(57)【要約】      （修正有）【課題】部位特異的コンジュゲーションのための操作された抗体定常ドメインの提供。【解決手段】（ａ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ３３４、Ｑ３４７、Ｅ３８０、Ｅ３８８、Ｋ３９２、Ｎ４２１、及びＬ４４３からなる群から選択される位置における１つ又は２つのアミノ酸置換を含むヒトＩｇＧ重鎖定常ドメインポリペプチド又はその部分、及び、（ｂ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ１８３の位置におけるアミノ酸置換を含むヒトカッパ軽鎖定常ドメインポリペプチド又はその部分からなる群から選択され、抗体定常ドメインポリペプチドの部分は、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含む部位特異的コンジュゲーションのための操作された抗体定常ドメインの提供。【選択図】図１１
2019034942.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分であって、
操作された抗体定常ドメインは、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、操作された抗体定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ３３４、Ｑ３４７、Ｅ３８０、Ｅ３８８、Ｋ３９２、Ｎ４２１、およびＬ４４３におけるものからなる群から選択される位置における１つまたは２つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、および、
（ｂ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ１８３の位置におけるアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分
からなる群から選択され、
操作された抗体定常ドメインポリペプチドの部分は、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、かつ、
操作された抗体定常ドメインポリペプチドの活性の少なくとも９０％を保持する、
操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分。
【請求項２】
操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分であって、
操作された抗体定常ドメインは、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、操作された抗体定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＥＵインデックスに従って、ｉ）Ｅ３８０とＬ４４３、ｉｉ）Ｌ３９８とＬ４４３、ｉｉｉ）Ｖ４２２とＬ４４３、ｉｖ）Ｅ３８０とＬ３９８、ｖ）Ｌ３９８とＶ４２２、ｖｉ）Ｅ３８０とＶ４２２、ｖｉｉ）Ｋ３９２とＬ４４３、ｖｉｉｉ）Ｆ４０４とＬ４４３、ｉｘ）Ｋ３９２とＦ４０４からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換の対を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、および、
（ｂ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ１８３アミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分
からなり、
操作された抗体定常ドメインポリペプチドの部分は、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、かつ、
操作された抗体定常ドメインポリペプチドの活性の少なくとも９０％を保持する、
操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分。
【請求項３】
Ｃκポリペプチドが、位置Ｋ１８３におけるアミノ酸置換を含む、請求項１または２に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分。
【請求項４】
ポリペプチドが、（ａ）配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１０２のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１３１のアミノ酸配列、（ｄ）配列番号１３４のアミノ酸配列、（ｅ）配列番号１４１のアミノ酸配列、（ｆ）配列番号１４６のアミノ酸配列、および（ｇ）配列番号１６６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも一つのアミノ酸配列を含む、請求項１から３のいずれか１項に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分。
【請求項５】
Ｃγポリペプチドが、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４サブクラスから選択される、請求項１から４のいずれか１項に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分。
【請求項６】
請求項１から５のいずれか１項に記載の、操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分を含む、抗体またはその抗原結合部分。
【請求項７】
請求項６に記載の抗体またはその抗原結合部分であって、
（ａ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ３３４、Ｑ３４７、Ｅ３８０、Ｅ３８８、Ｋ３９２、Ｎ４２１、およびＬ４４３からなる群から選択される位置における１つまたは２つのアミノ酸置換を含む操作された重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、および、
（ｂ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ１８３の位置におけるアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
からなる群から選択される、少なくとも一つの操作された定常ドメインポリペプチドを含む、抗体またはその抗原結合部分。
【請求項８】
請求項６に記載の抗体またはその抗原結合部分であって、
（ａ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ３３４、Ｑ３４７、Ｋ３９２、およびＬ４４３からなる群から選択される位置における１つまたは２つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）ＥＵインデックスに従って、Ｋ１８３の位置におけるアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、および
（ｃ）それらの組み合わせ
からなる群から選択される、少なくとも一つの操作された定常ドメインポリペプチドを含む、抗体またはその抗原結合部分。
【請求項９】
操作された抗体定常ドメインポリペプチドが、細胞傷害性剤、細胞増殖抑制剤、化学療法剤、毒素、放射性核種、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、マイクロＲＮＡ、ペプチド核酸、非天然アミノ酸、ペプチド、酵素、蛍光タグ、およびビオチンのうちの１つまたは複数にコンジュゲートしており、コンジュゲーションが、置換システインにおけるものである、請求項１から５のいずれか１項に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドもしくはその部分、または請求項６から８のいずれか１項に記載の抗体もしくはその抗原結合部分。
【請求項１０】
細胞傷害性剤、細胞増殖抑制剤、化学療法剤、毒素、放射性核種、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、マイクロＲＮＡ、ペプチド核酸、非天然アミノ酸、ペプチド、酵素、蛍光タグ、およびビオチンのうちの１つまたは複数が、リンカーを介してポリペプチドにコンジュゲートしている、請求項９に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドもしくはその部分、または抗体もしくはその抗原結合部分。
【請求項１１】
リンカーが、ｍｃ（マレイミドカプロイル）、ｖａｌ−ｃｉｔ（バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルカルバメート）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］３ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］６ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項１０に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドもしくはその部分、または抗体もしくはその抗原結合部分。
【請求項１２】
リンカーおよび細胞傷害性剤が、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＤ（ｍｃＭＭＡＤ）、マレイミドカプロイル−０１０１（ｍｃ０１０１）、マレイミドカプロイル−３３７７（ｍｃ３３７７）、マレイミドカプロイル−８２６１（ｍｃ８２６１）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ（ｖｃＭＭＡＤ）、バリン−シトルリン−０１０１（ｖｃ０１０１）、バリン−シトルリン−３３７７（ｖｃ３３７７）、バリン−シトルリン−８２６１（ｖｃ８２６１）、ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ）、ｍｃＶａｌＣｉｔ０１０１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−０１０１）、ｍｃＶａｌＣｉｔ３３７７（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−３３７７）、ｍｃＶａｌＣｉｔ８２６１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−８２６１）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−３３７７、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−８２６１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−８２６１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−８２６１からなる群から選択される、請求項１０または１１に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドもしくはその部分、または抗体もしくはその抗原結合部分。
【請求項１３】
請求項１または２に記載の操作されたＣγポリペプチドを含む、Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１４】
請求項６から１２のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合部分、および薬学的に許容できる担体を含む、医薬組成物。
【請求項１５】
請求項１４に記載の医薬組成物を含む、がん、自己免疫性、炎症性、または感染性の疾患または障害の治療剤。
【請求項１６】
操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分が、細胞傷害性剤、細胞増殖抑制剤、化学療法剤、毒素、放射性核種、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、マイクロＲＮＡ、ペプチド核酸、非天然アミノ酸、ペプチド、酵素、蛍光タグ、およびビオチンのうちの１つまたは複数にコンジュゲートしており、コンジュゲーションが、置換アミノ酸におけるものである、請求項１５に記載の治療剤。
【請求項１７】
請求項１から５のいずれか１項に記載の操作された抗体定常ドメインポリペプチドもしくはその部分、または請求項６から１２のいずれか1項に記載の抗体もしくはその抗原結合部分をコードする核酸。
【請求項１８】
請求項１３に記載の操作されたＦｃポリペプチドをコードする核酸。
【請求項１９】
請求項１７または１８に記載の核酸を含む、宿主細胞。
【請求項２０】
操作された抗体またはその抗原結合部分を生成する方法であって、請求項１９に記載の宿主細胞をインキュベートするステップを含む方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
配列表への参照
本願は、ＥＦＳ−Ｗｅｂを介して電子的に出願されており、．ｔｘｔ形式で電子的に提出された配列表を含む。この．ｔｘｔファイルは、２０１２年１２月１５日に作成され、３０３ＫＢのサイズを有する、「ＰＣ０７１８６８Ａ＿Ｓｅｑｕｅｎｃｅ＿Ｌｉｓｔｉｎｇ．ｔｘｔ」という表題の配列表を含む。この．ｔｘｔファイル中に含まれている配列表は、本明細書の一部であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。
【０００２】
本発明は、少なくとも１つの定常領域が、部位特異的コンジュゲーションのためのアミノ酸を導入するように操作されている、抗体およびこれらの断片に関する。本発明はさらに、とりわけ、抗体−薬物コンジュゲート治療剤を生成するための方法、ならびにそのための操作された抗体および断片の使用に関する。
【背景技術】
【０００３】
１２０万人超の米国人が毎年がんを発症する。がんは、米国における死亡の第２の主要原因であり、男性二人に一人および女性三人に一人が、彼らの寿命の間のある時期にがんと診断される。
【０００４】
多くの化学療法剤が開発されているが、これらは、容認できない毒性、および／または非がん組織に対してがん細胞への特異性の欠如を示すことが多い。化学療法剤の非特異的細胞傷害効果を回避するために、標的抗体療法ががん治療を激変させており、いくつかのモノクローナル抗体（ｍＡｂ）が臨床的可能性を実証している。腫瘍特異的抗原に対する抗体は、治療活性を欠くことが多いので、これらは、化学療法の有効性を抗体の標的化と組み合わせるために、細胞傷害性剤にコンジュゲートしている。原理上は、抗体結合によって特定の腫瘍組織に細胞傷害性剤を選択的に送達すると、伝統的な低分子化学療法剤の全身毒性が低減されるはずである。
【０００５】
抗体は、ＤＮＡをアルキル化し（例えば、デュオカルマイシンおよびカリケアマイシン）、微小管を破壊し（例えば、マイタンシノイドおよびオーリスタチン）、またはＤＮＡに結合する（例えば、アントラサイクリン）低分子を含めた、様々な細胞傷害性薬にコンジュゲートしている。カリケアマイシンにコンジュゲートしたヒト化抗ＣＤ３３抗体を含む、１つのこのような抗体−薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）、すなわち、Ｍｙｌｏｔａｒｇ（商標）（ゲムツズマブオゾガマイシン、Ｗｙｅｔｈ）が、急性骨髄性白血病に関して２０００年に認可された。より最近では、米国食品医薬品局は、ホジキンリンパ腫および未分化大細胞リンパ腫の治療用に、Ａｄｃｅｔｒｉｓ（商標）（ブレンツキシマブベドチン；Ｓｅａｔｔｌｅ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ）、すなわち、モノメチルオーリスタチンＥ（ＭＭＡＥ；Ｎ−メチルバリン−バリン−ドライソロイイン−ドラプロイン−ノルエフェドリンとも呼ばれる）にコンジュゲートしたＣＤ３０に対するキメラ抗体を含むＡＤＣを認可した。
【０００６】
ＡＤＣはがん療法に有望であるが、細胞傷害性薬は一般に、リシン側鎖を介して、または抗体中に存在する鎖間ジスルフィド結合を還元して活性化システインスルフヒドリル基をもたらすことによって抗体にコンジュゲートしている。しかし、この非特異的コンジュゲーション手法は、多数の欠点を有する。シスチン結合を破壊することによってタンパク質折り畳みに影響し得るだけでなく、非特異的なコンジュゲーションは、抗体対薬物比（ＡＤＲ）の多様なミックスを有し、様々な位置でコンジュゲートした抗体の複雑な混合物も有する抗体の不均一な混合物を作り出す。したがって、所望の抗体：薬物比を有する十分な抗体を精製することが何とか可能であっても、画分は、様々な位置でコンジュゲートした抗体の複雑なミックスを依然として含むはずである。それぞれの種は、別個の治療特性を潜在的に有することができ、バッチ間の一貫性は、制御することが困難であり、これらの全ては、がん療法にＡＤＣを使用して成功することにかなりのハードルを提示する。
【０００７】
非特異的コンジュゲーションの欠点を回避することを試みるために、抗体への薬物の部位特異的コンジュゲーションをもたらすのに、いくつかの手法が提案されている。しかし、抗体中に反応性コンジュゲーション部位をもたらすことを試みる以前の研究では、ヒトＩｇＧ１の他の位置で操作されたシステインにコンジュゲートしたビオチンまたは他の低無毒性分子は、ある特定の抗原への抗体結合に影響しないように思われることが示された。例えば、ＷＯ２０１１／００５４８１（ビオチン−マレイミドコンジュゲーション）、ＷＯ２０１０／１４１９０２（システインバリアントをマレイミド色素とコンジュゲートすること）、ならびにＷＯ２００６／０３４４８８（ビオチン−マレイミドコンジュゲーションが実施され、モノメチルオーリスタチンＥ（ＭＭＡＥ；Ｎ−メチルバリン−バリン−ドライソロイイン−ドラプロイン−ノルエフェドリン）、およびモノメチルオーリスタチンＦ（ＭＭＡＦ；「Ｎ−メチルバリン−バリン−ドライソロイイン−ドラプロイン−フェニルアラニン」とも呼ばれる）へのコンジュゲーションを記述する全ての例は、予言的であるだけであった）を参照。しかし、こうした研究で典型的に使用されたビオチンなどの低無毒性分子のコンジュゲーションは、リンカーおよび細胞傷害性分子を含む抗体分子の生物学的特性に対するインパクトを模倣しにくい。成功するＡＤＣプラットフォーム抗体は、非標的細胞への著しい結合を伴うことなく標的細胞に毒性ペイロードを送達するために、標的抗原に順調に結合しなければならないので、本発明の操作された突然変異抗体は、毒性ペイロードにコンジュゲートしながら特異的結合能力を保持することが非常に重要である。ＡＤＣは、標的細胞に毒性ペイロードを送達することができ、それによって内在化され得、次いで細胞内の適切なコンパートメント内部に入った際にこのペイロードを放出することができることも非常に重要である。成功するＡＤＣに関するこれらの必要な特徴のそれぞれは、先行研究によって実証されていなかった。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
現在利用可能な抗がん治療の成功にもかかわらず、これらの治療の完全奏功または生存時間の延長は、観察されることがほとんどなく、これらの治療に難治性の患者集団は依然として大きい。したがって、新しい治療モダリティー、特に、現在の化学療法剤の細胞傷害性副作用を低減しながら、抗新生物剤の抗腫瘍活性を増強または強化することができるものの開発に対する満たされていない要求があり、本発明は、この要求を満たす。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
新規の操作された抗体定常ドメイン、これらを組み込んでいる抗体、操作された抗体断片を含む新規抗体−薬物コンジュゲート、ならびにこれらに関する方法および使用を含めて、本発明の代替の実施形態を以下に記載する。
【００１０】
本発明は、操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分であって、操作された定常ドメインは、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｄ）配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、および１２９〜１６３のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分、
（ｅ）配列番号９０、９２、９５、１６４、１６６、および１６９のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｆ）配列番号１７２〜１８６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分である、操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分を含む。
【００１１】
一態様では、操作されたＣγポリペプチドは、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、アミノ酸位置２８４、２８７、Ａ３２７、Ｎ３８４、Ｌ３９８、およびＶ４２２での突然変異からなる群から選択される少なくとも１つの突然変異をさらに含む。
【００１２】
別の態様では、操作されたＣγポリペプチドは、アミノ酸置換の以下の対：ａ）Ｅ３８０とＬ４４３、ｂ）Ｌ３９８とＬ４４３、ｃ）Ｖ４２２とＬ４４３、ｄ）Ｅ３８０とＬ３９８、ｅ）Ｌ３９８とＶ４２２、ｆ）Ｅ３８０とＶ４２２、ｇ）Ｋ３９２とＬ４４３、ｈ）Ｆ４０４とＬ４４３、およびｉ）Ｋ３９２とＦ４０４のうちの１つまたは複数を含む。
【００１３】
さらに別の態様では、操作されたＣγポリペプチドは、（ａ）配列番号９９のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１０３のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１０５のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｄ）配列番号９９のアミノ酸配列と配列番号１０３のアミノ酸配列、（ｅ）配列番号１０３のアミノ酸配列と配列番号１０５のアミノ酸配列、（ｆ）配列番号９９のアミノ酸配列と配列番号１０５のアミノ酸配列、（ｇ）配列番号１０２のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｈ）配列番号１０４のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、および（ｉ）配列番号１０２のアミノ酸配列と配列番号１０４のアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００１４】
別の態様では、操作されたＣγポリペプチドは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４サブクラスから選択される。
【００１５】
さらに別の態様では、操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分は、細胞傷害性剤、細胞増殖抑制剤、化学療法剤、毒素、放射性核種、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、マイクロＲＮＡ、ペプチド核酸、非天然アミノ酸、ペプチド、酵素、蛍光タグ、およびビオチンのうちの１つまたは複数にコンジュゲートしており、コンジュゲーションは、置換システインにおけるものである。
【００１６】
さらなる態様では、細胞傷害性剤は、リンカーを介してポリペプチドにコンジュゲートしている。
【００１７】
なおさらなる態様では、リンカーは、ｍｃ（マレイミドカプロイル）、ｖａｌ−ｃｉｔ（バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルカルバメート）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］３ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］６ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））からなる群から選択される。
【００１８】
別の態様では、細胞傷害性剤は、オーリスタチン、マイタンシノイド、およびカリケアマイシンからなる群から選択される。
【００１９】
一態様では、リンカーおよび細胞傷害性剤は、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＤ（ｍｃＭＭＡＤ）、マレイミドカプロイル−０１０１（ｍｃ０１０１）、マレイミドカプロイル−３３７７（ｍｃ３３７７）、マレイミドカプロイル−８２６１（ｍｃ８２６１）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ（ｖｃＭＭＡＤ）、バリン−シトルリン−０１０１（ｖｃ０１０１）、バリン−シトルリン−３３７７（ｖｃ３３７７）、バリン−シトルリン−８２６１（ｖｃ８２６１）、ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルカルバメート−モノメチルオーリスタチンＤ）、ｍｃＶａｌＣｉｔ０１０１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−０１０１）、ｍｃＶａｌＣｉｔ３３７７（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−３３７７）、ｍｃＶａｌＣｉｔ８２６１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−８２６１）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−３３７７、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−８２６１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−８２６１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−８２６１からなる群から選択される。
【００２０】
別の態様では、本発明は、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分を含む、抗体またはその抗原結合部分を含む。
【００２１】
別の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分をさらに含む。
【００２２】
さらに別の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分をさらに含む。
【００２３】
一態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分を含み、この抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含むＣλポリペプチドまたはその部分をさらに含み、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含むＣκポリペプチドまたはその部分をさらに含む。
【００２４】
一態様では、本発明は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分を含む、抗体またはその抗原結合部分を含む。
【００２５】
一態様では、本発明は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分を含む、抗体またはその抗原結合部分を含む。
【００２６】
本発明は、操作された定常ドメインまたはその部分を含む抗体またはその抗原結合部分であって、操作された定常ドメインは、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｄ）配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、および１２９〜１６３のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分、
（ｅ）配列番号９０、９２、９５、１６４、１６６、および１６９のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｆ）配列番号１７２〜１８６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分のうちの少なくとも１つである、抗体またはその抗原結合部分を含む。
【００２７】
一態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作された重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分を含み、
（ａ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分
からなる群から選択される操作された定常ドメインを含む軽鎖をさらに含む。
【００２８】
別の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、
（ａ）Ｋａｂａｔの番号付けに従ってＡ１１１Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドもしくはその部分、およびＫａｂａｔのＥｕ番号付けに従ってＱ３４７Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドもしくはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従ってＡ１１１Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドもしくはその部分、およびＫａｂａｔのＥｕ番号付けに従ってＥ３８８Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドもしくはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従ってＡ１１１Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドもしくはその部分、およびＫａｂａｔのＥｕ番号付けに従ってＫ３９２Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドもしくはその部分、
（ｄ）Ｋａｂａｔの番号付けに従ってＡ１１１Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドもしくはその部分、およびＫａｂａｔのＥｕ番号付けに従ってＬ４４３Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドもしくはその部分、
（ｅ）Ｋａｂａｔの番号付けに従ってＫ１８３Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドもしくはその部分、およびＫａｂａｔのＥｕ番号付けに従ってＬ４４３Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドもしくはその部分、または
（ｆ）Ｋａｂａｔの番号付けに従ってＫ２０７Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドもしくはその部分、およびＫａｂａｔのＥｕ番号付けに従ってＬ４４３Ｃでアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドもしくはその部分のうちの少なくとも１つをさらに含む。
【００２９】
一態様では、本発明は、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分を含む、Ｆｃ融合タンパク質を含む。
【００３０】
一態様では、本発明は、抗体またはその抗原結合部分、および薬学的に許容できる担体を含む医薬組成物であって、抗体またはその抗原結合部分は、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作された定常ドメインを含み、定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｄ）配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、および１２９〜１６３のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分、
（ｅ）配列番号９０、９２、９５、１６４、１６６、および１６９のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｆ）配列番号１７２〜１８６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分である、医薬組成物を含む。
【００３１】
一態様では、本発明は、抗体またはその抗原結合部分、および薬学的に許容できる担体を含む医薬組成物であって、抗体またはその抗原結合部分は、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作された重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分を含み、
（ａ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分からなる群から選択される操作された定常ドメインを含む軽鎖をさらに含む、医薬組成物を含む。
【００３２】
本発明は、がん、自己免疫性、炎症性、または感染性の疾患または障害の治療を必要とする対象においてこれらを治療する方法を含む。本方法は、対象に治療有効量の抗体もしくはその抗原結合部分、またはＦｃ融合タンパク質を投与するステップを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、またはＦｃ融合タンパク質は、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作された定常ドメインポリペプチドまたはその部分を含み、操作された定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｄ）配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、および１２９〜１６３のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分、
（ｅ）配列番号９０、９２、９５、１６４、１６６、および１６９のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｆ）配列番号１７２〜１８６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分である。
【００３３】
一態様では、操作された定常ドメインポリペプチドは、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、アミノ酸位置２８４、２８７、３２７、３５９、３６１、３８３、３８４、３９８、および４２２での突然変異からなる群から選択される少なくとも１つの突然変異をさらに含むＣγポリペプチドである。
【００３４】
さらに別の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分を含み、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１Ｃ、Ｋ１８３Ｃ、およびＮ２１０Ｃからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびにＫａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０Ｃ、Ｌ１２５Ｃ、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５Ｃ、Ｇ１５８Ｃ、Ｔ１６１Ｃ、Ｑ１８５Ｃ、Ｓ１８８Ｃ、Ｈ１８９Ｃ、Ｓ１９１Ｃ、Ｔ１９７Ｃ、Ｖ２０５Ｃ、Ｅ２０６Ｃ、およびＫ２０７Ｃ、Ｔ２０８Ｃ、およびＡ２１０Ｃからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分からなる群から選択される少なくとも１つの軽鎖定常ドメインをさらに含む。
【００３５】
さらに別の態様では、操作された定常ドメインポリペプチドまたはその部分は、細胞傷害性剤、細胞増殖抑制剤、化学療法剤、毒素、放射性核種、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、マイクロＲＮＡ、ペプチド核酸、非天然アミノ酸、ペプチド、酵素、蛍光タグ、およびビオチンのうちの１つまたは複数にコンジュゲートしており、コンジュゲーションは、置換アミノ酸におけるものである。
【００３６】
なおさらなる態様では、抗体は、操作された定常ドメインポリペプチドまたはその部分を含み、リンカーおよび細胞傷害性剤をさらに含み、リンカーおよび細胞傷害性剤は、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＤ（ｍｃＭＭＡＤ）、マレイミドカプロイル−０１０１（ｍｃ０１０１）、マレイミドカプロイル−３３７７（ｍｃ３３７７）、マレイミドカプロイル−８２６１（ｍｃ８２６１）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ（ｖｃＭＭＡＤ）、バリン−シトルリン−０１０１（ｖｃ０１０１）、バリン−シトルリン−３３７７（ｖｃ３３７７）、バリン−シトルリン−８２６１（ｖｃ８２６１）、ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ）、ｍｃＶａｌＣｉｔ０１０１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−０１０１）、ｍｃＶａｌＣｉｔ３３７７（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−３３７７）、ｍｃＶａｌＣｉｔ８２６１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−８２６１）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−３３７７、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−８２６１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−８２６１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−８２６１からなる群から選択される。
【００３７】
本発明は、操作された定常ドメインポリペプチドまたはその部分をコードする核酸であって、操作された定常ドメインは、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、定常ドメインポリペプチドは、
（ａ）ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｄ）配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、および１２９〜１６３のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分、
（ｅ）配列番号９０、９２、９５、１６４、１６６、および１６９のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｆ）配列番号１７２〜１８６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分である、核酸を含む。
【００３８】
本発明は、操作されたＦｃポリペプチドをコードする核酸であって、操作されたＦｃポリペプチドは、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分を含む、核酸を含む。
【００３９】
一態様では、本発明は、操作されたＦｃポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を含む。
【００４０】
本発明は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む、操作されたＣκポリペプチドまたはその部分をコードする核酸を含む。
【００４１】
一態様では、本発明は、操作されたＣκポリペプチドまたはその部分をコードする核酸を含む、宿主細胞を含む。
【００４２】
本発明は、Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む、操作されたＣλポリペプチドまたはその部分をコードする核酸を含む。
【００４３】
本発明は、抗体またはその抗原結合部分をコードする核酸であって、抗体は、少なくとも１つの操作された抗体定常ドメインポリペプチドまたはその部分を含み、操作された定常ドメインポリペプチドは、コンジュゲーションに有用なシステイン残基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含み、
（ａ）ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４におけるものからなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトＩｇＧ重鎖定常ドメイン（Ｃγ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｂ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ｋ１１０、Ａ１１１、Ｌ１２５、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７、Ｔ２０８、およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｃ）Ｋａｂａｔの番号付けに従って、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸置換を含む操作されたヒトカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）ポリペプチドまたはその部分、
（ｄ）配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、および１２９〜１６３のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣγポリペプチドまたはその部分、
（ｅ）配列番号９０、９２、９５、１６４、１６６、および１６９のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣκポリペプチドまたはその部分、ならびに
（ｆ）配列番号１７２〜１８６のアミノ酸配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む操作されたＣλポリペプチドまたはその部分からなる群から選択される、核酸を含む。
【００４４】
一態様では、本発明は、核酸を含む宿主細胞を含む。
【００４５】
本発明は、操作された抗体またはその抗原結合部分を生成する方法であって、抗体またはその抗原結合部分を発現させるのに適当な条件下で宿主細胞をインキュベートするステップと、抗体または抗原結合部分を単離するステップとを含む方法を含む。
【００４６】
前記概要、ならびに以下の発明の詳細な説明は、添付の図面と一緒に読んだ場合、よりよく理解される。本発明を例示する目的で、現在好ましい実施形態が図面に示される。しかしながら、本発明は示された正確な配置および手段に限定されないことが理解されるべきである。
【図面の簡単な説明】
【００４７】
【図１】標的抗原（すなわち、５Ｔ４）への結合が、システイン置換を含む操作されたＦｃドメインを含む抗体において影響されないことを示す競合結合ＥＬＩＳＡアッセイの結果を示す図である。５Ｔ４の膜貫通および細胞内ドメインを欠く（ならびにＭｙｃおよびヒスチジンタグをさらに含む）ヒト切断型組換え５Ｔ４タンパク質（５Ｔ４−ｔｍ−＿ｍｙｃ＿ｈｉｓ）への競合的結合は、ビオチンにコンジュゲートされた野生型ＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む親抗５Ｔ４抗体（ｂｉｏ抗５Ｔ４  Ａｂ［１．３ｎＭ］）と比較して、Ｆｃドメイン中に単一のシステイン突然変異を含む抗体間で同等であった。置換は以下のように示される：５Ｔ４−Ｔ３５９Ｃ；５Ｔ４−Ｋ３９２Ｃ；５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ；５Ｔ４−Ｆ４０４Ｃ；５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ；５Ｔ４−Ｓ４４０Ｃ。
【図２】ｖｃＭＭＡＤにコンジュゲートされた２つの操作されたシステインバリアントの分析的ＳＥＣトレースを示す、Ａ〜Ｂを含む図である。Ａは、（方法ＳＥＣ−Ａを用いてコンジュゲートされた）５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル）（モノメチルオーリスタチンＤ）のＳＥＣトレース図を示す。Ｂは、（方法ＳＥＣ−Ｂを用いてコンジュゲートされた）５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ−ｖｃＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−パラ−アミノベンジルオキシカルボニル）（モノメチルオーリスタチンＤ））のＳＥＣトレース図を示す。
【図３−１】例示的ＡＤＣに関するＭＳトレース図を示す図である。図３Ａは、５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤのＭＳトレース図およびローディング計算を示す。
【図３−２】例示的ＡＤＣに関するローディング計算を示す図である。図３Ｂは、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｖｃＭＭＡＤのＭＳトレース図およびローディング計算を示す。
【図４】ＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）を用いるインタクトな抗体の処理、次いで、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）によるジスルフィド結合の還元により生成される断片を示す略図である。システイン残基は小さい黒色のボックスで示され、鎖間Ｓ−Ｓ結合は線で示される。
【図５】Ａにおける非コンジュゲート化システインバリアント抗体（５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ）の、ＢにおけるｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートした同抗体（５Ｔ４−Ｌ４４３−ＭｃＭＭＡＤ）と比較した消化により生成されたＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）断片のＭＳトレース図を示す、パネルＡおよびＢを含む図である。生成された断片は、重鎖Ｃ末端（ＨＣ（Ｃ））、重鎖Ｎ末端（ＨＣ（Ｎ））、軽鎖（ＬＣ）、１つのｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートした重鎖Ｃ末端（ＨＣ（Ｃ）＋１）、および１つのｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートした重鎖Ｎ末端（ＨＣ（Ｎ）＋１）であり、Ｂにおいて示されるトレース図上の２６５０５．１で検出された。
【図６】軽鎖（ＬＣ）はあまり改変されていないままであるが、重鎖（ＨＣ）は改変されていることを示す還元条件下での逆相ＨＰＬＣ分析の結果生じるトレース図を示す、パネルＡ〜Ｃを含む図である。Ａは、非改変野生型抗５Ｔ４抗体の還元条件下での逆相ＨＰＬＣトレースを示す。Ｂは、５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤの還元条件下での逆相ＨＰＬＣトレースを示す。Ｃは、５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤの還元条件下での逆相ＨＰＬＣトレースを示す。
【図７−１】図７−１と図７−２は、非コンジュゲート化、およびｖｃＭＭＡＤとコンジュゲートしたバリアント５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ、ならびにｖｃＭＭＡＤまたはｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートしたバリアント５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃに関する、疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）を用いて得られたトレース図を示す、パネルＡ〜Ｄを含む図である。図７−１のＡは、非コンジュゲート化５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃに関するＨＩＣ結果のトレース図を示す。Ｂは、ｖｃＭＭＡＤとコンジュゲートした５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃに関するＨＩＣ結果のトレース図を示し、ＭＳ（２．００）およびＨＩＣ（２．０７）を用いて決定されたローディング値が一致することを示す。１個（＋１）、２個（＋２）および４個（＋４）のｖｃＭＭＡＤをロードした抗体を含むピークが示される。
【図７−２】Ｃは、ｖｃＭＭＡＤとコンジュゲートした５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃに関するＨＩＣ結果のトレース図を示し、ＭＳ（１．８０）およびＨＩＣ（１．７４）を用いて決定されたローディング値が一致することを示す。０個（＋０）、１個（＋１）、２個（＋２）、３個（＋３）および４個（＋４）のｖｃＭＭＡＤをロードした抗体を含むピークが示される。Ｄは、ｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートした５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃに関するＨＩＣ結果のトレース図を示し、ＭＳ（１．７８）およびＨＩＣ（１．８１）を用いて決定されたローディング値が一致することを示す。０個（＋０）、１個（＋１）、２個（＋２）および４個（＋４）のｖｃＭＭＡＤをロードした抗体を含むピークが示される。
【図８】様々なシステインバリアント抗体に関する、方法「Ｂ」と比較した方法「Ａ」を用いるコンジュゲーションにより生成されたトレース図を示す、パネルＡ〜Ｊを含む図である。パネルＡ、Ｃ、Ｅ、ＧおよびＪは、抗体５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ａ）；５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｃ）；５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｅ）；および５Ｔ４−Ｋ３９２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｇ）に関する「方法Ａ」を用いるコンジュゲーションの結果を示す。パネルＢ、Ｄ、Ｆ、Ｈは、抗体：５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｂ）；５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｄ）；５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｆ）；および５Ｔ４−Ｋ３９２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｈ）に関する「方法Ｂ」を用いるコンジュゲーションの結果を示す。
【図９】様々なシステインバリアント抗体に関する、方法「Ｂ」と比較した方法「Ａ」を用いるコンジュゲーションにより生成されたトレース図を示す、パネルＡ〜Ｈを含む図である。パネルＡ、Ｃ、ＥおよびＧは、抗体５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ａ）；５Ｔ４−Ｅ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｃ）；５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｅ）；および５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｇ）に関する、「方法Ａ」を用いるコンジュゲーションの結果を示す。パネルＢ、Ｄ、ＦおよびＨは、抗体：５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｂ）；５Ｔ４−Ｅ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｄ）；５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｆ）；および５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ（Ｈ）に関する、「方法Ｂ」を用いるコンジュゲーションの結果を示す。
【図１０】以下のリンカーペイロード組合せ：ｍｃＭＭＡＤ（Ａ）；ｍｃＭＭＡＥ（Ｂ）：ｍｃＭＭＡＦ（Ｃ）；ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣ−ＭＭＡＤ、本明細書では「ｖｃＭＭＡＤ」とも呼ばれる（Ｄ）；Ｍａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ（Ｅ）およびＭａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ（Ｆ）の構造を示す、パネルＡ〜Ｅを含む図である。
【図１１】野生型ＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む親抗５Ｔ４抗体の結合と比較した、平均計算された蛍光として表される５Ｔ４抗原を発現するＭＤＡＭＢ４３５細胞（ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４）への非コンジュゲート化システイン突然変異抗５Ｔ４抗体の結合を示すグラフである。結果は、システインバリアント抗体Ｌ４４３Ｃ、Ｅ３８０Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｖ４２２Ｃ、Ｔ３５９Ｃ、Ｓ２５４Ｃ、Ｓ４４０ＣおよびＫ３９２Ｃが、１μｇ（灰色のバー）および１０μｇ／ｍｌ（黒色のバー）の両方で、野生型親抗体（「ｗｔＩｇＧ１」と示される）と同等のＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４細胞への結合を示すことを示している。
【図１２−１】図１２−１と図１２−２は、野生型ＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む親抗体による結合と比較した、ｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートしたシステイン突然変異抗体の結合を示す、図１２ＡおよびＢを含むグラフである。図１２Ａは、野生型親抗５Ｔ４抗体と比較した、５Ｔ４抗原を発現する細胞（ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４細胞）への、ｍｃＭＭＡＤにコンジュゲートしたシステインバリアント抗体の結合を示すグラフである。抗体５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤおよび５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ抗体の結合を、親抗体５Ｔ４（ｗｔ  ＩｇＧ１）による結合と比較した。
【図１２−２】図１２Ｂは、標的抗原５Ｔ４を発現しないＲａｊｉ細胞中での野生型親抗体の結合の同様の欠如と比較したｍｃＭＭＡＤにコンジュゲートしたシステインバリアント抗体の結合の欠如を示すグラフである。
【図１３】ｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートした野生型抗体（５Ｔ４−ＩｇＧ１−ｍｃＭＭＡＤ）およびコンジュゲートしていない野生型抗体（ｗｔ  ＩｇＧ１）の内在化と比較した、ｍｃＭＭＡＤとコンジュゲートしたシステインバリアント抗体の内在化を示すグラフである。データは、システイン突然変異抗体薬コンジュゲート５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、および５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤが、野生型親抗体薬コンジュゲート５Ｔ４−ＩｇＧ１−ｍｃＭＭＡＤおよびコンジュゲートしていない野生型親抗体５Ｔ４（ｗｔ  ＩｇＧ１）と実質的に同じＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４細胞により内在化されたことを示している。
【図１４−１】図１４−１と図１４−２は、操作されたシステインバリアント抗体が、野生型親抗体と比較して変化したＦｃエフェクター活性を示さないことを示す、図１４ＡおよびＢを含む図である。図１４Ａは、システインバリアント５−Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ、５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ、および５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃが、５Ｔ４を発現する細胞（ＭＤＡ４３５／５Ｔ４）中で野生型親抗体（５Ｔ４）と同じＡＤＣＣ活性を示すことを示すグラフを示す。
【図１４−２】図１４Ｂは、システインバリアント５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ、５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃおよび５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃが、５Ｔ４抗原を発現しない細胞（ＭＤＡ４３５／Ｎｅｏ）中で野生型親抗体（５Ｔ４）と比較して同じＡＤＣＣ活性（なし）を示すことを示すグラフを示す。
【図１５−１】以下の配列を示す、配列番号１〜２を含む図である。Ｆｃ領域がアミノ酸残基２３６（グリシン、Ｇ）（配列番号１）で開始するＦｃ領域を含む野生型ヒトＩｇＧ１重鎖定常ドメインのアミノ酸配列、Ｆｃ領域を含むヒト野生型ＩｇＧ１定常ドメインをコードする例示的核酸配列（配列番号２）。
【図１５−２】以下の配列を示す、配列番号３〜５を含む図である。ヒトＩｇＧ２定常ドメインのアミノ酸配列（配列番号３）、ヒト野生型ＩｇＧ３定常ドメインのアミノ酸配列（配列番号４）、ヒト野生型ＩｇＧ４定常ドメインのアミノ酸配列（配列番号５）。
【図１５−３】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｋ２４６（配列番号６）、Ｄ２４９（配列番号７）、Ｓ２５４（配列番号８）、Ｄ２６５（配列番号９）、Ｓ２６７（配列番号１０）。
【図１５−４】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｄ２７０（配列番号１１）、Ｎ２７６（配列番号１２）、Ｙ２７８（配列番号１３）、Ｅ２８３（配列番号１４）、Ｖ２８４（配列番号１５）。
【図１５−５】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ａ２８７（配列番号１６）、Ｒ２９２（配列番号１７）、Ｅ２９３（配列番号１８）、Ｅ２９４（配列番号１９）、Ｙ３００（配列番号２０）。
【図１５−６】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｖ３０２（配列番号２１）、Ｖ３０３（配列番号２２）、Ｌ３１４（配列番号２３）、Ｎ３１５（配列番号２４）、Ｅ３１８（配列番号２５「）。
【図１５−７】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｋ３２０（配列番号２６）、Ａ３２７（配列番号２７）、Ｉ３３２（配列番号２８）、Ｅ３３３（配列番号２９）、Ｋ３３４（配列番号３０）。
【図１５−８】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｉ３３６（配列番号３１）、Ｅ３４５（配列番号３２）、Ｑ３４７（配列番号３３）、Ｓ３５４（配列番号３４）、Ｒ３５５（配列番号３５）。
【図１５−９】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｍ３５８（配列番号３６）、Ｔ３５９  （配列番号３７）、Ｋ３６０（配列番号３８）、Ｎ３６１（配列番号３９）、Ｑ３６２（配列番号４０）。
【図１５−１０】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｋ３７０（配列番号４１）、Ｙ３７３（配列番号４２）、Ｄ３７６（配列番号４３）、Ａ３７８（配列番号４４）、Ｅ３８０（配列番号４５）。
【図１５−１１】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｅ３８２（配列番号４６）、Ｓ３８３（配列番号４７）、Ｎ３８４（配列番号４８）、Ｑ３８６（配列番号４９）、Ｅ３８８（配列番号５０）。
【図１５−１２】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｎ３９０（配列番号５１）、Ｋ３９２（配列番号５２）、Ｔ３９３（配列番号５３）、Ｌ３９８（配列番号５４）、Ｄ４０１（配列番号５５）。
【図１５−１３】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｆ４０４（配列番号５６）、Ｔ４１１（配列番号５７）、Ｄ４１３（配列番号５８）、Ｋ４１４（配列番号５９）。
【図１５−１４】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｒ４１６（配列番号６０）、Ｑ４１８（配列番号６１）、Ｑ４１９（配列番号６２）、Ｎ４２１（配列番号６３）、Ｖ４２２（配列番号６４）。
【図１５−１５】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｍ４２８（配列番号６５）、Ａ４３１（配列番号６６）、Ｌ４３２（配列番号６７）、Ｔ４３７（配列番号６８）、Ｑ４３８（配列番号６９）。
【図１５−１６】以下の位置でシステインの置換を含む操作されたＦｃポリペプチドのアミノ酸配列（全てＫａｂａｔのＥＵ番号付けシステムに従う）を示す配列を含む図である。：Ｋ４３９（配列番号７０）、Ｓ４４０（配列番号７１）、Ｌ４４３（配列番号７２）、およびＳ４４４（配列番号７３）。
【図１６−１】下記：Ｅ３８０Ｃ−Ｌ４４３Ｃ（配列番号７４）；Ｌ３９８Ｃ−Ｌ４４３Ｃ（配列番号７５）；Ｖ４２２Ｃ−Ｌ４４３Ｃ（配列番号７６）；Ｅ３８０Ｃ−Ｌ３９８Ｃ  （配列番号７７）のような２個の突然変異を含む以下のＩｇＧ１操作Ｆｃ領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１６−２】下記：Ｌ３９８Ｃ−Ｖ４２２Ｃ（配列番号７８）；Ｅ３８０Ｃ−Ｖ４２２Ｃ（配列番号７９）；Ｋ３９２Ｃ−Ｌ４４３Ｃ（配列番号８０）；Ｆ４０４Ｃ−Ｌ４４３Ｃ（配列番号８１）；Ｋ３９２Ｃ−Ｆ４０４Ｃ（配列番号８２）のような２個の突然変異を含む以下のＩｇＧ１操作Ｆｃ領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１７−１】様々な抗体の完全長重鎖および軽鎖のアミノ酸配列を示す図である。配列番号８３は、可変ドメイン（ＶＨ）が大文字で示され、３個のＣＤＲが下線付きで示され、ヒトＩｇＧ１定常領域の配列が小文字で示される重鎖抗５Ｔ４抗体のアミノ酸配列を示す。配列番号８４は、可変ドメイン（ＶＬ）が大文字で示され、３個のＣＤＲが下線付きで示され、ヒトカッパ定常領域の配列が小文字で示される抗５Ｔ４抗体の軽鎖のアミノ酸配列を示す。配列番号８５は、可変ドメイン（ＶＨ）が大文字で示され、３個のＣＤＲが下線付きで示され、ヒトＩｇＧ１定常領域の配列が小文字で示される重鎖抗Ｈｅｒ２抗体のアミノ酸配列を示す。
【図１７−２】様々な抗体の完全長重鎖および軽鎖のアミノ酸配列を示す図である。配列番号８６は、可変ドメイン（ＶＬ）が大文字で示され、３個のＣＤＲが下線付きで示され、ヒトカッパ定常領域の配列が小文字で示される抗Ｈｅｒ２抗体の軽鎖のアミノ酸配列を示す。配列番号８７は、可変ドメイン（ＶＨ）が大文字で示され、３個のＣＤＲが下線付きで示され、ヒトＩｇＧ１定常領域の配列が小文字で示される重鎖抗ＶＥＧＦＲ２（血管内皮増殖因子受容体２）抗体のアミノ酸配列を示す。配列番号８８は、可変ドメイン（ＶＬ）が大文字で示され、３個のＣＤＲが下線付きで示され、ヒトカッパ定常領域の配列が小文字で示される抗ＶＥＧＦＲ２抗体の軽鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１８】野生型ヒトカッパ定常領域のアミノ酸配列（図１８Ａ：配列番号８９）および以下の突然変異：Ａ１１１Ｃ（図１８Ｂ：配列番号９０）；Ｋ１８３Ｃ（図１８Ｃ：配列番号９２）；およびＮ２１０Ｃ（図１８Ｄ：配列番号９５）を含む操作されたＣκ領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１９−１】４個のＩｇＧサブクラス間で同等の位置を示すヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４のアミノ酸配列アラインメントを示す図である。図１９Ａは、ヒト野生型ＩｇＧ１（ｈＩｇＧ１）、ＩｇＧ２（ｈＩｇＧ２）、ＩｇＧ３（ｈＩｇＧ３）およびＩｇＧ４（ｈＩｇＧ４）のＦｃドメインのアミノ酸配列アラインメントを示す。
【図１９−２】４個のＩｇＧサブクラス間で同等の位置を示すヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４のアミノ酸配列アラインメントを示す図である。図１９Ｂは、ヒト野生型ＩｇＧ１（ヒトガンマ１）、ＩｇＧ２（ヒトガンマ２）、ＩｇＧ３（ヒトガンマ３）およびＩｇＧ４（ヒトガンマ４）の定常ドメイン（ＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３領域を含む）のアミノ酸配列アラインメントを示す。
【図２０−１】野生型ヒトラムダ定常領域をコードする核酸配列（配列番号１７０）、野生型ヒトラムダ定常領域のアミノ酸配列（配列番号１７１）ならびに以下の突然変異：Ｋ１１０Ｃ（配列番号１７２）；Ａ１１１Ｃ（配列番号１７３）；Ｌ１２５Ｃ（配列番号１７４）；Ｋ１４９Ｃ（配列番号１７５）；Ｖ１５５Ｃ（配列番号１７６）；Ｇ１５８Ｃ（配列番号１７７）を含む操作されたＣλ領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図２０−２】以下の突然変異：Ｔ１６１Ｃ（配列番号１７８）；Ｑ１８５Ｃ（配列番号１７９）；Ｓ１８８Ｃ（配列番号１８０）；Ｈ１８９Ｃ（配列番号１８１）；Ｓ１９１Ｃ（配列番号１８２）；Ｔ１９７Ｃ（配列番号１８３）；Ｖ２０５Ｃ（配列番号１８４）；Ｅ２０６Ｃ（配列番号１８５）；Ｋ２０７Ｃ（配列番号１８６）；Ｔ２０８Ｃ（配列番号１８７）；およびＡ２１０Ｃ（配列番号１８８）を含む操作されたＣλ領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図２１−１】特許で守られたオーリスタチンペイロード（Ａｕｒ）にＭａｌＰｅｇ６Ｃ２リンカーを介してコンジュゲートされた様々な操作されたシステイン抗体のＰＫパラメータを示すグラフである。図２１Ａは、抗Ｈｅｒ２抗体が、ＡｕｒにＭａｌＰｅｇ６Ｃ２リンカーを介して示された特定の部位（複数可）でコンジュゲートされた、部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣの経時的な血漿濃度を示すグラフである。操作されたコンジュゲーション部位は、Ｑ３４７Ｃ；Ｎ４２１Ｃ；カッパＫ１８３Ｃ；Ｋ３８８Ｃ；Ｌ４４３Ｃ；Ｌ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ；およびＫ３９２Ｃ＋Ｌ４４３Ｃであった。
【図２１−２】特許で守られたオーリスタチンペイロード（Ａｕｒ）にＭａｌＰｅｇ６Ｃ２リンカーを介してコンジュゲートされた様々な操作されたシステイン抗体のＰＫパラメータを示すグラフである。図２１Ｂは、様々な部位特異的コンジュゲートＡＤＣの総抗Ｈｅｒ２  ＡＤＣ血漿濃度を示すグラフである。抗Ｈｅｒ２抗体は、特許で守られたオーリスタチンペイロード「Ａｕｒ」（本明細書では「８２６１」とも呼ばれる）に、ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２リンカーを介してコンジュゲートされた。特異的な操作コンジュゲーション部位は、以下の通りであった：Ｑ３４７Ｃ；Ｎ４２１Ｃ；カッパＫ１８３Ｃ；Ｋ３８８Ｃ；Ｌ４４３Ｃ；Ｌ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ；およびＫ３９２Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ。
【図２２−１】部位特異的コンジュゲーション部位がＬ４４３Ｃである、ならびに異なるリンカーおよびペイロード組合せを用いる、抗Ｈｅｒ２部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣの腫瘍減少効果を示す図である。図２２Ａは、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３ＣがＭａｌＰｅｇ６Ｃ２リンカーを介してＭＭＡＤにコンジュゲートされ、陰性対照（ビヒクル）と比較して１ｍｇ／ｋｇ、３ｍｇ／ｋｇおよび１０ｍｇ／ｋｇで投与された、胃がんのＮ８７マウスモデルにおける腫瘍サイズを示すグラフである。
【図２２−２】部位特異的コンジュゲーション部位がＬ４４３Ｃである、ならびに異なるリンカーおよびペイロード組合せを用いる、抗Ｈｅｒ２部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣの腫瘍減少効果を示す図である。図２２Ｂは、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３ＣがＭａｌＰｅｇ６Ｃ２リンカー（本明細書では「ＭＰ６」と省略される）を介してＡｕｒ（「８２６１」とも呼ばれる、新規オーリスタチンに基づく細胞傷害性化合物）にコンジュゲートされ、陰性対照（ビヒクル）と比較して１ｍｇ／ｋｇ、３ｍｇ／ｋｇおよび１０ｍｇ／ｋｇで投与された胃がんのＮ８７マウスモデルにおける腫瘍サイズを示すグラフである。
【図２２−３】部位特異的コンジュゲーション部位がＬ４４３Ｃである、ならびに異なるリンカーおよびペイロード組合せを用いる、抗Ｈｅｒ２部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣの腫瘍減少効果を示す図である。図２２Ｃは、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃがｖｃリンカーを介して特許で守られたペイロード（「０１０１」とも呼ばれる）にコンジュゲートされ、陰性対照（ビヒクル）と比較して１ｍｇ／ｋｇ、３ｍｇ／ｋｇおよび１０ｍｇ／ｋｇで投与された胃がんのＮ８７マウスモデルにおける腫瘍サイズを示すグラフである。
【図２３】ＤＹＴ２  Ｈｅｒ２＋がんモデルにおける部位特異的コンジュゲート化抗Ｈｅｒ２  ＡＤＣの効果を示すグラフである。抗Ｈｅｒ２  ＡＤＣを様々な操作されたシステイン（Ｋ３９２Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ、Ｑ３４７Ｃ、カッパＫ１８３Ｃ；Ｋ３８８Ｃ；Ｎ４２１Ｃ、カッパＫ２０７Ｃ；Ｌ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ；Ｌ４４３Ｃ）でコンジュゲートさせ；その効果をビヒクルのみならびにＤＭ１（Ｈｅｒ２−ＤＭ１）およびＡｕｒ（Ｈｅｒ２−Ａｕｒ）と従来通りコンジュゲートさせた抗Ｈｅｒ２抗体と比較した。
【発明を実施するための形態】
【００４８】
本明細書で別段の定義のない限り、本発明に関連して使用される科学用語および技術用語は、当業者が一般に理解する意味を有するものとする。さらに、脈絡によって別段に要求されない限り、単数形の用語は、複数存在することを含むものとし、複数形の用語は、単数形を含むものとする。一般に、本明細書に記載の細胞培養および組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学、ならびにタンパク質化学および核酸化学、ならびにハイブリダイゼーションに関連して使用される命名法、ならびにこれらの技法は、当技術分野で周知であり、一般に使用されるものである。
【００４９】
本発明の方法および技法は一般に、別段の指定のない限り、当技術分野で周知の方法に従って、かつ本明細書全体にわたって引用され、論じられている様々な一般的な、およびより具体的な参考文献に記載されているように実施される。このような参考文献としては、例えば、ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、第３版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ（２００１）、Ａｕｓｕｂｅｌら、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、ＮＹ（２００２）、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ、Ｕｓｉｎｇ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ（１９９８）、ならびにＣｏｌｉｇａｎら、Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、ＮＹ（２００３）があり、これらは、参照により本明細書に組み込まれている。酵素反応および精製技法は、製造者の仕様に従って、当技術分野で一般に達成されるように、または本明細書に記載するように実施される。本明細書に記載の分析化学、生化学、免疫学、分子生物学、合成有機化学、ならびに医化学および製薬化学に関連して使用される命名法、ならびにこれらの実験室手順および技法は、当技術分野で周知であり、一般に使用されるものである。標準的な技法が、化学合成、化学分析、医薬調製物、製剤、および送達、および患者の治療に使用される。
【００５０】
本明細書および特許請求の範囲全体にわたって、単語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」、または「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」もしくは「含むこと」などの変形は、述べた整数または整数の群を含めることを暗示するが、任意の他の整数または整数の群の除外を暗示しないことが理解されるであろう。
【００５１】
本明細書において、以下の用語のそれぞれは、本セクションにおいてそれと関連する意味を有する。
【００５２】
冠詞「１つの（ａ）」および「１つの（ａｎ）」は、冠詞の文法的対象の１つ、または１つを超える（すなわち、少なくとも１つ）を指すのに本明細書で使用する。例として、「１つのエレメント（ａｎ  ｅｌｅｍｅｎｔ）」は、１つのエレメントまたは１つを超えるエレメントを意味する。
【００５３】
本発明の広い範囲を示す数値範囲およびパラメータは、近似であるにもかかわらず、具体例に示される数値は、可能な限り正確に報告する。しかし、任意の数値は、これらのそれぞれの試験測定において見出される標準偏差から必然的に生じるある特定の誤差を本質的に含有する。さらに、本明細書に開示の全ての範囲は、その中に包摂される任意および全ての部分範囲を包含することが理解されるべきである。例えば、「１〜１０」という述べた範囲は、１の最小値と１０の最大値の間の（およびこれらを含む）任意および全ての部分範囲、すなわち、１以上、例えば、１〜６．１の最小値で始まり、１０以下、例えば、５．５〜１０の最大値で終わる全ての部分範囲を含むとみなされるべきである。
【００５４】
本明細書において「約」のついた値またはパラメータへの言及は、それ自体その値またはパラメータを対象とする実施形態を含む（かつ記述する）。例えば、「約Ｘ」に言及する記述は、「Ｘ」の記述を含む。数値（ｎｕｍｅｒｉｃ  ｖａｌｕｅ）は、範囲を定義する数値（ｎｕｍｂｅｒ）を含む。
【００５５】
さらに、「本明細書に組み込まれている」と呼ばれる任意の言及は、その全体が組み込まれていると理解されるべきである。
【００５６】
本発明の態様または実施形態が、選択肢のマーカッシュ群または他の分類の観点から記載されている場合、本発明は、全体として列挙された群全体だけでなく、群の各メンバーを個々に、および主群の全ての可能な亜群、ならびにまた、群メンバーの１つまたは複数を欠いた主群を包含する。本発明は、請求項に係る発明における群メンバーのいずれかの１つまたは複数の明確な除外も想定する。
【００５７】
本明細書において、２０の慣例的なアミノ酸およびこれらの略語は、慣例的な使用法に従う。参照により本明細書に組み込まれているＩｍｍｕｎｏｌｏｇｙ−−Ａ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（第２版、Ｅ．Ｓ．ＧｏｌｕｂおよびＤ．Ｒ．Ｇｒｅｎ編、Ｓｉｎａｕｅｒ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ、Ｓｕｎｄｅｒｌａｎｄ、Ｍａｓｓ．（１９９１））を参照。
【００５８】
本明細書において、アミノ酸は、以下の表に示したように、これらの完全名、これらに対応する３文字コード、またはこれらに対応する１文字コードによって表す：
【００５９】
【表１】
2019034942.tif 000003
「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が、類似の化学的特性（例えば、電荷または疎水性）を有する側鎖Ｒ基を有する別のアミノ酸残基によって置換されているものである。一般に、保存的アミノ酸置換は、タンパク質の機能的特性を実質的に変化させない。２つ以上のアミノ酸配列が保存的置換によって互いに異なる場合では、パーセント配列同一性または類似性の程度は、置換の保存的性質について補正するために上向きに調整することができる。この調整を行うための手段は、当業者に周知である。例えば、Ｐｅａｒｓｏｎ、Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、２４３：３０７〜３１（１９９４）を参照。
【００６０】
類似の化学的特性を伴った側鎖を有するアミノ酸の群の例としては、１）脂肪族側鎖：グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシン；２）脂肪族−ヒドロキシル側鎖：セリンおよびトレオニン；３）アミド含有側鎖：アスパラギンおよびグルタミン；４）芳香族側鎖：フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファン；５）塩基性側鎖：リシン、アルギニン、およびヒスチジン；６）酸性側鎖：アスパラギン酸およびグルタミン酸；ならびに７）硫黄含有側鎖：システインおよびメチオニンがある。好ましい保存アミノ酸置換の群は、バリン−ロイシン−イソロイシン、フェニルアラニン−チロシン、リシン−アルギニン、アラニン−バリン、グルタミン酸−アスパラギン酸、およびアスパラギン−グルタミンである。
【００６１】
代わりに、保存的置換は、参照により本明細書に組み込まれているＧｏｎｎｅｔら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２５６：１４４３〜４５（１９９２）に開示されたＰＡＭ２５０対数尤度行列中の正の値を有する任意の変化である。「中程度に保存的な」置換は、ＰＡＭ２５０対数尤度行列中で負でない値を有する任意の変化である。
【００６２】
好ましいアミノ酸置換は、（１）タンパク質分解に対する感受性を低減し、（２）酸化に対する感受性を低減し、（３）タンパク質複合体を形成するための結合親和性を変更し、（４）このような類似体の他の物理化学的または機能的特性を付与または改変するものである。置換、欠失、および／または挿入を含む類似体は、指定されたペプチド配列以外の配列の様々な突然変異タンパク質を含むことができる。例えば、単一または複数のアミノ酸置換（好ましくは保存的アミノ酸置換）を、指定された配列中（好ましくは分子間接触を形成するドメイン（複数可）の外側、例えば、ＣＤＲの外側のポリペプチドの部分中）で行うことができる。保存的アミノ酸置換は、親配列の構造的特徴を実質的に変化させないべきである（例えば、置換アミノ酸は、親配列中に存在するヘリックスを破壊し、または親配列を特徴付ける他のタイプの二次構造を混乱させる傾向がないべきである）。当技術分野で認められているポリペプチド二次および三次構造の例は、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ（Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ編、Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９８４））；Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｔｏ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ（Ｃ．ＢｒａｎｄｅｎおよびＪ．Ｔｏｏｚｅ編、Ｇａｒｌａｎｄ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．（１９９１））；およびＴｈｏｒｎｔｏｎら、Ｎａｔｕｒｅ、３５４：１０５（１９９１）に記載されており、これらは、それぞれ参照により本明細書に組み込まれている。
【００６３】
ポリペプチドの配列類似性は、典型的には配列分析ソフトウェアを使用して測定される。タンパク質分析ソフトウェアは、保存的アミノ酸置換を含めた様々な置換、欠失、および他の修飾に割り当てられた類似性の尺度を使用して類似の配列をマッチさせる。例えば、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ（Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，Ｉｎｃ．から入手可能なＧＣＧ）は、Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｐａｃｋａｇｅとも呼ばれ、ヌクレオチド配列およびタンパク質配列を評価、分析、およびマニピュレートするための１３０超のプログラムの統合ソフトウェアパッケージである。ＧＣＧは、「Ｇａｐ」および「Ｂｅｓｔｆｉｔ」などのプログラムを含み、これらは、デフォルトのパラメータで使用して、生物の異なる種に由来する相同ポリペプチドなどの密接に関連したポリペプチド同士間、または野生型タンパク質とその突然変異タンパク質との間の配列類似性、相同性、および／または配列同一性を求めることができる。例えば、ＧＣＧバージョン６．１、バージョン７．０、バージョン９．１、およびバージョン１０．０を参照。
【００６４】
ポリペプチド配列も、ＧＣＧ中のプログラムであるＦＡＳＴＡを使用して、デフォルトの、または推奨されたパラメータを使用して比較することができる。ＦＡＳＴＡ（例えば、ＦＡＳＴＡ２およびＦＡＳＴＡ３）は、クエリー配列とサーチ配列との間のベストオーバーラップの領域のアラインメント、およびパーセント配列同一性をもたらす（Ｐｅａｒｓｏｎ、Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．、１８３：６３〜９８（１９９０）；Ｐｅａｒｓｏｎ、Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、１３２：１８５〜２１９（２０００））。異なる生物に由来する多数の配列を含有するデータベースに対して本発明の配列を比較する際の別の好ましいアルゴリズムは、デフォルトのパラメータを使用するコンピュータープログラムＢＬＡＳＴ、特に、ｂｌａｓｔｐまたはｔｂｌａｓｔｎである。例えば、参照により本明細書に組み込まれている、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、２１５：４０３〜４１０（１９９０）；Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、２５：３３８９〜４０２（１９９７）を参照。
【００６５】
ポリペプチド配列を表現するのに慣例的な表示法を本明細書で使用し、ポリペプチド配列の左端は、アミノ末端であり、ポリペプチド配列の右端は、カルボキシル末端である。
【００６６】
本明細書において、用語「上流の」は、分子がタンパク質である場合、２番目の残基に対してＮ末端である残基、分子が核酸である場合、２番目の残基に対して５’である残基を指す。やはり本明細書において、用語「下流の」は、分子がタンパク質である場合、２番目の残基に対してＣ末端である残基、分子が核酸である場合、２番目の残基に対して３’である残基を指す。
【００６７】
「核酸」は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）またはリボ核酸（ＲＮＡ）などのポリヌクレオチドである。この用語は、一本鎖核酸、二本鎖核酸、ならびにヌクレオチドまたはヌクレオシド類似体から作製されるＲＮＡおよびＤＮＡを含むように使用される。
【００６８】
用語「ベクター」は、細胞内に第２の核酸分子を輸送するのに使用することができる核酸分子を指す。一実施形態では、ベクターは、ベクター中に挿入されたＤＮＡ配列の複製を可能にする。ベクターは、少なくともいくつかの宿主細胞内の核酸分子の発現を増強するためのプロモーターを含み得る。ベクターは、自発的に（染色体外）複製することができ、または宿主細胞染色体中に組み込まれ得る。一実施形態では、ベクターは、ベクター中に挿入された核酸配列の少なくとも一部に由来するタンパク質を生成することができる発現ベクターを含み得る。
【００６９】
当技術分野で知られているように、互いに核酸配列をハイブリダイズするための条件は、低ストリンジェンシーから高ストリンジェンシーに及ぶとして記述することができる。一般に、高度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、低塩緩衝液中で、高温でハイブリッドを洗浄することを指す。ハイブリダイゼーションは、６５℃で０．５ＭのＮａＨＰＯ４、７％のドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）などの当技術分野で標準的なハイブリダイゼーション溶液を使用して結合したＤＮＡを濾過すること、および０．２５ＭのＮａＨＰＯ４、３．５％のＳＤＳ中での洗浄、その後のプローブの長さに応じて室温〜６８℃の範囲の温度で０．１×ＳＳＣ／０．１％のＳＤＳ中での洗浄とすることができる（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら、Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、第４版、第２章、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、Ｎ．Ｙを参照）。例えば、高ストリンジェンシー洗浄は、１４塩基のオリゴヌクレオチドプローブについて３７℃で、または１７塩基のオリゴヌクレオチドプローブについて４８℃で、または２０塩基のオリゴヌクレオチドプローブについて５５℃で、または２５塩基のオリゴヌクレオチドプローブについて６０℃で、または長さが約２５０ヌクレオチドのヌクレオチドプローブについて６５℃で、６×ＳＳＣ／０．０５％のピロリン酸ナトリウム中での洗浄を含む。核酸プローブは、例えば、［γ−３２Ｐ］ＡＴＰを用いた末端標識、またはランダムプライマー標識による［α−３２Ｐ］ｄＣＴＰなどの放射標識ヌクレオチドの取込みによって、放射性ヌクレオチドで標識することができる。代わりに、プローブを、ビオチン化またはフルオレセイン標識ヌクレオチドの取込みによって標識することができ、このプローブを、ストレプトアビジンまたは抗フルオレセイン抗体を使用して検出することができる。
【００７０】
用語「融合タンパク質」は、２種以上のタンパク質に由来するアミノ酸配列を有するタンパク質またはポリペプチドを指す。融合タンパク質は、別々のタンパク質に由来するアミノ酸部分同士間でアミノ酸の連結領域も含み得る。
【００７１】
用語「宿主細胞」は、本明細書において、対象のタンパク質またはポリペプチドを生成するために、本発明に従って培養で増殖する細胞を指す。ある特定の実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞である。
【００７２】
用語「ハイブリドーマ」とは、この用語を本明細書で使用する場合、不死化細胞と抗体産生細胞との融合から生じる細胞または細胞の子孫を包含することを意味する。得られるハイブリドーマは、抗体を産生する不死化細胞である。ハイブリドーマを創製するのに使用される個々の細胞は、それだけに限らないが、ラット、ブタ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、およびヒトを含めた任意の哺乳動物源に由来し得る。この用語は、ヒト細胞とマウス骨髄腫細胞系との融合の生成物であるヘテロハイブリッド骨髄腫融合物の子孫が血漿細胞と引き続いて融合されるとき生じるトリオーマ細胞系も包含する。さらに、この用語は、例えば、クアドローマなどの抗体を産生する任意の不死化ハイブリッド細胞系を含むことを意味する（例えば、Ｍｉｌｓｔｅｉｎら、１９８３、Ｎａｔｕｒｅ、５３７：３０５３を参照）。
【００７３】
用語「ポリペプチド」は、本明細書において、ペプチド結合を介して一緒に連結されたアミノ酸の連続した鎖を指す。この用語は、任意の長さのアミノ酸鎖を指すのに使用されるが、この用語は、非常に長い鎖に限定されず、ペプチド結合を介して一緒に連結された２つのアミノ酸を含む最小の鎖を指すことができることを当業者は理解するであろう。当業者に公知であるように、ポリペプチドは、処理および／または修飾することができる。例えば、ポリペプチドは、グリコシル化することができる。本発明によって発現されるポリペプチドは、治療用ポリペプチドであり得る。治療用ポリペプチドは、これが作用する体内の一領域、またはこれが中間体を介して間接的に作用する体の一領域に対して生物学的効果を有するポリペプチドである。治療用ポリペプチドの例は、以下でより詳細に論じる。
【００７４】
「タンパク質」は、この用語を本明細書で使用する場合、別個のユニットとして機能する１つまたは複数のポリペプチドを指す。単一のポリペプチドが、別個の機能ユニットであり、別個の機能ユニットを形成するために他のポリペプチドとの永続的または一時的な物理的会合を必要としない場合、用語「ポリペプチド」および「タンパク質」は、互換的に使用することができる。別個の機能的なユニットが互いに物理的に会合する複数のポリペプチドから構成される場合、用語「タンパク質」は、本明細書において、物理的にカップリングされ、別個のユニットとして一緒に機能する複数のポリペプチドを指す。本発明によって発現されるタンパク質は、タンパク質治療剤であり得る。タンパク質治療剤は、これが作用する体内の一領域、またはこれが中間体を介して間接的に作用する体の一領域に対して生物学的効果を有するタンパク質である。タンパク質治療剤の例は、以下でより詳細に論じる。
【００７５】
用語「断片」とは、本明細書において、ポリペプチドを指し、所与のポリペプチドの任意の別個の部分であって、そのポリペプチドにユニークであり、またはそのポリペプチドの特徴である、部分として定義される。この用語は、本明細書において、所与のポリペプチドの任意の別個の部分であって、その完全長ポリペプチドの活性の少なくとも一画分を保持する、部分も指す。ある特定の実施形態では、保持される活性の画分は、完全長ポリペプチドの活性の少なくとも１０％である。ある特定の実施形態では、保持される活性の画分は、完全長ポリペプチドの活性の少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％である。ある特定の実施形態では、保持される活性の画分は、完全長ポリペプチドの活性の少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％である。ある特定の実施形態では、保持される活性の画分は、完全長ポリペプチドの活性の１００％以上である。代替としてまたは追加的に、この用語は、本明細書において、所与のポリペプチドの任意の部分であって、その完全長ポリペプチド中に見つかる少なくとも１つの確立された配列エレメントを含む、部分も指す。いくつかの実施形態では、配列エレメントは、完全長ポリペプチドの少なくとも約４〜５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、またはそれ以上のアミノ酸に及ぶ。
【００７６】
「組換えで発現されるポリペプチド」および「組換えポリペプチド」は、本明細書において、そのポリペプチドを発現するように操作した宿主細胞から発現されるポリペプチドを指す。ある特定の実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞である。ある特定の実施形態では、この操作は、１つまたは複数の遺伝子改変を含み得る。例えば、宿主細胞は、発現されるポリペプチドをコードする１種または複数の異種遺伝子の導入によって遺伝的に改変することができる。非相同の組換えで発現されるポリペプチドは、宿主細胞内で通常発現されるポリペプチドと同一または同様であり得る。非相同の組換えで発現されるポリペプチドは、宿主細胞に対して異質、例えば、宿主細胞内で通常発現されるポリペプチドと非相同であってもよい。ある特定の実施形態では、非相同の組換えで発現されるポリペプチドは、キメラである。例えば、ポリペプチドの部分は、宿主細胞内で通常発現されるポリペプチドと同一または同様であるアミノ酸配列を含有することができ、一方、他の部分は、宿主細胞に対して異質であるアミノ酸配列を含有する。さらにまたは代わりに、ポリペプチドは、宿主細胞内でともに通常発現される２種以上の異なるポリペプチドに由来するアミノ酸配列を含有し得る。さらに、ポリペプチドは、宿主細胞に対してともに異質である２種以上のポリペプチドに由来するアミノ酸配列を含有し得る。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、１種または複数の内在性遺伝子の活性化または上方制御によって遺伝的に改変されている。
【００７７】
インタクトな「抗体」は、ジスルフィド結合によって相互接続された少なくとも２本の重（Ｈ）鎖および２本の軽（Ｌ）鎖を含む。一般に、Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第７章（Ｐａｕｌ，Ｗ．編、第２版、Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎ．Ｙ．（１９８９））（全ての目的に関してその全体が参照により組み込まれている）を参照。各重鎖は、重鎖可変領域（ＨＣＶＲまたはＶＨ）および重鎖定常領域（ＣＨ）から構成されている。重鎖定常領域は、３つのドメイン、ＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３から構成されている。各軽鎖は、軽鎖可変領域（ＬＣＶＲまたはＶＬ）および軽鎖定常領域から構成されている。軽鎖定常領域は、１つのドメイン、ＣＬから構成されている。ヒトでは、２つのタイプの軽鎖、カッパ（κ）およびラムダ（λ）があり、その結果、これらの２つのタイプの軽鎖の定常領域は、それぞれＣκおよびＣλと命名されている。ＶＨおよびＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれるより保存された領域が点在した、相補性決定領域（ＣＤＲ）と呼ばれる超可変性の領域にさらに細分することができる。各ＶＨおよびＶＬは、以下の順序でアミノ末端からカルボキシル末端に配列された３つのＣＤＲおよび４つのＦＲから構成されている：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４。各ドメインへのアミノ酸の割り当ては、Ｋａｂａｔ、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ（国立衛生研究所、Ｂｅｔｈｅｓｄａ、ＭＤ（１９８７および１９９１））、またはＣｈｏｔｈｉａ＆Ｌｅｓｋ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．、１９６：９０１〜９１７（１９８７）；Ｃｈｏｔｈｉａら、Ｎａｔｕｒｅ、３４２：８７８〜８８３（１９８９）の定義に従う。
【００７８】
抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞（例えば、エフェクター細胞）および古典的補体系の第１成分（Ｃ１ｑ）を含めた、宿主組織または宿主因子への免疫グロブリンの結合を媒介することができる。軽鎖および重鎖内で、可変領域および定常領域は、約１２以上のアミノ酸の「Ｊ」領域によって接合されており、重鎖は、約１０を超えるアミノ酸の「Ｄ」領域も含む。一般に、Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第７章（Ｐａｕｌ，Ｗ．編、第２版、Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎ．Ｙ．（１９８９））を参照。
【００７９】
用語の抗体の「抗原結合部分」（または単に「抗体部分」）は、本明細書において、抗原（例えば、腫瘍関連抗原、ＴＡＡ）に特異的に結合する能力を保持する抗体の１つまたは複数の断片を指す。抗体の抗原結合機能は、完全長抗体の断片によって実施され得ることが示されている。用語の抗体の「抗原結合部分」の中に包含される結合断片の例としては、（ｉ）Ｆａｂ断片、すなわち、ＶＬ、ＶＨ、ＣＬ、およびＣＨ１ドメインからなる一価の断片；（ｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２断片、すなわち、ヒンジ領域においてジスルフィド架橋によって連結された２つのＦａｂ断片を含む二価の断片；（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；（ｉｖ）抗体の単一アームのＶＬおよびＶＨドメインからなるＦｖ断片、（ｖ）ＶＨドメインからなるｄＡｂ断片（Ｗａｒｄら（１９８９）Ｎａｔｕｒｅ、３４１：５４４〜５４６）；ならびに（ｖｉ）単離相補性決定領域（ＣＤＲ）、ジスルフィド連結Ｆｖ（ｄｓＦｖ）、および抗イディオタイプ（抗Ｉｄ）抗体、および細胞内抗体がある。さらに、Ｆｖ断片の２つのドメイン、すなわち、ＶＬおよびＶＨは、別々の遺伝子によってコードされるが、これらは、組換え法を使用して、合成リンカーによって接合することができ、合成リンカーは、ＶＬおよびＶＨ領域が対形成して一価の分子を形成する単一タンパク質鎖（単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として公知；例えば、Ｂｉｒｄら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２４２：４２３〜４２６（１９８８）およびＨｕｓｔｏｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、８５：５８７９〜５８８３（１９８８）を参照）としてこれらが作製されることを可能にする。このような単鎖抗体も、用語の抗体の「抗原結合部分」の中に包含されることが意図されている。ダイアボディなどの他の形態の単鎖抗体も包含される。ダイアボディは、ＶＨおよびＶＬドメインが、単一ポリペプチド鎖上であるが、短すぎて同じ鎖上の２つのドメイン間で対形成することを可能にすることができず、それによってこれらのドメインを別の鎖の相補的なドメインと強制的に対形成させ、２つの抗原結合部位を創製するリンカーを使用して発現される二価の二重特異性抗体である（例えば、Ｈｏｌｌｉｇｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、９０：６４４４〜６４４８（１９９３）；Ｐｏｌｊａｋら、１９９４、Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ、２：１１２１〜１１２３を参照）。抗体は、それだけに限らないが、ヒト、サル、ブタ、ウマ、ウサギ、イヌ、ネコ、マウスなどを含めた任意の哺乳動物、または他の動物、例えば、トリ（例えば、ニワトリ）、魚（例えば、サメ）、およびラクダ科の動物（例えば、ラマ）などに由来し得る。
【００８０】
用語「ＩｇＧ  Ｆｃ領域」、「Ｆｃ領域」、「Ｆｃドメイン」、および「Ｆｃ」は、本明細書で互換的に使用され、ＩｇＧ分子のパパイン消化によって得られる結晶化可能断片に相関するＩｇＧ分子の一部を指す。本明細書において、この用語は、第１定常領域免疫グロブリンドメインを除く抗体の定常領域に関係し、さらに、その領域の一部に関係する。したがって、Ｆｃは、ＩｇＡ、ＩｇＤ、およびＩｇＧの最後の２つの定常領域免疫グロブリン、ならびにＩｇＥおよびＩｇＭの最後の３つの定常領域免疫グロブリンドメイン、ならびにこれらのドメインの柔軟なヒンジＮ末端、またはこれらの部分を指す。ＩｇＡおよびＩｇＭに関して、Ｆｃは、Ｊ鎖を含み得る。ＩｇＧに関して、Ｆｃは、免疫グロブリンドメインＣγ２およびＣγ３（Ｃガンマ２およびＣガンマ３）、およびＣγ１（Ｃガンマ１）とＣγ２（Ｃガンマ２）との間のヒンジを含む。Ｆｃ領域の境界は様々であり得るが、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、通常、残基Ｃ２２６またはＰ２３０からそのカルボキシル末端まで含むように定義され、ここで、番号付けは、Ｋａｂａｔら、１９９１に記載されたＥｄｅｌｍａｎら、１９６９、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、６３（１）：７８〜８５のＥＵインデックスに従う。典型的には、Ｆｃドメインは、ヒトＩｇＧ１定常ドメインのアミノ酸残基約２３６〜約４４７を含む。例示的なヒト野生型ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４  Ｆｃドメインアミノ酸配列を図１９Ｂに示す。Ｆｃポリペプチドは、単独でのこの領域、または抗体もしくはその抗原結合部分との脈絡におけるこの領域、またはＦｃ融合タンパク質を指す場合がある。部位特異的コンジュゲーション部位を導入する少なくとも１つのアミノ酸置換を含むＦｃの天然に存在しないバリアントである操作されたＦｃポリペプチドが特に好ましい。
【００８１】
重鎖定常ドメインは、Ｆｃ領域を含み、ＩｇＧ重鎖のＣＨ１ドメインおよびヒンジ、ならびにＣＨ２およびＣＨ３（ならびに任意選択により、ＩｇＡおよびＩｇＥのＣＨ４）ドメインをさらに含む。例示的なヒト野生型ＩｇＧ１定常ドメインアミノ酸配列を配列番号１に示し、図１５Ａに示す。
【００８２】
「操作されたＦｃポリペプチド」、「操作されたＦｃ領域」、および「操作されたＦｃ」とは、この用語が本明細書で互換的に使用される場合、コンジュゲーションのための部位を導入する少なくとも１つの突然変異、例えば、アミノ酸置換を含むＦｃポリペプチドまたはその部分を意味する。好ましくは、突然変異により、天然に存在するアミノ酸残基の代わりにその位置でシステインが導入され、この場合、突然変異により、１つの部分のＦｃへのコンジュゲーションのための反応部位（例えば、反応性スルフヒドリル基）が創製される。
【００８３】
「操作されたＦｃバリアント」は、コンジュゲーション部位を創製する突然変異に加えて、それだけに限らないが、とりわけ、アミノ酸突然変異、翻訳後修飾（例えば、グリコシル化の変更）などの少なくとも１つの追加の修飾をさらに含む操作されたＦｃポリペプチドを指す。
【００８４】
「ヒンジ領域」は、本明細書において一般に、ヒトＩｇＧ１のＧｌｕ２１６からＰｒｏ２３０へのストレッチングとして定義され（Ｂｕｒｔｏｎ、１９８５、Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、２２：１６１〜２０６）、ＣＨ１ドメインのＣ末端部分およびＣＨ２ドメインのＮ末端部分を含むＩｇＧ分子の部分を指す。ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４、ならびにマウスＩｇＧ１およびＩｇＧ２Ａについての例示的なヒンジ領域は、米国特許第６，１６５，４７６号中に、第４段５４行目〜第５段１５行目に示された表で提供されており、例えば、Ｊａｎｅｗａｙら、１９９９、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ：Ｔｈｅ  Ｉｍｍｕｎｅ  Ｓｙｓｔｅｍ  ｉｎ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｄｉｓｅａｓｅ、第４版（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｌｔｄ．）；Ｂｌｏｏｍら、１９９７、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、６：４０７〜４１５；Ｈｕｍｐｈｒｅｙｓら、１９９７、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ、２０９：１９３〜２０２にも例示されている。他のＩｇＧアイソタイプのヒンジ領域は、同じ位置内で重鎖間Ｓ−−Ｓ結合を形成する最初および最後のシステイン残基を配置することによって、ＩｇＧ１配列と整列させることができる。各サブクラスのヒンジ領域のアラインメントを示すヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４の定常ドメインの例示的なアラインメントを、図１９Ｂに示す。Ｆｃ領域の「下ヒンジ領域」は、通常、直接Ｃ末端にある残基からヒンジ領域までのストレッチ、すなわち、Ｆｃ領域の残基２３３〜２３９として定義される。
【００８５】
用語「ＩｇＧヒンジ−Ｆｃ領域」または「ヒンジ−Ｆｃ断片」は、本明細書において、ヒンジ領域（およそ残基２１６〜２３０）およびＣ末端までのＦｃ領域（残基２３１〜４４７）を指す。
【００８６】
「操作されたカッパ軽鎖」は、この用語を本明細書で使用する場合、操作されたカッパ軽鎖定常領域（Ｃκ）であって、その部位でコンジュゲーションに有用な反応基を導入するための少なくとも１つのアミノ酸置換を含む、操作されたカッパ軽鎖定常領域（Ｃκ）を含むカッパ軽鎖またはその部分を指す。
【００８７】
本明細書で互換的に使用する「操作されたカッパ定常領域」、「操作されたＣκポリペプチド」、「操作されたＣκ」、および「操作されたＣκ領域」は、コンジュゲーションに有用な反応基を含むアミノ酸を導入するために、そのように修飾されていない野生型カッパ定常領域と比較して、少なくとも１つのアミノ酸突然変異を含む、カッパ軽鎖の定常領域またはその部分を意味する。例示的なヒト野生型カッパ定常領域アミノ酸配列を図１８Ａに示し、配列番号８９に示す。
【００８８】
本明細書で互換的に使用する「操作されたラムダ定常領域」、「操作されたＣλポリペプチド」、「操作されたＣλ」、および「操作されたＣλ領域」は、コンジュゲーションに有用な反応基を含むアミノ酸を導入するために、そのように修飾されていない野生型ラムダ定常領域と比較して、少なくとも１つのアミノ酸突然変異を含む、ラムダ軽鎖の定常領域またはその部分を意味する。
【００８９】
「操作された抗体」は、この用語を本明細書で使用する場合、少なくとも１つの操作された定常領域、例えば、操作されたＦｃ領域、操作されたＣκ領域、および／または操作されたＣλ領域を含む抗体またはその抗原結合部分を意味する。
【００９０】
用語「操作された抗体抗原結合部分」または「操作された抗体部分」とは、本明細書において、少なくとも１つの操作された定常領域を含む抗体の抗原結合断片、例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２などを意味する。
【００９１】
なおさらに、抗体またはその抗原結合部分は、抗体または抗体部分の、１種または複数の他のタンパク質またはペプチドとの共有結合性または非共有結合性会合によって形成されるより大きい免疫接着分子の一部であり得る。このような免疫接着分子の例としては、四量体ｓｃＦｖ分子を作製するためのストレプトアビジンコア領域の使用（Ｋｉｐｒｉｙａｎｏｖら、Ｈｕｍａｎ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ、６：９３〜１０１（１９９５））、ならびに二価のビオチン化ｓｃＦｖ分子を作製するためのシステイン残基、マーカーペプチド、およびＣ末端ポリヒスチジンタグの使用（Ｋｉｐｒｉｙａｎｏｖら、Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、３１：１０４７〜１０５８（１９９４））がある。他の例には、抗体に由来する１つまたは複数のＣＤＲが、共有結合的または非共有結合的に分子内に組み込まれて、これが腫瘍抗原などの対象の抗原に特異的に結合するイムノアドヘシンになる場合が含まれる。このような実施形態では、ＣＤＲ（複数可）は、より大きいポリペプチド鎖の一部として組み込むことができ、別のポリペプチド鎖に共有結合的に連結することができ、または非共有結合的に組み込むことができる。ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２断片などの抗体部分は、慣例的な技法、例えば、それぞれ、全抗体のパパインまたはペプシン消化などを使用して、全抗体から調製することができる。さらに、抗体、抗体部分、および免疫接着分子は、本明細書に記載するように、標準的な組換えＤＮＡ技法を使用して得ることができる。
【００９２】
「抗体」が本発明に関して本明細書で言及される場合、その抗原結合部分も使用することができることが理解されるべきである。抗原結合部分は、インタクトな抗体と特異的結合を競合する。一般に、Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第７章（Ｐａｕｌ，Ｗ．編、第２版、Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎ．Ｙ．、（１９８９））（全ての目的に関してその全体が参照により組み込まれている）を参照。抗原結合部分は、組換えＤＮＡ技法によって、またはインタクトな抗体の酵素的もしくは化学的切断によって生成することができる。いくつかの実施形態では、抗原結合部分として、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、Ｆｖ、ｄＡｂ、および相補性決定領域（ＣＤＲ）断片、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）、キメラ抗体、ダイアボディ、ラクダ科の動物またはサメ免疫グロブリン新規抗原受容体（ＩｇＮＡＲ）に由来するものなどの単鎖抗体、およびポリペプチドへの特異的抗原結合を付与するのに十分である抗体の少なくとも一部を含有するポリペプチドが挙げられる。１つまたは複数の結合部位を有する実施形態では、結合部位は、互いに同一であり得、または異なっていてもよい。
【００９３】
用語「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」は、本明細書において、単一分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性および親和性を提示する。
【００９４】
用語「ヒト抗体」または「完全ヒト抗体」は、本明細書において、フレームワーク領域およびＣＤＲ領域がともにヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する抗体を含むことが意図されている。さらに、抗体が定常領域を含有する場合、定常領域もヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する。本開示のヒト抗体またはその抗原結合部分は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基（例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでのランダムもしくは部位特異的な突然変異誘発によって、またはｉｎ  ｖｉｖｏでの体細胞突然変異によって導入される突然変異）を含むことができる。しかし、用語「ヒト抗体」は、本明細書において、マウスなど別の哺乳動物種の生殖系列に由来するＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列上に移植された抗体を含むように意図されていない。
【００９５】
用語「ヒトモノクローナル抗体」または「完全ヒトモノクローナル抗体」は、フレームワーク領域およびＣＤＲ領域がともにヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する単一結合特異性を提示する抗体を指す。一実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、ヒト重鎖導入遺伝子および軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有するトランスジェニック非ヒト動物、例えば、トランスジェニックマウスから得られるＢ細胞を含むハイブリドーマによって生成され、この場合、Ｂ細胞は、不死化細胞に融合されている。
【００９６】
用語「組換えヒト抗体」は、本明細書において、組換え手段によって調製、発現、創製、または単離される全てのヒト抗体、例えば、（ａ）ヒト免疫グロブリン遺伝子についてトランスジェニックもしくは導入染色体性である動物（例えば、マウス）、またはそれから調製されるハイブリドーマから単離される抗体（以下にさらに記載する）、（ｂ）ヒト抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えば、トランスフェクトーマから単離される抗体、（ｃ）組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離される抗体、および（ｄ）ヒト免疫グロブリン遺伝子配列を他のＤＮＡ配列にスプライシングする任意の他の手段によって調製、発現、創製、または単離される抗体などを含む。このような組換えヒト抗体は、フレームワーク領域およびＣＤＲ領域がヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかし、ある特定の実施形態では、このような組換えヒト抗体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ突然変異誘発（またはヒトＩｇ配列についてトランスジェニックな動物が使用される場合、ｉｎ  ｖｉｖｏ体細胞突然変異誘発）に付すことができ、したがって、組換え抗体のＶＨおよびＶＬ領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列ＶＨおよびＶＬ配列に由来し、関連しながら、ｉｎ  ｖｉｖｏでヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然に存在することができない配列である。
【００９７】
本明細書において、「アイソタイプ」または「クラス」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス（例えば、ＩｇＭまたはＩｇＧ）を指す。抗体の定常ドメインは、抗原に結合しないが、様々なエフェクター機能を呈する。重鎖定常領域のアミノ酸配列に応じて、所与のヒト抗体または免疫グロブリンは、免疫グロブリンの５つの主要クラス、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭの１つに割り当てることができる。免疫グロブリンの異なるクラスの構造および３次元立体配置は周知である。様々なヒト免疫グロブリンクラスのうちで、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、およびＩｇＭのみが補体を活性化することが知られている。ヒトＩｇＧ１およびＩｇＧ３は、ヒトにおいてＡＤＣＣを媒介することが知られている。
【００９８】
本明細書において、「サブクラス」は、重鎖定常領域遺伝子のアイソタイプ内のさらなる特定化、例えば、ＩｇＧアイソタイプ内のＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４サブクラスを指す。
【００９９】
語句「抗原を認識する抗体」および「抗原に特異的な抗体」は、用語「抗原に特異的に結合する抗体」とともに本明細書で互換的に使用される。
【０１００】
用語「抗体依存性細胞傷害」または「ＡＤＣＣ」は、非特異的な細胞傷害性細胞（例えば、ＮＫ細胞、好中球、マクロファージなど）が標的細胞上に結合した抗体を認識し、引き続いて標的細胞を溶解させる細胞媒介反応を指す。ＡＤＣＣを媒介するこのような細胞傷害性細胞は一般に、Ｆｃ受容体（ＦｃＲ）を発現する。ＡＤＣＣを媒介するための初代細胞（ＮＫ細胞）は、ＦｃγＲＩＩＩを発現し、一方、単球は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、ＦｃγＲＩＩＩ、および／またはＦｃγＲＩＶを発現する。造血細胞上のＦｃＲ発現は、ＲａｖｅｔｃｈおよびＫｉｎｅｔ、Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、９：４５７〜９２（１９９１）に要約されている。分子のＡＤＣＣ活性を評価するために、米国特許第５，５００，３６２号または同第５，８２１，３３７号に記載されたものなどのｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ＡＤＣＣアッセイを実施することができる。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞がある。代替としてまたは追加的に、対象の分子のＡＤＣＣ活性を、ｉｎ  ｖｉｖｏで、例えば、Ｃｌｙｎｅｓら、１９９８、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、９５：６５２〜６５６に開示されたものなどの動物モデルにおいて評価することができる。
【０１０１】
用語「Ｆｃ受容体」または「ＦｃＲ」は、抗体のＦｃ領域であって、ヒンジ領域ならびに重鎖のＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む、Ｆｃ領域に結合する受容体を記述するのに使用される。例えば、ＦｃＲは、天然配列ヒトＦｃＲであり得る。ＦｃＲは、ＩｇＧ抗体に結合するもの（ガンマ受容体）であり得、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、ＦｃγＲＩＩＩ、およびＦｃγＲＩＶサブクラスの受容体を含み、これらの受容体の対立遺伝子バリアントおよび選択的にスプライスされた形態を含む。ＦｃγＲＩＩ受容体には、ＦｃγＲＩＩＡ（「活性化受容体」）およびＦｃγＲＩＩＢ（「阻害受容体」）が含まれ、これらは、その細胞質ドメインが主に異なる類似のアミノ酸配列を有する。活性化受容体ＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメイン内に免疫受容体チロシンベース活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含有する。阻害受容体ＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメイン内に免疫受容体チロシンベース阻害モチーフ（ＩＴＩＭ）を含有する（Ｄａｅｒｏｎ、１９９７、Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、１５：２０３〜２３４を参照）。ＦｃＲは、ＲａｖｅｔｃｈおよびＫｉｎｅｔ、１９９１、Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、９：４５７〜９２；Ｃａｐｅｌら、１９９４、Ｉｍｍｕｎｏｍｅｔｈｏｄｓ、４：２５〜３４；ｄｅ  Ｈａａｓら、１９９５、Ｊ．Ｌａｂ．Ｃｌｉｎ．Ｍｅｄ．、１２６：３３０〜３４１；およびＮｉｍｍｅｒｊａｈｎら、２００５、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ、２３：２〜４に総説されている。将来同定されるものを含めた他のＦｃＲも、本明細書で用語「ＦｃＲ」によって包含されている。この用語は、新生児受容体、ＦｃＲｎも含み、これは、母系性ＩｇＧの胎児への移動に関与する（Ｇｕｙｅｒら、１９７６、Ｉｍｍｕｎｏｌ．、１１７：５８７；およびＫｉｍら、１９９４、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、２４：２４９）。免疫グロブリンＦｃ断片上の主要ＦｃＲ結合部位は、ＣＨ１とＣＨ２との間のヒンジ領域内に存在する。このヒンジ領域は、様々な白血球上のＦｃＲ１〜３と相互作用し、これらの細胞に標的を攻撃することを誘発する。（Ｗｉｎｅｓら、２０００、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、１６４：５３１３〜５３１８）。ヒンジ領域は、それだけに限らないが、米国特許第６，１６５，４７６号に記載の配列を包含する。
【０１０２】
用語「抗体依存性細胞傷害（ＡＤＣＣ）を誘導することができる」は、当業者に公知のアッセイ（複数可）によって測定した場合、ＡＤＣＣを示す、抗体などの作用物質の能力を指す。このような活性は、典型的にはＦｃ領域の様々なＦｃＲとの結合によって特徴付けられる。いずれの特定の機構によっても制限されることなく、抗体がＡＤＣＣを示す能力は、例えば、そのサブクラス（ＩｇＧ１もしくはＩｇＧ３など）、Ｆｃ領域内に導入された突然変異、または抗体のＦｃ領域内の炭水化物パターンへの修飾によるものであり得ることを当業者は認識するであろう。このような修飾は、例えば、米国特許公開第２００７／００９２５２１号に記載されている。
【０１０３】
用語「ヒト抗体誘導体」は、ヒト抗体の任意の修飾型、例えば、抗体と別の作用物質または抗体とのコンジュゲートを指す。
【０１０４】
用語「ヒト化抗体」は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖系列に由来するＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列上に移植された抗体を指すように意図されている。追加のフレームワーク領域修飾をヒトフレームワーク配列内で行うことができる。
【０１０５】
語句「特異的に結合する」は、本明細書において、特定の分子を認識および結合するが、試料中の他の分子を実質的に認識または結合しない化合物、例えば、タンパク質、核酸、抗体などを意味する。例えば、試料中の同族リガンド（例えば、その同族抗原、ＩｇＥに結合する抗ＩｇＥ抗体）を認識および結合するが、試料中の他の分子を実質的に認識または結合しない抗体またはペプチド阻害剤。したがって、指定されたアッセイ条件下で、特定された結合部分（例えば、抗体またはその抗原結合部分）は、特定の標的分子、例えば、ＩｇＥに優先的に結合し、検査試料中に存在する他の成分に著しい量で結合しない。対象の分子に特異的に結合する抗体を選択するのに、様々なアッセイ形式を使用することができる。例えば、固相ＥＬＩＳＡイムノアッセイ、免疫沈降、ＢＩＡｃｏｒｅ、ＦＡＣＳ、およびウエスタンブロット分析は、ＩｇＥと特異的に反応する抗体を同定するのに使用され得る多くのアッセイの中にある。典型的には、特異的または選択的な反応は、バックグラウンドシグナルまたはノイズの少なくとも２倍、より典型的には、バックグラウンドの１０倍超となり、さらにより具体的には、抗体は、平衡解離定数（ＫＤ）が１μＭ以下、好ましくは、１００ｎＭ以下、最も好ましくは、１０ｎＭ以下であるとき、抗原に「特異的に結合する」と言われる。
【０１０６】
用語「結合親和性」は、２つの分子、例えば、抗体またはその断片と抗原との間の非共有結合性相互作用の強度の尺度として本明細書で使用する。用語「結合親和性」は、一価の相互作用（内在活性）を記述するのに使用される。
【０１０７】
一価の相互作用による２つの分子、例えば、抗体またはその断片と抗原との間の結合親和性は、解離定数（ＫＤ）の判定によって定量化することができる。さらに、ＫＤは、複合体形成および解離の動態の測定によって、例えば、ＳＰＲ法（Ｂｉａｃｏｒｅ）によって求めることができる。一価複合体の会合および解離に対応する速度定数は、それぞれ、会合速度定数ｋａ（またはｋｏｎ）および解離速度定数ｋｄ（またはｋｏｆｆ）と呼ばれる。ＫＤは、式ＫＤ＝ｋｄ／ｋａによってｋａおよびｋｄと関連している。
【０１０８】
上記定義に従って、異なる分子相互作用に伴う結合親和性、例えば、所与の抗原に対する異なる抗体の結合親和性の比較は、個々の抗体／抗原複合体のＫＤ値の比較によって比較することができる。
【０１０９】
同様に、相互作用の特異性は、対象の相互作用、例えば、抗体と抗原との特異的相互作用のＫＤ値を求め、この値を、対象でない相互作用のＫＤ値と比較することによって評価することができる。
【０１１０】
用語「ｋｏｎ」は、本明細書において、特定の抗体−抗原または受容体−リガンド相互作用のオンレートまたは会合速度を指すように意図されており、一方、用語「ｋｏｆｆ」は、本明細書において、特定の抗体−抗原／受容体−リガンド相互作用のオフレートまたは解離速度を指すように意図されている。用語「ＫＤ」は、本明細書において、ｋｏｆｆとｋｏｎの比（すなわち、ｋｏｆｆ／ｋｏｎ）から得られ、モル濃度（Ｍ）として表される解離定数を指すように意図されている。抗体または他の結合パートナーのＫＤ値は、当技術分野で十分確立された方法を使用して求めることができる。ＫＤを求めるための一方法は、典型的にはＢｉａｃｏｒｅ（登録商標）システムなどのバイオセンサーシステムを使用して、表面プラズモン共鳴を使用することによるものである。
【０１１１】
用語「キメラ抗体」は、本明細書において、２種以上の異なる抗体に由来する領域を含む抗体を意味する。ある特定の実施形態では、「キメラ抗体」は、１つの種に由来する可変領域配列および別の種に由来する定常領域配列を含み、例えば、可変領域配列がマウス抗体に由来し、定常領域配列がヒト抗体に由来する抗体などである。一実施形態では、ＣＤＲの１つまたは複数は、マウス抗ヒト腫瘍抗原抗体に由来する。別の実施形態では、ＣＤＲの全てがマウス抗ヒト腫瘍抗原抗体に由来する。別の実施形態では、１種を超えるマウス抗ヒト腫瘍抗原抗体に由来するＣＤＲが、キメラヒト抗体内で組み合わされる。例えば、キメラ抗体は、第１のマウス抗ヒト腫瘍抗原抗体の軽鎖に由来するＣＤＲ１、第２のマウス抗ヒト腫瘍抗原抗体の軽鎖に由来するＣＤＲ２、および第３のマウス抗ヒト腫瘍抗原抗体の軽鎖に由来するＣＤＲ３を含むことができ、重鎖に由来するＣＤＲは、１種または複数の他の抗ヒト腫瘍抗原抗体に由来し得る。さらに、フレームワーク領域は、同じマウス抗ヒト腫瘍抗原抗体の１つ、または１種もしくは複数の異なるマウスに由来し得る。
【０１１２】
さらに、本明細書で先に論じたように、キメラ抗体は、１種を超える種の生殖系列配列に由来する部分を含む抗体を含む。
【０１１３】
「糖型」は、様々な炭水化物単位の連結を含む複合オリゴ糖構造を指す。このような構造は、例えば、Ｅｓｓｅｎｔｉａｌｓ  ｏｆ  Ｇｌｙｃｏｂｉｏｌｏｇｙ、Ｖａｒｋｉら編、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ（１９９９）に記載されており、この文献は、標準的な糖鎖生物学命名法の総説も提供している。このような糖型としては、それだけに限らないが、Ｇ２、Ｇ１、Ｇ０、Ｇ−１、およびＧ−２がある（例えば、国際特許公開第ＷＯ９９／２２７６４号を参照）。
【０１１４】
「グリコシル化パターン」は、タンパク質に共有結合している炭水化物単位のパターン（例えば、糖型）、および糖型（複数可）がタンパク質のペプチド骨格、より具体的には、免疫グロブリンタンパク質に共有結合している部位（複数可）として定義される。
【０１１５】
異なる細胞系によって、またはトランスジェニック動物内で発現される抗体は、互いに比較して異なる糖型および／またはグリコシル化パターンを有することになる可能性が高い。しかし、本明細書に提供される核酸分子によってコードされ、または本明細書に提供されるアミノ酸配列を含む全ての抗体は、抗体のグリコシル化にかかわらず、本発明の一部である。
【０１１６】
「抗体−薬物コンジュゲート」は、本明細書において、細胞傷害性または細胞増殖抑制性の薬物／作用物質に共有結合的に連結された抗体または抗体の部分を指し、ここで薬物／作用物質は、「ペイロード」とも本明細書で呼ばれる。抗体および薬物は、直接連結することができ、またはこれらは、「リンカー」と呼ばれる部分を介して連結することができる。
【０１１７】
用語「有効量」または「治療有効量」とは、本明細書において、哺乳動物、好ましくはヒトに投与されるとき、化合物の非存在下で検出される応答と比較して、検出可能な治療応答を媒介する量を意味する。治療応答、例えば、それだけに限らないが、腫瘍増殖、腫瘍サイズ、転移などの阻害および／または減少などは、例えば、本明細書に開示の方法などを含めた、多数の当技術分野で認められている方法によって容易に評価することができる。
【０１１８】
本明細書の投与される化合物または組成物の有効量は、様々であり、いくつかの要因、例えば、治療される疾患または状態、疾患の段階、治療される哺乳動物の年齢および健康および身体状態、疾患の重症度、投与される特定の化合物、抗体−薬物コンジュゲートの標的の発現／利用可能性のレベルなどに基づいて容易に決定され得ることを、当業者は理解するはずである。
【０１１９】
用語「競合する」とは、抗体に関して本明細書で使用する場合、第１の抗体またはその抗原結合部分が、第２の抗体またはその抗原結合部分と結合を競合することを意味し、この場合、第１の抗体のその同族エピトープとの結合は、第２の抗体の非存在下での第１の抗体の結合と比較して、第２の抗体の存在下で検出可能な程度に減少する。第２の抗体のそのエピトープへの結合も第１の抗体の存在下で検出可能な程度に減少する代替の様式は、そうであってもよいが、そうである必要はない。すなわち、第１の抗体は、第２の抗体のそのエピトープへの結合を、その第２の抗体が第１の抗体のそのそれぞれのエピトープへの結合を阻害することなく阻害することができる。しかし、各抗体が、他の抗体のその同族エピトープまたはリガンドとの結合を、同じ程度であっても、より大きい程度であっても、より小さい程度であっても、検出可能な程度に阻害する場合、抗体は、これらのそれぞれのエピトープ（複数可）の結合を互いに「交差競合する」と言われる。例えば、交差競合抗体は、本発明で使用される抗体が結合するエピトープまたはエピトープの部分に結合することができる。競合抗体および交差競合抗体の両方の使用は、本発明によって包含されている。このような競合または交差競合が起こる機構（例えば、立体障害、コンホメーション変化、または共通エピトープもしくはその部分への結合など）にかかわらず、当業者は、本明細書に提供される教示に基づいて、このような競合抗体および／または交差競合抗体は、包含されており、本明細書に開示の方法に有用であり得ることを理解するはずである。
【０１２０】
用語「エピトープ」は、免疫グロブリンまたはＴ細胞受容体に特異的に結合することができる任意のタンパク質決定基を含む。エピトープ決定基は通常、アミノ酸または糖側鎖などの分子の化学的に活性な表面基からなり、通常、特定の３次元構造的特徴、および特定の帯電の特徴を有する。コンフォメーショナルおよび非コンフォメーショナルエピトープは、後者ではなく前者への結合が変性溶媒の存在下で喪失されるという点で区別される。
【０１２１】
「説明資料」は、その用語を本明細書で使用する場合、本明細書に列挙される様々な疾患または障害に影響し、これらを軽減または治療するために、キット内の本発明の化合物、組合せ、および／または組成物の有用性を伝えるのに使用され得る表現の刊行物、記録、図、または任意の他の媒体を含む。任意選択により、または代わりに、説明資料は、本明細書に他で開示するものを含めて、細胞、組織、または哺乳動物内で疾患または障害を軽減する１つまたは複数の方法を記述することができる。
【０１２２】
キットの説明資料は、例えば、本発明の化合物および／もしくは組成物を含有する容器に貼ってもよく、または化合物および／もしくは組成物を含有する容器と一緒に出荷してもよい。代わりに、説明資料は、レシピエントが説明資料および化合物を協調的に使用するという意図で、容器と別個に出荷してもよい。
【０１２３】
注記したときを除き、用語「患者」または「対象」は、互換的に使用され、哺乳動物、例えば、ヒト患者および非ヒト霊長類、ならびに獣医対象、例えば、ウサギ、ラット、およびマウスなど、ならびに他の動物を指す。好ましくは、患者は、ヒトを指す。
【０１２４】
ポリペプチド配列を描くのに慣例的な表示法を本明細書で使用し、ポリペプチド配列の左端は、アミノ末端であり、ポリペプチド配列の右端は、カルボキシル末端である。
【０１２５】
語句「特異的に結合する」とは、本明細書において、特定の分子を認識および結合するが、試料中の他の分子を実質的に認識または結合しない化合物、例えば、タンパク質、核酸、抗体などを意味する。例えば、試料中の同族リガンドまたは結合パートナー（例えば、腫瘍抗原に結合する抗ヒト腫瘍抗原抗体）を認識および結合するが、試料中の他の分子を実質的に認識または結合しない抗体またはペプチド受容体。したがって、指定されたアッセイ条件下で、特定された結合部分（例えば、抗体もしくはその抗原結合部分、または受容体もしくはそのリガンド結合部分）は、特定の標的分子に優先的に結合し、検査試料中に存在する他の成分に著しい量で結合しない。対象の分子に特異的に結合する抗体またはペプチドを選択するのに、様々なアッセイ形式を使用することができる。例えば、固相ＥＬＩＳＡイムノアッセイ、免疫沈降、ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）、蛍光活性化細胞分類（ＦＡＣＳ）、Ｏｃｔｅｔ（商標）（ＦｏｒｔeＢｉｏ，Ｉｎｃ．、Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ、ＣＡ）、およびウエスタンブロット分析は、同族リガンドまたは結合パートナーと特異的に結合する抗原もしくは受容体またはそのリガンド結合部分と特異的に反応する抗体を同定するのに使用され得る多くのアッセイの中にある。典型的には、特異的または選択的な反応は、バックグラウンドシグナルまたはノイズの少なくとも２倍、より典型的には、バックグラウンドの１０倍超となり、さらにより具体的には、抗体は、平衡解離定数（ＫＤ）が１μＭ以下、好ましくは、１００ｎＭ以下、最も好ましくは、１０ｎＭ以下であるとき、抗原に「特異的に結合する」と言われる。
【０１２６】
「ＡＤＣＣ」または「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害」とは、本明細書において、ＦｃガンマＲを発現する非特異的な細胞傷害性細胞が標的細胞上に結合した抗体を認識し、引き続いて標的細胞を溶解させる細胞媒介反応を意味する。対象の分子のＡＤＣＣ活性は、米国特許第５，５００，３６２号または同第５，８２１，３３７号に記載されたものなどのｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ＡＤＣＣアッセイを使用して評価することができる。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞がある。代替としてまたは追加的に、対象の分子のＡＤＣＣ活性を、ｉｎ  ｖｉｖｏで、例えば、Ｃｌｙｎｅｓら、１９９８、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、９５：６５２〜６５６に開示されたものなどの動物モデルにおいて評価することができる。
【０１２７】
「ＡＤＣＰ」または「抗体依存性細胞媒介性食作用」とは、本明細書において、ＦｃガンマＲを発現する非特異的な細胞傷害性細胞が標的細胞上に結合した抗体を認識し、引き続いて標的細胞の食作用を引き起こす細胞媒介反応を意味する。
【０１２８】
「ＣＤＣ」または「補体依存性細胞傷害」は、補体の存在下での標的細胞の溶解を指す。補体活性化経路は、同族抗原と複合体形成した分子（例えば、抗体）への補体系の第１成分（Ｃ１ｑ）の結合によって開始される。補体活性化を評価するために、それだけに限らないが、Ｇａｚｚａｎｏ−Ｓａｎｔｏｒｏら、１９９６、Ｊ．  Ｉｍｍｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ、２０２：１６３に記載されたアッセイなどのＣＤＣアッセイを実施することができる。
【０１２９】
ヒトＩｇＧ  Ｆｃ領域の「ＣＨ２ドメイン」（「Ｃγ２」ドメインとも呼ばれる）は通常、アミノ酸約２３１〜アミノ酸約３４０に及ぶ。ＣＨ２ドメインは、別のドメインと密接に対形成しないという点でユニークである。むしろ、２本のＮ連結型分枝状炭水化物鎖が、インタクトな天然ＩｇＧ分子の２つのＣＨ２ドメイン間で介在している。炭水化物は、ドメイン−ドメイン対形成の代替をもたらし、ＣＨ２ドメインを安定化するのに役立つことができると推測されている。Ｂｕｒｔｏｎ、Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、２２：１６１〜２０６（１９８５）。
【０１３０】
「ＣＨ３ドメイン」は、Ｆｃ領域内のＣ末端〜ＣＨ２ドメインの残基のストレッチ（すなわち、ＩｇＧのアミノ酸残基約３４１〜アミノ酸残基約４４７）を含む。
【０１３１】
用語「エフェクター機能」は、この用語を本明細書で使用する場合、抗体のＦｃ領域に起因し、またはこれによって媒介される生物活性を指す。例示的な「エフェクター機能」としては、それだけに限らないが、Ｃ１ｑ結合、補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）、Ｆｃ受容体結合、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害（ＡＤＣＣ）、抗体依存性細胞媒介性食作用（ＡＤＣＰ）、細胞表面受容体（例えば、Ｂ細胞受容体；ＢＣＲ）の下方制御などがある。例えば、米国特許第６，７３７，０５６号を参照。このようなエフェクター機能は一般に、Ｆｃ領域が結合ドメイン（例えば、抗体可変ドメイン）と組み合わされる必要があり、このような抗体エフェクター機能を評価するための、例えば、本明細書に開示した様々なアッセイ、および当技術分野で公知のアッセイを使用して評価することができる。
【０１３２】
「Ｆｃ融合物」または「Ｆｃ融合タンパク質」とは、本明細書において、１種または複数のポリペプチドがＦｃ領域またはその誘導体に作動可能に連結されているタンパク質を意味する。Ｆｃ融合物は、先行技術（Ｃｈａｍｏｗら、１９９６、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．、１４：５２〜６０；Ａｓｈｋｅｎａｚｉら、１９９７、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．、９：１９５〜２００）で使用された用語「イムノアドヘシン」、「Ｉｇ融合物」、「Ｉｇキメラ」、および「受容体グロブリン」（時に−を含む）と同義であるように本明細書で意味する。Ｆｃ融合では、免疫グロブリンのＦｃ領域が、一般に任意のタンパク質または低分子であり得る融合パートナーと組み合わされる。Ｆｃ融合物の非Ｆｃ部分、すなわち、融合パートナーの役割は、標的結合を媒介することであり、したがってこれは、抗体の可変領域に機能的に類似している。実質的に任意のタンパク質または低分子をＦｃポリペプチドに連結してＦｃ融合物を生成することができる。タンパク質融合パートナーとして、それだけに限らないが、受容体の標的結合領域、接着分子、リガンド、酵素、サイトカイン、ケモカイン、またはいくつかの他のタンパク質もしくはタンパク質ドメインを挙げることができる。低分子融合パートナーとして、Ｆｃ融合物を治療標的に向ける任意の治療剤を挙げることができる。このような標的は、疾患に関係づけられる任意の分子、好ましくは細胞外受容体であり得る。
【０１３３】
「ＩｇＧ」とは、本明細書において、認識された免疫グロブリンガンマ遺伝子によって実質的にコードされる抗体のクラスに属するポリペプチドを意味する。ヒトでは、このクラスは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４を含む。マウスでは、このクラスは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、ＩｇＧ２ｂ、ＩｇＧ３を含む。本明細書で「免疫グロブリン（Ｉｇ）」とは、免疫グロブリン遺伝子によって実質的にコードされる１種または複数のポリペプチドからなるタンパク質を意味する。免疫グロブリンとしては、それだけに限らないが、抗体がある。免疫グロブリンは、それだけに限らないが、完全長抗体、抗体断片、および個々の免疫グロブリンドメインを含めたいくつかの構造形態を有し得る。本明細書で「免疫グロブリン（Ｉｇ）ドメイン」とは、タンパク質構造の技術分野における当業者が確認した別個の構造エンティティとして存在する免疫グロブリンの領域を意味する。Ｉｇドメインは、典型的には特徴的な折り畳みトポロジーを有する。抗体のＩｇＧクラス内の公知のＩｇドメインは、可変重鎖ドメイン（ＶＨ）、Ｃγ１とＣγ２の間にヒンジ領域を含むＣγドメインをともに含む重鎖定常ドメイン、すなわち、Ｃγ１、Ｃγ２、Ｃγ３、軽鎖（ＶＬ）の可変ドメイン（ＶＬ）、ならびにヒトにおいて、カッパ（Ｃκ）またはラムダ（Ｃλ）軽鎖定常ドメインを含む軽鎖の定常ドメイン（ＣＬ）である。典型的には、「Ｆｃポリペプチド」は、この用語を本明細書で使用する場合、Ｃγ２およびＣγ３ドメインを含み、ヒンジドメインの少なくとも一部を含むことができ、しかし通常、Ｃγ１ドメイン全体を含まない。
【０１３４】
「親ポリペプチド」または「前駆体ポリペプチド」（Ｆｃ親または前駆体を含む）とは、本明細書において、引き続いて修飾されてバリアントまたは突然変異体を生成するポリペプチドを意味する。前記親ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド、または天然に存在するポリペプチドのバリアントもしくは操作されたバージョンであり得る。親ポリペプチドは、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物を指すことができ、ポリペプチドのアミノ酸配列を指すことができ、またはそれをコードする核酸配列を指すことができる。したがって、「親Ｆｃポリペプチド」とは、本明細書において、修飾されてバリアントを生成する無修飾Ｆｃポリペプチドを意味し、「親抗体」とは、本明細書において、修飾されてバリアント抗体を生成する無修飾抗体を意味する。
【０１３５】
本明細書において、用語「野生型アミノ酸」、「野生型ＩｇＧ」、「野生型抗体」、または「野生型ｍＡｂ」は、ある特定の集団（例えば、ヒト、マウス、ラット、細胞など）内で天然に存在するアミノ酸または核酸の配列を指す。
【０１３６】
上記に概説したように、Ｆｃ分子のある特定の位置を変更することができる。「位置」とは、本明細書において、タンパク質の配列中の１つの場所を意味する。位置は、逐次に、または確立された形式、例えば、ＫａｂａｔにおけるＥＵインデックスに従って番号付けることができる。例えば、２９７位は、ヒト抗体ＩｇＧ１内の１つの位置である。対応する位置は、一般に、他の親配列とのアラインメントによって、上記に概説したように求められる。
【０１３７】
「残基」とは、本明細書において、タンパク質中の位置およびその付随するアミノ酸素性を意味する。例えば、アスパラギン２９７（Ａｓｎ２９７とも呼ばれ、Ｎ２９７とも呼ばれる）は、ヒト抗体ＩｇＧ１内の１つの残基である。
【０１３８】
「標的抗原」とは、本明細書において、所与の抗体の可変領域によって特異的に結合される分子を意味する。標的抗原は、タンパク質、炭水化物、脂質、または他の化学化合物であり得る。
【０１３９】
「標的細胞」とは、本明細書において、標的抗原を発現する細胞を意味する。
【０１４０】
「可変領域」とは、本明細書において、それぞれ、カッパ、ラムダ、および重鎖免疫グロブリン遺伝子座を構成するＶカッパ、Ｖラムダ、および／またはＶＨ遺伝子のいずれかによって実質的にコードされる１種または複数のＩｇドメインを含む免疫グロブリンの領域を意味する。
【０１４１】
「バリアントポリペプチド」とは、本明細書において、少なくとも１つのアミノ酸修飾によって親ポリペプチド配列のものと異なるポリペプチド配列を意味する。バリアントポリペプチドは、ポリペプチド自体、ポリペプチドを含む組成物、またはそれをコードするアミノ配列を指すことができる。好ましくは、バリアントポリペプチドは、親ポリペプチドと比較して少なくとも１つのアミノ酸修飾、例えば、親と比較して約１〜約１０のアミノ酸修飾、好ましくは約１〜約５のアミノ酸修飾を有する。本明細書でバリアントポリペプチド配列は、好ましくは、親ポリペプチド配列と少なくとも約８０パーセントの相同性、最も好ましくは、親ポリペプチド配列と、少なくとも約９０パーセントの相同性、より好ましくは、少なくとも約９５パーセントの相同性、さらにより好ましくは、少なくとも約９７％の相同性、より好ましくは、少なくとも約９８％の相同性、なおより好ましくは、少なくとも約９９％の相同性を有することになる。したがって、「Ｆｃバリアント」とは、本明細書において、少なくとも１つのアミノ酸修飾によって親Ｆｃ配列のものと異なるＦｃ配列を意味する。Ｆｃバリアントは、Ｆｃ領域を包含するだけである場合があり、または抗体、Ｆｃ融合物、もしくはＦｃによって実質的にコードされる他のポリペプチドとの関連で存在し得る。Ｆｃバリアントは、Ｆｃポリペプチド自体、Ｆｃバリアントポリペプチドを含む組成物、Ｆｃポリペプチドのアミノ酸配列、またはそれをコードする核酸配列を指すことができる。好ましい実施形態では、本発明のバリアントタンパク質は、本明細書に記載のＦｃバリアントを含み、したがって、Ｆｃバリアントを有する抗体（および対応する誘導体）、またはＦｃバリアントを含むＦｃ融合タンパク質を含むことができる。さらに、いくつかの場合では、Ｆｃは、野生型Ｆｃ、または「親」バリアントと比較してバリアントである。
【０１４２】
本発明で論じる全ての重鎖定常領域アミノ酸位置に関して、番号付けは、配列決定された最初のヒトＩｇＧ１である骨髄腫タンパク質Ｅｕのアミノ酸配列を記載しているＥｄｅｌｍａｎら、１９６９、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、６３（１）：７８〜８５に最初に記載されたＥｕインデックスに従う。ＥｄｅｌｍａｎらのＥｕインデックスは、Ｋａｂａｔら、１９９１、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ、第５版、米国公衆衛生局、国立衛生研究所、Ｂｅｔｈｅｓｄａにも示されている。したがって、「Ｋａｂａｔに示されたＥＵインデックス」、または「ＫａｂａｔのＥＵインデックス」は、Ｋａｂａｔ、１９９１に示されたＥｄｅｌｍａｎらのヒトＩｇＧ１  Ｅｕ抗体に基づく残基番号付けシステムを指す。
【０１４３】
軽鎖定常領域アミノ酸配列に使用される番号付けシステムは、Ｋａｂａｔ、１９９１に示されたものである。
【０１４４】
本明細書において、「実質的に純粋な」は、目的種が、存在する支配的な種であり（すなわち、モルに基づいて、これが、組成物中の任意の他の個々の種より豊富である）、好ましくは、実質的に精製された画分が組成物であって、目的種（例えば、抗体または受容体を含めた糖タンパク質）が、存在する全ての巨大分子種の少なくとも約５０パーセント（モルに基づいて）を占める、組成物であることを意味する。一般に、実質的に純粋な組成物は、組成物中に存在する全ての巨大分子種の約８０パーセント超、より好ましくは、約８５％超、９０％超、９５％超、および９９％超を占めることになる。最も好ましくは、目的種は、本質的に均質になるまで精製され（混入物種が慣例的な検出法によって組成物中に検出され得ない）、組成物は、単一の巨大分子種から本質的になる。
【０１４５】
本明細書において、「治療する」は、疾患の症状（すなわち、腫瘍増殖および／もしくは転移、または免疫細胞の数および／もしくは活性によって媒介される他の効果など）が、患者によって経験される頻度を低減することを意味する。この用語は、疾患の症状、合併症、もしくは生化学的徴候の開始を防止し、もしくは遅延させるために本発明の化合物もしくは作用物質を投与すること、症状を軽減すること、または疾患、状態、もしくは障害のさらなる発達を阻止もしくは阻害することを含む。治療は、予防的であり得（疾患の開始を防止し、もしくは遅延させるため、またはその臨床的もしくは準臨床的症状の顕在化を防止するため）、または疾患が顕在化した後の症状の治療的抑制もしくは軽減であり得る。
【０１４６】
「併用療法」は、維持期を含んでもよい特定の治療レジメンの一部としての抗体−薬物コンジュゲートおよび別の治療剤の、これらの治療剤の共作用から有益な効果をもたらすように意図された投与を包含する。併用の有益な効果としては、それだけに限らないが、治療剤の併用から生じる薬物動態学的または薬力学的な共作用がある。併用におけるこれらの治療剤の投与は、典型的には規定された時間（通常、選択される組合せに応じて数分、数時間、数日、または数週間）にわたって実施される。「併用療法」は一般に、本発明の組合せを偶発的に任意でもたらす別個の単剤療法レジメンの一部としてのこれらの治療剤の２種以上の投与を包含するように意図されていない。
【０１４７】
「併用療法」は、逐次様式での、すなわち各治療剤が異なる時間に投与される、これらの治療剤の投与、および実質的に同時の様式での、これらの治療剤、または治療剤の少なくとも２種の投与を包含する。各治療剤の逐次投与または実質的に同時の投与は、それだけに限らないが、経口経路、静脈内経路、筋肉内、皮下経路、および粘膜組織による直接吸収を含めた、任意の適切な経路によって行うことができる。治療剤は、同じ経路または異なる経路によって投与することができる。例えば、第１の治療剤（例えば、化学療法剤）を経口投与することができ、第２の作用物質（例えば、ＡＤＣ）を静脈内投与することができる。さらに、選択された組合せの第１の治療剤を静脈内注射によって投与してもよく、一方、組合せの他の治療剤を経口投与してもよい。代わりに、例えば、治療剤をともに静脈内注射または皮下注射によって投与してもよい。
【０１４８】
本明細書では、用語「逐次の」は、別段の指定のない限り、規則的な順序または順番によって特徴付けられることを意味し、例えば、投薬レジメンがＡＤＣおよび化学療法剤の投与を含む場合、逐次投薬レジメンは、化学療法剤を投与する前、同時、実質的に同時、または後のＡＤＣの投与を含み得るが、両作用物質は、規則的な順序でまたは順番に投与されることになる。用語「分離する」は、別段の指定のない限り、一方を他方から離して保つことを意味する。用語「同時に」は、別段の指定のない限り、同じ時間に起こり、または行われることを意味し、すなわち、本発明の化合物は、同じ時間に投与される。用語「実質的に同時に」は、化合物が互いに数分以内（例えば、互いに１０分以内）に投与されることを意味し、共同投与および連続投与を包含するように意図するが、投与が連続している場合、これは、ほんの短い期間（例えば、医師が２種の化合物を別個に投与するのに要する時間）にわたって時間が離れている。本明細書において、同時的投与および実質的に同時の投与は、互換的に使用される。逐次投与は、ＡＤＣおよび化学療法剤の時間的に離れた投与を指す。
【０１４９】
「併用療法」は、他の生物学的に活性な成分（それだけに限らないが、第２の異なる抗新生物剤、樹状細胞ワクチン、または他の腫瘍ワクチンなど）、および非薬物療法（それだけに限らないが、手術または放射線治療など）とさらに組み合わせた、上述した治療剤の投与も包含し得る。併用療法が放射線治療をさらに含む場合、放射線治療は、治療剤と放射線治療の組合せの共作用からの有益な効果が実現される限り、任意の適当な時間に行うことができる。例えば、適切な場合では、有益な効果は、放射線治療が治療剤の投与からおそらく数日、またはさらには数週間、時間的に離れているときでも依然として実現される。
【０１５０】
本明細書において、「薬学的に許容できる担体」は、生理学的に適合した任意の、および全ての溶媒、分散媒質、被覆、抗細菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを含む。薬学的に許容できる担体の例としては、水、生理食塩水、リン酸緩衝溶液、デキストロース、グリセロール、エタノールなど、およびこれらの組合せの１種または複数がある。多くの場合では、組成物中に等張剤、例えば、糖、多価アルコール、例えば、マンニトール、ソルビトールなど、または塩化ナトリウムを含むことが好ましいであろう。タンパク質またはその部分の保存可能期間または有効性を増強する薬学的に許容できる物質、例えば、湿潤量または軽微な量の補助物質、例えば、湿潤剤もしくは乳化剤、保存剤、または緩衝剤なども、組成物中に含まれていてもよい。
【０１５１】
Ｉ．操作された抗体および抗体断片
本開示は、抗体の重鎖のＣＨ２もしくはＣＨ３ドメインの表面上、または軽鎖の定常ドメイン上におそらく存在する、またはさもなければ接近可能な特定の残基が、天然に存在する野生型アミノ酸の、例えば、システインとの置換にとって好適であり、したがって、様々な作用物質にコンジュゲートすることができる部位を操作するのに有用であるという知見に基づく。
【０１５２】
天然および／または非天然アミノ酸を含む、システイン以外の他のアミノ酸を、特に、様々な作用物質のコンジュゲーションを可能にする置換において用いることができる。そのような他のアミノ酸としては、リシン（Ｂｅｎｈａｒら（１９９４）Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ．Ｃｈｅｍ．５５：３２１〜３２６に記載）、チロシン（ＢｙｅｒｓおよびＢａｌｄｗｉｎ（１９８８）Ｉｍｍｕｎｏｌ．６５：３２９〜３３５に記載）、ヒスチジン（Ｗａｉｂｅｌら（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：８９７〜９０１に記載）、セレノシステイン、セレノメチオニン、および／または非天然アミノ酸が挙げられる。したがって、１個または複数個のシステイン置換が本明細書で記載される場合、当業者であれば、システインの代わりに１個または複数個のこれらの天然および／または非天然アミノ酸を任意選択で用いることができる。また、当業者であれば、いくつかの位置でシステインならびに任意の組合せで他の位置でリシン、チロシン、ヒスチジン、セレノシステイン、セレノメチオニン、および／または非天然アミノ酸が置換されたバリアント抗体を生成するためにシステインおよびリシンで置換することなど、アミノ酸の任意の組合せを置換において用いることもできる。
【０１５３】
アミノ酸改変を、当技術分野で公知の任意の方法により作製することができ、多くのそのような方法が当業者にとって周知であり、日常的である。例えば、限定されるものではないが、アミノ酸の置換、欠失および挿入を、任意の周知のＰＣＲに基づく技術を用いて達成することができる。アミノ酸置換を、部位特異的突然変異誘発により作製することができる（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれるＺｏｌｌｅｒおよびＳｍｉｔｈ、１９８２、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１０：６４８７〜６５００；Ｋｕｎｋｅｌ、１９８５、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ８２：４８８を参照されたい）。
【０１５４】
いくつかの実施形態においては、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを用いて、抗体またはその断片が、操作された残基（すなわち、野生型非改変Ｆｃと比較して置換されたアミノ酸）で、様々な部分をコンジュゲートするのに用いることができる操作されたＦｃ領域を含むような、抗体またはその抗原結合断片を調製することができる。
【０１５５】
いくつかの実施形態においては、本開示の操作されたカッパ軽鎖定常ポリペプチドを用いて、抗体またはその断片が、操作されたアミノ酸残基で、様々な部分をコンジュゲートするのに用いることができるアミノ酸突然変異、またはその一部を含む操作されたＣＬ領域を含むような、抗体またはその抗原結合断片を調製することができる。
【０１５６】
操作された抗体定常領域
Ａ．操作された重鎖定常領域
本発明は、限定されるものではないが、定常領域の番号付けシステムが、親、天然、または野生型抗体のＫａｂａｔら（１９９１、ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ、ＶＡ、以後「Ｋａｂａｔ」とする）に記載のＥＵインデックスのものである、抗体重鎖の位置：２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個以上のアミノ酸が、別のアミノ酸（天然および非天然／合成アミノ酸を含む）で置換された、Ｆｃポリペプチドなどの操作されたＣγポリペプチドを包含する。
【０１５７】
例えば、システイン残基のＦｃポリペプチドにおける単一の置換は通常、ＩｇＧ抗体分子のホモ二量体性質のため、得られるＩｇＧ抗体中の２個の対応する残基の提示をもたらすことに留意すべきである。したがって、得られる操作された本発明のＩｇＧ抗体は、薬物または化合物へのコンジュゲーションのために、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０個以上の反応性基を提示することができる。ある実施形態においては、１個または複数個の置換はシステイン残基によるものであり、得られる操作された抗体は薬物または化合物へのコンジュゲーションのために少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０個以上のチオール基を提示することができる。
【０１５８】
別の実施形態において、操作された抗体は、第２の操作されたＦｃ領域に由来する異なる置換された位置を含む１つの操作されたＦｃポリペプチドを含む。すなわち、ＩｇＧ抗体の二量体性質のため、およびヘテロ二量体抗体を調製するための様々な当技術分野で認識された方法が、特に、互いに異なる２つ以上のＦｃ領域を含むため、本発明は、操作されていても、またはされていなくてもよい他のＦｃ領域中には存在しないアミノ酸置換を含む少なくとも１つの操作されたＦｃ領域を含む抗体を包含する。異なる突然変異を含むＦｃ領域を含むヘテロ二量体抗体を作製するための方法は、当技術分野で周知であり、限定されるものではないが、Ａｒａｔｈｏｏｎらの米国特許第７，１８３，０７６号で論じられた方法が挙げられる。
【０１５９】
いくつかの実施形態において、操作された抗体は、２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＦｃポリペプチドを含み、操作されていない第２のＦｃ領域をさらに含む、例えば、それは野生型ＩｇＧ１のアミノ酸配列を含む。
【０１６０】
いくつかの実施形態において、操作された抗体は、２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＦｃポリペプチドを含み、２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＦｃポリペプチドをさらに含み、ここで第１の操作されたＦｃポリペプチド中に存在する置換は、第２の操作されたＦｃポリペプチド中に存在する置換ではない。
【０１６１】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置に少なくとも１個の置換を含み、ここで定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６２】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置に少なくとも２個の置換を含み、ここで定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６３】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４位から選択される少なくとも２個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６４】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４位から選択される少なくとも３個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６５】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４位から選択される少なくとも４個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６６】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４位から選択される少なくとも５個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６７】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４位から選択される少なくとも６個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６８】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４位から選択される少なくとも７個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１６９】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４、位から選択される少なくとも８個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１７０】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４、位から選択される少なくとも９個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１７１】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３２７、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８３、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、３９８、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２２、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４０、４４３、および４４４、位から選択される少なくとも１０個の置換を含み、ここで少なくとも１個の置換は、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択され、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＥＵインデックスのものである。
【０１７２】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２５４、３５９、３６１、３８０、３８３、３８４、３９２、３９８、４０４、４２２、４４２、および４４３位のそれぞれに置換を含み、ここで定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである。
【０１７３】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、１２９〜１６３のアミノ酸配列から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む。
【０１７４】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、配列番号９７〜１００、１０２、１０４、１０７〜１２７、１２９〜１６３のアミノ酸配列から選択される少なくとも２つのアミノ酸配列を含む。
【０１７５】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、（ａ）配列番号９９のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｂ）配列番号１０３のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｃ）配列番号１０５のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｄ）配列番号９９のアミノ酸配列と配列番号１０３のアミノ酸配列、（ｅ）配列番号１０３のアミノ酸配列と配列番号１０５のアミノ酸配列、（ｆ）配列番号９９のアミノ酸配列と配列番号１０５のアミノ酸配列、（ｇ）配列番号１０２のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、（ｈ）配列番号１０４のアミノ酸配列と配列番号１０７のアミノ酸配列、および（ｉ）配列番号１０２のアミノ酸配列と配列番号１０４のアミノ酸配列から選択される少なくとも１対のアミノ酸配列を含む。
【０１７６】
Ｂ．操作された軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）ポリペプチド
他の実施形態において、本開示の操作されたＣκポリペプチドは、配列番号９０〜９５の配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む。
【０１７７】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＣκポリペプチドは、配列番号１６４〜１６９の配列からなる群から選択される少なくとも１つのアミノ酸配列を含む。
【０１７８】
当業者であれば、一度、本明細書で提供される教示で武装したら、多くの抗体の二量体性質のため（例えば、ＩｇＧは２個の軽鎖およびそれぞれの重鎖がＦｃ領域を含む２個の重鎖を含む）、本発明の抗体が、少なくとも１個の操作されたＦｃ領域を含んでもよく、２個の操作されたＦｃ領域を含んでもよく、それぞれの操作されたＦｃ領域が同じか、または異なる突然変異を含んでもよいことを理解できる。より好ましくは、両方の操作されたＦｃ領域は、同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃ領域あたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。
【０１７９】
当業者であれば、一度、本明細書で提供される教示で武装したら、多くの抗体の二量体性質のため（例えば、ＩｇＧは２個の軽鎖およびそれぞれの重鎖がＦｃ領域を含む２個の重鎖を含む）、本発明の抗体が、少なくとも１個の操作された軽鎖定常ポリペプチド（例えば、ＣκまたはＣλ）を含んでもよく、２個の操作された軽鎖定常ポリペプチドを含んでもよく、それぞれの操作された軽鎖定常ポリペプチドは同じか、または異なる突然変異を含んでもよいことを理解できる。より好ましくは、両方の操作された軽鎖定常ポリペプチドは、同じ突然変異を含み、したがって、それぞれの軽鎖定常領域あたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。
【０１８０】
他の実施形態において、多くの抗体の二量体性質のため（例えば、ＩｇＧは２個の軽鎖およびそれぞれの重鎖がＦｃポリペプチドを含む２個の重鎖を含む）、本発明の抗体は、少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含んでもよく、少なくとも１個の操作された軽鎖定常ポリペプチドをさらに含んでもよく、それによって、一方はＦｃポリペプチド中に、他方はＣＬポリペプチド中に少なくとも２個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。
【０１８１】
別の実施形態において、本発明の抗体は、それぞれの操作されたＦｃが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい、２個の操作されたＦｃポリペプチドを含んでもよく、抗体は少なくとも１個の突然変異を含む少なくとも１個の操作された軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）ポリペプチドをさらに含む。他の実施形態において、抗体は、少なくとも１個の突然変異を含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、それぞれ少なくとも１個の突然変異を含む２個の操作された軽鎖定常（ＣκまたはＣλ）ポリペプチドをさらに含み、それによって、重鎖あたり１個および軽鎖あたり１個の少なくとも４個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは、互いに関して同じ突然変異を含み、両方の軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）ポリペプチドは互いに関して同じ突然変異を含む。
【０１８２】
別の実施形態において、本発明の抗体は、それぞれの操作されたＦｃが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい、２個の操作されたＦｃポリペプチドを含んでもよく、抗体は少なくとも１個の突然変異を含む少なくとも１個の操作された軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）ポリペプチドをさらに含む。他の実施形態において、抗体は、少なくとも１個の突然変異を含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、突然変異が２つの軽鎖定常ドメイン間で同じか、または異なっていてもよい、少なくとも１個の突然変異をそれぞれ含む２個の操作された軽鎖定常（２個のＣκ、２個のＣλまたは１個のＣκおよび１個のＣλ）ポリペプチドをさらに含み、それによって、重鎖あたり１個および軽鎖あたり１個の少なくとも４個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。すなわち、本発明は、抗体が、例えば、２つの異なる抗原または同じ抗原の異なるエピトープに結合し、重鎖が少なくとも１個の操作されたＦｃおよび／または１個の操作された軽鎖定常ドメインを含むような、２個の異なる重鎖および２個の異なる軽鎖を含む二特異的抗体を包含する。一態様において、抗体は、同じか、または異なる操作されたシステイン突然変異をそれぞれ含む２個の異なる重鎖ならびにそれぞれの軽鎖が少なくとも１個の操作されたシステイン突然変異を含んでもよい、１個のラムダ軽鎖および１個のカッパ軽鎖を含む。
【０１８３】
いくつかの実施形態において、操作されたＦａｂは、少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供するために軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）中に少なくとも１個の突然変異を含んでもよく、それによって少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を含むＦａｂを提供する。
【０１８４】
他の実施形態において、本発明は、少なくとも１個の軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）が少なくとも１個の突然変異を含み、それによって、少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を含むＦａｂを提供する、操作されたＦ（ａｂ’）２を包含する。いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＦ（ａｂ’）２は、それぞれの軽鎖定常領域（ＣκまたはＣλ）中に少なくとも１個の突然変異を含み、それによって、少なくとも２個の部位特異的コンジュゲーション部位を含む操作されたＦ（ａｂ’）２を提供する。
【０１８５】
いくつかの実施形態において、抗体は、少なくとも１個の突然変異を含む１個の操作されたＦｃポリペプチドおよびそれぞれ少なくとも１個の突然変異を含む２個の操作された軽鎖Ｃκポリペプチドを含む。
【０１８６】
他の実施形態において、本発明の抗体は、それぞれのＦｃおよびそれぞれのＣＬが少なくとも１個の突然変異を含み、Ｆｃ領域突然変異がそれぞれのＦｃポリペプチド中で同じであり、一方のＣＬ（ＣκまたはＣλ）ポリペプチド中の突然変異が他方のＣＬ（ＣκまたはＣλ）ポリペプチド中の突然変異と異なる、２個の操作されたＦｃポリペプチドおよび２個の操作された（ＣκまたはＣλ）ポリペプチドを含んでもよい。
【０１８７】
他の実施形態において、抗体が少なくとも２個の操作されたＦｃポリペプチドおよび２個の操作されたＣＬ（ＣκまたはＣλ）ポリペプチドを含む場合、２つのＦｃ領域中のそれぞれの突然変異は同じであってもよく、ＣＬ中のそれぞれの突然変異は同じであってもよく、またはそれぞれのＦｃおよび／もしくはＣＬ（ＣκまたはＣλ）は異なる突然変異を含む、またはその任意の順列であってもよい。
【０１８８】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを用いて、Ｆｃ融合タンパク質が、Ｆｃポリペプチドに大量の部分をコンジュゲートさせるのに用いることができる操作されたＦｃポリペプチドを含むようなＦｃ融合タンパク質を調製することができる。
【０１８９】
当業者であれば、Ｆｃポリペプチドが二量体化する傾向のため、本発明は、それぞれの操作されたＦｃポリペプチドがコンジュゲーションにとって特異的な部位を提供する少なくとも１個の突然変異を含んでもよい、少なくとも２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む二量体Ｆｃ融合タンパク質を包含する。
【０１９０】
一実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、ａ）３８０および４４３；ｂ）３９８および４４３；ｃ）４２２および４４３；ｄ）３８０および３９８；ｅ）３９８および４４２；ｆ）３８０および４２２；ｇ）３９２および４４３；ｈ）４０４および４４３；ならびにｉ）３９２および４０４位に上記対の置換の１つを含む。
【０１９１】
別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、ａ）３８０および４４３；ｂ）３９８および４４３；ｃ）４２２および４４３；ｄ）３８０および３９８；ｅ）３９８および４４２；ｆ）３８０および４２２；ｇ）３９２および４４３；ｈ）４０４および４４３；ならびにｉ）３９２および４０４位に上記対の置換の少なくとも１つを含む。
【０１９２】
上記の置換は、配列番号１（野生型ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域）中の位置に対応し、本開示を通してＫａｂａｔ  １９９１に記載のような、Ｅｄｅｌｍａｎら、１９６９のＥｕインデックス番号付けシステムを参照する番号を、本開示の組成物を記載するために配列番号１を参照する置換の配列位置番号付けと互換的に用いることができることが意図される。
【０１９３】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、Ｋ２４６、Ｄ２４９、Ｄ２６５、Ｓ２６７、Ｄ２７０、Ｎ２７６、Ｙ２７８、Ｅ２８３、Ｒ２９２、Ｅ２９３、Ｅ２９４、Ｙ３００、Ｖ３０２、Ｖ３０３、Ｌ３１４、Ｎ３１５、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｉ３３２、Ｅ３３３、Ｋ３３４、Ｉ３３６、Ｅ３４５、Ｑ３４７、Ｓ３５４、Ｒ３５５、Ｍ３５８、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｋ３７０、Ｙ３７３、Ｄ３７６、Ａ３７８、Ｅ３８０、Ｅ３８２、Ｑ３８６、Ｅ３８８、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９３、Ｄ４０１、Ｆ４０４、Ｔ４１１、Ｄ４１３、Ｋ４１４、Ｒ４１６、Ｑ４１８、Ｑ４１９、Ｎ４２１、Ｍ４２８、Ａ４３１、Ｌ４３２、Ｔ４３７、Ｑ４３８、Ｋ４３９、Ｌ４４３、およびＳ４４４から選択される少なくとも１個の天然アミノ酸の置換を含み、ここで番号付けはＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる抗体の重鎖に基づくものである。
【０１９４】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２３９、２５４、２８４、２８７、３２７、３６１、３８３、３８４、３９８、４２２および４４０から選択される位置（複数可）に置換を含まず、ここで定常領域の番号付けシステムはＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである。
【０１９５】
一実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置で置換された（例えば、システインで）天然アミノ酸を有するＩｇＧ１を含み、ここで定常領域の番号付けシステムはＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである。他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４形式から誘導される。さらに他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＭ、ＩｇＤ、またはＩｇＥなどの非ＩｇＧ形式から誘導される。他の実施形態において、本開示のＦｃポリペプチドは、天然残基のシステインおよび／または他のアミノ酸への置換による、ＩｇＧ１分子のＣＨ２および／もしくはＣＨ３領域の表面残基またはその等価物の操作を含む。
【０１９６】
本発明は、親、天然、または野生型抗体の抗体軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０位（軽鎖定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（１９９１，ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ、ＶＡ、以後「Ｋａｂａｔ」とする）に記載のＫａｂａｔの番号付けシステムのものである）から選択される１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個以上のアミノ酸が、別のアミノ酸（天然および非天然／合成アミノ酸を含む）で置換された、軽鎖がカッパ軽鎖もしくはラムダ軽鎖、またはその一部である操作された抗体軽鎖定常領域（ＣＬ）を包含する。
【０１９７】
いくつかの実施形態において、軽鎖定常領域は、ラムダ定常領域（Ｃλ）である。別の実施形態において、軽鎖定常領域は、カッパ定常領域（Ｃκ）である。
【０１９８】
例えば、システイン残基の、軽鎖定常領域中の単一の置換は通常、ＩｇＧ抗体分子のホモ二量体性質のため、得られるＩｇＧ抗体中の２個の対応する残基の提示をもたらすことに留意すべきである。したがって、得られる操作された本発明のＩｇＧ抗体は、薬物または化合物へのコンジュゲーションのために、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０個以上の反応性基を提示することができる。ある実施形態においては、１個または複数個の置換はシステイン残基によるものであり、得られる操作された抗体は薬物または化合物へのコンジュゲーションのために少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０個以上のチオール基を提示することができる。
【０１９９】
一実施形態において、本発明は、第２の操作されたカッパ軽鎖定常ドメインに由来する同じ置換位置を含むカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）を含む１個の操作されたポリペプチドを含む操作された抗体を提供する。すなわち、ＩｇＧ抗体の二量体二価性のため、抗体は、同じか、または互いに異なる２個のＣκポリペプチドを含んでもよく、本発明は、他のＣκポリペプチド中に存在するアミノ酸置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含む抗体を包含する。
【０２００】
別の実施形態において、操作された抗体は、第２の操作されたカッパ軽鎖定常ドメインに由来する異なる置換位置を含むカッパ軽鎖定常ドメイン（Ｃκ）を含む１個の操作されたポリペプチドを含む。すなわち、ＩｇＧ抗体の二量体性質のため、およびヘテロ二量体抗体を調製するための様々な当技術分野で認識された方法が、特に、互いに異なる２個以上のＣκポリペプチドを含むため、本発明は、操作されていても、またはされていなくてもよい、他のＣκポリペプチド中には存在しないアミノ酸置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含む抗体を包含する。異なる突然変異を含むＣＬ領域を含むヘテロ二量体抗体を作製するための方法は当技術分野で周知であり、限定されるものではないが、Ａｒａｔｈｏｏｎらの米国特許第７，１８３，０７６号で論じられた方法が挙げられる。
【０２０１】
いくつかの実施形態において、本発明の操作された抗体は、１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣκポリペプチドを含み、操作されていない第２のＣκポリペプチドをさらに含む、例えば、それは例示的ヒト野生型Ｃκポリペプチドアミノ酸配列が図１８Ａに示され、配列番号８９に提供される野生型Ｃκのアミノ酸配列を含む。
【０２０２】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦａｂは、１１１、１８３および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む操作されたＣκポリペプチドを含む。
【０２０３】
いくつかの実施形態において、操作された抗体は、第１の操作されたＣκポリペプチド中に存在する置換が第２の操作されたＣκポリペプチド中に存在する置換ではない、１１１、１８３、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣκポリペプチドを含み、１１１、１８３、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＣκポリペプチドをさらに含む。
【０２０４】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＦ（ａｂ’）２は、第１の操作されたＣκポリペプチド中に存在する置換が第２の操作されたＣκポリペプチド中に存在する置換ではない、１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣκポリペプチドを含み、１１１、１８３、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＣκポリペプチドをさらに含む。
【０２０５】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦ（ａｂ’）２は、第１の操作されたＣκポリペプチド中に存在する少なくとも１個の置換が第２の操作されたＣκポリペプチド中に存在する同じ置換である、１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣκポリペプチドを含み、１１１、１８３、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＣκポリペプチドをさらに含む。
【０２０６】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＣκポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔのインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１１、１８３、および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む。
【０２０７】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＣκポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔのインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１１、１８３、および２１０から選択される位置に少なくとも２個の置換を含む。
【０２０８】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣκポリペプチドは、抗体の軽鎖定常領域の１１１、１８３および２１０位から選択される３個全部の置換を含み、ここで、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである。
【０２０９】
上記の置換は、配列番号８９（野生型ヒトカッパ軽鎖定常領域）中の位置に対応し、本開示を通してＫａｂａｔを参照する番号は、本開示の組成物を記載するために配列番号８９を参照する置換の配列位置番号付けと互換的に用いることができることが意図される。
【０２１０】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣκポリペプチドは、番号付けがＫａｂａｔに記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスの番号付けシステムを用いる抗体の軽鎖に基づくものである、Ａ１１１、Ｋ１８３およびＮ２１０から選択される少なくとも１個の天然アミノ酸の置換を含む。
【０２１１】
他の実施形態において、操作された軽鎖定常ドメインは、ラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）である。
【０２１２】
一実施形態において、操作された抗体は、第２の操作されたラムダ軽鎖定常ドメインと同じであるか、または異なる置換位置を含むラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）を含む１個の操作されたポリペプチドを含む。すなわち、ＩｇＧ抗体の二量体性質のため、およびヘテロ二量体抗体を調製するための様々な当技術分野で認識された方法が、特に、同じであるか、または互いに異なる２個以上のＣλポリペプチドを含むため、本発明は、操作されていてもよく、またはされていなくてもよい、他のＣλポリペプチド中には存在しないアミノ酸置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドを含む抗体を包含する。異なる突然変異を含むＣＬ領域を含むヘテロ二量体抗体を作製するための方法は当技術分野で周知であり、限定されるものではないが、Ａｒａｔｈｏｏｎらの米国特許第７，１８３，０７６号で論じられた方法が挙げられる。
【０２１３】
別の態様において、操作された抗体は、抗体が同じ突然変異（複数可）をそれぞれ含む２個のＣλドメインを含む、ラムダ軽鎖定常ドメイン（Ｃλ）を含む少なくとも１個の操作されたポリペプチドを含む。
【０２１４】
いくつかの実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋ１１０Ｃ、Ｌ１２５Ｃ、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５Ｃ、Ｇ１５８Ｃ、Ｔ１６１Ｃ、Ｑ１８５Ｃ、Ｓ１８８Ｃ、Ｈ１８９Ｃ、Ｓ１９１Ｃ、Ｔ１９７Ｃ、Ｖ２０５Ｃ、Ｅ２０６Ｃ、Ｋ２０７Ｃ、Ｔ２０８およびＡ２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣλポリペプチドを含み、操作されていない第２のＣλポリペプチドをさらに含む、例えば、それは例示的ヒト野生型Ｃλポリペプチドアミノ酸配列が図２０Ａに示され、配列番号１７０に提供される、野生型Ｃλのアミノ酸配列を含む。
【０２１５】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦａｂは、Ｋ１１０、Ｌ１２５、Ｋ１４９、Ｖ１５５、Ｇ１５８、Ｔ１６１、Ｑ１８５、Ｓ１８８、Ｈ１８９、Ｓ１９１、Ｔ１９７、Ｖ２０５、Ｅ２０６、Ｋ２０７Ｃ、Ｔ２０８およびＡ２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む操作されたＣλポリペプチドを含む。
【０２１６】
いくつかの実施形態において、操作された抗体は、第１の操作されたＣλポリペプチド中に存在する置換が第２の操作されたＣλポリペプチド中に存在する置換ではない、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、Ｋ２０７Ｃ、Ｔ２０８およびＡ２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣλポリペプチドを含み、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、Ｋ２０７Ｃ、Ｔ２０８およびＡ２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＣλポリペプチドをさらに含む。
【０２１７】
いくつかの実施形態においては、本開示の操作されたＦ（ａｂ’）２は、第１の操作されたＣλポリペプチド中に存在する置換が第２の操作されたＣλポリペプチド中に存在する置換ではない、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣλポリペプチドを含み、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＣκポリペプチドをさらに含む。
【０２１８】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦ（ａｂ’）２は、第１の操作されたＣλポリペプチド中に存在する少なくとも１個の置換が第２の操作されたＣλポリペプチド中に存在する同じ置換である、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第１の操作されたＣλポリペプチドを含み、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む第２の操作されたＣλポリペプチドをさらに含む。
【０２１９】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔのインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む。
【０２２０】
いくつかの実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔのインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される位置に少なくとも２個の置換を含む。
【０２２１】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖定常領域の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも２個の置換を含む。
【０２２２】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖定常領域の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも３個の置換を含む。
【０２２３】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、少なくとも１個の置換が抗体の軽鎖定常ドメインの１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択され、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖定常領域の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも４個の置換を含む。
【０２２４】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖定常領域の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも５個の置換を含む。
【０２２５】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも６個の置換を含む。
【０２２６】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも７個の置換を含む。
【０２２７】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも８個の置換を含む。
【０２２８】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも９個の置換を含む。
【０２２９】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位から選択される少なくとも１０個の置換を含む。
【０２３０】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔに記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０位のそれぞれに置換を含む。
【０２３１】
上記の置換は、配列番号１７０（野生型ヒトラムダ軽鎖定常領域）中の位置に対応し、本開示を通してＫａｂａｔを参照する番号を、本開示の組成物を記載するために配列番号１７０を参照する置換の配列位置番号付けと互換的に用いることができることが意図される。
【０２３２】
他の実施形態において、本開示の操作されたＣλポリペプチドは、番号付けがＫａｂａｔに記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスの番号付けシステムを用いる抗体の軽鎖に基づくものである、１１０、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６、２０７、２０８および２１０から選択される少なくとも１個の天然アミノ酸の置換を含む。
【０２３３】
Ｃ．操作された定常ドメイン（重鎖および／または軽鎖）を含む、操作された抗体、またはその抗原結合部分
当業者であれば、一度、本明細書で提供される教示で武装したら、多くの抗体の二量体性質のため（例えば、ＩｇＧは、それぞれ定常領域（ＣＬ）を含む２個の軽鎖およびそれぞれＦｃ領域を含む２個の重鎖を含む）、本発明の抗体が、少なくとも１個の操作された定常領域（例えば、重鎖定常領域、ＩｇＧ  Ｃγ領域、Ｃκ領域、および／またはＣλ領域）を含んでもよく、それぞれの操作されたＣＬ領域が同じか、または異なる突然変異を含んでもよい、２個の操作されたＣＬ領域を含んでもよいことを理解できる。より好ましくは、両方の操作されたＣＬ（ＣκまたはＣλ）領域は、同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＣＬ（ＣκまたはＣλ）領域あたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。
【０２３４】
別の実施形態において、本発明の操作された抗体は、少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、それぞれの操作されたＦｃポリペプチドが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい２個の操作されたＦｃポリペプチドを含んでもよい。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは、同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。抗体は、少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドをさらに含んでもよく、それぞれの操作されたＣκポリペプチドが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい２個の操作されたＣκポリペプチドを含んでもよい。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは同じ突然変異を含み、両方の操作されたＣκポリペプチドは同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位およびＣκポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供し、それによって、少なくとも４個の潜在的なコンジュゲーション部位を含む抗体を提供する。
【０２３５】
いくつかの実施形態において、本発明の操作された抗体は、少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、それぞれの操作されたＦｃポリペプチドが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい２個の操作されたＦｃポリペプチドを含んでもよい。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは、同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。抗体は、少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドをさらに含んでもよく、それぞれの操作されたＣλポリペプチドが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい２個の操作されたＣλポリペプチドを含んでもよい。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは同じ突然変異を含み、両方の操作されたＣλポリペプチドは同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位およびＣλポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供し、それによって、少なくとも４個の潜在的なコンジュゲーション部位を含む抗体を提供する。
【０２３６】
一実施形態において、本発明の操作された抗体は、少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、それぞれの操作されたＦｃポリペプチドが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい２個の操作されたＦｃポリペプチドを含んでもよい。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは、同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供する。抗体は、少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドをさらに含んでもよく、それぞれの操作されたＣλポリペプチドが同じか、または異なる突然変異を含んでもよい２個の操作されたＣλポリペプチドを含んでもよい。より好ましくは、両方の操作されたＦｃポリペプチドは同じ突然変異を含み、両方の操作されたＣλポリペプチドは同じ突然変異を含み、したがって、それぞれのＦｃポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位およびＣλポリペプチドあたり少なくとも１個の部位特異的コンジュゲーション部位を提供し、それによって、少なくとも４個の潜在的なコンジュゲーション部位を含む抗体を提供する。
【０２３７】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含み、ここで、軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである。すなわち、操作された抗体が、ＫａｂａｔのＥｕ番号付けによる２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位での置換から選択される少なくとも１個のアミノ酸置換を含む少なくとも１個の操作された重鎖定常ドメイン（Ｃγ）を含む場合、および／または抗体が、Ｋ１１０Ｃ、Ｌ１２５Ｃ、Ｋ１４９Ｃ、Ｖ１５５Ｃ、Ｇ１５８Ｃ、Ｔ１６１Ｃ、Ｑ１８５Ｃ、Ｓ１８８Ｃ、Ｈ１８９Ｃ、Ｓ１９１Ｃ、Ｔ１９７Ｃ、Ｖ２０５Ｃ、Ｅ２０６Ｃ、Ｋ２０７Ｃ、Ｔ２０８およびＡ２１０からなる群から選択される少なくとも１個のアミノ酸置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλドメインを含む場合、抗体は、Ａ１１１、Ｋ１８３、およびＮ２１０からなる群から選択される少なくとも１個の置換、ならびに／または限定されるものではないが、Ｋ１４９（配列番号９１）、Ｋ１８８（配列番号９３）およびＫ２０７（配列番号９４）などの、２０１１年１２月１５日に公開された国際特許出願公開ＷＯ２０１１／１５６３８２に開示されたＣκ中のアミノ酸置換などの当技術分野で公知の少なくとも１個の置換を含む、少なくとも１個の操作されたＣκをさらに含んでもよい。
【０２３８】
一実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドを含み、ここで軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである。
【０２３９】
いくつかの実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、（ａ）抗体の軽鎖の１１１、１８３および２１０位から選択される少なくとも１個の置換を含む操作されたＣκポリペプチド、および／または（ｂ）抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドのうちの少なくとも１つを含み、ここで軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである。
【０２４０】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、（ａ）抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも１個の置換を含む操作されたＣκポリペプチド、および／または（ｂ）抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドのうちの少なくとも１つを含み、ここで軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである。
【０２４１】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含み、（ａ）Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含むＦｃポリペプチド、ならびに／または（ｂ）抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドのうちの少なくとも１つを含み、ここで軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムは、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである。
【０２４２】
いくつかの実施形態において、本発明の操作された抗体は、番号付けがＫａｂａｔによるものである、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含むＦｃポリペプチドを含む。
【０２４３】
一態様において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けによるＡ１１１に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いるＱ３４７に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む。
【０２４４】
一態様において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けによるＡ１１１に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いるＥ３８８に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む。
【０２４５】
別の態様において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けによるＡ１１１に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いるＫ３９２に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む。
【０２４６】
さらに別の態様において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けによるＡ１１１に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いるＬ４４３に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む。
【０２４７】
さらなる態様において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けによるＫ１８３に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いるＬ４４３に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む。
【０２４８】
別の態様において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔの番号付けによるＫ２０７に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＣκポリペプチド、ならびにＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いるＬ４４３に置換をそれぞれ含む２個の操作されたＦｃポリペプチドを含む。
【０２４９】
さらに、本発明は、定常ドメイン間のこれらの、または任意の他の特定の置換の組合せに限定されないが、新規アミノ酸置換の任意の組合せまたは順列および本明細書に開示されるその組合せを含む。
【０２５０】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムがＫａｂａｔらに記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドを含み、（ａ）Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の置換を含むＦｃポリペプチド、ならびに／または（ｂ）軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムがＫａｂａｔの番号付けインデックス（上掲）のものである、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも１個の置換を含む操作されたＣκポリペプチドのうちの少なくとも１つを含む。
【０２５１】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも２個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムが、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも２個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含み、ならびに／または軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドを含む。
【０２５２】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも３個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムが、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも３個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含み、ならびに／または軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドを含む。
【０２５３】
他の実施形態において、本発明の操作された抗体は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスの番号付けシステムを用いる重鎖の２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも５個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＦｃポリペプチドを含み、軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムが、Ｋａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも５個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣκポリペプチドを含み、ならびに／または軽鎖定常ポリペプチドの番号付けシステムがＫａｂａｔら（上掲）に記載のＫａｂａｔの番号付けインデックスのものである、抗体の軽鎖の１１０、１１１、１２５、１４９、１５５、１５８、１６１、１８５、１８８、１８９、１９１、１９７、２０５、２０６および２０７位から選択される少なくとも１個の置換を含む少なくとも１個の操作されたＣλポリペプチドを含む。
【０２５４】
他の実施形態において、抗体が少なくとも２個の操作されたＦｃポリペプチドおよび２個の操作された軽鎖定常ポリペプチド（Ｃκ−Ｃκ、Ｃλ−ＣλまたはＣκ−Ｃλ）を含み、２個のＦｃポリペプチド中のそれぞれの突然変異は同じであってもよく、ＣκもしくはＣλ中のそれぞれの突然変異は同じであってもよく、またはそれぞれのＦｃポリペプチドおよび／もしくはそれぞれのＣκもしくはＣλは異なる突然変異を含むか、または突然変異を含まないか、前記の任意の組合せである。
【０２５５】
当業者であれば、置換において用いるための好適なアミノ酸を容易に選択することができる。タンパク質構造に対する変化を最小化するために、非天然残基と類似する残基（例えば、保存的置換）を選択することが望ましい場合もある。例えば、システイン置換について、必要ではないが、システインを天然のアラニンまたはセリンに置換することが望ましい場合もある。
【０２５６】
ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４中の置換の場合、当業者であれば、対象のＩｇ型と、ＩｇＧ１との配列アラインメントを用いて、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである、抗体の重鎖の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位の上記位置に対応する所望のアイソフォームの相対的残基を決定することができる。ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４のヒト野生型重鎖定常ドメイン（ＨＣ  Ｆｃ）のアミノ酸配列は、本明細書に配列番号２、３および４として開示され、それぞれ図１５Ｃ、１５Ｄおよび１５Ｅに示される。
【０２５７】
ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４のＦｃドメインのそれぞれのアミノ酸の対応する位置を示す例示的アラインメントが、図１９Ａに提供される。ヒトＩｇＧ１のＦｃ領域は、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスを用いるアミノ酸残基２３６のグリシン（２３６Ｇ）で始まる。したがって、図１５に示される配列は、ＣＨ１領域およびヒトＦｃ領域が、より好ましくは２３６Ｇで始まるヒトＩｇＧ１の完全なヒンジ領域を示す。
【０２５８】
他の実施形態において、本発明は、操作された残基を含む単離されたＦｃポリペプチドの発現を包含する。そのような単離されたＦｃポリペプチドは、提示目的のための足場として、または単独で、もしくは別の作用物質と組み合わせた場合の二量体化ドメインとして有用であり得る。一態様において、本発明は、操作されたＦｃポリペプチドにコンジュゲートされた任意の部分が結合ドメインと特異的に結合する同族結合分子に標的化されるように、結合ドメインが操作されたＦｃポリペプチドに対する結合特異性を提供するような、操作されたＦｃポリペプチドおよび受容体、サイトカイン、リガンドなどの結合部位を含む結合ドメインを含む融合タンパク質を含む。本発明により包含される例示的なＦｃ融合タンパク質は、本発明の操作されたＦｃポリペプチドと融合された、腫瘍壊死因子受容体２（ＴＮＦＲ２）、またはそのＴＮＦ−α結合部分、同様に、同一ではないが、野生型ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドと融合されたＴＮＦＲ２を含む、エタネルセプト（ＥＮＢＲＥＬ（商標））を含む。したがって、当業者であれば、一度、本明細書に提供される教示で武装したら、本発明が操作された抗体に限定されず、むしろ、本発明が対象の標的に対する特異性を提供する任意の結合ドメインと融合された操作されたＦｃポリペプチドを包含することを理解できる。
【０２５９】
他の実施形態において、本開示は、別のタンパク質に融合された、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである、２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４から選択される位置に少なくとも１個または複数個の置換を含む操作されたＦｃポリペプチドを含む融合タンパク質を提供する。
【０２６０】
抗体親和性
典型的には、標的に関する抗体のＫＤは、限定されるものではないが、非関連材料または環境中の付随する材料などの別の非標的分子に関するＫＤよりも２倍、好ましくは５倍、より好ましくは１０倍小さい。より好ましくは、ＫＤは、非標的分子に関するＫＤよりも５０倍小さい、例えば、１００倍小さい、または２００倍小さい、さらにより好ましくは、５００倍小さい、例えば、１０００倍小さい、または１０，０００倍小さい。
【０２６１】
この解離定数の値を、周知の方法によって直接測定することができ、例えば、Ｃａｃｅｃｉら、１９８４、Ｂｙｔｅ  ９：３４０〜３６２に記載のものなどの方法により複合体混合物についてさえ計算することができる。例えば、ＫＤを、ＷｏｎｇおよびＬｏｈｍａｎ、１９９３、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：５４２８〜５４３２により開示されたものなどの二重フィルターニトロセルロースフィルター結合アッセイを用いて確立することができる。標的に対する抗体などのリガンドの結合能力を評価するための他の標準的なアッセイは当技術分野で公知であり、例えば、ＥＬＩＳＡ、ウエスタンブロット、ＲＩＡ、およびフローサイトメトリー分析が挙げられる。また、抗体の結合速度および結合親和性を、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）などの当技術分野で公知の標準的なアッセイにより、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ（商標）システムを用いることにより評価することもできる。
【０２６２】
標的への抗体の結合を、別の抗体などのその標的の別のリガンドによる標的の結合と比較する競合的結合アッセイを行うことができる。５０％の結合阻害が起こる濃度は、Ｋｉとして知られる。理想的な条件下では、ＫｉはＫＤと等しい。Ｋｉ値はＫＤより決して小さくないため、Ｋｉの測定値を、ＫＤの上限を提供するために都合良く置きかえてもよい。
【０２６３】
本発明の抗体は、１ｘ１０−７Ｍ以下、１ｘ１０−８Ｍ以下、または１ｘ１０−９Ｍ以下、または１ｘ１０−１０Ｍ以下、１ｘ１０−１１Ｍ以下、または１ｘ１０−１２Ｍ以下のその標的に関するＫＤを有してもよい。
【０２６４】
その標的に特異的に結合する抗体は、高い親和性でその標的に結合してもよい、すなわち、上記で論じられた低いＫＤを示し、より低い親和性で他の非標的分子に結合してもよい。例えば、抗体は、１ｘ１０−６Ｍ以上、より好ましくは１ｘ１０−５Ｍ以上、より好ましくは１ｘ１０−４Ｍ以上、より好ましくは１ｘ１０−３Ｍ以上、さらにより好ましくは１ｘ１０−２Ｍ以上のＫＤで非標的分子に結合してもよい。本発明の抗体は、別の非標的分子に対する結合のその親和性よりも少なくとも２倍、１０倍、５０倍、１００倍、２００倍、５００倍、１，０００倍または１０，０００倍以上である親和性でその標的に結合することができるのが好ましい。
【０２６５】
一実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、少なくとも１０２Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０２Ｍ−１、少なくとも１０３Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０３Ｍ−１、少なくとも１０４Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０４Ｍ−１、少なくとも１０５Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０５Ｍ−１、少なくとも１０６Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０６Ｍ−１、少なくとも１０７Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０７Ｍ−１、少なくとも１０８Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０８Ｍ−１、少なくとも１０９Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０９Ｍ−１、少なくとも１０１０Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０１０Ｍ−１、少なくとも１０１１Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０１１Ｍ−１、少なくとも１０１２Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０１２Ｍ−１、少なくとも１０１３Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０１３Ｍ−１、少なくとも１０１４Ｍ−１、少なくとも５ｘ１０１４Ｍ−１、少なくとも１０１５Ｍ−１、または少なくとも５ｘ１０１５Ｍ−１の親和性速度定数またはＫａ（ｋｏｎ／ｋｏｆｆ）を有してもよい。
【０２６６】
別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、５ｘ１０−２Ｍ未満、１０−２Ｍ未満、５ｘ１０−３Ｍ未満、１０−３Ｍ未満、５ｘ１０−４Ｍ未満、１０−４Ｍ未満、５ｘ１０−５Ｍ未満、１０−５Ｍ未満、５ｘ１０−６Ｍ未満、１０−６Ｍ未満、５ｘ１０−７Ｍ未満、１０−７Ｍ未満、５ｘ１０−８Ｍ未満、１０−８Ｍ未満、５ｘ１０−９Ｍ未満、１０−９Ｍ未満、５ｘ１０−１０Ｍ未満、１０−１０Ｍ未満、５ｘ１０−１１Ｍ未満、１０−１１Ｍ未満、５ｘ１０−１２Ｍ未満、１０−１２Ｍ未満、５ｘ１０−１３Ｍ未満、１０−１３Ｍ未満、５ｘ１０−１４Ｍ未満、１０−１４Ｍ未満、５ｘ１０−１５Ｍ未満、または１０−１５Ｍ未満の解離速度定数またはＫｄ（ｋｏｆｆ／ｋｏｎ）を有してもよい。
【０２６７】
本明細書に記載の方法に従って用いられる操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、本明細書に記載されるか、または当業者には公知の方法（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅアッセイ（商標）、ＥＬＩＳＡ）（Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＡＢ、Ｕｐｐｓａｌａ、Ｓｗｅｄｅｎ）を用いて評価された場合、３０００ｐＭ未満、２５００ｐＭ未満、２０００ｐＭ未満、１５００ｐＭ未満、１０００ｐＭ未満、７５０ｐＭ未満、５００ｐＭ未満、２５０ｐＭ未満、２００ｐＭ未満、１５０ｐＭ未満、１００ｐＭ未満、７５ｐＭ未満の解離定数（Ｋｄ）を有してもよい。
【０２６８】
本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、その天然の対応物の抗原結合能力を保持する。一実施形態においては、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、操作前の抗体と比較して本質的に同じ親和性を示す。別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、操作前の抗体と比較して低下した親和性を示す。別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、操作前の抗体と比較して増強された親和性を示す。
【０２６９】
一実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、操作前の抗体の解離定数（Ｋｄ）とほぼ等しいＫｄを有してもよい。
【０２７０】
一実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、操作前の抗体のＫｄと比較して、その同種抗原に対する約１倍、より好ましくは約２倍、さらにより好ましくは約３倍、より好ましくは約４倍、さらにより好ましくは約５倍、さらにより好ましくは約１０倍、より好ましくは約２０倍、さらにより好ましくは約５０倍、より好ましくは約１００倍、さらにより好ましくは約１５０倍、より好ましくは約２００倍、さらにより好ましくは約２５０倍、さらにより好ましくは約３００倍、より好ましくは約４００倍、さらにより好ましくは約５００倍、より好ましくは約６００倍、さらにより好ましくは約７００倍、より好ましくは約８００倍、さらにより好ましくは９００倍、およびさらにより好ましくは約１０００倍高い解離定数（Ｋｄ）を有してもよい。
【０２７１】
さらに別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体は、操作前の抗体のＫｄと比較して、その同種抗原に対する約１倍、より好ましくは約２倍、さらにより好ましくは約３倍、より好ましくは約４倍、さらにより好ましくは約５倍、さらにより好ましくは約１０倍、より好ましくは約２０倍、さらにより好ましくは約５０倍、より好ましくは約１００倍、さらにより好ましくは約１５０倍、より好ましくは約２００倍、さらにより好ましくは約２５０倍、さらにより好ましくは約３００倍、より好ましくは約４００倍、さらにより好ましくは約５００倍、より好ましくは約６００倍、さらにより好ましくは約７００倍、より好ましくは約８００倍、さらにより好ましくは９００倍、およびさらにより好ましくは約１０００倍低いＫｄを有してもよい。
【０２７２】
抗体特異性
いくつかの実施形態において、本開示の操作された抗体、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２は、アバゴボマブ、アバタセプト（ＯＲＥＮＣＩＡ（登録商標））、アブシキシマブ（ＲＥＯＰＲＯ（登録商標）、ｃ７Ｅ３  Ｆａｂ）、アダリムマブ（ＨＵＭＩＲＡ（登録商標））、アデカツムマブ、アレムツズマブ（ＣＡＭＰＡＴＨ（登録商標）、ＭａｂＣａｍｐａｔｈもしくはＣａｍｐａｔｈ−１Ｈ）、アルツモマブ、アフェリモマブ、アナツモマブマフェナトックス、アネツムマブ、アンルキズマブ、アポリズマブ、アルシツモマブ、アセリズマブ、アトリズマブ、アトロリムマブ、バピネウズマブ、バシリキシマブ（ＳＩＭＵＬＥＣＴ（登録商標））、バビツキシマブ、ベクツモマブ（ＬＹＭＰＨＯＳＣＡＮ（登録商標））、ベリムマブ（ＬＹＭＰＨＯ−ＳＴＡＴ−Ｂ（登録商標））、ベルチリムマブ、ベシレソマブ、ベタセプト（ＥＭＢＲＥＬ（登録商標））、ベバシズマブ（ＡＶＡＳＴＩＮ（登録商標））、ビシロマブブラロバルビタール、ビバツズマブメルタンシン、ブレンツキシマブベドチン（ＡＤＣＥＴＲＩＳ（登録商標））、カナキヌマブ（ＡＣＺ８８５）、カンツズマブメルタンシン、カプロマブ（ＰＲＯＳＴＡＳＣＩＮＴ（登録商標））、カツマキソマブ（ＲＥＭＯＶ  ＡＢ（登録商標））、セデリズマブ（ＣＩＭＺＩＡ（登録商標））、セルトリズマブペゴール、セツキシマブ（ＥＲＢＩＴＵＸ（登録商標））、クレノリキシマブ、ダセツズマブ、ダクリキシマブ、ダクリズマブ（ＺＥＮＡＰ  ＡＸ（登録商標））、デノスマブ（ＡＭＧ  １６２）、デツモマブ、ドルリモマブアリトックス、ドルリキシズマブ、ダンツムマブ、デュリムルマブ、デュルムルマブ、エクロメキシマブ、エクリズマブ（ＳＯＬＩＲＩＳ（登録商標））、エドバコマブ、エドレコロマブ（Ｍａｂｌ７−１Ａ、ＰＡＮＯＲＥＸ（登録商標））、エファリズマブ（ＲＡＰＴＩＶＡ（登録商標））、エフングマブ（ＭＹＣＯＧＲＡＢ（登録商標））、エルシリモマブ、エンリモマブペゴール、エピツモマブシツキセタン、エファリズマブ、エピツモマブ、エプラツズマブ、エルリズマブ、エルツマキソマブ（ＲＥＸＯＭＵＮ（登録商標））、エタラシズマブ（エタラツズマブ、ＶＩＴＡＸＩＮ（登録商標）、ＡＢＥＧＲＩＮ（商標））、エクスビビルマブ、ファノレソマブ（ＮＥＵＴＲＯＳＰＥＣ（登録商標））、ファラリモマブ、フェルビズマブ、フォントリズマブ（ＨＵＺＡＦ（登録商標））、ガリキシマブ、ガンテネルマブ、ガビリモマブ（ＡＢＸ−ＣＢＬ（Ｒ））、ゲムツズマブオゾガマイシン（ＭＹＬＯＴＡＲＧ（登録商標））、ゴリムマブ（ＣＮＴＯ  １４８）、ゴミリキシマブ、イバリズマブ（ＴＮＸ−３５５）、イブリツモマブチウキセタン（ＺＥＶＡＬＩＮ（登録商標））、イゴボマブ、イムシロマブ、インフリキシマブ（ＲＥＭＩＣＡＤ  Ｅ（登録商標））、イノリモマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ（ＹＥＲＶＯＹ（登録商標）、ＭＤＸ−０１０）、イラツムマブ、ケリキシマブ、ラベツズマブ、レマレソマブ、レブリリズマブ、レルデリムマブ、レキサツムマブ（ＨＧＳ−ＥＴＲ２、ＥＴＲ２−ＳＴ０１）、レキシツムマブ、リビビルマブ、リンツズマブ、ルカツムマブ、ルミリキシマブ、マパツムマブ（ＨＧＳ−ＥＴＲＩ、ＴＲＭ−Ｉ）、マスリモマブ、マツズマブ（ＥＭＤ７２０００）、メポリズマブ（ＢＯＳＡＴＲＩＡ（登録商標））、メテリムマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミツモマブ、モロリムマブ、モタビズマブ（ＮＵＭＡＸ（商標））、ムロモナブ（ＯＫＴ３）、ナコロマブタフェナトックス、ナプツモマブエスタフェナトックス、ナタリズマブ（ＴＹＳＡＢＲＩ（登録商標）、ＡＮＴＥＧＲＥＮ（登録商標））、ネバクマブ、ネレリモマブ、ニモツズマブ（ＴＨＥＲＡＣＩＭ  ｈＲ３（登録商標）、ＴＨＥＲＡ−ＣＩＭ−ｈＲ３（登録商標）、ＴＨＥＲＡＬＯＣ（登録商標））、ノフェツモマブメルペンタン（ＶＥＲＬＵＭＡ（登録商標））、オクレリズマブ、オデュリモマブ、オファツムマブ、オマリズマブ（ＸＯＬＡＩＲ（登録商標））、オレゴボマブ（ＯＶＡＲＥＸ（登録商標））、オテリキシズマブ、パギバキシマブ、パリビズマブ（ＳＹＮＡＧＩＳ（登録商標））、パニツムマブ（ＡＢＸ−ＥＧＦ、ＶＥＣＴＩＢＩＸ（登録商標））、パスコリズマブ、ペムツモマブ（ＴＨＥＲＡＧＹＮ（登録商標））、ペルツズマブ（２Ｃ４、ＯＭＮＩＴＡＲＧ（登録商標）、ペキセリズマブ、ピンツモマブ、ポネズマブ、プリリキシマブ、プリツムマブ、ランビズマブ（ＬＵＣＥＮＴＩＳ（登録商標））、ラキシバクマブ、レガビルマブ、レスリズマブ、リツキシマブ（ＲＩＴＵＸＡＮ（登録商標）、ＭａｂＴＨＥＲＡ（登録商標））、ロベリズマブ、ルプリズマブ、サツモマブ、セビルマブ、シブロツズマブ、シプリズマブ（ＭＥＤＩ−５０７）、ソンツズマブ、スタムルマブ（Ｍｙｏ−０２９）、スレソマブ（ＬＥＵＫＯＳＣＡＮ（登録商標））、タカツズマブテトラキセタン、タドシズマブ、タリズマブ、タプリツモマブパプトックス、テフィバズマブ（ＡＵＲＥＸＩＳ（登録商標））、テリモマブアリトックス、テネリキシマブ、テプリズマブ、チシリムマブ、トシリズマブ（ＡＣＴＥＭＲＡ（登録商標））、トラリズマブ、トシツモマブ、トラスツズマブ（ＨＥＲＣＥＰＴＩＮ（登録商標））、トレメリムマブ（ＣＰ−６７５，２０６）、ツコツズマブセルモロイキン、ツビルマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ（ＣＮＴＯ  １２７５）、バパリキシマブ、ベルツズマブ、ベパリモマブ、ビシリズマブ（ＮＵＶＩＯＮ（登録商標））、ボロシキシマブ（Ｍ２００）、ボツムマブ（ＨＵＭＡＳＰＥＣＴ（登録商標））、ザルツムマブ、ザノリムマブ（ＨｕＭＡＸ−ＣＤ４）、ジラリムマブ、またはゾリモマブアリトックスから選択される、エピトープ結合ドメイン（例えば、限定されるものではないが、６個全部のＣＤＲを有する抗体可変領域、または抗体可変領域と少なくとも９０％同一である等価な領域）を含む抗体、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２を含む。
【０２７３】
他の実施形態において、本開示の操作された抗体、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２は、６個のＣＤＲを有する重鎖および軽鎖可変ドメインを含む、ならびに／または前記一覧から選択される抗体と結合について競合する。他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドを含む抗体、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２は、前記一覧中の抗体と同じエピトープに結合する。他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドを含む抗体、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２は、６個全部のＣＤＲを有する重鎖および軽鎖可変ドメインを含み、前記一覧中の抗体と同じ抗原に結合する。
【０２７４】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドを含む抗体、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２は、６個全部のＣＤＲを有する重鎖および軽鎖可変ドメインを含み、ＰＤＧＦＲアルファ、ＰＤＧＦＲベータ、ＰＤＧＦ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＶＥＧＦ−Ｅ、ＶＥＧＦ−Ｆ、ＶＥＧＦＲ１、ＶＥＧＦＲ２、ＶＥＧＦＲ３、ＦＧＦ、ＦＧＦ２、ＨＧＦ、ＫＤＲ、ｆｌｔ−１、ＦＬＫ−１、Ａｎｇ−２、Ａｎｇ−１、ＰＬＧＦ、ＣＥＡ、ＣＸＣＬ１３、Ｂａｆｆ、ＩＬ−２１、ＣＣＬ２１、ＴＮＦ−アルファ、ＣＸＣＬ１２、ＳＤＦ−Ｉ、ｂＦＧＦ、ＭＡＣ−Ｉ、ＩＬ２３ｐｌ９、ＦＰＲ、ＩＧＦＢＰ４、ＣＸＣＲ３、ＴＬＲ４、ＣＸＣＲ２、ＥｐｈＡ２、ＥｐｈＡ４、ＥｐｈｒｉｎＢ２、ＥＧＦＲ（ＥｒｂＢｌ）、ＨＥＲ２（ＥｒｂＢ２またはｐｌ８５ｎｅｕ）、ＨＥＲ３（ＥｒｂＢ３）、ＨＥＲ４  ＥｒｂＢ４またはｔｙｒｏ２）、ＳＣｌ、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６、ＲＡＧＥ、ｓ１００Ａ８、ｓ１００Ａ９、Ｎａｖｌ．７、ＧＬＰｌ、ＲＳＶ、ＲＳＶ  Ｆタンパク質、インフルエンザＨＡタンパク質、インフルエンザＮＡタンパク質、ＨＭＧＢｌ、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２８、ＣＤ３２、ＣＤ３２ｂ、ＣＤ６４、ＣＤ７９、ＣＤ２２、ＩＣＡＭ−Ｉ、ＦＧＦＲｌ、ＦＧＦＲ２、ＨＤＧＦ、ＥｐｈＢ４、ＧＩＴＲ、ベータ−アミロイド、ｈＭＰＶ、ＰＩＶ−Ｉ、ＰＩＶ−２、ＯＸ４０Ｌ、ＩＧＦＢＰ３、ｃＭｅｔ、ＰＤ−Ｉ、ＰＬＧＦ、ネプリライシン（Ｎｅｐｒｏｌｙｓｉｎ）、ＣＴＤ、ＩＬ−１８、ＩＬ−６、ＣＸＣＬ−１３、ＩＬ−ＩＲｌ、ＩＬ−１５、ＩＬ−４Ｒ、ＩｇＥ、ＰＡＩ−Ｉ、ＮＧＦ、ＥｐｈＡ２、ｕＰＡＲｔ、ＤＬＬ−４、αｖβ５、αｖβ６、α５β１、α３β１、インターフェロン受容体Ｉ型およびＩＩ型、ＣＤ  １９、ＩＣＯＳ、ＩＬ−１７、第ＩＩ因子、Ｈｓｐ９０、ＩＧＦ、ＩＧＦ−Ｉ、ＩＧＦ−ＩＩ、ＣＤ  １９、ＧＭ−ＣＳＦＲ、ＰＩＶ−３、ＣＭＶ、ＩＬ−１３、ＩＬ−９、およびＥＢＶから選択される抗原に特異的に結合する。
【０２７５】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドを含む抗体、またはその抗原結合部分、例えば、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２断片は、ＴＮＦスーパーファミリーのメンバー（受容体またはリガンド）に特異的に結合する。様々な分子として、限定されるものではないが、腫瘍壊死因子−アルファ（「ＴＮＦ−アルファ」）、腫瘍壊死因子−ベータ（「ＴＮＦ−ベータ」）、リンホトキシン−アルファ（「ＬＴ−アルファ」）、ＣＤ３０リガンド、ＣＤ２７リガンド、ＣＤ４０リガンド、４−１ＢＢリガンド、Ａｐｏ−１リガンド（ＦａｓリガンドまたはＣＤ９５リガンドとも呼ばれる）、Ａｐｏ−２リガンド（ＴＲＡＩＬとも呼ばれる）、Ａｐｏ−３リガンド（ＴＷＥＡＫとも呼ばれる）、オステオプロテゲリン（ＯＰＧ）、ＡＰＲＩＬ、ＲＡＮＫリガンド（ＴＲＡＮＣＥとも呼ばれる）、ＴＡＬＬ−１（ＢｌｙＳ、ＢＡＦＦまたはＴＨＡＮＫとも呼ばれる）、ＤＲ４、ＤＲ５（Ａｐｏ−２、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＴＲ６、Ｔａｎｇｏ−６３、ｈＡＰＯ８、ＴＲＩＣＫ２、またはＫＩＬＬＥＲとしても知られる）、ＤＲ６、ＤｃＲＩ、ＤｃＲ２、ＤｃＲ３（ＴＲ６またはＭ６８としても知られる）、ＣＡＲＩ、ＨＶＥＭ（ＡＴＡＲまたはＴＲ２としても知られる）、ＧＩＴＲ、ＺＴＮＦＲ−５、ＮＴＲ−Ｉ、ＴＮＦＬＩ、ＣＤ３０、ＬＴＢｒ、４−１ＢＢ受容体およびＴＲ９が挙げられる。
【０２７６】
別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドを含む抗体、またはその抗原結合部分、例えば、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ’）２断片は、５Ｔ４、ＡＢＬ、ＡＢＣＢ５、ＡＢＣＦｌ、ＡＣＶＲｌ、ＡＣＶＲｌＢ、ＡＣＶＲ２、ＡＣＶＲ２Ｂ、ＡＣＶＲＬｌ、ＡＤ０ＲＡ２Ａ、アグレカン、ＡＧＲ２、ＡＩＣＤＡ、ＡＩＦＩ、ＡＩＧｌ、ＡＫＡＰｌ、ＡＫＡＰ２、ＡＭＨ、ＡＭＨＲ２、アンギオゲニン（ＡＮＧ）、ＡＮＧＰＴｌ、ＡＮＧＰＴ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＡＮＧＰＴＬ４、アネキシンＡ２、ＡＮＰＥＰ、ＡＰＣ、ＡＰＯＣｌ、ＡＲ、アロマターゼ、ＡＴＸ、ＡＸｌ、ＡＺＧＰｌ（亜鉛−ａ−糖タンパク質）、Ｂ７．１、Ｂ７．２、Ｂ７−Ｈ１、ＢＡＤ、ＢＡＦＦ、ＢＡＧｌ、ＢＡＩｌ、ＢＣＲ、ＢＣＬ２、ＢＣＬ６、ＢＤＮＦ、ＢＬＮＫ、ＢＬＲｌ（ＭＤＲ１５）、ＢＩｙＳ、ＢＭＰ１、ＢＭＰ２、ＢＭＰ３Ｂ（ＧＤＦｌＯ）、ＢＭＰ４、ＢＭＰ６、ＢＭＰ７、ＢＭＰ８、ＢＭＰ９、ＢＭＰ１１、ＢＭＰ１２、ＢＭＰＲ１Ａ、ＢＭＰＲ１Ｂ、ＢＭＰＲ２、ＢＰＡＧｌ（プレクチン）、ＢＲＣＡｌ、Ｃ１９ｏｒｆｌＯ（ＩＬ２７ｗ）、Ｃ３、Ｃ４Ａ、Ｃ５、Ｃ５Ｒ１、ＣＡＮＴｌ、ＣＡＳＰｌ、ＣＡＳＰ４、ＣＡＶｌ、ＣＣＢＰ２（Ｄ６／ＪＡＢ６１）、ＣＣＬｌ（１−３０９）、ＣＣＬＩ  １（エオタキシン）、ＣＣＬ１３（ＭＣＰ−４）、ＣＣＬ１５（ＭＩＰ−Ｉｄ）、ＣＣＬ１６（ＨＣＣ−４）、ＣＣＬ１７（ＴＡＲＣ）、ＣＣＬ１８（ＰＡＲＣ）、ＣＣＬ１９（ＭＩＰ−３ｂ）、ＣＣＬ２（ＭＣＰ−１）、ＭＣＡＦ、ＣＣＬ２０（ＭＩＰ−３ａ）、ＣＣＬ２１（ＭＥＰ−２）、ＳＬＣ、エクソダス−２、ＣＣＬ２２（ＭＤＣ／ＳＴＣ−Ｉ）、ＣＣＬ２３（ＭＰＩＦ−Ｉ）、ＣＣＬ２４（ＭＰＩＦ−２／エオタキシン−２）、ＣＣＬ２５（ＴＥＣＫ）、ＣＣＬ２６（エオタキシン−３）、ＣＣＬ２７（ＣＴＡＣＫ／ＩＬＣ）、ＣＣＬ２８、ＣＣＬ３（ＭＩＰ−Ｉａ）、ＣＣＬ４（ＭＩＰ−Ｉｂ）、ＣＣＬ５（ＲＡＮＴＥＳ）、ＣＣＬ７（ＭＣＰ−３）、ＣＣＬ８（ｍｃｐ−２）、ＣＣＮＡｌ、ＣＣＮＡ２、ＣＣＮＤｌ、ＣＣＮＥｌ、ＣＣＮＥ２、ＣＣＲｌ（ＣＫＲｌ／ＨＭ１４５）、ＣＣＲ２（ｍｃｐ−ＩＲＢ／ＲＡ）、ＣＣＲ３（ＣＫＲ３／ＣＭＫＢＲ３）、ＣＣＲ４、ＣＣＲ５（ＣＭＫＢＲ５／ＣｈｅｍＲ１３）、ＣＣＲ６（ＣＭＫＢＲ６／ＣＫＲ−Ｌ３／ＳＴＲＬ２２／ＤＲＹ６）、ＣＣＲ７（ＣＫＲ７／ＥＢＩ１）、ＣＣＲ８（ＣＭＫＢＲ８／ＴＥＲｌ／ＣＫＲ−Ｌｌ）、ＣＣＲ９（ＧＰＲ−９−６）、ＣＣＲＬｌ（ＶＳＨＫｌ）、ＣＣＲＬ２（Ｌ−ＣＣＲ）、ＣＤ１６４、ＣＤ１９、ＣＤｌＣ、ＣＤ２０、ＣＤ２００、ＣＤ−２２、ＣＤ２４、ＣＤ２８、ＣＤ３、ＣＤ３３、ＣＤ３５、ＣＤ３７、ＣＤ３８、ＣＤ３Ｅ、ＣＤ３Ｇ、ＣＤ３Ｚ、ＣＤ４、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ４４、ＣＤ４５ＲＢ、ＣＤ４６、ＣＤ５２、ＣＤ６９、ＣＤ７２、ＣＤ７４、ＣＤ７９Ａ、ＣＤ７９Ｂ、ＣＤ８、ＣＤ８０、ＣＤ８１、ＣＤ８３、ＣＤ８６、ＣＤ１０５、ＣＤ１３７、ＣＤＨｌ（Ｅ−カドヘリン）、ＣＤＣＰ１ＣＤＨ１０、ＣＤＨ１２、ＣＤＨ１３、ＣＤＨ１８、ＣＤＨ１９、ＣＤＨ２０、ＣＤＨ５、ＣＤＨ７、ＣＤＨ８、ＣＤＨ９、ＣＤＫ２、ＣＤＫ３、ＣＤＫ４、ＣＤＫ５、ＣＤＫ６、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫＮｌＡ（ｐ２１Ｗａｐｌ／Ｃｉｐｌ）、ＣＤＫＮｌＢ（ｐ２７Ｋｉｐｌ）、ＣＤＫＮｌＣ、ＣＤＫＮ２Ａ（ｐｌ６ＩＮＫ４ａ）、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ３、ＣＥＢＰＢ、ＣＥＲｌ、ＣＨＧＡ、ＣＨＧＢ、キチナーゼ、ＣＨＳＴｌＯ、ＣＫＬＦＳＦ２、ＣＫＬＦＳＦ３、ＣＫＬＦＳＦ４、ＣＫＬＦＳＦ５、ＣＫＬＦＳＦ６、ＣＫＬＦＳＦ７、ＣＫＬＦＳＦ８、ＣＬＤＮ３、ＣＬＤＮ７（クラウジン−７）、ＣＬＮ３、ＣＬＵ（クラステリン）、ＣＭＫＬＲｌ、ＣＭＫＯＲｌ（ＲＤＣｌ）、ＣＮＲｌ、ＣＯＬｌ  ８Ａｌ、ＣＯＬ１Ａ１、ＣＯＬ４Ａ３、ＣＯＬ６Ａ１、ＣＲ２、Ｃｒｉｐｔｏ、ＣＲＰ、ＣＳＦｌ（Ｍ−ＣＳＦ）、ＣＳＦ２（ＧＭ−ＣＳＦ）、ＣＳＦ３（ＧＣＳＦ）、ＣＴＬＡ４、ＣＴＬ８、ＣＴＮＮＢｌ（ｂ−カテニン）、ＣＴＳＢ（カテプシンＢ）、ＣＸ３ＣＬ１（ＳＣＹＤｌ）、ＣＸ３ＣＲ１（Ｖ２８）、ＣＸＣＬｌ（ＧＲＯｌ）、ＣＸＣＬｌＯ（ＩＰ−ＩＯ）、ＣＸＣＬＩｌ（Ｉ−ＴＡＣ／ＩＰ−９）、ＣＸＣＬ１２（ＳＤＦｌ）、ＣＸＣＬ１３、ＣＸＣＬ  １４、ＣＸＣＬ  １６、ＣＸＣＬ２（ＧＲ０２）、ＣＸＣＬ３（ＧＲ０３）、ＣＸＣＬ５（ＥＮＡ−７８／ＬＩＸ）、ＣＸＣＬ６（ＧＣＰ−２）、ＣＸＣＬ９（ＭＩＧ）、ＣＸＣＲ３（ＧＰＲ９／ＣＫＲ−Ｌ２）、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ６（ＴＹＭＳＴＲ／ＳＴＲＬ３３／Ｂｏｎｚｏ）、ＣＹＢ５、ＣＹＣｌ、Ｃｙｒ６１、ＣＹＳＬＴＲｌ、ｃ−Ｍｅｔ、ＤＡＢ２ＩＰ、ＤＥＳ、ＤＫＦＺｐ４５１Ｊ０１１８、ＤＮＣＬｌ、ＤＰＰ４、Ｅ２Ｆ１、ＥＣＧＦｌ５ＥＤＧｌ、ＥＦＮＡｌ、ＥＦＮＡ３、ＥＦＮＢ２、ＥＧＦ、ＥＧＦＲ、ＥＬＡＣ２、ＥＮＧ、エンドグリン、ＥＮＯｌ、ＥＮ０２、ＥＮ０３、ＥＰＨＡｌ、ＥＰＨＡ２、ＥＰＨＡ３、ＥＰＨＡ４、ＥＰＨＡ５、ＥＰＨＡ６、ＥＰＨＡ７、ＥＰＨＡ８、ＥＰＨＡ９、ＥＰＨＡｌＯ、ＥＰＨＢｌ、ＥＰＨＢ２、ＥＰＨＢ３、ＥＰＨＢ４、ＥＰＨＢ５、ＥＰＨＢ６、ＥＰＨＲＩＮ−Ａｌ、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ２、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ３、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ４、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ５、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ６、ＥＰＨＲＩＮ−Ｂｌ、ＥＰＨＲＩＮ−Ｂ２、ＥＰＨＲＴＮ−Ｂ３、ＥＰＨＢ４、ＥＰＧ、ＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ−２）、ＥＲＥＧ、ＥＲＫ８、エストロゲン受容体、ＥＳＲｌ、ＥＳＲ２、Ｆ３（ＴＦ）、ＦＡＤＤ、ファルネシルトランスフェラーゼ、ＦａｓＬ、ＦＡＳＮｆ、ＦＣＥＲ１Ａ、ＦＣＥＲ２、ＦＣＧＲ３Ａ、ＦＧＦ、ＦＧＦｌ（ａＦＧＦ）、ＦＧＦｌＯ、ＦＧＦｌ  １、ＦＧＦ１２、ＦＧＦ１２Ｂ、ＦＧＦ１３、ＦＧＦ１４、ＦＧＦ１６、ＦＧＦ１７、ＦＧＦ１８、ＦＧＦ１９、ＦＧＦ２（ｂＦＧＦ）、ＦＧＦ２０、ＦＧＦ２１、ＦＧＦ２２、ＦＧＦ２３、ＦＧＦ３（ｉｎｔ−２）、ＦＧＦ４（ＨＳＴ）、ＦＧＦ５、ＦＧＦ６（ＨＳＴ−２）、ＦＧＦ７（ＫＧＦ）、ＦＧＦ８、ＦＧＦ９、ＦＧＦＲ３、ＦＩＧＦ（ＶＥＧＦＤ）、ＦＩＬｌ（ＥＰＳＩＬＯＮ）、ＦＢＬｌ（ＺＥＴＡ）、ＦＬＪ１２５８４、ＦＬＪ２５５３０、ＦＬＲＴｌ（フィブロネクチン）、ＦＬＴｌ、ＦＬＴ−３、ＦＯＳ、ＦＯＳＬｌ（ＦＲＡ−Ｉ）、ＦＹ（ＤＡＲＣ）、ＧＡＢＲＰ（ＧＡＢＡａ）、ＧＡＧＥＢｌ、ＧＡＧＥＣｌ、ＧＡＬＮＡＣ���Ｓ−６ＳＴ、ＧＡＴＡ３、ＧＤ２、ＧＤ３、ＧＤＦ５、ＧＤＦ８、ＧＦＩｌ、ＧＧＴｌ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＧＮＡＳｌ、ＧＮＲＨｌ、ＧＰＲ２（ＣＣＲｌＯ）、ＧＰＲ３１、ＧＰＲ４４、ＧＰＲ８１（ＦＫＳＧ８０）、ＧＲＣＣｌＯ（ＣｌＯ）、ｇｒｅｍｌｉｎ、ＧＲＰ、ＧＳＮ（ゲルゾリン）、ＧＳＴＰｌ、ＨＡＶＣＲ２、ＨＤＡＣ、ＨＤＡＣ４、ＨＤＡＣ５、ＨＤＡＣ７Ａ、ＨＤＡＣ９、ヘッジホッグ、ＨＧＦ、ＨＩＦｌＡ、ＨＩＰｌ、ヒスタミンおよびヒスタミン受容体、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−ＤＲＡ、ＨＭ７４、ＨＭＯＸｌ、ＨＳＰ９０、ＨＵＭＣＹＴ２Ａ、ＩＣＥＢＥＲＧ、ＩＣＯＳＬ、ＩＤ２、ＩＦＮ−ａ、ＩＦＮＡｌ、ＩＦＮＡ２、ＩＦＮＡ４、ＩＦＮＡ５、ＥＦＮＡ６、ＢＦＮＡ７、ＩＦＮＢｌ、ＩＦＮガンマ、ＩＦＮＷｌ、ＩＧＢＰｌ、ＩＧＦｌ、ＩＧＦｌＲ、ＩＧＦ２、ＩＧＦＢＰ２、ＩＧＦＢＰ３、ＩＧＦＢＰ６、ＤＬ−Ｉ、ＩＬｌＯ、ＩＬｌＯＲＡ、ＩＬｌＯＲＢ、ＩＬ−１、ＩＬｌＲｌ（ＣＤ１２１ａ）、ＩＬｌＲ２（ＣＤ１２１ｂ）、ＩＬ−ＩＲＡ、ＩＬ−２、ＩＬ２ＲＡ（ＣＤ２５）、ＩＬ２ＲＢ（ＣＤ１２２）、ＩＬ２ＲＧ（ＣＤ１３２）、ＩＬ−４、ＩＬ−４Ｒ（ＣＤ１２３）、ＩＬ−５、ＩＬ５ＲＡ（ＣＤ１２５）、ＩＬ３ＲＢ（ＣＤ１３１）、ＩＬ−６、ＩＬ６ＲＡ（ＣＤ１２６）、ＩＲ６ＲＢ（ＣＤ１３０）、ＩＬ−７、ＩＬ７ＲＡ（ＣＤ１２７）、ＩＬ−８、ＣＸＣＲｌ（ＩＬ８ＲＡ）、ＣＸＣＲ２（ＩＬ８ＲＢ／ＣＤ１２８）、ＩＬ−９、ＩＬ９Ｒ（ＣＤ１２９）、ＩＬ−１０、ＩＬ１０ＲＡ（ＣＤ２１０）、ＩＬ１０ＲＢ（ＣＤＷ２１０Ｂ）、ＩＬ−１１、ＩＬｌ  ＩＲＡ、ＩＬ−１２、ＩＬ−１２Ａ、ＩＬ−１２Ｂ、ＩＬ−１２ＲＢ１、ＩＬ−１２ＲＢ２、ＩＬ−１３、ＩＬ１３ＲＡ１、ＩＬ１３ＲＡ２、ＩＬ１４、ＩＬ１５、ＩＬ１５ＲＡ、１Ｌ１６、ＩＬ１７、ＩＬ１７Ａ、ＩＬ１７Ｂ、ＩＬ１７Ｃ、ＩＬ１７Ｒ、ＩＬ１８、ＩＬ１８ＢＰ、ＩＬ１８Ｒ１、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＬ１９、ＩＬＩＡ、ＩＬｌＢ、ＩＬｌＦｌＯ、ＩＬ１Ｆ５、ＩＬ１Ｆ６、ＩＬ１Ｆ７、ＩＬ１Ｆ８、ＤＬ１Ｆ９、ＩＬｌＨＹｌ、ＩＬｌＲｌ、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬｌＲＡＰ、ＩＬｌＲＡＰＬｌ、ＩＬ１ＲＡＰＬ２、ＩＬｌＲＬｌ、ＩＬ１ＲＬ２、ＩＬｌＲＮ、ＩＬ２、ＩＬ２０、ＩＬ２０ＲＡ、ＩＬ２１Ｒ、ＩＬ２２、ＩＬ２２Ｒ、ＩＬ２２ＲＡ２、ＩＬ２３、ＤＬ２４、ＩＬ２５、ＩＬ２６、ＩＬ２７、ＩＬ２８Ａ、ＩＬ２８Ｂ、ＩＬ２９、ＩＬ２ＲＡ、ＩＬ２ＲＢ、ＩＬ２ＲＧ、ＩＬ３、ＩＬ３０、ＩＬ３ＲＡ、ＩＬ４、ＩＬ４Ｒ、ＩＬ６ＳＴ（糖タンパク質１３０）、ＩＬＫ、ＩＮＨＡ、ＩＮＨＢＡ、ＩＮＳＬ３、ＩＮＳＬ４、ＩＲＡＫＩ、ＩＲＡＫ２、ＩＴＧＡ１、ＩＴＧＡ２、ＩＴＧＡ３、ＩＴＧＡ６（アルファ６インテグリン）、ＩＴＧＡＶ、ＩＴＧＢ３、ＩＴＧＢ４（ベータ４インテグリン）、ＪＡＧｌ、ＪＡＫｌ、ＪＡＫ３、ＪＴＢ、ＪＵＮ、Ｋ６ＨＦ、ＫＡＩｌ、ＫＤＲ、ＫＩＭ−１、ＫＩＴＬＧ、ＫＬＦ５（ＧＣボックスＢＰ）、ＫＬＦ６、ＫＬＫｌＯ、ＫＬＫ１２、ＫＬＫ１３、ＫＬＫ１４、ＫＬＫ１５、ＫＬＫ３、ＫＬＫ４、ＫＬＫ５、ＫＬＫ６、ＫＬＫ９、ＫＲＴｌ、ＫＲＴ１９（ケラチン１９）、ＫＲＴ２Ａ、ＫＲＴＨＢ６（毛髪特異的ＩＩ型ケラチン）、ＬＡＭＡ５、Ｌ��Ｐ（レプチン）、Ｌｉｎｇｏ−ｐ７５、Ｌｉｎｇｏ−Ｔｒｏｙ、ＬＰＳ、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６、ＬＴＡ（ＴＮＦ−ｂ）、ＬＴＢ、ＬＴＢ４Ｒ（ＧＰＲ１６）、ＬＴＢ４Ｒ２、ＬＴＢＲ、ＭＡＣＭＡＲＣＫＳ、ＭＡＧまたはＯｍｇｐ、ＭＡＰ２Ｋ７（ｃ−Ｊｕｎ）、ＭＣＰ−Ｉ、ＭＤＫ、ＭＩＢｌ、ミドカイン、ＭＩＦ、ＭＩＳＲＩＩ、ＭＪＰ−２、ＭＫ、ＭＫＩ６７（Ｋｉ−６７）、ＭＭＰ２、ＭＭＰ９、ＭＳ４Ａ１、ＭＳＭＢ、ＭＴ３（メタロチオネクチン−Ｕｉ）、ｍＴＯＲ、ＭＴＳＳｌ、ＭＵＣｌ（ムチン）、ＭＹＣ、ＭＹＤ８８、ＮＣＫ２、ニューロカン、ニューレグリン−１、ニューロピリン−１、ＮＦＫＢｌ、ＮＦＫＢ２、ＮＧＦＢ（ＮＧＦ）、ＮＧＦＲ、ＮｇＲ−Ｌｉｎｇｏ、ＮｇＲ−Ｎｏｇｏ６６（Ｎｏｇｏ）、ＮｇＲ−ｐ７５、ＮｇＲ−Ｔｒｏｙ、ＮＭＥｌ（ＮＭ２３Ａ）、ＮＯＴＣＨ、ＮＯＴＣＨｌ、Ｎ０Ｘ５、ＮＰＰＢ、ＮＲＯＢｌ、ＮＲ０Ｂ２、ＮＲｌＤｌ、ＮＲ１Ｄ２、ＮＲ１Ｈ２、ＮＲ１Ｈ３、ＮＲ１Ｈ４、ＮＲ１Ｉ２、ＮＲ１Ｉ３、ＮＲ２Ｃ１、ＮＲ２Ｃ２、ＮＲ２Ｅ１、ＮＲ２Ｅ３、ＮＲ２Ｆ１、ＮＲ２Ｆ２、ＮＲ２Ｆ６、ＮＲ３Ｃ１、ＮＲ３Ｃ２、ＮＲ４Ａ１、ＮＲ４Ａ２、ＮＲ４Ａ３、ＮＲ５Ａ１、ＮＲ５Ａ２、ＮＲ６Ａ１、ＮＲＰｌ、ＮＲＰ２、ＮＴ５Ｅ、ＮＴＮ４、ＯＣＴ−１、ＯＤＺ１、ＯＰＮ１、ＯＰＮ２、ＯＰＲＤｌ、Ｐ２ＲＸ７、ＰＡＰ、ＰＡＲＴｌ、ＰＡＴＥ、ＰＡＷＲ、ＰＣＡ３、ＰＣＤＧＦ、ＰＣＮＡ、ＰＤＧＦＡ、ＰＤＧＦＢ、ＰＤＧＦＲＡ、ＰＤＧＦＲＢ、ＰＥＣＡＭｌ、ｐｅｇ−アスパラギナーゼ、ＰＦ４（ＣＸＣＬ４）、Ｐｌｅｘｉｎ  Ｂ２（ＰＬＸＮＢ２）、ＰＧＦ、ＰＧＲ、ホスファカン、ＰＩＡＳ２、ＰＩ３キナーゼ、ＰＩＫ３ＣＧ、ＰＬＡＵ（ｕＰＡ）、ＰＬＧ５ＰＬＸＤＣｌ、ＰＫＣ、ＰＫＣ−ベータ、ＰＰＢＰ（ＣＸＣＬ７）、ＰＰＩＤ、ＰＲｌ、ＰＲＫＣＱ、ＰＲＫＤｌ、ＰＲＬ、ＰＲＯＣ、ＰＲＯＫ２、ｐｒｏ−ＮＧＦ、プロサポシン、ＰＳＡＰ、ＰＳＣＡ、ＰＴＡＦＲ、ＰＴＥＮ、ＰＴＧＳ２（ＣＯＸ−２）、ＰＴＮ、ＲＡＣ２（Ｐ２１Ｒａｃ２）、ＲＡＮＫ、ＲＡＮＫリガンド、ＲＡＲＢ、ＲＧＳｌ、ＲＧＳ１３、ＲＧＳ３、ＲＮＦＩ１０（ＺＮＦ１４４）、Ｒｏｎ、Ｒ０Ｂ０２、ＲＸＲ、セレクチン、Ｓ１００Ａ２、Ｓ１００Ａ８、Ｓ１００Ａ９、ＳＣＧＢ  １Ｄ２（リポフィリンＢ）、ＳＣＧＢ２Ａ１（マンマグロビン２）、ＳＣＧＢ２Ａ２（マンマグロビン１）
、ＳＣＹＥｌ（内皮単球活性化サイトカイン）、ＳＤＦ２、ＳＥＲＰＥＮＡ１、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＥＲＰＩＮＢ５（マスピン）、ＳＥＲＰＩＮＥｌ（ＰＡＩ−Ｉ）、ＳＥＲＰＩＮＦｌ、ＳＨＩＰ−Ｉ、ＳＨＩＰ−２、ＳＨＢｌ、ＳＨＢ２、ＳＨＢＧ、ＳｆｃＡＺ、ＳＬＣ２Ａ２、ＳＬＣ３３Ａ１、ＳＬＣ４３Ａ１、ＳＬＩＴ２、ＳＰＰｌ、ＳＰＲＲｌＢ（Ｓｐｒｌ）、ＳＴ６ＧＡＬ１、ＳＴＡＢｌ、ＳＴＡＴ６、ＳＴＥＡＰ、ＳＴＥＡＰ２、ＳＵＬＦ−１、Ｓｕｌｆ−２、ＴＢ４Ｒ２、ＴＢＸ２１、ＴＣＰｌＯ、ＴＤＧＦｌ、ＴＥＫ、ＴＧＦＡ、ＴＧＦＢｌ、ＴＧＦＢｌＩｌ、ＴＧＦＢ２、ＴＧＦＢ３、ＴＧＦＢＩ、ＴＧＦＢＲｌ、ＴＧＦＢＲ２、ＴＧＦＢＲ３、ＴＨｌＬ、ＴＨＢＳｌ（トロンボスポンジン−１）、ＴＨＢＳ２／ＴＨＢＳ４、ＴＨＰＯ、ＴＩＥ（Ｔｉｅ−１）、ＴＩＭＰ３、組織因子、ＴＩＫＩ２、ＴＬＲ１０、ＴＬＲ２、ＴＬＲ３、ＴＬＲ４、ＴＬＲ５、ＴＬＲ６ＪＬＲ７、ＴＬＲ８、ＴＬＲ９、ＴＭ４ＳＦ１、ＴＮＦ、ＴＮＦ−ａ、ＴＮＦＡＩＰ２（Ｂ９４）、ＴＮＦＡＩＰ３、ＴＮＦＲＳＦＩｌＡ、ＴＮＦＲＳＦｌＡ、ＴＮＦＲＳＦｌＢ、ＴＮＦＲＳＦ２１、ＴＮＦＲＳＦ５、ＴＮＦＲＳＦ６（Ｆａｓ）、ＴＮＦＲＳＦ７、ＴＮＦＲＳＦ８、ＴＮＦＲＳＦ９、ＴＮＦＳＦｌＯ（ＴＲＡＩＬ）、ＴＮＦＳＦｌ  １（ＴＲＡＮＣＥ）、ＴＮＦＳＦ１２（ＡＰ０３Ｌ）、ＴＮＦＳＦ１３（Ａｐｒｉｌ）、ＴＮＦＳＦ１３Ｂ、ＴＮＦＳＦ１４（ＨＶＥＭ−Ｌ）、ＴＮＦＳＦ１５（ＶＥＧＩ）、ＴＮＦＳＦ  １８、ＴＮＦＳＦ４（ＯＸ４０リガンド）、ＴＮＦＳＦ５（ＣＤ４０リガンド）、ＴＮＦＳＦ６（ＦａｓＬ）、ＴＮＦＳＦ７（ＣＤ２７リガンド）、ＴＮＦＳＦ８（ＣＤ３０リガンド）、ＴＮＦＳＦ９（４−１ＢＢリガンド）、ＴＯＬＬＩＰ、Ｔｏｌｌ様受容体、ＴＬＲ２、ＴＬＲ４、ＴＬＲ９、Ｔ０Ｐ２Ａ（トポイソメラーゼＩｉａ）、ＴＰ５３、ＴＰＭｌ、ＴＰＭ２、ＴＲＡＤＤ、ＴＲＡＦｌ、ＴＲＡＦ２、ＴＲＡＦ３、ＴＲＡＦ４、ＴＲＡＦ５、ＴＲＡＦ６、ＴＲＫＡ、ＴＲＥＭｌ、ＴＲＥＭ２、ＴＲＰＣ６、ＴＲＯＹ、ＴＳＬＰ、ＴＷＥＡＫ、チロシナーゼ、ｕＰＡＲ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＢ、ＶＥＧＦＣ、バーシカン、ＶＨＬ  Ｃ５、ＶＬＡ−４、Ｗｎｔ−１、ＸＣＬｌ（リンホタクチン）、ＸＣＬ２（ＳＣＭ−Ｉｂ）、ＸＣＲｌ（ＧＰＲ５／ＣＣＸＣＲｌ）、ＹＹｌ、およびＺＦＰＭ２から選択される１つまたは複数の標的に結合することができる。
【０２７７】
操作されたＦｃ融合タンパク質
別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを、前記一覧中の任意のタンパク質の一部に融合させる／共有結合させるか、またはＦｃポリペプチドを、前記一覧中のタンパク質に特異的に結合する任意の受容体もしくはリガンドに融合させる／共有結合させることができる。一態様において、本発明は、上記で列挙されたタンパク質、またはその同族リガンドもしくは受容体に結合するタンパク質の一部と融合した操作されたＦｃポリペプチドを含むＦｃポリペプチド融合タンパク質を包含する。例えば、アバタセプトおよびベタネルセプトは、それぞれ、ＣＴＬＡ４およびＴＮＦＲ２の一部を含むＦｃ融合タンパク質である。したがって、本発明は、Ｆｃが本発明の操作されたＦｃポリペプチドであり、ＣＴＬＲ４がその同種抗原、例えば、ＣＤ８０（Ｂ７−１）およびＣＤ８６（Ｂ７−２）に結合することができるＣＴＬＡ４の細胞外ドメインである、ＣＴＬＡ４−Ｆｃ融合タンパク質（アバタセプト；ＯＲＥＮＣＩＡ（商標））を含む融合タンパク質を包含する。同様に、本発明は、Ｆｃが本発明の操作されたＦｃポリペプチドであるＴＮＦアルファに結合するＴＮＦＲ２−Ｆｃ融合タンパク質（エタネルセプト；ＥＮＢＲＥＬ（商標））；Ｆｃが本発明の操作されたＦｃポリペプチドであるＣＤ２に結合するＬＦＡ３の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を含むＦｃ融合タンパク質（アレファセプト；ＡＭＥＶＩＶＥ（商標））；およびＦｃが本発明の操作されたＦｃポリペプチドであるトロンボポエチン受容体に結合するトロンボポエチン受容体結合ペプチド（ロミプロスチム）を含むＦｃ融合タンパク質を包含する。本発明は、いかなる意味でもこれらの特定の実施形態に限定されないが、むしろ、本発明の操作されたＦｃポリペプチドと融合した対象の任意のタンパク質を含む様々なＦｃ融合タンパク質を包含する。
【０２７８】
一実施形態において、本発明は、以下のタンパク質のいずれか、またはその結合部分と融合した操作されたＦｃポリペプチドを含む融合タンパク質を包含する：ＰＤＧＦＲアルファ、ＰＤＧＦＲベータ、ＰＤＧＦ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＶＥＧＦ−Ｅ、ＶＥＧＦ−Ｆ、ＶＥＧＦＲ−Ｉ、ＶＥＧＦＲ−２、ＶＥＧＦＲ−３、ＦＧＦ、ＦＧＦ２、ＨＧＦ、ＫＤＲ、ｆｌｔ−１、ＦＬＫ−１、Ａｎｇ−２、Ａｎｇ−１、ＰＬＧＦ、ＣＥＡ、ＣＸＣＬ１３、Ｂａｆｆ、ＩＬ−２１、ＣＣＬ２１、ＴＮＦ−アルファ、ＣＸＣＬ１２、ＳＤＦ−Ｉ、ｂＦＧＦ、ＭＡＣ−Ｉ、ＩＬ２３ｐｌ９、ＦＰＲ、ＩＧＦＢＰ４、ＣＸＣＲ３、ＴＬＲ４、ＣＸＣＲ２、ＥｐｈＡ２、ＥｐｈＡ４、ＥｐｈｒｉｎＢ２、ＥＧＦＲ（ＥｒｂＢｌ）、ＨＥＲ２（ＥｒｂＢ２またはｐｌ８５ｎｅｕ）、ＨＥＲ３（ＥｒｂＢ３）、ＨＥＲ４  ＥｒｂＢ４またはｔｙｒｏ２）、ＳＣｌ、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６、ＲＡＧＥ、Ｎａｖｌ．７、ＧＬＰｌ、ＲＳＶ、ＲＳＶ  Ｆタンパク質、インフルエンザＨＡタンパク質、インフルエンザＮＡタンパク質、ＨＭＧＢｌ、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２８、ＣＤ３２、ＣＤ３２ｂ、ＣＤ６４、ＣＤ７９、ＣＤ２２、ＩＣＡＭ−１、ＦＧＦＲ１、ＦＧＦＲ２、ＨＤＧＦ、ＥｐｈＢ４、ＧＩＴＲ、ベータ−アミロイド、ｈＭＰＶ、ＰＩＶ−１、ＰＩＶ−２、ＯＸ４０Ｌ、ＩＧＦＢＰ３、ｃＭｅｔ、ＰＤ−１、ＰＬＧＦ、ネプリライシン、ＣＴＤ、ＩＬ−１８、ＩＬ−６、ＣＸＣＬ−１３、ＩＬ−１Ｒ１、ＩＬ−１５、ＩＬ−４Ｒ、ＩｇＥ、ＰＡＩ−Ｉ、ＮＧＦ、ＥｐｈＡ２、ｕＰＡＲｔ、ＤＬＬ−４、αｖβ５、αｖβ６、α５β１、α３β１、インターフェロン受容体Ｉ型およびＩＩ型、ＣＤ  １９、ＩＣＯＳ、ＩＬ−１７、第ＩＩ因子、Ｈｓｐ９０、ＩＧＦ、ＩＧＦ−Ｉ、ＩＧＦ−ＩＩ、ＣＤ１９、ＧＭ−ＣＳＦＲ、ＰＩＶ−３、ＣＭＶ、ＩＬ−１３、ＩＬ−９、およびＥＢＶ、ＴＮＦ−アルファ、ＴＮＦ−ベータ、ＬＴ−アルファ、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ２７Ｌ、ＣＤ４０Ｌ、４−１  ＢＢＬ、Ａｐｏ−１リガンド（ＦａｓリガンドまたはＣＤ９５リガンドとも呼ばれる）、Ａｐｏ−２リガンド（ＴＲＡＩＬとも呼ばれる）、Ａｐｏ−３リガンド（ＴＷＥＡＫとも呼ばれる）、オステオプロテゲリン（ＯＰＧ）、ＡＰＲＩＬ、ＲＡＮＫＬ（ＴＲＡＮＣＥとも呼ばれる）、ＴＡＬＬ−Ｉ（ＢｌｙＳ、ＢＡＦＦまたはＴＨＡＮＫとも呼ばれる）、ＤＲ４、ＤＲ５（Ａｐｏ−２、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＴＲ６、Ｔａｎｇｏ−６３、ｈＡＰＯ８、ＴＲＩＣＫ２、またはＫＩＬＬＥＲとしても知られる）、ＤＲ６、ＤｃＲＩ、ＤｃＲ２、ＤｃＲ３（ＴＲ６またはＭ６８としても知られる）、ＣＡＲＩ、ＨＶＥＭ（ＡＴＡＲまたはＴＲ２としても知られる）、ＧＩＴＲ、ＺＴＮＦＲ−５、ＮＴＲ−１、ＴＮＦＬ１、ＣＤ３０、ＬＴＢｒ、４−１ＢＢ受容体およびＴＲ９。
【０２７９】
別の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含むＦｃ融合物は、５Ｔ４、ＡＢＬ、ＡＢＣＢ５、ＡＢＣＦｌ、ＡＣＶＲｌ、ＡＣＶＲｌＢ、ＡＣＶＲ２、ＡＣＶＲ２Ｂ、ＡＣＶＲＬｌ、ＡＤ０ＲＡ２Ａ、アグレカン、ＡＧＲ２、ＡＩＣＤＡ、ＡＩＦＩ、ＡＩＧｌ、ＡＫＡＰｌ、ＡＫＡＰ２、ＡＭＨ、ＡＭＨＲ２、アンギオゲニン（ＡＮＧ）、ＡＮＧＰＴｌ、ＡＮＧＰＴ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＡＮＧＰＴＬ４、アネキシンＡ２、ＡＮＰＥＰ、ＡＰＣ、ＡＰＯＣｌ、ＡＲ、アロマターゼ、ＡＴＸ、ＡＸｌ、ＡＺＧＰｌ（亜鉛−ａ−糖タンパク質）、Ｂ７．１、Ｂ７．２、Ｂ７−Ｈ１、ＢＡＤ、ＢＡＦＦ、ＢＡＧｌ、ＢＡＩｌ、ＢＣＲ、ＢＣＬ２、ＢＣＬ６、ＢＤＮＦ、ＢＬＮＫ、ＢＬＲｌ（ＭＤＲ１５）、ＢＩｙＳ、ＢＭＰｌ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ３Ｂ（ＧＤＦｌＯ）、ＢＭＰ４、ＢＭＰ６、ＢＭＰ８、ＢＭＰＲｌＡ、ＢＭＰＲｌＢ、ＢＭＰＲ２、ＢＰＡＧｌ（プレクチン）、ＢＲＣＡｌ、Ｃ１９ｏｒｆｌＯ（ＩＬ２７ｗ）、Ｃ３、Ｃ４Ａ、Ｃ５、Ｃ５Ｒ１、ＣＡＮＴ１、ＣＡＳＰ１ｌ、ＣＡＳＰ４、ＣＡＶｌ、ＣＣＢＰ２（Ｄ６／ＪＡＢ６１）、ＣＣＬｌ（１−３０９）、ＣＣＬＩ  １（エオタキシン）、ＣＣＬ１３（ＭＣＰ−４）、ＣＣＬ１５（ＭＩＰ−Ｉｄ）、ＣＣＬ１６（ＨＣＣ−４）、ＣＣＬ１７（ＴＡＲＣ）、ＣＣＬ１８（ＰＡＲＣ）、ＣＣＬ１９（ＭＩＰ−３ｂ）、ＣＣＬ２（ＭＣＰ−１）、ＭＣＡＦ、ＣＣＬ２０（ＭＩＰ−３ａ）、ＣＣＬ２１（ＭＥＰ−２）、ＳＬＣ、エクソダス−２、ＣＣＬ２２（ＭＤＣ／ＳＴＣ−１）、ＣＣＬ２３（ＭＰＩＦ−１）、ＣＣＬ２４（ＭＰＩＦ−２／エオタキシン−２）、ＣＣＬ２５（ＴＥＣＫ）、ＣＣＬ２６（エオタキシン−３）、ＣＣＬ２７（ＣＴＡＣＫ／ＩＬＣ）、ＣＣＬ２８、ＣＣＬ３（ＭＩＰ−Ｉａ）、ＣＣＬ４（ＭＩＰ−Ｉｂ）、ＣＣＬ５（ＲＡＮＴＥＳ）、ＣＣＬ７（ＭＣＰ−３）、ＣＣＬ８（ｍｃｐ−２）、ＣＣＮＡｌ、ＣＣＮＡ２、ＣＣＮＤｌ、ＣＣＮＥｌ、ＣＣＮＥ２、ＣＣＲ１（ＣＫＲ１／ＨＭ１４５）、ＣＣＲ２（ｍｃｐ−ＩＲＢ／ＲＡ）、ＣＣＲ３（ＣＫＲ３／ＣＭＫＢＲ３）、ＣＣＲ４、ＣＣＲ５（ＣＭＫＢＲ５／ＣｈｅｍＲ１３）、ＣＣＲ６（ＣＭＫＢＲ６／ＣＫＲ−Ｌ３／ＳＴＲＬ２２／ＤＲＹ６）、ＣＣＲ７（ＣＫＲ７／ＥＢＩ１）、ＣＣＲ８（ＣＭＫＢＲ８／ＴＥＲ１／ＣＫＲ−Ｌ１）、ＣＣＲ９（ＧＰＲ−９−６）、ＣＣＲＬｌ（ＶＳＨＫｌ）、ＣＣＲＬ２（Ｌ−ＣＣＲ）、ＣＤ１６４、ＣＤ１９、ＣＤｌＣ、ＣＤ２０、ＣＤ２００、ＣＤ−２２、ＣＤ２４、ＣＤ２８、ＣＤ３、ＣＤ３３、ＣＤ３５、ＣＤ３７、ＣＤ３８、ＣＤ３Ｅ、ＣＤ３Ｇ、ＣＤ３Ｚ、ＣＤ４、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ４４、ＣＤ４５ＲＢ、ＣＤ４６、ＣＤ５２、ＣＤ６９、ＣＤ７２、ＣＤ７４、ＣＤ７９Ａ、ＣＤ７９Ｂ、ＣＤ８、ＣＤ８０、ＣＤ８１、ＣＤ８３、ＣＤ８６、ＣＤ１０５、ＣＤ１３７、ＣＤＨｌ（Ｅ−カドヘリン）、ＣＤＣＰ１ＣＤＨ１０、ＣＤＨ１２、ＣＤＨ１３、ＣＤＨ１８、ＣＤＨ１９、ＣＤＨ２０、ＣＤＨ５、ＣＤＨ７、ＣＤＨ８、ＣＤＨ９、ＣＤＫ２、ＣＤＫ３、ＣＤＫ４、ＣＤＫ５、ＣＤＫ６、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫＮｌＡ（ｐ２１Ｗａｐｌ／Ｃｉｐｌ）、ＣＤＫＮｌＢ（ｐ２７Ｋｉｐｌ）、ＣＤＫＮｌＣ、ＣＤＫ���２Ａ（ｐｌ６ＩＮＫ４ａ）、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ３、ＣＥＢＰＢ、ＣＥＲｌ、ＣＨＧＡ、ＣＨＧＢ、キチナーゼ、ＣＨＳＴｌＯ、ＣＫＬＦＳＦ２、ＣＫＬＦＳＦ３、ＣＫＬＦＳＦ４、ＣＫＬＦＳＦ５、ＣＫＬＦＳＦ６、ＣＫＬＦＳＦ７、ＣＫＬＦＳＦ８、ＣＬＤＮ３、ＣＬＤＮ７（クラウジン−７）、ＣＬＮ３、ＣＬＵ（クラステリン）、ＣＭＫＬＲｌ、ＣＭＫＯＲｌ（ＲＤＣｌ）、ＣＮＲｌ、ＣＯＬｌ  ８Ａｌ、ＣＯＬ１Ａ１．ＣＯＬ４Ａ３、ＣＯＬ６Ａ１、ＣＲ２、Ｃｒｉｐｔｏ、ＣＲＰ、ＣＳＦｌ（Ｍ−ＣＳＦ）、ＣＳＦ２（ＧＭ−ＣＳＦ）、ＣＳＦ３（ＧＣＳＦ）、ＣＴＬＡ４、ＣＴＬ８、ＣＴＮＮＢｌ（ｂ−カテニン）、ＣＴＳＢ（カテプシンＢ）、ＣＸ３ＣＬ１（ＳＣＹＤｌ）、ＣＸ３ＣＲ１（Ｖ２８）、ＣＸＣＬｌ（ＧＲＯｌ）、ＣＸＣＬｌＯ（ＩＰ−ＩＯ）、ＣＸＣＬＩｌ（Ｉ−ＴＡＣ／ＩＰ−９）、ＣＸＣＬ１２（ＳＤＦｌ）、ＣＸＣＬ１３、ＣＸＣＬ  １４、ＣＸＣＬ  １６、ＣＸＣＬ２（ＧＲ０２）、ＣＸＣＬ３（ＧＲ０３）、ＣＸＣＬ５（ＥＮＡ−７８／ＬＩＸ）、ＣＸＣＬ６（ＧＣＰ−２）、ＣＸＣＬ９（ＭＩＧ）、ＣＸＣＲ３（ＧＰＲ９／ＣＫＲ−Ｌ２）、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ６（ＴＹＭＳＴＲ／ＳＴＲＬ３３／Ｂｏｎｚｏ）、ＣＹＢ５、ＣＹＣｌ、Ｃｙｒ６１、ＣＹＳＬＴＲｌ、ｃ−Ｍｅｔ、ＤＡＢ２ＩＰ、ＤＥＳ、ＤＫＦＺｐ４５１Ｊ０１１８、ＤＮＣＬｌ、ＤＰＰ４、Ｅ２Ｆ１、ＥＣＧＦｌ５ＥＤＧｌ、ＥＦＮＡｌ、ＥＦＮＡ３、ＥＦＮＢ２、ＥＧＦ、ＥＧＦＲ、ＥＬＡＣ２、ＥＮＧ、エンドグリン、ＥＮＯｌ、ＥＮ０２、ＥＮ０３、ＥＰＨＡｌ、ＥＰＨＡ２、ＥＰＨＡ３、ＥＰＨＡ４、ＥＰＨＡ５、ＥＰＨＡ６、ＥＰＨＡ７、ＥＰＨＡ８、ＥＰＨＡ９、ＥＰＨＡ１０、ＥＰＨＢｌ、ＥＰＨＢ２、ＥＰＨＢ３、ＥＰＨＢ４、ＥＰＨＢ５、ＥＰＨＢ６、ＥＰＨＲＩＮ−Ａｌ、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ２、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ３、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ４、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ５、ＥＰＨＲＩＮ−Ａ６、ＥＰＨＲＩＮ−Ｂｌ、ＥＰＨＲＩＮ−Ｂ２、ＥＰＨＲＴＮ−Ｂ３、ＥＰＨＢ４、ＥＰＧ、ＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ−２）、ＥＲＥＧ、ＥＲＫ８、エストロゲン受容体、ＥＳＲｌ、ＥＳＲ２、Ｆ３（ＴＦ）、ＦＡＤＤ、ファルネシルトランスフェラーゼ、ＦａｓＬ、ＦＡＳＮｆ、ＦＣＥＲ１Ａ、ＦＣＥＲ２、ＦＣＧＲ３Ａ、ＦＧＦ、ＦＧＦｌ（ａＦＧＦ）、ＦＧＦｌＯ、ＦＧＦｌ  １、ＦＧＦ１２、ＦＧＦ１２Ｂ、ＦＧＦ１３、ＦＧＦ１４、ＦＧＦ１６、ＦＧＦ１７、ＦＧＦ１８、ＦＧＦ１９、ＦＧＦ２（ｂＦＧＦ）、ＦＧＦ２０、ＦＧＦ２１、ＦＧＦ２２、ＦＧＦ２３、ＦＧＦ３（ｉｎｔ−２）、ＦＧＦ４（ＨＳＴ）、ＦＧＦ５、ＦＧＦ６（ＨＳＴ−２）、ＦＧＦ７（ＫＧＦ）、ＦＧＦ８、ＦＧＦ９、ＦＧＦＲ３、ＦＩＧＦ（ＶＥＧＦＤ）、ＦＩＬｌ（ＥＰＳＩＬＯＮ）、ＦＢＬｌ（ＺＥＴＡ）、ＦＬＪ１２５８４、ＦＬＪ２５５３０、ＦＬＲＴｌ（フィブロネクチン）、ＦＬＴｌ、ＦＬＴ−３、ＦＯＳ、ＦＯＳＬｌ（ＦＲＡ−Ｉ）、ＦＹ（ＤＡＲＣ）、ＧＡＢＲＰ（ＧＡＢＡａ）、ＧＡＧＥＢｌ、ＧＡＧＥＣｌ、ＧＡＬＮＡＣ４Ｓ−６ＳＴ、ＧＡＴＡ３、ＧＤ２、ＧＤ３、ＧＤＦ５、ＧＦＩｌ、ＧＧＴｌ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＧＮＡＳｌ、ＧＮＲＨｌ、ＧＰＲ２（ＣＣＲｌＯ）、ＧＰＲ３１、ＧＰＲ��４、ＧＰＲ８１（ＦＫＳＧ８０）、ＧＲＣＣ１０（Ｃ１０）、ＧＲＰ、ＧＳＮ（ゲルゾリン）、ＧＳＴＰｌ、ＨＡＶＣＲ２、ＨＤＡＣ、ＨＤＡＣ４、ＨＤＡＣ５、ＨＤＡＣ７Ａ、ＨＤＡＣ９、ヘッジホッグ、ＨＧＦ、ＨＩＦｌＡ、ＨＩＰｌ、ヒスタミンおよびヒスタミン受容体、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−ＤＲＡ、ＨＭ７４、ＨＭＯＸｌ、ＨＳＰ９０、ＨＵＭＣＹＴ２Ａ、ＩＣＥＢＥＲＧ、ＩＣＯＳＬ、ＩＤ２、ＩＦＮ−ａ、ＩＦＮＡｌ、ＩＦＮＡ２、ＩＦＮＡ４、ＩＦＮＡ５、ＥＦＮＡ６、ＢＦＮＡ７、ＩＦＮＢｌ、ＩＦＮガンマ、ＩＦＮＷｌ、ＩＧＢＰｌ、ＩＧＦｌ、ＩＧＦｌＲ、ＩＧＦ２、ＩＧＦＢＰ２、ＩＧＦＢＰ３、ＩＧＦＢＰ６、ＤＬ−Ｉ、ＩＬｌＯ、ＩＬｌＯＲＡ、ＩＬｌＯＲＢ、ＩＬ−１、ＩＬｌＲｌ（ＣＤ１２１ａ）、ＩＬｌＲ２（ＣＤ１２１ｂ）、ＩＬ−ＩＲＡ、ＩＬ−２、ＩＬ２ＲＡ（ＣＤ２５）、ＩＬ２ＲＢ（ＣＤ１２２）、ＩＬ２ＲＧ（ＣＤ１３２）、ＩＬ−４、ＩＬ−４Ｒ（ＣＤ１２３）、ＩＬ−５、ＩＬ５ＲＡ（ＣＤ１２５）、ＩＬ３ＲＢ（ＣＤ１３１）、ＩＬ−６、ＩＬ６ＲＡ（ＣＤ１２６）、ＩＲ６ＲＢ（ＣＤ１３０）、ＩＬ−７、ＩＬ７ＲＡ（ＣＤ１２７）、ＩＬ−８、ＣＸＣＲｌ（ＩＬ８ＲＡ）、ＣＸＣＲ２（ＩＬ８ＲＢ／ＣＤ１２８）、ＩＬ−９、ＩＬ９Ｒ（ＣＤ１２９）、ＩＬ−１０、ＩＬ１０ＲＡ（ＣＤ２１０）、ＩＬ１０ＲＢ（ＣＤＷ２１０Ｂ）、ＩＬ−１１、ＩＬｌ  ＩＲＡ、ＩＬ−１２、ＩＬ−１２Ａ、ＩＬ−１２Ｂ、ＩＬ−１２ＲＢ１、ＩＬ−１２ＲＢ２、ＩＬ−１３、ＩＬ１３ＲＡ１、ＩＬ１３ＲＡ２、ＩＬ１４、ＩＬ１５、ＩＬ１５ＲＡ、１Ｌ１６、ＩＬ１７、ＩＬ１７Ａ、ＩＬ１７Ｂ、ＩＬ１７Ｃ、ＩＬ１７Ｒ、ＩＬ１８、ＩＬ１８ＢＰ、ＩＬ１８Ｒ１、ＩＬ１８ＲＡＰ、ＩＬ１９、ＩＬＩＡ、ＩＬｌＢ、ＩＬｌＦｌＯ、ＩＬ１Ｆ５、ＩＬ１Ｆ６、ＩＬ１Ｆ７、ＩＬ１Ｆ８、ＤＬ１Ｆ９、ＩＬｌＨＹｌ、ＩＬｌＲｌ、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬｌＲＡＰ、ＩＬｌＲＡＰＬｌ、ＩＬ１ＲＡＰＬ２、ＩＬｌＲＬｌ、ＩＬ１ＲＬ２、ＩＬｌＲＮ、ＩＬ２、ＩＬ２０、ＩＬ２０ＲＡ、ＩＬ２１Ｒ、ＩＬ２２、ＩＬ２２Ｒ、ＩＬ２２ＲＡ２、ＩＬ２３、ＤＬ２４、ＩＬ２５、ＩＬ２６、ＩＬ２７、ＩＬ２８Ａ、ＩＬ２８Ｂ、ＩＬ２９、ＩＬ２ＲＡ、ＩＬ２ＲＢ、ＩＬ２ＲＧ、ＩＬ３、ＩＬ３０、ＩＬ３ＲＡ、ＩＬ４、ＩＬ４Ｒ、ＩＬ６ＳＴ（糖タンパク質１３０）、ＩＬＫ、ＩＮＨＡ、ＩＮＨＢＡ、ＩＮＳＬ３、ＩＮＳＬ４、ＩＲＡＫＩ、ＩＲＡＫ２、ＩＴＧＡｌ、ＩＴＧＡ２、ＩＴＧＡ３、ＩＴＧＡ６（＜ｘ６インテグリン）、ＩＴＧＡＶ、ＩＴＧＢ３、ＩＴＧＢ４（ベータ４インテグリン）、ＪＡＧｌ、ＪＡＫｌ、ＪＡＫ３、ＪＴＢ、ＪＵＮ、Ｋ６ＨＦ、ＫＡＩｌ、ＫＤＲ、ＫＩＭ−１、ＫＩＴＬＧ、ＫＬＦ５（ＧＣボックスＢＰ）、ＫＬＦ６、ＫＬＫｌＯ、ＫＬＫ１２、ＫＬＫ１３、ＫＬＫ１４、ＫＬＫ１５、ＫＬＫ３、ＫＬＫ４、ＫＬＫ５、ＫＬＫ６、ＫＬＫ９、ＫＲＴｌ、ＫＲＴ１９（ケラチン１９）、ＫＲＴ２Ａ、ＫＲＴＨＢ６（毛髪特異的ＩＩ型ケラチン）、ＬＡＭＡ５、ＬＥＰ（レプチン）、Ｌｉｎｇｏ−ｐ７５、Ｌｉｎｇｏ−Ｔｒｏｙ、ＬＰＳ、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６、ＬＴＡ（ＴＮＦ−ｂ）、ＬＴＢ、ＬＴＢ４Ｒ（ＧＰＲ１６）、ＬＴＢ４Ｒ２、ＬＴＢＲ、ＭＡＣＭＡＲＣＫＳ、ＭＡＧまたはＯｍｇｐ、ＭＡＰ２Ｋ７（ｃ−Ｊｕｎ）、ＭＣＰ−Ｉ、ＭＤＫ、ＭＩＢｌ、ミドカイン、ＭＩＦ、ＭＩＳＲＩＩ、ＭＪＰ−２、ＭＫ、ＭＫＩ６７（Ｋｉ−６７）、ＭＭＰ２、ＭＭＰ９、ＭＳ４Ａ１、ＭＳＭＢ、ＭＴ３（メタロチオネクチン−Ｕｉ）、ｍＴＯＲ、ＭＴＳＳｌ、ＭＵＣｌ（ムチン）、ＭＹＣ、ＭＹＤ８８、ＮＣＫ２、ニューロカン、ニューレグリン−１、ニューロピリン−１、ＮＦＫＢｌ、ＮＦＫＢ２、ＮＧＦＢ（ＮＧＦ）、ＮＧＦＲ、ＮｇＲ−Ｌｉｎｇｏ、ＮｇＲ−Ｎｏｇｏ６６（Ｎｏｇｏ）、ＮｇＲ−ｐ７５、ＮｇＲ−Ｔｒｏｙ、ＮＭＥｌ（ＮＭ２３Ａ）、ＮＯＴＣＨ、ＮＯＴＣＨｌ、Ｎ０Ｘ５、ＮＰＰＢ、ＮＲＯＢｌ、ＮＲ０Ｂ２、ＮＲｌＤｌ、ＮＲ１Ｄ２、ＮＲ１Ｈ２、ＮＲ１Ｈ３、ＮＲ１Ｈ４、ＮＲ１Ｉ２、ＮＲ１Ｉ３、ＮＲ２Ｃ１、ＮＲ２Ｃ２、ＮＲ２Ｅ１、ＮＲ２Ｅ３、ＮＲ２Ｆ１、ＮＲ２Ｆ２、ＮＲ２Ｆ６、ＮＲ３Ｃ１、ＮＲ３Ｃ２、ＮＲ４Ａ１、ＮＲ４Ａ２、ＮＲ４Ａ３、ＮＲ５Ａ１、ＮＲ５Ａ２、ＮＲ６Ａ１、ＮＲＰｌ、ＮＲＰ２、ＮＴ５Ｅ、ＮＴＮ４、ＯＣＴ−１、ＯＤＺ１、ＯＰＮ１、ＯＰＮ２、ＯＰＲＤｌ、Ｐ２ＲＸ７、ＰＡＰ、ＰＡＲＴｌ、ＰＡＴＥ、ＰＡＷＲ、ＰＣＡ３、ＰＣＤＧＦ、ＰＣＮＡ、ＰＤＧＦＡ、ＰＤＧＦＢ、ＰＤＧＦＲＡ、ＰＤＧＦＲＢ、ＰＥＣＡＭｌ、ｐｅｇ−アスパラギナーゼ、ＰＦ４（ＣＸＣＬ４）、Ｐｌｅｘｉｎ  Ｂ２（ＰＬＸＮＢ２）、ＰＧＦ、ＰＧＲ、ホスファカン、ＰＩＡＳ２、ＰＩ３キナーゼ、ＰＩＫ３ＣＧ、ＰＬＡＵ（ｕＰＡ）、ＰＬＧ５ＰＬＸＤＣｌ、ＰＫＣ、ＰＫＣ−ベータ、ＰＰＢＰ（ＣＸＣＬ７）、ＰＰＩＤ、ＰＲｌ、ＰＲＫＣＱ、ＰＲＫＤｌ、ＰＲＬ、ＰＲＯＣ、ＰＲＯＫ２、ｐｒｏ−ＮＧＦ、プロサポシン、ＰＳＡＰ、ＰＳＣＡ、ＰＴＡＦＲ、ＰＴＥＮ、ＰＴＧＳ２（ＣＯＸ−２）、ＰＴＮ、ＲＡＣ２（Ｐ２１Ｒａｃ２）、ＲＡＮＫ、ＲＡＮＫリガンド、ＲＡＲＢ、ＲＧＳｌ、ＲＧＳ１３、ＲＧＳ３、ＲＮＦＩ１０（ＺＮＦ１４４）、Ｒｏｎ、Ｒ０Ｂ０２、ＲＸＲ、セレクチン、Ｓ１００Ａ２、Ｓ１００Ａ８、Ｓ１００Ａ９、ＳＣＧＢ  １Ｄ２（リポフィリンＢ）、ＳＣＧＢ２Ａ１（マンマグロビン２）、ＳＣＧＢ２Ａ２（マンマグロビン１）、ＳＣＹＥｌ（内皮単球活性化サイトカイン）、ＳＤＦ２、ＳＥＲＰＥＮＡ１、ＳＥＲＰＩＮＡ３、ＳＥＲＰＩＮＢ５（マスピン）、ＳＥＲＰＩＮＥｌ（ＰＡＩ−Ｉ）、ＳＥＲＰＩＮＦｌ、ＳＨＩＰ−Ｉ、ＳＨＩＰ−２
、ＳＨＢｌ、ＳＨＢ２、ＳＨＢＧ、ＳｆｃＡＺ、ＳＬＣ２Ａ２、ＳＬＣ３３Ａ１、ＳＬＣ４３Ａ１、ＳＬＩＴ２、ＳＰＰｌ、ＳＰＲＲｌＢ（Ｓｐｒｌ）、ＳＴ６ＧＡＬ１、ＳＴＡＢｌ、ＳＴＡＴ６、ＳＴＥＡＰ、ＳＴＥＡＰ２、ＳＵＬＦ−１、Ｓｕｌｆ−２、ＴＢ４Ｒ２、ＴＢＸ２１、ＴＣＰｌＯ、ＴＤＧＦｌ、ＴＥＫ、ＴＧＦＡ、ＴＧＦＢｌ、ＴＧＦＢｌＩｌ、ＴＧＦＢ２、ＴＧＦＢ３、ＴＧＦＢＩ、ＴＧＦＢＲｌ、ＴＧＦＢＲ２、ＴＧＦＢＲ３、ＴＨｌＬ、ＴＨＢＳｌ（トロンボスポンジン−１）、ＴＨＢＳ２／ＴＨＢＳ４、ＴＨＰＯ、ＴＩＥ（Ｔｉｅ−１）、ＴＩＭＰ３、組織因子、ＴＩＫＩ２、ＴＬＲ１０、ＴＬＲ２、ＴＬＲ３、ＴＬＲ４、ＴＬＲ５、ＴＬＲ６ＪＬＲ７、ＴＬＲ８、ＴＬＲ９、ＴＭ４ＳＦ１、ＴＮＦ、ＴＮＦ−ａ、ＴＮＦＡＩＰ２（Ｂ９４）、ＴＮＦＡＩＰ３、ＴＮＦＲＳＦＩｌＡ、ＴＮＦＲＳＦｌＡ、ＴＮＦＲＳＦｌＢ、ＴＮＦＲＳＦ２１、ＴＮＦＲＳＦ５、ＴＮＦＲＳＦ６（Ｆａｓ）、ＴＮＦＲＳＦ７、ＴＮＦＲＳＦ８、ＴＮＦＲＳＦ９、ＴＮＦＳＦｌＯ（ＴＲＡＩＬ）、ＴＮＦＳＦｌ  １（ＴＲＡＮＣＥ）、ＴＮＦＳＦ１２（ＡＰ０３Ｌ）、ＴＮＦＳＦ１３（Ａｐｒｉｌ）、ＴＮＦＳＦ１３Ｂ、ＴＮＦＳＦ１４（ＨＶＥＭ−Ｌ）、ＴＮＦＳＦ１５（ＶＥＧＩ）、ＴＮＦＳＦ  １８、ＴＮＦＳＦ４（ＯＸ４０リガンド）、ＴＮＦＳＦ５（ＣＤ４０リガンド）、ＴＮＦＳＦ６（ＦａｓＬ）、ＴＮＦＳＦ７（ＣＤ２７リガンド）、ＴＮＦＳＦ８（ＣＤ３０リガンド）、ＴＮＦＳＦ９（４−１ＢＢリガンド）、ＴＯＬＬＩＰ、Ｔｏｌｌ様受容体、ＴＬＲ２、ＴＬＲ４、ＴＬＲ９、Ｔ０Ｐ２Ａ（トポイソメラーゼＩｉａ）、ＴＰ５３、ＴＰＭｌ、ＴＰＭ２、ＴＲＡＤＤ、ＴＲＡＦｌ、ＴＲＡＦ２、ＴＲＡＦ３、ＴＲＡＦ４、ＴＲＡＦ５、ＴＲＡＦ６、ＴＲＫＡ、ＴＲＥＭｌ、ＴＲＥＭ２、ＴＲＰＣ６、ＴＲＯＹ、ＴＳＬＰ、ＴＷＥＡＫ、チロシナーゼ、ｕＰＡＲ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＢ、ＶＥＧＦＣ、バーシカン、ＶＨＬ  Ｃ５、ＶＬＡ−４、Ｗｎｔ−１、ＸＣＬｌ（リンホタクチン）、ＸＣＬ２（ＳＣＭ−Ｉｂ）、ＸＣＲｌ（ＧＰＲ５／ＣＣＸＣＲｌ）、ＹＹｌ、およびＺＦＰＭ２から選択される１つまたは複数のタンパク質に結合することができる。
【０２８０】
Ｆｃ領域のさらなる改変
本開示はまた、さらに改変することができる操作されたＦｃポリペプチドも提供する。Ｆｃ領域のバリアント、例えば、アミノ酸置換、挿入、および／または付加および／または欠失は、エフェクター機能を増強または減少させることが知られている。例えば、Ｐｒｅｓｔａら、２００２、Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．Ｔｒａｎｓ．３０：４８７〜４９０；Ｓｔｒｏｈｌ、２００９、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０（６）：６８５〜６９１；米国特許第５，６２４，８２１号、第５，６４８，２６０号、第５，８８５，５７３号、第６，７３７，０５６号、第７，３１７，０９１号；ＰＣＴ公開ＷＯ９９／５８５７２、ＷＯ００／４２０７２、ＷＯ０４／０２９２０７、ＷＯ２００６／１０５３３８、ＷＯ２００８／０２２１５２、ＷＯ２００８／１５０４９４、ＷＯ２０１０／０３３７３６；米国特許出願公開第２００４／０１３２１０１号、第２００６／００２４２９８号、第２００６／０１２１０３２号、第２００６／０２３５２０８号、第２００７／０１４８１７０号；Ａｒｍｏｕｒら、１９９９、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２９（８）：２６１３〜２６２４（低下したＡＤＣＣおよびＣＤＣ）；Ｓｈｉｅｌｄｓら、２００１、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６（９）：６５９１〜６６０４（低下したＡＤＣＣおよびＣＤＣ）；Ｉｄｕｓｏｇｉｅら、２０００、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６４（８）：４１７８〜４１８４（増加したＡＤＣＣおよびＣＤＣ）；Ｓｔｅｕｒｅｒら、１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５５（３）：１１６５〜１１７４（低下したＡＤＣＣおよびＣＤＣ）；Ｉｄｕｓｏｇｉｅら、２００１、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６６（４）：２５７１〜２５７５（増加したＡＤＣＣおよびＣＤＣ）；Ｌａｚａｒら、２００６、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １０３（１１）：４００５〜４０１０（増加したＡＤＣＣ）；Ｒｙａｎら、２００７、Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ．Ｔｈｅｒ．、６：３００９〜３０１８（増加したＡＤＣＣ）；Ｒｉｃｈａｒｄｓら、２００８、Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒ．７（８）：２５１７〜２５２７を参照されたい。
【０２８１】
一実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然の野生型Ｆｃポリペプチドと比較して類似するレベルのエフェクター機能の誘導を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然Ｆｃと比較してエフェクター機能のより高い誘導を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然Ｆｃと比較してエフェクター機能のより低い誘導を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然Ｆｃと比較してＡＤＣＣのより高い誘導を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然Ｆｃと比較してＡＤＣＣのより低い誘導を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然Ｆｃと比較してＣＤＣのより高い誘導を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、天然Ｆｃと比較してＣＤＣのより低い誘導を示す。エフェクター機能に影響するようにさらに改変された操作されたＦｃポリペプチドの特定の実施形態を、以下に詳述する。
【０２８２】
本開示は、参照分子（例えば、天然の野生型Ｆｃポリペプチドを有すること以外は同じアミノ酸を有するタンパク質）と比較して、Ｆｃリガンド（例えば、Ｆｃ受容体、ＣＩｑなど）に対する変化した結合特性をさらに含む操作されたＦｃタンパク質を包含する。結合特性の例としては、限定されるものではないが、結合特異性、平衡解離定数（ＫＤ）、解離および会合速度（それぞれ、ｋｏｆｆおよびｋｏｎ）、結合親和性および／またはアビディティが挙げられる。一般に、低いＫＤを有する結合分子（例えば、抗体などのＦｃバリアントタンパク質）が高いＫＤを有する結合分子よりも好ましい場合があることが理解される。しかしながら、いくつかの例においては、ｋｏｎまたはｋｏｆｆの値がＫＤの値よりも関連性があり得る。当業者であれば、動的パラメータが所与の抗体適用にとって最も重要であることを決定することができる。
【０２８３】
Ｆｃポリペプチドのそのリガンドに対する親和性および結合特性を、Ｆｃ−ＦｃγＲ相互作用、すなわち、ＦｃポリペプチドのＦｃγＲへの特異的結合を決定するための当技術分野で公知の様々なｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイ法（生化学または免疫学に基づくアッセイ）、例えば、限定されるものではないが、平衡法（例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、もしくはラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））、または動力学（例えば、ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）分析、ＯＣＴＥＴ（登録商標）、ＦｏｒｔeＢｉｏ、Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ、ＣＡ）、および間接結合アッセイ、競合阻害アッセイ、蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）、ゲル電気泳動およびクロマトグラフィー（例えば、ゲル濾過）などの他の方法により決定することができる。これらの方法および他の方法は、試験される１つもしくは複数の成分上の標識を利用する、および／または限定されるものではないが、発色、蛍光、発光、または同位体標識などの様々な検出方法を用いてもよい。結合親和性および動力学の詳細な説明を、抗体−免疫原相互作用に焦点を当てたＰａｕｌ，Ｗ．Ｅ．（編）、Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第４版（Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ−Ｒａｖｅｎ、Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ、１９９９）に見出すことができる。
【０２８４】
一実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、さらなる突然変異を含み、野生型の非改変型Ｆｃと比較してさらなる突然変異を含まない同等の分子操作されたＦｃと比較して、１つまたは複数のＦｃリガンドへの結合の増強を示す。別の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、さらなる突然変異を含まない同等の操作されたＦｃよりも少なくとも２倍、または少なくとも３倍、または少なくとも５倍、または少なくとも７倍、または少なくとも１０倍、または少なくとも２０倍、または少なくとも３０倍、または少なくとも４０倍、または少なくとも５０倍、または少なくとも６０倍、または少なくとも７０倍、または少なくとも８０倍、または少なくとも９０倍、または少なくとも１００倍、または少なくとも２００倍高いＦｃリガンドに対する親和性を有する。特定の実施形態においては、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体への増強された結合を有する。別の特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体ＦｃγＲＩＩＩＡへの増強された結合を有する。さらに特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体ＦｃγＲＩＩＢへの増強された結合を有する。さらに別の特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体ＦｃＲｎへの増強された結合を有する。さらに別の特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、突然変異を欠く同等のＦｃ分子（例えば、野生型親Ｆｃ）と比較して、ＣＩｑへの増強された結合を有する。
【０２８５】
任意の特定の操作されたＦｃバリアントタンパク質がＡＤＣＣにより標的細胞の溶解を媒介する能力を評価することができる。ＡＤＣＣ活性を評価するために、対象の操作されたＦｃバリアントタンパク質を、標的細胞の細胞溶解をもたらす抗原抗体複合体により活性化され得る免疫エフェクター細胞と共に標的細胞に添加する。細胞溶解は、一般的には溶解された細胞からの標識（例えば、放射性基質、蛍光色素または天然の細胞内タンパク質）の放出により検出される。そのようなアッセイにとって有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が挙げられる。ｉｎ  ｖｉｔｒｏでのＡＤＣＣアッセイの特定例は、Ｗｉｓｅｃａｒｖｅｒら、１９８５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  ７９（２）：２７７〜２８２；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎら、１９８７、Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６６：１３５１〜１３６１；Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎら、２００１、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２５８：１８３〜１９１；Ｐａｔｅｌら、１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  １８４：２９〜３８に記載されている。対象の操作されたＦｃバリアントタンパク質のＡＤＣＣ活性を、ｉｎ  ｖｉｖｏで、例えば、Ｃｌｙｎｅｓら、１９９８、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９５：６５２〜６５６に開示されたものなどの動物モデルにおいて評価することもできる。
【０２８６】
一実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子（例えば、突然変異を含まない野生型天然Ｆｃおよび／またはさらなる改変を含まない操作されたＦｃ）と比較して増強されたＡＤＣＣ活性を有する。特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、同等の分子のものよりも少なくとも２倍、または少なくとも３倍、または少なくとも５倍、または少なくとも１０倍、または少なくとも５０倍、または少なくとも１００倍高いＡＤＣＣ活性を有する。別の特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体ＦｃγＲＩＩＩＡへの増強された結合を有し、同等の分子と比較して増強されたＡＤＣＣ活性を有する。他の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、同等の分子と比較して増強されたＡＤＣＣ活性と増強された血清半減期との両方を有する。
【０２８７】
一実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子（例えば、突然変異を含まない野生型天然Ｆｃおよび／またはさらなる改変を含まない操作されたＦｃ）と比較して低下したＡＤＣＣ活性を有する。特定の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子のものよりも少なくとも２倍、または少なくとも３倍、または少なくとも５倍、または少なくとも１０倍、または少なくとも５０倍、または少なくとも１００倍低いＡＤＣＣ活性を有する。別の特定の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体ＦｃγＲＩＩＩＡへの低下した結合を有し、同等の分子と比較して低下したＡＤＣＣ活性を有する。他の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子と比較して低下したＡＤＣＣ活性と増強された血清半減期との両方を有する。
【０２８８】
一実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子（例えば、突然変異を含まない野生型天然Ｆｃおよび／またはさらなる改変を含まない操作されたＦｃ）と比較して増強されたＣＤＣ活性を有する。特定の実施形態において、Ｆｃバリアントタンパク質は、同等の分子のものよりも少なくとも２倍、または少なくとも３倍、または少なくとも５倍、または少なくとも１０倍、または少なくとも５０倍、または少なくとも１００倍高いＣＤＣ活性を有する。他の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子と比較して増強されたＣＤＣ活性と増強された血清半減期との両方を有する。一実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子と比較して１つまたは複数のＦｃリガンドへの低下した結合を有する。別の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子のものよりも少なくとも２倍、または少なくとも３倍、または少なくとも５倍、または少なくとも７倍、または少なくとも１０倍、または少なくとも２０倍、または少なくとも３０倍、または少なくとも４０倍、または少なくとも５０倍、または少なくとも６０倍、または少なくとも７０倍、または少なくとも８０倍、または少なくとも９０倍、または少なくとも１００倍、または少なくとも２００倍低いＦｃリガンドに対する親和性を有する。特定の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体への低下した結合を有する。別の特定の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、Ｆｃ受容体ＦｃγＲＩＩＩＡへの低下した結合を有する。さらなる特定の実施形態において、本明細書に記載の操作されたＦｃバリアントは、同等の分子のものよりも少なくとも約５倍低いＦｃ受容体ＦｃγＲＩＩＩＡに対する親和性を有し、ここで前記操作されたＦｃバリアントは同等の分子のものの約２倍以内であるＦｃ受容体ＦｃγＲＩＩＢに対する親和性を有する。さらに別の特定の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質はＦｃ受容体ＦｃＲｎへの低下した結合を有する。さらに別の特定の実施形態において、操作されたＦｃバリアントタンパク質は、同等の分子と比較してＣＩｑへの低下した結合を有する。
【０２８９】
アミノ酸配列の改変に加えて、Ｆｃポリペプチドの糖鎖を改変して、エフェクター機能を増加または減少させることができることも公知である（例えば、Ｕｍａｎａら、１９９９、Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：１７６〜１８０；Ｄａｖｉｅｓら、２００１、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｅｎｇ．７４：２８８〜２９４；Ｓｈｉｅｌｄｓら、２００２、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７７：２６７３３〜２６７４０；Ｓｈｉｎｋａｗａら、２００３、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７８：３４６６〜３４７３；米国特許第６，６０２，６８４号；米国特許出願公開第２００３／０１５７１０８号；米国特許出願公開第２００３／０００３０９７号；国際特許出願公開ＷＯ００／６１７３９Ａ１；ＷＯ０１／２９２２４６Ａ１；ＷＯ０２／３１１１４０Ａ１；およびＷＯ０２／３０９５４Ａ１；Ｐｏｔｉｌｌｅｇｅｎｔ（商標）技術（Ｂｉｏｗａ，Ｉｎｃ．Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ、Ｎ．Ｊ．）；ＧｌｙｃｏＭＡｂ（商標）糖鎖工学技術（ＧＬＹＣＡＲＴ  ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ＡＧ、Ｚｕｒｉｃｈ、Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）を参照されたい）。
【０２９０】
したがって、一実施形態において、本開示の抗体および融合タンパク質の操作されたＦｃポリペプチドは、アミノ酸残基の糖鎖の変化を含んでもよい。別の実施形態において、アミノ酸残基の糖鎖の変化は、エフェクター機能の減少をもたらす。別の実施形態において、アミノ酸残基の糖鎖の変化は、エフェクター機能の増加をもたらす。特定の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは、低下したフコシル化を有する。別の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドは無フコシル化されている（例えば、米国特許出願公開第２００５／０２２６８６７号を参照されたい）。
【０２９１】
他の実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドがＣ末端リシン（Ｋ）アミノ酸残基を含む（例えば、ヒトＩｇＧ１重鎖が末端リシンを含む）場合、当業者であれば、リシン残基を切り取り、Ｃ末端リシン残基を欠く融合タンパク質を得ることができることを理解できる。したがって、いくつかの実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体またはＦｃ融合タンパク質は、さもなければ存在する末端リシンが存在しないポリペプチドを含む。
【０２９２】
他の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、２９７位に天然アミノ酸の置換を含み、前記置換は２９７位での糖鎖を検出可能に減少させる、および／または無効化する。特定の実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドは、抗体の重鎖の２９７位にシステインからアスパラギンへの置換を含む。さらに他の実施形態において、本開示は、抗体の重鎖の２９７位の糖鎖を欠く抗体を提供する。これらのそれぞれにおいて、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである。
【０２９３】
ＩｇＧ分子上のオリゴ糖へのシアル酸の付加は、その抗炎症活性を増強し、その細胞傷害性を変化させる（Ｋｅｎｅｋｏら、２００６、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３１３：６７０〜６７３、Ｓｃａｌｌｏｎら、２００７、Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４４（７）：１５２４〜１５３４）。したがって、抗体治療剤の効果を、意図される適用に合わせた糖型の選択により最適化することができる。抗体の２個のＣＨ２ドメイン間に挿入された２個のオリゴ糖鎖は、Ｆｃポリペプチドのその受容体への結合に関与する。上記で参照された研究は、シアル化が増加したＩｇＧ分子は抗炎症特性を有するが、シアル化が減少したIｇＧ分子は増加した免疫刺激特性を有することを示している。したがって、本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む抗体治療剤を、特定の適用のための適切なシアル化プロファイルを用いて改変することができる。抗体のシアル化状態を調節するための方法は、それぞれ全ての目的に関してその全体が参照により本明細書に組み込まれるＷＯ２００７／００５７８６およびＷＯ２００７／１１７５０５に提示されている。
【０２９４】
また、Ｆｃ領域を改変して、タンパク質の半減期を増加させることができることも公知である。半減期の増加は、患者に与えられる薬物の量を減少させ、ならびに投与頻度を減少させることができる。したがって、半減期が増加した本開示の抗体を、ＦｃとＦｃＲｎ受容体との間の相互作用に関与するものとして同定されたアミノ酸残基を改変（例えば、置換、欠失、または付加）することにより生成することができる（例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ９７／３４６３１およびＷＯ０２／０６０９１９、Ｈｉｎｔｏｎら、２００４、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７９（８）：６２１３〜６２１６、Ｖａｃｃａｒｏら、２００５、Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２３（１０）：１２８３〜１２８８（それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）。
【０２９５】
さらに、本開示の抗体および融合タンパク質の半減期を、当技術分野で広く用いられる技術により、バイオポリマー（例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、アルブミン、ヒドロキシエチルスターチ（ＨＥＳ）、ヒドロキシアルキルスターチ、ＸＴＥＮ（Ａｍｕｎｉｘ，Ｉｎｃ．）へのコンジュゲーションにより増加させることができる。いくつかの実施形態において、本開示の抗体の操作されたＦｃポリペプチドは、参照野生型非改変Ｆｃポリペプチドと比較して、約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約１００％、約１２５％、約１５０％以上の半減期の増加を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体の操作されたＦｃポリペプチドは、非改変参照Ｆｃポリペプチドと比較して、約２倍、約３倍、約４倍、約５倍、約１０倍、約２０倍、約５０倍以上の半減期の増加を含む。
【０２９６】
代替的な実施形態において、本開示の抗体およびＦｃ融合タンパク質の操作されたＦｃポリペプチドは、半減期の減少を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体の操作されたＦｃポリペプチドは、参照非改変Ｆｃポリペプチドと比較して、約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約１００％、約１２５％、約１５０％以上の半減期の減少を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体の操作されたＦｃポリペプチドは、非改変参照Ｆｃポリペプチドと比較して、約２倍、約３倍、約４倍、約５倍、約１０倍、約２０倍、約５０倍以上の半減期の減少を含む。
【０２９７】
一実施形態において、本開示は、操作されたＦｃポリペプチドが、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスにより番号付けられた場合、２３４、２３５、２３６、２３７、２３８、２３９、２４０、２４１、２４３、２４４、２４５、２４７、２５１、２５２、２５４、２５５、２５６、２６２、２６３、２６４、２６５、２６６、２６７、２６８、２６９、２７９、２８０、２８４、２９２、２９６、２９７、２９８、２９９、３０５、３１３、３１６、３２５、３２６、３２７、３２８、３２９、３３０、３３１、３３２、３３３、３３４、３３９、３４１、３４３、３７０、３７３、３７８、３９２、４１６、４１９、４２１、４４０および４４３から選択される１個または複数個の位置に上記に開示された置換に加えて、またはそれ以外に、非天然アミノ酸残基をさらに含む、Ｆｃバリアントを提供する。場合により、操作されたＦｃポリペプチドは、当業者には公知のさらなるおよび／または代替的な位置にさらなる非天然アミノ酸残基を含んでもよい（例えば、米国特許第５，６２４，８２１号、第６，２７７，３７５号、第６，７３７，０５６号、第７，２１７，７９７号、米国特許出願公開第ＵＳ２００７／０１３５６２０号；ＰＣＴ公開ＷＯ０１／５８９５７；ＷＯ０２／０６９１９；ＷＯ０４／０１６７５０；ＷＯ０４／０２９２０７；ＷＯ０４／０３５７５２；ＷＯ０４／０７４４５５；ＷＯ０４／０９９２４９；ＷＯ０４／０６３３５１；ＷＯ０５／０７０９６３；ＷＯ０５／０４０２１７、ＷＯ０５／０９２９２５およびＷＯ０６／０２０１１４（それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）。
【０２９８】
特定の実施形態において、本開示は、操作されたＦｃポリペプチドが、２３４、２３５、２３７および３３１から選択される１個または複数個の位置に少なくとも１つの改変、例えば、アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、アミノ酸付加を含む、操作されたＦｃバリアント抗体を提供する。一実施形態において、非天然アミノ酸は、２３４Ｆ、２３５Ｆ、２３５Ｙ、および３３１Ｓから選択される。一実施形態において、非天然アミノ酸は、２３４Ａ、２３５Ａおよび２３７Ａから選択される。別の特定の実施形態において、本開示は、Ｆｃポリペプチドが２３９、３３０および３３２から選択される１個または複数個の位置に少なくとも１個の非天然アミノ酸を含む、操作されたＦｃバリアントを提供する。一実施形態において、非天然アミノ酸は、２３９Ｄ、３３０Ｌおよび３３２Ｅから選択される群から選択される。
【０２９９】
特定の実施形態において、本開示は、Ｆｃポリペプチドが２５２、２５４および２５６から選択される１個または複数個の位置に少なくとも１個の非天然アミノ酸を含む、操作されたＦｃバリアント抗体を提供する。一実施形態において、非天然アミノ酸は、Ｄａｌｌ’Ａｃｑｕａら、２００６、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８１：２３５１４〜２３５２４、および米国特許第７，０８３，７８４号（両方ともその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載のように、２５２Ｙ、２５４Ｔおよび２５６Ｅ（「ＹＴＥ改変」とも呼ばれる）から選択される群から選択される。
【０３００】
他の実施形態において、操作されたＦｃバリアントは、Ｋａｂａｔ（上掲）に記載のＥＵインデックスを用いる、２４６、２４９、２５４、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２８４、２８７、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位での置換から選択される少なくとも１個のアミノ酸置換を含み、４２８および４３４から選択される１個または複数個の位置に少なくとも１個の非天然アミノ酸をさらに含む、操作されたＦｃポリペプチドを含む。一実施形態において、さらなるアミノ酸置換は、国際特許出願公開ＷＯ２００９／０８６３２０に記載の４２８Ｌおよび４３４Ｓを含む。
【０３０１】
他の実施形態において、本開示の操作されたバリアント抗体は、抗体のＣＨ１ドメインの１３１〜１３９領域中に少なくとも１個または複数個の非天然システインアミノ酸をさらに含んでもよい。いくつかの実施形態において、本開示の操作された抗体は、定常領域の番号付けシステムがＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである、抗体のＣＨ１ドメインの１３１、１３２、１３３、１３４、１３５、１３６、１３７、１３８および１３９から選択される位置に少なくとも１個の置換を含む。
【０３０２】
抗体を生成する方法
本開示の操作された定常ドメイン（Ｆｃ、ＣκおよびＣλ）ポリペプチドならびに操作されたポリペプチドを含む抗体、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２を、抗体、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２の合成のための当技術分野で公知の任意の方法により、特に、化学的合成によるか、または好ましくは、組換え発現技術により生成することができる。
【０３０３】
モノクローナル抗体を、ハイブリドーマ、組換え、およびファージディスプレイ技術、またはその組合せの使用などの、当技術分野で公知の様々な技術を用いて調製することができる。例えば、モノクローナル抗体を、当技術分野で公知であり、例えば、Ｈａｒｌｏｗら、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、第２版、１９８８）；Ｈａｍｍｅｒｌｉｎｇら、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｔ−ＣｅＩｌ  Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ  ５６３〜６８１（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ、Ｎ．Ｙ．、１９８１）（前記参考文献はその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に教示されたものなどのハイブリドーマ技術を用いて生成することができる。本明細書で用いられる用語「モノクローナル抗体」は、ハイブリドーマ技術により生成された抗体に限定されない。用語「モノクローナル抗体」とは、それが生成される方法ではなく、任意の真核生物、原核生物、またはファージクローンなどの単一のクローンから誘導される抗体を指す。
【０３０４】
ハイブリドーマ技術を用いて特異的抗体を生成し、スクリーニングするための方法は、日常的であり、当技術分野で周知である。簡単に述べると、マウスを標的抗原（完全長タンパク質またはそのドメイン、例えば、細胞外ドメインまたはリガンド結合ドメイン）で免疫し、一度、免疫応答が検出されたら、例えば、標的抗原に特異的な抗体がマウス血清中で検出されたら、マウス脾臓を収穫し、脾臓細胞を単離する。次いで、脾臓細胞を周知の技術により任意の好適なミエローマ細胞、例えば、ＡＴＣＣから入手可能な細胞系ＳＰ２０に由来する細胞に融合する。ハイブリドーマを限界希釈により選択し、クローニングする。次いで、ハイブリドーマクローンを、本開示のポリペプチドに結合することができる抗体を分泌する細胞について当技術分野で公知の方法によりアッセイする。一般に高レベルの抗体を含有する腹水を、マウスを陽性ハイブリドーマクローンで免疫することにより生成することができる。
【０３０５】
したがって、好ましくは、ハイブリドーマが、標的抗原で免疫されたマウスから単離された脾臓細胞とミエローマ細胞とを融合した後、特定の標的抗原に結合することができる抗体を分泌するハイブリドーマクローンについて、融合物から得られるハイブリドーマをスクリーニングすることにより生成された、本開示の抗体を分泌するハイブリドーマ細胞を培養することにより、モノクローナル抗体を生成することができる。
【０３０６】
特異的標的抗原エピトープを認識する抗体断片を、当業者には公知の任意の技術により生成することができる。例えば、本開示のＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２断片を、パパイン（Ｆａｂ断片を生成するため）またはペプシン（Ｆ（ａｂ’）２断片を生成するため）などの酵素を用いて、免疫グロブリン分子のタンパク質分解的切断により生成することができる。Ｆ（ａｂ’）２断片は可変領域、軽鎖定常領域および重鎖のＣＨ１ドメインを含有する。さらに、本開示の抗体を、当技術分野で公知の様々なファージディスプレイ法を用いて生成することもできる。
【０３０７】
ファージディスプレイ法においては、機能的抗体ドメインは、それらをコードするポリヌクレオチド配列を担持するファージ粒子の表面上に提示される。特に、ＶＨおよびＶＬドメインをコードするＤＮＡ配列を、動物ｃＤＮＡライブラリー（例えば、リンパ組織のヒトまたはマウスｃＤＮＡライブラリー）から増幅する。ＶＨおよびＶＬドメインをコードするＤＮＡを、ＰＣＲによりｓｃＦｖリンカーと一緒に組換え、ファージミドベクター（例えば、ｐＣＡＮＴＡＢ６またはｐＣｏｍｂ３  ＨＳＳ）中にクローニングする。ベクターを大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）中にエレクトロポレーションし、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）をヘルパーファージに感染させる。これらの方法において用いられるファージは、典型的には、ｆｄおよびＭ１３などの繊維性ファージであり、ＶＨおよびＶＬドメインは通常、ファージ遺伝子ＩＩＩまたは遺伝子ＶＩＩＩのいずれかに組換えで融合される。対象のエピトープに結合する抗原結合ドメインを発現するファージを、抗原、例えば、標識された抗原または固相表面もしくはビーズに結合もしくは捕捉された抗原を用いて、選択または同定することができる。本開示の抗体を作製するのに用いることができるファージディスプレイ法の例としては、Ｂｒｉｎｋｍａｎら、１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  １８２：４１〜５０；Ａｍｅｓら、１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  １８４：１７７；Ｋｅｔｔｌｅｂｏｒｏｕｇｈら、１９９４、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２４：９５２〜９５８；Ｐｅｒｓｉｃら、１９９７、Ｇｅｎｅ  １８７：９；Ｂｕｒｔｏｎら、１９９４、Ａｄｖａｎｃｅｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  ５７：１９１〜２８０；国際特許出願公開ＷＯ９２／０１０４７、ＷＯ９０／０２８０９、ＷＯ９１／１０７３７、ＷＯ９２／０１０４７、ＷＯ９２／１８６１９、ＷＯ９３／１１２３６、ＷＯ９５／１５９８２、ＷＯ９５／２０４０１、およびＷＯ９７／１３８４４；ならびに米国特許第５，６９８，４２６号、第５，２２３，４０９号、第５，４０３，４８４号、第５，５８０，７１７号、第５，４２７，９０８号、第５，７５０，７５３号、第５，８２１，０４７号、第５，５７１，６９８号、第５，４２７，９０８号、第５，５１６，６３７号、第５，７８０，２２５号、第５，６５８，７２７号、第５，７３３，７４３号、および第５，９６９，１０８号（それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に開示されたものが挙げられる。
【０３０８】
上記参考文献に記載されたように、ファージ選択後、ファージに由来する抗体コード領域を単離し、これを用いてヒト抗体などの全抗体、またはその任意の他の所望の抗原結合断片を生成し、例えば、以下に記載のような哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞、酵母、および細菌などの任意の所望の宿主中で発現させることができる。Ｆａｂ、Ｆａｂ’およびＦ（ａｂ’）２断片を組換え生成するための技術を、国際公開ＷＯ９２／２２３２４；Ｍｕｌｌｉｎａｘら、１９９２、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １２：８６４；Ｓａｗａｉら、１９９５、ＡＪＲＩ  ３４〜．２６；およびＢｅｔｔｅｒら、１９８８、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４０：１０４１（前記参考文献はその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に開示されたものなどの当技術分野で公知の方法を用いて使用することもできる。
【０３０９】
全抗体を生成するために、ＶＨまたはＶＬヌクレオチド配列、制限部位、および制限部位を保護するためのフランキング配列を含むＰＣＲプライマーを用いて、ｓｃＦｖクローン中のＶＨまたはＶＬ配列を増幅することができる。当業者には公知のクローニング技術を用いて、ＰＣＲ増幅されたＶＨドメインを、ＶＨ定常領域、例えば、ヒトガンマ１定常領域を発現するベクター中にクローニングし、ＰＣＲ増幅されたＶＬドメインを、ＶＬ定常領域、例えば、ヒトカッパまたはラムダ定常領域を発現するベクター中にクローニングすることができる。好ましくは、ＶＨまたはＶＬドメインを発現させるためのベクターは、ＥＦ−１αプロモーター、分泌シグナル、可変ドメイン、定常ドメイン、およびネオマイシンなどの選択マーカーのためのクローニング部位を含む。ＶＨおよびＶＬドメインを、必要な定常領域を発現する１つのベクター中にクローニングすることもできる。次いで、重鎖変換ベクターおよび軽鎖変換ベクターを細胞系中に同時トランスフェクトして、当業者には公知の技術を用いて、完全長抗体、例えば、ＩｇＧを発現する安定な、または一過性の細胞系を生成する。
【０３１０】
ヒトにおける抗体のｉｎ  ｖｉｖｏでの使用およびｉｎ  ｖｉｔｒｏでの検出アッセイなどのいくつかの使用にとっては、ヒトまたはキメラ抗体を使用するのが好ましい場合がある。完全ヒト抗体は、ヒト対象の治療的処置にとって特に好ましい。ヒト抗体を、ヒト免疫グロブリン配列から誘導された抗体ライブラリーを用いる上記のファージディスプレイ法などの当技術分野で公知の様々な方法により作製することができる。また、米国特許第４，４４４，８８７号および第４，７１６，１１１号；ならびに国際公開ＷＯ９８／４６６４５、ＷＯ９８／５０４３３、ＷＯ９８／２４８９３、ＷＯ９８／１６６５４、ＷＯ９６／３４０９６、ＷＯ９６／３３７３５、およびＷＯ９１／１０７４１（それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる）も参照されたい。
【０３１１】
機能的な内因性免疫グロブリンを発現することはできないが、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現することができるトランスジェニックマウスを用いて、ヒト抗体を生成することもできる。例えば、ヒト重鎖および軽鎖免疫グロブリン遺伝子複合体を、マウス胚性幹細胞中に無作為に、または相同組換えにより導入することができる。あるいは、ヒト可変領域、定常領域、および多様性領域を、ヒト重鎖および軽鎖遺伝子に加えてマウス胚性幹細胞中に導入することができる。マウス重鎖および軽鎖免疫グロブリン遺伝子を、個別に、または相同組換えによるヒト免疫グロブリン遺伝子座の導入と同時に、非機能的にすることができる。特に、ＪＨ領域のホモ接合欠失は、内因性抗体生成を防止する。改変された胚性幹細胞を拡張し、胚細胞にマイクロインジェクションしてキメラマウスを生成する。次いで、キメラマウスを育種して、ヒト抗体を発現するホモ接合性子孫を生成する。トランスジェニックマウスを通常の様式で、選択された抗原、例えば、本開示のポリペプチドの全部または一部で免疫する。抗原に対するモノクローナル抗体を、従来のハイブリドーマ技術を用いて、免疫されたトランスジェニックマウスから取得することができる。トランスジェニックマウスにより担持されるヒト免疫グロブリントランスジーンは、Ｂ細胞分化の間に再配列し、続いて、クラススイッチングおよび体細胞突然変異を受ける。したがって、そのような技術を用いて、治療上有用なＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭおよびＩｇＥ抗体を生成することができる。ヒト抗体を生成するためのこの技術の概説については、ＬｏｎｂｅｒｇおよびＨｕｓｚａｒ、１９９５、Ｉｎｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３：６５〜９３を参照されたい。ヒト抗体およびヒトモノクローナル抗体を生成するためのこの技術ならびにそのような抗体を生成するためのプロトコールの詳細な論述については、例えば、国際公開ＷＯ９８／２４８９３、ＷＯ９６／３４０９６、およびＷＯ９６／３３７３５；ならびに米国特許第５，４１３，９２３号、第５，６２５，１２６号、第５，６３３，４２５号、第５，５６９，８２５号、第５，６６１，０１６号、第５，５４５，８０６号、第５，８１４，３１８号、および第５，９３９，５９８号（その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。さらに、Ｍｅｄａｒｅｘ（Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ、ＮＪ）のような会社を、上記のものと同様の技術を用いて選択された抗原に対するヒト抗体を提供するために従事させることができる。
【０３１２】
キメラ抗体は、抗体の異なる部分が、非ヒト抗体から誘導される可変領域と、ヒト免疫グロブリン定常領域とを有する抗体などの異なる免疫グロブリン分子から誘導された分子である。キメラ抗体を生成するための方法は当技術分野で公知である。例えば、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ、１９８５、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２９：１２０２；Ｏｉら、１９８６、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ４：２１４；Ｇｉｌｌｉｅｓら、１９８９、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  １２５：１９１〜２０２；ならびに米国特許第６，３１１，４１５号、第５，８０７，７１５号、第４，８１６，５６７号、および第４，８１６，３９７号（その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。非ヒト種に由来する１個または複数個のＣＤＲおよびヒト免疫グロブリン分子に由来するフレームワーク領域を含むキメラ抗体を、例えば、ＣＤＲ−移植（ＥＰ０２３９４００；国際公開ＷＯ９１／０９９６７；ならびに米国特許第５，２２５，５３９号、第５，５３０，１０１号、および第５，５８５，０８９号）、ベニアリング（ｖｅｎｅｅｒｉｎｇ）またはリサーフェシング（ｒｅｓｕｒｆａｃｉｎｇ）（ＥＰ０５９２１０６；ＥＰ０５１９５９６；Ｐａｄｌａｎ、１９９１、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  ２８（４／５）：４８９〜４９８；Ｓｔｕｄｎｉｃｋａら、１９９４、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ７：８０５；およびＲｏｇｕｓｋａら、１９９４、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：９６９）、ならびに鎖シャッフリング（米国特許第５，５６５，３３２号）などの、当技術分野で公知の様々な技術を用いて生成することができる。
【０３１３】
フレームワーク領域中のフレームワーク残基は、典型的には抗原結合を変化させる、好ましくは改善するためにＣＤＲドナー抗体に由来する対応する残基で置換される。これらのフレームワーク置換は、当技術分野で周知の方法により、例えば、抗原結合にとって重要なフレームワーク残基を同定するためのＣＤＲとフレームワーク残基との相互作用のモデリングおよび特定の位置での通常でないフレームワーク残基を同定するための配列比較により同定される（例えば、米国特許第５，５８５，０８９号；およびＲｉｅｃｈｍａｎｎら、１９８８、Ｎａｔｕｒｅ  ３３２：３２３（これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）。
【０３１４】
ヒト化抗体は、所定の抗原に結合することができ、実質的にヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有するフレームワーク領域と、実質的に非ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有するＣＤＲとを含む抗体またはそのバリアントもしくは断片である。ヒト化抗体は、全部または実質的に全部のＣＤＲ領域が非ヒト免疫グロブリン（すなわち、ドナー抗体）のものに対応し、全部または実質的に全部のフレームワーク領域がヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである、実質的に全部の少なくとも１個、および典型的には２個の可変ドメインを含む。好ましくは、ヒト化抗体はまた、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的には、ヒト免疫グロブリンのものを含む。通常、抗体は、軽鎖ならびに重鎖の少なくとも可変ドメインの両方を含有する。抗体はまた、重鎖のＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２、ＣＨ３およびＣＨ４（ＩｇＡおよびＩｇＭアイソタイプに関する）領域を含んでもよい。ヒト化抗体を、任意のクラスの免疫グロブリン、例えば、ＩｇＭ、ＩｇＧ、ＩｇＤ、ＩｇＡおよびＩｇＥならびに任意のアイソタイプ、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４から選択することができる。通常、定常ドメインは、ヒト化抗体が細胞傷害活性を示し、クラスが典型的にはヒトＩｇＧ１であることが望ましい補体固定定常ドメインである。そのような細胞傷害活性が望ましくない場合、定常ドメインはヒトＩｇＧ２クラスのものであってもよい。ヒト化抗体は、１つより多いクラスまたはアイソタイプに由来する配列を含んでもよく、所望のエフェクター機能を最適化するために特定の定常ドメインを選択することは当技術分野における通常の知識の範囲内にある。ヒト化抗体のフレームワークおよびＣＤＲ領域は、親配列と正確に一致する必要はなく、例えば、ドナーＣＤＲまたはコンセンサスフレームワークを、その部位でのＣＤＲまたはフレームワーク残基がコンセンサスまたは輸入抗体のいずれかと一致しないような少なくとも１個の残基の置換、挿入または欠失により突然変異誘発することができる。しかしながら、そのような突然変異は広範囲ではない。通常、少なくとも７５％、より頻繁には９０％、またはさらには９５％より多いヒト化抗体残基が、親フレームワーク領域（ＦＲ）およびＣＤＲ配列のものと一致する。
【０３１５】
ヒト化抗体を、限定されるものではないが、ＣＤＲ−移植（欧州特許第ＥＰ０２３９４００号；国際公開ＷＯ９１／０９９６７；ならびに米国特許第５，２２５，５３９号、第５，５３０，１０１号、および第５，５８５，０８９号）、ベニアリングまたはリサーフェシング（欧州特許第ＥＰ０５９２１０６号；第ＥＰ０５１９５９６号；Ｐａｄｌａｎ、１９９１、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  ２８（４／５）：４８９〜４９８；Ｓｔｕｄｎｉｃｋａら、１９９４、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ７（６）：８０５〜８１４；およびＲｏｇｕｓｋａら、１９９４、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：９６９〜９７３）、鎖シャッフリング（米国特許第５，５６５，３３２号）、ならびに例えば、米国特許第６，４０７，２１３号、第５，７６６，８８６号、第５，５８５，０８９号、国際公開ＷＯ９３１７１０５、Ｔａｎら、２００２、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：１１１９〜２５、Ｃａｌｄａｓら、２０００、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．１３：３５３〜３６０、Ｍｏｒｅａら、２０００、Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２０：２６７〜２７９、Ｂａｃａら、１９９７、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２：１０６７８〜１０６８４、Ｒｏｇｕｓｋａら、１９９６、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．９：８９５〜９０４、Ｃｏｕｔｏら、１９９５、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５５（２３  Ｓｕｐｐ）：５９７３ｓ〜５９７７ｓ、Ｃｏｕｔｏら、１９９５、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５５：１７１７〜１７２２、Ｓａｎｄｈｕ、１９９４、Ｇｅｎｅ  １５０：４０９〜４１０、Ｐｅｄｅｒｓｅｎら、１９９４、Ｊ．ＭｏＩ．Ｂｉｏｌ．２３５：９５９〜９７３、Ｊｏｎｅｓら、１９８６、Ｎａｔｕｒｅ  ３２１：５２２〜５２５、Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら、１９８８、Ｎａｔｕｒｅ  ３３２：３２３、およびＰｒｅｓｔａ、１９９２、Ｃｕｒｒ．Ｏｐ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．２：５９３〜５９６に開示された技術などの、当技術分野で公知の様々な技術を用いて生成することができる。しばしば、フレームワーク領域中のフレームワーク残基は、抗原結合を変化させる、好ましくは、改善するために、ＣＤＲドナー抗体に由来する対応する残基で置換される。これらのフレームワーク置換は、当技術分野で周知の方法により、例えば、抗原結合にとって重要なフレームワーク残基を同定するためのＣＤＲとフレームワーク残基との相互作用のモデリングおよび特定の位置での通常でないフレームワーク残基を同定するための配列比較により同定される（例えば、Ｑｕｅｅｎらの米国特許第５，５８５，０８９号；およびＲｉｅｃｈｍａｎｎら、１９８８、Ｎａｔｕｒｅ  ３３２：３２３（これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）。
【０３１６】
さらに、本開示の抗体を、順に、当業者には周知の技術を用いて抗イディオタイプ抗体を生成するために用いることができる（例えば、ＧｒｅｅｎｓｐａｎおよびＢｏｎａ、１９８９、ＦＡＳＥＢ  Ｊ．７：４３７〜４４４；ならびにＮｉｓｓｉｎｏｆｆ、１９９１、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：２４２９〜２４３８を参照されたい）。本開示は、本開示の抗体またはその断片をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドの使用を用いる方法を提供する。
【０３１７】
さらに、様々な刊行物が、ＦｃＲｎ結合ポリペプチドを生理的に活性な分子中に導入することにより（ＷＯ９７／４３３１６；米国特許第５，８６９，０４６号；米国特許第５，７４７，０３５号；ＷＯ９６／３２４７８；ＷＯ９１／１４４３８）、または前記分子を、ＦｃＲｎ結合親和性は保存されるが、他のＦｃ受容体に対する親和性は大きく減少した抗体と融合させる（ＷＯ９９／４３７１３）か、もしくは抗体のＦｃＲｎ結合ドメインと融合させる（ＷＯ００／０９５６０；米国特許第４，７０３，０３９号）ことにより、半減期が改変された前記分子を取得するための方法を記載している。生理学的に活性な分子の半減期を増加させる特定の技術および方法は、全ての目的に関して参照により本明細書に組み込まれる米国特許第７，０８３，７８４号に見出すこともできる。特に、本開示の抗体はアミノ酸残基突然変異（Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスにより番号付けられる）；Ｍ２５２Ｙ／Ｓ２５４Ｔ／Ｔ２５６ＥまたはＨ４３３Ｋ／Ｎ４３４Ｆ／Ｙ４３６Ｈを含むＦｃポリペプチドを含むことが考えられる。
【０３１８】
抗体をコードするポリヌクレオチド
当技術分野で公知の任意の方法により、ポリヌクレオチドを取得し、そのポリヌクレオチドのヌクレオチド配列を決定することができる。抗体のアミノ酸配列は公知であるため、これらの抗体をコードするヌクレオチド配列を、当技術分野で周知の方法を用いて決定することができる、すなわち、特定のアミノ酸をコードすることが知られるヌクレオチドコドンを、本開示の抗体またはその断片をコードする核酸を生成するような方法で集合させる。抗体をコードするそのようなポリヌクレオチドを、化学的に合成されたオリゴヌクレオチド（例えば、Ｋｕｔｍｅｉｅｒら、１９９４、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １７：２４２に記載）から集合させることができ、簡単に述べると、抗体をコードする配列の一部を含有する重複オリゴヌクレオチドの合成、これらのオリゴヌクレオチドのアニーリングおよびライゲーション、ならびに次いで、ＰＣＲによるライゲーションされたオリゴヌクレオチドの増幅を含む。
【０３１９】
あるいは、抗体をコードするポリヌクレオチドを、好適な供給源に由来する核酸から生成することができる。特定の抗体をコードする核酸を含有するクローンが入手可能でないが、抗体の配列が公知である場合、免疫グロブリンをコードする核酸を、化学的に合成するか、または好適な供給源、例えば、抗体ｃＤＮＡライブラリー、もしくは配列の３’および５’末端にハイブリダイズし得る合成プライマーを用いるＰＣＲ増幅により、もしくは例えば、抗体をコードするｃＤＮＡライブラリーに由来するｃＤＮＡクローンを同定するための特定の遺伝子配列に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを用いるクローニングにより、抗体を発現する任意の組織もしくは細胞から生成されたｃＤＮＡライブラリー、またはそれらから単離された核酸、好ましくは、ポリＡ＋ＲＮＡから取得することができる。次いで、ＰＣＲにより生成された増幅された核酸を、当技術分野で周知の任意の方法を用いて複製可能なクローニングベクター中にクローニングすることができる。
【０３２０】
抗体のヌクレオチド配列が決定されたら、抗体のヌクレオチド配列を、ヌクレオチド配列の操作のための当技術分野で周知の方法、例えば、組換えＤＮＡ技術、部位特異的突然変異誘発、ＰＣＲなど（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９９０、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹおよびＡｕｓｕｂｅｌら（編）、１９９８、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ、ＮＹ（両方ともその全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい）を用いて操作して、異なるアミノ酸配列を有する抗体を生成する、例えば、アミノ酸置換、欠失、および／または挿入を創製することができる。
【０３２１】
一実施形態においては、１個または複数個のＣＤＲを、日常的な組換えＤＮＡ技術を用いてフレームワーク領域内に挿入する。フレームワーク領域は、天然またはコンセンサスフレームワーク領域、好ましくは、ヒトフレームワーク領域であってもよい（例えば、ヒトフレームワーク領域の一覧についてはＣｈｏｔｈｉａら、１９９８、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２７８：４５７〜４７９を参照されたい）。好ましくは、フレームワーク領域とＣＤＲとの組合せにより生成されたポリヌクレオチドは、５Ｔ４、Ｈｅｒ２またはＶＥＧＦに特異的に結合する抗体をコードする。好ましくは、上記で論じられたように、１個または複数個のアミノ酸置換をフレームワーク領域内で作製してもよく、アミノ酸置換は抗体のその抗原への結合を改善するのが好ましい。さらに、そのような方法を用いて鎖内ジスルフィド結合に関与する１個または複数個の可変領域システイン残基のアミノ酸置換または欠失を作製して、１個または複数個の鎖内ジスルフィド結合を欠く抗体を生成することができる。ポリヌクレオチドに対する他の変更は本開示により包含され、当技術分野の知識内にある。
【０３２２】
操作された定常ドメイン（Ｆｃ、ＣκおよびＣλ）ポリペプチド、ならびに該ポリペプチドを含む抗体の組換え発現
本開示の操作された定常ドメインポリペプチド、またはその誘導体、類似体もしくは断片を含む、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２などの操作された抗体の組換え発現には、前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する発現ベクターの構築が必要である。一度、本開示の操作された抗体または抗体の操作された重鎖もしくは軽鎖、またはその一部をコードするポリヌクレオチドが得られたら、抗体またはそれを含む操作されたポリペプチドの生成のためのベクターを、当技術分野で周知の技術を用いる組換えＤＮＡ技術により生成することができる。したがって、抗体をコードするヌクレオチド配列を含有するポリヌクレオチドを発現させることによりタンパク質を調製するための方法が本明細書に記載される。当業者には周知である方法を用いて、抗体コード配列ならびに適切な転写および翻訳制御シグナルを含有する発現ベクターを構築することができる。これらの方法としては、例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ組換えＤＮＡ技術、合成技術、およびｉｎ  ｖｉｖｏ遺伝子組換えが挙げられる。
【０３２３】
したがって、本開示は、プロモーターに作動可能に連結した、本開示の抗体、抗体の重鎖もしくは軽鎖、抗体の重鎖もしくは軽鎖可変ドメインまたはその一部、または重鎖もしくは軽鎖ＣＤＲをコードするヌクレオチド配列を含む複製可能ベクターを提供する。そのようなベクターは、抗体の定常領域をコードするヌクレオチド配列（例えば、国際公開ＷＯ８６／０５８０７およびＷＯ８９／０１０３６；ならびに米国特許第５，１２２，４６４号を参照されたい）を含んでもよく、抗体の可変ドメインを、重鎖が本発明の操作されたＦｃ領域を含む、および／または軽鎖が本発明の操作されたＣκ領域を含む、重鎖全体、軽鎖全体、または重鎖全体と軽鎖全体の両方の発現のためにそのようなベクター中にクローニングすることができる。
【０３２４】
発現ベクターを、従来の技術（トランスフェクションおよび形質導入）により宿主細胞に導入した後、宿主細胞を従来の技術により培養して、本開示の抗体を生成させる。したがって、本開示は、操作されたＦｃポリペプチド、操作されたＣκもしくはＣλポリペプチド、またはそれを含む抗体、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２、またはその断片、またはその重鎖もしくは軽鎖、またはその一部、または本開示の一本鎖抗体、または異種プロモーターに作動可能に連結した本開示の操作されたＦｃポリペプチドを含む融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する宿主細胞を含む。二本鎖抗体の発現のための特定の実施形態において、重鎖と軽鎖の両方をコードするベクターを、以下に詳述するように全免疫グロブリン分子の発現のために宿主細胞中で同時発現させることができる。
【０３２５】
様々な宿主発現ベクター系を用いて、本開示の抗体および操作されたポリペプチドを発現させることができる（例えば、米国特許第５，８０７，７１５号を参照されたい）。そのような宿主発現系は、対象のコード配列を生成し、次いで精製することができるビヒクルであるが、適切なヌクレオチドコード配列で形質転換またはトランスフェクトした場合、本開示の抗体をｉｎ  ｓｉｔｕで発現することができる細胞でもある。これらのものとしては、限定されるものではないが、抗体コード配列を含有する組換えバクテリオファージＤＮＡ、プラスミドＤＮＡもしくはコスミドＤＮＡ発現ベクターで形質転換された細菌（例えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）および枯草菌（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ））などの微生物；抗体コード配列を含有する組換え酵母発現ベクターで形質転換された酵母（例えば、サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、ピチア（Ｐｉｃｈｉａ））；抗体コード配列を含有する組換えウイルス発現ベクター（例えば、バキュロウイルス）に感染させた昆虫細胞系；抗体コード配列を含有する組換えウイルス発現ベクター（例えば、カリフラワーモザイクウイルス、ＣａＭＶ；タバコモザイクウイルス、ＴＭＶ）に感染させた、もしくは組換えプラスミド発現ベクター（例えば、Ｔｉプラスミド）で形質転換された植物細胞系；または哺乳動物細胞のゲノムから誘導されるプロモーター（例えば、メタロチオネインプロモーター）もしくは哺乳動物ウイルスから誘導されるプロモーター（例えば、アデノウイルス後期プロモーター；ワクシニアウイルス７．５Ｋプロモーター）を含有する組換え発現構築物を担持する哺乳動物細胞系（例えば、ＣＯＳ、ＣＨＯ、ＢＨＫ、２９３、ＮＳ０、および３Ｔ３細胞）が挙げられる。好ましくは、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）などの細菌細胞、より好ましくは、特に組換え全抗体の発現のための真核細胞を、操作されたポリペプチドおよび／またはそれを含む組換え抗体の発現のために用いる。
【０３２６】
例えば、ヒトサイトメガロウイルスに由来する主要最初期遺伝子プロモーターエレメントを含むベクターと共に、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）などの哺乳動物細胞は、抗体のための有効な発現系である（Ｆｏｅｃｋｉｎｇら、１９８６、Ｇｅｎｅ  ４５：１０１；およびＣｏｃｋｅｔｔら、１９９０、ＢｉｏＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ８：２）。
【０３２７】
細菌系においては、いくつかの発現ベクターを、発現させる抗体のために意図される使用に応じて有利に選択することができる。例えば、抗体の医薬組成物の生成のために、大量のそのようなタンパク質を生成しようとする場合、容易に精製される高レベルの融合タンパク質生成物の発現を指令するベクターが望ましい。そのようなベクターとしては、限定されるものではないが、抗体コード配列を、ｌａｃＺコード領域と読み枠を合わせたベクター中に個別にライゲーションし、融合タンパク質を生成させることができる大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）発現ベクターｐＵＲ２７８（Ｒｕｔｈｅｒら、１９８３、ＥＭＢＯ  １２：１７９１）；ｐＦＮベクター（ＩｎｏｕｙｅおよびＩｎｏｕｙｅ、１９８５、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１３：３１０１〜３１０９；Ｖａｎ  ＨｅｅｋｅおよびＳｃｈｕｓｔｅｒ、１９８９、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２４：５５０３〜５５０９）などが挙げられる。ＰＧＥＸベクターを用いて、グルタチオン５−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）との融合タンパク質として外来ポリペプチドを発現させることもできる。一般に、そのような融合タンパク質は可溶性であり、マトリックスグルタチオン−アガロースビーズへの吸着および結合、次いで、遊離グルタチオンの存在下での溶出により、溶解された細胞から容易に精製することができる。ｐＧＥＸベクターは、クローニングされた標的遺伝子生成物をＧＳＴ部分から遊離させることができるように、トロンビンまたはＸａ因子プロテアーゼ切断部位を含むように設計される。
【０３２８】
昆虫系においては、オートグラファ・カリフォルニカ（Ａｕｔｏｇｒａｐｈａ  ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ）核多角体病ウイルス（ＡｃＮＰＶ）が、外来遺伝子を発現させるためのベクターとして用いられる。このウイルスは、スポドプテラ・フルギペルダ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ  ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ）細胞中で増殖する。抗体コード配列を、ウイルスの非必須領域中に個別にクローニングし、ＡｃＮＰＶプロモーターの制御下に置くことができる。
【０３２９】
哺乳動物宿主細胞においては、いくつかのウイルスに基づく発現系を用いることができる。アデノウイルスを発現ベクターとして用いる場合、対象の抗体コード配列を、アデノウイルス転写／翻訳制御複合体、例えば、後期プロモーターおよび三部分リーダー配列にライゲーションすることができる。次いで、このキメラ遺伝子を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏでの組換えにより、アデノウイルスゲノム中に挿入することができる。ウイルスゲノムの非必須領域（例えば、領域Ｅ１またはＥ３）中への挿入は、感染した宿主中で生存でき、抗体を発現することができる組換えウイルスをもたらす（例えば、ＬｏｇａｎおよびＳｈｅｎｋ、１９８４、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８１：６３５５〜６３５９を参照されたい）。また、挿入された抗体コード配列の効率的な翻訳のためには、特異的開始シグナルも必要であり得る。これらのシグナルは、ＡＴＧ開始コドンおよび隣接配列を含む。さらに、開始コドンは、全挿入物の翻訳を確保するために所望のコード配列の読み枠と同調する必要がある。これらの外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、天然および合成の両方の様々な起源のものであってもよい。発現の効率を、適切な転写エンハンサーエレメント、転写ターミネーターなどの含有により増強することができる（例えば、Ｂｉｔｔｎｅｒら、１９８７、Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５３：５１６〜５４４を参照されたい）。
【０３３０】
さらに、挿入された配列の発現を調節するか、または望ましい特定の様式で遺伝子生成物を改変および加工する宿主細胞株を選択することができる。タンパク質生成物のそのような改変（例えば、糖鎖付加）およびプロセッシング（例えば、切断）は、タンパク質の機能にとって重要であってもよい。異なる宿主細胞は、タンパク質および遺伝子生成物の翻訳後プロセッシングおよび改変のための特徴的で特異的な機構を有する。適切な細胞系または宿主系を選択して、発現される外来タンパク質の正確な改変およびプロセッシングを確保することができる。この目的のために、遺伝子生成物の一次転写物、糖鎖、およびリン酸化の適切なプロセッシングのための細胞機構を有する真核宿主細胞を用いることができる。そのような哺乳動物宿主細胞としては、限定されるものではないが、ＣＨＯ、ＶＥＲＯ、ＢＨＫ、ＨｅＬａ、ＣＯＳ、ＭＤＣＫ、２９３、３Ｔ３、Ｗ１３８、ＢＴ４８３、Ｈｓ５７８Ｔ、ＨＴＢ２、ＢＴ２Ｏ、ＮＳ１およびＴ４７Ｄ、ＮＳ０（免疫グロブリン鎖を内因的に生成しないマウスミエローマ細胞系）、ＣＲＬ７０３０およびＨｓＳ７８Ｂｓｔ細胞が挙げられる。
【０３３１】
一実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または本開示の操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドを含む抗体および融合タンパク質を、米国特許第７，５２１，５４１号および米国特許出願公開第２００９／０１７５８６５号（これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に開示された方法に従って生成する。
【０３３２】
組換えタンパク質の長期的な高収率の生成のためには、安定な発現が好ましい。例えば、抗体を安定に発現する細胞系を操作することができる。ウイルス複製起点を含有する発現ベクターを用いるよりもむしろ、適切な発現制御エレメント（例えば、プロモーター、エンハンサー、配列、転写ターミネーター、ポリアデニル化部位など）により制御されるＤＮＡ、ならびに選択マーカーを用いて宿主細胞を形質転換することができる。外来ＤＮＡの導入後、操作された細胞を、富化された培地中で１〜２日間増殖させた後、選択培地に切替えることができる。組換えプラスミド中の選択マーカーは、選択に対する耐性を付与し、細胞の染色体中にプラスミドを安定に組み込ませ、増殖させてフォーカスを形成させ、次いで、細胞系中にクローニングし、拡張することができる。この方法を有利に用いて、抗体を発現する細胞系を操作することができる。そのような操作された細胞系は、抗体と直接的または間接的に相互作用する組成物のスクリーニングおよび評価において特に有用であってよい。
【０３３３】
いくつかの選択系を用いることができ、限定されるものではないが、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（Ｗｉｇｌｅｒら、１９７７、Ｃｅｌｌ  １１：２２３）、グルタミン合成酵素、ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＳｚｙｂａｌｓｋａおよびＳｚｙｂａｌｓｋｉ、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ４８：２０２）、およびアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（Ｌｏｗｒｙら、１９８０、Ｃｅｌｌ  ２２：８〜１７）遺伝子を、それぞれ、ｔｋ−、ｇｓ−、ｈｇｐｒｔ−またはａｐｒｔ−細胞において用いることができる。また、代謝拮抗物質耐性を、以下の遺伝子に関する選択の基礎として用いることができる：メトトレキサートに対する耐性を付与するｄｈｆｒ（Ｗｉｇｌｅｒら、１９８０、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７７：３５７；Ｏ’Ｈａｒｅら、１９８１、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７８：１５２７）；ミコフェノール酸に対する耐性を付与するｇｐｔ（ＭｕｌｌｉｇａｎおよびＢｅｒｇ、１９８１、ＰＮＡＳ  ７８：２０７２）；アミノグリコシドＧ−４１８に対する耐性を付与するｎｅｏ（ＷｕおよびＷｕ、１９９１、Ｂｉｏｔｈｅｒａｐｙ  ３：８７；Ｔｏｌｓｔｏｓｈｅｖ、１９９３、Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｔｏｘｉｃｏｌ．３２：５７３；Ｍｕｌｌｉｇａｎ、１９９３、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６０：９２６；ならびにＭｏｒｇａｎおよびＡｎｄｅｒｓｏｎ、１９９３、Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．６２：１９１；Ｍａｙ、１９９３、ＴＩＢ  ＴＥＣＨ  １１：１５５）；およびヒグロマイシンに対する耐性を付与するｈｙｇｒｏ（Ｓａｎｔｅｒｒｅら、１９８４、Ｇｅｎｅ  ３０：１４７）を選択目的で用いることができる。組換えＤＮＡ技術の当技術分野で一般的に公知の方法を日常的に適用して所望の組換えクローンを選択することができ、そのような方法は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編）、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ、ＮＹ（１９９３）；Ｋｒｉｅｇｌｅｒ、Ｇｅｎｅ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ  ａｎｄ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ、Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、Ｓｔｏｃｋｔｏｎ  Ｐｒｅｓｓ、ＮＹ（１９９０）；ならびにＤｒａｃｏｐｏｌｉら（編）、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、第１２および１３章、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ、ＮＹ（１９９４）；Ｃｏｌｂｅｒｒｅ−Ｇａｒａｐｉｎら、１９８１、Ｊ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５０：１（これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。
【０３３４】
宿主細胞を、第１のベクターが重鎖由来ポリペプチドをコードし、第２のベクターが軽鎖由来ポリペプチドをコードする、本開示の２つの発現ベクターで同時トランスフェクトすることができる。２つのベクターは、重鎖および軽鎖ポリペプチドの同等の発現を可能にする同一の選択マーカーを含有してもよい。あるいは、重鎖と軽鎖ポリペプチドの両方をコードし、それを発現することができる単一のベクターを用いることができる。そのような状況では、軽鎖を重鎖の前に置いて、過剰の毒性の遊離重鎖を回避するべきである（Ｐｒｏｕｄｆｏｏｔ、１９８６、Ｎａｔｕｒｅ  ３２２：５２；およびＫｏｈｌｅｒ、１９８０、ＰＮＡＳ  ７７：２１９７）。重鎖および軽鎖のためのコード配列は、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡを含んでもよい。
【０３３５】
一度、操作されたＦｃポリペプチド、もしくは抗体、もしくはその抗原結合部分、または操作されたＦｃポリペプチドを含むＦｃ融合タンパク質、または操作されたＣκもしくはＣλポリペプチドが組換え発現により生成されたら、免疫グロブリン分子の精製のための当技術分野で公知の任意の方法により、例えば、クロマトグラフィー（例えば、イオン交換クロマトグラフィー、特に、プロテインＡ後の特異的抗原に対する親和性によるアフィニティクロマトグラフィー、またはサイズカラムクロマトグラフィー）、遠心分離、示差的溶解度、またはタンパク質の精製のための任意の他の標準的な技術によりそれを精製することができる。さらに、本開示のタンパク質またはその断片を、本明細書に記載の、またはさもなければ当技術分野で公知の異種ポリペプチド配列に融合させて、精製を容易にすることができる。
【０３３６】
抗体コンジュゲートおよび融合タンパク質
本開示は、異種の作用物質に組換えで融合された、または化学的にコンジュゲートされた（共有結合的および非共有結合的コンジュゲーションの両方を含む）、操作された抗体定常領域、例えば、Ｆｃおよび／またはＣγ、ＣκもしくはＣλ、およびそれを含む抗体（すなわち、「操作された抗体」）の使用を包含する。本開示はまた、操作された定常ドメイン領域、例えば、Ｆｃおよび／またはＣγ、ＣκもしくはＣλを含む操作されたＦａｂおよびＦ（ａｂ’）２も包含する。抗体免疫コンジュゲートは、特に、Ｆｒａｎｃｉｓｃｏら、２００３、Ｂｌｏｏｄ  １０２：１４５８〜１４６５、Ｄｏｒｏｎｉｎａら、２００８、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．  １９：１９６０〜１９６３、およびＤｏｓｉｏら、２０１１、Ｔｏｘｉｎｓ  ３：８４８〜８８３に記載されている。本開示の操作された抗体への結合のための好適な物質としては、限定されるものではないが、アミノ酸、ペプチド、タンパク質、多糖、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、核酸、ハプテン、薬物、ホルモン、脂質、脂質アセンブリ、合成ポリマー、ポリマー微粒子、生物細胞、ウイルス、フルオロフォア、発色団、色素、毒素、ハプテン、酵素、抗体、抗体断片、放射性同位体、固相マトリックス、半固体マトリックスおよびその組合せが挙げられる。
【０３３７】
抗体に別の物質をコンジュゲートさせるか、または共有結合させるための方法は、当技術分野で周知である。融合またはコンジュゲーションは直接的なものである必要はないが、リンカー配列を介して行ってもよい。異種の作用物質に融合されたか、またはコンジュゲートされた操作された抗体をｉｎ  ｖｉｖｏで用いて、当技術分野で公知の方法を用いて障害の進行を検出、処置、管理またはモニタリングすることができる。例えば、国際公開ＷＯ９３／２１２３２；ＥＰ０４３９０９５；Ｎａｒａｍｕｒａら、１９９４、Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｌｅｔｔ．３９：９１〜９９；米国特許第５，４７４，９８１号；Ｇｉｌｌｉｅｓら、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：１４２８〜１４３２；およびＦｅｌｌら、１９９１、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４６：２４４６〜２４５２（その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。いくつかの実施形態において、検出、処置、管理、またはモニタリングしようとする障害は、自己免疫疾患、炎症疾患、感染症またはがん関連障害である。抗体部分にポリペプチドを融合させるか、またはコンジュゲートさせるための方法は、当技術分野で公知である。例えば、米国特許第５，３３６，６０３号、第５，６２２，９２９号、第５，３５９，０４６号、第５，３４９，０５３号、第５，４４７，８５１号、および第５，１１２，９４６号；ＥＰ０３０７４３４；ＥＰ０３６７１６６；国際公開ＷＯ９６／０４３８８およびＷＯ９１／０６５７０；Ａｓｈｋｅｎａｚｉら、１９９１、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：１０５３５〜１０５３９；Ｚｈｅｎｇら、１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５４：５５９０〜５６００；ならびにＶｉｌら、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：１１３３７〜１１３４１（前記参考文献はその全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。
【０３３８】
さらなる融合タンパク質を、遺伝子シャッフリング、モチーフシャッフリング、エクソンシャッフリング、および／またはコドンシャッフリング（集合的に「ＤＮＡシャッフリング」と呼ばれる）の技術により生成することができる。ＤＮＡシャッフリングを用いて、本開示の操作された抗体の活性を変化させることができる（例えば、より高い親和性およびより低い解離速度を有する抗体）。一般的には、米国特許第５，６０５，７９３号；第５，８１１，２３８号；第５，８３０，７２１号；第５，８３４，２５２号；および第５，８３７，４５８号、ならびにＰａｔｔｅｎら、１９９７、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８：７２４〜３３；Ｈａｒａｙａｍａ、１９９８、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１６：７６；Ｈａｎｓｓｏｎら、１９９９、Ｊ．ＭｏＩ．Ｂｉｏｌ．２８７：２６５；ならびにＬｏｒｅｎｚｏおよびＢｌａｓｃｏ、１９９８、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ２４：３０８（これらの特許および刊行物はそれぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。抗体もしくはその断片、またはコードされた抗体もしくはその断片を、エラープローンＰＣＲ、無作為ヌクレオチド挿入または他の方法により無作為突然変異誘発にかけた後、組換えることにより変化させることができる。抗体または抗体断片をコードするポリヌクレオチドの１つまたは複数の部分を、１つまたは複数の異種の作用物質の１つまたは複数の成分、モチーフ、セクション、部分、ドメイン、断片などで組換えることができる。
【０３３９】
ある特定の実施形態においては、操作されたＦｃ領域、Ｃκ領域、およびＣλ領域、またはそれらを含む本開示の抗体を、固相支持体にコンジュゲートする。抗体をスクリーニングおよび／または精製および／または製造プロセスの一部として固相支持体にコンジュゲートさせることができる。あるいは、本開示の抗体を、診断方法または組成物の一部として固相支持体にコンジュゲートさせることができる。本開示における使用にとって好適な固相支持体は、典型的には、実質的に液相に不溶性である。多数の支持体が入手可能であり、当業者には公知である。したがって、固相支持体としては、固体および半固体マトリックス、例えば、エアロゲルおよびヒドロゲル、樹脂、ビーズ、バイオチップ（薄層被覆バイオチップなど）、マイクロ流体チップ、シリコンチップ、多ウェルプレート（マイクロタイタープレートまたはマイクロプレートとも呼ばれる）、膜、伝導性および非伝導性金属、ガラス（顕微鏡スライドなど）および磁気支持体が挙げられる。
【０３４０】
いくつかの実施形態において、固相支持体は、本開示の操作された抗体を結合させるための、限定されるものではないが、ヒドロキシル、カルボキシル、アミノ、チオール、アルデヒド、ハロゲン、ニトロ、シアノ、アミド、ウレア、カルボネート、カルバメート、イソシアネート、スルホン、スルホネート、スルホンアミド、スルホキシドなどの反応性官能基を含んでもよい。
【０３４１】
一実施形態において、本開示の操作された抗体またはその断片もしくはバリアントを、ペプチドなどのマーカー配列にコンジュゲートまたは融合させて、精製を容易にする。特定の実施形態において、マーカーアミノ酸配列は、ｐＱＥベクター（ＱＩＡＧＥＮ，Ｉｎｃ．、Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ、ＣＡ）中で提供されるタグなどのヘキサヒスチジンペプチドであり、特に、その多くは市販されている。Ｇｅｎｔｚら、１９８９、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：８２１に記載のように、例えば、ヘキサヒスチジンは、融合タンパク質の都合の良い精製を提供する。精製にとって有用な他のペプチドタグとしては、限定されるものではないが、インフルエンザヘマグルチニンタンパク質から誘導されるエピトープに対応するヘマグルチニン「ＨＡ」タグ（Ｗｉｌｓｏｎら、１９８４、Ｃｅｌｌ  ３７：７６７）および「フラッグ」タグが挙げられる。
【０３４２】
他の実施形態においては、本開示の操作された抗体を、診断または検出剤にコンジュゲートまたは融合させる。そのような操作された抗体は、特定の療法の効果を決定することなど、臨床試験手順の一部として障害（限定されるものではないが、がんなど）の発生または進行をモニタリングまたは予後診断するのに有用であり得る。
【０３４３】
そのような診断および検出を、限定されるものではないが、西洋わさびペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼなどの様々な酵素；限定されるものではないが、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンなどの補欠分子族；限定されるものではないが、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンなどの蛍光材料；限定されるものではないが、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンなどの生物発光材料などの発光材料；限定されるものではないが、ビスマス（２１３Ｂｉ）、炭素（１４Ｃ）、クロム（５１Ｃｒ）、コバルト（５７Ｃｏ）、フッ素（１８Ｆ）、ガドリニウム（１５３Ｇｄ、１５９Ｇｄ）、ガリウム（６８Ｇａ、６７Ｇａ）、ゲルマニウム（６８Ｇｅ）、ホルミウム（１６６Ｈｏ）、インジウム（１１５Ｉｎ、１１３Ｉｎ、１１２Ｉｎ、１１１Ｉｎ）、ヨウ素（１３１Ｉ、１２５Ｉ、１２３Ｉ、１２１Ｉ）、ランタン（１４０Ｌａ）、ルテチウム（１７７Ｌｕ）、マンガン（５４Ｍｎ）、モリブデン（９９Ｍｏ）、パラジウム（１０３Ｐｄ）、リン（３２Ｐ）、プラセオジミウム（１４２Ｐｒ）、プロメチウム（１４９Ｐｍ）、レニウム（１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ）、ロジウム（１０５Ｒｈ）、ルテミウム（９７Ｒｕ）、サマリウム（１５３Ｓｍ）、スカンジウム（４７Ｓｃ）、セレン（７５Ｓｅ）、ストロンチウム（８５Ｓｒ）、硫黄（３５Ｓ）、テクネチウム（９９Ｔｃ）、タリウム（２０１Ｔｉ）、スズ（１１３Ｓｎ、１１７Ｓｎ）、トリチウム（３Ｈ）、キセノン（１３３Ｘｅ）、イッテルビウム（１６９Ｙｂ、１７３Ｙｂ）、イットリウム（９０Ｙ）、亜鉛（６５Ｚｎ）などの放射性材料；様々なポジトロン放出断層撮影を用いるポジトロン放出金属、および非放射性常磁性金属イオンなどの検出物質に操作された抗体を融合させるか、または部位特異的にコンジュゲートすることにより達成することができる。
【０３４４】
他の実施形態において、本開示の操作された抗体を、細胞毒素、例えば、細胞増殖抑制剤もしくは細胞破壊剤、治療剤または放射性金属イオン、例えば、アルファ放射体などの治療剤にコンジュゲートする。細胞毒素または細胞傷害性剤は、細胞に対して有害である任意の作用物質を含む。例としては、パクリタキセル、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、エチジウムブロミド、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、糖質コルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、エピルビシン、およびシクロホスファミドならびにその類似体または相同体が挙げられる。治療剤としては、限定されるものではないが、代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルデカルバジン）、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオエパクロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＣＮＵ）およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロトスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、およびシスジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（以前はダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（以前はアクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン（ＡＭＣ））、ならびに抗有糸分裂剤（例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン）が挙げられる。化学的毒素を、デュオカルミシン（米国特許第５，７０３，０８０号；第４，９２３，９９０号）、メトトレキサート、ドキソルビシン、メルファラン、クロラムブシル、ＡＲＡ−Ｃ、ビンデシン、マイトマイシンＣ、シスプラチン、エトポシド、ブレオマイシンおよび５−フルオロウラシルから選択される群から取ることもできる。化学療法剤の例としては、アドリアマイシン、ドキソルビシン、５−フルオロウラシル、シトシンアラビノシド（Ａｒａ−Ｃ）、シクロホスファミド、チオテパ、タキソテール（ドセタキセル）、ブスルファン、サイトキシン、タキソール、メトトレキサート、シスプラチン、メルファラン、ビンブラスチン、ブレオマイシン、エトポシド、イフォスファミド、マイトマイシンＣ、ミトキサントロン、ビンクリスチン、ビノレルビン、カルボプラチン、テニポシド、ダウノマイシン、カルミノマイシン、アミノプテリン、ダクチノマイシン、マイトマイシン、エスペラミシン（米国特許第４，６７５，１８７号）、メルファラン、および他の関連する窒素マスタードも挙げられる。
【０３４５】
一実施形態において、細胞傷害性剤は、エネジイン、レキシトロプシン、デュオカルミシン、タキサン、ピューロマイシン、ドラスタチン、メイタンシノイド、およびビンカアルカロイドから選択される。他の実施形態において、細胞傷害性剤は、パクリタキセル、ドセタキセル、ＣＣ−１０６５、ＳＮ−３８、トポテカン、モルホリノ−ドキソルビシン、リゾキシン、シアノモルホリノ−ドキソルビシン、ドラスタチン−１０、エキノマイシン、コンブレタスタチン、カリケアミシン、メイタンシン、メイタンシノイド薬１（ＤＭ−１）、オーリスタチンまたは他のドラスタチン誘導体、例えば、オーリスタチンＥもしくはオーリスタチンＦ、ＡＥＢ、ＡＥＶＢ、ＡＥＦＰ、ＭＭＡＤ（モノメチルオーリスタチンＤ）、ＭＭＡＥ（モノメチルオーリスタチンＥ）、ＭＭＡＦ（モノメチルオーリスタチンＦ）、エレウテロビンまたはネトロプシンである。ドラスタチン−１０としても当技術分野で知られるオーリスタチンＥ、およびその誘導体の合成および構造は、米国特許出願公開第２００３／００８３２６３号および第２００５／０００９７５１号；国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ０２／１３４３５、米国特許第６，３２３，３１５号；第６，２３９，１０４号；第６，０３４，０６５号；第５，７８０，５８８号；第５，６６５，８６０号；第５，６６３，１４９号；第５，６３５，４８３号；第５，５９９，９０２号；第５，５５４，７２５号；第５，５３０，０９７号；第５，５２１，２８４号；第５，５０４，１９１号；第５，４１０，０２４号；第５，１３８，０３６号；第５，０７６，９７３号；第４，９８６，９８８号；第４，９７８，７４４号；第４，８７９，２７８号；第４，８１６，４４４号；および第４，４８６，４１４号（全てその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。
【０３４６】
いくつかの実施形態において、細胞傷害性剤は、あたかもその全体が本明細書に記載されるように参照により本明細書に組み込まれる２０１２年１１月７日に出願された国際特許出願ＰＣＴ／ＩＢ２０１２／０５６２２４に開示された新規細胞毒素である。そのような新規細胞傷害性剤としては、限定されるものではないが、その合成をさらに開示する出願中に記載の０１０１（＃５４）、３３７７（＃１１５）、および８２６１（＃６９）が挙げられる。
【０３４７】
ある特定の実施形態において、細胞傷害性剤は、操作された定常領域（Ｆｃを含むＣγ、Ｃλ、Ｃκ）を含む本開示の抗体（完全長または断片）が、１つまたは複数のメイタンシノイド分子に、操作されたアミノ酸置換において部位特異的にコンジュゲートされた、メイタンシンまたはメイタンシノイド、およびその誘導体である。メイタンシノイドは、チューブリンポリマー化を阻害することにより作用する有糸分裂阻害剤である。メイタンシンは、東アフリカの低木であるメイテヌス・セラッタ（Ｍａｙｔｅｎｕｓ  ｓｅｒｒａｔａ）から初めて単離されたものであり（米国特許第３，８９６，１１１号）、例えば、メイタンシノールおよびＣ−３メイタンシノールエステル（米国特許第４，１５１，０４２号）などのさらなるメイタンシノイドが他の特定の微生物から後に単離された。合成メイタンシノールならびにその誘導体および類似体は、例えば、米国特許第４，１３７，２３０号；第４，２４８，８７０号；第４，２５６，７４６号；第４，２６０，６０８号；第４，２６５，８１４号；第４，２９４，７５７号；第４，３０７，０１６号；第４，３０８，２６８号；第４，３０８，２６９号；第４，３０９，４２８号；第４，３１３，９４６号；第４，３１５，９２９号；第４，３１７，８２１号；第４，３２２，３４８号；第４，３３１，５９８号；第４，３６１，６５０号；第４，３６４，８６６号；第４，４２４，２１９号；第４，４５０，２５４号；第４，３６２，６６３号；および第４，３７１，５３３号に開示されている。
【０３４８】
抗体に非特異的にコンジュゲートされたメイタンシノイドを含む免疫コンジュゲートおよびその治療的使用は、例えば、米国特許第５，２０８，０２０号、第５，４１６，０６４号、および欧州特許ＥＰ０４２５２３５；Ｌｉｕら、１９９６、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ９３：８６１８〜８６２３（ヒト結腸直腸がんを標的化するｍＡｂ  Ｃ２４２に非特異的にコンジュゲートされたＤＭ１を含む免疫コンジュゲート）；Ｃｈａｒｉら、１９９２、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ５２：１２７〜１３１（マウス抗結腸がん細胞ｍＡｂ  Ａ７またはマウスｍＡｂ  ＴＡ．１抗ＨＥＲ−２）に開示されている。したがって、本開示は、特定のがんの治療的処置のためのメイタンシノイド剤に部位特異的にコンジュゲートされた操作された抗体を意図する。
【０３４９】
特定の実施形態において、薬物はメイタンシノイドである。より特定の実施形態においては、薬物はメイタンシンである。さらに、特定の実施形態において、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤は、ＤＭ−１（ＩｍｍｕｎｏＧｅｎ，Ｉｎｃ．；Ｃｈａｒｉら、１９９２、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ５２：１２７〜１３１も参照されたい）である。
【０３５０】
他の実施形態において、本開示の操作された抗体コンジュゲートの細胞傷害性剤は、抗チューブリン剤である。抗チューブリン剤は、定評のあるクラスのがん療法化合物である。抗チューブリン剤の例としては、限定されるものではないが、タキサン（例えば、Ｔａｘｏｌ（登録商標）（パクリタキセル）、ドセタキセル）、Ｔ６７（Ｔｕｌａｒｉｋ）、ビンカ、およびオーリスタチン（例えば、特に、オーリスタチンＥ、ＡＥＢ、ＡＥＶＢ、ＡＥＦＰ、ＭＭＡＤ、ＭＭＡＥ、ＭＭＡＦ）が挙げられる。また、このクラスに含まれる抗チューブリン剤は、ビンカアルカロイド、例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン、ビンデシンおよびビノレルビン；タキサン、例えば、パクリタキセルおよびドセタキセルおよびバッカチン誘導体、エピチロンＡおよびＢ、ノコダゾール、５−フルオロウラシルおよびコルシミド、エストラムスチン、クリプトフィシン、セマドチン、メイタンシノイド、コンブレタスタチン、ドラスタチン、ジスコデルモリドおよびエレウテロビンである。より特定の実施形態においては、細胞傷害性剤は、ビンカアルカロイド、ポドフィロトキシン、タキサン、バッカチン誘導体、クリプトフィシン、メイタンシノイド、コンブレタスタチン、およびドラスタチンから選択される。
【０３５１】
より特定の実施形態においては、細胞傷害性剤は、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシン、ビノレルビン、ＶＰ−１６、カンプトテシン、パクリタキセル、ドセタキセル、エピチロンＡ、エピチロンＢ、ノコダゾール、コルヒチン、コルシミド、エストラムスチン、セマドチン、ジスコデルモリド、メイタンシン、ＤＭ−１、オーリスタチンもしくは他のドラスタチン誘導体、例えば、オーリスタチンＥもしくはオーリスタチンＦ、ＡＥＢ、ＡＥＶＢ、ＡＥＦＰ、ＭＭＡＤ（モノメチルオーリスタチンＤ）、ＭＭＡＥ（モノメチルオーリスタチンＥ）、ＭＭＡＦ（モノメチルオーリスタチンＦ）、エレウテロビンまたはネトロプシンである。
【０３５２】
いくつかの実施形態においては、操作されたＦｃ領域を含む本開示の抗体を、限定されるものではないが、アブリン、ブルシン、シクトキシン、ジフテリア毒素、バトラコトキシン、ボツリヌス毒素、シガ毒素、内毒素、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）外毒素、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）内毒素、破傷風毒素、百日咳毒素、炭疽菌毒素、コレラ毒素、ファルカリノール、フモニシンＢ１、フモニシンＢ２、アルファ毒素、モーロトキシン、アジトキシン、カリブドトキシン、マルガトキシン、スロトキシン、スキラトキシン、ヘフトキシン、カルシセプチン、タイカトキシン、カルシクルジン、ゲルダナマイシン、ゲロニン、ロタウストラリン、オクラトキシンＡ、パツリン、リシン（ｒｉｃｉｎ）、ストリキニン、トリコテセン、ゼアラレノン、およびテトラドトキシンなどの、他の低分子またはタンパク質毒素にコンジュゲートまたは融合させることができる。用いることができる酵素活性毒素およびその断片としては、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合活性断片、外毒素Ａ鎖（シュードモナス・エルギノーサ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）由来）、リシン（ｒｉｃｉｎ）Ａ鎖、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、アルファ−サルシン、アレウリテス・フォルジ（Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ  ｆｏｒｄｉｉ）タンパク質、ジアンチンタンパク質、フィトラカ・アメリカーナ（Ｐｈｙｔｏｌａｃａ  ａｍｅｒｉｃａｎａ）タンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ、およびＰＡＰ−Ｓ）、モモルディカ・カランチア（Ｍｏｍｏｒｄｉｃａ  ｃｈａｒａｎｔｉａ）阻害剤、クルシン、クロチン、サパオナリア・オフィシナリス（Ｓａｐａｏｎａｒｉａ  ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ）阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシンおよびトリコテセンが挙げられる。
【０３５３】
毒素、スペーサー、リンカー、ストレッチャーなどのさらなる例、およびその構造を、米国特許出願公開第２００６／００７４００８号、第２００５／０２３８６４９号、第２００５／０１２３５３６号、第２００５／０１８０９７２号、第２００５／０１１３３０８号、第２００４／０１５７７８２号、米国特許第６，８８４，８６９号、米国特許第５，６３５，４８３号（全てその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に見出すことができる。
【０３５４】
本明細書の前記で論じられたように、本開示の抗体コンジュゲートへのコンジュゲーションに用いられる化合物は、従来の化学療法剤、例えば、ドキソルビシン、パクリタキセル、カルボプラチン、メルファラン、ビンカアルカロイド、メトトレキサート、マイトマイシンＣ、エトポシドなどを含んでもよい。さらに、ＣＣ−１０６５類似体、カリケアミシン、メイタンシン、ドラスタチン１０の類似体、リゾキシン、およびパリトキシンなどの強力な作用物質を、Ｆｃ領域中で提供される操作されたコンジュゲーション部位で抗体に連結して、強力な免疫コンジュゲートを提供することができる。
【０３５５】
ある特定の実施形態において、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤は、ドラスタチンである。より特定の実施形態において、ドラスタチンは、オーリスタチンクラスのものである。本開示の特定の実施形態において、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤は、ＭＭＡＤである。本開示の別の特定の実施形態において、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤は、ＭＭＡＥである。本開示のさらに別の特定の実施形態において、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤は、ＭＭＡＦである。
【０３５６】
他の実施形態において、本開示の抗体または操作された定常ドメイン、またはその一部を、所与の生物学的応答を改変する治療剤または薬物部分にコンジュゲートまたは融合させる。
【０３５７】
治療剤または薬物部分は、古典的な化学療法剤に限定されると解釈されるべきではない。例えば、薬物部分は、所望の生物活性を有するタンパク質またはポリペプチドであってもよい。そのようなタンパク質は、例えば、アブリン、リシン（ｒｉｃｉｎ）Ａ、シュードモナス外毒素、コレラ毒素、またはジフテリア毒素などの毒素；腫瘍壊死因子、アルファ−インターフェロン、ベータ−インターフェロン、神経増殖因子、血小板由来増殖因子、組織プラスミノーゲン活性化因子、アポトーシス剤、例えば、ＴＮＦ−ａ、ＴＮＦ−ベータ、ＡＩＭ  Ｉ（国際公開ＷＯ９７／３３８９９を参照されたい）、ＡＩＭ  ＩＩ（国際公開ＷＯ９７／３４９１１を参照されたい）、Ｆａｓリガンド（Ｔａｋａｈａｓｈｉら、１９９４、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．６：１５６７）およびＶＥＧＦ（国際公開ＷＯ９９／２３１０５を参照されたい）、血栓剤もしくは抗血管新生剤、例えば、アンギオスタチンもしくはエンドスタチンなどのタンパク質；または例えば、リンホカイン（例えば、インターロイキン−１（「ＩＬ−１」）、インターロイキン−２（「ＩＬ−２」）、インターロイキン−４（「ＩＬ−４」）、インターロイキン−６（「ＩＬ−６」）、インターロイキン−７（「ＩＬ−７」）、インターロイキン−９（「ＩＬ−９」）、インターロイキン−１０（「ＩＬ−１０」）、インターロイキン−１５（「ＩＬ−１５」）、インターロイキン−１２（「ＩＬ−１２」）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（「ＧＭ−ＣＳＦ」）、および顆粒球コロニー刺激因子（「Ｇ−ＣＳＦ」））、もしくは増殖因子（例えば、増殖ホルモン（「ＧＨ」））などの生物応答改変剤、ならびに前記分子のいずれかの受容体、もしくはそのリガンド結合部分を含んでもよい。
【０３５８】
他の実施形態において、本開示の操作された抗体を、ポリアルギニンまたはポリリシン残基を含むポリペプチドに特異的にコンジュゲートする。いくつかの実施形態においては、前記ポリペプチドは、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態においては、ポリアルギニンポリペプチドは、少なくとも５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のアルギニン残基を含んでもよい。他の実施形態においては、ポリリシンポリペプチドは、少なくとも５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５個以上のリシン残基を含んでもよい。他の実施形態においては、ポリペプチドはアルギニン残基とリシン残基の任意の組合せを含んでもよい。
【０３５９】
他の実施形態において、本開示の操作された抗体を、放射性金属イオンをコンジュゲートさせるのに有用な放射性材料または大環状キレーターなどの治療剤にコンジュゲートする（放射性材料の例については上記を参照されたい）。ある特定の実施形態において、大環状キレーターは、リンカー分子を介して抗体に結合させることができる１，４，７，１０−テトラアザシクロドデカン−Ｎ，Ｎ’，Ｎ’’，Ｎ’’−四酢酸（ＤＯＴＡ）である。本明細書の以下でさらに論じられるそのようなリンカー分子は、当技術分野で一般に公知であり、Ｄｅｎａｒｄｏら、１９９８、Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．４：２４８３〜９０；Ｐｅｔｅｒｓｏｎら、１９９９、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ．Ｃｈｅｍ．１０：５５３；およびＺｉｍｍｅｒｍａｎら、１９９９、Ｎｕｃｌ．Ｍｅｄ．Ｂｉｏｌ．２６：９４３〜５０（それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。
【０３６０】
他の実施形態において、本開示の操作された抗体を、核酸にコンジュゲートする。核酸を、ＤＮＡ、ＲＮＡ、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ、ヘアピンまたは核酸模倣体、例えば、ペプチド核酸から選択することができる。いくつかの実施形態においては、コンジュゲートされる核酸は、少なくとも１０、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも６０、少なくとも１００、少なくとも２００、少なくとも５００、少なくとも１０００、少なくとも５０００個以上の塩基対である。いくつかの実施形態において、コンジュゲートされる核酸は、一本鎖である。代替的な実施形態において、コンジュゲートされる核酸は、二本鎖である。
【０３６１】
細胞への核酸の送達のための技術を、Ｓｏｎｇら、２００５、Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２３（６）：７０９〜７１７およびまた米国特許第６，３３３，３９６号（これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に見出すことができる。
【０３６２】
コンジュゲーション方法
抗体に治療部分をコンジュゲートさせるための技術は周知である。限定されるものではないが、アルデヒド／Ｓｃｈｉｆｆ連結、スルフヒドリル連結、酸不安定連結、ｃｉｓ−アコニチル連結、ヒドラゾン連結、酵素分解性連結（一般的には、Ｇａｒｎｅｔｔ、２００２、Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．５３：１７１〜２１６を参照されたい）などの、当技術分野で公知の任意の方法により、部分を抗体にコンジュゲートさせることができる。抗体に治療部分をコンジュゲートさせるためのさらなる技術が周知であり、例えば、Ａｒｎｏｎら、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ、Ｒｅｉｓｆｅｌｄら（編）、ｐｐ．２４３〜５６（Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．１９８５）；Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍら、Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ（第２版）、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら（編）、ｐｐ．６２３〜５３（Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．１９８７）；Ｔｈｏｒｐｅ、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、Ｐｉｎｃｈｅｒａら（編）、ｐｐ．４７５〜５０６（１９８５）；Ｂａｌｄｗｉｎら（編）、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ、ｐｐ．３０３〜３１６（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９８５）、およびＴｈｏｒｐｅら、１９８２、Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．６２：１１９〜１５８を参照されたい。
【０３６３】
ポリペプチド部分に抗体を融合またはコンジュゲートさせるための方法は、当技術分野で公知である。例えば、米国特許第５，３３６，６０３号、第５，６２２，９２９号、第５，３５９，０４６号、第５，３４９，０５３号、第５，４４７，８５１号、および第５，１１２，９４６号；ＥＰ０３０７４３４；ＥＰ０３６７１６６；国際公開ＷＯ９６／０４３８８およびＷＯ９１／０６５７０；Ａｓｈｋｅｎａｚｉら、１９９１、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：１０５３５〜１０５３９；Ｚｈｅｎｇら、１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５４：５５９０〜５６００；ならびにＶｉｌら、１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：１１３３７〜１１３４１を参照されたい。ある部分への抗体の融合は直接的である必要はなく、リンカー配列を介して行うことができる。そのようなリンカー分子は当技術分野で一般に公知であり、Ｄｅｎａｒｄｏら、１９９８、Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．４：２４８３〜９０；Ｐｅｔｅｒｓｏｎら、１９９９、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ．Ｃｈｅｍ．１０：５５３；Ｚｉｍｍｅｒｍａｎら、１９９９、Ｎｕｃｌ．Ｍｅｄ．Ｂｉｏｌ  ２６：９４３〜５０；Ｇａｒｎｅｔｔ、２００２、Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．５３：１７１〜２１６；Ｆｒａｎｃｉｓｃｏら、２００３、Ｂｌｏｏｄ  １０２：１４５８〜１４６５；Ｄｏｒｏｎｉｎａら、２００８、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．１９：１９６０〜１９６３；およびＤｏｓｉｏら、２０１１、Ｔｏｘｉｎｓ  ３：８４８〜８８３（それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。
【０３６４】
本開示の抗体コンジュゲートにより標的化される細胞の外部での薬物活性を最小化するために、２つの例示的な手法を取ることができる：第１に、細胞膜受容体に結合するが、可溶性受容体には結合しない抗体を用いて、プロドラッグ変換酵素の作用により生成される薬物などの薬物を、活性化リンパ球などの細胞の細胞表面に集中させる；第２に、薬物が加水分解されるか、または抗体から切断されない限り、その活性を低下させる様式で、薬物をコンジュゲートさせる。そのような方法は、活性化リンパ球の細胞表面での環境（例えば、活性化リンパ球の細胞表面に存在するプロテアーゼの活性）またはコンジュゲートが活性化リンパ球によって取り込まれる場合にコンジュゲートが遭遇する活性化リンパ球の内部の環境（例えば、エンドソーム中、または例えば、ｐＨ感受性もしくはプロテアーゼ感受性の理由から、リソソーム環境中）に対して感受性であるリンカーを有する抗体に、薬物を結合させることを用いる。本開示において用いることができるリンカーの例は、米国特許出願公開第２００５／０１２３５３６号、第２００５／０１８０９７２号、第２００５／０１１３３０８号、第２００４／０１５７７８２号、および米国特許第６，８８４，８６９号（全てその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に開示されている。
【０３６５】
一実施形態において、リンカーは、リソソーム中で加水分解される酸不安定性ヒドラゾンまたはヒドラジド基である（例えば、米国特許第５，６２２，９２９号を参照されたい）。代替的な実施形態においては、ｃｉｓ−アコニットアミド、オルトエステル、アセタールおよびケタールなどの他の酸不安定性リンカーを介して、薬物を抗体にコンジュゲートさせることができる（ＤｕｂｏｗｃｈｉｋおよびＷａｌｋｅｒ、１９９９、Ｐｈａｒｍ．Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ  ８３：６７〜１２３；Ｎｅｖｉｌｌｅら、１９８９、Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６４：１４６５３〜１４６６１）。そのようなリンカーは、血液中などの中性ｐＨ条件下では比較的安定であるが、リソソームのおよそのｐＨであるｐＨ５より下では不安定である。
【０３６６】
他の実施形態においては、細胞内プロテアーゼにより切断されるペプチドスペーサーを用いて、操作された反応部位で本開示の抗体に薬物を結合させる。標的酵素としては、カテプシンＢおよびＤならびにプラスミンが挙げられ、それらは全て、標的細胞の内部で活性薬物の放出をもたらすジペプチド薬物誘導体を加水分解することが知られる（ＤｕｂｏｗｃｈｉｋおよびＷａｌｋｅｒ、１９９９、Ｐｈａｒｍ．Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ  ８３：６７〜１２３）。細胞内タンパク質分解的薬物放出を用いる利点は、コンジュゲートさせた場合に薬物が高度に弱体化され、コンジュゲートの血清安定性を極端に高くすることができるということである。
【０３６７】
一実施形態において、カテプシンＢ感受性ジペプチドリンカーは、例えば、全ての目的に関してその全体が参照により本明細書に組み込まれるＧｅｒｂｅｒら、２００９、Ｂｌｏｏｄ  １１３（１８）：４３５２〜４３６１に記載のバリン−シトルリン（本明細書では「ｖａｌ−ｃｉｔ」または「ＶａｌＣｉｔ」と呼ばれる）である。
【０３６８】
一実施形態において、操作された抗体の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκポリペプチドを、切断可能リンカー、例えば、限定されるものではないが、特に、ｖａｌ−ｃｉｔ−ＭＭＡＤ、ｖａｌ−ｃｉｔ−ＭＭＡＥ、およびｖａｌ−ｃｉｔ−ＭＭＡＦなどの、オーリスタチンにコンジュゲートさせた、ｖａｌ−ｃｉｔに部位特異的にコンジュゲートさせる。
【０３６９】
一実施形態において、本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκポリペプチド、または前記ポリペプチドを含む操作された抗体を、非切断可能リンカー、例えば、限定されるものではないが、特に、ｍｃ−ＭＭＡＤ、ｍｃ−ＭＭＡＥ、およびｍｃ−ＭＭＡＦなどの、オーリスタチンにコンジュゲートさせた、マレイミドカプロイル（ｍｃまたはｍａｌ−ｃ）に部位特異的にコンジュゲートさせる。本明細書で用いられる「マレイミド」は、「ｍａｌ」により表すことができる。
【０３７０】
他の実施形態において、非切断可能リンカーを用いて、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤を、操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκポリペプチド、または本開示の操作されたポリペプチドを含む操作された抗体に部位特異的にコンジュゲートさせることができる。非切断可能リンカーとしては、限定されるものではないが、Ｌｅｅら、２００９、Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．２００９  １０１：１１９３〜１２０５に記載のものなどのマレイミドカプロイル（ｍｃ）リンカーが挙げられる（マレイミドカプロイルリンカーを用いてＭＭＡＦを抗ＥｐｈＡ２抗体とコンジュゲートさせる）。
【０３７１】
さらに他の実施形態においては、リンカーはマロネートリンカー（Ｊｏｈｎｓｏｎら、１９９５、Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１５：１３８７〜１３９３）、マレイミドベンゾイルリンカー（Ｌａｕら、１９９５、Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３（１０）：１２９９〜１３０４）、または３’−Ｎ−アミド類似体（Ｌａｕら、１９９５、Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３（１０）：１３０５〜１３１２）である。
【０３７２】
マレイミド基およびスペーサー（ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）など）を用いる連結化合物が、システイン、リシン、セレノシステイン、およびセレノメタオニン（ｓｅｌｅｎｏｍｅｔｈａｉｏｎｉｎｅ）置換にとって好適である。ヒスチジン置換については、コンジュゲーションのために金属（銅、亜鉛、鉄、ニッケルなど）と共役させたスペーサーを用いることができる。チロシンについては、糖または他のヒドロキシル化合物中に存在する官能基にコンジュゲートさせることができる。これらの、および他の好適なコンジュゲーション技術の詳細は、当業者には公知であり、例えば、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、第２版、Ｇｒｅｇ．Ｔ．Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ（２００８）に見出すことができる。
【０３７３】
いくつかの実施形態において、操作されたＦｃポリペプチドおよび／または操作されたＣκポリペプチドまたは本開示の操作された抗体を、限定されるものではないが、特に、−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−（ＰＥＧ２−Ｃ２）、−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］３ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−（ＰＥＧ３−Ｃ２）および−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］６ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−（ＰＥＧ６−Ｃ２）などのスペーサーをさらに含む切断可能または非切断可能リンカーを介して細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤に部位特異的にコンジュゲートさせる。他の実施形態において、非切断可能リンカーを、限定されるものではないが、ＰＥＧ２−Ｃ２、ＰＥＧ３−Ｃ２およびＰＥＧ６−Ｃ２などのスペーサーにマレイミドカプロイル連結して、特に、リンカー−スペーサー部分ｍｃ−ＰＥＧ２−Ｃ２、ｍｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２、およびｍｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２を形成させる。他の実施形態においては、リンカーは、限定されるものではないが、ＰＥＧ２−Ｃ２、ＰＥＧ３−Ｃ２およびＰＥＧ６−Ｃ２などのスペーサー部分にコンジュゲートさせて、特に、ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＥＧ２−Ｃ２、ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＥＧ３−Ｃ２およびｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＥＧ６−Ｃ２などのリンカー−スペーサー部分を形成する、カテプシンＢ切断に感受性である、限定されるものではないが、バリン−シトルリンなどの切断可能リンカーである。
【０３７４】
いくつかの実施形態において、切断可能リンカー−スペーサー部分を、限定されるものではないが、ＭＭＡＤ、ＭＭＡＥ、ＭＭＡＦ、０１０１、３３７７および８２６１などのオーリスタチンにコンジュゲートする。いくつかの実施形態において、リンカー−スペーサー−オーリスタチンは、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＭＭＡＤ（ｖｃ−ＭＭＡＤ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＭＭＡＥ（ｖｃ−ＭＭＡＥ）およびｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＭＭＡＦ（ｖｃ−ＭＭＡＦ）を包含する。本明細書で用いられる「パラアミノベンジルオキシカルボニル」は、「ＰＡＢＣ」により表される。いくつかの実施形態において、リンカー−スペーサー−オーリスタチンは、特に、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＤ（ｖｃ−ＰＥＧ−Ｃ２−ＭＭＡＤ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＤ（ｖｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＤ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＤ（ｖｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＤ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＥ（ｖｃ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＥ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＥ（ｖｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＥ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＥ（ｖｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＥ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＦ（ｖｃ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＦ）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＦ（ｖｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＦ）、およびｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＦ（ｖｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＦ）を包含する。
【０３７５】
他の実施形態において、非切断可能リンカー−スペーサー部分を、限定されるものではないが、ＭＭＡＤ、ＭＭＡＥ、ＭＭＡＦ、０１０１、３３７７、および８２６１などのオーリスタチンにさらにコンジュゲートする。いくつかの実施形態において、リンカー−スペーサー−オーリスタチンは、特に、ｍｃ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＤ、ｍｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＤ、ｍｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＤ、ｍｃ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＥ、ｍｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＥ、ｍｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＥ、ｍｃ−ＰＥＧ２−Ｃ２−ＭＭＡＦ、ｍｃ−ＰＥＧ３−Ｃ２−ＭＭＡＦ、およびｍｃ−ＰＥＧ６−Ｃ２−ＭＭＡＦを包含する。
【０３７６】
いくつかの実施形態において、細胞傷害性剤を、リンカーを介して操作されたＦｃポリペプチドにコンジュゲートする。他の実施形態において、リンカーは、ｍｃ（マレイミドカプロイル）、ｖａｌ−ｃｉｔ（バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルカルバメート）、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］３ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］６ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））であってもよい。
【０３７７】
別の実施形態において、細胞傷害性剤を、限定されるものではないが、本明細書に記載のリンカーまたは当技術分野で公知のリンカーなどのリンカーを介して、操作された抗体定常ドメインポリペプチド、またはその一部にコンジュゲートし、細胞傷害性剤は特に、オーリスタチン、メイタンシノイドおよびカリケアミシンである。
【０３７８】
いくつかの実施形態において、導入されたシステインを含む、操作された抗体定常ドメインポリペプチド、またはその一部を、リンカーを介してコンジュゲートし、細胞傷害性剤組合せとしては、限定されるものではないが、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＤ（ｍｃＭＭＡＤ）、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＥ（ｍｃＭＭＡＥ）、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＦ（ｍｃＭＭＡＦ）、マレイミドカプロイル−０１０１（ｍｃ０１０１）、マレイミドカプロイル−３３７７（ｍｃ３３７７）、マレイミドカプロイル−８２６１（ｍｃ８２６１）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ（ｖｃＭＭＡＤ）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＥ（ｖｃＭＭＡＥ）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＦ（ｖｃＭＭＡＦ）、バリン−シトルリン−０１０１（ｖｃ０１０１）、バリン−シトルリン−３３７７（ｖｃ３３７７）、バリン−シトルリン−８２６１（ｖｃ８２６１）、ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ）、ｍｃＶａｌＣｉｔＭＭＡＥ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＥ）、ｍｃＶａｌＣｉｔＭＭＡＦ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＦ）、ｍｃＶａｌＣｉｔ０１０１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−０１０１）、ｍｃＶａｌＣｉｔ３３７７（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−３３７７）、ｍｃＶａｌＣｉｔ８２６１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−８２６１）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＥ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＥ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＥ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＦ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＦ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＦ、ＰＥＧ２Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−０１０１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−０１０１、ＰＥＧ２Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−３３７７、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−３３７７、ＰＥＧ２Ｃ２−８２６１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−８２６１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−８２６１などが挙げられる。
【０３７９】
いくつかの実施形態において、細胞傷害性剤を、リンカーを介して操作されたＣκポリペプチドにコンジュゲートする。他の実施形態において、リンカーは、ｍｃ（マレイミドカプロイル）、ｖａｌ−ｃｉｔ（バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン）、ｍｃ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢＣ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−ｐ−アミノベンジルカルバメート）、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］２ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２（マレイミド−［ＣＨ２ＣＨ２Ｏ］６ＣＨ２ＣＨ２Ｃ（＝Ｏ））であってもよい。
【０３８０】
いくつかの実施形態において、細胞傷害性剤を、リンカーを介して、操作された抗体定常ドメイン（例えば、Ｃγ、ＣκおよびＣλ）ポリペプチド、またはその一部にコンジュゲートし、細胞傷害性剤に対して、リンカーおよび細胞傷害性剤は、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＤ（ｍｃＭＭＡＤ）、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＥ（ｍｃＭＭＡＥ）、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＦ（ｍｃＭＭＡＦ）、マレイミドカプロイル−０１０１（ｍｃ０１０１）、マレイミドカプロイル−３３７７（ｍｃ３３７７）、マレイミドカプロイル−８２６１（ｍｃ８２６１）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ（ｖｃＭＭＡＤ）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＥ（ｖｃＭＭＡＥ）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＦ（ｖｃＭＭＡＦ）、バリン−シトルリン−０１０１（ｖｃ０１０１）、バリン−シトルリン−３３７７（ｖｃ３３７７）、バリン−シトルリン−８２６１（ｖｃ８２６１）、ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ）、ｍｃＶａｌＣｉｔＭＭＡＥ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＥ）、ｍｃＶａｌＣｉｔＭＭＡＦ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＦ）、ｍｃＶａｌＣｉｔ０１０１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−０１０１）、ｍｃＶａｌＣｉｔ３３７７（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−３３７７）、ｍｃＶａｌＣｉｔ８２６１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−８２６１）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＥ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＥ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＥ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＦ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＦ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＦ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−０１０１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−３３７７、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−８２６１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−８２６１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−８２６１からなる群から選択される。
【０３８１】
別の実施形態において、細胞傷害性剤を、限定されるものではないが、本明細書に記載のリンカーまたは当技術分野で公知のリンカーなどのリンカーを介して操作されたＣκポリペプチドにコンジュゲートし、細胞傷害性剤は、特に、オーリスタチン、メイタンシノイドおよびカリケアミシンである。
【０３８２】
いくつかの実施形態において、導入されたシステインを含む操作されたＣκまたはＣλポリペプチドを、リンカーを介してコンジュゲートし、細胞傷害性剤組合せとしては、当技術分野で公知の、または本明細書に開示される多くの他のリンカー／細胞傷害性剤組合せのうち、限定されるものではないが、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＤ（ｍｃＭＭＡＤ）、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＥ（ｍｃＭＭＡＥ）、マレイミドカプロイル−モノメチルオーリスタチンＦ（ｍｃＭＭＡＦ）、マレイミドカプロイル−０１０１（ｍｃ０１０１）、マレイミドカプロイル−３３７７（ｍｃ３３７７）、マレイミドカプロイル−８２６１（ｍｃ８２６１）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ（ｖｃＭＭＡＤ）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＥ（ｖｃＭＭＡＥ）、バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＦ（ｖｃＭＭＡＦ）、バリン−シトルリン−０１０１（ｖｃ０１０１）、バリン−シトルリン−３３７７（ｖｃ３３７７）、バリン−シトルリン−８２６１（ｖｃ８２６１）、ｍｃＶａｌＣｉｔＰＡＢＣＭＭＡＤ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＤ）、ｍｃＶａｌＣｉｔＭＭＡＥ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＥ）、ｍｃＶａｌＣｉｔＭＭＡＦ（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−モノメチルオーリスタチンＦ）、ｍｃＶａｌＣｉｔ０１０１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−０１０１）、ｍｃＶａｌＣｉｔ３３７７（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−３３７７）、ｍｃＶａｌＣｉｔ８２６１（マレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−８２６１）、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＥ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＥ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＥ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−ＭＭＡＦ、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＦ、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＦ、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−０１０１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−０１０１、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−３３７７、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−３３７７、Ｍａｌ−ＰＥＧ２Ｃ２−８２６１、Ｍａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−８２６１、およびＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−８２６１、が挙げられる。
【０３８３】
上記で論じられた通り、操作された抗体コンジュゲートは一般に、リンカーを介して、化合物または薬物を操作された抗体、または操作されたＦｃポリペプチドおよび／もしくは操作されたＣκポリペプチドにコンジュゲートさせることにより作製される。例えば、二官能性作用物質（ジアルデヒドもしくはイミドエステルなど）または分枝ヒドラゾンリンカー（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第５，８２４，８０５号を参照されたい）などの、当技術分野で公知の任意のリンカーを、本開示のコンジュゲートにおいて用いることができる。
【０３８４】
本開示のある特定の非限定的実施形態において、コンジュゲート部分と、操作された抗体／操作されたＦｃ／Ｃκポリペプチド部分との間のリンカー領域は、ある特定の条件下で切断可能であり、リンカーの切断または加水分解は、抗体／操作されたＦｃ／Ｃκ部分から薬物部分を遊離させる。いくつかの実施形態において、リンカーは、細胞内条件下で切断または加水分解に対して感受性である。
【０３８５】
一実施形態において、コンジュゲート部分と、操作された抗体部分との間のリンカー領域は、ｐＨがある特定の値により変化するか、またはある特定の値を超える場合、切断可能である。本開示の別の実施形態において、リンカーは、例えば、酸性条件下で（すなわち、約５〜５．５以下のｐＨ）、リソソームの環境中で切断可能である。他の実施形態において、リンカーは、限定されるものではないが、リソソームプロテアーゼ酵素、膜会合型プロテアーゼ、細胞内プロテアーゼ、またはエンドソームプロテアーゼなどのペプチダーゼまたはプロテアーゼ酵素により切断されるペプチジルリンカーである。典型的には、リンカーは、少なくとも２アミノ酸長、より典型的には、少なくとも３アミノ酸長である。例えば、カテプシンＢにより切断可能であるペプチジルリンカー（例えば、特に、Ｖａｌ−Ｃｉｔリンカー、Ｇｌｙ−Ｐｈｅ−Ｌｅｕ−Ｇｌｙリンカー）、がん組織中で高度に発現されるチオール依存的プロテアーゼを用いることができる。他のそのようなリンカーは、例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第６，２１４，３４５号に記載されている。
【０３８６】
本開示の他の相互に排他的ではない実施形態において、本開示の操作された抗体および抗体コンジュゲートの化合物がコンジュゲートされたリンカーは、細胞内在化を促進する。特定の実施形態において、リンカー−薬物部分は、細胞内在化を促進する。特定の実施形態において、抗体コンジュゲート全体の構造が細胞内在化を促進するようなリンカーが選択される。一実施形態において、リンカーは、チオエーテルリンカーである（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第５，６２２，９２９号を参照されたい）。別の実施形態において、リンカーは、ヒドラゾンリンカーである（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第５，１２２，３６８号および第５，８２４，８０５号を参照されたい）。
【０３８７】
さらに他の実施形態において、リンカーは、ジスルフィドリンカーである。様々なジスルフィドリンカーが当技術分野で公知であり、限定されるものではないが、ＳＡＴＡ（Ｎ−スクシンイミジル−Ｓ−アセチルチオアセテート）、ＳＰＤＰ（Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルジ−チオ）プロピオネート）、ＳＰＤＢ（Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルジチオ）ブチレート）およびＳＭＰＴ（Ｎ−スクシンイミジル−オキシカルボニル−アルファ−メチル−アルファ−（２−ピリジル−ジチオ）トルエン）を用いて形成させることができるものが挙げられる。ＳＰＤＢおよびＳＭＰＴ（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｔｈｏｒｐｅら、１９８７、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．、４７：５９２４〜５９３１；Ｗａｗｒｚｙｎｃｚａｋら、１９８７、Ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ：Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ  ｉｎ  Ｒａｄｉｏｉｍａｇｅｒｙ  ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ｏｆ  Ｃａｎｃｅｒ、Ｃ．Ｗ．Ｖｏｇｅｌ（編）、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕ．Ｐｒｅｓｓ、ｐｐ．２８〜５５を参照されたい；また、米国特許第４，８８０，９３５号も参照されたい）。
【０３８８】
本開示の組成物および方法と共に用いることができる様々なリンカーが、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第ＵＳ２００４／００１８１９４Ａ１号に記載されている。
【０３８９】
グリシンのａ位置で置換されるアミン含有薬物の除去（Ｋｉｎｇｓｂｕｒｙら、Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．、１９８４、２７、１４４７）も、本開示の抗体−リンカー−薬物コンジュゲートに適用することができる自壊型スペーサー戦略の例である。
【０３９０】
本開示のさらに他の実施形態において、抗体コンジュゲートのリンカー単位は、細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤（薬物；−Ｄ）と、抗体（−Ａｂ）とを連結する。ある特定の実施形態において、リンカー単位は、一般式：
−Ｔａ−Ｗｗ−Ｙｙ−
（式中、
ｉ．−Ｔ−はストレッチャー単位であり；
ｉｉ．ａは０または１であり；
ｉｉｉ．−Ｗ−はそれぞれ独立にアミノ酸単位であり；
ｉｖ．ｗは独立に２〜１２の範囲の整数であり；
ｖ．−Ｙ−はスペーサー単位であり；および
ｖｉ．ｙは０、１または２である）
を有する。
【０３９１】
存在する場合、ストレッチャー単位（−Ｔ−）は、抗体単位をアミノ酸単位（−Ｗ−）に連結する。天然に、または化学的操作を介して、抗体上に存在してもよい有用な官能基としては、限定されるものではないが、スルフヒドリル、アミノ、ヒドロキシル、炭水化物のアノマーヒドロキシル基、およびカルボキシルが挙げられる。システインが導入された本開示の操作された抗体は、コンジュゲーションのための少なくとも１個のスルフヒドリル基を提供する。スルフヒドリル基を導入する他の方法は、抗体の分子内ジスルフィド結合の還元を含む。あるいは、抗体の操作されたリシン部分のアミノ基（導入された）と、２−イミノチオラン（Ｔｒａｕｔ試薬）または他のスルフヒドリル生成試薬との反応により、スルフヒドリル基を生成することができる。
【０３９２】
アミノ酸単位（−Ｗ−）は、スペーサー単位が存在する場合、ストレッチャー単位（−Ｔ−）をスペーサー単位（−Ｙ−）に連結し、スペーサー単位が存在しない場合、ストレッチャー単位を細胞傷害性剤または細胞増殖抑制剤（薬物；Ｄ）に連結する。
【０３９３】
いくつかの実施形態において、−Ｗｗ−は、ジペプチド、トリペプチド、テトラペプチド、ペンタペプチド、ヘキサペプチド、ヘプタペプチド、オクタペプチド、ノナペプチド、デカペプチド、ウンデカペプチドまたはドデカペプチド単位である。リンカー単位のアミノ酸単位を、限定されるものではないが、腫瘍関連プロテアーゼ、カテプシンＢ、カテプシンＤ、プラスミンなどの酵素により酵素的に切断して、放出の際にｉｎ  ｖｉｖｏでプロトン化される薬物（−Ｄ）を遊離させ、細胞傷害性剤（Ｄ）を提供することができる。
【０３９４】
一実施形態において、アミノ酸単位は、フェニルアラニン−リシンジペプチド（ｐｈｅ−ｌｙｓまたはＦＫリンカー）である。別の実施形態において、アミノ酸単位は、バリン−シトルリンジペプチド（ｖａｌ−ｃｉｔ）である。
【０３９５】
存在する場合、スペーサー単位（−Ｙ−）は、アミノ酸単位を薬物単位に連結する。スペーサー単位は、２つの一般的な型のものである：自壊型および非自壊型。非自壊型スペーサー単位は、スペーサー単位の一部または全部が、抗体−リンカー−薬物コンジュゲートまたは薬物−リンカー化合物からのアミノ酸単位の酵素的切断後にも薬物単位に結合したままである。非自壊型スペーサー単位の例としては、限定されるものではないが、（グリシン−グリシン）スペーサー単位およびグリシンスペーサー単位が挙げられる。グリシン−グリシンスペーサー単位またはグリシンスペーサー単位を含有する本開示の抗体−リンカー−薬物コンジュゲートが腫瘍細胞関連プロテアーゼ、がん細胞関連プロテアーゼまたはリンパ球関連プロテアーゼを介する酵素的切断を受ける場合、グリシン−グリシン−薬物部分またはグリシン−薬物部分はＡｂ−Ｔ−Ｗｗ−から切断される。薬物を遊離させるためには、標的細胞内で独立した加水分解反応を行って、グリシン−薬物単位結合を切断するべきである。
【０３９６】
自壊型スペーサーの他の例としては、限定されるものではないが、パラアミノベンジルオキシカルボニル（ＰＡＢＣ）ならびに２−アミノイミダゾール−５−メタノール誘導体（例えば、Ｈａｙら、１９９９、Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．９：２２３７を参照されたい）およびオルト−またはパラ−アミノベンジルアセタールなどのＰＡＢＣ基と電気的に同等である芳香族化合物が挙げられる。置換および無置換４−アミノ酪酸アミド（Ｒｏｄｒｉｇｕｅｓら、Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｂｉｏｌｏｇｙ、１９９５、２、２２３）、適切に置換された環系（Ｓｔｏｒｍら、Ｊ．Ａｍｅｒ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ、１９７２、９４、５８１５）および２−アミノフェニルプロピオン酸アミド（Ａｍｓｂｅｒｒｙら、Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．、１９９０、５５、５８６７）などの、アミド結合加水分解の際に容易な環化を受けるスペーサーを用いることができる。
【０３９７】
異種分子を操作された定常ドメインにコンジュゲートさせる方法
本明細書に記載のものなどの異種分子を、操作されたアミノ酸残基が提供する反応基を介して、本開示の操作されたＦｃ領域および／または操作されたＣκ領域および／または操作されたＣλ領域を含む操作された抗体に効率的にコンジュゲートさせることができる。一態様において、本開示は、異種分子をシステイン操作された抗体に効率的にコンジュゲートさせるための方法を提供する。一実施形態において、異種分子のコンジュゲーションは、Ｆｃ領域またはＦｃポリペプチドを含む抗体の、２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の操作された残基により提供される反応基で起こってもよく、ここで、定常領域の番号付けシステムは、Ｋａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである。さらなる態様において、反応基はチオールであり、異種分子のコンジュゲーションは、ＦｃポリペプチドまたはＦｃポリペプチドを含む抗体の、２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の操作されたシステイン残基により提供されるチオール基で起こってもよく、ここで、定常領域の番号付けシステムはＫａｂａｔに記載のＥＵインデックスのものである。
【０３９８】
一実施形態において、異種分子のコンジュゲーションは、操作されたＣκポリペプチドまたは操作されたＣκポリペプチドを含む操作された抗体の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７、および２１０位から選択される少なくとも１個の操作された残基により提供される反応基で起こってもよく、ここで、定常領域の番号付けシステムはＫａｂａｔに記載のＫａｂａｔの番号付けシステムのものである。さらなる態様において、反応基はチオールであり、異種分子のコンジュゲーションは、操作されたＣκポリペプチドまたは操作されたＣκポリペプチドを含む操作された抗体の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも１個の操作されたシステイン残基により提供されるチオール基で起こってもよく、ここで定常領域の番号付けシステムはＫａｂａｔに記載のＫａｂａｔの番号付けシステムのものである。
【０３９９】
抗体中への非天然システイン残基の操作は、ジスルフィド結合の一部であった天然のシステイン残基が遊離され、コンジュゲートすることができるチオール基を提供するように、重鎖と軽鎖とのジスルフィド対形成を変化させることができる。別の実施形態において、前記方法は、抗体のＦｃ領域の２４６、２４９、２６５、２６７、２７０、２７６、２７８、２８３、２９２、２９３、２９４、３００、３０２、３０３、３１４、３１５、３１８、３２０、３３２、３３３、３３４、３３６、３４５、３４７、３５４、３５５、３５８、３６０、３６２、３７０、３７３、３７６、３７８、３８０、３８２、３８６、３８８、３９０、３９２、３９３、４０１、４０４、４１１、４１３、４１４、４１６、４１８、４１９、４２１、４２８、４３１、４３２、４３７、４３８、４３９、４４３、および４４４位から選択される少なくとも１個の操作されたシステイン残基により提供されるチオール基でのシステイン操作された抗体への異種分子の効率的なコンジュゲーションを含む。
【０４００】
抗体中への非天然システイン残基の操作は、ジスルフィド結合の一部であった天然システイン残基が遊離され、コンジュゲートすることができるチオール基を提供するように、重鎖と軽鎖とのジスルフィド対形成を変化させることができる。別の実施形態において、前記方法は、抗体のＣκ領域の１１１、１４９、１８３、１８８、２０７および２１０位から選択される少なくとも１個の操作されたシステイン残基により提供されるチオール基でのシステイン操作された抗体への異種分子の効率的なコンジュゲーションを含む。
【０４０１】
抗体中の遊離チオール基の存在を、本明細書の以下に記載のものなどの様々な当技術分野で許容される技術によって決定することができる。抗体への異種分子のコンジュゲーションの効率を、コンジュゲーション反応後に残存する遊離チオールの存在を評価することによって決定することができる。一実施形態において、本開示は、システイン操作抗体に異種分子を効率的にコンジュゲートさせる方法を提供する。一実施形態においては、コンジュゲーション効率は、コンジュゲーション反応後に残存する遊離チオール基のレベルにより測定された場合、少なくとも５％、少なくとも２０％、少なくとも５０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％以上である。
【０４０２】
別の実施形態において、本開示は、抗体またはＦｃ、Ｃκおよび／またはＣλ領域が少なくとも１個のアミノ酸置換を含み、２個以上の反応基が形成されるような、抗体のＦａｂもしくはＦ（ａｂ’）２、または操作されたＦｃ領域および／またはＣκ領域もしくはＣλなどの操作された抗体に異種分子をコンジュゲートさせる方法を提供する。別の実施形態において、前記方法は、少なくとも２、少なくとも４、少なくとも６、少なくとも８、少なくとも１０、少なくとも１２、少なくとも１４、少なくとも１６、少なくとも１８、少なくとも２０個以上の新しく導入された反応基が形成されるような、少なくとも１個のアミノ酸置換を含む操作されたＦｃポリペプチド、操作されたＣκポリペプチド、操作されたＣλポリペプチド、または操作された抗体を含む。さらなる実施形態において、少なくとも１個の置換はシステインによるものであり、反応基はチオール基である。
【０４０３】
コンジュゲートすることができる本開示の操作された定常領域（Ｆｃ、ＣκおよびＣλ）、およびそれらを含む抗体は、遮断されたか、またはキャップ付きのスルフヒドリル基を含むシステイン残基を含有してもよい。そのようなキャップとしては、スルフヒドリル基と相互作用し、コンジュゲート形成を防止または阻害するタンパク質、ペプチド、イオンおよび他の材料が挙げられる。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、コンジュゲーション反応の前にアンキャッピングを要してもよい。特定の実施形態において、操作された定常領域（Ｆｃ、ＣκおよびＣλ）、ならびに該ポリペプチドを含む本開示の操作された抗体は、アンキャッピングされ、コンジュゲートすることができるスルフヒドリル基を提示する。他の特定の実施形態において、本開示の抗体は、天然のジスルフィド結合の最小限の破壊または再配置をもたらすアンキャッピング反応にかけられる。いくつかの実施形態において、天然ジスルフィド結合破壊のレベルは、未処理のポリペプチドにおける破壊のレベルと比較して、約３０％から検出不可能なレベルの範囲であってもよい。他の実施形態において、本開示の抗体は、国際特許出願公開ＷＯ２００８／１４１０４４、ＷＯ２００９／０９２０１１、およびＷＯ２０１０／１４１１９０２に提供されたようなアンキャッピング反応にかけられる。
【０４０４】
いくつかの実施形態において、本開示の操作された抗体を、コンジュゲートされる抗体が少なくとも１ｍｇ／ｍｌ、少なくとも２ｍｇ／ｍｌ、少なくとも３ｍｇ／ｍｌ、少なくとも４ｍｇ／ｍｌ、少なくとも５ｍｇ／ｍｌ、少なくとも８ｍｇ／ｍｌ、少なくとも１０ｍｇ／ｍｌ、少なくとも１３ｍｇ／ｍｌ、少なくとも１４ｍｇ／ｍｌ、少なくとも１５ｍｇ／ｍｌ、少なくとも１６ｍｇ／ｍｌ以上の濃度で存在するコンジュゲーション反応にかけることができる。
【０４０５】
操作された抗体コンジュゲートの使用方法
Ａ．診断のための操作された抗体コンジュゲートの使用
操作された抗体コンジュゲートを、画像診断のために用いることができる。例えば、操作された抗体コンジュゲートは、放射標識モノクローナル抗体であってもよい。例えば、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ（編）、Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｉｍａｇｉｎｇ  Ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ、Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｒｅｓｓ（１９８８）；Ｃｈａｓｅ、「Ｍｅｄｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  Ｒａｄｉｏｉｓｏｔｏｐｅｓ」、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第１８版、Ｇｅｎｎａｒｏら（編）、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．、ｐｐ．６２４〜６５２（１９９０）；およびＢｒｏｗｎ、「Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｕｓｅ  ｏｆ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ」、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｐｈａｒｍａｃｙ、Ｐｅｚｚｕｔｏら（編）、Ｃｈａｐｍａｎ  ａｎｄ  Ｈａｌｌ、ｐｐ．２２７〜２４９（１９９３）を参照されたい。イムノシンチグラフィーとしても知られるこの技術は、モノクローナル抗体にコンジュゲートされたガンマ線を放射する放射性同位体の位置を検出するためにガンマカメラを用いる。画像診断を用いて、がん、自己免疫疾患、感染症および／または心血管疾患を診断することができる（例えば、Ｂｒｏｗｎら、上掲を参照されたい）。
【０４０６】
一実施形態において、操作された抗体コンジュゲートを用いて、心血管疾患を診断することができる。例えば、抗ミオシン抗体断片を含む操作された抗体コンジュゲートを、急性心筋梗塞に伴う心筋壊死を画像化するために用いることができる。血小板またはフィブリンに結合する抗体断片を含む操作された抗体コンジュゲートを、深静脈血栓症を画像化するために用いることができる。さらに、活性化された血小板に結合する抗体断片を含む操作された抗体コンジュゲートを、アテローム性動脈硬化プラークを画像化するために用いることができる。
【０４０７】
操作された抗体コンジュゲートを、感染症の診断において用いることもできる。例えば、特定の細菌抗原に結合する抗体断片を含む操作された抗体コンジュゲートを用いて、膿瘍の位置を特定することができる。さらに、顆粒球および炎症白血球に結合する抗体断片を含む操作された抗体コンジュゲートを用いて、細菌感染の部位を特定することができる。
【０４０８】
いくつかの研究が、がんのシンチグラフィー検出のためのモノクローナル抗体の使用を評価してきた。例えば、Ｂｒｏｗｎ、上掲を参照されたい。調査は、メラノーマ、結腸直腸がん、卵巣がん、乳がん、肉腫、および肺がんなどの主要な型の固形腫瘍を包含していた。したがって、本発明はまた、がんを検出するための腫瘍マーカーに結合する抗体断片を含む操作された抗体コンジュゲートを用いるがんの検出を意図する。そのような腫瘍マーカーの例としては、がん胎児抗原、アルファ−フェトタンパク質、がん遺伝子生成物、腫瘍関連細胞表面抗原、および壊死関連細胞内抗原、ならびに上記で論じられた腫瘍関連抗原および腫瘍特異的抗原が挙げられる。
【０４０９】
診断に加えて、モノクローナル抗体画像化を用いて、治療応答をモニタリングする、疾患の再発を検出する、およびその後の臨床決定を指導することができる。
【０４１０】
診断およびモニタリングのために、中間官能基を用いることにより、直接的または間接的に、放射性同位体を抗体断片に結合させることができる。そのような中間官能基としては、例えば、ＤＴＰＡ（ジエチレントリアミン五酢酸）およびＥＤＴＡ（エチレンジアミン四酢酸）が挙げられる。患者に送達される放射線用量は、典型的には、できるだけ低いレベルに維持する。これを、体内での最小の半減期、最小の滞留、ならびに検出および正確な測定を許容する最小限の同位体量の最良の組合せのための同位体の選択により達成することができる。抗体に結合させることができ、画像診断にとって適切である放射性同位体の例としては、９９ｍＴｃおよび１１１Ｉｎが挙げられる。
【０４１１】
研究は、抗体断片、特に、ＦａｂおよびＦａｂ’が好適な腫瘍／バックグラウンド比を提供することを示している（例えば、Ｂｒｏｗｎ、上掲を参照されたい）。
【０４１２】
操作された抗体コンジュゲートを、ｉｎ  ｖｉｖｏでの診断のために常磁性イオンで標識することもできる。磁気共鳴画像化にとって特に有用である元素としては、Ｇｄ、Ｍｎ、ＤｙおよびＦｅイオンが挙げられる。
【０４１３】
操作された抗体コンジュゲートは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで特定の抗原の存在を検出することもできる。そのような免疫アッセイにおいては、操作された抗体コンジュゲートを、液相中で用いるか、または固相担体に結合させることができる。例えば、インタクトな抗体、またはその抗原結合断片を、アミノデキストランなどのポリマーに結合させて、抗体成分をポリマー被覆ビーズ、プレート、またはチューブなどの不溶性支持体に連結することができる。
【０４１４】
あるいは、操作された抗体コンジュゲートを用いて、組織標本から調製された組織切片中の特定の抗原の存在を検出することができる。そのようなｉｎ  ｓｉｔｕでの検出を、例えば、検出可能に標識された免疫コンジュゲートを組織切片に適用することにより達成することができる。ｉｎ  ｓｉｔｕ検出を用いて、検査される組織中の特定の抗原の存在を決定し、抗原の分布を決定することができる。ｉｎ  ｓｉｔｕ検出の一般的な技術は、当業者には周知である（例えば、Ｐｏｎｄｅｒ、「Ｃｅｌｌ  Ｍａｒｋｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ａｎｄ  Ｔｈｅｉｒ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ」、Ｍａｍｍａｌｉａｎ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ、Ｍｏｎｋ（編）、ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ、ｐｐ．１１５〜１３８（１９８７）；Ｃｏｌｉｇａｎら、上掲を参照されたい）。
【０４１５】
酵素、蛍光化合物、電子移動剤などの検出可能な標識を、当技術分野で周知の従来の方法により担体に連結することができる。これらの標識された担体およびそれらから調製された操作された抗体コンジュゲートを、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ免疫アッセイおよびｉｎ  ｓｉｔｕ検出のために用いることができるが、抗体コンジュゲートを抗体への標識の直接的結合によって調製することができる。操作された抗体コンジュゲートの複数の標識によるローディングは、達成される抗体、または抗体断片の標的抗原への結合の程度が低いものに過ぎない免疫アッセイまたは組織学的手順の感度を増加させることができる。
【０４１６】
Ｂ．治療のための操作された抗体コンジュゲートの使用
操作された抗体コンジュゲートを用いて、ウイルスおよび細菌感染症、心血管疾患、自己免疫疾患、ならびにがんを処置することができる。そのような治療の目的は、非標的組織への曝露を最小化しながら、細胞傷害用量または細胞増殖抑制用量の活性作用物質（例えば、放射活性、毒素、または薬物）を標的細胞に送達することである。
【０４１７】
放射性同位体を、インタクトな抗体、またはその抗原結合断片に、キレート化剤を介して、直接的または間接的に結合させることができる。例えば、６７Ｃｕを、キレート化剤、ｐ−ブロモ−アセトアミドベンジル−テトラエチルアミン四酢酸（ＴＥＴＡ）を用いて抗体成分にコンジュゲートさせることができる（例えば、Ｃｈａｓｅ、上掲を参照されたい）。
【０４１８】
さらに、治療剤が毒素または薬物である操作された抗体コンジュゲートを調製することができる。そのような操作された抗体コンジュゲートの調製のための有用な毒素としては、リシン（ｒｉｃｉｎ）、アブリン、ヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、ゲロニン、ジフテリン毒素、およびシュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）外毒素が挙げられる。免疫コンジュゲートの調製のための有用な化学療法剤としては、オーリスタチン、ドラスタチン、ＭＭＡＥ、ＭＭＡＦ、ＡＦＰ、ＡＥＢ、ドキソルビシン、ダウノルビシン、メトトレキサート、メルファラン、クロラムブシル、ビンカアルカロイド、５−フルオロウリジン、マイトマイシン−Ｃ、タキソール、Ｌ−アスパラギナーゼ、メルカプトプリン、チオグアニン、ヒドロキシウレア、シタラビン、シクロホスファミド、イフォスファミド、ニトロソウレア、シスプラチン、カルボプラチン、マイトマイシン、デカルバジン、プロカルバジン、トポテカン、窒素マスタード、サイトキサン、エトポシド、ＢＣＮＵ、イリノテカン、カンプトテシン、ブレオマイシン、イダルビシン、ダクチノマイシン、プリカマイシン、ミトキサントロン、アスパラギナーゼ、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、パクリタキセル、およびドセタキセルならびにその塩、溶媒および誘導体が挙げられる。他の好適な作用物質としては、蛍光分子などの検出可能な標識または重金属もしくは放射性核種などの細胞傷害性剤を複合体化させることができる、ＤＴＰＡなどのキレート化剤；ならびにシュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）外毒素などの毒素などが挙げられる。
【０４１９】
いくつかの実施形態において、診断剤、予防剤または治療剤は、オーリスタチンＥ（当技術分野ではドラスタチン−１０としても知られる）またはその誘導体ならびにその薬学的塩もしくは溶媒和物である。典型的には、オーリスタチンＥ誘導体は、例えば、オーリスタチンＥとケト酸の間に形成されるエステルである。例えば、オーリスタチンＥを、パラアセチル安息香酸またはベンゾイル吉草酸と反応させて、それぞれ、ＡＥＢおよびＡＥＶＢを生成することができる。他の典型的なオーリスタチン誘導体としては、ＡＦＰ、ＭＭＡＦおよびＭＭＡＥが挙げられる。オーリスタチンＥおよびその誘導体、ならびにリンカーの合成および構造は、米国特許出願第０９／８４５，７８６号（米国特許出願公開第２００３００８３２６３号）、米国特許出願公開第２００５−０２３８６２９号；国際特許公開ＷＯ２００４／０１０９５７；国際特許公開ＷＯ２００２／０８８１７２；国際特許公開ＷＯ０４／０７３６５６；ならびに米国特許第６，８８４，８６９号；第６，３２３，３１５号；第６，２３９，１０４号；第６，２１４，３４５号；第６，０３４，０６５号；第５，７８０，５８８号；第５，６６５，８６０号；第５，６６３，１４９号；第５，６３５，４８３号；第５，５９９，９０２号；第５，５５４，７２５号；第５，５３０，０９７号；第５，５２１，２８４号；第５，５０４，１９１号；第５，４１０，０２４号；第５，１３８，０３６号；第５，０７６，９７３号；第４，９８６，９８８号；第４，９７８，７４４号；第４，８７９，２７８号；第４，８１６，４４４号；および第４，４８６，４１４号（これらは全てその全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。
【０４２０】
いくつかの実施形態において、抗がん剤としては、限定されるものではないが、以下に列挙される薬物：メトトレキサート、タキソール、メルカプトプリン、チオグアニン、ヒドロキシウレア、シタラビン、シクロホスファミド、イフォスファミド、ニトロソウレア、シスプラチン、カルボプラチン、マイトマイシン、ダカルバジン、プロカルビジン、エトポシド、カンプトテシン、ブレオマイシン、ドキソルビシン、イダルビシン、ダウノルビシン、ダクチノマイシン、プリカマイシン、ミトキサントロン、アスパラギナーゼ、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、パクリタキセル、およびドセタキセル、ドキソルビシン、エピルビシン、５−フルオロウラシル、タキサン、例えば、ドセタキセルおよびパクリタキセル、ロイコボリン、レバミソール、イリノテカン、エストラムスチン、エトポシド、ニトロソウレア、例えば、カルムスチンおよびロムスチン、Ｌ−アスパラギナーゼ、トポテカン、窒素マスタード、サイトキサン、エトポシド、ＢＣＮＵ、ビンカアルカロイド、白金化合物、マイトマイシン、ゲムシタビン、ヘキサメチルメラミン、テムシロリムス（ＣＣＩ−７７９）；ラパチニブ（ＧＷ５７２０１６）；ＲＡＤ−００１（エベロリムス）；ＸＲＰ−９８８１；イキサベピロン（ＢＭＳ−２４７５５０）；ペルツズマブ（ＯＭＮＩＴＡＲＧ、２Ｃ４）；トポテカン、チロシンキナーゼ阻害剤、チルホスチン、イマチニブメシレート（ＧＬＥＥＶＥＣ）、ハービマイシンＡ、ゲニステイン、エルブスタチン、およびラベンダスチンＡが挙げられる。
【０４２１】
他の実施形態において、好適な化学療法剤としては、限定されるものではないが、当技術分野で公知の多くの他の作用物質の中でも、アルキル化剤：窒素マスタード（例えば、シクロホスファミド、イフォスファミド、トロフォスファミド、クロラムブシル）；ニトロソウレア（例えば、カルムスチン（ＢＣＮＵ）、ロムスチン（ＣＣＮＵ））；アルキルスルホネート（例えば、ブスルファン、トレオスルファン）；トリアゼン（例えば、ダカルバジン）；白金含有化合物（例えば、シスプラチン、カルボプラチン、アロプラチン、オキサリプラチン）；植物アルカロイド：ビンカアルカロイド（例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシン、ビノレルビン）；タキソイド（例えば、パクリタキセル、ドセタキセル）；ＤＮＡトポイソメラーゼ阻害剤：エピポドフィリン（例えば、エトポシド、テニポシド、トポテカン、９−アミノカンプトテシン、カンプトテシン、クリスナトール）；マイトマイシン（例えば、マイトマイシンＣ、代謝拮抗物質）；抗葉酸剤：ＤＨＦＲ阻害剤（例えば、メトトレキサート、トリメトレキサート）、ＩＭＰデヒドロゲナーゼ阻害剤（例えば、ミコフェノール酸、チアゾフリン、リバビリン、ＥＩＣＡＲ）；リボヌクレオチドリダクターゼ阻害剤（例えば、ヒドロキシウレア、デフェロキサミン）；ピリミジン類似体：ウラシル類似体（例えば、５−フルオロウラシル、フロクスウリジン、ドキシフルリジン、ラチトレキセド）；シトシン類似体（例えば、シタラビン（ａｒａＣ）、シトシンアラビノシド、フルダラビン）；プリン類似体（例えば、メルカプトプリン、チオグアニン）；ＤＮＡ代謝拮抗剤（例えば、３−ＨＰ、２’−デオキシ−５−フルオロウリジン、５−ＨＰ、アルファ−ＴＧＤＲ、アフィジコリングリシネート、ａｒａ−Ｃ、５−アザ−２’−デオキシシチジン、ベータ−ＴＧＤＲ、シクロシチジン、グアナゾール、イノシングリコジアルデヒド、マセベシンＩＩ、ピラゾロイミダゾール）；ホルモン療法剤：受容体アンタゴニスト：抗エストロゲン剤（例えば、タモキシフェン、ラロキシフェン、メゲストロール）；アロマターゼ阻害剤（例えば、エキセメスタン、アナストロゾール、レトロゾール）；ＧｎＲＨアンタゴニスト（例えば、アバレリックス、ヒストレリン）；選択的エストロゲン受容体調節剤（ＳＥＲＭ）（例えば、ラソフォキシフェン）；ＬＨ−ＲＨアゴニスト（例えば、ゴセレリン、トリプトレリン、ブセレリン、酢酸ロイプロリド）；抗アンドロゲン剤（例えば、フルタミド、ビカルタミド、ニルタミド、メゲストロール、シプロテロン）；レチノイド／デルトイド：ｃｉｓ−レチノイン酸；ビタミンＡ誘導体（例えば、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ−ＩＶ））；ビタミンＤ３類似体（例えば、ＥＢ１０８９、ＣＢ１０９３、ＫＨ１０６０）；光力学療法（例えば、ベルトポルフィン（ＢＰＤ−ＭＡ）、フタロシアニン、光増感剤Ｐｃ４、デメトキシ−ヒポクレリンＡ（２ＢＡ−２−ＤＭＨＡ）；サイトカイン、例えば、ＩＬ−１α、ＩＬ−１β、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１１、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１８、ＩＦＮα、ＩＦＮβ、ＩＦＮγ、Ｔ��Ｆα、ＴＮＦβ、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＧＦ−β、ＳＬＣ、ＥＭＡＰ２、ＭＩＰ−３α、ＭＩＰ−３β、ＨＬＡ−Ｂ７、ＴＮＦファミリーの他のメンバー（例えば、ＴＲＡＩＬ、ＴＲＡＮＣＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＤ４０Ｌ、ＬＴ−α、ＬＴ−β、ＯＸ４０Ｌ、ＣＤ４０Ｌ、ＦａｓＬ、ＣＤ２７Ｌ、ＣＤ３０Ｌ、４−１ＢＢＬ、ＡＰＲＩＬ、ＬＩＧＨＴ、ＴＬ１、ＴＮＦＳＦ１６、ＴＮＦＳＦ１７、およびＡＩＴＲ−Ｌ、またはその機能的部分）；血管新生阻害剤：アンギオスタチン（プラスミノーゲン断片）、抗血管新生抗トロンビンＩＩＩ、アンギオザイム、ＡＢＴ−６２７、Ｂａｙ１２−９５６６、ベネフィン、ベバシズマブ、ＢＭＳ−２７５２９１、軟骨由来阻害剤（ＣＤＩ）、ＣＡＩ、ＣＤ５９補体断片、Ｇｒｏ−ベータ、ハロフギノン、ヘパリナーゼ、ヘパリンヘキササッカリド断片、ＨＭＶ８３３、ヒト絨毛性ゴナトトロピン（ｈＣＧ）、ＩＭ−８６２、インターフェロンアルファ／ベータ／ガンマ、インターフェロン誘導性タンパク質（ＩＰ−１０）、インターロイキン−１２、Ｋｒｉｎｇｌｅ５（プラスミノーゲン断片）、マリマスタット、メタロプロテイナーゼ阻害剤（ＴＩＭＰ）、２−メトキシエストラジオール、ＭＭＩ２７０（ＣＧＳ２７０２３Ａ）、ＭｏＡｂ  ＩＭＣ−１Ｃ１１、ネオバスタット（Ａｅｔｅｒｎａ）、ＮＭ−３、パンゼム、ＰＩ−８８、胎盤リボヌクレアーゼ阻害剤、プラスミノーゲン活性化因子阻害剤、血小板因子−４（ＰＦ４）、プリノマスタット、プロラクチン１６ｋＤ断片、プロリフェリン関連タンパク質（ＰＲＰ）、ＰＴＫ７８７／ＺＫ２２２５９４、レチノイド、ソリマスタット、スクアラミン、ＳＳ３３０４、ＳＵ５４１６、ＳＵ６６３８、ＳＵ１１２４８、ＳＵ１２６６２、ＳＵ１４８１３、ＢＡＹ４３−９００６、ＡＧ−０１３７３６、テトラヒドロコルチゾール−Ｓ、テトラチオモリブデート、サリドマイド、トロンボスポンジン−１（ＴＳＰ−１）、ＴＮＰ−４７０、トランスフォーミング増殖因子−ベータ（ＴＧＦ−ｂ）、バスクロスタチン、バソスタチン（カルレチクリン断片）、ＺＤ６１２６、ＺＤ６４７４、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤（ＦＴＩ）、ビスホスフォネート；抗有糸分裂剤（例えば、アロコルヒチン、ハリコンドリンＢ、コルヒチン、コルヒチン誘導体、ドルスタチン１０、メイタンシン、リゾキシン、チオコルヒチン、トリチルシステイン）；他の作用物質：イソプレニル化阻害剤；ドーパミン作動性神経毒（例えば、１−メチル−４−フェニルピリジニウムイオン）；細胞周期阻害剤（例えば、スタウロスポリン）：アクチノマイシン（例えば、アクチノマイシンＤ、ダクチノマイシン）；ブレオマイシン（例えば、ブレオマイシンＡ２、ブレオマイシンＢ２、ペプロマイシン）；アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン、ドキソルビシン（アドリアマイシン）、イダルビシン、エピルビシン、ピラルビシン、ゾルビシン、ミトキサントロン）；ｍＴＯＲ阻害剤（例えば、テムシロリムス、エベロリムス）；ＭＤＲ阻害剤（例えば、ベラパミル）；Ｃａ２＋ＡＴＰａｓｅ阻害剤（例えば、タプシガルギン）；ｔｏｌｌ様受容体アゴニスト（例えば、ＣｐＧ−７９０９、ＰＦ０３５１２６７６またはＰＲＯＭＵＮＥとして���知られる；Ｃｏｌｅｙ  Ｐｈａｒｍ）；共刺激分子（例えば、ＣＤ４、ＣＤ２５、ＰＤ−１、Ｂ７−Ｈ３、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＩＣＯＳ、ＣＤ３０、ＨＬＡ−ＤＲ、ＭＨＣＩＩ、およびＬＦＡ、ならびにそれに対するアゴニスト抗体）が挙げられる。
【０４２２】
本発明の方法において用いることができるさらなる抗がん剤としては、限定されるものではないが、アシビシン；アクラルビシン；塩酸アコダゾール；アクロニン；アドゼレシン；アルデスロイキン；アルトレタミン；アンボマイシン；酢酸アメタントロン；アミフォスチン三水和物；アミノグルテチミド；アムサクリン；アナストロゾール；アントラマイシン；三酸化ヒ素；アスパラギナーゼ；アスペルリン；アザシチジン；アゼテパ；アゾトマイシン；バチルスカルメット−ゲリン；バチマスタット；ベンゾデパ；ベバシズマブ；ビカルタミド；塩酸ビサントレン；ジメシル酸ビスナフィド；ビゼレシン；硫酸ブレオマイシン；ボルテゾミブ；ブレキナルナトリウム；ブロピリミン；ブスルファン；カクチノマイシン；カルステロン；カペシタビン；カラセミド；カルベチメル；カルボプラチン；カルムスチン；塩酸カルビシン；カルゼレシン；セデフィンゴール；クロラムブシル；シロレマイシン；シスプラチン；クロラムブシル；クラドリビン；クロドロネート；メシル酸クリスナトール；シクロホスファミド；シタラビン；ダカルバジン；ダクチノマイシン；ダルベポエチン；塩酸ダウノルビシン；デシタビン；デキソルマプラチン；デクスラゾキサン；デザグアニン；メシル酸デザグアニン；ジアジクオン；ジエチルスチルベストロール；ドセタキセル；ドキソルビシン；塩酸ドキソルビシン；ドロロキシフェン；クエン酸ドロロキシフェン；プロピオン酸ドロモスタノロン；デュアゾマイシン；ファルモルビシン；エダトレキサート；塩酸エフォルニチン；エルサミトルシン；エンロプラチン；エンプロマート；エピプロピジン；塩酸エピルビシン；エルブロゾール；エルロチニブ；エリスロポエチン；塩酸エソルビシン；エストラムスチン；エストラムスチンリン酸ナトリウム；エタニダゾール；エトポシド；リン酸エトポシド；エトプリン；エベロリムス；エキセメスタン；塩酸ファドロゾール；ファザラビン；フェンレチニド；フィラガストリム（Ｇ−ＣＳＦ）；フロクスウリジン；リン酸フルダラビン；フルドロコルチゾン；フルオロウラシル；フルオキシメステロン；フルロシタビン；フォスキドン；フォストリエシンナトリウム；フルベストラント；ゲフィチニブ；ゲムシタビン；塩酸ゲムシタビン；ゲムツズマブ；ゴセレリン；ヒドロキシウレア；イブリツモマブチウキセタン；塩酸イダルビシン；イフォスファミド；イルモフォシン；イマチニブ；インターロイキンＩＩ（組換えインターロイキンＩＩ、またはｒＩＬ２など）、インターフェロンアルファ−２ａ；インターフェロンアルファ−２ｂ；インターフェロンアルファ−ｎ１；インターフェロンアルファ−ｎ３；インターフェロンベータ−１ａ；インターフェロンガンマ−１ｂ；イプロプラチン；塩酸イリノテカン；イキサベピロン；ケトコナゾール；酢酸ランレオチド；ラパチニブ；レトロゾール；ロイコボリン；酢酸ロイプロリド；レバミソール；塩酸リアロゾール；ロメトレキソールナトリウム；ロムスチン；塩酸ロソキサントロン；マソプロコール；メイタンシン；塩酸メクロレタミン；メドロキシプロゲステロン；酢酸メゲストロール；酢酸メレンゲストロール；メルファラン；メノガリル；メルカプトプリン；メスナ；メトトレキサート；メトトレキサートナトリウム；メトプリン；メツレデパ；ミチンドミド；ミトカルシン；ミトクロミン；ミトギリン；ミトマルシン；マイトマイシン；マイトスペル；ミトタン；塩酸ミトキサントロン；ミコフェノール酸；ノコダゾール；ノガラマイシン；オクトレオチド；オルマプラチン；オキサリプラチン；オキシスラン；パクリタキセル；パミドロナート；ペガスパルガーゼ；ＰＥＧ−Ｌ−アスパラギナーゼ；ＰＥＧ−フィルガストリム；ペリオマイシン；ペンタムスチン；ペントスタチン；硫酸ペプロマイシン；ペルフォスファミド；ペルツズマブ；ピポブロマン；ピポスルファン；塩酸ピロキサントロン；プリカマイシン；プロメスタン；ポルフィマーナトリウム；ポルフィマー；ポルフィロマイシン；プレドニムスチン；ペメトレキセド；塩酸プロカルバジン；ピューロマイシン；塩酸ピューロマイシン；ピラゾフリン；ラルチトレキセド；リボプリン；リツキシマブ；ログレチミド；サフィンゴール；塩酸サフィンゴール；セムスチン；シムトラゼン；ソマバート（ＰＥＧＶＩＳＯＭＡＮＴ）；スパルフォサートナトリウム；スパルソマイシン；塩酸スピロゲルマニウム；スピロムスチン；スピロプラチン；ストレプトニグリン；ストレプトゾシン；スロフェヌル；スニチニブ；ストレプトゾシン；タリソマイシン；テコガランナトリウム；テガフル；塩酸テロキサントロン；テモポルフィン；テモゾロミド；テムシロリムス；テニポシド；テロキシロン；テストラクトン；サリドマイド；チアミプリン；チオグアニン；チオテパ；チアゾフリン；チラパザミン；トポテカン；クエン酸トレミフェン；トラスツズマブ；トレチノイン；酢酸トレストロン；リン酸トリシリビン；トリメトレキサート；グルクロン酸トリメトレキサート；トリプトレリン；トポテカン；塩酸ツブロゾール；ウラシルマスタード；ウレデパ；バプレオチド；ベルテポルフィン；硫酸ビンブラスチン；硫酸ビンクリスチン；ビンデシン；硫酸ビンデシン；硫酸ビネピジン；硫酸ビングリシナート；硫酸ビンロイロシン；酒石酸ビノレルビン；硫酸ビンロシジン；硫酸ビンゾリジン；ボロゾール；ゼニプラチン；ジノスタチン；ゾレンドロネート；塩酸ゾルビシンが挙げられる。
【０４２３】
用いることができる他の抗がん剤としては、限定されるものではないが、２０−エピ−１，２５ジヒドロキシビタミンＤ３；５−エチニルウラシル；アビラテロン；アクラルビシン；アシルフルベン；アデシペノール；アドゼレシン；アルデスロイキン；ＡＬＬ−ＴＫアンタゴニスト；アルトレタミン；アンバムスチン；アミドックス；アミフォスチン；アミノレブリン酸；アムルビシン；アムサクリン；アナグレリド；アナストロゾール；アンドログラホリド；血管新生阻害剤；アンタゴニストＤ；アンタゴニストＧ；アンタレリックス；抗背側形成タンパク質−１；抗アンドロゲン剤、前立腺がん；抗エストロゲン剤；抗ネオプラストン剤；アンチセンスオリゴヌクレオチド；アフィジコリングリシネート；アポトーシス遺伝子調節剤；アポトーシス調節剤；アプリン酸；アラ−ＣＤＰ−ＤＬ−ＰＴＢＡ；アルギニンデアミナーゼ；アスラクリン；アタメスタン；アトリムスチン；アキシナスタチン１；アキシナスタチン２；アキシナスタチン３；アザセトロン；アザトキシン；アザチロシン；バッカチンＩＩＩ誘導体；バラノール；バチマスタット；ＢＣＲ／ＡＢＬアンタゴニスト；ベンゾクロリン；ベンゾイルスタウロスポリン；ベータラクタム誘導体；ベータアレチン；ベタクラマイシンＢ；ベツリン酸；ｂＦＧＦ−阻害剤；ビカルタミド；ビサントレン；ビサジリジニルスペルミン；ビスナフィド；ビストラテンＡ；ビゼレシン；ブレフラート；ブロピリミン；ブドチタン；ブチオニンスルホキシミン；カルシポトリオール；カルホスチンＣ；カンプトテシン誘導体；カナリポックスＩＬ−２；カペシタビン；カルボキサミド−アミノ−トリアゾール；カルボキシアミドトリアゾール；ＣａＲｅｓｔＭ３；ＣＡＲＮ７００；軟骨由来阻害剤；カルゼレシン；カゼインキナーゼ阻害剤（ＩＣＯＳ）；カスタノスペルミン；セクロピンＢ；セトロレリックス；クロリン；クロロキノキサリンスルホンアミド；シカプロスト；ｃｉｓ−ポルフィリン；クラドリビン；クロミフェン類似体；クロトリマゾール；コリスマイシンＡ；コリスマイシンＢ；コンブレタスタチンＡ４；コンブレタスタチン類似体；コナゲニン；クラムベシジン８１６；クリスナトール；クリプトフィシン８；クリプトフィシンＡ誘導体；クラシンＡ；シクロペンタアントラキノン；シクロプラタム；シペマイシン；シタラビンオクフォスフェート；細胞溶解因子；サイトスタチン；ダクリキシマブ；デシタビン；デヒドロジデムニンＢ；デスロレリン；デキサメタゾン；デキシホスファミド；デクスラゾキサン；デクスベラパミル；ジアジクオン；ジデムニンＢ；ジドックス；ジエチルノルスペルミン；ジヒドロ−５−アザシチジン；ジヒドロタキソール；９−；ジオキサマイシン；ジフェニルスピロムスチン；ドセタキセル；ドコサノール；ドラセトロン；ドキシフルリジン；ドロロキシフェン；ドロナビノール；デュオカルミシンＳＡ；エブセレン；エコムスチン；エデルフォシン；エドレコロマブ；エフォルニチン；エレメン；エミテフル；エピルビシン；エプリステリド；エストラムスチン類似体；エストロゲンアゴニスト；エストロゲンアンタゴニスト；エタニダゾール；リン酸エトポシド；エキセメスタン；ファドロゾール；ファザラビン；フェンレチニド；フィルグラスチム；フィナステリド；フラボピリドール；フレゼラスチン；フルアステロン；フルダラビン；塩酸フルオロダウノルビシン；フォルフェニメックス；フォルメスタン；フォストリエシン；フォテムスチン；ガドリニウムテキサフィリン；硝酸ガリウム；ガロシタビン；ガニレリックス；ゼラチナーゼ阻害剤；ゲムシタビン；グルタチオン阻害剤；ヘプスルファム；ヘレグリン；ヘキサメチレンビスアセタミド；ハイペリシン；イバンドロン酸；イダルビシン；イドキシフェン；イドラマントン；イルモフォシン；イロマスタット；イミダゾアクリドン；イミキモッド；免疫刺激ペプチド；インスリン様増殖因子１受容体阻害剤；インターフェロンアゴニスト；インターフェロン；インターロイキン；イオベングアン；ヨードドキソルビシン；イポメアノール、４−；イロプラクト；イルソグラジン；イソベンガゾール；イソホモハリコンドリンＢ；イタセトロン；ジャスプラキノリド；カハラリドＦ；ラメラリン−Ｎ三酢酸；ランレオチド；レイナマイシン；レノグラスチム；硫酸レンチナン；レプトルスタチン；レトロゾール；白血病阻害因子；白血球アルファインターフェロン；ロイプロリド＋エストロゲン＋プロゲステロン；ロイプロレリン；レバミソール；リアロゾール；線状ポリアミン類似体；親油性ジサッカリドペプチド；親油性白金化合物；リソクリナミド７；ロバプラチン；ロムブリシン；ロメトレキソール；ロニダミン；ロソキサントロン；ロバスタチン；ロキソリビン；ルルトテカン；ルテチウムテキサフィリン；リゾフィリン；溶解ペプチド；メイタンシン；マンノスタチンＡ；マリマスタット；マソプロコール；マスピン；マトリリシン阻害剤；マトリックスメタロプロテイナーゼ阻害剤；メノガリル；メルバロン；メテレリン；メチオニナーゼ；メトクロプラミド；ＭＩＦ阻害剤；ミフェプリストン；ミルテフォシン；ミリモスチム；不一致二本鎖ＲＮＡ；ミトグアゾン；ミトラクトール；マイトマイシン類似体；ミトナフィド；ミトトキシン線維芽細胞増殖因子−サポリン；ミトキサントロン；モファロテン；モルグラモスチム；モノクローナル抗体、ヒト絨毛性ゴナドトロピン；モノホスホリルリピドＡ＋ミオバクテリウム細胞壁ｓｋ；モピダモール；多剤耐性遺伝子阻害剤；多腫瘍抑制因子１に基づく療法；マスタード抗がん剤；ミカペルオキシドＢ；マイコバクテリウム細胞壁抽出物；ミリアポロン；Ｎ−アセチルジナリン；Ｎ−置換ベンズアミド；ナファレリン；ナグレスチップ；ナロキソン＋ペンタゾシン；ナパビン；ナフテルピン；ナルトグラスチム；ネダプラチン；ネモルビシン；ネリドロン酸；中性エンドペプチダーゼ；ニルタミド；ニサマイシン；一酸化窒素調節剤；ニトロオキシド抗酸化剤；ニトルリン；Ｏ６−ベンジルグアニン；オクトレオチド；オキセノン；オリゴヌクレオチド；オナプリストン；オンダンセトロン；オンダンセトロン；オラシン；経口サイトカイン誘導剤；オルマプラチン；オサテロン；オキサリプラチン；オキサウノマイシン；パクリタキセル；パクリタキセル類似体；パクリタキセル誘導体；パラウアミン；パルミトイルリゾキシン；パミドロン酸；パナキシトリオール；パノミフェン；パラバクチン；パゼリプチン；ペガスパルガーゼ；ペルデシン；ペントサンポリ硫酸ナトリウム；ペントスタチン；ペントロゾール；ペルフルブロン；ペルフォスファミド；ペリリルアルコール；フェナジノマイシン；フェニル酢酸；ホスファターゼ阻害剤；ピシバニル；塩酸ピロカルピン；ピラルビシン；ピリトレキシム；プラセチンＡ；プラセチンＢ；プラスミノーゲン活性化因子阻害剤；白金複合体；白金化合物；白金−トリアミン複合体；ポルフィマーナトリウム；ポルフィロマイシン；プレドニゾン；プロピルビスアクリドン；プロスタグランジンＪ２；プロテアソーム阻害剤；プロテインＡに基づく免疫調節剤；タンパク質キナーゼＣ阻害剤；タンパク質キナーゼＣ阻害剤、小型藻類；タンパク質チロシンホスファターゼ阻害剤；プリンヌクレオシドホスホリラーゼ阻害剤；プルプリン；ピラゾロアクリジン；ピリドキシル化ヘモグロビンポリオキシエチレンコンジュゲート；ｒａｆアンタゴニスト；ラルチトレキセド；ラモセトロン；ｒａｓファメシルタンパク質トランスフェラーゼ阻害剤；ｒａｓ阻害剤；ｒａｓ−ＧＡＰ阻害剤；脱メチル化レテリプチン；レニウムＲｅ１８６エチドロネート；リゾキシン；リボザイム；ＲＩＩレチナミド；ログレチミド；ロヒツキン；ロムルチド；ロキニメックス；ルビギノンＢ１；ルボキシル；サフィンゴール；サイントピン；ＳａｒＣＮＵ；サルコフィトールＡ；サルグラモスチム；Ｓｄｉ１模倣体；セムスチン；セネセンス由来阻害剤１；センスオリゴヌクレオチド；シグナル伝達阻害剤；シグナル伝達調節剤；一本鎖抗原結合タンパク質、シゾフラン；ソブゾキサン；ボロカプテートナトリウム；フェニル酢酸ナトリウム；ソルベロール；ソマトメジン結合タンパク質；ソネルミン；スパルホス酸；スピカマイシンＤ；スピロムスチン；スプレノペンチン；スポンギスタチン１；スクアラミン；幹細胞阻害剤；幹細胞分裂阻害剤；スチピアミド；ストロメルシン阻害剤；スルフィノシン；超活性血管作動性腸管ペプチドアンタゴニスト；スラジスタ；スラミン；スワインソニン；合成グリコサミノグリカン；タリムスチン；タモキシフェンメチオジド；タウロムスチン；タザロテン；テコガランナトリウム；テガフル；テルラピリウム；テロメラーゼ阻害剤；テモポルフィン；テモゾロミド；テニポシド；テトラクロロデカオキシド；テトラゾミン；サリブラスチン；チオコラリン；トロンボポエチン；トロンボポエチン模倣体；チマルファシン；チモポエチン受容体アゴニスト；チモトリナン；甲状腺刺激ホルモン；エチルエチオプルプリンスズ；チラパザミン；チタノセンビクロリド；トプセンチン；トレミフェン；全能性幹細胞因子；翻訳阻害剤；トレチノイン；トリアセチルウリジン；トリシリビン；トリメトレキサート；トリプトレリン；トロピセトロン；ツロステリド；チロシンキナーゼ阻害剤；チルホスチン；ＵＢＣ阻害剤；ウベニメックス；泌尿生殖洞由来増殖阻害因子；ウロキナーゼ受容体アンタゴニスト；バプレオチド；バリオリンＢ；ベクター系、赤血球遺伝子療法；ベラレソール；ベラミン；ベルジン；ベルテポルフィン；ビノレルビン；ビンキサルチン；ビタキシン；ボロゾール；ザノテロン；ゼニプラチン；ジラスコルブ；およびジノスタチンスチマラマーが挙げられる。
【０４２４】
いくつかの実施形態において、診断剤、予防剤または治療剤は、放射性同位体ではない。
【０４２５】
いくつかの実施形態において、操作された抗体コンジュゲートを用いて、以下の特定の型のがんの１つを処置することができる：本開示の操作された抗体コンジュゲートを用いて、例えば、腫瘍抗原の過剰発現を特徴とするものなどの様々な疾患または障害を処置することができることが考えられる。例示的な状態または過増殖性障害としては、良性または悪性腫瘍、白血病およびリンパ性悪性腫瘍が挙げられる。他のものとしては、ニューロン、グリア、アストロサイト、視床下部、腺、マクロファージ、上皮、内皮、および間質の悪性腫瘍が挙げられる。他のがんまたは過増殖性障害としては、頭部、頸部、眼、口、喉、食道、胸部、皮膚、骨、肺、結腸、直腸、結腸直腸、胃、脾臓、腎臓、骨格筋、皮下組織、転移性メラノーマ、子宮内膜、前立腺、乳房、卵巣、精巣、甲状腺、血液、リンパ節、腎臓、肝臓、膵臓、脳、または中枢神経系のがんが挙げられる。本開示の方法に従って防止、管理、処置または改善することができるがんの例としては、限定されるものではないが、頭部、頸部、眼、口、喉、食道、胸部、骨、肺、結腸、直腸、胃、前立腺、乳房、卵巣、腎臓、肝臓、膵臓、および脳のがんが挙げられる。さらなるがんとしては、限定されるものではないが、以下のもの：白血病、例えば、限定されるものではないが、急性白血病、急性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病、例えば、骨髄芽細胞性、前骨髄球性、骨髄単球性、単球性、赤白血病性白血病および骨髄異形成症候群、慢性白血病、例えば、限定されるものではないが、慢性骨髄性（顆粒球性）白血病、慢性リンパ球性白血病、ヘアリー細胞白血病；真性赤血球増加症；リンパ腫、例えば、限定されるものではないが、ホジキン病、非ホジキン病；多発性骨髄腫、例えば、限定されるものではないが、くすぶり型多発性骨髄腫、非分泌性骨髄腫、骨硬化性骨髄腫、形質細胞白血病、孤立性形質細胞腫および髄外性形質細胞腫；ヴァルデンストレームマクログロブリン血症；意義不明の単クローン性高ガンマグロブリン血症；良性単クローン性免疫グロブリン血症；重鎖疾患；骨のがんおよび結合組織肉腫、例えば、限定されるものではないが、骨肉腫、骨髄腫骨疾患、多発性骨髄腫、真珠腫誘導性骨肉腫、骨のパジェット病、骨肉腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性巨細胞腫瘍、骨の線維肉腫、脊索腫、骨膜肉腫、柔組織肉腫、血管肉腫（ヘマンギオサルコーマ）、線維肉腫、カポジ肉腫、平滑筋肉腫、脂肪肉腫、リンパ管肉腫、神経鞘腫、横紋筋肉腫、および滑膜肉腫；脳腫瘍、例えば、限定されるものではないが、グリオーマ、アストロサイトーマ、脳幹グリオーマ、上衣腫、オリゴデンドログリオーマ、非グリア腫瘍、聴神経鞘腫、頭蓋咽頭腫、髄芽腫、髄膜腫、松果体細胞腫、松果体芽細胞腫、および原発性脳リンパ腫；乳がん、例えば、限定されるものではないが、腺がん、小葉（小細胞）がん、腺管内がん、髄様乳がん、粘液乳がん、管状乳がん、乳頭乳がん、パジェット病（若年性パジェット病など）および炎症性乳がん；副腎がん、例えば、限定されるものではないが、褐色細胞腫および副腎皮質がん；甲状腺がん、例えば、限定されるものではないが、甲状腺乳頭がんまたは濾胞性甲状腺がん、甲状腺髄様がんおよび未分化甲状腺がん；膵臓がん、例えば、限定されるものではないが、インスリノーマ、ガストリノーマ、グルカゴノーマ、ビポーマ、ソマトスタチン分泌腫瘍、およびカルチノイドまたは島細胞腫瘍；下垂体がん、例えば、限定されるものではないが、クッシング病、プロラクチン分泌腫瘍、末端肥大症、および尿崩症；眼のがん、例えば、限定されるものではないが、眼のメラノーマ、例えば、虹彩メラノーマ、脈絡膜メラノーマ、および毛様体メラノーマ、ならびに網膜芽腫；膣のがん、例えば、扁平上皮がん、腺がん、およびメラノーマ；外陰がん、例えば、扁平上皮がん、メラノーマ、腺がん、基底細胞がん、肉腫、およびパジェット病；頸部がん、例えば、限定されるものではないが、扁平上皮がん、および腺がん；子宮がん、例えば、限定されるものではないが、子宮内膜がんおよび子宮肉腫；卵巣がん、例えば、限定されるものではないが、卵巣上皮がん、境界線腫瘍、胚細胞腫瘍、および間質腫瘍；食道がん、例えば、限定されるものではないが、扁平がん、腺がん、腺様嚢胞がん、粘膜表皮がん、腺扁平上皮がん、肉腫、メラノーマ、形質細胞腫、いぼ状がん、およびオート細胞（小細胞）がん；胃がん、例えば、限定されるものではないが、腺がん、菌状（ポリープ状）、潰瘍状、表在拡大型、びまん性拡大型の悪性リンパ腫、脂肪肉腫、線維肉腫、およびがん肉腫；結腸がん；直腸がん；肝臓がん、例えば、限定されるものではないが、肝細胞がんおよび肝芽腫、胆嚢がん、例えば、腺がん；胆管がん、例えば、限定されるものではないが、乳頭状、結節性、およびびまん性；肺がん、例えば、非小細胞肺がん、扁平上皮がん（類表皮がん）、腺がん、大細胞がんおよび小細胞肺がん；精巣がん、例えば、限定されるものではないが、胚腫瘍、セミノーマ、未分化、古典的（典型的）、精母細胞性、非セミノーマ、胎生期がん、テラトーマがん、絨毛がん（卵黄嚢腫瘍）、前立腺がん、例えば、限定されるものではないが、腺がん、平滑筋肉腫、および横紋筋肉腫；陰茎がん；口腔がん、例えば、限定されるものではないが、扁平上皮がん；基底がん；唾液腺がん、例えば、限定されるものではないが、腺がん、粘膜表皮がん、および腺様嚢胞癌；咽頭がん、例えば、限定されるものではないが、扁平上皮がんおよびいぼ状；皮膚がん、例えば、限定されるものではないが、基底細胞がん、扁平上皮がんおよびメラノーマ、表在拡大型メラノーマ、結節性メラノーマ、悪性黒子型メラノーマ、末端性黒子性メラノーマ；腎臓がん、例えば、限定されるものではないが、腎細胞がん、腺がん、副腎腫、線維肉腫、移行細胞がん（腎盂および／または尿管）；ウィルムス腫瘍；膀胱がん、例えば、限定されるものではないが、移行細胞がん、扁平上皮がん、腺がん、がん肉腫が挙げられる。さらに、がんとしては、粘液肉腫、骨原性肉腫、内皮肉腫、リンパ管内皮肉腫、中皮腫、滑膜腫、血管芽腫、上皮がん、嚢胞腺がん、気管支原性がん、汗腺がん、皮脂腺がん、乳頭がんおよび乳頭腺がん（そのような障害の概説については、Ｆｉｓｈｍａｎら、１９８５、Ｍｅｄｉｃｉｎｅ、第２版、Ｊ．Ｂ．Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ  Ｃｏ．、Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ  ａｎｄ  Ｍｕｒｐｈｙら、１９９７、Ｉｎｆｏｒｍｅｄ  Ｄｅｃｉｓ���ｏｎｓ：Ｔｈｅ  Ｃｏｍｐｌｅｔｅ  Ｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ,  Ｔｒｅａｔｍｅｎｔ，  ａｎｄ  Ｒｅｃｏｖｅｒｙ、Ｖｉｋｉｎｇ  Ｐｅｎｇｕｉｎ、Ｐｅｎｇｕｉｎ  Ｂｏｏｋｓ  Ｕ．Ｓ．Ａ．，ｉｎｃ．、Ｕｎｉｔｅｄ  Ｓｔａｔｅｓ  ｏｆ  Ａｍｅｒｉｃａを参照されたい）。また、アポトーシス異常により引き起こされるがんを、本開示の方法および組成物によって処置することもできることも考えられる。そのようながんとしては、限定されるものではないが、濾胞性リンパ腫、ｐ５３突然変異を含むがん、乳房、前立腺および卵巣のホルモン依存的腫瘍、ならびに家族性腺腫性ポリポーシスなどの前がん病変、および骨髄異形成症候群が挙げられる。
【０４２６】
本開示の操作された抗体コンジュゲート、および操作されたＦｃポリペプチドおよび操作されたＣκポリペプチド、ならびにそれを含む組成物は、多くの目的にとって、例えば、限定されるものではないが、シェーグレン症候群、関節リウマチ、乾癬状狼瘡、アテローム性動脈硬化症、糖尿病性網膜症および他の網膜症、水晶体後部線維増殖症、加齢黄斑変性、新血管緑内障、血管腫、甲状腺過形成（グレーブス病など）、角膜および他の組織の移植、および慢性炎症、敗血症、関節リウマチ、腹膜炎、クローン病、再かん流傷害、敗血症、内毒素ショック、嚢胞性線維症、心内膜炎、乾癬、関節炎（例えば、乾癬性関節炎）、アナフィラキシーショック、臓器虚血、再かん流傷害、脊髄損傷および同種移植拒絶を含む自己免疫障害および／または炎症性障害などの様々な慢性および急性の疾患および障害に対する治療剤として有用である。自己免疫障害および／または炎症性障害の他の例としては、限定されるものではないが、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性アジソン病、副腎の自己免疫疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性卵巣炎および精巣炎、シェーグレン症候群、乾癬、アテローム性動脈硬化症、糖尿病性網膜症および他の網膜症、水晶体後部線維増殖症、加齢黄斑変性、新血管緑内障、血管腫、甲状腺過形成（グレーブス病など）、角膜および他の組織の移植、および慢性炎症、敗血症、関節リウマチ、腹膜炎、再かん流傷害、敗血症、内毒素ショック、嚢胞性線維症、心内膜炎、乾癬、関節炎（例えば、乾癬性関節炎）、アナフィラキシーショック、臓器虚血、再かん流傷害、脊髄損傷および同種移植拒絶、自己免疫性血小板減少症、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、心筋症、セリアック病−皮膚炎、慢性疲労免疫不全症候群（ＣＦＩＤＳ）、慢性炎症性脱髄性多発性ニューロパシー、チャーグ−ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、ＣＲＥＳＴ症候群、寒冷凝集素症、円板状ループス、本態性混合型クリオグロブリン血症、線維筋痛−線維筋炎、糸球体腎炎、グレーブス病、ギラン−バレー症候群、橋本甲状腺炎、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、ＩｇＡニューロパシー、若年性関節炎、扁平苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合型結合組織疾患、多発性硬化症、１型または免疫媒介性糖尿病、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発性筋痛、多発性筋炎および皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症、スティッフマン症候群、全身性エリテマトーデス、エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎／巨細胞動脈炎、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、血管炎、例えば、疱疹状皮膚炎血管炎、白斑、およびヴェグナー肉芽腫が挙げられる。炎症性障害の例としては、限定されるものではないが、喘息、脳炎、炎症性腸疾患、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、アレルギー障害、敗血症ショック、肺線維症、未分化脊椎関節症、未分化関節症、関節炎、炎症性骨溶解、および慢性ウイルスまたは細菌感染の結果生じる慢性炎症が挙げられる。本開示の���成物および方法を、上記疾患を防止、管理または処置するために用いられる１つまたは複数の従来の療法と共に用いることができる。
【０４２７】
本開示はまた、ウイルス、真菌、真核微生物、および細菌などの様々な感染因子を不活化するための、本開示の操作された抗体コンジュゲート、ならびに本開示の操作されたＦｃポリペプチドおよび操作されたＣκポリペプチドを使用する方法も提供する。いくつかの実施形態において、本開示の組成物を用いて、ＲＳＶ、ｈＭＰＶ、ＰＩＶ、またはインフルエンザウイルスを不活化することができる。他の実施形態において、本開示の組成物を用いて、真菌病原体、例えば、限定されるものではないが、ネグレリア（Ｎａｅｇｌｅｒｉａ）、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、ブラストミセス（Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ）、ヒストプラズマ（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）またはチネア（Ｔｉｎｅａ）属のメンバーを不活化することができる。他の実施形態において、本開示の組成物を用いて、真核微生物、例えば、限定されるものではないが、ジアルジア（Ｇｉａｒｄｉａ）、トキソプラズマ（Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ）、プラスモジウム（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ）、トリパノソーマ（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａ）、およびエントアメーバ（Ｅｎｔａｍｏｅｂａ）属のメンバーを不活化することができる。他の実施形態において、本開示の組成物を用いて、細菌病原体、例えば、限定されるものではないが、スタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、ボレリア（Ｂｏｒｒｅｌｉａ）、ビブロ（Ｖｉｂｒｏ）およびナイセリア（Ｎｅｉｓｅｒｒｉａ）属のメンバーを不活化することができる。
【０４２８】
本開示の組成物は、多くの目的にとって、例えば、限定されるものではないが、ウイルス、細菌および真菌症などの感染症を含む様々な慢性および急性の疾患および障害に対する治療剤として有用である。ウイルス病原体の例としては、限定されるものではないが、アデノウイルス科（例えば、マストアデノウイルスおよびアビアデノウイルス）、ヘルペスウイルス科（例えば、単純ヘルペスウイルス１型、単純ヘルペスウイルス２型、単純ヘルペスウイルス５型、および単純ヘルペスウイルス６型）、レビウイルス科（例えば、レビウイルス、エンテロバクテリアフェーズＭＳ２、アロレウイルス）、ポックスウイルス科（例えば、コルドポックスウイルス亜科、パラポックスウイルス、アビポックスウイルス、カプリポックスウイルス、レポリポックスウイルス、スイポックスウイルス、モルシポックスウイルス、およびエントモポックスウイルス亜科）、パポバウイルス科（例えば、ポリオーマウイルスおよびパピローマウイルス）、パラミクソウイルス科（例えば、パラミクソウイルス、パラインフルエンザウイルス１、モビリウイルス（例えば、麻疹ウイルス）、ルブラウイルス（例えば、ムンプスウイルス）、ニューモノウイルス亜科（例えば、ニューモウイルス、ヒト呼吸器合胞体ウイルス）、およびメタニューモウイルス（例えば、鳥ニューモウイルスおよびヒトメタニューモウイルス））、ピコルナウイルス科（例えば、エンテロウイルス、ライノウイルス、ヘパトウイルス（例えば、ヒトＡ型肝炎ウイルス）、カルジオウイルス、およびアプトウイルス）、レオウイルス科（例えば、オルトレオウイルス、オルビウイルス、ロタウイルス、サイポウイルス、フィジウイルス、フィトレオウイルス、およびオリザウイルス）、レトロウイルス科（例えば、哺乳動物Ｂ型レトロウイルス、哺乳動物Ｃ型レトロウイルス、鳥Ｃ型レトロウイルス、Ｄ型レトロウイルス群、ＢＬＶ−ＨＴＬＶレトロウイルス、レンチウイルス（例えば、ヒト免疫不全ウイルス１およびヒト免疫不全ウイルスＴ、スプマウイルス）、フラビウイルス科（例えば、Ｃ型肝炎ウイルス）、ヘパドナウイルス科（例えば、Ｂ型肝炎ウイルス）、トガウイルス科（例えば、アルファウイルス（例えば、シンドビスウイルス）およびルビウイルス（例えば、ルベラウイルス））、ラブドウイルス科（例えば、ベシクロウイルス、リッサウイルス、エフェメロウイルス、サイトラブドウイルスおよびネクレオラブドウイルス）、アレナウイルス科（例えば、アレナウイルス、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス、イッピウイルス、およびラッサウイルス）、ならびにコロナウイルス科（例えば、コロナウイルスおよびトロウイルス）が挙げられる。細菌病原体の例としては、限定されるものではないが、アクアスピリルム（Ａｑｕａｓｐｉｒｉｌｌｕｍ）科、アゾスピリルム（Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ）科、アゾトバクター（Ａｚｏｔｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）科、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）科、バルトネラ（Ｂａｒｔｏｎｅｌｌａ）種、ブデロビブリオ（Ｂｄｅｌｌｏｖｉｂｒｉｏ）科、カンピロバクター（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）種、クラミジア（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ）種（例えば、クラミジア・ニューモニア（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ））、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、エンテロバクテリア（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）科（例えば、シトロバクター（Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ）種、エドワードシエラ（Ｅｄｗａｒｄｓｉｅｌｌａ）、エンテロバクター・エロゲネス（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ）、エルウィニア（Ｅｒｗｉｎｉａ）種、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、ハフニア（Ｈａｆｎｉａ）種、クレブシエラ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ）種、モルガネラ（Ｍｏｒｇａｎｅｌｌａ）種、プロテウス・ブルガリス（Ｐｒｏｔｅｕｓ  ｖｕｌｇａｒｉｓ）、プロビデンシア（Ｐｒｏｖｉｄｅｎｃｉａ）、サルモネラ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）種、セラチア・マルセセンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ）、およびシゲラ・フレクスネリ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ））、ガルジネラ（Ｇａｒｄｉｎｅｌｌａ）科、ヘモフィルス・インフルエンザ（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ）、ハロバクテリア（Ｈａｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）科、ヘリコバクター（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ）科、レジオネラ（Ｌｅｇｉｏｎａｌｌａｃｅａｅ）科、リステリア（Ｌｉｓｔｅｒｉａ）種、メチロコッカス（Ｍｅｔｈｙｌｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）科、マイコバクテリア（例えば、マイコバクテリウム・ツベルクロシス（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ））、ナイセリア（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａｃｅａｅ）科、オセアノスピルム（Ｏｃｅａｎｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ）科、パスツレラ（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａｃｅａｅ）科、ニューモコッカス（Ｐｎｅｕｍｏｃｏｃｃｕｓ）種、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）種、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）科、スピリルム（Ｓｐｉｒｉｌｌｕｍ）科、スピロソマ（Ｓｐｉｒｏｓｏｍａｃｅａｅ）科、スタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）（例えば、メチシリン耐性スタフィロコッカス・オーレウス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）およびスタフィロコッカス・ピロゲネス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｒｏｇｅｎｅｓ））、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）（例えば、ストレプトコッカス・エンテリティディス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ）、ストレプトコッカス・ファシア（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｓｃｉａｅ）、およびストレプトコッカス・ニューモニア（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ））、バンピロビブルヘリコバクター（Ｖａｍｐｉｒｏｖｉｂｒ  Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ）科、およびバンピロビブリオ（Ｖａｍｐｉｒｏｖｉｂｒｉｏ）科が挙げられる。真菌病原体の例としては、限定されるものではないが、アブシジア（Ａｂｓｉｄｉａ）種（例えば、アブシジア・コリンビフェラ（Ａｂｓｉｄｉａ  ｃｏｒｙｍｂｉｆｅｒａ）およびアブシジア・ラモサ（Ａｂｓｉｄｉａ  ｒａｍｏｓａ））、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）種（例えば、アスペルギルス・フラバス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｆｌａｖｕｓ）、アスペルギルス・フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）、アスペルギルス・ニデュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｎｉｄｕｌａｎｓ）、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｎｉｇｅｒ）、およびアスペルギルス・テレウス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｔｅｒｒｅｕｓ））、バシジオボラス・ラナラム（Ｂａｓｉｄｉｏｂｏｌｕｓ  ｒａｎａｒｕｍ）、ブラストミセス・デルマティティディス（Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ  ｄｅｒｍａｔｉｔｉｄｉｓ）、カンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）種（例えば、カンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）、カンジダ・グラブラタ（Ｃａｎｄｉｄａ  ｇｌａｂｒａｔａ）、カンジダ・ケル（Ｃａｎｄｉｄａ  ｋｅｒｒ）、カンジダ・クルセイ（Ｃａｎｄｉｄａ  ｋｒｕｓｅｉ）、カンジダ・パル・アプシロシス（Ｃａｎｄｉｄａ  ｐａｒ  ａｐｓｉｌｏｓｉｓ）、カンジダ・シュードトロピカリス（Ｃａｎｄｉｄａ  ｐｓｅｕｄｏｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ）、カンジダ・キレルモンジ（Ｃａｎｄｉｄａ  ｑｕｉｌｌｅｒｍｏｎｄｉｉ）、カンジダ・ルゴサ（Ｃａｎｄｉｄａ  ｒｕｇｏｓａ）、カンジダ・ステラトイデア（Ｃａｎｄｉｄａ  ｓｔｅｌｌａｔｏｉｄｅａ）、およびカンジダ・トロピカリス（Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ））、コクシジオイデス・イミティス（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ  ｉｍｍｉｔｉｓ）、コニジオボラス（Ｃｏｎｉｄｉｏｂｏｌｕｓ）種、クリプトコッカス・ネオフォルムス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｎｅｏｆｏｒｍｓ）、クニングハメラ（Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍｅｌｌａ）種、デルマトフィテス（ｄｅｒｍａｔｏｐｈｙｔｅｓ）、ヒストプラズマ・カプスラタム（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ  ｃａｐｓｕｌａｔｕｍ）、ミクロスポルム・ジプセウム（Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｕｍ  ｇｙｐｓｅｕｍ）、ムコル・プシルス（Ｍｕｃｏｒ  ｐｕｓｉｌｌｕｓ）、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス（Ｐａｒａｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ  ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）、シュードアレシェリア・ボイジ（Ｐｓｅｕｄａｌｌｅｓｃｈｅｒｉａ  ｂｏｙｄｉｉ）、リノスポリジウム・シーベリ（Ｒｈｉｎｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ  ｓｅｅｂｅｒｉ）、ニューモシスティス・カリニ（Ｐｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｃａｒｉｎｉｉ）、リゾプス（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ）種（例えば、リゾプス・アリズス（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ  ａｒｒｈｉｚｕｓ）、リゾプス・オリザ（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ  ｏｒｙｚａｅ）、およびリゾプス・ミクロスポルス（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ  ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｕｓ））、サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）種、スポロトリックス・シェンキ（Ｓｐｏｒｏｔｈｒｉｘ  ｓｃｈｅｎｃｋｉｉ）、接合菌網、ならびにザイゴミセテス（Ｚｙｇｏｍｙｃｅｔｅｓ）、アスコミセテス（Ａｓｃｏｍｙｃｅｔｅｓ）、バシジオミセテス（Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｅｔｅｓ）、デューテロミセテス（Ｄｅｕｔｅｒｏｍｙｃｅｔｅｓ）、およびオーミセテス（Ｏｏｍｙｃｅｔｅｓ）などのクラスが挙げられる。
【０４２９】
本開示はまた、細胞集団を枯渇させるために操作された抗体コンジュゲートを用いる方法も提供する。一実施形態において、本開示の方法は、以下の細胞型：好酸球、好塩基球、好中球、Ｔ細胞、Ｂ細胞、マスト細胞、単球、内皮細胞および腫瘍細胞の枯渇において有用である。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、対照非操作抗体またはそのコンジュゲートと比較して、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％以上、それぞれの細胞集団を枯渇させる。
【０４３０】
本開示の操作された抗体およびそのコンジュゲートはまた、疾患の症状の診断および検出においても有用であってよい。別の実施形態において、本開示の組成物は、疾患進行のモニタリングにおいて有用であってもよい。別の実施形態において、本開示の組成物は、処置レジメンのモニタリングにおいて有用であってもよい。別の実施形態において、本開示の組成物は、診断キットなどの、ｅｘ  ｖｉｖｏでの適用における診断にとって有用である。
【０４３１】
本開示の組成物は、標的抗原の可視化において有用であってもよい。いくつかの実施形態において、標的抗原は、内在化する細胞表面受容体である。他の実施形態において、標的抗原は、細胞内抗原である。他の実施形態において、標的は核内抗原である。
【０４３２】
一実施形態において、本開示の操作された抗体または抗体−薬物コンジュゲートは、一度結合したら、細胞中に内在化し、内在化は本明細書に記載の対照抗体よりも少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約１００％、少なくとも約１１０％、少なくとも約１３０％、少なくとも約１４０％、少なくとも約１５０％、少なくとも約１６０％、または少なくとも約１７０％多い。
【０４３３】
他のがんまたは自己免疫障害の処置のための本開示の操作された抗体コンジュゲート、ならびに操作されたＦｃポリペプチド、操作されたＣκポリペプチド、および操作されたＣλポリペプチドも考えられ、本発明の範囲内にある。
【０４３４】
医薬組成物
別の態様において、本開示は、薬学的に許容できる担体と一緒に製剤化された、操作された抗体または操作された抗体コンジュゲート、操作されたＦｃポリペプチドまたはそのコンジュゲート、操作されたＦｃ領域またはそのコンジュゲートを含む操作されたＦｃ融合タンパク質、操作されたＣκポリペプチドまたはそのコンジュゲート、および操作されたＣλポリペプチドまたはそのコンジュゲートを含有する組成物、例えば、限定されるものではないが、医薬組成物を提供する。
【０４３５】
別の態様において、前記組成物は、薬学的に許容できる担体と一緒に製剤化された、本開示の１つもしくは組合せの操作された抗体、または操作された抗体コンジュゲートを含む医薬組成物である。
【０４３６】
そのような組成物は、１つまたは組合せの、例えば、限定されるものではないが、２つ以上の異なる本開示の操作された抗体を含んでもよい。例えば、本開示の医薬組成物は、標的抗原上の異なるエピトープに結合するか、または補体活性を有する操作された抗体の組合せを含んでもよい。
【０４３７】
本開示の医薬組成物はまた、例えば、他の作用物質と組み合わせた組合せ療法において投与することもできる。例えば、組合せ療法は、療法が外科手術、免疫療法、化学療法、放射線処置、または薬物療法であってもよい少なくとも１つの他の療法と組み合わせた、本開示の操作された抗体またはそのコンジュゲートを含んでもよい。
【０４３８】
本開示の医薬化合物は、１つまたは複数の薬学的に許容できる塩を含んでもよい。そのような塩の例としては、酸付加塩および塩基付加塩が挙げられる。酸付加塩としては、非毒性無機酸、例えば、塩酸、硝酸、リン酸、硫酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、亜リン酸など、ならびに非毒性有機酸、例えば、脂肪族モノ−およびジカルボン酸、フェニル置換アルカン酸、ヒドロキシアルカン酸、芳香族酸、脂肪族および芳香族スルホン酸などに由来するものが挙げられる。塩基付加塩としては、アルカリ土類金属、例えば、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウムなど、ならびに非毒性有機アミン、例えば、Ｎ，Ｎ’−ジベンジルエチレンジアミン、Ｎ−メチルグルカミン、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、エチレンジアミン、プロカインなどに由来するものが挙げられる。
【０４３９】
本開示の医薬組成物はまた、薬学的に許容できる酸化防止剤を含んでもよい。薬学的に許容できる酸化防止剤の例としては、（１）水溶性酸化防止剤、例えば、アスコルビン酸、塩酸システイン、重硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなど；（２）油溶性酸化防止剤、例えば、パルミチン酸アスコルビル、ブチル化ヒドロキシアニソール（ＢＨＡ）、ブチル化ヒドロキシトルエン（ＢＨＴ）、レシチン、プロピルガラート、アルファ−トコフェロールなど；および（３）金属キレート化剤、例えば、クエン酸、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、ソルビトール、酒石酸、リン酸などが挙げられる。
【０４４０】
本開示の医薬組成物において用いることができる好適な水性および非水性担体の例としては、水、エタノール、ポリオール（グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど）、およびその好適な混合物、植物油、例えば、オリーブ油、ならびに注射用有機エステル、例えば、オレイン酸エチルが挙げられる。例えば、レシチンなどの被覆材料の使用により、分散物の場合は必要な粒径の維持により、および界面活性剤の使用により、適切な流動性を維持することができる。
【０４４１】
これらの組成物は、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤などのアジュバントを含有してもよい。滅菌手順と、様々な抗細菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノールソルビン酸などの含有との両方によって、微生物の存在の防止を確保することができる。また、糖、塩化ナトリウムなどの等張剤を組成物中に含有させることも望ましい。さらに、注射用医薬形態の吸収の延長を、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンなどの吸収を遅延させる作用物質の含有によってもたらすことができる。
【０４４２】
医薬組成物は、典型的には、製造および保存の条件下で無菌性であり、安定でなければならない。組成物を、溶液、マイクロエマルジョン、リポソーム、または高い薬物濃度にとって好適な他の秩序ある構造として製剤化することができる。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、およびその好適な混合物を含有する溶媒または分散媒体であってもよい。例えば、レシチンなどの被覆の使用により、分散物の場合は必要な粒径の維持により、および界面活性剤の使用により、適切な流動性を維持することができる。多くの場合、組成物中に等張剤、例えば、糖、ポリアルコール、例えば、マンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムを含有させることが好適である。注射用組成物の吸収の延長を、組成物中に吸収を遅延させる作用物質、例えば、モノステアリン酸塩およびゼラチンを含有させることによりもたらすことができる。
【０４４３】
適切な溶媒中に必要な量の活性化合物を、上記で列挙された成分の１つまたは組合せと共に組み込み、必要に応じて、その後滅菌精密濾過を行うことにより、滅菌注射溶液を調製することができる。
【０４４４】
一般に、分散物は、基本分散媒体と、上記に列挙されたものに由来する必要な他の成分とを含有する滅菌ビヒクル中に活性化合物を組み込むことにより調製される。滅菌注射溶液の調製のための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、活性成分と、前もって滅菌濾過された溶液に由来する任意のさらなる所望の成分との粉末が得られる減圧乾燥および凍結−乾燥（凍結乾燥）である。
【０４４５】
本発明の医薬組成物を、眼への投与にとって好適な製剤中で調製、包装、または販売することができる。そのような製剤は、例えば、水性または油性液体担体中の活性成分の０．１〜１．０％（ｗ／ｗ）溶液または懸濁液などの、点眼剤の形態にあってもよい。そのような点眼剤は、緩衝剤、塩、または１つまたは複数の他の本明細書に記載のさらなる成分をさらに含んでもよい。有用である他の眼科的に投与可能な製剤としては、微結晶形態またはリポソーム調製物中に活性成分を含むものが挙げられる。
【０４４６】
本明細書で用いられる「さらなる成分」としては、限定されるものではないが、１つまたは複数の以下のもの：賦形剤；界面活性剤；分散剤；不活性希釈剤；顆粒化剤および崩壊剤；結合剤；潤滑剤；甘味料；香料；着色料；保存剤；ゼラチンなどの生理的に分解される組成物；水性ビヒクルおよび溶媒；油性ビヒクルおよび溶媒；懸濁剤；分散剤または湿潤剤；乳化剤、粘滑剤；緩衝剤；塩；増粘剤；充填剤；乳化剤；酸化防止剤；抗生物質；抗真菌剤；安定剤；ならびに薬学的に許容できるポリマーまたは疎水性材料が挙げられる。本発明の医薬組成物中に含有させることができる他の「さらなる成分」は当技術分野で公知であり、例えば、参照により本明細書に組み込まれるＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｇｅｎａｒｏ（編）、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．、Ｅａｓｔｏｎ、ＰＡ（１９８５）に記載されている。
【０４４７】
一実施形態において、操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートは、約５〜６の範囲のｐＨの酢酸ナトリウム、ポリソルベート８０、および塩化ナトリウムと共に、５ｍｇ／ｍｌ、またはより好ましくは、約１０ｍｇ／ｍｌ、またはさらにより好ましくは、約１５ｍｇ／ｍｌ、またはさらにより好ましくは、約２０ｍｇ／ｍｌの抗体を含有する滅菌水性溶液として、静脈内製剤中で投与される。好ましくは、静脈内製剤は、ｐＨ５．５の２０ｍＭ酢酸ナトリウム、０．２ｍｇ／ｍｌポリソルベート８０、および１４０ｍＭ塩化ナトリウムと共に、５または１０ｍｇ／ｍｌの抗体を含有する滅菌水性溶液である。さらに、操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを含む溶液は、多くの他の化合物の中でも、ヒスチジン、マンニトール、スクロース、トレハロース、グリシン、ポリ（エチレン）グリコール、ＥＤＴＡ、メチオニン、およびその任意の組合せ、ならびに関連業界で公知の多くの他の化合物を含んでもよい。
【０４４８】
一実施形態において、用量の一部を、静脈内ボーラスにより投与し、残りを操作された抗体または操作された抗体コンジュゲート製剤の注入により投与する。例えば、操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートの０．０１ｍｇ／ｋｇの静脈内注射を、ボーラスとして与え、残りの所定の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲート用量を静脈内注射により投与することができる。所定の用量の操作された抗体を、例えば、１．５時間〜２時間から５時間の期間にわたって投与することができる。
【０４４９】
治療剤に関して、作用物質が例えば、低分子である場合、当技術分野で周知であるように、それは生理的に許容できるエステルまたは塩の形態で、例えば、生理的に許容できる陽イオンまたは陰イオンと共に医薬組成物中に存在してもよい。
【０４５０】
本明細書に記載の医薬組成物の製剤を、製薬業界で公知の、または今後開発される任意の方法により調製することができる。一般に、そのような調製方法は、活性成分を担体または１つもしくは複数の他の補助成分と会合させるステップ、次いで、必要に応じて、または望ましい場合、所望の単回または複数回用量単位中に生成物を形状化または包装するステップを含む。
【０４５１】
一実施形態において、本開示の組成物は、内毒素および／または関連する発熱物質を実質的に含まない無発熱物質製剤である。内毒素としては、微生物の内部で確認され、微生物が破壊されるか、または死ぬ時に放出される毒素が挙げられる。発熱物質はまた、細菌および他の微生物の外膜に由来する熱誘導性、熱安定物質（糖タンパク質）も含む。これらの物質は両方とも、ヒトに投与した場合、発熱、低血圧およびショックを引き起こし得る。潜在的な有害効果のため、静脈内投与される医薬溶液から、少量の内毒素であっても除去することが有利である。米国食品医薬品局（「ＦＤＡ」）は、静脈内薬物適用について、１時間に体重１キログラムあたり、用量あたり上限５内毒素単位（ＥＵ）を設定した（Ｔｈｅ  Ｕｎｉｔｅｄ  Ｓｔａｔｅｓ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅｉａｌ  Ｃｏｎｖｅｎｔｉｏｎ、Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅｉａｌ  Ｆｏｒｕｍ  ２６（１）：２２３（２０００））。治療タンパク質を体重１キログラムあたり数百または数千ミリグラムの量で投与する場合、微量でも内毒素を除去することが有利である。一実施形態において、組成物中の内毒素および発熱物質レベルは、１０ＥＵ／ｍｇ未満、または５ＥＵ／ｍｇ未満、または１ＥＵ／ｍｇ未満、または０．１ＥＵ／ｍｇ未満、または０．０１ＥＵ／ｍｇ未満、または０．００１ＥＵ／ｍｇ未満である。別の実施形態において、組成物中の内毒素および発熱物質レベルは、約１０ＥＵ／ｍｇ未満、または約５ＥＵ／ｍｇ未満、または約１ＥＵ／ｍｇ未満、または約０．１ＥＵ／ｍｇ未満、または約０．０１ＥＵ／ｍｇ未満、または約０．００１ＥＵ／ｍｇ未満である。
【０４５２】
一実施形態において、本開示は、投与が経口、非経口、筋肉内、鼻内、膣内、直腸、舌、舌下、頬、頬内、静脈内、皮膚、皮下または経皮である、組成物を投与することを含む。
【０４５３】
別の実施形態において、本開示は、外科手術、化学療法、ホルモン療法、生物療法、免疫療法または放射線療法などの他の療法と組み合わせて組成物を投与することをさらに含む。
【０４５４】
投薬／投与
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを含む医薬組成物または滅菌組成物を調製するために、抗体／抗体コンジュゲートを、薬学的に許容できる担体または賦形剤と混合する。治療剤または診断剤の製剤を、例えば、凍結乾燥粉末、スラリー、水溶液、ローション、または懸濁液の形態で生理的に許容される担体、賦形剤、または安定剤と混合することにより調製することができる（例えば、Ｈａｒｄｍａｎら（２００１）、Ｇｏｏｄｍａｎ  ａｎｄ  Ｇｉｌｍａｎ’ｓ  Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ、ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．；Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ、Ｗｉｌｌｉａｍｓ、およびＷｉｌｋｉｎｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．；Ａｖｉｓら（編）（１９９３）、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ：Ｐａｒｅｎｔｅｒａｌ  Ｍｅｄｉｃａｔｉｏｎｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、ＮＹ；Ｌｉｅｂｅｒｍａｎら（編）（１９９０）、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ：Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、ＮＹ；Ｌｉｅｂｅｒｍａｎら（編）（１９９０）、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ：Ｄｉｓｐｅｒｓｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、ＮＹ；ＷｅｉｎｅｒおよびＫｏｔｋｏｓｋｉｅ（２０００）、Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔ  Ｔｏｘｉｃｉｔｙ  ａｎｄ  Ｓａｆｅｔｙ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．を参照されたい）。
【０４５５】
治療剤のための投与レジメンの選択は、その実体の血清または組織代謝回転率、症状のレベル、実体の免疫原性、および生物マトリックス中の標的細胞の接近可能性などのいくつかの因子に依存する。特定の実施形態において、投与レジメンは、許容できるレベルの副作用と一致する患者に送達される治療剤の量を最大化する。したがって、送達される生物製剤の量は、特定の実体および処置される状態の重症度に一部依存する。抗体、サイトカイン、および低分子の適切な用量を選択する際の指針が利用可能である（例えば、Ｗａｗｒｚｙｎｃｚａｋ、１９９６、Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｔｈｅｒａｐｙ、Ｂｉｏｓ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｐｕｂ．Ｌｔｄ，Ｏｘｆｏｒｄｓｈｉｒｅ、ＵＫ；Ｋｒｅｓｉｎａ（編）、１９９１、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，  Ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ  ａｎｄ  Ａｒｔｈｒｉｔｉｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．；Ｂａｃｈ（編）、１９９３、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ｉｎ  Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｅ  Ｄｉｓｅａｓｅｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．；Ｂａｅｒｔら、２００３、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４８：６０１〜６０８；Ｍｉｌｇｒｏｍら、１９９９、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４１：１９６６〜１９７３；Ｓｌａｍｏｎら、２００１、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４４：７８３〜７９２；Ｂｅｎｉａｍｉｎｏｖｉｔｚら、２０００、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４２：６１３〜６１９；Ｇｈｏｓｈら、２００３、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４８：２４〜３２；Ｌｉｐｓｋｙら、２０００、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４３：１５９４〜１６０２を参照されたい）。
【０４５６】
適切な用量の決定は、例えば、処置に影響することが当技術分野で公知であるか、もしくは疑われるか、または処置に影響すると予測されるパラメータまたは因子を用いて、医師によｒって行われる。一般に、用量は最適用量よりもいくらか少ない量で開始し、その後、負の副作用と比較して所望の効果または最適な効果が達成されるまで少しずつ増加させる。重要な診断尺度は、例えば、炎症の症状のもの、または生成される炎症性サイトカインのレベルを含む。
【０４５７】
本開示の医薬組成物中の活性成分の実際の用量レベルは、患者に対して毒性的になることなく、特定の患者、組成物、および投与様式について所望の治療応答を達成するために有効である活性成分の量を得るために変化してもよい。選択される用量レベルは、用いられる本開示の特定の組成物、またはそのエステル、塩もしくはアミドの活性、投与経路、投与時間、用いられる特定の化合物の排出速度、処置の持続期間、用いられる特定の化合物と共に用いられる他の薬物、化合物および／または材料、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、一般的健康および以前の病歴、ならびに医学界で周知の同様の因子などの、様々な薬物動態因子に依存するであろう。
【０４５８】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを含む組成物を、連続注入により、または例えば、１日、１週間の間隔で、もしくは週に１〜７回の投与により提供することができる。用量を、静脈内、皮下、局所、経口、鼻内、直腸、筋肉内、大脳内的に、または吸入により提供することができる。特定の用量プロトコールは、有意な望ましくない副作用を回避する最大用量または用量頻度を含むものである。合計週用量は、少なくとも０．０５μｇ／ｋｇ体重、少なくとも０．２μｇ／ｋｇ、少なくとも０．５μｇ／ｋｇ、少なくとも１μｇ／ｋｇ、少なくとも１０μｇ／ｋｇ、少なくとも１００μｇ／ｋｇ、少なくとも０．２ｍｇ／ｋｇ、少なくとも１．０ｍｇ／ｋｇ、少なくとも２．０ｍｇ／ｋｇ、少なくとも１０ｍｇ／ｋｇ、少なくとも２５ｍｇ／ｋｇ、または少なくとも５０ｍｇ／ｋｇであってもよい（例えば、Ｙａｎｇら、２００３、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４９：４２７〜４３４；Ｈｅｒｏｌｄら、２００２、Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３４６：１６９２〜１６９８；Ｌｉｕら、１９９９、Ｊ．Ｎｅｕｒｏｌ．Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ．Ｐｓｙｃｈ．６７：４５１〜４５６；Ｐｏｒｔｉｅｌｊｉら、２００３、Ｃａｎｃｅｒ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．５２：１３３〜１４４を参照されたい）。用量は、少なくとも１５μｇ、少なくとも２０μｇ、少なくとも２５μｇ、少なくとも３０μｇ、少なくとも３５μｇ、少なくとも４０μｇ、少なくとも４５μｇ、少なくとも５０μｇ、少なくとも５５μｇ、少なくとも６０μｇ、少なくとも６５μｇ、少なくとも７０μｇ、少なくとも７５μｇ、少なくとも８０μｇ、少なくとも８５μｇ、少なくとも９０μｇ、少なくとも９５μｇ、または少なくとも１００μｇであってよい。対象に投与される用量は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２回以上の回数であってもよい。
【０４５９】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートについて、患者に投与される用量は、０．０００１ｍｇ／ｋｇ患者体重〜１００ｍｇ／ｋｇ患者体重であってもよい。用量は、０．０００１ｍｇ／ｋｇ〜２０ｍｇ／ｋｇ、０．０００１ｍｇ／ｋｇ〜１０ｍｇ／ｋｇ、０．０００１ｍｇ／ｋｇ〜５ｍｇ／ｋｇ、０．０００１〜２ｍｇ／ｋｇ、０．０００１〜１ｍｇ／ｋｇ、０．０００１ｍｇ／ｋｇ〜０．７５ｍｇ／ｋｇ、０．０００１ｍｇ／ｋｇ〜０．５ｍｇ／ｋｇ、０．０００１ｍｇ／ｋｇ〜０．２５ｍｇ／ｋｇ、０．０００１〜０．１５ｍｇ／ｋｇ、０．０００１〜０．１０ｍｇ／ｋｇ、０．００１〜０．５ｍｇ／ｋｇ、０．０１〜０．２５ｍｇ／ｋｇまたは０．０１〜０．１０ｍｇ／ｋｇ患者体重であってもよい。
【０４６０】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートの用量を、キログラム（ｋｇ）の患者体重にｍｇ／ｋｇで投与される用量を掛けたものを用いて算出することができる。本開示の抗体の用量は、患者体重の１５０μｇ／ｋｇ以下、１２５μｇ／ｋｇ以下、１００μｇ／ｋｇ以下、９５μｇ／ｋｇ以下、９０μｇ／ｋｇ以下、８５μｇ／ｋｇ以下、８０μｇ／ｋｇ以下、７５μｇ／ｋｇ以下、７０μｇ／ｋｇ以下、６５μｇ／ｋｇ以下、６０μｇ／ｋｇ以下、５５μｇ／ｋｇ以下、５０μｇ／ｋｇ以下、４５μｇ／ｋｇ以下、４０μｇ／ｋｇ以下、３５μｇ／ｋｇ以下、３０μｇ／ｋｇ以下、２５μｇ／ｋｇ以下、２０μｇ／ｋｇ以下、１５μｇ／ｋｇ以下、１０μｇ／ｋｇ以下、５μｇ／ｋｇ以下、２．５μｇ／ｋｇ以下、２μｇ／ｋｇ以下、１．５μｇ／ｋｇ以下、１μｇ／ｋｇ以下、０．５μｇ／ｋｇ以下、または０．５μｇ／ｋｇ以下であってもよい。
【０４６１】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートの単位用量は、０．１ｍｇ〜２０ｍｇ、０．１ｍｇ〜１５ｍｇ、０．１ｍｇ〜１２ｍｇ、０．１ｍｇ〜１０ｍｇ、０．１ｍｇ〜８ｍｇ、０．１ｍｇ〜７ｍｇ、０．１ｍｇ〜５ｍｇ、０．１〜２．５ｍｇ、０．２５ｍｇ〜２０ｍｇ、０．２５〜１５ｍｇ、０．２５〜１２ｍｇ、０．２５〜１０ｍｇ、０．２５〜８ｍｇ、０．２５ｍｇ〜７ｍｇ、０．２５ｍｇ〜５ｍｇ、０．５ｍｇ〜２．５ｍｇ、１ｍｇ〜２０ｍｇ、１ｍｇ〜１５ｍｇ、１ｍｇ〜１２ｍｇ、１ｍｇ〜１０ｍｇ、１ｍｇ〜８ｍｇ、１ｍｇ〜７ｍｇ、１ｍｇ〜５ｍｇ、または１ｍｇ〜２．５ｍｇであってもよい。
【０４６２】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートの用量は、対象中で少なくとも０．１μｇ／ｍｌ、少なくとも０．５μｇ／ｍｌ、少なくとも１μｇ／ｍｌ、少なくとも２μｇ／ｍｌ、少なくとも５μｇ／ｍｌ、少なくとも６μｇ／ｍｌ、少なくとも１０μｇ／ｍｌ、少なくとも１５μｇ／ｍｌ、少なくとも２０μｇ／ｍｌ、少なくとも２５μｇ／ｍｌ、少なくとも５０μｇ／ｍｌ、少なくとも１００μｇ／ｍｌ、少なくとも１２５μｇ／ｍｌ、少なくとも１５０μｇ／ｍｌ、少なくとも１７５μｇ／ｍｌ、少なくとも２００μｇ／ｍｌ、少なくとも２２５μｇ／ｍｌ、少なくとも２５０μｇ／ｍｌ、少なくとも２７５μｇ／ｍｌ、少なくとも３００μｇ／ｍｌ、少なくとも３２５μｇ／ｍｌ、少なくとも３５０μｇ／ｍｌ、少なくとも３７５μｇ／ｍｌ、または少なくとも４００μｇ／ｍｌの血清力価を達成してもよい。あるいは、本開示の抗体の用量は、対象中で少なくとも０．１μｇ／ｍｌ、少なくとも０．５μｇ／ｍｌ、少なくとも１μｇ／ｍｌ、少なくとも２μｇ／ｍｌ、少なくとも５μｇ／ｍｌ、少なくとも６μｇ／ｍｌ、少なくとも１０μｇ／ｍｌ、少なくとも１５μｇ／ｍｌ、少なくとも２０μｇ／ｍｌ、少なくとも２５μｇ／ｍｌ、少なくとも５０μｇ／ｍｌ、少なくとも１００μｇ／ｍｌ、少なくとも１２５μｇ／ｍｌ、少なくとも１５０μｇ／ｍｌ、少なくとも１７５μｇ／ｍｌ、少なくとも２００μｇ／ｍｌ、少なくとも２２５μｇ／ｍｌ、少なくとも２５０μｇ／ｍｌ、少なくとも２７５μｇ／ｍｌ、少なくとも３００μｇ／ｍｌ、少なくとも３２５μｇ／ｍｌ、少なくとも３５０μｇ／ｍｌ、少なくとも３７５μｇ／ｍｌ、または少なくとも４００μｇ／ｍｌの血清力価を達成してもよい。
【０４６３】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートの投薬を反復してもよく、その投与を少なくとも１日、２日、３日、５日、１０日、１５日、３０日、４５日、２カ月、７５日、３カ月、または少なくとも６カ月空けてもよい。
【０４６４】
特定の患者のための有効量は、処置される状態、患者の全体的な健康状態、投与の方法経路および用量ならびに副作用の重症度などの因子に応じて変化してもよい（例えば、Ｍａｙｎａｒｄら、１９９６、Ａ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  ＳＯＰｓ  ｆｏｒ  Ｇｏｏｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ、Ｉｎｔｅｒｐｈａｒｍ  Ｐｒｅｓｓ、Ｂｏｃａ  Ｒａｔｏｎ、ＦＩａ．；Ｄｅｎｔ、２００１、Ｇｏｏｄ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ａｎｄ  Ｇｏｏｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ、Ｕｒｃｈ  Ｐｕｂｌ、Ｌｏｎｄｏｎ、ＵＫを参照されたい）。
【０４６５】
投与経路は、例えば、局所もしくは皮膚適用、静脈内、腹腔内、大脳内、筋肉内、眼内、動脈内、脳脊髄内、病変内投与による注射もしくは注入、または持続放出系もしくはインプラントによるものであってもよい（例えば、Ｓｉｄｍａｎら、１９８３、Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ  ２２：５４７〜５５６；Ｌａｎｇｅｒら、１９８１、Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｍａｔｅｒ．Ｒｅｓ．１５：１６７〜２７７；Ｌａｎｇｅｒ、１９８２、Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈ．１２：９８〜１０５；Ｅｐｓｔｅｉｎら、１９８５、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８２：３６８８〜３６９２；Ｈｗａｎｇら、１９８０、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７７：４０３０〜４０３４；米国特許第６，３５０，４６６号および第６，３１６，０２４号を参照されたい）。必要に応じて、組成物はまた、可溶化剤および注射部位での疼痛を緩和するためのリドカインなどの局部麻酔剤を含んでもよい。さらに、例えば、吸入器または噴霧器、およびエアロゾル化剤を含む製剤の使用により、肺投与を用いることもできる。例えば、米国特許第６，０１９，９６８号、第５，９８５，３２０号、第５，９８５，３０９号、第５，９３４，２７２号、第５，８７４，０６４号、第５，８５５，９１３号、第５，２９０，５４０号、および第４，８８０，０７８号；ならびにＰＣＴ公開ＷＯ９２／１９２４４、ＷＯ９７／３２５７２、ＷＯ９７／４４０１３、ＷＯ９８／３１３４６、およびＷＯ９９／６６９０３（それぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。一実施形態において、本開示の操作された抗体もしくは操作された抗体コンジュゲート、組合せ療法、または組成物を、Ａｌｋｅｒｍｅｓ  ＡＩＲ（商標）肺薬物送達技術（Ａｌｋｅｒｍｅｓ，Ｉｎｃ．、Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ、Ｍａｓｓ．）を用いて投与する。
【０４６６】
本開示の組成物を、１つまたは複数の当技術分野で公知の様々な方法を用いる１つまたは複数の投与経路を介して投与することもできる。当業者には理解できるように、投与の経路および／または様式は、所望の結果に応じて変化するであろう。本開示の抗体のための選択される投与経路は、例えば、注射または注入による、静脈内、筋肉内、皮内、腹腔内、皮下、脊髄または他の非経口投与経路を含む。非経口投与は、通常は注射による腸内投与および局所投与以外の投与様式であってよく、限定されるものではないが、静脈内、筋肉内、動脈内、鞘内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、くも膜下、脊髄内、硬膜外および胸骨内注射および注入が挙げられる。あるいは、本開示の組成物を、局所、表皮または粘膜投与経路、例えば、鼻内、経口、膣、直腸、舌下または局所などの非経口経路により投与することができる。
【０４６７】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを制御放出または持続放出系において投与する場合、ポンプを用いて制御放出または持続放出を達成することができる（Ｌａｎｇｅｒ、上掲；Ｓｅｆｔｏｎ、１９８７、ＣＲＣ  Ｃｒｉｔ．Ｒｅｆ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｅｎｇ．１４：２０；Ｂｕｃｈｗａｌｄら、１９８０、Ｓｕｒｇｅｒｙ  ８８：５０１；Ｓａｕｄｅｋら、１９８９、Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３２１：５１４を参照されたい）。
【０４６８】
ポリマー材料を用いて、本開示の療法の制御放出または持続放出を達成することができる（例えば、Ｍｅｄｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ、ＬａｎｇｅｒおよびＷｉｓｅ（編）、ＣＲＣ  Ｐｒｅｓ．、Ｂｏｃａ  Ｒａｔｏｎ、ＦＩａ．（１９７４）；Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｂｉｏａｖａｉｌａｂｉｌｉｔｙ，  Ｄｒｕｇ  Ｐｒｏｄｕｃｔ  Ｄｅｓｉｇｎ  ａｎｄ  Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ、ＳｍｏｌｅｎおよびＢａｌｌ（編）、Ｗｉｌｅｙ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９８４）；ＲａｎｇｅｒおよびＰｅｐｐａｓ、１９８３、Ｊ．Ｍａｃｒｏｍｏｌ．ＳｃＬＲｅｖ．Ｍａｃｒｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．２３：６１を参照されたい；また、Ｌｅｖｙら、１９８５、Ｓｃｉｅｎｃｅ  １１  ２２５：１９０；Ｄｕｒｉｎｇら、１９Ｚ９、Ａｎｎ．Ｎｅｕｒｏｌ．２５：３５１；Ｈｏｗａｒｄら、１９８９、Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ．７  １：１０５も参照されたい）；米国特許第５，６７９，３７７号；米国特許第５，９１６，５９７号；米国特許第５，９１２，０１５号；米国特許第５，９８９，４６３号；米国特許第５，１２８，３２６号；ＰＣＴ公開ＷＯ９９／１５１５４；およびＰＣＴ公開ＷＯ９９／２０２５３。持続放出製剤中で用いられるポリマーの例としては、限定されるものではないが、ポリ（２−ヒドロキシエチルメタクリレート）、ポリ（メチルメタクリレート）、ポリ（アクリル酸）、ポリ（エチレン−ｃｏ−ビニル酢酸）、ポリ（メタクリル酸）、ポリグリコリド（ＰＬＧ）、ポリ無水物、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリエチレングリコール、ポリラクチド（ＰＬＡ）、ポリラクチド（ｐｏｌｙｏｅａｃｔｉｄｅ）−ｃｏ−グリコリド（ＰＬＧＡ）、およびポリオルトエステルが挙げられる。一実施形態において、持続放出製剤中で用いられるポリマーは、不活性であり、濾過できる不純物を含まず、保存時に安定であり、無菌性であり、生分解性である。制御放出または持続放出系を、予防または治療標的の近くに置き、したがって、ほんの少量の全身用量を必要とすることができる（例えば、Ｇｏｏｄｓｏｎ、Ｍｅｄｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ、上掲、第２巻、ｐｐ．１１５〜１３８（１９８４）を参照されたい）。
【０４６９】
制御放出系は、Ｌａｎｇｅｒ、１９９０、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：１５２７〜１５３３による概説で論じられている。当業者には公知の任意の技術を用いて、本開示の１つもしくは複数の抗体またはそのコンジュゲートを含む持続放出製剤を生成することができる。例えば、米国特許第４，５２６，９３８号、国際特許公開ＷＯ９１／０５５４８、ＷＯ９６／２０６９８、Ｎｉｎｇら、１９９６、「Ｉｎｔｒａｔｕｍｏｒａｌ  Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒａｐｈｙ  ｏｆ  ａ  Ｈｕｍａｎ  Ｃｏｌｏｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｘｅｎｏｇｒａｆｔ  Ｕｓｉｎｇ  ａ  Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ−Ｒｅｌｅａｓｅ  Ｇｅｌ」、Ｒａｄｉｏｔｈｅｒａｐｙ  ａｎｄ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ  ５９：１７９〜１８９、Ｓｏｎｇら、１９９５、「Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｍｅｄｉａｔｅｄ  Ｌｕｎｇ  Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  ｏｆ  Ｌｏｎｇ−Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ  Ｅｍｕｌｓｉｏｎｓ」、ＰＤＡ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ５０：３７２〜３９７、Ｃｌｅｅｋら、１９９７、「Ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｂｌｅ  Ｐｏｌｙｍｅｒｉｃ  Ｃａｒｒｉｅｒｓ  ｆｏｒ  ａ  ｂＦＧＦ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｆｏｒ  Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ」、Ｐｒｏ．Ｍｌ．Ｓｙｍｐ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌ．Ｂｉｏａｃｔ．Ｍａｔｅｒ．２４：８５３〜８５４、およびＬａｍら、１９９７、「Ｍｉｃｒｏｅｎｃａｐｓｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  Ｈｕｍａｎｉｚｅｄ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｆｏｒ  Ｌｏｃａｌ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ」、Ｐｒｏｃ．Ｍｌ．Ｓｙｍｐ．Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｒｅｌ．Ｂｉｏａｃｔ．Ｍａｔｅｒ．２４：７５９〜１６０（それぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。
【０４７０】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを局所投与する場合、それは軟膏、クリーム、経皮パッチ、ローション、ゲル、シャンプー、スプレー、エアロゾル、溶液、乳濁液、または当業者には周知の他の形態に製剤化することができる。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  ａｎｄ  Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｔｏ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ、第１９版、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂ．Ｃｏ．、Ｅａｓｔｏｎ、Ｐａ．（１９９５）を参照されたい。噴霧不可能な局所剤形については、局所適用に適合し、いくつかの例においては、水よりも高い動的粘度を有する担体または１つもしくは複数の賦形剤を含む粘性から半固体の形態または固体形態が典型的に用いられる。好適な製剤としては、限定されるものではないが、必要に応じて、滅菌されたか、または例えば、浸透圧などの様々な特性に影響を及ぼすための補助剤（例えば、保存剤、安定剤、湿潤剤、緩衝剤、もしくは塩）と混合した、溶剤、懸濁剤、乳剤、クリーム、軟膏、粉末、リニメント剤、膏薬などが挙げられる。他の好適な局所剤形としては、いくつかの例において、固体または液体不活性担体と組み合わせた活性成分が、加圧された揮発性物質（例えば、フロンなどの気体性推進剤）との混合物中、またはスクイーズボトル中に包装された、噴霧可能なエアロゾル調製物が挙げられる。必要に応じて、湿潤剤または保湿剤を医薬組成物および剤形に添加してもよい。そのようなさらなる成分の例は、当技術分野で周知である。
【０４７１】
操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを含む組成物を鼻内投与する場合、それをエアロゾル形態、スプレー、ミスト中で、または液滴の形態で製剤化することができる。特に、本開示に従う使用のための予防剤または治療剤を、好適な推進剤（例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素または他の好適な気体）を用いて、加圧パックまたは噴霧器からのエアロゾルスプレー提供物の形態で都合良く送達することができる。加圧エアロゾルの場合、用量単位を、一定量を送達するためのバルブを提供することにより決定することができる。化合物と、ラクトースまたはデンプンなどの好適な粉末基剤との粉末混合物を含有する吸入器または通気装置における使用のためのカプセルおよびカートリッジ（例えば、ゼラチンから構成される）を製剤化することができる。
【０４７２】
第２の治療剤、例えば、サイトカイン、ステロイド、化学療法剤、抗生物質、または放射線との同時投与または処置のための方法は、当技術分野で周知である（例えば、Ｈａｒｄｍａｎら（編）（２００１）、Ｇｏｏｄｍａｎ  ａｎｄ  Ｇｉｌｍａｎ’ｓ  Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ、第１０版、ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．；ＰｏｏｌｅおよびＰｅｔｅｒｓｏｎ（編）（２００１）、Ｐｈａｒｍａｃｏｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ  ｆｏｒ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ、ＷｉｌｌｉａｍｓおよびＷｉｌｋｉｎｓ、Ｐｈｉｌａ．，Ｐａ．；ＣｈａｂｎｅｒおよびＬｏｎｇｏ（編）（２００１）、Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｔｈｅｒａｐｙ、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ、ＷｉｌｌｉａｍｓおよびＷｉｌｋｉｎｓ、Ｐｈｉｌａ．，Ｐａ．を参照されたい）。治療剤の有効量は、症状を少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも約３０％、少なくとも４０％、または少なくとも５０％減少させてもよい。
【０４７３】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートと共に投与することができるさらなる療法剤（例えば、予防剤または治療剤）を、本開示の抗体から５分未満空けて、３０分未満空けて、１時間空けて、約１時間空けて、約１〜約２時間空けて、約２時間〜約３時間空けて、約３時間〜約４時間空けて、約４時間〜約５時間空けて、約５時間〜約６時間空けて、約６時間〜約７時間空けて、約７時間〜約８時間空けて、約８時間〜約９時間空けて、約９時間〜約１０時間空けて、約１０時間〜約１１時間空けて、約１１時間〜約１２時間空けて、約１２時間〜１８時間空けて、１８時間〜２４時間空けて、２４時間〜３６時間空けて、３６時間〜４８時間空けて、４８時間〜５２時間空けて、５２時間〜６０時間空けて、６０時間〜７２時間空けて、７２時間〜８４時間空けて、８４時間〜９６時間空けて、または９６時間〜１２０時間空けて投与することができる。２つ以上の療法を、１回の同じ患者訪問内で投与することができる。
【０４７４】
本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートおよび他の療法剤を、周期的に投与することができる。周期的療法は、１つの療法剤に対する耐性の発生を減少させるため、１つの療法剤の副作用を回避するか、もしくは減少させるため、および／または療法の効率を改善するために、一定期間にわたる第１の療法剤（例えば、第１の予防剤または治療剤）の投与、次いで、一定期間にわたる第２の療法剤（例えば、第２の予防剤または治療剤）の投与、場合により、次いで一定期間にわたる第３の療法剤（例えば、予防剤または治療剤）の投与など、およびこの逐次投与、すなわち、周期を反復することを含む。
【０４７５】
ある特定の実施形態において、本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを、適切なｉｎ  ｖｉｖｏでの分布を確保するように製剤化することができる。例えば、血液脳関門（ＢＢＢ）は、多くの高度に親水性の化合物を排除する。本開示の治療化合物がＢＢＢを通過することを確保するために（必要に応じて）、それらを、例えば、リポソーム中で製剤化することができる。リポソームを製造する方法については、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号；第５，３７４，５４８号；および第５，３９９，３３１号を参照されたい。リポソームは、特定の細胞または臓器中に選択的に輸送され、したがって、標的薬物送達を増強する１つまたは複数の部分を含んでもよい（例えば、Ｖ．Ｖ．Ｒａｎａｄｅ、１９８９、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２９：６８５を参照されたい）。例示的な標的化部分としては、葉酸またはビオチン（例えば、米国特許第５，４１６，０１６号を参照されたい）；マンノシド（Ｕｍｅｚａｗａら、Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．１５３：１０３８）；抗体（Ｐ．Ｇ．Ｂｌｏｅｍａｎら、１９９５、ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．３５７：１４０；Ｍ．Ｏｗａｉｓら、１９９５、Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ．Ａｇｅｎｔｓ  Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．３９：１８０）；界面活性剤プロテインＡ受容体（Ｂｒｉｓｃｏｅら（１９９５）、ＡＭ．Ｊ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．１２３３：１３４）；ｐｌ２０（Ｓｃｈｒｅｉｅｒら（１９９４）、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６９：９０９０）が挙げられる；また、Ｋ．Ｋｅｉｎａｎｅｎ；Ｍ．Ｌ．Ｌａｕｋｋａｎｅｎ、１９９４、ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．３４６：１２３；Ｋｉｌｌｉｏｎ；Ｆｉｄｌｅｒ、１９９４、Ｉｍｍｕｎｏｍｅｔｈｏｄｓ  ４：２７３も参照されたい。
【０４７６】
本開示は、本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを単独で、または他の療法剤と共に含む医薬組成物の、それを必要とする対象への投与のためのプロトコールを提供する。本開示の組合せ療法の療法剤（例えば、予防剤または治療剤）を、対象に同時に、または逐次投与することができる。本開示の組合せ療法の療法剤（例えば、予防剤または治療剤）を、周期的に投与することもできる。周期的療法は、１つの療法剤（例えば、作用物質）に対する耐性の発生を減少させるため、１つの療法剤（例えば、作用物質）の副作用を回避するか、もしくは減少させるため、および／または療法の有効性を改善するために、一定期間にわたる第１の療法剤（例えば、第１の予防剤または治療剤）の投与、次いで、一定期間にわたる第２の療法剤（例えば、第２の予防剤または治療剤）の投与、およびこの逐次投与、すなわち、周期を反復することを含む。
【０４７７】
本開示の組合せ療法の療法剤（例えば、予防剤または治療剤）を、対象に同時に投与することができる。用語「同時に」は、正確に同時の療法剤（例えば、予防剤または治療剤）の投与に限定されないが、むしろ、本開示の抗体またはそのコンジュゲートが他の療法剤（複数可）と一緒に作用して、それらを別に投与した場合よりも増大した利益を提供することができるような順序および時間間隔内で、本開示の操作された抗体または操作された抗体コンジュゲートを含む医薬組成物が対象に投与されることを意味する。例えば、それぞれの療法を、同時に、または異なる時点で任意の順序で逐次対象に投与することができる；しかしながら、同時に投与しない場合、それらを、所望の治療または予防効果を提供するように十分に近い時間内に投与すべきである。それぞれの療法を、任意の適切な形態で、および任意の好適な経路により、別々に対象に投与することができる。様々な実施形態において、療法剤（例えば、予防剤または治療剤）を、１５分未満空けて、３０分未満空けて、１時間未満空けて、約１時間空けて、約１時間〜約２時間空けて、約２時間〜約３時間空けて、約３時間〜約４時間空けて、約４時間〜約５時間空けて、約５時間〜約６時間空けて、約６時間〜約７時間空けて、約７時間〜約８時間空けて、約８時間〜約９時間空けて、約９時間〜約１０時間空けて、約１０時間〜約１１時間空けて、約１１時間〜約１２時間空けて、２４時間空けて、４８時間空けて、７２時間空けて、または１週間空けて対象に投与する。他の実施形態において、２つ以上の療法剤（例えば、予防剤または治療剤）を、同じ患者訪問内に投与する。
【０４７８】
組合せ療法の予防剤または治療剤を、同じ医薬組成物中で対象に投与することができる。あるいは、組合せ療法の予防剤または治療剤を、別々の医薬組成物中で対象に同時に投与することができる。予防剤または治療剤を、同じか、または異なる投与経路によって対象に投与してもよい。
【０４７９】
等価物
前記明細書は、当業者が本開示の実施を可能とするのに十分なものであると考えられる。前記説明および実施例は、本開示の特定の例示的実施形態を詳述するものである。しかしながら、本文中に出現し得る前記のことがどんなに詳述されていたとしても、本開示を多くの方法で実施することができ、本開示が添付の特許請求の範囲およびその任意の等価物に従って解釈されるべきであるということが理解されるであろう。
【０４８０】
特許、特許出願、論文、教科書などを含む本明細書で引用される全ての参考文献、およびそこで引用される参考文献は、それらがまだされていない程度で、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０４８１】
例示的実施形態
本発明を、以下の実験的実施例を参照してさらに詳細に説明する。これらの実施例は、例示のためだけに提供されるものであり、別途特定しない限り、限定的であることを意図しない。したがって、本発明は、いかなる意味でも以下の実施例に限定されると解釈されるべきではなく、むしろ、本明細書に提供される教示の結果として明らかになる任意かつ全ての変更を包含すると解釈されるべきである。
【実施例】
【０４８２】
（実施例１）
部位特異的コンジュゲーションのためのヒト抗体ＩｇＧ１−Ｆｃ領域中への反応性システインの操作
抗体薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）のための従来のコンジュゲーション戦略は、リシンまたはシステインを介してペイロードを抗体に無作為にコンジュゲートさせることに依っている。本明細書に例示される方法は、規定の薬物：抗体モル比（ＤＡＲ）を有する種から構成されるＡＤＣの均一な集団を生成する。本明細書に開示されるデータは、これらの新しい位置での反応性アミノ酸残基を用いる抗体への毒性ペイロードの部位特異的コンジュゲーションが、コンジュゲートの薬物動態、生体内分布および安全性プロファイルの改善をもたらす均一の化学量論を有する均一なＡＤＣ調製物をもたらすことを証明する。本明細書に開示されるデータは、２または４のいずれかの薬物：抗体比を有する均一なＡＤＣの生成および様々な治療標的化部分のための部位特異的コンジュゲーションのための有用なプラットフォームとしてのこれらの新規抗体の使用の成功を容易にするために反応性システイン残基を抗体定常領域（例えば、重鎖および軽鎖定常領域）中に操作した手法を証明する。
【０４８３】
本質的に、ヒトＩｇＧ１の結晶構造（Ｓｏｎｄｅｒｍａｎｎら、２０００、Ｎａｔｕｒｅ  ４０６：２６７〜２７３；ＰＤＢコード３ＤＯ３、１０．２２１０／ｐｄｂ３ｄｏ３／ｐｄｂで公共的に入手可能）を用いて、構造モデリングを用いて、スルフヒドリル反応性作用物質との最適なコンジュゲーションのために反応性システインを導入するべき位置を予測した。以下の表１に記載の１２個の位置が、以下の基準：約３０〜５０％の溶媒近接性、タンパク質構造／安定性の保持、ならびに限定されるものではないが、抗原への結合、ＦｃγＲ結合、ＦｃＲｎへの結合および／またはプロテインＡへの結合などの、抗体の機能的特性を有するそれぞれの位置での反応性システインの導入の干渉の欠如に基づいて、ヒトＩｇＧ１のＣＨ２およびＣＨ３ドメイン中で同定された。突然変異を含まず、生じる順番に番号付けた野生型ＩｇＧ１のアミノ酸配列（アラニン１で始まり、リシン３３０で終わる）は、以下の通りであり、配列番号１と命名される：
ＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰ  ＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧ  ＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫ  ＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳ  ＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶ  ５０
ＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳ  ＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴ  ＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴ  ＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳ  ＮＴＫＶＤＫＫＶＥＰ  １００
ＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰ  ＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧ  ＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰ  ＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰ  ＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳ  １５０
ＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷ  ＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡ  ＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮ  ＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴ  ＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫ  ２００
ＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡ  ＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳ  ＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱ  ＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥ  ＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣ  ２５０
ＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩ  ＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰ  ＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶ  ＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹ  ＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷ  ３００
ＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶ  ＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴ  ＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ  ３３０
【０４８４】
表２は、アミノ酸残基がチオール反応性部位特異的コンジュゲーションのためにシステインに突然変異された野生型内因性ヒトＩｇＧ１と比較した突然変異の位置を記載する。表２は、ヒトＩｇＧ１残基が反応性システインで置きかえられた位置を示す。位置は、Ｋａｂａｔら（１９９１、ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ、ＶＡ）に記載のＥＵインデックス番号付けシステムを用いて、およびまた、配列番号１の配列と比較した配列番号付けに従って同定される。
【０４８５】
【表２】
2019034942.tif 000004
【０４８６】
材料および方法
単一のシステインが操作された抗体ヒトＩｇＧ１の生成
ヒト５Ｔ４およびヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域（本明細書に記載の抗体を抗５Ｔ４または単に「５Ｔ４」と呼ぶ）に特異的に結合するヒト化重鎖および軽鎖可変ドメインを含むヒト化抗体中に、単一の反応性システイン残基を導入した。反応性システイン残基を、重複ＰＣＲ突然変異誘発法を用いて、表２に列挙された１２個の位置でＩｇＧ１中に導入した。突然変異を含まない、野生型ヒトＩｇＧ１のアミノ酸配列を、配列番号１に記載する。
【０４８７】
ＰＣＲ突然変異誘発を、以下のように実施した。個々のシステイン突然変異を担持するセンスおよびアンチセンス変異原オリゴヌクレオチドならびにフォワードおよびリバースヒトＩｇＧ１定常領域フランキングプライマーを、Ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ  ＤＮＡ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．（ＰａｒｋＣｏｒａｌｖｉｌｌｅ、Ｉｏｗａ）で合成した。ＰＣＲ反応１は、１００ナノグラム（ｎｇ）の抗５Ｔ４抗体をコードするプラスミドＤＮＡ、１００ｐｍｏｌのフォワードフランキングプライマーオリゴヌクレオチド、１００ｐｍｏｌのアンチセンス変異原オリゴヌクレオチド、１μｌのＶｅｎｔ（登録商標）ポリメラーゼ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ  Ｉｎｃ．、Ｉｐｓｗｉｃｈ、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）、２５μｌの２ｘＨＮ  ＰＣＲバッファー（ＥＰＩＣＥＮＴＲＥ（登録商標）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）およびＨ２Ｏを含有し、反応液の容量を５０μｌにした。同様に、ＰＣＲ反応２を、１００ｎｇのＡ１抗５Ｔ４抗体をコードするプラスミドＤＮＡ、１００ｐｍｏｌのセンス変異原オリゴヌクレオチド、１００ｐｍｏｌのリバースフランキングプライマーオリゴヌクレオチド、１μｌのＶｅｎｔ（登録商標）ポリメラーゼ、２５μｌの２ｘＨＮ  ＰＣＲバッファーおよび追加のＨ２Ｏを混合して、反応液の容量を５０μｌにすることにより作製した。反応１および２のためのＰＣＲパラメータは、９５℃で１分間、６３℃で１分間、７２℃で１分間を２５サイクル、次いで、７２℃で１０分間であった。最終的なＰＣＲ反応を、１μｌのそれぞれのＰＣＲ反応１および２、１００ｐｍｏｌのそれぞれのフォワードおよびリバースフランキングプライマーオリゴヌクレオチド、１μｌのＶｅｎｔ（登録商標）ポリメラーゼ、２５μｌの２ｘＨＮ  ＰＣＲバッファーおよびＨ２Ｏを混合して、反応液の容量を５０μｌにすることにより行った。最終的なＰＣＲ反応パラメータは、反応１および２について用いられたものと同じであった。個々の操作されたシステイン残基を担持するヒトＩｇＧ１バリアントを、Ｔ４  ＤＮＡリガーゼ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ  Ｉｎｃ．、Ｉｐｓｗｉｃｈ、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）を用いてＡ１重鎖可変領域に連結し、その核酸を配列確認した。
【０４８８】
単一のシステインが操作された抗５Ｔ４抗体バリアントの一過性発現の評価
操作された単一のシステインを含むヒト化抗５Ｔ４抗体を効率的に発現させることができることを確認するために、ＣＯＳ−１細胞を、標準的な方法を用いて、システインバリアントおよび親抗５Ｔ４抗体、すなわち、突然変異を含まない野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域をコードするプラスミドＤＮＡで一過的に同時トランスフェクトした。４８時間後、細胞培養培地を収穫し、５Ｔ４−システイン抗体バリアントを含有する得られる条件化培地を、総ヒトＩｇＧサンドイッチＥＬＩＳＡによって定量した。簡単に述べると、平底ＥＬＩＳＡプレート（Ｃｏｓｔａｒカタログ番号３５９０）を、１００μｌ／ウェルのＰＢＳ中の１μ／ｍｌのヤギ抗ヒトＩｇＧ（Ｔｈｅｒｍｏ／Ｐｉｅｒｃｅカタログ番号３１１２５）で室温で一晩被覆した。プレートを、１００μｌ／ウェルのＰＢＳ中の０．０２％カゼイン溶液で、室温で最小３時間または最大２４時間遮断した。標準物および試料をアッセイバッファー（ＰＢＳ中の０．５％ＢＳＡ＋０．０２％Ｔｗｅｅｎ−２０）中で連続希釈し、１００μｌを被覆／遮断されたＥＬＩＳＡプレートに添加し、室温で３〜２４時間インキュベートした。プレートの内容物を廃棄し、プレートを、ウェルあたり２００μｌのＰＢＳ中の０．０３％Ｔｗｅｅｎ−２０で４回洗浄した。ヤギ抗ヒトＩｇＧ（Ｔｈｅｒｍｏ／Ｐｉｅｒｃｅカタログ番号３１４１３）をアッセイバッファー中で１：５０００に希釈し、１００μｌをウェルに添加し、室温で１５分間インキュベートした。プレートを以前に記載のように洗浄し、ウェルあたり１００μｌのＢｉｏＦＸ  ＴＭＢ（３，３’，５，５’テトラメチルベンジジン；カタログ番号ＴＭＢＷ−０１００−０１、ＢｉｏＦＸ  Ｌａｂｓ．，Ｉｎｃ．、Ｏｗｉｎｇｓ  Ｍｉｌｌｓ、ＭＤ）中で発生させた。ウェルあたり１００μｌの０．１８Ｎ  Ｈ２ＳＯ４中で反応を停止させ、プレートをＭｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ  ｖＭａｘプレートリーダー上、４５０ｎＭで読み取った。未知のものの中の抗体の濃度を、標準物の希釈系列に由来する曲線の直線範囲から算出した。表３に示されるように、全ての単一システイン操作抗５Ｔ４抗体バリアントは、突然変異を欠く野生型ヒトＩｇＧ１定常領域を含む親抗５Ｔ４抗体と同等のレベルで発現した。したがって、これらのデータは、単一システイン操作抗体バリアントの一過的発現レベルが、これらの位置での反応性システインの導入によって影響されないことを示している。
【０４８９】
【表３】
2019034942.tif 000005
【０４９０】
抗５Ｔ４単一システインバリアントを発現する安定にトランスフェクトされた細胞の生成
単一操作抗体バリアントを細胞中で安定的に発現させ、大規模生成することができることを決定するために、ＣＨＯ細胞を、８個（Ｓ２５４Ｃ、Ｔ３５９Ｃ、Ｅ３８０Ｃ、Ｋ３９２Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｖ４２２Ｃ、Ｓ４４０ＣおよびＬ４４３Ｃ）の抗５Ｔ４抗体単一システインバリアントをコードする重鎖および軽鎖ＤＮＡで同時トランスフェクトし、安定な高生成プールを当技術分野で周知の標準的な手順を用いて単離した。重鎖および軽鎖発現構築物は別々の発現プラスミド上にあったため、ＤＮＡをＣＨＯ細胞中に同時トランスフェクトした。重鎖および軽鎖発現構築物をＣＨＯ細胞中に同時トランスフェクトすることにより、親抗５Ｔ４抗体のためのＣＨＯプールも生成した。全てのＦｃ操作システイン突然変異体については、これらは親抗５Ｔ４抗体と共通の軽鎖ＤＮＡ配列を共有するが、重鎖定常領域中へのシステインの組み込みのため、異なる重鎖配列を有する。安定なＣＨＯプール中で発現されたこれらの単一操作システイン抗体バリアントの力価および細胞生産性は許容できるものであり、野生型ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域を含む親抗５Ｔ４抗体と同等であった（表４）。
【０４９１】
標準的な２ステップの精製戦略、すなわち、プロテインＡ親和性捕捉、次いで、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を用いて、濃縮されたＣＨＯプール出発材料からこれらのシステインバリアントを単離した。この２ステッププロセスを用いて抗体を単離する能力は、Ｆｃ領域プロテインＡ結合部位が、操作されたシステインの存在によって変化せず、突然変異したＩｇＧ１  Ｆｃ領域が野生型ＩｇＧ１  Ｆｃと同様にプロテインＡに結合することを示していた。８個の単一システインバリアントのうちの６個について、プロテインＡ樹脂からの溶出後に最少の高分子量凝集種が検出されたが、この種は表４中で対象のピーク率（％ＰＯＩ）として報告される。予想外にも、８個の突然変異体のうちの２個（Ｓ２５４ＣおよびＳ４４０Ｃ）が、凝集する傾向があった（表４）。これらのデータは、安定な哺乳動物細胞プールを用いるこれらの位置での操作された単一システインバリアントを含む抗体の生成が、野生型ＩｇＧ１と比較して影響されなかったことを示している。
【０４９２】
【表４】
2019034942.tif 000006
【０４９３】
単一システイン抗５Ｔ４抗体バリアントの５Ｔ４抗原結合特性の評価
野生型ヒトＩｇＧ１定常領域を含むビオチン化野生型抗５Ｔ４抗体を、５Ｔ４システインバリアントが５Ｔ４抗原への結合についてこの野生型５Ｔ４抗体と効率的に競合することができるかどうかを決定するためのリポーター抗体として用いる競合ＥＬＩＳＡアッセイを用いて、単一システインバリアントを含む抗５Ｔ４抗体バリアントについて５Ｔ４結合特性を評価した。この競合ＥＬＩＳＡアッセイのために、ＥＺ−ｌｉｎｋ  Ｓｕｌｆｏ−ＮＨＳ−Ｂｉｏｔｉｎ  Ｓｕｌｆｏｓｕｃｃｉｎｉｍｉｄｏｂｉｏｔｉｎ（Ｔｈｅｒｍｏ／Ｐｉｅｒｃｅ、カタログ番号２１２１７）を、製造業者のプロトコールに従って２０：１のモルカップリング比で用いて、親抗５Ｔ４リポーター抗体（突然変異を含まない野生型ＩｇＧ１  Ｆｃを含む）をビオチン化した。このアッセイのためのタンパク質を、抗５Ｔ４単一システインバリアントおよび野生型抗５Ｔ４抗体をコードするＤＮＡをＣＯＳ−１細胞中に一過的にトランスフェクトすることによって生成した。すなわち、バリアントと対照野生型抗体は両方とも、ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域を含んでいた。抗５Ｔ４単一システインバリアントおよび抗５Ｔ４野生型ＩｇＧ１抗体を含有する得られる条件化培地を、以前に記載された総ヒトＩｇＧサンドイッチＥＬＩＳＡを用いてアッセイした。この競合ＥＬＩＳＡアッセイ手順のために、９６穴プレート（Ｃｏｓｔａｒカタログ番号３５９０）を、５Ｔ４の膜貫通および細胞内ドメインを欠き、Ｍｙｃおよびヒスチジンタグをさらに含むヒト切断型組換え５Ｔ４タンパク質（５Ｔ４−ｔｍ−＿ｍｙｃ＿ｈｉｓ）（Ｂｏｇｈａｅｒｔら、２００８、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｏｎｃｏｌ．３２：２２１〜２３４を参照されたい）で被覆した。５Ｔ４−ｔｍ−＿ｍｙｃ＿ｈｉｓ構築物を、ＰＢＳ−ＣＭＦ  ｐＨ７．２中で１μｇ／ｍｌに希釈し、１００μｌをプレートの各ウェルに添加し、プレートを４℃で一晩インキュベートした。プレートの内容物を廃棄した後、プレートを室温で３時間、ＰＢＳ−ＣＭＦ  ｐＨ７．２＋０．０２％カゼインで遮断した。ＰＢＳ中の２０ｎｇ／ｍｌのビオチン化抗５Ｔ４抗体＋０．５％ＢＳＡ＋０．０２％Ｔｗｅｅｎ−２０を、変化する濃度の抗５Ｔ４単一システインバリアントまたは陽性対照としての野生型抗５Ｔ４抗体と混合し、試料を５Ｔ４被覆−遮断プレートに添加し、室温で２時間インキュベートした。より具体的には、このアッセイにおいて用いられるそれぞれの抗体は、同一のヒト化抗５Ｔ４  ＶＬおよびＶＨドメインを含むが、ビオチン化されたリポーター抗体は操作されたシステインを含まない野生型ＩｇＧ  Ｆｃ領域を含む一方、競合抗体は野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域または単一システイン突然変異を含む突然変異型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域のいずれかを含む。
【０４９４】
ウェルを、ＰＢＳ−ＣＭＦ  ｐＨ７．２＋０．０３％Ｔｗｅｅｎ−２０で４回洗浄した。１：１０，０００に希釈されたストレプトアビジン−ＨＲＰ（カタログ番号７１００−０５、Ｓｏｕｔｈｅｒｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈ、Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ、Ａｌａｂａｍａ）を添加し、室温で３０分間インキュベートした。ウェルをＰＢＳ−ＣＭＦ  ｐＨ７．２＋０．０３％Ｔｗｅｅｎ−２０で４回洗浄し、ＴＭＢ（ＢｉｏＦｘ）を添加した。反応を５〜１０分間を発生させた後、０．１８Ｎ  Ｈ２ＳＯ４でクエンチした。４５０ｎｍでの吸光度を決定し、結果を図１に示す。これらのデータは、グラフに示された位置での抗５Ｔ４抗体ＩｇＧ１  Ｆｃ領域中への反応性システインの組み込みが、抗体の５Ｔ４結合特性を変化させないことを示している。すなわち、それぞれの５Ｔ４単一システインバリアントは、５Ｔ４への結合についてビオチン化リポーター抗５Ｔ４抗体と同等に競合した。
【０４９５】
抗５Ｔ４単一システインバリアントに関する遊離スルフヒドリルの検出
以前に論じられた通り、抗体は４個のペプチド鎖を連結する鎖間および鎖内ジスルフィド結合を含有し、これらの標準的なジスルフィド結合は全て、適切な抗体折り畳みのために形成されるべきである。遊離スルフヒドリル（−ＳＨ）基の存在は、部分的に折り畳まれないか、または不適切に折り畳まれる分子をもたらし、抗体の不均一な集団およびタンパク質安定性の低下を誘導し得る。マレイミド化合物を用いて結合する色素である蛍光試薬ＴｈｉｏＧｌｏ（登録商標）（ＥＭＤ  Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）を用いて、抗５Ｔ４単一システインバリアントについて遊離スルフヒドリル基を検出した。
【０４９６】
全ての抗体を、ジチオトレイトールＤＴＴ還元を用いて、および用いずに評価した（例えば、Ａｎｔｉｏｘｉｄａｎｔｓ  ＆  Ｒｅｄｏｘ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ、第４巻、第５号（２００２）、Ｍａｒｙ  Ａｎｎ  Ｌｉｅｂｅｒｔ，Ｉｎｃ．を参照されたい）。簡単に述べると、ジチオトレイトール（ＤＴＴ；２ｍＭ）を用いる部分的還元は、ＣＨＯ細胞培養プロセスの間におそらく形成されるシステインまたはグルタチオン付加物から対形成していないシステインを露出させるが、ジスルフィド結合を形成した残存する対形成したシステインを無傷のままにした。ＤＴＴ部分的還元の後、抗体を塩酸グアニジン（６．７Ｍ）で処理して、埋没した−ＳＨ基を露出させ、ＴｈｉｏＧｌｏ（登録商標）１蛍光試薬（２０Ｍ）の添加の前に溶媒接近性を増加させた。Ｎ−アセチル−Ｌ−システインを標準物として用いて、それぞれの抗体について存在する遊離スルフヒドリルの量を定量した。ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ；ＯｍｎｉＰｕｒ  ＢＳＡ  Ｆｒａｃｔｉｏｎ  Ｖ、カタログ番号２９１０、ＥＭＤ  Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ）は、単一の対形成していないシステインを含有するため、それを陽性対照としてさらに含有させた。表５に示されるように、本明細書に開示される結果は、遊離スルフヒドリルが抗５Ｔ４単一システインバリアントについては検出されたが、親抗５Ｔ４抗体については検出されなかったことを示す。ＤＴＴの非存在下では、野生型抗５Ｔ４タンパク質と比較して、評価された６つのシステインバリアントについて遊離−ＳＨのレベルの増加が観察されなかった。予想外に、５Ｔ４−Ｓ２５４Ｃバリアントは凝集を示し、ＤＴＴを用いる還元後に不安定であった。
【０４９７】
【表５】
2019034942.tif 000007
【０４９８】
ヒトＦｃＲｎに結合する抗５Ｔ４操作単一システインバリアントの評価
ＦｃＲｎはｐＨ依存的様式でサブタイプに関係なくＩｇＧと相互作用し、それが分解されるリソソームコンパートメントに進入するのを防ぐことによって分解から抗体を保護すると考えられている。したがって、野生型ＩｇＧ１−Ｆｃ領域中への反応性システインの導入のための位置を選択するための考慮は、操作されたシステインを含む抗体のＦｃＲｎ結合特性および半減期の変化を回避することであった。
【０４９９】
ＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）分析を実施して、ヒトＦｃＲｎへの結合について抗５Ｔ４操作単一システインバリアントの定常状態親和性（ＫＤ）を決定した。ＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）技術は、表面層上に固定されたヒトＦｃＲｎタンパク質への抗５Ｔ４単一操作システインバリアントの結合の際のセンサーの表面層での屈折率の変化を用いる。結合は、表面から屈折するレーザー光の表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）により検出される。ヒトＦｃＲｎを、ＢｉｒＡ試薬（カタログ番号ＢＩＲＡ５００、Ａｖｉｄｉｔｙ、ＬＬＣ、Ａｕｒｏｒａ、Ｃｏｌｏｒａｄｏ）を用いて操作されたＡｖｉタグにより特異的にビオチン化し、ストレプトアビジン（ＳＡ）センサーチップ上に固定して、センサー上でのＦｃＲｎタンパク質の均一な方向を可能にした。次に、２０ｍＭのＭＥＳ（２−（Ｎ−モルホリノ）エタンスルホン酸ｐＨ６．０、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、３ｍＭ  ＥＤＴＡ（エチレンジアミン四酢酸）、０．５％Ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ  Ｐ２０（ＭＥＳ−ＥＰ）中の様々な濃度の抗５Ｔ４単一システインバリアントを、チップ表面上に注入した。注入サイクルの間に、ＨＢＳ−ＥＰ＋０．０５％Ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ  Ｐ２０（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）、ｐＨ７．４を用いて表面を再生させた。定常状態結合親和性を、抗５Ｔ４操作単一システインバリアントについて決定し、これらのものを親野生型抗５Ｔ４（ＩｇＧ１  Ｆｃ領域中にシステイン突然変異を含まない）と比較した。結果を表６に記載するが、これらのデータは、本発明の新規位置でのＩｇＧ−Ｆｃ領域中への操作されたシステイン残基の組み込みが、ＦｃＲｎに対する親和性を変化させなかったことを示す。
【０５００】
【表６】
2019034942.tif 000008
【０５０１】
ヒトＦｃＲｎに結合する単一システイン抗５Ｔ４バリアントＡＤＣの評価
ＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）分析を実施して、操作されたシステインを介してＡＤＣを部位特異的にコンジュゲートさせることによって、毒素を抗体に連結したヒトＦｃＲｎに結合する抗５Ｔ４  ＡＤＣについて定常状態親和性（ＫＤ）を決定した。簡単に述べると、以下により完全に開示されるようなｍｃＭＭＡＤを、バリアント５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ、５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃおよび５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃの操作されたシステインにコンジュゲートさせることにより、ＡＤＣを調製した。以前に記載された同じＢｉａｃｏｒｅ  ＳＰＲ法を用いて、ＭＥＳ−ＥＰ＋０．５％Ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ  Ｐ２０  ｐＨ６．０中の、様々な濃度の部位特異的にコンジュゲートされた５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣ、ｍｃＭＭＡＤにコンジュゲートされていない単一システインバリアント（以前に記載され、表６に結果を示す）、および親「ネイキッド」（すなわち、ｍｃＭＭＡＤにコンジュゲートされていない）野生型抗５Ｔ４抗体を、別々に、ヒトＦｃＲｎ表面上に注入し、定常状態親和性を決定し、その結果を表７に示す。
【０５０２】
【表７】
2019034942.tif 000009
【０５０３】
表７に示された結果は、本発明の新規システイン位置を用いて部位特異的にコンジュゲートされた５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣが、互いに比較してヒトＦｃＲｎに対する同様の親和性を有し、ＦｃＲｎに対するこれらの親和性がネイキッドのコンジュゲートされていない単一システインバリアント（上記の表６と比較されたい）、ならびにコンジュゲートされていない親５Ｔ４抗体のものと同等であることを示す。したがって、これらのデータは、ＩｇＧ１  Ｆｃ領域中に導入された操作された反応性システインへの毒素部分のコンジュゲーションがＦｃＲｎへのＦｃ結合に影響しなかったことを示している。
【０５０４】
（実施例２）
二重システイン操作抗５Ｔ４抗体の生成
２個の反応性システイン残基の９つの組合せを、ヒトＩｇＧ１を含む抗５Ｔ４抗体中に導入した。この抗体の野生型完全長重鎖のアミノ酸配列を、図１７Ａ（配列番号８３）に示し、この抗体の完全長カッパ軽鎖のアミノ酸配列を図１７Ｂ（配列番号８４）に示す。関連する野生型アミノ酸を重鎖定常領域中の新しい操作されたシステインに置換する突然変異を、実施例１に記載されたものと同じ重複ＰＣＲ突然変異誘発法を用いて導入した。したがって、それぞれのＩｇＧ１  Ｆｃ領域中への２個の反応性システインの導入は、それぞれの抗体について４の薬物：抗体比（ＤＡＲ）を有するＡＤＣをもたらす４個の新しいシステインコンジュゲーション部位（すなわち、抗体分子あたり２個の反応性新規システインｘ２個の重鎖Ｆｃ領域）を提供した。それぞれの二重突然変異体の操作された反応性システインの対応する部分を以下の表８に示し、この表は、突然変異がＦｃ領域のＣ末端から１０アミノ酸残基未満であることを除く、突然変異の前後の両方の１０個のアミノ酸を示す。それぞれのＦｃ領域の完全長アミノ酸配列を、表中に示される配列番号で提供する。
【０５０５】
【表８】
2019034942.tif 000010
【０５０６】
二重システイン操作抗５Ｔ４抗体の一過的発現
操作された二重システインを含む抗５Ｔ４抗体を発現させることができることを確認するために、ＣＯＳ−１細胞を、５Ｔ４二重システインバリアントおよび親５Ｔ４抗体をコードする重鎖および軽鎖ＤＮＡで一過的に同時トランスフェクトした。４８時間後、それぞれの細胞培養培地をアッセイして、以前に記載された総ヒトＩｇＧサンドイッチＥＬＩＳＡを用いて、それぞれの構築物について発現されたヒトＩｇＧ１抗体のレベルを決定した。表９に示されるように、それぞれの二重システイン操作抗５Ｔ４抗体バリアントは、任意のさらなるシステインを含まない親抗５Ｔ４抗体と比較して同等のレベルで発現した。
【０５０７】
【表９】
2019034942.tif 000011
【０５０８】
一過的ＨＥＫ−２９３発現系からの５Ｔ４二重システインバリアントの生成
コンジュゲーション研究のための十分な材料を生成するために、標準的な方法を用いて、ＨＥＫ−２９３細胞を６つの５Ｔ４二重システイン操作抗体バリアントをコードする重鎖および軽鎖ＤＮＡで一過的に同時トランスフェクトした。次に、二重システインバリアント抗体を、標準的な２ステップ精製戦略、プロテインＡ親和性捕捉、次いで、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を用いて精製した。表１０に示されるこれらの結果は、高分子量（ＨＭＷ）凝集種が６つ全部の５Ｔ４二重システインバリアントについてプロテインＡ樹脂からの溶出後に検出され、この望ましくないＨＭＷ種をサイズ排除クロマトグラフィーを用いて除去することができることを示している。さらに、本明細書に開示されるデータは、ヒトＩｇＧ１定常領域中のプロテインＡ結合部位が操作された二重システイン残基の存在によって変化しなかったことを示している。
【０５０９】
【表１０】
2019034942.tif 000012
【０５１０】
（実施例３）
抗Ｈｅｒ２単一および二重システイン操作抗体バリアントの生成
反応性システインを操作するためのこれらの選択された位置を、抗原結合特異性に関係なく他の抗体に適用することができることを証明するために、４つの単一および９つの二重システイン残基を、抗ヒトＨｅｒ２抗体のＩｇＧ１  Ｆｃ領域中に操作した。抗Ｈｅｒ２抗体の完全長重鎖のアミノ酸配列は図１７Ｃ（配列番号８５）に示され、これは突然変異を含まない野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域を示す（小文字）。抗Ｈｅｒ２抗体の完全長軽鎖のアミノ酸配列は図１７Ｄ（配列番号８６）に示され、これは突然変異を含まない野生型Ｃκ領域を示す（小文字）。導入されるシステイン突然変異の位置は、表１１に記載される。抗Ｈｅｒ２抗体ヒトＩｇＧ１定常領域をコードする核酸を、制限酵素消化によりベクターから除去し、Ｔ４ＤＮＡリガーゼ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ  Ｉｎｃ．、Ｉｐｓｗｉｃｈ、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）を用いて単一および二重操作システイン残基を含むヒト重鎖定常ＩｇＧ１  Ｆｃ領域をコードする核酸で置きかえた。得られた核酸を、それぞれの構築物について配列確認した。
【０５１１】
【表１１】
2019034942.tif 000013
【０５１２】
抗Ｈｅｒ２操作システインバリアントの生成
ＣＯＳ−１細胞を、抗Ｈｅｒ２単一および二重システイン操作抗体バリアントをコードする重鎖および軽鎖ＤＮＡで一過的に同時トランスフェクトすることにより、コンジュゲーション研究における使用のための抗体を上手く生成し、その抗体を細胞中で一過的に発現させることができることを示した。さらに、標準的な２ステップの精製戦略、プロテインＡ親和性捕捉、次いで、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を用いて、抗体を精製した。本明細書に開示されるデータ（表１２）は、低レベルの高分子量（ＨＭＷ）凝集種が、６つ全部の抗Ｈｅｒ２二重システインバリアントについてプロテインＡ樹脂からの溶出後に検出されたこと、およびこのＨＭＷ種をサイズ排除クロマトグラフィーを用いて除去することができたことを示す。これらのデータは、これらのバリアントに関するプロテインＡへのＦｃ結合が新しい位置での反応性システインの導入によって影響されなかったことを示す。
【０５１３】
【表１２】
2019034942.tif 000014
【０５１４】
（実施例４）
抗ＶＥＧＦＲ２単一システイン操作抗体バリアントの生成
反応性システインを操作するための新しい位置を血管内皮を標的化する抗体に適用することができることをさらに証明するために、単一システイン残基を抗ヒトＶＥＧＦＲ２抗体中に操作した。抗ＶＥＧＦＲ２抗体の完全長重鎖のアミノ酸配列は図１７Ｅ（配列番号８７）に示され、これは突然変異を含まない野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域を示す（小文字）。抗ＶＥＧＦＲ２抗体の完全長軽鎖のアミノ酸配列は図１７Ｆ（配列番号８８）に示され、これは突然変異を含まない野生型Ｃκ領域を示す（小文字）。抗ヒトＶＥＧＦＲ２抗体の野生型ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ定常領域をコードする核酸配列を、制限酵素消化により除去し、Ｔ４ＤＮＡリガーゼ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ  Ｉｎｃ．、Ｉｐｓｗｉｃｈ、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）を用いてＬ４４３Ｃ位（配列番号７２）に単一システイン残基を含む重鎖定常領域をコードする核酸配列で置きかえ、得られた核酸を配列確認した。
【０５１５】
ＣＯＳ−１に、抗体をコードする核酸をトランスフェクトすることにより抗体を生成し、２ステップ（プロテインＡ、次いで、ＳＥＣクロマトグラフィー）プロセスを用いてタンパク質を精製する。これは、単一反応性システインを含む抗ヒトＶＥＧＦＲ２抗体を発現させることができ、Ｆｃ領域のプロテインＡ結合が影響されないことを示す。
【０５１６】
まとめると、本明細書の以前に開示されたように、１２個の残基位置が、ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域中への反応性システインの導入のために同定された。これらの１２個の新しい位置のうち、９個の抗体単一システインバリアントを、コンジュゲーションおよび特徴付けのために生成した。これらの９個のうち、２つの単一突然変異のみが、明確なタンパク質凝集Ｓ２５４ＣおよびＳ４４０Ｃ（ＥＵ番号付けによる）を予想外に示し、他の７個の単一システインバリアントは、野生型ＩｇＧ１定常領域を含む親抗体と同様のわずかな凝集を示した。さらに、明確な凝集を示さなかった７個のバリアントのうち、２個（Ｔ３５９ＣおよびＦ４０４Ｃ）（ＥＵ番号付けによる）が、異なるリンカーおよびペイロードの組合せでわずかなコンジュゲーション効率を示した。５つの位置、Ｅ３８０Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｋ３９２Ｃ、Ｖ４２２ＣおよびＬ４４３Ｃ（ＫａｂａｔのＥｕインデックスを用いる番号付け）での操作されたシステインは、いくつかの条件にわたって許容できるコンジュゲーション効率を示した。さらに、コンジュゲーション効率におけるこの差異は、ビオチンとコンジュゲートする能力だけが評価された場合には検出されなかった。すなわち、コンジュゲーション効率における差異は、より厳密な基準を適用した場合、すなわち、より大きい毒性ペイロードを抗体にコンジュゲートさせた場合にのみ検出された。このより厳密な要求の下では、本発明の新規システインは、潜在的に治療上有効なＡＤＣの生成のための効率的な新規コンジュゲーションプラットフォームを提供することが示された。
【０５１７】
（実施例５）
部位特異的コンジュゲーションのための反応性システインの導入のためのヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域中のさらなる位置
反応性システインを含む操作されたＦｃ領域の生成の成功のための本明細書の以前に開示されたヒトＩｇＧ１における新しい１２個の位置に加えて、反応性システインの組み込みのためのさらなる位置を以下のように同定した。簡単に述べると、ヒトＩｇＧ１のＦｃドメインの結晶複合体（ＰＤＢコード３ＤＯ３、１０．２２１０／ｐｄｂ３ｄｏ３／ｐｄｂ）を、ＲＣＳＢタンパク質データバンクから取得し、Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  Ｓｔｕｄｉｏ（Ａｃｃｅｌｒｙｓ  Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）における可視化およびモデリングのために調製した。個々の側鎖をシステインに突然変異させ、製造業者の説明書に従ってＤｉｓｃｏｖｅｒｙ  Ｓｔｕｄｉｏ中のＭｕｔａｔｅ  Ｒｅｓｉｄｕｅ特性を用いて最小化した。突然変異残基の側鎖溶媒接近性を、ＳｐａｓｓｏｖおよびＹａｎ（２００８、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．１７（１１）：１９５５〜１９７０）の方法を用いて、残基ｐＫａとして算出した。
【０５１８】
より具体的に、またいかなる特定の理論によっても束縛されることを望むものではないが、以前に開示された新しい１２個のＦｃ位置について初めて本明細書で開示されたデータを見れば、低いｐＫａまたは高い側鎖接近性が非効率的な薬物ローディング、タンパク質凝集または他の問題を誘導し得ることが示唆された。これらの側鎖溶媒接近性およびｐＫａ範囲と一致するさらなる部位を、Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  Ｓｔｕｄｉｏを用いる算出に基づいて同定した。
【０５１９】
本明細書に開示されるデータは、９．５〜１１．５の範囲の最適予測ｐＫａ、および／または１５〜６０の予測された側鎖溶媒接近性を有するシステイン残基が、限定されるものではないが、Ｅ３８０Ｃ、Ｋ３９２Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｖ４２２ＣおよびＬ４４３Ｃなどの、本明細書の以前に開示されたコンジュゲートされたシステイン突然変異体の特性を模倣することができることを示唆する。これらの特性（ｐＫａおよび予測された側鎖溶媒接近性）は相関していたため、どの基準を、限定されるものではないが、低い凝集傾向ならびにリンカーおよびペイロードへの容易なコンジュゲーションなどの、所望の生物学的結果と関連付けるかを確立するのは難しい。本明細書に開示される新しい１２個の突然変異体について得られた驚くべきデータに基づいて反応性システインを導入するための本発明者らの新しいｉｎ  ｓｉｌｉｃｏでの設計方法により選択されたさらなる位置を、その対応するＥＵ番号位置と共に表１３に列挙する。
【０５２０】
【表１３−１】
2019034942.tif 000015
【０５２１】
【表１３−２】
2019034942.tif 000016
【０５２２】
（実施例６）
さらなる単一システイン操作抗Ｈｅｒ２抗体バリアントの生成
表１３に示された特定の反応性システインの位置を、最適な側鎖溶媒接近性およびｐＫａ範囲と共に選択し、これらのものを表１４に示す。これらの１１個の新しい位置に操作された単一システインを含むヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域を、さらなる評価のために抗Ｈｅｒ２抗体（上記参照）中に組み込んだ。
【０５２３】
【表１４】
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【０５２４】
（実施例７）
単一システインバリアント抗体を用いるＡＤＣのコンジュゲーションおよび特徴付け
単一システインバリアント抗体と、リンカーおよびペイロードとのコンジュゲーション：操作された反応性システインを含む新規ＩｇＧ１  Ｆｃ領域を含む抗体のコンジュゲーションの成功を示す以前に開示された新規ＡＤＣを、ここで以下に記載されるように調製した。
【０５２５】
条件Ａ：（条件Ｂは下記の実施例８に記載される）コンジュゲーション反応を、Ａｍｉｃｏｎ  Ｕｌｔｒａ  ５０ｋ  Ｕｌｔｒａｃｅｌフィルター（パート番号ＵＦＣ８０５０９６、ＧＥ）などの遠心分離限界濾過デバイスの上側部分で実施した。Ｌ−システインの１３２ｍＭ保存溶液を、５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有するＰＢＳ中で調製した。この溶液（５０μＬ）を、５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有する９５０μＬのＰＢＳ中のそれぞれの突然変異抗体（５ｍｇ）の混合物に添加した。反応混合物中の最終システイン濃度は、６．６ｍＭであった。ｒｔ（約２３℃）で１．５時間、反応物を静置した後、反応チューブを遠心分離して材料を約１００μＬに濃縮した。混合物を５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有するＰＢＳで１ｍＬに希釈した。このプロセスを４回繰り返して、全てのシステイン還元剤を除去した。
【０５２６】
得られた材料を、５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有するＰＢＳ中で１ｍＬに希釈し、ジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）中のｍｃＭＭＡＤの５ｍＭ溶液１６μｌ（約５当量）で処理した。室温（約２３℃）で１．５時間静置した後、反応チューブを遠心分離して、材料を約１００μＬに濃縮した。混合物をＰＢＳで１ｍＬに希釈した。このプロセスを２回繰り返して、過剰のマレイミド還元剤（例えば、ｍｃＭＭＡＤ）を除去した。
【０５２７】
抗体コンジュゲートは一般に、以下に記載のようなサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を用いて精製され特徴付けられた。意図されるコンジュゲーション部位への薬物のローディングを、以下でより完全に説明される、質量分析（ＭＳ）、逆相ＨＰＬＣ、および疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）などの様々な方法を用いて決定した。これらの３つの分析方法の組合せは、タンパク質上への低分子のローディングを検証および定量するための様々な方法を提供し、それによって、それぞれのコンジュゲートのＤＡＲの正確な決定を提供する。
【０５２８】
サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）：分取ＳＥＣによるシステイン突然変異抗体ＡＤＣの特徴付け：抗体−薬物コンジュゲート（Ａｂ−リンカー−ペイロード、例えば、Ａｂ−ｍｃＭＭＡＤおよびＡｂ−ｖｃＭＭＡＤ）は一般に、タンパク質凝集物を除去するため、および反応混合物中に残存する微量のペイロード−リンカーを除去するためのＡｋｔａ  Ｅｘｐｌｏｒｅｒ  ＦＰＬＣシステム上のＷａｔｅｒｓ  Ｓｕｐｅｒｄｅｘ２００  １０／３００ＧＬカラムを用いるＳＥＣクロマトグラフィーを用いて精製された。ＡＤＣはＳＥＣ精製の前に凝集物および低分子を含まないこともあったが、したがってこの場合は分取ＳＥＣにはかけなかった。用いた溶離液は、１ｍＬ／ｍｉｎの流量のＰＢＳであった。これらの条件下では、凝集材料（室温で約１０分で溶出する）は、非凝集材料（室温で約１５分で溶出する）から容易に分離された。疎水性ペイロード−リンカー組合せは、ＳＥＣピークの「右シフト」をもたらすことが多かった。いかなる特定の理論によっても束縛されることを望むものではないが、このＳＥＣピークシフトは、リンカー−ペイロードと、固定相との疎水性相互作用に起因するものであり得る。いくつかの場合、この右シフトにより、非コンジュゲート化タンパク質からコンジュゲート化タンパク質を部分的に分割することができる。
【０５２９】
分析的サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）：分析的ＳＥＣを、溶離液としてＰＢＳを用いるＡｇｉｌｅｎｔ  １１００  ＨＰＬＣ上で実行した。溶離液を２２０および２８０ｎＭでモニタリングした。用いた方法は以下の通りである。
【０５３０】
方法ＳＥＣ−Ａ：カラムは、ＴＳＫＧｅｌ  Ｇ３０００ＳＷカラム（７．８ｘ３００ｍｍ、カタログ番号Ｒ８７４８０３Ｐ）であった。用いた移動相は、０．９ｍＬ／ｍｉｎの流量で３０分間のＰＢＳであった。
【０５３１】
方法ＳＥＣ−Ｂ：カラムは、１．０ｍＬ／ｍｉｎの流量を２５分間用いる移動相としてのＰＢＳを用いるＢｉｏｓｅｐＳＥＣ３０００カラム（７．８ｘ３００ｍｍ）であった。
【０５３２】
ここで、上記方法の結果について論じる。
【０５３３】
以下の表１５は、上記方法を用いて精製および特徴付けられた様々な抗体−薬物コンジュゲートに関する結果を記載する。ローディングの分析およびＭＳ特徴付けについて以下で論じる。
【０５３４】
コンジュゲートを分析的ＳＥＣにより分析して、精製されたタンパク質コンジュゲートの完全性を確立し、コンジュゲーション中に最小限の凝集が起こることを確保した。上記の２つの方法は、ほぼ等しい保持時間を与え、単にカラムの利用性および信頼性などの実用的な目的のために異なる環境において用いた。一般的には、凝集材料は約１分の保持時間の左へのシフトを誘導することが観察された。２つの分析的ＳＥＣトレースの例を、図２に例示する。図２Ａは、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤに関するＳＥＣトレースを示す（方法ＳＥＣ−Ａを用いる）；図２Ｂは、５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ−ｖｃＭＭＡＤに関するＳＥＣトレースを示す（方法ＳＥＣ−Ｂを用いる）。これらのトレース図は、材料が凝集せず、測定可能な低分子汚染物質を含有しないことを示す。一般に、ｖｃＭＭＡＤなどのより多くの疎水性ペイロードがややより広く、あまり均一でないＳＥＣピークを有するＡＤＣをもたらすことが観察された。いくつかの場合、疎水性ペイロード（ｖｃＭＭＡＤなど）のコンジュゲーションは、保持時間の有意な右へのシフトをもたらした（例えば、表１５中の５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｖｃＭＭＡＤを参照されたい）。しかしながら、主要ピークは、典型的には約７．５ｍｉｎで溶出する凝集物のピークから常に容易に識別することができた。様々な５Ｔ４  ＡＤＣ（全て方法Ａにより調製された）に関する分析的ＳＥＣデータを、表１５に概略する。
【０５３５】
【表１５】
2019034942.tif 000018
【０５３６】
抗体コンジュゲートの質量分析の特徴付けおよび分析
ＭＳ分析および試料調製：
約２０μＬの試料（ＰＢＳ中の約１ｍｇ／ｍＬのＡＤＣ）と、２０μＬの２０ｍＭジチオトレイトール（ＤＴＴ）とを混合することにより、ＬＣＭＳ分析のための試料を調製した。混合物を室温で５分間静置した後、Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｐｏｒｏｓｈｅｌｌ  ３００ＳＢ−Ｃ８（２．１ｘ７５ｍｍ）カラムを取り付けたＡｇｉｌｅｎｔ  １１００  ＨＰＬＣシステム中に試料を注入した。システム温度は６０℃に設定した。水中の２０％〜４５％のアセトニトリル（０．１％ギ酸改変剤を含む）の５分間の勾配を用いた。溶離液を、ＵＶ（２２０ｎＭ）およびＷａｔｅｒｓ  ＭｉｃｒｏｍａｓｓＺＱ質量分析装置（ＥＳＩイオン化；コーン電圧：２０Ｖ；ソース温度：１２０℃；脱溶媒和温度：３５０℃）によりモニタリングした。多電荷種を含有する粗スペクトルについて、製造業者の説明書に従ってＭａｓｓＬｙｎｘ４．１ソフトウェアパッケージ内のＭａｘＥｎｔ１を用いてデコンボリューションを行った。
【０５３７】
抗体あたりのローディングのＭＳ決定：
全溶出ウィンドウ（通常は５分）のスペクトルを、単一合計スペクトル（すなわち、全試料のＭＳを代表する質量スペクトル）中に組み合わせる。ＡＤＣ試料に関するＭＳ結果を、同一の非ロード対照抗体の対応するＭＳと直接比較した。これにより、ロード／非ロード重鎖（ＨＣ）ピークおよびロード／非ロード軽鎖（ＬＣ）ピークの同定が可能になる。様々なピークの比を用いて、以下の式（式１）に基づいてローディングを確立することができる。計算は、一般的に妥当な仮定であると決定された、ロードされた、およびロードされていない鎖が同等にイオン化するという仮定に基づくものである。さらに、これらのローディング計算を照合するために、以下のセクションでより完全に説明される代替的な方法（逆相高速液体クロマトグラフィー［ｒｐＨＰＬＣ］に基づく方法および疎水性相互作用クロマトグラフィー［ＨＩＣ］に基づく方法）を用いて、ローディングについてＡＤＣのサブセットも評価した。
【０５３８】
以下の計算を実施して、コンジュゲートの全ローディング（「薬物抗体比」または「ＤＡＲ」とも呼ばれる）を確立した：
式１：
ローディング＝２＊［ＬＣ１／（ＬＣ１＋ＬＣ０）］＋２＊［ＨＣ１／（ＨＣ０＋ＨＣ１＋ＨＣ２）］＋４＊［ＨＣ２／（ＨＣ０＋ＨＣ１＋ＨＣ２）］
（式中、示された変数は、ＬＣ０＝非ロード軽鎖、ＬＣ１＝単一ロード軽鎖、ＨＣ０＝非ロード重鎖、ＨＣ１＝単一ロード重鎖、およびＨＣ２＝二重ロード重鎖の相対的存在量である）。当業者であれば、本発明がＬＣ２、ＬＣ３、ＨＣ３、ＨＣ４、ＨＣ５などのより高いロード種を包含するためのこの計算の拡張を包含することを理解できる。
【０５３９】
以下の式２を用いて、非操作システイン残基上へのローディング量を見積もる。操作されたＦｃ突然変異体については、軽鎖（ＬＣ）上へのローディングは、定義により、非特異的ローディングであると考えられた。さらに、ＬＣのみへのローディングは、ＨＣ−ＬＣジスルフィド架橋の故意ではない還元の結果であると仮定された（すなわち、抗体は「過剰還元」された）。コンジュゲーション反応のために大過剰のマレイミド求電子試薬を用いたことを考慮すると（一般的には、単一突然変異体については約５当量および二重突然変異体については１０当量）、軽鎖上への非特異的ローディングが、重鎖上への対応する量の非特異的ローディングと同時に起こると仮定された（すなわち、破壊されたＨＣ−ＬＣジスルフィドの他の「半分」）。これらの仮定を念頭に置いて、以下の式（式２）を用いて、タンパク質上への非特異的ローディング量を見積もった：
式２：
非特異的ローディング＝４＊［ＬＣ１／（ＬＣ１＋ＬＣ０）］
（式中、示された変数は、ＬＣ０＝非ロード軽鎖、ＬＣ１＝単一ロード軽鎖の相対的存在量である）。
【０５４０】
２つの例示的ＡＤＣ（５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤおよび５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｖｃＭＭＡＤ）に関するこのＭＳ分析を用いるローディング計算を、それぞれ、図３Ａおよび図３Ｂに示す。
【０５４１】
表１６は、アッセイされたＡＤＣに関する質量分析の結果およびローディング算出を記載する。
【０５４２】
【表１６】
2019034942.tif 000019
【０５４３】
ローディング部位を確立するためのＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）を用いるタンパク質溶解
表１４〜１６に開示されたシステイン突然変異体は、ＩｇＧ１重鎖のＦｃドメイン内のＣＨ２およびＣＨ３ドメイン中に位置する。抗体上への求電子性ペイロードの非特異的ローディングは、「内部」システイン残基とも呼ばれる「鎖間」で起こると推定される（すなわち、典型的には、ＨＣ−ＨＣまたはＨＣ−ＬＣジスルフィド架橋の一部であるもの）。Ｆｃドメイン中の操作されたシステイン上の求電子試薬のローディングと、内部システイン残基上のローディング（さもなければ典型的には、ＨＣ−ＨＣまたはＨＣ−ＬＣ間でＳ−Ｓ結合を形成する）とを区別するために、コンジュゲートを、抗体のＦａｂドメインとＦｃドメインとの間を切断することが知られるプロテアーゼで処理した。１つのそのようなプロテアーゼは、Ｇｅｎｏｖｉｓにより「ＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）」として市販され、ｖｏｎ  Ｐａｗｅｌ−Ｒａｍｍｉｎｇｅｎら、２００２、ＥＭＢＯ  Ｊ．２１：１６０７に記載されたシステインプロテアーゼＩｄｅＳである。図４は、内部システイン結合の位置（黒い四角）を示すインタクトな抗体分子のこのプロテアーゼによる切断を例示する略図を示す。
【０５４４】
簡単に述べると、製造業者に提示された条件に従って、ＡＤＣをＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）プロテアーゼで処理し、試料を３７℃で３０分間インキュベートした。約２０μＬの試料（ＰＢＳ中の約１ｍｇ／ｍＬ）と、２０μＬの２０ｍＭジチオトレイトール（ＤＴＴ）とを混合し、混合物を室温で５分間静置することにより、試料をＬＣＭＳ分析のために調製した。ヒトＩｇＧ１のこの処理により、３つの抗体断片が得られ、それらは全て、ＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ処理の結果生じる断片：典型的には、ＬＣ−ＨＣ鎖間ジスルフィド結合を形成する内部システインを含むＬＣ断片；３個の内部システインを含むＮ末端ＨＣ断片（１個は、典型的にはＬＣ−ＨＣジスルフィド結合を形成し、抗体のヒンジ領域中に見出される他の２個のシステインは典型的には、抗体の２個の重鎖の間でＨＣ−ＨＣジスルフィド結合を形成する）；および本明細書に開示される新規構築物中の突然変異により導入されたもの以外の反応性システインを含有しないＣ末端ＨＣ断片を例示する図４に示される略図に例示されるように約２３〜２６ｋＤの範囲のサイズである。試料を、上記のようにＭＳにより分析した。ローディング計算を以前に記載の（上記）ものと同じ様式で実施して、ＬＣ、Ｎ末端ＨＣ、およびＣ末端ＨＣのローディングを定量した。Ｃ末端ＨＣ上でのローディングは、「特異的」ローディングであると考えられるが、ＬＣおよびＮ末端ＨＣ上へのローディングは「非特異的」ローディングであると考えられる。図５Ａは、ＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）プロテアーゼ処理後にロードされていない５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃバリアントに関するＭＳトレースの結果を示す。挿入図は、ＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）処理により生成されたタンパク質溶解切断断片を例示する略図を示す。図５Ｂは、ＡＤＣ  ５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤのＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）処理に関するＭＳトレースの結果を示すグラフである。挿入図は、タンパク質溶解切断から得られる断片を例示し、リンカーとペイロードがＣ末端ＨＣ断片と会合することを例示する略図を示し、ローディングが突然変異により導入された反応性システインに位置することを示す。ＡＤＣのサブセットの分析に関する結果を、表１７に記載する。
【０５４５】
【表１７】
2019034942.tif 000020
【０５４６】
本発明の新規ＡＤＣのＦａｂＲＩＣＡＴＯＲ（登録商標）切断の結果は、あったとしても非常に少ない、検出可能な抗体の非特異的ローディングが存在することを示す。さらに、データは、抗体のローディングが反応性システインにおいてＩｇＧ１  Ｆｃ領域中に導入され、新規ＡＤＣの全部ではなくとも多くについて２：１の予想される化学量論（ＤＡＲ＝２）が達成されることを示す。これらのデータは、新規システイン突然変異体を、薬物送達の成功のために制御された特異的な化学量論を有する潜在的に治療的なＡＤＣを生成するために上手く特異的にコンジュゲートさせることができることを示す。
【０５４７】
ＡＤＣの逆相ＨＰＬＣ分析：
約２０μＬの試料（ＰＢＳ中の約１ｍｇ／ｍＬ）と、２０μＬの２０ｍＭジチオトレイトール（ＤＴＴ）とを混合することにより、逆相ＨＰＬＣ分析のための試料を調製した。混合物を室温で５分間静置した後、Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｐｏｒｏｓｈｅｌｌ  ３００ＳＢ−Ｃ８（２．１ｘ７５ｍｍ）カラムを取り付けたＡｇｉｌｅｎｔ  １１００  ＨＰＬＣシステム中に試料を注入した。システム温度は６０℃に設定し、溶離液をＵＶ（２２０ｎＭおよび２８０ｎＭ）によりモニタリングした。水中の２０％〜４５％のアセトニトリル（０．１％ＴＦＡ改変剤を含む）の２０分間の勾配を用いた：Ｔ＝０ｍｉｎ：２５％アセトニトリル；Ｔ＝２ｍｉｎ：２５％アセトニトリル；Ｔ＝１９ｍｉｎ：４５％アセトニトリル；およびＴ＝２０ｍｉｎ：２５％アセトニトリル。
【０５４８】
これらの条件を用いて、抗体のＨＣおよびＬＣをベースライン分離することができる。図６に例示されるように、この分析の結果は、ＬＣは大部分は未改変のままであるが、ＨＣは改変されていることを示す。より具体的には、図６は、（Ａ）非改変野生型抗５Ｔ４抗体；（Ｂ）５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；および（Ｃ）５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤに関する還元条件下での逆相ＨＰＬＣトレースを示す。逆相ＨＰＬＣについて得られた結果は、本明細書の以前に開示されたＭＳ分析を用いて得られたものと一致する。ローディングを決定するために以前に記載された式を用いて、特異的ローディングおよび非特異的ローディングを、図６中のそれぞれ示されたピークに関するＡＵＣを用いてそれぞれの試料について算出した。かくして得られたローディング値は、以前のローディング計算と一致する。
【０５４９】
疎水性相互作用クロマトグラフィー（ＨＩＣ）
３０μＬの試料（約１ｍｇ／ｍＬのＡＤＣ）を、３０μＬの２Ｍ  Ｋ２ＨＰＯ４（ｐＨ８．５）で希釈することにより、ＨＩＣ分析のための化合物を調製した。ＴＳＫ−ＧＥＬ  Ｂｕｔｙｌ  ＮＰＲカラム（４．５ｘ３５ｍｍ、２．５μｍ）を備えたＡｇｉｌｅｎｔ  １２００  ＨＰＬＣを用いて、試料を分析した。約６０μＬの試料を注入し、勾配方法を以下のように実行した：移動相Ａ：１Ｍ  Ｋ２ＨＰＯ４（ｐＨ８．５）；移動相Ｂ：水；Ｔ＝０ｍｉｎ、９０％Ａ；Ｔ＝４０ｍｉｎ、０％Ａ；およびＴ＝５０ｍｉｎ、０％Ａ。
【０５５０】
ピークは一般に、最も低いロード種から最も高いロード種に向かってカラムから溶出したが、これは全ての例について検証することができたわけではなかった。図７は、様々にロードされた抗体種の分布を例示するいくつかのバリアントについて生成されたＨＩＣトレースを示す。図７は、（Ａ）対照抗５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ非ロード抗体；（Ｂ）５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｖｃＭＭＡＤ；（Ｃ）５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｖｃＭＭＡＤ；および（Ｄ）５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤに関するトレースを示す。見られるように、ロードされた抗体を、記載の方法を用いて非ロード抗体から容易にベースライン分離することができる。さらに、示差的にロードされた種を、典型的には（常にではないが）分割することができる。図７に示される様々なピークに関するＡＵＣを用いて、ＨＩＣに基づくローディング値を算出し、以前に記載された他の方法によって決定されたローディング値を補完し、さらに検証した。かくして算出されたローディングを、ＨＩＣ方法およびＭＳ方法を用いて生成されたローディング見積もり値を比較する表１８に記載する。見られるように、２つの異なる方法を用いて算出されたローディング値間には非常に厳密な相関がある。
【０５５１】
【表１８】
2019034942.tif 000021
【０５５２】
上記方法は、操作されたＣｙｓ残基上への求電子的ペイロード−リンカーのローディングを確立するためのいくつかの独立した方法を提供する。これらの方法は、補完的であり、一貫しており、互いに独立している。これらの方法の組合せにより、通常ではないＭＳイオン化または高いＵＶ吸収をもたらす官能基を含有してもよいペイロードなどの複雑な因子に対してもローディング見積もり値を決定することができる。これらのデータは、ＩｇＧ１  Ｆｃ領域中の新しい位置に反応性システインを含むＡＤＣが、注意深く制御、測定することができる正確なＤＡＲを示す潜在的に治療上有効なＡＤＣの生成のための有用なプラットフォームを提供することを示している。
【０５５３】
（実施例８）
代替的なコンジュゲーション法（「方法Ｂ」）を用いる単一および二重ｃｙｓ突然変異体へのマレイミドペイロードのコンジュゲーションのための還元／再酸化方法
上記のコンジュゲーション法は単一ｃｙｓ突然変異体のコンジュゲーションに関する許容できる結果を与えたが、ＨＩＣクロマトグラフィーは、実施例７に記載の方法（方法Ａ）を用いてコンジュゲートさせた二重ｃｙｓ突然変異体の場合、有意な不均一性が存在することを示した。４個の反応性システインが存在し、それぞれのＨＣが２個を含み、それによって、１、２、３、または４個がロードされた抗体の不均一な混合物を提供する様々な部分的にロードされた二重突然変異体を理論的には取得することができるため、これは予想されたことであった。さらに、それぞれのロードされたＡＤＣは、実施例７に示されたように、内部システイン残基上に部分的な非特異的ローディングを有し得る。正味の結果は、単一突然変異体と比較した二重突然変異体の不均一性の指数的増加である。
【０５５４】
ローディングの均一性を改善するために、より均一なＡＤＣをもたらすマレイミドとのコンジュゲーションを可能にする、ＴＣＥＰ（トリス２−カルボキシエチル）ホスフィン）を用いる操作された抗体の完全な還元、次いで、ＤＨＡ（デヒドロアスコルビン酸）を用いる内部ジスルフィドの再酸化を含む代替的手順（「方法Ｂ」）を用いた（ＭＳおよびＨＩＣにより測定）。図８および図９は、方法「Ａ」を用いるコンジュゲーション（図８Ａ、８Ｃ、８Ｅ、８Ｇ、９Ａ、９Ｃ、９Ｅおよび９Ｇ）および「方法Ｂ」を用いるコンジュゲーション（図８Ｂ、８Ｄ、８Ｆ、８Ｈ、９Ｂ、９Ｄ、９Ｆ、および９Ｈ）により生成されたトレース図を示す。８つのコンジュゲートの説明は以下の通りである：８Ａおよび８Ｂ、５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；８Ｃおよび８Ｄ、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；８Ｅおよび８Ｆ、５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；８Ｇおよび８Ｈ、５Ｔ４−Ｋ３８８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；９Ａおよび９Ｂ、５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；９Ｃおよび９Ｄ、５Ｔ４−Ｅ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；９Ｅおよび９Ｆ、５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ；ならびに９Ｇおよび９Ｈ、５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ＋Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ。
【０５５５】
「方法Ａ」および「方法Ｂ」を用いる様々なコンジュゲーションの結果の概要を、表１９に提供する。表１９ならびに図８および図９に開示されるデータは、「方法Ｂ」を用いて生成されたコンジュゲートが、「方法Ａ」により調製された同じコンジュゲートと比較して改善された特異的ローディングおよび改善された均一性を示したことを示す。
【０５５６】
コンジュゲーション「方法Ｂ」
コンジュゲーション「方法Ｂ」を、以下のように実施した。２０ｍＭのＴＣＥＰ溶液（５０〜１００モル当量）を、最終抗体濃度が５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有するＰＢＳ中で５ｍｇ／ｍＬとなるように抗体（５ｍｇ）に添加した。３７℃で１．５時間、反応物を静置した後、５０ｋＤ  ＭＷカットオフスピン濃縮装置を用いて５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有するＰＢＳに抗体をバッファー交換した（３ｘ３ｍＬ洗浄、１０ｘ濃縮／サイクル）。得られた抗体を、５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有する１ｍＬのＰＢＳ中に再懸濁し、１：１のＰＢＳ／ＥｔＯＨ中の新鮮に調製されたＤＨＡの５０ｍＭ溶液（最終ＤＨＡ濃度＝１ｍＭ〜４ｍＭ）で処理し、４℃で一晩静置した。
【０５５７】
抗体／ＤＨＡ混合物を、５０ｋＤ  ＭＷカットオフスピン濃縮装置を用いて５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有するＰＢＳにバッファー交換した（３ｘ３ｍＬ洗浄、１０ｘ濃縮／サイクル）。得られた抗体を、５０ｍＭ  ＥＤＴＡを含有する１ｍＬのＰＢＳ中に再懸濁し、ＤＭＡ中の１０ｍＭマレイミドペイロード（ｍｃＭＭＡＤ）３３μＬで処理した。１．５時間静置した後、材料を１ｍＬのＰＢＳにバッファー交換した（上記のように）（３ｘ３ｍＬ洗浄、１０ｘ濃縮／サイクル）。ＳＥＣによる精製を（必要に応じて）実施して、凝集した材料を除去した。表１５〜１９の結果をもたらすために用いたｍｃＭＭＡＤ、ｖｃＭＭＡＤ、およびｍｃＭＭＡＦリンカー−ペイロードの構造を、図１０に示し、これはＭａｌ−ＰＥＧ６Ｃ２−ＭＭＡＤおよびＭａｌ−ＰＥＧ３Ｃ２−ＭＭＡＤも含む。
【０５５８】
方法Ａおよび方法Ｂの両方を用いる、Ｆｃおよび／またはカッパ（表２４；実施例１０）定常ドメイン中に操作されたシステインを含む、二重システイン突然変異体の様々なコンジュゲーションのローディング結果を、以下の表１９に提供する。
【０５５９】
【表１９−１】
2019034942.tif 000022
【０５６０】
【表１９−２】
2019034942.tif 000023
【０５６１】
＊実施例３に記載のＭＳ方法を用いて、報告されたローディングを測定した。括弧内の数値は、軽鎖上の観察されたローディングにより決定された、非特異的ローディングの見積もり値である。
【０５６２】
表１９からのローディング／特異性データと、図８および図９からのＨＩＣデータとの組合せは、二重システイン突然変異体を以前に記載の方法Ａを用いてコンジュゲートさせた場合の、コンジュゲーション方法Ｂを用いて達成されたはるかにより均一なローディングと比較した薬物ローディングの不均一性を示す。
【０５６３】
これらのデータは、本発明の新規システイン突然変異体のローディングにおける潜在的な不均一性を、当技術分野で認識されたコンジュゲーション方法を用いて容易に減少させることができることを示している。したがって、本明細書に開示されるデータは、本発明の新規二重ｃｙｓ突然変異体を様々なリンカーを用いて容易にコンジュゲートさせて、抗体あたりの予測可能な、望ましい数のペイロード部分（すなわち、ＤＡＲ）を含むほぼ均一なＡＤＣ、ならびに抗体上のコンジュゲーション部位に関する均一性をもたらすことができることを示している。
【０５６４】
（実施例９）
５Ｔ４操作システイン突然変異体の特徴付け
本実施例における材料および方法は以下の通りである。
【０５６５】
細胞系：
ヒト５Ｔ４抗原を発現するＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４トランスフェクト細胞およびトランスフェクトされなかった対照ＭＤＡＭＢ４３５／ｎｅｏ細胞を、以前に記載のように調製した（Ｂｏｇｈａｅｒｔら、２００８、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｏｎｃｏｌ．３２：２２１〜２３４）。Ｒａｊｉ（ＣＣＬ−８６）細胞系を、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡ）から取得した。ポリメラーゼ連鎖反応マイコプラズマ検出アッセイ（ＡＴＣＣ、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡ）により決定されたように、細胞系はマイコプラズマを含まないと決定された。
【０５６６】
細胞系ＭＤＡＭＢ４５３／５Ｔ４を、１０％ウシ胎仔血清（ＦＢＳ）、１％ＭＥＭ非必須アミノ酸および１％ＭＥＭビタミン、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、ペニシリンＧナトリウム１００Ｕ／ｍｌ、硫酸ストレプトマイシン１００μｇ／ｍｌおよび２ｍＭ  Ｌ−グルタミン＋１．５ｍｇ／ｍＬの選択抗生物質Ｇ４１８を添加したＥａｒｌ塩を含むＭＥＭ培地中で維持した。
【０５６７】
Ｒａｊｉ細胞系を、１０％ウシ胎仔血清（ＦＢＳ）、１０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（Ｎ−２−ヒドロキシエチルピペラジン−Ｎ’−２−エタンスルホン酸）、１ｍＭピルビン酸ナトリウム、０．２％グルコース、ペニシリンＧナトリウム１００Ｕ／ｍｌ、硫酸ストレプトマイシン１００μｇ／ｍｌおよび２ｍＭ  Ｌ−グルタミンを添加したＲＰＭＩ１６４０培地中で維持した。Ｒａｊｉを用いる前に、生細胞を、Ｌｙｍｐｈｏｐｒｅｐ（Ｎｙｃｏｍｅｄ、Ｏｓｌｏ、Ｎｏｒｗａｙ）を用いる密度勾配遠心分離（１０００ｘｇで３０ｍｉｎ）により単離した。
【０５６８】
マウス：
メスのｎｕ／ｎｕ（ヌード）マウス（１８〜２３ｇ）を、Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ、ＭＡから取得した。マウスを用いる全ての手順は、確立された指針に従ってＷｙｅｔｈ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって認可された。
【０５６９】
結合試験：
５Ｔ４を発現する細胞、および陰性対照Ｒａｊｉ細胞を、非組織培養処理９６穴プレート上に５００，０００細胞／ウェルの密度で播き、氷上で保持した。一次抗体の希釈液を、ｄＰＢＳ（Ｄｕｌｂｅｃｃｏリン酸緩衝溶液、１００ｍＭリン酸、ｐＨ７．４）中の３％ＢＳＡ中で作製し、１０μｇ／ｍＬの最終濃度でプレートに添加した。次いで、プレートを氷上で１時間インキュベートした後、１Ｘ  ＤＰＢＳで２回洗浄した。二次抗体であるＰＥコンジュゲート化ヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ＃１０９−１１５−０９８）を１：１００の希釈率でウェルに添加した。４℃で３０分間インキュベートした後、プレートを１Ｘ  ＤＰＢＳで２回洗浄した後、ＦＡＣＳｏｒｔフローサイトメーター（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｃｙｔｏｍｅｔｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ、ＣＡ）を用いて平均蛍光強度を測定した。
【０５７０】
調節試験：
結合した抗体の表面提示の喪失により定義される表面結合した抗５Ｔ４抗体の調節を、フローサイトメトリーにより評価した。ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４細胞を、黒色の９６穴プレート中、１０，０００個の細胞で播いた。一次抗体を１μｇ／ｍＬの最終濃度で添加した。次いで、プレートを氷上で１時間インキュベートし、１Ｘ  ＤＰＢＳで２回洗浄した後、さらに１時間、冷たい培地中、４℃でインキュベートした（これを以後「結合プレート」と呼ぶ）。内在化試験のため、内在化プレートを３７℃で１、４または２０時間インキュベートした。プレートを１Ｘ  ＤＰＢＳで１回洗浄した。二次抗体であるペルオキシダーゼコンジュゲート化Ａｆｆｉｎｉｔｙ  Ｐｕｒｅヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｓ＃１０９−０３５−００８）を、１：４０００の希釈率でウェルに添加した。二次抗体と共に４℃で１時間インキュベートした後、プレートを３回洗浄し、基質であるＬｕｍｉＧＬＯ（登録商標）（カタログ番号５４−６１−０１、Ｋｉｒｋｅｇａａｒｄ  ＆  Ｐｅｒｒｙ  Ｌａｂｓ．、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）を添加した。結合プレートと内在化プレートとの平均相対蛍光の差異を、抗体の内在化を見積もるための結合のパーセンテージとして表した。
【０５７１】
毒素への抗５Ｔ４抗体（突然変異体および親野生型）のコンジュゲーション
野生型親抗５Ｔ４抗体（突然変異を含まないヒト野生型ＩｇＧ１）および単一反応性システインをＩｇＧ１  Ｆｃ領域中に導入する突然変異を含む新規バリアントの両方に対するｍｃＭＭＡＤおよびｖｃＭＭＡＤへのコンジュゲーションを、本明細書の他の場所に前記されている（実施例７）。
【０５７２】
増殖阻害試験：
細胞系に対するＡＤＣの効果を、細胞生存能力指示因子アッセイＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）ＡＱｕｅｏｕｓＮｏｎ−Ｒａｄｉｏａｃｔｉｖｅ  Ｃｅｌｌ  Ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ（ＭＴＳ）（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）を用いて評価して、様々なＡＤＣ処理への曝露後に生存細胞数を決定した。細胞をウェルあたり５，０００〜１０，０００個の細胞の密度で９６穴マイクロタイタープレート中に播種し、様々な濃度の抗体またはＡＤＣに曝露した。薬物曝露の９６時間（または３７６２２ａ一次細胞については２４０時間）を生き残る生細胞数の決定後、それぞれの処理のＩＣ５０を、用量応答曲線から誘導されるロジスティック回帰パラメータに基づいて算出した。ＩＣ５０を、ロジスティック非線形回帰により算出し、細胞生存能力の５０％の喪失を引き起こす各処理群に由来する濃度（ｎＭ）として報告する。
【０５７３】
抗体依存的細胞性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）アッセイ：
健康なボランティアからの血液を、ヘパリンナトリウムと共にＢＤ  Ｖａｃｕｔａｉｎｅｒ  ＣＰＴ細胞調製チューブ中に採取した。ヒト末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を収穫し、２．５ｘ１０７細胞／ｍｌでアッセイバッファー（１０ｍＭ  ＨＥＰＥＳを添加したＲＰＭＩ１６４０）中に再懸濁した。標的細胞ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４またはＭＤＡＭＢ４３５／ｎｅｏ対照細胞を、９６穴アッセイプレート中に１ｘ１０４細胞／ウェルの密度で播種した。抗体またはＡＤＣを添加した後、ヒトＰＢＭＣエフェクター細胞（５ｘ１０５個）を、５０：１のエフェクター：標的細胞比（Ｅ：Ｔ）のためにウェル中に分注した。アッセイプレートを、ＡＤＣＣ活性について３７℃で４時間インキュベートした。等量のＣｙｔｏＴｏｘ−Ｏｎｅ試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ）を添加することにより、プレートを収穫した。停止溶液（Ｐｒｏｍｅｇａ；５０μｌ）を各ウェルに添加し、乳酸デヒドロゲナーゼ放出を、蛍光強度を測定することにより定量した。陽性対照として、ウェルあたり２μｌの溶解バッファーを添加して、対照ウェル中で最大のＬＤＨ放出（１００％の細胞傷害性）を生成させた。特異的細胞傷害性（％）を、以下の式：
特異的細胞傷害性（％）＝実験−自発的エフェクター−自発的標的ｘ１００
最大標的−自発的標的
を用いて算出した。
【０５７４】
式中、「実験」は実験条件の１つにおいて測定されたシグナルに対応し、「自発的エフェクター」はＰＢＭＣのみの存在下で測定されたシグナルに対応し、「自発的標的」は標的細胞のみの存在下で測定されたシグナルに対応し、「最大標的」は洗剤で溶解した標的細胞のみの存在下で測定されたシグナルに対応する。
【０５７５】
実験結果は以下の通りであった。
【０５７６】
非コンジュゲート化抗５Ｔ４バリアントによる細胞上での５Ｔ４への結合は、非コンジュゲート化野生型抗５Ｔ４親抗体による結合と同等である：
５Ｔ４の膜＋細胞系ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４上で発現された５Ｔ４への、全て非コンジュゲート化「ネイキッド」抗体である抗５Ｔ４  ＩｇＧ１単一システイン突然変異抗体（Ｌ４４３Ｃ、Ｅ３８０Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｖ４２２Ｃ、Ｔ３５９Ｃ、Ｓ２５４Ｃ、Ｓ４４０Ｃ、およびＫ３９２Ｃ）の結合は、図１１に示されるように示された。それぞれの非コンジュゲート化ｃｙｓ突然変異体５Ｔ４  Ａｂの結合は、試験した両方の濃度（１μｇ／ｍｌおよび１０μｇ／ｍｌ）で野生型非コンジュゲート化５Ｔ４  ＩｇＧ１  Ａｂ（「ｗｔＩｇＧ１」と標識）と類似していた。これらのデータは、ヒトＩｇＧ１のこれらの新規位置への操作されたシステインの導入が、抗原を発現する腫瘍細胞への抗体の結合に有意に影響しなかったことを示している。
【０５７７】
５Ｔ４抗原を発現する細胞への結合は、毒性ペイロードにコンジュゲートした新規突然変異システインバリアントＡＤＣのコンジュゲーションにより影響されなかった：
本明細書の以前に開示されたデータは、ヒトＩｇＧ１の新規位置での操作されたシステインの導入が、突然変異を含まないヒト野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域を含む野生型抗体の結合と比較した場合、細胞への抗体結合に影響しなかったことを示している。以前の研究により、ヒトＩｇＧ１の他の位置で操作されたシステインにコンジュゲートされたビオチンまたは他の低分子が、その抗原に対する抗体結合に影響するとは考えられないことが示された。例えば、ＷＯ２０１１／００５４８１（ビオチン−マレイミドコンジュゲーション）；ＷＯ２０１０／１４１９０２（システインバリアントとマレイミド色素とのコンジュゲーション）；およびＷＯ２００６／０３４４８８（ビオチン−マレイミドコンジュゲーションが実施されたが、ＭＭＡＥおよびＭＭＡＦへのコンジュゲーションを記載する全ての例が予言的なものに過ぎなかった）を参照されたい。しかしながら、ビオチンなどの非毒性低分子のコンジュゲーションは、これらの研究において典型的に用いられたように、リンカーおよび毒素分子などのはるかにより大きい部分のコンジュゲーションにより媒介される抗体分子の生物学的特性に対する影響を模倣する可能性は低い。成功したＡＤＣプラットフォーム抗体は、標的細胞に毒性ペイロードを送達するために、非標的細胞に有意に結合することなく、標的抗原に効率的に結合しなければならないため、本発明の操作された突然変異抗体は毒性ペイロードにコンジュゲートされる間に特異的結合能力を保持することが重要である。したがって、本発明の新規な操作された突然変異抗体が５Ｔ４抗原を発現する標的細胞に結合し、５Ｔ４陰性細胞には結合しない能力を評価した。以下に示されるように、新規システイン突然変異抗体は、毒素にコンジュゲートされた場合、非コンジュゲート化親抗体の特異的結合特性を保持したが、非特異的結合を示さない。
【０５７８】
抗体薬物コンジュゲートを、４つの５Ｔ４システイン突然変異体：Ｅ３８０Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｌ４４３ＣおよびＶ４２２Ｃを用いて調製した。それぞれの例において、本明細書の以前に開示されたように突然変異抗体をｍｃＭＭＡＤおよびｖｃＭＭＡＤにコンジュゲートさせることにより、ＡＤＣを調製した（実施例７を参照されたい）。
【０５７９】
操作されたシステインを介してｍｃＭＭＡＤと特異的にコンジュゲートした５Ｔ４  ＡＤＣの結合を、５Ｔ４陽性ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４細胞系および５Ｔ４陰性Ｒａｊｉ細胞系上で天然の非コンジュゲート化５Ｔ４野生型ＩｇＧ１親抗体と比較した。その結果を図１１に示す。図１２Ａは、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤおよび５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤに関する、５Ｔ４陽性細胞系へのＡＤＣの結合が、試験した３つのＡＤＣ濃度（１、３および１０μｇ／ｋｇ）の平均で、天然の非コンジュゲート化５Ｔ４抗体のものと類似していたことを示すグラフを示す。これらのデータは、これらの新規５Ｔ４システイン突然変異抗体の各々へのリンカーおよびペイロードのコンジュゲーションが、細胞上の５Ｔ４抗原に結合するその能力に有意に影響しなかったことを示している。図１２Ｂに示されるデータは、それぞれのＡＤＣが、５Ｔ４陰性Ｒａｊｉ細胞系への無視できる程度の結合を示すことを示し、それによって、システイン突然変異抗体へのリンカーおよびペイロードのコンジュゲーションが親野生型ＩｇＧ１抗体と比較して５Ｔ４結合特性に影響しないことを示す。
【０５８０】
ｃｙｓ突然変異ＡＤＣの内在化は親野生型ＩｇＧ１抗体と同等である：
ＡＤＣ活性の別の重要な特性は、細胞内リソソームコンパートメントに毒性ペイロードを送達するために毒素にコンジュゲートされる間に迅速に内在化されることである。再度、以前の研究により、低分子ビタミンビオチンにコンジュゲートされる間に内在化される意図される新規ＡＤＣの能力が示された。本発明の新規システイン突然変異ＡＤＣを、より厳密で適切な試験にかけて、同じリンカー−ペイロード組合せに従来通りコンジュゲートされた野生型ＩｇＧ１を含む親抗体の内在化と比較した場合に、それらが同等の効率で真の代表的なリンカーおよび細胞傷害性ペイロードの組合せ（例えば、ｍｃＭＭＡＤ）にコンジュゲートされる間に内在化されるかどうかを決定した。本明細書に開示される結果は、新規Ｃｙｓ突然変異ＡＤＣが、親対照ＡＤＣと同等の効率で内在化されたことを示している。
【０５８１】
非コンジュゲート化５Ｔ４−ＩｇＧ１親抗体またはＣｙｓ突然変異ＡＤＣ（それぞれｍｃＭＭＡＤにコンジュゲートされたＥ３８０Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｌ４４３ＣおよびＩｇＧ１親抗体）を、２．２５μｇ／ｍｌの濃度で３７℃で４時間、ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４細胞と共にインキュベートした場合、ＡＤＣは、図１３に示される結果により示されるような時間依存的様式で調節された（すなわち、細胞膜で最早検出されなかった点で内在化された）。４時間で、約６５％の非コンジュゲート化親抗５Ｔ４抗体またはＡＤＣが内在化された（範囲はＬ３９８Ｃについての７０％の高さから、Ｌ４４３Ｃについての５４％の低さであった）。これらの結果は、５Ｔ４抗原に結合する５Ｔ４抗体が比較的速い様式で内在化し、リンカーおよび毒素ペイロードへの４つの突然変異抗５Ｔ４  Ａｂのコンジュゲーションが非コンジュゲート化５Ｔ４  Ａｂと比較してその内在化に有意に影響せず、突然変異抗５Ｔ４  ＡＤＣが非突然変異（天然）５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣ（「Ａ１−ＩｇＧ１ｍｃＭＭＡＤ」と命名）と等しい程度で内在化することを示している。したがって、これらのデータは、ビオチンだけでなく、細胞傷害性ペイロードおよびリンカーへのコンジュゲーションが、非コンジュゲート化抗５Ｔ４  ｃｙｓ突然変異抗体または従来の方法によりＭＭＡＤペイロードにコンジュゲートされた野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域を含む親抗体と比較して、ｃｙｓ突然変異ＡＤＣが内在化される能力に影響しないことを示している。
【０５８２】
ｃｙｓ突然変異ＡＤＣの細胞傷害性は親野生型ＡＤＣと同等であった：
ＡＤＣプラットフォームも試験して、それが標的細胞に対する細胞傷害効果を媒介することができるが、非標的細胞には有意に影響しないかどうかを決定した。すなわち、ＡＤＣは、細胞傷害性ペイロードを担持しながら、標的細胞には依然として特異的に結合しなければならないが、非標的細胞には有意に結合せず、次いで、それは、ごく近いところにあり得る非標的細胞を取っておきながら標的細胞に対する細胞傷害効果を媒介するコンパートメントにペイロードを内在化させ、送達しなければならない。本発明の新規ＡＤＣを、この試験にかけたところ、以下に示されるように、真のリンカーおよびペイロード（非毒性ビタミンビオチンだけではない）を担持しながら標的細胞に結合することができ、内在化され、非標的細胞に影響することなく、標的細胞に対する細胞傷害効果を媒介することができた。この効果は、野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域を含む親抗体と同等であった。
【０５８３】
表２０に記載の結果は、５Ｔ４  Ｃｙｓ突然変異ｍｃＭＭＡＤおよびｖｃＭＭＡＤ  ＡＤＣがそれぞれ、５Ｔ４を発現する細胞系ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４（５Ｔ４発現が高い）およびＭＤＡＭＢ−４６８（中程度に５Ｔ４を発現するＨＥＲ２耐性細胞系）の増殖を阻害することができた。同じＡＤＣは、５Ｔ４陰性Ｒａｊｉ細胞上でも大部分は不活性であることが観察された。二重Ｃｙｓ突然変異体上への薬物のローディングの増加は、ＭＤＡＭＢ４３５およびＭＤＡＭＢ−４６８細胞系の増殖の阻害の効力の検出可能な増加に反映される。ｖｃＭＭＡＤのコンジュゲートしたＣｙｓ突然変異Ａｂは、５Ｔ４＋細胞における増殖の阻害においてｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣよりも約１０倍強力であった。ｖｃＭＭＡＤ  ＡＤＣはより不安定なカテプシン感受性ｖｃリンカーに連結され、したがって、より安定に連結されたｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣよりも細胞増殖の阻害においてより活性が高い。不安定になるほど、ｖｃ連結ＡＤＣも動物において毒性が高くなる傾向がある。両方のリンカー型はＡＤＣとして診療所で試験された。これらのデータは、本発明の新規ｃｙｓ突然変異体が、ＤＡＲの正確な化学量論で細胞傷害性ペイロードを送達することができる効率的で均一なＡＤＣの生成のための効率的なプラットフォームを提供し、それによって、治療効果を提供することを示している。これらのＡＤＣについて観察された細胞傷害性は、抗原発現および抗体ローディング（ＤＡＲ）に依存する。
【０５８４】
【表２０】
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【０５８５】
表２１は、ペイロードｍｃＭＭＡＤにコンジュゲートした抗Ｈｅｒ２突然変異体の細胞傷害性を示す。開示されるデータは、抗Ｈｅｒ２  Ｆｃ突然変異体ならびにｍｃ、ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２およびＭａｌＰｅｇ３Ｃ２リンカーを介してＭＭＡＤにコンジュゲートされたＦｃおよびカッパ鎖二重突然変異体の細胞傷害性をさらに示す。再度、二重突然変異体のローディングの増加は、Ｈｅｒ２発現細胞系ＢＴ４７４およびＮ８７（両方ともＨｅｒ２を高く発現すると考えられる）に対する効力の増加により反映される。ＡＤＣは、非Ｈｅｒ２発現細胞系（ＭＤＡ−ＭＢ４６８）に対して１００〜１０００倍低い活性であった。これらのデータは、開示された突然変異部位を、様々なリンカーおよびペイロードを用いて、異なる抗体プラットフォーム（５Ｔ４およびＨｅｒ２に結合する抗体）間で効率的に移動させることができることを示す。したがって、これらのデータは、本発明の新規ｃｙｓ突然変異体が広く有用であり、一般に、抗体プラットフォームおよびリンカーおよびペイロードにわたって適用可能であり、本明細書に例示される抗体、リンカーおよびペイロードに限定されないことを示している。
【０５８６】
【表２１】
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【０５８７】
エフェクター機能（ＡＤＣＣ）はヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域中の新規ｃｙｓ突然変異によって影響されない：
ＩｇＧ１のＦｃ領域は、抗体に対するさらなる治療効果を提供することができるＡＤＣＣなどの望ましいエフェクター機能を媒介することができる。したがって、本発明のｃｙｓ突然変異抗体のエフェクター機能、例えば、ＡＤＣＣを媒介する能力を、以下のように評価した。
【０５８８】
本明細書に開示されるデータは、Ｃｙｓ突然変異５Ｔ４抗体（Ｅ３８０Ｃ、Ｌ３９８Ｃ、Ｖ４２２Ｃ、Ｌ４４３Ｃ）および野生型ＩｇＧ１を含む天然５Ｔ４抗体が、それぞれ、健康なボランティアに由来するヒトエフェクター細胞（Ｅ）を用いて５Ｔ４陽性ＭＤＡＭＢ４３５／５Ｔ４標的細胞（Ｔ）に対する用量依存的ＡＤＣＣ活性を媒介したことを示す（図１４Ａ）。ＭＤＡＭＢ４３５ｎｅｏ細胞（５Ｔ４＋／−）に対しては、ＡＤＣＣ活性を媒介するための５Ｔ４抗原の標的化要件を示すＡｂのいずれについても活性は観察されなかった（図１４Ｂ）。これらのデータは、本明細書に開示される新規位置での反応性システインの導入が、ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域のエフェクター機能、例えば、ＡＤＣＣを媒介する能力に影響しないことを示している。エフェクター機能は、治療的利益を提供することが知られており、それによって、本発明の突然変異体の潜在的な治療的有用性をさらに強調している。
【０５８９】
ｃｙｓ突然変異ＡＤＣの薬物動態は、親野生型ＩｇＧ１抗体と同等である：
５Ｔ４抗体のみ、５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣ（従来のｃｙｓコンジュゲーション）または様々な５Ｔ４ｃｙｓ突然変異ｍｃＭＭＡＤ  ＡＤＣの単回３ｍｇ／ｋｇＩＶ用量を与えたメスのｎｕ／ｎｕマウス（腫瘍を担持しない）において、野生型ＩｇＧ１  Ｆｃ領域およびペイロード（ＡＤＣ）に特異的にコンジュゲートしたヒトｃｙｓ突然変異抗５Ｔ４抗体部位を含むヒト抗５Ｔ４抗体の薬物動態パラメータを決定するための研究を行った。個々の動物からの血液試料を、投与後最大で３３６時間までの様々な時点で採取し、ＥＬＩＳＡに基づくアッセイを用いて５Ｔ４抗体およびコンジュゲートの濃度について分析した。
【０５９０】
この研究においては、５Ｔ４非コンジュゲート化抗体（表２２）および部位特異的にコンジュゲートしたＡＤＣ（表２３）の全身クリアランスは、従来のシステインコンジュゲーションＡＤＣのクリアランスと比較して遅かった。５Ｔ４抗体に対する曝露（ＡＵＣ）値は、表２２に示されるように、５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ（従来のｃｙｓコンジュゲーション）を投与したものと比較して、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤおよび５Ｔ４−Ｅ３７６−ＣｍｃＭＭＡＤを与えたマウスにおいて、それぞれ約８５％、７４％、６１％および４３％高かった。
【０５９１】
【表２２】
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【０５９２】
コンジュゲート（ＡＤＣ）濃度を評価する場合、曝露値は、表２３に示されるように、５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ（従来のシステインコンジュゲーション）ＡＤＣを投与したものと比較して、５Ｔ４−Ｌ３９８Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ、５Ｔ４−Ｖ４２２Ｃ−ｍｃＭＭＡＤおよび５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤを与えたマウスにおいて、それぞれ約５８％、６１％および５５％高かった。５Ｔ４−Ｅ３８０Ｃ−ｍｃＭＭＡＤのＡＤＣ曝露は、従来のＡＤＣ（５Ｔ４−ｍｃＭＭＡＤ）よりも低かった（−９％）。
【０５９３】
【表２３】
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【０５９４】
従来のＡＤＣと比較して特定のシステイン突然変異ＡＤＣ（例えば、５Ｔ４−Ｌ４４３Ｃ−ｍｃＭＭＡＤ）のより高い曝露は、ＰＫパラメータの改善が操作されたシステインの位置により決定されるペイロードコンジュゲーションの部位に依存することを示す。したがって、本発明の特定の操作されたシステイン位置を介して新規部位特異的コンジュゲーション法を用いて生成されたＡＤＣの投与は、従来のＡＤＣと比較して標的腫瘍部位への細胞傷害性ペイロードのより効率的な送達をもたらすことができる。
【０５９５】
（実施例１０）
部位特異的コンジュゲーションのための反応性システインを含む操作されたカッパ定常領域
反応性システインを操作するための部位を、部位特異的コンジュゲーションのための位置の多様性を拡張し、操作されたカッパ領域を選択された単一Ｆｃ領域システイン突然変異体と組み合わせることにより抗体あたり４個の毒性ペイロードのコンジュゲーションを可能にするカッパ軽鎖定常領域中で選択した。カッパ定常領域中の操作されたシステインの好ましい位置は、９．５〜１１．５の予測されたｐＫａ値および１５〜６０Å２の予測された側鎖溶媒接近性を有し、この特性は限定されるものではないが、Ｑ３４７Ｃ、Ｅ３８０Ｃ、Ｋ３９２ＣおよびＬ４４３Ｃなどの本明細書の以前に開示された最も上手くいくコンジュゲート化システイン突然変異体を模倣することが予測される。
【０５９６】
特性予測を、いくつかのカッパドメイン結晶構造に対して実施したが、複数の構造上に最適な特性予測を与える位置（２Ｒ８Ｓおよび１Ｎ８Ｚ；それぞれ、Ｙｅら、２００８、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １０５：８２〜８７およびＣｈｏら、２００３、Ｎａｔｕｒｅ  ４２１：７５６〜７６０）が好ましかった。それぞれの位置を、最初にその位置をシステインに突然変異させ、ＳＣＷＲＬ４を有する回転異性体を予測し（Ｋｒｉｖｏｖら、２００９、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ７７（４）：７７８〜７９５）、次いで、特に、ＳｐａｓｓｏｖおよびＹａｎ、２００８、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．１７：１９５５〜１９７０に開示されたものなどの方法を用いてシステイン側鎖ｐＫａを予測し、Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  Ｓｔｕｄｉｏ  ３．０（Ａｃｃｅｌｒｙｓ，Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）を用いて側鎖溶媒接近性を予測することにより、それぞれの結晶構造中で検査した。表２４は、アミノ酸残基がチオール反応性部位特異的コンジュゲーションのためにシステインに突然変異された野生型内因性ヒトカッパ定常領域と比較した突然変異の位置を記載する。表２４は、ヒトカッパ残基が反応性システインで置きかえられた位置を示す。位置は、Ｋａｂａｔら（１９９１、ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ、ＶＡ）に記載のＫａｂａｔの番号付けシステムにより定義されたものであり、したがって全ての位置はＫａｂａｔのシステムに従って番号付けられる。
【０５９７】
【表２４】
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【０５９８】
（実施例１１）
単一システイン操作ヒトカッパ定常領域抗Ｈｅｒ２抗体の生成
表２４に示されたこれらの新規位置に操作された単一システインを含むヒトカッパ定常領域を、さらなる評価のために抗Ｈｅｒ２抗体（例示的Ｈｅｒ２抗体のＶＨおよびＶＬドメインのアミノ酸配列を、それぞれ図１７Ｃおよび１７Ｄに示す）に組み込んだ。抗Ｈｅｒ２抗体ヒト野生型カッパ定常領域をコードする核酸を、制限酵素消化により発現ベクターから除去し、Ｔ４  ＤＮＡリガーゼ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ  Ｉｎｃ．、Ｉｐｓｗｉｃｈ、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）を用いて単一操作システイン残基を含むヒト軽鎖定常カッパ領域をコードする核酸と置きかえた。得られた核酸を、それぞれの構築物について配列確認した。これらのデータは、定常領域中に反応性システインを導入するための突然変異を含む操作されたカッパ軽鎖をコードする核酸が生成されたことを示している。
【０５９９】
（実施例１２）
一過的ＨＥＫ−２９３発現系からの抗Ｈｅｒ２抗体単一システイン操作ヒトカッパバリアントの生成
コンジュゲーション研究のための十分な材料を生成するため、およびバリアントをより大量に生成することができるかどうかを決定するために、１０Ｌのウェーブバッグ中のＨＥＫ−２９３細胞に、標準的な方法を用いて以前に記載された６つの抗Ｈｅｒ２単一システインカッパ操作抗体バリアントをコードする重鎖および軽鎖ＤＮＡを一過的に同時トランスフェクトした。次に、単一システインカッパバリアント抗体を、標準的な２ステップ精製戦略、プロテインＡ親和性捕捉、次いで、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）を用いて精製した。表２５に示されるこれらの結果は、許容できるレベルの高分子量（ＨＭＷ）凝集種が６つ全部の単一システインカッパバリアントについてプロテインＡ樹脂からの溶出後に検出されたこと、およびこのＨＭＷ種をサイズ排除クロマトグラフィーを用いて除去することができることを示している。最終的な精製された単一システイン操作カッパ抗Ｈｅｒ２抗体タンパク質調製物は、４℃で１週間保存した場合、または３回の凍結／解凍サイクルにかけた場合、高分子量凝集種を形成しないことが示された（表２５）。
【０６００】
【表２５】
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【０６０１】
一過的ＨＥＫ−２９３発現系における抗Ｈｅｒ２単一システイン操作カッパ抗体バリアントの概要を示す。これらのデータは、反応性システインを導入するための、Ａ１１１、Ｋ１８３およびＮ２１０に突然変異を含む操作されたカッパ軽鎖を、抗体収率および凝集する傾向に対する有意な効果なしに容易に生成することができることを示している。
【０６０２】
（実施例１３）
操作されたＡＤＣのｉｎ  ｖｉｔｒｏでの安定性
マレイミド−システイン連結の安定性は、近年大変興味深い分野になっている。最近の報告により、マレイミドをｉｎ  ｖｉｔｒｏおよびｉｎ  ｖｉｖｏの両方において外因性チオール求核試薬に移すことができる（例えば、Ｓｈｅｎら、２０１２、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．３０（２）：１８４〜１８５を参照されたい）。ＡＤＣの安定性を評価するため、およびｉｎ  ｖｉｖｏでの評価のための試料を優先させるため、過剰の水性グルタチオン（ＧＳＨ）または血漿を用いるマレイミド連結ＡＤＣの処理を含む新規アッセイを開発した。反応混合物のアリコートを、様々な時点で分析して、ＡＤＣのローディングを決定した。以下に記載されるこの方法を用いて、ｍｃＭＭＡＤおよび他のペイロード−リンカーに連結された本発明の一連のシステイン突然変異抗体の安定性を評価した。結果は、薬物−抗体連結がＧＳＨ依存的様式でゆっくりと切断されることを示している（表２６）。重要なことは、切断の速度が改変部位に高度に依存し、それによって、安定性に基づくシステイン突然変異体の順位付けが可能になることである。表２６に示されるＧＳＨ安定性アッセイ結果は、特定の突然変異体（例えば、Ｅ３８８ＣおよびＬ４４３Ｃ）が他の突然変異体（例えば、Ｅ３８０ＣおよびＶ４２２Ｃ）よりも有意に安定であることを示している。
【０６０３】
アッセイプロトコール：
ＰＢＳ中のＡＤＣ試料（３０μｇ）を、グルタチオン（ＧＳＨ）溶液と混合して、０．５ｍＭおよび３ｍｇ／ｍＬのタンパク質濃度のＧＳＨの最終濃度を生成した。対照試料（ＧＳＨを含まない）を、ＰＢＳ中で３ｍｇ／ｍＬに希釈した３０μｇのＡＤＣから同様に調製した。ＧＳＨ処理されたＡＤＣ試料および対照ＡＤＣ試料を３７℃でインキュベートし、０、３および６日目でサンプリングした。アリコートを過剰のＴＣＥＰで還元し、１０％アセトニトリルを含む０．１％ギ酸溶液を添加することにより酸性化し、以下に記載のようにＬＣ／ＭＳによりローディングについて分析した。
【０６０４】
試料分析：Ｗａｔｅｒｓ  Ｘｅｖｏ  Ｇ２  Ｑ−ＴＯＦ質量分析装置と一体化したＡｇｉｌｅｎｔ  １１００キャピラリーＨＰＬＣを用いて、分析を実施した。分析物を、０．１％ギ酸と共にＺｏｒｂａｘ  Ｐｏｒｏｓｈｅｌｌ  ３００ＳＢ  Ｃ８カラム（０．５ｍｍＸ７５ｍｍ、８０℃で維持）上にロードし、５．５分かけて２０μｌ／ｍｉｎの流量で２０〜４０％のバッファーＢ（８０％のアセトニトリル、１８％の１−プロパノール、０．１％のギ酸を含む２％の水）の勾配を用いて溶出させた。質量分析検出を、３．３ｋＶに設定されたキャピラリー電圧と共にポジティブ、感受性モードで実行した。データ分析をＭａｓｓＬｙｎｘ中のＭａｘＥｎｔ１機能を用いて実施し、強度を、以前に記載された式（すなわち、本明細書の他の場所に以前に記載された式１）に基づくローディング計算のために用いた。分析の結果を以下の表２６に示す。
【０６０５】
【表２６−１】
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【０６０６】
【表２６−２】
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【０６０７】
（実施例１４）
部位特異的コンジュゲーションのための反応性システインを含む操作されたラムダ定常領域
本明細書に開示されるラムダ軽鎖定常領域中で選択される操作された反応性システインは、部位特異的コンジュゲーションのための位置の多様性を拡張し、操作されたラムダ領域を選択された単一Ｆｃ領域システイン突然変異体と組み合わせることにより、抗体あたり４個の毒性ペイロードのコンジュゲーションを可能にする。本発明のラムダ定常領域中の操作されたシステインのための好ましい位置は、９．５〜１１．５の予測されたｐＫａ値を有し、１５〜６０Å２の予測された側鎖溶媒接近性を有する。いかなる特定の理論によっても束縛されることを望むものではないが、これらの特性は、限定されるものではないが、以下の位置：Ｑ３４７Ｃ、Ｅ３８０Ｃ、Ｋ３９２Ｃ、およびＬ４４３Ｃで操作された重鎖定常ドメインシステインなどの、本明細書の以前に開示された好ましいコンジュゲート化システイン突然変異体と共有されている。
【０６０８】
望ましい特性の予測を、いくつかのラムダドメイン結晶構造に対して実施したが（それぞれ、Ｃｈａｎら、２００９、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １０６：９８２０〜９８２５およびＴｅｐｌｙａｋｏｖら、２００９、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏ．３８９：１１５〜１２３に記載された、２つの非公開の構造、＋ＰＤＢエントリー３Ｈ４２および３Ｇ６Ａ）、複数の構造に対して最適な特性予測を与える位置が好ましかった。それぞれの位置を、最初にその位置をシステインに突然変異させ、ＳＣＷＲＬ４を有する回転異性体を予測し（Ｋｒｉｖｏｖら、２００９、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ７７（４）：７７８〜７９５）、次いで、（特に、ＳｐａｓｓｏｖおよびＹａｎ、２００８、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．１７：１９５５〜１９７０に記載のものなどの方法を用いて）システイン側鎖ｐＫａを予測し、Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  Ｓｔｕｄｉｏ  ３．０（Ａｃｃｅｌｒｙｓ，Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）を用いて側鎖溶媒接近性を予測することにより、それぞれの結晶構造中で検査した。表２７は、アミノ酸残基がチオール反応性部位特異的コンジュゲーションのためにシステインに突然変異された野生型内因性ヒトラムダ定常領域と比較した突然変異の位置を記載する。表２７は、ヒトラムダ残基が反応性システインで置きかえられた位置を示す。位置は、Ｋａｂａｔら（１９９１、ＮＩＨ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ９１−３２４２、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅ、Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ、ＶＡ）に記載のラムダ番号付けシステムにより定義されたものであり、全ての位置はＫａｂａｔのシステムに従って番号付けられる。
【０６０９】
【表２７】
2019034942.tif 000032
【０６１０】
（実施例１５）
部位特異的コンジュゲーションのための操作された抗体のｉｎ  ｖｉｖｏでの特徴付け
本発明の様々な部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣのｉｎ  ｖｉｖｏでのＰＫパラメータを、マウスモデルにおいて評価した。簡単に述べると、ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２＿Ａｕｒリンカー−ペイロード（ここで、「Ａｕｒ」は、「８２６１」とも呼ばれ、あたかも全体が本明細書に記載されたかのように参照により本明細書に組み込まれる２０１２年１１月７日に出願された国際特許出願ＰＣＴ／ＩＢ２０１２／０５６２２４に開示された特許で守られたオーリスタチンペイロードである）を用いてｍｃＭＭＡＤをロードされた様々な部位特異的抗Ｈｅｒ２コンジュゲート化ＡＤＣのＰＫを決定し、その結果を図２１に示す。コンジュゲーションに用いた部位（Ｆｃ  Ｃ３４７、Ｆｃ  Ｃ４２１、カッパ１８３、Ｆｃ  Ｃ３８８、Ｆｃ  Ｃ４４３、Ｆｃ  Ｃ３９８＋Ｃ４４３、およびＦｃ  Ｃ３９２＋Ｃ４４３）に関係なく部位特異的ＡＤＣについて有意な検出可能なＰＫの差異は観察されなかった（図２１Ａ）。図２１Ｂに開示されるデータは、部位特異的コンジュゲートが少なくとも約７０％のＡＤＣ／抗体ＡＵＣ比を示し、従来のコンジュゲートについて典型的に観察されるものと違って、大部分がほぼ１００％であったことを示す。ＡＤＣ  ＡＵＣと抗体ＡＵＣとの比は、典型的にはより低く、４０〜６０％の範囲であった。本明細書に開示されるデータは、２つの二重操作された（すなわち、ＤＡＲ＝４）ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２＿Ａｕｒ部位特異的ＡＤＣ（Ｌ３９８Ｃ＋Ｌ４４３ＣおよびＫ３９２Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ）は、単一操作されたＡＤＣ（ＤＡＲ＝２）と同等のＰＫを示したことを示している。両方の型の部位特異的ＡＤＣは、ＡＤＣ／抗体比の有意な改善を示した。さらに、抗Ｈｅｒ２−ｍｃＭＭＡＤのＰＫデータは、抗５Ｔ４抗体上で同等のＡＤＣについて決定されたＰＫパラメータと相関していたが、これは、操作されたシステイン位置を複数の抗体プラットフォームにわたって使用して、安定なコンジュゲートを生成することができることを示唆している。
【０６１１】
Ｎ８７胃がんモデル
選択されたリードである特許で守られたリンカー−ペイロードとコンジュゲートさせた、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ  ＡＤＣバリアントの有効性を、ｉｎ  ｖｉｖｏでのＮ８７胃がんモデルにおいて決定した。結果は、抗体あたり約５０％より低いローディングにも拘らず、従来の非部位特異的コンジュゲートの組織学的データと比較して、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ−Ｍａｌ−Ｐｅｇ６−Ｃ２−ＭＭＡＤ（図２２Ａ）、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ−ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２−Ａｕｒ（図２２Ｂ）および抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ−ｖｃ０１０１（国際特許出願ＰＣＴ／ＩＢ２０１２／０５６２２４に開示された新規細胞傷害性化合物）（図２２Ｃ）のＡＤＣに関する同等のｉｎ  ｖｉｖｏでの有効性を示す。すなわち、抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ  ＡＤＣの平均は、従来の非特異的抗Ｈｅｒ２コンジュゲート（Ｔ−ＤＭ１；薬物メイタンシノイド１）に関するＤＡＲ＝４と比較してＤＡＲ＝２である。
【０６１２】
ＤＹＴ２異種移植腫瘍モデル
抗Ｈｅｒ２部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣの有効性を、別の腫瘍モデルにおいて評価した。８つのＭａｌＰｅｇ６Ｃ２−Ａｕｒ操作された部位特異的システイン突然変異体ＡＤＣを、ＤＹＴ２異種移植モデルにおいて１ｍｇ／ｋｇで従来のコンジュゲートと比較し、その結果を図２３に示す。この研究からのデータは、Ｌ４４３Ｃ、Ｋ３８８Ｃ、およびＮ４２１Ｃ単一突然変異体ならびにＬ３９８Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ二重突然変異体が、従来のコンジュゲートと比較して同等の効力を有することを示していた。しかしながら、Ｋ３９２Ｃ＋Ｌ４４３Ｃ二重突然変異体、ならびにＱ３４７Ｃおよびカッパ−Ｋ１８３Ｃ単一突然変異体は、従来のコンジュゲートほど有効ではなかった（図２３）。全体として、様々なリンカー−ペイロード組合せを用いる部位特異的にコンジュゲートされたＡＤＣのｉｎ  ｖｉｖｏでの効力は、従来のコンジュゲートについて観察されるものと同等である。
【０６１３】
ｉｎ  ｖｉｖｏでの毒性試験
Ｎ８７胃がんモデルにおいて抗Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ−ｖｃ０１０１、抗Ｈｅｒ２−ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２−ＭＭＡＤおよび抗Ｈｅｒ２−ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２−Ａｕｒコンジュゲートを用いて、ラット毒性試験を実施した。本発明の１つの部位特異的コンジュゲート、Ｌ４４３Ｃ−ｖｃ０１０１は、試験した最も高いペイロード用量で、従来のようにコンジュゲートされたＨｅｒ２−ｖｃ０１０１よりも良好な毒性プロファイルを示した。同様に、Ｈｅｒ２−Ｌ４４３Ｃ−ＭａｌＰｅｇ６Ｃ２−Ａｕｒ部位特異的ＡＤＣについて、従来のコンジュゲートと比較してわずかであるが、より顕著な安全性の改善も観察された。
【０６１４】
部位特異的コンジュゲート化ＡＤＣに関する治療指数（ＴＩ）値の決定
従来のコンジュゲートと、本発明の部位特異的コンジュゲート化ｍｃＭＭＡＤ、ｖｃ０１０１およびｍｃＡｕｒ抗Ｈｅｒ２コンジュゲートとの治療指数（ＴＩ）値を決定し、その結果を図２３に示す。ラット毒性試験からのｃＮＯＡＥＬ（連続応答変数に基づく統計的に誘導された無有害作用量）と、腫瘍静止濃度（ＴＳＣ）と定義される有効性との比を用いることにより、ＴＩ値を決定した。抗Ｈｅｒ２部位特異的Ｌ４４３Ｃ−ｖｃ０１０１  ＡＤＣは、従来のようにコンジュゲートされたＡＤＣと比較してＴＩ値の２倍を超える増加を示した。これは、安全性の６倍の増加（ｃＮＯＡＥＬの改善）で相殺された有効性（ＴＳＣ）の３倍の低下に起因するものであった。本明細書に開示されるデータは、本発明の新規部位特異的抗体コンジュゲートを、ｖｃ０１０１などの特定のリンカー−ペイロード組合せと共に用いることができ、それは従来のようにコンジュゲートされた抗体よりも良好な治療域を示すことができることを示唆する。
【０６１５】
本明細書に開示されるデータは、部位特異的コンジュゲーションを可能にするために反応性システインを操作するための新しく同定された位置により、複数の抗体、ペイロードおよびリンカープラットフォームにわたる従来のコンジュゲートと比較して、改善されたＰＫおよびＴＩと共に安定で有効なＡＤＣが得られた。
【０６１６】
本明細書で引用されたそれぞれの、および全ての特許、特許出願、および刊行物の開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０６１７】
本発明を特定の実施形態を参照して開示してきたが、当業者であれば、本発明の真の精神および範囲から逸脱することなく、本発明の他の実施形態および変更を考案することができることが明らかである。添付の特許請求の範囲は、あらゆるそのような実施形態および等価な変更を含むと解釈されることが意図される。
【図１】
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【図２】
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【図３−１】
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【図３−２】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７−１】
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【図７−２】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２−１】
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【図１２−２】
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【図１３】
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【図１４−１】
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【図１４−２】
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【図１５−１】
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【図１５−２】
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【図１５−３】
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【図１５−４】
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【図１５−５】
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【図１５−６】
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【図１５−７】
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【図１５−８】
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【図１５−９】
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【図１５−１０】
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【図１５−１１】
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【図１５−１２】
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【図１５−１３】
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【図１５−１４】
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【図１５−１５】
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【図１５−１６】
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【図１６−１】
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【図１６−２】
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【図１７−１】
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【図１７−２】
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【図１８】
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【図１９−１】
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【図１９−２】
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【図２０−１】
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【図２０−２】
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【図２１−１】
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【図２１−２】
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【図２２−１】
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【図２２−２】
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【図２２−３】
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【図２３】
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【配列表】
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