【手続補正書】
【提出日】平成27年11月2日(2015.11.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）配列番号１、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１４０、
ｂ）配列番号２、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４０、
ｃ）配列番号３、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１２０、
ｄ）配列番号４、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−６０、および
ｅ）配列番号５、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４１
からなる群から選択される、３から８の間のｐＨにおいて活性なＳ８／Ｓ５３ファミリーのエンドペプチダーゼ。
【請求項２】
ａ）配列番号１または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１４０、
ｂ）配列番号２または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４０、
ｃ）配列番号３または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１２０、
ｄ）配列番号４または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−６０、および
ｅ）配列番号５または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４１
からなる群から選択される、請求項１に記載のエンドペプチダーゼ。
【請求項３】
ａ）配列番号１または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１４０、および
ｂ）配列番号２または少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４０
からなる群から選択される、請求項１または２に記載のエンドペプチダーゼ。
【請求項４】
アクチノアロムルス（Ａｃｔｉｎｏａｌｌｏｍｕｒｕｓ）株から得られる、請求項１から３のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ。
【請求項５】
ＤＳＭＺに受託番号ＤＳＭ２４９８８として寄託されたアクチノアロムルス属種（Ａｃｔｉｎｏａｌｌｏｍｕｒｕｓ  ｓｐ．）から得られる、請求項４に記載のエンドペプチダーゼ。
【請求項６】
胃および膵臓の酵素による切断に対して耐性があり、腸管腔内に存在することにより毒性作用を生じる、グルテンオリゴペプチドを加水分解できる、請求項１から５のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ。
【請求項７】
請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼを含む、酵素組成物。
【請求項８】
さらに、プロリル−エンドプロテアーゼ、ｘ−プロリル−ジペプチジルアミノペプチダーゼおよびプロリル−アミノペプチダーゼから選択される１つ以上の他のタンパク質分解酵素を含む、請求項７に記載の酵素組成物。
【請求項９】
エンドペプチダーゼが、別のポリペプチドに作動可能に融合されて、キメラまたは標識（ｔａｐｐｅｄ）タンパク質を形成する、請求項７または８に記載の酵素組成物。
【請求項１０】
セリアック病、疱疹状皮膚炎および／またはグルテン不耐性に関連する任意の他の障害を治療または予防するための医薬として使用するための、請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ。
【請求項１１】
セリアック病、疱疹状皮膚炎および／またはグルテン不耐性に関連する任意の他の障害を治療または予防するための医薬として使用するための、請求項７から９のいずれか一項に記載の酵素組成物。
【請求項１２】
食品および飲み物に使用されるタンパク質加水分解物を製造するための、請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ、または請求項７から９のいずれか一項に記載の酵素組成物の使用。
【請求項１３】
請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ、または請求項７から９のいずれか一項に記載の酵素組成物を、活性タンパク質分解成分として含む、医薬製剤。
【請求項１４】
経口医薬製剤である、請求項１３に記載の医薬製剤。
【請求項１５】
請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ、または請求項７から９のいずれか一項に記載の酵素組成物を、活性タンパク質分解成分として含む、栄養補助食品。
【請求項１６】
配列番号７、８、９、１０および１１から選択される少なくとも１つのポリヌクレオチド配列または配列番号７、８、９、１０および１１のいずれか１つに対して少なくとも９０％の同一性を有する少なくとも１つのポリヌクレオチド配列を含み、請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼをコードする、単離された核酸。
【請求項１７】
配列番号７、８、９、１０および１１のいずれか１つに対して少なくとも９５％の同一性を有する、少なくとも１つのポリヌクレオチド配列を含む、請求項１６に記載の単離された核酸。
【請求項１８】
配列番号７および８から選択される少なくとも１つのポリヌクレオチド配列を含む、請求項１６または１７に記載の単離された核酸。
【請求項１９】
請求項７に記載の酵素組成物を産生する方法であって、
Ａ）請求項１に定義されたＳ８／Ｓ５３ファミリーの少なくとも１つのエンドペプチダーゼを産生できる天然に存在するアクチノアロムルス株を、前記酵素組成物を産生するのに適した条件下で、培養培地中に培養し、培養バッチから酵素組成物を回収する工程、または
Ｂ）請求項１に定義されたＳ８／Ｓ５３ファミリーの少なくとも１つのエンドペプチダーゼを産生する能力を維持し、工程Ａ）で定義された天然に存在する株から従来の変異および／もしくは選択手順により得られる、アクチノアロムルス株を、前記酵素組成物を産生するのに適した条件下で、培養培地中に培養し、培養バッチから酵素組成物を回収する工程、または
Ｃ）
ａ）配列番号１、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％もしくは９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１４０、
ｂ）配列番号２、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％もしくは９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４０、
ｃ）配列番号３、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％もしくは９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−１２０、
ｄ）配列番号４、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％もしくは９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−６０および
ｅ）配列番号５、この生物学的活性断片、この天然に存在する対立遺伝子バリアントまたは少なくとも９０％もしくは９５％の同一性を有する配列を含むｅｎｄｏｐｅｐ−４１
からなる群から選択されるＳ８／Ｓ５３ファミリーの少なくとも１つのエンドペプチダーゼをコードする核酸を宿主細胞内に組み込み、前記エンドペプチダーゼを産生するのに適した条件下で培養培地中に細胞を培養し、培養バッチからエンドペプチダーゼを回収する工程、
を含む、方法。
【請求項２０】
アクチノアロムルス株が、請求項１に記載の少なくとも１つのエンドペプチダーゼを産生できるカテヌリスポラ（Ｃａｔｅｎｕｌｉｓｐｏｒａ）、クテドノバクター（Ｋｔｅｄｏｎｏｂａｃｔｅｒ）またはストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）の属に属している株により置き換えられる、請求項１９の工程Ａ）または工程Ｂ）に記載の方法。
【請求項２１】
アクチノアロムルス株が、ＤＳＭＺに受託番号ＤＳＭ２４９８８として寄託されたアクチノアロムルス属種である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２２】
核酸が、請求項１６または１７において同定されたポリヌクレオチド配列のうちの少なくとも１つを含む、請求項１９の工程Ｃ）に記載の方法。
【請求項２３】
核酸が、配列番号７および８のポリヌクレオチド配列のうちの少なくとも１つまたは配列番号７および８のいずれか１つに対して少なくとも９５％の同一性を有するポリヌクレオチド配列のうちの少なくとも１つを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
宿主細胞が、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、ストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、パイロコッカス（Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ）、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）およびエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）から選択される微生物である、請求項１９の工程Ｃ）、請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項２５】
宿主細胞が、エシェリキア・コリＢＬ２１（ＤＥ３）Ｓｔａｒである、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
ＤＳＭＺに受託番号ＤＳＭ２４９８８として寄託された、アクチノアロムルス株。
【請求項２７】
胃および膵臓の酵素による切断に対して耐性があり、腸管腔内に存在することにより毒性作用を生じる、グルテンオリゴペプチドを分解する方法であって、グルテンオリゴペプチドを、請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ、または請求項７から９のいずれか一項に記載の酵素組成物と接触させる工程を含む、方法。
【請求項２８】
胃および膵臓の酵素による切断に対して耐性があり、内部管腔に存在することにより毒性作用を生じる、グルテンオリゴペプチドを加水分解するための、栄養補助食品の製造における、請求項１から６のいずれか一項に記載のエンドペプチダーゼ、または請求項７から９のいずれか一項に記載の酵素組成物の使用。
【請求項２９】
エンドペプチダーゼまたは酵素組成物が固定化形態である、請求項２８に記載の使用。
【請求項３０】
流動食品を処理するための、請求項２９に記載の使用。