【手続補正書】
【提出日】平成27年4月30日(2015.4.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
補体Ｂ因子タンパク質アナログを含有しているポリペプチドであって、ここでは、該補体Ｂ因子タンパク質アナログが遊離のシステインアミノ酸の変異を含む、ポリペプチド。
【請求項２】
前記変異が前記遊離のシステインの置換を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号４のアナログであり、該補体Ｂ因子タンパク質アナログがジスルフィド結合を形成するシステインアミノ酸を有しており、そして遊離のシステインアミノ酸が別のアミノ酸で置換されている、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
前記遊離のシステインが、アラニン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、セリン、スレオニン、チロシン、およびバリンからなる群より選択されるアミノ酸で置換されている、請求項１〜３のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項５】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログがネイティブの補体Ｂ因子の結合と競合する、請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項６】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログがヒト補体Ｂ因子タンパク質アナログである、請求項１〜５のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項７】
前記遊離のシステインが配列番号１のアミノ酸２９２に対応する、請求項１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項８】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、Ｋ２５８Ａ、Ｒ２５９Ａ、Ｋ２６０Ａ、Ｄ２７９Ｇ、Ｎ２８５Ｄ、およびＤ７４０Ｎからなる群より選択される配列番号１の変異に対応する少なくとも１つの変異を含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項９】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号２のアミノ酸２６〜４８０を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号２のアミノ酸４８１〜７６４を含まない、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログがＣ３ｂ結合ドメイン中に変異を含み、該補体Ｂ因子タンパク質アナログが、対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質のＣ３ｂに対する結合親和性と比較して増大した、Ｃ３ｂに対する結合親和性を示す、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
前記Ｃ３ｂ結合ドメイン中の変異が以下を含む、請求項１１に記載のポリペプチド：
（ｉ）配列番号１のアミノ酸２７９に対応するアスパラギン酸の置換もしくは欠失、配列番号１のアミノ酸２８５に対応するアスパラギンの置換もしくは欠失、またはこれらの両方；あるいは
（ｉｉ）前記アスパラギン酸または前記アスパラギンの隣への少なくとも１つのアミノ酸の挿入。
【請求項１３】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログがさらに、補体Ｄ因子切断部位中に変化を含み、ここでは、該変化が、Ｄ因子タンパク質による補体Ｂ因子タンパク質アナログの切断を減少させるかまたは取り除く、請求項１１に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
前記Ｄ因子切断部位中の変化が以下を含む、請求項１３に記載のポリペプチド：
（ｉ）配列番号１のアミノ酸２５９に対応するアルギニンの置換もしくは欠失、配列番号１のアミノ酸２５８もしくは２６０に対応する一方もしくは両方のリジンの置換もしくは欠失、またはアルギニンおよび両方のリジンの置換または欠失；あるいは
（ｉｉ）アルギニンの隣、１つもしくは両方のリジンの隣、またはアルギニンおよび１つもしくは両方のリジンの隣への挿入。
【請求項１５】
配列番号１のアミノ酸２５８〜２６０に対応する前記アミノ酸がそれぞれアラニンで置換されている、請求項１４に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、前記セリンプロテアーゼドメインの活性部位の中に変異を含み、ここで、該変異が、対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して補体Ｂ因子タンパク質アナログが補体因子Ｃ３を切断する能力を低下させるかまたは取り除く、請求項１〜１５のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
前記変異が、配列番号１のアミノ酸７４０に対応するアスパラギン酸の欠失または置換を含む、請求項１６に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
前記配列番号１のアミノ酸７４０に対応するアスパラギン酸が、セリン、チロシン、グリシン、アラニン、またはグルタミン酸で置換されている、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
前記置換が前記アスパラギン酸のアスパラギンでの置換を含む、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項２０】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号１、２、３、２２、２３、または２６に対して少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％同一である、請求項１〜１９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２１】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号１、２、もしくは３のアミノ酸２６〜７６４に対して；配列番号２２もしくは２３のアミノ酸２６〜９９０に対して；配列番号２のアミノ酸２６〜４８０に対して；または配列番号２６のアミノ酸２６〜１００３に対して少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％同一である、請求項１〜１９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２２】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号２、３、２２、２３、２６、または配列番号２のアミノ酸１〜４８０を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項２３】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号２のアミノ酸２６〜７６４、配列番号３のアミノ酸２６〜７６４、配列番号２のアミノ酸２６〜４８０、配列番号２２のアミノ酸２６〜９９０、配列番号２３のアミノ酸２６〜９９０、または配列番号２６のアミノ酸２６〜１００９を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項２４】
前記ポリペプチドが免疫グロブリンＦｃドメインを含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項２５】
前記Ｆｃドメインが前記補体Ｂ因子アナログに対してＣ末端側にある、請求項２４に記載のポリペプチド。
【請求項２６】
前記Ｆｃドメインが前記Ｆｃドメインの配列中にシステインの１つ以上の変異を有しており、ここでは、該１つ以上の変異が二量体の形成を阻害する、請求項２４または２５に記載のポリペプチド。
【請求項２７】
前記Ｆｃドメインが、配列番号２７のアミノ酸１７または２０に対応する１つ以上のシステインの変異を含む、請求項２４〜２６のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２８】
前記１つ以上のシステインが、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、セリン、スレオニン、チロシン、およびバリンからなる群より選択されるアミノ酸で置換されている、請求項２６〜２７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２９】
前記Ｆｃドメインが、配列番号２１のアミノ酸７６６〜９９０、配列番号２６の７６６〜１００３、配列番号２６の７８６〜１００３、配列番号２７の１〜２３８より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２４または２５に記載のポリペプチド。
【請求項３０】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、崩壊促進因子と相互作用する補体Ｂ因子中のアミノ酸に対応するアミノ酸の変異を含む、請求項１〜２９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３１】
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号１のアミノ酸２９０、２９１、３２３、３６３、３６４、または４０７に対応するアミノ酸の１つ以上の変異を含む、請求項１〜３０のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３２】
前記１つ以上の変異が、配列番号１のＫ２９０Ａ、Ｋ２９１Ａ、Ｋ３２３Ｅ、Ｙ３６３Ａ、Ｓ３６４Ａ、またはＤ４０７Ｎのうちの１つ以上に対応する、請求項３１に記載のポリペプチド。
【請求項３３】
前記ポリペプチドが補体活性を阻害するかまたは低下させる、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項３４】
前記ポリペプチドが代替補体経路を阻害する、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３５】
請求項１〜３４のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含有している核酸。
【請求項３６】
請求項３５に記載の核酸を含有しているウイルスベクター。
【請求項３７】
前記ウイルスベクターが、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、肝炎ウイルスベクター、ＳＶ４０ウイルスベクター、ＡＡＶベクター、ＥＢＶベクター、およびＮＤＶベクターからなる群より選択される、請求項３６に記載のウイルスベクター。
【請求項３８】
前記レンチウイルスベクターが、ＢＩＶ、ＨＩＶ、ＥＩＡＶ、ＳＩＶ、またはＦＩＶベクターである、請求項３７に記載のウイルスベクター。
【請求項３９】
請求項１〜３４のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項３５に記載の核酸、請求項３６〜３８のいずれか１項に記載のウイルスベクター、またはこれらの任意の組み合わせを含有している、薬学的製剤。
【請求項４０】
補体活性を阻害するための組成物であって、該組成物は、該補体活性を阻害するために十分な量の請求項１〜３４のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項３５に記載の核酸、請求項３６〜３８のいずれか１項に記載のウイルスベクター、請求項３９に記載の薬学的製剤、またはこれらの任意の組み合わせを含み、該組成物は、該補体活性の部位に導入または投与され、ここでは、該ポリペプチドが該補体活性を阻害することを特徴とする、組成物。
【請求項４１】
患者の補体媒介疾患を処置するための、請求項４０に記載の組成物。
【請求項４２】
前記補体媒介疾患が眼の疾患である、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４３】
前記組成物が眼に投与されることを特徴とする、請求項４２に記載の組成物。
【請求項４４】
前記組成物が、硝子体内注射、網膜下注射、前眼房内への注射、角膜への注射または局所適用、結膜下注射、テノン下注射、または点眼により投与されることを特徴とする、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４５】
前記補体媒介疾患が、黄斑変性症、加齢性黄斑変性（ＡＭＤ）、地図状委縮、湿性ＡＭＤ、心筋梗塞、乾性ＡＭＤ、ドルーゼン形成、関節炎、脳卒中、虚血再灌流傷害、糖尿病性網膜症、硝子体網膜症、外傷性臓器損傷、角膜の炎症、角膜血管新生、ブドウ膜炎、高眼圧症、または緑内障である、請求項４１〜４４のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４６】
前記補体媒介疾患が、アテローム性動脈硬化症、気道応答性亢進、免疫関連疾患、自己免疫関連疾患、ループス腎炎、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、関節炎、リウマチ性疾患、抗リン脂質抗体症候群、腸および腎臓のＩ／Ｒ傷害、喘息、非定型溶血性尿毒症症候群、ＩＩ型膜増殖性糸球体腎炎、非増殖性糸球体腎炎、胎児喪失、脳傷害、外傷後臓器損傷、梗塞後臓器損傷、血管炎、遺伝性血管浮腫、発作性夜間ヘモグロビン尿症、脳血管偶発症、アルツハイマー病、移植片拒絶、感染症、敗血症、敗血症性ショック、シェーグレン症候群、重症筋無力症、抗体に媒介される皮膚疾患、Ｉ型およびＩＩ型真性糖尿病、インスリン抵抗性症候群、妊娠性糖尿病、甲状腺炎、特発性血小板減少性紫斑病および溶血性貧血、神経障害、多発性硬化症、心肺バイパス傷害、結節性多発性動脈炎、ヘノッホ−シェーンライン紫斑病、血清病、グッドパスチャー病、全身性壊死性血管炎、連鎖球菌感染後の糸球体腎炎、特発性肺線維症、膜性糸球体腎炎、急性ショック性肺症候群、成人呼吸窮迫症候群、および再灌流からなる群より選択される、請求項４１〜４４のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４７】
前記ウイルスベクターを含有している組成物が、約１週間、１か月、２か月、３か月、６か月、９か月、１年、１８か月、２年、３０か月、３年、５年、または１０年に１回投与されることを特徴とする、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４８】
請求項３５に記載の核酸を含有している細胞であって、前記ポリペプチドを発現する、細胞。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２０】
本発明のこの概要は、本発明の全ての特徴または必須の特徴を必ずしも記載しているものではない。本発明はまた記載する特徴の部分的組み合わせにおいても固有であり得る。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
補体Ｂ因子タンパク質アナログを含有しているポリペプチドであって、ここでは、該補体Ｂ因子アナログが遊離のシステインアミノ酸の変異を含む、ポリペプチド。
（項目２）
前記変異が前記遊離のシステインの置換を含む、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３）
前記遊離のシステインが２つ以上のアミノ酸で置換されている、項目２に記載のポリペプチド。
（項目４）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号４のアナログであり、該補体Ｂ因子タンパク質アナログがジスルフィド結合を形成するシステインアミノ酸を有しており、そして遊離のシステインアミノ酸が別のアミノ酸で置換されている、項目１に記載のポリペプチド。
（項目５）
前記遊離のシステインが、アラニン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、セリン、スレオニン、チロシン、およびバリンからなる群より選択されるアミノ酸で置換されている、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目６）
前記ヒト補体Ｂ因子アナログがネイティブの補体Ｂ因子の結合と競合する、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目７）
前記変異が前記遊離のシステインの欠失を含む、項目１に記載のポリペプチド。
（項目８）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログがヒト補体Ｂ因子タンパク質アナログである、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目９）
前記遊離のシステインが配列番号１のアミノ酸２９２に対応する、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目１０）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、Ｋ２５８Ａ、Ｒ２５９Ａ、Ｋ２６０Ａ、Ｄ２７９Ｇ、Ｎ２８５Ｄ、およびＤ７４０Ｎからなる群より選択される配列番号１の変異に対応する少なくとも１つの変異を含む、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目１１）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号１のＫ２５８Ａ、Ｒ２５９Ａ、Ｋ２６０Ａ、Ｄ２７９Ｇ、およびＮ２８５Ｄに対応する変異を含む、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目１２）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号１のＤ７４０Ｎに対応する変異を含む、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目１３）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号２のアミノ酸２６〜４８０を含む、項目１に記載のポリペプチド。
（項目１４）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが配列番号２のアミノ酸４８１〜７６４を含まない、項目１に記載のポリペプチド。
（項目１５）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して増大したＣ３ｂ結合親和性を有しており、該補体Ｂ因子タンパク質アナログが以下を含む、項目１〜９のいずれかに記載のポリペプチド：
（ｉ）対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して低下したプロテアーゼ活性；
（ｉｉ）対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して低下した、Ｄ因子タンパク質により切断される能力；または
（ｉｉｉ）対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して低下したプロテアーゼ活性、および対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して低下した、Ｄ因子タンパク質により切断される能力。
（項目１６）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログがＣ３ｂ結合ドメイン中に変異を含み、該補体Ｂ因子タンパク質アナログが、対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質のＣ３ｂに対する結合親和性と比較して増大した、Ｃ３ｂに対する結合親和性を示す、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目１７）
前記Ｃ３ｂ結合ドメイン中の変異が以下を含む、項目１６に記載のポリペプチド：
（ｉ）配列番号１のアミノ酸２７９に対応するアスパラギン酸の置換もしくは欠失、配列番号１のアミノ酸２８５に対応するアスパラギンの置換もしくは欠失、またはこれらの両方；あるいは
（ｉｉ）前記アスパラギン酸または前記アスパラギンの隣への少なくとも１つのアミノ酸の挿入。
（項目１８）
前記アスパラギン酸、前記アスパラギン、または両方が１つ以上のアミノ酸で置換されている、項目１７に記載のポリペプチド。
（項目１９）
前記アスパラギン酸が、グリシン、アラニン、またはアスパラギンで置換されている、項目１７または１８に記載のポリペプチド。
（項目２０）
前記アスパラギンがグリシン、アラニン、またはアスパラギン酸で置換されている、項目１７、１８、または１９に記載のポリペプチド。
（項目２１）
前記置換が、前記アスパラギン酸をグリシンで置き換えること、および前記アスパラギンをアスパラギン酸で置き換えることを含む、項目１７に記載のポリペプチド。
（項目２２）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、補体Ｄ因子切断部位中に変化を含み、ここでは、該変化が、Ｄ因子タンパク質による補体Ｂ因子タンパク質アナログの切断を減少させるかまたは取り除く、項目１５に記載のポリペプチド。
（項目２３）
前記Ｄ因子切断部位中の変化が以下を含む、項目２２に記載のポリペプチド：
（ｉ）配列番号１のアミノ酸２５９に対応するアルギニンの置換もしくは欠失、配列番号１のアミノ酸２５８もしくは２６０に対応する一方もしくは両方のリジンの置換もしくは欠失、またはアルギニンおよび両方のリジンの置換または欠失；あるいは
（ｉｉ）アルギニンの隣、１つもしくは両方のリジンの隣、またはアルギニンおよび１つもしくは両方のリジンの隣への挿入。
（項目２４）
配列番号１のアミノ酸２５８〜２６０に対応する前記アミノ酸がそれぞれアラニンで置換されている、項目２３に記載のポリペプチド。
（項目２５）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、前記セリンプロテアーゼドメインの活性部位の中に変異を含み、ここで、該変異が、対応するネイティブの補体Ｂ因子タンパク質と比較して補体Ｂ因子タンパク質アナログが補体因子Ｃ３を切断する能力を低下させるかまたは取り除く、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目２６）
前記変異が、配列番号１のアミノ酸７４０に対応するアスパラギン酸の欠失または置換を含む、項目２５に記載のポリペプチド。
（項目２７）
前記配列番号１のアミノ酸７４０に対応するアスパラギン酸が、セリン、チロシン、グリシン、アラニン、またはグルタミン酸で置換されている、項目２６に記載のポリペプチド。
（項目２８）
前記置換が前記アスパラギン酸のアスパラギンでの置換を含む、項目２６に記載のポリペプチド。
（項目２９）
前記ヒト補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号１、２、３、２２、２３、または２６に対して少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％同一である、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目３０）
前記ヒト補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号１、２、もしくは３のアミノ酸２６〜７６４に対して；配列番号２２もしくは２３のアミノ酸２６〜９９０に対して；配列番号２のアミノ酸２６〜４８０に対して；または配列番号２６のアミノ酸２６〜１００３に対して少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％同一である、項目１〜２８のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目３１）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号２、３、２２、２３、２６、または配列番号２のアミノ酸１〜４８０を含む、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３２）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号２のアミノ酸２６〜７６４、配列番号３のアミノ酸２６〜７６４、配列番号２のアミノ酸２６〜４８０、配列番号２２のアミノ酸２６〜９９０、配列番号２３のアミノ酸２６〜９９０、または配列番号２６のアミノ酸２６〜１００９を含む、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３３）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、配列番号２のアミノ酸２６〜７６４、配列番号３のアミノ酸２６〜７６４、配列番号２のアミノ酸２６〜４８０、配列番号２２のアミノ酸２６〜９９０、配列番号２３のアミノ酸２６〜９９０、または配列番号２６のアミノ酸２６〜１００９から本質的になる、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３４）
前記ポリペプチドが免疫グロブリンＦｃドメインを含む、項目１に記載のポリペプチド。
（項目３５）
前記Ｆｃドメインが前記補体Ｂ因子アナログに対してＣ末端側にある、項目３４に記載のポリペプチド。
（項目３６）
前記Ｆｃドメインが前記Ｆｃドメインの配列中にシステインの１つ以上の変異を有しており、ここでは、該１つ以上の変異が二量体の形成を阻害する、項目３４または３５に記載のポリペプチド。
（項目３７）
Ｆｃドメインが、配列番号２７のアミノ酸１７または２０に対応する１つ以上のシステインの変異を含む、項目３４〜３６のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目３８）
前記１つ以上のシステインが、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、セリン、スレオニン、チロシン、およびバリンからなる群より選択されるアミノ酸で置換されている、項目３６〜３７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目３９）
前記Ｆｃドメインが、配列番号２１のアミノ酸７６６〜９９０、配列番号２６の７６６〜１００３、配列番号２６の７８６〜１００３、配列番号２７の１〜２３８より選択されるアミノ酸配列を含む、項目３４または３５に記載のポリペプチド。
（項目４０）
前記補体Ｂ因子アナログのアミノ酸配列が補体Ｂ因子の断片に対応する、項目１〜３または３４〜３９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目４１）
前記補体Ｂ因子アナログがＢ因子のＮ末端の短縮化に対応する短縮化を含む、項目４０に記載のポリペプチド。
（項目４２）
前記補体Ｂ因子アナログがＢ因子のＣ末端の短縮化に対応する短縮化を含む、項目４０または４１に記載のポリペプチド。
（項目４３）
前記補体Ｂ因子アナログが、配列番号１、２、または４のアミノ酸４０７、４２７、４５７、４７７、４８０、４８４、４８７、５０７、または５２７に対応するアミノ酸に対してＣ末端側の短縮化に対応するＣ末端の短縮化を含む、項目４２に記載のポリペプチド。
（項目４４）
前記補体Ｂ因子アナログが、配列番号１、２、または４のアミノ酸４０７〜４８７、４７０〜４９５、または４７７〜４８７に対応するアミノ酸の間のアミノ酸でのＣ末端短縮化に対応する短縮化を含む、項目４２に記載のポリペプチド。
（項目４５）
前記補体Ｂ因子アナログが、配列番号１、２、または４のアミノ酸４０８〜７６４、４２８〜７６４、４５８〜７６４、４７８〜７６４、４８１〜７６４、４８５〜７６４、４８８〜７６４、５０８〜７６４、５２８〜７６４に対応するアミノ酸を含まない、項目４０〜４２のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目４６）
前記補体Ｂ因子アナログが、崩壊促進因子と相互作用する補体Ｂ因子中のアミノ酸に対応するアミノ酸の変異を含む、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目４７）
前記補体Ｂ因子アナログが、配列番号１のアミノ酸２９０、２９１、３２３、３６３、３６４、または４０７に対応するアミノ酸の１つ以上の変異を含む、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目４８）
前記１つ以上の変異が置換または欠失である、項目４７に記載のポリペプチド。
（項目４９）
前記１つ以上の変異が、配列番号１のＫ２９０Ａ、Ｋ２９１Ａ、Ｋ３２３Ｅ、Ｙ３６３Ａ、Ｓ３６４Ａ、またはＤ４０７Ｎのうちの１つ以上に対応する、項目４８に記載のポリペプチド。
（項目５０）
前記補体Ｂ因子アナログが、配列番号１のＫ２９０Ａ／Ｋ２９１Ａ、Ｙ３６３Ａ／Ｓ３６４Ａ、またはＫ２９０Ａ／Ｋ２９１Ａ／Ｙ３６３Ａ／Ｓ３６４Ａに対応する変異の組み合わせのうちの１つを含む、項目４９に記載のポリペプチド。
（項目５１）
前記補体Ｂ因子タンパク質アナログが、タンパク質全体において少なくとも９０％、少なくとも９３％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９．５％、または少なくとも９９．９％純粋である、上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチド。
（項目５２）
前記ポリペプチドが補体活性を阻害するかまたは低下させる、上記項目のいずれか１項
に記載のポリペプチド。
（項目５３）
前記ポリペプチドが代替補体経路を阻害する、項目５２に記載のポリペプチド。
（項目５４）
上記項目のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含有している核酸。
（項目５５）
項目５４に記載の核酸を含有しているウイルスベクター。
（項目５６）
前記ウイルスベクターが、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、肝炎ウイルスベクター、ＳＶ４０ウイルスベクター、ＡＡＶベクター、ＥＢＶベクター、およびＮＤＶベクターからなる群より選択される、項目５５に記載のウイルスベクター。
（項目５７）
前記レンチウイルスベクターが、ＢＩＶ、ＨＩＶ、ＥＩＡＶ、ＳＩＶ、またはＦＩＶベクターである、項目５６に記載のウイルスベクター。
（項目５８）
前記ウイルスベクターが崩解促進因子を含む、項目５７に記載のウイルスベクター。
（項目５９）
項目１〜５３のいずれか１項に記載のポリペプチド、項目５４に記載の核酸、項目５５〜５８のいずれか１項に記載のウイルスベクター、またはこれらの任意の組み合わせを含有している、薬学的製剤。
（項目６０）
ヒスチジン、ＭｇＣｌ２、トレハロース、ポリソルベート、ポリソルベート２０、スクロース、アルギニン、およびプロリンからなる群より選択される少なくとも１つの成分を含有している、項目５９に記載の薬学的製剤。
（項目６１）
補体活性を阻害する方法であって、該方法は、該補体活性を阻害するために十分な量の項目１〜５３のいずれか１項に記載のポリペプチド、項目５４に記載の核酸、項目５５〜５８のいずれか１項に記載のウイルスベクター、項目５９〜６０のいずれか１項に記載の薬学的組成物、またはこれらの任意の組み合わせを、補体活性の部位に導入または投与する工程を含み、ここでは、該ポリペプチドが該補体活性を阻害する、方法。
（項目６２）
患者に対して、前記ポリペプチド、前記核酸、前記ウイルスベクター、前記薬学的組成物、またはこれらの任意の組み合わせを投与する工程を含む、項目６１に記載の方法。
（項目６３）
前記ポリペプチドが、ネイティブの補体Ｂ因子の結合と競合する、項目６１または６２に記載の方法。
（項目６４）
項目６２または６３に記載の方法を含む、患者の補体媒介疾患を処置する方法。
（項目６５）
前記補体媒介疾患が眼の疾患である、項目６４に記載の方法。
（項目６６）
前記薬学的組成物を眼に投与する、項目６５に記載の方法。
（項目６７）
前記薬学的組成物を、硝子体内注射、網膜下注射、前眼房内への注射、角膜への注射または局所適用、結膜下注射、テノン下注射、または点眼により投与する、項目６６に記載の方法。
（項目６８）
前記補体媒介疾患が、黄斑変性症、加齢性黄斑変性（ＡＭＤ）、地図状委縮、湿性ＡＭＤ
、心筋梗塞、乾性ＡＭＤ、ドルーゼン形成、関節炎、脳卒中、虚血再灌流傷害、糖尿病性網膜症、硝子体網膜症、外傷性臓器損傷、角膜の炎症、角膜血管新生、ブドウ膜炎、高眼圧症、または緑内障である、項目６４〜６７のいずれか１項に記載の方法。
（項目６９）
前記補体媒介疾患が、アテローム性動脈硬化症、気道応答性亢進、免疫関連疾患、自己免疫関連疾患、ループス腎炎、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、関節炎、リウマチ性疾患、抗リン脂質抗体症候群、腸および腎臓のＩ／Ｒ傷害、喘息、非定型溶血性尿毒症症候群、ＩＩ型膜増殖性糸球体腎炎、非増殖性糸球体腎炎、胎児喪失、脳傷害、外傷後臓器損傷、梗塞後臓器損傷、血管炎、遺伝性血管浮腫、発作性夜間ヘモグロビン尿症、脳血管偶発症、アルツハイマー病、移植片拒絶、感染症、敗血症、敗血症性ショック、シェーグレン症候群、重症筋無力症、抗体に媒介される皮膚疾患、Ｉ型およびＩＩ型真性糖尿病、インスリン抵抗性症候群、妊娠性糖尿病、甲状腺炎、特発性血小板減少性紫斑病および溶血性貧血、神経障害、多発性硬化症、心肺バイパス傷害、結節性多発性動脈炎、ヘノッホ−シェーンライン紫斑病、血清病、グッドパスチャー病、全身性壊死性血管炎、連鎖球菌感染後の糸球体腎炎、特発性肺線維症、膜性糸球体腎炎、急性ショック性肺症候群、成人呼吸窮迫症候群、および再灌流からなる群より選択される、項目６４〜６７のいずれか１項に記載の方法。
（項目７０）
前記薬学的組成物の投与前、投与と同時、または投与後に、補体阻害因子または抗血管形成因子を前記患者に投与する工程をさらに含む、項目６４〜６９のいずれか１項に記載の方法。
（項目７１）
前記補体阻害因子が、Ｈ因子、Ｈ因子様１、ＭＣＰ、ＤＡＦ、または可溶性形態のＭＣＰからなる群より選択される、項目７０に記載の方法。
（項目７２）
前記抗血管形成因子が、エンドスタチン、ＶＥＧＦ結合分子、ＰＥＤＦ、Ｔ２−ＴｒｐＲＳ、ｓＦＬＴ、アフリバーセプト、およびキニノスタチンからなる群より選択される、項目７０または７１に記載の方法。
（項目７３）
抗炎症剤を、前記薬学的組成物の投与前、投与と同時、または投与後に投与する、項目６４〜７２のいずれか１項に記載の方法。
（項目７４）
前記抗炎症剤を
（ｉ）前記薬学的組成物と同時に投与する、または
（ｉｉ）前記薬学的組成物が前記抗炎症剤を含む、
項目７３に記載の方法。
（項目７５）
前記抗炎症剤を眼に投与する、項目７３または７４に記載の方法。
（項目７６）
前記抗炎症剤が、デキサメタゾン、デキサメタゾンナトリウムメタスルホベンゾエート、デキサメタゾンナトリウムホスフェート、フルオロメトロン、ブロムフェナク、プラノプロフェン、シクロスポリン眼科用乳液、ナプロキセン、糖質コルチコイド、ケトロラク、イブプロフェン、トルメチン、非ステロイド性抗炎症薬、ステロイド性抗炎症薬、ジクロフェナク、フルルビプロフェン、インドメタシン、およびスプロフェンからなる群より選択される、項目７３、７４、または７５に記載の方法。
（項目７７）
前記ウイルスベクターを含有している薬学的製剤を、約１週間、１か月、２か月、３か月、６か月、９か月、１年、１８か月、２年、３０か月、３年、５年、または１０年に１回投与する、項目６２〜６４のいずれか１項に記載の方法。
（項目７８）
補体活性、Ｔ細胞の活性化、Ｂ細胞、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）、エストロゲン、インターロイキン−１、またはインターフェロン−γを阻害する化合物を、前記薬学的組成物の投与前、投与と同時、または投与後に投与する、項目６４〜７７のいずれか１項に記載の方法。
（項目７９）
前記化合物が、インフリキシマブ、アダリムマブ、ゴリムマブ、エタネルセプト、アバタセプト、およびリツキシマブからなる群より選択される、項目７８に記載の方法。
（項目８０）
前記ウイルスベクターを含有している薬学的製剤を前記患者に１度だけ投与する、項目６２〜６４のいずれか１項に記載の方法。
（項目８１）
項目５４に記載の核酸を含有している細胞であって、ポリペプチドを発現する、細胞。
（項目８２）
前記細胞が哺乳動物細胞である、項目８１のいずれか１項に記載の細胞。
（項目８３）
前記細胞が、２９３細胞、ＣＨＯ細胞、ＰｅｒＣ６細胞、またはＶｅｒｏ細胞からなる群より選択される、項目８１に記載の細胞。
（項目８４）
前記細胞が原核生物細胞である、項目８１に記載の細胞。
（項目８５）
前記細胞が大腸菌細胞である、項目８１に記載の細胞。
（項目８６）
補体Ｂ因子タンパク質アナログを含有しているポリペプチドを生産する方法であって：
ａ．項目１〜５３のいずれか１項に記載のポリペプチドを細胞中で発現させる工程；および
ｂ．該ポリペプチドを精製する工程
を含む、方法。