【誤訳訂正書】
【提出日】平成26年12月19日(2014.12.19)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
血液疾患、特に骨髄性および／またはリンパ性血液疾患、好ましくは骨髄性血液疾患の、好ましくはインビトロでの、診断および／または分類の補助のための方法であって、
ａ）被験者の血液試料に含まれる細胞から、好ましくは血液細胞または骨髄細胞を含有する試料から、少なくとも、２４遺伝子の群の中から選択される遺伝子のセットに属する６遺伝子のサブグループの遺伝子の発現レベルを測定する工程、ここで、前記２４遺伝子の群は配列番号：１〜２４の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成され、
前記６遺伝子は、配列番号：１〜６の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成される前記サブグループに属するものとし、
ｂ）工程ａ）で測定された各遺伝子の発現レベルを、対照試料に含まれる細胞から、好ましくは血液細胞または骨髄細胞を含有する試料からの同じそれぞれの遺伝子の発現レベルと比較して、前記サブグループの各遺伝子ついての遺伝子発現レベル比を確立する工程、ここで、前記対照試料は前記生物学的試料と同じ性質であるものとし、および
ｃ）前記生物学的試料の状態を、前記サブグループからの少なくとも３個の遺伝子の任意の組合せの各遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２または≦０．５のいずれかである場合に、前記生物学的試料は血液疾患細胞を示していると判定する工程、
を含む前記方法。
【請求項２】
工程ｂ）で確立された比率が、
・配列番号：１の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成される遺伝子について、≦０．３、ならびに
・配列番号：２および３の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成される遺伝子について、≧３．０である場合に、
前記生物学的試料は急性骨髄性白血病を示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
工程ｃ）が次のとおりである：
・前記サブグループからの３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２または≦０．５のいずれかである場合、
ただし、
・前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：１の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の発現レベル間の比率が≦０．３ではないか、または
・前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：２もしくは３の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の各々の発現レベル間の比率が≧３ではない場合、
前記生物学的試料は、骨髄異形成疾患、特に不応性貧血、不応性血球減少症または芽球増加を伴う不応性貧血、５ｑ−症候群の中から選択される骨髄異形成を示す、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記セットが１０遺伝子を含み、前記１０遺伝子は、配列番号：１〜１０の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成され、ならびに工程ｃ）は次のとおりである：
・前記サブグループからの３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２または≦０．５のいずれかである場合、
ただし、
前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：１の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の発現レベル間の比率が≦０．３ではないか、または
・前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：２もしくは３の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の各々の発現レベル間の比率が≧３ではなく、
さらに
・前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２であり、および前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の他の遺伝子の工程ｂ）で確立された比率が≦０．５であれば、
前記生物学的試料は、芽球増加を伴う不応性貧血または５ｑ−症候群を示す、請求項１または３に記載の方法。
【請求項５】
前記セットが１０遺伝子を含み、前記１０遺伝子は、配列番号：１〜１０の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成され、および工程ｃ）は次のとおりである：
・前記サブグループからの３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２または≦０．５のいずれかである場合、
ただし、
前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：１の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の発現レベル間の比率が≦０．３ではないか、または
・前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：２もしくは３の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の各々の発現レベル間の比率が≧３ではなく、
ならびに
・前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２であり、および前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の他の遺伝子の工程ｂ）で確立された比率が≦０．５であり、
さらに
前記セットに属さない２４遺伝子の群の少なくとも４遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧３であれば、
前記生物学的試料は芽球増加を伴う不応性貧血を示す、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
遺伝子の発現レベルを定量的方法、特にＲＴ−ｑＰＣＲによって測定する、請求項１から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
少なくとも工程ａ）における前記サブグループの遺伝子の発現レベルの測定を、少なくとも配列番号：２５〜３６のヌクレオチド分子を使用することによって実施する、請求項１から６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
配列番号：２５〜７２の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列から成る４８オリゴヌクレオチドのライブラリの中から選択される少なくとも１２のオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項９】
配列番号：２５〜３６の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列から成る少なくとも１２のオリゴヌクレオチドを含む、請求項８に記載の組成物。
【請求項１０】
血液疾患、特に骨髄性および／またはリンパ性血液疾患、好ましくは骨髄性血液疾患の、好ましくはインビトロでの、診断および／または分類に使用するための、請求項８または９に記載の組成物。
【請求項１１】
配列番号：２５〜７２の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列から成る４８オリゴヌクレオチドの群の中から選択される少なくとも１２のオリゴヌクレオチドを含むキットであって、前記少なくとも１２のオリゴヌクレオチドが配列番号：２５〜３６の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列から成る、キット。
【請求項１２】
血液疾患の治療の効果の判定を補助するための方法であって、前記治療は患者に投与される傾向があり、
ａ）血液疾患、好ましくは骨髄性および／またはリンパ性血液疾患、より好ましくは骨髄性血液疾患に罹患した被験者の生物学的試料を、好ましくはインビトロで、前記血液疾患を治療するために使用される傾向があるかまたは前記疾患を治療する傾向がある薬剤と接触させる工程、
ｂ）工程ａ）で薬剤と接触させた生物学的試料において、少なくとも、２４遺伝子の群の中から選択される遺伝子のセットに属する６遺伝子のサブグループの遺伝子の発現レベルを測定する工程、ここで、前記２４遺伝子の群は配列番号：１〜２４の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成され、
前記６遺伝子は、配列番号：１〜６の核酸配列を含むかまたは前記核酸配列によって構成される前記サブグループに属し、および
ｃ）前記の、少なくとも、工程ｂ）で得られた２４遺伝子の群の中から選択される遺伝子のセットに属する６遺伝子のサブグループの遺伝子の発現レベルを、前記血液疾患を治療するために使用される傾向があるかまたは前記疾患を治療する傾向がある前記薬剤と接触させていない前記生物学的試料での測定で得られた、前記の、少なくとも、２４遺伝子の群の中から選択される遺伝子のセットに属する６遺伝子のサブグループの遺伝子の発現レベルと比較する工程、
を含む方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６５】
ＧＰＸ４遺伝子は、２つの異なる変異体：配列番号：１４の核酸配列を含むかまたはこの核酸配列から成る第一変異体および配列番号：８３の核酸配列を含むかまたはこの核酸配列から成る第二変異体を発現することができる。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００８８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００８８】
本発明によれば、配列番号：１〜６の核酸を含むかまたはこれによって構成される遺伝子によって構成されるサブグループに属する少なくとも３個の遺伝子の比率が、配列番号：１の比率が≦０．３であり、ならびに配列番号：２および３の比率が≧３である配列番号：１、配列番号：２および配列番号：３の特定の組合せを除き、≧２または≦０．５のいずれかである場合、生物学的試料は、骨髄異形成疾患、特に環状鉄芽球を伴う不応性貧血（ＲＡＲＳ）、多血球系異形成を伴う不応性血球減少症（ＲＣＭＤ）、芽球増加を伴う不応性貧血（ＲＡＥＢ）または５ｑ−症候群および分類できない骨髄異形成の中から選択される骨髄異形成を示す。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００９５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００９５】
さらに別の実施形態では、本発明は上記で定義された方法に関し、ここで、
前記セットは１０遺伝子を含み、前記１０遺伝子は、配列番号：１〜１０の核酸配列を含むかまたはこれらの核酸配列によって構成され、および工程ｃ）は次のとおりである：
・前記サブグループからの３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２または≦０．５のいずれかである場合、
ただし、
前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：１の核酸配列を含むかもしくはこの核酸配列によって構成される遺伝子の発現レベル間の比率が≦０．３ではないか、または
・前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：２もしくは３の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の各々の発現レベル間の比率が≧３ではなく、
さらに
・前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２であり、および前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の他の遺伝子の工程ｂ）で確立された比率が≦０．５であれば、
前記生物学的試料は、芽球増加を伴う不応性貧血または５ｑ−症候群を示す。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１００
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１００】
本発明の別の好都合な実施形態は、先に定義された方法に関し、ここで、
前記セットは１０遺伝子を含み、前記１０遺伝子は、配列番号：１〜１０の核酸配列を含むかまたはこれらの核酸配列によって構成され、および工程ｃ）は次のとおりである：
・前記サブグループからの３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２または≦０．５のいずれかである場合、
ただし、
前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：１の核酸配列を含むかもしくはこの核酸配列によって構成される遺伝子の発現レベル間の比率が≦０．３ではないか、または
・前記生物学的試料で測定されたおよび前記対照試料で測定された配列番号：２もしくは３の核酸配列を含むかもしくは前記核酸配列によって構成される遺伝子の各々の発現レベル間の比率が≧３ではなく、
ならびに
・前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧２であり、および前記サブグループに属さない前記セットの少なくとも１個の他の遺伝子の工程ｂ）で確立された比率が≦０．５であり、
さらに
前記セットに属さない２４遺伝子の群の少なくとも４遺伝子について工程ｂ）で確立された比率が≧３であれば、
前記生物学的試料は、芽球増加を伴う不応性貧血を示す。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１０６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１０６】
本発明による方法のこの好都合な実施形態では、工程ｃ）において、遺伝子ＧＰＸ３（配列番号：１）の発現レベルの比率Ｒｉが≦０．３であり、遺伝子ＧＰＸ１（１）（配列番号：２）の発現レベルの比率が≧３.０であり、および遺伝子ＧＬＲＸ２（２）（配列番号：３）の発現レベルの比率が≧３.０である場合、生物学的試料は急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）を示す。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１１８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１１８】
１つの別の好都合な実施形態では、本発明は上述した定義による方法に関し、ここでさらに、工程ｃ）において、
・前記セットに属さない遺伝子の前記群に属する少なくとも１個の遺伝子の比率Ｒｉが≦０．３である場合、前記生物学的試料は環状鉄芽球を伴う不応性貧血を示し、および
・前記セットに属さない遺伝子の前記群に属する少なくとも１個の遺伝子の比率Ｒｉが≧３.０である場合、前記生物学的試料は多血球系異形成を伴う不応性血球減少症を示す。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２２】
要約すると、
１）ａ）白血病を定義する組合せを除き、配列番号：１、２、３、４、５および６によって示される６遺伝子の中から選択される３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子についての比率が≧２．０または≦０．５のいずれかであり、ならびに
ｂ）配列番号：７、８、９および１０によって示される各遺伝子の比率が区間］０．３；２．０［に含まれ、ならびに
ｃ）配列番号：１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３および２４によって示される、少なくとも１個の遺伝子、すなわち１または２または３または４または５または６または７または８または９または１０または１１または１２または１３または１４個の遺伝子の比率が≧３．０である場合、前記生物学的試料は多血球系異形成を伴う不応性血球減少症を示し、ならびに
２）ａ）白血病を定義する組合せを除き、配列番号：１、２、３、４、５および６によって示される６遺伝子の中から選択される３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子についての比率が≧２．０または≦０．５のいずれかであり、ならびに
ｂ）配列番号：７、８、９および１０によって示される各遺伝子の比率が区間］０．３；２．０［に含まれ、ならびに
ｃ）配列番号：１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３および２４によって示される、少なくとも１個の遺伝子、すなわち１または２または３または４または５または６または７または８または９または１０または１１または１２または１３または１４個の遺伝子の比率が≦０．３である場合、前記生物学的試料は環状鉄芽球を伴う不応性貧血を示す。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１４０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１４０】
要約すると、
ａ）白血病を定義する組合せを除き、配列番号：１、２、３、４、５および６によって示される６遺伝子の中から選択される３遺伝子の任意の組合せの各遺伝子についての比率が≧２．０または≦０．５のいずれかであり、ならびに
ｂ）配列番号：７、８、９および１０によって示される少なくとも１個の遺伝子の比率が≦０．３であり、ならびに配列番号：７、８、９および１０によって示されるいずれの遺伝子の比率も≧２．０ではなく、ならびに
ｃ）配列番号：１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４によって示される少なくとも１個の遺伝子の比率Ｒｉが≧２．０である場合、前記生物学的試料は、５ｑ−症候群または多血球系異形成を伴う不応性血球減少症を示す。
【誤訳訂正１０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１５８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１５８】
配列番号：２５〜７２の核酸配列を含むかまたはこれらによって構成される２４対のオリゴヌクレオチドの群に属する少なくとも１０対のオリゴヌクレオチドを使用する、前記で定義された方法に関し、前記少なくとも１０対のオリゴヌクレオチドは、配列番号：２５〜４４の核酸配列を含むかまたはこれらによって構成される。
【誤訳訂正１１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０３０３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０３０３】
これらのデータは、ＣＭＭＬがＭＤＳとは異なることを明らかにする。