【手続補正書】
【提出日】平成27年9月7日(2015.9.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生物学的分析システムであって、
１つ以上のケースを収容するように構成されているブロックアセンブリであって、各ケースは、複数の試料を受け取る試料ホルダを収容するように構成されている、ブロックアセンブリと、
カバーと
を備え、
前記カバーは、
接触表面を有するフレームと、
取り付け盤と、
前記ブロックアセンブリに接触し、前記試料ホルダと前記取り付け盤との間に封入された空気の体積を形成するように構成されている密閉材料と、
前記封入された空気の体積を加熱し、（ａ）前記１つ以上のケースにおける凝縮と、（ｂ）前記試料ホルダが一連の温度を通して循環されるときの前記試料ホルダの温度非均一性とを防止するように構成されている熱源と
を備えている、生物学的分析システム。
【請求項２】
前記密閉材料は、前記フレームの接触表面に形成されているガスケットである、請求項１に記載の生物学的分析システム。
【請求項３】
前記ガスケットは、前記ブロックアセンブリに接触し、前記試料ホルダに接触しないように構成および配列されている、請求項２に記載の生物学的分析システム。
【請求項４】
前記ブロックアセンブリは、前記１つ以上のケースを収容するように成形されている荷台をさらに備え、前記密閉材料は、前記荷台を形成するように配列されている、請求項１に記載の生物学的分析システム。
【請求項５】
前記１つ以上のケースは、熱的に伝導性の材料を含む、請求項１に記載の生物学的分析システム。
【請求項６】
前記熱的に伝導性の材料は、アルミニウム、黒鉛、亜鉛、ベリリウム、ステンレス鋼、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、請求項５に記載の生物学的分析システム。
【請求項７】
前記取り付け盤は、各々が対応する試料ホルダの直上に位置付けられている１つ以上の透明プレートを備えている、請求項１に記載の生物学的分析システム。
【請求項８】
前記１つ以上の透明プレートの各々は、前記対応する試料ホルダと実質的に同一の寸法を有する、請求項７に記載の生物学的分析システム。
【請求項９】
前記１つ以上の透明プレートは、前記試料ホルダに対して、ある角度で位置付けられることにより、前記１つ以上の透明プレートを通過する光の反射を防止する、請求項７に記載の生物学的分析システム。
【請求項１０】
前記透明プレートは、ガラスプレートである、請求項７に記載の生物学的システム。
【請求項１１】
生物学的分析システムであって、
複数の試料ホルダのうちの任意の１つを収容するように構成されている交換可能アセンブリであって、各それぞれの試料ホルダは、複数の試料を受け取るように構成されている、交換可能アセンブリと、
一連の温度を通して前記複数の試料を循環させるように構成されている制御システムと
、
前記複数の試料から放出される蛍光シグナルを検出するように構成されている光学系と
を備え、
前記光学系は、
単一の視野レンズと、
励起源と、
光学センサと、
複数のフィルタ構成要素と
を備えている、生物学的分析システム。
【請求項１２】
前記複数の試料ホルダは、９６ウェルブロック、３８４ウェルブロック、低密度アレイ、および貫通孔アレイから成る群から選択される、請求項１１に記載の生物学的分析システム。
【請求項１３】
前記光学系は、前記試料ホルダが、前記交換可能アセンブリ上に適切に位置付けられていることを確認するようにさらに構成されている、請求項１１に記載の生物学的分析システム。
【請求項１４】
前記試料ホルダは、前記試料ホルダに関連するデータを記憶するデータファイルを参照する識別子をさらに備え、前記光学系は、前記識別子を撮像し、正しい試料ホルダが、前記交換可能アセンブリ上に位置付けられていることを確認するようにさらに構成されている、請求項１１に記載の生物学的分析システム。
【請求項１５】
前記励起源は、１つ以上の発光ダイオードである、請求項１１に記載の生物学的分析システム。
【請求項１６】
前記励起源を定義された温度範囲内に維持するように構成されている温度制御システムをさらに備えている、請求項１１に記載の生物学的分析システム。
【請求項１７】
前記温度制御システムは、断続的に動作することにより、前記励起源を定義された温度範囲内に維持するように構成されているファンを備えている、請求項１６に記載の生物学的分析システム。
【請求項１８】
前記視野レンズは、両凸レンズである、請求項１１に記載の生物学的分析システム。
【請求項１９】
前記試料ホルダは、貫通孔アレイである、請求項１２に記載の生物学的分析システム。
【請求項２０】
前記貫通孔アレイは、４８個の場所を備え、各場所は、８個の貫通孔×８個の貫通孔の寸法を有するサブアレイを含む、請求項１９に記載の生物学的分析システム。
【請求項２１】
サーマルサイクラーを備えている生物学的分析システムであって、
前記サーマルサイクラーは、
複数の試料を受け取り、一連の温度を通して前記複数の試料を循環させるように構成されているブロックアセンブリと、
前記複数の試料の各々から放出される蛍光レベルを検出するように構成されている光学センサを備えている光学系と、
サーマルサイクラーデバイスの外部表面上に統合されたユーザインターフェースと、
前記検出された蛍光レベルを処理し、前記蛍光レベルを前記統合されたユーザインターフェース上にリアルタイムで表示するようにプログラムされているプロセッサであって、蛍光レベルを表示するためのパラメータは、ユーザ選好に基づいて変更可能である、プロセッサと
を備えている、生物学的分析システム。
【請求項２２】
前記パラメータは、前記複数の試料を受け取る１つ以上の試料ホルダの選択、前記１つ以上の試料ホルダ内の１つ以上のウェルの選択、前記１つ以上のウェル内の１つ以上の染料の選択、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、請求項２１に記載の生物学的分析システム。
【請求項２３】
前記１つ以上の試料ホルダは、９６ウェルブロック、３８４ウェルブロック、低密度アレイ、および貫通孔アレイから成る群から選択される、請求項２２に記載の生物学的分析システム。
【請求項２４】
前記プロセッサは、前記蛍光レベルをリアルタイム増幅プロットの形態で表示するようにプログラムされている、請求項２１に記載の生物学的分析システム。
【請求項２５】
前記ブロックアセンブリは、交換可能ブロックアセンブリであり、９６ウェルブロック、３８４ウェルブロック、低密度アレイ、および貫通孔アレイから成る群から選択される複数の試料ホルダのうちの任意の１つを収容するように構成され、前記プロセッサは、前記複数の試料ホルダのうちの任意の１つに対して、前記蛍光レベルをリアルタイム増幅プロットの形態で表示するようにプログラムされている、請求項２２に記載の生物学的分析システム。
【請求項２６】
生物学的分析システムであって、
１つ以上のケースを収容するように構成されているブロックアセンブリであって、各ケースは、複数の試料で装填された試料ホルダを収容するように構成されている、ブロックアセンブリと、
前記複数の試料を前記１つ以上の試料ホルダ上の複数の試料場所に配列するための命令を有するデータファイルと、
前記命令を実行するように構成されているプロセッサを有する充填ステーションであって、前記充填ステーションは、前記実行される命令に従って、各試料ホルダに複数の試料を装填するように構成されている、充填ステーションと
を備えている、生物学的分析システム。
【請求項２７】
前記１つ以上のケースの各々は、前記装填された試料ホルダの各々を封入するためのケースカバーを受け入れ、各ケースおよび対応するケースカバー内に密閉された内部を提供するように構築および配列されている、請求項２６に記載の生物学的分析システム。
【請求項２８】
各ケースまたは各対応するケースカバーは、前記試料と不混和性である液体を前記密閉された内部に受け取るように構成されている、請求項２７に記載の生物学的分析システム。
【請求項２９】
装填された試料ホルダを前記充填ステーションから前記ブロックアセンブリに移送するための自動化デバイスをさらに備えている、請求項２６に記載の生物学的分析システム。
【請求項３０】
前記命令は、試料装填命令、各試料に対するアッセイ定義、試料場所定義、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、請求項２６に記載の生物学的分析システム。
【請求項３１】
少なくとも１つの試料ホルダは、識別子を備えている、請求項２６に記載の生物学的分析システム。
【請求項３２】
前記識別子は、バーコードである、請求項３１に記載の生物学的分析システム。
【請求項３３】
前記プロセッサは、更新された試料場所、更新された位置的場所、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される情報を用いて、前記受信されたデータファイルを修正するように構成されている、請求項２６に記載の生物学的分析システム。
【請求項３４】
前記不混和性液体は、フッ素化炭化水素、炭化水素、油、またはシリコーン流体である、請求項２８に記載の生物学的分析システム。
【請求項３５】
生物学的分析システムであって、
複数の試料で装填された１つ以上の試料ホルダを収容するように構成されているブロックアセンブリであって、前記試料ホルダは、識別子を含む、ブロックアセンブリと、
命令を記憶しているデータファイルと、
（ａ）前記複数の試料から放出される蛍光シグナルを検出し、（ｂ）前記識別子を撮像し、前記データファイルを識別し、前記試料ホルダを識別するように構成さている光学系と、
前記識別されたデータファイルの命令を実行し、一連の温度を通して前記複数の試料を循環させるプロセッサと
を備えている、生物学的分析システム。
【請求項３６】
前記命令は、試料装填命令、各試料に対するアッセイ定義、試料場所定義、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、請求項３５に記載の生物学的分析システム。
【請求項３７】
前記識別子は、バーコードである、請求項３５に記載の生物学的分析システム。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
本発明の追加の側面、特徴、および利点は、特に、類似部品が類似参照番号を有する、付随の図面と併せて検討されながら、以下の説明および請求項に記載される。
本願明細書は、例えば、以下の項目も提供する。
（項目１）
生物学的分析システムであって、
複数の試料ホルダのうちの任意の１つを収容するように構成されている交換可能アセンブリであって、各それぞれの試料ホルダは、複数の試料を受け取るように構成されている、交換可能アセンブリと、
一連の温度を通して前記複数の試料を循環させるように構成されている制御システムと
、
前記複数の試料から放出される蛍光シグナルを検出するように構成されている光学系と
を備え、
前記光学系は、
単一の視野レンズと、
励起源と、
光学センサと、
複数のフィルタ構成要素と
を備えている、生物学的分析システム。
（項目２）
前記複数の試料ホルダは、９６ウェルブロック、３８４ウェルブロック、低密度アレイ、および貫通孔アレイから成る群から選択される、項目１に記載の生物学的分析システム。
（項目３）
前記光学系は、前記試料ホルダが、前記交換可能アセンブリ上に適切に位置付けられていることを確認するようにさらに構成されている、項目１に記載の生物学的分析システム。
（項目４）
前記試料ホルダは、前記試料ホルダに関連するデータを記憶するデータファイルを参照する識別子をさらに備え、前記光学系は、前記識別子を撮像し、正しい試料ホルダが、前記交換可能アセンブリ上に位置付けられていることを確認するようにさらに構成されている、項目１に記載の生物学的分析システム。
（項目５）
前記励起源は、１つ以上の発光ダイオードである、項目１に記載の生物学的分析システム。
（項目６）
前記励起源を定義された温度範囲内に維持するように構成されている温度制御システムをさらに備えている、項目１に記載の生物学的分析システム。
（項目７）
前記温度制御システムは、断続的に動作することにより、前記励起源を定義された温度範囲内に維持するように構成されているファンを備えている、項目６に記載の生物学的分析システム。
（項目８）
前記視野レンズは、両凸レンズである、項目１に記載の生物学的分析システム。
（項目９）
前記試料ホルダは、貫通孔アレイである、項目２に記載の生物学的分析システム。
（項目１０）
前記貫通孔アレイは、４８個の場所を備え、各場所は、８個の貫通孔×８個の貫通孔の寸法を有するサブアレイを含む、項目９に記載の生物学的分析システム。
（項目１１）
サーマルサイクラーを備えている生物学的分析システムであって、
前記サーマルサイクラーは、
複数の試料を受け取り、一連の温度を通して前記複数の試料を循環させるように構成されているブロックアセンブリと、
前記複数の試料の各々から放出される蛍光レベルを検出するように構成されている光学センサを備えている光学系と、
サーマルサイクラーデバイスの外部表面上に統合されたユーザインターフェースと、
前記検出された蛍光レベルを処理し、前記蛍光レベルを前記統合されたユーザインターフェース上にリアルタイムで表示するようにプログラムされているプロセッサであって、蛍光レベルを表示するためのパラメータは、ユーザ選好に基づいて変更可能である、プロセッサと
を備えている、生物学的分析システム。
（項目１２）
前記パラメータは、前記複数の試料を受け取る１つ以上の試料ホルダの選択、前記１つ以上の試料ホルダ内の１つ以上のウェルの選択、前記１つ以上のウェル内の１つ以上の染料の選択、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、項目１１に記載の生物学的分析システム。
（項目１３）
前記１つ以上の試料ホルダは、９６ウェルブロック、３８４ウェルブロック、低密度アレイ、および貫通孔アレイから成る群から選択される、項目１２に記載の生物学的分析システム。
（項目１４）
前記プロセッサは、前記蛍光レベルをリアルタイム増幅プロットの形態で表示するようにプログラムされている、項目１１に記載の生物学的分析システム。
（項目１５）
前記ブロックアセンブリは、交換可能ブロックアセンブリであり、９６ウェルブロック、３８４ウェルブロック、低密度アレイ、および貫通孔アレイから成る群から選択される複数の試料ホルダのうちの任意の１つを収容するように構成され、前記プロセッサは、前記複数の試料ホルダのうちの任意の１つに対して、前記蛍光レベルをリアルタイム増幅プロットの形態で表示するようにプログラムされている、項目１２に記載の生物学的分析システム。
（項目１６）
生物学的分析システムであって、
１つ以上のケースを収容するように構成されているブロックアセンブリであって、各ケースは、複数の試料を受け取る試料ホルダを収容するように構成されている、ブロックアセンブリと、
カバーと
を備え、
前記カバーは、
接触表面を有するフレームと、
取り付け盤と、
前記ブロックアセンブリに接触し、前記試料ホルダと前記取り付け盤との間に封入された空気の体積を形成するように構成されている密閉材料と、
前記封入された空気の体積を加熱し、（ａ）前記１つ以上のケースにおける凝縮と、（ｂ）前記試料ホルダが一連の温度を通して循環されるときの前記試料ホルダの温度非均一性とを防止するように構成されている熱源と
を備えている、生物学的分析システム。
（項目１７）
前記密閉材料は、前記フレームの接触表面に形成されているガスケットである、項目１６に記載の生物学的分析システム。
（項目１８）
前記ガスケットは、前記ブロックアセンブリに接触し、前記試料ホルダに接触しないように構成および配列されている、項目１７に記載の生物学的分析システム。
（項目１９）
前記ブロックアセンブリは、前記１つ以上のケースを収容するように成形されている荷台をさらに備え、前記密閉材料は、前記荷台を形成するように配列されている、項目１６に記載の生物学的分析システム。
（項目２０）
前記１つ以上のケースは、熱的に伝導性の材料を含む、項目１６に記載の生物学的分析システム。
（項目２１）
前記熱的に伝導性の材料は、アルミニウム、黒鉛、亜鉛、ベリリウム、ステンレス鋼、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、項目２０に記載の生物学的分析システム。
（項目２２）
前記取り付け盤は、各々が対応する試料ホルダの直上に位置付けられている１つ以上の透明プレートを備えている、項目１６に記載の生物学的分析システム。
（項目２３）
前記１つ以上の透明プレートの各々は、前記対応する試料ホルダと実質的に同一の寸法を有する、項目２２に記載の生物学的分析システム。
（項目２４）
前記１つ以上の透明プレートは、前記試料ホルダに対して、ある角度で位置付けられることにより、前記１つ以上の透明プレートを通過する光の反射を防止する、項目２２に記載の生物学的分析システム。
（項目２５）
前記透明プレートは、ガラスプレートである、項目２２に記載の生物学的システム。
（項目２６）
生物学的分析システムであって、
１つ以上のケースを収容するように構成されているブロックアセンブリであって、各ケースは、複数の試料で装填された試料ホルダを収容するように構成されている、ブロックアセンブリと、
前記複数の試料を前記１つ以上の試料ホルダ上の複数の試料場所に配列するための命令を有するデータファイルと、
前記命令を実行するように構成されているプロセッサを有する充填ステーションであって、前記充填ステーションは、前記実行される命令に従って、各試料ホルダに複数の試料を装填するように構成されている、充填ステーションと
を備えている、生物学的分析システム。
（項目２７）
前記１つ以上のケースの各々は、前記装填された試料ホルダの各々を封入するためのケースカバーを受け入れ、各ケースおよび対応するケースカバー内に密閉された内部を提供するように構築および配列されている、項目２６に記載の生物学的分析システム。
（項目２８）
各ケースまたは各対応するケースカバーは、前記試料と不混和性である液体を前記密閉された内部に受け取るように構成されている、項目２７に記載の生物学的分析システム。
（項目２９）
装填された試料ホルダを前記充填ステーションから前記ブロックアセンブリに移送するための自動化デバイスをさらに備えている、項目２６に記載の生物学的分析システム。
（項目３０）
前記命令は、試料装填命令、各試料に対するアッセイ定義、試料場所定義、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、項目２６に記載の生物学的分析システム。
（項目３１）
少なくとも１つの試料ホルダは、識別子を備えている、項目２６に記載の生物学的分析システム。
（項目３２）
前記識別子は、バーコードである、項目３１に記載の生物学的分析システム。
（項目３３）
前記プロセッサは、更新された試料場所、更新された位置的場所、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される情報を用いて、前記受信されたデータファイルを修正するように構成されている、項目２６に記載の生物学的分析システム。
（項目３４）
前記不混和性液体は、フッ素化炭化水素、炭化水素、油、またはシリコーン流体である、項目２８に記載の生物学的分析システム。
（項目３５）
生物学的分析システムであって、
複数の試料で装填された１つ以上の試料ホルダを収容するように構成されているブロックアセンブリであって、前記試料ホルダは、識別子を含む、ブロックアセンブリと、
命令を記憶しているデータファイルと、
（ａ）前記複数の試料から放出される蛍光シグナルを検出し、（ｂ）前記識別子を撮像し、前記データファイルを識別し、前記試料ホルダを識別するように構成さている光学系と、
前記識別されたデータファイルの命令を実行し、一連の温度を通して前記複数の試料を循環させるプロセッサと
を備えている、生物学的分析システム。
（項目３６）
前記命令は、試料装填命令、各試料に対するアッセイ定義、試料場所定義、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、項目３５に記載の生物学的分析システム。
（項目３７）
前記識別子は、バーコードである、項目３５に記載の生物学的分析システム。