【手続補正書】
【提出日】平成27年1月22日(2015.1.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも１つの化合物のレベルを、試験被験体からのサンプルを分析するための指標とする方法であって、該方法は、
ｉ）該試験被験体からの該サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも１つの化合物のレベルを決定するステップ、ならびに
ｉｉ）ステップｉ）において決定された該少なくとも１つの化合物のレベルを少なくとも１つの対照レベルと比較するステップであって、該少なくとも１つの化合物のレベルは、該被験体が肝がんを有するかどうかの指標となるステップ
を含む、方法。
【請求項２】
前記対照レベルは、健康な被験体からのサンプルから決定され、該対照レベルと比較して低減したレベルは、肝がんの指標となる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記対照レベルは、肝がん患者からのサンプルから決定され、該対照レベルと比較して同様であるレベルは、肝がんの指標となる、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも２つの化合物のレベルを決定するステップを含む、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも３つの化合物のレベルを決定するステップを含む、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートのレベルを決定するステップを含む、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つの化合物のレベルを用いて、前記試験被験体からの前記サンプルについてのプロフィールを決定するステップ；および該試験被験体からの該サンプルの該プロフィールを、健康な被験体からのサンプルから決定された少なくとも１つの対照レベルを用いて決定された対照プロフィールと比較するステップを含む、請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
ａ）クレアチニン、クレアチン、カルニチン、およびアセトンからなる群から選択される少なくとも１つのさらなる化合物のレベルを決定するステップ；ならびに
ｂ）ステップａ）において決定された該少なくとも１つの化合物のレベルを健康な被験体からのサンプルから決定された対照レベルと比較するステップであって、
ｉ）クレアチニンおよび／もしくはアセトンのレベルの低減；および／または
ｉｉ）クレアチンおよび／もしくはカルニチンのレベルの増大
は、肝がんの指標となる、ステップ
を含む、クレアチニン、クレアチン、カルニチン、およびアセトンからなる群から選択される少なくとも１つのさらなる化合物のレベルを、試験被験体からのサンプルを分析するための指標とすること、
をさらに含む、請求項１〜７のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
前記サンプルは哺乳動物から得られる、請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記哺乳動物はヒトである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記サンプルは、選択された、血液、血漿、血清、脳脊髄液、胆汁酸、唾液、滑液、胸膜液、囲心腔液、腹膜液、排泄物、鼻液（ｎａｓａｌ  ｆｌｕｉｄ）、眼液（ｏｃｕｌａｒ  ｆｌｕｉｄ）、細胞内液、細胞間液、リンパ液、および尿である、請求項１〜１０のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記サンプルは尿である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記肝がんは肝細胞癌である、請求項１〜１２のいずれかに記載の方法。
【請求項１４】
化合物のレベルを決定するステップは、前記サンプルを、該化合物に特異的に結合する抗体と接触させるステップを含む、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
化合物のレベルを決定するステップは、前記サンプルにおいて比色アッセイまたは分光光度アッセイを実施するステップを含む、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
前記方法は、肝がんを有する患者と肝硬変を有する患者とを区別することができる、請求項１〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
肝がんを診断することにおいて使用するためのキットであって、該キットは、グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される化合物のレベルを決定するための、少なくとも１つの試薬を含む、キット。
【請求項１８】
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される化合物のレベルを決定するための、少なくとも２つの試薬を含む、請求項１７に記載のキット。
【請求項１９】
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される化合物のレベルを決定するための、少なくとも３つの試薬を含む、請求項１７に記載のキット。
【請求項２０】
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートのレベルを決定するための試薬を含む、請求項１７に記載のキット。
【請求項２１】
前記少なくとも１つの化合物のレベルを決定するための前記試薬は、前記アッセイにおいて、該少なくとも１つの化合物のレベルに依存して色の変化をもたらす、請求項１７〜２０のいずれかに記載のキット。
【請求項２２】
前記少なくとも１つの化合物のレベルを決定するための前記試薬は、該少なくとも１つの化合物に特異的に結合する少なくとも１つの抗体を含む、請求項１７〜２０のいずれかに記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２１】
本発明の方法は、２つ以上の異なる時点において、同じ被験体からのサンプルを試験するために使用され得る。同じ被験体において、時間の経過とともに複数の試験を実施することは、疾患の重症度が測定されることを可能にし、例えば、疾患が悪化しているかどうかを観測する。あるいは、複数の試験を行うことは、薬物の効力が時間の経過とともにモニタリングされることを可能にし得る。
本発明の好ましい実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
試験被験体からのサンプルを分析するための方法であって、該方法は、
ｉ）該試験被験体からの該サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも１つの化合物のレベルを決定するステップ、ならびに
ｉｉ）ステップｉ）において決定された該少なくとも１つの化合物のレベルを少なくとも１つの対照レベルと比較するステップであって、該少なくとも１つの化合物のレベルは、該被験体が肝がんを有するかどうかの指標となるステップ
を含む、方法。
（項目２）
前記対照レベルは、健康な被験体からのサンプルから決定され、該対照レベルと比較して低減したレベルは、肝がんの指標となる、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記対照レベルは、肝がん患者からのサンプルから決定され、該対照レベルと比較して同様であるレベルは、肝がんの指標となる、項目１に記載の方法。
（項目４）
サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも２つの化合物のレベルを決定するステップを含む、項目１〜３のいずれかに記載の方法。
（項目５）
サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される少なくとも３つの化合物のレベルを決定するステップを含む、項目１〜３のいずれかに記載の方法。
（項目６）
サンプル中のグリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートのレベルを決定するステップを含む、項目１〜３のいずれかに記載の方法。
（項目７）
前記少なくとも１つの化合物のレベルを用いて、前記試験被験体からの前記サンプルについてのプロフィールを決定するステップ；および該試験被験体からの該サンプルの該プロフィールを、健康な被験体からのサンプルから決定された少なくとも１つの対照レベルを用いて決定された対照プロフィールと比較するステップを含む、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目８）
ａ）クレアチニン、クレアチン、カルニチン、およびアセトンからなる群から選択される少なくとも１つのさらなる化合物のレベルを決定するステップ；ならびに
ｂ）ステップａ）において決定された該少なくとも１つの化合物のレベルを健康な被験体からのサンプルから決定された対照レベルと比較するステップであって、
ｉ）クレアチニンおよび／もしくはアセトンのレベルの低減；および／または
ｉｉ）クレアチンおよび／もしくはカルニチンのレベルの増大
は、肝がんの指標となる、ステップ
をさらに含む、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目９）
前記サンプルは哺乳動物から得られる、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目１０）
前記哺乳動物はヒトである、項目９に記載の方法。
（項目１１）
前記サンプルは、選択された、血液、血漿、血清、脳脊髄液、胆汁酸、唾液、滑液、胸膜液、囲心腔液、腹膜液、排泄物、鼻液（ｎａｓａｌ  ｆｌｕｉｄ）、眼液（ｏｃｕｌａｒ  ｆｌｕｉｄ）、細胞内液、細胞間液、リンパ液、および尿である、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目１２）
前記サンプルは尿である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記肝がんは肝細胞癌である、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目１４）
化合物のレベルを決定するステップは、前記サンプルを、該化合物に特異的に結合する抗体と接触させるステップを含む、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目１５）
化合物のレベルを決定するステップは、前記サンプルにおいて比色アッセイまたは分光光度アッセイを実施するステップを含む、項目１〜１３のいずれかに記載の方法。
（項目１６）
前記方法は、肝がんを有する患者と肝硬変を有する患者とを区別することができる、前述の項目のいずれかに記載の方法。
（項目１７）
肝がんを診断することにおいて使用するためのキットであって、該キットは、グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される化合物のレベルを決定するための、少なくとも１つの試薬を含む、キット。
（項目１８）
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される化合物のレベルを決定するための、少なくとも２つの試薬を含む、項目１７に記載のキット。
（項目１９）
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートからなる群から選択される化合物のレベルを決定するための、少なくとも３つの試薬を含む、項目１７に記載のキット。
（項目２０）
グリシン、トリメチルアミン−Ｎ−オキシド、ヒップレート、およびシトレートのレベルを決定するための試薬を含む、項目１７に記載のキット。
（項目２１）
前記少なくとも１つの化合物のレベルを決定するための前記試薬は、前記アッセイにおいて、該少なくとも１つの化合物のレベルに依存して色の変化をもたらす、項目１７〜２０のいずれかに記載のキット。
（項目２２）
前記少なくとも１つの化合物のレベルを決定するための前記試薬は、該少なくとも１つの化合物に特異的に結合する少なくとも１つの抗体を含む、項目１７〜２０のいずれかに記載のキット。