【手続補正書】
【提出日】平成27年9月8日(2015.9.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１種の細胞集団の増大した量および／もしくは減少した量を、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療での処置に対する、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する被験体の応答性の指標として使用する方法であって、前記方法は、
前記被験体から得られた少なくとも１つのサンプルにおいて、ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋Ｔ細胞からなる群より選択される少なくとも１種の細胞集団の量を決定する工程、
を包含し、
ここで、前記少なくとも１種の細胞集団の既知のコントロールレベルと比較して前記少なくとも１つのサンプル中の前記細胞集団ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の増大した量、および／もしくは前記細胞集団ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋Ｔ細胞のうちの少なくとも１つの減少した量は、前記抗ＳＭＡＤ７治療に対する、ＩＢＤを有する前記被験体の応答性を示す、
方法。
【請求項２】
以下：
ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における増大は、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少は、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少は、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における減少は、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少は、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少は、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す、
のうちの２つまたはそれより多くの調節を同定して、前記被験体の応答性を決定することを補助する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
インビトロで行われる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記被験体は、前記少なくとも１つのサンプルが得られるときに、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療を受けている最中である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記炎症性腸疾患（ＩＢＤ）は、クローン病（ＣＤ）および／もしくは潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における増大、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における減少、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少またはＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少のうちの少なくとも１つは、前記被験体が寛解に入る可能性があることを示す、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つのサンプルは、血液サンプルもしくは組織サンプルである、請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
前記組織サンプルは、前記被験体の胃・腸管に由来する、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１種の細胞集団の量は、フローサイトメトリーによって、免疫組織化学によって、および／もしくはＲＮＡ／ＤＮＡ分析によって決定される、請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
フローサイトメトリーおよび／もしくは免疫組織化学は、抗ＣＣＲ９抗体、抗ＦｏｘＰ３抗体、抗ＩＦＮ−γ抗体および抗ＩＬ１７Ａ抗体からなる群より選択される抗体を使用して行われる、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記コントロールレベルは、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療の投与の前に前記患者から得られるか、または少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療の投与の直後に得られる少なくとも１種の細胞集団のベースラインレベルである、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
前記少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療は、抗ＳＭＡＤ７アンチセンス治療である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記抗ＳＭＡＤ７アンチセンス治療は、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８および配列番号９からなる群より選択される抗ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
細胞集団を同定するための抗ＣＣＲ９抗体、抗ＦｏｘＰ３抗体、抗ＩＦＮ−γ抗体および／もしくは抗ＩＬ１７Ａ抗体のうちの少なくとも２種、またはＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋Ｔ細胞のうちの少なくとも１種に対するタンパク質細胞マーカーをコードするＲＮＡの発現を検出するための試薬を含むキット。
【請求項１５】
ＦＡＣＳ技術を使用して細胞を同定し、選別し、計数するための緩衝液、試薬、および詳細な指示書のうちの少なくとも１つをさらに含む、請求項１４に記載のキット。
【請求項１６】
前記抗体は、ＣＣＲ９タンパク質に対する一次抗体、ＦｏｘＰ３タンパク質に対する一次抗体、およびレポーター酵素に対して結合体化される二次抗体であり、そして前記キットは、免疫組織化学を使用して細胞集団を同定するための少なくとも緩衝液、試薬、および詳細な指示書を必要に応じてさらに含む、請求項１４に記載のキット。
【請求項１７】
ＣＣＲ９タンパク質に対する捕捉抗体、ＦｏｘＰ３タンパク質に対する検出抗体、および／もしくはレポーター酵素に結合体化される二次抗体を含み；そしてＥＬＩＳＡ技術を使用して細胞集団を同定するための緩衝液、試薬、および詳細な指示書を必要に応じてさらに含む、請求項１６に記載のキット。
【請求項１８】
ヒトもしくは動物の身体で実施される診断法において使用するための組成物であって、前記組成物は、ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞のうちの少なくとも１種のための細胞マーカーに対する少なくとも１種の抗体を含む、組成物。
【請求項１９】
前記診断法は、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療での処置に対する、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する被験体の応答性を予測もしくはモニターすること、または少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療での処置に対する、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する被験体の適切性を決定すること、前記被験体が前記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、もしくは応答性であることを決定すること、そして／あるいは前記被験体が寛解に入る可能性があるか否かを決定することである、請求項１８に規定される使用のための少なくとも１種の抗体を含む組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３５】
本発明の前述の局面および実施形態は、以下の図面、詳細な説明および特許請求の範囲を参照することによって、より完全に理解され得る。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療での処置に対する、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する被験体の応答性を決定するための方法であって、上記方法は、
上記被験体から得られた少なくとも１つのサンプルにおいて、ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋Ｔ細胞からなる群より選択される少なくとも１種の細胞集団の量を決定する工程、
を包含し、
ここで、上記少なくとも１種の細胞集団の既知のコントロールレベルと比較して上記少なくとも１つのサンプル中の上記細胞集団ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の増大した量、および／もしくは上記細胞集団ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋Ｔ細胞のうちの少なくとも１つの減少した量は、上記抗ＳＭＡＤ７治療に対する、ＩＢＤを有する上記被験体の応答性を予測する、
方法。
（項目２）
以下：
ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における増大は、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少は、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少は、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における減少は、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少は、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す；
ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少は、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、または応答性であることを示す、
のうちの２つまたはそれより多くの調節を同定して、上記被験体の応答性を決定することを補助する、項目１に記載の方法。
（項目３）
インビトロで行われる、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
上記被験体は、上記少なくとも１つの生物学的サンプルが得られるときに、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療を受けている最中である、項目１〜３のいずれか１項に記載の方法。
（項目５）
上記炎症性腸疾患（ＩＢＤ）は、クローン病（ＣＤ）および／もしくは潰瘍性大腸炎（ＵＣ）である、前述の項目のいずれか１項に記載の方法。
（項目６）
ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における増大、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞の量における減少、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞の量における減少またはＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞の量における減少のうちの少なくとも１つは、上記被験体が寛解に入る可能性があることを示す、項目１〜５のいずれか１項に記載の方法。
（項目７）
上記少なくとも１つのサンプルは、血液サンプルもしくは組織サンプルである、項目１〜６のいずれか１項に記載の方法。
（項目８）
上記組織サンプルは、上記被験体の胃・腸管に由来する、項目７に記載の方法。
（項目９）
上記少なくとも１種の細胞集団の量は、フローサイトメトリーによって、免疫組織化学によって、および／もしくはＲＮＡ／ＤＮＡ分析によって決定される、項目１〜８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０）
フローサイトメトリーおよび／もしくは免疫組織化学は、抗ＣＣＲ９抗体、抗ＦｏｘＰ３抗体、抗ＩＦＮ−γ抗体および抗ＩＬ１７Ａ抗体からなる群より選択される抗体を使用して行われる、項目９に記載の方法。
（項目１１）
上記コントロールレベルは、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療の投与の前に上記患者から得られるか、または少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療の投与の直後に得られる少なくとも１種の細胞集団のベースラインレベルである、項目１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２）
上記少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療は、抗ＳＭＡＤ７アンチセンス治療である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
上記抗ＳＭＡＤ７アンチセンス治療は、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８および配列番号９からなる群より選択される抗ＳＭＡＤ７アンチセンスオリゴヌクレオチドである、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
細胞集団を同定するための抗ＣＣＲ９抗体、抗ＦｏｘＰ３抗体、抗ＩＦＮ−γ抗体および／もしくは抗ＩＬ１７Ａ抗体のうちの少なくとも２種、またはＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋Ｔ細胞のうちの少なくとも１種に対するタンパク質細胞マーカーをコードするＲＮＡの発現を検出するための試薬を含むキット。
（項目１５）
ＦＡＣＳ技術を使用して細胞を同定し、選別し、計数するための緩衝液、試薬、および詳細な指示書のうちの少なくとも１つをさらに含む、項目１４に記載のキット。
（項目１６）
上記抗体は、ＣＣＲ９タンパク質に対する一次抗体、ＦｏｘＰ３タンパク質に対する一次抗体、およびレポーター酵素に対して結合体化される二次抗体であり、そして上記キットは、免疫組織化学を使用して細胞集団を同定するための少なくとも緩衝液、試薬、および詳細な指示書を必要に応じてさらに含む、項目１４に記載のキット。
（項目１７）
ＣＣＲ９タンパク質に対する捕捉抗体、ＦｏｘＰ３タンパク質に対する検出抗体、および／もしくはレポーター酵素に結合体化される二次抗体を含み；そしてＥＬＩＳＡ技術を使用して細胞集団を同定するための緩衝液、試薬、および詳細な指示書を必要に応じてさらに含む、項目１６に記載のキット。
（項目１８）
ヒトもしくは動物の身体で実施される診断法において使用するための、ＣＣＲ９＋  ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞、ＣＣＲ９＋  ＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞、ＦｏｘＰ３＋  Ｔ細胞、ＩＦＮ−γ＋  Ｔ細胞およびＩＬ１７Ａ＋  Ｔ細胞のうちの少なくとも１種のための細胞マーカーに対する少なくとも１種の抗体。
（項目１９）
上記診断法は、少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療での処置に対する、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する被験体の応答性を予測もしくはモニターすること、または少なくとも１種の抗ＳＭＡＤ７治療での処置に対する、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）を有する被験体の適切性を決定すること、上記被験体が上記抗ＳＭＡＤ７治療に対して応答する可能性があるか、もしくは応答性であることを決定すること、そして／あるいは上記被験体が寛解に入る可能性があるか否かを決定することである、項目１８に規定される使用のための少なくとも１種の抗体。
（項目２０）
添付の説明、例および図面に言及して本明細書上部に実質的に記載されるとおりの方法、キットもしくは使用。