【手続補正書】
【提出日】平成27年10月9日(2015.10.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせでドープされたシトクロムｃと、
前記カルジオリピンおよび／またはペプチドのレベルの変化により誘導される前記シトクロムｃの特性変化を測定する計量器とを含むセンサー、
（ｂ）シトクロムｃと、
前記シトクロムｃと連通しているカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせの供給源と、
前記シトクロムｃと連通している前記カルジオリピンおよび／またはペプチドの量を制御するアクチュエータとを含むスイッチ、
（ｃ）有効量のカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせでドープされたシトクロムｃと、
前記シトクロムｃからの発光を刺激する光源とを含む発光素子、または、
（ｄ）カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせでドープされたシトクロムｃを含むバイオセンサー
であることを特徴とする製品。
【請求項２】
前記カルジオリピンおよび／またはペプチドのレベルが、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方の変動に応答して変化するか、
前記特性が、導電率であり、前記計量器が、前記シトクロムｃと電気的に連通しているアノードおよびカソードを含むか、または、
前記特性が、フォトルミネセンスであり、前記計量器が、前記シトクロムｃにより発光された光の強度および前記シトクロムｃにより発光された光の波長のうちの少なくとも一方の変化を測定する光検出器を含む、
請求項１の（ａ）に記載のセンサー。
【請求項３】
前記アクチュエータが、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方を制御する、請求項１の（ｂ）に記載のスイッチ。
【請求項４】
前記ドープされたシトクロムｃが、電極への電子流動におけるメディエータを含むか、
前記ドープされたシトクロムｃが、前記電極に直接固定されているか、
前記カルジオリピン、ペプチドおよび／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内の表面に固定されているか、または、
前記カルジオリピン、ペプチドおよび／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内で自由に拡散可能である、
請求項１の（ｄ）に記載のバイオセンサー。
【請求項５】
（Ａ）カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせでドープされたシトクロムｃの特性の変化を測定する工程を含む、感知方法であって、前記変化が、前記カルジオリピンおよび／またはペプチドのレベルの変化により誘導される方法、
（Ｂ）シトクロムｃと連通しているカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせのレベルを変化させる工程を含む、切り替え方法、
（Ｃ）有効量のカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせでドープされたシトクロムｃを刺激する工程を含む、発光方法、
（Ｄ）試料中の基質を検出する方法であって、
ａ）前記試料を、ｉ）前記基質に特異的なレドックス活性酵素、ii）カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせでドープされたシトクロムｃ、ならびに、iii）電極を含むバイオセンサーと接触させる工程と、
ｂ）前記バイオセンサー内の電子流動を検出する工程と
を含む方法、
（Ｅ）環境汚染物質を含有する材料を、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドまたはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチドを発現する組換えバクテリアを含むバイオレメディエーション組成物と接触させる工程を含む、環境汚染物質のバイオレメディエーションのための方法、または、
（Ｆ）シトクロムｃを含有する試料中のシトクロムｃ還元を増大させる方法、シトクロムｃを含有する試料中のシトクロムｃを通る電子の拡散を増加させる方法、または、シトクロムｃを含有する試料中のシトクロムｃの周囲にπ−π相互作用を導入する方法であって、前記試料を、有効量のカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドもしくはＤｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンとＤ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドの１種以上との組み合わせと接触させる工程を含む方法
であることを特徴とする方法。
【請求項６】
（ａ）前記カルジオリピンおよび／またはペプチドのレベルが、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方の変動に応答して変化するか、または、
（ｂ）前記特性が、導電率、フォトルミネセンス強度、およびフォトルミネセンス波長のうちの少なくとも１つである、
請求項５の（Ａ）に記載の方法。
【請求項７】
カルジオリピンおよび／またはペプチドのレベルを変化させる工程が、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方を変動させる工程を含む、請求項５の（Ｂ）に記載の方法。
【請求項８】
（ａ）前記ドープされたシトクロムｃが、電極への電子流動におけるメディエータを含むか、
（ｂ）前記ドープされたシトクロムｃが、前記電極に直接固定されているか、
（ｃ）前記カルジオリピン、ペプチド、および／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内の表面に固定されているか、または、
（ｄ）前記カルジオリピン、ペプチド、および／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内で自由に拡散可能である、
請求項５の（Ｄ）に記載の方法。
【請求項９】
（ａ）前記環境汚染物質が、金属を含むか、
（ｂ）前記環境汚染物質が、非金属を含むか、
（ｃ）前記環境汚染物質が、過塩素酸塩を含むか、
（ｄ）前記環境汚染物質が、硝酸塩を含むか、
（ｅ）前記環境汚染物質が、放射線核種を含むか、
（ｆ）前記環境汚染物質が、メチル−ｔｅｒｔ−ブチルエーテル（ＭＴＢＥ）、塩化ビニル、またはジクロロエチレンを含むか、または、
（ｇ）バイオレメディエーションが、インサイチュまたはエクスサイチュで実施される、
請求項５の（Ｅ）に記載の方法。
【請求項１０】
（ａ）前記金属が、Ｓｃ、Ｔｉ、Ｖ、Ｃｒ、Ｍｎ、Ｆｅ、Ｃｏ、Ｎｉ、Ｃｕ、Ｚｎ、Ｙ、Ｚｒ、Ｎｂ、Ｍｏ、Ｔｃ、Ｒｕ、Ｐｄ、Ａｇ、Ｃｄ、Ｈｆ、Ｔａ、Ｗ、Ｒｅ、Ｏｓ、Ｉｒ、Ｐｔ、Ａｕ、Ｈｇ、Ｒｆ、Ｄｂ、Ｓｇ、Ｂｈ、Ｈｓ、Ｃｎ、Ａｌ、Ｇａ、Ｉｎ、Ｓｎ、Ｔｉ、Ｐｂ、またはＢｉを含むか、
（ｂ）前記非金属が、硫酸塩を含むか、
（ｃ）前記過塩素酸塩が、ＮＨ4ＣｌＯ4、ＣｓＣｌＯ4、ＬｉＣｌＯ4、Ｍｇ（ＣｌＯ4）2、ＨＣｌＯ4、ＫＣｌＯ4、ＲｂＣｌＯ4、ＡｇＣｌＯ4、またはＮａＣｌＯ4を含むか、
（ｄ）前記硝酸塩が、ＨＮＯ3、ＬｉＮＯ3、ＮａＮＯ3、ＫＮＯ3、ＲｂＮＯ3、ＣｓＮＯ3、Ｂｅ（ＮＯ3）2、Ｍｇ（ＮＯ3）2、Ｃａ（ＮＯ3）2、Ｓｒ（ＮＯ3）2、Ｂａ（ＮＯ3）2、Ｓｃ（ＮＯ3）3、Ｃｒ（ＮＯ3）3、Ｍｎ（ＮＯ3）2、Ｆｅ（ＮＯ3）3、Ｃｏ（ＮＯ3）2、Ｎｉ（ＮＯ3）2、Ｃｕ（ＮＯ3）2、Ｚｎ（ＮＯ3）2、Ｐｄ（ＮＯ3）2、Ｃｄ（ＮＯ3）2、Ｈｇ（ＮＯ3）2、Ｐｂ（ＮＯ3）2、またはＡｌ（ＮＯ3）3を含むか、または、
（ｅ）前記放射線核種が、アクチニドまたはウランを含む、
請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記試料が、センサー、導体、スイッチ、または発光素子の成分を含む、請求項５の（Ｆ）に記載の方法。
【請求項１２】
１種以上の芳香族カチオン性ペプチドを発現する組換えバクテリアを含む、環境汚染物質のバイオレメディエーションにおいて使用するための組成物。
【請求項１３】
前記組換えバクテリアが、
（ａ）前記１種以上の芳香族カチオン性ペプチドをコードする核酸配列を含み、および／または、
（ｂ）前記組換えバクテリアが、表７に列挙されたバクテリア種に由来する、
請求項１２に記載の組成物または請求項５の（Ｅ）に記載の方法。
【請求項１４】
前記核酸配列が、
（ａ）誘導性プロモータまたは構成性プロモータの制御下で発現されるか、
（ｂ）プラスミドＤＮＡを含むか、および／または、
（ｃ）ゲノムインサートを含む、
請求項１３に記載の組成物または方法。
【請求項１５】
前記芳香族カチオン性ペプチドが、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2およびＤ−Ａｒｇ−２’，６’−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2からなる群から選択されるペプチドを含む、請求項５の（Ｅ）、請求項９および請求項１０のいずれか一項に記載の方法、請求項１２に記載の組成物、または、請求項１３もしくは１４に記載の方法もしくは組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２９２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２９２】
本発明のまた別の態様は、以下のとおりであってもよい。
〔１〕シトクロムｃを含有する試料中のシトクロムｃ還元を増大させる方法であって、前記試料を有効量のＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドと接触させる工程を含むことを特徴とする、方法。
〔２〕シトクロムｃを含有する試料中のシトクロムｃを通る電子の拡散を増加させる方法であって、前記試料を有効量のＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドと接触させる工程を含むことを特徴とする、方法。
〔３〕シトクロムｃを含有する試料中のシトクロムｃの周囲にπ−π相互作用を導入する方法であって、前記試料を有効量のＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドと接触させる工程を含むことを特徴とする、方法。
〔４〕あるレベルのカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、カルジオリピンおよびペプチドがドープされたシトクロムｃと、カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンの前記レベルの変化により誘導される前記シトクロムｃの特性変化を測定する計量器とを含むことを特徴とする、センサー。
〔５〕カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンの前記レベルが、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方の変動に応答して変化する、前記〔４〕に記載のセンサー。
〔６〕前記特性が、導電率であり、前記計量器が、前記シトクロムｃと電気的に連通するアノードおよびカソードを含む、前記〔４〕に記載のセンサー。
〔７〕前記特性が、フォトルミネセンスであり、前記計量器が、前記シトクロムｃにより発光された光の強度および前記シトクロムｃにより発光された光の波長のうちの少なくとも一方の変化を測定する光検出器を含む、前記〔４〕に記載のセンサー。
〔８〕カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンのレベルの変化により誘導される、前記レベルのカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンがドープされたシトクロムｃの特性の変化を測定する工程を含むことを特徴とする、検知方法。
〔９〕カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンの前記レベルが、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方の変動に応答して変化する、前記〔８〕に記載のセンサー。
〔１０〕前記特性が、導電率、フォトルミネセンス強度、およびフォトルミネセンス波長のうちの少なくとも１つである、前記〔８〕に記載の方法。
〔１１〕シトクロムｃ；前記シトクロムｃと連通するカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンの供給源；ならびに、前記シトクロムｃと連通するカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンの量を制御するアクチュエータ、を含むスイッチ。
〔１２〕前記アクチュエータが、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方を制御する、前記〔１１〕に記載のスイッチ。
〔１３〕シトクロムｃと連通するカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンのレベルを変化させる工程を含むことを特徴とする、切り替え方法。
〔１４〕カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンのレベルを変化させる工程が、前記シトクロムｃの温度および前記シトクロムｃのｐＨの少なくとも一方を変動させる工程を含む、前記〔１３〕に記載の方法。
〔１５〕有効量のカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンがドープされたシトクロムｃ；および前記シトクロムｃからの発光を刺激する光源を含むことを特徴とする、発光素子。
〔１６〕有効量のカルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンがドープされたシトクロムｃを刺激する工程を含むことを特徴とする、発光方法。
〔１７〕前記試料が、センサー、導体、スイッチ、または発光素子の成分を含む、前記〔１〕〜〔３〕のいずれか１項に記載の方法。
〔１８〕カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンがドープされたシトクロムｃを含むことを特徴とする、バイオセンサー。
〔１９〕カルジオリピンがドープされた、またはペプチドがドープされた、またはカルジオリピンおよびペプチドがドープされたシトクロムｃが、電極への電子流動におけるメディエータを含む、前記〔１８〕に記載のバイオセンサー。
〔２０〕カルジオリピンがドープされた、またはペプチドがドープされた、またはカルジオリピンおよびペプチドがドープされたシトクロムｃが、前記電極に直接固定されている、前記〔１８〕に記載のバイオセンサー。
〔２１〕カルジオリピン、もしくはＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、および／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内の表面に固定されている、前記〔１８〕に記載のバイオセンサー。
〔２２〕カルジオリピン、もしくはＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、および／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内で自由に拡散可能である、前記〔１８〕に記載のバイオセンサー。
〔２３〕試料中の基質を検出する方法であって、
ａ）前記試料を、
ｉ）前記基質に特異的なレドックス活性酵素、
ii）カルジオリピン、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、または、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチドおよびカルジオリピンがドープされたシトクロムｃ、ならびに、
iii）電極、
を含むバイオセンサーと接触させる工程と、
ｂ）前記バイオセンサー内の電子流動を検出する工程と
を含むことを特徴とする、方法。
〔２４〕ペプチドがドープされた、カルジオリピンがドープされた、またはペプチドとカルジオリピンとがドープされたシトクロムｃが、電極への電子流動におけるメディエータを含む、前記〔２３〕に記載の方法。
〔２５〕ペプチドがドープされた、カルジオリピンがドープされた、またはペプチドとカルジオリピンとがドープされたシトクロムｃが、前記電極に直接固定されている、前記〔２３〕に記載の方法。
〔２６〕カルジオリピン、もしくはＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、および／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内の表面に固定されている、前記〔２３〕に記載の方法。
〔２７〕カルジオリピン、もしくはＤ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2ペプチド、および／またはシトクロムｃが、前記バイオセンサー内で自由に拡散可能である、前記〔２３〕に記載の方法。
〔２８〕１種以上の芳香族カチオン性ペプチドを発現する組換えバクテリアを含む、環境汚染物質のバイオレメディエーションにおいて使用するための組成物。
〔２９〕前記組換えバクテリアが、前記１種以上の芳香族カチオン性ペプチドをコードする核酸配列を含む、前記〔２８〕に記載の組成物。
〔３０〕前記核酸配列が、誘導性プロモータの制御下で発現される、前記〔２９〕に記載の組成物。
〔３１〕前記核酸配列が、構成性プロモータの制御下で発現される、前記〔２９〕に記載の組成物。
〔３２〕前記核酸配列が、プラスミドＤＮＡを含む、前記〔２９〕に記載の組成物。
〔３３〕前記核酸配列が、ゲノムインサートを含む、前記〔２９〕に記載の組成物。
〔３４〕前記組換えバクテリアが、表７に列挙されたバクテリア種に由来する、前記〔２８〕に記載の組成物。
〔３５〕環境汚染物質を含有する材料を、１種以上の芳香族カチオン性ペプチドを発現する組換えバクテリアを含むバイオレメディエーション組成物と接触させる工程を含むことを特徴とする、環境汚染物質のバイオレメディエーションの方法。
〔３６〕前記環境汚染物質が、金属を含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔３７〕前記金属が、Ｓｃ、Ｔｉ、Ｖ、Ｃｒ、Ｍｎ、Ｆｅ、Ｃｏ、Ｎｉ、Ｃｕ、Ｚｎ、Ｙ、Ｚｒ、Ｎｂ、Ｍｏ、Ｔｃ、Ｒｕ、Ｐｄ、Ａｇ、Ｃｄ、Ｈｆ、Ｔａ、Ｗ、Ｒｅ、Ｏｓ、Ｉｒ、Ｐｔ、Ａｕ、Ｈｇ、Ｒｆ、Ｄｂ、Ｓｇ、Ｂｈ、Ｈｓ、Ｃｎ、Ａｌ、Ｇａ、Ｉｎ、Ｓｎ、Ｔｉ、Ｐｂ、またはＢｉを含む、前記〔３６〕に記載の方法。
〔３８〕前記環境汚染物質が、非金属を含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔３９〕前記非金属が、硫酸塩を含む、前記〔３８〕に記載の方法。
〔４０〕前記環境汚染物質が、過塩素酸塩を含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔４１〕前記過塩素酸塩が、ＮＨ4ＣｌＯ4、ＣｓＣｌＯ4、ＬｉＣｌＯ4、Ｍｇ（ＣｌＯ4）2、ＨＣｌＯ4、ＫＣｌＯ4、ＲｂＣｌＯ4、ＡｇＣｌＯ4、またはＮａＣｌＯ4を含む、前記〔４０〕に記載の方法。
〔４２〕前記環境汚染物質が、硝酸塩を含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔４３〕前記硝酸塩が、ＨＮＯ3、ＬｉＮＯ3、ＮａＮＯ3、ＫＮＯ3、ＲｂＮＯ3、ＣｓＮＯ3、Ｂｅ（ＮＯ3）2、Ｍｇ（ＮＯ3）2、Ｃａ（ＮＯ3）2、Ｓｒ（ＮＯ3）2、Ｂａ（ＮＯ3）2、Ｓｃ（ＮＯ3）3、Ｃｒ（ＮＯ3）3、Ｍｎ（ＮＯ3）2、Ｆｅ（ＮＯ3）3、Ｃｏ（ＮＯ3）2、Ｎｉ（ＮＯ3）2、Ｃｕ（ＮＯ3）2、Ｚｎ（ＮＯ3）2、Ｐｄ（ＮＯ3）2、Ｃｄ（ＮＯ3）2、Ｈｇ（ＮＯ3）2、Ｐｂ（ＮＯ3）2、またはＡｌ（ＮＯ3）3を含む、前記〔４２〕に記載の方法。
〔４４〕前記環境汚染物質が、放射線核種を含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔４５〕前記放射線核種が、アクチニドを含む、前記〔４４〕に記載の方法。
〔４６〕前記放射線核種が、ウランを含む、前記〔４４〕に記載の方法。
〔４７〕前記環境汚染物質が、メチル−ｔｅｒｔ−ブチルエーテル（ＭＴＢＥ）、塩化ビニル、またはジクロロエチレンを含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔４８〕バイオレメディエーションが、インサイチュで実施される、前記〔３５〕に記載の方法。
〔４９〕バイオレメディエーションが、エクスサイチュで実施される、前記〔３５〕に記載の方法。
〔５０〕前記バクテリアが、前記１種以上の芳香族カチオン性ペプチドをコードする核酸配列を含む、前記〔３５〕に記載の方法。
〔５１〕前記核酸配列が、誘導性プロモータの制御下で発現される、前記〔５０〕に記載の方法。
〔５２〕前記核酸配列が、構成性プロモータの制御下で発現される、前記〔５０〕に記載の方法。
〔５３〕前記核酸配列が、プラスミドＤＮＡを含む、前記〔５０〕に記載の方法。
〔５４〕前記核酸配列が、ゲノムインサートを含む、前記〔５０〕に記載の方法。
〔５５〕前記組換えバクテリアが、表７に列挙されたバクテリア種に由来する、前記〔３５〕に記載の方法。
〔５６〕前記芳香族カチオン性ペプチドが、Ｄ−Ａｒｇ−Ｄｍｔ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2を含む、前記〔３５〕〜〔５５〕のいずれか１項に記載の方法。
〔５７〕Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ａｔｎ）Ｄａｐ−ＮＨ2（（ａｔｎ）Ｄａｐは、β−アントラニロイル−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸である）、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ａｌｄ−Ｌｙｓ−ＮＨ2（Ａｌｄは、β−（６’−ジメチルアミノ−２’−ナフトイル）アラニンである）、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−Ｌｙｓ−Ａｌｄ−ＮＨ2（Ａｌｄは、β−（６’−ジメチルアミノ−２’−ナフトイル）アラニンである）、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2（（ｄｎｓ）Ｄａｐは、β−ダンシル−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸である）、またはその医薬的に許容可能な塩からなる群より選択される１種以上の芳香族カチオン性ペプチドを含むことを特徴とする、組成物。
〔５８〕医薬的に許容可能な担体を含む、前記〔５７〕に記載の組成物。
〔５９〕シトクロムｃペルオキシダーゼ活性を阻害することを必要としている対象において、シトクロムｃペルオキシダーゼ活性を阻害する方法であって、治療有効量の芳香族カチオン性ペプチドまたはその医薬的に許容可能な塩を投与する工程を含むことを特徴とする、方法。
〔６０〕前記芳香族カチオン性ペプチドが、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ａｔｎ）Ｄａｐ−ＮＨ2（（ａｔｎ）Ｄａｐは、β−アントラニロイル−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸である）、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ａｌｄ−Ｌｙｓ−ＮＨ2（Ａｌｄは、β−（６’−ジメチルアミノ−２’−ナフトイル）アラニンである）、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−Ｌｙｓ−Ａｌｄ−ＮＨ2（Ａｌｄは、β−（６’−ジメチルアミノ−２’−ナフトイル）アラニンである）、Ｄ−Ａｒｇ−Ｔｙｒ−Ｌｙｓ−Ｐｈｅ−ＮＨ2、Ｄｍｔ−Ｄ−Ａｒｇ−Ｐｈｅ−（ｄｎｓ）Ｄａｐ−ＮＨ2（（ｄｎｓ）Ｄａｐは、β−ダンシル−Ｌ−α，β−ジアミノプロピオン酸である）、またはその医薬的に許容可能な塩からなる群より選択される、前記〔５９〕に記載の方法。
他の実施形態は、以下の特許請求の範囲に示される。