【手続補正書】
【提出日】平成27年6月19日(2015.6.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質のアミノ末端から始まって、（ｉ）アルファ−１抗トリプシンまたはそのカルボキシ末端フラグメントに存在する連続アミノ酸、（ｉｉ）ペプチドリンカーに存在する連続アミノ酸、および（ｉｉｉ）免疫フラグメントに存在する連続アミノ酸に対応する連続アミノ酸を含む融合ポリペプチドであって、前記連続アミノ酸（ｉ）が、精製された場合、（ｉｉｉ）に対して結合したままである、融合ポリペプチド。
【請求項２】
前記免疫フラグメントが、Ｆｃフラグメントを含む、請求項１に記載の融合タンパク質。
【請求項３】
前記Ｆｃフラグメントが、ＩｇＧ２を含む、請求項２に記載の融合タンパク質。
【請求項４】
アルファ−１抗トリプシン（ＡＡＴ）またはそのフラグメントもしくはペプチド切断分子をコードする核酸、
リンカー、および
免疫フラグメントをコードする核酸を含む核酸構築物であって、前記免疫フラグメントが免疫グロブリン分子である、核酸構築物。
【請求項５】
ＡＡＴをコードする前記核酸が、天然に存在するＡＡＴ（配列番号１）をコードする核酸を含む、請求項４に記載の構築物。
【請求項６】
前記ＡＡＴペプチド切断分子をコードする前記核酸が、天然に存在するＡＡＴの１つまたはそれより多いカルボキシ末端フラグメントをコードする核酸を含む、請求項４に記載の構築物。
【請求項７】
カルボキシ末端フラグメントが、配列番号１の最後の８０アミノ酸またはその１０またはそれより多い連続アミノ酸を含む、請求項４に記載の構築物。
【請求項８】
前記カルボキシ末端フラグメントが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の構築物。
【請求項９】
請求項２に記載のポリペプチドをコードする、請求項４に記載の構築物。
【請求項１０】
前記免疫フラグメントが、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、またはＩｇＤフラグメントを含む、請求項４に記載の構築物。
【請求項１１】
前記構築物が、前記免疫フラグメントに、ＡＡＴまたはそのカルボキシ末端フラグメントを、そのＮ−末端を通して連結することによって、形成される、請求項４に記載の構築物。
【請求項１２】
配列番号４８のポリペプチドをコードする、請求項４に記載の構築物。
【請求項１３】
請求項４に記載の核酸構築物または請求項１に記載の融合ポリペプチドを含む、組換え細胞クローン。
【請求項１４】
タンパク質またはペプチドの混合物から、請求項２に記載の融合ポリペプチドを精製するためのプロセスであって、
ａ．マトリックスと結合したプロテインＡに対して、タンパク質またはペプチドの前記混合物を曝露するステップおよび
ｂ．構築物または融合分子の免疫フラグメントを、前記マトリックスと結合したプロテインＡと結合させるステップ、
ｃ．前記混合物のうちの結合していないタンパク質またはペプチドを除去するステップ、ならびに
ｄ．競合的結合分子を使用して、プロテインＡから前記タンパク質または前記ペプチドを溶出するステップを含む、プロセス。
【請求項１５】
前記免疫フラグメントが、前記構築物または前記融合分子から切断される、請求項１４に記載のプロセス。
【請求項１６】
前記競合的結合分子が、Ｆｃ受容体である、請求項１４に記載のプロセス。
【請求項１７】
回収された前記構築物または前記融合分子が、血漿由来のＡＡＴ調製物と比較して、少なくとも１０％増大した抗炎症活性を有する、請求項１４に記載のプロセス。
【請求項１８】
請求項１に記載の融合ポリペプチドまたはタンパク質および薬学的に許容され得る賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項１９】
前記融合ポリペプチドが、治療有効量で前記組成物中に存在する、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
請求項４に記載の核酸構築物を含むベクター。
【請求項２１】
請求項２０に記載のベクターを含む形質転換細胞。
【請求項２２】
請求項１に記載の融合タンパク質を含む、発現された封入体の単離調製物。
【請求項２３】
被験体において、状態を治療するための組成物であって、前記組成物は、治療有効量の請求項１に記載の融合ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアまたはその塩を含み、前記組成物は、前記被験体に投与されることを特徴とし、そして前記投与が、前記被験体において、前記状態を治療することを特徴とする、組成物。
【請求項２４】
前記状態が、Ｉ型糖尿病またはＩＩ型糖尿病である、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２５】
前記被験体が、器官移植または非器官移植を受けており、前記治療が、前記被験体において移植拒絶反応を調整することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２６】
前記状態が、前記被験体におけるＡＡＴ欠乏症であり、前記治療が、前記被験体に対してＡＡＴ代償療法を提供することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２７】
前記状態が、痛風であり、前記組成物の前記投与が、前記被験体において、痛風を調整することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２８】
前記状態が、心臓の状態であり、前記投与が、前記被験体において、前記心臓の状態を調整することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２９】
前記被験体に対する前記組成物の投与が、前記組成物を有していないコントロール被験体と比較して、心臓のリモデリングを低下させることを特徴とする、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
前記状態が、感染症であり、前記投与が、前記被験体において前記感染症を調整することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項３１】
前記感染症が、ウイルス感染症または細菌性感染症である、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３２】
前記状態が、再建手術または形成外科手術の副作用であり、前記組成物が、前記被験体において炎症を低下させる、請求項２３に記載の組成物。
【請求項３３】
前記状態が、前記状態に関連する過剰な炎症であり、前記組成物が、前記被験体において炎症を低下させる、請求項２３に記載の組成物。
【請求項３４】
投与が、静脈内投与、気管内投与、皮内投与、鼻腔内投与、吸入による投与、皮下投与、局所投与、膣投与、または他の様式の投与のうちの１つまたはそれより多くを含むことを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項３５】
前記状態が、自己免疫性の状態であり、前記組成物が、前記被験体において前記自己免疫性の状態を治療することを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項３６】
前記組成物の投与が、月に１回、週に１回、週に２回、または１日１回であることを特徴とする、請求項２３に記載の組成物。
【請求項３７】
被験体における移植のための器官、組織、または細胞を保存するための組成物であって、前記組成物は、請求項１に記載の融合ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアまたはその塩を含み、前記器官、前記組織、または前記細胞が、前記組成物に対して曝露されることを特徴とし、そして投与される前記組成物が、融合ポリペプチドでないアルファ−１抗トリプシンの投与と比較して、低減され、前記組成物が、移植または保存のために、前記器官、前記組織、または前記細胞を保存するのに有効であることを特徴とする、組成物。
【請求項３８】
セリンプロテアーゼ阻害活性が、有意に低下している、反応中心ループ（ＲＣＬ）に変異を有する変異体ＡＡＴをコードする核酸、および
免疫グロブリン分子である免疫フラグメントをコードする核酸、
を含む、核酸構築物。
【請求項３９】
放射線に対して曝露されたことがある被験体を治療するための組成物であって、前記組成物は、請求項１に記載の融合ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアまたはその塩を含み、前記組成物は、前記被験体に投与されることを特徴とし、前記投与が、前記被験体において、放射線の副作用を低下させることを特徴とし、そして投与される前記組成物が、融合ポリペプチドでないアルファ−１抗トリプシンの投与と比較して、低減されることを特徴とする、組成物。
【請求項４０】
前記被験体が、癌療法により放射線に対して曝露されることを特徴とする、請求項３９に記載の組成物。
【請求項４１】
前記被験体が、前立腺癌を有し、前記治療が、放射線療法を受けている前記被験体において、インポテンスまたは勃起障害の発症を低減させることを特徴とする、請求項３９に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２６】
以下の図面は、本明細書の一部を形成し、本明細書において開示される、ある実施形態をさらに実証するために含まれる。実施形態は、本明細書において示される特定の実施形態の詳細な説明と組み合わせて、１つまたはそれより多いこれらの図面に対する参照によって、より理解されてもよい。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
タンパク質のアミノ末端から始まって、（ｉ）アルファ−１抗トリプシンまたはそのカルボキシ末端フラグメントに存在する連続アミノ酸、（ｉｉ）ペプチドリンカーに存在する連続アミノ酸、および（ｉｉｉ）免疫フラグメントに存在する連続アミノ酸に対応する連続アミノ酸を含む融合ポリペプチドであって、上記連続アミノ酸（ｉ）が、精製された場合、（ｉｉｉ）に対して結合したままである、融合ポリペプチド。
（項目２）
上記免疫フラグメントが、Ｆｃフラグメントを含む、項目１に記載の融合タンパク質。
（項目３）
上記Ｆｃフラグメントが、ＩｇＧ２を含む、項目２に記載の融合タンパク質。
（項目４）
アルファ−１抗トリプシン（ＡＡＴ）またはそのフラグメントもしくはペプチド切断分子をコードする核酸、
リンカー、および
免疫フラグメントをコードする核酸を含む核酸構築物であって、上記免疫フラグメントが免疫グロブリン分子である、核酸構築物。
（項目５）
ＡＡＴをコードする上記核酸が、天然に存在するＡＡＴ（配列番号１）をコードする核酸を含む、項目４に記載の構築物。
（項目６）
上記ＡＡＴペプチド切断分子をコードする上記核酸が、天然に存在するＡＡＴの１つまたはそれより多いカルボキシ末端フラグメントをコードする核酸を含む、項目４に記載の構築物。
（項目７）
カルボキシ末端フラグメントが、配列番号１の最後の８０アミノ酸またはその１０またはそれより多い連続アミノ酸を含む、項目４に記載の構築物。
（項目８）
上記カルボキシ末端フラグメントが、配列番号３４のアミノ酸配列を含む、項目６に記載の構築物。
（項目９）
項目２に記載のポリペプチドをコードする、項目４に記載の構築物。
（項目１０）
上記免疫フラグメントが、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、またはＩｇＤフラグメントを含む、項目４に記載の構築物。
（項目１１）
上記構築物が、上記免疫フラグメントに、ＡＡＴまたはそのカルボキシ末端フラグメントを、そのＮ−末端を通して連結することによって、形成される、項目４に記載の構築物。
（項目１２）
配列番号４８のポリペプチドをコードする、項目４に記載の構築物。
（項目１３）
項目４に記載の核酸構築物または項目１に記載の融合ポリペプチドを含む、組換え細胞クローン。
（項目１４）
タンパク質またはペプチドの混合物から、項目２に記載の融合ポリペプチドを精製するためのプロセスであって、
ａ．マトリックスと結合したプロテインＡに対して、タンパク質またはペプチドの上記混合物を曝露するステップおよび
ｂ．構築物または融合分子の免疫フラグメントを、上記マトリックスと結合したプロテインＡと結合させるステップ、
ｃ．上記混合物のうちの結合していないタンパク質またはペプチドを除去するステップ、ならびに
ｄ．競合的結合分子を使用して、プロテインＡから上記タンパク質または上記ペプチドを溶出するステップを含む、プロセス。
（項目１５）
上記免疫フラグメントが、上記構築物または上記融合分子から切断される、項目１４に記載のプロセス。
（項目１６）
上記競合的結合分子が、Ｆｃ受容体である、項目１４に記載のプロセス。
（項目１７）
回収された上記構築物または上記融合分子が、血漿由来のＡＡＴ調製物と比較して、少なくとも１０％増大した抗炎症活性を有する、項目１４に記載のプロセス。
（項目１８）
項目１に記載の融合ポリペプチドまたはタンパク質および薬学的に許容され得る賦形剤を含む医薬組成物。
（項目１９）
上記融合ポリペプチドが、治療有効量で上記組成物中に存在する、項目１８に記載の組成物。
（項目２０）
項目４に記載の核酸構築物を含むベクター。
（項目２１）
項目２０に記載のベクターを含む形質転換細胞。
（項目２２）
項目１に記載の融合タンパク質を含む、発現された封入体の単離調製物。
（項目２３）
被験体において、状態を治療するための方法であって、治療有効量の項目１に記載の融合ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアまたはその塩の組成物を上記被験体に対して投与するステップを含み、上記投与が、上記被験体において、上記状態を治療する、方法。
（項目２４）
上記状態が、Ｉ型糖尿病またはＩＩ型糖尿病である、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
上記被験体が、器官または非器官移植を受けており、上記治療が、上記被験体において移植拒絶反応を調整する、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
上記状態が、上記被験体におけるＡＡＴ欠乏症であり、上記治療が、上記被験体に対してＡＡＴ代償療法を提供する、項目２３に記載の方法。
（項目２７）
上記状態が、痛風であり、上記組成物の上記投与が、上記被験体において、痛風を調整する、項目２３に記載の方法。
（項目２８）
上記状態が、心臓の状態であり、上記投与が、上記被験体において、上記心臓の状態を調整する、項目２３に記載の方法。
（項目２９）
上記被験体に対する上記組成物の投与が、上記組成物を有していないコントロール被験体と比較して、心臓のリモデリングを低下させる、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
上記状態が、感染症であり、上記投与が、上記被験体において上記感染症を調整する、項目２３に記載の方法。
（項目３１）
上記感染症が、ウイルス感染症または細菌性感染症である、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
上記状態が、再建手術または形成外科手術の副作用であり、上記組成物が、上記被験体において炎症を低下させる、項目２３に記載の方法。
（項目３３）
上記状態が、上記状態に関連する過剰な炎症であり、上記組成物が、上記被験体において炎症を低下させる、項目２３に記載の方法。
（項目３４）
投与が、静脈内投与、気管内投与、皮内投与、鼻腔内投与、吸入による投与、皮下投与、局所投与、膣投与、または他の様式の投与のうちの１つまたはそれより多くを含む、項目２３に記載の方法。
（項目３５）
上記状態が、自己免疫性の状態であり、上記組成物が、上記被験体において上記自己免疫性の状態を治療する、項目２３に記載の方法。
（項目３６）
上記組成物の投与が、月に１回、週に１回、週に２回、または１日１回である、項目２３に記載の方法。
（項目３７）
被験体における移植のための器官、組織、または細胞を保存するための方法であって、上記方法は、項目１に記載の融合ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアまたはその塩の組成物に対して上記器官、上記組織、または上記細胞を曝露するステップを含み、上記投与が、融合ポリペプチドでないアルファ−１抗トリプシンの投与と比較して、低減され、上記組成物が、移植または保存のために、上記器官、上記組織、または上記細胞を保存するのに有効である、方法。
（項目３８）
セリンプロテアーゼ阻害活性が、有意に低下している、反応中心ループ（ＲＣＬ）に変異を有する変異体ＡＡＴをコードする核酸、および
免疫グロブリン分子である免疫フラグメントをコードする核酸、
を含む、核酸構築物。
（項目３９）
放射線に対して曝露されたことがある被験体を治療するための方法であって、項目１に記載の融合ポリペプチドおよび薬学的に許容され得るキャリアまたはその塩の組成物を上記被験体に対して投与するステップを含み、上記投与が、上記被験体において、放射線の副作用を低下させ、投与される上記組成物が、融合ポリペプチドでないアルファ−１抗トリプシンの投与と比較して、低減される、方法。
（項目４０）
上記被験体が、癌療法により放射線に対して曝露される、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
上記被験体が、前立腺癌を有し、上記治療が、放射線療法を受けている上記被験体において、インポテンスまたは勃起障害の発症を低減させる、項目３９に記載の方法。