【手続補正書】
【提出日】平成28年2月3日(2016.2.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者の生理学的特徴づけの方法であって、
被験者中の肝細胞増殖因子（ＨＧＦ）、インターロイキン（ＩＬ）−１０、ＩＬ−１２（ｐ７０）、ＩＬ−２、ＩＬ−５、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ミエロペルオキシダーゼ（ＭＰＯ）、マクロファージ遊走阻止因子（ＭＩＦ）、マトリックスメタルプロテイナーゼ（ＭＭＰ）９、レジスチン、可溶性細胞間接着分子（ｓＩＣＡＭ）−１、単球走化性タンパク質１（“ＭＣＰ−１”）、ＩＬ−４、およびレプチンからなる群から選択される少なくとも三つのバイオマーカーの組合せのレベルが異常であるか否かを決定するための工程
を含んでなり、
ここにおいて、前記バイオマーカーの異常なレベルが、非小細胞肺癌の指標である、前記方法。
【請求項２】
被験者の生理学的特徴づけの方法であって、
ＨＧＦ、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２（ｐ７０）、ＩＬ−２、ＩＬ−５、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＭＭＰ９、レジスチン、ｓＩＣＡＭ−１、ＭＣＰ−１、ＩＬ−４、レプチン、ＭＰＯ、およびＭＩＦからなる群から選択される少なくとも三つのバイオマーカーのレベルを測定する工程
を含んでなり、
ここにおいて、前記バイオマーカーのレベルが異常である場合、被験者が非小細胞肺癌の増加した可能性を有する、前記方法。
【請求項３】
被験者の生理学的特徴づけの方法であって、前記被験者の生理学的試料中の表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの少なくとも三つのバイオマーカーの発現の程度を決定することを含んでなり、ここにおいて、前記少なくとも三つのバイオマーカーの発現の程度が、肺疾患の指標である、前記方法。
【請求項４】
被験者の生理学的特徴づけの方法であって、前記被験者の生理学的試料中の配列番号１−１７からなる群から選択される少なくとも一つのポリペプチドの発現の程度を決定し、そして前記被験者の生理学的試料中の表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの少なくとも三つのバイオマーカーの発現の程度を決定することを含んでなり、ここにおいて、前記少なくとも一つのポリペプチドの発現の程度及び表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの前記少なくとも三つのバイオマーカーの発現の程度が、肺疾患の指標である、前記方法。
【請求項５】
被験者の生理学的特徴づけの方法であって、前記被験者の生理学的試料中の配列番号１２の発現の程度を決定することを含んでなり、ここにおいて、前記ポリペプチドの発現の程度が、肺疾患の指標である、前記方法。
【請求項６】
前記生理学的特徴づけが、前記被験者の生理学的試料中の表２、表６、表１０、表１７、又は表２１からの少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度を決定することを含んでなる被験者の反応性気道疾患を診断することであり、ここにおいて、前記少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度が、反応性気道疾患の指標である、請求項３に記載の方法。
【請求項７】
前記生理学的特徴づけが、前記被験者の生理学的試料中の表３、表７、表１１、表１８、又は表２２からの少なくとも一つのバイオマーカーの前記被験者中の発現の程度を決定することを含んでなる被験者の非小細胞肺癌を診断することであり、ここにおいて、前記少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度が、非小細胞肺癌の存在又は発症の指標である、請求項３に記載の方法。
【請求項８】
前記生理学的特徴づけが、前記被験者の生理学的試料中の表４、表８、表１２、表１９、又は表２３からの少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度を決定することを含んでなる被験者の肺疾患を診断することであり、ここにおいて、前記少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度が肺疾患を診断することを援助する、請求項３に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも一つのバイオマーカーが、複数のバイオマーカーを含んでなる、請求項３、４、および６−８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも三つのバイオマーカーが、表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、又は前記表の組合せから選択される、請求項３、４、および６−８に記載の方法。
【請求項１１】
更に、前記バイオマーカーの少なくとも一つが、表１３Ｂ及び／又は表１４Ｂ上にも見出される、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記ヒトが男性であり、そして前記バイオマーカーの少なくとも１つが、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、又は前記表の組合せから選択される、請求項３、４、および６−８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
前記ヒトが女性であり、そして前記バイオマーカーの少なくとも一つが、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せから選択される、請求項３、４、および６−８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
更に、前記少なくとも一つのバイオマーカーが、表１３Ａ及び／又は表１４Ａ上にも見出される、請求項１２又は１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記肺疾患が、非小細胞肺癌又は反応性気道疾患である、請求項３−５および８−１４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１６】
前記反応性気道疾患が、喘息である、請求項６又は１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記発現の程度を決定することが、定量的多重免疫アッセイを行うことである、請求項３−１６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
前記方法が、更に前記被験者の生理学的試料を得ることを含んでなる、請求項３−１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１９】
前記生理学的試料が、生物学的流体である、請求項３−１８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２０】
前記被験者が、哺乳動物である、請求項３−１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２１】
（ａ）表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せから複数のバイオマーカーを選択し；（ｂ）前記バイオマーカーの発現の程度を決定するための手段を選択し；そして（ｃ）発現の程度を決定するための前記手段を含んでなるキットを設計すること；
を含んでなる、被験者中の肺疾患を診断するためのキットを設計するための方法。
【請求項２２】
（ａ）配列番号１−１７からなる群から選択される少なくとも一つのポリペプチド、及び表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの少なくとも一つのバイオマーカーを選択し；（ｂ）配列番号１−１７からなる群から選択される少なくとも一つのポリペプチド、及び表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの前記少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度を決定するための手段を選択し；そして（ｃ）前記発現の程度を決定するための前記手段を含んでなるキットを設計すること；を含んでなる、被験者中の肺疾患を診断するためのキットを設計するための方法。
【請求項２３】
前記バイオマーカーが、表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、又は前記表の組合せから選択される、請求項２１又は２２に記載の方法。
【請求項２４】
更に、表１３Ｂ及び／又は表１４Ｂから少なくとも一つのバイオマーカーを選択することを含んでなる、請求項２１−２３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２５】
前記被験者が男性であり、そして前記バイオマーカーが、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、又は前記表の組合せから選択される、請求項２１又は２２に記載の方法。
【請求項２６】
前記被験者が女性であり、そして前記少なくとも一つのバイオマーカーが、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せから選択される、請求項２１又は２２に記載の方法。
【請求項２７】
更に、表１３Ａ及び／又は表１４Ａから少なくとも一つのバイオマーカーを選択することを含んでなる、請求項２５又は２６に記載の方法。
【請求項２８】
表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの複数のバイオマーカーの発現の程度を決定するための手段を含んでなるキット。
【請求項２９】
（ａ）配列番号１−１７からなる群から選択される少なくとも一つのポリペプチドの発現の程度を決定するための手段；及び（ｂ）表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せからの少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度を決定するための手段を含んでなるキット。
【請求項３０】
前記バイオマーカーが、表１Ａ、表１Ｂ、表１Ｃ、表２、表３、表４、又は前記表の組合せから選択される、請求項２８又は２９に記載のキット。
【請求項３１】
更に、表１３Ｂ及び／又は表１４Ｂからの少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度を決定するための手段を含んでなる、請求項２８−３０のいずれか１項に記載のキット。
【請求項３２】
前記バイオマーカーが、表５Ａ、表５Ｂ、表５Ｃ、表６、表７、表８、表１６Ａ、表１６Ｂ、表１６Ｃ、表１７、表１８、表１９、又は前記表の組合せから選択される、請求項２８又は２９に記載のキット。
【請求項３３】
前記バイオマーカーが、表９Ａ、表９Ｂ、表９Ｃ、表１０、表１１、表１２、表２０Ａ、表２０Ｂ、表２０Ｃ、表２１、表２２、表２３、又は前記表の組合せから選択される、請求項２８又は２９に記載のキット。
【請求項３４】
更に、表１３Ａ及び／又は表１４Ａからの少なくとも一つのバイオマーカーの発現の程度を決定するための手段を含んでなる、請求項３２又は３３に記載のキット。
【請求項３５】
前記バイオマーカーがポリペプチドである、請求項２８−３４のいずれか１項に記載のキット。
【請求項３６】
前記発現の程度を決定するための前記手段が、検出剤を含んでなる、請求項２８−３５のいずれか１項に記載のキット。
【請求項３７】
前記検出剤が、前記バイオマーカー又は前記ポリペプチドに特異的に結合する試薬を含んでなる、請求項３６に記載のキット。
【請求項３８】
前記試薬が、抗体を含んでなる、請求項３７に記載のキット。