【手続補正書】
【提出日】平成27年8月26日(2015.8.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）配列番号２に示されるアミノ酸配列を有する細菌Ｉｇ様ドメインタンパク質断片（ｏｒｆ４０５Ｂ）またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質と、（ｉｉ）配列番号８に示されるアミノ酸配列を有する推定リポタンパク質（ｏｒｆ３５２６）またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質の組み合わせを含む免疫原性組成物。
【請求項２】
（ｉｉｉ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を有するｕｐｅｃ１２３２またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質をさらに含む、請求項１に記載の免疫原性組成物。
【請求項３】
（ｉｖ）配列番号３０に示されるアミノ酸配列を有するｇｓｐＫ（ｏｒｆ３５１５）またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質をさらに含む、請求項１または請求項２に記載の免疫原性組成物。
【請求項４】
少なくとも１種の細菌毒素をさらに含む、請求項１から３のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【請求項５】
前記細菌毒素が、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ毒素である、請求項４に記載の免疫原性組成物。
【請求項６】
前記細菌毒素が、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ（ＬＴＫ６３）の修飾された熱不安定性毒素である、請求項５に記載の免疫原性組成物。
【請求項７】
前記推定リポタンパク質（ｏｒｆ３５２６）が、配列番号８に関して位置１３０４、１３０５、１３０６、１３０７および／または１３０８の少なくとも１個のアミノ酸が、別のアミノ酸によって置換されており、変異体ｏｒｆ３５２６タンパク質の亜鉛結合活性が、野生型ｏｒｆ３５２６に対して少なくとも５０％低下している変異体タンパク質である、請求項１から６のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【請求項８】
前記変異体ｏｒｆ３５２６タンパク質が、配列番号３１のアミノ酸配列を含む、請求項７に記載の免疫原性組成物。
【請求項９】
１種または複数の薬学的に許容される担体、希釈剤および／またはアジュバントをさらに含む、請求項１から８のいずれかに記載の免疫原性組成物。
【請求項１０】
ワクチン組成物である、請求項９に記載の免疫原性組成物。
【請求項１１】
医薬において使用するための、請求項１から１０のいずれかに記載の免疫原性組成物。
【請求項１２】
Ｅ．ｃｏｌｉによる感染の処置または予防において使用するための、請求項１から１０のいずれかに記載の免疫原性組成物。
【請求項１３】
哺乳動物においてＥ．ｃｏｌｉによる感染を処置または予防するための、請求項１から１０のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【請求項１４】
Ｅ．ｃｏｌｉによる前記感染が、腸外病原性Ｅ．ｃｏｌｉおよび腸内病原性Ｅ．ｃｏｌｉの両方による感染を含む、請求項１２または１３に記載の免疫原性組成物。
【請求項１５】
前記免疫原性組成物が、粘膜表面に投与されることを特徴とする、請求項１２から１４のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【請求項１６】
前記粘膜表面が、鼻上皮を含む、請求項１５に記載の免疫原性組成物。
【請求項１７】
前記粘膜表面が、口腔粘膜を含む、請求項１５に記載の免疫原性組成物。
【請求項１８】
前記粘膜表面が、胃、小腸、大腸および直腸からなる群より選択される胃腸器官の管腔表面を含む、請求項１５に記載の免疫原性組成物。
【請求項１９】
前記免疫原性組成物が、非経口投与によって投与されることを特徴とする、請求項１２、１３もしくは１４に記載の免疫原性組成物。
【請求項２０】
（ｉ）配列番号３１のアミノ酸配列または（ｉｉ）アミノ酸位置１３０４、１３０５および１３０８を含む配列番号３１の免疫原性断片を含むポリペプチド。
【請求項２１】
抗体に結合するポリペプチドであって、前記抗体は、
（ｉ）１７分あたりで溶出するか、またはアイソフォームＡの後および／もしくはアイソフォームＣの前に溶出する画分の組換え３５２６ポリペプチド（複数可）を含む組成物から、サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、ＣａｐｔｏＱおよび／またはブチルセファロースクロマトグラフィー）を使用する精製によって取得可能な３５２６ポリペプチドのアイソフォームＢと結合するが、前記抗体が、
（ｉｉ）１６分あたりで溶出する画分の、またはアイソフォームＢの前および／もしくはアイソフォームＣの前に溶出する画分の組換え３５２６ポリペプチド（複数可）を含む組成物から、サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、ＣａｐｔｏＱおよび／またはブチルセファロースクロマトグラフィー）を使用する精製によって取得可能な３５２６ポリペプチドのアイソフォームＡと結合せず、
１９分あたりで溶出するか、またはアイソフォームＡの後および／もしくはアイソフォームの後に溶出する画分の組換え３５２６ポリペプチド（複数可）を含む組成物から、サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、ＣａｐｔｏＱおよび／またはブチルセファロースクロマトグラフィー）を使用する精製によって取得可能な３５２６ポリペプチドのアイソフォームＣとも結合しない、
ポリペプチド。
【請求項２２】
前記推定リポタンパク質（ｏｒｆ３５２６）が、請求項２１に記載のポリペプチドである、請求項１から１２のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３２】
本発明はまた、これらのアイソフォームのうち１種または複数を含む免疫原性組成物および例えば、哺乳動物においてＥ．ｃｏｌｉ感染を処置または予防するための方法におけるそれらの使用を提供する。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
（ｉ）配列番号２に示されるアミノ酸配列を有する細菌Ｉｇ様ドメインタンパク質断片（ｏｒｆ４０５Ｂ）またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質と、（ｉｉ）配列番号８に示されるアミノ酸配列を有する推定リポタンパク質（ｏｒｆ３５２６）またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質の組み合わせを含む免疫原性組成物。
（項目２）
（ｉｉｉ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を有するｕｐｅｃ１２３２またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質をさらに含む、項目１に記載の免疫原性組成物。
（項目３）
（ｉｖ）配列番号３０に示されるアミノ酸配列を有するｇｓｐＫ（ｏｒｆ３５１５）またはそれに対して少なくとも８０％の類似性を有するタンパク質をさらに含む、項目１または項目２に記載の免疫原性組成物。
（項目４）
少なくとも１種の細菌毒素をさらに含む、項目１から３のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目５）
上記細菌毒素が、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ毒素である、項目４に記載の免疫原性組成物。
（項目６）
上記細菌毒素が、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ（ＬＴＫ６３）の修飾された熱不安定性毒素である、項目５に記載の免疫原性組成物。
（項目７）
上記推定リポタンパク質（ｏｒｆ３５２６）が、配列番号８に関して位置１３０４、１３０５、１３０６、１３０７および／または１３０８の少なくとも１個のアミノ酸が、別のアミノ酸によって置換されており、変異体ｏｒｆ３５２６タンパク質の亜鉛結合活性が、野生型ｏｒｆ３５２６に対して少なくとも５０％低下している変異体タンパク質である、項目１から６のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目８）
上記変異体ｏｒｆ３５２６タンパク質が、配列番号３１のアミノ酸配列を含む、項目７に記載の免疫原性組成物。
（項目９）
１種または複数の薬学的に許容される担体、希釈剤および／またはアジュバントを含む、上記の項目のいずれかに記載の免疫原性組成物。
（項目１０）
ワクチン組成物である、項目９に記載の免疫原性組成物。
（項目１１）
医薬において使用するための、項目１から１０のいずれかに記載の免疫原性組成物。
（項目１２）
Ｅ．ｃｏｌｉによる感染の処置または予防において使用するための、項目１から１０のいずれかに記載の免疫原性組成物。
（項目１３）
哺乳動物においてＥ．ｃｏｌｉ感染を処置または予防するための方法であって、上記哺乳動物に、有効量の項目１から１０のいずれか一項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む、方法。
（項目１４）
Ｅ．ｃｏｌｉによる上記感染が、腸外病原性Ｅ．ｃｏｌｉおよび腸内病原性Ｅ．ｃｏｌｉの両方による感染を含む、項目１３に記載の方法または項目１２に記載の使用のための項目１２に記載の免疫原性組成物。
（項目１５）
上記免疫原性組成物が、粘膜表面に投与される、項目１３もしくは１４に記載の方法または項目１２もしくは１４に記載の使用のための項目１２もしくは１４に記載の免疫原性組成物。
（項目１６）
上記粘膜表面が、鼻上皮を含む、項目１５に記載の方法または項目１５に記載の使用のための項目１５に記載の免疫原性組成物。
（項目１７）
上記粘膜表面が、口腔粘膜を含む、項目１５に記載の方法または項目１５に記載の使用のための項目１５に記載の免疫原性組成物。
（項目１８）
上記粘膜表面が、胃、小腸、大腸および直腸からなる群より選択される胃腸器官の管腔表面を含む、項目１５に記載の方法または項目１５に記載の使用のための項目１５に記載の免疫原性組成物。
（項目１９）
上記免疫原性組成物が、非経口投与によって投与される、項目１３もしくは１４に記載の方法または項目１２もしくは１４に記載の使用のための項目１２もしくは１４に記載の免疫原性組成物。
（項目２０）
（ｉ）配列番号３１のアミノ酸配列または（ｉｉ）アミノ酸位置１３０４、１３０５および１３０８を含む配列番号３１の免疫原性断片を含むポリペプチド。
（項目２１）
抗体に結合するポリペプチドであって、上記抗体は、
（ｉ）１７分あたりで溶出するか、またはアイソフォームＡの後および／もしくはアイソフォームＣの前に溶出する画分の組換え３５２６ポリペプチド（複数可）を含む組成物から、サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、ＣａｐｔｏＱおよび／またはブチルセファロースクロマトグラフィー）を使用する精製によって取得可能な３５２６ポリペプチドのアイソフォームＢと結合するが、上記抗体が、
（ｉｉ）１６分あたりで溶出する画分の、またはアイソフォームＢの前および／もしくはアイソフォームＣの前に溶出する画分の組換え３５２６ポリペプチド（複数可）を含む組成物から、サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、ＣａｐｔｏＱおよび／またはブチルセファロースクロマトグラフィー）を使用する精製によって取得可能な３５２６ポリペプチドのアイソフォームＡと結合せず、
１９分あたりで溶出するか、またはアイソフォームＡの後および／もしくはアイソフォームの後に溶出する画分の組換え３５２６ポリペプチド（複数可）を含む組成物から、サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、ＣａｐｔｏＱおよび／またはブチルセファロースクロマトグラフィー）を使用する精製によって取得可能な３５２６ポリペプチドのアイソフォームＣとも結合しない、
ポリペプチド。
（項目２２）
上記推定リポタンパク質（ｏｒｆ３５２６）が、項目２１に記載のポリペプチドである、項目１から１２のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。