【事件の表示】
　特願２０００−５６２３９３「内因性の構成的に活性化されるＧタンパク質−共役オーファン受容体」拒絶査定不服審判事件〔平成１２年　２月１０日国際公開、ＷＯ００／０６５９７、平成１４年　７月１６日国内公表、特表２００２−５２１６８１、請求項の数（９）〕について、次のとおり審決する。
【結　論】
　原査定を取り消す。
　本願の発明は、特許すべきものとする。
【理　由】
第１　手続の経緯
　
　この出願は、１９９９年７月３０日（パリ条約による優先権主張外国庁受理　１９９８年７月３１日、１９９８年１０月３０日、１９９８年１２月４日、１９９９年２月２６日　米国）を国際出願日とする出願であって、以降の手続の経緯は以下のとおりのものである。
　
　平成２１年　８月１０日付け　拒絶理由通知書
　平成２１年　２月　９日　　　意見書
　平成２２年　５月１８日付け　拒絶理由通知書
　平成２２年１１月１９日　　　意見書
　平成２３年　１月１２日付け　拒絶査定
　平成２３年　５月１７日　　　審判請求書・手続補正書
　平成２４年　１月１６日付け　審尋
　
　
第２　本願発明の認定
　
　この出願の請求項１〜９に係る発明は、平成２３年５月１７日付け手続補正書の特許請求の範囲の請求項１〜９に記載されたとおりのものと認められる（以下、それぞれ「本願発明１」〜「本願発明９」という。）。
 　 
【請求項１】　内因性の構成的に活性なＧタンパク質共役オーファン受容体に対する、インバースアゴニスト、部分アゴニストおよびアゴニストから成る群から選択される化合物として候補化合物を直接同定するための方法であって、
（ａ）候補化合物と、哺乳動物細胞中で発現されるＧＰＣＲ融合タンパク質を接触させる工程であって、該ＧＰＣＲ融合タンパク質は、内因性の構成的に活性な哺乳動物のＧタンパク質共役オーファン受容体およびＧタンパク質を含む、工程；および
（ｂ）該接触した受容体における該化合物の効能を測定することによって、該化合物が該受容体のインバースアゴニスト、部分アゴニストまたはアゴニストであるか否かを決定する工程
を包含する、方法。
【請求項２】　前記化合物が、前記オーファン受容体に対するインバースアゴニストであると直接同定される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】　前記化合物が、前記オーファン受容体に対するアゴニストであると直接同定される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】　前記化合物が、前記オーファン受容体に対する部分アゴニストであると直接同定される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】　前記オーファン受容体が、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ６、ＧＰＲ１２、ＧＰＲ２１、ＯＧＲ１、ＧＨＳＲ、ＲＥ２およびＡＬＯ２２１７１から成る群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】　前記オーファン受容体がＧＰＲ６である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】　前記Ｇタンパク質が、Ｇｓ、Ｇｉ、ＧｑおよびＧｏから成る群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】　前記Ｇタンパク質が、Ｇｓαである請求項１に記載の方法。
【請求項９】　前記受容体がヒト受容体である、請求項１〜８のいずれか1項に記載の方法。
　
　
第３　原査定で引用した刊行物に記載された事項
　
　拒絶理由通知で引用した下記の刊行物について、以下「刊行物１」〜「刊行物３」という。
　
刊行物１：ファルマシア、３３巻６号、６１７−６２１頁（１９９７年６月１日発行）
刊行物２：国際公開第９６／４１１６９号
刊行物３：Trends Pharmacol. Sci.、Vol.18(11)、pp.430-437（Nov. 1997）
　
１．刊行物１（ファルマシア、３３巻６号、６１７−６２１頁（１９９７年６月１日発行））
　刊行物１には、以下の事項が記載されている。（下線は当審による。以下同様。）
［１ａ］「１．はじめに
　Ｇタン白質共役型受容体と結合して活性反応を示すagonist(活性薬)は、活性反応を引き起こす力を示すefficacy(有効性)が大きい、言葉を換えればintrinsic activity(内活性)が１であるfull agonist(完全活性薬)とefficacyが小さい、すなわちintrinsic activityが１と０の間にあるpartial agonist(部分活性薬)と呼ばれるものに分けられる。また、受容体と結合しても活性反応を示さないantagonist(拮抗薬)が存在し、これのefficacy及びintrinsic activityは０である。ところが、近年antagonistの一部に、普通の条件では単に競合的拮抗薬として作用しているが、ある条件下でＧタン白質と受容体の共役が亢進した場合には、agonistとは逆の(inverse)活性作用を示す、すなわちinverse agonism(逆活性現象)を示すもので、negative efficacy(負有効性)またはnegative intrinsic activity (負内活性)を示す薬物の存在が明らかとなった。これらをinverse agonist(逆活性薬)または拮抗薬でありながら負の作用を持っていると云う意味でnegative antagonist(負拮抗薬)と言う。Inverse agonistにもfull及びpartial inverse agonist(完全及び部分逆活性薬)の存在が知られている(図1)。すなわち、 agonistには正と負の相反する２種類がある。
　
　」（６１７頁の第１段落および図１）
　
［１ｂ］「２．Two-stateモデルとagonist及びinverse agonistの相互作用
　従来、普通の静止状態では、Ｇタン白質と共役している受容体はinactive conformation (不活性型)Ｒをとっており、 agonistが結合すると活性化され、active conformation(活性型)Ｒ＊へと変わると考えられていた。
　しかし、最近では
受容体は不活性型Ｒだけでなく、agonistが存在しなくても受容体が極度に活性化される条件になれば、活性型R
＊
をもとりうると言う考え方、すなわちtwo-stateモデルが提唱されている(図2)。このモデルでは、受容体はRとR
＊
が平衡状態にあり、 agonistが存在すると、agonistはR
＊
へ高親和性を示すので、平衡関係はR
＊
へ移動し、R
＊
の濃度が増加する。もし、ある薬物がRへ高親和性であるならば、この薬物の存在で平衡関係はR側へ移動し、R
＊
は減少し、Rが増加する。この薬物がinverse agonistである
　
　」（６１７〜６１８頁の第２段落および図２）
　
［１ｃ］「３．ベンゾジアゼピン受容体におけるinverse agonistの相互作用(モデル)
　ベンゾジアゼピン受容体については早くからinverse agonist の存在が論じられていた。この受容体はＧＡＢＡＡ受容体を介して生体に影響を及ぼす。ベンゾジアゼピン受容体活性薬は幅広い数値のintrinsic activityを持っており、また、それに従ってＧＡＢＡ作動性効果を強めたり逆に弱めたりする。一方、flumazenilなどベンゾジアゼピン受容体拮抗薬はintrinsic activity は０であり、受容体活性薬の効果を抑制する。これらを模型的に説明したのが、図３である。５）この図ではtwo-stateモデルの考慮はないが、agonist、inverse agonist及びantagonistが同じ受容体に結合することがうまく示してある。agonistが結合する場合とinverse agonist が結合する場合で受容体の結合部位が微妙に違えてある。これをＲ＊とＲとみなすならば、two-stateモデルを考えに入れてあるとも言える。
　
　」（６１８頁の第３段落および図３） 
　
［１ｄ］「４．Inverse agonistに関する実験例
　Ｂｏｎｄら６)は、最近
β
2
−アドレナリン受容体が大量に発現しているトランスジェニックマウス
であるＴＧ-４マウスの心臓を用いることでβ
２
−選択的拮抗薬であるICI 118551 がinverse agonist として作用することを報告している。ＴＧ−４マウスは、活性なＲ
＊
型受容体が多量に分布していて、agonist非存在下でもアデニル酸シクラーゼ活性が上昇しており、心臓の運動も促進されている。この心臓標本にイソプレナリンなどfull agonist を与えると、普通のマウスの心臓標本同様に、濃度依存的に反応は増大し、β−遮断薬alprenololによって濃度反応曲線は高濃度側へ平行移動する
ＴＧ-４マウスの心臓標本にβ
2
−選択的拮抗薬の１つであるICI 118551 を与えると、活性型のＲ
＊
は不活性なＲへ変わり、ＲとICI 118551 との複合体の形成が促進され、アデニル酸シクラーゼ活性が抑制され心臓の運動も抑制される
（注６）Bond R. A. et al., Nature, Vol.374, pp.272 (1995)
　
　」（６１９頁１〜１５行目および図４）
　
［１ｅ］「今まで述べてきた実験例は、何らかの方法で受容体の基礎活性を増大しておくとinverse agonistとしての作用が見出しやすいことを示唆している。
ICI 174864
はδ−オピオイド受容体のinverse agonistである
NG 108-15 細胞の膜分画を用いてICI 174864のGTPase活性への抑制効果を検討した
NaClを含んだ正常液中ではGTPaseの基礎活性は弱いので、ICI 174864の抑制作用も明らかではないが、液中のNaClをKClで置換することで標本のGTPaseの基礎活性が刺激されてinverse agonist としての抑制作用は顕著になる(図5)。Inverse agonist とＣａ−拮抗薬とでは作用機序は全く異なるが、ここに示した現象は、Ｃａ−拮抗薬の平滑筋弛緩効果が平滑筋標本を正常栄養液中に懸垂した状態よりもNaClをKClで置換したＫ−栄養液中に吊るすことで初期張力を大きくした方が大きくなり観察しやすいのと同じで、単純なことであるが、何らかの方法で受容体の基礎活性を高めた標本にantagonistを与えることでinverse agonistが次々と見出されている。
　
　」（６２０頁３〜２５行目および図５） 
　
［１ｆ］「５．おわりに
　Inverse agonistが受容体と結合した後どのような機序によって抑制作用をおこすかは現在のところ不明である。しかし、antagonistはＧタン白質共役型受容体と結合するだけでなく、受容体にＧタン白質への共役には不向きな構造変化を起こすことが報告されており、11)この性質が何らかの関与をしているとも考えられる。また、
inverse agonistの生理的意義についても明確ではないので、生体への作用は今後の研究成果による。しかしながら、Ｇタン白質共役型受容体の突然変異は病変に関係することがあるので、変異受容体の活性を抑えるinverse agonist は、ここでは有益な効果が期待できそうである。薬理学的に新しい型の薬物であるinverse agonist が、今後の研究の発展によって医療の場へ医薬品として供されることを期待して稿を閉じる
　
　
２．刊行物２（国際公開第９６／４１１６９号）
　刊行物２には、以下の事項が記載されている。
　なお、併記した訳文は、対応する日本語出願の公表公報である特表平１１−５０７５１８号公報の記載に基づくものである。
　
[２ａ] 「CLAIMS
1. A method for identifying an agonist or an antagonist of a G-protein coupled receptor, comprising:
　a) contacting a population of indicator cells with a test composition containing at least one test compound; 
　b) measuring at least one parameter of cellular metabolism of the indicator cells; and 
　c) identifying the at least one test compound as an agonist or an antagonist of the G-protein coupled receptor.
2. The method of claim 1 , wherein the indicator cells are mammalian cells.
3. The method of claim 2, wherein 
a nucleic acid molecule that encodes the receptor has been introduced into the indicator cells such that the receptor is expressed on a membrane of the cells.
7. The method of claim 3, wherein 
the natural ligand for the G-protein coupled receptor is unknown
（訳文）「【特許請求の範囲】
１．Ｇ蛋白質とカップルしたレセプターのアゴニスト又はアンタゴニストを同定する方法であって、下記を含む該方法：
　ａ）動物指標細胞の集団を、少なくとも１種の試験化合物を含む試験組成物と接触させ；
　ｂ）これらの指標細胞の細胞代謝の少なくとも１つのパラメーターを測定し；そして
　ｃ）Ｇ蛋白質とカップルしたレセプターのアゴニスト又はアンタゴニストとして少なくとも１つの試験化合物を同定する。
２．指標細胞が哺乳動物細胞である、請求項１に記載の方法。
３．
レセプターをコードする核酸分子をそのレセプターが細胞膜上で発現されるように指標細胞に導入した
４．試験組成物が試験化合物のライブラリーを含む、請求項３に記載の方法。
７．
Ｇ蛋白質とカップルしたレセプターの天然のリガンドが未知である
　
［２ｂ］「summary of the Invention
　Given the important role of GPCRs in both normal cellular responses and aberrant disease processes, assays that allow for the identification of agonists or antagonists of GPCRs are highly desirable. 
This invention provides functional bioassays for identifying agonists or antagonists of a wide variety of GPCRs. The bioassays of the invention are simple, rapid an high-throughput
　
Moreover, these screening methods enable mammalian GPCRs, and in particular human GPCRs, to be assayed within a mammalian cellular environment. Compounds can be tested in these assays singly or, more preferably, in libraries of compounds. Thus, the assays allow for rapid screening of large panels of compounds. Furthermore, the assays of the invention can be applied both to known GPCRs and to orphan GPCRs for which a natural ligand is unknown
　In the methods of the invention, a population of indicator cells (e.g., mammalian cells) is contacted with a test composition containing one or more test compounds, at least one parameter of cellular metabolism of the indicator cells is measured and the test compound(s) is identified as a receptor agonist or antagonist. The indicator cells express the GPCR of interest, preferably by introduction into the cells of a nucleic acid molecule encoding the GPCR. The test composition can include one or several (e.g., a library) of test compounds.」
（訳文）「発明の要約
  正常の細胞応答及び異常型の病的過程の両者におけるＧＰＣＲの重要な役割を仮定すれば、ＧＰＣＲのアゴニスト又はアンタゴニストの同定を可能にするアッセイは、大いに望ましい。
この発明は、広範囲のＧＰＣＲのアゴニスト又はアンタゴニストを同定するための機能的バイオアッセイを提供する。この発明のバイオアッセイは、簡単で、迅速且つ高スループットである。その上、これらのスクリーニング法は、哺乳動物のＧＰＣＲ特にヒトのＧＰＣＲを哺乳動物細胞環境にてアッセイすることを可能にする。化合物を、単独で又は一層好ましくは化合物のライブラリーにて、これらのアッセイで試験することができる。従って、これらのアッセイは、化合物の大きいパネルの迅速なスクリーニングを可能にする
　
更に、この発明のアッセイは、既知のＧＰＣＲ及び天然のリガンドが未知である「孤児」ＧＰＣＲの両者に適用することができる
  この発明の方法においては、指標細胞（例えば、哺乳動物細胞）の集団を、１種以上の試験化合物を含む試験組成物と接触させ、これらの指標細胞の細胞代謝の少なくとも１つのパラメーターを測定して試験化合物をレセプターアゴニスト又はアンタゴニストとして同定する。これらの指標細胞は、好ましくは、ＧＰＣＲをコードする核酸分子を細胞中に取り込むことにより、関心のあるＧＰＣＲを発現する。この試験組成物は、１種類又は数種類（例えば、ライブラリー）の試験化合物を含むことができる。」（２頁３３行目〜３頁１３行目）
　
［２ｃ］「The methods of the invention are simple, rapid and high-throughput assays that allow for the efficient screening of either individual compounds or libraries of compounds. Furthermore, these methods are widely applicable to different GPCRs and can even be used to identify ligands for orphan receptors of unknown function. Accordingly, 
the methods of the invention can be used both to investigate GPCR function and to identify compounds useful for manipulating or altering GPCR activity, e.g., for therapeutic purposes
（訳文）「この発明の方法は、個々の化合物又は化合物のライブラリーの効率的なスクリーニングを可能にする簡単で、迅速且つ高スループットのアッセイである。その上、これらの方法は、種々のＧＰＣＲに広く適用可能であり、未知の機能の「孤児」レセプターのリガンドを同定するために用いることさえできる。従って、
この発明の方法を、ＧＰＣＲ機能を研究するため及び、例えば治療目的のためにＧＰＣＲ活性を操作し又は変えるために有用な化合物を同定するための両方に用いることができる
　
［２ｄ］「In yet another embodiment, the GPCR is what has been referred to in the art as an orphan receptor. An orphan receptor is a GPCR that is structurally similar to other GPCR but for which the natural ligand is unknown prior to use of the orphan receptor in the screening assay of the invention. In this latter embodiment, 
the screening assay can thus be used to identify test compounds as ligands of the orphan receptor
the bioassays of the invention also are useful for investigating the function of orphan GPCRs by identifying ligands for these receptors.
（訳文）「更に別の具体例において、ＧＰＣＲは、当分野で「孤児」レセプターとして言及されてきたものである。孤児レセプターは、他のＧＰＣＲに構造的に類似しているが、この発明のスクリーニングアッセイにおけるその孤児レセプターの使用前にその天然のリガンドが未知であるＧＰＣＲである。この後者の具体例において、このスクリーニングアッセイは、こうして、
試験化合物を、孤児レセプターのリガンドとして同定するために用いることができる
この発明のバイオアッセイは又、孤児ＧＰＣＲの機能をこれらのレセプターのリガンドを同定することにより研究するのにも有用である
　
［２ｅ］「In a preferred embodiment, the nucleic acid introduced into the cells is a recombinant expression vector carrying a cDNA encoding the GPCR. In recombinant expression vectors, the regulatory functions responsible for transcription and/or translation of the cDNA are often provided by viral sequences. Examples of commonly used viral promoters and/or enhancers include those derived from polyoma, Adenovirus 2, cytomegalovirus and Simian Virus 40, and retroviral LTRs. 
Suitable expression vectors for expression of a GPCR in an indicator cell are well known in the art and many are commercially available
　
In addition to introducing into the host cell a nucleic acid molecule encoding a GPCR
a nucleic acid molecule encoding a G- protein of interest (e.g., Gq/11, G s , Gj, etc.) can be cotransfected into the host cell such that the G-protein is expressed in the host cell
（訳文）「好適具体例において、これらの細胞に導入される核酸は、ＧＰＣＲをコードするｃＤＮＡを有する組換え発現ベクターである。組換え発現ベクターにおいて、ｃＤＮＡの転写及び／又は翻訳の原因となり得る調節機能は、しばしば、ウイルス性の配列により与えられる。一般に用いられるウイルスプロモーター及び／又はエンハンサーの例には、ポリオーマ、アデノウイルス２、サイトメガロウイルス及びシミアンウイルス４０並びにレトロウイルスのＬＴＲから導かれたものが含まれる。
指標細胞中のＧＰＣＲの発現のために適した発現ベクターは、当分野では周知であり、多くのものが市販されている
　
宿主細胞中にＧＰＣＲをコードする核酸分子を導入することに加えて、
Ｇ蛋白質（例えば、Ｇｑ／１１、Ｇ
S
、Ｇ
i
等）をコードする核酸分子を、宿主細胞に同時トランスフェクトして、Ｇ蛋白質がその宿主細胞で発現されるようにすることができる
　
［２ｆ］「A nucleic acid encoding a GPCR (e.g., a recombinant expression vector) can be introduced into cells by a variety of well-known cell transfection techniques useful for this purpose, including electroporation, calcium-phosphate precipitation, DEAE-dextran treatment, lipofection, microinjection and infection with viral vectors. 
Suitable methods for introducing nucleic acid into cells can be found in Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Edition. Cold Spring Harbor Laboratory press (1989)) and other laboratory manuals, and kits for transfecting cells are commercially available
Mammalian cell lines from which indicator cells can be prepared are available from the American Type Culture Collection, Rockville, MD
（訳文）「ＧＰＣＲをコードする核酸（例えば、組換え発現ベクター）を、様々な周知の細胞トランスフェクション技術によって細胞に導入することができ、該技術は、この目的に有用であって、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈殿、ＤＥＡＥ−デキストラン処理、リポフェクション、マイクロインジェクション及びウイルスベクターの感染が含まれる。
核酸を細胞に導入するのに適した方法は、Sambrook等（Molecular Cloning: A Laboratory Manual,第二版、Cold Spring Harbor Laboratory press(1989)）及び他の実験マニュアル中に見出すことができ、細胞をトランスフェクトするためのキットは市販されている
指標細胞を調製することのできる哺乳動物細胞系統は、American Type Culture Collection（メリーランド、Rockville在）より入手することができる
　
　
３．刊行物３（Trends Pharmacol Sci.、Vol.18(11)、pp.430-437（Nov. 1997））
　刊行物３には、以下の事項が記載されている。
［３ａ］「The examples given above are for receptors with significant homology to known GPCR superfamily members and thier activating ligands proved to be known GPCR ligands. Will ligand fishing be successful in identifying novel endogenous ligands ? Recently, two groups investigated an orphan opioid-like receptor, ORL1（Refs 47 and 48）. 
Both groups expressed the orphan GPCR in CHO cells and challenged the transfected cells with a series of opiate agonists, but without response. Both groups then used a similar ligand fishing approach. Taking crude extracts from rat brain
47
 or porcine brain
48
, they screened against the stably transfected cell lines using inhibition of adenylate cyclase activity as a functional assay. They were able to fractionate the brain extracts and identify the novel dynorphin-like ligand, which they called nociceptin
47
 or orphanin FQ（Ref .48）. Thus, both teams successfully established a functional assay in transfected CHO cells that allowed the purification of a novel neuropeptide ligand that is 17 amino acids long for the orphan receptor. This work validates the ligand fishing approach for characterizing the function of orphan GPCRs
（訳文）「上記の事例は公知のGPCRスーパーファミリーメンバーに顕著な相同性を有するレセプターに関するものであって、それらの活性リガンドは公知のGPCRリガンドであることが判明した。リガンド検索は新規な内因性リガンドを同定することに成功するか？最近、２つのグループがオーファン・オピオイド様レセプターであるORL1を研究した（参考文献47と48）。
両グループは、オーファンGPCRをCHO細胞中で発現し、形質転換された細胞に一群のオピオイド・アゴニストでチャレンジしたが、反応がなかった。両グループは類似のリガンドを用いた。ラットの脳
47
またはブタの脳
48
からの粗抽出物を使用し、機能アッセイとしてアデニルシクラーゼ活性の抑制を用いて、安定な形質転換細胞に対するスクリーニングを行った。彼らは脳抽出物を画分化し、callednociceptin
47
またはorphanin FQ（参考文献48）と呼ばれる新規なダイノルフィリン様リガンドを同定できた。そこで両チームは、オーファンレセプターに対する17アミノ酸の新規な脳ペプチド・リガンドの精製を可能とする形質転換されたCHO細胞中での機能アッセイを成功裏に確立した。この業績は、オーファンGPCRの機能を特定するためのリガンド検索アプローチを確認した
（参考文献47）Nature, Vol.377, pp.532-535 (1995)
（参考文献48）Science, Vol.270, pp.792-794 (1995)
　
［３ｂ］「As a consequence, the pharmaceutical industry has recognized the power of genomics to provide it with new and unique drug targets. Genomics has responded with a plethora of novel proteins, included among them over 100 orphan GPCRs. Because of the proven link of GPCRs to a wide variety of diseases and the historical success of drugs that target GPCRs, we believe that these orphan receptors are among the best targets of the genomic era to advance into the drug discovery process.」
（当審の訳文）「結果として、製薬産業は、ゲノミクスの力で新規かつユニークな創薬ターゲットが提供されると認識している。その中に100を超えるオーファンGPCRが含まれる、おびただしい量の新規タンパク質にゲノミクスは応じる。
広範な種類の疾病に対するGPCRが立証された関連およびGPCRをターゲットとする薬の歴史的な成功のため
　
　
第４　当審の判断
１．刊行物１に記載された発明 
　摘記［１ｄ］には、「β2−アドレナリン受容体が大量に発現しているトランスジェニックマウス」「であるＴＧ-４マウスの心臓を用いることでβ２−選択的拮抗薬であるICI 118551 がinverse agonist として作用することを報告している。ＴＧ−４マウスは、活性なＲ＊型受容体が多量に分布していて、agonist非存在下でもアデニル酸シクラーゼ活性が上昇しており、心臓の運動も促進されている。この心臓標本にイソプレナリンなどfull agonist を与えると、普通のマウスの心臓標本同様に、濃度依存的に反応は増大し、β−遮断薬alprenololによって濃度反応曲線は高濃度側へ平行移動する。」「ＴＧ-４マウスの心臓標本にβ2−選択的拮抗薬の１つであるICI 118551 を与えると、活性型のＲ＊は不活性なＲへ変わり、ＲとICI 118551 との複合体の形成が促進され、アデニル酸シクラーゼ活性が抑制され心臓の運動も抑制される。」と記載されており、
「β2−アドレナリン受容体」が発現するのは「心臓標本」の細胞中であるから、
刊行物１には、「ＴＧ−４マウスの心臓の細胞中に大量に発現しているβ2−アドレナリン受容体を用いて、ある化合物がインバースアゴニストまたはアゴニストであることを同定するための方法」の発明（以下、「刊行物１発明」という。）が記載されていると認められる。
　
２．本願発明１と刊行物１発明の対比
　本願発明１と刊行物１発明を対比する。 
　本願発明１の「内因性の構成的に活性な」の意義について、本願明細書には、
「【００１６】 構成的に活性化される受容体（構成的に活性な受容体）とは、構成的な受容体の活性化に供される受容体を意味する。構成的に活性化される受容体は内因性または非内因性でよい。
【００１７】構成的な受容体の活性化とは、受容体とその内因性リガンドまたはそれらの化学的均等物との結合以外の手段による受容体の活性状態の安定化を意味する。」と記載されており、
摘記［１ｂ］の「受容体は不活性型Ｒだけでなく、agonistが存在しなくても受容体が極度に活性化される条件になれば、活性型R＊をもとりうると言う考え方、すなわちtwo-stateモデルが提唱されている(図2)。このモデルでは、受容体はRとR＊が平衡状態にあり、 agonistが存在すると、agonistはR＊へ高親和性を示すので、平衡関係はR＊へ移動し、R＊の濃度が増加する。もし、ある薬物がRへ高親和性であるならば、この薬物の存在で平衡関係はR側へ移動し、R＊は減少し、Rが増加する。この薬物がinverse agonistである。」との記載を参酌すれば、
「内因性の構成的に活性な」とは、agonist（内因性リガンド）が存在しなくても受容体が活性化された「活性型R＊」の状態であると解釈できるから、
摘記［１ｄ］の「ＴＧ−４マウスは、活性なＲ＊型受容体が多量に分布していて、agonist非存在下でもアデニル酸シクラーゼ活性が上昇しており、心臓の運動も促進されている」との状態は、本願発明１の「内因性の構成的に活性な」状態に該当する。
　また、刊行物１発明の「β2−アドレナリン受容体」は、本願発明１の「Ｇタンパク質共役受容体」（ＧＰＣＲ）の一種である。
　
　してみると、本願発明１と刊行物１発明とは、「内因性の構成的に活性なＧタンパク質共役受容体に対する、インバースアゴニストおよびアゴニストから成る群から選択される化合物として候補化合物を同定するための方法」という点で一致し、以下の相違点を有する。
　
（相違点１）
　本願発明１では「直接同定する」のに対し、刊行物１発明ではそのような特定がなされていない点
　
（相違点２）
　本願発明１では「Ｇタンパク質共役オーファン受容体」（以下、「オーファンＧＰＣＲ」ともいう。）に対して「候補化合物」を接触させて、「該化合物が該受容体のインバースアゴニスト、部分アゴニストまたはアゴニストであるか否かを決定する」のに対して、刊行物１発明ではＧタンパク質共役受容体である「β2−アドレナリン受容体」に対する公知のリガンド（インバースアゴニスト、アゴニスト、アンタゴニスト）を用いる点
　
（相違点３）
　本願発明１では「哺乳動物細胞中で発現される」「ＧＰＣＲ融合タンパク質」を用いているのに対して、刊行物１発明では「活性なＲ＊型受容体が多量に分布して」いる「トランスジェニックマウスであるＴＧ-４マウスの心臓」の細胞を用いる点
　
３．相違点１に対する判断
　本願発明１の「直接同定する」の意義について、本願明細書には、
「【００１９】直接的に同定するまたは直接的に同定したとは、「候補化合物」という句と関連して、構成的に活性化される受容体に対する、好ましくは構成的に活性化されるオーファン受容体、そして最も好ましくは構成的に活性化されるＧタンパク質共役細胞表面オーファン受容体に対する候補化合物をスクリーニングし、そしてそのような化合物の化合物の効能を評価することを意味する。この句はどのようなことがあっても「間接的に同定する」または「間接的に同定した」という句に包含されるか、または包含するとは解釈されないか、または理解されない。」
「【００２２】間接的に同定する、または間接的に同定されるとは、内因性受容体に特異的な内因性リガンドの同定、リガンド−受容体相互作用を妨害および／または競合するものを決定するための受容体に対する候補化合物のスクリーニング、および活性化受容体に関連する少なくとも１つの第２メッセンジャー経路で影響を及ぼす化合物の効能を評価することが関与する薬剤発見法に対する従来の取り組みを意味する。」
「【０１２１】実施例１１　プロトコール：[35S]GTPγSを使用したインバースアゴニストおよびアゴニストの直接同定」と記載され、
本願発明１の「直接同定する」とは、「第２メッセンジャー経路で影響を及ぼす化合物の効能を評価する」のではなく、[35S]GTPγSを使用した同定を含むと解釈できる。
　
　[35S]GTPγSを使用したＧＰＣＲに対するリガンド（インバースアゴニスト、アゴニスト、アンタゴニスト）の同定方法の詳細は、本願明細書には記載されていないものの、例えば下記刊行物Ａ〜Ｃに記載された本願優先日前の技術常識によれば、ＧＰＣＲとリガンドの結合により活性化されたＧタンパク質（ＧＴＰａｓｅ活性を有するもの）を検出する方法として一般的なものであって、技術的には、ＧＴＰのγ位がチオリン酸になっていることから活性化されたＧタンパク質（ＧＴＰａｓｅ活性を有するもの）により加水分解されないために活性化されたＧタンパク質を[35S]GTPγS中の同位体元素[35S]の放射能を液体シンチレーションカウンター等で定量的に検出可能としたものである。
　この方法が一般的な同定方法にすぎないことは、本願明細書の実施例で何ら説明もなく使用されていることからも裏付けられる。
　
刊行物Ａ：European Journal of Pharmacology, Vol.343, pp.303-312 (1998.2.19)
「Characterization of 5-HT1A receptor-mediated [35S]GTPγS binding in rat hippocampal membranes」
　
刊行物Ｂ：Brain Research, Vol.791, pp.341-346 (1998.4.27)
「μ-Opioid agonist-stimulated [35S]GTPγS binding in guinea pig hypothalamus: effects of estrogen」
　
刊行物Ｃ：European Journal of Pharmacology, Vol.352, pp.117-124 (1998.7.3)
「Human 5-HT1F receptor-stimulated [35S]GTPγS binding: correlation with inhibition of guinea pig dural plasma protein extravasation」
　
　ここで、上記［１ｅ］には、ＧＰＣＲの一種である「δ−オピオイド受容体」に対してinverse agonistとして作用する化合物「ICI 174864」を用いて、マウス細胞である「NG 108-15 細胞の膜分画を用いてICI 174864のGTPase活性への抑制効果を検討した」ことが記載されており、この記載を考慮すれば、刊行物１発明における「ＴＧ−４マウスの心臓の細胞中に大量に発現しているβ2−アドレナリン受容体」（活性型のＲ＊）に係るＧタンパク質のGTPase活性を「直接同定」することも当業者であれば容易に想到し得ることである。
　
４．相違点２に対する判断
　摘記［２ａ］、［２ｂ］および［２ｄ］〜［２ｆ］並びに摘記［３ａ］（特に下線部を参照）に記載されているように、オーファンＧＰＣＲを哺乳動物細胞中に発現してリガンド（インバースアゴニスト、アゴニスト、アンタゴニスト）候補化合物と接触させてオーファンＧＰＣＲのリガンド（インバースアゴニスト、アゴニスト、アンタゴニスト）を同定することは、GPCRの研究現場では本願優先日前からよく行われていたことである。
　そして、刊行物２および３に記載された発明の課題（目的）も「ＧＰＣＲ機能を研究するため及び、例えば治療目的のためにＧＰＣＲ活性を操作し又は変えるために有用な化合物を同定するため」（摘記［２ｃ］）および「広範な種類の疾病に対するGPCRが立証された関連およびGPCRをターゲットとする薬の歴史的な成功のため」（摘記［３ｂ］）であるから、刊行物１発明の課題（目的）である「Ｇタン白質共役型受容体の突然変異は病変に関係することがあるので、変異受容体の活性を抑えるinverse agonistは、ここでは有益な効果が期待できそうである。薬理学的に新しい型の薬物であるinverse agonist が、今後の研究の発展によって医療の場へ医薬品として供されること」（摘記［１ｆ］）と共通しており、刊行物１発明に刊行物２および３に記載された発明を適用することは当業者であれば容易になし得ることである。
　
５．相違点３に対する判断
　本願発明１の「ＧＰＣＲ融合タンパク質」の意義について、本願明細書には、「【００２１】Ｇタンパク質共役受容体融合タンパク質およびGPCR融合タンパク質とは、本明細書に開示する発明の内容において、それぞれ、少なくとも１つのＧタンパク質、最も好ましくはそのようなＧタンパク質のアルファ(α)サブユニット（これはGTPに結合するサブユニット）に融合した内因性の構成的に活性化されるオーファンGPCRを含んで成る非内因性タンパク質を意味し、Ｇタンパク質は好ましくは内因性のオーファンGPCRと自然に共役するＧタンパク質と同じ種類である。例えば、そして限定するわけではないが内因性の状態で、Ｇタンパク質“Gsα”は、GPCR6に基づくGPCR融合タンパク質がGsαに融合したGPCR6を含んで成る非−内因性タンパク質となるように、GPCR6と共役する主要なＧタンパク質である。このＧタンパク質は内因性の構成的に活性なオーファンGPCRのＣ−末端に直接融合することができるか、あるいは２つの間にスペーサーがあってもよい。」と記載されている。
　一方、摘記［２ｅ］（特に下線部を参照）には、「宿主細胞中にＧＰＣＲをコードする核酸分子を導入することに加えて、・・・Ｇ蛋白質（例えば、Ｇｑ／１１、ＧS、Ｇi等）をコードする核酸分子を、宿主細胞に同時トランスフェクトして、Ｇ蛋白質がその宿主細胞で発現されるようにすることができる」と記載されているが、「同時トランスフェクト」であって、段落【００２１】で定義された本願発明１の「ＧＰＣＲ融合タンパク質」ではない。
　
　ここで、同じグループが発表した刊行物Ｄ（FEBS Letters, Vol.419, pp.141-146 (1997)）および刊行物Ｅ（FEBS Letters, Vol.428, pp.17-22 (1998.5.22)）には、公知のＧＰＣＲとＧタンパク質を融合タンパク質としてＣＯＳ細胞中で発現して公知のリガンド（アゴニスト、アンタゴニスト）との結合性およびＧタンパク質（ＧＴＰａｓｅ）の活性を検出したことが記載されている。しかしながら、これらは、公知のリガンドの有効性を定量的に検証するための一連の研究であって、本願発明のようなオーファンＧＰＣＲのリガンドを同定することを課題（目的）とするものではない。したがって、刊行物ＤおよびＥを刊行物１〜３に組み合わせる動機付けが存在しない。
　むしろ、従来のオーファンＧＰＣＲのリガンドを同定する実験においては、「第２メッセンジャー経路で影響を及ぼす化合物の効能を評価する」ことが一般的であったことから、第２メッセンジャー経路へのシグナル伝達に影響を与えかねない「オーファンＧＰＣＲ」と「Ｇタンパク質」を結合させる試みはなされていなかったようである。
　
６．本願発明１の効果
　本願発明１は、「内因性の構成的に活性な哺乳動物のＧタンパク質共役オーファン受容体およびＧタンパク質を含む」「ＧＰＣＲ融合タンパク質」を用いて、[35S]GTPγS等の試薬によりＧタンパク質（ＧＴＰａｓｅ）の活性を「直接」検出することにより、「第２メッセンジャー経路で影響を及ぼす化合物の効能を評価する」ことなく、「内因性の構成的に活性なＧタンパク質共役オーファン受容体に対する、インバースアゴニスト、部分アゴニストおよびアゴニストから成る群から選択される化合物として候補化合物を直接同定」できるという有利な効果を有する。
　
７．本願発明１についてのまとめ
　したがって、本願発明１は、刊行物１〜３に記載された発明に基づいて、当業者が容易に発明をすることができたから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない、とすることはできない。
　
８．本願発明２〜９について
　本願発明２〜９は、本願発明１を引用するものであるから、上述したとおり、本願発明１について刊行物１〜３に記載された発明に基づいて当業者が容易に発明をすることができたとすることができない以上、本願発明１と同様の理由により、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない、とすることはできない。
　
　
第５　むすび
　本願については、原査定の拒絶理由を検討してもその理由によって拒絶すべきものとすることはできない。
　また、他に本願を拒絶すべき理由を発見しない。
　よって、結論のとおり審決する。