【手続補正書】
【提出日】平成27年10月23日(2015.10.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＲｄＣＶＦタンパク質のコード配列をコードするヌクレオチド配列を含有している核酸であって、ここでは、前記ＲｄＣＶＦコード配列が再コード化されたヌクレオチド配列を含有している、核酸。
【請求項２】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質がＲｄＣＶＦ１タンパク質である、請求項１に記載の核酸。
【請求項３】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質がＲｄＣＶＦ２タンパク質である、請求項１に記載の核酸。
【請求項４】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質が短いバージョンのＲｄＣＶＦタンパク質である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項５】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質が長いバージョンのＲｄＣＶＦタンパク質である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項６】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質がヒトＲｄＣＶＦタンパク質である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項７】
前記再コード化されたヌクレオチド配列が開始メチオニンコドンを欠いている、請求項１〜６のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項８】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列が、配列番号１のヌクレオチド１０６〜７４１、配列番号１のヌクレオチド１０６〜４２９、配列番号３のヌクレオチド１０６〜４３２、または配列番号３のヌクレオチド１０６〜７４４を含有している、請求項１に記載の核酸。
【請求項９】
前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列に作動可能に連結されたＮ末端シグナル配列の第２のコード領域をさらに含有している、請求項１〜８のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項１０】
前記シグナル配列が、Ｉｇｋシグナル配列、ヒト成長ホルモン（ＨＧＨ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、インシュリン様成長因子１（ＩＧＦ−１）およびβ−グルクロニダーゼ（β−ｇｌｕｃｏｒｏｎｉｄａｓｅ）（ＧＵＳＢ）からなる群より選択される、請求項９に記載の核酸。
【請求項１１】
前記シグナル配列が配列番号１のヌクレオチド１〜１０５を含有している、請求項９に記載の核酸。
【請求項１２】
前記シグナル配列が、配列番号１５、配列番号２のアミノ酸２〜３４、または配列番号２のアミノ酸７〜２１を含有しているアミノ酸配列をコードする、請求項９に記載の核酸。
【請求項１３】
前記ヌクレオチド配列が配列番号１または３を含有している、請求項１に記載の核酸。
【請求項１４】
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、少なくとも４０％の再コード化されたコドンを有している、請求項１に記載の核酸。
【請求項１５】
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、対応するネイティブなヌクレオチド配列と比べると異なる、少なくとも１５％のヌクレオチドを有している、請求項１に記載の核酸。
【請求項１６】
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、対応するネイティブなヌクレオチド配列に対して９０％未満同一である、請求項１に記載の核酸。
【請求項１７】
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、原核生物の阻害性モチーフを持たないこと、コンセンサススプライスドナー部位を持たないこと、潜在的なスプライスドナー部位を持たないこと、およびＧＣ含量が６０〜６５％の間であることからなる群より選択される特徴のうちの１つ以上を有している、請求項１〜７および９〜１６のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項１８】
プロモーター配列が、前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列に作動可能に連結されている、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項１９】
前記プロモーターがサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーターである、請求項１８に記載の核酸。
【請求項２０】
前記ＣＭＶプロモーターが配列番号１１の１５０〜８１２を含有している、請求項１９に記載の核酸。
【請求項２１】
イントロン配列が前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列に作動可能に連結されている、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項２２】
前記イントロン配列がβ−グロビンイントロン配列である、請求項２１に記載の核酸。
【請求項２３】
前記イントロン配列が配列番号１１のヌクレオチド８２０〜１３１２を含有している、請求項２１に記載の核酸。
【請求項２４】
前記核酸が、配列番号１１、配列番号１１の１５０〜２０８０のヌクレオチド配列、または配列番号１１の１５０〜８１２、８２０〜１３１２および１３４０〜２０８０のヌクレオチド配列を含有している、請求項１に記載の核酸。
【請求項２５】
請求項１〜２４のいずれか１項に記載の核酸を含有しているウイルスベクター。
【請求項２６】
前記ウイルスベクターがアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターである、請求項２５に記載のウイルスベクター。
【請求項２７】
前記ＡＡＶベクターがＡＡＶ血清型２をベースとしている、請求項２６に記載のウイルスベクター。
【請求項２８】
前記ＡＡＶベクターがＡＡＶ血清型８をベースとしている、請求項２６に記載のウイルスベクター。
【請求項２９】
前記ウイルスベクターがウシ免疫不全ウイルスベクターではない、請求項２５に記載のウイルスベクター。
【請求項３０】
前記ウイルスベクターが１種類のウイルスベクターではない、請求項２５に記載のウイルスベクター。
【請求項３１】
前記ウイルスベクターが、ＤＮＡウイルスベクター、非エンベロープ型ウイルスベクター、およびアデノウイルスベクターからなる群より選択される、請求項２５に記載のウイルスベクター。
【請求項３２】
ＲｄＣＶＦタンパク質を分泌する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の核酸を含有している単離された細胞。
【請求項３３】
天然に存在するタンパク質ではない、請求項３２に記載の細胞により産生されたＲｄＣＶＦタンパク質。
【請求項３４】
（ｉ）薬学的に受容可能な担体、および（ｉｉ）請求項１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、請求項２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクター、請求項３３に記載のＲｄＣＶＦタンパク質、またはこれらの組み合わせを含有している、薬学的調製物。
【請求項３５】
ＲｄＣＶＦタンパク質を産生するための方法であって、前記方法は、請求項３２に記載の細胞を、前記ＲｄＣＶＦタンパク質の発現と分泌を可能にする条件下で培養する工程、および前記細胞の培養物から前記ＲｄＣＶＦタンパク質を単離する工程を含む、方法。
【請求項３６】
前記細胞の培養物の上清からの前記ＲｄＣＶＦタンパク質の精製をさらに含む、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
天然に存在するタンパク質ではない、請求項３５または３６に記載の方法により産生されたＲｄＣＶＦタンパク質。
【請求項３８】
哺乳動物の眼において眼の桿体細胞を保存するための、請求項１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、請求項２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクター、請求項３３または３７に記載のＲｄＣＶＦタンパク質、請求項３４に記載の薬学的調製物、あるいはそれらの組み合わせを含む組成物であって、前記組成物は、前記哺乳動物の前記眼に投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項３９】
前記組成物が、網膜下注射により投与されることを特徴とする、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４０】
前記組成物が、硝子体内注射、前房への注射、結膜下注射、またはテノン嚢下注射により投与されることを特徴とする、請求項３９に記載の組成物。
【請求項４１】
前記哺乳動物がヒトである、請求項３８〜４０のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４２】
前記哺乳動物が、網膜ジストロフィー、シュタルガルト病、網膜色素変性、ドライ型加齢性黄斑変性（ドライ型ＡＭＤ）、地図状萎縮（進行期のドライ型ＡＭＤ）、滲出型加齢性黄斑変性（滲出型ＡＭＤ）、緑内障／高眼圧症、糖尿病網膜症、バルデ・ビードル症候群、バッセン−コーンツバイク症候群、ベスト病、全脈絡膜萎縮（ｃｈｏｒｏｉｄｅｍａ）、脳回転状萎縮症、先天黒内障、レフサム病（ｒｅｆｓｕｎ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、アッシャー症候群、甲状腺関連眼疾患、グレーヴス病、網膜色素上皮細胞と関係がある疾患、前上葉区の疾患、水晶体疾患／白内障、眼杯の障害、またはぶどう膜炎からなる群より選択される眼疾患に罹患している、請求項３８〜４１のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４３】
前記投与の前には、保存される前記眼の桿体細胞が請求項１〜２４のいずれか１項に記載の核酸を含まず、また前記ウイルスベクターが形質導入されていない、請求項３８〜４２のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４４】
哺乳動物の眼において眼の桿体細胞を保存するための、請求項１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、または請求項２５〜３０のいずれか１項に記載のウイルスベクターを含む組成物であって、前記組成物は、網膜下注射により投与され、前記桿体細胞が、前記網膜下注射の前記部位から少なくとも１ｍｍの部位で保存されることを特徴とする、組成物。
【請求項４５】
前記桿体細胞が、前記網膜下注射の前記部位から少なくとも２ｍｍの部位で保存される、請求項４４に記載の組成物。
【請求項４６】
細胞からＲｄＣＶＦタンパク質を分泌させるための、請求項９〜１３および２４のいずれか１項に記載の核酸、または請求項２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクターを含む組成物であって、前記組成物は、前記核酸または前記ウイルスベクターによりコードされるＲｄＣＶＦの発現および分泌を可能にする条件下で前記細胞に投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項４７】
前記細胞が哺乳動物細胞である、請求項４６に記載の組成物。
【請求項４８】
前記細胞がヒト細胞である、請求項４６に記載の組成物。
【請求項４９】
前記細胞が眼細胞である、請求項４６〜４８のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項５０】
前記細胞が、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、桿体細胞、錐体細胞、双極細胞、水平細胞、無軸索細胞、神経節細胞、およびＡＲＰＥ−１９細胞からなる群より選択される、請求項４９に記載の組成物。
【請求項５１】
前記細胞がインビトロにある、請求項４６〜５０のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項５２】
前記細胞がインビボにある、請求項４６〜５０のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項５３】
前記細胞がエクスビボにある、請求項４６〜５０のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項５４】
前記細胞が、２９３細胞、ＣＨＯ細胞、ＰｅｒＣ６細胞、Ｖｅｒｏ細胞、ＢＨＫ細胞、ＨｅＬａ細胞、ＣＯＳ細胞、ＭＤＣＫ細胞、３Ｔ３細胞、およびＷＩ３８からなる群より選択される、請求項４７および５１〜５２のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項５５】
前記細胞が被包されている、請求項４６〜５４のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項５６】
疾患を処置するための、請求項１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、請求項２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクター、請求項３３に記載のＲｄＣＶＦタンパク質、請求項３４に記載の薬学的調製物、またはそれらの組み合わせを含む組成物であって、前記組成物は、哺乳動物に投与され、ここで、前記疾患が、アルツハイマー病、ハンチントン病、パーキンソン病、および嗅覚の疾患からなる群より選択されることを特徴とする、組成物。
【請求項５７】
前記哺乳動物がヒトである、請求項５６に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
本発明を説明する目的のために、本発明の特定の実施形態が図面で示される。しかし、本発明は、図面に示される実施形態の正確な取り合わせおよび手段に限定されない。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
ＲｄＣＶＦタンパク質のコード配列をコードするヌクレオチド配列を含有している核酸であって、ここでは、前記ＲｄＣＶＦコード配列が再コード化されたヌクレオチド配列を含有している、核酸。
（項目２）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質がＲｄＣＶＦ１タンパク質である、項目１に記載の核酸。
（項目３）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質がＲｄＣＶＦ２タンパク質である、項目１に記載の核酸。
（項目４）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質が短いバージョンのＲｄＣＶＦタンパク質である、前述の項目のいずれか１項に記載の核酸。
（項目５）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質が長いバージョンのＲｄＣＶＦタンパク質である、項目１〜３のいずれか１項に記載の核酸。
（項目６）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質がヒトＲｄＣＶＦタンパク質である、前述の項目のいずれか１項に記載の核酸。
（項目７）
前記再コード化されたヌクレオチド配列が開始メチオニンコドンを欠いている、前述の項目のいずれか１項に記載の核酸。
（項目８）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列が、配列番号１のヌクレオチド１０６〜７４１、配列番号１のヌクレオチド１０６〜４２９、配列番号３のヌクレオチド１０６〜４３２、または配列番号３のヌクレオチド１０６〜７４４を含有している、項目１に記載の核酸。
（項目９）
前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列に作動可能に連結されたＮ末端シグナル配列の第２のコード領域をさらに含有している、前述の項目のいずれか１項に記載の核酸。
（項目１０）
前記シグナル配列が、Ｉｇｋシグナル配列、ヒト成長ホルモン（ＨＧＨ）、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、インシュリン様成長因子１（ＩＧＦ−１）およびβ−グルクロニダーゼ（β−ｇｌｕｃｏｒｏｎｉｄａｓｅ）（ＧＵＳＢ）からなる群より選択される、項目９に記載の核酸。
（項目１１）
前記シグナル配列が配列番号１のヌクレオチド１〜１０５を含有している、項目９に記載の核酸。
（項目１２）
前記シグナル配列が、配列番号１５、配列番号２のアミノ酸２〜３４、または配列番号２のアミノ酸７〜２１を含有しているアミノ酸配列をコードする、項目９に記載の核酸。
（項目１３）
前記ヌクレオチド配列が配列番号１または３を含有している、項目１に記載の核酸。
（項目１４）
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、少なくとも４０％の再コード化されたコドンを有している、項目１に記載の核酸。
（項目１５）
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、対応するネイティブなヌクレオチド配列と比べると異なる、少なくとも１５％のヌクレオチドを有している、項目１に記載の核酸。
（項目１６）
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、対応するネイティブなヌクレオチド配列に対して９０％未満同一である、項目１に記載の核酸。
（項目１７）
前記再コード化されたヌクレオチド配列が、原核生物の阻害性モチーフを持たないこと、コンセンサススプライスドナー部位を持たないこと、潜在的なスプライスドナー部位を持たないこと、およびＧＣ含量が６０〜６５％の間であることからなる群より選択される特徴のうちの１つ以上を有している、項目１〜７および９〜１６のいずれか１項に記載の核酸。
（項目１８）
プロモーター配列が、前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列に作動可能に連結されている、前述の項目のいずれか１項に記載の核酸。
（項目１９）
前記プロモーターがサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーターである、項目１８に記載の核酸。
（項目２０）
前記ＣＭＶプロモーターが配列番号１１の１５０〜８１２を含有している、項目１９に記載の核酸。
（項目２１）
イントロン配列が前記ＲｄＣＶＦタンパク質の前記コード配列に作動可能に連結されている、前述の項目のいずれか１項に記載の核酸。
（項目２２）
前記イントロン配列がβ−グロビンイントロン配列である、項目２１に記載の核酸。
（項目２３）
前記イントロン配列が配列番号１１のヌクレオチド８２０〜１３１２を含有している、項目２１に記載の核酸。
（項目２４）
前記核酸が、配列番号１１、配列番号１１の１５０〜２０８０のヌクレオチド配列、または配列番号１１の１５０〜８１２、８２０〜１３１２および１３４０〜２０８０のヌクレオチド配列を含有している、項目１に記載の核酸。
（項目２５）
前述の項目のいずれか１項に記載の核酸を含有しているウイルスベクター。
（項目２６）
前記ウイルスベクターがアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターである、項目２５に記載のウイルスベクター。
（項目２７）
前記ＡＡＶベクターがＡＡＶ血清型２をベースとしている、項目２６に記載のウイルスベクター。
（項目２８）
前記ＡＡＶベクターがＡＡＶ血清型８をベースとしている、項目２６に記載のウイルスベクター。
（項目２９）
前記ウイルスベクターがウシ免疫不全ウイルスベクターではない、項目２５に記載のウイルスベクター。
（項目３０）
前記ウイルスベクターが１種類のウイルスベクターではない、項目２５に記載のウイルスベクター。
（項目３１）
前記ウイルスベクターが、ＤＮＡウイルスベクター、非エンベロープ型ウイルスベクター、およびアデノウイルスベクターからなる群より選択される、項目２５に記載のウイルスベクター。
（項目３２）
ＲｄＣＶＦタンパク質を分泌する、項目１〜４のいずれか１項に記載の核酸を含有している単離された細胞。
（項目３３）
天然に存在するタンパク質ではない、項目３２に記載の細胞により産生されたＲｄＣＶＦタンパク質。
（項目３４）
（ｉ）薬学的に受容可能な担体、および（ｉｉ）項目１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、項目２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクター、項目３３に記載のＲｄＣＶＦタンパク質、またはこれらの組み合わせを含有している、薬学的調製物。
（項目３５）
ＲｄＣＶＦタンパク質を産生するための方法であって、前記方法は、項目３２に記載の細胞を、前記ＲｄＣＶＦタンパク質の発現と分泌を可能にする条件下で培養する工程、および前記細胞の培養物から前記ＲｄＣＶＦタンパク質を単離する工程を含む、方法。
（項目３６）
前記細胞の培養物の上清からの前記ＲｄＣＶＦタンパク質の精製をさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
天然に存在するタンパク質ではない、項目３５または３６に記載の方法により産生されたＲｄＣＶＦタンパク質。
（項目３８）
哺乳動物の眼において眼の桿体細胞を保存する方法であって、前記方法は、前記哺乳動物の前記眼に、前記眼の桿体細胞を保存するために有効な量の、項目１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、項目２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクター、項目３３または３７に記載のＲｄＣＶＦタンパク質、項目３３に記載の薬学的組成物、あるいはそれらの組み合わせを投与する工程を含む、方法。
（項目３９）
前記ウイルスベクターまたは前記核酸が、網膜下注射により投与される、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記ウイルスベクターまたは前記核酸が、硝子体内注射、前房への注射、結膜下注射、またはテノン嚢下注射により投与される、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
前記哺乳動物がヒトである、項目３８〜４０のいずれか１項に記載の方法。
（項目４２）
前記哺乳動物が、網膜ジストロフィー、シュタルガルト病、網膜色素変性、ドライ型加齢性黄斑変性（ドライ型ＡＭＤ）、地図状萎縮（進行期のドライ型ＡＭＤ）、滲出型加齢性黄斑変性（滲出型ＡＭＤ）、緑内障／高眼圧症、糖尿病網膜症、バルデ・ビードル症候群、バッセン−コーンツバイク症候群、ベスト病、全脈絡膜萎縮（ｃｈｏｒｏｉｄｅｍａ）、脳回転状萎縮症、先天黒内障、レフサム病（ｒｅｆｓｕｎ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、アッシャー症候群、甲状腺関連眼疾患、グレーヴス病、網膜色素上皮細胞と関係がある疾患、前上葉区の疾患、水晶体疾患／白内障、眼杯の障害、またはぶどう膜炎からなる群より選択される眼疾患に罹患している、項目３８〜４１のいずれか１項に記載の方法。
（項目４３）
前記投与の前には、保存される前記眼の桿体細胞が項目１〜２４のいずれか１項に記載の核酸を含まず、また前記ウイルスベクターが形質導入されていない、項目３８〜４２のいずれか１項に記載の方法。
（項目４４）
哺乳動物の眼において眼の桿体細胞を保存する方法であって、前記哺乳動物の前記眼に、項目１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、または項目２５〜３０のいずれか１項に記載のウイルスベクターを投与する工程を含み、前記核酸または前記ウイルスベクターが、網膜下注射により投与され、前記桿体細胞が、前記網膜下注射の前記部位から少なくとも１ｍｍの部位で保存される、方法。
（項目４５）
前記桿体細胞が、前記網膜下注射の前記部位から少なくとも２ｍｍの部位で保存される、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
細胞からＲｄＣＶＦタンパク質を分泌させる方法であって、前記方法は、前記細胞に、項目９〜１３および２４のいずれか１項に記載の核酸、または項目２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクターを、前記核酸または前記ウイルスベクターによりコードされるＲｄＣＶＦの発現および分泌を可能にする条件下で投与する工程を含む、方法。
（項目４７）
前記細胞が哺乳動物細胞である、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記細胞がヒト細胞である、項目４６に記載の方法。
（項目４９）
前記細胞が眼細胞である、項目４６〜４８のいずれか１項に記載の方法。
（項目５０）
前記細胞が、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、桿体細胞、錐体細胞、双極細胞、水平細胞、無軸索細胞、神経節細胞、およびＡＲＰＥ−１９細胞からなる群より選択される、項目４９に記載の方法。
（項目５１）
前記細胞がインビトロにある、項目４６〜５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目５２）
前記細胞がインビボにある、項目４６〜５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目５３）
前記細胞がエクスビボにある、項目４６〜５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目５４）
前記細胞が、２９３細胞、ＣＨＯ細胞、ＰｅｒＣ６細胞、Ｖｅｒｏ細胞、ＢＨＫ細胞、ＨｅＬａ細胞、ＣＯＳ細胞、ＭＤＣＫ細胞、３Ｔ３細胞、およびＷＩ３８からなる群より選択される、項目４７および５１〜５２のいずれか１項に記載の方法。
（項目５５）
前記細胞が被包されている、項目４６〜５４のいずれか１項に記載の方法。
（項目５６）
疾患を処置する方法であって、前記方法は、哺乳動物に、項目１〜２４のいずれか１項に記載の核酸、項目２５〜３１のいずれか１項に記載のウイルスベクター、項目３３に記載のＲｄＣＶＦタンパク質、項目３４に記載の薬学的調製物、またはそれらの組み合わせを投与する工程を含み、ここで、前記疾患が、アルツハイマー病、ハンチントン病、パーキンソン病、および嗅覚の疾患からなる群より選択される、方法。
（項目５７）
前記哺乳動物がヒトである、項目５６に記載の方法。