【手続補正書】
【提出日】平成27年1月26日(2015.1.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞において組み換え生産された水不混和性化合物を検出する方法であって、
（ａ）ヒドロゲル粒子に前記細胞を封入する工程；
（ｂ）前記ヒドロゲル粒子内で前記細胞を培養する工程であって、それにより細胞集団が前記粒子内で形成される、工程；ならびに
（ｃ）前記ヒドロゲル粒子内の前記組み換え生産された水不混和性化合物を検出する工程であって、前記検出する工程が、前記ヒドロゲル粒子と、蛍光ソルバトクロミック色素とを接触させること、および前記ヒドロゲル粒子内の水不混和性化合物の量を前記ヒドロゲル粒子内の細胞バイオマスの量に対して正規化することを含む、工程
を包含する、方法。
【請求項２】
前記封入する工程が、前記細胞と水性ヒドロゲル懸濁液とを、前記細胞を含むヒドロゲル粒子を形成するのに十分な条件下で接触させることを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記条件が、前記細胞を含む前記水性ヒドロゲル懸濁液と、フッ素系界面活性剤を含むフルオロカーボン油とを接触させることを含む、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
フルオロカーボン油との前記接触が、前記細胞を含む前記水性ヒドロゲル懸濁液を、前記フルオロカーボン油を含むマイクロ流体デバイスに負荷することを含み、前記ヒドロゲル懸濁液が、前記マイクロ流体デバイスのＴ字接合部で前記フルオロカーボン油と接触し、前記フルオロカーボン油との前記接触により、前記細胞を含む非水性ヒドロゲル粒子が形成されることとなる、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記ヒドロゲル粒子を前記フルオロカーボン油から分離する工程をさらに包含する、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記検出する工程の前に前記ヒドロゲル粒子内で前記細胞を培養する工程をさらに包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記培養する工程が、１２時間から２４時間の期間にわたるものである、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
水不混和性化合物を組み換え生産する細胞について細胞のライブラリをスクリーニングする方法であって、
（ａ）前記ライブラリの各細胞をヒドロゲル粒子に封入する工程；
（ｂ）前記ヒドロゲル粒子内で前記細胞を培養する工程であって、それにより細胞集団が前記粒子内で形成される、工程； 
（ｃ）各ヒドロゲル粒子内の組み換え生産された水不混和性化合物を検出する工程であって、前記検出する工程が、前記ヒドロゲル粒子と、蛍光ソルバトクロミック色素とを接触させること、および前記ヒドロゲル粒子内の水不混和性化合物の量を前記ヒドロゲル粒子内の細胞バイオマスの量に対して正規化することを含む、工程；ならびに
（ｄ）前記組み換え生産された水不混和性化合物を生産する細胞を選択する工程
を包含する、方法。
【請求項９】
水不混和性化合物を組み換え生産する細胞について細胞の集団を富化する方法であって、
（ａ）水不混和性化合物を生産するように遺伝的に修飾された細胞または細胞のクローン集団を封入するヒドロゲル粒子を含む、ヒドロゲル粒子の集団を提供する工程；
（ｂ）各ヒドロゲル粒子内で前記細胞または前記細胞のクローン集団を培養する工程；
（ｃ）組み換え生産された水不混和性化合物を含むヒドロゲル粒子を検出する工程であって、前記検出する工程が、前記ヒドロゲル粒子と、蛍光ソルバトクロミック色素とを接触させること、および前記ヒドロゲル粒子内の水不混和性化合物の量を前記ヒドロゲル粒子内の細胞バイオマスの量に対して正規化することを含む、工程；
（ｄ）前記細胞または前記細胞のクローン集団を工程（ｃ）のヒドロゲル粒子から回収する工程；
（ｅ）工程（ｄ）からの細胞または細胞のクローン集団を再び封入する工程；および
（ｆ）工程（ａ）〜（ｄ）を反復する工程
を包含する、方法。
【請求項１０】
ヒドロゲルに封入された細胞集団であって、前記細胞集団は、組み換え生産された水不混和性化合物、および前記ヒドロゲル内の水不混和性化合物の量を前記ヒドロゲル内の細胞バイオマスの量に対して正規化することを可能にする蛍光ソルバトクロミック色素を含む、細胞集団。
【請求項１１】
前記蛍光ソルバトクロミック色素が、ナイルレッドである、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記細胞が、酵母細胞、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、昆虫細胞および植物細胞からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記蛍光ソルバトクロミック色素が、ナイルレッドである、請求項１０に記載のヒドロゲルに封入された細胞集団。
【請求項１４】
前記細胞が、酵母細胞、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、昆虫細胞および植物細胞からなる群より選択される、請求項１０に記載のヒドロゲルに封入された細胞集団。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
もう１つの態様では、細胞またはクローン細胞集団を含み、組み換え生産された水不混和性化合物をさらに含むヒドロゲル粒子を本明細書に提供する。一部の実施形態において、前記細胞は、真菌細胞、例えば酵母細胞、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、昆虫細胞、および植物細胞からなる群より選択される。一部の実施形態において、前記細胞は酵母細胞である。一部の実施形態において、前記酵母は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅである。一部の実施形態において、前記ヒドロゲルはアガロースを含む。一部の実施形態において、前記ヒドロゲル粒子は、直径約１ミリメートル未満である。一部の実施形態において、前記ヒドロゲル粒子は、直径約５００マイクロメートル未満である。一部の実施形態において、前記ヒドロゲル粒子は、直径約１００マイクロメートル未満である。一部の実施形態において、前記ヒドロゲル粒子は、直径約５０マイクロメートル未満である。一部の実施形態において、前記ヒドロゲル粒子は、直径約５０マイクロメートル、約４５マイクロメートル、約４０マイクロメートル、約３５マイクロメートル、約３０マイクロメートルまたは約２５マイクロメートルである。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
細胞において組み換え生産された水不混和性化合物を検出する方法であって、
（ａ）ヒドロゲル粒子に上記細胞を封入する工程；および
（ｂ）上記ヒドロゲル粒子内の上記組み換え生産された水不混和性化合物を検出する工程
を包含する、方法。
（項目２）
上記検出する工程が、上記ヒドロゲル粒子と、上記組み換え生産された水不混和性化合物に直接結合する蛍光色素とを接触させること、および上記ヒドロゲル粒子内の上記蛍光色素を検出することを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
上記蛍光色素が、ソルバトクロミック色素である、項目２に記載の方法。
（項目４）
上記蛍光色素が、ナイルレッドである、項目２に記載の方法。
（項目５）
上記検出する工程が、上記ヒドロゲル粒子内の水不混和性化合物の量を上記ヒドロゲル粒子内の細胞バイオマスの量に対して正規化することを含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
上記細胞が、酵母細胞、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、昆虫細胞および植物細胞からなる群より選択される、項目１に記載の方法。
（項目７）
上記細胞が酵母細胞である、項目５に記載の方法。
（項目８）
上記組み換え生産された水不混和性化合物が、イソプレノイド、ポリケチドおよび脂肪酸からなる群より選択される、項目１に記載の方法。
（項目９）
上記ヒドロゲル粒子が、水不混和性化合物を保持することができる、項目１に記載の方法。
（項目１０）
上記ヒドロゲルが、アガロースを含む、項目１に記載の方法。
（項目１１）
上記ヒドロゲル粒子が、直径約１ミリメートル未満である、項目１に記載の方法。
（項目１２）
上記ヒドロゲル粒子が、直径約１００マイクロメートル未満である、項目１に記載の方法。
（項目１３）
上記ヒドロゲル粒子が、直径約５０マイクロメートル未満である、項目１に記載の方法。
（項目１４）
上記ヒドロゲル粒子が、直径約５０マイクロメートル、約４５マイクロメートル、約４０マイクロメートル、約３５マイクロメートル、約３０マイクロメートルまたは約２５マイクロメートルである、項目１に記載の方法。
（項目１５）
上記封入する工程が、上記細胞と水性ヒドロゲル懸濁液とを、上記細胞を含むヒドロゲル粒子を形成するのに十分な条件下で接触させることを含む、項目１に記載の方法。
（項目１６）
上記条件が、上記細胞を含む上記水性ヒドロゲル懸濁液と、フッ素系界面活性剤を含むフルオロカーボン油とを接触させることを含む、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
フルオロカーボン油との上記接触が、上記細胞を含む上記水性ヒドロゲル懸濁液を、上記フルオロカーボン油を含むマイクロ流体デバイスに負荷することを含み、上記ヒドロゲル懸濁液が、上記マイクロ流体デバイスのＴ字接合部で上記フルオロカーボン油と接触し、上記フルオロカーボン油との上記接触により、上記細胞を含む非水性ヒドロゲル粒子が形成されることとなる、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
上記ヒドロゲル粒子を上記フルオロカーボン油から分離する工程をさらに包含する、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
上記検出する工程の前に上記ヒドロゲル粒子内で上記細胞を培養する工程をさらに包含する、項目１に記載の方法。
（項目２０）
上記培養が、１２時間から２４時間の期間にわたるものである、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
上記組み換え生産された水不混和性化合物が、テルペン、Ｃ５イソプレノイド、Ｃ１０イソプレノイドまたはＣ１５イソプレノイドである、項目１に記載の方法。
（項目２２）
上記組み換え生産された水不混和性化合物がファルネセンである、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
上記細胞が、メバロン酸（ＭＥＶ）経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
上記組み換え酵母細胞が、ファルネセンシンターゼをコードしている核酸を含む、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
上記組み換え酵母細胞が、ＨＭＧ−ＣｏＡをメバロネートに転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
上記組み換え酵母細胞が、メバロネートをメバロン酸５−リン酸に転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目２３に記載の方法。
（項目２７）
上記１つ以上の異種ヌクレオチド配列が、メバロン酸経路の１つより多くの酵素をコードしている、項目２３に記載の方法。
（項目２８）
イソペンテニルピロリン酸（ＩＰＰ）をジメチルアリルピロリン酸（ＤＭＡＰＰ）に転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列をさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目２９）
イソプレノイド化合物を形成するようにＩＰＰまたはポリプレニルを修飾することができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列をさらに含む、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
上記酵素が、カレンシンターゼ、ゲラニオールシンターゼ、リナロールシンターゼ、リモネンシンターゼ、ミルセンシンターゼ、オシメンシンターゼ、α−ピネンシンターゼ、β−ピネンシンターゼ、γ−テルピネンシンターゼ、テルピノレンシンターゼ、アモルファジエンシンターゼ、α−ファルネセンシンターゼ、β−ファルネセンシンターゼ、ファルネソールシンターゼ、ネロリドールシンターゼ、パチュロールシンターゼ、ノートカトンシンターゼおよびアビエタジエンシンターゼからなる群より選択される、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
上記イソプレノイドが、Ｃ５〜Ｃ２０イソプレノイドである、項目２９に記載の方法。
（項目３２）
上記イソプレノイドが、アビエタジエン、アモルファジエン、カレン、α−ファルネセン、β−ファルネセン、ファルネソール、ゲラニオール、ゲラニルゲラニオール、イソプレン、リナロール、リモネン、ミルセン、ネロリドール、オシメン、パチュロール、β−ピネン、サビネン、γ−テルピネン、テルピノレンおよびバレンセンからなる群より選択される、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
上記細胞が、メバロン酸（ＭＥＶ）経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目２２に記載の方法。
（項目３４）
上記細胞が、ポリケチド生合成経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目２２に記載の方法。
（項目３５）
上記組み換え酵母細胞が、ポリケチドシンターゼ系（ＰＫＳ）をコードしている１つ以上の核酸を含む、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
上記ＰＫＳがモジュラーＰＫＳである、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
上記ＰＫＳが芳香族ＰＫＳである、項目３５に記載の方法。
（項目３８）
上記組み換え酵母細胞が、ケトシンターゼ／アシルトランスフェラーゼ（ＫＳ／ＡＴ）触媒領域を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目３５に記載の方法。
（項目３９）
上記組み換え酵母細胞が、鎖長因子（ＣＬＦ）触媒領域を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目３５に記載の方法。
（項目４０）
上記組み換え酵母細胞が、アシル担体タンパク質（ＡＣＰ）活性を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目３５に記載の方法。
（項目４１）
上記組み換え酵母細胞が、シクラーゼ（ＣＹＣ）触媒領域、ケトレダクターゼ（ＫＲ）触媒領域、アロマターゼ（ＡＲＯ）触媒領域、エノイルレダクターゼ（ＥＲ）触媒領域、チオエステラーゼ（ＴＥ）触媒領域またはホロＡＣＰシンターゼ活性を含む酵素をコードしている核酸をさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目４２）
上記細胞が、脂肪酸生合成経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目２２に記載の方法。
（項目４３）
上記組み換え酵母細胞が、アセチル−ＣｏＡシンターゼをコードしている核酸を含む、項目４２に記載の方法。
（項目４４）
上記組み換え酵母細胞が、アセチル−ＣｏＡをマロニル−ＣｏＡに転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目４２に記載の方法。
（項目４５）
上記組み換え酵母細胞が、マロニル−ＣｏＡシンターゼをコードしている核酸を含む、項目４２に記載の方法。
（項目４６）
上記組み換え酵母細胞が、異種ｐｄｈ、ｐａｎＫ、ａｃｅＥＦ、ｆａｂＨ、ｆａｂＤ、ｆａｂＧ、ａｃｐＰまたはｆａｂＦヌクレオチド配列を含む、項目４２に記載の方法。
（項目４７）
細胞において組み換え生産された水不混和性化合物を検出する方法であって、
（ａ）上記細胞を水性ヒドロゲル懸濁液と接触させる工程；
（ｂ）上記細胞を含む上記水性ヒドロゲル懸濁液を、フルオロカーボン油を含むマイクロ流体デバイスに負荷する工程であって、ここで、上記ヒドロゲル懸濁液は、上記マイクロ流体デバイスのＴ字接合部で上記フルオロカーボン油と接触し、上記フルオロカーボン油との上記接触によって、上記細胞を含む非水性ヒドロゲル粒子が形成されることとなる、工程；
（ｃ）上記ヒドロゲル粒子を上記フルオロカーボン油から分離する工程；
（ｄ）上記ヒドロゲル粒子内で上記細胞を培養する工程；
（ｅ）上記ヒドロゲル粒子と、上記組み換え生産された水不混和性化合物に直接結合する蛍光色素とを接触させる工程；および
（ｆ）上記ヒドロゲル粒子内の上記蛍光色素を検出する工程
を包含する、方法。
（項目４８）
水不混和性化合物を組み換え生産する細胞について細胞のライブラリをスクリーニングする方法であって、
（ａ）上記ライブラリの各細胞をヒドロゲル粒子に封入する工程；
（ｂ）各ヒドロゲル粒子内の組み換え生産された水不混和性化合物を検出する工程；および
（ｃ）上記組み換え生産された水不混和性化合物を生産する細胞を選択する工程
を包含する、方法。
（項目４９）
水不混和性化合物を組み換え生産する細胞について細胞の集団を富化する方法であって、
（ａ）水不混和性化合物を生産するように遺伝的に修飾された細胞または細胞のクローン集団を封入するヒドロゲル粒子を含む、ヒドロゲル粒子の集団を提供する工程；
（ｂ）組み換え生産された水不混和性化合物を含むヒドロゲル粒子を検出する工程；
（ｃ）上記細胞または上記細胞のクローン集団を工程（ｂ）のヒドロゲル粒子から回収する工程；
（ｄ）工程（ｃ）からの細胞または細胞のクローン集団を再び封入する工程；および
（ｅ）工程（ａ）〜（ｃ）を反復する工程
を包含する、方法。
（項目５０）
ヒドロゲル粒子内に細胞を封入する方法であって、
（ａ）上記細胞を水性ヒドロゲル懸濁液と接触させる工程；および
（ｂ）上記細胞を含む水性ヒドロゲル懸濁液を、フルオロカーボン油を含むマイクロ流体デバイスに負荷する工程であって、ここで、上記ヒドロゲル懸濁液は、上記マイクロ流体デバイスのＴ字接合部で上記フルオロカーボン油と接触し、上記フルオロカーボン油との上記接触によって、上記細胞を含む非水性ヒドロゲル粒子が形成されることとなる、工程
を包含する、方法。
（項目５１）
組み換え生産された水不混和性化合物を含む、ヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５２）
蛍光ソルバトクロミック色素と接触させられる、項目５１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５３）
ナイルレッドと接触させられる、項目５１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５４）
上記細胞が、酵母細胞、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、昆虫細胞および植物細胞からなる群より選択される、項目５１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５５）
上記細胞が酵母細胞である、項目５１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５６）
上記組み換え生産された水不混和性化合物が、イソプレノイド、ポリケチドおよび脂肪酸からなる群より選択される、項目５１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５７）
上記組み換え生産された水不混和性化合物が、テルペン、Ｃ５イソプレノイド、Ｃ１０イソプレノイドまたはＣ１５イソプレノイドである、項目５６に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５８）
上記組み換え生産された水不混和性化合物がファルネセンである、項目５６に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目５９）
上記細胞が、メバロン酸（ＭＥＶ）経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目５５に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６０）
上記組み換え酵母細胞が、ファルネセンシンターゼをコードしている核酸を含む、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６１）
上記組み換え酵母細胞が、ＨＭＧ−ＣｏＡをメバロネートに転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６２）
上記組み換え酵母細胞が、メバロネートをメバロン酸５−リン酸に転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６３）
上記１つ以上の異種ヌクレオチド配列が、メバロン酸経路の１つより多くの酵素をコードしている、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６４）
イソペンテニルピロリン酸（ＩＰＰ）をジメチルアリルピロリン酸（ＤＭＡＰＰ）に転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列をさらに含む、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６５）
イソプレノイド化合物を形成するようにＩＰＰまたはポリプレニルを修飾することができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列をさらに含む、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６６）
上記酵素が、カレンシンターゼ、ゲラニオールシンターゼ、リナロールシンターゼ、リモネンシンターゼ、ミルセンシンターゼ、オシメンシンターゼ、α−ピネンシンターゼ、β−ピネンシンターゼ、γ−テルピネンシンターゼ、テルピノレンシンターゼ、アモルファジエンシンターゼ、α−ファルネセンシンターゼ、β−ファルネセンシンターゼ、ファルネソールシンターゼ、ネロリドールシンターゼ、パチュロールシンターゼ、ノートカトンシンターゼおよびアビエタジエンシンターゼからなる群より選択される、項目６５に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６７）
上記イソプレノイドが、Ｃ５〜Ｃ２０イソプレノイドである、項目６５に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６８）
上記イソプレノイドが、アビエタジエン、アモルファジエン、カレン、α−ファルネセン、β−ファルネセン、ファルネソール、ゲラニオール、ゲラニルゲラニオール、イソプレン、リナロール、リモネン、ミルセン、ネロリドール、オシメン、パチュロール、β−ピネン、サビネン、γ−テルピネン、テルピノレンおよびバレンセンからなる群より選択される、項目６７に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目６９）
上記細胞が、メバロン酸（ＭＥＶ）経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目５９に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７０）
上記細胞が、ポリケチド生合成経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目５５に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７１）
上記組み換え酵母細胞が、ポリケチドシンターゼ系（ＰＫＳ）をコードしている１つ以上の核酸を含む、項目７０に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７２）
上記ＰＫＳがモジュラーＰＫＳである、項目７１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７３）
上記ＰＫＳが芳香族ＰＫＳである、項目７１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７４）
上記組み換え酵母細胞が、ケトシンターゼ／アシルトランスフェラーゼ（ＫＳ／ＡＴ）触媒領域を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目７１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７５）
上記組み換え酵母細胞が、鎖長因子（ＣＬＦ）触媒領域を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目７１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７６）
上記組み換え酵母細胞が、アシル担体タンパク質（ＡＣＰ）活性を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目７１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７７）
上記組み換え酵母細胞が、シクラーゼ（ＣＹＣ）触媒領域、ケトレダクターゼ（ＫＲ）触媒領域、アロマターゼ（ＡＲＯ）触媒領域、エノイルレダクターゼ（ＥＲ）触媒領域、チオエステラーゼ（ＴＥ）触媒領域またはホロＡＣＰシンターゼ活性を含む酵素をコードしている核酸をさらに含む、項目７１に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７８）
上記細胞が、脂肪酸生合成経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目５５に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目７９）
上記組み換え酵母細胞が、アセチル−ＣｏＡシンターゼをコードしている核酸を含む、項目７８に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目８０）
上記組み換え酵母細胞が、アセチル−ＣｏＡをマロニル−ＣｏＡに転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目７８に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目８１）
上記組み換え酵母細胞が、マロニル−ＣｏＡシンターゼをコードしている核酸を含む、項目７８に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目８２）
上記組み換え酵母細胞が、異種ｐｄｈ、ｐａｎＫ、ａｃｅＥＦ、ｆａｂＨ、ｆａｂＤ、ｆａｂＧ、ａｃｐＰまたはｆａｂＦヌクレオチド配列を含む、項目７８に記載のヒドロゲル封入細胞またはヒドロゲル封入クローン細胞集団。
（項目８３）
細胞または細胞集団を含み、かつ組み換え生産された水不混和性化合物をさらに含む、ヒドロゲル粒子。
（項目８４）
蛍光ソルバトクロミック色素と接触させられる、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目８５）
ナイルレッドと接触させられる、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目８６）
上記細胞が、酵母細胞、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、昆虫細胞および植物細胞からなる群より選択される、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目８７）
上記細胞が酵母細胞である、項目８４に記載のヒドロゲル粒子。
（項目８８）
上記組み換え生産された水不混和性化合物が、イソプレノイド、ポリケチドおよび脂肪酸からなる群より選択される、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目８９）
上記イソプレノイドが、テルペン、Ｃ５イソプレノイド、Ｃ１０イソプレノイドまたはＣ１５イソプレノイドである、項目８８に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９０）
上記イソプレノイドがファルネセンである、項目８８に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９１）
上記組み換え酵母細胞が、ファルネセンシンターゼをコードしている核酸を含む、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９２）
水不混和性化合物を保持することができる、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９３）
上記水不混和性化合物が、イソプレノイド、ポリケチドおよび脂肪酸からなる群より選択される、項目９２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９４）
上記水不混和性化合物がファルネセンである、項目９２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９５）
上記ヒドロゲルがアガロースを含む、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９６）
直径約１ミリメートル未満である、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９７）
直径約５００マイクロメートル未満である、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９８）
直径約１００マイクロメートル未満である、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目９９）
直径約５０マイクロメートル未満である、項目８３に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１００）
上記細胞が、メバロン酸（ＭＥＶ）経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目８７に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０１）
上記組み換え酵母細胞が、ファルネセンシンターゼをコードしている核酸を含む、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０２）
上記組み換え酵母細胞が、ＨＭＧ−ＣｏＡをメバロネートに転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０３）
上記組み換え酵母細胞が、メバロネートをメバロン酸５−リン酸に転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０４）
上記１つ以上の異種ヌクレオチド配列が、メバロン酸経路の１つより多くの酵素をコードしている、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０５）
イソペンテニルピロリン酸（ＩＰＰ）をジメチルアリルピロリン酸（ＤＭＡＰＰ）に転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列をさらに含む、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０６）
イソプレノイド化合物を形成するようにＩＰＰまたはポリプレニルを修飾することができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列をさらに含む、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０７）
上記酵素が、カレンシンターゼ、ゲラニオールシンターゼ、リナロールシンターゼ、リモネンシンターゼ、ミルセンシンターゼ、オシメンシンターゼ、α−ピネンシンターゼ、β−ピネンシンターゼ、γ−テルピネンシンターゼ、テルピノレンシンターゼ、アモルファジエンシンターゼ、α−ファルネセンシンターゼ、β−ファルネセンシンターゼ、ファルネソールシンターゼ、ネロリドールシンターゼ、パチュロールシンターゼ、ノートカトンシンターゼおよびアビエタジエンシンターゼからなる群より選択される、項目１０６に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０８）
上記イソプレノイドが、Ｃ５〜Ｃ２０イソプレノイドである、項目１０６に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１０９）
上記イソプレノイドが、アビエタジエン、アモルファジエン、カレン、α−ファルネセン、β−ファルネセン、ファルネソール、ゲラニオール、ゲラニルゲラニオール、イソプレン、リナロール、リモネン、ミルセン、ネロリドール、オシメン、パチュロール、β−ピネン、サビネン、γ−テルピネン、テルピノレンおよびバレンセンからなる群より選択される、項目１０８に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１０）
上記細胞が、メバロン酸（ＭＥＶ）経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目１００に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１１）
上記細胞が、ポリケチド生合成経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目８７に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１２）
上記組み換え酵母細胞が、ポリケチドシンターゼ系（ＰＫＳ）をコードしている１つ以上の核酸を含む、項目１１１に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１３）
上記ＰＫＳがモジュラーＰＫＳである、項目１１２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１４）
上記ＰＫＳが芳香族ＰＫＳである、項目１１２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１５）
上記組み換え酵母細胞が、ケトシンターゼ／アシルトランスフェラーゼ（ＫＳ／ＡＴ）触媒領域を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目１１２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１６）
上記組み換え酵母細胞が、鎖長因子（ＣＬＦ）触媒領域を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目１１２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１７）
上記組み換え酵母細胞が、アシル担体タンパク質（ＡＣＰ）活性を含む酵素をコードしている核酸を含む、項目１１２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１８）
上記組み換え酵母細胞が、シクラーゼ（ＣＹＣ）触媒領域、ケトレダクターゼ（ＫＲ）触媒領域、アロマターゼ（ＡＲＯ）触媒領域、エノイルレダクターゼ（ＥＲ）触媒領域、チオエステラーゼ（ＴＥ）触媒領域またはホロＡＣＰシンターゼ活性を含む酵素をコードしている核酸をさらに含む、項目１１２に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１１９）
上記細胞が、脂肪酸生合成経路の１つ以上の酵素をコードしている１つ以上の異種ヌクレオチド配列を含む組み換え酵母細胞である、項目８７に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１２０）
上記組み換え酵母細胞が、アセチル−ＣｏＡシンターゼをコードしている核酸を含む、項目１１９に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１２１）
上記組み換え酵母細胞が、アセチル−ＣｏＡをマロニル−ＣｏＡに転化させることができる酵素をコードしている異種ヌクレオチド配列を含む、項目１１９に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１２２）
上記組み換え酵母細胞が、マロニル−ＣｏＡシンターゼをコードしている核酸を含む、項目１１９に記載のヒドロゲル粒子。
（項目１２３）
上記組み換え酵母細胞が、異種ｐｄｈ、ｐａｎＫ、ａｃｅＥＦ、ｆａｂＨ、ｆａｂＤ、ｆａｂＧ、ａｃｐＰまたはｆａｂＦヌクレオチド配列を含む、項目１１９に記載のヒドロゲル粒子。