(57)【要約】本発明は、新規クラミジア抗原、そのような抗原をコードする核酸、及びそのような抗原を含む免疫原性組成物を提供する。本発明はさらに、そのような抗原を使用して免疫応答（例えば、Ｔ細胞媒介性及び／又はＢ細胞媒介性免疫応答）を誘発する方法を提供する。本発明は、クラミジア媒介性疾患を予防及び／又は治療する方法であって、本明細書に記載される新規抗原の１つ以上を含む免疫原性組成物を投与するステップを含む方法を提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される１つ以上の単離されたクラミジア抗原を含む免疫原性組成物。
【請求項２】
前記クラミジア抗原が少なくとも７アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記クラミジア抗原が少なくとも２０アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項４】
前記クラミジア抗原が少なくとも５０アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記クラミジア抗原が少なくとも７５アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項６】
前記クラミジア抗原が少なくとも１００アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
前記クラミジア抗原が少なくとも１２５アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項８】
前記クラミジア抗原が少なくとも１５０アミノ酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項９】
前記クラミジア抗原が、対応する野生型ポリペプチド抗原に存在する対応する野生型配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を有する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１０】
前記クラミジア抗原が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号２３、配列番号６３、又はその一部分から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項１〜９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１１】
前記クラミジア抗原が異種ポリペプチドと融合される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１２】
薬学的に許容可能な賦形剤を含む、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１３】
アジュバントを含む、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１４】
前記アジュバントがミネラル含有アジュバントを含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１５】
前記ミネラル含有アジュバントが水酸化アルミニウムを含む、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
前記アジュバントが免疫調節オリゴヌクレオチドを含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１７】
前記アジュバントが油乳剤を含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１８】
前記アジュバントがサポニンを含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１９】
前記アジュバントが免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）を含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２０】
２個以上のクラミジア抗原を含む、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２１】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の２個以上を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２２】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の３個以上を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２３】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の４個以上を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２４】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の５個以上を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２５】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の６個以上を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２６】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の７個以上を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２７】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、及びＣＴ４７６ポリペプチド抗原を含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２８】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、（ａ）ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、及びＣＴ４７６ポリペプチド抗原から選択される第１のクラミジア抗原と；（ｂ）１つ以上のさらなるクラミジア抗原とを含む、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２９】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３１】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、（ａ）ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原と；（ｂ）ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原とを含む、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３２】
１つ以上のさらなるクラミジア抗原をさらに含む、請求項２１〜２５のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３３】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３４】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３５】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、（ａ）ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原と；（ｂ）ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原とを含む、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３６】
クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に対する免疫応答を誘発する、請求項１〜３５のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３７】
前記クラミジア抗原に対するＴ細胞媒介性免疫応答を誘発する、請求項１〜３６のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３８】
前記クラミジア抗原に対するＣＤ４＋  Ｔ細胞媒介性免疫応答を誘発する、請求項３７に記載の組成物。
【請求項３９】
前記クラミジア抗原に対するＣＤ８＋  Ｔ細胞媒介性免疫応答を誘発する、請求項３７に記載の組成物。
【請求項４０】
前記クラミジア抗原に対する抗体応答を誘発する、請求項１〜３９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４１】
前記免疫原性組成物がワクチンである、請求項１〜４０のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４２】
哺乳動物でクラミジアに対する免疫応答を誘発する方法であって、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される１つ以上の単離されたクラミジア抗原を含む免疫原性組成物を前記哺乳動物に投与するステップを含む方法。
【請求項４３】
クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に対する免疫応答を誘発する、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
前記クラミジア抗原に対するＴ細胞応答を誘発する、請求項４２に記載の方法。
【請求項４５】
前記クラミジア抗原に対するＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘発する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記クラミジア抗原に対するＣＤ４＋  Ｔ細胞応答を誘発する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
前記クラミジア抗原に対する抗体応答を誘発する、請求項４２に記載の方法。
【請求項４８】
前記クラミジア抗原に対するＩｇＧ応答を誘発する、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
前記クラミジア抗原に対するＩｇＡ応答を誘発する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５０】
前記免疫原性組成物が前記哺乳動物に少なくとも２回投与される、請求項４２に記載の方法。
【請求項５１】
前記哺乳動物が、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による感染のリスクがある、請求項４２に記載の方法。
【請求項５２】
前記哺乳動物が、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に感染している、請求項４２に記載の方法。
【請求項５３】
前記哺乳動物が雌性である、請求項４２に記載の方法。
【請求項５４】
前記哺乳動物がヒトである、請求項４２に記載の方法。
【請求項５５】
前記クラミジア抗原が少なくとも７アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項５６】
前記クラミジア抗原が少なくとも２０アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項５７】
前記クラミジア抗原が少なくとも５０アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項５８】
前記クラミジア抗原が少なくとも７５アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項５９】
前記クラミジア抗原が少なくとも１００アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項６０】
前記クラミジア抗原が少なくとも１２５アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項６１】
前記クラミジア抗原が少なくとも１５０アミノ酸を含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項６２】
前記クラミジア抗原が、対応する野生型ポリペプチド抗原に存在する対応する野生型配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を有する、請求項４２〜６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６３】
前記クラミジア抗原が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号２３、配列番号６３、又はその一部分から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項４２〜６２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６４】
前記クラミジア抗原が異種ポリペプチドと融合される、請求項４２〜６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
前記組成物が、薬学的に許容可能な賦形剤を含む、請求項４２〜６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６６】
前記組成物がアジュバントを含む、請求項４２〜６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６７】
前記アジュバントがミネラル含有アジュバントを含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
前記ミネラル含有アジュバントが水酸化アルミニウムを含む、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記アジュバントが免疫調節オリゴヌクレオチドを含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７０】
前記アジュバントが油乳剤を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７１】
前記アジュバントがサポニンを含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７２】
前記アジュバントが免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７３】
前記組成物が２個以上のクラミジア抗原を含む、請求項４２〜７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の２個以上を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の３個以上を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７６】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の４個以上を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７７】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の５個以上を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７８】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の６個以上を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７９】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、又はＣＴ４７６ポリペプチド抗原の７個以上を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項８０】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、及びＣＴ４７６ポリペプチド抗原を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項８１】
前記２個以上の単離されたクラミジア抗原が、（ａ）ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、及びＣＴ４７６ポリペプチド抗原からなる群から選択される第１のクラミジア抗原と；（ｂ）１つ以上のさらなるクラミジア抗原とを含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項８２】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項８１に記載の方法。
【請求項８３】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項８１に記載の方法。
【請求項８４】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、（ａ）ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原と；（ｂ）ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原とを含む、請求項８１に記載の方法。
【請求項８５】
前記組成物が、１つ以上のさらなるクラミジア抗原をさらに含む、請求項７４〜７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項８５に記載の方法。
【請求項８７】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原を含む、請求項８５に記載の方法。
【請求項８８】
前記１つ以上のさらなるクラミジア抗原が、（ａ）ＣＴ８５６ポリペプチド抗原、ＣＴ７５７ポリペプチド抗原、ＣＴ５６４ポリペプチド抗原、ＣＴ７０３ポリペプチド抗原、Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ０３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２５２ポリペプチド抗原、ＣＴ０６４ポリペプチド抗原、ＣＴ１３７ポリペプチド抗原、ＣＴ２０４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３４ポリペプチド抗原、ＣＴ６３５ポリペプチド抗原、ＣＴ３６６ポリペプチド抗原、ＣＴ１４０ポリペプチド抗原、ＣＴ１４２ポリペプチド抗原、ＣＴ２４２ポリペプチド抗原、ＣＴ８４３ポリペプチド抗原、ＣＴ３２８ポリペプチド抗原、ＣＴ１８８ポリペプチド抗原、ＣＴ５７８ポリペプチド抗原、ＣＴ７２４ポリペプチド抗原、ＣＴ７２２ポリペプチド抗原、ＣＴ７３２ポリペプチド抗原、ＣＴ７８８ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原と；（ｂ）ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原、ＣＴ１７２ポリペプチド抗原、ＣＴ４４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５２５ポリペプチド抗原、ＣＴ６０６ポリペプチド抗原、ＣＴ６４８ポリペプチド抗原、ＣＴ８７０ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される抗原とを含む、請求項８５に記載の方法。
【請求項８９】
ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、及びＣＴ４７６ポリペプチド抗原からなる群から選択されるクラミジア抗原をコードするヌクレオチド配列を含む単離核酸。
【請求項９０】
前記クラミジア抗原をコードするヌクレオチド配列が、対応する野生型ポリペプチド抗原に存在する対応する野生型配列と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を有する、請求項８９に記載の単離核酸。
【請求項９１】
前記ヌクレオチド配列が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号２３、配列番号６３、又はその一部分から選択されるアミノ酸配列を有するクラミジア抗原をコードする、請求項８９に記載の単離核酸。
【請求項９２】
前記クラミジア抗原と融合される異種ペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む、請求項８９に記載の核酸。
【請求項９３】
請求項８９〜９２のいずれか一項に記載の核酸と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含む組成物。
【請求項９４】
アジュバントをさらに含む、請求項９３に記載の組成物。
【請求項９５】
哺乳動物でクラミジアに対する免疫応答を誘発する方法であって、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される１つ以上のクラミジア抗原をコードする１つ以上の核酸を含む組成物を前記哺乳動物に投与するステップを含む方法。
【請求項９６】
ＣＴ０６２ポリペプチド、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される１つ以上の単離されたクラミジア抗原を含むキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本願は、２０１０年１０月２０日に出願された米国仮特許出願第６１／４０５，１６２号明細書に対する優先権を主張し、その全体が本明細書に参照により援用される。
【背景技術】
【０００２】
クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）は偏性細胞内細菌であり、眼又は泌尿生殖器管に対する異なるトロピズムを有する複数の血清型変種として存在する。泌尿生殖器型変種による感染は、尿道炎、子宮頸管炎、咽頭炎、直腸炎、精巣上体炎、及び前立腺炎などの様々な病態を引き起こし得る。未治療のクラミジア感染症は骨盤内炎症性疾患を引き起こすことがあり、次にはそれが子宮外妊娠、不妊症、及び慢性骨盤痛をもたらし得る。妊娠時の感染は、自然流産、早産、早期破水、低出生体重、及び新生児感染症などの重篤な合併症と関連付けられている（非特許文献１）。眼型変種のＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による感染は、トラコーマ、すなわち眼瞼及び角膜表面の結膜炎を引き起こすことがあり、予防可能な失明の主な原因である。ヒトにおけるＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の病理学的影響は大きな社会経済的負担であるとともに、工業先進国及び発展途上国の双方で進行中の公衆衛生問題でもある。米国だけで毎年推定４００万〜５００万件の新規クラミジア感染症症例が発生している。骨盤内炎症性疾患の年間の治療費は、１００億米ドルに上り得る。発展途上国世界でのＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）感染症の有病率は９０％を超え、推定５億人が高い感染リスクを有する（世界保健機関（Ｗｏｒｌｄ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ）、Ｓｅｘｕａｌｌｙ  Ｔｒａｎｓｍｉｔｔｅｄ  Ｄｉｓｅａｓｅｓ，２００８）。世界的に、クラミジア感染症を抑制する有効な免疫原性ワクチンが喫緊に必要とされている。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００３】
【非特許文献１】Ｎａｖａｒｒｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎ．Ｊ．Ｉｎｆ．Ｄｉｓ．１３（３）：１９５−２０７，２００２
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
本発明は、哺乳動物において抗原特異的免疫応答を誘発するクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）由来の新規抗原の発見を包含する。かかる新規抗原、及び／又はこの抗原をコードする核酸は、免疫原性組成物に組み込まれて投与されることにより免疫応答を誘発し、それにより例えば、クラミジア感染症及びクラミジア生物により引き起こされる疾患に対する防御を提供することができる。かかる新規抗原、及び／又は新規抗原に対する応答を検出することにより、クラミジア生物に対する免疫応答を同定し、及び／又は特徴付けることができる。
【０００５】
従って、一態様において、本発明は、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、及びそれらの組み合わせから選択される単離されたクラミジア抗原を含む免疫原性組成物（例えば、ワクチン）を提供する。一部の実施形態では、クラミジア抗原は完全長クラミジアポリペプチドを含む。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、完全長クラミジアポリペプチドの１つ又は複数の部分を含む。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、シグナル配列及び／又は膜貫通ドメインが欠損しているクラミジアポリペプチドを含む。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、完全長クラミジアポリペプチドと、発現宿主、例えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞株（例えば、バキュロウイルス発現系）、又は哺乳動物（例えば、ヒト又はチャイニーズハムスター卵巣）細胞株によるシグナル配列のプロセシング、又は部分的プロセシングから得られる断片との混合物を含む。本明細書で使用されるとき、用語「部分」及び「断片」、又は文法上の等価語は、同義的に使用される。
【０００６】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ０６２ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６２ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【０００７】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ５７２ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、ＣＴ５７２ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、配列番号３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、配列番号３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【０００８】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ０４３ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、ＣＴ０４３ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、配列番号５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、配列番号５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【０００９】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ５７０ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、ＣＴ５７０ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、配列番号７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、配列番号７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１０】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ１７７ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、ＣＴ１７７ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、配列番号９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、配列番号９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１１】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ７２５ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、ＣＴ７２５ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、配列番号１１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、配列番号１１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１２】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ０６７ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６７ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、配列番号２３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、配列番号２３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１３】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ４７６ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、ＣＴ４７６ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、配列番号６３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、配列番号６３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１４】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジアのクリプティックプラスミド由来のｐ６ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、ｐ６ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、配列番号６５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、配列番号６５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１５】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ３１０ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、ＣＴ３１０ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、配列番号６７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、配列番号６７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１６】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ６３８ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、ＣＴ６３８ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、配列番号６９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、配列番号６９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００１７】
【表１】
2013545448.tif 000002
【００１８】
【表２】
2013545448.tif 000003
【００１９】
【表３】
2013545448.tif 000004
【００２０】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、２個以上の単離されたクラミジア抗原を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の２個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の３個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の４個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の５個、６個、７個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択される８個のポリペプチド抗原を含む。
【００２１】
本明細書に記載される本発明のクラミジア抗原は、当該技術分野において公知のものなどの他のクラミジア抗原と共に使用されてもよい。一部の実施形態では、免疫原性組成物は２個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで２個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表１から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表２から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は２個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで２個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表１から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表３から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は２個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで２個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表２から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表３から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は３個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで３個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表１から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表２から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｃ）表３から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。
【００２２】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表２から選択される単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００２３】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表３から選択される単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００２４】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表２から選択される２個、３個、４個、５個又はそれ以上の単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００２５】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表３から選択される２個、３個、４個、５個又はそれ以上の単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００２６】
一部の実施形態では、クラミジア抗原は異種ポリペプチド（例えばエピトープタグ）と融合される。
【００２７】
一部の実施形態では、クラミジア抗原を含む免疫原性組成物は、薬学的に許容可能な賦形剤を含む。
【００２８】
一部の実施形態では、クラミジア抗原を含む免疫原性組成物はアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はミネラル含有アジュバントを含む。一部の実施形態では、ミネラル含有アジュバントは水酸化アルミニウムを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、免疫調節オリゴヌクレオチドを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はＩＣ３１（商標）アジュバント（Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌ  ＡＧ）を含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、毒素を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、エンドトキシンを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、ムラミルジペプチドを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、油乳剤を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、サポニンを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、非イオン性ブロック共重合体を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はウイルス様粒子（ＶＬＰ）を含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はレプリコンを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、リポソーム（ｌｉｐｏｓｏｓｍｅ）を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、微粒子を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、生分解性マイクロスフェアを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、サイトカインを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、リポペプチドを含むアジュバントを含む。
【００２９】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に対する免疫応答を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジア抗原に対するＴ細胞媒介性免疫応答（例えば、ＣＤ４＋  Ｔ細胞媒介性免疫応答及び／又はＣＤ８＋  Ｔ細胞媒介性免疫応答）を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物はＴｈ１  Ｔ細胞応答を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物はＴｈ１７  Ｔ細胞応答を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、抗原特異的Ｔ細胞によるＩＦＮ−γ分泌を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は細胞傷害性Ｔ細胞応答を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は抗体応答（例えば、ＩｇＧ応答、及び／又はＩｇＡ応答）を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物はＢ細胞媒介性免疫応答を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、Ｔ細胞媒介性及びＢ細胞媒介性の双方の応答を誘発する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は自然免疫応答を誘発する。
【００３０】
別の態様において、本発明は、哺乳動物においてクラミジアに対する免疫応答を誘発する方法を提供する。この方法は、例えば、表１、表２、又は表３から選択される単離されたクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせを含む免疫原性組成物、例えば、本明細書に記載される免疫原性組成物を哺乳動物に投与するステップを含む。
【００３１】
一部の実施形態では、方法は、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に対する免疫応答を誘発する。一部の実施形態では、方法は、クラミジア抗原に対するＴ細胞応答（例えば、ＣＤ４＋  Ｔ細胞媒介性免疫応答及び／又はＣＤ８＋  Ｔ細胞媒介性免疫応答）を誘発する。一部の実施形態では、方法はＴｈ１  Ｔ細胞応答を誘発する。一部の実施形態では、方法はＴｈ１７  Ｔ細胞応答を誘発する。一部の実施形態では、方法は、抗原特異的Ｔ細胞によるＩＦＮ−γ分泌を誘発する。一部の実施形態では、方法は抗体応答（例えば、ＩｇＧ応答、及び／又はＩｇＡ応答）を誘発する。一部の実施形態では、方法は細胞傷害性Ｔ細胞応答を誘発する。一部の実施形態では、方法はＢ細胞媒介性免疫応答を誘発する。一部の実施形態では、方法は、Ｔ細胞媒介性及びＢ細胞媒介性の双方の応答を誘発する。一部の実施形態では、方法は自然免疫応答を誘発する。
【００３２】
一部の実施形態では、方法は、組成物を投与された対象におけるクラミジア感染症の発生率を低下させる。一部の実施形態では、方法は、クラミジア生物による下部器官感染症の可能性を低下させる。一部の実施形態では、方法は、クラミジア生物による上部器官感染症の可能性を低下させる。一部の実施形態では、方法は、クラミジア生物による慢性感染症の可能性を低下させる。一部の実施形態では、方法は、クラミジア感染症に起因する骨盤内炎症性疾患に罹患する可能性を低下させる。一部の実施形態では、方法は、クラミジア感染症に続発する不妊症の可能性を低下させる。
【００３３】
方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は、哺乳動物に少なくとも２回（例えば、２回、３回、４回、又は５回）投与される。
【００３４】
一部の実施形態では、初回投与後に（すなわちブーストとして）投与される免疫原性組成物は、最初に投与される組成物と異なり、例えば組成物は異なるクラミジア抗原若しくは異なるサブセットのクラミジア抗原、又は異なるクラミジア抗原物質（ポリペプチド又はそれをコードする核酸）、又は異なる用量の抗原、又は異なるアジュバント、又は異なる用量のアジュバントを含む。一部の実施形態では、ブーストは、前回の投与と異なる経路によって投与される。
【００３５】
一部の実施形態では、哺乳動物は、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による感染のリスクがある。一部の実施形態では、哺乳動物はクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に感染している。一部の実施形態では、哺乳動物は雌性である。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【００３６】
一部の実施形態では、方法で投与される免疫原性組成物はアジュバントを含む。一部の実施形態では、アジュバントはミネラル含有アジュバントである。一部の実施形態では、方法で投与される免疫原性組成物は、薬学的に許容可能な賦形剤を含む。
【００３７】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はミネラル含有アジュバントを含む。一部の実施形態では、ミネラル含有アジュバントは水酸化アルミニウムを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、免疫調節オリゴヌクレオチドを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はＩＣ３１（商標）アジュバント（Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌ  ＡＧ）を含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、毒素を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、エンドトキシンを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、ムラミルジペプチドを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、油乳剤を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、サポニンを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、非イオン性ブロック共重合体を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はウイルス様粒子（ＶＬＰ）を含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物はレプリコンを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、リポソーム（ｌｉｐｏｓｏｓｍｅ）を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、微粒子を含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、生分解性マイクロスフェアを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、サイトカインを含むアジュバントを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、リポペプチドを含むアジュバントを含む。
【００３８】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ０６２ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６２ポリペプチド配列の７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００３９】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ５７２ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、ＣＴ５７２ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、配列番号３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、配列番号３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４０】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ０４３ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、ＣＴ０４３ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、配列番号５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、配列番号５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４１】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ５７０ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、ＣＴ５７０ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、配列番号７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、配列番号７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４２】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ１７７ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、ＣＴ１７７ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、配列番号９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、配列番号９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４３】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ７２５ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、ＣＴ７２５ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、配列番号１１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、配列番号１１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４４】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ０６７ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６７ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、配列番号２３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、配列番号２３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４５】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ４７６ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、ＣＴ４７６ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、配列番号６３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、配列番号６３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４６】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジアのクリプティックプラスミド由来のｐ６ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、ｐ６ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、配列番号６５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、配列番号６５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４７】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ３１０ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、ＣＴ３１０ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、配列番号６７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、配列番号６７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４８】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物はＣＴ６３８ポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、ＣＴ６３８ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、配列番号６９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、配列番号６９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。
【００４９】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は２個以上の単離されたクラミジア抗原を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の２個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の３個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の４個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択されるポリペプチド抗原の５個、６個、７個以上を含む。一部の実施形態では、２個以上の単離されたクラミジア抗原は、表１から選択される８個のポリペプチド抗原を含む。
【００５０】
提供される方法の一部の実施形態では、本明細書に記載される本発明のクラミジア抗原は、当該技術分野において公知のものを含む１つ以上のさらなるクラミジア抗原と共に使用される。一部の実施形態では、本発明の方法に好適な免疫原性組成物は、２個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで２個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表１から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表２から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は２個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで２個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表１から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表３から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は２個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで２個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表２から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表３から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は３個以上の単離されたクラミジア抗原を含み、ここで３個以上の単離されたクラミジア抗原は、（ａ）表１から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｂ）表２から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原と；（ｃ）表３から選択される１個以上のクラミジアポリペプチド抗原とを含む。
【００５１】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表２から選択される単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００５２】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表３から選択される単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００５３】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表２から選択される２個、３個、４個、５個又はそれ以上の単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００５４】
提供される方法の一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表３から選択される２個、３個、４個、５個又はそれ以上の単離されたクラミジアポリペプチド抗原を含む。
【００５５】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジア抗原と、異なる感染病原体由来の抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせと；パピローマウイルス（例えば、ヒトパピローマウイルス）由来の抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせと；ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス２型）由来の抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせと；淋菌（Ｎｅｉｓｓｉｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ）由来の抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせと；カンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）由来の抗原とを含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせと；パピローマウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス２型）、淋菌（Ｎｅｉｓｓｉｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ）、及びカンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）の１つ以上に由来する抗原とを含む。
【００５６】
別の態様において、本発明は、本明細書に記載されるクラミジア抗原をコードするヌクレオチド配列を含む単離核酸を提供する。一部の実施形態では、本発明は、表１、表２、表３から選択されるクラミジア抗原をコードするヌクレオチド配列、又はそれらの組み合わせを含む単離核酸を提供する。一部の実施形態では、核酸は、クラミジア抗原と融合される異種ペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む。
【００５７】
本発明はまた、本明細書に記載されるとおりのクラミジア抗原をコードする核酸を含む組成物も提供する。一部の実施形態では、組成物は、表１、表２、表３から選択されるクラミジア抗原をコードするヌクレオチド配列、又はそれらの組み合わせを含む単離核酸を含み、及び薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含む。一部の実施形態では、組成物はアジュバントをさらに含む。
【００５８】
さらに別の態様において、本発明は、本明細書に記載される核酸に基づき哺乳動物においてクラミジアに対する免疫応答を誘発する方法を提供する。一部の実施形態では、本発明は、核酸を含む組成物を哺乳動物に投与することにより、哺乳動物においてクラミジアに対する免疫応答を誘発する方法を提供し、ここで核酸は、表１、表２、表３から選択されるクラミジア抗原をコードするヌクレオチド配列、又はそれらの組み合わせを含む。
【００５９】
別の態様において、本発明は、対象におけるクラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせ）に対する免疫応答を特徴付け、及び／又は検出する方法を提供する。一部の実施形態では、未感作の対象における免疫応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、クラミジアに感染した対象、又はクラミジアに感染していることが疑われる対象における免疫応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、クラミジア抗原を含む免疫原性組成物（例えば、本明細書に記載される免疫原性組成物）を投与された対象における免疫応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、抗体応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、Ｂ細胞応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、Ｔ細胞応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、抗原特異的Ｔ細胞によるＩＦＮ−γ分泌が特徴付けられる。一部の実施形態では、Ｔｈ１  Ｔ細胞応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、Ｔｈ１７  Ｔ細胞応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、細胞傷害性Ｔ細胞応答が特徴付けられる。一部の実施形態では、Ｔ細胞応答及びＢ細胞応答の双方が特徴付けられる。一部の実施形態では、自然免疫応答が特徴付けられる。
【００６０】
本発明はさらに、クラミジア抗原を含む組成物、及びクラミジア抗原に特異的に結合する抗体の調製方法を提供する。
【００６１】
本明細書に記載される組成物及び方法は、任意のクラミジア疾患、障害、及び／又は病態、例えばクラミジア感染症に起因する尿道炎、子宮頸管炎、咽頭炎、直腸炎、精巣上体炎、前立腺炎、骨盤内炎症性疾患、及びトラコーマのいずれかの予防及び／又は治療に用いることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載される免疫原性組成物は、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態の１つ以上の症状又は特徴による感染リスクを低減し、及び／又はそれを治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させる。一部の実施形態では、クラミジア感染症の予防及び／又は治療は、本明細書に記載される新規クラミジア抗原を含む免疫原性組成物の治療有効量を、それを必要とする対象に対し、所望の結果を達成するために必要なだけの量及び回数で投与するステップを含む。本発明の特定の実施形態において本発明の免疫原性組成物の「治療有効量」は、クラミジア感染症の１つ以上の症状又は特徴を治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させるのに有効な量である。
【００６２】
一部の実施形態では、本発明の予防的、予後診断的及び／又は治療的プロトコルには、Ｔ細胞及びＢ細胞の一方又は双方における免疫応答が刺激されるように、新規クラミジア抗原を含む１つ以上の免疫原性組成物の治療有効量を対象に投与するステップが含まれる。
【００６３】
本発明は、治療有効量の１つ以上のクラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原の１つ以上、又はそれらの組み合わせ）と、１つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤とを含む新規免疫原性組成物を提供する。一部の実施形態では、本発明は、本明細書に記載されるとおりの免疫原性組成物を含む医薬組成物を提供する。一部の実施形態では、本発明の組成物を含む医薬組成物を、それを必要とする対象（例えばヒト、例えば、小児、青年、又は若年成人）に投与する方法が提供される。
【００６４】
一部の実施形態では、治療有効量の免疫原性組成物は、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態と診断される前、診断と同時、及び／又は診断の後に患者及び／又は動物に送達される。一部の実施形態では、治療量の本発明の免疫原性組成物は、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態の症状が発症する前、発症と同時、及び／又は発症の後に患者及び／又は動物に送達される。
【００６５】
一部の実施形態では、本発明の免疫原性組成物は、経口、筋肉内、皮下、経皮、皮内、直腸、腟内、粘膜、経鼻、口腔内、経腸、舌下を含む様々な経路のいずれかにより；気管内注入、気管支注入、及び／又は吸入により；及び／又は経口スプレー、鼻腔内スプレー、及び／又はエアロゾルとして投与される。一部の実施形態では、本発明の免疫原性組成物は、静脈内、動脈内、髄内、髄腔内、脳室内、経皮、腹腔内、局所（散剤、軟膏、クリーム、及び／又はドロップによるなど）、経皮を含む様々な経路により、又は気管内注入により投与される。
【００６６】
特定の実施形態において、免疫原性組成物は、クラミジア感染症の症状を（例えば、エリスロマイシン又はテトラサイクリンなどの抗生物質により）治療する１つ以上のさらなる治療剤と併用して投与されてもよい。
【００６７】
本発明は、本発明の免疫原性組成物の１つ以上を含む様々なキットを提供する。例えば、本発明は、クラミジア抗原を含む免疫原性組成物、又は抗原をコードする核酸（ここで抗原は、表１、表２、表３、又はそれらの組み合わせから選択される）と；使用説明書とを含むキットを提供する。キットは複数の異なるクラミジア抗原を含み得る。キットは、多数のさらなる構成要素又は試薬のいずれかを任意の組み合わせで含み得る。本発明の特定の実施形態によれば、キットは、例えば、（ｉ）表１、表２、表３から選択されるクラミジアポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせと；（ｉｉ）アジュバントと；（ｉｉｉ）クラミジア抗原及びアジュバントを含む組成物を、それを必要とする対象に投与することについての指示書とを含み得る。
【００６８】
本願は、様々な発行済み特許、公開特許出願、学術論文、アミノ酸及び核酸配列情報を含むデータベースエントリー、並びに他の文献を参照し、その全てが参照により本明細書に援用される。
共に図面を構成する以下に記載される図は、例示を目的としているに過ぎず、限定を目的とするものではない。
【図面の簡単な説明】
【００６９】
【図１】同定された抗原がそれぞれヒトドナーＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞により認識された頻度を示す例示的グラフを示す。ヒトドナーは、確認されているクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）曝露又は性器感染症の病歴を有する女性とした。ドナーは、細菌に繰り返し曝露しているが感染はしていない場合、又は感染したものの医学的介入なしにその感染が排除された場合、「防御あり」に分類された。ドナーは、持続的に感染している場合、又はその感染が骨盤内炎症性疾患などのより重篤な合併症に進行した場合、「防御なし」に分類された。陰性対照の評価並びにドナー及びプレート変動の正規化に基づき、陰性対照に対する応答値の倍数比が１．６３（ＣＤ４＋）又は１．６６（ＣＤ８＋）より大きい場合、ドナーを「レスポンダー」に分類した。１０％を超えるレスポンダーの割合が、偶然のみに起因するより多いレスポンダー数を示した。レスポンダーの割合が１５％より多い（陰性対照を含む全ドナー）又は約１９％（防御ありドナー及び防御なしドナー）であるとき、統計的に有意となった。図１は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての例示的結果を示す。図２は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての別の例示的結果を示す。４個のＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）タンパク質が、防御なしドナーと比較して防御ありにおいて統計的により高頻度でＣＤ４＋又はＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導した（それぞれ２つずつのクローン）（ｐ値０．０５）。防御ありドナーにおいてより高頻度で、さらなる１６個のクローンがＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導し、及び６個のクローンがＣＤ４＋  Ｔ細胞応答を誘導した（ｐ値０．１）。臨床的にその感染から防御されているドナーでより高い頻度を示した抗原は防御免疫と相関があり、最良のワクチン製剤候補であった。図３は、全ドナー（防御あり及び防御なし）についてのＣＤ４＋、ＣＤ８＋、及び混合Ｔ細胞応答を示す例示的結果を示す。最も高い総頻度を示した抗原もまた、防御ありドナーで統計的により高い頻度を示したか否かに関わらず、ワクチン、診断及び予後判定での適用に魅力的な候補である。
【図２】同定された抗原がそれぞれヒトドナーＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞により認識された頻度を示す例示的グラフを示す。ヒトドナーは、確認されているクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）曝露又は性器感染症の病歴を有する女性とした。ドナーは、細菌に繰り返し曝露しているが感染はしていない場合、又は感染したものの医学的介入なしにその感染が排除された場合、「防御あり」に分類された。ドナーは、持続的に感染している場合、又はその感染が骨盤内炎症性疾患などのより重篤な合併症に進行した場合、「防御なし」に分類された。陰性対照の評価並びにドナー及びプレート変動の正規化に基づき、陰性対照に対する応答値の倍数比が１．６３（ＣＤ４＋）又は１．６６（ＣＤ８＋）より大きい場合、ドナーを「レスポンダー」に分類した。１０％を超えるレスポンダーの割合が、偶然のみに起因するより多いレスポンダー数を示した。レスポンダーの割合が１５％より多い（陰性対照を含む全ドナー）又は約１９％（防御ありドナー及び防御なしドナー）であるとき、統計的に有意となった。図１は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての例示的結果を示す。図２は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての別の例示的結果を示す。４個のＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）タンパク質が、防御なしドナーと比較して防御ありにおいて統計的により高頻度でＣＤ４＋又はＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導した（それぞれ２つずつのクローン）（ｐ値０．０５）。防御ありドナーにおいてより高頻度で、さらなる１６個のクローンがＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導し、及び６個のクローンがＣＤ４＋  Ｔ細胞応答を誘導した（ｐ値０．１）。臨床的にその感染から防御されているドナーでより高い頻度を示した抗原は防御免疫と相関があり、最良のワクチン製剤候補であった。図３は、全ドナー（防御あり及び防御なし）についてのＣＤ４＋、ＣＤ８＋、及び混合Ｔ細胞応答を示す例示的結果を示す。最も高い総頻度を示した抗原もまた、防御ありドナーで統計的により高い頻度を示したか否かに関わらず、ワクチン、診断及び予後判定での適用に魅力的な候補である。
【図３】同定された抗原がそれぞれヒトドナーＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞により認識された頻度を示す例示的グラフを示す。ヒトドナーは、確認されているクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）曝露又は性器感染症の病歴を有する女性とした。ドナーは、細菌に繰り返し曝露しているが感染はしていない場合、又は感染したものの医学的介入なしにその感染が排除された場合、「防御あり」に分類された。ドナーは、持続的に感染している場合、又はその感染が骨盤内炎症性疾患などのより重篤な合併症に進行した場合、「防御なし」に分類された。陰性対照の評価並びにドナー及びプレート変動の正規化に基づき、陰性対照に対する応答値の倍数比が１．６３（ＣＤ４＋）又は１．６６（ＣＤ８＋）より大きい場合、ドナーを「レスポンダー」に分類した。１０％を超えるレスポンダーの割合が、偶然のみに起因するより多いレスポンダー数を示した。レスポンダーの割合が１５％より多い（陰性対照を含む全ドナー）又は約１９％（防御ありドナー及び防御なしドナー）であるとき、統計的に有意となった。図１は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての例示的結果を示す。図２は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての別の例示的結果を示す。４個のＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）タンパク質が、防御なしドナーと比較して防御ありにおいて統計的により高頻度でＣＤ４＋又はＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導した（それぞれ２つずつのクローン）（ｐ値０．０５）。防御ありドナーにおいてより高頻度で、さらなる１６個のクローンがＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導し、及び６個のクローンがＣＤ４＋  Ｔ細胞応答を誘導した（ｐ値０．１）。臨床的にその感染から防御されているドナーでより高い頻度を示した抗原は防御免疫と相関があり、最良のワクチン製剤候補であった。図３は、全ドナー（防御あり及び防御なし）についてのＣＤ４＋、ＣＤ８＋、及び混合Ｔ細胞応答を示す例示的結果を示す。最も高い総頻度を示した抗原もまた、防御ありドナーで統計的により高い頻度を示したか否かに関わらず、ワクチン、診断及び予後判定での適用に魅力的な候補である。
【図４】クラミジア抗原がドナー血清中に存在するＩｇＧに結合した頻度、すなわちドナーＢ細胞応答を誘発した頻度を示す例示的結果を示す。パネルの左側は、全ドナー（防御あり及び防御なし）において最も高い総頻度でＩｇＧにより検出されたクラミジア抗原を示す。パネルの右側は、防御なしドナーと比較したとき防御ありドナーにおいて統計的により高頻度でＩｇＧにより検出されたクラミジア抗原を示す。
【図５Ａ】同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫したマウス由来のＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞において、同じ抗原で誘発した後のエキソビボで誘導されたＩＦＮ−γレベルを示す例示的結果を示す。図５Ａは、当初Ｔ細胞応答によって同定された抗原を示す例示的結果を示す。図５Ｂは、当初Ｂ細胞応答によって同定された抗原を示す例示的結果を示し、これらの抗原はある場合にはロバストなＴ細胞応答も誘発し得ることを実証している。
【図５Ｂ】同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫したマウス由来のＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞において、同じ抗原で誘発した後のエキソビボで誘導されたＩＦＮ−γレベルを示す例示的結果を示す。図５Ａは、当初Ｔ細胞応答によって同定された抗原を示す例示的結果を示す。図５Ｂは、当初Ｂ細胞応答によって同定された抗原を示す例示的結果を示し、これらの抗原はある場合にはロバストなＴ細胞応答も誘発し得ることを実証している。
【図６】各クラミジア抗原で免疫した後の同じ抗原に対するＩｇＧ抗体価を示す例示的結果を示す。パネルの左側に示される例示的結果は、当初Ｔ細胞応答によって同定された抗原（例えば図１、図２及び図３）が、ある場合にはロバストなＢ細胞応答も誘発し得ることを示している。
【図７Ａ】同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫し、続いてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）を腟内感染させたマウスにおける子宮腟部クラミジア負荷の低下を示す例示的結果を示す。図７Ａは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６２、ＣＴ０４３、及びＣＴ０６２＋ＣＴ０４３の組み合わせについての例示的結果を示す。図７Ｂは、代表的なクラミジアタンパク質抗原であるＣＴ６３８＋ＣＴ４７６の組み合わせについての例示的結果を示す。
【図７Ｂ】同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫し、続いてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）を腟内感染させたマウスにおける子宮腟部クラミジア負荷の低下を示す例示的結果を示す。図７Ａは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６２、ＣＴ０４３、及びＣＴ０６２＋ＣＴ０４３の組み合わせについての例示的結果を示す。図７Ｂは、代表的なクラミジアタンパク質抗原であるＣＴ６３８＋ＣＴ４７６の組み合わせについての例示的結果を示す。
【図８Ａ】同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫し、続いてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）を腟内感染させたマウスにおける上部生殖器系クラミジア負荷の低下を示す例示的結果を示す。図８Ａは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６２、ＣＴ０４３、及びＣＴ０６２＋ＣＴ０４３の組み合わせについての例示的結果を示す。ＵＶＥＢは、陽性対照である紫外線で不活化された全クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）基本小体で免疫したマウスの応答を示す。図８Ｂは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６７、ＣＴ０７８８ｔｍ、及びＣＴ３２８についての例示的結果を示す。
【図８Ｂ】同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫し、続いてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）を腟内感染させたマウスにおける上部生殖器系クラミジア負荷の低下を示す例示的結果を示す。図８Ａは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６２、ＣＴ０４３、及びＣＴ０６２＋ＣＴ０４３の組み合わせについての例示的結果を示す。ＵＶＥＢは、陽性対照である紫外線で不活化された全クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）基本小体で免疫したマウスの応答を示す。図８Ｂは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６７、ＣＴ０７８８ｔｍ、及びＣＴ３２８についての例示的結果を示す。
【図９】感染マウスの脾臓から採取して、且つ同定されたクラミジアタンパク質抗原で刺激したＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞におけるＩＦＮ−γの誘導を示す例示的結果を示す。例示される結果から、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による感染が同定された抗原に特異的なＴ細胞をプライミングし得ること、及びその抗原が再誘発時に防御性Ｔ細胞の標的となり得ることが示される。
【発明を実施するための形態】
【００７０】
本発明がさらに容易に理解されるようにするため、初めに以下に特定の用語を定義する。以下の用語及び他の用語のさらなる定義は、本明細書全体を通じて示される。
【００７１】
アジュバント：本明細書で使用されるとき、用語「アジュバント」は、抗原に対する免疫応答を変化させる（例えば亢進させる）薬剤を指す。一部の実施形態では、アジュバントは、対象に投与されるペプチド抗原に対する免疫応答を亢進させるために使用される。一部の実施形態では、アジュバントは、対象に投与される核酸によってコードされる抗原に対する免疫応答を亢進させるために使用される。
【００７２】
抗体：本明細書で使用されるとき、用語「抗体」は、天然であるか、又は完全に若しくは部分的に合成的に産生されるかに関わらず、任意の免疫グロブリンを指す。特異的結合能を維持するその全ての誘導体もまた、この用語に含まれる。この用語はまた、免疫グロブリン結合ドメインに相同な又は概して相同な結合ドメインを有する任意のタンパク質を包含する。かかるタンパク質は、天然の供給源に由来しても、又は部分的に若しくは完全に合成的に産生されてもよい。抗体はモノクローナル又はポリクローナルであってよい。抗体は、ヒトクラス：ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、及びＩｇＥのいずれかを含む任意の免疫グロブリンクラスのメンバーであってもよい。本明細書で使用されるとき、用語「抗体断片」又は「抗体の特徴的部分」は同義的に使用され、全長未満の抗体の任意の誘導体を指す。一般に、抗体断片は、完全長抗体の特異的結合能力の少なくとも実質的な部分を保持している。抗体断片の例としては、限定はされないが、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、ｓｃＦｖ、Ｆｖ、ｄｓＦｖダイアボディ、及びＦｄ断片が挙げられる。抗体断片は任意の手段により産生され得る。例えば、抗体断片は、インタクトな抗体を断片化することによって酵素的又は化学的に産生されてもよく、及び／又は部分抗体配列をコードする遺伝子から組換え産生されてもよい。それに代えて又は加えて、抗体断片は、完全に又は部分的に合成的に産生されてもよい。抗体断片は、場合により一本鎖抗体断片を含んでもよい。それに代えて又は加えて、抗体断片は、例えばジスルフィド結合によって互いに連結された複数の鎖を含んでもよい。抗体断片は、場合により多分子複合体を含んでもよい。機能的抗体断片は、典型的には少なくとも約５０アミノ酸を含むことができ、さらに典型的には少なくとも約２００アミノ酸を含むことができる。
【００７３】
抗原：用語「抗原」は、本明細書で使用されるとき、特異的免疫応答を誘発する分子（例えば、ポリペプチド）を指す。抗原特異的免疫応答は、適応免疫応答としても知られ、抗原受容体（例えば、Ｔ細胞受容体、Ｂ細胞受容体）を発現するリンパ球（例えば、Ｔ細胞、Ｂ細胞）によって媒介される。特定の実施形態において、抗原はＴ細胞抗原であり、細胞性免疫応答を誘発する。特定の実施形態において、抗原はＢ細胞抗原であり、体液性（すなわち、抗体）応答を誘発する。特定の実施形態において、抗原は、Ｔ細胞抗原及びＢ細胞抗原の双方である。本明細書で使用されるとき、用語「抗原」は、完全長ポリペプチドも、並びにかかる完全なポリペプチドの免疫原性断片（すなわち、抗原特異的なＴ細胞応答、Ｂ細胞応答、又はその双方を誘発する断片）に相当するポリペプチドの一部分も包含する。一部の実施形態では、抗原は、ポリペプチド配列内に存在するペプチドエピトープ（例えば、主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）分子が結合するペプチドエピトープ（例えば、ＭＨＣクラスＩ、又はＭＨＣクラスＩＩ）である。従って、５〜１５アミノ酸長のペプチド、及びそれより長い、例えば、６０、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、２００、２５０個、又はそれ以上のアミノ酸を有するポリペプチドは、「抗原」であり得る。一例において、本発明はＣＴ０６２ポリペプチド抗原を提供する。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、完全長ＣＴ０６２ポリペプチドアミノ酸配列（例えば、配列番号１の完全長ＣＴ０６２ポリペプチド）を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６２ポリペプチドの一部分（例えば、配列番号１のＣＴ０６２ポリペプチドの一部分、この一部分は、配列番号１の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸を含む）を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、天然に存在する野生型ＣＴ０６２ポリペプチド配列からの１つ以上のアミノ酸改変（例えば、欠失、置換、及び／又は挿入）を含む。例えば、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１又はその一部分（例えば、配列番号１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸）と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含み得る。或いは、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一である配列の一部分（例えば、少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸）を含み得る。ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は例として用いられる。この概念は、限定はされないが、ＣＴ５７２、ＣＴ０４３、ＣＴ５７０、ＣＴ１７７、ＣＴ７２５、ＣＴ０６７、ＣＴ４７６、ｐ６、ＣＴ３１０、及びＣＴ６３８ポリペプチド抗原を含めた、本明細書に記載される他のポリペプチド抗原に適用可能である。
【００７４】
およそ：本明細書で使用されるとき、数に関連して用語「およそ（ａｐｐｒｏｘｉｍａｔｅｌｙ）」又は「約（ａｂｏｕｔ）」は、概して、特に指定されない限り、又は他の形で文脈上明らかでない限り、その数の（その数より大きい又はより小さい）いずれの方向にも５％、１０％、１５％、又は２０％の範囲内に入る数値を含む（かかる数値が可能な値の０％未満又は１００％超となる場合を除く）ものと解釈される。
【００７５】
クラミジア抗原：本明細書で使用されるとき、用語「クラミジア抗原」は、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）生物、クラミジア・シッタシ（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｐｓｉｔｔａｃｉ）生物、又はクラミジア・ニューモニエ（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）生物、クラミジア・スイス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｕｉｓ）生物、クラミジア・ムリダルム（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｍｕｒｉｄａｒｕｍ）生物など、クラミジア属（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ）の任意の生物に対する抗原特異的免疫応答を誘発する抗原を指す。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、複数の種（例えば、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）、クラミジア・シッタシ（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｐｓｉｔｔａｃｉ）、及びクラミジア・ニューモニエ（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）のうちの２つ又は３つ）のクラミジア生物に対する抗原特異的免疫応答を誘発する。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、複数の血清型（例えば、Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の血清型Ａ、Ｂ、Ｂａ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｊ、Ｋ、Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３の１つ以上）のクラミジア生物に対する抗原特異的免疫応答を誘発する。クラミジア抗原は、クラミジア遺伝子によりコードされる完全長ポリペプチド、並びにそのようなポリペプチドの免疫原性部分を含む。
【００７６】
免疫原性組成物：本明細書で使用されるとき、用語「免疫原性組成物」は、対象において免疫応答を誘導する分子を含む組成物を指す。一部の実施形態では、免疫原性組成物はポリペプチド又はペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、ポリペプチド又はペプチド抗原をコードする核酸を含む。免疫原性組成物は、複数の抗原に対する免疫応答を誘導する分子を含み得る。
【００７７】
インビトロ：本明細書で使用されるとき、用語「インビトロ」は、生物（例えば、動物、植物、及び／又は微生物）の体内ではなく、人工的な環境、例えば試験管又は反応槽内、細胞培養物中等で起こる事象を指す。
【００７８】
インビボ：本明細書で使用されるとき、用語「インビボ」は、生物（例えば、動物、植物、及び／又は微生物）の体内で起こる事象を指す。
【００７９】
単離された：用語「単離された」は、本明細書で使用されるとき、単離された実体が、それまで連係していた少なくとも１つの構成要素から分離されていることを意味する。他のほとんどの構成要素が取り除かれた場合、その単離された実体は「精製されている」。単離及び／又は精製及び／又は濃縮は、例えば、クロマトグラフィー、分画、沈殿、又は他の分離法を含め、当該技術分野において公知の任意の技法を用いて実施することができる。
【００８０】
核酸：本明細書で使用されるとき、用語「核酸」は、その広義の意味において、オリゴヌクレオチド鎖に組み込まれる、又は組み込むことのできる任意の化合物及び／又は物質を指す。一部の実施形態では、核酸は、リン酸ジエステル結合を介してオリゴヌクレオチド鎖に組み込まれる、又は組み込むことのできる化合物及び／又は物質である。本明細書で使用されるとき、用語「オリゴヌクレオチド」と「ポリヌクレオチド」とは同義的に使用することができる。一部の実施形態では、「核酸」は、ＲＮＡ並びに一本鎖及び／又は二本鎖ＤＮＡ及び／又はｃＤＮＡを包含する。さらに、用語「核酸」、「ＤＮＡ」、「ＲＮＡ」、及び／又は類似の用語には、核酸類似体、すなわちリン酸ジエステル骨格以外の骨格を有する類似体が含まれる。用語「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」には、互いの縮重種である、及び／又は同じアミノ酸配列をコードする全てのヌクレオチド配列が含まれる。核酸は、天然の供給源から精製したり、組換え発現系を使用して産生して、且つ場合により精製したり、化学的に合成したり等してもよい。適切な場合、例えば化学的に合成された分子の場合、核酸は、化学的に修飾された塩基又は糖、骨格修飾等を有する類似体などの、ヌクレオシド類似体を含むことができる。核酸配列は、特に指示されない限り５’から３’方向で提示される。
【００８１】
ポリペプチド：用語「ポリペプチド」は、本明細書で使用されるとき、概して、少なくとも３個のアミノ酸のポリマーというその当該技術分野で認知されている意味を有する。しかしながら、この用語はまた、特定の抗原ポリペプチドクラス、例えば、ＣＴ０６２ポリペプチド、ＣＴ５７２ポリペプチド、ＣＴ０４３ポリペプチド、ＣＴ５７０ポリペプチド、ＣＴ１７７ポリペプチド、及びＣＴ７２５ポリペプチドなどを指しても使用される。かかるクラスの各々について、本明細書は、かかるポリペプチドの既知の配列の例をいくつか提供する。しかしながら当業者は、用語「ポリペプチド」が、本明細書で「ポリペプチド抗原」を指して使用されるとき、本明細書に記載される配列を有するポリペプチドを包含するのみならず、ポリペプチドに対する抗原特異的な応答を誘発する種類の配列を有するポリペプチドも包含するのに十分な一般性を有するように意図されることを理解するであろう。例えば、「ＣＴ０６２ポリペプチド」は、配列番号１に示されるＣＴ０６２ポリペプチド、並びに配列番号１の配列の変種を有するポリペプチド及び配列番号１のポリペプチドに対する抗原特異的な応答を誘発する能力を維持するポリペプチドを含む。当業者は、タンパク質配列が概して免疫原性及び抗原特異性を破壊することなくいくらかの置換を許容することを理解する。従って、免疫原性を保持し、且つ同じクラスの別のポリペプチドと少なくとも約３０〜４０％、多くの場合に約５０％、６０％、７０％、又は８０％超の全体的な配列同一性を共有し、さらに通常は、多くの場合に１つ以上の高度に保存された領域において９０％超又はさらには９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％であるさらに高い同一性の少なくとも１つの領域であって、通常少なくとも３〜４個及び多くの場合に最大２０個又はそれ以上のアミノ酸を包含する領域を含む任意のポリペプチドが、本明細書で使用されるときの関連用語「ポリペプチド」の範囲内に包含される。類似性及び／又は同一性の他の領域は、当業者により、本明細書に提示される様々なポリペプチド配列の分析によって決定され得る。抗原の定義を参照のこと。
【００８２】
パーセント配列同一性及び配列類似性の決定に好適なアルゴリズムの一例はＢＬＡＳＴアルゴリズムであり、これについては、Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２，１９７７に記載される。本明細書に記載されるパラメータでＢＬＡＳＴを用いることにより、本開示の核酸及びタンパク質のパーセント配列同一性が決定される。ＢＬＡＳＴ解析を実行するソフトウェアは、国立バイオテクノロジー情報センター（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）から公的に利用可能である（以下のインターネットアドレスから利用可能：ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）。このアルゴリズムは、初めに、問い合わせ配列における長さＷの短いワードであって、データベース配列における同じ長さのワードとアラインメントしたときに一致するか、或いは何らかの正値の閾値スコアＴを満たすワードを特定することにより、ハイスコアリング配列対（ＨＳＰ）を特定することを含む。Ｔは隣接ワードスコア閾値と称される（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．、前掲）。これらの初期隣接ワードヒットが、その中に含まれるより長いＨＳＰを見付ける検索を開始する際の種として働く。ワードヒットは、累積アラインメントスコアが増加し得る限り、各配列に沿って両方向に拡張される。累積スコアは、ヌクレオチド配列については、パラメータＭ（一致する残基ペアに対する報酬スコア；常に＞０）及びＮ（ミスマッチを有する残基に対するペナルティスコア；常に＜０）を使用して計算される。アミノ酸配列については、スコアリング行列を使用して累積スコアが計算される。それぞれの方向におけるワードヒットの拡張は、以下の場合に停止される：累積アラインメントスコアが、それが達成した最大値から量Ｘだけ減少したとき；１つ以上の負のスコアを有する残基のアラインメントが蓄積したため累積スコアがゼロ以下になったとき；又はいずれかの配列の末端に達したとき。ＢＬＡＳＴアルゴリズムパラメータＷ、Ｔ、及びＸが、アラインメントの感度及び速度を決定する。ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列用）はデフォルトとしてワード長（Ｗ）１１、期待値（Ｅ）１０、Ｍ＝５、Ｎ＝−４及び両鎖比較を使用する。アミノ酸配列については、ＢＬＡＳＴＰプログラムはデフォルトとしてワード長３、及び期待値（Ｅ）１０、及びＢＬＯＳＵＭ６２スコアリング行列（Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ＆  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：１０９１５（１９８９）を参照のこと）アラインメント（Ｂ）５０、期待値（Ｅ）１０、Ｍ＝５、Ｎ＝−４、及び両鎖比較を使用する。
【００８３】
ＢＬＡＳＴアルゴリズムは、２つの配列間の類似性の統計的分析も実行する（例えば、Ｋａｒｌｉｎ  ＆  Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：５８７３−５７８７，１９９３を参照のこと）。ＢＬＡＳＴアルゴリズムにより提供される類似性の一つの尺度は最小和確率（ｓｍａｌｌｅｓｔ  ｓｕｍ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ）（Ｐ（Ｎ））であり、これは、２つのヌクレオチド配列間又はアミノ酸配列間の一致が偶然に起こる確率の指標を提供する。例えば、被験核酸と参照核酸との比較における最小和確率が約０．２未満、より好ましくは約０．０１未満、及び最も好ましくは約０．００１未満である場合、核酸は参照配列と類似していると見なされる。
【００８４】
対象：本明細書で使用されるとき、用語「対象」又は「患者」は、本発明の組成物を、例えば実験、診断、及び／又は治療を目的として投与し得る任意の生物を指す。典型的な対象としては、マウス、ラット、ウサギ、非ヒト霊長類、及びヒトなどの哺乳動物が挙げられる。
【００８５】
〜に罹患している：疾患、障害、及び／又は病態「に罹患している」個体は、その疾患、障害、及び／又は病態と診断されているか、又はその１つ以上の症状を示す。
【００８６】
〜に罹り易い：疾患、障害、及び／又は病態「に罹り易い」個体は、その疾患、障害、及び／又は病態とは診断されておらず、及び／又はその症状を呈していないこともある。一部の実施形態では、疾患、障害、及び／又は病態は、クラミジア感染症（例えば、Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）感染症、Ｃ．ニューモニエ（Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）感染症、又はＣ．シッタシ（Ｃ．ｐｓｉｔｔａｃｉ）感染症）と関連付けられる。一部の実施形態では、クラミジア感染症に罹り易い個体は、クラミジア微生物に（例えば、経口摂取、吸息、身体的接触等により）曝露されていることがあり得る。一部の実施形態では、クラミジア感染症に罹り易い個体は、微生物に感染している個体に曝露されていることがあり得る。一部の実施形態では、クラミジア感染症に罹り易い個体は、微生物が蔓延している場所にいる人（例えば、微生物が蔓延している場所を旅行中の人）である。一部の実施形態では、クラミジア感染症に罹り易い個体は、若齢（例えば、小児、青年、又は若年成人）に起因して罹り易い。一部の実施形態では、疾患、障害、及び／又は病態に罹り易い個体は、その疾患、障害、及び／又は病態を発症する。一部の実施形態では、疾患、障害、及び／又は病態に罹り易い個体は、その疾患、障害、及び／又は病態を発症しない。
【００８７】
治療有効量：本明細書で使用されるとき、用語「治療有効量」は、疾患、障害、及び／又は病態に罹患している又はそれに罹り易い対象に投与したとき、その疾患、障害、及び／又は病態の症状を治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、緩和し、それを予防し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させるのに十分な治療剤、予防剤、及び／又は診断剤（例えば、本発明の免疫原性組成物）の量を意味する。
【００８８】
治療剤：本明細書で使用されるとき、語句「治療剤」は、対象に投与したとき、治療的、予防的、及び／又は診断的効果を有し、及び／又は所望の生物学的及び／又は薬理学的効果を誘発する任意の薬剤を指す。
【００８９】
治療する：本明細書で使用されるとき、用語「治療する」は、特定の疾患、障害、及び／又は病態の１つ以上の症状又は特徴を部分的に又は完全に緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させることを指す。例えば、微生物感染を「治療する」とは、微生物の生存、成長、及び／又は蔓延を抑制することを指し得る。治療は、疾患、障害、及び／又は病態の徴候を呈していない対象に投与されても、及び／又は疾患、障害、及び／又は病態に関連する病状が発展するリスクを低下させることを目的として、疾患、障害、及び／又は病態の初期徴候のみを呈する対象に投与されてもよい。一部の実施形態では、治療は、対象への免疫原性組成物（例えば、ワクチン）の送達を含む。
【００９０】
ワクチン：本明細書で使用されるとき、用語「ワクチン」は、少なくとも１つの免疫原性成分（例えば、ペプチド又はタンパク質を含む免疫原性成分、及び／又は核酸を含む免疫原性成分）を含む実体を指す。特定の実施形態において、ワクチンは、少なくとも２つの免疫原性成分を含む。一部の実施形態では、ワクチンは、Ｔ細胞及びＢ細胞の双方の免疫応答を刺激する能力を有する。一部の実施形態では、Ｔ細胞及び／又はＢ細胞が刺激されたかどうかは、当該技術分野で利用可能な任意のアッセイを用いて決定され得る。一部の実施形態では、Ｔ細胞刺激は、抗原誘導性のサイトカイン産生、抗原誘導性のＴ細胞増殖、及び／又は抗原誘導性のタンパク質発現の変化を観察することによりアッセイされ得る。一部の実施形態では、Ｂ細胞刺激は、抗体価、抗体親和性、中和アッセイにおける抗体性能、クラススイッチ組換え、抗原特異的抗体の親和性成熟、記憶Ｂ細胞の発生、大量の高親和性抗体を長時間産生することができる長命形質細胞の発生、胚中心反応、及び／又は中和アッセイにおける抗体性能を観察することによりアッセイされ得る。一部の実施形態では、ワクチンは、Ｔ細胞及び／又はＢ細胞における免疫応答の刺激を促進し得る少なくとも１つのアジュバントをさらに含む。
【００９１】
野生型：本明細書で使用されるとき、用語「野生型」は、自然中に存在する典型的な又は最も一般的な形態を指す。
【００９２】
クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に感染すると粘膜組織に炎症及び損傷が生じ、尿道炎、子宮頸管炎、咽頭炎、直腸炎、精巣上体炎、前立腺炎、及びトラコーマなどの病態、並びにこれらの病態に続発する不妊症が引き起こされる。クラミジア菌は、主に上皮細胞に感染する細菌であり、２つの成長形態、基本小体（ＥＢ）と網様体（ＲＢ）とを交互に呈する。ＥＢ形態のクラミジアは感染性で、宿主細胞に侵入する。宿主細胞内で封入体を形成した後、ＥＢ形態はＲＢ形態に分化し、ある期間増殖してから分化し、ＥＢ形態に戻る。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）種は、主要外膜タンパク質（ＭＯＭＰ）に対する患者血清の応答性に基づく血清型に分類される。血清型Ａ、Ｂ、Ｂａ、及びＣは、結膜上皮の感染に関連する。血清型Ｄ〜Ｋは、泌尿生殖器管の感染に関連する。血清型Ｌ１〜Ｌ３は、泌尿生殖器管の感染及び全身症状の性病性リンパ肉芽腫に関連する。
【００９３】
クラミジア感染に対する応答では、適応免疫系の様々な機構が役割を果たしているものと思われる。Ｔｈ１サブタイプのＣＤ４＋  Ｔ細胞応答は、動物モデルにおいてクラミジア感染症の排除に重要であることが示されている（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７０：２７４１−２７５１，２００２）。Ｂ細胞応答はヒト及び非ヒト霊長類における防御免疫に寄与していると考えられる（Ｂｒｕｎｈａｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．３９：１４９１−１４９４，１９８３；Ｔａｙｌｏｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ．Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ．Ｖｉｓ．Ｓｃｉ  ２９：１８４７−１８５３，１９８８）。ＣＤ８＋  Ｔ細胞は溶解を起こす機能を有し、これは細胞内病原体の抑制に重要である。感染したヒトからクラミジア特異的ＣＤ８＋  Ｔ細胞が単離されており、クラミジア感染症への応答におけるこの細胞の役割が示唆される（Ｇｅｒｖａｓｓｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７１：４２７８−４２８６，２００３）。
【００９４】
本発明は、限定はされないが、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、及びＣＴ６３８ポリペプチド抗原を含む、感染哺乳動物の免疫細胞（例えば、Ｔ細胞及び／又はＢ細胞）によって認識されるクラミジア抗原を提供する。本明細書の実施例に記載されるとおり、これらの抗原は、生体内でのＴ細胞媒介性又はＢ細胞媒介性免疫の標的として発見された。従ってこれらの抗原は、有益な免疫応答を誘発し、それにより例えばクラミジア感染症及び関連する病態から防御することを目的とした、免疫応答を誘発する新規組成物を提供する。これらの抗原はまた、クラミジア感染症及びクラミジア感染症に対する免疫応答を特徴付けるための新規標的も提供する。
【００９５】
ＣＴ０６２ポリペプチドは、クラミジア生物の細胞質チロシルｔＲＮＡ合成酵素である。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ０６２ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号１及び２として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６２ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号１に示される配列又は配列番号１と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、又は４００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ０６２ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号１のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメインを欠損している（例えば、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原は、配列番号１のアミノ酸５５〜７４位を欠損している）。
【００９６】
ＣＴ５７２ポリペプチドは、一般的な分泌経路タンパク質Ｄとして知られる。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ５７２ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号３及び４として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、ＣＴ５７２ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号３に示される配列又は配列番号３と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、配列番号３に示される配列の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、又は７５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ５７２ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号３のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメイン及び／又はシグナル配列を欠損している（例えば、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原は、配列番号３のアミノ酸１〜２４位を欠損している）。
【００９７】
Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ０４３ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号５及び６として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、ＣＴ０４３ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号５に示される配列又は配列番号５と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、配列番号５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、又は１６０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ０４３ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号５のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメインを欠損している（例えば、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原は、配列番号５のアミノ酸７５〜９３位を欠損している）。
【００９８】
ＣＴ５７０ポリペプチドは、一般的な分泌経路タンパク質Ｆとして知られる。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ５７０ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号７及び８として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、ＣＴ５７０ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号７に示される配列又は配列番号７と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、配列番号７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ５７０ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号７のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメインを欠損している（例えば、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原は、配列番号７のアミノ酸１６４〜１８２位及び／又は２１１〜２３０位及び／又は３６３〜３８２位を欠損している）。
【００９９】
ＣＴ１７７ポリペプチドは、ジスルフィド結合シャペロンタンパク質である。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ１７７ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号９及び１０として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、ＣＴ１７７ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号９に示される配列又は配列番号９と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、配列番号９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１５０、又は２００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ１７７ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号９のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメイン及び／又はシグナル配列を欠損している（例えば、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原は、配列番号９のアミノ酸１〜３０位を欠損している）。
【０１００】
ＣＴ７２５ポリペプチドはビオチン合成酵素である。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ７２５ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号１１及び１２として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、ＣＴ７２５ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号１１に示される配列又は配列番号１１と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は、配列番号１１に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、又は１８０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ７２５ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号１１のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ７２６ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメインを欠損している（例えば、ＣＴ７２６ポリペプチド抗原は、配列番号１１のアミノ酸５１〜７５位及び／又は１１６〜１３６位を欠損している）。
【０１０１】
ＣＴ０６７ポリペプチドは、ＡＢＣトランスポータータンパク質である。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ０６７ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号２３及び２４として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、ＣＴ０６７ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号２３に示される配列又は配列番号２３と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、配列番号２３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２５個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ０６７ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号２３のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメイン及び／又はシグナル配列を欠損している（例えば、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原は、配列番号２３のアミノ酸１〜３３位及び／又はアミノ酸１１〜３１位を欠損している）。
【０１０２】
ＣＴ４７６ポリペプチドは、機能が不明である。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ４７６ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号６３及び６４として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、ＣＴ４７６ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号６３に示される配列又は配列番号６３と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、配列番号６３に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、又は３２０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ４７６ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号６３のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメイン及び／又はシグナル配列を欠損している（例えば、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原は、配列番号６３のアミノ酸１〜１８位及び／又はアミノ酸１〜２０位を欠損している）。
【０１０３】
クラミジアｐ６ポリペプチドは、プラスミドのビルレンス因子ＰＧＰ４−Ｄである。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ｐ６ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号６５及び６６として以下に示される。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、ｐ６ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号６５に示される配列又は配列番号６５と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、配列番号６５に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、又は１００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は完全長ｐ６ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号６５のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ｐ６ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメインを欠損している（例えば、ｐ６ポリペプチド抗原は、配列番号６５のアミノ酸５２〜６８位を欠損している）。
【０１０４】
ＣＴ３１０ポリペプチドは推定ＡＴＰ合成酵素サブユニットである。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ３１０ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号６７及び６８として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、ＣＴ３１０ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号６７に示される配列又は配列番号６７と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、配列番号６７に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、又は２００個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ３１０ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号６７のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメインを欠損している（例えば、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原は、配列番号６７のアミノ酸１１７〜１３６位を欠損している）。
【０１０５】
ＣＴ６３８ポリペプチドは、機能が不明である。Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の完全長ＣＴ６３８ポリペプチド由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号６９及び７０として以下に示される。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、ＣＴ６３８ポリペプチド配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸、例えば、配列番号６９に示される配列又は配列番号６９と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一の配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、配列番号６９に示される配列の少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４５、５０、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、又は２５０個の連続するアミノ酸と少なくとも６０％（例えば、少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は９８％）同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は完全長ＣＴ３１０ポリペプチドである（例えば、この抗原は配列番号６９のアミノ酸配列を含む）。一部の実施形態では、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、１つ以上の膜貫通ドメイン及び／又はシグナル配列を欠損している（例えば、ＣＴ６３８ポリペプチド抗原は、配列番号６９のアミノ酸１〜３３位及び／又はアミノ酸１３〜３１位を欠損している）。
【０１０６】
完全長ＣＴ８５６、ＣＴ７５７、ＣＴ５６４、ＣＴ７０３、Ｐ１−ＯＲＦ７、ＣＴ０６７、ＣＴ０３７、ＣＴ２５２、ＣＴ０６４、ＣＴ１３７、ＣＴ２０４、ＣＴ６３４、ＣＴ６３５、ＣＴ３６６、ＣＴ１４０、ＣＴ１４２、ＣＴ２４２、ＣＴ８４３、ＣＴ３２８、ＣＴ１８８、ＣＴ５７８、ＣＴ７２４、ＣＴ７２２、ＣＴ７３２、及びＣＴ７８８ポリペプチド抗原由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号１３〜６２として以下に示される。完全長ＣＴ１７２、ＣＴ４４３、ＣＴ５２５、ＣＴ６０６、ＣＴ６４８、及びＣＴ８７０ポリペプチド抗原由来の例示的アミノ酸及びヌクレオチド配列は、配列番号７１〜８２として以下に示される。
【０１０７】
表１のポリペプチド抗原は、互いの及び／又は他のクラミジア抗原との任意の組み合わせで提供され得る。一部の実施形態では、クラミジアポリペプチド抗原の組み合わせは、表１から選択される２個のポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、組み合わせは、表１から選択される３個のポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、組み合わせは、表１から選択される４個のポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、組み合わせは、表１から選択される５個のポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、組み合わせは、表１から選択される６個のポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、組み合わせは、表１から選択される７個のポリペプチド抗原を含む。一部の実施形態では、組み合わせは、表１から選択される８個のポリペプチド抗原を含む。
【０１０８】
表１から選択される１個以上のポリペプチド抗原との組み合わせで提供され得る他の抗原には、表２から選択される１個以上のポリペプチド抗原、及び／又は表３から選択される１個以上のポリペプチド抗原が含まれる。一部の実施形態では、抗原の組み合わせは、表１から選択される１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、又は８個のポリペプチド抗原と、表２から選択される１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、抗原の組み合わせは、表１から選択される１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、又は８個のポリペプチド抗原と、表３から選択される１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、抗原の組み合わせは、表１から選択される１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、又は８個のポリペプチド抗原と；表２から選択される１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のポリペプチド抗原と；表３から選択される１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のポリペプチド抗原とを含む。一部の実施形態では、抗原の組み合わせは、表２から選択される１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のポリペプチド抗原と、表３から選択される１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のポリペプチド抗原とを含む。抗原ＣＴ０６２、ＣＴ８４３、ＣＴ２４２、ＣＴ７３２、ＣＴ７８８、及びこれらの抗原の特異的エピトープについては、ＰＣＴ／ＵＳ２００７／００４６７５号明細書（国際公開第２００７／０９８２５５号パンフレットとして公開されている）、ＰＣＴ／ＵＳ２００８／００９２８２号明細書（国際公開第２００９／０２０５５３号パンフレットとして公開されている）、ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０１３２９８号明細書（国際公開第２００９／０７３１７９号パンフレットとして公開されている）、及びＰＣＴ／ＵＳ２００９／０６８４５７号明細書（国際公開第２００１０／０７８０２７号パンフレットとして公開されている）に記載され、これらの明細書の内容は全て、本明細書によって参照により援用される。本明細書に記載される新規抗原と組み合わせて提供され得るさらなるクラミジアポリペプチド抗原としては、多型膜タンパク質Ｄ（ＰｍｐＤ又はＣＴ８１２；ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿２２０３３２．１  ＧＩ：１５６０５５４６を参照のこと）、主要外膜タンパク質（ＭＯＭＰ又はｏｍｐＡ又はＣＴ６８１；ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿２２０２００．１  ＧＩ：１５６０５４１４を参照のこと）、ＣＴ８５８又はｃｐａｆ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿２２０３８０  ＧＩ：１５６０５５９４）、ＣＴ７１３又はＰｏｒＢ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿２２０２３２．１  ＧＩ：１５６０５４４６）、ＯＭＰ８５（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿２１９７４６．１  ＧＩ：１５６０４９６２）、ＣＴ３１５又はＲｐｏＢ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿２１９８２０．１  ＧＩ：１５６０５０３６）、ｐｇｐ３又はｐＯＲＦ  ５（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０４０３８４．１  ＧＩ：３２０５５２８）、ＣＴ３１６、ＣＴ７３７、又はＣＴ６７４が挙げられる。上述のポリペプチド、及びそれらをコードする核酸の配列は公知である。例えば、ＧｅｎＢａｎｋにおける受託番号ＮＣ＿０００１１７、ＧＩ：１５６０４７１７のＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）ゲノム配列、アノテートされた遺伝子、及びそこで関連付けられたポリペプチド配列を参照のこと。
【０１０９】
本発明はまた、本明細書に記載されるクラミジア抗原と、異なる感染病原体由来の抗原とを含む組成物も提供する。一部の実施形態では、組成物は、クラミジア抗原と、性感染症を引き起こす異なる感染病原体由来の抗原とを含む。一部の実施形態では、クラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせ）とパピローマウイルス抗原（例えば、ヒトパピローマウイルス抗原）とを含む組成物が提供される。一部の実施形態では、クラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせ）とヘルペスウイルス抗原（例えば、ヒト単純ヘルペスウイルス２型抗原）とを含む組成物が提供される。一部の実施形態では、クラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせ）と淋菌（Ｎｅｉｓｓｉｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａ）抗原とを含む組成物が提供される。一部の実施形態では、クラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせ）とカンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）抗原とを含む組成物が提供される。一部の実施形態では、クラミジア抗原（例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原、又はそれらの組み合わせ）と、パピローマウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、ＨＳＶ−２）、淋菌（Ｎｅｉｓｓｉｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ）、及びカンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）の１つ以上に由来する抗原とを含む組成物が提供される。
【０１１０】
アジュバント
免疫原性組成物の各種製剤を用いて免疫応答を誘導することができる。ヒトにおける一般的な投与経路は筋肉内（ｉ．ｍ．）注射によるが、免疫原性組成物はまた、経口的に、鼻腔内に、皮下に、吸入により、静脈内に、又は他の投与経路により適用されてもよい。ほとんどの場合、クラミジア抗原は、初めに所属リンパ節の未感作リンパ球に提示される。
【０１１１】
一部の実施形態では、クラミジア抗原組成物は精製成分（例えば精製抗原）を含む。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、他の分子、例えば、アジュバント活性を付与することのできるタンパク質、又は単離及び精製を促進する部分（例えばエピトープタグ）と融合される。
【０１１２】
一部の実施形態では、クラミジア抗原組成物はアジュバントを含む。一部の実施形態では、アジュバントはミネラル含有アジュバントを含む。ミネラル含有アジュバント（ａｊｄｕｖａｎｔ）は、ゲルとして、結晶形態に、非晶質形態に、粒子として等、製剤化することができる。ミネラル含有アジュバントとしては、例えば、アルミニウム塩及び／又はカルシウム塩（例えば、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、硫酸アルミニウム、リン酸カルシウム等）が挙げられる。一部の実施形態では、クラミジア抗原組成物は水酸化アルミニウムを含む。Ａｌｈｙｄｒｏｇｅｌ（商標）は、水酸化アルミニウムゲルアジュバントの例である。
【０１１３】
一部の実施形態では、アジュバントは免疫調節オリゴヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、免疫調節オリゴヌクレオチド配列はＣｐＧ（非メチル化シトシン−グアノシン）モチーフを含む。ＣｐＧモチーフを有するオリゴヌクレオチドは、ヌクレオチド類似体及び／又は天然に存在しないヌクレオシド間結合（例えば、ホスホロチオエート結合）を含むことができる。ＣｐＧモチーフを含む様々なオリゴヌクレオチドの例については、Ｋａｎｄｉｍａｌｌａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．３１（９）：２３９３−２４００，２００３；国際公開第０２／２６７５７号パンフレット；国際公開第９９／６２９２３号パンフレット；Ｋｒｉｅｇ，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９（７）：８３１−８３５，２００３；ＭｃＣｌｕｓｋｉｅ，ｅｔ  ａｌ．，ＦＥＭＳ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｄ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３２：１７９−１８５，２００２；国際公開第９８／４０１００号パンフレット；米国特許第６，２０７，６４６号明細書；米国特許第６，２３９，１１６号明細書及び米国特許第６，４２９，１９９号明細書を参照のこと。他の免疫調節ヌクレオチド配列  二本鎖ＲＮＡ配列、パリンドローム配列、及びポリ（ｄＧ）配列。
【０１１４】
一部の実施形態では、アジュバントはＩＣ３１（商標）（Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌ  ＡＧ）を含む。ＩＣ３１（商標）は、抗菌ペプチドのＫＬＫと免疫賦活性オリゴヌクレオチドのＯＤＮ１ａとを含む合成アジュバントであり、Ｔｏｌｌ様受容体９（ＴＬＲ９）アゴニストとして作用する。
【０１１５】
一部の実施形態では、アジュバントは毒素を含む。一部の実施形態では、毒素は、細菌性ＡＤＰリボシル化毒素、例えば、コレラ毒素、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）易熱性毒素、又は百日咳毒素である。一部の実施形態では、細菌毒素は無毒化形態のＡＤＰリボシル化毒素である（例えば、Ｂｅｉｇｎｏｎ，ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆ．Ｉｍｍｕｎ．７０（６）：３０１２−３０１９，２００２；Ｐｉｚｚａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｖａｃｃｉｎｅ  １９：２５３４−２５４１，２００１；Ｐｉｚｚａ，ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｔ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２９０（４−５）：４５５−４６１，２０００；Ｓｃｈａｒｔｏｎ−Ｋｅｒｓｔｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆ．Ｉｍｍｕｎ．６８（９）：５３０６−５３１３，２０００；Ｒｙａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆ．Ｉｍｍｕｎ．６７（１２）：６２７０−６２８０，１９９９；Ｐａｒｔｉｄｏｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｌｅｔｔ．６７（３）：２０９−２１６，１９９９；Ｐｅｐｐｏｌｏｎｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｖａｃｃｉｎｅｓ  ２（２）：２８５−２９３，２００３；及びＰｉｎｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｒｅｌｅａｓｅ  ８５（１−３）：２６３−２７０，２００２を参照のこと）。
【０１１６】
一部の実施形態では、アジュバントは、モノホスホリルリピドＡ又は３−デ−Ｏ−アシル化モノホスホリルリピドＡなどのエンドトキシンを含む（米国特許第４，９８７，２３７号明細書及び英国特許第２１２２２０４Ｂ号明細書を参照のこと）。
【０１１７】
一部の実施形態では、アジュバントは、ムラミルジペプチド（例えば、Ｎ−アセチル−ムラミル−Ｌ−スレオニル−Ｄ−イソグルタミン（ｔｈｒ−ＭＤＰ）、Ｎ−アセチル−ノルムラミル−１−アラニル−ｄ−イソグルタミン（ｎｏｒ−ＭＤＰ）、及びＮ−アセチルムラミル−１−アラニル−ｄ−イソグルタミニル−１−アラニン−２−（１’−２’−ジパルミトイル−ｓ−ｎ−グリセロ−３−ヒドロキシホスホリルオキシ）−エチルアミンＭＴＰ−ＰＥ）を含む。
【０１１８】
一部では、アジュバントは、油乳剤及び／又は乳化剤ベースのアジュバントを含む。一部の実施形態では、油乳剤アジュバントはフロイントアジュバント（例えば、完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）、又は不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ））を含む。一部の実施形態では、油乳剤アジュバントはスクアレン水乳剤、例えばＭＦ５９（Ｎｏｖａｒｔｉｓ；例えば、国際公開第９０１４８３７号パンフレットを参照）、又はＳｙｎｅｘアジュバント製剤（ＳＡＦ））を含む。一部の実施形態では、油乳剤は分散剤、例えばソルビタン又はマンニドのモノ−又はジ−Ｃ１２−Ｃ２４−脂肪酸エステル、例えば、モノステアリン酸ソルビタン、モノオレイン酸ソルビタン、又はモノオレイン酸マンニドを含む。スクアレン及び分散剤を含む油乳剤の例としては、Ａｒｌａｃｅｌ（商標）、Ｍｏｎｔａｎｉｄｅ（商標）ＩＳＡ−７２０、及びＭｏｎｔａｎｉｄｅ（商標）ＩＳＡ−７０３が挙げられる。他の油乳剤が、例えば国際公開第９５／１７２１０号パンフレット及び欧州特許第０３９９８４２号明細書に記載されている。
【０１１９】
一部の実施形態では、アジュバントはサポニンを含む。サポニンは、キラヤ・サポナリア（Ｑｕｉｌｌａｊａ  ｓａｐｏｎａｒｉａ）、サボンソウ（Ｓａｐｏｎａｒｉａ  ｏｆｆｉｃｉａｎａｌｉｓ）、スミラクス・オルナタ（Ｓｍｉｌａｘ  ｏｒｎａｔａ）、及び宿根カスミソウ（Ｇｙｐｓｏｐｈｉｌｌａ  ｐａｎｉｃｕｌａｔａ）などの植物から得られるステロイド配糖体及び／又はトリテルペノイド配糖体である。記載があり、且つクラミジア抗原用のアジュバントとして用いることのできるサポニン含有抽出物の画分としては、Ｑｕｉｌ（商標）Ａ、ＱＳ２１、ＱＳ７、ＱＳ１７、ＱＳ１８、ＱＨ−Ａ、ＱＨ−Ｂ、ＱＨ−Ｃ、及びＱｕｉｌＡが挙げられる（例えば、米国特許第５，０５７，５４０号明細書を参照のこと）。一部の実施形態では、ＱＳ２１がアジュバントとして使用される。
【０１２０】
一部の実施形態では、アジュバントは免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）を含む。ＩＳＣＯＭは、典型的にはグリコシド（例えばサポニン）及び脂質を含む粒子である。一部の実施形態では、ＩＳＣＯＭはサポニン及びコレステロールを含む。一部の実施形態では、ＩＳＣＯＭは、サポニン、コレステロール、及びリン脂質（例えば、ホスファチジルコリン及び／又はホスファチジルエタノールアミン）を含む。一部の実施形態では、ＩＳＣＯＭは非イオン性ブロック共重合体を含む。ＩＳＣＯＭは、さらなるアジュバント、例えば、本明細書に記載されるさらなるアジュバント物質を含み得る（例えば、国際公開第０５／００２６２０号パンフレットを参照のこと）。一部の実施形態では、ＩＳＣＯＭは、それを粘膜に標的化させる物質を含む（例えば、国際公開第９７／０３０７２８号パンフレットを参照のこと）。本明細書に提供されるクラミジア抗原と組み合わせるのに好適な他のＩＳＣＯＭ組成物及び組成物の配合物が、例えば、米国特許出願公開第２００６０１２１０６５号明細書、国際公開第００／０７６２１号パンフレット、国際公開第０４／００４７６２号パンフレット、国際公開第０２／２６２５５号パンフレット、及び国際公開第０６／０７８２１３号パンフレットに記載されている。一部の実施形態では、アジュバントは、ＡｂＩＳＣＯ（登録商標）アジュバント（例えば、Ｍａｔｒｉｘ−Ｍ（商標）、Ｉｓｃｏｎｏｖａ）を含む。一部の実施形態では、アジュバントはＡｂＩＳＣＯ（登録商標）−１００を含む。一部の実施形態では、アジュバントはＡｂＩＳＣＯ（登録商標）−３００を含む。
【０１２１】
一部の実施形態では、アジュバントは非イオン性ブロック共重合体を含む。非イオン性ブロック共重合体は、典型的には、疎水性ポリオキシプロピレンのブロックと組み合わされた様々な長さの疎水性ポリオキシエチレンの２本の鎖を含む。一部の実施形態では、非イオン性ブロック共重合体は、水中油型乳剤中に（例えば、油及びスクアレンと）製剤化される。
【０１２２】
一部の実施形態では、アジュバントはウイルス様粒子（ＶＬＰ）を含む。ＶＬＰは、典型的には１つ以上のウイルスタンパク質を含む非複製非感染性粒子であり、場合によりリン脂質などのさらなる成分と共に製剤化される。一部の実施形態では、ＶＬＰは、以下の１つ以上からのタンパク質を含む：インフルエンザウイルス（例えば、ヘマグルチニン（ｈｅｍａｇｌｕｔｉｎｉｎ）（ＨＡ）又はノイラミニダーゼ（ＮＡ）ポリプチド（ｐｏｌｙｐｔｉｄｅ））、Ｂ型肝炎ウイルス（例えば、コア又はカプシドポリペプチド）、Ｅ型肝炎ウイルス、麻疹ウイルス、シンドビスウイルス、ロタウイルス、口蹄疫ウイルス、レトロウイルス、ノーウォークウイルス、ヒトパピローマウイルス、ＨＩＶ、ＲＮＡファージ、Ｑβファージ（例えば、コートタンパク質）、ＧＡファージ、ｆｒファージ、ＡＰ２０５ファージ、Ｔｙ（例えば、レトロトランスポゾンＴｙタンパク質ｐ１）。例えば、国際公開第０３／０２４４８０号パンフレット、国際公開第０３／０２４４８１号パンフレット、国際公開第０８／０６１２４３号パンフレット、及び国際公開第０７／０９８１８６号パンフレットを参照のこと。
【０１２３】
一部の実施形態では、アジュバントはレプリコンを含む。レプリコンは、ウイルスタンパク質を含む非感染性の粒子である点でＶＬＰと類似しており、ポリペプチド（例えば抗原）をコードする核酸をさらに含む。一部の実施形態では、レプリコンは、アルファウイルス由来のタンパク質を含む。アルファウイルスとしては、例えば、東部ウマ脳炎ウイルス（ＥＥＥ）、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＶＥＥ）、エバーグレーズ（Ｅｖｅｒｇｌａｄｅｓ）ウイルス、ムカンボウイルス、ピクスナウイルス、西部ウマ脳炎ウイルス（ＷＥＥ）、シンドビスウイルス、セムリキ森林ウイルス、ミドルバーグ（Ｍｉｄｄｌｅｂｕｒｇ）ウイルス、チクングニヤウイルス、オニョンニョンウイルス、ロスリバーウイルス、バーマフォレストウイルス、ゲタウイルス、サギヤマウイルス、ベバルウイルス、マヤロウイルス、ウナウイルス、アウラウイルス、ワタロアウイルス、ババンキ（Ｂａｂａｎｋｉ）ウイルス、クイズイルアガシュ（Ｋｙｚｙｌａｇａｃｈ）ウイルス、ハイランドＪウイルス、フォートモーガン（Ｆｏｒｔ  Ｍｏｒｇａｎ）ウイルス、ヌドゥムウイルス、及びバギークリーク（Ｂｕｇｇｙ  Ｃｒｅｅｋ）ウイルスが挙げられる。一部の実施形態では、アジュバントは、本明細書に記載される１つ以上のクラミジア抗原をコードする核酸を含むレプリコンを含む。一部の実施形態では、アジュバントは、サイトカイン（例えば、インターロイキン−１２（ＩＬ−１２）、ＩＬ−２３、又は顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ））をコードするレプリコンを含む。レプリコンの産生及び使用については、例えば、国際公開第０８／０５８０３５号パンフレット、国際公開第０８／０８５５５７号パンフレット、及び国際公開第０８／０３３９６６号パンフレットに記載されている）。一部の実施形態では、ＶＬＰ又はレプリコンアジュバントは、１つ以上のクラミジア抗原を含む（すなわち、ＶＬＰ又はレプリコン粒子は、粒子の一部としてクラミジア抗原を含む）。一部の実施形態では、ＶＬＰ又はレプリコンアジュバントはクラミジア抗原ポリペプチドと同時投与される。
【０１２４】
一部の実施形態では、アジュバントはリポソームを含み、リポソームは、人工的に構築された球状の脂質小胞である（例えば、米国特許第４，０５３，５８５号明細書；同第６，０９０，４０６号明細書；及び同第５，９１６，５８８号明細書を参照のこと）。特定の実施形態において、リポソームに使用される脂質は、限定はされないが、以下の１つ又は複数であってよい：ホスファチジルコリン、リピドＡ、コレステロール、ドリコール、スフィンゴシン、スフィンゴミエリン、セラミド、グリコシルセラミド、セレブロシド、スルファチド、フィトスフィンゴシン、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルセリン、カルジオリピン、ホスファチジン酸、及びリゾリン脂質であってもよい。一部の実施形態では、アジュバントは、リポソームと、Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ；例えば、国際公開第２００５／０１３８９１号パンフレット、国際公開第２００５／０７９５１１号パンフレット、国際公開第２００５／０７９５０６号パンフレット、及び国際公開第２００５／０１３８９１号パンフレットを参照のこと）に対するリガンドとを含む。一部の実施形態では、アジュバントはＪＶＲＳ−１００を含む。ＪＶＲＳ−１００は、非コードオリゴヌクレオチド又はプラスミドと組み合わされたカチオン性リポソームを含む。
【０１２５】
一部の実施形態では、アジュバントは、ポリマー、例えば、アクリル酸又はメタクリル酸のポリマー、ポリホスファゼン、ポリカーボネート、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、乳酸又はグリコール酸の共重合体、ポリヒドロキシ酪酸、ポリオルトエステル、ポリ酸無水物、ポリシロキサン、ポリカプロラクトン、又はこれらのポリマーの単量体から調製された共重合体から構成される微粒子を含む。一部の実施形態では、アジュバントは、ポリビニルピロリドン、ポリビニルアルコール、ポリメタクリル酸ヒドロキシエチル、ポリアクリルアミド、ポリメタクリルアミド、及びポリエチレングリコールからなる群から選択されるポリマーから構成される微粒子を含む（例えば、米国特許第５，５００，１６１号明細書を参照のこと）。
【０１２６】
一部の実施形態では、アジュバントは、生分解性マイクロスフェア（例えば、ポリ（Ｄ，Ｌ−乳酸）、ポリ（Ｄ，Ｌ−グリコール酸）、ポリ（ε−カプロラクトン）、ポリ（α−ヒドロキシ酸）（ｐｏｌｙｅ（α−ｈｙｄｒｏｘｙ  ａｃｔｉｄ））、ポリヒドロキシ酪酸、ポリオルトエステル、ポリ酸無水物等から構成されるマイクロスフェア）を含む。
【０１２７】
一部の実施形態では、アジュバントはサイトカインを含む。一部の実施形態では、アジュバントはＩＬ−１２を含む。一部の実施形態では、アジュバントはＩＬ−２３を含む。一部の実施形態では、アジュバントはＧＭ−ＣＳＦを含む。
【０１２８】
一部の実施形態では、アジュバントはリポペプチドを含む。一部の実施形態では、アジュバントは、Ｐａｍ−３−Ｃｙｓリポペプチドを含む。一部の実施形態では、リポペプチドを含むアジュバントはＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）を活性化させる。
【０１２９】
修飾
本明細書に記載されるクラミジア抗原は、修飾を伴って又は伴わずに使用され得る。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、所望の免疫応答を誘発するように修飾され得る。一部の実施形態では、クラミジア抗原は、破傷風毒素（ｔｅｔａｔｕｓ  ｔｏｘｉｎ）、ニューモリシン、キーホールリンペットヘモシアニンなどの適切な免疫原性の担体とコンジュゲートされる。一部の実施形態では、クラミジアポリペプチド抗原は、例えば、リン酸化、ミリストイル化、アシル化、グリコシル化、糖化などにより、翻訳後修飾される。一部の実施形態では、クラミジアポリペプチド抗原は脂質化される。脂質部分とのコンジュゲーションは、直接的であっても、又は（例えばリンカーを介して）間接的であってもよい。脂質部分は、合成のものであっても、又は天然に産生されてもよい。一部の実施形態では、クラミジアポリペプチド抗原は脂質部分と化学的にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、クラミジアポリペプチド抗原をコードするＤＮＡコンストラクトが脂質化配列を含む。脂質化配列はポリペプチドのＮ末端側又はＣ末端側であってもよく、シグナル配列又は他の配列に組み込まれてもよい。例示的脂質化配列は、配列番号８３として示される大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）遺伝子ＲｌｐＢのシグナル配列である。
【０１３０】
一部の実施形態では、クラミジアポリペプチド抗原は別の分子と共有結合する。これにより、例えば、抗原の半減期、溶解度、バイオアベイラビリティ、又は免疫原性が増加し得る。抗原に共有結合し得る分子には、炭水化物、ビオチン、ポリ（エチレングリコール）（ＰＥＧ）、ポリシアル酸、Ｎ−プロピオニル化ポリシアル酸、核酸、多糖類、及びＰＬＧＡが含まれる。一部の実施形態では、天然に産生される形態のポリペプチドは、免疫系を刺激する部分と共有結合する。かかる部分の例は、脂質部分である。ある場合には、脂質部分はＴＬＲ２又はＴＬＲ４などのＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）によって認識され、自然免疫系を活性化する。
【０１３１】
核酸組成物及び抗原発現
様々な種類のベクターが、発現系（例えば宿主細胞）におけるクラミジア抗原の発現に好適である。一部の実施形態では、組成物は、例えばポリペプチド組成物を産生するための、インビトロ（細胞内であろうと、又は無細胞系内であろうと）での発現に好適なベクターを含む。用語「ベクター」は、連結された別の核酸を運ぶ能力を有する核酸分子を指し、例えば、プラスミド、コスミド又はウイルスベクターが含まれ得る。ベクターは自己複製能を有することができ、又は宿主ＤＮＡに組み込むことができる。ウイルスベクターとしては、例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルスが挙げられる。他の種類のウイルスベクターが当該技術分野において公知である。
【０１３２】
ベクターは、宿主細胞における核酸の発現に好適な形態のクラミジア抗原をコードする核酸を含み得る。組換え発現ベクターは、典型的には、発現させる核酸配列に作動可能に連結された１つ以上の調節配列を含む。調節配列には、プロモーター、エンハンサー及び他の発現制御エレメント（例えばポリアデニル化シグナル）が含まれる。調節配列には、ヌクレオチド配列の構成的発現を誘導するもの、並びに組織特異的な調節配列及び／又は誘導性配列が含まれる。クラミジア抗原をコードする配列は、抗原が宿主細胞から分泌されるようにシグナルペプチド（例えば、異種シグナルペプチド）をコードする配列を含み得る。発現ベクターの設計は、形質転換する宿主細胞の選択、所望のタンパク質発現レベルなどの要因に依存し得る。
【０１３３】
組換え発現ベクターは、原核細胞又は真核細胞でクラミジア抗原が発現及び産生するように設計することができる。例えば、抗原は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞（例えば、バキュロウイルス発現ベクターを使用）、酵母細胞又は哺乳動物細胞で発現させることができる。好適な宿主細胞は、Ｇｏｅｄｄｅｌ，Ｇｅｎｅ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ，１９９０でさらに考察されている。或いは、組換え発現ベクターは、インビトロで、例えばＴ７プロモーター調節配列及びＴ７ポリメラーゼを使用して転写及び翻訳されてもよい。
【０１３４】
原核生物におけるポリペプチドの発現は、多くの場合に、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）において、融合或いは非融合タンパク質の発現を誘導する構成的又は誘導性プロモーターを含むベクターにより実施される。融合ベクターは、そこでコードされるタンパク質、例えば組換えタンパク質のアミノ末端又はカルボキシ末端に複数のアミノ酸を付加し、それにより例えば、組換えタンパク質の発現を増加させ；組換えタンパク質の溶解度を増加させ；及び／又はアフィニティー精製においてリガンドとして作用することにより組換え抗原の精製を促進する。多くの場合に、融合タンパク質の精製後に組換え抗原を融合部分から分離することができるように、融合部分と組換え抗原との接合部にタンパク質分解切断部位が導入される。かかる酵素、及びその同種認識配列には、Ｘａ因子、トロンビン及びエンテロキナーゼが含まれる。典型的な融合発現ベクターとしては、ｐＧＥＸ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  Ｉｎｃ；Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｂ．ａｎｄ  Ｊｏｈｎｓｏｎ，Ｋ．Ｓ．Ｇｅｎｅ  ６７：３１−４０，１９８８）、ｐＭＡＬ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）及びｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）が挙げられ、これらはそれぞれグルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合タンパク質、又はプロテインＡを、標的組換えタンパク質に融合する。本明細書に提供されるクラミジア抗原発現ベクターには、酵母発現ベクター、昆虫細胞での発現用ベクター（例えば、バキュロウイルス発現ベクター）及び哺乳動物細胞での発現に好適なベクターが含まれる。
【０１３５】
哺乳動物細胞で使用される発現ベクターは、ウイルス調節エレメントを含み得る。例えば、一般的に使用されるプロモーターは、ポリオーマ、アデノウイルス２、サイトメガロウイルス及びシミアンウイルス４０に由来する。ベクターは、誘導性プロモーター、例えば、ステロイドホルモンによるか、ポリペプチドホルモンによるか（例えば、シグナル伝達経路を用いて）、又は異種ポリペプチド（例えば、テトラサイクリン誘導系の「Ｔｅｔ−Ｏｎ」及び「Ｔｅｔ−Ｏｆｆ」；例えば、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ  Ｉｎｃ．，ＣＡ，Ｇｏｓｓｅｎ  ａｎｄ  Ｂｕｊａｒｄ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：５５４７，１９９２、及びＰａｉｌｌａｒｄ，Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ９：９８３，１９８９を参照のこと）により調節されるプロモーターを含み得る。
【０１３６】
宿主細胞は、任意の原核細胞又は真核細胞であってよい。例えば、クラミジア抗原は、細菌細胞（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）など）、昆虫細胞、酵母又は哺乳動物細胞（チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）又はＣＯＳ細胞（アフリカミドリザル腎細胞ＣＶ−１起源のＳＶ４０細胞など；Ｇｌｕｚｍａｎ，Ｃｅｌｌ  ２３：１７５−１８２，１９８１）で発現することができる。他の好適な宿主細胞が当業者に公知である。
【０１３７】
ベクターＤＮＡは、従来の形質転換又はトランスフェクション技法によって宿主細胞に導入することができる。本明細書で使用されるとき、用語「形質転換」及び「トランスフェクション」は、リン酸カルシウム又は塩化カルシウム共沈殿、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介性のトランスフェクション、リポフェクション、遺伝子銃、又は電気穿孔を含め、外来核酸（例えば、ＤＮＡ）を宿主細胞に導入するための当該技術分野で認知されている様々な技法を指すことが意図される。
【０１３８】
宿主細胞を使用してクラミジア抗原を産生（すなわち発現）させることができる。従って、本発明はさらに、宿主細胞を使用してクラミジア抗原を産生する方法を提供する。一実施形態において、この方法は、宿主細胞（その中にクラミジア抗原をコードする組換え発現ベクターが導入されている）を、クラミジア抗原が産生されるような好適な培地で培養するステップを含む。別の実施形態において、この方法は、クラミジア抗原を培地又は宿主細胞から単離するステップをさらに含む。精製されたクラミジア抗原は、哺乳動物に投与することにより免疫応答の誘導、及び／又は抗原に特異的な抗体の生成に使用することができる。
【０１３９】
本発明はまた、例えば抗原に対する免疫応答を誘発するためにインビボで対象に投与される、クラミジア抗原をコードする核酸組成物も提供する。一部の実施形態では、インビボで投与される核酸組成物には、クラミジア抗原をコードするネイキッドＤＮＡプラスミドが含まれる。異種遺伝子の発現用の細菌ベクター、レプリコンベクター、弱毒生菌、及びウイルスベクターもまた使用することができる。弱毒生ウイルスベクター（例えば、組換えワクシニア（例えば、修飾ワクシニアアンカラ（ＭＶＡ）、ＩＤＴ  Ｇｅｒｍａｎｙ）、組換えアデノウイルス、トリポックスウイルス（例えば、カナリア痘（例えば、ＡＬＶＡＣ（商標）、Ａｖｅｎｔｉｓ  Ｐａｓｔｅｕｒ）又は鶏痘）、ポリオウイルス、及びアルファウイルスビリオンベクター）が、抗原に対する細胞媒介性の免疫応答の誘導に成功している。トリポックスウイルスは哺乳動物宿主では欠損しているが、初期プロモーター下にある挿入された異種遺伝子を発現し得る。組換えアデノウイルス及びポリオウイルスベクターは腸で育つことができ、そのため効率的な粘膜免疫応答を刺激することができる。最後に、弱毒化した細菌はまた、ＤＮＡワクチンデリバリー用の媒体としても使用することができる。好適な細菌の例としては、Ｓ．エンテリカ（Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｃａ）、ネズミチフス菌（Ｓ．ｔｙｍｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、リステリア属（Ｌｉｓｔｅｒｉａ）、及びＢＣＧが挙げられる。細胞壁が弱い突然変異菌を使用すると、ＤＮＡプラスミドが細菌から抜け出ることが促進され得る。
【０１４０】
免疫化に使用される核酸組成物は、アジュバント（例えば、ポリマー、サポニン、ムラミルジペプチド、リポソーム、免疫調節オリゴヌクレオチドなどのアジュバント、又は本明細書に記載される別のアジュバント）を含んでもよく、それにより核酸の取り込みを促進することができる。経路に関わらず、アジュバントは、核酸の投与前、投与中、又は投与後に投与することができる。一部の実施形態では、アジュバントにより、宿主細胞への核酸の取り込みが増加し、及び／又は細胞内での核酸からの抗原の発現が増加し、抗原提示細胞が組織のなかの抗原の発現領域に浸潤するよう誘導され、又はリンパ球によって提供される抗原特異的な応答が増加する。
【０１４１】
抗体
本発明は、特に、本明細書に記載される新規クラミジア抗原、例えば、ＣＴ０６２ポリペプチド抗原、ＣＴ５７２ポリペプチド抗原、ＣＴ０４３ポリペプチド抗原、ＣＴ５７０ポリペプチド抗原、ＣＴ１７７ポリペプチド抗原、ＣＴ７２５ポリペプチド抗原、ＣＴ０６７ポリペプチド抗原、ＣＴ４７６ポリペプチド抗原、ｐ６ポリペプチド抗原、ＣＴ３１０ポリペプチド抗原、又はＣＴ６３８ポリペプチド抗原に対する抗体、又はその抗原結合断片を提供する。抗体は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４）、ＩｇＭ、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤ、又はＩｇＥを含む様々なアイソタイプの抗体であり得る。一部の実施形態では、抗体は、ＩｇＧアイソタイプ、例えばＩｇＧ１である。クラミジア抗原に対する抗体は完全長（例えば、ＩｇＧ１又はＩｇＧ４抗体）であってもよく、又は抗原結合断片（例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ）２、Ｆｖ又は単鎖Ｆｖ断片）のみを含んでもよい。これらには、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ヒト抗体、及びヒト化抗体、並びに前述の抗原結合断片が含まれる。
【０１４２】
モノクローナル抗体は、従来のモノクローナル抗体法、例えば、Ｋｏｈｌｅｒ  ａｎｄ  Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ  ２５６：４９５，１９７５の標準的な体細胞ハイブリダイゼーション技法を含む様々な技法によって産生することができる。ポリクローナル抗体は、動物又はヒト対象の免疫化により産生することができる。概略的には、Ｈａｒｌｏｗ，Ｅ．ａｎｄ  Ｌａｎｅ，Ｄ．Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８８を参照のこと。本明細書に記載されるクラミジア抗原に対する抗体は、例えば、診断アッセイ、又は治療上の適用に使用することができる。
【０１４３】
本発明の一部の実施形態では、本明細書に記載される免疫原性組成物に対する対象の応答が評価され、それにより例えば、組成物の効力が決定され、及び／又は組成物により誘発された応答が、異なる組成物により誘発された反応と比較される。
【０１４４】
Ｔ細胞活性化アッセイ
一部の実施形態では、抗原又は組成物を特徴付け、及び／又は免疫応答がＴ細胞又はＴ細胞群で刺激されたかどうかを決定するため、様々なアッセイを利用することができる。一部の実施形態では、アッセイを用いて、免疫原性組成物を投与されて抗クラミジア応答が誘発された対象におけるＴ細胞応答が特徴付けられる（それにより例えば、検出可能なＴ細胞応答が誘発されたかどうかが評価され、及び／又は応答能が評価される）。本明細書に記載される新規クラミジア抗原はまた、クラミジア感染症に対する曝露を（例えば、ワクチン非接種の対象において）評価する診断用薬剤も提供する。一部の実施形態では、アッセイを用いて対象におけるＴ細胞応答が特徴付けられ、対象がクラミジア生物に感染しているかどうかが決定される。対象は、最近クラミジア生物に曝露したことが疑われる対象であってもよい（すなわち、応答を検出するアッセイは、クラミジア生物に曝露したと疑われる約３日後、４日後、５日後、６日後、７日後、８日後、９日後、１０日後、１４日後、３０日後、又はそれ以上後に対象から採取された試料で実施することができる）。対象は、アッセイの数週間前、数ヶ月前、又は数年前にクラミジア生物に曝露したことが疑われる対象であってもよい。本明細書に記載される新規クラミジア抗原はまた、クラミジア生物に対する曝露の転帰を（例えば、クラミジア生物に感染していることが分かっている、又は感染したことがある対象において）評価する予後診断用薬剤も提供する。一部の実施形態では、アッセイを用いて対象におけるＴ細胞応答が特徴付けられ、クラミジア生物による感染の続発症（例えば、骨盤内炎症性疾患及び不妊症）の可能性が評価される。
【０１４５】
一部の実施形態では、Ｔ細胞による抗原誘導性のサイトカイン産生を測定することにより、Ｔ細胞における免疫応答の刺激が決定される。一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答の刺激は、Ｔ細胞によるＩＦＮ−γ、ＩＬ−４、ＩＬ−２、ＩＬ−６、ＩＬ−１０、ＩＬ−１７及び／又はＴＮＦ−αの抗原誘導性の産生を測定することにより決定することができる。一部の実施形態では、Ｔ細胞による抗原誘導性のサイトカイン産生は、細胞内サイトカイン染色と、それに続くフローサイトメトリーにより測定することができる。他の好適な方法としては、表面捕捉染色と、それに続くフローサイトメトリー、又はＥＬＩＳＡ若しくはＥＬＩＳＰＯＴアッセイなどの、活性化されたＴ細胞培養物の上清中のサイトカイン濃度を決定する方法が挙げられる。
【０１４６】
一部の実施形態では、Ｔ細胞による抗原により生じるサイトカイン産生は、ＥＬＩＳＰＯＴアッセイにより測定される。ＥＬＩＳＰＯＴアッセイは、典型的にはサンドイッチ酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）技法と極めて類似した技法を用いる。抗体（例えばモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体等）が、ＰＶＤＦ（ポリフッ化ビニリデン）を敷いたマイクロプレートに無菌的にコーティングされる。抗体は、目的のサイトカインに対するその特異性について選択される。プレートが（例えば、アッセイ中の抗体のいずれとも反応性を有しない血清タンパク質により）ブロッキングされる。サイトカイン産生について試験される細胞が様々な密度で抗原又はマイトジェンと共に播かれ、次に加湿した３７℃のＣＯ２インキュベーターに特定の時間にわたり置かれる。活性化された細胞によって分泌されたサイトカインは、大きい表面積のＰＶＤＦ膜上にコーティングされた抗体によって局所的に捕捉される。ウェルを洗浄して細胞、デブリ、及び培地成分を取り除いた後、サイトカインに特異的な二次抗体（例えばビオチン化ポリクローナル抗体）がウェルに添加される。この抗体は標的サイトカインの特有のエピトープと反応性を有し、従って捕捉されたサイトカインの検出に用いられる。洗浄によって未結合のビオチン化抗体を全て取り除いた後、次にアビジン−ＨＲＰ、及び沈殿基質（例えば、ＡＥＣ、ＢＣＩＰ／ＮＢＴ）を使用して、検出されたサイトカインを可視化する。着色された最終産物（スポット、通常は赤色又は青色）が、典型的には個々のサイトカイン産生細胞に相当する。スポットは手動で数えてもよく（例えば、解剖顕微鏡により）、又は自動化されたリーダーを使用することによりマイクロウェルの像を取得して、スポット数及びサイズを解析してもよい。一部の実施形態では、各スポットが単一のサイトカイン産生細胞と関連付けられる。
【０１４７】
一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答は、抗原特異的Ｔ細胞の約１％〜約１００％がサイトカインを産生する場合に、刺激されたと言われる。一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答は、抗原特異的Ｔ細胞の少なくとも約１％、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９９％、又は約１００％がサイトカインを産生する場合に、刺激されたと言われる。
【０１４８】
一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答は、免疫された対象が、未感作の対照と比べて少なくとも約１０倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、少なくとも約５００倍、少なくとも約１０００倍、少なくとも約５０００倍、少なくとも約１０，０００倍、少なくとも約５０，０００倍、少なくとも約１００，０００倍、又は少なくとも約１００，０００倍超多いサイトカイン産生細胞を含む場合に、刺激されたと言われる。
【０１４９】
一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答の刺激は、抗原誘導性のＴ細胞増殖を測定することにより検出することができる。一部の実施形態では、抗原誘導性の増殖は、分裂Ｔ細胞におけるＨ３−チミジンの取り込みとして測定され得る（「リンパ球芽球化試験」、又は「ＬＴＴ」と称されることもある）。一部の実施形態では、抗原誘導性の増殖は、３Ｈ−チミジンの取り込み（γカウンタのカウント数として与えられる）が、未感作の対照と比べて少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２０倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、少なくとも約５００倍、少なくとも約１０００倍、少なくとも約５０００倍、少なくとも約１０，０００倍、又は少なくとも約１０，０００倍超高い場合に、起こったと言われる。
【０１５０】
一部の実施形態では、抗原誘導性の増殖は、フローサイトメトリーにより測定され得る。一部の実施形態では、抗原誘導性の増殖は、カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル（ＣＦＳＥ）希釈アッセイにより測定され得る。ＣＦＳＥは、非毒性の蛍光性膜透過性色素であり、細胞質タンパク質のアミノ基をスクシンイミジル反応基（例えば、Ｔ細胞タンパク質）と結合させる。細胞が分裂すると、ＣＦＳＥ標識タンパク質が娘細胞の間に均等に分配され、従って分裂する毎に細胞蛍光が半減する。結果的に、抗原特異的Ｔ細胞は、それぞれの抗原の存在下で培養した後その蛍光を失い（ＣＦＳＥｌｏｗ）、培養中の他の細胞（ＣＦＳＥｈｉｇｈ）と区別される。一部の実施形態では、抗原誘導性の増殖は、ＣＦＳＥ希釈率（全てのＣＦＳＥ＋細胞のうちのＣＦＳＥｌｏｗ細胞の割合として与えられる）が、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、又は少なくとも約１００％である場合に、起こったと言われる。
【０１５１】
一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答は、細胞活性化の細胞マーカーが、刺激されていない細胞と比べて異なるレベルで（例えば、より高い又はより低いレベル）で発現する場合、刺激されたと言われる。一部の実施形態では、ＣＤ１１ａ、ＣＤ２７、ＣＤ２５、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ４４、ＣＤ４５ＲＯ、及び／又はＣＤ６９が、刺激されていないＴ細胞と比べて活性化したＴ細胞でより高度に発現する。一部の実施形態では、Ｌ−セレクチン（ＣＤ６２Ｌ）、ＣＤ４５ＲＡ、及び／又はＣＣＲ７が、刺激されていないＴ細胞と比べて活性化したＴ細胞で発現がより低い。
【０１５２】
一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答は、抗原によりパルスされた標的細胞に対するエフェクターＣＤ８＋  Ｔ細胞によって細胞傷害性をアッセイすることにより測定される。例えば、５１クロム（５１Ｃｒ）遊離アッセイを実施することができる。このアッセイでは、エフェクターＣＤ８＋  Ｔ細胞が、クラスＩ  ＭＨＣ上でウイルスペプチドを提示する感染細胞と結合し、感染細胞にアポトーシスを起こすようシグナルを送る。エフェクターＣＤ８＋  Ｔ細胞が加わる前に細胞が５１Ｃｒで標識されている場合、上清中に遊離する５１Ｃｒの量は、死滅した標的の数に比例する。一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答はインビボ細胞傷害性アッセイにより測定され、ここでは標的細胞が抗原パルスされ、蛍光色素で標識され、次に免疫された動物に移される。特定の細胞溶解性Ｔ細胞が、関連抗原でパルスされる蛍光標識細胞の消失を引き起こし、しかしながら対照抗原でパルスされた細胞は減少しない。例えば、Ｃｏｌｉｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，３．１１．１４−１６，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，２００７を参照のこと。一部の実施形態では、Ｔ細胞における免疫応答は、パーフォリン、グランザイムＢ、又はＣＤ１０７ａの１つ以上の発現を（例えば、ＥＬＩＳＰＯＴ又はフローサイトメトリーにより）検出することにより測定される。例えば、Ｂｅｔｔｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．２８１（１−２）：６５−７８，２００３を参照のこと。
【０１５３】
Ｂ細胞活性化アッセイ
一部の実施形態では、免疫応答がＢ細胞又はＢ細胞群で刺激されたかどうかを決定し、それにより例えば、クラミジアに対する免疫原性組成物を投与された対象における抗体応答を特徴付けるため、又は対象がクラミジア生物に曝露されたかどうかを決定するため、様々なアッセイを利用することができる。一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答の刺激は、抗体価を測定することにより決定することができる。一般に、「抗体価」は、抗体が特定の希釈で抗原に結合する能力を指す。例えば、高抗体価は、高希釈であっても抗体が抗原に結合する能力を指す。一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答は、免疫されていない個体又は免疫前血清と比べて少なくとも約５倍高い、少なくとも約１０倍高い、少なくとも約２０倍高い、少なくとも約５０倍高い、少なくとも約１００倍高い、少なくとも約５００倍高い、少なくとも約１０００倍高い、又は約１０００倍超高い希釈で抗体価が陽性であると測定される場合に、刺激されたと言われる。
【０１５４】
一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答の刺激は、抗体親和性を測定することにより決定され得る。特に、Ｂ細胞における免疫応答は、平衡解離定数（Ｋｄ）が１０−７Ｍ未満、１０−８Ｍ未満、１０−９Ｍ未満、１０−１０Ｍ未満、１０−１１Ｍ未満、１０−１２Ｍ未満、又はそれ未満である抗体が誘発された場合に、刺激されたと言われる。
【０１５５】
一部の実施形態では、Ｂ細胞におけるＴ細胞依存性免疫応答は、クラススイッチ組換えが起こった場合に、刺激されたと言われる。特に、ＩｇＭから別のアイソタイプへの（例えば、ＩｇＧアイソタイプへの、又はＩｇＡへの、又はこれらの混合のアイソタイプへの）転換が、Ｂ細胞におけるＴ細胞依存性免疫応答を示すものである。
【０１５６】
一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答は、抗原特異的抗体の親和性成熟を測定することにより決定される。親和性成熟は胚中心反応で起こり、それにより活性化されたＢ細胞が、抗原結合領域をコードする免疫グロブリン遺伝子の領域を繰り返し変異させる。Ｂ細胞により産生される変異抗体は抗原に対する親和性がより高く、選択的に生存及び増殖させることが可能である。従って、時間の経過に伴い、ＧＣのＢ細胞によって作られる抗体は、漸増的により高い親和性を獲得する。一部の実施形態では、このプロセスで読み取られるのは、高抗体価（例えば高希釈であっても抗原を結合及び中和する高親和性ＩｇＧ抗体）の存在である。
【０１５７】
一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答は、大量の高親和性抗体を長時間産生することのできる記憶Ｂ細胞及び／又は長命形質細胞が形成された場合に、刺激されたと言われる。一部の実施形態では、大量の高親和性抗体を長時間産生することのできる記憶Ｂ細胞及び／又は長命形質細胞の存在を試験するため、ワクチン接種後異なる時間間隔（例えば２週間、１ヶ月、２ヶ月、６ヶ月、１年、２年、５年、１０年、１５年、２０年、２５年、又はそれ以上）が経った後に抗体価が測定される。一部の実施形態では、大量の高親和性抗体を長時間産生することのできる記憶Ｂ細胞及び／又は長命形質細胞は、体液性応答を測定することにより（例えば体液性応答が著しく速まり、後のブースターワクチン接種後の力価が初回感作における力価と比べて高くなる場合に）、存在すると言われる。
【０１５８】
一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答は、活発な胚中心反応が起こる場合に、刺激されたと言われる。一部の実施形態では、活発な胚中心反応は、組織学的実験を実施することにより視覚的に評価され得る。一部の実施形態では、活発な胚中心反応は、抗原含有リンパ組織（例えば、ワクチン流入領域リンパ節、脾臓等）の免疫組織化学を実施することによりアッセイされ得る。一部の実施形態では、免疫組織化学の後にフローサイトメトリーが行われる。
【０１５９】
一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答の刺激は、抗体アイソタイプ（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＭ）を同定することにより決定され得る。特定の実施形態では、Ｂ細胞によるＩｇＧアイソタイプ抗体の産生が、Ｂ細胞による望ましい免疫応答である。特定の実施形態において、Ｂ細胞によるＩｇＡアイソタイプ抗体の産生が、Ｂ細胞による望ましい免疫応答である。
【０１６０】
一部の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答は、中和アッセイで抗体機能を分析することにより決定される。一例では、インビトロで血清の非存在下に感受性細胞を感染させるクラミジア生物の能力が、細胞を成長させる培養培地に異なる希釈の免疫血清及び非免疫血清が添加されるときの条件と比較される。特定の実施形態では、Ｂ細胞における免疫応答は、クラミジア生物による感染が約１：５、約１：１０、約１：５０、約１：１００、約１：５００、約１：１０００、約１：５０００、約１：１０，０００、又はそれ未満の希釈で中和される場合に、刺激されたと言われる。クラミジアの中和アッセイについては、例えば、Ｐｅｅｌｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．４６：４８４−４８８，１９８４；及びＰｅｔｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．５９：４１４７−４１５３，１９９１に記載されている。
【０１６１】
インビボアッセイ
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、典型的に特定の病態（例えば、上部泌尿生殖器管感染症）又は細菌負荷を生じる用量のクラミジア生物に免疫マウス群及び非免疫マウス群を（例えば、ワクチン接種の３週間以上後に）感染させることによって特徴付けられ得る（それにより例えば、動物モデルにおいて有益な応答を誘導する効力が評価され得る）。両群の感染に起因する病態又は細菌負荷の重大さ及び持続期間がモニタされ、比較される。一例では、免疫マウス由来の血清を「受動ワクチン」として導入することによりＢ細胞応答が特徴付けられ、それにより感染の病理学的作用又は負荷からの非免疫マウスの防御が評価される。一部の実施形態では、白血球集合の浸潤が特徴付けられる（それにより例えば、感染領域の細胞の数及び種類、例えば、存在するのがＣＤ４＋  Ｔ細胞か、ＣＤ８＋  Ｔ細胞か、又は他の細胞型かどうかが評価される）。クラミジア泌尿生殖器感染症の動物モデルについては記載がある。一部の実施形態では、クラミジア生物は腟内接種として適用され、感染動物の下部及び上部生殖器官の１つ以上の感染及び病態が特徴付けられる。例えば、マウスにおける腟内感染モデルについて記載しているＢａｒｒｏｎ  ｅｔ  ａｌ．（Ｊ．Ｉｎｆｅｃｔ．Ｄｉｓ．１４３（１）：６３−６，１９８１）を参照のこと。一部の実施形態では、初感染の排除が、このモデルにおける防御免疫の尺度である。一部の実施形態では、Ｔｈ１サブタイプのＣＤ４＋  Ｔ細胞応答の検出が防御と相関する（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７０：２７４１−２７５１，２００２）。
【０１６２】
一部の実施形態では、免疫原性組成物はクラミジア感染症の動物モデルで評価される。一部の実施形態では、クラミジアによる下部尿生殖器官感染症がモデルで評価される（例えば、感染に起因する下部器官細菌負荷及び／又は炎症が評価される）。一部の実施形態では、クラミジアによる上部器官感染症がモデルで評価される（例えば、感染に起因する上部器官細菌負荷、炎症、不妊症、コラーゲン沈着、瘢痕の１つ以上が評価される）。一部の実施形態では、下部器官から上部生殖器官へのクラミジア感染症の上昇を予防する能力が評価される。一部の実施形態では、下部器官からの細菌排除率が評価される。一部の実施形態では、上部器官からの細菌排除率が評価される。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、対象動物の複数の系統（例えば、複数のマウス系統）の動物モデルで評価される。一部の実施形態では、卵管留水症（ファロピウス管の流体による遮断）の存在及びサイズが評価される。
【０１６３】
一部の実施形態では、望ましい免疫原性組成物は、インビボで（例えば動物モデルで）上記の作用のうちの１つ以上を有するものとして特徴付けられる。例えば、一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジア菌による下部尿生殖器官感染症を低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は下部器官細菌負荷を低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、感染に起因する下部器官炎症を低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジアによる上部器官感染症を低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、クラミジア感染症に起因する上部器官細菌負荷、炎症、不妊症、コラーゲン沈着、瘢痕のうちの１つ以上を低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、下部器官から上部生殖器官へのクラミジア感染症の上昇を低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、下部器官及び／又は上部器官からの細菌排除率を上昇させる。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、感染に起因する卵管留水症又は卵管炎の存在及び／又はサイズを低減する。一部の実施形態では、免疫原性組成物は、複数の動物系統（例えば、複数のマウス系統）で上記の作用のうちの１つ以上を有する。
【０１６４】
当業者は、上記に記載されるアッセイが、Ｔ細胞活性化及び／又はＢ細胞活性化が起こったかどうかを決定するために利用し得る例示的な方法に過ぎないことを認識するであろう。Ｔ細胞及び／又はＢ細胞の活性化が起こったかどうかを決定するために用い得る当業者に公知の任意のアッセイが、本発明の範囲内に含まれる。本明細書に記載されるアッセイ並びにＴ細胞及び／又はＢ細胞の活性化が起こったかどうかを決定するために用い得るさらなるアッセイについては、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｈｏｂｏｋｅｎ，ＮＹ，２００７；参照により本明細書に援用される）に記載されている。
【０１６５】
適用
本明細書に記載される組成物及び方法は、任意のクラミジア感染症、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態の予防及び／又は治療に用いることができる。本明細書で使用されるとき、「予防」は、クラミジア感染症、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態に起因する症状の発症前及び／又はクラミジア生物に対する予め分かっている曝露の前の使用を指す。対象としては、限定はされないが、ヒト及び／又は他の霊長類；並びにクラミジア生物に感染し易い他の動物、例えば、ウシ、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、及び／又はイヌなどの商業的に関連性のある哺乳動物；及び／又は鳥類、例えば、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、及び／又はシチメンチョウなどの商業的に関連性のある鳥類が挙げられる。
【０１６６】
一部の実施形態では、本発明に係る免疫原性組成物を用いることにより、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態の１つ以上の症状又は特徴を治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、それによる感染リスクを低下させ、及びその重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させ得る。一部の実施形態では、本発明の免疫原性組成物を用いることにより、クラミジア感染症（例えば、Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）感染症、Ｃ．ニューモニエ（Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）感染症、Ｃ．シッタシ（Ｃ．ｐｓｉｔｔａｃｉ）感染症）の１つ以上の症状又は特徴を治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させ得る。
【０１６７】
本発明の一態様において、クラミジア感染症の予防及び／又は治療方法が提供される。一部の実施形態では、クラミジア感染症の予防及び／又は治療は、本明細書に記載される免疫原性組成物の治療有効量を、それを必要とする対象に対し、所望の結果を達成するために必要なだけの量及び回数で投与するステップを含む。本発明の特定の実施形態において本発明の免疫原性組成物の「治療有効量」は、クラミジア感染症の１つ以上の症状又は特徴による感染リスクを低下させ、又はそれを治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させるのに有効な量である。治療有効量は集団に基づき決定されてもよく、特定の対象において防御反応を天然に誘導する量である必要はない。
【０１６８】
一部の実施形態では、本発明の予防的及び／又は治療的プロトコルは、１つ以上の本発明の免疫原性組成物の治療有効量を、健康な対象（すなわち、クラミジア感染症のいかなる症状も呈していない対象及び／又はクラミジア感染症と診断されたことがない対象）に投与するステップを含む。例えば、健康な個体に、クラミジア感染の発生前及び／又はクラミジア感染症の症状の発生前に本発明の免疫原性組成物を使用して予防接種してもよい；リスクを有する個体（例えば、クラミジア感染症に罹患している人に接触した患者、性感染症のリスクが高い患者、若齢に起因するリスクを有する人（例えば、小児、青年、又は若年成人））を、症状の発生及び／又はクラミジア感染症に対する曝露と実質的に同時に（例えば、その４８時間以内、２４時間以内、又は１２時間以内に）治療することができる。当然ながら、クラミジア感染症を有することが分かっている個体は、いつでも治療を受けることができる。
【０１６９】
一部の実施形態では、本発明の予防的及び／又は治療的プロトコルは、１つ以上の本発明の免疫原性組成物の治療有効量を、Ｔ細胞及びＢ細胞の双方で免疫応答が刺激されるように対象に投与するステップを含む。
【０１７０】
一部の実施形態では、１つ以上のクラミジア抗原及びアジュバントを組み合わせることにより、所与の徴候に最も望ましい種類の免疫応答、例えば、体液性応答、Ｔｈ１  Ｔ細胞応答、Ｔｈ１７  Ｔ細胞応答、抗原特異的Ｔ細胞によるＩＦＮ−γ分泌、細胞傷害性Ｔ細胞応答、抗体応答、Ｂ細胞応答、自然免疫応答、又はこれらの応答の組み合わせが選択的に誘発されるように免疫応答（例えばＴ細胞及び／又はＢ細胞応答）を調整することができる。
【０１７１】
免疫原性組成物
本発明は、新規クラミジア抗原、例えば、表１、表２、表３から選択されるポリペプチド抗原の１つ以上、又はそれらの組み合わせと、１つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤とを含む免疫原性組成物（例えば、ワクチン）を提供する。一部の実施形態において、本発明の免疫原性組成物を、それを必要とする対象に投与する方法が提供される。一部の実施形態では、本発明の組成物はヒトに投与される。本発明の目的上、語句「活性成分」は、概して、少なくとも１つのクラミジア抗原を含み、場合により１つ以上のさらなる薬剤、例えばアジュバントを含む本発明の免疫原性組成物を指す。
【０１７２】
本明細書に提供される免疫原性組成物の説明は、主としてヒトへの投与に好適な組成物に関するが、当業者は、かかる組成物が概してあらゆる種類の動物への投与に好適であることを理解するであろう。組成物を様々な動物に対する投与に好適なものとするための、ヒトへの投与に好適な免疫原性組成物の修飾は、十分に理解されており、獣医薬理学分野の当業者は、たとえあったとしても通常のものに過ぎない実験で、かかる修飾を設計及び／又は実施することができる。本発明の免疫原性組成物の投与が企図される対象としては、限定はされないが、ヒト及び／又は他の霊長類；哺乳動物（ウシ、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、及び／又はイヌなどの商業的に関連性のある哺乳動物を含む）；及び／又は鳥類（ニワトリ、アヒル、ガチョウ、及び／又はシチメンチョウなどの商業的に関連性のある鳥類を含む）が挙げられる。
【０１７３】
本明細書に記載される免疫原性組成物の製剤は、ワクチンの技術分野で公知の、又はこれから開発される任意の方法によって調製され得る。一部の実施形態では、かかる調製方法は、１つ又は複数の抗原（又は核酸ベースの適用向けに、抗原をコードする核酸）を、１つ以上の賦形剤及び／又は１つ以上の他の補助的な成分と組み合わせ、次に、必要である及び／又は望ましい場合には、その生成物を所望の単回又は複数回用量単位に成形及び／又は包装するステップを含む。
【０１７４】
本発明の免疫原性組成物は、バルクで、単回単位用量として、及び／又は複数の単回単位用量として調製、包装、及び／又は販売され得る。本明細書で使用されるとき、「単位用量」は、１つ又は複数の抗原の所定量を含む免疫原性組成物の個別の量である。
【０１７５】
本発明の組成物中の１つ又は複数の抗原、１つ又は複数の薬学的に許容可能な賦形剤、及び／又は任意のさらなる成分（例えばアジュバント）の相対的な量は、治療対象のアイデンティティ、体格、及び／又は状態に応じて異なり、さらには組成物を投与する経路に応じて異なり得る。
【０１７６】
本発明の免疫原性製剤は薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含んでもよく、賦形剤は、本明細書で使用されるとき、詳細な所望の剤形に適するとおりのあらゆる溶媒、分散媒、希釈剤、又は他の液体媒体、分散若しくは懸濁助剤、表面活性剤、等張剤、増粘剤又は乳化剤、防腐剤、固体結合剤、潤滑剤などを含む。Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，２１ｓｔ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ，（Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ，Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ，ＭＤ，２００６；参照により本明細書に援用される）が、医薬組成物の製剤化に使用される様々な賦形剤及びその公知の調製技法を開示している。任意の望ましくない生物学的作用を生じたり、又は他の有害な形で免疫原性組成物の任意の他の１つ又は複数の構成成分と相互作用したりするなど、任意の従来の賦形剤が物質又はその誘導体と適合しない場合を除き、その使用は本発明の範囲内にあるものと考えられる。
【０１７７】
一部の実施形態では、薬学的に許容可能な賦形剤は、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％純粋である。一部の実施形態では、賦形剤は、ヒトにおける使用及び獣医学的使用が承認されている。一部の実施形態では、賦形剤は、米国食品医薬品局（Ｆｏｏｄ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ）により承認されている。一部の実施形態では、賦形剤は医薬品グレードである。一部の実施形態では、賦形剤は、米国薬局方（Ｕｎｉｔｅｄ  Ｓｔａｔｅｓ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ：ＵＳＰ）、欧州薬局方（Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ：ＥＰ）、英国薬局方（Ｂｒｉｔｉｓｈ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ）、及び／又は国際薬局方（Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ）の基準に適合している。
【０１７８】
免疫原性組成物の製造に使用される薬学的に許容可能な賦形剤としては、限定はされないが、不活性な希釈剤、分散剤及び／又は造粒剤、表面活性剤及び／又は乳化剤、崩壊剤、結合剤、防腐剤、緩衝剤、潤滑剤、及び／又は油が挙げられる。かかる賦形剤は、場合により本発明の製剤中に含められ得る。
【０１７９】
注射用製剤、例えば、無菌注射用水性又は油性懸濁液が、好適な分散剤又は湿潤剤及び懸濁剤を使用して、公知の技術により製剤化されてもよい。無菌注射用製剤は、例えば１，３−ブタンジオール中の溶液としての、非毒性の非経口的に許容可能な希釈剤又は溶媒中の無菌注射用溶液、懸濁液又は乳剤であってもよい。用いられ得る許容可能な媒体及び溶媒の中には、水、リンゲル液、Ｕ．Ｓ．Ｐ．及び等張性塩化ナトリウム溶液がある。加えて、無菌の固定油が、溶媒又は懸濁媒として従来用いられている。この目的上、合成モノグリセリド又はジグリセリドを含む任意の無刺激固定油を用いることができる。加えて、オレイン酸などの脂肪酸が注射液の調製に用いられる。
【０１８０】
注射用製剤は、例えば、細菌保持フィルタによるろ過によるか、又は使用前に滅菌水若しくは他の無菌注射用媒体に溶解若しくは分散させることができる無菌固体組成物の形態の滅菌剤を組み込むことにより、滅菌することができる。
【０１８１】
免疫原性組成物の放出を持続させ、且つ注射部位近傍での抗原提示細胞による最大限の取り込みを刺激するため、多くの場合に、皮下注射又は筋肉内注射からの吸収を減速させることが望ましい。これは、水溶性が低い結晶質又は非晶質物質の液体懸濁物を使用することにより達成され得る。或いは、非経口的に投与される薬物形態の吸収の遅延は、その薬物を油媒体中に溶解又は懸濁することにより達成され得る。
【０１８２】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は粘膜表面に投与される。直腸投与又は腟内投与用の組成物としては坐薬を挙げることができ、坐薬は、本発明の免疫原性組成物を好適な賦形剤、例えば、カカオ脂、ポリエチレングリコール又は坐薬ワックスと混合して調製することができ、このような賦形剤は、周囲温度では固体だが、体温では液体であり、従って直腸又は腟腔で溶けて抗原を放出する。
【０１８３】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は経口投与される。経口投与用の固形剤形としては、カプセル、錠剤、丸薬、散剤、及び顆粒が挙げられる。かかる固形剤形では、抗原は、クエン酸ナトリウム又はリン酸二カルシウムなどの少なくとも１つの不活性な、薬学的に許容可能な賦形剤、及び／又はａ）デンプン、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトール、及びケイ酸などの充填剤又は増量剤、ｂ）結合剤、例えば、カルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリジノン、スクロース、及びアカシアなど、ｃ）グリセロールなどの保湿剤、ｄ）寒天、炭酸カルシウム、ジャガイモ又はタピオカデンプン、アルギン酸、特定のケイ酸塩、及び炭酸ナトリウムなどの崩壊剤、ｅ）パラフィンなどの溶解抑制剤、ｆ）第４級アンモニウム化合物などの吸収促進剤、ｇ）湿潤剤、例えば、セチルアルコール及びモノステアリン酸グリセロールなど、ｈ）カオリン及びベントナイト粘土などの吸収剤、及びｉ）タルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウム、及びこれらの混合物などの潤滑剤と混合され得る。カプセル、錠剤及び丸薬の場合、剤形は緩衝剤を含み得る。
【０１８４】
本明細書に記載される皮内経路による免疫原性組成物の送達に使用するのに好適な装置としては、米国特許第４，８８６，４９９号明細書；同第５，１９０，５２１号明細書；同第５，３２８，４８３号明細書；同第５，５２７，２８８号明細書；同第４，２７０，５３７号明細書；同第５，０１５，２３５号明細書；同第５，１４１，４９６号明細書；及び同第５，４１７，６６２号明細書に記載されるものなどの短針装置が挙げられる。液体ジェット注射器による、及び／又は角質層を穿刺してジェットを生じ、それを真皮に到達させる針による、液体の免疫原性組成物を真皮に送達するジェット注射装置が好適である。ジェット注射装置については、例えば、米国特許第５，４８０，３８１号明細書；同第５，５９９，３０２号明細書；同第５，３３４，１４４号明細書；同第５，９９３，４１２号明細書；同第５，６４９，９１２号明細書；同第５，５６９，１８９号明細書；同第５，７０４，９１１号明細書；同第５，３８３，８５１号明細書；同第５，８９３，３９７号明細書；同第５，４６６，２２０号明細書；同第５，３３９，１６３号明細書；同第５，３１２，３３５号明細書；同第５，５０３，６２７号明細書；同第５，０６４，４１３号明細書；同第５，５２０，６３９号明細書；同第４，５９６，５５６号明細書；同第４，７９０，８２４号明細書；同第４，９４１，８８０号明細書；同第４，９４０，４６０号明細書；及び国際公開第９７／３７７０５号パンフレット及び国際公開第９７／１３５３７号パンフレットに記載されている。圧縮ガスを使用して粉末形態の免疫原性組成物を加速させ、皮膚の外層を通って真皮に至らせるバリスティック粉末／粒子デリバリー装置が好適である。それに代えて又は加えて、皮内投与の古典的なマントー法で従来のシリンジを使用することができる。
【０１８５】
医薬品の製剤化及び／又は製造における一般的な考慮事項は、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ  ２１ｓｔ  ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ  Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ，２００５に見ることができる。
【０１８６】
投与
一部の実施形態では、本発明の免疫原性組成物の治療有効量は、クラミジア生物に曝露される又はクラミジア疾患、障害、及び／又は病態と診断される前、それと同時、及び／又はその後に、患者及び／又は動物に送達される。一部の実施形態では、本発明の組成物の治療量が、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態の症状が発生する前、それと同時、及び／又はその後に、患者及び／又は動物に送達される。一部の実施形態では、免疫原性組成物の量は、クラミジア疾患、障害、及び／又は病態の１つ以上の症状又は特徴による感染リスクを低下させ、又はそれを治療し、緩和し、寛解させ、軽減し、その発症を遅延させ、その進行を抑制し、その重症度を低減し、及び／又はその発生率を低下させるのに十分である。
【０１８７】
本発明の方法に係る免疫原性組成物は、治療に有効な任意の量及び任意の投与経路を用いて投与され得る。正確な所要量は、対象の種、年齢、及び全身状態、感染の重症度、詳細な組成物、その投与様式、その活性様式などに応じて対象毎に異なり得る。任意の特定の対象又は生物に対する具体的な有効用量レベルは、用いられる抗原組成物の免疫原性；用いられる具体的な組成物；使用するアジュバントの性質；対象の年齢、体重、全身状態、性別及び食事；投与時間、投与経路、及び医学分野で周知されている同様の要因を含めた、様々な要因に依存し得る。
【０１８８】
本発明の免疫原性組成物は、免疫応答を誘発する任意の経路によって投与され得る。一部の実施形態では、免疫原性組成物は皮下投与される。一部の実施形態では、免疫原性組成物は筋肉内投与される。一部の実施形態では、本発明の免疫原性組成物は、経口、静脈内、動脈内、髄内、髄腔内、脳室内、経皮、皮内、直腸、腟内、腹腔内、局所（散剤、軟膏、クリーム、及び／又はドロップによるなど）、経皮、粘膜、経鼻、口腔内、経腸、舌下を含む様々な経路により；気管内注入、気管支注入、及び／又は吸入により；及び／又は経口スプレー、鼻腔内スプレー、及び／又はエアロゾルとして投与される。
【０１８９】
特定の実施形態において、本発明の免疫原性組成物は、１μｇ〜５００μｇの範囲のタンパク質抗原を含む量で投与され得る。一部の実施形態では、約１０μｇ、２０μｇ、３０μｇ、５０μｇ、又は１００μｇの用量がヒトに投与される。
【０１９０】
一部の実施形態では、免疫原性組成物は、１回より多く（例えば、２回、３回、４回、５回）投与される。一部の実施形態では、初回免疫の約１週間後、２週間後、３週間後、１ヶ月後、３ヶ月後、６ヶ月後、１年後、又はそれ以上後にブーストが投与される。
【０１９１】
キット
本発明は、本明細書に記載される抗原の１つ以上を含む様々なキットを提供する。例えば、本発明は、新規クラミジア抗原と使用説明書とを含むキットを提供する。キットは複数の異なるクラミジア抗原を含み得る。キットは、多数のさらなる構成要素又は試薬のいずれかを任意の組み合わせで含み得る。様々な組み合わせの全てを明示的に記載するわけではないが、それぞれの組み合わせが本発明の範囲内に含まれる。
【０１９２】
本発明の特定の実施形態によれば、キットは、例えば、（ｉ）以下のクラミジア抗原の少なくとも１つを含む免疫原性組成物：ＣＴ０６２、ＣＴ５７２、ＣＴ０４３、ＣＴ５７０、ＣＴ１７７、ＣＴ７２５、ＣＴ０６７、ＣＴ４７６、ｐ６、ＣＴ３１０、又はＣＴ６３８ポリペプチド抗原；及び（ｉｉ）必要とする対象への組成物の投与についての説明書を含み得る。一部の実施形態では、キットはアジュバントをさらに含む。
【０１９３】
クラミジア抗原をコードする核酸を含むキットもまた提供される。特定の実施形態において、キットは、例えば、（ｉ）クラミジア抗原をコードする核酸を含む組成物；（ｉｉ）核酸組成物の使用説明書（例えば、抗原を産生する核酸の発現についての説明書、又は必要とする対象に組成物を投与することによるクラミジアに対する応答の誘発についての説明書）を含み得る。
【０１９４】
キットと共に含まれる説明書は、例えば、プロトコルを含んでもよく、及び／又は免疫原性組成物の産生及び／又は必要とする対象への免疫原性組成物の投与等に関する条件を記載してもよい。キットは、概して、個々の構成要素及び試薬の一部又は全てを個別に収容し得るように１つ以上のベッセル又は容器を含む。キットはまた、市販用に比較的厳重に密閉するようにして個々の容器を取り囲む手段、例えばプラスチック製の箱も含むことができ、そこに説明書、スタイロフォーム（ｓｔｙｒｏｆｏａｍ）等の包装材料が入れられてもよい。識別子、例えばバーコード、無線認証（ＩＤ）タグ等が、キット内若しくはキット上又はキットに含まれるベッセル若しくは容器の１つ以上に存在してもよい。識別子は、例えば、品質管理、在庫管理、追跡、作業場間の移動等の目的でキットを一意的に識別するために使用することができる。
【実施例】
【０１９５】
実施例１：クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）感染症の病歴を有する女性からの末梢血単核球及び血漿を使用してクラミジアタンパク質抗原を同定する
クラミジア特異的Ｔ細胞の単離及びスクリーニング
ヘパリン添加全血を、確認されているクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）曝露又は性器感染症の病歴を有する女性から採取した。ドナーは、細菌に繰り返し曝露しているが感染はしていない場合、又は感染したものの医学的介入なしにその感染が排除された場合、「防御あり」に分類された。ドナーは、持続的に感染している場合、又はその感染が骨盤内炎症性疾患などのより重篤な合併症に進行した場合、「防御なし」に分類された。フィコール（Ｆｉｃｏｌｌ）密度勾配遠心法により血液試料から末梢血単核球（ＰＢＭＣ）を単離し、後日使用するため凍結保存（ｃｙｒｏｐｒｅｓｅｒｖｅ）した。ＰＢＭＣの解凍時、抗体被覆磁気ビーズを使用してＣＤ１４＋単球を分離し、ＧＭ−ＣＳＦ及びＩＬ−４サイトカインを含有する培養液中に置いて、樹状細胞（ＭＤＤＣ）となるよう誘導した。さらに、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｐａｎ  Ｔ選別キットを製造者の指示に従い用いてＰＢＭＣから磁気ビーズ枯渇法によりＴ細胞を濃縮した。得られた濃縮Ｔ細胞集団を、次にＣＤ４＋  Ｔ細胞に特異的な抗体コンジュゲート磁気ビーズ（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）を使用して選別した。ＣＤ４陰性集団をＣＤ８＋と見なした（ある場合には、Ｔ細胞が枯渇したＰＢＭＣを凍結保存（ｃｙｒｏｐｒｅｓｅｒｖｅ）した）。双方のＴ細胞サブセットを、抗ＣＤ３及び抗ＣＤ２８抗体が被覆された磁気ビーズ（Ｄｙｎａｌ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘｐａｎｄｅｒ）を使用して、インビトロで非特異的に展開した。Ｔ細胞は、ＡＩＭ−Ｖ−５％（ＡＩＭ−Ｖ、５％ＦＣＳ、非必須アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、Ｌ−グルタミン、及びβ−メルカプトエタノール）＋組換えＩＬ−２中に１０６細胞／ｍＬに維持した。十分なＴ細胞数に達したところで、培養物からＣＤ３／ＣＤ２８磁気ビーズを取り出し、クラミジアＯＲＦｅｏｍｅライブラリを使用してどの抗原が天然でＴ細胞応答を誘導したかを決定することにより、濃縮及び展開したＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞を個別にスクリーニングした。Ｔ細胞スクリーニングには、展開したＴ細胞を、プロテオームライブラリでパルスした自己抗原提示細胞（ＡＰＣ）と共培養する必要があった。ＡＰＣは、１００：１の誘導細菌対ＡＰＣ比でプロテオームライブラリからの誘導細菌によりパルスした。Ｔ細胞スクリーニング用の自己ＡＰＣを調製する方法は２つあった。方法１は、３８４ウェル平底プレートにウェル当たり１０４個のＭＤＣＣを播いた。方法２は、９６ウェル丸底プレートに、ＭＤＣＣと解凍したＴ細胞枯渇ＰＢＭＣとから構成されるウェル当たり１０５個のＡＰＣを播いた。いずれの方法についても、ＡＰＣとライブラリ発現細菌とを含むスクリーンプレートを、３７℃の５％ＣＯ２加湿インキュベーターに置いた。２時間インキュベートした後、ＡＰＣをＰＢＳで洗浄し、次に１％パラホルムアルデヒド（ＰＦＡ）で固定した。固定したＡＰＣを十分に洗浄し、次に展開したＴ細胞を、パルスして固定したＡＰＣに加えて、プレートを３７℃の５％ＣＯ２加湿インキュベーターに戻した。最適には、４×１０４個のＴ細胞を、方法１に記載される３８４ウェルプレートの各ウェルに播いた１０４個のパルスしたＭＤＣＣに加えた。或いは、最大１０５���のＴ細胞を、方法２に記載される９６ウェルプレートの各ウェルに播いた１０５個のパルスしたＡＰＣに加えた。２４時間共培養した後、ＥＬＩＳＡによって無細胞上清中のインターフェロンγ（ＩＦＮ−γ）を計測することにより（ＢＤ  ＯｐｔＥＩＡキット）、Ｔ細胞応答を観察した。
【０１９６】
Ｔ細胞応答を誘導するクラミジアタンパク質抗原の同定
ヒト対象からの１１０件を超える試料を、上記に記載したとおりライブラリに対してスクリーニングした。バックグラウンド補正後データ中央値の平均偏差の２倍を超えたＩＦＮ−γ応答を誘導したライブラリタンパク質を、このスクリーニングにおける陽性と見なした。各同定された抗原の同一性を検証するため、ライブラリストックからのプラスミドＤＮＡを精製及び配列決定した。配列決定に使用したプライマーは、プラスミド内で各クローンの上流に位置するコンセンサスプライマーであった。以下のアドレスにあるインターネット上のＮＣＢＩウェブサイトのヌクレオチドＢＬＡＳＴ機能を使用して、アラインメントを実施した：ｂｌａｓｔ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｂｌａｓｔ．ｃｇｉ。列挙される配列は、ＧｅｎＢａｎｋに見出されるとおりの、単離クローンに対応するアノテートされた遺伝子の配列である。
【０１９７】
図１、図２、及び図３は、同定された抗原が防御ありドナー及び防御なしドナーから得られたＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞のそれぞれによって認識された頻度を示す例示的グラフを示す。陰性対照、ドナー及びプレート変動の評価に基づき、陰性対照に対する値の倍数比が１．６３（ＣＤ４＋）又は１．６６（ＣＤ８＋）より大きい場合、ドナーを「レスポンダー」に分類した。１０％を超えるレスポンダーの割合が、偶然のみに起因するより多いレスポンダー数を示した。レスポンダーの割合が１５％より多い（陰性対照を含む全ドナー）又は約１９％（防御ありドナー及び防御なしドナー）であるとき、統計的に有意となった。図１及び図２は、防御ありドナー及び防御なしドナーについての別々の例示的結果を示す。４個のＣ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）タンパク質が、防御なしドナーと比較して防御ありにおいて統計的により高頻度でＣＤ４＋又はＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導した（それぞれ２個ずつのクローン）（ｐ値０．０５）。防御ありドナーにおいてより高頻度で、さらなる１６個のクローンがＣＤ８＋  Ｔ細胞応答を誘導し、及び６個のクローンがＣＤ４＋  Ｔ細胞応答を誘導した（ｐ値０．１）。臨床的にその感染から防御されているドナーでより高い頻度を示した抗原は防御免疫と相関があり、最良のワクチン製剤候補であった。図３は、全ドナー（防御あり及び防御なし）についてのＣＤ４＋、ＣＤ８＋、及び混合Ｔ細胞応答を示す例示的結果を示す。最も高い総頻度を示した抗原もまた、防御ありドナーで統計的により高い頻度を示したか否かに関わらず、ワクチン、診断及び予後判定での適用に魅力的な候補である。
【０１９８】
Ｂ細胞応答を誘導するクラミジアタンパク質抗原の同定
前の実施例に記載されるとおり、確認されているクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）曝露又は性器感染症の病歴を有する女性からのヘパリン添加全血の血漿画分を遠心によって収集し、使用時まで−８０℃で保存した。大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）におけるクラミジアＯＲＦｅｏｍｅライブラリの各クローンを２４時間誘導してタンパク質を発現させた。細菌をペレット化し、溶解緩衝液に再懸濁し、９６ウェルプレートに並べた。尿素による２ラウンドの抽出後、タンパク質を含む上清（ｓｕｐｅｒｎａｎａｎｔ）を２０ｍＭトリス緩衝液で１：２希釈し、クーマシー（Ｃｏｏｍａｓｉｅ）染色により各タンパク質濃度を決定した。４ｍＭ尿素／トリス緩衝液を添加することにより、各タンパク質の濃度を４００μｇ／ｍＬに調節した。次にプレートを密封し、マイクロアレイ上へのプリンティングに発送した（Ｇｅｎｔｅｌ  Ｂｉｏｓｃｅｉｎｃｅｓ，Ｉｎｃ．）。タンパク質マイクロアレイを、上記のＴ細胞スクリーニングのために募集した対象の血漿試料でプローブした。ヒトＩｇＧに特異的な抗体を使用して、タンパク質特異的抗体についての結合した血漿試料をプローブし、発色基質により検出した。応答は、シグナルが陰性対照のバックグラウンド値を統計的に有意に上回った場合に陽性と見なした。選択には２つの基準を用いた：第１の基準は、全コホートにわたる応答の総頻度であり、及び第２の基準は、防御なしドナーと比較した防御あり対象における統計的により高い頻度（ｐ値＜０．０５）での応答であった。
【０１９９】
図４は、クラミジア抗原がドナー血清中に存在するＩｇＧに結合した頻度、すなわちドナーＢ細胞応答を誘発した頻度を示す例示的結果を示す。パネルの左側は、全ドナー（防御あり及び防御なし）において最も高い総頻度でＩｇＧにより検出されたクラミジア抗原を示す。パネルの右側は、防御なしドナーと比較したとき防御ありドナーにおいて統計的により高頻度でＩｇＧにより検出されたクラミジア抗原を示す。
【０２００】
実施例２：同定されたクラミジアタンパク質抗原はマウスにおいて免疫原性である
免疫化プロトコル
生理食塩水中５μｇ抗原＋アジュバント（キラヤサポニンマトリックスＡとマトリックスＣとの９１：９混合物を含む１２μｇ用量のＩＳＣＯＭマトリックス）の１００μｌ注射を、マウスの首筋に皮下免疫した。マウスは２回の注射を２１日間隔で受けた。最終回の注射の７日後、マウスを安楽死させ、さらなる分析用に血液及び組織を回収した。
【０２０１】
エキソビボＴ細胞媒介性ＩＦＮ−γ応答アッセイ
エキソビボＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴを使用してＴ細胞応答を定量化した。上記で回収したマウス脾臓から出発し、マウス脾細胞から磁気ビーズを使用してＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞を濃縮した。ＩＦＮ−γに特異的な捕捉抗体で一晩コーティングすることにより膜プレートを調製し、続いて補足培地で最低でも２時間、３７℃でブロッキングした。未感作のＴ枯渇脾細胞を抗原によって３７℃で２時間パルスすることにより、ＡＰＣを調製した。ＣＤ４＋  ＥＬＩＳＰＯＴについては、ＡＰＣは全タンパク質でパルスした。ＣＤ８＋  ＥＬＩＳＰＯＴについては、全タンパク質に２０μｇ／ｍＬの濃度のＩＳＣＯＭマトリックスを添加して、抗原取り込み及びプロセシングを促進した。ＡＰＣ及びＴ細胞を、予め被覆したプレートの適切なウェルに添加した。陰性対照は、さらなる抗原なしに３７℃で２時間インキュベートしたＡＰＣであり、及び陽性対照は、ホルボールミリステートアセテート（ＰＭＡ）及びイオノマイシンとインキュベートしたＴ細胞であった。プレートは、５％ＣＯ２下３７℃で１８時間インキュベートさせた。ＩＦＮ−γに特異的な二次ビオチン化抗体、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）及び３−アミノ−９−エチルカルバゾール（ＡＥＣ）基質を使用して、スポットを視覚化した。
【０２０２】
図５は、指示されるクラミジアタンパク質抗原で免疫したマウス由来の、且つインビトロで同じ抗原によって再刺激したＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞においてエキソビボで誘導されたＩＦＮ−γレベルを示す例示的結果を示す。図５Ａは、当初Ｔ細胞応答によって同定された抗原を示す例示的結果を示す。図５Ｂは、当初Ｂ細胞応答によって同定された抗原を示す例示的結果を示し、これらの抗原が、ある場合にはロバストなＴ細胞応答も誘発し得ることを実証している。
【０２０３】
Ｂ細胞媒介性抗体応答アッセイ
直接タンパク質ＥＬＩＳＡにより免疫マウスの抗原特異的血清抗体価を測定した。最終回の注射の７日後に、終末心穿刺により血液を採取した。血清を処理し、−８０℃で保存した。ＥＬＩＳＡプレートを４℃で一晩、０．１Ｍカーボネート緩衝液ｐＨ９．５中５μｇの全タンパク質によりコーティングした。ＴＢＳ＋０．０５％ツイーン（Ｔｗｅｅｎ）−２０（ＴＢＳ−Ｔ）でプレートを洗浄し、ＴＢＳ−Ｔ＋１％ウシ血清アルブミンで１時間ブロッキングした。血清試料を段階希釈し、抗原被覆ウェルにおいて室温で２時間インキュベートした。プレートを洗浄し、１：１０，０００希釈のヤギ抗マウスアルカリホスファターゼ（ＡＰ）コンジュゲート抗ＩｇＧにより１時間プローブした。ＡＰ活性の検出は、ｐ−ニトロフェニルリン酸（ｐＮＰＰ；Ｓｉｇｍａｆａｓｔ、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）を添加することによって達成し、反応は３Ｎ  ＮａＯＨにより吸光度の読み取り４０５ｎｍで停止させた。段階希釈の直線部分を外挿し、曲線の直線部分がバックグラウンドのカットオフと交わる希釈度としてエンドポイントを定義することにより、エンドポイント力価を計算した。データの計算に使用したカットオフは、未感作マウスからの陰性対照血清の値の２倍であった。
【０２０４】
図６は、同じ抗原で免疫した後の指示されるクラミジア抗原に対するＩｇＧ抗体価を示す例示的結果を示す。パネルの左側に示される結果は、当初Ｔ細胞応答によって同定された抗原（例えば図１、図２及び図３）が、ある場合にはロバストなＢ細胞応答も誘発し得ることを実証している。
【０２０５】
実施例３：同定されたクラミジアタンパク質抗原で免疫したマウスは、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の誘発に対して防御されている
免疫化プロトコル
生理食塩水中５μｇ抗原＋アジュバント（キラヤサポニンマトリックスＡとマトリックスＣとの９１：９混合物を含む２４μｇ用量のＩＳＣＯＭマトリックス）の１００μｌ注射を、Ｃ５７ＢＬ／６マウス（８匹／群）の首筋に皮下免疫した。マウスは２回の注射を２１日間隔で受けた。腟内誘発の１０日前及び３日前にデポ・プロベラ（Ｄｅｐｏ−Ｐｒｏｖｅｒａ）（１．２５ｍｇ）を皮下投与して発情を同期させた。
【０２０６】
クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による腟内感染
ＭｃＣｏｙ細胞においてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）血清型Ｄ（Ｄ／ＵＷ−３／ＣＸ）細菌を増殖させ、ＲｅｎｏＣａｌ−７６勾配遠心法により基本小体を精製し、スクロースホスフェート（ＳＰＧ）緩衝液中に保存した。最終回の免疫の７日後に、０．５〜１×１０６ＩＦＵクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）血清型Ｄ基本小体を容積式ピペットで子宮頸腟部に直接腟内付着させることにより、マウスを誘発した。
【０２０７】
感染後の子宮頸腟部におけるクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）負荷の測定
感染３日後、７日後、１０日後、１４日後、及び２１日後に、免疫して誘発したマウスの子宮頸腟部及び腟円蓋の試料を採取した。ＭｃＣｏｙ細胞単層上での直接培養により、試料中に存在するクラミジアを定量化した。ＳＰＧ緩衝液中のスワブ試料の段階希釈物をコンフルエントなＭｃＣｏｙ細胞単層に加え、２４００ＲＰＭ、３７℃で１時間遠心した。上清を除去し、１μｇ／ｍＬのシクロヘキサミドを含むｃＲＰＭＩと交換し、３７℃で４４時間インキュベートした。単層を１００％メタノールで固定し、ＦＩＴＣ標識抗クラミジア抗体（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）で染色し、封入体をカウントしてＩＦＵを決定した。
【０２０８】
図７は、指示されるクラミジアタンパク質抗原で免疫し、続いてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に腟内感染させたマウスにおける子宮腟部クラミジア負荷の低下を示す例示的結果を示す。図７Ａは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６２、ＣＴ０４３、及びＣＴ０６２＋ＣＴ０４３の組み合わせについての例示的結果を示す。図７Ｂは、代表的なクラミジアタンパク質抗原の組み合わせＣＴ６３８＋ＣＴ４７６についての例示的結果を示す。
【０２０９】
感染後の上部生殖器系におけるクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）負荷の測定
免疫して誘発したマウスから、感染後２１日目に卵管及び卵巣を採取した。リアルタイム定量ＰＣＲにより、全卵管及び卵巣に存在する生菌及び死菌のクラミジアを検出した。卵管及び卵巣は、０．６ｍｇのプロテイナーゼＫを含有する組織溶解緩衝液中５６℃で一晩消化させた。ＱＩＡａｍｐ  ＤＮＡ  Ｍｉｎｉキット（Ｑｉａｇｅｎ）を製造者の指示に従い使用して、ＤＮＡを抽出した。抽出したＤＮＡを、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）１６ＳｒＲＮＡ遺伝子に特異的なプライマーと共にＰＣＲに供した。簡潔に言えば、１５μＬの抽出ＤＮＡを、０．８ｕＭの各プライマー及び１ＵのＴａｑポリメラーゼを含有する２０ｕＬの反応容量中でプロセシングした。増幅はＳｔｅｐＯｎｅＰｌｕｓリアルタイムＰＣＲシステム（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）で実施した。既知のコピー数のクラミジア１６ｓ  ｒＲＮＡ精製プラスミドの標準曲線を使用して外挿することにより、遺伝子コピー数を決定した。
【０２１０】
図８は、指示されるクラミジアタンパク質抗原で免疫し、続いてクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）に腟内感染させたマウスにおける上部生殖器系クラミジア負荷の低下を示す例示的結果を示す。図８Ａは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６２、ＣＴ０４３、及びＣＴ０６２＋ＣＴ０４３の組み合わせについての例示的結果を示す。ＵＶＥＢは、陽性対照である紫外線で不活化された全クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）基本小体で免疫されたマウスからの応答を示す。図８Ｂは、代表的なクラミジアタンパク質抗原ＣＴ０６７、ＣＴ０７８８ｔｍ、及びＣＴ３２８についての例示的結果を示す。
【０２１１】
実施例４：クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による感染後、リンパＴ細胞及び脾臓Ｔ細胞がプライミングされ、同定されたクラミジアタンパク質抗原に応答する。
感染後のリンパ及び脾臓Ｔ細胞媒介性ＩＦＮ−γ応答アッセイ
非免疫マウスを、上記に記載したとおり１×１０６ＩＦＵの精製クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）血清型Ｄ基本小体に腟内感染させた。感染７〜１４日後に、外側腸骨の大動脈腰及び仙骨流入領域リンパ節（ＤＬＮ）及び脾臓を摘出した。上記の実施例２に記載されるとおり、保存されたＣＤ４＋又はＣＤ８＋  Ｔ細胞に対するＥＬＩＳＰＯＴアッセイにより、同定されたクラミジアタンパク質抗原による刺激後の抗原特異的Ｔ細胞応答を測定した。
【０２１２】
図９は、感染マウスの脾臓から採取し、指示されるクラミジアタンパク質抗原で刺激したＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞におけるＩＦＮ−γの誘導を示す例示的結果を示す。結果は、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）による感染が同定された抗原に特異的なＴ細胞をプライミングし得ること、及びその抗原が再誘発時に防御性Ｔ細胞の標的となり得ることを示している。
【０２１３】
配列
配列番号１  ＣＴ０６２ポリペプチド（４１２アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７６５３．１）
【化１】
2013545448.tif 000005
配列番号２  ＣＴ０６２  ＤＮＡ
【化２】
2013545448.tif 000006
配列番号３  ＣＴ５７２ポリペプチド（７６０アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８１７４．１）
【化３】
2013545448.tif 000007
配列番号４  ＣＴ５７２  ＤＮＡ
【化４】
2013545448.tif 000008
配列番号５  ＣＴ０４３ポリペプチド（１６７アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７６３４．１）
【化５】
2013545448.tif 000009
配列番号６  ＣＴ０４３  ＤＮＡ
【化６】
2013545448.tif 000010
配列番号７  ＣＴ５７０ポリペプチド（３９１アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８１７２．１）
【化７】
2013545448.tif 000011
配列番号８  ＣＴ５７０  ＤＮＡ
【化８】
2013545448.tif 000012
配列番号９  ＣＴ１７７ポリペプチド（２３８アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７６８．２）
【化９】
2013545448.tif 000013
配列番号１０  ＣＴ１７７  ＤＮＡ
【化１０】
2013545448.tif 000014
配列番号１１  ＣＴ７２５ポリペプチド（１８４アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８３２０．１）
【化１１】
2013545448.tif 000015
配列番号１２  ＣＴ７２５  ＤＮＡ
【化１２】
2013545448.tif 000016
配列番号１３  ＣＴ８５６ポリペプチド（５６７アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８４５３．１）
【化１３】
2013545448.tif 000017
配列番号１４  ＣＴ８５６  ＤＮＡ
【化１４】
2013545448.tif 000018
配列番号１５  ＣＴ７５７ポリペプチド（３３６アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８３５２．１）
【化１５】
2013545448.tif 000019
配列番号１６  ＣＴ７５７  ＤＮＡ
【化１６】
2013545448.tif 000020
配列番号１７  ＣＴ５６４ポリペプチド（２８９アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８１６６．１）
【化１７】
2013545448.tif 000021
配列番号１８  ＣＴ５６４  ＤＮＡ
【化１８】
2013545448.tif 000022
配列番号１９  ＣＴ７０３ポリペプチド（４９０アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８２９８．１）
【化１９】
2013545448.tif 000023
配列番号２０  ＣＴ７０３  ＤＮＡ
【化２０】
2013545448.tif 000024
配列番号２１  Ｐ１−ＯＲＦ７ポリペプチド（ＰＧＰ７−Ｄ；１６０アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０４０３８０．１）
【化２１】
2013545448.tif 000025
配列番号２２  Ｐ１−ＯＲＦ７  ＤＮＡ（ＰＧＰ７−Ｄ  ＣＡＬＣＵＬＡＴＥＤ＿ＭＯＬ＿ＷＴ＝３４７０５）
【化２２】
2013545448.tif 000026
配列番号２３  ＣＴ０６７ポリペプチド（３２６アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７６５８．１）
【化２３】
2013545448.tif 000027
配列番号２４  ＣＴ０６７  ＤＮＡ
【化２４】
2013545448.tif 000028
配列番号２５  ＣＴ０３７ポリペプチド（１１８アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７６２７．１）
【化２５】
2013545448.tif 000029
配列番号２６  ＣＴ０３７  ＤＮＡ
【化２６】
2013545448.tif 000030
配列番号２７  ＣＴ２５２ポリペプチド（２７２アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７８４５．１）
【化２７】
2013545448.tif 000031
配列番号２８  ＣＴ２５２  ＤＮＡ
【化２８】
2013545448.tif 000032
配列番号２９  ＣＴ０６４ポリペプチド（６０２アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７６５５．１）
【化２９】
2013545448.tif 000033
配列番号３０  ＣＴ０６４  ＤＮＡ
【化３０】
2013545448.tif 000034
配列番号３１  ＣＴ１３７ポリペプチド（２８１アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７２８．１）
【化３１】
2013545448.tif 000035
配列番号３２  ＣＴ１３７  ＤＮＡ
【化３２】
2013545448.tif 000036
配列番号３３  ＣＴ２０４ポリペプチド（４７１アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７９６．１）
【化３３】
2013545448.tif 000037
配列番号３４  ＣＴ２０４  ＤＮＡ
【化３４】
2013545448.tif 000038
配列番号３５  ＣＴ６３４ポリペプチド（４６５アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８２３８．１）
【化３５】
2013545448.tif 000039
配列番号３６  ＣＴ６３４  ＤＮＡ
【化３６】
2013545448.tif 000040
配列番号３７  ＣＴ６３５ポリペプチド（１４４アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８２３９．１）
【化３７】
2013545448.tif 000041
配列番号３８  ＣＴ６３５  ＤＮＡ
【化３８】
2013545448.tif 000042
配列番号３９  ＣＴ３６６ポリペプチド（４４０アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７９６２．１）
【化３９】
2013545448.tif 000043
配列番号４０  ＣＴ３６６  ＤＮＡ
【化４０】
2013545448.tif 000044
配列番号４１  ＣＴ１４０ポリペプチド（２２８アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７３１．１）
【化４１】
2013545448.tif 000045
配列番号４２  ＣＴ１４０  ＤＮＡ
【化４２】
2013545448.tif 000046
配列番号４３  ＣＴ１４２ポリペプチド（２８５アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７３３．１）
【化４３】
2013545448.tif 000047
配列番号４４  ＣＴ１４２  ＤＮＡ
【化４４】
2013545448.tif 000048
配列番号４５  ＣＴ２４２ポリペプチド（１７３アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７８３５．１）
【化４５】
2013545448.tif 000049
配列番号４６  ＣＴ２４２  ＤＮＡ
【化４６】
2013545448.tif 000050
配列番号４７  ＣＴ８４３ポリペプチド（８９アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８４４０．２）
【化４７】
2013545448.tif 000051
配列番号４８  ＣＴ８４３  ＤＮＡ
【化４８】
2013545448.tif 000052
配列番号４９  ＣＴ３２８ポリペプチド（２７４アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７９２１．１）
【化４９】
2013545448.tif 000053
配列番号５０  ＣＴ３２８  ＤＮＡ
【化５０】
2013545448.tif 000054
配列番号５１  ＣＴ１８８ポリペプチド（２０３アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７８０．１）
【化５１】
2013545448.tif 000055
配列番号５２  ＣＴ１８８  ＤＮＡ
【化５２】
2013545448.tif 000056
配列番号５３  ＣＴ５７８ポリペプチド（４８７アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８１８０．１）
【化５３】
2013545448.tif 000057
配列番号５４  ＣＴ５７８  ＤＮＡ
【化５４】
2013545448.tif 000058
配列番号５５  ＣＴ７２４ポリペプチド（１７４アミノ酸）
【化５５】
2013545448.tif 000059
配列番号５６  ＣＴ７２４  ＤＮＡ
【化５６】
2013545448.tif 000060
配列番号５７  ＣＴ７２２ポリペプチド（２２６アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８３１７．１）
【化５７】
2013545448.tif 000061
配列番号５８  ＣＴ７２２  ＤＮＡ
【化５８】
2013545448.tif 000062
配列番号５９  ＣＴ７３２ポリペプチド（１５７アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８３２７．１）
【化５９】
2013545448.tif 000063
配列番号６０  ＣＴ７３２  ＤＮＡ
【化６０】
2013545448.tif 000064
配列番号６１  ＣＴ７８８ポリペプチド（１６６アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ    ＡＡＣ６８３８３．１）
【化６１】
2013545448.tif 000065
配列番号６２  ＣＴ７８８  ＤＮＡ
【化６２】
2013545448.tif 000066
配列番号６３  ＣＴ４７６ポリペプチド（３２１アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８０７６．１）
【化６３】
2013545448.tif 000067
配列番号６４  ＣＴ４７６  ＤＮＡ
【化６４】
2013545448.tif 000068
配列番号６５  ｐ６ポリペプチド（ｐＧＰ４−Ｄ；１０２アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＡ９１５７２．１）
【化６５】
2013545448.tif 000069
配列番号６６  ｐ６  ＤＮＡ
【化６６】
2013545448.tif 000070
配列番号６７  ＣＴ３１０ポリペプチド（２０８アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７９０３．１）
【化６７】
2013545448.tif 000071
配列番号６８  ＣＴ３１０  ＤＮＡ
【化６８】
2013545448.tif 000072
配列番号６９  ＣＴ６３８ポリペプチド（２５５アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８２４２．１）
【化６９】
2013545448.tif 000073
配列番号７０  ＣＴ６３８  ＤＮＡ
【化７０】
2013545448.tif 000074
配列番号７１  ＣＴ１７２ポリペプチド（１６３アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６７７６３．１）
【化７１】
2013545448.tif 000075
配列番号７２  ＣＴ１７２  ＤＮＡ
【化７２】
2013545448.tif 000076
配列番号７３  ＣＴ４４３ポリペプチド（５５３アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８０４２．１）
【化７３】
2013545448.tif 000077
配列番号７４  ＣＴ４４３  ＤＮＡ
【化７４】
2013545448.tif 000078
配列番号７５  ＣＴ５２５ポリペプチド（２８４アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８１２６．１）
【化７５】
2013545448.tif 000079
配列番号７６  ＣＴ５２５  ＤＮＡ
【化７６】
2013545448.tif 000080
配列番号７７  ＣＴ６０６ポリペプチド（２０９アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８２０９．１）
【化７７】
2013545448.tif 000081
配列番号７８  ＣＴ６０６  ＤＮＡ
【化７８】
2013545448.tif 000082
配列番号７９  ＣＴ６４８ポリペプチド（４２４アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８８２５．１）
【化７９】
2013545448.tif 000083
配列番号８０  ＣＴ６４８  ＤＮＡ
【化８０】
2013545448.tif 000084
配列番号８１  ＣＴ８７０ポリペプチド（１０３４アミノ酸；ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６８４６８．１）
【化８１】
2013545448.tif 000085
配列番号８２  ＣＴ８７０  ＤＮＡ
【化８２】
2013545448.tif 000086
配列番号８３  大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＲｌｐＢシグナル配列（脂質化配列）
【化８３】
2013545448.tif 000087
【０２１４】
均等物及び範囲
当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態の多くの均等物を認識し、又はルーチン程度の実験を用いて確認することができるであろう。本発明の範囲は上記の説明に限定されることは意図されず、むしろ添付の特許請求の範囲に記載されるとおりである。
【０２１５】
特許請求の範囲において、「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」などの冠詞は、そうでない旨が示されない限り、又は他の形で文脈上明らかでない限り、１つではなく１つ以上を意味し得る。従って、例えば「細胞（ａ  ｃｅｌｌ）」と言うとき、それは当業者に公知の１つ以上の細胞に対する参照を含むなどする。群の１つ以上の構成要素間に「又は」を含むクレーム又は説明は、そうでない旨が示されない限り、又は他の形で文脈上明らかでない限り、群の構成要素の１つ、２つ以上、又は全てが所与の物又は方法に存在する、それにおいて用いられる、又は他の形でそれに関連する場合を満たしているものと見なされる。本発明は、群のなかの正確に一つの構成要素が所与の物又は方法に存在する、それにおいて用いられる、又は他の形でそれに関連する実施形態を含む。本発明は、群の構成要素の２つ以上、又は全てが所与の物又は方法に存在する、それにおいて用いられる、又は他の形でそれに関連する実施形態を含む。さらに、本発明は、列挙されるクレームの１つ又は複数からの１つ以上の限定、要素、クローズ、記述的用語等が別のクレームに導入される全ての変形例、組み合わせ、及び並べ替えを包含することが理解されるべきである。例えば、別のクレームに従属する任意のクレームを、同じ基本クレームに従属する任意の他のクレームに見られる１つ以上の限定を含むように変更することができる。さらに、クレームが組成物について記載している場合、特に指示されない限り、又は矛盾若しくは不整合が生じるであろうことが当業者に明らかでない限り、本明細書に開示される任意の目的のために組成物を使用する方法が含まれ、及び本明細書に開示される作製方法のいずれか又は当該技術分野において公知の他の方法によって組成物を作製する方法が含まれることが理解されるべきである。
【０２１６】
例えばマーカッシュ群形式において、要素がリストとして提示される場合、それらの要素の部分的な群の各々もまた開示され、及びその群から任意の１つ又は複数の要素が取り除かれてもよいことが理解されるべきである。一般に、本発明又は本発明の態様が特定の要素、特徴等を含むものとして言及される場合、本発明の特定の実施形態又は本発明の態様は、かかる要素、特徴等からなる、又はそれらから本質的になることが理解されなければならない。簡潔にするため、本明細書でそれらの実施形態がこの言葉で（ｉｎ  ｈａｅｃ  ｖｅｒｂａ）具体的に記載されることはない。用語「〜を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」はオープンであるものと意図され、さらなる要素又はステップの包含を許容することが注記される。
【０２１７】
範囲が示される場合、端点は含まれる。さらに、特に指示されない限り、又は他の形で文脈及び当業者の理解から明らかでない限り、範囲として表現される値は、本発明の異なる実施形態では、文脈上特に明確に指示されない限りその範囲の下限値の１０分の１単位までの記載される範囲内の任意の具体的な値又は部分的範囲をとり得ることが理解されるべきである。
【０２１８】
加えて、先行技術の範囲内に含まれる本発明の任意の特定の実施形態がクレームの任意の１つ以上から明示的に除外され得ることが理解されるべきである。かかる実施形態は当業者に公知であると見なされるため、除外が本明細書に明示的に記載されない場合であっても、それらは除外され得る。本発明の組成物の任意の特定の実施形態（例えば、任意の抗原、任意の投与方法、任意の予防的及び／又は治療的適用等）は、先行技術の存在が関係するか否かに関わらず、何らかの理由で、任意の１つ以上のクレームから除外され得る。
【０２１９】
上記で及びテキスト全体を通じて考察される文献は、単にそれらの開示が本願の出願日より前であるために提供される。本明細書のいかなる事項も、先行する開示であるという理由で本発明者らがかかる開示に先行する権利を有しないことを認めるものとして解釈されてはならない。
【０２２０】
他の実施形態
当業者は、上記が単に本発明の特定の好ましい実施形態を表すに過ぎないことを容易に理解するであろう。以下の特許請求の範囲に記載されるとおりの本発明の趣旨又は範囲から逸脱することなく、上記に記載される手順及び組成物に様々な変更及び改良を加えることができる。
【図１】
2013545448.tif 000088
【図２】
2013545448.tif 000089
【図３】
2013545448.tif 000090
【図４】
2013545448.tif 000091
【図５Ａ】
2013545448.tif 000092
【図５Ｂ】
2013545448.tif 000093
【図６】
2013545448.tif 000094
【図７Ａ】
2013545448.tif 000095
【図７Ｂ】
2013545448.tif 000096
【図８Ａ】
2013545448.tif 000097
【図８Ｂ】
2013545448.tif 000098
【図９】
2013545448.tif 000099
【配列表】
2013545448000001.app
【国際調査報告】
2013545448.tif 000100
2013545448.tif 000101
2013545448.tif 000102