【手続補正書】
【提出日】平成27年10月9日(2015.10.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４６９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４６９】
本明細書に挙げられる全ての刊行物、特許および特許出願は、あたかもそれぞれの個々の刊行物、特許または特許出願が具体的かつ個別的に参照により本明細書に組み込まれると示されるのと同程度まで、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明の実施形態として、例えば以下を挙げることができる。
(1)  ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場であって、前記モノマーサブユニットは、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、およびＧと命名される７つのベータ鎖、ならびにＡＢ、ＢＣ、ＣＤ、ＤＥ、ＥＦ、およびＦＧと命名される６つのループ領域を含み、ＣＤ４０Ｌに特異的に結合するＴｎ３足場。
(2)  単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(3)  タンデムに連結されている２つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(4)  前記２つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、直接連結されている、(3)に記載のＴｎ３足場。
(5)  前記２つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、リンカーにより連結されている、(3)に記載のＴｎ３足場。
(6)  前記リンカーは、ペプチドリンカーを含む、(5)に記載のＴｎ３足場。
(7)  前記ペプチドリンカーが、フレキシブルペプチドリンカーである、(6)に記載のＴｎ３足場。
(8)  前記ペプチドリンカーが、（ＧｍＸ）ｎ配列（式中、
（ａ）Ｘは、セリン（Ｓ）、アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）、Ｌｅｕ（Ｌ）、イソロイシン（Ｉ）、またはバリン（Ｖ）であり；
（ｂ）ｍおよびｎは、整数であり；
（ｃ）ｍは、１、２、３または４であり；
（ｄ）ｎは、１、２、３、４、５、６、または７である）
を含む、(7)に記載のＴｎ３足場。
(9)  前記ペプチドリンカーが、配列番号１３１、配列番号１３２、配列番号１４２または配列番号１４３を含む、(8)に記載のＴｎ３足場。
(10)  前記足場のＣＤ４０Ｌへの結合は、単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場のそれと比べて改善される、(3)に記載のＴｎ３足場。
(11)  前記足場のＣＤ４０Ｌへの結合は、標的に対する作用を単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場のそれと比べて改善する、(3)に記載のＴｎ３足場。
(12)  前記ＣＤ４０Ｌへの結合の改善は、結合親和性の改善、結合アビディティーの改善、またはその両方である、(10)に記載のＴｎ３足場。
(13)  ＣＤ４０Ｌについての結合親和性およびタンパク質安定性が、単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場のそれらと比べて改善される、(10)に記載のＴｎ３足場。
(14)  ＣＤ４０Ｌについての結合アビディティーおよびタンパク質安定性が、単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場のそれらと比べて改善される、(10)に記載のＴｎ３足場。
(15)  少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、リンカーに、または異種部分に結合している、(1)〜(9)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(16)  リンカーまたは異種部分が、前記足場のＮ末端またはＣ末端にコンジュゲートしている、(15)に記載のＴｎ３足場。
(17)  前記リンカーが、ペプチドリンカーを含む、(15)または(16)に記載のＴｎ３足場。
(18)  前記ペプチドリンカーが、フレキシブルペプチドリンカーである、(17)に記載のＴｎ３足場。
(19)  前記ペプチドリンカーが、（ＧｍＸ）ｎ配列（式中、
（ａ）Ｘは、セリン（Ｓ）、アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）、ロイシン（Ｌ）、イソロイシン（Ｉ）、またはバリン（Ｖ）であり；
（ｂ）ｍおよびｎは、整数であり；
（ｃ）ｍは、１、２、３または４であり；
（ｄ）ｎは、１、２、３、４、５、６、または７である）
を含む、(17)または(18)に記載のＴｎ３足場。
(20)  前記ペプチドリンカーが、配列番号１３１、配列番号１３２、配列番号１４２、または配列番号１４３を含む、(19)に記載のＴｎ３。
(21)  前記リンカーが、機能的部分を含む、(15)に記載のＴｎ３足場。
(22)  前記機能的部分が、免疫グロブリンまたはその断片である、(21)に記載のＴｎ３足場。
(23)  前記免疫グロブリンまたはその断片が、Ｆｃドメインを含む、(22)に記載のＴｎ３足場。
(24)  前記Ｆｃドメインが、少なくとも１つのＦｃγＲ媒介エフェクター機能を誘導し得ない、(23)に記載のＴｎ３足場。
(25)  前記少なくとも１つのＦｃγＲ媒介エフェクター機能が、ＡＤＣＣである、(24)に記載のＴｎ３足場。
(26)  少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、異種部分に結合している、(15)に記載のＴｎ３足場。
(27)  前記異種部分が、タンパク質、ペプチド、タンパク質ドメイン、リンカー、薬物、毒素、細胞傷害剤、造影剤、放射性核種、放射性化合物、有機ポリマー、無機ポリマー、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ビオチン、アルブミン、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、ＨＳＡ  ＦｃＲｎ結合部分、抗体、抗体のドメイン、抗体断片、単鎖抗体、ドメイン抗体、アルブミン結合ドメイン、酵素、リガンド、受容体、結合ペプチド、非ＦｎＩＩＩ足場、エピトープタグ、組換えポリペプチドポリマー、サイトカイン、および前記部分の２つ以上の組合せからなる群から選択される組成物を含む、(15)または(26)に記載のＴｎ３足場。
(28)  少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、ＰＥＧにコンジュゲートしている、(27)に記載のＴｎ３足場。
(29)  少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、アルブミンにコンジュゲートしている、(27)に記載のＴｎ３足場。
(30)  前記アルブミンが、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）である、(29)に記載のＴｎ３足場。
(31)  前記ＨＳＡが、バリアントＨＳＡである、(30)に記載のＴｎ３足場。
(32)  前記バリアントＨＳＡのアミノ酸配列が、配列番号１３３である、(31)に記載のＴｎ３足場。
(33)  前記バリアントＨＳＡが、ネイティブＨＳＡまたはネイティブＨＳＡ断片と比較して少なくとも１つの改善された特性を有する、(31)に記載のＴｎ３足場。
(34)  前記改善された特性が、ネイティブＨＳＡまたはネイティブＨＳＡ断片の血漿半減期と比較して変化した血漿半減期である、(33)に記載のＴｎ３足場。
(35)  前記変化した血漿半減期が、ネイティブＨＳＡまたはネイティブＨＳＡ断片の血漿半減期と比較して長い血漿半減期である、(34)に記載のＴｎ３足場。
(36)  前記変化した血漿半減期が、ネイティブＨＳＡまたはネイティブＨＳＡ断片の血漿半減期と比較して短い血漿半減期である、(34)に記載のＴｎ３足場。
(37)  前記ＨＳＡバリアントが、ＨＳＡドメインＩＩＩ中の少なくとも１つのアミノ酸置換を含む、(31)または(33)〜(36)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(38)  前記ＨＳＡバリアントが、全長成熟ＨＳＡ（配列番号１３３または１３８）の配列をまたはその断片を含み、但し、４０７、４１５、４６３、５００、５０６、５０８、５０９、５１１、５１２、５１５、５１６、５２１、５２３、５２４、５２６、５３５、５５０、５５７、５７３、５７４、および５８０からなる群から選択される位置における全長成熟ＨＳＡ中の位置に対して番号付与される少なくとも１つのアミノ酸置換を除き；前記少なくとも１つのアミノ酸置換は、５７３位におけるリジン（Ｋ）のグルタミン酸（Ｅ）への置換を含まず、前記ＨＳＡバリアントにコンジュゲートしていないＴｎ３足場の血漿半減期よりも長い血漿半減期を有する、(31)または(33)〜(37)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(39)  全長成熟ＨＳＡ中の位置に対して番号付与される前記少なくとも１つのアミノ酸置換が、４６３、５０８、５２３、および５２４からなる群から選択される位置におけるものであり、前記ＨＳＡバリアントにコンジュゲートしていないＴｎ３足場の血漿半減期よりも長い血漿半減期を有する、(38)に記載のＴｎ３足場。
(40)  前記ＨＳＡバリアントが、全長成熟ＨＳＡ（配列番号１３３または１３８）の配列またはその断片を含み、但し、
（ａ）４０７位におけるロイシン（Ｌ）のアスパラギン（Ｎ）またはチロシン（Ｙ）への置換；
（ｂ）４１５位におけるバリン（Ｖ）のトレオニン（Ｔ）への置換；
（ｃ）４６３位におけるロイシン（Ｌ）のアスパラギン（Ｎ）への置換；
（ｄ）５００位におけるリジン（Ｋ）のアルギニン（Ｒ）への置換；
（ｅ）５０６位におけるトレオニン（Ｔ）のチロシン（Ｙ）への置換；
（ｆ）５０８位におけるトレオニン（Ｔ）のアルギニン（Ｒ）への置換；
（ｇ）５０９位におけるフェニルアラニン（Ｆ）のメチオニン（Ｍ）またはトリプトファン（Ｗ）への置換；
（ｈ）５１１位におけるアラニン（Ａ）のフェニルアラニン（Ｆ）への置換；
（ｉ）５１２位におけるアスパラギン酸（Ｄ）のチロシン（Ｙ）への置換；
（ｊ）５１５位におけるトレオニン（Ｔ）のグルタミン（Ｑ）への置換；
（ｋ）５１６位におけるロイシン（Ｌ）のトレオニン（Ｔ）またはトリプトファン（Ｗ）への置換；
（ｌ）５２１位におけるアルギニン（Ｒ）のトリプトファン（Ｗ）への置換；
（ｍ）５２３位におけるイソロイシン（Ｉ）のアスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）、グリシン（Ｇ）、リジン（Ｋ）、またはアルギニン（Ｒ）への置換；
（ｎ）５２４位におけるリジン（Ｋ）のロイシン（Ｌ）への置換；
（ｏ）５２６位におけるグルタミン（Ｑ）のメチオニン（Ｍ）への置換；
（ｐ）５３５位におけるヒスチジン（Ｈ）のプロリン（Ｐ）への置換；
（ｑ）５５０位におけるアスパラギン酸（Ｄ）のグルタミン酸（Ｅ）への置換；
（ｒ）５５７位におけるリジン（Ｋ）のグリシン（Ｇ）への置換；
（ｓ）５７３位におけるリジン（Ｋ）のフェニルアラニン（Ｆ）、ヒスチジン（Ｈ）、プロリン（Ｐ）、トリプトファン（Ｗ）、またはチロシン（Ｙ）への置換；
（ｔ）５７４位におけるリジン（Ｋ）のアスパラギン（Ｎ）への置換；
（ｕ）５８０位におけるグルタミン（Ｑ）のリジン（Ｋ）への置換；および
（ｖ）前記置換の２つ以上の組合せ
からなる群から選択される全長成熟ＨＳＡ中の位置に対して番号付与される少なくとも１つのアミノ酸置換を除き、
前記ＨＳＡバリアントにコンジュゲートしていないＴｎ３足場の血漿半減期よりも長い血漿半減期を有する、(31)または(33)〜(38)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(41)  前記ＨＳＡバリアントが、全長成熟ＨＳＡ（配列番号１３３または１３８）の配列またはその断片を含み、但し、
（ａ）４６３位におけるロイシン（Ｌ）のアスパラギン（Ｎ）への置換；
（ｂ）５０８位におけるトレオニン（Ｔ）のアルギニン（Ｒ）への置換；
（ｃ）５２３位におけるイソロイシン（Ｉ）のアスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）、グリシン（Ｇ）、リジン（Ｋ）、またはアルギニン（Ｒ）への置換；
（ｄ）５２４位におけるリジン（Ｋ）のロイシン（Ｌ）への置換；および
（ｅ）前記置換の２つ以上の組合せ
からなる群から選択される全長成熟ＨＳＡ中の位置に対して番号付与される少なくとも１つのアミノ酸置換を除き、
前記ＨＳＡバリアントにコンジュゲートしていないＴｎ３足場の血漿半減期よりも長い血漿半減期を有する、(40)に記載のＴｎ３足場。
(42)  少なくとも２つの同一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含む、(3)〜(14)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(43)  少なくとも２つの異なるＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含む、(3)〜(15)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(44)  ＣＤ４０受容体アゴニストである、(1)〜(43)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(45)  ＣＤ４０受容体アンタゴニストである、(1)〜(44)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(46)  少なくとも２つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、同一のＣＤ４０Ｌエピトープに特異的に結合する、(3)〜(14)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(47)  少なくとも２つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、異なるＣＤ４０Ｌエピトープに特異的に結合する、(3)〜(14)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(48)  前記異なるＣＤ４０Ｌエピトープが、非重複エピトープである、(47)に記載のＴｎ３足場。
(49)  前記異なるＣＤ４０Ｌエピトープが、重複エピトープである、(47)に記載のＴｎ３足場。
(50)  少なくとも２つのＣＤ４０Ｌ分子に結合する、(1)〜(49)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(51)  単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、少なくとも２つのＣＤ４０Ｌ分子に結合する、(1)〜(50)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(52)  少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットのベータ鎖が、配列番号３のベータ鎖と少なくとも９０％の配列同一性を有する、(1)に記載のＴｎ３足場。
(53)  前記Ａベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１１を含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(54)  前記Ｂベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１２を含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(55)  前記Ｃベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１３または１４を含み、配列番号１３のシステインも配列番号１４のシステインも置換されていない、(1)に記載のＴｎ３足場。
(56)  前記Ｄベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１５を含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(57)  前記Ｅベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１６を含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(58)  前記Ｆベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１７を含み、配列番号１７のシステインが置換されていない、(1)に記載のＴｎ３足場。
(59)  前記Ｇベータ鎖が、少なくとも１つの突然変異を除き配列番号１８を含む、(1)に記載のＴｎ３足場。
(60)  前記ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、アミノ酸配列：
ＩＥＶ（ＸＡＢ）ｎＡＬＩＴＷ（ＸＢＣ）ｎＣＥＬＸ１ＹＧＩ（ＸＣＤ）ｎＴＴＩＤＬ（ＸＤＥ）ｎＹＳＩ（ＸＥＦ）ｎＹＥＶＳＬＩＣ（ＸＦＧ）ｎＫＥＴＦＴＴ
（式中、
（ａ）ＸＡＢ、ＸＢＣ、ＸＣＤ、ＸＤＥ、ＸＥＦ、およびＸＦＧは、それぞれ前記ＡＢ、ＢＣ、ＣＤ、ＤＥ、ＥＦ、およびＦＧループの配列中に存在するアミノ酸残基を表し；
（ｂ）Ｘ１は、アミノ酸残基ＡまたはＴを表し；
（ｃ）ループの長さｎは、２から２６の整数である）
を含む、(1)〜(59)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(61)  前記ＡＢループの配列が、配列番号４または配列番号１３６を含み、前記ＣＤループの配列が、配列番号６を含み、前記ＥＦループの配列が、配列番号８または配列番号１３７を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(62)  前記ＢＣループの配列が、配列番号８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２からなる群から選択される配列を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(63)  前記ＤＥループの配列が、配列番号９４、９５、９６、９７、９８、および１６９からなる群から選択される配列を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(64)  前記ＦＧループの配列が、配列番号９、９９、１３９、および１７０からなる群から選択される配列を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(65)  前記ＢＣループの配列が、配列番号１００、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、１１５、１１６、１１７、および１７４からなる群から選択される配列を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(66)  前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２３、１２４、１２５、１２６、１２７、１２８、および１７５からなる群から選択される配列を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(67)  前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９、１３０、および１７７からなる群から選択される配列を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(68)  （ａ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｂ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９９を含み；
（ｃ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８４を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｄ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８５を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｅ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８６を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９６を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｆ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８７を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９７を含み、前記ＦＧループの配列は、配列番号９または１３９を含み；
（ｇ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８８を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｈ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８９を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９０を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｊ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９１を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｋ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９２を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；または
（ｌ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含む、
(60)に記載のＴｎ３足場。
(69)  （ａ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１００を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｂ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０１を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１９を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｃ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０２を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２０を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｄ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｅ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０４を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２２を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｆ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０５を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｇ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０６を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｈ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０７を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０８を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｊ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０９を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｋ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１０を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｌ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１１を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１３０を含み；
（ｍ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０８を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｎ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１２を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｏ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｐ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１４を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｑ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１５を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２６を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｒ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１６を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２７を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；または
（ｓ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１７を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含む、
(60)に記載のＴｎ３足場。
(70)  前記ＡＢループが、配列番号１３６を含む、(69)に記載のＴｎ３足場。
(71)  前記ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、配列番号２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２および１４６からなる群から選択される配列を含む、(68)に記載のＴｎ３足場。
(72)  前記ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、アミノ酸配列：
ＩＥＶＫＤＶＴＤＴＴＡＬＩＴＷＸ１ＤＸ２Ｘ３Ｘ４Ｘ５Ｘ６Ｘ７Ｘ８ＣＥＬＴＹＧＩＫＤＶＰＧＤＲＴＴＩＤＬＷＸ９ＨＸ１０ＡＸ１１ＹＳＩＧＮＬＫＰＤＴＥＹＥＶＳＬＩＣＲＸ１２ＧＤＭＳＳＮＰＡＫＥＴＦＴＴ（配列番号１６７）
（式中、
（ａ）Ｘ１は、アミノ酸残基セリン（Ｓ）またはロイシン（Ｌ）を表し；
（ｂ）Ｘ２は、アミノ酸残基アスパラギン酸（Ｄ）またはグルタミン酸（Ｅ）を表し；
（ｃ）Ｘ３は、アミノ酸残基ヒスチジン（Ｈ）、イソロイシン（Ｉ）、バリン（Ｖ）、フェニルアラニン（Ｆ）またはトリプトファン（Ｗ）を表し；
（ｄ）Ｘ４は、アミノ酸残基アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）、グルタミン酸（Ｅ）またはアスパラギン酸（Ｄ）を表し；
（ｅ）Ｘ５は、アミノ酸残基グルタミン酸（Ｅ）、ロイシン（Ｌ）、グルタミン（Ｑ）、セリン（Ｓ）、アスパラギン酸（Ｄ）またはアスパラギン（Ｎ）を表し；
（ｆ）Ｘ６は、アミノ酸残基フェニルアラニン（Ｆ）またはチロシン（Ｙ）を表し；
（ｇ）Ｘ７は、アミノ酸残基イソロイシン（Ｉ）、バリン（Ｖ）、ヒスチジン（Ｈ）、グルタミン酸（Ｅ）またはアスパラギン酸（Ｄ）を表し；
（ｈ）Ｘ８は、アミノ酸残基グリシン（Ｇ）、トリプトファン（Ｗ）またはバリン（Ｖ）を表し；
（ｉ）Ｘ９は、アミノ酸残基トリプトファン（Ｗ）、フェニルアラニン（Ｆ）またはチロシン（Ｙ）を表し；
（ｊ）Ｘ１０は、アミノ酸残基セリン（Ｓ）、グルタミン（Ｑ）、メチオニン（Ｍ）またはヒスチジン（Ｈ）を表し；
（ｋ）Ｘ１１は、アミノ酸残基トリプトファン（Ｗ）またはヒスチジン（Ｈ）を表し；
（ｌ）Ｘ１２は、アミノ酸残基アルギニン（Ｒ）またはセリン（Ｓ）を表す）
を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(73)  前記ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、配列番号４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、および８２からなる群から選択される配列を含む、(69)に記載のＴｎ３足場。
(74)  前記ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、アミノ酸配列：
ＩＥＶＸ１ＤＶＴＤＴＴＡＬＩＴＷＸ２Ｘ３ＲＳＸ４Ｘ５Ｘ６Ｘ７Ｘ８Ｘ９Ｘ１０ＣＥＬＸ１１ＹＧＩＫＤＶＰＧＤＲＴＴＩＤＬＸ１２Ｘ１３Ｘ１４Ｘ１５ＹＶＨＹＳＩＧＮＬＫＰＤＴＸ１６ＹＥＶＳＬＩＣＬＴＴＤＧＴＹＸ１７ＮＰＡＫＥＴＦＴＴ（配列番号１７１）
（式中、
（ａ）Ｘ１は、アミノ酸残基リジン（Ｋ）またはグルタミン酸（Ｅ）を表し；
（ｂ）Ｘ２は、アミノ酸残基トレオニン（Ｔ）またはイソロイシン（Ｉ）を表し；
（ｃ）Ｘ３は、アミノ酸残基アスパラギン（Ｎ）またはアラニン（Ａ）を表し；
（ｄ）Ｘ４は、アミノ酸残基セリン（Ｓ）、ロイシン（Ｌ）、アラニン（Ａ）、フェニルアラニン（Ｆ）またはチロシン（Ｙ）を表し；
（ｅ）Ｘ５は、アミノ酸残基チロシン（Ｙ）、アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）、バリン（Ｖ）、イソロイシン（Ｉ）またはセリン（Ｓ）を表し；
（ｆ）Ｘ６は、アミノ酸残基チロシン（Ｙ）、セリン（Ｓ）、アラニン（Ａ）またはヒスチジン（Ｈ）を表し；
（ｇ）Ｘ７は、アミノ酸残基アスパラギン（Ｎ）、アスパラギン酸（Ｄ）、ヒスチジン（Ｈ）またはチロシン（Ｙ）を表し；
（ｈ）Ｘ８は、アミノ酸残基ロイシン（Ｌ）、フェニルアラニン（Ｆ）、ヒスチジン（Ｈ）またはチロシン（Ｙ）を表し；
（ｉ）Ｘ９は、アミノ酸残基ヒスチジン（Ｈ）、プロリン（Ｐ）、セリン（Ｓ）、ロイシン（Ｌ）またはアスパラギン酸（Ｄ）を表し；
（ｊ）Ｘ１０は、アミノ酸残基グリシン（Ｇ）、フェニルアラニン（Ｆ）、ヒスチジン（Ｈ）またはチロシン（Ｙ）を表し；
（ｋ）Ｘ１１は、アミノ酸残基アラニン（Ａ）またはトレオニン（Ｔ）を表し；
（ｌ）Ｘ１２は、アミノ酸残基セリン（Ｓ）、アスパラギン（Ｎ）、グルタミン酸（Ｅ）、アスパラギン（Ｒ）またはアスパラギン酸（Ｄ）を表し；
（ｍ）Ｘ１３は、アミノ酸残基セリン（Ｓ）、グルタミン（Ｑ）、トレオニン（Ｔ）、アスパラギン（Ｎ）またはアラニン（Ａ）を表し；
（ｎ）Ｘ１４は、アミノ酸残基プロリン（Ｐ）、バリン（Ｖ）、イソロイシン（Ｉ）またはアラニン（Ａ）またはアミノ酸無しを表し；
（ｏ）Ｘ１５は、アミノ酸残基イソロイシン（Ｉ）またはアミノ酸無しを表し；
（ｐ）Ｘ１６は、アミノ酸残基グルタミン酸（Ｅ）またはリジン（Ｋ）を表し；
（ｑ）Ｘ１７は、アミノ酸残基セリン（Ｓ）またはアスパラギン（Ｎ）を表す）
を含む、(60)に記載のＴｎ３足場。
(75)  配列番号１３４、１３５、２０５、２０６、２０７および２０８からなる群から選択される配列を含むＴｎ３足場。
(76)  配列番号１３４、１３５、２０５、２０６、２０７および２０８からなる群から選択される配列からなるＴｎ３足場。
(77)  配列番号２０１、２０２、２０３、および２０４からなる群から選択される配列を含むＴｎ３足場。
(78)  配列番号２０１、２０２、２０３、および２０４からなる群から選択される配列からなるＴｎ３足場。
(79)  前記ＣＤ４０Ｌが、ヒトＣＤ４０Ｌである、(1)〜(78)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(80)  前記ＣＤ４０Ｌが、膜結合ＣＤ４０Ｌ（配列番号１）、可溶性ＣＤ４０Ｌ（配列番号２）、またはその断片である、(79)に記載のＴｎ３足場。
(81)  ＣＤ４０Ｌに結合し、ＣＤ４０ＬのＣＤ４０への結合を妨害する、(1)〜(80)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(82)  ＣＤ４０Ｌに結合し、ＣＤ４０媒介シグナリングを破壊する、(1)〜(81)のいずれか一項に記載のＴｎ３足場。
(83)  ＣＤ４０Ｌ発現細胞を(1)〜(82)のいずれかに記載のＴｎ３足場と接触させることを含むＣＤ４０Ｌ発現細胞の活性を変化させる方法であって、前記Ｔｎ３足場は、ＣＤ４０Ｌに結合し、ＣＤ４０ＬのＣＤ４０への結合を妨害する方法。
(84)  ＣＤ４０Ｌ発現細胞を(1)〜(82)のいずれかに記載のＴｎ３足場と接触させることを含むＣＤ４０媒介シグナリング応答を変化させる方法であって、前記Ｔｎ３足場は、ＣＤ４０Ｌに結合し、ＣＤ４０媒介シグナリングを破壊する方法。
(85)  前記ＣＤ４０媒介シグナリング応答が、Ｔ依存性免疫応答である、(84)に記載の方法。
(86)  約１μＭ以下、または約５００ｎＭ以下、または約１００ｎＭ以下、または約５０ｎＭ以下、または約２５ｎＭ以下、または約１０ｎＭ以下、または約５ｎＭ以下、または約２ｎＭ以下の親和性（Ｋｄ）でＣＤ４０Ｌに結合する、(1)〜(82)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(87)  ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、配列番号２の１４２から１５５、２００から２３０、または２４７から２５１位に局在するアミノ酸を含むＣＤ４０Ｌエピトープに特異的に結合する、(1)〜(82)および(86)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(88)  ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、ＣＤ４０Ｌアミノ酸Ｅ１４２、Ｙ１４６、Ｍ１４８、Ｎ１５１、Ｌ１５５、Ｒ２００、Ｒ２０３、およびＥ２３０と相互作用する、(1)〜(61)、(65)〜(67)、(69)、(70)、(73)、(74)、(77)、および(78)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(89)  ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、ＣＤ４０Ｌアミノ酸Ｒ２０３、Ｉ２０４、Ｖ２４７、Ｈ２４９、およびＴ２５１と相互作用する、(1)〜(64)、(68)、(71)、(72)、(75)および(76)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(90)  ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、ＣＤ４０Ｌアミノ酸Ｓ２４５、Ｖ２４７、Ｈ２４９、およびＴ２５１と相互作用する、(1)〜(64)、(68)、(71)、(72)、(75)および(76)のいずれかに記載のＴｎ３足場。
(91)  ＣＤ４０Ｌアミノ酸Ｅ１４２、Ｙ１４６、Ｍ１４８、Ｎ１５１、Ｌ１５５が、第１のＣＤ４０Ｌ分子中に局在し、アミノ酸Ｒ２００、Ｒ２０３、およびＥ２３０が、第２のＣＤ４０Ｌ分子中に局在する、(88)に記載のＴｎ３足場。
(92)  ＣＤ４０Ｌアミノ酸Ｒ２０３およびＩ２０４が、第１のＣＤ４０Ｌ分子中に局在し、ＣＤ４０Ｌアミノ酸Ｖ２４７、Ｈ２４９、およびＴ２５１が、第２のＣＤ４０Ｌ分子中に局在する、(89)に記載のＴｎ３足場。
(93)  (1)〜(82)および(86)〜(92)のいずれかに記載のＴｎ３足場をコードする単離核酸分子。
(94)  (93)に記載の核酸を含む発現ベクター。
(95)  (94)に記載のベクターを含む宿主細胞。
(96)  前記核酸分子によりコードされるＴｎ３足場が発現される条件下で(95)に記載の宿主細胞を培養することを含む、Ｔｎ３足場を産生する方法。
(97)  (1)〜(82)および(86)〜(92)のいずれかに記載のＴｎ３足場および薬学的に許容可能な賦形剤を含む組成物。
(98)  有効量の(96)に記載の組成物を投与することを含む、自己免疫疾患の予防、治療、改善、または管理が必要とされる患者における自己免疫疾患を予防、治療、改善、または管理する方法。
(99)  治療有効量の(93)に記載の組成物を患者に投与することを含む、自己免疫疾患を有する患者に投与されるコルチコステロイドの頻度および量を低減させる方法。
(100)  前記自己免疫疾患が、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性アジソン病、副腎の自己免疫疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性卵巣炎および精巣炎、シェーグレン症候群、乾癬、アテローム性動脈硬化症、糖尿病性および他の網膜症、水晶体後線維増殖症、加齢性黄斑変性、血管新生性緑内障、血管腫、甲状腺過形成（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織移植、ならびに慢性炎症、敗血症、関節リウマチ、腹膜炎、クローン病、再灌流損傷、敗血症、内毒素ショック、嚢胞性線維症、心内膜炎、乾癬、関節炎（例えば、乾癬性関節炎）、アナフィラキシーショック、臓器虚血、再灌流損傷、脊髄損傷および同種移植片拒絶反応、自己免疫性血小板減少症、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、心筋症、セリアックスプルー皮膚炎、慢性疲労免疫機能不全症候群（ＣＦＩＤＳ）、慢性炎症性脱髄多発性神経障害、チャーグストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、ＣＲＥＳＴ症候群、寒冷凝集素症、クローン病、円板状ループス、本態性混合型クリオグロブリン血症、線維筋痛−線維筋炎、糸球体腎炎、グレーブス病、ギランバレー、橋本甲状腺炎、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、ＩｇＡ神経障害、若年性関節炎、扁平苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合性結合組織病、多発性硬化症、１型または免疫介在性糖尿病、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発筋痛、多発性筋炎および皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症、シェーグレン症候群、スティッフマン症候群、全身性エリテマトーデス、エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎／巨細胞動脈炎、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、血管炎、例えば、疱疹状皮膚炎血管炎、白斑およびウェゲナー肉芽腫症からなる群から選択される、(98)または(99)のいずれかに記載の方法。
(101)  前記自己免疫疾患が、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）である、(98)または(99)のいずれかに記載の方法。
(102)  追加の治療法をさらに含み、前記治療法は、免疫療法、生物療法、化学療法、放射線療法、または小分子薬物療法である、(98)または(99)のいずれかに記載の方法。
(103)  可溶性ＣＤ４０Ｌ（配列番号２）との複合体中の配列番号２０からなるＴｎ３足場を含むタンパク質結晶であって、Ｐ２１２１２１斜方晶空間群およびａ＝８５．６９Å、ｂ＝９０．６４Å、ｃ＝９５．５６Åの単位格子寸法、＋／−０．１％における結晶格子を有するタンパク質結晶。
(104)  前記結晶の非対称単位が、ＣＤ４０ＬのトリマーおよびＴｎ３足場の３つの分子を含む、(103)に記載のタンパク質結晶。
(105)  構造座標の決定のためのＸ線を、３．２Å以下の値の分解能に回折させる、(103)に記載のタンパク質結晶。
(106)  可溶性ＣＤ４０Ｌ（配列番号２）との複合体中の配列番号６８からなるＴｎ３足場を含むタンパク質結晶であって、Ｐ２１３立方晶空間群およびａ＝ｂ＝ｃ＝９７．６２Åの単位格子寸法、＋／−０．１％における結晶格子を有するタンパク質結晶。
(107)  前記結晶の非対称単位が、１つのＣＤ４０Ｌ分子および１つのＴｎ３足場分子を含む、(106)に記載のタンパク質結晶。
(108)  構造座標を決定するためのＸ線を、２．７Å以下の値の分解能に回折させる、(106)に記載のタンパク質結晶。
(109)  可溶性ＣＤ４０Ｌ（配列番号２）との複合体中の配列番号２８または１４６からなるＴｎ３足場を含むタンパク質結晶であって、Ｐ３２１空間群および、ａ＝９５．５３Å、ｂ＝９３．５３Å、ｃ＝６６．６９Åの単位格子寸法、＋／−０．１％における結晶格子を有するタンパク質結晶。
(110)  前記結晶の非対称単位が、１つのＣＤ４０Ｌ分子および１つのＴｎ３足場分子を含む、(109)に記載のタンパク質結晶。
(111)  構造座標を決定するためのＸ線を、２．８Å以下の値の分解能に回折させる、(109)に記載のタンパク質結晶。
(112)  可溶性ＣＤ４０Ｌ（配列番号２）との複合体中の配列番号６８および配列番号２８または１４６からなる２つの異なるＴｎ３足場を含むタンパク質結晶であって、Ｐ２１立方晶空間群およびａ＝８０．３２Å、ｂ＝１４３．４８Å、ｃ＝１１１．２７Å、β＝９８．２２Åの単位格子寸法、＋／−０．１％における結晶格子を有するタンパク質結晶。
(113)  前記結晶の非対称単位が、２つのＣＤ４０Ｌトリマーおよび６つのそれぞれのＴｎ３足場分子を含む、(112)のタンパク質結晶。
(114)  構造座標を決定するためのＸ線を、１．９Å以下の値の分解能に回折させる、(112)に記載のタンパク質結晶。
(115)  シッティングドロップ蒸気拡散により結晶化されている、(103)〜(114)のいずれか一項に記載のタンパク質結晶。
(116)  （ａ）ＣＤ４０Ｌとの複合体中のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場を含むある容量の液体を、沈殿剤を含むある容量のリザーバー溶液と混合すること；および
（ｂ）工程（ａ）において得られた混合物を密閉容器中で、タンパク質結晶が形成するまで結晶化に好適な条件下でインキュベートすること
を含む、タンパク質結晶を作製する方法。
(117)  前記タンパク質結晶を、シッティングドロップ蒸気拡散により産生する、(116)に記載の方法。
(118)  前記Ｔｎ３足場が、配列番号２０、配列番号２８、配列番号６８または配列番号１４６を含む、(116)に記載の方法。
(119)  （ａ）データを、ＣＤ４０Ｌと複合体化されたＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場のタンパク質結晶の一部の構造についてのグラフ三次元表示に変換するための；および
（ｂ）前記グラフ三次元表示の表示をもたらすための、
機械可読命令が符号化されたデータ保存材料を含む機械可読データ保存媒体。
(120)  前記Ｔｎ３足場が、配列番号２０、配列番号２８、配列番号６８または配列番号１４６を含む、(119)に記載の機械可読データ保存媒体。
(121)  前記タンパク質結晶が、(103)に記載の結晶、(106)に記載の結晶、(118)に記載の結晶、またはそれらの任意の組合せである、(119)に記載の機械可読データ保存媒体。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含むＴｎ３足場であって、前記モノマーサブユニットは、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、およびＧと命名される７つのベータ鎖、ならびにＡＢ、ＢＣ、ＣＤ、ＤＥ、ＥＦ、およびＦＧと命名される６つのループ領域を含み、前記Ｔｎ３足場は、配列番号２の１４２から１５５、２００から２３０、または２４７から２５１位に局在するアミノ酸を含むＣＤ４０Ｌエピトープに特異的に結合する、前記Ｔｎ３足場。
【請求項２】
単一のＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットまたは、場合によりペプチドリンカーによりタンデムに連結されている２つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットを含む、請求項１に記載のＴｎ３足場。
【請求項３】
前記足場がＣＤ４０Ｌに結合し、ＣＤ４０ＬのＣＤ４０への結合を妨害するおよび／またはＣＤ４０媒介シグナリングを破壊する、請求項１または２に記載のＴｎ３足場。
【請求項４】
少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、タンパク質、ペプチド、タンパク質ドメイン、リンカー、薬物、毒素、細胞傷害剤、造影剤、放射性核種、放射性化合物、有機ポリマー、無機ポリマー、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ビオチン、アルブミン、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、ＨＳＡ  ＦｃＲｎ結合部分、抗体、抗体のドメイン、抗体断片、単鎖抗体、ドメイン抗体、アルブミン結合ドメイン、酵素、リガンド、受容体、結合ペプチド、非ＦｎＩＩＩ足場、エピトープタグ、組換えポリペプチドポリマーおよびサイトカインからなる群から選択される異種部分に融合またはコンジュゲートしている、請求項１、２または３に記載のＴｎ３足場。
【請求項５】
少なくとも１つのＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、ＰＥＧにコンジュゲートしているか、またはヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）に融合している、請求項４に記載のＴｎ３足場。
【請求項６】
前記ＨＳＡが、バリアントＨＳＡである、請求項５に記載のＴｎ３足場。
【請求項７】
前記ＨＳＡバリアントが、配列番号１３３のアミノ酸配列を有するか、または前記ＨＳＡバリアントが、全長成熟ＨＳＡ（配列番号１３３または１３８）の配列をまたはその断片を含み、但し、４０７、４１５、４６３、５００、５０６、５０８、５０９、５１１、５１２、５１５、５１６、５２１、５２３、５２４、５２６、５３５、５５０、５５７、５７３、５７４、および５８０からなる群から選択される位置における全長成熟ＨＳＡ中の位置に対して番号付与される少なくとも１つのアミノ酸置換を除き；前記少なくとも１つのアミノ酸置換が、５７３位におけるリジン（Ｋ）のグルタミン酸（Ｅ）への置換を含まず、前記Ｔｎ３足場が、前記ＨＳＡバリアントにコンジュゲートしていないＴｎ３足場の血漿半減期よりも長い血漿半減期を有する、請求項６に記載のＴｎ３足場。
【請求項８】
前記ＣＤ４０Ｌ特異的モノマーサブユニットが、アミノ酸配列：
ＩＥＶ（ＸＡＢ）ｎＡＬＩＴＷ（ＸＢＣ）ｎＣＥＬＸ１ＹＧＩ（ＸＣＤ）ｎＴＴＩＤＬ（ＸＤＥ）ｎＹＳＩ（ＸＥＦ）ｎＹＥＶＳＬＩＣ（ＸＦＧ）ｎＫＥＴＦＴＴ
（式中、
（ａ）ＸＡＢ、ＸＢＣ、ＸＣＤ、ＸＤＥ、ＸＥＦ、およびＸＦＧは、それぞれ前記ＡＢ、ＢＣ、ＣＤ、ＤＥ、ＥＦ、およびＦＧループの配列中に存在するアミノ酸残基を表し；
（ｂ）Ｘ１は、アミノ酸残基ＡまたはＴを表し；
（ｃ）ループの長さｎは、２から２６の整数である）
を含み、場合により前記ＡＢループの配列が、配列番号４または配列番号１３６を含み、前記ＣＤループの配列が、配列番号６を含み、前記ＥＦループの配列が、配列番号８または配列番号１３７を含み；さらに
または場合により
（ｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９９を含み；
（ｉｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８４を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｉｖ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８５を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｖ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８６を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９６を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｖｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８７を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９７を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｖｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８８を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｖｉｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号８９を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｉｘ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９０を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｘ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９１を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｘｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９２を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｘｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号９３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号９４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号９または１３９を含み；
（ｘｉｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１００を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｉｖ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０１を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１９を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｖ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０２を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２０を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｖｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｖｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０４を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２２を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｖｉｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０５を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｉｘ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０６を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０７を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０８を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０９を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｉｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１０を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｉｖ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１１を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２３を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１３０を含み；
（ｘｘｖ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１０８を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２１を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｖｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１２を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２４を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｖｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１３を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２５を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｖｉｉｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１４を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１１８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｉｘ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１５を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２６を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；
（ｘｘｘ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１６を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２７を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含み；または
（ｘｘｘｉ）前記ＢＣループの配列が、配列番号１１７を含み、前記ＤＥループの配列が、配列番号１２８を含み、前記ＦＧループの配列が、配列番号１２９を含む、
請求項１〜７のいずれか一項に記載のＴｎ３足場。
【請求項９】
配列番号１３４、１３５、２０１、２０２、２０３、２０４、２０５、２０６、２０７および２０８からなる群から選択される配列を含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載のＴｎ３足場。
【請求項１０】
ＣＤ４０Ｌ発現細胞を請求項１〜９のいずれか一項に記載のＴｎ３足場と接触させることを含むＣＤ４０媒介シグナリング応答を変化させる方法であって、前記Ｔｎ３足場は、ＣＤ４０Ｌに結合し、ＣＤ４０媒介シグナリングを破壊する、前記方法。
【請求項１１】
前記ＣＤ４０媒介シグナリング応答が、Ｔ依存性免疫応答である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
請求項１〜１１のいずれか一項に記載のＴｎ３足場をコードする単離核酸分子。
【請求項１３】
請求項１２に記載の核酸分子を含む発現ベクターを含む宿主細胞を、前記核酸分子によりコードされるＴｎ３足場が発現される条件下で培養することを含む、Ｔｎ３足場を産生する方法。
【請求項１４】
請求項１〜１３のいずれか一項に記載のＴｎ３足場および薬学的に許容可能な賦形剤を含む組成物。
【請求項１５】
1)  自己免疫疾患の予防、治療、改善、または管理が必要とされる患者における自己免疫疾患を予防、治療、改善、または管理する方法；または
2)  自己免疫疾患を有する患者に投与されるコルチコステロイドの頻度または量を低減させる方法であって、場合により
前記自己免疫疾患が、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性アジソン病、副腎の自己免疫疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性卵巣炎および精巣炎、シェーグレン症候群、乾癬、アテローム性動脈硬化症、糖尿病性および他の網膜症、水晶体後線維増殖症、加齢性黄斑変性、血管新生性緑内障、血管腫、甲状腺過形成（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織移植、ならびに慢性炎症、敗血症、関節リウマチ、腹膜炎、クローン病、再灌流損傷、敗血症、内毒素ショック、嚢胞性線維症、心内膜炎、乾癬、関節炎（例えば、乾癬性関節炎）、アナフィラキシーショック、臓器虚血、再灌流損傷、脊髄損傷および同種移植片拒絶反応、自己免疫性血小板減少症、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、心筋症、セリアックスプルー皮膚炎、慢性疲労免疫機能不全症候群（ＣＦＩＤＳ）、慢性炎症性脱髄多発性神経障害、チャーグストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、ＣＲＥＳＴ症候群、寒冷凝集素症、クローン病、円板状ループス、本態性混合型クリオグロブリン血症、線維筋痛−線維筋炎、糸球体腎炎、グレーブス病、ギランバレー、橋本甲状腺炎、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、ＩｇＡ神経障害、若年性関節炎、扁平苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合性結合組織病、多発性硬化症、１型または免疫介在性糖尿病、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発筋痛、多発性筋炎および皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症、シェーグレン症候群、スティッフマン症候群、全身性エリテマトーデス、エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎／巨細胞動脈炎、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、血管炎、例えば、疱疹状皮膚炎血管炎、白斑およびウェゲナー肉芽腫症からなる群から選択される、前記方法において使用するための、請求項１４に記載の組成物。