【手続補正書】
【提出日】平成27年6月19日(2015.6.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、
配列番号２６のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、
配列番号２７のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、
配列番号２８のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、
配列番号３０のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、
配列番号３１のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および
配列番号３２のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３
を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント。
【請求項２】
前記抗体はマウス抗体、キメラ抗体又はヒト化抗体であることを特徴とする請求項１に記載の単離抗体または抗原結合フラグメント。
【請求項３】
配列番号２９のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域および/または配列番号３３のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を有することを特徴とする請求項１に記載の単離抗体または抗原結合フラグメント。
【請求項４】
葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な抗体またはその抗原結合フラグメントをコードする単離ポリヌクレオチド配列であって、
前記コードされる抗体の軽鎖ＣＤＲ１が、配列番号２６のアミノ酸配列を含み、
前記コードされる抗体の軽鎖ＣＤＲ２が、配列番号２７のアミノ酸配列を含み、
前記コードされる抗体の軽鎖ＣＤＲ３が、配列番号２８のアミノ酸配列を含み、
前記コードされる抗体の重鎖ＣＤＲ１が、配列番号３０のアミノ酸配列を含み、
前記コードされる抗体の重鎖ＣＤＲ２が、配列番号３１のアミノ酸配列を含み、および
前記コードされる抗体の重鎖ＣＤＲ３が、配列番号３２のアミノ酸配列を含む
ことを特徴とする単離ポリヌクレオチド。
【請求項５】
配列番号６１のヌクレオチド配列および配列番号６５のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする、請求項４に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６】
配列番号５８の核酸配列、配列番号５９の核酸配列、配列番号６０の核酸配列、配列番号６２の核酸配列、配列番号６３の核酸配列、および配列番号６４の核酸配列を含むことを特徴とする請求項４に記載の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項５〜６のいずれか１項に記載の単離ポリヌクレオチドを含むことを特徴とするベクター。
【請求項８】
請求項７に記載のベクターを含むことを特徴とする遺伝子組み換え細胞。
【請求項９】
前記細胞は真核細胞、植物細胞、または細菌であることを特徴とする請求項８に記載の遺伝子組み換え細胞。
【請求項１０】
ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８５を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体。
【請求項１１】
生体試料中の葉酸受容体アルファ（ＦＲα）またはＦＲαを発現する癌を検出する方法であって、請求項１もしくは１０に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントに前記試料を曝して、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）を検出することを特徴とする方法。
【請求項１２】
前記生体試料は、ヒト、齧歯類、非ヒト霊長類、ウサギ、または、犬に由来することを特徴とする請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
対象者における葉酸受容体アルファを発現する癌を診断する方法であって、
ａ．前記対象者の生体試料を、
ｉ．請求項１もしくは１０に記載の抗体もしくはその抗原結合フラグメントに、または
ｉｉ．請求項１もしくは１０に記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくはその抗原結合フラグメントに曝すこと；
ｂ．前記試料に存在する葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の量を定量化すること；
ｃ．前記試料に存在する葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の量を既知の基準と比較すること；および
ｄ．前記対象者の葉酸受容体アルファ（ＦＲα）レベルが、癌に関連する葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のレベルの範囲に入るかを判断すること
を含むことを特徴とする方法。
【請求項１４】
前記対象者の腺癌細胞が葉酸受容体アルファを発現することが認められることは、前記腺癌細胞が葉酸受容体アルファを発現しない場合に比べて、前記対象者の５年生存率が改善された可能性が高いことを示すことを特徴とする請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
対象者における葉酸受容体アルファを発現する癌を監視する方法であって、
ａ．前記対象者の生体試料を、
ｉ．請求項１もしくは１０に記載の抗体もしくはその抗原結合フラグメントに、または
ｉｉ．請求項１もしくは１０に記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくはその抗原結合フラグメントに曝すこと；
ｂ．前記抗体またはその抗原結合フラグメントが結合した、前記試料に存在する葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の量を定量化すること；
ｃ．前記試料に存在する葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の量を、
ｉ．既知の基準、または
ｉｉ．前記対象者からより早い時点に得た生体試料
のいずれかと比較すること；および
ｄ．前記対象者の葉酸受容体アルファ（ＦＲα）レベルが、癌の進行、退行、または安定を示すかを判断すること
を含むことを特徴とする方法。
【請求項１６】
前記生体試料は、尿、血液、血清、血漿、唾液、腹水、循環細胞、循環癌細胞、組織に関連しない細胞、組織、手術摘出癌組織、生検、細針吸引試料、または、組織プレパラートに由来することを特徴とする請求項１１〜１５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１７】
前記癌は、乳癌、甲状腺癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、卵管癌、または卵巣癌であることを特徴とする請求項１３に記載の方法。
【請求項１８】
前記癌は肺癌であることを特徴とする請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記肺癌は腺癌であることを特徴とする請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記既知の基準は、
a  癌がないと確認された対象者に由来する葉酸受容体アルファ（ＦＲα）レベル、または、既知の濃度の葉酸受容体アルファタンパクの調製物、
b  早期ステージにある葉酸受容体アルファを発現する癌を有すると確認された対象者に由来するＦＲαレベル、
c  中期ステージにある葉酸受容体アルファを発現する癌を有すると確認された対象者に由来するＦＲαレベル、または
d  後期ステージにある葉酸受容体アルファを発現する癌を有すると確認された対象者に由来するＦＲαレベル
を含むことを特徴とする請求項１３に記載の方法。
【請求項２１】
前記癌は、乳癌、甲状腺癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、卵管癌、卵巣癌、または肺癌であることを特徴とする請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
請求項１３〜２１のいずれか１項に記載の方法であって、
前記対象者の生体試料を
ｉ．請求項１もしくは１０に記載の抗体もしくはその抗原結合フラグメントに、または
ｉｉ．請求項１もしくは１０に記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくはその抗原結合フラグメントに曝すことは、
さらに、前記対象者の前記生体試料を、
ｉｉｉ．請求項１に記載の抗体、
ｉｖ．請求項１０に記載の抗体、
ｖ．葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、配列番号１０のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、配列番号１２のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、配列番号１４のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、配列番号１５のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および配列番号１６のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント、
ｖｉ．ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８４を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体、
ｖｉｉ．葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、配列番号１８のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、配列番号１９のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、配列番号２０のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、配列番号２２のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、配列番号２３のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および配列番号２４のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント、
ｖｉｉｉ．ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８６を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体、
ｉｘ．葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、配列番号２のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、配列番号３のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、配列番号４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、配列番号６のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、配列番号７のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および配列番号８のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント、
ｘ．ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８７を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体、
ｘｉ．ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、ｉｘ）またはｘ）のいずれか１つに記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくその抗原結合フラグメント
から選択される第２の抗体またはその抗原結合フラグメントに曝すことを含むことを特徴
とする方法。
【請求項２３】
前記第２の抗体は第１の抗体とは異なることを特徴とする請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記対象者の前記生体試料は、請求項１もしくは１０に記載の抗体もしくはその抗原結合フラグメントに曝され、次いで、
ａ．葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、配列番号１０のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、配列番号１２のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、配列番号１４のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、配列番号１５のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および配列番号１６のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント、
ｂ．ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８４を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体、
ｃ．葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、配列番号１８のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、配列番号１９のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、配列番号２０のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、配列番号２２のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、配列番号２３のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および配列番号２４のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント、
ｄ．ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８６を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体、
ｅ．葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、配列番号２のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１、配列番号３のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２、配列番号４のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３、配列番号６のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１、配列番号７のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２、および配列番号８のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３を含むことを特徴とする単離抗体または抗原結合フラグメント、
ｆ．ＡＴＣＣに寄託され受託番号ＰＴＡ−１１８８７を有する細胞株によって産生されることを特徴とする、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）に特異的な単離抗体、
ｇ．ａ）、ｂ）、ｃ）、ｄ）、ｅ）またはｆ）の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくその抗原結合フラグメントに曝される
ことを特徴とする請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
前記対象者の癌の治療に続いて行われることを特徴とする請求項１５〜２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
前記抗体または抗体フラグメントは、標識されることを特徴とする請求項１１〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
前記標識は、放射性標識、蛍光標識、エピトープタグ、ビオチン、発色団標識、ＥＣＬ標識、または酵素であることを特徴とする請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記曝される葉酸受容体アルファ（ＦＲα）は細胞に結合している、または結合していないことを特徴とする請求項１１〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
前記試料における葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の存在は、ウエスタンブロット、免疫組織化学、フローサイトメトリー、ラジオイムノアッセイ、免疫沈降、電気化学発光免疫アッセイ（ＥＣＬＩＡ）またはＥＬＩＳＡを使用して検出されることを特徴とする請求項１１〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
生体試料における葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の存在を検出するためのキットであって、
ｉ．請求項１もしくは１０に記載の少なくとも１つの抗体もしくはその抗原結合フラグメント、および／または、
ｉｉ．請求項１０に記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくはその抗原結合フラグメント；ならびに
使用しないときに前記抗体を収容するための容器、および、前記抗体の使用の指示
を含むことを特徴とするキット。
【請求項３１】
生体試料における葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の存在を検出するためのキットであって、
ｉ．請求項１もしくは１０に記載の少なくとも１つの抗体もしくはその抗原結合フラグメント、および／または、
ｉｉ．請求項１０に記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくはその抗原結合フラグメント
を含み、
前記含まれる抗体またはその抗原結合フラグメントが、固体支持体に貼付されていることを特徴とするキット。
【請求項３２】
生体試料における葉酸受容体アルファ（ＦＲα）の存在を検出するためのキットであって、
ｉ．請求項１もしくは１０に記載の少なくとも１つの抗体もしくはその抗原結合フラグメント、および／または、
ｉｉ．請求項１０に記載の抗体が結合する、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）のエピトープに結合することが可能な抗体もしくはその抗原結合フラグメント
を含み、
前記含まれる抗体またはその抗原結合フラグメントが、検出可能に標識されていることを特徴とするキット。
【請求項３３】
前記対象者の葉酸受容体アルファ（ＦＲα）レベルは、前記対象者が患う癌の種類を示すことを特徴とする請求項１３〜１４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
前記癌は肺腺癌または肺扁平上皮癌であることを特徴とする請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記抗体は検出可能に標識されていることを特徴とする請求項１〜３または１０のいずれか１項に記載の単離抗体。
【請求項３６】
前記識別可能な標識は、放射性標識、蛍光標識、エピトープタグ、ビオチン、発色団標識、ＥＣＬ標識、または酵素であることを特徴とする請求項３５に記載の抗体。
【請求項３７】
前記標識は、ルテニウム、１１１Ｉｎ−ＤＯＴＡ、１１１Ｉｎ−ジエチレントリアミン５酢酸（ＤＴＰＡ）、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリ性ホスファターゼおよびベータガラクトシダーゼ、またはポリヒスチジンであることを特徴とする請求項３６に記載の抗体。
【請求項３８】
前記抗体または抗原結合フラグメントは、固体支持体に貼付されていることを特徴とする請求項１１〜２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
請求項１３〜１４のいずれか１項に記載の方法であって、葉酸受容体アルファ（ＦＲα）を発現する腺癌を有する対象者の好ましい転帰を予測することをさらに含み、前記好ましい転帰は、５年生存率が高くなることであると定義されることを特徴とする方法。