(57)【要約】  ＭＨＣＩＩ結合ペプチドに関連する組成物および方法が、本明細書に提供されている。一部の実施形態において、ペプチドは共通の供給源から得られるかまたは誘導される。他の実施形態において、ペプチドは対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導される。【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘは結合を含んでも、結合を全く含まなくても、または結合基を含んでもよく、
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢが共通の供給源から得られるかまたは誘導される剤形。
【請求項２】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘは結合を含んでも、結合を全く含まなくても、結合基を含んでもよく、
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形。
【請求項３】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが、共通の供給源から得られるかまたは誘導される、請求項２に記載の剤形。
【請求項４】
ｘは、アミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、ヒドラジドリンカー、イミンリンカー、チオ尿素リンカー、アミジンリンカー、またはアミンリンカーを含むリンカーを含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項５】
ｘは、ペプチド配列、リソソームプロテアーゼ切断部位、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーまたはオリゴマーグリコールスペーサーを含むリンカーを含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６】
ｘは、リンカーを全く含まず、かつＡおよびＢは、前記組成物中に存在する混合物を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項７】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１〜６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項７に記載の剤形。
【請求項９】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１０】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項９に記載の剤形。
【請求項１１】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１２】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１１に記載の剤形。
【請求項１３】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１４】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１３に記載の剤形。
【請求項１５】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１６】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１５に記載の剤形。
【請求項１７】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１８】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項１７に記載の剤形。
【請求項１９】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜５０−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２０】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜３０−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項１９に記載の剤形。
【請求項２１】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、６−ｍｅｒ〜２５−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項２０に記載の剤形。
【請求項２２】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜５０−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項１〜２１のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２３】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜３０−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項２２に記載の剤形。
【請求項２４】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、６−ｍｅｒ〜２５−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項２３に記載の剤形。
【請求項２５】
前記天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項１〜２４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２６】
前記感染性媒介物が細菌、原生動物、またはウイルスである、請求項２５に記載の剤形。
【請求項２７】
前記ウイルスがノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である、請求項２６に記載の剤形。
【請求項２８】
前記天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する前記感染性生物、から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項１〜２４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２９】
前記天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項３０】
前記感染性媒介物が細菌、原生動物、またはウイルスである、請求項２９に記載の剤形。
【請求項３１】
前記ウイルスがノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である、請求項３０に記載の剤形。
【請求項３２】
前記天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する前記感染性生物、から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項３３】
前記天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項３４】
前記感染性媒介物が細菌、原生動物、またはウイルスである、請求項３３に記載の剤形。
【請求項３５】
前記ウイルスがノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である、請求項３４に記載の剤形。
【請求項３６】
前記天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する前記感染性生物、から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の剤形
【請求項３７】
共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢが、前記同じ菌株、種および／もしくは属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢを含む、請求項１〜３６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項３８】
ＡおよびＢが、異なるＭＨＣＩＩ結合レパートリーを有するペプチドを含む、請求項１〜３７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項３９】
Ａ、ｘ、またはＢは、Ａ−ｘ−Ｂの水溶解度を増大させる配列または化学修飾を含み、ここで、前記配列または化学修飾は、親水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸、疎水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸の付加、約７．４のｐＩを得て、かつ約ｐＨ３．０で正の正味電荷を得るためのアミノ酸の置換、ならびに再配列を受けやすいアミノ酸の置換を含む、請求項１〜３８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４０】
前記組成物が
Ａ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃと、
薬学的に許容できる賦形剤と、
を含み、
ここで、ｙはリンカーを含んでも含まなくてもよく、
ここで、Ｃは第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、Ａ、Ｂ、およびＣが互いに対して１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣは、共通の供給源から得られるかまたは誘導される、請求項１〜３９のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４１】
前記組成物が
Ａ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃと、
薬学的に許容できる賦形剤と、
を含み、
ここで、ｙはリンカーを含んでも含まなくてもよく、
ここで、Ｃは第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、Ａ、Ｂ、およびＣが互いに対して１００％の同一性を有さず、かつ
前記抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導される、請求項１〜３９のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４２】
前記抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣは、共通の供給源から得られるかまたは誘導される、請求項４１に記載の剤形。
【請求項４３】
ｙは、アミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、ヒドラジドリンカー、イミンリンカー、チオ尿素リンカー、アミジンリンカー、またはアミンリンカーを含むリンカーを含む、請求項４０〜４２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４４】
ｙは、ペプチド配列、リソソームプロテアーゼ切断部位、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーまたはオリゴマーグリコールスペーサーを含むリンカーを含む、請求項４０〜４２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４５】
ｙは、リンカーを全く含まず、かつＡ−ｘ−ＢおよびＣは、前記組成物中に存在する混合物を含む、請求項４０〜４２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４６】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項４０〜４５のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４７】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項４６に記載の剤形。
【請求項４８】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項４０〜４７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項４９】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項４８に記載の剤形。
【請求項５０】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項４０〜４９のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項５１】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む、請求項５０に記載の剤形。
【請求項５２】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜５０−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項４０〜５１のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項５３】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜３０−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項５２に記載の剤形。
【請求項５４】
前記第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、６−ｍｅｒ〜２５−ｍｅｒの範囲の長さを有する、請求項５３に記載の剤形。
【請求項５５】
前記天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項４０〜５４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項５６】
前記感染性媒介物が細菌、原生動物、またはウイルスである、請求項５５に記載の剤形。
【請求項５７】
前記ウイルスがノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である、請求項５６に記載の剤形。
【請求項５８】
前記天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する前記感染性生物、から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項４０〜５４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項５９】
前記天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項４０〜５８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６０】
前記感染性媒介物が細菌、原生動物、またはウイルスである、請求項５９に記載の剤形。
【請求項６１】
前記ウイルスがノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である、請求項６０に記載の剤形。
【請求項６２】
前記天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する前記感染性生物、から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項４０〜５８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６３】
前記天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項４０〜６２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６４】
前記感染性媒介物が細菌、原生動物、またはウイルスである、請求項６３に記載の剤形。
【請求項６５】
前記ウイルスがノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である、請求項６４に記載の剤形。
【請求項６６】
前記天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する前記感染性生物、から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む、請求項４０〜６２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６７】
共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣが、同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣを含む、請求項４０〜６６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６８】
Ａ、Ｂ、およびＣのそれぞれは、異なるＭＨＣＩＩ結合レパートリーを有するペプチドを含む、請求項４０〜６７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項６９】
Ａ、ｘ、Ｂ、ｙ、またはＣは、Ａ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃの水溶解度を増大させる配列または化学修飾を含み、ここで、前記配列または化学修飾は、親水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸、疎水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸の付加、約７．４のｐＩを得て、かつ約ｐＨ３．０で正の正味電荷を得るためのアミノ酸の置換、ならびに再配列を受けやすいアミノ酸の置換を含む、請求項４０〜６８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項７０】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘはリンカーを含むかまたはリンカーを全く含まず；
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み；
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形。
【請求項７１】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘはリンカーを含むかまたはリンカーを全く含まず；
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み；
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形。
【請求項７２】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘはリンカーを含むかまたはリンカーを全く含まず；
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み；
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／またはｖ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形。
【請求項７３】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘは、アミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、ヒドラジドリンカー、イミンリンカー、チオ尿素リンカー、アミジンリンカー、またはアミンリンカーを含むリンカーを含み；
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形。
【請求項７４】
（ｉ）抗原と、
（ｉｉ）Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、
（ｉｉｉ）薬学的に許容できる賦形剤と、
を含む剤形であって、
ここで、ｘはペプチド配列、リソソームプロテアーゼ切断部位、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーもしくはオリゴマーグリコールスペーサー（ｏｌｉｇｏｍｅｒｉｃ  ｇｌｙｃｏｌ  ｓｐａｃｅｒ）を含むリンカーを含んで構成され、
ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、
ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつ
ここで、前記抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形。
【請求項７５】
前記リンカーが請求項４〜６に定義されている、請求項７０〜７４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項７６】
前記第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが請求項７〜１２および１９〜２１のいずれか一項に定義されている、請求項７０〜７５のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項７７】
前記第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが請求項１３〜１８および２２〜２４のいずれか一項に定義されている、請求項７０〜７６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項７８】
前記天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドが請求項２５〜２８のいずれか一項に定義されている、請求項７０〜７７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項７９】
前記天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドが請求項２９〜３２のいずれか一項に定義されている、請求項７０〜７８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８０】
前記天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドが請求項３３〜３６のいずれか一項に定義されている、請求項７０〜７９のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８１】
前記抗原ならびにＡおよび／またはＢが請求項３７または３８に定義されている、請求項７０〜８０のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８２】
Ａ、ｘ、またはＢが請求項３９に定義されている、請求項７０〜８１のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８３】
前記組成物が前記合成ナノ担体にカップリングされている、請求項１~８２のいずれか一項に記載の剤形を含む剤形。
【請求項８４】
前記抗原が前記合成ナノ担体にカップリングされている、請求項８３に記載の剤形。
【請求項８５】
前記組成物の少なくとも一部が前記合成ナノ担体の表面に存在する、請求項８３または８４に記載の剤形。
【請求項８６】
前記組成物の少なくとも一部が前記合成ナノ担体によってカプセル化されている、請求項８３〜８５のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８７】
共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣが、同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣを含む、請求項８３〜８６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８８】
前記抗原が前記合成ナノ担体にカップリングされている、請求項８３に記載の剤形を含む剤形。
【請求項８９】
前記組成物が前記ナノ担体にカップリングされている、請求項８８に記載の剤形。
【請求項９０】
前記抗原の少なくとも一部が前記ナノ担体の表面に存在する、請求項８８または８９に記載の剤形。
【請求項９１】
前記抗原の少なくとも一部が前記合成ナノ担体によってカプセル化されている、請求項８８〜９０のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項９２】
請求項１〜９１のいずれか一項に記載の剤形を含むワクチンを含有する剤形。
【請求項９３】
薬学的に許容できる賦形剤を更に含む、請求項９２に記載の剤形。
【請求項９４】
アジュバントを更に含む、請求項９２または９３に記載の剤形。
【請求項９５】
前記ワクチンが合成ナノ担体を含む、請求項９２〜９４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項９６】
前記ワクチンが前記組成物に複合した担体を含む、請求項９２〜９５のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項９７】
共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣが、同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣを含む、請求項９２〜９６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項９８】
ポリペプチド、または前記ポリペプチドをコードする核酸と、抗原とを含む剤形であって、
ここで、前記抗原および前記ポリペプチドの少なくとも一部が共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ
前記ポリペプチドの配列が、配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示される前記アミノ酸配列のいずれか１つに対して少なくとも７５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む剤形。
【請求項９９】
ポリペプチド、または前記ポリペプチドをコードする核酸を含む剤形または組成物であって、
ここで、前記ポリペプチドが共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ
前記ポリペプチドの配列が、配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して少なくとも７５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む剤形または組成物。
【請求項１００】
ポリペプチド、または前記ポリペプチドをコードする核酸を含む剤形または組成物であって、
ここで、前記ポリペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導され、かつ
前記ポリペプチドの配列が、配列番号１００〜１１５および１１９として示される前記アミノ酸配列のいずれか１つに対して少なくとも７５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む剤形または組成物。
【請求項１０１】
前記ポリペプチドが共通の供給源から得られるかまたは誘導される、請求項１００に記載の剤形。
【請求項１０２】
ポリペプチド、または前記ポリペプチドをコードする核酸を含む剤形または組成物であって、前記ポリペプチドが配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９のいずれか１つとして示されるアミノ酸配列を含む、剤形または組成物。
【請求項１０３】
前記ポリペプチドの配列が配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項９８〜１０２のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１０４】
前記ポリペプチドの配列が、配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示される前記アミノ酸配列のいずれか１つに対して少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１０３に記載の剤形または組成物。
【請求項１０５】
前記ポリペプチドの配列が配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つのアミノ酸配列を含む、請求項１０４に記載の剤形または組成物。
【請求項１０６】
前記ポリペプチドが合成ナノ担体にカップリングされている、請求項９８〜１０５のいずれか一項に記載の剤形または組成物を含む剤形。
【請求項１０７】
薬学的に許容できる賦形剤を更に含む、請求項１０６に記載の剤形。
【請求項１０８】
前記ポリペプチドの少なくとも一部が前記合成ナノ担体の表面に存在する、請求項１０６または１０７に記載の剤形。
【請求項１０９】
前記ポリペプチドの少なくとも一部が前記合成ナノ担体によってカプセル化されている、請求項１０６〜１０８のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１１０】
請求項９８〜１０９のいずれか一項に記載の剤形または組成物を含むワクチンを含有する剤形。
【請求項１１１】
薬学的に許容できる賦形剤を更に含む、請求項１１０に記載の剤形。
【請求項１１２】
１種以上のアジュバントを更に含む、請求項１１０または１１１に記載の剤形。
【請求項１１３】
前記ワクチンが合成ナノ担体を含む、請求項１１０〜１１２のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１１４】
前記合成ナノ担体が前記抗原にカップリングされている、請求項１１３に記載の剤形。
【請求項１１５】
前記ワクチンが前記ポリペプチドに複合した担体を含む、請求項１１０〜１１４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１１６】
請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物を、対象に投与する工程を含む、方法。
【請求項１１７】
処置または予防に使用される、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１１８】
請求項１１６に定義されている方法に使用される、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１１９】
ワクチン接種に使用される、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２０】
免疫応答を誘発、促進、抑制、誘導、または再誘導する方法に使用される、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２１】
癌、感染性疾患、代謝疾患、変性疾患、自己免疫疾患、炎症性疾患、および免疫学的疾患から選択される状態の予防および／または処置の方法に使用するための、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２２】
依存、例えばニコチンまたは麻酔剤への依存の予防および／または処置の方法に使用するための、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２３】
毒素、毒性媒介物、環境毒素、または他の有害な作用剤への暴露に起因する状態の予防および／または処置の方法に使用するための、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２４】
Ｔ細胞増殖またはサイトカイン産生を誘導または増強する方法に使用される、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２５】
複合体、または非複合体、ワクチンとの並行投与を含む予防および／または処置の方法に使用するための、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２６】
複合体、または非複合体、ワクチンとの並行投与を含む処置を受ける対象の予防および／または処置の方法に使用するための、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２７】
静脈内、非経口（例えば、皮下、筋肉内、静脈内、もしくは皮内など）、肺、舌下、経口、鼻腔内、経鼻、粘膜内、経粘膜、直腸、眼、経皮、経皮経路、またはこれらの経路の組み合わせによる投与を含む処置または予防の方法に使用される、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物。
【請求項１２８】
請求項１１６〜１２７のいずれか一項に記載の方法に使用される薬剤、例えば、ワクチン、の製造のための、請求項１〜１１５のいずれか一項に記載の剤形または組成物の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、米国特許法第１１９条に基づき、その内容全体が参照により本明細書中に援用されている２０１０年８月２３日出願の米国仮特許出願第６１／３７５，９６６号明細書の利益を主張するものである。
【背景技術】
【０００２】
ワクチンは強力な疾患処置方法であるが、多くの標的は十分に反応しない。特定のワクチンの活性は、付随するＴ細胞ヘルプの供給によって促進されうる。Ｔ細胞ヘルプは、ＭＨＣＩＩとの複合体を形成しうる特定のペプチド抗原の提示を通じて誘発されうる。必要とされているのは、抗原および改善されたＴ細胞ヘルプを提供することによって免疫反応を良好化しうる剤形、および関連する方法である。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００３】
一態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘは結合を含んでも、結合を全く含まなくても、結合基を含んでもよく、ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢが共通の供給源から得られるかまたは誘導される、剤形が提供されている。
【０００４】
別の態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘは結合を含んでも、結合を全く含まなくても、結合基を含んでもよく、ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む剤形が提供されている。
【０００５】
一実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは共通の供給源から得られるかまたは誘導される。
【０００６】
別の実施形態において、ｘは、アミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、ヒドラジドリンカー、イミンリンカー、チオ尿素リンカー、アミジンリンカー、またはアミンリンカーを含むリンカーを含む。更に別の実施形態において、ｘはペプチド配列、リソソームプロテアーゼ切断部位、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーもしくはオリゴマーグリコールスペーサー（ｏｌｉｇｏｍｅｒｉｃ  ｇｌｙｃｏｌ  ｓｐａｃｅｒ）を含むリンカーを含んで構成される。更にもう１つの実施形態において、ｘはリンカーを全く含まず、かつＡおよびＢは組成物中に存在する混合物を含む。
【０００７】
更なる実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。なお更なる実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。別の実施形態において、ここで、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。更なる実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。なお更なる実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。なお更なる実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。別の実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。更にもう１つの実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。別の実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。
【０００８】
一実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは５ｍｅｒ〜５０ｍｅｒの範囲の長さを有する。別の実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは５ｍｅｒ〜３０ｍｅｒの範囲の長さを有する。更にもう１つの実施形態において、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは６ｍｅｒ〜２５ｍｅｒの範囲の長さを有する。更なる実施形態において、ここで、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは５ｍｅｒ〜５０ｍｅｒの範囲の長さを有する。更に別の実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは５ｍｅｒ〜３０ｍｅｒの範囲の長さを有する。なお更なる実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは６ｍｅｒ〜２５ｍｅｒの範囲の長さを有する。
【０００９】
別の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。一実施形態において、感染性媒介物は細菌、原生動物、またはウイルスである。別の実施形態において、ウイルスはノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である。更に別の実施形態において、感染性媒介物は本明細書中で表１などの他の個所に記載されている媒介物である。
【００１０】
一実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。
【００１１】
別の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。一実施形態において、感染性媒介物は細菌、原生動物、またはウイルスである。更に別の実施形態において、ウイルスはノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である。更に別の実施形態において、感染性媒介物は本明細書中で表１などの他の個所に記載されている媒介物である。
【００１２】
更なる実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。
【００１３】
更に他の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。一実施形態において、感染性媒介物は細菌、原生動物、またはウイルスである。別の実施形態において、ウイルスはノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である。更に別の実施形態において、感染性媒介物は本明細書中で表１などの他の個所に記載されている媒介物である。
【００１４】
なお更なる実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。
【００１５】
別の実施形態において、抗原ならびにＡおよび／またはＢは、共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される、抗原ならびにＡおよび／またはＢを含む。更に別の実施形態において、ＡおよびＢは、異なるＭＨＣＩＩ結合レパートリーを有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、Ａ、ｘ、またはＢは、Ａ−ｘ−Ｂの水溶解度を増大させる配列または化学修飾を含み、ここで、配列または化学修飾は、親水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸、疎水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸の付加、約７．４のｐＩを得て、かつ約ｐＨ３．０で正の正味電荷を得るためのアミノ酸の置換、ならびに再配列を受けやすいアミノ酸の置換を含む。
【００１６】
別の態様では、本組成物はＡ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃと、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｙはリンカーを含んでも含まなくてもよく、ここで、Ｃは第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、Ａ、Ｂ、およびＣは互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣは、共通の供給源から得られるかまたは誘導される。
【００１７】
更に別の態様では、本組成物はＡ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃと、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここでｙはリンカーを含んでも含まなくてもよく、ここで、Ｃは第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、Ａ、Ｂ、およびＣは互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導される。
【００１８】
一実施形態において、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣは、共通の供給源から得られるかまたは誘導される。
【００１９】
別の実施形態において、ｙはアミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、ヒドラジドリンカー、イミンリンカー、チオ尿素リンカー、アミジンリンカー、またはアミンリンカーを含むリンカーを含む。更に別の実施形態において、ｙはペプチド配列、リソソームプロテアーゼ切断部位、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーまたはオリゴマーグリコールスペーサーを含むリンカーを含む。更に別の実施形態において、ｙはリンカーを全く含まず、かつＡ−ｘ−ＢおよびＣは、組成物中に存在する混合物を含む。
【００２０】
一実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。別の実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。更なる実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも８０％の同一性を有するペプチドを含む。更に他の実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドを含む。
【００２１】
なお更なる実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは５ｍｅｒ〜５０ｍｅｒの範囲の長さを有する。別の実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは５ｍｅｒ〜３０ｍｅｒの範囲の長さを有する。更に別の実施形態において、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは６ｍｅｒ〜２５ｍｅｒの範囲の長さを有する。
【００２２】
更に別の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。一実施形態において、感染性媒介物は細菌、原生動物、またはウイルスである。別の実施形態において、ウイルスはノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である。更に別の実施形態において、感染性媒介物は本明細書中で表１などの他の個所に記載されている媒介物である。
【００２３】
別の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。
【００２４】
更にもう１つの実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。一実施形態において、感染性媒介物は細菌、原生動物、またはウイルスである。別の実施形態において、ウイルスはノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である。更に別の実施形態において、感染性媒介物は本明細書中で表１などの他の個所に記載されている媒介物である。
【００２５】
更にもう１つの実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。
【００２６】
更なる実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。一実施形態において、感染性媒介物は細菌、原生動物、またはウイルスである。別の実施形態において、ウイルスはノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、またはコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）である。更に別の実施形態において、感染性媒介物は本明細書中で表１などの他の個所に記載されている媒介物である。
【００２７】
更に別の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。
【００２８】
一実施形態において、共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣが、同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣを含む。別の実施形態において、Ａ、ＢおよびＣはそれぞれ、異なるＭＨＣＩＩ結合レパートリーを有するペプチドを含む。更に別の実施形態において、Ａ、ｘ、Ｂ、ｙ、またはＣは、Ａ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃの水溶解度を増大させる配列または化学修飾を含み、ここで、配列または化学修飾は、親水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸、疎水性Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸の付加、約７．４のｐＩを得て、かつ約ｐＨ３．０で正の正味電荷を得るためのアミノ酸の置換、ならびに再配列を受けやすいアミノ酸の置換を含む。
【００２９】
更なる態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘはリンカーを含むかまたはリンカーを全く含まず；ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み；ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む、剤形が提供されている。
【００３０】
更に他の態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘはリンカーを含むかまたはリンカーを全く含まず；ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み；ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む、剤形が提供されている。
【００３１】
なお更なる態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘはリンカーを含むかまたはリンカーを全く含まず；ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み；ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む、剤形が提供されている。
【００３２】
別の態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘはアミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、ヒドラジドリンカー、イミンリンカー、チオ尿素リンカー、アミジンリンカー、またはアミンリンカーを含むリンカーを含み；ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む、剤形が提供されている。
【００３３】
更なる態様では、抗原と、Ａ−ｘ−Ｂを含む組成物と、薬学的に許容できる賦形剤とを含み、ここで、ｘはペプチド配列、リソソームプロテアーゼ切断部位、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーもしくはオリゴマーグリコールスペーサー（ｏｌｉｇｏｍｅｒｉｃ  ｇｌｙｃｏｌ  ｓｐａｃｅｒ）を含むリンカーを含んで構成され、ここで、Ａは第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、Ｂは第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつ第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチド、または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有するペプチドを含み、ここで、ＡおよびＢは、互いに１００％の同一性を有さず、かつここで、抗原ならびにＡおよび／またはＢは共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつ／または第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチドを含む、剤形が提供されている。
【００３４】
提供されているいずれかの剤形の一実施形態においてリンカーは、本明細書に記載されているいずれかのリンカーである。
【００３５】
提供されているいずれかの剤形の別の実施形態では、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、本明細書に記載のいずれかのＭＨＣＩＩ結合ペプチド（図に掲載されているいずれかのペプチドを含む）を含有する。
【００３６】
提供されているいずれかの剤形の更に別の実施形態において、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、本明細書に記載のいずれかのＭＨＣＩＩ結合ペプチド（図に掲載されているいずれかのペプチドを含む）を含有する。
【００３７】
提供されているいずれかの剤形の更にもう１つの実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、本明細書に記載のいずれかの天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチド（図に掲載されているいずれかのペプチドを含む）を含有する。
【００３８】
提供されているいずれかの剤形の別の実施形態では、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは、本明細書に記載のいずれかの天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチド（図に掲載されているいずれかのペプチドを含む）を含有する。
【００３９】
提供されているいずれかの剤形の更なる実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは、本明細書に記載のいずれかの天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチド（図に掲載されているいずれかのペプチドを含む）を含有する。
【００４０】
提供されているいずれかの剤形の一実施形態において、抗原ならびにＡおよび／またはＢは本明細書中の任意の個所に定義されている。提供されているいずれかの剤形の別の実施形態において、Ａ、ｘ、またはＢは本明細書中の任意の個所に定義されている。
【００４１】
提供されているいずれかの剤形の一実施形態において、組成物は合成ナノ担体にカップリングされている。提供されているいずれかの剤形の別の実施形態において、抗原は合成ナノ担体にカップリングされている。提供されているいずれかの剤形の更にもう１つの実施形態においては、組成物の少なくとも一部が合成ナノ担体の表面に存在する。提供されているいずれかの剤形の別の実施形態では、組成物の少なくとも一部が合成ナノ担体によってカプセル化されている。
【００４２】
提供されているいずれかの剤形の一実施形態においては、共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣが、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣを含む同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される。
【００４３】
提供されているいずれかの剤形の別の実施形態において、抗原は合成ナノ担体にカップリングされている。提供されているいずれかの剤形の更にもう１つの実施形態において、組成物はナノ担体にカップリングされている。提供されているいずれかの剤形の更に別の実施形態において、抗原の少なくとも一部はナノ担体の表面に存在する。提供されているいずれかの剤形の更なる実施形態において、抗原の少なくとも一部は合成ナノ担体によってカプセル化されている。
【００４４】
別の態様では、提供されている剤形のいずれかを含むワクチンが提供されている。一実施形態において、剤形は薬学的に許容できる賦形剤を含む。別の実施形態において、剤形はアジュバントを更に含む。
【００４５】
更なる実施形態において、ワクチンは合成ナノ担体を含む。別の実施形態において、ワクチンは組成物に複合した担体を含む。
【００４６】
別の実施形態において、共通の供給源から得られるかまたは誘導される抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣは、同じ菌株、種および／または属の有機体；同じ細胞型、組織型、および／もしくは器官型；または同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／もしくはその断片から得られるかまたは誘導される、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣを含む。
【００４７】
一態様では、ポリペプチド、またはポリペプチドをコードする核酸と、抗原とを含み、ここで、抗原およびポリペプチドの少なくとも一部が共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつポリペプチドの配列が、配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して、または図に示すいずれの配列に対しても、少なくとも７５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、剤形が提供されている。
【００４８】
別の態様では、ポリペプチド、またはポリペプチドをコードする核酸を含み、ここで、ポリペプチドが共通の供給源から得られるかまたは誘導され、かつポリペプチドの配列が配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して、または図に示すいずれの配列に対しても少なくとも７５％の同一性を有する、剤形または組成物が提供されている。更なる態様では、ポリペプチド、またはポリペプチドをコードする核酸を含み、ここで、ポリペプチドが、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導され、かつポリペプチドの配列が、配列番号１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して、または図に示すいずれの配列に対しても、少なくとも７５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、剤形または組成物が提供されている。
【００４９】
一実施形態において、ポリペプチドは共通の供給源から得られるかまたは誘導される。
【００５０】
別の実施形態において、ポリペプチドの配列は配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して、または図に示すいずれの配列に対しても少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。更に別の実施形態において、ポリペプチドの配列は配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して、または図に示すいずれの配列に対しても少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。更にもう１つの実施形態において、ポリペプチドの配列は配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つのアミノ酸配列、または図に示すいずれかの配列を含む。
【００５１】
更なる別の態様では、ポリペプチド、またはポリペプチドをコードする核酸を含み、ここで、ポリペプチドが、配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９のいずれか１つとして示されるアミノ酸配列、または図に示すいずれかの配列を含む、剤形または組成物が提供されている。
【００５２】
更なる態様では、本明細書に記載のポリペプチドのいずれか（図に掲載されているものを含む）、またはポリペプチドをコードする核酸を含む剤形または組成物が提供されている。
【００５３】
別の態様では、提供されている任意の剤形または組成物を含み、ポリペプチドが合成ナノ担体にカップリングされた剤形が提供されている。一実施形態において、剤形は薬学的に許容できる賦形剤を更に含む。
【００５４】
提供されているいずれかの剤形の別の実施形態では、ポリペプチドの少なくとも一部が合成ナノ担体の表面に存在する。提供されているいずれかの剤形の更に別の実施形態において、ポリペプチドの少なくとも一部は合成ナノ担体によってカプセル化される。
【００５５】
更なる態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを含むワクチンを含んでなる剤形が提供されている。一実施形態において、剤形は薬学的に許容できる賦形剤を更に含む。別の実施形態において、剤形は１種以上のアジュバントを含む。
【００５６】
更に別の実施形態において、ワクチンは合成ナノ担体を含む。一実施形態において、合成ナノ担体は抗原にカップリングされている。更にもう１つの実施形態において、ワクチンはポリペプチドに複合した担体を含む。
【００５７】
更にもう１つの態様において、提供されているいずれかの剤形のまたは組成物の第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドおよび／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、本明細書に記載のポリペプチド（図に掲載されているものを含む）を含有しうる。
【００５８】
別の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを対象に投与する工程を含む方法が提供されている。
【００５９】
更に別の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、処置または予防に使用しうる。
【００６０】
更にもう１つの態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、提供されている任意の方法に使用しうる。
【００６１】
更なる態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、ワクチン接種に使用しうる。
【００６２】
なお更なる態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかは、免疫応答を誘発、促進、抑制、誘導、または再誘導する方法に使用しうる。
【００６３】
更に他の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、癌、感染性疾患、代謝疾患、変性疾患、自己免疫疾患、炎症性疾患、および免疫学的疾患から選択される症状の予防および／または処置の方法に使用しうる。
【００６４】
別の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、依存、例えばニコチンまたは麻酔剤への依存の予防および／または処置の方法に使用しうる。
【００６５】
更に別の態様では提供されている剤形または組成物のいずれかを、毒素、毒性媒介物、環境毒素、または他の有害な作用剤への暴露に起因する状態の予防および／または処置の方法に使用しうる。
【００６６】
更にもう１つの態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかをＴ細胞増殖またはサイトカイン産生を誘導または増強する方法に使用しうる。
【００６７】
別の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを複合体、または非複合体、ワクチンとの並行投与を含む予防および／または処置の方法に使用しうる。
【００６８】
更なる態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを複合体、または非複合体、ワクチンとの並行投与を含む処置を受ける対象の予防および／または処置の方法に使用しうる。
【００６９】
更に他の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、静脈内、非経口（例えば、皮下、筋肉内、静脈内、もしくは皮内など）、肺、舌下、経口、鼻腔内、経鼻、粘膜内、経粘膜、直腸、眼、経皮的（ｔｒａｎｓｃｕｔａｎｅｏｕｓ）、経皮（ｔｒａｎｓｄｅｒｍａｌ）経路、またはこれらの経路の組み合わせによる投与を含む処置または予防の方法に使用しうる。
【００７０】
別の態様では、提供されている剤形または組成物のいずれかを、提供されている任意の方法に用いる、薬剤（例えば、ワクチン）の製造に供しうる。
【図面の簡単な説明】
【００７１】
【図１】ＨＬＡ−ＤＲ集団範囲（ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ  ｃｏｖｅｒａｇｅ）−ヨーロッパに対して予測された単一およびキメラエピトープの例を示す。キメラエピトープの選択は、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ＊（ＩＥＤＢ）Ｔ細胞エピトープ予測プログラムを使用して行った。ペプチドごとに３つの方法（ＡＲＢ、ＳＭＭ＿ａｌｉｇｎおよびＳｔｕｒｎｉｏｌｏ）の各々を用い、ペプチドのスコアをＳＷＩＳＳＰＲＯＴデータベースから選択された５００万のランダムな１５ｍｅｒのスコアと比較してパーセンタイルランクを得た。次いで、３つの方法にパーセンタイルランクを用い、コンセンサス法におけるランクを得た。小さい数のパーセンタイルランクは、高親和性を示す。予測された高親和性結合（＜３のトップパーセンタイル）は、太字で示されている。ヨーロッパ人口（ブルガリア、クロアチア、キューバ（Ｅｕ）、チェコ、フィンランド、グルジア、アイルランド、北アメリカ（Ｅｕ）、スロベニア）については対立遺伝子分布が示されている。
【図２】ＨＬＡ−ＤＲ集団範囲（ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ  ｃｏｖｅｒａｇｅ）−ヨーロッパに対して予測された単一およびキメラエピトープの例を示す。
【図３】クラスＩＩに対して予測される結合親和性の低下を伴わないアミノ酸置換を示す。
【図４】ペプチド刺激ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞内でのＩＦＮ−γ発現を示すフローサイトメトリーデータの代表例を示す。
【図５】非刺激ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｍｅｄ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ／ＩＦＮ−γ＋Ｔ細胞に対して正規化された中央記憶Ｔ細胞のパーセントを示す。クラスＩＩペプチドキメラは、強固なＣＤ４記憶Ｔ細胞リコール応答をもたらす。ペプチドは、４μＭの最終濃度で加えられた。陰性および陽性ＰＢＭＣ対照はそれぞれ、刺激されないかまたは５つのペプチドのプール（５ＰＰ）で刺激された。フローサイトメトリー分析に先立ち、細胞は、ＣＤ４−ＦＩＴＣ、ＣＤ４５ＲＡ−ＰＥおよびＣＤ６２ＬＣｙ７ＰＥで染色された。次いで、細胞は、透過性にされ、固定され、またＩＦＮ−γで染色された。中央記憶Ｔ細胞は、ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｍｅｄｉｕｍ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ／ＩＦＮ−γ＋である。示される値は、ＣＤ４＋／ＣＤ６２Ｌゲート内に見出されるＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋細胞のパーセントである。同値は、各ドナーに対する非刺激対照における値を差し引くことによって正規化された。
【図６】ペプチドに対して応答する記憶Ｔ細胞について陽性の（２０のうちの）ドナー数を示す。ドナーは、値がＣＤ４＋ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ集団内の中央記憶Ｔ細胞に対応する０．０８％より大きい場合、陽性であると考えられた。
【図７】ペプチドに特異的なＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞内でのＴＮＦ−αおよびＩＦＮ−γの発現を示すフローサイトメトリーデータの代表例を示す。クラスＩＩペプチドキメラは、強固な樹状細胞／ＣＤ４中央記憶Ｔ細胞のリコール応答をもたらす。単球が、磁気ビーズ陰性選択によってＰＢＭＣから単離され、ＩＬ−４およびＧＭ−ＣＳＦ中で１週間成長し、樹状細胞（ＤＣ）分化が誘導された。自己ＣＤ４＋細胞が凍結保存ＰＢＭＣから単離され、ペプチドの存在下または不在下でＤＣとともに培養された。中央記憶Ｔ細胞内でのＴＮＦ−αおよびＩＦＮ−γの発現が検出された。未熟中央記憶Ｔ細胞がＩＦＮ−γ／ＴＮＦ−αおよびＩＬ−２を発現する一方、免疫委任エフェクター記憶Ｔ細胞はＩＬ−４またはＩＦＮ−γのみを発現する。
【図８】ペプチドに特異的なＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞内でのＩＬ−４、ＴＮＦ−α、またはＩＦＮ−γの発現のパーセントを示す。ペプチドの存在下または不在下で、樹状細胞／自己ＣＤ４  Ｔ細胞共培養物中でのサイトカイン発現が示される。（非刺激物に対して正規化された）フローサイトメトリーによって回収された７５０００の事象あたりのサイトカイン陽性記憶Ｔ細胞の数が示されている。
【図９】ペプチドに特異的なＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞内でのＴＮＦ−α＋ＩＦＮ−γまたはＴＮＦ−α＋ＩＬ−４の同時発現のパーセントを示す。ペプチドの存在下または不在下で、樹状細胞／自己ＣＤ４  Ｔ細胞共培養物中でのサイトカイン同時発現が示されている。
【図１０】ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ（４つのドナー）中でのＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋中央記憶Ｔ細胞のパーセントを示す。クラスＩＩペプチドキメラは、強固なＣＤ４記憶Ｔ細胞のリコール応答をもたらす。中央記憶Ｔ細胞は、ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋である。示される値は、ＣＤ４＋／ＣＤ６２Ｌゲート内で見出されるＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋細胞のパーセントである。
【図１１】ＴＴ８３０ｐＤＴｔ変異体を示す。
【図１２】アデノウイルスＡｄＶｋＤＴｔ変異体におけるＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞（１６のドナー）のパーセントを示す。修飾ＡｄＶｋＤＴｔペプチドキメラは、強固なＣＤ４記憶Ｔ細胞のリコール応答をもたらす。中央記憶Ｔ細胞は、ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋である。示される値は、ＣＤ４＋／ＣＤ６２Ｌゲート内で見出されるＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋細胞のパーセントである。
【図１３】高度に保存されたｐａｎ  ＨＬＡ−ＤＲ特性について選択された、インフルエンザにおけるキメラエピトープを示す。
【図１４】キメラの保存されたインフルエンザエピトープにおけるＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞（５つのドナー）のパーセントを示す。高度に保存された修飾インフルエンザペプチドキメラは、強固なＣＤ４記憶Ｔ細胞のリコール応答をもたらす。中央記憶Ｔ細胞は、ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋である。示される値は、ＣＤ４＋／ＣＤ６２Ｌゲート内で見出されるＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋細胞のパーセントである。
【図１５】インフルエンザＡ型における各クラスＩＩエピトープの予測される結合分析例から得られた結果である。
【図１６】インフルエンザＡ型におけるキメラエピトープの予測される結合分析例から得られた結果である。
【図１７】インフルエンザＡ型およびＢ型における、保存されたｐａｎ−クラスＩＩ  ＰＢ１キメラペプチドを示す。
【図１８】本発明の組成物および合成ナノ担体を用いて得られる抗ニコチン力価を示す。
【図１９】本発明の組成物および合成ナノ担体を用いて得られる抗ニコチン力価を示す。
【図２０】アデノウイルスエピトープを有するキメラペプチドを使用するＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌｈｉｇｈ中央記憶Ｔ細胞（１６のドナー）のパーセントを示す。クラスＩＩペプチドキメラは、強固なＣＤ４記憶Ｔ細胞のリコール応答をもたらす。中央記憶Ｔ細胞は、ＣＤ４＋／ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ／ＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋である。示される値は、ＣＤ４＋／ＣＤ６２Ｌゲート内で見出されるＣＤ６２Ｌ＋／ＩＦＮ−γ＋細胞のパーセントである。
【図２１】ＭＨＣクラスＩＩ結合におけるＲＳＶエピトープのＩＥＤＢ分析から得られた結果を示す。
【図２２】ＲＳＶキメラエピトープに対してＥｌｉｓｐｏｔを用い、記憶Ｔ細胞を定量化して得られた結果である。５つの異なるドナーにおけるスポット数／１×１０７細胞が、非刺激対照に対して正規化された。
【発明を実施するための形態】
【００７２】
本発明について詳述する前に、本発明が、当然変化しうるものとして、特別に例示される材料またはプロセスパラメータに限定されないことは理解されるべきである。また、本明細書で使用される用語が、あくまで本発明の特定の実施形態を記述することを目的とし、本発明を説明するための代替用語の使用の限定が意図されていないことは理解されるべきである。
【００７３】
本明細書中で引用されるすべての発行物、特許および特許出願は、上記または下記のいずれかであっても、あらゆる目的においてそれら全体が参照により本明細書中に援用される。
【００７４】
本明細書および添付の特許請求の範囲でいう単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、その内容が明示されていない限り、複数形の指示物を包含する。例えば、「ポリマー」は２つ以上のこの種の分子の混合物または異なる分子重量の単一ポリマー種の混合物を包含し、「合成ナノ担体」は２つ以上のこの種の合成ナノ担体または複数のこの種の合成ナノ担体の混合物を包含し、「ＤＮＡ分子」は２つ以上のこの種のＤＮＡ分子または複数のこの種のＤＮＡ分子の混合物を包含し、「アジュバント」は２つ以上のこの種の材料または複数のアジュバント分子の混合物、およびこれらに類するものを包含する。
【００７５】
本明細書において「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」という用語、またはそのバリエーション（「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」もしくは「包含する（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」など）は、列挙されている任意の完全体（例えばフィーチャ、要素、特徴、特性、方法／プロセスステップもしくは制限）、または完全体の群（例えばフィーチャ、要素、特徴、特性、方法／プロセスステップもしくは制限）を包含することを指すが、他の任意の完全体または完全体の群を排除するものではないと読むべきである。したがって、本明細書において「包含する（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は包括的であり、列挙されていない付加的な完全体または方法／プロセスステップを除外するものではない。
【００７６】
本明細書に記載のいかなる組成物および方法の実施形態においても、「包含する（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は「から本質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ  ｏｆ）」または「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」と置き換えることができる。「から本質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」という語句は、指定された完全体またはステップだけでなく、請求された発明の特徴もしくは機能に実質的な影響を及ぼさない完全体またはステップも必要とする。本明細書において「で構成される（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ）」という用語は、列挙されている完全体（例えばフィーチャ、要素、特徴、特性、方法／プロセスステップもしくは制限）、または完全体の群（例えばフィーチャ、要素、特徴、特性、方法／プロセスステップもしくは制限）が単独で存在することを示すために使用されている。
【００７７】
以下、本発明について更に詳細に記述する。
【００７８】
Ａ．はじめに
発明者は、予想外にまた驚くべきことに、上記の課題および制限が、本明細書で開示される本発明を実施することによって克服できることを発見した。特に、発明者は、予想外に、当該技術分野における課題および制限に対処するような本発明の組成物および関連する方法を提供することが可能であることを発見した。
【００７９】
ワクチンに対する免疫応答は、ワクチン中にクラスＩＩ結合記憶エピトープを含めることにより、有効に促進され、より強固な抗体応答をもたらすことが可能である。しかし、クラスＩＩは、３つの異なる遺伝子セット（ＨＬＡ−ＤＲ、ＤＰおよびＤＱ）から構成され、各々は異なるエピトープ結合親和性を有する。さらに、遺伝子の各々は、集団内に見出されうるいくつかの対立遺伝子を有し、それらは可変エピトープ結合能を有するタンパク質を生成することから、個別のＴ細胞エピトープは、制限されたクラスＩＩ対立遺伝子である。したがって、エピトープのクラスＩＩ制限は、エピトープが制限された集団範囲を有するという点で問題を引き起こす。広範な集団範囲を得るため、ペプチドであれば、ＤＰ、ＤＱ、およびＤＲに対して無差別（ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ）かつ非選択的であるように設計されなければならないことになる。この問題は、ペプチドが、集団の大部分が暴露されている抗原に対して特異的であり、かつＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子の全体にわたって広範な活性を有するように設計することにより、克服されうる。広範であるが制限された活性を有する個別のエピトープは、例えば、破傷風毒素（ＴＴ）およびジフテリア毒素（ＤＴ）などの一般的なワクチンに対するエピトープを包含する。更に、集団の大部分が暴露されておりかつ活性抗体力価（ａｃｔｉｖｅ  ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｔｉｔｒｅ）を有する天然ウイルスまたは他の感染性媒介物（例えば、アデノウイルス（ＡｄＶ））に対するエピトープは、幅広い集団範囲を有しうる。望ましくは、設計されるペプチドは、優性ＤＰ４対立遺伝子（ＤＰＡ１＊０１／ＤＰＢ１＊４０１およびＤＰＡ１＊０１０３／ＤＰＢ１＊０４０２）に対する高親和性エピトープ、および／またはＨＬＡ−ＤＲもしくはＨＬＡ−ＤＱ対立遺伝子に対する高親和性エピトープを有することで、集団内での広範な反応性を有することになる。広範なクラスＩＩペプチドを同定するため、予測されるＨＬＡクラスＩＩ親和性に基づき、キメラエピトープを設計し、試験した。実施例に示すように、予測されるＨＬＡクラスＩＩ親和性に基づいて設計された本発明のペプチドは、ヒトにおける複数のＨＬＡクラスＩＩのＤＰ、ＤＱ、およびＤＲ対立遺伝子全体にわたって広範囲性を示し、かつ強固な記憶Ｔ細胞活性化をもたらす。これらの新しいペプチドは、いくつかのクラスＩＩ対立遺伝子全体にわたる広範囲性、およびＣＤ４＋記憶Ｔ細胞のリコール応答をもたらす上での有意な改善を示す。
【００８０】
更に、共通の供給源から得られるかまたは誘導された抗原および組成物を用いた本発明の剤形は、ヘルパーＴ細胞、ならびに細胞障害性Ｔ細胞および／またはＢ細胞を活性化しうる強固な特定の免疫反応をもたらす。特に、予測されるＨＬＡクラスＩＩ親和性に基づいて一部が設計された列挙されている組成物を使用することにより、ヒトにおける大部分の対立遺伝子全体にわたって範囲性が最も広くなり、結果として本発明の剤形は従来技術と比較して免疫反応が向上する。抗原の供給源を列挙されている組成物の供給源と調整することで（特に、抗原の供給源をＡおよび／またはＢおよび／またはＣの供給源と調整することで）、従来技術と比較してはるかに免疫反応が向上する。例えば、特定の実施形態において、特定の病原体に対するＢ細胞、およびＣＤ４＋細胞の応答は、本発明の剤形を使用すれば適切に増強されうる。
【００８１】
他の実施形態においては、第１および／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含むように選択すると有利である。これにより、対象が受ける感染性媒介物に対して複数の免疫性が与えられている場合、本発明の組成物に対する記憶応答が強固なものになる。このことは、ＲＳＶから得られるかまたは誘導される第１および／または第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドに対する記憶応答が強固であることが強調されている実施例において見受けられる。
【００８２】
下記の実施例では、一般的な本発明のアプローチの態様、ペプチド物理特性の改良、および共通の供給源から得られるかまたは誘導される本発明の組成物のほか、本発明の組成物の様々な適用の例についても示す。
【００８３】
ここで、本発明について更に詳細に記述する。
【００８４】
Ｂ．定義
「アジュバント」は、特異的抗原を構成しないが、同時投与される抗原に対する免疫応答の強さおよび寿命を増強する作用剤を意味する。かかるアジュバントは、限定はされないが、パターン認識受容体、例えばＴｏｌｌ様受容体、ＲＩＧ−１およびＮＯＤ様受容体（ＮＬＲ）の刺激剤、無機塩類、例えばカリ明礬、腸内細菌（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａ）、例えば大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｈｉａ  ｃｏｌｉ）、サルモネラ・ミネソタ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｍｉｎｎｅｓｏｔａ）、ネズミチフス菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、もしくはフレクスナー赤痢菌（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ）のモノホスホリル脂質（ＭＰＬ）Ａ、または具体的にはＭＰＬ（登録商標）（ＡＳ０４）（別々に上記細菌のＭＰＬ  Ａ）と結合されたカリ明礬、サポニン、例えばＱＳ−２１、Ｑｕｉｌ−Ａ、ＩＳＣＯＭ、ＩＳＣＯＭＡＴＲＩＸ（商標）、エマルジョン、例えばＭＦ５９（商標）、Ｍｏｎｔａｎｉｄｅ（登録商標）ＩＳＡ５１およびＩＳＡ７２０、ＡＳ０２（ＱＳ２１＋スクアレン＋ＭＰＬ（登録商標））、リポソームおよびリポソーム製剤、例えばＡＳ０１、合成のもしくは特異的に調製された微粒子および微小担体、例えば淋菌（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｅａｅ）、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）およびその他の細菌由来の外膜小胞（ＯＭＶ）、またはキトサン粒子、デポー形成剤（ｄｅｐｏｔ−ｆｏｒｍｉｎｇ  ａｇｅｎｔ）、例えばＰｌｕｒｏｎｉｃ（登録商標）ブロック共重合体、特異的に修飾または調製されたペプチド、例えばムラミールジペプチド、アミノアルキルグルコサミニド４−ホスフェート（ｇｌｕｃｏｓａｍｉｎｉｄｅ  ４−ｐｈｏｓｐｈａｔｅ）、例えばＲＣ５２９、またはタンパク質、例えば細菌トキソイドもしくは毒素断片を含みうる。
【００８５】
実施形態では、アジュバントは、限定はされないが、Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）、具体的には、ＴＬＲ２、３、４、５、７、８、９および／またはその組み合わせを含む、パターン認識受容体（ＰＲＲ）に対するアゴニストを含む。他の実施形態において、アジュバントはＴｏｌｌ様受容体３に対するアゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体７および８に対するアゴニスト、またはＴｏｌｌ様受容体９に対するアゴニストを含み、好ましくは、列挙されているアジュバントは、イミダゾキノリン；Ｒ８４８など；アデニン誘導体、例えば米国特許出願公開第６，３２９，３８１号明細書（Ｓｕｍｉｔｏｍｏ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｃｏｍｐａｎｙ）に開示されたもの、米国特許出願公開第２０１０／００７５９９５明細書（Ｂｉｇｇａｄｉｋｅらに付与）、または、国際公開第２０１０／０１８１３２号パンフレット（Ｃａｍｐｏｓらに付与）；免疫刺激性ＤＮＡ；または免疫刺激性ＲＮＡを含む。特定の実施形態において、合成ナノ担体は、ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）７および８に対するアゴニスト（「ＴＬＲ７／８アゴニスト」）である化合物をアジュバントとして組み込む。限定はされないが、イミダゾキノリンアミン、イミダゾピリジンアミン、６，７−融合シクロアルキルイミダゾピリジンアミン、および１，２−架橋イミダゾキノリンアミンを含む、米国特許第６，６９６，０７６号明細書（Ｔｏｍａｉらに付与）に開示されたＴＬＲ７／８アゴニスト化合物が有用である。好ましいアジュバントはイミキモドおよびレシキモド（別称：Ｒ８４８）を含む。特定の実施形態において、アジュバントはＤＣ表面分子ＣＤ４０に対するアゴニストであってもよい。特定の実施形態において、合成ナノ担体は耐性でなく寧ろ免疫を刺激するために、（ナイーブＴ細胞のプライミングにとって必要とされる）ＤＣ成熟と、抗体免疫応答を促進するサイトカイン（例えばＩ型インターフェロン）の産生とを促進するアジュバントを取り込む。実施形態において、アジュバントはまた、免疫刺激性ＲＮＡ分子、例えば限定はされないが、ｄｓＲＮＡ、ポリＩ：Ｃ、ポリＩ：Ｃ１２Ｕ（ポリＩ：ＣとポリＩ：Ｃ１２Ｕの両方はＴＬＲ３刺激剤として知られ、Ａｍｐｌｉｇｅｎ（登録商標）として提供されている）、および／またはＦ．Ｈｅｉｌ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｓｐｅｃｉｅｓ−Ｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｓｉｎｇｌｅ−Ｓｔｒａｎｄｅｄ  ＲＮＡ  ｖｉａ  Ｔｏｌｌ−ｌｉｋｅ  Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ７  ａｎｄ  ８”  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３０３（５６６３），１５２６−１５２９（２００４）；Ｊ．Ｖｏｌｌｍｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｉｍｍｕｎｅ  ｍｏｄｕｌａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｃｈｅｍｉｃａｌｌｙ  ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ  ａｎｄ  ｏｌｉｇｏｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ”；国際公開第２００８０３３４３２Ａ２号パンフレット；Ａ．Ｆｏｒｓｂａｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ  ｏｌｉｇｏｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ｓｐｅｃｉｆｉｃ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｍｏｔｉｆ（ｓ）ａｎｄ  ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｔｏｌｌ−ｌｉｋｅ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ８  ｐａｔｈｗａｙ”；国際公開第２００７０６２１０７��２号パンフレット；Ｅ．Ｕｈｌｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ｏｌｉｇｏｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ａｎａｌｏｇｓ  ｗｉｔｈ  ｅｎｈａｎｃｅｄ  ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ  ａｃｔｉｖｉｔｙ”；米国特許出願公開第２００６２４１０７６号明細書；Ｇ．Ｌｉｐｆｏｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ  ｖｉｒａｌ  ＲＮＡ  ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  ｕｓｅ  ｆｏｒ  ｔｒｅａｔｉｎｇ  ｃａｎｃｅｒ  ａｎｄ  ｉｎｆｅｃｔｉｏｎｓ”；国際公開第２００５０９７９９３Ａ２号パンフレット；Ｇ．Ｌｉｐｆｏｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ  Ｇ，Ｕ−ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ｏｌｉｇｏｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ，ａｎｄ  ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ  ｍｅｔｈｏｄｓ”；国際公開第２００３０８６２８０Ａ２号パンフレットに開示されているものを含みうる。一部の実施形態において、アジュバントはＴＬＲ−４アゴニスト、例えば細菌リポ多糖（ＬＰＳ）、ＶＳＶ−Ｇ、および／またはＨＭＧＢ−１であってもよい。一部の実施形態において、アジュバントはＴＬＲ−５アゴニスト、例えば、フラジェリン、またはその一部または誘導体、例えば限定はされないが、米国特許第６，１３０，０８２号明細書、米国特許第６，５８５，９８０号明細書、および米国特許第７，１９２，７２５号明細書に開示されたものを包含しうる。特定の実施形態において、合成ナノ担体はＩ型インターフェロン分泌を誘発し、かつ、ＴおよびＢ細胞活性化を刺激し、抗体産生および細胞毒性Ｔ細胞応答の増大をもたらす、ＣｐＧを含む免疫刺激性ＤＮＡ分子などのＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）−９に対するリガンドを組み込む（Ｋｒｉｅｇ  ｅｔ  ａｌ．，ＣｐＧ  ｍｏｔｉｆｓ  ｉｎ  ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ＤＮＡ  ｔｒｉｇｇｅｒ  ｄｉｒｅｃｔ  Ｂ  ｃｅｌｌ  ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ．Ｎａｔｕｒｅ．１９９５．３７４：５４６−５４９；Ｃｈｕ  ｅｔ  ａｌ．ＣｐＧ  ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｃｔ  ａｓ  ａｄｊｕｖａｎｔｓ  ｔｈａｔ  ｓｗｉｔｃｈ  ｏｎ  Ｔ  ｈｅｌｐｅｒ  １（Ｔｈ１）ｉｍｍｕｎｉｔｙ．Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１９９７．１８６：１６２３−１６３１；Ｌｉｐｆｏｒｄ  ｅｔ  ａｌ．ＣｐＧ−ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ  ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ｐｒｏｍｏｔｅ  Ｂ  ａｎｄ  ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ｔ  ｃｅｌｌ  ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ  ｔｏ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ａｎｔｉｇｅｎ：ａ  ｎｅｗ  ｃｌａｓｓ  ｏｆ  ｖａｃｃｉｎｅ  ａｄｊｕｖａｎｔｓ．Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１９９７．２７：２３４０−２３４４；Ｒｏｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ  ＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｆｕｎｃｔｉｏｎ  ａｓ  Ｔ  ｈｅｌｐｅｒ−１−ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ  ａｄｊｕｖａｎｔｓ．．Ｎａｔ．Ｍｅｄ．１９９７．３：８４９−８５４；Ｄａｖｉｓ  ｅｔ  ａｌ．ＣｐＧ  ＤＮＡ  ｉｓ  ａ  ｐｏｔｅｎｔ  ｅｎｈａｎｃｅｒ  ｏｆ  ｓｐｅｃｉｆｉｃ  ｉｍｍｕｎｉｔｙ  ｉｎ  ｍｉｃｅ  ｉｍｍｕｎｉｚｅｄ  ｗｉｔｈ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ｈｅｐａｔｉｔｉｓ  Ｂ  ｓｕｒｆａｃｅ  ａｎｔｉｇｅｎ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．��９９８．１６０：８７０−８７６；Ｌｉｐｆｏｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ＤＮＡ  ａｓ  ｉｍｍｕｎｅ  ｃｅｌｌ  ａｃｔｉｖａｔｏｒ．Ｔｒｅｎｄｓ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１９９８．６：４９６−５００；米国特許第６，２０７，６４６号明細書（Ｋｒｉｅｇらに付与）；米国特許第７，２２３，３９８号明細書（Ｔｕｃｋらに付与）；米国特許第７，２５０，４０３号明細書（Ｖａｎ  Ｎｅｓｔらに付与）；または米国特許第７，５６６，７０３号明細書（Ｋｒｉｅｇらに付与））。
【００８６】
一部の実施形態では、アジュバントは、壊死細胞（例えば尿酸結晶）から放たれる炎症誘発性刺激であってもよい。一部の実施形態では、アジュバントは、補体カスケードの活性化成分であってもよい（例えばＣＤ２１、ＣＤ３５など）。一部の実施形態では、アジュバントは、免疫複合体の活性化成分であってもよい。アジュバントはまた、補体受容体アゴニスト、例えばＣＤ２１またはＣＤ３５に結合する分子を含む。一部の実施形態では、補体受容体アゴニストは、合成ナノ担体の内因性補体オプソニン化を誘導する。一部の実施形態では、アジュバントは、サイトカインであり、細胞によって放出される小タンパク質または生物学的因子（５ｋＤ〜２０ｋＤの範囲内）であり、細胞−細胞相互作用、コミュニケーションおよび他の細胞の挙動に対して特異的効果を有する。一部の実施形態では、サイトカイン受容体アゴニストは、小分子、抗体、融合タンパク質、またはアプタマーである。
【００８７】
実施形態では、アジュバント投与の少なくとも一部は、合成ナノ担体とカップリングされる場合があり、好ましくは、アジュバント投与の全部が、合成ナノ担体とカップリングされる。他の実施形態では、アジュバント投与の少なくとも一部が合成ナノ担体とカップリングされることはない。実施形態では、アジュバント投与は、２種以上のアジュバントを含む。例えば、また限定はされないが、異なるＴＬＲ受容体に対して作用するアジュバントは併用してもよい。例として、実施形態では、ＴＬＲ７／８アゴニストは、ＴＬＲ９アゴニストと併用してもよい。別の実施形態では、ＴＬＲ７／８アゴニストは、ＴＬＲ４アゴニストと併用してもよい。さらに別の実施形態では、ＴＬＲ９アゴニストは、ＴＬＲ３アゴニストと併用してもよい。
【００８８】
「投与する」または「投与」は、薬剤を薬理学的に有用な方法で対象に提供することを意味する。
【００８９】
「抗原」は、Ｂ細胞抗原またはＴ細胞抗原を意味する。
【００９０】
「Ｂ細胞抗原」は、Ｂ細胞によって認識され、かつＢ細胞において免疫応答を引き起こす任意の抗原（例えば、Ｂ細胞上のＢ細胞受容体によって特異的に認識される抗原）を意味する。一部の実施形態では、Ｔ細胞抗原である抗原がまた、Ｂ細胞抗原である。他の実施形態では、Ｔ細胞抗原がさらにＢ細胞抗原であることはない。Ｂ細胞抗原は、限定はされないが、タンパク質、ペプチド、小分子、および炭水化物を含む。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、非タンパク質抗原を含む（すなわち、タンパク質またはペプチド抗原ではない）。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、感染性媒介物に関連した炭水化物を含む。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、感染性媒介物に関連した糖タンパク質または糖ペプチドを含む。感染性媒介物は、細菌、ウイルス、真菌、原生動物、または寄生虫であってもよい。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、免疫原性が乏しい抗原を含む。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、乱用物質またはその一部を含む。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、中毒性のある物質（ａｄｄｉｃｔｉｖｅ  ｓｕｂｓｔａｎｃｅ）またはその一部を含む。中毒性のある物質は、限定はされないが、ニコチン、麻酔剤、鎮咳剤、精神安定剤、および鎮静剤を含む。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、毒素、例えば化学兵器または天然源から誘導される毒素を含む。Ｂ細胞抗原はまた、有害な環境作用物質（ｈａｚａｒｄｏｕｓ  ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  ａｇｅｎｔ）を含んでもよい。一部の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、自己抗原を含む。他の実施形態では、Ｂ細胞抗原は、アロ抗原、アレルゲン、接触感作物質、変性疾患抗原、ハプテン、感染性疾患抗原、癌抗原、アトピー性疾患抗原、自己免疫疾患抗原、中毒性のある物質、異種抗原、または代謝性疾患酵素もしくはその酵素生成物を含む。
【００９１】
「共通の供給源」とは、抗原ならびにＡおよび／またはＢおよび／またはＣ（実施形態に依存する）が生物学的、化学的、および／または免疫学的特徴を共有する供給源から生じることを意味する。実施形態において、共通の供給源は有機体の同じ菌株、種属、および／または属でありうる。他の実施形態において、共通の供給源は同じ細胞型、組織型、および／または器官型でありうる。他の実施形態において、共通の供給源は同じ多糖、ポリペプチド、タンパク質、糖タンパク質、および／またはその断片でありうる。列挙されている抗原および組成物は、共通の供給源から得られるかまたは誘導されうる。これは、例えば、組成物が共通の供給源から得られるかまたは誘導されるかどうかには関係なく、抗原は共通の供給源から誘導されうることを意味するものである。同様に、組成物が共通の供給源から得られるかまたは誘導されるには関係なく、抗原は共通の供給源から得ることが可能である。実施形態においては逆も当てはまる。すなわち、抗原が共通の供給源から得られるかまたは誘導されるかどうかには関係なく、組成物は共通の供給源から誘導することが可能であり、また、抗原が共通の供給源から得られるかまたは誘導されるには関係なく、組成物は共通の供給源から得ることが可能である。
【００９２】
「カップリング」または「カップリングされた」または「カップリングする」（およびこれらに類するもの）は、あるエンティティ（例えば、残基）を別のエンティティに化学的に結合することを意味する。一部の実施形態において、カップリングは共有結合であり、２つのエンティティ間に共有結合が存在するというコンテキスト内でカップリングが発生することを意味する。非共有結合の実施形態において、非共有カップリングは、限定はされないが、電荷相互作用、親和性相互作用、金属配位、物理吸着、宿主−ゲスト相互作用、疎水性相互作用、ＴＴスタッキング相互作用、水素結合相互作用、ファンデルワールス相互作用、磁気相互作用、静電相互作用、双極子−双極子相互作用、および／またはそれらの組み合わせを含む非共有的相互作用によって媒介される。実施形態において、カプセル化はカップリングの一形態である。
【００９３】
「誘導される」は、供給源から取得され、かつ実質的修飾を受けることを意味する。例えば、天然ペプチドまたは核酸、好ましくは天然コンセンサスペプチドまたは核酸に対してわずか５０％の同一性を有する配列を有するペプチドまたは核酸であれば、天然ペプチドまたは核酸から誘導されると述べられることになる。しかし、誘導される核酸は、遺伝子コードの縮重のみに起因し、天然核酸配列、好ましくは天然コンセンサス核酸配列に対して同一でない配列を有する核酸を含むように意図されていない。実質的修飾は、問題の材料の化学的または免疫学的特性に有意に影響を与える修飾である。誘導されるペプチドおよび核酸はまた、前記誘導されるペプチドおよび核酸における化学的または免疫学的特性が、天然ペプチドまたは核酸に対して改変されている場合、天然ペプチドまたは核酸配列に対して５０％を超える同一性を有する配列を有するものを含み得る。これらの化学的または免疫学的特性は、親水性、安定性、ＭＨＣＩＩに対する結合親和性、および合成ナノ担体などの担体とのカップリング能を含む。
【００９４】
「剤形」とは、対象への投与に好適な培地、担体、溶媒、またはデバイス中の薬理学的におよび／または免疫学的に活性な材料を意味する。
【００９５】
「カプセル化」は、物質の少なくとも一部を合成ナノ担体内に封入することを意味する。一部の実施形態において、物質は合成ナノ担体内に完全に封入される。他の実施形態において、カプセル化された物質の大部分または全部は、合成ナノ担体の外部にある局所環境に暴露されない。他の実施形態において、５０％、４０％、３０％、２０％、１０％、または５％以下が局所環境に繰り返し暴露されている。カプセル化は吸着とは異なり、吸着では物質の大部分もしくは全部が合成ナノ担体の表面上に配置され、その物質が合成ナノ担体の外部にある局所環境に暴露されずに、合成ナノ担体の外部にある局所環境に繰り返し暴露されたままになる。
【００９６】
「ＭＨＣＩＩ結合ペプチド」は、主要組織適合性複合体クラスＩＩに、ペプチド／ＭＨＣ複合体がＴ細胞上のＴ細胞受容体と相互作用できるだけの十分な親和性で結合するペプチドを意味する。ペプチド／ＭＨＣ複合体とＴ細胞上のＴ細胞受容体との相互作用は、従来の技術を用いるサイトカイン産生および／またはＴ細胞増殖の測定を通じて確定されうる。実施形態では、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、ＭＨＣＩＩ分子への結合に対して、５０００ｎＭ以下、好ましくは５００ｎＭ以下、またより好ましくは５０ｎＭ以下の親和性ＩＣ５０値を有する。実施形態では、（明らかに第１、第２、および第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む）本発明に従うＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ以上の長さを有し、またタンパク質と同程度の大きさであってもよい。他の実施形態では、（明らかに第１、第２、および第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む）本発明に従うＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、５−ｍｅｒ〜５０−ｍｅｒの範囲、好ましくは５−ｍｅｒ〜４０−ｍｅｒの範囲、より好ましくは５−ｍｅｒ〜３０−ｍｅｒの範囲、またさらにより好ましくは６−ｍｅｒ〜２５−ｍｅｒの長さを有する。
【００９７】
「同一性」は、一次元配列アラインメントにおいて同様に配置されたアミノ酸もしくは残基または核酸塩基のパーセントを意味する。同一性は、比較されている配列がいかに密接に関連するかについての尺度である。一実施形態では、２つの配列間の同一性は、ＢＥＳＴＦＩＴプログラムを用いて判定することができる。実施形態では、列挙されるＭＨＣＩＩ結合ペプチド（Ａ、Ｂ、もしくはＣなど）は、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチド、および／または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対し、少なくとも７０％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９７％、またはさらにより好ましくは少なくとも９９％の同一性を有しうる。実施形態では、Ａ、Ｂ、およびＣは、互いに１００％同一でなく、また実施形態では、ＡおよびＢは、互いに１００％同一でない。実施形態では、列挙される核酸は、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチド、および／または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドをコードする核酸配列、あるいはそれらをコードする核酸配列に相補的である核酸配列に対し、少なくとも６０％、好ましくは少なくとも７０％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９７％、またはさらにより好ましくは少なくとも９９％の同一性を有しうる。
【００９８】
「単離核酸」は、その天然環境から分離され、その同定または使用を可能にするだけの十分な量で存在する核酸を意味する。単離核酸は、（ｉ）例えばポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によってインビトロで増幅されるか；（ｉｉ）クローニングによって組換え的に生成されるか；（ｉｉｉ）切断およびゲル分離に従って精製されるか；あるいは（ｉｖ）例えば化学合成によって合成されるものであってもよい。単離核酸は、当該技術分野で周知の組換えＤＮＡ技術によって容易に操作可能なものである。したがって、５'および３'制限部位が既知であるかまたはポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）のプライマー配列が開示されている、ベクター内に含まれるヌクレオチド配列は、単離されていると考えられるが、その天然宿主内にその天然状態で存在する核酸配列はそうではない。単離核酸は、実質的に精製されてもよいが、そうである必要はない。例えば、クローニングまたは発現ベクター内部の単離された核酸は、それが属する細胞内にほんのわずかな割合の材料を含みうる点で、純粋ではない。しかし、かかる核酸は、同用語が、それが当業者に既知の標準的技術によって容易に操作可能である理由で本明細書中で使用される場合、単離される。本明細書中に提供される核酸のいずれもが、単離されていてもよい。実施形態において、本明細書に記載の抗原またはペプチドのいずれかは、単離核酸の形態で提供されうるものであり、それらの抗原もしくはペプチドまたはその完全長補体は、単離核酸によってコードされる。
【００９９】
「単離ポリペプチド」は、その天然環境から分離され、その同定または使用を可能にするだけの十分な量で存在するポリペプチドを意味する。これは、例えば、ポリペプチドが、（ｉ）発現クローニングによって選択的に生成されてもよく、あるいは（ｉｉ）クロマトグラフィーまたは電気泳動に従って精製されてもよいことを意味する。単離タンパク質またはポリペプチドは、実質的に純粋でありうるが、その必要がない。単離ポリペプチドは、薬剤中で薬学的に許容できる担体と混合可能であることから、ポリペプチドは、薬剤の重量に対してほんのわずかな割合を含んでもよい。にもかかわらず、ポリペプチドは、生体内でそれが結合可能な物質から分離されている点で単離されており、例えば他のタンパク質から単離されている。本明細書中に提供されるペプチドまたはポリペプチドのいずれもが、単離されていてもよい。
【０１００】
「リンカー」は、２つの化学成分を、単一の共有結合または複数の共有結合のいずれかを通じて互いに連結する部分を意味する。
【０１０１】
「合成ナノ担体の最大寸法」は、合成ナノ担体の任意の軸に沿って測定されるナノ担体の最大寸法を意味する。「合成ナノ担体の最小寸法」は、合成ナノ担体の任意の軸に沿って測定される合成ナノ担体の最小寸法を意味する。例えば、回転楕円体の合成ナノ担体の場合、合成ナノ担体の最大および最小寸法は、実質的に同一となり、かつその直径のサイズとなる。同様に、立方形の合成ナノ担体の場合、合成ナノ担体の最小寸法は、その高さ、幅または長さの最小となる一方、合成ナノ担体の最大寸法は、その高さ、幅または長さの最大となる。一実施形態では、試料中の合成ナノ担体の総数に基づく、試料中の合成ナノ担体の少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％の最小寸法は、１００ｎｍより大きい。一実施形態では、試料中の合成ナノ担体の総数に基づく、試料中の合成ナノ担体の少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％の最大寸法は、５μｍ以下である。好ましくは、試料中の合成ナノ担体の総数に基づく、試料中の合成ナノ担体の少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％の最小寸法は、１１０ｎｍ以上、より好ましくは１２０ｎｍ以上、より好ましくは１３０ｎｍ以上、またより好ましくはさらに１５０ｎｍ以上。本発明の合成ナノ担体の最大および最小寸法のアスペクト比は、実施形態に応じて変化しうる。例えば、合成ナノ担体の最大および最小寸法のアスペクト比は１：１から１，０００，０００：１まで、好ましくは１：１から１００，０００：１まで、より好ましくは１：１から１０００：１まで、更に好ましくは１：１から１００：１まで、更により好ましくは１：１から１０：１まで変化しうる。好ましくは、試料中の合成ナノ担体の総数に基づく、試料中の合成ナノ担体の少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％の最大寸法は、３μｍ以下、より好ましくは２μｍ以下、より好ましくは１μｍ以下、より好ましくは８００ｎｍ以下、より好ましくは６００ｎｍ以下、またより好ましくはさらに５００ｎｍ以下である。好ましい実施形態では、試料中の合成ナノ担体の総数に基づく、試料中の合成ナノ担体の少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％の最大寸法は、１００ｎｍ以上、より好ましくは１２０ｎｍ以上、より好ましくは１３０ｎｍ以上、より好ましくは１４０ｎｍ以上、またより好ましくはさらに１５０ｎｍ以上である。合成ナノ担体サイズの測定値は、合成ナノ担体を液体（通常は水性）培地中に懸濁し、動的光散乱（ＤＬＳ）（例えばＢｒｏｏｋｈａｖｅｎ  ＺｅｔａＰＡＬＳ機器を使用）を使用することによって得られる。例えば、合成ナノ担体の懸濁液を水性緩衝液から精製水中に希釈することによって、最終的な合成ナノ担体懸濁液濃度約０．０１〜０．１ｍｇ／ｍＬを得ることが可能である。希釈された懸濁液は、内側で直接に調製してもよいし、またはＤＬＳ分析用の好適なキュベットに移してもよい。次いで、キュベットをＤＬＳ内に配置し、調整された温度に平衡させてから、十分な時間スキャンして、培地の粘性および試料の屈折率に関する適切な入��に基づき、安定かつ再生可能な分布を得る。分布の有効径または平均をレポートする。
【０１０２】
「天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチド」とは、天然物から得られるかまたは誘導され、かつペプチド／ＨＬＡ−ＤＰ複合体がＴ細胞上のＴ細胞受容体と相互作用するのに十分な親和性にてＭＨＣクラスＩＩヒト白血球型抗原ＤＰに特異的に結合するペプチドを意味する。実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドはＭＨＣクラスＩＩヒト白血球型抗原ＤＰに対して５０００ｎＭ以下、好ましくは５００ｎＭ以下、より好ましくは５０ｎＭ以下の親和性ＩＣ５０値を有する。実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。この種の感染性媒介物は、対象が２回以上暴露されているものを包含する。一般に、この種の感染性媒介物に暴露されている対象は、毎年、毎月、毎週、または毎日などのように定期的に暴露される。一部の実施形態において、この種の感染性媒介物は対象の環境に流布しているため、対象はその媒介物に繰り返し暴露されている。この種の感染性媒介物としては、細菌、原生動物、またはウイルスなどが挙げられる。対象が繰り返し暴露されうるウイルスとしては、ノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、およびコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１０３】
対象が繰り返し暴露されうるその他の感染性媒介物の例（および関連する感染性疾患）は、下記の表１に示すとおりである。そのような感染性媒介物は典型例として示したものであって、付加的な感染性媒介物（例えば、本明細書に記載されている媒介物の亜系、および本明細書に記載されていない感染性媒介物）は、本発明の一部の態様に準じて好適でありえ、この点において本発明は限定されるものではない。
【０１０４】
【表１−１】
2013538211.tif 000002
【０１０５】
【表１−２】
2013538211.tif 000003
【０１０６】
【表１−３】
2013538211.tif 000004
【０１０７】
【表１−４】
2013538211.tif 000005
【０１０８】
【表１−５】
2013538211.tif 000006
【０１０９】
【表１−６】
2013538211.tif 000007
【０１１０】
また、この種の感染性媒介物は、専らまたは主としてヒト被検対象に感染するヒト感染性媒介物だけに限られないという点も理解すべきである。対象が繰り返し暴露されうる感染性媒介物は、ヒト以外の被検対象を含む複数の宿主に感染するか、専らまたは主としてヒト以外の被検対象に感染する、感染性媒介物を包含する。例えば、この種の感染性媒介物としては、人間以外の哺乳類動物、脊椎動物、または無脊椎動物（マウス、ネズミ、スナネズミなどの齧歯動物、ネコ、イヌ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタなどの家畜、魚、蛙、爬虫類、およびその他）が挙げられるが、それらに限定されない。ヒト以外の対象に関連する感染性媒介物は当業者に周知であり、この種の疾患および媒介物の非限定的な例のいくつかは、表１に示すとおりである。本発明の態様に従った好適な更なる媒介物は当業者にとって明らかであり、この点において本発明は限定されるものではない。
【０１１１】
一部の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドはウイルス、細菌、または酵母（破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、および／または天然痘ウイルスを含むが、これらに限定されない）から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。クラスＩＩエピトープの予測は、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ＊（ＩＥＤＢ）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｍｕｎｅｅｐｉｔｏｐｅ．ｏｒｇ／）Ｔ細胞エピトープの予測ツールを使用して実施された。実施例に記載のコンピュータ分析、またはペプチドごとに３つの方法（ＡＲＢ、ＳＭＭ＿ａｌｉｇｎおよびＳｔｕｒｎｉｏｌｏ）の各々を用い、ペプチドのスコアをＳＷＩＳＳＰＲＯＴデータベースから選択された５００万のランダムな１５ｍｅｒのスコアと比較してパーセンタイルランクを得た。次いで、３つの方法にパーセンタイルランクを用い、コンセンサス法におけるランクを得た。
【０１１２】
「天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチド」とは、天然物から得られるかまたは誘導され、かつペプチド／ＨＬＡ−ＤＱ複合体がＴ細胞上のＴ細胞受容体と相互作用するのに十分な親和性にてＭＨＣクラスＩＩヒト白血球型抗原ＤＱに特異的に結合するペプチドを意味する。実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドはＭＨＣクラスＩＩヒト白血球型抗原ＤＱに対して５０００ｎＭ以下、好ましくは５００ｎＭ以下、またより好ましくは、５０ｎＭ以下の親和性ＩＣ５０値を有する。実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。この種の感染性媒介物は、対象が２回以上暴露されているものを包含する。一般に、この種の感染性媒介物に暴露されてきた対象は、毎年、毎月、毎週、または毎日などのように定期的に暴露される。一部の実施形態において、この種の感染性媒介物は対象の環境に流布しているため、対象はその媒介物に繰り返し暴露されている。この種の感染性媒介物としては、細菌、原生動物、またはウイルスなどが挙げられる。対象が繰り返し暴露されるウイルスとしては、ノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、およびコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１３】
対象が繰り返し暴露されうるその他の典型的な感染性媒介物（および関連する感染性疾患）は、上の表１に示すとおりである。感染性媒介物は典型例として示したものであって、付加的な感染性媒介物（例えば、本明細書に記載されている媒介物の亜系、および本明細書に記載されていない感染性媒介物）は、本発明の一部の態様に準じて好適でありえ、この点において本発明は限定されるものではない。
【０１１４】
また、この種の感染性媒介物は、専らまたは主としてヒト被検対象に感染するヒト感染性媒介物だけに限らないという点も理解すべきである。この種の感染性媒介物は、ヒト以外の被検対象を含む複数の宿主に感染するか、専らまたは主としてヒト以外の被検対象に感染する、ヒト感染性媒介物でありえる。例えば、この種の感染性媒介物としては、人間以外の哺乳類動物、脊椎動物、または無脊椎動物（マウス、ネズミ、スナネズミなどの齧歯動物、ネコ、イヌ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタなどの家畜、魚、蛙、爬虫類、およびその他）が挙げられるが、それらに限定されない。ヒト以外の対象に関連する感染性媒介物は当業者に周知であり、この種の媒介物の非限定的な例のいくつかは、表１に示すとおりである。本発明の態様に従った好適な更なる媒介物は当業者にとって明らかであり、この点において本発明は限定されない。
【０１１５】
一部の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドはウイルス、細菌、または酵母（破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、および／または天然痘ウイルスを含むが、これらに限定されない）から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。クラスＩＩエピトープの予測を、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ＊（ＩＥＤＢ）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｍｕｎｅｅｐｉｔｏｐｅ．ｏｒｇ／）Ｔ細胞エピトープ予測ツールを使用して行った。実施例に記載されているコンピュータ分析を実施した。つまり、ペプチドごとに３つの方法（ＡＲＢ、ＳＭＭ＿ａｌｉｇｎおよびＳｔｕｒｎｉｏｌｏ）の各々を用い、ペプチドのスコアをＳＷＩＳＳＰＲＯＴデータベースから選択された５００万のランダムな１５ｍｅｒのスコアと比較してパーセンタイルランクを得た。次いで、３つの方法にパーセンタイルランクを用い、コンセンサス法におけるランクを得た。
【０１１６】
「天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチド」とは、天然物から得られるかまたは誘導され、かつペプチド／ＨＬＡ−ＤＲ複合体がＴ細胞上のＴ細胞受容体と相互作用するのに十分な親和性にてＭＨＣクラスＩＩヒト白血球型抗原ＤＲに特異的に結合するペプチドを意味する。実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドはＭＨＣクラスＩＩヒト白血球型抗原ＤＲに対して５０００ｎＭ以下、好ましくは５００ｎＭ以下、またより好ましくは５０ｎＭ以下の親和性ＩＣ５０値を有する。実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるペプチド配列を含む。この種の感染性媒介物は、対象が２回以上暴露されているものを包含する。一般に、この種の感染性媒介物に暴露されている対象は、毎年、毎月、毎週、または毎日などのように定期的に暴露される。一部の実施形態において、この種の感染性媒介物は対象の環境に流布しているため、対象はその媒介物に繰り返し暴露されている。この種の感染性媒介物としては、細菌、原生動物、またはウイルスなどが挙げられる。対象が繰り返し暴露されうるウイルスとしては、ノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、およびコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１７】
対象が繰り返し暴露されうるその他の典型的な感染性媒介物（および関連する感染性疾患）は、上の表１に示すとおりである。感染性媒介物は典型例として示したものであって、付加的な感染性媒介物（例えば、本明細書に記載されている媒介物の亜系、および本明細書に記載されていない感染性媒介物）は、本発明の一部の態様に準じて好適でありえ、この点において本発明は限定されるものではない。
【０１１８】
また、この種の感染性媒介物は、専らまたは主としてヒト被検対象に感染するヒト感染性媒介物だけに限られないという点も理解すべきである。この種の感染性媒介物は、ヒト以外の被検対象を含む複数の宿主に感染するか、専らまたは主としてヒト以外の被検対象に感染する、ヒト感染性媒介物でありえる。例えば、この種の感染性媒介物としては、人間以外の哺乳類動物、脊椎動物、または無脊椎動物（マウス、ネズミ、スナネズミなどの齧歯動物、ネコ、イヌ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタなどの家畜、魚、蛙、爬虫類、およびその他）が挙げられるが、それらに限定されない。ヒト以外の対象に関連する感染性媒介物は当業者に周知であり、この種の媒介物の非限定的な例のいくつかは、表１に示すとおりである。本発明の態様に従った好適な更なる媒介物は当業者にとって明らかであり、この点において本発明は限定されるものではない。
【０１１９】
一部の実施形態において、天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドはウイルス、細菌、または酵母（破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、および／または天然痘ウイルスを含むが、これらに限定されない）から得られるかまたは誘導される、ペプチド配列を含む。クラスＩＩエピトープの予測は、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ＊（ＩＥＤＢ）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｍｕｎｅｅｐｉｔｏｐｅ．ｏｒｇ／）Ｔ細胞エピトープの予測ツールを使用して実施された。実施例に記載されているコンピュータ分析を実施した。つまり、ペプチドごとに３つの方法（ＡＲＢ、ＳＭＭ＿ａｌｉｇｎおよびＳｔｕｒｎｉｏｌｏ）の各々を用い、ペプチドのスコアをＳＷＩＳＳＰＲＯＴデータベースから選択された５００万のランダムな１５ｍｅｒのスコアと比較してパーセンタイルランクを得た。次いで、３つの方法にパーセンタイルランクを用い、コンセンサス法におけるランクを得た。
【０１２０】
「得られる」は、実質的修飾を伴わずに供給源から取得されることを意味する。実質的修飾は、問題の材料の化学的または免疫学的特性に有意に作用する修飾である。例えば、非限定例として、天然ペプチドまたはヌクレオチド配列、好ましくは天然コンセンサスペプチドまたはヌクレオチド配列に対し、９０％超、好ましくは９５％超、好ましくは９７％超、好ましくは９８％超、好ましくは９９％超、好ましくは１００％の同一性を有する配列、ならびに天然ペプチドまたは核酸と有意に異ならない化学的および／または免疫学的特性、を有するペプチドまたは核酸であれば、天然ペプチドまたはヌクレオチド配列から得られると称されることになる。得られる核酸は、専ら遺伝子コードの縮重に起因し、天然コンセンサスヌクレオチド配列と同一でない配列を有する核酸を含むように意図される。かかる核酸は、さらに、天然ヌクレオチド配列、好ましくは天然コンセンサスヌクレオチド配列に対して９０％未満の同一性を有する配列を有してもよい。これらの化学的または免疫学的特性は、ＭＨＣＩＩに対する親水性、安定性、結合親和性、ならびに合成ナノ担体などの担体とのカップリング能を含む。
【０１２１】
「薬学的に許容できる賦形剤」は、本発明の組成物、剤形、ワクチンなどの実施形態を調合する上で、列挙されるペプチドと併用される薬理学的に不活性な材料を意味する。薬学的に許容できる賦形剤は、限定はされないが、糖類（グルコース、ラクトースなど）、抗菌剤などの防腐剤、再構成補助剤（ｒｅｃｏｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎ  ａｉｄ）、着色剤、生理食塩水（リン酸塩緩衝生理食塩水など）、緩衝液、分散剤、安定化剤、本明細書中に記載の他の賦形剤、および従来既知の他のかかる材料を含む、当該技術分野で既知の種々の材料を含む。
【０１２２】
「対象」は、ヒトおよび霊長類などの温血の哺乳類；鳥類；ネコ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ウシ、ウマおよびブタなどの家庭内または家畜動物；マウス、ラットおよびモルモットなどの実験動物；魚類、爬虫類、および野生動物などを含む動物を意味する。
【０１２３】
「合成ナノ担体」は、天然に見出されない、サイズが５μｍ以下の少なくとも一次元を占める離散物体を意味する。アルブミンナノ粒子は、一般に合成ナノ担体中に含められるが、特定の実施形態では、合成ナノ担体は、アルブミンナノ粒子を含まない。実施形態では、合成ナノ担体は、キトサンを含まない。
【０１２４】
合成ナノ担体は、限定はされないが、１つまたは複数の脂質に基づくナノ粒子、ポリマーナノ粒子、金属ナノ粒子、界面活性剤に基づくエマルション、デンドリマー、バッキーボール、ナノワイヤ、ウイルス様粒子、ペプチドもしくはタンパク質に基づく粒子（アルブミンナノ粒子など）、および／または、脂質−ポリマーナノ粒子などの、ナノ材料の組み合わせを用いて開発されるナノ粒子であってもよい。合成ナノ担体は、限定はされないが、回転楕円体、立方形、角錐形（ｐｙｒａｍｉｄ）、長方形、円筒形、ドーナツ形などを含む種々の異なる形状であってもよい。本発明による合成ナノ担体は、１つ以上の表面を含む。本発明の実施に使用に適しうる典型的な合成ナノ担体は、（１）米国特許第５，５４３，１５８号明細書（Ｇｒｅｆらに付与）に開示された生分解性ナノ粒子、（２）公開された米国特許出願公開第２００６０００２８５２号明細書（Ｓａｌｔｚｍａｎらに付与）の高分子ナノ粒子、（３）公開された米国特許出願公開第２００９００２８９１０号明細書（ＤｅＳｉｍｏｎｅらに付与）のリソグラフィで作製されたナノ粒子、（４）国際公開第２００９／０５１８３７号パンフレット（ｖｏｎ  Ａｎｄｒｉａｎらに付与）の開示物、もしくは（５）公開された米国特許出願公開第２００８／０１４５４４１号明細書（Ｐｅｎａｄｅｓらに付与）に開示されたナノ粒子、（６）公開された米国特許出願公開第２００９０２２６５２５号明細書（ｌｏｓ  Ｒｉｏｓらに付与）に開示されたタンパク質ナノ粒子、（７）公開された米国特許出願公開第２００６０２２２６５２号明細書（Ｓｅｂｂｅｌらに付与）に開示されたウイルス様粒子（８）公開された米国特許出願公開第２００６０２５１６７７号明細書（Ｂａｃｈｍａｎｎらに付与）に開示された、核酸にカップリングされたウイルス様粒子、（９）国際公開第２０１００４７８３９Ａ１号パンフレットもしくは国際公開第２００９１０６９９９Ａ２号パンフレットに開示されたウイルス様粒子、または（１０）Ｐ．Ｐａｏｌｉｃｅｌｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｓｕｒｆａｃｅ−ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ＰＬＧＡ−ｂａｓｅｄ  Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ  ｔｈａｔ  ｃａｎ  Ｅｆｆｉｃｉｅｎｔｌｙ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅ  ａｎｄ  Ｄｅｌｉｖｅｒ  Ｖｉｒｕｓ−ｌｉｋｅ  Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ”  Ｎａｎｏｍｅｄｉｃｉｎｅ，５（６）：８４３−８５３（２０１０）に開示されたナノ沈殿したナノ粒子を含む。実施形態において、合成ナノ担体は１：１、１：１．２、１：１．５、１：２、１：３、１：５、１：７を超える、または１：１０を超えるアスペクト比を有しうる。
【０１２５】
約１００ｎｍ以下、好ましくは１００ｎｍ以下の最小寸法を有する本発明による合成ナノ担体は、補体を活性化する水酸基を有する表面を含まないか、あるいは補体を活性化する水酸基でない部分から本質的になる表面を含む。好ましい実施形態では、約１００ｎｍ以下、好ましくは１００ｎｍ以下の最小寸法を有する本発明による合成ナノ担体は、補体を実質的に活性化する表面を含まないか、あるいは補体を実質的に活性化しない部分から本質的になる表面を含む。より好ましい実施形態では、約１００ｎｍ以下、好ましくは１００ｎｍ以下の最小寸法を有する本発明による合成ナノ担体は、補体を活性化する表面を含まないか、あるいは補体を活性化しない部分から本質的になる表面を含む。一実施形態では、本発明に従う合成ナノ担体は、ウイルス様粒子を含まない。
【０１２６】
「Ｔ細胞抗原」は、ＣＤ４＋Ｔ細胞抗原またはＣＤ８＋細胞抗原を意味する。「ＣＤ４＋Ｔ細胞抗原」は、ＣＤ４＋Ｔ細胞によって認識され、かつそれにおいて免疫応答を引き起こす任意の抗原、例えば、ＣＤ４＋Ｔ細胞上のＴ細胞受容体により、クラスＩＩ主要組織適合性複合体分子（ＭＨＣ）に結合された抗原もしくはその一部の提示を介して特異的に認識される抗原を意味する。「ＣＤ８＋Ｔ細胞抗原」は、ＣＤ８＋Ｔ細胞によって認識され、かつそれにおいて免疫応答を引き起こす任意の抗原、例えば、ＣＤ８＋Ｔ細胞上のＴ細胞受容体により、クラスＩ主要組織適合性複合体分子（ＭＨＣ）に結合された抗原もしくはその一部の提示を介して特異的に認識される抗原を意味する。一部の実施形態では、Ｔ細胞抗原である抗原がまた、Ｂ細胞抗原である。他の実施形態では、Ｔ細胞抗原がさらにＢ細胞抗原であることはない。Ｔ細胞抗原は、一般に、タンパク質またはペプチドであるが、脂質および糖脂質などの他の分子であってもよい。実施形態において、本発明によるＴ細胞抗原には、列挙されている組成物が除外されている。
【０１２７】
「ワクチン」は、特定の病原体または疾患に対する免疫応答を改善する物質の組成物を意味する。ワクチンは、典型的には、特定の抗原を外来物として認識し、それを対象の身体から除去するための、対象の免疫系を刺激する因子を有する。また、ワクチンが免疫学的「記憶」を確立することにより、個人が再免疫される場合、抗原は速やかに認識され、応答を受けることになる。ワクチンは、（例えば任意の病原体による未来の感染を予防するため）予防的でありうるか、または治療的でありうる（例えば癌の処置を目的とした腫瘍特異的抗原に対するワクチン）。本発明に従うワクチンは、１つまたは複数のＭＨＣＩＩ結合ペプチド、あるいは、１つまたは複数のＭＨＣＩＩ結合ペプチドをコードするかまたはそれをコードする１つまたは複数の核酸に対して相補的である、１つまたは複数の核酸を含んでもよい。
【０１２８】
Ｃ．本発明のペプチドおよびそれを作製しかつ使用する方法
実施形態では、本発明の組成物およびそれに関する方法は、Ａ−ｘ−Ｂを含み、ここで、ｘは、リンカーを含むかまたはリンカーを全く含まない場合があり、Ａは、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつＢは、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む。さらに、実施形態では、本発明の組成物およびそれに関する方法は、Ａ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃを含み、ここで、ｘは、リンカーを含むかまたはリンカーを全く含まない場合があり、ｙは、リンカーを含むかまたはリンカーを全く含まない場合があり、Ａは、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、Ｂは、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつＣは、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む。
【０１２９】
特定の実施形態では、ｘおよび／またはｙ（ｙが存在する場合）は、リンカーを全く含まない場合があり、この場合、Ａ、Ｂ、Ｃ、および各々の様々な組み合わせは、本発明の組成物中に混合物として存在しうる。混合物として存在しうるかかる組み合わせの例として、限定はされないが、ＡおよびＢ、ＡおよびＢ−ｙ−Ｃ、Ａ−ｘ−ＢおよびＣ、ＡおよびＢおよびＣなどが挙げられ、ここで、「および」は、結合の不在を意味するように使用され、また「−ｘ−」または「−ｙ−」は、結合の存在を意味するように使用される。かかる混合物のアプローチを用いることで、多数の異なるＭＨＣＩＩ結合ペプチドを容易に組み合わせ、それにより、例えばＭＨＣＩＩ結合ペプチドの残基を有する単一のより大きい分子を生成する上で、使いやすさおよび／または合成の簡素化を提供することが可能である。混合物は、従来の薬剤混合法を用いて調合してもよい。これらは、２種以上の懸濁液（各々、１つまたは複数のペプチドセットを含有する）が直接組み合わされるか、または希釈剤を有する１つまたは複数の容器を介して結合される液体−液体混合を含む。ペプチドはまた、粉末形態で生成または保存されうることから、場合により、乾燥粉末−粉末混合を、２種以上の粉末を共通の媒体に再懸濁できるように、実施することが可能である。ペプチドの特性およびその相互作用ポテンシャルに依存し、混合経路のいずれであっても優位性が与えられうる。
【０１３０】
混合物は、従来の製剤加工および配合技術を用いて作製することで、有用な剤形に到達してもよい。本発明の実施での使用に適した技術は、Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ  Ｍｉｘｉｎｇ：Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ、Ｅｄｗａｒｄ  Ｌ．Ｐａｕｌ，Ｖｉｃｔｏｒ  Ａ．Ａｔｉｅｍｏ−Ｏｂｅｎｇ、およびＳｕｚａｎｎｅ  Ｍ．Ｋｒｅｓｔａ編、２００４年、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎ、Ｉｎｃ．；およびＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃｓ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ｏｆ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍ  Ｄｅｓｉｇｎ、第２版、Ｍ．Ｅ．Ａｕｔｅｎ編、２００１年、Ｃｈｕｒｃｈｉｌｌ  Ｌｉｖｉｎｇｓｔｏｎｅにおいて見出されうる。実施形態では、ペプチド混合物を含む典型的な本発明の組成物は、無機または有機緩衝液（例えば、リン酸塩、炭酸塩、酢酸塩、またはクエン酸塩のナトリウムまたはカリウム塩）およびｐＨ調整剤（例えば塩酸、水酸化ナトリウムもしくは水酸化カリウム、クエン酸塩もしくは酢酸塩の塩、アミノ酸およびそれらの塩）、抗酸化剤（例えばアスコルビン酸、α−トコフェロール）、界面活性剤（例えばポリソルベート２０、ポリソルベート８０、ポリオキシエチレン９−１０ノニルフェノール、デオキシコール酸ナトリウム）、溶液および／または冷凍／溶解安定化剤（ｃｒｙｏ／ｌｙｏ  ｓｔａｂｉｌｉｚｅｒ）（例えば、スクロース、ラクトース、マンニトール、トレハロース）、浸透圧調整剤（ｏｓｍｏｔｉｃ  ａｄｊｕｓｔｍｅｎｔ  ａｇｅｎｔ）（例えば、塩または糖類）、抗菌剤（例えば、安息香酸、フェノール、ゲンタマイシン）、消泡剤（例えば、ポリジメチルシロゾン（ｐｏｌｙｄｉｍｅｔｈｙｌｓｉｌｏｚｏｎｅ））、防腐剤（例えば、チメロサール、２−フェノキシエタノール、ＥＤＴＡ）、高分子安定化剤および粘度調整剤（ｖｉｓｃｏｓｉｔｙ−ａｄｊｕｓｔｍｅｎｔ  ａｇｅｎｔ）（例えば、ポリビニルピロリドン、ポロキサマ４８８、カルボキシメチルセルロース）、ならびに共溶媒（例えば、グリセロール、ポリエチレングリコール、エタノール）を含んでもよい。
【０１３１】
実施形態では、ｘおよび／またはｙ（それが存在する場合）は、リンカーを含んでもよい。実施形態では、リンカーは、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドの一部であるアミノ酸（天然または修飾のいずれか）に直接接続してもよく、またはリンカーは、原子、好ましくは複数の原子の付加により、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドに連結してもよい。リンカーは、限定はされないが、合成の容易性、化学的切断の促進、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドの分離、（ジスルフィドのような）化学反応部位および／またはプロテアーゼ切断部位の挿入を含む多くの理由で有用でありうる。リンカーは、本発明の組成物が対象に投与される場合に遭遇する、特定の生理的条件下で切断される切断可能なリンカーおよび典型的な生理的条件下で切断しにくい切断不能なリンカーを含んでもよい。
【０１３２】
特定の実施形態では、ｘおよび／またはｙ（それが存在する場合）は、アミドリンカー、ジスルフィドリンカー、硫化物リンカー、１，４−二置換１，２，３−トリアゾールリンカー、チオールエステルリンカー、またはイミンリンカーを含むリンカーを含んでもよい。本発明の実施において有用な追加的なリンカーは、チオールおよび酸から形成されるチオールエステルリンカー、ヒドラジンおよび酸から形成されるヒドラジドリンカー、アミンおよびアルデヒドまたはケトンから形成されるイミンリンカー、チオールおよびチオイソシアネート（ｔｈｉｏｉｓｏｃｙａｎｔｅ）から形成されるチオ尿素リンカー、アミンおよびイミデートエステルから形成されるアミジンリンカー、ならびにアミンおよびアルデヒドの還元的アミノ化から形成されるアミンリンカーを含む。実施形態では、ｘおよび／またはｙ（それが存在する場合）は、ペプチド配列、好ましくは、リソソームプロテアーゼ切断部位（例えばカテプシン切断部位）、生分解性ポリマー、置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族もしくは複素環リンカー、ｐＨ感受性ポリマー、ヘテロ二官能性リンカーまたはオリゴマーグリコールスペーサーを含む配列を含むリンカーを含んでもよい。
【０１３３】
切断可能なリンカーは、限定はされないが、ペプチド配列、好ましくは、リソソームプロテアーゼ切断部位；生分解性ポリマー；ｐＨ分解性ポリマー；またはジスルフィド結合を含むペプチド配列を含む。リソソームプロテアーゼ切断部位は、セリンプロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、アスパルテートプロテアーゼ、亜鉛プロテアーゼ、メタロプロテアーゼ、グルタミン酸プロテアーゼ、システインプロテアーゼ（ＡＭＳＨ／ＳＴＡＭＢＰ、カテプシンＦ、カテプシン３、カテプシンＨ、カテプシン６、カテプシンＬ、カテプシン７／カテプシン１  カテプシンＯ、カテプシンＡ、カテプシンＳ、カテプシンＢ、カテプシンＶ、カテプシンＣ／ＤＰＰＩ、カテプシンＸ／Ｚ／Ｐ、カテプシンＤ、レグマイン）を含むリソソームプロテアーゼによって切断されることが具体的に知られているペプチド配列を含む。生分解性ポリマーは、種々の生理的条件下で分解する一方、ｐＨ分解性ポリマーは、低い（生理的ｐＨに満たない）ｐＨ条件下で加速度的に分解する。特定の実施形態では、リンカーのペプチド配列は、配列番号１１６または１１７で示されるアミノ酸配列を含む。
ｐｍｇｌｐ（配列番号１１６）
ｓｋｖｓｖｒ（配列番号１１７）
【０１３４】
追加的な情報については、Ａ．Ｐｕｒｃｅｌｌら、「Ｍｏｒｅ  ｔｈａｎ  ｏｎｅ  ｒｅａｓｏｎ  ｔｏ  ｒｅｔｈｉｎｋ  ｔｈｅ  ｕｓｅ  ｏｆ  ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ｉｎ  ｖａｃｃｉｎｅ  ｄｅｓｉｇｎ．」  Ｊ．Ｎａｔ  Ｒｅｖ  Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖ．２００７年；５：４０４−１４頁；Ｒ．Ｂｅｉら、「ＴＡＡ  ｐｏｌｙｅｐｉｔｏｐｅ  ＤＮＡ−ｂａｓｅｄ  ｖａｃｃｉｎｅｓ：Ａ  ｐｏｔｅｎｔｉａｌ  ｔｏｏｌ  ｆｏｒ  ｃａｎｃｅｒ  ｔｈｅｒａｐｙ．」  Ｊ  Ｂｉｏｍｅｄ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．２０１０年；１０２７８５：１−１２頁；Ｗ．Ｗｒｉｇｇｅｒｓら、「Ｃｏｎｔｒｏｌ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  ｄｙｎａｍｉｃｓ  ｂｙ  ｐｅｐｔｉｄｅ  ｌｉｎｋｅｒｓ．」  Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ．２００５年；８０（６）：７３６−４６頁；Ｊ．Ｔｉｍｍｅｒｍａｎら、「Ｃａｒｒｉｅｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｃｏｎｊｕｇａｔｅ  ｖａｃｃｉｎｅｓ：ｔｈｅ  “ｍｉｓｓｉｎｇ  ｌｉｎｋ”  ｔｏ  ｉｍｐｒｏｖｅｄ  ａｎｔｉｂｏｄｙ  ａｎｄ  ＣＴＬ  ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ？」  Ｈｕｍ  Ｖａｃｃｉｎ．２００９年３月；５（３）：１８１−３頁  Ｂ．Ｌａｗら、Ｐｒｏｔｅｏｌｙｓｉｓ：ａ  ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  ｐｒｏｃｅｓｓ  ａｄａｐｔｅｄ  ｉｎ  ｄｒｕｇ  ｄｅｌｉｖｅｒｙ，ｔｈｅｒａｐｙ，ａｎｄ  ｉｍａｇｉｎｇ．」  Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ  Ｃｈｅｍ．２００９年９月；２０（９）：１６８３−９５頁において見出されうる。
【０１３５】
アミドリンカーは、第１の化学成分上のアミノ基と第２の化学成分のカルボキシル基との間に形成されるリンカーである。これらのリンカーは、好適に保護されたアミノ酸またはポリペプチドと化学的構造を形成する、従来のアミドリンカーのいずれかを用いて作製することができる。一実施形態では、列挙されるアミドリンカーであれば、ＡおよびＢ（またはＢおよびＣなど）の合成全体にわたって形成可能であることから、ｘおよび／またはｙの生成が簡素化される。このタイプの連結化学反応は、切断可能な連結基を含むように容易に調整可能である。
【０１３６】
ジスルフィドリンカーは、例えばＲ１−Ｓ−Ｓ−Ｒ２の型の２つの硫黄原子間のリンカーである。ジスルフィドリンカーは、メルカプタン置換基（−ＳＨ）を有するペプチドなど、２つの同じもしくは異なる分子の酸化的カップリング、または、好ましくは、例えばＨ２Ｎ−Ｒ１−Ｓ−Ｓ−Ｒ２−ＣＯ２Ｈ（式中、アミノおよび／またはカルボキシル機能は好適に保護される）の型の予め形成されたリンカーの使用により、形成することができる。このタイプの連結化学反応は、還元的切断の影響を受けやすく、その場合、２つの別個の記憶ペプチド（ｍｅｍｏｒｙ  ｐｅｐｔｉｄｅ）の分離に至ることになる。これは、還元的環境が免疫学的対象の標的区画であるリソソーム内に見出されうることから、有意である。
【０１３７】
ヒドラジドおよびアルデヒド／ケトンの化学反応を用い、リンカーを形成してもよい。第１のペプチド鎖に対する末端でヒドラジドまたはアルデヒド／ケトン機能を有する第１のペプチドが調製される。第２のペプチド鎖に対する末端でヒドラジド（第１のペプチドがアルデヒド／ケトンを有する場合）またはアルデヒド／ケトン（第１のペプチドがヒドラジドを有する場合）のいずれかを有する第２のペプチドが調製される。次いで、２つのペプチドの反応が可能になり、それによって２つのペプチドがヒドラゾン機能を通じて連結される。一般に、このようにして形成されるヒドラゾン結合は、酸性条件下、例えばリソソーム内に見出される条件下で切断可能である。リンカーの安定性の増大が所望される場合、ヒドラゾンを還元し、対応する安定な（切断不能な）アルキル化ヒドラジドを形成することができる（対応するアルキルアミンを形成するためのアルデヒドまたはケトンによるアミンの還元的アミノ化と同様）。
【０１３８】
切断不能なリンカーは、種々の化学反応を用いて形成可能であり、また多数の異なる物質を用いて形成可能である。一般に、リンカーは、各々のかかる切断不能なリンカーが、リソソームｐＨ条件下で１２時間超にわたり安定である場合、切断不能であると考えられる。切断不能なリンカーの例として、限定はされないが、アミン、硫化物、トリアゾール、ヒドラゾン、アミド（エステル）、および置換もしくは未置換アルカン、アルケン、芳香族化合物または複素環；ポリマー；オリゴマーグリコールスペーサー；および／または非天然もしくは化学修飾されたアミノ酸を有する基が挙げられる。以下は、いくつかの一般的方法の例である。リストは決して完全ではなく、多数の他の方法が考えられる。
【０１３９】
硫化物リンカーは、例えばＲ１−Ｓ−Ｒ２の型である。このリンカーは、メルカプタンのアルキル化またはペプチドなどの第１の分子上のメルカプタンのペプチドなどの第２の分子上の活性化アルケンへのＭｉｃｈａｅｌ付加、あるいはペプチドなどの第１の分子上のメルカプタンのペプチドなどの第２の分子上のアルケンへのラジカル付加によって作製可能である。硫化物リンカーはまた、例えばＨ２Ｎ−Ｒ１−Ｓ−Ｒ２−ＣＯ２Ｈ（ここで、アミノおよび／またはカルボキシル機能は好適に保護される）として、予め形成可能である。このタイプのリンカーは、切断に対して抵抗性を示すが、それを使用し、２つの好適に置換され、また保護されたペプチドを特異的に連結することが可能である。
【０１４０】
トリアゾールリンカーは、具体的には、
【化１】
2013538211.tif 000008
（式中、Ｒ１およびＲ２は、任意の化学的実体であってもよい）
の型の１，２，３−トリアジンであってもよく、また第１のペプチドに結合されたアジドの第２のペプチドに結合されたアルキン末端への１，３−双極性付加によって作製される。この化学反応は、Ｓｈａｒｐｌｅｓｓら、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．４１（１４）、２５９６頁、（２００２年）によって詳述されており、「Ｓｈａｒｐｌｅｓｓクリック反応」と称されることが多い。第１のペプチド鎖の末端でアジドまたはアルキン機能を有する第１のペプチドが調製される。第２のペプチド鎖の末端でアルキン（第１のペプチドがアジドを有する場合）またはアジド（第１のペプチドがアルキンを有する場合）のいずれかを有する第２のペプチドが調製される。次いで、２つのペプチドにより、２つのペプチドを１，２，３−トリアジン機能を通じて連結する触媒の存在下または不在下、３＋２付加環化での反応が可能になる。
【０１４１】
硫黄「クリック」反応を用い、リンカーを形成してもよい。第１のペプチド鎖の末端でメルカプタンまたはアルケン機能を有する第１のペプチドが調製される。第２のペプチド鎖の末端でアルケン（第１のペプチドがメルカプタンを有する場合）またはメルカプタン（第１のペプチドがアルケンを有する場合）のいずれかを有する第２のペプチドが調製される。２つのペプチドにより、２つのペプチドを硫化物機能を通じて連結する、光またはラジカル源の存在下での反応が可能になる。
【０１４２】
Ｍｉｃｈａｅｌ付加反応を用い、リンカーを形成してもよい。種々のＭｉｃｈａｅｌアクセプタおよびドナーの対がこの目的に使用可能であるが、この方法の好ましい例は、ＭｉｃｈａｅｌドナーとしてのメルカプタンおよびＭｉｃｈａｅｌアクセプタとしての活性化アルケンの使用である。この反応は、アルケンが電子欠乏である必要があり、かつラジカル触媒作用が必要でないという点で、上記の硫黄クリック反応と異なる。第１のペプチド鎖の末端でメルカプタンまたはアルケン機能を有する第１のペプチドが調製される。第２のペプチド鎖の末端でアルケン（第１のペプチドがメルカプタンを有する場合）またはメルカプタン（第１のペプチドがアルケンを有する場合）のいずれかを有する第２のペプチドが調製される。２つのペプチドにより、２つのペプチドを硫化物機能を通じて連結する酸または塩基の存在下での反応が可能になる。
【０１４３】
実施形態では、ＡおよびＢ；ＡおよびＣ、ＢおよびＣ、ならびにＡ、Ｂ、およびＣはそれぞれ、異なるＭＨＣＩＩ結合レパートリーを有するペプチドを含む。ＤＰ、ＤＱおよびＤＲは、独立した遺伝子によってコードされるタンパク質である。非近交系ヒト集団においては、ＤＰ、ＤＱおよびＤＲの多数の変異体（対立遺伝子）が存在し、また各対立遺伝子は、異なる特性を示すペプチド結合を有する。例えば、特定の天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドは、一部のＤＰ対立遺伝子に結合しうるが、それ以外に結合しない場合がある。ペプチド「結合レパートリー」は、個別のペプチドが結合することになるＤＰ、ＤＱおよび／またはＤＲ中に見出される対立遺伝子の組み合わせを示す。すべてのＤＰ、ＤＱおよび／またはＤＲ対立遺伝子に結合することにより、最大１００％までの高い百分率の人においてメモリリコール（ｍｅｍｏｒｙ  ｒｅｃａｌｌ）応答を生成する、ペプチドおよび／またはその組み合わせの同定により、ワクチン効率を改善する手段が提供される。
【０１４４】
実施形態では、好ましいペプチド配列であれば、Ｔ細胞によって認識可能なペプチドまたはタンパク質エピトープの配列であってもよい。好ましいペプチド配列は、破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、および／または、ヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物、から得られるかまたは誘導されるＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む。好ましいペプチド配列としてはまた、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されるＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含むペプチド配列も挙げられる。この種の感染性媒介物としては、細菌、原生動物、またはウイルスなどが挙げられる。対象が繰り返し暴露されうるウイルスとしては、ノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、およびコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。対象が繰り返し暴露されうる他の感染性媒介物は、上の表１にも記載されている。
【０１４５】
実施形態において、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドは天然ＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチド、天然ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチド、および／または天然ＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％、好ましくは少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも９０％、更により好ましくは少なくとも９５％、更により好ましくは少なくとも９７％、または更により好ましくは少なくとも９９％の同一性を有するペプチドを含む。この種のペプチドは、対象が繰り返し暴露されている感染性媒介物から得られるかまたは誘導されうる。この種の感染性媒介物としては、細菌、原生動物、またはウイルスなどが挙げられる。対象が繰り返し暴露されうるウイルスとしては、ノロウイルス（ｎｏｒｏｖｉｒｕｓ）、ロータウイルス（ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）、コロナウイルス、カリチウイルス（ｃａｌｉｃｉｖｉｒｕｓ）、アストロウイルス（ａｓｔｒｏｖｉｒｕｓ）、レオウイルス（ｒｅｏｖｉｒｕｓ）、内在性レトロウイルス（ＥＲＶ）、アネロウイルス／サーコウイルス、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）、ヒトヘルペスウイルス７（ＨＨＶ−７）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、ポリオーマウイルスＢＫ、ポリオーマウイルスＪＣ、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス１型（ＨＳＶ−１）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、単純ヘルペスウイルス２型（ＨＳＶ−２）、カポージ肉腫ヘルペスウイルス（ＫＳＨＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、ＧＢウイルスＣ、乳頭腫ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１、およびＨＩＶ−２）、Ｄ型肝炎ウイルス（ＨＤＶ）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型（ＨＴＬＶ１）、異栄養性マウス白血病ウイルス関連ウイルス（ＸＭＬＶ）、ＨＴＬＶ  ＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＩＩ、ＨＴＬＶ  ＩＶ、ポリオーマウイルスＭＣ、ポリオーマウイルスＫＩ、ポリオーマウイルスＷＵ、呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）、風疹ウイルス、パルボウイルスＢ１９（ｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ  Ｂ１９）、麻疹ウイルス、およびコクサッキー（ｃｏｘｓａｃｋｉｅ）が挙げられるが、これらに限定されない。対象が繰り返し暴露されうる他の感染性媒介物はまた、上記の表１に記載されている。他の実施形態において、この種のペプチドは破傷風菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｅｔａｎｉ）、Ｂ型肝炎ウイルス、ヒトヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、種痘ウイルス、エプスタイン−バーウイルス（ＥＢＶ）、水疱瘡ウイルス、麻疹ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、ムンプスウイルス、コリネバクテリウム・ジフテリア（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、ヒトアデノウイルス（Ｈｕｍａｎ  ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ）、天然痘ウイルス、および／またはヒトへの感染能を有し、かつ感染の開始後に感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する感染性生物から得られるかまたは誘導されうる。実施形態において、Ａ、Ｂ、およびＣは、実施例に概説されている一般的方法を用い、免疫応答が最適なものになるように選択される。
【０１４６】
特定の実施形態では、加工、調合のしやすさなどの目的で、および／または生体系内部での改善された送達のため、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドの水溶解度を増加させることが望ましい場合がある。このため、親水性Ｎ末端および／またはＣ末端アミノ酸を付加するか、結合部位間にアミノ酸配列を付加もしくは修飾するか、または結合部位アミノ酸に置換を施すことにより、親水性の増大が得てもよい。親水性の増大は、例えば、低下したＧＲＡＶＹ（Ｇｒａｎｄ  Ａｖｅｒａｇｅ  ｏｆ  Ｈｙｄｒｏｐａｔｈｙ）スコアを介して測定し得る。有望な修飾の設計は、実現可能な場合、結合親和性に対する潜在的な負の効果を回避するかまたは制限するなどの影響を受けうる。
【０１４７】
１つの有望な修飾経路は、結合部位エピトープに隣接するアミノ酸に基づく非結合部位アミノ酸の付加である（特に、それら隣接するアミノ酸がペプチドの平均または局所親水性を増大させることになる場合）。すなわち、その天然拡張配列内の結合部位エピトープが、親水性アミノ酸により、Ｎおよび／またはＣ末端側に隣接される場合、ペプチド内のそれら隣接する親水性アミノ酸の一部を保護することは、その水溶解度を増大させる。溶解度を増大させる可能性が高くなる隣接配列の不在下で、または親水性のさらなる増大が所望される場合、望ましくは天然配列に対する類似性に基づき、非天然による付加（ｎｏｎ−ｎａｔｉｖｅ  ａｄｄｉｔｉｏｎ）を行ってもよい。アミノ酸の類似性は、Ｂｌｏｓｕｍ  ４５もしくはＰＡＭ２５０マトリックスなどの指標により、または当該技術分野で既知の他の手段により、判定してもよい。例えば、エピトープが、−１．０のＧＲＡＶＹスコアを有し、かつＮ末端で天然アミノ酸配列ＥＡＳＦによって先行される場合（ＧＲＡＶＹ＝０．０７５）、ＥＡＳＦを含むためのペプチドの伸長であれば、ＧＲＡＶＹスコアが低下することになる。あるいは、ＡとＳ、ＳとＮ、またはＦとＹなど、前記ＥＡＳＦリード配列に対する１つまたは複数の置換（例えばＥＡＳＹ、ＧＲＡＶＹ＝−０．９５）、または切断および置換（例えばＮＹ、ＧＲＡＶＹ＝−２．４）の場合でも、親水性の増大を得ることができる。
【０１４８】
場合により、ペプチドの水溶解度を低下させ、例えば疎水性担体マトリックス内部への封入を改善することが好ましい場合がある。かかる場合、親水性を低下させる以外は上記と同様の付加および置換を行ってもよい。
【０１４９】
１つまたは複数のｐＨ値でペプチドの正味電荷を調節することが、さらに有利でありうる。例えば、最低溶解度がペプチドのｐＩ（等電ｐＨ）で観察される場合がある。低下した溶解度（ｐＨ７．４）およびｐＨ３．０で増大した溶解度を有することが望ましくなる場合、アミノ酸配列に対する修飾または付加を行い、７．４のｐＩを得て、またｐＨ３．０で有意な正味の正の電荷を得ることが可能である。塩基性ペプチドの場合、ＥもしくはＤなどの酸性残基の付加またはＫとＥの置換が、ｐＩが低下しうる場合の修飾例である。
【０１５０】
ペプチドの生物学的または化学的安定性はまた、当該技術分野で既知の技術を用いる、アミノ酸または末端修飾基の付加または置換によって改善されうる。例として、限定はされないが、アミド化およびアセチル化が挙げられ、かつそれはまた、例えば、Ｃ末端Ｑ（Ｇｌｎ）を、再配列を受けにくいＬもしくは他のアミノ酸と置換する場合の置換を含んでもよい。
【０１５１】
実施形態では、本発明は、配列が配列番号１〜４６、７１〜９８、１００〜１１５および１１９として示されるアミノ酸配列のいずれか１つに対して少なくとも７５％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド、および好ましくは、本明細書中の別の個所に記載されるＭＨＣＩＩ分子に結合するポリペプチドを含む組成物を対象とする。
ＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号１）（２１，ＴＴ３１７５５７（９５０−９６９））；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶ（配列番号２）（９，ＡｄＶｈｅｘ６４９５０（９１３−９２１））；
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号３）（１５，ＴＴ２７２１３（８３０−８４１））；
ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＧＥＬ（配列番号４）（２０，ＤＴ５２３３６（３３１−３５０））；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号５）（３０，ＡｄＶＴＴ９５０）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号６）（２４，ＡｄＶＴＴ８３０）；
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＧＥＬ（配列番号７）（３５，ＴＴ８３０ＤＴ）；
ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＧＥＬＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号８）（３５，ＤＴＴＴ８３０）；
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号９）（２７，ＴＴ８３０ＤＴｔｒｕｎｃ）；
ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号１０）（２９，ＤＴｔｒｕｎｃＴＴ８３０）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＰＭＧＬＰＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号１１）（２９，ＡｄＶｐｍｇｌｐｉＴＴ８３０）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＫＶＳＶＲＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号１２）（２９，ＡｄＶｋｖｓｖｒＴＴ８３０）；
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＰＭＧＬＰＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１３）（３２，ＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴＴｒｕｎｃまたはＴＴ８３０ｐＤＴｔ）；
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＫＶＳＶＲＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１４）（３２，ＴＴ８３０ｋｖｓｖｒＤＴＴｒｕｎｃ１）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１５）（２１，ＡｄＶＤＴｔ）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶｐｍｇｌｐＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１６）（２６，ＡｄＶｐＤＴｔ）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶｋｖｓｖｒＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１７）（２６，ＡｄＶｋＤＴｔ）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶｐｍｇｌｐＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号１８）（３５，ＡｄＶｐＴＴ９５０）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶｋｖｓｖｒＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号１９）（３５，ＡｄＶｋＴＴ９５０）；
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＴＬＬＹＶＬＦＥＶ（配列番号２０）（３６，ＴＴ８３０ＤＴｔＡｄＶ）；
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号２１）（３６，ＡｄＶＴＴ８３０ＤＴｔ）；
ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶ（配列番号２２）（１７，ＤＴｔ−３）；
ＩＤＫＩＳＤＶＳＴＩＶＰＹＩＧＰＡＬＮＩ（配列番号２３）（２０，ＴＴ６３２）
ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＩＤＫＩＳＤＶＳＴＩＶＰＹＩＧＰＡＬＮＩ（配列番号２４）（３７，ＤＴｔ−３ＴＴ６３２）；
ＩＤＫＩＳＤＶＳＴＩＶＰＹＩＧＰＡＬＮＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶ（配列番号２５）（３７，ＴＴ６３２ＤＴｔ−３）；
ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶｐｍｇｌｐＩＤＫＩＳＤＶＳＴＩＶＰＹＩＧＰＡＬＮＩ（配列番号２６）（４３，ＤＴｔ−３ｐＴＴ６３２）；
ＩＤＫＩＳＤＶＳＴＩＶＰＹＩＧＰＡＬＮＩｐｍｇｌｐＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶ（配列番号２７）（４３，ＴＴ６３２ｐＤＴｔ−３）；
ＹＶＫＱＮＴＬＫＬＡＴ（配列番号２８）（１１，ｍｉｎＸ）；
ＣＹＰＹＤＶＰＤＹＡＳＬＲＳＬＶＡＳＳ（配列番号２９）（１９，７４３０）；
ＮＡＥＬＬＶＡＬＥＮＱＨＴＩ（配列番号３０）（１４，３１２０１ｔ）；
ＴＳＬＹＶＲＡＳＧＲＶＴＶＳＴＫ（配列番号３１）（１６，６６３２５）；
ＥＫＩＶＬＬＦＡＩＶＳＬＶＫＳＤＱＩＣＩ（配列番号３２）（２０，ＡＢＷ１）；
ＱＩＬＳＩＹＳＴＶＡＳＳＬＡＬＡＩＭＶＡ（配列番号３３）（２０，ＡＢＷ２）；
ＭＶＴＧＩＶＳＬＭＬＱＩＧＮＭＩＳＩＷＶＳＨＳＩ（配列番号３４）（２４，ＡＢＰ）；
ＥＤＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲＧＳＶ（配列番号３５）（１７，ＡＡＴ）；
ＣＳＱＲＳＫＦＬＬＭＤＡＬＫＬＳＩＥＤ（配列番号３６）（１９，ＡＡＷ）；
ＩＲＧＦＶＹＦＶＥＴＬＡＲＳＩＣＥ（配列番号３７）（１４，ＩＲＧ）；
ＴＦＥＦＴＳＦＦＹＲＹＧＦＶＡＮＦＳＭＥＬ（配列番号３８）（２１，ＴＦＥ）；
ＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲｋｖｓｖｒＮＡＥＬＬＶＡＬＥＮＱＨＴＩ（配列番号３９）（３１，ＡＡＴｋ３１２０ｔ）；
ＮＡＥＬＬＶＡＬＥＮＱＨＴＩｋｖｓｖｒＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲ（配列番号４０）（３１，３１２０ｔｋＡＡＴ）；
ＩＬＳＩＹＳＴＶＡＳＳＬＡＬＡＩｋｖｓｖｒＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲ（配列番号４１）（３３，ＡＢＷ２ｋＡＡＴ）；
ＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲｋｖｓｖｒＩＬＳＩＹＳＴＶＡＳＳＬＡＬＡＩ（配列番号４２）（３３，ＡＡＴｋＡＢＷ２）；
ＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲｋｖｓｖｒＣＳＱＲＳＫＦＬＬＭＤＡＬＫＬ（配列番号４３）（３２，ＡＡＴｋＡＡＷ）；
ＣＳＱＲＳＫＦＬＬＭＤＡＬＫＬｋｖｓｖｒＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲ（配列番号４４）（３２，ＡＡＷｋＡＡＴ）；
ＴＦＥＦＴＳＦＦＹＲＹＧＦＶＡＮＦＳＭＥＬＩＲＧＦＶＹＦＶＥＴＬＡＲＳＩＣＥ（配列番号４５）（３８，ＴＦＥＩＲＧ）；または
ＩＲＧＦＶＹＦＶＥＴＬＡＲＳＩＣＥＴＦＥＦＴＳＦＦＹＲＹＧＦＶＡＮＦＳＭＥＬ（配列番号４６）（３８，ＩＲＧＴＦＥ）
【０１５２】
本発明に従うペプチド、特にＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、種々の従来の技術を用いて作製してもよい。特定の実施形態では、ペプチドは、Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄまたはそれに類する樹脂を使用する固体支持体上の合成などの標準的方法を用い、合成的に作製してもよい。これは、かかる合成用に設計された機械の有無にかかわらず行うことができる。
【０１５３】
他の実施形態では、本発明に従うペプチド、特にＭＨＣＩＩ結合ペプチドを発現するため、組換え技術を用いてもよい。かかる実施形態では、全ペプチド配列（およびリンカー配列（妥当な場合））をコードする核酸であれば、細胞系に形質移入される場合、転写されることになる発現ベクターにクローン化されることになる。実施形態では、発現ベクターは、特に、プラスミド、レトロウイルス、またはアデノウイルスを含んでもよい。ペプチド（および連結基（存在する場合））に対するＤＮＡは、標準の分子生物学的アプローチを用い、例えばポリメラーゼ連鎖反応を用いることによって単離し、ＤＮＡ断片を生成することができ、次いでそれは精製され、発現ベクターにクローン化され、細胞系に形質移入される。本発明の実施において有用な追加的技術は、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、２００７年、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎ，Ｉｎｃ．；Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第３版）  Ｊｏｓｅｐｈ  Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｐｅｔｅｒ  ＭａｃＣａｌｌｕｍ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ（Ｍｅｌｂｏｕｒｎｅ，Ａｕｓｔｒａｌｉａ）；Ｄａｖｉｄ  Ｒｕｓｓｅｌｌ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｔｅｘａｓ  Ｓｏｕｔｈｗｅｓｔｅｒｎ  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ（Ｄａｌｌａ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ）において見出されうる。
【０１５４】
本発明の組換えペプチドの生成は、異なる生物由来の細胞、例えばＣＨＯ細胞、昆虫細胞（例えばバキュロウイルス発現用）、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）などを使用し、いくつかの方法で行ってもよい。さらに、最適なタンパク質翻訳を得るため、核酸配列は、細胞の供給元である生物において一般に使用されるコドンを含むように修飾し得る。例えば、配列番号１〜４６は、破傷風トキソイド、ジフテリア毒素、およびアデノウイルスペプチドから得られるかまたは誘導される配列の例を含み、また配列番号４７〜６８は、ヒトおよび大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）における好ましいコドン使用に基づく、等価なＤＮＡ配列を含む。特定種におけるコドン使用が最適化されたＤＮＡを使用することにより、最適な組換えタンパク質の生成が可能になりうる。コドン頻度は、例えば様々なコドン使用レコードから入手可能な頻度データを使用し、ヒトでの使用を意図して最適化可能である。１つのかかるレコードが、Ｃｏｄｏｎ  Ｕｓａｇｅ  Ｄａｔａｂａｓｅである。Ｙ．Ｎａｋａｍｕｒａら、「Ｃｏｄｏｎ  ｕｓａｇｅ  ｔａｂｕｌａｔｅｄ  ｆｒｏｍ  ｔｈｅ  ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｄａｔａｂａｓｅｓ：ｓｔａｔｕｓ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｙｅａｒ  ２０００．」  Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２８、２９２頁（２０００年）。
【０１５５】
実施形態では、本発明の組成物は、本明細書中に提供されるペプチドをコードする核酸を含む。かかる核酸は、Ａ、Ｂ、もしくはＣ、またはそれらの組み合わせをコードすることができる。核酸は、ＤＮＡまたはＲＮＡ、例えばｍＲＮＡであってもよい。実施形態では、本発明の組成物は、本明細書中に提供される核酸のいずれかの補体、例えば完全長補体、または（遺伝子コードの縮重に起因する）縮重物（ｄｅｇｅｎｅｒａｔｅ）を含む。
【０１５６】
実施形態では、核酸は、Ａ−ｘ−Ｂをコードし、ここで、ｘは、アミドリンカーまたはペプチドリンカーであり、Ａは、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつＢは、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む。さらに、実施形態では、核酸は、Ａ−ｘ−Ｂ−ｙ−Ｃをコードし、ここで、ｘは、アミドリンカーまたはペプチドリンカーであり、ｙは、アミドリンカーまたはペプチドリンカーであり、Ａは、第１のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、Ｂは、第２のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含み、かつＣは、第３のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを含む。
【０１５７】
目的の特定の配列は、下に列挙される。天然配列は、組成物１（Ｃ１）である。ヒトコドン使用の頻度に基づく最良のヒト配列は、組成物２（Ｃ２）である。変換は、Ｔｈｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｏｎ  Ｓｕｉｔｅ：ＪａｖａＳｃｒｉｐｔ（登録商標）  ｐｒｏｇｒａｍｓ  ｆｏｒ  ａｎａｌｙｚｉｎｇ  ａｎｄ  ｆｏｒｍａｔｔｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ａｎｄ  ＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ．  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ２８：１１０２−１１０４頁（ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｏｒｇ／ｓｍｓ２／ｒｅｖ＿ｔｒａｎｓ．ｈｔｍｌ）を用いて行われた。
【０１５８】
ＴＴ９５０：ＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号１）
Ｃ１：ａａｔａａｔｔｔｔａｃｃｇｔｔａｇｃｔｔｔｔｇｇｔｔｇａｇｇｇｔｔｃｃｔａａａｇｔａｔｃｔｇｃｔａｇｔｃａｔｔｔａｇａａ（配列番号４７）ＡＦ１５４８２８  ２５０−３０９
Ｃ２（ヒト）：
ａａｃａａｃｔｔｃａｃｃｇｔｇａｇｃｔｔｃｔｇｇｃｔｇａｇａｇｔｇｃｃｃａａｇｇｔｇａｇｃｇｃｃａｇｃｃａｃｃｔｇｇａｇａｃｃ（配列番号４８）
ＡｄＶ：ＴＬＬＹＶＬＦＥＶ（配列番号２）
Ｃ１：ａｃｇｃｔｔｃｔｃｔａｔｇｔｔｃｔｇｔｔｃｇａａｇｔ（配列番号４９）
ＦＪ０２５９３１  ２０８９１−２０９１７
Ｃ２（ヒト）：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｃｇｔｇｃｔｇｔｔｃｇａｇｇｔｇ（配列番号５０）
ＴＴ８３０：ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号３）
Ｃ１：ａｔｔｔｔａａｔｇｃａｇｔａｔａｔａａａａｇｃａａａｔｔｃｔａａａｔｔｔａｔａｇｇｔａｔａ（配列番号５１）
Ｘ０６２１４  ２８００−２８４４
Ｃ２（ヒト）：
Ａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃ（配列番号５２）
ＤＴ：ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＧＥＬ（配列番号４）
Ｃ１：ｃａａｔｃｇａｔａｇｃｔｔｔａｔｃｇｔｃｔｔｔａａｔｇｇｔｔｇｃｔｃａａｇｃｔａｔａｃｃａｔｔｇｇｔａｇｇａｇａｇｃｔａ（配列番号５３）
ＦＪ８５８２７２  １０６６−１１２５
Ｃ２（ヒト）：
ｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇｇｃｃａｔｃｃｃｃｃｔｇｇｔｇｇｇｃｇａｇｃｔｇ（配列番号５４）
キメラエピトープ：
ＡｄＶＴＴ９５０：ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号５）
Ｃ２（ヒト）：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｃｇｔｇｃｔｇｔｔｃｇａｇｇｔｇａａｃａａｃｔｔｃａｃｃｇｔｇａｇｃｔｔｃｔｇｇｃｔｇａｇａｇｔｇｃｃｃａａｇｇｔｇａｇｃｇｃｃａｇｃｃａｃｃｔｇｇａｇａｃｃ（配列番号５５）
ＡｄＶＴＴ８３０：ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号６）
Ｃ２（ヒト）：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｃｇｔｇｃｔｇｔｔｃｇａｇｇｔｇａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃ（配列番号５６）
ＴＴ８３０ＤＴ：ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＧＥＬ（配列番号７）
Ｃ２（ヒト）：
ａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇｇｃｃａｔｃｃｃｃｃｔｇｇｔｇｇｇｃｇａｇｃｔｇ（配列番号５７）
ＤＴ  ＴＴ８３０：ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＰＬＶＧＥＬＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号８）
Ｃ２（ヒト）：
ｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇｇｃｃａｔｃｃｃｃｃｔｇｇｔｇｇｇｃｇａｇｃｔｇａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃ（配列番号５８）
ＴＴ８３０ＤＴｔｒｕｎｃ：ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号９）
Ｃ２（ヒト）：
ａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇ（配列番号５９）
ＤＴ  ｔｒｕｎｃ  ＴＴ８３０：ＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＡＩＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号１０）
Ｃ２（ヒト）：
ｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇｇｃｃａｔｃａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃ（配列番号６０）
予測されたキメラカテプシン切断ユニバーサルエピトープ
ＡｄＶｐｍｇｌｐＴＴ８３０：ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＰＭＧ．ＬＰＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号１１）
Ｃ１（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｔｇｔｇｃｔｇｔｔｔｇａａｇｔｇｃｃｇａｔｇｇｇｃｃｔｇｃｃｇａｔｔｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｔａｔｔａａａｇｃｇａａｃａｇｃａａａｔｔｔａｔｔｇｇｃａｔｔ（配列番号６１）
Ｃ２（ヒト）：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｃｇｔｇｃｔｇｔｔｃｇａｇｇｔｇｃｃｃａｔｇｇｇｃｃｔｇｃｃｃａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃ（配列番号６２）
ＡｄＶｋｖｓｖｒＴＴ８３０：ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＫＶＳ．ＶＲＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩ（配列番号１２）
Ｃ１（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｔｇｔｇｃｔｇｔｔｔｇａａｇｔｇａａａｇｔｇａｇｃｇｔｇｃｇｃａｔｔｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｔａｔｔａａａｇｃｇａａｃａｇｃａａａｔｔｔａｔｔｇｇｃａｔｔ（配列番号６３）
Ｃ２（ヒト）：
ａｃｃｃｔｇｃｔｇｔａｃｇｔｇｃｔｇｔｔｃｇａｇｇｔｇａａｇｇｔｇａｇｃｇｔｇａｇａａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃ（配列番号６４）
ＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴｔｒｕｎｃ：ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＰＭＧ．ＬＰＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１３）
Ｃ１（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））：
ａｔｔｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｔａｔｔａａａｇｃｇａａｃａｇｃａａａｔｔｔａｔｔｇｇｃａｔｔｃｃｇａｔｇｇｇｃｃｔｇｃｃｇｃａｇａｇｃａｔｔｇｃｇｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｇｃａｇ（配列番号６５）
Ｃ２（ヒト）：
ａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃｃｃｃａｔｇｇｇｃｃｔｇｃｃｃｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇ（配列番号６６）
ＴＴ８３０ｋｖｓｖｒＤＴｔｒｕｎｃ：ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＫＶＳ．ＶＲＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１４）
Ｃ１（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））：
ａｔｔｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｔａｔｔａａａｇｃｇａａｃａｇｃａａａｔｔｔａｔｔｇｇｃａｔｔａａａｇｔｇａｇｃｇｔｇｃｇｃｃａｇａｇｃａｔｔｇｃｇｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｇｃａｇ（配列番号６７）
Ｃ２（ヒト）：
ａｔｃｃｔｇａｔｇｃａｇｔａｃａｔｃａａｇｇｃｃａａｃａｇｃａａｇｔｔｃａｔｃｇｇｃａｔｃａａｇｇｔｇａｇｃｇｔｇａｇａｃａｇａｇｃａｔｃｇｃｃｃｔｇａｇｃａｇｃｃｔｇａｔｇｇｔｇｇｃｃｃａｇ（配列番号６８）
【０１５９】
実施形態では、ペプチドリンカーは、リソソームプロテアーゼ切断部位（例えばカテプシン切断部位）を含む。特定の実施形態では、ペプチドリンカーをコードする核酸配列は、配列番号６９または７０として示される核酸配列、その縮重物または補体を含む。
ｃｃｇａｔｇｇｇｃｃｔａｃｃａ（配列番号６９）
ａａｇｇｔｃｔｃａｇｔｇａｇａａｃ（配列番号７０）
【０１６０】
実施形態では、本発明の核酸によってコードされるＡ、Ｂおよび／またはＣは、天然ＨＬＡ−ＤＰ、ＨＬＡ−ＤＱ、またはＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対して少なくとも７０％の同一性を有する。特定の実施形態では、核酸によってコードされるＡ、Ｂおよび／またはＣは、天然ＨＬＡ−ＤＰ、ＨＬＡ−ＤＱ、またはＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドに対し、好ましくは少なくとも７５％、より好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、さらにより好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９７％、またはさらにより好ましくは少なくとも９９％の同一性を有する。好ましくは、かかるペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ分子に結合する。
【０１６１】
実施形態では、核酸は、それ故、天然ＨＬＡ−ＤＰ、ＨＬＡ−ＤＱ、またはＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドをコードする核酸配列に対して少なくとも６０％の同一性を有する核酸配列を含む。特定の実施形態では、核酸は、天然ＨＬＡ−ＤＰ、ＨＬＡ−ＤＱ、またはＨＬＡ−ＤＲ結合ペプチドをコードする核酸配列に対し、好ましくは少なくとも６５％、より好ましくは少なくとも７０％、さらにより好ましくは少なくとも７５％、さらにより好ましくは少なくとも８０％、さらにより好ましくは少なくとも８５％、さらにより好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９７％、またはさらにより好ましくは少なくとも９９％の同一性を有する。この種の核酸は、好ましくはＭＨＣクラスＩＩ分子供給源を結合するペプチドをコードする。
【０１６２】
パーセント同一性は、インターネット（ｆｔｐ：／ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｐｕｂ／）を通じて入手可能な、ＮＣＢＩ（Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍａｒｙｌａｎｄ）によって開発された様々な公的に利用可能なソフトウェアツールを用いて計算されうる。典型的なツールは、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖで利用可能なＢＬＡＳＴシステムを含む。ペアワイズおよびＣｌｕｓｔａｌ  Ｗアラインメント（ＢＬＯＳＵＭ３０マトリックスセッティング）ならびにＫｙｔｅ−Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅハイドロパシー分析は、ＭａｃＶｅｃｔｏｒ配列分析ソフトウェア（Ｏｘｆｏｒｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｇｒｏｕｐ）を用いて得ることができる。上記核酸のワトソン−クリック（Ｗａｔｓｏｎ−Ｃｒｉｃｋ）補体（完全長補体を含む）もまた、本発明によって包含される。
【０１６３】
また、本明細書中に提供される核酸のいずれかにハイブリダイズする核酸が、本明細書中に提供される。標準の核酸ハイブリダイゼーション法を用い、選択されたパーセント同一性の関連核酸配列が同定可能である。本明細書で使用される用語「ストリンジェントな条件」は、当該技術分野で周知であるパラメータを示す。かかるパラメータは、塩、温度、プローブ長などを含む。ハイブリダイゼーション時に得られた塩基ミスマッチの量は、約０％（「高ストリンジェンシー」）から約３０％（「低ストリンジェンシー」）の範囲でありうる。高ストリンジェンシー条件の一例が、ハイブリダイゼーション緩衝液（３．５×ＳＳＣ、０．０２％フィコル、０．０２％ポリビニルピロリドン、０．０２％ウシ血清アルブミン、２．５ｍＭ  ＮａＨ２ＰＯ４（ｐＨ７）、０．５％ＳＤ、２ｍＭ  ＥＤＴＡ）中、６５℃でのハイブリダイゼーションである。ＳＳＣは０．１５Ｍ塩化ナトリウム／０．０１５Ｍクエン酸ナトリウム、ｐＨ７であり、ＳＤＳはドデシル硫酸ナトリウムであり、またＥＤＴＡはエチレンジアミン四酢酸である。ハイブリダイゼーション後、核酸が移される膜は、例えば、室温で２×ＳＳＣ、次いで最大６８℃の温度、０．１〜０．５×ＳＳＣ／０．１×ＳＤＳで洗浄される。
【０１６４】
実施形態では、核酸は、プロモーターに作動可能に連結することができる。原核生物宿主における発現は、原核生物調節領域を用いて行うことができる。真核生物宿主における発現は、真核生物調節領域を用いて行うことができる。かかる領域は、一般に、ＲＮＡ合成の開始を誘導するのに十分なプロモーター領域を含み得る。実施形態では、核酸は、宿主の性質に依存し、転写および翻訳調節配列をさらに含んでもよい。転写および翻訳調節シグナルは、ウイルス源、例えばレトロウイルス、アデノウイルス、ウシパピローマウイルス、シミアンウイルス、またはそれに類するものから得られるかまたは誘導されてもよい。
【０１６５】
実施形態では、核酸は、所望される配列を宿主細胞染色体に融合する能力があるベクターに挿入される。追加的因子もまた、ｍＲＮＡの最適な合成にとって必要とされうる。これらの因子は、スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサー、および終結シグナルを含んでもよい。
【０１６６】
実施形態では、核酸は、レシピエント宿主内での自己複製能を有するプラスミドまたはウイルスベクターに組み込まれる。この目的のため、多種多様なベクター、例えば原核生物および真核生物ベクターのいずれかを使用してもよい。真核生物ベクターは、ウイルスベクターであり得る。例えば、限定はされないが、ベクターは、ポックスウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、アデノウイルスベクターまたは多数のレトロウイルスベクターのいずれかであり得る。ウイルスベクターは、挿入ＤＮＡまたは挿入ＲＮＡの発現を引き起こすため、ＤＮＡまたはＲＮＡウイルスのいずれかを含む。
【０１６７】
ベクターまたは他のコンストラクトは、種々の好適な手段、すなわち、形質転換、形質移入、複合、原形質融合、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈殿、直接マイクロインジェクションなどのいずれかにより、適切な宿主細胞に導入することができる。さらに、ＤＮＡまたはＲＮＡは、細胞に直接注入することができ、または微粒子もしくはナノ粒子、例えば本明細書中に提供される合成ナノ担体に付着させてから、細胞膜を貫通するように駆動してもよい。
【０１６８】
Ｄ．本発明の剤形および関連する方法
実施において有用な抗原および組成物は、本明細書中の他の個所に記載されている感染性および非感染性生物を含む対象の標的から選択しうる。抗原および組成物は、互いに共通の「自己」（例えば、自動抗原および自動組成物）または「非自己」（例えば、感染性生物から供給される抗原および組成物）から得られるかまたは誘導されうる。
【０１６９】
本発明の剤形が任意の好適な方法で作製しうることと、本発明が本明細書中に記載の方法を用いて生成できる剤形だけに限定されるものでないことを、理解すべきである。適切な方法を選択する際には、関連のある特定の部分の特性に配慮しなければならない場合がある。
【０１７０】
本発明の剤形は、限定はされないが、静脈内、非経口（例えば、皮下、筋肉内、静脈内、もしくは皮内など）、肺、舌下、経口、鼻腔内、経鼻、粘膜内、経粘膜、直腸、眼、経皮的（ｔｒａｎｓｃｕｔａｎｅｏｕｓ）、経皮（ｔｒａｎｓｄｅｒｍａｌ）経路、またはこれらの経路の組み合わせを含む、種々の投与経路によって投与しうる。
【０１７１】
本明細書に記載されている剤形および方法は、免疫応答を誘発、促進、抑制、誘導、または再誘導する場合に使用しうる。本明細書に記載されている剤形および方法は、癌、感染性疾患、代謝疾患、変性疾患、自己免疫疾患、炎症性疾患、免疫学的疾患、あるいは他の障害および／または症状などの状態の予防および／または処置のために使用することができる。本明細書に記載されている剤形および方法はまた、依存、例えばニコチンまたは麻酔剤への依存の処置のために使用することができる。本明細書に記載されている剤形および方法はまた、毒素、毒性媒介物、環境毒素、または他の有害な作用剤への暴露に起因する状態の予防および／または処置のために使用することができる。本明細書に記載されている剤形および方法はまた、例えば、本明細書中に記載の剤形がインビボまたはインビトロでＴ細胞と接触状態に置かれる場合、Ｔ細胞増殖またはサイトカイン産生を誘発または促進するように使用することができる。一実施形態において本発明の剤形は、複合体、または非複合体、ワクチンと並行投与しうる。
【０１７２】
剤形の用量は、本発明に準じた様々な量の合成ナノ担体、抗原および／またはペプチドを包含する。本発明の剤形に存在する合成ナノ担体および／または抗原および／またはペプチドの量は、抗原および／またはペプチドの性質、達成される処置上の利点、およびこの種の他のパラメータに従って変化しうる。実施形態においては、合成ナノ担体の処置上の最適な分量、ならびに剤形中に存在する抗原および／またはペプチドの分量を、用量範囲探索試験を実施することで確定しうる。実施形態において、対象に投与したときに抗原に対する免疫反応を発生させるのに有効な量の合成ナノ担体ならびに抗原および／またはペプチドが、剤形中に存在する。対象に従来の用量範囲探索試験および技術を使用すれば、免疫反応を発生させるのに有効な分量を定量することが可能である。本発明の剤形は、様々な頻度で投与しうる。一実施形態においては、剤形を少なくとも１回投与すれば、薬理学的に適切な反応を発生させるのに十分である。追加の実施形態においては、薬理学的に適切な反応を確実に発生させるために剤形を少なくとも２回投与、少なくとも３回投与、または少なくとも４回投与する。
【０１７３】
実施形態において、剤形は混合された抗原および／または組成物を含みうる。他の実施形態においては、抗原および組成物の一方または両方を（共有結合または非共有結合によって）担体にカップリングしうる。
【０１７４】
実施形態において、組成物および／または抗原は、共有結合または非共有結合によって担体ペプチドもしくはタンパク質、または相互に結合しうる。有用な担体は、限定はされないが、破傷風トキソイド（ＴＴ）、ジフテリアトキソイド（ＤＴ）、ジフテリア毒素の非毒性突然変異体ＣＲＭ１９７、Ｂ群髄膜炎菌（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）由来の外膜タンパク質複合体、およびスカシ貝ヘモシアニン（ＫＬＨ）を含む、複合ワクチンにおいて有用であることで知られる担体タンパク質を含む。他の担体は、本明細書中の他の個所に記載の合成ナノ担体、および従来公知でありうる他の担体を含んでいてもよい。
【０１７５】
カップリングを行う際は、従来の共有または非共有カップリング技術を利用できる。列挙されている組成物を、複合したワクチン中または従来のワクチン中に使用するための有用な技術は、限定されないがＭＤ  Ｌａｉｒｍｏｒｅ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｈｕｍａｎ  Ｔ−ｌｙｍｐｈｏｔｒｏｐｉｃ  ｖｉｒｕｓ  ｔｙｐｅ  １  ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ｉｎ  ｃｈｉｍｅｒｉｃ  ａｎｄ  ｍｕｌｔｉｖａｌｅｎｔ  ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｓ  ｗｉｔｈ  ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ  Ｔ−ｃｅｌｌ  ｅｐｉｔｏｐｅｓ  ｅｎｈａｎｃｅ  ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ  ａｎｄ  ｏｖｅｒｃｏｍｅ  ｇｅｎｅｔｉｃ  ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ．”  Ｊ  Ｖｉｒｏｌ．Ｏｃｔ；６９（１０）：６０７７−８９（１９９５）；ＣＷ  Ｒｉｔｔｅｒｓｈａｕｓｅ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｖａｃｃｉｎｅ−ｉｎｄｕｃｅｄ  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ｉｎｈｉｂｉｔ  ＣＥＴＰ  ａｃｔｉｖｉｔｙ  ｉｎ  ｖｉｖｏ  ａｎｄ  ｒｅｄｕｃｅ  ａｏｒｔｉｃ  ｌｅｓｉｏｎｓ  ｉｎ  ａ  ｒａｂｂｉｔ  ｍｏｄｅｌ  ｏｆ  ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ．”  Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｖａｓｃ  Ｂｉｏｌ．Ｓｅｐ；２０（９）：２１０６−１２（２０００）；ＭＶ  Ｃｈｅｎｇａｌｖａｌａ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｅｎｈａｎｃｅｄ  ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ  ｏｆ  ｈｅｐａｔｉｔｉｓ  Ｂ  ｓｕｒｆａｃｅ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｂｙ  ｉｎｓｅｒｔｉｏｎ  ｏｆ  ａ  ｈｅｌｐｅｒ  Ｔ  ｃｅｌｌ  ｅｐｉｔｏｐｅ  ｆｒｏｍ  ｔｅｔａｎｕｓ  ｔｏｘｏｉｄ．”  Ｖａｃｃｉｎｅ．Ｍａｒ  ５；１７（９−１０）：１０３５−４１（１９９９）．ＮＫ  Ｄａｋａｐｐａｇａｒｉ  ｅｔ  ａｌ．，“Ａ  ｃｈｉｍｅｒｉｃ  ｍｕｌｔｉ−ｈｕｍａｎ  ｅｐｉｄｅｒｍａｌ  ｇｒｏｗｔｈ  ｆａｃｔｏｒ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ−２  Ｂ  ｃｅｌｌ  ｅｐｉｔｏｐｅ  ｐｅｐｔｉｄｅ  ｖａｃｃｉｎｅ  ｍｅｄｉａｔｅｓ  ｓｕｐｅｒｉｏｒ  ａｎｔｉｔｕｍｏｒ  ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ．”  Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ａｐｒ  １５；１７０（８）：４２４２−５３（２００３）；ＪＴ  Ｇａｒｒｅｔｔ  ｅｔ  ａｌ．“Ｎｏｖｅｌ  ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ  ｔｒａｓｔｕｚｕｍａｂ  ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌ  ｅｐｉｔｏｐｅｓ  ｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅ  ｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ａｎｄ  ｉｎ  ｖｉｖｏ  ａｎｔｉｔｕｍｏｒ  ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  ａｇａｉｎｓｔ  ＨＥＲ−２／ｎｅｕ．”  Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｊｕｎ  １；１７８（１１）：７１２０−３１（２００７）に概説されているものを含む。
【０１７６】
実施形態において、剤形は一形態の担体とカップリングされた抗原を含みうる一方、組成物は別の形態の担体とカップリングされうる。例えば、抗原は合成ナノ担体の一集団にカップリングしうるのに対して、列挙されている組成物は合成ナノ担体の別の集団にカップリングしうる。この種の実施形態においては、合成ナノ担体の２集団を結合して、完全な剤形を形成しうる。別の実施形態においては、抗原を共有結合によって担体タンパク質にカップリングし、組成物を合成ナノ担体にカップリングし、抗原にカップリングされたタンパク質および組成物にカップリングされた合成ナノ担体を結合して完全な剤形を形成しうる。この種の他の組み合わせも可能である。
【０１７７】
他の実施形態において、本発明の剤形は、媒体中での調合（従来のワクチンとの調合を含む）によって注入可能な混合物を形成しうる。混合物は、従来の製剤加工および配合技術を用いて作製することで、有用な剤形に到達しうる。本発明の実施での使用に適した技術は、限定はされないが、Ｍ．Ｆ．Ｐｏｗｅｌｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｖａｃｃｉｎｅ  Ｄｅｓｉｇｎ，１９９５  Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ  ｐｕｂｌ．；またはＬ．Ｃ．Ｐａｏｌｅｔｔｉ  ｅｔ  ａｌ．ｅｄｓ．，Ｖａｃｃｉｎｅｓ：ｆｒｏｍ  Ｃｏｎｃｅｐｔ  ｔｏ  Ｃｌｉｎｉｃ．Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  ｔｈｅ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｔｅｓｔｉｎｇ  ｏｆ  Ｖａｃｃｉｎｅｓ  ｆｏｒ  Ｈｕｍａｎ  Ｕｓｅ  １９９９  ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ  ｐｕｂｌ．を含む種々のソースにおいて見出されうる。
【０１７８】
実施形態において、剤形は抗原または組成物の一方または両方にカップリングされた合成ナノ担体を含みうる。本発明に従って使用できる合成ナノ担体には様々なものがある。一部の実施形態において、合成ナノ担体は球体または回転楕円体である。一部の実施形態において、合成ナノ担体は平面または円盤状である。一部の実施形態において、合成ナノ担体は、立方体または立方形である。一部の実施形態において、合成ナノ担体は長円または楕円である。一部の実施形態において、合成ナノ担体は円筒形、円錐形、または角錐形である。
【０１７９】
一部の実施形態において、各合成ナノ担体が類似の特性を有するように、サイズ、形状、および／または組成が比較的均一な合成ナノ担体の集団を使用することが望ましい。例えば、合成ナノ担体の総数に基づいて、合成ナノ担体の少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％は、合成ナノ担体の平均直径または平均寸法の５％、１０％、もしくは２０％の範囲内に収まる最小寸法または最大寸法を有しうる。一部の実施形態において、合成ナノ担体の集団は、サイズ、形状、および／または組成が異なってもよい。
【０１８０】
合成ナノ担体は、固体または空洞であってもよく、また１つ以上の層を含んでもよい。一部の実施形態では、各層は、それ以外の層に対して固有の組成および固有の特性を有する。一例だけ示すと、合成ナノ担体は、コア／シェル構造を有してもよく、ここでコアは第１層（例えばポリマーコア）であり、またシェルは第２層（例えば脂質二重層または単層）である。合成ナノ担体は、複数の異なる層を含んでもよい。
【０１８１】
一部の実施形態では、合成ナノ担体は、場合により、１つ以上の脂質を含んでもよい。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、リポソームを含んでもよい。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、脂質二重層を含んでもよい。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、脂質単層を含んでもよい。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、ミセルを含んでもよい。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、脂質層（例えば、脂質二重層、脂質単層など）によって囲まれたポリマーマトリックスを含むコアを含んでもよい。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、脂質層（例えば、脂質二重層、脂質単層など）によって囲まれた非ポリマーコア（例えば、金属粒子、量子ドット、セラミック粒子、骨粒子、ウイルス粒子、タンパク質、核酸、炭水化物など）を含んでもよい。
【０１８２】
一部の実施形態では、合成ナノ担体は、１つ以上のポリマーを含んでもよい。一部の実施形態では、かかるポリマーは、コーティング層（例えば、リポソーム、脂質単層、ミセルなど）によって囲まれうる。一部の実施形態では、合成ナノ担体の様々な成分は、ポリマーとカップリングされうる。
【０１８３】
一部の実施形態では、免疫特徴表面、標的化部分、オリゴヌクレオチドおよび／または他の要素は、ポリマーマトリックスと共有結合されうる。一部の実施形態では、共有結合は、リンカーによって媒介される。一部の実施形態では、免疫特徴表面、標的化部分、オリゴヌクレオチドおよび／または他の要素は、ポリマーマトリックスと非共有結合されうる。例えば、一部の実施形態では、免疫特徴表面、標的化部分、オリゴヌクレオチドおよび／または他の要素は、ポリマーマトリックスの内部にカプセル化され、それによって囲まれ、および／またはその全体にわたって分散されうる。その他または追加として、免疫特徴表面、標的化部分、オリゴヌクレオチドおよび／または他の要素は、疎水性相互作用、電荷相互作用、ファンデルワールス力などにより、ポリマーマトリックスと結合されうる。
【０１８４】
多種多様なポリマーおよびそれからポリマーマトリックスを形成するための方法は、既知である。一般に、ポリマーマトリックスは、１つ以上のポリマーを含む。ポリマーは、天然または非天然（合成）ポリマーであってもよい。ポリマーは、２つ以上のモノマーを含むホモポリマーまたは共重合体であってもよい。配列の観点では、共重合体は、ランダム、ブロックであってもよく、またはランダムおよびブロック配列の組み合わせを含んでもよい。典型的には、本発明によるポリマーは、有機ポリマーである。
【０１８５】
本発明における使用に適したポリマーの例は、限定はされないが、ポリエチレン、ポリカーボネート（例えば、ポリ（１，３−ジオキサン−２−オン））、ポリ無水物（例えば、ポリ（セバシン酸無水物））、ポリプロピルフメレート（ｐｏｌｙｐｒｏｐｙｌｆｕｍｅｒａｔｅ）、ポリアミド（例えばポリカプロラクタム）、ポリアセタール、ポリエーテル、ポリエステル（例えば、ポリラクチド、ポリグリコリド）、ポリラクチド−コ−グリコリド、ポリカプロラクトン、ポリヒドロキシ酸（例えばポリ（β−ヒドロキシアルカノエート））、ポリ（オルソエステル）、ポリシアノアクリレート、ポリビニルアルコール、ポリウレタン、ポリホスファゼン、ポリアクリル酸塩、ポリメタクリル酸塩、ポリ尿素、ポリスチレン、およびポリアミンを含む。
【０１８６】
一部の実施形態では、本発明によるポリマーは、米国食品医薬品局（Ｕ．Ｓ．Ｆｏｏｄ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ）（ＦＤＡ）によって、２１Ｃ．Ｆ．Ｒ．１７７．２６００下でヒト使用が認可されているポリマー、例えば限定はされないが、ポリエステル（例えば、ポリ乳酸、ポリ（乳酸−コ−グリコール酸）、ポリカプロラクトン、ポリバレロラクトン、ポリ（１，３−ジオキサン−２−オン））；ポリ無水物（例えば、ポリ（セバシン酸無水物））；ポリエーテル（例えばポリエチレングリコール）；ポリウレタン；ポリメタクリル酸塩；ポリアクリル酸塩；およびポリシアノアクリレートを含む。
【０１８７】
一部の実施形態では、ポリマーは親水性であってもよい。例えば、ポリマーは、アニオン基（例えば、リン酸基、硫酸基、カルボン酸基）；カチオン基（例えば、第四級アミン基）；または極性基（例えば、水酸基、チオール基、アミン基）であってもよい。一部の実施形態では、親水性ポリマーマトリックスを含む合成ナノ担体は、合成ナノ担体中に親水性環境をもたらす。一部の実施形態では、ポリマーは、疎水性であってもよい。一部の実施形態では、疎水性ポリマーマトリックスを含む合成ナノ担体は、合成ナノ担体中に疎水性環境をもたらす。ポリマーの親水性または疎水性の選択は、合成ナノ担体内部に組み込まれる（例えばカップリングされる）材料の性質に対して影響を有しうる。
【０１８８】
一部の実施形態では、ポリマーは、１つ以上の部分および／または官能基で修飾してもよい。種々の部分または官能基は、本発明に従って使用してもよい。一部の実施形態では、ポリマーは、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、炭水化物、および／または多糖類由来の非環状ポリアセタールで修飾してもよい（Ｐａｐｉｓｏｖ、２００１年、ＡＣＳ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ、７８６：３０１頁）。特定の実施形態は、米国特許第５５４３１５８号明細書（Ｇｒｅｆらに付与）または国際公開第２００９／０５１８３７号パンフレット（Ｖｏｎ  Ａｎｄｒｉａｎらによる）の一般的な教示を用いて行ってもよい。
【０１８９】
一部の実施形態では、ポリマーは、脂質または脂肪酸基で修飾してもよい。一部の実施形態では、脂肪酸基は、酪酸、カプロン酸、カプリル酸、カプリン酸、ラウリン酸、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、アラキジン酸、ベヘン酸、またはリグノセリン酸のうちの１つ以上であってもよい。一部の実施形態では、脂肪酸基は、パルミトレイン酸、オレイン酸、バクセン酸、リノール酸、α−リノール酸、γ−リノール酸、アラキドン酸、ガドレイン酸、アラキドン酸、エイコサペンタエン酸、ドコサヘキサエン酸、またはエルカ酸のうちの１つ以上であってもよい。
【０１９０】
一部の実施形態では、ポリマーは、乳酸およびグリコール酸単位、例えばポリ（乳酸−コ−グリコール酸）およびポリ（ラクチド−コ−グリコリド）（集合的に本明細書中で「ＰＬＧＡ」と称される）を含む共重合体；ならびにグリコール酸単位（本明細書中で「ＰＧＡ」と称される）および乳酸単位、例えばポリ−Ｌ−乳酸、ポリ−Ｄ−乳酸、ポリ−Ｄ，Ｌ−乳酸、ポリ−Ｌ−ラクチド、ポリ−Ｄ−ラクチド、およびポリ−Ｄ，Ｌ−ラクチド（集合的に本明細書中で「ＰＬＡ」と称される）を含むホモポリマー、を含むポリエステルであってもよい。一部の実施形態では、典型的なポリエステルは、例えば、ポリヒドロキシ酸；ＰＥＧ共重合体ならびにラクチドおよびグリコリドの共重合体（例えば、ＰＬＡ−ＰＥＧ共重合体、ＰＧＡ−ＰＥＧ共重合体、ＰＬＧＡ−ＰＥＧ共重合体、およびそれらの誘導体）を含む。一部の実施形態では、ポリエステルは、例えば、ポリ（カプロラクトン）、ポリ（カプロラクトン）−ＰＥＧ共重合体、ポリ（Ｌ−ラクチド−コ−Ｌ−リジン）、ポリ（セリンエステル）、ポリ（４−ヒドロキシ−Ｌ−プロリンエステル）、ポリ[α−（４−アミノブチル）−Ｌ−グリコール酸]、およびそれらの誘導体を含む。
【０１９１】
一部の実施形態では、ポリマーは、ＰＬＧＡであってもよい。ＰＬＧＡは、乳酸およびグリコール酸の生体適合性および生分解性共重合体であり、かつ様々な形態のＰＬＧＡは、乳酸：グリコール酸の比によって特徴づけられる。乳酸は、Ｌ−乳酸、Ｄ−乳酸、またはＤ，Ｌ−乳酸であってもよい。ＰＬＧＡの分解速度は、乳酸：グリコール酸比を変更することによって調節してもよい。一部の実施形態では、本発明に従って使用されるべきＰＬＧＡは、約８５：１５、約７５：２５、約６０：４０、約５０：５０、約４０：６０、約２５：７５、または約１５：８５の乳酸：グリコール酸比によって特徴づけられる。
【０１９２】
一部の実施形態では、ポリマーは、１つ以上のアクリルポリマーであってもよい。特定の実施形態では、アクリルポリマーは、例えば、アクリル酸およびメタクリル酸共重合体、メチルメタクリレート共重合体、エトキシエチルメタクリレート、シアノエチルメタクリレート、アミノアルキルメタクリレート共重合体、ポリ（アクリル酸）、ポリ（メタクリル酸）、メタクリル酸アルキルアミド共重合体、ポリ（メチルメタクリレート）、ポリ（メタクリル酸無水物）、メチルメタクリレート、ポリメタクリレート、ポリ（メチルメタクリレート）共重合体、ポリアクリルアミド、アミノアルキルメタクリレート共重合体、グリシジルメタクリレート共重合体、ポリシアノアクリレート、および上記ポリマーのうちの１つ以上を含む組み合わせを含む。アクリルポリマーは、第四級アンモニウム基の含量が少ない、アクリル酸およびメタクリル酸エステルの完全に重合された共重合体を含んでもよい。
【０１９３】
一部の実施形態では、ポリマーは、カチオンポリマーであってもよい。一般に、カチオンポリマーは、核酸の負に帯電した鎖（例えば、ＤＮＡ、またはそれらの誘導体）を濃縮し、および／または保護することができる。ポリ（リジン）（Ｚａｕｎｅｒら、１９９８年、Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌ．Ｒｅｖ．、３０：９７頁；およびＫａｂａｎｏｖら、１９９５年、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、６：７頁）、ポリ（エチレンイミン）（ＰＥＩ；Ｂｏｕｓｓｉｆら、１９９５年、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．、ＵＳＡ、１９９５年、９２：７２９７頁）、およびポリ（アミドアミン）デンドリマー（Ｋｕｋｏｗｓｋａ−Ｌａｔａｌｌｏら、１９９６年、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．、ＵＳＡ、９３：４８９７頁；Ｔａｎｇら、１９９６年、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、７：７０３頁；およびＨａｅｎｓｌｅｒら、１９９３年、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、４：３７２頁）などのアミン含有ポリマーは、生理的ｐＨで正に帯電し、核酸とイオン対を形成し、種々の細胞系における形質移入を媒介する。実施形態では、本発明の合成ナノ担体は、カチオンポリマーを含まなくてもよい（または除外してもよい）。
【０１９４】
一部の実施形態では、ポリマーは、カチオン側鎖を担持する分解性ポリエステルであってもよい（Ｐｕｔｎａｍら、１９９９年、Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ、３２：３６５８頁；Ｂａｒｒｅｒａら、１９９３年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１１５：１１０１０頁；Ｋｗｏｎら、１９９８年、Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ、２２：３２５０頁；Ｌｉｍら、１９９９年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１２１：５６３３頁；およびＺｈｏｕら、１９９０年、Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ、２３：３３９９頁）。これらのポリエステルの例として、ポリ（Ｌ−ラクチド−コ−Ｌ−リシン）（Ｂａｒｒｅｒａら、１９９３年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１１５：１１０１０頁）、ポリ（セリンエステル）（Ｚｈｏｕら、１９９０年、Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ、２３：３３９９頁）、ポリ（４−ヒドロキシ−Ｌ−プロリンエステル）（Ｐｕｔｎａｍら、１９９９年、Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ、３２：３６５８頁；およびＬｉｍら、１９９９年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１２１：５６３３頁）、およびポリ（４−ヒドロキシ−Ｌ−プロリンエステル）（Ｐｕｔｎａｍら、１９９９年、Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅｓ、３２：３６５８頁；およびＬｉｍら、１９９９年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１２１：５６３３頁）が挙げられる。
【０１９５】
これらや他のポリマーの特性およびそれらを調製するための方法は、当該技術分野で周知である（例えば、米国特許第６，１２３，７２７号明細書；米国特許第５，８０４，１７８号明細書；米国特許第５，７７０，４１７号明細書；米国特許第５，７３６，３７２号明細書；米国特許第５，７１６，４０４号明細書；米国特許第６，０９５，１４８号明細書；米国特許第５，８３７，７５２号明細書；米国特許第５，９０２，５９９号明細書；米国特許第５，６９６，１７５号明細書；米国特許第５，５１４，３７８号明細書；米国特許第５，５１２，６００号明細書；米国特許第５，３９９，６６５号明細書；米国特許第５，０１９，３７９号明細書；米国特許第５，０１０，１６７号明細書；米国特許第４，８０６，６２１号明細書；米国特許第４，６３８，０４５号明細書；および米国特許第４，９４６，９２９号明細書；Ｗａｎｇら、２００１年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１２３：９４８０頁；Ｌｉｍら、２００１年、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１２３：２４６０頁；Ｌａｎｇｅｒ、２０００年、Ａｃｃ．Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．、３３：９４頁；Ｌａｎｇｅｒ、１９９９年、Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ、６２：７頁；およびＵｈｒｉｃｈら、１９９９年、Ｃｈｅｍ．Ｒｅｖ．、９９：３１８１頁を参照）。より一般的には、特定の好適なポリマーを合成するための種々の方法は、Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  ｏｆ  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｏｌｙｍｅｒｉｃ  Ａｍｉｎｅｓ  ａｎｄ  Ａｍｍｏｎｉｕｍ  Ｓａｌｔｓ、Ｇｏｅｔｈａｌｓ編、Ｐｅｒｇａｍｏｎ  Ｐｒｅｓｓ、１９８０年；Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｐｏｌｙｍｅｒｉｚａｔｉｏｎ、Ｏｄｉａｎ編、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ、第４版、２００４年；Ｃｏｎｔｅｍｐｏｒａｒｙ  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、Ａｌｌｃｏｃｋら編、Ｐｒｅｎｔｉｃｅ−Ｈａｌｌ、１９８１年；Ｄｅｍｉｎｇら、１９９７年、Ｎａｔｕｒｅ、３９０：３８６頁；および米国特許第６，５０６，５７７号明細書、米国特許第６，６３２，９２２号明細書、米国特許第６，６８６，４４６号明細書、および米国特許第６，８１８，７３２号明細書において記載がなされている。
【０１９６】
一部の実施形態では、ポリマーは、直鎖状または分枝状ポリマーであってもよい。一部の実施形態では、ポリマーは、デンドリマーであってもよい。一部の実施形態では、ポリマーは、実質的に互いに架橋されていてもよい。一部の実施形態では、ポリマーは、実質的に架橋を含まなくてもよい。一部の実施形態では、ポリマーは、架橋ステップを受けることなく、本発明に従って使用してもよい。さらに、本合成ナノ担体が、上記および他のポリマーのいずれかの、ブロック共重合体、グラフト共重合体、混和物、混合物、および／または付加物を含んでもよいことは理解されるべきである。当業者は、本明細書中に列挙されるポリマーが、例示的な、包括的でない、本発明に従って使用可能なポリマーのリストを示すことを理解するであろう。
【０１９７】
一部の実施形態では、合成ナノ担体は、ポリマー成分を含まない。一部の実施形態では、合成ナノ担体は、金属粒子、量子ドット、セラミック粒子などを含んでもよい。一部の実施形態では、非重合体合成ナノ担体は、非重合体成分の凝集体、例えば金属原子（例えば金原子）の凝集体である。
【０１９８】
一部の実施形態では、合成ナノ担体は、場合により、１つ以上の両親媒性実体を含んでもよい。一部の実施形態では、両親媒性実体は、安定性が高まり、均一性が改善され、または粘度が高まった合成ナノ担体の生成を促進しうる。一部の実施形態では、両親媒性実体は、脂質膜（例えば、脂質二重層、脂質単層など）の内部表面と結合されうる。当該技術分野で既知の多数の両親媒性実体は、本発明による合成ナノ担体の作製における使用に適する。かかる両親媒性実体は、限定はされないが、ホスホグリセリド；ホスファチジルコリン；ジパルミトイルホスファチジルコリン（ＤＰＰＣ）；ジオレイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）；ジオレイルオキシプロピルトリエチルアンモニウム（ＤＯＴＭＡ）；ジオレイルホスファチジルコリン；コレステロール；コレステロールエステル；ジアシルグリセロール；ジアシルグリセロールスクシネート；ジホスファチジルグリセロール（ＤＰＰＧ）；ヘキサデカノール；ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの脂肪アルコール；ポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテル；表面活性脂肪酸、例えばパルミチン酸またはオレイン酸；脂肪酸；脂肪酸モノグリセリド；脂肪酸ジグリセリド；脂肪酸アミド；ソルビタントリオレアート（Ｓｐａｎ（登録商標）８５）グリココレート；ソルビタンモノラウレート（Ｓｐａｎ（登録商標）２０）；ポリソルベート２０（Ｔｗｅｅｎ（登録商標）２０）；ポリソルベート６０（Ｔｗｅｅｎ（登録商標）６０）；ポリソルベート６５（Ｔｗｅｅｎ（登録商標）６５）；ポリソルベート８０（Ｔｗｅｅｎ（登録商標）８０）；ポリソルベート８５（Ｔｗｅｅｎ（登録商標）８５）；ポリオキシエチレンモノステアレート；サーファクチン；ポロキサマー；ソルビタントリオレアートなどのソルビタン脂肪酸エステル；レシチン；リゾレシチン；ホスファチジルセリン；ホスファチジルイノシトール；スフィンゴミエリン；ホスファチジルエタノールアミン（セファリン）；カルジオリピン；ホスファチジン酸；セレブロシド；リン酸ジセチル；ジパルミトイルホスファチジルグリセロール；ステアリルアミン；ドデシルアミン；ヘキサデシル−アミン；アセチルパルミテート（ａｃｅｔｙｌ  ｐａｌｍｉｔａｔｅ）；グリセロールリシノレエート；ヘキサデシルステレート；イソプロピルミリステート；チロキサポール；ポリ（エチレングリコール）５０００−ホスファチジルエタノールアミン；ポリ（エチレングリコール）４００−モノステアレート；リン脂質；高い界面活性剤特性を有する合成および／または天然洗剤；デオキシコール酸塩；シクロデキストリン；カオトロピック塩；イオン対試薬；ならびにそれらの組み合わせを含む。両親媒性実体成分は、異なる両親媒性実体の混合物であってもよい。当業者は、これが、典型的であり、包括的でない、界面活性剤活性を有する物質のリストを示すことを理解するであろう。任意の両親媒性実体は、本発明に従って使用されるべき合成ナノ担体の生成において使用してもよい。
【０１９９】
一部の実施形態では、合成ナノ担体は、場合により、１つ以上の炭水化物を含んでもよい。炭水化物は、天然または合成であってもよい。炭水化物は、誘導体化された天然炭水化物であってもよい。特定の実施形態では、炭水化物は、限定はされないが、グルコース、フルクトース、ガラクトース、リボース、ラクトース、スクロース、マルトース、トレハロース、セロビオース、マンノース、キシロース、アラビノース、グルクロン酸、ガラクトロン酸、マンヌロン酸、グルコサミン、ガラクトサミン、およびノイラミン酸を含む、単糖類または二糖類を含む。特定の実施形態では、炭水化物は、限定はされないが、ブルラン、セルロース、微晶質セルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）、ヒドロキシセルロース（ＨＣ）、メチルセルロース（ＭＣ）、デキストラン、シクロデキストラン（ｃｙｃｌｏｄｅｘｔｒａｎ）、グリコーゲン、ヒドロキシエチルスターチ、カラギーナン、グリコン、アミロース、キトサン、Ｎ，Ｏ−カルボキシメチルキトサン、アルギンおよびアルギン酸、デンプン、キチン、イヌリン、コンニャク、グルコマンナン、プスチュラン（ｐｕｓｔｕｌａｎ）、ヘパリン、ヒアルロン酸、カードラン、およびキサンタンを含む多糖類である。実施形態では、本発明の合成ナノ担体は、炭水化物、例えば多糖類を含まない（または詳細には除外する）。特定の実施形態では、炭水化物は、限定はされないが、マンニトール、ソルビトール、キシリトール、エリスリトール、マルチトール、およびラクチトールを含む、糖アルコールなどの炭水化物誘導体を含んでもよい。
【０２００】
本発明による組成物は、薬学的に許容できる賦形剤（例えば、防腐剤、緩衝液、生理食塩水、またはリン酸塩緩衝生理食塩水）と組み合わされた本合成ナノ担体またはワクチンコンストラクトを含みうる。組成物は、有用な剤形に到達するため、従来の医薬品製造および配合技術を用いて作製してもよい。一実施形態では、本合成ナノ担体は、防腐剤とともに注入するため、無菌生理食塩溶液中に懸濁される。実施形態では、典型的な本発明の組成物は、無機または有機緩衝液（例えば、リン酸塩、炭酸塩、酢酸塩、またはクエン酸塩のナトリウムまたはカリウム塩）およびｐＨ調整剤（例えば塩酸、水酸化ナトリウムもしくは水酸化カリウム、クエン酸塩もしくは酢酸塩の塩、アミノ酸およびそれらの塩）、抗酸化剤（例えばアスコルビン酸、α−トコフェロール）、界面活性剤（例えばポリソルベート２０、ポリソルベート８０、ポリオキシエチレン９−１０ノニルフェノール、デオキシコール酸ナトリウム）、溶液および／または冷凍／溶解安定化剤（例えば、スクロース、ラクトース、マンニトール、トレハロース）、浸透圧調整剤（例えば、塩または糖類）、抗菌剤（例えば、安息香酸、フェノール、ゲンタマイシン）、消泡剤（例えば、ポリジメチルシロゾン）、防腐剤（例えば、チメロサール、２−フェノキシエタノール、ＥＤＴＡ）、高分子安定化剤および粘度調整剤（例えば、ポリビニルピロリドン、ポロキサマ４８８、カルボキシメチルセルロース）、ならびに共溶媒（例えば、グリセロール、ポリエチレングリコール、エタノール）を含む賦形剤を含んでもよい。
【０２０１】
本発明に従うＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、限定はされないが、Ｃ．Ａｓｔｅｔｅら、「Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ＰＬＧＡ  ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ」  Ｊ．Ｂｉｏｍａｔｅｒ．Ｓｃｉ．Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｅｄｎ、第１７巻、第３号、２４７−２８９頁（２００６年）；Ｋ．Ａｖｇｏｕｓｔａｋｉｓ  「Ｐｅｇｙｌａｔｅｄ  Ｐｏｌｙ（Ｌａｃｔｉｄｅ）  ａｎｄ  Ｐｏｌｙ（Ｌａｃｔｉｄｅ−Ｃｏ−Ｇｌｙｃｏｌｉｄｅ）  Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ：Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ，Ｐｒｏｐｅｒｔｙ  ａｎｄ  Ｐｏｓｓｉｂｌｅ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ」  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  １：３２１−３３３頁（２００４年）；Ｃ．Ｒｅｉｓら、「Ｎａｎｏｅｎｃａｐｓｕｌａｔｉｏｎ  Ｉ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｄｒｕｇ−ｌｏａｄｅｄ  ｐｏｌｙｍｅｒ  ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ」  Ｎａｎｏｍｅｄｉｃｉｎｅ  ２：８−２１（２００６年）を含む種々の方法を用い、合成ナノ担体にカプセル化してもよい。限定はされないが、米国特許第６，６３２，６７１号明細書（Ｕｎｇｅｒに付与）、２００３年１０月１４日に開示された方法を含む、ペプチドなどの材料を合成ナノ担体にカプセル化するのに適した他の方法を用いてもよい。別の実施形態では、ＭＨＣＩＩ結合ペプチドは、概して、Ｍ．Ｓｉｎｇｈら、「Ａｎｉｏｎｉｃ  ｍｉｃｒｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ  ａｒｅ  ａ  ｐｏｔｅｎｔ  ｄｅｌｉｖｅｒｙ  ｓｙｓｔｅｍ  ｆｏｒ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ａｎｔｉｇｅｎｓ  ｆｒｏｍ  Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ  ｓｅｒｏｔｙｐｅ  Ｂ．」  Ｊ  Ｐｈａｒｍ  Ｓｃｉ．Ｆｅｂ；９３（２）：２７３−８２頁（２００４年）に記載のように、合成ナノ担体の表面に吸着させてもよい。
【０２０２】
実施形態において、本発明による剤形はアジュバントを含みうる。実施形態において、本発明の剤形は、アジュバントを含みうるワクチンを含んで構成しうる。本発明の実施において有用な、異なるタイプのアジュバントは、本明細書中の別の個所に記載されている。本明細書中の他の個所に記載されているように、本発明の剤形のＭＨＣＩＩ結合ペプチドは抗原および／またはアジュバントに共有的または非共有的にカップリングしてもよいし、抗原および／またはアジュバントと混合してもよい。材料をカップリングまたは混合するための一般的技術は、本明細書中の他の個所に記載されており、そのような技術は、本発明の組成物のＭＨＣＩＩ結合ペプチドを、抗原および／またはアジュバントにカップリングまたは抗原および／またはアジュバントと混合するのに適合させうる。利用可能な共有複合方法に関する詳細な説明については、Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ  Ｇ  Ｔ  “Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ”，２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｄ  ｂｙ  Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．，２００８を参照のこと。共有結合に加え、カップリングは、予め形成された担体（例えば合成ナノ担体）への吸着により、または担体（例えば合成ナノ担体）の形成時のカプセル化により、遂行しうる。好ましい実施形態において、本発明の組成物を合成ナノ担体にカップリングし、その合成ナノ担体も抗原および／またはアジュバントにカップリングする。
【０２０３】
合成ナノ担体は、当該技術分野で公知の様々な方法で調製できる。例えば、合成ナノ担体は、ナノ沈殿、流体チャネルを用いるフローフォーカシング、スプレー乾燥、単一および二重エマルション溶媒蒸発、溶媒抽出、相分離、ミリング、マイクロエマルション法、マイクロ加工、ナノ加工、犠牲層、単純および複合コアセルベーション、および当業者に周知の他の方法によって形成しうる。代替または追加として、単分散半導体、導電性、磁性、有機、および他のナノ材料のための水性および有機溶媒合成については、記載がなされている（Ｐｅｌｌｅｇｒｉｎｏ  ｅｔ  ａｌ．，２００５，Ｓｍａｌｌ，１：４８；Ｍｕｒｒａｙ  ｅｔ  ａｌ．，２０００，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｍａｔ．Ｓｃｉ．，３０：５４５；および  Ｔｒｉｎｄａｄｅ  ｅｔ  ａｌ．，２００１，Ｃｈｅｍ．Ｍａｔ．，１３：３８４３）。付加的な方法は、文献に記載がなされている（例えば、Ｄｏｕｂｒｏｗ，Ｅｄ．，“Ｍｉｃｒｏｃａｐｓｕｌｅｓ  ａｎｄ  Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ  ｉｎ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ  ａｎｄ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，”  ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ  Ｒａｔｏｎ，１９９２；Ｍａｔｈｉｏｗｉｔｚ  ｅｔ  ａｌ．，１９８７，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ，５：１３；Ｍａｔｈｉｏｗｉｔｚ  ｅｔ  ａｌ．，１９８７，Ｒｅａｃｔｉｖｅ  Ｐｏｌｙｍｅｒｓ，６：２７５；および  Ｍａｔｈｉｏｗｉｔｚ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８，Ｊ．Ａｐｐｌ．Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉ．，３５：７５５、更に米国特許第５５７８３２５号明細書および米国特許第６００７８４５号明細書；Ｐ．Ｐａｏｌｉｃｅｌｌｉ  ｅｔ  ａｌ．“Ｓｕｒｆａｃｅ−ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ＰＬＧＡ−ｂａｓｅｄ  Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ  ｔｈａｔ  ｃａｎ  Ｅｆｆｉｃｉｅｎｔｌｙ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅ  ａｎｄ  Ｄｅｌｉｖｅｒ  Ｖｉｒｕｓ−ｌｉｋｅ  Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ”．Ｎａｎｏｍｅｄｉｃｉｎｅ．５（６）：８４３−８５３（２０１０）を参照）。
【０２０４】
様々な材料が、限定はされないが、Ｃ．Ａｓｔｅｔｅ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ＰＬＧＡ  ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ”  Ｊ．Ｂｉｏｍａｔｅｒ．Ｓｃｉ．Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｅｄｎ，Ｖｏｌ．１７，Ｎｏ．３，ｐｐ．２４７−２８９（２００６）；Ｋ．Ａｖｇｏｕｓｔａｋｉｓ  “Ｐｅｇｙｌａｔｅｄ  Ｐｏｌｙ（Ｌａｃｔｉｄｅ）ａｎｄ  Ｐｏｌｙ（Ｌａｃｔｉｄｅ−Ｃｏ−Ｇｌｙｃｏｌｉｄｅ）Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ：Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ，Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  ａｎｄ  Ｐｏｓｓｉｂｌｅ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ”  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  １：３２１−３３３（２００４）；Ｃ．Ｒｅｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｎａｎｏｅｎｃａｐｓｕｌａｔｉｏｎ  Ｉ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｄｒｕｇ−ｌｏａｄｅｄ  ｐｏｌｙｍｅｒｉｃ  ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ”  Ｎａｎｏｍｅｄｉｃｉｎｅ  ２：８−２１（２００６）；Ｐ．Ｐａｏｌｉｃｅｌｌｉ  ｅｔ  ａｌ．“Ｓｕｒｆａｃｅ−ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ＰＬＧＡ−ｂａｓｅｄ  Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ  ｔｈａｔ  ｃａｎ  Ｅｆｆｉｃｉｅｎｔｌｙ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅ  ａｎｄ  Ｄｅｌｉｖｅｒ  Ｖｉｒｕｓ−ｌｉｋｅ  Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ”．Ｎａｎｏｍｅｄｉｃｉｎｅ．５（６）：８４３−８５３（２０１０）を含む種々の方法を用い、望ましくは合成ナノ担体へのカプセル化を通じてカップリングしうる。材料、例えばオリゴヌクレオチドを合成ナノ担体にカプセル化するのに適した他の方法、例えば限定はされないが、米国特許第６，６３２，６７１号明細書（Ｕｎｇｅｒに付与）（２００３年１０月１４日）中に開示される方法を用いてもよい。
【０２０５】
特定の実施形態では、合成ナノ担体は、ナノ沈殿プロセスまたはスプレー乾燥によって調製される。合成ナノ担体の調製に使用される条件を変更することにより、所望されるサイズまたは特性（例えば、疎水性、親水性、外的形態、「粘性」、形状など）の粒子が生成されうる。合成ナノ担体を調製する方法および使用される条件（例えば、溶媒、温度、濃度、気流速度など）は、合成ナノ担体にカップリングされるべき材料および／またはポリマーマトリックスの組成物に依存する場合がある。
【０２０６】
上記の方法のいずれかによって調製される粒子が所望される範囲外のサイズ範囲を有する場合、粒子を、例えばふるいを使用してサイジングしてもよい。
【０２０７】
本発明の組成物が任意の好適な方法で作製しうることと、本発明が本明細書中に記載の方法を用いて生成できる組成物だけに限定されるものでないことを、理解すべきである。適切な方法を選択する際には、関連のある特定の部分の特性に配慮すべき場合がある。
【０２０８】
一部の実施形態において、本発明の剤形は無菌条件下で作製されるか、最終滅菌されている。これにより、結果として得られる剤形が無菌性および非感染性になり、非滅菌の剤形と比べて安全性が高まることを保証しうる。これは、特に、剤形を受ける対象が免疫不全を有し感染症を患いかつ／または感染症にかかりやすい場合に、貴重な安全対策となる。一部の実施形態において本発明の剤形は凍結乾燥させて、長期間活性を低下させることのない調合方法に応じて、懸濁液中に保存するかまたは凍結乾燥粉末として保存しうる。
【実施例】
【０２０９】
実施例
本発明は、本発明の特定の態様および実施形態の、限定としてではなくあくまで例示目的で、含められる以下の実施例を参照することにより、より容易に理解されるであろう。
【０２１０】
当業者は、直前に記載の実施形態の様々な適応および修飾が、本発明の範囲および精神から逸脱することなく設けられうることを理解するであろう。当該技術分野で既知の他の好適な技術および方法は、本明細書中に記載の本発明の説明を踏まえた、当業者による極めて多数の特定のモダリティにおいて適用することができる。
【０２１１】
したがって、本発明が、本明細書中に詳述される場合と異なるように実施することができることが理解されるべきである。上記は、例示的であっても、限定的でないことが意図されている。多数の他の実施形態が、当業者にとっては、上記をレビューする際に理解されるであろう。したがって、本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲を踏まえ、またかかる特許請求の範囲において権利を与えられた相当物の全範囲と併せて、判断される必要がある。
【０２１２】
実施例１：ユニバーサル記憶ペプチドの生成
キメラペプチドを生成するため、クラスＩＩエピトープの予測を、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ（ＩＥＤＢ）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｍｕｎｅｅｐｉｔｏｐｅ．ｏｒｇ／）Ｔ細胞エピトープ予測ツールを使用して行った。各ペプチドにおいては、予測ツールは、３つの方法（ＡＲＢ、ＳＭＭ＿ａｌｉｇｎおよびＳｔｕｒｎｉｏｌｏ）の各々に対し、パーセンタイルランクを生成する。ランキングは、ペプチドのスコアをＳＷＩＳＳＰＲＯＴデータベースから選択される５百万のランダムな１５ｍｅｒのスコアに対して比較することによって生成される。次いで、３つの方法に対するパーセンタイルランクの中央値を用い、コンセンサス法におけるランクを生成する。コンセンサス法を用いて評価されるべきペプチドは、被検対象が繰り返し暴露されるかまたはヒトへの感染能を有し、かつ感染開始後にその感染性生物に特異的なヒトＣＤ４＋記憶細胞を生成する能力がある感染性生物を含む、様々な供給源から誘導されるかまたは得られる配列を用いて生成してもよい。この種の感染性生物の例は本明細書中の他の個所に記載されている。
【０２１３】
特定の実施形態では、予測ＨＬＡ−ＤＲおよびＨＬＡ−ＤＰエピトープを同定するため、個別のタンパク質およびペプチドエピトープを、破傷風毒素、ジフテリア毒素またはアデノウイルスから選択し、分析した。全タンパク質分析においては、ＨＬＡ−ＤＲ予測エピトープを、コンセンサスランキング（予測される高親和性バインダー）およびＨＬＡ−ＤＲ対立遺伝子全体にわたる広範囲性に基づいて選択した。さらに、ＨＬＡ−ＤＰ０４０１およびＤＰ０４０２に対する予測される高親和性バインダーであるエピトープを選択した。ＤＰに対するこれら２つの対立遺伝子を、北アメリカにおける高パーセントの集団（約７５％）内で見出されることが理由で選択した。特定の実施形態では、個別のエピトープから得られた結果に基づき、場合により、予測される最も広い範囲および高親和性結合をもたらすことになるキメラペプチドを生成した。図１および２を参照のこと。図１に示されるように、ＡもしくはＢ単独を有するが双方を有しない組成物に対してより広範な予測範囲およびより高い親和性結合を有するＡ−ｘ−Ｂ型を有する組成物が生成されうる。
【０２１４】
場合により、カテプシン切断部位を、ペプチドの接合部に挿入した。使用のため、キメラペプチドを合成し（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔ）、水に再懸濁した。
【０２１５】
上記の特定の実施形態を使用し、ＨＬＡ−ＤＲおよびＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドを含む最適化された組成物を生成したが、同じ技術を用い、ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドを含む最適化された組成物を生成してもよい。
【０２１６】
実施例２：コアアミノ酸配列評価
ＨＬＡ−ＤＰおよびＨＬＡ−ＤＲに特異的なエピトープの双方は、切断分析により、コア結合エピトープについて評価している（１，２）。特異的ＨＬＡ−クラスＩＩタンパク質に対して選択的なコアアミノ酸配列が、いくつかのエピトープにおいて共通に見出されている。この例として、ＨＬＡ−ＤＰ４に対するペプチド結合特異性のスーパータイプを構成することが同定されている共通のコア結合構造が挙げられる（３）。これらのコアアミノ酸が高親和性結合を可能にする構造配置を維持する可能性は高い。結果として、クラスＩＩに対する結合能を阻害することなく、非コア領域のアミノ酸を類似の化学特性と置換することが可能である（４）。これは、置換分析、次いでエピトープ結合予測プログラムを用いて実験的に示されうる。分析を行うため、個別のアミノ酸置換を導入し、クラスＩＩに対する予測される親和性結合を、ＩＥＤＢ  Ｔ細胞結合予測ツールを用いて判定した（図３を参照）。
【０２１７】
この場合、２つの例を示し、ここでパートＡでは、アデノウイルスエピトープにおける最大７０％の置換が、ＤＰ４への結合に対する親和性を破壊することはなかった。パートＢでは、破傷風トキソイドエピトープにおける最大７０％の置換が、そのＨＬＡＤＲ０１０１もしくはＨＬＡＤＲ０４０４（ＤＲ対立遺伝子を代表する）に対する予測される結合を阻害しないことを示した。したがって、アミノ酸配列の修飾を通じた広範なＨＬＡ範囲を有する高親和性キメラペプチドの生成により、ペプチドのＭＨＣＩＩに対する結合能は破壊されなかった。さらに、改善されたペプチドの予測される親和性が、本実施例において示されるように、アミノ酸の置換によって得ることができる。
【０２１８】
上記の特定の実施形態を用い、ＨＬＡ−ＤＲもしくはＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドを含む最適化された組成物を例示したが、同じ技術を使用し、ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドを含む最適化された組成物を生成することが可能である。
【０２１９】
実施例３：ペプチドの評価
キメラエピトープペプチドを含む本発明の組成物を、（１）リコール応答の効力；（２）無作為集団の試料集団（Ｎ＝２０）に対するリコール応答の頻度；および（３）個体（Ｎ＝２０）内での抗原特異的記憶Ｔ細胞の頻度について評価した。
【０２２０】
単一のエピトープおよびキメラエピトープの効力を、ヒトＰＢＭＣをペプチドでインビトロで２４時間刺激し、次いで細胞をフローサイトメトリーによって分析することによって評価した。活性化ＣＤ４中央記憶Ｔ細胞は、表現型：ＣＤ４＋ＣＤ４５ＲＡｌｏｗ  ＣＤ６２Ｌ＋ＩＦＮ−γ＋を有する。選択されたエピトープに特異的なリコール応答の集団内での頻度を評価するため、２０の末梢血ドナーを、サイトカイン発現の誘発について評価した。
【０２２１】
要するに、全血は、Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｂｌｏｏｄ  Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ）から得た。血液を、リン酸塩緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）中で１：１に希釈し、次いで３５ｍＬを、５０ｍＬの管内、１２ｍＬのＦｉｃｏｌｌ−ｐａｑｕｅ  ｐｒｅｍｉｕｍ（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）上に重層した。管を１４００ＲＰＭで３０分間回転し、遷移期ＰＢＭＣを回収し、１０％ウシ胎仔血清（ＦＣＳ）を有するＰＢＳで希釈し、１２００ｒｐｍで１０分間回転した。細胞を、細胞凍結媒体（ｃｅｌｌ  ｆｒｅｅｚｉｎｇ  ｍｅｄｉａ）（Ｓｉｇｍａ製）に再懸濁し、直ちに−８０℃で一晩凍結させた。長期間貯蔵する間、細胞を液体窒素に移した。細胞を、必要に応じて解凍し（３７℃の水槽）、１０％ＦＣＳを有するＰＢＳに再懸濁し、沈降させ、５％熱不活化ヒト血清（Ｓｉｇｍａ）ｌ−グルタミン、ペニシリンおよびストレプトマイシン）を補充した培地（ＲＰＭＩ[ｃｅｌｌｇｒｏ]）中、５×１０６個の細胞／ｍＬに再懸濁した。
【０２２２】
記憶Ｔ細胞リコール応答アッセイにおいては、細胞を、（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔから入手した）本発明に記載の４μＭのペプチドを有する２４ウェルプレート内で、３７℃（５％ＣＯ２）で２時間培養した。次いで、培地の１ｍＬあたり１μＬのブレフェルジンＡ（Ｇｏｌｇｉｐｌｕｇ，ＢＤ）を添加し、細胞を３７℃のインキュベーターに４〜６時間戻した。次いで、細胞をより低温（２７℃）のインキュベーター（５％ＣＯ２）に一晩移し、次いでフローサイトメトリー分析のために処理した。活性化記憶Ｔ細胞の検出を、細胞とＣＤ４−ＦＩＴＣ、ＣＤ４５ＲＡ−ＰＥ、ＣＤ６２Ｌ−Ｃｙ７ＰＥ（ＢＤ）とのインキュベーションと、その後の膜浸透化および固定（ＢＤ）によって行った。インターフェロン−γの細胞内発現を、インターフェロン−γ−ＡＰＣモノクローナル（ＢｉｏＬｅｇｅｎｄ）を使用して検出した。次いで、２００，０００〜５００，０００個の細胞を、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｒｅフローサイトメーターおよびＣｅｌｌｑｕｅｓｔソフトウェアを使用して分析した。細胞は、ＣＤ４＋、ＣＤ４５ＲＡｍｅｄｉｕｍ、ＣＤ６２ＬｈｉｇｈおよびＩＦＮ−γ陽性である場合、陽性とスコアリングした。
【０２２３】
キメラペプチドによる活性化を示すフローサイトメトリーデータの代表例を図４に示し、すべてのデータの概要を図５に示す。
【０２２４】
データは次のことを示す。（１）本発明に従うキメラペプチドは、個別のペプチド単独の場合より多数の中央記憶Ｔ細胞を活性化し、またキメラペプチドＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴｔ（カテプシン切断部位を有する）は、最大の応答をもたらした。（２）本発明のキメラペプチドは、個別のペプチドの場合より多くの人々からリコール応答を得て、ＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴｔは２０／２０のドナーにおいて陽性である（図６）。（３）カテプシン切断部位を有するキメラペプチドＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴｔは、その個別の成分（ＴＴ８３０およびＤＴ）単独よりも高い活性を示し、また切断部位を有しない以外は同一のペプチド（ＴＴ８３０ＤＴ）より優れており、これは、カテプシン切断部位の本発明のキメラペプチドへの付加が促進されたリコール応答を提供しうることを示唆している。（４）データから、図１に示されるＴ細胞エピトープ予測分析が確認される。分析によると、ＴＴ８３０およびＤＴエピトープ（ＴＴ８３０ＤＴｔ）の双方からなるキメラペプチドが、広範囲のＨＬＡ−ＤＲ対立遺伝子にわたって最高の結合親和性を提供することになり、またカテプシン切断部位を含めることにより（ＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴｔ）、応答が促進されることが予測された。ＴＴ８３０またはＴＴ９５０のＤＰに特異的なエピトープＡｄＶへの付加により、陽性応答（ｒｅｓｐｏｎｄｅｒｓ）の数が、ＡｄＶエピトープ単独の場合に対して改善されなかった。ＡｄＶＴＴ８３０の高親和性および広範囲性は、ＡｄＶおよびＴＴ８３０の接合部でのネオエピトープ（ｎｅｏｅｐｉｔｏｐｅ）の生成に起因するもであった。高親和性の予測がもたらされうる一方、ネオエピトープは、免疫された個体においてメモリリコール応答を誘発しないことになる。エピトープ間にカテプシン切断部位を含めることにより、ネオエピトープが除外される。ある場合には、カテプシン切断部位の挿入により、おそらくは、エピトープをクラスＩＩ結合に適さないようにする構造上の改変に起因し、ＡｄＶエピトープ（ＡｄＶｐＴＴ８３０）の活性が除かれた。
【０２２５】
実施例４：ペプチド活性化記憶Ｔ細胞の試験
初期の中央記憶細胞は、特定のペプチドで再活性化される場合、複数のサイトカイン（ＩＬ−２、ＴＮＦ−α、ＩＦＮ−γ）を発現する一方、免疫委任（ｃｏｍｍｉｔｔｅｄ）エフェクター記憶Ｔ細胞は、ＴＨ２免疫委任エフェクター記憶に対してＩＬ−４を、またＴＨ１免疫委任エフェクター記憶に対してＩＦＮ−γを選択的に発現すると考えられる。ペプチド活性化記憶Ｔ細胞の状態を、樹状細胞／ＣＤ４細胞共培養物の多色細胞内サイトカイン分析を用いて試験した。
【０２２６】
ヒト末梢血単球を、樹状細胞への分化を誘導するため、陰性選択の磁気ビーズ（Ｄｙｎａｌ）を用いて単離し、ＧＭ−ＣＳＦおよびＩＬ−４の存在下で１週間培養した。同種ＣＤ４  Ｔ細胞を、磁気ビーズ分離（Ｄｙｎａｌ）を用いて単離し、ペプチドの存在または不在下、ＤＣの存在下で共培養した。そのポイントからの刺激および分析用のプロトコルは、実施例２における上記のＰＢＭＣにおける場合と同一である。
【０２２７】
ペプチドＴＴ８３０ＤＴ（配列番号７）およびＴＴ８３０ｐＤＴｔ（ＴＴ８３０ｐｍｇｌｐＤＴＴｒｕｎｃまたは配列番号１３）による刺激の結果、ＴＮＦ−αおよびＩＦＮ−γの発現が増大したが、ＩＬ−４では増大しなかった（図７、８）。多色フローサイトメトリーによると、ＴＴ８３０ＤＴｔおよびＴＴ８３０ｐＤＴｔの双方で処理されたＰＢＭＣが、ペプチド誘発性のＴＮＦ−αおよびＩＦＮ−γの同時発現を有するが、ＴＮＦ−αおよびＩＬ−４の同時発現を有しないことが示されたが（図９）、これは初期の中央記憶細胞が活性化されることを示唆している。
【０２２８】
ＴＴおよびＤＴに由来するＨＬＡ−ＤＲエピトープとともに、ＤＰ４に特異的なアデノウイルスエピトープからの配列を有する一連のキメラペプチドを、エピトープ間のカテプシンリンカーの存在下および不在化で作成した（図１０）。上記のように、細胞を、４μＭの本発明に従うペプチド（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔから入手）を有する２４ウェルプレート内で、３７℃および５％ＣＯ２で２時間培養した。次いで、培地の１ｍＬあたり１μＬのブレフェルジンＡ（Ｇｏｌｇｉｐｌｕｇ，ＢＤ）を添加し、細胞を３７℃のインキュベーターに４〜６時間戻した。次いで、細胞をより低温（２７℃）のインキュベーター（５％ＣＯ２）に一晩移し、次いでフローサイトメトリー分析のために処理した。活性化記憶Ｔ細胞の検出を、細胞とＣＤ４−ＦＩＴＣ、ＣＤ４５ＲＡ−ＰＥ、ＣＤ６２Ｌ−Ｃｙ７ＰＥ（ＢＤ）とのインキュベーションと、その後の膜浸透化および固定（ＢＤ）によって行った。インターフェロン−γの細胞内発現を、インターフェロン−γ−ＡＰＣモノクローナル（ＢｉｏＬｅｇｅｎｄ）を使用して検出した。次いで、２００，０００〜５００，０００個の細胞を、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｒｅフローサイトメーターおよびＣｅｌｌｑｕｅｓｔソフトウェアを使用して分析した。細胞は、ＣＤ４＋、ＣＤ４５ＲＡｍｅｄｉｕｍ、ＣＤ６２ＬｈｉｇｈおよびＩＦＮ−γ陽性である場合、陽性とスコアリングした。記憶Ｔ細胞のリコール応答についての４つのドナーの分析によると、個別のペプチド、およびカテプシン切断部位を有しないヘテロ二量体ペプチドが、「ｋｖｓｖｒ」（配列番号１１８）カテプシン切断部位を有するヘテロ三量体ペプチド（ＡｄＶｋＤＴｔ、ＡｄＶｋＴＴ９５０）に対するドナー応答と比べてより弱い応答をもたらすことが示された。さらに、ＡｄＶ、ＤＴ、およびＴＴエピトープを有するヘテロ三量体ペプチド（ＴＴ８３０ＤＴＡｄＶ）がまた、４つ全部のドナーにおいてリコール応答を示した。
【０２２９】
実施例５：物理特性を調節するためのＭＨＣＩＩ結合ペプチドの修飾
図１１に示されるようにペプチド特性を変更するため、一連の修飾ＴＴ８３０ｐＤＴｔ（配列番号１３）配列を生成した。これらのタイプの修飾の一般的範囲および性質については、本明細書中の別の個所で説明されている。ペプチドの修飾の初期の目的は、１）水溶解度を改善すること（より低いＧＲＡＶＹ−ハイドロパシシティのグランドアベレージ（Ｇｒａｎｄ  Ａｖｅｒａｇｅ  ｏｆ  ｈｙｄｒｏｐａｔｈｉｃｉｔｙ）、２）Ｎおよび／またはＣ末端アミノ酸の修飾を通じてｐＩを変化させること、３）内部結合を修飾すること（Ｃａｔ  Ｓ切断ＰＭＧＬＰ（配列番号１１６））、および外部および内部結合の双方を修飾すること、４）Ｃａｔｈｅｓｐｉｎ  Ｂ切断に変更するかまたは他のペプチド分解プロセスを創出することにより、Ｃａｔ  Ｓ結合部位の修飾を通じたエンドソーム区画内でのペプチドの処理の重要性を理解すること、であった。
【０２３０】
さらに、ペプチドの疎水性を改変し、かつｐＩをほぼ中性のｐＨまで低下させるため、ＡｄＶｋＤＴ配列のバリエーションを生成した。Ｎ末端への配列付加が、部分的に、ＡｄＶ由来エピトープのＮ末端に先行する天然アミノ酸配列に対する類似性によって誘導された。
【表２】
2013538211.tif 000009
【０２３１】
ＡｄＶｋＤＴの変異体（配列番号７１〜７３）における結果を示す（図１２）。３つの異なるドナーからのすべての実験において、ＡｄＶｋＤＴ変異体（配列番号７１〜７３）は、非刺激（ＮＳ）対照と比べて、強固なリコール応答を誘発した。
【０２３２】
実施例６：インフルエンザに特異的な記憶ペプチド
特定の単一の病原体で最適化された本発明に従う組成物の例として、ｂｌａｓｔ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｂｌａｓｔ．ｃｇｉからのＮａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ’ｓ（ＮＩＨ）Ｂｌａｓｔプログラムおよびヌクレオチドデータベースと、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ（ＩＥＤＢ）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｉｍｍｕｎｅｅｐｉｔｏｐｅ．ｏｒｇ／）Ｔ細胞エピトープの予測ツールを使用したクラスＩＩエピトープの予測とを併用し、インフルエンザＡ型、インフルエンザＡおよびＢ型、またはインフルエンザＡ、Ｂ、およびＣ型（図１３および図１４）内で高度に保存されたｐａｎ  ＨＬＡ−ＤＲエピトープを同定した。個別のエピトープおよびキメラエピトープにおけるＴ細胞エピトープ予測結果を図１５〜１７に示し、予測された高親和性を有するキメラエピトープを、記憶Ｔ細胞応答を生成する能力について試験した。要するに、ＰＢＭＣを、４μＭのペプチドを有する２４ウェルプレート内、３７℃（５％ＣＯ２）で２時間培養した。次いで、ブレフェルジンＡを添加し、細胞を３７℃のインキュベーターに４〜６時間戻した。次いで、細胞をより低温（２７℃）のインキュベーター（５％ＣＯ２）に一晩移し、次いでフローサイトメトリー分析のために処理した。活性化記憶Ｔ細胞の検出を、細胞とＣＤ４−ＦＩＴＣ、ＣＤ４５ＲＡ−ＰＥ、ＣＤ６２Ｌ−Ｃｙ７ＰＥ（ＢＤ）とのインキュベーションによって行った。次いで、２００，０００〜５００，０００個の細胞を、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｒｅフローサイトメーターおよびＣｅｌｌｑｕｅｓｔソフトウェアを使用して分析した。細胞は、ＣＤ４＋、ＣＤ４５ＲＡｍｅｄｉｕｍ、ＣＤ６２ＬｈｉｇｈおよびＩＦＮ−γ陽性である場合、陽性とスコアリングした。
【表３】
2013538211.tif 000010
【表４】
2013538211.tif 000011
【０２３３】
キメラインフルエンザペプチド配列を図１３に示す。５つのＰＢＭＣドナーからのＴ細胞記憶リコール応答を図１４に示す。記憶Ｔ細胞リコール応答は、キメラエピトープＡＡＷｋＡＡＴ、ＡＡＴｋＡＢＷ２、３１２０ｔｋＡＡＴ、およびＡＢＷ２ｋＡＡＴについて陽性であったが、非キメラＨ５に制限されたｐａｎ  ＨＬＡ−ＤＲエピトープＡＢＷ９においてはそうではなかった。これらのデータは、インフルエンザに特異的なペプチドを有する、４つの本発明のキメラの保存されたエピトープが、メモリリコール応答の誘発において活性があることを示す。
【０２３４】
実施例７：合成ナノ担体調合物（予想）
レシキモド（別名Ｒ８４８）は、米国特許第５，３８９，６４０号明細書（Ｇｅｒｓｔｅｒらに付与）の実施例９９中に提供される合成に従って合成する。ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン複合体は、従来の複合方法を用いて調製する。ＰＬＡは、Ｄ，Ｌ−ラクチド（ＭＷ＝約１５ＫＤ〜１８ＫＤ）を用いる開環重合によって調製する。ＰＬＡ構造は、ＮＭＲによって確認する。ポリビニルアルコール（Ｍｗ＝１１ＫＤ〜３１ＫＤ、８５％が加水分解された）は、ＶＷＲ  ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃから購入する。これらを使用し、以下の溶液を調製する。
１．塩化メチレン中レシキモド（７．５ｍｇ／ｍＬ）
２．塩化メチレン中ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン（１００ｍｇ／ｍＬ）
３．塩化メチレン中ＰＬＡ（１００ｍｇ／ｍＬ）
４．水中ペプチド（１０ｍｇ／ｍＬ）、ペプチドは、配列：
ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＰＭＧＬＰＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１３）を有する
５．水中ポリビニルアルコール（５０ｍｇ／ｍＬ）
【０２３５】
溶液＃１（０．４ｍＬ）、溶液＃２（０．４ｍＬ）、溶液＃３（０．４ｍＬ）および溶液＃４（０．１ｍＬ）を小バイアル内で結合させ、混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、５０％の振幅で４０秒間超音波処理する。このエマルションに溶液＃５（２．０ｍＬ）を添加し、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、３５％の振幅で４０秒間の超音波処理により、第２のエマルションを形成する。これを、水（３０ｍＬ）を有するビーカーに添加し、この混合物を室温で２時間撹拌し、ナノ粒子を形成する。ナノ担体分散体の一部（１．０ｍＬ）を水（１４ｍＬ）で希釈し、これを、１００ＫＤの膜カットオフを有するＡｍｉｃｏｎ  Ｕｌｔｒａ遠心濾過装置での遠心分離によって濃縮する。容量が約２５０μＬである場合、水（１５ｍＬ）を添加し、粒子を、Ａｍｉｃｏｎ装置を使用して再び約２５０μＬに濃縮する。リン酸塩緩衝生理食塩水（ｐＨ＝７．５、１５ｍＬ）での２回目の洗浄を同様にして行い、最終濃縮物を全容量が１．０ｍＬになるまでリン酸塩緩衝生理食塩水で希釈する。これにより、濃度が約２．７ｍｇ／ｍＬの最終ナノ担体分散体が得られると予想される。
【０２３６】
実施例８：合成ナノ担体調合物（予想）
レシキモド（別名Ｒ８４８）は、米国特許第５，３８９，６４０号明細書（Ｇｅｒｓｔｅｒらに付与）の実施例９９中に提供される合成に従って合成する。ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン複合体を調製する。ＰＬＡは、Ｄ，Ｌ−ラクチド（ＭＷ＝約１５ＫＤ〜１８ＫＤ）を用いる開環重合によって調製する。ＰＬＡ構造は、ＮＭＲによって確認する。ポリビニルアルコール（Ｍｗ＝１１ＫＤ〜３１ＫＤ、８５％が加水分解された）は、ＶＷＲ  ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃから購入する。これらを使用し、以下の溶液を調製する。
１．塩化メチレン中ＰＬＡ−Ｒ８４８複合体（１００ｍｇ／ｍＬ）
２．塩化メチレン中ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン（１００ｍｇ／ｍＬ）
３．塩化メチレン中ＰＬＡ（１００ｍｇ／ｍＬ）
４．水中ペプチド（１２ｍｇ／ｍＬ）、ペプチドは、配列：
ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ（配列番号５）を有する
５．水中ポリビニルアルコール（５０ｍｇ／ｍＬ）
【０２３７】
溶液＃１（０．２５〜０．７５ｍＬ）、溶液＃２（０．２５ｍＬ）、溶液＃３（０．２５〜０．５ｍＬ）および溶液＃４（０．１ｍＬ）を、小型バイアル内で混合し、混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、５０％振幅で４０秒間超音波処理する。このエマルジョンに溶液＃５（２．０ｍＬ）を添加し、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、３５％振幅、４０秒間の超音波処理により、第２のエマルジョンを形成する。これを、リン酸塩緩衝溶液（３０ｍＬ）を含有するビーカーに添加し、この混合物を室温で２時間撹拌し、ナノ粒子を形成する。粒子を洗浄するため、ナノ粒子分散体（ｄｉｓｐｅｒｓｉｏｎ）の一部（７．０ｍＬ）を、遠心管に移し、５，３００ｇで１時間回転し、上清を除去し、ペレットを７．０ｍＬのリン酸塩緩衝生理食塩水に再懸濁する。予想される最終のナノ粒子分散体が約１０ｍｇ／ｍＬであるように、遠心分離手順を繰り返し、ペレットを２．２ｍＬのリン酸塩緩衝生理食塩水に再懸濁する。
【０２３８】
実施例９：本発明の組成物と担体タンパク質との複合（予想）
ペプチド（配列番号５）を、担体タンパク質（配列番号１１９）ＣＲＭ１９７への複合のため、Ｃ末端に、追加的なＧｌｙ−ＣｙｓでＣｙｓのＣ末端のチオール基を介して修飾する。ＣＲＭ１９７は、その一次配列内に１つのアミノ酸変化を有するジフテリア毒素の非毒性突然変異体である。分子のアミノ酸位置５２に存在するグリシンは、単一の核酸コドン変化を介してグルタミン酸と置換される。この変化に起因し、タンパク質は、ＡＤＰ−リボシルトランスフェラーゼ活性が欠損し、非毒性になる。それは、５８，４０８Ｄａの分子量を有する。
【０２３９】
ＣＲＭ１９７の遊離アミノ基は、過剰なブロモ酢酸Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（Ｓｉｇｍａ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏ．（Ｓｔ．Ｌｏｕｉ、Ｍｏ．））との反応によってブロモアセチル化する。ＣＲＭ１９７（１５ｍｇ）は、１．０Ｍ  ＮａＨＣＯ３（ｐＨ８．４）中に溶解し、氷で冷却する。ブロモ酢酸Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステルの溶液（２００μＬのジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）中、１５ｍｇ）をＣＲＭ１９７溶液に徐々に添加し、溶液を、暗所、室温で、緩やかに２時間混合する。次いで、得られたブロモアセチル化（活性化）タンパク質を、１０Ｋ  ＭＷＣＯ膜による透析を介する血液透析濾過（ｄｉａｆｉｌｔｒａｔｉｏｎ）によって精製する。ブロモアセチル化の度合いを、活性化ＣＲＭ１９７をシステインと反応させた後、アミノ酸分析および得られたカルボキシメチルシステイン（ＣＭＣ）の定量を行うことによって判定した。
【０２４０】
ブロモアセチル化ＣＲＭ１９７を、ｐＨ９．０で１Ｍ炭酸ナトリウム／重炭酸塩緩衝液中に溶解し、アルゴン下、２〜８℃で維持した。１Ｍ炭酸ナトリウム／重炭酸塩緩衝液（ｐＨ９．０）中のペプチド（ＴＬＬＹＶＬＦＥＶＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬＥＴ−Ｇ−Ｃ（変更された配列番号１１９））（１０ｍｇ）の溶液をブロモアセチル化ＣＲＭ１９７溶液に添加し、混合物を、２〜８℃で１５〜２０時間撹拌する。次いで、残存するブロモアセチル基を、２０倍モル過剰のＮ−アセチルシステアミンで、２〜８℃で４〜８時間キャッピングする。次いで、得られたペプチド−ＣＲＭ１９７複合体を、０．０１Ｍリン酸ナトリウム緩衝液／０．９％ＮａＣｌ（ｐＨ７．０）に対する透析濾過による１０Ｋ  ＭＷＣＯ膜上での透析濾過により、室温で精製する。残余分のペプチド−ＣＲＭ１９７複合体を回収し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより、アミノ酸分析により、タンパク質含量について（ＬｏｗｒｙまたはＭｉｃｒｏ−ＢＣＡ比色分析アッセイ）、またマウスにおける免疫原性について分析する。
【０２４１】
実施例１０：本発明の組成物と抗原を含む従来のワクチンとの混合（予想）
ＰＬＡを、Ｄ，Ｌ−ラクチド（ＭＷ＝約１５ＫＤ〜１８ＫＤ）を用いる開環重合によって調製する。ＰＬＡ構造を、ＮＭＲによって確認する。ポリビニルアルコール（Ｍｗ＝１１ＫＤ〜３１ＫＤ、８７〜８９％が加水分解された）は、ＶＷＲ  ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃから購入する。これらを使用し、以下の溶液を調製する。
１．塩化メチレン中ＰＬＡ（１００ｍｇ／ｍＬ）
２．塩化メチレン中ＰＬＡ−ＰＥＧ（１００ｍｇ／ｍＬ）
３．水溶液中ペプチド（配列番号９１の配列を有するペプチド）（１０ｍｇ／ｍＬ）
４．水またはリン酸塩緩衝液中ポリビニルアルコール（５０ｍｇ／ｍＬ）
【０２４２】
溶液＃１（０．５〜１．０ｍＬ）、溶液＃２（０．２５〜０．５ｍＬ）、および溶液＃３（０．０５〜０．３ｍＬ）を、ガラス製プレッシャーチューブ内で混合し、混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、５０％振幅で４０秒間超音波処理する。このエマルジョンに溶液＃４（２．０〜３．０ｍＬ）を添加し、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、３０％振幅、４０〜６０秒間の超音波処理により、第２のエマルジョンを形成する。これを、リン酸塩緩衝溶液（３０ｍＬ）を含有するビーカーに添加し、この混合物を室温で２時間撹拌し、ナノ担体を形成する。粒子を洗浄するため、ナノ担体分散体の一部（２７．０〜３０．０ｍＬ）を、遠心管に移し、２１，０００ｇで４５分間回転し、上清を除去し、ペレットを３０．０ｍＬのリン酸塩緩衝生理食塩水に再懸濁する。遠心分離手順を繰り返し、ペレットを８．１−９．３ｍＬのリン酸塩緩衝生理食塩水に再懸濁する。
【０２４３】
一定分量４ｍＬの懸濁された合成ナノ担体を遠心分離し、合成ナノ担体を静置する。上清を廃棄し、０．５ｍＬの懸濁液Ｆｌｕａｒｉｘ（登録商標）三価インフルエンザウイルスワクチンを添加する。混合ワクチンを撹拌し、ナノ担体を再懸濁し、得られた懸濁液を、使用前に−２０℃で保存する。
【０２４４】
実施例１１：本発明の組成物と金ナノ担体とのカップリング（予想）
ステップ１：金ナノ担体（ＡｕＮＣ）の形成：５００ｍＬの１ｍＭ  ＨＡｕＣｌ４の水溶液を加熱し、コンデンサを備えた１Ｌの丸底フラスコ内で、激しく撹拌しながら１０分間還流する。次いで、５０ｍＬの４０ｍＭクエン酸三ナトリウムの溶液を、撹拌溶液に速やかに添加する。得られた深いワインレッド溶液を還流下で２５〜３０分間保持し、熱を回収し、溶液を室温まで冷却する。次いで、溶液を０．８μｍの膜フィルタを通して濾過し、ＡｕＮＣ溶液を得る。ＡｕＮＣを、可視分光学および伝導電子顕微鏡を使用して特徴づける。ＡｕＮＣは、直径が約２０ｎｍであり、クエン酸塩によってキャッピングされ、５２０ｎｍで吸収ピークを有する。
【０２４５】
ステップ２：ＡｕＮＣへの直接的ペプチド複合：実施例９のＣ末端ペプチド（Ｃ末端システインを有する配列番号５のペプチド）を、ＡｕＮＣに以下のようにしてカップリングする。ペプチド１４５μｌの溶液（１０ｍＭ（ｐＨ９．０）炭酸塩緩衝液中、１０μΜ）を、１ｍＬの２０ｎｍ直径のクエン酸塩でキャッピングされた金ナノ粒子（１．１６ｎＭ）に添加し、チオール対金のモル比２５００：１を得る。混合物を、アルゴン下、室温で１時間撹拌し、金ナノ粒子上でチオールとクエン酸塩との完全な交換を可能にする。次いで、ペプチド−ＡｕＮＣ複合体を、１２，０００ｇで３０分間の遠心分離によって精製する。さらなる分析およびバイオアッセイのため、上清をデカントし、ペプチド−ＡｕＮＣを含有するペレットを、ＷＦＩ水１ｍＬに再懸濁する。
【０２４６】
実施例１２：実施例５の修飾組成物を使用する合成ナノ担体
レシキモド（別名Ｒ８４８）は、米国特許第５，３８９，６４０号明細書（Ｇｅｒｓｔｅｒらに付与）の実施例９９中に提供される合成に従って合成し、アミドリンカーを使用し、ＰＬＧＡに複合し、ＰＬＧＡ−Ｒ８４８を形成した。ＰＬＧＡ（ＩＶ０．１０ｄＬ／ｇ）およびＰＬＡ（ＩＶ０．２１ｄＬ／ｇ）は、Ｌａｋｅｓｈｏｒｅ  Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓから購入した。ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン複合体は、従来の複合方法を用い調製した。ポリビニルアルコール（Ｍｗ＝１１ＫＤ〜３１ＫＤ、８７〜８９％が加水分解された）は、ＪＴ  Ｂａｋｅｒから購入した。これらを使用し、以下の溶液を調製した。
１．塩化メチレン中ＰＬＧＡ−Ｒ８４８（１００ｍｇ／ｍＬ）
２．塩化メチレン中ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン（１００ｍｇ／ｍＬ）
３．塩化メチレン中ＰＬＡ（１００ｍｇ／ｍＬ）
４．１０％ＤＭＳＯ、５０％乳酸ＵＳＰ、および４０％水からなる溶液中ペプチド（１０ｍｇ／ｍＬ）、ペプチドは、配列：ＥＥＳＴＬＬＹＶＬＦＥＶＫＶＳＶＲＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱＫ（配列番号７１）を有する
５．ｐＨ８のリン酸塩緩衝液中ポリビニルアルコール（５０ｍｇ／ｍＬ）
【０２４７】
小容器内で、溶液＃１（０．５ｍＬ）、溶液＃２（０．２５ｍＬ）および溶液＃３（０．２５ｍＬ）を混合し、溶液＃４（０．２５ｍＬ）を添加し、混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、５０％振幅で４０秒間超音波処理した。このエマルジョンに溶液＃５（２．０ｍＬ）を添加した。混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、３０％振幅で４０秒間超音波処理し、第２のエマルジョンを形成した。次いで、このエマルジョンを、７０ｍＭ（ｐＨ８）リン酸塩緩衝溶液（３０ｍＬ）を含有する５０ｍＬの撹拌ビーカーに添加し、次いで室温で２時間撹拌し、合成ナノ担体を形成した。
【０２４８】
合成ナノ担体を洗浄するため、合成ナノ担体分散体の一部（２７．５ｍＬ）を、５０ｍＬの遠心管に移し、４℃、９５００ｒｐｍ（１３，８００ｇ）で１時間回転し、上清を除去し、ペレットを２７．５ｍＬのＰＢＳ（リン酸塩緩衝生理食塩水）に再懸濁した。合成ナノ担体分散体の設定濃度が１０ｍｇ／ｍＬであるため、遠心分離に基づく洗浄手順を繰り返し、ペレットを８．５ｇのリン酸塩緩衝生理食塩水に再懸濁した。実濃度の重量測定を行い、その後、濃度をＰＢＳ中で５ｍｇ／ｍＬに調整した。
【０２４９】
合成ナノ担体調合物の免疫原性を、Ｃ５７ＢＬ６マウスにおける接種試験によって判定した。接種は、０日目のプライミングに続き、１４および２８日目の追加免疫（ｂｏｏｓｔ）といったスケジュールに従い、ナイーブＣ５７ＢＬ６マウス（５マウス／群）の後足蹠皮下に行った。各接種においては、全部で１００μｇのナノ担体を、後肢あたり５０μｇで注射した。２６、４０、５５、および６７日目、血清を採取した。血清についての抗ニコチン抗体力価を、ＥＣ５０値として測定した。同様に、対照群に、陽性対照として既知のマウスＭＨＣＩＩ結合ペプチド（オバルブミン３２３〜３３９アミド）を組み込むかまたはＭＨＣＩＩ結合ペプチドを全く有しない、同じ高分子製剤の合成ナノ担体を使用し、接種した。データを図１８に示す。
【０２５０】
実施例１３：本発明の組成物を使用する合成ナノ担体
ＰＬＧＡ（５０５０ＤＬＧ２．５Ａ、ＩＶ０．２５ｄＬ／ｇ）は、Ｌａｋｅｓｈｏｒｅ  Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓから購入した。ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン複合体を調製した。ポリビニルアルコール（Ｍｗ＝１１ＫＤ〜３１ＫＤ、８７〜８９％が加水分解された）は、ＪＴ  Ｂａｋｅｒから購入した。これらを使用し、以下の溶液を調製した。
１．塩化メチレン中ＰＬＧＡ（１００ｍｇ／ｍＬ）
２．塩化メチレン中ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン（１００ｍｇ／ｍＬ）
３．水中１０％ＤＭＳＯからなる溶媒中ペプチド（４ｍｇ／ｍＬ）、ペプチドは、配列：ＩＬＭＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＰＭＧＬＰＱＳＩＡＬＳＳＬＭＶＡＱ（配列番号１３）を有する
４．ｐＨ８のリン酸塩緩衝液中ポリビニルアルコール（５０ｍｇ／ｍＬ）
【０２５１】
小容器内で、溶液＃１（０．３７５ｍＬ）および溶液＃３（０．１２５ｍＬ）を混合し、０．５０ｍＬの塩化メチレンで希釈した後、溶液＃３（０．２５ｍＬ）を添加し、混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、５０％振幅で４０秒間超音波処理した。このエマルジョンに溶液＃４（３．０ｍＬ）を添加した。混合物を、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、３０％振幅で６０秒間超音波処理し、第２のエマルジョンを形成した。次いで、このエマルジョンを、７０ｍＭ（ｐＨ８）リン酸塩緩衝溶液（３０ｍＬ）を含有する５０ｍＬの撹拌ビーカーに添加し、次いで室温で２時間撹拌し、合成ナノ担体を形成した。
【０２５２】
粒子を洗浄するため、合成ナノ担体分散体の一部（２９ｍＬ）を、５０ｍＬの遠心管に移し、４℃、２１，０００ｒｃｆで４５分間回転し、上清を除去し、ペレットを２９ｍＬのＰＢＳ（リン酸塩緩衝生理食塩水）に再懸濁した。合成ナノ担体分散体の設定濃度が１０ｍｇ／ｍＬであるため、遠心分離に基づく洗浄手順を繰り返し、ペレットを４．４ｇのＰＢＳに再懸濁した。実濃度の重量測定を行い、その後、濃度をＰＢＳ中で５ｍｇ／ｍＬに調整した。
【０２５３】
合成ナノ担体調合物の免疫原性を、ＢＡＬＢ／ｃマウスにおける接種試験によって判定した。合成ナノ担体は、注射の直前に、マウス−活性ＣｐＧアジュバントＰＳ−１８２６の溶液と混合した。接種は、０日目のプライミングに続き、１４および２８日目の追加免疫といったスケジュールに従い、ナイーブＢＡＬＢ／ｃマウス（５マウス／群）の後足蹠皮下に行った。各接種においては、全部で１００μｇの合成ナノ担体および２０μｇのＰＳ−１８２６を、後肢間に等間隔に注射した。２６および４０日目、血清を採取した。血清についての抗ニコチン抗体力価を、ＥＣ５０値として測定した。同様に、対照群に、既知のマウスＭＨＣＩＩ結合ペプチド（オバルブミン３２３〜３３９アミド）を組み込んだ陽性対照の合成ナノ担体、およびＭＨＣＩＩ結合ペプチドが欠如した陰性対照のナノ担体を有する類似の高分子製剤の合成ナノ担体を使用し、接種した。結果を図１９に示す。
【０２５４】
実施例１４：本発明の組成物を使用した合成ナノ担体（予想）
ＨＢＴＵなどのカップリング剤、例えば、ＰＬＧＡ（Ｌａｋｅｓｈｏｒｅｓ社製ポリマー、ＭＷ約５０００、７５２５ＤＬＧ１Ａ、酸価０．７ｍｍｏｌ／ｇ、１０ｇ、７．０ｍｍｏｌ）の混合物の存在下、酸末端基含有のＰＬＧＡポリマーをＲ８４８と反応させてＰＬＧＡ−Ｒ８４８を調合し、アルゴン下、室温にて無水ＥｔＯＡｃ（１６０ｍＬ）中でＨＢＴＵ（５．３ｇ、１４ｍｍｏｌ）を５０分間撹拌する。化合物Ｒ８４８（レシキモド２．２ｇ、７ｍｍｏｌ）を添加した後、ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（５ｍＬ、２８ｍｍｏｌ）を添加する。混合物を室温にて６時間、続いて５０〜５５ｏＣで一晩（約１６時間）撹拌する。冷却後、混合物をＥｔＯＡｃ（２００ｍＬ）で希釈し、飽和ＮＨ４Ｃｌ溶液（２×４０ｍＬ）、水（４０ｍＬ）および生理食塩水（４０ｍＬ）で洗浄する。溶液をＮａ２ＳＯ４（２０ｇ）で乾燥させて、ゲル状残基に濃縮する。次いで、イソプロピルアルコール（ＩＰＡ）（３００ｍＬ）を加えると、溶液からポリマー複合体が沈殿する。その後、ポリマーをＩＰＡ（４×５０ｍＬ）で洗浄し、３５〜４０℃で３日間残留試薬を除去し、真空下で白色粉体として乾燥させる（予想収量：１０．２６ｇ、ＧＰＣにてＭＷ５２００、Ｒ８４８の装填量はＨＰＬＣにて１２％）。
【０２５５】
Ｓｎ（Ｏｃｔ）２などの触媒の存在下、ＨＯ−ＰＥＧ−アジドをｄｌ−ラクチドを用いた開環重合によってＰＬＡ−ＰＥＧ−Ｎ３ポリマーを調製し、ＤＣＣ（ＭＷ２０６、０．１１７ｇ、０．５７ｍｍｏｌ）およびＮＨＳ（ＭＷ１１５、０．０６６ｇ、０．５７ｍｍｏｌ）の存在下、乾燥したＤＣＭ（１０ｍＬ）中でＨＯ−ＰＥＧ−ＣＯ２Ｈ（ＭＷ３５００、１．３３ｇ、０．３８ｍｍｏｌ）を一晩ＮＨ２−ＰＥＧ３−Ｎ３（ＭＷ２１８．２、０．１ｇ、０．４５８ｍｍｏｌ）で処理する。濾過後に、不溶性副産物（ＤＣＣ−尿素）を除去し、溶液を濃縮してから、エーテルで希釈し、ポリマー、ＨＯ−ＰＥＧ−Ｎ３（１．１７ｇ）を沈殿させる。乾燥後、１００ｍＬのフラスコ中でＨＯ−ＰＥＧ−Ｎ３（ＭＷ３７００、１．１７ｇ、０．３２ｍｍｏｌ）をｄｌ−ラクチド（ＥｔＯＡｃからの再結晶物、ＭＷ１４４、６．８３ｇ、４７．４ｍｍｏｌ）およびＮａ２ＳＯ４（１０ｇ）と混合する。真空下で４５Ｃにて一晩で固体混合物を乾燥させ、乾燥したトルエン（３０ｍＬ）を添加する。結果として得られた懸濁液をアルゴン下で１１０℃まで加熱し、Ｓｎ（Ｏｃｔ）２（ＭＷ４０５、０．１ｍＬ、０．３２ｍｍｏｌ）を添加する。混合物を還流させながら１８時間加熱してから、室温まで冷却させる。混合物をＤＣＭ（５０ｍＬ）で希釈してフィルタ処理する。油状残渣に濃縮した後、ＭＴＢＥ（２００ｍＬ）を添加してポリマーを沈殿させ、１０％ＭｅＯＨ含有のＭＴＢＥ１００ｍＬ、およびＭＴＢＥ５０ｍＬで１回洗浄した。乾燥後、ＰＬＡ−ＰＥＧ−Ｎ３が白色の気泡として得られる（予想収量：７．２ｇ、Ｈ  ＮＭＲによる平均ＭＷ：２３，７００）。
【０２５６】
合成ナノ担体（ＮＣ）は、ＰＬＧＡ−Ｒ８４８、およびＰＬＡ−ＰＥＧ−Ｎ３（ポリペプチド抗原へのリンカー）から構成されている。ＡＡＷｋＡＡＴ（インフルエンザウイルスから誘導されかつ配列：ＣＳＱＲＳＫＦＬＬＭＤＡＬＫＬｋｖｓｖｒＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲ（配列番号９１）を有するポリペプチド）は、ＮＣ内にカプセル化されている。ＮＣ懸濁液（ＰＢＳ（ｐＨ７．４緩衝液）中９．５ｍｇ／ｍＬ、１．８５ｍＬ、ＰＬＡ−ＰＥＧ−Ｎ３を約４．４ｍｇ（ＭＷ：２５，０００；０．０００１８ｍｍｏｌ、１．０等量）含有）に、Ｃ末端アルキンリンカー（Ｃ末端グリシンプロパルギルアミド）含有のＨＡポリペプチド（Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  Ｃｏｒｐ．Ｍｅｒｉｄｅｎ  ＣＴ）（ＰＢＳ中０．２〜１ｍＭ）を添加して、穏やかに撹拌する。ＣｕＳＯ４溶液（Ｈ２Ｏ中１００ｍＭ、０．１ｍＬ）および銅（Ｉ）リガンド、Ｔｒｉｓ（３−ヒドロキシプロピルトリアゾリルメチル）アミン（ＴＨＰＴＡ）溶液（Ｈ２Ｏ中２００ｍＭ、０．１ｍＬ）を混合し、結果として得られた溶液をＮＣ懸濁液に添加する。塩酸アミノグアニジン塩の溶液（Ｈ２Ｏ中２００ｍＭ、０．２ｍＬ）を添加し、その後、アスコルビン酸ナトリウム（Ｈ２Ｏ中２００ｍＭ、０．２ｍＬ）を添加する。結果として得られた懸濁液を４℃にて暗所で１８時間撹拌してから、ＰＢＳ緩衝液（ｐＨ７．４）で５ｍＬに希釈し、遠心分離して上澄みを除去する。残留したＮＣペレットを２×５ｍＬのＰＢＳ緩衝液で洗浄する。その後、洗浄したＮＣ−Ｈポリペプチド複合体を２ｍＬのＰＢＳ緩衝液中で再懸濁し、以後の分析および生物学的試験まで冷凍保存する。
【０２５７】
実施例１５：呼吸系発疹ウイルス（ＲＳＶ）ユニバーサル記憶ペプチドの生成
キメラＲＳＶペプチドを生成するため、クラスＩＩエピトープの予測を、Ｉｍｍｕｎｅ  Ｅｐｉｔｏｐｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ（ＩＥＤＢ）（ｉｍｍｕｎｅｅｐｉｔｏｐｅ．ｏｒｇ／）を使用して行った。ＩＥＤＢデータベースは、２０１０年に複数のアルゴリズム、ならびに広範なＨＬＡＤＰ、ＨＬＡＤＱ、およびＨＬＡＤＲ対立遺伝子を含めて改訂された。計算処理上の変化および対立遺伝子の頻度に関する情報は公開されている（Ｗａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．ＢＭＣ  Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ  ２０１０，１１：５６８，ｂｉｏｍｅｄｃｅｎｔｒａｌ．ｃｏｍ／１４７１−２１０５／１１／５６８）。その記載によれば、「個々の対立遺伝子の平均ハプロタイプおよび表現型頻度はｄｂＭＨＣで利用可能なデータに基づくものであり、ｄｂＭＨＣデータは、ヨーロッパ、北アフリカ、東北アジア、南太平洋（オーストラリアおよびオセアニア）、ヒスパニック系の北アメリカおよび南アメリカ、アメリカ原住民、東南アジア、南西アジア、ならびにサブサハラアフリカの集団における罹患率を考慮している。ＤＲＡ鎖が主に単形態性であってＤＲＡにおける差異が結合に有意な影響を及ぼすと仮定しない場合、ＤＰ、ＤＲＢ１、およびＤＲＢ３／４／５の頻度は、β鎖の頻度だけを考慮したものになる。ＤＲＢ３／４／５対立遺伝子に関しては頻度データを利用できない。しかし、ＤＲＢ１対立遺伝子と結合することから、これらの特性の適用範囲は、ＤＲＢ３はＤＲ３、ＤＲ１１、ＤＲ１２、ＤＲ１３およびＤＲ１４と結合し；ＤＲＢ４はＤＲ４、ＤＲ７およびＤＲ９と結合し；ＤＲ１５はＤＲＢ５およびＤＲ１６と結合すると予想しうる。各Ｂ３／Ｂ４／Ｂ５遺伝子座における特定の対立遺伝子の頻度は、種々のＤＲＢ１対立遺伝子との公開された関連に基づくものであり、指示された遺伝子座における制限された変動だけを想定する」。
【０２５８】
予測される出力は、ＡＲＢ、コンビナトリアルライブラリーおよびＳＭＭ＿ａｌｉｇｎでＩＣ５０ｎＭの単位で与えられる。したがって、小さい数ほど高い親和性を示す。大まかな指標基準として、ＩＣ５０値が５０ｎＭ未満であればペプチドの親和性が高いと見なされ、５００ｎＭ未満であれば親和性が中程度であると見なされ、５０００ｎＭ未満であれば親和性が低いと見なされる。公知のエピトープのほとんどは、高または中程度の親和性を有する。エピトープによっては親和性が低いものもあるが、公知のＴ細胞エピトープの場合はＩＣ５０値が５０００を超えるものが存在していない。Ｓｔｕｒｎｉｏｌｏの予測結果は、生スコアとして与えられる。スコアが高いほど、高い親和性を示す。ペプチドごとに４つの方法の（ＡＲＢ、コンビナトリアルライブラリー、ＳＭＭ＿ａｌｉｇｎおよびＳｔｕｒｎｉｏｌｏ）の各々に対するパーセンタイルランクが、ＳＷＩＳＳＰＲＯＴデータベースから選択された５００万のランダムな１５ｍｅｒのスコアとの比較によって得られる。パーセンタイルランクの数値が小さい場合、高い親和性を示す。次いで、４つの方法に対するパーセンタイルランクの中央値を用い、コンセンサス法におけるランクを生成した。
【０２５９】
ＩＥＤＢを使用して２３５ＲＳＶのＴ細胞エピトープをスクリーニングし、３つの新規なペプチドを発見し、キメラペプチドを生成する際に用いた。また、キメラペプチドを生成する際には、前述のペプチド（ＲＳＶＧ（配列番号９９））も含める（Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ３２６（２００４）２２０−２３０、ＨＬＡ−ＤＰ４によってＲＳＶＧタンパク質からＣＤ４  Ｔ細胞への免疫優性ペプチドが提示される）。
【０２６０】
【表５】
2013538211.tif 000012
【０２６１】
特定の実施形態では、個別のエピトープから得られた結果に基づき、予測される最も広い範囲および高親和性結合をもたらすことになるキメラペプチドを生成した。図２１に示されるように、ＡとＢの両方を含まずそのどちらか一方のみを含む組成物に対してより広範な予測範囲およびより高い親和性結合を有するＡ−ｘ−Ｂ型を有する組成物が生成されうる。カテプシン切断部位をペプチドの接合部に挿入した。使用のため、キメラペプチドを合成し（ＣＳＢＩＯ）、水に再懸濁した。上記の特定の実施形態を使用し、ＨＬＡ−ＤＲおよびＨＬＡ−ＤＰ結合ペプチドを含む最適化された組成物を生成したが、同じ技術を用い、ＨＬＡ−ＤＱ結合ペプチドを含む最適化された組成物を生成してもよい。
【０２６２】
実施例１６：ペプチドの評価
キメラエピトープペプチドを含む本発明の組成物を、（１）リコール応答の効力；（２）無作為集団の試料集団（Ｎ＝５）に対するリコール応答の頻度；および（３）個体（Ｎ＝５）内での抗原特異的記憶Ｔ細胞の頻度について評価した。
【０２６３】
インビトロにてヒトＰＢＭＣをペプチドで１８時間刺激し、次いで細胞をＥｌｉｓｐｏｔで分析することによって、単一のエピトープおよびキメラエピトープの効力を評価した。要するに、全血をＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｂｌｏｏｄ  Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ）から得た。血液を、リン酸塩緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）中で希釈し、次いで５０ｍＬの管内、Ｆｉｃｏｌｌ−ｐａｑｕｅ  ｐｒｅｍｉｕｍ（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）上に重層した。管を３０分間回転し、遷移期ＰＢＭＣを回収し、１０％ウシ胎仔血清（ＦＣＳ）含有のＰＢＳで希釈し、１０分間回転した。細胞を細胞凍結媒体（ｃｅｌｌ  ｆｒｅｅｚｉｎｇ  ｍｅｄｉａ）（Ｓｉｇｍａ製）に再懸濁し、直ちに−８０℃で一晩凍結させた。長期間貯蔵する間、細胞を液体窒素に移した。細胞を、必要に応じて解凍し、１０％ＦＣＳを有するＰＢＳに再懸濁し、沈降させ、１０％熱不活化ウシ胎仔血清（Ｓｉｇｍａ）ｌ−グルタミン、ペニシリンおよびストレプトマイシン）を補充した培地（ＲＰＭＩ［ｃｅｌｌｇｒｏ］）中、１×１０７個の細胞／ｍＬに再懸濁した。
【０２６４】
Ｅｌｉｓｐｏｔアッセイを、ＩＦＮγ（Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ−ｇａｍｍａ）Ｅｌｉｓｐｏｔキット（Ｍａｂｔｅｃｈ製）を使用して実施した。要するに、９６ウェルフィルタプレートをＩＦＮ−γ捕捉抗体でコーティングし、１０％ＦＣＳ含有の完全培養基で遮断して非特異的結合を防ぎ、Ｅｌｉｓｐｏｔを実施した。１０μＭペプチドを用いてまたは用いずに、抗体が予めコーティングされたＥｌｉｓｐｏｔプレートにＰＢＭＣ（１×１０６細胞）を蒔いた。陽性対照ウェルを１０  μｇ／ｍＬのＰＨＡで刺激した。Ｅｌｉｓｐｏｔプレートを、１８時間３７℃でインキュベートし、次いでビオチン化抗−ＩＦＮ−γ二次抗体でコーティングして室温にて２時間置き、その後、Ｅｌｉｓｐｏｔプレートを洗浄し、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、ジメチルホルムアミド、および過酸化水素を使用した酢酸塩緩衝液中でＩＦＮ−γスポットを成長させた。ＩＦＮ−γ陽性Ｅｌｉｓｐｏｔの計数、および１千万細胞につきスコアされたスポット数が、外部ベンダー（Ｚｅｌｎｅｔ）によって評価された。
【０２６５】
データ（図２２）は、ＲＳＶキメラペプチドが多数の中央記憶Ｔ細胞を活性化することを示している。キメラペプチドＶＷＬｋＡＧＦおよびＶＳＴｋＡＧＦによって、記憶Ｔ細胞応答が最大限に促され、５つ全部のドナーからのリコール応答が実証された。
【０２６６】
実施例１７：合成ナノ担体調合物（予想）
レシキモド（別名Ｒ８４８）は、米国特許第５，３８９，６４０号明細書（Ｇｅｒｓｔｅｒらに付与）の実施例９９中に提供される合成に従って合成する。ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン複合体は、従来の複合方法を用いて調製する。ＰＬＡを、Ｄ，Ｌ−ラクチド（ＭＷ＝約１５ＫＤ〜１８ＫＤ）を用いる開環重合によって調製する。ＰＬＡ構造を、ＮＭＲによって確認する。ポリビニルアルコール（Ｍｗ＝１１ＫＤ〜３１ＫＤ、８５％が加水分解された）は、ＶＷＲ  ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃから購入する。これらを使用し、以下の溶液を調製する。
１．塩化メチレン中レシキモド（７．５ｍｇ／ｍＬ）
２．塩化メチレン中ＰＬＡ−ＰＥＧ−ニコチン（１００ｍｇ／ｍＬ）
３．塩化メチレン中ＰＬＡ（１００ｍｇ／ｍＬ）
４．水溶液中ペプチド（配列番号１００の配列を有するペプチド）（１０ｍｇ／ｍＬ）
５．水溶液中ポリビニルアルコール（５０ｍｇ／ｍＬ）．
【０２６７】
溶液＃１（０．４ｍＬ）、溶液＃２（０．４ｍＬ）、溶液＃３（０．４ｍＬ）および溶液＃４（０．１ｍＬ）を小バイアル内で結合させ、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、５０％振幅で４０秒間超音波処理した。このエマルションに溶液＃５（２．０ｍＬ）を添加し、Ｂｒａｎｓｏｎ  Ｄｉｇｉｔａｌ  Ｓｏｎｉｆｉｅｒ  ２５０を使用し、３５％の振幅で４０秒間の超音波処理により、第２のエマルションを形成する。これを、水（３０ｍＬ）が入ったビーカーに添加し、この混合物を室温で２時間撹拌し、ナノ粒子を形成する。ナノ担体分散体の一部（１．０ｍＬ）を水（１４ｍＬ）で希釈してから、カットオフが１００ＫＤのメンブレンを装着したＡｍｉｃｏｎ  Ｕｌｔｒａ遠心濾過装置で遠心分離により濃縮する。容量が約２５０μＬである場合、水（１５ｍＬ）を添加し、Ａｍｉｃｏｎ装置を使用して粒子を再び約２５０μＬに濃縮する。リン酸塩緩衝生理食塩水（ｐＨ＝７．５、１５ｍＬ）での２回目の洗浄を同様にして行い、最終濃縮物を全容量が１．０ｍＬになるまでリン酸塩緩衝生理食塩水で希釈する。これにより、濃度が約２．７ｍｇ／ｍＬの最終ナノ担体分散体が得られると予想される。
【０２６８】
参考文献
1.Truncation analysis of several DR binding epitopes.O'Sullivan D,Sidney J,Del Guercio MF,Colon SM,Sette A.J Immunol.1991 Feb 15;146(4):1240-6。
2.Adenovirus hexon T-cell epitope is recognized by most adults and is restricted by HLA DP4,the most common class II allele.Tang J,Olive M,Champagne K,Flomenberg N,Eisenlohr L,Hsu S,Flomenberg P.Gene Ther.2004 Sep;11(18):1408-15。
3.HLA-DP4,the most frequent HLA II molecule,defines a new supertype of peptide-binding specificity.Castelli FA,Buhot C,Sanson A,Zarour H,Pouvelle-Moratille S,Nonn C,Gahery-Segard H,Guillet JG,Menez A,Georges B,Maillere B.J Immunol.2002 Dec 15;169(12):6928-34。
4.Prediction of CD4(+)T cell epitopes restricted to HLA-DP4 molecules.Busson M,Castelli FA,Wang XF,Cohen WM,Charron D,Menez A,Maillere B.J Immunol Methods.2006 Dec 20;317(1-2):144-51。
【図１】
2013538211.tif 000013
【図２】
2013538211.tif 000014
【図３】
2013538211.tif 000015
【図４】
2013538211.tif 000016
【図５】
2013538211.tif 000017
【図６】
2013538211.tif 000018
【図７】
2013538211.tif 000019
【図８】
2013538211.tif 000020
【図９】
2013538211.tif 000021
【図１０】
2013538211.tif 000022
【図１１】
2013538211.tif 000023
【図１２】
2013538211.tif 000024
【図１３】
2013538211.tif 000025
【図１４】
2013538211.tif 000026
【図１５】
2013538211.tif 000027
【図１６】
2013538211.tif 000028
【図１７】
2013538211.tif 000029
【図１８】
2013538211.tif 000030
【図１９】
2013538211.tif 000031
【図２０】
2013538211.tif 000032
【図２１】
2013538211.tif 000033
【図２２】
2013538211.tif 000034
【配列表】
2013538211000001.app
【国際調査報告】
2013538211.tif 000035
2013538211.tif 000036
2013538211.tif 000037