(57)【要約】【課題】腫瘍及び繊維形成性疾患において、繊維形成と、繊維芽細胞の活性化とを減少させる方法及び組成物を提供する。【解決手段】本発明に係る方法は、細胞外酵素リシルオキシダーゼＬｉｋｅ２の活性を阻害することによって、腫瘍環境を調節する。本発明に係る方法は、腫瘍の成長を減少させること、腫瘍の細胞の増殖を減少させること、繊維芽細胞の活性化を減少させること、線維形成を減少させること、コラーゲン沈着を阻害すること、腫瘍の壊死及び核凝縮を増加させることに有効である。ＬＯＸＬ２活性の阻害剤の例は、抗体及びｓｉＲＮＡである。【選択図】  図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
腫瘍環境における繊維芽細胞の活性化を阻害する方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項２】
前記繊維芽細胞の活性化が、トランスフォーミング成長因子−β（ＴＧＦ−β）のシグナリングによって媒介されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＬＯＸＬ２の活性の阻害が、細胞外マトリックスの組織非形成をもたらすことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項４】
細胞外マトリックスの組織非形成が、腫瘍ストロマ内の細胞の細胞骨格の崩壊をもたらすことを特徴とする請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記繊維芽細胞が腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）であることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項６】
繊維芽細胞が筋繊維芽細胞であることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項７】
腫瘍環境における繊維形成を阻害する方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項８】
腫瘍が転移性腫瘍であることを特徴とする請求項７に記載の方法。
【請求項９】
腫瘍環境における血管形成を阻害する方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項１０】
前記血管形成が、腫瘍環境への血管細胞又は血管前駆細胞の増殖（リクルートメント）を含むことを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記血管形成が、血管の枝状化を含むことを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
前記血管形成が、血管の長さの増加を含むことを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１３】
前記血管形成が、血管の本数の増加を含むことを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１４】
腫瘍ストロマ内の腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数を減少させるための方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項１５】
腫瘍環境におけるコラーゲン沈着を阻害する方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項１６】
腫瘍環境を調節する方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項１７】
前記調節が、繊維形成の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記調節が、腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項１９】
前記調節が、筋繊維芽細胞の細胞数の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
前記調節が、細胞の細胞骨格のリモデリング（再構築）を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２１】
前記細胞が、腫瘍細胞であることを特徴とする請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記細胞が、繊維芽細胞であることを特徴とする請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
前記細胞が、内皮細胞であることを特徴とする請求項２０に記載の方法。
【請求項２４】
前記調節が、腫瘍血管系の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２５】
前記調節が、コラーゲン生成の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２６】
前記調節が、繊維芽細胞の活性化の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２７】
前記調節が、腫瘍環境への繊維芽細胞の増殖（リクルートメント）の阻害を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２８】
ストロマ成分をコードする遺伝子の発現の減少を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項２９】
前記ストロマ成分が、α−平滑筋アクチン、タイプＩコラーゲン、ビメンチン、マトリックスメタロプロテアーゼ９及びフィブロネクチンから成る群から選択されることを特徴とする請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
腫瘍環境における成長因子の生成を調節する方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項３１】
成長因子が、血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）及びストロマ細胞由来因子１（ＳＤＦ−１）から成る群から選択されることを特徴とする請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
腫瘍の壊死を増加させる方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項３３】
腫瘍における核凝縮を増加させる方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【請求項３４】
ＬＯＸＬ２の活性が、抗ＬＯＸＬ２抗体を使用して阻害されることを特徴とする請求項１、７、９、１４、１５、１６、３０、３２又は３３の何れか１項に記載の方法。
【請求項３５】
抗体が、配列番号１に記載された重鎖配列及び配列番号２に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
抗体が、ヒトに適合化させた抗体（ヒト化抗体）であることを特徴とする請求項３４に記載の方法。
【請求項３７】
抗体が、配列番号３に記載された重鎖配列及び配列番号４に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
ＬＯＸＬ２の活性が、核酸を使用して阻害されることを特徴とする 請求項１、７、９、１４、１５、１６、３０、３２又は３３の何れか１項に記載の方法。
【請求項３９】
核酸が、ｓｉＲＮＡであることを特徴とする請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
ＬＯＸＬ２の阻害剤を同定する方法であって、
腫瘍環境を調節する能力について、テスト分子を分析することを含む方法。
【請求項４１】
前記調節が、繊維形成の減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記調節が、腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数の減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
前記調節が、筋繊維芽細胞の細胞数の減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項４４】
前記調節が、細胞の細胞骨格のリモデリングを含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項４５】
前記細胞が、腫瘍細胞であることを特徴とする請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記細胞が、繊維芽細胞であることを特徴とする請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
前記細胞が、内皮細胞であることを特徴とする請求項４４に記載の方法。
【請求項４８】
前記調節が、腫瘍血管系の減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項４９】
腫瘍血管系の減少が、ＣＤ３１、及び／又は、血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）のレベルの減少によって証明されることを特徴とする請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記調節が、コラーゲン生成の減少、及び／又は、コラーゲンクロスリンキングの度合いの減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５１】
前記調節が、繊維芽細胞の活性化の減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５２】
前記調節が、腫瘍環境への繊維芽細胞の増殖（リクルートメント）の阻害を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５３】
ストロマ成分をコードする遺伝子の発現の減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５４】
ストロマ成分が、α−平滑筋アクチン、タイプＩコラーゲン、ビメンチン、マトリックスメタロプロテアーゼ９及びフィブロネクチンから成る群から選択されることを特徴とする請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
前記調節が、腫瘍環境における ストロマ細胞由来因子１（ＳＤＦ−１）のレベルの減少を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５６】
前記調節が、腫瘍の細胞における、壊死及び／又は核凝縮の発生率の増加を含むことを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５７】
テスト分子が、分子量１ｋＤ未満の小（Small）有機分子であることを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５８】
テスト分子が、ポリペプチドであることを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項５９】
ポリペプチドが、抗体であることを特徴とする請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
テスト分子が、核酸であることを特徴とする請求項４０に記載の方法。
【請求項６１】
核酸が、ｓｉＲＮＡであることを特徴とする請求項６０に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【関連出願の相互引用】
【０００１】
本出願は、２００９年８月２１日に出願された米国仮特許出願６１／２３５，８５２号の利益（優先権）を主張する。当該出願の開示は、全体にわたって全ての目的のために本願に引用によって組み込まれる。
【０００２】
本出願は、米国仮特許出願６１／２３５，８４６号（２００９年８月２１日に出願された）及び米国仮特許出願６１／２３５，７９６号（２００９年８月２１日に出願された）に関連する。各出願の開示は、全体にわたって全ての目的のために本願に引用によって組み込まれる。
【０００３】
本出願は、同一出願人による米国特許出願（発明の名称「In vivo Screening Assays」、代理人整理番号ＡＲＢＳ−０１２、クライアント参照番号Ａ１２−ＵＳ１）、及び、同一出願人による米国特許出願（発明の名称「In vitro Screening Assays」、代理人整理番号ＡＲＢＳ−０１３、クライアント参照番号Ａ１３−ＵＳ１）にも関連する。各出願は、本出願と同日付で出願されたものであり、各出願の開示は、全体にわたって全ての目的のために本願に引用によって組み込まれる。
【０００４】
［政府による支持に関する宣言］
不適用
【技術分野】
【０００５】
本出願は、癌、腫瘍学及び繊維形成性疾患の分野に関連する。
【背景技術】
【０００６】
広範囲にわたる臨床上の証拠、及び、マウスモデルにおける腫瘍形成は、腫瘍の成長及び転移の促進に関する微細環境の決定的な役割を支持している。腫瘍細胞による繊維芽細胞、血管細胞、炎症細胞の増殖（リクルートメント）及び活性化は、転移の可能性を高めることと、治療の効果に対して影響を及ぼし得ることとが示されている。膵臓、胸部、前立腺、大腸、肺及び子宮の上皮性腫瘍は、しばしば、腫瘍関連性繊維芽細胞（tumor-associated fibroblasts：ＴＡＦｓ）を含む繊維形成性のストロマと、細胞外マトリックスの蓄積とを含み、より不良な予後と関連していた。これらのＴＡＦｓは、腫瘍の血管新生を刺激することによって、腫瘍形成に部分的に寄与すると考えられる。ＴＡＦｓは、平滑筋様の（muscle-like）収縮性の特徴（筋繊維芽細胞の特徴）を発揮し、器官の病的なリモデリング（再構築）において顕著な役割を果たして、繊維形成へと導く。最近の研究は、微細環境を変化させる因子が病気の進行において果たす役割に関する更なる証拠を示し、細胞外マトリックスの力学的な張力における変化が、細胞の形態、シグナル経路の活性化、組織のリモデリング及び病因に顕著な変化をもたらし得ることを示している。これらの知見は、腫瘍及び繊維形成に関する新たなる治療方法（細胞外マトリックスの組成及び力学的な特徴を制御するタンパク質をターゲットする治療方法）のポテンシャルを強調する。
【０００７】
リシルオキシダーゼ型の酵素（ＬＯＸ／Ｌｓ）は、保存されたＣ−末端の酵素ドメインと分岐状のＮ−末端とを共有する５つの酵素のファミリーを含む。ＬＯＸ／Ｌｓは、ε−アミン基（特に、リシン残基）の酸化的な脱アミノ化反応を触媒する銅含有酵素であり、繊維性コラーゲンＩ（繊維形成性のストロマの主要な構成要素）などのタンパク質の共有結合性のクロスリンキングを促進する。あるＬＯＸ／Ｌｓが腫瘍性疾患と繊維形成性疾患との両方の開始及び進行に関する役割を果たし、リシルオキシダーゼ（ＬＯＸ）が、転移の発生及び転移性のニッシェ（niche）の形成において役割を果たすという証拠がいくつかある。例えば、同一出願人による米国特許出願公開ＵＳ２００９／０１０４２０１号（２００９年４月２３日、発明の名称「Methods and compositions for treatment and diagnosis of fibrosis, tumor invasion, angiogenesis & metastasis」）を参照。当該出願の開示は、リシルオキシダーゼ型の酵素に関する種々の生物学的視点を開示するために、全体にわたって本願に引用によって組み込まれる。
【０００８】
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（lysyl-oxidase like 2：ＬＯＸＬ２）のｍＲＮＡは、いくつかの異なる固体の腫瘍及び腫瘍細胞の系統において、高度に（highly）発現する。ＬＯＸＬ２は、インビボにおいて、ＬＯＸＬ２発現性の癌細胞によって形成された胸部腫瘍及びグリオーマにおけるコラーゲンの蓄積及び沈着を増強することが報告されている。ＬＯＸＬ２タンパク質の発現については、以前は、胸部腫瘍、食道腫瘍及び扁平上皮癌における、主に、細胞内の局在が述べられていたが、最近の報告は、胃癌における腫瘍細胞増殖を促進するという分泌されたＬＯＸＬ２の役割を支持している。ＬＯＸＬ２レベルの増加は、変性疾患（例えば、ウィルソン病を患う患者の肝細胞の変性疾患や原発性胆汁性肝硬変）、及び、繊維形成性疾患（例えば、腎臓の尿細管間質性繊維形成）とも関連する。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００９】
【特許文献１】米国特許出願公開ＵＳ２００９／０１０４２０１号
【発明の概要】
【００１０】
本願の開示において、本願発明者らは、（１）腫瘍微細環境の生成に関するＬＯＸＬ２の役割、及び、（２）繊維芽細胞の活性化に関するＬＯＸＬ２の役割を確認した。
【００１１】
従って、本開示は、腫瘍及び繊維形成性疾患において、繊維形成と、繊維芽細胞の活性化とを減少させる方法及び組成物を提供する。本発明は、以下の実施形態を含むがこれらに限定されない。
【００１２】
（形態１）
腫瘍環境における繊維芽細胞の活性化を阻害する方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（lysyl oxidase-like 2：ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００１３】
（形態２）
前記繊維芽細胞の活性化が、トランスフォーミング成長因子−β（transforming growth factor-beta：ＴＧＦ−β）のシグナリングによって媒介されることを特徴とする形態１に記載の方法
【００１４】
（形態３）
前記ＬＯＸＬ２の活性の阻害が、細胞外マトリックスの組織非形成（disorganization）をもたらすことを特徴とする形態１に記載の方法。
【００１５】
（形態４）
前記細胞外マトリックスの組織非形成が、腫瘍ストロマ内の細胞の細胞骨格の崩壊をもたらすことを特徴とする形態３に記載の方法。
【００１６】
（形態５）
前記繊維芽細胞が腫瘍関連性繊維芽細胞（tumor-associated fibroblasts：ＴＡＦｓ）であることを特徴とする形態１に記載の方法。
【００１７】
（形態６）
繊維芽細胞が筋繊維芽細胞であることを特徴とする形態１に記載の方法。
【００１８】
（形態７）
腫瘍環境における繊維形成を阻害する方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００１９】
（形態８）
腫瘍が転移性腫瘍であることを特徴とする形態７に記載の方法。
【００２０】
（形態９）
腫瘍環境における血管形成を阻害する方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００２１】
（形態１０）
前記血管形成が、腫瘍環境への血管細胞又は血管前駆細胞の増殖（リクルートメント）を含むことを特徴とする形態９に記載の方法。
【００２２】
（形態１１）
前記血管形成が、血管の枝状化を含むことを特徴とする形態９に記載の方法。
【００２３】
（形態１２）
前記血管形成が、血管の長さの増加を含むことを特徴とする形態９に記載の方法。
【００２４】
（形態１３）
前記血管形成が、血管の本数の増加を含むことを特徴とする形態９に記載の方法。
【００２５】
（形態１４）
腫瘍ストロマ内の腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数を減少させるための方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００２６】
（形態１５）
腫瘍環境におけるコラーゲン沈着を阻害する方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００２７】
（形態１６）
腫瘍環境を調節（modulating）する方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００２８】
（形態１７）
前記調節が、繊維形成（desmoplasia）の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００２９】
（形態１８）
前記調節が、腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３０】
（形態１９）
前記調節が、筋繊維芽細胞の細胞数の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３１】
（形態２０）
前記調節が、細胞の細胞骨格のリモデリング（再構築）を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３２】
（形態２１）
前記細胞が腫瘍細胞であることを特徴とする形態２０に記載の方法。
【００３３】
（形態２２）
前記細胞が、繊維芽細胞であることを特徴とする形態２０に記載の方法。
【００３４】
（形態２３）
前記細胞が、内皮細胞であることを特徴とする形態２０に記載の方法。
【００３５】
（形態２４）
前記調節が、腫瘍血管系の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３６】
（形態２５）
前記調節が、コラーゲン生成の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３７】
（形態２６）
前記調節が、繊維芽細胞の活性化の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３８】
（形態２７）
前記調節が、腫瘍環境への繊維芽細胞の増殖（recruitment）の阻害を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００３９】
（形態２８）
ストロマ成分をコードする遺伝子の発現の減少を含むことを特徴とする形態１６に記載の方法。
【００４０】
（形態２９）
前記ストロマ成分が、α−平滑筋アクチン、タイプＩコラーゲン、ビメンチン、マトリックスメタロプロテアーゼ９及びフィブロネクチンから成る群から選択されることを特徴とする形態２８に記載の方法。
【００４１】
（形態３０）
腫瘍環境における成長因子の生成を調節（modulating）する方法であって、リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００４２】
（形態３１）
成長因子が、血管内皮成長因子（vascular endothelial growth factor：ＶＥＧＦ）及びストロマ細胞由来因子１（stromal cell-derived factor-1：ＳＤＦ−１）から成る群から選択されることを特徴とする形態３０に記載の方法。
【００４３】
（形態３２）
腫瘍の壊死を増加させる方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００４４】
（形態３３）
腫瘍における核凝縮を増加させる方法であって、
リシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の活性を阻害することを含む方法。
【００４５】
（形態３４）
ＬＯＸＬ２の活性が、抗ＬＯＸＬ２抗体を使用して阻害されることを特徴とする形態形態１、７、９、１４、１５、１６、３０、３２又は３３の何れか１つに記載の方法。
【００４６】
（形態３５）
抗体が、配列番号１に記載された重鎖配列及び配列番号２に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする形態３４に記載の方法。
【００４７】
（形態３６）
抗体が、ヒトに適合化させた（humanized）抗体（ヒト化抗体）であることを特徴とする形態３４に記載の方法。
【００４８】
（形態３７）
抗体が、配列番号３に記載された重鎖配列及び配列番号４に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする形態３６に記載の方法。
【００４９】
（形態３８）
ＬＯＸＬ２の活性が、核酸を使用して阻害されることを特徴とする形態１、７、９、１４、１５、１６、３０、３２又は３３の何れか１つに記載の方法。
【００５０】
（形態３９）
核酸が、ｓｉＲＮＡであることを特徴とする形態３８に記載の方法。
【００５１】
（形態４０）
ＬＯＸＬ２の阻害剤を同定する方法であって、
腫瘍環境を調節（modulate）する能力について、テスト分子を分析することを含む方法。
【００５２】
（形態４１）
前記調節が、繊維形成（desmoplasia）の減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００５３】
（形態４２）
前記調節が、腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数の減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００５４】
（形態４３）
前記調節が、筋繊維芽細胞の細胞数の減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００５５】
（形態４４）
前記調節が、細胞の細胞骨格のリモデリングを含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００５６】
（形態４５）
前記細胞が、腫瘍細胞であることを特徴とする形態４４に記載の方法。
【００５７】
（形態４６）
前記細胞が、繊維芽細胞であることを特徴とする形態４４に記載の方法。
【００５８】
（形態４７）
前記細胞が、内皮細胞であることを特徴とする形態４４に記載の方法。
【００５９】
（形態４８）
前記調節が、腫瘍血管系の減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６０】
（形態４９）
腫瘍血管系の減少が、ＣＤ３１、及び／又は、血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）のレベルの減少によって証明されることを特徴とする形態４８に記載の方法。
【００６１】
（形態５０）
前記調節が、コラーゲン生成の減少、及び／又は、コラーゲンクロスリンキングの度合いの減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６２】
（形態５１）
前記調節が、繊維芽細胞の活性化の減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６３】
（形態５２）
前記調節が、腫瘍環境への繊維芽細胞の増殖（リクルートメント）の阻害を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６４】
（形態５３）
ストロマ成分をコードする遺伝子の発現の減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６５】
（形態５４）
ストロマ成分が、α−平滑筋アクチン、タイプＩコラーゲン、ビメンチン、マトリックスメタロプロテアーゼ９及びフィブロネクチンから成る群から選択されることを特徴とする形態５３に記載の方法。
【００６６】
（形態５５）
前記調節が、腫瘍環境におけるストロマ細胞由来因子１（ＳＤＦ−１）のレベルの減少を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６７】
（形態５６）
前記調節が、腫瘍の細胞における、壊死及び／又は核凝縮の発生率の増加を含むことを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６８】
（形態５７）
テスト分子が、分子量１ｋＤ未満の小（Small）有機分子であることを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００６９】
（形態５８）
テスト分子が、ポリペプチドであることを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００７０】
（形態５９）
ポリペプチドが、抗体であることを特徴とする形態５８に記載の方法。
【００７１】
（形態６０）
テスト分子が、核酸であることを特徴とする形態４０に記載の方法。
【００７２】
（形態６１）
核酸が、ｓｉＲＮＡ（低分子干渉ＲＮＡ、small interfering RNA）であることを特徴とする形態６０に記載の方法。
【００７３】
（形態６２）
腫瘍環境における繊維芽細胞の活性化を阻害することに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００７４】
（形態６３）
腫瘍環境における繊維形成を阻害することに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００７５】
（形態６４）
腫瘍環境における血管形成を阻害することに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００７６】
（形態６５）
腫瘍ストロマ内の腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数を減少させることに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００７７】
（形態６６）
腫瘍環境におけるコラーゲン沈着を阻害することに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００７８】
（形態６７）
腫瘍環境を調節することに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００７９】
（形態６８）
腫瘍環境における成長因子の生成を調節することに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００８０】
（形態６９）
腫瘍の壊死を増加させることに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００８１】
（形態７０）
腫瘍における核凝縮（pyknosis）を増加させることに使用されるＬＯＸＬ２の阻害剤。
【００８２】
（形態７１）
ＬＯＸＬ２の阻害剤が、抗ＬＯＸＬ２抗体であることを特徴とする形態６２〜７０の何れか１つに記載の阻害剤。
【００８３】
（形態７２）
抗体が、配列番号１に記載された重鎖配列及び配列番号２に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする形態７１に記載の阻害剤。
【００８４】
（形態７３）
抗体が、ヒトに適合化させた抗体であることを特徴とする形態７１に記載の阻害剤。
【００８５】
（形態７４）
抗体が、配列番号３に記載された重鎖配列及び配列番号４に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする形態７３に記載の阻害剤。
【００８６】
（形態７５）
阻害剤が核酸であることを特徴とする形態６２〜７０の何れか１つに記載の阻害剤。
【００８７】
（形態７６）
核酸が、ｓｉＲＮＡであることを特徴とする形態７５に記載の阻害剤。
【００８８】
（形態７７）
腫瘍環境における繊維芽細胞の活性化を阻害することに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤と薬学的に許容可能な賦形剤とを含むことを特徴とする医薬組成物。
【００８９】
（形態７８）
腫瘍環境における繊維形成を阻害することに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤と薬学的に許容可能な賦形剤とを含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９０】
（形態７９）
腫瘍環境における血管形成を阻害することに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤及び薬学的に許容可能な賦形剤を含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９１】
（形態８０）
腫瘍ストロマ内の腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）の細胞数を減少させることに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤と薬学的に許容可能な賦形剤とを含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９２】
（形態８１）
腫瘍環境におけるコラーゲン沈着を阻害することに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤及び薬学的に許容可能な賦形剤を含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９３】
（形態８２）
腫瘍環境を調節することに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤及び薬学的に許容可能な賦形剤を含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９４】
（形態８３）
腫瘍環境における成長因子の生成を調節することに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤及び薬学的に許容可能な賦形剤を含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９５】
（形態８４）
腫瘍における壊死を増加させることに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤及び薬学的に許容可能な賦形剤を含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９６】
（形態８５）
腫瘍における核凝縮を増加させることに使用される医薬組成物であって、
ＬＯＸＬ２の阻害剤及び薬学的に許容可能な賦形剤を含むことを特徴とする医薬組成物。
【００９７】
（形態８６）
ＬＯＸＬ２の阻害剤が、抗ＬＯＸＬ２抗体であることを特徴とする形態７７〜８５の何れか１つに記載の組成物。
【００９８】
（形態８７）
抗体が、配列番号１に記載された重鎖配列及び配列番号２に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする形態８６に記載の医薬組成物。
【００９９】
（形態８８）
抗体が、ヒトに適合化させた抗体であることを特徴とする形態８６に記載の医薬組成物。
【０１００】
（形態８９）
抗体が、配列番号３に記載された重鎖配列及び配列番号４に記載された軽鎖配列を含むことを特徴とする形態８８に記載の医薬組成物。
【０１０１】
（形態９０）
阻害剤が、核酸であることを特徴とする形態７７−８５の何れか１つに記載の医薬組成物。
【０１０２】
（形態９１）
核酸が、ｓｉＲＮＡであることを特徴とする形態９０に記載の医薬組成物。
【図面の簡単な説明】
【０１０３】
【図１】パネルａ−ｐは、固体の腫瘍及び肝繊維形成において、ＬＯＸＬ２が高度に発現、分泌したことを示す。パネルａは、非腫瘍性の組織と比較した場合の、固体の腫瘍におけるＬＯＸＬ２転写産物のｑＲＴ−ＰＣＲ解析を示す。図１のパネルｂ及び図１のパネルｃは、喉頭の扁平上皮細胞癌の対応する（matched）腫瘍切片における、コラーゲンＩ（図１ｂ）及びＬＯＸＬ２（図１ｃ）の発現に関する免疫組織化学（immunohistochemistry：ＩＨＣ）を示す。図１のパネルｄ及び図１のパネルｅは、コラーゲンＩ（図１、パネルｄ）及びＬＯＸＬ２（図１、パネルｅ）の発現についてテストした、肺の扁平上皮細胞癌（グレード２）の切片のＩＨＣ解析を示す。図１のパネルｆ及び図１のパネルｇは、膵臓腺癌（グレード３）の切片におけるＬＯＸＬ２発現のＩＨＣ解析を示す。図１のパネルｆは、マトリックス及び腫瘍−ストロマ境界部におけるＬＯＸＬ２発現を示す。糸球体様構造（Glomeruloid Structures）におけるＬＯＸＬ２発現は、図１のパネルｆ及び図１のパネルｇにおいても明白だった。図１のパネルｈ及び図１のパネルｉは、卵巣癌の大網転移のＬＯＸＬ２発現のＩＨＣ解析を示す。図１のパネルｈは、腫瘍細胞における発現を示し、図１のパネルｉは、糸球体様構造におけるＬＯＸＬ２発現を示す。図１のパネルｊ及び図１のパネルｋは、膵臓腺癌の切片のＩＨＣを示す。図１のパネルｊはＬＯＸＬ２発現を示し、図１のパネルｋはＬＯＸ発現を示す。図１のパネルｌは、明細胞型腎細胞癌の切片におけるＬＯＸＬ２発現を示す。図１のパネルｍ、図１のパネルｎは、活動性Ｃ型肝炎によって誘導された繊維形成性の肝臓におけるＬＯＸＬ２発現に関するＩＨＣを示す（図１のパネルｍ：５ｘ倍率、図１のパネルｎ：４０ｘ倍率）。図１のパネルｏ及び図１のパネルｐは、それぞれ、脂肪性肝炎の肝臓の切片におけるＬＯＸＬ２発現及びＬＯＸ発現のＩＨＣを示す（４０ｘ倍率）。
【０１０４】
【図２】図２のパネルａ−ｆは、インビトロにおいて、分泌されたＬＯＸＬ２が腫瘍細胞の湿潤を促進することを示す。図２のパネルａ及びｂは、ＬＯＸＬ２（図２のパネルａ）及びコラーゲンＩ（図２のパネルｂ）を共染色したＨｓ５７８ｔ腫瘍細胞の培養細胞の免疫蛍光解析を示す。コラーゲンＩ及びＬＯＸＬ２の発現は、培養細胞の細胞外マトリックスにおいて共局在する。図２のパネルｃ−ｆは、ＭＣＦ７ならし培地（図２のパネルｃ）、ＭＤＡ−ＭＢ２３１ならし培地（図２のパネルｄ）、ＭＤＡ−ＭＢ２３１ならし培地（４μｇの抗ＩｇＧ抗体でプレインキュベートした、図２のパネルｅ）、又は、ＭＤＡ−ＭＢ２３１ならし培地（４μｇの抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３でプレインキュベートした、図２のパネルｆ）で、ＭＣＦ−７培養細胞を処置した後の、ＭＣＦ−７培養細胞のローダミン−ファロイジン染色を示す。
【０１０５】
【図３】図３のパネルａ−ｋは、 ＬＯＸＬ２がインビトロ及びインビボにおいて繊維芽細胞の活性化を促進することを示す。図３のパネルａは、ヒト包皮繊維芽細胞（human foreskin fibroblasts：ＨＦＦｓ）におけるＬＯＸＬ２の発現レベルに対する張力の影響をテストしたタンパク質（「ウェスタン」）ブロット解析を示す。細胞は、組織培養プレート（レーン１）、０．２％ビス−アクリルアミドクロスリンクドコラーゲンコートドゲル（bis-acrylamide cross-linked collagen coated gel）（レーン２）、又は、０．８％ビス−アクリルアミドクロスリンクドコラーゲンコートドゲル（レーン３）の上で成長させた。図３のパネルｂ及び図３のパネルｃは、ノンターゲッティングｓｉＲＮＡ（図３のパネルｂ）又はＬＯＸＬ２ｓｉＲＮＡ（図３のパネルｃ）を導入し、導入の１０日後にコラーゲンＩについて染色したＨＦＦ細胞の写真を示す。図３のパネルｄ及びパネルｅは、ノンターゲッティングｓｉＲＮＡ（図３のパネルｄ）又はＬＯＸＬ２ｓｉＲＮＡ（図３のパネルｅ）を導入し、導入の１０日後にローダミン−ファロイジンで染色したＨＦＦ細胞の写真を示す。図３のパネルｆ及びｇは、低張力条件下（図３のパネルｆ）又は高張力条件下（図３のパネルｇ）で成長させ、ローダミン−ファロイジンで染色したＨＦＦ細胞の写真を示す。図３のパネルｈは、ＭＤＡ−ＭＤ−２３１細胞と一緒に、又は、ＭＣＦ７−ＬＯＸＬ２細胞と一緒にトランスウェル培養したＨＦＦ細胞の溶解物のタンパク質（「ウェスタン」）ブロットを示す。図３のパネルｉは、図３のパネルｈに示された結果の濃度測定による定量であり、ｐＳＭＡＤ２及びＶＥＧＦの発現に対するＡＢ００２３の特異的な影響を示す。図３のパネルｊは、腎被膜下移植法（sub-renal capsule）によって、ＭＣＦ７細胞（ＭＣＦ７−コントロール）、又は、ＬＯＸＬ２発現ベクターを安定に形質導入したＭＣＦ７細胞（ＭＣＦ７−ＬＯＸＬ２）を移植したｎｕ／ｎｕマウスが、腎被膜下において生成した異種移植片のサイズの比較を示す。図３のパネルｋは、ＬＯＸＬ２発現性の腫瘍における種々のストロマ成分の相対的な誘導を検査する、定量的なＲＴ−ＰＣＲによる異種移植片の解析を示す。マウス特異的プライマーを使用して、ストロマの発現と、移植された（ヒト）細胞における発現とを区別した。ａＳＭＡ＝α−平滑筋アクチン、ＣＯＬ１Ａ１＝タイプＩコラーゲン、ＭＭＰ９＝マトリックスメタロプロテアーゼ９、ＦＮ１＝フィブロネクチンタイプ１、ＶＩＭ＝ビメンチン。ＭＣＦ７−ＬＯＸＬ２誘導性の腫瘍のストロマにおける活性化倍率（fold activation）を、各遺伝子を示すバーの上の数値によって示した。
【０１０６】
【図４】図４のパネルａ−ｏは、インビトロ及びインビボにおける抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３による血管新生及び血管形成の阻害の例を示す。図４のパネルａ及びｂは、ノンターゲッティングｓｉＲＮＡ（図４のパネルａ）、又は、ＬＯＸＬ２をターゲットにしたｓｉＲＮＡ（図４のパネルｂ）を導入し、１０日間培養したＨＵＶＥＣ細胞のローダミン−ファロイジン染色を示す。図４のパネルｃ−ｉは、インビトロにおけるチューブ形成分析の結果を示す。図４のパネルｃ−ｉでは、培養液中のヒト臍帯静脈内皮細胞（human umbilical vein endothelial cells：ＨＵＶＥＣ）を、ＡＢ００２３の濃度を増加させて処理し、続いて、内皮細胞マーカーＣＤ３１について染色した。４つのパネルは、抗体の不在下で培養したＨＵＶＥＣ（図４のパネルｃ）、あるいは、１μｇ／ｍｌ（図４のパネルｄ）、１０μｇ／ｍｌ、（図４のパネルｅ）、５０μｇ／ｍｌ（図４のパネルｆ）のＡＢ００２３の存在下で培養されたＨＵＶＥＣを示す。分岐ポイントの平均個数（図４のパネルｇ）、血管の平均本数（図４のパネルｈ）、トータルのチューブの長さの平均値（図４のパネルｉ）の定量も実行した。図４のパネルｊ−ｍは、マトリゲル（登録商標）プラグ分析における、血管形成に対する抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３の影響を示す。ＢＡＬＢ／ｃマウスの側腹部にｂＦＧＦを含むマトリゲル（登録商標）プラグを移植し、次に、ＡＢ００２３又はビヒクル（ＰＢＳＴ）の何れかで処置した。移植の１０日後において、ビヒクルのみで処置したプラグ導入動物の組織学的解析（Ｈ＆Ｅ染色）は、分岐した血管系と湿潤性の血管系に関する証拠を示したが（図４のパネルｊ）、これらの証拠は、ＡＢ００２３で処置した動物のプラグには実質的に存在しなかった（図４のパネルｋ）。ビヒクルのみで処置した動物のプラグのＣＤ３１染色（図４のパネルｌ）、及び、ＡＢ００２３で処置した動物のプラグのＣＤ３１染色（図４のパネルｍ）は、類似の結果を示した。すなわち、ＡＢ００２３で処置した動物のプラグにおいては血管形成が無かった。図４のパネルｎは、ビヒクルで処置した動物のプラグ及びＡＢ００２３で処置した動物のプラグにおける血管の平均本数の定量的な解析であり、ＡＢ００２３で処置したマウスにおいて、血管形成が〜１／７へ減少したことを示す（ｐ＝０．０３１９）。図４のパネルｏは、ビヒクルで処置したマウスのプラグ及びＡＢ００２３で処置したマウスのプラグにおけるＣＤ３１ポジティブな細胞の定量であり、血管形成の減少を示す（ｐ＝０．０１６８）。
【０１０７】
【図５−１】図５のパネルａ−ｕは、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３が、インビボにおいて、原発性腫瘍及び癌の転移性異種移植片モデルの両方におけるストロマの活性化の減少及び腫瘍環境の生成の阻害に対して有効であることを示す。図５のパネルａ及びｂにおいて示された結果に関しては、およそ１０６個のＭＤＡ−ＭＢ２３１細胞をマウスに（左心室に）注射して、播種性の骨転移モデルを作製し、そして、注射の２８日後に腫瘍負荷を評価した。注射した動物を、抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３、タキソテレ（Taxotere、アルカイド系抗癌剤）、又は、ビヒクルコントロールで処置した。図５のパネルａは２８日目の大腿骨における腫瘍細胞性負荷（ＡＢ００２３  ｐ＝０．００２１、Ｍ６４  ｐ＝０．５２６２）を示し、図５のパネルｂは２８日目のトータルの側腹部の骨（total ventral bone）における腫瘍細胞性負荷（ＡＢ００２３  ｐ＝０．０１９７、Ｍ６４  ｐ＝０．５１５３）を示す。
【０１０８】
図５のパネルｃ−ｍに示した結果については、原発性腫瘍を、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５細胞系統を使用して生成し、記載されるように処置した。このモデルシステム（宿主動物はビヒクルのみで処置した）において生成された腫瘍の切片を、ＬＯＸＬ２の発現（図５のパネルｃ）、及び、ＬＯＸの発現（図５のパネルｄ）について染色した。
図５のパネルｅは、ビヒクルのみ、タキソテレ（腫瘍体積の減少に関するポジティブコントロール）、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３及び抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４で処置したマウスにおける腫瘍体積の測定を示す。ＡＢ００２３で処置したマウスは、腫瘍体積の顕著な減少を維持したが（３週目で４５％（ｐ＝０．００１）、５週目で３３％（ｐ＝０．０２４０））、Ｍ６４で処置したマウスは維持しなかった（３週目で２７％（ｐ＝０．０４０）、５週目で有意差無し）。図５のパネルｆ−ｉは、ビヒクルで処置した動物（図５のパネルｆ）、ＡＢ００２３で処置した動物（図５のパネルｇ）、Ｍ６４で処置した動物（図５のパネルｈ）、及び、タキソテレで処置した動物（図５のパネルｉ）の腫瘍のシリウスレッド染色の例を示す。図５のパネルｊ−ｍは、ビヒクルのみ（図５のパネルｊ）、ＡＢ００２３（図５のパネルｋ）、Ｍ６４（図５のパネルｌ）、及び、タキソテレ（図５のパネルｍ）で処置した動物から取得した腫瘍の切片におけるα−平滑筋（α−ＳＭＡ）発現のＩＨＣ解析を示す。
図５ｎは、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５誘導性の腫瘍の腫瘍環境における、シリウスレッド染色、α−ＳＭＡ発現及びＣＤ３１発現の定量を示す。図５ｎの結果は、ＡＢ００２３で処置したマウスにおけるクロスリンクしたコラーゲンの６１％減少（ｐ＝０．００２７、シリウスレッド染色によって測定した）、ＴＡＦｓの存在の８８％減少（ｐ＝０．０１１、α−ＳＭＡ発現によって評価した）、及び、腫瘍血管系の７４％減少（ｐ＝０．０００２、ＣＤ３１発現によって評価した）を示す。
【０１０９】
図５のパネルｏは、ＡＢ００２３で処置したマウス及びＢＡＰＮで処置したマウスにおけるＭＤＡ−ＭＢ−４３５誘導性の原発性腫瘍における腫瘍体積の個別の研究の結果を示し、抗ＬＯＸＬ２抗体で処置した後の腫瘍体積の統計的に顕著な減少を示す。
【０１１０】
図５（同５−２）のパネルｐは、ＡＢ００２３で処置したマウス及びＢＡＰＮで処置したマウスのＭＤＡ−ＭＢ−４３５誘導性の腫瘍における、シリウスレッド染色（コラーゲン生成）、ＣＤ−３１発現（血管形成）、及び、α−ＳＭＡ発現（繊維芽細胞の活性化）の定量的な解析を表し、ＡＢ００２３で処置したマウスにおける３つのマーカー全ての減少を示す。
図５（同５−２）のパネルｑは、ＡＢ００２３で処置したマウス及びコントロールマウス（ビヒクルで処置した）のＭＤＡ−ＭＢ−４３５誘導性の腫瘍におけるＬＯＸＬ２、ＶＥＧＦ及びＳＤＦ−１の発現の解析を示し、ＡＢ００２３で処置したＭＤＡ−ＭＢ−４３５腫瘍におけるＶＥＧＦレベルの７６％減少（ｐ＝０．０００１）、ＳＤＦ１レベルの８０％減少（ｐ＝０．０２００）、ＬＯＸＬ２レベルの５５％減少（ｐ＝０．０００５）を示した。
【０１１１】
図５（同５−２）のパネルｒ及びｓは、ＡＢ００２３で処置したＭＤＡ−ＭＢ−４３５腫瘍における壊死の証拠を示す。図５のパネルｒは、ＡＢ００２３で処置したＭＤＡ−ＭＢ−４３５腫瘍からの切片における腫瘍壊死因子α（ＴＮＦ−α）についてのＩＨＣ解析を示す。図５のパネルｓは、ＡＢ００２３で処置したＭＤＡ−ＭＢ−４３５腫瘍からの切片のヘマトキシリン＆エオシン（Ｈ＆Ｅ）染色を示す。図５ｔ及び５ｕは、ＡＢ００２３で処置したＭＤＡ−ＭＢ−４３５腫瘍における核凝縮の証拠を示す。ビヒクルで処置した腫瘍の切片における核は良く定義されたが（図５のパネルｔ）、ＡＢ００２３で処置した腫瘍の切片における核は核凝縮しているように思われた（図５のパネルｕ）。
【０１１２】
【図５−２】図５−１の説明と同様。
【０１１３】
【図６】図６のパネルａ−ｅは、ＣＣｌ４誘導性の肝繊維形成及び筋繊維芽細胞の活性化の、ＡＢ００２３媒介性阻害を示す。図６のパネルａは、ＣＣｌ４処置し、その上更に、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３、抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４又はビヒクルのいずれかで処置したマウスのカプラン・マイヤー法による生存解析を示す。生存の顕著な増加がＡＢ００２３処置群（arm）において観察された（ログランク検定においてｐ＝０．００２９、又は、マンテル・コックス検定においてｐ＝０．００６４ in ）。図６のパネルｂは、ＡＢ００２３で処置したマウスの肝臓における架橋状繊維形成（Bridging Fibrosis）の量の顕著な減少を示す（ｐ＝０．００２０）。図６のパネルｃ及びｄは、ＡＢ００２３で処置したマウス（図６のパネルｄ）からの肝臓と比較した場合の、ビヒクルで処置したマウス（図６のパネルｃ）からの肝臓の門脈−門脈（Porto−Portal）領域の切片におけるα−ＳＭＡについてのＩＨＣ解析を示す。図６のパネルｅは、α−ＳＭＡシグナルの定量的な解析を表し、ＡＢ００２３で処置した動物の肝臓における架橋状繊維形成の欠落は、α−ＳＭＡポジティブな筋繊維芽細胞の細胞数の顕著な減少を伴ったことを示した（ｐ＝０．０２６０）。
【０１１４】
【図７−１】図７のパネルａ−ｚは、ヒトの腫瘍組織及び正常組織におけるＬＯＸＬ２発現の証拠を示す。（パネルａ−ｆ）ヒトの結腸腺癌（パネルａ）、膵臓腺癌（パネルｂ）、子宮腺癌（パネルｃ）、腎臓細胞癌（パネルｄ）、胃腺癌（パネルｅ）、及び、喉頭の扁平上皮細胞癌（パネルｆ）について、ＬＯＸＬ２転写産物の定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析を実行した。腫瘍グレードの増加とともに、ＬＯＸＬ２転写産物が増加する傾向が観察された。（パネルｇ−ｙ）種々のＬＯＸ／Ｌのウェスタンブロット解析は、ヒト及びマウスの組織切片のＩＨＣに使用したポリクローナル抗体が、ＬＯＸＬ２に特異的であることを示す（パネルｇ、ｃＬＯＸ＝成熟ＬＯＸ（切断されたプロペプチド）、ＭＣＤ＝触媒ドメインのタンパク質のみ、ＦＬ＝全長タンパク質、この特異性はＥＬＩＳＡによっても確認した（データは示さない））。ＬＯＸＬ２発現の更なる例：増殖性乳管癌（パネルｈ）、子宮内膜癌（パネルｉ）、大腸腺癌（パネルｊ）、肝細胞癌（パネルｋ、ＬＯＸ発現についても染色した（パネルｌ））。
【０１１５】
【図７−２】脾臓の神経内分泌癌（パネルｍ、ＬＯＸ発現についても染色した（パネルｎ））、メラノーマ（パネルｏ）、正常な心臓（パネルｐ、ＣＤ３１でも染色した（パネルｑ））、正常な肝臓（パネルｒ）、正常な肺（パネルｓ、ＣＤ３１でも染色した（パネルｔ））、正常な卵巣（パネルｕ）、正常な脾臓（パネルｖ）、正常な平滑筋（パネルｘ、ＬＯＸ発現についても染色した（パネルｗ））、及び、正常な動脈（パネルｚ、ＬＯＸ発現についても染色した（パネルｙ））。図７の表１は、ヒトの健康な組織におけるＬＯＸＬ２発現の概要である。ヒト正常組織を抗ＬＯＸＬ２ポリクローナル抗体で染色し、相対的なＬＯＸＬ２発現レベルの品質的な評価を下した。図７の表１は、ヒトの健康な組織におけるＬＯＸＬ２発現の概要である。ヒト正常組織を抗ＬＯＸＬ２ポリクローナル抗体で染色し、相対的なＬＯＸＬ２発現レベルの品質的な評価を下した。
【０１１６】
【図８−１】図８のパネルａ−ｔは、インビトロにおいて、分泌されたＬＯＸＬ２が腫瘍細胞のリモデリング及び湿潤を促進することを示す。（パネルａ）種々の腫瘍及び繊維芽細胞の細胞系統におけるＬＯＸＬ２転写産物のｑＲＴ−ＰＣＲ解析（Ｃｔ値）（正常酸素圧条件、リファレンス（reference）にＲＰＬ１９を使用した）。（パネルｂ）ヒトの腫瘍及び繊維芽細胞の細胞系統におけるＬＯＸＬ２発現のウェスタン解析（全細胞のペレット＝ｃｅｌｌ、ならし培地＝ＣＭ）。（パネルｃ）精製組み換え型ヒトＬＯＸＬ２を使用したＡｍｐｌｅｘＲｅｄ分析によって、ＬＯＸＬ２の８７ｋｄ及び５５ｋｄの両方の形態が活性型であること、及び、ＢＡＰＮによって阻害されることが示された（混合物＝両方の形態の〜５０：５０混合物）。（パネルｄ）精製組み換え型ヒトＬＯＸＬ２のＢＡＰＮ阻害に関する投与量応答曲線（ＡｍｐｌｅｘＲｅｄ分析、データはコントロールに対して規格化した）。（パネルｅ−ｇ）ＨＳ５７８ｔに、ノンターゲッティングｓｉＲＮＡ（ｓｉＮＴ）又はＬＯＸＬ２ｓｉＲＮＡを導入し、ＬＯＸＬ２又はコラーゲンＩの発現について染色した。ＬＯＸＬ２発現は、コラーゲンＩと共局在化した（ｓｉＮＴを導入してＬＯＸＬ２を染色（パネルｅ）、ＬＯＸＬ２ｓｉＲＮＡを導入してＬＯＸＬ２を染色（パネルｆ）、ＬＯＸＬ２ｓｉＲＮＡを導入してコラーゲンＩを染色（パネルｇ））。
【０１１７】
（パネルｈ）ＭＣ３Ｔ３Ｅ１におけるＬＯＸの分泌（ＣＭは、〜２０ｘ濃縮）。（パネルｉ、ｊ）正常酸素圧条件下（パネルｉ）又は低酸素圧条件下（パネルｊ）での腫瘍又は繊維芽細胞の細胞系統におけるＬＯＸ発現の解析では、検出可能なＬＯＸの分泌が示されなかった（ＣＭ＝〜２０ｘ濃縮）。
【０１１８】
【図８−２】（パネルｋ、ｌ）ノンターゲッティングｓｈＲＮＡを導入したＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞は、間葉の表現型を保持した（パネルｋ）（ローダミン−ファロイジンで染色される）が、ＬＯＸＬ２ｓｈＲＮＡを導入したものは、より上皮様の表現型を示した（パネルｌ）。（パネルｍ、ｎ）ウェスタンブロット解析及びＥＬＩＳＡ（パネルｎ）は、両方ともに、ＡＢ００２３がＬＯＸＬ２に特異的であることを示す。（パネルｏ）ＡＢ００２３によるＬＯＸＬ２酵素活性の阻害についての投与量応答曲線（ＡｍｐｌｅｘＲｅｄ分析）。（パネルｐ）ＡＢ００２３は、マウスＬＯＸＬ２と交差反応する。（パネルｑ−ｔ）ＳＷ６２０細胞の成長メディアに、以下のならし培地を添加した：ＭＤＡ−ＭＢ−２３１のＣＭ（パネルｒ）、空のベクターを形質導入したＨＥＫ２９３のＣＭ（パネルｑ）ＬＯＸＬ２を形質導入したＨＥＫ２９３のＣＭ（パネルｓ）又は、ＬＯＸＬ２ｙ６８９ｆを形質導入したＨＥＫ２９３のＣＭ（パネルｔ）。細胞はローダミン−ファロイジンで染色した。
【０１１９】
【図９】図９のパネルａ−ｂは、張力を変化させた条件下でのＨＦＦ細胞におけるＬＯＸＬ２発現と、ＬＯＸＬ２ノックダウンの確認を示す。（パネルａ）ＨＦＦ細胞を、組織培養プレート（Plastic）、２ｍｇ／ｍｌのコラーゲンＩを含むコラーゲンＩゲル（２）、又は、２ｍｇ／ｍｌのコラーゲンＩを含むコラーゲンＩゲル（３）において成長させた。ゲルは、培養皿から分離させる（浮遊）か、培養皿に固定させた（接着）。ならし培地を、ウェスタン解析によって解析し、ＬＯＸＬ２発現についてプローブした。（パネルｂ）ＨＦＦ細胞に、ノンターゲッティングｓｉＲＮＡ（ｓｉＮＴ）又はＬＯＸＬ２ｓｉＲＮＡ（ｓｉＬＯＸＬ２）を導入し、ならし培地をウェスタンブロット解析を介してＬＯＸＬ２発現についてプローブした。
【０１２０】
【図１０】図１０のパネルａ−ｂは、インビボのマトリゲルプラグにおける湿潤性の細胞のＬＯＸＬ２発現を示す。（パネルａ、ｂ）ＩＨＣ解析により、マトリゲルプラグ内の増殖性の内皮細胞においてＬＯＸＬ２発現が確認される（パネルａ）。切片をＣＤ３１で染色して、内皮細胞の存在も確認した（パネルｂ）。
【０１２１】
【図１１】図１１のパネルａ−ｏは、原発性腫瘍及び癌の転移性異種移植片モデルにおけるインビボのＡＢ００２３の効果を示す。（パネルａ）ＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞のｑＲＴ−ＰＣＲ解析によって、全種類のＬＯＸ／Ｌタンパク質の転写が確認される（リファレンスとしてＲＰＬ−１９を使用する）。（パネルｂ−ｅ）ビヒクル（パネルｂ）、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３（パネルｃ）、抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４（パネルｄ）、又は、タキソテレ（パネルｅ）で処置したマウスから収集したＭＤＡ−ＭＢ−４３５によって確立された原発性腫瘍のＣＤ３１染色は、ビヒクルに対して相対的に、ＡＢ００２３処置におけるＣＤ３１染色の７４％減少を示した（ｐ＝０．０００２）。（パネルｆ、g）ＶＥＧＦ（パネルｆ）及びＬＯＸＬ２（パネルｇ）の発現に関して染色したヒト胸部腺癌は、ＴＡＦ発現の類似性を示した。
【０１２２】
（図１１のパネルｈ−ｏ）ビヒクルで処置したマウス及びＡＢ００２３で処置したマウスからのＭＤＡ−ＭＢ−４３５確立性原発性腫瘍を、ＬＯＸＬ２（パネルｈ  ビヒクル処置、パネルｉ  ＡＢ００２３処置）、ＶＥＧＦ（パネルｊ  ビヒクル、パネルｋ  ＡＢ００２３）、ＳＤＦ−１（パネルｌ  ビヒクル、パネルｍ  ＡＢ００２３）の発現について染色し、更に、Ｈ＆Ｅ染色（パネルｎ  ビヒクル、パネルｏ  ＡＢ００２３）も実行した。
【０１２３】
【図１２】図１２のパネルａ−ｄは、ＣＣｌ４誘導性の繊維形成モデルからのネズミの肝臓における繊維形成を示す。（パネルａ−ｄ）健康な肝臓（パネルｂ）と比較した場合の、早期死亡動物（１１日）の肝臓（パネルａ）のコラーゲンＩ染色（シリウスレッド）によって示されるように、ネズミのＣＣｌ４誘導性肝繊維形成モデルは、肝臓のダメージ及び繊維形成の早期的（early）証拠を示した。架橋状繊維形成（bridging fibrosis）の解析に使用した肝臓の例：ビヒクル（パネルｃ）と比較した場合に、ＡＢ００２３で処置したマウス（パネルｄ）は、顕著に、完全な（complete）架橋状繊維形成がほとんど無かった。
【発明を実施するための形態】
【０１２４】
本発明の実施において、特段の指示のない限り、細胞生物学、毒性学、分子生物学、生化学、細胞培養、免疫学、腫瘍学、組み換えＤＮＡの分野、及び、関連分野における標準的な方法及び慣習的な技術を、本発明の分野における通常の技術を有する者（ないし当業者）の技術的範疇内のものとして採用する。そのような技術は従来文献に記載されており、該従来文献を参照することによって当業者は利用可能である。例えば、Alberts, B. et al., "Molecular Biology of the Cell," 5th edition, Garland Science, New York, NY, 2008、Voet, D. et al., "Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level," 3rd edition, John Wiley & Sons, Hoboken, NJ, 2008、Sambrook, J. et al., "Molecular Cloning: A Laboratory Manual," 3rd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001、Ausubel, F. et al., "Current Protocols in Molecular Biology," John Wiley & Sons, New York, 1987 and periodic updates、Freshney, R.I., "Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique," 4th edition, John Wiley & Sons, Somerset, NJ, 2000、及び、the series "Methods in Enzymology," Academic Press, San Diego, CAを参照。
【０１２５】
本願発明者らは、マトリックス酵素であるリシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（lysyl oxidase-like-2：ＬＯＸＬ２）の腫瘍及び繊維形成性疾患の病的な微細環境の生成における役割を同定（確認）した。ヒトの腫瘍及び肝繊維形成の解析は、活性化した繊維芽細胞及び新生血管による、広範囲に広がり、保存されたＬＯＸＬ２の発現を明らかにした。抗ＬＯＸＬ２モノクローナル抗体でのＬＯＸＬ２の阻害は、癌の原発性腫瘍モデル及び転移性異種移植片モデルの両方において、そして、ＣＣｌ４誘導性の肝繊維形成においても有効だった。ＬＯＸＬ２の阻害は、繊維芽細胞の活性化、繊維芽細胞の増殖（湿潤、ないしリクルートメント）、繊維形成、及び、血管新生に実質的な減少をもたらすのみならず、ＶＥＧＦやＳＤＦ１などの血管新生促進性成長因子及びサイトカインの生成にも顕著な減少をもたらす。リシルオキシダーゼ（lysyl oxidase：ＬＯＸ）の阻害には、そのような効果はほとんど無かった。
【０１２６】
小分子β-アミノプロピオニトリル（beta-aminopropionitrile：ＢＡＰＮ）を使用して、インビトロ及びインビボにおけるＬＯＸ／Ｌ活性の阻害の効果を検査した。ＢＡＰＮは、酵素的ドメインのリシン−チロシンキノンを共有結合的に修飾する（ないし変化させる）ので、不可逆的な阻害剤として作用する。ＢＡＰＮは、各ＬＯＸ／Ｌｓの潜在的に異なる活性を阻害するのみならず、類似のドメインを有する他のアミンオキシダーゼの活性も同様に阻害するので、特異性が欠落している。抗ＬＯＸＬ２抗体は、汎用的（pan-）リシルオキシダーゼ阻害剤である小分子β-アミノプロピオニトリル（ＢＡＰＮ）よりも優れていた。抗ＬＯＸＬ２抗体は、ＬＯＸＬ２の特異的な阻害剤として作用し、腫瘍性疾患及び繊維形成性疾患における広範な適用可能性を有する新たなる治療上のアプローチを示した。
【０１２７】
本願発明者らは、腫瘍性疾患及び繊維形成性疾患の病的な微細環境の確立におけるＬＯＸＬ２の役割を発見し、それが治療上のターゲットであることを実証した。ＴＡＦｓ及び腫瘍血管系によるＬＯＸＬ２タンパク質の発現及び分泌は、広範囲の固体の腫瘍において共通しており、特に、腫瘍−ストロマ（支質）間のインターフェイス（境界部）においては明確である。ＬＯＸＬ２発現は、繊維形成領域及び（腎）糸球体様の微小血管の増殖領域においても明確であり、両領域における発現が、いくつかの癌における予後不良と関連する。活動性の肝繊維症において、ＬＯＸＬ２は、肝細胞−筋繊維芽細胞間のインターフェイスにおいても同様に発現し、血管新生と関連した。
【０１２８】
本願発明者らは、更に、ＬＯＸＬ２の発現が、上皮原発性の腫瘍細胞（tumor cells of epithelial origin）、内皮細胞、及び繊維芽細胞を含む複数のタイプの細胞において、アクチン性細胞骨格のリモデリングをもたらすことを決定した。病気の進行に対するＬＯＸＬ２の寄与の１つは、疾患関連性繊維芽細胞の活性化及び増殖（湿潤ないしリクルートメント）である。この寄与は、酵素的に触媒された繊維性コラーゲンのクロスリンキングを介するものであり、局部的なマトリックスの張力（テンション）の変化に対応すると思われる。腫瘍及び肝繊維形成において、張力の増加は疾患関連性の細胞の分化をもたらし得る。繊維性コラーゲンの生成及び組織内張力の生成（増加）を経て、ＴＡＦｓ（潜在的には筋繊維芽細胞も含む）は、進行しつつある腫瘍形成及び繊維形成を支持する多数の血管新生性の、血管性の、化学走性の成長因子及びサイトカインを分泌する。
【０１２９】
種々のパラメータによって評価されるように、癌モデル及び繊維形成モデルの両方において、分泌されたＬＯＸＬ２の活性を特異的に阻害すると、病気の顕著な減少がもたらされることが本願に開示されている。ＬＯＸＬ２の阻害は、血管新生に対して、そして、疾患関連性の上皮の湿潤及び分化に対して直接的に影響を及ぼすことが可能である。しかしながら、ＶＥＧＦＲ及びＰｌＧＦ経路に向けられる強力な抗血管新生性が、ＬＯＸＬ２の阻害のように、腫瘍におけるαＳＭＡポジティブな細胞の数に対して影響を与えなければ、血管新生の阻害のみでは、ＬＯＸＬ２の阻害の後に観察される効果を完全にはもたらし得ない。
【０１３０】
インビボにおけるＬＯＸＬ２の阻害は、繊維芽細胞の活性化及び増殖の阻害をもたらすこと、そして、その結果には、繊維形成の実質的な減少、血管新生促進性成長因子やサイトカインの発現の実質的な減少、腫瘍血管系の形成の欠落、及び、腫瘍細胞の壊死や自食現象（ないしオートファジー）の増加が含まれることも本願は開示する。コラーゲン発現の直接的な制御に起因するというよりも、むしろ、活性化状態の筋繊維芽細胞（コラーゲン生成の大半を担う細胞種）の細胞数の実質的な減少に起因して、繊維性コラーゲンの生成（繊維形成の特徴となるもの）もＬＯＸＬ２の阻害によって大幅に減少した。
【０１３１】
疾患関連性活性化状態の繊維芽細胞の潜在的な起源は多数報告されており、繊維細胞、他の骨髄由来の細胞、常在性の繊維芽細胞、他の前駆細胞、及び、上皮間葉移行性（epithelial-to-mesenchymal transition：ＥＭＴ）の上皮細胞を含む。本願の研究においては、非常に異なる（疾患の部位の違いを含む）３つのマウスモデルにおいて治療効果が得られた。その内の２つのモデルについて更に解析したところ、メカニズムが保存されているように思われ、繊維芽細胞の活性化が実質的に減少していた。これらの結果は、ＬＯＸＬ２が、それらの起源（オリジン）と独立して、繊維芽細胞の最終的な分化及び活性化に関して重要であることを示唆する。
【０１３２】
本願発明者らは、複数のリシルオキシダーゼ型の酵素（ＬＯＸを含む）を生成する細胞を含むモデルシステムを使用しているにもかかわらず、治療効果を得るためにはＬＯＸＬ２単独の阻害で十分あったことを示す。以前に同定されているペプチドをターゲットする特定のＬＯＸ特異的モノクローナル抗体を腫瘍及び繊維形成モデルに使用すると、対照的に、ＬＯＸ酵素活性を阻害することが可能なポリクローナル抗血清が生成されるものの、ほとんど治療効果をもたらさなかった。
【０１３３】
病的な組織と、健康な組織とにおけるＬＯＸＬ２の発現の差は、機能的（有効）な治療域（therapeutic window）を提供する。抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３の安全性の支持に関して、本願発明者らは、ＡＢ００２３が、マウスにおいて、５０ｍｇ／ｋｇを１週間に２回のペースでの１４週間に亘る投与で良好に許容され（well-tolerated）、体重又は挙動に対して影響を及ぼさず、そして、検死解剖、血液学、臨床化学及び組織病理学の観察において薬剤関連性の差が無いことを発見した。カニクイザルにおける、ヒトに適合化させた抗ＬＯＸＬ２変異体（ＡＢ００２４）を用いた試験的な研究は、抗ＬＯＸＬ２抗体による治療が１００ｍｇ／ｋｇで繰り返し投与した際にも良好に許容されることについての更なる支持を提供する。
【０１３４】
抗体治療剤は、高度に特異的な阻害のメカニズムの一例である。実際に、細胞ベースの分析及びインビボにおいて、ＬＯＸＬ２酵素活性を阻害する抗体（ＡＢ００２３）での特異的な分泌されたＬＯＸＬ２のターゲッティングは、特異性の低い細胞透過性の汎用的（pan-）阻害剤であるＢＡＰＮよりも優れていた。（注：従来の報告（複数）に反して、インビトロにおいてＬＯＸＬ２がＢＡＰＮによって容易に阻害される（低ナノモラーＩＣ５０での）（ＬＯＸについて観察された結果に類似した）（図８のパネルｄとRodriguez et al., (2010) J. Biol. Chem. 285:20964-20974）参照）。特異性に加え、この治療モードは追加的な利点をもたらす。即ち、基質濃度に独立して、あるいは、ＬＯＸＬ２とその基質との会合状態に独立して、ＬＯＸＬ２の非競合的なアロステリックな阻害剤（ＡＢ００２３及びＡＢ００２４）が作用する。それに反し、非可逆的な阻害剤であるＢＡＰＮは、競合的な阻害剤として挙動し、高基質濃度条件において、あるいは、ＬＯＸＬ２がその基質と結合した条件の下では、有効性が低い。この異なる阻害メカニズムは、活動的な疾患における局部的な高濃度の基質（繊維性コラーゲンなど）を有するダイナミックで複雑な細胞環境内で機能するマトリックス酵素についての広範囲の適用可能性を有する新規の治療上のアプローチを示す。
【０１３５】
本願において記載のように、ＬＯＸＬ２のアロステリック阻害（＊）は、疾患の進行の根本的で共通な特徴（例えば、ストロマ区画、マトリックス微細環境、又は、転移性ニッシェの形成）をターゲットすることによる、腫瘍の成長及び繊維形成性疾患の進行を阻害する新たなるアプローチを示す。すなわち、単一のターゲット（ＬＯＸＬ２）の阻害は、いくつかの異なる繊維形成の作動因子（ないしドライバー）に対する複数の効果を有する。ＬＯＸＬ２のターゲッティングは、モノクローナル抗体の使用によって高い特異性をもたらすことが可能である。更に、腫瘍微細環境のより安定なストロマ細胞をターゲットとすることは、遺伝子学的に、薬剤抵抗性を減少させる可能性をもたらす。［＊訳注：アロステリックとは、酵素の活性部位以外の部位に他の物質が結合することにより、酵素の活性が変化すること］
【０１３６】
［定義］
「腫瘍環境（tumor environment）」とは、腫瘍及びその周囲の組織を意味する。腫瘍環境のサブセットは、腫瘍−ストロマ間のインターフェイス、すなわち、隣接するストロマ組織に沿った腫瘍の周囲（例えば、腫瘍カプセル）である。他のサブセットは腫瘍自身であり、更なる他のサブセットは腫瘍の外側のストロマ組織である。
【０１３７】
「繊維芽細胞の活性化（fibroblast activation）」とは、腫瘍細胞によって放出されたシグナル（例えば、成長因子、サイトカイン）に対する応答において、正常な繊維芽細胞が腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）に変化するプロセスを意味する。そのような成長因子の例は、変異増殖因子−β（Transforming Growth Factor-beta：ＴＧＦ−β）である。繊維芽細胞の活性化によって、例えば、活性化状態の繊維芽細胞におけるα−平滑筋アクチン（alpha-smooth muscle actin：αＳＭＡ）の発現増加、及び、血管内皮細胞増殖因子（vascular endothelial growth factor：ＶＥＧＦ）の発現増加がもたらされる。
【０１３８】
「腫瘍関連性繊維芽細胞（tumor-associated fibroblasts：ＴＡＦｓ）」とは、繊維芽細胞の活性化が行われた繊維芽細胞であり、特に、α−平滑筋アクチン（αＳＭＡ）及び血管内皮細胞増殖因子（ＶＥＧＦ）の発現の増加によって特徴付けられる。
【０１３９】
「筋繊維芽細胞（myofibroblasts）」とは、繊維芽細胞及び平滑筋細胞の両方の特徴を有する細胞である。それらは繊維性組織に存在することができ、特に、α−平滑筋アクチンの発現によって特徴付けられる。
【０１４０】
「繊維形成（desmoplasia）」とは、繊維性組織又は結合組織の成長を意味する。いくつかの腫瘍は、繊維形成性の反応、すなわち、腫瘍の周囲の密集繊維状組織の増殖的（pervasive）成長を誘導する。
【０１４１】
「血管新生（angiogenesis）」とは、既存の血管からの新たなる血管の形成を意味する。
【０１４２】
「血管形成（vasculogenesis）」とは、既存の血管の存在無しでの新たなる血管の形成を意味する。
【０１４３】
［腫瘍ストロマ］
腫瘍の成長及び発生は、腫瘍とその周囲のストロマ組織との間の相互作用に起因する。腫瘍は、結合組織、繊維芽細胞、筋繊維芽細胞、白血球、内皮細胞、周皮細胞及び平滑筋細胞を含むストロマのフレームワーク（構成）の内で成長する。腫瘍の成長は、特に、成長因子（ストロマ細胞の挙動に対して影響を及ぼす成長因子）を分泌することや、プロテアーゼ（ストロマの細胞外マトリックスをリモデル（再構築）するプロテアーゼ）を分泌することによって、周囲のストロマに対して影響を及ぼす。ストロマ細胞は、この影響に応じて、腫瘍細胞の成長及び分裂を刺激する成長因子を分泌し、そして、マトリックスを更に変化（modify）させるプロテアーゼを分泌する。このようにして、腫瘍及びその周囲のストロマ組織は、腫瘍の更なる成長を支持する腫瘍環境を形成する。例えば、ある腫瘍は、継続した成長に関して、腫瘍関連性繊維芽細胞の存在に依存し、正常な繊維芽細胞の存在下では、検出可能なレベル又は視認可能なレベルには成長しないという研究結果が示されている。ある腫瘍の強壮な成長は、通常はマスト細胞によって分泌される特定のマトリックスメタロプロテアーゼを必要とし、該マトリックスメタロプロテアーゼは、細胞外マトリックスから血管新生因子を放出するように作用することも示されている。
【０１４４】
［リシルオキシダーゼ型の酵素］
本願において使用される用語「リシルオキシダーゼ型の酵素（lysyl oxidase-type enzyme）」及び「ＬＯＸ／Ｌ」とは、特に、リシン残基及びヒドロキシリシン残基のε−アミノ基の酸化的脱アミノ反応を触媒して、ペプチジルリシンのペプチジル−α−アミノアジピン酸−δ−セミアルデヒド（アリシン）への転換と、理論量のアンモニア及び過酸化水素の放出とをもたらすタンパク質ファミリーのメンバーを意味する。
2013502437.tif 000003
【０１４５】
この反応は、細胞外で、コラーゲン及びエラスチンのリシン残基において最も頻繁に生じる。アリシンのアルデヒド残基は反応性であり、他のアリシン及びリシン残基と自発的に縮合することができ、結果として、コラーゲン分子のクロスリンキングを生じてコラーゲン細繊維を形成する。
【０１４６】
リシルオキシダーゼ型の酵素は、鶏、ラット、マウス、ウシ及びヒトから精製されている。全てのリシルオキシダーゼ型の酵素は、共通の触媒ドメイン（およそ２０５アミノ酸の長さで、タンパク質のカルボキシ末端の部分に位置し、酵素の活性部位を含む）を含む。活性部位は、Ｃｕ（ＩＩ）原子に配位する４つのヒスチジン残基を含む保存されたアミノ酸配列の銅結合部を含む。活性部位は、リシン残基とチロシン残基と（ラットリシルオキシダーゼのｌｙｓ３１４とｔｙｒ３４９とに対応し、そして、ヒトリシルオキシダーゼのｌｙｓ３２０とｔｙｒ３５５とに対応する）の間の分子内の共有結合性の連結（ないしリンケージ）によって形成される、リシルチロシルキノン（lysyltyrosyl quinone：ＬＴＱ）補因子も含む。ＬＴＱ補因子を形成するチロシン残基の周囲の配列は、リシルオキシダーゼ型の酵素にも保存される。触媒ドメインは、１０個の保存されたシステイン残基も含み、５つのジスルフィド結合の形成に関与する。触媒ドメインは、フィブロネクチン結合ドメインも含む。つまり、成長因子及びサイトカインの受容体ドメイン（４つのシステイン残基を含む）に類似のアミノ酸配列が触媒ドメインに存在する。これらの保存領域が存在するにも関わらず、分岐状のヌクレオチド及びアミノ酸配列の領域のおかげで、異なるリシルオキシダーゼ型の酵素が（それらの触媒ドメインの内側と外側の両方ともが）互いに区別される。
【０１４７】
この酵素ファミリーにおいて、第１のメンバーとして単離され、特徴付けられたものは、リシルオキシダーゼ（ＥＣ１．４．３．１３）であり、タンパク質−リシン６−オキシダーゼ、タンパク質−Ｌ−リシン：酸素６−オキシドレダクターゼ（脱アミノ化する）又はＬＯＸとしても知られている。例えば、Harris et al., Biochim. Biophys. Acta 341:332-344 (1974)、Rayton et al., J. Biol. Chem. 254:621-626 (1979)、Stassen, Biophys. Acta 438:49-60 (1976)参照。
【０１４８】
更なるリシルオキシダーゼ型の酵素（複数）は、その後に発見された。これらのタンパク質は、「ＬＯＸ−ｌｉｋｅ」又は「ＬＯＸＬ」と称されている。それらは、全て、上記の共通の触媒ドメインを含み、類似の酵素活性を有する。現在、以下の５つの異なるリシルオキシダーゼ型の酵素が、ヒト及びマウスの両方に存在することが知られている：ＬＯＸ、４つのＬＯＸ関連性タンパク質（ないしはＬＯＸ−ｌｉｋｅタンパク質）であるＬＯＸＬ１（「リシルオキシダーゼ−ｌｉｋｅ」、「ＬＯＸＬ」又は「ＬＯＬ」とも表記される）、ＬＯＸＬ２（「ＬＯＲ−１」とも表記される）、ＬＯＸＬ３（「ＬＯＲ−２」とも表記される）及びＬＯＸＬ４。これらの５つの異なるリシルオキシダーゼ型の酵素をコードする遺伝子の各々は、異なる染色体に存在する。例えば、Molnar et al., Biochim Biophys Acta. 1647:220-24 (2003)、Csiszar, Prog. Nucl. Acid Res. 70:1-32 (2001)、国際公開ＷＯ０１／８３７０２号（２００１年１１月８日に公開）、及び、米国特許６，３００，０９２号を参照（全ての文献は引用によって本願に組み込まれる）。ＬＯＸＣと称されるＬＯＸ−ｌｉｋｅタンパク質（ＬＯＸＬ４に対していくつかの類似性を有するが、異なる発現パターンを有する）が、ネズミＥＣ細胞系統から単離されている（Ito et al., (2001) J. Biol. Chem. 276:24023-24029）。２つのリシルオキシダーゼ型の酵素（ＤｍＬＯＸＬ−１及びＤｍＬＯＸＬ−２）が、ショウジョウバエから単離されている。
【０１４９】
全てのリシルオキシダーゼ型の酵素は共通の触媒ドメインをいずれも有するが、それらは、特にアミノ末端領域において、互いに異なる。４つのＬＯＸＬタンパク質は、ＬＯＸと比べて、アミノ末端の延長領域を有する。ヒトのプレプロＬＯＸ（preproLOX：すなわち、シグナル配列切断される前の一次翻訳産物、下記参照）は、４１７アミノ酸残基を含むが、ＬＯＸＬ１は５７４アミノ酸残基を含み、ＬＯＸＬ２は６３８アミノ酸残基を含み、ＬＯＸＬ３は７５３アミノ酸残基を含み、そして、ＬＯＸＬ４は７５６アミノ酸残基を含む。
【０１５０】
ＬＯＸＬ２、ＬＯＸＬ３及びＬＯＸＬ４は、それらのアミノ末端領域の中に、スカベンジャー受容体システインリッチ（scavenger receptor cysteine-rich：ＳＲＣＲ）ドメインの４回の繰り返しを含む。これらのドメインは、ＬＯＸ又はＬＯＸＬ１には存在しない。ＳＲＣＲドメインは、分泌型の、膜貫通型の、又は、細胞外のマトリックスタンパク質に見られ、いくつかの分泌型及び受容体タンパク質においてリガンド結合を媒介することが知られている。Hoheneste et al., (1999) Nat. Struct. Biol. 6:228-232、Sasaki et al. (1998) EMBO J. 17:1606-1613. ＳＲＣＲドメインに加えて、ＬＯＸＬ３はアミノ末端領域に核内移行シグナルも含む。プロリンリッチドメインは、ＬＯＸＬ１に独特であると思われる。Molnar et al., (2003) Biochim. Biophys. Acta 1647:220-224. 種々のリシルオキシダーゼ型の酵素は、グリコシル化のパターンにおいても異なる。
【０１５１】
リシルオキシダーゼ型の酵素の間では、組織分布も異なる。ヒトＬＯＸのｍＲＮＡは、心臓、胎盤、精巣、肺、腎臓及び子宮において高度に発現するが、脳及び肝臓においては、わずかばかりである。ヒトＬＯＸＬ１のｍＲＮＡは、胎盤、腎臓、筋肉、心臓、肺及び膵臓において発現し、脳及び肝臓においてはＬＯＸに類似して非常に低レベルで発現する。Kim et al., (1995) J. Biol. Chem. 270:7176-7182. 高いレベルのＬＯＸＬ２ｍＲＮＡは、子宮、胎盤、及び他の器官において発現するが、脳及び肝臓においては、ＬＯＸ及びＬＯＸＬ１と同様に、低いレベルで発現する。Jourdan Le-Saux et al., (1999) J. Biol. Chem. 274: 12939:12944. ＬＯＸＬ３のｍＲＮＡは、精巣、脾臓、及び、前立腺においては高度に発現し、胎盤においては中程度に発現し、肝臓においては発現しないが、その一方で、高いレベルのＬＯＸＬ４ｍＲＮＡが肝臓において観察される。Huang et al., (2001) Matrix Biol. 20:153-157、Maki and Kivirikko, (2001) Biochem. J. 355: 381-387、Jourdan Le-Saux et al., (2001) Genomics 74:211-218、Asuncion et al., (2001) Matrix Biol. 20:487-491.
【０１５２】
リシルオキシダーゼ型の酵素の発現、及び／又は、関与も疾患ごとに変化する。例えば、Kagen (1994) Pathol., Res. Pract. 190: 910-919、Murawaki et al., (1991) Hepatology 14:1167-1173、Siegel et al., (1978) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75:2945-2949、Jourdan Le-Saux et al., (1994) Biochem. Biophys. Res. Comm. 199:587-592、及び、Kim et al. (1999) J. Cell Biochem. 72:181-188参照。リシルオキシダーゼ型の酵素は、頭部の癌、頚部の癌、頸部の癌、膀胱癌、大（結）腸癌、食道癌及び胸部の癌を含むいくつかの癌とも関連する。例えば、Wu et al., (2007) Cancer Res. 67:4123-4129、Gorough et al., (2007) J. Pathol. 212:74-82、Csiszar, (2001) Prog. Nucl. Acid Res. 70:1-32、及び、Kirschmann et al., (2002) Cancer Res. 62:4478-4483参照。
【０１５３】
リシルオキシダーゼ型の酵素は、構造及び機能においていくつかの重複を示すが、各々に、別個の構造及び機能も有する。構造に関しては、例えば、ヒトＬＯＸタンパク質の触媒ドメインに対して生じたある抗体は、ヒトＬＯＸＬ２に対しては結合しない。機能に関しては、ターゲットとしたＬＯＸの欠損は、マウスの出産時の死をもたらすことがわかっているが、その一方では、ＬＯＸＬ１欠損は、発生上の表現型に重篤な変化を生じさせない。Hornstra et al., (2003) J. Biol. Chem. 278:14387-14393、Bronson et al., (2005) Neurosci. Lett. 390:118-122.
【０１５４】
最も広範に報告されているリシルオキシダーゼ型の酵素の活性は、細胞外部のコラーゲン及びエラスチンにおける特定のリシン残基の酸化であるが、リシルオキシダーゼ型の酵素がいくつかの細胞内のプロセスにも関与するという証拠もある。例えば、いくつかのリシルオキシダーゼ型の酵素が遺伝子発現を制御するという報告がある。Li et al., (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:12817-12822、Giampuzzi et al., (2000) J. Biol. Chem. 275:36341-36349. 更に、ＬＯＸは、ヒストンＨ１のリシン残基を酸化することが報告されている。ＬＯＸの更なる細胞外の活性は、単球、繊維芽細胞及び平滑筋細胞の化学走性の誘導を含む。Lazarus et al., (1995) Matrix Biol. 14:727-731、Nelson et al., (1988) Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 188:346-352. ＬＯＸの発現自体は、ＴＧＦ−β、ＴＮＦ−α及びインターフェロンなどのいくつかの成長因子やステロイドによって誘導される。Csiszar (2001) Prog. Nucl. Acid Res. 70:1-32. 最近の研究は、発生上の制御、腫瘍抑制、細胞運動性、及び、細胞老化などの種々の生物学的な機能において、ＬＯＸが他の役割に関連することを報告する。
【０１５５】
種々のソースのリシルオキシダーゼ（ＬＯＸ）タンパク質の例は、以下の配列の１つから発現した又は翻訳されたポリペプチドと実質的に同一のアミノ酸配列を有する酵素を含む：EMBL/GenBankアクセッション: M94054; AAA59525.1 -- mRNA; S45875; AAB23549.1−mRNA; S78694; AAB21243.1−mRNA; AF039291; AAD02130.1−mRNA; BC074820; AAH74820.1−mRNA; BC074872; AAH74872.1 - mRNA; M84150; AAA59541.1--ゲノムDNA。ＬＯＸの一形態は、ヒトリシルオキシダーゼ（ｈＬＯＸ）プレプロタンパク質である。
【０１５６】
リシルオキシダーゼ−ｌｉｋｅの酵素をコードする配列の開示の例は、以下のとおりである。ＬＯＸＬ１は、ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ  ＢＣ０１５０９０；ＡＡＨ１５０９０．１で寄託されたｍＲＮＡによってコードされる。ＬＯＸＬ２は、ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ  Ｕ８９９４２で寄託されたｍＲＮＡによってコードされる。ＬＯＸＬ３は、ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ  ＡＦ２８２６１９；ＡＡＫ５１６７１．１で寄託されたｍＲＮＡによってコードされる。ＬＯＸＬ４は、ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ  ＡＦ３３８４４１；ＡＡＫ７１９３４．１で寄託されたｍＲＮＡによってコードされる。
【０１５７】
ＬＯＸタンパク質の一次翻訳産物（プレプロペプチドとして知られる）は、アミノ酸１-２１に延在するシグナル配列を含む。このシグナル配列は、マウスＬＯＸ及びヒトＬＯＸの両方において、Ｃｙｓ２１及びＡｌａ２２の間の切断によって細胞内に放出されて、４６−４８ｋＤａのプロペプチド形態のＬＯＸ（本願において、全長形態とも称される）が生成される。プロペプチドはゴルジ体を通過する経路の間にＮ−グリコシル化されて、５０ｋＤａのタンパク質を生成し、続いて細胞外環境に分泌される。この段階において、該タンパク質は触媒作用的に不活性である。更なる切断（マウスＬＯＸにおけるＧｌｙ１６８及びＡｓｐ１６９の間、そして、ヒトＬＯＸにおけるＧｌｙ１７４及びＡｓｐ１７５の間）は、成熟して触媒作用的に活性化状態の３０−３２ｋＤａの酵素を生成し、１８ｋＤａのプロペプチドを放出する。この最終的な切断イベントは、メタロエンドプロテアーゼプロコラーゲンＣ−プロテイナーゼ（骨形成タンパク質−1（bone morphogenetic protein：ＢＭＰ−１）としても知られる）によって触媒される。興味深いことに、この酵素は、ＬＯＸの基質であるコラーゲンのプロセッシングにおいても機能する。Ｎ−グリコシルユニットは、その後に除去される。
【０１５８】
潜在的なシグナルペプチドの切断部位は、ＬＯＸＬ１、ＬＯＸＬ２、ＬＯＸＬ３、及び、ＬＯＸＬ４のアミノ末端であると予測されている。予測されるシグナル切断部位は、ＬＯＸＬ１についてＧｌｙ２５及びＧｌｎ２６の間、ＬＯＸＬ２についてＡｌａ２５及びＧｌｎ２６の間、ＬＯＸＬ３についてＧｌｙ２５及びＳｅｒ２６の間、ＬＯＸＬ４についてＡｒｇ２３及びＰｒｏ２４の間である。
【０１５９】
ＬＯＸＬ１タンパク質におけるＢＭＰ−１の切断部位は、Ｓｅｒ３５４及びＡｓｐ３５５の間であることが同定されている。Borel et al., (2001) J. Biol. Chem. 276: 48944-48949. 他のリシルオキシダーゼ型の酵素における潜在的なＢＭＰ−１切断部位は、プロコラーゲン及びプロ−ＬＯＸにおけるＢＭＰ−１切断のコンセンサス配列であるＡｌａ／Ｇｌｙ−Ａｓｐ配列（しばしば、酸性残基又は荷電残基がその後に続く）に基づいて予測される。ＬＯＸＬ３での予測されるＢＭＰ−１の切断部位は、Ｇｌｙ４４７及びＡｓｐ４４８の間に位置し、この部位におけるプロセッシングは、成熟ＬＯＸと類似サイズの成熟ペプチドを生成する。ＢＭＰ−１の潜在的な切断部位は、ＬＯＸＬ４（残基Ａｌａ５６９及び残基Ａｓｐ５７０の間）においても同定された。Kim et al., (2003) J. Biol. Chem. 278:52071-52074. ＬＯＸＬ２は、ＬＯＸＬファミリーの他のメンバーと同様にタンパク分解的に切断され、分泌される。Akiri et al., (2003) Cancer Res. 63:1657-1666.
【０１６０】
リシルオキシダーゼ型の酵素における共通の触媒ドメインの存在から予想されるように、酵素前駆体のＣ−末端の３０ｋＤａの領域の配列（活性部位が位置する）は、高度に保存されている（およそ９５％）。より緩慢な（moderate）保存の度合い（およそ６０−７０％）がプロペプチドドメインにおいて観察される。
【０１６１】
本願の用語「リシルオキシダーゼ型の酵素」は、上記の５つのリシン酸化酵素（ＬＯＸ、ＬＯＸＬ１、ＬＯＸＬ２、ＬＯＸＬ３及びＬＯＸＬ４）の全てを含み、そして、実質的に酵素活性（例えば、リシル残基の脱アミノ化反応を触媒する能力）を保持するＬＯＸ、ＬＯＸＬ１、ＬＯＸＬ２、ＬＯＸＬ３及びＬＯＸＬ４の機能的フラグメント、及び／又は、これらの誘導体も含む。典型的には、機能的フラグメント又は誘導体は、そのリシン酸化活性の少なくとも５０％を保持する。いくつかの実施形態において、機能的フラグメント又は誘導体は、そのリシン酸化活性の少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９９％又は１００％を保持する。
【０１６２】
リシルオキシダーゼ型の酵素の機能的フラグメントが実質的に触媒作用性の活性を変化させない保存的なアミノ酸置換（天然のポリペプチド配列に関する）を含み得ることも意図される。用語「保存的なアミノ酸置換」とは、ある共通の構造、及び／又は、特徴に基づくアミノ酸のグループ分けを意味する。共通の構造に関して、アミノ酸は、無極性の側鎖を有するもの（グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、プロリン、フェニルアラニン及びトリプトファン）と、無電荷で極性の側鎖を有するもの（セリン、スレオニン、アスパラギン、グルタミン、チロシン及びシステイン）と、そして、電荷を帯びて極性の側鎖を有するもの（リシン、アルギニン、アスパラギン酸、グルタミン酸及びヒスチジン）とにグループ分けすることができる。芳香族の側鎖を含むアミノ酸のグループは、フェニルアラニン、トリプトファン及びチロシンを含む。複素環式の側鎖は、プロリン、トリプトファン及びヒスチジンに存在する。無極性の側鎖を含むアミノ酸のグループの中で、短い炭化水素の側鎖を有するもの（グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン）は、より長く、非炭化水素の側鎖を有するもの（メチオニン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファン）から区別され得る。電荷を帯びて極性の側鎖を有するアミノ酸のグループの中で、酸性アミノ酸（アスパラギン酸、グルタミン酸）は、塩基性側鎖を有するもの（リシン、アルギニン及びヒスチジン）から区別され得る。
【０１６３】
個々のアミノ酸の共通の特徴を定義するための機能的な方法は、相同性の生命体の対応するタンパク質の間のアミノ酸変化の規格化された頻度を解析することである（Schulz, G. E. and R. H. Schirmer, Principles of Protein Structure, Springer-Verlag, 1979）。そのような解析に従って、アミノ酸のグループを定義することができる（一グループ内のアミノ酸は、相同性のタンパク質の間で互いに優先的に置換されており、全体的なタンパク質構造に対して類似の影響を有する）（Schulz, G. E. and R. H. Schirmer, Principles of Protein Structure, Springer-Verlag, 1979）。このタイプの解析に従って、互いに保存的に置換され得る以下のグループのアミノ酸を規定することができる。
（ｉ）Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ及びＨｉｓから成る電荷を帯びた基を含むアミノ酸
（ｉｉ）Ｌｙｓ、Ａｒｇ及びＨｉｓから成るポジティブに電荷を帯びた基を含むアミノ酸（ｉｉｉ）Ｇｌｕ及びＡｓｐから成るネガティブに電荷を帯びた基を含むアミノ酸
（ｉｖ）Ｐｈｅ、Ｔｙｒ及びＴｒｐから成る芳香族の基を含むアミノ酸
（ｖ）Ｈｉｓ及びＴｒｐから成る窒素環の基を含むアミノ酸
（ｖｉ）Ｖａｌ、Ｌｅｕ及びＩｌｅから成る大きい（large）脂肪族の非極性の基を含むアミノ酸
（ｖｉｉ）Ｍｅｔ及びＣｙｓから成るわずかに（slightly）極性の基を含むアミノ酸
（ｖｉｉｉ）Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｐ、Ａｓｎ、Ｇｌｙ、Ａｌａ、Ｇｌｕ、Ｇｌｎ及びＰｒｏから成る小さい（small）残基の基を含むアミノ酸
（ｉｘ）Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｍｅｔ及びＣｙｓから成る脂肪族の基を含むアミノ酸（ｘ）Ｓｅｒ及びＴｈｒから成るヒドロキシル基を含むアミノ酸
【０１６４】
従って、上記の例のように、アミノ酸の保存的な置換は、本発明の分野において通常の知識を有する者（当業者）に知られており、一般的には、結果として生じる分子の生物学的な活性を変化させずに生じさせることができる。当業者は、ポリペプチドの非本質的な（non-essential）領域の一般的な単一のアミノ酸置換が、生物学的な活性を実質的に変化させないことも認識する。例えば、Watson, et al., "Molecular Biology of the Gene," 4th Edition, 1987, The Benjamin/Cummings Pub. Co., Menlo Park, CA, p. 224参照。
【０１６５】
リシルオキシダーゼ型の酵素に関する更なる情報については、例えば、Rucker et al., (1998) Am. J. Clin. Nutr., 67:996S-1002S、及び、Kagan et al., (2003) J. Cell. Biochem 88:660-672を参照。同一出願人による米国特許出願公開２００９／００５３２２４号（２００９年２月２６日）及び同一出願人による米国特許出願公開２００９／０１０４２０１号（２００９年４月２３日）も参照。これらの各出願の開示事項は、本願に引用によって組み込まれる。
【０１６６】
［リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子］
リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子は、活性化因子（アゴニスト）及び阻害因子（アンタゴニスト）の両方を含み、種々のスクリーニングアッセイを使用することによって選択することができる。１つの実施形態において、調節因子は、テスト化合物がリシルオキシダーゼ型の酵素に結合するか否かを決定することによって同定することができる。つまり、結合が生じる場合には、その化合物は候補調節因子である。任意的に、そのような候補調節因子に対して追加のテストを実行することができる。あるいは、候補化合物をリシルオキシダーゼ型の酵素と接触させて、リシルオキシダーゼ型の酵素の生物学的な活性を分析することもできる。すなわち、リシルオキシダーゼ型の酵素の調節因子を変化させる化合物は、リシルオキシダーゼ型の酵素の調節因子である。一般的には、リシルオキシダーゼ型の酵素の生物学的な活性を減少させる化合物は、該酵素の阻害因子である。
【０１６７】
リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子を同定する他の方法は、１つ以上のリシルオキシダーゼ型の酵素を含む細胞培養液の中で候補化合物をインキュベートして、細胞の１つ以上の生物学的な活性又は特徴を分析することを含む。培養液中において細胞の生物学的な活性又は特徴を変化させる化合物は、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の潜在的な調節因子である。分析することが可能な生物学的な活性は、例えば、リシンの酸化、過酸化物（過酸化水素）の生成、アンモニアの生成、リシルオキシダーゼ型の酵素のレベル、リシルオキシダーゼ型の酵素をコードするｍＲＮＡのレベル、及び／又は、リシルオキシダーゼ型の酵素に特異的な１つ以上の機能を含む。前述の分析の更なる実施形態において、候補化合物との接触が無い場合には、１つ以上の生物学的な活性又は細胞の特徴が、１つ以上のリシルオキシダーゼ型の酵素のレベル又は活性と相関される。例えば、生物学的な活性は、移動、化学走性、上皮から間葉への移行、又は、間葉のから上皮への移行などの細胞の機能であり得るし、変化は、１つ以上のコントロールないしは対照サンプル（複数）との比較によって検出される。例えば、ネガティブコントロールのサンプルは、候補化合物が添加されているがリシルオキシダーゼ型の酵素のレベルが減少している培養液か、又は、リシルオキシダーゼ型の酵素の量がテスト培養液と同一（ただし、候補化合物は添加しない）の培養液を含み得る。いくつかの実施形態において、異なるレベルのリシルオキシダーゼ型の酵素を含む個別の培養液を、候補化合物と接触させる。生物学的な活性の変化が観察される場合や、培養液におけるリシルオキシダーゼ型の酵素のレベルが高くなるにつれて変化が大きくなる場合には、候補化合物は、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子として同定される。候補化合物がリシルオキシダーゼ型の酵素の活性化因子であるか、あるいは、阻害因子であるかの決定は、化合物によって誘導される表現型から明白であるかもしれないし、あるいは、１つ以上のリシルオキシダーゼ型の酵素の酵素活性に対する候補化合物の効果のテストなどの更なる分析を必要とするかもしれない。
【０１６８】
生化学的に又は組み換え的にリシルオキシダーゼ型の酵素を取得するための方法、及び、上述のようなリシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子を同定する細胞培養方法・酵素分析方法は、本発明の分野において知られている。
【０１６９】
リシルオキシダーゼ型の酵素の酵素活性は、いくつかの異なる方法によって分析することができる。例えば、リシルオキシダーゼの酵素活性は、過酸化水素、アンモニウムイオン、及び／又は、アルデヒドの生成を検出すること、及び／又は、定量すること、リシンの酸化、及び／又は、コラーゲンのクロスリンクを分析すること、あるいは、細胞の増殖能力、細胞接着、細胞の成長又は転移性の成長を測定することによって評価することができる。例えば、Trackman et al., (1981) Anal. Biochem. 113:336-342;  Kagan et al., (1982) Meth. Enzymol. 82A:637-649;  Palamakumbura et al., (2002) Anal. Biochem. 300:245-251;  Albini et al., (1987) Cancer Res. 47:3239-3245;  Kamath et al., (2001) Cancer Res. 61:5933-5940; 米国特許４，９９７，８５４号、及び、米国特許公開２００４／０２４８８７１号参照。
【０１７０】
テスト化合物は、例えば、小有機化合物（small organic compounds：例えば、約５０Ｄａ及び約２，５００Ｄａの間の分子量を有する有機分子）、核酸又はタンパク質を含むが、これらに限定されない。化合物又は多数の（ないし複数の）化合物は、化学的に合成することもできるし、微生物学的に生成することもできる、そして／又は、例えば、サンプル（例えば、植物、動物又は微生物からの細胞抽出液）に含まれている。更に、化合物（複数）は、本発明の分野において知られているかもしれないが、しかしながら、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性を調節することが可能であることは未だに知られていない。リシルオキシダーゼ型の酵素の調節因子について分析するための反応混合溶液は、無細胞抽出液であり得るし、又は、細胞培養液や組織培養液を含み得る。複数ないし多数の化合物は、例えば、反応混合溶液に添加すること、細胞培養メディウムに添加すること、細胞に注射すること、又は、遺伝形質転換動物に投与することができる。分析に採用する細胞又は組織は、例えば、細菌細胞、真菌細胞、昆虫細胞、脊椎動物細胞、哺乳類細胞、霊長類細胞、ヒト細胞でありえるし、あるいは、ヒト以外の遺伝形質転換動物に含まれうるし、遺伝形質転換動物から取得することもできる。
【０１７１】
いくつかの方法は、本発明の分野における通常の知識を有する者に、大きなライブラリを生成及びスクリーニングして、リシルオキシダーゼ型の酵素などのターゲットに対して特異的親和性を有する化合物を同定する方法として知られている。これらの方法は、無作為に選択したペプチドをファージから発現（displayed）させ、固定化レセプターを使用するアフィニティクロマトグラフィによってスクリーニングする、ファージディスプレイ法を含む。例えば、ＷＯ９１／１７２７１号、ＷＯ９２／０１０４７号、及び米国特許５，２２３，４０９号参照。他のアプローチにおいて、固体支持器（例えば、「チップ」）に固定されるポリマーの組み合わせ的なライブラリは、フォトリソグラフィーを使用して合成される。例えば、米国特許５，１４３，８５４号、ＷＯ９０／１５０７０号及びＷＯ９２／１００９２号参照。固定化ポリマーを、ラベルしたレセプター（例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素）と接触させ、支持器をスキャンして、ラベルの位置を決定し、レセプターに結合するポリマーを同定する。
【０１７２】
目的のポリペプチド（例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素）のリガンドの結合を同定することに使用することが可能な連続的なセルロース膜支持器上でのペプチドライブラリの合成及びスクリーニングは、例えば、Kramer (1998) Methods Mol. Biol. 87: 25-39に記載されている。そのような分析によって同定されるリガンドは、目的のタンパク質の候補調節因子であり、更なるテストについて選択することができる。この方法は、例えば、目的のタンパク質の結合部位及び認識モチーフを決定することにも使用することができる。例えば、Rudiger (1997) EMBO J. 16:1501-1507及びWeiergraber (1996) FEBS Lett. 379:122-126参照。
【０１７３】
ＷＯ９８／２５１４６号は、複合体のライブラリを、所望の特徴（例えば、ポリペプチド又は細胞のレセプターを刺激する、結合する、拮抗阻害する能力）を有する化合物についてスクリーニングする更なる方法を開示する。そのようなライブラリにおける複合体は、テストする化合物、化合物の合成における少なくとも１つのステップを記録するタグ、レポーター分子による修飾に対して感受性のテザー（tether）を含む。テザーの修飾は、複合体が所望の特徴を有する化合物を含むことを示すことに使用される。タグは、そのような化合物の合成において少なくとも１つのステップを表すようにデコードされ得る。リシルオキシダーゼ型の酵素と相互作用する化合物を同定する他の方法は、例えば、インビトロにおけるファージディスプレイシステムを用いたスクリーニング、フィルタ結合アッセイ、及び、相互作用の「リアルタイム」測定（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ装置（Pharmacia社）を使用する測定）である。
【０１７４】
これらの方法は全て、本願の記載に従って、リシルオキシダーゼ型の酵素又は関連するポリペプチドの活性化因子／アゴニスト及び阻害因子／アンタゴニストを同定することに使用することができる。
【０１７５】
リシルオキシダーゼ型の酵素の調節因子の合成に対する他のアプローチは、ペプチドの模倣（類似）体を使用することである。模倣ペプチドの類似体は、例えば、天然に生じるアミノ酸を立体異性体（すなわち、Ｄ−アミノ酸）に置換することによって生成することができる。例えば、Tsukida (1997) J. Med. Chem. 40:3534-3541参照。更に、前駆模倣性構成物質（pro-mimetic components）をペプチドに取り込ませて、オリジナルのポリペプチドの一部を除去する際に喪失させることができる構造的（conformational）な特徴を再確立することができる。例えば、Nachman (1995) Regul. Pept. 57:359-370参照。
【０１７６】
ペプチド模倣物を構築する他の方法は、光学不活性（achiral）のｏ−アミノ酸残基をペプチドに取り込み、脂肪族鎖のポリメチレンユニットによってアミド結合を置換することである。例えば、Banerjee (1996) Biopolymers 39:769-777参照。他のシステムにおける小（small）ペプチドホルモンのスーパーアクティブなペプチド模倣性の類似体は、Zhang (1996) Biochem. Biophys. Res. Commun. 224:327-331に記載されている。
【０１７７】
リシルオキシダーゼ型の酵素の調節因子のペプチド模倣物は、連続的なアミドアルキル化に続いて、結果として生じる化合物をテストすること（例えば、結合の特徴及び免疫学的な特徴についてテストすること）を介して、ペプチド模倣物の組み合わせ的なライブラリの合成によっても同定することができる。ペプチド模倣性の組み合わせ的なライブラリの生成方法及び使用方法は記載されている。例えば、Ostresh, (1996) Methods in Enzymology 267:220-234 and Dorner (1996) Bioorg. Med. Chem. 4:709-715参照。更に、１つ以上のリシルオキシダーゼ型の酵素の３次元構造、及び／又は、結晶学的な構造を、１つ以上のリシルオキシダーゼ型の酵素の活性のペプチド模倣性阻害因子を設計することに使用することができる。Rose (1996) Biochemistry 35:12933-12944;  Rutenber (1996) Bioorg. Med. Chem. 4:1545-1558。
【０１７８】
天然の生物学的なポリペプチドの活性を模倣する低分子量の合成分子の構造ベースのデザイン及び構造ベースの合成は、例えば、Dowd (1998) Nature Biotechnol. 16:190-195;  Kieber-Emmons (1997) Current Opinion Biotechnol. 8:435-441;  Moore (1997) Proc. West Pharmacol. Soc. 40:115-119;  Mathews (1997) Proc. West Pharmacol. Soc. 40:121-125; 及び Mukhija (1998) European J. Biochem. 254:433-438に更に、記載されている。
【０１７９】
例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素の基質又はリガンドとして作用することができる小（Small）有機化合物の模倣物を設計、合成、評価することが可能であることも、本発明の分野における通常の知識を有する者には、良く知られている。例えば、細胞毒性におけるタンパク質補助−関連性の多剤耐性を拮抗阻害することにおいて、ハパロシン（Hapalosin）のＤ−グルコースの模倣物が、ハパロシンと類似の効率を示したことが記載されている、Dinh (1998) J. Med. Chem. 41:981-987。
【０１８０】
リシルオキシダーゼ型の酵素の構造を検査して、例えば、小分子、ペプチド、ペプチド模倣物及び抗体などの調節因子の選択をガイドすることができる。リシルオキシダーゼ型の酵素の構造上の特徴は、リシルオキシダーゼ型の酵素のリガンド、基質、結合パートナー又はレセプターに結合するあるいは、それらとして機能する天然・合成分子を同定することに役立てることができる。例えば、Engleman (1997) J. Clin. Invest. 99:2284-2292参照。例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素の構造上のモチーフの折り畳み構造シミュレーション及びコンピュータリデザインを、適切なコンピュータプログラムを使用して実行することができる。Olszewski (1996) Proteins 25:286-299;  Hoffman (1995) Comput. Appl. Biosci. 11:675-679。タンパク質の折り畳み構造のコンピュータモデリングを、詳細なペプチド及びタンパク質構造の構造的解析及びエネルギー的解析に使用することができる。Monge (1995) J. Mol. Biol. 247:995-1012;  Renouf (1995) Adv. Exp. Med. Biol. 376:37-45。適切なプログラムを、相補的なペプチド配列についてのコンピュータ補助的な検査を使用して、リガンド及び結合パートナーと相互作用する部位（リシルオキシダーゼ型の酵素上の部位）の同定に使用することができる。Fassina (1994) Immunomethods 5:114-120.タンパク質及びペプチドのデザインのための更なるシステムは、例えば、Berry (1994) Biochem. Soc. Trans. 22:1033-1036;  Wodak (1987), Ann. N.Y. Acad. Sci. 501:1-13;及び Pabo (1986) Biochemistry 25:5987-5991に記載されている。上述の構造解析から得られる結果は、例えば、１つ以上のリシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子として機能する有機分子、ペプチド及びペプチド模倣物の調製に使用することができる。
【０１８１】
リシルオキシダーゼ型の酵素の阻害因子は、競合的な阻害因子、不競合的（uncompetitive）な阻害因子、混合型の阻害因子、又は、非競合的な阻害因子であり得る。競合的な阻害因子は、しばしば、基質に対する構造上の類似性を有しており、通常、活性部位に結合し、そして、基質濃度が低ければ低いほど有効である。競合的な阻害因子の存在下では、ＫＭが明確に増加する。不競合的な阻害因子は、一般的には、酵素−基質複合体、あるいは、基質が活性部位に結合して活性部位を歪ませることができた後に利用可能になる部位に結合する。不競合的な阻害因子の存在下では、ＫＭ及びＶｍａｘは両方ともに明確に減少し、基質濃度は阻害に対して、ほとんど、又は、全く影響を有さない。混合型の阻害因子は、フリー状態の酵素と酵素−基質複合体との両方に結合することが可能であり、基質結合と触媒活性との両方に影響を及ぼす。非競合的な阻害は、阻害因子が、酵素と、酵素−基質複合体とに同等の親和性（avidity）で結合し、基質濃度によっては阻害が影響を受けない混合型の阻害の特別なケースである。非競合的な阻害因子は、一般的には、活性部位の外側の領域において酵素に結合する。酵素阻害についての更なる詳細な説明は、例えば、上述のVoet et al. (2008)を参照。天然の基質（例えば、コラーゲン、エラスチン）がインビボにおいて通常時に過剰に（インビボにおいて達成され得るいずれかの阻害因子の濃度と比較して）存在するリシルオキシダーゼ型の酵素などの酵素に関しては、阻害が基質濃度と独立しているので、非競合的な阻害因子が有利である。
【０１８２】
［抗体］
ある実施形態において、リシルオキシダーゼ型の酵素の調節因子は抗体である。更なる実施形態において、抗体は、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の阻害因子である。
【０１８３】
本願において使用される用語「抗体」とは、抗原決定部位に特異的に結合するペプチド配列（例えば、可変領域配列）を含む、単離された又は組み換えのポリペプチド結合剤を意味する。当該用語は、最も広義の意味で使用され、特に、モノクローナル抗体（全長モノクローナル抗体を含む）、ポリクローナル抗体、ヒト抗体、ヒトに適合化させた抗体（ヒト化抗体）、キメラ抗体、ナノボディ、ダイアボディ、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、そして、抗体フラグメント（Ｆｖ、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２及びＦａｂ２を含み、所望の生物学的な活性を示す限りそれらに限定されない）をカバーする。用語「ヒト抗体」とは、ヒトに由来する（origin）配列（ヒトでない可能性のあるＣＤＲ領域を除く）を含む抗体を意味し、免疫グロブリン分子の全長構造が存在することを意味するのではなく、抗体がヒトに対して最小限の免疫原性の影響を有すること（すなわち、それ自体に対し、臨床的に顕著な抗体の生成が誘導されないこと）のみを意味する。
【０１８４】
「抗体フラグメント」とは、全長抗体の部分（例えば、全長抗体の抗原結合領域又は可変領域）を含む。抗体フラグメントの例は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、及びＦｖフラグメント、ダイアボディ、直線状の抗体（Zapata et al. (1995) Protein Eng. 8(10):1057-1062）、単一鎖の抗体分子及び抗体フラグメントから形成される多重特異性抗体を含む。抗体のパパイン消化は、２つの同一抗原結合性フラグメント（「Ｆａｂ」フラグメントと称され、各々、単一の抗原結合部位を有する）と、残りの「Ｆｃ」フラグメントとを生成し、該記号は容易に結晶化される能力を反映する指標である。ペプシン処理は、２つの抗原を組み合わせる部位（sites）を有して、なお抗原をクロスリンクすることが可能なＦ（ａｂ’）２フラグメントを生成する。
【０１８５】
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識−かつ結合−部位を含む最小の抗体フラグメントである。この領域は、堅固で非共有結合的に会合した重鎖及び軽鎖の可変ドメインの二量体から成る。各可変ドメインの３つのＣＤＲＳが相互作用してＶＨ−ＶＬ二量体の表面上の抗原結合部位を定義するのは、この構成においてである。要するに、６つのＣＤＲｓが、抗体に抗原結合特異性を与える。しかしながら、一般的には、その親和性はＦｖフラグメント全体の親和性よりも低いが、単一の可変ドメイン（あるいは、抗原に特異的な６つのＣＤＲｓの内の３つのみを含む単離されたＶＨ又はＶＬ領域）であっても、抗原を認識し、かつ、結合する能力を有する。
【０１８６】
「Ｆａｂ」フラグメントは、重鎖及び軽鎖の可変領域に加えて、軽鎖の定常ドメインと、重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ１）とを更に含む。Ｆａｂフラグメントは、そもそもは、抗体のパパイン消化の後に観察された。Ｆａｂ’フラグメントは、Ｆ（ａｂ’）フラグメントが重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシ末端にいくつかの追加の残基（抗体ヒンジ領域由来の１つ以上のシステインを含む）を含むという点で、Ｆａｂフラグメントと異なる。Ｆ（ａｂ’）２フラグメントは、ジスルフィド結合によってヒンジ領域の近隣に結合した２つのＦａｂフラグメントを含み、そもそもは、抗体のペプシン消化の後に観察された。Ｆａｂ’−ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基（複数）が自由なチオール基を有するＦａｂ’フラグメントに関する本願の記号である。抗体フラグメントの他の化学カップリングも知られている。
【０１８７】
任意の脊椎動物種由来の抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」には、定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、２つの明確な別個のタイプ（カッパ（κ）及びラムダ（λ）と称される）の内の一方を割り当てることができる。それらの重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に依存して、免疫グロブリンを５つの主要な区分クラス（ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭ）に割り当てることができ、これらの内のいくつかは、更に、サブクラス（アイソタイプ、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２）に区分することができる。
【０１８８】
「単一鎖のＦｖ」、「ｓＦｖ」又は「ｓｃＦｖ」抗体フラグメントは、抗体のＶＨ及びＶＬドメインを含み、これらのドメインは単一のポリペプチド鎖に存在する。いくつかの実施形態において、Ｆｖポリペプチドは、ＶＨドメインとＶＬドメインとの間のポリペプチドリンカーを更に含み、ｓＦｖが抗原結合のための所望の構造を形成することが可能である。ｓＦｖについての総論（レビュー）に関しては、Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113 (Rosenburg and Moore eds.) Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)を参照。
【０１８９】
用語「ダイアボディ（diabodies）」とは、２つの抗原結合部位を有する小さい（small）抗体フラグメントを意味し、当該フラグメントは、同一のポリペプチド鎖（ＶＨ−ＶＬ）において軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に結合した重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。同一鎖上の２つのドメインをペアリングするには短すぎるリンカーを使用することによって、該ドメインは他の鎖の相補的なドメインとペアにさせられ、２つの抗原結合部位が作製される。ダイアボディについては、例えば、ＥＰ４０４，０９７、ＷＯ９３／１１１６１及びHollinger et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448に更に開示される。
【０１９０】
「単離された」抗体は、同定されており、そして、天然の環境の構成要素から分離された、及び／又は、回収されたものである。天然の環境の構成要素は、酵素、ホルモン、及び、他のタンパク質性の又は非タンパク質性の溶質を含むことができる。いくつかの実施形態において、単離された抗体は、（１）ローリー法によって決定される抗体の重量が９５％を上回るまで精製される（例えば、９９％重量を上回るまで精製される）か、（２）例えば、スピニングキャップ配列決定装置（Spinning Cup Sequenator）の使用によって、Ｎ−末端の又は内部のアミノ酸配列の少なくとも１５残基を取得するのに十分な度合いまで精製されるか、あるいは、（３）還元条件下又は非還元条件下でのゲル電気泳動（例えば、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）によって均質化して、クーマシーブルー染色又は銀染色によって検出して精製される。用語「単離された抗体」とは、抗体の天然の環境における少なくとも１つの構成要素が存在しない、組み換え細胞内のインサイチュウの抗体を含む。ある実施形態において、単離された抗体は、少なくとも１つの精製ステップによって調製される。
【０１９１】
いくつかの実施形態において、抗体は、ヒトに適合化された抗体（ヒト化抗体）又はヒト抗体である。ヒトに適合化された抗体は、レシピエントの相補性決定領域（complementary determining region：ＣＤＲ）由来の残基が、所望の特異性、親和性及びキャパシティを有するマウス、ラット又はウサギなどの非ヒト種（ドナー抗体）のＣＤＲ由来の残基によって置き換えられたヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）を含む。従って、ヒトに適合化された形状の非ヒト（例えば、ネズミ）抗体は、非ヒト免疫グロブリン由来の最小限の配列を含むキメラの免疫グロブリンである。非ヒトの配列は、主に、可変領域、特に、相補性決定領域（complementarity-determining regions：ＣＤＲｓ）における可変な領域に位置する。いくつかの実施形態において、ヒト免疫グロブリンのＦｖ構造（フレームワーク）の残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。ヒトに適合化させた抗体は、レシピエント抗体、導入したＣＤＲ又はフレームワーク配列のいずれにも発見されない残基を含むこともできる。ある実施形態において、ヒトに適合化された抗体は、全ての可変ドメインの内で、実質的に少なくとも１つの、典型的には２つの可変ドメインを含み、全ての（又は実質的に全ての）ＣＤＲｓは、非ヒト免疫グロブリンのＣＤＲｓに対応し、そして、全ての（又は実質的に全ての）フレームワーク領域は、ヒト免疫グロブリンのコンセンサス配列のものである。本願の開示の目的において、ヒトに適合化された抗体は、免疫グロブリンフラグメント（Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２又は抗体の他の抗原結合性サブシーケンスなど）も含むことができる。
【０１９２】
ヒトに適合化された抗体は、少なくとも免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の部分（典型的には、ヒト免疫グロブリンの部分）も含み得る。例えば、Jones et al. (1986) Nature 321:522-525;  Riechmann et al. (1988) Nature 332:323-329; and Presta (1992) Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596参照。
【０１９３】
非ヒト抗体をヒトに適合化させる方法は、本発明の分野において知られている。一般的には、ヒトに適合化された抗体は、ヒトでないソース由来の抗体に導入される１つ以上のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトのアミノ酸残基は、しばしば、「インポート」又は「ドナー」残基と称され、典型的には「インポート」又は「ドナー」可変ドメインから取得される。例えば、ヒトへの適合化は、本質的には、Winterらの方法に従って、げっ歯類ＣＤＲｓ又はＣＤＲ配列でヒト抗体の対応する配列を置き換えることによって実行することができる。例えば、上述のJones et al.、上述のRiechmann et al.、及びVerhoeyen et al. (1988) Science 239:1534-1536参照。従って、そのような「ヒトに適合化された」抗体はキメラ抗体（米国特許４，８１６，５６７号）を含み、実質的には、無処置のヒト可変ドメインよりも少ない部分が非ヒト種由来の対応する配列によって置換されている。ある実施形態において、ヒトに適合化された抗体は、いくつかのＣＤＲ残基及び任意的にいくつかのフレームワーク領域の残基が、げっ歯類抗体（例えば、ネズミモノクローナル抗体）における類似の部位由来の残基によって置換されるヒト抗体である。
【０１９４】
ヒト抗体は、例えば、ファージディスプレイライブラリを使用することによって生成することもできる。Hoogenboom et al. (1991) J. Mol. Biol, 227:381;  Marks et al. (1991) J. Mol. Biol. 222:581. ヒトモノクローナル抗体を調製する他の方法は、Cole et al. (1985) "Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy," Alan R. Liss, p. 77 及び Boerner et al. (1991) J. Immunol. 147:86-95に記載されている。
【０１９５】
ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子座（loci）を、内来性の免疫グロブリン遺伝子が部分的に又は完全に失活している遺伝形質転換動物（例えば、マウス）に導入することによって作製することができる。免疫学的なチャレンジの際に、ヒト抗体の生成が観察され、全ての観点（遺伝子再構成、アッセンブリー、抗体レパートリーを含む）においてヒトで見られるものと非常に似ている。このアプローチは、例えば、米国特許５，５４５，８０７号；５，５４５，８０６号；５，５６９，８２５号；５，６２５，１２６号；５，６３３，４２５号；５，６６１，０１６号、及び、以下の科学的刊行物：Marks et al., (1992) Bio/Technology 10:779-783 (1992)； Lonberg et al., (1994) Nature 368: 856-859；  Morrison (1994) Nature 368:812-813； Fishwald et al., (1996) Nature Biotechnology 14:845-851；  Neuberger (1996) Nature Biotechnology 14:826；及び Lonberg et al., (1995) Intern. Rev. Immunol. 13:65-93に記載されている。
【０１９６】
抗体は、公知のセレクション方法、及び／又は、上述のような突然変異誘発方法を使用して親和性を成熟させることができる。いくつかの実施形態において、親和性が成熟した抗体は、その成熟抗体を調製するソースである出発時の抗体（一般的には、ヒトに適合化させたネズミ、ウサギ、鶏、あるいはヒトの抗体）の５倍以上、１０倍以上、２０倍以上、又は、３０倍以上の親和性を有する。
【０１９７】
抗体は、二重特異性の抗体でもあり得る。二重特異性の抗体はモノクローナルであり、少なくとも２つの異なる抗原への結合特異性を有するヒト抗体又はヒトに適合化させた抗体であり得る。本願のケースでは、２つの異なる結合特異性を、２つの異なるリシルオキシダーゼ型の酵素、又は、単一のリシルオキシダーゼ型の酵素上の２つの異なるエピトープに向けさせることができる。
【０１９８】
本願で開示した抗体は、免疫複合体（コンジュゲート）でもあり得る。そのような免疫複合体は、第２の分子（レポーターなど）にコンジュゲートした抗体（例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素にコンジュゲートした抗体）を含む。免疫複合体は、化学療法的な薬剤、トキシン（例えば、細菌オリジン、真菌オリジン、植物オリジン又は動物オリジンの酵素的に活性のトキシン、あるいは、それらのフラグメント）、放射性同位体（例えば、放射性コンジュゲート提供するもの）などの細胞毒性の薬剤にコンジュゲートした抗体を含むこともできる。
【０１９９】
「特異的に結合する」抗体、あるいは、特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド上のエピトープに「特異的な」抗体は、他のポリペプチド又はポリペプチドエピトープへ実質的に結合すること無く、特定のポリペプチド又はエピトープに結合するものである。いくつかの実施形態において、本願に開示の抗体は、１００ｎＭ以下、任意的に１０ｎＭ未満、任意的に１ｎＭ未満、任意的に０．５ｎＭ未満、任意的に０．１ｎＭ未満、任意的に０．０１ｎＭ未満、又は、任意的に０．００５ｎＭ未満の解離定数（Ｋｄ）で、モノクローナル抗体の形態、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ又は他の抗体の形態において、約４℃、２５℃、３７℃又は４２℃の温度で、そのターゲットへ特異的に結合する。
【０２００】
ある実施形態において、本願に開示の抗体は、リシルオキシダーゼ型の酵素における１つ以上のプロセッシング部位（例えば、タンパク分解性の切断部位）へ結合し、それによって、触媒作用的に活性の酵素への酵素前駆体又はプレプロ酵素（preproenzyme）のプロセッシングを効果的にブロッキングして、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性を減少させる。
【０２０１】
ある実施形態において、本願に開示の抗体は、他のリシルオキシダーゼ型の酵素、例えば、ＬＯＸＬ１、ＬＯＸＬ３、及び、ＬＯＸＬ４への結合親和性よりも、例えば、１０倍の、少なくとも１００倍の、少なくとも１０００倍さえも上回る、より大きな結合親和性で、ヒトＬＯＸ、及び／又は、ヒトＬＯＸＬ２へ結合する。
【０２０２】
ある実施形態において、本願に開示の抗体は、リシルオキシダーゼ型の酵素の触媒作用性の活性の非競合的な阻害剤である。ある実施形態において、本願に開示の抗体は、リシルオキシダーゼ型の酵素の触媒ドメインの外側に結合する。ある実施形態において、本願に開示の抗体は、ＬＯＸＬ２のＳＲＣＲ４ドメインに結合する。ある実施形態において、ＬＯＸＬ２のＳＲＣＲ４ドメインに結合し、非競合的な阻害剤として機能する抗ＬＯＸＬ２抗体は、本願及び同一出願人による米国特許出願ＵＳ２００９／００５３２２４号及びＵＳ２００９／０１０４２０１に記載のＡＢ００２３抗体である。ある実施形態において、ＬＯＸＬ２のＳＲＣＲ４ドメインに結合し、非競合的な阻害剤として機能する抗ＬＯＸＬ２抗体は、本願及び同一出願人による米国特許出願ＵＳ２００９／００５３２２４号及びＵＳ２００９／０１０４２０１に記載のＡＢ００２４抗体（ＡＢ００２３抗体のヒトバージョン）である。
【０２０３】
任意的に、本願に開示の抗体は、リシルオキシダーゼ型の酵素に結合するだけでなく、例えば、インテグリンβ１、あるいは、他の細胞受容体やタンパク質を介してリシルオキシダーゼ型の酵素の取り込み又は内部移行を減少させるか阻害する。そのような抗体は、例えば、細胞外マトリックスタンパク質、細胞受容体、及び／又は、インテグリンに結合することができる。
【０２０４】
リシルオキシダーゼ型の酵素を認識する抗体の例、及び、リシルオキシダーゼ型の酵素に関連する更なる開示は、同一出願人による米国特許出願ＵＳ２００９／００５３２２４号及びＵＳ２００９／０１０４２０１号に提供される。当該出願の開示は、リシルオキシダーゼ型の酵素に対する抗体、それらの製造、及び、それらの使用を記載する目的のために引用によって本願に組み込まれる。
【０２０５】
［リシルオキシダーゼ型の酵素の発現を調節するポリヌクレオチド］
アンチセンス
リシルオキシダーゼ型の酵素の調節（例えば、阻害）には、リシルオキシダーゼ型の酵素の発現を転写レベル又は翻訳レベルで下方制御することによって影響を与えることができる。そのような調節方法は、リシルオキシダーゼ型の酵素をコードするｍＲＮＡ転写産物と配列特異的に結合することが可能なアンチセンスオリゴヌクレオチド又はアンチセンスポリヌクレオチドの使用を含む。
【０２０６】
ターゲットｍＲＮＡ分子へのアンチセンスオリゴヌクレオチド（又はアンチセンスオリゴヌクレオチド類似体）の結合は、細胞内のＲＮａｓｅＨによるハイブリッドの酵素的切断を導くことができる。あるケースにおいて、アンチセンスＲＮＡ−ｍＲＮＡのハイブリッドの形成は、正確なスプライシングと干渉する。他のケースにおいて、アンチセンスオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド類似体のターゲットｍＲＮＡへの結合は、（例えば、立体障害によって）リボソーム結合を阻止して、ｍＲＮＡの翻訳を阻止することができる。
【０２０７】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、任意のタイプのヌクレオチドサブユニット（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ペプチド核酸（peptide nucleic acids：ＰＮＡ）などの類似体、又は、これらの混合物を含むことができる。ＲＮＡオリゴヌクレオチドは、ターゲットｍＲＮＡ分子とより安定な二本鎖を形成するが、ハイブリダイズしていないオリゴヌクレオチドは、他のタイプのオリゴヌクレオチド及びオリゴヌクレオチド類似体よりも細胞内的に不安定である。このことは、この目的のために設計されたベクターを使用して、細胞内でＲＮＡオリゴヌクレオチドを発現することによって対抗することができる。このアプローチは、例えば、豊富（abundant）で長命のタンパク質のターゲットを試みる場合に、使用することができる。
【０２０８】
アンチセンスオリゴヌクレオチドを設計する際に、（ｉ）ターゲット配列へ結合するのに十分な特異性；（ｉｉ）溶解度；（ｉｉｉ）細胞内ヌクレアーゼ及び細胞外ヌクレアーゼに対する安定性；（ｉｖ）細胞膜を透過する能力；（ｖ）低毒性（生命体の処置に使用する場合）、を含む更なる考察を考慮することができる。
【０２０９】
ターゲットｍＲＮＡに関する最高の予測的結合親和性を有するオリゴヌクレオチド配列を同定するためのアルゴリズムは、熱力学的な周期をもたらすターゲットｍＲＮＡとオリゴヌクレオチドの両方のエネルギーの構造上の変化に基づいて、利用可能である。例えば、Walton et al., (1999) Biotechnol. Bioeng. 65:1-9は、ウサギβ−グロブリン（ＲＢＧ）及びマウス腫瘍壊死因子−α（tumor necrosis factor-α：ＴＮＦα）転写産物に向けられたアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計するそのような方法を使用した。同じ研究グループは、細胞培養液中の３つのモデルターゲットｍＲＮＡｓ（ヒト乳酸脱水素酵素Ａ及びＢ、そしてラットｇｐ１３０）に対する合理的に選択されたオリゴヌクレオチドのアンチセンス活性がほとんど全てのケースにおいて有効であったことを証明した、ということ報告している。これには、３つの異なるターゲットに対する、２つの細胞種における、リン酸ジエステル化学及びホスホロチオエート化学の両方によって作製されたオリゴヌクレオチドを使用するテストが含まれていた。
【０２１０】
更に、インビトロシステムを使用して特定のオリゴヌクレオチドの効率を設計及び予測するいくつかのアプローチが利用可能である。例えば、Matveeva et al., (1998) Nature Biotechnology 16:1374-1375参照。
【０２１１】
本願に開示のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも１０ヌクレオチド、例えば、１０と１５の間、１５と２０の間、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、少なくとも２２、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも４０ヌクレオチドのポリヌクレオチド又はポリヌクレオチド類似体を含む。そのようなポリヌクレオチド又はポリヌクレオチド類似体は、インビボにおいて、生理学的な条件の下で、リシルオキシダーゼ型の酵素（例えば、ＬＯＸ又はＬＯＸＬ２）をコードするｍＲＮＡを用いて、アニール又はハイブリダイズする（すなわち、塩基の相補性に基づいて二本鎖構造を形成する）ことができる。
【０２１２】
本願に開示のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞又は組織に投与された核酸構築物から発現させることができる。任意的に、アンチセンス配列の発現を、誘導性のプロモーターによってコントロールして、細胞又は組織におけるアンチセンス配列の発現のオンとオフをスイッチすることができる。あるいは、アンチセンスオリゴヌクレオチドを化学的に合成して、例えば、医薬組成物の一部として、細胞又は組織に直接的に投与することができる。
【０２１３】
アンチセンステクノロジーは、高度に正確なアンチセンスデザインアルゴリズムの生成、及び、広範囲にわたる種々のオリゴヌクレオチド輸送システムの生成を導く。それによって、本発明の分野において通常の知識を有する者は、公知の配列の発現の下方制御に適したアンチセンスアプローチをデザインして、実行することができる。アンチセンステクノロジーに関連する更なる情報は、例えば、Lichtenstein et al., "Antisense Technology: A Practical Approach," Oxford University Press, 1998を参照。
【０２１４】
小（Small）ＲＮＡ及びＲＮＡｉ
リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の阻害に関する他の方法は、ＲＮＡ干渉（RNA interference：ＲＮＡｉ）、すなわち、ターゲットｍＲＮＡに対して相同性であり、その分解に導く二本鎖の低分子干渉ＲＮＡ（small interfering RNA：ｓｉＲＮＡ）分子を利用するアプローチである。Carthew (2001) Curr. Opin. Cell. Biol. 13:244-248.
【０２１５】
ＲＮＡ干渉は、典型的には、２ステップのプロセスである。第１のステップ（開始ステップと称される）において、インプットｄｓＲＮＡは、２１−２３ヌクレオチド（ｎｔ）の低分子干渉ＲＮＡｓ（ｓｉＲＮＡｓ）に消化される（おそらく、二本鎖特異的リボヌクレアーゼのＲＮａｓｅＩＩＩファミリーのメンバーであり、ＡＴＰ依存的な様式で二本鎖ＲＮＡを切断するダイサー（Dicer）の作用による）。インプットＲＮＡは、例えば、直接的に、あるいは、導入遺伝子又はウイルスを介して送達することができる。連続的な切断イベントは、ＲＮＡを１９−２１ｂｐの二本鎖（ｓｉＲＮＡ）（各々、２−ヌクレオチドの３’オーバーハングを有する）に分解する。Hutvagner et al., (2002) Curr. Opin. Genet. Dev. 12:225-232;  Bernstein (2001) Nature 409:363-366.
【０２１６】
第２のステップ（エフェクターステップ）において、ｓｉＲＮＡ二本鎖をヌクレアーゼ複合体に結合させて、ＲＮＡ誘導性サイレンシング複合体（RNA-induced silencing complex：ＲＩＳＣ）を形成する。ｓｉＲＮＡ二本鎖のＡＴＰ依存性アンワインディングは、ＲＩＳＣの活性化に必要である。次に、活性化ＲＩＳＣ（単一のｓｉＲＮＡ及びＲＮａｓｅを含む）は、塩基対形成性の相互作用によって相同性の転写産物をターゲットし、典型的にはｍＲＮＡをｓｉＲＮＡの３’末端から開始するおよそ１２ヌクレオチドのフラグメントに切断する。Hutvagner et al., supra; Hammond et al. (2001) Nat. Rev. Gen. 2:110-119; Sharp (2001) Genes. Dev. 15:485-490.
【０２１７】
ＲＮＡｉ及び関連する方法は、Tuschl (2001) Chem. Biochem. 2:239-245; Cullen (2002) Nat. Immunol. 3:597-599;及びBrantl (2002) Biochem. Biophys. Acta. 1575:15-25にも記載されている。
【０２１８】
本願の開示の使用に適するリシルオキシダーゼ型の酵素の活性の阻害剤としてのＲＮＡｉ分子の合成に関する手法の例は、ＡＡジヌクレオチド配列についての開始コドンの下流の適切なｍＲＮＡ配列をスキャンすることである。各ＡＡ（プラス下流の（すなわち、３’に隣接する）１９ヌクレオチド）は、潜在的なｓｉＲＮＡターゲット部位として記録される。ｍＲＮＡの非翻訳領域（untranslated regions：ＵＴＲｓ）、及び／又は、翻訳開始複合体に結合するタンパク質は、ｓｉＲＮＡエンドヌクレアーゼ複合体の結合を干渉することができるので、コード領域におけるターゲット部位が好ましい。前記、Tuschl (2001)参照。しかしながら、ＧＡＰＤＨ遺伝子の５’ＵＴＲに向けられたｓｉＲＮＡが細胞のＧＡＰＤＨｍＲＮＡの約９０％減少を媒介し、完全にタンパク質レベルを消失させるケース(www.ambion.com/techlib/tn/91/912.html)において証明されているように、非翻訳領域に方指向されたｓｉＲＮＡｓも有効であり得ることも分かるだろう。一度、上述のように、潜在的なターゲット部位のセットが取得されると、潜在的なターゲットの配列は、配列アライメントソフトウェア（ＮＣＢＩ（www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/）において利用可能なＢＬＡＳＴソフトウェアなど）を使用して、適切なゲノムデータベース（例えば、ヒト、マウス、ラットなど）と比較される。他のコード配列に対して顕著なホモロジーを示す潜在的なターゲット部位は、拒絶される。
【０２１９】
ターゲットとして認定された配列は、ｓｉＲＮＡ合成の鋳型として選択される。選択された配列は、Ｇ／Ｃ含有量が５５％より高いものと比較して、遺伝子サイレンシングを媒介することに、より有効であることが示されているので、Ｇ／Ｃ含有量が低いものを含むことができる。いくつかのターゲット部位は、ターゲット遺伝子の長さに関する評価に沿って選択することができる。選択したｓｉＲＮＡｓのより良い評価のために、ネガティブコントロールが組み合わせて使用される。ネガティブコントロールｓｉＲＮＡは、テストｓｉＲＮＡとしてのヌクレオチド組成物と同一の配列を含むことができるが、ゲノムに対する顕著なホモロジーが欠落する。従って、例えば、ｓｉＲＮＡのスクランブル化したヌクレオチド配列を使用することができる（ただし、それは、他の遺伝子に対する顕著なホモロジーを示さないものとする）。
【０２２０】
本願に開示のｓｉＲＮＡ分子は、一度宿主細胞に導入されるとｓｉＲＮＡ転写産物の安定な発現を促進することが可能な発現ベクターから転写することができる。これらのベクターは遺伝子操作されて、インビボにおいて遺伝子特異的なサイレンシングを実行することが可能なｓｉＲＮＡ分子に変化する低分子ヘアピン型ＲＮＡｓ（small hairpin RNAs：ｓｈＲＮＡｓ）を発現する。例えば、Brummelkamp et al., (2002) Science 296:550-553; Paddison et al., (2002) Genes Dev. 16:948-958; Paul et al., (2002) Nature Biotech. 20:505-508; Yu et al., (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99:6047-6052参照。
【０２２１】
低分子ヘアピン型ＲＮＡｓ（ｓｈＲＮＡｓ）は、二本鎖のヘアピンループ構造を形成する一本鎖のポリヌクレオチドである。二本鎖の領域は、リシルオキシダーゼ型の酵素（例えば、ＬＯＸ又はＬＯＸＬ２ｍＲＮＡ）をコードするポリヌクレオチドなどのターゲット配列にハイブリダイズすることが可能な第１の配列と、第１の配列に相補的な第２の配列とから形成される。第１及び第２の配列は二本鎖の領域を形成するが、第１及び第２の配列の間に存在する非塩基対状態のリンカーヌクレオチドは、ヘアピンループ構造を形成する。ｓｈＲＮＡの二本鎖の領域（ｓｔｅｍ）は、制限エンドヌクレアーゼ認識部位を含むことができる。
【０２２２】
ｓｈＲＮＡ分子は、２〜ｂｐオーバーハング（例えば、３’ＵＵ−オーバーハング）などの任意的なヌクレオチドオーバーハングを有することができる。種々のバリエーションがあり得るが、ｓｔｅｍの長さは、典型的には、およそ１５〜４９ｂｐ、およそ１５〜３５ｂｐ、およそ１９〜３５ｂｐ、およそ２１〜３１ｂｐ、又は、およそ２１〜２９ｂｐにわたり、そして、ループのサイズは、およそ４〜３０ｂｐ、例えば、約４〜２３ｂｐの範囲であり得る。
【０２２３】
細胞内のｓｈＲＮＡｓの発現に関して、プラスミドベクターは、プロモーター（例えば、ＲＮＡポリメラーゼＩＩＩＨ１−ＲＮＡプロモーター又はＵ６ＲＮＡプロモーター）と、ｓｈＲＮＡをコードする配列の挿入のためのクローニング部位と、転写終結シグナル（例えば、４−５個のアデニン−チミジン塩基対の伸長）とを含むものを採用することができる。一般的には、ポリメラーゼＩＩＩプロモーターは、良く定義された転写開始部位及び転写終結部位を有し、転写産物にはポリ（Ａ）テイル（tails）が無い。これらのプロモーターの終結シグナルは、ポリチミジントラクトによって定義され、典型的には、転写産物は２番目にコードされるウリジンの後で切断される。この位置での切断は、発現したｓｈＲＮＡの中に、合成ｓｉＲＮＡｓの３’オーバーハングに類似する３’ＵＵオーバーハングを生成する。哺乳類の細胞内でｓｈＲＮＡを発現する更なる方法は、上記文献に記載されている。
【０２２４】
適切なｓｈＲＮＡ発現の例は、ｐＳＵＰＥＲ（登録商標、Oligoengine, Inc., Seattle, WA）であり、良く定義された転写開始部位を有するポリメラーゼ−ＩＩＩＨ１−ＲＮＡ遺伝子プロモーターと、５つの連続的なアデニン−チミジンペアから成る終了シグナルとを含む。上記のBrummelkamp et al.参照。転写産物は、２番目（終結配列をコードする５つの内の２番目）のウリジンの後の部位で切断され、合成ｓｉＲＮＡｓの終端に似ており、ヌクレオチドオーバーハングも含む転写産物を生成する。ｓｈＲＮＡに転写されるべき配列は、ｍＲＮＡターゲット（例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素をコードするｍＲＮＡ）の一部分に相補的な第１の配列（第１の配列とは逆向きで相補的な配列を含む第２の配列から短いスペーサーによって隔てられる）を含む転写産物を生成するようにベクターにクローン化される。結果として生じる転写産物は、自身に向かって折れ曲がり、ｓｔｅｍ−ループ構造を形成して、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を媒介する。
【０２２５】
他の適切なｓｉＲＮＡ発現ベクターは、別個のｐｏｌＩＩＩプロモーターの制御下でセンスｓｉＲＮＡ及びアンチセンスｓｉＲＮＡをコードする。Miyagishi et al., (2002) Nature Biotech. 20:497-500. このベクターによって生成したｓｉＲＮＡは、５つのチミジン（Ｔ５）の終了シグナルも含む。
【０２２６】
ｓｉＲＮＡｓ、ｓｈＲＮＡｓ、及び／又は、それらをコードするベクターは、種々の方法（例えば、リポフェクション）によって細胞に導入することができる。ベクター媒介性の方法も、開発されている。例えば、ｓｉＲＮＡ分子を、レトロウィルスを使用して細胞に送達することができる。レトロウィルスを用いた運搬は、安定な「ノックダウン」細胞を、効率的に、均一に、そして、即座に選択するので、レトロウィルスを使用するｓｉＲＮＡの運搬は、あるシチュエーションにおいて利点を提供する。Devroe et al., (2002) BMC Biotechnol. 2:15.
【０２２７】
最近の科学的刊行物によれば、そのような短い二本鎖ＲＮＡ分子によるターゲットｍＲＮＡの発現を阻害する効果が確認されており、そのような分子の治療上の潜在的可能性が明確に示されている。例えば、ＲＮＡｉは、Ｃ型肝炎ウイルスに感染した細胞（McCaffrey et al., (2002) Nature 418:38-39）、ＨＩＶ−１に感染した細胞（Jacque et al., (2002) Nature 418:435-438）、頸部の癌細胞（Jiang et al., (2002) Oncogene 21:6041-6048）、及び、白血病性の細胞（Wilda et al., (2002) Oncogene 21:5716-5724）における阻害に利用されている。
【０２２８】
［リシルオキシダーゼ型の酵素の発現を調節する方法］
リシルオキシダーゼ型の酵素の活性を調節する他の方法は、それをコードする遺伝子の発現を調節することであり、遺伝子発現が抑制される場合にはより低いレベルの活性を導き、遺伝子発現が活性化される場合にはより高いレベルの活性を導く。細胞における遺伝子発現の調節は、いくつかの方法によって達成することができる。
【０２２９】
例えば、鎖置換（strand displacement）又は三重らせんの形成によってゲノムＤＮＡ（例えば、リシルオキシダーゼ型遺伝子の調節領域）に結合するオリゴヌクレオチドは、転写をブロックして、リシルオキシダーゼ型の酵素の発現を妨げることができる。この点において、オリゴヌクレオチドがターゲットの片方の鎖の上のポリプリン伸長と、他の鎖の上のホモプリン配列とを認識する、いわゆる「スイッチバック（switch back）」化学リンキングの使用が記載されている。三重らせんの形成は、人工的な塩基を含むオリゴヌクレオチドを使用して取得することもでき、イオン強度及びｐＨに関して結合条件を延長することができる。
【０２３０】
リシルオキシダーゼ型の酵素をコードする遺伝子の転写の調節は、例えば、機能ドメイン及びＤＮＡ結合ドメインを含む融合タンパク質、又は、そのような融合タンパク質をコードする核酸を細胞に導入することによって達成することもできる。機能ドメインは、例えば、転写活性化ドメイン又は転写抑制ドメインであり得る。転写活性化ドメインの例は、ＶＰ１６、ＶＰ６４及びＮＦ−κＢのｐ６５サブユニットを含み、転写抑制ドメインの例は、ＫＲＡＢ、ＫＯＸ及びｖ−ｅｒｂＡを含む。
【０２３１】
ある実施形態において、そのような融合タンパク質のＤＮＡ−結合ドメイン部分は、リシルオキシダーゼ型の酵素をコードする遺伝子の中に、又は、近傍に、あるいは、そのような遺伝子の調節領域に結合する配列特異的ＤＮＡ−結合ドメインである。ＤＮＡ−結合ドメインは、遺伝子又は調節領域に、あるいは、それらの近傍の配列に自然に結合することもできるし、そのように結合するように（遺伝子）操作することもできる。例えば、ＤＮＡ−結合ドメインは、リシルオキシダーゼ型の酵素をコードする遺伝子の発現を制御する、天然に生じるタンパク質から取得することができる。あるいは、ＤＮＡ−結合ドメインを、（遺伝子）操作して、リシルオキシダーゼ型の酵素をコードする遺伝子の中に又は近傍に、あるいは、そのような遺伝子の調節領域の中から選択した配列に結合させることができる。
【０２３２】
この点に関して、ジンクフィンガー（Zinc Finger）タンパク質を選択したＤＮＡ配列に結合するように遺伝子操作するすることが可能であるならば、ジンクフィンガーＤＮＡ−結合ドメインは有用である。ジンクフィンガー結合ドメインは、１つ以上のジンクフィンガー構造を含む。Miller et al., (1985) EMBO J 4:1609-1614; Rhodes (1993) Scientific American, February: 56-65; 米国特許６，４５３，２４２号。典型的には、単一のジンクフィンガーは、長さが約３０個のアミノ酸であり、４つの亜鉛配位性アミノ酸残基を含む。構造の研究は、限界構造性の（Canonical、Ｃ２Ｈ２）ジンクフィンガーモチーフが、αへリックス（一般的には、２つの亜鉛調節ヒスチジン残基を含む）に対向して備えられる、２つのβシート（一般的に２つの亜鉛配位システイン残基を含むβターンに保持される）を含むことを示す。
【０２３３】
ジンクフィンガーは、限界構造性のＣ２Ｈ２ジンクフィンガー（すなわち、亜鉛イオンが２つのシステイン残基と２つのヒスチジン残基とによって配位（coordinated）するもの）と、例えば、Ｃ３Ｈジンクフィンガー（亜鉛イオンが３つのシステイン残基と１つのヒスチジン残基とによって配位するもの）やＣ４ジンクフィンガー（亜鉛イオンが４つのシステイン残基によって配位するもの）などの非限界構造性の（non-canonical）ジンクフィンガーとの両方を含む。非限界構造性のジンクフィンガーは、システイン又はヒスチジン以外の他のアミノ酸が亜鉛を配位させる残基の１つに置換されたものも含むことができる。例えば、ＷＯ０２／０５７２９３号（２００２年７月２５日）及びＵＳ２００３／０１０８８８０号（２００３年６月１２日）参照。
【０２３４】
ジンクフィンガー結合ドメインは、天然に生じるジンクフィンガータンパク質と比較して、新規の結合特異性を有するように遺伝子操作することができ、それによって、選択された配列に結合するように遺伝子操作されたジンクフィンガー結合ドメインの構築がもたらされる。例えば、Beerli et al., (2002) Nature Biotechnol. 20:135-141; Pabo et al., (2001) Ann. Rev. Biochem. 70:313-340; Isalan et al., (2001) Nature Biotechnol. 19:656-660; Segal et al., (2001) Curr. Opin. Biotechnol. 12:632-637; Choo et al. (2000) Curr. Opin. Struct. Biol. 10:411-416参照。遺伝子操作方法は、合理的なデザインや、種々のタイプの経験的な選択方法を含むがそれらに限定されない。
【０２３５】
合理的なデザインは、例えば、三重の（又は四重の）ヌクレオチド配列や、個々のジンクフィンガーアミノ酸配列（三重又は四重のヌクレオチド配列の各々が、特定の三重又は四重の配列を結合するジンクフィンガーの１つ以上のアミノ酸配列と会合するもの）を含むデータベースの使用を含む。例えば、米国特許６、１４０，０８１号；６，４５３，２４２号；６，５３４，２６１号；６，６１０，５１２号；６，７４６，８３８号；６，８６６，９９７号；７，０３０，２１５号；７，０６７，６１７号；米国特許出願公開２００２／０１６５３５６号；２００４／０１９７８９２号；２００７／０１５４９８９号；２００７／０２１３２６９号；や国際特許出願公開ＷＯ９８／５３０５９号及びＷＯ２００３／０１６４９６号参照。
【０２３６】
選択方法の例は、ファージディスプレイ、相互作用トラップシステム、ハイブリッド選択システム及びツーハイブリッドシステムを含み、米国特許出願５，７８９，５３８；５，９２５，５２３；６，００７，９８８；６,０１３，４５３号；６，１４０，４６６号；６，２００，７５９号；６，２４２，５６８号；６，４１０，２４８号；６，７３３，９７０号；６，７９０，９４１号；７，０２９，８４７号及び７，２９７，４９１号；そして、米国特許出願公開２００７／０００９９４８号及び２００７／０００９９６２；ＷＯ９８／３７１８６；ＷＯ０１／６０９７０及びＧＢ２，３３８，２３７号に開示される。
【０２３７】
ジンクフィンガー結合ドメインの結合特異性の増強は、例えば、米国特許６，７９４，１３６号（２００４年９月２１日）に記載されている。フィンガー構造内の（inter-finger）リンカー配列に関するジンクフィンガーの遺伝子操作方法についての更なる視点は、米国特許６，４７９，６２６号及び米国特許出願公開２００３／０１１９０２３号に開示されている。Moore et al., (2001a) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98:1432-1436; Moore et al., (2001b) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98:1437-1441、及びＷＯ０１／５３４８０も参照。
【０２３８】
遺伝子操作されたジンクフィンガーＤＮＡ−結合ドメインを含む融合タンパク質の使用の更なる詳細については、例えば、米国特許６，５３４，２６１号；６，６０７，８８２号；６，８２４，９７８号；６，９３３，１１３号；６，９７９，５３９号；７，０１３，２１９号；７，０７０，９３４号；７，１６３，８２４号及び７，２２０，７１９号において見られる。
【０２３９】
リシルオキシダーゼ型の酵素の発現を調節する更なる方法は、遺伝子、又は遺伝子の発現を調節する調節領域の何れかをターゲットとした突然変異誘発を含む。ヌクレアーゼドメイン及び遺伝子操作されたＤＮＡ−結合ドメインを含む融合タンパク質を使用するターゲット突然変異誘発の方法の例は、例えば、米国特許出願公開２００５／００６４４７４号；２００７／０１３４７９６号；及び２００７／０２１８５２８号において提供されている。
【０２４０】
［製剤、キット及び投与の経路］
リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子（例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素の阻害剤又は活性化因子）として同定された化合物を含む治療組成物も提供される。そのような組成物は、典型的には、調節因子（modulator）及び薬学的に許容可能な担体を含む。添加する活性化合物は、組成物の中に組み込むこともできる。リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子、特に阻害剤を、例えば、化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤（例えば、繊維形成、及び／又は、繊維芽細胞の活性化を減少させる又は除去する薬剤）と組み合わせて使用することができる。従って、本願で開示のように、治療組成物はリシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子と、１つ以上の化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤との両方を含むことができる。更なる実施形態において、治療組成物は、治療的に有効量のリシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子を含むが、化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤を含まない。そして、該組成物は、化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤とは別々に投与される。
【０２４１】
本願において使用される用語「治療的に有効量」又は「有効量」とは、細胞、組織又は被験者（例えば、ヒトなどの哺乳類や、霊長類、げっ歯類、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジなどの非ヒト動物）に対して単独又は他の治療剤と組み合わせて投与される場合に、病状又は病気の進行を妨げる又は回復させることに有効な治療剤の量を意味する。治療的に有効量は、更に、症状の完全な又は部分的な回復（例えば、処置、治療、予防又は適切な医療状態の改善、あるいは、処置、治療、予防又はそのような状態の改善の速度の増加）をもたらすのに十分な化合物の量を意味する。例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の阻害剤の治療的に有効量は、病気又は疾患のタイプ、病気又は疾患の延長性、そして、病気又は疾患を患う生命体のサイズに伴って変化する。
【０２４２】
本願に開示の治療組成物は、特に、腫瘍の成長から結果的に生じる繊維形成（desmoplasia）、及び／又は、繊維形成（fibrosis）を減少させることに有用である。従って、リシルオキシダーゼ型の酵素（例えば、ＬＯＸＬ２）の活性の調節因子（例えば、阻害剤）の「治療的に有効量」は、繊維形成 、及び／又は、繊維形成と関連する症状の減少をもたらす量である。例えば、リシルオキシダーゼ型の酵素の阻害剤が抗体であり、当該抗体がインビボで投与される場合には、通常の投与量は、例えば、体重、投与の経路、病気の重篤度などに依存して、約１０ｎｇ／ｋｇから１００ｍｇ／ｋｇ（哺乳類体重又はそれ以上）まで変化する（日当り）（例えば、約１μｇ／ｋｇ／日から５０ｍｇ／ｋｇ／日、例えば、約３０ｍｇ／ｋｇ／日、任意的に約１００μｇ／ｋｇ／日から２０ｍｇ／ｋｇ／日、５００μｇ／ｋｇ／日から１０ｍｇ／ｋｇ／日、又は、１ｍｇ／ｋｇ／日から１０ｍｇ／ｋｇ／日）。上記投与量は、毎日でなくとも、例えば、１週間に１回、１週間に２回、１週間に３回、１０日毎に１回、２週間に１回、又は、１ヶ月に１回のスケジュールで投与することもできる。投与量は、例えば、１回の投与ごとに約１０ｎｇ／ｋｇから１００ｍｇ／ｋｇ（哺乳類の体重又はそれ以上）、例えば、約１μｇ／ｋｇ／１回の投与ごと〜５０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごと、例えば、約３０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごと、任意的に約１００μｇ／ｋｇ／１回の投与ごと〜２０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごと、５００μｇ／ｋｇ／１回の投与ごと〜１０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごと、又は、１ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごと〜１０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごと、あるいは、約１５ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとの量であり得る。一例において、投与量は、１週間に２回投与の約１５／ｍｇ／ｋｇである。処置の期間は、例えば、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間又は１４週間、あるいはそれ以上の範囲にわたり得る。投与処置法（レジメン）は、２週間ごとに１回の投与（例えば、約１０ｎｇ／ｋｇから１００ ｍｇ／ｋｇまで（哺乳類の体重又はそれ以上）（１回の投与ごとに）、例えば、約１μｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに〜５０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに、例えば、約３０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに、任意的に約１００μｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに〜２０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに、５００μｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに〜１０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに、又は、１ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに〜１０ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに、あるいは、約１５ｍｇ／ｋｇ／１回の投与ごとに）を含むことができる。 
【０２４３】
リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子を化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤と組み合わせて使用する場合には、組み合わせて投与される、連続的に投与される、又は同時に投与されるのいずれであるかにかかわらず、組み合わせ物の治療的に有効量（調節因子と、繊維形成の減少をもたらす化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤とを組み合わせた量）を意味することもできる。１つを上回る濃度の組み合わせが治療的に有効であり得る。
【０２４４】
種々の医薬組成物及びそれらを調製・使用するための技術は、本発明の分野における通常の知識を有する者に知られている。適切な医薬組成物及びそれらの投与のための技術の詳細なリストについては、本願の詳細な記載を参照することができ、Remington's Pharmaceutical Sciences, 17th ed. 1985;  Brunton et al., "Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics," McGraw-Hill, 2005;  University of the Sciences in Philadelphia (eds.), "Remington: The Science and Practice of Pharmacy," Lippincott Williams & Wilkins, 2005;及びUniversity of the Sciences in Philadelphia (eds.), "Remington: The Principles of Pharmacy Practice," Lippincott Williams & Wilkins, 2008などの刊行物を更に参照することもできる。
【０２４５】
開示された治療組成物は、更に、液体又は固体状の充填剤、希釈液、賦形剤、溶媒あるいはカプセル化材料（すなわち、担体）などの薬学的に許容可能な材料、組成物又はビヒクルを含む。これらの担体は、体内のある器官又は領域から、体内の他の器官又は領域へ、目的の調節因子を送達することに含まれる。各担体は、製剤の他の成分であることと、患者にとって無害であることとが両立可能な意味合いにおいて「許容可能」であるべきである。薬学的に許容可能な担体としての役割を果たすことが可能な材料のいくつかの例は、糖（ラクトース、グルコース及びスクロースなど）；デンプン（コーンスターチ及びジャガイモデンプンなど）；セルロース及びその誘導体（ナトリウムカルボキシメチルセルロース、エチルセルロース及びセルロースアセタートなど）；粉末状のトラガント；麦芽；ゼラチン；タルク；賦形剤（ココアバター及び座薬ワックスなど）；油（ピーナッツ油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、コーン油及び大豆油など）；グリコール（プロピレングリコールなど）；ポリオール（グリセリン、ソルビトール、マンニトール及びポリエチレングリコールなど）；エステル（エチルオレイン酸エステル及びエチルラウリン酸エステル）；寒天；バッファ化剤（水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなど）；アルギン酸；パイロジェンフリーの水；等張生理食塩水；リンガー溶液；エチルアルコール；リン酸バッファ；そして、他の無毒な医薬の製剤で採用される他の無毒で両立可能な物質を含む。湿潤剤、乳化剤、潤滑剤（ラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムなど）、着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味剤、香味料、芳香剤、保存料及び抗酸化剤も組成物に存在することが可能である。
【０２４６】
他の視点に係る本願の開示は、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子の投与を実行するキットに関連する。他の視点に係る本願の開示は、リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の調節因子と、化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤とを組み合わせた投与を実行するキットに関連する。１つの実施形態において、キットは、医薬的な担体に製剤化される（適切に１つ以上の個別の医薬調製物に調製される）リシルオキシダーゼ型の酵素の活性の阻害剤（例えば、ＬＯＸＬ２の阻害剤、例えば、抗ＬＯＸＬ２抗体）を含む（任意的に少なくとも１つの化学療法的な薬剤又は抗腫瘍性の薬剤を含む）。
【０２４７】
製剤化方法及び運搬（投与）方法は、繊維形成の部位及び度合いに従って適用することができる。製剤の例は、非経口投与に適したもの（例えば、静脈内の投与、動脈内の投与、眼球内の投与、又は、皮下の投与、ミセル、リポソーム又は薬剤放出性カプセルにカプセル化した製剤（スローに放出するように設計された生体適合性のコーティングに組み込まれた活性化薬剤）を含む）；経口投与可能な製剤；局所的に使用する製剤（点眼剤、クリーム、軟膏及びゲルなど）；そして、他の製剤（吸入剤、エアロゾル及びスプレーなど）を含むがそれらに限定されない。開示の化合物の投与量は、処置が必要な程度及び重篤度、投与される組成物の活性、被験者の普段の健康状態、そして、当業者にとって公知の他の考慮に従って変化するだろう。
【０２４８】
治療組成物は、隣接するストロマ組織、及び／又は、腫瘍外部のストロマの組織に沿って腫瘍−ストロマ間のインターフェイス（すなわち、腫瘍の周囲）へ組成物（例えば、腫瘍カプセル）を運搬するいずれかの適切な経路によって腫瘍の成長から結果として生じる繊維形成を減少させるために投与することができる。
【０２４９】
更なる実施形態において、本願に記載の組成物は、局部的に送達される。局在化させた送達は、非全身的な（例えば、創傷又は繊維形成性の領域への）組成物の送達をもたらし、全身性の送達と比較した場合に、組成物による身体的負荷を減少させる。そのような局部的な送達は、例えば、種々の医学的な移植デバイス（ステント及びカテーテルを含むがそれらに限定されない）の使用を介して達成することもできるし、あるいは、注射又は外科処置によって達成することもできる。コーティング方法、移植方法、包埋方法、そして、所望の薬剤をステント及びカテーテルなどの医療デバイスに付着する方法は、本発明の分野において確立されており、本願において考慮される。
【０２５０】
［抗ＬＯＸＬ２抗体］
ＬＯＸＬ２に向けられたモノクローナル抗体は、同一出願人による米国特許出願公開ＵＳ２００９／００５３２２４号（２００９年２月２６日）に記載されている。この抗体は、ＡＢ００２３と命名される。目的の抗体は、ＡＢ００２３のＣＤＲｓ（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３）を有する重鎖と、ＡＢ００２３のＣＤＲｓ（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３）を有する軽鎖とを有する抗体である。ＣＤＲｓ及び重鎖可変領域の介在フレームワーク領域の配列は、以下のとおりである（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３の配列にはアンダーラインが付される）。
MEWSRVFIFLLSVTAGVHSQVQLQQSGAELVRPGTSVKVSCKASGYAFTYYLIEWVKQRPGQGLEWIGVINPGSGGTNYNEKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSDDSAVYFCARNWMNFDYWGQGTTLTVSS（配列番号１）
配列番号１に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、又は９９％以上のホモロジーを有する更なる重鎖可変領域のアミノ酸配列も提供される。
【０２５１】
ＣＤＲｓ及びＡＢ００２３抗体の軽鎖可変領域の介在性フレームワーク領域の配列は、以下のとおりである（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３の配列にはアンダーラインが付される）。
MRCLAEFLGLLVLWIPGAIGDIVMTQAAPSVSVTPGESVSISCRSSKSLLHSNGNTYLYWFLQRPGQSPQFLIYRMSNLASGVPDRFSGSGSGTAFTLRISRVEAEDVGVYYCMQHLEYPYTFGGGTKLEIK（配列番号２）
配列番号２に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、又は９９％以上のホモロジーを有する更なる軽鎖可変領域のアミノ酸配列も提供される。
【０２５２】
上述の抗ＬＯＸＬ２モノクローナル抗体のヒトに適合化させたバージョンは、同一出願人による米国特許出願公開ＵＳ２００９／００５３２２４号（２００９年２月２６日）に記載されている。ヒトに適合化させた抗体の例は、ＡＢ００２４と命名される。目的の抗体は、ＡＢ００２４抗体のＣＤＲｓ（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３）を有する重鎖と、ＡＢ００２４抗体のＣＤＲｓ（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３）を有する軽鎖とを有するヒトに適合化させた抗体である。
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYAFTYYLIEWVRQAPGQGLEWIGVINPGSGGTNYNEKFKGRATITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYFCARNWMNFDYWGQGTTVTVSS（配列番号３）
配列番号３に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、又は９９％以上のホモロジーを有する更なる重鎖可変領域のアミノ酸配列も提供される。
【０２５３】
ＣＤＲｓ及びＡＢ００２４抗体の軽鎖可変領域の介在フレームワーク領域の配列は、以下のとおりである（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３の配列にはアンダーラインが付される）。
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCRSSKSLLHSNGNTYLYWFLQKPGQSPQFLIYRMSNLASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQHLEYPYTFGGGTKVEIK（配列番号４）
配列番号４に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、又は９９％以上のホモロジーを有する更なる軽鎖可変領域のアミノ酸配列も提供される。
【０２５４】
更なる抗ＬＯＸＬ２抗体（追加のヒトに適合化させた変異体の可変領域を含む）の配列、フレームワーク領域のアミノ酸配列、及び、相補性決定領域のアミノ酸配列は、同一出願人による米国特許出願公開ＵＳ２００９／００５３２２４号（２００９年２月２６日）に開示されている。当該出願の開示は、種々の抗ＬＯＸＬ２抗体のアミノ酸配列を提供する目的のために全体にわたって本願に引用によって組み込まれる。
【実施例】
【０２５５】
［実施例１：組織及び細胞系統］
細胞系統は、ＡＴＣＣ（Manassas、VA）から取得し、ＤＭＥＭ＋１０％ＦＢＳ又は血清フリーのＤＭＥＭ（実験に依存する）の中で維持した。
【０２５６】
［実施例２：構築物及び発現ベクター］
ヒト、ラット及びカニクイザルのＬＯＸＬ２発現ベクターの生成
ラットＬＯＸＬ２を、プラチナＰｆｘＤＮＡポリメラーゼ（Invitrogen）と、プライマー5'atggagatcccttttggctc3'（配列番号５）と、5'ttactgcacagagagctgatta3'（配列番号６）とを使用するＰＣＲによって、正常なラットｃＤＮＡ（心臓、腎臓、骨格筋及び大腸のｃＤＮＡの混合物、Biochain Institute）からクローン化した。９４℃を４分間の最初のインキュベーションを実行した後に、９４℃を１５秒間、５５℃を３０秒間、６８℃を２．５分間のＰＣＲ（３０サイクル）を実行した。ＰＣＲフラグメントをゲルで精製し（ゲル抽出キット、Qiagen）、配列を検証した（MCLab, South San Francisco, CA）。正確なクローンを、プライマー5'atagctagcgccaccatggagatcccttttggctc3'（配列番号７）と、5'tatactcgagtctgcacagagagctgattatttag3'（配列番号８）とを使用するＰＣＲ（上記と同様であるが、１８サイクル）によって増幅し、pSecTag2hygro-B（Invitrogen）にＮｈｅＩサイト及びＸｈｏＩサイトでクローン化して、配列を検証した。カニクイザルＬＯＸＬ２を、正常なｃＤＮＡ（胃、腎臓、大腸、ペニス及び骨格筋のｃＤＮＡの混合物、Biochain Institute）から、プライマー5'cctgtcccccctgagcctggcacag3'（配列番号９）と、5'ttactgcggggagagctggttgttcaagag3'（配列番号１０）（不完全なシグナルペプチドを有するフラグメントを生成する）とを使用するＰＣＲ（上記と同様）によってクローン化し、正確なＯＲＦ配列を複数のＰＣＲ反応物の比較によって決定した。これを、プライマー5'tataggcccagccggcccagtatgacagctggccc3'（配列番号１１）と、5'tatagcggccgcctgcggggagagctggttg3'（配列番号１２）とを使用して、ＳｆｉＩサイト及びＮｏｔＩサイト（内来性のシグナルペプチドを切除する）でpSecTag2hygroベクターにクローン化し、配列を検証した（ＭＣＬａｂ）。ヒトＬＯＸＬ２は、Genecopoeia（Germantown, MD）によってpReceiverM08ベクターに組み込まれ、赤血球凝集素（ＨＡ）及びｈｉｓ６タグを含んだ。リシンチロシルキノン（lysine tyrosylquinone：ＬＴＱ）領域にＹ６８９Ｆ突然変異を有する触媒作用的に不活性状態のＬＯＸＬ２は、Gera Neufeld lab.（Technion, the Israel Institute of Technology）から提供された。
【０２５７】
［実施例３：抗体の生成及び精製］
ハイブリドーマ細胞は、ペニシリン／ストレプトマイシン、５％ハイブリドーマクローニング因子、及び、ＨＴメディア添加剤を含む、低（low）ＩｇＧ  ＤＭＥＭ、１０％胎児性ウシ血清中で培養した。腹水をＢＡＬＢ／ｃマウスで生成し、抗体をMabSelect resin（GE Health）のパックドベッドクロマトグラフィ（packed bed chromatography）によって精製した。バッチ結合の後に、フロースルーを回収し、レジンを１０カラム量のＰＢＳ、ｐＨ７．４で洗浄した。抗体を０．１Ｍクエン酸、ｐＨ３で溶出した。溶出液を、１：１０量の０．１Ｍトリス、ｐＨ８．０で中和し、オーバーナイトで４℃で０．０１％Ｔｗｅｅｎ２０／ＰＢＳの中で透析した。
【０２５８】
マウス抗ヒトＬＯＸＬ２抗体（ＡＢ００２３）を、全長ＬＯＸＬ２タンパク質で免疫化することによって取得し、ＳＥＣ−ＨＰＬＣ（Tosoh TSKGEL G3000SWXL 7.8X300）によって精製した。解析用の分子篩クロマトグラフィ（size exclusion chromatography）を使用して、抗体の安定性及び純度を評価した。精製したＡＢ００２３をＳＤＳ−ＰＡＧＥクーマシー（Invitrogen、ＢＴ４−１２％ゲル）還元性及び非還元性ゲルに流して、純度を評価した。力価をＥＬＩＳＡによって検査して、Ｋｄを測定し、ＬＯＸＬ２酵素活性に対する効果をＡｍｐｌｅｘＲｅｄ分析（Molecular Probes/Invitrogen, Carlsbad, CA）を使用して測定した。抗体濃度は、吸光係数（Extinction Coefficient Abs）0.1% of 1.4を使用して、２８０ｎｍでの吸光度によって測定した。同一性（アイデンティティ）は、等電点分画法（Invitrogen pH 3-10 IEF Gels）によって分析した。安全な解析のために、エンドトキシンのレベルを０．０１−１ＥＵ／ｍｌ（Charles River EndoSafe PTS）の感受性の範囲で測定した。
【０２５９】
抗ＬＯＸ抗体を、アミノ酸配列DTYERPRPGGRYRPGC（配列番号１３）を有するペプチドでの免疫化によって取得した。
【０２６０】
［実施例４：ＬＯＸＬ２及びＬＯＸＬ２フラグメントの精製］
Ｎｉ−セファロース（GE Healthcare）レジンを、０．１Ｍのトリス−ＨＣｌ、ｐＨ８．０で平衡化した。ならし培地（conditioned medium：ＣＭ）を平衡化したレジンに載せた。載せた後に、ニッケルアフィニティカラムを０．１Ｍトリス−ＨＣｌ、ｐＨ８．０、０．２５Ｍ  ＮａＣｌ、０．０２Ｍイミダゾールで洗浄した。溶出は、０．１Ｍトリス、ｐＨ８．０、０．１５０Ｍ  ＮａＣｌ、０．３Ｍイミダゾールで実行した。４−１２％ビストリス（Invitrogen）ゲルで還元したサンプルのＳＤＳ−ＰＡＧＥを実行して、純度を測定した。次に、精製したタンパク質を、オーバーナイトで、４℃で、０．０５Ｍボラート、ｐＨ８．０の中で透析した。
【０２６１】
［実施例５：免疫蛍光分析］
ローダミンファロイジン染色
染色の日の２４時間前に、細胞を８０％の培養密度で８つのチャンバのスライドガラスに蒔いた。２４時間後、メディアを吸引して、チャンバをＰＢＳで洗浄した。次に、細胞を、４％パラホルムアルデヒド（ＰＦＡ）で２０分間室温で固定し、続いて、０．５％サポニン（JT Baker, Phillipsburg, NJ）で５分間室温で透過化処理した。次に、細胞を、１５分間室温で１：１００の希釈度のローダミンファロイジン（Invitrogen, Carlsbad, CA）で染色した。スライドガラスは、Vectashield（Vector Laboratories, Burlingame, CA）でマウントした。
【０２６２】
ＬＯＸ、ＬＯＸＬ２及びコラーゲンタイプ１の共局在化：免疫蛍光法
Ｈｓ５７８ｔ細胞を、８つのチャンバのスライドガラス（BD Falcon, Franklin Lakes, NJ）に蒔いて、オーバーナイトでインキュベートした。低い（low）培養密度のものについては、細胞を、スライドガラス当たりに３０−４０，０００細胞で蒔いた。低い培養密度条件は、細胞を蒔いた２４時間後のサイトゾルにおけるＬＯＸの検出に使用した。高い（high）培養密度のものについては、細胞をスライドガラス当たりに１００，０００細胞で蒔いた。高い培養密度条件は、細胞を蒔いたおよそ４８−７２時間後のマトリックス関連性ＬＯＸ及びコラーゲンの検出に使用した。
【０２６３】
細胞を２４時間インキュベートした後に、抗ＬＯＸ又は抗ＬＯＸＬ２のｍＡｂｓをスライドガラス（普通の（regular）成長メディウム）に最終濃度１μｇ／ｍｌで添加し、スライドガラスをおよそ２４時間インキュベートした。２４時間後に、メディウムを除去して、細胞を１ｘＰＢＳでリンスした。次に、細胞を４％パラホルムアルデヒド（ＰＦＡ）で室温で２０分間固定した。コラーゲンの検出については、抗コラーゲン抗体（１：５０の抗コラーゲンタイプＩウサギポリクローナル抗体、Calbiochem. Gibbstown, NJ）を、４％ＰＦＡで細胞を固定する１時間前に加え、抗ウサギＣｙ３（ImmunoJackson Labs, West Grove, PA）を２次Ａｂとして使用して検出した。
【０２６４】
細胞は、サポニンバッファ（０．５％サポニン／１％ＢＳＡのＰＢＳ溶液）の細胞への添加、室温で２０分間インキュベーションによって透過化処理した。２次抗体（Alexa Fluor 488 donkey anti-mouse IgG, Invitrogen, Carlsbad, CA）をサポニンバッファに室温で添加し３０−４５分間インキュベートした。細胞をサポニンバッファで３回洗浄し、続いて、Vectashield（Vector Laboratories, Burlingame, CA）でマウントした。
【０２６５】
［実施例６：細胞ベースの分析］
タンパク質ブロッティング解析のための細胞溶解物サンプル及びならし培地サンプルの調製
Ｈｓ５７８Ｔ細胞系統、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞系統、ＭＣＦ７細胞系統、Ａ５４９細胞系統及びＨＦＦ細胞系統を、１０％ＦＢＳ（PAA, Etobicoke, Ontario, Canada）と、Ｌ−グルタミン（Mediatech, Manasas, VA）とを添加したDulbecco's modified Eagle's medium（DMEM, Mediatech, Manasas, VA）の中で成長させた。細胞を、正常酸素圧条件下（９５％空気、５％ＣＯ２）又は低酸素条件下（２％Ｏ２、５％ＣＯ２、Ｎ２でバランスを取った）で３７℃で培養した。ならし培地（ＦＢＳ無しのＤＭＥＭ）を収集して、Amicon Ultra-4（Millipore, Billerica, MA）を使用して濃縮した。細胞を掻き集めて、ボルテックスに供し、８Ｍ尿素（１６ｍＭ  Ｎａ２ＨＰＯ４溶液）の中で超音波処理した。次に、細胞溶解物を、Amicon Ultra-15（Millipore, Billerica, MA）を使用して濃縮した。濃縮したならし培地及び細胞溶解物を、ＳＤＳサンプルバッファ（Boston Bioproducts, Worcester, MA）と混合し、９５℃で５分間茹でた。
【０２６６】
ＬＯＸＬ２を含むメディアによるＥＭＴ様の表現型の誘導
ならし培地（conditioned medium：ＣＭ）に曝す２４時間前に、ＭＣＦ７又はＳＷ６２０細胞を、ＨＧＤＭＥＭ（４．５ｇ／ｌのグルコースを含む、高グルコースDulbecco's modified Eagle's medium）、＋１０％ＦＢＳ、２ｍＭ  Ｌ−グルタミンが入った８つのチャンバの培養スライドガラスにウェル当たり５０，０００細胞で蒔いた。５００μｌの新鮮なＭＤＡ  ＭＢ  ２３１細胞のならし培地をＭＣＦ７細胞を含むチャンバに加えた。細胞をＣＭと一緒に４８−９６時間インキュベートした。ＭＣＦ７又はＳＷ６２０細胞のならし培地をネガティブコントロールとして使用した。ＣＭと一緒に４８−９６時間インキュベーションした後に、細胞を、上述のようにローダミン−ファロイジンで染色した。
【０２６７】
ＬＯＸＬ２触媒性の活性は、ＬＯＸＬ２  ＣＭで処理されたＳＷ６２０細胞におけるＥＭＴ様の変化を必要とする。
Lipofectamine 2000（Invitrogen, Carlsbad, CA）を製造元からの指示に従って使用して、ラット、カニクイザル及びヒトのＬＯＸＬ２（野生型及びＹ６８９Ｆ突然変異体）を、個々に、ＨＥＫ２９３細胞に、Ｔ１７５フラスコの中で形質導入した。形質導入の４時間後に、形質導入メディウムを吸引して、３０ｍｌ  ＤＭＥＭ＋０．５％ＦＢＳで置き換え、そして、３７℃で５％ＣＯ２で７２時間細胞を成長させた。ならし培地を収集し、10,000MW cutoff column（Millipore）の中で、〜１０ｘに濃縮し、０．２μｍフィルタ（Aerodisk）を介して濾過した。
【０２６８】
３次元のコラーゲンＩゲル
６ウェルのプレートにおいて、ＨＦＦ細胞を、２ｍｇ／ｍｌ又は３ｍｇ／ｍｌのコラーゲンＩゲルで２ｘ１０５細胞／ウェルの密度で成長させた。Wozniak MA & Keely PJ (2005) Biological Procedures Online 7(1):144-161。手短に述べると、コラーゲン１（BD Biosciences）を、中和化溶液（１００ｍＭ  ＨＥＰＥＳのＰＢＳ溶液、ｐＨ７．３）と混合し、そして、１ｍｌのＲＰＭＩ（Mediatech、１０％ＦＢＳ及び２ｍＭのＬ−グルタミンを含む）に懸濁したＨＦＦ細胞をウェルに加えた。プレートを、３７℃で３０分間インキュベートし、次に、２ｍｌ／ウェルのＲＰＭＩ／１０％ＦＢＳ／２ｍＭグルタミンメディウムを添加した。小さいピペットチップでゲルを剥離することによって半分のゲルをウェル内で浮遊させ、他の半分のゲルはウェルに接着したままにした。ならし培地（ＣＭ、上清）のアリコットを４日目、７日目及び８日目に収集して、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルで分画し、ゲル内のタンパク質ニトロセルロース膜に転写して、ブロッティングした。ニトロセルロース膜をマウス抗ＬＯＸＬ２モノクローナル抗体でインキュベートし、次に、ＨＲＰ−コンジュゲート型のヤギ抗マウス抗体（GE-Healthcare）でインキュベートした。シグナルを化学発光性の溶液（AlphaInnotech）で発生させ、ＵＶＰイメージングを使用して解析した。
【０２６９】
２次元のポリアクリルアミドゲル電気泳動
上述のように（Schlunck et al., 2007）、ポリアクリルアミドゲルを６ウェルプレートにキャストした（ないし載せた）。１ｘ１０５細胞／ウェルで６ウェルプレートに細胞を蒔き、７−８日間メディアを交換することなく培養した。その後に、解析のためにメディウムを除去した。次に、ゲル上の細胞を、溶解して、タンパク質ブロット（「ウェスタン」）解析を行うか、もしくは、４％パラホルムアルデヒドで固定して、製造元の推奨に従って、ローダミンファロイジン（Invitrogen, Carlsbad, CA）で染色した。
【０２７０】
ＨＦＦ細胞におけるＬＯＸ及びＬＯＸＬ２のｓｉＲＮＡノックダウン
ＬＯＸＬ２発現の阻害のためのｓｉＲＮＡ配列は以下のものである。
5'-UAU GCU UUC CGG AAU CUC GAG GGU C- 3'（配列番号１４）（二重鎖のオリゴ）
5'-UGG AGU AAU CGG AUU CUG CAA CCU C- 3'（配列番号１５）（二重鎖のオリゴ）
5'- UCA ACG AAU UGU CAA AUU UGA ACC C- 3'（配列番号１６）（二重鎖のオリゴ）
ＬＯＸ発現の阻害のためのｓｉＲＮＡ配列は以下のものである。
5'-AUA ACA GCC AGG ACU CAA UCC CUG U- 3'（配列番号１７）（二重鎖のオリゴ）
【０２７１】
６０マイクロリットルの２０μＭ  ｓｉＲＮＡを、１ｍｌのＯｐｔｉＭＥＭ（登録商標）（最終ｓｉＲＮＡ濃度は１００ｎＭであった）に混ぜ入れて、３０μｌのDharmafect 3 transfection reagent（Thermo Scientific, Chicago, IL）を１ｍｌのＯｐｔｉＭＥＭ（登録商標）に混ぜ入れた。２つの混合物を組み合わせて、２０分間、室温でインキュベートした。
【０２７２】
ＨＦＦ細胞を、１０ｃｍ２組織培養プレートにおいて、およそ７５％の培養密度に到達するまで培養し、次に、それらをトリプシン処理し、１０ｍｌの完全メディウムに再懸濁した。２ｍｌの形質導入混合溶液（上述のもの）を細胞に添加し、結果として生じた混合溶液を、１０ｃｍ２の培養皿に載せた。タンパク質レベルの測定のために５日後に細胞培養液を収集した。
【０２７３】
インビトロのＨＵＶＥＣ分析
ヒト臍帯静脈内皮細胞（human umbilical vein endothelial cells：ＨＵＶＥＣｓ）を、繊維芽細胞の支持細胞層上に蒔き、ｈＥＧＦ、ヒドロコルチゾン、ＧＡ−１０００（Gentamicin, Amphotericin-B）、ＦＢＳ（胎児性ウシ血清）１０ｍｌ（最終２％）、ＶＥＧＦ、ｈＦＧＦ−Ｂ、Ｒ３−ＩＧＦ−１、アスコルビン酸及びヘパリンを添加したＬｏｎｚａ  ＥＢＭ−２メディウム（低血清環境の正常ヒト内皮細胞のために開発された基本メディウム）が入った２４ウェルのプレートにおいて培養した。培養物が細管形成の最初期段階の様相を示すまで、細胞を成長させた。この時点（１日目）において、添加物を含まない（コントロール）、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３を含む、又は、スラミンを含む、０．５ｍｌの新鮮な内皮細胞の成長メディウムをウェルに添加した。次に、プレートを３７℃及び５％ＣＯ２で培養した。４、７、９日目に、全てのウェルからメディウムを除去し、上記列挙した添加物を含む０．５ｍｌの新鮮なメディウムで慎重に置き換えた。１１日目に、プレートを固定し、以下のように細管をＣＤ３１発現について分析した。ウェルを１ｍｌＰＢＳで洗浄し、１ｍｌの氷冷７０％エタノールで、３０分間、室温で固定した。次に、細胞を６０分間３７℃で、０．５ｍｌマウス抗ヒトＣＤ３１抗体（１％ＢＳＡを含むＰＢＳで１：４００に希釈した）でインキュベートした。次に、ウェルを１ｍｌＰＢＳで３回洗浄し、続いて、６０分間３７℃で、０．５ｍｌアルカリフォスファターゼコンジュゲート型のヤギ抗マウスＩｇＧの２次抗体（１％ＢＳＡを含むＰＢＳで１：５００に希釈した）でインキュベートした。１０分間３７℃で、０．５ｍｌの鮮度よく調製されかつ濾過されたＢＣＩＰ／ＮＢＴ基質でインキュベーションする前に、ウェルを１ｍｌＰＢＳで更に３回洗浄した。次に、ウェルを慎重に１ｍｌ蒸留水で３回洗浄し、オーバーナイトで風乾した。
【０２７４】
各ウェルのデジタル画像を、１０ｘ拡大で、Ｌｅｉｃａ倒立顕微鏡に取り付けたNikon Coolpixカメラを使用して撮像した。ウェル当たりに４つのランダムなフィールドを画像処理して作製し、トータルで９６画像を作製した。次に、画像をＢＭＰファイルに変換して、画像解析パッケージにインポートし、血管の分岐の数、血管の本数、及び、トータルの血管の長さを測定した。これらの測定は、ＣＤ３１で染色された血管のみが検出されるように画像を閾値判別すること（thresholding）によって実行した（このソフトウェアは、単一ピクセル幅にスケルトン化した（ないし格子状化した）血管画像を作成し、そこから個々の血管の長さ、トータルの血管の長さ、及び、血管の分岐点の数を測定することができる）。次に、データをエクセルにエクスポートして、各データセットについて平均値及び標準偏差を算出する。基本的には統計処理は、１要因ＡＮＯＶＡを使用して実行した。
【０２７５】
［実施例７：異種移植片モデルにおける転移及び原発腫瘍の形成］
その後の同所性（ないし正常位置：orthotopic）の移植に成長腫瘍組織ストックを提供するために、５週齢〜６週齢のヌードマウス（ＮＣｒ  ｎｕ／ｎｕ）に、２ｘ１０６ＭＤＡ−ＭＢ−４３５−ＧＦＰ細胞（Anticancer, Inc., San Diego, CA）を右の側腹部に皮下注射した。この目的のために、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５−ＧＦＰ細胞の培養物を収集して、トリプシン処理によって分離し、冷却した血清を含むメディウムで３回洗浄し、そして、注射まで氷上で保持した。収集から３０分内に、細胞を、総量０．１ｍｌで、該動物の側腹部の皮下のスペースに注射した。腫瘍フラグメントの外科的同所性移植手術（surgical orthotopic implantation：ＳＯＩ）のために、腫瘍細胞注射の４〜６週後に、ヌードマウスを犠牲にして、腫瘍組織を収集した。
【０２７６】
皮下において成長したＧＦＰ発現性の胸部腫瘍から抽出した腫瘍片（〜１ｍｍ３）を、メスのヌードマウス（ＮＣｒ  ｎｕ／ｎｕ）の胸部に、同所性移植手術（ＳＯＩ）によって移植した。原発腫瘍の平均体積が７５ｍｍ３に到達した時に、ＡＢ００２３（抗ＬＯＸＬ２モノクローナル抗体）、Ｍ６４（抗ＬＯＸモノクローナル抗体）及びビヒクルでの処置（全て腹腔内注射を介する）、そして、タキソテレでの処置（静脈内注射による）を開始した。マウスに、抗体を、３０ｍｇ／ｋｇの投与量で、１週間に２回、２８日間投与し、そして、タキソテレを１０ｍｇ／ｋｇで、１週間に１回、３週間投与した。
【０２７７】
体重及び腫瘍のサイズを１週間に１回記録した。研究の終局段階において、二酸化炭素で麻酔をかけた後に、頚椎脱臼によってマウスを犠牲にした。組織学的な解析及び免疫組織化学的な解析のために、原発性の胸部腫瘍を、画像処理して、収集して、対称的となるように半分に切断して、瞬間凍結した。
【０２７８】
［実施例８：ＣＣＬ４誘導性の肝臓繊維形成］
オスのＢＡＬＢ／ｃマウス（１０−１２週齢）を、Aragen Biosciences （Morgan Hill, CA）から取得した。マウスを４つの群に分けた。３つの群のマウスにはＣＣＬ４（Sigma-Aldrich, St. Louis, MO）を注射し、残りの群のマウスには生理食塩水を注射した。
【０２７９】
ＣＣＬ４は、１ｍｌ／ｋｇ体重（ＣＣＬ４：ミネラルオイルが１：１（ｖ／ｖ）の割合）で、１週間に２回、４週間、マウスへ腹腔内に投与した。コントロール群には、同一の投与法を使用して、０．９％生理食塩水（生理食塩水：ミネラルオイルが１：１（ｖ／ｖ）の割合）を腹腔内に投与した。
【０２８０】
ＣＣＬ４で処置した群の中で、第１群はＡＢ００２３（ＰＢＳ／０．０１％Ｔｗｅｅｎ−２０に希釈）で処置し、第２群はｐｅｐ４  Ｍ６４（１０ｍｌ−ヒスチジンバッファに希釈した）で処置し、第３群はビヒクル（ＰＢＳＴ）で処置した。抗体及びビヒクルは、腹腔内に、３０ｍｇ／ｋｇの投与量で、１週間に２回注射した。処置をＣＣＬ４の最初の投与の１日前に開始し、研究の最後まで継続させた。研究は、４週間のＣＣＬ４及び抗体の投与の後に終了した。マウスを人道的に安楽死させて犠牲にし、そして、投与が完了した９６時間後に肝臓を収集した。組織学的な解析及び免疫組織化学的な解析のために、肝臓を瞬間凍結した。
【０２８１】
［実施例９：インビボのマトリゲルプラグ血管新生分析］
胸腺欠損のメスのＮＣｒ：ｎｕ／ｎｕマウスに、側腹部の皮下に、１００ｎｇ／ｍｌのＦＧＦ及び６０Ｕのヘパリンを添加した０．５ｍｌの高濃度マトリゲル（BD Biosciences, San Jose, CA）を注射した。マトリゲル注射は、抗体での処置の開始から１週間後に実行した。抗体（又はＰＢＳＴ、コントロールとして）を、３０ｍｇ／ｋｇで１週間に２回、腹腔内注射で投与した。プラグに付着した皮膚と一緒に切除することによって、移植の１０日後にマトリゲルプラグを収集し、１０％中性の緩衝溶液化したホルマリン内で固定して、パラフィンに包埋した。５ｕｍの切片を切り出して、ヘマトキシリン・エオシン、抗ＣＤ３１抗体又は抗ＣＤ３４抗体で染色し、血管形成の度合いを検査した。
【０２８２】
［実施例１０：免疫組織化学］
免疫組織化学（ＩＨＣ）のプロトコルに使用される溶液は、特段の指示のない限り、Biocare Medical （Concord, CA）から取得した。全ての手法は、室温で実行した。スライドガラスを４％ＰＦＡで１０分固定し、続いて、Ｐｅｒｏｘｉｄａｚｅｄ−１（Biocare Medical, Concord, CA）で５分間処置した。次に、スライドガラスに、SNIPER （Biocare Medical, Concord, CA）で、バックグラウンドブロック処理を１０分間施した。一次抗体（最終濃度２−５μｇ／ｍｌ）を、Da Vinci Green Universal Diluentに希釈し、スライドガラスへ３０分間適用した。次に、スライドガラスをＰＢＳ−Ｔｗｅｅｎ−２０でリンスした。ウサギプローブを３０分間添加することによって、Ｍａｃｈ２ポリマーキットを抗原の検出に使用した。ＤＡＢクロモゲンを、スライドガラスに３−５分間添加し、次に、スライドガラスを脱イオン水で１回リンスした。次に、スライドガラスをヘマトキシリンで対比染色し、続いて、段階的濃度の（graded）アルコールで脱水した。スライドガラスをエンテラン包埋メディウム（Electron Microscopy Sciences, Hatfield, PA）でマウントした。
【０２８３】
［実施例１１：ＩＨＣ画像の定量的な解析］
肝臓繊維形成
各処置法について、１０個のフィールド（ないし、領域、ローブ）をランダムに選択し、シリウス・レッドで染色した。スコア化に使用した領域は、１．７ｍｍｘ１．３ｍｍであり、少なくとも８つの門脈三つ組（portal triads）を含ませた。
【０２８４】
門脈三つ組の領域及び完全な架橋状繊維形成（complete bridging fibrosis）の領域をカウントした。完全な架橋状繊維形成の領域の数を、門脈三つ組の領域の総数で除算して、完全な架橋状繊維形成のパーセンテージを各フィールドから取得した。１０個のフィールドからのパーセンテージ（処置ごとの）を平均化し、標準誤差を算出した。
【０２８５】
ａＳＭＡ発現の染色による繊維芽細胞の活性化
各処置について、５つのフィールドを選択し、抗α−平滑筋アクチン（ａＳＭＡ）抗体で染色した。門脈−門脈（Porto−Portal）領域におけるａＳＭＡ−ポジティブなシグナルは（閾値判別領域％：threshold area %）、Metamorph（Molecular Devices, Downingtown, PA）によって解析した。ＡＢ００２３処置を行った動物の切片におけるＳＭＡ−ポジティブなシグナルを、ビヒクル（ＰＢＳ）で処置した動物の切片において取得されたシグナルと比較した。
【０２８６】
［実施例１２：ＲＴ−ＰＣＲ解析］
トータルＲＮＡの単離及び定量的なリアルタイムＰＣＲ
ＲＮＡは、製造元の指示に従って、RNeasy Mini Kit（Qiagen, Valencia, CA）を使用して凍結組織の断片から抽出した。手短に述べると、組織を、ホモジナイザ（Polytron hand-held electric homogenizer）を用いて、ＲＬＴ溶解バッファの中で均質化処理（ホモジナイズ）し、ヌクレアーゼフリーの水（Ambion, Austin, TX）で溶出した。残りのゲノムＤＮＡ混入物は、組み換え型ＤＮａｓｅ Ｉ（Ambion, Austin, TX）を使用して除去した。逆転写酵素媒介性のｃＤＮＡ合成に、１反応当たりに１００ナノグラムのトータルＲＮＡを使用し、その後、BrilliantII qPCR one-step core reagent kit（Agilent, Santa Clara, CA）を用いてＰＣＲを行った。反応は、Mx3000P instrument（Agilent, Santa Clara, CA）で、２通り（duplicate）実行した。遺伝子発現は、Beacon Designer softwareによって設計されたヒト（ｈ）及びマウス（ｍ）についての種特異的プライマー及びプローブセットを使用して、リアルタイムＰＣＲ（TaqMan、登録商標）によって解析した。
ｈＬＯＸ：
フォワード  5’CTTGACTGGGGAAGGGTCTG3’（配列番号１８）,
リバース  5’AAAACGGGGCTCAAATCACG3’（配列番号１９）,
プローブ  5’ATCCCACCCTTGGCATTGCTTGGT3’（配列番号２０）
ｈＬＯＸＬ１：
フォワード  5’AGCAGACTTCCTCCCCAACC3’（配列番号２１）,
リバース  5’CAGTAGGTCGTAGTGGCTGAAC3’（配列番号２２）,
プローブ  5’CACGGCACACCTGGGAGTGGCAC3’（配列番号２３）
ｈＬＯＸＬ２：
フォワード  5’GGGGTTTGTCCACAGAGCTG3’（配列番号２４）,
リバース  5’ACGTGTCACTGGAGAAGAGC3’（配列番号２５）, 
プローブ  5’TGGAGCAGCACCAAGAGCCAGTCT3’（配列番号２６）
ｈＬＯＸＬ３：
フォワード  5’GTGTGCGACAAAGGCTGGAG3’（配列番号２７）, 
リバース  5’CCGCGTTGACCCTCTTTTCG3’（配列番号２８）,
プローブ  5’AAGCCCAGCATCCCGCAGACCAC3’（配列番号２９）
ｈＬＯＸＬ４：
フォワード  5’CTTACCACACACATGGGTGTTTC3’（配列番号３０）, 
リバース  5’TCAAGCACTCCGTAACTGTTGG3’（配列番号３１）, 
プローブ  5’CCTTGGAAGCACAGACCTCGGGCA3’（配列番号３２）
ｈＡＣＴＡ２：（α−平滑筋アクチン）
フォワード  5’CTATCCAGGCGGTGCTGTC3’（配列番号３３）, 
リバース  5’ATGATGGCATGGGGCAAGG3’（配列番号３４）, 
プローブ  5’CCTCTGGACGCACAACTGGCATCG3’（配列番号３５）
ｈＦＮ１：（フィブロネクチン）
フォワード  5’TGGGAGTTTCCTGAGGGTTTTC3’（配列番号３６）, 
リバース  5’GCATCTTGGTTGGCTGCATATG3’（配列番号３７）, 
プローブ  5’AGGGCTGCACATTGCCTGTTCTGC3’（配列番号３８）
ｈＶＩＭ：（ビメンチン）
フォワード  5’CAGGCAAAGCAGGAGTCCAC3’(配列番号３９), 
リバース  5’CTTCAACGGCAAAGTTCTCTTCC3’(配列番号４０), 
プローブ  5’ACCGGAGACAGGTGCAGTCCCTCA3’(配列番号４１)
ｈＳＮＡＩ１：(Ｓｎａｉｌ)  
フォワード  5’TCAAGATGCACATCCGAAGCC3’（配列番号４２）, 
リバース  5’CAGTGGGGACAGGAGAAGGG3’（配列番号４３）, 
プローブ  5’CCTGCGTCTGCGGAACCTGCGG3’（配列番号４４）
ｈＣＯＬ１Ａ１：（タイプＩコラーゲン）
フォワード  5’ACAGAACGGCCTCAGGTACC3’（配列番号４５）, 
リバース  5’TTCTTGGTCTCGTCACAGATCAC3’（配列番号４６）, 
プローブ  5’CGTGTGGAAACCCGAGCCCTGCC3’（配列番号４７）
ｈＲＰＬ１９：（リボソームタンパク質Ｌ１９）
フォワード  5’CCGGCTGCTCAGAAGATAC3’（配列番号４８）, 
リバース  5’TTCAGGTACAGGCTGTGATACAT3’（配列番号４９）, 
プローブ  5’TGGCGATCGATCTTCTTAGATTCACG3’（配列番号５０）
ｍＬＯＸ：
フォワード  5’CAAGAGGGAAGCAGAGCCTTC3’（配列番号５１）, 
リバース  5’GCACCTTCTGAATGTAAGAGTCTC3’（配列番号５２）, 
プローブ  5’ACCAAGGAGCACGCACCACAACGA3’（配列番号５３）
ｍＬＯＸＬ１：
フォワード  5’GGCCTTCGCCACCACCTATC3’（配列番号５４）, 
リバース  5’GTAGTACACGTAGCCCTGTTCG3’（配列番号５５）, 
プローブ  5’CCAGCCATCCTCCTACCCGCAGCA3’（配列番号５６）
ｍＬＯＸＬ２：
フォワード  5’GCTATGTAGAGGCCAAGTCCTG3’（配列番号５７）, 
リバース  5’CAGTGACACCCCAGCCATTG3’（配列番号５８）, 
プローブ  5’TCCTCCTACGGTCCAGGCGAAGGC3’（配列番号５９）
ｍＬＯＸＬ３：
フォワード  5’AACGGCAAGCTGTCTGGAAG3’（配列番号６０）, 
リバース  5’AGCCAACATTGACCTAGCACTG3’（配列番号６１）, 
プローブ  5’TCCCGCCCATTCCCACCCATCTCG3’（配列番号６２）
ｍＬＯＸＬ４：
フォワード  5’CAAGACAGGTCCAGTAGAGTTAGG3’（配列番号６３）, 
リバース  5’AGGTCTTATACCACCTGAGCAAG3’（配列番号６４）, 
プローブ  5’ACAGAGCACAGCCGCCTCACTGGA3’（配列番号６５）
ｍＡＣＴＡ２：（α−平滑筋アクチン）  
フォワード  5’TCTGCCTCTAGCACACAACTG3’（配列番号６６）, 
リバース  5’AAACCACGAGTAACAAATCAAAGC3’（配列番号６７）, 
プローブ  5’TGTGGATCAGCGCCTCCAGTTCCT3’（配列番号６８）
ｍＦＮ１：（フィブロネクチン）
フォワード  5’CACCTCTGCTTTCTTTTGCCATC3’（配列番号６９）, 
リバース  5’CTGTGGGAGGGGTGTTTGAAC3’（配列番号７０）, 
プローブ  5’TGCAGCACTGTCAGGACATGGCCT3’（配列番号７１）
ｍＶＩＭ：（ビメンチン）
フォワード  5’CGCCCTCATTCCCTTGTTGC3’（配列番号７２）, 
リバース  5’GGAGGACGAGGACACAGACC3’（配列番号７３）, 
プローブ  5’TTCCAGCCGCAGCAAGCCAGCC3’（配列番号７４）
ｍＣＯＬ１Ａ１：（タイプＩコラーゲン）
フォワード  5’CGGCTGTGTGCGATGACG3’（配列番号７５）, 
リバース  5’ACGTATTCTTCCGGGCAGAAAG3’（配列番号７６）, 
プローブ  5’CAGCACTCGCCCTCCCGTCTTTGG3’（配列番号７７）
ｍＲＰＬ１９：（リボソームタンパク質Ｌ１９）
フォワード  5’AGAAGGTGACCTGGATGAGAA3’（配列番号７８）, 
リバース  5’TGATACATATGGCGGTCAATCT3’（配列番号７９）, 
プローブ  5’CTTCTCAGGAGATACCGGGAATCCAAG3’（配列番号８０）
【０２８７】
転写産物レベルの平均値の倍数変化を、腫瘍サンプルと正常サンプルとの間のスレショルドサイクル（threshold cycles：Ｃｔ）の差によって算出した。発現レベルは、ＲＰＬ１９遺伝子の発現レベルに規格化した。
【０２８８】
［実施例１３：ＬＯＸＬ２は、種々の腫瘍タイプのストロマ及び肝繊維形成性の病原性細胞によって強力に発現する］
腫瘍におけるＬＯＸＬ２転写産物の解析は、非腫瘍性の組織と比較した場合に、ほとんどの主要な固体の腫瘍における発現の増加を示した（図１のパネルＡに概説される）。いくつかの腫瘍タイプにおいて、ＬＯＸＬ２の転写産物は、ステージ又はグレードの増加によって、発現が増加する傾向を示した（大腸細胞、膵臓細胞、子宮細胞、腎臓細胞、胃癌及び頭部の癌、頚癌など、図７、パネルＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ；グレードＩＩＩの肺腺癌においても転写が上昇（図示されない））。腫瘍におけるＬＯＸＬ２タンパク質の分布及び局在を、ＬＯＸＬ２特異的ポリクローナル抗体（図７、パネルＧ）と、最小限度に処理された新鮮な凍結組織とを使用する免疫組織化学によって更に検査した。いくつかの原形質のシグナルに加えて、腫瘍においてＬＯＸＬ２が多量に分泌されており、しばしば、コラーゲンマトリックスの領域と関連した（図１、パネルＢ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、図７、パネルＨ、Ｉ、Ｊ、Ｋ、Ｍ、Ｏ）。間質繊維芽細胞、血管系、及び、いくつかの腫瘍細胞の領域によるＬＯＸＬ２発現パターンと類似の発現パターンが、種々の固体の腫瘍タイプにわたって観察された（図１、パネルＣ、Ｅ、Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｊ、図７、パネルＨ−Ｏ）。図１、パネルＫはＬＯＸ発現を示す。ＬＯＸＬ２を発現する間質繊維芽細胞は、αＳＭＡポジティブであった（図示されない）。顕著に分泌されたＬＯＸＬ２のシグナルが、活性化状態の病気のインターフェイス（腫瘍−ストロマの境界など）において検出され（図１、パネルＥ、Ｆ、Ｇ、図７、パネルＨ）、強力なＬＯＸＬ２シグナルが、腫瘍関連血管新生を表す腎糸球体様毛細血管構造（glomeruloid microvascular structures）と関連した（図１、パネルＦ、Ｉ）。ＬＯＸＬ２は、明細胞型腎細胞癌（clear cell renal cell carcinomas）などの高度な（highly）血管新生性の腫瘍においても強力に発現した（図１、パネルＬ）。対照的に、ほとんどの非腫瘍性の組織や主要器官（心臓、肝臓及び肺など）においては、ＬＯＸＬ２タンパク質は、ほとんど検出されなかった（図７、パネルＰ、Ｒ、Ｓ、図７の表１に概説される）。いくつかのシグナルが卵巣や子宮などの生殖器において観察され（以前の報告と一致する）、さらに、脾臓の細網繊維（図７の例、パネルＵ、Ｖ）やいくつかの非腫瘍性の腎臓の領域においても観察された。腫瘍関連性の血管系における強力な発現にも関わらず、ＬＯＸＬ２タンパク質は、健常組織の血管系においてはほとんど検出されなかった（図７、パネルＰ、Ｑ、Ｓ、Ｔ）。活性化状態の病気との発現、分泌及び関連の差は、腫瘍学におけるＬＯＸＬ２のターゲッティングを支持する。腫瘍細胞におけるＬＯＸＬ２の発現（主に原形質のもの）は以前に報告されているが、本解析によれば、ＴＡＦｓや新生血管などの腫瘍関連性ストロマ細胞による広範囲の発現が示されている。このＬＯＸＬ２の局在パターンは、異なる種（オリジン）の固体の腫瘍にわたって保存された。
【０２８９】
対照的に、腫瘍性の（neoplastic）組織においてＬＯＸタンパク質を検出した際の局在の優性のパターンは、繊維芽細胞、内皮細胞、及びいくつかの腫瘍細胞の原形質における染色（cytoplasmic staining）であり、分泌に関する証拠がほとんど無く、腫瘍のコラーゲンマトリックスとの関係もほとんど無い。この発現のパターンは、異なる腫瘍タイプにおいても保存されていた（図１、パネルＫ、図７、パネルＬ、Ｎ）。ＬＯＸＬ２とは対照的に、高レベルのＬＯＸタンパク質が、動脈や、血管平滑筋及び非血管平滑筋などの通常組織において検出された（図７、パネルＷ、Ｘ、Ｙ、Ｚ）。動脈における顕著なＬＯＸ発現は、ウシ大動脈が、切断されて、酵素的に活性状態のＬＯＸタンパク質の主要な供給源であることを開示する文献と一致する。
【０２９０】
ＬＯＸＬ２及びＬＯＸの発現は、繊維形成性の肝臓においても評価した。ＬＯＸＬ２は、繊維芽細胞、肝細胞、血管細胞及び炎症性の細胞から成る病的インターフェイスにおいて高度に発現及び分泌していた（図１、パネルＭ、Ｎ、Ｏ）。ＬＯＸタンパク質も検出されたが、しかし、繊維芽細胞における優性的な原形質細胞局在で検出された（図１、パネルＰ）。腫瘍及び活性化状態の繊維形成性の肝臓の両方において、それらの病因が異なるにも関わらず、ＬＯＸ及びＬＯＸＬ２に関する類似の発現・局在パターンが観察された。
【０２９１】
［実施例１４：分泌されたＬＯＸＬ２は、インビトロにおいて、腫瘍細胞のリモデリング及び浸潤を促進する］
ＬＯＸＬ２は、正常酸素圧条件下において、いくつかの異なる腫瘍細胞系統によって発現された（図８、パネルＡ、Ｂ）。ＬＯＸＬ２タンパク質は、ならし培地において、全長タンパク質（〜８０ｋＤａ）及び切断されたタンパク質（〜５５ｋＤａ）の両方として検出された。精製したＬＯＸＬ２タンパク質の解析によって、以前の報告に反して、ＬＯＸＬ２のこれらの両方の形態が、酵素的に活性状態であること、及び、インビトロにおいてＢＡＰＮによって阻害されることが示された（図８、パネルＣ、Ｄ）。免疫蛍光法及びＬＯＸＬ２特異的モノクローナル抗体（ＡＢ００２３）を使用することにより、腫瘍細胞の細胞外マトリックスにおいて、ＬＯＸＬ２がその基質コラーゲンＩと共局在することが示され、腫瘍組織から得られた結果と一致した（図２、パネルＡ、Ｂ、図８、パネルＥ、Ｆ、Ｇ）。対照的に、分泌・加工されたＬＯＸは、骨芽細胞の細胞系統のならし培地に存在したが（図８のパネルＨ）、ＬＯＸは、正常酸素圧条件下又は低酸素圧条件下の腫瘍細胞系統又は繊維芽細胞から単離されたならし培地においては再現性よく検出されず（図８のパネルｉ、ｊ）、その代わりに、細胞ペレット分画において発見された。
【０２９２】
ＬＯＸＬ２は、上皮から間葉への移行（epithelial-to-mesenchymal transition：ＥＭＴ）のＥＭＴ関連性転写因子であるＳＮＡＩＬとの直接的な相互作用を介して、ＥＭＴにおける役割を果たすことが記載されている。リシルオキシダーゼ型の酵素を５個全て発現する胸部腫瘍細胞系統ＭＤＡ−ＭＢ−２３１において、ＬＯＸＬ２のｓｈＲＮＡノックダウンを使用してＬＯＸＬ２を枯渇化させると、アクチン性細胞骨格のリモデリングが起こり、アクチンストレス繊維（ファロイジン染色によって可視化される）の減少と関連する、より上皮様の表現型を生じた（図８［図８−２］のパネルＫ、Ｌ）。しかしながら、完全な（full）間葉から上皮への移行（ＭＥＴ）様の変化は、ＬＯＸＬ２阻害の結果としては観察されず、細胞は、Ｅ−カドヘリンに対してネガティブなままであった。
【０２９３】
本願発明者らは、ＭＣＦ７細胞（正常酸素圧条件下ではほとんどＬＯＸＬ２を発現しない）を、ＭＤＡ−ＭＢ２３１又はＨｓ−５７８ｔ腫瘍細胞のならし培地（内因的に分泌されたＬＯＸＬ２を含む）で処理することによって、腫瘍細胞のリモデリングにおける細胞外ＬＯＸＬ２の役割を研究した。ならし培地は、ＩｇＧコントロール抗体又はＡＢ００２３（阻害性ＬＯＸＬ２モノクローナル抗体）の何れかで処理した。ＡＢ００２３は、ＬＯＸＬ２のＳＲＣＲ３−４領域に結合するが、他のリシルオキシダーゼ型の酵素との交差反応性を示さず（図８のパネルＭ、Ｎ）、ＬＯＸＬ２のリシルオキシダーゼ酵素活性を阻害する（図８のパネルＯ）。ＡＢ００２３は、類似の親和性でヒト及びマウスＬＯＸＬ２に結合する（図８のパネルＰ）。ＬＯＸＬ２を含むならし培地は、アクチン性細胞骨格のリモデリングを誘導し、細胞形態を伸長させて、アクチンストレス繊維を増加させた。そして、このリモデリングは、ＡＢ００２３の添加によって抑制された（図２のパネルＣ、Ｄ、Ｅ、Ｆ）。しかしながら、この表現型の変化は、ＢＡＰＮを含むならし培地のプレインキュベーションによっては、高濃度（２ｍＭ、データは示さない）であっても阻害されなかった。精製した酵素的に活性状態のＬＯＸＬ２は、単独では細胞のリモデリングを誘導することができないが、細胞によって分泌されたＬＯＸＬ２が他のタンパク質（単数ないし複数）と協力してこれらの変化を誘導することが示唆された。分泌されたＬＯＸＬ２による表現型のリモデリングに必要なドメインを更に調査するために、切り詰めた（truncated）バージョン（Ｎ−末端のＳＲＣＲドメインを含む）のタンパク質と、突然変異を導入したバージョン（酵素ドメインにおけるＬＴＱの形成に必要なリシン残基を突然変異させることによって生成される、分泌されるが酵素的に不活性状態のＬＯＸＬ２の変異体）のタンパク質とを発現させて、この変化を誘導する能力について評価した。ならし培地において発現させた場合には、ＳＲＣＲドメイン単独と、酵素的に不活性状態のＬＯＸＬ２との両方とも、リモデリングを誘導できず（図８、パネルＱ、Ｒ、Ｓ、Ｔ）、酵素ドメイン及び酵素活性の両方ともがこのプロセスに必要であることがわかった。全体的に、これらのデータは、腫瘍細胞のアクチン性細胞骨格をリモデリングして、より間葉的な表現型に向かわせることにおける、分泌され酵素的に活性状態のＬＯＸＬ２の役割を支持する。
【０２９４】
［実施例１５：ＬＯＸＬ２は、インビトロ及びインビボにおいて繊維芽細胞の活性化を促進する］
繊維芽細胞によるＬＯＸＬ２の分泌の制御を調査するために、ビス−アクリルアミドクロスリンクドゲル（コラーゲンマトリックスでコーティングし、そして、コラーゲンゲルを浮遊させるように処置するか、又はコラーゲンゲルを接着させたままにした）を使用して可変張力のインビトロモデルを確立した。低張力条件（０．２％ビス・浮遊コラーゲンゲル）では、ＬＯＸＬ２タンパク質は細胞内において検出され、ならし培地における分泌型タンパク質は非常に少なかった。より高張力条件（０．８％ビス・接着コラーゲンゲル、及び、標準の組織培養プレート）では、ＬＯＸＬ２は、繊維芽細胞によって多量に分泌された（図３のパネルＡ、図９のパネルＡ）。これらのデータは、ＬＯＸＬ２の分泌が局部的な張力の変化（例えば、炎症、マトリックス生成又はクロスリンキングと関連する）によって誘導され得ることを示唆する。顕著なレベルの分泌されたＬＯＸは、０．２％又は０．８％ビスーアクリルアミドコラーゲンゲルのいずれにおいても、あるいは、浮遊コラーゲンゲル又は接着コラーゲンゲルのいずれにおいても、ＨＦＦ細胞から検出されず、組織培養プレートで成長させたＨＦＦ細胞（Plastic）のみにおいて検出された。
【０２９５】
ヒト腫瘍のＴＡＦｓにおいてＬＯＸＬ２が強力に発現することと、腫瘍細胞リモデリングに対するＬＯＸＬ２の影響とに鑑みて、繊維芽細胞の形態変化におけるＬＯＸＬ２の役割をｓｉＲＮＡノックダウン法を使用して検査した。コントロール導入細胞と比較した場合に、ＨＦＦにおいてＬＯＸＬ２を枯渇化させると、細胞間組織が減少した。ｓｉＬＯＸＬ２導入細胞はコラーゲンＩを尚分泌したが、コラーゲンは組織に組み込まれておらず、コントロール導入細胞において明確であった繊維性構造組織が無かった（図３のパネルＢ及びＣ、図９のパネルＢ）。ファロイジンを使用したｓｉＬＯＸＬ２ノックダウン細胞の染色は、アクチン性細胞骨格に対するドラマチックな変化を明らかにした。すなわち、細胞は、伸長した形態でなくなるとともに、より丸みを帯びた形態になり、アクチンストレス繊維（中心又は抹消のいずれか）が減少していた（図３のパネルＤ、Ｅ）。表現型の変化と一致して、低張力条件下で成長させた繊維芽細胞（０．２％ビス、ＬＯＸＬ２をほとんど分泌しない）は、より丸みを帯びた類上皮細胞のような構造を示し、アクチンストレス繊維が減少していた。その一方で、高張力条件下で成長させた繊維芽細胞（０．８％ビス、顕著により多くのＬＯＸＬ２を分泌する）は、より伸長した繊維芽細胞のような表現型を示した（図３、パネルＦ、Ｇ）。これらの知見は、活性化型の繊維芽細胞様の形態、及び、コラーゲン性細胞外マトリックスを介する細胞間組織の維持におけるＬＯＸＬ２の役割を支持する。
【０２９６】
繊維芽細胞の活性化及び繊維形成（fibrosis、及び、desmoplasia）と関連する経路に、ＬＯＸＬ２が関与するか否かを検査した。繊維芽細胞又は腫瘍細胞系統のＰＤＧＦ−ＢＢを有する細胞を処理した際には、ＡＢ００２３の存在下又はＡＢ００２３の不在下のいずれにおいても、１０〜６０分の間で、ＡＫＴリン酸化に対する顕著な影響は観察されなかった（図示されない）。ＴＧＦｂシグナリングの検査は、ＡＢ００２３が、１０〜６０分の間に、ＳＭＡＤ２のリン酸化に対して中程度（modest）の阻害（約１０〜２０％）をもたらすことを示した。しかしながら、腫瘍細胞系統のならし培地（ＬＯＸＬ２を含む）でＨＦＦ細胞を処理した際に（より長期間トランスウェル共培養した際に）、よりドラマチックな影響が現れた。ＡＢ００２３の存在下で７２時間共培養した後には、ｐＳＭＡＤ２のリン酸化に関して、５６〜９４％の相対的な減少がもたらされた（図３のパネルＨ、Ｉ）。α−ＳＭＡレベルにおける４１％の減少も観察された。ＶＥＧＦタンパク質の発現（腫瘍関連性繊維芽細胞の特徴）の評価は、ＡＢ００２３の存在下における３９〜４６％の減少を示した。短いインキュベーション時間にわたって実行した実験においては、より顕著な影響が予想できるだろうから、これらのデータは全体的に、成長因子によって駆動されるシグナル経路を直接的に増強するように、ＬＯＸＬ２が作用するのではないことを示唆する。むしろ、これらの結果は、ＬＯＸＬ２がＴＧＦｂシグナリングを媒介し得ること、そして、細胞外マトリックスに対する活性によって、繊維芽細胞の活性化に関与することを示し得る。細胞外マトリックスにおける潜在型複合体（latent complex）由来のＴＧＦｂシグナリングの活性化が、張力の増加によって誘導されることが示されている。従って、これらの知見は、ＬＯＸＬ２によって誘導される細胞外マトリックスの変化（直接的変化、又は、おそらくクロスリンクした繊維性コラーゲンのインテグリン媒介性のセンシングを介する変化）を介するシグナリングの調節と一致する。
【０２９７】
ＭＣＦ７コントロール細胞と、ＬＯＸＬ２をコードする発現ベクターを安定に形質導入したＭＣＦ７細胞（ＭＣＦ７−ＬＯＸＬ２）との間の腫瘍形成の比較によって、ＬＯＸＬ２発現の結果をインビボにおいて評価した。インビトロにおける形質導入細胞の増殖速度は、ＭＣＦ７−コントロール細胞に関して観察された増殖速度よりも遅かった。しかしながら、腎被膜下移植法（Sub-Renal Capsule）を施したｎｕ／ｎｕマウスにおける腫瘍の生成に関しては、コントロールＭＣＦ７細胞に比べて、ＭＣＦ７−ＬＯＸＬ２細胞は、より大きい腫瘍を生成した（３．５ｘの体積増加、図３のパネルＪ）。マウス特異的プライマーでのｑＲＴ−ＰＣＲを使用したこれらの腫瘍のストロマ成分の解析は、コントロールと比較して、ＭＣＦ７−ＬＯＸＬ２細胞が、ストロマの活性化を誘導して、αＳＭＡ、コラーゲンＩ、ビメンチン、ＭＭＰ９及びフィブロネクチンの転写産物を増加させることを示した（図３のパネルＫ）。これらの結果は、インビボにおける腫瘍関連性のストロマの活性化及びリモデリングに対するＬＯＸＬ２の役割を支持する。
【０２９８】
要するに、これらの結果は、ＬＯＸＬ２の破壊が、細胞と、細胞環境との間の相互作用の混乱をもたらすことができ（おそらくコラーゲン／マトリックスの破壊を媒介したシグナリングを介して）、その結果、細胞内組織のアクチン性細胞骨格と、繊維芽細胞の細胞間組織との両方の破壊がもたらされることを示唆する。これらのデータは、ＬＯＸＬ２が、より高度に活性化した状態の維持において自己刺激的な役割も果たすことができ、そのため、ＴＡＦｓや筋繊維芽細胞などの疾患関連性の繊維芽細胞の進行性の活性化に重要であることも示す。
【０２９９】
［実施例１６：抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３は、インビトロ及びインビボにおいて、血管新生を阻害する］
ヒト腫瘍の解析は、内皮細胞の腎糸球体様の血管及び他の血管新生によってＬＯＸＬ２が顕著に発現することを示した。ＬＯＸＬ２は、初代培養した内皮細胞によって発現することが知られており、この意味合いにおいて、血管のエラストジェネシスに重要であることが記載されている。ＨＵＶＥＣ細胞は、ｓｉＲＮＡノックダウン法を使用してＬＯＸＬ２を枯渇化させ、形態の変化について検査した。コントロール導入細胞と比較して、ｓｉＬＯＸＬ２を導入したＨＵＶＥＣ細胞は、アクチンストレス繊維の減少を示し（図４のパネルＡ、Ｂ）、上述の繊維芽細胞及び腫瘍細胞に対するＬＯＸＬ２阻害の効果と類似した。
【０３００】
分泌されたＬＯＸＬ２の役割を更に評価するために、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３の血管新生を阻害する能力について、インビトロにおけるＨＵＶＥＣチューブ形成分析を使用して検査した。ＡＢ００２３は、血管の分岐化（枝分かれ）、血管の長さ、形成される血管の総数を投与量依存的な様式で阻害し、５０μｇ／ｍｌで全てのプロセスを完全に阻害した（図４のパネルＣ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｉ）。ＡＢ００２３によるこれらのプロセスの阻害についてそれぞれ算出されたＩＣ５０（図４のパネルＧ、Ｈ、Ｉ；それぞれ、２２．２ｎＭ、１９．９ｎＭ、３３．２ｎＭ）は、インビトロにおけるＡＢ００２３による精製したＬＯＸＬ２の酵素活性の阻害について観察された実際のＩＣ５０（〜３０ｎＭ）と一致した。
【０３０１】
インビボにおけるＡＢ００２３の血管新生を阻害する能力は、ｂＦＧＦを含むマトリゲルプラグ（ｂＦＧＦを含み、Ｂａｌｂ／ｃマウスの側腹部に挿入した）を使用して評価した。ビヒクルで処置した動物から取り出したプラグは、ＣＤ３１ポジティブな細胞から成る血管系（浸潤及び分岐化する）の証拠を有した（図４のパネルＪ、Ｌ）。その一方で、腹腔内注射によってＡＢ００２３で処置した動物から取り出したプラグは、ＣＤ３１ポジティブな細胞から成る血管系に関する証拠やＣＤ３１ポジティブな細胞を僅かしか（ほとんど）示さなかった（図４のパネルＫ、Ｍ）。浸潤性の内皮細胞によるＬＯＸＬ２発現は、ＩＨＣによって確認した（図１０のパネルＡ、Ｂ）。定量的な解析によれば、ＡＢ００２３で処置した動物の独立プラグからの血管の平均本数が〜１／７へ減少した（ｐ＝０．０３１９；図４のパネルＮ）。マトリゲルプラグにおけるＣＤ３１ポジティブな細胞を計測する別の解析によっても、ＡＢ００２３で処置した動物での顕著な減少が示される（ｐ＝０．０１６８；図４のパネルＯ）。これらの結果は、血管新生に関する複数の視点において、分泌されたＬＯＸＬ２が重要な役割を果たすこと、そして、インビトロ及びインビボの両方において血管新生がＡＢ００２３によって直接的に阻害されることを示す。
【０３０２】
［実施例１７：ＬＯＸＬ２の阻害は、インビボにおいて、原発性腫瘍及び癌の転移性異種移植片モデルの両方に治療効果をもたらす］
ＬＯＸＬ２又はＬＯＸの何れかの阻害による治療結果は、播種性骨転移モデルにおいて評価した。ＬＯＸＬ２又はＬＯＸをターゲットする特異的抗体を使用して、〜１００万個のラベルしたＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞を左心室に注射したマウスを処置した。胸部腫瘍細胞系統ＭＤＡ−ＭＢ−２３１は、ＬＯＸを研究するためのモデルとして広く使用されており、５つのリシルオキシダーゼ型の酵素を全て発現する（図１１のパネルＡ）。ＬＯＸＬ２阻害性の抗体ＡＢ００２３の腫瘍負荷を減少させる能力を、ＬＯＸ特異的抗体Ｍ６４（ＬＯＸ酵素ドメインの同一ペプチド配列をターゲットするモノクローナル抗体であり、該ドメインは阻害性の阻害性のポリクローナル抗血清を生成することが以前に開示されている）の能力と比較した。２８日後、大腿骨及びトータルの側腹部の骨（total ventral bone）における腫瘍細胞性負荷の顕著な減少が、抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３で処置した腫瘍において観察されたが（大腿骨：１２７倍（中央値）、ｐ＝０．００２１；トータルの側腹部の骨：２８倍（中央値）、ｐ＝０．０１９７；図５のパネルＡ、Ｂ）、抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４で処置した腫瘍においては観察されなかった（それぞれｐ＝０．５２６２及びｐ＝０．５１５３；図５のパネルＡ、Ｂ；高投与量のタキソテレ（２０ｍｇ／ｋｇ）もポジティブコントロールとして使用した）。別の研究では、１週間に２回の３０ｍｇ／ｋｇのＡＢ００２３投与と、１週間に１回の５ｍｇ／ｋｇのパクリタキセル投与とを組み合わせて処置した動物において、顕著な延命効果（ｐ＝０．０２５）が観察された。
【０３０３】
本願発明者らによるヒト腫瘍の解析によれば、異なる複数癌についてストロマ細胞よる、今までに認識されていなかった強力なＬＯＸＬ２の発現が示された。異種移植原発性腫瘍形成モデルは、ヒト腫瘍において明白な（表われる）腫瘍微細環境及び繊維形成が、典型的に乏しいモデルである。そのため、いくつかの異なる細胞系統を評価して、ＬＯＸＬ２発現を代表する腫瘍形成を生じるヒト腫瘍モデルを同定した。ＭＤＡ−ＭＢ−４３５細胞による腫瘍は、繊維形成性の応答を生じたこと、ＬＯＸＬ２の局在に関してヒト腫瘍との類似性を有すること、腫瘍−ストロマのインターフェイス及びコラーゲン性マトリックスにおいてＬＯＸＬ２タンパク質を分泌したこと、そして、繊維芽細胞、血管及びいくつかの腫瘍細胞においてＬＯＸＬ２が発現するという点（図５のパネルＣ）において類似することを理由に、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３の解析のために、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５を原発性腫瘍モデルとして選択した。ＭＤＡ−ＭＢ−４３５が生成した腫瘍におけるＬＯＸの局在も、ヒト腫瘍において検出されたパターン（繊維芽細胞の原形質、腫瘍細胞の一部及び血管の一部が染色される）と一致し、分泌されたＬＯＸに関するいくつかの証拠は、マトリックスと関連した（図５のパネルＤ）。
【０３０４】
腫瘍は、先ず、ｎｕ／ｎｕマウスの側腹部において増殖させ、次に、乳房の脂肪性パッドに移植して確立させた。確立された原発性腫瘍は、３週間にわたって抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３で処置すると、腫瘍体積が４５％減少した（ｐ＝０．００１）。抗ＬＯＸＭ６４については、より弱い阻害が観察された（腫瘍体積の２７％減少、ｐ＝０．０４）。研究期間を２週間延長した場合には、腫瘍の成長が継続した。しかしながら、統計的に顕著な腫瘍体積の減少は、ＡＢ００２３での処置によっては維持されたが（ｐ＝０．０２４；腫瘍体積の３３％減少；図５のパネルＥ）、抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４での処置によっては維持されなかった。全体的には、これらの結果は、抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３が５週間にわたって確立された原発性腫瘍の腫瘍負荷を減少させるという点で有効であったことを示す。
【０３０５】
［実施例１８：ＬＯＸＬ２の阻害は、ストロマの活性化を顕著に減少させ、そして、腫瘍微細環境の生成を阻害する］
抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３によって原発性腫瘍の体積が減少するメカニズムを更に検査するために、対応する範囲をカバーする相対的なサイズの腫瘍を、ビヒクルで処置したコントロール、抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３で処置したグループ、抗ＬＯＸＭ６４で処置したグループ、及び、タキソテレで処置したグループから、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５によって原発性腫瘍を確立させる研究における３９日目に収集した。腫瘍は、組織学及び免疫組織化学のために断片化し、特異的細胞マーカーに関する種々の抗体を使用して解析した。ＡＢ００２３で処置した腫瘍の組織組成は、他の全てのグループ（高投与量のタキソテレで処置した動物（ポジティブコントロールグループ）から単離される非常に小さい腫瘍（サイズが小さいという点では類似したが）から、はるかに大きいビヒクルで処置した腫瘍を含む）と異なっていた。ＡＢ００２３で処置した腫瘍においては、腫瘍微細環境に関する顕著な多くの特徴が消失していた。具体的には、コラーゲン性マトリックスないしは繊維形成の顕著な減少があり、シリウスレッド染色において６１％減少が示された（ｐ＝０．００２７；図５のパネルＧ、Ｎ）。これに関連してαＳＭＡシグナルによって評価されるように、活性化されたＴＡＦｓの存在下で８８％減少（ｐ＝０．０１１）があった（図５のパネルＫ、Ｎ）。抗ＬＯＸＭ６４で処置した腫瘍又はタキソテレで処置した腫瘍においては、これらのマーカーの何れにおいても顕著な差が観察されなかった（図５のパネルＦ〜Ｎ）。腫瘍血管系は、抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３で処置した腫瘍においても顕著に減少していた（ＣＤ３１シグナルでの７４％減少、ｐ＝０．０００２；図５のパネルＮ）。有効性は少ないが、タキソテレ処置によっても相対的な腫瘍血管系が減少し（ＣＤ３１シグナルでの４３％減少、ｐ＝０．０２３；図５のパネルＮ）、以前の報告と一致していた（図５のパネルＮ；図１１、パネルＢ、Ｃ、Ｄ、Ｅ）。
【０３０６】
独立した研究において、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５原発性腫瘍モデルを使用して、ＡＢ００２３（５ｍｇ／ｋｇ、１週間に２回）とＢＡＰＮ（１００ｍｇ／ｋｇ、毎日）とを直接的に比較した。類似の腫瘍体積の減少が、４６日後に、ＡＢ００２３で処置した動物において観察された（３８．４％；ｐ＝０．０４；図５のパネルＯ）。対照的に、腫瘍体積の１９％減少（統計的に有意ではない）がＢＡＰＮで毎日処置したマウスにおいて観察された（図５のパネルＯ）。重要なことに、これらの腫瘍のストロマ及びマトリックスの解析によれば、ストロマの活性化、及び、腫瘍の基盤（インフラストラクチャ）生成の阻害に関して、ＡＢ００２３が顕著により有効であったことが示された。ＡＢ００２３での処置は、上述の研究結果と類似して、再度、コラーゲン生成の減少（４７％減少、ｐ＝０．０１９３、シリウスレッド染色によって評価した）、繊維芽細胞の活性化の大幅な減少（＞９０％減少、ｐ＝０．０１６１、αＳＭＡのポジティブ度によって測定した）をもたらしたが、その一方では、ＢＡＰＮで処置した腫瘍は、ビヒクルで処置したコントロールと類似して、繊維形成性のマトリックス及び活性化された繊維芽細胞を含んだ（図５のパネルＰ）。血管系の形成は、再度、ＡＢ００２３で処置した腫瘍において顕著に阻害されたが（ＣＤ３１シグナルの５２％減少、ｐ＝０．０３０７） 、その一方では、ＢＡＰＮ処置によっては腫瘍血管系の減少は無かった（図５のパネルＰ）。全体として、これらの結果によれば、ＬＯＸＬ２媒介性の腫瘍微細環境の生成の阻害におけるＡＢ００２３の有効性が確認される。対照的に、汎用的リシルオキシダーゼ阻害剤（pan-LOX/L inhibitor）であるＢＡＰＮは、繊維芽細胞の活性化、繊維形成又は血管新生の阻害に関して、無効であった。
【０３０７】
血管新生、血管形成及び他のプロセスを介する腫瘍成長の促進に関する活性化された腫瘍関連性繊維芽細胞の重要な役割の出現と、抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３で処置した腫瘍における活性化された繊維芽細胞の実質的な減少とに鑑みて、腫瘍形成と関連する他のキーファクタの発現に対するＡＢ００２３処置の影響を検査した。ＴＡＦｓは腫瘍における顕著なＶＥＧＦ生成に関与し、ヒト腫瘍におけるＬＯＸＬ２の発現パターンとＶＥＧＦの発現パターンとは、ＴＡＦに関連した発現という意味合いにおいて、類似性を共有する（図１１のパネルＦ、Ｇ）。ＭＤＡ−ＭＢ−４３５腫瘍の解析によれば、ビヒクルで処置した腫瘍と比較して、ＡＢ００２３で処置した腫瘍において、ＶＥＧＦシグナルの７６％減少が示された（ｐ＝０．０００１；図５のパネルＱ）。ＳＤＦ−１／ＣＸＣＬ１２（ＴＡＦｓによって発現する血管新生促進性で腫瘍形成促進性（pro-tumorigeni）のサイトカイン）の解析によれば、シグナルに関して、類似の減少が示された（８０％、ｐ＝０．０２０５；図５のパネルＱ）。結合組織成長因子（ＣＴＧＦ）のレベルは、ＡＢ００２３で処置した動物の組織においても減少していた。ＬＯＸＬ２シグナル自体は、ＡＢ００２３で処置した腫瘍において５５％（ｐ＝０．０００５）減少した（図５のパネルＱ；図１１のパネルＨ、Ｉ、Ｊ、Ｋ、Ｌ、Ｍ）。これらの成長因子のレベルの減少、又は、ＬＯＸＬ２のレベルの減少は、抗ＬＯＸ抗体で処置した動物においては、観察されなかった。
【０３０８】
組織ベースのＥＬＩＳＡを使用して、トランスフォーミング成長因子β１（transforming growth factor beta1：ＴＧＦ−β１）のレベル及びリン酸化型ＳＭＡＤ２（ＰＳＭＡＤ２、ＴＧＦ−βシグナリングの下流のマーカー）のレベルを測定した。ＡＢ００２３で処置した動物の繊維芽細胞及び腫瘍細胞の両方において、両方のタンパク質のレベルが減少した。抗ＬＯＸで処置した動物、又は、抗体を投与しなかったコントロールにおいては、比較可能な減少が観察されなかった。これらの結果によれば、ＬＯＸＬ２の阻害は、腫瘍組織におけるＴＧＦ−βシグナル経路をブロックし、よりスローな腫瘍の成長、及び／又は、腫瘍細胞の死をもたらすことが示される。
【０３０９】
Ｈ＆Ｅ染色及び他のマーカーを使用した腫瘍の解析によれば、ＡＢ００２３で処置した腫瘍において繊維芽細胞が存在するが、ビヒクルで処置したコントロールよりも、全体的に発現量が少ない（less abundant）ことが示された（図１１のパネルＮ、Ｏ）。この結果は、抗ＬＯＸＬ２処置は、繊維芽細胞の活性化に影響を及ぼすことに加えて、繊維芽細胞の進行する増殖（リクルートメント）にもおそらく影響を及ぼすことを示す。［＊これらを総合して、これらのデータは、ＡＢ００２３によるＬＯＸＬ２の阻害は、ＴＡＦ活性化と繊維芽細胞リクルートメントの実質的減少を生じ、対応して、ＶＦＧＦ及びＳＤＦ−１並びにＬＯＸＬ２自身のような血管新生、血管形成及び腫瘍関連性の腫瘍因子のレベルの顕著な減少を示す。］
【０３１０】
ＡＢ００２３で処置した腫瘍の腫瘍細胞は、ビヒクルで処置した腫瘍細胞との差も示した。ＡＢ００２３で処置したグループのいくつかの腫瘍は、顕著な壊死領域を有したが（図５のパネルＲ、Ｓ）、その一方では、他の処置グループにおいては、壊死はほとんど見られなかった。更に、ＡＢ００２３で処置した腫瘍は、ビヒクルで処置した腫瘍の良く（well）定義された核に比べて、生存率の減少に関する他の証拠（核凝縮が生じていること、原形質の凝縮が増加していること：初期の腫瘍壊死に対応する）を示した（図５のパネルＴ、Ｕ）。べクリン−１（Beclin-1、自食現象と関連するタンパク質）のレベルは、ＡＢ００２３で処置した動物及びタキソテレで処置した動物の腫瘍細胞において増加していたが、抗ＬＯＸ抗体で処置した動物又はビヒクルコントロールの腫瘍細胞においては、増加していなかった。これらの結果は、上述のようにＡＢ００２３で処置した動物においてＴＡＦｓの細胞数が減少し、ＴＡＦｓによって分泌される成長因子が欠乏することによって、ＡＢ００２３で処置した動物の腫瘍細胞が壊死性でタイプＩＩ自食現象的な細胞死を起こしたというアイデアと一致する。これらの解析結果は、抗ＬＯＸ抗体Ｍ６４又は汎用的ＬＯＸ／Ｌ阻害剤であるＢＡＰＮでの処置に比べて、ＡＢ００２３によるＬＯＸＬ２の阻害は、腫瘍負荷を減少させること、及び、腫瘍の微細環境を確立することにおいて顕著により有効であったことを示した。ＬＯＸＬ２の特定のモノクローナル抗体による阻害は、腫瘍細胞よりも遺伝子学的により安定なストロマの微細環境をターゲットする新規の治療手法（strategy）の例を提供する。複数の腫瘍タイプにわたるストロマのＬＯＸＬ２発現パターンの保存は、癌治療におけるＬＯＸＬ２阻害剤の使用に関する広域の適用可能性を示唆する。ＬＯＸＬ２活性を阻害することによる影響は、腫瘍の基盤（インフラストラクチャ）に変化をもたらすことのみならず、ＴＡＦｓによる成長因子、血管新生促進性のタンパク質や血管形成促進性のタンパク質の生成に対する影響も含む。従って、抗ＬＯＸＬ２による治療は、ターゲットに対して高度に特異的であるが、広い意義での治療上の効果（腫瘍の発生に対してネガティブに影響を及ぼすという効果）を有する。
【０３１１】
［実施例１９：抗ＬＯＸＬ２ＡＢ００２３は、インビボにおいて、肝繊維形成及び筋繊維芽細胞の活性化を阻害する］
抗ＬＯＸＬ２及び抗ＬＯＸ抗体での処置の有効性は、Ｂａｌｂ／Ｃマウスにおける、ＣＣＬ４誘導性の肝繊維形成で評価した。動物へのＣＣＬ４の注射（肝臓ダメージ及び繊維形成の証拠と関連する（図１２のパネルＡ、Ｂ））に起因する顕著な度合いの死亡率は、抗ＬＯＸＬ２抗体ＡＢ００２３によって防止されるが、抗ＬＯＸ特異的抗体Ｍ６４によっては防止されなかった（ＡＢ００２３の延命効果は、ログランク検定によってはｐ＝０．００２９であり、マンテル・コックス検定によってはｐ＝０．００６４であった、図６のパネルＡ）。全てのグループの生存動物の肝臓の解析は、ＡＢ００２３が架橋状繊維形成（bridging fibrosis）を顕著に阻害したことを示したが（ｐ＝０．００２、図６のパネルＢ；図１２のパネルＣ、Ｄ）、その一方では、抗ＬＯＸＭ６４での処置は、架橋状繊維形成を減少させる傾向を示すが統計的な有意性を満足しなかった（ｐ＝０．１２７）。ビヒクルで処置した動物（図６のパネルＣ）及びＭ６４で処置した動物の門脈−門脈の中隔（Porto−Portal septa）は、顕著な個体数のαＳＭＡポジティブな筋繊維芽細胞（架橋状繊維形成と関連する）を含んでいた。ＡＢ００２３で処置した動物において架橋状繊維形成がない状態ことと一致して、ＡＢ００２３で処置した動物の肝臓の門脈−門脈の中隔におけるαＳＭＡポジティブな筋繊維芽細胞の実質的な減少があり（図６のパネルＣ、Ｄ）、ＡＢ００２３がＣＣＬ４誘導による疾患関連性繊維芽細胞の活性化を阻害することを示した。図６のパネルＥは、α−ＳＭＡシグナルの定量的な解析を示し、ＡＢ００２３で処置した動物の肝臓における架橋状繊維形成の欠乏は、α−ＳＭＡポジティブな筋繊維芽細胞の細胞数の顕著な減少（ｐ＝０．０２６０）を伴った。これらの結果は、インビボにおける筋繊維芽細胞の活性化にＬＯＸＬ２が必要であることと一致し、ストロマのＴＡＦｓに関する上述の観察結果と同様である。
【０３１２】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５−１】
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【図５−２】
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【図６】
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【図７−１】
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【図７−２】
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【図８−１】
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【図８−２】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成24年6月13日(2012.6.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
腫瘍環境又は繊維形成性疾患を患う被験者における、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、繊維芽細胞の数を減少させること、あるいは、繊維形成を減少させること、に使用される単離されたリシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の阻害剤。
【請求項２】
抗ＬＯＸＬ２抗体であることを特徴とする請求項１に記載の阻害剤。
【請求項３】
抗体が、ＮＷＭＮＦＤＹのアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を有する重鎖と、ＭＱＨＬＥＹＰＹＴのアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を有する軽鎖とを含むことを特徴とする請求項１又は２に記載の阻害剤。
【請求項４】
重鎖が、ＧＹＡＦＴＹＹＬＩＥのアミノ酸配列を含むＣＤＲ１と、ＶＩＮＰＧＳＧＧＴＮＹＮＥＫＦＫＧのアミノ酸配列を含むＣＤＲ２とを更に含み、
軽鎖が、ＲＳＳＫＳＬＬＨＳＮＧＮＴＹＬＹのアミノ酸配列を含むＣＤＲ１と、ＲＭＳＮＬＡＳのアミノ酸配列を含むＣＤＲ２とを更に含むことを特徴とする請求項３に記載の阻害剤。
【請求項５】
重鎖が、配列番号１に記載されたアミノ酸配列を含み、
軽鎖が、配列番号２に記載されたアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項４に記載の阻害剤。
【請求項６】
抗体が、ヒトに適合化されていることを特徴とする請求項１〜４の何れか１項に記載の阻害剤。
【請求項７】
抗体が、配列番号３に記載されたアミノ酸配列を含む重鎖と、配列番号４に記載されたアミノ酸配列を含む軽鎖とを含むことを特徴とする請求項６に記載の阻害剤。
【請求項８】
抗体が、抗体フラグメントであることを特徴とする請求項１〜７の何れか１項に記載の阻害剤。
【請求項９】
阻害剤が、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、又は、繊維芽細胞の数を減少させることに使用されること、
前記繊維芽細胞が、腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）であること、
を特徴とする請求項１−８の何れか１項に記載の阻害剤。
【請求項１０】
阻害剤が、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、又は、繊維芽細胞の数を減少させることに使用されることを特徴とする請求項１−８の何れか１項に記載の阻害剤。
【請求項１１】
繊維芽細胞の活性化の阻害、又は、繊維芽細胞の数の減少が、繊維形成性疾患を患う被験者において行われることを特徴とする請求項１−１０の何れか１項に記載の阻害剤。
【請求項１２】
繊維形成性疾患が、肝繊維症であることを特徴とする請求項１１に記載の阻害剤。
【請求項１３】
核酸であることを特徴とする請求項１−１１の何れか１項に記載の阻害剤。
【請求項１４】
腫瘍環境又は繊維形成性疾患を患う被験者における、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、又は、繊維芽細胞の数を減少させることに使用される医薬組成物であって、
単離されたＬＯＸＬ２の阻害剤と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含むことを特徴とする医薬組成物。
【請求項１５】
阻害剤が、請求項１−１３の何れか１項に記載の阻害剤であることを特徴とする請求項１４に記載の医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０２】
（形態９１）
核酸が、ｓｉＲＮＡであることを特徴とする形態９０に記載の医薬組成物。
なお、以下の変化形態も本願に含まれる。
（変化形態１）
腫瘍環境又は繊維形成性疾患を患う被験者における、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、繊維芽細胞の数を減少させること、あるいは、繊維形成を減少させること、に使用される単離されたリシルオキシダーゼｌｉｋｅ２（ＬＯＸＬ２）の阻害剤。
（変化形態２）
抗ＬＯＸＬ２抗体であることを特徴とする変化形態１に記載の阻害剤。
（変化形態３）
抗体が、ＮＷＭＮＦＤＹのアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を有する重鎖と、ＭＱＨＬＥＹＰＹＴのアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を有する軽鎖とを含むことを特徴とする変化形態１又は２に記載の阻害剤。
（変化形態４）
重鎖が、ＧＹＡＦＴＹＹＬＩＥのアミノ酸配列を含むＣＤＲ１と、ＶＩＮＰＧＳＧＧＴＮＹＮＥＫＦＫＧのアミノ酸配列を含むＣＤＲ２とを更に含み、
軽鎖が、ＲＳＳＫＳＬＬＨＳＮＧＮＴＹＬＹのアミノ酸配列を含むＣＤＲ１と、ＲＭＳＮＬＡＳのアミノ酸配列を含むＣＤＲ２とを更に含むことを特徴とする変化形態３に記載の阻害剤。
（変化形態５）
重鎖が、配列番号１に記載されたアミノ酸配列を含み、
軽鎖が、配列番号２に記載されたアミノ酸配列を含むことを特徴とする変化形態４に記載の阻害剤。
（変化形態６）
抗体が、ヒトに適合化されていることを特徴とする変化形態１〜４の何れか１形態に記載の阻害剤。
（変化形態７）
抗体が、配列番号３に記載されたアミノ酸配列を含む重鎖と、配列番号４に記載されたアミノ酸配列を含む軽鎖とを含むことを特徴とする変化形態６に記載の阻害剤。
（変化形態８）
抗体が、抗体フラグメントであることを特徴とする変化形態１〜７の何れか１形態に記載の阻害剤。
（変化形態９）
阻害剤が、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、又は、繊維芽細胞の数を減少させることに使用されること、
前記繊維芽細胞が、腫瘍関連性繊維芽細胞（ＴＡＦｓ）であること、
を特徴とする変化形態１−８の何れか１形態に記載の阻害剤。
（変化形態１０）
阻害剤が、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、又は、繊維芽細胞の数を減少させることに使用されることを特徴とする変化形態１−８の何れか１形態に記載の阻害剤。
（変化形態１１）
繊維芽細胞の活性化の阻害、又は、繊維芽細胞の数の減少が、繊維形成性疾患を患う被験者において行われることを特徴とする変化形態１−１０の何れか１形態に記載の阻害剤。
（変化形態１２）
繊維形成性疾患が、肝繊維症であることを特徴とする変化形態１１に記載の阻害剤。
（変化形態１３）
核酸であることを特徴とする変化形態１−１１の何れか１形態に記載の阻害剤。
（変化形態１４）
腫瘍環境又は繊維形成性疾患を患う被験者における、繊維芽細胞の活性化を阻害すること、又は、繊維芽細胞の数を減少させることに使用される医薬組成物であって、
単離されたＬＯＸＬ２の阻害剤と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含むことを特徴とする医薬組成物。
（変化形態１５）
阻害剤が、変化形態１−１３の何れか１形態に記載の阻害剤であることを特徴とする変化形態１４に記載の医薬組成物。
【国際調査報告】
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