(57)【要約】      （修正有）【課題】ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物、及び例えば、抗原特異的免疫応答に関連した疾患及び障害の治療のためのその使用方法の提供。【解決手段】ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びインターロイキン（例えば、ＩＬ−２）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）の投与を含む併用療法。実施形態によっては、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたもしくは組換え核酸であって、該融合タンパク質が、（ａ）腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合するポリペプチド配列を含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、前記単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列。【選択図】図９
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
それらを必要とする対象における自己免疫疾患の治療に使用するための組み合わせ医薬であって、当該医薬は、
（ｉ）ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物、及び
（ｉｉ）有効量のインターロイキン（ＩＬ）−２または有効量のｍＴＯＲ阻害剤
を組み合わせてなり、
前記組成物は、
（ａ）腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合するヒトＴＬ１Ａポリペプチドの細胞外ドメインまたはそのフラグメントを含む第１ポリペプチドと、
（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチドと、
を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２】
請求項１に記載の組み合わせ医薬において、前記第１ポリペプチドが、（ａ）配列番号１２のアミノ酸配列、または（ｂ）配列番号１２と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項３】
請求項１または２に記載の組み合わせ医薬において、前記ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質がホモ多量体であり、当該ホモ多量体が三量体の二量体であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項４】
請求項１または２に記載の組み合わせ医薬において、前記Ｉｇポリペプチドが、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインの１または複数を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項５】
請求項１乃至４の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、前記Ｉｇポリペプチドが、（ａ）配列番号１４のアミノ酸配列、または（ｂ）配列番号１４と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項６】
請求項１乃至５の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、前記ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質が、（ａ）配列番号１６のアミノ酸配列、または（ｂ）配列番号１６と約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項７】
請求項１乃至６の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、当該組み合わせ医薬が、Ｉｇポリペプチドと結合していない場合に、前記第１ポリペプチドと比べて高いインビボ効果によって特徴付けられることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項８】
請求項１乃至７の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の有効量が、対象に投与される場合に、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質との併用で、Ｔｒｅｇ細胞の拡張に対する相乗効果を達成するのに十分な量であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項９】
請求項１乃至８の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の有効量が、対象に単独で投与される場合に、Ｔｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導するか、またはＴｒｅｇ細胞の拡張を誘導できないであろうＩＬ−２の用量であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１０】
請求項９に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、１，０００，０００単位／平方メートル／日未満であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１１】
請求項１０に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、３０，０００〜５００，０００単位／平方メートル／日の範囲内であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１２】
請求項１０に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、３０，０００〜５００，０００単位／平方メートル／日の範囲内であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１３】
請求項１０に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、約３００，０００単位／平方メートル／日であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１４】
請求項１に記載の組み合わせ医薬において、前記ｍＴＯＲ阻害剤がラパマイシンであることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１５】
それらを必要とする対象における総ＣＤ４＋細胞のうちＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の頻度の増加に使用するための組み合わせ医薬であって、当該医薬は、
（ｉ）ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物、及び
（ｉｉ）有効量のインターロイキン（ＩＬ）−２、
を組み合わせてなり、
前記組成物は、
（ａ）腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合するヒトＴＬ１Ａポリペプチドの細胞外ドメインまたはそのフラグメントを含む第１ポリペプチドと、
（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチドと、
を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１６】
請求項１５に記載の組み合わせ医薬において、前記ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質が、（ａ）配列番号１６のアミノ酸配列、または（ｂ）配列番号１６と約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１７】
請求項１５または１６に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２が、対象に単独で投与される場合に、Ｔｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導するか、またはＴｒｅｇ細胞の拡張を誘導できないであろう用量で投与されることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１８】
請求項１５乃至１７の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の有効量が、１，０００，０００単位／平方メートル／日未満であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項１９】
請求項１８に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２０】
請求項１８に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、３０，０００〜５００，０００単位／平方メートル／日の範囲内であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２１】
請求項１８に記載の組み合わせ医薬において、前記ＩＬ−２の用量が、約３００，０００単位／平方メートル／日であることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２２】
それを必要とする対象におけるエフェクターＴ細胞の頻度及び／または拡張の減少に使用するための組み合わせ医薬であって、当該医薬は、
（ｉ）ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物、及び
（ｉｉ）有効量のｍＴＯＲ阻害剤
を組み合わせてなり、
前記組成物は、
（ａ）腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合するヒトＴＬ１Ａポリペプチドの細胞外ドメインまたはそのフラグメントを含む第１ポリペプチドと、
（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチドと、
を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２３】
請求項２２に記載の組み合わせ医薬において、前記ｍＴＯＲ阻害剤がラパマイシンであることを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２４】
請求項２２に記載の組み合わせ医薬において、前記Ｉｇポリペプチドが、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインを含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【請求項２５】
請求項２２乃至２４の何れか１項に記載の組み合わせ医薬において、前記ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質が、（ａ）配列番号１６のアミノ酸配列、または（ｂ）配列番号１６と約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことを特徴とする組み合わせ医薬。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本開示は、分子生物学及び免疫学の分野に関する。
【０００２】
連邦政府によって支援された研究または開発に関する陳述
本願に記載の研究は、米国国立衛生研究所からの助成金（ＮＩＨ  ５Ｐ０１ＣＡ１０９０９４）によって一部指示された。従って、政府は本発明にある権利を有する。
【０００３】
関連出願
本願は、２０１３年１月９日に出願された米国仮出願第６１／７５０，６７２号；２０１３年１月１７に出願された米国仮出願第６１／７５３，６３４号；２０１３年７月２日に出願された米国仮出願第６１／８４２，１２７号；及び２０１３年７月８日に出願された米国仮出願第６１／８４３，５５８号の優先権の利益を主張し、その各々の全体の内容が参照によって本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００４】
腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーである、メンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）のインビトロでの、その天然リガンドＴＮＦＳＦ１５（ＴＬ１Ａとしても知られている）による刺激は、マウスにおけるＴｒｅｇの選択的増殖、及びアレルギー性肺炎症、異種心臓移植及びＨＳＶ−１介在眼炎症における免疫病理学の抑制を促進する。しかし、ヒトでのＴｒｅｇ療法の解読の進行は遅かったので、エクスビボ細胞培養法にかなり限定されていた。更に、かかる療法は安全でなければならず、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）にかかり易さ等の危険な副作用を避けなければならない。あるＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストによる長期の刺激は、喘息、炎症性腸疾患及び関節炎のマウスモデルでの増加した炎症を含む、インビボでの有害な副作用を引き起こすことが知られていた。従って、ヒトでのＴｒｅｇ療法に安全で効果的な改善された治療法が必要とされる。
【発明の概要】
【０００５】
上で議論したように、自己免疫疾患及び障害を治療し、異種固体臓器移植に対する寛容を確立し、及び特にヒト患者での他の抗原特異的免疫応答を調節するための、安全かつ効果的な治療法が当該分野で必要とされる。本開示はこれら及び他の関連する利益を提供する。
【０００６】
実施形態によっては、本明細書では、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列であって、該融合タンパク質が（ａ）腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合するポリペプチド配列を含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列を提供する。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、ヒトＴＬ１Ａポリペプチドの細胞外ドメインまたはそのフラグメントを含み、該フラグメントはＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合する。実施形態によっては、該核酸は、融合タンパク質ホモ多量体を形成することができる単量体融合タンパク質をコードする。実施形態によっては、該ホモ多量体は三量体の二量体である。実施形態によっては、該核酸は、それを必要としているヒトに投与した時に、ヒトでのナイーブＣＤ４  Ｔ細胞の頻度を減少させるポリペプチドをコードする。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧポリペプチド（例えば、ＩｇＧ１）のヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインの１またはそれ以上を含む。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインの２またはそれ以上を含む。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインを含む。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、配列番号１４のポリペプチド配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９０％の配列同一性を有するポリペプチド配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９５％の配列同一性を有するポリペプチド配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９７％、９８％または９９％の配列同一性を有するポリペプチド配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２の配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２の配列からなる。実施形態によっては、該核酸は、配列番号１２及び配列番号１４を含む融合タンパク質をコードする。実施形態によっては、該核酸は、配列番号１６を含む融合タンパク質をコードする。実施形態によっては、該核酸は、配列番号１６からなる融合タンパク質をコードする。実施形態によっては、融合タンパク質をコードする配列を含む核酸は、シグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列を更に含む。実施形態によっては、該核酸は、該融合タンパク質に作動可能に連結された分泌性及び／またはシグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列を更に含む。実施形態によっては、該融合タンパク質は、融合タンパク質ホモ多量体（例えば、三量体の二量体）として宿主細胞から分泌される。
【０００７】
また、本明細書では、上記の核酸（例えば、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列）を含むベクターを提供する。実施形態によっては、該核酸は、プロモーターに作動可能に連結される。実施形態によっては、ベクターは発現ベクターである。実施形態によっては、ベクターは、プラスミドベクターである。実施形態によっては、本明細書では、上記ベクター（例えば、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列、を含むベクター）を含む単離されたまたは組換え宿主細胞を提供する。実施形態によっては、本明細書では、上記核酸（例えば、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列）のいずれかで形質転換された単離されたまたは組換え宿主細胞であって、該融合タンパク質を発現することができる宿主細胞も提供する。実施形態によっては、宿主細胞は真核細胞である。
【０００８】
また、ポリペプチドの製造方法であって、以下：（ａ）上記核酸（例えば、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、単離されたもしくは組換え核酸、またはその相補的ポリヌクレオチド配列）を細胞集団に導入し、ここで、該核酸は該核酸によってコードされたポリペプチドを製造するために有効な制御配列に作動可能に連結され；そして、（ｂ）該ペプチドを製造するために培養培地中で該細胞を培養すること、を含む、製造方法を提供する。実施形態によっては、該方法は、（ｃ）該細胞または培養培地から該ポリペプチドを単離することを更に含む。実施形態によっては、該ポリペプチドは融合タンパク質である。実施形態によっては、該核酸は、該融合タンパク質に作動可能に連結された分泌性またはシグナルペプチドをコードする第３ヌクレオチド配列を更に含む。実施形態によっては、該融合タンパク質は、融合タンパク質ホモ多量体（例えば、三量体の二量体）として宿主細胞から分泌される。実施形態によっては、該融合タンパク質ホモ多量体は、培養培地から回収される。実施形態によっては、該融合タンパク質は、培養培地、宿主細胞または宿主細胞ペリプラスムから回収される。実施形態によっては、該融合タンパク質は、第１融合タンパク質のシステイン残基と１またはそれ以上の追加の融合タンパク質の少なくとも１つのシステイン残基との間の１またはそれ以上の共有ジスルフィド結合を含む。
【０００９】
また、本明細書では、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、組成物を提供する。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、ヒトＴＬ１Ａポリペプチドの細胞外ドメインまたはそのフラグメントを含み、該フラグメントはＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合することができる。実施形態によっては、該組成物は、それを必要としているヒトに投与される時に、ヒトでのナイーブＣＤ４  Ｔ細胞の頻度を減少させる。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９０％の配列同一性を有するポリペプチド配列を含む。実施形態によっては、実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９５％の配列同一性を有する配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９８％の配列同一性を有する配列を含む。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有する配列を含む。実施形態によっては、該融合タンパク質はホモ多量体である。実施形態によっては、該融合タンパク質は三量体の二量体である。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインの１またはそれ以上を含む。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインの２またはそれ以上を含む。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、ＩｇＧポリペプチドのヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及びＣＨ３ドメインを含む。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、配列番号１４と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、配列番号１４と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、配列番号１４と少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、Ｉｇポリペプチドは、配列番号１４と少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、該融合タンパク質は、配列番号１６と少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、該融合タンパク質は、配列番号１６と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、該融合タンパク質は、配列番号１６と少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、該融合タンパク質は、配列番号１６と少なくとも９９％または１００％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。実施形態によっては、該組成物は、Ｉｇポリペプチドと結合されない時に、第１ポリペプチドと比べて高いインビボ効果によって特徴付けられる。
【００１０】
また、本明細書では、抗原特異的免疫応答の調節を必要としているヒト患者において、抗原特異的免疫応答を調節する方法であって、上記の組成物（例えば、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、組成物）を該患者に投与することを含み、該組成物が前記融合タンパク質の治療上有効量を含む量で投与される、方法を提供する。実施形態によっては、それを必要としている患者は、固体臓器または幹細胞移植のための調製物において誘導療法を受けているまたは受けそうな患者、固体臓器または幹細胞移植レシピエントであって、維持療法を受けているまたは受けそうな患者、固体臓器または幹細胞移植レシピエントである患者、アレルギー患者、ワクチンを受けているまたは受けそうな患者、及び免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＣＴＬＡ−４またはＰＤ−１阻害剤）で治療されることになるまたはされそうな患者からなる群より選ばれる患者である。実施形態によっては、前記融合タンパク質の治療上の有効量は、０．１〜１０ミリグラム／キログラム体重／日（ｍｇ／ｋｇ／日）の範囲にある。実施形態によっては、前記融合タンパク質の治療上の有効量は、０．５〜５ｍｇ／ｋｇ／日の範囲にある。実施形態によっては、前記融合タンパク質の治療上の有効量は、１〜２ｍｇ／ｋｇ／日の範囲にある。実施形態によっては、前記組成物は、少なくとも２０％で該患者の抗原特異的免疫応答を誘導する。実施形態によっては、本方法は、該患者への該組成物の複数回投与を含む。実施形態によっては、上記組成物は、ＩＬ−２の有効量を更に含む。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、対象に単独で投与される場合にＴｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導する量である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲の用量である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３００，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、上記組成物のいずれかは、ｍＴＯＲ阻害剤の有効量を更に含む。実施形態によっては、ｍＴＯＲ阻害剤は、ラパマイシン（シロリムス）、ＣＩ−７７９、エベロリムスＡＢＴ−５７８、タクロリムス、ＡＰ−２３６７５、ＢＥＺ−２３５、ＯＳＩ−０２７、ＱＬＴ−０４４７、ＡＢＩ−００９、ＢＣ−２１０、サリラシブ、ＴＡＦＡ−９３、デフォロリムス（ＡＰ−２３５７３）、テムシロリムス、２−（４−アミノ−１−イソプロピル−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３−イル）−１Ｈ−インドール−５−オ−ル（ＰＰ２４２）、ＡＰ−２３８４１、３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−４０−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−ラパマイシン、４０−［３−ヒドロキシ−２−（ヒドロキシメチル）−２−メチルプロパノエート］−ラパマイシン（ＣＣＩ７７９）、４０−エピ−（テトラゾリル）−ラパマイシン（ＡＢＴ５７８）、バイオリムス−７、バイオリムス−９、及びＡＰ２３４６４からなる群より選ばれる。
【００１１】
また、本明細書では、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、あるいは該疾患または障害の１またはそれ以上の症状を治療する必要のあるヒト患者において、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、あるいは該疾患または障害の１またはそれ以上の症状を治療する方法であって、上記組成物（例えば、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、組成物）を該患者に投与することを含み、該組成物が該融合タンパク質の治療上有効量を含む量で投与される、方法を提供する。実施形態によっては、融合タンパク質の治療上有効量は、０．１〜１０ｍｇ／ｋｇ／日の範囲にある。実施形態によっては、融合タンパク質の治療上有効量は、０．５〜５ｍｇ／ｋｇ／日の範囲にある。実施形態によっては、融合タンパク質の治療上有効量は、１〜２ｍｇ／ｋｇ／日の範囲にある。実施形態によっては、該疾患または障害は、自己免疫疾患または障害、移植拒絶、移植片対宿主疾患、炎症、喘息、アレルギー、及び慢性感染症からなる群より選ばれる。実施形態によっては、該疾患または障害は喘息である。実施形態によっては、本方法は、該患者への該組成物の複数回投与を含む。抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療する方法の実施形態によっては、該組成物は、少なくとも２０％患者の抗原特異的免疫応答を減少させる。実施形態によっては、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療する方法は、ＩＬ−２の有効量を該患者に投与することを更に含む。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、患者に単独で投与される場合にＴｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導するかまたは誘導できないであろう量である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３００，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療する方法は、ｍＴＯＲ阻害剤の有効量を該患者に投与することを更に含む。実施形態によっては、ｍＴＯＲ阻害剤は、ラパマイシン（シロリムス）、ＣＩ−７７９、エベロリムスＡＢＴ−５７８、タクロリムス、ＡＰ−２３６７５、ＢＥＺ−２３５、ＯＳＩ−０２７、ＱＬＴ−０４４７、ＡＢＩ−００９、ＢＣ−２１０、サリラシブ、ＴＡＦＡ−９３、デフォロリムス（ＡＰ−２３５７３）、テムシロリムス、２−（４−アミノ−１−イソプロピル−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３−イル）−１Ｈ−インドール−５−オ−ル（ＰＰ２４２）、ＡＰ−２３８４１、３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−４０−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−ラパマイシン、４０−［３−ヒドロキシ−２−（ヒドロキシメチル）−２−メチルプロパノエート］−ラパマイシン（ＣＣＩ７７９）、４０−エピ−（テトラゾリル）−ラパマイシン（ＡＢＴ５７８）、バイオリムス−７、バイオリムス−９、及びＡＰ２３４６４からなる群より選ばれる。
【００１２】
また、本明細書は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの投与を含む治療に関連した有害事象の重度及び／または頻度を減少させる方法であって、生理学的に許容される担体中の上記組成物（例えば、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチド、及び／またはアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、及び／またはＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト、及び／またはインターロイキンまたはそのアナログ（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５）、及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）を含む、組成物）を、それを必要としているヒト患者に投与することを含む、方法を提供する。実施形態によっては、該有害事象は、炎症性腸疾患の１またはそれ以上の症状の発症である。実施形態によっては、該有害事象は炎症性腸疾患の発症である。実施形態によっては、該有害事象は、体重減少、発疹、下痢、筋肉痛、減少血小板数、上昇肝臓酵素レベル、及び死からなる群より選ばれる。実施形態によっては、該組成物は、該投与後に、該患者にＴｒｅｇ細胞の増殖を顕著に増加させる量で投与される。実施形態によっては、該組成物は、該投与後に、該患者に少なくとも２倍Ｔｒｅｇ細胞の増殖を増加させる量で投与される。実施形態によっては、本方法は、該患者への該組成物の複数回投与を含む。実施形態によっては、該疾患または障害は自己免疫疾患である。実施形態によっては、自己免疫疾患は、炎症性腸疾患及びリウマチ様関節炎からなる群より選ばれる。実施形態によっては、該組成物は医薬組成物として製剤化される。実施形態によっては、有害事象の重度及び／または頻度を減少させる上記方法は、ＩＬ−２の有効量を該患者に投与することを更にまた含む。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、患者に単独で投与される場合にＴｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導するかまたは誘導できないであろう量である。有害事象の重度及び／または頻度を減少させる上記方法の実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３００，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、有害事象の重度及び／または頻度を減少させる上記方法は、ｍＴＯＲ阻害剤の有効量を該患者に投与することを更にまた含む。実施形態によっては、ｍＴＯＲ阻害剤は、ラパマイシン（シロリムス）、ＣＩ−７７９、エベロリムスＡＢＴ−５７８、タクロリムス、ＡＰ−２３６７５、ＢＥＺ−２３５、ＯＳＩ−０２７、ＱＬＴ−０４４７、ＡＢＩ−００９、ＢＣ−２１０、サリラシブ、ＴＡＦＡ−９３、デフォロリムス（ＡＰ−２３５７３）、テムシロリムス、２−（４−アミノ−１−イソプロピル−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３−イル）−１Ｈ−インドール−５−オ−ル（ＰＰ２４２）、ＡＰ−２３８４１、３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−４０−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−ラパマイシン、４０−［３−ヒドロキシ−２−（ヒドロキシメチル）−２−メチルプロパノエート］−ラパマイシン（ＣＣＩ７７９）、４０−エピ−（テトラゾリル）−ラパマイシン（ＡＢＴ５７８）、バイオリムス−７、バイオリムス−９、及びＡＰ２３４６４からなる群より選ばれる。
【００１３】
また、本明細書では、（ａ）上記組成物（例えば、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチド、及び／またはアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、及び／またはＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト、及び／またはインターロイキンまたはそのアナログ（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５）、及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）を含む、組成物）のいずれか；及び（ｂ）薬学的に許容される担体、を含む、医薬組成物を開示する。実施形態によっては、該医薬組成物は、ＩＬ−２の有効量を更に含む。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、単独で患者に投与される場合に、Ｔｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導し、または該拡張を誘導できないであろう量である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３００，０００単位／平方メートル／日である。
【００１４】
また、本明細書では、抗原特異的免疫応答を調節し、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、あるいは該疾患または障害の１またはそれ以上の症状を治療する必要のあるヒト患者において、抗原特異的免疫応答を調節し、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、あるいは該疾患または障害の１またはそれ以上の症状を治療する方法であって、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びインターロイキン２の有効量、及び／またはｍＴＯＲ阻害剤を含む併用療法を患者に投与することを含む方法を提供する。本方法の実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスは、本明細書で上記した、小分子、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、またはＴＬ１Ａ融合タンパク質である。実施形態によっては、ＴＬ１Ａ融合タンパク質は、０．１〜１０ｍｇ／ｋｇ／日、０．５〜５ｍｇ／ｋｇ／日、または１〜２ｍｇ／ｋｇ／日の範囲の量で投与される。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、それが単独で患者に投与される場合に、Ｔｒｅｇ細胞の至適拡張を誘導し、または該拡張を誘導できないであろう量である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３０，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、３００，０００単位／平方メートル／日である。実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びインターロイキン２の有効量は、同日に一緒にまたは別箇に投与される。実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びインターロイキン２の有効量は、異なった日に投与される。本発明の実施形態によっては、併用療法は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びｍＴＯＲ阻害剤の有効量を含む。実施形態によっては、ｍＴＯＲ阻害剤は、７５〜３００マイクログラム／ｋｇ体重／日の範囲の量で投与される。実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びｍＴＯＲ阻害剤は、同日に一緒にまたは別箇に投与される。実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びｍＴＯＲ阻害剤は、異なった日に投与される。併用療法を含む上記方法の実施形態によっては、疾患または障害は、自己免疫疾患または障害、移植拒絶、移植片対宿主疾患、炎症、喘息、アレルギー及び慢性感染からなる群より選ばれる。これらの方法の実施形態によっては、ｍＴＯＲ阻害剤は、ラパマイシン（シロリムス）、ＣＩ−７７９、エベロリムスＡＢＴ−５７８、タクロリムス、ＡＰ−２３６７５、ＢＥＺ−２３５、ＯＳＩ−０２７、ＱＬＴ−０４４７、ＡＢＩ−００９、ＢＣ−２１０、サリラシブ、ＴＡＦＡ−９３、デフォロリムス（ＡＰ−２３５７３）、テムシロリムス、２−（４−アミノ−１−イソプロピル−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３−イル）−１Ｈ−インドール−５−オ−ル（ＰＰ２４２）、ＡＰ−２３８４１、３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−４０−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−ラパマイシン、４０−［３−ヒドロキシ−２−（ヒドロキシメチル）−２−メチルプロパノエート］−ラパマイシン（ＣＣＩ７７９）、４０−エピ−（テトラゾリル）−ラパマイシン（ＡＢＴ５７８）、バイオリムス−７、バイオリムス−９、及びＡＰ２３４６４からなる群より選ばれる。
【００１５】
本開示の１またはそれ以上の実施形態の詳細は、以下の添付図面及び説明に記載される。本発明の他の特徴、目的及び利点は、説明及び図面、及び特許請求の範囲から明らかであろう。
【００１６】
他に定義しない限り、本明細書で使用される全ての技術及び科学的用語は、本開示が関する当業者によって共通して理解されると同じ意味を有する。コンフリクトの点から、提示を含む本書類は調節することになる。
【００１７】
本明細書で言う全ての刊行物、特許出願、特許及び他の参考文献は、各々、その全体が参考によって組み込まれる。本明細書に開示された資料、方法及び実施例は、例示的なものであり、限定することを意図していない。
【図面の簡単な説明】
【００１８】
【図１】図１は、ネズミ養子移入モデルの図解である。
【図２】図２は、腸間膜リンパ節（ｍＬＮ）（上のグラフ）と脾臓細胞（下のグラフ）における総ＣＤ４＋細胞のうちＦｏｘＰ３＋Ｋｉ６７＋の割合（％）として表される、ＯＴ−ＩＩ  ｐＴｒｅｇ細胞とＦｏｘＰ３−ＲＦＰ陽性ｎＴｒｅｇ細胞との割合を定量化する棒グラフである。データは、群当たり≧３匹のマウスでの平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示し；＊はｐ＜０．０５の統計的有意性を示す。
【図３】図３は、ＦｏｘＰ３＋Ｋｉ６７＋ｍＬＮ  ｐＴｒｅｇの割合を定量化する折れ線グラフ（上パネル）、及び、飲料水で１％オバアルブミン（ｏｖａ）を継続的に投与されたマウス群中の総ＣＤ４＋細胞のうちのｍＬＮ  ｔＴｒｅｇ細胞（左パネル）、または指示した日数（０〜２０）間、ｏｖａを「ウオッシュアウト」するために１％ｏｖａ含有飲料水を通常の水と置き換えたマウス群中の総ＣＤ４＋細胞のうちのｍＬＮ  ｔＴｒｅｇ細胞（右パネル）の割合を定量化する折れ線グラフを示す。各グラフにおけるマウスの１群は、アイソトープコントロールＩｇＧを投与されたマウスに対応し、他の群は４Ｃ１２抗体を投与されたマウスに対応する。データは、０及び１０日の時点での≧３マウス／群での平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示し、２０日時点でのＮ≧４マウス／群での２つの独立実験から、＊はｐ＜０．０５の統計的有意性を示す。
【図４】図４は、脾臓のＦｏｘＰ３＋Ｋｉ６７＋ｐＴｒｅｇの割合を定量化する折れ線グラフ（上パネル）、及び、飲料水で１％オバアルブミン（ｏｖａ）を継続的に投与されたマウス群中の総ＣＤ４＋細胞のうちの脾臓のｔＴｒｅｇ細胞（左パネル）、または指示した日数（０〜２０）間、ｏｖａを「ウオッシュアウト」するために１％ｏｖａ含有飲料水を通常の水と置き換えたマウス群中の総ＣＤ４＋細胞のうちの脾臓のｔＴｒｅｇ細胞（右パネル）の割合を定量化する折れ線グラフを示す。各グラフにおけるマウスの１群は、アイソトープコントロールＩｇＧを投与されたマウスに対応し、他の群は４Ｃ１２抗体を投与されたマウスに対応する。データは、０及び１０日の時点での≧３マウス／群での平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示し、２０日時点でのＮ≧４マウス／群での２つの独立実験から、＊はｐ＜０．０５の統計的有意性を示す。
【図５】図５は、非制限及び制限条件下での精製されたｈＴＬ１Ａのウェスタンブロットを示す。分子量は写真の左に示す。
【図６】図６は、所定の用量（（ｎｇ／ｍｌ）でネズミ（ｍｓ）またはヒト（ｈｕ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質で処置した、ヒト（ｈ）ＴＮＦＲＳＦ２形質導入ｐ８１５細胞の（ローダミン１１０総数に基づく）機能性活性を定量化する折れ線グラフを示す
【図７】図７〜９は、ヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質（１００μｇ、腹腔内（ｉ．ｐ．））またはＩｇＧコントロール（ｉ．ｐ．）で処置した５日後のＮＳＧ−ｈｕマウスの、脾臓（図７）、ｍＬＮ（図８）、及び小腸（図９）での、生着％（ヒトＣＤ４５＋細胞／総生リンパ系細胞）（左上グラフ）、ＣＤ４＋細胞の頻度（％）（右上グラフ）、ＣＤ８＋細胞の頻度（％）（左下グラフ）及びヒトＴｒｅｇ細胞の頻度（総ＣＤ２５＋ＣＤ１２７−ＣＤ４＋細胞のうちの％ＦｏｘＰ３＋）（右下グラフ）を定量化する棒グラフを示す。各群において、薄いグレーの棒はＫｉ６７−細胞の割合（％）を定量化し、濃いグレーの棒はＫｉ６７＋細胞の割合（％）を定量化する。データは、３つの独立実験からの８匹／群の総数での平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示す。
【図８】図７〜９は、ヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質（１００μｇ、腹腔内（ｉ．ｐ．））またはＩｇＧコントロール（ｉ．ｐ．）で処置した５日後のＮＳＧ−ｈｕマウスの、脾臓（図７）、ｍＬＮ（図８）、及び小腸（図９）での、生着％（ヒトＣＤ４５＋細胞／総生リンパ系細胞）（左上グラフ）、ＣＤ４＋細胞の頻度（％）（右上グラフ）、ＣＤ８＋細胞の頻度（％）（左下グラフ）及びヒトＴｒｅｇ細胞の頻度（総ＣＤ２５＋ＣＤ１２７−ＣＤ４＋細胞のうちの％ＦｏｘＰ３＋）（右下グラフ）を定量化する棒グラフを示す。各群において、薄いグレーの棒はＫｉ６７−細胞の割合（％）を定量化し、濃いグレーの棒はＫｉ６７＋細胞の割合（％）を定量化する。データは、３つの独立実験からの８匹／群の総数での平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示す。
【図９】図７〜９は、ヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質（１００μｇ、腹腔内（ｉ．ｐ．））またはＩｇＧコントロール（ｉ．ｐ．）で処置した５日後のＮＳＧ−ｈｕマウスの、脾臓（図７）、ｍＬＮ（図８）、及び小腸（図９）での、生着％（ヒトＣＤ４５＋細胞／総生リンパ系細胞）（左上グラフ）、ＣＤ４＋細胞の頻度（％）（右上グラフ）、ＣＤ８＋細胞の頻度（％）（左下グラフ）及びヒトＴｒｅｇ細胞の頻度（総ＣＤ２５＋ＣＤ１２７−ＣＤ４＋細胞のうちの％ＦｏｘＰ３＋）（右下グラフ）を定量化する棒グラフを示す。各群において、薄いグレーの棒はＫｉ６７−細胞の割合（％）を定量化し、濃いグレーの棒はＫｉ６７＋細胞の割合（％）を定量化する。データは、３つの独立実験からの８匹／群の総数での平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示す。
【図１０】図１０は、０日での所定の用量（ｍｇ／ｋｇ）でアカゲザル（ｒｍ）またはヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を投与されたアカゲザルの経時（実験日）での体重（ｋｇ）を定量化する折れ線グラフを示す。
【図１１】図１１は、０日に所定の用量で個々のアカゲザルにｒｈＴＬ１Ａ−ＩｇまたはｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を投与した後に、所定の試験日での末梢血ＣＢＣ分析によって決定された、白血球の絶対数（１０３／μｌ）（上パネル）及び総多形核（ＰＭＮ）細胞（１０３／μｌ）（下パネル）を定量化する折れ線グラフを示す。
【図１２】図１２は、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質で処理したアカゲザルの血清中の経時での、該融合タンパク質の平均濃度（μｇ／ｍｌ）を定量化する折れ線グラフを示す。
【図１３】図１３は、アカゲザル（ｒｍ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質またはヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質の所定の濃度で処置後０、２及び４日後に、個々のアカゲザルにおけるＩＦＮ−γ（ｎｇ／ｍｌ）の血清濃度（上パネル）及びＴＧＦβ（ｎｇ／ｍｌ）の血清濃度（下パネル）を定量化する棒グラフである。データは、０．５ｍｇ／ｋｇ  ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇを投与された２動物、１．５ｍｇ／ｋｇ  ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇを投与された４動物、及び１．５ｍｇ／ｋｇ  ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇを投与された２動物での平均±Ｓ．Ｅ．Ｍ．を示す。
【図１４】図１４〜１５は、０日に所定の用量のｒｈＴＬ１Ａ−ＩｇまたはｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質で処置された後の所定の日数でのアカゲザルにおける、（総ＣＤ４＋細胞のうちの）ＦｏｘＰ３  Ｔｒｅｇ細胞の頻度（％）（図１４）、及び（総ＣＤ４＋ＣＣＲ７＋細胞のうちの）ＣＤ２８＋ＣＤ９５−ナイーブＣＤ４  Ｔ細胞の頻度（％）（図１５）を定量化する折れ線グラフを示す。
【図１５】図１４〜１５は、０日に所定の用量のｒｈＴＬ１Ａ−ＩｇまたはｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質で処置された後の所定の日数でのアカゲザルにおける、（総ＣＤ４＋細胞のうちの）ＦｏｘＰ３  Ｔｒｅｇ細胞の頻度（％）（図１４）、及び（総ＣＤ４＋ＣＣＲ７＋細胞のうちの）ＣＤ２８＋ＣＤ９５−ナイーブＣＤ４  Ｔ細胞の頻度（％）（図１５）を定量化する折れ線グラフを示す。
【図１６】図１６は、Ｙ軸の総ＣＤ４＋細胞（細胞はＣＤ３＋細胞上で予プレゲートした）のうちのＦｏｘＰ３＋ＣＤ４＋Ｔｒｅｇ細胞の頻度（％）  対  Ｘ軸の所定の治療レジメ（低用量ＩＬ−２（３００，０００単位）；ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋極低用量ＩＬ−２（３０，０００単位）；ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋低用量ＩＬ−２（３００，０００単位）；コントロール（ＩｇＧ）；またはＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質）での治療後の日数を定量化する折れ線グラフである。データは３匹のマウス／群を用いる平均±ＳＥＭとして示される。テューキー事後検定による片側ＡＮＯＶＡを用いる５日目分析は、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ対コントロール（ｐ＜０．０５）、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ＋極低用量ＩＬ−２対コントロール（ｐ＜０．０１）、及びＴＬ１Ａ−Ｉｇ＋低用量ＩＬ−２対コントロール（ｐ＜０．００１）について有意差を証明した。
【図１７】図１７は、Ｙ軸の総ＣＤ４＋細胞（細胞はＣＤ３＋細胞上でプレゲートした）のうちのＦｏｘＰ３＋ＣＤ４＋Ｔｒｅｇ細胞の頻度（％）  対  Ｘ軸の所定の治療レジメ（低用量ＩＬ−２（３００，０００単位）；４Ｃ１２抗体＋低用量ＩＬ−２（３００，０００単位）；４Ｃ１２抗体；またはコントロール（ＩｇＧ））での治療後の日数を定量化する折れ線グラフである。データは５匹のマウス／群を用いる平均±ＳＥＭとして示される。テューキー事後検定による片側ＡＮＯＶＡを用いる５日目分析は、４Ｃ１２対コントロール（ｐ＜０．０５）、及び４Ｃ１２＋低用量ＩＬ−２対コントロール（ｐ＜０．００１）について有意差を証明した。
【図１８】図１８〜２０は、グラフで示したよう処置した群（Ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋ラパマイシン；ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋ラパマイシン；ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ラパマイシン；ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質；またはｏｖａ／ａｌｕｍ）由来のマウスの末梢血における、総ＣＤ８＋Ｔ細胞のうちの養子的に移入されたＯＴ−Ｉ（ＣＤ８＋オバアルブミン（ｏｖａ）−特異的）Ｔ細胞の頻度（割合）（図１８）、または総ＣＤ４＋Ｔ細胞のうちの養子的に移入されたＯＴ−ＩＩ（ＣＤ４＋ｏｖａ特異的）Ｔ細胞の頻度（割合）（図１９）、または総ＣＤ４＋Ｔ細胞のうちのＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇ細胞の頻度（割合）（図２０）を定量化する折れ線グラフを示す。データは、２つの独立実験の総数からの６匹のマウス／群を用いる平均±ＳＥＭとして示す。
【図１９】図１８〜２０は、グラフで示したよう処置した群（Ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋ラパマイシン；ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋ラパマイシン；ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ラパマイシン；ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質；またはｏｖａ／ａｌｕｍ）由来のマウスの末梢血における、総ＣＤ８＋Ｔ細胞のうちの養子的に移入されたＯＴ−Ｉ（ＣＤ８＋オバアルブミン（ｏｖａ）−特異的）Ｔ細胞の頻度（割合）（図１８）、または総ＣＤ４＋Ｔ細胞のうちの養子的に移入されたＯＴ−ＩＩ（ＣＤ４＋ｏｖａ特異的）Ｔ細胞の頻度（割合）（図１９）、または総ＣＤ４＋Ｔ細胞のうちのＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇ細胞の頻度（割合）（図２０）を定量化する折れ線グラフを示す。データは、２つの独立実験の総数からの６匹のマウス／群を用いる平均±ＳＥＭとして示す。
【図２０】図１８〜２０は、グラフで示したよう処置した群（Ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋ラパマイシン；ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質＋ラパマイシン；ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ラパマイシン；ｏｖａ／ａｌｕｍ＋ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質；またはｏｖａ／ａｌｕｍ）由来のマウスの末梢血における、総ＣＤ８＋Ｔ細胞のうちの養子的に移入されたＯＴ−Ｉ（ＣＤ８＋オバアルブミン（ｏｖａ）−特異的）Ｔ細胞の頻度（割合）（図１８）、または総ＣＤ４＋Ｔ細胞のうちの養子的に移入されたＯＴ−ＩＩ（ＣＤ４＋ｏｖａ特異的）Ｔ細胞の頻度（割合）（図１９）、または総ＣＤ４＋Ｔ細胞のうちのＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇ細胞の頻度（割合）（図２０）を定量化する折れ線グラフを示す。データは、２つの独立実験の総数からの６匹のマウス／群を用いる平均±ＳＥＭとして示す。
【発明を実施するための形態】
【００１９】
実施形態によっては、本開示は、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたまたは組換え核酸を提供する。融合タンパク質は、（ａ）腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合するポリペプチド配列を含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチド；またはそれらの相補的ポリヌクレオチド配列を含み得る。
【００２０】
実施形態によっては、本明細書では、融合タンパク質及び該融合タンパク質をコードする核酸であって、該融合タンパク質がヒトまたはアカゲザルのＴＬ１Ａポリペプチドの機能的に活性なフラグメントを含む融合タンパク質が開示される。機能的に活性なフラグメントは、例えば、ＴＬ１Ａ（例えば、ヒトまたはアカゲザルＴＬ１Ａ）細胞外ドメイン、またはＴＬ１Ａ受容体すなわちＴＮＦＲＳＦ２５への特異的な結合を維持するそれらの任意のフラグメントでよい。実施形態によっては、ＴＬ１Ａの機能的に活性なフラグメントは、ヒトＴＬ１Ａ細胞外ドメイン由来のアミノ酸６８〜２５２を含む。該融合タンパク質はまた、Ｉｇ分子の１またはそれ以上、例えばＩｇ定常領域の１またはそれ以上のドメイン、例えばヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、及び／またはＣＨ３ドメインを含んでよい。
【００２１】
本明細書に開示される融合タンパク質は、コグネート制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の増殖をインビボで安全にかつ選択的に刺激する、ことが発見されている。ヒトでの炎症性腸疾患（ＩＢＤ）へのＴＬ１Ａ多形を関連付ける疫学的データ（例えば、国際特許出願公開ＷＯ２００６／１２７９００参照）に基づいて、また、ＴＬ１Ａの遺伝子導入過剰発現がＩＢＤに罹患しやすいことを証明するネズミの研究に基づいて、該融合タンパク質がインビボで安全にかつ効果的に投与され得るか否かははっきりしていなかった。更に、あるＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストはインビボで有害な副作用を引き起こすことがある程度知られているので、ＴＬ１Ａ融合タンパク質の治療上有効量が安全に投与され得るか否か全く予測不可能であった。例えば、上記の炎症性腸疾患、喘息及び関節炎のマウスモデルでのＴＬ１Ａの遺伝子導入発現を試験する先のマウスモデル、例えばＭｅｙｌａｎら、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ．２００８年７月１８日；２９（１）：７９−８９；Ｍｅｙｌａｎら、Ｍｕｃｏｓａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１１年３月；４（２）：１７２−８５；Ｍｉｇｏｎｅら、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ．２００２年３月；１６（３）：４７９−９２；Ｆａｎｇら、Ｊ  Ｅｘｐ  Ｍｅｄ．２００８年５月１２日；２０５（５）：１０３７−４８；及びＢｕｌｌら、Ｊ  Ｅｘｐ  Ｍｅｄ．２００８年１０月２７日；２０５（１１）：２４５７−６４によるマウスモデル。これらの報告は、ＴＬ１Ａの存在、及びＴＮＦＲＳＦ２５を介するシグナル伝達が、研究される疾患状況で観察された、エフェクターＴ細胞の増加した刺激及び免疫病理学の増加した重度をもたらしたことを証明した。更に、ワクチン化の文脈では、ＴＮＦＲＳＦ２５を介するシグナル伝達は、Ｔｒｅｇ細胞の同時拡張にもかかわらず、エフェクターＴ細胞の増加した増殖を導いたことを証明した（Ｓｃｈｒｅｉｂｅｒら、Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１２年１０月１日；１８９（７）：３３１１−８参照）。これらの研究は、ＴＮＦＲＳＦ２５刺激の特異性がコグネート抗原の利用性によって左右され、霊長類でのこれらの抗原の特異性に関する重大な安全性の関心事をもたらしたことを証明した。この関心事の理由は、以前の研究が病原無しの環境で飼育された研究室用マウスで行われたとの知見から起こったため、環境的抗原の多様なアレイへの曝露の歴史を有さなかった。環境的な状況はヒト及び非ヒト霊長類（すなわち、病原無しでない）で非常に異なるので、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ由来アゴニスト）へのヒト及び非ヒト霊長類細胞の曝露が、Ｔｒｅｇ細胞への影響を亢進する代わりに、エフェクターＴ細胞の刺激及び亢進された免疫病理学をもたらすだろうとの重大な関心事があった。特に、マウスでの研究室データに基づいて、肺及び腸系での亢進された炎症は、「外来」抗原（内因性細菌）及び環境的なまたは食品抗原の高蔓延性に因って予測された。
【００２２】
しかしながら、予想外にも、ヒト化マウス及び霊長類での研究では、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質での処置が、Ｔｒｅｇ細胞増殖を誘導するために効果的であるばかりでなく、体重減少を誘導せず、白血球数の変化を誘導せず、または任意の他の危険なもしくは望ましくない副作用をもたらさなかったことが現在では証明され、このことは、驚くべきことに、ＴＬ１Ａ融合タンパク質がインビボで安全に投与され得ることを示す（ＴＬ１Ａ融合タンパク質がヒトに安全に投与され得ることを示す）。従って、該融合タンパク質自体に加えて、本明細書では、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの投与を含む治療法に関連する有害事象を減少させる方法であって、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物を投与することを含む方法が記載される。これらの方法は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト療法に関連した有害事象を減少させ、一方では、同時に、以下で議論する、抗原特異的免疫応答を調節し、抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療するために効果的である。
【００２３】
更に、任意の特別な理論または作用メカニズムによって拘束されるものではないが、本実施例はまた、ＴＬ１Ａ融合タンパク質の効果が全身的に及び粘膜中での両方で抗原特異性であったことを証明し、このことは、該融合タンパク質が全身性及び粘膜抗原特異的免疫応答の両方を調節するために使用され得ることを示している。従って、本明細書ではまた、抗原特異的免疫応答を調節するための該融合タンパク質を（例えば、それを必要とするヒト患者において）用いる方法が記載される。また、（例えば、それを必要とするヒト患者において）抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害（例えば、自己免疫疾患または障害（例えば、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）及びリウマチ様関節炎）、移植拒絶、移植片対宿主疾患（ＧＶＨＤ）、炎症、喘息、アレルギー、及び慢性炎症）を治療し、及び／または該疾患または症状の１またはそれ以上の症状を治療する方法が記載される。該融合タンパク質及びそれらの使用方法が以下に詳述される。
【００２４】
また、（１）ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（本明細書に開示されたＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、４Ｃ１２）及び（２）インターロイキン（ＩＬ）−２の低用量または非常に低用量を対象に投与することを含む併用療法が、驚くべきかつ予測できないＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞の拡張に対する相乗効果を有することも、最近、発見されている。任意の特別な理論または作用メカニズムによって拘束されるものではないが、Ｔｒｅｇ細胞の拡張は、望ましくない抗原特異的免疫応答に関連した疾患及び障害、例えば、自己免疫疾患または障害（例えば、ＩＢＤ及びリウマチ様関節炎）、移植拒絶、ＧＶＨＤ、炎症、喘息、アレルギー、及び慢性感染における有利な効果を有すると考えられる。従って、本明細書では、上記の併用療法を用いる上記疾患及び障害及びその他を治療する方法も提供される。
【００２５】
アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体４Ｃ１２と組み合わせてｍＴＯＲ阻害剤ラパマイシンを対象に投与することは、エフェクターＴ細胞の特異的減少をもたらしたが、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体によって誘導されたＴｒｅｇ細胞の拡張に対する効果を有さなかった、ことも現在発見されている。ラパマイシンがエフェクターＴ細胞及びＴｒｅｇ細胞の両方に対する広範囲の阻害効果を有するので、この発見は驚くべきことである。少なくとも一部この発見に基づいて、本明細書には、例えば望ましくない活性化及びＣＤ４＋及び／またはＣＤ８＋Ｔエフェクター細胞の拡張を阻害するために、ＴＮＦＲＳＦ２５抗体のそれを必要としている対象への投与、及びｍＴＯＲ阻害剤の投与を含む、併用療法も提供される。
【００２６】
定義
本明細書で使用される用語「単離された」は、参照される物質が通常見出される環境から除かれることを意味する。従って、単離された生物学的物質は細胞成分、すなわち該物質が見出されまたは産生される細胞の成分を含まないことがある。単離された核酸分子は、例えば、ＰＣＲ産物、単離されたｍＲＮＡ、ｃＤＮＡまたはその制限フラグメントを含むが、これらに限定されない。単離された核酸はまた、例えば、ベクター、プラスミド、コスミド、人工染色体等に挿入された配列を含む。単離された核酸は、好ましくは、見出され得るゲノムから切り取られ、好ましくは非制御配列、非コーディング配列、またはゲノム内に見出される時に核酸分子の上流もしくは下流に位置する他の遺伝子に連結されない。単離された核酸は、その天然環境における（すなわち、細胞の核における）核酸の３’及び５’末端とは異なる３’及び５’末端を有する。単離されたタンパク質は、他のタンパク質もしくは核酸またはその両方と会合し得る（該単離されたタンパク質は細胞中でそれらと会合する）か、あるいはそれが膜関連タンパク質である場合には細胞膜と会合し得る。単離された融合タンパク質は、インビトロで該融合タンパク質を産生するために使用される細胞の細胞成分と会合し得る。
【００２７】
本明細書で使用される用語ＴＬ１Ａ融合タンパク質を「コードする核酸」または「コードするポリヌクレオチド」は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質のコーディング配列のみを含む核酸、並びに追加のコーディング及び／または非コーディング配列（複数）を含む核酸を包含する。
【００２８】
用語「パーセント（％）配列同一性」等は、を一般的には、共通の進化源を共有してもよいまたはしなくてもよい異なった核酸分子のヌクレオチド配列または異なったタンパク質のアミノ酸配列間の同一性または相同性の程度を言う。配列同一性は、多数の公的に入手可能な配列比較アルゴリズム、例えばＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡ、ＤＮＡストライダー、ＧＣＧ（ジェネティクス・コンピュータ・グループ、ＧＣＧプログラムパッケージ・プログラム説明書、バージョン７、マジゾン・ウィスコンシン）等のいずれかを用いて決定され得る。２つのアミノ酸配列または２つの核酸分子間の同一性の割合を決定するために、これらの配列は最適な比較目的のために整列される。２配列間の同一性の割合は、配列によって共有される同一の位置の数の関数である（すなわち、パーセント同一性＝同一位置の数／位置の総数（例えば、重複位置）×１００）。１つの実施形態では、２配列は、同じ長さかまたはほぼ同じ長さである。２配列間のパーセント同一性は、ギャップを許可するかまたは許可することなく、以下に記載の技術と類似の技術を用いて決定され得る。パーセント配列同一性の計算においては、典型的には、厳密な適合は計数される。２配列間のパーセント同一性の決定は、数学アルゴリズムを用いて達成され得る。２配列間の比較のために利用される数学アルゴリズムの非限定的な例は、Ｋａｒｌｉｎ及びＡｌｔｓｃｈｕｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １９９３年，９０：５８７３−５８７７において変更された、Ｋａｒｌｉｎ及びＡｌｔｓｃｈｕｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １９９０年，８７：２２６４のアルゴリズムである。かかるアルゴリズムは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９９０年；２１５：４０３のＮＢＬＡＳＴ及びＸＢＬＡＳＴプログラムに組み込まれている。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索は、ＮＢＬＡＳＴプログラム、スコア＝１００、ワード長＝１２で行い、本明細書に開示された配列に相同なヌクレオチド配列を得ることができる。ＢＬＡＳＴタンパク質検索はＸＢＬＡＳＴプログラム、スコア＝５０、ワード長＝３で行い、本明細書に開示されたタンパク質配列に相同なタンパク質配列を得ることができる。比較のためのギャップ有りアライメントを得るために、Ａｌｔｓｃｈｕｌら，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１９９７年，２５：３３８９に記載されているようにギャップＢＬＡＳＴが利用できる。あるいは、ＰＳＩ−Ｂｌａｓｔは、分子間の遠隔関係を検出する反復検索を行うために使用され得る。Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９７年）、前掲参照。ＢＬＡＳＴ、ギャップ有りＢＬＡＳＴ及びＰＳＩ−Ｂｌａｓｔプログラムを利用する時には、各プログラム（例えば、ＸＢＬＡＳＴ及びＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメータは使用できる。ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ／ｏｎ  ｔｈｅ  ＷｏｒｌｄＷｉｄｅＷｅｂ参照。配列比較のために利用される数学アルゴリズムの別の非限定的例は、Ｍｙｅｒｓ及びＭｉｌｌｅｒ，ＣＡＢＩＯＳ１９８８；４：１１−１７のアルゴリズムである。かかるアルゴリズムは、ＧＣＧ配列アライメントソフトウエアパッケージの一部であるＡＬＩＧＮプログラム���バージョン２．０）に組み込まれる。アミノ酸配列比較のためのＡＬＩＧＮプログラムを利用する時には、ＰＡＭ１２０重量残基表、１２のギャップ長ペナルティ、及び４のギャップペナルティが使用できる。２アミノ酸配列間のパーセント同一性は、Ｂｌｏｓｓｕｍ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックス、１６、１４、１２、１０、８、６、または４のギャップ重量、及び１、２、３、４、５、または６の長重量のいずれかを用いて、ＧＣＧソフトウエアパッケージ（Ａｃｃｅｌｒｙｓ，Ｂｕｒｌｉｎｇｔｏｎ，Ｍａｓｓ．；ａｃｃｅｌｒｙｓ．ｃｏｍ  ｏｎ  ｔｈｅ  ＷｏｒｌｄＷｉｄｅＷｅｂから入手可能）のギャッププログラムに組み込まれる、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈのアルゴリズム（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９７０年，４８：４４４−４５３）を用いて決定され得る。更に別の好ましい実施形態では、２ヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリックス、４０、５０、６０、７０、または８０のギャップ重量、及び１、２、３、４、５、または６の長重量を用いて、ＧＣＧソフトウエアパッケージのギャッププログラムを使用して決定される。特に好ましいパラメータ群（及び、分子がある配列同一性を有するか否かを決定するためにどのパラメータが適用されるべきかについて技術者が明確でない場合に使用され得るもの）は、１２のギャップオープンペナルティ、４のギャップ拡張ペナルティ及び５のフレームシフトギャップペナルティを有するＢｌｏｓｓｕｍ６２スコアマトリックスを使用することである。
【００２９】
アミノ酸配列レベルにおいて用語「実質的に同一な」とは、２アミノ酸配列の配列同一性は少なくとも約７０％以上（例えば、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％）の配列同一性を意味する。
【００３０】
本明細書で使用される、「腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバーであるメンバー２５（ＴＮＦＲＳＦ２５）に特異的に結合することができるＴＬ１Ａポリペプチドは、天然リガンドＴＬ１Ａによって介在される少なくとも１つの機能が介在されるようにＴＮＦＲＳＦ２５と相互作用するものである。この機能は、例えば、制御性Ｔ細胞増殖の誘導及び／または亢進でよい。更に、本明細書に記載のＴＬ１Ａポリヌクレオチド及び融合タンパク質は、１）それらが結合活性の閾値レベルを示すか、及び／または２）それらが公知の関連受容体と顕著に交差反応しない場合に、「特異的に結合する」と言われる。ＴＮＦＲＳＦ２５への結合特異性は、図６に証明されているカスパーゼ放出アッセイを用いて規定どおりに確認される。これらの研究のコントロール群は、ＴＬ１Ａ−Ｉｇを含むＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストで処置した後の死感受性がないことを証明する、ＴＮＦＲＳＦ２５で形質導入されない細胞を含む。アゴニストの能力及びＥＣ５０もこのアッセイで見積もられ、図６で証明されるようにｎｇからμｇの範囲であることが規定どおりに証明されている。
【００３１】
用語「抗原特異的免疫応答」の意味は、当該分野で知られている。例として、抗原「Ｘ」に特異的である免疫応答は、抗原「Ｘ」に存在する１またはそれ以上のエピトープを認識する活性化Ｂ及び／またはＴ細胞を有することになる。
【００３２】
本明細書で使用する用語「抗原特異的免疫応答を調節すること」は、任意の好適な手段（例えば、抗原特異的抗体、Ｔ細胞、Ｂ細胞、抗原特異的Ｔ細胞増殖等の頻度）によって測定される抗原に対する免疫応答が、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、２５％、５０％、７０％、７５％、８０％、９０％、９５％、９９％または１００％、増加または減少することを意味する。
【００３３】
本明細書で使用する「ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト」は、ＴＮＦＲＳＦ２５受容体に結合し、天然のＴＮＦＲＳＦ２５リガンド、例えばＴＬ１Ａに細胞を曝露することによって観察されたであろう応答に類似した、ＴＮＦＲＳＦ２５受容体が発現される細胞中での応答を誘起する物質を意味する。
【００３４】
本明細書で使用する、別の物質（例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト、例えばＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、またはＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト）との併用療法におけるインターロイキン（例えば、ＩＬ−２またはそのアナログ）によって誘導されたＴｒｅｇ細胞の拡張の文脈での「至適」とは、同一のインターロイキンまたはそのアナログ単独（すなわち、併用療法でない）の存在下で誘導されるＴｒｅｇ細胞拡張の量または程度に比べて１００％未満を意味する。本明細書で用いる用語「抗体」は、ヒト及びヒト化抗体を含む全ての種を包括し、抗原性標的、例えばＴＮＦＲＳＦ２５は任意の種由来でよい。従って、抗体、例えば抗ＴＮＦＲＳＦ２５は、マウス抗ヒトＴＮＦＲ２５、ヤギ抗ヒトＴＮＦＲ２５、ヤギ抗マウスＴＮＦＲ２５、ラット抗ヒトＴＮＦＲ２５、マウス抗ラットＴＮＦＲ２５等でよい。（例えば、自己免疫または炎症性応答における）別の種または場合によっては同一種由来の、抗原標的例えばＴＮＦＲＳＦ２５に対するある種で産生された抗体の組合せは、制限なく、本開示では全ての種が実現される。用語抗体は、最も広い意味で使用され、十分に組織化された抗体、モノクローナル抗体（ヒト、ヒト化またはキメラ抗体を含む）、ポリクローナル抗体、多特異的抗体（例えば、二重特異性抗体）、及び所望の生物学的活性を示す限り、先の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む抗原に結合できる抗体フラグメント（例えば、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ）２、Ｆｖ、一本鎖抗体、二重特異性抗体）、を含む。
【００３５】
その重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に依って、ヒト免疫グロブリンは、異なったクラスに分類され得る。５つの主なクラス、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭがあり、その中のいくつかはサブクラスまたはアイソタイプ、例えばＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２に更に分けられる。免疫グロブリンの異なったクラスに対応する重鎖定常ドメインは、アルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ及びミューとそれぞれ呼ばれる。免疫グロブリンの異なったクラスのサブユニット構造及び三次元立体配置は周知である。異なったアイソタイプは、異なったエフェクター機能を有し；例えばＩｇＧ１及びＩｇＧ３アイソタイプは、ＡＤＣＣ活性を有する。本発明は、ＩｇＧが好ましいが、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭを含む任意のクラスまたはサブクラスの抗体が調製され得ることを画する。
【００３６】
「免疫原性ポリペプチド」または「抗原」は、抗体介在免疫応答（すなわち、「Ｂ細胞」応答または体液性免疫）、細胞介在免疫応答（すなわち、「Ｔ細胞」応答）またはそれらの組み合わせを対象に引き起こす、細胞または生物由来のポリペプチドである。細胞介在免疫応答は、ヘルパーＴ細胞、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）またはそれらの両方の動員に関連し得る。好ましくは、免疫原性ポリペプチドは、１またはそれ以上の抗体介在応答、ＣＤ４＋Ｔｈ１−介在応答（Ｔｈ１：１型ヘルパーＴ細胞）及びＣＤ８＋Ｔ細胞応答を誘起する。本明細書で使用される用語「ポリペプチド」はアミノ酸のポリマーを意味し、アミノ酸のポリマーの特定の長さを意味しないことを理解されたい。従って、例えば、用語ペプチド、オリゴペプチド及びタンパク質は、ポリペプチドの定義に含まれる。
【００３７】
本明細書で使用される、状態、疾患、障害または症状を「治療する」またはその「治療」は、以下を含む：（１）状態、疾患、障害または症状に罹患しているかまたは罹患しやすいかもしれないが、該状態、疾患、障害または症状の臨床的または亜臨床的症候を未だ経験していないまたは呈していない、哺乳動物において発症する状態、疾患、障害または症状の臨床的または亜臨床的症候の発現を予防しまたは遅らせること；または（２）状態、疾患、障害または症状を阻害すること、すなわち、該状態、疾患、障害または症状の発症、またはそれらの再発（維持療法の場合に）、または少なくとも１つのそれらの臨床的または亜臨床的症候を停止し、減少させまたは遅らせること；または（３）状態、疾患、障害または症状を軽減すること、すなわち、該状態、疾患、障害または症状、または少なくとも１つのその臨床的または亜臨床的症候を回復させること。治療される対象に対する利益（例えば、状態、疾患、障害または症状の少なくとも１つの症候の緩和）は、統計的に有意であるか、あるいは患者または医師に少なくとも認知できるかのいずれかである。または緩和（例えば状態、疾患、障害または症状の少なくとも１つの症候の緩和）は、典型的には、（治療前と比べて）少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％またはそれ以上である。
【００３８】
本明細書で使用される、対象において、状態、疾患、障害または症状（例えば、抗原特異的免疫応答に関連した状態、疾患、障害または症状、例えば、自己免疫疾患または障害、移植拒絶、移植片対宿主疾患、炎症、喘息、アレルギー、及び慢性感染）を「予防すること」は、例えば、対象における状態、疾患、障害または症状の１またはそれ以上の症候の発症を、それらが起こるまたは例えば患者もしくは患者の医師によって検出できる前に停止することを意味する。好ましくは、状態、疾患、障害または症状が全く発症しない、すなわち、状態、疾患、障害または症状の症候が検出できない。しかしながら、それは、状態、疾患、障害または症状の症候の１またはそれ以上の症候の発症を遅らせるかまたは遅くすることもできる。あるいはまたはそれに加えて、１またはそれ以上の次に起こる症候の重度を減少させることもできる。
【００３９】
本明細書で使用される「併用療法」は、本明細書に記載のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、小分子等）、及び、例えば抗原特異的免疫宇藤を修飾し及び／または疾患または障害を治療する（例えば、該疾患または障害の１またはそれ以上の症候を治療する）ための１またはそれ以上の他の療法（例えば、薬物または治療的処置）での、対象（例えば、治療を必要としている対象、例えばヒト患者）の治療を意味する。かかる併用療法は、患者が１つの療法で最初に治療され、次いで他の療法で治療される等の連続的療法でよく、あるいは全ての療法は同時に投与され得る。いずれの場合でも、これらの療法は、「同時投与される」と言われる。「同時投与される」とは、薬物及び／または療法が混合形態で投与されることを必ずしも意味するものではない（すなわち、それらは、別個にまたは一緒に、同一または異なった部位に、同時にまたは異なった時間に投与されてもよい）。
【００４０】
用語「薬学的に許容される担体」とは、化合物が投与される希釈剤、アジュバント、賦形剤またはビヒクルを意味する。かかる薬学的担体は、殺菌液体、例えば水、及び石油、動物、植物または合成起源、例えばピーナッツ油、大豆油、鉱油、ゴマ油等を含む油でよい。水または水性溶液、生理食塩水及び水性デキストロース及びグリセロール溶液は、好ましくは、担体として、特に注射溶液用担体として採用される。好適な薬学的担体はＥ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎによる「レミントンの薬学（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）」に記載されている。
【００４１】
本明細書で使用される用語「薬学的に許容される誘導体」は、レシピエントに投与した時に、本明細書に開示された化合物またはその活性代謝物もしくはその残渣を（直接的または間接的に）提供することができる、任意の薬学的に許容される塩、溶媒和物またはプロドラッグ、例えば本明細書に開示された化合物のエステルを意味する。かかる誘導体は、過度な実験無しに当業者に理解できる。それにもかかわらず、かかる誘導体を教示する程度に本明細書に参照として組み込まれている、Ｂｕｒｇｅｒ’ｓ  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ，第５版，第１巻：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅの教示を参照されたい。好ましい薬学的に許容される誘導体は、塩、溶媒和物、エステル、カルバメート及びリン酸エステルである。特に好ましい薬学的に許容される誘導体は、塩、溶媒和物及びエステルである。最も好ましい薬学的に許容される誘導体は、塩及びエステルである。
【００４２】
用語「核酸ハイブリダイゼーション」は、核酸の相補鎖のペアリングを意味する。ペアリングのメカニズムは、核酸鎖の相補的ヌクレオシドまたはヌクレオチド塩基（ヌクレオ塩基）間のワトソンクリック型、フーグスティーン型または逆フーグスティーン型の水素結合でよい水素結合に関連する。例えば、アデニン及びチミンは、水素結合の形成を介して対を形成する相補的ヌクレオ塩基である。ハイブリダイゼーションは、変動する環境下で起こり得る。核酸分子は、定義されたストリンジェンシー条件下で、１つの核酸分子の少なくとも１つの鎖が、別の核酸分子の相補的塩基との水素結合を形成できる場合に、互いに「ハイブリダイズ」する。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーは、例えば、（ｉ）ハイブリダイゼーション及び／または洗浄が行われる温度、及び（ｉｉ）イオン強度、及び（ｉｉｉ）ホルムアミド等の、ハイブリダイゼーションの変性剤、及び洗浄液の濃度、並びに他のパラメータ、によって決定される。ハイブリダイゼーションは、２つの鎖が実質的に相補的配列を含むことを必要とする。しかしながら、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーに依って、ある程度のミスマッチが許容される。「低ストリンジェンシー」条件下では、より大きな割合のミスマッチが許容される（すなわち、逆平行ハイブリッドの形成を避けない）。Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｃｅｌｌ，Ａｌｂｅｒｔｓ等、第３版、ニューヨーク及びロンドン：ガーランド出版社，１９９４年，第７章参照。
【００４３】
典型的には、高ストリンジェンシーでの２つの鎖のハイブリダイゼーションは、配列がその長さの拡張部分に渡って高い相補性を示すことを要求する。高ストリンジェンシー条件の例は以下を含む：６５℃、０．５Ｍ  ＮａＨＰＯ４、７％ＳＤＳ、１ｍＭ  ＥＤＴＡ中でのフィルタ結合ＤＮＡへのハイブリダイゼーション、続いて、６８℃、０．１ｘＳＳＣ／０．１％  ＳＤＳ（ここで、１ｘＳＳＣは０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、０．１５Ｍクエン酸Ｎａ）での洗浄、またはオリゴヌクレオチド（オリゴ）阻害剤については、約３７℃（１４ヌクレオチド長オリゴについて）、約４８℃（約１７ヌクレオチド長オリゴについて）、約５５℃（２０ヌクレオチド長オリゴについて）及び約６０℃（２３ヌクレオチド長オリゴについて）で６ｘＳＳＣ／０．５％ピロリン酸ナトリウムでの洗浄。
【００４４】
中間または中程度のストリンジェンシー条件（例えば、６５℃での２ｘＳＳＣの水溶液；あるいは、例えば、６５℃、０．５Ｍ  ＮａＨＰＯ４、７％ＳＤＳ、１ｍＭ  ＥＤＴＡでのフィルタ結合ＤＮＡへのハイブリダイゼーション、次いで、４２℃、０．２ｘＳＳＣ／０．１％ＳＤＳでの洗浄）、及び低ストリンジェンシー（例えば、５５℃での２ｘＳＳＣの水溶液）は、それに相当して、２つの配列間にハイブリダイゼーションの全体的相補性をほとんど要求しない。任意の所定のストリンジェンシーハイブリダイゼーション反応のための特定の温度及び塩条件は、標的ＤＮＡまたはＲＮＡ分子の濃度、及びプローブの長さ及び塩基組成の依拠し、通常、所定の予備的実験で常法により決定される（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９７５年；９８：５０３；Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，第２巻，第９．５０章，ＣＳＨ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，  １９８９年；Ａｕｓｕｂｅｌら（著），１９８９年，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．Ｉ，Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ，Ｉｎｃ．、及びＪｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、第２．１０．３頁参照）。核酸のハイブリダイゼーションに対する広い案内は、例えば、Ｔｉｊｓｓｅｎ（１９９３年）生化学及び分子生物学の研究室技術−核酸プローブを用いるハイブリダイゼーション、第１部、第２章、「ハイブリダイゼーションの原理及び核酸プローブアッセイ法の概略」Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．（「Ｔｉｊｓｓｅｎ」）に見られる。
【００４５】
本明細書で使用される用語「標準ハイブリダイゼーション条件」とは、少なくとも５０％の配列同一性を有する２つのヌクレオチド分子のハイブリダイゼーションを可能にするハイブリダイゼーション条件を言う。具体的な実施形態によれば、より高ストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件は、少なくとも７５％配列同一性、少なくとも８０％配列同一性、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％配列同一性を有する配列のみのハイブリダイゼーションを可能にするために使用され得る。
【００４６】
タンパク質、ペプチド及びポリペプチドの定義は、当該分野で周知である。本明細書で使用される用語「タンパク質」は、用語「ぺプチド」または「ポリペプチド」と同義であり、線状に配列され、かつ隣接するアミノ酸残基のカルボキシル基とアミノ基との間のペプチド結合によって結合された、アミノ酸鎖を意味すると理解される。従って、用語ポリペプチドは、タンパク質の完全長アミノ酸配列、またはそのフラグメントを意味し得る。
【００４７】
本明細書で使用される用語「核酸」、「オリゴヌクレオチド」、「ポリヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド配列」は交換的に使用され、一本鎖または二本鎖形態のいずれかでのデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドを言う。該用語は、合成骨格を有する核酸様構造を包含する。本発明によって提供されるＤＮＡ骨格アナログは、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、メチルメチルホスホナート、アミド亜リン酸エステル、アルキルホスホトリエステル、スルファミン酸、３’−チオアセタール、メチレン（メチルイミノ）、３’−Ｎ−カーバメート、モルホリノカーバメート、及びペプチド核酸（ＰＮＡ）を含む；「オリゴヌクレオチド及びアナログ、実用手法」Ｆ．Ｅｃｋｓｔｅｉｎ著、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ＰｒｅｓｓのＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ（１９９１年）；「アンチセンス法」ＮＹ科学アカデミー定例会、第６００巻、Ｂａｓｅｒｇａ及びＤｅｎｈａｒｄｔ著（ＮＹＡＳ  １９９２年）；Ｍｉｌｌｉｇａｎ（１９９３年）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３６：１９２３−１９３７；アンチセンス研究及び応用（１９９３，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ）参照。ＰＮＡは非イオン性骨格、例えばＮ−（２−アミノエチル）グリシン単位を含む。ホスホロチオエート結合は、ＷＯ９７／０３２１１；ＷＯ９６／３９１５４；Ｍａｔａ（１９９７年）Ｔｏｘｉｃｏｌ．Ａｐｐｌ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．１４４：１８９−１９７に記載されている。該用語によって包含される他の合成的骨格は、メチル−ホスホネート結合または別のメチルホスホネート及びホスホジエステル結合（Ｓｔｒａｕｓｓ−Ｓｏｕｋｕｐ（１９９７年）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３６：８６９２−８６９８）、及びベンジルホスホネート結合（Ｓａｍｓｔａｇ  （１９９６年）アンチセンス核酸薬開発（Ｄｒｕｇ  Ｄｅｖ）６：１５３−１５６）を含む。用語核酸は、ｃＤＮＡ、ｃＲＮＡ、ｍＲＮＡ、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド及び増幅産物と交換的に使用される。
【００４８】
本明細書で使用される、ポリヌクレオチド配列と「作動可能に連結された」とは、標的ポリヌクレオチド配列及び１またはそれ以上の発現コントロール配列（例えば、プロモーター）が、宿主細胞内の標的ポリヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドの発現を可能にするように物理的に連結される、ことを意味する。
【００４９】
本明細書で使用される用語「約」または「おおよそ」は、通常、数値の種類及び測定方法について許容される誤差範囲内を意味する。例えば、それは、所定の数値または範囲の２０％以内、より好ましくは１０％以内、及び最も好ましくはさらに約５％以内を意味し得る。あるいは、特に生物系では、用語「約」は、約１ログ（すなわち、１桁）以内、好ましくは所定の数値の２の倍数以内を意味する。
【００５０】
ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト
本開示は、ＴＮＦＲＳＦ２５（ＤＲ３としても知られている）のアゴニストの単独でまたは併用療法の一部としてのいずれかでの投与を含む方法を提供する。本開示は、新規なＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト、例えば本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質を提供する。しかしながら、本明細書ではまた、当該分野で知られている他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの使用を含む新規な方法を提供する。例えば、本明細書に開示された併用療法（ｍＴＯＲ阻害剤、例えばラパマイシン及び／またはＩＬ−２とＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストとの同時投与を含む）で使用され得るＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの非限定的な例は、例えば、小分子、抗体及び融合タンパク質を含む。かかるＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの非限定的な例は、例えば米国付与前公表番号第２０１１／０２４３９５１号、同第２０１２／００２９４７２号及び同第２０１２／０１３５０１１号（全てＰｏｄａｃｋら）に記載されている。抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体を調製する方法は、ＰｏｄａｃｋらによるＵＳ２０１２／００２９４７２に記載されている。本方法、例えば、本明細書に開示された併用療法は、当該分野で知られている任意の好適なＴＮＦＲＳＦ２５の使用を画する。実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは、Ｔｒｅｇ細胞の拡張を亢進するものである。
【００５１】
実施形態によっては、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは小分子である。当該分野で「小分子」として言われる化学物質は、典型的には、１０，０００Ｄａ未満、好ましくは５，０００Ｄａ未満、より好ましくは１，０００Ｄａ未満、及び最も好ましくは５００Ｄａ未満の分子量を有する、有機的な非ペプチド分子である。この種類の調節因子は、化学的に合成された分子、例えば、コンビナトリアルケミカルライブラリからの化合物を含む。合成化合物は、当該分野で公知の方法によるＴＮＦＲＳＦ２５調節活性のための化合物ライブラリをスクリーニングすることによって合理的に設計または同定され得る。別の好適なこの種類の調節因子は、天然生成物、特に、ＴＮＦＲＳＦ２５調節活性のための化合物ライブラリをスクリーニングすることによっても同定され得る、植物または真菌等の生物由来の二次代謝物である。小分子を作製または入手する方法は当該分野では周知である（例えば、Ｓｃｈｒｅｉｂｅｒ，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２０００；１５１：１９６４−１９６９；Ｒａｄｍａｎｎら，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２０００；１５１：１９４７−１９４８参照）。
【００５２】
実施形態によっては、本開示は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸及びＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物を提供する。また、本明細書は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質を製造する方法を提供する。該方法は、例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸、例えば本明細書に記載の核酸（例えば、配列番号１５）を細胞集団に導入し、ここで、該核酸は、該核酸によってコードされた融合タンパク質ポリペプチドを産生するために効果的な制御配列に作動可能に連結され；及び、該ポリペプチドを産生するための培養培地で該細胞を培養すること、を含み得る。実施形態によっては、本方法は、該融合タンパク質ポリペプチドを細胞または培養培地から単離することを更に含み得る。該核酸はまた、該融合タンパク質に作動可能に連結された分泌性またはシグナルペプチドをコードする第３のヌクレオチド配列を更に含み得る。実施形態によっては、該融合タンパク質は、融合タンパク質ホモ多量体として（例えば、三量体の二量体として）宿主細胞から分泌される。実施形態によっては、該融合タンパク質ホモ多量体は、培養培地、宿主細胞または宿主細胞ぺリプラスムから回収される。更に、該融合タンパク質ホモ多量体は、第１融合タンパク質のシステイン残基と１またはそれ以上の追加の融合タンパク質の少なくとも１つの残基との間に１またはそれ以上の共有ジスルフィド結合を含み得る。
【００５３】
ＴＬ１Ａは、ＴＮＦスーパーファミリーに属するＩＩ型膜貫通型タンパク質であり、ＴＮＦスーパーファミリーメンバー１５（ＴＮＦＳＦ１５）と表される。ＴＬ１Ａは、ＴＮＦＲＳＦ２５に対する天然リガンドである。米国特許第６，７１３，０６１号及びＢｏｒｙｓｅｎｋｏら、Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｒｅｓ  Ｃｏｍｍｕｎ．２００５年３月１８日；３２８（３）：７９４−９、Ｓｈｅｉｋｈら、Ｃｕｒｒ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｔａｒｇｅｔｓ．２００４年２月；４（１）：９７−１０４、及び米国特許出願公開第２００７／０１２８１８４号参照。ヒトＴＬ１Ａ核酸及びアミノ酸配列は公知であり、記載されている。例えば、ＧｅｎＢａｎｋ（登録商標）アクセッション番号ＣＣＤＳ６８０９．１（核酸配列）（配列番号１）；及びＧｅｎＢａｎｋ（登録商標）アクセッション番号ＥＡＷ８７４３１（アミノ酸配列）（配列番号２）参照。ＧｅｎＢａｎｋ（登録商標）アクセッション番号ＮＭ＿００１２０４３４４．１／ＮＰ＿００１１９１２７３．１、ＮＭ＿００５１１８．３／ＮＰ＿００５１０９．２、ＮＭ＿００１０３９６６４．１／ＮＰ＿００１０３４７５３．１、ＮＭ＿１４８９７０．１／ＮＰ＿６８３８７１．１、ＮＭ＿１４８９６７．１／ＮＰ＿６８３８６８．１、ＮＭ＿１４８９６６．１／ＮＰ＿６８３８６７．１、ＮＭ＿１４８９６５．１／ＮＰ＿６８３８６６．１、及びＮＭ＿００３７９０．２／ＮＰ＿００３７８１．１（その各々が参照によって組み込まれている）を含むがこれらに限定されないヒトＴＬ１Ａについての他の核酸及びアミノ酸配列（参照配列を含む）が記載されている。
【００５４】
アカゲザルＴＬ１Ａ核酸及びアミノ酸配列は、アカゲザル（Ｍａｃａｃａ  ｍｕｌａｔｔａ）染色体１５、Ｍｍｕｌ＿０５１２１２、ホールゲノムショットガン配列（ＧｅｎＢａｎｋ（登録商標）アクセッション番号ＮＣ＿００７８７２．１）から推察され得る。ＧｅｎＢａｎｋ（登録商標）アクセッション番号ＮＭ＿００１１９４１３２．１（配列番号３）を有するｍＲＮＡ配列。例示的なアカゲザルアミノ酸配列は、（参照配列を含めて）参照として本明細書に組み込まれている、ＧｅｎＢａｎｋ（登録商標）アクセッション番号ＮＰ＿００１１８１０６１を有する（配列番号４）。
【００５５】
本明細書には、ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合する融合タンパク質をコードする非天然ポリヌクレオチドが包含される。例えば、本明細書では、融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離されたまたは組換え核酸であって、該融合タンパク質が（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチド配列を含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）Ｉｇポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む単離されたまたは組換え核酸；またはその相補的ポリヌクレオチド配列が提供される。本明細書に記載の融合タンパク質はまた、多量化を促進する別の第２ポリペプチド、例えば、三量体の二量体、三量体等、に連結されたＴＬ１Ａポリペプチドを含み得る。例えば、第２ポリペプチドは、サーファクタントタンパク質でよい。
【００５６】
一般的に、融合タンパク質はＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストである。実施形態によっては、融合タンパク質は、ＴＬ１Ａポリペプチドを含む（「ＴＬ１Ａ融合タンパク質」）。典型的には、本明細書に包含されるＴＬ１Ａ融合タンパク質は、天然リガンドであるＴＬ１Ａによって誘導される応答に類似のシグナル伝達応答を誘導する。例えば、実施形態によっては、本明細書に包含されるＴＬ１Ａ融合タンパク質は、インビトロ及び／またはインビボでＴｒｅｇ細胞の増殖を誘導する。実施形態によっては、本明細書に包含されるＴＬ１Ａ融合タンパク質は、Ｔエフェクター細胞の同時刺激効果を有する。Ｔ細胞増殖をインビトロ及びインビボで測定するための好適なアッセイは、当該分野で知られており、実施例１に記載されている（材料及び方法）。ＴＬ１Ａ融合タンパク質の活性は、Ｋｈａｎら、Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１３年２月１５日；１９０（４）：１５４０−５０に詳細に記載されているようにして測定される。実施形態によっては、ＴＬ１Ａ融合タンパク質は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストに結合することができる第１ポリペプチド；及び少なくとも第２ポリペプチドを含む。実施形態によっては、該ポリペプチドは、ＴＮＦＲＳＦ２５に結合することができる、ＴＬ１Ａの細胞外ドメイン（例えば、ヒトＴＬ１Ａ細胞外ドメイン）またはそのフラグメント（すなわち、「機能的に活性なフラグメント」）を含むかまたはこれらから成る。実施形態によっては、該ポリペプチドは、ヒトＴＬ１Ａの変異体もしくはオルソログ、またはその機能的に活性なフラグメントである。実施形態によっては、ヒトＴＬ１Ａポリペプチドは、ＴＬ１Ａ細胞外ドメイン由来のアミノ酸残基６８〜２５２を含むかまたはそれから成る。
【００５７】
実施形態によっては、第２ポリペプチドはＩｇ分子でよい。例えば、免疫グロブリン分子は、抗体の定常領域でよい（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭまたはＩｇＤ）。Ｉｇ重鎖は、３つの機能性領域：Ｆｄ（ＶＨ及びＣＨ１ドメインを含む）、ヒンジ及びＦｃに分けられる。軽鎖と組み合わせたＦｄは、抗体の「Ｆａｂ」部分を形成する。ヒンジ領域は、ＩｇＧ、ＩｇＡ及びＩｇＤクラスに見られ、柔軟性スペーサとして働き、Ｆａｂ部分が空間で自由に動くようにする。ヒンジドメインは、構造的に多様であり、免疫グロブリンのクラス及びサブクラスの中で配列及び長さの両方で変動する。３つのヒトＩｇＧサブクラス、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２及びＩｇＧ４は、１２〜１５個のアミノ酸のヒンジ領域を有し、一方、ＩｇＧ３は、２１個のプロリン残基及び１１個のシステイン残基を含み、約６２個のアミノ酸を有する。ヒンジ領域の構造は、Ｓｈｉｎら、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  １３０：８７（１９９２年）、及び米国特許出願公開第２０１３／０１４２７９３号に詳述されている。
【００５８】
ヒトでの使用を意図した免疫グロブリン融合タンパク質については、定常領域は、潜在的な抗ヒト免疫応答を最小限にするためにヒト配列起源のものでよい。定常領域は、好適なエフェクター機能を提供するためにヒト配列起源のものでもよい。実施形態によっては、定常領域は、融合タンパク質の多量化を促進し得る。定常領域をコードする配列の操作は、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ及びＯｉのＰＣＴ公開、ＷＯ８９／００７１４２に記載されている。例えば、ＣＨ１ドメインは削除することができ、結合ドメインのカルボキシル末端はヒンジ領域を介してＣＨ２のアミノ末端に結合される。
【００５９】
実施形態によっては、Ｉｇ分子は、免疫グロブリンのＣＨ２ドメイン及び／またはＣＨ３ドメイン及び／またはヒンジ領域を含む。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧ分子（例えば、ヒトＩｇＧ）のヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含むＩｇ分子である。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧ分子（例えば、ヒトＩｇＧ）のＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインを含むＩｇ分子である。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧ分子（例えば、ヒトＩｇＧ）のヒンジ領域、及びＣＨ２ドメイン及びＣＨ３ドメインの１またはそれ以上を含むＩｇ分子である。実施形態によっては、第２ポリペプチドは、ＩｇＧ分子（例えば、ヒトＩｇＧ）のＣＨ２ドメイン、及びヒンジ領域及びＣＨ３ドメインの少なくとも１つを含むＩｇ分子である。実施形態によっては、ヒト免疫グロブリンヒンジ領域は、０、１、２または３またはそれ以上のシステイン残基を含むＩｇＧ１ヒンジ領域である。
【００６０】
本明細書に包含される融合タンパク質は、上記のＩｇ分子の代わりにまたはそれに加えて他のポリペプチドを含んでもよい。例えば、融合タンパク質は、ＴＮＦＲＳＦ２５及びサーファクタントタンパク質に結合するポリペプチド、または該融合タンパク質の多量化を促進する他のポリペプチドを含み得る。
【００６１】
本明細書に開示される核酸、本明細書ではポリヌクレオチドと称されるが、ＲＮＡの形態またはＤＮＡの形態でよく、ＤＮＡはｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ及び合成ＤＮＡを含む。ＤＮＡは二本鎖または一本鎖でよく、一本鎖はコーディング鎖または非コーディング（アンチセンス）鎖でよい。センス及びアンチセンス鎖は互いに「相補性」である。本明細書に開示される組成物及び方法に従う使用のためのＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸は、以下を含むがこれらに限定されない：ＴＬ１Ａ融合タンパク質のコーディング配列のみ；ＴＬ１Ａ融合タンパク質のコーディング配列及び追加のコーディング配列；ＴＬ１Ａ融合タンパク質のコーディング配列（及び、場合により追加のコーディング配列）及び非コーディング配列、例えば、イントロン、ＴＬ１Ａ融合ポリペプチドのコーディング配列の５’及び／または３’非コーディング配列。これらは、例えば、更に制御されたまたは制御可能なプロモーター、エンハンサー、他の転写制御配列、レプレッサ結合配列、翻訳制御配列または任意の他の制御核酸配列でよい、１またはそれ以上の制御核酸配列（但し、これらに限定されない）を含んでよい。従って、上で定義したように、用語ＴＬ１Ａ融合タンパク質を「コードする核酸」または「コードするポリヌクレオチド」は、ＴＬ１Ａ融合ポリペプチドのコーディング配列のみを含む核酸、並びに追加のコーディング配列及び／または非コーディング配列（複数）を含む核酸を包含する。
【００６２】
例示的な融合タンパク質及び該融合タンパク質をコードする核酸分子は、以下に記載されている。以下に記載された配列は限定されるものではないことを理解されたい。以下により詳細に議論するように、他のＴＬ１Ａ融合タンパク質（例えば、ＴＬ１Ａのフラグメント、変異体及びオルソログを含むもの）、並びに様々な第２ポリペプチド及び／または他の機能性ドメインも本開示によって包含される。例えば、本明細書にはまた、ＴＬ１Ａ及びサーファクタントタンパク質を含む融合タンパク質が包含される。実施形態によっては、ヒトＴＬ１Ａポリペプチドは、ＴＬ１Ａ細胞外ドメイン由来のアミノ酸残基６８〜２５２を含むまたはそれから成る。
【００６３】
非限定的な例として、実施形態によっては、アカゲザルＴＬ１Ａ融合タンパク質のＴＬ１Ａ部分の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
ａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｃａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｃｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｃｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ（配列番号５）；及び
ｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｔｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇｐｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号６）。
【００６４】
更に、実施形態によっては、アカゲザルＩｇ配列（ＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列）の核酸は：
ａｔａａａａａｃａｔｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇｃａｇｃａａａｃｃｔｃｃｃａｃｇｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔａｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｇｇａａｇａｃｃｃｃｇａｔｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔａａａｃｇｇｃｇｃｇｇａｇｇｔｇｃａｔｃａｔｇｃｃｃａｇａｃｇａａｇｃｃａｃｇｇｇａｇａｃｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃａｔａｔｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃａｃｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｃｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａｃｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃｇｇｔｃｃｃｃａｔｃｃａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇａｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａｇｃｃｔｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃｇｔｃｃｃｇｇｇａｇｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｃｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｔｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａａｃａｇｃｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａｃｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｃｃｃｇｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔａｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇ（配列番号７）
【００６５】
であり、残基１〜５２（太字）はヒンジ領域であり、残基５３〜３８２はＣＨ２ドメインであり、残基３８３〜６７５（太字、イタリック文字）はＣＨ３ドメインであり；アカゲザルＩｇ配列（ＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列）のアミノ酸配列は：
ｉｋｔｃｇｇｇｓｋｐｐｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｑｅｄｐｄｖｋｆｎｗｙｖｎｇａｅｖｈｈａｑｔｋｐｒｅｔｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｔｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｔｃｋｖｓｎｋａｌｐｖｐｉｑｋｔｉｓｋｄｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｅｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉｖｖｅｗｅｎｓｇｑｐｅｎｔｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｙｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑ（配列番号８）
【００６６】
であり、残基１〜１７（太字）はヒンジ領域であり、残基１８〜１２７はＣＨ２ドメインであり、残基１２８〜２２５（太字、イタリック文字）はＣＨ３ドメインである。
【００６７】
実施形態によっては、アカゲザルＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
ａｔｇｇａｇａｃａｇａｃａｃａｃｔｃｃｔｇｃｔａｔｇｇｇｔａｃｔｇｃｔｇｃｔｃｔｇｇｇｔｔｃｃａｇｇｔｔｃｃａｃｔｇｇｔｇａｃｃｔｃｇａｇａｔａａａａａｃａｔｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇｃａｇｃａａａｃｃｔｃｃｃａｃｇｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔａｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｇｇａａｇａｃｃｃｃｇａｔｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔａａａｃｇｇｃｇｃｇｇａｇｇｔｇｃａｔｃａｔｇｃｃｃａｇａｃｇａａｇｃｃａｃｇｇｇａｇａｃｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃａｔａｔｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃａｃｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｃｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａｃｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃｇｇｔｃｃｃｃａｔｃｃａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇａｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａｇｃｃｔｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃｇｔｃｃｃｇｇｇａｇｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｃｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｔｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａａｃａｇｃｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａｃｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｃｃｃｇｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔａｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇｇａａｔｔｃａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｃａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｃｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｃｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ（配列番号９）；及び
ｍｅｔｄｔｌｌｌｗｖｌｌｌｗｖｐｇｓｔｇｄｌｅｉｋｔｃｇｇｇｓｋｐｐｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｑｅｄｐｄｖｋｆｎｗｙｖｎｇａｅｖｈｈａｑｔｋｐｒｅｔｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｔｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｔｃｋｖｓｎｋａｌｐｖｐｉｑｋｔｉｓｋｄｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｅｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉｖｖｅｗｅｎｓｇｑｐｅｎｔｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｙｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑｅｆｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｔｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇｐｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号１０）。
【００６８】
上記の融合タンパク質配列（ＤＮＡ及びアミノ酸、配列番号９及び１０）において、イタリック及び下線の残基は、マウスカッパリーダー配列（配列番号９の残基１〜６３、及び配列番号１０の残基１〜２１）に相当し；太字及びイタリック文字は、制限酵素クローング部位（配列番号９の残基６４〜６９及び７４５〜７５０、及び配列番号１０の残基２２〜２３及び２４９〜２５０）に相当し；プレーン文字は、アカゲザルＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列（配列番号９の残基７０〜７４４、及び配列番号１０の残基２４〜２４８）に相当し；及び、下線文字は、アカゲザルＴＬ１Ａ細胞外ドメイン配列（配列番号９の残基７５１〜１２９０、及び配列番号１０の残基２５１〜４２９）に相当する。
【００６９】
実施形態によっては、ヒトＴＬ１Ａポリペプチドは、ヒトＴＬ１Ａの細胞外ドメイン由来のアミノ酸残基６８〜２５２を含むかまたはそれから成る。
【００７０】
また、非限定的な例として、実施形態によっては、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質のＴＬ１Ａ部分の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
ｃｇｇｇｃｃｃａｇｇｇａｇａｇｇｃｃｔｇｔｇｔｇｃａｇｔｔｃｃａｇｇｃｔｃｔａａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｇａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｇｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｔｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ（配列番号１１）（ヒトＴＬ１Ａの細胞外ドメインをコードする）；及び
ｒａｑｇｅａｃｖｑｆｑａｌｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｒｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇａｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号１２）（ヒトＴＬ１Ａの細胞外ドメイン）。
【００７１】
実施形態によっては、ヒトＩｇ分子（ＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列）の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
ｔｇｔｇａｃａａａａｃｔｃａｃａｃａｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｃｇａａｇａｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔｇｇａｃｇｇｃｇｔｇｇａｇｇｔｇｃａｔａａｔｇｃｃａａｇａｃａａａｇｃｃｇｃｇｇｇａｇｇａｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃｇｔａｃｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃｃｔｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｔｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａａｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃａｇｃｃｃｃｃａｔｃｇａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇｃｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａａｃｃａｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃａｔｃｃｃｇｇｇａｔｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｔｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｃｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａｇｃａａｔｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａａｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｇｃｃｔｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔｔｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇａａｇａｇｃｃｔｃｔｃｃｃｔｇｔｃｔｃｃｇｇｇｔａａａ（配列番号１３）；及び
ｃｄｋｔｈｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｈｅｄｐｅｖｋｆｎｗｙｖｄｇｖｅｖｈｎａｋｔｋｐｒｅｅｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｌｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｋｃｋｖｓｎｋａｌｐａｐｉｅｋｔｉｓｋａｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｄｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉａｖｅｗｅｓｎｇｑｐｅｎｎｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｆｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑｋｓｌｓｌｓｐｇｋ（配列番号１４）（ヒトＩｇＧのヒンジ、ＣＨ２及びＣＨ３領域）。
【００７２】
実施形態によっては、ヒトＴＬ１Ａ融合タンパク質の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
ｔｇｔｇａｃａａａａｃｔｃａｃａｃａｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｃｇａａｇａｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔｇｇａｃｇｇｃｇｔｇｇａｇｇｔｇｃａｔａａｔｇｃｃａａｇａｃａａａｇｃｃｇｃｇｇｇａｇｇａｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃｇｔａｃｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃｃｔｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｔｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａａｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃａｇｃｃｃｃｃａｔｃｇａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇｃｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａａｃｃａｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃａｔｃｃｃｇｇｇａｔｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｔｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｃｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａｇｃａａｔｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａａｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｇｃｃｔｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔｔｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇａａｇａｇｃｃｔｃｔｃｃｃｔｇｔｃｔｃｃｇｇｇｔａａａｇａａｔｔｃｃｇｇｇｃｃｃａｇｇｇａｇａｇｇｃｃｔｇｔｇｔｇｃａｇｔｔｃｃａｇｇｃｔｃｔａａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｇａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｇｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｔｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ（配列番号１５）；及び
ｃｄｋｔｈｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｈｅｄｐｅｖｋｆｎｗｙｖｄｇｖｅｖｈｎａｋｔｋｐｒｅｅｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｌｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｋｃｋｖｓｎｋａｌｐａｐｉｅｋｔｉｓｋａｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｄｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉａｖｅｗｅｓｎｇｑｐｅｎｎｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｆｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑｋｓｌｓｌｓｐｇｋｅｆｒａｑｇｅａｃｖｑｆｑａｌｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｒｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇａｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号１６）である。
【００７３】
上記の例示的な融合タンパク質配列（ヒト核酸及びアミノ酸配列、配列番号１５及び１６）において、太字及びイタリックの残基は、制限酵素クローニング部位（配列番号１５の残基６８５〜６９０、及び配列番号１６の残基２２９〜２３０）に相当し、制限酵素クローニング部位に位置する残基（プレーン文字）は、ヒトＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列（配列番号１５の残基１〜６８４、及び配列番号１６の残基１〜２２８）に相当し、そして、制限酵素クローニング部位後の残基（下線文字）は、ヒトＴＬ１Ａ細胞外ドメイン配列（配列番号１５の残基６９１〜１２６９、及び配列番号１６の残基２３１〜４２２）に相当する。
【００７４】
ネズミＴＬ１Ａ融合タンパク質も本明細書で説明され、包含される。その構築方法及び例示的なネズミ融合タンパク質の機能的特徴付けは、Ｋｈａｎ，Ｓ．Ｑ．ら（２０１３年）“ＴＬ１Ａ−Ｉｇのクローニング、発現及び機能的特徴付け”Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９０：１５４０−１５５０に詳細に記載されている。
【００７５】
上記のポリヌクレオチド配列に加えて、上記配列の任意とある割合の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド配列も包含される。例えば、本明細書に包含されるポリヌクレオチドは、（例えば、ヒトまたはアカゲザルＴＬ１Ａ及び／または免疫グロブリンポリヌクレオチドをコードする）上記のポリヌクレオチドの任意と例えば約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％配列同一性を有し得る。
【００７６】
かかるポリヌクレオチド配列は、例えば変異体及びオルソログ種を含んでよく、上記の中程度または高ストリンジェンシー条件下で好ましくはハイブリダイズし得る。変異体、例えばＴＬ１Ａポリヌクレオチドの変異体は、修飾もしくは改変された遺伝子、またはＤＮＡ配列、例えば変異体である。「変異体」及び「変異」は、遺伝子材料（例えば、ＤＮＡ）、プロセス、メカニズムでの任意の検出可能な変化、またはかかる変化の結果を意味する。このことは、遺伝子の構造（例えば、ＤＮＡ配列）が改変されている遺伝子変異、任意の変異プロセスから生じる任意の遺伝子またはＤＮＡ、及び修飾遺伝子またはＤＮＡ配列によって発現された任意の発現生成物（例えば、タンパク質、例えばＴＬ１Ａ）を含む。
【００７７】
ポリペプチドの修飾は、当業者に公知の任意の手段によって影響され得る。かかる方法は、融合タンパク質をコードするＤＮＡの修飾、及び修飾ＤＮＡの発現に依拠し得る。上で議論したＴＬ１Ａ融合タンパク質の１つをコードするＤＮＡは、以下に記載するものを含み、標準的な方法を用いて変異誘発され得る。例えば、他に多量体形成を促進するかまたは特定の分子の立体構造を促進し得るシステイン残基は、ポリペプチドから削除され得るか、または置換され得る、例えば、凝集体形成の原因となるシステイン残基。反対に、例えば三量体の二量体もしくは三量体及び／または二量体を産生するために凝集が望ましい場合、追加のシステイン残基が例えばＩｇ分子のヒンジ領域に導入され得る。必要であれば、凝集体形成に寄与するシステイン残基の同一性は、システイン残基を削除及び／または置換し、及び生理学的に許容されるバッファ及び塩を含む溶液中で得られるタンパク質が凝集するか否かを確認することによって経験的に決定され得る。更に、アミノ酸の保存的置換はよく知られており、得られるＴＬ１Ａ融合タンパク質分子の生物学的活性を変えることなく一般的になされる。例えば、かかる置換は、一般的に、極性残基、荷電残基、疎水性残基、小残基等の群内で交換することによってなされる。必要ならば、かかる置換は、好適な細胞表面受容体（例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５）に結合し及び／またはインビトロ生物学的アッセイにおける所望の効果（例えば、Ｔｒｅｇ細胞増殖）を誘起する能力について、得られる修飾タンパク質を単に試験することによって経験的に決定され得る。
【００７８】
オルソログは、種形成による共通の祖先遺伝子から明らかに進化する異なった種の遺伝子である。通常、オルソログは、進化の過程を通じて同一機能を保持する。オルソログの同定は、新しく配列決定されたゲノムの遺伝子機能の信頼性のある予測を提供し得る。オルソログを同定するために使用され得る配列比較アルゴリズムは、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡ、ＤＮＡストライダー及びＧＣＧパイルアッププログラムを含むが、これらに限定されない。オルソログは一般には高い配列類似性を有する。本明細書では、ＴＮＦＲＳＦ２５、好ましくはヒトＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合する能力を保持するＴＬ１Ａの全てのオルソログが使用のために画される。
【００７９】
実施形態によっては、ＴＬ１Ａ融合タンパク質において使用するための、ＴＬ１Ａポリペプチド、ヒンジ領域ポリペプチド、リンカー等の切断された成分（すなわち、フラグメント）も提供される。かかる切断された成分を有するＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸も提供される。切断された分子は、該分子の完全長体未満を含む任意の分子でよい。本開示によって提供された切断された分子は、切断された生物学的ポリマーを含んでよく、本開示の実施形態によっては、かかる切断された分子は、切断された核酸分子または切断されたポリペプチドでよい。切断された核酸分子は、公知のまたは記載された核酸分子の完全長ヌクレオチド配列未満を有し、またはであって、かかる公知のまたは記載された核酸分子は天然、合成または組換え核酸分子でよい。従って、例えば、遺伝子配列に対応する切断された核酸分子は、完全長未満の遺伝子であって、コーディング及び非コーディング配列、プロモーター、エンハンサー及びその他の制御配列、フランキング配列等、並びに該遺伝子の一部として認識される他の機能的及び非機能的配列を含む。別の例では、ｍＲＮＡ配列に対応する切断された核酸分子は、様々な翻訳及び非翻訳領域並びに他の機能的及び非機能的配列を含んでよい、完全長未満のｍＲＮＡ転写物を含む。
【００８０】
切断された分子は、特定のタンパク質またはポリペプチド成分の完全長未満のアミノ酸配列を含むポリヌクレオチドでよい。本明細書で使用される「削除」は、当業者によって理解される通常の意味を有し、例えば、本明細書で提供される切断された分子の場合のように、対応する完全長分子に比べて末端または非末端領域のいずれかからの配列の部分の１またはそれ以上を欠く分子を意味することがある。核酸分子またはポリペプチド等の線状生物学的ポリマーである切断された分子は、該分子の末端からの削除または該分子の非末端領域からの削除のいずれかの１またはそれ以上の分子を有してよく、かかる削除は、１〜５５０、１〜５００、１〜４５０、１〜４００、１〜３５０、１〜３００、１〜２５０、１〜２００、１〜１５０、１〜１００、１〜５０、１〜２５、１〜２０、１５、１〜１０、または１〜５の連続ヌクレオチド残基の削除でよい。切断されたポリペプチド分子は、１〜２５０、１〜２００、１〜１５０、１〜１００、１〜５０、１〜２５、１〜２０、１〜１５、１〜１０、または１〜５の連続ヌクレオチド残基の削除でよい。切断分子（すなわち、フラグメント）は、例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するＴＬ１Ａの細胞外ドメインの一部を含んでよい。
【００８１】
本明細書に開示された組成物及び方法で使用され得る例示的な切断ＴＬ１Ａポリペプチドは、例えば、配列番号１６の４２１またはそれより少ない連続的アミノ酸、例えば、配列番号１６の４００〜４２０、３５０〜４００、３００〜３５０、２５０〜３００、２００〜２５０、１５０〜２００、１００〜１５０、５０〜１００、２５〜７５、５０〜７５、２５〜７５、１５〜２５、または１０〜２０の連続的アミノ酸を含むフラグメントを含んでよい。ＴＬ１Ａポリペプチド（または核酸）の任意のフラグメントは、該フラグメントが機能的に活性である、すなわち、ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合する能力を保持することを条件に、本明細書に記載の用途（または、機能的に活性なポリペプチドをコードする核酸フラグメント）に画される。
【００８２】
本開示は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質のフラグメント、アナログ及び／または誘導体をコードする本明細書で意味する核酸の変異体に関する。ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸の変異体は、核酸の天然アレル変異体または非天然変異体でよい。当業者に知られているように、アレル変異体は、１またはそれ以上のヌクレオチドの置換、削除または付加の少なくとも１つを有してよい核酸配列の別の形態であって、そのうちのいずれかはコードされたＴＬ１Ａ融合タンパク質の機能を実質的に改変しない形態である。
【００８３】
ＴＬ１Ａ融合タンパク質の変異体及び誘導体は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードするヌクレオチド配列の変異によって得られる。天然アミノ酸配列の変更は、多数の慣用的な方法のいずれかによって達成され得る。突然変異は、天然配列のフラグメントへのライゲーションを可能にする制限部位に隣接した、変異配列を含むオリゴヌクレオチドを合成することによって特定の遺伝子座で導入され得る。ライゲーション後に、得られた再構築配列は、所望のアミノ酸挿入、置換または削除を有するアナログをコードする。
【００８４】
あるいは、オリゴヌクレオチド指向部位特異的変異形成手法は、変更された遺伝子を提供するために採用され得、予め決定されたコドンは、置換、削除または挿入によって変更され得る。かかる変更を作製する例示的方法は、Ｗａｌｄｅｒら（Ｇｅｎｅ  ４２：１３３，１９８６）；Ｂａｕｅｒら（Ｇｅｎｅ  ３７：７３，１９８５）；Ｃｒａｉｋ（ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，１９８５年１月，１２−１９）；Ｓｍｉｔｈら（Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，１９８５年１月，１２−１９）；Ｓｍｉｔｈら（Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄｓ，Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｒｅｓｓ，１９８１年）；Ｋｕｎｋｅｌ（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８２：４８８，１９８５）；Ｋｕｎｋｅｌら（Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５４：３６７，１９８７）；及び、米国特許第４，５１８，５８４号及び同第４，７３７，４６２号によって開示されている。
【００８５】
例えば、ＤＮＡの改変は、ＤＮＡテンプレートでの変更を導入し増幅するためのプライマーを用いるＤＮＡ増幅方法、例えばオーバーラップ・エクステンションＰＣＲスプライシング（ＳＯＥ）、の使用と組み合わされたタンパク質をコードするＤＮＡの部位指向変異形成によって達成され得る。部位指向変異形成は、典型的には、周知でかつ商業的に入できるＭ１３ファージベクター等の一本鎖及び二本鎖形態を有するファージベクターを用いて行われる。複製の一本鎖ファージ起点を含む他の好適なベクターが使用され得る（例えば、Ｖｅｉｒａら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５：３，１９８７）参照）。一般的に、部位指向変異形成は、対象のタンパク質（例えば、所定のＴＬ１Ａ融合タンパク質の全てまたは成分部分）をコードする一本鎖ベクターを調製することによって達成される。一本鎖ベクターのＤＮＡとのホモロジー領域内に所望の変異を含むオリゴヌクレオチドは、ベクターにアニールされ、次いでＤＮＡポリメラーゼ、例えば大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＤＮＡポリメラーゼＩ（クレノウ断片）が添加され、それは、１つの一本鎖が改変された配列及び他の最初の配列をコードするヘテロデュプレックスを生成するためのプライマーとしての二本鎖標準起点を用いる。ヘテロデュプレックスは、細菌細胞に導入され、所望の変異を含む好適なクローンが選択される。得られた改変ＤＮＡ分子は、改変されたタンパク質を産生するための好適な宿主細胞で遺伝子工学的に発現され得る。
【００８６】
アミノ酸残基または配列の様々な付加または置換、あるいは生物活性に必要とされない末端または内部残基または配列の削除をコードする等価なＤＮＡコンストラクトもまた、本明細書に包含される。例えば、また上で議論したように、生物活性に望ましくないまたは必須でないＣｙｓ残基をコードする配列は、Ｃｙｓ残基を削除させまたは他のアミノ酸と置換させるように改変され得、このことは、変性時に不正確な分子内ジスルフィド架橋の形成を抑制する。あるいは、追加のＣｙｓ残基は、多量化を促進するために導入され得る。
【００８７】
ＴＬ１Ａ及びＴＬ１Ａとその受容体ＴＮＦＲＳＦ２５との結合相互作用のための結合ドメインは、当業者が、本発現コンストラクトのコードされた生成物に含めるために好適なポリペプチドドメインを容易に選択することができ、どの核酸及び／またはアミノ酸残基が修飾を受ける（例えば、置換、削除、付加等）かを理解するように、特徴付けられている。例えば、Ｚｈａｎら、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．２００９年８月、１８；４８（３２）：７６３６−４５参照。更に、上記のポリヌクレオチドのいずれかが特異的にＴＮＦＲＳＦ２５に結合するか否かを決定するためのアッセイは、上で議論したように、当該分野では知られており、実施例１に記載されている。
【００８８】
本明細書に記載されるような用途のための核酸及びオリゴヌクレオチドは、当業者に公知の任意の方法によって合成され得る（例えば、ＷＯ９３／０１２８６、米国特許出願第０７／７２３，４５４号；米国特許第５，２１８，０８８号；米国特許第５，１７５，２６９号；米国特許第５，１０９，１２４号参照）。
【００８９】
本開示で使用するためのオリゴヌクレオチド及び核酸配列の同定は、当該分野で公知の周知の方法を含む。例えば、所望の性質、長さ、及び有用なオリゴヌクレオチドの他の性質は周知である。ある実施形態では、以下の結合を含むことによって、内因性宿主細胞核酸分解酵素による分解に抵抗する合成オリゴヌクレオチド及び核酸配列が設計され得る：ホスホロチオエート、メチルホスホネート、スルホン、スルフェート、ケチル、ホスホロジチオエート、ホスホロアミデート、リン酸エステル、及びアンチセンス適用において有用であることが判明している他のかかる結合（例えば、Ａｇｒａｗａｌ及びＧｏｏｄｃｈｉｌｄ；Ｔｅｔｒｅｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．２８：３５３９−３５４２（１９８７）；Ｍｉｌｌｅｒら，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．９３：６６５７−６６６５（１９７１）；Ｓｔｅｃら，Ｔｅｔｒｅｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．２６：２１９１−２１９４（１９８５）；Ｍｏｏｄｙら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１２：４７６９−４７８２（１９８９）；Ｕｚｎａｎｓｋｉら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．（１９８９）；Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒｒら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  ４０：１３７−１４３（１９８４）；Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５４：３６７−４０２（１９８５）；Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｌ．Ｓｃｉ．１４：９７−１００（１９８９）；Ｓｔｅｉｎ  Ｉｎ：Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ．Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ  ｏｆ  Ｇｅｎｅ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，Ｃｏｈｅｎ著，Ｍａｃｍｉｌｌａｎ  Ｐｒｅｓｓ，Ｌｏｎｄｏｎ，ｐｐ．９７−１１７（１９８９）；Ｊａｇｅｒら，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２７：７２３７−７２４６（１９８８）参照）。
【００９０】
宿主生物は、本開示の組換えコンストラクトによってコードされるＴＬ１Ａ融合生成物の組換え産生が起こる生物、例えば、細菌（例えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））、酵母（例えば、サッカロミケス・ケレウィシアエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）及びピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ））、昆虫細胞、及びインビトロ及びインビボでの発現を含む哺乳動物を含む。従って、宿主生物は、本明細書で提供される組成物の製造における構築、増殖、発現または他のステップのための生物を含み得る；宿主はまた、上記のように免疫応答が起こる対象を含む。現在好ましい宿主生物は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）株、近交系マウス株及びネズミ細胞株、非ヒト霊長類対象及び細胞株、並びにヒト細胞、対象及び細胞株を含む。
【００９１】
所望のＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードするＤＮＡコンストラクトは、好適な宿主での発現用プラスミドに導入される。宿主は細菌宿主でよい。リガンドまたは核酸結合ドメインをコードする配列は、好ましくは、特定の宿主での発現にコドン最適化される。従って、例えば、ヒトＴＬ１Ａ融合タンパク質が細菌で発現される場合には、コドンは細菌利用のために最適化されるだろう。小コーディング領域について、遺伝子は一本のオリゴヌクレオチドとして合成され得る。より大きなタンパク質については、複数のオリゴヌクレオチドのスプライシング、突然変異形成または他の当該分野で公知の技術が使用され得る。プロモーター及びオペレータ等の制御領域であるプラスミド中のヌクレオチド配列は、作動的に翻訳のために互いに結合される。ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードするヌクレオチド配列はまた、分泌シグナルをコードするＤＮＡを含み、それによって得られたペプチドは前駆体タンパク質である。得られたプロセスを受けたタンパク質は、細胞周辺腔または発酵媒体から回収され得る。
【００９２】
ＤＮＡプラスミドはまた、転写ターミネータ配列を含み得る。本明細書で使用される「転写ターミネータ領域」は転写終結をシグナルする配列である。転写ターミネータ全体は、挿入されたＴＬ１Ａ融合タンパク質コーディング遺伝子またはプロモーターの起源と同一であるかまたは異なっていてよい、タンパク質コーディング遺伝子から得られる。転写ターミネータは、本明細書に記載の発現系の任意の成分である。
【００９３】
本明細書で使用されるプラスミドは、対象のタンパク質またはポリペプチドをコードするＤＮＡと作動可能に結合しているプロモーターを含み、プラスミドの所望の用途（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質コーディング配列を含むワクチンの投与）に依って、上記の好適な宿主（例えば、細菌、ネズミまたはヒト）中のタンパク質の発現のために設計される。本明細書に記載のタンパク質及びポリペプチドの発現用の好適なプロモーターは、幅広く入手可能で、当該分野で周知である。制御領域に連結される誘導性プロモーターまたは構成的プロモーターが好ましい。かかるプロモーターは、Ｔ７ファージプロモーター、及び他のＴ７様ファージプロモーター、例えばＴ３、Ｔ５及びＳＰ６プロモーター、ｔｒｐ、１ｐｐ及び大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）由来のｌａｃプロモーター、例えばｌａｃＵＶ５、Ｐ１０またはバキュロウイルス／昆虫細胞発現系のポリヘドリン遺伝子プロモーター（例えば、米国特許第５，２４３，０４１号、同第５，２４２，６８７号、同第５，２６６，３１７号、同第４，７４５，０５１号及び同第５，１６９，７８４号参照）及び他の真菌発現系由来の誘導性プロモーターを含むが、これらに限定されない。これはまた、ヒトフェリチンプロモーターを含み得る。タンパク質の発現用には、かかるプロモーターは、ｌａｃオペロン等の制御領域を有する可動的結合でプラスミドに挿入される。
【００９４】
好ましいプロモーター領域は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）中で、誘導性で機能的なものである。好適な誘導性プロモーター及びプロモーター領域の例は、イソプロピルβ−Ｄ−チオガラクトピラノシドに応答するＥ．ｃｏｌｉ．ｌａｃオペレータ（ＩＰＴＧ；Ｎａｋａｍｕｒａら，Ｃｅｌｌ  １８：１１０９−１１１７，１９７９参照）；重金属（例えば、亜鉛）誘導に応答するメタロチオネインプロモーター金属制御要素（例えば、Ｅｖａｎｓらの米国特許第４，８７０，００９号参照）；ＩＰＴＧに応答するファージ  Ｔ７ｌａｃプロモーター（例えば、米国特許第４，９５２，４９６号；及びＳｔｕｄｉｅｒら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８５：６０−８９，１９９０）、及びＴＡＣプロモーターを含むが、これらに限定されない。
【００９５】
プラスミドは、場合により、宿主で機能的な選択可能なマーカー遺伝子または遺伝子群を含む。選択可能なマーカー遺伝子は、形質転換された細菌細胞を同定させ、そして非形質転換細胞の大多数の中から選択的に成長する、細菌に表現型を与える任意の遺伝子を含む。細菌宿主のための好適な選択可能なマーカー遺伝子は、例えば、アンピシリン耐性遺伝子（Ａｍｐｒ）、テトラサイクリン耐性遺伝子（Ｔｃｒ）及びカナマイシン耐性遺伝子（Ｋａｎｒ）を含む。
【００９６】
プラスミドはまた、作動可能に連結したタンパク質の分泌のためのシグナルをコードするＤＮＡを含んでよい。使用に好適な分泌シグナルは、幅広く入手可能であり、当該分野で周知である。大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）で機能的な原核及び真核細胞分泌シグナルが採用されてもよい。現在好ましい分泌シグナルは、以下の大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）遺伝子：ｏｍｐＡ、ｏｍｐＴ、ｏｍｐＦ、ｏｍｐＣ、β−ラクタマーゼ及びアルカリホスファターゼによってコードされるものを含むが、これらに限定されない（ｖｏｎ  Ｈｅｉｊｎｅ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８４：９９−１０５，１９８５）。加えて、細菌ｐｅｌＢ遺伝子分泌シグナル（Ｌｅｉら，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１６９：４３７９，１９８７）、ｐｈｏＡ分泌シグナル、及び昆虫細胞で機能的なｃｅｋ２も採用され得る。当該分野で公知の他の真核及び真核細胞分泌シグナルが採用されてもよい（例えば、ｖｏｎ  Ｈｅｉｊｎｅ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８４：９９−１０５，１９８５参照）。本明細書に記載の方法を用いて、当業者は、酵母、昆虫細胞または哺乳動物細胞由来のタンパク質を分泌するための酵母、昆虫細胞または哺乳動物細胞のいずれかで機能的な分泌シグナルを置き換えることができる。
【００９７】
実施形態によっては、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）細胞の形質転換のための好ましいプラスミドはｐＥＴ発現ベクターを含む（例えば、ｐＥＴ−１１ａ、ｐＥＴ−１２ａ−ｃ、ｐＥＴ−１５ｂ；米国特許第４，９５２，４９６号参照；Ｎｏｖａｇｅｎ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．から入手可能）。他の好ましいプラスミドはｐＫＫプラスミド、特にｔａｃプロモーターを含むｐＫＫ  ２２３−３を含む（Ｂｒｏｓｉｕｓら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８１：６９２９，１９８４；Ａｕｓｕｂｅｌら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ；米国特許第５，１２２，４６３号、同第５，１７３，４０３号、同第５，１８７，１５３号、同第５，２０４，２５４号、同第５，２１２，０５８号、同第５，２１２，２８６号、同第５，２１５，９０７号、同第５，２２０，０１３号、同第５，２２３，４８３号、及び同第５，２２９，２７９号）。プラスミドｐＫＫは、アンピシリン耐性遺伝子をカナマイシン耐性遺伝子と置換することによって改変されている（ファルマシア（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）入手可能；ｐＵＣ４Ｋから得られた、例えば、Ｖｉｅｉｒａら（Ｇｅｎｅ  １９：２５９−２６８，１９８２；及び米国特許第４，７１９，１７９号参照））。ｐＢｌｕｅＢａｃ（ｐＪＶＥＴＬ及びその誘導体とも呼ばれる）等のバキュロウイルスベクター、特にｐＢｌｕｅＢａｃ  ＩＩＩ（例えば、米国特許第５，２７８，０５０号、同第５，２４４，８０５号、同第５，２４３，０４１号、同第５，２４２，６８７号、同第５，２６６，３１７号、同第４，７４５，０５１号及び５，１６９，７８４号参照；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏから入手可能）はまた、昆虫細胞でポリペプチドの発現に使用され得る。他のプラスミドは、ｐＩＮ−ＩＩＩｏｍｐＡ２等のｐＩＮ−ＩＩＩｏｍｐＡプラスミドを含む（米国特許第４，５７５，０１３号；Ｄｕｆｆａｕｄら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．１５３：４９２−５０７，１９８７も参照）。
【００９８】
実施形態によっては、ＤＮＡ分子は細菌細胞、好ましくは大腸菌中で複製される。好ましいＤＮＡ分子はまた、細菌の世代から世代へのＤＮＡ分子の維持を確実にするために細菌の複製起点を含む。このようにして、大量のＤＮＡ分子は、細菌中で複製することによって得られる。好ましい細菌の複製起点は、ｆｌ−ｏｒｉ及びｃｏｌ  Ｅ１複製起点を含むが、これらに限定されない。好ましい宿主は、ｌａｃＵＶプロモーター等の誘導性プロモーターに作動可能に連結されたＴ７  ＲＮＡポリメラーゼをコードするＤＮＡの染色体コピーを含む（米国特許第４，９５２，４９６号参照）。かかる宿主は、溶原大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）株、ＨＭＳ１７４（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ、ＢＬ２１（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ、ＨＭＳ１７４（ＤＥ３）、及びＢＬ２１（ＤＥ３）を含むが、これらに限定されない。ＢＬ２１（ＤＥ３）株は好ましい。ｐＬｙｓ株は、Ｔ７  ＲＮＡポリメラーゼの天然阻害剤であるＴ７ライソザイムの低レベルを提供する。
【００９９】
提供されたＤＮＡ分子は、レプレッサタンパク質をコードする遺伝子を含んでよい。レプレッサタンパク質は、レプレッサタンパク質が結合するヌクレオチド配列を含むプロモーターの転写を抑制することができる。プロモーターは、細胞の生理学的条件を変更することによって抑制解除され得る。例えば、変更は、オペレータまたは制御タンパク質または他のＤＮＡ領域と相互作用する能力を阻害する分子を成長培地に加え、または成長培地の温度を変更することによって達成され得る。レプレッサタンパク質は、ＩＰＴＧ誘導に応答する大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ｌａｃＩレプレッサ、温度感受性λｃＩ８５７レプレッサ等を含むが、これらに限定されない。
【０１００】
一般的に、組換えコンストラクトはまた、転写及び翻訳に必要な要素を含むことになる。特に、かかる要素は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸配列を含む組換え発現コンストラクトが宿主細胞または生物で発現することを意図している場合には好ましい。本開示のある実施形態では、好ましい細胞種、または細胞ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする遺伝子の発現に特異的な細胞種は、プロモーターの制御下に遺伝子を置くことによって達成され得る。プロモーターの選択は、形質転換される細胞種及び望ましい制御の程度または種類に依拠することになる。プロモーターは、更に、構成的または活性でよく、細胞種特異的、組織特異的、個々の細胞特異的、事象特異的、一時的特異的または誘導性でよい。細胞種特異的プロモーター及び事象特異的プロモーターが好ましい。構成的または非特異的プロモーターの例は、ＳＶ４０初期プロモーター（米国特許第５，１１８，６２７号）、ＳＶ４０後期プロモーター（米国特許第５，１１８，６２７号）、ＣＭＶ初期遺伝子プロモーター（米国特許第５，１６８，０６２号）、及びアデノウイルスプロモーターを含む。ウイルスプロモーターに加えて、細胞性プロモーターも使用され得る。特に、いわゆるハウスキーピング遺伝子用細胞性プロモーターは有用である。ウイルスプロモーターは、一般的に、細胞性プロモーターより強力なプロモーターであるので、好ましい。特定の宿主での使用のための好適なプロモーターが当業者によって容易に選択され得るように、プロモーター領域は、より高等な真核生物を含む多くの真核生物の遺伝子で同定されている。
【０１０１】
誘導性プロモーターも使用され得る。これらのプロモーターは、デキサメタソンによって誘導できるＭＭＴＶ  ＬＴＲ（ＰＣＴ  ＷＯ  ９１／１３１６０）；重金属によって誘導できるメタロチオネインプロモーター；及びｃＡＭＰによって誘導できるｃＡＭＰ応答要素を有するプロモーターを含む。誘導性プロモーターを用いて、ＴＬ１Ａ誘導タンパク質をコードする核酸配列は発現コンストラクトによって細胞に送達され、インデューサの添加まで静止したままである。このことは、遺伝子産物の産生の時期に更なる制御を可能にする。
【０１０２】
事象特異的プロモーターは、腫瘍形成性またはウイルス感染等の事象の発生時のみ、活性であるかまたは上方調節されている。ＨＩＶ  ＬＴＲは事象特異的プロモーターの周知の例である。ウイルス感染時に生じるｔａｔ遺伝子産物が存在しない場合には、該プロモーターは不活性である。事象型プロモーターは組織特異的なものもある。
【０１０３】
更に、特定の細胞遺伝子で協調的に制御されるプロモーターが使用され得る。例えば、特定のＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする遺伝子の発現が１またはそれ以上の追加の内因性または外因的に導入された遺伝子の発現と協調して望まれる時に、協調的に発現される遺伝子のプロモーターが使用され得る。免疫系の特定の組織内の特定の免疫応答性細胞が活性化され得るか、またはそうでなければ免疫応答に参加するために補充され得るように、該組織における免疫応答の誘導に関連した遺伝子発現のパターンを当業者が知っている時に、この種のプロモーターは特に有用である。
【０１０４】
該プロモーターに加えて、レプレッサ配列、ネガティブ調節因子または組織特異的サイレンサは、ある状況、例えば治療方法の一部として一時的に免疫不全にされる宿主において遺伝子をコードするＴＬ１Ａ融合タンパク質の非特異的発現を減少させるために挿入され得る。複数のレプレッサ要素は、プロモーター領域に挿入され得る。転写の抑制は、レプレッサ要素の方向及びプロモーターからの距離に依らない。レプレッサ配列の１種はインサレータ配列である。かかる配列は転写を阻害し（Ｄｕｎａｗａｙら，Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ  １７：１８２−９，１９９７；Ｇｄｕｌａら，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ９３：９３７８−８３，１９９６、Ｃｈａｎら，Ｊ  Ｖｉｒｏｌ  ７０：５３１２−２８，１９９６；Ｓｃｏｔｔ及びＧｅｙｅｒ，ＥＭＢＯ  Ｊ．１４：６２５８−６７，１９９５；Ｋａｌｏｓ及びＦｏｕｒｎｉｅｒ，Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ  １５：１９８−２０７，１９９５；Ｃｈｕｎｇら，Ｃｅｌｌ  ７４：５０５−１４，１９９３）、バックグラウンド転写をサイレンスするだろう。
【０１０５】
レプレッサ要素はまた、ＩＩ型（カートリッジ）コラーゲン、コリンアセチルトランスフェラーゼ、アルブミン（Ｈｕら，Ｊ．Ｃｅｌｌ  Ｇｒｏｗｔｈ  Ｄｉｆｆｅｒ．３（９）：５７７−５８８，１９９２）、ホスホグリセレートキナーゼ（ＰＧＫ−２）（Ｍｉｓｕｎｏら，Ｇｅｎｅ  １１９（２）：２９３−２９７，１９９２）の遺伝子、及び６−ホスホフルクト−２−キナーゼ／フルクトース−２，６−ビスホスファターゼ遺伝子（Ｌｅｍａｉｇｒｅら，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１１（２）：１０９９−１１０６）のプロモーター領域で同定されている。更に、ネガティブ制御要素Ｔｓｅ−１は、多数の肝臓特異的遺伝子で同定されており、肝臓細胞での遺伝子活性のｃＡＭＰ応答要素（ＣＲＥ）介在誘導を遮断することが明らかにされている（Ｂｏｓｈａｒｔら，Ｃｅｌｌ  ６１（５）：９０５−９１６，１９９０）。
【０１０６】
実施形態によっては、所望の生成物の発現を増加させる要素はコンストラクトに組み込まれる。かかる要素は、内部リボゾーム結合部位（ＩＲＥＳ；Ｗａｎｇ及びＳｉｄｄｉｑｕｉ，Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐ．Ｍｉｃｒｏｈｉｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０３：９９，１９９５；Ｅｈｒｅｎｆｅｌｄ及びＳｅｍｌｅｒ，Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐ．Ｍｉｃｒｏｈｉｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０３：６５，１９９５；Ｒｅｅら，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ２０：１０２，１９９６；Ｓｕｇｉｍｏｔｏら，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １２：６９４，１９９４）を含む。ＩＲＥＳは翻訳効率を増加させる。他の配列は、例えばある遺伝子の発現を亢進し、特に５’末端の配列は転写及び／または翻訳を阻害する。これらの配列は、通常、ヘパリン構造を形成し得るパリンドロームである。送達される核酸の任意のかかる配列は一般的に削除される。転写物または翻訳された生成物の発現レベルは、どの配列が発現に影響を与えるかを確認または確かめるためにアッセイされる。転写物レベルは、ノーザンブロットハイブリダイゼーション、ＲＮａｓｅプローブプロテクション等を含む任意の公知の方法によってアッセイされ得る。タンパク質レベルは、ＥＬＩＳＡ、ウェスタンブロット、免疫細胞化学または他の周知の技術を含む任意の公知の方法によってアッセイされる。
【０１０７】
他の要素は、本開示のＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードするコンストラクトに組み込まれ得る。例えば、該コンストラクトは、ポリアデニル化配列を含む転写終結配列、スプライスドナー及びアクセプター部位、及びエンハンサーを含む。哺乳動物または他の真核細胞における該コンストラクトの発現及び維持に有用な他の要素も組み込まれてよい（例えば、複製起点）。該コンストラクトは細菌細胞で都合良く産生され得るので、細菌中での増殖に必要なまたはこれを亢進する要素が組み込まれてよい。かかる要素は、複製起点、選択性マーカー等を含む。
【０１０８】
本明細書で提供されるように、本明細書に開示されたコンストラクトを用いて細胞に送達されるＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸の発現を調節する追加のレベルは、２またはそれ以上の異なった制御された核酸コンストラクトを同時に送達することによって提供され得る。かかる複数の核酸コンストラクト方法の使用は、免疫応答の協調した制御、例えば、細胞種及び／または別の発現済みのコードされた成分の存在に依拠する時空の協調を可能にすることがある。当業者は、制御された遺伝子発現の複数のレベルが、プロモーター、エンハンサー及び他の周知の遺伝子制御要素を含むがこれらに限定されない好適な制御配列の選択によって類似の方法で達成され得る。
【０１０９】
本開示はまた、ベクター、本開示の核酸を含む公知のベクターから調製されたコンストラクト、特に、上記のＴＬ１Ａ融合タンパク質及びポリペプチドをコードする任意の核酸を含む「組換え発現コンストラクト」；ベクター及び／またはコンストラクトで遺伝子的に作製される宿主細胞、及び本明細書に開示された例えばＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはフラグメント、オルソログまたはその変異体をコードする核酸配列を含む発現コンストラクトを組換え技術によって投与する方法に関する。ＴＬ１Ａ融合タンパク質は、コンストラクトの性質（例えば、上記のプロモーターの性質）及び所望の宿主細胞の性質（例えば、有糸分裂後の最終的な分化または活発に分割；例えば、発現コンストラクトはエピソームとしての宿主細胞で起こるかまたは宿主細胞ゲノムに組み込まれるか）に依って、好適なプロモーターの制御条件下で実質的に任意の宿主で発現され得る。原核及び真核細胞宿主で使用するための好適なクローニング及び発現ベクターは、Ｓａｍｂｒｏｏｋら，  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．（１９８９）に記載され；上記のように、実施形態によっては、組換え発現は、本明細書に記載の組換え発現コンストラクトでトランスフェクトされたまたは形質転換された哺乳動物細胞で行われる。
【０１１０】
典型的には、コンストラクトはプラスミドベクターから得られる。好ましいコンストラクトは、アンピシリン耐性遺伝子をコードする核酸配列、ポリアデニル化シグナル及びＴ７プロモーター部位を有する、改変ｐＮＡＳＳベクター（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ，Ｃａｌｉｆ．）である。他の好適な哺乳動物発現ベクターは周知である（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら，１９９５；  Ｓａｍｂｒｏｏｋら，前掲参照；また、例えば、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．からのカタログ；Ｎｏｖａｇｅｎ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．；Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，Ｎ．Ｊ．；及びその他参照）。好適な選択剤（例えば、メトトレキサート）の適用後に遺伝子増幅から得られる結果に達するようなＴＬ１Ａ融合タンパク質の向上した産生レベルを促進するための、好適な制御的調整下でジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）コーディング配列を含む現在好ましいコンストラクトが調製され得る。
【０１１１】
一般的に、組換え発現ベクターは、複製起点及び宿主細胞の形質転換を許容する選択性マーカー、及び上記の下流構造的配列の直接的複製を指向するための高度に発現された遺伝子から得られたプロモーターを含むことになる。非相同構造的配列は、翻訳開始配列及び翻訳終結配列を有する好適なフェーズで集結される。従って、例えば、本明細書で提供されるＴＬ１Ａ融合タンパク質コーディング核酸は、宿主細胞中でＴＬ１Ａ融合タンパク質を発現する組換え発現コンストラクトとしての様々な発現ベクターコンストラクトのいずれか１つに含まれ得る。ある好ましい実施形態では、コンストラクトは、インビボで投与される製剤に含まれる。かかるベクター及びコンストラクトは、染色体、非染色体及び合成ＤＮＡ配列、例えば、ＳＶ４０の誘導体；細菌プラスミド；ファージＤＮＡ；酵母プラスミド；プラスミドおよびファージＤＮＡの組合せ、ウイルスＤＮＡ、例えばワクシニア、アデノウイルス、鶏ポックスウイルス、及び偽狂犬病、または以下に記載の複製欠損レトロウイルスから得られるベクターを含む。しかしながら、組換え発現コンストラクトの調製のために任意の他のベクターが使用されてもよく、好ましい実施形態ではかかるベクターは宿主で複製可能でかつ生存性である。
【０１１２】
好適なＤＮＡ配列（複数可）は、様々な手法によってベクターに挿入され得る。一般的に、ＤＮＡ配列は、当該分野で公知の手法によって好適な制限エンドヌクレアーゼ部位（複数可）に挿入される。クローニング、ＤＮＡ単離、増幅及び精製、酵素反応関連ＤＮＡリガーゼ、ＤＮＡポリメラーゼ、制限エンドヌクレアーゼ等のための標準的技術、及び様々な分離技術は、知られており、当業者によって一般的に採用されている。多数の標準的技術は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（１９９３年  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂｌ．Ａｓｓｏｃ．Ｉｎｃ．＆ＪｏｈｎＷｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｂｏｓｔｏｎ，Ｍａｓｓ．）；Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ，Ｎ．Ｙ．）；Ｍａｎｉａｔｉｓら（１９８２年  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ，Ｎ．Ｙ．）；Ｇｌｏｖｅｒ（著）（１９８５年  ＤＮＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  第Ｉ及びＩＩ巻，ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ，ＵＫ）；Ｈａｍｅｓ及びＨｉｇｇｉｎｓ（著），（１９８５年  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ，ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ，ＵＫ）；及び至るところに記載されている。
【０１１３】
発現ベクター中のＤＮＡ配列は、少なくとも１つの好適な発現制御配列（例えば、構成的プロモーターまたは制御されたプロモーター）に作動可能に連結されて、ｍＲＮＡ合成を指向する。かかる発現制御配列の代表例は、上記の真核細胞またはそのウイルスのプロモーターを含む。プロモーター領域は、ＣＡＴ（クロラムフェニコールトランスフェラーゼ）ベクターまたは選択性マーカーを有する他のベクターを用いて、任意の所望の遺伝子から選択され得る。真核細胞プロモーターは、最初期ＣＭＶ、ＨＳＶチミジンキナーゼ、初期及び後期ＳＶ４０、レトロウイルス由来のＬＴＲ、及びマウスメタロチオネイン−Ｉを含む。好適なベクター及びプロモーターの選択は、当業者のレベルの十分範囲内であり、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸に作動可能に連結された少なくとも１つのプロモーターまたは制御されたプロモーターを含む特に好ましい組換え発現コンストラクトの調製は本明細書に記載されている。
【０１１４】
より高等な真核細胞による本開示のポリペプチドをコードするＤＮＡの転写は、エンハンサー配列をベクターの挿入することによって増加され得る。エンハンサーは、その転写を増加するためのプロモーターとして働くＤＮＡのシス作用要素であり、通常約１０〜３００ｂｐである。例は、複製起点の１００〜２７０、後ろ側のＳＶ４０エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後ろ側のポリオーマエンハンサー、及びアデノウイルスエンハンサーを含む。
【０１１５】
本明細書で提供されているように、実施形態によっては、ベクターは、レトロウイルスベクター等のウイルスベクターでよい（Ｍｉｌｌｅｒら，１９８９  ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ７：９８０；Ｃｏｆｆｉｎ及びＶａｒｍｕｓ，１９９６  Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ．）。例えば、レトロウイルスプラスミドベクターが得られるレトロウイルスは、モロニーマウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、レトロウイルス、例えばラウス肉腫ウイルス、ハーベイ肉腫ウイルス、トリ白血病ウイルス、テナガザル白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、アデノウイルス、骨髄増殖症候群ウイルス、及び乳癌ウイルスを含むが、これらに限定されない。
【０１１６】
レトロウイルスは、複製し、ＤＮＡ中間体を介して宿主細胞のゲノムに組み込むことができるＲＮＡウイルスである。このＤＮＡ中間体はまたはプロウイルスは、宿主細胞のＤＮＡに安定的に組み込まれ得る。本開示のある実施形態によれば、発現コンストラクトは、外来タンパク質をコードする外来遺伝子が正常なレトロウイルスＲＮＡの代わりに取り込まれる、レトロウイルスを含み得る。レトロウイルスＲＮＡが感染と同時に宿主細胞に入ると、外来遺伝子も該細胞に導入され、次いで、該外来遺伝子があたかもレトロウイルスゲノムの一部であるかのように宿主細胞ＤＮＡに組み込まれ得る。宿主内のこの外来遺伝子の発現は、外来タンパク質の発現をもたらす。
【０１１７】
遺伝子治療のために開発されたほとんどのレトロウイルスベクター系は、ネズミレトロウイルスに基づく。かかるレトロウイルスは、ビリオンと言われる遊離ウイルス粒子としてまたは宿主細胞ＤＮＡに組み込まれたプロウイルスとしての２つの形態で存在する。ウイルスのビリオン形態は、レトロウイルスの構造的及び酵素タンパク質（酵素逆転写酵素を含む）、ウイルスゲノムの２つのＲＮＡコピー、及びウイルスエンベローブ糖タンパク質を含む細胞起源（ｓｏｕｒｃｅ  ｃｅｌｌ）プラズマメンブレンの一部を含む。レトロウイルスゲノムは、４つの主な領域に組織化される：転写の開始及び終結に必要なシス作用要素を含み、コーディング遺伝子の５’及び３’の両方に位置する、長い末端反復（ＬＴＲ）、並びに３つのコーディング遺伝子ｇａｇ、ｐｏｌ及びｅｎｖ。これらの３つの遺伝子ｇａｇ、ｐｏｌ及びｅｎｖは、各々、内部ウイルス構造、酵素タンパク質（インテグラーゼ等）、及びウイルスの感染性及び宿主領域特異性、及び未決定の機能の「Ｒ」ペプチドを与えるエンベローブ糖タンパク質（ｇｐ７０及びｐ１５ｅと指定）をコードする。
【０１１８】
別箇のパッケージング細胞株及びベクター産生細胞株は、本開示によって提供される発現コンストラクトでのレトロウイルスの使用を含む、レトロウイルスの使用に関する安全性の懸念のために開発されてきた。すなわち、この方法は、２つの成分、すなわちレトロウイルスベクター及びパッケージング細胞株（ＰＣＬ）を採用する。レトロウイルスベクターは、長い末端反復（ＬＴＲ）、移入される外来ＤＮＡ、及びパッケージング配列（ｙ）を含む。構造的及びエンベローブタンパク質をコードする遺伝子がベクターゲノム内に含まれないので、このレトロウイルスベクターはそれ自体再生しないだろう。ＰＣＬは、ｇａｇ、ｐｏｌ及びｅｎｖタンパク質をコードする遺伝子を含むがパッケージングシグナル「ｙ」を含まない。従って、ＰＣＬは、それ自体、空のビリオン粒子を形成できるにすぎない。この一般的な方法においては、レトロウイルスベクターはＰＣＬに導入され、それによってベクター産生細胞株（ＶＣＬ）を産生する。このＶＣＬは、レトロウイルスベクター（外来）ゲノムのみを含むビリオン粒子を製造し、そのため、治療的使用のための安全なレトロウイルスであると以前は考えられていた。
【０１１９】
「レトロウイルスベクターコンストラクト」は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質コーディング核酸配列等の対象の配列（複数可）または遺伝子（複数可）の発現を指向できるアセンブリを意味する。すなわち、レトロウイルスベクターコンストラクトは、５’ＬＴＲ、ｔＲＮＡ結合部位、パッケージングシグナル、第２鎖ＤＮＡ合成の起点、及び３’ＬＴＲを含まなければならない。広範囲な非相同配列が該ベクターコンストラクトに含まれ、該ベクターコンストラクトは、例えば、タンパク質（例えば、細胞傷害性タンパク質、疾患関連抗原、免疫アクセサリー分子、または置換遺伝子）をコードする配列、または分子自体として（例えば、リボザイムまたはアンチセンス配列として）有用である配列を含む。
【０１２０】
本開示のレトロウイルスベクターコンストラクトは、例えばＢ、Ｃ及びＤ型レトロウイルス、並びにスプマウイルス及びレンチウイルスを含む広範囲なレトロウイルスから容易に構築され得る（例えば、ＲＮＡ  Ｔｕｍｏｒ  Ｖｉｒｕｓｅｓ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，１９８５参照）。かかるレトロウイルスは、アメリカンタイプカルチャーコレクション（「ＡＴＣＣ」；Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，Ｍｄ．）等の寄託またはコレクションから容易に得られ、または一般的に利用可能な技術を用いて公知の起源から単離される。上記のレトロウイルスのいずれかは、本明細書で提供された本開示の、レトロウイルスベクターコンストラクト、パッケージング細胞、または産生細胞、及び標準的な組換え技術を統合または構築するために容易に利用され得る（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，１９８９；Ｋｕｎｋｌｅ，ＰＮＡＳ  ８２：４８８，１９８５）。
【０１２１】
ウイルスベクターでの使用のための好適なプロモーターは、一般的にレトロウイルスＬＴＲ；ＳＶ４０プロモーター；及びＭｉｌｌｅｒら，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ７：９８０−９９０（１９８９）に記載のヒトサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター、または任意の他のプロモーター（例えば、細胞プロモーター、例えばヒストン、ｐｏｌ  ＩＩＩを含むがこれらに限定されない真核細胞プロモーター、及び（β−アクチンプロモーター））を含み得るが、これらに限定されない。採用され得る他のウイルスプロモーターは、アデノウイルスプロモーター、チミジンキナーゼ（ＴＫ）プロモーター、及びＢ１９パルボウイルスプロモーターを含むが、これらに限定されない。好適なプロモーターの選択は、当業者には本明細書に含まれる技術から明らかであろう、また、制御されたプロモーターまたは上記のプロモーターのいずれかからでよい。
【０１２２】
上記のように、レトロウイルスベクターは、パッケージング用細胞株を形質導入して産生細胞株を形成するために採用される。トランスフェクトされ得るパッケージング細胞の例は、ＰＥ５０１、ＰＡ３１７、Ｐｓｉ−２、Ｐｓｉ−ＡＭ、ＰＡ１２、Ｔ１９−１４Ｘ、ＶＴ−１９−１７−Ｈ２、Ｐｓｉ−ＣＲＥ、Ｐｓｉ−ＣＲＩＰ、ＧＰ＋Ｅ−８６、ＧＰ＋ｅｎｖＡｍ１２、及びＭｉｌｌｅｒ，Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ，１：５−１４（１９９０）に記載のＤＡＮ細胞株を含むが、これらに限定されない。ベクターは、当該分野で公知の任意の手段を介してパッケージング細胞を形質導入し得る。かかる手段は、エレクトロポレーション、リポゾームの使用、ＣａＰＯ４沈殿を含むが、これらに限定されない。１つの選択肢として、レトロウイルスプラスミドベクターは、リポソームにカプセル化され、脂質に結合され、次いで宿主に投与され得る。
【０１２３】
産生細胞株は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸配列（複数可）を含む感染性レトロウイルスベクター粒子を作製する。かかるレトロウイルスベクター粒子は、インビトロまたはインビボのいずれかで真核細胞を形質導入するために採用され得る。形質導入された真核細胞は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする核酸配列（複数可）を発現することになる。形質導入され得る真核細胞は、胚幹細胞、及び造血幹細胞、肝細胞、線維芽細胞、循環末梢血単核球細胞及び骨髄単球性細胞を含む多形核（ＰＭＮ）細胞、リンパ球、筋芽細胞、組織マクロファージ、樹状細胞、クッパー細胞、リンパ節及び脾臓のリンパ細胞及び細網内皮細胞、ケラチノサイト、内皮細胞、及び気管支上皮細胞を含むが、これらに限定されない。
【０１２４】
ウイルスベクターが組換えＴＬ１Ａ融合発現コンストラクトを調製するために使用される別の例として、ＴＬ１Ａ融合タンパク質または融合タンパク質の発現を指向する組換えウイルスコンストラクトによって形質導入された宿主細胞は、ウイルス出芽中にウイルス粒子によって組み込まれた宿主細胞膜の部分から得られる発現されたＴＬ１Ａ融合タンパク質または融合タンパク質を含むウイルス粒子を産生し得る。
【０１２５】
実施形態によっては、本開示は、上記の組換えＴＬ１Ａ融合発現コンストラクトを含む宿主細胞に関する。宿主細胞は、例えばクローニングベクター、シャトルベクターまたは発現コンストラクトでよい、本明細書に開示されたベクター及び／または発現コンストラクトで、遺伝子工学的に作製（形質導入、形質転換またはトランスフェクト）される。ベクターまたはコンストラクトは、例えば、プラスミド、ウイルス粒子、ファージ等の形態でよい。作製された宿主細胞は、プロモーターを活性化し、形質転換体を選択し、またはＴＬ１Ａ融合タンパク質をコードする遺伝子等の特定の遺伝子またはＴＬ１Ａ融合タンパク質を増幅するための、必要に応じて改変された慣用的な栄養培地で培養され得る。発現のために選択された特定の宿主細胞のための培養条件、例えば温度、ｐＨ等は、当業者に容易に明らかであろう。
【０１２６】
宿主細胞は、哺乳動物細胞等のより高等な真核細菌細胞でよく、または酵母細胞等のより低度の真核細菌細胞でよく、あるいは宿主脂肪は細菌細胞等の原核細菌細胞でよい。本開示に従う好適な宿主細胞の代表例は、細菌細胞、例えば大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、ストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）、サルモネラ・チフィムリウム（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）；真菌細胞、例えば酵母；昆虫細胞、例えばショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）Ｓ２及びスポドプテラ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ）５１９；動物細胞、例えばＣＨＯ、ＣＯＳまたは２９３細胞；アデノウイルス；植物細胞、またはインビトロ増殖するように既に適合されたまたはそのようにデノボで確立された任意の好適な細胞を含む。好適な宿主の選択は、本明細書に記載の技術から、当業者の範囲内にあると考えられる。
【０１２７】
組換えタンパク質を発現するために様々な哺乳動物細胞培養系も採用され得る。哺乳動物発現系の例は、Ｇｌｕｚｍａｎ，Ｃｅｌｌ  ２３：１７５（１９８１）に記載のサル腎線維芽細胞のＣＯＳ−７株、及び適合性ベクターを発現することができる他の細胞株、例えばＣ１２７、３Ｔ３、ＣＨＯ、ＨｅＬａ及びＢＨＫ細胞株を含む。哺乳動物発現ベクターは、複製起点、好適なプロモーター及びエンハンサーを含み、また、任意の必要なリボゾーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライスドナー及びアクセプター部位、転写終結配列、及び５’隣接非転写配列、例えば、ＴＬ１Ａ融合発現コンストラクトの調製に関して本明細書に記載されたものを含む。ＳＶ４０スプライスから得られたＤＮＡ配列、及びポリアデニル化部位は、必要な非転写遺伝的要素を提供するために使用され得る。該コンストラクトの宿主細胞への導入は、リン酸カルシウムによるトランスフェクション、ＤＥＡＥデキストラン介在トランスフェクションまたはエレクトロポレーションを含むがこれらに限定されない当業者に周知の様々な方法によって行われ得る（Ｄａｖｉｓら，１９８６  Ｂａｓｉｃ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ）。
【０１２８】
ｍＴＯＲ阻害剤
実施形態によっては、本明細書では、例えば、それを必要とするヒト患者における、抗原特異的免疫応答を調節し、及び／または抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、該疾患または障害の１またはそれ以上の症候を治療するための併用療法が提供される。実施形態によっては、本方法は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、ＴＮＦＲ２５アゴニストの小分子アゴニスト等）、及びｍＴＯＲ阻害剤の有効量を含む組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む。実施形態によっては、上記方法は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びｍＴＯＲ阻害剤を含む併用療法を患者に投与することを含む。
【０１２９】
ｍＴＯＲとして共通して知られているラマパイシンの哺乳動物標的は、細胞成長、細胞増殖、細胞運動性、細胞生存、タンパク質合成及び転写を制御するセリン／スレオニンタンパク質キナーゼである。ｍＴＯＲは、複数の細胞分裂シグナル伝達経路において中継の鍵であり、正常組織及び新生物プロセスにおける増殖及び脈管形成を調節する点で中心的な役割を演じる。ｍＴＯＲは、２つの複合体ｍＴＯＲＣ１及びｍＴＯＲＣ２内に存在する。ｍＴＯＲＣ１はラパマイシンアナログ（例えば、テムシロリムスまたはエベロリムス）に感受性であり、ｍＴＯＲＣ２の大部分はラパマイシン非感受性である。
【０１３０】
本明細書で使用される用語「ｍＴＯＲ阻害剤」は、その基質の少なくとも１つに対する、ｍＴＯＲの少なくとも１つの活性、例えばセリン／スレオニンタンパク質キナーゼ活性、を阻害する化合物またはリガンドを意味する（例えば、ｐ７０Ｓ６キナーゼ１、４Ｅ−ＢＰ１、ＡＫＴ／ＰＫＢ及びｅＥＦ２）。当業者は、化合物、例えばラパマイシンまたはそのアナログまたはその誘導体、または他の化合物、抗体、または小分子等がｍＴＯＲ阻害剤であるか否かを容易に決定することができる。ｍＴＯＲ阻害剤を同定する方法は当該分野で知られている。ｍＴＯＲ阻害剤の例は、ラパマイシン（シロリムス）、ラパマイシン誘導体、ＣＩ−７７９、エベロリムス（サーティカン（商標））、ＡＢＴ−５７８、タクロリムス（ＦＫ５０６）、ＡＢＴ−５７８、ＡＰ−２３６７５、ＢＥＺ−２３５、ＯＳＩ−０２７、ＱＬＴ−０４４７、ＡＢＩ−００９、ＢＣ−２１０、サリラシブ、ＴＡＦＡ−９３、デフォロリムス（ＡＰ−２３５７３）、テムシロリムス（トリセル（商標）、２−（４−アミノ−１−イソプロピル−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３−イル）−１Ｈ−インドール−５−オール（ＰＰ２４２）、及びＡＰ−２３８４を含むが、これらに限定されない。
【０１３１】
本明細書で使用される用語「選択的ｍＴＯＲ阻害剤」は、ｍＴＯＲ活性を阻害するが、ＰＩ３Ｋ活性を阻害しない化合物またはリガンドを意味する。好適な選択的ｍＴＯＲ阻害剤はＲＡＤ００１を含む。従って、実施形態によっては、本明細書では、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの投与及び選択的ｍＴＯＲ阻害剤の投与を含む併用療法が提供される。
【０１３２】
ラパマイシンは、ストレプトミセス・ハイグロスコピクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ  ｈｙｇｒｏｓｃｏｐｉｃｕｓ）によって産生された公知のマクロライド抗生物質である。ラパマイシンの好適な誘導体は、例えばＷＯ９４／０９０１０、ＷＯ９５／１６６９１、ＷＯ９６／４１８０７、米国特許第５，３６２，７１８号及びＷＯ９９／１５５３０に開示されている。それらは、これらの文献に記載の手法を用いて調製され得る。代表的なラパマイシン誘導体は、例えば、３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２−デオキソラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−ラパマイシン、１６−ペント−２−イニルオキシ−３２（ＳまたはＲ）−ジヒドロ−４０−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−ラパマイシン、４０−［３−ヒドロキシ−２−（ヒドロキシメチル）−２−メチルプロパノエート］−ラパマイシン（ＣＣＩ７７９とも言われる）または４０−エピ−（テトラゾリル）−ラパマイシン（ＡＢＴ５７８とも言われる）である。ラパマイシン誘導体はまた、例えばＷＯ９８／０２４４１及びＷＯ０１／１４３８７、例えばＡＰ２３５７３、ＡＰ２３４６４、ＡＰ２３６７５またはＡＰ２３８４１に開示されたいわゆるラパログを含んでよい。更に、ラパマイシン誘導体の非限定的な例は、名称ＴＡＦＡ−９３（ラパマイシンプロドラッグ）、バイオリムス−７またはバイオリムス−９として開示されるものである。
【０１３３】
実施形態によっては、本明細書で提供される組成物及び／または併用療法で使用されるｍＴＯＲ阻害剤はエベロリムス（ＲＡＤ００１）または２−（４−アミノ−１−イソプロピル−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３−イル）−１Ｈ−インドール−５−オール（ＰＰ２４２）である（例えば、Ａｐｓｅｌら，Ｎａｔｕｒｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  ｔｏ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ４，６９１−６９９（２００８）参照）。
【０１３４】
インターロイキン
インターロイキンを含む本明細書に開示された組成物及び方法のいずれかにおいて、インターロイキンは、例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストとの併用療法において投与される場合に、Ｔｒｅｇ細胞の拡張に対する所望の相乗効果を達成する任意のインターロイキンでよい。実施形態によっては、インターロイキンはＩＬ−２である。実施形態によっては、インターロイキンはＩＬ−７である。実施形態によっては、インターロイキンはＩＬ−１５である。
【０１３５】
本明細書には、ＩＬ−２のアナログ、例えば、アゴニスト及び部分アゴニストＩＬ−２アナログ（例えば、ＩＬ−２ムテイン）も包含される。かかるアナログは、当該分野で知られている。アゴニストＩＬ−２アナログの非限定的な例は、例えば、ＢＡＹ  ５０−４７９８（Ｍａｒｇｏｌｉｎら  Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ，２００７年６月１日  １３；  ３３１２参照；他の例については、Ｉｍｌｅｒ及びＺｕｒａｗｓｋｉ．Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．１９９２年７月５日；２６７（１９）：１３１８５−９０参照）を含む。更に、化合物がＩＬ−２アナログであるか否かを決定するためのインビトロ・スクリーニングアッセイ（すなわち、高親和性ＩＬ−２受容体に結合し、Ｔ細胞増殖を開始する能力を維持する）は、当該分野で知られている。例えば、Ｚｕｒａｗｓｋｉ及びＺｕｒａｗｓｋｉ．ＥＭＢＯ  Ｊ．１９９２年１１月；  １１（１１）：３９０５−３９１０；“インターロイキン−２受容体”Ａｎｎｕａｌ  Ｒｅｖｉｅｗ  ｏｆ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ；第５巻：３９７−４２５（巻発行日：１９８９年１１月；及び“インターロイキン−２の生物学”；Ａｎｎｕａｌ  Ｒｅｖｉｅｗ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ；第２６巻：４５３−４７９（巻発行日：２００８年４月）参照。
【０１３６】
組成物及び医薬組成物
実施形態によっては、本明細書では、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質を含む組成物であって、該融合タンパク質が、（ａ）ＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合するポリペプチドを含む第１ポリペプチド、及び（ｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）ポリペプチドを含む第２ポリペプチドを含む、組成物が提供される。実施形態によっては、第１ポリペプチドは、ヒトＴＬ１Ａポリペプチドの細胞外ドメインまたはそのフラグメントを含み、該フラグメントはＴＮＦＲＳＦ２５に特異的に結合できる。実施形態によっては、それを必要とするヒトに投与される時に、本組成物は、ヒトでのナイーブＣＤ４  Ｔ細胞の頻度を減少させる。
【０１３７】
実施形態によっては、本明細書では、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５、またはそのアナログ）の１または２つ、及びｍＴＯＲ阻害剤を含む組成物が提供される。
【０１３８】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたＴＬ１Ａ融合タンパク質及びＩＬ−２の有効量を含む組成物が提供される。
【０１３９】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたアゴニスティックＴＮＦＲＳＦ２５抗体及びＩＬ−２の有効量を含む組成物が提供される。
【０１４０】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト及びＩＬ−２の有効量を含む組成物が提供される。
【０１４１】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたＴＬ１Ａ融合タンパク質及びｍＴＯＲ阻害剤の有効量を含む組成物が提供される。
【０１４２】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたアゴニスティックＴＮＦＲＳＦ２５抗体及びｍＴＯＲ阻害剤の有効量を含む組成物が提供される。
【０１４３】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト及びｍＴＯＲ阻害剤の有効量を含む組成物が提供される。
【０１４４】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたＴＬ１Ａ融合タンパク質及びラパマイシンの有効量を含む組成物が提供される。
【０１４５】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたアゴニスティックＴＮＦＲＳＦ２５抗体及びラパマイシンの有効量を含む組成物が提供される。
【０１４６】
実施形態によっては、本明細書では、本明細書に記載されたＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト及びラパマイシンの有効量を含む組成物が提供される。
【０１４７】
現状のままで、治療用に本明細書に開示された組成物（ＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物）を使用することができるが、実施形態によっては、医薬製剤において、組成物を、例えば、意図した投与経路及び標準的な医薬的慣行に関して選択された好適な薬学的賦形剤、希釈剤、または担体と組み合わせて調合することが好ましい。従って、本明細書に開示された少なくとも１つの活性成分（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、ＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト等）を含む医薬組成物または製剤は、薬学的に許容される賦形剤、希釈剤及び／または担体と組み合わせて、本明細書で提供される。賦形剤、希釈剤及び／または担体は、製剤の他の成分と適合し、そのレシピエントに有害でないとの意味で、「許容」されなければならない。
【０１４８】
組成物は、ヒトまたは動物薬での使用のための任意の簡便な方法での投与のために調合され得る。ヒトへのインビボ投与のためには、本明細書に開示された組成物は、薬学的に有用な組成物を調製するために使用される公知の方法に従って調合され得る。ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、ＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト等）は、単一の活性物質としてまたは他の公知の活性物質（例えば、以下に記載の併用療法に有用な１またはそれ以上の治療法）と一緒に、薬学的に好適な希釈剤（例えば、Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、酢酸塩、リン酸塩）、保存料（例えば、チメロサール、ベンジルアルコール、パラベン）、乳化剤、可溶化剤、アジュバント及び／または担体と組み合わせて混合される。好適な担体及びその製剤は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，第１６版  １９８０年，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．に記載されている。
【０１４９】
本明細書に記載のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、抗体）、並びにインターロイキン（ＩＬ−２またはそのアナログ等）及びｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン等）は、徐放組成物として一緒にまたは別箇に調合され得る。「徐放組成物」は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質を長時間に渡って放出する任意の好適なビヒクルを含み得る。徐放組成物の非限定的な例は、マイクロスフェア（例えば、グリコール酸／ＤＬ−乳酸共重合体（ＰＬＧＡ）マイクロスフェア、無水ポリビニルアルコール（ＰＶＡ）、ミリシリンダ、アルギン酸ゲル、生分解性ヒドロゲル、錯化剤及びナノ粒子［例えば、Ａｓｈｔｏｎら（２００７）Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓ，２８，３６，５５１８；Ｄｒｕｒｙ，Ｊ．Ｌ．ら（２００３）Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓ；２４：４３３７−４３５１；Ｄｉｎｇらの米国特許第７，２２６，６１７号；Ｓｉｍｍｏｎｓ，Ｃ．Ａ．ら（２００４）Ｂｏｎｅ；３５：５６２−５６９；Ｚｈｕ，Ｇ．ら（２０００）Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈ；１８：５２−５７、Ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｂｌｅ  Ｈｙｄｒｏｇｅｌｓ  ｆｏｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ，Ｋ．Ｐａｒｋら，１９９３，Ｔｅｃｈｎｏｍｉｃ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，Ｔｒａｎｓ  Ａｍ  Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ  Ｓｏｃ，Ｋ．Ｄｅｒｗｅｎｔら，２００８；１０６：２０６−１３参照。］。
【０１５０】
投与及び投薬量
本明細書に記載の組成物は、当該分野で公知の任意の好適な投与経路によって投与され得る。例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト、インターロイキン、及びｍＴＯＲ阻害剤は、非経口的投与（例えば、静脈内、腹腔内、硬膜外、鞘内、筋肉内、管腔内、気管内、皮内、または皮下）のために一緒にまたは別箇に製剤化され得る。
【０１５１】
例示的実施形態では、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、またはＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニストは、免疫化経路、例えば、静脈内、筋肉内、または腹腔内等によって患者に投与される。
【０１５２】
本明細書に記載の方法で使用される任意の組成物または製剤については、治療上有効量が動物モデルから最初に見積もられる。動物系からの用量−応答曲線は、次いで、ヒトでの初期臨床試験の試験用量を決定するために使用される。各組成物についての安全な決定において、投与の用量及び頻度は、該臨床試験での使用のために先行されたものを満たすかまたはそれを上回るべきである。動物試験から得られたデータは、ヒトでの使用のための用量範囲を調合する際に使用され得る。ヒトでの使用のための治療上有効用量は、好ましくは、毒性がないかまたはほとんどないＥＤ５０を含む循環濃度の範囲内である。用量は、採用された投薬剤形及び利用された投与経路によってこの範囲内で変動し得る。
【０１５３】
本明細書に記載の組成物は、典型的には、所望の効果を達成するための組成物の有効量を含むことになる。本明細書で使用される用語「治療上有効量」及び「有効量」は、交換的に使用され、用量または量にも適用され、それを必要とする動物への投与の際に所望の活性をもたらすに十分である、組成物、化合物または医薬製剤の量を意味する。本開示の文脈内では、用語「治療上有効量」は、組成物、化合物または医薬製剤の量が、本明細書で特定された疾患または症状の少なくとも１つの症候を減少または削除するために十分であることを意味する。活性成分の組合せが投与される場合には、該組合せの有効量は、個別に投与される場合に有効であったであろう各成分の量を含んでもまたは含まなくてもよい。治療製剤の投薬量は、疾患または症状の性質、患者の病歴、投与頻度、投与形式、宿主からの物質のクリアランス等によって変動することになる。初期用量は、より多くてもよく、次いでより少ない維持用量でもよい。用量は、有効量レベルを維持するために、例えば、毎週、隔週、毎日、半毎週等で投与される。本明細書で使用される「インターロイキンの有効量」（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５またはそのアナログ）は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、本明細書に記載された、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト）との併用療法の一部として対象に投与される時に、Ｔｒｅｇ細胞の拡張に相乗効果を与えるために十分な量である。典型的には、本明細書に開示された本方法（例えば、併用療法）で使用されるＩＬ−２もしくは他の好適なインターロイキンまたはそのアナログの有効量は、ヒト患者に単独で投与された場合（すなわち、併用療法でない）にＴｒｅｇ細胞の拡張の至適状態を誘導したであろう又は誘導できない量（用量）である。典型的には、ヒト患者においてＴｒｅｇ細胞の拡張の至適状態を誘導したであろう又は誘導できないＩＬ−２用量は、１００万単位／平方メートル／日未満の用量である（例えば、Ｋｏｒｅｔｈ，Ｊ．；Ｎ  Ｅｎｇｌ  Ｊ  Ｍｅｄ．２０１１年１２月１日；３６５（２２）：２０５５−６６；及び、Ｍａｔｓｕｏｋａ，Ｋ．Ｓｃｉ  Ｔｒａｎｓｌ  Ｍｅｄ．２０１３年４月３日；５（１７９）：１７９ｒａ４３参照）。実施形態によっては、ＩＬ−２は、ＩＬ−２の「低用量」またはＩＬ−２の「極低用量」と考えられる量でヒト患者に投与される。本明細書で使用される「ＩＬ−２の低用量」は、約３００，０００単位／平方メートル／日の用量である。本明細書で使用される「ＩＬ−２の極低用量」は、約３０，０００単位／平方メートル／日の用量である。実施形態によっては、ＩＬ−２の有効量は、約３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の範囲の量である。
【０１５４】
本明細書で使用される「ｍＴＯＲ阻害剤の有効量」（例えば、ラパマイシン）は、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、本明細書に記載の、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５の小分子アゴニスト）との併用療法の一部として対象に投与される時に、エフェクターＴ細胞の頻度及び／または拡張を減少させるために十分な量である。典型的には、ｍＴＯＲ阻害剤の有効量は、対象においてエフェクターＴ細胞の拡張を阻害及び／または頻度を減少する量であり、例えば、少なくとも１％、少なくとも２％、少なくとも３％、少なくとも４％、少なくとも５％、少なくとも６％、少なくとも７％、少なくとも８％、少なくとも９％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％，少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９９％である。他の実施形態によっては、エフェクターＴ細胞の拡張を阻害及び／または頻度を減少する量は、２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍以上である。治療上有効量は、方法、例えば（ｉ）例えば、読み出しとしての、制御性Ｔ細胞増殖を用いるインビトロ細胞培養アッセイにおける組成物または化合物の有効量の特徴付け、（ｉｉ）読み出しとしての、制御性Ｔ細胞増殖及び／または動物生存及び／またはモデル化症状（例えば、ＩＢＤ、喘息等）での改善を用いる動物試験での特徴付け、次いで、（ｉｉｉ）読み出しとしての、症状（例えば、疾患または障害、例えば、自己免疫疾患、喘息、移植片対宿主疾患、慢性感染症、炎症等）の改善及び／または向上した生存率を用いるヒト試験での特徴付けの組合せによって順次決定され得る。
【０１５５】
ある条件下での好適な用量及び投薬量は、標準的な臨床技術に従って、上記の指標に基づく試験によって決定され得るが、実務者の判断及び各患者の状況（年齢、全身状態、症状の重度、性別等）に従って精緻化され、最終的に決定され得る。
【０１５６】
本明細書に記載の組成物中のＴＬ１Ａ融合タンパク質の典型的な投薬量は、約０．００１〜１００ミリグラム／キログラム体重／日（ｍｇ／ｋｇ／日）、約０．００１〜５０ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００２５〜４０ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００５〜３０ｍｇ／ｋｇ／日、約０．０１〜２５ｍｇ／ｋｇ／日、約０．０２５〜２０ｍｇ／ｋｇ／日、約０．０５〜１５ｍｇ／ｋｇ／日、約０．０５〜１０ｍｇ／ｋｇ／日、約０．０５〜５ｍｇ／ｋｇ／日、または約１〜２ｍｇ／ｋｇ／日の範囲である。
【０１５７】
１日当たりのアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体の典型的な投薬量は、約０．０５ｍｇ／ｋｇ〜１０ｍｇ／ｋｇ、約０．１ｍｇ／ｋｇ〜８ｍｇ／ｋｇ、約０．２ｍｇ／ｋｇ〜約５ｍｇ／ｋｇ、または約０．４ｍｇ／ｋｇ〜約４ｍｇ／ｋｇである。実施形態によっては、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体の典型的な投薬量は、約０．４ｍｇ／ｋｇ、約０．５ｍｇ／ｋｇ、約１ｍｇ／ｋｇ、約１．５ｍｇ／ｋｇ、約２ｍｇ／ｋｇ、約２．５ｍｇ／ｋｇ、約３ｍｇ／ｋｇ、約３．５ｍｇ／ｋｇ、約４ｍｇ／ｋｇ等である。
【０１５８】
本明細書に開示された併用療法、例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体等）との併用療法で使用するためのＩＬ−２または他のサイトカイン（例えば、ＩＬ−７、ＩＬ−１５）の典型的な投薬量は、約１０，０００〜１，０００，０００単位／平方メートル／日、約１５，０００〜９００，０００単位／平方メートル／日、約２０，０００〜８００，０００単位／平方メートル／日、約２５，０００〜７００，０００単位／平方メートル／日、約３０，０００〜５００，０００単位／平方メートル／日、約３０，０００〜４００，０００単位／平方メートル／日、または約３０，０００〜３００，０００単位／平方メートル／日の投薬量である。
【０１５９】
１日当たりのラパマイシンの典型的な投薬量は、約２５μｇ／ｋｇ〜約５００μｇ／ｋｇ、約５０μｇ／ｋｇ〜約４００μｇ／ｋｇ、または約７５μｇ／ｋｇ〜約３００μｇ／ｋｇである。
【０１６０】
本明細書に記載のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、アゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体、ＴＮＦＲＳＦ２５の小分子阻害剤等）、及び／または、１またはそれ以上のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及び／またはインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５）を含む１またはそれ以上の組成物は、Ｔｒｅｇ細胞の増殖を少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍以上増加させるために十分な１またはそれ以上の投薬量で対象に投与され得る。本発明によれば、ＩＬ−２及びＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは、Ｔｒｅｇ細胞の拡張に対する相乗効果を一緒にもたらす量で投与される。Ｔｒｅｇ細胞増殖を測定するための方法は、当該分野で公知である。例えば、Ｔｒｅｇ増殖をインビボで監視するために、末梢血細胞が処置対象から回収され、ＣＤ４、ＣＤ２５、ＩＬ７Ｒ及びＦｏｘＰ３を含む細胞マーカーで染色され（例えば、免疫染色）、フローサイトメトリーで分析される。循環ＦｏｘＰ３  Ｔｒｅｇ細胞数は、定量化され、出発数（例えば、処置前）と比較され得る。
【０１６１】
更に、実施形態によっては、ｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）の有効量は、エフェクターＴ細胞拡張を阻害し、及び／またはエフェクターＴ細胞の頻度を少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９９％減少させるために十分な１またはそれ以上の投薬量で対象に投与される。実施形態によっては、エフェクターＴ細胞拡張の阻害、及び／またはエフェクターＴ細胞頻度の減少の量は、２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍またはそれ以上である。
【０１６２】
エフェクターＴ細胞の頻度及び／または拡張（例えば、増殖）を測定する方法は、当該分野で知られている。例えば、ＣＤ４及び／またはＣＤ８  Ｔ細胞増殖をインビボで監視するためには、末梢血細胞が処置対象から回収され、ＣＤ４、ＣＤ２５、ＦｏｘＰ３、Ｋｉ６７、及び増殖用の他の細胞マーカーのために染色され（例えば、免疫染色）、フローサイトメトリーで分析される。循環エフェクターＴ細胞数は、定量化され、出発数（例えば、処置前）と比較され得る。
【０１６３】
ＴＬ１Ａ融合タンパク質及び他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの使用
本明細書では、それを必要とするヒト患者における抗原特異的免疫応答を調節する方法が記載される。実施形態によっては、該方法は、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物を該患者に投与することを含み得る。典型的には、ＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む該組成物は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質の治療上有効量を含む。具体的な実施形態では、抗原特異的免疫応答は阻害される。
【０１６４】
実施形態によっては、抗原特異的免疫応答は、任意の好適な手段によって測定される、抗原に対する免疫応答（例えば、抗原特異的抗体、Ｔ細胞、Ｂ細胞、抗原特異的Ｔ細胞増殖の頻度等）が、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９９％増加するかまたは減少する場合に調節されると決定される。他の実施形態では、抗原特異的免疫応答は、任意の好適な手段によって測定される、抗原に対する該免疫応答（例えば、抗原特異的抗体、Ｔ細胞、Ｂ細胞、抗原特異的Ｔ細胞増殖の頻度等）が２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍またはそれ以上増加するかまたは減少する場合に調節されると決定される。また、本明細書には、それを必要とするヒト患者において、抗原特異的免疫応答と関連した疾患または障害を治療し、または該疾患または障害の１またはそれ以上の症候を治療する方法が記載される。該方法は、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物を該患者に投与することを含み得る。典型的には、ＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質の治療上有効量を含む。
【０１６５】
また、本明細書には、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの対象（例えば、患者）への投与と関連した及び／またはそれによって起こった１またはそれ以上の有害事象の重度及び／または頻度を減少させる方法が記載される。実施形態によっては、１またはそれ以上の有害事象の重度及び／または頻度を減少させる方法は、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質を生理学的に許容される担体中に含む組成物を、それを必要としているヒト患者に投与することを含む。実施形態によっては、減少されるまたは阻害される有害事象は、炎症性腸疾患の１またはそれ以上の症候、炎症性腸疾患の発症、体重減少、発疹、下痢、筋肉痛、減少した血小板数、高い肝臓酵レベル、及び死である。
【０１６６】
また、本明細書では、それを必要とするヒト患者における、抗原特異的免疫応答を調節し、及び／または抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、及び／または該疾患または障害の１またはそれ以上の症候を治療する方法であって、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びインターロイキン（例えば、インターロイキン、例えばＩＬ−２の有効量）を含む併用療法を、それを必要とする対象（患者）に投与することを含む、方法が提供される。また、本明細書では、それを必要とするヒト患者における、抗原特異的免疫応答を調節し、及び／または抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、及び／または該疾患または障害の１またはそれ以上の症候を治療する方法であって、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）を含む併用療法を、それを必要とする対象（患者）に投与することを含む、方法が提供される。また、本明細書では、それを必要とするヒト患者における、抗原特異的免疫応答を調節し、及び／または抗原特異的免疫応答に関連した疾患または障害を治療し、及び／または該疾患または障害の１またはそれ以上の症候を治療する方法であって、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト、インターロイキン（例えば、インターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５またはそれらのアナログ）の有効量）及びｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）を含む併用療法を、それを必要とする対象（患者）に投与することを含む、方法が提供される。
【０１６７】
本明細書に開示された方法で使用するためのＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト、インターロイキン、及びｍＴＯＲ阻害剤の例示的な有効量は、上記のとおりである。
【０１６８】
上記の方法のいずれかにおいて、治療を必要とする患者は、固体臓器または幹細胞移植のための調製において誘導療法を受けているまたは受けそうな患者、固体臓器または幹細胞移植レシピエントであって、維持療法を受けているまたは受けそうな患者、固体臓器または幹細胞移植レシピエントである患者、アレルギー患者；ワクチンを受けているまたは受けそうな患者、あるいは免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＣＴＬＡ−４またはＰＤ−１阻害剤）で治療されることになるまたはされそうな患者を含むが、これらに限定されない。
【０１６９】
上記の方法のいずれかにおいては、治療され得る疾患または障害は、自己免疫疾患または障害（例えば、炎症性腸疾患、リウマチ様関節炎）、移植拒絶、移植片対宿主疾患、炎症、喘息、アレルギー、及び慢性感染症でよい。
【０１７０】
実施形態によっては、上記方法は、該患者において抗原特異的免疫応答を少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９９％減少させる。他の実施形態では、抗原特異的免疫応答は、少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍またはそれ以上減少される。
【０１７１】
実施形態によっては、上記の方法は、本明細書に記載の、組成物（例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む）の投与または併用療法（例えば、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト及びＩＬ−２及び／またはｍＴＯＲ阻害剤の投与）の投与後に、患者において、Ｔｒｅｇ細胞の顕著に増加した増殖をもたらす。例えば、実施形態によっては、本明細書に記載の方法は、本方法の投与後に患者において、少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、または少なくとも１０倍またはそれ以上、Ｔｒｅｇ細胞の増加した増殖をもたらす。
【０１７２】
上記実施対応のいずれかにおいて、上記方法は、患者に投与される１またはそれ以上の組成物の１または複数回投与を含み得る。例えば、対象（例えば、患者）にＴＬ１Ａ融合タンパク質を含む組成物が投与される時には、該方法は、単回またはそれ以上の投与を含み得る。例示的な投薬レジメは上記のとおりである。ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストがインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）との併用療法で投与される時には、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは、インターロイキン及び／またはｍＴＯＲ阻害剤とは同日または異なった日に投与され得る。各活性物質は別箇の組成物で投与され、あるいは２またはそれ以上の活性物質は組み合わせて投与され得る。
【０１７３】
上で議論したように、実施形態によっては、本明細書に記載の方法は、自己免疫疾患、同種免疫、またはＴ細胞応答に関連する任意の他の疾患、障害もしくは症状（例えば、それを必要とする患者において）を治療するために有用である。一般的に、これらは、個体の免疫系（例えば、活性化されたＴ細胞）がその個体自体の組織及び細胞、または移植された組織、細胞、または（移植片（ｇｒａｆｔ）または移植片（ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ）としての）分子を攻撃する症状である。本明細書に記載の方法に従って処置され得る疾患及び障害の非限定的な例は、例えば、自己免疫疾患または障害（例えば、ＩＢＤ及びリウマチ様関節炎）、移植拒絶、移植片対宿主疾患（ＧＶＨＤ）、炎症、喘息、アレルギー、及び慢性感染症を含む。
【０１７４】
移植拒絶及びＧＶＨＤ関連障害について、治療を必要とする患者は、固体臓器または幹細胞移植のための調製において誘導療法を受けているまたは受けそうな患者、固体臓器または幹細胞移植レシピエントであって、維持療法を受けているまたは受けそうな患者、固体臓器または幹細胞移植レシピエントである患者（及び、治療法、例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストがインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５、またはそれらのアナログ）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）との併用療法が、維持免疫抑制療法の早期の中止を促進するために投与される）、アレルギー患者（及び、治療法、例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストがインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５、またはそれらのアナログ）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）との併用療法が、特定のアレルギー反応症候を減少させるために投与される）、ワクチンを受けているまたは受けそうな患者（及び、治療法、例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストがインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５、またはそれらのアナログ）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）との併用療法が、ワクチンによって刺激された抗原特異的Ｔ細胞応答を亢進するためにまたはＴ細胞メモリー免疫応答を亢進するために投与される）、あるいは免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＣＴＬＡ−４またはＰＤ−１阻害剤）で治療されることになるまたはされそうな患者（及び、治療法、例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストがインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５、またはそれらのアナログ）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）との併用療法が、Ｔ細胞免疫応答を亢進するために投与される）でよい。
【０１７５】
本開示の方法によって処置され得る例示的な自己免疫疾患は、例えば、Ｉ型糖尿病、多発性硬化症、甲状腺炎（例えば、橋本甲状腺炎、及びオード甲状腺炎）、グレーブス病、全身性エリテマトーデス、強皮症、乾癬、関節炎、リウマチ様関節炎、円形脱毛症、強直性脊椎炎、自己免疫溶血性貧血、自己免疫性肝炎、ベーチェット病、クローン病、皮膚筋炎、糸球体腎炎、ギラン・バレー症候群、ＩＢＤ、ループス腎炎、重症筋無力症、心筋炎、天疱瘡／類天疱瘡、悪性貧血、結節性多発動脈炎、多発筋炎、原発性胆汁性肝硬変症、リウマチ熱、サルコイドーシス、シェーグレン症候群、潰瘍性大腸炎、ぶどう膜炎、尋常性白斑、及びウェゲナー肉芽腫症を含む。
【０１７６】
本開示の方法で処置され得る同種免疫応答の例は、ＧＶＨＤ及び移植拒絶を含む。従って、例えば、本明細書に開示された融合タンパク質は、固体臓器または幹細胞移植のための調製物において「誘導療法」として、または固体臓器または幹細胞移植レシピエントにおいて「維持療法」として投与され、また、維持免疫抑制療法の早期での中止を促進するために固体臓器または幹細胞移植レシピエントに投与されてもよい。
【０１７７】
本明細書に記載の方法は、例えば、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストがインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５、またはそれらのアナログ）及び／またはｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）との併用療法の投与を含む方法は、特異的アレルギー反応の１またはそれ以上の症候を減少させるためにアレルギー患者に投与されてもよい。アレルギー反応の例は、例えば、アレルギー喘息、ナッツ（例えば、ピーナッツ）アレルギー、セリアック病（小麦グルテンアレルギー）、薬物アレルギーの寛容プロトコール（例えば、ペニシリン、スルホンアミド）である。多くの物質は、アレルゲンとして働き得る；しかしながら、物質の中には、非常に一般的なアレルゲン、例えば、花粉及びかび、家ほこりダ二飛散、ペットアレルゲン、様々な食品、虫刺され、及びゴキブリ抗原もある。
【０１７８】
本明細書に記載される組成物及び併用療法はまた、ワクチンで刺激された抗原特異的Ｔ細胞応答を亢進するためにワクチンと組み合わせて患者に投与され得る。上記のように、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質は、Ｔエフェクター細胞同時刺激に対して効果を奏することによって抗原特異的免疫応答を亢進し得る。
【０１７９】
ＴＬ１Ａ融合タンパク質、及びＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの投与及びインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５またはそれらのアナログ）の投与を含む併用療法、及び／または本明細書に記載のｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）はまた、Ｔ細胞メモリー免疫応答を亢進するためにワクチンと一緒に、またはＴ細胞免疫応答を亢進するために免疫チェックポイント阻害剤（例えば、ＣＴＬＡ−４またはＰＤ−１阻害剤）と一緒に、患者に投与され得る。上記のように、ＴＬ１Ａ融合タンパク質及びＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの投与及びインターロイキン（例えば、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１５またはそれらのアナログ）の投与を含む併用療法、及び／または本明細書に記載のｍＴＯＲ阻害剤（例えば、ラパマイシン）は、Ｔエフェクター細胞同時刺激に対する効果を有することによって抗原特異性免疫応答を亢進し得る。
【０１８０】
本明細書では、ＴＬ１Ａ融合タンパク質、及び／または別のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト、及び抗炎症及び／または免疫抑制抗体または他の抗炎症性もしくは免疫抑制剤の投与を含む併用療法も画される。例えば、実施形態によっては、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質または他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは、固体臓器または幹細胞移植のための調製物での誘導療法において、あるいは固体臓器または幹細胞移植レシピエントにおける維持療法として対象に投与され、維持免疫抑制療法の早期の中止を促進するために固体臓器または幹細胞移植レシピエントに投与され得る。実施形態によっては、ラパマイシン、タクロリムス、他のｍＴＯＲ阻害剤、ＭＥＫ阻害剤、ＣＴＬＡ４−Ｉｇ分子、ＣＤ８０またはＣＤ８６ブロッキング抗体または分子、ＣＤ４０またはＣＤ４０Ｌブロッキング抗体または分子、ＰＴＥＮブロッキング分子、ＯＸ４０またはＯＸ４０Ｌブロッキング抗体または分子、プレドニゾン、メチルプレドニゾン、フルチカゾンまたはこれらの組合せ等の他の物質との併用療法で、ＴＬ１Ａ融合タンパク質を同時投与することが有利かもしれない。あるいは、またはそれに加えて、ＴＬ１Ａ融合タンパク質または他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは、インターロイキン（例えば、以下の実施例に記載されたような低用量または極低用量のＩＬ−２）と一緒に投与され得る。
【０１８１】
別の例として、実施形態によっては、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質または他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストは、対象患者に投与されて、特定のアレルギー反応の１またはそれ以上の症候（例えば、喘息、セリアック病、薬物アレルギー）を減少させ得る。ラパマイシン、タクロリムス、他のｍＴＯＲ阻害剤、ＣＴＬＡ４−Ｉｇ分子、ＣＤ８０またはＣＤ８６ブロッキング抗体または分子、ＣＤ４０またはＣＤ４０Ｌブロッキング抗体または分子、ＰＴＥＮブロッキング分子、ＯＸ４０またはＯＸ４０Ｌブロッキング抗体または分子、プレドニゾン、メチルプレドニゾン、フルチカゾンまたはカルシニューリン阻害剤との併用療法で、該ＴＬ１Ａ融合タンパク質または他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストを同時投与することが有利かもしれない。代替的に、または加えて、該ＴＬ１Ａ融合タンパク質または他のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストを、インターロイキン（例えば下の実施例で記載されるように、低い、または非常に低い投与量のＩＬ−２）とともに投与することができる。
【０１８２】
更に、上で議論したように、本明細書に開示のＴＬ１Ａ融合タンパク質がコグネートＴ制御性細胞（Ｔｒｅｇ）の増殖をインビボで安全かつ選択的に刺激することが現在発見されている。特に、ＴＮＦＲＳＦ２５調節剤による免疫応答を調節しようとする先に記載のある試みに対して、ヒト化マウス及び霊長類での研究では、本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質による治療が体重減少を誘導せず、白血球数を変化せず、または任意の他の危険なもしくは望ましくない副作用をもたらさなかったことが現在証明されており、このことは、ＴＬ１Ａ融合タンパク質が霊長類を含み、インビボで安全に投与できたことを示している。本研究は、ＴＬ１Ａ融合タンパク質はヒト患者に安全に投与されると期待されることも証明した。従って、これの発見と組み合わせて、本明細書では、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストのヒト患者での投与を含む治療法と関連する有害事象を減少させる方法が提供される。この方法は、生理学的に許容される担体中に本明細書に記載のＴＬ１Ａ融合タンパク質含有組成物を、それを必要としている患者に投与することを含む。例えば、有害事象は、炎症性腸疾患の１またはそれ以上の症候の発症でよい。有害事象は、体重減少、発疹、下痢、筋肉痛、減少血小板数、上昇肝臓酵素レベル、及び／または死でもよい。
【０１８３】
本開示に従って、慣用的な分子生物学、微生物学、組換えＤＮＡ、免疫学、細胞生物学及び当該技術分野内の他の関連技術を採用し得る。例えば、特に、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（２００１）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．第３版  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ：Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．；Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．第２版  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ：  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．；Ａｕｓｕｂｅｌら著（２００５）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ．Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ及びＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．：Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ．；Ｂｏｎｉｆａｃｉｎｏら著（２００５）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ．Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ及びＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．：Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ．；Ｃｏｌｉｇａｎら著（２００５）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ及びＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．：Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ．；Ｃｏｉｃｏら著（２００５）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ及びＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．：Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ．；Ｃｏｌｉｇａｎら著（２００５）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ及びＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．：Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ．；Ｅｎｎａら著（２００５）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ及びＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．：Ｈｏｂｏｋｅｎ，Ｎ．Ｊ．；Ｈａｍｅｓら著（１９９９）Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ．Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ：Ｏｘｆｏｒｄ；Ｆｒｅｓｈｎｅｙ（２０００）Ｃｕｌｔｕｒｅ  ｏｆ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃｅｌｌｓ：Ａ  Ｍａｎｕａｌ  ｏｆ  Ｂａｓｉｃ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ  第４版  Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ参照。上記の現在のプロトコールは毎年数回更新されている。
【実施例】
【０１８４】
実施例１：材料及び方法
以下は、以下の実施例で使用される材料及び方法である。
【０１８５】
マウス及び養子移入モデル
Ｆｏｘｐ３＋ＲＦＰ＋（ＦＩＲマウス）及びバックグラウンド系統のＦｏｘｐ３＋ＧＦＰ＋レポーターマウス（ご親切にもＲｉｃｈａｒｄ  Ｆｌａｖｅｌｌ博士及びＡｌｅｘａｎｄｅｒ  Ｒｕｄｅｎｓｋｙ博士によって提供を受けた［Ｗａｎ，Ｙ．Ｙ．及びＲ．Ａ．Ｆｌａｖｅｌｌ．２００５年  バイシストロニックなレポーターでのＦｏｘｐ３発現サプレッサＴ細胞同定  Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １０２：５１２６?５１３１参照］）、ＣＤ４−／−マウス、ＮＯＤ．ＳＣＩＤ／γｃ−／−（ＮＳＧ）、ＯＴ−ＩＩ及びＯＴ−ＩＩ／ＦＩＲマウスを、動物施設で飼育した。マウスは６〜１２週齢で使用し、病原無しの条件下で維持した。先に記載のようにしてＴｒｅｇ養子移入モデルを樹立した（Ｓｃｈｒｅｉｂｅｒら  Ｏｎｃｏｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．２０１２年８月１日；１（５）：６４２−６４８参照）。
【０１８６】
アカゲザル及びヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇのクローニング
ＲＮｅａｓｙキット（Ｑｉａｇｅｎ）を用いてアカゲザル末梢血単核細胞の調製物から総ＲＮＡを単離した。次いで、５’ＲＡＣＥ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、５’キャップかつ３’ポリＡ鎖ＲＮＡのＰＣＲ増幅によってアカゲザルｃＤＮＡライブラリを作製した。アカゲザルＴＬ１Ａの細胞外ドメイン（アミノ酸７３〜２５２９）を、以下のプライマー：フォワード５’−ＡＡＡＧＧＡＣＡＧＧＡＧＴＴＴＧＣＡＣＣ−３’（配列番号１７）、リバース５’−ＣＴＡＴＡＧＴＡＡＧＡＡＧＧＣＴＣＣＡＡＡ−３’（配列番号１８）を用いて増幅し、アカゲザルＩｇＧ１のヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３ドメインに融合し、以下のプライマー：フォワード５’−ＡＴＡＡＡＡＡＣＡＴＧＴＧＧＴＧＧＴＧＧ−３’（配列番号１９）及びリバース５’−ＣＴＧＣＧＴＧＴＡＧＴＧＧＴＴＧＴＧＣＡ−３’（配列番号２０）を用いて増幅し、哺乳動物発現ベクターｐＶＩＴＲＯ２−ｈｙｇｒｏ−ｍｃｓ（Ｉｎｖｉｖｏｇｅｎ）の第２の複数クローニング部位にクローン化した。
【０１８７】
ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇについては、５’ＲＡＣＥ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、５’キャップかつ３’ポリＡ鎖ＲＮＡのＰＣＲ増幅によってヒトｃＤＮＡライブラリを作製した。ヒトＴＬ１Ａの細胞外ドメイン（アミノ酸６０〜２５１）を増幅し、ヒトＩｇＧ１のヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３ドメインに融合し、ｐＶＩＴＲＯ２−ｈｙｇｒｏ（Ｉｎｖｉｖｏｇｅｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．）にクローン化した。
【０１８８】
アカゲザル融合タンパク質のＴＬ１Ａ部分の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
核酸配列：
ａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｃａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｃｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｃｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ（配列番号５）；及び
アミノ酸配列：
ｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｔｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇｐｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ  （配列番号６）。
【０１８９】
アガゲザルＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
核酸配列：
ａｔａａａａａｃａｔｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇｃａｇｃａａａｃｃｔｃｃｃａｃｇｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔａｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｇｇａａｇａｃｃｃｃｇａｔｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔａａａｃｇｇｃｇｃｇｇａｇｇｔｇｃａｔｃａｔｇｃｃｃａｇａｃｇａａｇｃｃａｃｇｇｇａｇａｃｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃａｔａｔｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃａｃｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｃｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａｃｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃｇｇｔｃｃｃｃａｔｃｃａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇａｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａｇｃｃｔｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃｇｔｃｃｃｇｇｇａｇｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｃｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｔｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａａｃａｇｃｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａｃｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｃｃｃｇｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔａｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇ（配列番号７）；及び
アミノ酸配列：
ｉｋｔｃｇｇｇｓｋｐｐｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｑｅｄｐｄｖｋｆｎｗｙｖｎｇａｅｖｈｈａｑｔｋｐｒｅｔｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｔｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｔｃｋｖｓｎｋａｌｐｖｐｉｑｋｔｉｓｋｄｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｅｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉｖｖｅｗｅｎｓｇｑｐｅｎｔｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｙｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑ（配列番号８）。
【０１９０】
完全なアカゲザルＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
ＤＮＡ配列：
ａｔｇｇａｇａｃａｇａｃａｃａｃｔｃｃｔｇｃｔａｔｇｇｇｔａｃｔｇｃｔｇｃｔｃｔｇｇｇｔｔｃｃａｇｇｔｔｃｃａｃｔｇｇｔｇａｃｃｔｃｇａｇａｔａａａａａｃａｔｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇｃａｇｃａａａｃｃｔｃｃｃａｃｇｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔａｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｇｇａａｇａｃｃｃｃｇａｔｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔａａａｃｇｇｃｇｃｇｇａｇｇｔｇｃａｔｃａｔｇｃｃｃａｇａｃｇａａｇｃｃａｃｇｇｇａｇａｃｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃａｔａｔｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃａｃｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｃｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａｃｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃｇｇｔｃｃｃｃａｔｃｃａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇａｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａｇｃｃｔｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃｇｔｃｃｃｇｇｇａｇｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｃｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｔｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａａｃａｇｃｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａｃｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｃｃｃｇｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔａｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇｇａａｔｔｃａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｃａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｃｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｃｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ（配列番号９）；及び
アミノ酸配列：
ｍｅｔｄｔｌｌｌｗｖｌｌｌｗｖｐｇｓｔｇｄｌｅｉｋｔｃｇｇｇｓｋｐｐｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｑｅｄｐｄｖｋｆｎｗｙｖｎｇａｅｖｈｈａｑｔｋｐｒｅｔｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｔｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｔｃｋｖｓｎｋａｌｐｖｐｉｑｋｔｉｓｋｄｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｅｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉｖｖｅｗｅｎｓｇｑｐｅｎｔｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｙｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑｅｆｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｔｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇｐｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号１０）。
【０１９１】
上記の完全な融合タンパク質配列（ＤＮＡ及びアミノ酸）の各々において、イタリック及び下線の残基は、マウスカッパリーダー配列に相当し；太字及びイタリック文字は制限酵素クローニング部位に相当し；プレーン文字は、アカゲザルＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列に相当し；下線文字は、アカゲザルＴＬ１Ａ細胞外ドメイン配列に相当する。
【０１９２】
ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質のＴＬ１Ａ部分の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
核酸配列：
ｃｇｇｇｃｃｃａｇｇｇａｇａｇｇｃｃｔｇｔｇｔｇｃａｇｔｔｃｃａｇｇｃｔｃｔａａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｇａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｇｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｔｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ  （配列番号：１１）；及び
アミノ酸配列：
ｒａｑｇｅａｃｖｑｆｑａｌｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｒｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇａｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号：１２）。
【０１９３】
ヒトＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
核酸配列：
ｔｇｔｇａｃａａａａｃｔｃａｃａｃａｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｃｇａａｇａｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔｇｇａｃｇｇｃｇｔｇｇａｇｇｔｇｃａｔａａｔｇｃｃａａｇａｃａａａｇｃｃｇｃｇｇｇａｇｇａｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃｇｔａｃｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃｃｔｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｔｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａａｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃａｇｃｃｃｃｃａｔｃｇａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇｃｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａａｃｃａｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃａｔｃｃｃｇｇｇａｔｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｔｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｃｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａｇｃａａｔｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａａｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｇｃｃｔｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔｔｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇａａｇａｇｃｃｔｃｔｃｃｃｔｇｔｃｔｃｃｇｇｇｔａａａ（配列番号：１３）；及び
アミノ酸配列：
ｃｄｋｔｈｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｈｅｄｐｅｖｋｆｎｗｙｖｄｇｖｅｖｈｎａｋｔｋｐｒｅｅｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｌｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｋｃｋｖｓｎｋａｌｐａｐｉｅｋｔｉｓｋａｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｄｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉａｖｅｗｅｓｎｇｑｐｅｎｎｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｆｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑｋｓｌｓｌｓｐｇｋ（配列番号：１４）。
【０１９４】
完全ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質の核酸及びアミノ酸配列は以下である：
核酸配列：
ｔｇｔｇａｃａａａａｃｔｃａｃａｃａｔｇｃｃｃａｃｃｇｔｇｃｃｃａｇｃａｃｃｔｇａａｃｔｃｃｔｇｇｇｇｇｇａｃｃｇｔｃａｇｔｃｔｔｃｃｔｃｔｔｃｃｃｃｃｃａａａａｃｃｃａａｇｇａｃａｃｃｃｔｃａｔｇａｔｃｔｃｃｃｇｇａｃｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａｃａｔｇｃｇｔｇｇｔｇｇｔｇｇａｃｇｔｇａｇｃｃａｃｇａａｇａｃｃｃｔｇａｇｇｔｃａａｇｔｔｃａａｃｔｇｇｔａｃｇｔｇｇａｃｇｇｃｇｔｇｇａｇｇｔｇｃａｔａａｔｇｃｃａａｇａｃａａａｇｃｃｇｃｇｇｇａｇｇａｇｃａｇｔａｃａａｃａｇｃａｃｇｔａｃｃｇｔｇｔｇｇｔｃａｇｃｇｔｃｃｔｃａｃｃｇｔｃｃｔｇｃａｃｃａｇｇａｃｔｇｇｃｔｇａａｔｇｇｃａａｇｇａｇｔａｃａａｇｔｇｃａａｇｇｔｃｔｃｃａａｃａａａｇｃｃｃｔｃｃｃａｇｃｃｃｃｃａｔｃｇａｇａａａａｃｃａｔｃｔｃｃａａａｇｃｃａａａｇｇｇｃａｇｃｃｃｃｇａｇａａｃｃａｃａｇｇｔｇｔａｃａｃｃｃｔｇｃｃｃｃｃａｔｃｃｃｇｇｇａｔｇａｇｃｔｇａｃｃａａｇａａｃｃａｇｇｔｃａｇｃｃｔｇａｃｃｔｇｃｃｔｇｇｔｃａａａｇｇｃｔｔｃｔａｔｃｃｃａｇｃｇａｃａｔｃｇｃｃｇｔｇｇａｇｔｇｇｇａｇａｇｃａａｔｇｇｇｃａｇｃｃｇｇａｇａａｃａａｃｔａｃａａｇａｃｃａｃｇｃｃｔｃｃｃｇｔｇｃｔｇｇａｃｔｃｃｇａｃｇｇｃｔｃｃｔｔｃｔｔｃｃｔｃｔａｃａｇｃａａｇｃｔｃａｃｃｇｔｇｇａｃａａｇａｇｃａｇｇｔｇｇｃａｇｃａｇｇｇｇａａｃｇｔｃｔｔｃｔｃａｔｇｃｔｃｃｇｔｇａｔｇｃａｔｇａｇｇｃｔｃｔｇｃａｃａａｃｃａｃｔａｃａｃｇｃａｇａａｇａｇｃｃｔｃｔｃｃｃｔｇｔｃｔｃｃｇｇｇｔａａａｇａａｔｔｃｃｇｇｇｃｃｃａｇｇｇａｇａｇｇｃｃｔｇｔｇｔｇｃａｇｔｔｃｃａｇｇｃｔｃｔａａａａｇｇａｃａｇｇａｇｔｔｔｇｃａｃｃｔｔｃａｃａｔｃａｇｃａａｇｔｔｔａｔｇｃａｃｃｔｃｔｔａｇａｇｃａｇａｃｇｇａｇａｔａａｇｃｃａａｇｇｇｃａｃａｃｃｔｇａｃａｇｔｔｇｔｇａｇａｃａａａｃｔｃｃｃａｃａｃａｇｃａｃｔｔｔａａａａａｔｃａｇｔｔｃｃｃａｇｃｔｃｔｇｃａｃｔｇｇｇａａｃａｔｇａａｃｔａｇｇｃｃｔｇｇｃｃｔｔｃａｃｃａａｇａａｃｃｇａａｔｇａａｃｔａｔａｃｃａａｃａａａｔｔｃｃｔｇｃｔｇａｔｃｃｃａｇａｇｔｃｇｇｇａｇａｃｔａｃｔｔｃａｔｔｔａｃｔｃｃｃａｇｇｔｃａｃａｔｔｃｃｇｔｇｇｇａｔｇａｃｃｔｃｔｇａｇｔｇｃａｇｔｇａａａｔｃａｇａｃａａｇｃａｇｇｃｃｇａｃｃａａａｃａａｇｃｃａｇａｃｔｃｃａｔｃａｃｔｇｔｇｇｔｃａｔｃａｃｃａａｇｇｔａａｃａｇａｃａｇｃｔａｃｃｃｔｇａｇｃｃａａｃｃｃａｇｃｔｃｃｔｃａｔｇｇｇｇａｃｃａａｇｔｃｔｇｔｇｔｇｃｇａａｇｔａｇｇｔａｇｃａａｃｔｇｇｔｔｃｃａｇｃｃｃａｔｃｔａｃｃｔｃｇｇａｇｃｃａｔｇｔｔｃｔｃｃｔｔｇｃａａｇａａｇｇｇｇａｃａａｇｃｔａａｔｇｇｔｇａａｃｇｔｃａｇｔｇａｃａｔｃｔｃｔｔｔｇｇｔｇｇａｔｔａｃａｃａａａａｇａａｇａｔａａａａｃｃｔｔｃｔｔｔｇｇａｇｃｃｔｔｃｔｔａｃｔａｔａｇ  （配列番号：１５）；及び
アミノ酸配列：
ｃｄｋｔｈｔｃｐｐｃｐａｐｅｌｌｇｇｐｓｖｆｌｆｐｐｋｐｋｄｔｌｍｉｓｒｔｐｅｖｔｃｖｖｖｄｖｓｈｅｄｐｅｖｋｆｎｗｙｖｄｇｖｅｖｈｎａｋｔｋｐｒｅｅｑｙｎｓｔｙｒｖｖｓｖｌｔｖｌｈｑｄｗｌｎｇｋｅｙｋｃｋｖｓｎｋａｌｐａｐｉｅｋｔｉｓｋａｋｇｑｐｒｅｐｑｖｙｔｌｐｐｓｒｄｅｌｔｋｎｑｖｓｌｔｃｌｖｋｇｆｙｐｓｄｉａｖｅｗｅｓｎｇｑｐｅｎｎｙｋｔｔｐｐｖｌｄｓｄｇｓｆｆｌｙｓｋｌｔｖｄｋｓｒｗｑｑｇｎｖｆｓｃｓｖｍｈｅａｌｈｎｈｙｔｑｋｓｌｓｌｓｐｇｋｅｆｒａｑｇｅａｃｖｑｆｑａｌｋｇｑｅｆａｐｓｈｑｑｖｙａｐｌｒａｄｇｄｋｐｒａｈｌｔｖｖｒｑｔｐｔｑｈｆｋｎｑｆｐａｌｈｗｅｈｅｌｇｌａｆｔｋｎｒｍｎｙｔｎｋｆｌｌｉｐｅｓｇｄｙｆｉｙｓｑｖｔｆｒｇｍｔｓｅｃｓｅｉｒｑａｇｒｐｎｋｐｄｓｉｔｖｖｉｔｋｖｔｄｓｙｐｅｐｔｑｌｌｍｇｔｋｓｖｃｅｖｇｓｎｗｆｑｐｉｙｌｇａｍｆｓｌｑｅｇｄｋｌｍｖｎｖｓｄｉｓｌｖｄｙｔｋｅｄｋｔｆｆｇａｆｌｌ（配列番号：１６）。
【０１９５】
上記の完全な融合タンパク質配列（ヒト核酸及びアミノ酸配列）の各々において、太字及びイタリックの残基は、制限酵素クローニング部位に相当し、制限酵素クローニング部位前に位置する残基（プレーン文字）は、ヒトＩｇＧ１ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３配列に相当し、制限酵素クローニング部位後の残基（下線文字）は、ヒトＴＬ１Ａ細胞外ドメイン配列に相当する。
【０１９６】
ネズミＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質も構築した。その構築方法及びネズミ融合タンパク質の機能的特徴化は、本明細書に参照としてその内容が全体的に組み込まれている、Ｋｈａｎ，Ｓ．Ｑ．ら．（２０１３年）“ＴＬ１Ａ−Ｉｇのクローニング、発現及び機能的特徴化、Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９０：１５４０−１５５０”に詳細に記載されている。
【０１９７】
細胞培養
標準的エレクトロポレーション及び脂質系トランスフェクション法を用いて、ＮＩＨ−ＣＨＯ細胞のトランスフェクションを行った。好適な抗生物質（ハイグロマイシン）でトランスフェクトされた細胞を選択し、より高い力価産生クローンを同定するために限界希釈シングルセルクローニング法を限定することによって更に選択した。次いで、選択されたクローンから血清を除き、血清無しの条件下で成長するように適合した。次いで、血清無しの培地で成長する安定クローンを、融合タンパク質製造のために、ホロファイバーカートリッジシステムにロードした。ＮＩＨ−ＣＨＯ−ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ細胞をＯＰＴＩ−ＣＨＯ培地で維持し、ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ含有細胞培養上清を回収した。ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇの精製は、標準的方法を用いてプロテインＡまたはプロテインＧカラムに結合することによって行い、基本的な溶出バッファを用いてカラムから溶出して、融合タンパク質の好適な機能を維持した。基本的なバッファでの溶出は、酸性バッファでの溶出が機能活性を破壊したので必須であった。溶出後、タンパク質画分をプールし、標準的なタンパク質アッセイ（Ｂｒａｄｆｏｒｄ）及びＩｇＧ鎖の検出用の特定のＥＬＩＳＡアッセイの両方を用いて定量した。次いで、精製したタンパク質をＰＢＳに透析し、−８０℃で保存した。
【０１９８】
試薬、抗体及びフローサイトメトリー
フローサイトメトリー、ＥＬＩＳＡ及びインビボ試験で使用するための商業的な抗体は、ＢＤ  Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅまたはＢｉｏＬｅｇｅｎｄから購入した。アメリカンハムスターＩｇＧアイソタイプコントロールは、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅから得た。マウスＴＮＦＲＳＦ２５（４Ｃ１２、アゴニスティック）に対する抗体を産生するアメリカンハムスターハイブリドーマは、Ｆａｎｇら  ２００８年に記載のように作製した。アレルギー肺炎症の発症のおけるＴＮＦ受容体スーパーファミリー（ＴＮＦＲＳＦ２５）の必須の役割。Ｊ  Ｅｘｐ  Ｍｅｄ  ２０５：１０３７−１０４８。簡単には、４Ｃ１２、ｈＴＬ１Ａ−Ｉ及びｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇは、ホローファイバー・バイオリアクター（Ｆｉｂｅｒｃｅｌｌ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｒｅｄｅｒｉｃｋ，ＭＤ）で産生し、プロテインＧ（４Ｃ１２）またはプロテインＡ（（ＴＬ１Ａ−Ｉｇ）カラム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ，ＵＫ）上で血清無しの上清から精製した。フローサイトメトリー分析用に、脾臓及びリンパ節から単細胞浮遊液を調製した。１０６細胞を抗マウスＣＤ１６／ＣＤ３２で予めブロックし、異なった抗体組み合わせで染色した。細胞内染色は、標準的手法に従って行った。フローサイトメトリーによる分析は、Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ  Ｆｏｒｔｅｓｓａ装置で行い、ＦＡＣＳＤＩＶＡまたはＦｌｏｗＪｏソフトウエアを分析に用いた。
【０１９９】
ウェスタンブロット
１０〜４０ｎｇ／ウェルを有する４〜１２％  ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルのローディング、標準的バッファ及び電圧を用いるゲル操作、標準的方法を用いるＰＶＤＦ膜への移行、及びａ−ｈＩｇＧ−ＨＲＰを用いるワンステップ染色及びＰｉｃｏまたはＦｅｍｔｏアルカリホスファターゼ系型検出試薬（Ｐｉｅｒｃｅ）を用いる次の検出を含む標準的方法を用いた。
【０２００】
カスパーゼ検出アッセイ
ヒトＴＮＦＲＳＦ２５（ｈＴＮＦＲＳＦ２５）をクローン化し、ｐ８１５細胞（ＡＴＣＣから購入）をトランスフェクトするために使用した。細胞を標準的なエレクトロポレーションまたは脂質系トランスフェクション法を用いてトランスフェクトした。次いで、トランスフェクトしたｐ８１５細胞は、精製したｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ（１ｐｇ／ｍｌ−１μｇ／ｍｌ）の濃度を増加させながら同時インキュベートし、製造者のプロトコール（Ｒｏｃｈｅ，カスパーゼ３活性アッセイ，製品番号１２０１２９５２００１）に従ってカスパーゼ検出アッセイを行った。
【０２０１】
Ｔ細胞増殖アッセイ
これらのアッセイは、Ｋｈａｎら，Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１３年２月１５日；１９０（４）：１５４０−５０に記載のようにして行った。
【０２０２】
ヒト化マウスの作製
選択的中絶（妊娠期間の１２〜２０週齢，Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ  Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ）からのヒト胎児肝臓を調査基準価格で入手した。ＣＤ３４＋細胞は、単細胞浮遊液（ＣＤ３４＋セレクションキット；Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃ，Ａｕｂｕｒｎ，ＣＡ）の密度勾配遠心に従う製造者の教示に従って免疫磁性ビーズを用いて濃縮した。単離したＣＤ３４＋細胞の純度をフローサイトメトリーで評価し、８５％超であった。後のＨＬＡタイピングのために細胞をアリコートし、凍結し、亜致死照射新生児ＮＳＧマウスに移植した。１０％ヒト血清、インターロイキン（ＩＬ）−３、ＩＬ−６の各１０ｎｇ／ｍｌ及び幹細胞因子（ＳＣＦ）をＩＭＤＭ中に含む培養液にＨＬＡタイピングされたＣＤ３４＋細胞造血幹細胞（ＨＳＣ）を３〜５日間入れた。移植の日に、培養皿から細胞を採取し、ＨＢＳＳで洗浄し、増殖及び分化能を評価するためにＣＦＵ及びＬＴＣ−ＩＣアッセイを行った。標準試薬（ＳｔｅｍＣｅｌｌ  Ｉｎｃ．）及び製造者によって公表された方法を用いてこれらのアッセイを行った。ＣＦＵ能は、ＳＣＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−３及びＥＰＯで補充したメチルセルロース培地での１４日間培養後の骨髄前駆細胞と同一であった。これらのアッセイは、単離したＨＳＣの全体形態的特徴及びコロニー数が予測した限度内にあるか否かを容易に明らかにする。一対一交配から作製された１日令ＮＳＧマウスは、２４時間照射後、里母親で飼育し（亜致死，１Ｇｙ，全身照射）、その時点で、ハミルトンシリンジ及び３０ゲージ１／２インチのニードルを用いて、２０μｌの体積中、１ｘ１０６〜２ｘ１０６予備培養ＨＳＣ肝内（ｉ．ｈ．）で移植した。仔ネズミを直ぐに里母親に戻し、２８日間離乳するまで乳を飲ませた。フローサイトメトリーによってネズミ及びヒトＣＤ４５＋細胞の相対的パーセンテージを決定することによって１５週齢の末梢血でヒト／マウスキメラ性を評価した。一旦ヒトＣＤ４５＋が検出されると、全ての採血でヒトＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１１ｃ及びＣＤ１９を含むように分析を拡大した。末梢血中のヒトＣＤ４５＋細胞が６０％（ＮＳＧ−ｈｕ）を超える場合に成功的に生着したマウスを選択した。
【０２０３】
アカゲザルにおけるＴＬ１Ａ−Ｉｇの安全性及び活性
非ヒト霊長類（ＮＨＰ）（インド起源アカゲザル）におけるＴＬ１Ａ−Ｉｇの安全性及び有効性を決定した。規定どおりのスクリーニング及び６０日間隔離の後に、静脈内（ＩＶ）ボーラス投与（１５分）で０日にアカゲザル（ｒｍ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇまたはヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−ＩｇをＮＨＰに投与した。動物の体重及びケージ側の観察を毎日行い、全血算定法、規定どおりの化学、ＣＤ４  ＴｒｕＣｏｕｎｔｓ、血清分離及びフローサイトメトリー分析のために末梢血を集めた。フローサイトメトリー分析のためには、Ｃｏｕｎｔｅｓｓ自動細胞数カウンタで末梢血細胞を計数し、１．５ｘ１０６細胞のアリコートを試験管、ＦＭＯ（Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ  Ｍｉｎｕｓ  Ｏｎｅ）、コントロール及び補正チューブ（ｃｏｍｐｅｎｓａｔｉｏｎ  ｔｕｂｅｓ）に分配した。生死アクアブルー弁別装置（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）で試験管をＤ−ＰＢＳ及び０．５％  ＦＢＳで染色した。試験サンプル及び好適なコントロールを所定の抗体カクテル（ＢＤ  Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅまたはＬｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから購入）で３０分間表面染色した。分子内染色のために、４℃で３０分間Ｆｉｘ／ｐｅｒｍ溶液（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）で透過した。細胞を洗浄し、３０分間、抗ＦｏｘＰ３抗体で細胞内染色した。染色後、細胞を洗浄し、ＢＤ（商標）ＬＳＲＩＩフローサイトメトリー（Ｂｅｃｋｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏ（ＢＤ））での取得のために３００μＬ  ＦＡＣ洗浄バッファに再懸濁した。細胞を取得し、ＦｌｏｗＪｏソフトウエア（Ｔｒｅｅ  Ｓｔａｒ，Ｉｎｃ．，Ａｓｈｌａｎｄ，ＯＲ）で分析した。ＣＤ４／ＣＤ８Ｔｒｕｃｏｕｎｔについては、ＣＤ４５、ＣＤ３、ＣＤ４及びＣＤ８抗体をＴｒｕＣｏｕｎｔチューブ（ＢＤ，製品番号３４０３３４）に分散し；５０ｕＬサンプルを加え、暗所で室温で１５分間染色した。次いで、４５０μＬ  ＦＡＣＳ溶解液でサンプルを溶解し、１５分間インキュベートした。Ｃサイトメーター（Ｃａｌｉｂｕｒ，ＢＤ）で試験管を分析した。事象は、側方散乱（ＳＳＣ）ドットプロットにおいてリンパ球にゲートをかけ、ＣＤ４５−陽性集団を選択した後、報告した：ＣＤ３＋ＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ３＋ＣＤ８＋Ｔ細胞。血清サイトカインの多重分析のために、所定に日から得られた血清を集め、サンプル及び標準曲線用のコントロールをフィルタプレートに置き、１／４に希釈し、室温で２時間、抗サイトカインビーズでインキュベートした。内容を除去し、ビオチン化検出抗体の混合物を各ウェルに添加前にバッファで２回洗浄した。検出抗体で１時間インキュベートした後、プレートを２回洗浄し、ストレプトアビジン−ＰＥで３０分間インキュベートした。再度、プレートを洗浄し、１５０μＬシース液でウェルを再懸濁し；次いで、プレートを読み、Ｌｕｍｉｎｅｘ（登録商標）ＳＤアナライザー（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．）で分析した。ＰＥシグナル（中央蛍光強度，ＭＦＩ）はサンプルに存在する各サイトカインの量に比例し；濃度を標準曲線から計算した。
【０２０４】
統計的分析
ＡＢＩ  Ｐｒｉｓｍ（登録商標）プログラム（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて、グラフ化及び統計的分析の全てを行った。スチューデントＴ検定を用いてペア分析を行った。２超の症状を有する症状の分析は、ターキー事後検定で片側ＡＮＯＶＡを用いて行った。有意差は図に＊（ｐ＜０．０５）；＊＊（ｐ＜０．０１）；及び＊＊＊（ｐ＜０．００１）として示す。
【０２０５】
実施例２：コグネート抗原依存性Ｔｒｅｇ増殖
本実施例は、ＴＮＦＲＳＦ２５によって刺激されたＴｒｅｇ増殖がコグネート抗原に依拠することを証明する。
【０２０６】
ＣＤ４−／−マウスが、自己抗原、及びＳｃｈｒｅｉｂｅｒ，Ｔ．Ｈ．ら  ２０１２．Ｏｎｃｏｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １：６４２−６４８に記載されたオバアルブミン（ｏｖａ）特異的ＣＤ４＋Ｖα２＋Ｖβ５＋ＦｏｘＰ３ＲＦＰ−（ＯＴＩＩｃｏｎｖ，ＯＴ−ＩＩマウスとＦＩＲマウスとを交配させて作製した）に特異的であるＣＤ４＋ＦｏｘＰ３ＧＦＰ＋  ｔＴｒｅｇ）の混合集団を用いて養子移入された、マウスモデルを利用した。モデルを図１に概略として示す。これらの試験では、ｔＴｒｅｇは、内因性（生殖細胞系統コード）自己抗原を認識する胸腺由来Ｔｒｅｇ細胞の全てを含むと推定される。ｐＴｒｅｇは、ＦｏｘＰ３を発現せずに胸腺に存在する末梢Ｔ細胞から作製した全てのＴｒｅｇを含むと推定され、そのため、外来（非生殖細胞系統コード）抗原を認識すると推定される。そのため、ｐＴｒｅｇは、胃腸管、皮膚及び肺を含む内因性環境または微生物抗原に決まって出くわす組織中の免疫応答の制御のために重要であると推定される。ＯＴ−ＩＩｃｏｎｖは、外来抗原オバアルブミン（「ｏｖａ」）に特異的なＭＨＣクラスＩＩ制限Ｔ細胞受容体を発現するトランスジェニックマウスから得られる細胞である。ＣＤ４の発現及びＦｏｘＰ３の非発現に基づいて、ＯＴ−ＩＩトランスジェニックマウスからこれらの細胞を単離した。
【０２０７】
０．５％オバアルブミン飲料水の５日間経口投与後に、ＩｇＧアイソタイプコントロール抗体またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスティック抗体であるクローン４Ｃ１２のいずれかでマウスを処置した。５日後、脾細胞及び腸間膜リンパ節（ｍＬＮ）細胞を採取し、ＯＴ−ＩＩ  ｐＴｒｅｇ細胞及びＦｏｘＰ３−ＲＦＰ陽性Ｔｒｅｇ細胞について分析した。このモデルは、主に自己抗原特異的ｔＴｒｅｇがそれぞれＦｏｘＰ３ＧＦＰ及びＦｏｘＰ３ＲＦＰ発現に基づいてＯＶＡ−特異的ｐＴｒｅｇＯＴＩＩと識別され得た扱いやすいモデルを提供した。
【０２０８】
別の実験では、０．５％オバアルブミン飲料水の５日間経口投与後に、ｔＴｒｅｇ及びＯＴＩＩｃｏｎｖの混合集団が上記のように養子的に移入されたＣＤ４−／−マウスを、ＩｇＧアイソタイプコントロール抗体またはＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスティック抗体であるクローン４Ｃ１２のいずれかで処置した。図２では、ｍＬＮ及び脾臓において増殖（Ｋｉ６７＋）を経験したＯＴ−ＩＩ−ｉＴｒｅｇ細胞及びｎＴｒｅｇ細胞の割合を示す。脾臓ＯＴＩＩｃｏｎｖの６．６±１．６％がＦｏｘＰ３ＲＦＰを発現するために誘導され、ｐＴｒｅｇＯＴＩＩになった。ｍＬＮ（図３）及び脾臓（図４）においてＯＴ−ＩＩｉＴｒｅｇ細胞及びｎＴｒｅｇ細胞増殖の抗原依存性を決定する別の実験では、１％オバアルブミン飲料水を継続するか（左パネル）、または所定の日数、オバアルブミン（ｏｖａ）を「ウオッシュアウトする」ために通常の水と交換した（右パネル）。所定の処置期間（０、１０または２０日間）後に、群をＩｇＧアイソタイプコントロール抗体または４Ｃ１２抗体のいずれかで処置し、ＯＴ−ＩＩｉＴｒｅｇ細胞及びｎＴｒｅｇ細胞を上記のように分析して５日後の各組織におけるＦｏｘＰ３＋Ｋｉ６７＋細胞の割合を決定した。オバアルブミンの経口投与によってｐＴｒｅｇＯＴＩＩの誘導後、コグネート抗原利用性とＴＮＦＲＳＦ２５刺激に対する感受性との関係を決定するために、個々のゲージを、オバアルブミン含有飲料水で維持するかまたは規定の飲料水に置き換えた。
【０２０９】
抗原中止（０日）前のＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスティック抗体であるクローン４Ｃ１２の投与は、全てのマウスでｐＴｒｅｇＯＴＩＩ及びｔＴｒｅｇの両方の増殖をもたらした（図３）。全ての群について、ｔＴｒｅｇ増殖は、ｔＴｒｅｇのコグネート「自己」抗原の持続的利用性のため、内部コントロールとして働いた。オバアルブミン抗原中止の１０日後（「ｏｖａウオッシュアウトの日数」）に、ｐＴｒｅｇＯＴＩＩは４Ｃ１２投与後の増殖を継続した、このことは、飲料水からのその中止後少なくとも１０日間、オバアルブミンが固執することを示している。しかしながら、オバアルブミン抗原中止の２０日後は、腸間膜リンパ節（図３）及び脾臓（図４）の両方においてｔＴｒｅｇの継続した増殖にもかかわらず、ｐＴｒｅｇＯＴＩＩの増殖は４Ｃ１２投与後観察されなかった。Ｏｖａ含有飲料水が同じ２０日間提供された場合、ｐＴｒｅｇＯＴＩＩは、両組織（ｍＬＮ及び脾臓）での４Ｃ１２への応答において増殖を継続した。これらのデータは、コグネート抗原の中止が、４Ｃ１２刺激増殖に対するｐＴｒｅｇＯＴＩＩの応答性を抑制することを証明した、このことは抗原特異的応答を示す。
【０２１０】
実施例３：ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇはヒト化マウスでのヒトｔＴｒｅｇの増殖を刺激する
本実施例は、ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質はヒトＴｒｅｇの強力な増殖を全身的に及びヒト化マウスの粘膜で誘導したことを証明する。
【０２１１】
ヒトＴＬ１Ａ及びヒトＩｇＧ１のヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３ドメインの細胞外ドメインを含む融合タンパク質をクローン化し、上記のように細胞培養上清から精製した。単量体及び多量体ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ複合体をウェスタンブロットによって同定した（図５）。ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ（ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ）のインビトロ活性を、カスパーゼ検出アッセイを用いて証明し、該アッセイでは、カスパーゼ検出アッセイを用いて、ヒトＴＮＦＲＳＦ２５（ｈＴＮＦＲＳＦ２５）をトランスフェクトしたｐ８１５細胞を、精製したｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ濃度を増加させながら同時インキュベートした（図６）。
【０２１２】
ヒトＴｒｅｇに対するｈＴＬ１Ａ−Ｉｇのインビボ活性を決定するために、上記のように、ＮＯＤ、ＳＣＩＤ、共通のγ−鎖欠損（ＮＳＧ）レシピエントマウスにトランスフェクトされたヒト胎児肝臓ＣＤ３４＋細胞を用いてヒト化マウスを作製した。実験マウス（ＮＳＧ−ｈｕ）でのヒトＣＤ４５＋細胞の生着は、１５週齢の全てのマウスにおいて、脾細胞において６０％以上のキメラ性を、リンパ節において９０％以上のキメラ性を示した。脾臓におけるヒトＣＤ４５＋リンパ球の大部分は、Ｔ細胞（約５０％）、次いで、Ｂ細胞（約３５％）、ＮＫ細胞（約２〜３％）、そして樹状細胞（約１％）であった。
【０２１３】
ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇの投与は、注射後５日に分析されたレシピエントマウスにおける脾臓、リンパ節または小腸のいずれかにおいてｈＣＤ４５＋、ｈＣＤ４＋またはｈＣＤ８＋細胞の全体的バランスを著しく変更しなかった（図７〜９）。しかしながら、総ＣＤ４＋ＣＤ２５ｈｉＣＤ１２７−細胞の内、ＦｏｘＰ３＋細胞の割合としてのヒトＴｒｅｇ細胞の分析は、脾臓、リンパ節及び小腸において、処置５日後に、Ｔｒｅｇの総頻度及び活性増殖（Ｋｉ６７＋）のＴｒｅｇの割合の両方で顕著な増加を証明した（図７〜９）。脾臓では、コントロールの平均Ｔｒｅｇ値（±ＳＥＭ）は０．７２±０．１１％、ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇのそれは１．７１±０．２４％（図７）である。リンパ節では、コントロール平均Ｔｒｅｇ値は０．９１±０．１２であったが、ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇについては１．９４±０．２１であった（図８）。小腸では、コントロールの平均Ｔｒｅｇ値（±ＳＥＭ）は１．５６±０．３１％であったが、ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇについては４．５４±０．６９％であった（図９）。表現型的には、Ｔｒｅｇ細胞は、主にセントラルメモリー（ＣＣＲ７＋ＣＤ４５−ＲＡ−；約７０〜８０％）遺伝子型を有したが、非Ｔｒｅｇ細胞は、主にナイーブ（ＣＣＲ７＋ＣＤ４５−ＲＡ−；約７０〜８０％）遺伝子型を示した。慣用的ＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔ細胞によって発現された活性化マーカー（ＣＤ２５、ＣＤ６９）の分析は、脾臓ではＣＤ４＋（ｐ＝０．０３６３）及びＣＤ８＋（ｐ＝０．００６４）慣用的細胞の両方でＣＤ６９の高い発現を証明したが、ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ処置ＮＳＧ−ｈｕのリンパ節では証明しなかった。これらのデータが、ｈＴＬ１Ａ−ＩｇがヒトＴｒｅｇの強力な増殖を全身的に及びヒト化マウスの粘膜で誘導することを証明した。
【０２１４】
Ｋｈａｎ，Ｓ．Ｑ．ら（前掲）に詳述したネズミ融合タンパク質を用いて同様な結果を得た。
【０２１５】
実施例４：アカゲザルでのＴＬ１Ａ−Ｉｇの安全性及び活性
本実施例は、ＴＬ１Ａ−Ｉｇがヒト化マウス及び霊長類で、インビボで、コグネートＴｒｅｇ細胞の増殖を安全かつ選択的に刺激することができたことを証明する。
【０２１６】
齧歯動物モデルの固有の制限は、病原無しの条件下で繁殖され飼育された研究室動物の外来抗原チャレンジの高度に制御されかつ制限された歴史に関連する。ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの抗原依存的活性を考慮すると、この限界は、これらの物質のＮＨＰへの翻訳試験の重要な結果を有するが、外来抗原曝露の歴史は劇的により多様である。この疑問を解決するために、アカゲザルＴＬ１Ａ−Ｉｇ（ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇ）を産生しＮＨＰで試験した。処置済みナイーブインド起源アカゲザル（非ヒト霊長類（ＮＨＰ））を取得し、飼育し、Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ（ＡＢＬ，Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤ）で専門職員によって処置した。アカゲザルＴＬ１Ａ−Ｉｇ（ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇ）及びヒト（ｈ）ＴＬ１Ａ−Ｉｇを製造し、上記のようにして精製し、全体積１０ｍｌ  ＰＢＳで希釈したブラインド化チューブ中の所定の濃度でＡＢＬ職員に移送した。清浄６０日検疫後に、ベースラインの全血球数（ＣＢＣ）及び血清化学を、ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇ及びｈＴＬ１Ａ−Ｉｇの計画された静脈内投与前の１４日に得た。試験の０日に単回ＩＶ注射によって、２動物には０．５ｍｇ／ｋｇ  ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇを投与し、４動物には１．５ｍｇ／ｋｇ  ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇを投与し、２動物には１．５ｍｇ／ｋｇ  ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇを投与した。ＴＬ１Ａ−Ｉｇ半減期、Ｔｒｅｇ拡張、Ｔｃｏｎｖ亜群、及び活性化分析及びサイトカインプロファイルを、試験の２１日目に殺処分された動物由来の組織病理学と共に、実験の２１日間に渡る連続採血によって監視した。
【０２１７】
任意のＮＨＰでの注射直後１２時間または試験の残りの期間のいずれかにおいて、急性毒性は観察されなかった。毎日のケージ側での観察により、試験過程を通じて全ＮＨＰの正常な行動を見出し、喘息、催眠、下痢、嘔吐、アナフィラキシー、皮膚発疹または皮膚刺激、末梢性浮腫、関節滑液または粘膜分泌の証拠はなかった。試験過程ではＮＨＰのいずれかにおいて観察された下痢または体重減少はなかった（図１０）。血清化学は、電解質レベル：ナトリウム、カリウム、リン酸、塩化物、カルシウム、グルコース、クレアチニン、血液尿素窒素、全血清タンパク質、アルブミン、総コレステロールまたはグロブリンの変化を示さなかった。全血球数は、処置後最初の日に、総白血球（図１１Ａ）及び好中球（図１１Ｂ）の増加を示したが、試験過程に渡って、総ヘモグロビン、ヘマトクリット、総赤血球、ＭＣＶ、ＭＣＨ、血小板、リンパ球、単球、好酸球または好塩基球の変化は観察されなかった。肝臓酵素パネルは、アルカリホスファターゼ、総ビリルビンまたはＡＬＴに変化がないことを示した。しかしながら、全動物において、ＡＳＴが約１０倍増加し、クレアチニンホスホキナーゼが処置後の第１日目に観察され、その増加は、処置プロトコール前の麻酔の分子内注射後にＮＨＰで決まって観察される。ＡＳＴ及びＣＰＫレベルは、全動物において試験の４日目にベースラインに戻った。
【０２１８】
連続的に集めた血清サンプルの分析は、フェーズ減衰モデルを用いて計算したところ、ＮＨＰでのｈＴＬ１Ａ−Ｉｇについて１２．５時間の半減期を示した（図１２）。ベースライン（０日）、２日、及びピークＴｒｅｇ拡張時（４日）での血清サイトカインの多重分析（Ｌｕｍｉｎｅｘ（登録商標））は、ＩＬ−２、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−１０またはＴＮＦ−αレベルが検出できるほどの変化を示さず、処置後４日まではＩＦＮ−γ及びＴＧＦ−βの高いレベルに従う傾向を証明した（図１３）。末梢血Ｔｒｅｇ細胞のフローサイトメトリーによる分析は、ヒト化マウスと比べて、アカゲザルでのほとんど同一の相対的大きさ及びインビボＴｒｅｇ拡張の動力学を証明した（図１４）。相対的倍拡張は、Ｔｒｅｇ区画の約３倍拡張による処置後４日でピークとなった。０．５ｍｇ／ｋｇ  ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇ用量と共に１．５ｍｇ／ｋｇのｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇ及びｈＴＬ１Ａ−Ｉｇの両方を用いて、同様な応答が観察され、このことは、Ｔｒｅｇ拡張の顕著でない減少傾向を証明している。
【０２１９】
ＣＤ４＋及びＣＤ８＋  Ｔｃｏｎｖ細胞活性化を監視するために、末梢血での実験過程で、ナイーブ（ＣＣＲ７＋ＣＤ２８＋ＣＤ９５−）、セントラルメモリー（ＣＣＲ７＋ＣＤ２８＋ＣＤ９５＋）、エフェクターメモリー（ＣＣＲ７−ＣＤ２８−ＣＤ９５＋）及び移行型エフェクターメモリー（ＣＣＲ７−ＣＤ２８＋ＣＤ９５＋）のＴ細胞亜群を監視した。この分析は、ＣＤ８ナイーブ、セントラルメモリー、エフェクターメモリーまたは移行型エフェクターメモリーのＴ細胞区画に顕著な変動がないことを証明した。ＣＤ４区画内において、試験の１１日目までに末梢血ナイーブＣＤ４細胞の頻度の顕著な減少があり、その後、急速に１５日目までにベースラインまで回復した（図１５）。顕著ではないが、試験の１１日目までにＣＤ４セントラルメモリーの増加頻度に対する傾向があり、その後、絶対細胞数に調整する時に、何の変化も示さなかった；このことは、この相対的差が、セントラルメモリー細胞に対する増殖効果よりもむしろナイーブ細胞での相対的減少に関連しそうであったことを示している。
【０２２０】
ＴＬ１Ａ−Ｉｇ投与直後の、ＣＤ４＋もしくはＣＤ８＋エフェクターＴ細胞活性化または炎症性サイトカインの増加した濃度の証拠はなかったが、無症状免疫病理学の兆候は個々の組織内に存在し得る可能性が残された。個々の組織内の免疫病理学の兆候を研究するために、試験２１日目に剖検及び終末器官組織病理学について、ｒｍＴＬ１Ａ−Ｉｇ（１．５ｍｇ／ｋｇ）を投与した２動物、及びｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ（１．５ｍｇ／ｋｇ）を投与した２動物を選択した。中脳、脳幹、肝臓及び膵臓のヘマトキシリン及びエオシン染色切片の分析は、分析した動物のいずれかの炎症または病気の何の証拠も示さなかった。１動物では、肺切片は、最小の、多病巣性血管周囲性リンパ球性凝集体の証拠を示し、３動物は本質的に正常な肺組織であると解釈された。２動物では毛のある皮膚切片は、局所的に広い皮膚浮腫の軽度から中程度領域を示すことが分かり、残りの２動物は本質的に正常な皮膚組織であると解釈された。４動物の中の３動物において、空腸切片は、軽度の広範な粘膜下浮腫の証拠を示した。４動物の内の４動物で、末端回腸の切片は、軽度の広範な粘膜及び粘膜下浮腫の証拠を示した。４動物の内の４動物で、Ｓ状結腸の切片は、軽度の多病巣性のリンパ形質細胞の浸潤を示した。腸管膜リンパ節切片は、３または４動物で本質的に正常な組織であると解釈され、１動物で軽度の広範なリンパ球増加症の証拠を示した。
【０２２１】
更に、これらの結果は、受容体アゴニスティック抗体及びリガンド融合タンパク質によるＴＮＦＲＳＦ２５の刺激が、ヒト及びＮＨＰ  Ｔｒｅｇ細胞のインビボ調節のための特有かつ特異的な方法を提供するとの証拠を提供する。Ｔｒｅｇ刺激の動力学及び特異性は、マウス、アカゲザル及びヒト特異的ＴＬ１Ａ−Ｉｇによる処置後に、マウス、ＮＳＧ−ｈｕ及びＮＨＰで顕著に類似する；このことは、コグネート抗原／ＴＣＲ関与、ＩＬ−２受容体及びＡｋｔ活性化に関連する根底にあるメカニズムもヒトで保存され、マウスでも証明されたことを示し得る（Ｋｈａｎら（前掲））。末梢血でのＴｒｅｇ拡張のピーク直後のナイーブＣＤ４  Ｔ細胞の減少に関するＮＨＰでの観察は、ＣＤ４ナイーブ細胞のインビボ抑制の証拠を示し得る。
【０２２２】
考察
実施例２〜４のデータは、インビボにてマウス、ＮＳＧ−ｈｕおよびＮＨＰでＴＬ１Ａ−ＩｇがコグネートＴｒｅｇ細胞の増殖を安全にかつ選択的に刺激することができる分子であることを示している。特別な関心事は、ＴＬ１Ａのトランスジェニック発現がＩＢＤに罹患易くすることを証明するヒト及びマウスでの実験において、ＴＬ１Ａ多形をＩＢＤに関連付ける疫学的データがあるために、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）への可能な感受性であった。腸での内因性「外来」抗原への寛容は特にＴｒｅｇの免疫抑制活性に依るので、ＮＨＰでのＴＮＦＲＳＦ２５の調節は同様な免疫病理学をもたらすだろうと推測された。かかる毒性は、これらの試験期間での行動変化、下痢または体重減少によって証明されるようにこれらの試験で観察されず、末梢血でのエフェクター細胞活性化または炎症性サイトカイン産生を広める証拠はなかった。終末器官組織病理学は、組織免疫病理学の明白な兆候を示すことなく、末端回腸及びＳ状結腸内でのリンパ系細胞の軽度集積のみを証明した。
【０２２３】
実施例５：ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストとＩＬ−２との併用療法
本実施例は、低用量または極低用量のＩＬ−２とＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストとの併用、例えばＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質またはアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体４Ｃ１２がＴｒｅｇ細胞の拡張に対する相乗効果をインビボで有したとの驚くべきかつ予測できない発見を証明する。
【０２２４】
第１の実験群では、低用量ＩＬ−２（３００，０００単位／ｍ２）、コントロール（ＩｇＧ）、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ（０．５ｍｇ／ｋｇ）、あるいはＴＬ１Ａ−Ｉｇ及び極低用量のＩＬ−２（３０，０００単位／ｍ２）の単回注射との併用療法またはＴＬ１Ａ−Ｉｇ及び極低用量のＩＬ−２（３００，０００単位／ｍ２）の単回注射との併用療法によって野生型マウスを処置した。総ＣＤ４＋細胞の内、ＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋細胞の頻度を所定の日に末梢血で監視した。
【０２２５】
図１６から明らかなように、ＴＬ１Ａ−ＩｇとＩＬ−２の用量（極低用量ＩＬ−２（３０，０００単位）または低用量（３００，０００単位））との治療は、ＴＬ１Ａ−ＩｇまたはＩＬ−２単独による処置と比べて、Ｔｒｅｇ細胞拡張に対する相乗効果を有した。例えば、処置５日後には、ＦｏｘＰ３＋Ｔｒｅｇ細胞の割合は、ＴＬ１Ａ−Ｉｇで処置されたマウスでの４０％、及び低用量ＩＬ−２単独で処置されたマウスでの２０％と比べて、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ及び低用量ＩＬ−２で処置されたマウスでは６０％、ＴＬＬ１Ａ−Ｉｇ及び極低用量ＩＬ−２で処置されたマウスでは５０％であった。相乗効果は、処置後６日でより顕著であった。そこでは、Ｔｒｅｇ細胞の頻度は、ＴＬ１Ａ−Ｉｇまたは低用量ＩＬ−２単独で処置後に２５％未満、２０％未満であったのに対して、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ及び低用量または極低用量のＩＬ−２での各々の併用処置後に、５５％、約４０％であった。
【０２２６】
第２実験群では、低用量ＩＬ−２（３００，０００単位／ｍ２）、コントロール（ＩｇＧ）、４Ｃ１２抗体（０．４ｍｇ／ｋｇ）または４Ｃ１２抗体と低用量ＩＬ−２（３００，０００単位／ｍ２）の単回注射との併用療法で、野生型マウスを処置した。総ＣＤ４＋細胞の内、ＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋細胞の頻度を所定の日に末梢血で監視した。
【０２２７】
図１７で示すように、４Ｃ１２抗体と低用量ＩＬ−２との組み合わせによる処置は、Ｔｒｅｇ細胞の拡張に劇的な相乗的効果をもたらした。４Ｃ１２／ＩＬ−２併用での処置６日後に、Ｔｒｅｇ細胞の頻度は、４Ｃ１２抗体単独または低用量ＩＬ−２単独を投与したマウスでの、それぞれ、全ＣＤ４＋  ＣＤ３＋末梢血細胞の約３０％と比べて、及び全ＣＤ４＋  ＣＤ３＋末梢血細胞の約２０％未満と比べて、全ＣＤ４＋  ＣＤ３＋末梢血細胞の約７０％であった。
【０２２８】
上記の併用療法で得られた結果は、多数の理由により驚くべきことでありかつ予想外のことであった。例えば：１）ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト／ＩＬ−２併用は、ＩＬ−２の用量（３００，０００単位）でＴｒｅｇ拡張を達成したが、以前はＴｒｅｇ細胞を拡張することは示されていなかった；２）該併用療法は、Ｔｒｅｇ拡張を、「低用量」ＩＬ−２（３０，０００単位）と考えられた量よりも１０倍以下の用量で達成した；そして、３）Ｔｒｅｇ拡張の大きさは予想外であった。これは、ＣＤ４区画での５０％  Ｔｒｅｇ細胞を得る最初の記載（すなわち、全ＣＤ４＋細胞の５０％がＴｒｅｇ細胞であった）であり、４Ｃ１２／低用量ＩＬ−２の場合では該分画は７０％にさえ到達した最初の記載と考えられる。更に、ＩＬ−２との併用療法においてＴＬ１Ａ−Ｉｇ及びＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスティック抗体の両方を用いて、これらの大きい数のＴｒｅｇ細胞が得られた。このことは、受容体自体の性質であって、特定の物質の性質ではないことを示す。
【０２２９】
実施例６：ＴＬ１Ａ−Ｉｇとラパマイシンとの併用療法
本実施例は、ラパマイシンとＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質との併用がインビボでＴｒｅｇ細胞を保存した一方、同時エフェクターＴ細胞活性化を排除したとの驚くべきかつ予測できない発見を証明する。
【０２３０】
２日前（−２）に、オバアルブミン特異的ＣＤ８（ＯＴ−Ｉ）またはＣＤ４（ＯＴ−ＩＩ）Ｔ細胞で野生型マウスを養子移入した。次いで、コントロールＩｇＧ、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ（０．５ｍｇ／ｋｇ）及び／または低用量ラパマイシン（７５μｇ／ｋｇ）の６日コースと一緒に、水酸化アルミニウム（「ａｌｕｍ」）−アジュバンド化オバアルブミンでマウスを免疫した。１８日間フローサイトメトリーで、総ＣＤ８＋細胞の内のＯＴ−Ｉ細胞の頻度、総ＣＤ４＋細胞の内のＯＴ−ＩＩ細胞の頻度、及び総ＣＤ４＋細胞の内のＣＤ４＋ＦｏｘＰ３＋細胞（Ｔｒｅｇ細胞）の頻度を監視した。
【０２３１】
図１８及び図１９に示すように、ラパマイシンを含む処置後のＣＤ８＋（ＯＴ−Ｉ）及びＣＤ４＋（ＯＴ−ＩＩ）細胞の全頻度は、顕著に減少した。しかしながら、最も特筆すべきことは、ＯＶＡ／ａｌｕｍ、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ及びラパマイシンでの処置後のＴｒｅｇ細胞の頻度が影響を受けなかったことである（図２０）。このことは、ラパマイシンの効果が活性化Ｔエフェクター細胞で特異的だったがＴｒｅｇ細胞ではそうでなかったことを示している。
【０２３２】
この発見は驚くべきことであり、ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニスト（例えば、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質及び他のアゴニスト、例えば４Ｃ１２抗体）に関連する治療が、望ましくない活性化及びＣＤ４及びＣＤ８  Ｔエフェクター細胞の拡張を避けるために、ラパマイシンの同時投与から利益を得ることを示している。
【０２３３】
予言的実施例１：ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質のヒト対象への投与
ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質は静脈内投与用に緩衝化生理食塩水で調合する。０．１ｍｇ／ｋｇ／日〜１０ｍｇ／ｋｇ／日ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質の範囲内で増加し、上記実施例１に記載のように調製、単離された投薬は、固体臓器または幹細胞移植前に、数日間、誘導剤としてヒト患者に投与される。次いで、数週間の期間に渡って連続採血によってこの治療の有効性を測定する、そこでは、処置した対象の末梢血でＴｒｅｇ細胞、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）細胞及び炎症性サイトカインの頻度を測定する。タクロリムスまたは他のｍＴＯＲ阻害剤を含むがこれらに限定されない標準的な免疫抑制維持療法、シクロスポリン阻害剤、及びプレドニゾン及びメチルプレドニゾンを含むステロイドレジメン、の早期離乳の能力に基づいて、処置した対象におけるこの治療の長期間の利益も測定する。
【０２３４】
最初の安全性試験は、０．１〜１０ｍｇ／ｋｇ／日  ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇを緩衝化生理食塩水で静脈内に投与される、健常対象で行ってもよい。次いで、数週間の期間、連続採血によって処置した対象でｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ機能を測定する、そこでは、処置した対象の末梢血でＴｒｅｇ細胞、Ｔｅｆｆ細胞及び炎症性サイトカインの頻度を測定する。安全性は、標準的な観察方法を用いても監視される。
【０２３５】
予言的実施例２：ヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質とインターロイキン−２との併用療法
ｈＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質は、上記実施例１に記載のように調製、単離された上記予言的実施例１に効果的であると見出された投薬量（例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ／日〜１０ｍｇ／ｋｇ／日）での静脈内投与用に緩衝化生理食塩水で調合する。固体臓器または幹細胞移植前に、数日間、誘導剤としてヒト患者に投与される。ｈＴＬ１Ａ融合タンパク質の投与の１日または２日前、同日、またはその１日または２日後に、患者はまた、低用量ＩＬ−２（３００，０００単位）または極低用量（３０，０００単位）のいずれか、あるいはＩＬ−２の３０，０００〜３００，０００単位／平方メートルの量で静脈内で投与される。
【０２３６】
次いで、数週間の期間に渡って連続採血によってこの治療の有効性を測定する、そこでは、処置した対象の末梢血でＴｒｅｇ細胞、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）細胞及び炎症性サイトカインの頻度を測定する。タクロリムスまたは他のｍＴＯＲ阻害剤を含むがこれらに限定されない標準的な免疫抑制維持療法、シクロスポリン阻害剤、及びプレドニゾン及びメチルプレドニゾンを含むステロイドレジメン、の早期離乳の能力に基づいて、処置した対象におけるこの治療の長期間の利益も測定する。
【０２３７】
予言的実施例３：ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストとラパマイシンとの併用療法
例えば上記実施例１及び３に記載のヒトＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質、またはアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体は、有効量（例えば、ＴＬ１Ａ−Ｉｇ融合タンパク質については、上記の予言的実施例１で有効であることが見出された投薬量（例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ／日〜１０ｍｇ／ｋｇ／日の範囲））での静脈投与用に緩衝化生理食塩水で調合され、上記実施例１に記載のように調製、単離される。ヒトＴＬ１Ａ融合タンパク質、またはアゴニスティック抗ＴＮＦＲＳＦ２５抗体は、固体臓器または幹細胞移植の数日前に誘導剤としてヒト患者に投与される。ＴＮＦＲＳＦ２５アゴニストの投与の１日または２日前、同日、またはその１日または２日後に、患者はまた、７５〜３００マイクログラム／ｋｇ体重／日の投薬量でラパマイシンを投与される。
【０２３８】
次いで、数週間の期間に渡って連続採血によってこの治療の有効性を測定する、そこでは、処置した対象の末梢血でＴｒｅｇ細胞、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）細胞及び炎症性サイトカインの頻度を測定する。タクロリムスまたは他のｍＴＯＲ阻害剤を含むがこれらに限定されない標準的な免疫抑制維持療法、シクロスポリン阻害剤、及びプレドニゾン及びメチルプレドニゾンを含むステロイドレジメン、の早期離乳の能力に基づいて、処置した対象におけるこの治療の長期間の利益も測定する。
【０２３９】
本発明の多数の実施形態を記載してきた。にもかかわらず、様々な変更が本発明の趣旨及び範囲を逸脱することなくなされることが理解できよう。全ての数値は概算であり、詳細な説明に提供されることも理解されたい。従って、他の実施形態も以下の特許請求の範囲内にある。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【配列表】
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