(57)【要約】      （修正有）【課題】免疫グロブリン産物等の組換えタンパク質調製物中の単一プロセス固有のＨＣＰの検出及び定量化のための十分な特異性と感度を有する組成物及びその分析法。【解決手段】ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体及びポリクローナル抗体が提供される。また、組換えポリペプチド調製物等におけるハムスターホスホリパーゼＢ様２を検出及び定量化するための方法、及び該方法を実施するためのキットも提供される。低レベルのハムスターホスホリパーゼＢ様２を発現する宿主細胞株又は組換えポリペプチド発現細胞株をスクリーニング又は選択する方法も提供される。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
組換えポリペプチド調製物又は宿主細胞株から得られる試料中のハムスターホスホリパーゼＢ様２タンパク質（ＰＬＢＬ２）を検出するためのイムノアッセイ法であって、
（ａ）ハムスターＰＬＢＬ２に結合する一次捕捉抗体を試料と接触させ、それにより試料−捕捉抗体結合材料を生成すること、
（ｂ）ハムスターＰＬＢＬ２に結合する二次検出抗体を試料−捕捉抗体結合材料と接触させること、及び
（ｃ）試料−捕捉抗体結合材料に結合する二次抗体を検出すること
を含む方法。
【請求項２】
捕捉抗体が、結合に関して検出抗体と競合せず、検出抗体とは異なるエピトープに結合する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
標準的な滴定曲線を使用して二次検出抗体のレベルを定量化することを更に含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
試料中に存在するハムスターＰＬＢＬ２の量を、結合した二次検出抗体のレベルに基づいて算出することを更に含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
イムノアッセイが電気化学発光（ＥＣＬ）アッセイである、請求項１から４の何れか一項に記載の方法。
【請求項６】
イムノアッセイがサンドイッチアッセイである、請求項１から４の何れか一項に記載の方法。
【請求項７】
サンドイッチアッセイが、酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
組換えポリペプチド調製物又は宿主細胞株が、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞株から得られる、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
試料が収集細胞培養液である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
試料が組換えポリペプチド調製物から得られ、組換えポリペプチド調製物は一又は複数のクロマトグラフィー精製工程に供されている、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
組換えポリペプチド調製物が最終精製産物である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
組換えポリペプチド調製物中に含まれる組換えポリペプチドが抗体又はイムノアドヘシンである、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
抗体が、多重特異性抗体、二重特異性抗体、半抗体又は抗体断片である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
組換えポリペプチドがＩｇＧである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
組換えポリペプチドが、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
組換えポリペプチドがＩｇＧ１である、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
組換えポリペプチドがＩｇＧ４である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域を含む可変領域を含む抗体。
【請求項１９】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む抗体。
【請求項２０】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域、並びに配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む抗体。
【請求項２１】
配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む、請求項１８に記載の抗体。
【請求項２２】
配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む、請求項１９に記載の抗体。
【請求項２３】
配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域、及び配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む、請求項２０に記載の抗体。
【請求項２４】
配列番号１３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号１８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項２３に記載の抗体。
【請求項２５】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、１９Ｃ１０である抗体。
【請求項２６】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域を含む可変領域を含む抗体。
【請求項２７】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む抗体。
【請求項２８】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域、並びに配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む抗体。
【請求項２９】
配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む、請求項２６に記載の抗体。
【請求項３０】
配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む、請求項２７に記載の抗体。
【請求項３１】
配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域、及び配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む、請求項２８に記載の抗体。
【請求項３２】
配列番号３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項３１に記載の抗体。
【請求項３３】
ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合するモノクローナル抗体であって、１５Ｇ１１である抗体。
【請求項３４】
捕捉抗体が、請求項１８から２５の何れか一項に記載の抗体を含む、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項３５】
検出抗体が、請求項２６から３３の何れか一項に記載の抗体を含む、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項３６】
捕捉抗体が請求項１８から２５の何れか一項に記載の抗体を含み、検出抗体が請求項２６から３３の何れか一項に記載の抗体を含む、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項３７】
捕捉抗体がポリクローナルである、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項３８】
検出抗体がポリクローナルである、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項３９】
捕捉抗体がポリクローナルであり、検出抗体もポリクローナルである、請求項１から１７の何れか一項に記載の方法。
【請求項４０】
ポリクローナル抗体がウサギである、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
検出抗体がビオチンにコンジュゲートしている、請求項１から１７の何れか一項又は請求項３４から３６の何れか一項に記載の方法。
【請求項４２】
検出抗体がホースラディッシュペルオキシダーゼにコンジュゲートしている、請求項１から１７の何れか一項又は請求項３８から４０の何れか一項に記載の方法。
【請求項４３】
請求項１８から２５の何れか一項に記載の捕捉抗体、及び請求項２６から３３の何れか一項に記載の検出抗体を含む、ハムスターホスホリパーゼＢ様２タンパク質の検出のためのイムノアッセイキット。
【請求項４４】
ポリクローナル捕捉抗体及びポリクローナル検出抗体を含む、ハムスターホスホリパーゼＢ様２タンパク質の検出のためのイムノアッセイキット。
【請求項４５】
イムノアッセイがＥＣＬイムノアッセイである、請求項４３又は４４に記載のイムノアッセイキット。
【請求項４６】
イムノアッセイがＥＬＩＳＡイムノアッセイである、請求項４３又は請求項４４に記載のイムノアッセイキット。
【請求項４７】
宿主細胞株から得られる試料中のＰＬＢＬ２を検出することを含む、ハムスターＰＬＢＬ２の発現のための宿主細胞株のスクリーニング方法。
【請求項４８】
ＰＬＢＬ２を検出することが、請求項１又は２或いは８又は９の何れか一項に記載のイムノアッセイ法を含む、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
試料が全細胞培養液である、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
試料中のハムスターＰＬＢＬ２の量を、請求項４から７の何れか一項に記載の方法に従って算出することを更に含む、請求項４８に記載の方法。
【請求項５１】
低量のハムスターＰＬＢＬ２を発現する最適な宿主細胞株を、二以上の宿主細胞株から成る群から選択する方法であって、
（ｉ）二以上の宿主細胞株の各々から宿主細胞株試料を得ること、
（ｉｉ）請求項４から７の何れか一項に記載の方法に従って各宿主細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を算出すること、
（ｉｉｉ）各宿主細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を、その群の宿主細胞株試料の各々におけるＰＬＢＬ２の量と比較すること、
（ｉｖ）その群の宿主細胞株試料の各々と比較して最低量のＰＬＢＬ２を有する宿主細胞株試料を特定し、それにより、その群から特定された最低量のＰＬＢＬ２を有する宿主細胞株を生成すること、及び
最適な宿主細胞株として（ｉｖ）の特定された宿主細胞株を選択すること
を含む方法。
【請求項５２】
二以上の宿主細胞株の各々がＣＨＯ細胞株である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
各宿主細胞株試料が収集細胞培養液である、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
各宿主細胞株試料が全細胞培養液である、請求項５２に記載の方法。
【請求項５５】
生産物細胞株である組換えポリペプチド発現細胞株を、ハムスターＰＬＢＬ２の発現についてスクリーニングする方法であって、生産物細胞株から得られる試料中のＰＬＢＬ２を検出することを含む方法。
【請求項５６】
ＰＬＢＬ２を検出することが、請求項１又は２或いは８から１７の何れか一項に記載のイムノアッセイ法を含む、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
試料中のハムスターＰＬＢＬ２の量を、請求項４から７の何れか一項に記載の方法に従って算出することを更に含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
試料中の生産物を検出して生産物の量を定量化することを含む、生産物の発現についてのスクリーニングを更に含む、請求項５５から５７の何れか一項に記載の方法。
【請求項５９】
生産物を検出することと、生産物の量を定量化することが、分光光度法又はアフィニティークロマトグラフィー法を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
二以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群より最適な組換えポリペプチド発現細胞株を選択する方法であって、二以上の組換えポリペプチド発現細胞株の各々は生産物細胞株であり、最適な組換えポリペプチド発現細胞株は最適な生産物細胞株であり、各生産物細胞株は同一の生産物を発現し、最適な生産物細胞株は低量のハムスターＰＬＢＬ２及び大量の生産物を発現し、
（ｉ）二以上の生産物細胞株の各々から生産物細胞株試料を得ること、
（ｉｉ）請求項４から７の何れか一項に記載の方法に従って各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を算出すること、
（ｉｉｉ）生産物を検出し、各生産物細胞株試料中の生産物の量を定量化すること、
（ｉｖ）各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を、その群の生産物細胞株試料の各々におけるＰＬＢＬ２の量と比較すること、
（ｖ）各生産物細胞株試料中の生産物の量を、その群の生産物細胞株試料の各々における生産物の量と比較すること、
（ｉｖ）その群の生産物細胞株試料の各々と比較して最低量のＰＬＢＬ２且つ最高量の生産物を有する生産物細胞株試料を特定し、それにより、その群から特定された最低量のＰＬＢＬ２且つ最高量の生産物を有する生産物細胞株を生成すること、及び
最適な生産物細胞株として（ｖｉ）の特定された生産物細胞株を選択すること
を含む方法。
【請求項６１】
二以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群より最適な組換えポリペプチド発現細胞株を選択する方法であって、二以上の組換えポリペプチド発現細胞株の各々は生産物細胞株であり、最適な組換えポリペプチド発現細胞株は最適な生産物細胞株であり、各生産物細胞株は同一の生産物を発現し、最適な生産物細胞株は低量のハムスターＰＬＢＬ２及び大量の生産物を発現し、
（ｉ）二以上の生産物細胞株の各々から生産物細胞株試料を得ること、
（ｉｉ）請求項４から７の何れか一項に記載の方法に従って各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を算出すること、
（ｉｉｉ）生産物を検出し、各生産物細胞株試料中の生産物の量を定量化すること、
（ｉｖ）各生産物細胞株試料について、生産物の量に対するＰＬＢＬ２の量の比率を算出すること、
（ｖ）各生産物細胞株試料について算出した該比率を、その群の生産物細胞株試料の各々と比較すること、
（ｉｖ）その群の最も低い該比率を有する生産物細胞株試料を特定し、それにより、その群から特定された、最低量のＰＬＢＬ２且つ最高量の生産物を有する生産物細胞株を生成すること、及び
最適な生産物細胞株として（ｖｉ）の特定された生産物細胞株を選択すること
を含む方法。
【請求項６２】
二以上の各生産物細胞株がＣＨＯ細胞株である、請求項６０又は６１に記載の方法。
【請求項６３】
各生産物細胞株試料が収集細胞培養液である、請求項６２に記載の方法。
【請求項６４】
生産物が抗体又はイムノアドヘシンである、請求項５５、６０又は６１の何れか一項に記載の方法。
【請求項６５】
抗体が、多重特異性抗体、二重特異性抗体、半抗体又は抗体断片である、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
生産物がＩｇＧである、請求項６４に記載の方法。
【請求項６７】
生産物が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４から選択される、請求項６５に記載の方法。
【請求項６８】
生産物がＩｇＧ１である、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
生産物がＩｇＧ４である、請求項６７に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本出願は、２０１４年５月９日出願の米国仮特許出願第６１／９９１２２８号及び２０１３年９月１３日出願の同第６１／８７７５０３号の優先権の利益を主張し、この何れの出願も、その内容全体が参照により本明細書に援用される。
【０００２】
配列表
本出願は、ＥＦＳ−Ｗｅｂにより提出された配列表を含み、配列表の内容全体は参照により本明細書に援用される。前記ＡＳＣＩＩコピーは、２０１４年８月２８日に作成され、Ｐ５７０１Ｒ１ＷＯ＿ＰＣＴＳｅｑｕｅｎｃｅＬｉｓｔｉｎｇ．ｔｘｔと命名され、大きさは２８９６５バイトである。
【０００３】
技術分野
ハムスターホスホリパーゼＢ様２（ｐｈｏｓｐｈｏｌｉｐａｓｅ  Ｂ−ｌｉｋｅ２）に結合するモノクローナル抗体及びポリクローナル抗体が提供される。また、組換えポリペプチド調製物等におけるハムスターホスホリパーゼＢ様２を検出及び定量化するための方法、及び該方法を実施するためのキットが提供される。また、低レベルのハムスターホスホリパーゼＢ様２を発現する宿主細胞株又は組換えポリペプチド発現細胞株をスクリーニング又は選択する方法も提供される。
【背景技術】
【０００４】
ヒト患者への投与が許容される組換え生物医薬品タンパク質であるためには、製造及び精製プロセスから生じる残留不純物が最終的なバイオ生産物から除去されることが重要である。  このようなプロセス成分は、培地のタンパク質、免疫グロブリン親和性リガンド、ウイルス、エンドトキシン、ＤＮＡ及び宿主細胞タンパク質を含む。こうした宿主細胞不純物は、組換えＤＮＡ技術に由来する生物におけるプロセス関連不純物／夾雑物である、プロセス固有の宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）を含む。ＨＣＰは、最終原体中に少量で（目的の組換えタンパク質のパーツ・パー・ミリオン又はナノグラム・パー・ミリグラムで）通常存在するものの、望ましくないとされており、その量は最小限にされるべきである。例えば、米国食品医薬品局（ＦＤＡ）は、インビボでのヒトへの使用が目的の生物医薬品に余分な不純物が可能な限りないようにすることを要求しており、また、ＨＣＰ等の潜在的な夾雑物／不純物の検出及び定量化のための試験を要求している。加えて、医薬品規制調和国際会議（Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  ｏｎ  Ｈａｒｍｏｎｉｚａｔｉｏｎ（ＩＣＨ））は、バイオテクノロジー／バイオ生産物のための試験手順及び許容基準を提示している。ガイドラインは、ＨＣＰに対し、広範囲のタンパク質不純物を検出することができる高感度イムノアッセイを利用することを提案している。本発明者ら及び他が、免疫グロブリン、ＤＮＡ、エンドトキシン、ウイルス、及びトータルチャイニーズハムスター卵巣タンパク質（ＣＨＯＰ）のようなトータルＨＣＰを検出するためのアッセイ並びに試薬を開発してきたが（Chen AB, J Biotechnol in Healthcare 3:70-80 (1996); Krawitz et al., Proteomics 6:94-110 (2006)に記載）、免疫グロブリン産物等の組換えタンパク質調製物中の単一プロセス固有のＨＣＰの検出及び定量化のための十分な特異性と感度を有する市販の試薬又は分析法は、組換えタンパク質調製物と共精製するものも含め、現在存在しない。
【０００５】
特定の例において、トータルＣＨＯＰ等のトータルＨＣＰの検出及び定量化のためのイムノアッセイを使用した場合、顕著な希釈依存性が認められうるが、これは、該アッセイが、特定の生産物中のＨＣＰ不純物の正確な定量化のための適切な試験手順ではないことを示唆している。このような希釈依存性の研究は、より適切な試験手順の開発を容易にするために重要である。場合によっては、希釈依存性は、利用可能な抗体を上回って存在する単一ＨＣＰ種が、アッセイ性能に及ぼされる影響の主要因である「抗原過剰」により引き起こされ得る(Anicetti et al., J. Immunol. Methods 91:213-224 (1986); Chen AB, J Biotechnol in Healthcare 3:70-80 (1996), Wang X, et al., Biotechnol Bioeng. 103(3):446-58 (2009))。
【０００６】
ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ等の高感度分析法が、利用可能な抗体を上回って存在する単一ＨＣＰ種を特定及び定量化するために使用されうる。このような単一ＨＣＰ種の識別に際し、十分な感度と特異性を有し、規制当局による承認のために有効であり得、且つ複数の組換えタンパク質生産物にわたるプラットフォームとして使用されうる代替アッセイを開発する必要がある。
【０００７】
ＣＨＯ細胞中で生成される本発明者らの組換えタンパク質調製物の幾つかにおいて、本発明者らは、酵素、すなわちホスホリパーゼＢ様２を、トータルＣＨＯＰ  ＥＬＩＳＡアッセイで利用可能な抗体を上回って存在する単一のＣＨＯＰ種として特定した。本明細書で使用される「ＰＬＢ２」及び「ＰＬＢＬ２」及び「ＰＬＢＤ２」は互換的に用いられ、酵素「ホスホリパーゼＢ様２」又はその同意語である「ホスホリパーゼＢドメイン様２」（ｐｈｏｓｐｈｏｌｉｐａｓｅ  Ｂ−ｄｏｍａｉｎ−ｌｉｋｅ２）を指す。ＰＬＢＬ２についての幾つかの科学出版物は、Lakomek, K. et al., BMC Structural Biology 9:56 (2009); Deuschi, et al., FEBS Lett 580:5747-5752 (2006)を含む。ＰＬＢＬ２は、およそ６６０００の親ＭＷを有するプレプロ酵素として合成される。除去される初期リーダー配列があり、潜在的なマンノース６リン酸（Ｍ６Ｐ）の６つの基が、翻訳後修飾中に付加される。Ｍ６Ｐは、Ｍ６Ｐ受容体を介してリソソームに本酵素を向ける標的修飾である。ＰＬＢＬ２は６つのシステインを含有しており、そのうちの二つは遊離スルフヒドリルを有し、四つはジスルフィド結合を形成する。酸性条件下では、ＰＬＢＬ２は更に切断され、それぞれ３２０００及び４５０００ＭＷを有するＮ末端断片及びＣ末端断片に付加される。他のリソソーム酵素との類推から、この切断が活性化工程であり、活性部位への基質の接近を可能にする。
【０００８】
酵素のハムスター型とヒト型との間におよそ８０％のＰＬＢＬ２アミノ酸配列相同性がある。酵素活性は、脂肪酸鎖の何れか一方を、細胞膜を構成するリン脂質から切断すると考えられている。異なる基質切断特異性を有する他のホスホリパーゼが存在する。類似の酵素活性が微生物に存在し、微生物は多くの場合、病原性因子である。微生物が類似の酵素活性を有するとはいえ、この活性を生み出すタンパク質は異なっており、微生物と哺乳動物のＰＬＢＬ２酵素間の配列相同性は低い。ホスホリパーゼは、基質の加水分解生成物の一つである遊離脂肪酸（ＦＦＡ）を生成する。遊離脂肪酸はそれ自体、潜在的な免疫シグナル伝達因子である。脱水素化がＦＡＴを、エイコサノイドに関係する炎症カスケードに関与する可能性のあるアラキドン酸（ａｒａｃｈａｄｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）に変換する。
【０００９】
幾つかの組換えタンパク質調製物において、単一ＨＣＰ（ＣＨＯＰ）としてＰＬＢＬ２を特定したが、精製の様々な段階での細胞株又は複数の生産物中のＰＬＢＬ２レベルを、特異的、高感度且つ定量的に決定するための試薬、方法及びキットを有することが非常に有利であり、望ましいであろう。このような試薬、方法及びキットは、十分に一貫性があり、高感度で、特異的又は効率的な既存のアッセイが存在しない場合に特に必要とされる。本明細書に記載の発明は上記の特定の必要性を満たし、他のメリットも提供する。
【００１０】
特許出願及び特許公開を含む、本明細書に引用されるすべての参照文献は、その全体が参照により援用される。
【発明の概要】
【００１１】
本発明は、例えば組換えポリペプチド調製物又は宿主細胞株から得られる試料中のハムスターＰＬＢＬ２タンパク質の検出及び定量化のためのイムノアッセイ法における、抗ハムスターホスホリパーゼＢ様２（ＰＬＢＬ２）抗体とその使用に少なくとも部分的に基づいている。
【００１２】
したがって、一態様では、ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合する抗体が提供される。特定の実施態様において、抗体はモノクローナルである。特定の実施態様において、抗体は、ハムスターＰＬＢＬ２への特異的結合を示す。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域、並びに配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域、及び配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号１８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。特定の実施態様において、抗体は１９Ｃ１０である。
【００１３】
別の態様において、ハムスターホスホリパーゼＢ様２に結合する別の抗体が提供される。特定の実施態様において、抗体はモノクローナルである。特定の実施態様において、抗体は、ハムスターＰＬＢＬ２への特異的結合を示す。特定の実施態様において、抗体は、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域、並びに配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域、及び配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。特定の実施態様において、抗体は、配列番号３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。幾つかの実施態様において、抗体は１５Ｇ１１である。
【００１４】
更に別の態様において、ハムスターホスホリパーゼＢ様２タンパク質に結合するポリクローナル抗体が提供される。特定の実施態様において、ポリクローナル抗体はウサギである。
【００１５】
更に別の態様において、ハムスターホスホリパーゼＢ様２タンパク質（ＰＬＢＬ２）を検出するためのイムノアッセイ法が提供される。特定の実施態様において、組換えポリペプチド調製物又は宿主細胞株からの試料が得られる。特定の実施態様において、方法は、（ａ）ハムスターＰＬＢＬ２に結合する一次捕捉抗体を試料と接触させ、それにより試料−捕捉抗体結合材料を作成すること、（ｂ）ハムスターＰＬＢＬ２に結合する二次検出抗体を試料−捕捉抗体結合材料に接触させること、及び（ｃ）試料−捕捉抗体結合材料に結合した二次抗体を検出することを含む。幾つかの実施態様において、捕捉抗体は、結合に関して検出抗体と競合しない。幾つかの実施態様において、捕捉抗体は、検出抗体とは異なるエピトープに結合する。特定の実施態様において、結合した二次検出抗体のレベルは、標準的な滴定曲線を用いて定量化される。特定の実施態様において、試料中に存在するハムスターＰＬＢＬ２の量は、結合した二次検出抗体のレベルに基づいて算出される。幾つかの実施態様では、イムノアッセイは電気化学発光（ＥＣＬ）アッセイである。幾つかの実施態様では、イムノアッセイはサンドイッチアッセイである。幾つかの実施態様では、サンドイッチアッセイは、酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）である。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域、並びに配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域、及び配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は、配列番号１３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号１８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。特定の実施態様において、捕捉抗体は１９Ｃ１０である。特定の実施態様において、捕捉抗体はポリクローナルである。特定の実施態様において、ポリクローナル捕捉抗体はウサギである。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１、配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２、及び配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３を含む可変重鎖領域、並びに配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域、及び配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む可変領域を含む。特定の実施態様において、検出抗体は、配列番号３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。幾つかの実施態様において、検出抗体は１５Ｇ１１である。特定の実施態様において、検出抗体はポリクローナルである。特定の実施態様において、ポリクローナル検出抗体はウサギである。特定の実施態様において、検出抗体は、ビオチンにコンジュゲートされている。特定の実施態様において、検出抗体は、ホースラディッシュペルオキシダーゼにコンジュゲートされている。
【００１６】
上記の方法の特定の実施態様において、組換えポリペプチド調製物又は宿主細胞株は、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞株から得られる。特定の実施態様において、組換えポリペプチド調製物は収集細胞培養液（ｈａｒｖｅｓｔｅｄ  ｃｅｌｌ  ｃｕｌｔｕｒｅ  ｆｌｕｉｄ）（ＨＣＣＦ）である。特定の実施態様において、組換えポリペプチド調製物は一又は複数のクロマトグラフィー精製工程に供されている。特定の実施態様において、組換えポリペプチド調製物は最終精製産物である。幾つかの実施態様において、最終精製産物は原体である。
【００１７】
上記方法の更なる特定の実施態様において、組換えポリペプチド調製物中の組換えポリペプチドは、抗体又はイムノアドヘシンである。特定の実施態様では、抗体は、多重特異性抗体、二重特異性抗体、半抗体又は抗体断片である。幾つかの実施態様において、組換えポリペプチドはＩｇＧである。幾つかの実施態様において、組換えポリペプチドは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４から選択される。幾つかの実施態様において、組換えポリペプチドはＩｇＧ１である。幾つかの実施態様において、組換えポリペプチドはＩｇＧ４である。
【００１８】
更に別の態様では、ハムスターＰＬＢＬ２の検出のためのイムノアッセイキットが提供される。特定の実施態様では、キットは、上記の捕捉抗体の何れかによる捕捉抗体、及び上記の検出抗体の何れかによる検出抗体を含む。幾つかの実施態様では、イムノアッセイは、ＥＣＬイムノアッセイである。幾つかの実施態様では、イムノアッセイは、ＥＬＩＳＡイムノアッセイである。
【００１９】
一態様では、宿主細胞株から得られる試料中のＰＬＢＬ２を検出することを含む、ハムスターＰＬＢＬ２の発現のための宿主細胞株のスクリーニング方法が提供される。特定の実施態様では、ＰＬＢＬ２は、ハムスターＰＬＢＬ２の検出のための上記のイムノアッセイ法の何れかを用いることにより試料中に検出される。幾つかの実施態様では、試料は収集細胞培養液である。幾つかの実施態様では、試料  全細胞培養液である。特定の実施態様において、方法は、上記のイムノアッセイ法及び算出方法を用いて試料中のハムスターＰＬＢＬ２の量を算出することを更に含む。
【００２０】
別の態様において、低量のハムスターＰＬＢＬ２を発現する最適な宿主細胞株を、二以上の宿主細胞株から成る群より選択する方法が提供される。幾つかの実施態様において、最適な宿主細胞株は、三以上の宿主細胞株から成る群、又は五以上の宿主細胞株から成る群、又は１０以上の宿主細胞株から成る群、又は２０以上の宿主細胞株から成る群より選択される。特定の実施態様では、方法は、（ｉ）二以上の宿主細胞株の各々から宿主細胞株を得ること、（ｉｉ）各宿主細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を、上記のイムノアッセイ法及び算出方法を用いて算出すること、（ｉｉｉ）各宿主細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を、その群の各宿主細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量と比較すること、（ｉｖ）その群の各宿主細胞株試料と比較して最低量のＰＬＢＬ２を有する宿主細胞株試料を特定し、それにより最低量のＰＬＢＬ２を含む群から特定された宿主細胞株を作製し、（ｉｖ）の特定された宿主細胞株を最適な宿主細胞株として選択することを含む。幾つかの実施態様では、二以上の宿主細胞株の各々は、ＣＨＯ細胞株である。幾つかの実施態様では、宿主細胞株試料の各々は収集細胞培養液である。幾つかの実施態様では、宿主細胞株試料の各々は全細胞培養液である。
【００２１】
更に別の態様では、生産物細胞株である組換えポリペプチド発現細胞株を、ハムスターＰＬＢＬ２の発現についてスクリーニングする方法であって、生産物細胞株から得られる試料中のＰＬＢＬ２を検出することを含む方法が提供される。特定の実施態様では、ＰＬＢＬ２は、ハムスターＰＬＢＬ２の検出のための上記のイムノアッセイ法の何れかを用いることにより試料中に検出される。特定の実施態様において、方法は、上記のイムノアッセイ法及び算出方法を用いることを更に含む。幾つかの実施態様において、方法は、試料中の生産物を検出し、生産物の量を定量化することによって生産物の発現についてスクリーニングすることを更に含む。幾つかの実施態様において、生産物の検出及び生産物の量の定量化は、分光光度測定法又はアフィニティークロマトグラフィー法を含む。
【００２２】
また更なる別の態様において、ハムスターＰＬＢＬ２を低量且つ生産物を大量に発現する最適な組換えポリペプチド発現細胞株を、二以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群より選択する方法であって、二以上の組換えポリペプチド発現細胞株の各々が同じ生産物を発現する生産物細胞株である方法が提供される。幾つかの実施態様において、最適な組換えポリペプチド発現細胞株は、三以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群、又は五以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群、又は１０以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群、又は２０以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群、又は４０以上の組換えポリペプチド発現細胞株から成る群より選択される。特定の実施態様では、方法は、（ｉ）二以上の生産物細胞株の各々から一つの生産物細胞株試料を得ること、（ｉｉ）各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を、上記のイムノアッセイ法及び算出方法を用いて算出すること、（ｉｉｉ）各生産物細胞株試料中の生産物を検出し、生産物の量を定量すること、（ｉｖ）各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２量を、その群の各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２量と比較すること、（ｖ）各生産物細胞株試料中の生産物の量を、その群の各生産物細胞株試料中の生産物の量と比較すること、（ｖｉ）その群の各生産物細胞株試料と比較して最低量のＰＬＢＬ２且つ最高量の生産物を有する生産物細胞株試料を特定し、それにより最低量のＰＬＢＬ２且つ最高量の生産物を有する群から特定された生産物細胞株を作製し、（ｖｉ）の特定された生産物細胞株を最適な生産物細胞株として選択することを含む。特定の実施態様では、方法は、（ｉ）二以上の生産物細胞株の各々から一つの生産物細胞株試料を得ること、（ｉｉ）各生産物細胞株試料中のＰＬＢＬ２の量を、上記のイムノアッセイ法及び算出方法を用いて算出すること、（ｉｉｉ）各生産物細胞株試料中の生産物を検出し、生産物の量を定量化すること、（ｉｖ）各生産物細胞株試料中について、生産物の量に対するＰＬＢＬ２量の比率を算出すること、（ｖ）各生産物細胞株試料について算出した比率を、その群の各生産物細胞株試料と比較すること、（ｖｉ）その群の最も低い比率を有する生産物細胞株試料を特定し、それにより最低量のＰＬＢＬ２且つ最高量の生産物を有する群から特定された生産物細胞株を作製し、（ｖｉ）の特定された生産物細胞株を最適な生産物細胞株として選択することを含む。幾つかの実施態様では、二以上の生産物細胞株の各々は、ＣＨＯ細胞株である。幾つかの実施態様では、生産物細胞株試料の各々は収集細胞培養液である。
【００２３】
上記方法の更なる特定の実施態様において、組換えタンパク質発現細胞株により発現される生産物は抗体又はイムノアドヘシンである。特定の実施態様では、抗体は、多重特異性抗体、二重特異性抗体、半抗体又は抗体断片である。幾つかの実施態様において、生産物はＩｇＧである。幾つかの実施態様において、生産物は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４から選択される。幾つかの実施態様において、生産物はＩｇＧ１である。幾つかの実施態様において、生産物はＩｇＧ４である。
【図面の簡単な説明】
【００２４】
【図１】実施例１に記載の市販のＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡキットの代表的な検量線を示す。（Ａ）ＵＳＣＮ  ＥＬＩＳＡキットを用いて作成された検量線；（Ｂ）ＣＵＳＡＢＩＯ  ＥＬＩＳＡキットを用いて作成された検量線。
【図２】実施例３に記載のマウスモノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの代表的な検量線を示す。
【図３】実施例４に記載のＬＣ−ＭＳ／ＭＳによりモニターされた各ＰＬＢＬ２ペプチドの代表的な検量線を示す。各検量線の直線性（Ｒ）は、＞０．９９である。
【図４】実施例４に記載の異なるｍＡｂ  ＨＣＣＦ試料におけるＰＬＢＬ２比率（単位：ｐｐｍ）を示す。同一のｍＡｂ試験からの複製試験は、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３により示される。
【図５】実施例４に記載のｍＡｂ  Ｇのインプロセスプール試料において測定されたＰＬＢＬ２クリアランスを示す。
【図６】実施例５に記載のウサギポリクローナル  ＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの代表的な検量線を示す。
【図７】実施例６に記載のｍＡｂ  Ｇのインプロセスプール試料において測定されたＰＬＢＬ２クリアランスを示す。
【図８Ａ−Ｄ】実施例７に記載の（Ａ）生産物Ｊ、（Ｂ）生産物Ｋ、（Ｃ）生産物Ｌ、（Ｄ）生産物Ｍを発現する組換えＣＨＯ細胞株におけるトータルＣＨＯＰ（ｇ／Ｌ）、ＰＬＢＬ２（ｍｇ／Ｌ）及び生産物濃度（ｇ／Ｌ）を示す；クローン細胞株の番号を横軸に沿って示す。すべての測定値は、１４日目のＨＣＣＦ試料を用いて得られた。エラーバーは、重複２Ｌバイオリアクター培養物から得られた最大測定値及び最小測定値を示す。
【図８Ｅ−Ｆ】実施例７に記載の（Ｅ）生産物Ｎ、及び（Ｆ）生産物Ｏを発現する組換えＣＨＯ細胞株におけるトータルＣＨＯＰ（ｇ／Ｌ）、ＰＬＢＬ２（ｍｇ／Ｌ）及び生産物濃度（ｇ／Ｌ）を示す；クローン細胞株の番号を横軸に沿って示す。すべての測定値は、１４日目のＨＣＣＦ試料を用いて得られた。エラーバーは、重複２Ｌバイオリアクター培養物から得られた最大測定値及び最小測定値を示す。
【図９Ａ−Ｂ】実施例７に記載の（Ａ）生産物Ｊ、（Ｂ）生産物Ｋを発現する組換えＣＨＯ細胞株におけるＰＬＢＬ２（ｍｇ／Ｌ）の生産物濃度（ｇ／Ｌ）に対する比率を示す；クローン細胞株の番号を横軸に沿って示す。この比率は、パーツ・パー・ミリオン（ｐｐｍ）で示され、ｍｇの生産物に対するｎｇのＰＬＢＬ２に相当する。エラーバーは、重複２Ｌバイオリアクター培養物由来の１４日目のＨＣＣＦから得られた最大測定値及び最小測定値を示す。
【図９Ｃ−Ｆ】実施例７に記載の（Ｃ）生産物Ｌ、（Ｄ）生産物Ｍ、（Ｅ）生産物Ｎ、及び（Ｆ）生産物Ｏを発現する組換えＣＨＯ細胞株におけるＰＬＢＬ２（ｍｇ／Ｌ）の生産物濃度（ｇ／Ｌ）に対する比率を示す；クローン細胞株の番号を横軸に沿って示す。この比率は、パーツ・パー・ミリオン（ｐｐｍ）で示され、ｍｇの生産物に対するｎｇのＰＬＢＬ２に相当する。エラーバーは、重複２Ｌバイオリアクター培養物由来の１４日目のＨＣＣＦから得られた最大測定値及び最小測定値を示す。
【図１０】図１０は、実施例７に記載の生産物Ｐを発現する４８の細胞株の単一（ｓｉｎｇｌｉｃａｔｅ）振盪フラスコ培養物におけるＰＬＢＬ２／生産物比率（ｐｐｍ）を示す；クローン細胞株の番号を横軸に沿って示す。この比率は、パーツ・パー・ミリオン（ｐｐｍ）で示され、ｍｇの生産物に対するｎｇのＰＬＢＬ２に相当する。すべての測定値は、１４日目のＨＣＣＦ試料を用いて得られた。
【図１１】実施例７に記載の生産物Ｐを発現する４８の細胞株の培養物における、ＰＬＢＬ２（ｍｇ／Ｌ）、トータルＣＨＯＰ（ｇ／Ｌ）及び生産物濃度（ｇ／Ｌ）を示す。これら三つの測定値間の相関関係が、（Ａ）生産物濃度に対するＰＬＢＬ２、（Ｂ）生産物濃度に対するトータルＣＨＯＰ、及び（Ｃ）トータルＣＨＯＰ濃度に対するＰＬＢＬ２をプロッティングすることにより評価された。すべての測定値は、１４日目のＨＣＣＦ試料を用いて得られた。各細胞株は、単一振盪フラスコ中で培養された。方程式は、線形回帰及び決定係数（Ｒ２）を表す。
【図１２】実施例７に記載の如何なる生産物遺伝子も発現しない３つのＣＨＯ宿主細胞株（宿主１、宿主２及び宿主３）の２Ｌバイオリアクター培養物におけるＰＬＢＬ２濃度を示す。ＰＬＢＬ２レベルは、これらの空試験から得られた（Ａ）ＨＣＣＦ試料及び（Ｂ）ＷＣＣＦ試料の双方において測定された。
【図１３】実施例７に記載の積算生存血中血球容積（ｖｏｌｕｍｅｔｒｉｃ  ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ  ｖｉａｂｌｅ  ｐａｃｋｅｄ  ｃｅｌｌ  ｖｏｌｕｍｅ）（ＩＶＰＣＶ）の関数としての３つのＣＨＯ宿主細胞株（宿主１、宿主２及び宿主３）の２Ｌバイオリアクター培養物におけるＰＬＢＬ２濃度を示す。ＰＬＢＬ２レベルは、これらの空試験から得られた（Ａ）ＨＣＣＦ試料及び（Ｂ）ＷＣＣＦ試料の双方において測定された。方程式は、線形回帰及び決定係数（Ｒ２）を表す。線形回帰の傾きは、日ごと単位生細胞体積当たりの細胞特異的ＰＬＢＬ２生産力の推定値を示す。
【発明を実施するための形態】
【００２５】
特に定義しない限り、本明細書で使用される技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって通常理解されるのと同じ意味を有する。Singleton et al., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology 2nd ed., J. Wiley & Sons (New York, N.Y. 1994), 及びMarch, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure 4th ed., John Wiley & Sons (New York, N.Y. 1992)は、本願で使用される多くの用語に対する一般的な指針を当業者に提供する。
【００２６】
特定の定義
本明細書の説明のために以下の定義を適用し、単数形で用いられる用語は、適切な場合は常に、複数形を含み、その逆の場合も同じである。以下に記載の如何なる定義も、参照により本明細書に援用される任意の文書と矛盾する場合には、以下に記載する定義が優先するものとする。
【００２７】
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、文脈が明らかにそうでないことを表していない限り複数の対象物を含む。したがって、例えば、「タンパク質」又は「抗体」への言及は、それぞれ複数のタンパク質又は抗体を含み、「細胞」への言及は、細胞の混合物等を含む。
【００２８】
用語「検出（すること）」は、本明細書では最も広い意味で使用され、標的分子の定性的及び定量的測定の双方を含む。検出は、試料中の標的分子の単なる存在を特定するだけでなく、標的分子が検出可能なレベルで試料中に存在するかどうかを決定することを含む。
【００２９】
「試料」は、大量の材料のごく一部を指す。通常、本明細書に記載の方法に従った試験は、試料上で実施される。試料は、通常、例えば、本明細書では「生産物細胞株」とも称される培養された組換えポリペプチド発現細胞株から、又は培養された宿主細胞から得られた組換えポリペプチド調製物から得られる。本明細書で使用される場合、「宿主細胞」は、目的の組換えポリペプチド又は生産物の発現のための遺伝子を含有しない。試料は、例えば、限定されないが、収集細胞培養液から、精製プロセスの特定の工程におけるインプロセスプールから、又は最終精製産物から得られうる。
【００３０】
「捕捉抗体」は、試料中の標的分子に特異的に結合する抗体を指す。特定の条件下で捕捉抗体は、標的分子と複合体を形成し、その捕捉抗体‐標的分子複合体が試料の残りから分離されうる。特定の実施態様では、そのような分離は、捕捉抗体に結合しなかった試料中の物質又は材料を洗い流すことを含んでもよい。特定の実施態様では、捕捉抗体は、例えば、プレート又はビーズを含むがこれらに限定されない固体支持体に結合されてもよい。
【００３１】
「検出抗体」は、試料中又は試料−捕捉抗体結合材料中の標的分子に特異的に結合する抗体を指す。特定の条件下で検出抗体は、標的分子と、又は標的分子−捕捉抗体複合体と複合体を形成する。検出抗体は、増幅することができる標識を介して直接的に、或いは、例えば、標識され且つ検出抗体に結合する別の抗体の使用を介して間接的に検出されることが可能である。直接標識の場合、検出抗体は通常、例えば、ビオチン又はルテニウムを含むがこれらに限定されない幾つかの手段によって検出可能な部分にコンジュゲートされている。
【００３２】
用語「標識」又は「検出可能な標識」は、検出又は定量化すべき物質（例えば抗体）に結合することができる任意の化学基又は部分を指す。標識は通常、物質の高感度な検出又は定量化に適した検出可能な標識である。検出可能な標識の例は、限定されないが、発光標識（例えば、蛍光、リン光、化学発光、生物発光及び電気化学発光標識）、放射性標識、酵素、粒子、磁性体、電気活性種等を含む。或いは、検出可能な標識は、特異的結合反応に関与することにより、自身の存在を知らせることができる。そのような標識の例は、ハプテン、抗体、ビオチン、ストレプトアビジン、ｈｉｓタグ、ニトリロ三酢酸、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ、グルタチオン等を含む。
【００３３】
用語「検出手段」は、その時アッセイで読み出されるシグナル報告を介して検出可能な抗体の存在を検出するために使用される部分又は技術を指す。検出は、通常、例えばマイクロタイタープレート上に捕捉された標識といったような固定化された標識（例：アビジン又はストレプトアビジン‐ＨＲＰ）を増幅する試薬を用いることを意味する。
【００３４】
「フォトルミネッセンス」は、材料による光の吸収（或いは電磁波放射と呼ばれる）の後、材料が発光する過程を指す。蛍光とリン光は、二つの異なる種類のフォトルミネッセンスである。「化学発光」過程は、化学反応による発光種の生成を必要とする。「電気化学発光」又は「ＥＣＬ」は、例えば抗体等の種が、適切な周囲の化学的環境下で電気化学的エネルギーに曝露する際に発光する過程である。
【００３５】
用語「ポリペプチド」及び「タンパク質」は、本明細書においては、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指すために互換的に使用される。ポリマーは、直鎖状でも分枝状でもよく、修飾されたアミノ酸を含んでもよく、非アミノ酸が割り込んでいてもよい。この用語はまた、自然に又は介入により修飾されているアミノ酸ポリマーを包含しており、その例として、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、又は任意の他の操作若しくは修飾（例えば、標識化成分とのコンジュゲーション）が挙げられる。この定義には、例えば、アミノ酸（例えば、非天然アミノ酸等を含む）の一又は複数の類似体を含むポリペプチド、及び当該技術分野で知られている他の修飾も含まれる。本明細書で使用される用語「ポリペプチド」及び「タンパク質」は、特に抗体を包含する。
【００３６】
「精製された」ポリペプチド（例えば、抗体又はイムノアドヘシン）は、ポリペプチドが純度を増し、その天然の環境に存在するよりも、及び／又は実験室条件下で最初に合成及び／又は増幅された時よりも純粋な形態で存在することを意味する。純度は相対的な用語であって、絶対的な純度を必ずしも意味しない。
【００３７】
目的の抗原に「結合する」抗体、例えば宿主細胞タンパク質は、抗体がアッセイ試薬として（例えば、捕捉抗体として、又は検出抗体として）有用なほどに十分な親和性で抗原に結合する抗体である。通常、そのような抗体は、他のポリペプチドと有意に交差反応しない。
【００３８】
ポリペプチドの標的分子への結合に関して、「特異的結合」、又は特定のポリペプチド若しくは特定のポリペプチド標的上のエピトープと「特異的に結合する」又はそれに対して「特異的である」という用語は、非特異的相互作用とは測定可能な程度に異なる結合を意味する。特異的結合は、例えば、標的分子の結合をコントロール分子の結合との比較で決定することにより測定でき、コントロール分子は、一般に、結合活性を有さない類似構造の分子である。
【００３９】
「親和性」は、分子（例えば、抗体）の単一結合部位とその結合パートナー（例えば、抗原）との間の非共有結合性相互作用の総和の強度を指す。本明細書で使用する場合、特に断らない限り、「結合親和性」は、結合対（例えば、抗体と抗原）のメンバー間の１対１の相互作用を反映する固有の結合親和性を指す。分子ＸのそのパートナーＹに対する親和性は、一般的に解離定数（Ｋｄ）によって表すことができる。親和性は、本明細書に記載したものを含む、当該技術分野で知られている一般的な方法により測定することができる。
【００４０】
用語「抗ＰＬＢＬ２抗体」及び「ＰＬＢＬ２に結合する抗体」は、抗体が、ＰＬＢＬ２を標的とする際に薬剤（例えば、本明細書に記載のアッセイにおける薬剤）として有用であるほどに十分な親和性でＰＬＢＬ２（例えば、ハムスターＰＬＢＬ２）を結合することが可能な抗体を指す。一実施態様において、無関係な非ＰＬＢＬ２タンパク質に対する抗ＰＬＢＬ２抗体の結合の程度は、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）で測定される場合、ＰＬＢＬ２に対する抗体の結合のおよそ１０％未満である。特定の実施態様では、ＰＬＢＬ２に結合する抗体は、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、≦０．１ｎＭ、≦０．０１ｎＭ又は≦０．００１ｎＭ（例えば１０−８Ｍ以下、例えば１０−８Ｍから１０−１３Ｍ、例えば１０−９Ｍから１０−１３Ｍ）の解離定数（ＫＤ）を有する。
【００４１】
本明細書における用語「抗体」は最も広い意味で用いられ、様々な抗体構造を包含し、限定されないが、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異性抗体（例えば二重特異性抗体）、及び、所望の抗原結合活性を示す限り、抗体断片を含む。
【００４２】
抗体は、様々な構造を有する天然に存在する免疫グロブリン分子であり、すべてが免疫グロブリンフォールドに基づく。例えば、ＩｇＧ抗体は二つの「重」鎖及び二つの「軽」鎖を持ち、それらはジスルフィド結合され機能的抗体を形成する。各重鎖及び軽鎖自体は、「定常」（Ｃ）及び「可変」（Ｖ）領域を含む。Ｖ領域は抗体の抗原結合特異性を決定し、Ｃ領域は免疫エフェクターとの非抗原特異的相互作用において構造的サポート及び機能を提供する。抗体の抗原結合特異性又は抗体の抗原結合断片は、特定の抗原に特異的に結合する抗体の能力である。
【００４３】
抗体の抗原結合特異性は、可変すなわちＶ領域の構造的特性により決定される。用語「可変」とは、可変ドメインの特定の部分が、抗体間で広範に配列が異なり、各特定の抗体のその特定の抗原に対する結合及び特異性に利用されることを指す。しかしながら、可変性は、抗体の可変ドメイン全体にわたって均一に分布しているわけではない。可変性は、軽鎖及び重鎖可変ドメインの双方において、超可変領域と称される三つのセグメントに集中している。可変ドメインのより高度に保存されている部分は、フレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる。天然型の重鎖及び軽鎖の可変ドメインは四つのＦＲをそれぞれ含み、これらのＦＲは、主としてβシート構造をとり、三つの超可変領域によって結合されており、この三つの超可変領域は、βシート構造をつなぐループを形成し、場合によってはβシート構造の一部を形成するループを形成する。各鎖の超可変領域は、ＦＲによって極めて近接して結合され、他の鎖の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)参照）。定常ドメインは、抗体の抗原への結合に直接関連しているものではないが、例えば抗体依存性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）への抗体の関与等、種々のエフェクター機能を呈する。
【００４４】
用語「超可変領域」は、本明細書において使用される場合、抗原結合を担う抗体のアミノ酸残基を指す。超可変領域は、「相補性決定領域」すなわち「ＣＤＲ」由来のアミノ酸残基（例えば、ＶＬのおよそ２４−３４（Ｌ１）、５０−５６（Ｌ２）及び８９−９７（Ｌ３）周辺と、ＶＨのおよそ３１−３５Ｂ（Ｈ１）、５０−６５（Ｈ２）及び９５−１０２（Ｈ３）周辺(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991))及び／又は「超可変ループ」由来のアミノ酸残基（例えば、ＶＬの残基２６−３２（Ｌ１）、５０−５２（Ｌ２）及び９１−９６（Ｌ３）と、ＶＨの２６−３２（Ｈ１）、５２Ａ−５５（Ｈ２）及び９６−１０１（Ｈ３）(Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987))を含み得る。
【００４５】
「フレームワーク」又は「ＦＲ」残基は、本明細書で定義している超可変領域残基以外の可変ドメイン残基である。
【００４６】
「抗体断片」は、インタクトな抗体の一部を含み、好ましくはその抗原結合領域を含む。抗体断片の例は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２及びＦｖ断片；ダイアボディ；タンデムダイアボディ（ｔａＤｂ）；直鎖状抗体（例えば、米国特許第５６４１８７０号、実施例２；Zapata et al., Protein Eng. 8(10):1057-1062 (1995))；１アーム抗体、単一可変ドメイン抗体、ミニボディ、単鎖抗体分子；抗体断片から形成された多重特異性抗体（例えば、Ｄｂ−Ｆｃ、ｔａＤｂ−Ｆｃ、ｔａＤｂ−ＣＨ３、（ｓｃＦＶ）４−Ｆｃ、ｄｉ−ｓｃＦｖ、ｂｉ−ｓｃＦｖ又はタンデム（ｄｉ，ｔｒｉ）−ｓｃＦｖを含むがこれらに限定されない）；及び二重特異性Ｔ細胞エンゲージャー（ＢｉＴＥ）を含む。
【００４７】
抗体のパパイン消化は、「Ｆａｂ」断片と呼ばれ、各々が単一の抗原結合部位を持つ二つの同一の抗体結合断片と、その名称が容易に結晶化する能力を反映している残りの「Ｆｃ」断片を生成する。ペプシン処理により、二つの抗原結合部位を持ち、抗原を尚も架橋可能なＦ（ａｂ’）２断片が得られる。
【００４８】
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識及び抗原結合部位を含む最小抗体断片である。この領域は、堅固な非共有結合をなした一つの重鎖及び一つの軽鎖可変ドメインの二量体から成る。各可変ドメインの三つの超可変領域が相互作用してＶＨ−ＶＬ二量体の表面に抗原結合部位を既定するのは、この構造においてである。合計で六つの超可変領域が抗原結合特異性を抗体に付与する。とはいえ、単一の可変ドメイン（又は抗原に対して特異的な三つの超可変領域のみを含むＦｖの半分）であっても、全結合部位よりも低い親和性でではあるが、抗原を認識して結合する能力を有している。
【００４９】
またＦａｂ断片は、軽鎖の定常ドメインと重鎖の第一定常領域（ＣＨ１）を含む。Ｆａｂ’断片は、抗体ヒンジ領域からの一又は複数のシステインを含む重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシ末端に数個の残基が付加されている点でＦａｂ断片とは異なる。Ｆａｂ’−ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基が少なくとも一の遊離チオール基を有しているＦａｂ’に対するここでの命名である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片はもともと、間にヒンジシステインを有するＦａｂ’断片の対として産生された。抗体断片の他の化学結合も知られている。
【００５０】
任意の脊椎動物種からの抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」には、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいてカッパ（κ）及びラムダ（λ）と呼ばれる二つの明確に区別される型の一つを割り当てることができる。
【００５１】
抗体には、その重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、異なる「クラス」を割り当てることができる。インタクトな抗体には五つの主要なクラス：ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭがあり、これらの幾つかは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩＧＡ及びＩｇＡ２等のサブクラス（アイソタイプ）に更に分かれる。抗体の異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、及びμと呼ばれる。異なるクラスの免疫グロブリンのサブユニット構造及び三次元構造はよく知られている。
【００５２】
「単鎖Ｆｖ」又は「ｓｃＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨドメイン及びＶＬドメインを含み、これらのドメインは、単一のポリペプチド鎖に存在する。幾つかの実施態様では、Ｆｖポリペプチドは、ｓｃＦｖが抗原結合にとって望ましい構造を形成するのを可能にするポリペプチドリンカーをＶＨドメインとＶＬドメインの間に更に含む。ｓｃＦｖの概説については、Pluckthun, The Pharmacology of Monoclonal  Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)を参照のこと。
【００５３】
用語「ダイアボディ」は、二つの抗原結合部位を持つ小さい抗体断片を指し、この断片は、同一ポリペプチド鎖（ＶＨ−ＶＬ）において軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）と連結した重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。同じ鎖上のこの二つのドメイン間に対形成するには短すぎるリンカーを用いることにより、これらのドメインを別の鎖の相補的ドメインと強制的に対形成させ、二つの抗原結合部位を作り出す。ダイアボディは、例えば、ＥＰ４０４０９７号；国際公開第９３／０１１６１号；及びHollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)に更に詳細に記載されている。
【００５４】
用語「多重特異性抗体」は最も広い意味で用いられ、特にポリエピトープ特異性を有する（すなわち、一生体分子上の二以上の異なるエピトープに特異的に結合することができるか、又は二以上の異なる生体分子上のエピトープに特異的に結合することができる）抗原結合ドメインを含む抗体を包含する。幾つかの実施態様では、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）の抗原結合ドメインは二つのＶＨ／ＶＬユニットを含み、第一のＶＨ／ＶＬユニットは第一のエピトープに特異的に結合し、第二のＶＨ／ＶＬユニットは第二のエピトープに特異的に結合し、各ＶＨ／ＶＬユニットは重鎖可変ドメイン（ＶＨ）及び軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む。このような多重特異性抗体は、完全長抗体、二以上のＶＬ及びＶＨドメインを有する抗体、Ｆａｂ、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、ｓｃＦｖ、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ及びトリアボディ（ｔｒｉａｂｏｄｙ）、共有結合又は非共有結合した抗体断片を含むがこれらに限定されない。少なくとも重鎖定常領域の一部及び／又は少なくとも軽鎖定常領域の一部を更に含むＶＨ／ＶＬユニットは、「ヘミマー」又は「半抗体」と呼ばれることもある。「ポリエピトープ特異性」とは、同じか異なる標的（複数可）上の二以上の異なるエピトープに特異的に結合する能力を指す。「単一特異性」は唯一つのエピトープに結合する能力を指す。一実施態様によると、多重特異性は、５μＭから０．００１ｐＭ、３μＭから０．００１ｐＭ、１μＭから０．００１ｐＭ、０．５μＭから０．００１ｐＭ、又は０．１μＭから０．００１ｐＭの親和性で各エピトープと結合するＩｇＧ抗体である。
【００５５】
「二重特異性抗体」とは、一生体分子上の二の異なるエピトープに特異的に結合することができるか、又は二の異なる生体分子上のエピトープに特異的に結合することができる抗原結合ドメインを含む多重特異性抗体である。本明細書において二重特異性抗体は、「二重特異性」を有する、又は「二重特異的」である、とも言われる。
【００５６】
「単一ドメイン抗体」（ｓｄＡｂ）又は「単一可変ドメイン（ＳＶＤ）抗体」なる表現は、単一可変ドメイン（ＶＨ又はＶＬ）が抗原結合を付与することができる抗体を一般に指す。言い換えると、単一可変ドメインは、標的抗原を認識するために別の可変ドメインと相互作用する必要がない。単一ドメイン抗体の例は、ラクダ科（ラマ及びラクダ）及び軟骨魚類（例えばコモリザメ）に由来するもの、並びにヒト及びマウス抗体に由来し、組換え法から得られるものを含む(Nature(1989)341:544-546;Dev Comp Immunol(2006)30:43-56;Trend Biochem Sci(2001)26:230-235;Trends Biotechnol(2003):21:484-490；国際公開第２００５／０３５５７２号；国際公開第０３／０３５６９４号；Febs Lett(1994)339:285-290；国際公開第００／２９００４号；国際公開第０２／０５１８７０号）。
【００５７】
本明細書で使用される用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指し、すなわち一般的に少量で存在しうる突然変異体等の、モノクローナル抗体の生成中に生じる可能性のある突然変異体を除いて、集団を構成する個々の抗体が同一であり、及び／又は同じエピトープに結合する。異なる決定基（エピトープ）に対する異なる抗体を通常含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対するものである。モノクローナル抗体は、その特異性に加えて、他の免疫グロブリンが混入していないという点で有利である。修飾語「モノクローナル」は、実質的に均一な抗体集団から得られているという抗体の特徴を示し、抗体を何か特定の方法で作製しなければならないことを意味するものではない。例えば、本明細書において提供される方法に従って使用されるモノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature 256:495 (1975)により最初に記載されたハイブリドーマ法により作製されてもよく、又は組換えＤＮＡ法（例えば、米国特許第４８１６５６７号参照）により作製されてもよい。「モノクローナル抗体」はまた、例えば、Clackson et al., Nature 352:624-628 (1991)及びMarks et al., J. Mol. Biol. 222:581-597 (1991)に記載されている技術を用いてファージ抗体ライブラリーから単離されてもよい。
【００５８】
本明細書においてモノクローナル抗体は、重鎖及び／又は軽鎖の一部分が特定の種に由来する抗体又は特定の抗体クラス若しくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一又は相同であるが、鎖（複数可）の残りの部分が別の種に由来する抗体又は別の抗体クラス若しくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一又は相同である「キメラ」抗体（免疫グロブリン）、並びに、所望の生物活性を呈する限りはそのような抗体の断片を特に含む（米国特許第４８１６５６７号；及びMorrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984））。本明細書において、目的のキメラ抗体は、非ヒト霊長類（例えば、ヒヒ、アカゲザル、カニクイザル等の旧世界サル）に由来する可変ドメイン抗原結合配列及びヒト定常領域配列を含む「霊長類化」抗体を含む（米国特許第５６９３７８０号）。
【００５９】
本明細書の目的のためには、「インタクトな抗体」は重及び軽可変ドメイン並びにＦｃ領域を含む抗体である。定常ドメインは、天然配列定常ドメイン（例えば、ヒト天然配列定常ドメイン）又はそのアミノ酸配列変異体でありうる。好ましくは、インタクトな抗体は、一又は複数のエフェクター機能を有する。
【００６０】
「天然抗体」は、通常、二つの同一の軽（Ｌ）鎖及び二つの同一の重（Ｈ）鎖から成る、約１５００００ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。各軽鎖は一つの共有ジスルフィド結合により重鎖に結合しており、ジスルフィド結合の数は、異なった免疫グロブリンアイソタイプの重鎖間で変化する。また各重鎖と軽鎖は、規則的に離間した鎖内ジスルフィド架橋を有している。各重鎖は一端に可変ドメイン（ＶＨ）を有し、それに続いて複数の定常ドメインがある。各軽鎖は、一端に可変ドメイン（ＶＬ）を、他端に定常ドメインを有する。軽鎖の定常ドメインは重鎖の第一定常ドメインと平行に並び、軽鎖可変ドメインは重鎖の可変ドメインと平行に並んでいる。特定のアミノ酸残基は、軽鎖及び重鎖可変ドメイン間の境界面を形成すると考えられる。
【００６１】
「ネイキッド抗体」は、検出部分又は標識等の異種分子とコンジュゲートされていない抗体（本明細書に定義されている）である。
【００６２】
用語「宿主細胞」、「宿主細胞株」及び「宿主細胞培養物」は互換的に使用され、外因性の核酸が導入された細胞を指し、そのような細胞の子孫を含む。宿主細胞は、「形質転換体」及び「形質転換細胞」を含み、継代の数に関係なく、それに由来する初代形質転換細胞及び子孫を包含する。子孫は、親細胞と核酸含量が完全に同一でなくてもよく、変異を含有していてもよい。本明細書には、最初に形質転換された細胞においてスクリーニングされたか又は選択されたものと同じ機能又は生物活性を有する突然変異体子孫が含まれる。
【００６３】
用語「夾雑物」及び「不純物」は本明細書では互換的に使用され、所望のポリペプチド産物とは異なる材料又は物質を指す。夾雑物は、ＣＨＯＰ等の宿主細胞材料；浸出プロテインＡ；核酸；所望のポリペプチドの変異体、断片、凝集体又は誘導体；他のポリペプチド；エンドトキシン；ウイルス夾雑物；細胞培養培地成分等を含むがこれらに限定されない。幾つかの例において、夾雑物は、例えば、大腸菌細胞等の細菌細胞、昆虫細胞、原核細胞、真核細胞、酵母細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞等の哺乳動物細胞Ｉ、鳥類細胞、真菌細胞であるがこれらに限定されない。
【００６４】
「単離された」核酸とは、その自然環境の成分から分離された核酸分子を指す。単離された核酸は、核酸分子を通常含有する細胞中に含まれる核酸分子を含むが、その核酸分子は、染色体外又はその天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在している。
【００６５】
「抗ＰＬＢＬ２抗体をコードする単離された核酸」とは、抗体重鎖及び軽鎖をコードする一又は複数の核酸分子（又はその断片）指し、単一のベクター又は別々のベクター中のそのような核酸分子（複数可）、及び宿主細胞中の一又は複数の位置に存在するそのような核酸分子を含む。
【００６６】
参照ポリペプチド配列に関する「アミノ酸配列同一性パーセント（％）」は、配列を整列させ、最大の配列同一性パーセントを得るために必要ならば間隙を導入した後、如何なる保存的置換も配列同一性の一部と考えないとした、参照ポリペプチド配列のアミノ酸残基と同一である候補配列のアミノ酸残基のパーセントとして定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアライメントは、例えばＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ−２、ＡＬＩＧＮ又はＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェアのような公的に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用する、当業者の技量の範囲内の種々の方法で達成可能である。当業者であれば、比較される配列の完全長にわたって最大の整列を達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、配列を整列させるための適切なパラメーターを決定することができる。特定の実施態様では、アミノ酸配列同一性％の値は、配列比較コンピュータプログラムＡＬＩＧＮ−２を使用することによって生成される。ＡＬＩＧＮ−２配列比較コンピュータプログラムはジェネンテック社により著作され、そのソースコードが米国著作権庁（Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ  Ｄ．Ｃ．，２０５５９）に使用者用書類とともに提出され、米国著作権登録番号ＴＸＵ５１００８７の下で登録されている。ＡＬＩＧＮ−２は、ジェネンテック社（Ｓｏｕｔｈ  Ｓａｎ  Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）から公的に入手可能であり、又はそのソースコードからコンパイルすることもできる。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、デジタルＵＮＩＸ（登録商標）のＶ４．０Ｄを含むＵＮＩＸ（登録商標）オペレーティングシステムでの使用のためにコンパイルされる。すべての配列比較パラメーターは、ＡＬＩＧＮ−２プログラムによって設定され、変動しない。
【００６７】
アミノ酸配列比較にＡＬＩＧＮ−２が用いられる状況では、与えられたアミノ酸配列Ａの、与えられたアミノ酸配列Ｂとの、又はそれに対するアミノ酸配列同一性％（或いは、与えられたアミノ酸配列Ｂと、又はそれに対してある程度の％のアミノ酸配列同一性を持つか又は含む、与えられたアミノ酸配列Ａと言うこともできる）は次のように計算される：
１００×分率Ｘ／Ｙ
【００６８】
上式中、Ｘは、配列アラインメントプログラムＡＬＩＧＮ−２のＡ及びＢのアライメントによって完全一致を記録したアミノ酸残基の数であり、Ｙは、Ｂ中の全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの長さと異なる場合、ＡのＢに対するアミノ酸配列同一性％は、ＢのＡに対するアミノ酸配列同一性％とは異なることは理解されるであろう。特に断らない限り、本明細書で使用されるすべてのアミノ酸配列同一性％の値は、ＡＬＩＧＮ−２コンピュータプログラムを使用し、直前の段落で説明したようにして得られる。
【００６９】
用語「可変領域」又は「可変ドメイン」は、抗体の抗原への結合に関与する抗体の重鎖又は軽鎖のドメインを指す。天然型抗体の重鎖及び軽鎖の可変ドメイン（それぞれＶＨ及びＶＬ）は通常、各々が四つの保存されたフレームワーク領域（ＦＲ）と三つの超可変領域（ＨＶＲ）とを含む類似構造を有する。（例えば、Kindt et al., Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., page 91 (2007)を参照されたい。）単一のＶＨ又はＶＬドメインは、抗原結合特異性を付与するのに十分でありうる。更に、特定の抗原を結合する抗体は、相補性ＶＬ又はＶＨドメインそれぞれのライブラリーをスクリーニングするために、抗原に結合する抗体からのＶＨ又はＶＬドメインを用いて単離されてもよい。例えば、Portolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991)を参照のこと。
【００７０】
本明細書で使用される場合、用語「ベクター」は、それが結合している別の核酸を伝播することができる核酸分子を指す。この用語は、自己複製核酸構造としてのベクター、及びそれが導入された宿主細胞のゲノムに組み込まれたベクターを含む。特定のベクターは、自身が作動可能に結合している核酸の発現を指令することができる。本明細書でこのようなベクターは、「発現ベクター」と称される。
【００７１】
本明細書中の「およそ」の値又はパラメーターへの言及は、その値又はパラメーター自体に関する変動を含む（記載する）。例えば、「およそＸ」に言及する記載は、「Ｘ」の記載を含む。
【００７２】
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、文脈が明らかにそうでないことを表していない限り複数の対象物を含む。本明細書に記載される本発明の態様及び変形形態は、態様及び変形形態「から成る」及び／又は「から本質的に成る」ことを含む。
【００７３】
アッセイ法
本明細書に提供されるのは、ハムスターＰＬＢＬ２の検出及び定量化のためのイムノアッセイ法である。該方法が、例えばチャイニーズハムスター卵巣細胞等の宿主細胞中で産生された組換えポリペプチド調製物中のハムスターＰＬＢＬ２の検出及び定量化のために使用されうる。幾つかの実施態態様では、該方法は、本明細書に記載の捕捉及び検出用抗ＰＬＢＬ２抗体を使用する。幾つかの実施態態様では、抗体は、サンドイッチアッセイ、酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）、電気化学的アッセイ（ＥＣＬ）、磁気イムノアッセイを含むがこれらに限定されない、当該技術分野で知られている任意のイムノアッセイ法において使用される。特定の実施態様では、方法は、抗ＰＬＢＬ２抗体のハムスターＰＬＢＬ２への結合を許容する条件下で、本明細書に記載の抗ＰＬＢＬ２抗体と組換えポリペプチド調製物の試料を接触させることと、抗ＰＬＢＬ２抗体とハムスターＰＬＢＬ２との間に複合体が形成されているか否かを検出することとを含む。
【００７４】
特定の実施態様では、標識された抗ＰＬＢＬ２抗体が提供される。標識は、限定されないが、直接的に検出される標識又は部分（例えば、蛍光、化学発光及び放射性標識）、及び、例えば酵素反応若しくは分子相互作用を通して間接的に検出される酵素又はリガンドのような部分を含む。標識の例は、限定されないが、放射性同位体３２Ｐ、１４Ｃ、１２５Ｉ、３Ｈ及び１３１Ｉ、フルオロフォア（例えば、希土類キレート又はフルオレセイン及びその誘導体）、ローダミン及びその誘導体、ダンシル、ウンベリフェロン、ルシフェラーゼ（例えば、ホタルルシフェラーゼ及び細菌ルシフェラーゼ（米国特許第４７３７４５６号）、ルシフェリン、２，３−ジヒドロフタラジンジオン類、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖類オキシダーゼ（例えば、グルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ及びグルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ）、過酸化水素を用いて色素前駆体を酸化させる酵素（例えばＨＲＰ、ラクトペルオキシダーゼ又はミクロペルオキシダーゼ）と結合した複素環式オキシダーゼ（例えば、ウリカーゼ及びキサンチンオキシダーゼ）、ビオチン／アビジン、スピン標識、バクテリオファージ標識、安定なフリーラジカル等を含む。
【００７５】
特定の実施態様では、捕捉用抗ＰＬＢＬ２抗体は固相に固定化されている。幾つかの実施態様では、固定化に使用される固相は、例えば、表面、粒子、多孔性マトリックス、ビーズ等の形態の支持体を含めて、本質的に非水溶性であり、且つイムノメトリックアッセイにおいて有用である任意の不活性支持体又は担体である。一般的に使用される支持体の例は、小シート、ＳＥＰＨＡＤＥＸ（登録商標）、ゲル、ポリ塩化ビニル、プラスチックビーズ、及びポリエチレン、ポリプロピレン、ポリスチレン等から製造されたアッセイプレート又は試験管（９６ウェルマイクロタイタープレートを含む）、並びに紙、アガロース、架橋デキストラン及び他の多糖類等の粒子状材料を含む。或いは、米国特許第３９６９２８７号、同第３６９１０１６号、同第４１９５１２８号、同第４２４７６４２号、同第４２２９５３７号及同第４３３０４４０号に記述されている反応性非水溶性マトリックス、例えば臭化シアン活性化炭水化物及び反応基質が、捕捉試薬固定化に好適に用いられる。幾つかの実施態様では、固定化されている捕捉試薬は、一度に複数の試料を分析するために使用することができるマイクロタイタープレート上に被覆されている。  マイクロタイタープレートの例は、限定されないが、ＭＩＣＲＯＴＥＳＴ（登録商標）、ＭＡＸＩＳＯＲＰ（登録商標）、ＮＵＮＣ  ＭＡＸＩＳＯＲＢ（登録商標）及びＩＭＭＵＬＯＮ（登録商標）を含む。固相は上記の捕捉試薬で被覆され、この試薬は、必要に応じて非共有結合性若しくは共有結合性相互作用又は物理的結合によって結合されうる。結合のための技術は、米国特許第４３７６１１０号及びそこに引用されている文献に記載のものを含む。共有結合性の場合、プレート又は他の固相は、例えば室温で１時間というような当該技術分野で周知の条件下で、捕捉試薬及び架橋結合剤と共にインキュベートされる。幾つかの実施態様では、プレートはアッセイ自体にかなり先んじて積み重ねて被覆され、その後、手動、半自動、又はロボットを使用するなどした自動的な形式で幾つかの試料に対して同時にアッセイが実施される。
【００７６】
幾つかの実施態様では、遊離リガンドがプレートのウェル上の過剰部位に望ましくない結合をするのを防止するために、結合部位に非特異的に結合して結合部位を飽和させるブロッキング剤で被覆プレートを処理する。この目的に適したブロッキング剤の例は、限定されないが、例えば、ゼラチン、ウシ血清アルブミン、卵アルブミン、カゼイン及び脱脂乳を含む。一般的に、ブロッキング処理は、一定の期間、通常およそ１〜４時間、周囲温度の条件下で実施される。
【００７７】
幾つかの実施態様では、被覆及びブロッキングの後、分析される試料は適切に希釈され、固定化相に添加される。この目的のために希釈用に使用されうるバッファーの例は、限定されないが、（ａ）リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）であって、０．５％ＢＳＡ、０．０５％ＴＷＥＥＮ  ２０（登録商標）洗剤（Ｐ２０）、０．０５％ＰＲＯＣＬＩＮ（登録商標）３００抗生物質、５ｍＭのＥＤＴＡ、０．２５％の３−（（３−コラミドプロピル）ジメチルアンモニオ）−１−プロパンスルホナート（ＣＨＡＰＳ）界面活性剤、０．２％ベータ−ガンマグロブリン及び０．３５ＭのＮａＣｌを含有するもの；（ｂ）ＰＢＳであって、０．５％ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、０．０５％Ｐ２０及び０．０５％ＰＲＯＣＬＩＮ（登録商標）３００を含有するもの、ｐＨ７；（ｃ）ＰＢＳであって、０．５％ＢＳＡ、０．０５％Ｐ２０、０．０５％ＰＲＯＣＬＩＮ（登録商標）３００、５ｍＭ  ＥＤＴＡ及び０．３５ＭのＮａＣｌを含有するもの、ｐＨ６．３５；（ｄ）ＰＢＳであって、０．５％ＢＳＡ、０．０５％Ｐ２０、０．０５％ＰＲＯＣＬＩＮ（登録商標）３００、５ｍＭのＥＤＴＡ、０．２％ベータ−ガンマグロブリン及び０．３５ＭのＮａＣｌを含有するもの；並びに（ｅ）ＰＢＳであって、０．５％ＢＳＡ、０．０５％Ｐ２０、０．０５％ＰＲＯＣＬＩＮ（登録商標）３００、５ｍＭのＥＤＴＡ、０．２５％ＣＨＡＰＳ及び０．３５ＭのＮａＣｌを含有するものを含む。
【００７８】
試料と固定化捕捉試薬のインキュベーション条件は、アッセイの感度を最大にし、解離を最小にするように、且つ（例えば、ハムスターＰＬＢＬ２等）試料中に存在する任意の目的の分析物が固定化捕捉試薬に結合することを確実にするように選択される。任意選択的に、試料は、捕捉されていない材料を除去するために固定化捕捉試薬から（例えば、洗浄によって）分離される。洗浄に使用される溶液は、一般に、バッファー（例えば、「洗浄バッファー」）である。また、捕捉された目的の材料が次の工程である程度解離する懸念があれば、現在結合されている目的材料（例えば、ハムスターＰＬＢＬ２）が捕捉試薬に共有結合されるように、架橋剤又は他の適切な薬剤をこの段階で添加してもよい。
【００７９】
現在結合されている任意の目的材料と共に固定化されている捕捉試薬を、検出用抗ＰＬＢＬ２抗体と接触させる。幾つかの実施態様では、検出用抗体はビオチン化されている。幾つかの実施態様では、ビオチン化標識の検出手段は、アビジン又はストレプトアビジン−ＨＲＰである。幾つかの実施態様では、検出手段の読み出しは、蛍光定量的又は比色定量的である。
【００８０】
現在捕捉試薬に結合されている試料から遊離している任意の目的材料（例えば、ハムスターＰＬＢＬ２）のレベルは、検出用抗体の検出手段を用いて測定又は定量化される。幾つかの実施態様では、この測定又は定量化は、上記の工程の結果として起きる反応を検量線と比較し、既知の量と比較された目的材料（例えば、ハムスターＰＬＢＬ２）のレベルを決定することを含む。
【００８１】
固定化捕捉試薬に添加された抗体は、直接的に標識されるか、又は一次抗体の動物種のＩｇＧに対する標識二次抗体の過剰モルを、過剰な一次抗体から洗い落とした後に添加することにより間接的に検出される。後者の間接アッセイでは、標識抗体をｉｎ  ｓｉｔｕで産生するために、一次抗体に対する標識された抗血清が試料に添加される。
【００８２】
一次又は二次抗体の何れかに使用される標識は、遊離している目的材料（例えば、ハムスターＰＬＢＬ２）の、一次又は二次抗体への結合を妨害しない任意の検出可能な機能性である。適切な標識の例は、上で列挙した標識のような、イムノアッセイでの使用が知られているものを含む。
【００８３】
従来の方法は、タンパク質又はポリペプチドにこれらの標識を共有結合させるのに利用可能である。例えば、ジアルデヒド、カルボジイミド、ジマレイミド、ビス−イミダート、ビス−ジアゾ化ベンジジン等のカップリング剤は、上記の蛍光、化学発光及び酵素標識で抗体にタグをつけるのに使用されうる。例えば、米国特許第３９４０４７５号（蛍光分析）及び  米国特許第３６４５０９０号（酵素）；Hunter et al., Nature 144:945 (1962);David et al., Biochemistry, 13:1014-1021 (1974); Pain et al., J. Immunol. Methods 40:219-230 (1981);並びにNygren, J. Histochem. and Cytochem., 30:407-412 (1982)を参照のこと。幾つかの実施態様では、標識はビオチンであり、検出手段にストレプトアビジン−ＨＲＰを用いる。
【００８４】
酵素を含むこのような標識の抗体へのコンジュゲーションは、イムノアッセイ技術分野の当業者にとっては標準的な操作法である。例えば、Methods in Enzymology, ed. J. J. Langone and H. Van Vunakis, Vol. 73 (Academic Press, New York, N.Y., 1981), pp. 147-166の、O’Sullivan et al. 「Methods for the Preparation of Enzyme-antibody Conjugates for Use in Enzyme Immunoassay」を参照のこと。
【００８５】
最後の標識抗体を添加した後、結合した抗体の量は、結合していない過剰な標識抗体を洗浄により除去し、次いで標識に適した検出方法を用いて結合した標識の量を測定又は定量化し、測定量を生体試料中の目的の抗体の量と関連づけることにより決定される。例えば、酵素の場合、発色及び測定された色の量は、目的抗体の存在量の定量化を可能にする直接的な測定値となる。一実施態様では、ＨＲＰは標識であり、その色は、４９０ｎｍの吸光度で基質ＯＰＤを用いて検出される。
【００８６】
一例では、非標識一次抗体に対する酵素標識二次抗体が固定化相から洗浄された後、色又は化学発光は、固定化された捕捉試薬を酵素の基質と共にインキュベートすることにより発色及び測定される。次いで、目的材料（例えばハムスターＰＬＢＬ２）の濃度は、同時に行われる標準試験により生成される色又は化学発光と比較することにより算出される。
【００８７】
ポリペプチド
例示的な抗ハムスターＰＬＢＬ２抗体
本明細書に記載の任意のアッセイ法で使用するためのポリペプチドが提供される。一態様では、ハムスターＰＬＢＬ２を結合する単離された抗体が提供される。幾つかの実施態様では、抗ＰＬＢＬ２抗体は、（ａ）配列番号１５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１；（ｂ）配列番号１６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２；（ｃ）配列番号１７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３；（ｄ）配列番号２０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１；（ｅ）配列番号２１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２；及び（ｆ）配列番号２２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３から選択される、少なくとも一、二、三、四、五又は六のＣＤＲを含む。幾つかの実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号１４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む。幾つかの実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号１９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。幾つかの実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体（「１９Ｃ１０」）は、配列番号１３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号１８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。別の実施態様において、抗体は、配列番号１３及び配列番号１８のＣＤＲ配列と９５％以上同一であるＣＤＲ配列を含む。
【００８８】
別の態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号１４のアミノ酸配列と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む。特定の実施態様において、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するＶＨ  配列は、参照配列と比較して置換（例えば、保存的置換）、挿入又は欠失を含有するが、その配列を含む抗ＰＬＢＬ２抗体はＰＬＢＬ２に結合する能力を保持する。特定の実施態様において、合計１から１０のアミノ酸が、配列番号１４において置換、挿入又は欠失されている。特定の実施態様において、置換、挿入又は欠失はＣＤＲの外部の領域（すなわち、ＦＲ内）で起こる。場合によって、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号１４におけるＶＨ配列を、その配列の翻訳後修飾を含めて、包含する。
【００８９】
別の態様において、  配列番号１９のアミノ酸配列と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む抗ＰＬＢＬ２抗体が提供される。特定の実施態様において、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するＶＬ配列は、参照配列と比較して置換（例えば、保存的置換）、挿入又は欠失を含有するが、その配列を含む抗ＰＬＢＬ２抗体はＰＬＢＬ２に結合する能力を保持する。特定の実施態様において、合計１から１０のアミノ酸が、配列番号１９において置換、挿入又は欠失されている。特定の実施態様において、置換、挿入又は欠失はＣＤＲの外部の領域（すなわち、ＦＲ内）で起こる。場合によって、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号１９におけるＶＬ配列を、その配列の翻訳後修飾を含めて、包含する。
【００９０】
特定の実施態様では、抗ＰＬＢＬ２抗体は、（ａ）配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ１；（ｂ）配列番号６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２；（ｃ）配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ３；（ｄ）配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ１；（ｅ）配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ２；及び（ｆ）配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲＬ３から選択される、少なくとも一、二、三、四、五又は六のＣＤＲを含む。幾つかの実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号４のアミノ酸配列を含む可変重鎖領域を含む。幾つかの実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号９のアミノ酸配列を含む可変軽鎖領域を含む。幾つかの実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体（「１５Ｇ１１」）は、配列番号３のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。別の実施態様において、抗体は、配列番号３及び配列番号８のＣＤＲ配列と９５％以上同一であるＣＤＲ配列を含む。
【００９１】
別の態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号４のアミノ酸配列と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む。特定の実施態様において、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するＶＨ配列は、参照配列と比較して置換（例えば、保存的置換）、挿入又は欠失を含有するが、その配列を含む抗ＰＬＢＬ２抗体はＰＬＢＬ２に結合する能力を保持する。特定の実施態様において、合計１から１０のアミノ酸が、配列番号４において置換、挿入又は欠失されている。特定の実施態様において、置換、挿入又は欠失はＣＤＲの外部の領域（すなわち、ＦＲ内）で起こる。場合によって、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号４におけるＶＨ配列を、その配列の翻訳後修飾を含めて、包含する。
【００９２】
別の態様において、  配列番号９のアミノ酸配列と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む抗ＰＬＢＬ２抗体が提供される。特定の実施態様において、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するＶＬ配列は、参照配列と比較して置換（例えば、保存的置換）、挿入又は欠失を含有するが、その配列を含む抗ＰＬＢＬ２抗体はＰＬＢＬ２に結合する能力を保持する。特定の実施態様において、合計１から１０のアミノ酸が、配列番号９において置換、挿入又は欠失されている。特定の実施態様において、置換、挿入又は欠失はＣＤＲの外部の領域（すなわち、ＦＲ内）で起こる。場合によって、抗ＰＬＢＬ２抗体は、配列番号９におけるＶＬ配列を、その配列の翻訳後修飾を含めて、包含する。
【００９３】
別の態様では、上に提供されている実施態様の何れにあるようなＶＨ及び上に提供されている実施態様の何れにあるようなＶＬを含む抗ＰＬＢＬ２抗体が提供される。
【００９４】
更なる態様では、本明細書に記載の抗ＰＬＢＬ２抗体と同じエピトープに結合する抗体も提供される。例えば、特定の実施態様では、配列番号１４のＶＨ配列及び配列番号１９のＶＬ配列を含む抗ＰＬＢＬ２抗体と同じエピトープに結合する抗体が提供される。例えば、特定の実施態様では、配列番号４のＶＨ配列及び配列番号９のＶＬ配列を含む抗ＰＬＢＬ２抗体と同じエピトープに結合する抗体が提供される。
【００９５】
本発明の更なる態様では、上記実施態様の何れに記載の抗ＰＬＢＬ２抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体又はヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施態様において、抗ＰＬＢＬ２抗体は、例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、ｓｃＦｖ、ダイアボディ又はＦ（ａｂ’）２断片等の抗体断片である。別の実施態様において、抗体は、例えば、インタクトなＩｇＧ１抗体、又は本明細書に記載の他の抗体クラスすなわちアイソタイプ等の完全長抗体である。別の実施態様では、抗体は、多重特異性抗体、二重特異性抗体、半抗体又は抗体断片である。
【００９６】
例示的組換えポリペプチド
組換えポリペプチド及びその調製物も提供されており、その試料は本明細書に記載の方法によりアッセイされうる。このような組換えポリペプチドの例は、限定されないが、免疫グロブリン、イムノアドヘシン、抗体、酵素、ホルモン、融合タンパク質、Ｆｃ含有タンパク質、イムノコンジュゲート、サイトカイン及びインターロイキン、哺乳類タンパク質（例えば、レニン）；ホルモン；成長ホルモン（ヒト成長ホルモン及びウシ成長ホルモンを含む）；成長ホルモン放出因子；甲状腺傍ホルモン；甲状腺刺激ホルモン；リポタンパク質；アルファ−１−抗トリプシン；インシュリンＡ鎖；インシュリンＢ鎖；プロインシュリン；卵胞刺激ホルモン；カルシトニン；黄体ホルモン；グルカゴン；凝固因子（要子ＶＩＩＩＣ、要子ＩＸ、組織因子及びフォン・ヴィレブランド因子等）；抗凝固因子（プロテインＣ等）；心房性ナトリウム利尿因子；肺界面活性剤；プラスミノゲン活性剤（ウロキナーゼ又はヒトの尿又は組織タイプ・プラスミノゲン活性剤（ｔ−ＰＡ））；ボンベシン；トロンビン；造血成長因子；腫瘍壊死因子−アルファ及び−ベータ；エンケファリナーゼ；RANTES;(regulated on activation normally T-cell expressed and secreted)；ヒトのマクロファージ炎症タンパク質（ＭＩＰ−１−アルファ）；血清アルブミン（ヒト血清アルブミン等）；Ｍｕｅｌｌｅｒｉａｎ−阻害物質；リラキシンＡ鎖；リラキシンＢ鎖；プロリラキシン；マウス性腺刺激ホルモン関連ペプチド；酵素；微生物タンパク質（ベータ−ラクタマーゼ等）；ＤＮａｓｅ；ＩｇＥ；Ｔ−リンパ球関連抗原（ＣＴＬＡ）（ＣＴＬＡ−４等）；インヒビン；アクチビン；血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）；ホルモン受容体又は増殖因子受容体；プロテインＡ又はＤ；リューマチ因子；神経栄養因子（骨由来の神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、ニューロトロフィン−３、−４、−５、又は−６（ＮＴ−３、ＮＴ−４、ＮＴ−５、又はＮＴ−６等）、或いは神経成長因子（ＮＧＦ−ｂ等）；血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）；線維芽細胞増殖因子（ａＦＧＦ及びｂＦＧＦ等）；上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）；形質転換増殖因子（ＴＧＦ）（ＴＧＦ−アルファ、及びＴＧＦ−β１、ＴＧＦ−β２、ＴＧＦ−β３、ＴＧＦ−β４又はＴＧＦ−β５を含むＴＧＦベータ等）；インスリン様増殖因子−Ｉ及び−ＩＩ（ＩＧＦ−Ｉ及びＩＧＦ−ＩＩ）；デス（１−３）−ＩＧＦ−Ｉ（脳ＩＧＦ−Ｉ）、インスリン様増殖因子結合タンパク質（ＩＧＦＢＰ）；サイトカイン；ＣＤタンパク質（ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１９及びＣＤ２０等）；エリスロポエチン；骨誘導因子；免疫毒素；融合ポリペプチド、すなわち二以上の異種ポリペプチド又はその断片で構成され、組換え核酸によりコードされているポリペプチド；Ｆｃｇ含有ポリペプチド、例えば、第二のポリペプチドに融合した、免疫グロブリンＦｃ領域を含む融合タンパク質又はその断片；イムノコンジュゲート；骨形成タンパク質（ＢＭＰ）；インターフェロン（インターフェロン−アルファ、−ベータ及び−ガンマ等）；コロニー刺激因子（ＣＳＦ）（例えばＭ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ及びＧ−ＣＳＦ）；インターロイキン（ＩＬ）、例えば、ＩＬ−１からＩＬ−１０；スーパーオキシド・ジスムターゼ；Ｔ細胞受容体；表面膜タンパク質；崩壊加速因子；ウイルスの抗原（例えば、ＡＩＤＳエンべロープの一部）；輸送タンパク質；ホーミング受容体；アドレシン；調節タンパク質；インテグリン（ＣＤ１１ａ、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ１８、ＩＣＡＭ、ＶＬＡ−４及びＶＣＡＭ等）；腫瘍関連抗原（ＣＡ１２５（卵巣がん抗原）又はＨＥＲ２、ＨＥＲ３若しくはＨＥＲ４受容体等）；イムノアドヘシン；並びに、タンパク質（例えば、上に列挙した任意のタンパク質を含む）を結合する抗体（抗体断片を含む）の他に、上に列挙した任意のタンパク質の断片及び／又は変異体を含む。
【００９７】
幾つかの実施態様では、本明細書に記載のアッセイ法のいずれにも使用されるポリペプチド調製物は目的の抗体を含有する。すなわち、宿主細胞が産生する組換えポリペプチドは抗体である。
【００９８】
このような抗体のための分子標的は、例えば、限定されないが、（ｉ）ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１９、ＣＤ１１ａ、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３４、ＣＤ４０、ＣＤ７９α（ＣＤ７９ａ）及びＣＤ７９β（ＣＤ７９ｂ）；（ｉｉ）ＥＧＦ受容体、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３又はＨＥＲ４受容体等のＥｒｂＢ受容体ファミリーのメンバー；（ｉｉｉ）ＬＦＡ−１、Ｍａｃ１、ｐ１５０，９５、ＶＬＡ−４、ＩＣＡＭ−１、ＶＣＡＭ及びαｖ／β３インテグリン（それらのアルファ又はベータサブユニット（例えば、抗ＣＤ１１ａ、抗ＣＤ１８又は抗ＣＤ１１ｂ抗体）を含む）等の細胞接着分子；（ｉｖ）ＶＥＧＦ；ＩｇＥ；血液型抗原；ｆｌｋ２／ｆｌｔ３受容体；肥満（ＯＢ）受容体；ｍｐｌ受容体；ＣＴＬＡ−４；タンパク質Ｃ、ＢＲ３、ｃ−ｍｅｔ、組織因子、β７等の増殖因子、及び（ｖ）米国特許第７５２１５４１号に記載されているもののような細胞表面及び膜貫通腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）といったＣＤタンパク質及びそのリガンドを含む。
【００９９】
他の例示的抗体は、限定されないが、抗エストロゲン受容体抗体、抗プロゲステロン受容体抗体、抗ｐ５３抗体、抗ＨＥＲ−２／ｎｅｕ抗体、抗ＥＧＦＲ抗体、抗カテプシンＤ抗体、抗Ｂｃｌ−２抗体、抗Ｅカドヘリン抗体、抗ＣＡ１２５抗体、抗ＣＡ１５−３抗体、抗ＣＡ１９−９抗体、抗ｃ−ｅｒｂＢ−２抗体、抗Ｐ−糖タンパク質抗体、抗ＣＥＡ抗体、抗網膜芽細胞腫タンパク質抗体、抗−ｒａｓ腫瘍性タンパク質抗体、抗ＬｅｗｉｓＸ抗体、抗Ｋｉ−６７抗体、抗ＰＣＮＡ抗体、抗ＣＤ３抗体、抗ＣＤ４抗体、抗ＣＤ５抗体、抗ＣＤ７抗体、抗ＣＤ８抗体、抗ＣＤ９／ｐ２４抗体、抗ＣＤ１０抗体、抗ＣＤ１１ａ抗体、抗ＣＤ１１ｃ抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＣＤ１５抗体、抗ＣＤ１９抗体、抗ＣＤ２０抗体、抗ＣＤ２２抗体、抗ＣＤ２３抗体、抗ＣＤ３０抗体、抗ＣＤ３１抗体、抗ＣＤ３３抗体、抗ＣＤ３４抗体、抗ＣＤ３５抗体、抗ＣＤ３８抗体、抗ＣＤ４１抗体、抗ＬＣＡ／ＣＤ４５抗体、抗ＣＤ４５ＲＯ抗体、抗ＣＤ４５ＲＡ抗体、抗ＣＤ３９抗体、抗ＣＤ１００抗体、抗ＣＤ９５／Ｆａｓ抗体、抗ＣＤ９９抗体、抗ＣＤ１０６抗体、抗ユビキチン抗体、抗ＣＤ７１抗体、抗ｃ−ｍｙｃ抗体、抗サイトケラチン抗体、抗ビメンチン抗体、抗ＨＰＶタンパク質抗体、抗カッパ軽鎖抗体、抗ラムダ軽鎖抗体、抗メラノソーム抗体、抗前立腺特異的抗原抗体、抗Ｓ−１００抗体、抗タウ抗原抗体、抗フィブリン抗体、抗ケラチン抗体及び抗Ｔｎ抗原抗体から選択されるものを含む。
【０１００】
ポリクローナル抗体
幾つかの実施態様では、抗体は、ポリクローナル抗体である。ポリクローナル抗体は、好ましくは、関連する抗原及びアジュバントの複数回にわたる皮下（ｓｃ）又は腹腔内（ｉｐ）注入により動物内で産生される。二官能性剤又は誘導体化剤、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル（システイン残基を介したコンジュゲーション）、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド（リジン残基を介した）、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、ＳＯＣｌ２、又はＲ１Ｎ＝Ｃ＝ＮＲ（式中、ＲとＲ１は異なるアルキル基である）を用いて、免疫化される種において免疫原性であるポリペプチド（例えばキーホールリンペットヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリン、又はダイズトリプシン阻害因子）に関連抗原をコンジュゲートすることは有益でありうる。
【０１０１】
動物は、例えば、ポリペプチド又はコンジュゲート１００μｇ又は５μｇ（それぞれウサギ又はマウスの場合）を３体積の完全フロイントアジュバントと合わせ、この溶液を複数部位に皮内注入することにより、抗原、免疫原性コンジュゲート又は誘導体に対して免疫される。一か月後、該動物は、完全フロイントアジュバント中のペプチド又はコンジュゲートを初期量の１／５から１／１０用いて複数部位に皮下注入することにより、追加免疫される。７から１４日後、該動物は採血され、抗体価について血清がアッセイされる。動物は、力価がプラトーに達するまで追加免疫される。幾つかの実施態様では、同じ抗原のコンジュゲートであるが、異なるポリペプチドにコンジュゲートされたコンジュゲート、及び／又は異なる架橋試薬によってコンジュゲートされたコンジュゲートで、該動物を追加免疫する。また、コンジュゲートは、ポリペプチド融合体として組換え細胞培養液中で作製されてもよい。また、免疫応答を高めるために、ミョウバン等の凝集剤が適切に使用される。
【０１０２】
モノクローナル抗体
幾つかの実施態様において、抗体は、モノクローナル抗体である。モノクローナル抗体は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指し、すなわち一般的に少量で存在しうる突然変異体等の、モノクローナル抗体の生成中に生じる突然変異体を除いて、集団を構成する個々の抗体が同一であり、及び／又は同じエピトープに結合する。したがって、修飾語「モノクローナル」は、別々の抗体の混合物（すなわちポリクローナル抗体）ではないという抗体の性質を示す。
【０１０３】
例えば、モノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature 256:495 (1975)により最初に記載されたハイブリドーマ法を用いて作製されてもよく、又は組換えＤＮＡ法（米国特許第４８１６５６７号）により作製されてもよい。
【０１０４】
ハイブリドーマ法では、マウス又は他の適切な宿主動物を本明細書に記載のように免疫し、免疫化に用いられたポリペプチドと特異的に結合する抗体を産生するか又は産生可能なリンパ球を誘発する。或いは、リンパ球はインビトロで免疫化されてもよい。次いで、ポリエチレングリコールのような適切な融剤を用いて骨髄腫細胞とリンパ球を融合させ、ハイブリドーマ細胞を形成させる(Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp. 59-103 (Academic Press, 1986))。
【０１０５】
このように調製されたハイブリドーマ細胞を、非融合の親骨髄腫細胞の増殖又は生存を阻害する一又は複数の物質を好ましくは含有する適切な培地中に播種し、増殖させる。例えば、親骨髄腫細胞が酵素ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴ又はＨＰＲＴ）を欠くならば、ハイブリドーマの培地は、通常、ヒポキサンチン、アミノプテリン及びチミジン（ＨＡＴ培地）を含むことになり、これらの物質はＨＧＰＲＴ欠損細胞の増殖を妨げる。
【０１０６】
幾つかの実施態様では、該骨髄腫細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベルの産生を助け、ＨＡＴ培地等の培地に対して感受性な細胞である。この内、幾つかの実施態様において、骨髄腫細胞株は、マウス骨髄腫細胞株（例えば、米国カリフォルニア州サンディエゴのＳａｌｋ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  Ｃｅｌｌ  Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ  Ｃｅｎｔｅｒから入手可能なＭＯＰＣ−２１及びＭＰＣ−１１マウス腫瘍、並びに米国メリーランド州ロックビルにあるＡｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎから入手可能なＳＰ−２又はＸ６３−Ａｇ８−６５３細胞から誘導されるもの）である。ヒトモノクローナル抗体の産生のためのヒト骨髄腫及びマウス−ヒトヘテロ骨髄腫細胞株もまた記載されている(Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987))。
【０１０７】
ハイブリドーマ細胞が増殖している培地を、抗原に対するモノクローナル抗体の産生についてアッセイする。幾つかの実施態様では、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降法又はインビトロ結合アッセイ、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）又は酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）によって決定される。
【０１０８】
モノクローナル抗体の結合親和性は、例えばMunson et al., Anal. Biochem. 107:220 (1980)に記載のスキャッチャード解析により決定され得る。
【０１０９】
ハイブリドーマ細胞が所望の特異性、親和性及び／又は活性の抗体を産生することが確認された後、そのクローンを、限界希釈法によりサブクローニングしてもよく、標準的な方法により培養してもよい(Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice pp. 59-103 (Academic Press, 1986))。この目的のための好適な培地は、例えばＤ−ＭＥＭ又はＲＰＭＩ−１６４０培地を含む。加えて、該ハイブリドーマ細胞は、動物の腹水腫瘍としてインビボで増殖させてもよい。
【０１１０】
サブクローンにより分泌されたモノクローナル抗体は、例えばポリペプチドＡ−セファロース、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析又はアフィニティークロマトグラフィーのような従来の免疫グロブリン精製手順によって、培地、腹水又は血清から適切に分離される。
【０１１１】
該モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは容易に単離され、一般的な手順を用いて（例えば、抗体の重鎖と軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合できるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって）配列決定される。幾つかの実施態様では、該ハイブリドーマ細胞は、このようなＤＮＡの供給源となる。ＤＮＡを単離して、発現ベクター中に配置し、次いで、この発現ベクターを、  別の方法では免疫グロブリンポリペプチドを生成することのない、大腸菌細胞、サルＣＯＳ細胞、ヒト胎児性腎臓（ＨＥＫ）２９３細胞、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞又は骨髄腫細胞のような宿主細胞にトランスフェクトし、組換え宿主細胞におけるモノクローナル抗体の合成を得る。抗体をコードするＤＮＡの、細菌における組換え発現に関する総説は、Skerra et al., Curr. Opinion in Immunol. 5:256-262 (1993)及びPluckthun, Immunol. Revs., 130:151-188 (1992)を含む。
【０１１２】
更なる実施態様では、抗体又は抗体断片は、McCafferty et al., Nature 348:552-554 (1990)に記載の技術を使用して作成される抗体ファージライブラリーから分離されうる。Clackson et al., Nature 352:624-628 (1991)及びMarks et al., J. Mol. Biol. 222:581-597 (1991)は、ファージライブラリーを使用したマウス抗体及びヒト抗体の単離をそれぞれ記述している。それに続く刊行物は、鎖シャッフリングによる高親和性（ｎＭ範囲）のヒト抗体の生産(Marks et al., Bio/Technology 10:779-783 (1992))、及び非常に大きなファージライブラリーを構築するための方策としてコンビナトリアル感染とインビボ組換えを記述している(Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res. 21:2265-2266 (1993)）。したがって、これらの技術はモノクローナル抗体の単離に関する伝統的なモノクローナル抗体ハイブリドーマ法の実行可能な代替法である。
【０１１３】
ＤＮＡはまた、例えば、ヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインのコード配列を相同マウス配列の代わりに置換することにより（米国特許第４８１６５６７号；Morrison et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA 81:6851 (1984)）、又は非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全部又は一部を免疫グロブリンコード配列に共有結合させることにより修飾され得る。
【０１１４】
通常、このような非免疫グロブリンポリペプチドは抗体の定常ドメインを置換し、又は抗体の一つの抗原結合部位の可変ドメインを置換して、抗原に対する特異性を有する一つの抗原結合部位と、異なる抗原に対する特異性を有するもう一つの抗原結合部位とを含むキメラ二価抗体を作り出す。
【０１１５】
本明細書に記載の任意の方法の幾つかの実施態様において、抗体は、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ又はＩｇＭである。幾つかの実施態様において、抗体は、ＩｇＧモノクローナル抗体である。
【０１１６】
抗体断片
幾つかの実施態様において、抗体は、抗体断片である。抗体断片を生産するために様々な技術が開発されてきている。伝統的には、こうした断片は、インタクトな抗体のタンパク分解性消化を介して誘導されていた（例えば、Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 (1992)及びBrennan et al., Science 229:81 (1985)を参照）。しかし、こうした断片は、現在では組換え宿主細胞により直接生産することができる。例えば、抗体断片は、上述の抗体ファージライブラリーから単離されうる。或いは、Ｆａｂ’−ＳＨ断片を大腸菌から直接回収し、化学的に結合させてＦ（ａｂ’）２断片を形成することができる(Carter et al., Bio/Technology 10:163-167 (1992))。他のアプローチ法では、Ｆ（ａｂ’）２断片を組換え宿主細胞培養から直接単離することができる。抗体断片の生産のための他の技術は当業者には明らかであろう。他の実施態様では、選択抗体は単鎖Ｆｖ断片（ｓｃＦｖ）である。国際公開第９３／１６１８５号、米国特許第５５７１８９４号及び米国特許第５５８７４５８号を参照のこと。抗体断片は、例えば、米国特許第５６４１８７０号に記載されるように「直鎖状抗体」であってもよい。このような直鎖状抗体断片は、単一特異性又は二重特異性であり得る。
【０１１７】
幾つかの実施態様では、本明細書に記載の抗体の断片が提供される。幾つかの実施態様において、抗体断片は抗原結合断片である。幾つかの実施態様において、抗原結合断片は、Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、ｓｃＦｖ、Ｆｖ及びダイアボディから成る群より選択される。
【０１１８】
ポリペプチド変異体及び修飾
本明細書に記載の抗体を含むポリペプチドのアミノ酸配列修飾は、本明細書に記載のポリペプチド調製物（例えば、抗体）をアッセイする方法において使用されうる。
【０１１９】
変異体ポリペプチド
「ポリペプチド変異体」とは、ポリペプチドの完全長天然配列、シグナルペプチドを欠くポリペプチド配列、（シグナルペプチドを伴うか又は伴わない）ポリペプチドの細胞外ドメイン）と、少なくともおよそ８０％のアミノ酸配列同一性を有する、本明細書に定義されているポリペプチド、例えば活性ポリペプチドを意味する。このようなポリペプチド変異体は、例えば完全長天然アミノ酸配列のＮ末端又はＣ末端に、一又は複数のアミノ酸残基が付加されているか又は欠失しているポリペプチドを含む。通常、ポリペプチド変異体は、完全長天然配列ポリペプチド配列、シグナルペプチドを欠くポリペプチド配列、ポリペプチドの（シグナルペプチドを伴うか又は伴わない）細胞外ドメインに対して、少なくともおよそ８０％のアミノ酸配列同一性、或いは少なくともおよそ８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の何れかのアミノ酸配列同一性を有するであろう。場合によっては、変異体ポリペプチドは、天然ポリペプチド配列と比較して一以下の保存的アミノ酸置換、或いは天然ポリペプチド配列と比較して約２、３、４、５、６、７、８、９、又は１０の何れか以下の保存的アミノ酸置換を有する。
【０１２０】
変異体ポリペプチドは、例えば完全長天然ポリペプチドと比較した場合、Ｎ末端又はＣ末端で切断されているか、又は内部残基を欠如しうる。特定の変異体ポリペプチドは、所望の生物活性に必須ではないアミノ酸残基を欠如しうる。切断、欠失及び挿入を有するこれらの変異体ポリペプチドは、多くの一般的な技術の何れかにより調製されうる。所望の変異体ポリペプチドは化学的に合成されうる。別の好適な技術は、所望の変異体ポリペプチドをコードする核酸断片を、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により単離及び増幅させることを含む。核酸断片の所望の終端を定めるオリゴヌクレオチドは、ＰＣＲにおいて５’及び３’プライマーで用いられる。好ましくは、変異体ポリペプチドは、少なくとも一つの生物及び／又は免疫活性を本明細書に開示の天然ポリペプチドと共有する。
【０１２１】
アミノ酸配列挿入は、 長さが１残基から、１００以上の残基を含むポリペプチドの範囲のアミノ末端融合及び／又はカルボキシル末端融合、並びに単一又は複数のアミノ酸残基の配列内挿入を含む。末端挿入の例は、Ｎ末端メチオニル残基を有する抗体又は細胞傷害性ポリペプチドへ融合した抗体を含む。抗体分子の他の挿入変異体は、抗体の血清半減期を延長させる酵素又はポリペプチドに対する抗体のＮ末端又はＣ末端への融合を含む。
【０１２２】
例えば、ポリペプチドの結合親和性及び／又は他の生物学的特性を改善することができれば望ましい。ポリペプチドのアミノ酸配列変異体は、抗体核酸への適切なヌクレオチド変化の導入により、又はペプチド合成により調製されるこのような修飾は、例えば、ポリペプチドのアミノ酸配列内の残基からの欠失、及び／又はそのような残基への挿入、及び／又はそのような残基の置換を含む。最終コンストラクトが所望の特性を有する限り、欠失、挿入及び置換の任意の組み合わせが、最終コンストラクトに到達するためになされる。アミノ酸変化はまた、ポリペプチド（例えば抗体）の翻訳後プロセスを変更し得、例えばグリコシル化部位の数又は位置を変化させる。
【０１２３】
どのアミノ酸残基が、所望の活性に悪影響を及ぼすことなく挿入、置換又は欠失されうるか決定するためのガイダンスは、ポリペプチドの配列を、相同の既知ポリペプチド分子の配列と比較し、高相同性の領域に為されるアミノ酸配列変化の数を最小限にすることによって見出されうる。
【０１２４】
突然変異誘発に好ましい位置であるポリペプチド（例えば抗体）の特定の残基又は領域の同定のための有用な方法は、Cunningham及びWells (1989) Science, 244:1081-1085により記載されているように、「アラニンスキャニング突然変異誘発」と呼ばれる。この方法では、標的となる残基又は残基群が同定され（例えば、Ａｒｇ、Ａｓｐ、Ｈｉｓ、Ｌｙｓ及びＧｌｕのような荷電残基）、中性の、又は負に荷電したアミノ酸（最も好ましくはアラニン又はポリアラニン）で置換され、アミノ酸と抗原との相互作用に影響を与える。次いで、更なる又は他の変異体を置換部位において又は置換部位に対して導入することにより、置換に対する機能的感受性を示しているアミノ酸位置を精緻化する。よって、アミノ酸配列差異を導入する部位は予め決定されるが、突然変異自体の性質は予め決まっている必要はない。例えば、所与の部位での変異能力を分析するために、標的コドン又は領域においてａｌａスキャニング突然変異誘発又はランダム突然変異誘発を実施し、発現した抗体変異体を所望の活性についてスクリーニングする。
【０１２５】
別のタイプの変異体は、アミノ酸置換変異体である。こうした変異体は、抗体分子中に、異なる残基で置換される少なくとも一のアミノ酸残基を有する。置換突然変異誘発について最も目的とする部位は超可変領域を含むが、ＦＲ改変もまた考慮される。保存的置換は、「好ましい置換」と題して以下の表１に示される。このような置換が生物活性の変化をもたらす場合、表１で「例示的置換」と称されているか又は以下にアミノ酸クラスに関して更に記載されている、より実質的な変化を導入し、その生成物をスクリーニングしてもよい。
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【０１２６】
ポリペプチドの生物学的特性の実質的な修飾は、（ａ）置換領域におけるポリペプチド骨格の、例えばシート又はへリックス構造としての構造（ｂ）標的部位における分子の電荷又は疎水性、又は（ｃ）側鎖の嵩の維持に及ぼす効果が有意に異なる置換を選択することにより達成される。アミノ酸は、その側鎖の特性の類似性に従ってグループ化されうる(A. L. Lehninger, Biochemistry second ed., pp. 73-75, Worth Publishers, New York (1975))：
（１）非極性：Ａｌａ（Ａ）、Ｖａｌ（Ｖ）、  Ｌｅｕ（Ｌ）、Ｉｌｅ（Ｉ）、Ｐｒｏ（Ｐ）、Ｐｈｅ（Ｆ）、Ｔｒｐ（Ｗ）、Ｍｅｔ（Ｍ）
（２）非荷電極性：Ｇｌｙ（Ｇ）、Ｓｅｒ（Ｓ）、Ｔｈｒ（Ｔ）、Ｃｙｓ（Ｃ）、Ｔｙｒ（Ｙ）、Ａｓｎ（Ｎ）、Ｇｌｎ（Ｑ）
（３）酸性：Ａｓｐ（Ｄ）、Ｇｌｕ（Ｅ）
（４）塩基性：Ｌｙｓ（Ｋ）、Ａｒｇ（Ｒ）、Ｈｉｓ（Ｈ）
【０１２７】
或いは、天然に存在する残基は、共通の側鎖特性に基づいて以下の群に分けることができる：
（１）疎水性：ノルロイシン、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ；
（２）中性の親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ；
（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；
（４）塩基性：Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ；
（５）鎖配向に影響する残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ；
（６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ。
【０１２８】
非保存的置換は、これらのクラスのメンバーの一つと別のクラスとの交換を伴うであろう。
【０１２９】
抗体の適切な構造の維持に関与していない任意のシステイン残基も、分子の酸化的安定性を改善して異常な架橋を防ぐために、一般にセリンと置換されうる。逆に、システイン結合をポリペプチドに付加して、その安定性を改善してもよい（特に抗体がＦｖ断片等の抗体断片である場合）。
【０１３０】
置換変異体の一例は、親抗体（例えばヒト化抗体）の一又は複数の超可変領域残基の置換を含む。一般に、得られた変異体で更なる開発のために選択されるものは、それらが作製された親抗体と比較して向上した生物学的特性を有するであろう。そのような置換変異体を作製するための簡便な方法は、ファージディスプレイを使用する親和性成熟を含む。簡潔に言えば、幾つかの超可変領域部位（例えば、６−７部位）を突然変異させて、各部位においてすべての可能なアミノ置換を生じさせる。こうして作製された抗体変異体は、各粒子内にパッケージされたＭ１３の遺伝子ＩＩＩ産物への融合体として、繊維状ファージ粒子から一価の様式で提示される。次いで、ファージディスプレイされた変異体は、本明細書に開示されているようなそれらの生物活性（例えば、結合親和性）に関してスクリーニングされる。修飾の候補となる超可変領域部位を識別するために、アラニンスキャニング突然変異誘発を実施し、抗原結合に有意に寄与する超可変領域残基を特定することができる。代替的又は追加的に、抗原−抗体複合体の結晶構造を解析して、抗体と標的との接点を特定することが有益である場合もある。そのような接触残基及び隣接残基は、本願明細書において詳しく述べられている技術による置換の候補である。そのような変異体がひとたび作製されると、変異体のパネルが本明細書に記載のようにスクリーニングに供され、一又は複数の関連アッセイにおいて優れた特性を持つ抗体が更なる開発のために選択される。
【０１３１】
ポリペプチドの他のタイプのアミノ酸変異体は、抗体の元のグリコシル化パターンを改変する。ポリペプチドは、非アミノ酸部分を含みうる。例えば、ポリペプチドはグリコシル化されうる。このようなグリコシル化は、宿主細胞又は宿主生物においてポリペプチドの発現中に自然に生じてもよく、又はヒトの介入から生じる故意の修飾であってもよい。改変とは、ポリペプチドに見出される一又は複数の炭水化物部分の欠失、及び／又はポリペプチドに存在しない一又は複数のグリコシル化部位の付加を意味する。
【０１３２】
ポリペプチドのグリコシル化は、典型的にはＮ結合又はＯ結合の何れかである。Ｎ結合とは、アスパラギン残基の側鎖への炭水化物部分の結合を指す。トリペプチド配列のアスパラギン−Ｘ−セリン及びアスパラギン−Ｘ−スレオニン（ここで、Ｘは、プロリン以外の任意のアミノ酸である）は、アスパラギン側鎖への炭水化物部分の酵素的結合のための認識配列である。よって、ポリペプチドにおけるこれらのトリペプチド配列の何れかの存在が、潜在的なグリコシル化部位をつくる。Ｏ結合グリコシル化とは、ヒドロキシアミノ酸、最も一般的にはセリン又はスレオニンに、糖類Ｎ−アセチルガラクトサミン、ガラクトース又はキシロースの一つが結合することを指すが、５−ヒドロキシプロリン又は５−ヒドロキシリジンもまた用いられうる。
【０１３３】
ポリペプチドへのグリコシル化部位の付加は、一又は複数の上記トリペプチド配列（Ｎ結合グリコシル化部位の場合）を含むようにアミノ酸配列を改変することによって簡便に達成される。この改変は、元の抗体の配列への一又は複数のセリン又はスレオニン残基の付加、又はこれらによる置換によってもなされうる（Ｏ結合グリコシル化部位の場合）。
【０１３４】
ポリペプチド上に存在する炭水化物部分の除去は、化学的又は酵素的に、或いはグルコシル化の標的となるアミノ酸残基をコードするコドンの変異的置換により達成されうる。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、種々のエンドグリコシダーゼ及びエキソグリコシダーゼを用いることにより達成されうる。
【０１３５】
他の修飾には、グルタミニル及びアスパラギニル残基の各々対応するグルタミル及びアスパルチル残基への脱アミノ化、プロリン及びリシンのヒドロキシル化、セリル又はトレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リシン、アルギニン及びヒスチジン側鎖のα−アミノ基のメチル化、Ｎ末端アミンのアセチル化、並びに任意のＣ末端カルボキシル基のアミド化を含む。
【０１３６】
キメラポリペプチド
本明細書に記載のポリペプチドは、他の異種ポリペプチド配列又はアミノ酸配列に融合したポリペプチドを含むキメラ分子を形成するように修飾されうる。幾つかの実施態様では、キメラ分子は、抗タグ抗体が選択的に結合できるエピトープを提供するタグポリペプチドとのポリペプチドの融合を含む。エピトープタグは一般的に、ポリペプチドのアミノ末端又はカルボキシル末端に置かれる。ポリペプチドのこのようなエピトープタグ形態の存在は、タグポリペプチドに対する抗体を使用して検出されうる。また、エピトープタグの提供は、抗タグ抗体又はエピトープタグに結合する他のタイプのアフィニティーマトリックスを使用する親和性精製により、ポリペプチドが容易に精製されるのを可能にする。
【０１３７】
アッセイ法での使用のためのポリペプチドの入手
本明細書に記載のアッセイ法において使用されるポリペプチドは、組換え法を含む当該技術分野で周知の方法を用いて得ることができる。以下のセクションは、これらの方法に関するガイダンスを提供する。
【０１３８】
（Ａ）ポリヌクレオチド
本明細書で互換的に使用される「ポリヌクレオチド」又は「核酸」は、任意の長さのヌクレオチドのポリマーを指し、ＤＮＡ及びＲＮＡを含む。
【０１３９】
ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、限定されないが、ポリペプチドｍＲＮＡを保有し検出可能なレベルでそれを発現すると信じられている組織から調製されるｃＤＮＡライブラリーを含む、任意の供給源から得られうる。従って、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、ヒト組織から調製されたｃＤＮＡライブラリーから簡便に得ることができる。ポリペプチドをコードする遺伝子はまた、ゲノムライブラリーから、又は既知の合成手順（例えば、自動核酸合成）によって得ることができる。
【０１４０】
例えば、ポリヌクレオチドは、軽鎖又は重鎖のような全免疫グロブリン分子鎖をコードしうる。完全な重鎖は、重鎖可変領域（ＶＨ）だけでなく重鎖定常領域（ＣＨ）も含み、重鎖定常領域は通常、三つの定常ドメイン、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３、並びに「ヒンジ」領域を含む。幾つかの状況では、定常領域の存在が望ましい。
【０１４１】
ポリヌクレオチドによってコードされうる他のポリペプチドは、抗原結合抗体断片、例えば単一ドメイン抗体（「ｄＡｂｓ」）、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ’及びＦ（ａｂ’）２及び「ミニボディ」を含む。ミニボディは（通常）ＣＨ１及びＣＫ又はＣＬドメインが切り取られた二価抗体断片である。ミニボディは一般的な抗体より小さいので、それらは臨床／診断用途では良好な組織浸透を達成するはずであるが、ｄＡｂｓのような一価抗体断片よりも高い結合親和性を保持しなければならない二価である。したがって、内容が矛盾しない限り、本明細書で使用される「抗体」なる用語は抗体分子全体だけではなく、上で述べたタイプの抗原結合抗体断片も包含する。好ましくは、コードされたポリペプチド中に存在する各フレームワーク領域は、対応するヒトアクセプターフレームワークに対して少なくとも一つのアミノ酸置換を含む。よって、例えば、フレームワーク領域は、アクセプターフレームワーク領域に対して、合計で３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５のアミノ酸置換を含みうる。
【０１４２】
適切には、本明細書に記載のポリヌクレオチドは単離及び／又は精製されうる。幾つかの実施態様では、ポリヌクレオチドは単離されたポリヌクレオチドである。
【０１４３】
用語「単離されたポリヌクレオチド」は、分子がその通常の若しくは自然の環境から除去され又は分離されており、或いはそれがその通常の又は自然の環境では存在しないような形で製造されたことを示すものである。幾つかの実施態様では、ポリヌクレオチドは精製されたポリヌクレオチドである。精製されたという用語は、少なくとも幾らかの汚染分子又は物質が除去されたことを示すものである。
【０１４４】
適切には、ポリヌクレオチドは、組成物中に存在する優勢な（すなわち、最も豊富な）ポリヌクレオチドを構成するように、十分に精製される。
【０１４５】
（Ｂ）ポリヌクレオチドの発現
下記の説明は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するベクターで形質転換又は形質移入された細胞を培養することによるポリペプチドの生成に主に関する。当然、当該技術分野でよく知られている代替的方法を用いてポリペプチドを調製することも考えられる。例えば、適切なアミノ酸配列又はその一部が、固相技術を用いて直接ペプチド合成により生成されうる（例えば、Stewart et al., Solid-Phase Peptide Synthesis W.H. Freeman Co., San Francisco, Calif. (1969); Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85:2149-2154 (1963)を参照のこと）。インビトロタンパク質合成は、手動技術を用いるか、又は自動操作により実施されうる。自動化合成は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｒ（Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，Ｃａｌｉｆ．）を用いて、製造者の指示を用いて達成されうる。ポリペプチドの種々の部分を別々に化学的に合成し、化学的又は酵素的方法を用いて結合させて所望するポリペプチドを生成させてもよい。
【０１４６】
本明細書に記載のポリヌクレオチドは、ポリペプチドの生成のために発現ベクターに挿入される。用語「制御配列」は、特定の宿主生物において操作可能に結合されたコード配列の発現のために必要なＤＮＡ配列を指す。制御配列は、限定されないが、プロモーター（例えば、天然に会合したプロモーター又は異種プロモーター）、シグナル配列、エンハンサーエレメント及び転写終結配列を含む。
【０１４７】
ポリヌクレオチドが他のポリヌクレオチド配列と機能的な関係に配置されている場合、「操作可能に結合」されている。例えば、プレ配列又は分泌リーダーの核酸は、それがポリペプチドの分泌に関与するプレタンパク質として発現されるならば、そのポリペプチドの核酸に操作可能に結合されており；プロモーター又はエンハンサーは、それが配列の転写に影響を及ぼすならば、コード配列に操作可能に結合されており；又はリボソーム結合部位は、それが翻訳を容易にするような位置にあるならば、コード配列と操作可能に結合されている。通常、「操作可能に結合された」とは、結合される核酸配列が近接していること、また、分泌リーダーの場合には、近接しており且つ読み取り相（ｒｅａｄｉｎｇ  ｐｈａｓｅ）にあることを意味する。しかし、エンハンサーは近接している必要はない。結合は簡便な制限部位でのライゲーションにより達成される。そのような部位が存在しない場合は、慣行に従って、合成オリゴヌクレオチドアダプター又はリンカーが使用される。
【０１４８】
抗体の場合、軽鎖及び重鎖は、同じか又は異なる発現ベクター中でクローニングされうる。免疫グロブリン鎖をコードする核酸セグメントは、免疫グロブリンポリペプチドの発現を確実にする発現ベクター中の制御配列に操作可能に結合されている。
【０１４９】
ポリヌクレオチド配列を含むベクター（例えば、可変重鎖及び／又は可変軽鎖をコードする配列、並びに任意選択の発現制御配列）は、細胞宿主のタイプに応じて異なる周知の方法によって宿主細胞に導入されうる。例えば、塩化カルシウムトランスフェクションは一般に原核細胞に利用され、一方、リン酸カルシウム処理、エレクトロポレーション、リポフェクション、微粒子銃又はウイルスベースのトランスフェクションは他の細胞宿主に用いられうる。（一般的にはSambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Press, 2nd ed., 1989を参照）。哺乳動物細胞を形質転換するために使用される他の方法は、ポリブレン、プロトプラスト融合、リポソーム、エレクトロポレーション及びマイクロインジェクションの使用を含む。トランスジェニック動物の作製のためには、導入遺伝子を、受精卵母細胞にマイクロインジェクションするか、又は胚性幹細胞のゲノムに組み込むことができ、また、胚性幹細胞の核を除核された卵母細胞に導入することができる。
【０１５０】
（Ｃ）ベクター
用語「ベクター」は、  発現ベクター及び形質転換ベクター及びシャトルベクターを含む。
【０１５１】
用語「発現ベクター」は、インビボ又はインビトロ発現ができるコンストラクトを意味する。
【０１５２】
用語「形質転換ベクター」は、一つの実体から別の実体に導入され得るコンストラクトを意味し、別の実体は同一種であるか、又は異なる種であってもよい。コンストラクトが、一つの種から別のものに‐例えば、大腸菌プラスミドからバチルス属等の細菌に‐導入されうる場合、形質転換ベクターは時として「シャトルベクター」と称される。シャトルベクターは、大腸菌プラスミドから植物に対するアグロバクテリウム属に導入することができるコンストラクトでもありうる。
【０１５３】
ベクターは、ポリペプチドの発現を提供するために、以下に記載されるように適切な宿主細胞に形質転換されうる。様々なベクターが公的に入手可能である。ベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、ウイルス粒子又はファージの形態であってもよい。適切な核酸配列は、種々の手順によりベクターに挿入されうる。一般に、ＤＮＡは、当該該分野で既知の技術を用いて、適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。一又は複数のこれらの構成要素を含む適切なベクターの構築は、当業者に周知の標準的なライゲーション技術を用いる。
【０１５４】
ベクターは例えば、複製起点、任意選択的に前記ポリヌクレオチドの発現のためのプロモーター、及び任意選択的にプロモーターの制御因子を備えたプラスミド、ウイルス又はファージベクターであってもよい。ベクターは、当該技術分野でよく知られている一又は複数の選択マーカー遺伝子を含有してもよい。
【０１５５】
これらの発現ベクターは、エピソームとして、又は宿主染色体ＤＮＡの不可欠な部分として、宿主生物中で典型的に複製可能である。
【０１５６】
（Ｄ）宿主細胞
宿主細胞は、例えば、細菌、酵母又は他の真菌細胞、昆虫細胞、植物細胞、又は哺乳動物細胞であってもよい。通常、宿主細胞は、ポリペプチドをコードする外因性核酸を含有しうるが、目的の組換えポリペプチド又は生産物をコードする外因性核酸は含有せず、ポリペプチドの発現は、例えば抗生物質耐性を付与するポリペプチドをコードする核酸といった特定の条件下で望ましい特性を細胞に付与する。
【０１５７】
トランスジェニック多細胞宿主生物が、ポリペプチドを生成するために使用されうる。該生物は、例えば、トランスジェニック哺乳動物生物（例えば、トランスジェニックヤギ又はマウス株）でありうる。
【０１５８】
適切な原核生物は、限定されないが、真正細菌（例えば大腸菌のような腸内細菌科等のグラム陰性生物又はグラム陽性生物）を含む。大腸菌Ｋ１２株  ＭＭ２９４（ＡＴＣＣ  ３１，４４６）；大腸菌Ｘ１７７６（ＡＴＣＣ  ３１，５３７）；大腸菌株Ｗ３１１０（ＡＴＣＣ  ２７，３２５）及びＫ５  ７７２（ＡＴＣＣ  ５３，６３５）等、様々な大腸菌株が公的に入手可能である。他の適切な原核生物宿主細胞は、腸内細菌科（例えば、大腸菌属（例：大腸菌）、エンテロバクター属、エルウイニア属、クレブシエラ属、プロテウス属、サルモネラ属（例：ネズミチフス菌）、セラチア属（例：セラチア・マルセサンス）及びシゲラ属）並びにバチルス属（例えば、枯草菌及びバチルス・リケニフォルミス（例：バチルス・リケニフォルミス４１Ｐ）、シュードモナス属（例えば、緑膿菌）及びストレプトミセス属を含む。これらの例は、限定ではなく例示である。株Ｗ３１１０は、組換えポリヌクレオチド生産物発酵の一般的な宿主株であるため、特に好ましい宿主又は親宿主である。好ましくは、宿主細胞は、最小量のタンパク質分解酵素を分泌する。例えば、株Ｗ３１１０は、内因性ポリペプチドをコードする遺伝子における遺伝子突然変異を宿主にもたらすために修飾されうる。そのような宿主の例としては、完全な遺伝子型ｔｏｎＡを有する大腸菌Ｗ３１１０  株１Ａ２、完全な遺伝子型ｔｏｎＡ  ｐｔｒ３を有する大腸菌Ｗ３１１０株９Ｅ４、完全な遺伝子型ｔｏｎＡ  ｐｔｒ３  ｐｈｏＡ  Ｅ１５（ａｒｇＦ−ｌａｃ）１６９  ｄｅｇＰ  ｏｍｐＴ  ｋａｎ’を有する大腸菌Ｗ３１１０株２７Ｃ７（ＡＴＣＣ  ５５，２４４）、完全な遺伝子型ｔｏｎＡ  ｐｔｒ３  ｐｈｏＡ  Ｅ１５（ａｒｇＦ−ｌａｃ）１６９  ｄｅｇＰ  ｏｍｐＴ  ｒｂｓ７  ｉｌｖＧ  ｋａｎ’を有する大腸菌Ｗ３１１０株３７Ｄ６、非カナマイシン耐性ｄｅｇＰ欠失変異を持つ３７Ｄ６株である大腸菌Ｗ３１１０株４０Ｂ４、及び変異周辺質プロテアーゼ．を有する大腸菌株を含む。或いは、クローニングのインビトロ法、例えばＰＣＲ又は他の核酸ポリメラーゼ反応等が適切である。
【０１５９】
これらの原核生物宿主において、宿主細胞と適合性の発現制御配列（例えば、複製開始点）を典型的に含む発現ベクターを作製することができる。更に、ラクトースプロモーター系、トリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系、ベータ−ラクタマーゼプロモーター系又はファージラムダからのプロモーター系等の、多種多様なよく知られているプロモーターが存在するであろう。プロモーターは通常、場合によってはオペレーター配列と共に発現を制御し、また転写及び翻訳を開始及び完了するためのリボソーム結合部位配列等を有する。
【０１６０】
真核微生物が発現のために使用されうる。糸状菌又は酵母等の真核微生物は、ポリペプチドをコードするベクターのための好適なクローニング宿主又は発現宿主である。サッカロミセス・セレビシエは、通常用いられる下等真核生物宿主微生物である。他に、分裂酵母；クルイベロミセス属宿主例えば、クルイベロミセス  ラクチス（ＭＷ９８−８Ｃ、ＣＢＳ６８３、ＣＢＳ４５７４）、クルイベロミセス  フラジリス（ＡＴＣＣ１２４２４）、クルイベロミセス  ブルガリカス（ＡＴＣＣ１６０４５）、クルイベロミセス  ウィッカーラミ（ｗｉｃｋｅｒａｍｉｉ）（ＡＴＣＣ２４１７８）、クルイベロミセス  ワルティー（ｗａｌｔｉｉ）（ＡＴＣＣ５６５００）、クルイベロミセス  ドロソフィラルム（ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａｒｕｍ）（ＡＴＣＣ３６９０６）、クルイベロミセス  サーモトレランス及びクルイベロミセス  マルキシアナス（ｍａｒｘｉａｎｕｓ）等；ヤロウィア属（ＥＰ４０２２２６）；ピキア  パストリス（ＥＰ１８３０７０）；カンジダ属；トリコデルマ  リージア（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｉａ）（ＥＰ２４４２３４）；アカパンカビ；シュワンニオミセス（Ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ属、例えば、シュワンニオミセス  オクシデンタリス（Ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ  ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｉｓ）；並びに糸状菌、例えば、アカパンカビ属、アオカビ属、トリポクラディウム属（Ｔｏｌｙｐｏｃｌａｄｉｕｍ）及びアスペルギルス属（例えば、為巣性麹菌及びクロカビ）の宿主を含む。メチロトローフ酵母は、本明細書では好適であり、限定されないが、ハンゼヌラ、カンジダ、クロエケラ、ピキア、サッカロミセス、トルロプシス及びロドトルラから成る属から選択される、メタノール上での増殖が可能な酵母を含む。サッカロミセス属は好ましい酵母宿主であり、所望に応じて発現制御配列（例えばプロモーター）、複製開始点、終止配列等を有する適切なベクターを伴う。代表的なプロモーターは、３−ホスホグリセリン酸キナーゼ及び他の解糖酵素を含む。誘導可能な酵母プロモーターは、とりわけ、アルコール脱水素酵素、イソシトクロムＣ、並びにマルトース及びガラクトース利用を担う酵素由来のプロモーターを含む。
【０１６１】
微生物に加えて哺乳動物組織細胞培養も、本明細書に記載のポリペプチドを発現させ生成するために使用することができ、場合によっては好ましい（Winnacker, From Genes to Clones VCH Publishers, N.Y., N.Y. (1987)参照）。幾つかの実施態様の場合、異種ポリペプチド（例えは、インタクトな免疫グロブリン）を分泌することができる多くの好適な宿主細胞株が当該技術分野で開発されているため、真核細胞が好ましく、それは、ＣＨＯ細胞株、種々のＣｏｓ細胞株、ＨｅＬａ細胞、好ましくは骨髄腫細胞株又は形質転換されたＢ−細胞若しくはハイブリドーマを含む。幾つかの実施態様において、哺乳動物宿主細胞はＣＨＯ細胞である。
【０１６２】
幾つかの実施態様において、  宿主細胞は脊椎動物宿主細胞である。有用な哺乳動物宿主細胞株の例は、ＳＶ４０によって形質転換されたサル腎臓ＣＶ１株（ＣＯＳ−７、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １６５１）；ヒト胎児腎臓株（懸濁培養における増殖のためにサブクローニングされた２９３又は２９３細胞）；ベビーハムスター腎臓細胞（ＢＨＫ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  １０）；チャイニーズマムスター卵巣細胞−ＤＨＦＲ（ＣＨＯ又はＣＨＯ−ＤＰ−１２系）；マウスセルトリ細胞；サル腎臓細胞（ＣＶ１  ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ７０）；アフリカミドリザル腎臓細胞（ＶＥＲＯ−７６、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−１５８７）；ヒト子宮頸がん細胞（ＨＥＬＡ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ２）；イヌ腎臓細胞（ＭＤＣＫ、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ３４）；バッファローラット肝臓細胞（ＢＲＬ  ３Ａ、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １４４２）；ヒト肺細胞（Ｗ１３８、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ  ７５）；ヒト肝臓細胞（Ｈｅｐ  Ｇ２、ＨＢ  ８０６５）；マウス乳房腫瘍（ＭＭＴ  ０６０５６２、ＡＴＣＣ  ＣＣＬ５１）；ＴＲＩ細胞；ＭＲＣ５細胞；ＦＳ４細胞；及びヒト肝がん系（Ｈｅｐ  Ｇ２）である。
【０１６３】
組換え法
本明細書において生産物（例えば、抗体）とも称される目的の組換えポリペプチドは、例えば米国特許第４８１６５６７号に記載されているように、組換え法と組成物を使用して製造されうる。幾つかの実施態様では、抗体等の組換えポリペプチドをコードする単離された核酸が提供される。このような核酸は、抗体（例えば、抗体の軽鎖及び／又は重鎖）のＶＬを含むアミノ酸配列及び／又はＶＨを含むアミノ酸配列をコードしうる。幾つかの実施態様では、このような核酸を含む一又は複数のベクター（例えば、発現ベクター）が提供される。幾つかの実施態様では、宿主細胞は、組換えポリペプチド発現細胞又は生産物細胞を生成するために、形質転換又は形質移入される。このような一実施態様において、組換えポリペプチド発現細胞は、（１）抗体のＶＬを含むアミノ酸配列及び抗体のＶＨを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、又は（２）抗体のＶＬを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第一のベクター及び抗体のＶＨを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター第二のベクターを含む（例えば、これらで形質転換されている）。
【０１６４】
幾つかの実施態様では、宿主細胞は真核細胞、例えば、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である。幾つかの実施態様では、生産物をコードする核酸を含む組換えポリペプチド細胞を、生産物の発現に適した条件下で、上述のように培養することと、場合によって、細胞（又は細胞培地）から生産物を回収することとを含む、組換えポリペプチドの製造方法が提供される。
【０１６５】
製造品
本明細書に記載の方法において使用されるポリペプチドは、製造品内に含まれていてもよい。製造品はポリペプチドを収容する容器を含んでもよい。幾つかの実施態様では、製造品は、（ａ）容器内に、本明細書に記載のポリペプチドを含む組成物を含む容器、及び（ｂ）アッセイ法においてポリペプチドを使用するための使用説明書を伴う添付文書を含む。
【０１６６】
製造品は、容器と、容器上の又は容器に付随するラベル又は添付文書とを含む。好適な容器は、例えば、ボトル、バイアル、試験管等を含む。容器は、ガラス又はプラスチック等の種々の材料から形成されうる。容器は、ポリペプチド組成物を入れるか又は収容する。組成物中の少なくとも一の活性剤はポリペプチドである。ラベル又は添付文書は、本発明の組成物のアッセイでの使用を、量及びインキュベーション時間に関する具体的なガイダンスで示している。製造品は、他の緩衝液、希釈剤、フィルターを含む、商業的及び使用者の観点から望ましい他の材料を更に含んでもよい。
【０１６７】
本明細書中で開示されたすべての特徴は、任意の組み合わせで組み合わされてもよい。本明細書中で開示された各特徴は、同一、同等又は類似の目的を果たす代替の特徴により置き換えられてもよい。したがって、特に明記しない限り、開示された各特徴は、同等又は類似の一般的な一連の特徴の一例にすぎない。
【実施例】
【０１６８】
以下は本発明の方法及び組成物の実施例である。上に提供された一般的な説明を前提として、他の様々な実施態様が実施されうる。
【０１６９】
下記の実施例及び本明細書の他の箇所で使用される「ＰＬＢ２」及び「ＰＬＢＬ２」及び「ＰＬＢＤ２」は、互換的に用いられ、酵素「ホスホリパーゼＢ様２」又はその同意語である「ホスホリパーゼＢドメイン様２」を指す。
【０１７０】
実施例１-一般的な方法
ＭＡｂフィードストック
すべての実施例のためのＭＡｂのフィードストックは、ジェネンテック社（Ｓｏｕｔｈ  Ｓａｎ  Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ，Ｕ．Ｓ．Ａ．）での、産業用、試験的又は小規模の細胞培養バッチから選択された。細胞培養発酵期間の後、該細胞を分離し、特定の場合には清澄液（収集細胞培養液、ＨＣＣＦ）をプロテインＡクロマトグラフィー、並びに下記の実施例に記載の一又複数の追加のクロマトグラフィー工程及び濾過工程により精製した。精製の様々な工程でのＨＣＣＦ又はインプロセスプールを、実施例３及び５に記載のＥＬＩＳＡアッセイの性能を調べるために使用した。実施例３のＥＬＩＳＡアッセイの使用結果は実施例４に記載されており、実施例５のＥＬＩＳＡアッセイの使用結果は実施例６に記載されている。
【０１７１】
ＭＡｂ定量化のための分光光度法  
抗体の濃度は、ＵＶ可視分光光度計（８４５３モデルＧ１１０３Ａ；Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ；Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ，ＣＡ，Ｕ．Ｓ．Ａ．）又はＮａｎｏＤｒｏｐ  １０００モデルＮＤ−１０００（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ；Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ，Ｕ．Ｓ．Ａ．）を用いて２８０と３２０ｎｍの吸光度により測定した。抗体以外の種（すなわち、不純物）は濃度が低すぎて、ＵＶ吸光度に大した影響はなかった。必要に応じて、試料は、０．１から１．０吸光度単位の範囲内の適切な非干渉希釈剤で希釈した。試料調製及びＵＶ測定は反復で実施し、平均値を記録した。ｍＡｂの吸光係数は、１．４２から１．６４５／ｍｇ・ｍｌ・ｃｍの範囲であった。
【０１７２】
生産物定量化のためのアフィニティークロマトグラフィー／ＨＰＬＣ法（生産物濃度アッセイ）
生産物濃度アッセイは、プロテインＡに結合するポリペプチドの測定のためのアフィニティークロマトグラフィー法である。該方法は、アフィニティークロマトグラフィーを実施するための手段としてＨＰＬＣを用いてもよい。  このアッセイによって測定することができる生産物は、任意のＦｃ含有ポリペプチドを含み、例えば、限定されないが、モノクローナル抗体、二重特異性又は多重特異性抗体、半抗体を含む抗体断片及びイムノアドヘシンを含む。固定化されたプロテインＡ（約１ｍｇ）を含有で容量約０．１ｍＬのアフィニティークロマトグラフィーカラム（直径２．１ｍｍｘ長さ３０ｍｍ、粒径２０μｍ）を、該方法において使用した。プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーカラムは、当該技術分野で既知の方法により作成することができ、また、例えばＬｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから商業的に入手可能である。リン酸緩衝生理食塩水のローディングバッファー中、試料及び異なるＩｇＧ濃度の４つの標準物質をカラム（２０μＬの標準的な注入量）に適用した。典型的に、試料は収集細胞培養液（ＨＣＣＦ）であり、生産物は流速２ｍＬ／分で２％酢酸／１００ｍＭグリシン（ｐＨ２．５）でカラムから溶出された。分析産物（ｐｒｏｄｕｃｔ  ａｎａｌｙｔｅ）の量を算出するために、溶出された物質のピーク面積を、適切な 生成物の吸光係数を用いて、４点ＩｇＧ検量線のピーク面積と比較した。該アッセイの範囲は、典型的に０．０２５ｍｇ／ｍＬから４．０ｍｇ／ｍＬであった。生産物濃度を、次式に従って決定した：ｍｇ／ｍＬ  ＩｇＧ＝ＨＰＬＣ値（ｍｇ／ｍＬ）ｘ（標準物質の吸光係数／供試材の吸光係数）。
【０１７３】
トータルＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＣＨＯＰ）定量化
ＥＬＩＳＡを、ＣＨＯＰと呼ばれるトータル宿主細胞タンパク質のレベルを定量化するために使用した。生産物中のＣＨＯタンパク質を検出するために用いたＥＬＩＳＡは、サンドイッチＥＬＩＳＡフォーマットに基づいていた。アフィニティー精製されたＣＨＯＰに対するポリクローナル抗体を、９６ウェルマイクロタイタープレート上に被覆した。次いで、標準物質、コントロール及び試料を別々のウェルに２つ組で充填した。ＣＨＯＰは、試料中に存在する場合には、被覆抗体（ポリクローナル抗ＣＨＯＰ）に結合する。インキュベーション工程の後、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）コンジュゲート抗ＣＨＯＰポリクローナル抗体をプレートに添加した。最後の洗浄工程の後、ＫＰＬ（Ｋｉｒｋｅｇａａｒｄ  ＆  Ｐｅｒｒｙ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ，カタログ番号５３−００−０３）よりＳＵＲＥＢＬＵＥ  ＲＥＳＥＲＶＥＴＭとして入手可能でもある、テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）の溶液（ＨＲＰによりこの溶液に作用すると、酵素が比色標識を発生させる）を添加することによって、ＣＨＯＰを定量化した。４５０ｎｍでの光学濃度（ＯＤ）を各ウェルにおいて測定した。５−パラメーターカーブフィッティングプログラム（ＳＯＦＴＭＡＸ（登録商標）Ｐｒｏ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ，Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ，ＣＡ）を使用して検量線を作成し、試料ＣＨＯＰの濃度を検量線から算出した。トータルＣＨＯＰ  ＥＬＩＳＡのアッセイ範囲は、５から３２０ｎｇ／ｍｌであった。ＣＨＯＰ濃度（単位ｎｇ／ｍＬ）は、キャリブレーターとしてＣＨＯＰ標準物質を使用する試料中のＣＨＯＰの量を指す。ＣＨＯＰ比率（単位ｎｇ／ｍｇ又はｐｐｍ）は、生産物濃度に対するＣＨＯＰ濃度の算出比率を指し、場合によっては、試験方法用の報告値であった。トータルＣＨＯＰ  ＥＬＩＳＡは、試料中のトータルＣＨＯＰのレベルを定量化するために使用されうるが、個々のタンパク質の濃度は定量化しない。
【０１７４】
市販のＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイキット
本発明者らは、ＰＬＢＬ２を検出する目的のために市販されている二つのキットが、組換え抗体調製物中のＰＬＢＬ２を検出することができるかどうか、また、もし検出できるのであれば、十分な定量化を提供するのか否かを試験した。最初に試験したキットは、ＵＳＣＮ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｉｎｃ．のヒトホスホリパーゼＢ（ＰＬＢ）Ｅ９２０４８Ｈｕ用のＥＬＩＳＡ  Ａｓｓａｙ  Ｋｉｔであった。このキットは、ヒト組織ホモジネート及び他の生体液におけるＰＬＢのインビトロ定量測定用のサンドイッチＥＬＩＳＡとされている。このアッセイで試験した試料は、ＰＬＢＬ２不純物のレベルが質量分析アッセイ（更に後述する）を用いて約３００ｎｇ／ｍｇと決定されている、既知であり陽性の、ハムスターＰＬＢＬ２の供給源（ＣＨＯ細胞から精製した組換え抗体調製物）を含む。ＣＨＯ細胞から精製し、検出可能なＰＬＢＬ２を持たないことが知られている第二の組換え抗体調製物も試験された。０．３から２０ｎｇ／ｍｌ（図１Ａ）の範囲で本キットに含まれるヒトＰＬＢＬ２標準物質の検出を示す検量線が作成されたが、試験試料の反応性は検出されなかった。抗体調製物は双方とも、１０ｍｇ／ｍＬ（陽性試料中のＰＬＢＬ２約３，０００ｎｇ／ｍＬに相当）で、１０ｍｇ／ｍＬから約１．３ｍｇ／ｍＬまでの４回の２倍段階希釈液（陽性試料中のＰＬＢＬ２  ３７５ｎｇ／ｍＬに相当）中で試験された。抗体調製物は双方とも、すべての希釈液で同じ結果、すなわち（例えばバックグラウンドの）ＯＤがおよそ０．１ＡＵがであった。ハムスターＰＬＢＬ２を含有するとわかっている試料と、この不純物を含まないことがわかっている試料との間に差異はなかった。試料希釈の関数としての差異は存在せず、本発明者らの試料中のハムスターＰＬＢＬ２を定量化する能力がないことを示した。本発明者らは、このキットの抗体が本発明者らの試料中のハムスターＰＬＢＬ２不純物を認識しなかったと結論づけた。
【０１７５】
試験した他のキットは、ＣＵＳＡＢＩＯ社のカタログＣＳＢ−ＥＬ０１８１２５Ｈａの、ハムスター推定ホスホリパーゼＢ様２（ＰＬＢＤ２）ＥＬＩＳＡキットであった。このキットは、血清、血漿、組織ホモジネート、細胞溶解物中のハムスター推定ホスホリパーゼＢ−様（ＰＬＢＤ２）濃度の定量的な決定を提供するとしている。ＵＳＣＮ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｉｎｃ．社のキットで試験されたのと同じ試料が、このキットでもアッセイされた。０．１２から８ｎｇ／ｍｌ（図１Ｂ）の範囲での、本キットに含まれるハムスターＰＬＢＬ２標準物質の検出を示す検量線が作成されたが、試験試料の反応性は検出されなかった。上記の通り、抗体調製物は双方とも、１０ｍｇ／ｍＬ（陽性試料中、およそ３，０００ｎｇ／ｍＬＰＬＢＬ２に相当）で、１０ｍｇ／ｍＬからおよそ６２５μｇ／ｍＬまで５回の２倍段階希釈液（陽性試料中、１８８ｎｇ／ｍＬのＰＬＢＬ２に相当）中で試験された。抗体調製物は双方とも、すべての希釈液で同じ結果、すなわち（例えばバックグラウンドの）ＯＤがおよそ０．１ＡＵがであった。ハムスターＰＬＢＬ２を含有するとわかっている試料と、この不純物を含まないことがわかっている試料との間に差異はなかった。試料希釈の関数としての差異は存在せず、本発明者らの試料中のハムスターＰＬＢＬ２を定量化する能力がないことを示した。本発明者らは、このキットの抗体が本発明者らの試料中のハムスターＰＬＢＬ２不純物を認識しなかったと結論づけた。
【０１７６】
したがって、本発明者らは、これらの市販のアッセイは、ハムスターＰＬＢＬ２に陽性であることがわかっている試料中のハムスターＰＬＢＬ２を定量化しなかったと結論づけた。一つの説明としては、これらのアッセイにおける抗ＰＬＢＬ２抗体が本発明者らの試料中で見られるハムスター（ＣＨＯ）−ＰＬＢＬ２に対して低親和性であるということである。別の説明としては、本発明者らの試料のような組換えヒトＩｇＧを高レベルで含有する試料マトリックス中にＣＨＯ−ＰＬＢＬ２が出現した場合に、抗ＰＬＢＬ２抗体はＣＨＯ−ＰＬＢＬ２を検出することができなかったということである。これらの結果は、本発明者らの組換え抗体調製物中のＰＬＢＬ２不純物の検出と正確な定量化を可能にするために、新しい抗ＰＬＢＬ２抗体と新しいアッセイ条件を開発することの必要性を示した。そうした試みは下記の実施例に記されている。
【０１７７】
実施例２-ハムスターＰＬＢＬ２に結合する抗体の生成
抗体調製物中の不純物としてのＰＬＢＬ２の識別は、遺伝子を合成し、次いで発現させ、ハムスターＰＬＢＬ２を精製することに本発明者らを向かわせた。ＰＬＢＬ２に関する文献は、約６６ｋＤの分子量のリソソーム酵素としてＰＬＢＬ２を説明している(F. Deuschl et al., FEBS Lett 580:5747-5752 (2006))。他のリソソーム酵素と同様に、このタンパク質は、マンノース−６−リン酸に対する複数の翻訳後修飾を含み、元々プレプロ酵素として合成される。プロセシングの間、リーダー配列が切り取られ、タンパク質切断が生じ、その結果タンパク質は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル上で３つのバンド、すなわち、インタクトなＰＬＢＬ２（ＭＷ  ６６ｋＤ）、Ｎ末端ドメイン（２８ｋＤ）及びＣ末端ドメイン（４０ｋＤ）として現れる。切断は、酸性ｐＨレベルで生じる。ＮドメインとＣドメインはＳＤＳ−ＰＡＧＥ上で分離しているが、本発明者らは強力な溶媒（例えば、尿素、グアニジン又はエタノール）が断片を分離するために必要とされることを観察したことから、これらの断片はおそらく未変性条件下では分離しない。更に、結晶学的研究のためにＰＬＢＬ２を精製している他の研究所もこの切断を観察しており、クロマトグラフ法で切断されたタンパク質からインタクトなタンパク質を分離することはできていない(F. Deuschl et al., FEBS Lett 580:5747-5752 (2006); A. Jensen et al., Biochem Journal 402, 449-458 (2007), F. Lakomek et al., BMC Structural Biology 9:56 (2009))。
【０１７８】
可溶性ハムスター（チャイニーズハムスター）ＰＬＢＬ２をコードするＤＮＡを公的に入手可能な配列情報（例示的な核酸及びアミノ酸配列については、下記の配列表を参照）から合成し、ヒスチジン（ｈｉｓ）タグの付加を含む当該技術分野で周知の典型的な方法を用いて、標準的な哺乳動物発現ベクターへとクローニングした。可溶性ＰＬＢＬ２は、ＣＨＯ−Ｋ１細胞（ＡＴＣＣ（登録商標）ＣＲＬ９６１８ＴＭ）中に一過性発現された。細胞培養上清を収集し（ＨＣＣＦと呼ばれる）、以下の方法を使用してＰＬＢＬ２を精製した。
【０１７９】
収集細胞培養液（ＨＣＣＦ）を、１０ｋＤａの分子量カットオフ（ＭＷＣＯ）膜を使用するタンジェント流濾過（ＴＦＦ）により１０倍に限外濾過（ＵＦ）した。ＵＦ  ＨＣＣＦを、１０容量のリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）、ＮａＣｌバッファーに対してダイアフィルトレーション（ＤＦ）した。ＵＦ／ＤＦ  ＨＣＣＦを、Ｎｉ−ＮＴＡ固定化金属アフィニティークロマトグラフィー（ＩＭＡＣ）カラム（ＱＩＡＧＥＮ、カタログ番号３０６２２）に適用し、イミダゾールの上昇勾配で溶出した。硫酸ナトリウム含有バッファーでＮｉ−ＮＴＡプールを調整し、次いでオクチル−セファロースＣＬ−４Ｂ疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）カラム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、製品番号１７−０７９０−０１）に適用した。オクチル−セファロースカラムを、硫酸ナトリウムの下降勾配で溶出した。オクチル−セファロースプールを、Ｎｉ−ＮＴＡカラム上で再度クロマトグラフィーにかけ、高濃度のイミダゾールで段階溶出した。Ｎｉ−ＮＴＡ再クロマトグラフィープールを、１０ｋＤａの分子量カットオフ膜（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）を備えた遠心濾過ユニットを用いて濃縮した。濃縮されたＮｉ−ＮＴＡ再クロマトグラフィープールを、Ｓｕｐｅｒｄｅｘ２００サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）カラム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、製品番号１７−１０４３−０２）上で作成した。Ｓｕｐｅｒｄｅｘ  ２００カラムからの画分を回収し、ドデシル硫酸ナトリウム  ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）、高圧液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）及びウェスタンブロット法（トータルチャイニーズハムスター卵巣タンパク質、ＣＨＯＰに対する抗体（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．）と、ホスホリパーゼＢ２に対する市販の抗体を使用）により分析し、純度を決定した。
【０１８０】
モノクローナル抗体を生成するために、５匹のＢａｌｂ／ｃマウス（Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，Ｉｎｃ．，Ｈｏｌｌｉｓｔｅｒ，ＣＡ）を、代謝可能なスクアレン（４％ｖ／ｖ）、Ｔｗｅｅｎ８０（０．２％ｖ／ｖ）、トレハロース６，６−ジミコレート（０．０５％ｗ／ｖ）及びモノホスホリルリピドＡ（０．０５％ｗ／ｖ；全成分は米国のＳｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ社から入手）含有アジュバント中の精製した組換え可溶性ＰＬＢＬ２を用いて３−４日おきに各足蹠及び腹腔内に免疫した。６回の注射後、標準的な酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）により血清力価を評価し、ＰＬＢＬ２に対する陽性血清力価を有するマウスを特定した。最も高い力価を示した二匹のマウスの脾臓及びリンパ節からのＢ細胞を、電気融合（Ｈｙｂｒｉｍｕｎｅ；Ｈａｒｖａｒｄ  Ａｐｐａｒａｔｕｓ，Ｉｎｃ．，Ｈｏｌｌｉｓｔｏｎ，ＭＡ）によりマウス骨髄腫細胞と融合させた。７日後、Ｃｌｏｎｅｐｉｘ−ＦＬ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ，Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ，ＣＡ）を使用して、ハイブリドーマ培地含有９６ウェル組織培養プレートに約５０００個のコロニーを採取した。ハイブリドーマ上清を収集し、直接ＥＬＩＳＡによりＰＬＢＬ２特異的抗体生成についてスクリーニングした。ＥＬＩＳＡによりＰＬＢＬ２タンパク質への特異的結合を示した２５個のクローンが、  ＯＣＴＥＴ（登録商標）（ＦｏｒｔｅＢｉｏ，Ｉｎｃ．，Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ，ＣＡ）によって測定される親和性に基づき更にランク付けされた。マウスハイブリドーマ上清を、カイネティックス（ｋｉｎｅｔｉｃｓ）バッファー（ＦｏｒｔｅＢｉｏ，Ｉｎｃ．，Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ，ＣＡ）中５μ／ｍｌに希釈するか又は（濃度が５ｍｇ／ｍｌ未満であれば）希釈せずに、抗マウスＩｇＧ（Ｆｖ）センサーチップ（ＦｏｒｔｅＢｉｏ，Ｉｎｃ．，Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ，ＣＡ）上に捕捉し、続いて１０μ／ｍｌで該センサーをＰＬＢＬ２タンパク質に浸した。会合及び解離反応速度測定は、ＦｏｒｔｅＢｉｏデータ分析ソフトウェアを用いて決定した。２５個のクローンをすべて、Ｃ末端、Ｎ末端及びＰＬＢＬ２全体への結合についてウェスタンブロットにより更に特徴づけた。Ｃ若しくはＮ末端又はインタクトなＰＬＢＬ２タンパク質の何れかに免疫結合を示すクローン１．２６Ｇ６、１．２０Ｂ５、１．１９Ｃ１０、１．１５Ｇ１１、１．４Ｅ２、１．３９Ｃ１０及び１．３０Ｆ３のハイブリドーマ上清を、アフィニティークロマトグラフィー（ＭａｂＳｅｌｅｃｔ  ＳｕＲｅ；ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ  Ｂｉｏ−Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）により精製し、滅菌濾過し、ＰＢＳに４℃で保存した。７抗体から高収率の４抗体をビオチン化のために選択した。ビオチン化抗体と非ビオチン化抗体双方の結合活性をＯｃｔｅｔにより確認した。次いで精製抗体を、ＥＬＩＳＡアッセイの開発における使用可能性について評価した。二の抗体（１．１９Ｃ１０と１．１５Ｇ１１）が、ＥＬＩＳＡアッセイの開発用に選択された。
【０１８１】
抗体１．１９Ｃ１０と１．１５Ｇ１１の双方を、Ｉｓｏｓｔｒｉｐ  Ｍｏｕｓｅ  ｍＡｂ  Ｉｓｏｔｙｐｉｎｇ  Ｋｉｔ（Ｒｏｃｈｅ  Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｉｎｄｉａｎａｐｏｌｉｓ，ＩＮ）を用い、ＩｇＧ１、カッパであると判定した。これらの抗体の各々をコードするＤＮＡをクローニングし、２９３細胞又はＣＨＯ細胞の何れかにおいて一過性に発現させた。ＣＨＯ細胞における一過性発現のためのクローン１．１５Ｇ１１及び１．１９Ｃ１０由来の抗体可変配列を得るために、ｃＤＮＡの５’末端の迅速増幅（５’ＲＡＣＥ）法が使用されたが、この方法は、上述した方法に基づいている（例えば、Nature Methods 2, 629 - 630 (2005)、及びMolecular Cloning: A Laboratory Manual (eds. Sambrook, J. & Russell, D.W.)第8章 Protocol 9, 8.54-8.60 (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, USA, 2001)の「Rapid amplification of 5’ cDNA ends」 参照）。トータルＲＮＡを、ＲＮｅａｓｙ  Ｐｌｕｓキット（Ｑｉａｇｅｎ，Ｖａｌｅｎｃｉａ，ＣＡ）を用いて培養したハイブリドーマ細胞（少なくとも１０６細胞）から抽出し、ＳＭＡＲＴｅｒ  ＲＡＣＥ  ｃＤＮＡ増幅キット（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ  Ｉｎｃ．，Ｍｏｕｎｔａｉｎ  Ｖｉｅｗ，ＣＡ）を用いてｃＤＮＡを調製した。重鎖及び軽鎖の可変領域を増幅するために、ｃＤＮＡの５’末端のオリゴを標的とするユニバーサルライマーＡミックス（ＳＭＡＲＴｅｒ  ＲＡＣＥ  ｃＤＮＡ増幅キットに含められている）、及びマウスＩｇＧ重鎖の定常領域とカッパ軽鎖を標的とするリバースプライマーを、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）においてそれぞれ使用した。ＰＣＲ条件は次のように設定した：１μＬのｃＤＮＡ、５μＬ１０倍のユニバーサルプライマーミックス、１μＬ１０μＭのリバースプライマー、４５μＬＰＣＲプレミックス（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｉｎｃ．Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）；９４℃で２分、続いて９４℃で３０秒、５５℃で３０秒、７２℃で３０秒を３０サイクル、そして７２℃で１０分。ＰＣＲ産物は、ＤＮＡのアガロースゲル上で分解され、期待されるサイズ（重鎖が７００ｂｐ、及び軽鎖が５００ｂｐ）を有するＰＣＲ産物を配列解析用ゲルから精製し、重鎖及び軽鎖（ＶＨ及びＶＫ）の可変領域のＤＮＡ配列を決定した。
【０１８２】
上記のＶＨ／ＶＫ領域を抗体発現ベクターへとクローニングするために、本発明者らはＩｎ−Ｆｕｓｉｏｎ（登録商標）クローニング法（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ  Ｉｎｃ．）及び次のプライマーを使用した：１．１５Ｇ１１重鎖、フォワードプライマー  ５’−ＡＣＴ  ＧＧＡ  ＧＣＧ  ＴＡＣ  ＧＣＴ  ＧＡＡ  ＧＴＧ  ＡＡＧ  ＣＴＴ  ＧＡＧ  ＧＡＧ  ＴＣＴ−３’（配列番号２３）、リバースプライマー  ５’−ＡＡＧ  ＡＣＣ  ＧＡＴ  ＧＧＧ  ＣＣＣ  ＴＴＧ  ＧＴＧ  ＧＡＧ  ＧＣＴ  ＧＡＧ  ＧＡＧ  ＡＣＧ  ＧＴＧ  ＡＣＴ  ＧＡＧ  ＧＴＴ  Ｃ−３’（配列番号２４）；１．１９Ｃ１０重鎖、フォワードプライマー  ５’−ＡＣＴ  ＧＧＡ  ＧＣＧ  ＴＡＣ  ＧＣＴ  ＧＡＧ  ＧＴＧ  ＣＡＧ  ＣＴＴ  ＣＡＧ  ＧＡＧ  ＴＣＡ−３’（配列番号２５）、リバースプライマー  ５’−ＡＡＧ  ＡＣＣ  ＧＡＴ  ＧＧＧ  ＣＣＣ  ＴＴＧ  ＧＴＧ  ＧＡＧ  ＧＣＴ  ＧＡＧ  ＧＡＧ  ＡＣＴ  ＧＴＧ  ＡＧＡ  ＧＴＧ  ＧＴＧ  Ｃ−３’（配列番号２６）。１．１５Ｇ１１と１．１９Ｃ１０双方の軽鎖については、フォワードプライマー  ５’−ＧＣＡ  ＡＣＴ  ＧＣＡ  ＡＣＣ  ＧＧＴ  ＧＴＡ  ＣＡＴ  ＴＣＡ  ＧＡＣ  ＡＴＴ  ＧＴＧ  ＡＴＧ  ＡＣＣ  ＣＡＧ  ＴＣＴ−３’（配列番号２７）、リバースプライマー  ５’−ＧＧＴ  ＧＣＡ  ＧＣＣ  ＡＣＧ  ＧＴＣ  ＣＧＣ  ＴＴＣ  ＡＧＣ  ＴＣＣ  ＡＧＣ  ＴＴＧ  ＧＴＡ  ＣＣ−３’（配列番号：２８）を使用した。１μＬのｃＤＮＡを、前述したのと同じ条件下でＰＣＲの鋳型として使用した。次いでＰＣＲ産物を、抗体発現ベクターへのサブクローニング用のＰＣＲクリーンアップキット（Ｑｉａｇｅｎ  Ｉｎｃ．）を用いて精製した。マウスＩｇＧ１発現ベクターをＢｓｉＷＩ及びＡｐａＩ消化により線状化し、マウスカッパ発現ベクターをＡｇｅＩ及びＢｓｓＨＩＩを用いて消化した。Ｉｎ−Ｆｕｓｉｏｎ（登録商標）クローニング反応のために、５０ｎｇの線状化ベクターＤＮＡ及び５０ｎｇのＶＨ又はＶＫ  ＰＣＲ産物を、５倍Ｉｎ−Ｆｕｓｉｏｎ（登録商標）酵素と共に混ぜ合わせ、次いで５０℃で１５分間インキュベートした。３μＬのＩｎ−Ｆｕｓｉｏｎ（登録商標）反応液を、形質転換及びカルベニシリン（５０μｇ／ｍＬ）選択ＬＢ寒天プレート上でのプレーティングのために使用した。プラスミドＤＮＡ精製のために単一コロニーを採取し、培養した。インフレームＶＨ又はＶＫインサートを有するクローンを配列解析で同定した。
【０１８３】
組換え抗体を、上記のように精製し、直接ＥＬＩＳＡとＯＣＴＥＴ（登録商標）（ＦｏｒｔｅＢｉｏ，Ｉｎｃ．，Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ，ＣＡ）の双方により（上記の通りにアッセイし）精製ハイブリドーマ由来の抗体と比較して同等のものであることがわかった。上記のように生成される組換え抗体は、それぞれ１９Ｃ１０及び５Ｇ１１と称される。１９Ｃ１０及び５Ｇ１１のアミノ酸配列情報は、配列表中に提供される。
【０１８４】
ポリクローナル抗体を生成するために、血清病原体フリーのメスのニュージーランド白ウサギ三羽（Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ，Ｍｏｕｎｔａｉｎ  Ｖｉｅｗ，ＣＡ）を、ヒドロゲル及びムラミルジペプチド（ＭＤＰ）含有アジュバント中の（上述の通りに）精製された組換えＰＬＢＬ２を用いて、２週間おきに首の皮下に免疫した。各注射は、精製組換え可溶性ＰＬＢＬ２を１５０ｕｇ含有していた。０日目、２１日目、４９日目、６３日目、８４日目及び１１２日目の計６回注射が施された。抗体価を調べるために、各ウサギを、４２日目、７０日目、７７日目、９１日目、９８日目、１１９日目及び１２６日目の計７回採血した。これらのウサギを１３４日目に失血させた。コントロールとして、注射前０日目に、各ウサギから免疫前血清を採取した。
【０１８５】
ＰＬＢＬ２に対する抗体の反応性を決定するために、溶液相捕捉法（ｓｏｌｕｔｉｏｎ  ｐｈａｓｅ  ｃａｐｔｕｒｅ  ｍｅｔｈｏｄ）において抗血清を使用した。溶液相捕捉法では、三羽の異なるウサギ（ウサギＡ、Ｂ及びＣ）からの免疫前抗血清を、１／１０００の初期希釈から連続的に希釈した。希釈した血清を、非結合９６ウェルプレートに２時間３μｇ／ｍＬで、固定濃度のビオチン化ＰＬＢＬ２と共にインキュベートした。次いで、その溶液を、Ｓｕｐｅｒｂｌｏｃｋ  Ｂｌｏｃｋｉｎｇバッファー（Ｐｉｅｒｃｅ  製品＃１５１２９）をと共にＰｉｅｒｃｅ  ＮｅｕｔｒＡｖｉｄｉｎ  Ｃｏａｔｅｄ  Ｃｌｅａｒ  ９６ウェルプレートに移し、ビオチン化ＰＬＢＬ２を捕捉するために１時間インキュベートした。インキュベーション工程の後、非結合材料を、Ｗａｓｈ  Ｂｕｆｆｅｒ（０．０５％Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ  ２０／ＰＢＳ［Ｃｏｒｎｉｎｇ  Ｃｅｌｌｇｒｏ  カタログ番号９９−７１７−ＣＭ］）を用いて洗い流した。ペルオキシダーゼコンジュゲートＡｆｆｉｎｉＰｕｒｅヤギ抗ウサギＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｒｅｓｅａｒｃｈ  カタログ番号１１１−０３５−１４４）を、希釈因子１／２００００でＡｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔ中に希釈し、マイクロタイタープレートのウェルに添加した。２時間の室温でのペルオキシダーゼコンミュゲートヤギ抗ウサギＩｇＧを用いたインキュベーション工程の後、（上記の）Ｗａｓｈ  Ｂｕｆｆｅｒでの最終洗浄工程を実施した。次に、ＴＭＢの溶液（５０μｌ／ウェル）（メリーランド州ゲイサーズバーグのＫＰＬ（Ｋｉｒｋｅｇａａｒｄ  ＆  Ｐｅｒｒｙ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．）社のＳＵＲＥＢＬＵＥ  ＲＥＳＥＲＶＥＴＭ、カタログ番号５３−００−０３）を添加することにより色を発色させ、続いて１０〜２０分間室温でインキュベーションした。検出は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ社ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ  Ｍ５ｅを使用し、各ウェルにおいて４５０ｎｍの光学密度（ＯＤ）を評価することにより実施された。５−パラメーターカーブフィッティングプログラム（ＳｏｆｔＭａｘ  Ｐｒｏ  ｖ５．２  ｒｅｖ  Ｃ）を使用してデータを処理した。
【０１８６】
上述の溶液相捕捉実験に基づいて、三羽すべてのウサギからの抗血清がＰＬＢＬ２に対する良質の抗体を持つことが判明した。三羽すべてのウサギの免疫前血清は、ＰＬＢＬ２に対して親和性を持たなかった。三羽すべてのウサギがＰＬＢＬ２に対して類似した応答曲線を示したため、三羽すべてのウサギからの全採血抗血清を、ポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイ（下記の実施例５に記載）のために単一ロットにまとめた。
【０１８７】
６０％硫酸アンモニウムを用い、プールされたウサギ抗血清を最初に分画し、次いで血清中のすべての抗体を沈殿させた。ＰＬＢＬ２に対して産生された抗体を選択するために、アフィニティークロマトグラフィーを使用した。ＰＬＢＬ２をグリセリル−ＣＰＧ上に固定化させ、ゲルをクロマトグラフィーカラムに充填した。６０％硫酸アンモニウムペレットをＰＢＳに溶解させ（ｐＨ７．２）、ＰＬＢＬ２−ＣＰＧカラムに充填した。充填完了後、カラムをＰＢＳ＋０．０２％ＮａＮ３（ｐＨ７．２）で洗浄した。ＰＬＢＬ２に対する抗体を、ＰＢＳ（ｐＨ２．０）を用いてアフィニティーカラムから溶出させ、溶出プールを１．０Ｍトリス（ｐＨ７．５〜８．０）溶液中に回収した。  最後に、精製された抗ＰＬＢＬ２抗体を濃縮し、サイズ排除クロマトグラフィーを使用してバッファーをＰＢＳ＋０．０２％ＮａＮ３（ｐＨ７．２）に交換した。下記の実施例５に記載のポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡにおいて、アフィニティー精製されたウサギポリクローナル抗体を使用した。
【０１８８】
実施例３-マウスモノクローナル抗ハムスターＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイ
組換えポリペプチド試料（例えば組換え抗体又はイムノアドヘシン調製物）中のＣＨＯＰ不純物であるＰＬＢＬ２を検出し定量化するためのＥＬＩＳＡアッセイを開発した。手順は以下の通り。マウスモノクローナル抗体１９Ｃ１０を、炭酸バッファー（０．０５Ｍの炭酸ナトリウム、ｐＨ９．６）中０．５μ／ｍＬの濃度で、９６ウェルマイクロタイタープレートの半分に一晩２〜８℃で被覆した。被覆後、タンパク質の非特異的な付着を防ぐために、Ｂｌｏｃｋｉｎｇ  Ｂｕｆｆｅｒ（０．１５ＭのＮａＣｌ、０．１Ｍリン酸ナトリウム、０．１％魚ゼラチン、０．０５％ポリソルベート２０、０．０５％Ｐｒｏｃｌｉｎ（登録商標）３００［Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ］；Ａｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔとも称される）を用いて該プレートをブロックした。標準物質、コントロール及び試料を、Ａｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔ（０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、０．１Ｍ  リン酸ナトリウム、０．１％魚ゼラチン、０．０５％ポリソルベート２０、０．０５％Ｐｒｏｃｌｉｎ（登録商標）３００  ［Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ］）に希釈し、次いで別々のウェルに二つ組で充填し、室温（２２〜２７℃）で２時間インキュベートした。ＰＬＢＬ２は、試料中に存在する場合、被覆（本明細書では捕捉とも言われる）抗体に結合するであろう。上記のインキュベーション工程の後、Ｗａｓｈ  Ｂｕｆｆｅｒ（０．０５％ポリソルベート２０／ＰＢＳ［Ｃｏｒｎｉｎｇ  ｃｅｌｌｇｒｏ  カタログ番号９９−７１７−ＣＭ］）を用いて未結合材料を洗い流し、ビオチンコンジュゲート１５Ｇ１１抗ＰＬＢＬ２マウスモノクローナル抗体をＡｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔに濃度０．０３１２５μ／ｍＬまで希釈し、マイクロタイタープレートのウェルに添加した。
【０１８９】
ビオチンコンジュゲーションを以下の通り実施した。Ｐｉｅｒｃｅ  Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社からビオチン化キット（Ｐ／Ｎ  ２０２１７，Ｅ−Ｚ  Ｌｉｎｋ  ＮＨＳ−Ｂｉｏｔｉｎ）を、またＪａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏ社からストレプトアビジン−ＨＲＰ（ＳＡ−ＨＲＰ）（カタンログ゛番号０１６−０３０−０８４）を購入した。Ｐｉｅｒｃｅのキットの説明書に従った。簡潔に述べれば、ＩｇＧをＰＢＳ（ｐＨ７．４）に透析し、ビオチンをそのタンパク質に添加し、室温で１時間混合した。次いで、過剰ビオチンを除去するためにＰＢＳ（ｐＨ７．４）に対して標識抗体を透析し、濾過し、Ａ２８０によりタンパク質濃度を決定した。
【０１９０】
室温でのビオチン化１５Ｇ１１との２時間のインキュベーション工程の後、ストレプトアビジンＨＲＰ（Ａｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔに１：２０００００希釈）をマイクロタイタープレートウェルに添加した。（上記の）Ｗａｓｈ  Ｂｕｆｆｅｒを用いた最終洗浄工程の後、ＴＭＢの溶液（５０μ／ウェル）（メリーランド州ゲイサーズバーグのＫＰＬ（Ｋｉｒｋｅｇａａｒｄ  ＆  Ｐｅｒｒｙ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．）社のＳＵＲＥＢＬＵＥ  ＲＥＳＥＲＶＥＴＭ、カタログ番号５３−００−０３）を添加することにより（ＰＬＢＬ２の定量化のために）色を発色させ、続いて、室温で１０〜２０分間のインキュベーションをした。検出は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ社ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ  Ｍ５ｅを使用し、各ウェルにおいて４５０ｎｍの光学密度（ＯＤ）を評価することにより実施された。４−パラメーターカーブフィッティングプログラム（ＳｏｆｔＭａｘ  Ｐｒｏ  ｖ５．２  ｒｅｖ  Ｃ）を使用して検量線を作成し、試料ＰＬＢＬ２濃度を検量線の直線範囲から算出した。
【０１９１】
図２に示すように、１９Ｃ１０及び１５Ｇ１１モノクローナル抗体を用いるＰＬＢＬ２アッセイは、４−ｐｔパラメーターフィットを用いてＳ字形曲線を示した。名目上のＰＬＢＬ２（ｎｇ／ｍｇ又はｐｐｍ）を算出するために、検量線の直線範囲の値を用いた。直線範囲は、プレートによってわずかに変化し、約ＥＣ１０‐ＥＣ８５又は１．５−４０ｎｇ／ｍＬであった。このＥＬＩＳＡを用いて得られたＰＬＢＬ２についての値は、他の方法（例えば、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ、ポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡ、又はアッセイのＬＯＱまで希釈した場合はトータルＣＨＯＰ  ＥＬＩＳＡ［表３及び４参照］）による推定値と同等であった。
【０１９２】
実施例４-モノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイ使用結果
上の実施例３で述べたハムスターＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイを使用して、本発明者らは、異なる条件下でＰＬＢＬ２の混入量を定量化するために、ＣＨＯ細胞中で産生された種々のモノクローナル抗体（ｍＡｂ）調製物を評価した。本発明者らは、未精製の収集細胞培養液（ＨＣＣＦ）のみならず精製調製物の複数回の試験を評価した。場合によっては、比較のために、本発明者らはＬＣ−ＭＳ／ＭＳによりＰＬＢＬ２ペプチドの量も定量化した。ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ法は以下の通り実施された。
【０１９３】
ＬＣ−ＭＳ／ＭＳによるＰＬＢＬ２の定量化のために、Ｗａｔｅｒｓ  Ａｃｑｕｉｔｙ  Ｈ−Ｃｌａｓｓ  Ｂｉｏ  ＵＰＬＣ及びＡＢ  Ｓｃｉｅｘ  ＴｒｉｐｌｅＴＯＦ  ５６０００＋質量分析計を用いた。試料及びキャリブレーション標準物質（マウスＮＳ０細胞株から得られた組換えヒト化モノクローナル抗体調製物にスパイクされた組換えＰＬＢＬ２［該ＮＳ０細胞株は、ハムスターＰＬＢＬ２を含有しない］）が減少し、トリプシンにより消化された。合計４０μｇの消化された試料は、Ｗａｔｅｒｓ  ＢＥＨ３００  Ｃ１８カラム、粒径１．７μｍを使用してＵＰＬＣに注入された。アセトニトリルの直線勾配を、３００μｌ／分の流速及び６０℃のカラム温度で、ペプチドを溶出するために使用した。
【０１９４】
ＵＰＬＣから溶出するペプチドは、ポジティブイオン化モードでのエレクトロスプレーイオン化により、質量分析計に導入された。５５００ｖのＩｏｎＳｐｒａｙ電圧でイオン源温度を４００℃に、デクラスタリング電位を７６ｖに設定した。選択されたペプチドイオンの断片化のために衝突エネルギー設定３２を使用した。質量分析計は、４つの特定のＰＬＢＬ２ペプチド及びそれらの断片イオン遷移を用いる、多重反応モニタリング高解像度（ＭＲＭＨＲ）モードで操作した。親イオンは、１．２ａｍｕの質量電荷比（ｍ／ｚ）選択ウィンドウを備える四重極質量分析計により選択された。各親イオンの断片イオンを、飛行時間型質量分析計により分離し、０．０２５ａｍｕの選択ウィンドウで定量化ポストデータ収集のために選択した。
【０１９５】
試料中のＰＬＢＬ２の濃度は、四つの遷移の特異的なシグナルレスポンスを測定すること、線形フィットを用いて２から５００ｐｐｍの範囲で、標準物質のシグナルレスポンスによってキャリブレーションされることにより決定された。以下の表２は、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳによりモニターされたＰＬＢＬ２ペプチドのリストを示す。ＬＣ−ＭＳ／ＭＳによりモニターされた各ペプチドの代表的な検量線を図３に示す。
2019197059.tif 000003
【０１９６】
以下の表３及び４は、二つの異なるｍＡｂ調製物（ｍＡｂ  Ａ及びｍＡｂ  Ｂ）の、実施例３に記載のＬＣ−ＭＳ／ＭＳ及びハムスターＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの双方により決定された種々の精製試験でのＰＬＢＬ２比率を示す。正確には上述のＣＨＯＰの比率は、ＰＬＢＬ２比率がｎｇ／ｍｇ又はパーツ・パー・ミリオン（ｐｐｍ）として提供され、生産物（ｍＡｂ）濃度に対するＰＬＢＬ２濃度の算出比率を表す。表３及び４に示された結果は、ＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイが広範囲にわたり異なる精製プロセス下で（各試験番号は異なる精製プロセスを示す）、二の異なるｍＡｂ調製物中のＰＬＢＬ２レベルを定量化することができたことを表す。
2019197059.tif 000004
2019197059.tif 000005
【０１９７】
本発明者らはまた、実施例３に記載のＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの、未精製ＨＣＣＦ中に混入しているＰＬＢＬ２のレベルを決定する能力を、多くのｍＡｂ調製物（そのうちの幾つかはＩｇＧ１で、幾つかはＩｇＧ４であった）について評価した。結果は図４に示されている。図４でわかるように、このＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイは、ＨＣＣＦ中の広範囲のＰＬＢＬ２を定量化することができた。ＰＬＢＬ２のレベルは異なるｍＡｂ  ＨＣＣＦ試料間で大きく異なるものの、複製ＨＣＣＦ調製物（試験）の再現性は、どのｍＡｂでも良好であった。アイソタイプ（ＩｇＧ１又はＩｇＧ４）とＨＣＣＦ中のＰＬＢＬ２レベルとの間に明確な相関関係は見られなかった（データは示さない）。
【０１９８】
更に、本発明者らは、実施例３に記載のモノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイを使用し、ｍＡｂ  Ｇの最終的な限外濾過／ダイアフィルトレーション（ＵＦＤＦ）工程を伴う３カラムクロマトグラフィー精製プロセスによってＰＬＢＬ２のクリアランスを評価した。結果を図５に示す。ＰＬＢＬ２レベルはＨＣＣＦ中で最も高く、該精製プロセスは最終的なｍＡｂ  Ｇ調製物からＰＬＢＬ２を取り除くのに有効であった。モノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイは、良好な感度及び特異性を実証し、未精製ＨＣＣＦ中のＰＬＢＬ２レベルを精製の各段階で定量化するのに有効であった。本発明者らは、モノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイがトータルＣＨＯＰアッセイで見られた「抗原過剰」問題の対象ではないことを示す、様々な生産物希釈度での直線性を認めた。
【０１９９】
実施例５‐ウサビポリクローナル抗ハムスターＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイ
組換え抗体又はイムノアドヘシン調製物といった組換えポリペプチド試料中のＣＨＯＰ不純物であるＰＬＢＬ２を検出し定量化するためのＥＬＩＳＡアッセイが開発された。手順は以下の通り。アフィニティー精製ウサギポリクローナル抗体を、炭酸バッファー（０．０５Ｍの炭酸ナトリウム、ｐＨ９．６）中０．５／ｍＬの濃度で、９６ウェルマイクロタイタープレートの半分に一晩２〜８℃で被覆した。被覆後、タンパク質の非特異的な付着を防ぐために、Ｂｌｏｃｋｉｎｇ  Ｂｕｆｆｅｒ（０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、０．１Ｍリン酸ナトリウム、０．１％魚ゼラチン、０．０５％Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ２０、０．０５％Ｐｒｏｃｌｉｎ（登録商標）３００［Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ］）を用いて該プレートをブロックした。標準物質、コントロール及び試料を、Ａｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔ（０．１５ＭのＮａＣｌ、０．１Ｍのリン酸ナトリウム、０．１％魚ゼラチン、０．０５％Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ２０、０．０５％Ｐｒｏｃｌｉｎ（登録商標）３００［Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ］）中に希釈し、次いで別々のウェルに二つ組で充填し、室温（２２〜２７℃）で２時間インキュベートした。ＰＬＢＬ２が試料中に存在する場合、被覆抗体（本明細書では捕捉抗体とも称される）に結合させる。上記のインキュベーション工程の後、Ｗａｓｈ  Ｂｕｆｆｅｒ（０．０５％Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ２０／ＰＢＳ［Ｃｏｒｎｉｎｇ  Ｃｅｌｌｇｒｏ  カタログ番号９９−７１７−ＣＭ］）を用いて未結合材料を洗い流し、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）コンジュゲートアフィニティー精製ウサギポリクローナル抗体をＡｓｓａｙ  Ｄｉｌｕｅｎｔに濃度４０ｎｇ／ｍＬまで希釈し、マイクロタイタープレートのウェルに添加した。
【０２００】
ＨＲＰコンジュゲーションを以下の通り実施した。ＨＲＰコンジュゲーションキットをＰｉｅｒｃｅ  Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃより購入した（製品番号３１４８９、Ｅ−Ｚ  Ｌｉｎｋ  Ｐｌｕｓ  Ａｃｔｉｖａｔｅｄ  Ｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ  ａｎｄ  Ｋｉｔ）。Ｐｉｅｒｃｅのキットの説明書に従った。簡潔に述べれば、ＩｇＧをＣａｒｂｏｎａｔｅ−Ｂｉｃａｒｂｏｎａｔｅバッファー（ｐＨ９．４）に透析し、ＥＺ−Ｌｉｎｋ  Ｐｌｕｓ  Ａｃｔｉｖａｔｅｄ  Ｐｅｒｏｘｉｄａｓｅをそのタンパク質に添加し、室温で１時間混合した。次にシアノ水素化ホウ素ナトリウム及びグエンチングバッファーを添加し、コンジュゲーションを安定させ反応をクエンチした。次いで、ＰＢＳ（ｐＨ７．４）に対して標識抗体を透析し、濾過し、Ａ２８０によりタンパク質濃度を決定した。
【０２０１】
２時間の室温でのＨＲＰコンジュゲートウサギポリクローナル抗体とのインキュベーション工程の後、（上に記載の）Ｗａｓｈ  Ｂｕｆｆｅｒでの最終洗浄工程を実施した。その後、ＴＭＢの溶液（５０μｌ／ウェル）（メリーランド州ゲイサーズバーグのＫＰＬ（Ｋｉｒｋｅｇａａｒｄ  ＆  Ｐｅｒｒｙ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．）社のＳＵＲＥＢＬＵＥ  ＲＥＳＥＲＶＥＴＭ、カタログ番号  ５３−００−０３）を添加することにより、（ＰＬＢＬ２定量化に対して）色を発色させ、続いて１０〜２０分間室温でインキュベーションした。検出は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ社ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ  Ｍ５ｅを使用し、各ウェルにおいて４５０ｎｍの光学密度（ＯＤ）を評価することにより実施された。５−パラメーターカーブフィッティングプログラム（ＳｏｆｔＭａｘ  Ｐｒｏ  ｖ５．２  ｒｅｖ  Ｃ）を使用して検量線を作成し、試料ＰＬＢＬ２の濃度を検量線の直線範囲から算出した。
【０２０２】
図６に示すように、アフィニティー精製ウサギポリクローナル抗体を用いるＰＬＢＬ２アッセイは、５−ｐｔパラメーターフィットを用いてＳ字形曲線を示した。名目上のＰＬＢＬ２（ｎｇ／ｍｇ又はｐｐｍ）を算出するために、検量線の直線範囲の値を用いた。このアッセイの定量範囲は０．５‐５０ｎｇ／ｍＬであった。このＥＬＩＳＡを用いて得られたＰＬＢＬ２についての値は、他の方法（例えば、マウスモノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡ、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ又はアッセイのＬＯＱまで希釈した場合はトータルＣＨＯＰ  ＥＬＩＳＡ）によってなされた推定値と同等であった。
【０２０３】
実施例６-ポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイ使用結果
本発明者らは、実施例５に記載のポリローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイを使用し、ｍＡｂ  Ｇの最終的な限外濾過／ダイアフィルトレーション（ＵＦＤＦ）工程を伴う３カラムクロマトグラフィー精製プロセスによってＰＬＢＬ２のクリアランスを評価した。結果を図７に示す。モノクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイで見られたように、ＰＬＢＬ２レベルはＨＣＣＦ中で最も高く、該精製プロセスは最終的なｍＡｂ  Ｇ調製物からＰＬＢＬ２を取り除くのに有効であった。ポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイは、良好な感度及び特異性を実証し、未精製ＨＣＣＦ中のＰＬＢＬ２レベルを精製の各段階で定量化するのに有効であった。本発明者らは、ＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイがトータルＣＨＯＰアッセイで見られた「抗原過剰」問題の対象ではないことを示す、様々な生産物希釈度での直線性を認めた。
【０２０４】
更に、本発明者らは、モノクローナルアッセイを使用して検出されたＰＬＢＬ２の量を、異なる七回のｍＡｂ  Ａ試験（表５に示すように、精製の様々な段階を含む）及び一回のｍＡｂ  Ｂの試験でのポリクローナルアッセイを用いて検出されたＰＬＢＬ２の量とを比較した。結果を表５に示す。見てわかるように、各アッセイを使用して得られた結果の間の相対的差異％は、二つのアッセイが同等の結果をもたらすことを示している。
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【０２０５】
結論
まとめると、これらのデータは、本明細書に記載のモノクローナル及びポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの各々が強固で特異的且つ高感度であることを示している。各アッセイが、様々な精製条件下で広範囲のＰＬＢＬ２レベルを有する多数の異なるＭＡｂ調製物に混入しているハムスターＰＬＢＬ２  ＣＨＯＰを正確に定量化できることを本発明者らは示した。本発明者らはまた、ＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイが、不純物クリアランスをモニターするために精製プロセスの各工程中に使用されうることも示した。したがって、本明細書に記載のモノクローナル及びポリクローナルＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの各々は、最終産物中のＰＬＢＬ２レベルを定量化するためのみならず、精製プロセス進行中のクリアランスをモニターするための有効なツールである。
【０２０６】
実施例７‐細胞株をスクリーニング又は選択するためのＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイの使用
上記及び図４に示した通り、本発明者らは、異なるｍＡｂ産生細胞株間で、ＨＣＣＦ中のＰＬＢＬ２レベルに大きな差異（幾つかの細胞株は他と比較して２０倍のＰＬＢＬ２レベルを有した）があることを認めた。このような大きな差異は、例えば下流の精製プロセスの負荷を削減するために、ＨＣＣＦ中に低レベルのＰＬＢＬ２を生成する生産物細胞株、更に場合によっては宿主細胞株（すなわち、如何なる生産物も生成しない宿主細胞）を特定することが望まれることを示唆している。生産物細胞株に関して、大量の生産物と低量のＰＬＢＬ２を同時に生成する株を特定することが望ましい。重要な問題は、大量の生産物と低量のＰＬＢＬ２を生成するクローンを選択するために、生産物細胞株の異なるクローンをスクリーニングすることが可能であるどうかである。
【０２０７】
下記の結果を生む前には、本発明者らは、このようなクローン選択法が実行可能とは考えなかった。なぜなら、異なる生産株間で認められるＰＬＢＬ２レベルの差（図４参照）は、生成された生産物（例えば、Ｍａｂ）特有の特徴であるとの仮説を立てたからである。例えば、本発明者らは、ＭＡｂ  Ａ株のすべてのクローンはほぼ同じレベルのＰＬＢＬ２を生成し、そのレベルはＭＡｂ  Ｇ株のすべてのクローンにより生成されるＰＬＢＬ２のレベルよりかなり高いだろうと予想した（図４参照）。この仮説は、様々なＭＡｂ産生細胞株での本発明者らの過去の経験と矛盾するものではなく、その経験では、特定のＭＡｂ産生細胞株は異なるＭＡｂを産生する株と比較して高レベルのＭＡｂを産生すること、すなわちＭＡｂ産生は、産生されるＭＡｂの特性に左右されるようであることが認められた。更に、本発明者らは、高増殖及び生存率プロファイルを有する細胞株は相対的に効率的なタンパク質生成機構を有し、ゆえに特定のＭＡｂレベルに関してのみならずＰＬＢＬ２レベルに関しても、より生産性が高いであろうと予想した。要するに、本発明者らは、ある特定の細胞株の種々のクローン中の生産物に対するＰＬＢＬ２の比率はクローン間で比較的一致するであろうと予想した。
【０２０８】
低ＰＬＢＬ２／高生産物濃度クローン選択法の実現可能性を探るために、本発明者らは、上に記載の方法を使用して、６の異なる組換えタンパク質生産物ＣＨＯ細胞株（生産物Ｊ、生産物Ｋ、生産物Ｌ、生産物Ｍ、生産物Ｎ及び生産物Ｏ）の複数のクローン株からの１４日目のＨＣＣＦ試料におけるＰＬＢＬ２レベル、トータルＣＨＯＰレベル及び生産物濃度を測定した。各クローン細胞株の重複２Ｌバイオリアクター培養物から得られた結果は、図８に示されている。予想されたように、特定の生産物細胞株のクローン中の生産物濃度はクローンによって大きな差はなく、特定の生産物細胞株のクローン中の生産物濃度の平均レベルは生成される生産物に左右されるものであった。例えば、生産物Ｎ（図８Ｅ）を一番多く生成するものは、生産物Ｌ（図８Ｃ）を一番多く生成するものより少なくと１．５倍の生産物濃度を有した。
【０２０９】
しかし、驚くべきことに、上記の生産物濃度に関する所見は、ＰＬＢＬ２レベルには当てはまらなかった。図８に見られるように、特定の生産物細胞株の異なるクローン間でのＰＬＢＬ２レベルにはかなりばらつきがあり、このクローン間のばらつきは６の異なる生産物の各々で見られた。別の言い方をすれば、生産物濃度とＰＬＢＬ２レベルとの間に強い相関関係はなかった。例えば、図８Ｅ（生産物Ｎ）に見られるように、生産物Ｎ細胞株の各クローン１〜４は、およそ３．５〜４．５ｇ／Ｌの範囲の同程度の生産物濃度を生じたが、５倍以上（およそ０．７５ｍｇ／Ｌからおよそ４．５ｍｇ／Ｌの範囲）異なるＰＬＢＬ２濃度を生じた。図８Ｅに示した結果から、生産物Ｎ細胞株３番は、他のすべての生産物Ｎ細胞株と比較して最も低いＰＬＢＬ２レベル及び最も高い生産物濃度を生じ、こうした望ましい特性を有する生産物クローンを選択することの実現可能性を示していることは明らかである。更に、これらの結果は、ＰＬＢＬ２濃度及び生産物濃度を評価すること、及び低ＰＬＢＬ２レベル及び高生産物濃度を生ずる生産物クローンを選択することから成るこの選択法の汎用性を示す。
【０２１０】
本選択法を実施することの有用性は、例えば、生産物Ｌクローン細胞株の結果（図８Ｃ）を検討ことにより理解される。クローン細胞株はすべて、生産物の生成が相対的に少ないが、ＰＬＢＬ２のレベルには大きな差異がある。生産物濃度がスクリーニングされる唯一の特性であれば、生産物Ｌ細胞株６番が選択されるであろう。なぜなら、それが最も高い生産物濃度を生じるからである。しかし、生産物Ｌ細胞株６番はまた、他のすべてのクローンよりもかなり高いレベル（場合によっては３倍以上）のＰＬＢＬ２を生成した。スケールアップ及び更なる開発作業のために選択される生産物細胞株中のＰＬＢＬ２レベルを最小にすることが望ましい状況では、それゆえにＰＬＢＬ２レベルの追加的スクリーニングが重要であり、且つ低ＰＬＢＬ２と高生産物濃度を兼ね備えた望ましい特性を有する生産物細胞株の選択を可能にする。
【０２１１】
図８に示されたデータを分析するための別の方法は、生産物濃度に対するＰＬＢＬ２レベルの比率を算出することである。  図８に関して上述した各細胞株について該比率を算出し、図９に示すようにプロットした。図９に示したデータにより明らかな通り、特定の生産物細胞株からのクローン細胞株は、２倍から１０倍も異なるＰＬＢＬ２／生産物濃度比率を生じた。
【０２１２】
このような分析は、特定の生産物細胞株の複数のクローン細胞にわたって望まれる特性の迅速な比較、及び最も低い比率（すなわち最低レベルのＰＬＢＬ２と最高レベルの生産物濃度）を有する株の簡便な選択を可能にする。例えば、生産物Ｌについて、図８Ｃのデータからは、何番の細胞株が最低レベルのＰＬＢＬ２と最高レベルの生産物濃度を生じたか明らかではなかった。しかし、ＰＬＢＬ２／生産物濃度の比率を表す図９Ｃのデータは、生産物Ｌ細胞株１番が最も低い比率、したがって望まれる特性の最適な組み合わせを有することがはっきりと示している。
【０２１３】
特定の生産物細胞株の複数のクローン細胞株にわたるばらつきの程度を更に調べるために、本発明者らは、生産物Ｐを発現する４８の異なる組換えＣＨＯ細胞株を分析した。生産物Ｐの４８の細胞株の各々のＰＬＢＬ２／生産物比率を図１０に示す。これらの４８の異なる生産物Ｐ細胞株にわたるＰＬＢＬ２／生産物比率には、１０倍も差があった。更に、図１０に示したデータを概観すると、生産物Ｐ細胞株３４番が最も低い比率を有し、ゆえに低ＰＬＢＬ２と高生産物濃度という所望の特性を有する生産物細胞株を選択する容易さを明確に示している。
【０２１４】
次に、本発明者らは、上述の４８の生産物Ｐ細胞株の振盪フラスコ培養物からの１４日目のＨＣＣＦ試料におけるトータルＣＨＯＰ、ＰＬＢＬ２及び生産物の濃度レベルを測定することにより、ＰＬＢＬ２濃度と生産物濃度の間に一見したところ相関関係がないことを調査した。一つの生産物に関するこのかなり膨大なデータセットで、より正確にこれらの３つの測定値間の相関関係を定量化することができた。図１１Ａは、ＰＬＢＬ２濃度と生産物濃度の間に弱い線形相関があったこと、すなわち、線形回帰に関連付けられた決定係数（Ｒ２）が低かった（＜０．１２）ことを示す。この弱い相関関係は、他の細胞株と比較して、高い組換えタンパク質生産力及び低いＰＬＢＬ２レベルという所望の特性を有する細胞株を選択することの実現可能性を実証する。対照的に、図１１Ｂは、トータルＣＨＯＰ濃度と生産物濃度との間に適度に強い線形相関があったことを示している（Ｒ２＞０．４５）。この相関関係は、所望の生産物について高い生産力を有する細胞株は、かなり増殖し、高い生存率を維持し、また強力なタンパク質生産機構を有することが予想されるために、宿主細胞タンパク質一般についても高い生産力を有する可能性が高いという本発明者らの元々の仮説と一致している。図１１Ｃに示した、ＰＬＢＬ２濃度とトータルＣＨＯＰ濃度との間の強い線形相関の欠如（Ｒ２＜０．２９）は、驚くべき知見である。ＰＬＢＬ２は単一のＣＨＯＰ種であるため、より多くのトータルＣＨＯＰを生成する細胞株はＰＬＢＬ２も多く生成し、トータルＣＨＯＰに対するＰＬＢＬ２の比率は異なる細胞株にわたって比較的一貫性が維持されるだろうと、本発明者らは予想していた。４８細胞株にわたるＨＣＣＦ中のＰＬＢＬ２レベルとトータルＣＨＯＰレベルとの間の強い正の相関関係のこの予想外の欠如は、トータルＣＨＯＰ測定値をＰＬＢＬ２測定値の代わりとして当てにできないことを実証している。したがって、低いトータルＣＨＯＰレベルを有する細胞株はＰＬＢＬ２レベルも低いだろうと推測することはできない。ゆえに、ＨＣＣＦ中のＰＬＢＬ２の直接測定値は、低ＰＬＢＬ２レベルを有する細胞株の選択のために重要である。
【０２１５】
異なるＣＨＯ宿主細胞株が異なるレベルのＰＬＢＬ２を生じるかどうかを決定するため、また、そのようなＰＬＢＬ２レベルの差異を、細胞培養における組換えタンパク質のＰＬＢＬ２レベルに対する影響と区別するために、本発明者らはＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡを使用し、如何なる生産物遺伝子（ｐｒｏｄｕｃｔ  ｇｅｎｅ）も発現しない三つの異なるＣＨＯ宿主細胞株―宿主１、宿主２及び宿主３―の２Ｌバイオリアクター培養物におけるＰＬＢＬ２レベルを測定した。これらのバイオリアクター培養物（何の生産物も生成されないため、空試験ともいう）を、Ｖｉ−Ｃｅｌｌ  ＸＲ（カタログ番号７３１０５０，  Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｃｏｕｌｔｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｂｒｅａ，ＣＡ，ＵＳＡ）を使用して、生細胞密度及び生存率について分析した。また、細胞増殖は、ＫＩＭＡＸ目盛付き沈殿管（カタログ番号４５２２５−１０，Ｋｉｍｂｌｅ  Ｃｈａｓｅ，Ｖｉｎｅｌａｎｄ，ＮＪ，ＵＳＡ）中の培養試料を遠心（８２０ｇ、１０分）することにより、血中血球容積（ＰＣＶ）に基づいて培養期間中を通して評価された。本発明者らは、これらの空試験のために、ＨＣＣＦ及び全細胞培養液（ＷＣＣＦ）の双方においてＰＬＢＬ２レベルを測定した。ＷＣＣＦ試料は、細胞とＨＣＣＦの双方から成る。したがって、ＷＣＣＦ試料中で測定されるＰＬＢＬ２レベルは、培養物中のＰＬＢＬ２の総細胞内及び細胞外濃度の組み合わせを反映している。ＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイを用いて、本発明者らは、ＨＣＣＦ（図１２Ａ）とＷＣＣＦ（図１２Ｂ）の双方におけるＰＬＢＬ２プロファイルに関する、三つのＣＨＯ宿主細胞株にわたる差異を定量化した。このようにして、本発明者らは、宿主１が、ＨＣＣＦとＷＣＣＦの双方において最高レベルのＰＬＢＬ２を生成したことを確認した。対照的に、本発明者らは、宿主３が収集の時点（１４日目）で最低レベルのＰＬＢＬ２を生成するＣＨＯ細胞株であることを確認した。
【０２１６】
宿主３は、ＨＣＣＦとＷＣＣＦの双方において全体的に最低レベルのＰＬＢＬ２を生成したが、三つのＣＨＯ宿主細胞株はすべて、異なる増殖プロファイルを示した（データは示さない）。したがって、ＰＬＢＬ２レベルに対する細胞増殖の差異の影響を打ち消すために、本発明者らは、ＰＬＢＬ２生成を生細胞体積に対して日ごとに正規化することによって、これらの三つの細胞株を更に分析した。宿主１、宿主２及び宿主３における細胞特異的ＰＬＢＬ２生産力を算出するために、本発明者らは、対応する積算生存血中血球容積（ＩＶＰＣＶ）に対してＰＬＢＬ２濃度をプロットした。随伴性細胞溶解に起因する細胞死及びＰＬＢＬ２放出によって複雑になるのを最小限に抑えるため、本発明者らは使用するデータを、７０％を超える培養生存率のデータに限定した。線形回帰から得られた結果としての傾きは、細胞特異的ＰＬＢＬ２生産力の推定値を、日ごと単位生細胞体積当たりのＰＬＢＬ２をｍｇ単位で提供した。図１３に示すように、線形回帰の傾きは宿主１で最も大きく、宿主３で最も小さかった。これは、測定値がＨＣＣＦ（図１３Ａ）を使用して得られたものであろうと、ＷＣＣＦ（図１３Ｂ）を使用して得られたものであろうと、宿主３が平均で日ごと単位生細胞体積当たり数分の１のＰＬＢＬ２を生成したことを更に実証している。これらの知見に基づいて、生産物細胞株を生成するための安定したトランスフェクション用のＣＨＯ親宿主として、例えば宿主３のような、低ＰＬＢＬ２生成宿主を優先的に選択することができる。このようなアプローチはまた、他のＣＨＯ宿主細胞に基づく組換え細胞株と比較してもより低いＰＬＢＬ２レベルを示す、安定的にトランスフェクトされた組換え細胞株をもたらしうる。
【０２１７】
上述の結果は、本明細書に記載のＰＬＢＬ２  ＥＬＩＳＡアッセイは、複数の組換え生産物ＣＨＯ細胞株及び複数のＣＨＯ宿主細胞株にわたってＰＬＢＬ２レベルを評価するために使用することができ、したがって、低ＰＬＢＬ２濃度、また、組換え生産物ＣＨＯ細胞株の場合には、高生産物濃度といった所望の特性を有する組換え株又は宿主株の選択を可能にする。細胞株選択に対するこのようなアプローチは組換え製造プロセスの最適化にとって重要であり、例えば、下流の精製プロセスの負荷を軽減する。
【０２１８】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８Ａ−Ｄ】
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【図８Ｅ−Ｆ】
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【図９Ａ−Ｂ】
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【図９Ｃ−Ｆ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】令和1年7月19日(2019.7.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
明細書に記載の発明。
【外国語明細書】
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