【事件の表示】
　特許第６６４７４３０号発明「アンチセンス核酸」の特許異議申立事件について、次のとおり決定する。
【結　論】
　特許第６６４７４３０号の請求項１〜５に係る特許を維持する。
【理　由】
第１　手続の経緯　　　
　特許第６６４７４３０号の請求項１〜５に係る特許についての出願は、平成２３年８月３１日（優先権主張　平成２２年９月１日　日本国(ＪＰ)）を国際出願日とする特願２０１２−５３１９８７号の一部を、新たな特許出願とした特願２０１３−１８４１９３号の一部を、さらに新たな特許出願とした特願２０１５−２５６９６２号の一部を、さらに新たな特許出願とした特願２０１７−１５４３２０号の一部を、さらに新たな特許出願として平成３１年１月８日に出願されたものであって、令和２年１月１６日に特許権の設定登録がされ、同年２月１４日に特許掲載公報が発行された。
　その特許に対し、同年８月１４日に特許異議申立人サレプタ　セラピューティクス　インコーポレイテッド（以下、「異議申立人」という。）により特許異議の申立てがされたものである。
第２　本件発明　　　
　特許第６６４７４３０号の請求項１〜５に係る発明は、その特許請求の範囲の請求項１〜５に記載された事項により特定される次のとおりものである（以下、特許第６６４７４３０号の請求項１〜５に係る発明を、その請求項に付された番号にしたがって、「本件発明１」〜「本件発明５」のように記載し、また、これらをまとめて「本件発明」という。）。　　
「【請求項１】
  ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー（ＰＭＯ）アンチセンスオリゴマーであって、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーは、前記ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の標的配列５’−ＧＡＡＣＡＣＣＵＵＣＡＧＡＡＣＣＧＧＡＧＧＣＡＡＣ−３’（配列番号１２４）に１００％相補的な２５塩基のオリゴマーからなり、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの各ホスホロジアミデートモルホリノモノマーが、式［１］
【化１】
　　　　
（式中、各Ｒ２及びＲ３は、メチルを表し、Ｂａｓｅは、ウラシル、シトシン、チミン、アデニン、及びグアニンからなる群から選択される核酸塩基である）
である、前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマー。
【請求項２】
　ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー（ＰＭＯ）アンチセンスオリゴマーであって、
　前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーは、前記ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の標的配列５’−ＧＡＡＣＡＣＣＵＵＣＡＧＡＡＣＣＧＧＡＧＧＣＡＡＣ−３’（配列番号１２４）に１００％相補的な２５塩基のオリゴマーからなり、
　前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの各ホスホロジアミデートモルホリノモノマーが、式［２］
【化２】
（式中、各Ｒ２及びＲ３は、メチルを表し、Ｂａｓｅは、ウラシル、シトシン、チミン、アデニン、及びグアニンからなる群から選択される核酸塩基である）
であり、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの５’末端が、式［３］
【化３】
で示す基である、前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマー。
【請求項３】
  ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー（ＰＭＯ）アンチセンスオリゴマーであって、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーは、前記ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の標的配列５’−ＧＡＡＣＡＣＣＵＵＣＡＧＡＡＣＣＧＧＡＧＧＣＡＡＣ−３’（配列番号１２４）に１００％相補的な２５塩基のオリゴマーからなり、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーは、生理的条件下で前記標的配列とワトソン・クリック塩基対でハイブリダイズし、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの各ホスホロジアミデートモルホリノモノマーが、式［１］
【化４】
（式中、各Ｒ２及びＲ３は、メチルを表し、Ｂａｓｅは、ウラシル、シトシン、チミン、アデニン、及びグアニンからなる群から選択される核酸塩基である）
である、前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマー。
【請求項４】
  ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー（ＰＭＯ）アンチセンスオリゴマーであって、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーは、前記ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の標的配列５’−ＧＡＡＣＡＣＣＵＵＣＡＧＡＡＣＣＧＧＡＧＧＣＡＡＣ−３’（配列番号１２４）に１００％相補的な２５塩基のオリゴマーからなり、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーは、生理的条件下で前記標的配列とワトソン・クリック塩基対でハイブリダイズし、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの各ホスホロジアミデートモルホリノモノマーが、式［２］
【化５】
（式中、各Ｒ２及びＲ３は、メチルを表し、Ｂａｓｅは、ウラシル、シトシン、チミン、アデニン、及びグアニンからなる群から選択される核酸塩基である）
であり、
  前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの５’末端が、式［３］
【化６】
で示す基である、前記ＰＭＯアンチセンスオリゴマー。
【請求項５】
  請求項１〜４のいずれか1項に記載のＰＭＯアンチセンスオリゴマーを含む、筋ジストロフィー治療用医薬組成物。」
第３　申立理由の概要及び証拠
　異議申立人が申し立てた理由の概要及び証拠方法は、次のとおりである。
１　申立理由の概要
　本件発明１〜５は、同日出願された下記甲第１号証に係る出願（特願２０１５−２５６９６２号）の請求項７〜１０に係る発明と同一の発明と認められ、かつ、下記の出願に係る特許は特許されており協議をすることができないから、本件発明１〜５は、特許法第３９条第２項の規定により特許を受けることができない。
　よって、本件発明１〜５に係る特許は、特許法第３９条第２項の規定に違反してなされたものであるから、同法第１１３条第２号に該当し取り消されるべきものである。
２　証拠方法
甲第１号証：特願２０１５−２５６９６２号の特許第６１９３３４３号公報（以下「甲１」という。）
甲第２号証：ＡＮＴＩＳＥＮＳＥ　＆　ＮＵＣＬＥＩＣ　ＡＣＩＤ　ＤＲＵＧ　ＤＥＶＥＬＯＰＭＥＮＴ　１９９７，Ｖｏｌ．７，ｐｐ．１８７−１９５（以下「甲２」という。）
甲第３号証：ＡＮＴＩＭＩＣＲＯＢＩＡＬ　ＡＧＥＮＴＳ　ＡＮＤ　ＣＨＥＭＯＴＨＥＲＡＰＹ，２００３，Ｖｏｌ．４７，Ｎｏ．１０，ｐｐ．３２３３−３２３９（以下「甲３」という。）
第４　当審の判断
１　特願２０１５−２５６９６２号［特許第６１９３３４３号公報(甲１)］の請求項１、６〜１０に係る発明
　特願２０１５−２５６９６２号［特許第６１９３３４３号公報(甲１)］の請求項１、６〜１０に係る発明(以下「同日出願発明１」、「同日出願発明６」〜「同日出願発明１０」のようにいう。)は、その特許請求の範囲の請求項１、６〜１０に記載された事項により特定される以下のとおりのものである。
「【請求項１】
　ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするアンチセンスオリゴマーであって、ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンの５’末端から第３６〜６０番目のヌクレオチドからなる配列に相補的な塩基配列からなる、アンチセンスオリゴマー。
……
【請求項６】
  モルホリノオリゴマーである、請求項１に記載のアンチセンスオリゴマー。
【請求項７】
  ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、請求項６に記載のアンチセンスオリゴマー。
【請求項８】
  ５’末端が、下記化学式（１）〜（３）のいずれかの基である、請求項６又は７に記載のアンチセンスオリゴマー。
【化２４】
【請求項９】
  配列番号５７に示す塩基配列からなる、請求項１〜８のいずれか１項に記載のアンチセンスオリゴマー。
【請求項１０】
  請求項１〜９のいずれか１項に記載のアンチセンスオリゴマー、その医薬的に許容可能な塩又は水和物を有効成分とする、筋ジストロフィー治療用医薬組成物。」
　したがって、同日出願発明１、６を引用する同日出願発明７は次のとおりのものであると認められる（以下、これを「引用発明Ａ」という）。
「ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするアンチセンスオリゴマーであって、ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンの５’末端から第３６〜６０番目のヌクレオチドからなる配列に相補的な塩基配列からなる、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、アンチセンスオリゴマー。」
　同様に、同日出願発明１、６、７を引用する同日出願発明９は次のとおりのものであると認められる（以下、これを「引用発明Ｂ」という）。
「ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするアンチセンスオリゴマーであって、配列番号５７に示す塩基配列からなる、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、アンチセンスオリゴマー。」
　同様に、同日出願発明１、６、７を引用する同日出願発明８は次のとおりのものであると認められる（以下、これを「引用発明Ｃ」という）。
「ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするアンチセンスオリゴマーであって、ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンの５’末端から第３６〜６０番目のヌクレオチドからなる配列に相補的な塩基配列からなる、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーであり、かつ、５’末端が、下記化学式（１）〜（３）のいずれかの基である、アンチセンスオリゴマー。
」
　同様に、同日出願発明１、６〜８を引用する同日出願発明９は次のとおりのものであると認められる（以下、これを「引用発明Ｄ」という）。
「ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にするアンチセンスオリゴマーであって、配列番号５７に示す塩基配列からなる、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーであり、かつ、５’末端が、下記化学式（１）〜（３）のいずれかの基である、アンチセンスオリゴマー。
」
２　本件発明１について
（１）引用発明Ａとの対比
　本件発明１と引用発明Ａとを対比すると、以下の点で相違する。
相違点１：本件発明１は「ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にする」ものであるのに対して、引用発明Ａは「ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンのスキッピングを可能にする」ものである点
相違点２：アンチセンスオリゴマーの配列が、本件発明１は「ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の標的配列５’−ＧＡＡＣＡＣＣＵＵＣＡＧＡＡＣＣＧＧＡＧＧＣＡＡＣ−３’（配列番号１２４）に１００％相補的な２５塩基のオリゴマーからな」るのに対して、引用発明Ａは「ヒトジストロフィン遺伝子の第５３番目のエクソンの５’末端から第３６〜６０番目のヌクレオチドからなる配列に相補的な塩基配列からなる」ものである点
相違点３：ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーが、本件発明１では、それを構成するモノマーが式［１］で特定されるものであるのに対して、引用発明Ａでは何ら特定されていない「ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである」点
（２）判断
　まず、相違点３から検討する。引用発明Ａにおける「ホスホロジアミデートモルホリノ」という記載は、その化合物の基本骨格（すなわち、式［１］に従えば、Ｒ２、Ｒ３、Ｂａｓｅを含まない部分）を示すものであり、「ホスホロジアミデートモルホリノ」を基本骨格として有する化合物一般を意味する包括的な概念と認められる。一方、本件発明１は、式［１］で特定される一の化合物に係るものである点で相違し、両者は、その発明を異にするものである。
　したがって、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明１が引用発明Ａと同一の発明であるということはできない。
（３）異議申立人の主張について
　異議申立人は、次のとおり主張する。
　本件発明１の式［１］において、ＰＭＯアンチセンスオリゴマーの各ホスホロジアミデートモルホリノモノマーが次の構造
を有し、式中、各Ｒ２及びＲ３がメチルを表すものであることは、本件発明１のＰＭＯアンチセンスオリゴマーが「ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー」であることを構造式で表現したものに過ぎない。そして、甲２、甲３から、「ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー」であれば、必ず本件発明１の式［１］の構造を有することは明らかであるから、この点で本件発明１と引用発明Ａとは相違しない。
　この主張について検討する。上記（２）で述べたように、「ホスホロジアミデートモルホリノ」オリゴマーまたはモノマーは、「ホスホロジアミデートモルホリノ」基本骨格を有するオリゴマーまたはモノマーの総称であって、本件発明１の式［１］の特定の構造を有するものを意味していると解釈することはできないから、「ホスホロジアミデートモルホリノ」オリゴマーまたはモノマーであれば、その構造は、本件発明１の式［１］の構造を有するものに一義的に定まるということはできない。
　そして、本件発明１の式［１］の構造を有するものの正確な名称は、例えば以下の参考文献１に記載があるように（１５６６３頁の図１の中央）、「Ｎ，Ｎ−ｄｉｍｅｔｈｙｌａｍｉｎｏ　Ｐｈｏｓｐｈｏｒｏｄｉａｍｉｄａｔｅ　ｍｏｒｐｈｏｌｉｎｏ」（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノホスホロジアミデートモルホリノ）である。なお、参考文献１は、本件優先日後に公表されたものであるが、本件発明１の式［１］の構造を有する化合物自体は甲２，３に開示があるように本件優先日前から当業者に知られたものであるし、その名称も本件優先日前と参考文献１公表日当時とにおいて相違しないから、本件発明１の式［１］の構造を有する化合物は、本件優先日前から上記の名称であったといえる。
　そうすると、引用発明Ａの「ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー」は、その基本骨格のみが特定されているに過ぎず、本件発明１の式［１］の構造を必ず有するということはできないから、異議申立人の主張を採用することはできない。
　
参考文献１　Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　ｔｈｅ　Ａｍｅｒｉｃａｎ　Ｃｈｅｍｉｃａｌ　Ｓｏｃｉｅｔｙ，２０１６，Ｖｏｌ．１３８，ｐｐ．１５６６３−１５６７２
（４）引用発明Ｂとの対比、判断
　本件発明１と引用発明Ｂとを対比すると、上記（１）に記載の相違点１、３に加えて、次の点で相違する。
相違点４：アンチセンスオリゴマーの配列が、本件発明１は「ヒトジストロフィンｍＲＮＡ前駆体の標的配列５’−ＧＡＡＣＡＣＣＵＵＣＡＧＡＡＣＣＧＧＡＧＧＣＡＡＣ−３’（配列番号１２４）に１００％相補的な２５塩基のオリゴマーからな」るのに対して、引用発明Ｂは「配列番号５７に示す塩基配列からなる」ものである点
　そして、上記（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明１が引用発明Ｂと同一の発明であるということはできない。
３　本件発明２について
（１）引用発明Ｃとの対比
　本件発明２と引用発明Ｃとを対比すると、両者は上記２（１）に記載した相違点１〜３で相違する。
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明２が引用発明Ｃと同一の発明であるということはできない。
（２）引用発明Ｄとの対比
　本件発明２と引用発明Ｄとを対比すると、両者は上記２（１）、（４）に記載した相違点１、３、４で相違する。
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明２が引用発明Ｄと同一の発明であるということはできない。
４　本件発明３について
（１）引用発明Ａとの対比
　本件発明３と引用発明Ａとを対比すると、両者は上記２（１）に記載した相違点１〜３に加えて、次の点で相違する。
相違点５：本件発明３では「生理的条件下で前記標的配列とワトソン・クリック塩基対でハイブリダイズ」することが特定されているのに対して、引用発明Ａではこのことが特定されていない点
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明３が引用発明Ａと同一の発明であるということはできない。
（２）引用発明Ｂとの対比
　本件発明３と引用発明Ｂとを対比すると、両者は上記２（１）、（４）、上記（１）に記載した相違点１、３、４、５で相違する。
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明３が引用発明Ｂと同一の発明であるということはできない。
５　本件発明４について
（１）引用発明Ｃとの対比
　本件発明４と引用発明Ｃとを対比すると、両者は上記２（１）、上記４（１）に記載した相違点１〜３、５で相違する。
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明４が引用発明Ｃと同一の発明であるということはできない。
（２）引用発明Ｄとの対比
　本件発明４と引用発明Ｄとを対比すると、両者は上記２（１）、（４）、上記４（１）に記載した相違点１、３〜５で相違する。
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明４が引用発明Ｄと同一の発明であるということはできない。
６　本件発明５について
（１）同日出願発明１０との対比
　本件発明５は、本件発明１〜４のいずれかを引用し、本件発明１〜４のいずれかのＰＭＯアンチセンスオリゴマーを含む、筋ジストロフィー治療用医薬組成物である。一方、同日出願発明１０も、引用発明Ａ〜Ｄのいずれかのアンチセンスオリゴマー、その医薬的に許容可能な塩又は水和物を有効成分とする、筋ジストロフィー治療用医薬組成物である。そうすると、両者は、上記２〜５で述べた点で相違する。
　そして、上記２（２）、（３）で検討したように、両者は相違点３で相違し、その発明を異にするものであるから、その他の相違点について検討するまでもなく、本件発明５が同日出願発明１０と同一の発明であるということはできない。
７　まとめ
　上記のとおり、本件発明１〜５は、甲１の請求項７〜１０のいずれの発明とも同一の発明であるとはいえない。
　よって、本件請求項１〜５に係る特許は、特許法第３９条第２項の規定に違反してなされたものではなく、異議申立理由は理由がない。
第５　むすび
　以上のとおりであるから、特許異議申立ての理由及び証拠によっては、本件請求項１〜５に係る特許を取り消すことはできない。
　また、他に本件請求項１〜５に係る特許を取り消すべき理由を発見しない。
　
　よって、結論のとおり決定する。
【異議決定日】
令和２年１０月２８日（２０２０．１０．２８）