(57)【要約】      （修正有）【課題】アテローム性動脈硬化を有する対象においてアテローム性動脈硬化プラーク増殖または血管新生を低下させ、阻害し、抑制し、かつ／または遅延させる方法の提供。【解決手段】セマフォリン-4D（SEMA4D）またはその高親和性プレキシン-B1受容体に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する。【選択図】図１Ａ
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象においてアテローム性動脈硬化プラークの増殖を阻害するか、抑制するか、低下させるか、または遅延させる方法。
【請求項２】
結合分子が、SEMA4Dのその受容体との相互作用を阻害する、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
受容体がプレキシン-B1またはプレキシン-B2である、請求項2に記載の方法。
【請求項４】
結合分子が、SEMA4Dによって媒介されるプレキシン-B1シグナル伝達を阻害する、請求項1に記載の方法。
【請求項５】
対象が心血管疾患を有する、請求項1に記載の方法。
【請求項６】
心血管疾患が、冠血管心疾患（虚血性心疾患または冠動脈疾患も）、心筋症、高血圧性心疾患、心不全、肺性心、不整脈、炎症性心疾患、心内膜炎、炎症性心拡大、心筋炎、心臓弁膜症、脳血管疾患、末梢動脈疾患、先天性心疾患、リウマチ性心疾患、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項5に記載の方法。
【請求項７】
単離された結合分子が、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67と同一のSEMA4Dエピトープに特異的に結合する、請求項1に記載の方法。
【請求項８】
単離された結合分子が、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67がSEMA4Dに特異的に結合することを競合的に阻害する、請求項1に記載の方法。
【請求項９】
単離された結合分子が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項1に記載の方法。
【請求項１０】
抗体またはその抗原結合断片が、SEQ ID NO 6、7、および8をそれぞれ含むVHCDR1〜3を含む可変重鎖（VH）、ならびにSEQ ID NO 14、15、および16をそれぞれ含むVLCDR1〜3を含む可変軽鎖（VL）を含む、請求項9に記載の方法。
【請求項１１】
VHおよびVLが、それぞれ、SEQ ID NO:9およびSEQ ID NO:17またはSEQ ID NO:10およびSEQ ID NO:18を含む、請求項10に記載の方法。
【請求項１２】
アテローム性動脈硬化プラーク周辺の血管新生の阻害、遅延、低下、または遅延をさらに含む、請求項1に記載の方法。
【請求項１３】
セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象において血管新生を阻害するか、遅延させるか、低下させるか、または遅延させる方法。
【請求項１４】
結合分子が、SEMA4Dのその受容体との相互作用を阻害する、請求項13に記載の方法。
【請求項１５】
受容体がプレキシン-B1である、請求項14に記載の方法。
【請求項１６】
結合分子が、SEMA4Dによって媒介されるプレキシン-B1シグナル伝達を阻害する、請求項13に記載の方法。
【請求項１７】
対象が心血管疾患を有する、請求項13に記載の方法。
【請求項１８】
心血管疾患が、冠血管心疾患（虚血性心疾患または冠動脈疾患も）、心筋症、高血圧性心疾患、心不全、肺性心、不整脈、炎症性心疾患、心内膜炎、炎症性心拡大、心筋炎、心臓弁膜症、脳血管疾患、末梢動脈疾患、先天性心疾患、リウマチ性心疾患、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項17に記載の方法。
【請求項１９】
単離された結合分子が、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67と同一のSEMA4Dエピトープに特異的に結合する、請求項13に記載の方法。
【請求項２０】
単離された結合分子が、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67がSEMA4Dに特異的に結合することを競合的に阻害する、請求項13に記載の方法。
【請求項２１】
単離された結合分子が、抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項13に記載の方法。
【請求項２２】
抗体またはその抗原結合断片が、SEQ ID NO 6、7、および8をそれぞれ含むVHCDR1〜3を含む可変重鎖（VH）、ならびにSEQ ID NO 14、15、および16をそれぞれ含むVLCDR1〜3を含む可変軽鎖（VL）を含む、請求項21に記載の方法。
【請求項２３】
VHおよびVLが、それぞれ、SEQ ID NO:9およびSEQ ID NO:17またはSEQ ID NO:10およびSEQ ID NO:18を含む、請求項22に記載の方法。
【請求項２４】
セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定された対象に投与し、それにより、アテローム性動脈硬化プラークの増殖を阻害するか、遅延させるか、低下させるか、または遅延させる段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象を処置する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
電子的に提示した配列表の参照
本出願とともに提出したASCIIテキストファイル（名称："Sequence_Listing_58008_136615.txt"；サイズ：36,964バイト；および作成日：2014年10月9日）における電子的に提示した配列表の内容は、全体として参照により本明細書に組み入れられる。
【背景技術】
【０００２】
発明の背景
CD100としても公知であるセマフォリン4D（SEMA4D）は、クラスIVセマフォリン遺伝子ファミリーに属する膜貫通タンパク質である（例えば、SEQ ID NO: 1（ヒト）；SEQ ID NO: 2（マウス））。SEMA4Dは、ホモ二量体として細胞表面上に発現しているが、細胞活性化時に、SEMA4Dは、タンパク質分解性切断を介して細胞表面から放出されて、タンパク質の可溶型であるsSEMA4Dを生成することができ、これもまた生物学的に活性を有する。例えば、Suzuki et al., Nature Rev. Immunol. 3:159-167 (2003)（非特許文献1）；Kikutani et al., Nature Immunol. 9:17-23 (2008)（非特許文献2）を参照されたい。
【０００３】
SEMA4Dは、脾臓、胸腺、およびリンパ節を含むリンパ系器官において、ならびに、脳、心臓、および腎臓などの非リンパ系器官において高レベルで発現している。リンパ系器官において、SEMA4Dは、休止T細胞上に豊富に発現しているが、休止B細胞、および樹状細胞（DC）などの抗原提示細胞（APC）上には弱くしか発現していない。しかしながら、その発現は、種々の免疫学的刺激による活性化後にこれらの細胞において上方制御される。免疫細胞からの可溶性SEMA4Dの放出もまた、細胞活性化により増加する。
【０００４】
アテローム性動脈硬化は、免疫細胞が疾患進行において重大な役割を果たす炎症性疾患として認識されている（Hansson GK et al., Nat Rev Immunol 6: 508-519, 2006（非特許文献3））。マクロファージはCD40分子を発現し、T細胞はCD40リガンド（CD40LまたはCD154）を細胞表面上に有する（Mach F et al., Circulation 96: 396-399, 1997（非特許文献4）；およびMach F et al., Proc Natl Acad Sci USA 94: 1931-36, 1997（非特許文献5））。プラーク内の免疫細胞におけるCD40のCD40Lとのライゲーションは、プロテアーゼおよび炎症促進性メディエーターの分泌を誘導し、それにより、炎症活性化が拡大される（Mach F et al., Circulation 96: 396-399, 1997（非特許文献4））。CD40ライゲーションの阻止またはCD40L遺伝子ノックアウトは、アテローム性動脈硬化易発性マウスにおいてアテローム性動脈硬化プラークの発達を妨害することができる（Mach F et al., Nature 394: 200-203, 1998（非特許文献6）；およびLutgens E et al., Nat Med 11: 1313-1316, 1999（非特許文献7））。免疫細胞における刺激性抗CD40抗体とのCD40のライゲーションは、 Sema4D（CD100）の発現を誘導することが報告されている（Kumanogoh A et al., Immunity 13: 621-31, 2000（非特許文献8））。
【０００５】
SEMA4Dは、免疫応答、血管形成、上皮形態形成、および骨リモデリングの増強のような様々な過程に関係している（Kruger RP et al., Nat Rev Mol Cell Biol 6: 789-800, 2005（非特許文献9）； Pasterkamp R.J., Nat Rev Neurosci 13:605-618, 2012（非特許文献10）；およびKang S et al., Seminars in Cell & Dev Biol 24:163-171, 2013（非特許文献11））。アテローム性動脈硬化プラーク内のリンパ球、マクロファージ、内皮細胞、および血小板は、Sema4Dの高親和性受容体であるプレキシン-B1を膜表面上に発現している（Basile JR et al., Moll Cell Biol 25: 6889-6898, 2005（非特許文献12）； Delaire S et al., J Immunol 166: 4348-4354, 2001（非特許文献13）；およびChabbert-de Ponnat I et al., Int Immunol 17: 439-447, 2005（非特許文献14））。従って、T細胞によって発現されたまたはT細胞膜から放出されたSema4Dは、アテローム性動脈硬化プラーク内に位置する細胞に対してある特定の作用を及ぼしうる（Basile JR et al., Mol. Cell Biol 25: 6889-6898, 2005（非特許文献12）； Delaire S et al., J Immunol 166: 4348-4354, 2001（非特許文献13）；およびChabbert-de Ponnat I et al., Int Immunol 17: 439-447, 2005（非特許文献14））。以前の研究により、インビトロおよびインビボの内皮細胞に対するSema4Dの血管形成促進活性が明らかにされた（Conrotto P et al., Blood 105: 4321-4329, 2005（非特許文献15）；およびBasil JR et al., Cancer Res 64: 5212-5224, 2004.（非特許文献16））。さらに、Sema4Dの高レベルの発現がいくつかの扁平上皮癌において観察され、そのことから、インビボの腫瘍によって誘導される血管形成におけるSema4Dの重大な役割が示唆された（Basile JR et al., Proc Natl Acad Sci USA 103: 9017-9022, 2006.（非特許文献17））。従って、Sema4Dは、例えば、アテロームにおいて起こる血管新生過程を促進することによって、プラーク増殖に影響を与えることができる。実際、ある研究は、アテローム性動脈硬化易発性アポE欠損（アポE-/-）マウスにおいて、Sema4D遺伝子の欠失が、アテローム性動脈硬化プラークの増殖およびプラーク区域における血管新生を遅延させることを明らかにし、このことから、アテローム性動脈硬化の進行期におけるSema4Dシグナルの阻止によりプラーク増殖および血管新生を防止し得ることが示唆された（Yukawa K et al., Int. J Mol. Med. 26: 39-44, 2010（非特許文献18））。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】Suzuki et al., Nature Rev. Immunol. 3:159-167 (2003)
【非特許文献２】Kikutani et al., Nature Immunol. 9:17-23 (2008)
【非特許文献３】Hansson GK et al., Nat Rev Immunol 6: 508-519, 2006
【非特許文献４】Mach F et al., Circulation 96: 396-399, 1997
【非特許文献５】Mach F et al., Proc Natl Acad Sci USA 94: 1931-36, 1997
【非特許文献６】Mach F et al., Nature 394: 200-203, 1998
【非特許文献７】Lutgens E et al., Nat Med 11: 1313-1316, 1999
【非特許文献８】Kumanogoh A et al., Immunity 13: 621-31, 2000
【非特許文献９】Kruger RP et al., Nat Rev Mol Cell Biol 6: 789-800, 2005
【非特許文献１０】Pasterkamp R.J., Nat Rev Neurosci 13:605-618, 2012
【非特許文献１１】Kang S et al., Seminars in Cell & Dev Biol 24:163-171, 2013
【非特許文献１２】Basile JR et al., Moll Cell Biol 25: 6889-6898, 2005
【非特許文献１３】Delaire S et al., J Immunol 166: 4348-4354, 2001
【非特許文献１４】Chabbert-de Ponnat I et al., Int Immunol 17: 439-447, 2005
【非特許文献１５】Conrotto P et al., Blood 105: 4321-4329, 2005
【非特許文献１６】Basil JR et al., Cancer Res 64: 5212-5224, 2004
【非特許文献１７】Basile JR et al., Proc Natl Acad Sci USA 103: 9017-9022, 2006
【非特許文献１８】Yukawa K et al., Int. J Mol. Med. 26: 39-44, 2010
【発明の概要】
【０００７】
アテローム性動脈硬化の処置のためにセマフォリン4D結合分子を使用する方法を本明細書において開示する。本明細書において例証される局面に従って、セマフォリン4D（SEMA4D）に特異的に結合しその活性を阻止する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象においてアテローム性動脈硬化プラーク形成を低下させ、阻害し、抑制し、かつ／または遅延させる方法が、提供される。ある特定の態様において、セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象においてアテローム性動脈硬化プラークの増殖を阻害するか、抑制するか、低下させるか、または遅延させる方法が、提供される。ある特定の態様において、結合分子は、SEMA4Dのその受容体との相互作用を阻害する。ある特定の態様において、受容体はプレキシン-B1またはプレキシン-B2である。ある特定の態様において、結合分子は、SEMA4Dによって媒介されるプレキシン-B1シグナル伝達を阻害する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、対象は心血管疾患を有する。ある特定の態様において、心血管疾患は、冠血管心疾患（虚血性心疾患または冠動脈疾患も）、心筋症、高血圧性心疾患、心不全、肺性心、不整脈、炎症性心疾患、心内膜炎、炎症性心拡大、心筋炎、心臓弁膜症、脳血管疾患、末梢動脈疾患、先天性心疾患、リウマチ性心疾患、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67と同一のSEMA4Dエピトープに特異的に結合する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67がSEMA4Dに特異的に結合することを競合的に阻害する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、抗体またはその抗原結合断片を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、抗体またはその抗原結合断片は、SEQ ID NO 6、7、および8をそれぞれ含むVHCDR1〜3を含む可変重鎖（VH）、ならびにSEQ ID NO 14、15、および16をそれぞれ含むVLCDR1〜3を含む可変軽鎖（VL）を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、VHおよびVLは、それぞれ、SEQ ID NO:9およびSEQ ID NO:17またはSEQ ID NO:10およびSEQ ID NO:18を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、方法は、アテローム性動脈硬化プラーク周辺の血管新生の阻害、遅延、低下、または遅延をさらに含む。
【０００８】
セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象において血管新生を阻害するか、遅延させるか、低下させるか、または遅延させる方法も、提供される。ある特定の態様において、結合分子は、SEMA4Dのその受容体との相互作用を阻害する。ある特定の態様において、受容体はプレキシン-B1である。ある特定の態様において、結合分子は、SEMA4Dによって媒介されるプレキシン-B1シグナル伝達を阻害する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、対象は心血管疾患を有する。ある特定の態様において、心血管疾患は、冠血管心疾患（虚血性心疾患または冠動脈疾患も）、心筋症、高血圧性心疾患、心不全、肺性心、不整脈、炎症性心疾患、心内膜炎、炎症性心拡大、心筋炎、心臓弁膜症、脳血管疾患、末梢動脈疾患、先天性心疾患、リウマチ性心疾患、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67と同一のSEMA4Dエピトープに特異的に結合する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67がSEMA4Dに特異的に結合することを競合的に阻害する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、抗体またはその抗原結合断片を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、抗体またはその抗原結合断片は、SEQ ID NO 6、7、および8をそれぞれ含むVHCDR1〜3を含む可変重鎖（VH）、ならびにSEQ ID NO 14、15、および16をそれぞれ含むVLCDR1〜3を含む可変軽鎖（VL）を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、VHおよびVLは、それぞれ、SEQ ID NO:9およびSEQ ID NO:17またはSEQ ID NO:10およびSEQ ID NO:18を含む。
【０００９】
セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定された対象に投与し、それにより、アテローム性動脈硬化プラークの増殖を阻害するか、遅延させるか、低下させるか、または遅延させる段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象を処置する方法も、提供される。ある特定の態様において、決定は、患者に由来する画像または試料の分析によって提供される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、患者は、患者におけるアテローム性動脈硬化プラークの数、サイズ、または特徴が、数、サイズ、または特徴の予定された閾値より高い場合に、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定され、処置される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、患者は、患者におけるアテローム性動脈硬化プラークの数、サイズ、または特徴が、1つまたは複数の対照試料と比較された時にアテローム性動脈硬化を示す場合に、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定され、処置される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、患者は、試料中のCRPおよび／またはLDLのレベルが、予定されたレベルの閾値より高いか、対照試料と比べて上昇しているか、またはその他の方法でアテローム性動脈硬化プラークを示す場合に、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定され、処置される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、患者は、アテローム性動脈硬化プラークの数、サイズ、または特徴が、予定されたレベルの閾値より高いか、対照試料と比べて上昇しているか、またはその他の方法でアテローム性動脈硬化プラークを示す場合に、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定され、処置される。方法のある特定の態様において、画像法は、冠動脈造影、血管内超音波検査（IVUS）、頸動脈超音波検査、冠血管コンピュータ断層撮影（CT）、磁気共鳴画像法（MRI）、陽電子放射断層撮影（PET）、光干渉断層撮影（OCT）、近赤外線分光法（NIRS）、およびNIR蛍光を含むことができる。前記方法のいずれかのある特定の態様において、患者は、患者が1つまたは複数の不安定なアテローム性動脈硬化プラークを有すると決定された場合に、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定され、処置される。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67と同一のSEMA4Dエピトープに特異的に結合する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、参照モノクローナル抗体VX15/2503または67がSEMA4Dに特異的に結合することを競合的に阻害する。前記方法のいずれかのある特定の態様において、単離された結合分子は、抗体またはその抗原結合断片を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、抗体またはその抗原結合断片は、SEQ ID NO 6、7、および8をそれぞれ含むVHCDR1〜3を含む可変重鎖（VH）、ならびにSEQ ID NO 14、15、および16をそれぞれ含むVLCDR1〜3を含む可変軽鎖（VL）を含む。前記方法のいずれかのある特定の態様において、VHおよびVLは、それぞれ、SEQ ID NO:9およびSEQ ID NO:17またはSEQ ID NO:10およびSEQ ID NO:18を含む。
【００１０】
本明細書において例証される局面に従って、セマフォリン4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化を有する対象において血管新生を低下させる方法が、提供される。
【図面の簡単な説明】
【００１１】
【図１Ａ】抗Sema4D抗体によって処置されたアポE欠損を有する自然発症高脂血症（SHL）マウスにおけるアテローム性動脈硬化プラークの発達阻害。14週齢から開始して12週間、抗SEMA4D抗体またはアイソタイプ対照によって処置されたSHLマウスにおけるアテローム性動脈硬化プラーク発達の脂質沈着物中のスダン親和性面積の定量的測定を示す。
【図１Ｂ】抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスのプラークにおける血管新生低下。抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスおよび対照抗体によって処置されたSHLマウスのプラーク内の内皮細胞のイソレクチンB4染色の定量的測定によって可視化された血管新生を示す。
【図１Ｃ】抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスのプラークにおける血管新生低下。CD31抗体を使用した免疫組織化学によって可視化された、抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスおよび対照抗体によって処置されたSHLマウスのプラーク内の内皮細胞を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１２】
I. 定義
「1つの」（「a」または「an」）実体という用語は、1つまたは複数のその実体を指し；例えば、「抗SEMA4D抗体（an anti-SEMA4D antibody）」は、1つまたは複数の抗SEMA4D抗体を表すように理解されることに、注意されたい。そのように、「1つの」、「1つまたは複数の」、および「少なくとも1つの」という用語は、本明細書において互換的に使用することができる。
【００１３】
本明細書において使用される際、「アテローム性動脈硬化」という用語は、大部分の冠動脈疾患、大動脈瘤、および下肢の動脈疾患の根底にあり、脳血管疾患においても主要な役割を果たす、より大きい動脈の障害を指す。アテローム性動脈硬化は、米国において、男女共に65歳以上および65歳以下の両方における主な死因である。E.L. Bierman, "Atherosclerosis and Other Forms of Arteriosclerosis," Ch. 208, p. 1 106 in Harrison's Principles of Internal Medicine. 13th edition, eds. KJ. Isselbacher, et al. (McGraw-Hill, Inc. NY 1994)。アテローム性動脈硬化は、心臓、脳、腕、脚、骨盤、および腎臓の動脈を含む、体内の任意の動脈に影響を与えることができる。アテローム性動脈硬化は、動脈壁の病変部におけるコレステロールの浸潤および泡沫細胞の出現を特徴とする。その後に、血小板、マクロファージ、平滑筋細胞、および増殖因子を含む、増殖性病変を生じる複雑な一連の変化が起こる。これらは、血管を歪め、硬くする。上昇した血漿コレステロールレベルを有する個体においては、アテローム性動脈硬化およびその合併症の発生率が増加する。W.F. Ganong, Review of Medical Physiology, 17th edition, p. 281 (Appleton & Lange Norwalk, CT 1995)。
【００１４】
本明細書において使用される際、「血管新生」または「血管形成」という用語は、既存の血管からの新しい血管の形成を指す。血管新生は、例えば、黄斑変性、腫瘍、癌、およびアテローム性動脈硬化の発症において存在する。
【００１５】
本明細書において使用される際、「炎症性障害」または「炎症性疾患」という用語は、炎症を特徴とし、一般的には、発赤、腫脹、および疼痛を伴う疾患を指す。炎症は、心血管疾患、慢性関節リウマチ、胃腸疾患、神経炎症性疾患（例えば、多発性硬化症）を含み、さらに癌（例えば、胆嚢癌）も含むが、これらに限定されない、多数の他の疾患をもたらすことができる。
【００１６】
本明細書において使用される際、「心血管疾患」という用語は、心臓、血管（動脈、毛細血管、および静脈）、またはその両方を含む疾患を指す。心血管疾患の例は、冠血管心疾患（虚血性心疾患または冠動脈疾患も）、心筋症、高血圧性心疾患、心不全、肺性心、不整脈、炎症性心疾患、心内膜炎、炎症性心拡大、心筋炎、心臓弁膜症、脳血管疾患、末梢動脈疾患、先天性心疾患、およびリウマチ性心疾患を含むが、これらに限定されない。
【００１７】
「治療的有効量」という用語は、対象または哺乳動物において疾患または障害を「処置する」ために有効である、抗体、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、有機低分子、または他の薬物の量を指す。アテローム性動脈硬化の場合、治療的有効量の薬物は、アテローム性動脈硬化プラークの形成を遅延させることができるか；新しいアテローム性動脈硬化プラーク形成の増加を低下させるか、妨害するか、もしくは停止させることができるか；炎症を低下させるか、抑制するか、もしくは停止させることができるか；アテローム性動脈硬化プラークの内部もしくは近傍における血管新生を阻害すること、例えば、抑制するか、妨害するか、防止するか、停止させるか、もしくは逆転させることができるか；アテローム性動脈硬化プラークの形態もしくは機能を変化させることができるか；またはアテローム性動脈硬化に関連した症候のうちの1つもしくは複数をある程度まで和らげることができるか；罹患率および死亡率を低下させることができるか；生活の質を改善することができるか；またはそのような作用の組み合わせを有する。
【００１８】
「処置」（「treating」もしくは「treatment」もしくは「to treat））または「緩和」（「alleviating」もしくは「to alleviate」）などの用語は、1）診断された病理学的状態または障害を治癒する、それを減速させる、その症候を減少させる、それを逆転する、および／またはその進行を停止させる治療的手段、ならびに2）標的とした病理学的状態または障害を予防する、および／またはその発症を緩徐化する防御的手段または予防的手段の両方を指す。従って、処置を必要とする人々は、既に障害を有する人々；障害を有する傾向がある人々；および障害が予防されるべき人々を含む。有益なまたは望ましい臨床結果は、検出可能であろうとまたは検出不可能であろうと、症候の緩和、疾患の程度の縮小、疾患の安定化（すなわち悪化させないこと）、疾患進行の遅延または緩徐化、疾患状態の改善または一時的緩和、および寛解（部分的であろうとまたは全体的であろうと）、あるいはそれらの任意の組み合わせを含むが、これらに限定されない。「処置」とはまた、処置を受けていない場合に期待される生存と比較した際に延長した生存も意味することができる。処置を必要とする人々は、既に状態もしくは障害を有する人々、および、状態もしくは障害を有する傾向がある人々、または、状態もしくは障害が予防されるべき人々を含む。
【００１９】
「対象」または「個体」または「動物」または「患者」または「哺乳動物」により、それについて診断、予後診断、または治療が望ましい任意の対象、特に、哺乳動物対象が意味される。哺乳動物対象は、ヒト、家庭内の動物、農場の動物、および、動物園、スポーツ、またはペットの動物、例えば、イヌ、ネコ、モルモット、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、ウシ、雌ウシ、クマなどを含む。
【００２０】
本明細書において使用される際、「抗SEMA4D抗体の投与から恩恵を受けるであろう対象」および「処置を必要とする動物」などの句は、例えば、SEMA4Dポリペプチドの検出のために（例えば診断手順のために）使用される抗SEMA4D抗体もしくは他のSEMA4D結合分子の投与から、および／または、抗SEMA4D抗体もしくは他のSEMA4D結合分子での処置、すなわち、疾患の軽減または予防から恩恵を受けるであろう、哺乳動物対象などの対象を含む。
【００２１】
本発明の「結合分子」または「抗原結合分子」は、その最も広い意味において、抗原決定基に特異的に結合する分子を指す。1つの態様において、結合分子は、SEMA4Dに、例えば、約150 kDaの膜貫通SEMA4Dポリペプチドまたは約120 kDaの可溶性SEMA4Dポリペプチド（一般的にsSEMA4Dと呼ばれる）に特異的に結合する。別の態様において、本発明の結合分子は、抗体またはその抗原結合断片である。別の態様において、本発明の結合分子は、抗体分子の少なくとも1個の重鎖CDRまたは軽鎖CDRを含む。別の態様において、本発明の結合分子は、1種または複数の抗体分子由来の少なくとも2個のCDRを含む。別の態様において、本発明の結合分子は、1種または複数の抗体分子由来の少なくとも3個のCDRを含む。別の態様において、本発明の結合分子は、1種または複数の抗体分子由来の少なくとも4個のCDRを含む。別の態様において、本発明の結合分子は、1種または複数の抗体分子由来の少なくとも5個のCDRを含む。別の態様において、本発明の結合分子は、1種または複数の抗体分子由来の少なくとも6個のCDRを含む。
【００２２】
本出願は、アテローム性動脈硬化を処置する方法であって、抗SEMA4D結合分子、たとえば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を、対象に投与する段階を含む方法に向けられる。天然に存在する抗体などの完全なサイズの抗体に具体的に言及しない限り、「抗SEMA4D抗体」という用語は、完全なサイズの抗体、およびそのような抗体の抗原結合断片、変異体、類似体、または誘導体、例えば、天然に存在する抗体、または免疫グロブリン分子、または工学により作製された抗体分子、または抗体分子と類似した様式で抗原に結合する断片を包含する。
【００２３】
本明細書において使用される際、「ヒト」抗体または「完全ヒト」抗体は、ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有する抗体を含み、ヒト免疫グロブリンライブラリーから、または、上記および例えばKucherlapatiらによる米国特許第5,939,598号に記載されるような、1種または複数のヒト免疫グロブリンの遺伝子導入動物から単離された抗体を含む。「ヒト」抗体または「完全ヒト」抗体は、少なくとも重鎖の可変ドメイン、または少なくとも重鎖および軽鎖の可変ドメインを含み、該可変ドメインがヒト免疫グロブリン可変ドメインのアミノ酸配列を有する抗体もまた含むか、あるいはヒト化抗体である。
【００２４】
「ヒト」抗体または「完全ヒト」抗体は、本明細書において記載される抗体分子（例えば、VH領域および／またはVL領域）の変異体（誘導体を含む）を含むか、それらから本質的になるか、またはそれらからなり、抗体またはその断片がSEMA4Dポリペプチドまたはその断片もしくは変異体に免疫特異的に結合する、上記のような「ヒト」抗体または「完全ヒト」抗体もまた含む。アミノ酸置換を結果として生じる部位特異的変異誘発およびPCR媒介変異誘発を含むがこれらに限定されない、当業者に公知である標準的な技術を、ヒト抗SEMA4D抗体をコードするヌクレオチド配列中に変異を導入するために使用することができる。一部の局面では、変異体（誘導体を含む）は、参照VH領域、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VL領域、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3に対して、50アミノ酸未満の置換、40アミノ酸未満の置換、30アミノ酸未満の置換、25アミノ酸未満の置換、20アミノ酸未満の置換、15アミノ酸未満の置換、10アミノ酸未満の置換、5アミノ酸未満の置換、4アミノ酸未満の置換、3アミノ酸未満の置換、または2アミノ酸未満の置換をコードする。
【００２５】
ある特定の態様において、アミノ酸置換は、下記でさらに議論される保存的アミノ酸置換である。あるいは、変異を、飽和変異誘発などにより、コード配列のすべてまたは一部に沿って無作為に導入することができ、結果として生じた変異体を、活性（例えば、SEMA4Dポリペプチド、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4Dに結合する能力）を保持する変異体を同定するために生物学的活性についてスクリーニングすることができる。「ヒト」抗体または「完全ヒト」抗体のそのような変異体（またはその誘導体）は、「最適化された」または「抗原結合について最適化された」ヒト抗体または完全ヒト抗体と呼ぶこともでき、抗原に対して改善された親和性を有する抗体を含む。
【００２６】
「抗体」および「免疫グロブリン」という用語は、本明細書において互換的に使用される。抗体または免疫グロブリンは、少なくとも重鎖の可変ドメインを含み、通常、少なくとも重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む。脊椎動物系における基本的な免疫グロブリン構造は、比較的よく理解されている。例えば、Harlow et al. (1988) Antibodies: A Laboratory Manual (2nd ed.; Cold Spring Harbor Laboratory Press)を参照されたい。
【００２７】
本明細書において使用される際、「免疫グロブリン」という用語は、生化学的に区別することができる種々の広範なクラスのポリペプチドを含む。当業者は、重鎖が、ガンマ、ミュー、アルファ、デルタ、またはイプシロン（γ、μ、α、δ、ε）として、それらの中にいくつかのサブクラス（例えばγ1〜γ4）を伴って分類されることを認識するであろう。抗体の「クラス」をそれぞれIgG、IgM、IgA、IgG、またはIgEと決定することが、この鎖の性質である。免疫グロブリンのサブクラス（アイソタイプ）、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1などは、十分に特徴決定されており、機能的特殊化を与えることが公知である。これらのクラスおよびアイソタイプの各々の修飾バージョンは、本開示を考慮して当業者が容易に識別可能であり、従って、本発明の範囲内である。すべての免疫グロブリンクラスが、明らかに本発明の範囲内であり、以下の議論は概して、IgGクラスの免疫グロブリン分子に向けられる。IgGに関して、標準的な免疫グロブリン分子は、分子量およそ23,000ダルトンの2個の同一の軽鎖ポリペプチド、および分子量53,000〜70,000の2個の同一の重鎖ポリペプチドを含む。4本の鎖は典型的に、ジスルフィド結合により「Y」形態に連結され、軽鎖が、「Y」の口部から始まり可変領域を通して連続して、重鎖をひとまとめにする。
【００２８】
軽鎖は、カッパまたはラムダ（κ、λ）のいずれかとして分類される。各重鎖のクラスは、κ軽鎖またはλ軽鎖のいずれと結合しうる。概して、免疫グロブリンがハイブリドーマ、B細胞、または遺伝子工学により作製された宿主細胞のいずれかにより生成される際、軽鎖および重鎖は互いに共有結合し、かつ2個の重鎖の「尾」部分は、共有ジスルフィド結合または非共有結合により互いに結合している。重鎖において、アミノ酸配列は、Y形態の叉状端のN末端から各鎖の底部のC末端までおよぶ。
【００２９】
軽鎖および重鎖は両方とも、構造的および機能的な相同性領域に分割される。「定常」および「可変」という用語は、機能的に使用される。この点において、軽鎖の可変ドメイン（VLまたはVK）および重鎖の可変ドメイン（VH）両方の部分は、抗原認識および特異性を決定することが、認識されるであろう。逆に、軽鎖の定常ドメイン（CL）および重鎖の定常ドメイン（CH1、CH2、またはCH3）は、分泌、経胎盤移動性、Fc受容体結合、補体結合などのような重要な生物学的特性を与える。慣例により、定常領域ドメインのナンバリングは、抗体の抗原結合部位またはアミノ末端からより遠くなるにつれて増大する。N末端部分が可変領域であり、C末端部分が定常領域である；CH3ドメインおよびCLドメインは、それぞれ重鎖および軽鎖のカルボキシ末端を実際に含む。
【００３０】
上記に示されるように、可変領域は、抗体が抗原上のエピトープを選択的に認識し、かつ特異的に結合することを可能にする。すなわち、抗体のVLドメインおよびVHドメイン、またはこれらの可変ドメイン内の相補性決定領域（CDR）のサブセットは、組み合わさって、三次元の抗原結合部位を規定する可変領域を形成する。この4要素からなる抗体構造は、Yの各腕の末端に存在する抗原結合部位を形成する。より具体的には、抗原結合部位は、VH鎖およびVL鎖の各々上の3個のCDRにより規定される。いくつかの場合には、例えば、ラクダ科の種に由来するかまたはラクダ科の免疫グロブリンに基づいて工学により作製されたある特定の免疫グロブリン分子は、完全な免疫グロブリン分子が軽鎖を有さず、重鎖のみからなり得る。例えば、Hamers-Casterman et al., Nature 363:446-448 (1993)を参照されたい。
【００３１】
天然に存在する抗体において、各抗原結合ドメイン中に存在する6個の「相補性決定領域」または「CDR」は、抗体が水性環境においてその三次元形態を呈する際に抗原結合ドメインを形成するように特異的に位置づけられる、アミノ酸の短い非隣接の配列である。「フレームワーク」領域と呼ばれる抗原結合ドメイン中のアミノ酸の残りの部分は、より低い分子間の可変性を示す。フレームワーク領域は、主としてβシート立体配座を採り、CDRは、βシート構造を連結し、いくつかの場合にはその一部を形成するループを形成する。従って、フレームワーク領域は、CDRを鎖間の非共有相互作用により正確な配向に位置づけることを提供する足場を形成するように作用する。位置づけられたCDRにより形成される抗原結合ドメインは、免疫反応性抗原上のエピトープに対して相補性の表面を規定する。この相補性の表面が、抗体のその同起源エピトープに対する非共有結合を促進する。それぞれCDRおよびフレームワーク領域を構成するアミノ酸は、正確に定義されているため（下記参照）、任意の所定の重鎖可変ドメインまたは軽鎖可変ドメインについて当業者が容易に同定することができる。
【００３２】
当技術分野内で使用される、および／または受け入れられる用語の2つまたはそれより多い定義がある場合には、本明細書において使用される用語の定義は、それとは反対に明示的に述べられない限り、そのような意味のすべてを含むように意図される。具体例は、重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチド両方の可変領域内に見出される非隣接の抗原結合部位を記載するための、「相補性決定領域」（「CDR」）という用語の使用である。この特定の領域は、参照により本明細書に組み入れられる、Kabat et al. (1983) U.S. Dept. of Health and Human Services, "Sequences of Proteins of Immunological Interest"およびChothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)によって記載されており、定義は、互いに対して比較した際のアミノ酸残基の重複またはサブセットを含む。それにもかかわらず、抗体またはその変異体のCDRに言及するためのいずれかの定義の適用は、本明細書において定義されかつ使用される用語の範囲内であることが意図される。上記で引用される参照文献の各々により定義されるCDRを包含する適切なアミノ酸残基を、比較として下記の表1に示す。特定のCDRを包含する正確な残基の数字は、CDRの配列およびサイズに応じて変動するであろう。当業者は日常的に、抗体の可変領域アミノ酸配列を考慮して、どの残基が特定のCDRを構成するかを決定することができる。
【００３３】
（表１）CDRの定義1
2019108359.tif 000003
1表1におけるすべてのCDRの定義のナンバリングは、Kabatらにより示されるナンバリング慣例に従う（下記参照）。
【００３４】
Kabatらはまた、任意の抗体に適用可能である可変ドメイン配列についてのナンバリングシステムも定義した。当業者は、配列自体を超えるいずれの実験データにも頼ることなく、「Kabatナンバリング」のこのシステムを任意の可変ドメイン配列に明白に割り当てることができる。本明細書において使用される際、「Kabatナンバリング」とは、Kabat et al. (1983) U.S. Dept. of Health and Human Services, "Sequence of Proteins of Immunological Interest."により示されるナンバリングシステムを指す。別の方法で特定化されない限り、本発明の抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体における特定のアミノ酸残基の位置のナンバリングについての言及は、Kabatナンバリングシステムに従う。
【００３５】
本発明の抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、少なくとも1本の腕がSEMA4Dに特異的である多重特異性抗体および二重特異性抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、霊長類化抗体、またはキメラ抗体、一本鎖抗体、エピトープ結合断片、例えば、Fab、Fab'およびF(ab')2、Fd、Fv、一本鎖Fv（scFv）、ジスルフィド結合Fv（sdFv）、VLドメインまたはVHドメインのいずれかを含む断片、Fab発現ライブラリーにより産生された断片、ならびに抗イディオタイプ（抗Id）抗体（例えば、本明細書において開示される抗SEMA4D抗体に対する抗Id抗体を含む）を含むが、これらに限定されない。ScFv分子は当技術分野において公知であり、例えば、米国特許第5,892,019号に記載されている。本発明の免疫グロブリンまたは抗体分子は、免疫グロブリン分子の任意のタイプ（例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、およびIgY）、クラス（例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2など）、またはサブクラスであり得る。
【００３６】
本明細書において使用される際、「重鎖部分」という用語は、免疫グロブリン重鎖に由来するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、重鎖部分を構成するポリペプチドは、VHドメイン、CH1ドメイン、ヒンジ（例えば、上部、中間部、および／または下部ヒンジ領域）ドメイン、CH2ドメイン、CH3ドメイン、またはその変異体もしくは断片の、少なくとも1つを含む。例えば、本発明における使用のための結合ポリペプチドは、CH1ドメインを構成するポリペプチド鎖；CH1ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、およびCH2ドメインを構成するポリペプチド鎖；CH1ドメインおよびCH3ドメインを構成するポリペプチド鎖；CH1ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、およびCH3ドメインを構成するポリペプチド鎖、または、CH1ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、CH2ドメイン、およびCH3ドメインを構成するポリペプチド鎖を含んでもよい。別の態様において、本発明のポリペプチドは、CH3ドメインを構成するポリペプチド鎖を含む。さらに、本発明における使用のための結合ポリペプチドは、CH2ドメインの少なくとも一部（例えば、CH2ドメインのすべてまたは部分）を欠如していてもよい。上記に示されるように、これらのドメイン（例えば重鎖部分）は、アミノ酸配列において天然に存在する免疫グロブリン分子とは異なるように修飾されてもよいことが、当業者に理解されるであろう。
【００３７】
本明細書において開示されるある特定の抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体において、多量体の1本のポリペプチド鎖の重鎖部分は、多量体の2本目のポリペプチド鎖上のものと同一である。あるいは、本発明の重鎖部分を含有する単量体は、同一ではない。例えば、各単量体は、例えば二重特異性抗体を形成する、異なる標的結合部位を含んでもよい。
【００３８】
本明細書中で開示される方法における使用のための結合分子の重鎖部分は、異なる免疫グロブリン分子に由来してもよい。例えば、ポリペプチドの重鎖部分は、IgG1分子に由来するCH1ドメインおよびIgG3分子に由来するヒンジ領域を含むことができる。別の例において、重鎖部分は、部分的にIgG1分子に、および部分的にIgG3分子に由来するヒンジ領域を含むことができる。別の例において、重鎖部分は、部分的にIgG1分子に、および部分的にIgG4分子に由来するキメラヒンジを含むことができる。
【００３９】
本明細書において使用される際、「軽鎖部分」という用語は、免疫グロブリン軽鎖、例えば、κ軽鎖またはλ軽鎖に由来するアミノ酸配列を含む。一つの局面において、軽鎖部分は、VLドメインまたはCLドメインの少なくとも1つを含む。
【００４０】
本明細書において開示される抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、これらが認識するかまたは特異的に結合する抗原、例えば、本明細書において開示される標的ポリペプチド（例えばSEMA4D）のエピトープまたは部分の観点から記載されるか、または特定化されてもよい。抗体の抗原結合ドメインと特異的に相互作用する標的ポリペプチドの部分が、「エピトープ」または「抗原決定基」である。標的ポリペプチドは、単一のエピトープを含むことができるが、典型的には、少なくとも2個のエピトープを含み、かつ、抗原のサイズ、立体配座、およびタイプに応じて、任意の数のエピトープを含むことができる。さらに、標的ポリペプチド上の「エピトープ」は、非ポリペプチド要素であってもよいか、またはそれを含んでもよく、例えば、エピトープは炭水化物側鎖を含んでもよいことに注意されたい。
【００４１】
抗体のためのペプチドまたはポリペプチドエピトープの最小サイズは、約4個〜5個のアミノ酸であると考えられている。ペプチドまたはポリペプチドエピトープは、少なくとも7個、少なくとも9個、または少なくとも約15個〜約30個の間のアミノ酸を含有しうる。CDRは、その三次形態において抗原性ペプチドまたはポリペプチドを認識することができるため、エピトープを構成するアミノ酸は、隣接している必要がなく、いくつかの場合には、2本以上の異なるペプチド鎖上にありうる。本発明の抗SEMA4D抗体により認識されるペプチドまたはポリペプチドエピトープは、少なくとも4個、少なくとも5個、少なくとも6個、少なくとも7個、少なくとも8個、少なくとも9個、少なくとも10個、少なくとも15個、少なくとも20個、少なくとも25個、または約15個〜約30個の間の、SEMA4Dの隣接または非隣接のアミノ酸の配列を含有しうる。
【００４２】
「特異的に結合する」により、抗体がその抗原結合ドメインを介してエピトープに結合すること、および結合が抗原結合ドメインとエピトープとの間のいくらかの相補性を必然的に伴うことが、概して意味される。この定義に従って、抗体が、無作為の関連のないエピトープに結合するよりも容易に、その抗原結合ドメインを介してそのエピトープに結合する際、抗体はエピトープに「特異的に結合する」と言われる。「特異性」という用語は、それによりある特定の抗体がある特定のエピトープに結合する相対的親和性を認定するために、本明細書において使用される。例えば、抗体「A」は、所定のエピトープに対して抗体「B」よりも高い特異性を有すると考えられ得、または抗体「A」は、関連するエピトープ「D」に対して有するよりも高い特異性でエピトープ「C」に結合すると言うこともできる。
【００４３】
「優先的に結合する」により、抗体が、関連する、同様の、相同の、または類似のエピトープに結合するよりも容易に、エピトープに特異的に結合することが意味される。従って、所定のエピトープに「優先的に結合する」抗体は、そのような抗体が関連するエピトープと交差反応し得るにもかかわらず、関連するエピトープよりもそのエピトープに結合する可能性が高いであろう。
【００４４】
非限定的な例として、抗体は、第2のエピトープについての抗体の解離定数（KD）より低いKDで第1のエピトープに結合する場合、該第1のエピトープに優先的に結合すると考えられてもよい。別の非限定的な例において、抗体は、第2のエピトープについての抗体のKDより少なくとも1桁低い親和性で第1のエピトープに結合する場合、第1の抗原に優先的に結合すると考えられてもよい。別の非限定的な例において、抗体は、第2のエピトープについての抗体のKDより少なくとも2桁低い親和性で第1のエピトープに結合する場合、第1のエピトープに優先的に結合すると考えられてもよい。
【００４５】
別の非限定的な例において、抗体は、第2のエピトープについての抗体のオフ速度（off rate）（k(オフ)）より低いk(オフ)で第1のエピトープに結合する場合、第1のエピトープに優先的に結合すると考えられてもよい。別の非限定的な例において、抗体は、第2のエピトープについての抗体のk(オフ)より少なくとも1桁低い親和性で第1のエピトープに結合する場合、第1のエピトープに優先的に結合すると考えられてもよい。別の非限定的な例において、抗体は、第2のエピトープについての抗体のk(オフ)より少なくとも2桁低い親和性で第1のエピトープに結合する場合、第1のエピトープに優先的に結合すると考えられてもよい。本明細書において開示される抗体、または抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、5×10-2 秒-1、10-2 秒-1、5×10-3 秒-1、または10-3 秒-1より低いかまたはそれと同等のオフ速度（k(オフ)）で、本明細書において開示される標的ポリペプチド（例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4D）またはその断片もしくは変異体に結合すると言いうる。特定の局面において、本発明の抗体は、5×10-4 秒-1、10-4 秒-1、5×10-5 秒-1、または10-5 秒-1、5×10-6 秒-1、10-6 秒-1、5×10-7 秒-1、または10-7 秒-1より低いかまたはそれと同等のオフ速度（k(オフ)）で、本明細書において開示される標的ポリペプチド（例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4D）またはその断片もしくは変異体に結合すると言われてもよい。
【００４６】
本明細書において開示される抗体、または抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、103 M-1秒-1、5×103 M-1秒-1、104 M-1秒-1、または5×104 M-1秒-1より高いかまたはそれと同等のオン速度（on rate）（k(オン)）で、本明細書において開示される標的ポリペプチド（例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4D）またはその断片もしくは変異体に結合すると言われてもよい。特定の局面において、本発明の抗体は、105 M-1秒-1、5×105 M-1秒-1、106 M-1秒-1、または5×106 M-1秒-1、または107 M-1秒-1より高いかまたはそれと同等のオン速度（k(オン)）で、本明細書において開示される標的ポリペプチド（例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4D）またはその断片もしくは変異体に結合すると言うことができる。
【００４７】
抗体は、参照抗体のエピトープへの結合をある程度遮断する範囲でそのエピトープに優先的に結合する場合、参照抗体の所定のエピトープへの結合を競合的に阻害すると言われる。競合的阻害は、当技術分野において公知である任意の方法、例えば、競合ELISAアッセイにより測定されてもよい。抗体は、少なくとも90％、少なくとも80％、少なくとも70％、少なくとも60％、または少なくとも50％、参照抗体の所定のエピトープへの結合を競合的に阻害すると言われてもよい。
【００４８】
本明細書において使用される際、「親和性」という用語は、個々のエピトープの免疫グロブリン分子のCDRとの結合の強度の尺度を指す。例えば、Harlow et al. (1988) Antibodies: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed.) の27〜28ページを参照されたい。本明細書において使用される際、「結合力」という用語は、免疫グロブリンの集団と抗原との間の複合体の全体の安定性、すなわち、免疫グロブリン混合物の抗原との機能的結合強度を指す。例えば、Harlowの29〜34ページを参照されたい。結合力は、集団中の個々の免疫グロブリン分子の特異的なエピトープとの親和性、ならびにまた免疫グロブリンおよび抗原の結合価の両方に関連する。例えば、2価のモノクローナル抗体と、ポリマーなどの高度に反復するエピトープ構造を有する抗原との間の相互作用は、高い結合力の1つであろう。
【００４９】
本発明の抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体はまた、その交差反応性の観点から記載されるか、または特定化されてもよい。本明細書において記載される際、「交差反応性」という用語は、1種の抗原に特異的な抗体の第2の抗原と反応する能力；2種の異なる抗原性物質の間の関連性の尺度を指す。従って、抗体が、その形成を誘導したエピトープ以外のエピトープに結合する場合、交差反応性である。交差反応性エピトープは、概して、誘導エピトープと同一の相補的構造特性の多くを含有し、いくつかの場合には、実際に元よりも良好に適合し得る。
【００５０】
例えば、ある特定の抗体は、関連するが同一ではないエピトープ、例えば、参照エピトープと少なくとも95％、少なくとも90％、少なくとも85％、少なくとも80％、少なくとも75％、少なくとも70％、少なくとも65％、少なくとも60％、少なくとも55％、および少なくとも50％の同一性（当技術分野において公知でありかつ本明細書において記載される方法を用いて算出した際）を有するエピトープに結合する、ある程度の交差反応性を有する。抗体は、参照エピトープと95％未満、90％未満、85％未満、80％未満、75％未満、70％未満、65％未満、60％未満、55％未満、および50％未満の同一性（当技術分野において公知でありかつ本明細書において記載される方法を用いて算出した際）を有するエピトープに結合しない場合、ほとんどまたはまったく交差反応性を有さないと言われてもよい。抗体は、そのエピトープの任意の他の類似体、オーソログ、または相同体に結合しない場合、ある特定のエピトープについて「高度に特異的」であると考えられてもよい。
【００５１】
本発明の抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体はまた、本発明のポリペプチド、例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4Dに対するその結合親和性の観点から記載されるか、または特定化されてもよい。結合親和性は、5×10-2 M、10-2 M、5×10-3 M、10-3 M、5×10-4 M、10-4 M、5×10-5 M、10-5 M、5×10-6 M、10-6 M、5×10-7 M、10-7 M、5×10-8 M、10-8 M、5×10-9 M、10-9 M、5×10-10 M、10-10 M、5×10-11 M、10-11 M、5×10-12 M、10-12 M、5×10-13 M、10-13 M、5×10-14 M、10-14 M、5×10-15 M、または10-15 Mより低い解離定数またはKdを有するものを含みうる。ある特定の態様において、本発明の抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその抗原結合断片は、約5×10-9〜約6×10-9のKdでヒトSEMA4Dに結合する。別の態様において、本発明の抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその抗原結合断片は、約1×10-9〜約2×10-9のKdでマウスSEMA4Dに結合する。
【００５２】
本明細書において使用される際、「キメラ抗体」という用語は、免疫反応性領域または部位が第1の種から取得されているかまたは由来し、かつ、定常領域（本発明に従って、無傷であるか、部分的であるか、または修飾されていてもよい）が第2の種から取得されている任意の抗体を意味すると考えられるであろう。一部の態様において、標的結合領域または部位は、非ヒト供給源（例えば、マウスまたは霊長類）由来であると考えられ、かつ、定常領域はヒトである。
【００５３】
本明細書において使用される際、「工学により作製された抗体」という用語は、重鎖または軽鎖のいずれかまたは両方における可変ドメインが、公知の特異性の抗体由来の1個または複数のCDRの少なくとも部分的な置換により、ならびに、必要な場合、部分的なフレーム領域の置換および配列交換により変更されている抗体を指す。CDRは、フレームワーク領域が由来する抗体と同一のクラスまたはさらにサブクラスの抗体に由来してもよいが、CDRが異なるクラスの抗体、たとえば異なる種由来の抗体に由来することが、想定される。公知の特異性の非ヒト抗体由来の1個または複数の「ドナー」CDRがヒト重鎖または軽鎖のフレームワーク領域中に移植されている、工学により作製された抗体は、本明細書において「ヒト化抗体」と呼ばれる。特定の態様において、1個の可変ドメインの抗原結合能力を別の可変ドメインに移すために、CDRのすべてをドナー可変ドメイン由来の完全なCDRで置換することは、必要ではない。むしろ、標的結合部位の活性を維持するために必要とされる残基のみを移すことができる。
【００５４】
ヒト化抗体の重鎖または軽鎖または両方における可変ドメイン内のフレームワーク領域は、ヒト起源の残基のみを含んでもよいことがさらに認識され、この場合、ヒト化抗体のこれらのフレームワーク領域は、「完全ヒトフレームワーク領域」と呼ばれる（例えば、全体として参照により本明細書に組み入れられる米国特許出願公開第2010/0285036 A1号においてMAb 2503として開示されているMAb VX15/2503）。あるいは、ドナー可変ドメインのフレームワーク領域の1個または複数の残基は、SEMA4D抗原に対する妥当な結合を維持するためまたは結合を増強するために、必要な場合、ヒト化抗体の重鎖または軽鎖または両方における可変ドメインのヒトフレームワーク領域の対応する位置の中で、工学により変更することができる。この様式において工学により変更されているヒトフレームワーク領域は、従って、ヒトおよびドナーのフレームワーク残基の混合物を含み、本明細書において「部分的ヒトフレームワーク領域」と呼ばれる。
【００５５】
例えば、抗SEMA4D抗体のヒト化は、Winterおよび共同研究者の方法に従って（Jones et al., Nature 321:522-525 (1986)；Riechmann et al., Nature 332:323-327 (1988)；Verhoeyen et al., Science 239:1534-1536 (1988)）、げっ歯類または変異げっ歯類のCDRまたはCDR配列を、ヒト抗SEMA4D抗体の対応する配列と置換することにより、本質的に行うことができる。参照により本明細書に組み入れられる、米国特許第5,225,539号；米国特許第5,585,089号；米国特許第5,693,761号；米国特許第5,693,762号；米国特許第5,859,205号もまた参照されたい。結果として生じたヒト化抗SEMA4D抗体は、ヒト化抗体の重鎖および／または軽鎖の可変ドメインの完全ヒトフレームワーク領域内に少なくとも1個のげっ歯類または変異げっ歯類のCDRを含むであろう。いくつかの例において、ヒト化抗SEMA4D抗体の1個または複数の可変ドメインのフレームワーク領域内の残基は、対応する非ヒト（例えばげっ歯類）残基により置換されており（例えば、米国特許第5,585,089号；米国特許第5,693,761号；米国特許第5,693,762号；および米国特許第6,180,370号を参照されたい）、その場合、結果として生じたヒト化抗SEMA4D抗体は、重鎖および／または軽鎖の可変ドメイン内に部分的ヒトフレームワーク領域を含むであろう。
【００５６】
さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体中またはドナー抗体中に見出されない残基を含むことができる。これらの修飾は、抗体の性能をさらに磨くために（例えば望ましい親和性を得るために）なされる。概して、ヒト化抗体は、少なくとも1個の、および典型的には2個の可変ドメインの実質的にすべてを含むと考えられ、その中で、CDRのすべてまたは実質的にすべては、非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、フレームワーク領域のすべてまたは実質的にすべては、ヒト免疫グロブリン配列のものである。ヒト化抗体は任意で、免疫グロブリン定常領域（Fc）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンのものも含むであろう。さらに詳細には、参照により本明細書に組み入れられるJones et al., Nature 331:522-525 (1986)；Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988)；およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)を参照されたい。従って、そのような「ヒト化」抗体は、無傷のヒト可変ドメインが非ヒト種由来の対応する配列により置換されているとは実質的に言えない抗体を含んでもよい。実際には、ヒト化抗体は、典型的に、いくつかのCDR残基および場合によりいくつかのフレームワーク残基が、げっ歯類抗体中の類似した部位由来の残基により置換されているヒト抗体である。例えば、米国特許第5,225,539号；米国特許第5,585,089号；米国特許第5,693,761号；米国特許第5,693,762号；米国特許第5,859,205号を参照されたい。また、あらかじめ決定された抗原について改善された親和性を有するヒト化抗体を産生するためのヒト化抗体および技術が開示されている、米国特許第6,180,370号、および国際公開公報第01/27160号も参照されたい。
【００５７】
II．標的ポリペプチドの説明
本明細書において使用される際、「セマフォリン-4D」、「SEMA4D」、および「SEMA4Dポリペプチド」という用語は、「SEMA4D」および「Sema4D」のように、互換的に使用される。ある特定の態様において、SEMA4Dは、細胞の表面上に発現しているか、または細胞により分泌される。別の態様において、SEMA4Dは膜結合性である。別の態様において、SEMA4Dは可溶性、例えばsSEMA4Dである。他の態様において、SEMA4Dは、完全なサイズのSEMA4D、またはその断片、またはSEMA4D変異体ポリペプチドを含んでもよく、該SEMA4Dの断片またはSEMA4D変異体ポリペプチドは、完全なサイズのSEMA4Dのいくつかまたはすべての機能特性を保持している。
【００５８】
完全なサイズのヒトSEMA4Dタンパク質は、150 kDaの2本のポリペプチド鎖からなるホモ二量体膜貫通タンパク質である。SEMA4Dは、細胞表面受容体のセマフォリンファミリーに属し、CD100とも呼ばれる。ヒトおよびマウス両方のSEMA4D／Sema4Dは、それらの膜貫通型からタンパク質分解性に切断されて120-kDaの可溶型を生じ、2種のSema4Dアイソフォームの存在を示す（Kumanogoh et al., J. Cell Science 116(7):3464 (2003)）。セマフォリンは、ニューロンとその適切な標的との間の正確な連結を確立する際に重要な役割を果たす発生中の軸索ガイダンス因子として元来定義された、可溶性タンパク質および膜結合性タンパク質からなる。SEMA4Dは、構造的にクラスIVセマフォリンと考えられ、アミノ末端のシグナル配列の後に、17個の保存されたシステイン残基を含有する特徴的な「セマ」ドメイン、Ig様ドメイン、リジンに富んだストレッチ、疎水性膜貫通領域、および細胞質尾部からなる。
【００５９】
SEMA4Dの各ポリペプチド鎖は、約13アミノ酸のシグナル配列の後に、約512アミノ酸のセマフォリンドメイン、約65アミノ酸の免疫グロブリン様（Ig様）ドメイン、104アミノ酸のリジンに富んだストレッチ、約19アミノ酸の疎水性膜貫通領域、および110アミノ酸の細胞質尾部を含む。細胞質尾部中のチロシンリン酸化のためのコンセンサス部位は、SEMA4Dのチロシンキナーゼとの予測される会合を支持する（Schlossman, et al., Eds. (1995) Leucocyte Typing V (Oxford University Press, Oxford)）。
【００６０】
SEMA4Dは、少なくとも3種の機能的受容体、プレキシン-B1、プレキシン-B2、およびCD72を有することが公知である。受容体の1種であるプレキシン-B1は、非リンパ系組織において発現し、SEMA4Dに対する高親和性（1 nM）受容体であることが示されている（Tamagnone et al., Cell 99:71-80 (1999)）。プレキシン-B1シグナル伝達のSEMA4D刺激は、ニューロンの成長円錐虚脱を誘導すること、ならびにオリゴデンドロサイトの突起伸長虚脱およびアポトーシスを誘導することが示されている（Giraudon et al., J. Immunol. 172:1246-1255 (2004)；Giraudon et al., NeuroMolecular Med. 7:207-216 (2005)）。プレキシン-B1シグナル伝達は、SEMA4Dへの結合後に、R-Rasの不活性化を媒介して、細胞外マトリクスへのインテグリン媒介性付着の減少およびRhoAの活性化をもたらし、細胞骨格の再構成および細胞遊走をもたらす。Kruger et al., Nature Rev. Mol. Cell Biol. 6:789-800 (2005)；Pasterkamp, TRENDS in Cell Biology 15:61-64 (2005)を参照されたい。一方、プレキシン-B2はSEMA4Dに対して中間的な親和性を有し、最近の報告により、プレキシン-B2は角化細胞上に発現されており、SEMA4D陽性γδT細胞を活性化して上皮修復に貢献していることが示されている（Witherden et al., Immunity. 2012 Aug 24;37(2):314-25）。
【００６１】
リンパ系組織においては、CD72が、低親和性（300nM）SEMA4D受容体として利用されている（Kumanogoh et al., Immunity 13:621-631 (2000)）。B細胞およびAPCがCD72を発現し、抗CD72抗体は、CD40により誘導されるB細胞応答およびCD23のB細胞切断の増強などの、sSEMA4Dと同一の作用の多くを有する。CD72は、多くの抑制性受容体と会合することができるチロシンホスファターゼSHP-1を動員することにより、B細胞応答の負の制御因子として働くと考えられている。SEMA4DのCD72との相互作用は、SHP-1の解離、およびこの負の活性化シグナルの損失を結果としてもたらす。SEMA4Dは、インビトロでT細胞刺激ならびにB細胞の凝集および生存を促進することが示されている。SEMA4D発現細胞またはsSEMA4Dの添加によって、インビトロでCD40により誘導されるB細胞増殖および免疫グロブリン産生が増強され、ならびにインビボの抗体応答が加速化される（Ishida et al., Inter. Immunol. 15:1027-1034 (2003)；Kumanogoh and H. Kukutani, Trends in Immunol. 22:670-676 (2001)）。sSEMA4Dは、共刺激分子の上方制御およびIL-12の分泌の増加を含む、CD40により誘導されるDCの成熟を増強する。さらに、sSEMA4Dは、免疫細胞の遊走を阻害することができ、それは、遮断する抗SEMA4D抗体の添加により逆転させることができる（Elhabazi et al., J. Immunol. 166:4341-4347 (2001)；Delaire et al., J. Immunol. 166:4348-4354 (2001)）。
【００６２】
Sema4Dは、脾臓、胸腺、およびリンパ節を含むリンパ系器官において、ならびに、脳、心臓、および腎臓などの非リンパ系器官において高レベルで発現している。リンパ系器官において、Sema4Dは、休止T細胞上に豊富に発現しているが、休止B細胞、および樹状細胞（DC）などの抗原提示細胞（APC）上には弱くしか発現していない。細胞の活性化により、SEMA4Dの表面発現および可溶性SEMA4D（sSEMA4D）の生成が増加する。
【００６３】
SEMA4Dの発現パターンにより、SEMA4Dが免疫系において重要な生理学的役割および病理学的役割を果たすことが示唆される。SEMA4Dは、B細胞の活性化、凝集、および生存を促進し；CD40により誘導される増殖および抗体産生を増強し；T細胞依存性抗原に対する抗体応答を増強し；T細胞増殖を増加させ；樹状細胞の成熟およびT細胞を刺激する能力を増強し；かつ脱髄および軸索変性に直接関係していることが、示されている（Shi et al., Immunity 13:633-642 (2000)；Kumanogoh et al., J Immunol 169:1175-1181 (2002)；およびWatanabe et al., J Immunol 167:4321-4328 (2001)）。
【００６４】
SEMA4Dノックアウト（SEMA4D-/-）マウスは、SEMA4Dが体液性免疫応答および細胞性免疫応答の両方において重要な役割を果たすことの追加的な証拠を提供している。SEMA4D-/-マウスにおいて、非リンパ系組織の主要な異常性は知られていない。SEMA4D-/-マウス由来の樹状細胞（DC）は、不十分な同種刺激能力を有し、sSEMA4Dの添加により救出することができる共刺激分子の発現の欠陥を示す。ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質特異的なT細胞が、SEMA4Dの非存在下では十分に生成されないため、SEMA4Dが欠損している（SEMA4D-/-）マウスは、ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質ペプチドにより誘導される実験的自己免疫性脳脊髄炎を発症することができない（Kumanogoh et al., J Immunol 169:1175-1181 (2002)）。有意な量の可溶性SEMA4Dがまた、自己免疫の傾向があるMRL/lprマウス（SLEなどの全身性自己免疫疾患のモデル）の血清中に検出されるが、正常マウスにおいては検出されない。さらに、sSEMA4Dのレベルは、自己抗体のレベルと相関し、年齢とともに増加する（Wang et al., Blood 97:3498-3504 (2001)）。可溶性SEMA4Dはまた、脱髄性疾患を有する患者の脳脊髄液および血清中に蓄積することも示されており、sSEMA4Dは、インビトロでヒト多能性神経前駆体（Dev細胞）のアポトーシスを誘導し、かつ、ラットオリゴデンドロサイトの突起伸長を阻害するとともにそのアポトーシスを誘導する（Giraudon et al., J Immunol 172(2):1246-1255 (2004)）。このアポトーシスは、抗SEMA4D MAbにより遮断された。
【００６５】
III．抗SEMA4D抗体
SEMA4Dに結合する抗体は、当技術分野において記載されている。例えば、米国特許出願公開第2008/0219971 A1号、米国特許出願公開第2010/0285036 A1号、および米国特許出願公開第2006/0233793 A1号、国際特許出願である国際公開公報第93/14125号、国際公開公報第2008/100995号、および国際公開公報第2010/129917号、ならびにHerold et al., Int. Immunol. 7(1): 1-8 (1995)を参照されたく、これらの各々は、全体として参照により本明細書に組み入れられる。
【００６６】
本開示は、概して、炎症性障害を有する対象、例えばヒト患者において、アテローム性動脈硬化を処置する方法であって、SEMA4Dに特異的に結合する抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の投与を含む方法に関連する。ある特定の態様において、抗体は、SEMA4Dの1種または複数のその受容体、例えばプレキシン-B1との相互作用を遮断する。これらの特性を有する抗SEMA4D抗体を、本明細書中で提供される方法において使用することができる。使用することができる抗体は、米国特許出願公開第2010/0285036 A1号に完全に記載されているMAb VX15/2503、67、および76、ならびにその抗原結合断片、変異体、または誘導体を含むが、これらに限定されない。本明細書中で提供される方法において使用することができる追加的な抗体は、米国特許出願公開第2006/0233793 A1号に記載されているBD16およびBB18抗体、ならびにその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体；または、米国特許出願公開第2008/0219971 A1号に記載されているMAb 301、MAb 1893、MAb 657、MAb 1807、MAb 1656、MAb 1808、Mab 59、MAb 2191、MAb 2274、MAb 2275、MAb 2276、MAb 2277、MAb 2278、MAb 2279、MAb 2280、MAb 2281、MAb 2282、MAb 2283、MAb 2284、およびMAb 2285の任意、ならびにその任意の断片、変異体、もしくは誘導体を含む。ある特定の態様において、本明細書中で提供される方法における使用のための抗SEMA4D抗体は、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4Dに結合する。また、前述の抗体の任意と同一のエピトープに結合する抗体、および／またはの任意の前述の抗体を競合的に阻害する抗体も有用である。
【００６７】
ある特定の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、参照抗SEMA4D抗体分子、例えば上記のもののアミノ酸配列と少なくとも約80％、約85％、約88％、約89％、約90％、約91％、約92％、約93％、約94％、または約95％の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する。さらなる態様において、結合分子は、参照抗体と少なくとも約96％、約97％、約98％、約99％、または100％の配列同一性を共有する。
【００６８】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン（VHドメイン）を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該VHドメインのCDRの少なくとも1個は、SEQ ID NO: 9または10のCDR1、CDR2、またはCDR3と少なくとも約80％、約85％、約90％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、または同一であるアミノ酸配列を有する。
【００６９】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン（VHドメイン）を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該VHドメインのCDRの少なくとも1個は、SEQ ID NO: 6、SEQ ID NO: 7、またはSEQ ID NO: 8と少なくとも約80％、約85％、約90％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、または同一であるアミノ酸配列を有する。
【００７０】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン（VHドメイン）を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該VHドメインのCDRの少なくとも1個は、SEQ ID NO: 6、SEQ ID NO: 7、またはSEQ ID NO: 8と、1、2、3、4、または5個の保存的アミノ酸置換以外は同一であるアミノ酸配列を有する。
【００７１】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、SEQ ID NO: 9またはSEQ ID NO: 10と少なくとも約80％、約85％、約90％、約91％、約92％、約93％、約94％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、または100％同一であるアミノ酸配列を有するVHドメインを含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該コードされたVHドメインを含む抗SEMA4D抗体は、SEMA4Dに特異的または優先的に結合する。
【００７２】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン（VLドメイン）を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該VLドメインのCDRの少なくとも1個は、SEQ ID NO: 17または18のCDR1、CDR2、またはCDR3と少なくとも約80％、約85％、約90％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、または同一であるアミノ酸配列を有する。
【００７３】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン（VLドメイン）を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該VLドメインのCDRの少なくとも1個は、SEQ ID NO: 14、SEQ ID NO: 15、またはSEQ ID NO: 16と少なくとも約80％、約85％、約90％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、または同一であるアミノ酸配列を有する。
【００７４】
別の態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン（VLドメイン）を含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該VLドメインのCDRの少なくとも1個は、SEQ ID NO: 14、SEQ ID NO: 15、またはSEQ ID NO: 16と、1、2、3、4、または5個の保存的アミノ酸置換以外は同一であるアミノ酸配列を有する。
【００７５】
さらなる態様において、本明細書中で提供される方法において有用である抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、SEQ ID NO: 17またはSEQ ID NO: 18と少なくとも約80％、約85％、約90％、約91％、約92％、約93％、約94％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、または100％同一であるアミノ酸配列を有するVLドメインを含むか、それから本質的になるか、またはそれからなり、該コードされたVLドメインを含む抗SEMA4D抗体は、SEMA4Dに特異的または優先的に結合する。
【００７６】
また、本明細書中で提供される方法における使用のために、本明細書において記載されるような抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体をコードするポリペプチド、そのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、そのようなポリヌクレオチドを含むベクター、およびそのようなベクターまたはポリヌクレオチドを含む宿主細胞も含まれ、すべては、本明細書中で記載される方法における使用のために、抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を産生するためのものである。
【００７７】
本発明の抗SEMA4D抗体の適した生物学的に活性を有する変異体を、本発明の方法において使用することができる。そのような変異体は、親抗SEMA4D抗体の望ましい結合特性を保持しているであろう。抗体変異体を作製する方法は、当技術分野において一般的に利用可能である。
【００７８】
変異誘発およびヌクレオチド配列変更のための方法は、当技術分野において周知である。例えば、参照により本明細書に組み入れられる、Walker and Gaastra, eds. (1983) Techniques in Molecular Biology (MacMillan Publishing Company, New York)；Kunkel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:488-492 (1985)；Kunkel et al., Methods Enzymol. 154:367-382 (1987)；Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor, N.Y.)；米国特許第4,873,192号；およびこれらにおいて引用される参照文献を参照されたい。関心対象のポリペプチドの生物学的活性に影響を及ぼさない適切なアミノ酸置換についての手引きは、全体として参照により本明細書に組み入れられるAtlas of Protein Sequence and Structure (Natl. Biomed. Res. Found., Washington, D.C.)の345-352ページにおけるDayhoffらのモデル（1978）において見出され得る。Dayhoffらのモデルは、適した保存的アミノ酸置換を決定するために、Point Accepted Mutation（PAM）アミノ酸類似度マトリクス（PAM 250マトリクス）を使用する。一部の局面において、アミノ酸置換は、1個のアミノ酸を類似した特性を有する別のアミノ酸と交換するような保存的置換でありうる。DayhoffらのモデルのPAM250マトリクスにより教示される保存的アミノ酸置換の例は、Gly⇔Ala、Val⇔Ile⇔Leu、Asp⇔Glu、Lys⇔Arg、Asn⇔Gln、およびPhe⇔Trp⇔Tyrを含むが、これらに限定されない。
【００７９】
関心対象のポリペプチドである、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその抗原結合断片の変異体を構築する際には、変異体が、例えば、本明細書において記載されるような、例えば、細胞の表面上に発現しているかまたは細胞により分泌されるSEMA4D、例えば、ヒト、マウス、またはヒトおよびマウス両方のSEMA4Dに特異的に結合することができる、およびSEMA4D遮断活性を有する、望ましい特性を保有し続けるように修飾がなされる。変異体ポリペプチドをコードするDNA中に作製される変異は、配列をリーディングフレームの外に置くべきでなく、特定の局面においては、mRNAの二次構造を生じ得る相補性領域を創出しない。欧州特許出願公開第75,444号を参照されたい。
【００８０】
抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の結合特異性を測定する方法は、標準的な競合結合アッセイ、T細胞またはB細胞による免疫グロブリン分泌をモニタリングするためのアッセイ、T細胞増殖アッセイ、アポトーシスアッセイ、ELISAアッセイなどを含むが、これらに限定されない。例えば、すべてが参照により本明細書に組み入れられる、国際公開公報第93/14125号；Shi et al., Immunity 13:633-642 (2000)；Kumanogoh et al., J Immunol 169:1175-1181 (2002)；Watanabe et al., J Immunol 167:4321-4328 (2001)；Wang et al., Blood 97:3498-3504 (2001)；およびGiraudon et al., J Immunol 172(2):1246-1255 (2004)において開示される、そのようなアッセイを参照されたい。
【００８１】
本明細書において開示される定常領域、CDR、VHドメイン、またはVLドメインを含む任意の特定のポリペプチドが、別のポリペプチドと少なくとも約65％、約70％、約75％、約80％、約85％、約90％、約91％、約92％、約93％、約94％、約95％、約96％、約97％、約98％、約99％、またはさらに約100％同一であるか否かを、本明細書において議論する際、％同一性は、BESTFITプログラム（Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, Wis. 53711）などの、しかしこれに限定されない、当技術分野において公知である方法およびコンピュータプログラム／ソフトウェアを用いて決定することができる。BESTFITは、2種の配列間の相同性の最も高いセグメントを見出すために、Smith and Waterman (1981) Adv. Appl. Math. 2:482-489の局所相同性アルゴリズムを使用する。特定の配列が、例えば、本発明による参照配列と95％同一であるか否かを判定するためにBESTFITまたは任意の他の配列アラインメントプログラムを用いる際は、パラメータを、当然、同一性のパーセンテージが参照ポリペプチド配列の完全長にわたって計算されるように、かつ参照配列中のアミノ酸の総数の5％までの相同性におけるギャップが許容されるように、設定する。
【００８２】
本発明の目的で、パーセント配列同一性を、Smith-Waterman相同性検索アルゴリズムを使用して、12のギャップ開始ペナルティおよび2のギャップ伸長ペナルティ、62のBLOSUMマトリクスを有するアフィンギャップ検索を用いて決定してもよい。Smith-Waterman相同性検索アルゴリズムは、Smith and Waterman (1981) Adv. Appl. Math. 2:482-489において教示される。変異体は、例えば、参照抗SEMA4D抗体（例えば、MAb VX15/2503、67、または76）と、わずか1〜15個のアミノ酸残基、わずか1〜10個のアミノ酸残基、例えば6〜10個、わずか5個、わずか4個、3個、2個、またはさらに1個のアミノ酸残基が異なっていてもよい。
【００８３】
2種の最適に整列化された配列を比較ウインドウにおいて比較することによっても、「配列同一性」の百分率を決定することができる。配列を比較のために最適に整列化するためには、参照配列を一定に保ったまま、比較ウインドウ内のポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列の部分に、付加またはギャップと呼ばれる欠失を含めることができる。最適な整列化とは、ギャップを含んでいるとしても、参照配列と比較配列との間の「同一の」位置の数を可能な限り大きくする整列化である。2004年9月1日時点でNational Center for Biotechnology Informationから入手可能であったプログラム「BLAST 2 Sequences」のバージョンを使用して、2種の配列の間の「配列同一性」百分率を決定することができる。このプログラムには、Karlin and Altschul（Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90(12):5873-5877, 1993）のアルゴリズムに基づくプログラムBLASTN（ヌクレオチド配列比較のため）およびBLASTP（ポリペプチド配列比較のため）が組み込まれている。「BLAST 2 Sequences」を利用する時、ワードサイズ（3）、オープンギャップペナルティ（11）、エクステンションギャップペナルティ（1）、ギャップドロップオフ（50）、期待値（10）、およびマトリックスオプションを含むが、これに限定されない、他の必要とされるパラメータについて、2004年9月1日時点でデフォルトパラメータであったパラメータを使用することができる。
【００８４】
抗SEMA4抗体の定常領域は、多数の方式でエフェクター機能を変化させるように変異させることができる。例えば、Fc受容体に対する抗体結合を最適化するFc変異を開示している、米国特許第6,737,056B1号および米国特許出願公開第2004/0132101A1号を参照されたい。
【００８５】
本明細書中で提供される方法において有用である、ある特定の抗SEMA4D抗体、またはその断片、変異体、もしくは誘導体において、Fc部分を、当技術分野において公知である技術を用いてエフェクター機能を低下させるように変異させることができる。例えば、定常領域ドメインの（点変異または他の手段を通した）欠失または不活性化は、循環する修飾抗体のFc受容体結合を低減させ、それにより腫瘍局在化を増加させることができる。他の場合には、本発明と一致する定常領域修飾は、補体結合を緩和し、従って血清半減期を低減させる。定常領域のさらに他の修飾を、ジスルフィド結合またはオリゴ糖部分を修飾して、抗原特異性または抗体柔軟性の増加による局在化の増強を可能にするために、使用することができる。結果として生じた修飾体の生理学的プロフィール、生物学的利用能、および他の生化学的作用、例えば、腫瘍局在化、生体内分布、および血清半減期は、過度の実験を伴わない周知の免疫学的技術を用いて、容易に測定および定量化することができる。本明細書中で提供される方法における使用のための抗SEMA4D抗体は、例えば、共有結合が抗体のその同起源のエピトープに対する特異的結合を妨げないような、任意のタイプの分子の抗体への共有結合により修飾されている誘導体を含む。例えば、しかし限定としてではなく、抗体誘導体は、例えば、グルコシル化、アセチル化、ペグ化、リン酸化、アミド化、公知の保護基／遮断基による誘導体化、タンパク質分解性切断、細胞性リガンドまたは他のタンパク質への結合などにより修飾されている抗体を含む。多数の化学修飾の任意は、特異的化学切断、アセチル化、ホルミル化などを含むがこれらに限定されない公知の技術により行うことができる。さらに、誘導体は、1個または複数の非古典的アミノ酸を含有することができる。
【００８６】
「保存的アミノ酸置換」とは、その中でアミノ酸残基が類似した電荷をもつ側鎖を有するアミノ酸残基と置き換えられているものである。類似した電荷をもつ側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが、当技術分野において定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β分岐側鎖を有するアミノ酸（例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン）、および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を含む。あるいは、変異を、例えば飽和変異誘発により、コード配列のすべてまたは一部に沿って無作為に導入することができ、結果として生じた変異体を、活性（例えば、抗SEMA4Dポリペプチドに結合する能力、SEMA4Dのその受容体との相互作用を遮断する能力、または、対象、例えば炎症性障害もしくはアテローム性動脈硬化を有する患者において、プラーク形成を低下、阻害、抑制、および／もしくは遅延させる能力）を保持する変異体を同定するために生物学的活性についてスクリーニングすることができる。
【００８７】
例えば、抗体分子のフレームワーク領域のみまたはCDR領域のみに変異を導入することが可能である。導入された変異は、サイレント変異または中立ミスセンス変異である、すなわち、抗原に結合する抗体の能力に対して何も効果を有さないか、またはほとんど効果を有さないことができる。これらのタイプの変異は、コドン使用頻度を最適化するため、またはハイブリドーマの抗体産生を改善するために有用であり得る。あるいは、非中立ミスセンス変異は、抗原に結合する抗体の能力を変更してもよい。当業者は、抗原結合活性の無変更または結合活性の変更（例えば、抗原結合活性の改善または抗体特異性の変化）などの望ましい特性を有する変異体分子を、設計しかつ試験することができるであろう。変異誘発後に、コードされたタンパク質を、日常的に発現させてもよく、コードされたタンパク質の機能的活性および／または生物学的活性（例えば、SEMA4Dポリペプチドの少なくとも1個のエピトープに免疫特異的に結合する能力）を、本明細書において記載される技術を用いて、または当技術分野において公知である日常的な修飾技術により、測定することができる。
【００８８】
ある特定の態様において、本明細書中で提供される方法における使用のための抗SEMA4D抗体は、少なくとも1個の最適化された相補性決定領域（CDR）を含む。「最適化されたCDR」により、CDRが、最適化されたCDRを含む抗SEMA4D抗体に付与される結合親和性および／または抗SEMA4D活性を改善するように、修飾されかつ最適化されていることが意図される。「抗SEMA4D活性」または「SEMA4D遮断活性」は、SEMA4Dと関連する以下の活性の1つまたは複数を調節する活性を含むことができる：B細胞の活性化、凝集、および生存；CD40により誘導される増殖および抗体産生；T細胞依存性抗原に対する抗体応答；T細胞もしくは他の免疫細胞の増殖；樹状細胞の成熟；脱髄および軸索変性；多能性神経前駆体および／もしくはオリゴデンドロサイトのアポトーシス；内皮細胞遊走の誘導；自発性単球遊走の阻害；細胞表面プレキシン-B1もしくは他の受容体に対する結合、または、可溶性SEMA4DもしくはSEMA4D+細胞の表面上に発現しているSEMA4Dと関連する任意の他の活性。抗SEMA4D活性はまた、リンパ腫を含む特定のタイプの癌、自己免疫疾患、中枢神経系（CNS）および末梢神経系（PNS）の炎症性疾患を含む炎症性疾患、移植片拒絶、ならびに浸潤性血管新生を含むが、これらに限定されない、SEMA4Dの発現と関連する疾患の発生率または重症度の低下に帰することができる。マウス抗SEMA4D MAb BD16およびBB18に基づく最適化された抗体の例は、米国特許出願公開第2008/0219971 A1号、国際特許出願である国際公開公報第93/141251号、およびHerold et al., Int. Immunol. 7(1): 1-8 (1995)に記載され、これらの各々は、全体として参照により本明細書に組み入れられる。修飾は、抗SEMA4D抗体が、SEMA4D抗原についての特異性を保持し、かつ改善された結合親和性および／または改善された抗SEMA4D活性を有するように、CDR内のアミノ酸残基の置換を含んでもよい。
【００８９】
IV．治療用抗SEMA4D抗体を用いた処置法
本発明の方法は、アテローム性動脈硬化を有する対象においてアテローム性動脈硬化を処置するための、抗SEMA4D結合分子、例えば、その抗原結合断片、変異体、および誘導体を含む抗体の使用に向けられる。ある特定の態様において、内皮細胞は、SEMA4D受容体を発現し；ある特定の態様において、受容体はプレキシン-B1である。以下の議論は、抗SEMA4D抗体の投与に言及するが、本明細書において記載される方法は、本発明の抗SEMA4D抗体の望ましい特性を保持する、例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、もしくはヒトおよびマウスのSEMA4Dに特異的に結合することができ、SEMA4D中和活性を有し、かつ／またはSEMA-4Dの受容体、例えば、プレキシン-B1との相互作用を阻止することができる、これらの抗SEMA4D抗体の抗原結合断片、変異体、および誘導体にも適用可能である。本明細書において記載される方法は、本発明の抗体の望ましい特性を保持する、例えば、SEMA4D、例えば、ヒト、マウス、もしくはヒトおよびマウスのSEMA4Dに特異的に結合することができ、SEMA4D中和活性を有し、かつ／またはSEMA-4Dのその受容体との相互作用を阻止することができる、他の生物学的生成物または低分子薬物にも適用可能である。
【００９０】
1つの態様において、処置は、患者が冠動脈疾患を有するかまたはそれを発症するリスクを有する場合の、本明細書において記載される抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその抗原結合断片の、患者への適用または投与を含む。別の態様において、処置は、患者が冠動脈疾患を有するかまたはそれを発症するリスクを有する場合の、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその抗原結合断片を含む薬学的組成物の、患者への適用または投与を含むようにも意図される。
【００９１】
本明細書において記載される抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその結合断片は、アテローム性動脈硬化を含む炎症性疾患の処置のために有用である。いくつかの態様において、アテローム性動脈硬化の処置は、アテローム性動脈硬化プラークの形成を低下させ、阻害し、抑制し、かつ／もしくは遅延させることができ、かつ／またはアテローム性動脈硬化プラークの増殖を低下させ、阻害し、抑制し、かつ／もしくは遅延させることができる。アテローム性動脈硬化プラークは、動脈を次第に硬化し狭窄し、それにより、身体の器官およびその他の部分への酸素に富む含む血液の流動を制限する、血中に見出される脂肪、コレステロール、カルシウム、およびその他の物質の蓄積である。
【００９２】
他の態様において、アテローム性動脈硬化の処置は、アテローム性動脈硬化プラークの内部または周辺において起こる血管新生を低下させるかまたは減少させることができる。血管新生が、ヒトの大動脈および冠動脈のアテローム性動脈硬化プラークにおいて起こる（Carmeliet P, Nature Med 9: 653-660, 2003；およびZhang Y et al., Am J Pathol 143: 164-172, 1993）。これらの新血管は、最初は外膜栄養血管に由来し、肥厚したアテローム性動脈硬化内膜増殖に栄養を供給する働きをする（Kumamoto M et al., Hum Pathol 26: 450-456, 1995）。従って、血管新生は、アテローム性動脈硬化プラークの増殖および不安定化の主要な原因である（Barger AC et al., N Engl J Med 310: 175-177, 1984）。いくつかの研究が、血管新生がアテローム形成を容易にする機序を探究している（Moreno PR et al., Circulation 113: 2245-2252, 2006；およびCheng XW et al., Hypertension 57:981-989, 2011）。栄養血管の密度は、プラークに浸潤する炎症性単核細胞の数と高度に相関するため、プラーク内の新しい血管形成は、アテローム性動脈硬化プラークへの白血球遊走のための重大な侵入部位を提供すると考えられる（O'Brien ER et al., Am J Pathol 145: 883-894, 1994；およびMoulton KS et al., Proc Natl Acad Sci USA 100: 4736-4741, 2003）。プラーク新血管からの出血は、アテロームの脂質コアにおける血中脂質沈着を助けることによって、プラークサイズをさらに拡大させる（Kolodgie FD et al., N Engl J Med 349: 2316-25, 2003）。アンジオスタチンまたはTNP-4570を含む血管形成阻害剤は、アテローム性動脈硬化易発性アポリポタンパク質E欠損（アポE-/-）マウスにおいて、新しい血管形成を減少させることによってプラーク増殖を抑制することが示されており、このことは、アテローム性動脈硬化の進行における血管新生の機能的重要性を示している（Moulton KS et al., Proc Natl Acad Sci USA 100: 4736-4741, 2003；およびMoulton KS et al., Circulation 99: 1726-32, 1999）。さらに、アテローム性動脈硬化プラークにおいて形成された新血管は、血液からプラークへ分泌されるメタロプロテイナーゼの量を増加させ、最終的には、プラーク破裂および血栓形成を誘導することによって、アテローム性動脈硬化を悪化させることができる（Jonsson-Rylander AC et al., Arterioscler Thromb Vasc Biol 25: 180-185, 2005.）。
【００９３】
他の態様において、本明細書に記載される抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体またはその結合断片は、他の炎症性疾患の処置のために有用であり得る。そのような疾患の例は、心血管疾患、慢性関節リウマチ、胃腸疾患、神経炎症性疾患（例えば、多発性硬化症）を含み、さらにある特定の型の癌（例えば、胆嚢癌）を含むことができるが、これらに限定されない。
【００９４】
1つの態様において、本発明は、薬剤としての、具体的には、アテローム性動脈硬化プラークの形成を阻害し、低下させ、防止し、最小化し、かつ／もしくは遅延させ、かつ／またはアテローム性動脈硬化プラークにおける血管新生を阻害し、低下させ、防止し、最小化し、かつ／もしくは遅延させるためのアテローム性動脈硬化の処置または予防において使用するための薬剤としての、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の使用に関する。
【００９５】
本発明の方法に従って、本明細書において他の場所で定義されるような、少なくとも1つの抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を、アテローム性動脈硬化に関する正の治療応答を促進するために使用することができる。アテローム性動脈硬化に関する「正の治療応答」とは、プラーク形成、プラーク血管新生、プラーク増殖に関連した疾患の改善、および／または疾患に関連した症候の改善を含むように意図される。すなわち、アテローム性動脈硬化プラーク形成の遅延、プラークの血管新生の低下、炎症の低下、プラークの増殖の減少、これらの組み合わせなどを観察することができる。そのような正の治療応答は、投与の経路に限定されず、ドナー、ドナー組織（例えば、器官灌流など）、宿主、これらの任意の組み合わせなどへの投与を含んでもよい。特に、本明細書において提供される方法は、患者におけるアテローム性動脈硬化の発症の阻害、防止、低下、緩和、または軽減に向けられる。従って、例えば、疾患の改善は、臨床的に観察可能な症候の欠如、プラーク形成もしくはプラーク増殖の低下、阻害、抑制、および／もしくは遅延、血管新生の低下、阻害、抑制、および／もしくは遅延、炎症の低下、またはプラークの形態もしくは機能の変化として特徴決定されてもよい。
【００９６】
抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を、アテローム性動脈硬化のための少なくとも1つまたは複数の他の処置と組み合わせて使用することができ；その場合、追加的な治療は、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の治療の前、その間、またはその後に投与される。従って、組み合わせ治療が、別の治療剤の投与と組み合わせられた、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の投与を含む場合、本発明の方法は、同時投与またはいずれかの順番での連続的投与による、別々の製剤または単一の薬学的製剤を使用した共投与を包含する。
【００９７】
ある特定の態様において本開示の方法および系を適用するため、（1）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量；または（2）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量のいずれかを含む治療の、アテローム性動脈硬化または炎症性疾患を有する対象への投与の前、その後、またはその前後に、患者から試料または画像を入手してもよい。いくつかの場合には、治療を開始した後、治療を中止した後、または治療の前後に、連続的な試料または画像を患者から入手してもよい。試料または画像は、例えば、医療提供者（例えば、医師）または医療給付金提供者によって請求され、同一のまたは異なる医療提供者（例えば、看護師、病院）または臨床検査室によって入手されかつ／または処理され、処理後、結果がさらに別の医療提供者、医療給付金提供者、または患者に転送されてもよい。同様に、1つまたは複数のスコアの測定／決定、スコアの比較、スコアの評価、および処置決定が、1つまたは複数の医療提供者、医療給付金提供者、および／または臨床検査室によって実施されてもよい。
【００９８】
本明細書において使用される際、「医療提供者」という用語は、生存している対象、例えば、ヒト患者と直接接するかまたは投与を行う個人または機関を指す。医療提供者の非限定的な例は、医師、看護師、技師、セラピスト、薬剤師、カウンセラー、代替医療実務者、医療施設、医院、病院、救急室、診療所、緊急ケアセンター、代替医療診療所／施設、ならびに一般医学的な、専門医学的な、外科的な、かつ／またはその他の型の処置、査定、維持、治療、薬物治療、および／または助言を含むが、これらに限定されない、患者の健康状態の全部または一部に関する一般的なかつ／または専門的な処置、査定、維持、治療、薬物治療、および／または助言を提供する他の実体を含む。
【００９９】
いくつかの局面において、医療提供者は、対象がアテローム性動脈硬化または炎症性疾患を有するかまたはそれを有すると推測される場合に（1）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量；または（2）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量のいずれかを含む治療を投与するかまたはそれを投与するよう別の医療提供者に指示することができる。医療提供者は、以下の行為を実行するかまたはそれを実施するよう別の医療提供者もしくは患者に指示することができる：試料または画像を入手すること、試料または画像を処理すること、試料または画像を提出すること、試料または画像を受け取ること、試料または画像を移動させること、試料または画像を分析するかまたは測定すること、試料または画像を定量化すること、試料または画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果を提供すること、試料または画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果を受け取ること、1つまたは複数の試料または画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果を比較／判定すること、1つまたは複数の試料からの比較／判定を提供すること、1つまたは複数の試料または画像からの比較／判定を入手すること、対象がアテローム性動脈硬化または炎症性疾患を有するかまたはそれを有すると推測される場合に治療（例えば、（1）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量；または（2）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量）を対象に投与すること、治療の投与を開始すること、治療の投与を中止すること、治療の投与を継続すること、治療の投与を一時的に中断すること、投与される治療剤の量を増加させること、投与される治療剤の量を減少させること、ある量の治療剤の投与を継続すること、治療剤の投与の頻度を増加させること、治療剤の投与の頻度を減少させること、治療剤の同一の投薬頻度を維持すること、治療または治療剤を少なくとも1つの別の治療または治療剤に交換すること、治療または治療剤を少なくとも1つの別の治療または追加的な治療剤と組み合わせること。
【０１００】
いくつかの局面において、医療給付金提供者は、例えば、試料もしくは画像の収集、試料もしくは画像の処理、試料もしくは画像の提出、試料もしくは画像の受け取り、試料もしくは画像の移動、試料もしくは画像の分析もしくは測定、試料もしくは画像の定量化、試料もしくは画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果の提供、試料もしくは画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果の移動、1つもしくは複数の試料もしくは画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果の比較／判定、1つもしくは複数の試料もしくは画像からの比較／判定の移動、治療もしくは治療剤の投与、治療もしくは治療剤の投与の開始、治療もしくは治療剤の投与の中止、治療もしくは治療剤の投与の継続、治療もしくは治療剤の投与の一時的中断、投与される治療剤の量の増加、投与される治療剤の量の減少、ある量の治療剤の投与の継続、治療剤の投与の頻度の増加、治療剤の投与の頻度の減少、治療剤の同一の投薬頻度の維持、治療もしくは治療剤の少なくとも1つの別の治療もしくは治療剤への交換、または治療もしくは治療剤の少なくとも1つの別の治療もしくは追加的な治療剤との組み合わせを、認定するかまたは否認することができる。
【０１０１】
さらに、医療給付金提供者は、例えば、治療の処方を認定するかまたは否認することができ、治療の保障を認定するかまたは否認することができ、治療費の償還を認定するかまたは否認することができ、治療の適格性を決定するかまたは否認することができる。
【０１０２】
いくつかの局面において、臨床検査室は、例えば、試料の収集もしくは入手、試料の処理、試料の提出、試料の受け取り、試料の移動、試料の分析もしくは測定、試料の定量化、試料の分析／測定／定量化の後に入手された結果の提供、試料の分析／測定／定量化の後に入手された結果の受け取り、1つもしくは複数の試料の分析／測定／定量化の後に入手された結果の比較／判定、1つもしくは複数の試料からの比較／判定の提供、1つもしくは複数の試料からの比較／判定の入手、またはその他の関連した作業を行うことができる。
【０１０３】
いくつかの局面において、医療提供者、臨床検査室、または他の実体は、例えば、画像の収集もしくは入手、画像の処理、画像の提出、画像の受け取り、画像の移動、画像の分析もしくは測定、画像の定量化、画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果の提供、画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果の受け取り、1つもしくは複数の画像の分析／測定／定量化の後に入手された結果の比較／判定、1つもしくは複数の画像からの比較／判定の提供、1つもしくは複数の画像からの比較／判定の入手、またはその他の関連した作業を行うことができる。そのような局面において使用することができる画像は、冠動脈造影、血管内超音波検査（IVUS）、頸動脈超音波検査、冠血管コンピュータ断層撮影（CT）、磁気共鳴画像法（MRI）、陽電子放射断層撮影（PET）、光干渉断層撮影（OCT）、近赤外線分光法（NIRS）、およびNIR蛍光によって入手された画像を含むが、これらに限定されない。ある特定の態様において、文献に記載された画像技術を使用することができる（Tardif et al. Circ Cardiovasc Imaging  4:319-333 (2011)）。
【０１０４】
VII. 診断および処置の方法
ある特定の態様において、本開示は、対象のB細胞、T細胞、またはB細胞およびT細胞の両方のレベルが、B細胞、T細胞、もしくはB細胞およびT細胞の両方のレベルの予定された閾値より高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるB細胞、T細胞、もしくはB細胞およびT細胞の両方のレベルと比較して上昇している場合に、セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量の組み合わせを投与する段階を含む、対象がB細胞、T細胞、またはB細胞およびT細胞の両方の上昇したレベルを有する場合に、対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者を処置する方法を提供する。対照試料は、アテローム性動脈硬化を有する他の患者または健常非アテローム性動脈硬化患者に由来する試料を含んでいてよいが、これらに限定されない。試料、例えば、血液試料が医療提供者または臨床検査室のいずれかによって患者から入手される場合、医療提供者または臨床検査室が、B細胞、T細胞、またはB細胞およびT細胞のレベルを測定することができる。1つの局面において、サイトメトリーに基づく免疫表現型アッセイにおいて、患者のB細胞、T細胞、またはB細胞およびT細胞の両方のレベルを測定することができる。
【０１０５】
ある特定の態様において、本開示は、対象から採取された試料におけるC反応性タンパク質（CRP）および／または低密度リポタンパク質（LDL）のレベルが、レベルの予定された閾値より高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるCRPおよび／もしくはLDLのレベルと比較して上昇している場合に、セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者を処置する方法も提供する。対象におけるCRPおよび／またはLDLのレベル発現は、医療提供者または臨床検査室によって測定されうる。ある特定の態様において、CRPおよび／またはLDLのレベルは、インサイチューで、例えばイメージング技術を通して、測定することができる。ある特定の態様において、対象から入手された試料において、CRPおよび／またはLDLのレベル発現を測定することができる。1つの局面において、CRPおよび／またはLDLを認識する抗体またはその抗原結合断片を利用したイムノアッセイにおいて、CRPおよび／またはLDLのレベルを測定することができる。別の局面において、定量的遺伝子発現アッセイ、例えば、RT-PCRアッセイを介して、CRPおよび／またはLDLのレベルを測定することができる。
【０１０６】
本開示は、対象がアテローム性動脈硬化または炎症性疾患を有するかまたはそれを有すると推測される場合に、対象、例えば、アテローム性動脈硬化または炎症性疾患を有する患者が、（1）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量；または（2）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量のいずれかによる処置から恩恵を得るか否かについての、医療提供者、医療給付金提供者、または臨床検査室による決定を容易にするための方法、アッセイ、およびキットも提供する。本明細書において提供される方法、アッセイ、およびキットは、対象、例えば、アテローム性動脈硬化または炎症性疾患を有する患者が、（1）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量および少なくとも1つの他の免疫調節治療の有効量；または（2）セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量による処置から恩恵を得るか否かについての、医療提供者、医療給付金提供者、または臨床検査室による決定も容易にする。
【０１０７】
本開示は、患者から採取された試料におけるB細胞、T細胞、またはB細胞およびT細胞のレベルが、予定されたレベルの閾値より高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベルより高い場合に；セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を投与する段階を含む、対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者を処置する方法を提供する。いくつかの局面において、試料は、患者から入手され、試料中のB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルの測定のため、例えば、臨床検査室に提出される。
【０１０８】
本開示は、セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を投与する段階を含む、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定された対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者を処置する方法も提供する。ある特定の態様において、対象は、患者におけるアテローム性動脈硬化プラークの数、サイズ、もしくは特徴が、数、サイズ、もしくは特徴の予定された閾値より高いか、または患者におけるアテローム性動脈硬化プラークの数、サイズ、もしくは特徴が、1つもしくは複数の対照試料と比較した時にアテローム性動脈硬化を示す場合に、アテローム性動脈硬化プラークを有すると決定され、処置される。いくつかの局面において、試料は、患者から入手され、試料中のCRPおよび／またはLDLのレベルの測定のため、例えば、臨床検査室に提出される。他の局面において、患者は、アテローム性動脈硬化プラークの数、サイズ、または特徴を決定するため、画像技術に供される。そのような方法において使用することができる画像は、冠動脈造影、血管内超音波検査（IVUS）、頸動脈超音波検査、冠血管コンピュータ断層撮影（CT）、磁気共鳴画像法（MRI）、陽電子放射断層撮影（PET）、光干渉断層撮影（OCT）、近赤外線分光法（NIRS）、およびNIR蛍光によって入手された画像を含むが、これらに限定されない。ある特定の態様において、文献に記載された画像技術を使用することができる（Tardif et al. Circ Cardiovasc Imaging. 4:319-333）。ある特定の態様において、アテローム性動脈硬化プラークが、大きい脂質コア、低いSMC含量、高いマクロファージ含量、および薄い線維皮膜を含むが、これらに限定されない特徴を有する「不安定なアテローム性動脈硬化プラーク」である場合に、処置が施される。判定システム（Virmani et al. Arterioscler Thromb Vasc Biol 20(5): 1262-75 (2000)）または他の技術（van Lammeren et al., Current Cardiology Reviews 7:22-27 (2011)）によって、対象における「不安定なアテローム性動脈硬化プラーク」の存在を決定することができる。ある特定の態様において、そのような「不安定なアテローム性動脈硬化プラーク」を有すると決定された対象は、本明細書において提供される方法に従って処置される。
【０１０９】
（a）対象から採取された試料を、試料中のB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベルの測定、またはCRPおよび／もしくはLDLの測定のために提出する段階；ならびに（b）対象のB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベル、またはCRPおよび／もしくはLDLのレベルが、予定されたレベルの閾値より高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベル、もしくはCRPおよび／もしくはLDLのレベルより高い場合に、セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与する段階を含む、対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者を処置する方法も提供される。
【０１１０】
本開示は、（a）対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者から入手された試料におけるB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルを、例えば、サイトメトリーに基づく免疫表現型アッセイにおいて測定する段階；（b）試料中のB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルが、予定されたレベルの閾値より高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベルより高いか否かを決定する段階；ならびに（c）対象のB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルが、予定された閾値レベルより高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベルより高い場合に、医療提供者がセマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量を対象に投与することを助言するか、指示するか、または認定する段階を含む、対象、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者を処置する方法も提供する。
【０１１１】
いくつかの局面において、サイトメトリーに基づく免疫表現型アッセイにおいて、対象のB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルを測定することができる。ある特定の態様において、例えば、「ポイントオブケア」診断キットとして製剤化された本明細書において記載されるアッセイを使用して、患者を処置する医療専門家が、対象から入手された試料に対してアッセイを実施することができる。いくつかの局面において、本明細書において記載されるサイトメトリーに基づく免疫表現型アッセイを使うことを含むが、これに限定されない、医療専門家の指示による試料中のB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルの測定のため、試料を対象から入手し、例えば、臨床検査室に提出することができる。ある特定の局面において、対象のB細胞、T細胞、またはT細胞およびB細胞のレベルが、予定された閾値レベルより高いか、または1つもしくは複数の対照試料におけるB細胞、T細胞、もしくはT細胞およびB細胞のレベルより高い場合に、アッセイを実施する臨床検査室は、患者がセマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子の有効量による処置から恩恵を得ることができるか否かについて、医療提供者または医療給付金提供者に助言することができる。
【０１１２】
ある特定の態様において、患者の保険が、セマフォリン-4D（SEMA4D）に特異的に結合する単離された結合分子による処置を保障するか否かの決定のため、イムノアッセイ、他の診断アッセイ、および／または画像法の結果を、医療給付金提供者に提出することができる。
【０１１３】
VIII．薬学的組成物および投与法
抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を調製する方法、およびこれらを必要とする対象に投与する方法は、当業者に周知であるか、または当業者により容易に決定される。抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の投与の経路は、例えば、経口であるか、非経口であるか、吸入によるか、または局所であることができる。本明細書において使用される非経口という用語は、例えば、静脈内投与、動脈内投与、腹腔内投与、筋肉内投与、皮下投与、直腸投与、または膣投与を含む。投与のこれらの形態のすべてが、本発明の範囲内であると明らかに企図されるが、投与のための形態の例は、注射用、特に、静脈内または動脈内の注射または点滴用の溶液であろう。注射に適した薬学的組成物は、緩衝剤（例えば、酢酸緩衝剤、リン酸緩衝剤、またはクエン酸緩衝剤）、界面活性剤（例えばポリソルベート）、任意で安定剤（例えばヒトアルブミン）などを含むことができる。しかしながら、本明細書における教示と適合する他の方法において、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を、有害な細胞集団の部位に直接送達し、それにより患部組織の治療剤への曝露を増加させることができる。
【０１１４】
本明細書において議論される際、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、炎症性障害のインビボ処置のための薬学的有効量で投与することができる。この点において、開示される結合分子を、投与を容易にし、かつ活性剤の安定性を促進するように製剤化できることが、認識されるであろう。ある特定の態様において、本発明に従う薬学的組成物は、生理食塩水、非毒性緩衝剤、保存薬などのような、薬学的に許容される非毒性の滅菌担体を含む。本出願の目的で、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の薬学的有効量は、標的に対する有効な結合を達成するため、および有益性を達成するため、例えば、アテローム性動脈硬化を有する患者においてプラーク形成または増殖を低下、阻害、抑制、および／または遅延させるために十分な量を意味すると見なされる。
【０１１５】
本発明において使用される薬学的組成物は、例えば、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、ヒト血清アルブミンなどの血清タンパク質、リン酸塩などの緩衝物質、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩または電解質、例えば、硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロースベースの物質、ポリエチレングリコール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリラート、ワックス、ポリエチレン-ポリオキシプロピレン-ブロックポリマー、ポリエチレングリコール、および羊毛脂を含む、薬学的に許容される担体を含む。
【０１１６】
非経口投与のための調製物は、滅菌の水性または非水性の溶液、懸濁液、および乳濁液を含む。非水性溶媒の例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、オリーブ油などの植物油、およびオレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステルである。水性担体は、例えば、水、食塩水および緩衝媒体を含むアルコール性／水性溶液、乳濁液、または懸濁液を含む。本発明において、薬学的に許容される担体は、0.01〜0.1 M、例えば0.05 Mのリン酸緩衝液または0.8％の食塩水を含むが、これらに限定されない。他の一般的な非経口賦形剤は、リン酸ナトリウム溶液、リンガーデキストロース、デキストロースおよび塩化ナトリウム、乳酸加リンガー溶液、または固定油を含む。静脈内賦形剤は、リンガーデキストロースに基づくものなどのような、流体および栄養補液、電解質補液を含む。例えば、抗微生物薬、抗酸化薬、キレート剤、および不活性ガスなどのような保存薬および他の添加物もまた、存在してもよい。
【０１１７】
より詳細に、注射可能な使用に適した薬学的組成物は、滅菌の注射可能な溶液または分散液の即時調製のための滅菌水性溶液（水溶性の場合）または分散液および滅菌粉末を含む。そのような場合に、組成物は滅菌でなければならず、かつ、易注射性（easy syringability）が存在する程度に流動性であるべきである。組成物は、製造および貯蔵の条件下で安定であるべきであり、一部の局面においては、細菌および真菌などの微生物の汚染作用に対して保護されるであろう。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、およびこれらの適当な混合物を含有する、溶媒または分散媒であることができる。妥当な流動性を、例えば、レシチンなどのコーティングの使用により、分散液の場合には必要な粒子サイズの維持により、および界面活性剤の使用により、維持することができる。本明細書において開示される治療法における使用に適した製剤は、Remington's Pharmaceutical Sciences (Mack Publishing Co.) 16th ed. (1980)に記載されている。
【０１１８】
微生物の作用の予防は、種々の抗細菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなどにより達成することができる。特定の局面においては、薬学的組成物は、等張剤、例えば、糖、ポリアルコール、例えば、マンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムを組成物中に含みうる。注射可能な組成物の長期の吸収を、組成物中に吸収を遅延させる剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを含むことによりもたらすことができる。
【０１１９】
いずれの場合にも、滅菌の注射可能な溶液を、活性化合物を（例えば、抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体をそれ自体でまたは他の活性剤と組み合わせて）、必要に応じて本明細書において列挙される成分の1つまたは組み合わせを有する適切な溶媒中に必要量組み入れ、その後濾過滅菌することにより、調製することができる。概して、分散液は、活性化合物を、基本的な分散媒および上記で列挙されるもの由来の必要な他の成分を含有する滅菌賦形剤中に組み入れることにより、調製する。滅菌の注射可能な溶液の調製のための滅菌粉末の場合、一部の局面においては、調製法は、真空乾燥および凍結乾燥を含み、活性成分に加えて任意の追加的な望ましい成分の粉末を、事前に濾過滅菌したその溶液から生じる。注射用の調製物を、当技術分野において公知である方法に従って無菌的条件下で、加工処理し、アンプル、袋、瓶、シリンジ、またはバイアルなどの容器中に満たし、密封する。さらに、調製物を、キットの形態でパッケージングして、販売してもよい。そのような製造品は、付随する組成物が、疾患または障害を患うかまたはその素因を有する対象を処置するために有用であることを示す、標識またはパッケージ挿入物を有することができる。
【０１２０】
非経口製剤は、単回ボーラス用量、注入、またはその後維持用量が続く負荷ボーラス用量であることができる。これらの組成物は、特異的な固定された間隔もしくは可変の間隔で、例えば1日に1回、または「必要に応じて」随時、投与することができる。
【０１２１】
本発明において使用されるある特定の薬学的組成物は、例えば、カプセル剤、錠剤、水性懸濁液、または溶液を含む許容される剤形において経口投与することができる。ある特定の薬学的組成物はまた、鼻エアロゾルまたは吸入によっても投与することができる。そのような組成物は、ベンジルアルコールまたは他の適当な保存薬、生物学的利用能を増強するための吸収促進剤、および／または他の従来の可溶化剤もしくは分散剤を使用して、食塩水中の溶液として調製することができる。
【０１２２】
単一剤形を産生するために担体材料と組み合わされるべき抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその断片、変異体、もしくは誘導体の量は、処置される宿主、および投与の特定の様式に応じて変動すると考えられる。組成物は、単一用量として、複数用量として、または確立された期間にわたって注入において投与することができる。投薬レジメンはまた、最適な望ましい応答（例えば、治療応答または防御応答）を提供するように調整することもできる。
【０１２３】
本開示の範囲に沿って、抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を、前述の処置の方法に従って治療効果を生じるのに十分な量で、ヒトまたは他の動物に投与することができる。抗SEMA4D抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体は、公知の技術に従って本発明の抗体を従来の薬学的に許容される担体または希釈剤と組み合わせることにより調製された従来の剤形において、そのようなヒトまたは他の動物に投与することができる。薬学的に許容される担体または希釈剤の形態および特徴は、それと組み合わされるべき活性成分の量、投与の経路、および他の周知の変数により規定されることが、当業者により認識されるであろう。当業者はさらに、本発明の抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の1つまたは複数の種を含むカクテルを使用できることを、認識するであろう。
【０１２４】
「治療的有効用量もしくは量」または「有効量」により、投与された際に、処置されるべき疾患を有する患者の処置に関して正の治療応答、例えば、アテローム性動脈硬化プラークの形成の遅延；新しいアテローム性動脈硬化プラークの形成の増加の低下、遅滞、もしくは停止；アテローム性動脈硬化プラーク中の血管新生の阻害、例えば、抑制、遅滞、予防、停止、もしくは逆行；アテローム性動脈硬化プラークの形態もしくは機能の変化；あるいはアテローム性動脈硬化に関する症状の1つもしくは複数の、ある程度の緩和；罹患率および死亡率の低下；生活の質の改善；またはこのような効果の組み合わせをもたらす、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の量が意図される。
【０１２５】
例えば、アテローム性動脈硬化プラークを低下、阻害、抑制、および／または遅延させるための、本発明の組成物の治療的有効用量は、投与の手段、標的部位、患者の生理学的状態、患者がヒトであるかまたは動物であるか、投与される他の薬剤、および処置が防御的であるかまたは治療的であるかを含む、多くの異なる要因に応じて変動する。ある特定の態様において、患者はヒトであるが、遺伝子導入哺乳動物を含む非ヒト哺乳動物もまた、処置することができる。処置投薬量を、安全性および有効性を最適化するように、当業者に公知である日常的な方法を用いて滴定してもよい。
【０１２６】
投与されるべき少なくとも1つの抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその結合断片、変異体、もしくは誘導体の量は、本発明の開示を考慮して過度の実験を伴わずに、当業者が容易に決定する。投与の様式、および少なくとも1つの抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、その抗原結合断片、変異体、または誘導体のそれぞれの量に影響を及ぼす要因は、疾患の重症度、疾患の履歴、ならびに治療を受ける個体の年齢、身長、体重、健康、および身体状態を含むが、これらに限定されない。同様に、投与されるべき抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその断片、変異体、もしくは誘導体の量は、投与の様式、および、対象がこの剤の単一用量を受けるかまたは複数用量を受けるかに依存するであろう。
【０１２７】
本発明はまた、炎症性障害を有する対象を処置する薬剤であって、少なくとも1つの他の療法で前処置されている対象において使用される薬剤の製造における、抗SEMA4D結合分子、例えば、本発明の抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体の使用も提供する。「前処置される」または「前処置」により、対象が、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を含む薬剤を受ける前に、1つまたは複数の他の治療を受けている（例えば、少なくとも1つの他の炎症性療法で処置されている）ことが意図される。「前処置される」または「前処置」とは、抗SEMA4D結合分子、例えば、本明細書において開示されるモノクローナル抗体VX15/2503、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を含む薬剤での処置の開始の前の2年以内、18か月以内、1年以内、6か月以内、2か月以内、6週間以内、1か月以内、4週間以内、3週間以内、2週間以内、1週間以内、6日以内、5日以内、4日以内、3日以内、2日以内、またはさらに1日以内に少なくとも1つの他の療法で処置されている対象を含む。対象が、1つまたは複数の先の療法での前処置に対して応答者であったことは必要ではない。従って、抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体を含む薬剤を受ける対象は、先の療法での前処置に対して、または前処置が複数の療法を含んだ先の療法の1つもしくは複数に対して、応答していてもよく、または応答できていなくてもよい。
【０１２８】
本発明の実施は、別の方法で指示されない限り、当技術分野の技能内である、細胞生物学、細胞培養、分子生物学、遺伝子導入生物学、微生物学、組み換えDNA、および免疫学の従来の技術を使用するであろう。そのような技術は、文献において完全に説明されている。例えば、Sambrook et al., ed. (1989) Molecular Cloning A Laboratory Manual (2nd ed.; Cold Spring Harbor Laboratory Press)；Sambrook et al., ed. (1992) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (Cold Springs Harbor Laboratory, NY)；D. N. Glover ed., (1985) DNA Cloning, Volumes I and II；Gait, ed. (1984) Oligonucleotide Synthesis；Mullis et al. 米国特許第4,683,195号；Hames and Higgins, eds. (1984) Nucleic Acid Hybridization；Hames and Higgins, eds. (1984) Transcription And Translation；Freshney (1987) Culture Of Animal Cells (Alan R. Liss, Inc.)；Immobilized Cells And Enzymes (IRL Press) (1986)；Perbal (1984) A Practical Guide To Molecular Cloning；論文であるMethods In Enzymology (Academic Press, Inc., N.Y.)；Miller and Calos eds. (1987) Gene Transfer Vectors For Mammalian Cells, (Cold Spring Harbor Laboratory)；Wu et al., eds., Methods In Enzymology, Vols. 154 and 155；Mayer and Walker, eds. (1987) Immunochemical Methods In Cell And Molecular Biology (Academic Press, London)；Weir and Blackwell, eds., (1986) Handbook Of Experimental Immunology, Volumes I-IV；Manipulating the Mouse Embryo, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., (1986)；およびAusubel et al. (1989) Current Protocols in Molecular Biology (John Wiley and Sons, Baltimore, Md.)を参照されたい。
【０１２９】
抗体工学の一般原理は、Borrebaeck, ed. (1995) Antibody Engineering (2nd ed.; Oxford Univ. Press)に示されている。タンパク質工学の一般原理は、Rickwood et al., eds. (1995) Protein Engineering, A Practical Approach (IRL Press at Oxford Univ. Press, Oxford, Eng.)に示されている。抗体および抗体-ハプテン結合の一般原理は、Nisonoff (1984) Molecular Immunology (2nd ed.; Sinauer Associates, Sunderland, Mass.)；およびSteward (1984) Antibodies, Their Structure and Function (Chapman and Hall, New York, N.Y.)に示されている。さらに、当技術分野において公知であり、かつ具体的に記載されていない免疫学における標準的な方法は、概して、Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons, New York；Stites et al., eds. (1994) Basic and Clinical Immunology (8th ed; Appleton & Lange, Norwalk, Conn.)、およびMishell and Shiigi (eds) (1980) Selected Methods in Cellular Immunology (W.H. Freeman and Co., NY)におけるように従う。
【０１３０】
免疫学の一般原理を示す標準的な参照著作物は、Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons, New York；Klein (1982) J., Immunology: The Science of Self-Nonself Discrimination (John Wiley & Sons, NY)；Kennett et al., eds. (1980) Monoclonal Antibodies, Hybridoma: A New Dimension in Biological Analyses (Plenum Press, NY)；Campbell (1984) "Monoclonal Antibody Technology" in Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology, ed. Burden et al., (Elsevire, Amsterdam)；Goldsby et al., eds. (2000) Kuby Immunology (4th ed.; H. Freemand & Co.)；Roitt et al. (2001) Immunology (6th ed.; London: Mosby)；Abbas et al. (2005) Cellular and Molecular Immunology (5th ed.; Elsevier Health Sciences Division)；Kontermann and Dubel (2001) Antibody Engineering (Springer Verlag)；Sambrook and Russell (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Press)；Lewin (2003) Genes VIII (Prentice Hall2003)；Harlow and Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Press)；Dieffenbach and Dveksler (2003) PCR Primer (Cold Spring Harbor Press)を含む。
【０１３１】
上記で引用された参照文献のすべて、および本明細書において引用されるすべての参照文献は、全体として参照により本明細書に組み入れられる。
【０１３２】
以下の実施例は、例証として提供され、限定としては提供されない。
【実施例】
【０１３３】
実施例1：抗SEMA4D結合分子、例えば、抗体、またはその抗原結合断片、変異体、もしくは誘導体、例えば、VX15/2503の、アポE欠損を有する自然発症高脂血症（SHL）マウスにおいてアテローム性動脈硬化プラーク形成を阻害し、血管新生を低下させる能力の試験
実験設計
以下の実験によって、アポE欠損を有するアテローム性動脈硬化易発性自然発症高脂血症（SHL）マウスの抗Sema4D阻止抗体による処置が、プラーク増殖および血管新生を低下させることができるか否かを調査した。
【０１３４】
マウス
C57BL/6, C57BL/6.KOR/Stm Slc-Apoeshlの遺伝的背景にあるアポリポタンパク質E（アポE）欠損を有する雄自然発症高脂血症（SHL）マウスを、Japan SLC, Inc.（Shizuoka, Japan）から入手した。SHLマウスは、通常の食事を給餌され、名城大学薬学部（faculty of Pharmacy, Meijo University）の動物センターに収容された。全ての実験プロトコルが、機関内動物倫理委員会（Animal Ethics Review Committee）によって承認された。
【０１３５】
マウスの抗体処置
雄14週齢SHLマウスを、2つの群にランダムに割り当て、各群に、週に1回、腹腔内注射によって、各マウス0.6mgで、マウス対照モノクローナル抗体（n＝10）（Control Ab 2B8.1E7, Vaccinex, Inc., Rochester, NY）またはマウス抗SEMA4D中和モノクローナル抗体（n＝9）（VX15/67-2, Vaccinex, Inc.）のいずれかを投与した。12週間の処置の後、マウスを屠殺した。
【０１３６】
組織処理
マウス大動脈を、左心尖部へ挿入された21ゲージ注射針を通して、リン酸緩衝生理食塩水（PBS）を使用して3分間灌流し、次いで、4％緩衝パラホルムアルデヒド（pH 7.4）によってさらに3分間灌流した。主な分岐部（腕頭動脈、左総頸動脈、および左鎖骨下動脈）を含む大動脈弓、ならびに胸部大動脈および腹部大動脈を切除し、4％緩衝パラホルムアルデヒド（pH 7.4）で固定した。次いで、スダン親和性脂質沈着物を明らかにするため、大動脈をスダンIV（Sigma-Aldrich, St. Louis, MO）によって染色し、文献（Dougherty A et al., Methods in Molecular Biology, vol. 209: Transgenic Mouse Methods and Protocols. Humana Press Inc., Totowa, NJ, pp.293-309, 2002）に従って、Image J Software（Wayne Rasband, NIH, Bethesda, MD）を使用して、総大動脈面積に対する脂質プラーク面積の百分率を定量化した。
【０１３７】
免疫組織化学および形態計測
麻酔下のマウスから切除された大動脈弓を、4％緩衝パラホルムアルデヒド（pH 7.4）で固定した。全ての血管を、縦にパラフィン包埋し、1μmの連続切片に切断した。内皮細胞を染色するため、切片を抗マウスCD31抗体（BD, Franklin Lakes, NJ）によって免疫標識した。その後、それらを、二次抗体およびペルオキシダーゼ（DakoCytomation, Kyoto, Japan）と結合したデキストランポリマーと共にインキュベートした。血管新生を検出するため、切片を、10μg/mlプロテイナーゼK（Life technologies Japan, Tokyo, Japan）によって室温で15分間前処理し、フルオレセイン（Sigma-Aldrich）と結合したバンディラマメ（Bandeiraea simpilicifolia）由来の7.5mg/mlイソレクチンB4と共に室温で1時間インキュベートした。イソレクチンB4（IB4）は、内皮細胞によって発現された末端αガラクトシル残基に結合する。Image-J形態計測系（Wayne Rasband）を使用して、イソレクチンB4陽性またはCD31陽性の面積をそれぞれのプラーク面積によって割ることによって計算された百分率として、血管新生の程度を決定した。
【０１３８】
統計分析
平均値±S.E.としてデータを表した。スチューデントt検定を使用して、抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスを、対照抗体によって処置されたSHLマウスと比較した。データは、*p＜0.05、**p<0.01で統計的に有意であった。
【０１３９】
抗Sema4D抗体処置はアテローム性動脈硬化プラークの発達を阻害した
アポE欠損を有するSHLマウスにおける抗Sema4D抗体処置のアテローム性動脈硬化発症に対する効果を分析するため、対照抗体によって処置されたSHLマウスおよび抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスの両方から解剖された大動脈に対して、脂質沈着物のスダン親和性染色を行った。図1Aは、抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスの大動脈領域におけるアテローム性動脈硬化プラーク発達の、対照抗体によって処置された群と比較した時の有意な阻害を示す。図1Aに示されるように、アテローム性動脈硬化プラーク面積の定量的測定は、抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスにおける大動脈領域全体に対するスダン親和性面積の平均百分率が、対照抗体に処理された群におけるものより有意に小さかったことを示す（抗Sema4D抗体によって処置されたマウス:4.89±1.11％に対して対照抗体によって処置されたマウス:17.64±3.41％；p=0.002）。これらの所見は、アテローム性動脈硬化の進行期におけるSema4D活性を阻止するための抗SEMA4D抗体の使用が、プラーク増殖を減少させることを証明する。
【０１４０】
抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスのアテローム性動脈硬化プラークにおけるより少ない血管新生
アテローム性動脈硬化プラークにおける新しい血管形成を研究するため、対照抗体によって処置されたSHLプラークおよび抗Sema4D抗体によって処置されたSHLプラークの両方における血管新生を検出するために、イソレクチンB4染色を利用した。結果は、抗Sema4D抗体によって処置されたプラークにおけるイソレクチンB4陽性染色の百分率が、対照抗体によって処置されたSHLプラークより有意に少ないことを明らかにした（抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウス:0.35±0.04％に対して対照抗体によって処置されたSHLマウス:1.70±0.24％；P＜0.001、図1B）。
【０１４１】
内皮細胞のマーカーであるCD31に対する抗体を使用した免疫組織化学も、抗Sema4D抗体によって処置されたSHLプラークにおいて、CD31陽性面積が、対照抗体によって処置されたSHLプラークと比較して有意に低下していることを示し（抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウス:12.62±1.34％に対して対照抗体によって処置されたSHLマウス:19.30±1.22％；P=0.012、図1C）、抗Sema4D抗体によって処置されたSHLマウスプラークにおける乏しい血管新生を強調した。
【０１４２】
これらの所見は、アテローム性動脈硬化の進行期におけるSema4D活性の阻止が、血管新生を減少させる働きをすることを証明する。さらに、それらは、抗SEMA4D抗体が内皮前駆細胞のアテローム性動脈硬化プラークへの遊走を阻止し、それが、次に、プラーク血管新生およびプラーク増殖の両方の減少をもたらすことを証明する。
【０１４３】
本明細書において示される本発明の多くの修飾物および他の態様が、前述の説明および関連する図面において提示される教示の恩恵を受ける、本発明が属する技術分野における当業者には、思い浮かぶであろう。従って、本発明は開示される具体的な態様に限定されるべきではないこと、ならびに、修飾物および他の態様は添付の特許請求の範囲および本明細書において開示される態様の列挙の範囲内に含まれるように意図されることが、理解されるべきである。具体的な用語が本明細書において使用されるが、それらは、総称的意味および説明的意味のみにおいて使用され、限定の目的では使用されない。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【配列表】
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【外国語明細書】
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