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　特願２０１２−５０３４１９「化学的ライゲーション依存型プローブ増幅（ＣＬＰＡ）」拒絶査定不服審判事件〔平成２２年１０月　７日国際公開、ＷＯ２０１０／１１４５９９、平成２４年１２月１３日国内公表、特表２０１２−５３１８８７〕について、次のとおり審決する。
【結　論】
　本件審判の請求は、成り立たない。
【理　由】
第１　手続の経緯、本願発明  
　本願は、平成２２年３月２９日（パリ条約による優先権主張　平成２１年４月１日　米国）を国際出願日とする出願であって、 平成２７年７月２３日に拒絶査定不服審判の請求がなされ、平成２８年６月２１日付けで当審より拒絶理由が通知され、これに対して同年１２月２２日に意見書および手続補正書が提出された。
　本願の請求項１〜１５に係る発明は、平成２８年１２月２２日付け手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１〜１５に記載の事項により特定される発明であり、そのうち、請求項１に係る発明（以下、「本願発明」という。）は、請求項１に記載される以下のとおりのものと認める。  
「【請求項１】
　細胞、組織、又は血液の溶解物を含む粗試料中の複数の異なる標的核酸であって、各標的核酸配列が隣接する第１及び第２の標的ドメインを含む標的核酸を検出する方法であり、
　ａ）ｉ）前記異なる標的核酸の一つと、
　　　ｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第１の標的ドメインと相補的な第１のプローブドメイン；及び
　　　　　　２）５'側ライゲーション部分；
　　　を備える第１の核酸ライゲーションプローブと、
　　　ｉｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第２の標的ドメインと相補的な第２のプローブドメイン；及び
　　　　　　　２）３'側ライゲーション部分；
　　　を備える第２の核酸ライゲーションプローブと、
　をそれぞれが備える、複数のライゲーション基質を用意するステップであって、前記核酸ライゲーションプローブの一方又は両方が、前記標的核酸配列ごとに異なる長さを有するスペーサー配列を備えるステップと、
　ｂ）前記粗試料中で、前記第１及び第２の核酸ライゲーションプローブを、リガーゼ酵素の不在下においてライゲーションして、複数の異なるライゲーション産物を形成させるステップであって、前記異なるライゲーション産物が異なる標的特異的長さを有するステップと、
　ｃ）前記ライゲーション産物を前記粗試料から精製するステップと、
　ｄ）前記ライゲーション産物を増幅するステップと、
　ｅ）前記異なる標的長さに基づいて、前記異なるライゲーション産物の存在を検出するステップと、
　を含む方法。」
　
　
第２　当審の判断
１．引用例１
　当審拒絶理由において引用された、特表２００４−５０７２２６号公報（以下、「引用例１」という。）には、以下の事項が記載されている。なお、下線は当審による。
ア　「【請求項１】
サンプル中の少なくとも１つの標的配列を検出するための方法であって、以下：
該サンプルを各標的配列に対するプローブセットと合わせてライゲーション反応混合物を形成する工程であって、該プローブセットは（ａ）標的特異的部分および５’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第１プローブ、ならびに（ｂ）標的特異的部分および３’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第２プローブを含み、ここで、各セット中の該プローブは、相補的な標的配列上で互いに隣接してハイブリダイズする場合に、一緒にライゲーションするのに適切であり、そしてここで、各プローブセット中の少なくとも１つのプローブは、該プライマー特異的部分と該標的特異的部分との間に配置されるアドレス可能支持体特異的部分をさらに含む、工程；
該ライゲーション反応混合物を少なくとも１サイクルのライゲーションに供する工程であって、ここで隣接してハイブリダイズする相補的なプローブが互いにライゲーションされて、該５’プライマー特異的部分、該標的特異的部分、少なくとも１つのアドレス可能支持体特異的部分、および該３’プライマー特異的部分を含むライゲーション産物を形成する工程；
該ライゲーション反応混合物を（ａ）少なくとも１つのプライマーセット、および（ｂ）ポリメラーゼと合わせて、第１増幅反応混合物を形成する工程であって、該プライマーセットは（ｉ）該ライゲーション産物の該５’プライマー特異的部分の配列を含む、少なくとも１つの第１プライマー、および（ｉｉ）該ライゲーション産物の該３’プライマー特異的部分に相補的な配列を含む、少なくとも１つの第２プライマーを含み、ここで、該プライマーセットの少なくとも１つのプライマーがさらにレポーター基を含む、工程；
該第１増幅反応混合物を少なくとも１サイクルの増幅に供して、少なくとも１つのレポーター基を含む第１増幅産物を生成する工程；
該第１増幅産物の該アドレス可能支持体特異的部分または少なくとも１つのレポーター基を含む該第１増幅産物の部分を、支持体に結合された捕獲オリゴヌクレオチドにハイブリダイズさせる工程；ならびに
該少なくとも１つのレポーター基を検出する工程、
を包含する、方法。
　・・・・
【請求項１２】
増幅の前に前記ライゲーション産物を精製する工程をさらに包含する、請求項１に記載の方法。」（特許請求の範囲）
イ　「【００１５】
なお他の実施形態において、
ライゲーションは、非酵素学的に行なわれる。限定されないが、非酵素学的ライゲーションは、化学的ライゲーション（「活性化」剤および／または還元剤の存在下での自己ライゲーションおよびライゲーション）を含む。
　
ウ　「【００４７】
本発明に従うライゲーション因子は、任意の数の酵素的薬剤または化学的（すなわち、非化学的）薬剤を含み得る。例えば、リガーゼは、適切な条件下で、ＤＮＡ分子もしくはＲＮＡ分子、またはハイブリッド中の隣接ヌクレオチドの３’−ＯＨおよび５’−リン酸の間のリン酸ジエステル結合を形成する、酵素的ライゲーション因子である。温度感受性リガーゼとしては、バクテリオファージＴ４リガーゼおよびＥ．Ｃｏｌｉリガーゼが挙げられるが、これらに限定されない。温度安定性リガーゼとしては、Ｔａｑリガーゼ、ＴｔｈリガーゼおよびＰｆｕリガーゼが挙げられるが、これらに限定されない。温度安定性リガーゼは、好熱生物または超好熱生物から獲得され得る。
【００４８】
化学的ライゲーション因子としては、限定でなく、活性化剤、濃縮剤および還元剤（例えば、カルボジイミド、臭化シアン（ＢｒＣＮ）、Ｎ−シアノイミダゾール、イミダゾール、１−メチルイミダゾール／カルボジイミド／シスタミン、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）および紫外線光）が挙げられる。ライゲーション因子非存在下での自己ライゲーション、すなわち、自然ライゲーションはまた、本発明の範囲内である。」
　
エ　「【図面の簡単な説明】
【図１】
図１は、本発明の特定の実施形態に従う、プローブセットを示す概略図である。
各プローブは、標的に相補的または実質的に相補的である部分（「標的特異的部分」Ｔ−ＳＰ）およびプライマーとしての同じ配列に相補的であるかまたはそれを有する部分（「プライマー特異的部分」Ｐ−ＳＰ）を含む。各プローブセットにおける少なくとも１つのプローブは、標的特異的部分とプライマー特異的部分との間に位置するアドレス可能な支持体特異的部分（ＡＳ−ＳＰ）をさらに含む（ここで、プローブＺ）。
各プローブセットは、第１のプローブ（ここで、プローブＡ）の３’末端が第２のプローブの５’末端に直ぐに隣接しそしてこれに対立する状態で、標的とハイブリダイズするように設計された、少なくとも１つの第１のプローブおよび少なくとも１つの第２のプローブ（ここで、プローブＺ）を含む。」
　
オ　「　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　」
カ　「【０１０６】
さらに他の実施形態において、
異なる標的および／または異なる対立遺伝子は、支持体上の捕獲オリゴヌクレオチドに対するハイブリダイゼーションよりもむしろ分離技術（例えば、電気泳動、質量分析法またはクロマトグラフィー）を使用する移動度の区別によって検出される。これらの実施形態において、プローブは、識別可能な固有の長さまたは分子量の、アドレス可能な支持体特異的部分を含み得る。
この増幅産物は、分子量または分子の長さによって分離されて、個々の増幅配列を区別し得る
　
キ　「【０１１０】
好ましい実施形態において、アドレス可能な支持体特異的部分およびタグ相補体は、それぞれポリヌクレオチドを含む。好ましいポリヌクレオチドタグ相補体において、このタグ相補体は、例えば、３’−リン酸、３’−アセチル、２’−３’−ジデオキシ、３’−アミノおよび２’−３’−デヒドロのような糖修飾を含むことによって、ポリメラーゼによって伸長不可能になる。
【０１１１】
特に好ましいアドレス可能な支持体特異的部分およびタグ相補体対は、従来の合成ポリヌクレオチドであるアドレス可能な支持体特異的部分、およびＰＮＡであるタグ相補体を含む。ＰＮＡタグ相補体がタグと三重鎖構造を形成するように設計される場合、このタグ相補体は、タグとタグ相補体との間の三重鎖結合を容易にするために、「ヒンジ」領域を含み得る。
より好ましい実施形態において、アドレス可能な支持体特異的部分
は、反復配列を含む。
特に好ましい反復配列は、（ＣＡＧ）ｎであり
　
２．周知例
　当審拒絶理由において引用された、特開平９−１８７２７７号公報（以下、「引用例２」という。）には、以下の事項が記載されている。
　「【請求項１】  ヒト体内から採取した全血液であって、白血球からもたらされる標的ＤＮＡを含む血液試料に、該標的ＤＮＡに相補的なオリゴヌクレオチドである２種またはそれ以上のプライマー、デオキシリボヌクレオチドフォスフェートおよび耐熱性ＤＮＡポリメラーゼを緩衝液中にて作用させて、（ａ）上記２種またはそれ以上のプライマーを該標的ＤＮＡにアニールさせ、（ｂ）耐熱性ＤＮＡポリメラーゼの作用によりプライマー伸長反応を行って２本鎖ＤＮＡを合成し、（ｃ）得られた２本鎖ＤＮＡを１本鎖ＤＮＡに分離し、そして（ｄ）得られたＤＮＡ増幅産物を鋳型として、上記工程（ａ）〜（ｃ）を繰り返すことことを特徴とする鋳型として全血液を用いた核酸の直接的ＰＣＲ増幅法。」（特許請求の範囲）
　当審拒絶理由において引用された、特開２００８−２７８７７４号公報（以下、「引用例３」という。）には、以下の事項が記載されている。
　「【請求項１】
  全血試料と所定の濃度に調製された前処理試薬とを混合する前処理工程と、
  前記前処理工程から得られる混合溶液を核酸増幅反応溶液に希釈混合する希釈混合工程と、
  前記希釈混合工程から得られる希釈混合溶液について核酸増幅反応を行う核酸増幅工程と、
  を含むことを特徴とする核酸増幅方法。」
　当審拒絶理由において引用された、国際公開２００８／１１７７８２号（以下、「引用例４」という。）には、以下の事項が記載されている。
　「【請求項１】
遺伝子増幅法により２種類の遺伝子を同時に増幅するためのプライマーセットであって、
 　前記２種類の遺伝子が、ＣＹＰ２Ｃ９遺伝子およびＶＫＯＲＣ１遺伝子であり、
 　下記（１）および（２）の２種類のプライマーセットを含むことを特徴とする遺伝子増幅用プライマーセット。・・・・
　【請求項３】
前記遺伝子増幅用プライマーセットが、生体試料中のＣＹＰ２Ｃ９遺伝子およびＶＫＯＲＣ１遺伝子を増幅するためのプライマーセットである、請求の範囲１記載の遺伝子増幅用プライマーセット。
　【請求項４】
前記生体試料が、全血である、請求の範囲３記載の遺伝子増幅用プライマーセット。」
　当審拒絶理由において引用された、特表２００８−５４３３１１号公報（以下、「引用例５」という。）には、以下の事項が記載されている。
　「【請求項１】
  少なくとも１つの細胞溶解物と、
  少なくとも１つのプライマーと、
  固有なゲノム核酸配列、目的の標的核酸、またはその両方を検出するための少なくとも１つのプローブと、
  ＰＣＲ反応のための１つまたは複数の成分と
を含む組成物。」
　
３．引用発明
　上記アより、引用例１には次の発明（以下、「引用発明」という。）が記載されていると認められる。
　
「サンプル中の少なくとも１つの標的配列を検出するための方法であって、以下：
　該サンプルを各標的配列に対するプローブセットと合わせてライゲーション反応混合物を形成する工程であって、該プローブセットは（ａ）標的特異的部分および５’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第１プローブ、ならびに（ｂ）標的特異的部分および３’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第２プローブを含み、ここで、各セット中の該プローブは、相補的な標的配列上で互いに隣接してハイブリダイズする場合に、一緒にライゲーションするのに適切であり、そしてここで、各プローブセット中の少なくとも１つのプローブは、該プライマー特異的部分と該標的特異的部分との間に配置されるアドレス可能支持体特異的部分をさらに含む、工程；
　該ライゲーション反応混合物を少なくとも１サイクルのライゲーションに供する工程であって、ここで隣接してハイブリダイズする相補的なプローブが互いにライゲーションされて、該５’プライマー特異的部分、該標的特異的部分、少なくとも１つのアドレス可能支持体特異的部分、および該３’プライマー特異的部分を含むライゲーション産物を形成する工程；
　前記ライゲーション産物を精製する工程；
　前記ライゲーション産物を（ａ）少なくとも１つのプライマーセット、および（ｂ）ポリメラーゼと合わせて、第１増幅反応混合物を形成する工程であって、該プライマーセットは（ｉ）該ライゲーション産物の該５’プライマー特異的部分の配列を含む、少なくとも１つの第１プライマー、および（ｉｉ）該ライゲーション産物の該３’プライマー特異的部分に相補的な配列を含む、少なくとも１つの第２プライマーを含み、ここで、該プライマーセットの少なくとも１つのプライマーがさらにレポーター基を含む、工程；
該第１増幅反応混合物を少なくとも１サイクルの増幅に供して、少なくとも１つのレポーター基を含む第１増幅産物を生成する工程；
　該第１増幅反応混合物を少なくとも１サイクルの増幅に供して、少なくとも１つのレポーター基を含む第１増幅産物を生成する工程；
　該第１増幅産物の該アドレス可能支持体特異的部分または少なくとも１つのレポーター基を含む該第１増幅産物の部分を、支持体に結合された捕獲オリゴヌクレオチドにハイブリダイズさせる工程；ならびに
　該少なくとも１つのレポーター基を検出する工程、
　を包含する、方法。」
　
４．対比
　本願発明と引用発明とを対比する。 
　引用発明は、複数の異なる標的核酸を検出することを含んでいると認められるから、引用発明の「サンプル中の少なくとも１つの標的配列」は本願発明の「試料中の複数の異なる標的核酸」に相当する。
　また、引用発明の「（ａ）標的特異的部分および５’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第１プローブ」は、３’側でライゲーションすると認められるから、本願発明の「ｉｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第２の標的ドメインと相補的な第２のプローブドメイン；及び　２）３'側ライゲーション部分；　を備える第２の核酸ライゲーションプローブ」に相当し、引用発明の「（ｂ）標的特異的部分および３’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第２プローブ」は５’側でライゲーションすると認められるから、本願発明の「ｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第１の標的ドメインと相補的な第１のプローブドメイン；及び　２）５'側ライゲーション部分；　を備える第１の核酸ライゲーションプローブ」に相当すると認められる。
　引用発明の第１のプローブと第２のプローブとは、相補的な標的配列上で互いに隣接してハイブリダイズするものであるから、隣接する標的配列を標的とするものと認められ、また、上記エ、オから、引用発明の「該プライマー特異的部分と該標的特異的部分との間に配置されるアドレス可能支持体特異的部分」とは、ポリヌクレオチドであって、本願発明の「スペーサー配列」に相当すると認められる。
　そうすると、引用発明の「サンプル中の少なくとも１つの標的配列を検出するための方法」は、本願発明の「試料中の複数の異なる標的核酸であって、各標的核酸配列が隣接する第１及び第２の標的ドメインを含む標的核酸を検出する方法」に相当し、引用発明の「該サンプルを各標的配列に対するプローブセットと合わせてライゲーション反応混合物を形成する工程であって、該プローブセットは（ａ）標的特異的部分および５’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第１プローブ、ならびに（ｂ）標的特異的部分および３’プライマー特異的部分を含む、少なくとも１つの第２プローブを含み、ここで、各セット中の該プローブは、相補的な標的配列上で互いに隣接してハイブリダイズする場合に、一緒にライゲーションするのに適切であり、そしてここで、各プローブセット中の少なくとも１つのプローブは、該プライマー特異的部分と該標的特異的部分との間に配置されるアドレス可能支持体特異的部分をさらに含む、工程；」は、本願発明の
　「ａ）ｉ）前記異なる標的核酸の一つと、
　　　ｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第１の標的ドメインと相補的な第１のプローブドメイン；及び
　　　　　　２）５'側ライゲーション部分；
　　　を備える第１の核酸ライゲーションプローブと、
　　　ｉｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第２の標的ドメインと相補的な第２のプローブドメイン；及び
　　　　　　　２）３'側ライゲーション部分；
　　　を備える第２の核酸ライゲーションプローブと、
　をそれぞれが備える、複数のライゲーション基質を用意するステップ」に相当すると認められる。
　上記イ、ウのとおり、引用発明のライゲーションは、非酵素学的に行われる場合を含んでいるから、引用発明の「該ライゲーション反応混合物を少なくとも１サイクルのライゲーションに供する工程であって、ここで隣接してハイブリダイズする相補的なプローブが互いにライゲーションされて、該５’プライマー特異的部分、該標的特異的部分、少なくとも１つのアドレス可能支持体特異的部分、および該３’プライマー特異的部分を含むライゲーション産物を形成する工程；」は、本願発明の「前記第１及び第２の核酸ライゲーションプローブを、リガーゼ酵素の不在下においてライゲーションして、複数の異なるライゲーション産物を形成させるステップであって、前記異なるライゲーション産物が異なる標的特異的長さを有するステップ」と、「前記第１及び第２の核酸ライゲーションプローブを、リガーゼ酵素の不在下においてライゲーションして、複数の異なるライゲーション産物を形成させるステップ」である点で共通すると認められる。
　さらに、引用発明の「前記ライゲーション産物を精製する工程；」は、本願発明の「ｃ）前記ライゲーション産物を・・・精製するステップ」に相当し、引用発明の「前記ライゲーション産物を（ａ）少なくとも１つのプライマーセット、および（ｂ）ポリメラーゼと合わせて、第１増幅反応混合物を形成する工程であって、・・・ここで、該プライマーセットの少なくとも１つのプライマーがさらにレポーター基を含む、工程；　該第１増幅反応混合物を少なくとも１サイクルの増幅に供して、少なくとも１つのレポーター基を含む第１増幅産物を生成する工程；」は、本願発明の「ｄ）前記ライゲーション産物を増幅するステップ」に相当し、引用発明の「該第１増幅産物の該アドレス可能支持体特異的部分または少なくとも１つのレポーター基を含む該第１増幅産物の部分を、支持体に結合された捕獲オリゴヌクレオチドにハイブリダイズさせる工程；ならびに　該少なくとも１つのレポーター基を検出する工程」は、本願発明の「ｅ）前記異なる標的長さに基づいて、前記異なるライゲーション産物の存在を検出するステップ」と「異なるライゲーション産物の存在を検出するステップ」である点で共通すると認められる。
　
　以上から、両者は、 
 　「試料中の複数の異なる標的核酸であって、各標的核酸配列が隣接する第１及び第２の標的ドメインを含む標的核酸を検出する方法であり、
　ａ）ｉ）前記異なる標的核酸の一つと、
　　　ｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第１の標的ドメインと相補的な第１のプローブドメイン；及び
　　　　　　２）５'側ライゲーション部分；
　　　を備える第１の核酸ライゲーションプローブと、
　　　ｉｉｉ）１）前記一つの標的核酸の第２の標的ドメインと相補的な第２のプローブドメイン；及び
　　　　　　　２）３'側ライゲーション部分；
　　　を備える第２の核酸ライゲーションプローブと、
　をそれぞれが備える、複数のライゲーション基質を用意するステップであって、前記核酸ライゲーションプローブの一方又は両方が、スペーサー配列を備えるステップと、
　ｂ）前記試料中で、前記第１及び第２の核酸ライゲーションプローブを、リガーゼ酵素の不在下においてライゲーションして、複数の異なるライゲーション産物を形成させるステップと、
　ｃ）前記ライゲーション産物を前記試料から精製するステップと、
　ｄ）前記ライゲーション産物を増幅するステップと、
　ｅ）前前記異なるライゲーション産物の存在を検出するステップと、
　を含む方法。」
である点で一致し、以下の点で相違すると認められる。 
  
 （相違点１） 
 　本願発明では、検出する試料が「細胞、組織、又は血液の溶解物を含む粗試料」に特定され、各ステップにおける試料が「粗試料」に特定されているのに対し、引用発明では特定されていない点。
 （相違点２）
　本願発明では、複数のライゲーション基質を用意するステップにおける一方又は両方プローブのスペーサー配列が「前記標的核酸配列ごとに異なる長さ」を有し、複数の異なるライゲーション産物を形成するステップで形成される異なるライゲーション産物が「異なる標的特異的長さを有する」ものであり、検出するステップで「前記異なる標的長さ」に基づいて異なるライゲーション産物の存在を検出することが特定されているのに対して、引用発明ではこれらの事項が特定されていない点。
　
５．判断 　 
 （相違点１）について 
　細胞、組織、又は血液の溶解物のような粗試料中の核酸を分析する際、粗試料から核酸を精製することなく、直接分析することによって、簡便で迅速な検出を行うことは、当業者の周知の技術課題であると認められる。
　また、引用例２〜５の記載からも分かるように、血液や細胞溶解物のような粗試料を用いても、粗試料中の核酸と検出に用いる核酸とがハイブリダイズできることは技術常識であるから、引用発明においてサンプルとして粗試料を用いた場合に、プローブが標的核酸にハイブリダイズすること、そしてプローブがハイブリダイズすればライゲーション産物が得られることは、当業者が理解することと認められる。　
　したがって、引用発明においてサンプルとして細胞、組織、又は血液の溶解物を含む粗試料を用いることは当業者が容易になし得ることである。
　そして、サンプルとして粗試料を用いれば、各ステップにおいても該粗試料から使用されることになるから、そのような事項を特定することも、当業者が容易になし得ることである。
　
 （相違点２）について 
　上記カのとおり、引用例１には「異なる標的および／または異なる対立遺伝子は、支持体上の捕獲オリゴヌクレオチドに対するハイブリダイゼーションよりもむしろ分離技術（例えば、電気泳動、質量分析法またはクロマトグラフィー）を使用する移動度の区別によって検出される。これらの実施形態において、プローブは、識別可能な固有の長さまたは分子量の、アドレス可能な支持体特異的部分を含み得る。」と、支持体上の捕獲オリゴヌクレオチドに対するハイブリダイゼーションにより検出する方法に代えて、分離技術を使用する移動度の区別によって標的核酸を検出する方法が採用できることが記載されているから、引用発明の
　「該第１増幅産物の該アドレス可能支持体特異的部分または少なくとも１つのレポーター基を含む該第１増幅産物の部分を、支持体に結合された捕獲オリゴヌクレオチドにハイブリダイズさせる工程；ならびに
　該少なくとも１つのレポーター基を検出する工程」に代えて、分離技術を使用する移動度の区別によって標的核酸を検出する工程を採用すること、そのために用いるプローブとして「識別可能な固有の長さまたは分子量の、アドレス可能な支持体特異的部分」を含むものを用いることは、当業者が容易になし得ることである。
　そして、「識別可能な固有の長さまたは分子量の、アドレス可能な支持体特異的部分」とは、本願発明にいう「前記標的核酸配列ごとに異なる長さ」を有するスペーサー配列であると認められる。
　さらに、上記キのとおり、引用例１には、アドレス可能支持体特異的部分が（ＣＡＧ）ｎ（ｎは１〜１０）のような反復配列であることも記載されており、このような反復配列を用いてアドレス可能とすることは、標的核酸配列ごとに繰り返し数ｎを異なるようにすることであると認められ、それはすなわち、「標的核酸配列ごとに異なる長さ」とすることであると認められる。
　したがって、引用発明において、「標的核酸配列ごとに異なる長さ」のスペーサー配列を有するプローブを用いることは当業者が容易になし得ることである。
　そして、引用発明において、分離技術を使用する移動度の区別によって標的核酸を検出する工程を採用して、「前記標的核酸配列ごとに異なる長さ」のスペーサー配列を有するプローブを用いれば、異なる標的特異的長さを有するライゲーション産物が生成し、検出するステップでは異なる標的長さに基づいて異なるライゲーション産物の存在が検出されることとなると認められる。
　したがって、相違点２は当業者が容易になし得ることである。
　そして、本願発明において、引用例１から予測できない効果が奏されたとは認められない。
　
６．小活
　したがって、本願発明は引用例１に記載された発明に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない。
　
　
第３　むすび
　以上のとおり、この出願の請求項１に係る発明は、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができないものであるから、他の請求項に係る発明について言及するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。  
　よって、結論のとおり審決する。