(57)【要約】      （修正有）【課題】ミクロRNA又はその前駆体に対するアンチセンスオリゴヌクオチド，及びそれを用いた、線維症及び/又は線維症関連疾患の治療及び/又は予防方法の提供。【解決手段】ミクロRNA又はその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる、糖、核酸塩基、及び/又はヌクレオシド間結合に対して1またはそれ以上の修飾を有する、アンチセンス修飾オリゴヌクレオチド、及びこれを投与することを含む、肝線維症、心線維症、腎線維症、肺線維症、及び皮膚線維症等の線維症の治療方法。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法。
【請求項２】
線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、該対象に12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である方法。
【請求項３】
線維症が発現するリスクがある対象にmiR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の予防方法。
【請求項４】
線維症が、肝線維症、心線維症、腎線維症、肺線維症、皮膚線維症、加齢関連線維症、または脾線維症である請求項1、2または3記載の方法。
【請求項５】
少なくとも1の心疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法。
【請求項６】
少なくとも1の心疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、
該対象に12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である方法。
【請求項７】
心疾患または病状が、心肥大、高血圧性心不全、拡張期心不全、収縮期心不全、心臓関連蓄積症、心筋症、収縮性心内膜症、冠動脈疾患、急性心筋梗塞、慢性心筋梗塞、右心不全、不整脈、心筋炎関連線維症、および心臓弁膜症からなる群から選ばれる請求項5または6記載の方法。
【請求項８】
心筋症が、拡張型心筋症、閉塞を伴う肥大型心筋症、閉塞を伴わない肥大型心筋症、拘束型心筋症、催不整脈性右室心筋症、および糖尿病性心筋症からなる群から選ばれる請求項7記載の方法。
【請求項９】
心臓弁膜症が、僧帽弁狭窄、大動脈弁狭窄、三尖弁狭窄、および肺動脈弁狭窄からなる群から選ばれる請求項7記載の方法。
【請求項１０】
心臓弁膜症が、僧帽弁閉鎖不全、大動脈弁閉鎖不全、三尖弁閉鎖不全、および肺動脈弁閉鎖不全からなる群から選ばれる請求項7記載の方法。
【請求項１１】
1またはそれ以上のさらなる医薬品を投与することを含む請求項5〜10のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
1またはそれ以上のさらなる医薬品が、利尿剤、変力物質、ジゴキシン、血管拡張剤、アンギオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤、アンギオテンシンIIレセプター遮断薬(ARb)、カルシウムチャンネル遮断薬、イソソルビドジニトレート、ヒドララジン、ニトレート、ヒドララジン、ベータ遮断薬、およびナトリウム利尿ペプチドからなる群から選ばれる請求項11記載の方法。
【請求項１３】
該投与が、静脈内投与、皮下投与、動脈内投与、または心臓内投与を含む請求項5〜11のいずれかに記載の方法。
【請求項１４】
該投与が、心重量増加、左心室拡大、または収縮率の低下を改善する請求項5〜13のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
該投与が、心重量増加、左心室拡大、または収縮率の低下を防ぐ請求項5〜14のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
該投与が、心機能を改善する請求子5〜15のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
少なくとも1の肝臓疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法。
【請求項１８】
少なくとも1の肝臓疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、
該対象に、12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である方法。
【請求項１９】
該少なくとも1の肝臓疾患または病状が慢性肝障害である請求項17または18記載の方法。
【請求項２０】
該少なくとも1の肝臓疾患または病状が肝炎ウイルス感染である請求項17または18記載の方法。
【請求項２１】
該肝炎感染がC型肝炎ウイルス感染である請求項20記載の方法。
【請求項２２】
該少なくとも1の肝臓疾患または病状が非アルコール性脂肪性肝炎である請求項17または18記載の方法。
【請求項２３】
該少なくとも1の肝臓疾患または病状が肝硬変である請求項17または18記載の方法。
【請求項２４】
該投与が静脈内投与または皮下投与を含む請求項17〜23のいずれかに記載の方法。
【請求項２５】
該投与が肝機能を改善する請求項17〜24のいずれかに記載の方法。
【請求項２６】
少なくとも1の肺疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法。
【請求項２７】
少なくとも1の肺疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、
該対象に、12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である方法。
【請求項２８】
該少なくとも1の他の肺疾患または病状が慢性閉塞性肺疾患である請求項26または27記載の方法。
【請求項２９】
該投与が肺投与を含む請求項26〜28のいずれかに記載の方法。
【請求項３０】
少なくとも1の他の疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法。
【請求項３１】
少なくとも1の他の疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、
該対象に、12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である方法。
【請求項３２】
該少なくとも1の他の疾患または病状が肺高血圧である請求項30または31記載の方法。
【請求項３３】
該少なくとも1の他の疾患または病状が血管関連疾患である請求項30または31記載の方法。
【請求項３４】
血管関連疾患が、動脈壁の硬化、中膜硬化症(mediasclerosis)、および動脈硬化症からなる群から選ばれる請求項33記載の方法。
【請求項３５】
該少なくとも1の他の疾患または病状が腸硬化症(gut sclerosis)である請求項30または31記載の方法。
【請求項３６】
該少なくとも1の他の疾患または病状が全身性硬化症である請求項30または31記載の方法。
【請求項３７】
該少なくとも1の他の疾患または病状が、後腹膜線維症、増殖性線維症、腫瘍性線維症、腎性全身性線維症、注射線維症、縦隔線維症、骨髄線維症、精管切除後痛症候群、リウマチ性関節炎からなる群から選ばれるである請求項30または31記載の方法。
【請求項３８】
該投与が、静脈内投与、皮下投与、動脈内投与、心臓内投与、または肺投与を含む請求項30〜37のいずれかに記載の方法。
【請求項３９】
該投与が線維症を改善する請求項1〜38のいずれかに記載の方法。
【請求項４０】
該投与が線維症のさらなる進行を遅くする請求項1〜38のいずれかに記載の方法。
【請求項４１】
該投与が線維症のさらなる進行を停止させる請求項1〜38のいずれかに記載の方法。
【請求項４２】
該投与が線維症を減少させる請求項1〜38のいずれかに記載の方法。
【請求項４３】
線維増殖性障害であるかまたはその疑いのある対象に、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することにより線維増殖性障害を治療する線維増殖性障害の治療方法。
【請求項４４】
線維芽細胞を、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物と接触させることにより線維芽細胞の増殖を阻害することを含む線維芽細胞の増殖を阻害する方法。
【請求項４５】
線維芽細胞を、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物と接触させることにより線維芽細胞のアポトーシスを促進することを含む線維芽細胞のアポトーシスを促進する方法。
【請求項４６】
線維芽細胞を、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物と接触させることにより、Sprouty 1タンパク質の発現を促進する、Sprouty 1タンパク質を増加させる方法。
【請求項４７】
該修飾オリゴヌクレオチドが12〜30結合ヌクレオシドからなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項４８】
該修飾オリゴヌクレオチドが12、13、または14結合ヌクレオシドからなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項４９】
該修飾オリゴヌクレオチドが15〜24結合ヌクレオシドからなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５０】
該修飾オリゴヌクレオチドが15、16、17、18、19、20、21、22、23、または24結合ヌクレオシドからなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５１】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体の核酸塩基配列とわずか2つのミスマッチを有する上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５２】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体の核酸塩基配列とわずか1つのミスマッチを有する上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５３】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体の核酸塩基配列とのミスマッチを有さない上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５４】
修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも15、少なくとも16、少なくとも17、少なくとも18、少なくとも19、少なくとも20、少なくとも21、または少なくとも22の連続核酸塩基配列を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５５】
該化合物がリガンドと結合した修飾オリゴヌクレオチドを含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５６】
該リガンドがコレステロールである上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５７】
該少なくとも1のヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５８】
各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項５９】
少なくとも1のヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６０】
各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６１】
少なくとも1のヌクレオシドが修飾糖を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６２】
複数のヌクレオシドのそれぞれが修飾糖を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６３】
各ヌクレオシドが修飾糖を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６４】
各ヌクレオシドが2'-O-メトキシエチル糖を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６５】
複数のヌクレオシドのそれぞれが2'-O-メトキシエチル糖を含み、複数のヌクレオシドのそれぞれが2'-フルオロ糖を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６６】
各修飾糖が独立して2'-O-メトキシエチル糖、2'-フルオロ糖、2'-O-メチル糖、または二環式糖部分から選ばれる請求項61〜63のいすれかに記載の方法。
【請求項６７】
少なくとも1のヌクレオシドが修飾核酸塩基を含む上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項６８】
該修飾核酸塩基が5-メチルシトシンである請求項67記載の方法。
【請求項６９】
少なくとも1のヌクレオシドがシトシンを含み、該シトシンが5-メチルシトシンである上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７０】
各シトシンが5-メチルシトシンである請求項69記載の方法。
【請求項７１】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号1の核酸塩基配列と少なくとも90%相補的であるかまたは少なくとも95%相補的である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７２】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号1の核酸塩基配列と100%相補的である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７３】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号1の核酸塩基配列と完全長の相補性を有する上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７４】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号11の核酸塩基配列と少なくとも90%相補的であるかまたは少なくとも95%相補的である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７５】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号11の核酸塩基配列と100%相補的である上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７６】
該miR-21核酸塩基配列が配列番号1の核酸塩基配列からなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７７】
前駆体核酸塩基配列が配列番号11の核酸塩基配列からなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７８】
該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物が医薬組成物として製造される上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項７９】
該化合物が修飾オリゴヌクレオチドからなる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項８０】
該修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖修飾オリゴヌクレオチドである上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項８１】
該投与がコラーゲン含有量を減少させる上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項８２】
修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである上記請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項８３】
線維症を治療および/または予防するための医薬を製造するためのmiR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用。
【請求項８４】
線維症を治療および/または予防するためのmiR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項８５】
線維症を診断するための医薬を製造するためのmiR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用。
【請求項８６】
線維症を診断するためのMiR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項８７】
a.  線維症に罹患していると推定される患者の試料を得、
b.  miR-21の発現を測定する工程を含む、
コントロール試料と比較したmiR-21レベルの上昇が線維症またはその素因を示す、線維症の診断方法。
【請求項８８】
a. miR-21を含む試料を得、
b. 候補物質と該試料を接触させ、
c. 該試料に対する候補物質の効果を測定する
工程を含む、miR-21の変化が医薬的に活性な化合物を示す
線維症またはその素因を治療および/または予防するための医薬的に活性な化合物のスクリーニング方法。
【請求項８９】
miRNAがmiR-21であり、線維症が修復または反応過程として器官または組織中の過剰な線維性結合組織の形成または発生として定義される、線維症を診断、予防、および/または治療するためのカルシウム/cAMP応答配列タンパク質(CREB)および/または血清応答因子(SRF)結合部位の修飾を含むミクロRNA(miRNA)のプロモーター領域。
【請求項９０】
miRNAが配列番号1である請求項89記載のプロモーター領域。
【請求項９１】
該修飾が、点突然変異、トランケーション、欠失、および反転からなる群から選ばれる請求項89または90記載のプロモーター領域。
【請求項９２】
該プロモーター領域が、配列番号2〜配列番号4からなる群から選ばれる上記請求項のいずれかに記載のプロモーター領域。
【請求項９３】
該細胞が請求項89記載のプロモーター領域を含むmiR-21欠損細胞。
【請求項９４】
リガンドに結合した修飾オリゴヌクレオチドを含む、以下の構造(III)を有する化合物：
(5')QxQz1(Qy)nQz2Qz3Qz4Q-L(3')
(III)
［式中、各Qは独立して2'-修飾ヌクレオシドである；
xは、
【化１】
2015107971.tif 000014
である；
ここで、AおよびBの一つがSであり、他方がOである；
yは、
【化２】
2015107971.tif 000015
である；
z1、z2、z3、およびz4のそれぞれが独立してxまたはyである；
n = 6〜17である；
Lは、
【化３】
2015107971.tif 000016
である；
ここで、
Xは、N(CO)R7またはNR7である；
R1、R3、およびR9はそれぞれ独立してH、OH、または-CH2ORbである；ただし、R1、R3、およびR9の少なくとも1つがOHであり、R1、R3、およびR9の少なくとも1つが-CH2ORbである；
R7は、Rd、またはNRcRdもしくはNHC(O)Rdで置換されたC1-C20アルキルである；
Rcは、HまたはC1-C6アルキルである；
Rdは、炭化水素ラジカル、または少なくとも1の炭化水素ラジカルに連結していることがあるステロイドラジカルである；
Rbは、
【化４】
2015107971.tif 000017
であり、ここで、AおよびBの1つがSであり、他方がOである；
ここで、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号11の核酸塩基配列と少なくとも90%相補的である。］。
【請求項９５】
Rdがコレステロールである請求項94記載の化合物。
【請求項９６】
z1、z2、z3、およびz4のそれぞれが、
【化５】
2015107971.tif 000018
であり、AおよびBの1つがSであり、他方がOである
請求項94または95記載の化合物。
【請求項９７】
R1が-CH2ORbである請求項94記載の化合物。
【請求項９８】
R9がOHである請求項97記載の化合物。
【請求項９９】
R1およびR9がトランスである請求項98記載の化合物。
【請求項１００】
R9がOHである請求項94記載の化合物。
【請求項１０１】
R1およびR3がトランスである請求項100記載の化合物。
【請求項１０２】
R3が-CH2ORbである請求項94記載の化合物。
【請求項１０３】
R1がOHである請求項102記載の化合物。
【請求項１０４】
R1およびR3がトランスである請求項103記載の化合物。
【請求項１０５】
R9がOHである請求項102記載の化合物。
【請求項１０６】
R3およびR9がトランスである請求項102記載の化合物。
【請求項１０７】
R9がCH2ORbである請求項94記載の化合物。
【請求項１０８】
R1がOHである請求項107記載の化合物。
【請求項１０９】
R1およびR9がトランスである請求項108記載の化合物。
【請求項１１０】
XがNC(O)R7である請求項94記載の化合物。
【請求項１１１】
R7が-CH2(CH2)3CH2NHC(O)Rdである請求項110記載の化合物。
【請求項１１２】
各2'-修飾ヌクレオシドが、独立して2'-O-メトキシエチルヌクレオシド、2'-フルオロヌクレオシド、2'-O-メチルヌクレオシド、または二環式ヌクレオシドから選ばれる先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１１３】
各2'-修飾ヌクレオシドが2'-O-メトキシエチルヌクレオシドである先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１１４】
各2'-修飾ヌクレオシドが2'-O-メチルヌクレオシドである先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１１５】
少なくとも1のヌクレオシドが修飾核酸塩基を含む上記請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１１６】
該修飾核酸塩基が5-メチルシトシンである請求項115記載の化合物。
【請求項１１７】
少なくとも1のヌクレオシドがシトシンを含み、該シトシンが5-メチルシトシンである先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１１８】
各シトシンが5-メチルシトシンである請求項117記載の化合物。
【請求項１１９】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号11の核酸塩基配列と少なくとも95%相補的である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２０】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号11の核酸塩基配列と100%相補的である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２１】
n = 15〜23である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２２】
n = 16である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２３】
n = 17である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２４】
n = 18である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２５】
n = 19である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２６】
n = 20である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２７】
n = 21である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２８】
n = 22である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１２９】
n = 23である先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３０】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも15連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３１】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも16連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３２】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも17連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３３】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも18連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３４】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも19連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３５】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも20連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３６】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも21連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３７】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも22連続核酸塩基を含む先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３８】
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が配列番号12の核酸塩基配列からなる先の請求項のいずれかに記載の化合物。
【請求項１３９】
以下の構造(III)からなる化合物：
(5')QxQz1(Qy)nQz2Qz3Qz4Q-L(3')
(III)
［式中、
各Qは、独立して2'-O-メチル修飾ヌクレオシドである；
xは、
【化６】
2015107971.tif 000019
であり、AおよびBの1つがSであり、他方がOである；
yは、
【化７】
2015107971.tif 000020
である；
z1、z2、z3、およびz4のそれぞれがxであり、AおよびBの1つがSであり、他方がOである；
n = 15である；
Lは、
【化８】
2015107971.tif 000021
であり、
ここで、R1はCH2ORbであり、R9はOHである；R1およびR9はトランスである；XはN(CO)R7である；
R7は-CH2(CH2)3CH2NHC(O)Rdであり；Rdはステロイドラジカルである；
Rbは、
【化９】
2015107971.tif 000022
であり、AおよびBの1つがSであり、他方がOである；
ここで、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は配列番号12の核酸塩基配列からなる。］。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、線維症および他の疾患を診断、予防、および/または治療するためのミクロRNA(miRNA)、具体的にはmiR-21、およびその下流標的の分野に関する。さらに本発明は、線維症を治療するための組成物、方法、および使用に関する。そのような方法は、線維症のある対象におけるmiRNA活性を調整および阻害することを含む。
【背景技術】
【０００２】
ミクロRNAは、相補的標的mRNAの発現を制御することにより主要なシグナル伝達経路を含む広範な生物学的プロセスを調節する広範なクラスの小非コーディングRNAである(Ambro、2004)。種々の疾患的存在におけるミクロRNAの調節異常は、ゲノムの変化(Mi et al.、2007)、ある場合には、ミクロRNA機能を腫瘍抑制遺伝子または腫瘍遺伝子に変化させる発現差異(differential expression)またはウイルス感染症により生じる。ミクロRNAは、最近の一連のすばらしい遺伝子研究において種々の心臓機能の調節に関与していた(Care et al.、2007；Yang et al.、2007)。これらの研究は、心臓の生理学、成長、および形態形成におけるミクロRNAの役割を正確に説明するのを助けるが、in vivoの疾患経路におけるミクロRNAに対する詳細な分子メカニズムはよく解っていない。一本鎖オリゴヌクレオチドミクロRNAアンタゴニストは、in vitroおよびin vivoで内因性ミクロRNAを沈黙させ(silence)、標的mRNAおよびタンパク質レベル、および代謝に対する効果を生じることが示されている(Kruetzfeldt et al.、2005；Esau et al.、2006)。これらの治験は、ミクロRNA機能をin vivoで、おそらくより重要なことは新規治療法として検証するためのミクロRNAアンタゴニストの応用を指摘した。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００３】
(要  約)
本発明は、ミクロRNAのプロモーター領域、ならびに線維症および/または線維症関連疾患を治療および/または予防するための医薬を製造するための、およびそれらを診断するためのミクロRNA、具体的にはミクロRNAおよび関連要素(関連配列)の使用に関する。さらに、本発明は、miR-21の標的に対する種々のアンチセンスオリゴヌクレオチドに関する。miR-21欠損細胞、miR-21のプロモーター領域および標的、ならびにそのノックアウト生物も含む。最後に、本発明は、線維症および/または線維症関連疾患の診断方法、ならびに線維症および/または線維症関連疾患を治療するための医薬活性化合物のスクリーニング方法を指向する。
【０００４】
本発明は、線維症があるかまたはその疑いがある対象にmiR-21と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法を提供する。本発明は、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、該対象に修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法を提供する。
【０００５】
線維症が発現するリスクがある対象にmiRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することにより線維症を予防することを含む方法を提供する。ある態様において、線維症は肝線維症である。ある態様において、線維症は肺線維症である。ある態様において、線維症は皮膚線維症である。ある態様において、線維症は加齢関連線維症である。ある態様において、線維症は心線維症である。ある態様において、線維症は腎線維症である。ある態様において、線維症は脾線維症である。
【０００６】
本発明は、少なくとも1の心疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法を提供する。
【０００７】
本発明は、少なくとも1の心疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、該対象に修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法を提供する。
【０００８】
ある態様において、該心疾患または病状は、心肥大、高血圧性心不全、拡張期心不全、収縮期心不全、心臓関連蓄積症、心筋症、収縮性心内膜症、冠動脈疾患、急性心筋梗塞、慢性心筋梗塞、右心不全、不整脈、心筋炎関連線維症、および心臓弁膜症からなる群から選ばれる。
【０００９】
ある態様において、心筋症は、拡張型心筋症、閉塞を伴う肥大型心筋症、閉塞を伴わない肥大型心筋症、拘束型心筋症、催不整脈性右室 心筋症、および糖尿病性心筋症からなる群から選ばれる。
【００１０】
ある態様において、心臓弁膜症は、僧帽弁狭窄、大動脈弁狭窄、三尖弁狭窄、および肺動脈弁狭窄からなる群から選ばれる。
【００１１】
ある態様において、心臓弁膜症は、僧帽弁閉鎖不全、大動脈弁閉鎖不全、三尖弁閉鎖不全、および肺動脈弁閉鎖不全からなる群から選ばれる。
【００１２】
ある態様において、さらに本発明が提供する方法は、1またはそれ以上のさらなる医薬品を投与することを含む。
【００１３】
ある態様において、該投与は、心重量増加、左心室拡大、または収縮率の低下を改善する。
【００１４】
ある態様において、該投与は、心重量増加、左心室拡大、または収縮率の低下を予防する。
【００１５】
ある態様において、該投与は心機能を改善する。
【００１６】
ある態様において、該投与は、静脈内投与、皮下投与、動脈内投与、または心臓内投与を含む。
【００１７】
本発明は、少なくとも1の肝臓疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法を提供する。
【００１８】
本発明は、少なくとも1の肝臓疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、該対象に修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法を提供する。ある態様において、少なくとも1の肝臓疾患または病状は慢性肝障害である。ある態様において、少なくとも1の肝臓疾患または病状は肝炎ウイルス感染である。ある態様において、肝炎感染はC型肝炎ウイルス感染である。ある態様において、少なくとも1の肝臓疾患または病状は非アルコール性脂肪性肝炎である。ある態様において、該投与は静脈内投与または皮下投与を含む。ある態様において、少なくとも1の肝臓疾患または病状は肝硬変である。ある態様において、該投与は肝機能を改善する。
【００１９】
本発明は、少なくとも1の肺疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象にmiRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法を提供する。
【００２０】
本発明は、少なくとも1の肺疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、該対象に修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法を提供する。ある態様において、少なくとも1の他の肺疾患または病状は慢性閉塞性肺疾患である。ある態様において、該投与は肺投与を含む。
【００２１】
本発明は、少なくとも1の他の疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象にmiRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法を提供する。
【００２２】
本発明は、少なくとも1の他の疾患または病状を有する、線維症があるかまたはその疑いがある対象を同定し、該対象に修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む方法を提供する。ある態様において、少なくとも1の他の疾患または病状は肺高血圧である。ある態様において、少なくとも1の他の疾患または病状は血管関連疾患である。ある態様において、血管関連疾患は動脈壁の硬化、中膜硬化症(mediasclerosis)、および動脈硬化症からなる群から選ばれる。ある態様において、少なくとも1の他の疾患または病状は、腸硬化症(gut sclerosis)である。ある態様において、少なくとも1の他の疾患または病状は全身性硬化症である。ある態様において、少なくとも1の他の疾患または病状は、後腹膜線維症、増殖性線維症、腫瘍性線維症、腎性全身性線維症、注射線維症、縦隔線維症、骨髄線維症、精管切除後痛症候群、リウマチ性関節炎からなる群から選ばれる。
【００２３】
ある態様において、該投与は線維症を改善する。ある態様において、該投与は線維症のさらなる進行を遅くする。ある態様において、該投与は線維症のさらなる進行を停止させる。ある態様において、該投与は線維症を減少させる。ある態様において、該投与はコラーゲン含有量を減少させる。
【００２４】
本発明は、線維増殖性障害があるかまたはその疑いがある対象に修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することにより線維増殖性障害を治療することを含む線維増殖性障害の治療方法を提供する。
【００２５】
ある態様において、該投与は、静脈内投与、皮下投与、肺投与、動脈内投与、または心臓内投与を含む。
【００２６】
本発明は、線維芽細胞を修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物と接触させて、線維芽細胞の増殖を阻害することを含む線維芽細胞の増殖を阻害する方法を提供する。
【００２７】
本発明は、線維芽細胞を修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR-21またはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる該修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物と接触させて、線維芽細胞のアポトーシスを促進することを含む線維芽細胞のアポトーシスを促進する方法を提供する。
【００２８】
線維芽細胞を修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiRNAまたはその前駆体と相補的である12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物と接触させて、Sprouty 1タンパク質の発現を促進する線維芽細胞中のSprouty 1タンパク質を増加させる方法を提供する。
【００２９】
本発明は、ミクロRNAを阻害するための組成物を提供する。ある態様において、miRNAはmiR-21である。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは、miR-21またはその前駆体と少なくとも80％同一な核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列を有する。ある態様において、miR-21は配列番号1の核酸塩基配列を有する。ある態様において、該miR-21前駆体は、配列番号11の核酸塩基配列を有する。
【００３０】
ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは、12〜30結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは12結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは13結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは14結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは15〜24結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは15結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは16結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは17結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは18結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは19結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは20結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは21結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは22結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは23結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは24結合ヌクレオシドからなる。
【００３１】
ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miR-21またはその前駆体の核酸塩基配列とわずか2つのミスマッチを有する。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miR-21またはその前駆体の核酸塩基配列とわずか1つのミスマッチを有する。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miR-21またはその前駆体の核酸塩基配列とミスマッチを有さない。
【００３２】
ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも15連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも16連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも17連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも18連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも19連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも20連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも21連続核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列の少なくとも22連続核酸塩基を含む。
【００３３】
ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号12の核酸塩基配列からなる。
【課題を解決するための手段】
【００３４】
ある態様において、該化合物はリガンドと結合した修飾オリゴヌクレオチドを含む。ある態様において、該化合物は、以下の構造(III)を有する：
(5')QxQz1(Qy)nQz2Qz3Qz4Q-L(3')
(III)
［式中、各Qは独立して2'-O-メチル修飾ヌクレオシドである；
xは、
【化１】
2015107971.tif 000002
である；
AおよびBの一つがSであり、他方がOである；
yは、
【化２】
2015107971.tif 000003
である；
z1、z2、z3、およびz4のそれぞれが独立してxまたはyである；
n = 6〜17である；
Lは、
【化３】
2015107971.tif 000004
である；
ここで、
Xは、N(CO)R7またはNR7である；
R1、R3、およびR9はそれぞれ独立してH、OH、または-CH2ORbである；ただし、R1、R3、およびR9の少なくとも1つがOHであり、R1、R3、およびR9の少なくとも1つが-CH2ORbである；
R7は、Rd、またはNRcRdもしくはNHC(O)Rdで置換されたC1-C20アルキルである；
Rcは、HまたはC1-C6アルキルである；
Rdは、炭化水素ラジカル、または少なくとも1の炭化水素ラジカルに連結していることがあるステロイドラジカルである；
Rbは、
【化４】
2015107971.tif 000005
であり、ここで、AおよびBの1つがSであり、他方がOである］。
【００３５】
ある態様において、Rdはコレステロールである。ある態様において、z1、z2、z3、およびz4のそれぞれは、
【化５】
2015107971.tif 000006
であり、AおよびBの1つがSであり、他方がOである。
【００３６】
ある態様において、R1は-CH2ORbである。ある態様において、R9がOHである。ある態様において、R1およびR9がトランスである。ある態様において、R1およびR3がトランスである。ある態様において、R3が-CH2ORbである。ある態様において、R1がOHである。ある態様において、R1およびR3がトランスである。ある態様において、R3およびR9がトランスである。ある態様において、R9がCH2ORbである。ある態様において、XがNC(O)R7である。ある態様において、R7が-CH2(CH2)3CH2NHC(O)Rdである。
【００３７】
ある態様において、少なくとも1のヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある態様において、各ヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある態様において、少なくとも1のヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。ある態様において、各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。ある態様において、少なくとも1のヌクレオシドは修飾糖を含む。ある態様において、複数のヌクレオシドが修飾糖を含む。ある態様において、各ヌクレオシドは修飾糖を含む。ある態様において、各ヌクレオシドは2'-O-メトキシエチル糖を含む。ある態様において、複数のヌクレオシドのそれぞれが2'-O-メトキシエチル糖を含み、複数のヌクレオシドのそれぞれが2'-フルオロ糖を含む。ある態様において、各修飾糖は、独立して2'-O-メトキシエチル糖、2'-フルオロ糖、2'-O-メチル糖、または二環式糖部分から選ばれる。ある態様において、少なくとも1のヌクレオシドが修飾核酸塩基を含む。ある態様において、該修飾核酸塩基が5-メチルシトシンである。ある態様において、少なくとも1のヌクレオシドがシトシンを含み、該シトシンが5-メチルシトシンである。ある態様において、各シトシンは5-メチルシトシンである。
【００３８】
ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号1の核酸塩基配列と少なくとも90％相補的である。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号1の核酸塩基配列と少なくとも95％相補的である。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号1の核酸塩基配列と少なくとも100％相補的である。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号1の核酸塩基配列と完全長の相補性を有する。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号11の核酸塩基配列と少なくとも90％相補的である。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号11の核酸塩基配列と少なくとも95％相補的である。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号11の核酸塩基配列と少なくとも100％相補的である。ある態様において、miR-21の核酸塩基配列は、配列番号1の核酸塩基配列からなる。ある態様において、該前駆体核酸塩基配列は配列番号11の核酸塩基配列からなる。
【００３９】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は医薬組成物として製造される。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは医薬組成物として製造される。
【００４０】
ある態様において、該化合物は修飾オリゴヌクレオチドからなる。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは一本鎖修飾オリゴヌクレオチドである。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドはアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
【００４１】
本発明は、線維症の治療、予防、および/または改善に用いるための組成物である。さらに本発明は、線維症の治療、予防、および/または改善に用いるためのmiRNAと相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を提供する。
【００４２】
本発明は、線維症を治療および/または予防するための医薬を製造するためのmiR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【００４３】
本発明は、線維症を治療および/または予防するのに用いるためのmiR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【００４４】
本発明は、線維症を治療するためのmiR-21および/またはmiR-21に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用を提供する。
【００４５】
本発明は、線維症を診断するためのmiR-21および/またはmiR-21に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用を提供する。
【図面の簡単な説明】
【００４６】
【図１−１】心臓疾患におけるmiR-21の調節異常と心臓線維芽細胞における顕著な発現。(a)マイクロアレイによるミクロRNA発現の分析。RNAは、心不全の初期(3ヶ月齢)、中等度(6ヶ月齢)、および後期(12ヶ月)における心不全ネズミモデル(β1AR-TGマウス)の左室心筋から単離した。発現は、野生型コントロールに対する調節倍率として表す。miR-21を赤色で印する。データは3〜4独立ハイブリダイゼーション/群である。(b)左：β1AR-TGマウスの心不全の種々の段階におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。右：上段パネルのデータの定量分析。(c)左：非不全および不全ヒト左室心筋におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。右：非不全および不全ヒト左室心筋における成熟型のmiR-21の定量分析。(d)上段：スクランブル-miR(コントロール-プレmiR、50 nM、72 h)、合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)、およびmiR-21阻害剤(抗miR-21、50 nM、72 h)によるトランスフェクション後の4',6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)およびα-アクチニンに対する抗体で染色した新生児心筋細胞。心筋細胞をコントロール条件(補足的方法参照)下で培養するか、またはFCS(5%)で48時間刺激した。下段：個々の心筋細胞サイズの定量分析(ヒストグラム解析)。n>200 心筋細胞/群を解析した。(e)上段：α-MHCプロモーターの制御下でmiR-21を発現するトランスジェニックマウスの生成。中段：野生型(WT)およびトランスジェニック(TG)動物における成熟miR-21のノーザンブロット。下段：一般的形態(HE染色)およびコラーゲン沈着(シリウスレッド)を測定するための染色した野生型およびmiR-21トランスジェニックマウスの横断面心臓領域。(f)心臓線維芽細胞および心筋細胞におけるmiR-21発現。ノーザンブロット(上段)および定量的リアルタイムPCR解析(下段)。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜fについてn=3〜6。
【図１−２】心臓疾患におけるmiR-21の調節異常と心臓線維芽細胞における顕著な発現。(a)マイクロアレイによるミクロRNA発現の分析。RNAは、心不全の初期(3ヶ月齢)、中等度(6ヶ月齢)、および後期(12ヶ月)における心不全ネズミモデル(β1AR-TGマウス)の左室心筋から単離した。発現は、野生型コントロールに対する調節倍率として表す。miR-21を赤色で印する。データは3〜4独立ハイブリダイゼーション/群である。(b)左：β1AR-TGマウスの心不全の種々の段階におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。右：上段パネルのデータの定量分析。(c)左：非不全および不全ヒト左室心筋におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。右：非不全および不全ヒト左室心筋における成熟型のmiR-21の定量分析。(d)上段：スクランブル-miR(コントロール-プレmiR、50 nM、72 h)、合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)、およびmiR-21阻害剤(抗miR-21、50 nM、72 h)によるトランスフェクション後の4',6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)およびα-アクチニンに対する抗体で染色した新生児心筋細胞。心筋細胞をコントロール条件(補足的方法参照)下で培養するか、またはFCS(5%)で48時間刺激した。下段：個々の心筋細胞サイズの定量分析(ヒストグラム解析)。n>200 心筋細胞/群を解析した。(e)上段：α-MHCプロモーターの制御下でmiR-21を発現するトランスジェニックマウスの生成。中段：野生型(WT)およびトランスジェニック(TG)動物における成熟miR-21のノーザンブロット。下段：一般的形態(HE染色)およびコラーゲン沈着(シリウスレッド)を測定するための染色した野生型およびmiR-21トランスジェニックマウスの横断面心臓領域。(f)心臓線維芽細胞および心筋細胞におけるmiR-21発現。ノーザンブロット(上段)および定量的リアルタイムPCR解析(下段)。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜fについてn=3〜6。
【図１−３】心臓疾患におけるmiR-21の調節異常と心臓線維芽細胞における顕著な発現。(a)マイクロアレイによるミクロRNA発現の分析。RNAは、心不全の初期(3ヶ月齢)、中等度(6ヶ月齢)、および後期(12ヶ月)における心不全ネズミモデル(β1AR-TGマウス)の左室心筋から単離した。発現は、野生型コントロールに対する調節倍率として表す。miR-21を赤色で印する。データは3〜4独立ハイブリダイゼーション/群である。(b)左：β1AR-TGマウスの心不全の種々の段階におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。右：上段パネルのデータの定量分析。(c)左：非不全および不全ヒト左室心筋におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。右：非不全および不全ヒト左室心筋における成熟型のmiR-21の定量分析。(d)上段：スクランブル-miR(コントロール-プレmiR、50 nM、72 h)、合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)、およびmiR-21阻害剤(抗miR-21、50 nM、72 h)によるトランスフェクション後の4',6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)およびα-アクチニンに対する抗体で染色した新生児心筋細胞。心筋細胞をコントロール条件(補足的方法参照)下で培養するか、またはFCS(5%)で48時間刺激した。下段：個々の心筋細胞サイズの定量分析(ヒストグラム解析)。n>200 心筋細胞/群を解析した。(e)上段：α-MHCプロモーターの制御下でmiR-21を発現するトランスジェニックマウスの生成。中段：野生型(WT)およびトランスジェニック(TG)動物における成熟miR-21のノーザンブロット。下段：一般的形態(HE染色)およびコラーゲン沈着(シリウスレッド)を測定するための染色した野生型およびmiR-21トランスジェニックマウスの横断面心臓領域。(f)心臓線維芽細胞および心筋細胞におけるmiR-21発現。ノーザンブロット(上段)および定量的リアルタイムPCR解析(下段)。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜fについてn=3〜6。
【図２−１】miR-21によるSprouty 1の阻害はERK-シグナル伝達を活性化し、線維芽細胞の生存を増強する。(a)Spry1LacZ +/-マウスからの心臓をX-galで染色した。肉眼的(上段)および顕微鏡的(下段)分析は、心臓線維芽細胞におけるLacZの検出を示す。短い黒色バーは100μmを示す。大きな黒いバーは10μmを示す。(b、c)上段：不全ヒト左心室(b)および共培養した心筋細胞および線維芽細胞のスクランブル-ミクロRNA(プレ-miR(登録商標)陰性コントロール#2、50 nM、72h)、合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)、またはmiR-21阻害剤(抗miR-21、50nM、72 h)によるトランスフェクション後におけるSPRY1、ERK1/2、およびホスホ-ERK1/2の検出。下段：ウエスタンブロッティング成績の定量分析。(d)上段：SPRY1のsiRNA介在ノックダウン(150 nM、72 h)、または共培養心臓細胞のスクランブルsiRNAによる処理(150 nM、72 h)後のSPRY1、ERK1/2、ホスホ-ERK1/2の測定。下段：ウエスタンブロッティング成績の定量分析。(e)上段：スクランブル-ミクロRNA(コントロール-プレ-miR、100 nM、72 h)、合成miR-21(プレ-miR-21、100 nM、72 h)、miR-21アンタゴニスト(抗miR-21、100 nM、72 h)、または各コントロール(100 nM、72 h)で処理後のアネクシンV陽性心臓線維芽細胞のFACS分析。下段：各処理後のアネクシンV陽性細胞の定量分析。(f)下段：スクランブル-ミクロRNA(コントロールプレ-miR、100 nM、72 h)、合成miR- 21(プレ-miR-21、100 nM、72 h)、またはmiR-21アンタゴニスト(抗miR-21、100 nM、72 h)処理後、または(下段)SPRY1のsiRNA介在ノックダウン(150 nM、72 h)またはスクランブルsiRNA処理(150 nM、72 h)後の培養心臓線維芽細胞上清中のFGF2濃度。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜fについてn=3-6。
【図２−２】miR-21によるSprouty 1の阻害はERK-シグナル伝達を活性化し、線維芽細胞の生存を増強する。(a)Spry1LacZ +/-マウスからの心臓をX-galで染色した。肉眼的(上段)および顕微鏡的(下段)分析は、心臓線維芽細胞におけるLacZの検出を示す。短い黒色バーは100μmを示す。大きな黒いバーは10μmを示す。(b、c)上段：不全ヒト左心室(b)および共培養した心筋細胞および線維芽細胞のスクランブル-ミクロRNA(プレ-miR(登録商標)陰性コントロール#2、50 nM、72h)、合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)、またはmiR-21阻害剤(抗miR-21、50nM、72 h)によるトランスフェクション後におけるSPRY1、ERK1/2、およびホスホ-ERK1/2の検出。下段：ウエスタンブロッティング成績の定量分析。(d)上段：SPRY1のsiRNA介在ノックダウン(150 nM、72 h)、または共培養心臓細胞のスクランブルsiRNAによる処理(150 nM、72 h)後のSPRY1、ERK1/2、ホスホ-ERK1/2の測定。下段：ウエスタンブロッティング成績の定量分析。(e)上段：スクランブル-ミクロRNA(コントロール-プレ-miR、100 nM、72 h)、合成miR-21(プレ-miR-21、100 nM、72 h)、miR-21アンタゴニスト(抗miR-21、100 nM、72 h)、または各コントロール(100 nM、72 h)で処理後のアネクシンV陽性心臓線維芽細胞のFACS分析。下段：各処理後のアネクシンV陽性細胞の定量分析。(f)下段：スクランブル-ミクロRNA(コントロールプレ-miR、100 nM、72 h)、合成miR- 21(プレ-miR-21、100 nM、72 h)、またはmiR-21アンタゴニスト(抗miR-21、100 nM、72 h)処理後、または(下段)SPRY1のsiRNA介在ノックダウン(150 nM、72 h)またはスクランブルsiRNA処理(150 nM、72 h)後の培養心臓線維芽細胞上清中のFGF2濃度。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜fについてn=3-6。
【図３−１】in vivoにおけるmiR-21の治療的サイレンシングは心線維症および心不全を抑制する。(a)上段：頸静脈へのCy3標識修飾オリゴヌクレオチド注射後の左室心組織のCy3およびDAPI染色の蛍光顕微鏡検出。コントロールはPBS注射を受けた。下段：経大動脈狭窄(TAC)または偽手術を受けたマウスに、手術の24時間後3日間連続でコントロール(PB、200μl)またはantagomir(アンタゴmir)-21(200μl；80mg/kg/d)を注射した。(b)上段：TAC後の無処置(コントロール)およびantagomir-21処理マウスにおけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。下段：心臓miR-21発現の定量分析。(c)上段：コントロールまたはantagomir-21で処理した偽手術またはTAC後のマウスにおけるSPRY1、ERK1/2およびホスホ-ERK1/2のウエスタンブロット分析。Gβの発現は、ハウスキーピングコントロールとして示した。下段：ウエスタンブロット成績の定量分析。(d)コントロール-およびantagomir-21処置マウスにおける心筋線維症を検出するためのシリウスレッド染色後の心臓切片。(e)コントロール-およびantagomir-21 処置マウスにおける心筋線維症(左)および心臓/体重(右)の定量分析。(f)上段：コントロールまたはantagomir-21処理した偽手術またはTAC後のマウスの心臓組織におけるマウスゲノムのグローバルトランスクリプトーム分析。赤色(緑色)ボックスは、有意に(p<0.05)誘導された(抑制された)遺伝子を表す。下段：antagomir-21処理によるTAC後の心筋線維症に関与するタンパク質をコードする上方調節された遺伝子の正常化。(g)心エコー分析。LVD、左心室直径；FS、短縮率。(h)SPRY1のmiR-21介在阻害による心臓ERKシグナル伝達の活性化の基礎となるメカニズムの提唱。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜gにつきn=3-6。
【図３−２】in vivoにおけるmiR-21の治療的サイレンシングは心線維症および心不全を抑制する。(a)上段：頸静脈へのCy3標識修飾オリゴヌクレオチド注射後の左室心組織のCy3およびDAPI染色の蛍光顕微鏡検出。コントロールはPBS注射を受けた。下段：経大動脈狭窄(TAC)または偽手術を受けたマウスに、手術の24時間後3日間連続でコントロール(PB、200μl)またはantagomir(アンタゴmir)-21(200μl；80mg/kg/d)を注射した。(b)上段：TAC後の無処置(コントロール)およびantagomir-21処理マウスにおけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。下段：心臓miR-21発現の定量分析。(c)上段：コントロールまたはantagomir-21で処理した偽手術またはTAC後のマウスにおけるSPRY1、ERK1/2およびホスホ-ERK1/2のウエスタンブロット分析。Gβの発現は、ハウスキーピングコントロールとして示した。下段：ウエスタンブロット成績の定量分析。(d)コントロール-およびantagomir-21処置マウスにおける心筋線維症を検出するためのシリウスレッド染色後の心臓切片。(e)コントロール-およびantagomir-21 処置マウスにおける心筋線維症(左)および心臓/体重(右)の定量分析。(f)上段：コントロールまたはantagomir-21処理した偽手術またはTAC後のマウスの心臓組織におけるマウスゲノムのグローバルトランスクリプトーム分析。赤色(緑色)ボックスは、有意に(p<0.05)誘導された(抑制された)遺伝子を表す。下段：antagomir-21処理によるTAC後の心筋線維症に関与するタンパク質をコードする上方調節された遺伝子の正常化。(g)心エコー分析。LVD、左心室直径；FS、短縮率。(h)SPRY1のmiR-21介在阻害による心臓ERKシグナル伝達の活性化の基礎となるメカニズムの提唱。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜gにつきn=3-6。
【図３−３】in vivoにおけるmiR-21の治療的サイレンシングは心線維症および心不全を抑制する。(a)上段：頸静脈へのCy3標識修飾オリゴヌクレオチド注射後の左室心組織のCy3およびDAPI染色の蛍光顕微鏡検出。コントロールはPBS注射を受けた。下段：経大動脈狭窄(TAC)または偽手術を受けたマウスに、手術の24時間後3日間連続でコントロール(PB、200μl)またはantagomir(アンタゴmir)-21(200μl；80mg/kg/d)を注射した。(b)上段：TAC後の無処置(コントロール)およびantagomir-21処理マウスにおけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。下段：心臓miR-21発現の定量分析。(c)上段：コントロールまたはantagomir-21で処理した偽手術またはTAC後のマウスにおけるSPRY1、ERK1/2およびホスホ-ERK1/2のウエスタンブロット分析。Gβの発現は、ハウスキーピングコントロールとして示した。下段：ウエスタンブロット成績の定量分析。(d)コントロール-およびantagomir-21処置マウスにおける心筋線維症を検出するためのシリウスレッド染色後の心臓切片。(e)コントロール-およびantagomir-21 処置マウスにおける心筋線維症(左)および心臓/体重(右)の定量分析。(f)上段：コントロールまたはantagomir-21処理した偽手術またはTAC後のマウスの心臓組織におけるマウスゲノムのグローバルトランスクリプトーム分析。赤色(緑色)ボックスは、有意に(p<0.05)誘導された(抑制された)遺伝子を表す。下段：antagomir-21処理によるTAC後の心筋線維症に関与するタンパク質をコードする上方調節された遺伝子の正常化。(g)心エコー分析。LVD、左心室直径；FS、短縮率。(h)SPRY1のmiR-21介在阻害による心臓ERKシグナル伝達の活性化の基礎となるメカニズムの提唱。全ての誤差バーはSEMを示す。a〜gにつきn=3-6。
【図４】miR-21の転写調節。(a)ヒトmiR-21-プロモーターと比較した種々の種のmiR-21プロモーター領域内の配列保存。バーは保存の程度を示す。(b)ヒトmiR-21-プロモーター構築物のルシフェラーゼ活性。天然プロモーターの進行的短縮は、miR-21の発現に関与する117bp領域の同定をもたらす。n=3。(c)個々の転写因子結合部位の欠失/突然変異後のヒトmiR-21-プロモーター構築物のルシフェラーゼデータ。n=3。
【図５】遍在性に発現したmiR-21のノックダウンは、ゼブラフィッシュの心臓表現形を誘導する。(a)左：MO-コントロール胚およびmiR-21モルファントの80hpfでの側面図。A、心房；V、心室；暗い矢印は心膜浮腫を強調する。右上段：コントロール-モルホリノ(MO-コントロール)注射した心臓は、80受精後時間(hpf)で正常な心臓の形態を示す。心臓はループし、心内膜および心筋層はよく発達し、心室(V)および心房(A)は房室(AV)輪により分離される。下段：miR-21モルファント(MO-1注射)は、心室の収縮性の喪失により心膜浮腫が発現し、尾部の短縮を示すが、他の器官系の発生は正常に進行する。(b)2つの異なるモルホリノ-修飾アンチセンスオリゴヌクレオチド(MO-1、n=496、およびMO-2、n=460)によるmiR-21機能の阻害は、注射した胚の＞90％に同じ表現形を生じた。データは、群あたり3回の独立した注射から得た。(c)心筋機能は、48、72、96、および120hpfで2つの異なるモルホリノ(MO-1、n=8、およびMO-2、n=8)により注射したMO-コントロール(n=6)およびmiR-21モルファントの心室腔の短縮率(FS)で表した。miR-21モルファント心室の心室FSは、経時的に重度に低下した。
【図６】培養心筋細胞のトランスフェクション効率。(a)培養新生児心筋細胞をCy-3標識miR-21(50 nM、72 h、Ambion、USA)でトランスフェクションし、DAPIで染色した(右)。比較のために、培養心筋細胞をDAPI単独で染色した(左)。(b)スクランブル-ミクロRNA(コントロール-プレ-miR、50 nM、72 h)、miR-21阻害剤(抗miR-21、50 nM、72 h)、または合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)でトランスフェクションした後の培養心筋細胞におけるmiR-21発現のノーザンブロット分析。すべての誤差バーはSEMを示す；a)およびb)についてn=3-6。
【図７】Spry1遺伝子の3'UTR内のミクロRNA結合部位。  上段：Spry1遺伝子の3'UTR内の結合部位を有する種々のミクロRNAの発現変化。下段：ミクロRNAマイクロアレイにより分析した3'UTR内の結合部位を有するミクロRNAを灰色で表す。Cds=コード配列。
【図８】miR-21リアルタイムPCR発現データ。  ノーザンブロッティングによる測定に加え、miR-21の発現を、偽手術、偽＋antagomir-21処理、TACおよびTAC＋antagomir-21処理後のマウスの左心室組織(左)、ならびに野生型マウスおよびmiR-21トランスジェニックマウスの心臓(右)においてリアルタイムPCRにより分析した。n=4-6/群。データ示さず：
【００４７】
理論的miR-21標的のスクリーニングにより22の既知の潜在的標的遺伝子が解り、その内の8つは心臓組織内に発現することが示された。3つの異なる標的推定ツールの組み合わせにより可能性の高い候補としてSpry1(sprouty1(スプロウティ1))が同定された。
miR-21の転写調節
【００４８】
ヒトmiR-21-プロモーターに比べて種々の種のmiR-21-プロモーター領域内には配列保存がある。個々の転写因子結合部位の欠失/突然変異後にヒトmiR-21-プロモーター構築物のルシフェラーゼ活性がみられた。該陰性プロモーターの進行性の短縮は、miR-21の発現に関与する117bp領域の同定をもたらす。n=3。
培養心筋細胞におけるトランスフェクション効果
【００４９】
培養新生児心筋細胞をCy-3標識miR-21(50 nM、72 h、Ambion、USA)でトランスフェクションし、次いでDAPIで染色した。比較のために培養心筋細胞をDAPIのみで染色した。スクランブル-ミクロRNA(コントロール-プレ-miR、50 nM、72 h)、miR-21阻害剤(抗miR-21、50 nM、72 h)、または合成miR-21(プレ-miR-21、50 nM、72 h)でトランスフェクションした後の培養心筋細胞におけるmiR-21発現のノーザンブロッティング分析を行った。
Spryl遺伝子の3．UTR内のミクロRNA結合部位
【００５０】
Spryl遺伝子の3'UTR内に結合部位を有する種々のミクロRNAの発現変化がある。3'UTR内に結合部位を有するミクロRNAをミクロRNAマイクロアレイにより分析した。
miR-21リアルタイムPCR発現データ
【００５１】
ノーザンブロッティングによる測定に加え、miR-21の発現を、偽手術、偽手術+miR-21アンタゴニスト処置、TACおよびTAC+miR-21アンタゴニスト処置後のマウスの左心室組織、ならびに野生型マウスおよびmiR-21トランスジェニックマウス由来の心臓においてリアルタイムPCRで分析した。
(詳細な説明)
定  義
【００５２】
「線維症」は、器官または組織における過剰な線維性結合組織の形成または発現を意味する。ある態様において、線維症は修復または反応過程として生じる。ある態様において、線維症は傷害または損傷に反応して生じる。用語「線維症」は、器官または組織の正常な構成要素としての線維性組織の形成と異なり、修復または反応過程としての器官または組織における過剰な線維性結合組織の形成または発現と理解すべきである。
【００５３】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、別の配列と相補的なある種の配列、具体的にはmiR-21と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドと理解すべきである。miR-21の標的もmiR-21の下流標的を含むと理解されうる。例えばmiR-21と少なくとも相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドを介するmiR-21の阻害はSproutyなどのようなmiR-21の標的の抑制解除または過剰発現さえもたらすと気づくことが重要である。
【００５４】
「対象」は、処置または治療のために選ばれる人または非ヒト動物を意味する。
【００５５】
「〜を有すると疑われる対象」は、疾患または病状の1またはそれ以上の臨床的兆候を有する対象を意味する。
【００５６】
「線維症を有すると疑われる対象」は、線維症の1またはそれ以上の臨床的指標を有する対象を意味する。
【００５７】
「予防する」または「予防」とは、病状または疾患の発症、発現、または進行を一定期間(数週間、数ヶ月、または数年を含む)遅延させまたは防止することをいう。
【００５８】
「処置(治療)」または「処置する」は、疾患を回復または改善させるために用いる1またはそれ以上の具体的方法の適用を意味する。ある態様において、該具体的方法は1またはそれ以上の医薬品を投与することである。
【００５９】
「改善」は、病状または疾患の少なくとも1の指標の重症度の減少を意味する。ある態様において、改善には病状または疾患の1またはそれ以上の指標の進行を遅延または遅らせることが含まれる。指標の重症度は、当業者に知られた主観的または客観的手段により決定することができる。
【００６０】
「それを必要とする対象」は、治療または処置が必要であることが確認された対象を意味する。
【００６１】
「投与する」とは、対象に医薬品または医薬組成物を与えることを意味し、これには限定されるものではないが、医療専門家による投与および自己投与が含まれる。
【００６２】
「非経口投与」は注射または注入による投与を意味する。
【００６３】
非経口投与には、限定されるものではないが、皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、および頭蓋内投与が含まれる。
【００６４】
「皮下投与」は皮膚直下への投与を意味する。
【００６５】
「静脈内投与」は静脈内への投与を意味する。
【００６６】
「動脈内投与」は動脈内への投与を意味する。
【００６７】
「心臓内投与」は心臓内への投与を意味する。ある態様において、心臓内投与はカテーテルを介してなされる。ある態様において、心臓内投与は開心術によりなされる。
【００６８】
「肺投与」は肺への投与を意味する。
【００６９】
「肝機能を改善する」は、肝機能が正常パラメーターに向かって変化することを意味する。ある態様において、肝機能は、対象の血液中にみられる分子を測定することにより評価される。例えば、ある態様において、肝機能の改善は血中肝臓トランスアミナーゼ濃度の減少により測定される。
【００７０】
「医薬組成物」は、医薬品を含む個体への投与に適した物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は、修飾オリゴヌクレオチドおよび無菌水性溶液を含みうる。
【００７１】
「医薬品」は、対象に投与すると治療効果をもたらす物質を意味する。
【００７２】
「活性医薬成分」は、目的とする効果をもたらす医薬組成物中の物質を意味する。
【００７３】
「標的核酸」、「標的RNA」、「標的RNA転写物」、および「核酸標的」は、すべてアンチセンス化合物が標的とすることができるあらゆる核酸を意味する。
【００７４】
「ターゲッティング(標的化)」は、標的核酸とハイブリダイズし、目的とする効果を誘導する核酸塩基配列の設計および選択過程を意味する。
【００７５】
「〜に標的化した」は標的核酸とハイブリダイズして目的とする効果を誘導することができる核酸塩基配列を有することを意味する。ある態様において、目的とする効果は標的核酸の減少である。
【００７６】
「モジュレーション(調節)」は機能または活性の摂動(動揺、perturbation)を意味する。ある態様において、モジュレーションは遺伝子発現の増加を意味する。ある態様において、モジュレーションは遺伝子発現の減少を意味する。
【００７７】
「発現」は、遺伝子がコードした情報が細胞中で存在し、作用する構造に変換されるあらゆる機能および工程を意味する。
【００７８】
「5'標的部位」は、特定のオリゴヌクレオチドの最も5'側の核酸塩基と相補的な核酸塩基の標的核酸を意味する。
【００７９】
「3'標的部位」は、特定のオリゴヌクレオチドの最も3'側の核酸塩基と相補的な核酸塩基の標的核酸を意味する。
【００８０】
「領域」は、核酸内の結合ヌクレオシドの部分を意味する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、標的核酸のある領域と相補的な核酸塩基配列を有する。例えば、あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、miRNAステムループ配列の領域と相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドはmiRNAステムループ配列の領域に対して100％である。
【００８１】
「断片」は、ある領域のより小さいかまたは下位の部分を意味する。
【００８２】
「核酸塩基配列」は、あらゆる糖、結合、および/または核酸塩基モジュレーションと無関係な5'から3'方向の連続核酸塩基の順序を意味する。
【００８３】
「隣接核酸塩基」は、核酸内で互いに隣り合った核酸塩基を意味する。
【００８４】
「核酸塩基相補性」は、水素結合を介して非共有結合的に対になる2つの核酸塩基の能力を意味する。
【００８５】
「相補性」は、第1核酸塩基配列が、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、またはそれ以上の核酸塩基のある領域にわたって第2核酸塩基配列の相補物と少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一、または100%同一であるか、または2つの配列がストリンジェントハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズすることを意味する。ある態様において、miRNAと100％相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドまたはその前駆体は、該修飾オリゴヌクレオチドの全長にわたりmiRNAまたはその前駆体と100％相補的ではないかもしれない。
【００８６】
「相補性」は、第1核酸と第2核酸の間の核酸塩基の対合能を意味する。
【００８７】
「完全長の相補性」は、第1核酸の各核酸塩基が第2核酸の対応する位置で各核酸塩基と対合することができることを意味する。例えば、ある態様において、各核酸塩基がmiRNA中の核酸塩基と相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドはmiRNAと完全長の相補性を有する。
【００８８】
「相補性パーセント」は、核酸中の相補的核酸塩基の数を核酸の長さで割ったものを意味する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの相補性パーセントは標的核酸と相補的な核酸塩基の数を該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基数で割ったものを意味する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの相補性パーセントはmiRNAと相補的な核酸塩基の数を該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基数で割ったものを意味する。
【００８９】
「結合領域パーセント」は、オリゴヌクレオチド領域と相補的な領域のパーセントを意味する。結合領域パーセントは、オリゴヌクレオチドと相補的な標的領域の核酸塩基の数を標的領域の長さで割ることにより計算する。ある態様において、結合領域パーセントは、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%である。
【００９０】
「同一性パーセント」は、第2核酸中の対応する位置の核酸塩基と同一な第1核酸中の核酸塩基数を第1核酸中の核酸塩基の総数で割ったものを意味する。
【００９１】
本明細書で用いている「実質的に同一」は、第1および第2核酸塩基配列が、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、またはそれ以上の核酸塩基の領域にわたり、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一、または100%同一であることを意味することがある。
【００９２】
「ハイブリダイズ」は、核酸塩基相補性を通して生じる相補的核酸のアニーリングを意味する。
【００９３】
「ミスマッチ」は、第2核酸の対応する位置の核酸塩基と対合することができない第1核酸の核酸塩基を意味する。
【００９４】
「非相補的核酸塩基」は、水素結合を介して対合することができない2つの核酸塩基を意味する。
【００９５】
「同一な」は同じ核酸塩基配列を有することを意味する。
【００９６】
「miRNA」または「miR」は、コーディングRNAとハイブリダイズし、その発現を調節する長さ18〜25核酸塩基の非コーディングRNAを意味する。ある態様において、miRNAは酵素Dicerによるプレ-miRNAの開裂産物である。miRNAの例は、miRBase(http://microrna.sanger.ac.uk/)として知られるmiRNAデータベースに記載されている。
【００９７】
「プレ-miRNA」または「プレ-miR」は、miRNAを含むエアピン構造を有する非コーディングRNAを意味する。ある態様において、プレ-miRNAはDroshaとして知られる二本鎖RNA特異的リボヌクレアーゼによるpri-miRの開裂産物である。
【００９８】
「ステムループ配列」は、成熟miRNA配列を含む、ヘアピン構造を有するRNAを意味する。プレ-miRNA配列およびステムループ配列は重複しうる。ステムループ配列の例は、miRBase(http://microrna.sanger.ac.uk/)として知られるmiRNAデータベースに記載されている。
【００９９】
「Pri-miRNA」または「pri-miR」は、二本鎖RNA特異的リボヌクレアーゼDroshaの基質であるヘアピン構造を有する非コーディングRNAを意味する。
【０１００】
「miRNA前駆体」は、ゲノムDNAに由来する、1またはそれ以上のmiRNA配列を含む非コーディング構造化RNAを含む転写物を意味する。例えば、ある態様において、miRNA前駆体はプレ-miRNAである。ある態様において、miRNA 前駆体はpri-miRNAである。
【０１０１】
「モノシストロン性転写物」は、ただ1つのmiRNA配列を含むmiRNA前駆体を意味する。
【０１０２】
「ポリシストロン性転写物」は、2またはそれ以上のmiRNA配列を含むmiRNA前駆体を意味する。
【０１０３】
「シード領域」は、成熟miRNA配列の5'末端から2〜6または2〜7番のヌクレオチドを意味する。
【０１０４】
「オリゴマー化合物」は、結合したモノマーサブユニットのポリマーを含む化合物を意味する。
【０１０５】
「オリゴヌクレオチド」は、それぞれ互いに独立して修飾または非修飾でありうる結合ヌクレオシドのポリマーを意味する。
【０１０６】
「天然のヌクレオシド間結合」は、ヌクレオシド間の3'から5'へのホスホジエステル結合を意味する。
【０１０７】
「天然の糖」は、DNA(2'-H)またはRNA(2'-OH)にみられる糖を意味する。
【０１０８】
「天然の核酸塩基」は、天然型に対して修飾されていない核酸塩基を意味する。
【０１０９】
「ヌクレオシド間結合」は、隣り合ったヌクレオシド間の共有結合を意味する。
【０１１０】
「結合ヌクレオシド」は、共有結合により結合したヌクレオシドを意味する。
【０１１１】
「核酸塩基」は、別の核酸塩基と非共有対合することができるヘテロサイクリック部分を意味する。
【０１１２】
「ヌクレオシド」は、糖と結合した核酸塩基を意味する。
【０１１３】
「ヌクレオチド」はヌクレオシドの糖部分と共有結合したリン酸基を有するヌクレオシドを意味する。
【０１１４】
「miRアンタゴニスト」は、miRNAまたはその前駆体と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを意味する。例えば、「miR-Xアンタゴニスト」は、miR-Xとの核酸塩基相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを意味する。ある態様において、アンタゴニストはmiR-21アンタゴニストである。
【０１１５】
「修飾オリゴヌクレオチド」は、天然末端、糖、核酸塩基、および/またはヌクレオシド間結合に対して1またはそれ以上の修飾を有するオリゴヌクレオチドを意味する。
【０１１６】
「一本鎖修飾オリゴヌクレオチド」は、相補鎖とハイブリダイズしていない修飾オリゴヌクレオチドを意味する。
【０１１７】
「修飾ヌクレオシド間結合」は、天然ヌクレオシド間結合からのあらゆる変化を意味する。
【０１１８】
「ホスホロチオエートヌクレオシド間結合」は、非架橋原子の一つが硫黄原子であるヌクレオシド間結合を意味する。
【０１１９】
「修飾糖」は、天然糖からの置換および/またはあらゆる変化を意味する。
【０１２０】
「修飾核酸塩基」は、天然核酸塩基からのあらゆる置換および/または変化を意味する。
【０１２１】
「5-メチルシトシン」は、5'位に結合したメチル基で修飾されたシトシンを意味する。
【０１２２】
「2'-O-メチル糖」または「2'-OMe糖」は、2'位にO-メチル修飾を含む糖を意味する。
【０１２３】
「2'-O-メトキシエチル糖」または「2'-MOE糖」は2'位にO-メトキシエチル修飾を含む糖を意味する。
【０１２４】
「2'-O-フルオロ糖」または「2'-F糖」は、2'位にフルオロ修飾を有する糖を意味する。
【０１２５】
「二環式糖部分」は、2つの非ゲミナル環原子の架橋により修飾された糖を意味する。
【０１２６】
「2'-O-メトキシエチルヌクレオシド」は、2'-O-メトキシエチル糖修飾を有する2'-修飾ヌクレオシドを意味する。
【０１２７】
「2'-フルオロヌクレオシド」は、2'-フルオロ糖修飾を有する2'-修飾ヌクレオシドを意味する。
【０１２８】
「2'-O-メチル」ヌクレオシドは、2'-O-メチル糖修飾を有する2'-修飾ヌクレオシドを意味する。
【０１２９】
「二環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分を有する2'-修飾ヌクレオシドを意味する。
【０１３０】
「モチーフ」は、オリゴヌクレオチド中の修飾および/または非修飾核酸塩基、糖、および/またはヌクレオシド間結合のパターンを意味する。
【０１３１】
「完全修飾オリゴヌクレオチド」は、各核酸塩基、各糖、および/または各ヌクレオシド間結合が修飾されていることを意味する。
【０１３２】
「均一修飾オリゴヌクレオチド」は、各核酸塩基、各糖、および/または各ヌクレオシド間結合が修飾オリゴヌクレオチド全体で同じ修飾を有することを意味する。
【０１３３】
「安定化修飾」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合により結合した2'-ヌクレオシドによりもたらされるものに比べてヌクレアーゼ存在下で修飾オリゴヌクレオチドに対する安定性の増加をもたらすヌクレオシドに対する修飾を意味する。例えば、ある態様において、安定化修飾は、安定化ヌクレオシド修飾である。ある態様において、安定化修飾はヌクレオシド間結合修飾である。
【０１３４】
「安定化ヌクレオシド」は、2'-デオキシヌクレオシドによりもたらされるものに比べてオリゴヌクレオチドに対するヌクレアーゼ安定性の増大をもたらすように修飾されたヌクレオシドを意味する。ある態様において、安定化ヌクレオシドは2'-修飾ヌクレオシドである。
【０１３５】
「安定化ヌクレオシド間結合」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合によりもたらされるものに比べてオリゴヌクレオチドに対するヌクレアーゼ安定性の増大をもたらすヌクレオシド間結合を意味する。ある態様において、安定化ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
(要約)
【０１３６】
本発明は、miR-21と相補的な修飾されたヌクレオチドがmiR-21を阻害するための医薬品であることをみいだした。ある態様において、該修飾オリゴヌクレオチドはmiR-21の上方調節を特徴とする疾患を有する対象に投与される。ある態様において、該疾患は癌である。ある態様において、該疾患は心不全である。ある態様において、該疾患は線維症である。線維症は、傷害または損傷に反応して器官または組織中に過剰の線維性結合組織が発現することによって生じる。無処置のまま放置すると線維症は心臓、肺、腎臓、肝臓、および皮膚、その他の組織に種々の病状を生じ得る。
【０１３７】
本発明は、線維芽細胞由来miR-21が線維症において重要な役割を果たすことをみいだした。miR-21レベルの増強は線維芽細胞の生存を促進したが、内因性miR-21の抑制はアポトーシスによる細胞死を誘導した。すなわち、本発明は、miR-21が線維芽細胞の生存を調節するメカニズムを確認した。異常な線維芽細胞の増殖と生存は線維症を生じうる。したがって、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、線維症を治療するための医薬品である。ある態様において、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、miR-21と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
【０１３８】
本発明者らは、心臓中の線維芽細胞由来miR-21およびSPRY1の重要な役割を明らかにする(図3h)。データは、ERK-MAPキナーゼ活性のストレス誘発性およびmiRNA介在性の活性化が心線維症の調節に重要かも知れないことを示唆する。この試験は、疾患モデルにおけるミクロRNAの治療的適用についての最初の例を示す。特異的に拮抗するmiR-21は、ネズミモデルにおける構造的および機能的崩壊を抑制した。この知見は、心不全に対する新しい治療への入り口を示唆し、ミクロRNAアンタゴニストの広い治療的可能性を示す。
【０１３９】
ある局面において、本発明は、線維症および/または線維症関連疾患を治療および/または予防するための医薬を製造するための、miR-21、miR-21に対するアンチセンスオリゴヌクレオチド、および/またはmiR-21の標的の使用に関する。
【０１４０】
本発明は、特に線維症関連心臓特異疾患(＝線維症関連疾患)、例えば、心肥大、高血圧性心疾患、拡張期および収縮期心不全、心臓関連蓄積症、例えば、M. Fabry、心筋症、例えば拡張型心筋症、閉塞を伴うか伴わない肥大型心筋症、拘束型心筋症、催不整脈性右室 心筋症、および他の形の心筋症、例えば糖尿病性心筋症、収縮性心内膜症、冠動脈疾患、心筋梗塞、急性および慢性右心不全、線維症による不整脈、心筋炎関連線維症、弁狭窄または機能不全(例えば硬化症)を生じる心臓弁疾患、例えば、僧帽弁狭窄および/または機能不全、大動脈弁狭窄および/または機能不全、三尖弁狭窄および/または機能不全、肺動脈弁狭窄および/または機能不全に関する。
【０１４１】
さらなる局面において、本発明は、心臓系と関連のない他の線維症関連疾患(＝線維症関連疾患)に関する。非限定的例は、肺線維症、慢性閉塞性肺疾患、肺高血圧、毒性環境や肝炎によるおよび/または右心不全に続発する肝線維症、皮膚線維症、例えば損傷後のケロイドの発現、血管関連疾患、例えば、年齢または高血圧に関連する動脈壁の硬化、中膜硬化症(mediasclerosis)、動脈硬化症、種々の器官の加齢関連線維症、腸硬化症(例えばクローン病における)、全身性硬化症、およびCREST症候群などの、腎線維症、腫瘍性線維症および/またはリウマチ性関節炎に関する。
【０１４２】
さらによく知られた線維症関連疾患および傷害には、例えば心内膜線維症および特発性心筋症、肝臓の線維症から生じうる肝硬変、特発性肺線維症、びまん性実質性肺疾患、縦隔線維症、骨髄線維症、精管切除後痛症候群、後腹膜線維症、および腎性全身性線維症がある。
【０１４３】
本発明のすべての局面、特に特許請求の範囲に記載の局面は、可能性のある例として示す上記疾患、障害、および病状を診断、治療、および/または予防するために用いることができよう。列挙したものに限定されるものではない。
【０１４４】
ある態様において、本発明は、miR-21を調節するための戦略に関する。別の態様において、本発明は、miR-21を調節、例えば過剰発現および/または上方調節するための戦略に関する。
【０１４５】
考えられるモジュレーションには、移植可能な用具、例えばウイルスベクターおよびリボソーム製剤など、遺伝子伝達系、スポンジ(sponge)などがある。
【０１４６】
Sprouty(SPRY1)は、本明細書においてmiR-21の標的であると確認されている。miR-21およびSPRY1は共に心臓線維芽細胞、その他の細胞種に発現する。心臓線維芽細胞におけるmiR-21発現の増加は、SPRYタンパク質発現の強い抑制を誘導し、さらにERK-MAPキナーゼ活性化を増加させた。好ましい態様において、該標的は、Sprouty1(SPRY1)、具体的には配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1、およびRtn4からなる群から選ばれる。
【０１４７】
ある局面において、本発明は、線維症および/または線維症関連疾患を診断、治療、および/または予防するための、配列番号2〜配列番号4、Sprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1、および/またはRtn4に対する(またはそれと相補的な)アンチセンスオリゴヌクレオチドに関する。ある局面において、Sprouty1(SPRY1)、具体的には配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1、および/またはRtn4からなる群から選ばれる標的と相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的部位と結合して選択した標的の発現を阻害し、ミクロRNA、例えばmiR-21の能力と干渉する。ある局面において、そのようなアンチセンスオリゴヌクレオチドは1またはそれ以上のヌクレオシド修飾を含む。
【０１４８】
ある局面において、本発明は、miR-21、配列番号2〜配列番号4、Sprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1および/またはRtn4が欠損した細胞に関する。
【０１４９】
ある局面において、本発明は、線維症および/または線維症関連疾患の動物モデルとしての、miR-21、配列番号2〜配列番号4、Sprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1、および/またはRtn4が欠損した非ヒト哺乳動物ノックアウト生物に関する。miR-21を過剰発現するトランスジェニック動物、具体的には非ヒト哺乳動物も含む。
【０１５０】
本発明は、線維芽細胞由来miR-21が心不全の一因となることをみいだした。特発性拡張型心筋症による末期心不全の対象から得た左心室心臓組織試料の分析は、miR-21発現の増加とSPRY1タンパク質発現の抑制を示した。さらに、ERK-MAPキナーゼは、phosphor(ホスホル)-ERK/ERK比の増加から明らかなようにこれら対象由来の試料において活性化した。本発明は、心不全動物モデルにおいて、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドの投与は心線維症の顕著な減弱をもたらすことをみいだした。心不全は、その他のパラメーターである心線維症を特徴とする。したがって、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドは心線維症を治療するための医薬品である。
【０１５１】
本発明は、心不全の動物モデルにおいて、心線維症の減弱は心重量増加の減少も伴うこともみいだした。さらに、心エコー検査による心機能の評価は、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドの投与は、左心室拡大を抑制し、短縮率のパラメーターを正常化したことを明らかにした。心不全は、その他のパラメーターである、心重量増加、左心室拡大、および収縮率の低下を特徴とすることがある。さらに、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、心線維症を伴う心不全の治療、改善、および予防のための治療薬である。
【０１５２】
ある局面において、本発明は、線維症および/または線維症関連疾患を診断、予防、および/または治療するためのカルシウム/cAMP応答配列タンパク質(CREB)および/または血清応答因子(SRF)結合部位の修飾を含むミクロRNA(miRNA)のプロモーター領域に関する。
【０１５３】
ある態様において、該プロモーター領域、mirR-21それ自体の遺伝子、および/または種々のメッセンジャーRNAの3'UTRは、多形性、突然変異、具体的には、点突然変異、欠失、トランケーション、および/または反転を含みうる。野生型配列に対するこれらすべての修正は、新規miR-21結合部位のde novo形成またはmiR-21結合部位の欠失をもたらす。別の態様において、該プロモーター領域の修飾は、点突然変異、トランケーション、欠失、および反転からなる群から選ばれる。さらに、該プロモーター領域は、配列番号2〜配列番号4からなる群から選ぶことができる。
診断的適用
【０１５４】
ある局面において、本発明は、線維症および/または線維症関連疾患を診断するためのmiR-21、miR-21に対するアンチセンスオリゴヌクレオチド、および/またはmiR-21の標的の使用に関する。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、別の配列と相補的なある配列、具体的には、miR-21と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドと理解すべきである。miR-21の標的は、miR-21の下流の標的を含むと理解されうる。例えばmiR-21と少なくとも相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドを介したmiR-21の阻害はSproutyなどのようなmiR-21の標的の抑制解除または過剰発現すらもたらすことに留意することが重要である。
【０１５５】
ある局面において、本発明は、以下の工程を含む線維症および/または線維症関連疾患の診断方法に関する：
(a)線維症および/または線維症関連疾患に罹患していると思われる患者の試料を得；
(b)miR-21、Sprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1および/またはRtn4の発現を測定する；
ここで、コントロール試料と比べてmiR-21レベルの上昇、および/またはSprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1および/またはRtn4のレベルの減少は、線維症および/または線維症関連疾患またはその素因を示す。
【０１５６】
ある局面において、本発明は、以下の工程を含む線維症および/または線維症関連疾患またはその素因を治療および/または予防するための医薬活性化合物のスクリーニング方法に関する：
(a)MiR-21、Sprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1および/またはRtn4を含む試料を得；
(b)候補物質と該試料を接触させ；
(c)該試料に対する候補物質の効果を測定する；
ここで、miR-21、Sprouty1(SPRY1)、具体的には、配列番号7または配列番号8、Tgfbi、Krit1、Pitx2、Fasl、Nfib、Lnx1および/またはRtn4の変化が医薬活性化合物を示す。
ある疾患および病状
【０１５７】
本発明は、線維症があるかまたはその疑いがある対象の治療方法を提供する。線維症があるかまたはその疑いがあると同定された対象の治療方法も提供する。ある態様において、そのような方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを対象に投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。
【０１５８】
さらに本発明は、線維症を発現するリスクがある対象の線維症の予防方法を提供する。ある態様において、そのような方法は、線維症が発現するリスクがある対象にmiRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。
【０１５９】
ある態様において、線維症は肝線維症である。ある態様において、線維症は肺線維症である。ある態様において、線維症は皮膚線維症である。ある態様において、線維症は心線維症である。ある態様において、線維症は腎線維症である。ある態様において、線維症は肺線維症である。ある態様において、線維症は加齢関連線維症である。ある態様において、線維症は脾線維症である。
【０１６０】
ある態様において、線維症があるかまたはその疑いがある対象は少なくとも1の心疾患または病状を有する。ある態様において、線維症があるかまたはその疑いがあると同定された対象は少なくとも1の心疾患または病状を有する。ある態様において、そのような方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを対象に投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。
【０１６１】
ある態様において、心疾患または病状は心肥大である。ある態様において、心疾患または病状は心筋症である。ある態様において、心筋症は、拡張型心筋症、閉塞を伴う肥大型心筋症、閉塞を伴わない肥大型心筋症、拘束型心筋症、催不整脈性右室 心筋症、または糖尿病性心筋症である。
【０１６２】
ある態様において、心疾患または病状は冠動脈疾患である。ある態様において、心疾患または病状は、心臓関連蓄積症、収縮性心内膜症、急性心筋梗塞、慢性心筋梗塞、心臓不整脈、または心筋炎関連線維症である。
【０１６３】
ある態様において、心疾患または病状は心不全である。ある態様において、心不全は、高血圧性心不全、拡張期心不全、収縮期心不全、または右心不全である。
【０１６４】
ある態様において、心疾患または病状は心臓弁膜症である。ある態様において、心臓弁膜症は、僧帽弁狭窄、大動脈弁狭窄、三尖弁狭窄、または肺動脈弁狭窄である。ある態様において、心臓弁膜症は、僧帽弁閉鎖不全、大動脈弁閉鎖不全、三尖弁閉鎖不全、または肺動脈弁閉鎖不全である。
【０１６５】
本発明は、線維症があるかまたはその疑いがある、肝疾患または病状を有する対象の治療方法を提供する。ある態様において、線維症があるかまたはその疑いがあると同定された対象は、少なくとも1の肝臓疾患または病状を有する。ある態様において、そのような方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを対象に投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。ある態様において、肝疾患または病状は慢性肝障害である。ある態様において、肝疾患または病状は肝炎ウイルス感染である。ある態様において、肝炎感染症はC型肝炎ウイルス感染症である。ある態様において、肝疾患または病状は非アルコール性脂肪性肝炎である。ある態様において、肝疾患または病状は肝硬変である。
【０１６６】
本発明は、線維症があるかまたはその疑いがある、少なくとも1の肺疾患または病状を有する対象の治療方法を提供する。また、本発明は、線維症があるかまたはその疑いがあると同定された、少なくとも1の肺疾患または病状を有する対象の治療方法も提供する。ある態様において、そのような方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを対象に投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。ある態様において、肺疾患または病状は慢性閉塞性肺疾患である。
【０１６７】
本発明は、線維症があるかまたはその疑いがある、少なくとも1の他の疾患または病状を有する対象の治療方法を提供する。本発明は、線維症があるかまたはその疑いがあると同定された、少なくとも1の他の疾患または病状を有する対象の治療方法も提供する。ある態様において、そのような方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを対象に投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。ある態様において、1の他の疾患または病状は肺高血圧である。ある態様において、1の他の疾患または病状は血管関連疾患である。あるそのような態様において、血管関連疾患は、動脈壁の硬化、中膜硬化症(mediasclerosis)、または動脈硬化症である。ある態様において、1の他の疾患または病状は腸硬化症である。ある態様において、別の他の疾患または病状は全身性硬化症である。ある態様において、1の他の疾患または病状は、後腹膜線維症、増殖性線維症、腫瘍性線維症、腎性全身性線維症、注射線維症、縦隔線維症、骨髄線維症、精管切除後痛症候群、またはリウマチ性関節炎である。
【０１６８】
本発明は、線維増殖性障害のある対象の治療方法を提供する。ある態様において、そのような方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを線維増殖性障害のある対象に投与することを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。
【０１６９】
さらに、本発明は、癌細胞のSPRY-1介在ERK情報伝達のモジュレーションによる特定の癌の標的化を含む癌のmiR-21に基づく治療に関する。miR-21は、一例を挙げると食道、結腸腺癌、乳癌、神経膠腫、膠芽細胞腫、卵巣癌、肝細胞癌、頭および首の癌、慢性リンパ球性白血病、膵臓癌を含む多くの種々の癌において過剰発現することが知られている。
【０１７０】
したがって、本発明は、上記癌の診断、予防、および/または治療にも関する。特許請求の範囲に記載のすべての特徴は、これら癌種の開示と組み合わされよう。
ある投与経路
【０１７１】
ある態様において、対象への投与は非経口投与を含む。ある態様において、対象への投与は静脈内投与を含む。ある態様において、対象への投与は皮下投与を含む。
【０１７２】
ある態様において、対象への投与は動脈内投与を含む。ある態様において、対象への投与は心臓内投与を含む。心臓内投与に適した手段には、カテーテルの使用、または開心術中の投与が含まれる。
【０１７３】
ある態様において、投与は肺投与を含む。ある態様において、肺投与は、吸入によりエアロゾル化したオリゴヌクレオチドを対象の肺に送達することを含む。エアロゾル化オリゴヌクレオチドを対象が吸入した後、オリゴヌクレオチドは、肺胞マクロファージ、好酸球、上皮、血管内皮、および細気管支上皮を含む正常および炎症肺組織の細胞に分配される。修飾オリゴヌクレオチドを含む医薬組成物の送達に適した装置には、限定されるものではないが標準的ネブライザー装置が含まれる。気道および肺の特定部分を標的とするネブライザー装置を用いる滴のサイズを調節するための方法および製剤は当業者によく知られている。さらなる適切な装置には乾燥粉末吸入器または定量吸入器が含まれる。
【０１７４】
ある態様において、医薬組成物は、全身暴露より局所暴露を達成するために投与される。例えば、肺投与は、全身暴露を最小限にして医薬組成物を肺に送達する。
【０１７５】
さらなる適切な投与経路には、例えば経口、直腸、経粘膜、腸、経腸、局所、坐剤(suppository)、髄腔内、静脈内、腹腔内、鼻内、眼内、筋肉内、髄内、および腫瘍内が含まれる。
臨床的結果
【０１７６】
ある態様において、本発明の方法は、線維症があるかまたはその疑いがある対象に臨床的に望ましい結果を提供する。
【０１７７】
ある態様において、臨床的に望ましい結果は心重量増加の改善である。あるそのような態様において、臨床的に望ましい結果は左心室拡大の改善である。ある態様において、a 臨床的に望ましい結果は短縮率障害の改善である。ある態様において、臨床的に望ましい結果は心重量増加の予防である。あるそのような態様において、臨床的に望ましい結果は左心室拡大の予防である。ある態様において、臨床的に望ましい結果は短縮率障害の予防である。
【０１７８】
ある態様において、臨床的に望ましい結果は心機能の改善である。
【０１７９】
ある態様において、臨床的に望ましい結果は線維症の改善である。ある態様において、臨床的に望ましい結果は、線維症のさらなる進行を減速させることである。ある態様において、臨床的に望ましい結果は線維症のさらなる進行を停止(halting)させることである。ある態様において、臨床的に望ましい結果は線維症の減少である。ある態様において、臨床的に望ましい結果はコラーゲン含有量の減少である。
【０１８０】
ある態様において、治療的に望ましい結果は肝機能の改善である。肝機能は、特に血中肝トランスアミナラーゼ濃度を測定する肝機能検査により評価することができる。ある態様において、肝機能が異常な対象は、血中肝トランスアミナーゼが上昇している。血中肝トランスアミナーゼには、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)が含まれる。ある態様において、肝機能が異常な対象は血中ビリルビンが上昇している。ある態様において、対象は、血中アルブミンレベルが異常である。ある態様において、本発明の方法は、ALT、AST、ビリルビンおよび/またはアルブミンの血中濃度を、これらの濃度の1またはそれ以上が正常範囲に近づくように変化させる。
【０１８１】
ある態様において、対象の肝機能は、3クラスの肝機能を定義するChild-Pugh分類システムにより評価される。この分類システムにおいて、ビリルビン濃度、アルブミン濃度、プロトロンビン時間、腹水、および脳症の5つのカテゴリーの1つの測定値にポイントが割り当てられる。存在する以下の特徴のぞれぞれにつき1ポイントが割り当てられる：血中ビリルビン2.0 mg/dl以下；血中アルブミン3.5 mg/dl以上；プロトロンビン時間1.7国際標準化比(INR)以下；腹水なし、または脳症なし。存在する以下の特徴のそれぞれにつき2ポイントが割り当てられる：血中ビリルビン2〜3 mg/dl；血中ビリルビン3.5〜2.8 mg/dl；プロトロンビン時間1.7〜2.3INR；腹水が軽度〜中等度；または脳症が軽度。存在する以下の特徴のそれぞれにつき3ポイントが割り当てられる：血中ビリルビン3 mg/dl以上；血中アルブミン2.8 mg/dl以下；プロトロンビン時間2.3INR以上；腹水が重度〜難治性；または脳症が重度。スコアを加算して、5〜6ポイントのスコアをクラスAに割り当て、7〜9ポイントのスコアをクラスBに割り当て、10〜15ポイントのスコアをクラスCに割り当てる。ある態様において、本発明の方法は、Child-Pugh分類システムで測定される肝機能の改善をもたらす。
細胞表現形
【０１８２】
本発明は、線維芽細胞の細胞増殖の阻害方法を提供する。本発明は、線維芽細胞のアポトーシスを促進する方法も提供する。さらに、本発明は、線維芽細胞のSprouty 1タンパク質を増加させる方法を提供する。ある態様において、そのような方法は、修飾オリゴヌクレオチドを含み、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する化合物と線維芽細胞を接触させることを含む。ある態様において、miRNAはmiR-21である。
【０１８３】
ある態様において、線維芽細胞がin vitroである。ある態様において、線維芽細胞はin vivoである。ある態様において、該接触はin vitroで生じる。ある態様において、該接触はin vivoで生じる。ある態様において、該接触はex vivoで生じる。
さらなる治療法
【０１８４】
線維症の治療は、2以上の治療法を含みうる。ある態様において、本発明は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドの投与に加えて少なくとも1の治療法を施すことを含む、線維症があるかまたはその疑いがある対象の治療方法を提供する。 
【０１８５】
ある態様において、本発明の方法は、1またはそれ以上のさらなる医薬品を投与することを含む。ある態様において、さらなる医薬品には、限定されるものではないが、利尿剤(例えば、スプリオノラクトン、エプレレノン、フロセミド)、変力物質(例えばドブタミン、ミルリノン)、ジゴキシン、血管拡張剤、アンギオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤(例えば、カプトプリル、エナラプリル、リシノプリル、ベナゼリル、キナプリル、フォシノプリル、およびラミプリル)、アンギオテンシンIIレセプター遮断薬(ARB)(例えば、カンデサルタン、イルベサルタン、オルメサルタン、ロサルタン、バルサルタン、テルミサルタン、エプロサルタン)、カルシウムチャンネル遮断薬、イソソルビドジニトレート、ヒドララジン、ニトレート(例えば、イソソルビドモノニトレート、イソソルビドジニトレート)、ヒドララジン、ベータ遮断薬(例えば、カルベジロール、メトプロロール)、およびナトリウム利尿ペプチド(例えば、ネシリチド)が含まれる。
【０１８６】
ある態様において、さらなる治療法は、以下のものを含む身体の免疫系を増強する医薬品でありうる：低用量シクロホスファミド、チモシチムリン、ビタミン、および栄養剤(例えばビタミンA、C、E、ベータカロチン、亜鉛、セレニウム、グルタチオン、コエンザイムQ-10、およびエチナセアを含む抗酸化剤)、およびワクチン、例えば、抗原の多量体的提示とアジュバントを組み合わせたワクチン製剤を含む疫刺激複合体(ISCOM)。
【０１８７】
あるそのような態様において、さらなる治療法は、本発明の1またはそれ以上の医薬組成物の副作用を治療または改善するために選ばれる。そのような副作用には、限定されるものではないが、注射部位の反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経系異常、およびミオパシーが含まれる。例えば、血清中のアミノトランスフェラーゼ濃度の増加は、肝毒性または肝機能異常を示すことがある。例えば、ビリルビンの増加は、肝毒性または肝機能異常を示すことがある。
【０１８８】
ある態様において、本発明の1またはそれ以上の医薬組成物および1またはそれ以上の他の医薬品は同時に投与される。ある態様において、本発明の1またはそれ以上の医薬組成物および1またはそれ以上の他の医薬品は異なる時に投与される。ある態様において、本発明の1またはそれ以上の医薬組成物および1またはそれ以上の他の医薬品は単一製剤で一緒に投与される。ある態様において、本発明の1またはそれ以上の医薬組成物および1またはそれ以上の他の医薬品は別個に製造される。
医薬組成物
【０１８９】
ある態様において、本明細書に記載のmiRNAまたはその前駆体と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は線維症を治療するための医薬組成物として製造される。ある態様において、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、線維症を予防するための医薬組成物として製造される。
【０１９０】
ある態様において、本発明の医薬組成物は投与単位の形(例えば、錠剤、カプセル剤、ボーラス剤など)で投与される。ある態様において、そのような医薬組成物は、以下から選ばれる用量の修飾オリゴヌクレオチドを含む：25mg、30mg、35mg、40mg、45mg、50mg、55mg、60mg、65mg、70mg、75mg、80mg、85mg、90mg、95mg、100mg、105mg、110mg、115mg、120mg、125mg、130mg、135mg、140mg、145mg、150mg、155mg、160mg、165mg、170mg、175mg、180mg、185mg、190mg、195mg、200mg、205mg、210mg、215mg、220mg、225mg、230mg、235mg、240mg、245mg、250mg、255mg、260mg、265mg、270mg、270mg、280mg、285mg、290mg、295mg、300mg、305mg、310mg、315mg、320mg、325mg、330mg、335mg、340mg、345mg、350mg、355mg、360mg、365mg、370mg、375mg、380mg、385mg、390mg、395mg、400mg、405mg、410mg、415mg、420mg、425mg、430mg、435mg、440mg、445mg、450mg、455mg、460mg、465mg、470mg、475mg、480mg、485mg、490mg、495mg、500mg、505mg、510mg、515mg、520mg、525mg、530mg、535mg、540mg、545mg、550mg、555mg、560mg、565mg、570mg、575mg、580mg、585mg、590mg、595mg、600mg、605mg、610mg、615mg、620mg、625mg、630mg、635mg、640mg、645mg、650mg、655mg、660mg、665mg、670mg、675mg、680mg、685mg、690mg、695mg、700mg、705mg、710mg、715mg、720mg、725mg、730mg、735mg、740mg、745mg、750mg、755mg、760mg、765mg、770mg、775mg、780mg、785mg、790mg、795mg、および800mg。あるそのような態様において、本発明の医薬組成物は、以下から選ばれる用量の修飾オリゴヌクレオチドを含む：25mg、50mg、75mg、100mg、150mg、200mg、250mg、300mg、350mg、400mg、500mg、600mg、700mg、および800mg。
【０１９１】
ある態様において、医薬品は、適切な希釈剤、例えば注射用無菌水または注射用無菌生理食塩水で再構成される無菌凍結乾燥された修飾オリゴヌクレチドである。再構成された生成物は皮下注射としてまたは生理食塩水で希釈した後に静脈内注入として投与される。凍結乾燥製剤は、注射用水または注射用生理食塩水中で調製され、調製中に酸または塩基でpH7.0〜9.0に調整され、次いで凍結乾燥された修飾オリゴヌクレオチドからなる。凍結乾燥修飾オリゴヌクレオチドは25〜800 mgの修飾オリゴヌクレオチドでありうる。これは、25、50、75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375、425、450、475、500、525、550、575、600、625、650、675、700、725、750、775、および800 mgの修飾凍結乾燥オリゴヌクレオチドを含むと理解される。凍結乾燥製剤は、2mLのType I透明ガラスバイアル(硫酸アンモニウム処理)に包装され、ブロモブチルゴム栓でとめ、アルミニウムFLIP-OFF(登録商標)オーバーシールで封入することができる。
【０１９２】
ある態様において、本発明の組成物は、さらに医薬組成物中に通常みられる他のアジュバント成分を確立された使用濃度で含むことができる。すなわち、例えば、該組成物はさらなる適合性の医薬活性物質、例えば、かゆみ止め薬、収斂剤、局所麻酔薬、または抗炎症剤などを含むか、または本発明組成物を種々の剤形に物理的に製剤化するのに有用なさらなる物質、例えば、染料、香味料、保存料、抗酸化剤、乳白剤、増粘剤、および安定化剤を含むことができる。しかしながら、そのような物質を加えるときは本発明組成物の成分の生物活性と過度に干渉すべきではない。該製剤は、滅菌することができ、所望により、該製剤のオリゴヌクレオチドと有害な相互作用をしない助剤、例えば、潤滑剤、保存料、安定化剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧に影響を与える塩、緩衝剤、着色料、香味料、および/または芳香物質などと混合することができる。
【０１９３】
ある態様において、本発明の医薬組成物は、1またはそれ以上の修飾オリゴヌクレオチドおよび1またはそれ以上の賦形剤を含む。あるそのような態様において、賦形剤は、水、塩溶液、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、およびポリビニルピロリドンから選ばれる。
【０１９４】
ある態様において、本発明の医薬組成物は、限定されるものではないが、混合、溶解、顆粒化、ドラジー化、ゲル化、乳化、カプセル化、封入、または錠剤化工程を含む既知の技術を用いて製造される。
【０１９５】
ある態様において、本発明の医薬組成物は液体(例えば、サスペンジョン、エリキシル、および/または溶液)である。あるそのような態様において、液体医薬組成物は、限定されるものではないが、水、グリコール、油、アルコール、香味料、保存料、および着色料を含む当該分野で知られた成分を用いて製造される。
【０１９６】
ある態様において、本発明の医薬組成物は固体(例えば、粉末、錠剤、および/またはカプセル)である。あるそのような態様において、1またはそれ以上のオリゴヌクレオチドを含む固体医薬組成物は、限定されるものではないが、デンプン、糖、希釈剤、顆粒化剤、潤滑剤、結合剤、および崩壊剤を含む当該分野で知られた成分を用いて製造される。
【０１９７】
ある態様において、本発明の医薬組成物は、デポー製剤として製剤化される。あるそのようなデポー製剤は、典型的には非デポー製剤より長く作用する。ある態様において、そのような製剤は、埋め込み(例えば皮下または筋肉内に)または筋肉内注射により投与される。ある態様において、デポー製剤は、適切なポリマーまたは疎水性物質(例えば許容される油中のエマルジョン)またはイオン交換樹脂を用いるか、または難溶性誘導体、例えば難溶性の塩として製造される。
【０１９８】
ある態様において、本発明の医薬組成物は送達系を含む。送達系の例には、例えばリポソームおよびエマルジョンが含まれる。ある送達系は疎水性化合物を含む医薬組成物を含むある医薬組成物を製造するのに有用である。ある態様において、ジメチルスルホキシドのようなある有機溶媒も用いられる。
【０１９９】
ある態様において、本発明の医薬組成物は、本発明の1またはそれ以上の医薬品を特定の組織または細胞種に送達するように設計された1またはそれ以上の組織特異的送達分子を含む。例えば、ある態様において、医薬組成物は組織特異抗体でコートされたリポソームを含む。
【０２００】
ある態様において、本発明の医薬組成物は共溶媒系を含む。あるそのような共溶媒系には、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー、および水性相が含まれる。ある態様において、そのような共溶媒系は疎水性化合物に用いられる。そのような共溶媒系の非限定的例には、3% w/vベンジルアルコール、8% w/v非極性界面活性剤 Polysorbate 80(登録商標)、および65% w/vポリエチレングリコール300を含む無水エタノールの溶液であるVPD共溶媒系がある。そのような共溶媒系の割合は、その溶解性および毒性特性を大きく変化させることなくかなり変えることができる。さらに、共溶媒成分の独自性は変化しうる。例えば、他の界面活性剤をPolysorbate 80(登録商標)の代わりに用いることができ、ポリエチレングリコールの分画サイズを変化させることができ、他の生体適合性ポリマーでポリエチレングリコール、例えばポリビニルピロリドンを置換することができ、また、デキストロースを他の糖または多糖に置換することができる。
【０２０１】
ある態様において、本発明の医薬組成物は持続放出系を含む。そのような持続放出系の非限定的例には、固体疎水ポリマーの半透過性マトリックスがある。ある態様において、持続放出系は、その化学的性質に応じて数時間、数日間、数週間、または数ヶ月間にわたり医薬品を放出する。
【０２０２】
ある態様において、本発明の医薬組成物は経口投与用に製造される。あるそのような態様において、医薬組成物は、修飾オリゴヌクレオチドを1またはそれ以上の医薬的に許容される担体を含む1またはそれ以上の化合物と混合することにより製剤化される。あるそのような担体は、医薬組成物を対象に経口投与するために錠剤、丸剤、ドラジー剤、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、サスペンジョン剤などとして製剤化するのを可能にする。ある態様において、経口用医薬組成物は、オリゴヌクレオチドと1またはそれ以上の固体賦形剤を混合することにより得られる。適切な賦形剤には、限定されるものではないが、増量剤、例えば、ラクトース、ショ糖、マンニトール、またはソルビトールを含む糖；セルロース調製物、例えば、トウモロコシデンプン、小麦デンプン、米デンプン、ジャガイモデンプン、ゼラチン、トラガカントゴム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ナトリウムカルボキシメチルセルロース、および/またはポリビニルピロリドン(PVP)などが含まれる。ある態様において、そのような混合物は粉末にされることがあり、助剤が加えられることがある。ある態様において、粉末組成物は、錠剤またはドラジー剤のコアが得られるように形成される。ある態様において、崩壊剤(例えば、架橋ポリビニルピロリドン、寒天、またはアルギン酸またはその塩、例えばアルギン酸ナトリウム)を加える。
【０２０３】
ある態様において、ドラジー剤のコアはコーティングして提供される。あるそのような態様において、濃縮糖溶液を用いることができ、該濃縮糖溶液はアラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポールゲル、ポリエチレングリコール、および/または二酸化チタン、ラッカー溶液、および適切な有機溶媒または溶媒混合物を含むことがありうる。染料または色素を錠剤またはドラジーコーティングに加えることができる。
【０２０４】
ある態様において、経口投与用の医薬組成物は、ゼラチンでできた押し込み式カプセルである。あるそのような押し込み式カプセルは、1またはそれ以上の本発明医薬品を、1またはそれ以上の増量剤、例えば、ラクトース、結合剤、例えばデンプン、および/または潤滑剤、例えばタルクまたはステアリン酸マグネシウム、および所望により安定化剤と共に含む。ある態様において、経口投与用医薬組成物は、ゼラチンおよび可塑剤、例えばグリセロールまたはソルビトール、でできた軟密封カプセル剤である。本発明の1またはそれ以上の医薬品は、適切な液体、例えば脂肪油、液体パラフィン、または液体ポリエチレングリコールに溶解または懸濁される。さらに、安定化剤を加えることができる。
【０２０５】
ある態様において、医薬組成物はバッカル投与用に製造される。あるそのような医薬組成物は、常套的に製剤化された錠剤またはローゼンジー剤である。
【０２０６】
ある態様において、医薬組成物は、注射(例えば、静脈内、皮下、筋肉内など)投与用に製造される。あるそのような態様において、医薬組成物は担体を含み、水性溶液、例えば水または生理学的に適合性の緩衝液、例えばハンクス溶液、リンゲル溶液、または生理食塩水緩衝液を用いて製剤化される。ある態様において、他の成分(例えば溶解性を助けるかまたは保存料として働く成分)を含む。ある態様において、注射可能サスペンジョン剤は、適切な液体担体、懸濁化剤などを用いて製造される。ある注射用医薬組成物は、単位剤形で、例えばアンプルまたは多用量容器中に存在する。ある注射用医薬組成物は、油状または水性ビークル中のサスペンジョン、溶液、またはエマルジョンであり、製剤化剤、例えば懸濁化剤、安定化剤、および/または分散剤を含みうる。注射用医薬組成物に用いるのに適した溶媒には、限定されるものではないが、脂溶性溶媒および脂肪油、例えばゴマ油、合成脂肪酸エステル、例えばエチルオレエートまたはトリグリセリド、およびリポソームが含まれる。水性注射用サスペンジョン剤は、該サスペンジョンの粘性を増加させる物質、例えばナトリウムカルボキシメチルセルロース、ソルビトール、またはデキストランを含みうる。所望により、そのようなサスペンジョン剤は、適切な安定化剤、または医薬品の溶解性を増加させて高濃縮溶液の製造を可能にする物質も含みうる。
【０２０７】
ある態様において、医薬組成物は経粘膜投与用に製造される。あるそのような態様において、透過すべき障壁に適した浸透剤を該製剤に用いる。そのような浸透剤は一般的に当該分野で知られている。
【０２０８】
ある態様において、医薬組成物は吸入投与用に製造される。あるそのような吸入用医薬組成物は、加圧パックまたはネブライザー中のエアロゾルスプレーの形で製造される。あるそのような医薬組成物は、プロペラント、例えばジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素、または他の適切なガスを含む。加圧エアロゾルを用いるある態様において、投与単位は定量を供給する弁により決定することができる。ある態様において、吸入剤または吸入器に用いるカプセルまたはカートリッジを製剤化することができる。あるそのような製剤には、本発明の医薬品と適切な粉末基剤、例えばラクトースまたはデンプンの粉末混合物が含まれる。
【０２０９】
ある態様において、医薬組成物は肛門投与用に製造される(例えば坐剤または停留浣腸)。あるそのような医薬組成物は、既知成分、例えばココアバターおよび/または他のグリセリドを含む。
【０２１０】
ある態様において、医薬組成物は局所投与用に製造される。あるそのような医薬組成物は無刺激性保湿基剤を含む(例えば軟膏またはクリーム)。典型的な適切な軟膏基剤には、限定されるものではないが、ワセリン、ワセリン＋揮発性シリコン、およびラノリンおよび油中水エマルジョンが含まれる。典型的な適切なクリーム基剤には、限定されるものではないが、コールドクリームおよび親水性軟膏が含まれる。
【０２１１】
ある態様において、本発明の医薬組成物は、治療的有効量の修飾オリゴヌクレオチドを含む。ある態様において、該治療的有効量は、疾患の症状を予防、軽減、または改善するか、または処置する対象の生存を延長するのに十分である。治療的有効量の決定は十分に当業者の能力範囲内である。
【０２１２】
ある態様において、1またはそれ以上の本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、プロドラッグとして製剤化される。ある態様において、in vivo投与するとプロドラッグは、修飾オリゴヌクレオチドの生物学的、医薬的、または治療的により活性な形に化学的に変換される。ある態様において、プロドラッグは、対応する活性型より投与しやすいので有用である。例えば、場合によっては、プロドラッグは対応する活性型より生体利用能が高いことがある(例えば経口投与による)。場合によっては、プロドラッグは対応する活性型にくらべて溶解性が改善していることがある。ある態様において、プロドラッグは対応する活性型より水溶性が低い。場合により、そのようなプロドラッグは、水溶性が流動性に有害である細胞膜に対する優れた透過性を有する。ある態様において、プロドラッグはエステルである。あるそのような態様において、該エステルは、投与すると代謝的に加水分解されてカルボン酸になる。場合により、該カルボン酸を含む化合物は対応する活性型である。ある態様において、プロドラッグは酸基と結合した短ペプチド(ポリアミノ酸)を含む。あるそのような態様において、該ペプチドは投与すると開裂し、対応する活性型を形成する。
【０２１３】
ある態様において、プロドラッグは、in vivo投与すると再生されるように医薬活性化合物を修飾することにより製造される。該プロドラッグは、薬剤の代謝安定性または輸送特性が変化するか、副作用や毒性をマスクするか、薬剤の風味を改善するか、または薬剤の他の特性または性質が変化するように設計することができる。in vivoの薬力学的プロセスおよび薬物代謝の知識により、当業者は医薬活性化合物がわかれば該化合物のプロドラッグを設計することができる(例えばNogrady(1985)Medicinal Chemistry A Biochemical Approach、OxfoRd University Pres、New York、pages 388-392参照)。
化合物
【０２１４】
ある態様において、本発明が提供する方法は、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物の投与を含む。ある態様において、該化合物は修飾オリゴヌクレオチドからなる。
【０２１５】
あるそのような態様において、化合物には相補鎖とハイブリダイズした修飾オリゴヌクレオチドが含まれる。すなわち化合物には二本鎖オリゴマー化合物が含まれる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの相補鎖とのハイブリダイゼーションは、少なくとも1の平滑末端を形成する。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの相補鎖とのハイブリダイゼーションは、二本鎖オリゴマー化合物の各末端に平滑末端を形成する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの末端は、相補鎖の結合ヌクレオシドの数に比べて1またはそれ以上のさらなる結合ヌクレオシドを含む。ある態様において、該1またはそれ以上のさらなるヌクレオシドは、修飾オリゴヌクレオチドの5'末端にある。ある態様において、該1またはそれ以上のさらなるヌクレオシドは、修飾オリゴヌクレオチドの3'末端にある。ある態様において、1またはそれ以上のさらなるヌクレオシドのヌクレオシドの少なくとも1の核酸塩基は、標的RNAと相補的である。ある態様において、各1またはそれ以上のさらなるヌクレオシドの各核酸塩基は標的RNAと相補的である。ある態様において、相補鎖の末端は、修飾オリゴヌクレオチドの結合ヌクレオシドの数に対して1またはそれ以上のさらなる結合ヌクレオシドを含む。ある態様において、1またはそれ以上のさらなる結合ヌクレオシドは、相補鎖の3'末端にある。ある態様において、1またはそれ以上のさらなる結合ヌクレオシドは相補鎖の5'末端にある。ある態様において、2つのさらなる結合ヌクレオシドが末端に結合している。ある態様において、1つのさらなるヌクレオシドが末端に結合している。
【０２１６】
ある態様において、化合物は、得られるアンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞への分散、または細胞への取り込みを増強する1またはそれ以上の部分と結合した修飾オリゴヌクレオチドを含む。あるそのような態様において、該部分はコレステロール部分または脂質部分である。結合のためのさらなる部分には、炭水化物、リン脂質、ビオチン、フェナジン、ホーレート、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、および染料が含まれる。ある態様において、結合基は、修飾オリゴヌクレオチドと直接結合している。ある態様において、結合基は、アミノ、ヒドロキシル、カルボン酸、チオール、不飽和(例えば、二重または三重結合)、8-アミノ-3,6-ジオキサオクタン酸(ADO)、スクシニミジル 4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(SMCC)、6-アミノヘキサン酸(AHEXまたはAHA)、置換C1-C10アルキル、置換または非置換C2-C10 アルケニル、および置換または非置換C2-C10アルキニルから選ばれる連結部分により修飾オリゴヌクレオチドと結合している。あるそのような態様において、置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルから選ばれる。
【０２１７】
あるそのような態様において、該化合物は、例えばヌクレアーゼ安定性のような特性を増強するように修飾オリゴヌクレオチドの1または両末端と結合している1またはそれ以上の安定化基を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。安定化基にはキャップ構造が含まれる。これらの末端修飾は、修飾オリゴヌクレオチドをエクソヌクレアーゼによる分解から保護し、細胞内の送達および/または局在を助けることができる。該キャップは5'末端(5'キャップ)または3'末端(3'キャップ)、または両末端に存在することができる。キャップ構造には、例えば、反転デオキシ脱塩基キャップが含まれる。
【０２１８】
適切なキャップ構造には、4',5'-メチレンヌクレオチド、1-(ベータ-D-エリスロフラノシル)ヌクレオチド、4'-チオヌクレオチド、炭素環式ヌクレオチド、1,5-アンヒドロヘキシトールヌクレオチド、L-ヌクレオチド、アルファ-ヌクレオチド、修飾塩基ヌクレオチド、ホスホロジチオエート結合、トレオペントラノシルヌクレオチド、非環式3',4'-セコヌクレオチド、非環式3,4-ジヒドキシブチルヌクレオチド、非環式3,5-ジヒドロキシペンチルヌクレオチド、3'-3'-反転ヌクレオチド部分、3'-3'-反転脱塩基部分、3'-2'-反転ヌクレオチド部分、3'-2'-反転脱塩基部分、1,4-ブタンジオールホスフェート、3'-ホスホラミデート、ヘキシルホスフェート、アミノヘキシルホスフェート、3'-ホスフェート、3'-ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、架橋メチルホスホネート部分、および非架橋メチルホスホネート部分  5'-アミノ-アルキルホスフェート、1,3-ジアミノ-2-プロピルホスフェート、3-アミノプロピルホスフェート、6-アミノヘキシルホスフェート、1,2-アミノドデシルホスフェート、ヒドロキシプロピルホスフェート、5'-5'-反転ヌクレオチド部分、5'-5'-反転脱塩基部分、5'-ホスホラミデート、5'-ホスホロチオエート、5'-アミノ、架橋および/または非架橋5'-ホスホラミデート、ホスホロチオエート、および5'-メルカプト部分が含まれる。
核酸塩基配列
【０２１９】
本発明は線維症の治療または予防方法を提供する。ある態様において、該方法は、修飾オリゴヌクレオチドを含む医薬組成物を投与することを含む。ある態様において、該方法は修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、miRNAまたはその前駆体と相補的な配列を有する。ある態様において、miRNAはmiR-21である。
【０２２０】
本明細書に記載の成熟miRNAの核酸塩基配列およびその対応するステムループ配列は、miRNA配列のオンラインで検索できるデータベースおよび注釈(http://microrna.sanger.ac.uk/参照)に記載の配列である。miRBase配列データベースに入ると、miRNA転写物の推定ヘアピン部分(ステムループ)と成熟miRNA配列の位置と配列に関する情報がわかる。該データベース中のmiRNAステムループ配列は厳密には前駆体miRNA(プレ-miRNA)ではなく、場合により、プレ-miRNAと推定一次転写物由来のある隣接配列を含むかもしれない。本明細書に記載のmiRNA 核酸塩基配列は、miRBase配列データベースのリリース10.0に記載の配列、およびmiRBase配列データベースのあらゆるより初期のリリースに記載の配列を含むmiRNAのあらゆるバージョンを含む。配列データベースのリリースは、あるmiRNA名の変更をもたらすかもしれない。配列データベースのリリースは、成熟miRNA配列の変化をもたらすかもしれない。本発明の化合物は、本明細書に記載のmiRNAのあらゆる核酸塩基配列バージョンと相補的な修飾オリゴヌクレオチドを含む。
【０２２１】
本明細書に記載のあらゆる核酸塩基配列は、糖部分、ヌクレオシド間結合、または核酸塩基に対するあらゆる修飾から独立していると理解される。さらに、Uを含む核酸塩基配列は、「U」を有する1またはそれ以上の位置で「U」が「T」で置換している同じ核酸塩基配列も含むと理解される。反対に、Tを含む核酸塩基配列は、「T」を有する1またはそれ以上の位置で「T」が「U」で置換している同じ核酸塩基配列も含むと理解される。
【０２２２】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、またはそれ以上の核酸塩基の領域にわたってmiRNAまたはその前駆体の相補物と少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一であるか、または該2つの配列がストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズすることを意味する。したがって、ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、その標的miRNAまたは標的miRNA前駆体配列に関して1またはそれ以上のミスマッチ塩基対を有することがあり、その標的配列とハイブリダイズすることができる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、miRNAまたはその前駆体と100％相補的である核酸塩基配列を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiRNAと完全長の相補性を有する。
【０２２３】
ある態様において、miR-21は、核酸塩基配列 5'-UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA-3'(配列番号1)を有する。ある態様において、miR-21ステムループ配列は核酸塩基配列 5'-UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA-3'(配列番号11)を有する。
【０２２４】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号1記載のmiR-21の核酸塩基配列と相補的な配列を有する。
【０２２５】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号11記載のmiR-21ステムループ配列の核酸塩基配列と相補的な配列を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号11の核酸塩基8〜29の領域と相補的な核酸塩基配列を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号11の核酸塩基46〜66の領域と相補的な配列を有する。
【０２２６】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは核酸塩基配列 5'-UCAACAUCAGUCUGAUAAGCUA-3'(配列番号12)を含む核酸塩基配列を有する。
【０２２７】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号12に記載の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
【０２２８】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、miR-21を含むpri-miR配列の核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列を有する。
【０２２９】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号1記載の核酸塩基配列と少なくとも80％の同一性を有する核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号1記載の核酸塩基配列と少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも94%、少なくとも96%、または少なくとも98%の同一性を有する核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列を有する。
【０２３０】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号11記載のmiR-21 ステムループ配列の核酸塩基配列と少なくとも80％の同一性を有する核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号11記載のmiR-21 ステムループ配列の核酸塩基配列と少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも94%、少なくとも96%、または少なくとも98%の同一性を有する核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列を有する。
【０２３１】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、本明細書に記載のmiRNAの核酸塩基配列またはその前駆体と完全長の相補性を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、成熟miRNAまたはその前駆体の核酸塩基配列に対して1つのミスマッチを有する核酸塩基配列を有する。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、該miRNAまたはその前駆体の核酸塩基配列に対して2つのミスマッチを有する核酸塩基配列を有する。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、成熟miRNAまたはその前駆体の核酸塩基配列に対してわずか2つのミスマッチを有する核酸塩基配列を有する。あるそのような態様において、ミスマッチ核酸塩基は隣接している。あるそのような態様において、該ミスマッチ核酸塩基は隣接していない。
【０２３２】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、相補的な成熟miRNAの長さと等しい多くの結合ヌクレオシドからなる。
【０２３３】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの結合ヌクレオシドの数は、相補的な成熟miRNAの長さより短い。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの結合ヌクレオシドの数は、相補的な成熟miRNAの長さより1つ短い。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、5'末端が1ヌクレオシド短い。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、3'末端が1ヌクレオシド短い。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、5'末端が2ヌクレオシド短い。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、3'末端が2ヌクレオシド短い。修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基がmiRNAの対応する位置の各核酸塩基と相補的なmiRNAの長さより短い多くの結合ヌクレオシドを有する修飾オリゴヌクレオチドは、miRNA配列配列の部分と100％相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドであると考えられる。
【０２３４】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの結合ヌクレオシドの数は、相補的なmiRNAの長さより長い。あるそのような態様において、さらなるヌクレオシドの核酸塩基は、miRNA ステムループ配列の核酸塩基と相補的である。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの結合ヌクレオシドの数は、それと相補的なmiRNAの長さより1個長い。あるそのような態様において、さらなるヌクレオシドは修飾オリゴヌクレオチドの5'末端にある。あるそのような態様において、さらなるヌクレオシドは修飾オリゴヌクレオチドの3'末端にある。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの結合ヌクレオシドの数は、それと相補的なmiRNAの長さより2個長い。あるそのような態様において、該2個のさらなるヌクレオシドは、修飾オリゴヌクレオチドの5'末端にある。あるそのような態様において、該2個のさらなるヌクレオシドは、修飾オリゴヌクレオチドの3'末端にある。1個のさらなるヌクレオシドは修飾オリゴヌクレオチドの5'末端にあり、1個のさらなるヌクレオシドは修飾オリゴヌクレオチドの3'末端にある。
【０２３５】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列の部分は、miRNAの核酸塩基配列と100％相補的であるが、該修飾オリゴヌクレオチドはその完全長にわたり100％相補的ではない。ある態様において、100％相補的な部分を有する修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの数は、miRNAの長さより長い。例えば、ヌクレオシド1〜23の核酸塩基が長さ23核酸塩基のmiRNAの対応する位置とそれぞれ相補的である24結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドは、miRNAの核酸塩基配列と100％相補的相補的な23ヌクレオシド部分を有し、miRNAの核酸塩基配列と全体として約96％の相補性を有する。
【０２３６】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miRNAの核酸塩基配列の部分と100％相補的である。例えば、ヌクレオシド1〜22の核酸塩基が長さ23核酸塩基のmiRNAの対応する部分とそれぞれ相補的な22結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドは、miRNAの核酸塩基配列の22核酸塩基部分と100％相補的％相補的である。そのような修飾オリゴヌクレオチドは、完全なmiRNAの核酸塩基配列と全体で約96％の相補性を有し、miRNAの22核酸塩基部分と100％の相補性を有する。
【０２３７】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列の部分は、miRNAまたはその前駆体の核酸塩基配列の部分と100％相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの15連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の15連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの16連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の16連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの17連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の17連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの18連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の18連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの19連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の19連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの20連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の20連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの22連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の22連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの23連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の23連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの24連続核酸塩基は、miRNAまたはその前駆体の24連続核酸塩基とそれぞれ相補的である。
修飾オリゴヌクレオチド
【０２３８】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは12〜30結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは15〜25結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは19〜24結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは21〜24結合ヌクレオシドからなる。
【０２３９】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは12結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは13結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは14結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは15結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは16結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは17結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは18結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは19結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは20結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは21結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは22結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは23結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは24結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは結25合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは26結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは27結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは28結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは29結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは30結合ヌクレオシドからなる。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号12の連続核酸塩基から選ばれる結合ヌクレオシドを含む。
修  飾
【０２４０】
本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、核酸塩基、糖、および/またはヌクレオシド間結合に1またはそれ以上の修飾を含む。修飾核酸塩基、糖、および/またはヌクレオシド間結合は、細胞への取り込みの増加、他のオリゴヌクレオチドまたは核酸標的に対する親和性の増加、およびヌクレアーゼ存在下での安定性の増加などの望ましい特性のため非修飾型以上に選択されうる。
【０２４１】
ある態様において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは1またはそれ以上の修飾ヌクレオシドを含む。あるそのような態様において、修飾ヌクレオシドは安定化ヌクレオシドである。安定化ヌクレオシドの例は、糖-修飾ヌクレオシドである。
【０２４２】
ある態様において、修飾ヌクレオシドは糖-修飾ヌクレオシドである。あるそのような態様において、糖-修飾ヌクレオシドは、さらに天然または修飾複素環塩基部分および/または天然または修飾ヌクレオシド間結合を含むことができ、さらに該糖修飾と独立してさらなる修飾を含むことがある。ある態様において、糖修飾ヌクレオシドは、糖環が天然リボースまたは2'-デオキシ-リボース由来の2'炭素で修飾されている2'-修飾ヌクレオシドである。
【０２４３】
ある態様において、2'-修飾ヌクレオシドは二環式糖部分を有する。あるそのような態様において、該二環式糖部分はアルファ配置のD糖である。あるそのような態様において、該二環式糖部分はベータ配置のD糖である。あるそのような態様において、該二環式糖部分はアルファ配置のL糖である。あるそのような態様において、該二環式糖部分はベータ配置のL糖である。
【０２４４】
ある態様において、該二環式糖部分は、2'炭素原子と4'-炭素原子間の架橋基を含む。あるそのような態様において、該架橋基は、1〜8結合ビラジカル基を含む。ある態様において、該二環式糖部分は、1〜4結合ビラジカル基を含む。ある態様において、該二環式糖部分は、2または3結合ビラジカル基を含む。ある態様において、該二環式糖部分は2結合ビラジカル基を含む。ある態様において、結合ビラジカル基は、-O-、-S-、-N(R1)-、-C(R1)(R2)-、-C(R1)=C(R1)-、-C(R1)=N-、-C(=NR1)-、-Si(R1)(R2)-、-S(=O)2-、-S(=O)-、-C(=O)-および-C(=S)-(ここで、各R1およびR2は独立してH、ヒドロキシル、C1-C12アルキル、置換C1-C12アルキル、C2-C12アルケニル、置換C2-C12 アルケニル、C2-C12アルキニル、置換C2-C12アルキニル、C5-C20アリール、置換C5-C20 アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、C5-C7脂環式ラジカル、置換C5-C7脂環式ラジカル、ハロゲン、置換オキシ(-O-)、アミノ、置換アミノ、アジド、カルボキシル、置換カルボキシル、アシル、置換アシル、CN、チオール、置換チオール、スルホニル(S(=O)2-H)、置換スルホニル、スルホキシル(S(=O)-H)、または置換スルホキシルから選ばれ、各置換基は、独立してハロゲン、C1-C12アルキル、置換C1-C12アルキル、C2-C12アルケニル、置換C2-C12アルケニル、C2-C12アルキニル、置換C2-C12アルキニル、アミノ、置換アミノ、アシル、置換アシル、C1-C12アミノアルキル、C1-C12アミノアルコキシ、置換C1-C12アミノアルキル、置換C1-C12アミノアルコキシ、または保護基である。
【０２４５】
ある態様において、該二環式糖部分は、-O-(CH2)p-、-O-CH2-、-O-CH2CH2-、-O-CH(アルキル)-、-NH-(CH2)p-、-N(アルキル)-(CH2)p-、-O-CH(アルキル)-、-(CH(アルキル))-(CH2)p-、-NH-O-(CH2)p-、-N(アルキル)-O-(CH2)p-、または-O-N(アルキル)-(CH2)p-(ここでpは、1、2、3、4、または5であり、各アルキル基はさらに置換されうる)から選ばれるビラジカル基で2'炭素原子と4'炭素原子の間が架橋される。ある態様において、pは、1、2、または3である。
【０２４６】
ある態様において、2'-修飾ヌクレオシドは、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-、S-、またはN(Rm)-アルキル；O-、S-、またはN(Rm)-アルケニル；O-、S-もしくはN(Rm)-アルキニル；O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)(ここで、各RmおよびRnは、独立してH、アミノ保護基、または置換または非置換C1-C10アルキルである)から選ばれる2'-置換基を含む。これら2'-置換基は、さらにヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO2)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルから独立して選ばれる1またはそれ以上の置換基で置換することができる。
【０２４７】
ある態様において、2'-修飾ヌクレオシドは、F、NH2、N3、OCF3、O-CH3、O(CH2)3NH2、CH2-CH=CH2、O-CH2-CH=CH2、OCH2CH2OCH3、O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O N(Rm)(Rn)、-O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2、およびN-置換アセトアミド(O-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)(ここで、各RmおよびRnは、独立してH、アミノ保護基、または置換または非置換C1-C10アルキルである)から選ばれる2'-置換基を含む。
【０２４８】
ある態様において、2'-修飾ヌクレオシドは、F、OCF3、O-CH3、OCH2CH2OCH3、2'-O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(CH3)2、-O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2、およびO-CH2-C(=O)-N(H)CH3から選ばれる2'-置換基を含む。
【０２４９】
ある態様において、2'-修飾ヌクレオシドは、F、O-CH3、およびOCH2CH2OCH3から選ばれる2'-置換基を含む。
【０２５０】
ある態様において、糖-修飾ヌクレオシドは4'-チオ修飾ヌクレオシドである。ある態様において、糖-修飾ヌクレオシドは4'-チオ-2'-修飾ヌクレオシドである。4'-チオ修飾ヌクレオシドは、4'-Oが4'-Sで置換されているβ-D-リボヌクレオシドを有する。4'-チオ-2'-修飾ヌクレオシドは、2'-置換基で置換された2'-OHを有する4'-チオ修飾ヌクレオシドである。適切な2'-置換基には、2'-OCH3、2'-O-(CH2)2-OCH3、および2'-Fが含まれる。
【０２５１】
ある態様において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、1またはそれ以上のヌクレオシド間修飾を含む。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある態様において、修飾ヌクレオシド間結合はリン原子を含む。
【０２５２】
ある態様において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは少なくとも1のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２５３】
ある態様において、修飾ヌクレオシド間結合はリン原子を含まない。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は短鎖アルキルヌクレオシド間結合により形成される。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は、シクロアルキルヌクレオシド間結合により形成される。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は、混合ヘテロ原子およびアルキルヌクレオシド間結合により形成される。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は、混合ヘテロ原子およびシクロアルキルヌクレオシド間結合により形成される。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は、1またはそれ以上の短鎖ヘテロ原子ヌクレオシド間結合により形成される。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は、1またはそれ以上の複素環ヌクレオシド間結合により形成される。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合はアミド骨格を有する。あるそのような態様において、ヌクレオシド間結合は、混合N、O、S、およびCH2成分部分を有する。
【０２５４】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは1またはそれ以上の修飾核酸塩基を含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは1またはそれ以上の5-メチルシトシンを含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの各シトシンは5-メチルシトシンを含む。
【０２５５】
ある態様において、修飾核酸塩基は、5-ヒドロキシメチルシトシン、7-デアザグアニン、および7-デアザアデニンから選ばれる。ある態様において、修飾核酸塩基は、7-デアザアデニン、7-デアザグアノシン、2-アミノピリジン、および2-ピリドンから選ばれる。ある態様において、修飾核酸塩基は、5-置換ピリミジン、6-アザピリミジン、およびN-2、N-6、およびO-6置換プリン(2-アミノプロピルアデニン、5-プロピニルウラシル、および5-プロピニルシトシンを含む)から選ばれる。
【０２５６】
ある態様において、修飾核酸塩基には多環複素環が含まれる。ある態様において、修飾核酸塩基には3環複素環が含まれる。ある態様において、修飾核酸塩基にはフェノキサジン誘導体が含まれる。ある態様において、該フェノキサジンをさらに修飾して、当該分野でGクランプとして知られた核酸塩基を形成することができる。
オリゴヌクレオチドモチーフ
【０２５７】
本発明の修飾オリゴヌクレオチドに対する適切なモチーフには、限定されるものではないが、完全に修飾され、均質に修飾され、位置的に置換されたもの、およびギャップマーが含まれる。均質修飾モチーフを含む完全修飾モチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドは、成熟miRNAを標的化するよう設計することができる。あるいはまた、均質修飾モチーフを含む完全修飾モチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドは、pri-miRNAsまたはプレ-miRNAのある部位を標的化し、成熟miRNA中のmiRNA前駆体のプロセシングを阻害するように設計することができる。完全修飾モチーフまたは均質修飾モチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドは、miRNA活性の有効な阻害剤である。
【０２５８】
ある態様において、完全修飾オリゴヌクレオチドは各ヌクレオシドに糖修飾を含む。あるそのような態様において、複数のヌクレオシドが2'-O-メトキシエチルヌクレオシドであり、残りのヌクレオシドが2'-フルオロヌクレオシドである。あるそのような態様において、複数のヌクレオシドのそれぞれが2'-O-メトキシエチルヌクレオシドであり、複数のヌクレオシドのそれぞれが二環式ヌクレオシドである。あるそのような態様において、完全修飾オリゴヌクレオチドは、さらに少なくとも1の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、完全糖修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある態様において、完全糖修飾オリゴヌクレオチドは、さらに少なくとも1のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、完全糖修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２５９】
ある態様において、完全修飾オリゴヌクレオチドは各ヌクレオシド間結合で修飾されている。あるそのような態様において、完全修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２６０】
ある態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドは各ヌクレオシドに同じ糖修飾を含む。あるそのような態様において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、2'-O-メトキシエチル糖修飾を含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは2'-O-メチル糖修飾を含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは2'-フルオロ糖修飾を含む。あるそのような態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドはさらに少なくとも1の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドはさらに少なくとも1のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２６１】
ある態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドは全体に同じヌクレオシド間結合修飾を含む。あるそのような態様において、均質修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２６２】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは各ヌクレオシドに同じ糖修飾を含み、さらに1またはそれ以上のヌクレオシド間結合修飾を含む。あるそのような態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは5'末端に1個の修飾ヌクレオシド間結合を、3'末端に1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは5'末端に2個の修飾ヌクレオシド間結合を、3'末端に2個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは5'末端に2個の修飾ヌクレオシド間結合を、3'末端に3個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、該修飾オリゴヌクレオチドは5'末端に2個の修飾ヌクレオシド間結合を、3'末端に4個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、該修飾ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２６３】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは下記式III：
(5')QxQz1(Qy)nQz2Qz3Qz4Q-L(3')
で示される。
【０２６４】
あるそのような態様において、化合物は式IIIで示される。ある態様において、Qは2'-O-メチル修飾ヌクレオシドである。ある態様において、xはホスホロチオエートである。ある態様において、yはホスホジエステルである。ある態様において、z1、z2、z3、およびz4のぞれぞれが、独立してホスホロチオエートまたはホスホジエステルである。ある態様において、nは6〜17である。ある態様において、Lはコレステロールである。ある態様において、nは12〜17である。
【０２６５】
ある態様において、xは、
【化６】
2015107971.tif 000007
である；
AおよびBの1つがSであり、他方がOである；
yは、
【化７】
2015107971.tif 000008
である；
z1、z2、z3、およびz4はそれぞれ独立してxまたはyである；
n = 6〜17である；
Lは、
【化８】
2015107971.tif 000009
である；
ここで、XはN(CO)R7またはNR7である；
R1、R3、およびR9はそれぞれ独立してH、OH、または-CH2ORbである；
ただし、R1、R3およびR9の少なくとも1がOHであり、R1、R3およびR9の少なくとも1つが-CH2ORbである；
R7は、Rd、またはNRcRdもしくはNHC(O)Rdで置換されたC1-C20アルキルである；
RcはHまたはC1-C6アルキルである；
Rdは、炭化水素ラジカル、または少なくとも1の炭化水素ラジカルと結合していることがあるステロイドラジカルである；
Rbは、
【化９】
2015107971.tif 000010
であり、ここで、AおよびBの1つがSであり、他方がOである。
【０２６６】
ある態様において、Rdはコレステロールである。ある態様において、z1、z2、z3、およびz4のそれぞれが、
【化１０】
2015107971.tif 000011
であり、ここで、AおよびBの1つがSであり、他方がOである。
【０２６７】
ある態様において、R1が-CH2ORbである。ある態様において、R9がOHである。ある態様において、R1およびR9がトランスである。ある態様において、R9がOHである。ある態様において、R1およびR3がトランスである。ある態様において、R3が-CH2ORbである。ある態様において、R1がOHである。ある態様において、R1およびR3がトランスである。ある態様において、R9がOHである。ある態様において、R3およびR9がトランスである。ある態様において、R9がCH2ORbである。ある態様において、R1がOHである。ある態様において、R1およびR9がトランスである。ある態様において、XがNC(O)R7である。ある態様において、R7が-CH2(CH2)3CH2NHC(O)Rdである。
【０２６８】
ある態様において、位置的に修飾されたオリゴヌクレオチドは結合ヌクレオシドの領域を含み、ここで、各領域の各ヌクレオシドは同じ糖部分を含み、各領域の各ヌクレオシドは隣接領域のそれとは異なる糖部分を含む。
【０２６９】
ある態様において、位置的に修飾されたオリゴヌクレオチドは少なくとも10の2'-フルオロ修飾ヌクレオシドを含む。そのような位置的に修飾されたオリゴヌクレオチドは、下記式I：
5'-T1-(Nu1-L1)n1-(Nu2-L2)n2-Nu2-(L3-Nu3)n3-T2-3'
で示され；
ここで、
各Nu1およびNu3は独立して安定化ヌクレオシドである；
少なくとも10のNu2は2'-フルオロヌクレオシドである；
各L1、L2、およびL3は独立してヌクレオシド間結合である；
各T1およびT2は独立してH、ヒドロキシル保護基、所望により結合した結合基、またはカップリング基である；
n1は0〜約3である；
n2は約14〜約22である；
n3は0〜約3である；
ただし、n1が0であるときは、T1はHまたはヒドロキシル保護基ではなく、n3が0であるときは、T2はHまたはヒドロキシル保護基ではない。
【０２７０】
あるそのような態様において、n1およびn3はそれぞれ独立して1〜約3である。ある態様において、n1およびn3はそれぞれ独立して2〜約3である。ある態様において、n1は1または2であり、n3は2または3である。ある態様において、n1およびn3は各2である。ある態様において、n1およびn3の少なくとも1は0より大きい。ある態様において、n1およびn3はそれぞれ0より大きい。ある態様において、n1およびn3の1つが0より大きい。ある態様において、n1およびn3の1つが1より大きい。
【０２７１】
ある態様において、n2は16〜20である。ある態様において、n2は17〜19である。ある態様において、n2は18である。ある態様において、n2は19である。ある態様において、n2は20である。
【０２７２】
ある態様において、約2〜約8のNu2ヌクレオシドが安定化ヌクレオシドである。ある態様において、約2〜約6のNu2ヌクレオシドが安定化ヌクレオシドである。ある態様において、約3〜約4のNu2ヌクレオシドが安定化ヌクレオシドである。ある態様において、3のNu2ヌクレオシドが安定化ヌクレオシドである。
【０２７３】
ある態様において、Nu2安定化ヌクレオシドのぞれぞれが2〜約8の2'-フルオロヌクレオシドによりNu3安定化ヌクレオシドから分離している。ある態様において、Nu2安定化ヌクレオシドのぞれぞれが3〜約8の2'-フルオロヌクレオシドによりNu3安定化ヌクレオシドから分離している。ある態様において、Nu2安定化ヌクレオシドのそれそれが5〜約8の2'-フルオロヌクレオシドによりNu3安定化ヌクレオシドから分離している。
【０２７４】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは2〜約6のNu2安定化ヌクレオシドを含む。ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドは3のNu2安定化ヌクレオシドを含む。
【０２７５】
ある態様において、Nu2安定化ヌクレオシドのぞれぞれが一緒に結合して1の連続配列になっている。ある態様において、少なくとも2のNu2安定化ヌクレオシドは少なくとも1の該2'-フルオロヌクレオシドにより分離している。ある態様において、Nu2安定化ヌクレオシドのそれぞれは少なくとも1の該2'-フルオロヌクレオシドで分離している。
【０２７６】
ある態様において、Nu2 2'-フルオロヌクレオシドの少なくとも2の連続配列は、少なくとも1の安定化ヌクレオシドにより分離しており、該連続配列のそれぞれが同数の2'-フルオロヌクレオシドを有する。
【０２７７】
ある態様において、T1およびT2はそれぞれ独立してHまたはヒドロキシル保護基である。ある態様において、T1およびT3の少なくとも1は、4,4'-ジメトキシトリチルである。ある態様において、T1およびT2の少なくとも1は所望により結合した結合基である。ある態様において、T1およびT2の少なくとも1はキャッピング基である。ある態様において、キャッピング基は反転デオキシ脱塩基基である。
【０２７８】
ある態様において、位置的に修飾されたオリゴヌクレオチドは少なくとも1の修飾ヌクレオシド間結合を含む。あるそのような態様において、位置的に修飾されたオリゴヌクレオシドの各ヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある態様において、位置的に修飾されたオリゴヌクレオチドの少なくとも1のヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。あるそのような態様において、位置的に修飾されたオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２７９】
ある態様において、位置的に修飾されたモチーフは、結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを表す下記式II：
T1-(Nu1)n1-(Nu2)n2-(Nu3)n3-(Nu4)n4-(Nu5)n5-T2
で示される；
ここで、Nu1およびNu5は独立して2'安定化ヌクレオシドである；
Nu2およびNu4は2'-フルオロヌクレオシドである；
Nu3は2'-修飾ヌクレオシドである；
n1およびn5はぞれぞれ独立して0〜3である；
n2＋n4の合計は10〜25である；
n3は0〜5である；
各T1およびT2は独立してH、ヒドロキシル保護基、所望により結合した結合基、またはキャッピング基である。
【０２８０】
ある態様において、n2とn4の合計が16である。ある態様において、n2とn4の合計が17である。ある態様において、n2およびn4の合計が18である。ある態様において、n1は2であり、n3が2または3であり、n5が2である。
【０２８１】
ある態様において、Nu1およびNu5は独立して2'-修飾ヌクレオシドである。
【０２８２】
ある態様において、Nu1がO-(CH2)2-OCH3であり、Nu3がO-(CH2)2-OCH3、Nu5がO-(CH2)2-OCH3であり、T1がHであり、T2がHである。
【０２８３】
ある態様において、miRNAと相補的な22結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドは、表Aから選ばれる式IIを有する(ここで、各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である)。ある態様において、表Aから選ばれる式IIを有する修飾オリゴヌクレオチドは配列番号12の核酸塩基配列を有する。
【表１】
2015107971.tif 000012
【０２８４】
ギャップマーモチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドは、結合2'-デオキシヌクレオチドからなる内部領域、および結合2'-修飾ヌクレオシドからなる外部領域を有することがある。そのようなギャップマーは、miRNA前駆体のRNアーゼH開裂を引き起こすように設計することができる。内部2'-デオキシヌクレオシド領域は、修飾オリゴヌクレオチドが標的化されるmiRNA前駆体の開裂を可能にするRNアーゼHの基質として働く。ある態様において、各外部領域の各ヌクレオシドは、同じ2'-修飾ヌクレオシドを含む。ある態様において、1の外部領域は均質に第一2'-修飾ヌクレオシドからなり、他の外部領域は均質に第二2'-修飾ヌクレオシドからなる。
【０２８５】
ギャップマーモチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドは、各ヌクレオシドに糖修飾を有することがある。ある態様において、該内部領域は均質に第一2'-修飾ヌクレオシドからなり、該ウイングのそれぞれは均質に第二2'-修飾ヌクレオシドからなる。あるそのような態様において、該内部領域は、均質に2'-フルオロヌクレオシドからなり、各外部領域は、均質に2'-O-メトキシエチルヌクレオシドからなる。
【０２８６】
ある態様において、ギャップマーの各外部領域は結合2'-O-メトキシエチルヌクレオシドからなる。ある態様において、ギャップマーの各外部領域は結合2'-O-メチルヌクレオシドからなる。ある態様において、ギャップマーの各外部領域は2'-フルオロヌクレオシドからなる。ある態様において、ギャップマーの各外部領域は、結合二環式ヌクレオシドからなる。
【０２８７】
ある態様において、ギャップマーの1外部領域の各ヌクレオシドは2'-O-メトキシエチルヌクレオシドを含み、その他の外部領域の各ヌクレオシドは異なる2'-修飾を含む。あるそのような態様において、ギャップマーの各外部領域の各ヌクレオシドは2'-O-メトキシエチルヌクレオシドを含み、その他の外部領域の各ヌクレオシドは2'-O-メチルヌクレオシドを含む。あるそのような態様において、ギャップマーの1外部領域の各ヌクレオシドは、2'-O-メトキシエチルヌクレオシドを含み、その他の外部領域の各ヌクレオシドは2'-フルオロヌクレオシドを含む。あるそのような態様において、ギャップマーの1外部領域の各ヌクレオシドは2'-O-メチルヌクレオシドを含み、その他の外部領域の各ヌクレオシドは2'-フルオロヌクレオシドを含む。あるそのような態様において、ギャップマーの1外部領域の各ヌクレオシドは2'-O-メトキシエチルヌクレオシドを含み、その他の外部領域の各ヌクレオシドは二環式ヌクレオシドを含む。あるそのような態様において、ギャップマーの1外部領域の各ヌクレオシドは2'-O-メチルヌクレオシドを含み、その他の外部領域の各ヌクレオシドは二環式ヌクレオシドを含む。
【０２８８】
ある態様において、1外部領域のヌクレオシドは2またはそれ以上の糖修飾を含む。ある態様において、各外部領域のヌクレオシドは2またはそれ以上の糖修飾を含む。ある態様において、外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-O-メトキシエチル糖を含み、同じ外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-フルオロ糖を含む。ある態様において、外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-O-メトキシエチル糖を含み、同じ外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは二環式糖部分を含む。ある態様において、外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-O-メチル糖を含み、同じ外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは二環式糖部分を含む。ある態様において、外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-O-メチル糖を含み、同じ外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-フルオロ糖を含む。ある態様において、外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは2'-フルオロ糖を含み、同じ外部領域の少なくとも1のヌクレオシドは二環式糖部分を含む。
【０２８９】
ある態様において、ギャップマーの各外部領域は、同数の結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、ギャップマーの1外部領域はその他の外部領域と異なる多くの結合ヌクレオシドからなる。
【０２９０】
ある態様において、該外部領域は、独立して1〜6のヌクレオシドを含む。ある態様において、外部領域は1ヌクレオシドを含む。ある態様において、外部領域は2ヌクレオシドを含む。ある態様において、外部領域は3ヌクレオシドを含む。ある態様において、外部領域は4ヌクレオシドを含む。ある態様において、外部領域は5ヌクレオシドを含む。ある態様において、外部領域は6ヌクレオシドを含む。ある態様において、該内部領域は17〜28結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は17〜21結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は17結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は18結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は19結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は20結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は21結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は22結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は23結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は24結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は25結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は26結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は27結合ヌクレオシドからなる。ある態様において、内部領域は28結合ヌクレオシドからなる。
定量分析
【０２９１】
修飾オリゴヌクレオチド投与後のmiRNAのアンチセンス阻害効果は、当該分野で知られた種々の方法により評価することができる。ある態様において、これらの方法を用いてin vitroまたはin vivoで細胞または組織中のmiRNA濃度を定量する。ある態様において、miRNA濃度の変化はマイクロアレイ分析により測定される。ある態様において、miRNAの変化は種々の市販されているPCRアッセイの1つ、例えばTaqMan(登録商標)MicroRNA Assay(Applied Biosystems)により測定される。ある態様において、miRNAのアンチセンス阻害は、miRNA標的のmRNAおよび/またはタンパク質濃度を測定することにより評価する。miRNAのアンチセンス阻害は、一般的にはmiRNA標的のmRNAおよび/またはタンパク質の濃度の増加をもたらす。
実験モデル
【０２９２】
ある態様において、本発明は、実験モデルにおいて本発明の修飾オリゴヌクレオチドを使用および/または試験する方法を提供する。ある態様において、実験モデルを用いて線維症を治療するための本発明の修飾オリゴヌクレオチドの効果を評価する。当業者は、本発明の医薬品を評価するためのそのような実験モデルのプロトコールを選択し、修飾することができる。
【０２９３】
修飾オリゴヌクレオチドは、最初に培養細胞中で試験することができる。適切な細胞種にはin vivoでの修飾オリゴヌクレオチドの送達が望まれる細胞種に関連するものが含まれる。例えば、線維症を治療するための修飾オリゴヌクレオチドを試験するための適切な細胞種には線維芽細胞、心筋細胞、および星細胞が含まれる。
【０２９４】
ある態様において、修飾オリゴヌクレオチドがmiRNAの活性を阻害する程度は培養細胞で評価する。ある態様において、miRNA活性の阻害はmiRNA濃度を測定することにより評価することができる。あるいはまた、miRNA 標的の推定濃度または有効濃度を測定することができる。miRNA活性の阻害は、miRNA標的のmRNAおよび/またはタンパク質の増加をもたらしうる。さらに、ある態様において、ある表現形的結果を測定することができる。例えば、適切な表現形的結果には細胞増殖の阻害、細胞死の誘導、および/またはアポトーシスの誘導が含まれる。
【０２９５】
miRNA活性を効果的に阻害する修飾オリゴヌクレオチドをin vitroで同定した後、修飾オリゴヌクレオチドをさらにin vivo実験モデルで試験する。
【０２９６】
miR-122と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを含む医薬品を含む、線維症を治療するための医薬品を試験するための適切な実験モデルには、本明細書に記載の過剰圧負荷肥大モデルが含まれる。
【０２９７】
線維症を治療するための医薬品を試験するためのさらなる実験モデルには、限定されるものではないが、塩化メチオニン欠乏(MCD)餌モデル(例えば、Yamaguchi et al.、Hepatology、2008、47、625-635参照)が含まれる。db/dbマウスは、自発的に肥満、糖尿病、および脂肪肝を発現する。そのようなマウスにMCD餌を与えると4〜8週間以内に非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)および肝線維症が誘発される。miRNAと相補的な核酸塩基を有する修飾オリゴヌクレオチドの肝線維症に対する効果をこのモデルを用いて試験する。
【発明を実施するための形態】
【０２９８】
以下の実施例は、本発明のいくつかの態様をより完全に示すために示すが、本発明の広い範囲を制限するものと解釈すべきではない。
【実施例１】
【０２９９】
心疾患におけるmiR-21の役割
心不全のトランスジェニックマウスモデル(β1-アドレナリン作動性レセプターの心臓制限過剰発現(Engelhardt et al.、1999))におけるミクロアレイ分析は、該疾患の重症度の増加を伴う心臓ミクロRNA発現の特徴の進行性脱制御(de-regulation)を示した(図1a)。miR-21発現は正常心筋において少量であったが、このミクロRNAは心不全において最も強く調節されたミクロRNAであった。実際に、末期心不全のマウスにおいて、miR-21は単一の最も強い上方調節されたミクロRNAであった(図1a)。定量的ノーザンブロット分析は、該マウスにおけるmiR-21の上方調節を確認し、さらにヒト心不全における顕著な上方調節を明らかにした(図1b、c)。ノーザンブロッティングで評価したmiR-21前駆体の発現増加は、転写メカニズムを示唆した。すなわち、ヒトmiR-21プロモーターについてさらに詳細に試験した。miR-21プロモーター領域を種々の種で同定した。これは種々の種で高度に保存されている(図4a)。ヒトmiR-21発現に関する試験(図4a-c)は、その転写調節が、心臓ストレス反応時に古典的に活性化される2つの転写物因子、カルシウム/cAMP応答配列タンパク質(CREB)および血清反応因子(SRF)によることを確認した。miR-21 プロモーター中のCREBの欠失およびSRF結合部位の突然変異は血清刺激に応じてmiR-21発現の顕著な減少を生じ、miR-21制御におけるこれら2つの転写因子の主な役割を示した(図4c)。心臓の形態と機能におけるmiR-21の本質的役割を、ゼブラフィッシュにおける種々の遍在性に発現するミクロRNAをノックダウンするバイアススクリーニングを用いるモルホリノに基づくアプローチによりみいだした。miR-21のノックダウンは、心臓の構造と機能の劇的な障害をもたらした(図5)。注射した動物の95％以上が、大量の心膜滲出(図5a挿入図およびb)およびビデオ顕微鏡でみいだされる心室機能障害を示した(図5c)。
【０３００】
哺乳動物心臓におけるmiR-21のこれらの本質的機能をさらに詳しく試験するため、本発明者らは、単離心筋細胞におけるmiR-21発現を調節した。本発明者らは、合成miR-21前駆体およびアンチセンスmiR-21阻害因子をトランスフェクトし、オリゴヌクレオチド送達の＞95％のトランスフェクション効率が常套的に達成された(図6a)。miR-21の過剰発現は、成熟miR-21の強い増強をもたらしたが、miR-21の阻害はノーザンブロット分析が示すように内因性miR-21発現を完全に阻害した(図6b)。しかしながら、心筋細胞のmiR-21濃度の増強および抑制はいずれも、安静条件下または心筋細胞肥大条件下の初代ラット心筋細胞の形態、サイズ、または数に有意な影響を与えなかった(図1d)。野生型同腹子に比べて25倍miR-21を過剰発現する心筋細胞特異的miR-21トランスジェニックマウスは、明確な心臓表現形を示さず、左室心筋の完全な構造を有し、間質性線維症はなかった(図1e、下段)。心不全におけるmiR-21発現の実質的な増加に反して、これらデータは単離心筋細胞および心筋細胞特異的miR-21トランスジェニックマウスモデルにおけるmiR-21発現濃度の操作では、ゼブラフィッシュで観察された効果により示される心臓におけるmiR-21の顕著な作用および心不全におけるmiR-21発現の実質的な増加を裏付けることができないことを示唆する。したがって、次に、本発明者らは、非心筋細胞種、例えば心臓線維芽細胞におけるmiR-21の潜在的役割について検討した。in situハイブリダイゼーションを用いて、弱いmiR-21シグナルが正常心筋に検出されたが、心筋障害ではハイブリダイゼーションシグナルは顕著に増強された。高倍率ではハイブリダイゼーションシグナルは主として小間質細胞、おそらく心臓線維芽細胞に限定された。プレプレーティング法を用いて、本発明者らは新生ラット心臓を心筋細胞分画と線維芽細胞分画に分けた。実際に、本発明者らは、主として心臓線維芽細胞において内因性miR-21発現をみいだした(図1f)。
【実施例２】
【０３０１】
miR-21は心臓線維芽細胞ERK-シグナル伝達を活性化する
MiR-21発現は、種々のヒト癌において選択的に増加し(Lu et al.、2005；Iorio et al.、2005)、種々の細胞における広範なメカニズムによる腫瘍の成長と蔓延の一因となることが示された。miR-21は、細胞種特異的に異なるmRNAを標的化するようであることから、本発明者らは潜在的な心臓特異的miR-21標的を検討することにした。生物情報学的方法を用い、本発明者らは、3'UTRを含むシード配列および対応隣接ヌクレオチドを用いて潜在的miR-21標的について種々のミクロRNAデータベースをスクリーニングし、心臓における発現が報告されている候補に対するこの分析に焦点を絞った。要約を下記の表1に示す。
【表２】
2015107971.tif 000013
【０３０２】
理論的miR-21標的のスクリーニングでは、22の既知の潜在的標的遺伝子が明らかとなり、そのうち8個は心臓組織内で発現することが以前に示された。3つの異なる標的予測手段の組み合わせによりきわめて有望な候補としてSpry1(sprouty1)が同定された。Ras/MEK/ERK-経路の既知の阻害剤であるSprouty1(SPRY1)(Hanafusa et al.、2002、Casci et al.、1999)は、心臓におけるその高スコアおよび有意な発現濃度により潜在的標的であることがわかった(表1)。Spry1 mRNAの3'UTRは、種々の推定ミクロRNA結合部位を含み、そのうちの1つのみが心臓病中に顕著に上方調節されるミクロRNAに対応する(miR-21、図7参照)。Spry1が発現する細胞種を決定するため、本発明者らはlacZ遺伝子がSpry1コーディング配列の部分と置換しているSpry1のアレルを用いた。lacZ発現に対するアッセイは、成体マウス心臓における顕著な染色を示した(図2a)。より高倍率では、間質性線維芽細胞由来のSpry1発現の斑状パターンが同定された(図2a、下段：パネル)。すなわち、miR-21とその推定標的であるSpry1はいずれも心臓線維芽細胞に共発現するが、心筋細胞分画には発現しない。これらの所見にしたがって、SPRY1発現の検出しうる下方調節は心筋細胞特異的にはmiR-21過剰発現トランスジェニックマウスにおいてみられなかった。さらに、miR-21発現の転写活性化因子である心臓CREB(図4)は、もっぱら線維芽細胞に局在する。次に、本発明者らはこれら所見のヒト疾患との関連について試験した。実際に、特発性拡張型心筋症による末期心不全の患者由来の左心室心臓組織試料の分析は、miR-21発現の増加(図1c)とSPRY1タンパク質発現の有意な抑制(図2b)を示した。これらの所見は、ホスホ-ERK/ERK比の増加により示されるERK-MAPキナーゼの活性化を伴った(図2b)。
【０３０３】
MiR-21機能は、完全な心臓組織の組成によく似た間質性線維芽細胞と心筋細胞の共培養において特徴づけられた。本発明者らは、合成miR-21前駆体分子または阻害因子のトランスフェクションによりmiR-21機能について評価した。miR-21の増加は、SPRY1タンパク質発現の強い抑制を誘導し、ERK-MAPキナーゼの活性化を増加させた(図2c)。同様に、SiRNA介在Spry1サイレンシングは、ERK-MAPキナーゼの活性化をもたらした(図2d)。次に、本発明者らは、線維芽細胞ERK-MAPキナーゼシグナル伝達のmiR-21介在抑制解除は、線維芽細胞の生存に影響を及ぼすのに十分であるか否かについて評価した。心筋線維症におけるERK-MAPキナーゼシグナル伝達の潜在的役割に一致して、miR-21濃度の増大は心臓線維芽細胞の生存を促進したが、内因性miR-21の抑制はアポトーシスによる細胞死を誘導した(図2e)。本発明者らは、miR-21の過剰発現およびSPRY1発現のsiRNA介在サイレンシングはともに線維芽細胞成長因子2(FGF2)の上清への分泌を有意に増強したことから、SPRY1発現のmiR-21に基づく調節が心臓線維芽細胞の分泌機能にきわめて重要であることもみいだした(図2f)。すなわち、この試験は心臓病中のmiR-21の再発現がSPRY1の阻害を介してERK-MAPキナーゼ活性を増大するという心不全における新規シグナル伝達の実例を示す。哺乳動物の心臓において、このメカニズムは線維芽細胞の生存を調節することにより、間質性線維症および心臓のリモデリングの程度に決定的な影響を与えるかもしれない。
【実施例３】
【０３０４】
in vivoにおけるmiR-21の治療的サイレンシング
正常環境および心不全におけるin vivoでのmiR-21の機能を評価するため、miR-21活性をmiR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチド(miR-21アンタゴニスト)を用いて阻害した。過剰圧付加誘発肥大マウスモデルをヒト心不全のモデルとして用いた。このモデルでは、再現性のある心臓ストレス反応が大動脈縮窄術(TAC)により達成される。このモデルは、広範囲の発現プロフィールにおけるミクロRNAおよびmRNA変化パターンの一致によりヒト心不全とよく似ている(Thum et al. 2007)。
【０３０５】
心臓内のantagomir(アンタゴmir)-21の局在を決定するため、Cy-3標識antagomir-21を頸静脈カテーテルを介して静脈内注射した。左室心筋全体に強い染色がみられ(図3a)、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドの心臓組織への分配が達成されることを示した。miR-21アンタゴニストは、各ヌクレオシドに2'-O-メチル糖、オリゴヌクレオチドの最も5'末端に2つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合、オリゴヌクレオチドの最も3'末端に3つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合、およびヒドロキシプロリノールリンカーを介して結合したコレステロールを含む。miR-21アンタゴニストは、配列番号1または配列番号12の核酸塩基配列を有する。無処置(偽)またはTAC手術マウスを、80 mg/kgの用量のantagomir-21またはコントロールオリゴヌクレオチドで3日間連続処置した。antagomir-21による処置は、ノーザンブロット(図3b)およびリアルタイムPCR分析(図8)が示すように3週間まで心臓miR-21発現の増大を強く抑制した。この処置は、過剰圧付加中のSPRY1およびERK-MAPキナーゼ活性化のTAC誘発下方調節を偽手術マウスでみられるレベルに完全に逆転させた(図3c)。間質性線維症および心重量は、無処置マウスにおいてTAC後3週間で有意に増加したが、antagomir-21処置では強く減少した(図3d、e)。実際に、心筋のコラーゲン含有量は、antagomir-21処置により本質的に正常化した。さらに、心重量がTAC後3週間で二倍になる肥大は、antagomir-21処置により抑制された。偽手術マウスにおいて、antagomir-21による処置は、心臓重量または間質性線維症の有意な変化をもたらさず、正常心臓に対するmiR-21拮抗作用またはantagomir-21処置の明白な心臓毒性の認識できる効果がないことを示唆した。TAC手術およびantagomir-21処置後、グローバルトランスクリプトーム分析は、種々の無秩序な遺伝子の正常化を示した(図3f)。具体的には、コラーゲン1α1、コラーゲン3α1、ビグリカン、フィブロモジュリン、または結合組織成長因子のような心線維症時に顕著に上方調節される遺伝子は、miR-21の特異的阻害後にそれぞれ42%、39%、44%、38%、および37%低下した(図3f下段：パネル)。さらなる試験において、心機能を心エコー検査により評価した。ヒト心不全で一般的にみられるように、左心室拡張終期直径はTAC後3週間で有意に増加し、短縮率は障害された(図3g)。コントロールと比較して、antagomir-21処置は、左心室の拡張を抑制し、実質的に短縮率のパラメーターを偽手術動物で観察されるレベルに正常化した(図3g)。同様の結果がイソプロテレノール誘発心臓疾患モデルにおいてantagomir-21処置により得られた。
【０３０６】
マウスに対しantagomir-21処置前3週間左心室に過剰圧付加をかけるさらなる実験を行った。この期間中、動物は有意な左心室肥大、線維症、および心機能不全を示した。この3週間の期間後、マウスをantagomir-21で処置し、さらに3週間観察した。コントロール処置動物は左心室機能の進行的機能障害ならびに間質性線維症および心肥大を示したが、antagomir-21処置動物は、心機能障害の有意な減弱と心肥大および線維症の軽減を示した。
【０３０７】
これらのデータは、心臓に対する線維芽細胞由来miR-21およびSPRY1の重要な役割を証明する。心臓線維芽細胞におけるmiR-21の異常発現はSPRY1タンパク質発現を阻害し、ERK-MAPキナーゼ活性の増大をもたらす。その結果、これは心臓線維芽細胞の生存を増強することにより、心不全の特徴である間質性線維症および心臓リモデリングを増強する。このモデル(図3hに要約)は、心筋疾患における心臓線維芽細胞の活性化に主な役割を与える。ネズミ心疾患モデルにおけるmiR-21の拮抗は、構造的および機能的な悪化を予防した。したがって、本発明は、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを投与することを含む線維症の治療方法を提供する。さらに、本発明は、miR-21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを投与することを含む心臓疾患に関連する線維症の治療方法を提供する。
【実施例４】
【０３０８】
細胞外シグナル調節キナーゼMAPK経路のmiRNA調節
正常細胞の癌細胞への悪性形質転換には、種々の発癌特性、例えば無制御な細胞分裂、プログラムされた細胞死(アポトーシス)に対する抵抗性、浸潤、および血管新生の獲得が必要である。遺伝子変化は、しばしば一般的下流情報伝達経路、例えばc-RAF-1、MEK-1、ERK 1/2、p38、JNK、その他を含むマイトジェン活性化タンパク質(MAP)キナーゼカスケードの構成的活性化を生じる。マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ(MAPK)カスケードは、正常細胞の増殖、生存、および分化の調節に関与する鍵となる情報伝達経路である。MAPKカスケードの調節異常は、癌および他のヒトの疾患の一因となる。具体的には、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)MAPK経路は、癌治療における薬理学的阻害剤の開発をもたらす集中的な研究の対象であった。正常細胞において、キナーゼ ERK 1/2の活性化はレセプターチロシンキナーゼ、例えば、EGFレセプターおよび血小板由来成長因子レセプター(PDGFR)により、Raの活性化、次いでRAF-1/MEK-l/ERK 1/2カスケードの活性化を介して調節されることはよく確立されている。この情報伝達経路は、多くのヒト癌で過剰活性化されるため、レセプターチロシンキナーゼ、Ras、c-RAF-1、およびMEK-1の阻害剤はすべて開発され、種々の開発段階にある。したがって、癌の治療は、有効量のRAF-1/MEK-l/P-ERK 1/2経路の阻害剤を投与することにより可能であるかもしれない。
【０３０９】
Sprouty(SPRY)は、レセプターチロシンキナーゼ経路、例えばRas/MAPキナーゼ経路の内因性調節因子である細胞内タンパク質のファミリーである。哺乳動物種は、成長因子誘発細胞分化、遊走、および増殖の阻害剤として作用するSproutyの4つのアイソフォームを発現する。本発明者らは、sprouty-1が腫瘍形成のモジュレーションをもたらすERKリン酸化を阻害することを確認した。本発明者らは、多くのヒト癌におけるmiR-21の上方調節がsprouty-1を阻害し、ERKを活性化して腫瘍形成および進行の増大をもたらすことを示唆する。したがって、miR-21の拮抗(例えばantagomir-21による)は、腫瘍形成および/または進行を予防および/または減弱することができる。
【実施例５】
【０３１０】
実験方法
発現分析(ミクロRNAアレイ、Affymetrix Genechip分析、ノーザンブロッティング、リアルタイムPCR)
ミクロRNA(Castoldi et al.、2007)および全体的mRNA発現プロフィールは、ネズミ左室心筋由来のRNA調製物から得られた。無秩序なミクロRNAは、ノーザンブロッティングおよびステムループ特異的リアルタイムPCRにより確認された。オリゴヌクレオチドアレイおよび斑状ミクロRNAアレイの両方のデータ分析は、先に記載(Thum et al.、2007)のBioconductor project(www.bioconductor.org)から得られるRパッケージを用いて行った。
miR-21 プロモーター分析
【０３１１】
単離後24時間に、確立されたリポソームトランスフェクション法(Lipofectamine、Invitrogen、USA)を用い、細胞をレポータープラスミド1ugでトランスフェクションした。12時間後、培地をFCS不含培地に交換した。24時間後、細胞を5％FCSで8時間処理し、その他の群はFCSなしで培養した。細胞溶解物中のルシフェラーゼ活性を、Dual Luciferase Kit(Promega、Germany)を製造業者の推奨に従って使用し、測定した。
心筋細胞の単離、培養、およびトランスフェクション実験
【０３１２】
新生児心筋細胞を以前に記載されたように単離した(Merkle et al.、2007)。心筋細胞の大きさをAxioVision LE 4.1ソフトウエアパッケージ(Carl Zeiss Vision GmbH、Jena、Germany)を用いてデジタル記録画像から測定した。心筋細胞培養をmiR-21の前駆体および阻害剤(Ambion、USA)、またはsprouty1に対するsiRNA(Promega、Germany)でトランスフェクションした。適切な培養条件を用いて、本発明者らは、心臓線維芽細胞、ならびに線維芽細胞/心筋細胞共培養を用いる実験も行った。
ゼブラフィッシュの維持、モルホリノアンチセンスオリゴヌクレオチドの微量注射、および心機能の測定
【０３１３】
標準的モルホリノ-修飾オリゴヌクレオチドを成熟dre-miR-21(MO-1 = 5´- GCCAACACCAGTCTGATAAGCTA-3´)に対して得、また、マルチブロッキングモルホリノ-修飾オリゴヌクレオチドを用いてmiR-21プロセシングおよび機能(MO-2 = 5´-TGTAACAGCCAACACCAGTCTGATAAGCTAT-3´)において多段階で干渉させた。標準コントロールオリゴヌクレオチド(MO-コントロール)(GENETOOL、LLC)を陰性コントロールとして同じ濃度で注射した。モルホリノを、1細胞段階野生型ゼブラフィッシュ胚にマイクロインジェクションし、全体的形態、特に心機能を発生時の数時点で評価した。写真および動画を記録し、心室の短縮率を実質的に記載(Rottbauer et al.、2005)のごとく48、72、80、96、および120受精後時間(hpt)(hpf)で測定した。
心肥大および心不全のマウスモデル
【０３１４】
経大動脈狭窄は常套的方法により行った。ベータ1-アドレナリン作動性レセプタートランスジェニックマウス(TG4系)は以前に詳細に記載されている(Engelhardt et al.、1999)。
ヒト心臓試料
【０３１５】
本発明者らは、拡張型心筋症による末期心不全により心臓移植を受けた患者由来の心臓組織について健康成人心臓試料と比較して試験した。外移植直後に組織片を左心室から取り出し、摘出組織を液体窒素でショックフリーズし、分析まで-80℃で保存した。
ミクロRNA標的推定法
【０３１６】
ミクロRNAデータベースおよび標的推定手段miRBase(http://microrna.sanger.ac.uk/)、PicTar(http://pictar.bio.nyu.edu/)、およびTargetScan(http://www.targetscan.org/index.html)を用いて潜在的ミクロRNA標的を同定した。
心線維症のウエスタンブロッティングおよび分析
【０３１７】
外移植心臓または共培養からのタンパク質溶解物を記載のごとく調整し(Buitrago et al.、2005)、Spry1、ERK1/2、ホスホERK1/2、およびGべータの発現を本明細書に記載のごとく検出した。形態および線維症を分析するため、心臓を4％ホルマリンで固定し、パラフィン包埋した。LVからの組織切片(5um)をヘマトキシリンおよびエオジンまたはピクロシリウスレッドで染色した。ピクロシリウスレッド切片を、円偏光照明を得るためのフィルターを取り付けたNikon ECLIPSE 50i顕微鏡を用いて試験した。組織画像を20Xの対物レンズを用いて得、冷却デジタルカメラ(DS-5Mc、Nikon)を用いて記録し、SigmaScan Pro 5.0画像分析ソフトウエア(SPSS Inc.、USA)を用いて分析した。コラーゲン含有量を各画像の面積のパーセンテージとして計算した(ピクセルで表現した)。
αMHC-miR-21トランスジェニックマウス
【０３１８】
miR-21を過剰発現するトランスジェニックマウスを、FVB/Nマウスから得た受精卵母細胞に、ネズミα-ミオシン重鎖(αMHC)プロモーターの制御下で天然前駆体配列の154 bp上流および136 bp下流に側面を接した成熟miR-21配列含有トランス遺伝子構築物を前核注射して作製した。
Spry-lacZマウス由来の心筋のX-gal染色
【０３１９】
心臓をSpry1-lacZ +/-マウスから回収し、2% ホルムアルデヒドおよび0.05% グルタルアルデヒドを含むPBSで2時間固定した。次に、心臓を、PBS中の0.01% Na-デオキシコーレート、0.02% Nonidet P-40、2mM MgCl2、および2mM EGTAで30分間、4回リンスした。β-ガラクトシダーゼ活性を検出するため、心臓を、37℃の0.5 mg/ml X-gal、10 mM K3Fe(CN)6、および10 mM K4Fe(CN)6 含有リンス溶液中でインキュベーションした。全載分析のために、心臓を30％グリセロールに写し、デジタル画像をNikonデジタルカメラDXM1200FおよびACT-1ソフトウエアを用いて得た。組織学的分析様に、心臓をイソプロパノール中で脱水し、キシレンで透徹し、パラフィンに移した。10umパラフィン切片を標準的プロトコールを用いて作製し、記録した。
修飾オリゴヌクレオチドの注射および検出
【０３２０】
頸静脈カテーテルを雄C57/Bl6マウス(10-12週齢)に恒久的に挿入し、次いでTAC法を行った。TAC後24時間に、80mg/kg/dの修飾オリゴヌクレオチドを頸静脈カテーテルを介して3日間毎日注射した。有効な送達のための陽性コントロール(Cy3標識修飾オリゴヌクレオチド)80mg/kgを該カテーテル中に1回注射し、3時間後に心臓を除去し、固定し、次いでCy3染色を蛍光顕微鏡で観察した。
線維芽細胞アポトーシスおよびFGF2産生
【０３２１】
miR-21前駆体、阻害剤、または各コントロールで処理後、Annexin V陽性線維芽細胞をFACS分析(Annexin-V-FLUOSキット、Roche Diagnostics GmbH、Mannheim、Germany)により測定した。酵素免疫測定法(ELISA)を実施し、miR-21調節心臓線維芽細胞の上清中のFGF2濃度を定量した。FGF2アッセイは、Quantikine FGF Basic Immunoassayキット(R&D System、Minneapoli、USA)を使用説明書に従って用いて実施した。
統計分析
【０３２２】
平均データは平均＋SEMで表す。統計分析を、Prismソフトウエア(GraphPad、San Diego、CA)またはStatView(SAS Institute Inc.、Cary、USA)パッケージを用いて行った。ANOVA、次いでBonferroni検定、およびStudent t-検定を必要に応じて用いた。P<0.05の場合を有意差とみなし、アスタリスクで示す。*はp < 0.05を、**はp < 0.01を、***はp < 0.005を示す。
RNAの単離、リアルタイムRT-PCR、およびノーザンブロッティング
【０３２３】
凍結組織または細胞培養から総RNAを抽出するため、RNeasy Miniキット(Qiagen、Hilden、Germany)を使用説明書に従って使用した。MiRNAは、TRIZOL(Invitrogen、Karlsruhe、Germany)またはmiRNA Isolationキット(mirVana(登録商標)、Ambion、USA)を用いて単離した。単離RNAの完全性は、記載のごとく(Thum and Borlak、2004)変性アガロースゲル電気泳動またはキャピラリー電気泳動(Bioanalyzer 2100；Agilent)により確認した。リアルタイムPCRにはiCycler iQ(登録商標)Real-Time PCR Detection System(BioRad、Germany)を用いた。
【０３２４】
本発明者らは、標的特異的ステムループ構造および逆転写プライマーを用い、逆転写後に特異的TaqManハイブリダイゼーションプローブを用いてmiR-21発現を定量した(TaqMan miR-21 MicroRNA Assay、Applied Biosystem、Foster City、USA)。小RNA分子U6B小核(RNU6B)をコントロール(TaqMan MicroRNA Assay Controls、Applied Biosystem、Foster City、USA)として増幅した。すべてのmiRNA試料は同じ総RNA濃度を含む単離物由来であった。
【０３２５】
ノーザンブロット分析では、3μgの総RNAを適切なDNAマーカーと共に15%アクリルアミド、6M尿素、およびTBEゲルに流した。電気泳動後、RNAをセミドライトランスファーを用いてナイロン膜(Qiabrane Nylon、Qiagen)に移した。次に、膜をハイブリダイゼーション緩衝液(ULTRAhyb-Oligo Hybridzation Buffer、Ambion、USA)中65℃で1時間プレハイブリダイゼーションした。次に、予めT4キナーゼ(Exiqon)および32P-ATPで標識したLNA オリゴヌクレオチド(miRCURY LNA Array検出プローブ；Exiqon)を緩衝液に加え、膜を42℃で一夜ハイブリダイズした。次に、ブロットを室温で3分間3回(0.2×SSC中)、次いで42℃で15分間1回洗浄した。次に膜をホスホイメージャーに暴露した。
ミクロRNA発現分析
【０３２６】
ミクロアレイミクロRNA発現分析のために、本発明者らは、flashPAGE Fractionatorシステム(Ambion、USA)を用いてミクロRNAを別個に精製した。8μgの総RNAから得たミクロRNAを、mirVana MicroRNA Labelingキット(Ambion、USA)を製造業者の推奨に従って用い染料Cy3(Molecular Probe、Carlsbad、Calif)で標識した。各試料を別個のアレイとハイブリダイズした。ミクロRNAミクロアレイハイブリダイゼーション、ミクロRNA精製および豊富化、標識、およびミクロアレイハイブリダイゼーション法を、Ambion mirVanaマニュアル(www.ambion.com/techlib/prot/)または2に記載のごとく実施した。データの獲得は、ScanAlyze Software(Eisen-Lab、Lawrence Berkeley National Lab(LBNL)、Berkeley、USA)を用いて行った。あるいはまた、5μgの総RNAをCy3結合RNAリンカー(Dharmacon、USA)で標識し、miRNAのゲノム全体のプロファイリングのためのミクロアレイプラットホームとハイブリダイズした[miChip； miRBaseバージョン6.1に寄託された(211ヒト、51ネズミ)ユニークヒトmiRNAに対応するアレイ上に固定化されたキャプチャープローブ]。ハイブリダイゼーションシグナル強度は、同じ光電子増倍管設定のAxonスキャナー(4000B、Molecular Dynamics)を用いて得た。さらなる分析をGenepix 6(Molecular Dynamics)およびExcelソフトウエアを用いて行った。MiR-21発現は、特異的TaqMan RT-PCR分析およびノーザンブロット分析を用いて確認した。
グローバルトランスクリプトーム分析
【０３２７】
トランスクリプトーム分析では、逆転写、第2鎖合成、および二本鎖cDNAの精製(cleanup)は、Affymetrixプロトコール(One-Cycle cDNA合成キット、Affymetrix、USA)に従い、2μgの総RNAから開始して実施した(n=4、偽手術後のコントロール心臓；n=4、TACおよびプラセボ処置後の左心室；n=4、TACおよびmiR-21アンタゴニスト処置後の左心室)。ビオチン標識cRNAの合成は、IVT Labelingキット(Affymetrix、USA)を用いて行った。cRNA濃度を測定し、cRNA分画サイズの分布をゲル電気泳動で確認した。15μの断片化cRNAをマウスゲノム430 2.0 GeneChip(Affymetrix、USA)を用いるハイブリダイゼーションに用いた。Bioconductorプロジェクト(www.bioconductor.org)のアレイ試験Rパッケージからのデータ分析を用いた。得られるシグナル強度を分散安定化により正規化した。すべてのデータの品質を試験し、統計分析を、特異的に発現した遺伝子を選択するためのlimma(Linear Models for Microarray Analysis)パッケージを用いて行った。
心臓共培養実験およびミクロRNA/siRNAトランスフェクション法
【０３２８】
新生児ラットから心筋細胞を記載(Merckle et al.、2007)のごとく単離し、培養した。心筋細胞サイズのmiR-21 モジュレーションを分析するため、主な非心筋細胞(例えば線維芽細胞)の混入を排除するプレプレーティング工程を加えることにより純粋心筋細胞培養を用いた。95%以上の培養心筋細胞がアクチニンに陽性に染まり、高純度の細胞培養であることが示された。スクランブル-miR(プレ陰性コントロール#2、Ambion；50 nmol/L、72時間)、miR-21 前駆体分子(プレ-MiR、Ambion；50 nmol/L、72時間)、またはmiR-21アンタゴニスト(Anti-miR、Ambion；50 nmol/L、72時間)を、リボソームに基づく方法(Lipofectamine、Invitrogen、USA；詳細は6を参照のこと)によりトランスフェクトした。心筋細胞を、低FCS(0.1 %、コントロール条件)、または高FCS(5.0 %)で48時間培養し、心筋細胞の肥大を誘導した。細胞サイズを測定するため、新生児心筋細胞の表面面積(トランスフェクション後72時間)を、AxioVison Rel 4.4パッケージ(Carl Zeiss GmbH、Jena、Germany)を用いて96ウェルプレートフォーマット(播種密度40,000細胞/ウェル)で計算した。データを平均±SEMで表す。
【０３２９】
心臓のin vivo条件に似せるため、上記プレプレーティング工程を無視した心筋細胞および心臓線維芽細胞の共培養系を用いた。本発明者らは、スクランブル-miR(50 nmol/L、72時間)、miR-21 前駆体分子(50 nmol/L、72時間)、またはmiR-21アンタゴニスト(50 nmol/L、72時間)のトランスフェクション後のSpry-1およびErk 活性化の発現を詳細に試験した。別の実験において、スクランブルsiRNAまたはSpry1に対する特異的siRNAカクテル(3つの異なるミクロRNA、各16.7 nmol/L)を該共培養にトランスフェクションした。トランスフェクション効率を、リアルタイムPCR測定法(TaqMan MicroRNA Assay、Applied Biosystems)およびノーザンブロッティングによりモニターした。
ミクロRNA標的推定手段
【０３３０】
miRandaアルゴリズム(Griffiths-Jones et al.、2006)を用いてヒトおよびネズミゲノムの3'UTR配列中の潜在的miR-21結合部位を精査した。次に、Karlin-Altschul正規化を行った(miRBase Targetsバージョン4.0；http://microrna.sanger.ac.uk/targets/v4/)。詳細には、本発明者らは、miRBaseデータベース(バージョン4、Sanger Institute；USA)を用い、アルゴリズム「多数の保存された種；>6」、「低p値；<0.001」、および高miRBaseスコア；>15を用いて潜在的miR-21標的を選別した。この方法は、22の既知遺伝子が潜在的miR-21標的であることを示し、そのうち8個はそのGEO発現プロフィール(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)に基づいて心臓組織内に発現することが以前に示された(表1参照)。さらに、5遺伝子が、PicTar miRNAデータベース9(Krek et al.、2005)(http://pictar.bio.nyu.edu/)を用いてmiR-21標的であると推定された。TargetScan miRNA標的推定ソフトウエア(Whitehead Institute for Biomedical Research、USA、Release 4.0；2007年7月；http://www.targetscan.org/)を用いて、本発明者らは、2つの標的についてのみ、miR-21に対する8マーシードマッチを有する保存された部位を有する標的を同定した。次に、Spry1をさらに詳細に試験した。
ウエスタンブロッティング
【０３３１】
外移植心臓または培養線維芽細胞/心筋細胞由来のタンパク質溶解物を記載のごとく調製した(Buitrago et al.、2005)。抽出物(20-50μgタンパク質/レーン)を試料ローディング緩衝液と混合し、還元条件下、10% SDSポリアクリルアミドゲル上で分離した。タンパク質をPVDF膜(Immun-Blot(登録商標)、Bio-Rad)上に電気転写した。化学ルミネッセンスアッセイ(ECL Plu、Amersham)を用いてバンドを検出した。本発明者らは、sprouty-1に対する一次抗体(Santa Cruz、sc- 30048、希釈1:250-1:500)、Erk1/2に対する一次抗体(Cell Signaling、#9102、希釈1:1000)；ホスホ-Erk1/2に対する一次抗体(Cell Signaling、#9101、希釈1:1000)、およびG-βに対する一次抗体(Santa Cruz Biotechnology、sc-378、希釈1:1000)、および適切な二次抗体(抗マウス-HRP(Cell Signaling、#7076、希釈1:10000；抗ウサギ-HRP(Cell Signaling、#7074、希釈1:10000)を用いた。
in vivoTACモデルおよび修飾オリゴヌクレオチド投与
【０３３２】
本発明者らは、雄C57BL/6マウス(10-12週齢、25g)(Charles River Laboratories(Sulzfeld、Germany))を用いた。経大動脈狭窄(TAC)は、大動脈および27ゲージ注射針の周囲を7-0縫合糸で2回結紮して作製した。次に、注射針を静かに引いて約80％の大動脈狭窄を生じさせた。同じ手術中に、頸静脈カテーテルを標準的外科手術法により埋め込んだ。配列は、antagomir-21、5'- oUsoCsoAoAoCoAoUoCoAoGoUoCoUoGoUoAoAoGsoCsoUsoAs-Chol-3'であった。合成に用いた全てのヌクレオチドは2'-OMe-修飾(下付き文字「o」)である。下付き文字「s」は、ホスホロチオエート結合を表す。「Cy3」は該オリゴの5'末端のCy3色素標識を示す。「Chol」はヒドロキシプロリノール結合を介して結合したコレステロールを表す。処置をTAC後24時間に開始し、動物は埋め込んだ頸静脈カテーテルを介してPBSまたはmiR-21アンタゴニスト注射を受けた(3日間連続、0.2mL/注射中、用量80mg/kg重量のmiR-21アンタゴニストまたはPBSを頸静脈注射)。効果的心臓送達の陽性コントロールとして、Cy-3標識修飾オリゴヌクレオチド(antagomir-181a)(80mg/kg)を頸静脈カテーテル内に注射し、3時間後に心臓を取り出し、固定し、蛍光顕微鏡によりCy3染色を観察した。
心機能分析
【０３３３】
TACの3週間後にマウスをイソフルランで麻酔し、心臓の体積と機能を15-MHzパルス波ドップラー心エコー検査により分析した。次に、心臓を取り出し、心房除去後に計量し、さらに分析に供した。心エコー検査をイソフルランを用いる自発呼吸軽麻酔下で行った。齧歯類の画像化の経験がある2人の別の超音波検査技師に、15 MHzトランスデューサーを取り付けたToshiba Power Vision 6000を操作する心エコー検査にて実験群を盲検させた。乳頭筋のレベルで2D左胸骨傍短軸像を記録した。正しいプローブの配置を、精密な角度測定後の左心室(LV)腔の周囲の外観および頭尾方向へのトランスデューサーの移動により判断した。LV拡張終期面積を、心内膜境界の手動トレース、次いでNiceソフトウエアパッケージ(Toshiba Medical Systems)による面積測定により計算した。同時横断線MモードトレーシングをLV腔の中間に置いたカーソルにより記録した。短縮率は記載のごとく計算した(Collins et al.、2001)。
心線維症の検出
【０３３４】
マウス心臓を4％緩衝ホルマリンで固定し、パラフィン包埋した。5μmのピクロシリウスレッド切片を円偏光照明を得るためのフィルターを取り付けたNikon ECLIPSE 50i顕微鏡を用いて試験した(Whittaker et al.、1994)。下段フィルターを顕微鏡の視野虹彩絞り環の上に置いた。上段フィルターを、その透過軸が波長板の速軸に対して45°となるように調整した直線偏光子の下に置いた四分の一波長板の組み合わせから構成した。これら2つのフィルターを交差させ、視野内の背景ができるだけ暗くなるよう調整した。組織画像を20Xの対物レンズを用いて得、冷却デジタルカメラ(DS-5Mc、Nikon)を用いて記録し、SigmaScan Pro 5.0画像分析ソフトウエア(SPSS Inc.、USA)を用いて分析した。オリジナル(円偏光)画像は、正確にそれぞれシアン、黄色、マジェンダ、および黒色成分に分解された(画像分析により提供される自動機能CYMKを用いる)。黒色成分を偏光画像から差し引いた。差し引く前に、黒色成分は、確実に間質腔および非コラーゲン要素が除去され、最も薄いコラーゲン線維が除去されないように適切に明るさが調整された(検査により確認した)。次に、差し引いた画像を、画像ソフトウエアが提供する自動機能HSVを用いて最終色分離にかけ、色相、彩度、明度(HSV)成分とした。色相周波数のヒストグラムを、256色を含む分解8ビット色相画像から得た。以下の色相定義を用いた：赤色2〜9および230〜256、橙色10〜38、黄色39〜51、緑色52〜128。色相範囲129〜229は間質腔および非複屈折組織要素からなる。色相の赤色、橙色、黄色、および緑色域内のピクセル数を決定し、コラーゲンピクセルの総数のパーセンテージで表し、次いで、該画像中の総ピクセル数のパーセンテージで表した。
線維芽細胞アポトーシスおよびFGF-2産生
【０３３５】
心筋細胞単離中のプレプレーティング工程により得られた心臓線維芽細胞をサブコンフルエントまで培養した。細胞の純度は、線維芽細胞マーカーの抗ラットプロリル-4-ヒドロキシラーゼ染色に基づいて＞95％であった(Acris Antibodies、AF5110-1；データ示さず)。miR-21前駆体、阻害剤、または各コントロール(上記参照)で処理後、Annexin V-陽性線維芽細胞はFACS分析により測定した(Annexin-VFLUOSキット、Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Germany)。酵素免疫測定法(ELISA)を実施し、miR-21調節心臓線維芽細胞の上清中のFGF-2濃度を定量した。FGF-2測定は、Quantikine FGF Basic Immunoassayキット(R&D System、Minneapoli、USA)を使用説明書に従って用いて行った。
参考文献
【０３３６】
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【図１−１】
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【図１−２】
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【図１−３】
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【図２−１】
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【図２−２】
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【図３−１】
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【図３−２】
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【図３−３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成26年12月25日(2014.12.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
線維症があるかまたはその疑いがある対象に、miR-21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する12〜30連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することを含む線維症の治療方法。
【手続補正書】
【提出日】平成26年12月25日(2014.12.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
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【外国語明細書】
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