(57)【要約】  本発明は、精子タンパク質受容体である、卵母細胞特異的タンパク質、ＳＡＳ１Ｒ（精子先体ＳＬＬＰ１受容体）がまた、卵巣癌および子宮癌を含む様々な癌においても発現されるという発見に基づいて、癌、特に卵巣癌および子宮癌を診断し、治療し、予防するのに有用な組成物および方法を提供する。６つのＳＡＳ１Ｒ変異体は、以前に同定されており、また、それらは、本発明によって包含される。本発明は、ＳＡＳ１Ｒ発現細胞を標的にし、そのような細胞を死滅させるのに有用な抗体をさらに提供する。
2013539018.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象における癌を診断するための方法であって、前記対象由来の試料におけるＳＡＳ１Ｒの存在を検出することを含み、試料におけるＳＡＳ１Ｒの存在が、対象が癌を有することを示す方法。
【請求項２】
前記ＳＡＳ１Ｒが、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記検出が、分析デバイスおよびプログラムにより結果を分析することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
分析デバイスが、コンピューターを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
分析デバイスが、配列分析機を含む、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
検出されたＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡのレベルが、分析デバイスおよびプログラムにより定量化される、請求項２に記載の方法。
【請求項７】
検出されたＳＡＳ１Ｒの前記レベルが、対照試料におけるレベルと比較される、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記試料が、腫瘍生検材料、組織試料、血液、血漿、腹膜液、卵胞液、腹水、尿、糞便、唾液、粘液、痰、喀痰、涙液、脳脊髄液、滲出液、洗浄液、およびＰａｐスミアからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡが、ＥＬＩＳＡ、イムノアッセイ、免疫蛍光法、免疫組織化学的検査、免疫沈降、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、ＰＣＲ、および表面プラズモン共鳴からなる群から選択される方法を使用して検出される、請求項２に記載の方法。
【請求項１０】
前記ＳＡＳ１Ｒタンパク質が、細胞表面タンパク質である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記ＳＡＳ１Ｒタンパク質が、細胞の表面上に検出される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記癌が、癌腫、肉腫、子宮癌、卵巣癌、肺癌、腺癌、肺の腺癌、扁平上皮癌、肺の扁平上皮癌、悪性ミュラー管混合腫瘍、白血病、リンパ腫、および類内膜癌からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記試料が、腫瘍生検材料である、請求項８に記載の方法。
【請求項１４】
前記ＳＡＳ１Ｒが、ＰＣＲを使用して検出される、請求項９に記載の方法。
【請求項１５】
前記ＰＣＲが、配列番号２８〜３３からなる群から選択されるプライマーを使用して実行される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記ＳＡＳ１Ｒタンパク質が、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体またはその断片もしくは相同体を使用して検出される、請求項２に記載の方法。
【請求項１７】
前記抗体が、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、および４２６〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記抗体が、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１２０、１２１〜１４０、１４１〜１６０、１６１〜１８０、１８１〜２００、２０１〜２２０、２２１〜２４０、２４１〜２６０、２６１〜２８０、２８１〜３００、３０１〜３２０、３２１〜３４０、３４１〜３６０、３６１〜３８０、３８１〜４００、４０１〜４２０、４２１〜４３１、および４１１〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する、請求項１６に記載の方法。
【請求項１９】
前記抗体が、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、完全ヒト抗体、またはその活性断片もしくは相同体からなる群から選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の進行または治療をモニターするための方法であって、ＳＡＳ１Ｒを検出することおよび前記対象由来の試料におけるＳＡＳ１Ｒのレベルを決定すること、前記対象におけるＳＡＳ１Ｒのレベルを、標準とまたは前記対象におけるＳＡＳ１Ｒの以前のレベルと比較することを含み、前記対象におけるレベルにおける変化が、対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の進行または治療と相関し、それによって、対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の進行または治療をモニターする方法。
【請求項２１】
前記ＳＡＳ１Ｒが、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡである、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記検出が、分析デバイスおよびプログラムにより結果を分析することを含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
分析デバイスが、コンピューターを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
分析デバイスが、配列分析機を含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
検出されたＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡのレベルが、分析デバイスおよびプログラムにより定量化される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２６】
検出されたＳＡＳ１Ｒの前記レベルが、対照試料におけるレベルと比較される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記試料が、腫瘍生検材料、組織試料、血液、血漿、腹膜液、卵胞液、腹水、尿、糞便、唾液、粘液、痰、喀痰、涙液、脳脊髄液、滲出液、洗浄液、およびＰａｐスミアからなる群から選択される、請求項２０に記載の方法。
【請求項２８】
前記ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡが、ＥＬＩＳＡ、イムノアッセイ、免疫蛍光法、免疫組織化学的検査、免疫沈降、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、ＰＣＲ、および表面プラズモン共鳴からなる群から選択される方法を使用して検出される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２９】
配列番号２８〜３３の配列を有する、ＳＡＳ１Ｒを検出するためのプライマーの組み合わせ。
【請求項３０】
配列番号２８の配列を有する単離核酸。
【請求項３１】
配列番号２９の配列を有する単離核酸。
【請求項３２】
配列番号３０の配列を有する単離核酸。
【請求項３３】
配列番号３１の配列を有する単離核酸。
【請求項３４】
配列番号３２の配列を有する単離核酸。
【請求項３５】
配列番号３３の配列を有する単離核酸。
【請求項３６】
対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を検出するための方法であって、リンカーまたはスペーサーをさらに含んでいてもよい、造影剤およびＳＡＳ１Ｒに結合する分子の複合体を含む組成物を前記対象に投与することと、前記造影剤を検出し、それによって、対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を検出することを含む方法。
【請求項３７】
前記分子が、タンパク質である、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記タンパク質が、ＳＬＬＰ１またはその断片もしくは相同体またはその抗体またはその断片もしくは相同体である、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
前記ＳＬＬＰ１が、配列番号１４の配列を有する、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記抗体が、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、完全ヒト抗体、またはその活性断片もしくは相同体からなる群から選択される、請求項３８に記載の方法。
【請求項４１】
前記造影剤が、放射性核種、放射線造影剤、常磁性イオン、金属、生物学的タグ、蛍光標識、化学発光標識、超音波造影剤、および光活性剤からなる群から選択される、請求項３６に記載の方法。
【請求項４２】
前記造影剤が、放射性核種である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記放射性核種が、１１０Ｉｎ、１１１Ｉｎ、１７７Ｌｕ、１８Ｆ、５２Ｆｅ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、６７Ｇａ、６８Ｇａ、８６Ｙ、９０Ｙ、８９Ｚｒ、９４ｍＴｃ、９４Ｔｃ、９９ｍＴｃ、１２０Ｉ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１５４−１５８Ｇｄ、３２Ｐ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、５１Ｍｎ、５２ｍＭｎ、５５Ｃｏ、７２Ａｓ、７５Ｂｒ、７６Ｂｒ、８２ｍＲｂ、８３Ｓｒ、および他のガンマ、ベータ、またはポジトロン放射体からなる群から選択される、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
前記放射性核種が、１１１Ｉｎである、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記造影剤が、コンピューターにつながれ、プログラムを使用して画像データを分析するＳＰＥＣＴ／ＣＴスキャナーにより検出される、請求項３６に記載の方法。
【請求項４６】
前記癌の位置を検出する、請求項３６に記載の方法。
【請求項４７】
前記癌が、対象における複数の位置において検出される、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
ＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストによる治療に対して応答性となる癌を有する対象を選択するための方法であって、前記対象由来の試料におけるＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡの存在を検出することを含み、試料におけるＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡの存在が、対象が、ＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストによる治療に対して応答性となるということを示す方法。
【請求項４９】
対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を予防または治療するための方法であって、免疫原性量のＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその免疫原性断片もしくは相同体を含む医薬組成物を対象に投与することを含む方法。
【請求項５０】
前記ＳＡＳ１Ｒタンパク質が、配列番号６、８、１０、１９、２０、２１、および２３から選択される配列を有する、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を予防または治療するための方法であって、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその免疫原性断片もしくは相同体をコードする配列を含む単離核酸を前記対象に投与することを含む方法。
【請求項５２】
前記単離核酸が、配列番号５、７、９、および２２から選択される配列を有する、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を治療するための方法であって、有効量のＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストまたは阻害剤をその必要のある対象に投与し、それによって、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を治療することを含む方法。
【請求項５４】
前記アンタゴニストが、ＳＡＳ１Ｒ活性、レベル、および発現を阻害する、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
前記アンタゴニストが、ＳＡＳ１Ｒタンパク質と結合する、請求項５３に記載の方法。
【請求項５６】
前記アンタゴニストが、薬剤、治療剤、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体ならびにその断片および相同体、アンチセンスオリゴヌクレオチド、アプタマー、ｐｈｙｌｏｍｅｒ、ならびにタンパク質からなる群から選択される、請求項５３に記載の方法。
【請求項５７】
前記抗体が、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、完全ヒト抗体、またはその活性断片もしくは相同体からなる群から選択される、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記抗体が、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、および４２６〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
前記抗体が、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１２０、１２１〜１４０、１４１〜１６０、１６１〜１８０、１８１〜２００、２０１〜２２０、２２１〜２４０、２４１〜２６０、２６１〜２８０、２８１〜３００、３０１〜３２０、３２１〜３４０、３４１〜３６０、３６１〜３８０、３８１〜４００、４０１〜４２０、４２１〜４３１、および４１１〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する、請求項５７に記載の方法。
【請求項６０】
前記タンパク質が、ＳＬＬＰ１またはその断片もしくは相同体である、請求項５６に記載の方法。
【請求項６１】
前記ＳＬＬＰ１が、配列番号１４の配列を有する、請求項５６に記載の方法。
【請求項６２】
増殖を阻害するかまたはＳＡＳ１Ｒ陽性の癌細胞を死滅させるための方法であって、ＳＡＳ１Ｒまたはその断片に対して導かれる有効量の抗体と当該癌細胞を接触させることを含み、ＳＡＳ１Ｒまたはその断片に対して導かれる前記抗体が、ＳＡＳ１Ｒと結合し、それによって、増殖を阻害するかまたは癌細胞を死滅させる方法。
【請求項６３】
前記死滅が、抗体媒介性補体依存性細胞死滅である、請求項６２に記載の方法。
【請求項６４】
前記癌が、癌腫、肉腫、子宮癌、卵巣癌、肺癌、腺癌、肺の腺癌、扁平上皮癌、肺の扁平上皮癌、悪性ミュラー管混合腫瘍、白血病、リンパ腫、および類内膜癌からなる群から選択される、請求項６２に記載の方法。
【請求項６５】
前記抗体が、他の分子または構造にコンジュゲートされる、請求項６２に記載の方法。
【請求項６６】
前記分子または構造が、抗体、タンパク質、プロドラッグ、薬剤、毒素、タンパク毒素、リポソーム、放射性同位体、および酵素からなる群から選択される、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
対象における癌を診断するための方法であって、前記対象由来の試料における癌−卵母細胞抗原の存在を検出することを含み、試料における癌−卵母細胞抗原の存在が、対象が癌を有することを示す方法。
【請求項６８】
癌が、肺癌、ＭＭＭＴ、膀胱癌、卵巣癌、子宮癌、子宮体癌、乳癌、頭頸部癌、肝臓癌、膵臓癌、食道癌、胃癌、子宮頸癌、前立腺癌、副腎癌、リンパ腫、白血病、唾液腺癌、骨癌、脳癌、小脳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、鼻腔口腔咽頭癌、ＮＰＣ、腎臓癌、皮膚癌、黒色腫、基底細胞癌、硬口蓋癌腫、舌扁平上皮癌、髄膜腫、多形腺腫、星状細胞腫、軟骨肉腫、皮質腺腫、肝細胞癌、膵臓癌、扁平上皮癌、および腺癌からなる群から選択される、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
対象における癌−卵母細胞抗原を検出するための方法であって、リンカーまたはスペーサーをさらに含んでいてもよい、造影剤および前記癌−卵母細胞抗原に結合する分子の複合体を含む組成物を前記対象に投与することと、前記造影剤を検出し、それによって、対象における癌−卵母細胞抗原を検出することを含む方法。
【請求項７０】
癌が、肺癌、ＭＭＭＴ、膀胱癌、卵巣癌、子宮癌、子宮体癌、乳癌、頭頸部癌、肝臓癌、膵臓癌、食道癌、胃癌、子宮頸癌、前立腺癌、副腎癌、リンパ腫、白血病、唾液腺癌、骨癌、脳癌、小脳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、鼻腔口腔咽頭癌、ＮＰＣ、腎臓癌、皮膚癌、黒色腫、基底細胞癌、硬口蓋癌腫、舌扁平上皮癌、髄膜腫、多形腺腫、星状細胞腫、軟骨肉腫、皮質腺腫、肝細胞癌、膵臓癌、扁平上皮癌、および腺癌からなる群から選択される、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
癌−卵母細胞抗原のアンタゴニストによる治療に対して応答性となる癌を有する対象を選択するための方法であって、前記対象由来の試料における癌−卵母細胞抗原タンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡの存在を検出することを含み、試料における癌−卵母細胞抗原タンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡの存在が、対象が、癌−卵母細胞抗原のアンタゴニストによる治療に対して応答性となるということを示す方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照   本出願は、２０１０年８月６日に出願された米国仮特許出願第６１／３７１，２１５号、２０１０年１２月１５日に出願された米国仮特許出願第６１／４２３，３０２号、および２０１１年６月２１日に出願された米国仮特許出願第６１／４９９，４４８号に対して、米国特許法１１９（ｅ）条の下で優先権を主張し、本開示は、本明細書においてそれらの全体が参照によって組み込まれる。
【０００２】
連邦政府による資金提供を受けた研究開発の記載   本発明は、部分的に、ＮＩＨによって与えられた助成金番号Ｒ０３  ＨＤ０５５１２９およびＦｏｇａｒｔｙ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒからの助成金番号Ｄ４３  ＴＷ／ＨＤ  ００６５４の下で、米国政府支援により行われた。米国政府は、本発明において一定の権利を有する。
【背景技術】
【０００３】
メタロエンドペプチダーゼのアスタシンファミリーは、１９９０年代にプロテアーゼの新規なファミリーとして認識された。アスタシンは、メタロプロテイナーゼのメトジンシンスーパーファミリーのサブファミリーである。最初に特徴付けられたのは、ザリガニ酵素アスタシンであった。現在までに、このファミリーの２００を超えるメンバーが、細菌からヒトに及ぶ種において同定されている。アスタシンは、形態発生、マトリックスアセンブリー、組織分化、および消化に関与する。ファミリーメンバーは、プロコラーゲンＣ−プロテイナーゼ（ＢＭＰ１、骨形成タンパク質１）、トロイドおよび哺乳動物トロイド様、ＨＭＰ［ヒドラ・ブルガリス（Ｈｙｄｒａ  ｖｕｌｇａｒｉｓ）メタロプロテイナーゼ］、ウニＢＰ１０（胞胚タンパク質）およびＳＰＡＮ（アメリカムラサキウニアスタシン）、アルベオリン（ａｌｖｅｏｌｉｎ）、オバスタシン（ｏｖａｓｔａｃｉｎ）、ＬＣＥ、ＨＣＥ［「低」および「高」卵膜溶解（ｃｈｏｒｉｏｌｙｔｉｃ）酵素］、ネフロシン（ｎｅｐｈｒｏｓｉｎ）（コイ頭腎由来の）、カエル由来のＵＶＳ．２を含む「孵化」サブファミリー、ならびにメプリンを含む。ヒトおよびマウスゲノムでは、６つのアスタシンファミリー遺伝子（２つのメプリン、３つのＢＭＰ１／トロイド様、１つのオバスタシン）があるが、線虫では、４０ある。
【０００４】
アスタシンファミリーメンバーは、ほとんどのメタロエンドペプチダーゼにおいて見いだせる５アミノ酸亜鉛結合モチーフから始まる、ユニークな１８アミノ酸のシグネチャ配列によって特徴付けられる（Ｂｏｎｄ  ａｎｄ  Ｂｅｎｙｏｎ，１９９５によって概説されるので参照されたい）。シグネチャ配列は、成熟ザリガニアスタシン全体であり、ファミリーのすべてのメンバーの触媒またはプロテアーゼドメインであるおよそ２００アミノ酸の配列の一部である。シグナルおよびプロ配列もまた、ファミリーメンバーの共通の特徴であり、ＱｕＣＡＭ−１は例外となる可能性があり、ＮＨ２末端ドメインは、この後者のタンパク質についてまだ発見されていない。アスタシンは、最近まで、プロテアーゼドメインから始まる成熟タンパク質として単に研究されていたが、現在、４９残基のプレプロセグメントを含有することが知られている。一時的なシグナルペプチドは、生合成の間に小胞体にタンパク質を導き、これは、これまでにこのように研究されたファミリーのタンパク質がすべて分泌されるまたは形質膜に結合するという発見と一致している。プロ配列は、サイズが非常に変動し、ショウジョウバエトロイド関連−１（ＤｒＴ／ｒ−１）については５１９までのアミノ酸を含有し、プロテアーゼの活性およびおそらく発現を調節するのに重要であると思われる。後者の点に関して、たとえば、ＤｒＴ／ｒ−１の大きなプロ配列は、細胞周期が非常に短い、胚発生の早期段階において、この遺伝子産物の発現を予防することが示唆されてきた。
【０００５】
メプリンは、亜鉛依存性の膜結合プロテアーゼであり、メタロプロテイナーゼの「アスタシンファミリー」のメンバーである（Ｂｏｎｄ  ａｎｄ  Ｂｅｙｎｏｎ，１９９５，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．  ４：１２４７−１２６１；Ｓｔｅｒｃｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，２００８，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ａｓｐｅｃｔｓ  ｏｆ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，２９：３０９−３２８）。これらの酵素は、マルチドメインオリゴマータンパク質である。発現は、転写および翻訳レベルで高度に調節される。典型的に、これらのタンパク質は、極性上皮細胞の頂端膜に向けられる（Ｅｌｄｅｒｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２４７：９２０−９３２，１９９７）。様々な増殖因子、サイトカイン、および細胞外マトリックスタンパク質が、メプリンに対する基質となる。メプリンは、白血球、癌細胞、ならびに腸および腎臓において同定されてきた。メプリンαおよびβ遺伝子の両方は、様々な癌細胞において発現される。結腸直腸腫瘍組織では、メプリンαｍＲＮＡ、免疫反応性タンパク質、および酵素活性が検出される。しかしながら、正常な結腸とは対照的に、メプリンαサブユニットは、それが蓄積し、免疫組織化学的方法によって検出することができる、腫瘍の間質の中に分泌される。この異常な分泌のメカニズムは、メプリンαを内因的に発現する結腸腺癌細胞株（Ｃａｃｏ−２）を使用して示された。ｔｒａｎｓｗｅｌｌフィルター支持体上で培養された場合、メプリンは、頂端膜ドメインおよび側底膜ドメインから同様に分泌される。上皮細胞層の側底側で、メプリンαは、腸線維芽細胞由来のｕＰＡによって触媒される活性化プロセスによってプラスミノーゲンから生成されるプラスミンによって活性化され得る（Ｒｏｓｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，２００２）。メプリン発現は、腫瘍細胞浸潤および遊走において役割を果たし得、また、そうする際に、腫瘍進行に関与し得る（Ｓｔｅｒｃｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，２００８；Ｒｏｓｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，２００２，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７７：４３：４０６５０−４０６５８）。
【０００６】
Ｑｕｅｓａｄａ  ｅｔ  ａｌ．（２００４，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７９：２５：２６６２７−２６６３４）は、マウスおよびヒトから新規なタンパク質を単離し、卵巣組織におけるその主な発現およびアスタシンに対する明らかな類似性のために、それを「オバスタシン」と命名した。Ｑｕｅｓａｄａは、胚孵化のプロセスに関与する候補メタロプロテイナーゼを探し、新規なアスタシンメタロプロテイナーゼを探すためにＢＬＡＳＴアルゴリズムを使用した。彼らは、マウスおよびヒトにおいて新規なタンパク質を発見し、配列決定し、ヒト染色体２ｑ１１．１にヒトの遺伝子の局在を決定した。コンピューター分析により、Ｎ末端シグナルペプチド、亜鉛依存性メタロプロテアーゼドメイン、およびプロドメインがプロテアーゼの潜在の維持におそらく関与していることが明らかにされた。しかしながら、オバスタシンは、他のアスタシンにおいて発見されていないさらなる１５０アミノ酸のＣ末端ドメインを有することが発見された。Ｑｕｅｓａｄａ  ｅｔ  ａｌ．はまた、タンパク質がメタロプロテアーゼ活性を有し、それが卵巣以外の正常組織において発現されなかったことを示した。彼らは、オバスタシンのその正常な機能が、下等の種のアスタシンファミリー「孵化酵素」に類似し得ることを示唆した。さらに、彼らは、それが、リンパ腫および白血病細胞株を含む一部の癌細胞において発現されることを発見したが、試験された５つの卵巣の癌腫のうちの２つだけであり、それは、ＲＴ−ＰＣＲを使用して検出可能であったにすぎなかった。他のグループは、最近、オバスタシンを「アスタシン様タンパク質」（ＡＳＴＬ）と呼んでいる。
【０００７】
Ｑｕｅｓａｄａが「オバスタシン」を発見したのとほぼ同時に、別のグループが、それを単離し、最初に、それを、Ｚｎエンドペプチダーゼ（ＺＥＰ）と呼び（Ｍａｎｄａｌ  ｅｔ  ａｌ．、２００６年８月３１日に公開、ＰＣＴ特許出願公開ＷＯ  ２００６／０９１５３５）、後に、それが、精子タンパク質ＳＬＬＰ１と相互作用することを彼らが発見した卵母細胞タンパク質であったので、精子先体ＳＬＬＰ１受容体（「ＳＡＳ１Ｒ」）と呼んだ（Ｍａｎｄａｌ  ｅｔ  ａｌ．，２００８，Ｂｉｏｌ．ｏｆ  Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ，７８：６９：７２；Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．、２０１０年５月１４日に公開されたＰＣＴ特許出願公開ＷＯ  ２０１０／０５４１８７）。
【０００８】
Ｍａｎｄａｌ  ｅｔ  ａｌ．（ＰＣＴ特許出願公開ＷＯ  ２００６／０９１５３５）は、ＺＥＰが２つの変異体、予測される膜貫通ドメイン、切断部位、および亜鉛結合シグネチャを示す配列を有することを示した。彼らは、それが、日本のウナギであるニホンウナギの孵化酵素ＥＨＥ７に相同であることを指摘し、それが、マウス胚発生において同様の機能を実行し得ることを仮定した。Ｍａｎｄａｌの生物情報学分析は、タンパク質が、２つのグリコシル化部位、リン酸化部位、およびミリスチル化部位を有することを示した。彼らは、その部位が膜タンパク質を示唆し、膜貫通形態もまた、タンパク質のＮ末端の強力な膜貫通ドメインを予測すると述べた。彼らのデータは、それが卵特異的であり、それが微絨毛領域において卵表面上に局在したが、発生上調節されたことを示した。データはまた、ＺＥＰおよび精子表面タンパク質ＳＬＬＰ１との間の相互作用をも示唆した。
【０００９】
Ｍａｎｄａｌ  ｅｔ  ａｌ．（Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ，７８：６９−７２，２００８）では、グループは、ＺＥＰをＳＡＳ１Ｒと呼び始めた。彼らは、ＳＡＳ１Ｒが、成熟生卵母細胞の微絨毛ドメイン上に局在し、受精後に著しく失われ、胚盤胞において事実上検出できないことを発見した。彼らは、タンパク質が、非透過処理細胞の表面上で発現されるのを、完全長ＳＡＳ１Ｒ  ｃＤＮＡコンストラクトによるＣＨＯ−Ｋ１細胞のトランスフェクションが可能にしたことを示し、活性な膜貫通ドメインの存在を示した。彼らはまた、プロテアーゼの特徴およびＳＡＳ１Ｒが精子タンパク質ＳＬＬＰ１に対する受容体として作用する能力について記載した。
【００１０】
Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．（ＰＣＴ特許出願公開ＷＯ  ２０１０／０５４１８７；２０１０年５月１４日に公開）は、天然のＳＡＳ１Ｒが、表面プラズモン共鳴技術を使用して組換えＳＬＬＰ１への結合を示したこと、結合された組換えＳＡＳ１Ｒが、膜オーバーレイアッセイ（ファーウエスタン分析）において組換えＳＬＬＰ１を捕捉したこと、ＳＡＳ１ＲおよびＳＬＬＰ１が、酵母２ハイブリッド分析によって分子結合特性を明らかにしたこと、組換えＳＡＳ１Ｒの免疫沈降により組換えＳＬＬＰ１を回収し、免疫沈降した組換えＳＬＬＰ１により、ウサギ網状赤血球抽出物から組換えＳＡＳ１Ｒを回収したこと、組換えＳＬＬＰ１が、卵母細胞微絨毛ドメインに結合し、天然のＳＡＳ１Ｒと共存すること、組換えＳＡＳ１Ｒが、精子の先体に結合し、天然のＳＬＬＰ１と共存すること、精子先体マトリックス由来の天然のＳＬＬＰ１が、天然のＳＡＳ１Ｒと局在すること、ならびに天然のＳＡＳ１Ｒおよび天然のＳＬＬＰ１が、卵母細胞および精子の非イオン性界面活性剤抽出物の混合物から共沈することを発見した。Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．はまた、インビトロ（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ）受精のために回収された生きているヒト卵子上にＳＡＳ１Ｒが局在し、対象への外因性ＳＡＳ１Ｒの投与が、ＳＡＳ１Ｒに対する免疫応答を誘発することを示した。彼らはまた、ＳＡＳ１Ｒタンパク質が、出生後の卵形成の間に、思春期の卵形成において、および成人の卵形成において、二層の二次卵胞中に最初に生じることを実証した。パターンは、動物の年齢に関係なく一定である。成体マウス卵巣では、ＳＡＳ１Ｒ染色は、二次卵胞およびすべての続く段階内の卵母細胞に制限される。原始卵母細胞および一次卵母細胞は、いかなる発生段階でもＳＡＳ１Ｒについて染色されない。彼らは、ＳＡＳ１Ｒについて染色された卵巣における唯一の細胞型が卵母細胞であり、ＳＡＳ１Ｒの存在が発生上調節されることを発見した。
【００１１】
Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｏｃｉｅｔｙ（ＡＣＳ）は、米国における２０１０年の子宮癌の４３，４７０の新しい症例および７，９５０人の死亡を予測している。子宮癌の早期検出およびモニタリングのためのスクリーニングアッセイはない。悪性ミュラー管混合腫瘍（ＭＭＭＴ）として知られている子宮癌の形態は、この種の子宮癌が閉経後の女性において主に生じるので、興味がある。ＭＭＭＴは、特に攻撃的な癌であり、患者は健康がすぐれない。ＭＭＭＴは、子宮内膜悪性疾患のおよそ１０％を占める。
【００１２】
世界的に、卵巣癌（ＣａＯ）は、婦人科学的癌による死亡の主要な原因であり、女性の癌による死亡の第４の最も一般的な原因である。２０１０年には、ＡＣＳは、ＣａＯの２０，１８０の新しい症例が米国において診断され、１５，３１０人の女性がその病気により死亡するであろうと推測する。高度な死亡率は、早期段階のＣａＯの検出と関連する難しさおよび進行型の疾患を治療するための有効な療法の不足に起因する。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
卵巣癌および子宮癌などのような癌のための決定的な診断試験の不足ならびに転移性疾患の患者についての予後不良を考慮すれば、これらおよび他の癌のための診断試験についての当技術分野における長年にわたる必要性がある。
【００１４】
癌バイオマーカーを同定し、使用し、かつ癌の治療および予防についてバイオマーカーを標的にすることを含めて、これらのバイオマーカーを調節するための方法を発見するための当技術分野における長年にわたる必要性がある。本発明は、これらの必要性を満たすものである。
【課題を解決するための手段】
【００１５】
本発明は、卵母細胞タンパク質ＳＡＳ１Ｒが、複数のタイプの癌において発現され、細胞表面に発現され、したがって、ＳＡＳ１Ｒを、発見された第１の癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーにする本明細書において開示される予想外の結果に基づいて、癌を診断し、治療し、予防するのに有用な組成物および方法を提供する。癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーは、卵母細胞においてのみおよび卵胞形成の特定の段階でのみ正常組織の中で発現されるタンパク質として定義される。様々な腫瘍における、卵母細胞に通常制限される細胞表面タンパク質の発現は、癌−卵母細胞抗原標的を発現する対象を同定するためのコンパニオン診断が伴う場合に、腫瘍選択的療法のための魅力的な機会を与える。そのため、ＳＡＳ１Ｒは、癌を検出し、診断するための有用なバイオマーカーである。
【００１６】
本明細書において開示されるデータに基づいて、ＳＡＳ１Ｒは、癌診断バイオマーカーとしてのおよび治療標的としての使用のために重要な基準を満たす。成人の組織の中で、ＳＡＳ１Ｒは、卵母細胞においておよび卵胞形成の厳密な段階にのみ発現され、いくつかの種類の腫瘍において発現されることが本明細書において開示され、実際に細胞表面に見つけられる。重要なことには、ＳＡＳ１Ｒは、卵母細胞および腫瘍細胞の形質膜の細胞質外（ｅｘｏｐｌａｓｍｉｃ）面上に結合している、抗体に接触可能な細胞表面タンパク質であることが本明細書において開示されている。そのため、それは、診断バイオマーカーとして有用である。細胞表面ＳＡＳ１Ｒを標的にすることによってＳＡＳ１Ｒを発現する癌細胞を死滅させる能力もまた、本明細書において開示される。そのため、ＳＡＳ１Ｒは、薬物療法のためのまたは痘苗原としての標的となる。ＳＡＳ１Ｒはまた、活性酵素でもあり、そのため、可能性として、その活性を阻害するための薬剤および他の作用物質についての標的となり、その触媒ポケットは、細胞内で作用する細胞毒性薬を送達するために標的にされてもよい。ＳＡＳ１Ｒの発現が卵胞形成の間で段階特異的であり、原始卵胞および大多数の一次卵胞において局在しないので、女性におけるＳＡＳ１Ｒの治療ターゲティングは卵巣予備能（ｏｖａｒｉａｎ  ｒｅｓｅｒｖｅ）として働く卵巣における静止状態の卵母細胞の集団に危害を加えないことが予測される。したがって、腫瘍におけるＳＡＳ１Ｒを標的にする療法は、女性における不妊症の誘発を回避し得る。ＳＡＳ１Ｒ発現が、女性において正常組織の中で卵母細胞に制限されるので、男性の腫瘍がＳＡＳ１Ｒを発現する場合、細胞表面のタンパク質の存在は、腫瘍選択的療法のための優れた機会を与える。
【００１７】
一実施形態では、本発明は、対象における癌を診断するための組成物および方法であって、対象由来の生物学的試料におけるＳＡＳ１Ｒの存在を検出することを含み、試料におけるＳＡＳ１Ｒの存在は、対象が癌を有することを示す、組成物および方法を提供する。一態様では、対象は、ヒトである。
【００１８】
一実施形態では、本発明は、ＳＡＳ１Ｒ  ｃＤＮＡ、タンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡを検出し、測定するのに有用な組成物および方法を提供する。
【００１９】
一実施形態では、検出は、本明細書において記載される工程を含み、分析デバイスおよびプログラムによる結果を分析することをさらに含む。一態様では、分析デバイスは、コンピューターを含む。一態様では、分析デバイスは、配列分析機を含む。
【００２０】
一実施形態では、検出されたＳＡＳ１Ｒ  ｃＤＮＡ、タンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡのレベルは、分析デバイスおよびプログラムにより定量化される。一態様では、検出されたＳＡＳ１Ｒのレベルは、対照試料におけるレベルと比較される。
【００２１】
一実施形態では、試料は、腫瘍生検材料、組織試料、血液、血漿、腹膜液、卵胞液、腹水、尿、糞便、唾液、粘液、痰、喀痰、涙液、脳脊髄液、滲出液、洗浄液、およびＰａｐスミアからなる群から選択される。一態様では、試料は、血液である。一態様では、試料は、血清である。一態様では、試料は、血漿である。
【００２２】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡは、ＥＬＩＳＡ、イムノアッセイ、免疫蛍光法、免疫組織化学的検査、免疫沈降、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、ドットブロット、ＰＣＲ、および表面プラズモン共鳴からなる群から選択される方法を使用して検出される。
【００２３】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、１ｐｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、１０ｐｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、５０ｐｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、１００ｐｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、５００ｐｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、１ｎｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、５ｎｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、１０ｎｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片は、２０ｎｇ／ｍｌもの低いレベルで検出することができる。
【００２４】
一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、細胞表面タンパク質である。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、細胞の表面上で検出される。
【００２５】
一実施形態では、診断されるまたは検出される癌は、癌腫、肉腫、子宮癌、卵巣癌、肺癌、腺癌、肺の腺癌、扁平上皮癌、肺の扁平上皮癌、悪性ミュラー管混合腫瘍、白血病、リンパ腫、および類内膜癌からなる群から選択される。
【００２６】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒは、ＰＣＲを使用して検出される。一態様では、試料は、腫瘍生検材料である。他の態様では、試料は、腫瘍細胞を含む。一態様では、ＰＣＲは、配列番号２８〜３３からなる群から選択されるプライマーを使用して実行される。一実施形態では、本発明は、ＰＣＲのための新規なプライマーを提供する。一態様では、６つのプライマーが、提供される。一態様では、プライマーは、配列番号２８〜３３を有するプライマーの群から選択される。
【００２７】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体またはその断片もしくは相同体を使用して検出される。一態様では、抗体は、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、および４２６〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する。一態様では、抗体は、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１２０、１２１〜１４０、１４１〜１６０、１６１〜１８０、１８１〜２００、２０１〜２２０、２２１〜２４０、２４１〜２６０、２６１〜２８０、２８１〜３００、３０１〜３２０、３２１〜３４０、３４１〜３６０、３６１〜３８０、３８１〜４００、４０１〜４２０、４２１〜４３１、および４１１〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する。
【００２８】
一実施形態では、抗体は、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、完全ヒト抗体、およびその活性断片または相同体からなる群から選択される。一態様では、本発明の抗体またはその断片もしくは相同体は、ＳＡＳ１Ｒのエピトープまたはその断片もしくは相同体に結合する。一態様では、エピトープは、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、４２６〜４３１、１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１２０、１２１〜１４０、１４１〜１６０、１６１〜１８０、１８１〜２００、２０１〜２２０、２２１〜２４０、２４１〜２６０、２６１〜２８０、２８１〜３００、３０１〜３２０、３２１〜３４０、３４１〜３６０、３６１〜３８０、３８１〜４００、４０１〜４２０、４２１〜４３１、および４１１〜４３１からなる群から選択される、ＳＡＳ１Ｒの断片から選択される。
【００２９】
本発明はまた、対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の進行または治療をモニターするための組成物および方法を提供する。一実施形態では、方法は、試料におけるＳＡＳ１Ｒを検出することおよび試料におけるＳＡＳ１Ｒのレベルを決定すること、次いで、その試料におけるＳＡＳ１Ｒのレベルを、標準とまたはその対象由来のＳＡＳ１Ｒの以前のレベルと比較することを含み、その対象由来の試料におけるレベルにおける変化は、対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の進行または治療と相関する。一態様では、検出され、定量化されるＳＡＳ１Ｒは、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡである。一態様では、検出は、分析デバイスまたはシステムおよびコンピュータープログラムにより結果を分析することを含む。一態様では、結果は、定量化される。一態様では、分析デバイスまたはシステムは、コンピューターを含む。一態様では、分析デバイスは、配列分析機を含む。一態様では、検出されたＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡのレベルは、分析デバイスおよびプログラムにより定量化される。一態様では、検出されたＳＡＳ１Ｒのレベルは、対照試料におけるレベルと比較される。
【００３０】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の進行をモニターするためにまたはその治療ために使用される試料は、腫瘍生検材料、組織試料、血液、血漿、腹膜液、卵胞液、腹水、尿、糞便、唾液、粘液、痰、喀痰、涙液、脳脊髄液、滲出液、洗浄液、およびＰａｐスミアからなる群から選択される。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡは、ＥＬＩＳＡ、イムノアッセイ、免疫蛍光法、免疫組織化学的検査、免疫沈降、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、ドットブロット、ＰＣＲ、および表面プラズモン共鳴からなる群から選択される方法を使用して検出される。
【００３１】
本発明は、対象におけるＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を検出し、局在を決定するための組成物および方法をさらに提供する。一実施形態では、本発明は、造影剤およびＳＡＳ１Ｒに結合する分子を含み、所望によりリンカーまたはスペーサーをさらに含む当該複合体を含む組成物を対象に投与することと、造影剤を検出することとを提供する。一態様では、ＳＡＳ１Ｒに結合する分子は、タンパク質である。一態様では、ＳＡＳ１Ｒに結合するタンパク質は、ＳＬＬＰ１またはその断片もしくは相同体である。一態様では、ＳＬＬＰ１タンパク質は、配列番号１４の配列を有する。一態様では、ＳＡＳ１Ｒに結合するタンパク質は、抗体またはその断片もしくは相同体である。一態様では、抗体は、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、またはヒト化抗体またはその活性断片もしくは相同体からなる群から選択される。
【００３２】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれるモノクローナル抗体は、ＳＢ１、ＳＢ２、ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５からなる群から選択される。本発明は、それぞれ、ＳＢ１、ＳＢ２、ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５を含むハイブリドーマをさらに提供する。本発明は、それぞれ、モノクローナル抗体ＳＢ１、ＳＢ２、ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５をコードする核酸配列を含む、単離核酸をさらに提供する。一態様では、抗体は、ヒト化抗体である。
【００３３】
一実施形態では、造影剤は、放射性核種、放射線造影剤、常磁性イオン、金属、生物学的タグ、蛍光標識、化学発光標識、超音波造影剤、および光活性剤からなる群から選択される。一態様では、放射性核種は、１１０Ｉｎ、１１１Ｉｎ、１７７Ｌｕ、１８Ｆ、５２Ｆｅ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、６７Ｇａ、６８Ｇａ、８６Ｙ、９０Ｙ、８９Ｚｒ、９４ｍＴｃ、９４Ｔｃ、９９ｍＴｃ、１２０Ｉ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１５４−１５８Ｇｄ、３２Ｐ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、５１Ｍｎ、５２ｍＭｎ、５５Ｃｏ、７２Ａｓ、７５Ｂｒ、７６Ｂｒ、８２ｍＲｂ、８３Ｓｒ、および他のガンマ、ベータ、またはポジトロン放射体からなる群から選択される。一態様では、造影剤は、コンピューターにつながれ、プログラムを使用して画像データを分析するＰＥＴまたはＳＰＥＣＴ／ＣＴスキャナーにより検出される。一態様では、方法は、対象における癌の位置を検出する。一態様では、本発明は、転移している癌を検出することおよび画像処理することを提供する、つまり、方法は、同じ対象において複数の位置の癌を検出することができる。
【００３４】
本発明は、テーラーメイド医療に有用な組成物および方法をさらに提供する。一実施形態では、本発明は、ＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストまたは阻害剤による治療に対して応答性となる、癌を有する対象を選択するのに有用な組成物および方法であって、対象由来の試料におけるＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡの存在を検出することを含み、試料におけるＳＡＳ１Ｒタンパク質、ｍｉＲＮＡ、またはｍＲＮＡの存在は、対象が、ＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストまたは阻害剤による治療に対して応答性となるということを示す、組成物および方法を提供する。
【００３５】
本発明はまた、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を予防および治療するのに有用な組成物および方法を提供する。一実施形態では、本発明は、癌を予防するためのワクチンを提供する。一実施形態では、本発明は、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片に対する免疫原性応答を誘発するための組成物および方法を提供する。一態様では、方法は、免疫原性量のＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその免疫原性断片もしくは相同体を含む医薬組成物を対象に投与することを含む。一態様では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその断片もしくは相同体は、配列番号６、８、１０、１９、２０、２１、および２３から選択される配列を有する。
【００３６】
一実施形態では、本発明は、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはその免疫原性断片もしくは相同体をコードする配列を含む単離核酸を対象に投与することを含む。一態様では、単離核酸は、配列番号５、７、９、および２２から選択される配列を有する。
【００３７】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を治療するための方法は、有効量のＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストまたは阻害剤をその必要のある対象に投与し、それによって、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を治療することを含む。一態様では、アンタゴニストまたは阻害剤は、ＳＡＳ１Ｒ活性、レベル、および発現を阻害する。一態様では、阻害剤またはアンタゴニストは、ＳＡＳ１Ｒタンパク質と結合する。
【００３８】
一実施形態では、阻害剤またはアンタゴニストは、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体ならびにその断片および相同体、薬剤、治療剤、アンチセンスオリゴヌクレオチド、アプタマー、ｐｈｙｌｏｍｅｒ、ならびにタンパク質からなる群から選択される。
【００３９】
一実施形態では、抗体は、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、またはヒト化抗体またはその活性断片もしくは相同体からなる群から選択される。一態様では、抗体は、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、および４２６〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する。一態様では、抗体は、ＳＡＳ１Ｒヒト変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１２０、１２１〜１４０、１４１〜１６０、１６１〜１８０、１８１〜２００、２０１〜２２０、２２１〜２４０、２４１〜２６０、２６１〜２８０、２８１〜３００、３０１〜３２０、３２１〜３４０、３４１〜３６０、３６１〜３８０、３８１〜４００、４０１〜４２０、４２１〜４３１、および４１１〜４３１からなる群から選択される１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒタンパク質断片に結合する。
【００４０】
一実施形態では、タンパク質阻害剤またはアンタゴニストは、ＳＬＬＰ１またはその断片もしくは相同体である。一態様では、ＳＬＬＰ１は、配列番号１４の配列を有する。
【００４１】
本発明は、癌細胞を死滅させるためのおよび癌細胞の増殖を阻害するための組成物および方法をさらに提供する。増殖を阻害するかまたはＳＡＳ１Ｒ陽性の癌細胞を死滅させるための方法は、ＳＡＳ１Ｒまたはその断片に対して導かれる有効量の抗体と当該癌細胞を接触させることを含み、ＳＡＳ１Ｒまたはその断片に対して導かれる抗体は、ＳＡＳ１Ｒと結合し、それによって、増殖を阻害するかまたは癌細胞を死滅させる。一実施形態では、死滅は、抗体媒介性補体依存性の細胞死滅である。一態様では、補体は、補足される。一実施形態では、本発明は、補体の存在下において、ＳＡＳ１Ｒまたはその断片に対して導かれるポリクローナルまたはモノクローナル抗体により癌細胞を溶解するための組成物および方法を提供する。一実施形態では、死滅させるまたは増殖を阻害する癌細胞は、癌腫、肉腫、子宮癌、卵巣癌、肺癌、腺癌、肺の腺癌、扁平上皮癌、肺の扁平上皮癌、悪性ミュラー管混合腫瘍、白血病、リンパ腫、および類内膜癌からなる群から選択される。一態様では、抗体は、他の分子または構造に対してコンジュゲートされる。一態様では、他の分子または構造は、抗体、タンパク質、プロドラッグ、薬剤、毒素、タンパク毒素、リポソーム、放射性同位体、および酵素からなる群から選択される。
【００４２】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌を診断し、検出し、画像処理し、かつ治療するためのキットをさらに提供する。
【００４３】
本開示が、癌−卵母細胞抗原の存在を開示する最初のものであるので、本出願は、ＳＡＳ１Ｒだけではなく、ＳＡＳ１Ｒ以外の癌−卵母細胞抗原を発現する癌を診断し、治療するのに有用であろう他のすべての癌−卵母細胞抗原を標的にすることを包含する。そのため、本出願は、癌−卵母細胞抗原を検出するためのおよび癌−卵母細胞抗原陽性の癌を予防し、診断し、治療するための組成物および方法を包含する。そのような組成物および方法は、本明細書において提供されるまたは当技術分野において開示される。
【００４４】
本発明の様々な態様および実施形態は、下記にさらに詳細に記載される。
【図面の簡単な説明】
【００４５】
【図１】図１は、マウスＳＡＳ１Ｒ発現が、ＥＳＴデータベース由来のマウスＳＡＳ１Ｒ発現プロファイルに基づいて、卵巣（特に受精卵、卵母細胞、未受精卵、および接合体）に特異的に制限されることを実証する研究の概要を示す。ヒト、イヌ、ネコ、およびウサギは、試験され、同様の結果であった（データ示さず）。
【図２】図２は、脳、胃、腸、結腸、肝臓、肺、腎臓、心臓、骨格筋、脾臓、精巣、子宮、および胎盤に比べて卵巣においてその発現が制限されることをさらに実証する複数の組織のノーザンブロットにおけるマウスＳＡＳ１Ｒ発現のノーザンブロット分析の画像を提供する。上のパネルは、ｍＳＡＳ１Ｒ発現を示し、下のパネルは、アクチンについての対照である。
【図３】図３は、ＥＳＴデータベース由来のヒトＳＡＳ１Ｒ発現プロファイルを示す。
【図４】図４は、免疫学的局在決定技術を使用して、ＳＡＳ１Ｒが悪性ミュラー管混合腫瘍（ＭＭＭＴ）において実際発現されることを実証する。左のパネル／顕微鏡写真−対照；右のパネル／顕微鏡写真−試験。
【図５】図５は、免疫学的局在決定技術を使用して、ＳＡＳ１Ｒが悪性ミュラー管混合腫瘍（ＭＭＭＴ）において実際発現されることを実証する。左のパネル／顕微鏡写真−対照；右のパネル／顕微鏡写真−試験。
【図６】図６は、免疫学的局在決定技術を使用して、ＳＡＳ１Ｒがまた類内膜癌においても発現されることを実証する。左のパネル／顕微鏡写真−対照；右のパネル／顕微鏡写真−試験。
【図７】図７は、ＳＡＳ１Ｒに対するＭＭＴの配列比較図を提供する。亜鉛リガンディング（ｌｉｇａｎｄｉｎｇ）のためのＨｉｓ三連構造ならびに活性部位グルタミン酸（アスタシン特異的グルタミン酸、ＲＸＤＲＤ、ＭｅｔおよびＴｙｒ残基）の保存が示される。ＭＭＰおよびアスタシンプロテイナーゼファミリーとの間で配列類似性はほとんどなかった。
【図８】図８は、パネルＡ〜Ｄを含み、ＳＡＳ１Ｒの構造モデルを提供する。Ｚｎ結合活性部位のくぼみは、両側の２つの別個のＮ末端およびＣ末端ドメインによって形成され、進化的に保存されたヒスチジン残基（右側、カラー版の緑色）が沿って並ぶ。強調表示した４つの高度に保存されたヒスチジンのうち、それらのうちの３つ（Ｈ１６１、Ｈ１６５、およびＨ１７１）が、Ｚｎ配位（モデルのカラー版の青緑色のボール）に関与することが高信頼度で予測される。
【図９】図９は、疾患進行の間の一連の癌介入における癌バイオマーカーの役割の略図を提供する。
【図１０】図１０は、プライマー１および２による、２つのＭＭＭＴ子宮腫瘍細胞株および正常な対照（ＭＭＭＴ３０８、ＭＭＭＴ５３９、およびＭＡＤ１０）についてのＰＣＲ増幅の電気泳動結果を実証する。２３７ｂｐ−上のゲル；１３０ｂｐ  ＧＡＰＤＨ対照−下のゲル
【図１１】図１１は、プライマー３および４についての、２つのＭＭＭＴ子宮腫瘍細胞株および正常な対照（ＭＭＭＴ３０８、ＭＭＭＴ５３９、およびＭＡＤ１０）についてのＰＣＲ増幅の電気泳動結果を実証する。３０９ｂｐ−上のゲル；１３０ｂｐ  ＧＡＰＤＨ対照−下のゲル
【図１２】図１２は、プライマー５および６についての、２つのＭＭＭＴ子宮腫瘍細胞株および正常な対照（ＭＭＭＴ３０８、ＭＭＭＴ５３９、およびＭＡＤ１０）についてのＰＣＲ増幅の電気泳動結果を実証する。５７９ｂｐ−上のゲル；１３０ｂｐ  ＧＡＰＤＨ対照−下のゲル
【図１３】図１３は、ＭＭＭＴ３０８Ｆの配列分析の結果を実証する。
【図１４】図１４は、ＭＭＭＴ３０８Ｒの配列分析の結果を実証する。
【図１５】図１５は、ＭＭＭＴ５３９Ｆの配列分析の結果を実証する。
【図１６】図１６は、ＭＭＭＴ５３９Ｒの配列分析の結果を実証する。
【図１７】図１７は、顕微鏡写真Ａ〜Ｄを含み、間接免疫蛍光法を使用する、ＭＭＭＴ３０８およびＭＭＭＴ５３９細胞株におけるＳＡＳ１Ｒの発現の対照（免疫前）の結果を提供する（パネルＡ〜Ｄ；上−３０８；下−５３９；ＡおよびＣ−位相差；ＢおよびＤ−免疫前）。
【図１８】図１８は、顕微鏡写真Ａ〜Ｄを含み、ＭＭＭＴ３０８の免疫染色についてのＢＦ（Ａ）、ＤＡＰＩ（Ｂ）、ＦＩＴＣ（Ｃ）、およびマージ（Ｄ）画像を提供する。
【図１９】図１９は、顕微鏡写真Ａ〜Ｄを含み、ＭＭＭＴ５３９の免疫染色についてのＢＦ（Ａ）、ＤＡＰＩ（Ｂ）、ＦＩＴＣ（Ｃ）、およびマージ（Ｄ）画像を提供する。
【図２０】図２０は、４つのパネルを含み、ＭＭＭＴ５３９の免疫染色についてのアクチン（Ａ）、ＤＡＰＩ（Ｂ）、ＦＩＴＣ（Ｃ）、およびマージ（Ｄ）画像を提供する。
【図２１】ヒト癌細胞および対照におけるＳＡＳ１Ｒ遺伝子発現の電気泳動法の結果を実証する。５７９ｂｐの触媒ドメイン産物。ブロットは、肺癌細胞株ＮＣＩ−Ｈ２２６（Ｌｎ−１）およびＡ５４９（Ｌｎ−２）、ＨＥＫ−２９３（Ｌｎ−３）、ヒト卵巣（Ｌｎ−４）、ＭＭＭＴ５３９（Ｌｎ−５）、対照の水（Ｌｎ−６）における５７９ｂｐのヒトＳＡＳ１Ｒ触媒ドメインのＰＣＲ増幅を示し、標準物質ラダーは、Ｌｎ−７に示す。
【図２２】図２２は、４つの顕微鏡写真（Ａ〜Ｄ）の画像を含み、免疫抗体によりプローブした培養物中の固定非透過処理ヒト肺腺癌細胞株Ａ５４９細胞におけるＳＡＳ１Ｒ局在の結果を示す。左上−位相差；右上−ＤＡＰＩ（核）のみ；左下−ＤＡＰＩおよびＳＡＳ１Ｒ；右下−ＳＡＳ１Ｒのみ
【図２３】図２３は、３つの顕微鏡写真（Ａ〜Ｃ）の画像を含み、免疫前抗体によりプローブした固定非透過処理ヒト肺腺癌細胞株Ａ５４９細胞におけるＳＡＳ１Ｒ局在研究の結果を示す。Ａ−位相差；Ｂ−ＤＡＰＩ（カラー写真の青色）；ＳＡＳ１Ｒ−（カラー写真の緑色）。図２３Ｃは、ネガティブ対照を示す。
【図２４】図２４は、３１０ｂｐ産物（上のパネル）を増幅するＣ−末端特異的プライマーを使用する、ＳＡＳ１Ｒ発現の電気泳動法の画像である。１０の卵巣腫瘍（レーン識別−Ｔ１〜Ｔ１０）を分析し、すべて、ＳＡＳ１Ｒを発現した。正常な卵巣組織試料対照（ＨＯ）もまた、ＳＡＳ１Ｒ転写物の存在を実証した。上のパネルは３１０ｂｐ産物を示し、下のパネルは、ＧＡＰＤＨ対照を示す。
【図２５】図２５は、子宮腫瘍および正常な子宮におけるＳＡＳ１Ｒ発現の電気泳動法の画像を提供する（上および下のパネル）。３１０ｂｐ産物を増幅するＣ−末端特異的プライマーは、発現を検出するために使用した。上のパネルは３１０産物を示し、下のパネルは、ＧＡＰＤＨ対照を示す。ＮＵ−正常な子宮の試料。ＳＡＳ１Ｒ転写物は、７つのグレード１子宮腫瘍のうちの７（７／７）において検出された。ＳＡＳ１Ｒ転写物は、４つのグレード３子宮腫瘍のうちの１つ（１／４）において検出された。ＳＡＳ１Ｒ転写物は、正常な子宮の組織において検出可能ではなかった。
【図２６】図２６は、対照子宮内膜細胞株（ＭＡＤ１０）と比較した、ＭＭＭＴ３０８およびＭＭＭＴ５３９癌細胞株についての３１０ｂｐ  ＳＡＳ１Ｒ産物の検出の電気泳動法の画像を提供し、９９％の同一性によりＳＡＳ１Ｒ遺伝子配列を確認し、ＭＭＭＴ癌細胞株について上記に記載される結果を検証する。上のパネルは、３１０ｂｐ  ＳＡＳ１Ｒ産物を示し、下のパネルは、ＧＡＰＤＨ対照を示す。
【図２７】図２７は、図２７Ａ〜２７Ｆ（それぞれ４つのパネル）を含み、ＭＭＴ腫瘍細胞におけるＳＡＳ１Ｒの細胞表面局在を示す、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれるウサギポリクローナル抗体により染色されている生細胞の画像を示す。パネル２７Ａ、Ｃ、およびＥは、免疫前血清により染色されている。パネルＢ、Ｄ、およびＦは、ＳＡＳ１Ｒに対する免疫血清により染色する。４つの列は、左から右に、図２７Ａ〜２７Ｆについて、ＤＡＰＩ染色、アクチンについての染色、ＳＡＳ１Ｒ染色、およびマージを示す。細胞核は、ＤＡＰＩにより対比染色した。ファロイジン（赤色の染色）は、細胞骨格アクチンタンパク質の局在を決定するために使用した。細胞株ＭＭＭＴ５３９（パネルＡ）、ＭＭＭＴ３０８（パネルＣ）、および対照子宮内膜細胞株ＭＡＤ１０（パネルＥ）が免疫前血清により染色される場合、免疫染色は見られない。しかしながら、別個の細胞表面局在は、免疫後血清により、ＭＭＭＴ５３９（パネルＢ）およびＭＭＭＴ３０８（パネルＤ）で観察された。免疫染色は、免疫後血清により、対照子宮内膜細胞株ＭＡＤ１０（パネルＦ）で観察されなかった。同様の結果は、肺癌細胞株の生染色を使用して得られた（ここに示さず）。
【図２８】図２８は、パネルＡ、Ｂ、およびＣを含み、ＳＡＳ１Ｒについての培養物におけるＭＭＭＴ細胞の生染色の結果を示し、細胞表面発現だけではなく、細胞形状の変化もまた実証する３つの顕微鏡写真の画像を示す。パネルＡは、ウサギポリクローナル抗血清を使用する、ＳＡＳ１Ｒの細胞表面局在を実証する（カラー図の緑色）。染色は、免疫前血清により観察されず、細胞形状およびアクチン細胞骨格分布の明らかな変化はなかった（パネルＢ）。最初にパラホルムアルデヒドにより固定し、次いで、免疫血清により免疫染色した場合、細胞は、ＳＡＳ１Ｒの細胞質内分布を示し、核周囲領域にＳＡＳ１Ｒが集中した。同じパネルにおいて、細胞がそれらの多角形形状を維持し、アクチン細胞骨格分布の変化がないことに注目されたい（パネルＣ）。
【図２９】図２９は、癌細胞の細胞死を誘発するために抗ＳＡＳ１Ｒ抗体を使用することができるかどうかを決定する実験の結果をグラフで示したものである。７０％の培養密度のＭＭＭＴ５３９細胞は、熱不活性化免疫および免疫前ウサギポリクローナル抗体と共に一晩インキュベートし、次いで、外因性不活性または活性補体タンパク質に曝露した。縦軸は、細胞指標、死亡および／またはアポトーシスの測定値を示す。横軸は、時間を示す。Ｒｂ−ウサギ；Ｒｂ  ｐＡｂ−ウサギポリクローナル抗体。対照群（カラーのグラフのオレンジ色の線）は、培地のみの細胞を示した。
【図３０】図３０は、ＳＡＳ１Ｒが、化学療法のための薬の標的になり得る（ｄｒｕｇａｂｌｅ）が、卵巣幹細胞に危害を加えない卵母細胞特異的酵素であることを示す略図である。
【図３１】図３１は、卵巣癌幹細胞におけるＳＡＳ１Ｒ発現の電気泳動結果を示す。Ｒ１８２は、ヒト卵巣幹細胞集団のクローンであり、Ｍ／Ｓ／Ｔ１８２は、Ｒ１８２の分化細胞株である。レーンＲ１８２のみが、予期されるＳＡＳ１Ｒアンプリマー（ａｍｐｌｉｍｅｒ）を示し、他の３つの細胞集団が、おそらく、幹細胞性の特性を失ったことを示す。ヒトＧＡＰＤＨは、ローディング対照として働くように使用した。Ｄ／Ｗは、プライマー特異性をチェックするための水対照である。
【図３２】図３２は、画像３２Ａおよび３２Ｂを含み、血清中のヒトＳＡＳ１Ｒを検出するウエスタンブロット分析の画像を示す。ヒト血清に、０ｎｇ／ｍｌ（対照）〜１００ｎｇ／ｍｌの範囲の、様々な濃度の組換えヒトＳＡＳ１Ｒを加えた。ウサギポリクローナル抗体（免疫前−図３２Ａ；および免疫−図３２Ｂ）は、ウエスタンブロット分析およびＥＬＩＳＡによってタンパク質の存在を検出するために使用した。分子量標準物質は、各ブロットの左のレーンに提供する。３６ｋＤａの免疫血清（図３２Ｂ）の特異的な免疫染色が存在し、試験した最低の濃度（１０ｎｇ／ｍｌ）でさえ、シグナルが検出された。シグナルは、ＳＡＳ１Ｒを添加しなかった対照レーンにおいて検出されなかった（免疫前−図３２Ａ）。
【図３３】図３３は、ヒト血清中のヒトＳＡＳ１Ｒレベルを検出し、測定するＥＬＩＳＡアッセイの結果をグラフで示す。ヒト血清に、０ｎｇ／ｍｌ（対照）〜２００ｎｇ／ｍｌの範囲の、様々な濃度の組換えヒトＳＡＳ１Ｒを加えた。比例関係は、試験したすべての範囲のシグナルについて見ることができ（２０〜２００ｎｇ／ｍｌ）、バックグラウンドに対する陽性のシグナルの比（免疫前に対する免疫）は、使用したＳＡＳ１Ｒの最低のレベル（２０ｎｇ／ｍｌ）でさえかなり高度である。吸光度は６０５ｎｍとした。群は、右から左に、ブランク、２００ｎｇ／ｍｌ  ＳＡＳ１Ｒ、１６０ｎｇ／ｍｌ  ＳＡＳ１Ｒ、８０ｎｇ／ｍｌ  ＳＡＳ１Ｒ、４０ｎｇ／ｍｌ  ＳＡＳ１Ｒ、２０ｎｇ／ｍｌ  ＳＡＳ１Ｒ、および０ｎｇ／ｍｌ  ＳＡＳ１Ｒを含む。各群の左のバーは、「免疫前」を示し、各群の右のバーは、「免疫」を示す。
【図３４】図３４は、左（Ａ）および右（Ｂ）パネルを含み、モルモットポリクローナル抗ヒトＳＡＳ１Ｒ抗体を使用する、肺癌Ｈ２２６およびＡ５４９細胞株由来のタンパク質抽出物のウエスタンブロッティングの画像を提供する。それらは、肺癌細胞株Ｈ２２６およびＡ５４９の両方における完全長（４６ｋＤ）および切断型ＳＡＳ１Ｒタンパク質の発現を示す。
【図３５】図３５は、４つのパネルを含み、ヒトまたはマウスＳＡＳ１Ｒとの、ヒトＳＡＳ１Ｒに対して生成されたマウスモノクローナル抗体の反応性のウエスタンブロット分析の画像を提供する。５つのマウスモノクローナル抗体（ＳＢ１、ＳＢ２、ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５）を、組換えヒトＳＡＳ１Ｒに対して産生した。４つをこの図に示す：ＳＢ１（左／第１のパネル）；ＳＢ２−第２のパネル；ＳＢ３−第３のパネル；ＳＢ４−第４のパネル。モノクローナル抗体は、ヒト（Ｈ）およびマウス（Ｍ）ＳＡＳ１Ｒに対するそれらの活性について試験した。分子量標準物質を同様に提供する。ウエスタンブロット分析は、ｍＡｂ  ＳＢ１およびＳＢ２が、ヒトおよびマウスＳＡＳ１Ｒの両方を認識したが、ｍＡｂ  ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５がヒトＳＡＳ１Ｒとのみ反応することを実証した。ブロットでは、精製組換えヒトＳＡＳ１Ｒが、自己タンパク分解により複数のペプチドを示したことに注意されたい。
【図３６】図３５は、４つのパネルを含み、ヒトまたはマウスＳＡＳ１Ｒとの、ヒトＳＡＳ１Ｒに対して生成されたマウスモノクローナル抗体の反応性のウエスタンブロット分析の画像を提供する。５つのマウスモノクローナル抗体（ＳＢ１、ＳＢ２、ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５）を、組換えヒトＳＡＳ１Ｒに対して産生した。ＳＢ５（左／第１のパネル）；ＳＢ１−第２のパネル；ｈＳＡＳ１Ｒポリクローナル抗体−第３のパネル；マウスＩｇＧ対照−第４のパネル。それらは、ヒト（Ｈ）およびマウス（Ｍ）ＳＡＳ１Ｒに対する活性について試験した。分子量標準物質を提供する。ウエスタンブロット分析は、ｍＡｂ  ＳＢ１およびＳＢ２が、ヒトおよびマウスＳＡＳ１Ｒの両方を認識したが、ｍＡｂ  ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５がヒトＳＡＳ１Ｒとのみ反応することを実証した。
【図３７】図３７は、Ｗｅｉｒ肺におけるＡＳＴＬ（ＳＡＳ１Ｒをコードする遺伝子）遺伝子コピー数の分析をグラフで示したものである。Ｗｅｉｒ，ｅｔ  ａｌ．（２００７，Ｎａｔｕｒｅ，４５０，８９３−８９８）は、遺伝子チップアレイデータセットを委託した。次いで、これらのデータセットは、Ｏｎｃｏｍｉｎｅを使用してＡＳＴＬについて本明細書において調べた。分析は、癌タイプによって分類される第９０百分位数の異常値分析である。縦軸は、ｌｏｇ２コピー数単位を示す。データは、３７１の肺腺癌を示す。ＤＮＡ−１８，８２３の測定遺伝子；ＲｅｆＳｅｑ  Ｇｅｎｅｓ−ＵＣＳＣ  ｒｅｆＧｅｎｅ、２００９年７月、ｈｇ１８、ＮＣＢＩ  ３６．１、２００６年３月；Ｃｏｐｙ  Ｎｕｍｂｅｒ  Ｇｅｎｅ  Ｒａｎｋ−１３８９（トップ８％）；ＣＯＰＡ−３．１５４；Ｒｅｐｏｒｔｅｒ−０２−０９６１６０６０８。
【発明を実施するための形態】
【００４６】
略語と頭文字
ａ．ａ．−アミノ酸（複数可）
ＡＤＥＰＴ−抗体指向性酵素プロドラッグ療法（ａｎｔｉｂｏｄｙ−ｄｉｒｅｃｔｅｄ  ｅｎｚｙｍｅ  ｐｒｏｄｒｕｇ  ｔｈｅｒａｐｙ）
ＡＳＴＬ−アスタシン様タンパク質；この名称は、現在一般的であり、使用され、認められており、オバスタシン、ＺＥＰ、ＳＡＳ１Ｒ、およびＳＡＳ１Ｂとも呼ばれる同じタンパク質を指す
ＢＳＡ−ウシ血清アルブミン
ＣＤＣ−補体依存性細胞障害作用
Ｃｏ−ＩＰ−免疫共沈降
ＦＩＴＣ−フルオレセインイソチオシアネート
ＦＲＥＴ−蛍光共鳴エネルギー転移
ＦＷ−ファーウエスタン
ＧＶ−胚胞
ｈ−ヒト（また時間）
ＨＥＫ−ヒト胎児腎臓
ＨＰＬＣ−逆相高圧液体クロマトグラフィー
ＨＳ−高ストリンジェンシー
Ｉ−誘発または免疫
ＩＦ−間接免疫蛍光法
ＩＰ−免疫沈降
ＩＰＴＧ−イソプロピル−β−Ｄ−チオガラクトピラノシド
ＬＢ−Ｌｕｒｉａ培地
ＬＣ／ＭＳは、液体クロマトグラフィー／質量分析法を意味する
ＬＮＡ−ロックド核酸
ＬＳ−低ストリンジェンシー
ＩＭ−免疫
ｍ−マウス
ＭＥＴ−マウス卵特異的ＴｏｌＡ（仮出願ではコリシン様取り込みタンパク質またはコリシン取り込みタンパク質と呼ばれる）
ｍｉｎ−分
ｍｉＲＮＡ−マイクロＲＮＡ
ＭＭＭＴ−悪性ミュラー管混合腫瘍
ＮＧＳ−正常ヤギ血清
ＯＬ−オーバーレイ
Ｐ−精製
ＰＩ−免疫前
ＰＢＳ−リン酸緩衝食塩水
ＰＢＳＴ−０．０５％  Ｔｗｅｅｎ  ２０を有するリン酸緩衝食塩水
ＰＶＡ−ポリビニルアルコール
ｒｅｃ−組換え（ｒｅｃは、「ｒ」と区別なく使用される）
ＳＡＳ１Ｒ−精子先体ＳＬＬＰ１受容体；以前はＺＥＰと呼ばれており、Ｑｕｅｓａｄａ  ｅｔ  ａｌ．によって最初に発見され、「オバスタシン」と称された；ＳＡＳ１Ｂとも呼ばれる；ＳＡＳ１Ｒをコードする遺伝子はＡＳＴＬと呼ばれる
ｒＳＡＳ１Ｒ−組換えＳＡＳ１Ｒ
ｓｅｃ−秒（複数可）
ＳＬＬＰ−精子リゾチーム様タンパク質
ＳＰＥＣＴ−単一光子放射型コンピューター断層撮影法
ＳＰＲ−表面プラズモン共鳴
Ｕ−非誘発
ＺＥＰ−亜鉛エンドペプチダーゼ（仮出願において亜鉛ペプチダーゼまたはＺＰと呼ばれる；ＳＡＳ１Ｒ、ＳＡＳ１Ｂ、オバスタシン、およびＡＳＴＬと区別なく使用される）
ＺＦＥ−透明帯除去（ｚｏｎａ  ｆｒｅｅ）卵
ＺＩＥ−透明帯がインタクトな卵
【００４７】
使用される配列番号および対応する名称の概要
配列番号
配列番号１−マウス（「ｍ」）ＭＥＴ正常核酸配列
配列番号２−マウスＭＥＴ正常アミノ酸配列
配列番号３−マウスＭＥＴ変異体核酸配列
配列番号４−マウスＭＥＴ変異体アミノ酸配列
配列番号５−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体２正常核酸配列（もとはＺＥＰ−正常と称された）
配列番号６−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体２正常アミノ酸配列（もとはＺＥＰ−正常と称された）
配列番号７−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体５核酸配列（もとはＺＥＰ変異体１と称された）
配列番号８−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体５アミノ酸配列（もとはＺＥＰ変異体１と称された）
配列番号９−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体３核酸配列（もとはＺＥＰ変異体２と称された）
配列番号１０−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体３アミノ酸配列（もとはＺＥＰ変異体２と称された）
配列番号１１−マウスＳＬＬＰ１核酸配列
配列番号１２−マウスＳＬＬＰ１アミノ酸配列
配列番号１３−ヒト（「ｈ」）ＳＬＬＰ１核酸配列
配列番号１４−ヒトＳＬＬＰ１アミノ酸配列
配列番号１５−マウスＳＬＬＰ２核酸配列
配列番号１６−マウスＳＬＬＰ２成熟タンパク質アミノ酸配列
配列番号１７−ヒトＳＬＬＰ２核酸配列
配列番号１８−ヒトＳＬＬＰ２アミノ酸配列
配列番号１９−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体１アミノ酸配列
配列番号２０−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体４アミノ酸配列
配列番号２１−マウスＳＡＳ１Ｒ変異体６アミノ酸配列
配列番号２２−ヒトＳＡＳ１Ｒ核酸配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿００１００２０３６、１２９６ｂｐ  ｍＲＮＡ）
配列番号２３−ヒトＳＡＳ１Ｒアミノ酸配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＰ＿００１００２０３６．３、４３１アミノ酸）
配列番号２４−ＨＥＬＭＨＶＬＧＦＷＨ（Ｚｎ配位のためのヒスチジン残基および保存触媒残基を有するＳＡＳ１Ｒにおけるモチーフ、Ｅ［グルタミン酸］は、モチーフＳＶＭＨＹ（配列番号２５）中に埋め込まれているチロシン亜鉛リガンドと共に触媒ポケットの一部を形成する）
配列番号２５−ＳＶＭＨＹ（触媒ポケットと関連するＳＡＳ１Ｒにおけるモチーフ）
配列番号２６−ＨＥＸＸＨＸＸＧＸＸＨ（配列番号２４のコンセンサスモチーフは、そのモチーフの機能を除去しない「Ｘ」によって示される任意のアミノ酸と置換することができる残基を有することができる） 配列番号２７−ＳＸＭＨＹ（配列番号２５のコンセンサスモチーフは、そのモチーフの機能を除去しない「Ｘ」によって示される任意のアミノ酸と置換することができる残基を有することができる）
配列番号28-  1F プライマー-  GCGCCCCTGGCCTCCAGCTGCGCA 配列番号29-  2R プライマー-  CACGACACCACTACCACCCATGGG 配列番号30-  3F プライマー-  GGCTGCAGCCCAAGTGGCCCCAGG 配列番号31-  4R プライマー-  AGCAACACCGGGGGCACCTGCTCC 配列番号32-  5F プライマー-  GAGGTCCCCTTCCTGCTCTCCAGC 配列番号33-  6R プライマー-  GGCATGGGACCCTCTCCCACGGGG。
【００４８】
配列番号１〜１８は、国際特許出願ＷＯ  ２００６／０９１５３５の配列番号１〜１８と同じ配列である（ＰＣＴ／ＵＳ２００６／００５９７０；Ｍａｎｄａｌ  ｅｔ  ａｌ．；２００６年８月３１日に公開）、この中で、ＳＡＳ１Ｒは、ＺＥＰと呼ばれた。ＷＯ  ２００６／０９１５３５は、本明細書においてその全体が参照によって組み込まれる。
【００４９】
配列番号１〜２７は、１１／６／０９に出願され、ＷＯ  ２０１０／０５４１８７として２０１０年５月１４日に公開された国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ／２００９／０６３５４０（Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．）において使用される同じ２７の配列である。米国出願（１２／６１３，９４７）は、公開ＵＳ２０１０／０１８３６１７として７／２２／１０に公開されたＰＣＴ出願に対する優先権を主張する。
【００５０】
配列番号２８〜３３は、ＳＡＳ１Ｒを検出するための新規なプライマーである。
【００５１】
定義
本発明を記載し、主張する際に、以下の術語は、下記に記載される定義に従って使用される。
【００５２】
冠詞「１つの（ａ）」および「１つの（ａｎ）」は、１つのまたは１つを超える（つまり少なくとも１つの）、冠詞の文法上の目的語を指すために本明細書において使用される。例として、「エレメント」は、１つのエレメントまたは１つを超えるエレメントを意味する。
【００５３】
本明細書において使用される「約」という用語は、およそ、の範囲の、ほぼ、またはくらいを意味する。「約」という用語が、数の範囲と共に使用される場合、それは、記載される数値以上および以下に範囲を広げることによってその範囲を修飾する。一般に、「約」という用語は、１０％の変動によって指定の値以上および値以下に数値を修飾するために本明細書において使用される。一態様では、「約」という用語は、それが使用されている数の数値のプラスまたはマイナス２０％を意味する。そのため、約５０％は、４５％〜５５％の範囲を意味する。終点によって本明細書において記載される数の範囲は、すべての数およびその範囲内に含められる小数を含む（たとえば、１〜５は、１、１．５、２、２．７５、３、３．９０、４、および５を含む）。すべての数およびその小数は、「約」という用語によって修飾されると考えられることもまた、理解されたい。
【００５４】
本発明との関連において使用される「さらなる治療活性化合物」または「さらなる治療剤」という用語は、治療されている特定の外傷、疾患、または障害についてのさらなる治療上の使用のための化合物の使用または投与を指す。そのような化合物は、たとえば、関連しない疾患もしくは障害または治療されている外傷、疾患、もしくは障害のための一次治療に対して応答性ではないかもしれない疾患もしくは障害を治療するために使用される化合物を含むことができる。
【００５５】
本明細書において使用される「アジュバント」という用語は、特異的抗原と組み合わせて使用される場合に免疫応答の増強を誘発する物質を指す。
【００５６】
本明細書において使用される、化合物「の投与」または「を投与すること」という用語は、本発明の化合物または本発明の化合物のプロドラッグを治療を必要とする対象に提供することを意味することを理解されたい。
【００５７】
本明細書において使用される「エアロゾル」という用語は、空気中の懸濁液を指す。特に、エアロゾルは、本発明の製剤の粒子化または噴霧化および空気中のその懸濁液を指す。
【００５８】
本明細書において使用される「アゴニスト」は、ヒトなどのような哺乳動物に投与された場合に、哺乳動物における対象とする標的化合物または分子のレベルまたは存在に起因し得る生物学的活性を増強するまたは広げる物質の組成物である。
【００５９】
「アンタゴニスト」は、ヒトなどのような哺乳動物に投与された場合に、哺乳動物における対象とする化合物または分子のレベルまたは存在に起因し得る生物学的活性を阻害する物質の組成物である。
【００６０】
本明細書において使用される「疾患または障害の症状を軽減する」は、症状の重症度もしくはそのような症状を患者が経験する頻度またはその両方を低下させることを意味する。
【００６１】
本明細書において使用されるように、アミノ酸は、以下の表において示されるように、そのフルネームによって、それに対応する３文字コードによって、またはそれに対応する１文字コードによって示される。
フルネーム          ３文字コード  １文字コード
アスパラギン酸        Ａｓｐ          Ｄ
グルタミン酸          Ｇｌｕ          Ｅ
リシン                Ｌｙｓ          Ｋ
アルギニン            Ａｒｇ          Ｒ
ヒスチジン            Ｈｉｓ          Ｈ
チロシン              Ｔｙｒ          Ｙ
システイン            Ｃｙｓ          Ｃ
アスパラギン          Ａｓｎ          Ｎ
グルタミン            Ｇｌｎ          Ｑ
セリン                Ｓｅｒ          Ｓ
トレオニン            Ｔｈｒ          Ｔ
グリシン              Ｇｌｙ          Ｇ
アラニン              Ａｌａ          Ａ
バリン                Ｖａｌ          Ｖ
ロイシン              Ｌｅｕ          Ｌ
イソロイシン          Ｉｌｅ          Ｉ
メチオニン            Ｍｅｔ          Ｍ
プロリン              Ｐｒｏ          Ｐ
フェニルアラニン      Ｐｈｅ          Ｆ
トリプトファン        Ｔｒｐ          Ｗ
【００６２】
「アミノ酸」という用語は、「アミノ酸残基」と区別なく使用され、遊離アミノ酸およびペプチドのアミノ酸残基を指す。それが遊離アミノ酸またはペプチドの残基を指すかどうかは、用語が使用される文脈から明らかであろう。
アミノ酸は、以下の一般的な構造を有する。
【００６３】
【化１】
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【００６４】
アミノ酸は、側鎖Ｒに基づいて７つの群に分類されてもよい：（１）脂肪族側鎖、（２）ヒドロキシル（ＯＨ）基を含有する側鎖、（３）硫黄原子を含有する側鎖、（４）酸性またはアミド基を含有する側鎖、（５）塩基性基を含有する側鎖、（６）芳香環を含有する側鎖、および（７）プロリン、側鎖がアミノ基に融合されているイミノ酸。
【００６５】
本発明のペプチド化合物を記載するために使用される命名法は、通常の方式に従い、アミノ基は、それぞれのアミノ酸残基の左に、カルボキシ基は、右に示される。本発明の選択される特定の実施形態を示す式において、アミノおよびカルボキシ末端基は、特に示されないが、特別の定めのない限り、それらが生理学的ｐＨ値でとる形態をしていることが理解されるであろう。
【００６６】
本明細書において使用される「塩基性」という用語または「正電荷」アミノ酸は、Ｒ基がｐＨ７．０で正味の正電荷を有するアミノ酸を指し、標準アミノ酸リシン、アルギニン、およびヒスチジンを含む。
【００６７】
本明細書において使用されるように、化学化合物の「アナログ」は、例として、構造が他のものに似ているが、必ずしも異性体ではない化合物である（たとえば、５−フルオロウラシルは、チミンのアナログである）。
【００６８】
本明細書において使用される「抗体」という用語は、抗原上の特異的なエピトープに特異的に結合することができる免疫グロブリン分子を指す。抗体は、天然の供給源または組換えの供給源に由来するインタクトな免疫グロブリンとすることができ、インタクトな免疫グロブリンの免疫反応性部分とすることができる。抗体は、典型的に、四量体の免疫グロブリン分子である。本発明における抗体は、たとえば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、Ｆｖ、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ）２ならびに単鎖抗体およびヒト化抗体を含む様々な形態で存在してもよい。
【００６９】
本明細書において使用される「抗体重鎖」は、すべての抗体分子において存在する２つのタイプのポリペプチド鎖の大きな方を指す。
【００７０】
本明細書において使用される「抗体軽鎖」は、すべての抗体分子において存在する２つのタイプのポリペプチド鎖の小さな方を指す。
【００７１】
本明細書において使用される「合成抗体」という用語は、たとえば、本明細書において記載されるようにバクテリオファージによって発現される抗体などのような、組換えＤＮＡ技術を使用して生成される抗体を意味する。用語はまた、抗体タンパク質を発現する、抗体をコードするＤＮＡ分子または抗体を特定するアミノ酸配列の合成によって生成される抗体を意味するようにも解釈されたい、ここで、ＤＮＡまたはアミノ酸配列は、当技術分野において入手可能であり、よく知られている合成ＤＮＡまたはアミノ酸配列技術を使用して得られる。
【００７２】
本明細書において使用される「抗原」という用語は、免疫応答を引き起こす分子として定義される。この免疫応答は、抗体産生もしくは特異的な免疫適格細胞の活性化またはその両方を含んでいてもよい。抗原は、生物、タンパク質／抗原のサブユニット、死滅したもしくは不活性化された細胞全体、または溶解物に由来してもよい。
【００７３】
本明細書において使用される「抗原決定基」という用語は、特定の抗体と接触する抗原のその部分（つまりエピトープ）を指す。タンパク質もしくはタンパク質の断片または化学成分が宿主動物を免疫化するために使用される場合、抗原の多数の領域は、タンパク質上の所定の領域または三次元構造に特異的に結合する抗体の産生を誘発してもよく、これらの領域または構造は、抗原決定基と呼ばれる。抗原決定基は、インタクトな抗原（つまり、免疫応答を誘発するために使用される「免疫原」）と抗体への結合について競合してもよい。
【００７４】
本明細書において使用される「抗菌剤」という用語は、任意の天然に存在する、合成、もしくは半合成化合物もしくは組成物またはその混合物を指し、これは、本発明の方法において実施されるヒトまたは動物での使用にとって安全であり、微生物を死滅させるまたはその成長を実質的に阻害するのに有効である。本明細書において使用される「抗菌薬」は、抗菌剤、抗真菌剤、および抗ウイルス剤を含む。
【００７５】
本明細書において使用される「アンチセンスオリゴヌクレオチド」という用語、またはアンチセンス核酸は、その少なくとも１つの部分が、正常細胞または罹患細胞において存在する核酸に対して相補的である核酸ポリマーを意味する。「アンチセンス」は、特に、タンパク質をコードする二本鎖ＤＮＡ分子の非コード鎖の核酸配列または非コード鎖に対して実質的に相同な配列を指す。本明細書において定義されるように、アンチセンス配列は、タンパク質をコードする二本鎖ＤＮＡ分子の配列に対して相補的である。アンチセンス配列は、もっぱらＤＮＡ分子のコード鎖のコード部分に対して相補的である必要がない。アンチセンス配列は、タンパク質をコードするＤＮＡ分子のコード鎖上で特定される調節配列に対して相補的であってもよく、この調節配列は、コード配列の発現を制御する。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドの他の修飾体を含むが、これらに限定されない。
【００７６】
「アプタマー」は、他の化合物（たとえば、本明細書において同定されるタンパク質）に対して優先的にインビトロで結合するように選択される化合物である。多くの場合、アプタマーは、大量のヌクレオチドまたはアミノ酸（天然に存在するまたは合成的に生成されるものの両方）からランダム配列を容易に生成することができるので、核酸またはペプチドであるが、もちろん、これらに限定される必要はない。
【００７７】
「結合」という用語は、これらに限定されないが、基質に対する酵素、受容体に対するリガンド、抗原に対する抗体、ＤＮＡに対するタンパク質のＤＮＡ結合ドメイン、および相補鎖に対するＤＮＡまたはＲＮＡ鎖などのような、互いの分子の付着を指す。
【００７８】
本明細書において使用される「結合パートナー」は、他の分子に結合することができる分子を指す。
【００７９】
本明細書において使用される「生体適合性」という用語は、宿主において実質的な有害な応答を誘発しない物質を指す。
【００８０】
本明細書において使用されるように、ポリペプチドの「生物学的活性断片」または「生物活性断片」という用語は、それらの天然リガンドへの特異的な結合またはタンパク質の機能の実行が可能である、完全長タンパク質の天然または合成部分を包含する。
【００８１】
本明細書において使用される「生物学的試料」という用語は、皮膚、毛、組織、血液、血漿、細胞、汗、および尿を含むが、これらに限定されない、対象から得られる試料を指す。
【００８２】
「Ｃ１９」および「Ｃ２３」は、「ＳＬＬＰ１」および「ＳＬＬＰ２」について使用される名称である。
【００８３】
本明細書において使用される「癌」という用語は、その特有の形質−正常な制御の損失−が、無秩序な増殖、分化の欠乏、局所的な組織の浸潤、および転移をもたらす、細胞の増殖として定義される。例として、黒色腫、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、子宮癌、子宮頸癌、皮膚癌、膵臓癌、結腸直腸癌、腎臓癌、および肺癌を含むが、これらに限定されない。
【００８４】
本明細書において使用される「キャリア分子」という用語は、天然の抗原に対して特異的な抗体をもたらす免疫応答を可能にする、対象とする抗原に対して化学的にコンジュゲートされる任意の分子を指す。
【００８５】
「細胞表面タンパク質」という用語は、タンパク質の少なくとも１つの部分が細胞膜の外部の側面で曝露されるところで見つけられるタンパク質を意味する。例として、増殖因子受容体を含む。
【００８６】
本明細書において使用される「化学的にコンジュゲートされる」または「化学的にコンジュゲートする」という用語は、抗原をキャリア分子に連結することを指す。この連結は、組換え技術を使用して遺伝的なレベルで生じ得、抗原およびキャリア分子の両方のアミノ酸配列またはその部分を含有するハイブリッドタンパク質が産生されてもよい。このハイブリッドタンパク質は、抗原およびキャリア分子の両方またはその部分をコードするオリゴヌクレオチド配列によって産生される。この連結はまた、これに限定されないがグルタルアルデヒド反応などのような他の化学反応を使用して抗原およびキャリアタンパク質の間で生成される共有結合をも含む。共有結合はまた、キャリア分子に抗原を架橋する第３の分子を使用して生成されてもよい。これらの架橋剤は、これらに限定されないが、抗原およびキャリア分子上の第一級アミン、スルフヒドリル、カルボニル、炭水化物、またはカルボン酸などのような基と反応することができる。化学的コンジュゲーションはまた、抗原およびキャリア分子の間の非共有結合をも含む。
【００８７】
遺伝子の「コード領域」は、それぞれ遺伝子の転写によって産生されるｍＲＮＡ分子のコード領域と相同であるまたはそれに対して相補的である、遺伝子のコード鎖のヌクレオチド残基および遺伝子の非コード鎖のヌクレオチドからなる。
【００８８】
「競合配列」という用語は、その関連する結合部位について他のペプチドと競合するペプチドまたはその修飾体、断片、誘導体、もしくは相同体を指す。
【００８９】
本明細書において使用される「相補的」は、２つの核酸、たとえば２つのＤＮＡ分子の間のサブユニットの配列相補性についての広い概念を指す。両方の分子におけるヌクレオチド位置が、互いに塩基対形成が通常可能なヌクレオチドによって占められる場合、核酸は、この位置で互いに相補的であると考えられる。したがって、それぞれの分子における対応する位置の実質的な数（少なくとも５０％）が、互いに通常塩基対形成するヌクレオチドによって占められる場合（たとえばＡ：ＴおよびＧ：Ｃヌクレオチド対）、２つの核酸は、互いに相補的である。したがって、第１の核酸領域のアデニン残基は、残基がチミンまたはウラシルである場合、第１の領域に対してアンチパラレルである第２の核酸領域の残基と特異的な水素結合（「塩基対形成」）を形成することができることが知られている。同様に、第１の核酸鎖のシトシン残基は、残基がグアニンである場合、第１の鎖に対してアンチパラレルである第２の核酸鎖の残基と塩基対形成することができることが知られている。核酸の第１の領域は、同じまたは異なる核酸の第２の領域に対して相補的であり、２つの領域がアンチパラレルに配置される場合、第１の領域の少なくとも１つのヌクレオチド残基は、第２の領域の残基と塩基対形成ができる。好ましくは、第１の領域は第１の部分を含み、第２の領域は第２の部分を含み、それによって、第１および第２の部分がアンチパラレルに配置される場合、第１の部分の少なくとも約５０％、好ましくは少なくとも約７５％、少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％のヌクレオチド残基は、第２の部分におけるヌクレオチド残基と塩基対形成することができる。より好ましくは、第１の部分のヌクレオチド残基はすべて、第２の部分におけるヌクレオチド残基と塩基対形成することができる。
【００９０】
本明細書において使用される「化合物」は、薬剤または薬剤としての使用のための候補と一般的に考えられる任意のタイプの物質または作用物質ならびに上記のものの組み合わせおよび混合物を指す。
【００９１】
本明細書において使用される「保存的アミノ酸置換」という用語は、以下の５つの群のうちの１つの範囲内のアミノ酸交換として本明細書において定義される。
Ｉ．小さな脂肪族の、無極性のまたはわずかに極性の残基：
Ａｌａ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｐｒｏ、Ｇｌｙ；
ＩＩ．極性負電荷残基およびそれらのアミド：
Ａｓｐ、Ａｓｎ、Ｇｌｕ、Ｇｌｎ；
ＩＩＩ．極性正電荷残基：
Ｈｉｓ、Ａｒｇ、Ｌｙｓ；
ＩＶ．大きな脂肪族の無極性残基：
Ｍｅｔ  Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｖａｌ、Ｃｙｓ
Ｖ．大きな芳香族残基：
Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ
【００９２】
「対照」細胞は、試験細胞と同じ細胞型を有する細胞である。対照細胞は、たとえば、試験細胞が検査されるのと正確に同時にまたはほぼ同時に検査されてもよい。対照細胞はまた、たとえば、試験細胞が検査される時間から離れた時間に検査されてもよく、対照細胞の検査の結果は、記録された結果が試験細胞の検査によって得られた結果と比較されてもよいように、記録されてもよい。
【００９３】
「試験」細胞は、検査されている細胞である。
【００９４】
本明細書において使用される「サイトカイン」は、細胞間シグナル伝達分子を指し、これらのうちで最もよく知られているのは、哺乳動物体細胞の調節に関与する。たとえば、インターロイキン、インターフェロン、および形質転換増殖因子を含む、それらの効果が増殖促進性および増殖阻害性の両方であるサイトカインの多くのファミリーは、特徴付けられている。多くの他のサイトカインは、当業者らに知られている。これらのサイトカインの供給源、特徴、標的、およびエフェクター活性が記載されている。
【００９５】
本明細書において使用されるように、化合物の「誘導体」は、アルキル、アシル、またはアミノ基によるＨの交換においてのように、１つまたは複数の工程において類似する構造の他の化合物から産生されてもよい化学化合物を指す。
【００９６】
「検出する」という語およびその文法上の変形の使用は、定量を伴わない化学種の測定を指すのに対して、「決定する」または「測定する」という語の使用は、それらの文法上の変形と共に、定量を伴う化学種の測定を指すことを意味する。「検出する」および「同定する」という用語は、本明細書において区別なく使用される。
【００９７】
本明細書において使用される「検出可能なマーカー」または「レポーター分子」は、マーカーを有していない類似する化合物の存在下において、マーカーを含む化合物の特異的な検出を可能にする原子または分子である。検出可能なマーカーまたはレポーター分子は、たとえば、放射性同位体、抗原決定基、酵素、ハイブリダイゼーションに利用可能な核酸、発色団、蛍光団、化学発光分子、電気化学的に検出可能な分子、および蛍光偏光の改変または光散乱の改変をもたらす分子を含む。
【００９８】
本明細書において使用される「診断」という用語は、ＳＡＳ１Ｒを発現する癌による異常なＳＡＳ１Ｒ発現を検出することを指す。診断の任意の方法において、偽陽性および偽陰性が存在する。診断のいかなる方法も、１００％の精度をもたらさない。
【００９９】
「疾患」は、動物がホメオスタシスを維持することができず、疾患が回復しない場合、動物の健康が悪化し続ける、動物の健康の状態である。
【０１００】
対照的に、動物における「障害」は、動物がホメオスタシスを維持することができるが、動物の健康の状態が障害がない状態よりも良好でない、健康の状態である。未治療のままにしても、障害は、動物の健康の状態のさらなる低下を必ずしも引き起こすものではない。
【０１０１】
本明細書において使用される「ドメイン」という用語は、これらに限定されないが、疎水性、極性、球状、およびらせん状ドメインなどのような共通の物理化学的特徴またはリガンド結合、シグナル伝達、細胞浸透、およびその他同種のものなどのような特性を共有する分子または構造の一部を指す。結合ドメインの特定の例は、ＤＮＡ結合ドメインおよびＡＴＰ結合ドメインを含むが、これらに限定されない。
【０１０２】
本明細書において使用されるように、「有効量」または「治療有効量」は、疾患または障害の症状を軽減するなどのような、選択される効果をもたらすのに十分な量を意味する。複数の化合物などのような組み合わせの形態で化合物を投与する文脈では、それぞれの化合物の量は、他の化合物（複数可）と組み合わせて投与される場合、その化合物が単独で投与される場合と異なっていてもよい。したがって、化合物の組み合わせの有効量は、総合的に、全体としての組み合わせを指すが、各化合物の実際の量は、変動してもよい。「より有効な」という用語は、選択される効果が、それが比較される第２の治療に比べて、ある治療によってより大きな程度まで軽減されることを意味する。
【０１０３】
本明細書において使用される「エフェクタードメイン」という用語は、生化学的経路を調節することができる細胞質におけるエフェクター分子、化学物質、または構造と直接相互作用することができるドメインを指す。
【０１０４】
本明細書において使用される「卵タンパク質」または「卵特異的タンパク質」という語句は、卵または卵巣において独占的にまたは優位に発現されるタンパク質を指す。タンパク質は、卵または卵巣の発生のすべての段階で発現される必要はない。
【０１０５】
本明細書において使用される「エリキシル剤」という用語は、香味物質および時に活性薬用作用物質を含有する、透明で、甘く、アルコール含有の、通常ヒドロアルコール性の液体を一般に指す。
【０１０６】
「コードする」は、ヌクレオチドの定められた配列（つまりｒＲＮＡ、ｔＲＮＡ、およびｍＲＮＡ）またはアミノ酸の定められた配列を有する、生物学的プロセスにおける他のポリマーおよび高分子の合成のための鋳型として働くための、遺伝子、ｃＤＮＡ、またはｍＲＮＡなどのようなポリヌクレオチドにおけるヌクレオチドの特異的配列の固有の特性ならびにそれから生じる生物学的特性を指す。したがって、その遺伝子に対応するｍＲＮＡの転写および翻訳が細胞または他の生物系においてタンパク質を産生する場合、遺伝子は、タンパク質をコードする。ヌクレオチド配列が、ｍＲＮＡ配列と同一であり、通常、配列表に提供されるコード鎖および遺伝子またはｃＤＮＡの転写に鋳型として使用される非コード鎖の両方は、その遺伝子またはｃＤＮＡのタンパク質または他の産物をコードするものとして指すことができる。
【０１０７】
「エンハンサー」は、転写の開始部位と比べたエンハンサーの距離または方向づけにかかわらず、転写の効率を増加させることができるＤＮＡ調節エレメントである。
【０１０８】
本明細書において使用される「エピトープ」という用語は、抗体を誘発し、それと反応することができる抗原分子上の小さな化学基として定義される。抗原は、１つまたは複数のエピトープを有することができる。ほとんどの抗原は、多くのエピトープを有する、つまり、それらは、多価である。一般に、エピトープは、サイズが、ほぼ５つのアミノ酸または糖である。当業者は、一般に、分子の特異的な直線状配列ではなく、全体的な三次元構造が、抗原特異性の主な判断基準となることを理解する。
【０１０９】
本明細書において使用されるように、特定のタンパク質またはペプチドの「本質的に純粋な」調製物は、調製物中のタンパク質またはペプチドの少なくとも約９５重量％、好ましくは少なくとも約９９重量％が、特定のタンパク質またはペプチドである調製物である。
【０１１０】
「断片」または「セグメント」は、少なくとも１つのアミノ酸を含むアミノ酸配列の一部または少なくとも１つのヌクレオチドを含む核酸配列の一部である。「断片」および「セグメント」という用語は、本明細書において区別なく使用される。
【０１１１】
本明細書において使用される、タンパク質またはペプチドに適用される「断片」という用語は、通常、長さが少なくとも約３〜１５のアミノ酸、少なくとも約１５〜２５のアミノ酸、長さが少なくとも約２５〜５０のアミノ酸、長さが少なくとも約５０〜７５のアミノ酸、長さが少なくとも約７５〜１００のアミノ酸、および長さが１００を超えるアミノ酸とすることができる。
【０１１２】
本明細書において使用される、核酸に適用される「断片」という用語は、通常、長さが少なくとも約２０のヌクレオチド、典型的に、少なくとも約５０のヌクレオチド、より典型的には、約５０〜約１００のヌクレオチド、好ましくは、少なくとも約１００〜約２００のヌクレオチド、さらにより好ましくは、少なくとも約２００のヌクレオチド〜約３００のヌクレオチド、さらにより好ましくは、少なくとも約３００〜約３５０、さらにより好ましくは、少なくとも約３５０のヌクレオチド〜約５００のヌクレオチド、さらにより好ましくは、少なくとも約５００〜約６００、さらにより好ましくは、少なくとも約６００のヌクレオチド〜約６２０のヌクレオチド、さらにより好ましくは、少なくとも約６２０〜約６５０であってもよく、最も好ましくは、核酸断片は、長さが約６５０を超えるヌクレオチドであろう。
【０１１３】
本明細書において使用される「機能的な」生物学的分子は、それが特徴付けられる特性を示す形態をした生物学的分子である。機能的な酵素は、たとえば、酵素が特徴付けられる、特徴的な触媒能力を示す酵素である。
【０１１４】
本明細書において使用される「相同な」は、２つのポリマー分子の間の、たとえば、２つの核酸分子、たとえば２つのＤＮＡ分子もしくは２つのＲＮＡ分子の間のまたは２つのポリペプチド分子の間のサブユニット配列類似性を指す。２つの分子の両方におけるサブユニット位置が、同じ単量体サブユニットによって占められる場合、たとえば、２つのＤＮＡ分子のそれぞれにおける位置がアデニンによって占められる場合、それらはその位置で相同である。２つの配列の間の相同性は、マッチングするまたは相同な位置の数の直接的な関数であり、たとえば、２つの化合物の配列における位置の半分（たとえば、長さが１０のサブユニットのポリマーにおける５つの位置）が相同な場合、２つの配列は、５０％相同であり、位置の９０％、たとえば１０のうちの９つがマッチするまたは相同である場合、２つの配列は、９０％の相同性を共有する。例として、ＤＮＡ配列３’ＡＴＴＧＣＣ５’および３’ＴＡＴＧＧＣは、５０％の相同性を共有する。
【０１１５】
本明細書において使用されるように、「相同性」は、「同一性」と同義的に使用される。
【０１１６】
２つのヌクレオチドまたはアミノ酸配列の間のパーセント同一性の決定は、数学的なアルゴリズムを使用して達成することができる。たとえば、２つの配列を比較するのに有用な数学的なアルゴリズムは、Ｋａｒｌｉｎ  ａｎｄ  Ａｌｔｓｃｈｕｌ（１９９３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：５８７３−５８７７）におけるように修飾された、Ｋａｒｌｉｎ  ａｎｄ  Ａｌｔｓｃｈｕｌ（１９９０，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８７：２２６４−２２６８）のアルゴリズムである。このアルゴリズムは、Ａｌｔｓｃｈｕｌ，  ｅｔ  ａｌ．（１９９０，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０）のＮＢＬＡＳＴおよびＸＢＬＡＳＴプログラムの中に組み込まれており、たとえば、ＮＣＢＩウェブサイトでＢＬＡＳＴツールを使用して、ユニバーサルリソースロケータを有するＮａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ）ワールドワイドウェブサイトで使用することができる。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索は、本明細書において記載される核酸に対して相同なヌクレオチド配列を得るために、以下のパラメーターを使用して、ＮＢＬＡＳＴプログラム（ＮＣＢＩウェブサイトで「ｂｌａｓｔｎ」と指定される）を用いて実行することができる：ｇａｐ  ｐｅｎａｌｔｙ＝５；ｇａｐ  ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ  ｐｅｎａｌｔｙ＝２；ｍｉｓｍａｔｃｈ  ｐｅｎａｌｔｙ＝３；ｍａｔｃｈ  ｒｅｗａｒｄ＝１；ｅｘｐｅｃｔａｔｉｏｎ  ｖａｌｕｅ  １０．０；およびｗｏｒｄ  ｓｉｚｅ＝１１。ＢＬＡＳＴタンパク質検索は、本明細書において記載されるタンパク質分子に対して相同なアミノ酸配列を得るために、以下のパラメーターを使用して、ＸＢＬＡＳＴプログラム（ＮＣＢＩウェブサイトで「ｂｌａｓｔｎ」と指定される）またはＮＣＢＩ「ｂｌａｓｔｐ」プログラムを用いて実行することができる：ｅｘｐｅｃｔａｔｉｏｎ  ｖａｌｕｅ  １０．０、ＢＬＯＳＵＭ６２  ｓｃｏｒｉｎｇ  ｍａｔｒｉｘ。比較の目的のためのギャップアライメントを得るために、Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２）において記載されるようにＧａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴを利用することができる。その代わりに、ＰＳＩ−ＢｌａｓｔまたはＰＨＩ−Ｂｌａｓｔは、分子の間の距離関係（Ｉｄ．）および共通のパターンを共有する分子の関係を検出する繰り返しの検索を実行するために使用することができる。ＢＬＡＳＴ、Ｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴ、ＰＳＩ−Ｂｌａｓｔ、およびＰＨＩ−Ｂｌａｓｔプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム（たとえばＸＢＬＡＳＴおよびＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメーターを使用することができる。
【０１１７】
２つの配列の間のパーセント同一性は、ギャップを許可するまたは許可しない、上記に記載されるものと同様の技術を使用して決定することができる。パーセント同一性を計算する際に、典型的に正確なマッチが数えられる。
【０１１８】
本明細書において使用される「ハイブリダイゼーション」という用語は、相補的核酸の対形成に関して使用される。ハイブリダイゼーションおよびハイブリダイゼーションの強度（つまり核酸の間の関連性の強度）は、核酸の間の相補性の程度、伴われる条件のストリンジェンシー、形成されるハイブリッドの長さ、および核酸内のＧ：Ｃ比のような因子によって影響を与えられる。
【０１１９】
「抗原に対して対象を免疫化する」という用語は、対象において免疫応答を誘発し、たとえば、抗原によって引き起こされる疾患に対する対象への保護をもたらすまたは抗原の機能を予防する組成物、タンパク質複合体、タンパク質複合体をコードするＤＮＡ、抗体、または抗体をコードするＤＮＡを対象に投与することを意味する。
【０１２０】
「その免疫学的活性断片」という用語は、少なくとも１つのエピトープを含むポリペプチド抗原の断片を指すことが当技術分野において一般に理解され、これは、断片が、ポリペプチド抗原の配列由来の４つの連続アミノ酸を少なくとも含むことを意味する。
【０１２１】
本明細書において使用される「アポトーシスの誘発」という用語は、細胞が、食作用のプロセスによって続いて排除される膜結合粒子への細胞の断片化によって特徴付けられるプログラム細胞死のプロセスを始めるように細胞が影響を与えられるプロセスを意味する。
【０１２２】
本明細書において使用される「吸入器」という用語は、たとえば溶液、粉末、およびその他同種のものの薬剤の鼻および肺投与のためのデバイスの両方を指す。たとえば、「吸入器」という用語は、急性喘息発作のための抗ヒスタミン剤を投与するために使用される噴霧剤方式の吸入器およびうっ血除去薬を投与するために使用されるプラスチックスプレーボトルを包含するように意図される。
【０１２３】
本明細書において使用される「阻害する」という用語は、「阻害する」という用語が使用される文脈に基づいて、化合物、作用物質、または方法が、記載される機能、レベル、活性、速度などを低下させるまたは妨げる能力を指す。好ましくは、阻害は、少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２５％、さらにより好ましくは少なくとも５０％であり、最も好ましくは、機能は、少なくとも７５％阻害される。「阻害する」という用語は、「低下させる」および「ブロックする」と区別なく使用される。
【０１２４】
本明細書において使用される「複合体を阻害する」という用語は、複合体の形成または２つ以上のタンパク質の相互作用の阻害および複合体の機能または活性の阻害を指す。用語はまた、形成された複合体の破壊をも包含する。しかしながら、用語は、これらの機能のひとつひとつの機能が同時に阻害されなければならないということを意味するものではない。
【０１２５】
本明細書において使用される「タンパク質を阻害する」という用語は、タンパク質合成、レベル、活性、または機能を阻害する任意の方法または技術および対象とするタンパク質の合成、レベル、活性、または機能の誘発または刺激を阻害する方法を指す。用語はまた、対象とするタンパク質の合成、レベル、活性、または機能を調節することができる任意の代謝または調節経路を指す。この用語は、他の分子との結合および複合体形成を含む。そのため、「タンパク質阻害剤」という用語は、任意の作用物質または化合物を指し、この適用は、タンパク質機能またはタンパク質経路機能の阻害をもたらす。しかしながら、用語は、これらの機能のひとつひとつの機能が同時に阻害されなければならないということを意味するものではない。
【０１２６】
本明細書において使用される「注射することまたは適用すること」は、局所、経口、頬側、静脈内、筋肉内、動脈内、髄内、鞘内、室内、経皮的、皮下、腹腔内、鼻腔内、腸内、局所、舌下、膣、点眼用、肺、または直腸手段を含むが、これらに限定されない、多くのルートおよび手段による本発明の化合物の投与を含む。
【０１２７】
本明細書において使用される「教材」は、本明細書において記載される様々な疾患または障害の軽減を達成するためのキットにおける本発明のペプチドの有用性を伝えるために使用することができる刊行物、記録、図、または表現についての任意の他の媒体を含む。所望によりまたは代わりに、教材は、哺乳動物の細胞または組織における疾患または障害を軽減するための１つまたは複数の方法を記載してもよい。本発明のキットの教材は、たとえば、本発明の同定された化合物を含有する容器に添付または同定された化合物を含有する容器と一緒に出荷されてもよい。その代わりに、教材は、教材および化合物がレシピエントによって協力的に使用されるという意図により、容器とは別々に出荷されてもよい。
【０１２８】
精子タンパク質および卵タンパク質との間の「相互作用」とは、精子−卵結合、融合、または受精などのような、事象またはプロセスが生じるのに必要な結合などのような相互作用を意味する。一態様では、「相互作用」は、受容体−リガンドタイプの結合または相互作用に類似してもよい。
【０１２９】
「単離核酸」は、天然に存在する状態でそれの側面に位置する配列から分離されている核酸セグメントまたは断片、たとえば、断片に通常隣接する配列、たとえば、それが天然に存在するゲノム中の断片に隣接する配列から取り出されているＤＮＡ断片を指す。用語はまた、天然に、核酸、たとえばＲＮＡまたはＤＮＡまたはタンパク質を伴う、細胞においてそれに天然に伴う他の構成成分から実質的に精製されている核酸にも適用される。そのため、この用語は、たとえば、ベクターの中に、自己複製プラスミドもしくはウイルスの中に、または原核生物もしくは真核生物のゲノムＤＮＡの中に組み込まれるまたは他の配列と無関係に、別々の分子として（たとえば、ｃＤＮＡまたはＰＣＲもしくは制限酵素消化によって産生されるゲノムもしくはｃＤＮＡ断片として）存在する組換えＤＮＡを含む。それはまた、さらなるポリペプチド配列をコードするハイブリッド遺伝子の一部である組換えＤＮＡをも含む。
【０１３０】
「リガンド」は、標的受容体に特異的に結合する化合物である。
【０１３１】
「受容体」は、リガンドに特異的に結合する化合物である。
【０１３２】
リガンドまたは受容体（たとえば抗体）は、リガンドまたは受容体が、異種の化合物の試料中の化合物の存在を決定する結合反応において機能する場合、化合物「に特異的に結合する」または「と特異的に免疫反応性である」。したがって、指定されるアッセイ（たとえばイムノアッセイ）条件下で、リガンドまたは受容体は、特定の化合物に優先的に結合し、試料中に存在する他の化合物に著しい量で結合しない。たとえば、ポリヌクレオチドは、相補的配列を含む化合物ポリヌクレオチドにハイブリダイゼーション条件下で特異的に結合し、抗体は、抗体が産生されるエピトープを有する抗原にイムノアッセイ条件下で特異的に結合する。様々なイムノアッセイ形式は、特定のタンパク質と特異的に免疫反応性である抗体を選択するために使用されてもよい。たとえば、固相ＥＬＩＳＡイムノアッセイは、タンパク質と特異的に免疫反応性であるモノクローナル抗体を選択するためにルーチン的に使用される。特異的な免疫反応性を決定するために使用することができるイムノアッセイ形式および条件の説明については、Ｈａｒｌｏｗ  ａｎｄ  Ｌａｎｅ（１９８８，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）を参照されたい。
【０１３３】
本明細書において使用される「連結」という用語は、２つの群の間の関連を指す。この関連は、イオン結合、水素結合、および疎水性／親水性相互作用を含むが、これらに限定されない、共有結合または非共有結合とすることができる。
【０１３４】
本明細書において使用される「リンカー」という用語は、２つの他の分子を共有結合でまたは非共有結合で、たとえばイオンもしくは水素結合またはファンデルワールス相互作用を通してつなぐ分子、たとえば、５’末端である相補的配列に、かつ３’末端で他の相補的配列にハイブリダイズし、したがって、２つの非相補的な配列をつなぐ核酸分子を指す。
【０１３５】
遺伝子の「発現不良（ｍａｌｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ）」は、疾患または障害に罹患している患者の細胞における遺伝子の発現を意味し、発現（非発現を含む）のレベル、発現される遺伝子の割合、または細胞周期に関する遺伝子の発現のタイミングは、疾患または障害に罹患していない患者の細胞における同じ遺伝子の発現と異なる。発現不良は、疾患もしくは障害を引き起こしてもよいもしくは一因となってもよい、疾患もしくは障害の症状となってもよい、またはその両方であってもよいことを理解されたい。
【０１３６】
本明細書において使用される「発現のレベルを測定すること」または「発現のレベルを決定すること」という用語は、アッセイの結果を対象とする遺伝子またはタンパク質の発現のレベルと相関させるために使用することができる任意の測定またはアッセイを指す。そのようなアッセイは、ｍＲＮＡ、タンパク質レベルなどのレベルを測定することを含み、ノーザンおよびウエスタンブロット分析、結合アッセイ、免疫ブロット法などのようなアッセイによって実行することができる。発現のレベルは、発現の速度を含むことができ、存在するｍＲＮＡまたはタンパク質の実際の量によって測定することができる。そのようなアッセイは、情報を保存し、処理し、レベル、シグナルなどを定量化するのを支援し、レベルを比較する際に使用するための情報をデジタル化するために、プロセスまたはシステムと結び付けられる。
【０１３７】
そのすべての文法上の形態の「鼻投与」という用語は、本発明の少なくとも１つの化合物の全身性のデリバリーのための、血流への鼻粘膜を通しての本発明の少なくとも１つの化合物の投与を指す。デリバリーのための鼻投与の長所は、それが、注射器および針を使用する注射を必要としないこと、それが、薬剤の筋肉内投与に伴い得る壊死を回避すること、ならびに薬剤の経粘膜投与は、自己投与に非常に適用可能であることである。
【０１３８】
「核酸」という用語は、典型的に、大きなポリヌクレオチドを指す。「核酸」とは、デオキシリボヌクレオシドまたはリボヌクレオシドから構成されるかどうかにかかわらず、また、ホスホジエステル連結またはホスホトリエステル、ホスホロアミデート、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチルエステル、アセトアミデート、カルバメート、チオエーテル、架橋ホスホロアミデート、架橋メチレンホスホネート、架橋ホスホロアミデート、架橋ホスホロアミデート、架橋メチレンホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、架橋ホスホロチオエート、もしくはスルホン連結およびそのような連結の組み合わせなどのような修飾連結から構成されるかどうかにかかわらず、任意の核酸を意味する。核酸という用語はまた、特に、５つの生物学的に存在する塩基（アデニン、グアニン、チミン、シトシン、およびウラシル）以外の塩基から構成される核酸をも含む。
【０１３９】
本明細書において使用される「核酸」という用語は、ＲＮＡならびに一および二本鎖ＤＮＡおよびｃＤＮＡを包含する。さらに、「核酸」、「ＤＮＡ」、「ＲＮＡ」という用語および類似する用語はまた、核酸アナログ、つまりホスホジエステル主鎖以外を有するアナログを含む。たとえば、当技術分野において知られており、主鎖中のホスホジエステル結合の代わりにペプチド結合を有するいわゆる「ペプチド核酸」は、本発明の範囲内にあると考えられる。「核酸」によって、デオキシリボヌクレオシドまたはリボヌクレオシドから構成されるかどうかにかかわらず、また、ホスホジエステル連結またはホスホトリエステル、ホスホロアミデート、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチルエステル、アセトアミデート、カルバメート、チオエーテル、架橋ホスホロアミデート、架橋メチレンホスホネート、架橋ホスホロアミデート、架橋ホスホロアミデート、架橋メチレンホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、架橋ホスホロチオエート、もしくはスルホン連結およびそのような連結の組み合わせなどのような修飾連結から構成されるかどうかにかかわらず、任意の核酸を意味する。核酸という用語はまた、特に、５つの生物学的に存在する塩基（アデニン、グアニン、チミン、シトシン、およびウラシル）以外の塩基から構成される核酸をも含む。従来の表示法は、ポリヌクレオチド配列を記載するために本明細書において使用され、一本鎖ポリヌクレオチド配列の左手末端は、５’末端であり、二本鎖ポリヌクレオチド配列の左手方向は、５’方向と呼ばれる。新生ＲＮＡ転写物に対するヌクレオチドの５’から３’への追加の方向は、転写方向と呼ばれる。ｍＲＮＡと同じ配列を有するＤＮＡ鎖は、「コード鎖」と呼ばれ、ＤＮＡ上の基準点に対して５’に位置するＤＮＡ鎖上の配列は、「上流配列」と呼ばれ、ＤＮＡ上の基準点に対して３’にあるＤＮＡ鎖上の配列は、「下流配列」と呼ばれる。
【０１４０】
本明細書において使用される「核酸コンストラクト」という用語は、ゲノムまたは合成方法によって得られるかどうかにかかわらず、所望される特定の遺伝子または遺伝子断片をコードするＤＮＡおよびＲＮＡ配列を包含する。
【０１４１】
特別の定めのない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」は、互いの縮重バージョンであり、同じアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列をすべて含む。タンパク質およびＲＮＡをコードするヌクレオチド配列は、イントロンを含んでいてもよい。
【０１４２】
「オリゴヌクレオチド」という用語は、典型的に、短いポリヌクレオチド、一般に、約５０以下のヌクレオチドを指す。ヌクレオチド配列がＤＮＡ配列（つまりＡ、Ｔ、Ｇ、Ｃ）によって示される場合、これはまた、「Ｕ」が「Ｔ」に取って代わるＲＮＡ配列（つまりＡ、Ｕ、Ｇ、Ｃ）を含むことが理解されるであろう。
【０１４３】
本明細書において使用される「卵母細胞」は、いくつかの方法でより具体的に分類することができる。「裸の卵母細胞」は、保育顆粒膜細胞（ｎｕｒｓｅ  ｇｒａｎｕｌｏｓａ  ｃｅｌｌ）の連続したシートによって囲まれない女性生殖細胞として定義される。「原始卵母細胞」は、単層の保育顆粒膜細胞によって囲まれる女性生殖細胞として定義される。「一次卵母細胞」は、単層の立方形保育顆粒膜細胞によって囲まれる女性生殖細胞として定義される。「二次卵母細胞」は、二層の立方形顆粒膜細胞によって囲まれる女性生殖細胞として定義される。「前胞状（ｐｒｅｅａｎｔｒａｌ）卵母細胞」は、３層以上の顆粒膜細胞によって囲まれるが、洞性の（ａｎｔｒａｌ）スペースを有していない女性生殖細胞として定義される。「胞状卵母細胞」は、顆粒膜細胞の３つ以上の層によって囲まれ、卵胞液スペースの形跡を含有する女性生殖細胞として定義される。
【０１４４】
２つのポリヌクレオチドが「作動可能に連結された」と記載することによって、２つのポリヌクレオチドのうちの少なくとも１つが、それが特徴付けられる生理学的な効果を他のものに対して及ぼすことができる様式で一本鎖または二本鎖核酸成分が核酸成分内に配置される２つのポリヌクレオチドを含むことを意味する。例として、遺伝子のコード領域に作動可能に連結されたプロモーターは、コード領域の転写を促すことができる。
【０１４５】
本明細書において使用される医薬組成物の「非経口投与」は、対象の組織の物理的な突破および組織における突破口を通しての医薬組成物の投与によって特徴付けられる投与の任意のルートを含む。非経口投与は、したがって、組成物の注射による、外科的な切開を通しての組成物の適用による、組織を貫通する非外科的な創傷を通しての組成物の適用、およびその他同種のものによる医薬組成物の投与を含むが、これらに限定されない。特に、非経口投与は、皮下、腹腔内、筋肉内、胸骨内注射、および腎臓透析注入技術を含むが、これらに限定されないことが企図される。
【０１４６】
「ペプチド」という用語は、典型的に、短いポリペプチドを指す。
【０１４７】
本明細書において使用される「適用当たりの」という用語は、対象への薬剤または化合物の投与を指す。
【０１４８】
「医薬組成物」という用語は、少なくとも１つの活性成分を含む組成物を意味するものとし、それによって、組成物は、哺乳動物（たとえば限定を伴うことなくヒト）における特定の効果的な結果についての調査に適用可能である。当業者らは、活性成分が当業者の必要に基づく所望の効果的な結果を有するかどうかを決定するのに適切な技術を理解し、認識するだろう。
【０１４９】
本明細書において使用される「薬学的に許容できるキャリア」という用語は、適切な化合物または誘導体を組み合わせることができ、組み合わせた後で、対象に適切な化合物を投与するために使用することができる化学組成物を意味する。
【０１５０】
本明細書において使用される「生理学的に許容できる」エステルまたは塩という用語は、医薬組成物の任意の他の成分と適合性であり、組成物が投与されることになっている対象に有害ではない、活性成分のエステルまたは塩の形態を意味する。
【０１５１】
「薬学的に許容できる」は、ヒトまたは動物用医薬の適用のために生理学的に許容できることを意味する。
【０１５２】
本明細書において使用される医薬組成物」は、ヒトおよび動物用医薬の使用のための製剤を含む。
【０１５３】
「複数」は、少なくとも２つを意味する。
【０１５４】
「ポリヌクレオチド」は、核酸の一本鎖またはパラレルおよびアンチパラレル鎖を意味する。したがって、ポリヌクレオチドは、一本鎖または二本鎖核酸であってもよい。
【０１５５】
「ポリペプチド」は、アミノ酸残基から構成されるポリマー、関連する天然に存在する構造変異体、およびペプチド結合により連結されたその合成の天然に存在しないアナログ、その関連する天然に存在する構造変異体、ならびにその合成の天然に存在しないアナログを指す。
【０１５６】
「合成ペプチドまたはポリペプチド」は、天然に存在しないペプチドまたはポリペプチドを意味する。合成ペプチドまたはポリペプチドは、たとえば、自動ポリペプチド合成装置を使用して合成することができる。様々な固相ペプチド合成方法は、当業者らに知られている。
【０１５７】
「前感作」とは、作用物質による抗原投与に先立った、少なくとも１つの先天性免疫系刺激物質の前投与を意味する。これは、時に、耐性の誘発と呼ばれる。
【０１５８】
本明細書において使用される「予防する」という用語は、ある事が起こるのを停止させることまたは可能性があるもしくはほとんど確実であることが起こることに対して事前の手段を取ることを意味する。医学との関連において、「予防」は、一般に、疾患または状態にかかる可能性を減少させるために取られる処置を指す。
【０１５９】
「予防的な」または「予防用の」治療は、疾患または障害の徴候を示さないまたは早期徴候のみを示す対象に施される治療である。予防用のまたは防止的な治療は、疾患または障害を発症することと関連する病態を発症する危険性を減少させる目的で施される。
【０１６０】
「プライマー」は、指定されるポリヌクレオチド鋳型に特異的にハイブリダイズすることができ、相補的ポリヌクレオチドの合成のための開始点を提供することができるポリヌクレオチドを指す。そのような合成は、合成が誘発される条件下に、つまり、ヌクレオチド、相補的ポリヌクレオチド鋳型、およびＤＮＡポリメラーゼなどのような重合のための作用物質の存在下にポリヌクレオチドプライマーが置かれる場合に、生じる。プライマーは、典型的に、一本鎖であるが、二本鎖であってもよい。プライマーは、典型的に、デオキシリボ核酸であるが、種々様々の合成プライマーおよび天然に存在するプライマーは、多くの適用に有用である。プライマーは、それが合成の開始のための部位として働くようにハイブリダイズするように設計される鋳型に相補的であるが、鋳型の正確な配列を反映する必要はない。そのような場合において、鋳型へのプライマーの特異的なハイブリダイゼーションは、ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに依存する。プライマーは、たとえば発色性、放射性、または蛍光成分により標識し、検出可能な成分として使用することができる。
【０１６１】
本明細書において使用される「プロモーター／調節配列」という用語は、プロモーター／レギュレーター配列に作動可能に連結された、遺伝子産物の発現に必要な核酸配列を意味する。一部の実例では、この配列は、コアプロモーター配列であってもよく、他の実例では、この配列はまた、遺伝子産物の発現に必要とされるエンハンサー配列および他の調節エレメントを含んでいてもよい。プロモーター／調節配列は、たとえば、組織特異的な様式で遺伝子産物を発現する配列であってもよい。
【０１６２】
「恒常的」プロモーターは、細胞において一定の様式で、それが作動可能に連結される遺伝子の発現を駆動するプロモーターである。例として、細胞のハウスキーピング遺伝子の発現を駆動するプロモーターは、恒常的プロモーターであると考えられる。
【０１６３】
「誘発性」プロモーターは、遺伝子産物をコードするまたは特定するポリヌクレオチドと作動可能に連結される場合に、実質的に、プロモーターに相当する誘発因子が細胞中に存在する場合にのみ、生きている細胞において遺伝子産物を産生させるヌクレオチド配列である。
【０１６４】
「組織特異的」プロモーターは、遺伝子産物をコードするまたは特定するポリヌクレオチドと作動可能に連結される場合に、実質的に、細胞がプロモーターに対応する組織タイプの細胞である場合にのみ、生きている細胞において遺伝子産物を産生させるヌクレオチド配列である。
【０１６５】
「予防用の」治療は、疾患と関連する病態を発症する危険性を減少させる目的で、疾患の徴候を示さないまたは疾患の早期徴候のみを示す対象に施される治療である。
【０１６６】
本明細書において使用されるように、末端アミノ基に関しての「保護基」は、ペプチドの末端アミノ基を指し、末端アミノ基は、ペプチド合成において従来より用いられている様々なアミノ末端保護基のいずれかと結び付けられる。そのような保護基は、たとえば、ホルミル、アセチル、ベンゾイル、トリフルオロアセチル、スクシニル、およびメトキシスクシニルなどのようなアシル保護基；ベンジルオキシカルボニルなどのような芳香族ウレタン保護基；ならびに脂肪族ウレタン保護基、たとえばｔｅｒｔ−ブトキシカルボニルまたはアダマンチルオキシカルボニルを含む。適した保護基については、Ｇｒｏｓｓ  ａｎｄ  Ｍｉｅｎｈｏｆｅｒ，ｅｄｓ．，Ｔｈｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅｓ，ｖｏｌ．３，ｐｐ．３−８８（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８１）を参照されたい。
【０１６７】
本明細書において使用されるように、末端カルボキシ基に関しての「保護基」は、ペプチドの末端カルボキシル基を指し、末端カルボキシル基は、様々なカルボキシル末端保護基のいずれかと結び付けられる。そのような保護基は、たとえば、ｔｅｒｔ−ブチル、ベンジル、またはエステルもしくはエーテル結合を通して末端カルボキシル基に連結される他の許容できる基を含む。
【０１６８】
「タンパク質」という用語は、典型的に、大きなポリペプチドを指す。従来の表示法は、ポリペプチド配列を表現するために本明細書において使用され、ポリペプチド配列の左手末端は、アミノ末端であり、ポリペプチド配列の右手末端は、カルボキシル末端である。
【０１６９】
本明細書において使用される「タンパク質調節経路」という用語は、タンパク質を調節する上流の調節経路およびそのタンパク質が調節する下流の事象の両方を指す。そのような調節は、対象とするタンパク質の転写、翻訳、レベル、活性、翻訳後修飾、および機能ならびにタンパク質が調節する下流の事象を含むが、これらに限定されない。
【０１７０】
「タンパク質経路」および「タンパク質調節経路」という用語は、本明細書において区別なく使用される。
【０１７１】
本明細書において使用される「精製された」という用語および同様の用語は、天然の環境において分子または化合物と通常関連する他の構成成分と比べた、分子または化合物の濃縮に関する。「精製された」という用語は、特定の分子の完全な純度がプロセスの間に達成されたことを必ずしも示さない。本明細書において使用される「高度に精製された」化合物は、９０％を超えて純粋な化合物を指す。特に、精製された精細胞ＤＮＡは、精製された精細胞ＤＮＡのＰＣＲ増幅およびその増幅されたＤＮＡの続く分析に際して著しい検出可能なレベルの非精細胞ＤＮＡを産生しないＤＮＡを指す。「著しい検出可能なレベル」は、示されるデータにおいて目に見え、法医学的証拠の分析の間に検討される／説明される必要があるであろう汚染の量である。
【０１７２】
「組換えポリヌクレオチド」は、ともに天然につながれていない配列を有するポリヌクレオチドを指す。増幅されたまたは構築された組換えポリヌクレオチドは、適したベクター中に含まれていてもよく、ベクターは、適した宿主細胞を形質転換するために使用することができる。
【０１７３】
組換えポリヌクレオチドは、同様に、非コード機能（たとえばプロモーター、複製開始点、リボソーム結合部位など）を果たしてもよい。
【０１７４】
組換えポリヌクレオチドを含む宿主細胞は、「組換え宿主細胞」と呼ばれる。遺伝子が組換えポリヌクレオチドを含む組換え宿主細胞において発現される遺伝子は、「組換えポリペプチド」を産生する。
【０１７５】
「組換えポリペプチド」は、組換えポリヌクレオチドの発現に際して産生されるポリペプチドである。
【０１７６】
「受容体」は、リガンドに特異的に結合する化合物である。
【０１７７】
「リガンド」は、標的受容体に特異的に結合する化合物である。
【０１７８】
「組換え細胞」は、導入遺伝子を含む細胞である。そのような細胞は、真核細胞または原核細胞であってもよい。また、トランスジェニック細胞は、導入遺伝子を含む胚性幹細胞、トランスジェニック胚性幹細胞に由来するキメラ哺乳動物から得られる細胞を包含するが、これらに限定されず、細胞は、導入遺伝子、トランスジェニック哺乳動物またはその胎児もしくは胎盤組織から得られる細胞、および導入遺伝子を含む原核細胞を含む。
【０１７９】
「調節する」という用語は、対象とする機能または活性を刺激するまたは阻害することを指す。
【０１８０】
本明細書において使用される「レポーター遺伝子」という用語は、その発現を知られている方法を使用して検出することができる遺伝子を意味する。例として、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ  ｌａｃＺ遺伝子は、ｌａｃＺ遺伝子の発現が、発色性基質ｏ−ニトロフェニル−β−ガラクトシドの培地への添加によって、知られている方法を使用して検出することができるので、培地においてレポーター遺伝子として使用されてもよい（Ｇｅｒｈａｒｄｔ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，１９９４，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  Ｇｅｎｅｒａｌ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ，Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｆｏｒ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，ＤＣ，ｐ．５７４）。
【０１８１】
本明細書において使用される「試料」は、好ましくは、正常な組織試料、疾患組織試料、生検材料、血液、唾液、糞便、精液、涙液、および尿を含むが、これらに限定されない、対象由来の生物学的試料を指す。試料はまた、対象とする細胞、組織、または体液を含有する、対象から得られる物質の任意の他の供給源とすることができる。試料はまた、細胞または組織培養から得ることもできる。
【０１８２】
本明細書において使用される「ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌」という用語は、癌の細胞がＳＡＳ１Ｒを発現する癌を指す。
【０１８３】
「ＳＬＬＰ１」および「ＳＬＬＰ２」はまた、それぞれ、「Ｃ１９」および「Ｃ２３」とも呼ばれる。
【０１８４】
本明細書において使用されるように、「二次抗体」という用語は、他の抗体（一次抗体）の定常領域に結合する抗体を指す。
【０１８５】
「シグナル配列」という用語は、ポリペプチドが細胞内で取る経路を指示するペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を意味する、つまり、それは、細胞からのポリペプチドの最終的な分泌を含むが、これらに限定されない、細胞におけるポリペプチドの細胞プロセシングを指示する。シグナル配列は、ポリペプチドの合成を小胞体に向ける、もっぱらではないが、典型的に、ポリペプチドのアミノ末端に見いだせるアミノ酸の配列である。いくつかの実例では、シグナルペプチドは、ポリペプチドからタンパク分解性により除去され、したがって、成熟タンパク質にない。
【０１８６】
「低分子干渉ＲＮＡ」（ｓｉＲＮＡ）とは、とりわけ、センスおよびアンチセンス鎖の両方から構成される単離ｄｓＲＮＡ分子を意味する。一態様では、それは、長さが１０ヌクレオチドを超える。ｓｉＲＮＡはまた、標的遺伝子由来のセンスおよび相補的アンチセンス配列の両方を有する単一の転写物、たとえばヘアピンを指す。ｓｉＲＮＡは、ｄｓＲＮＡの任意の形態（より大きなｄｓＲＮＡのタンパク分解性により切断された産物、部分的に精製されたＲＮＡ、本質的に純粋なＲＮＡ、合成ＲＮＡ、組換えで産生されたＲＮＡ）および１つまたは複数のヌクレオチドの添加、欠失、置換、および／または改変によって天然に存在するＲＮＡと異なる、改変されたＲＮＡをさらに含む。
【０１８７】
本明細書において使用される「固体支持体」という用語は、様々な化合物と連結（好ましくは共有結合）を形成することができる溶媒不溶性基質に関する。支持体は、限定を伴うことなく、細胞もしくはバクテリオファージ粒子などのような、自然界における生物学的なものまたは限定を伴うことなく、アクリルアミド誘導体、アガロース、セルロース、ナイロン、シリカ、もしくは磁化された粒子などのような合成のものとすることができる。
【０１８８】
本明細書において使用される「特異的に結合する」という用語は、化合物またはリガンドが結合反応またはアッセイにおいて機能する場合に、異種化合物の試料における化合物の存在を決定する状態を意味する。
【０１８９】
本明細書において使用される「標準」という用語は、比較に使用されるものを指す。たとえば、それは、試験化合物を投与する場合に結果を比較するために投与され、使用される、知られている標準作用物質もしくは化合物とすることができる、またはそれは、パラメーターまたは関数に対する作用物質または化合物の効果を測定する場合に対照の値を得るために測定される標準パラメーターまたは関数とすることができる。標準はまた、対象とするマーカーが測定される前に、知られている量で試料に添加され、試料が処理されるかまたは精製もしくは抽出手順にかけられる場合に精製または回収率のようなものを決定するのに有用である作用物質または化合物などのような「内部標準」を指すこともできる。内部標準は、多くの場合、放射性同位体などにより標識されており、それが内因性マーカーと区別されるのを可能にする、対象とする精製マーカーである。
【０１９０】
分析、診断、または治療の「対象」は、動物である。そのような動物は、哺乳動物、好ましくはヒトを含む。
【０１９１】
本明細書において使用される「その必要のある対象」とは、本発明の方法から利益を得るであろう患者、動物、哺乳動物、またはヒトである。
【０１９２】
本明細書において使用される「実質的に相同なアミノ酸配列」は、参照抗体鎖のアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％の相同性、好ましくは、少なくとも約９６％の相同性、より好ましくは、少なくとも約９７％の相同性、さらにより好ましくは、少なくとも約９８％の相同性、最も好ましくは、少なくとも約９９％またはそれ以上の相同性を有するアミノ酸配列を含む。アミノ酸配列類似性または同一性は、ＢＬＡＳＴ（ｂａｓｉｃ  ｌｏｃａｌ  ａｌｉｇｎｍｅｎｔ  ｓｅａｒｃｈ  ｔｏｏｌ）２．０．１４アルゴリズムを用いるＢＬＡＳＴＰおよびＴＢＬＡＳＴＮプログラムを使用することによって計算することができる。これらのプログラムに使用されるデフォルト設定は、本発明の目的のために、実質的に類似するアミノ酸配列を同定するのに適している。
【０１９３】
「実質的に相同な核酸配列」は、参照核酸配列に対応する核酸配列を意味し、対応する配列は、参照核酸配列によってコードされるペプチドと同じ構造および機能を実質的に有するペプチドをコードする、たとえば、ペプチド機能に著しく影響を与えないアミノ酸における変化のみが存在する。好ましくは、実質的に同一の核酸配列は、参照核酸配列によってコードされるペプチドをコードする。実質的に類似する核酸配列および参照核酸配列の間の同一性のパーセンテージは、少なくとも約５０％、６５％、７５％、８５％、９５％、９９％、またはそれ以上である。核酸配列の実質的な同一性は、２つの配列の配列同一性を比較することによって、たとえば、物理的／化学的方法（つまりハイブリダイゼーション）によってまたはコンピューターアルゴリズムによる配列アライメントによって決定することができる。ヌクレオチド配列が参照ヌクレオチド配列に実質的に類似するかどうかを決定するための適した核酸ハイブリダイゼーション条件は、５０℃での２×標準クエン酸添加生理食塩水（ＳＳＣ）、０．１％ＳＤＳにおける洗浄と共に、５０℃での７％硫酸ドデシルナトリウムＳＤＳ、０．５Ｍ  ＮａＰＯ４、１ｍＭ  ＥＤＴＡ；好ましくは、５０℃での１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳにおける洗浄と共に、５０℃での７％（ＳＤＳ）、０．５Ｍ  ＮａＰＯ４、１ｍＭ  ＥＤＴＡにおけるもの；５０℃での０．５×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳにおける洗浄と共に、５０℃での７％  ＳＤＳ、０．５Ｍ  ＮａＰＯ４、１ｍＭ  ＥＤＴＡ；ならびにより好ましくは、６５℃での０．１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳにおける洗浄と共に、５０℃での７％ＳＤＳ、０．５Ｍ  ＮａＰＯ４、１ｍＭ  ＥＤＴＡにおけるものである。２つの核酸配列の間の実質的な類似性を決定するための適したコンピューターアルゴリズムは、ＧＣＳプログラムパッケージ（Ｄｅｖｅｒｅｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，１９８４  Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１２：３８７）およびＢＬＡＳＴＮまたはＦＡＳＴＡプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，１９９０  Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．１９９０  ８７：１４：５５０９−１３；Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９９０  ２１５：３：４０３−１０；Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２）を含む。これらのプログラムと共に提供されるデフォルト設定は、本発明の目的のために、核酸配列の実質的な類似性を決定するのに適している。
【０１９４】
「実質的に純粋な」という用語は、化合物、たとえば、それに天然に伴う構成成分から分離されているタンパク質またはポリペプチドを説明する。典型的に、試料における全物質の少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２０％、より好ましくは少なくとも５０％、より好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも９０％、最も好ましくは少なくとも９９％（容量による、湿もしくは乾燥重量による、またはモルパーセントもしくはモル分率による）が、対象とする化合物である場合、化合物は、実質的に純粋である。純度は、任意の適切な方法によって、たとえば、ポリペプチドの場合には、カラムクロマトグラフイー、ゲル電気泳動法、またはＨＰＬＣ分析によって測定することができる。化合物、たとえばタンパク質もまた、それが天然に関連する構成成分が本質的にない場合またはそれがその自然の状態でそれに伴う天然の混入物から分離されている場合、実質的に精製されている。
【０１９５】
本明細書において使用される「症状」という用語は、患者によって経験され、疾患を示す、任意の病的な現象または構造、機能、もしくは感覚における常態からの逸脱を指す。対照的に、「徴候」は、疾患の客観的証拠である。たとえば、鼻血は、徴候である。それは、患者、医者、看護婦、他の観察者に明らかである。
【０１９６】
「治療上の」治療は、それらの徴候を減少させるまたは排除する目的で病態の徴候を示す対象に施される治療である。
【０１９７】
化合物の「治療有効量」は、化合物が投与される対象に有益な効果を提供するのに十分な化合物のその量である。
【０１９８】
本明細書において使用される「導入遺伝子」という用語は、アミノ酸配列をコードする核酸に作動可能に連結されたプロモーター／調節配列をコードする核酸を含む外因性核酸配列を意味し、この外因性核酸は、トランスジェニック哺乳動物によってコードされる。
【０１９９】
本明細書において使用される「トランスジェニック哺乳動物」という用語は、哺乳動物を意味し、この生殖細胞は、外因性核酸を含む。
【０２００】
本明細書において使用される「トランスジェニック細胞」は、導入核酸配列によってコードされる遺伝子の発現を可能にする様式で細胞の中に導入された核酸配列を含む任意の細胞である。
【０２０１】
本明細書において使用される「治療する」という用語は、患者もしくは対象が経験する症状の頻度を低下させることまたは経験する症状の頻度を低下させるために作用物質もしくは化合物を投与することを意味する。
【０２０２】
「予防用の」治療は、疾患と関連する病態を発症する危険性を減少させる目的で、疾患の徴候を示さないまたは疾患の早期徴候のみを示す対象に施される治療である。
【０２０３】
本明細書において使用される「ワクチン」という用語は、対象に接種された場合に、対象における免疫応答を刺激する効果を有し、状態、疾患、またはその症状から対象を完全にまたは部分的に保護するように働く組成物を意味する。一態様では、状態は、概念である。ワクチンという用語は、予防用および治療ワクチンを包含する。組み合わせワクチンは、２つ以上のワクチンまたは２つ以上の化合物もしくは作用物質を組み合わせるワクチンである。
【０２０４】
「ベクター」は、単離核酸を含み、細胞の内部に単離核酸を送達するために使用することができる物質の組成物である。直線状ポリヌクレオチド、イオンまたは両親媒性化合物と関連するポリヌクレオチド、プラスミド、およびウイルスを含むが、これらに限定されない多数のベクターが、当技術分野において知られている。したがって、「ベクター」という用語は、自己複製プラスミドまたはウイルスを含む。用語はまた、たとえばポリリシン化合物、リポソーム、およびその他同種のものなどのような、細胞への核酸の移行またはデリバリーを促進する非プラスミドおよび非ウイルス化合物を含むように解釈されるべきである。ウイルスベクターの例は、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、組換えウイルスベクター、およびその他同種のものを含むが、これらに限定されない。非ウイルスベクターの例は、リポソーム、ＤＮＡのポリアミン誘導体、およびその他同種のものを含むが、これらに限定されない。
【０２０５】
「発現ベクター」は、発現されることとなるヌクレオチド配列に、適切に作用するように連結された発現制御配列を含む組換えポリヌクレオチドを含むベクターを指す。発現ベクターは、発現のための十分なシス作用性エレメントを含み、発現のための他のエレメントは、宿主細胞によってまたはインビトロ発現系において供給することができる。発現ベクターは、コスミド、プラスミド（たとえば、裸またはリポソーム中に含有される）、および組換えポリヌクレオチドを組み込むウイルスなどのような当技術分野において知られているものをすべて含む。
【０２０６】
実施形態
本発明は、卵巣特異的タンパク質ＳＡＳ１Ｒが子宮、肺、膀胱、および卵巣癌を含む癌において発現されるという予想外の結果に基づいて癌を診断するための組成物および方法を提供する。すなわち、ＳＡＳ１Ｒは、発見された第１の癌−卵母細胞抗原である。他の組織は、昔から知られている精巣癌抗原などのように、一般に、高度に発生上調節されており、１つまたは少数の組織においてのみの発現に制限されるが、癌において調節不全であり、発現される抗原を有した。しかしながら、ＳＡＳ１Ｒは、第１の癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーである。さらに、ＳＡＳ１Ｒは、試験された、高いパーセンテージの様々な癌において発現される。ＳＡＳ１Ｒがこれらの癌において発現され、そのような高度なパーセンテージのこれらのタイプの癌がＳＡＳ１Ｒを発現することは予想外であった。ＳＡＳ１Ｒ発現は、たとえば、ＳＡＳ１Ｒタンパク質またはＳＡＳ１Ｒの断片、ＳＡＳ１Ｒ  ｍＲＮＡ、およびＳＡＳ１Ｒ  ｍｉＲＮＡを検出するであろう、当技術分野において知られている技術を使用して決定することができる。
【０２０７】
ある癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーが本明細書においてここで開示されたので、本発明は、同様に、ＳＡＳ１Ｒ以外の癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーを包含する。本発明は、他の癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーに対して導かれる抗体を使用すること、細胞を死滅させるまたは癌細胞を検出するためにそれらの抗原を標的にすること、および癌−卵母細胞抗原陽性の癌が発病するまたは進行するのを予防するために免疫原としてそれらの抗原またはその断片もしくは相同体を使用すること包含する。あらゆる特定の理論によって束縛されることを望むものではないが、バイオマーカーがタンパク質であり、ＳＡＳ１Ｒについて本明細書において記載される技術が同様に新しい癌−卵母細胞抗原を標的にするのに有用であろうということが企図される。
【０２０８】
本発明は、卵巣タンパク質、ＳＡＳ１Ｒが複数の癌において発現され、したがって、ＳＡＳ１Ｒを第１の癌−卵母細胞抗原にするという本明細書において開示される予想外の結果に基づいて、癌を診断し、治療し、予防するのに有用な組成物および方法を提供する。
【０２０９】
一態様では、癌は、癌腫である。一態様では、癌は、肉腫である。一態様では、癌は、子宮癌である。一態様では、癌は、卵巣癌である。一態様では、癌は、肺癌である。一態様では、肺癌は、腺癌である。一態様では、肺癌は、扁平上皮癌である。一態様では、癌は、悪性ミュラー管混合腫瘍（ＭＭＭＴ；肉腫様癌とも呼ばれる）である。一態様では、癌は、類内膜癌である。
【０２１０】
癌診断
ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌の検出および診断は、対象から試料を得て、試料がＳＡＳ１Ｒについて陽性かどうかを決定することによって実行することができ、組成物および方法はまた、ＳＡＳ１Ｒ陽性の細胞をインビボ（ｉｎ  ｖｉｖｏ）において画像処理するためにも提供される。
【０２１１】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒを発現する腫瘍は、診断のために直接標的にすることができる。これは、たとえば、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれ、インビボにおける画像処理に有用な造影剤にコンジュゲートされている抗体またはその断片を使用して、行うことができる。
【０２１２】
一実施形態では、対象から得られる組織試料および他の試料は、ＳＡＳ１Ｒを検出するために使用することができる。組織試料は、腫瘍生検材料および他の組織を含むことができ、癌細胞由来のＳＡＳ１Ｒは、死んでいる癌細胞から脱落したＳＡＳ１Ｒを含む。腫瘍生検材料以外の試料は、組織試料、血液、血漿、腹膜液、腹水、卵胞液、尿、糞便、唾液、粘液、痰、喀痰、涙液、脳脊髄液、肺滲出液などのような滲出液、洗浄液、およびＰａｐスミアを含むが、これらに限定されない。
【０２１３】
抗体および他のペプチドは、インビボにおいて画像処理することができ、免疫蛍光法、ＥＬＩＳＡなどのようなエスクビボ試験およびアッセイにおいて画像処理／検出に使用することができる多くの作用物質にコンジュゲートすることができる。一実施形態では、抗体は、酵素結合免疫測定法、ウエスタンブロット、ラテラルフローメンブレン試験、ラテックス凝集反応、および少なくとも１つの抗体を利用する免疫クロマトグラフィーまたはイムノアッセイの他の形態の少なくとも１つを使用して検出される。一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、ＥＬＩＳＡを使用して検出される。
【０２１４】
タンパク質およびペプチドを測定するための複数の技術は、当技術分野において知られており、または本明細書において記載され、本発明の実施において使用することができる。これらは、たとえば、
電気化学発光イムノアッセイ；
生物発光イムノアッセイ（たとえばアポエクオリンおよびセレンテラジンの使用を伴う）；
発光酸素チャネリングイムノアッセイ（ＬＯＣＩ）；
Ｅｒｅｎｎａイムノアッセイシステム（単一分子の計数を伴う修飾微粒子ベースのサンドイッチイムノアッセイ）；
ナノ粒子イムノアッセイ：固相としてナノ粒子、球体、またはチューブ
−反ストークスシフトを使用して、蛍光体ナノ粒子をアップコンバーターで変換する
−量子ドットイムノアッセイ（ナノメートルサイズ（１０ｎｍ未満）の半導体量子ドットを標識として使用する不均一イムノアッセイ。量子ドットは、ＣｄＳｅ、ＣｄＳ、ＺｎＳｅ、ＩｎＰ、もしくはＩｎＡｓまたはたとえばＣｄＳｅコア上のＺｎＳもしくはＣｄＳの層から構成される強い蛍光を発するナノ結晶である）；
蛍光励起移動イムノアッセイ；
イムノＰＣＲイムノアッセイ；
固相光散乱イムノアッセイ：インジウム球体は、抗原に結合する抗体を測定するためにグラス上にコートされる。抗原への抗体の結合は、誘電体層の厚みを増加させ、抗原のみが結合しているエリアよりも大きな散乱をもたらす。定量化は、濃度測定によって達成される；ならびに
表面効果イムノアッセイ：抗体は、導波管（石英、ガラス、もしくはプラスチックスライドまたは金もしくは銀をコートしたプリズム）の表面上に固定され、抗原の結合は、全反射蛍光、表面プラズモン共鳴、または全反射減衰によって直接測定される。
【０２１５】
一態様では、本発明の抗体またはその断片もしくは相同体は、造影剤にコンジュゲートすることができる。一実施形態では、抗体複合体は、放射性核種、放射線造影剤、常磁性イオン、金属、生物学的タグ、蛍光標識、化学発光標識、超音波造影剤、および光活性剤からなる群から選択される造影剤を含む。一態様では、造影剤は、放射性核種である。一態様では、放射性核種は、１１０Ｉｎ、１１１Ｉｎ、１７７Ｌｕ、１８Ｆ、５２Ｆｅ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、６７Ｇａ、６８Ｇａ、８６Ｙ、９０Ｙ、８９Ｚｒ、９４ｍＴｃ、９４Ｔｃ、９９ｍＴｃ、１２０Ｉ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１５４−１５８Ｇｄ、３２Ｐ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、５１Ｍｎ、５２ｍＭｎ、５５Ｃｏ、７２Ａｓ、７５Ｂｒ、７６Ｂｒ、８２ｍＲｂ、８３Ｓｒ、および他のガンマ、ベータ、またはポジトロン放射体からなる群から選択される。一態様では、放射性核種は、１１１Ｉｎである。
【０２１６】
本発明は、薬剤デリバリーおよび診断のための本明細書において記載されるモノクローナル抗体の使用をさらに提供する。たとえば、本明細書において記載される様々な作用物質を抗体にコンジュゲートすることができる。カリチアマイシンなどのような薬剤、Ｄ（ＫＬＡＫＬＡＫ）２などのようなペプチド、ならびにベータ９０Ｙ、ガンマ１３１Ｉ、およびポジトロン１２４Ｉ放射体などのような放射性核種は、ヒトＳＡＳ１Ｒに対するモノクローナル抗体にコンジュゲートすることができ、治療のための放射線療法剤および化学療法剤として、肺腫瘍を画像処理するために使用することができる。
【０２１７】
本発明は、癌を検出する、癌を診断する、癌の進行をモニターする、または癌の治療をモニターするための方法をさらに提供し、癌細胞は、ＳＡＳ１Ｒまたはその相同体もしくは断片を発現するまたは示す。方法は、造影剤を含むペプチドリガンド複合体を含む医薬組成物を試験対象に投与することならびに次いで、試験対象において、造影剤を検出し、造影剤のレベルおよび位置を決定することを含む。レベルは、それがＭＲＩ、ＰＥＴ、ＳＰＥＣＴ／ＣＴ、ＣＡＴスキャン、Ｘ線、超音波などであるかどうかにかかわらず、特定のその種類の画像処理のためにシステム、コンピューター、およびプログラムを使用して決定される。次いで、レベルの最終的なプロセシングから得られた値は、比較に使用される。試験対象におけるレベルおよび位置の比較は、非罹患対象由来のそうでなければ同一の位置からの造影剤のレベルおよび位置とまたは試験対象の非罹患エリアと行われる。非罹患対象または試験対象の非罹患エリア由来の当該試料における造影剤のレベルまたは位置と比較した試験対象における造影剤のより高度なレベルのまたは異なる位置は、試験対象が、ＳＡＳ１Ｒまたはその相同体もしくは断片を発現するまたは示す癌を有することを示す。検出された造影剤のレベルまたは位置は、バイオマーカーＳＡＳ１Ｒの位置の指標および量である。
【０２１８】
一実施形態では、癌は、肺癌、ＭＭＭＴ、膀胱癌、卵巣癌、子宮癌、子宮体癌、乳癌、頭頸部癌、肝臓癌、膵臓癌、食道癌、胃癌、子宮頸癌、前立腺癌、副腎癌、リンパ腫、白血病、唾液腺癌、骨癌、脳癌、小脳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、鼻腔口腔咽頭（ｏｒｏｎａｓｏｐｈａｒｙｎｇｅａｌ）癌、ＮＰＣ、腎臓癌、皮膚癌、黒色腫、基底細胞癌、硬口蓋癌腫、舌扁平上皮癌、髄膜腫、多形腺腫、星状細胞腫、軟骨肉腫、皮質腺腫、肝細胞癌、膵臓癌、扁平上皮癌、および腺癌からなる群から選択される。
【０２１９】
一態様では、癌は、転移癌である。
【０２２０】
本発明はまた、検出される造影剤のレベル（ＳＡＳ１Ｒの量の測定値）に基づいて、癌が良性または悪性であるかどうかを決定するのを支援するために画像処理されているＳＡＳ１Ｒのレベルを比較するのにも有用である。
【０２２１】
本発明はまた、癌の発癌の段階を決定し、早期から末期癌までのその進行をモニターするのにも有用である。この方法は、使用するための療法のタイプおよび量を決定するのに有用である。
【０２２２】
所望により、治療剤は、画像処理複合体を含む医薬組成物中に付加するまたは含むことができる。
【０２２３】
本明細書において使用される臨床的に適切なＰＥＴ／ＳＰＥＣＴトレーサーは、小さな腫瘍および転移の検出を可能にする。
【０２２４】
一態様では、造影剤または検出可能な成分は、放射性核種、放射線造影剤、常磁性イオン、金属、生物学的タグ、蛍光標識、化学発光標識、超音波造影剤、および光活性剤を含むが、これらに限定されない。
【０２２５】
本発明の抗体またはその相同体もしくは断片、画像処理複合体は、癌が、ＳＡＳ１Ｒ陽性の癌である限り、本明細書において開示されるもの以外の癌を検出し、診断し、局在を決定することを包含する。本発明は、ＳＡＳ１Ｒのレベルを定量化することをさらに提供し、したがって、正常、良性、および悪性組織を区別するための能力を包含する。
【０２２６】
本発明は、バイオマーカーとしての血液試料中のＳＡＳ１ＲマイクロＲＮＡの検出を含む。ｍｉＲＮＡは、長さが２２ヌクレオチド以下のＲＮＡ分子である。これらの分子は、いくつかのタイプの癌の病態に非常に関与することが見い出された。ｍｉＲＮＡ分子は、一般に、ＥＤＴＡ処理後の血清およびその構成成分と関連する場合、安定していることが分かっているが、ＰＣＲによるｍｉＲＮＡへのロックド核酸（ＬＮＡ）の導入は、ｍｉＲＮＡの安定性をさらに増加させる。ＬＮＡは、リボース環が、リボース環の２’−Ｏ原子および４’−Ｃ原子をつなぐメチレンブリッジによって「ロックされている」核酸類似体のクラスであり、これは、他の分子に対する分子の親和性を増加させる。
【０２２７】
本発明は、本発明の少なくとも１つの抗体リガンド複合体、教材を含むキットをさらに提供し、所望により、少なくとも１つの造影剤および所望により、少なくとも１つの治療剤を含む。
【０２２８】
本発明は、ＰＣＲ、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、免疫組織化学的検査、および免疫蛍光法を含むが、これらに限定されない、ＳＡＳ１Ｒ  ｍＲＮＡおよびタンパク質発現およびレベルを測定するための複数の技術を提供する。
【０２２９】
癌の治療
本発明は、ＳＡＳ１Ｒを発現する癌を治療するための組成物および方法を提供する。一態様では、発現されるＳＡＳ１Ｒは、タンパク質である。一態様では、本発明は、癌細胞の表面上のＳＡＳ１Ｒに特異的に結合することができる抗体の使用を包含する。一態様では、抗体は、本明細書において記載されるエピトープのうちの１つに結合することができる。一態様では、抗体は、本明細書において開示される配列および断片のうちの１つに結合することができる。当該抗体は、たとえば、単鎖抗体、モノクローナル抗体、二特異性抗体、キメラ抗体、合成抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、またはその活性断片もしくは相同体とすることができる。一態様では、治療剤は、抗体に結び付けられる。
【０２３０】
一実施形態では、本発明は、癌を診断し、治療するのに有用な抗体を提供し、当該抗体は、ＳＡＳ１Ｒに結合する。一実施形態では、本発明は、癌を診断し、治療するのに有用な抗体を提供し、当該抗体は、ＳＡＳ１Ｒのエピトープに結合する。一態様では、本発明は、本発明の抗体を含む医薬組成物を提供する。
【０２３１】
ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体にコンジュゲートし、抗体と組み合わせて使用することができる多くの治療剤が、入手可能である。たとえば、ＳＡＳ１Ｒに付加することができる分子は、プロドラッグ、薬剤、毒素、タンパク毒素、リポソーム、充填リポソーム、放射性同位体、および酵素を含むが、これらに限定されない。「抗体指向性酵素プロドラッグ療法」（ＡＤＥＰＴ）と名付けられる、強力な細胞毒性種へのプロドラッグの部位特異的活性化を達成するための腫瘍関連抗原に導かれる抗体−酵素コンジュゲートの使用。一態様では、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体は、抗体媒介性補体依存性細胞死によって癌を治療するのに有用である。
【０２３２】
ＳＡＳ１Ｒの段階特異的な発現のために、癌患者において療法のために標的にされる場合、卵巣における原始および一次卵胞中に含有される卵母細胞の予備能は保持されるであろう。それは、ＳＡＳ１Ｒが卵母細胞に対して特異的であるだけではなく、それが厳密な時間的および空間的な様式で卵母細胞において発現されるからである。たとえば、ＳＡＳ１Ｒ発現は、卵胞の成熟の間の卵母細胞発生の特定の段階に対して特異的である（データ示さず）。ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、卵胞の成熟の二次卵胞段階に達した卵母細胞においてのみ卵巣中に現れる。次いで、ＳＡＳ１Ｒは、前胞状および胞状卵胞の続く段階内の卵母細胞においてのみ存続する。ＳＡＳ１Ｒが現れる第１の段階、二次卵胞は、顆粒膜細胞の２つ以上の層によって囲まれる卵母細胞として定義される。この発見は、遺伝子または薬剤デリバリーのための薬剤標的、ワクチン、または表面標的としてＳＡＳ１Ｒを使用することが、原始および一次卵胞内に含有される卵母細胞ではなく、成熟卵母細胞のプールのみに対する選択的な攻撃を可能にするであろうということを示す。言いかえれば、これは、ＳＡＳ１Ｒを標的にすることが、未成熟卵母細胞の卵巣予備能に危害を加えないであろうという決定的な実証である。
【０２３３】
成人の組織の中で、ＳＡＳ１Ｒが、卵母細胞および本明細書において開示されるように腫瘍においてのみ発現されるので、ＳＡＳ１Ｒを標的にする本発明の方法は、薬剤標的またはワクチンとしてのその使用が、ＳＡＳ１Ｒを発現する細胞および組織の選択的なターゲティングを可能にするであろうということを意味する。
【０２３４】
さらに、ＳＡＳ１Ｒが活性酵素であり、したがって、癌療法のための、薬の標的になり得る標的であることが知られている。
【０２３５】
本明細書において開示されるものなどのような制癌剤標的は、標的癌療法のためのおよび標的を発現しない正常な細胞に危害を加えない本質的な基準を満たす。
【０２３６】
本発明は、他のタンパク質とのＳＡＳ１Ｒの相互作用を阻害するのに有用な組成物および方法を提供する。本出願は、癌を検出し、治療するためにＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体の使用をさらに提供する。一態様では、抗体のタイプは、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、および合成抗体を含むが、これらに限定されない。一態様では、抗体は、モノクローナル抗体である。本発明は、本発明のモノクローナル抗体を含むハイブリドーマをさらに提供する。本発明は、本発明の抗体の配列および断片をさらに提供する。
【０２３７】
ＳＡＳ１Ｒの阻害剤は、ＳＬＬＰ１などのような精子タンパク質もしくは任意の他のタンパク質とのその相互作用もしくは結合、プロテアーゼとしてのその活性を阻害する、または癌細胞におけるその役割を含む、ＳＡＳ１Ｒ情報伝達経路中に含まれる下流の活性のその調節を阻害するものを含む。一態様では、阻害剤は、ＳＡＳ１ＲまたはＳＬＬＰ１と結合するＳＡＳ１Ｒの断片もしくは相同体である。一態様では、ＳＡＳ１Ｒ断片は、タンパク質のＮ末端部分である。一態様では、Ｎ末端は、成熟ＳＡＳ１Ｒのアミノ末端の約１２１アミノ酸残基を含む。他の態様では、ＳＬＬＰ１と結合し、卵とのＳＬＬＰ１の相互作用を阻害するＳＡＳ１Ｒ断片は、ＳＡＳ１ＲのＣ末端部分である。一態様では、ＳＡＳ１ＲのＣ末端は、ＳＡＳ１Ｒのカルボキシ末端の約２１０アミノ酸残基を含む。当業者は、本明細書において記載される、ＳＡＳ１Ｒのレベル、機能、もしくは活性を阻害する任意の種類の化合物またはまだ知られていないものが、本発明によって包含されることを十分に理解するであろう。
【０２３８】
ＳＡＳ１Ｒの阻害剤は、たとえば、ＳＡＳ１Ｒの機能、活性、発現、およびタンパク質レベルを阻害する任意のタイプの分子とすることができる。
【０２３９】
一実施形態では、本発明は、活性メタロプロテアーゼとしてのそのＳＡＳ１Ｒの機能を決定し、その機能を測定するのに有用な組成物および方法を提供する。これらの方法は、試験化合物または分子がＳＡＳ１Ｒを阻害するかどうかおよびそれらが癌を治療するのに有用かどうかを決定するのに有用である。本出願は、これらの方法によって同定される化合物を含む。
【０２４０】
一態様では、ＳＡＳ１Ｒは、タンパク質のＮ末端部分において阻害される。一態様では、Ｎ末端は、成熟ＳＡＳ１Ｒのアミノ末端の約１２１アミノ酸残基を含む。他の態様では、ＳＡＳ１Ｒは、タンパク質のＣ末端部分において阻害される。一態様では、タンパク質のＣ末端は、ＳＡＳ１Ｒのカルボキシ末端の約２１０アミノ酸残基を含む。一態様では、阻害剤は、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体である。他の態様では、阻害剤は、薬剤または他の化合物である。一態様では、阻害剤は、ＳＡＳ１Ｒのプロテアーゼ活性を阻害する。他の態様では、阻害剤は、ＳＬＬＰ１または任意の他のタンパク質とのＳＡＳ１Ｒの相互作用を阻害する。一態様では、相互作用は、結合である。
【０２４１】
本発明者らは、驚いたことに、免疫療法戦略に適した抗原がタンパク質ＳＡＳ１Ｒを含むことを発見した。本出願は、本明細書において開示されるように、たとえば肺、子宮、および卵巣癌においても発現される、正常細胞における卵に由来する免疫原を含む免疫原性組成物を開示する。その抗原は、ＳＡＳ１Ｒタンパク質ならびにその抗原性断片および相同体である。本出願は、ＳＡＳ１Ｒを発現する細胞をそのような戦略を使用して死滅させることができるということを実証する。
【０２４２】
本発明は、子宮および卵巣癌を検出し、診断し、これらの疾患を治療するのに有用な組成物および方法を提供する。
【０２４３】
一態様では、ＳＡＳ１Ｒまたは完全長ＳＡＳ１Ｒの免疫原性活性を維持するその断片もしくは相同体は、ＳＡＳ１Ｒに対する免疫応答を誘発するために対象に投与することができる。一態様では、免疫応答を誘発するＳＡＳ１Ｒおよびその断片および相同体の投与は、ワクチンとして有用である。一態様では、それは、癌に対するワクチンである。一態様では、癌は、肺癌、子宮癌、または卵巣癌である。一態様では、癌は、悪性ミュラー管混合腫瘍である。一態様では、卵巣癌は、漿液性卵巣癌である。
【０２４４】
ＳＡＳ１Ｒアイソフォームは、卵母細胞およびトランスフェクト細胞における細胞表面上にならびに本明細書において記載されるように癌細胞上に見つけられる。そのため、表面上にＳＡＳ１Ｒを発現する癌細胞では、ＳＡＳ１Ｒは、腫瘍選択的表面標的である。一態様では、癌細胞は、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体により標的にすることができる。一態様では、抗体は、ヒト化抗体である。一態様では、抗体は、癌細胞へのデリバリーのためのそれに連結された毒素または薬剤を有する。
【０２４５】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒ発現を同定し、診断するのに有用な新規なプライマーをさらに提供する。
【０２４６】
一実施形態では、本発明の組成物および方法は、哺乳動物において有用である。一態様では、哺乳動物は、ヒトである。
【０２４７】
ＳＡＳ１Ｒ酵素は、二次ならびに前胞状および胞状卵胞を含む、続く卵胞の卵母細胞において段階特異的な発現を示し（データ示さず）、それを、裸の卵母細胞、原始卵母細胞、および一次卵母細胞に危害を加えず、生殖細胞の卵巣予備能を保持するであろう癌療法のためのまたはワクチンとしての適した標的にする。そのため、本発明は、ＳＡＳ１Ｒを阻害する化合物を同定するための組成物および方法をさらに包含する。
【０２４８】
本発明は、癌を治療するための方法をさらに提供する。一態様では、本発明は、ＳＡＳ１Ｒを発現する癌細胞を治療するための組成物および方法を提供する。一態様では、ＳＡＳ１Ｒは、細胞表面タンパク質である。ＳＡＳ１Ｒを発現する癌細胞を治療するための方法は、本明細書において記載されるものならびにＳＡＳ１Ｒおよびその活性を標的にすることができる他の知られている方法を含む。
【０２４９】
特異的な療法への診断バイオマーカーの連関は、疾患が特異的な治療に応答するであろう対象を同定することによって癌の「賢明な」治療をもたらすであろう。これは、多くの場合、「個々に取り扱われる療法」または「テーラーメイド医療」と呼ばれる。たとえば、卵巣癌または子宮癌バイオマーカーは、より少人数でより費用効果的な臨床試験のためのより均一な患者集団の選択を可能にすることによって、薬剤開発と関連する費用を大幅に低下させるであろう。有用なバイオマーカーはまた、臨床開発の早期段階においてどの作用物質を追求するべきかに関しての決定を促進することによって薬剤開発を加速することもできる。好結果の診断またはスクリーニング試験および治療薬またはワクチンの標的の両方となり得る標的を強調することによって、著しい進歩が可能となり得る。
【０２５０】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒシグネチャを同定するために対象の腫瘍を表現型で表すための手段を提供する。この対象は、おそらく、ＳＡＳ１Ｒ標的療法から利益を得るであろう。そのような療法は、それらの非選択的なメカニズムの作用により衰弱、脱毛、下痢、および貧血を誘発するより従来の化学療法剤の前に使用される第１のまたは「最前線の」療法となり得る。
【０２５１】
本発明は、癌細胞におけるアクチン分布を改変し、細胞の形を改変することをさらに提供し、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体と当該細胞を接触させることを含み、当該抗体は、ＳＡＳ１Ｒと結合し、細胞のアクチン分布は、改変し、細胞の形は、改変する。
【０２５２】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒに対する免疫応答を誘発するためにＳＡＳ１Ｒならびにその断片および相同体を利用するための組成物ならびに方法をさらに提供する。一態様では、ＳＡＳ１Ｒまたはその抗原性断片もしくは相同体の投与は、ＳＡＳ１Ｒの阻害をもたらす。一態様では、そのような免疫原性応答および結果として生じるＳＡＳ１Ｒ機能の阻害。
【０２５３】
子宮体癌分類は、１型および２型癌を含む。１型は、子宮内膜であり、それは最も一般的なものであり、ホルモンによって促進され、ほとんどが下位の段階で検出され、進行が遅い。２型（ＵＰＳＣ、ＭＭＴ、明細胞）は、攻撃的であり、生存が低い。米国では、毎年、子宮癌の約４０，０００の新しい症例があり、このうちの約７，５００人が死亡する。子宮癌の早期発見およびモニタリングのためのスクリーニングアッセイはない。データは、ＳＡＳ１Ｒが、予想外に、ＭＭＭＴ（悪性ミュラー管混合腫瘍）として知られている子宮癌の形態をした子宮癌マーカーであることを本明細書において開示した。２型子宮内膜癌腫のうちで、ＭＭＭＴ（肉腫様癌とも呼ばれる）は、複雑な生物学を有し、間葉系の分化を伴う上皮（腺）構成成分を含む。ＵＰＳＣは、ＰＴＥＮ突然変異を有し、上皮癌であり、移植癌である。
【０２５４】
ＭＭＭＴは、典型的に、子宮口を突き出るポリープ状の塊として存在する。それは、癌腫および肉腫の組織学的特徴を有する癌腫である（肉腫様癌）。このタイプの癌は、主に、閉経後の女性において生じる。ＭＭＭＴは、子宮内膜悪性疾患のおよそ１０％を占める。
【０２５５】
多くの研究は、診断の時に、癌患者が、既に、彼または彼女の血流内に流血中癌細胞を有することを実証している。血液の１ミリリットル毎に５または１０の癌細胞が見つけられるのは珍しいことではない。これは、診断の時に、何千もの癌細胞が、転移の可能性として、事実上すべての器官中に存在することは珍しいことではないことを意味する。これらの細胞のごく一部分の生存さえ、転移の発生をもたらし、患者の生存を低下させるであろう。
【０２５６】
以下は、有用な哺乳動物のＳＡＳ１Ｒ配列である。
【０２５７】
マウスＳＡＳ１Ｒ変異体１、４３５残基（配列番号１９）−
MGIMGSLWPWILTMLSLLGLSMGAPSASRCSGVCSTSVPEGFTPEGSPVFQDKDIPAINQGLISEETPESSFLVEGDIIRPSPFRLLSVTNNKWPKGVGGFVEIPFLLSRKYDELSRRVIMDAFAEFERFTCIRFVAYHGQRDFVSILPMAGCFSGVGRSGGMQVVSLAPTCLRKGRGIVLHELMHVLGFWHEHSRADRDRYIQVNWNEILPGFEINFIKSRSTNMLVPYDYSSVMHYGRFAFSWRGQPTIIPLWTSSVHIGQRWNLSTSDITRVCRLYNCSRSVPDSHGRGFEAQSDGSSLTPASISRLQRLLEALSEESGSSAPSGSRTGGQSIAGLGNSQQGWEHPPQSTFSVGALARPPQMLADASKSGPGAGADSLSLEQFQLAQAPTVPLALFPEARDKPAPIQDAFERLAPLPGGCAPGSHIREVPRD
マウスＳＡＳ１Ｒ変異体２（もとはＺＥＰ−Ｎと称された）、４１４アミノ酸残基（配列番号６）−
MGAPSASRCSGVCSTSVPEGFTPEGSPVFQDKDIPAINQGLISEETPESSFLVEGDIIRPSPFRLLSVTNNKWPKGVGGFVEIPFLLSRKYDELSRRVIMDAFAEFERFTCIRFVAYHGQRDFVSILPMAGCFSGVGRSGGMQVVSLAPTCLRKGRGIVLHELMHVLGFWHEHSRADRDRYIQVNWNEILPGFEINFIKSRSTNMLVPYDYSSVMHYGRFAFSWRGQPTIIPLWTSSVHIGQRWNLSTSDITRVCRLYNCSRSVPDSHGRGFEAQSDGSSLTPASISRLQRLLEALSEESGSSAPSGSRTGGQSIAGLGNSQQGWEHPPQSTFSVGALARPPQMLADASKSGPGAGADSLSLEQFQLAQAPTVPLALFPEARDKPAPIQDAFERLAPLPGGCAPGSHIREVPRD
マウスＳＡＳ１Ｒ変異体３（もとはＺＥＰ−変異体２と称された）、３８０アミノ酸残基（配列番号１０）−
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マウスＳＡＳ１Ｒ変異体４、４０１アミノ酸残基（配列番号２０）−
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マウスＳＡＳ１Ｒ変異体５（もとはＺＥＰ変異体１と称された）、３９２アミノ酸残基（配列番号８）−
MGAPSASRCSGVCSTSVPEGFTPEGSPVFQDKDIPAINQGLISEETPESSFLVEGDIIRPGVSHGVSFPDELSRRVIMDAFAEFERFTCIRFVAYHGQRDFVSILPMAGCFSGVGRSGGMQVVSLAPTCLRKGRGIVLHELMHVLGFWHEHSRADRDRYIQVNWNEILPGFEINFIKSRSTNMLVPYDYSSVMHYGRFAFSWRGQPTIIPLWTSSVHIGQRWNLSTSDITRVCRLYNCSRSVPDSHGRGFEAQSDGSSLTPASISRLQRLLEALSEESGSSAPSGSRTGGQSIAGLGNSQQGWEHPPQSTFSVGALARPPQMLADASKSGPGAGADSLSLEQFQLAQAPTVPLALFPEARDKPAPIQDAFERLAPLPGGCAPGSHIREVPRD
マウスＳＡＳ１Ｒ変異体６、４１３アミノ酸残基（配列番号２１）−
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ヒトＳＡＳ１Ｒ核酸配列−ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿００１００２０３６、１２９６ｂｐ  ｍＲＮＡ（配列番号２２）−
atggagggtgtagggggtctctggccttgggtgctgggtctgctctccttgccaggtgtg atcctaggagcgcccctggcctccagctgcgcaggagcctgtggtaccagcttcccagat ggcctcacccctgagggaacccaggcctccggggacaaggacattcctgcaattaaccaa gggctcatcctggaagaaaccccagagagcagcttcctcatcgagggggacatcatccgg ccgagtcccttccgactgctgtcagcaaccagcaacaaatggcccatgggtggtagtggt gtcgtggaggtccccttcctgctctccagcaagtacgatgagcccagccgccaggtcatc ctggaggctcttgcggagtttgaacgttccacgtgcatcaggtttgtcacctatcaggac cagagagacttcatttccatcatccccatgtatgggtgcttctcgagtgtggggcgcagt ggagggatgcaggtggtctccctggcgcccacgtgtctccagaagggccggggcattgtc cttcatgagctcatgcatgtgctgggcttctggcacgagcacacgcgggccgaccgggac cgctatatccgtgtcaactggaacgagatcctgccaggctttgaaatcaacttcatcaag tctcagagcagcaacatgctgacgccctatgactactcctctgtgatgcactatgggagg ctcgccttcagccggcgtgggctgcccaccatcacaccactttgggcccccagtgtccac atcggccagcgatggaacctgagtgcctcggacatcacccgggtcctcaaactctacggc tgcagcccaagtggccccaggccccgtgggagagggtcccatgcccacagcactggtagg agccccgctccggcctccctatctctgcagcggcttttggaggcactgtcggcggaatcc aggagccccgaccccagtggttccagtgcgggaggccagcccgttcctgcagggcctggg gagagcccacatgggtgggagtcccctgccctgaaaaagctcagtgcagaggcctcggca aggcagcctcagaccctagcttcctccccaagatcaaggcctggagcaggtgcccccggt gttgctcaggagcagtcctggctggccggagtgtccaccaagcccacagtcccatcttca gaagcaggaatccagccagtccctgtccagggaagcccagctctgccagggggctgtgta cctagaaatcatttcaaggggatgtccgaagattaa
ヒトＳＡＳ１Ｒタンパク質−４３１アミノ酸、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＰ＿００１００２０３６．３（配列番号２３）−
MEGVGGLWPWVLGLLSLPGVILGAPLASSCAGACGTSFPDGLTPEGTQASGDKDIPAINQGLILEETPESSFLIEGDIIRPSPFRLLSATSNKWPMGGSGVVEVPFLLSSKYDEPSRQVILEALAEFERSTCIRFVTYQDQRDFISIIPMYGCFSSVGRSGGMQVVSLAPTCLQKGRGIVLHELMHVLGFWHEHTRADRDRYIRVNWNEILPGFEINFIKSQSSNMLTPYDYSSVMHYGRLAFSRRGLPTITPLWAPSVHIGQRWNLSASDITRVLKLYGCSPSGPRPRGRGSHAHSTGRSPAPASLSLQRLLEALSAESRSPDPSGSSAGGQPVPAGPGESPHGWESPALKKLSAEASARQPQTLASSPRSRPGAGAPGVAQEQSWLAGVSTKPTVPSSEAGIQPVPVQGSPALPGGCVPRNHFKGMSED
【０２５８】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒを検出するための本明細書において示される技術を包含し、当業者は、同様に他の技術を使用することができることを十分に理解するであろう。タンパク質の検出および測定は、多くの方法において行うことができる。たとえば、有用な方法は、たとえば、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析を実行することを含み、これは、ＴｈｅｒｍｏＦｉｎｎｉｇａｎ  Ｓｕｒｖｅｙｏｒ  ＨＰＬＣポンプおよびマイクロエレクトロスプレー供給源を装備し、ＴｈｅｒｍｏＦｉｎｎｉｇａｎ  Ｘｃａｌｉｂｕｒバージョン１．２システム制御およびデータ分析ソフトウェアにより操作されるＴｈｅｒｍｏＦｉｎｎｉｇａｎ  ＬＣＱ  ＤｅｃａイオントラップＭＳ機器で実行することができる。試料の分析は、アセトニトリル勾配および１００μｍ  ＩＤ、３６０μｍ  ＯＤ、および５〜１５μｍチップ開口部を有するＭｏｎｉｔｏｒ  Ｃ１８（Ｃｏｌｕｍｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ）充填チップにより実行することができる。ＨＰＬＣポンプからの流れは、５００ｎＬ〜１μｌの流速を達成するために充填チップから分離することができる。「急速」および「通常」の２つの勾配を、分析されている試料の複雑さに依存して使用することができる。
【０２５９】
タンパク質は、タンデム質量分光分析にかけ、ペプチド配列を得ることができる。
【０２６０】
一実施形態では、本発明は、薬学的に許容できるキャリアおよびＳＡＳ１Ｒまたはその相同体、断片、もしくは誘導体を含む医薬組成物であって、当該タンパク質は、対象において免疫応答を誘発することができる、医薬組成物を提供する。一態様では、方法は、ワクチンとしてまたは治療として有用である。一態様では、本発明は、当該卵タンパク質またはペプチドが、配列番号６、８、１０、１９、２０、２１、および２３ならびにその断片および相同体からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む医薬組成物を提供する。
【０２６１】
一実施形態では、卵タンパク質をコードする核酸配列を含む少なくとも１つの単離核酸は、投与される。一態様では、卵タンパク質は、配列番号６、８、１０、１９、２０、２１、および２３からなる群から選択される配列ならびにその断片および相同体を含む。
【０２６２】
投与されたタンパク質またはタンパク質をコードする配列を含む、投与された単離核酸によって発現されるタンパク質は、ＳＬＬＰ１およびＳＡＳ１Ｒの相互作用または結合を阻害するように作用することができる。
【０２６３】
本発明はまた、ＳＡＳ１Ｒを検出するために、ＳＡＳ１Ｒと結合するまたは相互作用することができる少なくとも１つのＳＬＬＰ１タンパク質または生物学的に活性なその相同体および断片を投与することを提供する。一態様では、ＳＬＬＰ１タンパク質は、標識される。
【０２６４】
もちろん、本発明のタンパク質またはペプチドが、活性に影響を与えることなく修飾されたアミノ酸残基を組み込んでもよいことが十分に理解されるであろう。たとえば、末端は、ブロック基、つまり、おそらく化合物の機能に影響を与えるであろう、その末端での化合物の任意のタイプの酵素的、化学的、または生化学的破壊、つまり、その末端での化合物の連続的な分解を包含するように意味する用語である「望ましくない分解」からＮおよびＣ末端を保護するおよび／または安定化するのに適した化学的な置換基を含むように誘導体化されてもよい。
【０２６５】
ブロック基は、ペプチドのインビボ活性に悪影響を及ぼさないであろうペプチド化学の当技術分野において従来より使用されている保護基を含む。たとえば、適したＮ末端ブロック基は、Ｎ末端のアルキル化またはアシル化によって導入することができる。適したＮ末端ブロック基の例は、Ｃ１〜Ｃ５分岐または非分岐アルキル基、ホルミルおよびアセチル基などのようなアシル基、ならびにアセトアミドメチル（Ａｃｍ）基などのようなその置換形態を含む。アミノ酸のデスアミノアナログもまた、有用なＮ末端ブロック基であり、ペプチドのＮ末端に結び付けることができるまたはＮ末端残基の代わりに使用することができる。Ｃ末端のカルボキシル基が組み込まれるまたは組み込まれない適したＣ末端ブロック基は、エステル、ケトン、またはアミドを含む。エステルまたはケトン形成アルキル基、メチル、エチル、およびプロピルなどのような特に下級のアルキル基、ならびに第一級アミン（−ＮＨ２）などのようなアミド形成アミノ基ならびにメチルアミノ、エチルアミノ、ジメチルアミノ、ジエチルアミノ、メチルエチルアミノ、およびその他同種のものなどのようなモノおよびジアルキルアミノ基は、Ｃ末端ブロック基の例である。アグマチンなどのような脱カルボキシルアミノ酸類似体もまた、有用なＣ末端ブロック基であり、ペプチドのＣ末端残基に結び付けることができるまたはその代わりに使用することができる。さらに、ペプチド活性に影響を与えることなく、そのデスアミノおよび脱カルボキシル形態を産出するために、末端の遊離アミノおよびカルボキシル基をすべてペプチドから除去することができることが十分に理解されるであろう。
【０２６６】
他の修飾もまた、活性に悪影響を及ぼすことなく組み込むことができ、これらは、１つまたは複数の天然Ｌ−異性体形態のアミノ酸の、Ｄ−異性体形態のアミノ酸との置換を含むが、これらに限定されない。したがって、ペプチドは、１つまたは複数のＤ−アミノ酸残基を含んでいてもよいまたはすべてＤ−形態をしているアミノ酸を含んでいてもよい。本発明に従うペプチドのレトロインベルソ形態、たとえば、アミノ酸がすべてＤ−アミノ酸形態と置換されている逆方向のペプチドもまた企図される。
【０２６７】
本発明の酸付加塩もまた、機能的等価物として企図される。したがって、ペプチドの水溶性の塩を提供するために、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、およびその他同種のものなどのような無機酸または酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、リンゴ酸、マロン酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸、およびその他同種のものなどのような有機酸により処理された本発明に従うペプチドは、本発明における使用に適している。
【０２６８】
修飾（通常、一次配列を改変しない）は、ポリペプチドのインビボまたはインビトロにおける化学的な誘導体化、たとえばアセチル化またはカルボキシル化を含む。グリコシル化の修飾、たとえば、その合成およびプロセシングの間に、ポリペプチドのグリコシル化パターンを修飾することによってまたはさらなるプロセシング工程において、たとえば、グリコシル化に影響を与える酵素、たとえば哺乳動物のグリコシル化または脱グリコシル酵素にポリペプチドを曝露することによって生成されるものもまた、含まれる。リン酸化されたアミノ酸残基、たとえばホスホチロシン、ホスホセリン、またはホスホトレオニンを有する配列もまた、包含される。
【０２６９】
タンパク分解性の分解に対するそれらの抵抗性を改善するためにまたは溶解性の特性を最適化するためにまたはそれらを治療剤としてより適したようにするために通常の分子生物学的技術を使用して修飾されたポリペプチドもまた、含まれる。そのようなポリペプチドのアナログは、天然に存在するＬ−アミノ酸以外の残基、たとえばＤ−アミノ酸または天然に存在しない合成アミノ酸を含有するものを含む。本発明のペプチドは、本明細書において列挙される特定の例示的なプロセスのいずれかの産物に限定されない。
【０２７０】
本発明において有用な核酸は、限定ではなく、例として、アンチセンスＤＮＡおよび／またはＲＮＡなどのようなオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチド；リボザイム；遺伝子療法のためのＤＮＡ；ウイルスＤＮＡおよび／またはＲＮＡを含むウイルス断片；ＤＮＡおよび／またはＲＮＡキメラ；ｍＲＮＡ；プラスミド；コスミド；ゲノムＤＮＡ；ｃＤＮＡ；遺伝子断片；一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、スーパーコイルＤＮＡ、および／または三重らせんＤＮＡを含むＤＮＡの様々な構造形態；Ｚ−ＤＮＡ；ならびにその他同種のものを含む。核酸は、大量に核酸を調製するために典型的に使用される任意の従来の手段によって調製されてもよい。たとえば、ＤＮＡおよびＲＮＡは、当技術分野においてよく知られている方法によって、市販で入手可能な試薬および合成装置を使用して、化学的に合成されてもよい［たとえばＧａｉｔ，１９８５，ＯＬＩＧＯＮＵＣＬＥＯＴＩＤＥ  ＳＹＮＴＨＥＳＩＳ：Ａ  ＰＲＡＣＴＩＣＡＬ  ＡＰＰＲＯＡＣＨ（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ，Ｅｎｇｌａｎｄ）を参照されたい］。ＲＮＡは、ＳＰ６５（Ｐｒｏｍｅｇａ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）などのようなプラスミドを使用してインビトロ転写による高収率で産生されてもよい。
【０２７１】
抗体およびそれらの調製
本発明のタンパク質、ポリペプチド、またはそのペプチド断片に対して導かれる抗体は、当技術分野においてよく知られている方法を使用して生成されてもよい。たとえば、その全体が参照によって本明細書において組み込まれる米国特許出願第０７／４８１，４９１号は、ペプチドに対する抗体を産生するための方法を開示する。抗体の産生のために、ウサギ、マウス、およびラットを含むが、これらに限定されない様々な宿主動物は、ポリペプチドまたはそのペプチド断片による注射によって免疫化することができる。免疫学的応答を増加させるために、フロインド（完全および不完全）、水酸化アルミニウムなどのような鉱物ゲル、リソレシチンなどのような表面活性物質、プルロニックポリオール、ポリアニオン、ペプチド、油乳剤、キーホールリンペットヘモシニアン、ジニトロフェノール、ならびにＢＣＧ（カルメット−ゲラン桿菌）およびｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐａｒｖｕｍなどのような可能性として有用なヒトアジュバントを含むが、これらに限定されない様々なアジュバントは、宿主種に依存して使用されてもよい。
【０２７２】
一実施形態では、ＳＡＳ１Ｒまたはその相同体もしくは断片に対して導かれる抗体または抗血清は、他の分子または細胞と相互作用するその能力を含む、ＳＡＳ１Ｒの活性をブロックするのに有用である。
【０２７３】
ＳＡＳ１Ｒの断片は、生成されてもよく、抗体は、断片に対して調製されてもよい。アッセイは、抗体に対して導かれるＳＡＳ１Ｒまたはその断片が、ＳＡＳ１Ｒを検出する、ＳＡＳ１Ｒ活性を阻害する、またはＳＡＳ１Ｒ機能を調節する能力を有するかどうかを決定するために本明細書において提供される。
【０２７４】
アッセイは、ＳＡＳ１ＲがＳＬＬＰタンパク質と結合するまたは相互作用する能力および抗体が受精におけるＳＡＳ１Ｒの役割をブロックする能力を測定することを含む。たとえば、ＳＡＳ１Ｒに導かれる抗体を使用するインビトロ受精アッセイは、本明細書において記載され、このタイプのアッセイは、新しい抗体がＳＡＳ１Ｒの機能をブロックする能力を試験するために使用することができる。これらの同じアッセイは、任意の化合物または作用物質が、ＳＬＬＰタンパク質とのＳＡＳ１Ｒの相互作用を破壊するまたは受精を阻害する能力を試験するために使用することができる。ＳＡＳ１Ｒプロテアーゼ活性を測定するためのプロテアーゼアッセイはまた、ＳＡＳ１Ｒの断片または相同体が親ＳＡＳ１Ｒ分子と同じ活性を維持することを確認するために必要である場合にも、利用可能である。
【０２７５】
ＳＡＳ１Ｒの断片を調製し、ＳＡＳ１Ｒに対する抗体を生成する様々な方法は、利用可能であり、これらの方法は、抗体による阻害に感受性のＳＡＳ１Ｒの様々な領域をマッピングするために使用することができる。
【０２７６】
たとえば、ＳＡＳ１Ｒの断片は、抗体が、ＳＡＳ１Ｒ変異体２（配列番号６）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、および４０１〜４１４を含む１つまたは複数の断片に結合するまたは抗体が、ＳＡＳ１Ｒ変異体１（配列番号１９）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、および４２６〜４３５を含む１つまたは複数の断片に結合するまたは抗体が、ＳＡＳ１Ｒ変異体１（配列番号２３）のアミノ酸１〜２５、２６〜５０、５１〜７５、７６〜１００、１０１〜１２５、１２６〜１５０、１５１〜１７５、１７６〜２００、２０１〜２２５、２２６〜２５０、２５１〜２７５、２７６〜３００、３０１〜３２５、３２６〜３５０、３５１〜３７５、３７６〜４００、４０１〜４２５、および４２６〜４３１に結合するなどのように、抗原としての使用のために調製することができる。本発明は、アミノ酸残基１〜２０、２１〜４０、４１〜６０などのような２０のアミノ酸を含む断片をさらに包含する。そのような技術はまた、完全長タンパク質にも適用することができる。
【０２７７】
もちろん、これらの断片はまた、重複配列を産出するためにも調製することができ、より長いおよびより短い断片を調製することができる。たとえば、本明細書において記載されるように、ＳＬＬＰ１およびＳＡＳ１Ｒとの間の相互作用実験は、それらが相互作用する場合、異なる機能を有し得る、２つのタンパク質の間の少なくとも２つの結合領域があることを示す。そこで、抗体がアミノ酸約１〜約１２１（Ｎ末端）に結合するまたはＳＡＳ１Ｒ（配列番号６）の約２０４〜約４１４（よりＣ末端）に結合する抗体または配列番号２３（ヒトＳＡＳ１Ｒ）の類似領域に結合する抗体などのように、ＳＡＳ１ＲのよりＮ末端の領域またはＳＡＳ１ＲのよりＣ末端の領域のセクションを包含する断片を調製することができる。
【０２７８】
本発明のタンパク質の抗原性断片は、長さが少なくとも約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１１５、１２０、１２５、１３０、１３５、１４０、１４５、１５０、または約２００までのアミノ酸であるペプチド抗原を含んでいてもよい。完全長未処理タンパク質および成熟処理タンパク質もまた、含まれる。これらの様々な長さの抗原性断片は、ＳＡＳ１Ｒなどのような最適な免疫原の直線状アミノ酸配列の縦並びの順序で設計されてもよいまたはタンパク質の直線状配列において互い違いに配置されてもよい。さらに、三次元エピトープ、つまり非直線状エピトープに対する抗体もまた、たとえばタンパク質の結晶データに基づいて調製することができる。宿主はまた、所望の標的配列を包含する異なる長さのペプチドを注射されてもよい。その注射から得られる抗体は、ＳＡＳ１Ｒの短い抗原および成熟ＳＡＳ１Ｒに対してスクリーニングされてもよい。ＳＡＳ１Ｒペプチドに対して調製される抗体は、そのペプチドおよび完全長ＳＡＳ１Ｒタンパク質に対する活性について試験されてもよい。抗体は、ＳＡＳ１Ｒペプチドおよび／または完全長ＳＡＳ１Ｒタンパク質に対して、少なくとも約１０−６Ｍ、１０−７Ｍ、１０−８Ｍ、１０−９Ｍ、１０−１０Ｍ、１０−１１Ｍ、または１０−１２Ｍの親和性を有していてもよい。
【０２７９】
一実施形態では、本発明は、本発明の医薬組成物を含む治療癌ワクチンであって、当該組成物は、配列番号６、８、１０、１９、２０、２１、および２３からなる群から選択される配列ならびにその断片および相同体を含む、１つまたは複数のタンパク質またはその変異体、相同体、もしくは断片ならびに所望により、少なくとも１つの他の卵タンパク質またはその変異体、断片、もしくは相同体を含む、治療癌ワクチンを提供する。
【０２８０】
正常細胞におけるＳＡＳ１Ｒの一時的に調節される発現のために、死滅され得るいかなる細胞も、早期段階の生殖細胞を含まないであろう。
【０２８１】
モノクローナル抗体の調製のために、培養中の連続細胞株による抗体分子の生産を提供する任意の技術が、利用されてもよい。たとえば、Ｋｏｈｌｅｒ  ａｎｄ  Ｍｉｌｓｔｅｉｎ  （１９７５，Ｎａｔｕｒｅ  ２５６：４９５−４９７）によって最初に開発されたハイブリドーマ技術、トリオーマ技術、ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｚｂｏｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９８３，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  Ｔｏｄａｙ  ４：７２）、およびＥＢＶ−ハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅ  ｅｔ  ａｌ．，１９８５，ｉｎ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，ｐｐ．７７−９６）は、ヒトモノクローナル抗体を産生するために用いられてもよい。他の実施形態では、モノクローナル抗体は、無菌動物において産生される。
【０２８２】
一実施形態では、本明細書において記載されるモノクローナル抗体および抗体を生成するハイブリドーマならびに本明細書において記載されないものは、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（１０８０１  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｂｏｕｌｅｖａｒｄ，Ｍａｎａｓｓａｓ，Ｖａ．２０１１０−２２０９）に委託され、受託番号を指定されるであろう。委託物は、Ｂｕｄａｐｅｓｔ  Ｔｒｅａｔｙ  ｏｎ  ｔｈｅ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｄｅｐｏｓｉｔ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｐｕｒｐｏｓｅｓ  ｏｆ  Ｐａｔｅｎｔ  Ｐｒｏｃｅｄｕｒｅの条項の下で維持され、それらの条項の下で使用のために利用可能になるであろう。これは、委託の日付から３０年間、委託物の生きた培養物の維持を確実にする。委託物は、Ｂｕｄａｐｅｓｔ  Ｔｒｅａｔｙの条項の下でＡＴＣＣによって利用可能であり、関連する米国特許の発行またはあらゆる米国または外国特許出願の公衆への公開のいずれか早い方に、公衆に対する委託物の培養物の子孫の永久的な無制限の利用可能性を確実にする、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  ＶｉｒｇｉｎｉａおよびＡＴＣＣの間の協定に従うものとし、また、米国特許法１２２条によって権利を与えられるＵ．Ｓ．Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎｅｒ  ｏｆ  Ｐａｔｅｎｔｓ  ａｎｄ  Ｔｒａｄｅｍａｒｋｓおよびそれに準ずる長官の規則（特に８８６  ＯＧ  ６３８に関する米国特許法施行規則１．１４を含む）によって決定されたものに対する子孫の利用可能性を確実にする。本出願の受託者は、委託の物質の培養物が、適した条件下で培養された場合に、死亡する、失われる、または破壊される場合、物質は、同種類の他のものと、通知と同時に速やかに取り替えられるであろうということに同意している。委託された物質の利用可能性は、その特許法に従ってあらゆる政府の権利の下で与えられた権利に違反して本発明を実施するためのライセンスとして解釈されない。核酸およびアミノ酸配列は、ＧｅｎＢａｎｋに委託され、公衆に入手可能となるであろう。
【０２８３】
本発明に従って、ヒト抗体は、使用されてもよく、ヒトハイブリドーマを利用することによって（Ｃｏｔｅ  ｅｔ  ａｌ．，１９８３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８０：２０２６−２０３０）またはインビトロにおいてＥＢＶウイルスによりヒトＢ細胞を形質転換することによって（Ｃｏｌｅ  ｅｔ  ａｌ．，１９８５，ｉｎ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，ｐｐ．７７−９６）得られてもよい。さらに、ＳＬＬＰポリペプチドのエピトープに対して特異的なマウス抗体分子由来の遺伝子を適切な生物学的活性のヒト抗体分子由来の遺伝子と一緒に継ぎ合わせることによる、「キメラ抗体」の産生のために開発された技術（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８１：６８５１−６８５５；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９８４，Ｎａｔｕｒｅ  ３１２：６０４−６０８；Ｔａｋｅｄａ  ｅｔ  ａｌ．，１９８５，Ｎａｔｕｒｅ  ３１４：４５２−４５４）を用いることができ、そのような抗体は、本発明の範囲内にある。一度、特異的なモノクローナル抗体が開発されたら、従来の技術によるその突然変異体および変異体の調製もまた利用可能となる。
【０２８４】
一実施形態では、単鎖抗体の産生のために記載される技術（その全体が本明細書において参照によって組み込まれる米国特許第４，９４６，７７８号）は、タンパク質特異的単鎖抗体を産生するのに適している。他の実施形態では、Ｆａｂ発現ライブラリーの構築のために記載される技術（Ｈｕｓｅ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４６：１２７５−１２８１）は、本発明の特異的な抗原、タンパク質、誘導体、またはアナログに対して所望の特異性を有するモノクローナルＦａｂ断片の迅速で容易な同定を可能にするために利用される。
【０２８５】
抗体分子のイディオタイプを含有する抗体断片は、知られている技術によって生成することができる。たとえば、そのような断片は、抗体分子のペプシン消化によって産生することができるＦ（ａｂ’）２断片；Ｆ（ａｂ’）２断片のジスルフィドブリッジを還元することによって生成することができるＦａｂ’断片；パパインおよび還元剤により抗体分子を処理することによって生成することができるＦａｂ断片；ならびにＦｖ断片を含むが、これらに限定されない。
【０２８６】
ポリクローナル抗体の生成は、抗原を所望の動物に接種し、それ由来の抗原に特異的に結合する抗体を単離することによって達成される。
【０２８７】
タンパク質またはペプチドの完全長またはペプチド断片に対して導かれるモノクローナル抗体は、たとえば、Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．（１９８８，Ｉｎ：Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ）およびＴｕｓｚｙｎｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．（１９８８，Ｂｌｏｏｄ，７２：１０９−１１５）において記載されるものなどのような、任意のよく知られているモノクローナル抗体調製手順を使用して調製されてもよい。多量の所望のペプチドもまた、化学合成技術を使用して合成されてもよい。その代わりに、所望のペプチドをコードするＤＮＡは、クローニングされ、大量のペプチドの生成に適した細胞において適切なプロモーター配列から発現されてもよい。ペプチドに対して導かれるモノクローナル抗体は、本明細書において参照される標準の手順を使用して、ペプチドにより免疫化されたマウスから生成される。
【０２８８】
本明細書において記載される手順を使用して得られるモノクローナル抗体をコードする核酸は、当技術分野において利用可能であり、たとえば、Ｗｒｉｇｈｔ  ｅｔ  ａｌ．  （１９９２，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖ．ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．１２（３，４）：１２５−１６８）およびその中に引用される参考文献において記載される技術を使用してクローニングされ、配列決定されてもよい。さらに、本発明の抗体は、Ｗｒｉｇｈｔ  ｅｔ  ａｌ．（前掲）、その中に引用される参考文献、およびＧｕ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７，Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ  ａｎｄ  Ｈｅｍａｔｏｃｙｓｔ  ７７（４）：７５５−７５９）において記載される技術を使用して「ヒト化されてもよい」。
【０２８９】
ファージ抗体ライブラリーを生成するために、ｃＤＮＡライブラリーは、ファージ表面上に発現されることとなる所望のタンパク質、たとえば所望の抗体を発現する細胞、たとえばハイブリドーマから単離されるｍＲＮＡから最初に得られる。ｍＲＮＡのｃＤＮＡコピーは、逆転写酵素を使用して産生される。免疫グロブリン断片を特定するｃＤＮＡは、ＰＣＲによって得られ、結果として生じるＤＮＡは、免疫グロブリン遺伝子を特定するＤＮＡを含むバクテリオファージＤＮＡライブラリーを生成するために、適したバクテリオファージベクターの中にクローニングされる。異種ＤＮＡを含むバクテリオファージライブラリーを生成するための手順は、当技術分野においてよく知られており、たとえば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．（１９８９，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ）において記載される。
【０２９０】
所望の抗体をコードするバクテリオファージは、タンパク質が、それがその対応する結合タンパク質、たとえば抗体が導かれる抗原への結合に利用可能な様式で、その表面上にディスプレイされるように、遺伝子操作されてもよい。したがって、特異的な抗体を発現するバクテリオファージが、対応する抗原を発現する細胞の存在下においてインキュベートされる場合、バクテリオファージは、細胞に結合するであろう。抗体を発現しないバクテリオファージは、細胞に結合しないであろう。そのようなパニング技術は、当技術分野においてよく知られている。
【０２９１】
上記に記載されるものなどのようなプロセスは、Ｍ１３バクテリオファージディスプレイを使用するヒト抗体の産生のために開発されてきた（Ｂｕｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９９４，Ａｄｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．５７：１９１−２８０）。本質的に、ｃＤＮＡライブラリーは、抗体産生細胞の集団から得られるｍＲＮＡから生成される。ｍＲＮＡは、再配列された免疫グロブリン遺伝子をコードし、したがって、ｃＤＮＡは、それをコードする。増幅されたｃＤＮＡは、それらの表面上にヒトＦａｂ断片を発現するファージのライブラリーを生成するＭ１３発現ベクターの中にクローニングされる。対象とする抗体をディスプレイするファージは、抗原結合によって選択され、可溶性ヒトＦａｂ免疫グロブリンを産生するために細菌において増やされる。したがって、従来のモノクローナル抗体合成とは対照的に、この手順は、ヒト免疫グロブリンを発現する細胞ではなく、ヒト免疫グロブリンをコードするＤＮＡを不死化する。
【０２９２】
ほんの今示したばかりの手順は、抗体分子のＦａｂ部分をコードするファージの生成を記載する。しかしながら、本発明は、Ｆａｂ抗体をコードするファージの生成にもっぱら限定されるように解釈されるべきではない。むしろ、単鎖抗体（ｓｃＦｖ／ファージ抗体ライブラリー）をコードするファージもまた、本発明に含まれる。Ｆａｂ分子は、Ｉｇ軽鎖全体を含む、すなわち、それらは、軽鎖の可変および定常領域の両方を含むが、重鎖の可変領域および第１の定常領域ドメイン（ＣＨ１）のみを含む。単鎖抗体分子は、Ｉｇ  Ｆｖ断片を含むタンパク質の単鎖を含む。Ｉｇ  Ｆｖ断片は、抗体の重鎖および軽鎖の可変領域のみを含み、その中に含有される定常領域を有しない。ｓｃＦｖ  ＤＮＡを含むファージライブラリーは、Ｍａｒｋｓ  ｅｔ  ａｌ．，１９９１，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１−５９７において記載される手順に従って生成されてもよい。所望の抗体の単離のためにそのように生成されたファージのパニングは、Ｆａｂ  ＤＮＡを含むファージライブラリーについて記載されるものと同様の様式で行われる。
【０２９３】
本発明はまた、重鎖および軽鎖可変領域が、それらがほぼすべての可能な特異性を含むように合成され得る合成ファージディスプレイライブラリーを含むようにも解釈されるべきである（Ｂａｒｂａｓ，１９９５，Ｎａｔｕｒｅ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ  １：８３７−８３９；ｄｅ  Ｋｒｕｉｆ  ｅｔ  ａｌ．  １９９５，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２４８：９７−１０５）。
【０２９４】
抗体の産生では、所望の抗体についてのスクリーニングは、当技術分野において知られている技術、たとえばＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着アッセイ）によって達成することができる。本発明に従って生成される抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ（つまり「ヒト化」）抗体、ならびに単鎖（組換え）抗体、Ｆａｂ断片、およびＦａｂ発現ライブラリーによって産生される断片を含むが、これらに限定されない。
【０２９５】
本発明のペプチドは、Ｓｏｌｉｄ  Ｐｈａｓｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９８４，Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩｌｌｉｎｏｉｓにおいてＳｔｅｗａｒｔ  ｅｔ  ａｌ．によって記載されるように、また、Ｔｈｅ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，１９８４，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ  ＹｏｒｋにおいてＢｏｄａｎｓｚｋｙ  ａｎｄ  Ｂｏｄａｎｓｚｋｙによって記載されるように、固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）などのような標準の、十分に確立された技術によって容易に調製されてもよい。最初に、適切に保護されたアミノ酸残基が、架橋ポリスチレンまたはポリアミド樹脂などのような誘導体化不溶性ポリマー支持体にそのカルボキシル基を通して付加される。「適切に保護された」は、アミノ酸のα−アミノ基およびあらゆる側鎖官能基上の両方の保護基の存在を指す。側鎖保護基は、合成の全体にわたって使用される溶媒、試薬、および反応条件に対して一般に安定しており、最終ペプチド産物に影響を与えない条件下で除去可能である。オリゴペプチドの段階的合成は、最初のアミノ酸からのＮ−保護基の除去および所望のペプチドの配列における次のアミノ酸のカルボキシル末端をそれにつなぐことによって実行される。このアミノ酸もまた、適切に保護される。入って来るアミノ酸のカルボキシルは、カルボジイミド、対称酸無水物、またはヒドロキシベンゾトリアゾールもしくはペンタフルオロフェニルエステルなどのような「活性エステル」基への形成などのような、反応性基への形成によって、支持体に結合したアミノ酸のＮ末端と反応するように活性化することができる。
【０２９６】
固相ペプチド合成方法の例は、α−アミノ保護基としてｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニルを利用するＢＯＣ法およびアミノ酸残基のα−アミノを保護するために９−フルオレニルメチルオキシカルボニルを利用するＦＭＯＣ方法を含み、これらの両方の方法は、当業者らによってよく知られている。
【０２９７】
化学的または生物学的合成技術から得られるタンパク質またはペプチドが所望のペプチドであることを確実にするために、ペプチド組成物の分析は、行われるべきである。そのようなアミノ酸組成分析は、ペプチドの分子量を決定するために高分解能質量分析法を使用して行われてもよい。その代わりにまたはさらに、ペプチドのアミノ酸含有量は、水溶性の酸においてペプチドを加水分解し、ＨＰＬＣまたはアミノ酸分析機を使用して、混合物の構成成分を分離し、同定し、定量化することによって確認することができる。ペプチドを連続的に分解し、順番にアミノ酸を同定するタンパク質シークエネーターもまた、ペプチドの配列を明確に決定するために使用されてもよい。
【０２９８】
その使用に先立って、ペプチドは、混入物を除去するために精製することができる。この点に関して、適切な規制機関によって説明される基準を満たすために、ペプチドが精製されるであろうことは、十分に理解されるであろう。たとえば、Ｃ４−、Ｃ８−、またはＣ１８シリカなどのようなアルキル化シリカカラムを使用する逆相高圧液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）を含む、多くの従来の精製手順のいずれか１つが、純度の必要とされるレベルを達成するために使用されてもよい。有機含有量を増加させる勾配移動相、たとえば、通常少量のトリフルオロ酢酸を含有する水溶性の緩衝剤中のアセトニトリルは、精製を達成するために一般に使用される。イオン交換クロマトグラフィーもまた、それらの電荷に基づいてペプチドを単離するために使用することができる。
【０２９９】
本明細書において記載されるように得られた実質的に純粋なペプチドは、タンパク質精製のために以下の知られている手順によって精製されてもよく、免疫学的、酵素的、または他のアッセイは、手順におけるそれぞれの段階で精製をモニターするために使用される。たとえば、タンパク質精製方法は、当技術分野においてよく知られており、たとえばＤｅｕｔｓｃｈｅｒ  ｅｔ  ａｌ．  （ｅｄ．，１９９０，Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｈａｒｃｏｕｒｔ  Ｂｒａｃｅ  Ｊｏｖａｎｏｖｉｃｈ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ）において記載されている。
【０３００】
アプタマー
本発明または、ＳＡＳ１Ｒの機能および活性ならびにその発現レベルをブロックするための有用なアプタマーに関する。一実施形態では、アプタマーは、他の化合物（この場合、同定されるタンパク質）に対して優先的にインビトロで結合するように選択される化合物である。一態様では、アプタマーは、大量のヌクレオチドまたはアミノ酸（天然に存在するまたは合成的に生成されるものの両方）からランダム配列を容易に生成することができるので、核酸またはペプチドであるが、もちろん、これらに限定される必要はない。他の態様では、核酸アプタマーは、タンパク質標的に結合するＤＮＡの短い鎖である。一態様では、アプタマーは、オリゴヌクレオチドアプタマーである。オリゴヌクレオチドアプタマーは、対象とする特異的なタンパク質配列に結合することができるオリゴヌクレオチドである。アプタマーを同定するための一般的な方法は、部分的に縮重のオリゴヌクレオチドから始めることおよび次いで、所望のタンパク質に結合する能力について何千ものオリゴヌクレオチドを同時にスクリーニングすることである。結合したオリゴヌクレオチドは、タンパク質から溶離し、特異的な認識配列を同定するために配列決定することができる。大量の化学的に安定化されたアプタマーの細胞への移行は、対象とするポリペプチドに対する特異的な結合をもたらし、それによって、その機能をブロックすることができる。［たとえば、アプタマーのインビトロ選択を記載する以下の刊行物を参照されたい：Ｋｌｕｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｏｒｔｓ  ２０：９７−１０７（１９９４）；Ｗａｌｌｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．２：５４３−５５２（１９９５）；Ｅｌｌｉｎｇｔｏｎ，Ｃｕｒｒ．Ｂｉｏｌ．４：４２７−４２９（１９９４）；Ｌａｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．２：２９１−３０３（１９９５）；Ｃｏｎｒａｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｄｉｖ．１：６９−７８（１９９５）；およびＵｐｈｏｆｆ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．６：２８１−２８７（１９９６）］。
【０３０１】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒの機能またはレベルを阻害するかまたは予防するｐｈｙｌｏｍｅｒの使用をさらに包含する。
【０３０２】
アプタマーは、高度な親和性および特異性によりこれらの遺伝子のタンパク質産物に結合するそれらの能力により、標的遺伝子機能と人工的に干渉する他のオリゴヌクレオチドベースのアプローチと比較して長所を有する。しかしながら、ヌクレアーゼ抵抗性のアプタマーでさえ、細胞内コンパートメントに効率的に入らないので、ＲＮＡアプタマーは、細胞内タンパク質を標的にするためのそれらの能力において制限され得る。さらに、ベクターベースのアプローチを通して哺乳動物細胞内でＲＮＡアプタマーを発現する試みは、それらの機能的な立体構造を改変し得る、発現されたＲＮＡアプタマー中のさらなるフランキング配列の存在によって、妨げられてきた。
【０３０３】
タンパク質分子を標的にするために一本鎖核酸（ＤＮＡおよびＲＮＡアプタマー）を使用する考えは、それらが高度な親和性および特異性により標的タンパク質に結合するのを可能にする、短い配列（２０塩基長〜８０塩基長）が特有の３Ｄ立体構造にフォールドする能力に基づく。ＲＮＡアプタマーは、酵母および多細胞生物などのような真核細胞の内部でうまく発現されてきており、細胞環境においてそれらの標的タンパク質に対して阻害効果を有することが示されてきた。
【０３０４】
ＳＡＳ１Ｒのアンタゴニストおよび阻害剤を同定するための方法
本明細書において使用されるように、アンタゴニストまたは阻害性作用物質は、限定を伴うことなく、特定の標的タンパク質に結合する薬剤、小分子、抗体、その抗原結合性部分、または生合成抗体結合部位；標的タンパク質をコードする核酸またはそれと関連する調節エレメントにインビボにおいてハイブリダイズするアンチセンス分子、または標的タンパク質に結合するおよび／もしくはそれを阻害するまたは標的タンパク質をコードする核酸に結合するおよび／またはその発現を阻害する、低下させる、もしくはそうでなければ調整するリボザイム、アプタマー、または小分子を含んでいてもよい。
【０３０５】
本発明は、本明細書において記載されるタンパク質相互作用および経路のアゴニスト（刺激する）またはアンタゴニスト（阻害する）として作用する化合物を同定するための化合物をスクリーニングするための方法を包含する。アンタゴニスト化合物候補のためのスクリーニングアッセイは、本明細書において記載されるペプチドに結合するまたはそれと複合体を形成するまたはそうでなければ、他の細胞性タンパク質とのペプチドの相互作用に干渉する化合物を同定するように設計される。そのようなスクリーニングアッセイは、化学的ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適用可能なアッセイを含み、それらを小分子薬剤候補を同定するのに特に適するようにするであろう。
【０３０６】
ＳＡＳ１Ｒアッセイはまた、ファーウエスタン、免疫共沈降、イムノアッセイ、免疫細胞化学的／免疫学的局在決定、ＳＬＬＰタンパク質との相互作用、受精、避妊、および免疫原性などのような、本明細書において詳細に記載されるものを含む。
【０３０７】
アッセイは、当技術分野において十分に特徴付けられている、タンパク質間結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、ハイスループットアッセイ、イムノアッセイ、および細胞ベースのアッセイを含む様々な形式において実行することができる。
【０３０８】
アンタゴニストについてのアッセイはすべて、それらが、これらの２つの構成成分が相互作用するのを可能にするのに十分な条件下でおよびその時間、化合物または薬剤候補を本明細書において同定されるペプチドと接触させることを必要とするという点で、共通している。
【０３０９】
結合アッセイでは、相互作用は、結合であり、形成される複合体は、反応混合物において単離するまたは検出することができる。特定の実施形態では、本明細書において記載される複合体のペプチドの１つまたは試験化合物または薬剤候補は、共有結合または非共有結合によって、固相上に、たとえばマイクロタイタープレート上に固定される。非共有結合は、一般に、ペプチドの溶液により固体表面をコートすることおよび乾燥させることによって達成される。その代わりに、固定されることとなるペプチドに対して特異的な固定された抗体、たとえばモノクローナル抗体は、固体表面にそれを固定するために使用することができる。アッセイは、検出可能な標識によって標識されてもよい、固定されていない構成成分を、固定された構成成分、たとえば固定された構成成分を含有するコートされた表面に添加することによって実行される。反応が完了したら、反応しなかった構成成分は、たとえば洗浄によって除去され、固体表面上に固定された複合体が、検出される。最初に固定されていない構成成分が検出可能な標識を保持する場合、表面上に固定された標識の検出は、複合体形成が生じたことを示す。最初に固定されていない構成成分が標識を保持しない場合、複合体形成は、たとえば、固定された複合体に特異的に結合する標識抗体を使用することによって検出することができる。
【０３１０】
候補化合物が、本明細書において同定される特定のペプチドと相互作用するが、それに結合しない場合、そのペプチドとのその相互作用は、タンパク質間相互作用を検出するための、よく知られている方法によってアッセイすることができる。そのようなアッセイは、たとえば、架橋、免疫共沈降、および勾配またはクロマトグラフィーカラムを通しての同時精製などのような従来のアプローチを含む。さらに、タンパク質間相互作用は、Ｃｈｅｖｒａｙ  ａｎｄ  Ｎａｔｈａｎｓ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：５７８９−５７９３（１９９１）によって開示されるように、Ｆｉｅｌｄｓおよび共同研究者ら（Ｆｉｅｌｄｓ  ａｎｄ  Ｓｏｎｇ，Ｎａｔｕｒｅ（Ｌｏｎｄｏｎ），３４０：２４５−２４６（１９８９）；Ｃｈｉｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８８：９５７８−９５８２（１９９１））によって記載される酵母ベースの遺伝子系を使用することによってモニターすることができる。ツーハイブリッド技術を使用して、２つの特異的なタンパク質の間のタンパク質間相互作用を同定するための完全なキットが、入手可能である。この系はまた、特異的なタンパク質相互作用に関与するタンパク質ドメインをマッピングするおよびこれらの相互作用にとって重大なアミノ酸残基を正確に示すために拡張することができる。
【０３１１】
本明細書において同定されるペプチドおよび他の細胞内または細胞外構成成分の相互作用に干渉する化合物は、以下のように試験することができる。通常、２つの産物の相互作用および結合を可能にする条件下でおよびその時間、遺伝子および細胞内または細胞外構成成分の産物を含有する反応混合物が、調製される。候補化合物が結合を阻害する能力を試験するために、反応は、試験化合物の非存在下および存在下において実行される。さらに、プラセボは、陽性対照として働くように、第３の反応混合物に添加されてもよい。混合物中に存在する試験化合物および細胞内または細胞外構成成分の間の結合（複合体形成）は、上記に記載されるようにモニターされる。試験化合物を含有する反応混合物ではなく、対照の反応（複数可）における複合体の形成は、試験化合物が、試験化合物およびその反応パートナーの相互作用に干渉することを示す。
【０３１２】
アンタゴニストについてアッセイするために、ペプチドは、特定の活性についてスクリーニングされることとなる化合物と共に細胞に添加されてもよく、化合物がペプチドの存在下において対象とする活性を阻害する能力は、化合物が、ペプチドに対するアンタゴニストであることを示す。ペプチドは、放射活性などによって、標識することができる。
【０３１３】
他のアッセイおよびライブラリーは、ｐｈｙｌｏｍｅｒ（登録商標）およびリバース酵母ツーハイブリッドアッセイ（ｒｅｖｅｒｓｅ  ｙｅａｓｔ  ｔｗｏ−ｈｙｂｒｉｄ  ａｓｓａｙ）の使用などのように本発明の範囲内に包含される（Ｗａｔｔ，２００６，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２４：１７７；Ｗａｔｔ、米国特許第６，９９４，９８２号；Ｗａｔｔ、米国特許出願公開第２００５／０２８７５８０号；Ｗａｔｔ、米国特許第６，５１０，４９５番号；Ｂａｒｒ  ｅｔ  ａｌ．，２００４，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７９：４１：４３１７８−４３１８９を参照されたい；これらの刊行物のそれぞれの内容は、それらの全体が本明細書において参照によってこれによって組み込まれる）。Ｐｈｙｌｏｍｅｒ（登録商標）は、天然タンパク質のサブドメインに由来し、これは、それらを、従来の短いランダムペプチドよりも可能性として安定させる。Ｐｈｙｌｏｍｅｒ（登録商標）は、起源がヒトでない生物学的ゲノムから手に入れられる。この特徴は、ヒトタンパク質標的に対する、Ｐｈｙｌｏｍｅｒ（登録商標）と関連する効力を著しく増強する。Ｐｈｙｌｏｇｉｃａの現在のＰｈｙｌｏｍｅｒ（登録商標）ライブラリーは、５０百万クローンの複雑さを有し、これは、ランダムペプチドまたは抗体Ｆａｂ断片ライブラリーの数の複雑さと同等である。Ｂ４２活性化ドメインに融合された、６３百万ペプチドからなる相互作用ペプチドライブラリーは、フォワード酵母２ハイブリッドスクリーニング（ｆｏｒｗａｒｄ  ｙｅａｓｔ  ｔｗｏ  ｈｙｂｒｉｄ  ｓｃｒｅｅｎ）において標的タンパク質に結合することができるペプチドを単離するために使用することができる。次は、リバースツーハイブリッド系を使用して特異的なタンパク質相互作用を破壊することができるペプチドをスクリーニングするために使用することができる２百万を超えるペプチドから構成されるブロッキングペプチドライブラリーである。
【０３１４】
Ｐｈｙｌｏｍｅｒ（登録商標）ライブラリーは、多様な範囲の細菌ゲノムから手に入れられるタンパク質断片からなる。ライブラリーは、安定したサブドメイン（１５〜５０アミノ酸長）について非常に豊富である。この技術は、ファージディスプレイおよびリバース酵母ツーハイブリッドトラップなどのようなハイスループットスクリーニング技術と統合することができる。
【０３１５】
本出願は、本明細書において記載されるタンパク質を阻害するための組成物および方法を開示し、当技術分野において知られている開示されていないものは、本発明の範囲内に包含される。たとえば、様々な修飾因子／エフェクター、たとえば抗体、アンチセンス分子、ＲＮＡｉ分子、もしくはリボザイムなどのような生物学的に活性な核酸、アプタマー、ペプチド、または当該ポリヌクレオチドもしくはポリペプチドを認識する低分子量有機化合物が、知られている。
【０３１６】
本発明はまた、本発明の化合物を含む医薬および治療組成物をも包含する。
【０３１７】
本発明はまた、本発明の化合物を含む医薬組成物にも関する。特に、そのような化合物は、当業者らに知られている標準の薬学的に許容できるキャリア、増量剤、可溶化剤、および安定剤を使用して、医薬組成物として製剤することができる。
【０３１８】
ワクチンおよび免疫原
一実施形態では、本発明は、そのような特異的な抗原に対して特異的な細胞性および体液性免疫応答を誘発するために、ＳＡＳ１Ｒならびにその断片および相同体などのような本発明の抗原性化合物により対象を免疫化するおよび治療するための方法および試薬に関する。本発明は、新鮮なまたは凍結乾燥されたリポソーム中の調製された免疫原、免疫原の投与の適切なルート、免疫原の適切な用量、ならびに細胞媒介性の免疫応答、サイトカイン分泌、体液性免疫応答を増強する、とりわけ、Ｔヘルパー応答を、Ｔｈ１またはバランスのとれたＴｈ１およびＴｈ２型となるように傾斜させることに関して、免疫応答を調整するために、ある投与経路におけるＤＮＡ初回刺激、後続する、異なるルートにおけるリポソーム媒介性のタンパク質抗原追加免疫を含む異種免疫化の特異的な組み合わせを使用する方法を提供する。より詳細については、Ｋｌｉｎｅｆｅｌｔｅｒ（米国特許出願第１１／５７２，４５３号に対する国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０２６１０２に対する優先権を主張する）を参照されたい。
【０３１９】
本明細書における相同体は、上記に言及される、天然に存在するＳＡＳ１Ｒポリペプチドと、少なくとも７０％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、最も好ましくは少なくとも９９％のアミノ酸配列同一性を有する免疫原性ポリペプチドを含むことが理解され、それによって得られる免疫応答を少なくともなお誘発することができる。相同体またはアナログは、本明細書において、安定性、溶解性、および免疫原性を増加させるために、置換、挿入、欠失、さらなるＮ−もしくはＣ−末端アミノ酸、および／または炭水化物などのようなさらなる化学成分を含んでいてもよい。
【０３２０】
本発明の一実施形態では、本明細書において定義される本発明の免疫原性ポリペプチドは、グリコシル化される。あらゆる特定の理論によって束縛されることを望むものではないが、これらのポリペプチドのグリコシル化によって、その免疫原性が増加され得ることが本明細書において仮定される。そのため、一実施形態では、本明細書においてすでに定義されている前述の免疫原性ポリペプチドは、グリコシル化され、糖タンパク質またはグリコシル化ポリペプチドの全重量に基づいて１０〜８０重量％で変動する炭水化物含有量を有する。より好ましくは、当該炭水化物含有量は、１５〜７０重量％、さらにより好ましくは２０〜６０重量％の範囲にある。他の実施形態では、当該グリコシル化免疫原性ポリペプチドは、治療されるヒトの対応する透明帯糖タンパク質（またはその断片）に類似するグリコシル化パターンを含む。これが当該ポリペプチドの免疫原性をさらに増加させることが仮定される。したがって、免疫原性ポリペプチドが対応するＳＡＳ１Ｒ糖タンパク質に類似するグリコシル化パターンを含むことは好ましい。
【０３２１】
一実施形態では、ポリペプチドの供給源は、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、その免疫学的に活性な相同体および断片、または当該免疫原性ポリペプチドをコードする核酸配列から選択される、有効量の免疫原性ポリペプチドを含む。
【０３２２】
一実施形態では、免疫化の本発明の方法は、免疫原性活性ポリペプチド断片の供給源の投与を含み、当該ポリペプチド断片は、本明細書においてすでに定義されているＳＡＳ１Ｒタンパク質断片および／またはその相同体から選択され、当該ポリペプチド断片は、重要なＣＴＬおよび／またはＨＴＬエピトープを含み、この断片は、長さが１８〜４５アミノ酸である。１８〜４５のアミノ酸の長さを有するペプチドは、ＷＯ  ０２／０７０００６において記載されるように、優れた免疫原性特性をもたらすことが観察されている。
【０３２３】
ペプチドは、好都合に、化学的に合成されてもよく、所望により、（部分的に）重複していてもよく、および／または他の分子、ペプチド、もしくはタンパク質にライゲーションされてもよい。ペプチドはまた、Ｗｅｌｔｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．（Ｖａｃｃｉｎｅ．２００４  Ｄｅｃ．２；２３（３）：３０５−１１）におけるように、合成タンパク質を形成するように融合されてもよい。安定性を増加させるおよび／またはペプチドの生分解性を減少させるために、ペプチドのアミノまたはカルボキシ末端に、化学成分またはさらなる（修飾もしくはＤ−）アミノ酸を追加することは好都合であってもよい。免疫原性を改善するために、免疫刺激成分は、たとえば脂質付加またはグリコシル化によって付加されてもよい。ペプチドの溶解性を増強するために、荷電または極性アミノ酸の追加は、溶解性を増強し、かつインビボにおける安定性を増加させるために使用されてもよい。
【０３２４】
免疫化の目的のために、本発明の前述の免疫原性ポリペプチドはまた、これらに限定されないが、破傷風毒素／トキソイド、ジフテリア毒素／トキソイド、または他のキャリア分子などのようなタンパク質と融合されてもよい。本発明によるポリペプチドはまた、（参考文献：Ｒａｐｐ  Ｕ  Ｋ  ａｎｄ  Ｋａｕｆｍａｎｎ  Ｓ  Ｈ，Ｉｎｔ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００４  Ａｐｒｉｌ；１６（４）：５９７−６０５；Ｚｕｇｅｌ  Ｕ，Ｉｎｆｅｃｔ  Ｉｍｍｕｎ．２００１  Ｊｕｎｅ；６９（６）：４１６４−７）において記載されるように免疫優性ペプチドのためのキャリアとしての組換え内因性（マウス）ｇｐ９６（ＧＲＰ９４）などのような熱ショックタンパク質に好都合に融合されてもよいまたはＨｓｐ７０との融合タンパク質であってもよい（Ｔｒｉｅｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ；  ＷＯ９９５４４６４）。
【０３２５】
本発明の免疫原性（ポリ）ペプチドの個々のアミノ酸残基は、ペプチド結合またはペプチド結合ミメティックによってペプチド中に組み込むことができる。本発明のペプチド結合ミメティックは、当業者らによく知られているペプチド主鎖修飾を含む。そのような修飾は、アミド窒素、アルファ炭素、アミドカルボニル、アミド結合の全部の交換、伸長、欠失、または主鎖架橋の修飾を含む。一般に、Ｓｐａｔｏｌａ，Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ａｍｉｎｏ  Ａｃｉｄｓ，Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｖｏｌ．ＶＩＩ（Ｗｅｉｎｓｔｅｉｎ  ｅｄ．，１９８３）を参照されたい。いくつかのペプチド主鎖修飾は、知られており、本発明の実施において使用することができる。
【０３２６】
アミノ酸ミメティックもまた、ポリペプチド中に組み込まれてもよい。本明細書で使用される「アミノ酸ミメティック」は、本発明のポリペプチド中のアミノ酸の代わりとして立体構造的にかつ機能的に働く、天然に存在するアミノ酸以外の成分である。そのような成分は、それが、天然のＳＡＳ１Ｒ  Ｔ細胞エピトープに対して免疫応答を誘発するペプチドの能力に干渉しない場合、アミノ酸残基の代わりとして働く。アミノ酸ミメティックは、非タンパクアミノ酸を含んでいてもよい。多くの適したアミノ酸ミメティックは、当業者に知られており、それらは、シクロヘキシルアラニン、３−シクロヘキシルプロピオン酸、Ｌ−アダマンチルアラニン、アダマンチル酢酸、およびその他同種のものを含む。本発明のペプチドに適したペプチドミメティックは、Ｍｏｒｇａｎ  ａｎｄ  Ｇａｉｎｏｒ，（１９８９）Ａｎｎ．Ｒｅｐｔｓ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２４：２４３−２５２によって議論されている。
【０３２７】
一実施形態では、本発明の方法は、本明細書において上記に定義される１つまたは複数の本発明の免疫原性ポリペプチドおよび少なくとも１つの賦形剤を含む組成物の投与を含む。賦形剤は、薬学の当技術分野においてよく知られており、たとえば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，１９９５などのような教科書において見つけられる。
【０３２８】
免疫化のための本発明の方法は、少なくとも１つのアジュバントの投与、一態様では、その同時投与をさらに含んでいてもよい。アジュバントは、ワクチン接種の当技術分野において知られている任意のアジュバントを含み、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ  Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，２００４のような教科書を使用して選択されてもよい。
【０３２９】
アジュバントは、ヒトまたは動物を免疫化するために抗原と組み合わせて使用される場合に、好ましくはアジュバント自体に対する特異的な免疫応答を生成することなく、免疫系を刺激し、それによって、抗原に対する免疫応答を引き起こす、増強する、または促進する任意の物質または化合物を含むように本明細書において意図される。一態様では、アジュバントは、同じ条件下であるが、アジュバントの非存在下において抗原に対して生成される免疫応答と比較して、少なくとも１．５、２、２．５、５、１０、または２０倍、所定の抗原に対する免疫応答を増強することができる。対応する対照群と比較した、動物またはヒトの群においてアジュバントによって産生される、所定の抗原に対する免疫応答の統計的な平均的な増強を決定するための試験は、当技術分野において利用可能である。アジュバントは、好ましくは、少なくとも２つの異なる抗原に対する免疫応答を増強することができる。本発明のアジュバントは、通常、ヒトに対して外来の化合物となるであろう。それによって、たとえばインターロイキン、インターフェロン、および他のホルモンなどのような、ヒトに対して内因性である免疫賦活性化合物を除く。
【０３３０】
多くのアジュバントは、当業者によく知られている。適したアジュバントは、たとえば不完全フロインドアジュバント、ミョウバン、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、Ｎ−アセチル−ムラミル−Ｌ−トレオニル−Ｄ−イソグルタミン（ｔｈｒ−ＭＤＰ）、Ｎ−アセチル−ｎｏｒ−ムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＣＧＰ  １１６３７、ｎｏｒ−ＭＤＰと呼ばれる）、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミニル−Ｌ−アラニン−２−（１’−２’−ｄｉｐ−アルミトイル（ａｌｍｉｔｏｙｌ）−ｓｎ−グリセロ−３−ヒドロキシ−ホスホリルオキシ）−エチルアミン（ＣＧＰ  １９８３５Ａ、ＭＴＰ−ＰＥと呼ばれる）、ＤＤＡ（２ジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド）、ポリＩＣ、ポリＡポリＵ、ＲＩＢＩ（商標）、ＧＥＲＢＵ（商標）、Ｐａｍ３（商標）、Ｃａｒｂｏｐｏｌ（商標）、およびＳｐｅｃｏｌ（商標）、Ｔｉｔｅｒｍａｘ（商標）、破傷風トキソイド、ジフテリアトキソイド、髄膜炎菌性外膜タンパク質、ジフテリアタンパク質ＣＲＭ１９７を含む。好ましいアジュバントは、抗原提示細胞上に存在するＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）によって認識されるリガンドを含む。ＴＬＲによって認識される様々なリガンドは、当技術分野において知られており、たとえばリポペプチド（たとえばＷＯ  ０４／１１０４８６を参照されたい）、リポ多糖、ペプチドグリカン、リポテイコ酸、リポアラビノマンナン、リポタンパク質（マイコプラズマまたはスピロヘータ由来）、二本鎖ＲＮＡ（ポリＩ：Ｃ）、非メチル化ＤＮＡ、フラジェリン、ＣｐＧ含有ＤＮＡ、およびイミダゾキノリンならびに化学修飾を有するこれらのリガンドの誘導体を含む。
【０３３１】
本出願の免疫化の方法は、ＣＴＬ応答を増強し、それによって、本発明の方法および組成物の治療効果を増強するために、ＣＤ４０結合分子の、同時投与を含む投与をさらに包含する。ＣＤ４０結合分子の使用は参照によって本明細書において組み込まれるＷＯ  ９９／６１０６５において記載されている。ＣＤ４０結合分子は、好ましくは、抗体もしくはその断片またはＣＤ４０リガンドもしくはその変異体であり、別々に添加されてもよくまたは本発明による組成物内に含まれてもよい。そのような有効な投薬量は、患者の健康の状態および全身状態を含む様々な因子に依存するであろう。したがって、投与計画は、最適の治療または予防用の効果をもたらすために熟練した医療関係者によって決定され、調整することができる。
【０３３２】
本発明の方法では、１つまたは複数の免疫原性ポリペプチドは、少なくとも１回、約１ｕｇ／患者体重ｋｇまたそれ以上の投薬量で典型的に投与される。多くの場合、投薬量は、１０ｕｇ／ｋｇを超える。本発明によれば、投薬量は、好ましくは、１ｕｇ／ｋｇ〜１ｍｇ／ｋｇの範囲にある。
【０３３３】
一実施形態では、典型的な投与計画は、１、２、３、４、または５週間の期間、１週間に１回、２回、または３回、１〜１０００ｕｇ／ｋｇ、より好ましくは１０〜５００ｕｇ／ｋｇ、さらにより好ましくは１０〜１５０ｕｇ／ｋｇの投薬量を投与することを含む。一実施形態によれば、１０〜１００ｕｇ／ｋｇは、１または２週間の期間、１週間１回投与される。
【０３３４】
本発明の方法は、一態様では、注射、経皮的、または経口ルートによる、本発明の免疫原性ポリペプチドおよびそれらを含む組成物の投与を含む。本発明の他の実施形態では、本発明の方法は、本発明の免疫原性ポリペプチドおよびそれらを含む組成物の膣投与を含む。
【０３３５】
本発明の他の態様は、本明細書においてすでに定義されるポリペプチドの本発明の供給源を活性成分として含む医薬調製物に関する。特に、医薬調製物は、活性成分として、ＳＡＳ１Ｒタンパク質、そのホモログ、ならびに当該ＳＡＳ１Ｒタンパク質の断片およびその相同体の群から選択される１つもしくは複数の前述の免疫原性ポリペプチドまたはその代わりに、本明細書において上記に定義される遺伝子療法ベクターを含む。
【０３３６】
本発明は、本発明の１つまたは複数の免疫原性ポリペプチドを含む医薬調製物をさらに提供する。医薬組成物中の当該ポリペプチドの濃度は、広く、つまり、約０．１重量％未満、通常、少なくとも約１重量％〜２０重量％またはそれ以上に変動することができる。
【０３３７】
組成物は、活性成分に加えて、薬学的に許容できるキャリアを含んでいてもよい。医薬キャリアは、患者に免疫原性ポリペプチドまたは遺伝子療法ベクターを送達するのに適している任意の適合性の無毒性の物質とすることができる。ポリペプチドについては、滅菌水、アルコール、脂肪、ろう、および不活性の固形物は、キャリアとして使用されてもよい。薬学的に許容できるアジュバント、緩衝剤、分散剤、および同種のものもまた、医薬組成物の中に組み込まれてもよい。
【０３３８】
一実施形態では、本発明の医薬組成物は、本明細書においてすでにより詳細に定義されるように、アジュバントを含む。本発明の組成物中への組み込みに有用なアジュバントは、好ましくは、リポペプチド、リポ多糖、ペプチドグリカン、リポテイコ酸、リポアラビノマンナン、リポタンパク質（マイコプラズマまたはスピロヘータ由来）、二本鎖ＲＮＡ（ポリＩ：Ｃ）、非メチル化ＤＮＡ、フラジェリン、ＣｐＧ含有ＤＮＡ、およびイミダゾキノリンならびに化学修飾を有するこれらのリガンドの誘導体を含む、抗原提示細胞上に存在するＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）によって認識されるリガンドの群から選択される。ルーティナー（ｒｏｕｔｉｎｅｅｒ）は、それらを十分に免疫原性にするために、本発明の医薬調製物中に組み込まれることとなるこれらのアジュバントのいずれか１つの正確な量を決定することができるであろう。他の好ましい実施形態によれば、本発明の医薬調製物は、本明細書においてすでに説明されるように、ＣＴＬ免疫を増強するために使用される１つまたは複数のさらなる成分を含んでいてもよい。特に好ましい実施形態によれば、本発明の医薬調製物は、ＣＤ４０結合分子を含む。
【０３３９】
ポリペプチドを含む医薬組成物を産生するための方法は、米国特許第５，７８９，５４３号および第６，２０７，７１８号において記載されている。好ましい形態は、投与および治療上の適用の意図されるモードに依存する。
【０３４０】
一実施形態では、本発明の免疫原性タンパク質またはポリペプチドは、注射によって投与される。ポリペプチドの投与のための非経口ルートは、知られている方法、たとえば、静脈内、腹腔内、筋肉内、動脈内、皮下、または病巣内ルートによる注射または注入に従う。タンパク質またはポリペプチドは、注入またはボーラス注射によって連続的に投与されてもよい。静脈内注入のための典型的な組成物は、所望により２０％アルブミン溶液および１０ｕｇ〜５０ｍｇ、好ましくは、５０ｕｇ〜１０ｍｇのポリペプチドを補足した１０〜５０ｍｌの滅菌０．９％ＮａＣｌまたは５％グルコースを含有するように、構成することができる。筋肉内注射のための典型的な医薬組成物は、たとえば１〜１０ｍｌの滅菌緩衝水および１０ｕｇ〜５０ｍｇ、好ましくは５０ｕｇ〜１０ｍｇの本発明のポリペプチドを含有するように構成される。非経口的に投与可能な組成物を調製するための方法は、当技術分野においてよく知られており、たとえば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅ（１５ｔｈ  ｅｄ．，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ．，１９８０）（すべての目的のために参照によってその全体が組み込まれる）を含む、様々な資料においてより詳細に記載されている。
【０３４１】
便宜上、免疫応答は、多くの場合、「一次」または「二次」免疫応答であるとして本発明において記載される。「防御」免疫応答としても記載される一次免疫応答は、特定の抗原に対する一部の最初の曝露（たとえば最初の「免疫化」）の結果としての、個人において産生される免疫応答を指す。そのような免疫化は、たとえば、抗原に対する一部の天然の曝露の結果として生じ得る（たとえば、抗原を示すまたは提示する一部の病原体による初感染から）。その代わりに、免疫化は、抗原を含有するワクチンによる個人のワクチン接種のために生じ得る。たとえば、ワクチンは、ＳＡＳ１Ｒの１つまたは複数の抗原性エピトープまたは断片を含むワクチンとすることができる。
【０３４２】
ワクチンはまた、とりわけ、ＩＬ２などのような他の免疫活性化因子および同時刺激分子を発現するように修飾されてもよい。
【０３４３】
抗原に対する抗体と組み合わせることができる他のタイプのワクチンは、免疫アジュバントと共に対象とする細胞溶解物から調製されるワクチンまたは対象とする細胞由来の溶解物およびＤＥＴＯＸ（商標）免疫アジュバントの混合物である。ワクチン治療は、さらなる化学療法の治療と共にまたはそれを伴わないで、抗抗原抗体により追加免疫することができる。
【０３４４】
療法のためにインビボにおいて使用される場合、本発明の抗体は、治療有効量で対象に投与される（つまり、所望の治療効果を有する量）。それらは、通常、非経口的に投与されるであろう。用量および投与計画は、感染の程度、使用される特定の抗体または免疫毒素の特徴、たとえばその治療係数、患者、および患者の病歴に依存するであろう。好都合に、抗体または免疫毒素は、１〜２週間の期間、連続的に投与される。所望により、投与は、抗菌薬治療または腫瘍壊死因子、インターフェロン、もしくは他の細胞保護的もしくは免疫調節作用物質の投与などのような補助療法の経過の間に行われる。
【０３４５】
非経口投与については、抗体は、薬学的に許容できる非経口の媒体と関連した、単位投薬量の注射用の形態（溶液、懸濁液、エマルション）で製剤されるであろう。そのような媒体は、本質的に無毒性であり、非治療用である。そのような媒体の例は、水、生理食塩水、リンガー溶液、デキストロース溶液、および５％ヒト血清アルブミンである。固定油およびオレイン酸エチルなどのような非水溶性の媒体もまた、使用することができる。リポソームは、キャリアとして使用することができる。媒体は、等張性および化学的安定性を増強する物質、たとえば緩衝剤および保存剤などのような、わずかな量の添加剤を含有することができる。抗体は、典型的に、約１．０ｍｇ／ｍｌ〜約１０ｍｇ／ｍｌの濃度でそのような媒体中に製剤されるであろう。
【０３４６】
ＩｇＭ抗体の使用は、ある種の適用にとって好ましいものとなり得るが、ＩｇＧ分子は、より小さいものであることによって、ある種のタイプの感染細胞に局在するのに、ＩｇＭ分子よりも有能となり得る。
【０３４７】
インビボにおける補体活性化が、炎症応答の誘発およびマクロファージの活性化を含む様々な生物学的作用に至るという証拠がある（Ｕｎａｎｕｅ  ａｎｄ  Ｂｅｎｅｃｅｒｒａｆ，Ｔｅｘｔｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ，ｐ．２１８（１９８４））。炎症に伴う、血管拡張の増加は、様々な作用物質が局在する能力を増加させることができる。そのため、本発明によって特定されるタイプの抗原−抗体組み合わせは、多くの方法において使用することができる。さらに、精製された抗原（Ｈａｋｏｍｏｒｉ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：１０３，１９８４）またはそのような抗原に関する抗イディオタイプ抗体（Ｎｅｐｏｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８１：２８６４，１９８５；Ｋｏｐｒｏｗｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８１：２１６，１９８４）は、ヒト患者において活性免疫応答を誘発するために使用することができる。
【０３４８】
使用される抗体組成物は、製剤され、投薬量は、治療されることとなる状態または障害、個々の患者の状態、組成物のデリバリーの部位、投与の方法、および開業医らに知られている他の因子を考慮する好適な医療と一致する方法で確立される。抗体組成物は、後の投与のためのポリペプチドの調製物の説明に従って投与のために調製される。
【０３４９】
当技術分野において十分に理解されるように、生物特異的な捕捉試薬は、抗体、転移細胞上の活性化インテグリン受容体に結合する抗体の結合性断片（たとえば単鎖抗体、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ）’２断片、およびｓｃＦｖタンパク質ならびにａｆｆｉｂｏｄｙ（Ａｆｆｉｂｏｄｙ，Ｔｅｋｎｉｋｒｉｎｇｅｎ  ３０，ｆｌｏｏｒ  ６，Ｂｏｘ  ７００  ０４，Ｓｔｏｃｋｈｏｌｍ  ＳＥ−１００４４，Ｓｗｅｄｅｎ；その全体がおよびすべての目的のために参照によって本明細書において組み込まれる米国特許第５，８３１，０１２号を参照されたい）を含む。意図される使用に依存して、それらはまた、他の生体分子に特異的に結合する受容体および他のタンパク質を含むこともできる。
【０３５０】
ハイブリッド抗体およびハイブリッド抗体断片は、完全長重鎖および軽鎖を有する完全抗体分子またはＦａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、ｓｃＦｖ、抗体軽鎖、および抗体重鎖などのようなその任意の断片を含む。本明細書において記載されるような可変領域および定常領域を有するキメラ抗体もまた、適している。たとえば、米国特許出願第２００３００２２２４４号を参照されたい。
【０３５１】
最初に、抗体が産生され得る所定の標的目的物が選ばれる。目的物を標的にするように導かれるモノクローナル抗体を生成するための技術は、当業者らによく知られている。そのような技術の例は、ディスプレイライブラリー、ｘｅｎｏまたはｈｕｍａｂマウス、ハイブリドーマ、およびその他同種のものを伴うものを含むが、これらに限定されない。標的目的物は、抗原性を示すことができる任意の物質を含み、通常、タンパク質またはタンパク質多糖である。例として、受容体、酵素、ホルモン、増殖因子、ペプチド、およびその他同種のものを含む。本開示に従う使用に適した天然に存在する抗体だけではなく、所定の目的物に導かれる遺伝子操作された抗体および抗体断片もまた、適していることが理解されたい。
【０３５２】
本出願は、本明細書において記載されるタンパク質を阻害するための組成物および方法を開示し、当技術分野において知られている開示されていないものは、本発明の範囲内に包含される。たとえば、様々な修飾因子／エフェクター、たとえば抗体、アンチセンス分子、ＲＮＡｉ分子、もしくはリボザイムなどのような生物学的に活性な核酸、アプタマー、ペプチド、または当該ポリヌクレオチドもしくはポリペプチドを認識する低分子量有機化合物ならびにタンパク質自体およびその断片が、知られている。
【０３５３】
本発明は、治療用抗体に対する抗原としての使用ならびに免疫原および抗癌性ワクチンとしてのその使用のためのＳＡＳ１Ｒの使用のための機能的断片の同定をさらに包含する。
【０３５４】
一実施形態では、完全長ＳＡＳ１Ｒのミモトープ分析は、たとえば、各ペプチドが３アミノ酸ずつ重複する一連の１５アミノ酸ペプチドに配列を細分することによって実行することができる。ペプチドはすべて、ビオチン化し、９６ウェルプレート中のストレプトアビジンコートウェルに結合させることができる。様々な抗血清の反応性は、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）によって検出することができる。非特異的な結合をブロックした後、ＳＡＳ１Ｒ抗体を連続的に添加し（つまりアフィニティー精製抗ＳＡＳ１Ｒまたはアフィニティー精製抗完全長組換えＳＡＳ１Ｒ）、その後に、ペルオキシダーゼコンジュゲート二次抗体およびペルオキシダーゼ基質の連続的な添加を続ける。
【０３５５】
各ウェルの光学濃度は、４５０ｎｍで読み取ることができ、二つ組のウェルを平均する。対照血清（つまり免疫前血清）を使用する同様のＥＬＩＳＡから得られた平均値を、試験Ｉｇ値から引き算し、結果として生じた値は、どの直線状エピトープがＩｇによって認識されるかを決定するためにプロットする。
【０３５６】
ＳＡＳ１Ｒの機能的断片を同定するための戦略における第２および第３の構成成分は、ミモトープ分析によって予測されたエピトープ（ペプチド）に対応する非ビオチン化ペプチドの合成に依存する。ミモトープ分析によって認識されたエピトープのいずれかが卵上に曝露されるかどうかを決定するために、それぞれのペプチドありおよびなしでＩｇによる免疫細胞化学的染色を実行することができる。
【０３５７】
たとえば、ペプチドを使用して女性における受精能を低下させるための方法は、たとえばＫｌｉｎｅｆｅｌｔｅｒ（２００５年７月２２日に出願された国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０２６１０２に基づいて２００８年２月１９日に出願された米国特許出願第１１／５７２４５３号）において見つけることができる。
【０３５８】
医薬組成物および投与
本発明はまた、本発明の化合物を含む医薬組成物にも関する。特に、そのような化合物は、当業者らに知られている標準の薬学的に許容できるキャリア、増量剤、可溶化剤、および安定剤を使用して、医薬組成物として製剤することができる。
【０３５９】
本発明はまた、本発明の化合物を対象に投与するための方法にも関する。一実施形態では、本発明は、本発明に記載の方法を使用して同定された化合物を投与することによって対象を治療するための方法を提供する。本発明の化合物を含む医薬組成物は、局所、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、髄内、鞘内、室内、経皮的、皮下、腹腔内、鼻腔内、腸内、局所、舌下、または直腸手段を含むが、これらに限定されない多くのルートによってその必要のある対象に投与される。
【０３６０】
一実施形態に従って、そのような治療を必要とする対象を治療するための方法が、提供される。方法は、その必要のある対象に本発明の少なくとも１つの化合物を含む医薬組成物を投与することを含む。本発明の方法によって同定される化合物は、知られている化合物または他の薬品と共に同様に投与することができる。
【０３６１】
本発明はまた、本発明の方法を実施するための、適切な化合物およびその相同体、断片、アナログ、または誘導体の医薬組成物の使用をも包含し、組成物は、少なくとも１つの適切な化合物およびその相同体、断片、アナログ、または誘導体ならびに薬学的に許容できるキャリアを含む。
【０３６２】
本発明を実施するのに有用な医薬組成物は、１ｎｇ／ｋｇ／日〜１００ｍｇ／ｋｇ／日の用量を送達するように投与されてもよい。
【０３６３】
本発明は、活性成分として、本明細書において開示される疾患の治療に有用な化合物を含む医薬組成物の調製および使用を包含する。そのような医薬組成物は、対象への投与に適した形態をした活性成分から単独でなってもよいまたは医薬組成物は、活性成分および１つもしくは複数の薬学的に許容できるキャリア、１つもしくは複数のさらなる成分、またはこれらのいくらかの組み合わせを含んでいてもよい。活性成分は、当技術分野において十分に知られている生理学的に許容できる陽イオンまたは陰イオンと組み合わせてなどのように、生理学的に許容できるエステルまたは塩の形態で、医薬組成物中に存在してもよい。
【０３６４】
本明細書において使用されるように、「生理学的に許容できる」エステルまたは塩という用語は、組成物が投与されることになっている対象に有害ではない、医薬組成物の任意の他の成分と適合性である活性成分のエステルまたは塩の形態を意味する。
【０３６５】
本明細書において記載される医薬組成物の製剤は、薬理学の技術分野において知られているまたは今後開発される任意の方法によって調製されてもよい。一般に、そのような準備の方法は、活性成分をキャリアまたは１つもしくは複数の他の副成分と関連させる工程および次いで、必要であるまたは望ましい場合、所望の単一用量または複数用量単位に産物を成形するまたは包装する工程を含む。
【０３６６】
そのような医薬組成物が、一般に、すべての種類の動物への投与に適していることが当業者によって理解されるであろう。本発明の医薬組成物の投与が企図される対象は、ヒトおよび他の霊長動物、ウシ、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、およびイヌなどのような、商業的に適切な哺乳動物を含む哺乳動物、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、およびシチメンチョウなどのような商業的に適切な鳥を含む鳥を含むが、これらに限定されない。本発明はまた、げっ歯動物などのような公害動物用の避妊における使用のためにも企図される。
【０３６７】
本発明の医薬組成物は、バルクで、単一単位用量として、または複数の単一単位用量として調製されてもよい、包装されてもよい、または販売されてもよい。本明細書において使用されるように、「単位用量」は、所定の量の活性成分を含む別個の量の医薬組成物である。活性成分の量は、一般に、対象に投与されるであろう活性成分の投薬量またはたとえばそのような投薬量の２分の１もしくは３分の１などのような、そのような投薬量の好都合な画分と等しい。
【０３６８】
活性成分、薬学的に許容できるキャリア、および本発明の医薬組成物中の任意のさらなる成分の相対量は、治療される対象の個性、サイズ、および状態に依存して、さらに、組成物が投与されることになっているルートに依存して、異なるであろう。例として、組成物は、０．１％〜１００％（ｗ／ｗ）の活性成分を含んでいてもよい。
【０３６９】
活性成分に加えて、本発明の医薬組成物は、１つまたは複数のさらなる薬学的に活性な作用物質をさらに含んでいてもよい。特に企図されるさらなる作用物質は、制吐薬ならびにシアン化物およびシアネートスカベンジャーなどのようなスカベンジャーを含む。
【０３７０】
本発明の医薬組成物の放出制御または徐放性製剤は、従来技術を使用して作製されてもよい。
【０３７１】
本明細書において使用されるように、「さらなる成分」は、１つまたは複数の以下のものを含むが、これらに限定されない：賦形剤；界面活性剤；分散剤；不活性希釈剤；造粒剤および崩壊剤；結合剤；平滑剤；甘味料；香料；着色剤；保存剤；ゼラチンなどのような生理学的に分解性の組成物；水溶性の媒体および溶媒；油性媒体および溶媒；懸濁化剤；分散剤または湿潤剤；乳化剤、粘滑剤；緩衝剤；塩；増粘剤；増量剤；乳化剤；酸化防止剤；抗生物質；抗真菌物質；安定化剤；ならびに薬学的に許容できるポリマーまたは疎水性材料。本発明の医薬組成物において含まれていてもよい他の「さらなる成分」は、当技術分野において知られており、たとえば、参照によって本明細書において組み込まれるＧｅｎａｒｏ，ｅｄ．，１９８５，Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡにおいて記載されている。
【０３７２】
典型的に、動物、好ましくはヒトに投与されてもよい本発明の化合物の投薬量は、動物の体重の１キログラム当たり１μｇ〜約１００ｇの量の範囲にある。投与される厳密な投薬量は、動物のタイプ、治療されている疾患状態のタイプ、動物の年齢、および投与のルートを含むが、これらに限定されない多くの因子に依存して変動するであろう。好ましくは、化合物の投薬量は、動物の体重の１キログラム当たり約１ｍｇ〜約１０ｇで変動するであろう。より好ましくは、投薬量は、動物の体重の１キログラム当たり約１０ｍｇ〜約１ｇで変動するであろう。
【０３７３】
化合物は、毎日数回の頻度で動物に投与されてもよいまたはそれは、それほど頻繁ではないが、一日に一度、週に一度、２週間ごとに一度、月に一度などのように投与されてもよいもしくはさらにそれほど頻繁ではないが、数か月ごとに一度もしくはさらに一年に一度またはそれ以下などのように投与されてもよい。用量の頻度は、当業者に容易に明らかになるであろう、また、治療されている状態または疾患のタイプおよび重症度、動物タイプおよび年齢などのような、多くの因子に依存するであろう。
【０３７４】
ワクチンの適した調製物は、液体溶液または懸濁液としての注射液を含むが、注射前の、液体中の溶液または懸濁剤に適している固体形態もまた、調製されてもよい。その調製物はまた、乳化されてもよいまたはポリペプチドは、リポソーム中にカプセル化されてもよい。活性免疫原性成分は、多くの場合、薬学的に許容でき、活性成分と適合性の賦形剤と混合される。適した賦形剤は、たとえば、水、生理食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノール、またはその他同種のものおよびその組み合わせである。さらに、所望される場合、ワクチン調製物はまた、湿潤剤もしくは乳化剤、ｐＨ緩衝剤、および／またはワクチンの効力を増強するアジュバントなどのようなわずかな量の補助物質を含んでいてもよい。
【０３７５】
本発明はまた、本発明の化合物を対象に投与するための方法にも関する。一実施形態では、本発明は、本発明の方法を使用して同定された化合物を投与することによって対象を治療するための方法を提供する。本発明の化合物を含む医薬組成物は、局所、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、髄内、鞘内、室内、経皮的、皮下、腹腔内、鼻腔内、腸内、局所、舌下、または直腸手段を含むが、これらに限定されない多くのルートによってその必要のある個人に投与される。
【０３７６】
一実施形態に従って、そのような治療を必要とする対象を治療するおよびワクチン接種するための方法が、提供される。方法は、その必要のある対象に本発明の少なくとも１つの化合物を含む医薬組成物を投与することを含む。本発明の方法によって同定される化合物は、知られている化合物または他の薬品と共に同様に投与することができる。
【０３７７】
経口投与については、活性成分は、カプセル、錠剤および粉末などのような固体の剤形でまたはエリキシル剤、シロップ剤、および懸濁剤などのような液体の剤形で投与することができる。活性構成成分は、グルコース、ラクトース、スクロース、マンニトール、デンプン、セルロースまたはセルロース誘導体、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、ナトリウムサッカリン、滑石、炭酸マグネシウム、およびその他同種のものなどのような非活性成分および粉末のキャリアと一緒にゼラチンカプセル中にカプセル化することができる。望ましい色、味、安定性、緩衝能、分散、または他の知られている望ましい特徴を提供するために追加されてもよいさらなる非活性成分の例は、赤色酸化鉄、シリカゲル、ラウリル硫酸ナトリウム、二酸化チタン、食用白色インク、およびその他同種のものである。同様の希釈剤は、圧縮錠剤を作製するために使用することができる。錠剤およびカプセルの両方は、数時間の間、薬品の連続の放出をもたらすように徐放性産物として製造することができる。圧縮錠剤は、あらゆる不愉快な味を隠し、大気から錠剤を保護するために糖衣錠もしくはフィルムコーティング錠とすることができる、または胃腸管における選択的な分解のために腸溶錠とすることができる。経口投与のための液体剤形は、患者受容を増加させるために着色料および香味料を含有することができる。
【０３７８】
様々な膣ドラッグデリバリーシステムは、当技術分野において知られている。適したシステムは、クリーム剤、泡状物質、錠剤、ゲル、液体剤形、坐剤、およびペッサリーを含む。水に接して膨張し、粘膜の表面上に広がることができる弱い架橋ポリマーを含む粘膜付着性ゲルおよびヒドロゲルは、従来、膣ルートを通してのペプチドおよびタンパク質によるワクチン接種のために使用されてきた。本発明は、ペプチドおよびタンパク質薬剤の膣デリバリーのためのマイクロスフェアの使用をさらに提供する。賦形剤を含む、経膣的に投与される剤形のより詳細な仕様および当該剤形を調製するための実際の方法は、知られている、または当業者らに明らかであろう。たとえば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（１５ｔｈ  ｅｄ．，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ．，１９８０）が参照される。
【０３７９】
本発明はまた、本発明の組成物および哺乳動物の細胞または組織への組成物の外膜投与を記載する教材を含むキットをも含む。他の実施形態では、このキットは、哺乳動物に化合物を投与する前に本発明の組成物を溶解するまたは懸濁するのに適している（好ましくは滅菌）溶媒を含む。
【０３８０】
本明細書において使用されるように、「教材」は、本明細書において列挙される様々な疾患または障害の軽減を達成するために、キットにおける本発明のペプチドの有用性を伝えるために使用することができる刊行物、記録、図、または表現の任意の他の媒体を含む。所望によりまたは代わりに、教材は、哺乳動物の細胞または組織における疾患または障害の軽減のための１つまたは複数の方法を記載してもよい。本発明のキットの教材は、たとえば、本発明のペプチドを含有する容器に添付されてもよいまたはペプチドを含有する容器と一緒に出荷されてもよい。その代わりに、教材は、教材および化合物がレシピエントによって協力的に使用されるという意図により、容器とは別々に出荷されてもよい。
【０３８１】
その全体が本明細書において参照によって組み込まれる国際特許出願ＷＯ  ２００６／０９１５３５（ＰＣＴ／ＵＳ２００６／００５９７０）において記載されるものを含む当技術分野において知られている他の技術は、本発明の実施において使用されてもよい。
【０３８２】
ＳＡＳ１Ｒ陽性の腫瘍の画像処理
本発明は、造影剤と複合体を形成するようにキレート剤に典型的にコンジュゲートされる、ペプチドリガンドとしてＳＡＳ１Ｒに対して導かれる抗体ならびにその断片および相同体ならびに金属、放射性核種などのような少なくとも１つの造影剤を含む複合体の調製を包含する。ＳＡＳ１Ｒに対して導かれる有用な抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、およびヒト化抗体などを含むことができる。
【０３８３】
ある実施形態では、造影剤は、キレート剤によって複合体に付加される。一態様では、キレート剤は、ＤＯＴＡである。
【０３８４】
多くの三価金属放射性核種は、放射性同位元素画像処理に（インジウム１１１（１１１Ｉｎ）、ガリウム−６７／６８（６７／６８Ｇａ）、およびイットリウム−８６（８６Ｙ）または標的放射性核種療法（たとえば９０Ｙおよびルテチウム−１７７（１７７Ｌｕ））に適した物理的特性を有する。これらの金属放射性核種は、疾患を診断する、モニターする、または治療するために標的生体分子（ペプチドまたは抗体など）と組み合わせることができる。必要とされる安定性を有する放射標識生体分子を得るために、ペプチドまたはタンパク質は、金属と複合体を形成するように、第１に、適したキレート剤にコンジュゲートされなければならない。ペプチドを標識するための三価金属（Ｉｎ、Ｙ、Ｇａ、およびＬｕなど）用のキレート剤の必要性は、一般に、タンパク質を標識するためのものと同じである。複合体は、生物系において安定しているべきであり、それらのキレート能は、ペプチドとの反応によって損なわれるべきではない。多くの場合、ジエチレントリアミンペンタ酢酸（ＤＴＰＡ）および／または１，４，７，１０−テトラアザシクロドデカン−１，４，７，１０−四酢酸（ＤＯＴＡ；ＣＡＳ  ６０２３９−１８−１）が使用される（Ｃｈｏｅ  ａｎｄ  Ｌｅｅ，２００７，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｅｓｉｇｎ，１３：１７−３１；Ｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，２００７，Ｊ．Ｎｕｃｌｅａｒ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，"６４Ｃｕ−Ｌａｂｅｌｅｄ  Ｔｅｔｒａｍｅｒｉｃ  ａｎｄ  Ｏｃｔａｍｅｒｉｃ  ＲＧＤ  Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ｆｏｒ  Ｓｍａｌｌ−Ａｎｉｍａｌ  ＰＥＴ  ｏｆ  Ｔｕｍｏｒ  ａｖｂ３  Ｉｎｔｅｇｒｉｎ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ"，４８：１１６２−１１７１；Ｎａｈｒｅｎｄｏｒｆ  ｅｔ  ａｌ，２００９，ＪＡＣＣ  Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ．Ｉｍａｇｉｎｇ，２：１０：１２１３−１２２２；Ｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，２００９，Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒ．，８：５：１２３９−１２４９；Ｙｉｍ  ｅｔ  ａｌ．，２０１０，Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．，５３：３９４４−３９５３；Ｄｉｊｋｇｒａａｆ  ｅｔ  ａｌ．，２０１０，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｎｕｃｌ．Ｍｅｄ．Ｍｏｌ．Ｉｍａｇｉｎｇ，ｐｕｂｌｉｓｈｅｄ  ｏｎｌｉｎｅ  ２１  Ｓｅｐｔｅｍｂｅｒ，２０１０；米国特許第１０／７９２，５８２号；Ｄｒａｎｓｆｉｅｌｄ  ｅｔ  ａｌ．、米国特許公開ＵＳ２０１０／０２６１８７５；米国特許第７，６６６，９７９号）。挙げられる金属のうち、ＤＯＴＡ複合体は、ＤＴＰＡ複合体よりもより熱力学的におよび動力学的に安定している（Ｓｏｓａｂｏｗｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  １，−９７２−９７６（２００６）およびＬｅｏｎ−Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，０１／０３／２００８；１９（２）：３９１−４０２を参照されたい）。
【０３８５】
キレート化剤
一部の実施形態では、キレート化剤は、ペプチドに直接または間接的に付加されてもよく、放射性核種などのように、治療剤または診断剤をキレート化するために使用される。例示的なキレート剤は、ＤＴＰＡ（Ｍｘ−ＤＴＰＡなど）、ＤＯＴＡ、ＴＥＴＡ、ＮＥＴＡ、またはＮＯＴＡを含むが、これらに限定されない。タンパク質に金属または他のリガンドを付加するためのキレート化剤のコンジュゲーションの方法および使用は、当技術分野においてよく知られている（たとえば、参照によってその全体が本明細書において組み込まれる米国特許出願第１２／１１２，２８９号を参照されたい）。
【０３８６】
本発明によって包含される有用なキレート剤は、ＤＴＰＡ、ＤＯ３Ａ、ＤＯＴＡ、ＥＤＴＡ、ＴＥＴＡ、ＥＨＰＧ、ＨＢＥＤ、ＮＯＴＡ、ＤＯＴＭＡ、ＴＥＴＭＡ、ＰＤＴＡ、ＴＴＨＡ、ＬＩＣＡＭ、ＨＹＮＩＣ、およびＭＥＣＡＭを含むが、これらに限定されない。ＨＹＮＩＣは、本発明の他の造影剤であるＴｃ９９をキレート化するのに特に有用である。
【０３８７】
修飾
本発明は、複合体の一部としてのポリエチレングリコール（「ＰＥＧ」）分子などのような分子の使用をさらに提供する。一態様では、ＰＥＧは、約２０，０００分子量または約２０，０００分子量未満である。他の態様では、ＰＥＧは、約１８，０００分子量未満である。他の態様では、ＰＥＧは、約１６，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約１４，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約１２，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約１０，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約８，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約７，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約６，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約５，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約４，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約３，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約２，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約１，０００分子量未満である。さらなる態様では、ＰＥＧは、約５００分子量未満である。
【０３８８】
一態様では、ＰＥＧ、はＰＥＧ５０００である。
【０３８９】
ペプチド修飾および調製
ペプチド調製は、実施例において記載される。もちろん、本発明のタンパク質またはペプチドが、活性に影響を与えることなく修飾されたアミノ酸残基を組み込んでもよいことが十分に理解されるであろう。たとえば、末端は、ブロック基、つまり、おそらく化合物の機能に影響を与えるであろう、その末端での化合物の任意のタイプの酵素的、化学的、または生化学的破壊、つまり、その末端での化合物の連続的な分解を包含するように意味する用語である「望ましくない分解」からＮおよびＣ末端を保護するおよび／または安定化するのに適した化学的な置換基を含むように誘導体化されてもよい。
【０３９０】
ブロック基は、ペプチドのインビボ活性に悪影響を及ぼさないであろうペプチド化学の当技術分野において従来より使用されている保護基を含む。たとえば、適したＮ末端ブロック基は、Ｎ末端のアルキル化またはアシル化によって導入することができる。適したＮ末端ブロック基の例は、分岐Ｃ１〜Ｃ５または非分岐アルキル基、ホルミルおよびアセチル基などのようなアシル基、ならびにアセトアミドメチル（Ａｃｍ）基などのようなその置換形態を含む。アミノ酸のデスアミノアナログもまた、有用なＮ末端ブロック基であり、ペプチドのＮ末端に結び付けることができるまたはＮ末端残基の代わりに使用することができる。Ｃ末端のカルボキシル基が組み込まれるまたは組み込まれない適したＣ末端ブロック基は、エステル、ケトン、またはアミドを含む。エステルまたはケトン形成アルキル基、メチル、エチル、およびプロピルなどのような特に下級のアルキル基、ならびに第一級アミン（−ＮＨ２）などのようなアミド形成アミノ基ならびにメチルアミノ、エチルアミノ、ジメチルアミノ、ジエチルアミノ、メチルエチルアミノ、およびその他同種のものなどのようなモノおよびジアルキルアミノ基は、Ｃ末端ブロック基の例である。アグマチンなどのような脱カルボキシルアミノ酸類似体もまた、有用なＣ末端ブロック基であり、ペプチドのＣ末端残基に結び付けることができるまたはその代わりに使用することができる。さらに、ペプチド活性に影響を与えることなく、そのデスアミノおよび脱カルボキシル形態を産出するために、末端の遊離アミノおよびカルボキシル基をすべてペプチドから除去することができることが十分に理解されるであろう。
【０３９１】
本発明の酸付加塩もまた、機能的等価物として企図される。したがって、ペプチドの水溶性の塩を提供するために、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、およびその他同種のものなどのような無機酸または酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、リンゴ酸、マロン酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸、およびその他同種のものなどのような有機酸により処理された本発明に従うペプチドは、本発明における使用に適している。
【０３９２】
修飾（通常、一次配列を改変しない）は、ポリペプチドのインビボまたはインビトロにおける化学的な誘導体化、たとえばアセチル化またはカルボキシル化を含む。グリコシル化の修飾、たとえば、その合成およびプロセシングの間に、ポリペプチドのグリコシル化パターンを修飾することによってまたはさらなるプロセシング工程において、たとえば、グリコシル化に影響を与える酵素、たとえば哺乳動物のグリコシル化または脱グリコシル酵素にポリペプチドを曝露することによって生成されるものもまた、含まれる。リン酸化されたアミノ酸残基、たとえばホスホチロシン、ホスホセリン、またはホスホトレオニンを有する配列もまた、包含される。
【０３９３】
タンパク分解性の分解に対するそれらの抵抗性を改善するためにまたは溶解性の特性を最適化するためにまたはそれらを治療剤としてより適したようにするために通常の分子生物学的技術を使用して修飾されたポリペプチドもまた、含まれる。そのようなポリペプチドのアナログは、天然に存在するＬ−アミノ酸以外の残基、たとえばＤ−アミノ酸または天然に存在しないまたは非標準の合成アミノ酸を含有するものを含む。本発明のペプチドは、本明細書において列挙される特定の例示的なプロセスのいずれかの産物に限定されない。
【０３９４】
本発明は、構造：
【０３９５】
【化２】
2013539018.tif 000004
【０３９６】
を有するベータ−アラニン（β−アラニン、β−Ａｌａ、ｂＡ、およびβＡとも呼ばれる）の使用を含む。
【０３９７】
シンボル「βＡ」を使用する配列が、本明細書において提供されるが、本明細書と共に提出された配列表において、「βＡ」は、「Ｘａａ」として提供され、配列表の本文における指示は、Ｘａａがベータアラニンであることを示す。
【０３９８】
分析のための標準物質または修飾体などのような、本発明において有用なペプチドは、Ｓｏｌｉｄ  Ｐｈａｓｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９８４，Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩｌｌｉｎｏｉｓにおいてＳｔｅｗａｒｔ  ｅｔ  ａｌ．によって記載されるように、また、Ｔｈｅ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，１９８４，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ  ＹｏｒｋにおいてＢｏｄａｎｓｚｋｙ  ａｎｄ  Ｂｏｄａｎｓｚｋｙによって記載されるように、固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）などのような標準の、十分に確立された技術によって容易に調製されてもよい。最初に、適切に保護されたアミノ酸残基が、架橋ポリスチレンまたはポリアミド樹脂などのような誘導体化不溶性ポリマー支持体にそのカルボキシル基を通して付加される。「適切に保護された」は、アミノ酸のα−アミノ基およびあらゆる側鎖官能基上の両方の保護基の存在を指す。側鎖保護基は、合成の全体にわたって使用される溶媒、試薬、および反応条件に対して一般に安定しており、最終ペプチド産物に影響を与えない条件下で除去可能である。オリゴペプチドの段階的合成は、最初のアミノ酸からのＮ−保護基の除去および所望のペプチドの配列における次のアミノ酸のカルボキシル末端をそれにつなぐことによって実行される。このアミノ酸もまた、適切に保護される。入って来るアミノ酸のカルボキシルは、カルボジイミド、対称酸無水物、またはヒドロキシベンゾトリアゾールもしくはペンタフルオロフェニルエステルなどのような「活性エステル」基への形成などのような、反応性基への形成によって、支持体に結合したアミノ酸のＮ末端と反応するように活性化することができる。
【０３９９】
固相ペプチド合成方法の例は、α−アミノ保護基としてｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニルを利用するＢＯＣ法およびアミノ酸残基のα−アミノを保護するために９−フルオレニルメチルオキシカルボニルを利用するＦＭＯＣ方法を含み、これらの両方の方法は、当業者らによってよく知られている。
【０４００】
Ｎ−および／またはＣ−ブロック基の組み込みもまた、固相ペプチド合成方法についての従来のプロトコールを使用して達成することができる。Ｃ末端ブロック基の組み込みのために、たとえば所望のペプチドの合成は、樹脂からの切断により、所望のＣ末端ブロック基を有するペプチドがもたらされるように化学的に修飾されている支持樹脂を固相として使用して典型的に実行される。たとえばＣ末端が第一級アミノブロック基を有するペプチドを提供するために、ペプチド合成が完了した場合に、フッ化水素酸を用いる処理により所望のＣ末端アミド化ペプチドが放出されるように、合成は、ｐ−メチルベンズヒドリルアミン（ＭＢＨＡ）樹脂を使用して実行される。同様に、Ｃ末端でのＮ−メチルアミンブロック基の組み込みは、ＨＦ処理に際して、Ｎ−メチルアミド化Ｃ末端を有するペプチドを放出するＮ−メチルアミノエチル誘導体化ＤＶＢ樹脂を使用して達成される。エステル化によるＣ末端のブロックもまた、従来の手順を使用して達成することができる。これは、エステル官能基を形成するように、所望のアルコールとの続く反応を可能にするために、樹脂からの側鎖ペプチドの放出を可能にする、樹脂／ブロック基の組み合わせの使用を必要とする。メトキシアルコキシベンジルアルコールまたは等価なリンカーにより誘導体化されたＤＶＢ樹脂と組み合わせたＦＭＯＣ保護基は、この目的のために使用することができ、支持体からの切断は、ジクロロメタン中でＴＦＡによって達成される。たとえばＤＣＣによる、適切に活性化されたカルボキシル官能基のエステル化は、次いで、所望のアルコールの添加によって進むことができ、その後に、エステル化ペプチド産物の脱保護および単離が続く。
【０４０１】
Ｎ末端ブロック基の組み込みは、合成されるペプチドが樹脂にまだ付加されている間に、たとえば適した無水物およびニトリルによる処理によって、達成することができる。Ｎ末端にアセチルブロック基を組み込むために、たとえば、樹脂に結び付けられたペプチドは、アセトニトリル中の２０％無水酢酸により処理することができる。次いで、Ｎブロックペプチド産物は、樹脂から切断し、脱保護し、続いて単離することができる。
【０４０２】
化学的または生物学的合成技術から得られるペプチドが所望のペプチドであることを確実にするために、ペプチド組成物の分析は、行われるべきである。そのようなアミノ酸組成分析は、ペプチドの分子量を決定するために高分解能質量分析法を使用して行われてもよい。その代わりにまたはさらに、ペプチドのアミノ酸含有量は、水溶性の酸においてペプチドを加水分解し、ＨＰＬＣまたはアミノ酸分析機を使用して、混合物の構成成分を分離し、同定し、定量化することによって確認することができる。ペプチドを連続的に分解し、順番にアミノ酸を同定するタンパク質シークエネーターもまた、ペプチドの配列を明確に決定するために使用されてもよい。
【０４０３】
その使用に先立って、ペプチドは、混入物を除去するために精製されてもよい。この点に関して、適切な規制機関によって説明される基準を満たすために、ペプチドが精製されるであろうことは、十分に理解されるであろう。たとえば、Ｃ４−、Ｃ８−、またはＣ１８シリカなどのようなアルキル化シリカカラムを使用する逆相高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）を含む、多くの従来の精製手順のいずれか１つが、純度の必要とされるレベルを達成するために使用されてもよい。有機含有量を増加させる勾配移動相、たとえば、通常少量のトリフルオロ酢酸を含有する水溶性の緩衝剤中のアセトニトリルは、精製を達成するために一般に使用される。イオン交換クロマトグラフィーもまた、それらの電荷に基づいてペプチドを単離するために使用することができる。
【０４０４】
本明細書において記載されるように得られた実質的に純粋なタンパク質は、タンパク質精製のために以下の知られている手順によって精製されてもよく、免疫学的、酵素的、または他のアッセイは、手順におけるそれぞれの段階で精製をモニターするために使用される。たとえば、タンパク質精製方法は、当技術分野においてよく知られており、たとえばＤｅｕｔｓｃｈｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（ｅｄ．，１９９０，Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｈａｒｃｏｕｒｔ  Ｂｒａｃｅ  Ｊｏｖａｎｏｖｉｃｈ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ）において記載されている。
【０４０５】
議論されるように、本発明のペプチドリガンドの修飾または最適化は、本出願の範囲内にある。修飾ペプチドまたは最適化ペプチドは、ペプチド結合リガンドの定義内に含まれる。特に、同定されたペプチド配列は、その効力、薬物動態学的挙動、安定性、ならびに／または他の生物学的、物理的、および化学的特性を最適化するために修飾されてもよい。
【０４０６】
アミノ酸置換
ある実施形態では、開示される方法および組成物は、１つまたは複数の置換アミノ酸残基を有するペプチドを調製することを含んでいてもよい。
【０４０７】
様々な実施形態では、ペプチド配列の構造の、物理的な、および／または治療上の特徴は、１つまたは複数のアミノ酸残基を交換することによって最適化されてもよい。
【０４０８】
他の修飾もまた、活性に悪影響を及ぼすことなく組み込むことができ、これらは、１つまたは複数の天然Ｌ−異性体形態のアミノ酸の、Ｄ−異性体形態のアミノ酸との置換を含むが、これらに限定されない。したがって、ペプチドは、１つまたは複数のＤ−アミノ酸残基を含んでいてもよいまたはすべてＤ−形態をしているアミノ酸を含んでいてもよい。本発明に従うペプチドのレトロインベルソ形態、たとえば、アミノ酸がすべてＤ−アミノ酸形態と置換されている逆方向のペプチドもまた企図される。
【０４０９】
当業者は、一般に、ペプチドにおけるアミノ酸置換は、比較的類似する特性の他のアミノ酸とのアミノ酸の交換（つまり保存的アミノ酸置換）を典型的に含むことを知っているであろう。様々なアミノ酸の特性ならびにタンパク質構造および機能に対するアミノ酸置換の効果は、当技術分野における、他方面にわたる研究および理解の課題であった。たとえば、結果として生じるポリペプチドが上記に記載される特性の類似するまたは改善されたプロファイルを有するであろうという期待を伴って、親ポリペプチド配列における以下の等配電子および／または保存的アミノ酸変化を成すことができる。
【０４１０】
分岐、環状、直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニル置換を含むＣ１〜１０炭素の脂肪族側鎖によって置換されるアラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、ノルロイシン、Ｓ−２−アミノ酪酸、Ｓ−シクロヘキシルアラニン、または他の単純なアルファ−アミノ酸を含むアルキル置換疎水性アミノ酸の置換。
【０４１１】
前に列挙した芳香族アミノ酸のフェニルアラニン、トリプトファン、チロシン、ビフェニルアラニン、１−ナフチルアラニン、２−ナフチルアラニン、２−ベンゾチエニルアラニン、３−ベンゾチエニルアラニン、ヒスチジン、アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アザ、ハロゲン化（フルオロ、クロロ、ブロモ、もしくはヨード）、またはアルコキシ置換形態を含む芳香族化合物置換疎水性アミノ酸の置換、これらの例示となる例は、２−、３−、または４−アミノフェニルアラニン、２−、３−、または４−クロロフェニルアラニン、２−、３−、または４−メチルフェニルアラニン、２−、３−、または４−メトキシフェニルアラニン、５−アミノ−、５−クロロ−、５−メチル−、または５−メトキシトリプトファン、２’−、３’−、または４’−アミノ−、２’−、３’、または４’−クロロ−、２、３、または４−ビフェニルアラニン、２’、−３’、または４’−メチル−２、３、または４−ビフェニルアラニン、および２−または３−ピリジルアラニンである。
【０４１２】
置換基が、ヘテロ原子（アルファ窒素もしくは遠位の窒素（複数可）など）またはたとえばｐｒｏ−Ｒ配置におけるアルファ炭素上のものであるかどうかにかかわらず、前のアミノ酸のアルギニン、リシン、ヒスチジン、オルニチン、２，３−ジアミノプロピオン酸、ホモアルギニン、アルキル、アルケニル、またはアリール置換（Ｃ１〜Ｃ１０の分岐、直線状、または環状）誘導体を含む、塩基性官能基を含有するアミノ酸の置換。例示となる例として働く化合物は、Ｎ−イプシロン−イソプロピル−リシン、３−（４−テトラヒドロピリジル）−グリシン、３−（４−テトラヒドロピリジル）−アラニン、Ｎ，Ｎ−ガンマ、ガンマ’−ジエチル−ホモアルギニンを含む。アルファメチルアルギニン、アルファメチル２，３−ジアミノプロピオン酸、アルファメチルヒスチジン、アルファメチルオルニチンなどのような化合物もまた含まれ、アルキル基は、アルファ炭素のｐｒｏ−Ｒ配置を取る。アルキル、芳香族化合物、ヘテロ芳香族化合物（ヘテロ芳香族群は１つまたは複数の窒素、酸素、もしくは硫黄原子を一つずつまたは組み合わせて有する）、カルボン酸、または酸塩化物、活性エステル、活性アゾリド、および関連する誘導体などのような多くのよく知られている活性化誘導体のいずれかならびにリシン、オルニチン、または２，３−ジアミノプロピオン酸から形成されるアミドもまた、含まれる。
【０４１３】
アスパラギン酸、グルタミン酸、ホモグルタミン酸、チロシン、２，４−ジアミノプロピオン酸、オルニチン、またはリシンのアルキル、アリール、アリールアルキル、およびヘテロアリールスルホンアミド、ならびにテトラゾール置換アルキルアミノ酸を含む酸性アミノ酸の置換。
【０４１４】
アスパラギン、グルタミン、およびアスパラギンまたはグルタミンのアルキルまたは芳香族置換誘導体を含む側鎖アミド残基の置換。
【０４１５】
セリン、トレオニン、ホモセリン、２，３−ジアミノプロピオン酸、およびセリンまたはトレオニンのアルキルまたは芳香族置換誘導体を含むヒドロキシル含有アミノ酸の置換。上記に列挙されるカテゴリーのそれぞれの範囲内のアミノ酸が同じ群の別のものと置換されてもよいこともまた、理解される。
【０４１６】
たとえば、アミノ酸のヒドロパシー指標が、考慮されてもよい（Ｋｙｔｅ  ＆  Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ，１９８２，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１５７：１０５−１３２）。アミノ酸の相対的なヒドロパシー特徴は、結果として生じたタンパク質の二次構造に寄与し、これは、次には、他の分子とのタンパク質の相互作用を定める。アミノ酸はそれぞれ、その疎水性および電荷の特徴に基づいてヒドロパシー指標が指定されてきており（Ｋｙｔｅ  ＆  Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ，１９８２）、これらは、イソロイシン（＋４．５）；バリン（＋４．２）；ロイシン（＋３．８）；フェニルアラニン（＋２．８）；システイン／シスチン（＋２．５）；メチオニン（＋１．９）；アラニン（＋１．８）；グリシン（−０．４）；トレオニン（−０．７）；セリン（−０．８）；トリプトファン（−０．９）；チロシン（−１．３）；プロリン（−１．６）；ヒスチジン（−３．２）；グルタミン酸（−３．５）；グルタミン（−３．５）；アスパラギン酸（−３．５）；アスパラギン（−３．５）；リシン（−３．９）；およびアルギニン（−４．５）である。保存的置換を行う際に、そのヒドロパシー指標が＋／−２内にあるアミノ酸の使用が好ましく、＋／−１内は、より好ましく、＋／−０．５内は、さらに好ましい。
【０４１７】
アミノ酸置換はまた、アミノ酸残基の親水性を考慮に入れてもよい（たとえば米国特許第４，５５４，１０１号）。親水性値は、アミノ酸残基に対して指定されてきた：アルギニン（＋３．０）；リシン（＋３．０）；アスパラギン酸（＋３．０）；グルタミン酸（＋３．０）；セリン（＋０．３）；アスパラギン（＋０．２）；グルタミン（＋０．２）；グリシン（０）；トレオニン（−０．４）；プロリン（−０．５＋−０．１）；アラニン（−０．５）；ヒスチジン（−０．５）；システイン（−１．０）；メチオニン（−１．３）；バリン（−１．５）；ロイシン（−１．８）；イソロイシン（−１．８）；チロシン（−２．３）；フェニルアラニン（−２．５）；トリプトファン（−３．４）。アミノ酸の類似する親水性の他のものへの交換は、好ましい。
【０４１８】
他の考慮は、アミノ酸側鎖のサイズを含む。たとえば、グリシンまたはセリンなどのようなコンパクトな側鎖を有するアミノ酸を、かさ高い側鎖を有するアミノ酸、たとえばトリプトファンまたはチロシンと交換することは一般に好ましくないであろう。タンパク質二次構造に対する様々なアミノ酸残基の効果もまた、考慮される。実証研究を通して、アルファヘリックス、ベータシート、または逆向ターン二次構造を取るタンパク質ドメインの傾向に対する異なるアミノ酸残基の効果は、決定されており、当技術分野において知られている（たとえばＣｈｏｕ  ＆  Ｆａｓｍａｎ，１９７４，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，１３：２２２−２４５；１９７８，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，４７：２５１−２７６；１９７９，Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｊ．，２６：３６７−３８４を参照されたい）。
【０４１９】
そのような考慮および他方面にわたる実証研究に基づいて、保存的アミノ酸置換の表は、構築されており、当技術分野において知られている。たとえば：アルギニンおよびリシン；グルタミン酸およびアスパラギン酸；セリンおよびトレオニン；グルタミンおよびアスパラギン；ならびにバリン、ロイシン、およびイソロイシン。その代わりに：Ａｌａ（Ａ）ｌｅｕ、ｉｌｅ、ｖａｌ；Ａｒｇ（Ｒ）ｇｌｎ、ａｓｎ、ｌｙｓ；Ａｓｎ（Ｎ）ｈｉｓ、ａｓｐ、ｌｙｓ、ａｒｇ、ｇｌｎ；Ａｓｐ（Ｄ）ａｓｎ、ｇｌｕ；Ｃｙｓ（Ｃ）ａｌａ、ｓｅｒ；Ｇｌｎ（Ｑ）ｇｌｕ、ａｓｎ；Ｇｌｕ（Ｅ）ｇｌｎ、ａｓｐ；Ｇｌｙ（Ｇ）ａｌａ；Ｈｉｓ（Ｈ）ａｓｎ、ｇｌｎ、ｌｙｓ、ａｒｇ；Ｉｌｅ（Ｉ）ｖａｌ、ｍｅｔ、ａｌａ、ｐｈｅ、ｌｅｕ；Ｌｅｕ（Ｌ）ｖａｌ、ｍｅｔ、ａｌａ、ｐｈｅ、ｉｌｅ；Ｌｙｓ（Ｋ）ｇｌｎ、ａｓｎ、ａｒｇ；Ｍｅｔ（Ｍ）ｐｈｅ、ｉｌｅ、ｌｅｕ；Ｐｈｅ（Ｆ）ｌｅｕ、ｖａｌ、ｉｌｅ、ａｌａ、ｔｙｒ；Ｐｒｏ（Ｐ）ａｌａ；Ｓｅｒ（Ｓ）、ｔｈｒ；Ｔｈｒ（Ｔ）ｓｅｒ；Ｔｒｐ（Ｗ）ｐｈｅ、ｔｙｒ；Ｔｙｒ（Ｙ）ｔｒｐ、ｐｈｅ、ｔｈｒ、ｓｅｒ；Ｖａｌ（Ｖ）ｉｌｅ、ｌｅｕ、ｍｅｔ、ｐｈｅ、ａｌａ。
【０４２０】
アミノ酸置換についての他の考慮は、残基がタンパク質の内部に位置するまたは溶媒に曝露しているかどうかを含む。内部の残基については、保存的置換は、ＡｓｐおよびＡｓｎ；ＳｅｒおよびＴｈｒ；ＳｅｒおよびＡｌａ；ＴｈｒおよびＡｌａ；ＡｌａおよびＧｌｙ；ＩｌｅおよびＶａｌ；ＶａｌおよびＬｅｕ；ＬｅｕおよびＩｌｅ；ＬｅｕおよびＭｅｔ；ＰｈｅおよびＴｙｒ；ＴｙｒおよびＴｒｐを含むであろう（たとえばＰＲＯＷＬ  Ｒｏｃｋｅｆｅｌｌｅｒ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙのウェブサイトを参照されたい）。溶媒に曝露している残基については、保存的置換は、ＡｓｐおよびＡｓｎ；ＡｓｐおよびＧｌｕ；ＧｌｕおよびＧｌｎ；ＧｌｕおよびＡｌａ；ＧｌｙおよびＡｓｎ；ＡｌａおよびＰｒｏ；ＡｌａおよびＧｌｙ；ＡｌａおよびＳｅｒ；ＡｌａおよびＬｙｓ；ＳｅｒおよびＴｈｒ；ＬｙｓおよびＡｒｇ；ＶａｌおよびＬｅｕ；ＬｅｕおよびＩｌｅ；ＩｌｅおよびＶａｌ；ＰｈｅおよびＴｙｒを含むであろう。（同上）ＰＡＭ２５０スコアリングマトリックス、Ｄａｙｈｏｆｆマトリックス、Ｇｒａｎｔｈａｍマトリックス、ＭｃＬａｃｈｌａｎマトリックス、Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅマトリックス、Ｈｅｎｉｋｏｆｆマトリックス、Ｍｉｙａｔａマトリックス、Ｆｉｔｃｈマトリックス、Ｊｏｎｅｓマトリックス、Ｒａｏマトリックス、Ｌｅｖｉｎマトリックス、およびＲｉｓｌｅｒマトリックスなどのような様々なマトリックスが、アミノ酸置換の選択を支援するために構築されてきた（同上）。
【０４２１】
アミノ酸置換を決定する際に、正電荷残基（たとえばＨｉｓ、Ａｒｇ、Ｌｙｓ）および負電荷残基（たとえばＡｓｐ、Ｇｌｕ）の間のイオン結合（塩橋）または近くのシステイン残基同士の間のジスルフィド結合の形成などのような分子間または分子内結合の存在を考慮してもよい。
【０４２２】
コードペプチド配列において、任意のアミノ酸を任意の他のアミノ酸と置換するための方法は、よく知られており、たとえば部位特異的突然変異誘発の技術によるまたはアミノ酸置換をコードするオリゴヌクレオチドの合成およびアセンブリーならびに発現ベクターコンストラクトへの継ぎ合わせによる、当業者にとってルーチン的な実験作業の内容である。
【０４２３】
リンカー
さらに、本発明によって包含される修飾は、結合成分または結合ポリペプチドの標的配列および検出可能な標識または治療剤の間のリンカーまたはスペーサーの導入を含む。たとえば、そのようなリンカー／スペーサーの使用は、結合ペプチドの適切な特性を改善することができる（たとえば血清安定性などを増加させることができる）。これらのリンカーは、当技術分野において一般的な置換もしくは非置換アルキル鎖、ポリエチレングリコール誘導体、アミノ酸スペーサー、糖、または脂肪族もしくは芳香族スペーサーを含むが、これらに限定されない。
【０４２４】
たとえば、適したリンカーは、ホモ二機能性およびヘテロ二機能性架橋分子を含む。ホモ二機能性分子は、同じである、少なくとも２つの反応性の官能基を有する。ホモ二機能性分子上の反応性の官能基は、たとえばアルデヒド基および活性エステル基を含む。アルデヒド基を有するホモ二機能性分子は、たとえばグルタルアルデヒドおよびサブアルアルデヒド（ｓｕｂａｒａｌｄｅｈｙｄｅ）を含む。
【０４２５】
少なくとも２つの活性エステル単位を有するホモ二機能性リンカー分子は、ジカルボン酸およびＮ−ヒドロキシスクシンイミドのエステルを含む。そのようなＮ−スクシンイミジルエステルの一部の例は、ジスクシンイミジルスベレートおよびジチオ−ビス−（スクシンイミジルプロピオネート）ならびにそれらの可溶性ビス−スルホン酸ならびにそれらのナトリウムおよびカリウム塩などのようなビス−スルホン酸塩を含む。
【０４２６】
ヘテロ二機能性リンカー分子は、少なくとも２つの異なる反応性基を有する。反応性ジスルフィド結合を含有するヘテロ二機能性試薬の一部の例は、Ｎ−スクシンイミジル３−（２−ピリジル−ジチオ）プロピオネート（Ｃａｒｌｓｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９７８．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．，１７３：７２３−７３７）、ナトリウムＳ−４−スクシンイミジルオキシカルボニル−アルファ−メチルベンジルチオサルフェート、および４−スクシンイミジルオキシカルボニル−アルファ−メチル−（２−ピリジルジチオ）トルエンを含む。Ｎ−スクシンイミジル３−（２−ピリジルジチオ）プロピオネートは、好ましい。チオール基と反応する二重結合を有する反応性基を含むヘテロ二機能性試薬の一部の例は、スクシンイミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボキシレートおよびスクシンイミジルｍ−マレイミドベンゾエートを含む。他のヘテロ二機能性分子は、スクシンイミジル３−（マレイミド）プロピオネート、スルホスクシンイミジル４−（ｐ−マレイミド−フェニル）ブチレート、スルホスクシンイミジル４−（Ｎ−マレイミドメチル−シクロヘキサン）−１−カルボキシレート、マレイミドベンゾイル−５Ｎ−ヒドロキシ−スクシンイミドエステルを含む。
【０４２７】
さらに、上記に記載される分子および／または成分の組み合わせであるリンカーはまた、ペプチドの特性に特有の長所を与えるためにも用いることができる。リンカーを有する脂質分子は、超音波バブル、リポソーム、または他の凝集ベースのコンストラクトの製剤を可能にするために付加されてもよい。そのようなコンストラクトは、診断レポーター、治療剤（たとえば療法のための化学的な「弾頭」）、またはこれらの組み合わせのターゲティングおよびデリバリーための作用物質として用いることができる。
【０４２８】
本発明の１つまたは複数のペプチドリガンドの二量体、多量体、またはポリマーを用いるコンストラクトもまた、企図される。実際、効力が低いペプチドまたは小分子の結合は、二量体および多量体の形成によって実質的に増加させることができるという多くの文献の証拠がある。したがって、二量体および多量体コンストラクト（均一および不均一の両方）は、本発明の範囲内にある。二量体コンストラクトにおけるポリペプチド配列は、それらのＮ−もしくはＣ−末端または適切に置かれたリシン成分のＮ−イプシロン窒素（またはペンダントオキシアミノもしくは他の求核基などのような選択的に誘導体化することができる基を有する他の官能基）に付加することができるまたは適切な付加の化学作用を用いる１つもしくは複数のリンカー（たとえば本明細書において議論されるもの）を介してともにつなぐことができる。この連結化学作用は、アミド、尿素、チオ尿素、オキシム、またはアミノアセチルアミド（クロロまたはブロモアセトアミド誘導体から、しかしそのように限定されない）を含むことができる。リンカーはまた、キレート化剤への付加のために使用することもできる。
【０４２９】
インビボ画像処理による診断
さらなる態様では、本発明は、癌を診断するためのインビボ方法および組成物を提供する。方法は、ＳＡＳ１Ｒを発現する癌を有する危険性があるまたはそれが疑われる対象を同定すること、画像処理分子にコンジュゲートされた本発明の抗体／ペプチドリガンド複合体を含む診断組成物を対象に投与すること、およびインビボ画像処理技術を使用して対象内で画像処理分子を画像処理することを含む。一部の実施形態では、画像処理分子は、磁気蛍光粒子である。一部の実施形態では、磁気蛍光粒子は、近赤外線（ＮＩＲ）蛍光色素（ＮＩＲＦ）を含む。一部の実施形態では、組成物は、皮内、皮下、腹腔内、静脈内、動脈内、経口、および胃のルートからなる群から選択されるルートを介して投与される。一部の実施形態では、インビボ画像処理は、磁気共鳴画像（ＭＲＩ）、生体内レーザー走査顕微鏡、内視鏡検査、ＰＥＴ、ＳＰＥＣＴ／ＣＴ、および放射線画像診断を含むが、これらに限定されない。本発明は、癌のまたは発癌現象の間を含めて、癌の治療の間に進行をモニターすることをさらに提供する。
【０４３０】
一実施形態では、本発明は、癌の進行または治療をモニターするための組成物および方法をさらに提供する。
【０４３１】
他の実施形態では、本発明は、癌細胞を除去するための方法を提供する。方法は、ａ）ｉ）非癌細胞とＳＡＳ１Ｒを発現する癌細胞を区別するために本発明の抗体／ペプチドリガンド複合体を含む組成物をｉｉ）癌を有することが知られている対象に、ｉｉｉ）インビボ画像処理デバイスを提供することおよびｂ）組成物を対象に投与すること、ｃ）画像処理デバイスによりインビボにおいてＳＡＳ１Ｒ発現細胞を画像処理すること、ならびにｄ）それらの位置を検出した後に対象から癌細胞を除去することを含む。
【０４３２】
治療剤
他の実施形態では、細胞傷害性薬物、抗血管新生剤、アポトーシス促進剤、抗生物質、ホルモン、ホルモンアンタゴニスト、ケモカイン、薬剤、プロドラッグ、毒素、酵素、または他の作用物質を含むが、これらに限定されない、治療剤は、本明細書において記載される抗体／ペプチドリガンド複合体を使用する場合、補助療法として使用されてもよい。本発明において有用な薬剤は、たとえば、抗有糸分裂剤、抗キナーゼ剤、アルキル化剤、代謝拮抗薬、抗菌剤、アルカロイド剤、抗血管新生剤、アポトーシス促進剤、およびその組み合わせからなる群から選択される医薬特性を有していてもよい。
【０４３３】
他の態様では、本発明は、ＳＡＳ１Ｒに対して選択的親和性を有する、癌細胞結合パートナーを同定するための方法を提供する。方法は、固体支持体に結合分子の多様な集団を選択的に固定すること、１つまたは複数のＳＡＳ１ＲペプチドまたはＳＡＳ１Ｒを発現する細胞と固体支持体上に固定された多様な集団を接触させること（たとえば同時に接触させること）、およびバクテリオファージによって発現されるものを含む１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒペプチドリガンドに選択的に結合する少なくとも１つの結合分子を決定することを含む。対象とする分子に結合する１つまたは複数のＳＡＳ１Ｒに対して選択的な親和性を示す、結合分子の同定のための迅速で効率的な方法もまた本明細書において記載される。方法は、それらが、複数の結合分子の同時のスクリーニングを可能にするという点で好都合である。さらに、本発明における使用のための結合分子またはリガンドの個性または機能に関してほんの少しの情報しか必要とされない。たとえば、結合分子の多様な集団は、所望の結合特異性を示す多数の分子を迅速に同定するためにペプチドリガンドの多様な集団に対して同時にスクリーニングすることができる。そのため、本明細書において記載される方法は、ヒト疾患の診断および治療のための、ペプチドリガンドおよびバイオマーカーなどのような特異的な試薬の発見のために好都合に適用することができる。
【０４３４】
本発明において有用な核酸は、限定ではなく、例として、アンチセンスＤＮＡおよび／またはＲＮＡなどのようなオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチド；リボザイム；遺伝子療法のためのＤＮＡ；ウイルスＤＮＡおよび／またはＲＮＡを含むウイルス断片；ＤＮＡおよび／またはＲＮＡキメラ；ｍＲＮＡ；プラスミド；コスミド；ゲノムＤＮＡ；ｃＤＮＡ；遺伝子断片；一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、スーパーコイルＤＮＡ、および／または三重らせんＤＮＡを含むＤＮＡの様々な構造形態；Ｚ−ＤＮＡ；ならびにその他同種のものを含む。核酸は、大量に核酸を調製するために典型的に使用される任意の従来の手段によって調製されてもよい。たとえば、ＤＮＡおよびＲＮＡは、当技術分野においてよく知られている方法によって、市販で入手可能な試薬および合成装置を使用して、化学的に合成されてもよい（たとえばＧａｉｔ，１９８５，ＯＬＩＧＯＮＵＣＬＥＯＴＩＤＥ  ＳＹＮＴＨＥＳＩＳ：Ａ  ＰＲＡＣＴＩＣＡＬ  ＡＰＰＲＯＡＣＨ（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ，Ｅｎｇｌａｎｄ）を参照されたい）。ＲＮＡは、ＳＰ６５（Ｐｒｏｍｅｇａ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）などのようなプラスミドを使用してインビトロ転写による高収率で産生されてもよい。
【０４３５】
画像処理剤および診断剤
診断剤は、たとえば放射性核種、放射線造影剤、常磁性イオン、金属、蛍光標識、化学発光標識、超音波造影剤、および光活性剤からなる群から選択される。そのような診断剤は、よく知られており、任意のそのような知られている診断剤もまた、使用されてもよい。診断剤の非限定的な例は、１１０Ｉｎ、１１１Ｉｎ、１７７Ｌｕ、１８Ｆ、５２Ｆｅ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、６７Ｇａ、６８Ｇａ、８６Ｙ、９０Ｙ、８９Ｚｒ、９４ｍＴｃ、９４Ｔｃ、９９ｍＴｃ、１２０Ｉ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１５４−１５８Ｇｄ、３２Ｐ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、５１Ｍｎ、５２ｍＭｎ、５５Ｃｏ、７２Ａｓ、７５Ｂｒ、７６Ｂｒ、８２ｍＲｂ、８３Ｓｒ、または他のガンマ、ベータ、もしくはポジトロン放射体などのような放射性核種を含んでいてもよい。有益な常磁性イオンは、クロム（ＩＩＩ）、マンガン（ＩＩ）、鉄（ＩＩＩ）、鉄（ＩＩ）、コバルト（ＩＩ）、ニッケル（ＩＩ）、銅（ＩＩ）、ネオジム（ＩＩＩ）、サマリウム（ＩＩＩ）、イッテルビウム（ＩＩＩ）、ガドリニウム（ＩＩＩ）、バナジウム（ＩＩ）、テルビウム（ＩＩＩ）、ジスプロシウム（ＩＩＩ）、ホルミウム（ＩＩＩ）、またはエルビウム（ＩＩＩ）を含んでいてもよい。金属造影剤は、ランタン（ＩＩＩ）、金（ＩＩＩ）、鉛（ＩＩ）、またはビスマス（ＩＩＩ）を含んでいてもよい。超音波造影剤は、ガス充填リポソームなどのようなリポソームを含んでいてもよい。放射線不透過性診断剤は、化合物、バリウム化合物、ガリウム化合物、およびタリウム化合物から選択されてもよい。フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、ｏ−フタルデヒド（ｏ−ｐｈｔｈａｌｄｅｈｙｄｅ）、およびフルオレサミンを含むが、これらに限定されない種々様々の蛍光標識は、当技術分野において知られている。有益な化学発光標識は、ルミノール、イソルミノール、芳香族アクリジニウムエステル、イミダゾール、アクリジニウム塩、またはシュウ酸エステルを含んでいてもよい。
【０４３６】
自然界における原子の天然に存在する同位体の配置と異なる、分子における１つまたは複数の原子の同位体形態の包含は、分子の「同位体標識形態」と呼ばれる。原子の特異的な同位体の形態が示されない限り、原子の同位体形態はすべて、任意の分子の組成物において選択肢として含まれる。たとえば、分子における任意の水素原子またはそのセットは、任意の組み合わせの水素の同位体形態のいずれか、つまりプロチウム（１Ｈ）、重水素（２Ｈ）、またはトリチウム（３Ｈ）とすることができる。同様に、分子における任意の炭素原子またはそのセットは、１１Ｃ、１２Ｃ、１３Ｃ、もしくは１４Ｃなどのような炭素の同位体形態のいずれかとすることができるまたは分子における任意の窒素原子またはそのセットは、１３Ｎ、１４Ｎ、もしくは１５Ｎなどのような窒素の同位体形態のいずれかとすることができる。分子は、分子を構成する構成要素の原子において同位体形態の任意の組み合わせを含むことができ、分子を形成するすべての原子の同位体形態は、独立して選択される。化合物の多分子試料では、すべての個々の分子は、必ずしも、同じ同位体組成を有するとは限らない。たとえば、化合物の試料は、トリチウムまたは１４Ｃ放射標識試料においてなどのように、様々な異なる同位体組成を含有する分子を含むことができ、肉眼で見える試料を構成する分子のセットのいくつかの画分のみが、放射性原子を含有する。それら自体、人工的に同位体が豊富でない多くのエレメントは、１４Ｎおよび１５Ｎ、３２Ｓおよび３４Ｓなどのように、天然に存在する同位体の形態の混合物であることもまた理解される。本明細書において記載される分子は、分子におけるそれぞれの位置にそのすべての構成エレメントの同位体形態を含むとして定義される。当技術分野においてよく知られているように、同位体標識化合物は、同位体標識された前駆物質分子を置換することを除いて、化学合成の通常の方法によって調製することができる。放射標識されたまたは安定した同位体は、原子炉における前駆物質核種の中性子吸収による、サイクロトロン反応による、または質量分析法によってなどのように同位体分離による生成などのような、当技術分野において知られている任意の方法によって得ることができる。同位体形態は、任意の特定の合成ルートにおける使用のために、必要に応じて前駆物質の中に組み込まれる。たとえば、１４Ｃおよび３Ｈは、原子炉において生成される中性子を使用して調製することができる。核転換の後に、１４Ｃおよび３Ｈは、前駆物質分子の中に組み込まれ、その後に必要に応じてさらなる加工が続く。
【０４３７】
これらの作用物質を検出し、測定するための技術は、当技術分野において提供されるまたは本明細書において記載される。
【０４３８】
本発明は、ここで、以下の実施例および実施形態に関して記載される。さらなる説明を伴わないで、当業者は、前の説明および以下の例示となる例を使用して、本発明を行い、利用し、主張される方法を実施することができると考えられる。以下の実際に役立つ実施例は、そのため、例示のみの目的のために提供され、本発明の好ましい実施形態を特に明らかにし、残りの開示を限定するとして決して解釈されないものとする。そのため、実施例は、本明細書において提供される教示の結果として明白になるあらゆるすべての変形を包含するように解釈されるべきである。
【実施例】
【０４３９】
以下の実施例は、組織特異的および発生特異的タンパク質であることが知られているタンパク質ＳＡＳ１Ｒがまた、癌細胞において調節不全のタンパク質でもあり、おそらく、癌−卵母細胞抗原／バイオマーカーでもあり得るかどうかを決定するように設計された研究の結果を開示する。
【０４４０】
一般的な材料および方法−
ＨＥＫ２９３は、組織培養において成長させたヒト胎児腎臓細胞に由来するウイルス形質転換細胞株である。
【０４４１】
細胞画像およびＳＡＳ１Ｒ検出は、本明細書において記載される技術または当技術分野において知られている技術を使用して行うことができる。たとえば、固定の後に、細胞は、Ｎｉｋｏｎ  ＴＥ  ２０００−Ｅ２  共焦点顕微鏡を使用して画像処理することができる。代表的な画像は、６０Ｘ／１．４５  Ｎｉｋｏｎ油浸レンズおよびＭｉｃｒｏＦｉｒｅ  Ｐｉｃｔｕｒｅ  Ｆｒａｍｅ画像処理ソフトウェア（Ｏｐｔｒｏｎｉｃｓ、Ｇａｌｅｔａ、Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）を使用して獲得することができる。画像は、デジタル化し、分析することができる。
【０４４２】
本明細書において記載されない様々な抗ＳＡＳ１Ｒ抗体もまた、市販で入手可能であるまたはこのグループによって以前に記載された。たとえば、マウス抗Ｖ５タグモノクローナル抗体およびｃ−末端抗ｈｉｓモノクローナル抗体は、Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．（ＰＣＴ特許公開ＷＯ  ２０１０／０５４１８７）において記載されている。
【０４４３】
ＳＡＳ１Ｒ、子宮および卵巣腫瘍における癌−卵母細胞抗原
ＰＣＴ特許公開ＷＯ  ２００６／０９１５３５、２００６年８月３１日；Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．、ＰＣＴ特許公開ＷＯ  ２０１０／０５４１８７、２０１０年５月１４日もまた参照されたい。
【０４４４】
免疫組織化学的データは、マウスおよびヒトにおいて、ＳＡＳ１Ｒタンパク質が正常な組織の中で卵母細胞に制限されることを示す。この結果は、正常な組織の中で卵巣においてのみＳＡＳ１Ｒメッセージの発現を示すＥＳＴデータバンクによって支持される。ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、卵胞形成の間の一次〜二次卵胞移行時に現れる。
【０４４５】
ヒトＳＡＳ１Ｒは、配列番号２６（ＨＥＸＸＨＸＸＧＸＸＨ）の標準的な亜鉛メタロプロテイナーゼモチーフを含有し、Ｇは、Ｘと交換される。それは、約４６ｋＤａの分子量と共に４３１のアミノ酸残基を有する。ドメイン構造は、シグナル配列を含み、その後にプロペプチドドメイン、メタロプロテイナーゼドメイン（触媒ドメイン）、および特有のカルボキシ末端ドメインが続く。
【０４４６】
ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、Ｍ１−Ｍ２移行を経験した排卵されたマウスおよびヒト卵母細胞（表面染色）の表面上で接触可能である；つまり、ＳＡＳ１Ｒは、細胞表面タンパク質である（Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．、ＷＯ  ２０１０／０５４１８７を参照されたい）。それはまた、完全長遺伝子がトランスフェクトされたＣＨＯ細胞の表面上にも見つけられる。哺乳動物においてこの表面局在を媒介しているように思われる、触媒ドメインの上流の膜貫通ドメインがあるが、この膜貫通ドメインは、下等生物において不在であるように思われる。ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、活性メタロプロテアーゼ酵素である。
【０４４７】
ＳＡＳ１Ｒスプライス変異体は、マウスについて実証された（Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．、ＷＯ  ２０１０／０５４１８７を参照されたい）。マウスＳＡＳ１Ｒ発現が、ＥＳＴデータベース由来のマウスＳＡＳ１Ｒ発現プロファイルに基づいて、卵巣（特に受精卵、卵母細胞、未受精卵、および接合体）に特異的に制限されることが本明細書においてさらに実証される（図１）。さらに、複数の組織のノーザンブロットにおけるマウスＳＡＳ１Ｒ発現の検査が、脳、胃、腸、結腸、肝臓、肺、腎臓、心臓、骨格筋、脾臓、精巣、子宮、および胎盤に比べて卵巣においてその発現が制限されることをさらに実証した（図２）。
【０４４８】
次に、ＥＳＴデータベースからのヒトＳＡＳ１Ｒ発現プロファイルが、提供され（図３）、ＧｅｎＢａｎｋにおけるヒトＳＡＳ１Ｒ  ＥＳＴが、子宮癌において見つけられることが本明細書において実証される。次いで、一連の研究は、ＳＡＳ１Ｒがヒト子宮腫瘍において発現されるかどうかを決定するために実行した。図４および５は、免疫学的局在決定技術を使用して、ＳＡＳ１Ｒが悪性ミュラー管混合腫瘍（ＭＭＭＴ）において実際発現されることを実証する。図６は、ＳＡＳ１Ｒがまた類内膜癌においても発現されることを実証する。図７は、ＳＡＳ１Ｒに対するＭＭＴの配列比較図を提供する。
【０４４９】
亜鉛リガンディングのためのＨｉｓ三連構造ならびに活性部位グルタミン酸（アスタシン特異的グルタミン酸、ＲＸＤＲＤ、ＭｅｔおよびＴｙｒ残基）の保存があることが分かった。ＭＭＰおよびアスタシンプロテイナーゼファミリーとの間で配列類似性はほとんどなかった。あらゆる特定の理論によって束縛されることを望むものではないが、基質結合は、ファミリーの中で異なり得る。そのため、ＳＡＳ１Ｒは、広いアスタシンファミリーの他のメンバーに影響を与えない選択的阻害剤の開発のための標的となる。
【０４５０】
図８は、ＳＡＳ１Ｒの構造モデルを提供する。Ｚｎ結合活性部位のくぼみは、両側の２つの別個のＮ末端およびＣ末端ドメインによって形成され、進化的に保存されたヒスチジン残基（右側、カラー版の緑色）が沿って並ぶ。強調表示した４つの高度に保存されたヒスチジンのうち、それらのうちの３つ（Ｈ１６１、Ｈ１６５、およびＨ１７１）が、Ｚｎ配位（モデルのカラー版の青緑色のボール）に関与することが高信頼度で予測される。
【０４５１】
図９は、疾患進行の間の一連の癌介入における癌バイオマーカーの役割の略図を提供する。
【０４５２】
一連の実験を、子宮腫瘍および子宮癌細胞におけるＳＡＳ１Ｒ発現を検査するためにさらに実行した。
【０４５３】
ＭＭＭＴ細胞株−
ＳＮＵ５３９  ＭＭＭＴ（ＭＭＭＴ  ５３９）−軟骨肉腫および骨肉腫のような子宮外エレメントがない韓国の相同な腫瘍。それは、樹立細胞株である。
【０４５４】
ＭＭＭＴ  ３０８
【０４５５】
ＭＡＤ１０−細胞株は、正常なドナー由来の初代子宮内膜間質細胞株であり、ｈＴＥＲＴにより不死化され、対照細胞として使用される。
【０４５６】
本出願は、ＳＡＳ１Ｒ（ＳＡＳ１Ｂ）を発現する癌を同定し、診断するための新規なプライマーを提供する。プライマー１、２（１Ｆおよび２Ｒ）＝プロペプチドドメイン、２３７ｂｐ産物。プライマー３、４（３Ｆおよび４Ｒ）＝ｃ−末端ドメイン  ３０９ｂｐ産物。プライマー５、６（５Ｆおよび６Ｒ）＝触媒ドメイン  ５７９ｂｐ産物。
【０４５７】
ＴＯＰＯクローニングおよび配列決定−
ＴＯＰＯクローニングのために、ＰＣＲ産物は、溶離し、ＴＯＰ１０細胞における形質転換のためにＴＯＰＯベクターにおいてクローニングした。白色のコロニーはミニプレップ用に翌日採集し、ＥｃｏＲＩ制限酵素により消化した。次いで、それらを配列決定した。配列決定は、正常なヒト卵巣および卵巣／子宮腫瘍から摘出された産物を使用して、遺伝子の個性が、９９％の個性を有するＳＡＳ１Ｒであることを確認した。他の遺伝子は、あらゆる他のアスタシンファミリーメンバーまたは１３５くらいの知られているメタロプロテアーゼのいずれかを含めて、増幅のために発明者らによって設計され、それによって、遺伝子配列決定によって確認された、プライマーセット（６つのプライマー−以下を参照されたい）といかなる配列相同性をも共有しなかった。
【０４５８】
使用するプライマー（配列番号２８〜３３）は、以下の通りである。
1F GCGCCCCTGGCCTCCAGCTGCGCA 2R CACGACACCACTACCACCCATGGG 3F GGCTGCAGCCCAAGTGGCCCCAGG 4R AGCAACACCGGGGGCACCTGCTCC 5F GAGGTCCCCTTCCTGCTCTCCAGC 6R GGCATGGGACCCTCTCCCACGGGG。
【０４５９】
本発明は、ＳＡＳ１Ｒを発現する癌の進行および治療を同定し、診断し、モニターするのに有用な他のプライマーを同様に包含する。
【０４６０】
図１０、１１、および１２は、それぞれプライマー１および２、プライマー３および４、ならびにプライマー５および６についての、２つのＭＭＭＴ子宮腫瘍細胞株および正常な対照（ＭＭＭＴ３０８、ＭＭＭＴ５３９、およびＭＡＤ１０）についてのＰＣＲ増幅を示す。
【０４６１】
図１３は、ＭＭＭＴ３０８Ｆの配列分析の結果を実証する。
【０４６２】
図１４は、ＭＭＭＴ３０８Ｒの配列分析の結果を実証する。
【０４６３】
図１５は、ＭＭＭＴ５３９Ｆの配列分析の結果を実証する。
【０４６４】
図１６は、ＭＭＭＴ５３９Ｒの配列分析の結果を実証する。
【０４６５】
抗体は、ウサギポリクローナルを含めてＳＡＳ１Ｒに対して調製した。本研究所は、同様に、以前に、ＳＡＳ１Ｒに対する抗体を調製した（Ｈｅｒｒ  ｅｔ  ａｌ．、ＷＯ  ２０１０／０５４１８７）。ＳＡＳ１Ｒの研究における使用のための他の試薬は、市販で入手可能であるが、それらは、一般に、名称ＡＳＴＬと供給者によって呼ばれている。たとえば、Ａｂｃａｍは、プロペプチドドメイン、触媒ドメインに対するウサギ抗ＡＳＴＬ抗体ならびにウエスタンブロットおよび免疫組織化学的検査において使用することができる一般的な抗体を提供する。Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙは、ウエスタンブロッティング、免疫沈降、免疫蛍光法、およびＥＬＩＳＡに有用な抗ＡＳＴＬ抗体を提供する。Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈは、免疫組織化学的検査におよびタンパク質アレイにおいて有用な抗体を提供する。
【０４６６】
次に、ＭＭＭＴ３０８およびＭＭＭＴ５３９細胞株におけるＳＡＳ１Ｒの発現は、間接免疫蛍光法を使用して研究した。第１の図、図１７は、間接免疫蛍光法を使用する、ＭＭＭＴ３０８およびＭＭＭＴ５３９細胞株におけるＳＡＳ１Ｒの発現の対照（免疫前）の結果を提供する（パネルＡ〜Ｄ；上−３０８；下−５３９；ＡおよびＣ−位相差；ＢおよびＤ−免疫前）。図１８は、ＭＭＭＴ３０８の免疫染色についてのＢＦ（Ａ）、ＤＡＰＩ（Ｂ）、ＦＩＴＣ（Ｃ）、およびマージ（Ｄ）画像を提供する。図１９は、ＭＭＭＴ５３９の免疫染色についてのＢＦ（Ａ）、ＤＡＰＩ（Ｂ）、ＦＩＴＣ（Ｃ）、およびマージ（Ｄ）画像を提供する。図２０は、ＭＭＭＴ５３９の免疫染色についてのアクチン（Ａ）、ＤＡＰＩ（Ｂ）、ＦＩＴＣ（Ｃ）、およびマージ（Ｄ）画像を提供する。
【０４６７】
本発明の結果は、卵細胞質内のその制限された発現および局在に加えて、ＳＡＳ１Ｒタンパク質は、悪性ミュラー管混合腫瘍および子宮内膜癌腫を含む子宮の腫瘍においてヒトにおいて現れることを実証する。
【０４６８】
一連の腫瘍試料を得て、ＳＡＳ１Ｒ発現について検査した。ＭＭＭＴパンチ生検試料におけるＳＡＳ１Ｒタンパク質の発生率が、８６％（１４のＭＭＭＴ腫瘍のうち１２において発現）および子宮内膜癌腫において６６％（２１のうち１４において発現）であったことが分かった。顕微鏡写真および顕微鏡観察の調査は、間葉系の分化した腫瘍細胞の強力な細胞質内染色ならびに腫瘍の腺および間葉細胞の両方の細胞質内染色を実証した。
【０４６９】
肺癌および膀胱癌におけるＳＡＳ１Ｒ
一連の実験は、他の癌もまたＳＡＳ１Ｒを発現するかどうかを決定するために実行した。肺および膀胱癌の細胞株および腫瘍試料を使用した。いくつかの実験を実行し、それらにより、いくつかの扁平上皮および腺癌肺癌細胞株におけるＳＡＳ１Ｒ発現を確認した。一部の細胞株はまた、ＳＡＳ１Ｒタンパク質について培養中に染色し、一部は、完全長ＳＡＳ１Ｒ  ｃＤＮＡを単離し、それを増幅することによってＳＡＳ１Ｒの遺伝子発現について試験した。肺腫瘍試料もまた、ＳＡＳ１Ｒ  ｃＤＮＡの単離および増幅のために使用した。ヒト肺癌細胞株は、Ａ５４９およびＮＣＩ−Ｈ２２６を含んだ。膀胱癌細胞株は、ヒトＵＭＵＣ３を含んだ。ＳＡＳ１Ｒは、肺癌および細胞株において同定され、また、試験した２つの肺癌細胞株の表面に発現されることが分かった。対照は、ＨＥＫ２９３ヒト胎児腎臓細胞、正常な肺、ヒト卵巣、水、および陽性対照としてのＭＭＭＴ  ５３９子宮癌を含んだ。これらのデータは、ＳＡＳ１Ｒが肺癌（図２１）および膀胱癌（データ示さず）についての有用なマーカーとなり得、またそれが表面に位置することにより、それを診断および療法のための容易な標的にすることを実証する。図２１は、ヒト肺癌細胞および上記に記載される対照におけるＳＡＳ１Ｒ遺伝子発現の電気泳動法の結果を実証する。図は、５７９ｂｐの触媒ドメイン産物を実証する。図２２は、４つの顕微鏡写真（Ａ〜Ｄ）の画像を含み、免疫抗体によりプローブした培養物中の固定非透過処理ヒト肺腺癌細胞株Ａ５４９細胞におけるＳＡＳ１Ｒ局在の結果を示す。図２３は、３つの顕微鏡写真（Ａ〜Ｃ）の画像を含み、免疫前抗体によりプローブした固定非透過処理ヒト肺腺癌細胞株Ａ５４９細胞におけるＳＡＳ１Ｒ局在研究の結果を示す。図２３Ｃは、ネガティブ対照を示す。
【０４７０】
ＳＡＳ１Ｒ（ＡＳＴＬ）はまた、Ｏｎｃｏｍｉｎｅによっても分析し、その発現は、３７１の肺腺癌（図３７）においてアップレギュレートされることが分かり、これにより、ＳＡＳ１Ｒは、獲得コピー数ランキングが１３８９になり、これにより、ＳＡＳ１Ｒは、肺腺癌においてアップレギュレートされる遺伝子のトップ８％になる。原発腫瘍由来のこれらのデータは、肺腺扁平上皮および腺癌細胞株におけるＳＡＳ１Ｒのアップレギュレーションによって支持される。分析は、遺伝子チップアレイデータセットを委託したＷｅｉｒ，  ｅｔ  ａｌ．（２００７，Ｎａｔｕｒｅ，４５０，８９３−８９８）によって調製されたデータセットに基づくものとした。次いで、これらのデータセットは、Ｏｎｃｏｍｉｎｅを使用してＡＳＴＬについて本明細書において調べた。分析は、癌タイプによって分類される第９０百分位数の異常値分析である。縦軸は、ｌｏｇ２コピー数単位を示す。データは、３７１の肺腺癌を示す。ＤＮＡ−１８，８２３の測定遺伝子；ＲｅｆＳｅｑ  Ｇｅｎｅｓ−ＵＣＳＣ  ｒｅｆＧｅｎｅ、２００９年７月、ｈｇ１８、ＮＣＢＩ  ３６．１、２００６年３月）；Ｃｏｐｙ  Ｎｕｍｂｅｒ  Ｇｅｎｅ  Ｒａｎｋ−１３８９（トップ８％）；ＣＯＰＡ−３．１５４；Ｒｅｐｏｒｔｅｒ−０２−０９６１６０６０８。
【０４７１】
ＡＳＴＬコピー数（ＳＡＳ１Ｒをコードする遺伝子）についての、本明細書において記載される他の癌の分析は、同様にコピー数の増加を実証した（示さず）。
【０４７２】
モルモットポリクローナル抗ヒトオバスタシン抗体を使用する肺癌Ｈ２２６およびＡ５４９細胞株由来のタンパク質抽出物のウエスタンブロッティング（図３４）は、肺癌細胞株Ｈ２２６およびＡ５４９の両方において完全長（４６ｋＤ）および切断型オバスタシンタンパク質の発現を示した。
【０４７３】
培養中の細胞の染色もまた、ＳＡＳ１Ｒの局在を決定するために実行した。最も重要なことには、本明細書における他の細胞によりおよび卵巣において示されるように、ＳＡＳ１Ｒは、Ｈ２２６およびＡ５４９細胞の両方の表面に局在し得る（示さず）。
【０４７４】
卵巣腫瘍におけるＳＡＳ１Ｒ発現−
記載されるように、ＳＡＳ１Ｒは、正常な卵巣組織において発現されることが知られており、実際に、卵巣は、ＳＡＳ１Ｒタンパク質発現が正常な状態下で検出可能であることが分かっている唯一の組織である。このために、それは、ＳＡＳ１Ｒ発現について卵巣腫瘍を検査すると推定された。図２４は、３１０ｂｐ産物を増幅するＣ−末端特異的プライマーを使用する、ＳＡＳ１Ｒ発現の電気泳動法の画像である。１０の卵巣腫瘍（Ｔ１〜Ｔ１０）を分析し、すべて、ＳＡＳ１Ｒを発現した。正常な卵巣組織試料対照（ＨＯ）もまた、ＳＡＳ１Ｒ転写物の存在を示した。上のパネルは３１０ｂｐ産物を示し、下のパネルは、ＧＡＰＤＨ対照を示す。
【０４７５】
子宮腫瘍におけるＳＡＳ１Ｒ発現−
上記に記載される実験の継続調査として、ＳＡＳ１Ｒの３１０ｂｐ産物もまた、正常なヒト子宮組織およびヒト子宮腫瘍において検査した。図２５は、子宮腫瘍および正常な子宮におけるＳＡＳ１Ｒ発現の電気泳動法の画像を提供する（上および下のパネル）。３１０ｂｐ産物を増幅するＣ−末端特異的プライマーは、発現を検出するために使用した。上のパネルは３１０産物を示し、下のパネルは、ＧＡＰＤＨ対照を示す。ＮＵ−正常な子宮の試料。ＳＡＳ１Ｒ転写物は、７つのグレード１子宮腫瘍のうちの７（７／７）において検出された。ＳＡＳ１Ｒ転写物は、４つのグレード３子宮腫瘍のうちの１つ（１／４）において検出された。ＳＡＳ１Ｒ転写物は、正常な子宮の組織において検出可能ではなかった。
【０４７６】
ＭＭＭＴ細胞におけるＳＡＳ１Ｒ発現−
図２６は、対照子宮内膜細胞株（ＭＡＤ１０）と比較した、ＭＭＭＴ３０８およびＭＭＭＴ５３９癌細胞株についての３１０ｂｐ  ＳＡＳ１Ｒ産物の検出の電気泳動法の画像を提供し、９９％の同一性によりＳＡＳ１Ｒ遺伝子配列を確認し、ＭＭＭＴ癌細胞株について上記に記載される結果を検証する。上のパネルは、３１０ｂｐ  ＳＡＳ１Ｒ産物を示し、下のパネルは、ＧＡＰＤＨ対照を示す。
【０４７７】
次に、一連の実験は、染色法を使用して、ＳＡＳ１Ｒ発現についてインビトロ生ＭＭＭＴ癌細胞株を検査するために実行した。図２７は、図２７Ａ〜２７Ｆ（それぞれ４つのパネル）を含み、ＳＡＳ１Ｒの細胞表面局在を示す、ＳＡＳ１Ｒに対して導かれるウサギポリクローナル抗体により染色されている生細胞の画像を示す。パネル２７  Ａ、Ｃ、およびＥは、免疫前血清により染色されている。パネルＢ、Ｄ、およびＦは、ＳＡＳ１Ｒに対する免疫血清により染色する。４つの列は、左から右に、図２７Ａ〜２７Ｆについて、ＤＡＰＩ染色、アクチンについての染色、ＳＡＳ１Ｒ染色、およびマージを示す。細胞核は、ＤＡＰＩにより対比染色した。ファロイジン（赤色の染色）は、細胞骨格アクチンタンパク質の局在を決定するために使用した。細胞株ＭＭＭＴ５３９（パネルＡ）、ＭＭＭＴ３０８（パネルＣ）、および対照子宮内膜細胞株ＭＡＤ１０（パネルＥ）が免疫前血清により染色される場合、免疫染色は見られない。しかしながら、別個の細胞表面局在は、免疫後血清により、ＭＭＭＴ５３９（パネルＢ）およびＭＭＭＴ３０８（パネルＤ）で観察された。免疫染色は、免疫後血清により、対照子宮内膜細胞株ＭＡＤ１０（パネルＦ）で観察されなかった。
【０４７８】
予想外の現象、すなわち細胞形状の改変が、抗ＳＡＳ１Ｒ抗体に曝露された生細胞において観察された。図２８は、パネルＡ、Ｂ、およびＣを含み、ＳＡＳ１Ｒについての培養物におけるＭＭＭＴ細胞の生染色の結果を示し、細胞表面発現だけではなく、細胞形状の変化もまた示す３つの顕微鏡写真の画像を示す。パネルＡは、ウサギポリクローナル抗血清を使用する、ＳＡＳ１Ｒの細胞表面局在を実証する（カラー図の緑色）。生細胞染色において、免疫血清の添加は、球状化およびアクチン細胞骨格再分布（カラー写真における赤色）として見られる、細胞形状における変化を引き起こした。染色は、免疫前血清により観察されず、細胞形状およびアクチン細胞骨格分布の明らかな変化はなかった（パネルＢ）。最初にパラホルムアルデヒドにより固定し、次いで、免疫血清により免疫染色した場合、細胞は、ＳＡＳ１Ｒの細胞質内分布を示し、核周囲領域にＳＡＳ１Ｒが集中した。同じパネルにおいて、細胞がそれらの多角形形状を維持し、アクチン細胞骨格分布の変化がないことに注目されたい（パネルＣ）。
【０４７９】
癌細胞の抗ＳＡＳ１Ｒ抗体死滅
あらゆる特定の理論によって束縛されることを望むものではないが、上記に記載される結果に基づいて、特に、ＳＡＳ１Ｒが細胞表面上に見つけられることが本明細書において示されるので、抗ＳＡＳ１Ｒ抗体がＳＡＳ１Ｒを発現する細胞を死滅させるのに有用となり得るという可能性が存在することが本明細書において仮定された。抗体および補体に曝露された場合にそれらがＳＡＳ１Ｒ抗体媒介性補体依存性細胞死に感受性であるかどうかを決定するために、実験をＭＭＭＴ５３９癌細胞株に対して実行した。７０％の培養密度のＭＭＭＴ５３９細胞は、熱不活性化免疫および免疫前ウサギポリクローナル抗体と共に一晩インキュベートし、次いで、外因性不活性または活性補体タンパク質に曝露した。実験の結果を図２９のグラフに示す。７２時間で、ＳＡＳ１Ｒに対する免疫ウサギポリクローナル血清および活性補体に曝露された細胞に相当する線が、ピークに達し、減少し始めることを図２９のグラフにおいて見ることができる。これは、抗体が細胞死およびアポトーシスを媒介したことを示す。他のグループにおいてピークパターンの変化はなかった。Ｒｂ−ウサギ；Ｒｂ  ｐＡｂ−ウサギポリクローナル抗体。対照群（カラーのグラフのオレンジ色の線）は、培地のみの細胞を示した。
【０４８０】
卵巣幹細胞に対するＳＡＳ１Ｒ標的化学療法または免疫療法の効果の欠如
本明細書において記載されるように、ＳＡＳ１Ｒは、卵巣（それが発現される唯一の正常な組織）において発現されるが、癌を標的にする癌の療法は、子供を生む女性の能力に影響を与えるべきではない。図３０は、ＳＡＳ１Ｒが、薬の標的になり得る卵母細胞特異的酵素であることを示す略図である。ＳＡＳ１Ｒは、顆粒膜細胞の２つ以上の層を有する卵胞においてのみ示され、このメタロプロテアーゼは、原始および一次卵胞内の一次卵母細胞の幹細胞集団に危害を加えないで、発生中の卵母細胞に選択的に作用する可逆的な化学療法薬のための標的となり得る。
【０４８１】
本明細書において記載され、主張される仮説および提唱される療法レジメンのさらなる支持は、下記に記載される卵巣癌幹細胞に対して実行された研究である。
【０４８２】
ＳＡＳ１Ｒ発現および卵巣癌幹細胞
上記に記載されるように、ＳＡＳ１Ｒは、試験したすべての卵巣癌においておよび高度なパーセンテージの試験した他の癌において発現されることが分かっている。癌についての診断バイオマーカーとしてのＳＡＳ１Ｒの役割をよりよく決定し、正常および癌細胞におけるその機能を理解するために、卵巣癌幹細胞を利用した（Ａｌｖｅｒｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ，２００９，２７：２４０５−２４１３）。これらの細胞は、未分化および分化の状態で研究することができる。その目的のために、ＳＡＳ１Ｒ発現は、未分化卵巣癌幹細胞株および幹細胞株に由来する分化細胞の両方において検査した。Ｃ末端特異的プライマーは、卵巣癌幹細胞株の４つのｃＤＮＡプレップからｈＳＡＳ１Ｒを増幅するために使用した。Ｒ１８２は、ヒト卵巣幹細胞集団のクローンであり、Ｍ／Ｓ／Ｔ１８２は、Ｒ１８２の分化細胞株である。レーンＲ１８２のみが、予期されるＳＡＳ１Ｒアンプリマーを示し、他の３つの細胞集団が、おそらく、幹細胞性の特性を失ったことを示す（図３１）。これは、ｈＳＡＳ１Ｒ遺伝子が、分化した細胞においてではなく卵巣癌幹細胞集団中に存在することを示唆する。ヒトＧＡＰＤＨは、ローディング対照として働くように使用した。Ｄ／Ｗは、プライマー特異性をチェックするための水対照である。
【０４８３】
ヒトＳＡＳ１Ｒは、ヒト血清において検出することができる−
癌を診断するための有用なアッセイは、血液、血清、血漿、または他の体液においてバイオマーカーを測定することができるものを含む。その目的のために、市販で入手可能な正常な血清は、様々な濃度（ナノグラムレベル）の切断型完全長ヒト組換えｈＳＡＳ１Ｒタンパク質を加えた。様々な技術が、そのようなアッセイに有用であり、２つを本明細書で記載する。増強化学発光およびテルビウム放出などのような他の技術は、同様に使用することができる。
【０４８４】
ヒト血清に、０ｎｇ／ｍｌ（対照）〜２００ｎｇ／ｍｌの範囲の、様々な濃度の組換えヒトＳＡＳ１Ｒを加えた。ウサギポリクローナル抗体（免疫前および免疫）は、ウエスタンブロット分析およびＥＬＩＳＡによってタンパク質の存在を検出するために使用した。
【０４８５】
ウエスタンブロット分析（図３２）において見られるように、３６ｋＤａの免疫血清（図３２Ｂ）の特異的な免疫染色が存在し、試験した最低の濃度（１０ｎｇ／ｍｌ）でさえ、シグナルが検出された。シグナルは、対照ブロット（免疫前の−図３２Ａ）において検出されず、シグナルは、ＳＡＳ１Ｒを添加しなかった血清において検出されなかった（図３２Ｂ−「０」によって示す）。これは、正常な血清がこれらの条件下でＳＡＳ１Ｒの検出可能なレベルを有しないことを実証する。そのようなブロットは、スキャンし、デジタル化し、レベルは、標準のソフトウェアによって比較することができる（左のブロット−免疫前；右のブロット−免疫）。
【０４８６】
ＥＬＩＳＡ分析は、ウエスタンブロット分析において見られるのと同じ実験の仮説を実証するために使用した。比例関係は、試験したすべての範囲のシグナルについて見ることができ（２０〜２００ｎｇ／ｍｌ）、バックグラウンドに対する陽性のシグナルの比（免疫前に対する免疫）は、使用したＳＡＳ１Ｒの最低のレベルでさえかなり高度である（図３３）。吸光度は６０５ｎｍとした。これらの実験は、ナノグラムレベルのこのタンパク質が、個人の血清において容易に検出し、測定することができることを実証し、ピコグラム量が検出可能であることを示唆する。正常な血清が検出可能なＳＡＳ１Ｒを有しないこともまた実証する。さらに、ＳＡＳ１Ｒに対する他の抗体は、ヒトおよびモルモットのモノクローナルを含めて、本明細書において記載される。
【０４８７】
ＳＡＳ１Ｒに対して導かれるモノクローナル抗体−
モノクローナル抗体は、療法のための使用を含む複数の用途を有する。その目的のために、５つのさらなるモノクローナルを作製し、試験した。
【０４８８】
５つのマウスモノクローナル抗体（ＳＢ１、ＳＢ２、ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５）を、組換えヒトＳＡＳ１Ｒに対して産生した。それらは、ヒト（Ｈ）およびマウス（Ｍ）ＳＡＳ１Ｒに対する活性について試験した（図３５および３６）。ウエスタンブロット分析は、ｍＡｂ  ＳＢ１およびＳＢ２が、ヒトおよびマウスＳＡＳ１Ｒの両方を認識したが、ｍＡｂ  ＳＢ３、ＳＢ４、およびＳＢ５がヒトＳＡＳ１Ｒとのみ反応することを実証した。ブロットでは、精製組換えヒトＳＡＳ１Ｒが、自己タンパク分解により複数のペプチドを示したことに注意されたい。ヒトＳＡＳ１Ｒに対するこれらのマウスモノクローナルは、薬剤および放射性核種と結び付けられ、提唱されるトランスレーショナルな実験における生物学的プローブとして用いられるであろう。一態様では、モノクローナルは、ヒト化を含めて修飾することができる。
【０４８９】
将来の実験−これらの実験は、ＳＡＳ１Ｒを阻害するまたは癌療法において有用であろう薬剤、化合物、または他の作用物質を同定するために、アッセイにおいて標的としてＳＡＳ１Ｒを使用することを含むであろう。これらのアッセイは、ハイスループットスクリーニングとしてライブラリーと共にまたは個々の作用物質と共に実行することができる。ＳＡＳ１Ｒ発現、レベル、および活性を標的にする新しい薬剤もまた、作製することができる。ペプチドライブラリーは、生成し、ペプチドミメティックがＳＡＳ１Ｒを調節することを判断できるかどうかを決定するために使用することができる。ノックアウトマウスは、ＳＡＳ１Ｒ遺伝子の標的欠失によって調製されるであろう。
【０４９０】
要約−
卵巣において発現されることが以前に発見されたＳＡＳ１Ｒは、予想外に、複数の腫瘍タイプおよび高度なパーセンテージの腫瘍において発現されることが本発明の研究において分かった。ＳＡＳ１Ｒは、細胞表面を含めて、ｍＲＮＡレベルおよびタンパク質レベルで発現されることが本明細書において分かった。正常な組織の中で卵に制限される新規な腫瘍表面タンパク質を同定することによって、本出願は、癌診断、治療薬、および治療における突破口を与える発明を包含する。癌−卵母細胞バイオマーカーは、様々な腫瘍において発現されるタンパク質であるが、正常な組織の中では、卵形成の厳密な段階で、女性の生殖細胞、卵母細胞において卵巣内でのみ選択的に発現される。マウスにおける発明者らの研究は、卵巣および発生中の卵母細胞の細胞質においてのみＳＡＳ１Ｒタンパク質が局在したことを示す。正常な身体におけるこの制限された局在のために、癌−卵母細胞バイオマーカーは、それらが選択的なおよび特異的な診断ならびに腫瘍特異的な療法への道を開くので、腫瘍診断および治療のための優れた機会を提示する。本明細書において開示される本発明は、卵巣および子宮癌において、モデル癌−卵母細胞バイオマーカーとしてのＳＡＳ１Ｒのヒト生物学を調査する研究に基づく。ＳＡＳ１Ｒは、単層の一次卵胞および二層の二次卵胞の間の移行状態にある一次卵母細胞における卵発生の厳密な段階にヒト卵巣において最初に翻訳されることが観察された亜鉛メタロプロテアーゼであり、これは、マウス卵巣において見られるものに類似するパターンである。原始卵胞内の一次卵母細胞および一次卵胞内の大多数の一次卵母細胞は、このメタロプロテアーゼを発現せず、したがって、この酵素を標的にする療法によって影響を与えられず、卵巣予備能を含む卵母細胞の保護を確実にし、受精能を保持する癌治療に対する免疫および化学療法アプローチを可能にするであろう。
【０４９１】
特異的な試薬を使用して、ＳＡＳ１Ｒ転写物およびタンパク質をヒト卵巣および子宮腫瘍において同定した。悪性ミュラー管混合腫瘍（ＭＭＭＴ）および子宮内膜癌腫を含む組織マイクロアレイにおける生検材料は、ＳＡＳ１Ｒに対するポリクローナル抗体と強力な免疫反応性を示した。２つのＭＭＭＴ由来細胞株もまた、試験し、ＤＮＡ配列決定で９９％の配列同一性を有するＳＡＳ１Ｒ転写物の存在を確認した。重要なことには、生細胞を研究した場合、ＳＡＳ１Ｒは、細胞表面局在を示した。抗体によるこれらのヒト腫瘍細胞の治療は、規則的な多角形の形からアクチン細胞骨格が再分布した丸い細胞への変換を引き起こした。リアルタイムアッセイにおいて、腫瘍細胞は、特異的な抗体および補体の存在下において死滅した。１０の卵巣腫瘍のＰＣＲは、すべてにおいてＳＡＳ１Ｒを同定した。卵巣癌および子宮癌のための決定的な診断試験の不足ならびに転移疾患の患者についての予後不良を考慮すれば、ＳＡＳ１Ｒは、これらの癌の初期診断のための可能性のある診断標的を与える。ＳＡＳ１Ｒタンパク質に対して導かれる療法は、受精能を保持しながら、卵巣および子宮腫瘍を選択的に標的にする、テーラーメイド医療のための第一の戦略になり得る。癌−卵母細胞バイオマーカーは、腫瘍および成熟卵母細胞の不要な集団のみを標的にする薬物作用の選択的なメカニズムを提供する、発明者によって開発される、新しい分野の制癌剤標的に相当する。
【０４９２】
ＳＡＳ１Ｒが、１）活性メタロプロテアーゼであり、２）卵母細胞および試験した他の細胞の表面上に見つけられ、３）正常な組織の中で卵母細胞特異的であり、４）本明細書において開示される腫瘍において予想外に見つけられるので、ＳＡＳ１Ｒは、優れた候補癌バイオマーカーである。ＳＡＳ１Ｒは、身体における他のすべての組織に危害を加えることなく、子宮癌を選択的に標的にするための薬剤標的としての［それが原始卵胞内の一次卵母細胞上にないので、卵巣における幹細胞予備能（ｓｔｅｍ  ｃｅｌｌ  ｒｅｓｅｒｖｅ）を含む］および治療ワクチンにおける痘苗原としての適用を有していてもよい。そのため、ＳＡＳ１Ｒは、癌、特に子宮および卵巣癌ならびにＳＡＳ１Ｒを発現する任意の癌のための診断マーカーとして有用である。
【０４９３】
本出願は、ＳＡＳ１Ｒ抗体媒介性補体依存性細胞死がＭＭＭＴ細胞株において観察されることを示す。重要なことには、データはまた、生細胞において、ＳＡＳ１Ｒが細胞表面にあることを示す。
【０４９４】
本明細書において引用されるそれぞれのおよびすべての特許、特許出願、および刊行物の開示は、それらの全体が本明細書において参照によってこれによって組み込まれる。
【０４９５】
見出しは、参照のためにおよびあるセクションを捜し出すのを助けるために本明細書において含まれる。これらの見出しは、その中の下に記載される概念の範囲を限定するようには意図されず、これらの概念は、全本明細書を通じて他のセクションにおいて適用可能性を有していてもよい。
【０４９６】
本発明が特定の実施形態に関して開示されたが、本発明の他の実施形態および変形が、本発明の精神および範囲から逸脱することなく、当業者によって考案されてもよいことは明らかである。
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
2013539018.tif 000014
【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【図３３】
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【図３４】
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【図３５】
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【図３６】
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【図３７】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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2013539018.tif 000043
2013539018.tif 000044