【事件の表示】
　特願２０１４−　２３３２０「アッセイ装置、方法、および試薬」拒絶査定不服審判事件〔平成２６年　７月１０日出願公開、特開２０１４−１３０１５１〕について、次のとおり審決する。
【結　論】
　本件審判の請求は、成り立たない。
【理　由】
第１　手続の経緯  
　本願は、平成２１年４月１０日に国際出願した特願２０１１−５０４００４号（パリ条約による優先権主張：平成２０年４月１１日　米国）の一部を、平２６年２月１０日に新たな特許出願としたものであって、同年１０月２日付けで拒絶理由が通知され、平成２７年２月１０日に意見書及び手続補正書が提出され、同年２月２３日付けで拒絶査定がなされ、これに対し、同年７月３日に拒絶査定不服審判の請求がなされ、それと同時に手続補正書が提出されたものである。
第２　平成２７年７月３日にされた手続補正（以下「本件補正」という。）についての補正の却下の決定 
 ［補正の却下の決定の結論］  
　本件補正を却下する。  
 　  
 ［理由］  
１　本件補正について
　本件補正は、本件補正前の請求項１を、請求項１として、以下のように補正することを含むものである。（下線は補正箇所を示す。） 
 「　　【請求項１】
　マルチウェルプレートにおいてアッセイを実施するための方法であって、ここで前記方法は、（ａ）光検出サブシステム；（ｂ）液体操作サブシステム；（ｃ）プレート操作サブシステム、およびソフトウェアのスケジューラーへと動作可能に接続されたコンピュータを含有する装置を用い、
　前記方法が、前記マルチウェルプレートの個々のウェルにおいて実施される以下のステップ：
　（ｉ）期間ｎを含有するサンプル添加フェーズの間に前記個々のウェルに対してサンプルを添加するステップ；
　（ｉｉ）期間ｍを含有する放置フェーズの間に前記個々のウェル中に前記サンプルを放置するステップ；
　（ｉｉｉ）期間ｐを含有する試薬添加フェーズの間に前記個々のウェルへと試薬を添加するステップ；ならびに
　（ｉｖ）前記ソフトウェアのスケジューラーによって前記マルチウェルプレートの個々のウェルに対するステップ（ｉ）〜
（ｉｉｉ）
を含有するコンピュータを実装した連続交互プロセスを含有し、
ここでステップ（ｉ）が、サンプルを添加するステップの前に前記個々のウェルのシールを穴開けするステップをさらに含有し、
ここで前記マルチウェルプレートの第一のウェルがステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）へと供され、そして前記第一のウェルの少なくともステップ（ｉ）が完了したのちに前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が繰り返され、かつ
期間ｎ、ｍもしくはｐの一つもしくはそれ以上が、前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上のウェルにおいて、前記ソフトウェアのスケジューラーによって調整できる、方法。」 
 　  
　請求項１についての上記補正は、本件補正前の「
ステップ（ｉ）
サンプルを添加するステップの前に前記個々のウェルのシールを穴開けするステップをさらに含有
　そこで、本件補正後の請求項１に係る発明（以下「補正発明」という。）が特許出願の際に独立して特許を受けることができるものであるか（同法第１７条の２第６項において準用する同法第１２６条第７項の規定に違反しない否か）、いわゆる独立特許要件について以下に検討する。 
 　 
２　独立特許要件についての検討 
（１）引用例について  
ア　引用例１（米国特許出願公開第２００７／０２３１２１７号明細書）の記載事項  
　原査定の拒絶の理由に引用され、本願の優先日前に頒布された引用例１には、アッセイ装置、方法および試薬について、次の事項が記載されている。なお、下記イの引用発明の記載に関連する箇所に下線を付与した。  
（ア）「[0014] A method is provided of using the apparatuses comprising seal removal tools (described above), 
the method comprising removing a seal from a well of a multi-well plate
The method may further include one or more of: pipetting a sample into the well, pipetting an assay reagent into the well
Additionally, the method may further comprise repeating some portion or all of the process described above on one or more additional wells of the plate.
（当審訳：[0014]シール除去ツール（上述のような）を含有する装置を用いる方法が提供され、
該方法は、マルチウェルプレートのウェルからシールを除去すること
を含有している
サンプルをウェルへピペッティングすること、アッセイ試薬をウェルへピペッティングすること
含有することができる。
プレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェル上にて上記の工程の一部、もしくは全部を繰り返すステップをさらに含有することができる
 　 
（イ）「[0022] An apparatus is provided for 
conducting luminescence assays in multi-well plates
  
 [0023] The apparatus may also comprise a light detector which may be mounted within the light-tight enclosure or, alternatively, it may be mounted to a detection aperture on the enclosure top (e.g., via a light-tight connector or baffle). In certain embodiments, the light detector is an imaging light detector such as a CCD camera and may also include a lens. The apparatus may also comprise pipetting systems, seal piercing systems, reagent and waste storage containers, tube holders for sample or reagent tubes, fluidic stations for delivering/removing samples/regeants/waste, etc. These components may be conventional components such as components known in the art. Alternatively, the apparatus may employ specific components as described herein. Furthermore, 
the apparatus may comprise computers
for controlling operation the apparatus including, e.g., operating motorized mechanical systems,
  
 [0024] Another embodiment of an apparatus for conducting luminescence assays in multi-well plates comprises a light-tight enclosure comprising i) one or more plate elevators having plate lifting platforms that can be raised and lowered, ii) a light-tight enclosure top having one or more plate introduction apertures positioned above the plate elevators and a detection aperture, the enclosure top comprising a sliding light-tight door for sealing the plate introduction apertures, and iii) a plate translation stage for translating a plate in one or more horizontal directions. The plate translation stage comprises a plate holder for supporting the plate which has an opening under the plate to allow plate elevators positioned below the plate holder to access and lift the plate. Furthermore, the plate translation stage being configured to position plates below the detection aperture and to position the plates above the plate elevators.  
 」（第３頁左欄〜右欄） 
（当審訳：[0022]
マルチウェルプレートにおいて発光アッセイを実施する
 [0023]装置はまた、遮光性筐体内に備え付けられ得る光検出器を含むことができる。あるいは代替的に、光検出器は筐体頂部上の検出開口に（たとえば、遮光コネクタもしくは遮光バッフルを介して）取り付けられてもよい。ある実施形態において、光検出器はＣＣＤカメラのようなイメージング光検出器であり、レンズをもまた含んでいてもよい。装置はまた、ピペッティングシステム、シール貫通システム、試薬および廃液貯蔵コンテナ、サンプル管もしくは試薬管のための試験管ホルダ、サンプル／試薬／廃液を配送／除去するための流体ステーションなどを備えていてもよい。これらの構成要素は、この分野で知られている構成要素のような従来用られている構成要素であり得る。代替的に、本明細書に記載されているような特定の構成要素を用いることもできる。さらに、
装置は、たとえば、モーター駆動の機械システムを操作したり
することを含む装置の操作制御のために、コンピュータ
を含有し得る。
 　 
 [0024]マルチウェルプレートにおいて発光アッセイを実施するための装置の他の実施形態は、ｉ）上昇と下降のできるプレートリフティングプラットフォームを具備する一つ又はそれ以上のプレートエレベータ、ii）プレートエレベータの上に位置する一つ又はそれ以上のプレート導入開口と検出開口を含む遮光性筐体頂部であって、プレート導入開口をシールするためのスライド式の遮光ドアを備える遮光性筐体頂部、ならびにiii）一つ又はそれ以上の水平方向へとプレートを移動するためのプレート移動ステージ、を含む遮光性筐体を含有する。プレート移動ステージは、プレートホルダーの下に位置するプレートエレベータがプレートに接近して持ち上げることができるようにするために、プレートの下に開口を有する、プレートを支持するためのプレートホルダーを備える。さらにプレート移動ステージは、検出開口の下にプレートを配置し、そしてプレートエレベータ上にプレートを配置するように設定されている。）　 
（ウ）「[0031] Where the apparatus comprises a pipetting probe, and the enclosure top and sliding door includes pipetting apertures, the method may further comprise: sliding the sliding light-tight door to the pipetting position and using the pipetting probe to introduce and/or remove reagent and/or sample from one or more wells of the plate. Where the apparatus comprises a seal piercing probe, and the enclosure top and sliding door includes piercing apertures, the method may further comprise: sliding the sliding light-tight door to the piercing position, aligning a well of the plate under the piercing probe, and piercing a seal on the well. They may be repeated to seal additional wells of the plate.
 In one embodiment, a seal on a well of a plate is pierced with the seal piercing tool prior to being accessed by a pipetting probe.
（当審訳： [0031]　装置がピペッティングプローブを備え、筐体頂部およびスライド式ドアがピペッティング開口を含むところで、方法は、ピペッティングポジションまでスライド式遮光ドアをスライドするステップと、プレートの一つもしくはそれ以上のウェルから試薬および／もしくはサンプルを導入するかならびに／またはそこから取り除くためにピペッティングプローブを使用するステップを、さらに含有しても良い。装置がシール貫通プローブを備え、筐体頂部とスライド式ドアが貫通開口を含むところで、方法は、貫通ポジションまでスライド式遮光ドアを移動するステップと貫通プローブの下にプレートのウェルを並べるステップならびにシール上のシールを貫通するステップを、さらに含有しても良い。それらはプレートの追加のウェルをシールするのに繰り返しても良い。一つの実施形態において、
プレートのウェルのシールはピペッティングプローブによって接近されるのに先立ってシール貫通ツールによって貫通される。
（エ）「[0066] The apparatuses, systems, method, reagents, and kits may be used for conducting assays on environmental samples. 
They may be particularly well-suited for conducting automated sampling, sample preparation, and analysis in the multi-well plate assay format.
（当審訳：[0066]  装置、システム、方法、試薬、キットは環境サンプルにおけるアッセイを実施するためにも用いられても良い。それらは、
自動化したサンプリング、サンプル調整、およびマルチウェルプレートアッセイフォーマットにおける分析を実施するのに特によく適しているであろう。
（オ）「[0084]In one embodiment, 
the biological agent detection module has an integrated pipettor and a fluidic manifold for receiving samples and buffers, and distributing them to the wells of a plate. According to one preferred embodiment, the module allows to induce and measure ECL from only one well at a time.
 　 
 [0085]One example of the analyte detection module, picture in FIG. 1 , demonstrates the arrangement in a compact instrument of a mechanical system for storing and moving plates, a light detector for measuring luminescence (including ECL), a fluidic interface and pipetting system for 
transferring samples to the plates
（当審訳：[0084]一つの実施形態では、
生物剤検出モジュールは、サンプルおよびバッファーを受容し、プレートのウェルへそれらを分注するための集積ピペッターおよび流体マニホールドを有する。一つの好ましい実施形態において、モジュールは、１回に一つのウェルのみからＥＣＬを誘発して測定することができるようにする。
 　 
 [0085]アナライト検出モジュールの一つの例である、図１に示される図面は、プレートを貯蔵し移動するための機械的システム、発光（ＥＣＬを含む）を測定するための光検出器、
サンプルをプレートに移す
 　 
（カ）「[0086] According to one embodiment, 
the analyte detection module has three subsystems: (1) light detection, (2) liquid handling, and (3) plate handling.
（当審訳：[0086]一つの実施形態では、
アナライト検出モジュールは、（１）光検出、（２）液体操作、及び（３）プレート操作の三つのサブシステムを有する
 　 
（キ）「[0087] 
A method is also provided for conducting assays for biological agents
The method may also include contacting the assay composition with one or more detection reagents capable of specifically binding with the analytes of interest.
Suitable assay methods include sandwich
binding assays format
（当審訳：[0087]それに限定されないが生物兵器剤を含む、
生物剤のためのアッセイを実施する方法
方法はまた、アッセイ組成物を関心のあるアナライトと特異的に結合可能な一つもしくはそれ以上の検出試薬と接触させるステップを含有しても良い
適切なアッセイ方法は、サンドイッチ結合アッセイ
を含む
 　 
（ク）「[0090]Analytes may be detected using electrochemiluminescence-based assay formats. Electrochemiluminescence measurements are preferably carried out using binding reagents immobilized or otherwise collected on an electrode surface. Especially preferred electrodes include screen-printed carbon ink electrodes which may be patterned on the bottom of specially designed cartridges and/or multi-well plates (e.g., 24-, 96-, 384- etc. well plates). Electrochemiluminescence from ECL labels on the surface of the carbon electrodes is induced and measured using an imaging plate reader as described in copending U.S. application Ser. Nos. 10/185,274 and 10/185,363 (both entitled “Assay Plates, Reader Systems and Methods for Luminescence Test Measurements”, filed on Jun. 28, 2002, hereby incorporated by reference). Analogous plates and plate readers are now commercially available (MULTI-SPOT# and MULTI-ARRAYTM plates and SECTOR# instruments, Meso Scale Discovery, a division of Meso Scale Diagnostics, LLC, Gaithersburg, Md.).  
 　 
 [0091]In one embodiment, 
antibodies that are immobilized on the electrodes within the plates may be used to detect the selected biological agent in a sandwich immunoassay format.
each well contains
in dry form labeled detection antibodies
（当審訳：[0090]アナライトは、電気化学発光に基づいたアッセイフォーマットを用いて検出できる。電気化学発光測定は、好ましくは、電極表面に固定されるかさもなくば集められた結合試薬を用いて実施される。特に好ましい電極は、特別に設計されたカートリッジ及び／又はマルチウェルプレート（たとえば２４−、９６−、３８４−などのウェルプレート）の底部にパターン化されていてよいスクリーン印刷されたカーボンインク電極を含む。カーボン電極の表面上におけるＥＣＬ標識からの電気化学発光は誘発されて、同時継続出願の米国特許出願第１０／１８５，２７４号および米国特許出願第１０／１８５，３６３号（どちらも「発光試験測定のためのアッセイプレート、リーダーシステムおよび方法」と題され、２００２年６月２８日に出願された。引用によって本明細書に含まれる）に記載されるようなイメージングプレートリーダーによって測定される。今日では、類似のプレートおよびプレートリーダーが市販されている（ＭＵＬＴＩ−ＳＰＯＴ（登録商標）およびＭＵＬＴＩ−ＡＲＲＡＹ(登録商標）プレート、Meso Scale Discovery, a division of Meso Scale Diagnostics, LLC, Gaithersburg, Md.） 
 　 
 [0091]一つの実施形態では、
プレート内の電極に固定された抗体は、サンドイッチイムノアッセイフォーマットにおいて、選択された生物剤を検出するために用いることができる。
乾燥形態で、標識された検出抗体
を含む
 　 
（ケ）「[0099]In one embodiment, 
the plate has an immobilized array of binding reagents (e.g., antibodies or nucleic acids) and bioagents in the sample bind to the corresponding immobilized reagent and a corresponding labeled detection reagent to form a sandwich complex.
after addition of an ECL read buffer
（当審訳：[0099]一つの実施形態において、
プレートは、結合試薬（たとえば、抗体もしくは核酸）の固定されたアレイを有し、サンプル中の生物剤は対応する固定された試薬および対応する標識された検出試薬とに結合し、サンドイッチ複合体を形成する。
ＥＣＬ読み取りバッファーの添加後
 　 
 イ　引用例１に記載の発明  
（ア）引用例１には、サンプルをウェルへピペッティングすること、アッセイ試薬をウェルへピペッティングすることを含む方法であること、ピペッティングされたサンプルや試薬はマルチウェルプレートのウェルに対して添加されることが記載されている（上記ア（ア）、（オ）参照。）
（イ）そして、実行されるアッセイとして、マルチウェルプレートのウェルの底部に設けられた作用電極に固定された捕捉抗体と、乾燥形態でウェル内に含まれた標識された検出抗体と、該ウェルに添加されたサンプル中の生物剤すなわちアナライトとの間でサンドイッチ複合体を形成し、ＥＣＬ（電気化学発光）読み取りバッファー試薬を加えた後、電圧を作用電極に印加することで、電極上の標識がＥＣＬを放出するよう誘発され、ＣＣＤカメラなどで光検出する、ＥＣＬ測定を用いたサンドイッチイムノアッセイが記載されている（上記ア（カ）〜（ケ）参照）。 
 　 
（ウ）サンドイッチイムノアッセイにおいて、サンプルの添加により捕捉抗体および標識検出試薬とサンプルが接触して抗原抗体反応が開始され、サンドイッチ複合体が充分に形成されるためには、捕捉抗体や標識検出試薬が入ったウェル等に対してサンプルを添加するのに要する時間と比べて、相当に長い時間をいわゆるインキュベーションする期間を必要とすることは、技術常識であるから、引用例１に記載されたＥＣＬ測定を用いたサンドイッチイムノアッセイを用いる方法において、ウェルにサンプルを添加した後に、同ウェルにＥＣＬ（電気化学発光）読み取りバッファー試薬を添加するまでの間には、当然、同ウェル中に前記サンプルをインキュベーションする期間が存在することは明らかである。してみれば、それぞれの操作段階をステップと称すれば、ウェルにサンプルを添加するステップ、同ウェルにＥＣＬ（電気化学発光）読み取りバッファー試薬を添加するステップの間には、同ウェル中に前記サンプルをインキュベーションするステップが存在するものである。 
 　 
（エ）さらに、マルチウェルプレートでは個々のウェルに対してアッセイを連続して実施するものであり、引用例１に記載されたＥＣＬ測定を用いたサンドイッチイムノアッセイを用いる方法において、上記ア（ア）に「プレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェル上にて上記の工程の一部、もしくは全部を繰り返すステップをさらに含有する」と記載されているように、個々のウェル対して、上記（ウ）の各ステップである、ウェルにサンプルを添加するステップ、同ウェル中に前記サンプルをインキュベーションするステップ、同ウェルにＥＣＬ（電気化学発光）読み取りバッファー試薬を添加するステップを繰り返すものといえる。そして、マルチウェルプレートのウェルのうち、最初に（第一に）上記各ステップに供されるウェルは「第一のウェル」といえるものである。 
 　 
（オ）上記（ア）〜（エ）を踏まえ、ア（ア）〜（ケ）を含む引用例１全体の記載を総合すると、引用例１には、次の発明が記載されていると認められる。  
「マルチウェルプレートにおいて自動化したアッセイを実施するための方法であって、（１）光検出、（２）液体操作、及び（３）プレート操作の三つのサブシステム及び操作制御のためのコンピュータを有する装置を用い、
　アッセイが、前記マルチウェルプレートのウェル内に作用電極上に固定された捕捉抗体と乾燥形態の標識検出抗体を含むマルチウェルプレートを用いるＥＣＬ測定を用いたサンドイッチイムノアッセイであって、 
 　前記方法が、前記マルチウェルプレートの個々のウェルに対して連続して実施される以下のステップ：
 （ｉ）前記個々のウェルに対してサンプルを添加するステップ； 
 （ｉｉ）前記個々のウェル中に前記サンプルをインキュベーションするステップ；ならびに 
 （ｉｉｉ）前記個々のウェルへとＥＣＬ読み取りバッファー試薬を添加するステップ 
　を含有し、 
　前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が繰り返され、
　ここで前記マルチウェルプレートの第一のウェルが最初にステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）へと供され、そしてプレートのウェルのシールはピペッティングプローブによって接近されるのに先立ってシール貫通ツールによって貫通される方法。」（以下、「引用発明」という。） 
 　 
ウ　引用例２（特開平６−１９４３１５号公報）  
　同じく、原査定の拒絶の理由に引用され、本願優先日前に頒布された引用例２には、連続滴定発光測定装置について、次の事項が図面の記載とともに記載されている。  
（ア）「【０００１】 
【産業上の利用分野】本発明は連続滴定装置に係り特に多数の滴定容器を縦横に配列したマルチウェルプレ−トに対し、遂次連続的に試薬を注入し、滴定容器内サンプルの発光を測定することにより、例えば、生物発光・化学発光の基礎研究とか生細胞の活性度の研究、臨床検査（イムノアッセイ）、食品中の細菌数測定に用いて便な連続滴定装置に係る。
 　 
（イ）「【０００２】 
【従来の技術】滴定容器を多数縦横に配列したマルチウェルプレ−トの各滴定容器に対し、僅か乍ら性質の異なるサンプルを入れ、各滴定容器の発光を測定して解析する発光計測研究装置は従来から存在していたが、これらはサンプルを入れた各滴定容器に対し、発光源物質生成試薬分注、該サンプル及び発光源物質生成試薬のインキュベ−ション、発光試薬注入、発光測定及び発光停止試薬注入の５つの動作をこの順に所定時間ずつ行うものである。然し、滴定容器の数は一般に２４ケとか４８ケとか９６ケとあり自動化がなされていたとしてもこの全作業時間は甚大なものであった。 
【０００３】 
【発明を解決しようとする課題】このような連続滴定装置はもち論作業は自動的になされるものが普通であるが、全作業時間が長大化することにより、１日に計測出来るサンプルの数が少なくなると共に、サンプルに経時変化が起きて、デ−タに誤差が生じることもある。そこで本発明により、上述作業時間を短縮しようとするものである。」 
 　 
（ウ）「【０００４】 
【課題を解決するための手段及び作用】本発明によれば、上記５つの作業の中、最も時間のかかる作業が発光源物質生成試薬を注入してから容器の恒温化を尚持続せしめなければならないと云うインキュベ−ション行程にある点と、発光試薬注入、発光測定及び発光停止試薬注入作業は一連でなくてはならない点とに着目し、このインキュベ−ションの手前の作業とインキュベ−ションの後に行う作業とを分断し、夫々の作業が時間的に並行して他の容器に対しても行なえる様にした。」　 
 　 
（エ）「【００１０】ここで１つの滴定容器における滴定による発光測定をその段階順に説明すると、先づヒ−タ１１によりマルチウェルプレ−トを全体的に予熱しておきサンプルの入れた滴定容器の１つに先づ分注ノズル１から混合発光源物質生成試薬を注入する。一般にこの種試薬は注入の都度２つの試薬を正確に混合したものを分注するので図面には２つのボトル７、８を示してある。尚試薬Ｂは比較的大量であるので、補助加熱ユニット１３により加熱してからＡＢ混合ユニット１２に導く。又、ボトルから試薬Ａ、Ｂの汲上げはペリスタルティックポンプ又は、チュ−ブポンプ１４、１５とにより成される。 
【００１１】このように発光源物質生成試薬Ａ、Ｂの入れられた滴定容器に対し次の段階としてインキュベ−ションがある。このインキュベ−ションは前記予熱を引継ぎ当該滴定容器を恒温加熱したままにしておく事を意味するが、全段階の中、比較的長時間要する。第３段階目としてこの一定インキュベ−ション時間の終わった滴定容器に発光試薬Ｃを発光試薬注入ノズル２により注入する。この場合ジェット注入して攪拌する事が望ましいのでシリンジユニット１６を介して注入する。これに依り当該滴定容器内のサンプルは発光を始める。 
【００１２】この発光により生ずるフォトン数を一定時間で測定するのが第４段階目である。これはノズル２の近傍に１体に配置したレンズユニット４により発光を取り出し、光ファイバ１７を介して受光素子４に導き、この信号出力を数値電気信号に電子回路１８により変換し、コンピュ−タ１９で処理をすると共にその結果をディスプレイ２０に表示し、解析、研究に役立てる。 
【００１３】発光しているサンプルはその隣接滴定容器に光が漏れたり、次の測光操作に悪影響を与えない様に当該滴定容器の測光が終わったら直ちに発光を停止させる。この段階を発光停止試薬Ｄ注入と称し、発光停止試薬Ｄ用のボトル１０よりペリスタルティックポンプ２１を介し上記測光組立体に配設した発光停止試薬ノズル３より当該滴定容器に注入することによりなされる。」 
 　 
（オ）「【００１６】図３に本発明により多数の滴定容器の中、Ａ１、Ｂ１、Ｃ１に対し、なされる段階のタイムチャ−トを示す。先づ発光源物質生成試薬分注ノズル１は滴定容器Ａ１の上に駆動され試薬を注入すると共にインキュベ−ションが開始される。次に分注ノズル１は滴定容器Ｂ１のインキュベ−ションを開始せしめ、引続いて滴定容器Ｃ１へと進み、当該滴定容器Ｃ１のインキュベ−ションを開始せしめる。以下同様にして駆動装置による滴定容器の動作順序即ち行程は図３の各滴定容器間を結ぶ矢線で示す。 
【００１７】この間に滴定容器Ａ１のインキュベ−ションが完了し、発光試薬Ｃがそのノズル２より注入させられこれと共にレンズユニット４によりその発光の計測が進められる。この計測はノズル２よりの注入開始後の一定時間続きこの計測時間内のフォトンの数を計数する。この一定時間後には、発光停止試薬Ｄがノズル３より注入されその後直ちにマルチウェルプレ−ト駆動装置が動作し測光組立体の真下に滴定容器Ｂ１が来て前記と同じ作業段階をなし、この作業の完了と共に滴定容器Ｃ１が移動する。 
【００１８】これを総体的に見ると発光源物質生成試薬分注ノズルは、インキュベ−ション時間終了を待たずに他の滴定容器へと次々と移行し、インキュベ−ション時間を終わった順に測光組立体が発光源物質生成試薬分注ノズルを追いかける様な動作をなす。 
【００１９】この動作は２つのＸ−Ｙ駆動装置をタイミングを取りながら駆動し、更に各ポンプの作動、受光素子のシャッタ開閉等のタイミングをとった作動を伴ったものになるがこの動作はコンピュ−タを主体とする電子制御回路２１により容易になされる。」 
 　 
（カ）そして、以下の図３には、上記記載に対応して、マルチウェルプレ−トのウェルである滴定容器Ａ１、Ｂ１、Ｃ１に対する連続滴定操作のタイムチャ−トが示され、まず滴定容器Ａ１に発光源物質生成試薬（Ａ，Ｂ薬）を分注ノズル１が注入すると共にインキュベ−ションが開始されて測定手順が開始され、滴定容器Ａ１のＡ，Ｂ試薬の注入が完了した後のそのインキュベ−ション期間中で、さらなる別のＣ薬の滴定容器Ａ１への注入が完了する前に、分注ノズル１が滴定容器Ｂ１へＡ，Ｂ薬の注入を行って、滴定容器Ｂ１の測定手順が順次開始されるタイムスケジュールが記載されている。 
【図３】 
 
 　 
（２）補正発明と引用発明との対比・判断  
ア　対比
（ア）引用発明の「マルチウェルプレートにおいて自動化したアッセイを実施するための方法」は、補正発明の「マルチウェルプレートにおいてアッセイを実施するための方法」に相当する。
 
（イ）引用発明の「（１）光検出、（２）液体操作、及び（３）プレート操作の三つのサブシステム」は、補正発明の「（ａ）光検出サブシステム；（ｂ）液体操作サブシステム；（ｃ）プレート操作サブシステム」に相当する。
（ウ）引用発明の（ｉ）〜（ｉｉｉ）の各ステップを実行するにあたり、それぞれ所定の期間を要することは明らかである。また、引用発明の「インキュベ−ション」とは、抗原抗体反応が開始されサンドイッチ複合体が形成されていく保持過程であり、これは「放置」過程ともいえるものである。また、引用発明の「ＥＣＬ読み取りバッファー試薬」は、補正発明の「試薬」に相当する。
　そして、補正発明の「サンプル添加フェーズ」、「放置フェーズ」、「試薬添加フェーズ」について、本願明細書の段落【００８０】の記載を参照するに、それぞれの「フェーズ」は、ウェルに対してサンプルを添加するステップ、ウェル中に前記サンプルを放置するステップ、ウェルへ試薬を添加するステップの実行に要する期間のことを意味するものとして用いており、それぞれの期間を表す「期間ｎ」、「期間ｍ」、「期間ｐ」という記載も、各々が互いに異なる期間であることを意味する程度と解される。
　また、引用発明の「プレートのウェルのシールはピペッティングプローブによって接近されるのに先立ってシール貫通ツールによって貫通される」という動作について、「ピペッティングプローブ」は、サンプルの添加に使われるものであり、シールを貫通、つまりシールに穴を空けた状態でサンプルが添加されなければならないことは自明であるから、引用発明の上記工程は、（ｉ）のステップのウェルに対するサンプルの添加に先だって行われるものである。
　してみると、引用発明の「プレートのウェルのシールはピペッティングプローブによって接近されるのに先立ってシール貫通ツールによって貫通される」ことを含めた「（ｉ）前記個々のウェルに対してサンプルを添加するステップ」、「（ｉｉ）前記個々のウェル中に前記サンプルをインキュベーションするステップ」、及び「（ｉｉｉ）前記個々のウェルへとＥＣＬ読み取りバッファー試薬を添加するステップ」は、それぞれ、補正発明における「サンプルを添加するステップの前に前記個々のウェルのシールを穴開けするステップをさらに含有」する「（ｉ）期間ｎを含有するサンプル添加フェーズの間に前記個々のウェルに対してサンプルを添加するステップ」、「（ｉｉ）期間ｍを含有する放置フェーズの間に前記個々のウェル中に前記サンプルを放置するステップ」、及び「（ｉｉｉ）期間ｐを含有する試薬添加フェーズの間に前記個々のウェルへと試薬を添加するステップ」に相当する。 
（エ）引用発明において、（ｉ）〜（ｉｉｉ）の各ステップが「操作制御のためのコンピュータ」により実行されることは明らかである。また、「アッセイ」は「自動化」されているから、コンピュータに自動化に必要なソフトウェアのスケジューラーが実装、動作可能とされていることは自明である。そして（ウ）で説示した相当関係を踏まえると、引用発明の「操作制御のためのコンピュータ」は、補正発明の「ソフトウェアのスケジューラーへと動作可能に接続されたコンピュータ」に相当する。また、引用発明の（ｉ）〜（ｉｉｉ）の各ステップが「操作制御のためのコンピュータ」により実行されることと、補正発明の「コンピュータを実装した連続交互プロセス」とは、「コンピュータを実装したプロセス」で共通する。
（オ）したがって、補正発明と引用発明とは、次の一致点で一致し、次の相違点において相違する：
 （一致点）  
「マルチウェルプレートにおいてアッセイを実施するための方法であって、（ａ）光検出サブシステム；（ｂ）液体操作サブシステム；および（ｃ）プレート操作サブシステム、ソフトウェアのスケジューラーへと動作可能に接続されたコンピュータを含有する装置を用い、 
　前記方法が、前記マルチウェルプレートの個々のウェルに対して連続して実施される以下のステップ： 
　（ｉ）期間ｎを含有するサンプル添加フェーズの間に前記個々のウェルに対してサンプルを添加するステップ； 
　（ｉｉ）期間ｍを含有する放置フェーズの間に前記個々のウェル中に前記サンプルを放置するステップ；ならびに 
　（ｉｉｉ）期間ｐを含有する試薬添加フェーズの間に前記個々のウェルへと試薬を添加するステップ 
　を含有するコンピュータを実装したプロセスを含有し、 
　ここでステップ（ｉ）が、サンプルを添加するステップの前に前記個々のウェルのシールを穴開けするステップをさらに含有し
　ここで前記マルチウェルプレートの第一のウェルがステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）へと供され、そして前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が繰り返される、
方法。」 
 　 
（相違点） 
相違点１：マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が繰り返されることが、補正発明では「前記第一のウェルのステップ（ｉ）が完了したのちに」と特定されているのに対し、引用発明では、そのようには特定されていない点。
相違点２：コンピュータを実装したプロセスが、補正発明では、「連続交互プロセス」であるのに対して、引用発明は、そのように特定されていない点。
相違点３：補正発明が、「前記ソフトウェアのスケジューラーによって前記マルチウェルプレートの個々のウェルに対するステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）の状態をトラックするステップ」を備えているのに対して、引用発明は、スケジューラーがマルチウェルプレートの個々のウェルに対するステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）の状態をトラックするか否か不明であって、そのようなステップを備えることが特定されていない点。
相違点４：補正発明が、「期間ｎ、ｍもしくはｐの一つもしくはそれ以上が、前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上のウェルにおいて、前記ソフトウェアのスケジューラーによって調整できる」のに対して、引用発明は、各ステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）の期間が調整できることが特定されていない点。
 　 
イ　相違点についての検討 
（ア）相違点１について
ａ　マルチウェルプレートのウェルにおいてイムノアッセイ等を実施する場合（上記（１）ウ（ア）参照。）で、ウェルに対する複数の分注ステップを含むステップを所定の手順で順次、連続して行う場合の全作業時間を短縮するために、サンプルを入れた滴定容器Ａ１（引用発明の「第一のウェル」に相当）に試薬（Ａ，Ｂ薬）を添加するステップを行ってイムノアッセイのための処理を開始し、その後インキュベーション期間経過後に、さらに所定のステップを順次行ってイムノアッセイする際、前記第一のウェルへの添加ステップの後の、ウェル内でのサンプルと試薬（Ａ，Ｂ薬）との反応のためのインキュベーション期間の間に、前記マルチウェルプレートの一つの追加のウェルである滴定容器Ｂ１に試薬（Ａ，Ｂ薬）を添加するステップを行って、イムノアッセイのための処理を開始し、マルチウェルプレートにおけるイムノアッセイの全作業時間を短縮して、単位時間当たりの処理能力、いわゆるスループットを高めることができることが、引用例２に記載されている（上記（１）ウ（イ）〜（カ）参照。）。 
 　 
ｂ　引用発明では、マルチウェルプレートのウェルに捕捉抗体と乾燥形態の標識検出試薬を含むことから、サンドイッチイムノアッセイの開始は、引用例２に記載のように試薬のウェルへの添加ステップではなく、サンプルをウェルへ添加するステップによって開始されるものであるが、引用発明と引用例２記載の事項とは、イムノアッセイの反応開始に必要な液体（引用発明：サンプル、引用例２：試薬）を最初にマルチウェルプレートのウェルへ添加するステップ後に、ウェル内でのサンプルと試薬との反応のために長い放置（インキュベーション）時間を要する点で共通するものである。 
 　 
ｃ　そして、イムノアッセイにおける全作業時間を短縮させるという課題は、イムノアッセイ全般の一般的な技術課題に過ぎず、引用発明も当然その課題を内在しているといえることから、引用例２に記載されている、マルチウェルプレートの第一のウェルに反応開始に必要な液体を添加するステップを行ってイムノアッセイの処理を開始し、その第一のウェルでのインキュベーション期間に、前記マルチウェルプレートの一つの追加のウェルに反応開始に必要な液体を添加するステップを行ってイムノアッセイの処理を開始し、マルチウェルプレートにおけるイムノアッセイの全作業時間を短縮することを、引用発明に適用することは当業者が容易になし得たことである。すなわち、上記第一のウェルでのインキュベーション期間とは、引用発明における「第一のウェル」に対する「（ｉｉ）期間ｍを含有する放置フェーズの間に前記個々のウェル中に前記サンプルを放置するステップ」に対応する期間であり、「ステップ（ｉ）」が完了した後であるから、引用発明において、「前記第一のウェルの上記ステップ（ｉ）が完了したのちに前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）繰り返され」るようにすることは、当業者が容易になし得たことである。 
（イ）相違点２について
　補正発明における「連続交互プロセス」とは、本願明細書に「このようなアプローチの一実施態様は連続交互プロセスであり、動作が個々のウェルにおいて取られるときの異なるフェーズのために交互の期間を割り当てる（例えば、上述期間ｎおよびｐはフェーズ（ａ）および（ｃ）中である）。」（【００８４】）と記載されている。
　一方、上記（ア）での検討したように、引用発明に引用例２に記載された技術事項を適用することは当業者が容易になし得たことであり、そうすると、引用例２に記載された技術事項を適用した引用発明は、 「第一のウェル」に対するステップ（ｉｉ）中に「前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいて、」少なくともステップ（ｉ）を行い、その後で、「第一のウェル」に対するステップ（ｉｉｉ）を行う、つまり「連続交互プロセス」を含有することになる。
 　 
　なお、請求人は、平成２８年２月１９日付けの上申書において「引用文献１〜２には、「連続交互プロセス」を用いてアッセイを実施することについては示唆も教示もありません。「連続交互プロセス」は例えば図１８（段落００８４〜００８６）などに記載されるように、１のプロセスの休止期間（ピペットを使用していない期間）に他のプロセスを実施するようなものであり、スループットを向上するという効果があります。」と主張している。しかし、引用例２に記載された方法では、Ａ，Ｂ薬分注とＣ薬分注とが独立して移動できる別の分注プローブを用いて行われている（上記（２）ウ（オ）参照。）ので、図３のようなタイムスケジュールを採用しているに過ぎず、引用例１に記載の装置のような単一のピペティングプローブを用いた装置を利用する場合において、異なるウェルに異なる試薬を同時に分注しないような分注スケジュールとすることは技術的に明らかである。
　よって、請求人の上記主張は採用できない。
（ウ）相違点３について
　本願発明の「トラック」について、本願明細書に「ソフトウェアのスケジューラーは、装置によって単一のプレート上で実施される全てのアッセイの状態を常にトラックする。」（【００８４】）と記載されている。
　一方、引用発明は「アッセイ」を「自動化し」て「実施する」ものであるから、各ステップが順に行われたことをソフトウェアのスケジューラーが把握できなければ、あるステップが完了しないまま次のステップに進むという不具合が生じ得るのは明らかであって、各ステップを確実に行うために、各ステップの状態をトラックしなければならないから、引用発明においても、各ステップを実行するためのソフトウェアのスケジューラーによって、各ステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）の状態をトラックすることは当業者が適宜なし得る設計的事項にすぎない。
（エ）相違点４について
　分析装置に各工程の時間を調整することは、本願優先日前において従来周知の技術（例えば、特開２００４−３１７３２１号公報の段落【００２２】や特開２００２−４８７５５号公報の段落【００２２】、特開平８−２７８３１０号の【０００６】、【００１０】等を参照されたい。）であり、分析内容によって、工程の時間が異なることは技術常識であることを踏まえると、引用発明において、アッセイ内容に応じて、スケジューラーで各工程の時間を調整することは当業者が適宜なし得ることにすぎない。
ウ　補正発明の効果について
　補正発明の効果は、引用例１及び２に記載の事項、並び周知技術から、当業者が予測し得る程度のものである。
（３）小括  
　以上のとおり、補正発明は、引用発明、引用例２の記載事項、及び周知技術に基づいて、当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許出願の際独立して特許を受けることができないものである。  
 　 
３　まとめ  
　したがって、本件補正は、特許法第１７条の２第６項において準用する同法第１２６条第７項の規定に違反するものであり、同法第１５９条第１項で読み替えて準用する第５３条第１項の規定により却下されるべきものである。  
  
第３　本願発明について  
１　本願発明  
　本件補正は上記のとおり却下されたので、本願の請求項１ないし１０に係る発明は、平成２７年２月１０日付け手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１ないし１０に記載された事項により特定されるものであって、その請求項１は以下のとおりのものである（以下「本願発明」という。）。 　  
「【請求項１】 
　マルチウェルプレートにおいてアッセイを実施するための方法であって、ここで前記方法は、（ａ）光検出サブシステム；（ｂ）液体操作サブシステム；（ｃ）プレート操作サブシステム、およびソフトウェアのスケジューラーへと動作可能に接続されたコンピュータを含有する装置を用い、
　前記方法が、前記マルチウェルプレートの個々のウェルにおいて実施される以下のステップ：
　（ｉ）期間ｎを含有するサンプル添加フェーズの間に前記個々のウェルに対してサンプルを添加するステップ；
　（ｉｉ）期間ｍを含有する放置フェーズの間に前記個々のウェル中に前記サンプルを放置するステップ；
　（ｉｉｉ）期間ｐを含有する試薬添加フェーズの間に前記個々のウェルへと試薬を添加するステップ；ならびに
　（ｉｖ）前記ソフトウェアのスケジューラーによって前記マルチウェルプレートの個々のウェルに対するステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）の状態をトラックするステップ、
を含有するコンピュータを実装した連続交互プロセスを含有し、
ここで前記マルチウェルプレートの第一のウェルがステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）へと供され、そして前記第一のウェルの少なくともステップ（ｉ）が完了したのちに前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が繰り返され、かつ
期間ｎ、ｍもしくはｐの一つもしくはそれ以上が、前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上のウェルにおいて、前記ソフトウェアのスケジューラーによって調整できる、方法。」 
 　 
２　引用刊行物及びその記載事項  
　原査定の拒絶の理由に引用された引用例１、２とその記載事項は、前記第２の２（１）に記載したとおりである。  
 　  
３　本願発明と引用発明との対比・判断  
　本願発明は、実質的に補正発明の「ここでステップ（ｉ）が、サンプルを添加するステップの前に前記個々のウェルのシールを穴開けするステップをさらに含有し、」と限定する事項がないものであるから、本願発明は、前記第２の２で検討した補正発明を包含する。  
　そうすると、本願発明は、補正発明と同様に、引用発明、引用例２の記載事項、及び周知技術に基づいて、当業者が容易に発明をすることができたものである。  
４　平成２８年２月１９日付け上申書の補正案について
　平成２８年２月１９日付け上申書には、補正案が記載されており、その補正案の請求項１は、次のとおりである。（下線は補正発明からの補正箇所を示すものであり、当審が付したものである。）
「［請求項１］
　マルチウェルプレートにおいてアッセイを実施するための方法であって、ここで前記方法は、（ａ）光検出サブシステム；（ｂ）ピペッターを含有する液体操作サブシステム；（ｃ）プレート操作サブシステム、および（ｄ）個々のサンプルのプロセスをスケジュールするためのソフトウェアのスケジューラーへと動作可能に接続されたコンピュータを含有する装置を用い、
　前記方法が、前記マルチウェルプレートの個々のウェルにおいて実施される以下のステップ：
　（ｉ）期間ｎを含有するサンプル添加フェーズの間に
個々のウェルのシールを穴開けし、そして
ために前記ピペッターを用いる
　（ｉｉ）期間ｍを含有する放置フェーズの間に前記個々のウェル中に前記サンプルを放置するステップ；
　（ｉｉｉ）期間ｐを含有する試薬添加フェーズの間に前記個々のウェルへと試薬を添加する
ために前記ピペッターを用いる
　（ｉｖ）前記ソフトウェアのスケジューラーによって前記マルチウェルプレートの個々のウェルに対するステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）の状態をトラックするステップ、
を含有するコンピュータを実装した連続交互プロセスを含有し、
ここ
でス
が前記マルチウェルプレートの第一のウェルにおいて実施され、
、
前記第一のウェルにおけるステップ（ｉｉ）の間に前記一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてステップ（ｉ）が実施され、そして、前記一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおけるステップ（ｉｉ）の間に前記第一のウェルにおいてステップ（ｉｉｉ）が実施されるような連続交互プロセスを用いて
る
方法。」（以下、「補正案発明」という。）
　補正案発明は、補正発明から、「期間ｎ、ｍもしくはｐの一つもしくはそれ以上が、前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上のウェルにおいて、前記ソフトウェアのスケジューラーによって調整できる」との発明特定事項を削除し、新たに「ピペッター」を追加し、「ピペッター」についての特定事項を追加するなど、補正発明の内容を大幅に変えるものであり、このような特許法１７条の２第５項に掲げるいずれの目的にも該当しないような補正案についてまで検討しなければならないということはない。
　しかしながら、念のため、補正案発明の進歩性について検討しておくことにする。
　補正案発明における「液体サブシステム」が「ピペッターを含有」することは、第２の２のア（エ）で摘記したように引用例１の段落[0084]に記載されている。また、補正案発明の「ここでステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）が前記マルチウェルプレートの第一のウェルにおいて実施され、そして、前記マルチウェルプレートの一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいて、前記第一のウェルにおけるステップ（ｉｉ）の間に前記一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおいてステップ（ｉ）が実施され、そして、前記一つもしくはそれ以上の追加のウェルにおけるステップ（ｉｉ）の間に前記第一のウェルにおいてステップ（ｉｉｉ）が実施されるような連続交互プロセスを用いてこれらのステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）」という特定事項についても、第２の２（２）イ（ア）の「相違点１について」で検討したとおり、第１のウェルにおけるステップ（ｉｉ）の間に追加のウェルにおけるステップ（ｉ）を行ない、その後、第１のウェルにおけるステップ（ｉｉｉ）を行う事は当業者にとって容易であり、その場合、第１のウェルにおけるステップ（ｉｉｉ）は、追加のウェルのステップ（ｉｉ）が行われることになる。
　したがって、補正案発明は、引用発明、及び引用例２の記載事項に基づいて、当業者が容易に発明をすることができたものである。
第４　むすび  
　以上のとおり、本願発明は、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができないから、他の請求項について論及するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。  
 　 
　よって、結論のとおり審決する。