(57)【要約】【課題】脳疾患を処置するための方法および組成物を提供すること。【解決手段】本開示は、疾患を処置するか、または治療剤を哺乳動物に送達するための方法を提供し、上記方法は、上記哺乳動物の大槽および／もしくは脳室に、一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療用タンパク質をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を、脳脊髄液（ＣＳＦ）に接近した細胞が上記治療剤を発現し、およびある種の実施形態では、脳への分布のためにＣＳＦへと上記治療剤を分泌する様式で、投与する工程を包含する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
本明細書に記載の発明。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願）
本出願は、２０１３年７月２６日に出願された米国仮特許出願第６１／８５９，１５７号の優先権を主張し、当該出願はその全体が本明細書に参考として援用される。
【背景技術】
【０００２】
（背景）
遺伝子移入は、細胞レベルおよび分子レベルの両方で生物学的事象および疾患プロセスの分析のための強力なツールとしていまや広く認識されている。より近年になって、ヒト疾患（遺伝性（例えば、ＡＤＡ欠損症）もしくは後天性（例えば、癌もしくは感染性疾患）のいずれも）の処置のための遺伝子治療の適用は、かなりの注目を集めた。改善された遺伝子移入技術の出現および欠損遺伝子関連の疾患の拡大し続けているライブラリーの同定に伴って、遺伝子治療は、処置の理論から実際の現実性へと急速に進化した。
【０００３】
伝統的には、遺伝子治療は、先天性の遺伝的エラーを矯正するために、外因性遺伝子が患者の細胞へと導入される手順として定義されている。４５００を超えるヒト疾患が遺伝性であると正確に分類されているが、ヒトゲノムにおける具体的変異が同定されているのは、これら疾患のうちの比較的僅かに関してである。近年まで、これらの希な遺伝的疾患は、遺伝子治療の努力のもっぱらの標的を代表していた。よって、今日までにＮＩＨが承認した遺伝子治療プロトコルのうちの大部分は、既知の先天的な遺伝的エラーを有する個体の体細胞に欠損遺伝子の機能的コピーを導入することを指向していた。ごく近年になって、研究者および臨床医は、大部分のヒトの癌、心血管疾患のある種の形態、および多くの変性疾患にもまた、重要な遺伝的構成要素があり、新規な遺伝子治療を設計することを目的として、「遺伝的障害」を考慮するべきであると認識し始めた。従って、遺伝子治療はより近年になって、新たな遺伝情報を罹患した生物に導入することによる疾患表現型の矯正として広く定義された。
【０００４】
インビボ遺伝子治療では、移入される遺伝子は、インサイチュでレシピエント生物の細胞へと、すなわち、レシピエント内に導入される。インビボ遺伝子治療は、いくつかの動物モデルで試験されてきた。いくらかの近年の刊行物は、器官および組織（例えば、筋肉、造血幹細胞、動脈壁、神経系、および肺）へのインサイチュでの直接遺伝子移入の実現性を報告した。骨格筋、心筋へのＤＮＡの直接注射、および脈管構造へのＤＮＡ−脂質複合体の注射はまた、インビボで挿入された遺伝子産物の検出可能な発現レベルを得ることが報告された。中枢神経系の疾患、例えば、脳の遺伝性の遺伝子疾患の処置は、未だに難治性の問題である。そのような例は、リソソーム蓄積症およびアルツハイマー病である。まとめると、リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）の発生率は、全世界で１０，０００人が生まれた中で１人であり、症例のうちの６５％では、中枢神経系（ＣＮＳ）に重大な合併症がある。これら障害において欠損しているタンパク質は、静脈内に送達される場合、血液脳関門を横断しないか、または脳に直接投与される場合、広く分布しない。従って、ＣＮＳ障害の治療が開発される必要がある。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００５】
（要旨）
本発明は、治療剤（例えば、タンパク質もしくは核酸）を哺乳動物の中枢神経系に送達するための方法を提供し、上記方法は、上記哺乳動物の大槽に、上記哺乳動物の脳脊髄液（ＣＳＦ）と接触する細胞を上記細胞が上記哺乳動物において治療剤を発現するように感染させるために有効な様式で、ＡＡＶキャプシドタンパク質および一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療剤をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を投与する工程を包含する。
【０００６】
本発明は、哺乳動物において疾患を処置するための方法を提供し、上記方法は、上記哺乳動物の大槽に、ＡＡＶキャプシドタンパク質および一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療剤（例えば、治療用核酸もしくはタンパク質をコードする核酸）をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を、上記哺乳動物の脳脊髄液（ＣＳＦ）と接触する細胞を感染させるために有効な様式で投与する工程であって、ここで上記細胞は、上記疾患を処置するように上記治療剤を発現する、工程を包含する。
【０００７】
ある種の実施形態において、上記ＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶ２粒子である。本明細書で使用される場合、用語ＡＡＶ２／１は、ＡＡＶ２  ＩＴＲおよびＡＡＶ１キャプシドを意味するために使用され、用語ＡＡＶ２／２は、ＡＡＶ２  ＩＴＲおよびＡＡＶ２キャプシドであり、用語ＡＡＶ２／４は、ＡＡＶ２  ＩＴＲおよびＡＡＶ４キャプシドであるなど。ある種の実施形態において、上記ＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶ８粒子である。ある種の実施形態において、上記ＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶ９粒子である。ある種の実施形態において、上記ＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶｒｈ１０粒子である。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶキャプシドは、ＡＡＶ２キャプシドタンパク質ＶＰ１、ＶＰ２、および／もしくはＶＰ３と少なくとも８０％相同性を有する。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶ２キャプシドは、ＡＡＶ２キャプシドＶＰ１、ＶＰ２、および／もしくはＶＰ３と１００％相同性を有する。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶキャプシドは、ＡＡＶ４キャプシドタンパク質ＶＰ１、ＶＰ２、および／もしくはＶＰ３と少なくとも８０％相同性を有する。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶ４キャプシドは、ＡＡＶ４キャプシドＶＰ１、ＶＰ２、および／もしくはＶＰ３と１００％相同性を有する。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶキャプシドは、ＡＡＶ９キャプシドタンパク質ＶＰ１、ＶＰ２、および／もしくはＶＰ３と少なくとも８０％相同性を有する。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶ９キャプシドは、ＡＡＶ９キャプシドＶＰ１、ＶＰ２、および／もしくはＶＰ３と１００％相同性を有する。
【０００８】
ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶ粒子は、ＡＡＶ４の感染率より２０％高い率で、例えば、ＡＡＶ４の感染率より５０％もしくは１００％、１０００％もしくは２０００％高い率で、非齧歯類の上衣細胞に感染するｒＡＡＶ２粒子である。
【０００９】
ある種の実施形態において、上記細胞は、上記治療剤を発現し、上記治療剤をＣＳＦへと分泌する。ある種の実施形態において、上記細胞は、上衣細胞、軟膜細胞、内皮細胞、もしくは髄膜細胞である。ある種の実施形態において、上記方法は、上記ｒＡＡＶを非ヒト霊長類の脳室、くも膜下腔および／もしくは髄膜下腔にさらに投与する工程をさらに包含する。
【００１０】
本発明は、哺乳動物の脳細胞に核酸を送達するための方法を提供し、上記方法は、上記脳細胞に、一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される核酸を含むベクターを含むＡＡＶ粒子を投与し、それによって、上記核酸を上記脳細胞に送達する工程を包含する。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶは、ＡＡＶ４の感染率より２０％高い率で、例えば、ＡＡＶ４の感染率より５０％もしくは１００％、１０００％もしくは２０００％高い率で、上記脳細胞に感染するｒＡＡＶ２粒子である。
【００１１】
ある種の実施形態において、上記疾患は、リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）である。ある種の実施形態において、上記ＬＳＤは、小児性セロイドリポフスチン蓄積症もしくは後発型小児性セロイドリポフスチン蓄積症（ＬＩＮＣＬ）、神経型ゴーシェ病、若年性バッテン病、ファブリー病、ＭＬＤ、サンフィリッポ症候群Ａ型、ハンター症候群、クラッベ病、モルキオ症候群、ポンペ病、ニーマン・ピック病Ｃ型、テイ・サックス病、ハーラー症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ）、サンフィリッポ症候群Ｂ型、マロトー・ラミー症候群、ニーマン・ピック病Ａ型、シスチン症、ハーラー・シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ／Ｓ）、スライ症候群（ＭＰＳ  ＶＩＩ）、シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｓ）、小児性バッテン病、ＧＭ１ガングリオシドーシス、ムコリピドーシスＩＩ／ＩＩＩ型、もしくはサンドホフ病である。ある種の実施形態において、上記疾患は、ＬＩＮＣＬである。ある種の実施形態において、上記疾患は、神経変性疾患（例えば、アルツハイマー病、ハンチントン病、ＡＬＳ、遺伝性痙性片麻痺、原発性側索硬化症、脊髄性筋萎縮症、ケネディー病、ポリグルタミンリピート病、もしくはパーキンソン病）である。
【００１２】
ある種の実施形態において、上記哺乳動物は、非齧歯類哺乳動物（例えば、霊長類、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、もしくはイヌ）である。ある種の実施形態において、上記霊長類は、ヒトである。
【００１３】
ある種の実施形態において、上記治療剤は、治療用核酸である。ある種の実施形態において、上記治療剤は、タンパク質である。
【００１４】
ある種の実施形態において、上記核酸は、リソソーム加水分解酵素をコードする。ある種の実施形態において、上記核酸は、ＴＰＰ１をコードする。
【００１５】
ある種の実施形態において、上記治療用タンパク質は、保護性のＡｐｏＥアイソフォームタンパク質である。本明細書で使用される場合、用語「保護性のＡｐｏＥアイソフォーム」は、アルツハイマー病のリスクを少なくとも５％、例えば、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％もしくはより高い程度低減するＡｐｏＥアイソフォームを区別するために使用される。
【００１６】
ある種の実施形態において、上記保護性のＡｐｏＥアイソフォームは、ＡｐｏＥ  ε２と少なくとも約８０％相同性を有する。ある種の実施形態において、上記保護性のＡｐｏＥアイソフォームは、ＡｐｏＥ  ε２と１００％相同性を有する。
【００１７】
ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶ粒子は、脳の１〜３箇所に、例えば、脳の１箇所、２箇所もしくは３箇所に、注射される。
【図面の簡単な説明】
【００１８】
【図１Ａ−１】図１Ａは、ＡＡＶ２（配列番号１）およびＡＡＶ４（配列番号２）のタンパク質のアラインメントである。
【図１Ａ−２】図１Ａは、ＡＡＶ２（配列番号１）およびＡＡＶ４（配列番号２）のタンパク質のアラインメントである。
【図１Ａ−３】図１Ａは、ＡＡＶ２（配列番号１）およびＡＡＶ４（配列番号２）のタンパク質のアラインメントである。
【図１Ｂ−１】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図１Ｂ−２】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図１Ｂ−３】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図１Ｂ−４】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図１Ｂ−５】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図１Ｂ−６】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図１Ｂ−７】図１Ｂは、ＡＡＶ２（ＮＣ＿００１４０１）およびＡＡＶ４（ＮＣ＿００１８２９）の配列に基づいたＡＡＶ２（配列番号３）およびＡＡＶ４（配列番号４）のヌクレオチドのアラインメントである。
【図２】図２は、細胞間の「クロスコレクション（ｃｒｏｓｓ  ｃｏｒｒｅｃｔｉｏｎ）」の図示を示す。Ｓａｎｄｓ  ａｎｄ  Ｄａｖｉｄｓｏｎ，  Ｍｏｌ  Ｔｈｅｒ  １３（５）：８３９−８４９，  ２００６。
【図３】図３。上：イヌＴＰＰ１が欠損しているＬＩＮＣＬイヌモデルへのＡＡＶ２媒介性送達後のヒトＴＰＰ１に関する免疫組織化学染色。左、処置したイヌ。右、未処置の欠損している動物。右パネル中のバックグラウンド染色に対して左の強い陽性染色を比較のこと。下。処置した欠損している（ＬＩＮＣＬ）イヌにおいてヒトＴＰＰ１の存在を示す、ＴＰＰ１に関するウェスタンブロット。正常のイヌおよび欠損しているイヌの両方が、ヒトＴＰＰ１を発現しないので、バンドの存在を示さない。
【図４Ａ】図４Ａ。神経セロイドリポフスチン症におけるリポフスチンの病的蓄積を示す代表的自家蛍光を示す顕微鏡写真。左パネル、ＡＡＶ２．ＴＰＰ１処置したＬＩＮＣＬイヌにおける自家蛍光。右パネル、コントロールの未処置ＬＩＮＣＬイヌにおける自家蛍光。治療に伴う自家蛍光の減少に注目されたい。
【図４Ｂ】図４Ｂ。未処置ＬＩＮＣＬイヌ（左上）、未処置の正常イヌ（右上）、および２匹のＡＡＶ．ＴＰＰ１処置イヌ（下側のパネル）のＭＲＩスキャン。送達されるベクターの容積は、下側パネルの左下に示される。ウイルス力価は、約１ｅ１３ゲノム／ｍＬであった。
【図４Ｃ】図４Ｃ。４Ｂで画像化したイヌの脳室の（左パネル）ボリューム再構成。右パネルのグラフは、左パネルの画像の容積を示す。これら低用量のベクター（図４Ｂの凡例で示される）ですら、心室容積が大規模に低減することに注目されたい。
【図４Ｄ】図４Ｄ。種々の脳領域における免疫組織化学染色は、ＬＩＮＣＬイヌの脳室系へのＡＡＶ．ＴＰＰ１遺伝子移入後のＴＰＰ１タンパク質の広い分布を示す。上パネルは、イヌの脳地図からの冠状面切片である；右下挿入図は、冠状面画像の矢状方向画像を示す。上記地図のパネルの下の免疫組織化学染色した切片は、それら領域の切片における染色の程度を示す。まとめると、上記データは、酵素の広い分布を示す。
【図５】図５。ＡＡＶ．ＴＰＰ１送達後のＣＳＦ中のｈｕＴＰＰ１酵素活性は、ウイルス遺伝子移入直後に低下した。左パネル：処置した動物ＣｏおよびＳのＣＳＦにおけるＴＰＰ１活性は、ＡＡＶ．ＴＰＰ１遺伝子移入直のすぐ後に正常の活性レベルを超え、その後、検出不能なレベルへと急激に低下する。動物Ｎ、ＰｏおよびＰｉは、正常もしくはヘテロ接合性のイヌであり、臨床的に正常なイヌにおけるＴＰＰ１活性レベルの範囲の参照のみが示される。
【図６】図６は、持続した活性を提供することについてのミコフェノレートでの予備処置の結果を示す。
【図７】図７。酵素活性低下時、もしくは遺伝子移入前のミコフェノレートの導入は、上衣へのＡＡＶ．ＴＰＰ１送達後に、イヌにおけるＴＰＰ１発現の持続性を劇的に改善する。左上および右上のグラフ：時間の関数としての酵素活性。ミコフェノレートを投与した時間もまた示される。動物ＳＲおよびＢにおける発現の喪失から回復した後の高レベルおよび持続したレベル、ならびに動物Ｆにおいて極めて高い持続したレベルに注意のこと。従って、組換えタンパク質に関してヌルの動物におけるミコフェノレート予備処置は、形質導入した脳細胞において持続した遺伝子発現を提供する助けとなる。下側のグラフ：右上のグラフを拡大して、バックグラウンドレベルを超えて上回り、正常レベルに近いか、もしくは上回る（０．１〜０．４ｐｍｏｌ／ｍｇ）酵素があることを示す。
【図８】図８。ＣＳＦにおける持続した酵素発現は、酵素の間質レベルを上昇させる。種々の脳領域における酵素活性は、正常を上回る。
【図９Ａ】図９Ａおよび９Ｂ。種々の脳領域における免疫組織化学染色は、ＬＩＮＣＬイヌの脳室系へのＡＡＶ．ＴＰＰ１遺伝子移入後のＴＰＰ１タンパク質の広い分布を示す。イヌの脳地図の代表的パネルは、線によっても示される、評価している脳の領域を示す。まとめると、データは、酵素の広い分布を示す。
【図９Ｂ】図９Ａおよび９Ｂ。種々の脳領域における免疫組織化学染色は、ＬＩＮＣＬイヌの脳室系へのＡＡＶ．ＴＰＰ１遺伝子移入後のＴＰＰ１タンパク質の広い分布を示す。イヌの脳地図の代表的パネルは、線によっても示される、評価している脳の領域を示す。まとめると、データは、酵素の広い分布を示す。
【図１０】図１０。ＡＡＶ．ＴＰＰ１遺伝子治療は、疾患表現型の始まり（左の第１の青い線に対する左の第１の赤い線の出現）および疾患の進行（青い線の間隔に対する赤い線の間隔）を遅らせる。動物の寿命は、いくらかのイヌではほぼ２倍であった。他は、未だ評価中である。
【図１１】図１１。上衣からの持続したＴＰＰ１分泌を有する動物は、末梢の器官および脳の硬膜における酵素活性の証拠を示す。２匹の動物、ＢＧおよびＳＲに関しては、脳の硬膜において、および肝臓においても顕著な酵素活性があった。
【図１２】図１２。ＬＩＮＣＬイヌに臨床的利益を提供するために使用されるアプローチは、霊長類に移し変え可能である。アカゲザルに、ＡＡＶ２．ＴＰＰ１（１．５ｍＬの１ｅ１３ベクターゲノム／ｍＬ）の脳室内注射を与えたところ、脳幹（脊髄；左のグラフ）およびＣＳＦ（右のグラフ）におけるＴＰＰ１活性が、遺伝子移入の３ヶ月後に測定できるようになった。これらは、ＴＰＰ１活性の正常レベルを有する正常のサルである（注意される範囲−コントロール）。１匹を除く全ての動物において、上記酵素活性は、正常のサルのものを超える。組換えヒトＴＰＰ１に対する免疫組織化学染色を使用して遺伝子移入の３ヶ月後のサル脳におけるＴＰＰ１活性の証拠は、ＡＡＶベクターから発現された。
【図１３】図１３は、非ヒト霊長類における前庭領域（脳幹）を示す。
【図１４】図１４は、ヒトＴＰＰ１アミノ酸配列を提供する。
【図１５−１】図１５は、ヒトＴＰＰ１核酸配列を提供する。
【図１５−２】図１５は、ヒトＴＰＰ１核酸配列を提供する。
【図１６】図１６は、アカゲザルＴＰＰ１アミノ酸配列を提供する。
【図１７】図１７は、カニクイザルＴＰＰ１アミノ酸配列を提供する。
【発明を実施するための形態】
【００１９】
（詳細な説明）
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）は、パルボウイルス科の小さな非病原性ウイルスである。ＡＡＶは、複製するためにヘルパーウイルスに依存することで、この科の他のメンバーとは異なる。ヘルパーウイルスの非存在下では、ＡＡＶは、第１９染色体のｑアームへと位置特異的な様式で組み込まれ得る。ＡＡＶの約５ｋｂのゲノムは、プラス極性もしくはマイナス極性いずれかの１本鎖ＤＮＡの１つのセグメントからなる。上記ゲノムの末端は、ヘアピン構造へと折りたたまれ得、ウイルスＤＮＡ複製起点として働き得る短い逆方向末端反復である。物理的には、パルボウイルスビリオンは、エンベロープに包まれておらず、その正二十面体キャプシドは、直径約２０ｎｍである。
【００２０】
今日まで、多くの血清学的に異なるＡＡＶが同定されており、ヒトもしくは霊長類から１２種より多くが単離された。ＡＡＶ２のゲノムは、長さ４６８０ヌクレオチドであり、２つのオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を含む。左のＯＲＦは、非構造Ｒｅｐタンパク質、Ｒｅｐ  ４０、Ｒｅｐ  ５２、Ｒｅｐ  ６８およびＲｅｐ  ７８をコードし、これらは、１本鎖の子孫ゲノムの生成に加えて、複製および転写の調節に関与する。さらに、上記Ｒｅｐタンパク質のうちの２つは、ヒト第１９染色体のｑアームの領域へとＡＡＶゲノムを優先的に組み込むことに関連した。Ｒｅｐ６８／７８はまた、ＮＴＰ結合活性、ならびにＤＮＡおよびＲＮＡヘリカーゼ活性を有することが示された。上記Ｒｅｐタンパク質は、核局在シグナルおよびいくつかの潜在的リン酸化部位を有する。これらキナーゼ部位のうちの１つの変異は、複製活性の喪失を生じた。
【００２１】
ゲノムの末端は、ウイルスＤＮＡ複製起点として働くＴ字形のヘアピン構造へと折りたたまれる可能性を有する短い逆方向末端反復（ＩＴＲ）である。上記ＩＴＲ領域内では、上記ＩＴＲの機能に中心的である２つのエレメント、ＧＡＧＣ反復モチーフおよび末端分離部位（ｔｅｒｍｉｎａｌ  ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ  ｓｉｔｅ）（ｔｒｓ）が説明されてきた。上記反復モチーフは、上記ＩＴＲが直線状コンホメーションもしくはヘアピンコンホメーションのいずれかにある場合に、Ｒｅｐを結合することが示された。この結合は、部位特異的および鎖特異的様式において起こる上記ｔｒｓでの切断のためにＲｅｐ６８／７８を適切な位置に置くように働く。複製におけるそれらの役割に加えて、これら２つのエレメントは、ウイルス組み込みに重要であるようである。第１９染色体組み込み部位内に含まれるのは、Ｒｅｐ結合部位と隣接するｔｒｓである。これらエレメントは、位置特異的組み込みに対して機能的かつ必須であることが示された。
【００２２】
ＡＡＶビリオンは、エンベロープに包まれていない、ＶＰ１、ＶＰ２およびＶＰ３といわれる３種の関連タンパク質からなる、約２５ｎｍ直径の正二十面体粒子である。右のＯＲＦは、キャプシドタンパク質ＶＰ１、ＶＰ２、およびＶＰ３をコードする。これらタンパク質は、それぞれ、１：１：１０の比で見出され、全て右側のＯＲＦに由来する。上記キャプシドタンパク質は、選択的スプライシングおよび通常出ない開始コドンの使用によって互いに異なる。欠失分析は、選択的スプライシングされたメッセージから翻訳されるＶＰ１の除去もしくは変化が、感染性粒子の低下した収量を生じることを示した。上記ＶＰ３コード領域内の変異は、いかなる１本鎖子孫ＤＮＡも感染性粒子も生成できないことを生じる。ＡＡＶ粒子は、ＡＡＶキャプシドタンパク質を含むウイルス粒子である。ＡＡＶキャプシドポリペプチドは、ＶＰ１、ＶＰ２およびＶＰ３ポリペプチド全体をコードし得る。上記粒子は、ＡＡＶ２および他のＡＡＶキャプシドタンパク質（すなわち、ＡＡＶ４およびＡＡＶ２のようなキメラタンパク質）を含む粒子であり得る。ＡＡＶ２キャプシドタンパク質のアミノ酸配列におけるバリエーションは、上記ＡＡＶ２キャプシドを含む得られるウイルス粒子が、標準的方法によって慣用的に決定される場合にＡＡＶ４とは抗原的にもしくは免疫学的に異なったままである限りにおいて本明細書で企図される。具体的には、例えば、ＥＬＩＳＡおよびウェスタンブロットは、ウイルス粒子がＡＡＶ４とは抗原的にもしくは免疫学的に異なるか否かを決定するために使用され得る。さらに、上記ＡＡＶ２ウイルス粒子は、好ましくは、ＡＡＶ４とは異なる組織向性を保持する。
【００２３】
ＡＡＶ２粒子は、ＡＡＶ２キャプシドタンパク質を含むウイルス粒子である。ＶＰ１、ＶＰ２、およびＶＰ３ポリペプチド全体をコードするＡＡＶ２キャプシドポリペプチドは、全体的にみて、配列番号１に示されるヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列を有するポリペプチド（ＡＡＶ２キャプシドタンパク質）と少なくとも約６３％相同性（もしくは同一性）を有し得る。上記キャプシドタンパク質は、配列番号１に示されるタンパク質と約７０％相同性、約７５％相同性、８０％相同性、８５％相同性、９０％相同性、９５％相同性、９８％相同性、９９％相同性、もしくはさらに１００％相同性を有し得る。上記キャプシドタンパク質は、配列番号１に示されるタンパク質と約７０％同一性、約７５％同一性、８０％同一性、８５％同一性、９０％同一性、９５％同一性、９８％同一性、９９％同一性、もしくはさらに１００％同一性を有し得る。上記粒子は、別のＡＡＶおよびＡＡＶ２キャプシドタンパク質、すなわち、キメラタンパク質を含む粒子であり得る。上記ＡＡＶ２キャプシドタンパク質のアミノ酸配列におけるバリエーションは、上記ＡＡＶ２キャプシドを含む得られるウイルス粒子が標準的方法によって慣用的に決定され得る場合にＡＡＶ４とは抗原的にもしくは免疫学的に異なったままである限りにおいて、本明細書で企図される。具体的には、例えば、ＥＬＩＳＡおよびウェスタンブロットは、ウイルス粒子がＡＡＶ４とは抗原的にもしくは免疫学的に異なるか否かを決定するために使用され得る。さらに、上記ＡＡＶ２ウイルス粒子は、好ましくは、本明細書中の実施例において例証されるもののようなＡＡＶ４とは異なる組織向性を保持するが、少なくとも１つのＡＡＶ２コートタンパク質を含むＡＡＶ２キメラ粒子は、ＡＡＶ２コートタンパク質のみからなるＡＡＶ２粒子のものとは異なる組織向性を有し得る。
【００２４】
図１Ａおよび図１Ｂで示されるように、ＡＡＶ２キャプシド配列およびＡＡＶ４キャプシド配列は、約６０％相同性である。ある種の実施形態において、上記ＡＡＶ２キャプシドは、配列番号１に示されるアミノ酸配列と少なくとも６５％相同である配列を含む（もしくはからなる）。
【００２５】
ある種の実施形態において、本発明は、一対のＡＡＶ２逆方向末端反復を含むベクターを含む、すなわち、キャプシド化するＡＡＶ２粒子をさらに提供する。ＡＡＶ２  ＩＴＲのヌクレオチド配列は、当該分野で公知である。さらに、上記粒子は、ＡＡＶ４およびＡＡＶ２両方のキャプシドタンパク質、すなわち、キメラタンパク質を含む粒子であり得る。さらに、上記粒子は、他のＡＡＶ（例えば、ＡＡＶ１〜ＡＡＶ９およびＡＡＶｒｈ１０）に由来する一対のＡＡＶ逆方向末端反復を含むベクターをキャプシド化する粒子であり得る。上記粒子の中にキャプシド化されたベクターは、上記逆方向末端反復の間に挿入される外因性核酸をさらに含み得る。
【００２６】
ＡＡＶの以下の特徴は、ＡＡＶを遺伝子移入にとって魅力的なベクターにしている。ＡＡＶベクターは、細胞ゲノムの中にインビトロで安定して組み込まれる；広い宿主範囲を有する；分裂している細胞および分裂していない細胞の両方にインビトロおよびインビボで形質導入され、その形質導入された遺伝子の高レベルの発現を維持することが示された。ウイルス粒子は、熱安定性であり、溶媒、界面活性剤、ｐＨ、温度の変化に耐性であり、ＣｓＣｌ勾配でもしくは他の手段によって濃縮され得る。本発明は、ＡＡＶ粒子、組換えＡＡＶベクター、および組換えＡＡＶビリオンを投与するための方法を提供する。例えば、ＡＡＶ２粒子は、ＡＡＶ２キャプシドタンパク質を含むウイルス粒子であるか、またはＡＡＶ４粒子は、ＡＡＶ４キャプシドタンパク質を含むウイルス粒子である。組換えＡＡＶ２ベクターは、ＡＡＶ２のうちの少なくとも１つの特有の核酸を含む核酸構築物である。組換えＡＡＶ２ビリオンは、組換えＡＡＶ２ベクターを含む粒子である。用語「ＡＡＶ２  ＩＴＲ」内と考えられるには、上記ヌクレオチド配列は、上記ＡＡＶ２  ＩＴＲを上記ＡＡＶ４  ＩＴＲから区別する、本明細書で記載される一方の特徴もしくは両方の特徴を保持しなければならない：（１）３個の（ＡＡＶ４におけるようにむしろ４個の）「ＧＡＧＣ」反復および（２）上記ＡＡＶ２  ＩＴＲ  Ｒｅｐ結合部位において、最初の２個の「ＧＡＧＣ」反復の中の４番目のヌクレオチドが、ＴではなくＣである。
【００２７】
上記タンパク質もしくは送達される予定の別の薬剤をコードする配列の発現を駆動するプロモーターは、公知の考慮事項（例えば、上記プロモーターに機能的に連結される核酸の発現のレベルおよび上記ベクターが使用される予定の細胞タイプ）によって選択される、任意の所望のプロモーターであり得る。プロモーターは、外因性プロモーターであっても内因性プロモーターであってもよい。プロモーターは、例えば、公知の強力なプロモーター（例えば、ＳＶ４０もしくは誘導性メタロチオネインプロモーター）、またはＡＡＶプロモーター（例えば、ＡＡＶ  ｐ５プロモーター）を含み得る。プロモーターのさらなる例としては、アクチン遺伝子、免疫グロブリン遺伝子、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、アデノウイルス、ウシパピローマウイルスに由来するプロモーター、アデノウイルスプロモーター（例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター）、誘導性熱ショックプロモーター、呼吸器抱合体ウイルス、ラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）などが挙げられる。
【００２８】
上記ＡＡＶベクターは、上記プロモーターに機能的に連結された外因性（異種）核酸をさらに含み得る。「異種核酸」とは、任意の異種もしくは外因性の核酸が、細胞、組織もしくは生物の中に移入するためのベクターの中に挿入され得ることを意味する。上記核酸は、例えば、ポリペプチドもしくはタンパク質、またはアンチセンスＲＮＡをコードし得る。「機能的に連結される」とは、上記プロモーターが、当該分野で公知であるとおり、上記異種核酸の発現を促進し得ることになること（例えば、上記異種核酸に対する上記プロモーターの適切な配向）を意味する。さらに、上記異種核酸は、好ましくは、当該分野で公知であるとおり、機能的にコードする、すなわち、上記核酸が発現されることを可能にするために、上記核酸の発現に適切な配列を全て有する。上記核酸は、例えば、発現制御配列（例えば、エンハンサー）、および必須の情報プロセシング部位（例えば、リボソーム結合部位、ＲＮＡスプライス部位、ポリアデニル化部位、および転写終結配列）を含み得る。上記核酸は、パッケージされ得る核酸の大きさによってのみ限定される１種より多くの遺伝子産物をコードし得る。
【００２９】
上記異種核酸は、上記ベクターが移入される被験体によって必要とされる、失われているもしくは欠損しているタンパク質に置き換わる有益なタンパク質をコードし得るか、または例えば、癌細胞もしくは死滅が被験体にとって有益である他の細胞に指向され得る細胞傷害性ポリペプチドをコードし得る。上記異種核酸はまた、有害なタンパク質をコードする被験体によって作られたｍＲＮＡに結合し得、それによって不活性化し得るアンチセンスＲＮＡをコードし得る。一実施形態において、アンチセンスポリヌクレオチドは、ＡＡＶウイルス構築物の中の異種発現カセットから生成され得、ここで上記発現カセットは、細胞タイプ特異的発現を促進する配列を含む。
【００３０】
本発明のＡＡＶベクターの一部として細胞もしくは被験体に投与され得る異種核酸の例としては、以下が挙げられ得るが、これらに限定されない：治療剤（例えば、リソソーム加水分解酵素；腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）（例えば、ＴＮＦ−α）；インターフェロン（例えば、インターフェロン−α、インターフェロン−β、およびインターフェロン−γ）；インターロイキン（例えば、ＩＬ−１、ＩＬ−１β、およびＩＬ−２〜ＩＬ−１４）；ＧＭ−ＣＳＦ；アデノシンデアミナーゼ；分泌される因子（例えば、増殖因子）；イオンチャネル；化学療法剤；リソソームタンパク質；抗アポトーシス遺伝子産物；神経生存を促進するタンパク質（例えば、グルタメートレセプターおよび増殖因子）；細胞増殖因子（例えば、リンホカイン）；可溶性ＣＤ４；第ＶＩＩＩ因子；第ＩＸ因子；Ｔ細胞レセプター；ＬＤＬレセプター；ＡｐｏＥ；ＡｐｏＣ；α−１アンチトリプシン；オルニチントランスカルバミラーゼ（ＯＴＣ）；嚢胞性線維症膜貫通タンパク質（ＣＦＴＲ）；インスリン；抗体（例えば、免疫グロブリン）の抗原結合ドメインのＦｃレセプター；ならびにウイルス複製を阻害するアンチセンス配列（例えば、Ｂ型関連ウイルスもしくは非Ａ非Ｂ型肝炎ウイルスの複製を阻害するアンチセンス配列）をコードする核酸。さらに、上記核酸は、パッケージされ得る核酸の大きさによってのみ制限される、１種より多くの遺伝子産物をコードし得る。
【００３１】
ＡＡＶ２粒子は、ＡＡＶ２キャプシドタンパク質を含むウイルス粒子である。上記ＡＡＶ２キャプシドタンパク質のアミノ酸配列におけるバリエーションは、上記ＡＡＶ２キャプシドを含む得られるウイルス粒子が標準的方法によって慣用的に決定され得るとおりにＡＡＶ４とは抗原的にもしくは免疫学的に異なる限りにおいて、本明細書で企図される。具体的には、例えば、ＥＬＩＳＡおよびウェスタンブロットは、ウイルス粒子が他のＡＡＶ血清タイプとは抗原的にもしくは免疫学的に異なるか否かを決定するために使用され得る。
【００３２】
用語「ポリペプチド」とは、本明細書で使用される場合、アミノ酸のポリマーをいい、全長タンパク質およびそのフラグメントを含む。従って、「タンパク質」および「ポリペプチド」はしばしば、本明細書で交換可能に使用される。置換は、中立的であることが公知のパラメーターによって選択され得る。当業者によって認識されるように、本発明はまた、アミノ酸配列におけるわずかなバリエーションもしくは他の特性を有するそれらポリペプチドを含む。このようなバリエーションは、対立遺伝子バリエーションとして（例えば、遺伝的多型に起因して）天然に生じ得るか、またはヒトの介入によって（例えば、誘導される点、欠失、挿入および置換変異体のような、クローニングされたＤＮＡ配列の変異誘発によって）生成され得る。アミノ酸配列における小さな変化が一般に好ましい（例えば、保存的アミノ酸置換、小さな内部欠失もしくは挿入、および分子の末端での付加もしくは欠失）。これら改変は、アミノ酸配列における変化を生じ得るか、サイレント変異を提供し得るか、制限部位を改変し得るか、または他の特定の変異を提供し得る。
【００３３】
本発明の方法は、核酸を細胞に送達するための方法を提供し、上記方法は、上記細胞に、一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される核酸を含むベクターを含むＡＡＶ粒子を投与し、それによって、上記核酸を上記細胞に送達する工程を包含する。上記細胞への投与は、任意の手段（単に上記粒子を上記細胞と接触させる、必要に応じて、望ましい液体（例えば、組織培養培地、もしくは緩衝化生理食塩水溶液）中に上記細胞と共に含められることを含む）によって達成され得る。上記粒子は、任意の望ましい時間の長さにわたって上記細胞と接触した状態のままにさせられ得、代表的には、上記粒子は、投与され、無期限に保持させられ得る。このようなインビトロの方法に関しては、上記ウイルスは、当該分野で公知でありかつ本明細書で例証されるように、標準的なウイルス形質導入法によって上記細胞に投与され得る。投与するウイルスの力価は、具体的には細胞タイプに依存して変動し得るが、一般に、ＡＡＶ形質導入に使用されるものに代表される。さらに、本発明の例で特定の細胞を形質導入するために使用される力価が利用され得る。上記細胞は、ヒト、ならびに他の大きな（非齧歯類）哺乳動物、例えば、霊長類、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、およびイヌの任意の所望の細胞を含み得る。
【００３４】
より具体的には、本発明は、循環するＣＳＦに接触している細胞（例えば、上衣細胞、軟膜細胞、髄膜細胞、脳の内皮細胞）に核酸を送達するための方法を提供し、上記方法は、上記細胞に、一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される核酸を含むベクターを含むＡＡＶ粒子を投与し、それによって、上記核酸を上記細胞に送達する工程を包含する。
【００３５】
本発明はさらに、被験体において核酸を細胞に送達するための方法を提供し、上記方法は、上記被験体に、一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される核酸を含むＡＡＶ粒子を投与し、それによって、上記被験体において上記核酸を細胞に送達する工程を包含する。
【００３６】
被験体において上衣細胞、軟膜細胞もしくは他の髄膜細胞に核酸を送達するための方法もまた提供され、上記方法は、上記被験体に、一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される核酸を含むＡＡＶ粒子を投与し、それによって、上記被験体において上衣細胞、軟膜細胞もしくは他の髄膜細胞に上記核酸を送達する工程を包含する。
【００３７】
ある種の実施形態において、脳血管内皮を標的とするアミノ酸配列は、疾患（例えば、リソソーム蓄積症）を有する被験体において脳血管内皮を標的とする。
【００３８】
ある種の実施形態において、上記脳血管内比を標的とするアミノ酸配列は、リソソーム蓄積症を有しない被験体において脳血管内皮を標的とする。
【００３９】
ある種の実施形態において、上記ウイルスベクターは、治療剤をコードする核酸配列を含む。ある種の実施形態において、上記治療剤は、ＴＰＰ１である。
【００４０】
本開示のある種の実施形態は、本明細書で記載されるとおりのウイルスベクターを含む細胞を提供する。
【００４１】
本開示のある種の実施形態は、本明細書で記載されるとおりのウイルスベクターもしくは上記細胞を哺乳動物に投与する工程を包含する、上記哺乳動物において疾患を処置するための方法を提供する。
【００４２】
ある種の実施形態において、上記哺乳動物は、ヒトである。
【００４３】
ある種の実施形態において、上記疾患は、リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）である。ある種の実施形態において、上記ＬＳＤは、小児性セロイドリポフスチン蓄積症もしくは後発型小児性セロイドリポフスチン蓄積症（ＬＩＮＣＬ）、ゴーシェ病、若年性バッテン病、ファブリー病、ＭＬＤ、サンフィリッポ症候群Ａ型、後発型小児性バッテン病、ハンター症候群、クラッベ病、モルキオ症候群、ポンペ病、ニーマン・ピック病Ｃ型、テイ・サックス病、ハーラー症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ）、サンフィリッポ症候群Ｂ型、マロトー・ラミー症候群、ニーマン・ピック病Ａ型、シスチン症、ハーラー・シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ／Ｓ）、スライ症候群（ＭＰＳ  ＶＩＩ）、シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｓ）、小児性バッテン病、ＧＭ１ガングリオシドーシス、ムコリピドーシスＩＩ／ＩＩＩ型、もしくはサンドホフ病である。
【００４４】
ある種の実施形態において、上記疾患は、神経変性疾患である。ある種の実施形態において、上記神経変性疾患は、アルツハイマー病、ハンチントン病、ＡＬＳ、遺伝性痙性片麻痺、原発性側索硬化症、脊髄性筋萎縮症、ケネディー病、ポリグルタミンリピート病、もしくはパーキンソン病である。
【００４５】
本開示のある種の実施形態は、被験体の中枢神経系に薬剤を送達するための方法を提供し、上記方法は、上記ＣＳＦに本明細書で記載されるウイルスベクターを投与し、その結果、形質導入された上衣細胞、軟膜細胞、内皮細胞および／もしくは他の髄膜細胞が上記治療剤を発現し、上記薬剤を上記被験体の中枢神経系に送達する工程を包含する。ある種の実施形態において、上記ウイルスベクターは、上衣細胞、軟膜細胞、内皮細胞および／もしくは他の髄膜細胞を形質導入する。
【００４６】
本開示のある種の実施形態は、医療処置において使用するための本明細書で記載されるとおりのウイルスベクターもしくは細胞を提供する。
【００４７】
本開示のある種の実施形態は、哺乳動物において、疾患、例えば、リソソーム蓄積症を処置するために有用な医薬を調製するための、本明細書で記載されるとおりのウイルスベクターもしくは細胞の使用を提供する。
【００４８】
上記ベクターは、リソソーム酵素（例えば、リソソーム加水分解酵素）、分泌されるタンパク質、核タンパク質、もしくは細胞質タンパク質をさらに含み得る。本明細書で使用される場合、用語「分泌されるタンパク質」とは、天然に分泌されるか、それが分泌され得るようにシグナル配列を含むように改変されているかに関わらず、任意の分泌されるタンパク質を含む。
【００４９】
本開示のある種の実施形態は、哺乳動物において、疾患、例えば、アルツハイマー病を処置するために有用な医薬を調製するための、本明細書で記載されるとおりのウイルスベクターもしくは細胞の使用を提供する。
【００５０】
上記ベクターは、保護性のＡｐｏＥアイソフォームタンパク質をさらに含み得る。本明細書で使用される場合、用語「分泌されるタンパク質」とは、天然に分泌されるか、それが分泌され得るようにシグナル配列を含むように改変されているかに関わらず、任意の分泌されるタンパク質を含む。核酸は、これが別の核酸配列と機能的関係に置かれる場合、「作動可能に連結」される。一般に、「作動可能に連結される」とは、連結されるＤＮＡ配列が連続していることを意味する。しかし、エンハンサーは、連続していなくてもよい。連結は、便利な制限部位でのライゲーションによって達成される。このような部位が存在しない場合には、合成オリゴヌクレオチドアダプターもしくはリンカーが、従来の実務に従って使用される。さらに、酵素をコードする核酸の複数のコピーが、発現ベクターの中に一緒に連結され得る。このような複数の核酸は、リンカーによって分離され得る。
【００５１】
本開示はまた、本明細書で記載されるベクターを含む哺乳動物細胞を提供する。上記細胞は、ヒトであり得、脳由来であり得る。その細胞タイプは、幹細胞もしくは前駆細胞集団であり得る。
【００５２】
本開示は、本明細書で記載されるポリヌクレオチド、ポリペプチド、発現ベクター、もしくは細胞を投与することによって、哺乳動物において遺伝的疾患もしくは癌のような疾患を処置するための方法を提供する。上記遺伝的疾患もしくは癌は、リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）、例えば、小児性セロイドリポフスチン蓄積症もしくは後発型小児性セロイドリポフスチン蓄積症、ゴーシェ病、若年性バッテン病、ファブリー病、ＭＬＤ、サンフィリッポ症候群Ａ型、後発型小児性バッテン病、ハンター症候群、クラッベ病、モルキオ症候群、ポンペ病、ニーマン・ピック病Ｃ型、テイ・サックス病、ハーラー症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ）、サンフィリッポ症候群Ｂ型、マロトー・ラミー症候群、ニーマン・ピック病Ａ型、シスチン症、ハーラー・シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ／Ｓ）、スライ症候群（ＭＰＳ  ＶＩＩ）、シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｓ）、小児性バッテン病、ＧＭ１ガングリオシドーシス、ムコリピドーシスＩＩ／ＩＩＩ型、もしくはサンドホフ病であり得る。
【００５３】
上記遺伝的疾患は、神経変性疾患、例えば、ハンチントン病、ＡＬＳ、遺伝性痙性片麻痺、原発性側索硬化症、脊髄性筋萎縮症、ケネディー病、アルツハイマー病、ポリグルタミンリピート病、もしくは病巣曝露（ｆｏｃａｌ  ｅｘｐｏｓｕｒｅ）、例えば、パーキンソン病であり得る。
【００５４】
本開示のある種の局面は、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、および遺伝子操作された細胞（インビボで改変）、およびこれらの使用に関する。特に、本開示は、遺伝子もしくはタンパク質治療のための方法であって、治療剤の治療上有効な用量の両方の全身送達を可能にするものに関する。
【００５５】
一局面によれば、治療剤を哺乳動物レシピエントにおいて発現するための細胞発現系が提供される。上記発現系（本明細書で「遺伝的に改変された細胞」ともいわれる）は、上記治療剤を発現するための細胞および発現ベクターを含む。発現ベクターとしては、ウイルス、プラスミド、および異種遺伝物質を細胞に送達するための他のビヒクルが挙げられるが、これらに限定されない。よって、用語「発現ベクター」とは、本明細書で使用される場合、異種遺伝物質を細胞に送達するためのビヒクルをいう。特に、上記発現ベクターは、組換えアデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、またはレンチウイルスもしくはレトロウイルスベクターである。
【００５６】
上記発現ベクターは、上記異種遺伝子の転写を制御するためのプロモーターをさらに含む。上記プロモーターは、誘導性プロモーター（以下で記載される）であり得る。上記発現系は、上記哺乳動物レシピエントへの投与に適している。上記発現系は、複数の不死化されていない遺伝的に改変された細胞（各細胞は、少なくとも１種の治療剤をコードする少なくとも１種の組換え遺伝子を含む）を含み得る。
【００５７】
上記細胞発現系は、インビボで形成される。さらに別の局面によれば、哺乳動物レシピエントをインビボで処置するための方法が提供される。上記方法は、異種遺伝子産物を発現するための発現ベクターをインサイチュで、例えば、静脈内投与を介して上記患者の細胞へと導入する工程を包含する。上記発現系をインビボで形成するために、上記治療剤を発現するための発現ベクターは、哺乳動物レシピエントへとインビボで（ｉ．ｖ．で）導入され、ここで上記ベクターは、血管系を介して脳へと移動する。
【００５８】
さらに別の局面によれば、哺乳動物レシピエントをインビボで処置するための方法が提供される。上記方法は、その標的タンパク質を上記患者にインビボで導入する工程を包含する。
【００５９】
上記異種遺伝子を発現するための発現ベクターは、上記異種遺伝子産物の転写を制御するための誘導性プロモーターを含み得る。よって、上記治療剤のインサイチュでの送達は、上記細胞をインサイチュで上記異種遺伝子の転写を誘発する条件へと曝すことによって制御される。
【００６０】
上記哺乳動物レシピエントは、遺伝子置換療法に反応しやすい条件を有し得る。本明細書で使用される場合、「遺伝子置換療法」とは、上記レシピエントへの治療剤をコードする外因性遺伝物質の投与、およびその投与された遺伝物質のインサイチュでのその後の発現をいう。従って、語句「遺伝子置換療法に反応しやすい条件」は、遺伝的疾患（すなわち、１種以上の遺伝子欠損に帰し得る疾患条件）、後天性の病状（すなわち、先天性の欠損に帰することができない病的条件）、癌および予防プロセス（すなわち、疾患もしくは望ましくない医学的条件の防止）のような条件を包含する。よって、本明細書で使用される場合、用語「治療剤」とは、上記哺乳動物レシピエントに対して有益な効果を有する任意の薬剤もしくは物質をいう。従って、「治療剤」は、核酸もしくはタンパク質成分を有する治療的および予防的両方の分子を包含する。
【００６１】
一実施形態によれば、上記哺乳動物レシピエントは、遺伝的疾患を有し、上記外因性遺伝物質は、上記疾患を処置するための治療剤をコードする異種遺伝子を含む。さらに別の実施形態において、上記哺乳動物レシピエントは、後天性の病状を有し、上記外因性遺伝物質は、上記病状を処置するための治療剤をコードする異種遺伝子を含む。別の実施形態によれば、上記患者は、癌を有し、上記外因性遺伝物質は、抗新生物薬剤をコードする異種遺伝子を含む。さらに別の実施形態において、上記患者は、望ましくない医学的条件を有し、上記外因性遺伝物質は、上記条件を処置するための治療剤をコードする異種遺伝子を含む。
【００６２】
本明細書で使用される場合、用語「保護性のＡｐｏＥアイソフォーム」、「リソソーム酵素」、「分泌されるタンパク質」、「核タンパク質」もしくは「細胞質タンパク質」は、これらポリペプチドの改変体、または生物学的に活性もしくは不活性なフラグメントを含む。上記ポリペプチドのうちの１つの「改変体」は、天然タンパク質に完全には同一でないポリペプチドである。このような改変タンパク質は、１もしくはそれより多くのアミノ酸の挿入、欠失もしくは置換によりアミノ酸配列を変化させることによって得られ得る。上記タンパク質のアミノ酸配列は、天然のポリペプチドと比較して、実質的に同じかもしくは改善された品質を有するポリペプチドを作り出すために、例えば、置換によって改変される。上記置換は、保存された置換であり得る。「保存された置換」は、あるアミノ酸の、類似の側鎖を有する別のアミノ酸での置換である。保存された置換は、アミノ酸の電荷もしくはアミノ酸の側鎖の大きさにおいて（あるいは、側鎖内の化学基の大きさ、電荷もしくは種類において）考えられる最小の変化を作製し、その結果、ペプチド全体がその空間的コンホメーションを保持するが、変化した生物学的活性を有するアミノ酸での置換である。例えば、一般的な保存された変化は、Ａｓｐ→Ｇｌｕ、ＡｓｎもしくはＧｌｎ；Ｈｉｓ→Ｌｙｓ、ＡｒｇもしくはＰｈｅ；Ａｓｎ→Ｇｌｎ、Ａｓｐ、もしくはＧｌｕ、およびＳｅｒ→Ｃｙｓ、ＴｈｒもしくはＧｌｙであり得る。アラニンは、他のアミノ酸の代わりにするために一般に使用される。２０個の必須アミノ酸は、以下のようにグループ分けされ得る：非極性側鎖を有するアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファンおよびメチオニン；荷電されていない極性側鎖を有するグリシン、セリン、スレオニン、シスチン、チロシン、アスパラギンおよびグルタミン；酸性側鎖を有するアスパラギン酸およびグルタミン酸；ならびに塩基性側鎖を有するリジン、アルギニンおよびヒスチジン。
【００６３】
上記アミノ酸変化は、その相当する核酸配列のコドンを変化させることによって達成される。このようなポリペプチドが、生物学的活性を改変もしくは改善するために、上記ポリペプチド構造の中である種のアミノ酸の代わりに他のアミノ酸で置換することに基づいて得られ得ることは、公知である。例えば、代わりのアミノ酸の置換によって、小さなコンホメーション変化から、増大した活性を生じるポリペプチドが付与され得る。あるいは、ある種のポリペプチドにおけるアミノ酸置換は、他の分子へと連結されて、上記出発ポリペプチドの特性を他の目的に有用であるように十分保持するペプチド−分子結合体を提供し得る残基を提供するために使用され得る。
【００６４】
ポリペプチドに相互作用的な生物学的機能を付与するにあたって、アミノ酸の疎水性親水性指標が使用され得る。ここである種のアミノ酸は、類似の疽膵壊死親水性指標を有する他のアミノ酸で置換され得、類似の生物学的活性をなお保持し得ることが見出される。あるいは、類似のアミノ酸の置換は、特に、生成される予定のポリペプチドにおいて望ましい生物学的機能が、免疫学的実施形態における使用が意図されている場合に、親水性に基づいて行われ得る。その隣接するアミノ酸の親水性によって左右される場合、「タンパク質」の最大の局所的平均親水性は、その免疫原性と相関する。よって、置換は、各アミノ酸に割り当てられた親水性に基づいて行われ得ることに注意する。
【００６５】
親水性指標もしくは疎水性親水性指標（これは、各アミノ酸に値を割り当てる）のいずれかを使用するにあたって、これら値が±２であるアミノ酸の置換を行うことが好ましく、±１は特に好ましく、±０．５以内にあるものが最も好ましい置換である。
【００６６】
上記改変タンパク質は、相当する天然のタンパク質のアミノ酸配列と、少なくとも５０％、少なくとも約８０％、もしくはさらに少なくとも約９０％、しかし１００％未満の連続するアミノ酸配列相同性もしくは同一性を有する。
【００６７】
上記改変ポリペプチドのアミノ酸配列は、その天然のポリペプチドのアミノ酸配列に本質的は相当する。本明細書で使用される場合、「〜に本質的に相当する」とは、上記天然のタンパク質によって生成される応答と実質的に同じ生物学的応答を誘発するポリペプチド配列をいう。このような応答は、上記天然のタンパク質によって生成されるレベルのうちの少なくとも６０％であり得、さらには、天然のタンパク質によって生成されるレベルのうちの少なくとも８０％であり得る。
【００６８】
改変体は、その相当する天然のタンパク質に存在しないアミノ酸残基もしくはその相当する天然のタンパク質に対する欠失を含み得る。改変体はまた、その相当する天然のタンパク質と比較して、短縮された「フラグメント」、すなわち、全長タンパク質のうちの一部分のみであり得る。タンパク質改変体はまた、少なくとも１個のＤ−アミノ酸を有するペプチドを含む。
【００６９】
上記改変タンパク質は、上記改変タンパク質をコードする単離されたＤＮＡ配列から発現され得る。「組換え」とは、遺伝子操作の目的で生成されるペプチドもしくは核酸として定義される。遺伝コードの縮重に起因して、個々のヌクレオチドは、コドンの中で容易に交換され得、同一のアミノ酸配列をなお生じ得ることは、当該分野で周知であることに注意すべきである。
【００７０】
本開示は、発現ベクターを細胞もしくは患者に投与することによって、哺乳動物において疾患を処置するための方法を提供する。上記遺伝子治療法に関して、分子生物学および遺伝子治療の当業者は、過度の実験なく、本開示の新規方法で使用される発現ベクターの適切な投与量および投与経路を決定し得る。
【００７１】
一実施形態によれば、上記細胞は、形質転換されるか、さもなければインビボで遺伝子改変される。上記哺乳動物レシピエント由来の細胞は、治療剤をコードする異種（例えば、組換え）遺伝子を発現するために外因性遺伝物質を含むベクターで、インビボで形質転換され（すなわち、形質導入もしくはトランスフェクトされ）、上記治療剤がインサイチュで送達される。
【００７２】
本明細書で使用される場合、「外因性遺伝物質」とは、核酸もしくはオリゴヌクレオチド（天然もしくは合成、すなわち上記細胞には天然では見出されないか；またはそれが上記細胞において天然に見出される場合、上記細胞によって生物学的に有意なレベルで転写もしくは発現されないもののいずれも）をいう。従って、「外因性遺伝物質」は、例えば、アンチセンスＲＮＡへと転写され得る天然に存在しない核酸、ならびに「異種遺伝子」（すなわち、同じタイプの天然に存在する細胞中で発現されないかもしくは生物学的に僅かなレベルで発現されるタンパク質をコードする遺伝子）を含む。
【００７３】
そのある種の実施形態において、上記哺乳動物レシピエントは、遺伝子置換療法に反応しやすい条件を有する。本明細書で使用される場合、「遺伝子置換療法」とは、上記レシピエントへの治療剤をコードする外因性遺伝物質の投与、およびその投与された遺伝物質のインサイチュでのその後の発現をいう。従って、語句「遺伝子置換療法に反応しやすい条件」は、遺伝的疾患（すなわち、１種以上の遺伝子欠損に帰することができる疾患条件）、後天性の病状（すなわち、先天性の欠損に帰することができない病的条件）、癌および予防的プロセス（すなわち、疾患もしくは望ましくない医学的条件の防止）のような条件を包含する。よって、本明細書で使用される場合、用語「治療剤」とは、上記哺乳動物レシピエントに対して有益な効果を有する任意の薬剤もしくは物質をいう。従って、「治療剤」は、核酸（例えば、アンチセンスＲＮＡ）および／もしくはタンパク質成分を有する治療的分子および予防的分子の両方を含む。
【００７４】
あるいは、遺伝子置換療法に反応しやすい条件は、予防的プロセス、すなわち、疾患もしくは望ましくない医学的条件を防止するためのプロセスである。従って、本開示は、上記哺乳動物レシピエントに対して予防的機能を有する治療剤（すなわち、予防的薬剤）を送達するための細胞発現系を包含する。
【００７５】
まとめると、用語「治療剤」としては、上記に挙げた条件と関連する薬剤、ならびにそれらの機能的等価物が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用される場合、用語「機能的等価物」とは、上記哺乳動物レシピエントに対して治療剤と同じもしくは改善された有益な効果を有する分子（例えば、ペプチドもしくはタンパク質）（これが機能的等価物と考えられる）をいう。
【００７６】
上記で開示される治療剤および遺伝子置換療法に反応しやすい条件は、例証に過ぎず、本開示の範囲を限定するとは解釈されない。公知の条件を処置するための適切な治療剤の選択は、過度の実験なく、当業者の範囲内であるとみなされる。
（ＡＡＶベクター）
【００７７】
一実施形態において、本開示のウイルスベクターは、ＡＡＶベクターである。「ＡＡＶ」ベクターとは、アデノ随伴ウイルスをいい、天然に存在する野生型ウイルス自体もしくはその派生物をいうために使用され得る。この用語は、別段必要とされる場合を除いて、全てのサブタイプ、血清タイプおよび偽型（天然に存在する形態および組換え形態の両方）を網羅する。本明細書で使用される場合、用語「血清タイプ」とは、規定された抗血清とのキャプシドタンパク質反応性に基づいて同定され、他のＡＡＶから区別され得るＡＡＶをいい、例えば、霊長類ＡＡＶには８つの公知の血清タイプ、ＡＡＶ−１〜ＡＡＶ−９およびＡＡＶｒｈ１０がある。例えば、血清タイプＡＡＶ２は、ＡＡＶ２のキャップ遺伝子からコードされるキャプシドタンパク質ならびに同じＡＡＶ２血清タイプに由来する５’ＩＴＲ配列および３’ＩＴＲ配列を含むゲノムを含むＡＡＶをいうために使用される。本明細書で使用される場合、例えば、ｒＡＡＶ１は、同じ血清タイプに由来するキャプシドタンパク質および５’−３’  ＩＴＲの両方を有するＡＡＶをいうために使用され得るか、またはそれは、１つの血清タイプに由来するキャプシドタンパク質および異なるＡＡＶ血清タイプに由来する５’−３’  ＩＴＲ（例えば、ＡＡＶ血清タイプ２由来のキャプシドおよびＡＡＶ血清タイプ５由来のＩＴＲ）を有するＡＡＶをいい得る。本明細書で例証される各例に関して、ベクター設計および生成の説明は、キャプシドおよび５’−３’
ＩＴＲ配列の血清タイプを記載する。略語「ｒＡＡＶ」とは、組換えアデノ随伴ウイルス（組換えＡＡＶベクター（もしくは「ｒＡＡＶベクター」）ともいわれる）をいう。
【００７８】
「ＡＡＶウイルス」もしくは「ＡＡＶウイルス粒子」とは、少なくとも１種のＡＡＶキャプシドタンパク質（好ましくは、野生型ＡＡＶのキャプシドタンパク質のうちの全てによる）およびキャプシド化されたポリヌクレオチドから構成されるウイルス粒子をいう。上記粒子が異種ポリヌクレオチド（すなわち、野生型ＡＡＶゲノム以外のポリヌクレオチド（例えば、哺乳動物細胞に送達される予定の導入遺伝子））を含む場合、それは、代表的には、「ｒＡＡＶ」といわれる。
【００７９】
一実施形態において、上記ＡＡＶ発現ベクターは、転写の指示において作動可能に連結される構成要素として、転写開始領域を含む制御エレメント、目的のＤＮＡおよび転写終結領域を少なくとも提供するために公知の技術を使用して構築される。上記制御エレメントは、哺乳動物細胞において機能するように選択される。上記作動可能に連結される構成要素を含む得られた構築物は、機能的ＡＡＶ  ＩＴＲ配列と（５’側および３’側で）隣接している。
【００８０】
「アデノ随伴ウイルス逆方向末端反復」もしくは「ＡＡＶ  ＩＴＲ」とは、ＤＮＡ複製起点としておよびウイルスのパッケージングシグナルとして、シスで一緒に機能するＡＡＶゲノムの各末端で見出される当該分野で認識されている領域を意味する。ＡＡＶ  ＩＴＲは、ＡＡＶ  ｒｅｐコード領域と一緒になって、２つの隣り合うＩＴＲの間に挿入されるヌクレオチド配列からの効率的切り出しおよびレスキュー、ならびに哺乳動物細胞ゲノムへの組み込みを提供する。
【００８１】
ＡＡＶ  ＩＴＲ領域のヌクレオチド配列は公知である。本明細書で使用される場合、「ＡＡＶ  ＩＴＲ」は、示される野生型ヌクレオチド配列を有する必要はないが、例えば、ヌクレオチドの挿入、欠失もしくは置換によって変化していてもよい。さらに、上記ＡＡＶ  ＩＴＲは、いくつかのＡＡＶ血清タイプ（ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ７などが挙げられるが、これらに限定されない）のうちのいずれかに由来し得る。さらに、ＡＡＶベクターの中の選択されたヌクレオチド配列に隣接する５’および３’  ＩＴＲは、それらが、意図されたとおりに、すなわち、宿主細胞ゲノムもしくはベクターからの目的の配列の切り出しおよびレスキューを可能にするように、ならびにＡＡＶ  Ｒｅｐ遺伝子産物が上記細胞に存在する場合には上記異種配列をレシピエント細胞ゲノムの中に組み込まれるのを可能にするように機能する限りにおいて、同じＡＡＶ血清タイプもしくは単離物と必ずしも同一である必要もないし、これらに由来する必要もない。
【００８２】
一実施形態において、ＡＡＶ  ＩＴＲは、いくつかのＡＡＶ血清タイプ（ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ７などが挙げられるが、これらに限定されない）のうちのいずれかに由来し得る。さらに、ＡＡＶ発現ベクターの中で選択されたヌクレオチド配列に隣接する５’および３’  ＩＴＲは、それらが、意図されたとおりに、すなわち、宿主細胞ゲノムもしくはベクターからの目的の配列の切り出しおよびレスキューを可能にするように、ならびにＡＡＶ  Ｒｅｐ遺伝子産物が上記細胞に存在する場合には上記ＤＮＡ分子をレシピエント細胞ゲノムの中に組み込まれるのを可能にするように機能する限りにおいて、同じＡＡＶ血清タイプもしくは単離物と必ずしも同一である必要もないし、これらに由来する必要もない。
【００８３】
一実施形態において、ＡＡＶキャプシドは、ＡＡＶ２に由来し得る。ＡＡＶベクターで使用するための適切なＤＮＡ分子は、大きさ約５キロベース（ｋｂ）未満、約４．５ｋｂ未満、約４ｋｂ未満、約３．５ｋｂ未満、約３ｋｂ未満、約２．５ｋｂ未満であり、当該分野で公知である。
【００８４】
一実施形態において、上記選択されたヌクレオチド配列は、上記被験体においてその転写もしくは発現をインビボで統御する制御エレメントに作動可能に連結される。このような制御エレメントは、上記選択された遺伝子と通常会合している制御配列を含み得る。あるいは、異種制御配列が使用され得る。有用な異種制御配列は、一般に、哺乳動物遺伝子もしくはウイルス遺伝子をコードする配列に由来するものを含む。例としては、ＳＶ４０初期プロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルスＬＴＲプロモーター；アデノウイルス主要後期プロモーター（Ａｄ  ＭＬＰ）；単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）プロモーター、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター（例えば、ＣＭＶ最初期プロモーター領域（ＣＭＶＩＥ））、ラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）プロモーター、ｐｏｌ  ＩＩプロモーター、ｐｏｌ  ＩＩＩプロモーター、合成プロモーター、ハイブリッドプロモーターなどが挙げられるが、これらに限定されない。さらに、非ウイルス遺伝子（例えば、マウスメタロチオネイン遺伝子）由来の配列はまた、本明細書での使用が見出される。このようなプロモーター配列は、例えば、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ（Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，  Ｃａｌｉｆ．）から市販されている。
【００８５】
一実施形態において、異種プロモーターおよび他の制御エレメント（例えば、ＣＮＳ特異的および誘導性プロモーター、エンハンサーなど）は両方とも、特に有用である。異種プロモーターの例としては、ＣＭＶプロモーターが挙げられる。ＣＮＳ特異的プロモーターの例としては、ミエリン塩基性タンパク質（ＭＢＰ）、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、およびニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）に由来する遺伝子から単離されるものが挙げられる。誘導性プロモーターの例としては、エクジソン、テトラサイクリン、低酸素およびａｕｆｉｎに関するＤＮＡ応答性エレメントが挙げられる。
【００８６】
一実施形態において、ＡＡＶ  ＩＴＲによって境界が示された目的のＤＮＡ分子を有するＡＡＶ発現ベクターは、上記選択された配列を、ＡＡＶゲノムから切り出された主要なＡＡＶオープンリーディングフレーム（「ＯＲＦ」）を有するＡＡＶゲノムの中に直接挿入することによって構築され得る。上記ＡＡＶゲノムの他の部分はまた、上記ＩＴＲの十分な部分が保持されて、複製およびパッケージング機能を可能にする限りにおいて、欠失され得る。このような構築物は、当該分野で周知の技術を使用して設計され得る。
【００８７】
あるいは、ＡＡＶ  ＩＴＲは、上記ウイルスゲノムから、または同じものを含むＡＡＶベクターから切り出され得、標準的なライゲーション技術を使用して別のベクターに存在する選択された核酸構築物の５’側および３’側に融合され得る。例えば、ライゲーションは、２０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−Ｃｌ  ｐＨ７．５、１０ｍＭ  ＭｇＣｌ２、１０ｍＭ  ＤＴＴ、３３μｇ／ｍｌ  ＢＳＡ、１０ｍＭ〜５０ｍＭ  ＮａＣｌ、および０℃（「粘着末端」ライゲーションに関して）で４０μＭ  ＡＴＰ、０．０１〜０．０２（Ｗｅｉｓｓ）ユニット  Ｔ４  ＤＮＡリガーゼ、もしくは１４℃（「平滑末端」ライゲーションに関して）で１ｍＭ  ＡＴＰ、０．３〜０．６（Ｗｅｉｓｓ）ユニット  Ｔ４  ＤＮＡリガーゼのいずれかの中で達成され得る。分子間「粘着末端」ライゲーションは、通常、ＩＴＲを含む３０〜１００μｇ／ｍｌ  総ＤＮＡ濃度（５〜１００ｎＭ  総最終濃度）．ＡＡＶベクターで行われる。
【００８８】
さらに、キメラ遺伝子は、１種以上の選択された核酸配列の５’側および３’側に配置されたＡＡＶ  ＩＴＲ配列を含むように合成で生成され得る。哺乳動物ＣＮＳ細胞においてキメラ遺伝子配列を発現するために好ましいコドンが使用され得る。完全なキメラ配列は、標準的方法によって調製されたオリゴヌクレオチドを重ね合わせることからアセンブリされる。
【００８９】
ｒＡＡＶビリオンを生成するために、ＡＡＶ発現ベクターは、公知の技術を使用して（例えば、トランスフェクションによって）、適切な宿主細胞へと導入される。多くのトランスフェクション技術が一般に、当該分野で公知である。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．  （１９８９）  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，  ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｍａｎｕａｌ，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋを参照のこと。特に適切なトランスフェクション法としては、リン酸カルシウム共沈、培養細胞への直接マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、リポソーム媒介性遺伝子移入、脂質媒介性形質導入、および高速マイクロインジェクションを使用する核酸送達が挙げられる。
【００９０】
一実施形態において、ｒＡＡＶビリオンを生成するために適した宿主細胞としては、異種ＤＮＡ分子のレシピエントとして使用され得るか、もしくはレシピエントとして使用されてきた、微生物、酵母細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞が挙げられる。上記用語は、トランスフェクトされた元の細胞の子孫を含む。従って、「宿主細胞」は、本明細書で使用される場合、一般に、外因性ＤＮＡ配列でトランスフェクトされる細胞に言及する。安定なヒト細胞株に由来する細胞、２９３（例えば、アクセッション番号ＡＴＣＣ  ＣＲＬ１５７３の下でアメリカンタイプカルチャーコレクションから容易に入手可能）は、本開示の実施において使用され得る。特に、ヒト細胞株２９３は、アデノウイルス５型ＤＮＡフラグメントで形質転換され、アデノウイルスＥ１ａおよびＥ１ｂ遺伝子を発現するヒト胚性腎臓細胞株である。上記２９３細胞株は、容易にトランスフェクトされ、ｒＡＡＶビリオンを生成するために特に便利なプラットフォームを提供する。
【００９１】
「ＡＡＶ  ｒｅｐコード領域」とは、複製タンパク質Ｒｅｐ  ７８、Ｒｅｐ  ６８、Ｒｅｐ  ５２およびＲｅｐ  ４０をコードするＡＡＶゲノムの当該分野で認識されている領域を意味する。これらＲｅｐ発現産物は、ＡＡＶのＤＮＡ複製起点の認識、結合およびニック生成、ＤＮＡヘリカーゼ活性およびＡＡＶ（もしくは他の異種）プロモーターからの転写の調節を含め、多くの機能を有することが示された。上記Ｒｅｐ発現産物は、上記ＡＡＶゲノムを複製するためにまとめて必要とされる。上記ＡＡＶ  ｒｅｐコード領域の適切なホモログとしては、ＡＡＶ−２  ＤＮＡ複製を媒介することも公知であるヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ−６）ｒｅｐ遺伝子が挙げられる。
【００９２】
「ＡＡＶ  ｃａｐコード領域」とは、キャプシドタンパク質ＶＰ１、ＶＰ２、およびＶＰ３をコードするＡＡＶゲノムの当該分野で認識されている領域、もしくはその機能的ホモログを意味する。これらＣａｐ発現産物は、上記ウイルスゲノムをパッケージングするためにまとめて必要とされるパッケージング機能を供給する。
【００９３】
一実施形態において、ＡＡＶヘルパー機能は、上記宿主細胞をＡＡＶヘルパー構築物で、上記ＡＡＶ発現ベクターのトランスフェクションの前もしくはこれと同時のいずれかに、トランスフェクトすることによって、宿主細胞へと導入される。ＡＡＶヘルパー構築物は、このようにして、ＡＡＶ  ｒｅｐおよび／もしくはｃａｐ遺伝子の少なくとも一過性の発現を提供して、生産的なＡＡＶ感染に必要な、失われているＡＡＶ機能を補完するために使用される。ＡＡＶヘルパー構築物は、ＡＡＶ  ＩＴＲを欠いており、複製も、それら自体をパッケージすることもできない。これら構築物は、プラスミド、ファージ、トランスポゾン、コスミド、ウイルス、もしくはビリオンの形態にあり得る。多くのＡＡＶヘルパー構築物が使用されてきた（例えば、ＲｅｐおよびＣａｐ両方の発現産物をコードする、一般に使用されるプラスミドｐＡＡＶ／ＡｄおよびｐＩＭ２９＋４５）。Ｒｅｐおよび／もしくはＣａｐ発現産物をコードする多くの他のベクターも記載されてきた。
【００９４】
ウイルスベクターの送達法は、上記ＡＡＶ２をＣＳＦへと注射する工程を包含する。一般に、ｒＡＡＶビリオンは、インビボもしくはインビトロいずれかの形質導入技術を使用して、ＣＮＳの細胞へと導入され得る。インビトロで導入される場合、所望のレシピエント細胞は、被験体から取り出され、ｒＡＡＶビリオンで形質導入され、上記被験体へと再導入される。あるいは、共通遺伝子の細胞もしくは異種発生性の細胞は、それら細胞が上記被験体において不適切な免疫応答を生じない場合に使用され得る。
【００９５】
形質導入した細胞を被験体へ送達および導入するための適切な方法が、記載されてきた。例えば、細胞は、組換えＡＡＶビリオンと、ＣＮＳ細胞とを、例えば、適切な培地中で合わせることによってインビトロで形質導入され得、その目的のＤＮＡを有するそれら細胞のスクリーニングは、サザンブロットおよび／もしくはＰＣＲのような従来技術を使用して、または選択マーカーを使用することによって、スクリーニングされ得る。形質導入された細胞は、次いで、以下により十分に記載される薬学的組成物へと製剤化され得、上記組成物は、種々の技術によって、例えば、移植、筋肉内注射、静脈内注射、皮下注射および腹腔内注射によって、上記被験体に導入され得る。
【００９６】
一実施形態において、薬学的組成物は、目的の核酸の治療上有効な量、すなわち、問題の疾患状態の症状を低減もしくは改善するために十分な量もしくは所望の利益を付与するために十分な量を生じるために、十分な遺伝物質を含む。上記薬学的組成物はまた、薬学的に受容可能な賦形剤を含む。このような賦形剤は、これ自体が上記組成物を受容する個体にとって有害な抗体の生成を誘発せず、過度な毒性なしに投与され得る任意の薬剤を含む。薬学的に受容可能な賦形剤としては、ソルビトール、Ｔｗｅｅｎ８０、および液体（例えば、水、生理食塩水、グリセロールおよびエタノール）が挙げられるが、これらに限定されない。薬学的に受容可能な塩は、そこに含まれ得る（例えば、無機酸塩（例えば、塩酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩など）；および有機酸の塩（例えば、酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩など））。さらに、補助物質（例えば、湿潤剤もしくは乳化剤、ｐＨ緩衝化物質など）は、このようなビヒクル中に存在し得る。薬学的に受容可能な賦形剤の詳細な考察は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  （Ｍａｃｋ  Ｐｕｂ．  Ｃｏ．，  Ｎ．Ｊ．  １９９１）で入手可能である。
【００９７】
１種より多くの導入遺伝子が上記送達されるウイルスベクターによって発現され得ることは、理解されるべきである。あるいは、別個のベクター（各々、１種以上の異なる導入遺伝子を発現する）がまた、本明細書で記載されるように、ＣＮＳに送達され得る。さらに、本開示の方法によって送達されるウイルスベクターが、他の適切な組成物および治療と併用され得ることもまた、意図される。
【００９８】
本明細書の教示に鑑みれば当業者に明らかであるように、添加されなければならないウイルスベクターの有効量は、経験的に決定され得る。投与は、処置過程の間中ずっと、連続してもしくは周期的に、１用量で行われ得る。最も有効な手段および投与量を決定するための方法は、当業者に周知であり、ウイルスベクター、上記治療の組成物、標的細胞、および処置されている被験体に伴って変動する。１回もしくは複数回の投与は、処置している医師によって選択される投与レベルおよびパターンで行われ得る。
【００９９】
ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶは、１×１０５〜１×１０１６ｖｇ／ｍｌの約１〜５ｍｌの用量で投与される。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶは、約１×１０７〜１×１０１４ｖｇ／ｍｌの１〜３ｍｌの用量で投与される。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶは、１×１０８〜１×１０１３ｖｇ／ｍｌの約１〜２ｍｌの用量で投与される。
【０１００】
上記ｒＡＡＶ粒子を含む製剤は、ビヒクル中に上記ｒＡＡＶ粒子の有効量を含み、上記有効量は、当業者によって容易に決定される。上記ｒＡＡＶ粒子は、代表的には、上記組成物のうちの約１％〜約９５％（ｗ／ｗ）の範囲に及び得るか、または適切であれば、さらにより高くてもよいしより低くてもよい。投与される予定の量は、処置が考慮されている動物もしくはヒト被験体の年齢、体重および物理的状態のような要因に依存する。有効な投与量は、用量応答曲線を確立する慣用的な試験を通じて、当業者によって確立され得る。上記被験体は、１以上の用量での上記ｒＡＡＶ粒子の投与によって処置される。複数の用量は、適切な酵素活性を維持するために必要とされる場合に、投与され得る。
【０１０１】
水、水性生理食塩水、人工ＣＳＦ、もしくは他の公知の物質を含むビヒクルは、本発明とともに使用され得る。製剤を調製するために、精製された組成物が単離され得、凍結乾燥および安定化され得る。上記組成物は、次いで、適切な濃度へと調節され得、必要に応じて、抗炎症剤と合わせられ得、使用のためにパッケージされ得る。
（ＴＰＰ１タンパク質）
【０１０２】
ある種の実施形態において、上記投与される核酸は、ＴＰＰ１、野生型ＴＰＰ１と実質的な同一性を有するＴＰＰ１、および／またはＴＰＰ１の改変体、変異体もしくはフラグメントをコードする。上記ヒトＴＰＰ１アミノ酸配列は、図１４に提供され、その核酸配列は、図１５に提供される。図１６は、アカゲザルＴＰＰ１アミノ酸配列を提供し、図１７は、カニクイザルＴＰＰ１アミノ酸配列を提供する。ある種の実施形態において、上記ＴＰＰ１タンパク質は、図１４、図１６もしくは図１７に示されるタンパク質と、約７０％相同性、約７５％相同性、８０％相同性、８５％相同性、９０％相同性、９５％相同性、９８％相同性、９９％相同性、もしくはさらに１００％相同性を有し得る。上記ＴＰＰ１タンパク質は、図１４、図１６もしくは図１７に示されるタンパク質と、約７０％同一性、約７５％同一性、８０％同一性、８５％同一性、９０％同一性、９５％同一性、９８％同一性、９９％同一性、もしくはさらに１００％同一性を有し得る。
【０１０３】
変異タンパク質は、ＴＰＰ１において変異、例えば、ミスセンスもしくはナンセンス変異を有する遺伝子によってコードされるタンパク質をいう。用語「核酸」とは、１本鎖もしくは２本鎖いずれかの形態にあり、糖、ホスフェートおよび塩基（プリンもしくはピリミジンのいずれかである）を含むモノマー（ヌクレオチド）から構成される、デオキシリボヌクレオチドもしくはリボヌクレオチドおよびこれらのポリマーをいう。特段限定されなければ、上記用語は、参照核酸と類似の結合特性を有し、天然に存在するヌクレオチドに類似の様式で代謝される、天然のヌクレオチドの公知のアナログを含む核酸を含む。別段示されなければ、特定の核酸配列はまた、その保存的に改変された改変体（例えば、縮重コドン置換）および相補的配列、ならびに明示的に示される配列を包含する。具体的には、縮重コドン置換は、１以上の選択された（もしくは全ての）コドンの三番目の位置が混合塩基および／もしくはデオキシイノシン残基で置換される配列を作製することによって達成され得る。
【０１０４】
「核酸フラグメント」とは、所定の核酸分子の一部である。生物の大部分におけるデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）は、遺伝物質である一方で、リボ核酸（ＲＮＡ）は、ＤＮＡ内に含まれる情報をタンパク質へと移すのに関与する。上記開示されるヌクレオチド配列およびそれらによってコードされるタンパク質もしくは部分長のタンパク質のフラグメントおよび改変体もまた、本発明によって包含される。「フラグメント」もしくは「一部分」とは、ポリペプチドもしくはタンパク質をコードするヌクレオチド配列、または上記ポリペプチドもしくはタンパク質のアミノ酸配列の、全長もしくは全長未満を意味する。ある種の実施形態において、上記フラグメントもしくは一部分は、生物学的に機能的である（すなわち、野生型ＴＰＰ１の酵素活性のうちの５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％もしくは１００％を保持する）。
【０１０５】
分子の「改変体」とは、上記天然の分子の配列に実質的に類似である配列である。ヌクレオチド配列に関して、改変体は、遺伝コードの縮重が原因で、上記天然のタンパク質の同一なアミノ酸配列をコードするそれら配列を含む。これらのような天然に存在する対立遺伝子改変体は、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）およびハイブリダイゼーション技術のような分子生物学技術を使用して同定され得る。改変ヌクレオチド配列はまた、上記天然のタンパク質をコードする合成由来のヌクレオチド配列（例えば、部位指向性変異誘発を使用することによって生成されるもの）、ならびにアミノ酸置換を有するポリペプチドをコードするものを含む。一般に、本発明のヌクレオチド配列改変体は、上記天然の（内因性の）ヌクレオチド配列と、少なくとも４０％、５０％、６０％、〜７０％、例えば、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、〜７９％、一般には、少なくとも８０％、例えば、８１％〜８４％、少なくとも８５％、例えば、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、〜９８％の配列同一性を有する。ある種の実施形態において、上気海変態は、生物学的に機能的である（すなわち、野生型ＴＰＰ１の酵素活性のうちの５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％もしくは１００％を保持する）。
【０１０６】
特定の核酸配列の「保存的に改変された改変体」とは、同一なもしくは本質的に同一なアミノ酸配列をコードするそれら核酸配列をいう。遺伝コードの縮重が原因で、多数の機能的に同一な核酸が、任意の所定のポリペプチドをコードする。例えば、コドンＣＧＴ、ＣＧＣ、ＣＧＡ、ＣＧＧ、ＡＧＡおよびＡＧＧは全て、アミノ酸アルギニンをコードする。従って、アルギニンがあるコドンによって特定される全ての位置において、そのコドンは、コードされるタンパク質を変化させることなく、記載された対応するコドンのうちのいずれかに変化させ得る。この核酸バリエーションは、「サイレントバリエーション」であり、これは、「保存的に改変された改変体」のうちの１種である。ポリペプチドをコードする、本明細書で記載されるあらゆる核酸配列はまた、別段注記される場合を除いて、あらゆる考えられるサイレントバリエーションを記載する。当業者は、核酸中の各コドン（通常はメチオニンの唯一のコドンであるＡＴＧを除く）が、標準的な技術によって機能的に同一な分子を得るように改変され得ることを認識する。よって、ポリペプチドをコードする核酸の各「サイレントバリエーション」は、各記載される配列に内在する。
【０１０７】
ポリヌクレオチド配列の用語「実質的同一性」は、あるポリヌクレオチドが、標準的パラメーターを使用して記載されるアラインメントプログラムのうちの１つを使用して、参照配列と比較して、少なくとも７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、もしくは７９％、または少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、もしくは８９％、または少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、もしくは９４％、もしくはさらには少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を有する配列を包含することを意味する。当業者は、コドン縮重、アミノ酸類似性、リーディングフレームの配置などを考慮することによって、２つのヌクレオチド配列によってコードされるタンパク質の相当する同一性を決定するために適切に調節され得ることを認識する。これら目的のためのアミノ酸配列の実質的同一性は、通常、少なくとも７０％、少なくとも８０％、９０％、もしくはさらに少なくとも９５％の配列同一性を意味する。
【０１０８】
ペプチドの状況での用語「実質的同一性」とは、あるペプチドが、特定された比較ウインドウにわたって参照配列と、少なくとも７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、もしくは７９％、または８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、もしくは８９％、または少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、もしくは９４％、またはさらには、９５％、９６％、９７％、９８％もしくは９９％の配列同一性を有する配列を包含することを示す。２つのペプチド配列が実質的に同一であるというしるしは、１つのペプチドがその第２のペプチドに対して惹起された抗体と免疫学的に反応性であるということである。従って、ペプチドは、例えば、上記２つのペプチドが保存的置換によってのみ異なる場合に、第２のペプチドに実質的に同一である。
（アポリポプロテインＥ（ＡｐｏＥ））
【０１０９】
いくつかの異なるヒトアポリポプロテインＥ（ＡｐｏＥ）アイソフォームが存在し、脳中にこれらアイソフォームのうちのいくつかが存在すると、アルツハイマー病（ＡＤ）のリスクが増大するのに対して、他のアイソフォームが存在すると、ＡＤのリスクが低下する。ＡｐｏＥ  ε４アイソフォームの存在は、晩期発症型の孤発性ＡＤの強力な遺伝的因子である（Ｃａｓｅｌｌａｎｏ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｃｉ  Ｔｒａｎｓｌ  Ｍｅｄ，  ３（８９）：８９ｒａ５７  （２９  Ｊｕｎｅ  ２０１１））。上記ＡｐｏＥ  ε４対立遺伝子は、ＡＤリスクを強力に高め、発症年齢を低下させる。他方で、上記ＡｐｏＥ  ε２対立遺伝子の存在は、ＡＤリスクを低下させるようである。ヒトＡｐｏＥアイソフォームが、インビボでアミロイド−β（Αβ）のクリアランスもしくは合成に差次的に影響を及ぼすことが示唆される。
【０１１０】
ある種の実施形態において、上記投与される核酸は、ＡｐｏＥ、野生型ＡｐｏＥと実質的同一性を有するＡｐｏＥ、またはＡｐｏＥの改変体、変異体および／もしくはフラグメントをコードする。ある種の実施形態において、上記核酸は、ＡｐｏＥ  ε２、野生型ＡｐｏＥ  ε２と実質的同一性を有するＡｐｏＥ  ε２、および／またはＡｐｏＥ  ε２の改変体、変異体および／もしくはフラグメントをコードする。
（免疫抑制剤）
【０１１１】
ある種の実施形態において、免疫抑制剤もまた、上記哺乳動物に投与される。ある種の実施形態において、上記免疫抑制剤は、抗炎症剤である。ある種の実施形態において、上記抗炎症剤は、ミコフェノレートである。ある種の実施形態において、上記抗炎症剤は、上記ｒＡＡＶ粒子の投与前に投与される。ある種の実施形態において、上記抗炎症剤は、上記ｒＡＡＶ粒子の投与と同時に投与される。ある種の実施形態において、上記抗炎症剤は、上記ｒＡＡＶ粒子の投与後に投与される。
【０１１２】
ある種の実施形態において、上記抗炎症剤は、非経口的に、例えば、適切なビヒクル中で筋肉内注射もしくは皮下注射によって投与される。しかし、経口送達、鼻内送達もしくは皮内送達のような他の投与様式も、許容される。ある種の実施形態において、上記ｒＡＡＶ粒子および上記抗炎症剤を含む組成物が調製され、上記抗炎症剤およびｒＡＡＶ粒子は、上記哺乳動物の大槽に、ならびに／または上記哺乳動物の脳室、くも膜下腔および／もしくは髄膜下腔に、同時に投与される。
（遺伝物質を細胞に導入するための方法）
【０１１３】
上記外因性遺伝物質（例えば、１種以上の治療用タンパク質をコードするｃＤＮＡ）は、遺伝的に改変された細胞を提供するために、遺伝子移入法（例えば、トランスフェクションもしくは形質導入）によってインビボで細胞へと導入される。種々の発現ベクター（すなわち、標的細胞への外因性遺伝物質の送達を促進するためのビヒクル）は、当業者に公知である。
【０１１４】
本明細書で使用される場合、「細胞のトランスフェクション」とは、添加されたＤＮＡの組み込みによって、新たな遺伝物質を細胞が獲得することをいう。従って、トランスフェクションとは、物理的もしくは化学的な方法によって、細胞へと核酸を挿入することをいう。いくつかのトランスフェクション技術は、当業者に公知であり、以下が挙げられる：リン酸カルシウムＤＮＡ共沈；ＤＥＡＥ−デキストラン；エレクトロポレーション；カチオン性リポソーム媒介性トランスフェクション；およびタングステン粒子促進微粒子ボンバードメント。リン酸ストロンチウムＤＮＡ共沈は、別の考えられるトランスフェクション法である。
【０１１５】
対照的に、「細胞の形質導入」とは、ＤＮＡウイルスもしくはＲＮＡウイルスを使用して、細胞に核酸を移入するプロセスをいう。核酸を細胞に移入するためのＲＮＡウイルス（すなわち、レトロウイルス）は、本明細書では導入キメラレトロウイルス（ｔｒａｎｓｄｕｃｉｎｇ  ｃｈｉｍｅｒｉｃ  ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓ）といわれる。上記レトロウイルス内に含まれる外因性遺伝物質は、上記形質導入された細胞のゲノムへと組み込まれる。キメラＤＮＡウイルス（例えば、治療剤をコードするｃＤＮＡを有するアデノウイルス）で形質導入された細胞は、そのゲノムの中には上記外因性遺伝物質が組み込まれていないが、上記細胞内で染色体外に保持されている上記外因性遺伝物質を発現し得る。
【０１１６】
代表的には、上記外因性遺伝物質は、異種遺伝子（通常は、上記治療用タンパク質をコードするエキソンを含むｃＤＮＡの形態にある）と一緒に、上記新たな遺伝子の転写を制御するためのプロモーターを含む。上記プロモーターは、特徴としては、転写を開始するために必要な特定のヌクレオチド配列を有する。必要に応じて、上記外因性遺伝物質は、所望の遺伝子転写活性を得るために必要とされるさらなる配列（すなわち、エンハンサー）をさらに含む。この考察目的で、「エンハンサー」は、単純に、コード配列と（シスで）連続して働いて、上記プロモーターによって必然的に決められる基本的な転写レベルを変化させる、任意の翻訳されないＤＮＡ配列である。上記外因性遺伝物質は、上記プロモーターから直ぐ下流に細胞ゲノムへと導入され得、その結果、上記プロモーターおよびコード配列は、上記コード配列の転写を可能にするように作動可能に連結される。レトロウイルス発現ベクターは、上記挿入される外因性遺伝子の転写を制御するために、外因性プロモーターエレメントを含み得る。このような外因性プロモーターとしては、構成性および誘導性両方のプロモーターが挙げられる。
【０１１７】
天然に存在する構成性プロモーターは、必須の細胞機能の発現を制御する。結果として、構成性プロモーターの制御下にある遺伝子は、細胞増殖の全ての条件下で発現される。例示的な構成性プロモーターとしては、ある種の構成的もしくは「ハウスキーピング」機能をコードする以下の遺伝子：ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＰＲＴ）、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）、アデノシンデアミナーゼ、ホスホグリセロールキナーゼ（ＰＧＫ）、ピルビン酸キナーゼ、ホスホグリセロールムターゼ、アクチンプロモーターのためのプロモーター、ならびに当業者に公知の他の構成性プロモーターが挙げられる。さらに、多くのウイルスプロモーターが、真核生物細胞において構成的に機能する。これらとしては、中でもとりわけ以下が挙げられる：ＳＶ４０の初期および後期プロモーター；モロニー白血病ウイルスおよび他のレトロウイルスの長末端反復（ＬＴＲ）；ならびに単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼプロモーター。よって、上記で言及した構成性プロモーターのいずれも、異種遺伝子挿入物の転写を制御するために使用され得る。
【０１１８】
誘導性プロモーターの制御下にある遺伝子は、誘導因子の存在下でのみ、もしくは誘導因子の存在下でより大きな程度へと発現される（例えば、メタロチオネインプロモーターの制御下にある転写は、ある種の金属イオンの存在下で大きく増大される）。誘導性プロモーターは、それらの誘導因子が結合される場合に転写を刺激する応答性エレメント（ＲＥ）を含む。例えば、血清因子、ステロイドホルモン、レチノイン酸およびサイクリックＡＭＰに対するＲＥが存在する。特定のＲＥを含むプロモーターは、誘導性応答を得るために選択され得、いくらかの場合には、上記ＲＥ自体が、異なるプロモーターに結合され得、それによって、組換え遺伝子への誘導性を付与する。従って、適切なプロモーター（構成性  対  誘導性；強い  対  弱い）を選択することによって、上記遺伝的に改変された細胞における治療剤の存在および発現レベルの両方を制御することが可能である。上記治療剤をコードする遺伝子が誘導性プロモーターの制御下にある場合、上記治療剤のインサイチュでの送達は、上記遺伝的に改変された細胞をインサイチュで上記治療剤の転写を可能にするための条件に曝すことによって、例えば、上記薬剤の転写を制御する誘導性プロモーターの特異的誘導因子の腹腔内注射によって、誘発される。例えば、上記メタロチオネインプロモーターの制御下にある遺伝子によってコードされる治療剤の遺伝的に改変された細胞によるインサイチュ発現は、上記遺伝的に改変された細胞と、適切な（すなわち、誘導する）金属イオンを含む溶液とをインサイチュで接触させることによって増強される。
【０１１９】
よって、インサイチュで送達される治療剤の量は、以下のような要因を制御することによって調節される：（１）挿入される遺伝子の転写を統御するために使用されるプロモーターの性質（すなわち、上記プロモーターが構成性であるか誘導性であるか、強いのか弱いのか）；（２）上記細胞に挿入される外因性遺伝子のコピー数；（３）患者へと投与される（例えば、移植される）形質導入された／トランスフェクトされた細胞の数；（４）移植物（例えば、グラフトもしくは被包された発現系）の大きさ；（５）移植物の数；（６）上記形質導入された／トランスフェクトされた細胞もしくは移植物が適所に置かれる時間の長さ；および（７）上記遺伝的に改変された細胞による上記治療剤の生成速度。特定の治療剤の治療上有効な用量の送達のためのこれら因子の選択および最適化は、上記で開示される要因および上記患者の臨床プロフィールを考慮に入れれば、過度な実験なく、当業者の範囲内であると考えられる。
【０１２０】
少なくとも１つのプロモーターおよび上記治療剤をコードする少なくとも１つの異種核酸に加えて、上記発現ベクターは、上記発現ベクターでトランスフェクトもしくは形質導入される細胞の選択を促進するために、選択遺伝子、例えば、ネオマイシン耐性遺伝子を含み得る。あるいは、上記細胞は、２以上の発現ベクター（少なくとも１つのベクターは、上記治療剤をコードする遺伝子を含み、他方のベクターは、選択遺伝子を含む）でトランスフェクトされる。適切なプロモーター、エンハンサー、選択遺伝子および／もしくはシグナル配列（以下で記載）の選択は、過度な実験なく、当業者の範囲内であると考えられる。
【０１２１】
上記治療剤は、細胞外、細胞内もしくは膜の位置への送達のために標的化され得る。上記遺伝子産物が上記細胞から分泌されることが望ましい場合、上記発現ベクターは、上記治療用遺伝子産物を上記細胞から細胞外環境へと分泌するための適切な分泌「シグナル」配列を含むように設計される。上記遺伝子産物が上記細胞内に保持されることが望ましい場合、この分泌シグナル配列は省かれる。類似の様式で、上記発現ベクターは、上記治療剤を上記細胞質膜内にアンカーするために「保持」シグナル配列を含むように構築され得る。例えば、全ての膜タンパク質は、疎水性の膜貫通領域を有し、これは、膜におけるタンパク質の移動を止めさせ、上記タンパク質が分泌されないようにする。遺伝子産物を特定の位置に標的化するためのシグナル配列を含む発現ベクターの構築は、過度の実験の必要なく、当業者の範囲内であると考えられる。
【実施例】
【０１２２】
（実施例１：大型哺乳動物における遺伝子移入の方法）
リソソーム蓄積障害（Ｌｙｓｏｓｏｍａｌ  ｓｔｏｒａｇｅ  ｄｉｓｏｒｄｅｒ）（ＬＳＤ）は、遺伝性の代謝障害の大きなクラスを構成する。大部分のＬＳＤは、器官の損傷およびしばしば中枢神経系（ＣＮＳ）の変性をもたらすリソソーム酵素欠損によって引き起こされる。後発型小児性神経セロイドリポフスチン蓄積症（ＬＩＮＣＬ）は、リソソームプロテアーゼトリペプチジルペプチダーゼ１（ＴＰＰ１）をコードする、ｃｅｒｏｉｄ−ｌｉｐｏｆｕｓｃｉｎｏｓｉｓ  （ＣＬＮ），  ｎｅｕｒｏｎａｌ  ２遺伝子、ＣＬＮ２における変異によって引き起こされる常染色体劣性神経変性疾患である。ＬＩＮＣＬは、通常分娩および初期発生、１８〜２４ヶ月までに発作が始まること、進行性の運動低下および認知低下、ならびに早期死亡によって臨床的に特徴付けられる。上記疾患は、可溶性で、Ｍ−６−Ｐ修飾リソソーム酵素であるＴＰＰ１の欠損に起因する。
【０１２３】
酵素置換療法（ＥＲＴ）は、末梢組織に影響を及ぼしているリソソーム蓄積症に現在利用可能であるが、中枢神経系（ＣＮＳ）に困難を有する患者では使用されてこなかった。近年の研究によって、脳脊髄液を通じての酵素送達が、ＬＩＮＣＬにとってのＣＮＳへの潜在的代替経路であるか否かが調査された（Ｃｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ  １６：６４９−６５６，  ２００８）。処置したマウスは、ビヒクル処置マウスと比較して減弱した神経病理および低減した安静時振戦を示した
【０１２４】
現在の研究では、脳における注射によって脳脊髄液（ＣＳＦ）中の酵素の定常状態レベルを達成するために効率的に行われ得るか否かが調査された。ＬＩＮＣＬのイヌモデルにおいて研究を行った。上記ＬＩＮＣＬイヌは、出生時は正常であるが、約７ヶ月あたりで神経症状を、約５〜６ヶ月で検査できる程度の認知障害を、１０〜１１ヶ月で発作を、および進行性の視力喪失を発生させる。上記ＬＩＮＣＬイヌにおけるＣＬＮ２遺伝子変異は、ＴＰＰ１タンパク質を非機能的にし、ＴＰＰ１タンパク質は、検出不能である。疾患が進行すると、脳組織は萎縮し、脳における脳室空間の拡大がもたらされる。神経学的徴候としては、平衡および運動機能の低下、視力の喪失、振戦が挙げられる。
【０１２５】
罹患したＬＩＮＣＬの仔イヌには、３ヶ月齢で遺伝子治療を与えた。遺伝子治療のために、ＡＡＶ２−ＣＬＮ２を生成し（ＷＯ  ２０１２／１３５８５７を参照のこと）、脳の１箇所（側脳室）もしくは２箇所（側脳室＋大槽）に注射した。針を、脳室の中へと、もしくは脳室および大槽の中へと入れ、数分間にわたってゆっくりとベクターを注入した。ＴＰＰ１の大部分が細胞内でその細胞の中に留まらせられている一方で、一部分は分泌され、隣接する細胞によって取り込まれた。分泌および取り込みのこの特性は、「クロスコレクション」といわれる（図２）。クロスコレクションは、上記ＣＬＮ２遺伝子が、ＬＩＮＣＬの脳の中で戦略的に位置を定めた細胞に移入されれば、このことが、多くの周りの細胞のクロスコレクションを可能にし得るという点で、遺伝子治療の状況で価値がある。
【０１２６】
現在の研究では、上記治療剤を全体的に送達するという問題は、脳室を裏打ちする細胞および髄膜を構成する細胞を標的とすることによって、脳におけるＣＳＦの流れを利用した。ＡＡＶ２−ＣＬＮ２を、脳の１箇所（側脳室）もしくは２箇所（側脳室＋大槽）に注射した。ＴＰＰ１発現を、ＡＡＶ送達後にＣｌｎ２−／−イヌで観察した（図３）。脳室容積に関して有意に正の影響を観察した。自己蛍光に対するＡＡＶ．ＴＰＰ１の効果もまた、評価した（図４Ａ）。図４Ｂは、未処置のおよび処置したイヌのＴ１−ＭＲＩ画像を示す。図４Ｃは、ＬＩＮＣＬイヌにおけるＡＡＶ．ＴＰＰ１の効果を示す。図４Ｄは、ＡＡＶ２／２−ｈｕＣＬＮ２投与後のｈｕＴＰＰ１分布を示す。
【０１２７】
未処置の罹患したイヌにおいて、脳室空間は、正常なイヌの大きさの１０倍へと拡大するのに対して、ＡＡＶ２−ＣＬＮ２遺伝子治療は、この効果を有意に低下させた。さらに、臨床的利益（寿命および臨床検査）であるとおりの酵素の広い分布が観察された。処置なしでは、罹患したイヌは、３０週齢までに全２２の試験において疾患の徴候を示す。彼らは、最終ステージの疾患に達し、４５〜４８週齢の間には安楽死させねばならなかった。ＡＡＶ２−ＣＬＮ２遺伝子治療を受けたイヌでは、これら徴候のうちのあらゆるものの開始が、遅れたかもしくは防止された。
【０１２８】
ＴＰＰ１活性の増大が、大槽および脳室送達を合わせた後に、ＣＳＦ中で観察された。
【０１２９】
従って、上記ＬＩＮＣＬイヌにおいて、ＡＡＶ２−ＣＬＮ２遺伝子移入は、脳の多くの領域へのＴＰＰ１タンパク質補充を生じ、その結果、ＡＡＶ２−ＣＬＮ２遺伝子移入が、有意な治療効果を提供し、症状を低減もしくは遅らせ、ＬＩＮＣＬイヌのクオリティー・オブ・ライフを改善することが示された。
【０１３０】
ＣＳＦ中のｈｕＴＰＰ１活性は、注射の直後に低下した（図５）。酵素の広い分布が観察されたが、そのレベルは、遺伝子治療の６〜８ヶ月後の屠殺時には低かった。活性の低下は、上記イヌにおけるヒト酵素への免疫応答の結果であると推測された。活性の低下を阻害するために、抗炎症剤（ミコフェノレート）を導入した。上記結果は、上記抗炎症剤が、ｈｕＴＰＰ１の酵素活性を阻害せず、上記酵素活性が存在する時間の長さを伸ばすことにおいて有効であることを示し（図６）、持続した酵素活性レベルが観察された。
【０１３１】
ＣＳＦ中での高いｃａＴＰＰ１活性は、ＡＡＶ２ｃａＣＬＮ２脳室内注射および早期のミコフェノレート処置後の時間とともに観察された（図７）。
【０１３２】
ＴＰＰ１酵素活性の増大は、投与の２ヶ月後に多くの組織で観察された（図８、図９Ａおよび図９Ｂ）。
【０１３３】
図１０は、ＬＩＮＣＬイヌにおいて臨床徴候の開始を示す。ｃａＴＰＰ１活性は、髄膜および末梢組織（例えば、肝臓）で観察された（図１１）。
【０１３４】
従って、本発明者らは、ＡＡＶ２／２による上衣細胞の形質転換、イヌＴＰＰ１酵素が生成されＣＳＦとともに流れ、ｃａＣＬＮ２注射前のミコフェノレート処置がイヌにおける免疫応答を防止できたことを示す。
（実施例２：非ヒト霊長類での研究）
【０１３５】
上記で記載されるものに類似の技術を使用して、本発明者らは、ＡＡＶｅＧＦＰが非ヒト霊長類の脳の上衣を形質導入することを観察した。アカゲザルの脳におけるＡＡＶ２／２．ＴＰＰ１送達のインビボ評価を、ＡＡＶ．ＴＰＰ１を脳室もしくは大槽に注射し、４〜１２週間後にその組織を採取し、ＣＳＦもしくは組織溶解物中のＴＰＰ１活性を評価することによって行った（図１２）。活性を、非ヒト霊長類の前庭領域（脳幹）において観察した（図１３）。従って、脳室裏打ち細胞は、広いＣＮＳ分布のための組換え酵素供給源を提供した。
【０１３６】
全ての刊行物、特許および特許出願は、本明細書に参考として援用される。前述の詳細において、本発明は、そのある種の好ましい実施形態に関連して記載され、多くの詳細が例証目的で示されてきた一方で、本発明がさらなる実施形態を許容し、ある種の本明細書で記載される詳細は、本発明の基本的な原理から逸脱することなくかなり変動し得ることは、当業者に明らかである。
【０１３７】
本発明を記載する状況において用語「ａ（ある、１つの）」および「ａｎ（ある、１つの）」および「ｔｈｅ（上記、その、この）」および類似の指示物は、本明細書で別段示されなければ、もしくは状況が明らかに矛盾していなければ、単数形および複数形両方を網羅すると解釈されるべきである。用語「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ（含む、包含する）」、「ｈａｖｉｎｇ（有する）」、「ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ（含む、包含する）」、および「ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ（含む）」は、別段示されなければ、開放系の用語（すなわち、「ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ，  ｂｕｔ  ｎｏｔ  ｌｉｍｉｔｅｄ  ｔｏ（〜が挙げられるが、これらに限定されない）」を意味する）として解釈されるべきである。本明細書中の値の範囲の記載は、本明細書で別段示されなければ、上記範囲内に入る各別個の値に対して個々に言及するための略記法として働くことが意図されるに過ぎず、各別個の値は、これらが個々に本明細書で記載されているかのように、本明細書に援用される。本明細書で記載される全ての方法は、本明細書で別段示されなければ、もしくは状況が別段明示的に矛盾しなければ、任意の適切な順序で行われ得る。任意のおよび全ての例、または本明細書で提供される例示的表現（例えば、「ｓｕｃｈ  ａｓ（〜のような、例えば）」）の使用は、本発明をよりよく例証することが意図されているに過ぎず、別段特許請求されなければ、本発明の範囲に対する限定を与えない。本明細書中の表現は、どの特許請求されない要素をも本発明の実施に不可欠なものとして示すとは解釈されないものとする。
【０１３８】
本発明の実施形態が、本発明を実施するために本発明者らに公知の最良の態様を含め、本明細書で記載される。それら実施形態のバリエーションは、前述の説明を読めば、当業者に明らかになり得る。本発明者らは、当業者が適切な場合にこのようなバリエーションを使用することを予測し、本発明者らは、本発明に対して本明細書で具体的に記載されるとおり以外の別のものを実施する予定である。
【０１３９】
よって、本発明は、適用可能な法律によって許容されるとおり、本明細書に添付された特許請求の範囲に記載される主題の全ての改変および均等物を包含する。さらに、その全ての考えられるバリエーションにおいて上記で記載される要素の任意の組み合わせは、本明細書で別段示されなければ、さもなければ状況が明らかに矛盾しなければ、本発明によって包含される。
例えば、本発明は以下の項目を提供する。
（項目１）
治療剤を哺乳動物の中枢神経系に送達するための方法であって、該方法は、該哺乳動物の大槽に、該哺乳動物の脳脊髄液（ＣＳＦ）と接触している細胞を該細胞が該哺乳動物において該治療剤を発現するように感染させるために有効な様式で、ＡＡＶキャプシドタンパク質および一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療剤をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を投与する工程を包含する、方法。
（項目２）
哺乳動物において疾患を処置するための方法であって、該方法は、該哺乳動物の大槽に、ＡＡＶキャプシドタンパク質および一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療剤をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を、該哺乳動物の脳脊髄液（ＣＳＦ）と接触している細胞を感染させるために有効な様式で投与する工程であって、ここで該細胞は、該疾患を処置するように、該治療剤を発現する、工程を包含する、方法。
（項目３）
治療剤を哺乳動物の中枢神経系に送達するための方法であって、該方法は、該哺乳動物の脳室、くも膜下腔および／もしくは髄膜下腔に、該哺乳動物の脳脊髄液（ＣＳＦ）と接触した細胞を該細胞が該哺乳動物において該治療剤を発現するように感染させるために有効な様式で、ＡＡＶキャプシドタンパク質および一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療剤をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を投与する工程を包含する、方法。
（項目４）
哺乳動物において疾患を処置するための方法であって、該方法は、該哺乳動物の脳室、くも膜下腔および／もしくは髄膜下腔に、ＡＡＶキャプシドタンパク質および一対のＡＡＶ逆方向末端反復の間に挿入される治療剤をコードする核酸を含むベクターを含むｒＡＡＶ粒子を、該哺乳動物の脳脊髄液（ＣＳＦ）と接触する細胞を感染させるために有効な様式で投与する工程であって、ここで該細胞は、該疾患を処置するように該治療剤を発現する、工程を包含する、方法。
（項目５）
前記細胞は、前記治療剤を発現し、該治療剤をＣＳＦへと分泌する、項目１〜４のいずれか１項に記載の方法。
（項目６）
前記細胞は、上衣細胞、軟膜細胞、内皮細胞、脳室細胞、および／もしくは髄膜細胞である、項目１〜４のいずれか１項に記載の方法。
（項目７）
前記ｒＡＡＶを、前記哺乳動物の脳室、くも膜下腔および／もしくは髄膜下腔にさらに投与する工程をさらに包含する、項目１〜２および５〜６のいずれか１項に記載の方法。
（項目８）
前記哺乳動物は、非齧歯類哺乳動物である、項目１〜７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９）
前記非齧歯類哺乳動物は、霊長類、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、もしくはイヌである、項目８に記載の方法。
（項目１０）
前記哺乳動物は、イヌである、項目９に記載の方法。
（項目１１）
前記非齧歯類哺乳動物は、霊長類である、項目９に記載の方法。
（項目１２）
前記霊長類は、ヒトである、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記治療剤は、治療用核酸である、項目１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４）
前記治療剤は、タンパク質である、項目１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１５）
前記核酸は、リソソーム加水分解酵素をコードする、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記タンパク質は、ＴＰＰ１である、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記疾患は、リソソーム蓄積症（ＬＳＤ）である、項目１〜１６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１８）
前記ＬＳＤは、小児性セロイドリポフスチン蓄積症もしくは後発型小児性セロイドリポフスチン蓄積症（ＬＩＮＣＬ）、神経型ゴーシェ病、若年性バッテン病、ファブリー病、ＭＬＤ、サンフィリッポ症候群Ａ型、ハンター症候群、クラッベ病、モルキオ症候群、ポンペ病、ニーマン・ピック病Ｃ型、テイ・サックス病、ハーラー症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ）、サンフィリッポ症候群Ｂ型、マロトー・ラミー症候群、ニーマン・ピック病Ａ型、シスチン症、ハーラー・シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｈ／Ｓ）、スライ症候群（ＭＰＳ  ＶＩＩ）、シャイエ症候群（ＭＰＳ−Ｉ  Ｓ）、小児性バッテン病、ＧＭ１ガングリオシドーシス、ムコリピドーシスＩＩ／ＩＩＩ型、もしくはサンドホフ病である、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記疾患は、ＬＩＮＣＬである、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
前記疾患は、神経変性疾患である、項目１〜１６のいずれか１項に記載の方法。
（項目２１）
前記神経変性疾患は、アルツハイマー病、ハンチントン病、ＡＬＳ、遺伝性痙性片麻痺、原発性側索硬化症、脊髄性筋萎縮症、ケネディー病、ポリグルタミンリピート病、もしくはパーキンソン病である、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記神経変性疾患は、アルツハイマー病である、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記タンパク質は、保護性のＡｐｏＥアイソフォームタンパク質である、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記保護性のＡｐｏＥアイソフォームは、ＡｐｏＥ  ε２と８０％相同性を有する、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記保護性のＡｐｏＥアイソフォームは、ＡｐｏＥ  ε２と１００％相同性を有する、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
前記ｒＡＡＶ粒子は、脳中の１〜５箇所に注射される、項目１〜２５のいずれか１項に記載の方法。
（項目２７）
前記ｒＡＡＶ粒子は、脳中の１箇所に注射される、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記ｒＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶ２、ｒＡＡＶ４、ｒＡＡＶ５および／もしくはｒＡＡＶ９の粒子である、項目１〜２７のいずれか１項に記載の方法。
（項目２９）
前記ｒＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶ２粒子である、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記ｒＡＡＶ粒子は、ｒＡＡＶ９粒子である、項目２８に記載の方法。
（項目３１）
前記治療剤は、前記哺乳動物の大槽へと単一用量で投与される、項目１〜３０のいずれか１項に記載の方法。
（項目３２）
免疫抑制剤を投与する工程をさらに包含する、項目１〜３１のいずれか１項に記載の方法。
（項目３３）
前記免疫抑制剤は、抗炎症剤である、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記抗炎症剤は、ミコフェノレートである、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
前記ｒＡＡＶは、１×１０５〜１×１０１６ｖｇ／ｍｌを約１〜５ｍｌの用量で投与される、項目１〜３４のいずれか１項に記載の方法。
（項目３６）
前記ｒＡＡＶは、１×１０７〜１×１０１４ｖｇ／ｍｌを約１〜３ｍｌの用量で投与される、項目１〜３４のいずれか１項に記載の方法。
（項目３７）
前記ｒＡＡＶは、１×１０８〜１×１０１３ｖｇ／ｍｌを約１〜２ｍｌの用量で投与される、項目１〜３４のいずれか１項に記載の方法。
【図１Ａ−１】
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【図１Ａ−２】
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【図１Ａ−３】
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【図１Ｂ−１】
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【図１Ｂ−２】
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【図１Ｂ−３】
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【図１Ｂ−４】
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【図１Ｂ−５】
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【図１Ｂ−６】
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【図１Ｂ−７】
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【図２】
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【図３】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図４Ｃ】
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【図４Ｄ】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５−１】
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【図１５−２】
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【図１６】
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【図１７】
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【配列表】
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【外国語明細書】
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