【手続補正書】
【提出日】平成27年12月2日(2015.12.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ポルフィロモナス・ジンジバリスに対する免疫応答を誘導するキメラタンパク質又は融合タンパク質であって、該タンパク質が直接又はリンカーを介して第２のペプチド又はポリペプチドと連結する第１のペプチドを含み、
（Ａ）前記第１のペプチドが
（ｉ）配列番号１で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉ）配列番号２で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列を含み、
（Ｂ）前記第２のペプチド又はポリペプチドが
（ｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＬｙｓ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子(adhesin)ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＡｒｇ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＨａｇＡ付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列を含む、キメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２】
前記第１のペプチドが配列番号３又は配列番号４で示される配列を含む、請求項１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３】
前記第１のペプチドが配列番号５〜配列番号８のうちの１つで示される配列を含む、請求項１又は２に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項４】
前記第１のペプチドが配列番号９〜配列番号１２のうちの１つで示される配列を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項５】
前記第１のペプチドが配列番号１３〜配列番号１８のうちの１つで示される配列を含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項６】
前記第１のペプチドが配列番号１９〜配列番号２６のうちの１つで示される配列を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項７】
前記第１のペプチドが配列番号２７〜配列番号３０のうちの１つで示される配列を含む、請求項１〜６のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項８】
前記第１のペプチドが配列番号３１〜配列番号３４のうちの１つで示される配列を含む、請求項１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項９】
前記第１のペプチドが配列番号３〜配列番号３４のうちの１つと少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列を含む、請求項１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１０】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３５で示される配列、又は配列番号３６で示される配列を含むその断片を含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１１】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３６又は配列番号３７で示される配列を含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１２】
（ａ）前記第１のペプチドが配列番号２７〜配列番号３０のうちの１つで示される配列を含み、
（ｂ）前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３６又は配列番号３７で示される配列を含む、請求項１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１３】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３８で示される配列、又は配列番号３９で示される配列を含むその断片を含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１４】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３９で示される配列を含む、請求項１３に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１５】
（ａ）前記第１のペプチドが配列番号３１〜配列番号３４のうちの１つで示される配列を含み、
（ｂ）前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３９で示される配列を含む、請求項１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１６】
ポルフィロモナス・ジンジバリスに対する免疫応答を誘導するキメラタンパク質又は融合タンパク質であって、該タンパク質が直接又はリンカーを介してポリペプチドと連結するペプチドを含み、
（Ａ）前記ペプチドが
（ｉ）配列番号１で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉ）配列番号２で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列を含み、
（Ｂ）前記ポリペプチドが
（ｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＬｙｓ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＡｒｇ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＨａｇＡ付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する５から４０アミノ酸残基の配列を含む、キメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１７】
前記ペプチドが配列番号３又は配列番号４で示される配列を含む、請求項１６に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１８】
前記ペプチドが配列番号５〜配列番号８のうちの１つで示される配列を含む、請求項１６又は１７に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項１９】
前記ペプチドが配列番号９〜配列番号１２のうちの１つで示される配列を含む、請求項１６〜１８のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２０】
前記ペプチドが配列番号１３〜配列番号１８のうちの１つで示される配列を含む、請求項１６〜１８のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２１】
前記ペプチドが配列番号１９〜配列番号２６のうちの１つで示される配列を含む、請求項１６〜２０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２２】
前記ペプチドが配列番号２７〜配列番号３０のうちの１つで示される配列を含む、請求項１６〜２１のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２３】
前記ペプチドが配列番号３１〜配列番号３４のうちの１つで示される配列を含む、請求項１６に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２４】
前記ペプチドが配列番号３〜配列番号３４のうちの１つと少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列を含む、請求項１６に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２５】
前記ポリペプチドが配列番号３５で示される配列、又は配列番号３６で示される配列を含むその断片を含む、請求項１６〜２４のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２６】
前記ポリペプチドが配列番号３６又は配列番号３７で示される配列を含む、請求項１６〜２５のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２７】
（ａ）前記ペプチドが配列番号２７〜配列番号３０のうちの１つで示される配列を含み、
（ｂ）前記ポリペプチドが配列番号３６又は配列番号３７で示される配列を含む、請求項１６に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２８】
前記ポリペプチドが配列番号３８で示される配列、又は配列番号３９で示される配列を含むその断片を含む、請求項１６〜２４のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項２９】
前記ポリペプチドが配列番号３９で示される配列を含む、請求項２８に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３０】
（ａ）前記ペプチドが配列番号３１〜配列番号３４のうちの１つで示される配列を含み、
（ｂ）前記ポリペプチドが配列番号３９で示される配列を含む、請求項１６に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３１】
直接又はリンカーを介して第２のペプチド又はポリペプチドと連結する第１のペプチドを含むキメラタンパク質又は融合タンパク質であって、
（Ａ）前記第１のペプチドが、ポルフィロモナス・ジンジバリスに対する免疫応答を誘導するペプチドであって、
（ｉ）配列番号６４〜配列番号６６のうちの１つで示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列、又は
（ｉｉ）配列番号６７若しくは配列番号６８で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列からなるペプチドであり、
（Ｂ）前記第２のペプチド又はポリペプチドが、
（ｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＬｙｓ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＡｒｇ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＨａｇＡ付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列を含む、キメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３２】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３５で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列、又は配列番号３６で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列を有する断片を有する、請求項３１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３３】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３６又は配列番号３７で示される配列と同じであるか又は少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列を有する、請求項３１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３４】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３８で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列、又は配列番号３９で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列を有する断片を有する、請求項３１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３５】
前記第２のペプチド又はポリペプチドが配列番号３９で示される配列と同じであるか又は少なくとも９０％以上の配列同一性を有する配列を有する、請求項３４に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３６】
前記第２のペプチド又はポリペプチドがポリペプチドの形態で与えられる、請求項３１〜３５のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３７】
さらなるペプチドを少なくとも１つ含む請求項１〜３６のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質であって、
（Ｃ）前記さらなるペプチドが
（ｉ）配列番号１で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉ）配列番号２で示される配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｉｉ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＬｙｓ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｉｖ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＡｒｇ−Ｘ−プロテイナーゼの付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する、少なくとも５から４０アミノ酸残基の配列、又は
（ｖ）ポルフィロモナス・ジンジバリスのＨａｇＡ付着因子ドメインの配列と同じであるか若しくは少なくとも９０％以上の配列同一性を有する５から４０アミノ酸残基の配列を含む、キメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３８】
前記第１のペプチドのＣ末端残基が直接若しくはリンカーを介して前記第２のペプチド又はポリペプチドのＮ末端残基と共有結合するか、又は前記ペプチドのＣ末端残基が直接若しくはリンカーを介して前記ポリペプチドのＮ末端残基と共有結合する、請求項１〜３７のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項３９】
前記第１のペプチドのＮ末端残基が直接若しくはリンカーを介して前記第２のペプチド又はポリペプチドのＣ末端残基と共有結合するか、又は前記ペプチドのＮ末端残基が直接若しくはリンカーを介して前記ポリペプチドのＣ末端残基と共有結合する、請求項１〜３７のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項４０】
前記第１のペプチドが最大１５アミノ酸長、好ましくは５アミノ酸長未満のリンカーを介して前記第２のペプチド又はポリペプチドと連結するか又は前記ペプチドが最大１５アミノ酸長、好ましくは５アミノ酸長未満のリンカーを介して前記ポリペプチドと連結する、請求項１〜３９のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項４１】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質を含む組成物。
【請求項４２】
アジュバントをさらに含む、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４３】
被験体においてポルフィロモナス・ジンジバリス関連の状態若しくは疾患の罹患率若しくは重症度を抑える若しくは低減する薬剤の製造、又は、被験体においてポルフィロモナス・ジンジバリス関連の状態若しくは疾患の罹患率若しくは重症度を抑える若しくは低減する薬剤の製造における、請求項１〜４０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質若しくは融合タンパク質、又は請求項４１若しくは４２に記載の組成物の使用。
【請求項４４】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質に対して産生される抗体。
【請求項４５】
モノクローナル抗体である、請求項４４に記載の抗体。
【請求項４６】
被験体においてポルフィロモナス・ジンジバリス関連の状態又は疾患の罹患率又は重症度を抑える又は低減する薬剤の製造における請求項４４又は４５に記載の抗体の使用。
【請求項４７】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質をコードする配列を含む核酸分子。
【請求項４８】
前記配列が少なくとも１つの調節要素と操作可能に結び付いている、請求項４７に記載の核酸分子。
【請求項４９】
請求項４７又は４８に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項５０】
ウイルス又は細菌のワクチンベクターである、請求項４９に記載のベクター。
【請求項５１】
請求項４７若しくは４８に記載の核酸分子又は請求項４９若しくは５０に記載のベクターを含む原核細胞又は真核細胞。
【請求項５２】
被験体においてポルフィロモナス・ジンジバリス関連の疾患又は状態の重症度を抑える又は低減する薬剤の製造における請求項４７若しくは４８に記載の核酸分子、請求項４９若しくは５０に記載のベクター、又は請求項５１に記載の原核細胞若しくは真核細胞の使用。
【請求項５３】
被験体由来の生体試料において抗ポルフィロモナス・ジンジバリス抗体を検出するための請求項１〜４０のいずれか一項に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質の使用。
【請求項５４】
被験体由来の生体試料においてポルフィロモナス・ジンジバリスの存在を検出するための請求項４４又は４５に記載の抗体の使用。
【請求項５５】
前記第２のペプチドが配列番号６９〜配列番号７９のうちの１つ若しくは複数、又は配列番号８３〜配列番号８５のうちの１つ若しくは複数で示される配列を含むか又はそれらからなる、請求項１又は３１に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。
【請求項５６】
前記第１のペプチドが配列番号３〜配列番号２６のうちの１つ若しくは複数、又は配列番号６４〜配列番号６８のうちの１つ若しくは複数で示される配列を含むか又はそれらからなる、請求項５５に記載のキメラタンパク質又は融合タンパク質。