(57)【要約】本発明は、対応するポリペプチドに比べて改善された特性、例えば、プロテアーゼ抵抗性を有する生物学的に活性なペプチド模倣大環状分子を提供する。本発明はさらに、このような大環状分子の調製方法および、例えば、治療適用において使用する方法を提供する。一実施形態において、本発明は、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドを調製する方法を提供し、この方法は、（ａ）架橋剤を含む親ポリペプチドを提供する工程であって、該架橋剤は、前記ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している、工程；（ｂ）前記ポリペプチド内のプロテアーゼ切断部位を含む第１のモチーフを特定する工程などを含む。【特許請求の範囲】
【請求項１】
最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドを調製する方法であって、該方法は：
（ａ）架橋剤を含む親ポリペプチドを提供する工程であって、該架橋剤は、該ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している、工程；
（ｂ）該ポリペプチド内のプロテアーゼ切断部位を含む第１のモチーフを特定する工程；
（ｃ）該第１のモチーフを、少なくとも１つのα，α−二置換アミノ酸を含む第２のモチーフと交換し、それにより、改変ポリペプチドを作製する工程；
（ｄ）該改変ポリペプチドのタンパク質分解安定性を測定する工程；および
（ｅ）該改変ポリペプチドが該親ポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有する場合、該改変ポリペプチドを、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドとして選択する工程
を包含する、方法。
【請求項２】
最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドを調製する方法であって、該方法は：
（ａ）第１の架橋剤を含む親ポリペプチドを提供する工程であって、該架橋剤は、該ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している、工程；
（ｂ）該ポリペプチド内のプロテアーゼ切断部位を含む第１のモチーフを特定する工程；
（ｃ）該第１のモチーフを第３のアミノ酸を含む第２のモチーフと交換し、それにより、改変ポリペプチドを作製する工程であって、ここで、該第３のアミノ酸は、第２の架橋剤によって該ポリペプチド内の別のアミノ酸に連結されている、工程；
（ｄ）該改変ポリペプチドのタンパク質分解安定性を測定する工程；および
（ｅ）該改変ポリペプチドが該親ポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有する場合、該改変ポリペプチドを、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドとして選択する工程
を包含する、方法。
【請求項３】
前記第１のモチーフが、前記第１のアミノ酸および前記第２のアミノ酸を連結している前記架橋剤が架かっている配列の外側に特定される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記親ポリペプチドがへリックスを含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
前記親ポリペプチドがα−へリックスを含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項６】
前記親ポリペプチドの前記架橋剤が、前記第１のアミノ酸および前記第２のアミノ酸のα−炭素（または側鎖）を連結している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項７】
前記架橋剤が、第１のアミノ酸と、アミノ酸３個分離れた第２のアミノ酸とを連結している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項８】
前記架橋剤が、第１のアミノ酸と、アミノ酸６個分離れた第２のアミノ酸とを連結している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項９】
前記架橋剤がα−へリックスの１ターンから５ターンまでに架かる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１０】
前記親ポリペプチドが、ｐＨ７．４で正味中性または正味正電荷を有する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１１】
前記架橋剤によって連結された前記第１のアミノ酸および前記第２のアミノ酸のうち少なくとも一方が、α，α−二置換アミノ酸である、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１２】
前記架橋剤によって連結された前記第１のアミノ酸および前記第２のアミノ酸の両方が、α，α−二置換である、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１３】
前記プロテアーゼが細胞内プロテアーゼである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１４】
前記プロテアーゼが細胞外プロテアーゼである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１５】
前記プロテアーゼが脊椎動物の血液中に存在している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１６】
前記プロテアーゼが脊椎動物の口内または消化管内に存在している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１７】
前記プロテアーゼが脊椎動物の肺内に存在している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１８】
前記プロテアーゼが脊椎動物の副鼻腔内に存在している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１９】
前記プロテアーゼが脊椎動物の皮膚に存在している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項２０】
前記プロテアーゼが脊椎動物の目に存在している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項２１】
前記親ポリペプチドが治療効果を提供する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項２２】
前記親ポリペプチドが細胞内標的に結合する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項２３】
前記第３のアミノ酸が、前記第２の架橋剤によって前記第１のアミノ酸または前記第２のアミノ酸に連結されている、請求項２に記載の方法。
【請求項２４】
先の請求項のいずれかの方法によって調製される改変ポリペプチド。
【請求項２５】
前記改変ポリペプチドのプロテアーゼ安定性が、対応する親ポリペプチドのプロテアーゼ安定性の少なくとも５倍である、請求項２４に記載の改変ポリペプチド。
【請求項２６】
ＢＣＬ−２ファミリーメンバーの異常な発現または活性と関連している障害を処置または制御する方法であって、有効量の先の請求項のいずれかに記載のポリペプチドを、障害の処置または制御を必要とする被験体に投与することを含む、方法。
【請求項２７】
ＢＣＬ−２ファミリーメンバーの異常な発現または活性と関連している障害を処置または制御するための医薬の製造における、先の請求項のいずれかに記載のポリペプチドの使用。
【請求項２８】
最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドであって、該ポリペプチドは：
（ａ）該ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している架橋剤；
（ｂ）少なくとも１つのα，α−二置換アミノ酸であって、ここで、該ポリペプチドは、該α，α−二置換アミノ酸を含まない対応するポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有し、該対応するポリペプチドは、プロテアーゼ切断部位を含むモチーフを含む、α，α−二置換アミノ酸
を含み、
該より高いタンパク質分解安定性は、該ポリペプチドと該対応するポリペプチドとをプロテアーゼとともに、タンパク質分解性の分解が誘導されるのに充分な期間、インキュベートし、該ポリペプチドのタンパク質分解安定性を該対応するポリペプチドのタンパク質分解安定性と比較することにより測定される、
ポリペプチド。
【請求項２９】
前記α，α−二置換アミノ酸が、前記対応するポリペプチド内の前記プロテアーゼ切断部位の位置に対応する位置にある、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３０】
最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドであって、該ポリペプチドは：
（ａ）該ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している架橋剤；
（ｂ）第２の架橋剤によって該ポリペプチド内の別のアミノ酸に連結された第３のアミノ酸であって、ここで、該ポリペプチドは、該第３のアミノ酸を含まない対応するポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有し、該対応するポリペプチドは、プロテアーゼ切断部位を含むモチーフを含む、第３のアミノ酸
を含み、
該より高いタンパク質分解安定性は、該ポリペプチドと該対応するポリペプチドをプロテアーゼとともに、タンパク質分解性の分解が誘導されるのに充分な期間、インキュベートし、該ポリペプチドのタンパク質分解安定性を該対応するポリペプチドのタンパク質分解安定性と比較することにより測定される、
ポリペプチド。
【請求項３１】
前記第３のアミノ酸が、前記対応するポリペプチド内の前記プロテアーゼ切断部位の位置に対応する位置にある、請求項３０に記載のポリペプチド。
【請求項３２】
ポリペプチドであって、以下：
（ａ）架橋剤を含む親ポリペプチドを提供する工程であって、該架橋剤は、該ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している、工程；
（ｂ）該ポリペプチド内のプロテアーゼ切断部位を含む第１のモチーフを特定する工程；
（ｃ）該第１のモチーフを、少なくとも１つのα，α−二置換アミノ酸を含む第２のモチーフと交換し、それにより、改変ポリペプチドを作製する工程；
（ｄ）該改変ポリペプチドのタンパク質分解安定性を測定する工程；および
（ｅ）該改変ポリペプチドが該親ポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有する場合、該改変ポリペプチドを、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドとして選択する工程
を含む方法によって調製される、ポリペプチド。
【請求項３３】
ポリペプチドであって、以下：
（ａ）第１の架橋剤を含む親ポリペプチドを提供する工程、該架橋剤は、該ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している、工程；
（ｂ）該ポリペプチド内のプロテアーゼ切断部位を含む第１のモチーフを特定する工程；
（ｃ）該第１のモチーフを第３のアミノ酸を含む第２のモチーフと交換し、それにより、改変ポリペプチドを作製する工程であって、ここで、該第３のアミノ酸は、第２の架橋剤によって該ポリペプチド内の別のアミノ酸に連結されている、工程；
（ｄ）該改変ポリペプチドのタンパク質分解安定性を測定する工程；および
（ｅ）該改変ポリペプチドが該親ポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有する場合、該改変ポリペプチドを、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドとして選択する工程
を含む方法によって調製される、ポリペプチド。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
この出願は、２００９年１０月１４日に出願された米国仮出願第６１／２５１，７０９号（これは、その全体が参考として本明細書に援用される）の利益を主張する。
【背景技術】
【０００２】
発明の背景
ペプチドは、医薬適用において重要になってきている。非改変ペプチドは、代謝安定性が乏しく、細胞透過性が乏しく、コンフォメーションの可撓性に起因して乱雑な（ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ）結合を受ける場合が多い。これらの特性を改善するため、研究者らにより、さまざまな方法、例えば、ジスルフィド結合の形成、アミド結合の形成、および炭素−炭素結合の形成によって環状ペプチドおよびペプチド模倣物が生成されている（非特許文献１；非特許文献２；非特許文献３；非特許文献４；非特許文献５；非特許文献６；非特許文献７）。これらの方法の制限としては、乏しい代謝安定性（ジスルフィド結合およびアミド結合）、乏しい細胞透過性（ジスルフィド結合およびアミド結合）、ならびに潜在的に毒性の金属の使用（炭素−炭素結合の形成のため）が挙げられる。従って、プロテアーゼ安定性などの改善された生物学的特性を有するペプチドまたはペプチド模倣物の改善された作製方法に対する相当な必要性が存在する。本発明は、これらおよび当該技術分野における他の必要性に取り組むものである。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００３】
【非特許文献１】Ｊａｃｋｓｏｎら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．（１９９１）１１３：９３９１〜９３９２
【非特許文献２】Ｐｈｅｌａｎら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．（１９９７）１１９：４５５〜４６０
【非特許文献３】Ｔａｙｌｏｒ、Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ（２００２）６６：４９〜７５
【非特許文献４】Ｂｒｕｎｅｌら、Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．（２００５）（２０）：２５５２〜２５５４
【非特許文献５】Ｈｉｒｏｓｈｉｇｅら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．（１９９５）１１７：１１５９０〜１１５９１
【非特許文献６】Ｂｌａｃｋｗｅｌｌら、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．（１９９８）Ｅｄ．３７：３２８１〜３２８４
【非特許文献７】Ｓｃｈａｆｍｅｉｓｔｅｒら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．（２０００）１２２：５８９１〜５８９２
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
本発明は、対応する架橋ポリペプチドに比べて改善されたプロテアーゼ安定性を有する生物学的に活性なペプチド模倣大環状分子を提供する。
【０００５】
一実施形態において、本発明は、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドの調製方法を提供し、この方法は、（ａ）架橋剤を含む親ポリペプチドを提供する工程であって、該架橋剤は、前記ポリペプチドの第１のアミノ酸と第２のアミノ酸とを連結している、工程；（ｂ）前記ポリペプチド内のプロテアーゼ切断部位を含む第１のモチーフを特定する工程；（ｃ）第１のモチーフを、少なくとも１つのα，α−二置換アミノ酸を含む第２のモチーフと交換し、それにより、改変ポリペプチドを作製する工程；（ｄ）改変ポリペプチドのタンパク質分解安定性を測定する工程；および（ｅ）改変ポリペプチドが親ポリペプチドよりも高いタンパク質分解安定性を有する場合、該改変ポリペプチドを、最適化されたプロテアーゼ安定性を有するポリペプチドとして選択する工程を含む。
【０００６】
別の実施形態では、上記架橋ポリペプチドはＢＣＬ−２ファミリーメンバーのα−へリックスドメインを含む。例えば、上記架橋ポリペプチドはＢＨ３ドメインを含む。他の実施形態では、上記架橋ポリペプチドは、表１、２、３および４の任意の配列の少なくとも６０％、７０％、８０％、８５％、９０％または９５％を含む。
【０００７】
さらに他の実施形態では、改善されたプロテアーゼ安定性は、細胞内安定性の増加、細胞外安定性の増加、血中での安定性の増加、口内もしくは消化管内での安定性の増加、肺内での安定性の増加、副鼻腔（ｎａｓａｌ  ｓｉｎｕｓ）内での安定性の増加、眼内での安定性の増加、または皮膚での安定性の増加をもたらすものである。
【０００８】
他の実施形態では、架橋剤は２個のα−炭素原子を連結している。さらに他の実施形態では、架橋ポリペプチドはα−へリックスを含む。
【０００９】
一実施形態において、第１のモチーフは、前記第１のアミノ酸および前記第２のアミノ酸を連結している架橋剤が架かっている配列の外側に特定される。別の実施形態では、親ポリペプチドは、α−へリックスなどのへリックスを含む。また別の実施形態では、架橋剤は、前記第１のアミノ酸および前記第２のアミノ酸のα−炭素（または側鎖）を連結している。
【００１０】
一実施形態において、架橋剤は、第１のアミノ酸と、アミノ酸３個分離れた第２のアミノ酸とを連結している。例えば、架橋剤は６〜１４個の連続した結合、または８〜１２個の連続した結合を含む。別の実施形態では、親ポリペプチドは、約１８個の原子〜２６個の原子の大環状分子を含む。
【００１１】
別の実施形態では、架橋剤は、第１のアミノ酸と、アミノ酸６個分離れた第２のアミノ酸とを連結している。例えば、架橋剤は、８〜１６個の連続した結合、または１０〜１３個の連続した結合を含む。別の実施形態では、親ポリペプチドは、約２９個の原子〜３７個の原子の大環状分子を含む。
【００１２】
また別の実施形態では、架橋剤がα−へリックスの１ターンから５ターンまでに架かる。例えば、架橋剤は、α−へリックスの１ターンまたは２ターンに架かる。一実施形態において、架橋剤の長さは、α−へリックスのターン１つあたり約５Å〜約９Åである。
【００１３】
種々の実施形態において、親ポリペプチドは、ｐＨ７．４で正味正電荷を担持している。他の実施形態では、親ポリペプチドは、ハロゲン、アルキル基、蛍光部分、親和性標識、標的化部分、または放射性同位体の１つ以上を含む。一実施形態において、前記架橋剤によって連結された第１および第２のアミノ酸のうち少なくとも一方はα，α−二置換アミノ酸である。例えば、前記架橋剤によって連結された第１および第２のアミノ酸の両方がα，α−二置換である。
【００１４】
一実施形態において、プロテアーゼは細胞内または細胞外プロテアーゼである。例えば、プロテアーゼは、脊椎動物の血中、口内、消化管内、肺内、副鼻腔内、皮膚または眼内に存在している。別の実施形態では、最適化されたポリペプチドは、治療効果を提供する、および／または細胞内標的に結合する。
【００１５】
本発明はまた、ＢＣＬ−２ファミリーメンバーの異常な発現または活性と関連している障害を処置または制御する方法を提供し、この方法は、有効量の先の請求項のいずれかに記載のポリペプチドを、それを必要とする被験体に投与することを含む。
【００１６】
また、過剰増殖性疾患または過剰増殖性細胞内のｐ５３とｈＤＭ２間の相互作用もしくは結合に媒介される状態を処置または制御する方法も提供され、この方法は、有効量の先の請求項のいずれかに記載のポリペプチドを、それを必要とする被験体に投与することを含む。
【００１７】
別の局面において、本発明は、ＢＣＬ−２ファミリーメンバーの異常な発現または活性と関連している障害を処置または制御するための、あるいは過剰増殖性疾患または過剰増殖性細胞内のｐ５３とｈＤＭ２間の相互作用もしくは結合に媒介される状態を処置または制御するための、医薬の製造における本発明のポリペプチドの使用に関する。
【００１８】
いくつかの実施形態では、前記改変ポリペプチドの第２のモチーフ内に存在するアミノ酸のα−炭素原子は、式Ｒ−の部分で置換され、式中、Ｒ−は、非置換であるか、またはハロ−で置換される、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである。一実施形態において、Ｒ−はアルキルである。例えば、Ｒ−はメチルである。あるいは、Ｒ−と架橋剤の任意の部分が一緒になって環状構造を形成し得る。別の実施形態では、架橋剤は、連続する炭素−炭素結合で形成されている。例えば、架橋剤は、少なくとも８、９、１０、１１または１２個の連続した結合を含むものであってもよい。他の実施形態では、架橋剤は、少なくとも７、８、９、１０または１１個の炭素原子を含むものであってもよい。
【００１９】
他の実施形態では、改変ポリペプチドのプロテアーゼ安定性は、親ポリペプチドに比べて少なくとも２倍改善される。例えば、前記ポリペプチドのプロテアーゼ安定性は少なくとも５倍、１０倍、または１５倍改善される。
【００２０】
文献の引用
本明細書において言及される全ての刊行物、特許、および特許出願は、各個々の刊行物、特許、または特許出願が、具体的にかつ個々に参照により組み込まれて示されるのと同程度まで、参照により本明細書に援用される。
【００２１】
本発明の新規な特徴は、添付の特許請求の範囲で詳細に説明される。本発明の特徴および利点は、本発明の原理を利用し、図面を伴った例示的な実施形態を説明する、以下の詳細な説明を参照することにより、さらに十分に理解される。
【図面の簡単な説明】
【００２２】
【図１】図１は、ＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子の考えられ得るタンパク質分解産物を示す。
【図２】図２は、ＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子の配列を、それぞれのタンパク質分解産物に対応する番号とともに示す。
【図３】図３は、細胞内プロテアーゼカテプシンＤで処理した場合の、イオン移動度−ＭＳおよびＭＳ−ＭＳ解析によって測定されたＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子のタンパク質分解産物を示す。
【図４】図４は、細胞内プロテアーゼカテプシンＢで処理した場合の、イオン移動度−ＭＳおよびＭＳ−ＭＳ解析によって測定されたＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子のタンパク質分解産物を示す。
【図５】図５は、細胞内プロテアーゼカテプシンＬで処理した場合の、イオン移動度−ＭＳおよびＭＳ−ＭＳ解析によって測定されたＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子のタンパク質分解産物を示す。
【図６】図６は、本発明のペプチド模倣大環状分子の細胞内プロテアーゼカテプシンＤに対する安定性の増加を示す。
【図７】図７は、本発明のペプチド模倣大環状分子の細胞内プロテアーゼカテプシンＤに対する安定性の増加を示す。
【図８】図８は、本発明のペプチド模倣大環状分子のＨｅＬａ細胞アッセイでの安定性の増加を示す。
【図９】図９は、ラット胃腸粘膜ペプチダーゼで処理した場合の、イオン移動度−ＭＳおよびＭＳ−ＭＳ解析によって測定されたＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子のタンパク質分解産物を示す。
【図１０】図１０は、本発明のペプチド模倣大環状分子のラット胃腸粘膜ペプチダーゼに対する安定性の増加を示す。
【図１１】図１１は、本発明のペプチド模倣大環状分子のラット胃腸粘膜ペプチダーゼに対する安定性の増加を示す。
【図１２】図１２は、本発明のペプチド模倣大環状分子のラット胃腸粘膜ペプチダーゼに対する安定性の増加を示す。
【図１３】図１３は、本発明のペプチド模倣大環状分子の腸管プロテアーゼペプシンに対する安定性の増加を示す。
【図１４】図１４は、本発明のペプチド模倣大環状分子の腸管プロテアーゼペプシンに対する安定性の増加を示す。
【発明を実施するための形態】
【００２３】
本明細書において用いる場合、「処置すること」および「処置する」という用語は、症状を緩和すること、原因を一時的もしくは永久的基準のいずれかで解消すること、または症状の出現を抑制もしくは遅滞させることを意味する。「処置」という用語は、任意の状態と関連している症状および障害の緩和、それらの原因の（一時的もしくは永久的）解消、またはそれらの症状および障害の予防を包含する。処置は、症状の発生時の処置だけでなく、症状の事前処置であってもよい。
【００２４】
「標準治療法」という用語は、特定の適応症に対する標準治療の一部である任意の治療的または診断的な方法、化合物または実施を指す。「標準治療」は、特定のタイプの患者、病気または臨床環境に対して医師が従うべき任意の診断もしくは処置のプロセスのために健康管理提供者または国もしくは地域の機関などの任意の当局が確立したものであり得る。種々のタイプの癌に対する例示的な標準治療法は、例えば、米国国立癌研究所（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ）によって示されている。
【００２５】
本明細書において用いる場合、「細胞増殖性障害」という用語は、癌、過剰増殖性障害、腫瘍性障害、免疫増殖性障害などの障害を包含する。「細胞増殖性障害」は、自律的増殖能、すなわち、迅速に増殖する細胞増殖によって特徴付けられる異常な状況または状態を有する細胞に関する。過剰増殖性および腫瘍性疾患の状況は、病的なもの、すなわち、疾患状況を特徴付けているか、もしくは疾患状況を構成するものとして分類してもよいし、または非病的なもの、すなわち、正常な状況から逸脱しているが疾患状況を伴わないものとして分類してもよい。この用語は、組織病理学的タイプまたは侵襲性のステージに関係なく、あらゆるタイプの癌性増殖または腫瘍形成過程、転移性組織または悪性に形質転換した細胞、組織もしくは器官を包含することを意図する。転移性腫瘍は、乳房、肺、肝臓、結腸および卵巣の起源の腫瘍を含むがこれらに限定されない、複数の原発性腫瘍型から生じる可能性がある。「病的過剰増殖性」細胞は、悪性腫瘍増殖および免疫増殖性疾患によって特徴付けられる疾患状況において発生する。非病的な過剰増殖性細胞の例としては、創傷回復に伴う細胞の増殖が挙げられる。細胞増殖性障害および／または分化性障害の例としては、癌、例えば、癌腫、肉腫、または転移性障害が挙げられる。
【００２６】
細胞系統と関連する癌との関係に関する「〜に由来する」という用語は、細胞系統が、具体的な広い範疇の癌の任意の癌から樹立されたものであり得ることを表す。
【００２７】
本明細書において用いる場合、「大環状分子（ｍａｃｒｏｃｙｃｌｅ）」という用語は、少なくとも９個の共有結合された原子によって形成されるリングまたはサイクルを含む化学構造を有する分子を指す。
【００２８】
本明細書において用いる場合、「ペプチド模倣大環状分子（ｐｅｐｔｉｄｏｍｉｍｅｔｉｃ  ｍａｃｒｏｃｙｃｌｅ）」、「架橋ポリペプチド」または「係留ペプチド（ｓｔａｐｌｅｄ  ｐｅｐｔｉｄｅ）」という用語は、同じ分子内の第一の天然に存在するアミノ酸残基、または天然に存在しないアミノ酸残基（またはアナログ）および第二の天然に存在するアミノ酸残基、または天然に存在しないアミノ酸残基（またはアナログ）の間で大環状分子を形成する、複数のペプチド結合および少なくとも１つの大環状分子形成リンカーによって結合された複数のアミノ酸残基を含む化合物を指す。ペプチド模倣大環状分子は、大環状分子形成リンカーが、第一のアミノ酸残基（またはアナログ）のα炭素を第二のアミノ酸残基（またはアナログ）のα炭素に連結する実施形態を含む。ペプチド模倣大環状分子は必要に応じて、１つ以上のアミノ酸残基および／またはアミノ酸アナログ残基の間の１つ以上の非ペプチド結合を含み、そして必要に応じて、１つ以上の天然に存在しないアミノ酸残基またはアミノ酸アナログ残基を、大環状分子を形成する任意のものに加えて、含む。
【００２９】
別段の記載がない限り、本明細書に言及される化合物および構造はまた、１つ以上の同位体として濃縮された原子の存在においてのみ異なる化合物を含むことを意味する。例えば、水素がジュウテリウムもしくはトリチウムで置換されているか、または炭素原子が１３Ｃ濃縮炭素もしくは１４Ｃ濃縮炭素で置換されているか、または炭素原子がケイ素で置換されている、現状の構造を有する化合物は、本発明の範囲内である。本発明の化合物はまた、このような化合物を構成する原子のうちの１つ以上で、不自然な割合の原子の同位体を含んでもよい。例えば、この化合物は、例えば、トリチウム（３Ｈ）、ヨウ素−１２５（１２５Ｉ）または炭素−１４（１４Ｃ）などの放射性同位体で放射性標識されてもよい。本発明の化合物の全ての同位体バリエーションは、放射性であろうとなかろうと、本発明の範囲内に包含される。
【００３０】
本明細書において用いる場合、「安定性」という用語は、円二色性、ＮＭＲ、または別の生物物理学的手段によって測定される、本発明のペプチド模倣大環状分子によって溶液中で規定される二次構造の維持、またはインビトロもしくはインビボにおけるタンパク質分解性の分解に対する抵抗性を指す。本発明において企図される二次構造の非限定的な例は、α−へリックス、β−ターン、およびβ−プリーツシートである。
【００３１】
本明細書において用いる場合、「へリックス（ｈｅｌｉｃａｌ）安定性」という用語は、円二色性またはＮＭＲによって測定される、本発明のペプチド模倣大環状分子によるα−へリックス構造の維持を指す。例えば、いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子と比較して、円二色性によって決定されるα−ヘリシティにおいて、少なくとも１．２５、１．５、１．７５、または２倍の増大を示す。
【００３２】
「α−アミノ酸」または単に「アミノ酸」という用語は、α−炭素と呼ばれる炭素に結合したアミノ基およびカルボキシル基の両方を含有する分子を指す。適切なアミノ酸としては、限定するものではないが、天然に存在するアミノ酸のＤ−異性体およびＬ−異性体の両方、ならびに有機合成または他の代謝経路によって調製される天然に存在しないアミノ酸が挙げられる。文脈が具体的に別のことを示さない限り、本明細書において使用されるアミノ酸という用語は、アミノ酸アナログを含むものとする。
【００３３】
「天然に存在するアミノ酸」という用語は、自然界において合成されるペプチドにおいて一般に見つけられ、一文字の略語、Ａ、Ｒ、Ｎ、Ｃ、Ｄ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｌ、Ｋ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｓ、Ｔ、Ｗ、Ｙ、およびＶによって公知の２０個のアミノ酸のうちのいずれか１つを指す。
【００３４】
「アミノ酸アナログ」または「非天然アミノ酸」という用語は、アミノ酸に構造的に類似しており、かつペプチド模倣大環状分子の形成においてアミノ酸の代わりに用いることができる分子を指す。アミノ酸アナログとしては、限定するものではないが、アミノ基とカルボキシル基の間に１つ以上の追加のメチレン基を包含すること（例えばα−アミノβ−カルボキシ酸）を除いて、または同様に反応性の基によってアミノ基もしくはカルボキシ基が置換されること（例えば第二級もしくは第三級アミンでの第一級アミンの置換またはエステルでのカルボキシ基の置換）を除いて、本明細書において規定されるアミノ酸と構造的に同一である化合物が挙げられる。
【００３５】
「非必須」アミノ酸残基は、その必須の生物学的または生化学的活性（例えばレセプター結合または活性化）を消失することも、実質的に改変することもなく、ポリペプチドの野生型配列から改変することができる残基である（例えば、ＢＨ３ドメインまたはｐ５３  ＭＤＭ２結合ドメイン）。「必須」アミノ酸残基とは、ポリペプチドの野生型配列から改変された場合に、結果として、ポリペプチドの必須の生物学的または生化学的活性を消失し、または実質的に消失することになる残基である。
【００３６】
「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似した側鎖を有するアミノ酸残基と交換される置換である。類似した側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該分野において規定されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖（例えばＫ、Ｒ、Ｈ）、酸性の側鎖（例えば、Ｄ、Ｅ）、非荷電極性側鎖（例えば、Ｇ、Ｎ、Ｑ、Ｓ、Ｔ、Ｙ、Ｃ）、非極性側鎖（例えば、Ａ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｐ、Ｆ、Ｍ、Ｗ）、β分枝側鎖（例えば、Ｔ、Ｖ、Ｉ）、および芳香族側鎖（例えば、Ｙ、Ｆ、Ｗ、Ｈ）を有するアミノ酸が挙げられる。従って、ＢＨ３ポリペプチドにおける、予測される非必須アミノ酸残基は、例えば、好ましくは、同じ側鎖ファミリーからの別のアミノ酸残基と交換される。許容できる置換の他の例は、等比体積の（ｉｓｏｓｔｅｒｉｃ）考慮（例えば、メチオニンに対するノルロイシン）または他の特性（例えば、フェニルアラニンに対する２−チエニルアラニン）に基づく置換である。
【００３７】
大環状分子または大環状分子形成リンカーと組み合わせて、本明細書において用いられる「メンバー」という用語は、大環状分子を形成し、または大環状分子を形成することができる原子を指し、そして置換基または側鎖の原子を除外する。類推によって、シクロデカン、１，２−ジフルオロ−デカン、および１，３−ジメチルシクロデカンは全て、水素またはフルオロ置換基またはメチル側鎖が大環状分子の形成に参加しないので、１０員の大環状分子と考えられる。
【００３８】
記号
【００３９】
【化１−１】
2013507927.tif 000002
【００４０】
は、分子構造の一部として用いられる場合、単結合またはトランスもしくはシス二重結合を指す。
【００４１】
「アミノ酸側鎖」という用語は、アミノ酸におけるα−炭素に結合した部分を指す。例えば、アラニンについてのアミノ酸側鎖は、メチルであり、フェニルアラニンについてのアミノ酸側鎖は、フェニルメチルであり、システインについてのアミノ酸側鎖は、チオメチルであり、アスパルテートについてのアミノ酸側鎖は、カルボキシメチルであり、チロシンについてのアミノ酸側鎖は、４−ヒドロキシフェニルメチルであるなどである。他の天然に存在しないアミノ酸側鎖、例えば、自然界において生じるもの（例えば、アミノ酸代謝物）または合成的に作製されるもの（例えば、α，α二置換アミノ酸）もまた含まれる。
【００４２】
用語「α，α−二置換アミノ」酸という用語は、２つの天然または非天然アミノ酸側鎖に結合した炭素（α−炭素）に結合したアミノ基およびカルボキシル基の両方を含有する分子または部分を指す。
【００４３】
「ポリペプチド」という用語は、共有結合（例えば、アミド結合）によって結合した、２個以上の天然に存在するアミノ酸、または天然に存在しないアミノ酸を包含する。本明細書において記載されるポリペプチドとしては、完全長タンパク質（例えば、完全に処理された（ｐｒｏｃｅｓｓｅｄ）タンパク質）およびより短いアミノ酸配列（例えば、天然に存在するタンパク質の断片または合成ポリペプチド断片）が挙げられる。
【００４４】
本明細書において使用される場合、「大環状分子化試薬（ｍａｃｒｏｃｙｃｌｉｚａｔｉｏｎ  ｒｅａｇｅｎｔ）」または「大環状分子形成試薬」という用語は、２つの反応基の間の反応を媒介することによって、本発明のペプチド模倣大環状分子を調製するために用いられ得る任意の試薬を指す。反応性の基は、例えば、アジドおよびアルキンであってもよく、この場合には、大環状分子化試薬としては、限定するものではないが、ＣｕＢｒ、ＣｕＩ、またはＣｕＯＴｆなどの反応性Ｃｕ（Ｉ）種、ならびにアスコルビン酸またはアスコルビン酸ナトリウムなどの還元剤の添加によってインサイチュにおいて活性Ｃｕ（Ｉ）試薬に変換することができる、Ｃｕ（ＣＯ２ＣＨ３）２、ＣｕＳＯ４、およびＣｕＣｌ２などのＣｕ（ＩＩ）塩を提供する試薬などのＣｕ試薬が挙げられる。大環状分子化試薬としては、例えば、Ｃｐ＊ＲｕＣｌ（ＰＰｈ３）２、［Ｃｐ＊ＲｕＣｌ］４、または反応性Ｒｕ（ＩＩ）種を提供し得る他のＲｕ試薬などの、当該分野において公知のＲｕ試薬をさらに挙げることができる。他の場合において、反応基は、末端のオレフィンである。そのような実施形態において、大環状分子化試薬または大環状分子形成試薬は、第ＶＩＩＩ族遷移金属カルベン触媒などの、安定した後遷移金属カルベン錯体触媒を含むが、これらに限定されないメタセシス（ｍｅｔａｔｈｅｓｉｓ）触媒である。例えば、そのような触媒は、＋２酸化状態を有し、１６の電子数を有し、かつ五配位のＲｕおよびＯｓ金属中心である。追加の触媒は、Ｇｒｕｂｂｓら、「Ｒｉｎｇ  Ｃｌｏｓｉｎｇ  Ｍｅｔａｔｈｅｓｉｓ  ａｎｄ  Ｒｅｌａｔｅｄ  Ｐｒｏｃｅｓｓｅｓ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ」Ａｃｃ．Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．１９９５、２８、４４６〜４５２頁および米国特許第５，８１１，５１５号において開示される。さらに他の場合において、反応基は、チオール基である。そのような実施形態において、大環状分子化試薬は、例えば、ハロゲン基などの２つのチオール反応性基で官能化されたリンカーである。
【００４５】
「ハロ」または「ハロゲン」という用語は、フッ素、塩素、臭素、もしくはヨウ素またはその基を指す。
【００４６】
「アルキル」という用語は、示された数の炭素原子を含有する、直鎖または分枝鎖である炭化水素鎖を指す。例えば、Ｃ１〜Ｃ１０は、基が、その中に１〜１０個（両端を含む）の炭素原子を有することを示す。いかなる数の指示もない場合、「アルキル」とは、その中に１〜２０個（両端を含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分枝鎖）である。
【００４７】
「アルキレン」という用語は、二価アルキル（つまり−Ｒ−）を指す。
【００４８】
「アルケニル」という用語は、１つ以上の炭素−炭素二重結合を有する直鎖または分枝鎖である炭化水素鎖を指す。アルケニル部分は、示された数の炭素原子を含有する。例えば、Ｃ２〜Ｃ１０は、その基が、その中に２〜１０個（両端を含む）の炭素原子を有することを示す。「低級アルケニル」という用語は、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル鎖を指す。いかなる数の指示もない場合、「アルケニル」とは、その中に２〜２０個（両端を含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分枝鎖）である。
【００４９】
「アルキニル」という用語は、１つ以上の炭素−炭素三重結合を有する直鎖または分枝鎖である炭化水素鎖を指す。アルキニル部分は、示された数の炭素原子を含有する。例えば、Ｃ２〜Ｃ１０は、その基が、その中に２〜１０個（両端を含む）の炭素原子を有することを示す。「低級アルキニル」という用語は、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル鎖を指す。いかなる数の指示もない場合、「アルキニル」とは、その中に２〜２０個（両端を含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分枝鎖）である。
【００５０】
「アリール」という用語は、６個の炭素の単環式または１０個の炭素の二環式芳香族環系を指し、ここで各々の環の０、１、２、３、または４個の原子は、置換基によって置換される。アリール基の例としては、フェニル、ナフチルなどが挙げられる。「アリールアルキル」という用語または「アラルキル」という用語は、アリールで置換されたアルキルを指す。「アリールアルコキシ（ａｒｙｌａｌｋｏｘｙ）」という用語は、アリールで置換されたアルコキシを指す。
【００５１】
「アリールアルキル」とは、上記に規定されるアリール基であって、そのアリール基の水素原子のうちの１つが、上記に規定されるＣ１〜Ｃ５アルキル基で置き換えられているものを指す。アリールアルキル基の代表的な例としては、限定するものではないが、２−メチルフェニル、３−メチルフェニル、４−メチルフェニル、２−エチルフェニル、３−エチルフェニル、４−エチルフェニル、２−プロピルフェニル、３−プロピルフェニル、４−プロピルフェニル、２−ブチルフェニル、３−ブチルフェニル、４−ブチルフェニル、２−ペンチルフェニル、３−ペンチルフェニル、４−ペンチルフェニル、２−イソプロピルフェニル、３−イソプロピルフェニル、４−イソプロピルフェニル、２−イソブチルフェニル、３−イソブチルフェニル、４−イソブチルフェニル、２−ｓｅｃ−ブチルフェニル、３−ｓｅｃ−ブチルフェニル、４−ｓｅｃ−ブチルフェニル、２−ｔ−ブチルフェニル、３−ｔ−ブチルフェニル、および４−ｔ−ブチルフェニルが挙げられる。
【００５２】
「アリールアミド」とは、上記に規定されるアリール基であって、そのアリール基の水素原子のうちの１つが、１つ以上の−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２基で置き換えられているものを指す。アリールアミド基の代表的な例としては、２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−フェニル、３−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−フェニル、４−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−フェニル、２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−ピリジル、３−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−ピリジル、および４−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２−ピリジルが挙げられる。
【００５３】
「アルキルヘテロ環」とは、上記に規定されるＣ１〜Ｃ５アルキル基であって、そのＣ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子のうちの１つが、ヘテロ環で置き換えられているものを指す。アルキルヘテロ環基の代表的な例としては、限定するものではないが、−ＣＨ２ＣＨ２−モルホリン、−ＣＨ２ＣＨ２−ピペリジン、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−モルホリン、および−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−イミダゾールが挙げられる。
【００５４】
「アルキルアミド」とは、上記に規定されるＣ１〜Ｃ５アルキル基であって、そのＣ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子のうちの１つが、−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２基で置き換えられているものを指す。アルキルアミド基の代表的な例としては、限定するものではないが、−ＣＨ２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２−Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２ＣＨ（Ｃ（Ｏ）ＮＨ２）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ（Ｃ（Ｏ）ＮＨ２）ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ（Ｃ（Ｏ）ＮＨ２）ＣＨ２ＣＨ３、−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２Ｃ（Ｏ）ＮＨ２、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ３−ＣＨ３、および−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−Ｃ（Ｏ）−ＣＨ＝ＣＨ２が挙げられる。
【００５５】
「アルカノール」とは、上記に規定されるＣ１〜Ｃ５アルキル基であって、そのＣ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子のうちの１つが、ヒドロキシル基で置き換えられているものを指す。アルカノール基の代表的な例としては、限定するものではないが、−ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ３、および−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２ＯＨが挙げられる。
【００５６】
「アルキルカルボキシ」とは、上記に規定されるＣ１〜Ｃ５アルキル基であって、そのＣ１〜Ｃ５アルキル基の水素原子のうちの１つが、−−ＣＯＯＨ基で置き換えられているものを指す。アルキルカルボキシ基の代表的な例としては、限定するものではないが、−ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ（ＣＯＯＨ）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＯＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ（ＣＯＯＨ）ＣＨ２ＣＨ３、−ＣＨ（ＣＯＯＨ）ＣＨ２ＣＨ３、および−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２ＣＯＯＨが挙げられる。
【００５７】
「シクロアルキル」という用語は、本明細書において用いる場合、３〜１２個の炭素、好ましくは３〜８個の炭素、およびより好ましくは３〜６個の炭素を有する飽和環式炭化水素基および部分的に不飽和の環式炭化水素基であって、ここでそのシクロアルキル基が、必要に応じてさらに置換されている環式炭化水素基を包含する。いくつかのシクロアルキル基としては、限定するものではないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチル、およびシクロオクチルが挙げられる。
【００５８】
「ヘテロアリール」という用語は、単環式である場合、１〜３個のヘテロ原子、二環式である場合、１〜６個のヘテロ原子、または三環式である場合、１〜９個のヘテロ原子を有する芳香族の５〜８員の単環式、８〜１２員の二環式、または１１〜１４員の三環式環系を指し、このようなヘテロ原子は、Ｏ、Ｎ、またはＳから選択され（例えば、炭素原子と、単環式、二環式、または三環式である場合、それぞれ、１〜３、１〜６、または１〜９個のＯ、Ｎ、またはＳのヘテロ原子）、ここで各々の環の０、１、２、３、または４個の原子が、置換基によって置換されている。ヘテロアリール基の例としては、ピリジル、フリル、またはフラニル、イミダゾリル、ベンズイミダゾリル、ピリミジニル、チオフェニル、またはチエニル、キノリニル、インドリル、チアゾリルなどが挙げられる。
【００５９】
「ヘテロアリールアルキル」という用語または「ヘテロアラルキル」という用語は、ヘテロアリールで置換されたアルキルを指す。「ヘテロアリールアルコキシ」という用語は、ヘテロアリールで置換されたアルコキシを指す。
【００６０】
「ヘテロアリールアルキル」という用語または「ヘテロアラルキル」という用語は、ヘテロアリールで置換されたアルキルを指す。「ヘテロアリールアルコキシ」という用語は、ヘテロアリールで置換されたアルコキシを指す。
【００６１】
「ヘテロシクリル」という用語は、単環式である場合、１〜３個のヘテロ原子、二環式である場合、１〜６個のヘテロ原子、または三環式である場合、１〜９個のヘテロ原子を有する非芳香族の５〜８員の単環式、８〜１２員の二環式、または１１〜１４員の三環式環系を指し、このようなヘテロ原子は、Ｏ、Ｎ、またはＳから選択され（例えば、炭素原子と、単環式、二環式、または三環式である場合、それぞれ、１〜３、１〜６、または１〜９個のＯ、Ｎ、またはＳのヘテロ原子）、各々の環の０、１、２、または３個の原子は、置換基によって置換される。ヘテロシクリル基の例としては、ピペラジニル、ピロリジニル、ジオキサニル（ｄｉｏｘａｎｙｌ）、モルホリニル、テトラヒドロフラニルなどが挙げられる。
【００６２】
「置換基」という用語は、任意の分子、化合物、または部分の上の水素原子などの第２の原子または基を交換する基を指す。適切な置換基としては、限定するものではないが、ハロ、ヒドロキシ、メルカプト、オキソ、ニトロ、ハロアルキル、アルキル、アルカリル、アリール、アラルキル、アルコキシ、チオアルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アルコキシカルボニル、アミド、カルボキシ、アルカンスルホニル、アルキルカルボニル、およびシアノ基が挙げられる。
【００６３】
いくつかの実施形態において、本発明の化合物は、１つ以上の不斉中心を含有し、従ってラセミ化合物およびラセミ混合物、単一の鏡像異性体、個々のジアステレオマー、ならびにジアステレオマー混合物として存在する。これらの化合物の全てのそのような異性体形態は、別段明確に規定されない限り、本発明に含まれる。いくつかの実施形態において、本発明の化合物はまた、複数の互変異性形態で表され、そのような事例において、本発明は、本明細書において記載される化合物の全ての互変異性形態を含む（例えば、環系のアルキル化が、複数の部位でアルキル化をもたらす場合、本発明は、全てのそのような反応産物を含む）。そのような化合物の全てのそのような異性体形態は、別段明確に規定されない限り、本発明に含まれる。本明細書において記載される化合物の全ての結晶形態は、明確に規定されない限り、本発明に含まれる。
【００６４】
本明細書において用いる場合、「増加」および「減少」という用語は、統計的に有意に（すなわち、ｐ＜０．１）、それぞれ、少なくとも５％の増加または減少を引き起こすことを意味する。
【００６５】
本明細書において用いる場合、変数についての数値的な範囲の記述は、本発明が、その範囲内の値のうちのいずれかに等しい変数で実行されてもよいことを伝えるように意図される。従って、本質的に不連続の変数については、変数は、その範囲の終点を含む数値的な範囲内の任意の整数値と等しい。同様に、本質的に連続の変数については、変数は、その範囲の終点を含む数値的な範囲内の任意の実際の値と等しい。例として、限定するものではないが、０および２の間の値を有するとして記載される変数は、その変数が本質的に不連続の場合、値０、１、または２をとり、その変数が本質的に連続の場合、値０．０、０．１、０．０１、０．００１、または任意の他の実際の値≧０かつ≦２をとる。
【００６６】
本明細書において用いる場合、具体的に別のことを示されない限り、「または（あるいは、もしくは）」という単語は、「いずれか／または」の排他的な意味ではなく、「および／または」の包括的な意味で用いられる。
【００６７】
「平均して」という用語は、各データポイントについての、少なくとも３回の独立した反復の実行に由来する平均値を表す。
【００６８】
「プロテアーゼ安定性」という用語は、本発明の大環状分子の構造的および機能的特性を包含する。プロテアーゼ安定性は、例えば、構造的安定性、α−ヘリシティ、標的に対する親和性、タンパク質分解性の分解に対する抵抗性、細胞透過性、細胞内安定性、インビボ安定性、またはその任意の組合せである。
【００６９】
本発明の１つ以上の特定の実施形態の詳細は、添付の図面および下記の説明において記載される。本発明の他の特徴、目的、および利点は、本明細書本文および図面からならびに本特許請求の範囲から明白となる。
【００７０】
本発明のペプチド模倣大環状分子の設計
特異的または非特異的プロテアーゼ切断部位を含む既知の一次アミノ酸配列を有する任意のタンパク質またはポリペプチドが本発明の主題である。例えば、親ポリペプチドの配列は、該配列をすべての既知のプロテアーゼ切断認識モチーフのデータベースと比較するソフトウェアにより（例えば、Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔを用いて）解析することができる。あるいは、タンパク質分解部位は、親ポリペプチドを、精製プロテアーゼまたはプロテアーゼを含む生物学的抽出物もしくは組織とインキュベーションした後、得られたタンパク質分解産物をイオン移動度質量分析またはＭＳ／ＭＳ配列決定などの手法によって解析することにより決定される。このような試験はまた、ポリペプチドのインビボ投与および得られた切断産物の解析を行なうこともでき、一実施形態では、放射性標識ポリペプチドが使用され得る。このような測定により、適切なアミノ酸が本発明のアミノ酸アナログで置換される。
【００７１】
任意の既知のプロテアーゼ、例えば、哺乳動物（例えば、ヒト）プロテアーゼが本発明の主題であり得る。種々のプロテアーゼ／ペプチダーゼが、その特異的または非特異的切断部位とともに当該技術分野において知られている。このようなプロテアーゼ（およびその切断特性）としては、例えば、アミノペプチダーゼＭ（Ｎ末端から加水分解）；カルパイン１、１１、５、９、Ｓ１、Ｓ２；カルボキシペプチダーゼＹ（Ｃ末端から加水分解）；カスパーゼ１、４、５（Ｗ／ＬＥＨＤ−Ｘ）；カスパーゼ２、３、７（ＤＥＸＤ−Ｘ）；カスパーゼ６、８、９（Ｌ／ＶＥＸＤ−Ｘ）；カテプシンＢ、Ｄ、Ｅ、Ｇ、Ｋ、Ｌ、Ｏ、Ｓ、またはＷ；シスタチン８、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ／Ｍ、Ｆ、Ｓ、ＳＡ、またはＳＮ；ジペプチジルペプチダーゼ７（ＤＰＰ７、ＤＰＰＶＩＩ）；キモトリプシン（Ｙ−Ｘ、Ｆ−Ｘ、Ｔ−Ｘ、Ｌ−Ｘ、Ｍ−Ｘ、Ａ−Ｘ、Ｅ−Ｘ）；エラスターゼ；フリン；ＨｔｒＡ２（ＨｔｒＡセリンペプチダーゼ２）；プラスミン；プラスミノゲン（ＰＬＧ）；ＰＭＰＣＢ（ペプチダーゼ（ミトコンドリアプロセッシング）β）；プレカリクレイン；トリプシン；第Ｘａ因子（Ｉ−Ｅ／Ｄ−Ｇ−Ｒ）；第ＸＩａ、ＸＩＩａ、ＩＸ  ａ因子（Ｒ）；カリクレイン（Ｒ／Ｋ）；プロテインＣ（Ｒ）；トロンビン（Ｐ４−Ｐ３−Ｐ−Ｒ／Ｋ＊Ｐ１’−Ｐ２’−Ｐ３／Ｐ４疎水性；Ｐ１’／Ｐ２’非酸性；Ｐ２−Ｒ／Ｋ＊Ｐ１’  Ｐ２またはＰ１’はＧである）；およびペプシン（Ｆ−Ｚ、Ｍ−Ｚ、Ｌ−Ｚ、Ｗ−Ｚ消化（ここで、Ｚは疎水性残基である）、しかしながら他のものも切断する）が挙げられる。さらなるプロテアーゼおよびその切断特性は、当業者に知られており、例えば、Ｔｈｏｒｎｂｅｒｒｙら，Ａ  ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌ  ａｐｐｒｏａｃｈ  ｄｅｆｉｎｅｓ  ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｉｅｓ  ｏｆ  ｍｅｍｂｅｒｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｃａｓｐａｓｅ  ｆａｍｉｌｙ  ａｎｄ  ｇｒａｎｚｙｍｅ  Ｂ，Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２７２  １７９０７−１７９１１．Ｒｅｌｅａｓｅ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ａｎｄ  ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｆｕｓｉｏｎ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｕｓｉｎｇ  ａ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ｐｌａｎｔ  ｖｉｒｕｓ  ｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ，Ｐａｒｋｓ，Ｔ．Ｄ．，Ｋｅｕｔｈｅｒ，Ｋ．Ｋ．，Ｈｏｗａｒｄ，Ｅ．Ｄ．，Ｊｏｈｎｓｔｏｎ，Ｓ．Ａ．および  Ｄｏｕｇｈｅｒｔｙ，Ｗ．Ｇ．，Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ（１９９４）２１６  ４１３−４１７；Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｌｔｄ；Ｋｅｉｌ，Ｂ．Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｏｌｙｓｉｓ．Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ  Ｂｅｒｌｉｎ−Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ−ＮｅｗＹｏｒｋ，ｐｐ．３３５．（１９９２）；Ｌａｓｚｌｏ  Ｐｏｌｇａｒ，Ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅａｓｅ  Ａｃｔｉｏｎ（１９８９），ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ  Ｒａｔｏｎ；Ａｌｌｅｎ  Ｊ．Ｂａｒｒｅｔｔ，Ｎｅｉｌ  Ｄ．Ｒａｗｌｉｎｇｓ，Ｊ．Ｆ．Ｗｏｅｓｓｎｅｒ，Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｏｌｙｔｉｃ  Ｅｎｚｙｍｅｓ（２００４），Ｅｌｓｅｖｉｅｒ／Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓに記載されている。
【００７２】
親架橋ポリペプチドの配列内のプロテアーゼ切断部位を含むモチーフが決定された後、得られる改変ポリペプチドのプロテアーゼ安定性を最適化するため、該モチーフを第２のモチーフと交換する。一実施形態では、プロテアーゼ切断部位を含むモチーフを、２−アミノイソ酪酸などまたは本明細書に記載のような少なくとも１つのα，α−二置換アミノ酸を含む第２のモチーフと交換する。他の実施形態では、第１および第２の架橋アミノ酸を含む親ポリペプチド内で、プロテアーゼ切断部位を含むモチーフを、第２の架橋剤によってポリペプチド内の別のアミノ酸に連結された第３のアミノ酸を含むモチーフと交換する。例えば、架橋剤は、第３のアミノ酸を第１または第２のアミノ酸のいずれかに、得られるポリペプチドが、２つの架橋剤によって他の２つのアミノ酸に連結されたアミノ酸を含むように連結するものであり得る（「縫合型（ｓｔｉｔｃｈｅｄ）」ポリペプチド）。あるいは、架橋剤は、第３のアミノ酸を第１または第２のアミノ酸のいずれとも相違する第４のアミノ酸に、得られるポリペプチドが、共通のアミノ酸をもたない２つの架橋剤を含むように連結するものであり得る。
【００７３】
本発明のいくつかの実施形態において、ペプチド配列は、タンパク質のＢＣＬ−２ファミリーに由来する。ＢＣＬ−２ファミリーは、ＢＨ１、ＢＨ２、ＢＨ３、およびＢＨ４と呼ばれる、最大４つまでの保存ＢＣＬ−２相同性（ＢＨ）ドメインの存在によって規定され、これらのすべては、α−へリックスセグメントを含む（Ｃｈｉｔｔｅｎｄｅｎら（１９９５），ＥＭＢＯ  １４：５５８９；Ｗａｎｇら（１９９６），Ｇｅｎｅｓ  Ｄｅｖ．１０：２８５９）。ＢＣＬ−２およびＢＣＬ−ＸＬなどの抗アポトーシスタンパク質は、すべてのＢＨドメインにおいて配列保存を示す。プロアポトーシスタンパク質は、ＢＨ１、ＢＨ２、およびＢＨ３ドメインにおいて相同性を有する「多重ドメイン（ｍｕｌｔｉｄｏｍａｉｎ）」ファミリーメンバー（例えばＢＡＫ、ＢＡＸ）、ならびにＢＨ３両親媒性α−へリックスセグメントにおいて排他的に配列相同性を含有する「ＢＨ３ドメインのみの」ファミリーメンバー（例えばＢＩＤ、ＢＡＤ、ＢＩＭ、ＢＩＫ、ＮＯＸＡ、ＰＵＭＡ）に分類される。ＢＣＬ−２ファミリーメンバーは、ホモ二量体およびヘテロ二量体を形成するための能力を有し、このことは、プロアポトーシスタンパク質と抗アポトーシスタンパク質とのレベルの間の競合的な結合および比率が、死刺激に対する感受性を決定する（ｄｉｃｔａｔｅ）ことを示唆している。抗アポトーシスタンパク質は、プロアポトーシス過剰、つまり過剰なプログラム細胞死から細胞を保護するように機能する。追加の「防衛」手段としては、プロアポトーシスタンパク質の転写を調節すること、および、プロアポトーシスタンパク質を不活性なコンフォーマーとして維持することが挙げられる。死促進（ｐｒｏ−ｄｅａｔｈ）機能を活性化するために、タンパク質分解性の活性化、脱リン酸化、またはリガンド誘導性コンホメーション変化のいずれかが必要である。ある種の細胞型において、原形質膜で受け取られた死シグナルは、ミトコンドリア経路を介してアポトーシスを引き起こす。ミトコンドリアは、カスパーゼ９を活性化する、細胞質ゾル複合体の重要な成分であるシトクロムｃを隔離することにより、細胞死の門番（ｇａｔｅｋｅｅｐｅｒ）としての役割を担うことができ、これによって下流における致死的なタンパク質分解事象が生じる。ＢＣＬ−２／ＢＣＬ−ＸＬおよびＢＡＫ／ＢＡＸなどの多重ドメインタンパク質は、ミトコンドリア膜で保護者および実行者といった対立する（ｄｕｅｌｉｎｇ）役割を果たし、それらの活性は、ＢＣＬ−２ファミリーの上流のＢＨ３のみのメンバーによってさらに調節される。例えば、ＢＩＤは、プロアポトーシスのタンパク質のＢＨ３ドメインのみのファミリーのメンバーであり、原形質膜で受け取られる死シグナルを、ミトコンドリア膜のエフェクタープロアポトーシスタンパク質に伝達する。ＢＩＤは、プロアポトーシスタンパク質および抗アポトーシスタンパク質の両方と相互作用する能力を有し、カスパーゼ８による活性化に際して、シトクロムｃ放出およびミトコンドリアのアポトーシスを引き起こす。欠失および変異誘発の研究により、プロアポトーシスファミリーメンバーの両親媒性α−へリックスＢＨ３セグメントが、死ドメインとして機能する場合があり、従��て、多重ドメインアポトーシスタンパク質と相互作用するための重要な構造的モチーフに相当する（ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ）場合があることが確認された。構造的研究によって、ＢＨ３へリックスが、ＢＨ１、２、および３のドメインのインターフェースにより形成される疎水性の溝の中に挿入することによって、抗アポトーシスタンパク質と相互作用することができることが示された。活性化ＢＩＤは、抗アポトーシスタンパク質（例えばＢＣＬ−２およびＢＣＬ−ＸＬ）によって結合され、それらによって隔離され、そして、プロアポトーシスタンパク質ＢＡＸおよびＢＡＫの活性化を引き起こすことができ、シトクロムｃ放出およびミトコンドリアアポトーシスプログラムをもたらす。ＢＡＤもまた、その発現がＢＡＸ／ＢＡＫの活性化を引き起こすＢＨ３ドメインのみのプロアポトーシスファミリーメンバーである。しかしながら、ＢＩＤとは対照的に、ＢＡＤは、抗アポトーシスファミリーメンバーＢＣＬ−２およびＢＣＬ−ＸＬに対して優先的な結合を示す。ＢＡＤ  ＢＨ３ドメインは、ＢＣＬ−２に対して高い親和性結合を示すが、ＢＡＤ  ＢＨ３ペプチドは、ミトコンドリアからのシトクロムｃ放出をインビトロにおいて活性化することができず、このことは、ＢＡＤが、ＢＡＸ／ＢＡＫの直接の活性化因子ではないことを示唆している。ＢＣＬ−２を過剰発現するミトコンドリアは、ＢＩＤ誘導性シトクロムｃ放出に対して抵抗性であるが、ＢＡＤを用いる同時処理は、ＢＩＤ感度を回復することができる。ＢＡＤによるミトコンドリアアポトーシスの誘発は：（１）ＢＣＬ−２／ＢＣＬ−ＸＬ結合ポケットからの、ＢＩＤおよびＢＩＤ様タンパク質などのＢＡＸ／ＢＡＫ活性化因子の置き換えまたは（２）抗アポトーシスタンパク質によるＢＩＤ様タンパク質の隔離を予防するための、ＢＡＤによる、ＢＣＬ−２／ＢＣＬ−ＸＬ結合ポケットの選択的な占有、のいずれかに起因するようにみえる。従って、２つのクラスのＢＨ３ドメインのみのタンパク質、すなわち、ミトコンドリアアポトーシスを直接活性化するＢＩＤ様タンパク質、および、多重ドメイン抗アポトーシスタンパク質の結合ポケットを占有することによって、ＢＩＤ様プロアポトーシスに対する感受性をミトコンドリアに与えるための能力を有するＢＡＤ様タンパク質の２つが、明らかになっている。本明細書において開示される方法論に改めることのできるＢＣＬ−２ファミリーメンバータンパク質の種々のα−へリックスドメインは開示されている（Ｗａｌｅｎｓｋｙら（２００４），Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３０５：１４６６；およびＷａｌｅｎｓｋｙら、米国特許出願公開第２００５／０２５０６８０号、これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる）。
【００７４】
他の実施形態では、ペプチド配列は癌遺伝子タンパク質ＭＤＭ２に結合する腫瘍サプレッサーｐ５３タンパク質に由来する。ＭＤＭ２結合部位は、α−へリックスを形成するｐ５３腫瘍サプレッサーの領域内に位置する。米国特許第７，０８３，９８３号（その内容全体が参照によって本明細書に援用される）では、Ｌａｎｅらが、ＭＤＭ２に対する結合を担うｐ５３の領域が、成熟ヒトＰ５３タンパク質のアミノ酸１３〜３１（ＰＬＳＱＥＴＦＳＤＬＷＫＬＬＰＥＮＮＶ）によってほぼ示されることを開示する。Ｌａｎｅによって開示される他の改変された配列も本発明で意図される。さらに、ｐ５３およびＭＤＭ２の相互作用は、Ｓｈａｉｒら、（１９９７），Ｃｈｅｍ．＆Ｂｉｏｌ．４：７９１（その内容全体が参照によって本明細書に援用される）によって考察されており、かつｐ５３遺伝子における変異は、全ての報告された癌症例の実質半分で特定されている。細胞にストレスが課されるので、ｐ５３は、細胞周期停止およびＤＮＡ修復、またはプログラミングされた細胞死のいずれかをもたらす応答を組織化すると考えられる。ｐ５３タンパク質の機能を直接変更するｐ５３遺伝子の変異と同様、ｐ５３は、ＭＤＭ２における変化によっても変更され得る。ＭＤＭ２タンパク質は、ｐ５３に結合して、ｐ５３のトランス活性化ドメインと結合する（ａｓｓｏｃｉａｔｉｎｇ）ことによって転写活性化を破壊することが示されている。例えば、ｐ５３のトランス活性化ドメイン由来の１１アミノ酸のペプチドは、ＭＤＭ２の割れ目に挿入する２．５ターンの両親媒性α−へリックスを形成する。従って、いくつかの実施形態では、本発明の方法によって生成される新規なα−へリックス構造を操作して、へリックスアクセプターに緊密に結合し、かつ天然のタンパク質−タンパク質相互作用を破壊する構造を生成する。次いで、これらの構造を、ハイスループットの技術を用いてスクリーニングして、最適な低分子ペプチドを特定する。ＭＤＭ２相互作用を破壊するこの新規な構造は、多くの適用に有用であり、この適用としては限定するものではないが、軟部組織の肉腫（野性型ｐ５３の存在下でＭＤＭ２を過剰発現する）の制御が挙げられる。次いで、これらの癌は、いくつかの実施形態では、ＭＤＭ２を遮断する低分子を用いて防止され、それによってｐ５３の抑制が防止される。さらに、いくつかの実施形態では、ＭＤＭ２−ｐ５３相互作用の低分子破壊因子（ｄｉｓｒｕｐｔｅｒ）は、従来の化学療法でｐ５３依存性アポトーシス応答の程度を制御および調節することを補助するアジュバント療法として用いられる。
【００７５】
本発明での使用のための適切なペプチド配列の非限定的な例示のリストを下記に示す：
【００７６】
【表１】
2013507927.tif 000003
表１は、ＢＨ３結合部位を標的とし、癌、自己免疫障害、代謝性疾患および他のヒト疾患状態に関係するヒト配列を挙げている。
【００７７】
【表２】
2013507927.tif 000004
表２は、ＢＨ３結合部位を標的とし、癌、自己免疫障害、代謝性疾患および他のヒト疾患状態に関係するヒト配列を挙げている。
【００７８】
【表３】
2013507927.tif 000005
表３は、ＭＤＭ２／Ｘのｐ５３結合部位を標的とし、癌に関係するヒト配列を挙げている。
【００７９】
【表４】
2013507927.tif 000006
表４は、ヒトＧタンパク質共役レセプターを標的とし、かつ多くのヒト疾患状態に関係する配列を挙げている（Ｔｙｎｄａｌｌら（２００５）、Ｃｈｅｍ．Ｒｅｖ．１０５：７９３〜８２６）。
【００８０】
本発明のペプチド模倣大環状分子
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、式（Ｉ）：
【００８１】
【化１−２】
2013507927.tif 000007
【００８２】
を有し、
式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然または非天然のアミノ酸であり；
Ｂは、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【００８３】
【化２】
2013507927.tif 000008
【００８４】
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換される、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌは、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリール、またはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリール、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗの各々は独立して１〜１０００の整数であり；
ｘ、ｙおよびｚの各々は独立して０〜１０の整数であり；ｕは１〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である。
【００８５】
一例において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。別の例において、Ｒ１およびＲ２の両方は、独立して、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。いくつかの実施形態において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、メチルである。他の実施形態において、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。さらに他の実施形態では、Ｒ１またはＲ２のうち少なくとも一方が、式−Ｌ１−Ｌ２−のさらなる大環状分子リンカーである。例えば、本発明の大環状分子は少なくとも２つの架橋剤を含み、式Ｉに示すＲ１またはＲ２が、ペプチド模倣大環状分子内の第３のアミノ酸に連結された架橋剤である。
【００８６】
本発明のいくつかの実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも３である。本発明の他の実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である。本発明の大環状分子または大環状分子前駆体における、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの各出現（ｏｃｃｕｒｒｅｎｃｅ）は、独立して選択される。例えば、式［Ａ］ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一でない、例えばＧｌｎ−Ａｓｐ−Ａｌａである実施形態、および、アミノ酸が同一である、例えばＧｌｎ−Ｇｌｎ−Ｇｌｎである実施形態を包含する。これは、示される範囲におけるｘ、ｙ、またはｚの任意の値に適用される。
【００８７】
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、α−へリックスである二次構造を含み、Ｒ８は、−Ｈであり、へリックス内水素結合を可能にする。いくつかの実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。他の実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、
【００８８】
【化３】
2013507927.tif 000009
【００８９】
である。
【００９０】
他の実施形態において、第１のＣαから第２のＣαまで測定される大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαから第２のＣαまでの間のものを含むが、必ずしもこれらに限定されない、上記ペプチド模倣大環状分子の残基によって形成されるα−へリックスなどの所望の二次ペプチド構造を安定させるために選択される。
【００９１】
一実施形態において、式（Ｉ）のペプチド模倣大環状分子は：
【００９２】
【化４】
2013507927.tif 000010
【００９３】
である。
【００９４】
ここで、Ｒ１およびＲ２は各々独立して、独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、もしくはヘテロシクロアルキルである。
【００９５】
関連する実施形態において、式（Ｉ）のペプチド模倣大環状分子は：
【００９６】
【化５】
2013507927.tif 000011
【００９７】
である。
【００９８】
いくつかの実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、式：
【００９９】
【化６】
2013507927.tif 000012
を有しており、
式中、
Ａ、Ａ’、Ｃ、Ｃ’、ＤおよびＥはそれぞれ独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
ＢおよびＢ’はそれぞれ独立して、天然または非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【０１００】
【化７】
2013507927.tif 000013
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるか、またはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換される、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
ＬおよびＬ’はそれぞれ独立して、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリール、またはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８およびＲ８’はそれぞれ、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリール、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗはそれぞれ独立して１〜１０００の整数であり；
ｘ、ｙおよびｚはそれぞれ独立して０〜１０の整数であり；ｕは１〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である。
【０１０１】
他の実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、以下：
【０１０２】
【化８−１】
2013507927.tif 000014
【０１０３】
【化８−２】
2013507927.tif 000015
に示される式のいずれかの化合物であり、
式中、「ＡＡ」は、任意の天然または非天然アミノ酸側鎖を表し、かつ
【０１０４】
【化９】
2013507927.tif 000016
【０１０５】
は、上記で定義した［Ｄ］ｖ、［Ｅ］ｗであり、ｎは、０および２０、５０、１００、２００、３００、４００、または５００の間の整数である。いくつかの実施形態において、ｎは、０である。他の実施形態において、ｎは、５０未満である。
【０１０６】
大環状分子形成リンカーＬの例示的な実施形態は、下記に示される。
【０１０７】
【化１０】
2013507927.tif 000017
【０１０８】
本発明のペプチド模倣大環状分子の例示的な実施形態を以下に示す：
【０１０９】
【化１０−１】
2013507927.tif 000018
本発明のペプチド模倣大環状分子の他の実施形態としては、上記に示した大環状分子のアナログが挙げられる。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、本発明のペプチド模倣大環状分子は、式（ＩＩ）：
【０１１１】
【化１１】
2013507927.tif 000019
【０１１２】
を有しており、
式中：
Ａ、Ｃ、ＤおよびＥはそれぞれ独立して、天然または非天然のアミノ酸であり；
Ｂは、天然もしくは非天然のアミノ酸、アミノ酸アナログ、
【０１１３】
【化１２】
2013507927.tif 000020
【０１１４】
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換される、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌは、式
【０１１５】
【化１３】
2013507927.tif 000021
【０１１６】
の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１、Ｌ２、およびＬ３は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ、独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ、独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリール、またはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールまたはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗの各々は独立して１〜１０００の整数であり；
ｘ、ｙおよびｚの各々は独立して０〜１０の整数であり；ｕは１〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である。
【０１１７】
一例では、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。別の例において、Ｒ１およびＲ２の両方とも、独立して、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。いくつかの実施形態において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、メチルである。他の実施形態において、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。
【０１１８】
本発明のいくつかの実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも３である。本発明の他の実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である。本発明の大環状分子または大環状分子前駆体における、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの各出現は、独立して選択される。例えば、式［Ａ］ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一でない、例えばＧｌｎ−Ａｓｐ−Ａｌａである実施形態、および、アミノ酸が同一である、例えばＧｌｎ−Ｇｌｎ−Ｇｌｎである実施形態を包含する。これは、示される範囲におけるｘ、ｙ、またはｚの任意の値に適用される。
【０１１９】
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、α−へリックスである二次構造を含み、Ｒ８は、−Ｈであり、これによってへリックス内水素結合が可能になる。いくつかの実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。他の実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、
【０１２０】
【化１４】
2013507927.tif 000022
【０１２１】
である。
【０１２２】
他の実施形態において、第１のＣαから第２のＣαまで測定される大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαから第２のＣαまでの間のものを含むが、必ずしもこれらに限定されない、上記ペプチド模倣大環状分子の残基によって形成されるα−へリックスなどの所望の二次ペプチド構造を安定させるために選択される。
【０１２３】
大環状分子形成リンカーＬの例示的な実施形態は、下記に示される。
【０１２４】
【化１５】
2013507927.tif 000023
【０１２５】
【化１６】
2013507927.tif 000024
【０１２６】
他の実施形態において、本発明は、式（ＩＩＩ）のペプチド模倣大環状分子：
【０１２７】
【化１７】
2013507927.tif 000025
【０１２８】
を提供し、
式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【０１２９】
【化１８】
2013507927.tif 000026
【０１３０】
、［−ＮＨ−Ｌ４−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ４−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ４−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、非置換であるかもしくはＲ５で置換される、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３、およびＬ４は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであって、それぞれ、非置換であるかまたはＲ５で置換され；
Ｋは、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｒ５はそれぞれ、独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ、独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ７は、非置換であるかもしくはＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールまたはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８は、非置換であるかもしくはＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールまたはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗの各々は独立して１〜１０００の整数であり；
ｘ、ｙおよびｚの各々は独立して０〜１０の整数であり；ｕは１〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である。
【０１３１】
一例において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。別の例において、Ｒ１およびＲ２の両方は、独立して、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。いくつかの実施形態において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、メチルである。他の実施形態において、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。
【０１３２】
本発明のいくつかの実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも３である。本発明の他の実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、３、４、５、６、７、８、９、または１０である。本発明の大環状分子または大環状分子前駆体における、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの各々の出現は、独立して選択される。例えば、式［Ａ］ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一でない、例えばＧｌｎ−Ａｓｐ−Ａｌａである実施形態、および、アミノ酸が同一である、例えばＧｌｎ−Ｇｌｎ−Ｇｌｎである実施形態を包含する。これは、示される範囲におけるｘ、ｙ、またはｚの任意の値に適用される。
【０１３３】
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、α−へリックスである二次構造を含み、Ｒ８は、−Ｈであり、これによってへリックス内水素結合が可能になる。いくつかの実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。他の実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、
【０１３４】
【化１９】
2013507927.tif 000027
【０１３５】
である。
【０１３６】
他の実施形態において、第１のＣαから第２のＣαまで測定される大環状分子形成リンカー［−Ｌ１−Ｓ−Ｌ２−Ｓ−Ｌ３−］の長さは、第１のＣαから第２のＣαまでの間のものを含むが、必ずしもこれらに限定されない、上記ペプチド模倣大環状分子の残基によって形成されるα−へリックスなどの所望の二次ペプチド構造を安定させるために選択される。
【０１３７】
大環状分子または大環状分子前駆体は、例えば液相法または固相法によって合成され、天然に存在するアミノ酸および天然に存在しないアミノ酸の両方を含むことができる。例えばＣｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ａｍｉｎｏ  Ａｃｉｄｓ、Ｇ．Ｃ．Ｂａｒｒｅｔｔ編、Ｃｈａｐｍａｎ  ａｎｄ  Ｈａｌｌ、１９８５の中のＨｕｎｔ、「Ｔｈｅ  Ｎｏｎ−Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ａｍｉｎｏ  Ａｃｉｄｓ」を参照のこと。いくつかの実施形態では、チオール部分は、アミノ酸残基Ｌ−システイン、Ｄ−システイン、α−メチル−Ｌシステイン、α−メチル−Ｄ−システイン、Ｌ−ホモシステイン、Ｄ−ホモシステイン、α−メチル−Ｌ−ホモシステイン、またはα−メチル−Ｄ−ホモシステインの側鎖である。ビスアルキル化試薬は、一般式Ｘ−Ｌ２−Ｙで表されるものであり、式中、Ｌ２は、リンカー部分であり、ＸおよびＹは、Ｌ２との結合を形成するために−ＳＨ部分によって置き換えられる脱離基である。いくつかの実施形態において、ＸおよびＹは、Ｉ、Ｂｒ、またはＣｌなどのハロゲンである。
【０１３８】
他の実施形態において、式Ｉ、ＩＩ、またはＩＩＩの化合物におけるＤおよび／またはＥは、細胞の取り込みを促進するためにさらに改変される。いくつかの実施形態において、ペプチド模倣大環状分子の脂質付加（ｌｉｐｉｄａｔｉｎｇ）またはペグ化（ＰＥＧｙｌａｔｉｎｇ）は、細胞の取り込みを促進し、バイオアベイラビリティを増大させ、血液循環を増加させ、薬物動態を改変し、免疫原性を低下させ、および／または必要とされる投与の頻度を減少させる。
【０１３９】
他の実施形態において、式Ｉ、ＩＩ、またはＩＩＩの化合物における、［Ｄ］および［Ｅ］の少なくとも１つは、上記ペプチド模倣大環状分子が、少なくとも２つの大環状分子形成リンカーを含むような、追加の大環状分子形成リンカーを含む部分を表す。特定の実施形態において、ペプチド模倣大環状分子は、２つの大環状分子形成リンカーを含む。
【０１４０】
本発明のペプチド模倣大環状分子では、本明細書に記載されている任意の大環状分子形成リンカーは、表１〜４に示される任意の配列との任意の組み合わせで、および本明細書において示される任意のＲ−置換基との任意の組合せでも、用いられてもよい。
【０１４１】
いくつかの実施形態において、上記ペプチド模倣大環状分子は、少なくとも１つのα−へリックスモチーフを含む。例えば、式Ｉ、ＩＩ、またはＩＩＩの化合物におけるＡ、Ｂ、および／またはＣは、１つ以上のα−へリックスを含む。一般的な問題として、α−へリックスは、１ターンあたり３〜４個のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態において、上記ペプチド模倣大環状分子のα−へリックスは、１〜５個のターン、および従って３〜２０個のアミノ酸残基を含む。特定の実施形態において、α−へリックスは、１個のターン、２個のターン、３個のターン、４個のターン、または５個のターンを含む。いくつかの実施形態において、大環状分子形成リンカーは、上記ペプチド模倣大環状分子内に含まれるα−へリックスモチーフを安定化させる。従って、いくつかの実施形態において、第１のＣαから第２のＣαまでの大環状分子形成リンカーＬの長さは、α−へリックスの安定性を増加させるために選択される。いくつかの実施形態において、大環状分子形成リンカーは、α−へリックスの１ターン〜５ターンまでの間に架かる（ｓｐａｎ）。いくつかの実施形態において、大環状分子形成リンカーは、α−へリックスの約１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンに架かる。いくつかの実施形態において、大環状分子形成リンカーの長さは、α−へリックスの１ターンあたり約５Å〜９Åまたはα−へリックスの１ターンあたり約６Å〜８Åである。大環状分子形成リンカーが、α−へリックスの約１ターンに架かる場合、その長さは、約５個の炭素−炭素結合〜１３個の炭素−炭素結合、約７個の炭素−炭素結合〜１１個の炭素−炭素結合、または約９個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーが、α−へリックスの約２ターンに架かる場合、その長さは、約８個の炭素−炭素結合〜１６個の炭素−炭素結合、約１０個の炭素−炭素結合〜１４個の炭素−炭素結合、または約１２個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーが、α−へリックスの約３ターンに架かる場合、その長さは、約１４個の炭素−炭素結合〜２２個の炭素−炭素結合、約１６個の炭素−炭素結合〜２０個の炭素−炭素結合、または約１８個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーが、α−へリックスの約４ターンに架かる場合、その長さは、約２０個の炭素−炭素結合〜２８個の炭素−炭素結合、約２２個の炭素−炭素結合〜２６個の炭素−炭素結合、または約２４個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーが、α−へリックスの約５ターンに架かる場合、その長さは、約２６個の炭素−炭素結合〜３４個の炭素−炭素結合、約２８個の炭素−炭素結合〜３２個の炭素−炭素結合、または約３０個の炭素−炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーが、α−へリックスの約１ターンに架かる場合、その連結は、約４個の原子〜１２個の原子、約６個の原子〜１０個の原子、または約８個の原子を含む。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約２ターンに架かる場合、その連結は、約７個の原子〜１５個の原子、約９個の原子〜１３個の原子、または約１１個の原子を含む。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約３ターンに架かる場合、その連結は、約１３個の原子〜２１個の原子、約１５個の原子〜１９個の原子、または約１７個の原子を含む。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約４ターンに架かる場合、その連結は、約１９個の原子〜２７個の原子、約２１個の原子〜２５個の原子、または約２３個の原子を含む。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約５ターンに架かる場合、その連結は、約２５個の原子〜３３個の原子、約２７個の原子〜３１個の原子、または約２９個の原子を含む。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約１ターンに架かる場合、得られる大環状分子は、約１７員〜２５員、約１９員〜２３員、または約２１員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約２ターンに架かる場合、得られる大環状分子は、約２９員〜３７員、約３１員〜３５員、または約３３員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約３ターンに架かる場合、得られる大環状分子は、約４４員〜５２員、約４６員〜５０員、または約４８員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約４ターンに架かる場合、得られる大環状分子は、約５９員〜６７員、約６１員〜６５員、または約６３員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーが、上記α−へリックスの約５ターンに架かる場合、得られる大環状分子は、約７４員〜８２員、約７６員〜８０員、または約７８員を含有する環を形成する。
【０１４２】
他の実施形態において、本発明は、式（ＩＶ）または（ＩＶａ）のペプチド模倣大環状分子を提供し、
【０１４３】
【化２０】
2013507927.tif 000028
【０１４４】
式中、
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【０１４５】
【化２１】
2013507927.tif 000029
【０１４６】
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、もしくはヘテロシクロアルキル、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換される、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌは、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ、独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ、独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
ｖは１〜１０００の整数であり；
ｗは１〜１０００の整数であり；
ｘは０〜１０の整数であり；
ｙは０〜１０の整数であり；
ｚは０〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である。
【０１４７】
一例において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。別の例において、Ｒ１およびＲ２の両方は、独立して、非置換であるかまたはハロ−で置換されるアルキルである。いくつかの実施形態において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、メチルである。他の実施形態において、Ｒ１およびＲ２は、メチルである。
【０１４８】
本発明のいくつかの実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、少なくとも３である。本発明の他の実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である。本発明の大環状分子または大環状分子前駆体における、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの各々の出現は、独立して選択される。例えば、式［Ａ］ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一でない、例えばＧｌｎ−Ａｓｐ−Ａｌａである実施形態、および、アミノ酸が同一である、例えばＧｌｎ−Ｇｌｎ−Ｇｌｎである実施形態を包含する。これは、示される範囲におけるｘ、ｙ、またはｚの任意の値に適用される。
【０１４９】
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、α−へリックスである二次構造を含み、かつＲ８は、−Ｈであり、これによってへリックス内水素結合が可能になる。いくつかの実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。他の実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、またはＥの少なくとも１つは、
【０１５０】
【化２２】
2013507927.tif 000030
【０１５１】
である。
【０１５２】
他の実施形態において、第１のＣαから第２のＣαまで測定される大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαから第２のＣαまでの間のものを含むが、必ずしもこれらに限定されない、上記ペプチド模倣大環状分子の残基によって形成されるα−へリックスなどの所望の二次ペプチド構造を安定させるために選択される。
【０１５３】
大環状分子形成リンカーＬの例示的な実施形態は、下記に示される。
【０１５４】
【化２３】
2013507927.tif 000031
【０１５５】
ペプチド模倣大環状分子の調製
本発明のペプチド模倣大環状分子は、当技術分野において公知の任意の種々の方法によって調製され得る。例えば、表１、２、３または４において「Ｘ」で示される任意の残基が、同じ分子中の第２の残基またはそのような残基の前駆体とクロスリンカーを形成し得る残基で置換されてもよい。
【０１５６】
ペプチド模倣大環状分子の形成をもたらすための種々の方法が、当技術分野において公知である。例えば、式Ｉのペプチド模倣大環状分子の調製は、Ｓｃｈａｆｍｅｉｓｔｅｒら，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２２：５８９１−５８９２（２０００）；Ｓｃｈａｆｍｅｉｓｔｅｒ  ＆  Ｖｅｒｄｉｎｅ，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２２：５８９１（２００５）；Ｗａｌｅｎｓｋｙら，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３０５：１４６６−１４７０（２００４）；および米国特許７，１９２，７１３において記載されている。引用文献において開示されているα，α−二置換アミノ酸およびアミノ酸前駆体を、ペプチド模倣大環状分子の前駆体ポリペプチドの合成において使用してもよい。このようなアミノ酸を前駆体ポリペプチド中に組み込んだ後、末端オレフィンをメタセシス触媒と反応させ、これによってペプチド模倣大環状分子の形成をもたらす。
【０１５７】
他の実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、式ＩＶまたはＩＶａである。このような大環状分子の調製のための方法は、例えば、米国特許第７，２０２，３３２号において記載されている。
【０１５８】
いくつかの実施形態において、これらのペプチド模倣大環状分子の合成は、アジド部分およびアルキン部分を含有するペプチド模倣物前駆体の合成；その後ペプチド模倣物前駆体を大環状分子化試薬と接触させて、トリアゾール結合ペプチド模倣大環状分子を生成させることを特徴とする複数段階工程を含む。大環状分子または大環状分子前駆体は、例えば、液相法または固相法によって合成され、天然に存在するおよび天然に存在しないアミノ酸の両方を含有することができる。例えば、Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ａｍｉｎｏ  Ａｃｉｄｓ、Ｇ．Ｃ．Ｂａｒｒｅｔｔ編、Ｃｈａｐｍａｎ  ａｎｄ  Ｈａｌｌ、１９８５年の中のＨｕｎｔ、「Ｔｈｅ  Ｎｏｎ−Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ａｍｉｎｏ  Ａｃｉｄｓ」を参照のこと。
【０１５９】
いくつかの実施形態において、アジドはある残基のα−炭素に結合しており、アルキンは別の残基のα−炭素に結合している。いくつかの実施形態において、アジド部分は、アミノ酸Ｌ−リジン、Ｄ−リジン、α−メチル−Ｌ−リジン、α−メチル−Ｄ−リジン、Ｌ−オルニチン、Ｄ−オルニチン、α−メチル−Ｌ−オルニチンまたはα−メチル−Ｄ−オルニチンのアジド−アナログである。他の実施形態では、アジド部分は、２−アミノ−７−アジド−２−メチルヘプタン酸または２−アミノ−６−アジド−２−メチルヘキサン酸である。別の実施形態において、アルキン部分は、Ｌ−プロパルギルグリシンである。さらに別の実施形態において、アルキン部分は、Ｌ−プロパルギルグリシン、Ｄ−プロパルギルグリシン、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−５−ヘキシン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−５−ヘキシン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−７−オクチン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−７−オクチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−８−ノニン酸および（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−８−ノニン酸からなる群より選択されるアミノ酸である。
【０１６０】
いくつかの実施形態において、本発明は、ペプチド模倣大環状分子を合成するための方法であって、式Ｖまたは式ＶＩ：
【０１６１】
【化３０】
2013507927.tif 000032
であって、
式中、ｖ、ｗ、ｘ、ｙ、ｚ、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ７、Ｒ８、Ｌ１およびＬ２は式（ＩＩ）で定義されたとおりであり、大環状分子化試薬がＣｕ試薬である場合Ｒ１２は−Ｈであり、大環状分子化試薬がＲｕ試薬である場合Ｒ１２は−Ｈまたはアルキルである、ペプチド模倣物前駆体を、大環状分子化試薬と接触させる工程を含み、さらにこの接触させる工程が、式ＩＩＩまたは式ＩＶにおいてアルキンとアジド部分との間に形成される共有結合をもたらす、方法を提供する。例えば、大環状分子化試薬がＲｕ試薬である場合、Ｒ１２はメチルであってもよい。
【０１６２】
本発明のペプチド模倣大環状分子において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである。いくつかの実施形態において、Ｒ１およびＲ２の両方が独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである。いくつかの実施形態において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、α，α−二置換アミノ酸である。１つの例では、Ｂはα，α−二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２−アミノイソ酪酸である。
【０１６３】
例えば、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つは、非置換であるかまたはハロ−で置換される、アルキルである。別の例において、Ｒ１およびＲ２の両方が独立して、非置換であるかまたはハロ−で置換される、アルキルである。いくつかの実施形態において、Ｒ１およびＲ２の少なくとも１つはメチルである。他の実施形態において、Ｒ１およびＲ２はメチルである。大環状分子化試薬は、Ｃｕ試薬であっても、またはＲｕ試薬であってもよい。
【０１６４】
いくつかの実施形態において、ペプチド模倣物前駆体は、接触工程の前に精製される。他の実施形態において、上記ペプチド模倣大環状分子は、接触工程の後に精製される。さらに他の実施形態において、上記ペプチド模倣大環状分子は、接触工程の後に再折り畳み（リフォールディング）される。この方法は溶液中で行われてもよいし、または、あるいは、この方法は固体支持体上で行われてもよい。
【０１６５】
上記結合に有利な条件下でペプチド模倣物前駆体またはペプチド模倣大環状分子に結合する、標的高分子の存在下で本発明の方法を行うこともまた、本発明において想定される。いくつかの実施形態において、この方法は、上記結合に有利な条件下でペプチド模倣物前駆体またはペプチド模倣大環状分子に優先的に結合する標的高分子の存在下で行われる。またこの方法を適用して、ペプチド模倣大環状分子のライブラリーを合成してもよい。
【０１６６】
いくつかの実施形態において、式Ｖまたは式ＶＩのペプチド模倣物前駆体のアルキン部分は、Ｌ−プロパルギルグリシン、Ｄ−プロパルギルグリシン、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−５−ヘキシン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−５−ヘキシン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−７−オクチン酸、（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−７−オクチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−８−ノニン酸、および（Ｒ）−２−アミノ−２−メチル−８−ノニン酸からなる群より選択されるアミノ酸の側鎖である。他の実施形態において、式Ｖまたは式ＶＩのペプチド模倣物前駆体のアジド部分は、ε−アジド−Ｌ−リジン、ε−アジド−Ｄ−リジン、ε−アジド−α−メチル−Ｌ−リジン、ε−アジド−α−メチル−Ｄ−リジン、δ−アジド−α−メチル−Ｌ−オルニチン、およびδ−アジド−α−メチル−Ｄ−オルニチンからなる群より選択されるアミノ酸の側鎖である。
【０１６７】
いくつかの実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは３であり、Ａ、ＢおよびＣは独立して、天然または非天然のアミノ酸である。他の実施形態において、ｘ＋ｙ＋ｚは６であり、Ａ、ＢおよびＣは独立して天然または非天然のアミノ酸である。
【０１６８】
本発明のペプチド模倣大環状分子のいくつかの実施形態において、［Ｄ］Ｖおよび／または［Ｅ］Ｗは、追加のペプチド模倣大環状分子または大環状分子構造（ｍａｃｒｏｃｙｃｌｉｃ  ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ）を含む。例えば、［Ｄ］Ｖは、式：
【０１６９】
【化３１】
2013507927.tif 000033
を有してもよく、
式中、Ａ、Ｃ、Ｄ’、およびＥ’はそれぞれ独立して、天然または非天然のアミノ酸であり；
Ｂは、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【０１７０】
【化３２】
2013507927.tif 000034
【０１７１】
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、もしくはヘテロシクロアルキル、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換される、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換されており；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体、または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換される、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
ｖは１〜１０００の整数であり；
ｗは１〜１０００の整数であり；かつ
ｘは０〜１０の整数である。
【０１７２】
別の実施形態において、［Ｅ］Ｗは、式：
【０１７３】
【化３３】
2013507927.tif 000035
【０１７４】
を有し、式中、置換基は、前段落において定義されたとおりである。
【０１７５】
いくつかの実施形態において、接触工程は、プロトン性溶媒（ｐｒｏｔｉｃ  ｓｏｌｖｅｎｔ）、水性溶媒、有機溶媒、およびこれらの混合物からなる群より選択される溶媒において行われる。例えば、溶媒は、Ｈ２Ｏ、ＴＨＦ、ＴＨＦ／Ｈ２Ｏ、ｔＢｕＯＨ／Ｈ２Ｏ、ＤＭＦ、ＤＩＰＥＡ、ＣＨ３ＣＮまたはＣＨ２Ｃｌ２、ＣｌＣＨ２ＣＨ２Ｃｌまたはこれらの混合物からなる群から選択されてもよい。溶媒は、へリックス形成に有利な溶媒であってもよい。
【０１７６】
代替であるが等価な保護基、脱離基または試薬は置換され、かつ特定の合成工程は、代替の順番または所望の化合物を生成する順序で行われる。本明細書に記載の化合物の合成において有用な、合成化学による変換および保護基の方法論（保護および脱保護）としては、例えば、Ｌａｒｏｃｋ、Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎｓ、ＶＣＨ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ（１９８９）；ＧｒｅｅｎｅおよびＷｕｔｓ、Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ  Ｇｒｏｕｐｓ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ、第２版、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ（１９９１）；ＦｉｅｓｅｒおよびＦｉｅｓｅｒ、Ｆｉｅｓｅｒ  ａｎｄ  Ｆｉｅｓｅｒ’ｓ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ  ｆｏｒ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ（１９９４）；およびＰａｑｕｅｔｔｅ編、Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  ｏｆ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ  ｆｏｒ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ（１９９５）、ならびにこれらの後続の版において記載されているものなどを含む。
【０１７７】
本発明のペプチド模倣大環状分子は、例えば、Ｆｉｅｌｄｓら、Ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ  Ｐｅｐｔｉｄｅｓ：Ａ  Ｕｓｅｒ’ｓ  Ｇｕｉｄｅの第３章、Ｇｒａｎｔ編、Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ＆Ｃｏ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．、１９９２年、７７頁において記載されているものなどの化学合成法によって製造される。従って、例えば、ペプチドは、固相合成の自動化メリフィールド（Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ）技術を用いて、側鎖保護アミノ酸を用いてｔＢｏｃまたはＦｍｏｃ化学のいずれかによって保護されたアミンを用いて、例えば、自動ペプチド合成機（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ、ＣＡ）、４３０Ａ、４３１、または４３３型）において合成される。
【０１７８】
本明細書に記載のペプチド模倣物前駆体およびペプチド模倣大環状分子を製造する１つの方法は、固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）を用いる。Ｃ末端アミノ酸は、リンカー分子との酸不安定結合を介して架橋ポリスチレン樹脂に結合している。この樹脂は、合成に用いられる溶媒において不溶性であり、このため比較的簡単にかつ迅速に過剰な試薬および副産物を洗い流すようになる。Ｎ末端は、Ｆｍｏｃ基で保護されており、酸において安定であるが塩基によって除去することができる。側鎖官能基は、必要に応じて塩基に安定だが酸に不安定な基で保護されている。
【０１７９】
より長いペプチド模倣物前駆体は、例えば、自然な化学的ライゲーション（ｎａｔｉｖｅ  ｃｈｅｍｉｃａｌ  ｌｉｇａｔｉｏｎ）を用いて個々の合成ペプチドを結合することによって作製される。あるいは、より長い合成ペプチドは、周知の組換えＤＮＡ技術およびタンパク質発現技術によって生合成される。このような技術は、周知の標準的マニュアルにおいて詳細なプロトコールとともに提供されている。本発明のペプチド模倣物前駆体をコードする遺伝子を構築するために、アミノ酸配列を逆翻訳して、好ましくは遺伝子が発現される生物体に最適なコドンを有する、アミノ酸配列をコードする核酸配列を得る。次に、合成遺伝子を、典型的には、必要であればペプチドおよび任意の調節エレメントをコードするオリゴヌクレオチドを合成することによって作製する。合成遺伝子を適切なクローニングベクター中に挿入し、宿主細胞中にトランスフェクトする。次いでペプチドを、選択した発現系および宿主に適した適切な条件下で発現させる。ペプチドを標準的な方法によって精製し特徴付ける。
【０１８０】
ペプチド模倣物前駆体は、例えば、ハイスループット多チャンネルコンビナトリアル合成装置（例えば、ＣｒｅｏＳａｌｕｓ、Ｌｏｕｉｓｖｉｌｌｅ、ＫＹ製のＴｈｕｒａｍｅｄ  ＴＥＴＲＡＳマルチチャンネルペプチド合成装置またはＡＡＰＰＴＥＣ、Ｉｎｃ．、Ｌｏｕｉｓｖｉｌｌｅ、ＫＹ製のＭｏｄｅｌ  Ａｐｅｘ  ３９６マルチチャンネルペプチド合成装置）を用いるハイスループットなコンビナトリアル法において、例えば作製される。
【０１８１】
以下の合成スキームは、本発明を例示するためだけに提供され、本明細書に記載の本発明の範囲を限定することを意図するものではない。図面を簡略化するために、例示的なスキームは、アジドアミノ酸アナログであるε−アジド−α−メチル−Ｌ−リジンおよびε−アジド−α−メチル−Ｄ−リジン、ならびにアルキンアミノ酸アナログであるＬ−プロパルギルグリシン、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、および（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸を表す。従って、以下の合成スキームにおいて、各々のＲ１、Ｒ２、Ｒ７およびＲ８は、−Ｈであり；各々のＬ１は−（ＣＨ２）４−であり；各々のＬ２は−（ＣＨ２）−である。しかしながら、上記の詳細な説明の全体にわたって述べたように、多くの他のアミノ酸アナログを使用することが可能で、ここでＲ１、Ｒ２、Ｒ７、Ｒ８、Ｌ１およびＬ２は、本明細書に開示されている種々の構造から独立して選択することができる。
【０１８２】
合成スキーム１
【０１８３】
【化３４】
2013507927.tif 000036
合成スキーム１は、本発明のいくつかの化合物の調製を示す。キラル補助基（Ｓ）−２−［Ｎ−（Ｎ’−ベンジルプロリル）アミノ］ベンゾフェノン（ＢＰＢ）およびグリシンまたはアラニンなどのアミノ酸に由来するシッフ塩基のＮｉ（ＩＩ）複合体は、Ｂｅｌｏｋｏｎら（１９９８）、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ａｓｙｍｍ．９：４２４９〜４２５２において記載されているとおり調製する。得られた複合体を引き続き、アジドまたはアルキニル部分を含むアルキル化試薬と反応させて、鏡像異性的に濃縮された本発明の化合物を得る。必要に応じて、ペプチド合成において使用するために、得られた化合物を保護してもよい。合成スキーム１のいくつかの実施形態では、Ｘはヨウ素である。
【０１８４】
合成スキーム２
【０１８５】
【化３５】
2013507927.tif 000037
合成スキーム２に示されるペプチド模倣大環状分子の合成のための一般的な方法において、ペプチド模倣物前駆体は、アジド部分およびアルキン部分を含み、市販のアミノ酸Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｌ−プロパルギルグリシンならびにアミノ酸（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−６−ヘプチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、Ｎ−メチル−ε−アジド−Ｌ−リジン、およびＮ−メチル−ε−アジド−Ｄ−リジンのＮ−α−Ｆｍｏｃ保護形態を用いる、液相または固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。次いでペプチド模倣物前駆体は、標準的な条件（例えば、９５％ＴＦＡなどの強酸）によって脱保護され、固相樹脂から切断される。ペプチド模倣物前駆体を、粗混合物として反応させるか、または有機溶液もしくは水性溶液においてＣｕ（Ｉ）などの大環状分子化試薬との反応の前に精製する（Ｒｏｓｔｏｖｔｓｅｖら（２００２）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．４１：２５９６〜２５９９；Ｔｏｒｎｏｅら（２００２）、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．６７：３０５７〜３０６４；Ｄｅｉｔｅｒｓら（２００３）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２５：１１７８２〜１１７８３；Ｐｕｎｎａら（２００５）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．４４：２２１５〜２２２０）。一実施形態において、トリアゾール形成反応は、α−へリックス形成に有利な条件下で行われる。一実施形態において、大環状分子化工程は、Ｈ２Ｏ、ＴＨＦ、ＣＨ３ＣＮ、ＤＭＦ、ＤＩＰＥＡ、ｔＢｕＯＨまたはこれらの混合物からなる群より選択される溶媒において行われる。別の実施形態において、大環状分子化工程はＤＭＦにおいて行われる。いくつかの実施形態において、大環状分子化工程は、緩衝化された水性の溶媒または部分的に水性の溶媒において行われる。
【０１８６】
合成スキーム３
【０１８７】
【化３６】
2013507927.tif 000038
合成スキーム３に示されるペプチド模倣大環状分子の合成のための一般的な方法において、ペプチド模倣物前駆体は、アジド部分およびアルキン部分を含み、市販のアミノ酸Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｌ−プロパルギルグリシンならびにアミノ酸（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−６−ヘプチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、Ｎ−メチル−ε−アジド−Ｌ−リジン、およびＮ−メチル−ε−アジド−Ｄ−リジンのＮ−α−Ｆｍｏｃ保護形態を用いた、固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。ペプチド模倣物前駆体を、樹脂上で粗混合物としてＣｕ（Ｉ）試薬などの大環状分子化試薬と反応させる（Ｒｏｓｔｏｖｔｓｅｖら（２００２）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．４１：２５９６〜２５９９；Ｔｏｒｎｏｅら（２００２）、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．６７：３０５７〜３０６４；Ｄｅｉｔｅｒｓら（２００３）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２５：１１７８２〜１１７８３；Ｐｕｎｎａら（２００５）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．４４：２２１５〜２２２０）。次いで、得られたトリアゾール含有ペプチド模倣大環状分子を、標準的な条件（例えば、９５％ＴＦＡなどの強酸）によって脱保護して、固相樹脂から切断する。いくつかの実施形態において、大環状分子化工程は、ＣＨ２Ｃｌ２、ＣｌＣＨ２ＣＨ２Ｃｌ、ＤＭＦ、ＴＨＦ、ＮＭＰ、ＤＩＰＥＡ、２、６−ルチジン、ピリジン、ＤＭＳＯ、Ｈ２Ｏまたはこれらの混合物からなる群より選択される溶媒において行われる。いくつかの実施形態では、アルコルビン酸ナトリウムなどの還元剤の溶液が使用され得る。いくつかの実施形態において、大環状分子化工程は、緩衝化された水性の溶媒または部分的に水性の溶媒において行われる。
【０１８８】
合成スキーム４
【０１８９】
【化３７】
2013507927.tif 000039
合成スキーム４に示されるペプチド模倣大環状分子の合成のための一般的な方法において、ペプチド模倣物前駆体は、アジド部分およびアルキン部分を含み、市販のアミノ酸Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｌ−プロパルギルグリシンならびにアミノ酸（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−６−ヘプチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、Ｎ−メチル−ε−アジド−Ｌ−リジン、およびＮ−メチル−ε−アジド−Ｄ−リジンのＮ−α−Ｆｍｏｃ保護形態を用いる、液相または固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。次いでペプチド模倣物前駆体は、標準的な条件（例えば、９５％ＴＦＡなどの強酸）によって脱保護され、固相樹脂から切断される。ペプチド模倣物前駆体は、粗混合物として反応させるか、またはＲｕ（ＩＩ）試薬、例えば、Ｃｐ＊ＲｕＣｌ（ＰＰｈ３）２もしくは［Ｃｐ＊ＲｕＣｌ］４などの大環状分子化試薬と反応させる前に精製する（Ｒａｓｍｕｓｓｅｎら（２００７）、Ｏｒｇ．Ｌｅｔｔ．９：５３３７〜５３３９；Ｚｈａｎｇら（２００５）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２７：１５９９８〜１５９９９）。いくつかの実施形態において、大環状分子化工程は、ＤＭＦ、ＣＨ３ＣＮ、ベンゼン、トルエンおよびＴＨＦからなる群より選択される溶媒において行われる。
【０１９０】
合成スキーム５
【０１９１】
【化３８】
2013507927.tif 000040
合成スキーム５に示されるペプチド模倣大環状分子の合成のための一般的な方法において、ペプチド模倣物前駆体は、アジド部分およびアルキン部分を含み、かつ市販のアミノ酸Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｌ−プロパルギルグリシンならびにアミノ酸（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−４−ペンチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−６−ヘプチン酸、（Ｓ）−２−アミノ−２−メチル−６−ヘプチン酸、Ｎ−メチル−ε−アジド−Ｌ−リジン、Ｎ−メチル−ε−アジド−Ｄ−リジン、２−アミノ−７−アジド−２−メチルヘプタン酸および２−アミノ−６−アジド−２−メチルヘキサン酸のＮ−α−Ｆｍｏｃ保護形態を用いる、固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。ペプチド模倣物前駆体を、粗混合物として樹脂上でＲｕ（ＩＩ）試薬などの大環状分子化試薬と反応させる。例えば、試薬はＣｐ＊ＲｕＣｌ（ＰＰｈ３）２または［Ｃｐ＊ＲｕＣｌ］４であってもよい（Ｒａｓｍｕｓｓｅｎら（２００７）、Ｏｒｇ．Ｌｅｔｔ．９：５３３７〜５３３９；Ｚｈａｎｇら（２００５）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２７：１５９９８〜１５９９９）。いくつかの実施形態において、大環状分子化工程は、ＣＨ２Ｃｌ２、ＣｌＣＨ２ＣＨ２Ｃｌ、ＣＨ３ＣＮ、ＤＭＦ、ベンゼン、トルエンおよびＴＨＦからなる群より選択される溶媒において行われる。
【０１９２】
いくつかの例示的なペプチド模倣大環状分子を表５に示す。「Ｎｌｅ」はノルロイシンを表し、メチオニン残基を置換する。同様なリンカーを用いて、表１〜表４において開示されているポリペプチド配列に基づいてペプチド模倣大環状分子を合成することが想定される。
【０１９３】
【表５−１】
2013507927.tif 000041
【０１９４】
【表５−２】
2013507927.tif 000042
表５は、例示的な本発明のペプチド模倣大環状分子を示す。「Ｎｌｅ」はノルロイシンを示す。
【０１９５】
本発明は、本明細書に記載のペプチド模倣大環状分子の合成における天然に存在しないアミノ酸およびアミノ酸アナログの使用を想定する。安定なトリアゾール含有ペプチド模倣大環状分子の合成のために使用される合成方法を行い易い任意のアミノ酸またはアミノ酸アナログを、本発明において用いることができる。例えば、Ｌ−プロパルギルグリシンが本発明において有用なアミノ酸として想定される。しかし、異なるアミノ酸側鎖を含む他のアルキン含有アミノ酸もまた、本発明において有用である。例えば、Ｌ−プロパルギルグリシンは、アミノ酸のα−炭素とアミノ酸側鎖のアルキンとの間に１つのメチレン単位を含む。本発明はまた、α−炭素とアルキンとの間に複数のメチレン単位を有するアミノ酸の使用も想定する。また、アミノ酸であるＬ−リジン、Ｄ−リジン、α−メチル−Ｌ−リジン、およびα−メチル−Ｄ−リジンのアジド−アナログが、本発明において有用なアミノ酸であると想定される。しかし、異なるアミノ酸側鎖を含有する他の末端アジドアミノ酸もまた、本発明において有用である。例えば、Ｌ−リジンのアジドアナログは、アミノ酸のα−炭素とアミノ酸側鎖の末端アジドとの間に４つのメチレン単位を含む。本発明はまた、α−炭素と末端アジドとの間に４つ未満のメチレン単位または４つより多いメチレン単位を有するアミノ酸の使用も想定する。表６は、本発明のペプチド模倣大環状分子の調製において有用ないくつかのアミノ酸を示す。
【０１９６】
【表６】
2013507927.tif 000043
表６は、本発明のペプチド模倣大環状分子の調製において有用な例示的アミノ酸を示す。
【０１９７】
いくつかの実施形態において、アミノ酸およびアミノ酸アナログはＤ−配置のものである。他の実施形態において、アミノ酸およびアミノ酸アナログはＬ−配置のものである。いくつかの実施形態において、ペプチド模倣物中に含有されるアミノ酸およびアミノ酸アナログの一部はＤ−配置のものであるが、アミノ酸およびアミノ酸アナログの一部はＬ−配置のものである。いくつかの実施形態においてアミノ酸アナログは、α−メチル−Ｌ−プロパルギルグリシン、α−メチル−Ｄ−プロパルギルグリシン、ε−アジド−α−メチル−Ｌ−リジン、およびε−アジド−α−メチル−Ｄ−リジンなどのα，α−二置換のものである。いくつかの実施形態においてアミノ酸アナログは、Ｎ−アルキル化、例えば、Ｎ−メチル−Ｌ−プロパルギルグリシン、Ｎ−メチル−Ｄ−プロパルギルグリシン、Ｎ−メチル−ε−アジド−Ｌ−リジン、およびＮ−メチル−ε−アジド−Ｄ−リジンである。
【０１９８】
いくつかの実施形態において、そのアミノ酸の−ＮＨ部分は、−Ｆｍｏｃおよび−Ｂｏｃを含むがこれらに限定されない保護基を用いて保護される。他の実施形態において、そのアミノ酸は、ペプチド模倣大環状分子の合成の前には保護されていない。
【０１９９】
他の実施形態において、式ＩＩＩのペプチド模倣大環状分子が合成される。以下の合成スキームは、そのような化合物の調製を記載する。図面を簡略化するために、例示的なスキームは、Ｌ１およびＬ３が両方とも−（ＣＨ２）−であるＬ−システインまたはＤ−システインに由来するアミノ酸アナログを示す。しかしながら、上記の詳細な説明の全体にわたって述べたように、多くの他のアミノ酸アナログを使用することができ、Ｌ１およびＬ３は、本明細書に開示されている種々の構造から独立して選択することができる。「［ＡＡ］ｍ」、「［ＡＡ］ｎ」、「［ＡＡ］ｏ」という記号は、天然または非天然アミノ酸などのアミド結合による結合部分の配列を表す。以前に記述されているとおり、「ＡＡ」のそれぞれの出現は任意の他の「ＡＡ」の出現とは無関係であり、「［ＡＡ］ｍ」などの式は、例えば、同一ではないアミノ酸の配列ならびに同一なアミノ酸の配列を包含する。
【０２００】
合成スキーム６
【０２０１】
【化３９】
2013507927.tif 000044
【０２０２】
スキーム６において、ペプチド模倣物前駆体は２つの−ＳＨ部分を含み、かつＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−トリチル−Ｌ−システインまたはＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−トリチル−Ｄ−システインなどの市販のＮ−α−Ｆｍｏｃアミノ酸を用いる固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。Ｄ−システインまたはＬ−システインのα−メチル化バージョンは、公知の方法（Ｓｅｅｂａｃｈら（１９９６）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３５：２７０８〜２７４８、およびその参照文献）によって作製され、次いで公知の方法（その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、「Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ：Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ」、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ：１９９８）によって適切に保護されたＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−トリチルモノマーに変換される。次いで前駆体ペプチド模倣物は、標準的な条件（例えば、９５％ＴＦＡなどの強酸）によって脱保護され、固相樹脂から切断される。前駆体ペプチド模倣物は、粗混合物として反応されるか、または有機溶液もしくは水性溶液においてＸ−Ｌ２−Ｙとの反応の前に精製される。いくつかの実施形態においてアルキル化反応は、大環状分子化を容易にし、重合を回避するために希釈条件下（すなわち０．１５ｍｍｏｌ／Ｌ）で行われる。いくつかの実施形態において、アルキル化反応は、液体ＮＨ３（Ｍｏｓｂｅｒｇら（１９８５）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１０７：２９８６−２９８７；Ｓｚｅｗｃｚｕｋら（１９９２）、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓ．４０：２３３−２４２）、ＮＨ３／ＭｅＯＨ、またはＮＨ３／ＤＭＦ（Ｏｒら（１９９１）、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．５６：３１４６−３１４９）などの有機溶液中で行われる。他の実施形態において、アルキル化は、６ＭのグアニジニウムＨＣＬ、ｐＨ８などの水性溶液中で行われる（Ｂｒｕｎｅｌら（２００５）、Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．（２０）：２５５２〜２５５４）。他の実施形態において、アルキル化反応に使用される溶媒はＤＭＦまたはジクロロエタンである。
【０２０３】
合成スキーム７
【０２０４】
【化４０】
2013507927.tif 000045
【０２０５】
スキーム７において、前駆体ペプチド模倣物は２つ以上の−ＳＨ部分を含んでおり、その２つは特別に保護されていて、それにより大環状分子形成のためのその選択的な脱保護およびその後のアルキル化が可能になる。前駆体ペプチド模倣物は、Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−ｐ−メトキシトリチル−Ｌ−システインまたはＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−ｐ−メトキシトリチル−Ｄ−システインなどの市販のＮ−α−Ｆｍｏｃアミノ酸を用いる固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。Ｄ−システインまたはＬ−システインのα−メチル化バージョンは、公知の方法（Ｓｅｅｂａｃｈら（１９９６）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３５：２７０８−２７４８、およびその参照文献）によって作製され、次いで公知の方法（その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、「Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ：Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ」、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ：１９９８）によって、適切に保護されたＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−ｐ−メトキシトリチルモノマーに変換される。次いでペプチド模倣物前駆体のＭｍｔ保護基は、標準的な条件（例えば、ＤＣＭ中１％ＴＦＡなどの弱酸）によって選択的に切断される。次いで前駆体ペプチド模倣物を、樹脂上で有機溶液においてＸ−Ｌ２−Ｙと反応させる。例えば、この反応は、ジイソプロピルエチルアミンなどの立体障害塩基の存在下で起こる。いくつかの実施形態において、アルキル化反応は、液体ＮＨ３（Ｍｏｓｂｅｒｇら（１９８５）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１０７：２９８６−２９８７；Ｓｚｅｗｃｚｕｋら（１９９２）、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓ．４０：２３３−２４２）、ＮＨ３／ＭｅＯＨ、またはＮＨ３／ＤＭＦ（Ｏｒら（１９９１）、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．５６：３１４６−３１４９）などの有機溶液中で行われる。他の実施形態において、アルキル化反応は、ＤＭＦまたはジクロロエタン中で行われる。次いでペプチド模倣大環状分子は、標準的な条件（例えば、９５％ＴＦＡなどの強酸）によって脱保護され、固相樹脂から切断される。
【０２０６】
合成スキーム８
【０２０７】
【化４１】
2013507927.tif 000046
【０２０８】
スキーム８において、ペプチド模倣物前駆体は２つ以上の−ＳＨ部分を含んでおり、その２つが特別に保護されており、大環状分子形成のため、その選択的な脱保護およびその後のアルキル化が可能になる。ペプチド模倣物前駆体は、Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−ｐ−メトキシトリチル−Ｌ−システイン、Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−ｐ−メトキシトリチル−Ｄ−システイン、Ｎ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−Ｓ−ｔ−ブチル−Ｌ−システイン、およびＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−Ｓ−ｔ−ブチル−Ｄ−システインなどの市販のＮ−α−Ｆｍｏｃアミノ酸を用いる固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）によって合成される。Ｄ−システインまたはＬ−システインのα−メチル化バージョンは、公知の方法（Ｓｅｅｂａｃｈら（１９９６）、Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３５：２７０８−２７４８、およびその参照文献）によって作製され、次いで公知の方法（その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、「Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ：Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ」、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ：１９９８）によって、適切に保護されたＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−ｐ−メトキシトリチルまたはＮ−α−Ｆｍｏｃ−Ｓ−Ｓ−ｔ−ブチルモノマーに変換される。ペプチド模倣物前駆体のＳ−Ｓ−ｔブチル保護基は、公知の条件によって選択的に切断される（例えば、ＤＭＦ中２０％２−メルカプトエタノール、参照：Ｇａｌａｎｄｅら（２００５）、Ｊ．Ｃｏｍｂ．Ｃｈｅｍ．７：１７４−１７７）。次いで前駆体ペプチド模倣物を、樹脂上で、有機溶液においてモル過剰のＸ−Ｌ２−Ｙと反応させる。例えば、反応は、ジイソプロピルエチルアミンなどの立体障害塩基の存在下で起こる。次いでペプチド模倣物前駆体のＭｍｔ保護基は、標準的な条件（例えば、ＤＣＭ中１％ＴＦＡなどの弱酸）によって選択的に切断される。次いでペプチド模倣物前駆体は、樹脂上で有機溶液における立体障害塩基による処理によって環化される。いくつかの実施形態において、アルキル化反応は、ＮＨ３／ＭｅＯＨまたはＮＨ３／ＤＭＦ（Ｏｒら（１９９１）、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．５６：３１４６−３１４９）などの有機溶液中で行われる。次いでペプチド模倣大環状分子は、標準的な条件（例えば、９５％ＴＦＡなどの強酸）によって脱保護され、固相樹脂から切断される。
【０２０９】
合成スキーム９
【０２１０】
【化４２】
2013507927.tif 000047
【０２１１】
スキーム９において、ペプチド模倣物前駆体は、２つのＬ−システイン部分を含む。ペプチド模倣物前駆体は、生きた細胞中で公知の生物学的発現系によって、または公知のインビトロの無細胞発現方法によって合成される。前駆体ペプチド模倣物は、粗混合物として反応されるか、または有機溶液もしくは水性溶液においてＸ−Ｌ２−Ｙとの反応の前に精製される。いくつかの実施形態においてアルキル化反応は、大環状分子化を容易にし、重合を回避するために希釈条件下（すなわち０．１５ｍｍｏｌ／Ｌ）で行われる。いくつかの実施形態において、アルキル化反応は、液体ＮＨ３（Ｍｏｓｂｅｒｇら（１９８５）、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１０７：２９８６−２９８７；Ｓｚｅｗｃｚｕｋら（１９９２）、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓ．４０  ：２３３−２４２）、ＮＨ３／ＭｅＯＨ、またはＮＨ３／ＤＭＦ（Ｏｒら（１９９１）、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．５６：３１４６−３１４９）などの有機溶液中で行われる。他の実施形態において、アルキル化は、６ＭグアニジニウムＨＣＬ、ｐＨ８（Ｂｒｕｎｅｌら（２００５）、Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．（２０）：２５５２−２５５４）などの水性溶液中で行われる。他の実施形態において、アルキル化は、ＤＭＦまたはジクロロエタン中で行われる。別の実施形態において、アルキル化は非変性水溶液中で実行され、さらに別の実施形態においてアルキル化は、α−へリックス構造形成に有利な条件下で行われる。さらに別の実施形態において、アルキル化は、前駆体ペプチド模倣物が別のタンパク質に結合するのに有利な条件下で行われ、その結果、アルキル化の間に結合α−へリックスコンフォメーションの形成がもたらされる。
【０２１２】
チオール基との反応に適切な、ＸおよびＹについての種々の実施形態が想定される。一般に、各々のＸまたはＹは独立して、表５に示す一般的なカテゴリーから選択される。例えば、ＸおよびＹは、−Ｃｌ、−Ｂｒまたは−Ｉなどのハロゲン化物である。本明細書に記載の任意の大環状分子形成リンカーを、表１〜４に示す任意の配列との任意の組合せ、そしてまた、本明細書に示す任意のＲ−置換基との任意の組合せでも用いてもよい。
【０２１３】
【表７】
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【０２１４】
表８は、本発明の例示的な大環状分子を示す。「ＮＬ」は、ノルロイシンを表し、メチオニン残基を置き換える。同様なリンカーを用いて、表１〜表４において開示されているポリペプチド配列に基づいてペプチド模倣大環状分子を合成することが想定される。
【０２１５】
【表８】
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本発明は、式（ＩＩＩ）のペプチド模倣大環状分子の合成における、天然に存在するアミノ酸および天然に存在しないアミノ酸の両方のアミノ酸およびアミノ酸アナログの使用を想定する。安定なビス−スルフヒドリル含有ペプチド模倣大環状分子の合成に使用される合成方法を行い易い任意のアミノ酸またはアミノ酸アナログを、本発明において用いてもよい。例えば、システインが、本発明における有用なアミノ酸として想定される。しかし、異なるアミノ酸側鎖を含むシステイン以外の含硫アミノ酸もまた、有用である。例えば、システインは、アミノ酸のα−炭素とアミノ酸側鎖の末端−ＳＨとの間に１つのメチレン単位を含む。本発明はまた、α−炭素と末端−ＳＨの間に複数のメチレン単位を有するアミノ酸の使用も想定する。非限定的な例としては、α−メチル−Ｌ−ホモシステインおよびα−メチル−Ｄ−ホモシステインが挙げられる。いくつかの実施形態において、アミノ酸およびアミノ酸アナログは、Ｄ−配置のものである。他の実施形態において、アミノ酸およびアミノ酸アナログはＬ−配置のものである。いくつかの実施形態において、ペプチド模倣物に含有されるアミノ酸およびアミノ酸アナログの一部はＤ−配置のものであるが、アミノ酸およびアミノ酸アナログの一部はＬ−配置のものである。いくつかの実施形態において、アミノ酸アナログは、α−メチル−Ｌ−システインおよびα−メチル−Ｄ−システインなどのα，α−二置換のものである。
【０２１６】
本発明は、大環状分子形成リンカーを用いてペプチド模倣物前駆体内の２つ以上の−ＳＨ部分を連結させて本発明のペプチド模倣大環状分子が形成される、大環状分子を包含する。上述したように、大環状分子形成リンカーは、立体構造の剛性、代謝安定性の増加および／または細胞透過性の増加を付与する。さらに、いくつかの実施形態において、大環状形成の連結は、ペプチド模倣物の大環状分子のα−へリックス二次構造を安定化させる。大環状分子形成リンカーは式Ｘ−Ｌ２−Ｙのものであり、ここで、上記で定義したとおりＸおよびＹは両方とも同じ部分または異なる部分である。ＸおよびＹは両方とも、１つの大環状分子形成リンカー−Ｌ２−によるビス−スルフヒドリル含有ペプチド模倣物前駆体のビスアルキル化を可能にするという化学的特性を有する。上記で定義されているとおり、リンカー−Ｌ２−は、上記で定義されているとおり、全てが必要に応じてＲ５基で置換することができる、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレンもしくはヘテロシクロアリーレン、または−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−を含む。さらに、スルフヒドリル含有アミノ酸の−ＳＨに結合している炭素以外の、大環状分子形成リンカー−Ｌ２−内の１〜３個の炭素原子は、Ｎ、ＳまたはＯなどのヘテロ原子で必要に応じて置換される。
【０２１７】
大環状分子形成リンカーＸ−Ｌ２−ＹのＬ２成分は、とりわけ、ペプチド模倣大環状分子を形成するために用いられる２つのアミノ酸アナログの位置の間の距離に依存して、長さが変化し得る。さらに、大環状分子形成リンカーのＬ１成分および／またはＬ３成分の長さが変化するので、安定なペプチド模倣大環状分子の形成に適切な全長のリンカーを生み出すために、Ｌ２の長さもまた変化し得る。例えば、使用されるアミノ酸アナログがさらなるメチレン単位をＬ１およびＬ３のそれぞれに付加することによって変化する場合、Ｌ２の長さは、Ｌ１およびＬ３の増加した長さを相殺するために約２メチレン単位に相当する（ｅｑｕｉｖａｌｅｎｔ）長さだけ減少する。
【０２１８】
いくつかの実施形態において、Ｌ２は、式−（ＣＨ２）ｎ−のアルキレン基であり、ｎは約１〜約１５の整数である。例えば、ｎは１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。他の実施形態において、Ｌ２はアルケニレン基である。さらに別の実施形態において、Ｌ２はアリール基である。
【０２１９】
表９は、Ｘ−Ｌ２−Ｙ基のさらなる実施形態を示す。
【０２２０】
【表９】
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【０２２１】
本発明を実施するのに好適であることが想定されるペプチド模倣大環状分子を形成するさらなる方法としては、Ｍｕｓｔａｐａ，Ｍ．Ｆｉｒｏｕｚ  Ｍｏｈｄら，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ（２００３），６８，ｐｐ．８１９３−８１９８；Ｙａｎｇ，Ｂｉｎら  Ｂｉｏｏｒｇ  Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．（２００４），１４，ｐｐ．１４０３−１４０６；米国特許第５，３６４，８５１号；米国特許第５，４４６，１２８号；米国特許第５，８２４，４８３号；米国特許第６，７１３，２８０号；米国特許第７，２０２，３３２号；およびＷＯ  ２００８／１２１７６７（これらはすべて、参照によって本明細書に援用される）に開示されたものが挙げられる。そのような実施形態において、α位にさらなる置換基Ｒ−を含有しているアミノ酸前駆体が用いられる。そのようなアミノ酸は、架橋剤が置換される位置、または、あるいは、大環状分子前駆体の配列中のどこか他の場所であってもよい所望の位置で、大環状分子前駆体中に組み込まれる。次いで前駆体の環化を、示される方法に従って達成する。
【０２２２】
アッセイ
本発明のペプチド模倣大環状分子の特性を、例えば、以下に記述される方法を用いることによってアッセイする。いくつかの実施形態では、本発明のペプチド模倣大環状分子は、本明細書に記載の置換基がない対応するポリペプチドに比べて改善された生物学的特性を有する。
【０２２３】
α−ヘリシティを決定するためのアッセイ
溶液中で、α−へリックスドメインを有するポリペプチドの二次構造は、ランダムコイル構造とα−へリックス構造との間の動的平衡に到達し、「ヘリシティパーセント（ｐｅｒｃｅｎｔ  ｈｅｌｉｃｉｔｙ）」として表される場合が多い。従って、例えば、非改変プロアポトーシスＢＨ３ドメインは大部分が、溶液中で通常２５％未満のα−へリックス含量を有するランダムコイルである。一方、最適化されたリンカーを有するペプチド模倣大環状分子は、例えば、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子のそれよりも少なくとも２倍高いα−ヘリシティを有する。いくつかの実施形態において、本発明の大環状分子は、５０％より高いα−ヘリシティを有する。ＢＨ３ドメインベースの大環状分子などの本発明のペプチド模倣大環状分子のヘリシティをアッセイするために、上記化合物を、水性溶液（例えば、ｐＨ７の５０ｍＭのリン酸カリウム溶液、または蒸留水（ｄｉｓｔｉｌｌｅｄ  Ｈ２Ｏ）、２５〜５０μＭの濃度まで）に溶解する。標準的な測定パラメーター（例えば、温度、２０℃；波長、１９０〜２６０ｎｍ；ステップ分解能、０．５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；蓄積、１０；応答、１秒；帯域幅、１ｎｍ；光路長（ｐａｔｈ  ｌｅｎｇｔｈ）、０．１ｃｍ）を用いて、分光偏光計（例えば、Ｊａｓｃｏ  Ｊ−７１０）において円二色性（ＣＤ）スペクトルを得る。平均残基楕円率（例えば、［Φ］２２２ｏｂｓ）をへリックスデカペプチドモデル（Ｙａｎｇら（１９８６）、Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３０：２０８）について報告されている値で割ることによって、各ペプチドのα−へリックス含量を計算する。
【０２２４】
融解温度（Ｔｍ）を決定するためのアッセイ
α−へリックスなどの二次構造を含む本発明のペプチド模倣大環状分子は、例えば、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子よりも高い融解温度を示す。代表的には、本発明のペプチド模倣大環状分子は、水性溶液中で高度に安定な構造を表す６０℃超のＴｍを示す。融解温度に対する大環状分子形成の影響をアッセイするために、ペプチド模倣大環状分子または非改変ペプチドを、蒸留水中に溶解（例えば、５０μＭの最終濃度で）し、分光偏光計（例えば、Ｊａｓｃｏ  Ｊ−７１０）において標準的なパラメーター（例えば、波長２２２ｎｍ；ステップ解像度、０．５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；蓄積、１０；応答、１秒；帯域幅、１ｎｍ；温度上昇速度：１℃／分；光路長、０．１ｃｍ）を用いて、ある温度範囲（例えば、４〜９５℃）にわたって楕円率の変化を測定することによって、Ｔｍを決定する。
【０２２５】
プロテアーゼ耐性アッセイ
ペプチド骨格のアミド結合は、プロテアーゼによる加水分解を受けやすく、そのためペプチド性化合物は、インビボでの迅速な分解に対して脆弱になる。しかし、ペプチドへリックス形成は、代表的にはアミド骨格を埋没させ、従って、タンパク質分解性の切断からアミド骨格を保護することができる。本発明のペプチド模倣大環状分子をインビトロのペプシンおよびトリプシンのタンパク質分解に供して、対応する架橋されていないポリペプチドと比較した分解速度の任意の変化について評価し得る。例えば、ペプチド模倣大環状分子および対応する（非置換）ポリペプチドを、シリカゲル上に固定化したペプチダーゼ、ペプシンまたはトリプシンとともにインキュベートし、アセトニトリル／１，１，１，３，３，３−ヘキサフルオロ−２−プロパノール中の２％トリフルオロ酢酸の添加によって種々の時点で反応液をクエンチする。続いて、ＨＰＬＣへの注入を行ない、クロマトグラフィーピーク検出のマルチ反応モニタリングモード（ＭＲＭ）で残存基質の質量分析に基づく定量を行なう。簡単には、ペプチド模倣大環状分子およびペプチド模倣前駆体（５μＭ）を、ペプシンまたはトリプシンシリカゲル（Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ  Ｓｅｐａｒａｔｉｏｎｓ）（Ｓ／Ｅ約５０）とともに０分間、１０分間、２０分間、３０分間および６０分間インキュベートする。アセトニトリル／１，１，１，３，３，３−ヘキサフルオロ−２−プロパノール中の２％トリフルオロ酢酸の添加によって反応液をクエンチし、単離した上清中の残存基質を、ＭＲＭピーク検出によって定量する。タンパク質分解反応は、一次反応速度式（ｆｉｒｓｔ  ｏｒｄｅｒ  ｋｉｎｅｔｉｃｓ）を示し、時間に対するｌｎ［Ｓ］のプロットから速度定数ｋを決定する（ｋ＝−１×勾配）。反応半減期は、式Ｔ１／２＝ｌｎ２／ｋを用いて計算される。
【０２２６】
エキソビボ安定性アッセイ
最適化されたリンカーを有するペプチド模倣大環状分子は、例えば、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子のそれよりも少なくとも２倍高いエキソビボ半減期を有し、かつ１２時間以上のエキソビボ半減期を有する。エキソビボの血清安定性研究には、種々のアッセイを用いてもよい。例えば、ペプチド模倣大環状分子およびＲ置換基を欠く対応する大環状分子（２ｍｃｇ）を、新鮮なマウス血清、ラット血清および／またはヒト血清（２ｍＬ）とともに、３７℃で０、１、２、４、８、および２４時間インキュベートする。異なる大環状分子濃度のサンプルは、血清での段階希釈によって調製することができる。インタクトな化合物のレベルを決定するために、以下の手順を用いてもよい：１００μｌの血清を２ｍｌの遠心管に移すこと、その後に１０μＬの５０％ギ酸および５００μＬのアセトニトリルを添加し、４±２℃で１０分間、１４，０００ＲＰＭで遠心分離することによって、サンプルを抽出する。次いで上清を新しい２ｍｌのチューブに移し、ＴｕｒｂｏｖａｐにおいてＮ２＜１０ｐｓｉ下、３７℃でエバポレートさせる。サンプルを１００μＬのアセトニトリル：水（５０：５０）中で再構成し、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析にかける。エキソビボ安定性を試験するための同等または同様の手順は公知であり、血清中の大環状分子の安定性を決定するために用いることができる。
【０２２７】
インビトロ結合アッセイ
アクセプタータンパク質に対するペプチド模倣大環状分子およびペプチド模倣物前駆体の結合および親和性を評価するために、例えば、蛍光偏光アッセイ（ＦＰＡ）を用い得る。ＦＰＡ技術は、偏光および蛍光トレーサーを用いて分子の配向および運動性を測定する。偏光によって励起されると、高い見かけの分子量を有する分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、ＦＩＴＣ）（例えば、大きなタンパク質に結合したＦＩＴＣ標識ペプチド）は、より小さい分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、溶液中で遊離しているＦＩＴＣ標識ペプチド）と比較してそのより遅い回転速度のために、より高いレベルの偏光蛍光を発する。
【０２２８】
例えば、フルオレセイン化（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｉｎａｔｅｄ）ペプチド模倣大環状分子（２５ｎＭ）を、結合緩衝液（１４０ｍＭのＮａＣｌ、５０ｍＭのＴｒｉｓ−ＨＣＬ、ｐＨ７．４）中で、アクセプタータンパク質（２５〜１０００ｎＭ）と一緒に室温で３０分間インキュベートする。結合活性を、例えば、ルミネッセンス分光光度計（例えば、Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ  ＬＳ５０Ｂ）において蛍光偏光によって測定する。Ｋｄ値は、例えば、Ｇｒａｐｈｐａｄ  Ｐｒｉｓｍソフトウェア（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）を用いて、非線形回帰分析によって決定し得る。本発明のペプチド模倣大環状分子は、場合によっては、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子と同様のまたはそれより低いＫｄを示す。
【０２２９】
ＢＣＬ−２、ＢＣＬ−ＸＬ、ＢＡＸまたはＭＣＬ１などのＢＨ３ペプチドに対するアクセプタータンパク質を、例えば、このアッセイにおいて用いてもよい。ＭＤＭ２またはＭＤＭＸなどのｐ５３ペプチドに対するアクセプタータンパク質も、このアッセイで用いてもよい。
【０２３０】
ペプチド−タンパク質相互作用のアンタゴニストを特徴付けるためのインビトロ置換アッセイ
ペプチド（例えば、ＢＨ３ペプチドまたはｐ５３ペプチド）とアクセプタータンパク質との間の相互作用をアンタゴナイズする化合物の結合および親和性を評価するために、例えば、ペプチド模倣物前駆体配列に由来するフルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子を利用する蛍光偏光アッセイ（ＦＰＡ）を用いる。このＦＰＡ技術は、偏光および蛍光トレーサーを用いて分子の配向および運動性を測定する。偏光によって励起されるとき、高い見かけの分子量を有する分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、ＦＩＴＣ）（例えば、大きなタンパク質に結合したＦＩＴＣ標識ペプチド）は、より小さい分子に結合している蛍光トレーサー（例えば、溶液中で遊離しているＦＩＴＣ標識ペプチド）と比較してそのより遅い回転速度のために、より高いレベルの偏光蛍光を発する。フルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子とアクセプタータンパク質との間の相互作用をアンタゴナイズする化合物は、競合的結合ＦＰＡ実験において検出される。
【０２３１】
例えば、推定アンタゴニスト化合物（１ｎＭ〜１ｍＭ）およびフルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子（２５ｎＭ）を、結合緩衝液（１４０ｍＭのＮａＣｌ、５０ｍＭのＴｒｉｓ−ＨＣＬ、ｐＨ７．４）中で、アクセプタータンパク質（５０ｎＭ）と一緒に室温で３０分間インキュベートする。アンタゴニスト結合活性を、例えば、ルミネッセンス分光光度計（例えば、Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ  ＬＳ５０Ｂ）において蛍光偏光によって測定する。Ｋｄ値は、例えば、Ｇｒａｐｈｐａｄ  Ｐｒｉｓｍソフトウェア（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）を用いて非線形回帰分析によって決定することができる。
【０２３２】
有機低分子、ペプチド、オリゴヌクレオチドまたはタンパク質などの任意のクラスの分子を、このアッセイにおいて推定アンタゴニストとして検査してもよい。ＢＣＬ２、ＢＣＬ−ＸＬ、ＢＡＸまたはＭＣＬ１などのＢＨ３ペプチドに対するアクセプタータンパク質を、このアッセイにおいて用いてもよい。ＭＤＭ２またはＭＤＭＸなどのｐ５３ペプチドのアクセプタータンパク質をこのアッセイで用いてもよい。このようなアッセイを行なうためのさらなる方法を、以下の実施例のセクションに記載する。
【０２３３】
細胞溶解物またはインタクトな細胞における結合アッセイ
細胞溶解物またはインタクトな細胞における、ペプチドまたはペプチド模倣大環状分子のその天然アクセプターに対する結合は、免疫沈降およびプルダウン実験によって測定することが可能である。例えば、インタクトな細胞をフルオレセイン化（ＦＩＴＣ標識）またはビオチン化化合物とともに、血清の非存在下で４時間インキュベートし、続いて血清置換（ｓｅｒｕｍ  ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ）し、さらに、４〜１８時間の範囲でインキュベートする。あるいは、細胞を実験の期間中、Ｏｐｔｉ−ＭＥＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中でインキュベートしてもよい。細胞を、次いでペレット化し、溶解緩衝液（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ［ｐＨ７．６］、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、１％ＣＨＡＰＳおよびプロテアーゼインヒビターカクテル）中で、４℃にて１０分間インキュベートする。ＣＨＡＰＳの代わりに１％ＮＰ−４０またはＴｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００を使用してもよい。抽出物を１４，０００ｒｐｍで１５分間遠心分離にかけ、上清を回収して、１０μｌのヤギ抗ＦＩＴＣ抗体またはストレプトアビジンコートビーズとともに２時間、回転下で４℃にてインキュベートした後、４℃でプロテインＡ／Ｇ  Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（５０μｌの５０％ビーズスラリー）とともに、さらに２時間インキュベーションする。ビオチン化化合物のプルダウンにストレプトアビジンビーズを使用する場合、二次工程は必要でない。あるいは、ＦＩＴＣ標識化またはビオチン化化合物を上記のようにして調製した細胞溶解物とともに２時間、回転下で４℃にてインキュベートした後、１０μｌのヤギ抗ＦＩＴＣ抗体またはストレプトアビジンコートビーズとともに２時間、回転下で４℃にてインキュベートする。その後、４℃でプロテインＡ／Ｇ  Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（５０μｌの５０％ビーズスラリー）とともに、さらに２時間インキュベートする。ビオチン化化合物のプルダウンにストレプトアビジンビーズを使用する場合、二次工程は必要でない。短時間の遠心分離後、ペレットを、漸増濃度の塩（例えば、１５０、３００、５００ｍＭのＮａＣｌ）を含む溶解緩衝液中で洗浄し得る。ビーズを、次いで１５０ｍＭのＮａＣｌで再平衡化させ得、その後、ＳＤＳ含有サンプル緩衝液の添加および煮沸を行い得る。ビーズおよび細胞溶解物を、４％〜１２％の勾配のＢｉｓ−Ｔｒｉｓゲルを用いて電気泳動し、その後、Ｉｍｍｏｂｉｌｏｎ−Ｐメンブレンに移し得る。ブロッキング後、ブロットは、ＦＩＴＣまたはビオチンのそれぞれを検出する抗体とともに、また、ＢＣＬ２、ＭＣＬ１、ＢＣＬ−ＸＬ、Ａ１、ＢＡＸ、およびＢＡＫなどのペプチド模倣大環状分子に結合するタンパク質を検出する１種類以上の抗体とともにインキュベートされ得る。溶解物のブロットはまた、ローディングコントロールのために抗Ｈｓｃ−７０でプローブされる（ｐｒｏｂｅ）。あるいは、電気泳動後、ゲルを銀染色して、ＦＩＴＣ標識化化合物またはビオチン化化合物と特異的に沈降するタンパク質を検出してもよい。
【０２３４】
細胞透過性アッセイ
ペプチド模倣大環状分子は、例えば、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子に比べてより細胞透過性である。いくつかの実施形態では、ペプチド模倣大環状分子は、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子よりも細胞透過性である。最適化されたリンカーを有するペプチド模倣大環状分子は、例えば、Ｒ置換基を欠く対応する大環状分子よりも少なくとも２倍大きい細胞透過性を有し、多くの場合、４時間後において、適用されたペプチド模倣大環状分子の２０％以上が細胞を透過したことが観察される。ペプチド模倣大環状分子およびＲ置換基を欠く対応する大環状分子の細胞透過性を測定するために、インタクトな細胞を、フルオレセイン化ペプチド模倣大環状分子または対応する非架橋ポリペプチド（１０μＭ）と一緒に４時間、３７℃で、無血清媒体中で、インキュベートし、媒体で２回洗浄し、トリプシン（０．２５％）で１０分間、３７℃でインキュベートする。細胞を再度洗浄してＰＢＳ中に再懸濁する。細胞の蛍光を、例えば、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターまたはＣｅｌｌｏｍｉｃｓ’  ＫｉｎｅｔｉｃＳｃａｎ（登録商標）ＨＣＳ  Ｒｅａｄｅｒのいずれかを用いることによって分析する。別の細胞透過定量法を使用してもよい。具体的な方法を、ここに示す本実施例においてより詳細に記載する。
【０２３５】
細胞効力アッセイ
特定のペプチド模倣大環状分子の効力は、例えば、ヒトまたはマウス細胞集団に由来する種々の腫瘍形成性および非腫瘍形成性の細胞系統ならびに初代細胞を用いる細胞ベースの死滅アッセイにおいて決定される。細胞生存率を、例えば、ペプチド模倣大環状分子（０．５〜５０μＭ）による２４〜９６時間のインキュベーションにわたってモニターして、ＥＣ５０≦１０μＭで死滅させるペプチド模倣大環状分子を特定する。これとの関連において、ＥＣ５０は、集団の５０％が生存可能であるペプチド模倣大環状分子の濃度である最大半量有効濃度（ｈａｌｆ  ｍａｘｉｍａｌ  ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ  ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ）を指す。細胞生存率を測定するいくつかの標準的なアッセイが市販されており、ペプチド模倣大環状分子の効力を評価するために必要に応じて用いられる。さらに、ペプチド模倣大環状分子がアポトーシス機構を活性化することによって細胞を死滅させるか否かを評価するために、アネキシンＶおよびカスパーゼ活性化を測定するアッセイが必要に応じて用いられる。例えば、細胞内ＡＴＰ濃度の関数として細胞生存率を決定するＣｅｌｌ  Ｔｉｔｅｒ−ｇｌｏアッセイが用いられる。
【０２３６】
インビボ安定性アッセイ
ペプチド模倣大環状分子のインビボ安定性を検討するために、化合物を、例えば、マウスおよび／またはラットに、ＩＶ、ＩＰ、ＳＣ、ＰＯまたは吸入経路によって０．１〜５０ｍｇ／ｋｇの範囲の濃度で投与し、注入後０分、５分、１５分、３０分、１時間、４時間、８時間、１２時間、２４時間および４８時間で血液検体を採取する。次いで２５μＬの新鮮血清中のインタクトな化合物のレベルをＬＣ−ＭＳ／ＭＳによって本明細書に記載のとおり測定する。
【０２３７】
動物モデルにおけるインビボ効力
インビボでの本発明のペプチド模倣大環状分子の抗腫瘍形成活性を決定するために、化合物を、例えば、単独で（ＩＰ、ＩＶ、ＳＣ、ＰＯ、吸入または鼻腔内経路によって）または最適以下の用量の関連する化学療法（例えば、シクロフォスファミド、ドキソルビシン、エトポシド）と組み合わせて投与する。一例において、ルシフェラーゼを安定に発現する５×１０６個のＳＥＭＫ２細胞（急性リンパ芽球性白血病患者の骨髄から樹立した）を、ＮＯＤ−ＳＣＩＤマウス、ＳＣＩＤ−ｂｅｉｇｅマウスまたはＮＯＤ．ＩＬ２ｒｇ  ＫＯマウスの尾静脈内に、全身照射を受けてから３時間後に注入する。照射していないマウスをこれらの研究でも使用し得る。治療しないまま放置した場合、この形態の白血病はこのモデルにおいて３週間以内に死に至る。白血病は、例えば、マウスにＤ−ルシフェリン（６０ｍｇ／ｋｇ）を注入し、麻酔をかけた動物をイメージングする（例えば、Ｘｅｎｏｇｅｎ  Ｉｎ  Ｖｉｖｏ  Ｉｍａｇｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ、Ｃａｌｉｐｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｈｏｐｋｉｎｔｏｎ、ＭＡ）ことによって、容易にモニターされる。全身の生物発光を、Ｌｉｖｉｎｇ  Ｉｍａｇｅ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ（Ｃａｌｉｐｅｒ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｈｏｐｋｉｎｔｏｎ、ＭＡ）による光子フラックス（光子／秒）の積分によって定量する。単独のまたは最適以下の用量の関連する化学療法剤と組み合わせたペプチド模倣大環状分子を、例えば、白血病マウス（注入の８〜１０日後／実験の１日目、１４〜１６の生物発光範囲内）に尾静脈またはＩＰ経路で０．１ｍｇ／ｋｇ〜５０ｍｇ／ｋｇの範囲の用量で７〜２１日間投与する。必要に応じて、実験中１日おきにマウスをイメージングし、実験期間中、毎日生存をモニターする。死亡したマウスを必要に応じて、実験終了の時点で解剖する。別の動物モデルは、ルシフェラーゼを安定に発現する、ヒト濾胞性リンパ腫に由来する細胞系統ＤｏＨＨ２の、ＮＯＤ−ＳＣＩＤマウスへの移植である。これらのインビボ試験では必要に応じて、予備的な薬物動態的、薬力学的および毒性データを作成する。
【０２３８】
臨床試験
ヒトの治療に対する本発明のペプチド模倣大環状分子の適合を決定するために、臨床試験を行う。例えば、癌と診断されかつ治療を必要とする患者を選択して、治療群および１つ以上のコントロール群に分け、治療群には本発明のペプチド模倣大環状分子を投与し、一方コントロール群には、プラセボ、または公知の抗癌剤または標準的な治療を与える。従って、本発明のペプチド模倣大環状分子の治療の安全性および効力は、生存およびクオリティー・オブ・ライフなどの因子に関して患者群の比較を行うことによって評価することができる。この例において、ペプチド模倣大環状分子で治療した患者群は、プラセボまたは標準的な治療で治療した患者コントロール群と比較して長期生存の改善を示す。
【０２３９】
医薬組成物および投与経路
投与方法としては、限定されないが、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外、経口、舌下、脳内、膣内、経皮、経直腸、吸入、または耳、鼻、目もしくは皮膚への適用による局所が挙げられる。
【０２４０】
本発明のペプチド模倣大環状分子はまた、薬学的に受容可能な誘導体またはそのプロドラッグも含む。「薬学的に受容可能な誘導体」とは、レシピエントへの投与の際、本発明の化合物を（直接的または間接的に）提供することができる、本発明の化合物の任意の薬学的に受容可能な塩、エステル、エステルの塩、プロドラッグまたは他の誘導体を意味する。例えば、薬学的に受容可能な誘導体は、哺乳動物に投与される場合、本発明の化合物のバイオアベイラビリティを増加させ得る（例えば、経口投与された化合物の血液中への吸収を増加させることによって）か、またはその親種と比較して生物学的区画（例えば、脳またはリンパ系）への活性な化合物の送達を増加させ得る。いくつかの薬学的に受容可能な誘導体は、水溶解度（ａｑｕｅｏｕｓ  ｓｏｌｕｂｉｌｉｔｙ）または胃腸粘膜の能動輸送を増大する化学基を含む。
【０２４１】
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子は、選択的な生物学的特性を増強するために、適切な官能基を共有結合または非共有結合で結合することによって改変される。そのような改変としては、所与の生物学的コンパートメント（例えば、血液、リンパ系、中枢神経系）への生物学的浸透性を増大させる、経口の利用可能性を増加させる、可溶性を増大させて注入による投与を可能にする、代謝を変化させる、および排泄率を変化させる改変が挙げられる。
【０２４２】
本発明の化合物の薬学的に受容可能な塩としては、薬学的に受容可能な無機の酸および塩基に由来する塩ならびに有機の酸および塩基に由来する塩が挙げられる。適切な酸塩（ａｃｉｄ  ｓａｌｔ）の例としては、酢酸塩、アジピン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、酪酸塩、クエン酸塩、二グルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グリコール酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、パルモエート、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、サリチル酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、トシル酸塩およびウンデカン酸塩が挙げられる。適切な塩基に由来する塩としては、アルカリ金属（例えば、ナトリウム）塩、アルカリ土類金属（例えば、マグネシウム）塩、アンモニウム塩およびＮ−（アルキル）４＋塩が挙げられる。
【０２４３】
本発明の化合物から医薬組成物を調製するために、薬学的に受容可能なキャリアとしては固体または液体のいずれかのキャリアが挙げられる。固体形態の調製物としては、粉末剤、錠剤、丸剤、カプセル剤、カシェ剤、坐剤、および分散性粒剤が挙げられる。固体キャリアは、希釈剤、着香剤、結合剤、防腐剤、錠剤崩壊剤、またはカプセル化材料としても機能する１つ以上の物質であってもよい。処方および投与のための技術に関する詳細は、科学文献および特許文献において十分に記述されており、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｍａａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ、Ｅａｓｔｏｎ  ＰＡの最新版を参照のこと。
【０２４４】
粉末剤においては、キャリアとは、微粉化した（ｆｉｎｅｌｙ  ｄｉｖｉｄｅｓ）活性成分と混合されている微粉化した固体である。錠剤において、活性成分は、必要な結合特性を有するキャリアと適切な割合で混合され、所望の形状および大きさに圧縮される。
【０２４５】
適切な固体賦形剤は炭水化物またはタンパク質増量剤（ｆｉｌｌｅｒ）であり、これには、限定するものではないが、糖、例としては、ブドウ糖、ラクトース、スクロース、マンニトール、またはソルビトール；トウモロコシ、小麦、米、ジャガイモ、または別の植物由来のデンプン；セルロース、例えば、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチル−セルロース、またはカルボキシメチルセルロースナトリウム；ならびにアラビアゴムおよびトラガカントゴムを含むゴム；ならびにゼラチンおよびコラーゲンなどのタンパク質が挙げられる。所望であれば、架橋ポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸、またはアルギン酸ナトリウムなどのこれらの塩のような崩壊剤または可溶化剤を加える。
【０２４６】
液体形態の調製物としては、液剤、懸濁剤、および乳剤、例えば、水または水／プロピレングリコール溶液が挙げられる。非経口注入用に、液体調製物は、水性ポリエチレングリコール溶液中の溶液に処方することができる。「非経口」という用語は、本明細書において使用される場合、静脈内、動脈内、筋肉内、腹腔内、胸骨内、および皮下を含む投与方法のことをいう。
【０２４７】
薬学的調製物は、好ましくは単位剤形である。このような形態では、調製物は、適切な量の活性成分を含有する単位用量に小分割される。単位剤形は、バイアルまたはアンプル中に、小分けされた錠剤、カプセル、および粉末など、個別量の調製物を収容しているパッケージであるパッケージ調製物であってもよい。また、単位剤形は、それ自体カプセル剤、錠剤、カシェ剤、またはロゼンジであってもよく、または、適切な数の任意のこれらのパッケージ化形態であってもよい。
【０２４８】
本発明の組成物がペプチド模倣大環状分子と１つ以上のさらなる治療剤または予防剤の組合せを含む場合、化合物およびさらなる薬剤の両方は、単独療法レジメンにおいて通常投与される投薬量の約１〜１００％、およびより好ましくは約５〜９５％の投薬量レベルで存在するべきである。いくつかの実施形態において、さらなる薬剤は、反復投与レジメンの一部として、本発明の化合物とは別々に投与される。あるいは、これらの薬剤は１つの剤形の一部であり、１つの組成物中で本発明の化合物と一緒に混合される。
【０２４９】
使用方法
一局面において、本発明は、ペプチド模倣大環状分子がモデリングされる際にタンパク質またはペプチドの天然リガンド（単数または複数）に結合する因子を特定するための競合的結合アッセイにおいて有用である、新規なペプチド模倣大環状分子を提供する。例えば、ｐ５３ＭＤＭ２系において、ｐ５３に基づく標識され安定化されたペプチド模倣大環状分子を、競合的にＭＤＭ２に結合する低分子とともにＭＤＭ２結合アッセイにおいて用いる。競合的結合研究によって、ｐ５３／ＭＤＭ２系に特異的な薬物候補の迅速なインビトロ評価および決定が可能になる。同様に、ＢＨ３／ＢＣＬ−ＸＬ抗アポトーシス系では、ＢＨ３に基づく標識されたペプチド模倣大環状分子を、競合的にＢＣＬ−ＸＬに結合する低分子とともにＢＣＬ−ＸＬ結合アッセイにおいて用いてもよい。競合的結合研究によって、ＢＨ３／ＢＣＬ−ＸＬ系に特異的な薬物候補の迅速なインビトロ評価および決定が可能になる。本発明はさらに、ペプチド模倣大環状分子に対する抗体の産生を提供する。いくつかの実施形態において、これらの抗体は、ペプチド模倣大環状分子、およびそのペプチド模倣大環状分子が誘導されるｐ５３またはＢＨ３ペプチド模倣大環状分子前駆体の両方に特異的に結合する。そのような抗体は、例えば、ｐ５３／ＭＤＭ２系またはＢＨ３／ＢＣＬ−ＸＬ系をそれぞれ妨害する。
【０２５０】
他の局面において、本発明は、異常な（例えば、不十分なまたは過剰な）ＢＣＬ−２ファミリーメンバーの発現または活性（例えば、外因性または内因性アポトーシス経路異常）に関連する障害のリスクがある（または罹患しやすい）か、または障害を有する被験体を処置するための予防方法および治療方法の両方を提供する。いくつかのＢＣＬ−２型障害は、少なくとも一部は、１つ以上のＢＣＬ−２ファミリーメンバーの異常レベル（例えば、過剰または過少発現）によって、または異常な活性を示す１つ以上のＢＣＬ−２ファミリーメンバーの存在によって引き起こされると考えられている。そのように、ＢＣＬ−２ファミリーメンバーのレベルおよび／または活性の減少あるいはＢＣＬ−２ファミリーメンバーのレベルおよび／または活性の増強は、例えば、障害の有害な症状を改善または減少させるために用いられる。
【０２５１】
別の局面において、本発明は、腫瘍細胞においてｐ５３とＭＤＭ２との間の相互作用または結合を妨害することによって、過剰増殖性疾患を処置または予防するための方法を提供する。これらの方法は、ヒトを含む温血動物に対して、または野性型のｐ５３を含む腫瘍細胞に対して、本発明の化合物の有効量を投与する工程を包含する。いくつかの実施形態では、本発明の化合物の投与は、細胞増殖停止またはアポトーシスを誘導する。他の実施形態またはさらなる実施形態では、本発明を用いて、ＭＤＭ２レベルの上昇を含む疾患および／または腫瘍細胞を処置する。本明細書において用いる場合、ＭＤＭ２のレベルの上昇とは、ＥＬＩＳＡおよび同様のアッセイによって測定した場合、ｍｄｍ２の正常なコピー数（２）より多く、または１細胞あたり約１０，０００個を超えるＭＤＭ２分子を含む細胞中で見出されるより大きいＭＤＭ２レベルを指す（Ｐｉｃｋｓｌｅｙら、（１９９４），Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  ９，２５２３  ２５２９）。
【０２５２】
本明細書において使用される場合、「処置」という用語は、疾患、疾患の症状または疾患に対する素因を、回復させる、治癒する、軽減する、緩和する、変化させる、治す、改善する、好転させる、または影響を与えるという目的で、その疾患、疾患の症状または疾患に対する素因を有する患者への治療剤の適用もしくは投与、または、その患者から単離した組織もしくは細胞系統への治療剤の適用もしくは投与として定義される。
【０２５３】
いくつかの実施形態において、本発明のペプチド模倣大環状分子を用いて、癌および腫瘍性の状態を処置、予防、および／または診断する。本明細書において用いる場合、「癌」、「過剰増殖性」および「腫瘍性」という用語は、自律的増殖能、すなわち、迅速に増殖する細胞増殖によって特徴付けられる異常な状況または状態を有する細胞のことをいう。過剰増殖性疾患および腫瘍性疾患の状況は、病的なもの、すなわち、疾患状況を特徴付けているかまたは構成しているものとして分類してもよいし、または非病的なもの、すなわち、正常な状況から逸脱しているが疾患状況を伴わないものとして分類してもよい。この用語は、組織病理学的タイプまたは侵襲性のステージに関係なく、全てのタイプの癌増殖または腫瘍形成過程、転移組織または悪性に形質転換した細胞、組織、もしくは器官を含むことを意味する。転移性腫瘍は、乳房、肺、肝臓、結腸および卵巣の起源の腫瘍を含むがこれらに限定されない、複数の原発性腫瘍型から生じる可能性がある。「病的過剰増殖性」細胞は、悪性腫瘍増殖によって特徴付けられる疾患状況において発生する。非病的な過剰増殖性細胞の例としては、創傷回復に伴う細胞の増殖が挙げられる。細胞増殖性障害および／または分化性障害の例としては、癌、例えば、癌腫、肉腫、または転移性障害が挙げられる。いくつかの実施形態において、ペプチド模倣大環状分子は、乳癌、卵巣癌、結腸癌、肺癌、そのような癌の転移などを制御するための新規な治療剤である。
【０２５４】
癌または腫瘍形成病態の例としては、限定するものではないが、線維肉腫、筋肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫（ｅｎｄｏｔｈｅｌｉｏｓａｒｃｏｍａ）、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、滑膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、胃癌、食道癌、直腸癌、膵臓癌、卵巣癌、前立腺癌、子宮癌、頭頸部癌、皮膚癌、脳腫瘍、扁平上皮癌、皮脂腺腺癌（ｓｅｂａｃｅｏｕｓ  ｇｌａｎｄ  ｃａｒｃｉｎｏｍａ）、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、肝癌、胆管癌、絨毛癌、精上皮腫、胎児性癌、ウィルムス腫瘍、子宮頸癌、精巣癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、グリオーマ、星状膠細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫、乏突起膠腫、髄膜腫、メラノーマ、神経芽腫、網膜芽腫、白血病、リンパ腫、またはカポジ肉腫が挙げられる。
【０２５５】
増殖性障害の例としては、造血性新形成障害が挙げられる。本明細書において用いられる場合、「造血性新形成障害」という用語は、造血起源の、例えば、骨髄系、リンパ系または赤血球系、またはこれらの前駆体細胞から生じる、過形成／新形成細胞を伴う疾患を包含する。好ましくは、その疾患は、低分化急性白血病、例えば、赤芽球性白血病および急性巨核芽球性白血病から生じる。さらなる例示的な骨髄障害としては、急性前骨髄性白血病（ＡＰＭＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）および慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）（Ｖａｉｃｋｕｓ（１９９１）、Ｃｒｉｔ  Ｒｅｖ．Ｏｎｃｏｌ．／Ｈｅｍｏｔｏｌ．１１：２６７〜９７に概説されている）が挙げられるがこれらに限定されず；リンパ性悪性疾患としては、限定するものではないが、Ｂ細胞系ＡＬＬおよびＴ細胞系ＡＬＬを含む急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、前リンパ性白血病（ＰＬＬ）、ヘアリー細胞白血病（ＨＬＬ）およびワルデンストロームマクログロブリン血症（ＷＭ）が挙げられる。悪性リンパ腫のさらなる形態としては、限定するものではないが、非ホジキンリンパ腫およびその変種、末梢Ｔ細胞リンパ腫、成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫（ＡＴＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、大顆粒リンパ性白血病（ＬＧＦ）、ホジキン病およびＲｅｅｄ−Ｓｔｅｍｂｅｒｇ病が挙げられる。
【０２５６】
乳房の細胞増殖障害および／または細胞分化障害の例としては、限定するものではないが、増殖性乳房疾患、例としては、例えば、上皮過形成、硬化性腺症、および小管乳頭腫；腫瘍、例えば、線維腺腫、葉状腫瘍、および肉腫などの間質性腫瘍、ならびに大管乳頭腫などの上皮腫瘍；上皮内腺管癌（ｄｕｃｔａｌ  ｃａｒｃｉｎｏｍａ  ｉｎ  ｓｉｔｕ）（パジェット病を含む）および上皮内小葉癌を含む上皮内（非侵襲性）癌を含む乳房の癌、ならびに、侵襲性腺管癌、侵襲性小葉癌、髄様癌、膠様（粘液性）癌、管状癌、および侵襲性乳頭状癌を含むがこれらに限定されない侵襲性（浸潤性）癌、ならびに混合型悪性新生物が挙げられる。男性乳房における障害としては、女性化乳房および癌腫を含むがこれらに限定されない。
【０２５７】
肺の細胞増殖障害および／または細胞分化障害の例としては、限定するものではないが、気管支原性癌、例としては、腫瘍随伴症候群、細気管支肺胞癌、神経内分泌腫瘍、例えば、気管支カルチノイド、混合型腫瘍、および転移性腫瘍；肋膜の病理、例としては、炎症性胸水、非炎症性胸水、気胸、および胸膜腫瘍、例としては、孤立性線維性腫瘍（胸膜線維腫）および悪性中皮腫が挙げられる。
【０２５８】
結腸の細胞増殖障害および／または細胞分化障害の例としては、限定するものではないが、非新形成ポリープ、腺腫、家族性症候群、結腸直腸発癌、結腸直腸がん、およびカルチノイド腫瘍が挙げられる。
【０２５９】
肝臓の細胞増殖障害および／または細胞分化障害の例としては、限定するものではないが、結節性過形成、腺腫、ならびに悪性腫瘍、例としては、肝臓の原発性がんおよび転移性腫瘍が挙げられる。
【０２６０】
卵巣の細胞増殖障害および／または細胞分化障害の例としては、限定するものではないが、卵巣腫瘍、例えば、体腔上皮の腫瘍、漿液性腫瘍、粘液性腫瘍、子宮内膜性腫瘍、明細胞腺癌、嚢胞性線維腺腫（ｃｙｓｔａｄｅｎｏｆｉｂｒｏｍａ）、ブレンナー腫瘍、表層上皮腫瘍；胚細胞腫瘍、例えば、成熟型（良性）奇形腫、単胚葉性奇形腫（ｍｏｎｏｄｅｒｍａｌ  ｔｅｒａｔｏｍａ）、未熟型悪性奇形腫、未分化胚細胞種、内胚葉洞腫瘍、絨毛癌；性索間質性腫瘍、例えば、顆粒膜夾膜細胞腫、莢膜細胞腫線維腫（ｔｈｅｃｏｍａｆｉｂｒｏｍａ）、アンドロブラストーマ、ヒル（ｈｉｌｌ）細胞腫瘍、および性腺芽腫；ならびに転移性腫瘍、例えば、クルーケンベルグ腫瘍が挙げられる。
【０２６１】
他の実施形態またはさらなる実施形態では、本明細書に記載のペプチド模倣大環状分子を用いて、過活動性細胞死または生理的傷害などによる細胞死によって特徴付けられる病態を処置、予防または診断する。早発性のまたは望ましくない細胞死によって特徴付けられる病態、またはあるいは望ましくないまたは過剰な細胞増殖のいくつかの例としては、限定するものではないが、細胞低形成性（ｈｙｐｏｃｅｌｌｕｌａｒ）／低形成性、無細胞性／無形成性、または細胞過形成性（ｈｙｐｅｒｃｅｌｌｕｌａｒ）／過形成性の病態が挙げられる。いくつかの例としては、血液系の障害、例としては、限定するものではないが、ファンコニ−貧血、再生不良性貧血、サラセミア、先天性好中球減少症、骨髄異形成が挙げられる。
【０２６２】
他の実施形態またはさらなる実施形態において、アポトーシスを減少させるように作用する本発明のペプチド模倣大環状分子を用いて、望ましくないレベルの細胞死に関連する障害を処置する。従って、いくつかの実施形態において、本発明の抗アポトーシスペプチド模倣大環状分子を用いて、ウイルス感染、例えば、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）の感染に関連する感染に伴う細胞死を引き起こすものなどの障害を処置する。広範な神経系の疾患が、特定のセットのニューロンの逐次の消失によって特徴付けられ、本発明の抗アポトーシスペプチド模倣大環状分子は、いくつかの実施形態においてこれらの障害の処置に用いられる。そのような障害としては、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋委縮性側索硬化症（ＡＬＳ）色素性網膜炎、脊髄性筋委縮症、および種々の形態の小脳変性症が挙げられる。これらの疾患における細胞消失は、炎症応答を引き起こさず、アポトーシスが細胞死の機構であるようである。加えて、いくつかの血液系疾患が、血球の産生減少と関連している。これらの障害としては、慢性疾患に伴う貧血、再生不良性貧血、慢性好中球減少症、および骨髄異形成症候群が挙げられる。骨髄異形成症候群および一部の形態の再生不良性貧血などの血球産生の障害は、骨髄内のアポトーシス細胞死の増加と関連している。これらの障害は、アポトーシスを促進する遺伝子の活性化、間質細胞もしくは造血性生存因子の後天性欠乏、または毒素および免疫応答のメディエーターの直接的作用に起因する可能性がある。細胞死と関連する２つのよく見られる障害は、心筋梗塞および脳卒中（ｓｔｒｏｋｅ）である。両方の障害において、急激な血流の喪失という事象において生じる虚血の中心部内の細胞は、壊死の結果として迅速に死滅するように見える。しかしながら、中心虚血領域の外部では、細胞はより長い期間にわたって死滅し、形態学的にはアポトーシスによって死滅するように見える。他の実施形態またはさらなる実施形態では、本発明の抗アポトーシスペプチド模倣大環状分子を用いて、望ましくない細胞死に関連する全てのこのような障害を処置する。
【０２６３】
本明細書に記載のペプチド模倣大環状分子で処置される免疫障害のいくつかの例としては、限定するものではないが、臓器移植拒絶反応、関節炎、狼瘡、ＩＢＤ、クローン病、喘息、多発性硬化症、糖尿病などが挙げられる。
【０２６４】
本明細書に記載のペプチド模倣大環状分子で処置される神経障害のいくつかの例としては限定するものではないが、アルツハイマー病、ダウン症候群、オランダ型遺伝性脳出血アミロイドーシス、反応性アミロイドーシス、蕁麻疹および難聴を伴う家族性アミロイド腎症、マックルウェルズ症候群、特発性骨髄腫；マクログロブリン血症随伴性骨髄腫、家族性アミロイド多発性神経炎、家族性アミロイド心筋症、孤立性心アミロイド、全身性老人性アミロイドーシス、成人発症糖尿病、インスリノーマ、孤立性心房性アミロイド、甲状腺の髄様癌、家族性アミロイドーシス、アミロイドーシスを伴う遺伝性脳出血、家族性アミロイド性多発性ニューロパシー、スクレイピー、クロイツフェルトヤコブ病、ゲルストマンストロイスラー−シャインカー症候群、ウシ海綿状脳症、プリオン媒介疾患、およびハンチントン病が挙げられる。
【０２６５】
本明細書に記載のペプチド模倣大環状分子で処置される内分泌障害のいくつかの例としては、限定するものではないが、糖尿病、甲状腺機能低下症、下垂体機能低下症、副甲状腺機能低下症、性機能低下症などが挙げられる。
【０２６６】
本発明のペプチド模倣大環状分子で処置または予防される心臓血管障害（例えば、炎症性障害）の例としては、限定するものではないが、アテローム性動脈硬化症、心筋梗塞、発作（ｓｔｒｏｋｅ）、血栓症、動脈瘤、心不全、虚血性心疾患、狭心症、心臓突然死、高血圧性心疾患；細動脈硬化症、小血管疾患、腎症、高グリセリド血症、高コレステロール血症、高脂血症、黄色腫症、喘息、高血圧症、気腫および慢性肺疾患などの非冠動脈疾患；あるいは血管形成術後の再狭窄、シャント、ステント、合成もしくは天然切除移植片、留置カテーテル、弁または別の移植可能なデバイスの留置などの介入処置を伴う心臓血管状態（「処置による血管外傷」）が挙げられる。好ましい心臓血管障害としては、アテローム性動脈硬化症、心筋梗塞、動脈瘤、および発作が挙げられる。
【実施例】
【０２６７】
以下の節では、本発明の例示的実施例を提供する。
【０２６８】
実施例１．α，α−二置換アミノ酸の調製
【０２６９】
【化４３】
2013507927.tif 000051
１−アジド−ｎ−ヨード−アルカン１。ＤＭＦ（２０ｍｌ）中の１−ヨード−ｎ−クロロ−アルカン（８．２ｍｍｏｌ）に、アジ化ナトリウム（１．２当量）を添加し、反応混合物を周囲温度で一晩撹拌した。次いで、反応混合物をジエチルエーテルと水とで希釈した。有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮し、１−アジド−ｎ−クロロ−アルカンを得た。このアジドをアセトン（４０ｍｌ）で希釈し、ヨウ化ナトリウム（１．５当量）を添加した。この溶液を６０℃で一晩加熱した。その後、反応混合物を水で希釈し、生成物をジエチルエーテルで抽出した。有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。生成物１を、中性アルミナプラグに通すことにより精製した。全収率：６５％。１−アジド−３−ヨード−プロパン：１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：２．０４  （ｑ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２５  （ｔ，  ２Ｈ，  ＣＨ２Ｉ）；  ３．４４  （ｔ，  ２Ｈ，  ＣＨ２Ｎ３）。１−アジド−５−ヨード−ペンタン：１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．５０  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．８６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．１９  （ｔ，  ２Ｈ，  ＣＨ２Ｉ）；  ３．２９  （ｔ，  ２Ｈ，  ＣＨ２Ｎ３）。
【０２７０】
αＭｅ−Ｓｎ−アジド−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｍｅ），２。Ｓ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。化合物１（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応混合物を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、この溶液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物２を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。αＭｅ−Ｓ３−アジド−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（２，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．５９５．１９，Ｍ＋Ｈ観測値．５９５．１６；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２５  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ３−アジド））；  １．７２−１．８３  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０７  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．４８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２７  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４４  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．６８および４．４７（ＡＢ系，  ２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  １２．８Ｈｚ）；  ６．６２−６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．０５  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１３  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．３０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．２８−７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４７−７．５０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ８．０１  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０７  （ｍ，  ２Ｈ）。
【０２７１】
Ｓｎ−アジド−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｈ），２。Ｇｌｙ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。化合物１（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応混合物を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、この溶液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物２を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。Ｓ３−アジド−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（２，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．５８１．１７，Ｍ＋Ｈ観測値．５８１．０５；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．７２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１６  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．０８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４９  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．５９  （ｍ，  ＣＨα）；  ３．５８および４．４４（ＡＢ系，  ２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル））；  ３．８７  （ｍ，  ＣＨα’）；  ６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９６  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１４−７．１９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３５  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５１  （ｍ，  ４Ｈ）；  ８．０４  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１２  （ｄ，  １Ｈ）。
【０２７２】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓｎ−アジド−ＯＨ（Ｒ＝Ｍｅ），３。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１２ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物２（１．６５ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（３ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は１０〜２０分以内に消失した。次いで、緑色の反応混合物を真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（１６ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（１６ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物３を順相で精製し（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、粘性油状物を得た（両工程の全収率３６％）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓ３−アジド−ＯＨ（２，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．３９５．１６，Ｍ＋Ｈ観測値．３９５．１２；１Ｈ  ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）  δ：０．８５（ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．１０  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６１  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ３−アジド））；  １．９８  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．２２  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２７  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４２  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．５３  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５７  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２７３】
Ｆｍｏｃ−Ｓｎ−アジド−ＯＨ（Ｒ＝Ｈ），３。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１２ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物２，Ｒ＝Ｈ（１．６５ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（３ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は１０〜２０分以内に消失した。次いで、緑色の反応混合物を真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（１６ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（１６ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物３を順相で精製し（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、粘性油状物を得た（両工程の全収率３６％）。Ｆｍｏｃ−Ｓ３−アジド−ＯＨ（２，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．３８１．１５，Ｍ＋Ｈ観測値．３８１．０７；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  １．６６  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．７８  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９９  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．１２  （１Ｈ，  ＣＨα）；  ３．３２  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４３  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．３７  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５８  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）．
【０２７４】
【化４４】
2013507927.tif 000052
（ｎ＋２）−ヨード−１−アルキン，４。（ｎ＋２）−クロロ−１−アルキン（４７．８ｍｍｏｌ）のアセトン（８０ｍＬ）溶液に、ヨウ化ナトリウム（２当量）を添加した。反応液を６０℃で一晩加熱した。その後、反応液を水で希釈し、生成物をジエチルエーテルで抽出した。有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。生成物５を、中性アルミナプラグに通すことにより精製した。収率：９２％．５−ヨード−１−アルキン（ｎ＝３）：１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  ２．００  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２＋ＣＨ）；  ２．３４  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．３１  （ｔ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）。
【０２７５】
αＭｅ−Ｓ（ｎ＋２）−アルキン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｍｅ），５。Ｓ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。化合物４（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応液を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、反応液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物５を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。αＭｅ−Ｓ５−アルキン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（５，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．５７８．１９，Ｍ＋Ｈ観測値．５７８．１７；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２１  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ５−アルキン））；  １．６２  （１Ｈ，  ＣＨ，  アセチレン）；  １．７７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０５  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．２１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７０  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．４４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６６  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６９および４．４９（ＡＢ系，  ２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル））；  ６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．０５−７．１３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．２７−７．３１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４７  （ｍ，  ２Ｈ）；  ８．００  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０６  （ｍ，  ２Ｈ）。
【０２７６】
Ｓ（ｎ＋２）−アルキン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｈ），５。Ｇｌｙ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。化合物４（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応液を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、反応液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物５を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。Ｓ５−アルキン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（５，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．５６４．１７，Ｍ＋Ｈ観測値．５６４．１５；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：  １．７５  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ，  アセチレン）；  ２．０６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３０  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４９  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．５９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．８８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα’）；  ３．５８および４．４３（ＡＢ系，  ２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル））；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９６  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１４−７．１９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４４  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．４９  （ｍ，  ３Ｈ）；  ８．０５  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１２  （ｄ，  １Ｈ）。
【０２７７】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓ（ｎ＋２）−アルキン−ＯＨ（Ｒ＝Ｍｅ），６。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１８ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物５，Ｒ＝Ｍｅ（２．４ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（４ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は５〜１０分以内に消失した。この緑色の溶液を、次いで真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（２４ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。ジオキサン（２４ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物６を、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物（これは放置すると固化する）を得た（６０％収率）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓ５−アルキン−ＯＨ（６，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．３７８．１６，Ｍ＋Ｈ観測値．３７８．１５；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．４２（ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５４  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６１  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ３−アジド））；  １．９６  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．２０  （ｂｓ，  ３Ｈ，  ＣＨ２＋ＣＨアセチレン）；  ４．２１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４２  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．５１  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２７８】
Ｆｍｏｃ−Ｓ（ｎ＋２）−アルキン−ＯＨ（Ｒ＝Ｈ），６。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１８ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物５，Ｒ＝Ｈ（２．４ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（４ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は５〜１０分以内に消失した。この緑色の溶液を、次いで真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（２４ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。ジオキサン（２４ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物６を、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物（これは放置すると固化する）を得た（６０％収率）。Ｆｍｏｃ−Ｓ５−アルキン−ＯＨ（６，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．３６４．１５，Ｍ＋Ｈ観測値．３６４．１４；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．４８−１．６２（ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  １．８１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９９−２．１１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．２４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアセチレン）；  ４．２１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４２  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．５１  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２７９】
【化４５】
2013507927.tif 000053
αＭｅ−Ｓ（ｎ＋２）−アルケン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｍｅ），７。Ｓ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（２当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。１−ブロモ−ｎ−アルケン（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応液を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、反応液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物７を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。αＭｅ−Ｓ５−アルケン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（７，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．５８０．２０，Ｍ＋Ｈ観測値．５８０．１７；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２３  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ５−アルケン））；  １．６９  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０−２．１４  （ｍ，  ５Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３７−２．５３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２６  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．７０および４．５０（ＡＢ系，  ２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  １２．８Ｈｚ）；  ５．０−５．１０  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．８５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９６  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１２  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２７−７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４７−７．５０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．９９  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０６  （ｍ，  ２Ｈ）．αＭｅ−Ｓ８−アルケン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（７，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．６２２．２５，Ｍ＋Ｈ観測値．６２２．２２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２４  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ８−アルケン））；  １．２９−１．４４  （ｍ，  ５Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５６−１．７４  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０６  （ｍ，  ５Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３２−２．５１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．７０および４．５０（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  １２．８Ｈｚ）；  ４．９２−５．０２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．７６−５．８５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９６  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１２  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２７−７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４５−７．５１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．９９  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０６  （ｍ，  ２Ｈ）。
【０２８０】
Ｇｌｙ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（２当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。１−ブロモ−ｎ−アルケン（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応液を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、反応液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物７を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。Ｓ５−アルケン−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（７，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．５６６．１９，Ｍ＋Ｈ観測値．５６６．１７；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．６９  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９０−２．２３  （ｍ，  ５Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４４−３−４９  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．５０  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．９０  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα’）；  ３．５８および４．４４（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル））；  ４．９７  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．７２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９１  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１４−７．２０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４４−７．４９  （ｍ，  ４Ｈ）；  ８．０４  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１２  （ｄ，  １Ｈ）。
【０２８１】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓ（ｎ＋２）−アルケン−ＯＨ（Ｒ＝Ｍｅ），８。１／１  ３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ溶液（１８ｍＬ）に、７０℃で、化合物７，Ｒ＝Ｍｅ（２．４ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（４ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は５〜１０分以内に消失した。この緑色の溶液を、次いで真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（２４ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（２４ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物８を、順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物（これは放置すると固化する）を得た（７５％収率）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓ５−アルケン−ＯＨ（８，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．３８０．１８，Ｍ＋Ｈ観測値．３８０．１６；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２６−１．４１（ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６１  （ｂｓ，  ３Ｈ，  αＭｅ）；  １．８６  （ｂｓ，  １Ｈ）；  ２．０５  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  （Ｆｍｏｃ））；  ４．４０  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  （Ｆｍｏｃ））；  ４．９７  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．５３  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．７５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ７．２９−７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７６  （ｄ，  ２Ｈ）．Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｓ８−アルケン−ＯＨ（８，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．４２２．２３，Ｍ＋Ｈ観測値．４２２．２２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２８（ｍ，  ９Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６０  （ｂｓ，  ３Ｈ，  αＭｅ）；  １．８３  （ｂｓ，  １Ｈ）；  ２．０１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  （Ｆｍｏｃ））；  ４．３９  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  （Ｆｍｏｃ））；  ４．９０−５．００  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．４９  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．７５−５．８２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ７．２９−７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２８２】
Ｆｍｏｃ−Ｓ（ｎ＋２）−アルケン−ＯＨ（Ｒ＝Ｈ），８。１／１  ３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ溶液（１８ｍＬ）に、７０℃で、化合物７，Ｒ＝Ｈ（２．４ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（４ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は５〜１０分以内に消失した。この緑色の溶液を、次いで真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（２４ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（２４ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物８を、順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物（これは放置すると固化する）を得た（７５％収率）。Ｆｍｏｃ−Ｓ５−アルケン−ＯＨ（８，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝３）：Ｍ＋Ｈ計算値．３６５．１６，Ｍ＋Ｈ観測値．３６５．０９；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．４８（ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．７２  （ｍ，  １Ｈ）；  １．９１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ４．２３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  （Ｆｍｏｃ））；  ４．４２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  （Ｆｍｏｃ））；  ５．００  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２アルケン  ＋  ＣＨα）；  ５．２２  （ｄ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．７６  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ７．３１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７６  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２８３】
【化４６】
2013507927.tif 000054
αＭｅ−Ｓ−Ｓｅｒ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ，９。ＫＯＨ（７．５当量）のメタノール（２０ｍＬ）溶液に、Ｓ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（４ｍｍｏｌ）とパラホルムアルデヒド（２０当量）を室温で添加した。反応混合物を一晩撹拌し、酢酸で中和した。次いで、水を添加してジアステレオ異性体の混合物を沈殿させた。沈殿は一晩で完了させた。沈殿物を濾別し、水で洗浄し、真空乾燥させた。ジアステレオ異性体（Ｓ，Ｓ）９を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって単離した（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）。化合物９は赤色固形物である（収率３３％）。Ｍ＋Ｈ計算値．５４２．１５，Ｍ＋Ｈ観測値．５４２．０９；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．０５  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ（セリン））；  １．９８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．６９  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２（セリン））；  ３．５８および４．３７（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  Ｈｚ）；  ６．６０  （ｍ，  １Ｈ）；  ６．６７  （ｄｄ，  １Ｈ）；  ７．１  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．１７  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．２７  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３５−７．４７  （ｍ，  ５Ｈ）；  ７．９５  （ｄｄ，  １Ｈ）；  ８．０９  （ｍ，  ２Ｈ）。
【０２８４】
Ｂｏｃ−αＭｅ−Ｌ−Ｓｅｒ−ＯＨ，１０。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，６ｍｌ）溶液に、７０℃で、０．８６ｍｍｏｌの化合物１０（２ｍｌのＭｅＯＨに溶解）を添加した。この溶液を、赤色が消失するまで７０℃で１５〜２０分間撹拌した。この緑色の溶液を、次いで濃縮乾固した。水（３ｍｌ）を滴下して、ＢＰＢ助剤のＨＣｌ塩を沈殿させた。濾液を除去し、白色固形物を、それぞれ１．５ｍｌの水で２回洗浄した（ＢＰＢ，ＨＣｌの回収率８５％）。合わせた濾液に、８当量の固体のＮａ２ＣＯ３を添加した後、２当量のＥＤＴＡ二ナトリウム塩を添加した。反応液を室温で１時間撹拌した。溶液は青色になった。次いで、これを氷／水浴で０℃まで冷却し、１．１当量のＢｏｃ２Ｏ（６ｍｌのジオキサンに溶解）を滴下した。反応液を一晩撹拌した。その後、これをジエチルエーテルと水とで希釈した。水層をジエチルエーテルで１回抽出した。水層を１Ｎ  ＨＣｌでｐＨ＝３に酸性化し、ジエチルエーテルで洗浄した（３回）。合わせた有機層をブラインで洗浄し、ＭｇＳＯ４上で乾燥させ、真空濃縮した。このＢｏｃ保護アミノ酸を、さらに精製を行なって（ｗｉｔｈ  ａｎｙ  ｆｕｒｔｈｅｒ  ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ）次の工程に使用した。Ｍ＋Ｈ計算値．２６０．１４，Ｍ＋Ｈ観測値．２６０．１２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．４５（ｓ，  ９Ｈ，  Ｂｏｃ）；  １．５０  （ｓ，  ３Ｈ，  αＭｅ（セリン））；  ３．８６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．４８  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）。
【０２８５】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｌ−Ｓｅｒ（Ｏアリル）−ＯＨ（ｎ＝１），１１。１０（２ｍｍｏｌ）のＤＭＦ（１０ｍｌ）溶液に、０℃で、ＮａＨ（２当量）と臭化アリル（１当量）とを添加した。この溶液を０℃で２時間撹拌した。反応液を酢酸エチルと水とで希釈した。有機層をブラインで洗浄し、ＭｇＳＯ４上で乾燥させ、真空濃縮した。粗製物質をジクロロメタン（６ｍＬ）に溶解させ、この溶液にＴＦＡ（３ｍＬ）を添加した。反応液を１時間撹拌した。次いで、この溶液を濃縮乾固した。最後に、粗製物質を、ＮａＨＣＯ３とアセトン（１／１，２０ｍＬ）との水溶液に溶解させ、ＦｍｏｃＯＳｕ（１．１当量）を０℃で滴下した。反応液を一晩撹拌した。その後、この混合液をジエチルエーテルと水とで希釈した。有機層をブラインで洗浄し、ＭｇＳＯ４上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１１を、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物を得た（４９％収率）。Ｍ＋Ｈ計算値．３８２．１６，Ｍ＋Ｈ観測値．３８２．１４；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．６２  （ｓ，  ３Ｈ，  αＭｅ（セリン））；  ３．８０  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．０２  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４０  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．２３  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．７４  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．８４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．６０  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７６  （ｄ，  ２Ｈ）．
【０２８６】
【化４７】
2013507927.tif 000055
Ｆｍｏｃ−Ｌ−Ｓｅｒ（Ｏアリル）−ＯＨ，１２。Ｂｏｃ−Ｌ−セリン（２ｍｍｏｌ）のＤＭＦ（１０ｍｌ）溶液に、０℃で、ＮａＨ（２当量）と臭化アリル（１当量）とを添加した。この溶液を０℃で２時間撹拌した。反応液を酢酸エチルと水とで希釈した。有機層をブラインで洗浄し、ＭｇＳＯ４上で乾燥させ、真空濃縮した。粗製物質をジクロロメタン（６ｍＬ）に溶解させ、この溶液にＴＦＡ（３ｍＬ）を添加した。反応液を１時間撹拌した。次いで、この溶液を濃縮乾固した。最後に、粗製物質を、ＮａＨＣＯ３とアセトン（１／１，２０ｍＬ）との水溶液に溶解させ、ＦｍｏｃＯＳｕ（１．１当量）を０℃で滴下した。反応液を一晩撹拌した。その後、この混合液をジエチルエーテルと水とで希釈した。有機層をブラインで洗浄し、ＭｇＳＯ４上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１２を、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物を得た（６９％収率）。Ｍ＋Ｈ計算値．３６７．１４，Ｍ＋Ｈ観測値．３６７．１２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：３．６４（ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．８８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  Ｆｍｏｃ）；  ３．９６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  Ｆｍｏｃ）；  ４．１７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．３６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．４８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．１４  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．６０  （ｄ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．７９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ７．２４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．６８  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２８７】
【化４８】
2013507927.tif 000056
αＭｅ−Ｒｎ−アジド−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｍｅ），１３。Ｒ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。化合物１（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応混合物を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、この溶液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物１３を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。αＭｅ−Ｒ５−アジド−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１３，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝５）：Ｍ＋Ｈ計算値．６２３．２２，Ｍ＋Ｈ観測値．６２３．１９；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２４  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｒ５−アジド））；  １．３３  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６３  （ｍ，  ４Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０５  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．４８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２８  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．７１および４．５０（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２ベンジル）；  ６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９５  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１３  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２８−７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４７−７．５０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．９９  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０６  （ｄ，  ２Ｈ）．αＭｅ−Ｒ６−アジド−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１３，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．６３７．２４，Ｍ＋Ｈ観測値．６３７．２２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２４  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｒ６−アジド））；  １．３３  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．４８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６３  （ｍ，  ４Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０５  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．４８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２８  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．７１および４．５０（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２ベンジル）；  ６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９５  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１３  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２８−７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４７−７．５０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．９９  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０６  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２８８】
Ｒｎ−アジド−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｈ），１３。Ｇｌｙ−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。化合物１（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応混合物を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、この溶液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物１３を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。Ｒ５−アジド−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１３，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝５）：Ｍ＋Ｈ計算値．６０９．２０，Ｍ＋Ｈ観測値．６０９．１８；δ  １．１８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５２  （ｍ，  ４Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０６  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２０  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．５５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．９０  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα’）；  ３．５８および４．４４（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２ベンジル）；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９２  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１１−７．２１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．２７  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．３２−７．３６  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４６−７．５０  （ｍ，  ３Ｈ）；  ８．０４  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１１  （ｄ，  １Ｈ）．Ｒ６−アジド−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１３，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．６２３．２２，Ｍ＋Ｈ観測値．６２３．１９；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．１６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．３２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５４  （ｍ，  ４Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０５  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１６  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．５８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．９０  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα’）；  ３．５９および４．４４（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２ベンジル）；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９２  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１１−７．２１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．２７  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．３２−７．３６  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４５  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．５０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ８．０４  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１１  （ｄ，  １Ｈ）。
【０２８９】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｒｎ−アジド−ＯＨ（Ｒ＝Ｍｅ），１４。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１２ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物１３，Ｒ＝Ｍｅ（１．６５ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（３ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は１０〜２０分以内に消失した。次いで、緑色の反応混合物を真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（１６ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（１６ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１４を順相で精製し（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、粘性油状物を得た（両工程の全収率３６％）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｒ５−アジド−ＯＨ（１４，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝５）：Ｍ＋Ｈ計算値．４２３．２０，Ｍ＋Ｈ観測値．４２３．３４；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：０．９０（ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．３６  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５６  （ｍ，  ２Ｈ）；  １．６０  （ｂｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｒ５−アジド））；  １．８６  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１５  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２３  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  Ｆｍｏｃ）；  ４．４０  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  Ｆｍｏｃ）；  ５．５１  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７８  （ｄ，  ２Ｈ）．Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｒ６−アジド−ＯＨ（１４，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．４３７．２１，Ｍ＋Ｈ観測値．４３７．３１；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：０．９０（ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．３２  （ｂｓ，  ４Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５６  （ｍ，  ２Ｈ）；  １．６１  （ｂｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｒ６−アジド））；  １．８４  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１３  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２３  （ｔ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  Ｆｍｏｃ）；  ４．３９  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  Ｆｍｏｃ）；  ５．５１  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２９０】
Ｆｍｏｃ−Ｒｎ−アジド−ＯＨ（Ｒ＝Ｈ），１４。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１２ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物１３，Ｒ＝Ｈ（１．６５ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（３ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は１０〜２０分以内に消失した。次いで、緑色の反応混合物を真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（１６ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（１６ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１４を順相で精製し（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、粘性油状物を得た（両工程の全収率３６％）。Ｆｍｏｃ−Ｒ５−アジド−ＯＨ（１４，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝５）：Ｍ＋Ｈ計算値．４０９．１８，Ｍ＋Ｈ観測値．４０９．３７；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２９（ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．４０  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６０  （ｍ，  ２Ｈ）；  １．７２  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９０  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  Ｆｍｏｃ）；  ４．４１  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２  Ｆｍｏｃ  ＋  ＣＨα）；  ５．３０  （ｄ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４０  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７８  （ｄ，  ２Ｈ）．Ｆｍｏｃ−Ｒ６−アジド−ＯＨ（１４，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．４２３．２０，Ｍ＋Ｈ観測値．４２３．３４；ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．３７（ｂｓ，  ６Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５９  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．７０  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９０  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２５  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  Ｆｍｏｃ）；  ４．４１  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２  Ｆｍｏｃ  ＋  ＣＨα）；  ５．２４  （ｄ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．７６  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２９１】
【化４９】
2013507927.tif 000057
αＭｅ−Ｒ（ｎ＋２）−アルケン−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｍｅ），１５。Ｒ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（２当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。１−ブロモ−ｎ−アルケン（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応液を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、反応液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物１５を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。αＭｅ−Ｒ８−アルケン−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（７，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．６２２．２５，Ｍ＋Ｈ観測値．６２２．２２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２４  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｓ８−アルケン））；  １．２９−１．４４  （ｍ，  ５Ｈ，  ＣＨ２）；  １．５６−１．７４  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０６  （ｍ，  ５Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３２−２．５１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．６８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．６２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．７０および４．５０（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  １２．８Ｈｚ）；  ４．９２−５．０２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．７６−５．８５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９６  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１２  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２７−７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．４５−７．５１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．９８  （ｄ，  １Ｈ）；  ８．０６  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２９２】
Ｒ（ｎ＋２）−アルケン−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（Ｒ＝Ｈ），１５。Ｇｌｙ−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（２当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。１−ブロモ−ｎ−アルケン（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応液を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、反応液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物１５を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（５５％収率）。Ｒ８−アルケン−Ｎｉ−Ｒ−ＢＰＢ（１５，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．６０８．２３，Ｍ＋Ｈ観測値．６０８．２１；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．１４  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．３０  （ｍ，  ４Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９２−２．１６  （ｍ，  ６Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．５２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．７５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．４４−３．５２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．５８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα）；  ３．９１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨα’）；  ３．５８および４．４４（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル））；  ４．９２−５．００  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．７８  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ６．６３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９１  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１３−７．１８  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．２４  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．３４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４９  （ｍ，  ３Ｈ）；  ８．０３  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１２  （ｄ，  １Ｈ）。
【０２９３】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｒ（ｎ＋２）−アルケン−ＯＨ（Ｒ＝Ｍｅ），１６。１／１  ３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ溶液（１８ｍＬ）に、７０℃で、化合物１５，Ｒ＝Ｍｅ（２．４ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（４ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は５〜１０分以内に消失した。この緑色の溶液を、次いで真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（２４ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（２４ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１６を、順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物（これは放置すると固化する）を得た（７５％収率）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｒ８−アルケン−ＯＨ（１６，Ｒ＝Ｍｅ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．４２２．２３，Ｍ＋Ｈ観測値．４２２．２２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．２８（ｍ，  ８Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６０  （ｓ，  ３Ｈ，  αＭｅ）；  １．８３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０１  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．１１  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  （Ｆｍｏｃ））；  ４．３９  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  （Ｆｍｏｃ））；  ４．９０−５．００  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン）；  ５．４９  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．７５−５．８２  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ７．２９−７．３３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３８−７．４２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２９４】
Ｆｍｏｃ−Ｒ（ｎ＋２）−アルケン−ＯＨ（Ｒ＝Ｈ），１６。１／１  ３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ溶液（１８ｍＬ）に、７０℃で、化合物１５，Ｒ＝Ｈ（２．４ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（４ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は５〜１０分以内に消失した。この緑色の溶液を、次いで真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（２４ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（２４ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１６を、順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製（メタノールとジクロロメタンとを溶離剤として使用）した後に単離し、粘性油状物（これは放置すると固化する）を得た（７５％収率）。Ｆｍｏｃ−Ｒ８−アルケン−ＯＨ（１６，Ｒ＝Ｈ，ｎ＝６）：Ｍ＋Ｈ計算値．４０７．２１，Ｍ＋Ｈ観測値．４０７．１９；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．３２（ｍ，  ８Ｈ，  ＣＨ２）；  １．７１  （ｍ，  １Ｈ）；  １．８９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ４．２３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ  （Ｆｍｏｃ））；  ４．４２  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２  （Ｆｍｏｃ））；  ４．９６  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２アルケン  ＋  ＣＨα）；  ５．２０  （ｄ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ５．７９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨアルケン）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２９５】
【化５０】
2013507927.tif 000058
αＭｅ−Ｐｈｅ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ，１７．Ｓ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。臭化ベンジル（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応混合物を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、この溶液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物１７を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（６０％収率）。αＭｅ−Ｐｈｅ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１７）：Ｍ＋Ｈ計算値．６０２．１９，Ｍ＋Ｈ観測値．６０２．１８；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．１７  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｐｈｅ））；  １．５７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．８９  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０６  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．２４  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．０５  （ｍ，  １Ｈ）；  ３．１８  （ｓ，  ２Ｈ）；  ３．２６  （ｍ，  １Ｈ）；  ３．５６および４．３１（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  １２．８Ｈｚ）；  ６．６４  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９４  （ｄ，  １Ｈ）；  ７．１２  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２０  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２０−７．４０  （ｍ，  １０Ｈ）；  ７．４３  （ｍ，  ２Ｈ）；  ８．０１  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．１３  （ｍ，  １Ｈ）。
【０２９６】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｐｈｅ−ＯＨ，１８。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１５ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物１７（２．１ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（５ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は１０〜２０分以内に消失した。次いで、緑色の反応混合物を真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（１６ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（１６ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１８を順相で精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、白色泡状物を得た（両工程の全収率５２％）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｐｈｅ−ＯＨ（１８）：Ｍ＋Ｈ計算値．４０２．１６，Ｍ＋Ｈ観測値．４０２．１２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）    １．６４  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ）；  ３．３５  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２６  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４８  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．３５  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．０８  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．１９  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．７８  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０２９７】
【化５１】
2013507927.tif 000059
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ａｒｇ（Ｂｏｃ）２−ＯＨ，１９。化合物３（２．３ｍｍｏｌ）のイソプロパノール（２０ｍＬ）溶液に、１０％パラジウム担持活性炭を添加した。この懸濁液を水素下、雰囲気圧で一晩撹拌した。この溶液をセライトで濾過し、次いで真空濃縮した。粗製残渣をＴＨＦ（１６ｍｌ）に溶解させ、ピラゾール（Ｂｏｃ）２（１．１当量）を添加し、反応液を一晩撹拌した。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物１９を順相で精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、白色泡状物を得た（両工程の全収率４０％）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ａｒｇ（Ｂｏｃ）２−ＯＨ（１９）：Ｍ＋Ｈ計算値．６１１．３０，Ｍ＋Ｈ観測値．６１１．１５；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  １．４７および１．４８  （２ｓ，  １８Ｈ，  ２Ｂｏｃ）；  １．４８  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  １．６３  （ｓ，  ３Ｈ，  ＣＨ３）；  １．８４  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．３５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．３４  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２３  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．３４および４．４２  （２ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．９２  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．３９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．６０  （ｄ，  ２Ｈ）；  ７．７６  （ｄ，  ２Ｈ），  ８．４６  （ｂｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）。
【０２９８】
【化５２】
2013507927.tif 000060
αＭｅ−Ｔｙｒ（ＯＭｅ）−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ，２０。Ｓ−Ａｌａ−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（１０．０ｍｍｏｌ）とＫＯ−ｔＢｕ（１．５当量）に、アルゴン下で４５ｍＬのＤＭＦを添加した。塩化４−メトキシベンジル（１．５当量）のＤＭＦ（４．０ｍＬ）溶液をシリンジによって添加した。反応混合物を周囲温度で１時間撹拌した。次いで、この溶液を５％水性酢酸でクエンチし、水で希釈した。油状生成物を濾過によって回収し、水で洗浄した。所望の生成物２０を順相でのフラッシュクロマトグラフィーによって精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、赤色固形物を得た（６０％収率）。αＭｅ−Ｔｙｒ（ＯＭｅ）−Ｎｉ−Ｓ−ＢＰＢ（２０）：Ｍ＋Ｈ計算値．６３２．２０，Ｍ＋Ｈ観測値．６３２．１８；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）  δ：１．１２  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ  （αＭｅ−Ｔｙｒ（ＯＭｅ））；  １．５７  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  １．９０（ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．０５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ２）；  ２．２３  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．０８  （ｍ，  ３Ｈ，  ＣＨ２）；  ３．２６  （ｍ，  １Ｈ）；  ３．８０  （ｓ，  ３Ｈ，  ＯＭｅ）；  ３．５２および４．２７（ＡＢ系，２Ｈ，  ＣＨ２（ベンジル），  Ｊ＝  １２．８Ｈｚ）；  ６．５８  （ｍ，  ２Ｈ）；  ６．９６  （ｍ，  ３Ｈ）；  ７．０９  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．１７  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．２７−７．３２  （ｍ，  ５Ｈ）；  ７．３６  （ｍ，  １Ｈ）；  ７．４５  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．９９  （ｄ，  ２Ｈ）；  ８．０９  （ｄ，  １Ｈ）。
【０２９９】
Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｔｙｒ（ＯＭｅ）−ＯＨ，２１。３Ｎ  ＨＣｌ／ＭｅＯＨ（１／１，１５ｍＬ）溶液に、７０℃で、化合物２０（２．１ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（５ｍｌ）溶液を滴下した。出発物質は１０〜２０分以内に消失した。次いで、緑色の反応混合物を真空濃縮した。粗製残渣を１０％水性Ｎａ２ＣＯ３（１６ｍｌ）で希釈し、氷浴で０℃まで冷却した。アセトン（１６ｍｌ）に溶解させたＦｍｏｃ−ＯＳｕ（１．１当量）を添加し、反応液を、撹拌しながら一晩、周囲温度まで昇温させた。その後、反応液を酢酸エチルと１Ｎ  ＨＣｌとで希釈した。有機層を１Ｎ  ＨＣｌで洗浄した（３回）。次いで、有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥させ、真空濃縮した。所望の生成物２１を順相で精製し（アセトンとジクロロメタンとを溶離剤として使用）、白色泡状物を得た（両工程の全収率５６％）。Ｆｍｏｃ−αＭｅ−Ｔｙｒ（ＯＭｅ）−ＯＨ（２１）：Ｍ＋Ｈ計算値．４３２．１７，Ｍ＋Ｈ観測値．４３２．１２；１Ｈ  ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３）    １．６３  （ｓ，  ３Ｈ，  Ｍｅ）；  ３．２７  （ｍ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ４．２５  （ｍ，  １Ｈ，  ＣＨ）；  ４．４６  （ｂｓ，  ２Ｈ，  ＣＨ２）；  ５．３５  （ｓ，  １Ｈ，  ＮＨ）；  ６．７５  （ｄ，  ２Ｈ）；  ６．９７  （ｂｓ，  ２Ｈ）；  ７．３２  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．４１  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．５９  （ｍ，  ２Ｈ）；  ７．７７  （ｄ，  ２Ｈ）。
【０３００】
非天然アミノ酸（五炭素のオレフィンアミノ酸のＲおよびＳ鏡像異性体ならびに八炭素のオレフィンアミノ酸のＳ鏡像異性体）を、核磁気共鳴（ＮＭＲ）分光法（Ｖａｒｉａｎ  Ｍｅｒｃｕｒｙ  ４００）および質量分析法（Ｍｉｃｒｏｍａｓｓ  ＬＣＴ）により特徴付けた。ペプチド合成を、固相条件、リンクアミドＡＭ樹脂（ｒｉｎｋ  ａｍｉｄｅ  ＡＭ  ｒｅｓｉｎ）（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）およびＦｍｏｃ主鎖保護基化学を用いて、手作業または自動ペプチド合成装置（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，ｍｏｄｅｌ  ４３３Ａ）のいずれかで行った。天然Ｆｍｏｃ保護アミノ酸（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）のカップリングのために、１０当量のアミノ酸および１：１：２モル比のカップリング試薬ＨＢＴＵ／ＨＯＢｔ（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）／ＤＩＥＡを使用した。非天然のアミノ酸（４当量）を、１：１：２モル比のＨＡＴＵ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）／ＨＯＢｔ／ＤＩＥＡを用いて、またはさらに以下に記載するようにカップリングした。オレフィンメタセシスを、脱気したジクロロメタンに溶解した１０ｍＭのＧｒｕｂｂｓ触媒（Ｂｌａｃｋｅｗｅｌｌら，１９９４、上記）（Ｓｔｒｅｍ  Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ）を用いて、固相において行い、室温において２時間反応させた。メタセシスされた化合物の単離は、トリフルオロ酢酸が媒介する脱保護および切断、粗生成物を得るためのエーテル沈殿、ならびに純粋な化合物を得るための逆相Ｃ１８カラム（Ｖａｒｉａｎ）における高性能液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）（Ｖａｒｉａｎ  ＰｒｏＳｔａｒ）により達成した。純粋な生成物の化学組成は、ＬＣ／ＭＳ質量分析（Ａｇｉｌｅｎｔ  １１００  ＨＰＬＣシステムとインターフェース接続したＭｉｃｒｏｍａｓｓ  ＬＣＴ）およびアミノ酸分析（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、モデル４２０Ａ）により確認した。
【０３０１】
実施例２．本発明のペプチド模倣大環状分子の合成
α−へリックスＢＩＤペプチド模倣大環状分子は、先に記載されたように（Ｗａｌｅｎｓｋｙら（２００４）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３０５：１４６６−７０；Ｗａｌｅｎｓｋｙら（２００６）Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  ２４：１９９−２１０（これらはすべて、参照によって本明細書に援用される））および以下に示すとおりに合成し、精製し、解析した。以下の大環状分子をこの試験に使用した。
【０３０２】
【表１０】
2013507927.tif 000061
オレフィン側鎖を含むα，α−二置換非天然アミノ酸をＷｉｌｌｉａｍｓら（１９９１）Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１１３：９２７６；およびＳｃｈａｆｍｅｉｓｔｅｒら（２０００）Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ  Ｓｏｃ．１２２：５８９１に従って合成した。ペプチド模倣大環状分子は、天然に存在する２つのアミノ酸（上記参照）を対応する合成アミノ酸で置き換えることにより設計した。置換は、表示したｉおよびｉ＋４の位置ならびにｉからｉ＋７までの位置で行なった。ペプチド模倣大環状分子は、固相ペプチド合成の後、合成アミノ酸をその側鎖反応性部分によって架橋することにより生成した。ＢＩＤおよびＢＩＭペプチド模倣大環状分子のコントロール配列を上記に示す。上記の表において、１つの大環状分子名に対して２つの配列が示されている場合、各配列は、架橋反応の結果得られる異性体を表す。
【０３０３】
上記の配列において、以下の命名を使用する：
＄  α−Ｍｅ  Ｓ５オレフィンアミノ酸によって形成されるシスオレフィンｉからｉ＋４までの架橋
＄ｒ５  α−Ｍｅ  Ｒ５  オレフィンアミノ酸によって形成されるシスオレフィンｉからｉ＋４までの架橋
Ｓｔ  タンデムシスオレフィンｉからｉ＋４までの架橋；２つの架橋は「Ｓｔ」で示すアミノ酸に由来する
Ａｍｆ  α−Ｍｅフェニルアラニンアミノ酸
Ａｍｒ  α−Ｍｅアルギニンアミノ酸
Ａｃ  アセチル（アセチル化Ｎ末端）
ＮＨ２  アミド（アミド化Ｃ末端）
Ｎｌｅ  ノルロイシン
Ａｉｂ  ２−アミノイソ酪酸  。
【０３０４】
実施例３．本発明のペプチド模倣大環状分子で処理した腫瘍細胞系統の細胞生存率アッセイ
腫瘍細胞系統を、ＡＴＣＣおよびＮＣＩによって推奨された特定の血清補充培地（増殖培地）中で増殖させる。試験開始の前日、細胞を、マイクロタイタープレート内の２００μｌの増殖培地中に最適な細胞密度（１５，０００〜２５，０００細胞／ウェル）でプレーティングした。翌日、細胞を無血清／フェノールレッド無含有ＲＰＭＩ完全培地（アッセイ緩衝液）中で２回洗浄し、最終容量１００μｌのアッセイ緩衝液を各ウェルに添加した。ヒト末梢血リンパ球（ｈＰＢＬ）をバッフィーコート（Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ  Ｂｌｏｏｄ  Ｂａｎｋ）から、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐａｑｕｅ勾配分離を用いて単離し、実験の日に２５，０００細胞／ウェルでプレーティングした。
【０３０５】
ペプチド模倣大環状分子を１ｍＭストック（１００％ＤＭＳＯ）から滅菌水中で希釈し、４００μＭの作業溶液を調製した。次いで、大環状分子およびコントロールを投薬プレート内のアッセイ緩衝液中で１０倍もしくは４０倍に希釈するか、またはあるいは２倍連続希釈し、それぞれ、４０μＭおよび２０μＭまたは１．２μＭと４０μＭとの間のいずれかの濃度を得た。１００μＬのそれぞれの希釈物を次いで、試験プレートの適切なウェルに添加し、ポリペプチドの終濃度を、それぞれ、２０μＭもしくは５μＭ、または０．６μＭ〜２０μＭにした。コントロールには、大環状分子を含むウェルと同じ濃度のＤＭＳＯを含むポリペプチドなしのウェル、０．１％Ｔｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００を含むウェル、１μＭベルケイド、１００μＭエトポシドおよび２０μＭタキソールからなるケモカクテル（ｃｈｅｍｏ  ｃｏｃｋｔａｉｌ）を含むウェルおよび細胞を含まないウェルを含めた。プレートを加湿５％ＣＯ２雰囲気中、３７℃で４時間インキュベートした。
【０３０６】
４時間のインキュベーション時間の終了に向かって、総濃度１０％のＦＢＳのために、２２μｌのＦＢＳを各ウェルに添加した。血清の添加後、プレートを、加湿５％ＣＯ２雰囲気中、３７℃でさらに４４時間インキュベートした。インキュベーション期間の終了時、ＭＴＴアッセイを、製造業者の使用説明書（Ｓｉｇｍａ，カタログ番号Ｍ２１２８）に従って行ない、５６０ｎｍの吸光度をＤｙｎｅｘ  Ｏｐｓｙｓ  ＭＲ  Ｐｌａｔｅリーダーを用いて測定した。
【０３０７】
実施例４．融解温度（Ｔｍ）の測定：
凍結乾燥ペプチド模倣大環状分子をｄｄＨ２Ｏまたは５％ＰＥＧ−４００（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ（ｐＨ７．４）中）に溶解させ、最終濃度２５〜５０μＭにする。円偏光二色性（ＣＤ）スペクトルを、Ｊａｓｃｏ−８１０分光偏光計に、標準的な測定パラメーター（例えば、温度、１０または２０℃；波長、１９０〜２６０ｎｍ；ステップ分解能、０．５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；蓄積、１０；応答、１秒；帯域幅、１ｎｍ；光路長（ｐａｔｈ  ｌｅｎｇｔｈ）、０．１ｃｍ）を用いて取得する。平均残基楕円率（例えば、［Φ］２２２ｏｂｓ）をモデルへリックスデカペプチドについて報告されている値で除することによって各ペプチドのα−へリックス含量を計算する（Ｙａｎｇら（１９８６），Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３０：２０８））。Ｔｍは、Ｊａｓｃｏ−８１０分光偏光計で、２２２ｎｍの固定波長で５〜９５℃の温度における円偏光二色性（ＣＤ）スペクトルを測定することにより決定される。以下のパラメーター：データピッチ、０．１℃；帯域幅、１ｎｍおよび光路長、０．１ｃｍ（１６秒間のシグナルを平均する）を測定に使用する。
【０３０８】
実施例５．血漿安定性の測定のための試料の調製：
エキソビボ血漿安定性試験のため、１０μＭのペプチド模倣大環状分子を、予め清澄化したヒトおよびマウス血漿とともに、３７℃で０、１５および１２０分間インキュベートする。それぞれのインキュベーション時間の終了時、１００μＬの試料を取り出し、３００μｌの氷冷ＭＥＯＨを入れた新たな低保持エッペンドルフチューブ内に入れる。試料を１０，０００ｒｐｍで遠心分離し、上清を取り出し、新たな低保持エッペンドルフチューブ内に入れ、２００μｌのＨＰＬＣ  Ｈ２Ｏをそれぞれの試料に添加した。試料を次いでＬＣ−ＭＳ／ＭＳによって以下に示すようにして解析する。
【０３０９】
実施例６．プロテアーゼの安定性アッセイ：
ペプシン試験のため、親ペプチド模倣大環状分子配列とα，α−メチル二置換ペプチド模倣大環状分子配列とからなるそれぞれのペア（それぞれ、５μＭ）を、陽性コントロール線形ペプチド（５μＭ）（サフラワー油／エタノール／水懸濁液中、０．２：９．８：９０、ｖ／ｖ（％）、０．０１５Ｍ  ＨＣｌと０．１５Ｍ  ＮａＣｌとで緩衝（ｐＨ１．８））と組み合わせた。１１個のペアを１１個の作業溶液で試験し、それぞれを、１０、３０、４５、６０分間のペプシンインキュベーション時間、およびペプシン添加なしで６０分間インキュベートする０分間コントロールのために５×０．５ｍｌの反応容量のアリコートに分けた。反応は、２０μｌのペプシン−シリカゲルスラリー（０．４μｇのペプシン）を添加し、その後の４０℃のオーブン内でのインキュベーション中、バイアルを連続的に振盪することにより３８〜４０℃で開始した。それぞれの時点で、反応は、５００μｌの４８：４８：２ｖ／ｖ（％）のヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリル／ＴＦＡの添加によって停止させた。混合後に形成された二相混合物と底部層の液とを、続いて、ＭＲＭ検出モードでのＬＣ／ＭＳ解析のために二連で注入した。それぞれのペプチドの反応速度を、Ｅｘｃｅｌで、酵素のインキュベーション時間に対する未較正ＭＲＭ応答の自然対数の線形フィットによって得られる傾きの（−１）倍として計算した。それぞれのペプチドの反応半減期を、ｌｎ２／速度定数として計算した。
【０３１０】
同様の手順をトリプシン試験に使用した。親ペプチド模倣大環状分子配列とα，α−メチル二置換ペプチド模倣大環状分子配列とからなるそれぞれのペア（それぞれ、５μＭ）を、線形ペプチド（５μＭ）（サフラワー油／エタノール／水懸濁液中、０．２：９．８：９０、ｖ／ｖ（％）、０．０５５  Ｍ  Ｔｒｉｓ−酢酸塩、０．１５Ｍ  ＮａＣｌで緩衝（ｐＨ７．８））と組み合わせた。１０個のペアを１０個の作業溶液で試験し、それぞれを、１０、２０、３０、６０分間のトリプシンインキュベーション時間、およびトリプシン添加なしで６０分間インキュベートする０分間コントロールのために５×０．５ｍｌの反応容量のアリコートに分けた。反応は、２０μｌのトリプシン−シリカゲルスラリー（０．４μｇまたは０．３２μｇのトリプシン）を添加し、その後の４０℃のオーブン内でのインキュベーション中、バイアルを連続的に振盪することにより３８〜４０℃で開始した。それぞれの時点で、反応は、５００μｌの４８：４８：２ｖ／ｖ（％）のヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリル／ＴＦＡの添加によって停止させた。混合後に形成された二相混合物と底部層の液とを、続いて、ＭＲＭ検出モードでのＬＣ／ＭＳ解析のために二連で注入した。それぞれのペプチドの反応速度を、Ｅｘｃｅｌで、酵素のインキュベーション時間に対する未較正ＭＲＭ応答の自然対数の線形フィットによって得られる傾きの（−１）倍として計算した。それぞれのペプチドの反応半減期を、ｌｎ２／速度定数として計算した。
【０３１１】
カテプシンＤ試験では、親およびα，α−メチル二置換架橋ペプチドからなるそれぞれのペア（それぞれ、２４μＭ）を１３個のコントロール架橋ペプチドと、１２５ｍＭ  ＫＣｌおよび０．１％ポリソルベート８０を含む７５ｍＭ酢酸アンモニウム溶液（ｐＨ４．７）において組み合わせ、８×０．２５ｍＬのアリコートに分けた。反応は、１：１８０および１：９０（ｗ／ｗ）のＥ／Ｓ比で０、１．０、２．１μｇのカテプシンＤの添加によって３８〜４０℃で開始した（各混合物の複製を得た）。２４０分後、２００μＬの４９：４９：２ｖ／ｖ（％）のヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリル／ＴＦＡを添加することにより反応を停止させた。混合後に形成された二相混合物と底部層とを、続いて、１：１ｖ／ｖヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリル中で１：１０に希釈した。得られた混合物を勾配−ＬＣ／ＭＳ法によって解析し、これにより、それぞれのペプチドの特性ＬＣ保持時間と分子イオンを得た。それぞれのペプチドの見かけ上の反応速度を、Ｅｘｃｅｌで、酵素／基質比に対する未較正ＭＳ応答の自然対数の線形フィットによって得られる傾きの（−１）倍として計算した。それぞれのペプチドの反応半減期をｌｎ２／速度定数として計算した。コントロール混合物（プロテアーゼ添加せず）は、サフラワー油／エタノール／水懸濁液、０．２：９．８：９０、ｖ／ｖ（％）（０．０１５Ｍ  ＨＣｌで緩衝、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ含有）を含む緩衝液中で安定である（＞６０分間）ようであった。
【０３１２】
結果を図６に示す。本発明のペプチド模倣大環状分子では、カテプシン（ｃａｔｈｅｐｔｓｉｎ）Ｄに対する改善された安定性が観察される。α，α−二置換アミノ酸が切断部位に配置された場合、プロテアーゼ安定性における有意な改善が得られるが、α，α−二置換アミノ酸のより離れた配置は、プロテアーゼ安定性の改善はいくぶん減少する。
【０３１３】
実施例７．ラット粘膜安定性アッセイ：
ペプチド模倣大環状分子を２つの混合物に分け、１０個のペプチド（それぞれ、４μＭ）、０．１％Ｔｗｅｅｎ  ８０、ＰＢＳ（ｐＨ７．０）を含むそれぞれの混合物において固有分子質量が確保されるようにした。２匹のラット由来のＧＩ粘膜擦過物を、濡れた氷上で、０．１％Ｔｗｅｅｎ  ８０を含む１ｍＬのＰＢＳ中に懸濁させ、ビーズミルで２０秒間ホモジナイズし、約０．７ｇ／ｍｌの均一な組織分散物を得た。この粘膜ホモジネートとペプチド混合物とを１：１（容量基準）で合わせ、１分間ボルテックスした。最終濃度は、それぞれのペプチド２μＭとした。水浴中でのインキュベーションは３８〜４０℃にし、０、５、１０、１５、２０、３０および６０分後に１００μｌのアリコートを採取し、直ちに凍結させた。粘膜添加なしのペプチド混合物は水浴中に６０分間保持した。ペプチドおよび代謝産物を混合物から、４８：４８：２ｖ／ｖ（％）のヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリル／トリフルオロ酢酸を用いて抽出し、勾配−ＬＣ／ＭＳ解析のために有機（底部）層を直接注入した。再構成イオンクロマトグラムを作成し、インタクトなペプチドならびにそれぞれのペプチドＮおよびＣ末端切断によって生じたと思われる代謝産物に対応する分子イオン質量を予測した。ペプチド模倣大環状分子は、干渉がほとんどまたは全く観察されない勾配時間で溶出されたため、すべての推定代謝産物の再構成クロマトグラムにより、ベースラインなしの３７℃でのインキュベーション時間は、最小限の偏差または偏差なしであることが示された。それぞれのペプチドおよび推定切断産物のそれぞれのインキュベーション時間における未較正クロマトグラフィーピーク面積を得、最大ピーク面積応答が１００％およびピーク面積応答なしが０％となるように正規化した。ＧｒａｐｈＰａｄにて応答をインキュベーション時間に対してプロットした。
【０３１４】
結果を図８に示す。これは、ラット胃腸粘膜ペプチダーゼに対する本発明のペプチド模倣大環状分子の安定性の増加を示す。
【０３１５】
実施例８．カテプシンタンパク質分解産物の測定：
カテプシンＢ、ＤおよびＬ代謝の確認のため、親架橋ペプチドおよび陽性コントロール線形ペプチド（それぞれＤＭＳＯ中４ｍＭ）を、ｐＨ５．４（ｃａｔ  Ｂ、Ｌ）および１０ｍＭ  ＤＴＴの添加、またはｐＨ４．４（ｃａｔ  Ｄ）および０．１１７Ｍ  ＫＣｌの添加のいずれかで緩衝した１ｍＬ容量の６７ｍＭ酢酸アンモニウム溶液に、別々にアリコートにわけた（５μＬ）。酵素とペプチドのそれぞれのペアの初期重量比（％）が１：２０となるように、単一の酵素作業溶液（１０μｇ／ｍＬ）を次いで、それぞれのペプチド溶液（２０μＭ）に添加した（４０μＬ）。それぞれの混合物を、３０分および６０分のインキュベーション時間で３８〜４０℃のオーブン内に入れた。それぞれの時点で、反応は、５００μｌの４８：４８：２ｖ／ｖ（％）のヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリル／ＴＦＡの添加によって停止させた。混合後に形成された二相混合物と底部層の液とをアセトニトリル：水中で希釈し（１：１０）、続いて、勾配ＬＣ／イオン移動度ＴＯＦ−ＭＳ解析のために二連で注入した。
【０３１６】
実施例９．イオン移動度−ＭＳおよびＭＳ−ＭＳ解析ならびにペプチド配列決定：
イオン移動度−ＭＳおよびＭＳ−ＭＳ解析ならびにペプチド配列決定は、Ｗａｔｅｒｓ（Ｍｉｌｆｏｒｄ，ＭＡ）Ｓｙｎａｐｔ高分解度イオン移動度−飛行時間型質量分析装置において行なった。試料は、未精製架橋ペプチドタンパク質分解産物試料を１：１アセトニトリル−水（０．１％ギ酸含有）中で１０倍に希釈することによって調製した。ＬＣ−ＭＳ解析は、０．１％ギ酸およびアセトニトリル中０．１％ギ酸を溶離剤として使用し、５００μＬ／分での逆相勾配溶出によって行なった。エレクトロスプレーイオン化は、噴霧キャピラリーから３．５ｋＶで、脱溶媒和温度２００℃および３０Ｖコーン（ｃｏｎｅ）および１．８Ｖスキマー（抽出レンズ）の設定で行なった。単一荷電を有するバックグラウンドからの多重に荷電されたタンパク質分解断片のイオン移動度による分離は、Ｉｏｎ  ｍｏｂｉｌｉｔｙ−ｍａｓｓ  ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ．Ｋａｎｕ，Ａ．Ｂ．，Ｐ．Ｄｗｉｖｅｄｉ，Ｍ．Ｔａｍ，Ｌ．Ｍａｔｚ，およびＨ．Ｈ．Ｈｉｌｌ，Ｊｒ．，Ｊ  Ｍａｓｓ  Ｓｐｅｃｔｒｏｍ，２００８．４３（１）：ｐ．１−２２に記載のようにして行なった。
【０３１７】
結果を図３〜５に示す。図３は、Ｆ−Ｙ残基におけるカテプシン−ＤによるＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子の切断を示す。図４は、Ｒ−ＮＨ２におけるＲ−ＯＨへのカテプシン−ＢによるＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子の切断を示す。図５は、ペプチド模倣大環状分子のＣ末端からのカテプシン−ＬによるＳＰ−１ペプチド模倣大環状分子の分解を示す。
【０３１８】
ラット胃腸粘膜ペプチダーゼでの結果を図７に示す。このようなペプチダーゼは、ペプチドをＣ末端から内部へと分解することが観察される。
【０３１９】
切断産物の命名は以下のとおりである：生成物０は、Ｃ末端カルボキサミドのタンパク質分解によって得られ、生成物１は、アミノ酸１と２との間のアミド結合のタンパク質分解によって得られ、生成物２は、アミノ酸２と３との間のアミド結合のタンパク質分解によって得られ、生成物３は、アミノ酸３と４との間のアミド結合のタンパク質分解によって得られ、生成物４は、アミノ酸４と５との間のアミド結合のタンパク質分解によって得られ、生成物５は、アミノ酸５と６との間のアミド結合のタンパク質分解によって得られ、生成物６は、アミノ酸６と７との間のアミド結合のタンパク質分解によって得られるものである。
【０３２０】
ペプチドの断片化は、３５−４５Ｖ  Ｔｒａｐ電圧を、衝突ガスとしてのアルゴンとともに用いて行なった。ＭＳ−ＭＳスペクトルを、Ｍａｓｓｌｙｎｘ  ＭａｘＥｎｔ３アルゴリズムを用いて単一荷電を有する種にデコンボルーションした。配列決定は、該配列に存在しない残基の代わりにステープル大環状分子のＭＷを用いて、Ｗａｔｅｒｓ  ＢｉｏＬｙｎｘソフトウェアにより行なった。
【０３２１】
実施例１０．ＦＩＴＣ／ＦＡＭ標識ペプチド模倣大環状分子のＦＡＣＳ細胞内検出による細胞透過性アッセイ
ジャーカット細胞またはＳＪＳＡ−１細胞を、ＲＰＭＩ−１６４０（Ｇｉｂｃｏ，カタログ番号７２４００）＋１０％ＦＢＳ（Ｇｉｂｃｏ，カタログ番号１６１４０）および１％ペニシリン＋ストレプトマイシン（Ｈｙｃｌｏｎｅ，カタログ番号３００１０）を用いて、３７℃で加湿５％ＣＯ２雰囲気中にて培養した。試験開始の前日、ジャーカット細胞を、１×１０６／ｍｌもしくは０．５×１０６／ｍｌの細胞密度に分割するか、またはＳＪＳＡ−１細胞を２×１０５／ｍｌ／ウェルで２４ウェルプレートに播種した。翌日、細胞を、１２００ｒｐｍ、２３℃で５分間スピンしながらＯｐｔｉ−ＭＥＭ培地（Ｇｉｂｃｏ，カタログ番号５１９８５）中で２回洗浄した。ジャーカット細胞を２４ウェルプレート内で、血清なしの０．９ｍｌのＯｐｔｉ−ＭＥＭまたは１％ヒト血清を含有する０．９ｍｌのＯｐｔｉ−ＭＥＭ中に１×１０６細胞の密度で播種した。ＳＪＳＡ−１細胞では、各ウェル内に、血清なしの０．９ｍｌのＯｐｔｉ−ＭＥＭを加えた。ペプチドをＤＭＳＯ中で２ｍＭストックに希釈した後、滅菌水中で４００μＭに希釈し；無血清ＯＰＴＩ−ＭＥＭまたは１％ヒト血清含有Ｏｐｔｉ−ＭＥＭを用いて、１００μＭまでさらなる希釈を行なった；ＤＭＳＯコントロールに対しても同じ希釈を行なった。このような１００μｌの１００μＭペプチド作業溶液または最終希釈ＤＭＳＯを、次いで適切なウェルに添加し、ペプチド最終濃度を１０μＭまたは２．５μＭに、ＤＭＳＯ濃度を０．５％または０．１２５％（１ｍｌ容量）にした。プレートを、３７℃でインキュベータ（５％ＣＯ２）または４℃で湿った氷上で１時間または４時間インキュベートした。それぞれの時点の終わりに、細胞懸濁液をＲＰＭＩ−１６４０＋１０％ＦＢＳで希釈し、１ＸＰＢＳ（Ｇｉｂｃｏ）＋０．５％ＢＳＡで２回洗浄し、０．２５％トリプシン−ＥＤＴＡ（Ｇｉｂｃｏ，カタログ番号２５２００）に３７℃で１５分間または８分間供した。細胞を次いで、４０００ｒｐｍ、４℃で５分間（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ  Ｃｅｎｔｒｉｆｕｇｅ  ５４１５Ｄ）でスピンさせて、１ｍｌのＲＰＭＩ−１６４０＋１０％ＦＢＳで洗浄し、かつ０．５ｍｌの１ＸＰＢＳ＋０．５％ＢＳＡ（Ｓｉｇｍａ，カタログ番号Ａ７９０６）で２回洗浄した。細胞を０．５ｍｌまたは１ｍＬの１ＸＰＢＳ＋０．５％ＢＳＡ中に懸濁させた。蛍光またはＦＡＭ強度を、ＦＡＣＳ  Ｃａｌｉｂｕｒ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）またはＧｕａｖａ  Ｅａｓｙ  Ｃｙｔｅ  Ｐｌｕｓ（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）によって測定した。Ｆｌｏｗｊｏソフトウェア（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）によりＦＡＣＳデータを解析し、Ｐｒｉｓｍソフトウェアによりデータをグラフにした。アッセイはすべて二連で行なった。
【０３２２】
実施例１１．静脈内薬物動態解析：
ＩＶ投薬製剤は、ペプチドを５％ＤＭＳＯ／Ｄ５Ｗまたは５％ＰＥＧ−４００含有２％デキストロースに溶解させ、１０ｍｇ／Ｋｇ用量または３ｍｇ／Ｋｇ用量にすることにより調製される。カニューレを挿入したＣｒｌ：ＣＤ（登録商標）（ＳＤ）雄ラット（７〜８週齢，Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）を、大腿部のカニューレから投与する単回注射あたり１０ｍＬ／ｋｇでの静脈内投与に使用する。ＳＤ雄ラット（７〜８週齢，Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）をこれらの試験において、尾静脈注射を介して投与される単回注射あたり３ｍｇ／ｋｇでの１０ｍＬ／ｋｇの静脈内投薬に使用する。薬物動態解析用の血液は、１０個の時点（投薬後、０．０８３３、０．１６７、０．２５、０．５、１、２、３、４、６、８、１２および２４時間）で回収する。最後の試料採取後、動物を致死（ｔｅｒｍｉｎａｔｅ）させる（剖検なし）。
【０３２３】
全血試料を約４℃で１０分間遠心分離する（約１５００×ｇ）。血漿を調製し、血液採取／遠心分離の３０分以内に新鮮チューブに移し、これを凍結させ、暗所にて約−７０℃でＬＣ−ＭＳ／ＭＳ解析のために調製するまで保存する。
【０３２４】
試料の抽出は、１０μＬの５０％ギ酸を１００μＬの血漿（試料または標準品）に添加した後、１０秒間ボルテックスすることにより行なう。５００μＬのアセトニトリルを添加した後、２分間ボルテックスし、１４，０００ｒｐｍで１０分間、約４℃にて遠心分離する。上清みをきれいなチューブに移し、Ｔｕｒｂｏｖａｐにおいて＜１０ｐｓｉで３７℃にてエバポレートする。ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ解析の前に、試料を１００μＬの５０：５０のアセトニトリル：水で再構成する。
【０３２５】
ピーク血漿濃度（Ｃｍａｘ）、ピーク血漿濃度に達するのに要する時間（ｔｍａｘ）、血漿消失半減期（ｐｌａｓｍａ  ｔｅｒｍｉｎａｌ  ｈａｌｆ−ｌｉｆｅ）（ｔ１／２）、血漿濃度時間曲線下面積（ＡＵＣ）、クリアランスおよび分布容量を血漿濃度データから計算する。薬物動態の計算はすべて、ＷｉｎＮｏｎｌｉｎバージョン４．１（Ｐｈａｒｓｉｇｈｔ  Ｃｏｒｐ）を用いて、ノンコンパートメント解析によって行なう。
【０３２６】
以下のＬＣ−ＭＳ／ＭＳ法を使用する。簡単には、使用したＬＣ−ＭＳ／ＭＳ機器はＡＰＩ  ３６５（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）であった。分析カラムはＰｈｅｎｏｍｅｎｅｘ  Ｓｙｎｅｒｇｉ（４μ，Ｐｏｌａｒ−ＲＰ，５０ｍｍ×２ｍｍ）であり、移動相Ａ（水中の０．１％ギ酸）およびＢ（メタノール中の０．１％ギ酸）は、以下の勾配が得られるように０．４ｍｌ／分の流速でポンプ輸送する。
【０３２７】
【表１１】
2013507927.tif 000062
【０３２８】
ＭＲＭ：    ８１４．０〜３７４．２（陽イオン化）
実施例１２．レセプター結合アッセイのための質量分析に基づくアッセイ
Ｂｃｌ−ｘＬのタンパク質−リガンド結合実験。簡単なタンパク質−リガンド結合実験は、簡単なシステム全体のコントロール実験について概略が示された下記の代表的な手順を使用し、１μＭのＳＰ−４および５μＭのＢｃｌ−ｘＬを用いて行なった。ＳＰ−４の４０μＭストック溶液の１μＬのＤＭＳＯアリコートを、１９μＬのＰＢＳ（リン酸緩衝生理食塩水：５０ｍＭ、ｐＨ７．５の１５０ｍＭ  ＮａＣｌを含有するリン酸緩衝液）に溶解させる。得られた溶液を反復ピペッティングによって混合し、１００００ｇで１０分間の遠心分離によって清澄にする。得られた上清の４μＬアリコートに、４μＬの１０μＭ  ＢＣＬ−ｘＬ（ＰＢＳ中）を添加する。従って、各８．０μＬの実験試料は、４０ｐｍｏｌ（１．５μｇ）のタンパク質（ＰＢＳ中５．０μＭ濃度）＋１μＭ  ＳＰ−４および２．５％ＤＭＳＯを含む。このようにして調製したそれぞれの濃度点の二連の試料を、室温で６０分間インキュベートし、次いで４℃まで冷却した後、５．０μＬの注入物のサイズ排除クロマトグラフィー−ＬＣ−ＭＳ解析を行なう。標的タンパク質、タンパク質−リガンド複合体、および非結合化合物を含む試料をＳＥＣカラムに注入すると、ここでは、複合体が非結合成分から、迅速なＳＥＣ工程によって分離される。ＳＥＣカラム溶出液を、ＵＶ検出器を用いてモニタリングし、早期溶出タンパク質画分（これはＳＥＣカラムの空隙容積内に溶出する）が、カラムに保持された非結合成分から充分に分離されていることを確認する。タンパク質およびタンパク質−リガンド複合体を含むピークが一次ＵＶ検出器から溶出した後、これが試料ループに進入すると、ここでは、これがＳＥＣ段階の流動流から外れ、バルブ機構によって直接ＬＣ−ＭＳに移送される。ＥＳＩ−ＭＳによってｍ／ｚ  ８８３．８にＳＰ−４の（Ｍ＋３Ｈ）３＋イオンが観察され、タンパク質−リガンド複合体の検出が確認される。
【０３２９】
実施例  Ｂｃｌ−ｘＬのタンパク質−リガンドＫｄ滴定実験。タンパク質−リガンドＫｄ滴定実験は、以下のようにして行なった：滴定液ペプチド模倣大環状分子の連続希釈ストック溶液の２μＬのＤＭＳＯアリコート（５、２．５、．．．、０．０９８ｍＭ）を調製し、次いで、３８μＬのＰＢＳに溶解させる。得られた溶液を反復ピペッティングによって混合し、１００００ｇで１０分間の遠心分離によって清澄にする。得られた上清の４．０μＬアリコートに、４．０μＬの１０μＭ  ＢＣＬ−ｘＬ（ＰＢＳ中）を添加する。従って、各８．０μＬの実験試料は、４０ｐｍｏｌ（１．５μｇ）のタンパク質（ＰＢＳ中５．０μＭ濃度）、種々の濃度（１２５、６２．５、．．．、０．２４μＭ）の滴定液ペプチド、および２．５％ＤＭＳＯを含む。このようにして調製したそれぞれの濃度点の二連の試料を、室温で３０分間インキュベートし、次いで４℃まで冷却した後、２．０μＬの注入物のＳＥＣ−ＬＣ−ＭＳ解析を行なう。ＥＳＩ−ＭＳによって（Ｍ＋Ｈ）１＋、（Ｍ＋２Ｈ）２＋、（Ｍ＋３Ｈ）３＋、および／または（Ｍ＋Ｎａ）１＋イオンが観察される；抽出したイオンクロマトグラムを定量し、次いで、Ａｎｎｉｓら，２００７に記載の等式にあてはめると、結合親和性Ｋｄが導かれる。同様のアッセイをＭｃｌ−１、およびＢｃｌ−２についても行なった。
【０３３０】
Ｂｃｌ−ｘＬについての競合的結合実験。成分あたり４０μＭの混合リガンドを、３つのそれぞれの化合物の４００μＭストックの２μＬアリコートを１４μＬのＤＭＳＯと合わせることにより調製する。次いで、この成分あたり４０μＭの混合物の１μＬアリコートを、滴定液ペプチドの連続希釈ストック溶液（１０、５、２．５、．．．、０．０７８ｍＭ）の１μＬのＤＭＳＯアリコートと合わせる。これらの２μＬの試料を３８μＬのＰＢＳに溶解させる。得られた溶液を反復ピペッティングによって混合し、１００００ｇで１０分間の遠心分離によって清澄にする。得られた上清の４．０μＬアリコートに、４．０μＬの１０μＭ  ＢＣＬ−ｘＬ（ＰＢＳ中）を添加する。従って、各８．０μＬの実験試料は、４０ｐｍｏｌ（１．５μｇ）のタンパク質（ＰＢＳ中５．０μＭ濃度）＋０．５μＭのリガンド、２．５％ＤＭＳＯ、および種々の濃度（１２５、６２．５、．．．、１．９５μＭ）の滴定液ペプチドを含む。このようにして調製したそれぞれの濃度点の二連の試料を、室温で６０分間インキュベートし、次いで４℃まで冷却した後、２．０μＬの注入物のＳＥＣ−ＬＣ−ＭＳ解析を行なう。ＥＳＩ−ＭＳによって、滴定液およびそれぞれの混合物の成分の（Ｍ＋Ｈ）１＋、（Ｍ＋２Ｈ）２＋、（Ｍ＋３Ｈ）３＋、および／または（Ｍ＋Ｎａ）１＋イオンが観察される；抽出したイオンクロマトグラムを、次いで、Ａｎｎｉｓら，２００４に記載のようにして解析し、混合物の成分の結合親和性を順位付けする。これらのおよび他の方法に関するより詳細な情報は、“Ａ  Ｇｅｎｅｒａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ  ｔｏ  Ｒａｎｋ  Ｐｒｏｔｅｉｎ−Ｌｉｇａｎｄ  Ｂｉｎｄｉｎｇ  Ａｆｆｉｎｉｔｉｅｓ  ａｎｄ  Ｄｅｔｅｒｍｉｎｅ  Ａｌｌｏｓｔｅｒｉｃ  ｖｓ．Ｄｉｒｅｃｔ  Ｂｉｎｄｉｎｇ  Ｓｉｔｅ  Ｃｏｍｐｅｔｉｔｉｏｎ  ｉｎ  Ｃｏｍｐｏｕｎｄ  Ｍｉｘｔｕｒｅｓ．”Ａｎｎｉｓ，Ｄ．Ａ．；Ｎａｚｅｆ，Ｎ．；Ｃｈｕａｎｇ，Ｃ．Ｃ．；Ｓｃｏｔｔ，Ｍ．Ｐ．；Ｎａｓｈ，Ｈ．Ｍ．Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．２００４，１２６，１５４９５−１５５０３ならびに“ＡＬＩＳ：Ａｎ  Ａｆｆｉｎｉｔｙ  Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ−Ｍａｓｓ  Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  ａｎｄ  Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ−Ｌｉｇａｎｄ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ”Ｄ．Ａ．Ａｎｎｉｓ，Ｃ．−Ｃ．Ｃｈｕａｎｇ，およびＮ．Ｎａｚｅｆ．Ｉｎ  Ｍａｓｓ  Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ  ｉｎ  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．Ｗａｎｎｅｒ  Ｋ，Ｈｏｅｆｎｅｒ  Ｇ編：Ｗｉｌｅｙ−ＶＣＨ；２００７：１２１−１８４．Ｍａｎｎｈｏｌｄ  Ｒ，Ｋｕｂｉｎｙｉ  Ｈ，Ｆｏｌｋｅｒｓ  Ｇ（Ｓｅｒｉｅｓ  Ｅｄｉｔｏｒｓ）：Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｉｎ  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙにおいて入手可能である。
【０３３１】
実施例１３．ＨｅＬａ細胞代謝アッセイ：
ＨｅＬａ細胞試験では、α−メチルおよびα，α−メチル二置換ペプチド模倣大環状分子配列からなるそれぞれのペアを、２％ヒト血清を含む細胞培養緩衝液（ＯｐｔｉＭＥＭ）に別々に添加し（それぞれ、２．５μＭ）、３７℃で作業溶液を調製した。これらの各々を、ＯｐｔｉＭＥＭ培地（２ｍｌ）の交換のために６−ウェル培養プレートの３つのウェルにアリコートに分け（２ｍｌ）、該ウェル内ではＨｅＬａ細胞を対数増殖期（ｌｏｇ  ｐｈａｓｅ）で一晩増殖させ、各ウェルの底部におよそ１５０万個の細胞のほぼコンフルエントな単層を形成させておいた。細胞は、前日に培養フラスコから、トリプシンまたは他のプロテアーゼなしで、２ｍＭエチレンジアミン四酢酸二ナトリウム（Ｎａ２ＥＤＴＡ）含有１０ｍＭリン酸二ナトリウム生理食塩水（ＰＢＳ）溶液の補助を伴って回収しておいた。二連のプレートに滅菌条件下で作業溶液を満たし、２時間のインキュベーション期間にわたり３７℃の加湿５％ＣＯ２雰囲気に戻した。インキュベーション後、作業溶液を吸引除去し、各ウェル内の単層が覆われるのに充分な２％ＴＦＡの水溶液（０．２５ｍＬ）と交換した。各ウェル内の細胞単層を、擦過によって遊離させ、各ウェルの全内容物をピペットチップ内に吸引し、ポリプロピレン製バイアルに移した。ペプチド模倣大環状分子配列の抽出を、それぞれのバイアルの内容物を５００μｌの４８：４８：２ｖ／ｖ（％）のヘキサフルオロ−２−プロパノール／アセトニトリルと混合することにより行なった。ボルテックスおよび遠心分離の後に形成された二相混合物と底部層の液とを、続いて、ペプチダーゼ産物に対応する分子イオンの検出のために設計されたＬＣ／ＭＳ解析のために二連で注入した。
【０３３２】
本発明の好ましい実施形態を本明細書に示し、記載しているが、このような実施形態が例示目的のみで提供されていることは当業者には明らかであろう。多くの変形、改変および置き換えが、本発明から逸脱することなく当業者には思い浮かぶであろう。本明細書に記載される本発明の実施形態の種々の代替は、本発明の実践に使用可能であると理解されるべきである。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定義しており、そして本特許請求の範囲内の方法および構造、ならびにそれらの同等物が本発明の範囲に包含されるものとする。
【図１】
2013507927.tif 000063
【図２】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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