする必要がある。そうでなければ、上記の角度αに、細胞培養容器１００自体の傾きが含まれてしまい、細胞培養容器１００上では相対位置が異なるにもかかわらず、拡大画像上では相対位置が区別できない場合があるからである。
【００５１】
例えば、図４に示す細胞収容部１０６の拡大図において、右上頂点に配置されたマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対１０９Ａの拡大画像は、図４の右下頂点に配置されたマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対１０９Ｂを、細胞培養容器１００を図４の状態から左に９０°回転させて撮影した拡大画像と区別ができない（図８）。撮影する際の細胞培養容器１００の向きを常に一定とする観点から、細胞培養容器１００には、第１識別子１０１及び第２識別子１０２とは別の、細胞培養容器１００の向きを特定するための第３識別子を付すことが好ましい。
【００５２】
第３識別子は、拡大検体画像を撮影する際に用いることから、目視で確認できるものであることが好ましい。したがって、細胞培養容器１００の上面視において、第３識別子の面積は、マイクロウェル１０５の開口部の面積より大きいことが好ましい。第３識別子は、底部１０３上であって、複数のマイクロウェル１０５が配置されてなる細胞収容部１０６の外側に付すことが好ましい（例えば図２の１０７）。第３識別子は細胞培養容器１００の側壁１０４に付してもよい。あるいは、細胞培養容器１００自体の形状により、細胞培養容器の向きを常に一定とすることも可能である。すなわち、細胞培養容器１００の側壁１０４の外周形状を細胞培養容器の向きを特定できる形状、例えば円が欠けた形状とすることにより、撮影する際の細胞培養容器１００の向きを常に一定とすることも可能である。この場合、細胞培養容器の形状は、細胞培養容器１００の向きを特定できる限り、特に制限されない。
【００５３】
あるいは、第１識別子１０１が線状であれば、ドット状の場合と異なり、二次元の情報を有することから、第３識別子がなくても、高倍率で撮影されたマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対の拡大画像において、細胞培養容器の向きをある程度特定することができる。すなわち、いずれの第１識別子１０１も、細胞培養容器１００の上面視において、同方向を向いた線状とすることで、高倍率で撮影されたマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対の拡大画像においても、線（バー）の向きに基づいて、撮影時の細胞培養容器の向きをある程度特定できる。
【００５４】
また、細胞収容部１０６内の複数のマイクロウェル１０５すべてについて、第１識別子１０１をマイクロウェルの右側のみ、左側のみ、上側のみ、又は下側のみに付すことにより、高倍率で撮影されたマイクロウェル１０５と第１識別子１０１の対の拡大画像においても、細胞培養容器１００の向きを特定することができる。対象のマイクロウェル１０５ごとに第１識別子１０１のおおまかな位置がある程度決まっているため、高倍率で手動にて受精卵を撮影する際に撮影位置を決めやすい。また、このような形態では、後述するように拡大画像の回転補正を自動化することも可能である。
【００５５】
ここで、マイクロウェルの右側、左側、上側、又は下側とは、マイクロウェルの重心まわり３６０°を４つに分けたそれぞれの範囲と定義することができ、例えば、図５に示すαが４５〜１３５°の範囲を上側と定義できる。したがって、識別子をマイクロウェルの上側のみに付す場合であっても、その範囲内でマイクロウェルごとに相対位置を異なるようにすることは可能である。
【００５６】
次に、検体画像管理システム１の他の構成要素について説明する。画像取得装置１１０は、細胞培養容器１００のマイクロウェル１０５内の細胞及び第１識別子１０１を含む拡大検体画像を撮影するものであり、例えば、顕微鏡である。画像取得装置１１０として、例えば、１／２インチのＣＣＤ素子、４、１０、２０倍の対物レンズを備えたものがよく用いられる。
【００５７】
第２識別子読取装置１２０は、細胞培養容器１００の第２識別子１０２を読み取る装置である。第２識別子読取装置１２０については、第２識別子１０２に対応した装置を採用すればよく、例えば、公知の文字・図形認識装置、カメラ、バーコードスキャナ、ＩＣタグリーダーなどが挙げられる。
【００５８】
検体画像管理装置１３０は、パーソナルコンピュータやワークステーションなどの情報処理装置によって構成されている。この情報処理装置は、中央演算処理部（ＣＰＵ：Central Processing Unit）などのプロセッサと、メモリやハードディスクなどの記憶装置１３１と、キーボード、マウスなどの入力部１３２と、ディスプレイなどの出力部１３３とを備えている。なお、図１では、検体画像管理装置１３０を１つの情報処理装置として示しているが、これに限定されない。検体画像管理装置１３０の構成要素をネットワーク上の複数の情報処理装置に分散して構成してもよい。また、各種テーブル及びデータベースなどは、他の情報処理装置あるいはネットワーク上の記憶装置に格納されてもよい。
【００５９】
次に、本実施形態の検体画像管理システム１で使用される各種情報について説明する。記憶装置１３１には、検体情報データベース１４１と、ウェル設計情報１４２、第２識別子対応テーブル１４３と、画像データベース１４４とが格納されている。なお、これら各種テーブル及びデータベースについて、以後の説明では「テーブル」構造を用いて説明するが、必ずしもテーブルによるデータ構造で表現されていなくても良く、他のデータ構造で表現されていても良い。そのため、データ構造に依存しないことを示すために、以下では、各種テーブル及びデータベースを単に「情報」と呼ぶことがある。
【００６０】
図９は、検体情報データベース１４１の一例である。検体情報データベース１４１は、細胞培養容器内の細胞（受精卵などの個別管理が必要な細胞）に関する各種情報を格納する。検体情報データベース１４１は、患者ＩＤ９０１、施術日（施術番号）９０２と、容器番号９０３と、ウェルＩＤ９０４とを構成項目として含む。患者ＩＤ９０１は、患者を一意に識別する番号であり、施術日（施術番号）９０２は、施術日を示す数字の列である。容器番号９０３は、細胞培養容器１００を一意に識別する番号である。例えば、同一の患者ＩＤおよび同一の施術日で複数の細胞培養容器を使用する場合があり、その場合には各細胞培養容器が容器番号９０３によって管理される。同一の患者ＩＤおよび同一の施術日で複数の細胞培養容器を使用しない場合には、容器番号９０３を省略することも可能である。また、ウェルＩＤ９０４は、細胞培養容器１００内の各マイクロウェル１０５の位置を識別するＩＤである。ウェルＩＤ９０４によって、マイクロウェル１０５内部に配置した細胞（受精卵など）の検体の情報を管理することができる。
【００６１】
ウェル設計情報１４２は、少なくとも第１識別子対応テーブルを含む。図１０は、第１識別子対応テーブルの一例である。第１識別子対応テーブルは、ウェルＩＤ１００１と、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との相対位置を示す情報１００２（ここでは、第１識別子１０１のマイクロウェル１０５に対する角度α）とを構成項目として少なくとも含む。したがって、一対のマイクロウェル１０５と第１識別子１０１を観察するだけで、各マイクロウェル１０５の位置（ウェルＩＤ１００１）を特定することができる。本実施例では、マイクロウェルの位置に関する情報としてウェルＩＤ１００１を用いているが、これに限定されず、マイクロウェルの位置を特定できる情報であれば他の形式も可能である。
【００６２】
なお、第１識別子対応テーブルにおいて、角度αの値は所定の幅を持たせて設定されてもよい。後述する検体画像管理装置１３０における画像処理において誤差が生じる可能性があるためである。また、図１０では、角度αの情報のみを示しているが、第１識別子１０１が線（バー）の場合、第１識別子１０１とマイクロウェル１０５との相対位置を示す情報（角度α）及び／又は第１識別子１０１自体が有する情報（線の長さや向きなど）を格納してもよい。また、上述したように、第１識別子１０１としては、文字、数字、多角形などの図形、矢印、線（バー）、ドット、ＱＲコード、バーコードおよびこれらの組合せが挙げられる。したがって、第１識別子対応テーブルには、これらに対応する第１識別子に関する情報が格納されていればよい。
【００６３】
また、ウェル設計情報１４２は、第１識別子対応テーブルの他に、例えば、マイクロウェル１０５の形状、マイクロウェル１０５の開口部の外縁の寸法、マイクロウェル１０５の開口部の面積、マイクロウェル１０５間のピッチなどの設計情報を含んでもよい。また、ウェル設計情報１４２は、各マイクロウェル１０５と対となる第１識別子１０１の設計情報を含んでもよい。第１識別子１０１の設計情報は、第１識別子１０１の形状、サイズ、位置などの情報である。
【００６４】
図１１は、第２識別子対応テーブル１４３の一例である。第２識別子対応テーブル１４３は、容器番号１１０１と、第２識別子情報１１０２とを構成項目として少なくとも含む。このテーブルを用いて、細胞培養容器１００に付された第２識別子１０２から各細胞培養容器１００を特定することができる。なお、第２識別子１０２が、容器番号などの細胞培養容器を一意に示す情報を直接表している場合は、第２識別子対応テーブル１４３を省略することもできる。
【００６５】
図１２は、画像データベース１４４の一例である。画像データベース１４４は、画像取得装置１１０から取得した拡大検体画像と、この画像に関連する各種情報を格納する。画像データベース１４４は、画像ＩＤ１２０１と、容器番号１２０２と、ウェルＩＤ１２０３と、画像データ１２０４とを構成項目として含む。このように、画像データベース１４４では、各画像データ１２０４と、容器番号１２０２及びウェルＩＤ１２０３とが対応付けられている。したがって、画像データベース１４４と検体情報データベース１４１とを参照することにより、各画像データ１２０４が、どのマイクロウェルの拡大検体画像に対応し、かつ、どの患者のどの施術日に対応するかを管理することができる。なお、本実施形態では、画像データベース１４４を作成しているが、検体情報データベース１４１に拡大検体画像のファイルを登録できる項目を設け、検体情報データベース１４１に拡大検体画像を登録する形式でもよい。
【００６６】
検体画像管理装置１３０は、輪郭線抽出処理部１５１と、パターン検出処理部１５２と、画像補正処理部１５３と、第１識別子認識処理部１５４と、データベース作成処理部１５５と、第２識別子認識処理部１５６とを備える。検体画像管理装置１３０は、これらの処理部１５１〜１５６により、画像取得装置１１０で撮影した拡大検体画像を解析し、上述した各種テーブルなどに基づいて拡大検体画像とウェルＩＤを対応付ける。これにより、拡大検体画像に対して検体情報を一意に識別することが可能となる。
【００６７】
本実施形態では、検体画像管理装置１３０の各処理部１５１〜１５６を、コンピュータ上で実行されるプログラムの機能として実現してもよい。すなわち、各処理部１５１〜１５６は、プログラムコードとしてメモリに格納して、ＣＰＵが各プログラムコードを実行することによって各処理部１５１〜１５６が実現されてもよい。以下に各処理部１５１〜１５６について説明する。
【００６８】
輪郭線抽出処理部１５１は、細胞培養容器１００のマイクロウェル１０５内の細胞及び第１識別子１０１を含む拡大検体画像を画像取得装置１１０から受け取り、拡大検体画像に対して輪郭線抽出処理を実行する。輪郭線抽出処理としては、当業者に公知の技術を適用できる。輪郭線抽出処理の一例として、拡大検体画像に対して白と黒の２階調の画像に変換する２値化処理を実行し、２値化された画像で輪郭線を抽出する処理が挙げられる。なお、通常、観察の対象物が透明で、境界の濃淡さが付きにくいため、画素値の変化に対して微分演算を行った後に、２階調の画像に変換する処理を実行してもよい。また、その他の輪郭線抽出処理としては、特開２０１１−１９２１０９号公報に記載の技術を用いてもよい。この文献では、基準プロファイルと候補プロファイルと作成し、基準プロファイルと候補プロファイルとの類似性を示す類似度を算出することで、受精卵の輪郭を決定しているが、この技術をマイクロウェルの輪郭線や第１識別子の輪郭線の決定に適用してもよい。輪郭線抽出処理部１５１は、輪郭線抽出処理によって、マイクロウェル１０５の開口部の外縁が形成する図形の輪郭線（以下、「外周輪郭線」と呼ぶ）と、第１識別子１０１が形成する図形の輪郭線とを抽出し、輪郭線抽出画像を出力する（図１３）。
【００６９】
また、検体画像管理装置１３０において、輪郭線抽出処理部１５１における輪郭線抽出処理の後に、補間処理及び／又は領域定義処理を実行してもよい。補間処理とは、予め用意しておいたパターンと輪郭線抽出画像とを組み合わせることで、輪郭線の途切れた部分を推定して補間する処理である。例えば、輪郭線抽出処理のみだと、マイクロウェル１０５の外周輪郭線や第１識別子１０１が形成する図形の輪郭線が途切れ途切れになる場合がある。したがって、マイクロウェル１０５の形状のパターンと、第１識別子１０１の形状のパターンとを予め登録しておき、輪郭線抽出画像に対してそれぞれのパターンを重ね合わせて、それぞれの輪郭線を補間する。また、領域定義処理とは、輪郭線で囲まれた領域を定義する処理である。例えば、輪郭線抽出画像上の輪郭線が途切れ途切れの場合には、輪郭線の補間処理後に補間された輪郭線で囲まれた領域を定義する。この領域定義処理を行うことで、その後に行うパターンマッチングを行う範囲や輪郭線で囲まれた領域の寸法あるいは面積の計算の領域を決定することができる。
【００７０】
パターン検出処理部１５２は、輪郭線抽出画像に対してパターン検出処理を実行する。ここで、パターン検出処理とは、輪郭線抽出画像においてどの輪郭線がマイクロウェル１０５の外周輪郭線であるか、および、どの輪郭線が第１識別子１０１の輪郭線であるかを検出することである。パターン検出処理としては、当業者に公知の技術を適用できる。一例として、マイクロウェル１０５の形状のテンプレートと、第１識別子１０１の形状のテンプレートとを予め検体画像管理装置１３０に格納しておき、それぞれのテンプレートによってパターンマッチングする方法がある。パターン検出処理部１５２は、それぞれのテンプレートに対して所定の類似度以上の部分をマイクロウェル１０５の輪郭線あるいは第１識別子１０１の輪郭線として検出する。なお、画像取得装置１１０の拡大倍率に対応させてテンプレートを適宜拡大／縮小させてもよいし、テンプレートを回転させながらマッチングしてもよい。
【００７１】
輪郭線抽出画像においてマイクロウェル１０５の外周輪郭と第１識別子１０１の輪郭線を検出する処理としては、これに限定されず、他の方法でもよい。例えば、ウェル設計情報１４２内のマイクロウェル１０５の設計情報及び第１識別子１０１の設計情報を用いて検出を行ってもよい。例えば、輪郭線抽出画像上の輪郭線からなる図形の寸法や面積などの情報と、マイクロウェル１０５の設計情報及び第１識別子１０１の設計情報とを比較して、マイクロウェル１０５の外周輪郭線と第１識別子１０１の輪郭線を特定してもよい。
【００７２】
画像補正処理部１５３は、まず、パターン検出処理部１５２によって検出された第１識別子１０１の向きを検出する。第１識別子１０１が図６及び図７に示す線（バー）の場合、画像補正処理部１５３は、第１識別子１０１の輪郭線からなる図形の重心を通る直線（閉じられた図形内での直線）が最大の長さとなる方向を、第１識別子１０１の向きを示す直線として検出してもよい。当然ながら、第１識別子１０１の「向き」の検出は、第１識別子１０１の形状に対応するように行えばよく、他の手法で検出されてもよい。次に、画像補正処理部１５３は、第１識別子１０１の向きを表す角度を算出する。第１識別子１０１の「向き」については上述のとおりである。この例では、画像補正処理部１５３は、この算出された向きの角度が９０度であれば傾きはないと判定する。傾きがある場合、画像補正処理部１５３は、第１識別子１０１の向きが９０度の位置（図１４の点線Ｚの位置）になるように輪郭線抽出画像を回転補正する。画像補正処理部１５３は、回転補正した画像を補正画像として出力する（図１４の右側）。
【００７３】
別の例としては、パターン検出処理部１５２においてテンプレートを回転させながらマッチングを行った場合は、類似度が最も高いテンプレートの回転角度を第１識別子１０１の向きとし、その回転角度によって補正画像を作成してもよい。
【００７４】
さらに、別の例としては、第１識別子１０１がマイクロウェル１０５の右側のみ、左側のみ、上側のみ、又は下側のみに付されている場合も回転補正が可能である。例えば、ウェル設計情報１４２内に第１識別子１０１がマイクロウェル１０５の右側にあるという情報が格納されている場合、画像補正処理部１５３は、撮影した全ての拡大画像において第１識別子１０１がマイクロウェル１０５の右側の範囲に入るような回転角度を求め、その回転角度で輪郭線抽出画像を回転補正すればよい。
【００７５】
なお、上述したように、細胞培養容器１００の向きが一定で撮影されることが前提となる場合（細胞培養容器１００に対して細胞培養容器１００の向きを常に一定とするための第３識別子１０７が付されている場合や、細胞培養容器１００が細胞培養容器の向きを特定できるような形状となっている場合）は、画像補正処理部１５３の処理は省略することができる。
【００７６】
第１識別子認識処理部１５４は、補正画像が作成された場合は補正画像に対して、あるいは、補正画像が作成されていない場合は輪郭線抽出画像に対して第１識別子１０１の認識処理を実行する。第１識別子認識処理部１５４は、第１識別子１０１のマイクロウェルに対する角度αを算出する（図１５）。第１識別子１０１が線（バー）の場合、第１識別子認識処理部１５４は、角度α及び／又は線（バー）の長さを算出してもよい。その後、第１識別子認識処理部１５４は、算出された角度αによって第１識別子対応テーブルを参照し、算出された角度αに対応するウェルＩＤを出力する。
【００７７】
なお、第１識別子認識処理部１５４の処理はこれに限定されず、他の方法でもよい。第１識別子認識処理部１５４の処理では、マイクロウェル１０５と第１識別子１０１との相対的な位置関係からウェルＩＤへの対応づけができればよく、図１６に示すように、マイクロウェルと第１識別子とを含む複数のテンプレートを用意して、テンプレートマッチングを行ってもよい。第１識別子対応テーブルにおいて、各テンプレートとウェルＩＤとが関連付けられていれば、テンプレートマッチングの結果から拡大検体画像とウェルＩＤとの対応付けが可能となる。
【００７８】
以上では、第１識別子１０１を認識するための各処理部を説明したが、上述した処理の様々な組み合わせが可能であり、これら様々な組み合わせが本発明に含まれる。例えば、
（１）輪郭線抽出処理、補間処理、領域定義処理、及びパターンマッチングによる第１識別子認識処理の組み合わせ
（２）輪郭線抽出処理、補間処理、領域定義処理、パターン検出処理（各輪郭線のパターンマッチングあるいは各輪郭線の面積／寸法計算）、及び第１識別子認識処理（角度α及び／又は線（バー）の長さの計算）の組み合わせ
なども可能である。また、輪郭線抽出処理も必ずしも必要ではなく、顕微鏡などの画像取得装置１１０による拡大検体画像に近いテンプレートを用意しておき、このテンプレートと拡大検体画像自体（輪郭線抽出処理前の画像）とをパターンマッチングする処理を実行する構成でもよい。
【００７９】
第２識別子認識処理部１５６は、第２識別子読取装置１２０で読み取った第２識別子１０２の情報によって第２識別子対応テーブル１４３を参照し、その情報に対応する容器番号を出力する。なお、この方式とは別に、事前に容器番号を別の方法で認識させておいて、第２識別子１０２を第２識別子読取装置１２０で読み取ることによって認識の正誤をチェックする方式でもよい。
【００８０】
データベース作成処理部１５５は、第１識別子認識処理部１５４から出力されたウェルＩＤと、第２識別子認識処理部１５６から出力された容器番号と、拡大検体画像とを関連付けて画像データベース１４４に格納する。
【００８１】
上述では、マイクロウェル１０５と１の第１識別子１０１の１つの対を含む拡大検体画像に対する処理について説明したが、これに限定されない。観察視野に複数のマイクロウェル１０５が含まれるために、１の拡大検体画像にマイクロウェル１０５及び第１識別子１０１の複数の対が存在する場合も同様の処理を適用できる。この場合、パターン検出処理後に、マイクロウェル１０５間のピッチ等のウェル設計情報１４２を用いてマイクロウェル１０５及び第１識別子１０１のそれぞれの対の切り出し処理を行い、切り出した画像に対してその後の処理を実行すればよい。
【００８２】
次に、検体画像管理装置１３０における処理の流れについて説明する。図１７は、検体画像管理システム１における処理の流れを説明するフローチャートである。以下では、第１識別子１０１が線（バー）の場合として説明する。なお、検体画像管理装置１３０に１の画像を取り込むごとに以下の処理を実行する形式でもよいし、検体画像管理装置１３０に複数の画像を取り込んだ後に複数の画像に対して一括で以下の処理を実行する形式でもよい。
【００８３】
まず、第２識別子読取装置１２０によって、細胞培養容器１００の第２識別子１０２を読み取る（１７０１）。次に、検体画像管理装置１３０の第２識別子認識処理部１５６が、読み取った第２識別子１０２の情報を用いて、第２識別子対応テーブル１４３を参照する。そして、第２識別子認識処理部１５６は、第２識別子１０２に対応する容器番号を出力し、容器番号の情報を一旦記憶装置等に記録する（１７０２）。第２識別子１０２の読み取りエラーなどにより、第２識別子１０２が正常に認識されない場合（１７０３のＮ）は、ステップ１７０１に戻る。なお、ここでは、最初に第２識別子１０２を認識する手順としているが、これに限定されない。ステップ１７０７の画像データベース１４４の作成の前であれば、ステップ１７０１〜１７０２の処理はどの時点で実行されてもよい。
【００８４】
次に、検体画像管理装置１３０の操作者は、入力部１３２を用いて画像取得装置１１０を操作し、マイクロウェル１０５内の細胞及び第１識別子１０１を含む拡大検体画像を取得する（１７０４）。本実施形態では、入力部１３２を介して画像取得装置１１０の条件（倍率）や画像取得位置を指定することができるように構成されており、画像取得装置１１０での画像は、検体画像管理装置１３０の出力部１３３に表示される。拡大検体画像の取得の操作では、操作者が出力部１３３上に表示された検体画像を見ながら、入力部１３２を用いて画像の取り込みを指示する。なお、画像取得装置１１０に何らかの入力手段を設け、操作者が画像取得装置１１０（例えば、顕微鏡）を覗きながら、入力手段によって画像の取り込みを行う形式でもよい。なお、検体画像管理装置１３０は、必ずしも画像取得装置１１０と連動している必要はなく、検体画像管理装置１３０に少なくとも拡大検体画像が入力されれば本発明の効果を得ることができる。
【００８５】
次に、第１識別子の認識処理を実行する（１７０５）。図１８は、ステップ１７０５の具体的な処理の流れを説明するフローチャートである。まず、輪郭線抽出処理部１５１によって、細胞及び第１識別子を含む拡大検体画像の輪郭線を抽出し、輪郭線抽出画像を作成する（１８０１）。次に、パターン検出処理部１５２によって、輪郭線抽出画像においてマイクロウェル１０５の外周輪郭線と第１識別子１０１の輪郭線とをそれぞれ検出する（１８０２）。
【００８６】
次に、画像補正処理部１５３によって、パターン検出処理部１５２によって検出された第１識別子１０１の向きを検出する（１８０３）。画像補正処理部１５３は、第１識別子１０１の向きを表す角度に基づいて第１識別子１０１の傾きを判定する。第１識別子１０１に傾きがない場合は、ステップ１８０６へ進む（１８０４のＮ）。
【００８７】
一方、第１識別子１０１に傾きがあると判定された場合（１８０４のＹ）、ステップ１８０５へ進む。次に、画像補正処理部１５３は、第１識別子１０１の向きを表す角度に基づいて輪郭線抽出画像を回転させ、補正画像を作成する（１８０５）。
【００８８】
次に、第１識別子認識処理部１５４は、補正画像が作成された場合は補正画像に対して、または、補正画像が作成されていない場合は輪郭線抽出画像に対して第１識別子１０１の認識処理を実行する。第１識別子認識処理部１５４は、第１識別子のマイクロウェルに対する角度αを算出する（１８０６）。これらの処理が終了後、図１７のステップ１７０６へ進む。
【００８９】
次に、第１識別子認識処理部１５４は、算出された角度αを用いて第１識別子対応テーブルを検索する（１７０６）。第１識別子認識処理部１５４は、算出された角度αと対応するウェルＩＤの情報を一旦記憶装置等に記録する。なお、この時点でウェルＩＤなどの情報を出力部１３３に表示して、操作者に認識結果の確認をさせてもよい。
【００９０】
次に、データベース作成処理部１５５によって、第１識別子認識処理部１５４から出力されたウェルＩＤと、第２識別子認識処理部１５６から出力された容器番号と、拡大検体画像とを関連付けて画像データベース１４４に格納する（１７０７）。
【００９１】
以上のように、本実施形態によれば、拡大検体画像に対して自動でウェルＩＤが対応づけられるため、手作業で拡大検体画像と検体情報とを対応付ける手間がなくなり、しかも、手作業による対応付けのミスの危険性が低減する。また、ウェルＩＤだけでなく、容器番号も拡大検体画像と対応付けることができ、拡大検体画像に対して検体情報の全てを一意に識別することが可能となる。
【００９２】
なお、本発明は上述した実施形態に限定されるものではなく、様々な変形例が含まれる。例えば、上述した実施形態は本発明を分かりやすく説明するために詳細に説明したものであり、必ずしも説明した全ての構成を備えるものに限定されるものではない。また、ある実施形態の構成の一部を他の実施形態の構成に置き換えることがあり、また、ある実施形態の構成に他の実施形態の構成を加えることも可能である。また、各実施形態の構成の一部について、他の構成の追加・削除・置換をすることが可能である。
【００９３】
また、上述したように、検体画像管理装置１３０の各処理部は、実施形態の機能を実現するソフトウェアのプログラムコードで実現してもよい。この場合、プログラムコードを記録した記憶媒体を情報処理装置に提供し、その情報処理装置（またはＣＰＵ）が記憶媒体に格納されたプログラムコードを読み出す。この場合、記憶媒体から読み出されたプログラムコード自体が前述した実施形態の機能を実現することになり、そのプログラムコード自体、およびそれを記憶した記憶媒体は本発明を構成することになる。このようなプログラムコードを供給するための記憶媒体としては、例えば、フレキシブルディスク、ＣＤ−ＲＯＭ、ＤＶＤ−ＲＯＭ、ハードディスク、光ディスク、光磁気ディスク、ＣＤ−Ｒ、磁気テープ、不揮発性のメモリカード、ＲＯＭなどが用いられる。
【００９４】
また、図面における情報線は、説明上必要と考えられるものを示しており、製品上必ずしも全ての情報線を示しているとは限らない。全ての構成が相互に接続されていてもよい。
【符号の説明】
【００９５】
１        ：検体画像管理システム
１００    ：細胞培養容器
１０１    ：第１識別子
１０２    ：第２識別子
１０３    ：底部
１０４    ：側壁
１０５    ：マイクロウェル
１０６    ：細胞収容部
１０７    ：第３識別子
１１０    ：画像取得装置
１２０    ：第２識別子読取装置
１３０    ：検体画像管理装置
１３１    ：記憶装置
１３２    ：入力部
１３３    ：出力部
１４１    ：検体情報データベース
１４２    ：ウェル設計情報
１４３    ：第２識別子対応テーブル
１４４    ：画像データベース
１５１    ：輪郭線抽出処理部
１５２    ：パターン検出処理部
１５３    ：画像補正処理部
１５４    ：第１識別子認識処理部
１５５    ：データベース作成処理部
１５６    ：第２識別子認識処理部
ｒ        ：細胞培養容器の開口幅
Ｒ        ：マイクロウェルの開口幅
ａ        ：マイクロウェルのピッチ
α        ：第１識別子のマイクロウェルに対する角度
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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