【手続補正書】
【提出日】平成26年11月17日(2014.11.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
合成抗体又はその機能断片のコレクションにおいて、前記抗体又は機能断片が可変重鎖と可変軽鎖との対を含み、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ３−２１（配列番号２５７）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ２−１４（配列番号２５４）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−３０（配列番号２１２）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）の２０個以上から選択される生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項２】
請求項１に記載の合成抗体又はその断片のコレクションにおいて、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、前記可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ３−２１（配列番号２５７）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ２−１４（配列番号２５４）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−３０（配列番号２１２）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）の２５個以上から選択される生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項３】
請求項１又は２に記載の合成抗体又はその機能断片のコレクションにおいて、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、前記可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ３−２１（配列番号２５７）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ２−１４（配列番号２５４）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−３０（配列番号２１２）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）の３０個以上から選択される生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項４】
請求項１乃至３の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又は機能断片が、生殖系列タンパク質対の生殖系列タンパク質配列を含む可変重鎖及び可変軽鎖フレームワーク領域を含み、前記生殖系列タンパク質対が、以下の特性：
ｉ）少なくとも２．５ｍｇ／ＬのＦａｂフォーマットにおける発現収率；
ｉｉ）Ｆａｂフォーマットにおける７０℃以上での熱安定性；
ｉｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９８％のＦａｂフォーマットにおける単量体含量（％単量体）；
ｉｖ）少なくとも３０ｍｇ／ＬのＩｇＧ１フォーマットにおける発現収率；
ｖ）ＩｇＧ１フォーマットにおける７３℃以上での熱安定性；及び
ｖｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＩｇＧ１フォーマットにおける単量体含量（％単量体）
を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項５】
請求項１乃至４のいずれか１項に記載のコレクションにおいて、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、前記可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）の生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項６】
請求項１乃至５のいずれか１項に記載の合成抗体又はその機能断片のコレクションにおいて、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）の生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項７】
請求項６に記載のコレクションにおいて、前記抗体又は機能断片が、生殖系列タンパク質対の生殖系列タンパク質配列を含む可変重鎖及び可変軽鎖フレームワーク領域を含み、前記生殖系列タンパク質対が、以下の特性：
ｉ）少なくとも２．５ｍｇ／ＬのＦａｂフォーマットにおける発現収率；
ｉｉ）Ｆａｂフォーマットにおける７０℃以上での熱安定性；
ｉｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＦａｂフォーマットにおける単量体含量（％単量体）；
ｉｖ）少なくとも３０ｍｇ／ＬのＩｇＧ１フォーマットにおける発現収率；
ｖ）ＩｇＧ１フォーマットにおける７３℃以上での熱安定性；
ｖｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＩｇＧ１フォーマットにおける単量体含量（％単量体）、及び
ｖｉｉ）少なくとも８．３のＩｇＧ１フォーマットにおける等電点
を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項８】
請求項７に記載のコレクションにおいて、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；及びＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）からさらに選択される生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項９】
請求項１乃至８の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対由来の生殖系列タンパク質配列を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１０】
請求項１乃至９の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対由来の生殖系列タンパク質配列を含むＣＤＲ１領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１１】
請求項１乃至１０の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対由来の生殖系列タンパク質配列を含むＣＤＲ２領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１２】
請求項１乃至１１の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、潜在的な翻訳後修飾部位を取り除くアミノ酸修飾を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１３】
請求項１２に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれの可変重鎖の相補性決定領域（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｉｔｙ  ｄｅｔｅｒｍｉｎｇ  ｒｅｇｉｏｎ）配列を含む１つ以上の重鎖相補性決定領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１４】
請求項１３に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれのＨＣＤＲ１領域由来のＨＣＤＲ１領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１５】
請求項１３又は１４に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれのＨＣＤＲ２領域由来のＨＣＤＲ２領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１６】
請求項１乃至１５の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、ＪＨ４（配列番号２９３）、Ｊκ１（配列番号２９７）、及びＪλ２／３（配列番号３０１）からなる群から選択されるＦＲ４領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１７】
請求項１乃至１６の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、多様化されたＨＣＤＲ３領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１８】
請求項１乃至１７の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体又はその機能断片が、多様化されたＬＣＤＲ３領域を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項１９】
請求項１乃至１８（ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇ  ｃｌａｉｍｓ）の何れか１項に記載のコレクションにおいて、少なくとも１×１０４個の抗体又はその機能断片を含むことを特徴とするコレクション。
【請求項２０】
請求項１乃至１９（ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇ  ｃｌａｉｍｓ）の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体が、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＭ及びＩｇＤからなる群から選択されることを特徴とするコレクション。
【請求項２１】
請求項１乃至２０（ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇ  ｃｌａｉｍｓ）の何れか１項に記載のコレクションにおいて、前記抗体の前記機能断片が、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、Ｆｖ、及びｓｃＦｖからなる群から選択されることを特徴とするコレクション。
【請求項２２】
請求項１乃至２１の何れか１項に記載の抗体又はその機能断片のコレクションをコードすることを特徴とする核酸のコレクション。
【請求項２３】
請求項２２に記載の核酸のコレクションを含むことを特徴とするベクター。
【請求項２４】
請求項２２に記載の核酸又は請求項２３に記載のベクターを含むことを特徴とする組換え宿主細胞。
【請求項２５】
合成抗体又はその機能断片のコレクションの作製方法において、
ａ）ヒト免疫レパートリーに存在する可変重鎖及び可変軽鎖生殖系列遺伝子対を同定するステップ；
ｂ）ステップａ）で同定された前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系列タンパク質対を、以下の特性について試験するステップ：
ｉ）少なくとも２．５ｍｇ／ＬのＦａｂフォーマットにおける発現収率；
ｉｉ）Ｆａｂフォーマットにおける７０℃以上での熱安定性；
ｉｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９８％のＦａｂフォーマットにおける単量体含量（％単量体）；
ｉｖ）少なくとも３０ｍｇ／ＬのＩｇＧ１フォーマットにおける発現収率；
ｖ）ＩｇＧ１フォーマットにおける７３℃以上での熱安定性；及び
ｖｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＩｇＧ１フォーマットにおける単量体含量（％単量体）；及び
ｃ）コレクションを作成するステップにおいて、前記抗体又はその機能断片が可変重鎖と可変軽鎖との対を含み、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、ステップｂ）の特性を満たす生殖系列タンパク質対の生殖系列タンパク質配列を含む、ステップ
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２６】
請求項２５に記載の方法において、ステップａ）が、
ａａ）サンプルからヒトＢ細胞を単離するステップ；
ａｂ）前記Ｂ細胞からｃＤＮＡを作成するステップ；
ａｃ）前記Ｂ細胞から前記ｃＤＮＡをＰＣＲ増幅するステップ；
ａｄ）前記ＰＣＲ産物を配列決定するステップ；及び
ａｅ）各ＰＣＲ産物の生殖系列遺伝子を同定するステップ
をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項２７】
請求項２５又は２６に記載の方法において、ステップｂ）が、
ｂａ）ヒト免疫レパートリーに存在する対を代表する可変重鎖及び可変軽鎖生殖系列タンパク質対を含む抗体又はその機能断片をコードするＤＮＡを合成するステップ；
ｂｂ）ｂａ）で合成された前記生殖系列タンパク質対を発現させるステップ；及び
ｂｃ）ｂｂ）の前記生殖系列タンパク質対を前記特性の各々について試験するステップ
をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項２８】
請求項２５乃至２７の何れか１項に記載の方法において、ステップｃ）が、
ｃａ）前記抗体又はその機能断片をコードする核酸を合成するステップ；
ｃｂ）前記核酸をベクターにクローニングするステップ；
ｃｃ）前記抗体又はその機能断片を発現させるステップ
を含むことを特徴とする方法。
【請求項２９】
請求項２５乃至２８の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又は機能断片が可変重鎖と可変軽鎖との対を含み、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、生殖系列タンパク質配列を含み、前記抗体又はその機能断片が、ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ３−２１（配列番号２５７）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ２−１４（配列番号２５４）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−３０（配列番号２１２）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）から選択される２０個以上の可変重鎖と可変軽鎖との対を含むことを特徴とする方法。
【請求項３０】
請求項２５乃至２９の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又は機能断片が可変重鎖と可変軽鎖との対を含み、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）の生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とする方法。
【請求項３１】
請求項２５乃至３０の何れか１項に記載の方法において、ステップｂ）が、以下の特性：
ｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＦａｂフォーマットにおける単量体含量（％単量体）；及び
ｉｉ）少なくとも８．３のＩｇＧ１フォーマットにおける等電点
をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項３２】
請求項２５乃至３１の何れか１項に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）から選択される生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とする方法。
【請求項３３】
請求項２５乃至３２の何れか１項に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；及びＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）から選択される生殖系列タンパク質配列をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項３４】
請求項２５乃至３３の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対由来の生殖系列タンパク質配列を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項３５】
請求項２５乃至３４の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又は機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対の生殖系列タンパク質配列を含むＣＤＲ１領域をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項３６】
請求項２５乃至３５の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又は機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対の生殖系列タンパク質配列を含むＣＤＲ２領域をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項３７】
請求項２５乃至３６の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、潜在的な翻訳後修飾部位を取り除くアミノ酸修飾を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項３８】
請求項２５乃至３７の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれの可変重鎖の相補性決定領域（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｉｔｙ  ｄｅｔｅｒｍｉｎｇ  ｒｅｇｉｏｎ）配列を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項３９】
請求項２５乃至３８の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれのＨＣＤＲ１領域由来のＨＣＤＲ１領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項４０】
請求項２５乃至３９の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれのＨＣＤＲ２領域由来のＨＣＤＲ２領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項４１】
請求項２５乃至４０の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、ＪＨ４（配列番号２９３）、Ｊκ１（配列番号２９７）、及びＪλ２／３（配列番号３０１）からなる群から選択されるＦＲ４領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項４２】
請求項２５乃至４１の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、多様化されたＨＣＤＲ３領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項４３】
請求項２５乃至４２の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、多様化されたＬＣＤＲ３領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項４４】
請求項２５乃至４３の何れか１項に記載の方法において、前記コレクションが、少なくとも１×１０４個の抗体又はその機能断片を含むことを特徴とする方法。
【請求項４５】
請求項２５乃至４４の何れか１項に記載の方法において、前記抗体が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＤ及びＩｇＭからなる群から選択されることを特徴とする方法。
【請求項４６】
請求項２５乃至４５の何れか１項に記載の方法において、前記抗体の前記機能断片が、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、Ｆｖ、及びｓｃＦｖからなる群から選択されることを特徴とする方法。
【請求項４７】
抗原に特異的な抗体又は抗体断片の同定方法において、
（ａ）前記抗原を抗体又はその機能断片のコレクションと接触させるステップにおいて、前記コレクションの前記抗体又は機能断片の少なくとも９０％が、可変重鎖と可変軽鎖との対を含み、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、以下の特性を含む生殖系列タンパク質対の生殖系列タンパク質配列を含む、ステップ：
ｉ）少なくとも２．５ｍｇ／ＬのＦａｂフォーマットにおける発現収率；
ｉｉ）Ｆａｂフォーマットにおける７０℃以上での熱安定性；
ｉｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９８％のＦａｂフォーマットにおける単量体含量（％単量体）；
ｉｖ）少なくとも３０ｍｇ／ＬのＩｇＧ１フォーマットにおける発現収率；
ｖ）ＩｇＧ１フォーマットにおける７３℃以上での熱安定性；及び
ｖｉｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＩｇＧ１フォーマットにおける単量体含量（％単量体）、及び
（ｂ）前記抗原に結合する１つ以上の抗体又は抗体断片を選択するステップ
を含むことを特徴とする方法。
【請求項４８】
請求項４７に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）由来の生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とする方法。
【請求項４９】
請求項４７又は４８に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ３−２１（配列番号２５７）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１６（配列番号２３４）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ２−１４（配列番号２５４）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）；ＶＨ３−３０（配列番号２１２）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）由来の生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とする方法。
【請求項５０】
請求項４７乃至４９の何れか１項に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、生殖系列タンパク質対の生殖系列タンパク質配列を含み、以下の特性：
ｉ）ＳＥＣにより決定するとき少なくとも９９％のＦａｂフォーマットにおける単量体含量（％単量体）；及び
ｉｉ）少なくとも８．３のＩｇＧ１フォーマットにおける等電点
をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項５１】
請求項５０に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ１−１８（配列番号２０４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ１−４６（配列番号２０５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ１−６９＊０１（配列番号２０６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−０７（配列番号２０７）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−４７（配列番号２５１）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−１１（配列番号２０８）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ１−２７（配列番号２３５）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＫ３−１１（配列番号２３７）；ＶＨ３−１５（配列番号２０９）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ３−２１（配列番号２１０）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＫ３−１５（配列番号２３８）；ＶＨ３−５３（配列番号２１３）／ＶＬ２−１１（配列番号２５３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０５（配列番号２３０）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−０６（配列番号２３１）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ１−１２（配列番号２３３）；ＶＨ３−７４（配列番号２１４）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−４０（配列番号２５０）；ＶＨ５−５１（配列番号２１５）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ１−０９（配列番号２３２）；ＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＫ３−２０（配列番号２３９）及びＶＨ６−１（配列番号２１６）／ＶＬ１−５１（配列番号２５２）から選択される生殖系列タンパク質配列を含むことを特徴とする方法。
【請求項５２】
請求項５１に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；及びＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）から選択される生殖系列タンパク質配列をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項５３】
請求項４７乃至５２の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対由来の生殖系列タンパク質配列を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項５４】
請求項４７乃至５３の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又は機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対の生殖系列タンパク質配列を含むＣＤＲ１領域をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項５５】
請求項４７乃至５４の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又は機能断片が、前記それぞれの可変重鎖と可変軽鎖との対の生殖系列タンパク質配列を含むＣＤＲ２領域をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項５６】
請求項４７乃至５５の何れか１項に記載の方法において、前記可変重鎖と可変軽鎖との対のフレームワーク領域が、可変重鎖と可変軽鎖との対ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＫ１−３９（配列番号２３６）；ＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ２−２３（配列番号２５５）；及びＶＨ３−２３（配列番号２１１）／ＶＬ３−１（配列番号２５６）から選択される生殖系列タンパク質配列をさらに含むことを特徴とする方法。
【請求項５７】
請求項４７乃至５６の何れか１項に記載の方法において、発現させる前記抗体又はその機能断片が、潜在的な翻訳後修飾部位を取り除くアミノ酸修飾を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項５８】
請求項４７乃至５７の何れか１項に記載の方法において、発現させる前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれの可変重鎖由来の相補性決定領域（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｉｔｙ  ｄｅｔｅｒｍｉｎｇ  ｒｅｇｉｏｎ）配列を含む１つ以上の相補性決定領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項５９】
請求項４７乃至５８の何れか１項に記載の方法において、発現させる前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれのＨＣＤＲ１領域由来のＨＣＤＲ１領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項６０】
請求項４７乃至５９の何れか１項に記載の方法において、発現させる前記抗体又はその機能断片が、配列番号２６６〜２７８に示されるそれぞれのＨＣＤＲ２領域由来のＨＣＤＲ２領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項６１】
請求項４７乃至６０の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、多様化されたＨＣＤＲ３領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項６２】
請求項４７乃至６１の何れか１項に記載の方法において、前記抗体又はその機能断片が、多様化されたＬＣＤＲ３領域を含むことを特徴とする方法。
【請求項６３】
請求項４７乃至６２の何れか１項に記載の方法において、前記コレクションが、少なくとも１×１０４個の抗体又はその機能断片を含むことを特徴とする方法。
【請求項６４】
請求項４７乃至６３の何れか１項に記載の方法において、前記抗体が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＤ及びＩｇＭからなる群から選択されることを特徴とする方法。
【請求項６５】
請求項４７乃至６４の何れか１項に記載の方法において、前記抗体の前記機能断片が、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、Ｆｖ、及びｓｃＦｖからなる群から選択されることを特徴とする方法。