(57)【要約】【課題】がん転移の予後診断および処置のための方法を提供すること。【解決手段】本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルＡおよびβを含む）における骨転移の予後診断のための方法に関し、その方法は、原発腫瘍サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が増幅されているかを決定する工程を含む。同様に、本発明は、他の器官における転移に関して骨転移を起こす傾向を決定するための方法にも関し、その方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベル、増幅または転座を決定する工程を含む。本発明は、乳がんに罹患している被験体における早期の骨転移を予測するための方法にも関する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
本明細書に記載の発明。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
配列表への言及
本願とともに出願され、電子的に提出される配列表（「３１９０＿００１ＰＣ０３＿ＳＥＱＩＤＬｉｓｔｉｎｇ＿ａｓｃｉｉ．ｔｘｔ」、４８，２６９バイト、２０１３年３月１５日に作成）の内容は、その全体が参照により本明細書中に援用される。
【０００２】
発明の背景
発明の分野
本発明は、原発腫瘍サンプルにおけるｃ−ＭＡＦ遺伝子のレベル、１６ｑ２３または１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅または転座の決定に基づく、トリプルネガティブ（基底細胞様（ｂａｓａｌ−ｌｉｋｅ）を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルタイプ（ｌｕｍｉｎａｌ  ｔｙｐｅ）ＡおよびルミナルタイプＢを含む）における骨転移の予後診断に関する。同様に、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体において個別化治療（ｃｕｓｔｏｍｉｚｅｄ
ｔｈｅｒａｐｙ）をデザインするための方法にも関し、その方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベル、１６ｑ２３または１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅または転座を決定する工程を含む。最後に、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんの転移またはＥＲ＋乳がんの転移、特に、骨転移の処置における治療薬としてのｃ−ＭＡＦインヒビターの使用に関する。
【背景技術】
【０００３】
背景技術
乳がんは、世界中で２番目に一般的なタイプのがん（１０．４％；肺がんの次位）および５番目に一般的ながんによる死亡原因（肺がん、胃がん、肝臓がんおよび結腸がんの次位）である。女性の中で、乳がんは、最も一般的ながんによる死亡原因である。２００５年は、世界中で５０２，０００人が乳がんによって死亡した（がんによる死亡数の７％；全死亡数のほぼ１％）。１９７０年代から、世界中の症例数は著しく増加しており、これは、西洋諸国における現代的な生活様式に一部起因する現象である。
【０００４】
乳がんは、ＴＮＭシステムに従ってステージに分類される（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｊｏｉｎｔ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ  ｏｎ  Ｃａｎｃｅｒ．ＡＪＣＣ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｔａｇｉｎｇ  Ｍａｎｕａｌ．６ｔｈ  ｅｄ．Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ＮＹ：Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，２００２（その全体が参照により本明細書中に援用される）を参照のこと）。予後診断は、ステージ分類の結果と密接な関係があり、ステージ分類は、臨床試験と医療行為の両方において患者を処置に割り当てるためにも使用される。ステージに分類するための情報は、以下のとおりである：
・ＴＸ：原発腫瘍の評価が不可能である。Ｔ０：腫瘍のエビデンスが無い。Ｔｉｓ：上皮内癌腫（ｉｎ  ｓｉｔｕ  ｃａｒｃｉｎｏｍａ）で、浸潤無し。Ｔ１：腫瘍は、２ｃｍ以下である。Ｔ２：腫瘍は、２ｃｍより大きいが５ｃｍ未満である。Ｔ３：腫瘍は、５ｃｍより大きい。Ｔ４：胸壁もしくは皮膚において成長している任意のサイズの腫瘍、または炎症性乳がん。
・ＮＸ：近傍のリンパ節の評価が不可能である。Ｎ０：がんは、領域リンパ節に広がっていない。Ｎ１：がんは、１〜３つの腋窩リンパ節または１つの内乳腺リンパ節に広がっている。Ｎ２：がんは、４〜９つの腋窩リンパ節または複数の内乳腺リンパ節に広がっている。Ｎ３：以下のうちの１つに当てはまる：
・がんは、１０個以上の腋窩リンパ節に広がっているか、またはがんは、鎖骨下リンパ節に広がっているか、またはがんは、鎖骨上リンパ節に広がっているか、またはがんは、腋窩リンパ節に波及していて、内乳腺リンパ節に広がっているか、またはがんは、４つ以上の腋窩リンパ節に波及していて、最小限のがんが、内乳腺リンパ節またはセンチネルリンパ節の生検材料に存在する。
・ＭＸ：遠隔拡散（転移）の存在の評価が不可能である。Ｍ０：遠隔拡散は無い。Ｍ１：鎖骨上リンパ節を含まない遠隔器官への広がりが生じている。
【０００５】
固形腫瘍がんを有する患者のほとんどが転移後に死亡するという事実は、腫瘍を転移させる分子機序および細胞機序を理解することが極めて重要であることを意味している。最近の刊行物は、まだほとんど知られていない複雑な機序によってどのようにして転移が引き起こされるか、およびまた、どのようにして種々の転移細胞型が特定の器官に対する指向性を有するかを示してきた。これらの組織特異的な転移細胞は、それらを特定の器官に転移増殖させる（ｃｏｌｏｎｉｚｅ）、獲得した一連の機能を有する。
【０００６】
すべての細胞が、その表面上、細胞質内および細胞核内にレセプターを有する。ある特定の化学メッセンジャー（例えば、ホルモン）は、上記レセプターに結合し、これにより、細胞に変化が引き起こされる。乳がん細胞に影響し得る重要なレセプターは３つ存在する：エストロゲンレセプター（ＥＲ）、プロゲステロンレセプター（ＰＲ）およびＨＥＲ２／ｎｅｕである。これらのレセプターのいずれかを有する細胞を命名する目的で、そのレセプターが存在するときは、陽性の符号がそれに付けられ、存在しないときは、陰性の符号が付けられる：ＥＲ陽性（ＥＲ＋）、ＥＲ陰性（ＥＲ−）、ＰＲ陽性（ＰＲ＋）、ＰＲ陰性（ＰＲ−）、ＨＥＲ２陽性（ＨＥＲ２＋）およびＨＥＲ２陰性（ＨＥＲ２−）。レセプターの状態は、特定の処置、例えば、タモキシフェンまたはトラスツズマブを使用する適格性を決定するものであるので、そのレセプターの状態は、すべての乳がんに対して重大な評価になっている。
【０００７】
教師なし遺伝子発現アレイプロファイリングは、内因性サブタイプ（例えば、ルミナルＡ、ルミナルＢ、ＨＥＲ２＋／ＥＲ−および基底細胞様サブタイプ）の識別を通じて、乳がんの不均質性に対する生物学的エビデンスを提供した。
【０００８】
トリプルネガティブがんは、エストロゲンレセプター（ＥＲ）、プロゲステロンレセプター（ＰＲ）およびＨＥＲ２に対する遺伝子を発現しない腫瘍と定義されている。このサブグループは、全タイプの乳がんの１５％を占め、閉経前のアフリカ人女性およびアフリカ系アメリカ人女性に生じる乳がんのより高いパーセンテージを占める。トリプルネガティブ乳がんは、エストロゲンレセプター陽性乳がんとは非常に異なる再発パターンを有する：再発のリスクは、最初の３〜５年間はかなり高いが、その後は、急激に低下し、エストロゲンレセプター陽性乳がんのリスクよりも実質的に低くなる。
【０００９】
基底細胞様サブタイプは、ＥＲとＨＥＲ２の両方の遺伝子クラスターの低発現を特徴とするので、典型的には、臨床試験においてＥＲ陰性、ＰＲ陰性かつＨＥＲ２陰性である；この理由で、「トリプルネガティブ」乳がんと呼ばれることが多い（Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ２００７，９（Ｓｕｐｐｌ  １）：Ｓ１３）。基底細胞様がんは、高分子量サイトケラチン（５／６、１４および１７）、Ｐ−カドヘリン、カベオリン１および２、ネスチン、αＢクリスタリンならびに上皮成長因子レセプターを含む、正常な乳房の「基底」／筋上皮細胞に通常見られる遺伝子を発現する（Ｒｅｉｓ−Ｆｉｈｏ  Ｊ．ら、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｕｓｃａｐ．ｏｒｇ／ｓｉｔｅ〜／９８ｔｈ／ｐｄｆ／ｃｏｍｐａｎｉｏｎ０３ｈ０３．ｐｄｆ）。
【００１０】
基底細胞様乳がんに対して国際的に認められた定義が存在しないことを考えると、トリプルネガティブ乳がんおよび基底細胞様乳がんが同義であるか否かに関する混乱が非常に大きいことは、驚くべきことではない。いくつかのグループは、これらの用語を交換可能に使用しているが、すべての基底細胞様がんが、ＥＲ、ＰＲおよびＨＥＲ２を欠くとは限らず、すべてのトリプルネガティブがんが、基底細胞様の表現型を示すとも限らないことに注意すべきである。圧倒的多数のトリプルネガティブがんが、基底細胞様の表現型である。同様に、「基底細胞」マーカーを発現している圧倒的多数の腫瘍が、トリプルネガティブである。しかしながら、基底細胞マーカーを発現しないかなりの数のトリプルネガティブがんおよびホルモンレセプターまたはＨＥＲ２のいずれかを発現する基底細胞様がんの小さいがなおもかなりのサブグループが存在することに注意すべきである。Ｂｅｒｔｕｃｃｉら（Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ．２００８  Ｊｕｌ  １；１２３（１）：２３６−４０）は、この問題に真っすぐに取り組み、遺伝子発現プロファイリングによって解析されたとき、すべてのトリプルネガティブ腫瘍が、基底細胞様がんとして分類されるとは限らないこと（すなわち、７１％しか基底細胞様の表現型でなかった）および発現アレイによって分類されたすべての基底細胞様乳がん腫が、トリプルネガティブ表現型を示すとは限らないこと（すなわち７７％）を立証した。
【００１１】
乳がんを処置する場合に要となるものは、腫瘍が限局性であるとき、実行可能なアジュバントホルモン療法（タモキシフェンまたはアロマターゼインヒビターを用いる）、化学療法および／または放射線治療を伴う、手術である。現在、手術後の処置に対する提案（補助療法）は、あるパターンに従う。世界的な多施設研究の実際の結果を議論する世界会議がＳｔ．Ｇａｌｌｅｎ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄで２年ごとに開催されるので、このパターンは、変更される可能性がある。同様に、上記パターンはまた、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ（ＮＩＨ）のコンセンサス基準に従って見直される。これらの基準に基づくと、リンパ節に転移を有しない患者の８５〜９０％超が、アジュバント全身療法を受ける候補になるだろう。
【００１２】
現在、Ｏｎｃｏｔｙｐｅ  ＤＸなどのＰＣＲアッセイまたはＭａｍｍａＰｒｉｎｔなどのマイクロアレイアッセイが、特定の遺伝子の発現に基づいて乳がん再発のリスクを予測し得る。２００７年２月に、ＭａｍｍａＰｒｉｎｔアッセイは、Ｆｏｏｄ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎの公的認可を獲得した最初の乳がん指標になった。
【００１３】
特許出願ＥＰ１９６１８２５−Ａ１には、骨、肺、肝臓または脳への乳がん転移の発生率を予測するための方法が記載されており、その方法は、コントロールサンプルにおける対応する発現レベルと比べて、腫瘍組織サンプルにおいて１つまたは複数のマーカー（ｃ−ＭＡＦを含む）の発現レベルを決定する工程を含む。しかしながら、この文書では、乳がん患者の生存時間の決定を可能にするいくつかの遺伝子を同時に決定することが要求されており、骨転移なしでの生存可能性の予測についての遺伝子シグネチャ（ｇｅｎｅ  ｓｉｇｎａｔｕｒｅ）の能力の相関関係は、統計学的に有意でなかった。
【００１４】
特許出願ＵＳ２０１１／０１５０９７９には、基底細胞様乳がんの予後を予測するための方法が記載されており、その方法は、ＦＯＸＣ１のレベルを検出する工程を含む。
【００１５】
特許出願ＵＳ２０１０／０２１０７３８は、トリプルネガティブ乳がんを有する被験体におけるがんを予後診断するための方法に関し、その方法は、サンプル中の、ランダムにアップレギュレートされているかまたはダウンレギュレートされている一連の遺伝子の発現レベルを検出する工程を含む。
【００１６】
特許出願ＵＳ２０１１／０１３０２９６は、トリプルネガティブ乳がんの診断および予後診断において有用なマーカー遺伝子の同定に関する。
【００１７】
トリプルネガティブ乳がんに罹患している被験体が転移を起こす確率の予測を可能にする新しいマーカーを同定する必要がある。新しい予後因子の同定は、最も適した処置の選択において指針となり得る。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【００１８】
【非特許文献１】Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｊｏｉｎｔ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ  ｏｎ  Ｃａｎｃｅｒ．ＡＪＣＣ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｓｔａｇｉｎｇ  Ｍａｎｕａｌ．６ｔｈ  ｅｄ．Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ＮＹ：Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，２００２
【非特許文献２】Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ２００７，９（Ｓｕｐｐｌ  １）：Ｓ１３
【非特許文献３】Ｒｅｉｓ−Ｆｉｈｏ  Ｊ．ら、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｕｓｃａｐ．ｏｒｇ／ｓｉｔｅ〜／９８ｔｈ／ｐｄｆ／ｃｏｍｐａｎｉｏｎ０３ｈ０３．ｐｄｆ
【非特許文献４】Ｂｅｒｔｕｃｃｉら（Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ．２００８  Ｊｕｌ  １；１２３（１）：２３６−４０）
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１９】
１つの態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルＡおよびＢを含む）に罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、
ｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを決定する工程、および
ｉｉ）工程ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、骨転移を起こす上昇したリスクを示す。
【００２０】
別の態様において、本発明は、骨転移性トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいは骨転移性ＥＲ＋乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、
ｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）工程ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、不良な臨床転帰を示す。
【００２１】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法に関し、その方法は、
ｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、その発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は、骨転移の予防、阻害および／または処置を目指す治療を受けるのに適格である（is
susceptible  to  receive  a  therapy）。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬を投与される。発現レベルが、上記参照値と比較して高くない場合、上記被験体は、骨転移の予防、阻害および／または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬を投与されない。
【００２２】
別の態様において、本発明は、乳がん、例えば、トリプルネガティブ乳がんまたはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを決定するための方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを決定する工程を含み、ここで、平均値＋１標準偏差より高い上記遺伝子の発現レベルは、早期の骨転移の上昇したリスクを示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防するかまたは阻害する少なくとも１つの治療薬を投与される。
【００２３】
別の態様において、本発明は、骨転移を伴うトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法に関し、その方法は、
ｉ）上記被験体の骨転移サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）工程（ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は、骨分解を予防するための治療を受けるのに適格である。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬を投与される。ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、上記参照値と比較して上昇していない場合、上記被験体は、骨分解を予防するための治療を受けるのに適格ではない。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬を投与されない。
【００２４】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇したリスクを示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防するかまたは阻害する少なくとも１つの治療薬を投与される。
【００２５】
別の態様において、本発明は、乳がん、例えば、トリプルネガティブ乳がんまたはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、骨転移を起こす上昇したリスクを示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防するかまたは阻害する少なくとも１つの治療薬を投与される。
【００２６】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、不良な臨床転帰を示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬を投与される。そのような増幅が観察されない場合、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬を投与されない。別の実施形態において、本発明は、乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座（すなわち、ｔ（１４，１６））は、不良な臨床転帰を示す。いくつかの実施形態において、本発明は、ｃ−ＭＡＦの増幅または転座を有する患者のために個別化治療をデザインすることに関する。いくつかの実施形態において、個別化治療は、骨転移を予防する、阻害するおよび／または処置する少なくとも１つの治療薬である。
【００２７】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋乳がんからの骨転移の予防において使用するためのｃ−ＭＡＦ阻害剤に関する。
【００２８】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したｃ−ＭＡＦレベルを有する被験体における骨転移の処置において使用するための、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができる薬剤に関する。
【００２９】
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのキットに関し、そのキットは：ａ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；およびｂ）上記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段を備える。
【００３０】
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのキットに関し、そのキットは：ａ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座を決定するための手段；およびｂ）上記サンプル中のｃ−ＭＡＦの転座を参照ｃ−ＭＡＦサンプルと比較するための手段を備える。本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するための、そのようなキットの使用にも関する。１つの実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した結果に基づいて、骨転移を予防する、阻害するおよび／もしくは処置する少なくとも１つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
【００３１】
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのキットに関し、そのキットは：ａ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅、１６ｑ２３または１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅または転座を定量するための手段；およびｂ）上記サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅されたレベル、１６ｑ２３または１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅または転座を参照と比較するための手段を備える。
【００３２】
別の態様において、本発明は、乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するためのキットに関し、そのキットは：ａ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；およびｂ）上記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段を備える。本発明は、乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するための、そのようなキットの使用にも関する。１つの実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した結果に基づいて、骨転移を予防する、阻害するおよび／もしくは処置する少なくとも１つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
【００３３】
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するためのキットに関し、そのキットは：ａ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；ｂ）上記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段；ならびにｃ）定量された発現レベルと参照発現レベルとの比較に基づいて、上記被験体において骨転移を予防するためおよび／または減少させるための治療を決定するための手段を備える。本発明は、乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するための、そのようなキットの使用にも関する。１つの実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した結果に基づいて、骨転移を予防する、阻害するおよび／もしくは処置する少なくとも１つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
【００３４】
別の態様において、本発明は、ｉ）乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための試薬、およびｉｉ）骨転移のリスクと相関するように予め決定されている１つまたは複数のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベル指標を備えるキットに関する。本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するための、そのようなキットの使用にも関する。１つの実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した結果に基づいて、骨転移を予防する、阻害するおよび／もしくは処置する少なくとも１つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
【００３５】
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするためのインビトロでの方法に関し、その方法は：
ａ）上記被験体からのサンプルを提供する工程；
ｂ）上記サンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量する工程；
ｃ）定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルをｃ−ＭＡＦ発現の所定の参照レベルと比較することによって上記サンプルをタイプ分けする工程；
を含み、ここで、上記タイプ分けは、上記被験体における骨転移のリスクに関する予後情報を提供する。１つの実施形態において、被験体は、タイプ分けによって提供される予後情報に基づいて、少なくとも１つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
【００３６】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを予防するためまたは減少させるための方法に関し、上記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を上記被験体に投与する工程を含み、ここで、上記薬剤は、上記被験体におけるｃ−ＭＡＦの発現レベルの定量から決定された処置レジメンに従って投与される。
【００３７】
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体をコホートに分類する方法に関し、その方法は：ａ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを決定する工程；ｂ）上記サンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルをｃ−ＭＡＦ発現の所定の参照レベルと比較する工程；およびｃ）そのサンプル中のｃ−ＭＡＦの上記発現レベルに基づいて、上記被験体をコホートに分類する工程を含む。特定の態様において、そのコホートは、臨床試験を行うために使用される。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法であって、該方法は、
ｉ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを決定する工程、および
ｉｉ）工程ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、前記参照値と比較して上昇した前記遺伝子の発現レベルは、骨転移を起こす上昇したリスクを示す、インビトロでの方法。
（項目２）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんからの骨転移に罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法であって、該方法は、
ｉ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）工程ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、前記参照値と比較して上昇した前記遺伝子の発現レベルは、不良な臨床転帰を示す、インビトロでの方法。
（項目３）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、該方法は、
ｉ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該発現レベルが、前記参照値と比較して上昇した場合、前記被験体は、骨転移の予防および／または処置を目指す治療を受けるのに適格である、インビトロでの方法。
（項目４）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、該方法は、
ｉｉｉ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、およびｉｖ）ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該発現レベルが、前記参照値と比較して上昇していない場合、前記被験体は、骨転移の予防および／または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない、インビトロでの方法。
（項目５）
平均より高い前記遺伝子の発現レベルが、骨転移の上昇したリスクを示し、このリスクは、ｃ−ＭＡＦ発現のレベルに比例する、項目１に記載のインビトロでの方法。
（項目６）
乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを決定するためのインビトロでの方法であって、該方法は、前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを決定する工程を含み、ここで、平均値＋１標準偏差より高い前記遺伝子の発現レベルは、早期の骨転移の上昇したリスクを示す、インビトロでの方法。
（項目７）
該乳がんが、トリプルネガティブ乳がん、基底細胞様乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんである、項目６に記載の方法。
（項目８）
該骨転移が、溶骨性転移である、項目１〜７のいずれかに記載の方法。
（項目９）
骨転移を伴うトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、該方法は、
ｉ）前記被験体の骨転移サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）工程（ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、前記参照値と比較して上昇している場合、前記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格である、インビトロでの方法。
（項目１０）
骨転移を伴うトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、該方法は、
ｉｉｉ）前記被験体の骨転移サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｖ）工程（ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、前記参照値と比較して上昇していない場合、前記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格ではない、インビトロでの方法。
（項目１１）
前記骨分解を予防する薬剤が、ビスホスホネート、ＲＡＮＫＬインヒビター、ＰＴＨおよびＰＴＨＬＨのインヒビターまたはＰＲＧアナログ、ラネル酸ストロンチウム、ＤＫＫ−１インヒビター、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カルシトニン、ならびにカテプシンＫインヒビターからなる群より選択される、項目３〜４または９〜１０に記載の方法。
（項目１２）
前記ＲＡＮＫＬインヒビターが、ＲＡＮＫＬ特異的抗体、ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記ＲＡＮＫＬ特異的抗体が、デノスマブである、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディが、ＡＬＸ−０１４１である、項目１２に記載の方法。
（項目１５）
前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
前記ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビターが、Ｃａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂである、項目１１に記載の方法。
（項目１７）
ラジウム−２２３が、アルファラディンである、項目１１に記載の方法。
（項目１８）
前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの定量が、前記遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）または前記ｍＲＮＡのフラグメント、前記遺伝子の相補ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）または前記ｃＤＮＡのフラグメントを定量する工程を含む、項目１〜１７のいずれかに記載の方法。
（項目１９）
前記発現レベルが、定量的ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、またはＤＮＡ、ＲＮＡアレイ、またはヌクレオチドハイブリダイゼーション法によって定量される、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの定量が、前記遺伝子によってコードされるタンパク質またはそのバリアントのレベルを定量する工程を含む、項目１〜１７のいずれかに記載の方法。
（項目２１）
前記タンパク質のレベルが、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡ、免疫組織化学またはタンパク質アレイによって定量される、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記参照値が、転移に罹患していない被験体由来のトリプルネガティブ乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルＡおよびＢを含む）のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルである、項目１〜２１のいずれかに記載の方法。
（項目２３）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルＡおよびＢを含む）に罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、前記参照遺伝子コピー数と比較したときの前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇したリスクを示す、方法。
（項目２４）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中の前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含む、方法。
（項目２５）
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目２３〜２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目２６）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、前記参照遺伝子コピー数と比較したときの前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、不良な臨床転帰を示す、方法。
（項目２７）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルＡおよびＢを含む）に罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中の前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を示す、方法。
（項目２８）
遺伝子座１６ｑ２３または１６ｑ２２−ｑ２４が、転座している、項目２４および２７のいずれかに記載の方法。
（項目２９）
遺伝子座１６ｑ２３または１６ｑ２２−ｑ２４が、１４番染色体の遺伝子座１４ｑ３２に転座している、項目２４、２７または２８のいずれかに記載の方法。
（項目３０）
前記がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程をさらに含み、ここで、前記参照遺伝子コピー数と比較したときの前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇したリスクを示す、項目２３〜２９のいずれかに記載の方法。
（項目３１）
前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅および転座が、遺伝子座１６ｑ２３または１６ｑ２２−ｑ２４の増幅または転座を決定することによって決定される、項目２３〜３０のいずれかに記載の方法。
（項目３２）
前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座が、ｃ−ＭＡＦ遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される、項目２３〜３１のいずれかに記載の方法。
（項目３３）
前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子特異的プローブが、Ｖｙｓｉｓ  ＬＳＩ／ＩＧＨ  ＭＡＦ  Ｄｕａｌ  Ｃｏｌｏｒ  Ｄｕａｌ  Ｆｕｓｉｏｎ  Ｐｒｏｂｅである、項目３２に記載の方法。（項目３４）
前記参照遺伝子コピー数が、転移に罹患していない被験体由来のトリプルネガティブ乳がんの腫瘍組織サンプル中の遺伝子コピー数である、項目２３〜３３のいずれかに記載の方法。
（項目３５）
前記増幅が、インサイチュハイブリダイゼーションまたはＰＣＲによって決定される、項目２３〜３４のいずれかに記載の方法。
（項目３６）
前記被験体サンプルが、前記ｃ−ＭＡＦ遺伝子の倍数体であるかをさらに決定する工程を含む、項目２３〜３５のいずれかに記載の方法。
（項目３７）
前記サンプルが、腫瘍組織サンプルである、項目１〜３６のいずれかに記載の方法。
（項目３８）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋乳がんからの骨転移の予防において使用するためのｃ−ＭＡＦ阻害剤。
（項目３９）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんに罹患しており、かつ転移性腫瘍組織サンプルにおいて、コントロールサンプルと比較して上昇したｃ−ＭＡＦレベルを有する被験体における骨転移の処置において使用するための、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができる薬剤。
（項目４０）
前記ｃ−ＭＡＦ阻害剤が、ｃ−ＭＡＦ特異的ｓｉＲＮＡ、ｃ−ＭＡＦ特異的アンチセンスオリゴヌクレオチド、ｃ−ＭＡＦ特異的リボザイム、ｃ−ＭＡＦ阻害性抗体もしくはナノボディ、ドミナントネガティブｃ−ＭＡＦバリアント、表１もしくは表２の化合物、ｃ−ＭＡＦ特異的小分子、ｃ−ＭＡＦ特異的抗体、ｃ−ＭＡＦ特異的抗体様分子、ｃ−ＭＡＦ特異的な構造的に制約された（環状の）ペプチド、ｃ−ＭＡＦ特異的ステープルドペプチド、またはｃ−ＭＡＦ特異的アルファボディからなる群より選択される、項目３８または３９のいずれかに記載の使用のためのｃ−ＭＡＦ阻害剤。
（項目４１）
前記薬剤が、ビスホスホネート、ＲＡＮＫＬインヒビター、ＰＴＨもしくはＰＴＨＬＨインヒビターまたはＰＲＧアナログ、ラネル酸ストロンチウム、ＤＫＫ−１インヒビター、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カルシトニン、ラジウム−２２３およびカテプシンＫインヒビターからなる群より選択される、項目３９に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４２）
前記ＲＡＮＫＬインヒビターが、ＲＡＮＫＬ特異的抗体、ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンの群から選択される、項目４１に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４３）
前記ＲＡＮＫＬ特異的抗体が、デノスマブである、項目４２に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４４）
前記ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディが、ＡＬＸ−０１４１である、項目４２に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４５）
前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、項目４１に記載の、使用するための、
骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４６）
前記ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビターが、Ｃａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂである、項目４１に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４７）
前記ラジウム−２２３が、アルファラディンである、項目４１に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
（項目４８）
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目３８〜４７のいずれかに記載の、使用するための、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができる薬剤。
（項目４９）
乳がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのキットであって、前記キットは：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；およびｂ）前記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段を備える、キット。
（項目５０）
乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するためのキットであって、前記キットは：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；およびｂ）前記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段を備える、キット。
（項目５１）
乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するためのキットであって、前記キットは：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；ｂ）前記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段；ならびにｃ）定量された発現レベルと参照発現レベルとの比較に基づいて、前記被験体において骨転移を予防するためおよび／または減少させるための治療を決定するための手段を備える、キット。
（項目５２）
ｉ）乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための試薬、およびｉｉ）骨転移のリスクと相関するように予め決定されている１つまたは複数のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベル指標を備える、キット。
（項目５３）
発現を定量するための前記手段が、ｃ−ＭＡＦ遺伝子、１６ｑ２３遺伝子座または１６ｑ２２−１６ｑ２４染色体領域に特異的に結合および／または増幅するプローブおよび／またはプライマーのセットを含む、項目４９〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５４）
前記がんが、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんである、項目４９〜５３のいずれか１項に記載のキット。
（項目５５）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（ルミナルＡおよびＢを含む）に罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするためのインビトロでの方法であって、前記方法は：
（ａ）前記被験体からサンプルを提供する工程；
（ｂ）前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量する工程；
（ｃ）定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルをｃ−ＭＡＦ発現の所定の参照レベルと比較することによって前記サンプルをタイプ分けする工程；
を含み、ここで、前記タイプ分けは、前記被験体における骨転移のリスクに関する予後情報を提供する、インビトロでの方法。
（項目５６）
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを予防するためまたは減少させるための方法であって、前記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を前記被験体に投与する工程を含み、ここで、前記薬剤は、前記被験体におけるｃ−ＭＡＦの発現レベルの定量から決定された処置レジメンに従って投与される、方法。
（項目５７）
乳がんに罹患している被験体をコホートに分類する方法であって、前記方法は、ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを決定する工程；ｂ）前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルをｃ−ＭＡＦ発現の所定の参照レベルと比較する工程；およびｃ）前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの前記発現レベルに基づいて、前記被験体をコホートに分類する工程を含む、方法。
（項目５８）
前記コホートが、前記参照発現レベルと比較して、匹敵するｃ−ＭＡＦ発現レベルを有すると決定された少なくとも１つの他の個体を含む、項目５７に記載の方法。
（項目５９）
前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの前記発現レベルが、前記所定の参照レベルと比べて上昇しており、前記コホートのメンバーが、骨転移の上昇したリスクを有すると分類される、項目５７または５８に記載の方法。
（項目６０）
前記コホートが、臨床試験を行うためのコホートである、項目５７〜５８のいずれかに記載の方法。
（項目６１）
前記乳がんが、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんである、項目５７〜６０のいずれかに記載の方法。
（項目６２）
前記サンプルが、腫瘍組織サンプルである、項目５５〜６０のいずれかに記載の方法。
（項目６３）
ｃ−ＭＡＦ遺伝子、１６ｑ２３または１６ｑ２２−１６ｑ２４染色体領域が、増幅されているか、または転座されている、項目５５〜６０のいずれかに記載の方法。
（項目６４）
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、ｍＴｏｒインヒビターである、項目３に記載の方法。
（項目６５）
前記ｍＴｏｒインヒビターが、Ｅｖｅｒｏｌｉｍｕｓである、項目６４に記載の方法。
（項目６６）
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、Ｓｒｃキナーゼインヒビターである、項目３に記載の方法。
前記Ｓｒｃキナーゼインヒビターが、ダサチニブである、項目６６に記載の方法。
（項目６７）
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、ＣＯＸ−２インヒビターである、項目３に記載の方法。
（項目６８）
第２の処置が、前記ＣＯＸ−２インヒビターと組み合わせて使用される、項目６７に記載の方法。
（項目７０）
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、Ａｌｐｈａｒａｄｉｎである、項目３に記載の方法。
【図面の簡単な説明】
【００３８】
【図１】各スコアの密度プロット。ＥＳＲ１、ＥＲＢＢ２、ＰＧＲ、ルミナル、増殖。
【図２】Ｔｒｉｐｌｅ  Ｎｅｇａｔｉｖｅ（トリプルネガティブ）乳がんを有する患者に対する骨転移までの時間のカプラン・マイヤーグラフ（ｐ値０．０４）。各グラフの群は、ｃ−ＭＡＦのレベルによって定義される。（−）、（ｕｋ）および（＋）は、以下のようなｃ−ＭＡＦ発現レベルを表す：（−）（＜平均値−ＳＤ）、（ｕｋ）（≧平均値−ＳＤおよび≦平均値＋ＳＤ）および（＋）（＞平均値＋ＳＤ）。ＳＤは、標準偏差を表す。
【図３】ｃ−ＭＡＦ（ｍＲＮＡ）は、ＥＲ＋乳がんにおける乳がんの骨転移に対する臨床的バイオマーカーである。  ＥＲ＋原発性乳がん患者における、骨（左）、脳（右上）および肺（右下）への無転移生存率のカプラン・マイヤー曲線（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６のデータセットの組み合わせまたはコホートＩ）。低、中および高は、以下のようなｃ−ＭＡＦ発現レベルを表す：低（＜平均値−ＳＤ）、中（≧平均値−ＳＤおよび≦平均値＋ＳＤ）および高（＞平均値＋ＳＤ）。骨転移を有する患者は、脳転移および肺転移の解析から除外された。
【図４】ｃ−ＭＡＦ（タンパク質）は、乳がんの骨転移に対する臨床的バイオマーカーである。ａ）原発性乳がん組織の代表的なｃ−ＭＡＦ免疫染色。症例１は、ｃ−ＭＡＦ陰性腫瘍を表す（ＯＤ＜１０００）。症例２および症例３は、ＭＡＦ陽性腫瘍である（それぞれＯＤ＞１０００および＞２５０００）。ｂ）プロットは、３８０個の原発性乳がん腫瘍のコホート（コホートＩＩ）におけるｃ−ＭＡＦタンパク質発現（ＯＤ）を示している。ＢＣサブタイプ（ＥＲ＋、ＨＥＲ２＋およびＴＮ）に従って腫瘍を分ける。下の灰色の目盛りは、骨転移を有する腫瘍を示している。ＯＤ：ｃ−ＭＡＦ免疫染色に基づく光学密度。ｃ，ｄ）３８０個の原発性乳がん腫瘍（ステージＩ、ＩＩおよびＩＩＩ）のコホートにおける無病生存率（ｃ）および無骨転移生存率（ｄ）のカプラン・マイヤー曲線。ｃ−ＭＡＦ高群（赤線，ＯＤ＞１０００）；ｃ−ＭＡＦ低群（緑線，ＯＤ＜１０００）。ｅ）種々のＢＣサブタイプ（ＥＲ＋、ＨＥＲ２＋およびＴＮ）におけるｃ−ＭＡＦの骨転移の診断性能を表している表。ＣＩ（信頼区間）；Ｓｅ−感度；Ｓｐ−特異度；ＰＰＶ（正の予後値）；ＮＰＶ（負の予後値）。
【図５Ａ】乳がん細胞の骨転移に対するｃ−ＭＡＦの寄与。  ａ）ｃ−ＭＡＦ（短および長アイソフォーム）発現ありまたはなしの親ＭＣＦ７細胞をマウスの左心室に注射し、インビボ生物発光（ｂｉｏｌｕｍｉｎｉｓｃｅｎｔ）イメージングによって骨転移増殖（ｂｏｎｅ  ｃｏｌｏｎｉｚａｔｉｏｎ）を解析した。無骨転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。エンドポイントにおける代表的な骨の全光子束、ＨａｎｄＥ染色およびＣＴスキャンに対応する画像が、示されている。
【図５Ｂ】乳がん細胞の骨転移に対するｃ−ＭＡＦの寄与。  ｂ）ｃ−ＭＡＦ（短および長アイソフォーム）発現ありまたはなしの親Ｔ４７Ｄ細胞をマウスの左心室に注射し、骨転移増殖をインビボ生物発光イメージングによって解析した。無骨転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。
【図５Ｃ】乳がん細胞の骨転移に対するｃ−ＭＡＦの寄与。  ｃ）ｃ−ＭＡＦ（短および長アイソフォームの組合せまたは単独）の発現が枯渇したまたはその発現に対してレスキューされたＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物（ｃｅｌｌ  ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅｓ）を、マウスの左心室に注射し、骨転移増殖をインビボ生物発光イメージングによって解析した。無骨転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。エンドポイントにおける代表的な骨の全光子束、ＨａｎｄＥ染色およびＣＴスキャンに対応する画像が示されている。
【図５Ｄ】乳がん細胞の骨転移に対するｃ−ＭＡＦの寄与。  ｄ）ｃ−ＭＡＦ（短および長アイソフォーム）発現ありまたはなしの親ＭＣＦ７細胞をマウスの尾静脈を介して注射し、肺転移増殖（ｌｕｎｇ  ｃｏｌｏｎｉｚａｔｉｏｎ）をインビボ生物発光イメージングによって解析した。無肺転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。ウィルコクソン符号付き順位検定によって統計的差異を決定した。
【図６】ＭＣＦ７親および骨転移誘導物ＢｏＭ２におけるＭＡＦレベル。  ａ）コントロール、ｃ−ＭＡＦ短、ｃ−ＭＡＦ長またはｃ−ＭＡＦ短および長アイソフォーム発現構築物でトランスフェクトされた親細胞（左）、ならびにＢｏＭ２コントロール、ｓｈＭＡＦまたはＲｅｓｃｕｅ（レスキュー）ＢｏＭ２細胞（右）におけるＭＡＦ発現レベル。ＭＡＦ長の発現レベルを、ＴａｑＭａｎプローブを使用して決定し、Ｂｏ２Ｍレベルに対して正規化した。ＭＡＦ短の内因性レベルを、示したプライマーを用いるＳｙｂｅｒ  Ｇｒｅｅｎ反応を使用して決定し、ベータアクチンレベルに対して正規化した。異所的に発現されたｃ−ＭＡＦ短アイソフォームの存在を、ＰＣＲ反応を使用して検出した。  ｂ）親コントロール、ＭＡＦ短およびＭＡＦ長アイソフォームを（同時に）過剰発現している細胞、ならびにＢｏＭ２コントロール、ｓｈＭＡＦまたはＲｅｓｃｕｅ  ＢｏＭ２細胞におけるｃ−ＭＡＦタンパク質レベルを示しているＷＢ。α−チューブリンをローディングコントロールとして使用した。  ｃ）ａ）およびｂ）に記載されたようなＭＣＦ７とＢｏＭ２とＭＡＦ枯渇ＢｏＭ２との間のｃ−ＭＡＦ  ｍＲＮＡおよびタンパク質の発現の直接比較。  ｄ）コントロール、ｃ−ＭＡＦ短アイソフォーム、ｃ−ＭＡＦ長アイソフォームまたはｃ．ＭＡＦ短および長アイソフォームを発現するベクターで一過性にトランスフェクトされた親細胞におけるＣ−ＭＡＲＥ（ｃ−ＭＡＦ応答エレメント）レポータープラスミドのＲｅｎｉｌｌａ活性。Ｃ−ＭＡＲＥプロモーターの活性は、コントロール条件に対して正規化され、任意単位で提示されている。データは、ｓｄを伴う、３つの独立した実験の平均値である。
【図７】ＭＡＦは、実験的乳がん転移マウスモデルにおいて骨転移を駆動する。  （左）無骨転移生存率のカプラン・マイヤー曲線。親コントロールを過剰発現している細胞ならびにｃ−ＭＡＦ短アイソフォームを過剰発現している細胞およびｃ−ＭＡＦ長アイソフォームを過剰発現している細胞を左心室に注射し、転移を生物発光によって決定した。（右）各群に対する、マウス後肢の代表的なＣＴスキャンおよび骨転移のＨ＆Ｅ染色とともに、０日目およびエンドポイントである５４日目における代表的な生物発光の画像が示されている。スケールバー，１００μｍ。溶骨性の領域−黄色破線。（右）エキソビボでの後肢の全光子束をエンドポイントである５４日目に計測し、０日目に対して正規化した。コントロールおよびｃ−ＭＡＦ短発現ベクターとｃ−ＭＡＦ長発現ベクターの両方で、同時に（左）または別々に（右）トランスフェクトされた親細胞を比較することによって、Ｐ値を計算した。
【図８】ｃ−ＭＡＦは、骨への乳がん転移の原因媒介物質である。  骨転移発生の生物発光イメージングプロットが示されている。値は、０日目に対して正規化されている。コントロール、ｓｈＭＡＦまたはＲｅｓｃｕｅ  ＢｏＭ２細胞をヌードマウスの左心室に注射した。  骨転移を再発した動物だけを含む統計値を計算した。
【図９ａ−ｃ】ｃ−ＭＡＦは、乳がんの骨転移病変において破骨細胞の分化の引き金を引く。  ａ）骨病変の総数（ルミネセンスによって計測）あたりの溶骨性病変（Ｘ線によって計測）のパーセンテージ。親細胞、ｃ−ＭＡＦ短、ｃ−ＭＡＦ長ならびにｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞、ならびにＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物をマウスの左心室に注射し、インビボ生物発光イメージングによって骨転移増殖を解析した。  ｂ）ＭＣＦ７親細胞、またはｃ−ＭＡＦアイソフォーム（短−短アイソフォームおよび長−長アイソフォーム）のいずれかを過剰発現している細胞を起源とする馴化培地を使用した、マウス骨髄由来前駆細胞からの破骨細胞分化のアッセイ。破骨細胞の数を、ＴＲＡＰ技法によって測定する（＞３個の多核細胞）。  ｃおよびｄ）親細胞、ｃ−ＭＡＦ短を発現している親細胞、ｃ−ＭＡＦ長を発現している親細胞ならびにｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞、ならびにＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物を心臓内に（ｉｎｔｒａｃａｒｄｉａｃａｌｌｙ）注射されたマウスからの代表的な骨転移性病変のＴＲＡＰ染色。骨腫瘍境界面に沿ったＴＲＡＰ陽性破骨細胞（紫色）を、４匹の独立したマウスの少なくとも４つの異なる視野において数え、ＳＤ値とともにプロットした。スケールバー５０μＭ。群間の統計的差異を、両側ウィルコクソン検定によって評価する。
【図９ｄ】ｃ−ＭＡＦは、乳がんの骨転移病変において破骨細胞の分化の引き金を引く。  ａ）骨病変の総数（ルミネセンスによって計測）あたりの溶骨性病変（Ｘ線によって計測）のパーセンテージ。親細胞、ｃ−ＭＡＦ短、ｃ−ＭＡＦ長ならびにｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞、ならびにＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物をマウスの左心室に注射し、インビボ生物発光イメージングによって骨転移増殖を解析した。  ｂ）ＭＣＦ７親細胞、またはｃ−ＭＡＦアイソフォーム（短−短アイソフォームおよび長−長アイソフォーム）のいずれかを過剰発現している細胞を起源とする馴化培地を使用した、マウス骨髄由来前駆細胞からの破骨細胞分化のアッセイ。破骨細胞の数を、ＴＲＡＰ技法によって測定する（＞３個の多核細胞）。  ｃおよびｄ）親細胞、ｃ−ＭＡＦ短を発現している親細胞、ｃ−ＭＡＦ長を発現している親細胞ならびにｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞、ならびにＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物を心臓内に（ｉｎｔｒａｃａｒｄｉａｃａｌｌｙ）注射されたマウスからの代表的な骨転移性病変のＴＲＡＰ染色。骨腫瘍境界面に沿ったＴＲＡＰ陽性破骨細胞（紫色）を、４匹の独立したマウスの少なくとも４つの異なる視野において数え、ＳＤ値とともにプロットした。スケールバー５０μＭ。群間の統計的差異を、両側ウィルコクソン検定によって評価する。
【図１０】ｃ−ＭＡＦは、乳がんの増殖を支援しない。  皮下注射の模式的表示。（上）親コントロールまたはｃ−ＭＡＦ短アイソフォームおよびｃ−ＭＡＦ長アイソフォームを（同時に）過剰発現している細胞からの（ｆｏｒｍ）皮下腫瘍の成長曲線。値は、ｓｄを伴う平均値を表している。（下）コントロールまたはｃ−ＭＡＦ短アイソフォームおよびｃ−ＭＡＦ長アイソフォームを（同時に）過剰発現している細胞からの皮下腫瘍におけるＫｉ６７陽性細胞のパーセンテージ。各腫瘍について、最低１０個のランダムな視野を、Ｋｉ６７陽性細胞について数えた。値は、ｓｄを伴う平均値である（ｎ＝４）。
【図１１】ｃ−ＭＡＦの下流のＰＴＨＬＨは、乳がんの骨転移に寄与し、媒介する。  ａ）Ｂ２Ｍの発現レベルに対して正規化された、親細胞、ｃ−ＭＡＦ短を発現している親細胞、ｃ−ＭＡＦ長を発現している親細胞ならびにｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞、ならびにＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物におけるＰＴＨＬＨの相対的な発現レベル。＊ｐ値＜０．０５。  ｂ）ＧＳＥ１４０２０データセットからのヒト乳がん転移におけるＰＴＨＬＨの標準化された発現に対するＭＡＦの標準化された発現のドットチャート。赤色の点は、骨転移を示しており、黒色の点は、他の軟部組織転移を示している。点線は、転移サンプルにおける平均ＭＡＦ発現または平均ＰＴＨＬＨ発現を示した。  ｃ）破骨細胞分化培地と、親細胞、ｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞ならびにＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物の馴化培地（ＣＭ）との５０：５０、またはＣＭ無しだがヒトＰＴＨＬＨアンタゴニストペプチド（７−３４）（５μｇ／ｍｌ）で処理した骨髄細胞。破骨細胞の数を、ＴＲＡＰ技法によって測定し（破骨細胞（Ｏｓｔｏｃｌａｓｔｓ）は、白矢印で強調されている、＞３個の多核細胞である）、コントロールに対して正規化する。  ｄ）親細胞、ルシフェラーゼ遺伝子で標識されたｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞を、マウスの左心室に注射し、インビボ生物発光イメージングによって骨転移増殖を解析した。ｃ−ＭＡＦ短および長を発現している親細胞を注射されたマウスを、実験の経過中、１日に２回、腹腔内に接種される（６μｇ／動物）ＰＴＨＬＨアンタゴニストペプチド（７−３４）で処置したかまたは処置しなかった。そのプロットは、実験終点におけるエキソビボでの全光子束を表しており、これは、病変１つあたりの転移細胞の数を反映している（左パネル）。溶骨性骨転移の病変が示されている（右パネル）。  ｅ）１群あたりの代表的な溶骨性病変のＸ線（ＣＴスキャン）画像。骨腫瘍境界面に沿ったＴＲＡＰ陽性破骨細胞（白矢印で強調されている黒色）が、種々の群について示されている。病変から骨腫瘍境界面に沿ったＴＲＡＰ陽性破骨細胞（黒色）を、独立した各マウスからの少なくとも４つの異なる視野において数え、ＳＤ値とともにプロットした。スケールバー５０μＭ。群間の統計的差異を、両側ウィルコクソン検定によって評価する。
【図１２−１】四次スプライン（パッケージｐｈｅｎｏＴｅｓｔにおけるｓｍｏｏｔｈＣｏｘｐｈ関数）を用いるＣｏｘ回帰モデルによる、ｃ−ＭＡＦの発現と骨転移のハザード比との関係の推定。これらのプロットは、記載の群に対応する：ｃ−ＭＡＦ発現レベルが平均（０と命名）より高い腫瘍における骨転移を予測するｃ−ＭＡＦの能力のＨＲ比およびｐ値（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６データセットの組み合わせ，コホートＩ）。続いて、発現レベルにおける１は、１標準偏差を示す。
【図１２−２】四次スプライン（パッケージｐｈｅｎｏＴｅｓｔにおけるｓｍｏｏｔｈＣｏｘｐｈ関数）を用いるＣｏｘ回帰モデルによる、ｃ−ＭＡＦの発現と骨転移のハザード比との関係の推定。これらのプロットは、記載の群に対応する：ｃ−ＭＡＦ発現レベルが平均（０と命名）より高い腫瘍における骨転移を予測するｃ−ＭＡＦの能力のＨＲ比およびｐ値（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６データセットの組み合わせ，コホートＩ）。続いて、発現レベルにおける１は、１標準偏差を示す。
【図１３】ｃ−ＭＡＦ発現および骨転移リスクの決定。本発明者らは、どの程度こまでｃ−ＭＡＦの用量が高くなると骨再発のリスクが高くなるかを検証コホートＩＩにおいてアッセイした。本発明者らは、上に記載されたようなコンピュータ処理システムを使用した染色の光学密度の決定（図４ａ，ｂ）を用いて免疫組織化学（ＩＨＣ）によってｃ−ＭＡＦ発現を定量した。２つのタイプのｃ−ＭＡＦ陽性乳がん腫瘍に基づいて、それらが二峰性の挙動を有するとき、本発明者らは、それらを２群に分離し得る（左パネル）。この２つのカテゴリーを基礎にして、本発明者らは、ｃ−ＭＡＦの染色が強いほど、骨転移のリスクが高く（ＨＲ（骨転移）＝１９．４５；ｐ値＜０．００１）、より早く骨転移が生じる（右パネル）という観察結果を検証する。
【図１４】種々の時点におけるｃ−ＭＡＦおよび骨転移の独立性を試験するためのフィッシャーの正確検定の結果を示しているグラフ（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６データセットの組み合わせ、コホートＩ）。分割表およびフィッシャー検定のｐ値の比率が、各パネルに示されている。
【図１５ａ−ｂ】ｃ−ＭＡＦの過剰発現は、コピー数の変化に起因して起き得る。  ａ）遺伝子発現に基づくコピー数の変化の解析（ＡＣＥアルゴリズム）。影の領域は、ＥＲ＋乳がん腫瘍において再発と有意に関連するＤＮＡゲノム増幅を表している（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６データセットの組み合わせ、コホートＩ）。  ｂ）ＭＡＦ遺伝子コピー（１６ｑ２３）とＩＧＨ（１４ｑ３２）遺伝子コピーとの比に基づいて、親細胞およびＭＡＦ遺伝子が増幅しているＢｏＭ２骨転移細胞のパーセンテージを示しているパネル。ＦＩＳＨで染色した親細胞およびＢｏＭ２細胞の代表的な画像。  ｃ）１６番染色体について、黒色の点および灰色の横線は、それぞれ、正規化されたｌｏｇ２強度比およびセグメントを表している。ＢｏＭ２は、ＭＣＦ７親細胞に対して比較される。下に灰色で１６ｑ２２−２４ＤＮＡゲノム増幅が強調されている。
【図１５ｃ】ｃ−ＭＡＦの過剰発現は、コピー数の変化に起因して起き得る。  ａ）遺伝子発現に基づくコピー数の変化の解析（ＡＣＥアルゴリズム）。影の領域は、ＥＲ＋乳がん腫瘍において再発と有意に関連するＤＮＡゲノム増幅を表している（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６データセットの組み合わせ、コホートＩ）。  ｂ）ＭＡＦ遺伝子コピー（１６ｑ２３）とＩＧＨ（１４ｑ３２）遺伝子コピーとの比に基づいて、親細胞およびＭＡＦ遺伝子が増幅しているＢｏＭ２骨転移細胞のパーセンテージを示しているパネル。ＦＩＳＨで染色した親細胞およびＢｏＭ２細胞の代表的な画像。  ｃ）１６番染色体について、黒色の点および灰色の横線は、それぞれ、正規化されたｌｏｇ２強度比およびセグメントを表している。ＢｏＭ２は、ＭＣＦ７親細胞に対して比較される。下に灰色で１６ｑ２２−２４ＤＮＡゲノム増幅が強調されている。
【図１６】１６ｑ２２−２４ゲノムＤＮＡ領域の増幅は、乳がんの骨転移と関連する。ａおよびｂ）ステージＩ、ＩＩおよびＩＩＩのＢＣヒト原発腫瘍セットにおける無骨転移生存率（ａ）または全生存率（ｂｔ）のカプラン・マイヤー曲線（ｎ＝３３４）（コホートＩＩ）。腫瘍１つあたり３つのコアを使用して、平均として細胞１つあたり１６ｑ２３の２．５コピーというカットオフに基づく１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陰性群および１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陽性群に従って、患者を層別化した。Ｓｅ−感度；Ｓｐ−特異度；ＨＲ−ハザード比。ｃ）Ｉ、ＩＩおよびＩＩＩのＢＣヒト原発腫瘍セットにおけるＥＲ陽性患者（左）またはトリプルネガティブ患者（右）における無骨転移生存率のカプラン・マイヤー曲線（それぞれｎ＝２５０およびｎ＝４３）（コホートＩＩより）。腫瘍１つあたり３つのコアを使用して、平均として細胞１つあたり１６ｑ２３に対する２．５コピーというカットオフに基づいて、患者を１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陰性群および１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陽性群に分けた。ＨＲ−ハザード比。ｄ，ｅ）全体（ｄ）およびＥＲ＋乳がん（ｅ）における１６ｑ２３増幅の診断性能についての受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線。ＲＯＣ曲線において、真陽性率（感度）を、種々のカットオフ点に対する偽陽性率（１００−特異度）の関数でプロットする。ＲＯＣ曲線上の各点は、特定の決定閾値に対応する感度／特異度対を表す。
【発明を実施するための形態】
【００３９】
発明の詳細な説明
一般的な用語および表現の定義
本明細書中で使用されるとき、「骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤」とは、骨芽細胞の増殖を刺激するか、または破骨細胞の増殖を阻害するか、または骨の構造を固定することによって、骨分解を予防するか、阻害するか、処置するか、減少させるか、または停止することができる任意の分子のことを指す。
【００４０】
本明細書中で使用されるとき、用語「遺伝子の増幅」とは、遺伝子または遺伝子フラグメントの様々なコピーが、個別の細胞または細胞系において形成されるプロセスのことを指す。その遺伝子のコピーは、必ずしも同じ染色体に位置するとは限らない。その重複領域は、「アンプリコン」と呼ばれることが多い。通常は、生成されるｍＲＮＡの量、すなわち、遺伝子発現レベルは、特定の遺伝子のコピー数に比例して増加する。
【００４１】
本明細書中で使用されるとき、用語「基底細胞様」「基底細胞様サブタイプ」、「基底細胞様サブタイプの乳がん」などは、本明細書中で使用されるとき、２つのレセプターＥＲおよびＨＥＲ２が陰性であること、ならびにＣＫ５／６、ＣＫ１４、ＣＫ１７およびＥＧＦＲからなる群のうちの少なくとも１つのレセプターが陽性であることを特徴とする特定のサブタイプの乳がんのことを指す。したがって、トリプルネガティブ乳がん（ＥＲ、ＨＥＲ−２、ＰｇＲ）を引き合いに出し、言及する本願中のすべての文は、ＥＲおよびＨＥＲ２が陰性であり、ＣＫ５／６、ＣＫ１４、ＣＫ１７およびＥＧＦＲのうちの少なくとも１つが陽性である、基底細胞様乳がんのことも引き合いに出し、言及し得る。あるいは、「基底細胞様」とは、以下の１０個の遺伝子のアップレギュレーションおよび／またはダウンレギュレーションに基づく遺伝子発現プロファイルを特徴とする乳がんのことも指す：（１）フォークヘッドボックスＣＩ（ＦＯＸＣ１）；（２）メラノーマ阻害活性（ＭＩＡ）；（３）ＮＤＣ８０ホモログ，キネトコア複合体構成要素（ＫＮＴＣ２）；（４）中心体タンパク質５５ｋＤａ（ＣＥＰ５５）；（５）アニリン（Ａｎｉｌｌｉｎ），アクチン結合タンパク質（ＡＮＬＮ）；（６）母性胚性（Ｍａｔｅｒｎａｌ  ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ）ロイシンジッパーキナーゼ（ＭＥＬＫ）；（７）Ｇタンパク質共役レセプター１６０（ＧＰＲ１６０）；（８）膜貫通タンパク質４５Ｂ（ＴＭＥＭ４５Ｂ）；（９）エストロゲンレセプター１（ＥＳＲ１）；（１０）フォークヘッドボックスＡｌ（ＦＯＸＡ１）。乳がん腫瘍を基底細胞様サブタイプとして分類するために使用される遺伝子発現プロファイルは、エストロゲンレセプター、プロゲステロンレセプターまたはＨｅｒ２を含まないので、トリプルネガティブ乳がんと非トリプルネガティブ乳がんの両方が、基底細胞様サブタイプとして分類され得る。
【００４２】
本明細書中で使用されるとき、「トリプルネガティブ乳がん」とは、ＥＲとＰＲの両方の検出可能な発現を欠くことを特徴とする乳がんのことを指し（好ましくは、ＥＲおよびＰＲの発現の測定が、Ｍ．Ｅｌｉｚａｂｅｔｈ  Ｈら、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ，２８（１６）：２７８４−２７９５，２０１０によって開示された方法によって行われるとき）、その腫瘍細胞では、正常には細胞表面上に位置するレセプターである上皮成長因子レセプタータイプ２（ＨＥＲ２またはＥｒｂＢ２）が増幅されていない。標準的な免疫組織化学的技法を用いて、５パーセント未満の腫瘍細胞核しか、ＥＲおよびＰＲ発現について染色されない場合、その腫瘍細胞は、ＥＲおよびＰＲの発現について陰性であると考えられる。本明細書中で使用されるとき、腫瘍細胞は、ポリクローナル抗ＨＥＲ２一次抗体を使用する半定量的免疫組織化学的アッセイであるＨｅｒｃｅｐＴｅｓｔＴＭＫｉｔ（Ｃｏｄｅ  Ｋ５２０４，Ｄａｋｏ  Ｎｏｒｔｈ  Ａｍｅｒｉｃａ，Ｉｎｃ．，Ｃａｒｐｉｎｔｅｒｉａ，ＣＡ）を用いて試験されたときに０もしくは１＋もしくは２＋という試験結果スコアをもたらす場合、またはＨＥＲ２  ＦＩＳＨが陰性である場合、ＨＥＲ２過剰発現について陰性であると考えられる。
【００４３】
本明細書中で使用されるとき、「ｃ−ＭＡＦ遺伝子」（ＭＡＦまたはＭＧＣ７１６８５としても知られるｖ−ｍａｆ筋腱膜性線維肉腫癌遺伝子ホモログ（鳥類））は、ホモ二量体またはヘテロ二量体のように作用するロイシンジッパーを含む転写因子である。ＤＮＡ結合部位に応じて、コードされるタンパク質は、転写活性化因子または転写抑制因子であり得る。ｃ−ＭＡＦをコードするＤＮＡ配列は、アクセッション番号ＮＧ＿０１６４４０（配列番号１（ゲノム））としてＮＣＢＩデータベースに記載されている。ｃ−ＭＡＦのコード配列は、配列番号１３に示されている。本発明の方法は、コード配列またはゲノムＤＮＡ配列を利用し得る。上記ＤＮＡ配列からは２つのメッセンジャーＲＮＡが転写され、その各々が、２つのｃ−ＭＡＦタンパク質アイソフォーム、αアイソフォームおよびβアイソフォームのうちの１つを生じる。上記アイソフォームの各々に対する相補ＤＮＡ配列は、それぞれ、アクセッション番号ＮＭ＿００５３６０．４（配列番号２）およびＮＭ＿００１０３１８０４．２（配列番号３）としてＮＣＢＩデータベースに記載されている。
【００４４】
本明細書中で使用されるとき、「ｃ−ＭＡＦ阻害剤」とは、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現を完全にまたは部分的に阻害することができる（その両方が、上記遺伝子の発現産物の生成を妨げること（ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転写を妨害することおよび／またはｃ−ＭＡＦ遺伝子発現に由来するｍＲＮＡの翻訳を阻止すること）およびｃ−ＭＡＦタンパク質活性を直接阻害することによって）任意の分子のことを指す。Ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現インヒビターは、国際特許出願ＷＯ２００５／０４６７３１（その全内容が本明細書によって参照により援用される）に示されているような、ｃ−ＭＡＦがインビトロにおける細胞増殖を促進する能力をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法、ＷＯ２００８０９８３５１（その全内容が本明細書によって参照により援用される）に記載されているような、ｃ−ＭＡＦを発現する細胞においてサイクリンＤ２プロモーターもしくはｃ−ＭＡＦ応答領域（ＭＡＲＥまたはｃ−ＭＡＦ応答エレメント）を含むプロモーターの支配下のレポーター遺伝子の転写能力をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法、またはＵＳ２００９０４８１１７Ａ（その全内容が本明細書によって参照により援用される）に記載されているような、ＮＦＡＴｃ２およびｃ−ＭＡＦを発現する細胞においてＰＭＡ／イオノマイシンによる刺激に応答してＩＬ−４プロモーターの支配下のレポーター遺伝子の発現をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法を用いて同定され得る。
【００４５】
本明細書中で使用されるとき、ラパマイシンの哺乳動物における標的（ｍＴＯＲ）または「ｍＴｏｒ」とは、ＥＣ２．７．１１．１に相当するタンパク質のことを指す。ｍＴｏｒ酵素は、セリン／トレオニンタンパク質キナーゼであり、細胞増殖、細胞運動性、細胞成長、細胞生存および転写を制御する。
【００４６】
本明細書中で使用されるとき、「ｍＴｏｒインヒビター」とは、ｍＴｏｒ遺伝子の発現を完全にまたは部分的に阻害することができる（その両方が、上記遺伝子の発現産物の生成を妨げること（ｍＴｏｒ遺伝子の転写を妨害することおよび／またはｍＴｏｒ遺伝子発現に由来するｍＲＮＡの翻訳を阻止すること）およびｍＴｏｒタンパク質活性を直接阻害することによって）任意の分子のことを指す。二重またはそれより多くの標的および中でもｍＴｏｒタンパク質活性を有するインヒビターを含む。
【００４７】
本明細書中で使用されるとき、「Ｓｒｃ」とは、ＥＣ２．７．１０．２に相当するタンパク質のことを指す。Ｓｒｃは、非レセプターチロシンキナーゼおよび癌原遺伝子である。Ｓｒｃは、細胞成長および胚発生において役割を果たし得る。
【００４８】
本明細書中で使用されるとき、「Ｓｒｃインヒビター」とは、Ｓｒｃ遺伝子の発現を完全にまたは部分的に阻害することができる（その両方が、上記遺伝子の発現産物の生成を妨げること（Ｓｒｃ遺伝子の転写を妨害することおよび／またはＳｒｃ遺伝子発現に由来するｍＲＮＡの翻訳を阻止すること）およびＳｒｃタンパク質活性を直接阻害することによって）任意の分子のことを指す。
【００４９】
本明細書中で使用されるとき、「プロスタグランジン−エンドペルオキシドシンターゼ２」、「シクロオキシゲナーゼ−２」または「ＣＯＸ−２」とは、ＥＣ１．１４．９９．１に相当するタンパク質のことを指す。ＣＯＸ−２は、アラキドン酸からのプロスタグランジンエンドペルオキシドＨ２への変換に関与する。
【００５０】
本明細書中で使用されるとき、「ＣＯＸ−２インヒビター」とは、ＣＯＸ−２遺伝子の発現を完全にまたは部分的に阻害することができる（その両方が、上記遺伝子の発現産物の生成を妨げること（ＣＯＸ−２遺伝子の転写を妨害することおよび／またはＣＯＸ−２遺伝子発現に由来するｍＲＮＡの翻訳を阻止すること）およびＣＯＸ−２タンパク質活性を直接阻害することによって）任意の分子のことを指す。
【００５１】
本明細書中で使用されるとき、「転帰」または「臨床転帰」とは、結果として生じる疾患の経過および／または疾患の進行のことを指し、例えば、再発、再発までの期間、転移、転移までの期間、転移の数、転移の部位の数および／または疾患に起因する死亡によって特徴付けられ得る。例えば、良好な臨床転帰としては、治癒、再発の予防、転移の予防および／または一定の期間内の生存（再発なし）が挙げられ、不良な臨床転帰としては、疾患の進行、転移および／または一定の期間内の死亡が挙げられる。
【００５２】
本明細書中で使用されるとき、「ＥＲ＋乳がん」は、その腫瘍細胞がエストロゲンレセプター（ＥＲ）を発現する乳がんとして理解される。このおかげで上記腫瘍はエストロゲンに感受性になり、これは、エストロゲンががん性の乳房腫瘍を成長させることを意味する。対照的に、「ＥＲ−乳がん」は、その腫瘍細胞がエストロゲンレセプター（ＥＲ）を発現しない乳がんとして理解される。ＥＲ＋乳がんには、ルミナルＡおよびＢサブタイプが含まれる。
【００５３】
本明細書中で使用されるとき、本明細書中で使用される遺伝子の「発現レベル」という用語は、被験体のサンプル中の遺伝子によって生成される遺伝子産物の測定可能な量のことを指し、ここで、その遺伝子産物は、転写産物または翻訳産物であり得る。したがって、発現レベルは、核酸遺伝子産物（例えば、ｍＲＮＡまたはｃＤＮＡ）またはポリペプチド遺伝子産物に関係し得る。発現レベルは、被験体のサンプルおよび／または参照サンプル（複数可）から得られ、例えば、新規に検出され得るか、または事前の測定値に対応し得る。発現レベルは、例えば、当業者に公知であるような、マイクロアレイ法、ＰＣＲ法（例えば、ｑＰＣＲ）および／または抗体ベースの方法を用いて、決定され得るかまたは測定され得る。
【００５４】
本明細書中で使用されるとき、用語「遺伝子コピー数」とは、細胞における核酸分子のコピー数のことを指す。遺伝子コピー数は、細胞のゲノム（染色体）ＤＮＡにおける遺伝子コピー数を含む。正常な細胞（非腫瘍細胞）では、遺伝子コピー数は、通常、２コピー（染色体対の各メンバーにおいて１コピー）である。遺伝子コピー数は、時折、細胞集団のサンプルから採取された遺伝子コピー数の半数を含む。
【００５５】
「上昇した発現レベル」は、それが参照サンプルまたはコントロールサンプルにおけるｃ−ＭＡＦ遺伝子のレベルよりも高いレベルのことを指すときの発現レベルと理解される。この上昇したレベルは、ある遺伝子または１６ｑ２３もしくは１６ｑ２２−２４染色体遺伝子座の増幅または転座によって、他の機序を排除せずに引き起こされ得る。特に、患者から単離されたサンプル中の発現レベルが、参照またはコントロールと比較して、少なくとも、約１．１倍、１．５倍、５倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、６０倍、７０倍、８０倍、９０倍、１００倍またはなおもそれより高いとき、そのサンプルは、高いｃ−ＭＡＦ発現レベルを有すると考えられ得る。
【００５６】
「プローブ」は、本明細書中で使用されるとき、目的の特定の核酸配列に相補的なオリゴヌクレオチド配列のことを指す。いくつかの実施形態において、プローブは、転座を起こすと知られている染色体の領域に特異的であり得る。いくつかの実施形態において、プローブは、特異的な標識またはタグを有する。いくつかの実施形態において、タグは、フルオロフォアである。いくつかの実施形態において、プローブは、その標識が核酸およびタンパク質への白金の安定な配位結合（ｃｏｏｒｄｉｎａｔｉｖｅ  ｂｉｎｄｉｎｇ）に基づくＤＮＡインサイチュハイブリダイゼーションプローブである。いくつかの実施形態において、プローブは、米国特許出願１２／０６７５３２および米国特許出願１２／１８１，３９９（これらの全体が参照により援用される）に記載されているか、またはＳｗｅｎｎｅｎｈｕｉｓら、「Ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｒｅｐｅａｔ−ｆｒｅｅ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ  ｉｎ  ｓｉｔｕ  ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ｐｒｏｂｅｓ」Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ４０（３）：ｅ２０（２０１２）に記載されている。
【００５７】
「タグ」または「標識」は、本明細書中で使用されるとき、プローブまたはプローブの位置を可視化するか、マークするか、または別途捕捉することを可能にする、プローブと直接または間接的に会合されている任意の物理的な分子のことを指す。
【００５８】
「転座」は、本明細書中で使用されるとき、等しくない量または等しい量で染色体間で染色体材料が交換することを指す。場合によっては、転座は、同じ染色体上で起きる。場合によっては、転座は、異なる染色体間で起きる。転座は、乳がんおよび白血病を含む多くのタイプのがんにおいて高頻度で生じる。転座は、主要な相互転座またはより複雑な二次転座であり得る。多くのがんの起因事象を構成すると考えられている免疫グロブリン（ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｉｎ）重鎖（ＩｇＨ）遺伝子座が関わる主要な転座がいくつかある（Ｅｙｃｈｅｎｅ，Ａ．，Ｒｏｃｑｕｅｓ，Ｎ．，およびＰｕｏｐｏｎｎｏｔ，Ｃ．，Ａ
ｎｅｗ  ＭＡＦｉａ  ｉｎ  ｃａｎｃｅｒ．２００８．Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ：Ｃａｎｃｅｒ．８：６８３−６９３）。
【００５９】
「倍数体」または「倍数性」は、本明細書中で使用されるとき、細胞が、２より多いコピーの目的の遺伝子を含むことを示す。場合によっては、目的の遺伝子は、ＭＡＦである。いくつかの実施形態において、倍数性は、目的の遺伝子の発現の蓄積に関連する。いくつかの実施形態において、倍数性は、ゲノム不安定性に関連する。いくつかの実施形態において、ゲノム不安定性は、染色体転座に至り得る。
【００６０】
「ホールゲノムシーケンシング」は、本明細書中で使用されるとき、生物のゲノム全体が１回で配列決定されるプロセスである。例えば、Ｎｇ．，Ｐ．Ｃ．ａｍｄ  Ｋｉｒｋｎｅｓｓ，Ｅ．Ｆ．，Ｗｈｏｌｅ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ．２０１０．Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ．６２８：２１５−２２６を参照のこと。
【００６１】
「エクソームシーケンシング」は、本明細書中で使用されるとき、生物のＤＮＡのコード領域全体が配列決定されるプロセスである。エクソームシーケンシングでは、ｍＲＮＡが配列決定される。ゲノムの非翻訳領域は、エクソームシーケンシングに含められない。例えば、Ｃｈｏｉ，Ｍ．ら、Ｇｅｎｅｔｉｃ  ｄｉａｇｎｏｓｉｓ  ｂｙ  ｗｈｏｌｅ  ｅｘｏｍｅ  ｃａｐｔｕｒｅ  ａｎｄ  ｍａｓｓｉｖｅｌｙ  ｐａｒａｌｌｅｌ  ＤＮＡ
ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ．２００９．ＰＮＡＳ．１０６（４５）：１９０９６−１９１０１を参照のこと。
【００６２】
「転移」は、本明細書中で使用されるとき、最初にがんが生じた器官から異なる器官へのがんの伝播として理解されている。転移は、通常、血液またはリンパ系を通じて起きる。がん細胞が広がって、新しい腫瘍を形成するとき、後者は、二次性腫瘍または転移性腫瘍と呼ばれる。二次性腫瘍を形成しているがん細胞は、元の腫瘍のがん細胞に似ている。乳がんが、例えば、肺に広がる（転移する）場合、二次性腫瘍は、悪性の乳がん細胞から形成される。その肺における疾患は、転移性乳がんであって、肺がんではない。本発明の方法の特定の実施形態において、転移は、骨に広がった（転移した）トリプルネガティブ乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん（管腔タイプＡおよびタイプＢを含む）である。
【００６３】
「予測する」は、本明細書中で使用されるとき、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいは（ａｌｔｅｒｎａｔｉａｖｅｌｙ）ＥＲ＋乳がんに罹患している被験体が遠隔器官への転移を起こす可能性の決定のことを指す。本明細書中で使用されるとき、「予後良好」は、被験体が、一定期間内において生存するおよび／または再発もしくは遠隔転移を有しないかもしくは有するリスクが低いと予想される（例えば、予測される）ことを示す。用語「低い」は、相対的な用語であり、本願の文脈において、臨床転帰（再発、遠隔転移など）に関して「低」発現グループのリスクのことを指す。「低」リスクは、不均一ながん患者集団に対する平均リスクより低いリスクと考えられ得る。Ｐａｉｋら（２００４）の研究では、再発の全体的な「低」リスクは、１５パーセントより低いと考えられた。そのリスクはまた、期間に応じて変動し得る。その期間は、がんの最初の診断の後または予後診断が行われた後の、例えば、５年、１０年、１５年またはなおも２０年であり得る。
【００６４】
本明細書中で使用されるとき、「予後不良」は、被験体が、一定期間内において生存しないおよび／または再発もしくは遠隔転移を有するかもしくは有するリスクが高いと予想される、例えば、予測されることを示す。用語「高い」は、相対的な用語であり、本願の文脈において、臨床転帰（再発、遠隔転移など）に関して「高」発現グループのリスクのことを指す。「高」リスクは、不均一ながん患者集団に対する平均リスクより高いリスクと考えられ得る。Ｐａｉｋら（２００４）の研究では、再発の全体的な「高」リスクは、１５パーセントより高いと考えられた。そのリスクはまた、期間に応じて変動し得る。その期間は、がんの最初の診断のまたは予後診断が行われた後の、例えば、５年、１０年、１５年またはなおも２０年であり得る。
【００６５】
「参照値」は、本明細書中で使用されるとき、患者または患者から回収されたサンプルの臨床検査によって得られた値／データに対する参照として使用される検査値のことを指す。参照値または参照レベルは、絶対値；相対値；上限および／もしくは下限を有する値；一連の値；平均値（ａｖｅｒａｇｅ  ｖａｌｕｅ）；中央値、平均値（ｍｅａｎ  ｖａｌｕｅ）、または特定のコントロール値もしくはベースライン値と比較される値であり得る。参照値は、個別のサンプル値、例えば、試験されている被験体から得られた値などであるが、より早い時点における値に基づき得る。参照値は、多数のサンプル（例えば、暦年齢が一致する群の被験体の集団由来）に基づいてもよいし、試験されるべきサンプルを含むまたは除外したサンプルのプールに基づいてもよい。
【００６６】
本明細書中で使用されるとき、「被験体」または「患者」とは、哺乳動物として分類されるすべての動物のことを指し、それらとしては、家畜（ｄｏｍｅｓｔｉｃ  ａｎｉｍａｌ）および家畜（ｆａｒｍ  ａｎｉｍａｌ）、霊長類およびヒト、例えば、人間、非ヒト霊長類、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコまたはげっ歯類が挙げられるが、これらに限定されない。好ましくは、被験体は、任意の年齢または人種のヒトの男性または女性である。
【００６７】
用語「処置」は、本明細書中で使用されるとき、本明細書中に記載されるような臨床状態を終結させるか、予防するか、回復させるか、またはその臨床状態への罹患性を低下させることを目指す任意のタイプの治療のことを指す。好ましい実施形態において、処置という用語は、本明細書中で定義されるような障害または状態の予防的処置（すなわち、臨床状態への罹患性を低下させる治療）に関する。したがって、「処置」、「処置する」およびそれらの等価な用語は、ヒトを含む哺乳動物において、病理学的な状態または障害の任意の処置を包含する、所望の薬理学的効果または生理学的効果を得ることを指す。その効果は、障害もしくはその徴候を完全にもしくは部分的に予防することに関して予防的であり得、かつ／または障害および／もしくはその障害に起因し得る有害作用に対する部分的もしくは完全な治癒に関して治療的であり得る。すなわち、「処置」は、（１）被験体において障害が生じることもしくは再発することを予防すること、（２）障害を阻害すること、例えば、その進行を停止すること、（３）例えば、失った機能、不足している機能もしくは不完全な機能を再建するかもしくは修復するか、または非効率なプロセスを刺激することによって、宿主が障害もしくはその徴候にもはや罹患していないように、障害もしくはそれに関連する少なくとも徴候を停止することもしくは終結させること（例えば、障害またはその徴候の後退を引き起こすこと）、または（４）障害もしくはそれに関連する徴候を軽減すること、緩和すること、もしくは回復させること（ここで、回復させることとは、少なくとも、パラメータ（例えば、炎症、疼痛または免疫不全）の大きさの減少のことを指すために広い意味において使用される）を含む。
【００６８】
本明細書中で使用されるとき、「サンプル」または「生物学的サンプル」は、被験体から単離された生物学的材料を意味する。生物学的サンプルは、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルの決定に適した任意の生物学的材料を含み得る。サンプルは、任意の好適な生物学的組織または体液（例えば、腫瘍組織、血液、血漿、血清、尿または脳脊髄液（ＣＳＦ）など）から単離され得る。
【００６９】
「腫瘍組織サンプル」は、原発性トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がん腫瘍またはあるいはＥＲ＋乳がん腫瘍を起源とする組織サンプルと理解される。上記サンプルは、従来の方法、例えば、関連する医学的技法の当業者に周知の方法を用いる生検によって、得ることができる。
【００７０】
「溶骨性骨転移」とは、骨吸収（骨密度の進行性消失）が、腫瘍細胞による破骨細胞活性の刺激に起因する転移の近くにおいて生じる転移のタイプのことを指し、重篤な疼痛、病理学的骨折、高カルシウム血症、脊髄圧迫、および神経圧迫に起因する他の症候群を特徴とする。
【００７１】
ｃ−ＭＡＦの発現レベルに基づいてトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋乳がんの骨転移を予測するための方法
驚いたことに、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんのサンプル中およびＥＲ＋乳がんのサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルが、骨転移に罹患するリスクと相関することが見出された。さらに、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）原発腫瘍およびＥＲ＋原発腫瘍におけるｃ−ＭＡＦの遺伝子発現は、骨転移の再発と有意に相関し、無骨転移生存率および生存率と逆相関した。さらに、ｃ−ＭＡＦ発現レベルが、用量依存的様式で骨転移を予測することが見出された。
【００７２】
第１の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第１の方法）に関し、その方法は：
ｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを決定する工程、および
ｉｉ）工程ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、骨転移を起こす上昇したリスクを示す。
【００７３】
本発明の方法は、第１の工程に、被験体由来のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを決定する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【００７４】
生検サンプルを得るための方法は、腫瘍を大きな片に分割する工程、または顕微解剖、または当該分野で公知の他の細胞分離方法を含む。腫瘍細胞は、さらに、小ゲージ針を用いた吸引による細胞診によって得ることができる。サンプルの保存および取扱いを単純にするために、サンプルは、ホルマリン中で固定されて、パラフィンに浸され得るか、またはまず凍結されて、次いで、急速凍結を可能にする極低温媒体（ｈｉｇｈｌｙ  ｃｒｙｏｇｅｎｉｃ  ｍｅｄｉｕｍ）への浸漬によってＯＣＴ化合物などの組織凍結媒体に浸され得る。
【００７５】
好ましい実施形態において、本発明の第１の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルだけを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
【００７６】
当業者が理解するように、遺伝子発現レベルは、上記遺伝子の、または上記遺伝子によってコードされるタンパク質のメッセンジャーＲＮＡレベルならびに上記遺伝子を含むゲノム領域のコピー数または転座数を測定することによって、定量され得る。
【００７７】
この目的のために、生物学的サンプルは、組織または細胞の構造を物理的にまたは機械的に壊すように処理されて、細胞内の構成要素が核酸を調製するための水溶液中または有機溶液中に放出され得る。核酸は、当業者に公知の商業的に利用可能な方法によって抽出される（Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら、「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ」，第３版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎ．Ｙ．，１−３巻）。
【００７８】
したがって、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、上記遺伝子の転写に起因するＲＮＡ（メッセンジャーＲＮＡまたはｍＲＮＡ）またはあるいは上記遺伝子の相補ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）から定量され得る。ゆえに、本発明の特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの定量は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子のメッセンジャーＲＮＡもしくは上記ｍＲＮＡのフラグメント、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の相補ＤＮＡもしくは上記ｃＤＮＡのフラグメントまたはそれらの混合物の定量を含む。
【００７９】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子によってコードされるｍＲＮＡレベルまたはその対応するｃＤＮＡのｍＲＮＡレベルを検出するためおよび定量するために、実質的に任意の従来の方法を本発明の範囲内で使用することができる。非限定的な例証として、上記遺伝子によってコードされるｍＲＮＡレベルは、従来の方法、例えば、ｍＲＮＡ増幅および上記ｍＲＮＡ増幅産物の定量を含む方法（例えば、電気泳動および染色、またはあるいはサザンブロットおよび好適なプローブの使用、ノーザンブロットおよび目的の遺伝子（ｃ−ＭＡＦ）のｍＲＮＡの、またはその対応するｃＤＮＡの特異的プローブの使用、Ｓ１ヌクレアーゼを用いたマッピング、ＲＴ−ＰＣＲ、ハイブリダイゼーション、マイクロアレイなど）を用いて、好ましくは、好適なマーカーを使用するリアルタイム定量的ＰＣＲによって、定量され得る。同様に、ｃ−ＭＡＦ遺伝子によってコードされる上記ｍＲＮＡに対応するｃＤＮＡレベルもまた、従来の技法を用いることによって定量され得る；この場合、本発明の方法は、対応するｍＲＮＡの逆転写（ＲＴ）によって、対応するｃＤＮＡを合成し、それに続く増幅および上記ｃＤＮＡ増幅産物の定量のための工程を含む。発現レベルを定量するための従来の方法は、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、２００１（上掲）に見出すことができる。これらの方法は、当該分野で公知であり、当業者は、各技法に必要な正規化に精通している。例えば、多重ＰＣＲを使用して生成された発現の測定値は、測定された遺伝子の発現をいわゆる「ハウスキーピング」遺伝子（その発現は、すべてのサンプルにわたって一定であるはずであるので、比較するためのベースライン発現を提供する）またはその発現ががんによって調節されると知られている他のコントロール遺伝子と比較することによって正規化されるべきである。
【００８０】
特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、定量的ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）またはＤＮＡ／ＲＮＡアレイまたはヌクレオチドハイブリダイゼーション法によって定量される。
【００８１】
さらに、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、上記遺伝子によってコードされるタンパク質、すなわち、ｃ−ＭＡＦタンパク質（ｃ−ＭＡＦ）［ＮＣＢＩ，アクセッション番号Ｏ７５４４４］またはｃ−ＭＡＦタンパク質の任意の機能的に等価なバリアントの発現レベルを定量することによっても定量され得る。２つのｃ−ＭＡＦタンパク質アイソフォーム、４０３アミノ酸で構成されているαアイソフォーム（ＮＣＢＩ，ＮＰ＿００５３５１．２）（配列番号４）および３７３アミノ酸で構成されているβアイソフォーム（ＮＣＢＩ，ＮＰ＿００１０２６９７４．１）（配列番号５）が存在する。ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、いずれかのｃ−ＭＡＦタンパク質アイソフォームの発現レベルを定量することによって定量され得る。したがって、特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子によってコードされるタンパク質のレベルの定量は、ｃ−ＭＡＦタンパク質の定量を含む。
【００８２】
本発明の文脈において、「ｃ−ＭＡＦタンパク質の機能的に等価なバリアント」は、（ｉ）アミノ酸残基の１つまたは複数が、保存されたまたは保存されていないアミノ酸残基（好ましくは、保存されたアミノ酸残基）によって置換された、ｃ−ＭＡＦタンパク質（配列番号４または配列番号５）のバリアント（ここで、そのような置換されたアミノ酸残基は、遺伝暗号によってコードされるアミノ酸残基であってもよいし、そうでなくてもよい）または（ｉｉ）１つまたは複数のアミノ酸の挿入または欠失を含みかつｃ−ＭＡＦタンパク質と同じ機能を有する、すなわち、ＤＮＡ結合転写因子として作用するバリアントと理解される。ｃ−ＭＡＦタンパク質のバリアントは、国際特許出願ＷＯ２００５／０４６７３１（その全体が参照により本明細書中に援用される）に示されているような、ｃ−ＭＡＦがインビトロにおける細胞増殖を促進する能力に基づく方法、ＷＯ２００８０９８３５１（その全体が参照により本明細書中に援用される）に記載されているような、ｃ−ＭＡＦを発現する細胞においてサイクリンＤ２プロモーターまたはｃ−ＭＡＦ応答領域（ＭＡＲＥまたはｃ−ＭＡＦ応答エレメント）を含むプロモーターの支配下のレポーター遺伝子の転写能力をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法、またはＵＳ２００９０４８１１７Ａ（その全体が参照により本明細書中に援用される）に記載されているような、ＮＦＡＴｃ２およびｃ−ＭＡＦを発現する細胞においてＰＭＡ／イオノマイシンによる刺激に応答してＩＬ−４プロモーターの支配下のレポーター遺伝子の発現をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法を用いて同定され得る。
【００８３】
本発明に係るバリアントは、好ましくは、いずれかのｃ−ＭＡＦタンパク質アイソフォーム（配列番号４または配列番号５）のアミノ酸配列と少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％または少なくとも約９９％の配列類似性を有する。バリアントと先に定義された特定のｃ−ＭＡＦタンパク質配列との間の類似性の程度は、当業者に広く公知のアルゴリズムおよびコンピュータプロセスを用いて決定される。２つのアミノ酸配列間の類似度は、好ましくは、ＢＬＡＳＴＰアルゴリズム［ＢＬＡＳＴ  Ｍａｎｕａｌ，Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ．ら、ＮＣＢＩ
ＮＬＭ  ＮＩＨ  Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．２０８９４，Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ．ら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０（１９９０）］を用いて決定される。
【００８４】
ｃ−ＭＡＦタンパク質発現レベルは、被験体由来のサンプル中の上記タンパク質の検出および定量を可能にする任意の従来の方法によって定量され得る。非限定的な例証として、上記タンパク質レベルは、例えば、ｃ−ＭＡＦ結合能を有する抗体（または抗原決定基を含むそのフラグメント）を使用し、続いて、形成された複合体を定量することによって、定量され得る。これらのアッセイにおいて使用される抗体は、標識されていてもよいし、されていなくてもよい。使用され得るマーカーの例証的な例としては、放射性同位体、酵素、フルオロフォア、化学発光試薬、酵素基質または補因子、酵素インヒビター、粒子、色素などが挙げられる。標識されていない抗体（一次抗体）および標識された抗体（二次抗体）を使用する本発明において使用され得る幅広い公知のアッセイがある；これらの技法としては、ウエスタンブロットまたはウエスタントランスファー、ＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着測定法）、ＲＩＡ（ラジオイムノアッセイ）、競合ＥＩＡ（競合酵素免疫測定法）、ＤＡＳ−ＥＬＩＳＡ（二重抗体サンドイッチＥＬＩＳＡ）、免疫細胞化学的および免疫組織化学的技法、特異的抗体を含むタンパク質マイクロアレイもしくはバイオチップの使用に基づく技法、またはディップスティックなどの形式でのコロイド沈殿に基づくアッセイが挙げられる。上記ｃ−ＭＡＦタンパク質を検出するためおよび定量するための他の方法としては、アフィニティークロマトグラフィー法、リガンド結合アッセイなどが挙げられる。免疫学的方法が使用されるとき、ｃ−ＭＡＦタンパク質に高親和性で結合すると知られている任意の抗体または試薬が、その量を検出するために使用され得る。それにもかかわらず、抗体、例えば、ポリクローナル血清、ハイブリドーマの上清またはモノクローナル抗体、抗体フラグメント、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’およびＦ（ａｂ’）２、ｓｃＦｖ、ヒト化ダイアボディ、トリアボディ（ｔｒｉａｂｏｄｙ）、テトラボディ（ｔｅｔｒａｂｏｄｙ）、ナノボディ、アルファボディ、ステープルド（ｓｔａｐｌｅｄ）ペプチド、シクロペプチドおよび抗体の使用が、好ましい。本発明の状況において使用され得る市販の抗ｃ−ＭＡＦタンパク質抗体は、販売されている（例えば、抗体ａｂ４２７、ａｂ５５５０２、ａｂ５５５０２、ａｂ７２５８４、ａｂ７６８１７、ａｂ７７０７１（Ａｂｃａｍ  ｐｌｃ，３３０  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｐａｒｋ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ  ＣＢ４  ０ＦＬ，Ｕｎｉｔｅｄ  Ｋｉｎｇｄｏｍ）、ＡｂＤ  ＳｅｒｏｔｅｃのＯ７５４４４モノクローナル抗体（マウス抗ヒトＭＡＦアジド不含モノクローナル抗体、非結合体化、クローン６ｂ８（Ｍｏｕｓｅ  Ａｎｔｉ−Ｈｕｍａｎ  ＭＡＦ  Ａｚｉｄｅ  ｆｒｅｅ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  ａｎｔｉｂｏｄｙ，Ｕｎｃｏｎｊｕｇａｔｅｄ，Ｃｌｏｎｅ  ６ｂ８））など）。抗ｃ−ＭＡＦ抗体を提供している多くの営利会社がある（例えば、Ａｂｎｏｖａ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、Ｂｅｔｈｙｌ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、Ｓａｎｔａ
Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｂｉｏｗｏｒｌｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、ＧｅｎｅＴｅｘなど）。
【００８５】
特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦタンパク質レベルは、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡまたはタンパク質アレイによって定量される。
【００８６】
別の特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦタンパク質レベルは、エキソソームまたは循環（ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ）ＤＮＡから定量される。エキソソームは、インビボおよびインビトロにおいてほとんどの細胞型によって分泌される４０〜１００ｎｍの膜ベシクルである。エキソソームは、コンパートメントの内腔に内向きに出芽することによって、多胞体（ＭＶＢ）と呼ばれるエンドソームの特定の集団として形成する。ＭＶＢと原形質膜とが融合すると、これらの内部ベシクルが分泌される。エキソソームは、当該分野で周知のいくつかの方法によって多種多様な細胞系または体液から単離され得る（Ｔｈｅｒｙ  Ｃ．ら、Ｃｕｒｒ  Ｐｒｏｔｏｃ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．２００６  Ａｐｒ；Ｃｈａｐｔｅｒ  ３：Ｕｎｉｔ  ３．２２）（その全内容が、本明細書中に参照により援用される）。ＥｘｏＱｕｉｃｋＴＭまたはＥｘｏＴｅｓｔＴＭなどのいくつかの市販キットが、エキソソームを単離するために利用可能である。
【００８７】
本発明の第１の方法は、第２の工程に、被験体由来のサンプル（例えば、腫瘍サンプル）において得られたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを参照値と比較する工程を含む。
【００８８】
いったん、乳がん、例えば、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体由来のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、測定されて、参照値と比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は、骨転移を起こす傾向がより高いと結論づけられ得る。
【００８９】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの決定は、参照値と相関するはずである。
【００９０】
ある実施形態において、本明細書中で意図されるような参照値（複数可）は、ｃ−ＭＡＦの絶対量を伝達し得る。別の実施形態において、試験されている被験体由来のサンプル中のいずれか１つまたは複数のバイオマーカーの量は、参照値と直接比べて決定され得る（例えば、増加もしくは減少または増加率もしくは減少率に関して）。有益なことに、これにより、いずれの１つまたは複数のバイオマーカーのそれぞれの絶対量を最初に決定する必要なく、被験体由来のサンプル中の該１つまたは複数のバイオマーカーの量を参照値と比較すること（換言すれば、参照値に対する被験体由来のサンプル中のいずれか１つまたは複数のバイオマーカーの相対量を測定すること）が可能になり得る。
【００９１】
好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサンプルまたは参照サンプルにおけるｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルである。解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルまたは参照サンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、予後が評価されるべき事象において、参照サンプルは、転移していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体由来のサンプル、または転移していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体由来の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
【００９２】
上記参照サンプルは、代表的には、被験体集団由来の等量のサンプルを合わせることによって得られる。一般に、代表的な参照サンプルは、臨床的に十分に考証されている被験体および転移が無いことが十分に特徴付けられている被験体から得られる。そのようなサンプルでは、バイオマーカー（ｃ−ＭＡＦ遺伝子）の正常濃度（参照濃度）が、例えば、参照集団の平均濃度を提供することによって決定され得る。マーカーの参照濃度を決定する場合に、様々な考慮がなされる。そのような考慮すべき事柄は、患者の年齢、体重、性別、全般的な身体的状態などである。例えば、好ましくは、上記の考慮すべき事柄に従って、例えば、様々な年齢カテゴリーに従って分類された、等量の少なくとも約２人、少なくとも約１０人、少なくとも約１００人から好ましくは、約１０００人を超える被験体の群が、参照群としてみなされる。参照レベルが由来するサンプル集合は、好ましくは、その研究の患者対象と同じタイプのがんに罹患している被験体によって形成される。
【００９３】
特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ発現の「上昇した」または「低下した」発現に対する参照値は、有している疾患が上で述べられた方法のいずれかによって十分に考証された被験体から単離された１つまたはいくつかのサンプルにおいてアッセイを行うことを含む従来の手段によってｃ−ＭＡＦ発現レベルのパーセンタイルを計算することによって決定される。次いで、ｃ−ＭＡＦの「低下した」レベルは、好ましくは、ｃ−ＭＡＦ発現レベルが正常集団における５０パーセンタイル以下である（例えば、正常集団における６０パーセンタイル以下、正常集団における７０パーセンタイル以下、正常集団における８０パーセンタイル以下、正常集団における９０パーセンタイル以下および正常集団における９５パーセンタイル以下である発現レベルを含む）サンプルに対して割り当てられ得る。次いで、「上昇した」ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、好ましくは、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが正常集団における５０パーセンタイル以上である（例えば、正常集団における６０パーセンタイル以上、正常集団における７０パーセンタイル以上、正常集団における８０パーセンタイル以上、正常集団における９０パーセンタイル以上および正常集団における９５パーセンタイル以上である発現レベルを含む）サンプルに対して割り当てられ得る。
【００９４】
当業者は、原発性乳房腫瘍が転移する傾向の予測が、同定されるすべての被験体（すなわち、被験体の１００％）に対して正しくある必要はないことを理解する。それにもかかわらず、その用語は、被験体の統計学的に有意な一部（例えば、コホート研究におけるコホート）の同定を可能にすることを必要とする。ある一部が統計学的に有意であるかどうかは、当業者によって、様々な周知の統計評価ツール、例えば、信頼区間の決定、ｐ値の決定、スチューデントｔ検定、マン・ホイットニー検定などを使用する単純な様式で決定され得る。詳細は、ＤｏｗｄｙおよびＷｅａｒｄｅｎ，Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ  ｆｏｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  １９８３に提供されている。好ましい信頼区間は、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％または少なくとも９９％である。ｐ値は、好ましくは、０．１、０．０５、０．０１、０．００５または０．０００１である。より好ましくは、集団の被験体の少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％または少なくとも９０％が、本発明の方法によって適切に同定され得る。
【００９５】
なおも別の実施形態において、骨への転移は、溶骨性骨転移である。
【００９６】
なおも別の実施形態において、平均より高いｃ−ＭＡＦの発現レベルは、骨転移の上昇したリスクを示し、上記リスクは、ｃ−ＭＡＦ発現のレベルに比例する。したがって、乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクは、用量依存的である。
【００９７】
ｃ−ＭＡＦの発現レベルに基づいて、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんからの骨転移に罹患している患者の臨床転帰を予測するための方法
別の態様において、本発明は、骨転移性トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいは骨転移性ＥＲ＋骨がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第２の方法）に関し、その方法は：
ｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）工程ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、不良な臨床転帰を示す。
【００９８】
本発明の第２の方法は、第１の工程に、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【００９９】
好ましい実施形態において、本発明の第２の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルだけを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
【０１００】
第２の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルである。ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの決定は、コントロールサンプルまたは参照サンプルの値と相関するはずである。解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、本発明の第２の方法を含む場合において、参照サンプルは、骨転移に罹患していない乳がんを有する被験体のサンプルまたは転移に罹患していない乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
【０１０１】
いったん、サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、測定されて、コントロールサンプルと比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、コントロールサンプル中の発現レベルと比較して上昇している場合、それは、不良な臨床転帰を示す。
【０１０２】
具体的な実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０１０３】
別の具体的な実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの定量は、上記遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）または上記ｍＲＮＡのフラグメント、上記遺伝子の相補ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）または上記ｃＤＮＡのフラグメントを定量する工程を含む。より好ましい実施形態において、発現レベルは、定量的ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）またはＤＮＡアレイもしくはＲＮＡアレイにより定量される。
【０１０４】
別の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの定量は、上記遺伝子によってコードされるタンパク質またはそのバリアントのレベルを定量する工程を含む。なおもより好ましい実施形態において、タンパク質レベルは、ウエスタンブロット、免疫組織化学検査、ＥＬＩＳＡまたはタンパク質アレイにより決定される。
【０１０５】
別の実施形態において、参照サンプルは、転移に罹患していない被験体由来のトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんの腫瘍組織サンプルである。
【０１０６】
患者の臨床転帰の決定のために広く認められている任意のパラメータが、本発明において使用され得、それらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・本明細書中で使用されるとき、研究中の期間に疾患を再発しなかった完全寛解の被験体の比率のことを記載する、無病進行。
・本明細書とともに使用されるとき、被験体が疾患の兆候なしに生存している、その疾患に対する処置後の時間の長さと理解される、無病生存率（ＤＦＳ）。
・本発明において使用されるとき、完全奏効または部分奏効がみとめられる処置された被験体の比率のことを記載する、客観的奏効。
・本発明において使用されるとき、６ヶ月以上、完全奏効、部分奏効、低奏功（ｍｉｎｏｒ  ｒｅｓｐｏｎｓｅ）または安定病態がみとめられる、処置された被験体の比率に関する、腫瘍制御（ｔｕｍｏｕｒ  ｃｏｎｔｒｏｌ）。
・本明細書中で使用されるとき、処置開始からがんの成長が最初に決定されるまでの時間と定義される、無進行生存期間。
・本明細書中で使用されるとき、疾患が処置された後、疾患が悪化し始めるまでの時間に関する、進行までの期間（ＴＴＰ）。用語「進行」は、先に定義されている。
・本明細書中で使用されるとき、治療の開始後、最初の６ヶ月で進行しない被験体のパーセンテージに関する、６ヶ月無進行生存率または「ＰＦＳ６」率、および
・本明細書中で使用されるとき、研究に登録された被験体の半数が未だ生存している時間に関する、生存期間中央値。
【０１０７】
用語「不良」または「良好」は、本明細書中で使用されるとき、被験体が好ましいまたは好ましくない転帰を示すことを意味する臨床転帰のことを指す。当業者によって理解されるように、そのような確率の評価は、診断される被験体の１００％に対して正しいことが好ましいが、正しくない場合もある。しかしながら、この用語は、被験体の統計学的に有意な一部が、所与の転帰についての素因を有すると同定され得ることを要求する。ある一部が統計学的に有意であるかどうかは、当業者によって、様々な周知の統計評価ツール、例えば、信頼区間の決定、ｐ値の決定、スチューデントｔ検定、マン・ホイットニー検定などを使用して容易に決定され得る。詳細には、ＤｏｗｄｙおよびＷｅａｒｄｅｎ，Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ  ｆｏｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  １９８３に見出される。好ましい信頼区間は、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％である。ｐ値は、好ましくは、０．０５、０．０１、０．００５もしくは０．０００１またはそれ未満である。より好ましくは、集団の被験体の少なくとも約６０パーセント、少なくとも約７０パーセント、少なくとも約８０パーセントまたは少なくとも約９０パーセントが、本発明の方法によって適切に同定され得る。
【０１０８】
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳房腫瘍もしくはあるいはＥＲ＋乳房腫瘍、またはＳｒｃ応答性シグネチャ（ＳｒｃＲｅｓｐｏｎｓｉｖｅＳｉｇｎａｔｕｒｅ）＋もしくはＨＥＲ２＋乳房腫瘍を有する患者において個別化治療をデザインするための方法
当該分野において公知であるように、がんに罹患している被験体に施されるべき処置は、後者が悪性腫瘍であるかどうか、すなわち、それが転移を起こす高い確率を有するかどうか、または後者が良性の腫瘍であるかどうかに左右される。第１の仮定では、一般に好まれる処置は、化学療法などの全身性処置であり、第２の仮定では、一般に好まれる処置は、放射線治療などの局所性処置である。
【０１０９】
ゆえに、本発明に記載されるように、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がん細胞またはあるいはＥＲ＋乳がん細胞におけるｃ−ＭＡＦ遺伝子の過剰発現が、骨転移の存在に関係することを考えれば、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルは、上記癌に罹患している被験体に最も適した治療に関して決定するために有用である。
【０１１０】
したがって、別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第３の方法）に関し、その方法は、
ｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、その発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は、骨転移の予防および／または処置を目指す治療を受けるのに適格である。その発現レベルが、上記参照値と比較して上昇していない場合、上記被験体は、骨転移の予防および／または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない。
【０１１１】
特定の実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０１１２】
本発明の第３の方法は、第１の工程に、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【０１１３】
別の特定の実施形態において、本発明の第３の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルだけを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
【０１１４】
本発明の第３の方法の場合、サンプルは、被験体の原発腫瘍組織サンプルであり得る。
【０１１５】
第２の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサンプル中の上記遺伝子のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルである。ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの決定は、コントロールサンプルまたは参照サンプルの値と関係づけられるはずである。解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、好ましくは、参照サンプルは、転移していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体のサンプル、または転移していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
【０１１６】
いったん、サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、測定されて、参照値と比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は、転移の予防（被験体がまだ転移を起こしていない場合）および／または処置（被験体がすでに転移を受けている場合）を目指す治療を受けるのに適格であると結論づけられ得る。
【０１１７】
がんが転移していたとき、化学療法、ホルモン処置、免疫療法またはそれらの組み合わせを含むがこれらに限定されない全身性処置が使用され得る。さらに、放射線治療および／または手術が使用され得る。処置の選択は、通常、原発がんのタイプ、サイズ、転移の位置、患者の年齢、全般的な健康状態、および以前に使用された処置のタイプに左右される。
【０１１８】
全身性処置は、全身に到達する処置であり、例えば：
・化学療法は、がん細胞を破壊する医薬の使用である。それらの医薬は、通常、経口または静脈内の経路によって投与される。時折、化学療法は、放射線処置とともに使用される。乳がんに対する好適な化学療法処置としては、アントラサイクリン（ドキソルビシン、エピルビシン、ペグ化リポソームドキソルビシン）、タキサン（パクリタキセル、ドセタキセル、アルブミンナノ粒子結合型パクリタキセル）、５−フルオロウラシル（５−ＦＵ持続注入、カペシタビン）、ビンカアルカロイド（ビノレルビン、ビンブラスチン）、ゲムシタビン、白金塩（シスプラチン、カルボプラチン）、シクロホスファミド、エトポシド、および上記の１つまたは複数の組み合わせ、例えば、シクロホスファミド／アントラサイクリン  ＋／−  ５−フルオロウラシルレジメン（例えば、ドキソルビシン／シクロホスファミド（ＡＣ）、エピルビシン／シクロホスファミド、（ＥＣ）シクロホスファミド／エピルビシン／５−フルオロウラシル（ＣＥＦ）、シクロホスファミド／ドキソルビシン／５−フルオロウラシル（ＣＡＦ）、５−フルオロウラシル／エピルビシン／シクロホスファミド（ＦＥＣ））、シクロホスファミド／メトトレキサート（ｍｅｔｏｔｈｒｅｘａｔｅ）／５−フルオロウラシル（ＣＭＦ）、アントラサイクリン／タキサン（例えば、ドキソルビシン／パクリタキセルまたはドキソルビシン／ドセタキセル）、ドセタキセル／カペシタビン、ゲムシタビン／パクリタキセル、タキサン／白金レジメン（例えば、パクリタキセル／カルボプラチンまたはドセタキセル／カルボプラチン）が挙げられるがこれらに限定されない。
・免疫療法は、がんと戦う患者の免疫系自体を助ける処置である。患者における転移を処置するために使用される免疫療法にはいくつかのタイプがある。これらとしては、サイトカイン、モノクローナル抗体および抗腫瘍ワクチンが挙げられるがこれらに限定されない。
【０１１９】
別の態様において、処置は、アルファラディン（ラジウム−２２３二塩化物）である。アルファラディンは、がん細胞を殺すために、ラジウム−２２３の崩壊からのアルファ線を使用する。ラジウム−２２３は、天然に、カルシウム模倣物としてのその特性のおかげで骨転移に対して自身を標的化する。アルファ線は、２〜１０個の細胞という非常に短い範囲（ベータまたはガンマ線に基づく現行の放射線治療と比べて）を有するので、周囲の健常な組織（特に骨髄）にもたらす損傷はより少ない。カルシウムとよく似た特性を有するので、ラジウム−２２３は、身体内の骨を構築するためにカルシウムが使用されている位置（去勢抵抗性の進行前立腺がんを有する男性の骨格転移に見られるようなより速い異常な骨成長の部位を含む）に引き込まれる。ラジウム−２２３は、注射後、異常に骨が成長している部位に血流によって運ばれる。がんが身体内で生じ始めた位置は、原発腫瘍として公知である。これらの細胞のうちのいくつかは、離脱して、血流によって身体の別の部位に運ばれ得る。次いで、それらのがん細胞は、身体のその位置に定着して、新しい腫瘍を形成し得る。これが起きる場合、それは、二次がんまたは転移と呼ばれる。末期の前立腺がんを有するほとんどの患者は、骨にその疾患の最大の負担を被る。ラジウム−２２３を用いる目的は、この二次がんを選択的に標的化することである。骨に取り込まれない任意のラジウム−２２３は、すみやかに腸へと経路を定められ、排泄される。
【０１２０】
別の態様において、処置は、ｍＴｏｒインヒビターである。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、ｍＴｏｒ／ＰＩ３キナーゼの二重インヒビターである。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは：ＡＢＩ００９（シロリムス）、ラパマイシン（シロリムス）、Ａｂｒａｘａｎｅ（パクリタキセル）、Ａｂｓｏｒｂ（エベロリムス）、Ａｆｉｎｉｔｏｒ（エベロリムス）、Ｇｌｅｅｖｅｃと併用のＡｆｉｎｉｔｏｒ、ＡＳ７０３０２６（ピマセルチブ（ｐｉｍａｓｅｒｔｉｂ））、Ａｘｘｅｓｓ（ウミロリムス（ｕｍｉｒｏｌｉｍｕｓ））、ＡＺＤ２０１４、ＢＥＺ２３５、Ｂｉｏｆｒｅｅｄｏｍ（ウミロリムス）、ＢｉｏＭａｔｒｉｘ（ウミロリムス）、ＢｉｏＭａｔｒｉｘ  ｆｌｅｘ（ウミロリムス）、ＣＣ１１５、ＣＣ２２３、Ｃｏｍｂｏ  Ｂｉｏ−ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ  Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  Ｅｌｕｔｉｎｇ  Ｓｔｅｎｔ  ＯＲＢＵＳＮＥＩＣＨ（シロリムス）、Ｃｕｒａｘｉｎ  ＣＢＬＣ１０２（メパクリン）、ＤＥ１０９（シロリムス）、ＤＳ３０７８、Ｅｎｄｅａｖｏｒ  ＤＥＳ（ゾタロリムス）、Ｅｎｄｅａｖｏｒ  Ｒｅｓｏｌｕｔｅ（ゾタロリムス）、Ｆｅｍａｒａ（レトロゾール）、Ｈｏｃｅｎａ（アントロキノノール（ａｎｔｒｏｑｕｉｎｏｎｏｌ））、ＩＮＫ１２８、Ｉｎｓｐｉｒｏｎ（シロリムス）、ＩＰＩ５０４（レタスピマイシン（ｒｅｔａｓｐｉｍｙｃｉｎ）塩酸塩）、ＫＲＮ９５１（チボザニブ（ｔｉｖｏｚａｎｉｂ））、ＭＥ３４４、ＭＧＡ０３１（テプリズマブ（ｔｅｐｌｉｚｕｍａｂ））、ＭｉＳｔｅｎｔ  ＳＥＳ（シロリムス）、ＭＫＣ１、Ｎｏｂｏｒｉ（ウミロリムス）、ＯＳＩ０２７、ＯＶＩ１２３（コルジセピン）、Ｐａｌｏｍｉｄ  ５２９、ＰＦ０４６９１５０２、Ｐｒｏｍｕｓ  Ｅｌｅｍｅｎｔ（エベロリムス）、ＰＷＴ３３５９７、Ｒａｐａｍｕｎｅ（シロリムス）、Ｒｅｓｏｌｕｔｅ  ＤＥＳ（ゾタロリムス）、ＲＧ７４２２、ＳＡＲ２４５４０９、ＳＦ１１２６、ＳＧＮ７５（ボルセツズマブマホドチン（ｖｏｒｓｅｔｕｚｕｍａｂ  ｍａｆｏｄｏｔｉｎ））、Ｓｙｎｅｒｇｙ（エベロリムス）、Ｔａｌｔｏｒｖｉｃ（リダフォロリムス（ｒｉｄａｆｏｒｏｌｉｍｕｓ））、Ｔａｒｃｅｖａ（エルロチニブ）、Ｔｏｒｉｓｅｌ（テムシロリムス）、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｐｒｉｍｅ（エベロリムス）、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｖ（エベロリムス）、Ｚｏｍａｘｘ（ゾタロリムス）、Ｚｏｒｔｒｅｓｓ（エベロリムス）、ゾタロリムス溶出性末梢ステント（Ｐｅｒｉｐｈｅｒａｌ  Ｓｔｅｎｔ）ＭＥＤＴＲＯＮＩＣ（ゾタロリムス）、ＡＰ２３８４１、ＡＰ２４１７０、ＡＲｍＴＯＲ２６、ＢＮ１０７、ＢＮ１０８、Ｃａｎｓｔａｔｉｎ  ＧＥＮＺＹＭＥ（カンスタチン（ｃａｎｓｔａｔｉｎ））、ＣＵ９０６、ＥＣ０３７１、ＥＣ０５６５、ＫＩ１００４、ＬＯＲ２２０、ＮＶ１２８、Ｒａｐａｍｙｃｉｎ  ＯＮＣＯＩＭＭＵＮＥ（シロリムス）、ＳＢ２６０２、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＰＮＰ  ＳＡＭＹＡＮＧ  ＢＩＯＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ（シロリムス）、ＴＯＰ２１６、ＶＬＩ２７、ＶＳ５５８４、ＷＹＥ１２５１３２、ＸＬ３８８、Ａｄｖａｃａｎ���エベロリムス）、ＡＺＤ８０５５、Ｃｙｐｈｅｒ  Ｓｅｌｅｃｔ  Ｐｌｕｓ  シロリムス溶出性冠動脈ステント（シロリムス）、Ｃｙｐｈｅｒ  シロリムス溶出性冠動脈ステント（シロリムス）、薬物コーティングされたバルーン（シロリムス）、Ｅ−Ｍａｇｉｃ  Ｐｌｕｓ（シロリムス）、Ｅｍｔｏｒ（シロリムス）、Ｅｓｐｒｉｔ（エベロリムス）、Ｅｖｅｒｔｏｒ（エベロリムス）、ＨＢＦ００７９、ＬＣＰ−Ｓｉｒｏ（シロリムス）、Ｌｉｍｕｓ  ＣＬＡＲＩＳ（シロリムス）、ｍＴＯＲインヒビター  ＣＥＬＬＺＯＭＥ、Ｎｅｖｏ  シロリムス溶出性冠動脈ステント（シロリムス）、ｎＰＴ−ｍＴＯＲ、Ｒａｐａｃａｎ（シロリムス）、Ｒｅｎａｃｅｐｔ（シロリムス）、ＲｅＺｏｌｖｅ（シロリムス）、Ｒｏｃａｓ（シロリムス）、ＳＦ１１２６、Ｓｉｒｏｌｉｍ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＮＯＲＴＨ  ＣＨＩＮＡ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＲＡＮＢＡＸＹ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＷＡＴＳＯＮ（シロリムス）Ｓｉｒｏｐａｎ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｖａ（シロリムス）、Ｓｕｐｒａｌｉｍｕｓ（シロリムス）、Ｓｕｐｒａｌｉｍｕｓ−Ｃｏｒｅ（シロリムス）、Ｔａｃｒｏｌｉｍｕｓ  ＷＡＴＳＯＮ（タクロリムス）、ＴＡＦＡ９３、Ｔｅｍｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＡＣＣＯＲＤ（テムシロリムス）、Ｔｅｍｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＳＡＮＤＯＺ（テムシロリムス）、ＴＯＰ２１６、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｐｒｉｍｅ（エベロリムス）、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｖ（エベロリムス）からなる群より選択される。具体的な態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、Ａｆｉｎｉｔｏｒ（エベロリムス）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ａｆｉｎｉｔｏｒ．ｃｏｍ／ｉｎｄｅｘ．ｊｓｐ？ｕｓｅｒｔｒａｃｋ．ｆｉｌｔｅｒ＿ａｐｐｌｉｅｄ＝ｔｒｕｅ＆ＮｏｖａＩｄ＝４０２９４６２０６４３３８２０７９６３；最終アクセス日２０１２年１１月２８日）である。別の態様において、エベロリムスは、アロマターゼインヒビターと組合わされる（例えば、Ｂａｓｅｌｇａ，Ｊ．ら、Ｅｖｅｒｏｌｉｍｕｓ  ｉｎ  Ｐｏｓｔｍｅｎｏｐａｕｓａｌ  Ｈｏｒｍｏｎｅ−Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ．２０１２．Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３６６（６）：５２０−５２９（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。別の態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る（例えば、Ｚｈｏｕ，Ｈ．ら、Ｕｐｄａｔｅｓ  ｏｆ  ｍＴｏｒ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ．２０１０．Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ａｇｅｎｔｓ  Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１０（７）：５７１−８１（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、ホルモンレセプターが陽性である患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される（例えば、Ｂａｓｅｌｇａ，Ｊ．ら、Ｅｖｅｒｏｌｉｍｕｓ  ｉｎ  Ｐｏｓｔｍｅｎｏｐａｕｓａｌ  Ｈｏｒｍｏｎｅ−Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ．２０１２．Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３６６（６）：５２０−５２９を参照のこと）。いくつかの実施形態に���いて、患者は、ＥＲ＋である。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、第２の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第２の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
【０１２１】
別の態様において、処置は、Ｓｒｃキナーゼインヒビターである。いくつかの態様において、Ｓｒｃインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、以下の群：ＡＺＤ０５３０（サラカチニブ（ｓａｒａｃａｔｉｎｉｂ））、Ｂｏｓｕｌｉｆ（ボスチニブ（ｂｏｓｕｔｉｎｉｂ））、ＥＮＭＤ９８１６９３、ＫＤ０２０、ＫＸ０１、Ｓｐｒｙｃｅｌ（ダサチニブ（ｄａｓａｔｉｎｉｂ））、Ｙｅｒｖｏｙ（イピリムマブ（ｉｐｉｌｉｍｕｍａｂ））、ＡＰ２３４６４、ＡＰ２３４８５、ＡＰ２３５８８、ＡＺＤ０４２４、ｃ−Ｓｒｃキナーゼインヒビター  ＫＩＳＳＥＩ、ＣＵ２０１、ＫＸ２３６１、ＳＫＳ９２７、ＳＲＮ００４、ＳＵＮＫ７０６、ＴＧ１００４３５、ＴＧ１００９４８、ＡＰ２３４５１、Ｄａｓａｔｉｎｉｂ  ＨＥＴＥＲＯ（ダサチニブ）、Ｄａｓａｔｉｎｉｂ  ＶＡＬＥＡＮＴ（ダサチニブ）、Ｆｏｎｔｒａｘ（ダサチニブ）、Ｓｒｃキナーゼインヒビター  ＫＩＮＥＸ、ＶＸ６８０（トザセルチブ（ｔｏｚａｓｅｒｔｉｂ）乳酸塩）、ＸＬ２２８およびＳＵＮＫ７０６から選択される。いくつかの実施形態において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、ダサチニブである。別の態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る（例えば、Ｓｅｎ，Ｂ．ａｎｄ  Ｊｏｈｎｓｏｎ，Ｆ．Ｍ．Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｓｒｃ  Ｆａｍｉｌｙ  Ｋｉｎａｓｅｓ  ｉｎ  Ｈｕｍａｎ  Ｃａｎｃｅｒｓ．２０１１．Ｊ．Ｓｉｇｎａｌ  Ｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎ．２０１１：１４  ｐａｇｅｓ（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、ＳＲＣ応答性シグネチャ（ＳＲＳ）が陽性である患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、患者は、ＳＲＳ＋かつＥＲ−である（例えば、Ｚｈａｎｇ，ＣＨ．−Ｆ，ら、Ｌａｔｅｎｔ  Ｂｏｎｅ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｉｎ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｉｅｄ  ｔｏ  Ｓｒｃ−Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｓｕｒｖｉｖａｌ  ｓｉｇｎａｌｓ．２００９．Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌ．１６：６７−７８（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、第２の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第２の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
【０１２２】
別の態様において、処置は、ＣＯＸ−２インヒビターである。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、以下の群：ＡＢＴ９６３、Ａｃｅｔａｍｉｎｏｐｈｅｎ  ＥＲ  ＪＯＨＮＳＯＮ（アセトアミノフェン）、Ａｃｕｌａｒ  Ｘ（ケトロラクトロメタミン）、ＢＡＹ１０１９０３６（アスピリン）、ＢＡＹ９８７１１１（ジフェンヒドラミン、ナプロキセンナトリウム）、ＢＡＹｌ１９０２（ピロキシカム）、ＢＣＩＢＵＣＨ００１（イブプロフェン）、Ｃａｐｏｘｉｇｅｍ（アプリコキシブ（ａｐｒｉｃｏｘｉｂ））、ＣＳ５０２、ＣＳ６７０（ペルビプロフェン（ｐｅｌｕｂｉｐｒｏｆｅｎ））、Ｄｉｃｌｏｆｅｎａｃ  ＨＰＢＣＤ（ジクロフェナク）、Ｄｉｒａｃｔｉｎ（ケトプロフェン）、ＧＷ４０６３８１、ＨＣＴ１０２６（ニトロフルルビプロフェン（ｎｉｔｒｏｆｌｕｒｂｉｐｒｏｆｅｎ））、Ｈｙａｎａｌｇｅｓｅ−Ｄ（ジクロフェナク）、ＨｙｄｒｏｃｏＤｅｘ（アセトアミノフェン、デキストロメトルファン、ヒドロコドン）、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  Ｓｏｄｉｕｍ  ＰＦＩＺＥＲ（イブプロフェンナトリウム）、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  ｗｉｔｈ  Ａｃｅｔａｍｉｎｏｐｈｅｎ  ＰＦＩＺＥＲ（アセトアミノフェン、イブプロフェン）、Ｉｍｐｒａｃｏｒ（ケトプロフェン）、ＩＰ８８０（ジクロフェナク）、ＩＰ９４０（インドメタシン）、ＩＳＶ２０５（ジクロフェナクナトリウム）、ＪＮＳ０１３（アセトアミノフェン、トラマドール塩酸塩）、Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ  ＴＤＳ（ケトプロフェン）、ＬＴＮＳ００１（ナプロキセンエテメシル（ｎａｐｒｏｘｅｎ  ｅｔｅｍｅｓｉｌ））、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＡＬＩＸ（メサラミン）、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＯＦＡＲ（メサラミン）、Ｍｅｓａｌａｚｉｎｅ（メサラミン）、ＭＬ３０００（リコフェロン（ｌｉｃｏｆｅｌｏｎｅ））、ＭＲＸ７ＥＡＴ（エトドラク）、Ｎａｐｒｏｘｅｎ  ＩＲＯＫＯ（ナプロキセン）、ＮＣＸ４０１６（ニトロアスピリン）、ＮＣＸ７０１（ニトロアセトアミノフェン）、Ｎｕｐｒｉｎ  ＳＣＯＬＲ（イブプロフェン）、ＯＭＳ１０３ＨＰ（アミトリプチリン塩酸塩、ケトプロフェン、オキシメタゾリン塩酸塩）、Ｏｒａｌｅａｓｅ（ジクロフェナク）、ＯｘｙｃｏＤｅｘ（デキストロメトルファン、オキシコドン）、Ｐ５４、ＰｅｒｃｏＤｅｘ（アセトアミノフェン、デキストロメトルファン、オキシコドン）、ＰＬ３１００（ナプロキセン、ホスファチジルコリン）、ＰＳＤ５０８、Ｒ−Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ（ケトプロフェン）、Ｒｅｍｕｒａ（ブロムフェナクナトリウム）、ＲＯＸ８２８（ケトロラクトロメタミン）、ＲＰ１９５８３（ケトプロフェンリジン）、ＲＱ００３１７０７６、ＳＤＸ１０１（Ｒ−エトドラク）、ＴＤＳ９４３（ジクロフェナクナトリウム）、ＴＤＴ０７０（ケトプロフェン）、ＴＰＲ１００、ＴＱ１０１１（ケトプロフェン）、ＴＴ０６３（Ｓ−フルルビプロフェン）、ＵＲ８８８０（シミコキシブ（ｃｉｍｉｃｏｘｉｂ））、Ｖ０４９８ＴＡ０１Ａ（イブプロフェン）、ＶＴ１２２（エトドラク、プロプラノロール）、ＸＰ２０Ｂ（アセトアミノフェン、デキストロプロポキシフェン）、ＸＰ２１Ｂ（ジクロフェナクカリウム）、ＸＰ２１Ｌ（ジクロフェナクカリウム）、Ｚｏｅｎａｓａ（アセチルシステイン、メサラミン）、Ａｃｅｐｈｅｎ、Ａｃｔｉｆｅｄ  Ｐｌｕｓ、Ａｃｔｉｆｅｄ−Ｐ、Ａｃｕｌａｒ、Ａｃｕｌａｒ  ＬＳ、Ａｃｕｌａｒ  ＰＦ、Ａｃｕｌａｒ  Ｘ、Ａｃｕｖａｉｌ、Ａｄｖｉｌ、Ａｄｖｉｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｓｉｎｕｓ、Ａｄｖｉｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ、Ａｄｖｉｌ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ａｄｖｉｌ  ＰＭ、Ａｄｖｉｌ  ＰＭ  Ｃａｐｓｕｌｅ、Ａｉｒ  Ｓａｌｏｎｐａｓ、Ａｉｒｔａｌ、Ａｌｃｏｈｏｌ−Ｆｒｅｅ  ＮｙＱｕｉｌ  Ｃｏｌｄ  ＆  Ｆｌｕ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ａｌｅｖｅ、Ａｌｅｖｅ  ＡＢＤＩ  ＩＢＲＡＨＩＭ、Ａｌｅｖｅ−Ｄ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  ＢＡＹＥＲ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｅｘｔｒａ
Ｓｔｒｅｎｇｔｈ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｌｅｍｏｎ−Ｌｉｍｅ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｏｒｉｇｉｎａｌ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ
Ｐｌｕｓ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｄａｙ  Ｎｏｎ−Ｄｒｏｗｓｙ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｓｉｎｕｓ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｓｐａｒｋｌｉｎｇ  Ｏｒｉｇｉｎａｌ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ
ＰＭ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｗａｋｅ−Ｕｐ  Ｃａｌｌ、Ａｎａｃｉｎ、Ａｎａｐｒｏｘ、Ａｎａｐｒｏｘ  ＭＩＮＥＲＶＡ、Ａｎｓａｉｄ、Ａｐｉｔｏｘｉｎ、Ａｐｒａｎａｘ、Ａｐｒａｎａｘ  ａｂｄｉ、Ａｒｃｏｘｉａ、Ａｒｔｈｒｉｔｉｓ  Ｆｏｒｍｕｌａ  Ｂｅｎｇａｙ、Ａｒｔｈｒｏｔｅｃ、Ａｓａｃｏｌ、Ａｓａｃｏｌ  ＨＤ、Ａｓａｃｏｌ  ＭＥＤＵＮＡ  ＡＲＺＮＥＩＭＩＴＴＥＬ、Ａｓａｃｏｌ  ＯＲＩＦＡＲＭ、Ａｓｐｉｒｉｎ  ＢＡＹＥＲ、Ａｓｐｉｒｉｎ  Ｃｏｍｐｌｅｘ、Ａｓｐｉｒｉｎ  Ｍｉｇｒａｎ、ＡＺＤ３５８２、Ａｚｕｌｆｉｄｉｎｅ、Ｂａｒａｌｇａｎ  Ｍ、ＢＡＹ１０１９０３６、ＢＡＹ９８７１１１、ＢＡＹｌ１９０２、ＢＣＩＢＵＣＨ００１、Ｂｅｎａｄｒｙｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ、Ｂｅｎａｄｒｙｌ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  ４  Ｆｌｕ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐｌｕｓ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｂｅｎｙｌｉｎ１  Ａｌｌ−Ｉｎ−Ｏｎｅ、Ｂｒｅｘｉｎ、Ｂｒｅｘｉｎ  ＡＮＧＥＬＩＮＩ、Ｂｒｏｍｄａｙ、Ｂｕｆｆｅｒｉｎ、Ｂｕｓｃｏｐａｎ  Ｐｌｕｓ、Ｃａｌｄｏｌｏｒ、Ｃａｌｍａｔｅｌ、Ｃａｍｂｉａ、Ｃａｎａｓａ、Ｃａｐｏｘｉｇｅｍ、Ｃａｔａｆｌａｍ、Ｃｅｌｅｂｒｅｘ、Ｃｅｌｅｂｒｅｘ  ＯＲＩＦＡＲＭ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ａｄｖｉｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｓｉｎｕｓ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｕｇｈ  ａｎｄ  Ｒｕｎｎｙ  Ｎｏｓｅ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｃｏｌｄ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｃｏｌｄ  ａｎｄ  ｓｔｕｆｆｙ  ｎｏｓｅ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｃｏｌｄ  ＆  ａｌｌｅｒｇｙ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｕｇｈ  ＆  Ｒｕｎｎｙ  Ｎｏｓｅ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｕｇｈ  ＆  Ｓｏｒｅ  Ｔｈｒｏａｔ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｍｕｌｔｉ  ｓｙｍｐｔｏｍ  ｃｏｌｄ、Ｃｌｉｎｏｒｉｌ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｄａｙ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｄａｙ  ａｎｄ
Ｎｉｇｈｔ  Ｎｉｇｈｔ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｎｉｇｈｔｉｍｅ、Ｃｏｌａｚａｌ、Ｃｏｍｂｕｎｏｘ、Ｃｏｎｔａｃ  Ｃｏｌｄ  ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ、Ｃｏｎｔａｃ  Ｃｏｌｄ  ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ  Ｎｏｎ−Ｄｒｏｗｓｙ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  Ｄ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｍａｘｉｍｕｍ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｆｌｕ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ
ＩＩ  Ｅｘｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、ＣＳ５０２、ＣＳ６７０、Ｄａｙｐｒｏ、Ｄａｙｐｒｏ  Ａｌｔａ、ＤＤＳ０６Ｃ、Ｄｅｍａｚｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  Ｃｏｕｇｈ、Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  ｄａｙ／ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  ＰＥ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  ＰＥ  ｄａｙ／ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｉｃｌｏｆｅｎａｃ  ＨＰＢＣＤ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｄａｙ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｎｉｇｈｔ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｐａｉｎ  ａｎｄ  Ｆｅｖｅｒ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐａｉｎ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐａｉｎ  ｐｌｕｓ  Ａｌｌｅｒｇｙ、Ｄｉｐｅｎｔｕｍ、Ｄｉｒａｃｔｉｎ、Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｃｏｌｄ  ’ｎ’  Ｆｅｖｅｒ、Ｄｉｓｐｒｉｎ
Ｅｘｔｒａ、Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｆｏｒｔｅ．Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｐｌｕｓ、Ｄｒｉｓｔａｎ  Ｃｏｌｄ、Ｄｒｉｓｔａｎ  Ｊｕｎｉｏｒ、Ｄｒｉｘｏｒａｌ  Ｐｌｕｓ、Ｄｕｅｘｉｓ、Ｄｙｎａｓｔａｔ、Ｅｆｆｅｒａｌｇａｎ、Ｅｆｆｅｒａｌｇａｎ  Ｐｌｕｓ  Ｖｉｔａｍｉｎ  Ｃ、Ｅｆｆｅｒａｌｇａｎ  Ｖｉｔａｍｉｎ  Ｃ、Ｅｌｉｘｓｕｒｅ  ＩＢ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｂａｃｋ  ａｎｄ  Ｂｏｄｙ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｍｉｇｒａｉｎｅ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  ＰＭ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｓｉｎｕｓ  Ｈｅａｄａｃｈｅ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｔｅｎｓｉｏｎ  Ｈｅａｄａｃｈｅ、Ｆａｌｃｏｌ、Ｆａｎｓａｍａｃ、Ｆｅｌｄｅｎｅ、ＦｅｖｅｒＡｌｌ、Ｆｉｏｒｉｎａｌ、Ｆｉｏｒｉｎａｌ  ｗｉｔｈ
Ｃｏｄｅｉｎｅ、Ｆｌａｎａｘ、Ｆｌｅｃｔｏｒ  Ｐａｔｃｈ、Ｆｌｕｃａｍ、Ｆｏｒｔａｇｅｓｉｃ、Ｇｅｒｂｉｎ、Ｇｉａｚｏ、Ｇｌａｄｉｏ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  Ｂａｃｋ
ａｎｄ  Ｂｏｄｙ  Ｐａｉｎ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  Ｃｏｏｌ  Ｏｒａｎｇｅ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  Ｅｘｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  ＰＭ、Ｇｒｅａｓｅｌｅｓｓ  Ｂｅｎｇａｙ、ＧＷ４０６３８１、ＨＣＴ１０２６、Ｈｅ  Ｘｉｎｇ  Ｙｉ、Ｈｙａｎａｌｇｅｓｅ−Ｄ、ＨｙｄｒｏｃｏＤｅｘ、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  Ｓｏｄｉｕｍ  ＰＦＩＺＥＲ、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  ｗｉｔｈ、Ａｃｅｔａｍｉｎｏｐｈｅｎ  ＰＦＩＺＥＲ、Ｉｃｙ  Ｈｏｔ  ＳＡＮＯＦＩ  ＡＶＥＮＴＩＳ、Ｉｍｐｒａｃｏｒ、Ｉｎｄｏｃｉｎ、Ｉｎｄｏｍｅｔｈａｃｉｎ  ＡＰＰ  ＰＨＡＲＭＡ、Ｉｎｄｏｍｅｔｈａｃｉｎ  ＭＹＬＡＮ、Ｉｎｆａｎｔｓ’  Ｔｙｌｅｎｏｌ、ＩＰ８８０、ＩＰ９４０、Ｉｒｅｍｏｄ、ＩＳＶ２０５、ＪＮＳ０１３、Ｊｒ．Ｔｙｌｅｎｏｌ、Ｊｕｎｉｆｅｎ、Ｊｕｎｉｏｒ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ａｄｖｉｌ、Ｊｕｎｉｏｒ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｍｏｔｒｉｎ、Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ  ＴＤＳ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ  Ａｌｌ  ｉｎ  Ｏｎｅ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ  Ａｌｌ  Ｎｉｇｈｔ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ  Ｃｏｌｄ
ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｌｉａｌｄａ、Ｌｉｓｔｅｒｉｎｅ  Ｍｏｕｔｈ  Ｗａｓｈ、Ｌｌｏｙｄｓ  Ｃｒｅａｍ、Ｌｏｄｉｎｅ、Ｌｏｒｆｉｔ  Ｐ、Ｌｏｘｏｎｉｎ、ＬＴＮＳ００１、Ｍｅｒｓｙｎｄｏｌ、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＡＬＩＸ、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＯＦＡＲ、Ｍｅｓａｌａｚｉｎｅ、Ｍｅｓａｓａｌ  ＧＬＡＸＯ、Ｍｅｓａｓａｌ  ＳＡＮＯＦＩ、
Ｍｅｓｕｌｉｄ、Ｍｅｔｓａｌ  Ｈｅａｔ  Ｒｕｂ、Ｍｉｄｏｌ  Ｃｏｍｐｌｅｔｅ、Ｍｉｄｏｌ  Ｅｘｔｅｎｄｅｄ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｍｉｄｏｌ  Ｌｉｑｕｉｄ  Ｇｅｌｓ、Ｍｉｄｏｌ  ＰＭ、Ｍｉｄｏｌ  Ｔｅｅｎ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ｍｉｇｒａｎｉｎ  ＣＯＡＴＥＤ  ＴＡＢＬＥＴＳ、ＭＬ３０００、Ｍｏｂｉｃ、Ｍｏｈｒｕｓ、Ｍｏｔｒｉｎ、Ｍｏｔｒｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐａｉｎ、Ｍｏｔｒｉｎ  ＰＭ、Ｍｏｖａｌｉｓ  ＡＳＰＥＮ、ＭＲＸ７ＥＡＴ、Ｎａｌｆｏｎ、Ｎａｌｆｏｎ  ＰＥＤＩＮＯＬ、Ｎａｐｒｅｌａｎ、Ｎａｐｒｏｓｙｎ、Ｎａｐｒｏｓｙｎ  ＲＰＧ  ＬＩＦＥ  ＳＣＩＥＮＣＥ、Ｎａｐｒｏｘｅｎ  ＩＲＯＫＯ、ＮＣＸ４０１６、ＮＣＸ７０１、ＮｅｏＰｒｏｆｅｎ  ＬＵＮＤＢＥＣＫ、Ｎｅｖａｎａｃ、Ｎｅｘｃｅｄｅ、Ｎｉｆｌａｎ、Ｎｏｒｇｅｓｉｃ  ＭＥＤＩＣＩＳ、Ｎｏｖａｌｇｉｎ、Ｎｕｐｒｉｎ  ＳＣＯＬＲ、Ｎｕｒｏｆｅｎ、Ｎｕｒｏｆｅｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｎｕｒｏｆｅｎ  Ｍａｘ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｍｉｇｒａｉｎｅ、Ｎｕｒｏｆｅｎ  Ｐｌｕｓ、Ｎｕｒｏｍｏｌ、ＮｙＱｕｉｌ
ｗｉｔｈ  Ｖｉｔａｍｉｎ  Ｃ、Ｏｃｕｆｅｎ、ＯＭＳ１０３ＨＰ、Ｏｒａｌｅａｓｅ、Ｏｒｕｄｉｓ  ＡＢＢＯＴＴ  ＪＡＰＡＮ、Ｏｒｕｖａｉｌ、Ｏｓｔｅｌｕｃ、ＯｘｙｃｏＤｅｘ、Ｐ５４、Ｐａｎａｄｏｌ、Ｐａｎａｄｏｌ  Ａｃｔｉｆａｓｔ、Ｐａｒａｄｉｎｅ、Ｐａｒａｍａｘ、Ｐａｒｆｅｎａｃ、Ｐｅｄｅａ、Ｐｅｎｎｓａｉｄ、Ｐｅｎｔａｓａ、Ｐｅｎｔａｓａ  ＯＲＩＦＡＲＭ、Ｐｅｏｎ、Ｐｅｒｃｏｄａｎ、Ｐｅｒｃｏｄａｎ−Ｄｅｍｉ、ＰｅｒｃｏＤｅｘ、Ｐｅｒｃｏｇｅｓｉｃ、Ｐｅｒｆａｌｇａｎ、ＰＬ２２００、ＰＬ３１００、Ｐｏｎｓｔｅｌ、Ｐｒｅｘｉｇｅ、Ｐｒｏｌｅｎｓａ、ＰＳＤ５０８、Ｒ−Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ、Ｒａｎｔｕｄｉｌ、Ｒｅｌａｆｅｎ、Ｒｅｍｕｒａ、Ｒｏｂａｘｉｓａｌ、Ｒｏｔｅｃ、Ｒｏｗａｓａ、ＲＯＸ８２８、ＲＰ１９５８３、ＲＱ００３１７０７６、Ｒｕｂｏｒ、Ｓａｌｏｆａｌｋ、Ｓａｌｏｎｐａｓ、Ｓａｒｉｄｏｎ、ＳＤＸ１０１、Ｓｅｌｔｏｕｃｈ、ｓｆＲｏｗａｓａ、Ｓｈｉｎｂａｒｏ、Ｓｉｎｕｍａｘ、Ｓｉｎｕｔａｂ、Ｓｉｎｕｔａｂ、ｓｉｎｕｓ、Ｓｐａｌｔ、Ｓｐｒｉｘ、Ｓｔｒｅｆｅｎ、Ｓｕｄａｆｅｄ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ｓｕｄａｆｅｄ  Ｈｅａｄ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｃｏｌｄ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｕｇｈ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｐｒｅｓｓｕｒｅ  ｐｌｕｓ  Ｐａｉｎ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ、Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｌｄ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙ  ｐｌｕｓ  Ｎｉｇｈｔ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｄａｙ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙ  ｐｌｕｓ  Ｎｉｇｈｔ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｎｉｇｈｔ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  ｐｌｕｓ  Ａｎｔｉ−ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙ
Ｐａｉｎ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｓｕｄａｆｅｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ａｄｖａｎｃｅ、Ｓｕｒｇａｍ、Ｓｙｎａｌｇｏｓ−ＤＣ、Ｓｙｎｆｌｅｘ、Ｔａｖｉｓｔ  ａｌｌｅｒｇｙ／ｓｉｎｕｓ／ｈｅａｄａｃｈｅ、ＴＤＳ９４３、ＴＤＴ０７０、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｏｒｅ  Ｔｈｒｏａｔ、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｄａｙｔｉｍｅ  Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｄａｙｔｉｍｅ  Ｗａｒｍｉｎｇ  Ｒｅｌｉｅｆ，Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｗａｒｍｉｎｇ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｃａｐｌｅｔｓ  Ｄａｙｔｉｍｅ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｗａｒｍｉｎｇ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｈｅｓｔ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ  Ｃ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ  Ｅｆｆｅｒｖｅｓｃｅｎｔ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ  Ｍｅｄｉｕｍ、Ｔｉｌｃｏｔｉｌ、Ｔｉｓｐｏｌ、Ｔｏｌｅｃｔｉｎ、Ｔｏｒａｄｏｌ、ＴＰＲ１００、ＴＱ１０１１、Ｔｒａｕｍａ−Ｓａｌｂｅ、Ｔｒａｕｍａ−Ｓａｌｂｅ  Ｋｗｉｚｄａ、Ｔｒｅｏ、Ｔｒｅｘｉｍｅｔ、Ｔｒｏｖｅｘ、ＴＴ０６３、Ｔｙｌｅｎｏｌ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｂａｃｋ  Ｐａｉｎ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ＆  Ｃｏｕｇｈ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ＆  Ｃｏｕｇｈ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｈｅａｄ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｓｅｖｅｒｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｍｕｌｔｉ  Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｍｕｌｔｉ  Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ  Ｌｉｑｕｉｄ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｍｕｌｔｉ  Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｓｅｖｅｒｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｎｏｎ−Ｄｒｏｗｓｉｎｅｓｓ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｍｐｌｅｔｅ  Ｃｏｌｄ，Ｃｏｕｇｈ
ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｎｉｇｈｔ  ｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｆｌｕ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｍｅｎｓｔｒｕａｌ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  ＰＭ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  ＆  Ｐａｉｎ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  ＆  Ｐａｉｎ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  ＆  Ｐａｉｎ  Ｓｅｖｅｒｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｕｌｔｒａ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｗｉｔｈ  Ｃａｆｆｅｉｎｅ  ａｎｄ  Ｃｏｄｅｉｎｅ  ｐｈｏｓｐｈａｔｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｗｉｔｈ  Ｃｏｄｅｉｎｅ  ｐｈｏｓｐｈａｔｅ、Ｕｌｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｂｅｎｇａｙ  Ｃｒｅａｍ、Ｕｌｔｒａｃｅｔ、ＵＲ８８８０、Ｖ０４９８ＴＡ０１Ａ、Ｖｉｃｋｓ  ＮｙＱｕｉｌ  Ｃｏｌｄ
ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｖｉｃｏｐｒｏｆｅｎ、Ｖｉｍｏｖｏ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  Ｅｍｕｌｇｅｌ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  ＧＥＬ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  ＮＯＶＡＲＴＩＳ  ＣＯＮＳＵＭＥＲ  ＨＥＡＬＴＨ  ＧＭＢＨ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  ＸＲ、ＶＴ１２２、Ｘｅｆｏ、Ｘｅｆｏ  Ｒａｐｉｄ、Ｘｅｆｏｃａｍ、Ｘｉｂｒｏｍ、ＸＬ３、Ｘｏｄｏｌ、ＸＰ２０Ｂ、ＸＰ２１Ｂ、ＸＰ２１Ｌ、ＺｉｐｓｏｒおよびＺｏｅｎａｓａから選択される。別の態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る（例えば、Ｄａｎｎｈａｒｄｔ，Ｇ．ａｎｄ  Ｋｉｅｆｅｒ，Ｗ．Ｃｙｃｌｏｏｘｙｇｅｎａｓｅ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ−ｃｕｒｒｅｎｔ  ｓｔａｔｕｓ  ａｎｄ
ｆｕｔｕｒｅ  ｐｒｏｓｐｅｃｔｓ．２００１．Ｅｕｒ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３６：１０９−１２６（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、第２の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第２の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、デノスマブ、Ｚｏｍｅｔａ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｕｓ．ｚｏｍｅｔａ．ｃｏｍ／ｉｎｄｅｘ．ｊｓｐ？ｕｓｅｒｔｒａｃｋ．ｆｉｌｔｅｒ＿ａｐｐｌｉｅｄ＝ｔｒｕｅ＆ＮｏｖａＩｄ＝２９３５３７６９３４４６７６３３６３３；最終アクセス日２０１２年１２月２日）、ＣａｒｂｏｚａｎｔｉｎｉｂまたはＣａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂ、ＰＴＨＬＨ（副甲状腺ホルモン様ホルモン）またはＰＴＨｒＰ（副甲状腺ホルモン関連タンパク質）を阻止する抗体またはペプチドおよびＥｖｅｒｏｌｉｍｕｓからなる群より選択される第２の処置と組み合わせて使用される。
【０１２３】
別の態様において、骨分解を回避するためおよび／または予防するために使用される処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・副甲状腺ホルモン（ＰＴＨ）インヒビターおよび副甲状腺様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）インヒビター（阻止抗体を含む）またはそれらの組換え型（ＰＴＨのアミノ酸７〜３４に対応するテリパラチド）。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによって作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤（ｄｕａｌ  ａｃｔｉｏｎ  ｂｏｎｅ  ａｇｅｎｔｓ）」（ＤＡＢＡ）と呼ばれる薬物の群の一部を形成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子（ｍｏｄｕｌａｔｏｒ）」（ＳＥＲＭ）は、機序に関係なくエストロゲンがレセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲンレセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン（ｌａｓｏｆｏｘｉｆｅｎｅ）、ＴＳＥ−４２４、タモキシフェン、イドキシフェン（ｉｄｏｘｉｆｅｎｅ）、ＬＹ３５３３８１、ＬＹ１１７０８１、トレミフェン、フルベストラント（ｆｌｕｖｅｓｔｒａｎｔ）、４−［７−（２，２−ジメチル−１−オキソプロポキシ−４−メチル−２−［４−［２−（１−ピペリジニル）エトキシ］フェニル］−２Ｈ−１−ベンゾピラン−３−イル］−フェニル−２，２−ジメチルプロパノエート  ４，４’ジヒドロキシベンゾフェノン−２，４−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびＳＨ６４６が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん（後者は、乳がんおよび前立腺がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない）などの、骨吸収および再吸収を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第５の方法によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素含有ビスホスホネート（例えば、パミドロネート、ネリドロネート（ｎｅｒｉｄｒｏｎａｔｅ）、オルパドロネート（ｏｌｐａｄｒｏｎａｔｅ）、アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネート（ｚｏｌｅｄｒｏｎａｔｅ）またはゾレドロン酸など）および窒素非含有ビスホスホネート（例えば、エチドロネート、クロドロネート、チルドロネートなど）が挙げられるが、これらに限定されない。
・「カテプシンＫインヒビター」とは、カテプシンＫシステインプロテアーゼ活性に干渉する化合物のことを指す。カテプシンＫインヒビターの非限定的な例としては、４−アミノ−ピリミジン−２−カルボニトリル誘導体（Ｎｏｖａｒｔｉｓ  Ｐｈａｒｍａ  ＧＭＢＨの名称下の国際特許出願ＷＯ０３／０２０２７８に記載されている）、公報ＷＯ０３／０２０７２１（Ｎｏｖａｒｔｉｓ  Ｐｈａｒｍａ  ＧＭＢＨ）および公報ＷＯ０４／０００８４３（ＡＳＴＲＡＺＥＮＥＣＡ  ＡＢ）に記載されているピロロ−ピリミジン、ならびにＡｘｙｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓの公報ＰＣＴ  ＷＯ００／５５１２６、Ｍｅｒｃｋ  Ｆｒｏｓｓｔ  Ｃａｎａｄａ  ＆  Ｃｏ．およびＡｘｙｓ  ＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓのＷＯ０１／４９２８８に記載されているインヒビターが挙げられる。・本明細書中で使用されるとき「ＤＫＫ−１（Ｄｉｃｋｋｏｐｆ−１）インヒビター」は、ＤＫＫ−１活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。ＤＫＫ−１は、主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギュレートされる、可溶性Ｗｎｔ経路アンタゴニストである。ＤＫＫ−１を標的化する薬剤は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患の予防に役割を果たし得る。Ｎｏｖａｒｔｉｓ製のＢＨＱ８８０は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗ＤＫＫ−１中和抗体である。前臨床試験は、ＢＨＱ８８０が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している（Ｅｔｔｅｎｂｅｒｇ  Ｓ．ら、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ａｎｎｕａｌ  Ｍｅｅｔｉｎｇ．Ａｐｒｉｌ  １２−１６，２００８；Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．要旨）。
・本明細書中で使用されるとき「ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター」は、ＭＥＴによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、ＭＥＴ経路およびＶＥＧＦ経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。ＭＥＴは、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞（骨を形成する細胞）および破骨細胞（骨を除去する細胞）においても発現される。ＨＧＦは、これらの細胞型のすべてにおいてＭＥＴに結合し、ＭＥＴ経路に複数のオートクラインループおよびパラクリンループにおける重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるＭＥＴの活性化は、転移性の骨病変の確立において重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるＭＥＴ経路の活性化は、異常な骨の成長（すなわち、芽細胞性の病変）または破壊（すなわち、溶解性の病変）を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、ＭＥＴ経路の標的化は、転移性の骨病変の確立および進行を予防する実行可能なストラテジーであり得る。以前はＸＬ１８４（ＣＡＳ８４９２１７−６８−１）として知られていたカボザンチニブ（ｃａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂ）（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ，Ｉｎｃ）は、ＭＥＴによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、ＭＥＴ経路およびＶＥＧＦ経路の強力な二重インヒビターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を死滅させ、転移を減少させ、血管新生（腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成）を阻害することが示されている。別の好適な二重インヒビターは、Ｅ７０５０（Ｎ−［２−フルオロ−４−（｛２−［４−（４−メチルピペラジン−１−イル）ピペリジン−１−イル］カルボニルアミノピリジン−４−イル｝オキシ）フェニル］−Ｎ’−（４−フルオロフェニル）シクロプロパン−１，１−ジカルボキサミド（２Ｒ，３Ｒ）−タルトレート）（ＣＡＳ９２８０３７−１３−２）またはフォレチニブ（ｆｏｒｅｔｉｎｉｂ）（ＧＳＫ１３６３０８９、ＸＬ８８０、ＣＡＳ８４９２１７−６４−７としても知られる）である。
・本明細書中で使用されるとき「ＲＡＮＫＬインヒビター」は、ＲＡＮＫ活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。ＲＡＮＫＬは、ストローマ細胞およびＴ−リンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見出され、これらのＴ−リンパ球細胞は、それを分泌する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞である破骨細胞の活性化である。ＲＡＮＫＬインヒビターは、ＲＡＮＫＬがそのレセプター（ＲＡＮＫ）に結合するのを阻止すること、ＲＡＮＫ媒介性シグナル伝達を阻止すること、またはＲＡＮＫＬの転写もしくは翻訳を阻止することによってＲＡＮＫＬの発現を減少させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したＲＡＮＫＬアンタゴニストまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・ＲＡＮＫＬに結合することができ、ＲＡＮＫタンパク質の細胞外ドメインの全体またはフラグメントを含む、好適なＲＡＮＫタンパク質。可溶性ＲＡＮＫは、マウスもしくはヒトＲＡＮＫポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、またはあるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはＲＡＮＫＬ結合能を有するそのバリアント。
・ＲＡＮＫＬ特異的アンチセンス分子。
・ＲＡＮＫＬの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗ＲＡＮＫＬ抗体。「抗ＲＡＮＫＬ抗体またはＲＡＮＫＬに対し指向する抗体」は、１つまたは複数のＲＡＮＫＬの機能を阻害する、核因子κＢに対する活性化レセプターのリガンド（ＲＡＮＫＬ）に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ，Ｍｉｌｓｔｅｉｎら（Ｎａｔｕｒｅ，１９７５，２５６：４９５）に記載されている方法を用いて調製される。本発明の文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、フラグメント「Ｆａｂ」、「Ｆ（ａｂ’）２」および「Ｆａｂ’」、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗ＲＡＮＫＬナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療タンパク質である。ナノボディ技術は、ラクダ科動物（ラクダおよびラマ）が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
であり、ここで、ＦＲ１からＦＲ４は、フレームワーク領域１〜４であり、ＣＤＲ１からＣＤＲ３は、相補性決定領域１〜３である。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン（ＶＨＨ）および２つの定常ドメイン（ＣＨ２およびＣＨ３）を含む。重要なことには、クローニングされ、単離されたＶＨＨドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有する完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新しく発見されたＶＨＨドメインは、Ａｂｌｙｎｘがナノボディと名付けた新世代の治療用抗体の基礎を形成している。
【０１２４】
１つの実施形態において、ＲＡＮＫＬインヒビターは、ＲＡＮＫＬ特異的抗体、ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される。具体的な実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、モノクローナル抗体である。なおもより具体的な実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、デノスマブ（ｄｅｎｏｓｕｍａｂ）（Ｐａｇｅａｕ，Ｓｔｅｖｅｎ  Ｃ．（２００９）．ｍＡｂｓ  １（３）：２１０−２１５、ＣＡＳ番号６１５２５８−４０−７）（その全内容が本明細書によって参照により援用される）である。デノスマブは、ＲＡＮＫＬに結合して、その活性化を妨げる完全にヒトのモノクローナル抗体である（これは、ＲＡＮＫレセプターには結合しない）。デノスマブの様々な態様が、米国特許第６，７４０，５２２号；同第７，４１１，０５０号；同第７，０９７，８３４号；同第７，３６４，７３６号（これらの各々の全内容が本明細書によってその全体において参照により援用される）によって包含されている。別の実施形態において、ＲＡＮＫＬインヒビターは、デノスマブと同じエピトープに結合する抗体、抗体フラグメントまたは融合構築物。
【０１２５】
好ましい実施形態において、抗ＲＡＮＫＬナノボディは、ＷＯ２００８１４２１６４（その内容は参照により本願に援用される）に記載されているようなナノボディのいずれかである。なおもより好ましい実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、ＡＬＸ−０１４１（Ａｂｌｙｎｘ）である。ＡＬＸ−０１４１は、閉経後の骨粗鬆症、関節リウマチ（ｒｅｕｍａｔｏｉｄ  ａｒｔｈｒｉｔｉｓ）、がんおよびある特定の医薬に関連する骨減少を阻害するように、および健常な骨代謝のバランスを再建するように、デザインされた。
【０１２６】
好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネート、ＲＡＮＫＬインヒビター、ＰＴＨおよびＰＴＨＬＨインヒビターまたはＰＲＧアナログ、ラネル酸ストロンチウム、ＤＫＫ−１インヒビター、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、ラジウム−２２３カルシトニンならびにカテプシンＫインヒビターからなる群より選択される。より好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネートである。なおもより好ましい実施形態において、ビスホスホネートは、ゾレドロン酸である。
【０１２７】
１つの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、骨への原発性乳がん腫瘍の転移を予防するためまたは阻害するために投与される。１つの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、大分子である。別の実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、小分子である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、マラビロク（ｍａｒａｖｉｒｏｃ）（Ｖｅｌａｓｃｏ−Ｖｅｌａ’ｑｕｅｚ，Ｍ．ら、２０１２．ＣＣＲ５  Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ  Ｂｌｏｃｋｓ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｏｆ  Ｂａｓａｌ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌｓ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．７２：３８３９−３８５０）である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、ビクリビロク（ｖｉｃｒｉｖｉｒｏｃ）（Ｖｅｌａｓｃｏ−Ｖｅｌａ’ｑｕｅｚ，Ｍ．ら、２０１２．ＣＣＲ５  Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ  Ｂｌｏｃｋｓ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｏｆ  Ｂａｓａｌ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌｓ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．７２：３８３９−３８５０）である。いくつかの態様において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、アプラビロク（ａｐｌａｖｉｒｏｃ）（Ｄｅｍａｒｅｓｔ  Ｊ．Ｆ．ら、２００５．Ｕｐｄａｔｅ  ｏｎ  Ａｐｌａｖｉｒｏｃ：Ａｎ  ＨＩＶ  Ｅｎｔｒｙ  Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ  Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  ＣＣＲ５．Ｒｅｔｒｏｖｉｒｏｌｏｇｙ  ２（Ｓｕｐｐｌ．１）：Ｓ１３）である。いくつかの態様において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、スピロピペリジンＣＣＲ５アンタゴニスト（Ｒｏｔｓｔｅｉｎ  Ｄ．Ｍ．ら、２００９．Ｓｐｉｒｏｐｉｐｅｒｉｄｉｎｅ  ＣＣＲ５  ａｎｔａｇｏｎｉｓｔｓ．Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ．１９（１８）：５４０１−５４０６）である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、ＩＮＣＢ００９４７１（Ｋｕｒｉｔｚｋｅｓ，Ｄ．Ｒ．２００９．ＨＩＶ−１  ｅｎｔｒｙ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ：ａｎ  ｏｖｅｒｖｉｅｗ．Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．ＨＩＶ  ＡＩＤＳ．４（２）：８２−７）である。
【０１２８】
好ましい実施形態において、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビターは、カボザンチニブ、フォレチニブおよびＥ７０５０からなる群より選択される。
【０１２９】
好ましい実施形態において、ラジウム２２３治療は、アルファラディンである。
【０１３０】
あるいは、転移を処置するためおよび／もしくは予防するために上で述べられた薬剤のうちの２つ以上の薬剤が組み合わされる組合せ処置が行われ得るか、または上記薬剤は、他のサプリメント（例えば、カルシウムまたはビタミンＤ）もしくはホルモン処置と組合わされ得る。
【０１３１】
乳がん患者における早期の骨転移を予測するための方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんなどの乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを決定するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現レベルを決定する工程を含み、ここで、平均値＋１標準偏差より高い上記遺伝子の発現レベルは、早期の骨転移の上昇したリスクを示す。
【０１３２】
好ましい実施形態において、骨転移は、非常に早期の骨転移である。
【０１３３】
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０１３４】
「早期の骨転移」は、本明細書中で使用されるとき、乳がんの患者における手術後５年より前に現れる骨転移に関する。
【０１３５】
「非常に早期の骨転移」は、本明細書中で使用されるとき、乳がんの患者における手術後３年より前に現れる骨転移に関する。
【０１３６】
本発明の第４の方法は、第１の工程に、トリプルネガティブ（基底細胞様）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんなどの乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【０１３７】
好ましい実施形態において、本発明の第４の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルだけを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、
【０１３８】
その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルは、本発明の第１の方法に対して先に開示されたように定量され得る。
【０１３９】
好ましい実施形態において、乳がんは、基底細胞様乳がんを含むトリプルネガティブ乳がんまたはあるいはルミナルＡおよびＢを含むＥＲ＋乳がんである。
【０１４０】
第２の工程において、平均値＋１標準偏差より高い上記遺伝子の発現レベルは、早期の骨転移の上昇したリスクを示す。
【０１４１】
「平均レベル」は、本明細書中で使用されるとき、一群の等しくない値の全体的な有意性を要約するかまたは表す、ｃ−ＭＡＦ発現レベルの単一の値（平均値、最頻値または中央値として）に関する。好ましい実施形態において、平均レベルは、乳がん腫瘍の代表的なコホートから得られる発現レベルの平均に対応する。その患者コホートは、評価しようとしている個々の患者を代表する年齢によって定義される。
【０１４２】
「標準偏差」は、本明細書中で使用されるとき、数値の集合のばらつきの尺度に関する。例えば、ｃ−ＭＡＦの正常な平均レベルに対する標準偏差は、乳房腫瘍サンプルに見出されるｃ−ＭＡＦレベルの集合のばらつきである。そのデータから離れて広がるほど、偏差は大きくなる。標準偏差は、度数分布における平均値からの、実測値の平方偏差の平均値の平方根を求めることによって得ることができる。
【０１４３】
いったん、乳がん（例えば、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がん）を有する被験体由来のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、測定されて、平均レベルと比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、平均レベルと比較して平均＋１標準偏差より高い場合、上記被験体は、早期の骨転移を起こす傾向がより高いと結論づけられ得る。
【０１４４】
骨転移を伴うトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がん患者またはあるいはＥＲ＋乳がん患者において個別化治療をデザインするための方法
別の態様において、本発明は、骨転移を伴うトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいは骨転移を伴うＥＲ＋乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第５の方法）に関し、その方法は、
ｉ）上記被験体の骨転移サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ｉｉ）工程（ｉ）において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格である。
【０１４５】
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０１４６】
本発明の第５の方法は、第１の工程に、乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベル（またはｃ−ＭＡＦの転座もしくは増幅）を定量する工程を含む。本発明の第５の方法の場合、サンプルは、骨転移からの組織サンプルであり得る。
【０１４７】
好ましい実施形態において、本発明の第５の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルだけを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
【０１４８】
第２の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベル（またはｃ−ＭＡＦの転座もしくは増幅）は、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサンプルにおけるｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルである。解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、本発明の第５の方法を含む場合において、参照サンプルは、転移に罹患していない乳がんを有する被験体のサンプル、または転移に罹患していない乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
【０１４９】
いったん、サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルが、測定されて、参照値（例えば、コントロールサンプルのｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベル）と比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、参照値と比較して上昇している場合、これは、上記被験体が、骨分解の回避または予防を目指す治療を受けるのに適格であることを示している。
【０１５０】
骨分解の回避および／または予防のために使用される薬剤の例証的な例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・副甲状腺ホルモン（ＰＴＨ）インヒビターおよび副甲状腺様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）インヒビター（阻止抗体を含む）またはそれらの組換え型（ＰＴＨのアミノ酸７〜３４に対応するテリパラチド）。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによって作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤」（ＤＡＢＡ）と呼ばれる薬物の群の一部を形成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子」（ＳＥＲＭ）は、機序に関係なくエストロゲンがレセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲンレセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン、ＴＳＥ−４２４、タモキシフェン、イドキシフェン、ＬＹ３５３３８１、ＬＹ１１７０８１、トレミフェン、フルベストラント、４−［７−（２，２−ジメチル−１−オキソプロポキシ−４−メチル−２−［４−［２−（１−ピペリジニル）エトキシ］フェニル］−２Ｈ−１−ベンゾピラン−３−イル］−フェニル−２，２−ジメチルプロパノエート  ４，４’ジヒドロキシベンゾフェノン−２，４−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびＳＨ６４６が挙げられる。・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん（後者は、乳がんおよび前立腺がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない）などの、骨吸収および再吸収を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第５の方法によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素含有ビスホスホネート（例えば、パミドロネート、ネリドロネート、オルパドロネート、アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネートまたはゾレドロン酸など）および窒素非含有ビスホスホネート（例えば、エチドロネート、クロドロネート、チルドロネートなど）が挙げられるが、これらに限定されない。・アルファラディン（ラジウム−２２３二塩化物）。アルファラディンは、がん細胞を死滅させるために、ラジウム−２２３の崩壊からのアルファ線を使用する。ラジウム−２２３は、カルシウム模倣物としてのその特性のおかげで骨転移に向けて自然に自身を標的化する。アルファ線は、２〜１０個の細胞という非常に短い範囲（ベータまたはガンマ線に基づく現行の放射線治療と比べて）を有するので、周囲の健常な組織（特に骨髄）にほとんど損傷をもたらさない。カルシウムとよく似た特性を有するので、ラジウム−２２３は、身体内の骨を構築するためにカルシウムが使用されている位置（去勢抵抗性の進行前立腺がんを有する男性の骨格転移に認められるようなより速い異常な骨成長の部位を含む）に引き込まれる。ラジウム−２２３は、注射後、異常に骨が成長している部位に血流によって運ばれる。がんが身体内で生じ始めた位置は、原発腫瘍として公知である。これらの細胞のうちのいくつかは、離脱して、血流によって身体の別の部位に運ばれ得る。次いで、それらのがん細胞は、身体のその位置に定着して、新しい腫瘍を形成し得る。これが起きる場合、それは、二次がんまたは転移と呼ばれる。後期の前立腺がんを有するほとんどの患者は、骨にその疾患の最大の負荷を被る。ラジウム−２２３を用いる目的は、この二次がんを選択的に標的化することである。骨に取り込まれない任意のラジウム−２２３は、すみやかに腸を経由して排泄される。
・「カテプシンＫインヒビター」とは、カテプシンＫシステインプロテアーゼ活性に干渉する化合物のことを指す。カテプシンＫインヒビターの非限定的な例としては、４−アミノ−ピリミジン−２−カルボニトリル誘導体（Ｎｏｖａｒｔｉｓ  Ｐｈａｒｍａ  ＧＭＢＨの名称下の国際特許出願ＷＯ０３／０２０２７８に記載されている）、公報ＷＯ０３／０２０７２１（Ｎｏｖａｒｔｉｓ  Ｐｈａｒｍａ  ＧＭＢＨ）および公報ＷＯ０４／０００８４３（ＡＳＴＲＡＺＥＮＥＣＡ  ＡＢ）に記載されているピロロ−ピリミジン、ならびにＡｘｙｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓの公報ＰＣＴ  ＷＯ００／５５１２６、Ｍｅｒｃｋ  Ｆｒｏｓｓｔ  Ｃａｎａｄａ  ＆  Ｃｏ．およびＡｘｙｓ  ＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓのＷＯ０１／４９２８８に記載されているインヒビターが挙げられる。・本明細書中で使用されるとき「ＤＫＫ−１（Ｄｉｃｋｋｏｐｆ−１）インヒビター」は、ＤＫＫ−１活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。ＤＫＫ−１は、主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギュレートされる、可溶性Ｗｎｔ経路アンタゴニストである。ＤＫＫ−１を標的化する薬剤は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患の予防に役割を果たし得る。Ｎｏｖａｒｔｉｓ製のＢＨＱ８８０は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗ＤＫＫ−１中和抗体である。前臨床試験は、ＢＨＱ８８０が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している（Ｅｔｔｅｎｂｅｒｇ  Ｓ．ら、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ａｎｎｕａｌ  Ｍｅｅｔｉｎｇ．４月  １２−１６，２００８；Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．要旨）。
・本明細書中で使用されるとき「ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター」は、ＭＥＴによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、ＭＥＴ経路およびＶＥＧＦ経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。ＭＥＴは、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞（骨を形成する細胞）および破骨細胞（骨を除去する細胞）においても発現される。ＨＧＦは、これらの細胞型のすべてにおけるＭＥＴに結合し、ＭＥＴ経路に、複数のオートクラインループおよびパラクリンループにおいて重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるＭＥＴの活性化は、転移性の骨病変の確立において重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるＭＥＴ経路の活性化は、異常な骨の成長（すなわち、芽細胞性の病変）または破壊（すなわち、溶解性の病変）を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、ＭＥＴ経路の標的化は、転移性の骨病変の確立および進行の予防の実行可能なストラテジーであり得る。以前はＸＬ１８４（ＣＡＳ８４９２１７−６８−１）として知られていたカボザンチニブ（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ，Ｉｎｃ）は、ＭＥＴによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、ＭＥＴ経路およびＶＥＧＦ経路の強力な二重インヒビターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を死滅させ、転移を減少させ、血管新生（腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成）を阻害することが示されている。別の好適な二重インヒビターは、Ｅ７０５０（Ｎ−［２−フルオロ−４−（｛２−［４−（４−メチルピペラジン−１−イル）ピペリジン−１−イル］カルボニルアミノピリジン−４−イル｝オキシ）フェニル］−Ｎ’−（４−フルオロフェニル）シクロプロパン−１，１−ジカルボキサミド（２Ｒ，３Ｒ）−タルトレート）（ＣＡＳ９２８０３７−１３−２）またはフォレチニブ（ＧＳＫ１３６３０８９、ＸＬ８８０、ＣＡＳ８４９２１７−６４−７としても知られる）である。
・本明細書中で使用されるとき「ＲＡＮＫＬインヒビター」は、ＲＡＮＫ活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。ＲＡＮＫＬは、ストローマ細胞およびＴ−リンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見出され、これらのＴ−リンパ球細胞は、それを分泌する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞である破骨細胞の活性化である。ＲＡＮＫＬインヒビターは、ＲＡＮＫＬがそのレセプター（ＲＡＮＫ）に結合するのを阻止すること、ＲＡＮＫ媒介性シグナル伝達を阻止すること、またはＲＡＮＫＬの転写もしくは翻訳を阻止することによってＲＡＮＫＬの発現を減少させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したＲＡＮＫＬアンタゴニストまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・ＲＡＮＫＬに結合することができ、ＲＡＮＫタンパク質の細胞外ドメインの全体またはフラグメントを含む、好適なＲＡＮＫタンパク質。可溶性ＲＡＮＫは、マウスもしくはヒトＲＡＮＫポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、またはあるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはＲＡＮＫＬ結合能を有するそのバリアント。
・ＲＡＮＫＬ特異的アンチセンス分子。
・ＲＡＮＫＬの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗ＲＡＮＫＬ抗体。「抗ＲＡＮＫＬ抗体またはＲＡＮＫＬに対し指向する抗体」は、１つまたは複数のＲＡＮＫＬの機能を阻害する、核因子κＢに対する活性化レセプターのリガンド（ＲＡＮＫＬ）に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ，Ｍｉｌｓｔｅｉｎら（Ｎａｔｕｒｅ，１９７５，２５６：４９５）に記載されている方法を用いて調製される。本発明の文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、フラグメント「Ｆａｂ」、「Ｆ（ａｂ’）２」および「Ｆａｂ’」、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗ＲＡＮＫＬナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療タンパク質である。ナノボディ技術は、ラクダ科動物（ラクダおよびラマ）が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
であり、ここで、ＦＲ１からＦＲ４は、フレームワーク領域１〜４であり、ＣＤＲ１からＣＤＲ３は、相補性決定領域１〜３である。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン（ＶＨＨ）および２つの定常ドメイン（ＣＨ２およびＣＨ３）を含む。重要なことには、クローニングされ、単離されたＶＨＨドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有する完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新しく発見されたＶＨＨドメインは、Ａｂｌｙｎｘがナノボディと名付けた新世代の治療用抗体の基礎を形成している。
【０１５１】
１つの実施形態において、ＲＡＮＫＬインヒビターは、ＲＡＮＫＬ特異的抗体、ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される。具体的な実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、モノクローナル抗体である。なおもより具体的な実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、デノスマブ（Ｐａｇｅａｕ，Ｓｔｅｖｅｎ  Ｃ．（２００９）．ｍＡｂｓ  １（３）：２１０−２１５、ＣＡＳ番号６１５２５８−４０−７）（その全内容が本明細書によって参照により援用される）である。デノスマブは、ＲＡＮＫＬに結合して、その活性化を妨げる完全にヒトのモノクローナル抗体である（これは、ＲＡＮＫレセプターには結合しない）。デノスマブの様々な態様が、米国特許第６，７４０，５２２号；同第７，４１１，０５０号；同第７，０９７，８３４号；同第７，３６４，７３６号（これらの各々の全内容が本明細書によって参照により援用される）によって包含されている。別の実施形態において、ＲＡＮＫＬインヒビターは、デノスマブと同じエピトープに結合する抗体、抗体フラグメントまたは融合構築物。
【０１５２】
好ましい実施形態において、抗ＲＡＮＫＬナノボディは、ＷＯ２００８１４２１６４（その内容は参照により本願に援用される）に記載されているようなナノボディのいずれかである。なおもより好ましい実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、ＡＬＸ−０１４１（Ａｂｌｙｎｘ）である。ＡＬＸ−０１４１は、閉経後の骨粗鬆症、関節リウマチ、がんおよびある特定の薬剤に関連する骨減少を阻害するように、および健常な骨代謝のバランスを再建するように、デザインされた。
【０１５３】
好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネート、ＲＡＮＫＬインヒビター、ＰＴＨおよびＰＴＨＬＨインヒビターまたはＰＲＧアナログ、ラネル酸ストロンチウム、ＤＫＫ−１インヒビター、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、ラジウム−２２３、カルシトニンならびにカテプシンＫインヒビターからなる群より選択される。より好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネートである。なおもより好ましい実施形態において、ビスホスホネートは、ゾレドロン酸である。
【０１５４】
１つの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、骨への原発性乳がん腫瘍の転移を予防するためまたは阻害するために投与される。１つの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、大分子である。別の実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、小分子である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、Ｍａｒａｖｉｒｏｃ（Ｖｅｌａｓｃｏ−Ｖｅｌａ’ｑｕｅｚ，Ｍ．ら、２０１２．ＣＣＲ５  Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ  Ｂｌｏｃｋｓ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｏｆ  Ｂａｓａｌ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌｓ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．７２：３８３９−３８５０）である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、Ｖｉｃｒｉｖｉｒｏｃ（Ｖｅｌａｓｃｏ−Ｖｅｌａ’ｑｕｅｚ，Ｍ．ら、２０１２．ＣＣＲ５  Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ  Ｂｌｏｃｋｓ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｏｆ  Ｂａｓａｌ  Ｂｒｅａｓｔ
Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌｓ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．７２：３８３９−３８５０）である。いくつかの態様において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、Ａｐｌａｖｉｒｏｃ（Ｄｅｍａｒｅｓｔ  Ｊ．Ｆ．ら、２００５．Ｕｐｄａｔｅ  ｏｎ  Ａｐｌａｖｉｒｏｃ：Ａｎ  ＨＩＶ  Ｅｎｔｒｙ  Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ  Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  ＣＣＲ５．Ｒｅｔｒｏｖｉｒｏｌｏｇｙ  ２（Ｓｕｐｐｌ．１）：Ｓ１３）である。いくつかの態様において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、スピロピペリジンＣＣＲ５アンタゴニスト（Ｒｏｔｓｔｅｉｎ  Ｄ．Ｍ．ら、２００９．Ｓｐｉｒｏｐｉｐｅｒｉｄｉｎｅ  ＣＣＲ５  ａｎｔａｇｏｎｉｓｔｓ．Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ．１９（１８）：５４０１−５４０６）である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、ＩＮＣＢ００９４７１（Ｋｕｒｉｔｚｋｅｓ，Ｄ．Ｒ．２００９．ＨＩＶ−１  ｅｎｔｒｙ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ：ａｎ  ｏｖｅｒｖｉｅｗ．Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．ＨＩＶ  ＡＩＤＳ．４（２）：８２−７）である。
【０１５５】
好ましい実施形態において、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビターは、Ｃａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂ、ＦｏｒｅｔｉｎｉｂおよびＥ７０５０からなる群より選択される。
【０１５６】
好ましい実施形態において、ラジウム２２３治療は、アルファラディンである。
【０１５７】
あるいは、転移を処置するためおよび／もしくは予防するために上で述べられた薬剤のうちの２つ以上の薬剤が組み合わされる組合せ処置が行われ得るか、または上記薬剤は、他のサプリメント（例えば、カルシウムまたはビタミンＤ）もしくはホルモン処置と組合わされ得る。
【０１５８】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の検出に基づく、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんにおける転移の予後診断の方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第６の方法）に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇したリスクを示す。
【０１５９】
いくつかの実施形態において、増幅は、１６ｑ２３遺伝子座の領域における増幅である。いくつかの実施形態において、増幅は、およそ１６番染色体の約７９，３９２，９５９ｂｐ〜約７９，６６３，８０６ｂｐ（セントロメアからテロメアまで）の染色体領域の任意の部分における増幅である。いくつかの実施形態において、増幅は、１６番染色体の約７９，３９２，９５９ｂｐ〜約７９，６６３，８０６ｂｐであるがＤＮＡ反復エレメントを排除したゲノム領域における増幅である。いくつかの実施形態において、増幅は、その領域に特異的なプローブを使用して測定される。
【０１６０】
特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の程度は、上記遺伝子を含む染色体領域の増幅の決定によって決定され得る。好ましくは、その増幅がｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の存在を示す染色体領域は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子を含む遺伝子座１６ｑ２２−ｑ２４である。遺伝子座１６ｑ２２−ｑ２４は、１６番染色体、上記染色体の長腕およびバンド２２〜バンド２４の範囲に位置する。この領域は、ＮＣＢＩデータベースにおいてコンティグＮＴ＿０１０４９８．１５およびＮＴ＿０１０５４２．１５と対応する。別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の程度は、上記遺伝子に特異的なプローブを使用することによって決定され得る。別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、１４ｑ３２および１６ｑ２３に対するプローブを含むＶｙｓｉｓ  ＬＳＩ  ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ｄｕａｌ  Ｃｏｌｏｒ二重融合プローブを使用することによって決定される。
【０１６１】
本発明の第６の方法は、第１の工程に、ｃ−ＭＡＦ遺伝子が被験体のサンプルにおいて増幅されているかを決定する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。その目的のために、腫瘍サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、コントロールサンプルと比較される。
【０１６２】
特定の実施形態において、乳がんを有する被験体において骨転移を起こす傾向の予後診断のための本発明の第６の方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子コピー数を決定する工程および上記コピー数をコントロールサンプルまたは参照サンプルのコピー数と比較する工程を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦコピー数が、コントロールサンプルのｃ−ＭＡＦコピー数より多い場合、その被験体は、骨転移を起こす傾向がより高い。
【０１６３】
コントロールサンプルとは、転移に罹患していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体のサンプル、または転移に罹患していない、それぞれトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはＥＲ＋乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子コピー数の中央値に対応するサンプルのことを指す。上記参照サンプルは、代表的には、被験体集団由来の等量のサンプルを合わせることによって得られる。ｃ−ＭＡＦ遺伝子コピー数が、コントロールサンプル中の上記遺伝子のコピー数と比較して増加している場合、被験体は、転移を起こす傾向がより高い。
【０１６４】
好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子コピー数が、参照サンプルまたはコントロールサンプルが有するコピー数より多いとき、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、参照遺伝子コピー数と比較して、増幅されている。１つの例において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子のゲノムコピー数が、試験サンプルにおいて、コントロールサンプルと比べて少なくとも、２倍増加している（すなわち、６コピー）、３倍増加している（すなわち、８コピー）、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍または５０倍増加している場合、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、「増幅されている」と言われる。別の例において、細胞１つあたりのｃ−ＭＡＦ遺伝子のゲノムコピー数が、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０などである場合、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、「増幅されている」と言われる。
【０１６５】
特定の実施形態において、増幅またはコピー数は、インサイチュハイブリダイゼーションまたはＰＣＲによって決定される。
【０１６６】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子または染色体領域１６ｑ２２−ｑ２４が増幅されているかを決定するための方法は、当該分野において広く公知である。上記方法としては、インサイチュハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）（例えば、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、色素形成インサイチュハイブリダイゼーション（ＣＩＳＨ）またはシルバーインサイチュハイブリダイゼーション（ＳＩＳＨ））、ゲノム比較ハイブリダイゼーションまたはポリメラーゼ連鎖反応（例えば、リアルタイム定量的ＰＣＲ）が挙げられるがこれらに限定されない。いずれのＩＳＨ法の場合も、増幅またはコピー数は、染色体または核における、蛍光の点、有色の点または銀を有する点の数を数えることによって測定され得る。
【０１６７】
蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）は、染色体における特定のＤＮＡ配列の有無を検出するためおよびその特定のＤＮＡ配列の位置を特定するために使用される、細胞遺伝学的技法である。ＦＩＳＨは、染色体のいくつかの部分にだけ結合する蛍光プローブ（このプローブは、それらの部分と高い程度の配列類似性を示す）を使用する。代表的なＦＩＳＨ法では、ＤＮＡプローブは、ニックトランスレーションまたはＰＣＲなどの酵素反応を用いてＤＮＡに組み込まれる、代表的には、フッ素−ｄＵＴＰ、ジゴキシゲニン−ｄＵＴＰ、ビオチン−ｄＵＴＰまたはハプテン−ｄＵＴＰの形態の、蛍光分子またはハプテンで標識される。遺伝物質（染色体）を含むサンプルを、スライドガラスに載せ、ホルムアミド処理によって変性させる。次いで、標識されたプローブを、当業者が決定する好適な条件下で、その遺伝物質を含むサンプルとハイブリダイズさせる。ハイブリダイゼーションの後、直接（フッ素で標識されたプローブの場合）または間接的に（ハプテンを検出する蛍光標識された抗体を使用して）サンプルを観察する。
【０１６８】
ＣＩＳＨの場合、プローブを、ジゴキシゲニン、ビオチンまたはフルオレセインで標識し、好適な条件において、遺伝物質を含むサンプルとハイブリダイズさせる。
【０１６９】
ＤＮＡに結合し得る任意のマーキング分子または標識分子が、本発明の第４の方法において使用されるプローブを標識するために使用され得、それにより、核酸分子の検出が可能になる。標識するための標識の例としては、放射性同位体、酵素基質、補因子、リガンド、化学発光剤、フルオロフォア、ハプテン、酵素およびそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。標識するための方法および種々の目的のために適した標識を選択するための指針は、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８９）およびＡｕｓｕｂｅｌら（Ｉｎ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９９８）に見られ得る。
【０１７０】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅、１６ｑ２３遺伝子座の増幅を直接決定すること、または遺伝子座１６ｑ２２−ｑ２４の増幅を決定することによって、増幅の存在が決定され、コントロールサンプル中の上記遺伝子の増幅と比較されたら、その後、ｃ−ＭＡＦ遺伝子における増幅が検出される場合、被験体が骨転移を起こす傾向がより高いという事実が示される。
【０１７１】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の決定は、転移に罹患していない乳がんを有する被験体のサンプルにおいて計測されたｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅のレベルに対応するか、または転移に罹患していない乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の中央値に対応する、コントロールサンプルまたは参照サンプルの値と相関させることを必要とする。上記参照サンプルは、代表的には、被験体集団由来の等量のサンプルを合わせることによって得られる。一般に、代表的な参照サンプルは、臨床的に十分に考証されている被験体および転移が無いことが十分に特徴付けられている被験体から得られる。参照レベルが由来するサンプルコレクションは、好ましくは、その研究の患者対象と同じタイプのがんに罹患している被験体で構成されている。いったん、この中央値が確立されたら、患者の腫瘍組織におけるｃ−ＭＡＦの増幅のレベルは、この中央値と比較され得、ゆえに、増幅が存在する場合、被験体は、転移を起こす傾向がより高い。
【０１７２】
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性骨転移である。本明細書中で使用されるとき、「溶骨性骨転移」と言う表現は、腫瘍細胞による破骨細胞活性の刺激に起因して転移の近傍で骨吸収（骨密度の進行性消失）が生じ、重篤な疼痛、病理学的骨折、高カルシウム血症、脊髄圧迫、および神経圧迫に起因する他の症候群を特徴とする、転移のタイプを指す。
【０１７３】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座の検出に基づく、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんにおける転移の予後診断の方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を示す。
【０１７４】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を示す。
【０１７５】
いくつかの実施形態において、転座遺伝子は、１６ｑ２３遺伝子座の領域由来である。いくつかの実施形態において、転座遺伝子は、およそ１６番染色体の約７９，３９２，９５９ｂｐ〜約７９，６６３，８０６ｂｐ（セントロメアからテロメアまで）の染色体領域の任意の部分由来である。いくつかの実施形態において、転座遺伝子は、およそ１６番染色体の約７９，３９２，９５９ｂｐ〜約７９，６６３，８０６ｂｐであるがＤＮＡ反復エレメントを排除したゲノム領域由来である。いくつかの実施形態において、転座は、その領域に特異的なプローブを使用して測定される。
【０１７６】
特定の実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、上記遺伝子を含む染色体領域の転座の決定によって決定され得る。１つの実施形態において、転座は、ｔ（１４，１６）転座である。別の実施形態において、転座している染色体領域は、遺伝子座１６ｑ２２−ｑ２４由来である。遺伝子座１６ｑ２２−ｑ２４は、１６番染色体、上記染色体の長腕およびバンド２２〜バンド２４の範囲に位置する。この領域は、ＮＣＢＩデータベースにおいてコンティグＮＴ＿０１０４９８．１５およびＮＴ＿０１０５４２．１５と対応する。好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、１４番染色体の遺伝子座１４ｑ３２に転座し、転座ｔ（１４，１６）（ｑ３２，ｑ２３）が生じる。この転座は、ＩｇＨ遺伝子座における強力なエンハンサーの隣にＭＡＦ遺伝子に配置し、このことは、場合によってはＭＡＦの過剰発現をもたらす（Ｅｙｃｈｅｎｅ，Ａ．，Ｒｏｃｑｕｅｓ，Ｎ．，ａｎｄ
Ｐｕｏｐｏｎｎｏｔ，Ｃ．，Ａ  ｎｅｗ  ＭＡＦｉａ  ｉｎ  ｃａｎｃｅｒ．２００８．Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ：Ｃａｎｃｅｒ．８：６８３−６９３）。
【０１７７】
好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、上記転座に特異的なプローブを使用することによって決定され得る。いくつかの実施形態において、転座は、二色プローブを使用して測定される。いくつかの実施形態において、転座は、二重融合プローブを使用して測定される。いくつかの実施形態において、転座は、二色の二重融合プローブを使用して測定される。いくつかの実施形態において、転座は、２つの別個のプローブを使用して測定される。
【０１７８】
別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、１４ｑ３２および１６ｑ２３に対するプローブを含むＶｙｓｉｓ  ＬＳＩ  ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ｄｕａｌ  Ｃｏｌｏｒ二重融合プローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ａｂｂｏｔｔｍｏｌｅｃｕｌａｒ．ｃｏｍ／ｕｓ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ／ａｎａｌｙｔｅ−ｓｐｅｃｉｆｉｃ−ｒｅａｇｅｎｔ／ｆｉｓｈ／ｖｙｓｉｓ−ｌｓｉ−ｉｇｈ−ｍａｆ−ｄｕａｌ−ｃｏｌｏｒ−ｄｕａｌ−ｆｕｓｉｏｎ−ｐｒｏｂｅ．ｈｔｍｌ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）を使用して決定される。別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座は、Ｋｒｅａｔｅｃｈ
ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ  ＭＡＦ／ＩＧＨ  ｇｔ（１４；１６）Ｆｕｓｉｏｎプローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｋｒｅａｔｅｃｈ．ｃｏｍ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ／ｒｅｐｅａｔ−ｆｒｅｅｔｍ−ｐｏｓｅｉｄｏｎｔｍ−ｆｉｓｈ−ｐｒｏｂｅｓ／ｈｅｍａｔｏｌｏｇｙ／ｍａｆ−ｉｇｈ−ｇｔ１４１６−ｆｕｓｉｏｎ−ｐｒｏｂｅ．ｈｔｍｌ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ａｂｎｏｖａ  ＭＡＦ  ＦＩＳＨプローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ａｂｎｏｖａ．ｃｏｍ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ＿ｄｅｔａｉｌ．ａｓｐ？Ｃａｔａｌｏｇ＿ｉｄ＝ＦＡ０３７５；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ｃａｎｃｅｒ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｉｔａｌｉａ  ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ｔｗｏ  Ｃｏｌｏｒ，Ｔｗｏ  Ｆｕｓｉｏｎ転座プローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃａｎｃｅｒｇｅｎｅｔｉｃｓｉｔａｌｉａ．ｃｏｍ／ｄｎａ−ｆｉｓｈ−ｐｒｏｂｅ／ｉｇｈｍａｆ／；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ｃｒｅａｔｉｖｅ  Ｂｉｏａｒｒａｙ  ＩＧＨ／ＭＡＦ−ｔ（１４；１６）（ｑ３２；ｑ２３）ＦＩＳＨプローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃｒｅａｔｉｖｅ−ｂｉｏａｒｒａｙ．ｃｏｍ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ．ａｓｐ？ｃｉｄ＝３５＆ｐａｇｅ＝１０；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ａｒｕｐ  ＬａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓのＦＩＳＨによる多発性骨髄腫パネル（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ａｒｕｐｌａｂ．ｃｏｍ／ｆｉｌｅｓ／ｔｅｃｈｎｉｃａｌ−ｂｕｌｌｅｔｉｎｓ／Ｍｕｌｔｉｐｌｅ％２０Ｍｙｅｌｏｍａ％２０％２８ＭＭ％２９％２０ｂｙ％２０ＦＩＳＨ．ｐｄｆ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ａｇｉｌｅｎｔの１６ｑ２３または１４ｑ３２に特異的なプローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｉｃｓ．ａｇｉｌｅｎｔ．ｃｏｍ／ＰｒｏｄｕｃｔＳｅａｒｃｈ．ａｓｐｘ？ｃｈｒ  １６＆ｓｔａｒｔ＝７９４８３７００＆ｅｎｄ＝７９７５４３４０；最終アクセス日２０１２年１１月５日；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｉｃｓ．ａｇｉｌｅｎｔ．ｃｏｍ／ＰｒｏｄｕｃｔＳｅａｒｃｈ．ａｓｐｘ？Ｐａｇｅｉｄ＝３０００＆ＰｒｏｄｕｃｔＩＤ＝６３７；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ｄａｋｏの１６ｑ２３または１４ｑ３２に特異的なプローブ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｄａｋｏ．ｃｏｍ／ｕｓ／ａｒ４２／ｐｓｇ４２８０６０００／ｂａｓｅｐｒｏｄｕｃｔｓ＿ｓｕｒｅｆｉｓｈ．ｈｔｍ？ｓｅｔＣｏｕｎｔｒｙ＝ｔｒｕｅ＆ｐｕｒｌ＝ａｒ４２／ｐｓｇ４２８０６０００／ｂａｓｅｐｒｏｄｕｃｔｓ＿ｓｕｒｅｆｉｓｈ．ｈｔｍ？ｕｎｄｅｆｉｎｅｄ＆ｓｕｂｍｉｔ＝Ａｃｃｅｐｔ％２０ｃｏｕｎｔｒｙ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ｃｙｔｏｃｅｌｌ  ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ｔｒａｎｓｌｏｃａｔｉｏｎ，Ｄｕａｌ  Ｆｕｓｉｏｎ  Ｐｒｏｂｅ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｚｅｎｔｅｃｈ．ｂｅ／ｕｐｌｏａｄｓ／ｄｏｃｓ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ＿ｉｎｆｏ／ｐｒｅｎａｔａｌｏｇｙ／ｃｙｔｏｃｅｌｌ％２０２０１２−２０１３％２０ｃａｔａｌｏｇｕｅ％５Ｂ３％５Ｄ．ｐｄｆ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ｍｅｔａｓｙｓｔｅｍｓ  ＸＬ  ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ｔｒａｎｓｌｏｃａｔｉｏｎ  −Ｄｕａｌ  Ｆｕｓｉｏｎ  Ｐｒｏｂｅ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｍｅｔａｓｙｓｔｅｍｓ−ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ．ｃｏｍ／ｉｎｄｅｘ．ｐｈｐ？ｏｐｔｉｏｎ＝ｃｏｍ＿ｊｏｏｄｂ＆ｖｉｅｗ＝ａｒｔｉｃｌｅ＆ｊｏｏｂａｓｅ＝５＆ｉｄ＝１２％３Ａｄ−５０２９−１００−ｏｇ＆Ｉｔｅｍｉｄ＝２７２；最終アクセス日２０１２年１１月５日）、Ｚｅｉｓｓ  ＦＩＳＨ  Ｐｒｏｂｅｓ  ＸＬ，１００μｌ，ＩＧＨ／ＭＡＦＢ（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｍｉｃｒｏ−ｓｈｏｐ．ｚｅｉｓｓ．ｃｏｍ／？ｓ＝４４０６７５６７５ｄｅｄｃ６＆ｌ＝ｅｎ＆ｐ＝ｕｋ＆ｆ＝ｒ＆ｉ＝５０００＆ｏ＝＆ｈ＝２５＆ｎ＝１＆ｓｄ＝００００００−０５２８−２３１−ｕｋ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）またはＧｅｎｙｃｅｌｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ｄｕａｌ  Ｆｕｓｉｏｎ  Ｐｒｏｂｅ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｏｏｇｌｅ．ｃｏｍ／ｕｒｌ？ｓａ＝ｔ＆ｒｃｔ＝ｊ＆ｑ＝＆ｅｓｒｃ＝ｓ＆ｓｏｕｒｃｅ＝ｗｅｂ＆ｃｄ＝１＆ｖｅｄ＝０ＣＣＱＱＦｊＡＡ＆ｕｒｌ＝ｈｔｔｐ％３Ａ％２Ｆ％２Ｆｗｗｗ．ｇｅｎｙｃｅｌｌ．ｅｓ％２Ｆｉｍａｇｅｓ％２Ｆｐｒｏｄｕｃｔｏｓ％２Ｆｂｒｏｃｈｕｒｅｓ％２Ｆｌｐｈｍｉｅ６＿８６．ｐｐｔ＆ｅｉ＝ＭｈＧＹＵＯｉ３ＧＫＷＨ０ＱＧｌｔ４ＤｏＤｗ＆ｕｓｇ＝ＡＦＱｊＣＮＥｑＱＭｂＴ８ｖＱＧｊＪｂｉ９ｒｉＥｆ３ｌＶｇｏＦＴＦＱ＆ｓｉｇ２＝Ｖ５ＩＳ８ｊｕＥＭＶＨＢ１８Ｍｖ２Ｘｘ＿Ｗｗ；最終アクセス日２０１２年１１月５日）を使用して決定される。
【０１７９】
いくつかの実施形態において、プローブ上の標識は、フルオロフォアである。いくつかの実施形態において、プローブ上のフルオロフォアは、橙色である。いくつかの実施形態において、プローブ上のフルオロフォアは、緑色である。いくつかの実施形態において、プローブ上のフルオロフォアは、赤色である。場合によっては、プローブ上のフルオロフォアは、黄色である。いくつかの実施形態において、１つのプローブは、赤色フルオロフォアで標識され、１つは、緑色フルオロフォアで標識される。いくつかの実施形態において、１つのプローブは、緑色フルオロフォアで標識され、１つは、橙色フルオロフォアで標識される。場合によっては、プローブ上のフルオロフォアは、黄色である。例えば、ＭＡＦ特異的プローブが、赤色フルオロフォアで標識され、ＩＧＨ特異的プローブが、緑色フルオロフォアで標識され、白色が見られる場合、それは、それらのシグナルが重なっており、転座が起きていることを示す。
【０１８０】
いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＳｐｅｃｔｒｕｍＯｒａｎｇｅである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＳｐｅｃｔｒｕｍＧｒｅｅｎである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＤＡＰＩである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ４０５である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ４１５である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ４９５である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ５０５である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ５５０である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ５４７である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ５７０である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ５９０である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ６４７である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ４９５／５５０である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ４１５／４９５／５５０である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＤＡＰＩ／ＰｌａｔｉｎｕｍＢｒｉｇｈｔ４９５／５５０である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＦＩＴＣである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、Ｔｅｘａｓ  Ｒｅｄである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＤＥＡＣである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、Ｒ６Ｇである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、Ｃｙ５である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、ＦＩＴＣ、Ｔｅｘａｓ  ＲｅｄおよびＤＡＰＩである。いくつかの実施形態において、ＤＡＰＩ対比染色は、転座、増幅またはコピー数の変化を可視化するために使用される。
【０１８１】
本発明の１つの実施形態は、第１の工程においてｃ−ＭＡＦ遺伝子が被験体のサンプル中で転座しているかを決定する方法を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【０１８２】
特定の実施形態において、乳がんを有する被験体において骨転移を起こす傾向の予後診断のための本発明の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子が転座している上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子コピー数を決定する工程および上記コピー数をコントロールサンプルまたは参照サンプルのコピー数と比較する工程を含み、ここで、そのｃ−ＭＡＦのコピー数が、コントロールサンプルのｃ−ＭＡＦのコピー数と比較して多い場合、その被験体は、骨転移を起こす傾向がより高い。
【０１８３】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子または染色体領域１６ｑ２２−ｑ２４が転座しているかを決定するための方法は、当該分野において広く公知であり、ｃ−ＭＡＦの増幅について先に記載された方法を含む。上記方法としては、インサイチュハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）（例えば、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、色素形成インサイチュハイブリダイゼーション（ＣＩＳＨ）またはシルバーインサイチュハイブリダイゼーション（ＳＩＳＨ））、ゲノム比較ハイブリダイゼーションまたはポリメラーゼ連鎖反応（例えば、リアルタイム定量的ＰＣＲ）が挙げられるがこれらに限定されない。いずれのＩＳＨ方法の場合も、増幅、コピー数または転座は、染色体または核における、蛍光の点、有色の点または銀を有する点の数を数えることによって決定され得る。他の実施形態において、コピー数の変化および転座の検出は、ホールゲノムシーケンシング、エクソームシーケンシングの使用、または任意のＰＣＲに由来する技術の使用によって検出され得る。例えば、ＰＣＲは、転座を検出するためにゲノムＤＮＡのサンプルにおいて行われ得る。１つの実施形態において、定量的ＰＣＲが使用される。１つの実施形態において、ＰＣＲは、ｃ−ＭＡＦ遺伝子に特異的なプライマーおよびＩＧＨプロモーター領域に特異的なプライマーを用いて行われる；生成物が生成される場合、転座が生じている。
【０１８４】
いくつかの実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅およびコピー数は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の転座が決定された後に、決定される。いくつかの実施形態において、プローブを使用して、細胞がｃ−ＭＡＦ遺伝子倍数体であるかが決定される。いくつかの実施形態において、倍数性の決定は、目的の遺伝子からの２種より多いシグナルが存在するかを決定することによって行われる。いくつかの実施形態において、倍数性は、目的の遺伝子に特異的なプローブからのシグナルを測定し、それをセントロメアプローブまたは他のプローブと比較することによって決定される。
【０１８５】
ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅の検出に基づく、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんにおける臨床転帰の予後診断の方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第７の方法）に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、不良な臨床転帰を示す。
【０１８６】
本発明の第７の方法は、第１の工程に、ｃ−ＭＡＦ遺伝子が被験体のサンプルにおいて増幅されているかを決定する工程を含む。ｃ−ＭＡＦの増幅の決定は、本質的に本発明の第５の方法に記載されているように行われる。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、遺伝子座１６ｑ２３または１６ｑ２２−ｑ２４の増幅を決定することによって決定される。別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される。
【０１８７】
第２の工程において、本発明の第７の方法は、上記コピー数をコントロールサンプルまたは参照サンプルのコピー数と比較する工程を含み、ここで、そのｃ−ＭＡＦコピー数が、コントロールサンプルのｃ−ＭＡＦコピー数と比べて多い場合、これは、不良な臨床転帰を示す。
【０１８８】
好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子コピー数が、参照サンプルまたはコントロールサンプルが有するコピー数より多いとき、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、参照遺伝子コピー数と比較して、増幅されている。１つの例において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子のゲノムコピー数が、試験サンプルにおいて、コントロールサンプルと比べて少なくとも、２倍増加（すなわち、６コピー）、３倍増加（すなわち、８コピー）、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍または５０倍増加している場合、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、「増幅されている」と言われる。別の例において、細胞１つあたりのｃ−ＭＡＦ遺伝子のゲノムコピー数が、少なくとも、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０などである場合、ｃ−ＭＡＦ遺伝子は、「増幅されている」と言われる。
【０１８９】
別の実施形態において、参照遺伝子コピー数は、骨転移に罹患していない被験体由来のトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんのサンプル中の遺伝子コピー数である。
【０１９０】
別の実施形態において、増幅は、インサイチュハイブリダイゼーションまたはＰＣＲによって決定される。
【０１９１】
トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳房腫瘍またはあるいはＥＲ＋乳房腫瘍またはＨＥＲ２＋乳房腫瘍を有する患者において個別化治療をデザインするための方法
当該分野において公知であるように、がんに罹患している被験体に施されるべき処置は、後者が悪性腫瘍であるか否か、すなわち、それが転移を起こす高い確率を有するか否か、または後者が良性の腫瘍であるか否かに左右される。第１の仮定では、一般に好まれる処置は、化学療法などの全身性処置であり、第２の仮定では、一般に好まれる処置は、放射線治療などの局所性処置である。
【０１９２】
ゆえに、本願に記載されるように、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がん細胞またはあるいはＥＲ＋乳がん細胞におけるｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座が、骨転移の存在に関係することを考えれば、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座は、上記がんに罹患している被験体に最も適した治療に関して決定するために有用である。好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、遺伝子座１６ｑ２３または１６ｑ２２−ｑ２４の増幅を決定することによって決定される。別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される。
【０１９３】
したがって、別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法（本明細書中以後、本発明の第３の方法）に関し、その方法は、
ｉｉｉ）上記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座を定量する工程、および
ｉｖ）ｉ）において得られた遺伝子の増幅または転座を参照値と比較する工程
を含み、ここで、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座が、上記参照値と比較して増加している場合、上記被験体は、骨転移の予防および／または処置を目指す治療を受けるのに適格である。ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座が、上記参照値と比較して増加していない場合、上記被験体は、骨転移の予防および／または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない。好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、遺伝子座１６ｑ２３または１６ｑ２２−ｑ２４の増幅を決定することによって決定される。別の好ましい実施形態において、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される。
【０１９４】
特定の実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０１９５】
本発明の別の方法は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体におけるサンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座を定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【０１９６】
別の特定の実施形態において、本発明の方法は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座だけを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
【０１９７】
本発明のこの特定の方法の場合、サンプルは、被験体の原発腫瘍組織サンプルであり得る。
【０１９８】
第２の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座は、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサンプルにおける上記遺伝子のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座である。ｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座の測定は、コントロールサンプルまたは参照サンプルの値と関連させなければならない。解析される腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、好ましくは、参照サンプルは、転移していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体のサンプル、または転移していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅もしくは転座に対応するサンプルである。
【０１９９】
いったん、サンプル中のｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座が、計測されて、参照値と比較されたら、上記遺伝子の遺伝子の増幅または転座が、参照値と比較して増加している場合、上記被験体は、転移の予防（被験体がまだ転移を起こしていない場合）および／または転移の処置（被験体がすでに転移を受けている場合）を目指す治療を受けるのに適格であると結論づけられ得る。
【０２００】
がんが転移していたとき、化学療法、ホルモン処置、免疫療法またはそれらの組み合わせを含むがこれらに限定されない全身性処置が使用され得る。さらに、放射線治療および／または手術が使用され得る。処置の選択は、通常、原発がんのタイプ、サイズ、転移の位置、患者の年齢、全般的な健康状態、および以前に使用された処置のタイプに左右される。
【０２０１】
全身性処置は、全身に到達する処置であり、例えば：
・化学療法は、がん細胞を破壊する医薬の使用である。それらの医薬は、通常、経口または静脈内の経路によって投与される。時折、化学療法は、放射線処置とともに使用される。乳がんに対する好適な化学療法処置としては、アントラサイクリン（ドキソルビシン、エピルビシン、ペグ化リポソームドキソルビシン）、タキサン（パクリタキセル、ドセタキセル、アルブミンナノ粒子結合型パクリタキセル）、５−フルオロウラシル（５−ＦＵ持続注入、カペシタビン）、ビンカアルカロイド（ビノレルビン、ビンブラスチン）、ゲムシタビン、白金塩（シスプラチン、カルボプラチン）、シクロホスファミド、エトポシド、および上記の１つまたは複数の組み合わせ、例えば、シクロホスファミド／アントラサイクリン  ＋／−  ５−フルオロウラシルレジメン（例えば、ドキソルビシン／シクロホスファミド（ＡＣ）、エピルビシン／シクロホスファミド、（ＥＣ）シクロホスファミド／エピルビシン／５−フルオロウラシル（ＣＥＦ）、シクロホスファミド／ドキソルビシン／５−フルオロウラシル（ＣＡＦ）、５−フルオロウラシル／エピルビシン／シクロホスファミド（ＦＥＣ））、シクロホスファミド／メトトレキサート／５−フルオロウラシル（ＣＭＦ）、アントラサイクリン／タキサン（例えば、ドキソルビシン／パクリタキセルまたはドキソルビシン／ドセタキセル）、ドセタキセル／カペシタビン、ゲムシタビン／パクリタキセル、タキサン／白金レジメン（例えば、パクリタキセル／カルボプラチンまたはドセタキセル／カルボプラチン）が挙げられるがこれらに限定されない。
・免疫療法は、がんと戦う患者の免疫系自体を助ける処置である。患者における転移を処置するために使用される免疫療法にはいくつかのタイプがある。これらとしては、サイトカイン、モノクローナル抗体および抗腫瘍ワクチンが挙げられるがこれらに限定されない。
【０２０２】
別の態様において、処置は、アルファラディン（ラジウム−２２３二塩化物）である。アルファラディンは、がん細胞を殺すために、ラジウム−２２３の崩壊からのアルファ線を使用する。ラジウム−２２３は、天然に、カルシウム模倣物としてのその特性のおかげで骨転移に対して自身を標的化する。アルファ線は、２〜１０個の細胞という非常に短い範囲（ベータまたはガンマ線に基づく現行の放射線治療と比べて）を有するので、周囲の健常な組織（特に骨髄）にもたらす損傷はより少ない。カルシウムとよく似た特性を有するので、ラジウム−２２３は、身体内の骨を構築するためにカルシウムが使用されている位置（去勢抵抗性の進行前立腺がんを有する男性の骨格転移に見られるようなより速い異常な骨成長の部位を含む）に引き込まれる。ラジウム−２２３は、注射後、異常に骨が成長している部位に血流によって運ばれる。がんが身体内で生じ始めた位置は、原発腫瘍として公知である。これらの細胞のうちのいくつかは、離脱して、血流によって身体の別の部位に運ばれ得る。次いで、それらのがん細胞は、身体のその位置に定着して、新しい腫瘍を形成し得る。これが起きる場合、それは、二次がんまたは転移と呼ばれる。末期の前立腺がんを有するほとんどの患者は、骨にその疾患の最大の負担を被る。ラジウム−２２３を用いる目的は、この二次がんを選択的に標的化することである。骨に取り込まれない任意のラジウム−２２３は、すみやかに腸へと経路を定められ、排泄される。
【０２０３】
別の態様において、処置は、ｍＴｏｒインヒビターである。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、ｍＴｏｒ／ＰＩ３キナーゼの二重インヒビターである。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは：ＡＢＩ００９（シロリムス）、ラパマイシン（シロリムス）、Ａｂｒａｘａｎｅ（パクリタキセル）、Ａｂｓｏｒｂ（エベロリムス）、Ａｆｉｎｉｔｏｒ（エベロリムス）、Ｇｌｅｅｖｅｃと併用のＡｆｉｎｉｔｏｒ、ＡＳ７０３０２６（ピマセルチブ）、Ａｘｘｅｓｓ（ウミロリムス）、ＡＺＤ２０１４、ＢＥＺ２３５、Ｂｉｏｆｒｅｅｄｏｍ（ウミロリムス）、ＢｉｏＭａｔｒｉｘ（ウミロリムス）、ＢｉｏＭａｔｒｉｘ  ｆｌｅｘ（ウミロリムス）、ＣＣ１１５、ＣＣ２２３、Ｃｏｍｂｏ  Ｂｉｏ−ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ  Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  Ｅｌｕｔｉｎｇ  Ｓｔｅｎｔ  ＯＲＢＵＳＮＥＩＣＨ（シロリムス）、Ｃｕｒａｘｉｎ  ＣＢＬＣ１０２（メパクリン）、ＤＥ１０９（シロリムス）、ＤＳ３０７８、Ｅｎｄｅａｖｏｒ  ＤＥＳ（ゾタロリムス）、Ｅｎｄｅａｖｏｒ  Ｒｅｓｏｌｕｔｅ（ゾタロリムス）、Ｆｅｍａｒａ（レトロゾール）、Ｈｏｃｅｎａ（アントロキノノール）、ＩＮＫ１２８、Ｉｎｓｐｉｒｏｎ（シロリムス）、ＩＰＩ５０４（レタスピマイシン塩酸塩）、ＫＲＮ９５１（チボザニブ）、ＭＥ３４４、ＭＧＡ０３１（テプリズマブ）、ＭｉＳｔｅｎｔ  ＳＥＳ（シロリムス）、ＭＫＣ１、Ｎｏｂｏｒｉ（ウミロリムス）、ＯＳＩ０２７、ＯＶＩ１２３（コルジセピン）、Ｐａｌｏｍｉｄ５２９、ＰＦ０４６９１５０２、Ｐｒｏｍｕｓ
Ｅｌｅｍｅｎｔ（エベロリムス）、ＰＷＴ３３５９７、Ｒａｐａｍｕｎｅ（シロリムス）、Ｒｅｓｏｌｕｔｅ  ＤＥＳ（ゾタロリムス）、ＲＧ７４２２、ＳＡＲ２４５４０９、ＳＦ１１２６、ＳＧＮ７５（ボルセツズマブマホドチン（ｖｏｒｓｅｔｕｚｕｍａｂ  ｍａｆｏｄｏｔｉｎ））、Ｓｙｎｅｒｇｙ（エベロリムス）、Ｔａｌｔｏｒｖｉｃ（リダフォロリムス）、Ｔａｒｃｅｖａ（エルロチニブ）、Ｔｏｒｉｓｅｌ（テムシロリムス）、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｐｒｉｍｅ（エベロリムス）、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｖ（エベロリムス）、Ｚｏｍａｘｘ（ゾタロリムス）、Ｚｏｒｔｒｅｓｓ（エベロリムス）、ゾタロリムス溶出性末梢ステント(Ｐｅｒｉｐｈｅｒａｌ  Ｓｔｅｎｔ)  ＭＥＤＴＲＯＮＩＣ（ゾタロリムス）、ＡＰ２３８４１、ＡＰ２４１７０、ＡＲｍＴＯＲ２６、ＢＮ１０７、ＢＮ１０８、Ｃａｎｓｔａｔｉｎ  ＧＥＮＺＹＭＥ（カンスタチン）、ＣＵ９０６、ＥＣ０３７１、ＥＣ０５６５、ＫＩ１００４、ＬＯＲ２２０、ＮＶ１２８、Ｒａｐａｍｙｃｉｎ  ＯＮＣＯＩＭＭＵＮＥ（シロリムス）、ＳＢ２６０２、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＰＮＰ  ＳＡＭＹＡＮＧ
ＢＩＯＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ（シロリムス）、ＴＯＰ２１６、ＶＬＩ２７、ＶＳ５５８４、ＷＹＥ１２５１３２、ＸＬ３８８、Ａｄｖａｃａｎ（エベロリムス）、ＡＺＤ８０５５、Ｃｙｐｈｅｒ  Ｓｅｌｅｃｔ  Ｐｌｕｓ  シロリムス溶出性冠動脈ステント（シロリムス）、Ｃｙｐｈｅｒ  シロリムス溶出性冠動脈ステント（シロリムス）、薬物コーティングされたバルーン（シロリムス）、Ｅ−Ｍａｇｉｃ  Ｐｌｕｓ（シロリムス）、Ｅｍｔｏｒ（シロリムス）、Ｅｓｐｒｉｔ（エベロリムス）、Ｅｖｅｒｔｏｒ（エベロリムス）、ＨＢＦ００７９、ＬＣＰ−Ｓｉｒｏ（シロリムス）、Ｌｉｍｕｓ  ＣＬＡＲＩＳ（シロリムス）、ｍＴＯＲインヒビター  ＣＥＬＬＺＯＭＥ、Ｎｅｖｏ  シロリムス溶出性冠動脈ステント（シロリムス）、ｎＰＴ−ｍＴＯＲ、Ｒａｐａｃａｎ（シロリムス）、Ｒｅｎａｃｅｐｔ（シロリムス）、ＲｅＺｏｌｖｅ（シロリムス）、Ｒｏｃａｓ（シロリムス）、ＳＦ１１２６、Ｓｉｒｏｌｉｍ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＮＯＲＴＨ  ＣＨＩＮＡ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＲＡＮＢＡＸＹ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＷＡＴＳＯＮ（シロリムス）Ｓｉｒｏｐａｎ（シロリムス）、Ｓｉｒｏｖａ（シロリムス）、Ｓｕｐｒａｌｉｍｕｓ（シロリムス）、Ｓｕｐｒａｌｉｍｕｓ−Ｃｏｒｅ（シロリムス）、Ｔａｃｒｏｌｉｍｕｓ  ＷＡＴＳＯＮ（タクロリムス）、ＴＡＦＡ９３、Ｔｅｍｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＡＣＣＯＲＤ（テムシロリムス）、Ｔｅｍｓｉｒｏｌｉｍｕｓ  ＳＡＮＤＯＺ（テムシロリムス）、ＴＯＰ２１６、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｐｒｉｍｅ（エベロリムス）、Ｘｉｅｎｃｅ  Ｖ（エベロリムス）からなる群より選択される。具体的な態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、Ａｆｉｎｉｔｏｒ（エベロリムス）（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ａｆｉｎｉｔｏｒ．ｃｏｍ／ｉｎｄｅｘ．ｊｓｐ？ｕｓｅｒｔｒａｃｋ．ｆｉｌｔｅｒ＿ａｐｐｌｉｅｄ＝ｔｒｕｅ＆ＮｏｖａＩｄ＝４０２９４６２０６４３３８２０７９６３；最終アクセス日２０１２年１１月２８日）である。別の態様において、エベロリムスは、アロマターゼインヒビターと組合わされる（例えば、Ｂａｓｅｌｇａ，Ｊ．ら、Ｅｖｅｒｏｌｉｍｕｓ  ｉｎ  Ｐｏｓｔｍｅｎｏｐａｕｓａｌ  Ｈｏｒｍｏｎｅ−Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｂｒｅａｓｔ
Ｃａｎｃｅｒ．２０１２．Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３６６（６）：５２０−５２９（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。別の態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る（例えば、Ｚｈｏｕ，Ｈ．ら、Ｕｐｄａｔｅｓ  ｏｆ  ｍＴｏｒ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ．２０１０．Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ａｇｅｎｔｓ  Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１０（７）：５７１−８１（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、ホルモンレセプターが陽性である患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される（例えば、Ｂａｓｅｌｇａ，Ｊ．ら、Ｅｖｅｒｏｌｉｍｕｓ  ｉｎ  Ｐｏｓｔｍｅｎｏｐａｕｓａｌ  Ｈｏｒｍｏｎｅ−Ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ．２０１２．Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３６６（６）：５２０−５２９を参照のこと）。いくつかの実施形態において、患者は、ＥＲ＋である。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ｍＴｏｒインヒビターは、第２の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第２の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
【０２０４】
別の態様において、処置は、Ｓｒｃキナーゼインヒビターである。いくつかの態様において、Ｓｒｃインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、以下の群：ＡＺＤ０５３０（サラカチニブ）、Ｂｏｓｕｌｉｆ（ボスチニブ）、ＥＮＭＤ９８１６９３、ＫＤ０２０、ＫＸ０１、Ｓｐｒｙｃｅｌ（ダサチニブ）、Ｙｅｒｖｏｙ（イピリムマブ）、ＡＰ２３４６４、ＡＰ２３４８５、ＡＰ２３５８８、ＡＺＤ０４２４、ｃ−Ｓｒｃキナーゼインヒビター  ＫＩＳＳＥＩ、ＣＵ２０１、ＫＸ２３６１、ＳＫＳ９２７、ＳＲＮ００４、ＳＵＮＫ７０６、ＴＧ１００４３５、ＴＧ１００９４８、ＡＰ２３４５１、Ｄａｓａｔｉｎｉｂ  ＨＥＴＥＲＯ（ダサチニブ）、Ｄａｓａｔｉｎｉｂ  ＶＡＬＥＡＮＴ（ダサチニブ）、Ｆｏｎｔｒａｘ（ダサチニブ）、Ｓｒｃキナーゼインヒビター  ＫＩＮＥＸ、ＶＸ６８０（トザセルチブ乳酸塩）、ＸＬ２２８およびＳＵＮＫ７０６から選択される。いくつかの実施形態において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、ダサチニブである。別の態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る（例えば、Ｓｅｎ，Ｂ．ａｎｄ  Ｊｏｈｎｓｏｎ，Ｆ．Ｍ．Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｓｒｃ
Ｆａｍｉｌｙ  Ｋｉｎａｓｅｓ  ｉｎ  Ｈｕｍａｎ  Ｃａｎｃｅｒｓ．２０１１．Ｊ．Ｓｉｇｎａｌ  Ｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎ．２０１１：１４  ｐａｇｅｓ（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、ＳＲＣ応答性シグネチャ（ＳＲＳ）が陽性である患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、患者は、ＳＲＳ＋かつＥＲ−である（例えば、Ｚｈａｎｇ，ＣＨ．−Ｆ，ら、Ｌａｔｅｎｔ  Ｂｏｎｅ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｉｎ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｉｅｄ  ｔｏ  Ｓｒｃ−Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｓｕｒｖｉｖａｌ  ｓｉｇｎａｌｓ．２００９．Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌ．１６：６７−７８（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、Ｓｒｃキナーゼインヒビターは、第２の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第２の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
【０２０５】
別の態様において、処置は、ＣＯＸ−２インヒビターである。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、以下の群：ＡＢＴ９６３、Ａｃｅｔａｍｉｎｏｐｈｅｎ  ＥＲ  ＪＯＨＮＳＯＮ（アセトアミノフェン）、Ａｃｕｌａｒ  Ｘ（ケトロラクトロメタミン）、ＢＡＹ１０１９０３６（アスピリン）、ＢＡＹ９８７１１１（ジフェンヒドラミン、ナプロキセンナトリウム）、ＢＡＹｌ１９０２（ピロキシカム）、ＢＣＩＢＵＣＨ００１（イブプロフェン）、Ｃａｐｏｘｉｇｅｍ（アプリコキシブ）、ＣＳ５０２、ＣＳ６７０（ペルビプロフェン）、Ｄｉｃｌｏｆｅｎａｃ  ＨＰＢＣＤ（ジクロフェナク）、Ｄｉｒａｃｔｉｎ（ケトプロフェン）、ＧＷ４０６３８１、ＨＣＴ１０２６（ニトロフルルビプロフェン）、Ｈｙａｎａｌｇｅｓｅ−Ｄ（ジクロフェナク）、ＨｙｄｒｏｃｏＤｅｘ（アセトアミノフェン、デキストロメトルファン、ヒドロコドン）、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  Ｓｏｄｉｕｍ  ＰＦＩＺＥＲ（イブプロフェンナトリウム）、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  ｗｉｔｈ  Ａｃｅｔａｍｉｎｏｐｈｅｎ  ＰＦＩＺＥＲ（アセトアミノフェン、イブプロフェン）、Ｉｍｐｒａｃｏｒ（ケトプロフェン）、ＩＰ８８０（ジクロフェナク）、ＩＰ９４０（インドメタシン）、ＩＳＶ２０５（ジクロフェナクナトリウム）、ＪＮＳ０１３（アセトアミノフェン、トラマドール塩酸塩）、Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ  ＴＤＳ（ケトプロフェン）、ＬＴＮＳ００１（ナプロキセンエテメシル）、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＡＬＩＸ（メサラミン）、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＯＦＡＲ（メサラミン）、Ｍｅｓａｌａｚｉｎｅ（メサラミン）、ＭＬ３０００（リコフェロン）、ＭＲＸ７ＥＡＴ（エトドラク）、Ｎａｐｒｏｘｅｎ  ＩＲＯＫＯ（ナプロキセン）、ＮＣＸ４０１６（ニトロアスピリン）、ＮＣＸ７０１（ニトロアセトアミノフェン）、Ｎｕｐｒｉｎ
ＳＣＯＬＲ（イブプロフェン）、ＯＭＳ１０３ＨＰ（アミトリプチリン塩酸塩、ケトプロフェン、オキシメタゾリン塩酸塩）、Ｏｒａｌｅａｓｅ（ジクロフェナク）、ＯｘｙｃｏＤｅｘ（デキストロメトルファン、オキシコドン）、Ｐ５４、ＰｅｒｃｏＤｅｘ（アセトアミノフェン、デキストロメトルファン、オキシコドン）、ＰＬ３１００（ナプロキセン、ホスファチジルコリン）、ＰＳＤ５０８、Ｒ−Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ（ケトプロフェン）、Ｒｅｍｕｒａ（ブロムフェナクナトリウム）、ＲＯＸ８２８（ケトロラクトロメタミン）、ＲＰ１９５８３（ケトプロフェンリジン）、ＲＱ００３１７０７６、ＳＤＸ１０１（Ｒ−エトドラク）、ＴＤＳ９４３（ジクロフェナクナトリウム）、ＴＤＴ０７０（ケトプロフェン）、ＴＰＲ１００、ＴＱ１０１１（ケトプロフェン）、ＴＴ０６３（Ｓ−フルルビプロフェン）、ＵＲ８８８０（シミコキシブ）、Ｖ０４９８ＴＡ０１Ａ（イブプロフェン）、ＶＴ１２２（エトドラク、プロプラノロール）、ＸＰ２０Ｂ（アセトアミノフェン、デキストロプロポキシフェン）、ＸＰ２１Ｂ（ジクロフェナクカリウム）、ＸＰ２１Ｌ（ジクロフェナクカリウム）、Ｚｏｅｎａｓａ（アセチルシステイン、メサラミン）、Ａｃｅｐｈｅｎ、Ａｃｔｉｆｅｄ  Ｐｌｕｓ、Ａｃｔｉｆｅｄ−Ｐ、Ａｃｕｌａｒ、Ａｃｕｌａｒ  ＬＳ、Ａｃｕｌａｒ  ＰＦ、Ａｃｕｌａｒ  Ｘ、Ａｃｕｖａｉｌ、Ａｄｖｉｌ、Ａｄｖｉｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｓｉｎｕｓ、Ａｄｖｉｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ、Ａｄｖｉｌ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ａｄｖｉｌ  ＰＭ、Ａｄｖｉｌ  ＰＭ  Ｃａｐｓｕｌｅ、Ａｉｒ  Ｓａｌｏｎｐａｓ、Ａｉｒｔａｌ、Ａｌｃｏｈｏｌ−Ｆｒｅｅ  ＮｙＱｕｉｌ  Ｃｏｌｄ  ＆  Ｆｌｕ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ａｌｅｖｅ、Ａｌｅｖｅ  ＡＢＤＩ  ＩＢＲＡＨＩＭ、Ａｌｅｖｅ−Ｄ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  ＢＡＹＥＲ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｅｘｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｌｅｍｏｎ−Ｌｉｍｅ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ
Ｏｒｉｇｉｎａｌ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ
ｐｌｕｓ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｄａｙ  Ｎｏｎ−Ｄｒｏｗｓｙ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ
Ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｓｉｎｕｓ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｐｌｕｓ  Ｓｐａｒｋｌｉｎｇ  Ｏｒｉｇｉｎａｌ  Ｃｏｌｄ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  ＰＭ、Ａｌｋａ−Ｓｅｌｔｚｅｒ  Ｗａｋｅ−Ｕｐ  Ｃａｌｌ、Ａｎａｃｉｎ、Ａｎａｐｒｏｘ、Ａｎａｐｒｏｘ  ＭＩＮＥＲＶＡ、Ａｎｓａｉｄ、Ａｐｉｔｏｘｉｎ、Ａｐｒａｎａｘ、Ａｐｒａｎａｘ  ａｂｄｉ、Ａｒｃｏｘｉａ、Ａｒｔｈｒｉｔｉｓ  Ｆｏｒｍｕｌａ  Ｂｅｎｇａｙ、Ａｒｔｈｒｏｔｅｃ、Ａｓａｃｏｌ、Ａｓａｃｏｌ  ＨＤ、Ａｓａｃｏｌ  ＭＥＤＵＮＡ  ＡＲＺＮＥＩＭＩＴＴＥＬ、Ａｓａｃｏｌ  ＯＲＩＦＡＲＭ、Ａｓｐｉｒｉｎ  ＢＡＹＥＲ、Ａｓｐｉｒｉｎ  Ｃｏｍｐｌｅｘ、Ａｓｐｉｒｉｎ  Ｍｉｇｒａｎ、ＡＺＤ３５８２、Ａｚｕｌｆｉｄｉｎｅ、Ｂａｒａｌｇａｎ  Ｍ、ＢＡＹ１０１９０３６、ＢＡＹ９８７１１１、ＢＡＹｌ１９０２、ＢＣＩＢＵＣＨ００１、Ｂｅｎａｄｒｙｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ、Ｂｅｎａｄｒｙｌ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  ４  Ｆｌｕ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐｌｕｓ、Ｂｅｎｙｌｉｎ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｂｅｎｙｌｉｎ１  Ａｌｌ−Ｉｎ−Ｏｎｅ、Ｂｒｅｘｉｎ、Ｂｒｅｘｉｎ
ＡＮＧＥＬＩＮＩ、Ｂｒｏｍｄａｙ、Ｂｕｆｆｅｒｉｎ、Ｂｕｓｃｏｐａｎ  Ｐｌｕｓ、Ｃａｌｄｏｌｏｒ、Ｃａｌｍａｔｅｌ、Ｃａｍｂｉａ、Ｃａｎａｓａ、Ｃａｐｏｘｉｇｅｍ、Ｃａｔａｆｌａｍ、Ｃｅｌｅｂｒｅｘ、Ｃｅｌｅｂｒｅｘ  ＯＲＩＦＡＲＭ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ａｄｖｉｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｓｉｎｕｓ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｕｇｈ  ａｎｄ  Ｒｕｎｎｙ  Ｎｏｓｅ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｃｏｌｄ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｃｏｌｄ  ａｎｄ  ｓｔｕｆｆｙ  ｎｏｓｅ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｃｏｌｄ  ＆  ａｌｌｅｒｇｙ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｕｇｈ  ＆  Ｒｕｎｎｙ  Ｎｏｓｅ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｕｇｈ  ＆  Ｓｏｒｅ  Ｔｈｒｏａｔ、Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｐｌｕｓ  ｍｕｌｔｉ  ｓｙｍｐｔｏｍ  ｃｏｌｄ、Ｃｌｉｎｏｒｉｌ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｄａｙ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ
Ｎｉｇｈｔ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｃｏｄｒａｌ  Ｎｉｇｈｔｉｍｅ、Ｃｏｌａｚａｌ、Ｃｏｍｂｕｎｏｘ、Ｃｏｎｔａｃ  Ｃｏｌｄ  ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ、Ｃｏｎｔａｃ  Ｃｏｌｄ
ｐｌｕｓ  Ｆｌｕ  Ｎｏｎ−Ｄｒｏｗｓｙ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  Ｄ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｄａｙ  ａｎｄ  Ｎｉｇｈｔ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ
Ｍａｘｉｍｕｍ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｆｌｕ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＨＢＰ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ、Ｃｏｒｉｃｉｄｉｎ  ＩＩ  Ｅｘｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、ＣＳ５０２、ＣＳ６７０、Ｄａｙｐｒｏ、Ｄａｙｐｒｏ  Ａｌｔａ、ＤＤＳ０６Ｃ、Ｄｅｍａｚｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ
Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  Ｃｏｕｇｈ、Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  ｄａｙ／ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  ＰＥ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｅｍａｚｉｎ  ＰＥ  ｄａｙ／ｎｉｇｈｔ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｉｃｌｏｆｅｎａｃ  ＨＰＢＣＤ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｄａｙ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｎｉｇｈｔ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  Ｐａｉｎ  ａｎｄ  Ｆｅｖｅｒ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐａｉｎ、Ｄｉｍｅｔａｐｐ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐａｉｎ  ｐｌｕｓ  Ａｌｌｅｒｇｙ、Ｄｉｐｅｎｔｕｍ、Ｄｉｒａｃｔｉｎ、Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｃｏｌｄ  ’ｎ’  Ｆｅｖｅｒ、Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｅｘｔｒａ、Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｆｏｒｔｅ．Ｄｉｓｐｒｉｎ  Ｐｌｕｓ、Ｄｒｉｓｔａｎ  Ｃｏｌｄ、Ｄｒｉｓｔａｎ  Ｊｕｎｉｏｒ、Ｄｒｉｘｏｒａｌ  Ｐｌｕｓ、Ｄｕｅｘｉｓ、Ｄｙｎａｓｔａｔ、Ｅｆｆｅｒａｌｇａｎ、Ｅｆｆｅｒａｌｇａｎ  Ｐｌｕｓ  Ｖｉｔａｍｉｎ
Ｃ、Ｅｆｆｅｒａｌｇａｎ  Ｖｉｔａｍｉｎ  Ｃ、Ｅｌｉｘｓｕｒｅ  ＩＢ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｂａｃｋ  ａｎｄ  Ｂｏｄｙ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｍｉｇｒａｉｎｅ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  ＰＭ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｓｉｎｕｓ  Ｈｅａｄａｃｈｅ、Ｅｘｃｅｄｒｉｎ  Ｔｅｎｓｉｏｎ  Ｈｅａｄａｃｈｅ、Ｆａｌｃｏｌ、Ｆａｎｓａｍａｃ、Ｆｅｌｄｅｎｅ、ＦｅｖｅｒＡｌｌ、Ｆｉｏｒｉｎａｌ、Ｆｉｏｒｉｎａｌ  ｗｉｔｈ  Ｃｏｄｅｉｎｅ、Ｆｌａｎａｘ、Ｆｌｅｃｔｏｒ  Ｐａｔｃｈ、Ｆｌｕｃａｍ、Ｆｏｒｔａｇｅｓｉｃ、Ｇｅｒｂｉｎ、Ｇｉａｚｏ、Ｇｌａｄｉｏ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  Ｂａｃｋ  ａｎｄ  Ｂｏｄｙ  Ｐａｉｎ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  Ｃｏｏｌ  Ｏｒａｎｇｅ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  Ｅｘｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ、Ｇｏｏｄｙ’ｓ  ＰＭ、Ｇｒｅａｓｅｌｅｓｓ  Ｂｅｎｇａｙ、ＧＷ４０６３８１、ＨＣＴ１０２６、Ｈｅ  Ｘｉｎｇ  Ｙｉ、Ｈｙａｎａｌｇｅｓｅ−Ｄ、ＨｙｄｒｏｃｏＤｅｘ、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  Ｓｏｄｉｕｍ  ＰＦＩＺＥＲ、Ｉｂｕｐｒｏｆｅｎ  ｗｉｔｈ、Ａｃｅｔａｍｉｎｏｐｈｅｎ  ＰＦＩＺＥＲ、Ｉｃｙ  Ｈｏｔ
ＳＡＮＯＦＩ  ＡＶＥＮＴＩＳ、Ｉｍｐｒａｃｏｒ、Ｉｎｄｏｃｉｎ、Ｉｎｄｏｍｅｔｈａｃｉｎ  ＡＰＰ  ＰＨＡＲＭＡ、Ｉｎｄｏｍｅｔｈａｃｉｎ  ＭＹＬＡＮ、Ｉｎｆａｎｔｓ’  Ｔｙｌｅｎｏｌ、ＩＰ８８０、ＩＰ９４０、Ｉｒｅｍｏｄ、ＩＳＶ２０５、ＪＮＳ０１３、Ｊｒ．Ｔｙｌｅｎｏｌ、Ｊｕｎｉｆｅｎ、Ｊｕｎｉｏｒ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ
Ａｄｖｉｌ、Ｊｕｎｉｏｒ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｍｏｔｒｉｎ、Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ
ＴＤＳ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ  Ａｌｌ  ｉｎ  Ｏｎｅ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ  Ａｌｌ  Ｎｉｇｈｔ、Ｌｅｍｓｉｐ  Ｍａｘ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｌｉａｌｄａ、Ｌｉｓｔｅｒｉｎｅ  Ｍｏｕｔｈ  Ｗａｓｈ、Ｌｌｏｙｄｓ  Ｃｒｅａｍ、Ｌｏｄｉｎｅ、Ｌｏｒｆｉｔ  Ｐ、Ｌｏｘｏｎｉｎ、ＬＴＮＳ００１、Ｍｅｒｓｙｎｄｏｌ、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＡＬＩＸ、Ｍｅｓａｌａｍｉｎｅ  ＳＯＦＡＲ、Ｍｅｓａｌａｚｉｎｅ、Ｍｅｓａｓａｌ  ＧＬＡＸＯ、Ｍｅｓａｓａｌ  ＳＡＮＯＦＩ、Ｍｅｓｕｌｉｄ、Ｍｅｔｓａｌ  Ｈｅａｔ  Ｒｕｂ、Ｍｉｄｏｌ  Ｃｏｍｐｌｅｔｅ、Ｍｉｄｏｌ  Ｅｘｔｅｎｄｅｄ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｍｉｄｏｌ  Ｌｉｑｕｉｄ  Ｇｅｌｓ、Ｍｉｄｏｌ  ＰＭ、Ｍｉｄｏｌ  Ｔｅｅｎ  Ｆｏｒｍｕｌａ、
Ｍｉｇｒａｎｉｎ  ＣＯＡＴＥＤ  ＴＡＢＬＥＴＳ、ＭＬ３０００、Ｍｏｂｉｃ、Ｍｏｈｒｕｓ、Ｍｏｔｒｉｎ、Ｍｏｔｒｉｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｐａｉｎ、Ｍｏｔｒｉｎ  ＰＭ、Ｍｏｖａｌｉｓ  ＡＳＰＥＮ、ＭＲＸ７ＥＡＴ、Ｎａｌｆｏｎ、Ｎａｌｆｏｎ  ＰＥＤＩＮＯＬ、Ｎａｐｒｅｌａｎ、Ｎａｐｒｏｓｙｎ、Ｎａｐｒｏｓｙｎ  ＲＰＧ  ＬＩＦＥ  ＳＣＩＥＮＣＥ、Ｎａｐｒｏｘｅｎ  ＩＲＯＫＯ、ＮＣＸ４０１６、ＮＣＸ７０１、ＮｅｏＰｒｏｆｅｎ  ＬＵＮＤＢＥＣＫ、Ｎｅｖａｎａｃ、Ｎｅｘｃｅｄｅ、Ｎｉｆｌａｎ、Ｎｏｒｇｅｓｉｃ  ＭＥＤＩＣＩＳ、Ｎｏｖａｌｇｉｎ、Ｎｕｐｒｉｎ
ＳＣＯＬＲ、Ｎｕｒｏｆｅｎ、Ｎｕｒｏｆｅｎ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ、Ｎｕｒｏｆｅｎ  Ｍａｘ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｍｉｇｒａｉｎｅ、Ｎｕｒｏｆｅｎ  Ｐｌｕｓ、Ｎｕｒｏｍｏｌ、ＮｙＱｕｉｌ  ｗｉｔｈ  Ｖｉｔａｍｉｎ  Ｃ、Ｏｃｕｆｅｎ、ＯＭＳ１０３ＨＰ、Ｏｒａｌｅａｓｅ、Ｏｒｕｄｉｓ  ＡＢＢＯＴＴ  ＪＡＰＡＮ、Ｏｒｕｖａｉｌ、Ｏｓｔｅｌｕｃ、ＯｘｙｃｏＤｅｘ、Ｐ５４、Ｐａｎａｄｏｌ、Ｐａｎａｄｏｌ  Ａｃｔｉｆａｓｔ、Ｐａｒａｄｉｎｅ、Ｐａｒａｍａｘ、Ｐａｒｆｅｎａｃ、Ｐｅｄｅａ、Ｐｅｎｎｓａｉｄ、Ｐｅｎｔａｓａ、Ｐｅｎｔａｓａ  ＯＲＩＦＡＲＭ、Ｐｅｏｎ、Ｐｅｒｃｏｄａｎ、Ｐｅｒｃｏｄａｎ−Ｄｅｍｉ、ＰｅｒｃｏＤｅｘ、Ｐｅｒｃｏｇｅｓｉｃ、Ｐｅｒｆａｌｇａｎ、ＰＬ２２００、ＰＬ３１００、Ｐｏｎｓｔｅｌ、Ｐｒｅｘｉｇｅ、Ｐｒｏｌｅｎｓａ、ＰＳＤ５０８、Ｒ−Ｋｅｔｏｐｒｏｆｅｎ、Ｒａｎｔｕｄｉｌ、Ｒｅｌａｆｅｎ、Ｒｅｍｕｒａ、Ｒｏｂａｘｉｓａｌ、Ｒｏｔｅｃ、Ｒｏｗａｓａ、ＲＯＸ８２８、ＲＰ１９５８３、ＲＱ００３１７０７６、Ｒｕｂｏｒ、Ｓａｌｏｆａｌｋ、Ｓａｌｏｎｐａｓ、Ｓａｒｉｄｏｎ、ＳＤＸ１０１、Ｓｅｌｔｏｕｃｈ、ｓｆＲｏｗａｓａ、Ｓｈｉｎｂａｒｏ、Ｓｉｎｕｍａｘ、Ｓｉｎｕｔａｂ、Ｓｉｎｕｔａｂ、ｓｉｎｕｓ、Ｓｐａｌｔ、Ｓｐｒｉｘ、Ｓｔｒｅｆｅｎ、Ｓｕｄａｆｅｄ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ｓｕｄａｆｅｄ  Ｈｅａｄ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ
Ｃｏｌｄ  ｐｌｕｓ  Ｃｏｕｇｈ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｐｒｅｓｓｕｒｅ  ｐｌｕｓ  Ｐａｉｎ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ、Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｌｄ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ
Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙ  ｐｌｕｓ  Ｎｉｇｈｔ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｄａｙ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙ  ｐｌｕｓ  Ｎｉｇｈｔ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｎｉｇｈｔ  Ｔａｂｌｅｔｓ、Ｓｕｄａｆｅｄ  ＰＥ  Ｓｉｎｕｓ  ｐｌｕｓ  Ａｎｔｉ−ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙ  Ｐａｉｎ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｓｕｄａｆｅｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ａｄｖａｎｃｅ、Ｓｕｒｇａｍ、Ｓｙｎａｌｇｏｓ−ＤＣ、Ｓｙｎｆｌｅｘ、Ｔａｖｉｓｔ  ａｌｌｅｒｇｙ／ｓｉｎｕｓ／ｈｅａｄａｃｈｅ、ＴＤＳ９４３、ＴＤＴ０７０、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｏｒｅ  Ｔｈｒｏａｔ、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｄａｙｔｉｍｅ  Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｏｕｇｈ、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｄａｙｔｉｍｅ  Ｗａｒｍｉｎｇ  Ｒｅｌｉｅｆ，Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｗａｒｍｉｎｇ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｃａｐｌｅｔｓ  Ｄａｙｔｉｍｅ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｃｏｌｄ、Ｔｈｅｒａｆｌｕ  Ｗａｒｍｉｎｇ  Ｒｅｌｉｅｆ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｃｈｅｓｔ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ  Ｃ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ  Ｅｆｆｅｒｖｅｓｃｅｎｔ、Ｔｈｏｍａｐｙｒｉｎ  Ｍｅｄｉｕｍ、Ｔｉｌｃｏｔｉｌ、Ｔｉｓｐｏｌ、Ｔｏｌｅｃｔｉｎ、Ｔｏｒａｄｏｌ、ＴＰＲ１００、ＴＱ１０１１、Ｔｒａｕｍａ−Ｓａｌｂｅ、Ｔｒａｕｍａ−Ｓａｌｂｅ  Ｋｗｉｚｄａ、Ｔｒｅｏ、Ｔｒｅｘｉｍｅｔ、Ｔｒｏｖｅｘ、ＴＴ０６３、Ｔｙｌｅｎｏｌ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｍｕｌｔｉ−Ｓｙｍｐｔｏｍ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｂａｃｋ  Ｐａｉｎ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ＆  Ｃｏｕｇｈ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ＆  Ｃｏｕｇｈ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｓｉｎｕｓ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｈｅａｄ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｓｅｖｅｒｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｍｕｌｔｉ  Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ
Ｃｏｌｄ  Ｍｕｌｔｉ  Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ  Ｌｉｑｕｉｄ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｍｕｌｔｉ  Ｓｙｍｐｔｏｍ  Ｓｅｖｅｒｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｎｏｎ−Ｄｒｏｗｓｉｎｅｓｓ  Ｆｏｒｍｕｌａ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｌｄ  Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｃｏｍｐｌｅｔｅ  Ｃｏｌｄ，Ｃｏｕｇｈ  ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｎｉｇｈｔ  ｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ
Ｆｌｕ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｍｅｎｓｔｒｕａｌ、Ｔｙｌｅｎｏｌ
ＰＭ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  ＆  Ｐａｉｎ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  ＆  Ｐａｉｎ  Ｎｉｇｈｔｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  ＆  Ｐａｉｎ  Ｓｅｖｅｒｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｓｉｎｕｓ  Ｓｅｖｅｒｅ  Ｃｏｎｇｅｓｔｉｏｎ  Ｄａｙｔｉｍｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  Ｕｌｔｒａ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｗｉｔｈ  Ｃａｆｆｅｉｎｅ  ａｎｄ  Ｃｏｄｅｉｎｅ  ｐｈｏｓｐｈａｔｅ、Ｔｙｌｅｎｏｌ  ｗｉｔｈ  Ｃｏｄｅｉｎｅ  ｐｈｏｓｐｈａｔｅ、Ｕｌｔｒａ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｂｅｎｇａｙ  Ｃｒｅａｍ、Ｕｌｔｒａｃｅｔ、ＵＲ８８８０、Ｖ０４９８ＴＡ０１Ａ、Ｖｉｃｋｓ  ＮｙＱｕｉｌ  Ｃｏｌｄ  ａｎｄ  Ｆｌｕ  Ｒｅｌｉｅｆ、Ｖｉｃｏｐｒｏｆｅｎ、Ｖｉｍｏｖｏ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  Ｅｍｕｌｇｅｌ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  ＧＥＬ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  ＮＯＶＡＲＴＩＳ  ＣＯＮＳＵＭＥＲ  ＨＥＡＬＴＨ  ＧＭＢＨ、Ｖｏｌｔａｒｅｎ  ＸＲ、ＶＴ１２２、Ｘｅｆｏ、Ｘｅｆｏ  Ｒａｐｉｄ、Ｘｅｆｏｃａｍ、Ｘｉｂｒｏｍ、ＸＬ３、Ｘｏｄｏｌ、ＸＰ２０Ｂ、ＸＰ２１Ｂ、ＸＰ２１Ｌ、ＺｉｐｓｏｒおよびＺｏｅｎａｓａから選択される。別の態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る（例えば、Ｄａｎｎｈａｒｄｔ，Ｇ．ａｎｄ  Ｋｉｅｆｅｒ，Ｗ．Ｃｙｃｌｏｏｘｙｇｅｎａｓｅ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ−ｃｕｒｒｅｎｔ  ｓｔａｔｕｓ  ａｎｄ  ｆｕｔｕｒｅ  ｐｒｏｓｐｅｃｔｓ．２００１．Ｅｕｒ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３６：１０９−１２６（これは本明細書中で参照により援用される）を参照のこと）。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、第２の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第２の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。いくつかの態様において、ＣＯＸ−２インヒビターは、デノスマブ、Ｚｏｍｅｔａ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｕｓ．ｚｏｍｅｔａ．ｃｏｍ／ｉｎｄｅｘ．ｊｓｐ？ｕｓｅｒｔｒａｃｋ．ｆｉｌｔｅｒ＿ａｐｐｌｉｅｄ＝ｔｒｕｅ＆ＮｏｖａＩｄ＝２９３５３７６９３４４６７６３３６３３；最終アクセス日２０１２年１２月２日）、ＣａｒｂｏｚａｎｔｉｎｉｂまたはＣａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂ、ＰＴＨＬＨ（副甲状腺ホルモン様ホルモン）またはＰＴＨｒＰ（副甲状腺ホルモン関連タンパク質）を阻止する抗体またはペプチドおよびＥｖｅｒｏｌｉｍｕｓからなる群より選択される第２の処置と組み合わせて使用される。
【０２０６】
別の態様において、骨分解を回避するためおよび／または予防するために使用される処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・副甲状腺ホルモン（ＰＴＨ）インヒビターおよび副甲状腺様ホルモン（ＰＴＨＬＨ）インヒビター（阻止抗体を含む）またはそれらの組換え型（ＰＴＨのアミノ酸７〜３４に対応するテリパラチド）。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによって作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤」（ＤＡＢＡ）と呼ばれる薬物の群の一部を形成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子」（ＳＥＲＭ）は、機序に関係なくエストロゲンがレセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲンレセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン、ＴＳＥ−４２４、タモキシフェン、イドキシフェン、ＬＹ３５３３８１、ＬＹ１１７０８１、トレミフェン、フルベストラント、４−［７−（２，２−ジメチル−１−オキソプロポキシ−４−メチル−２−［４−［２−（１−ピペリジニル）エトキシ］フェニル］−２Ｈ−１−ベンゾピラン−３−イル］−フェニル−２，２−ジメチルプロパノエート４，４’ジヒドロキシベンゾフェノン−２，４−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびＳＨ６４６が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん（後者は、乳がんおよび前立腺がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない）などの、骨吸収および再吸収を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第５の方法によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素含有ビスホスホネート（例えば、パミドロネート、ネリドロネート、オルパドロネート、アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネートまたはゾレドロン酸など）および窒素非含有ビスホスホネート（例えば、エチドロネート、クロドロネート、チルドロネートなど）が挙げられるが、これらに限定されない。・「カテプシンＫインヒビター」とは、カテプシンＫシステインプロテアーゼ活性を干渉する化合物のことを指す。カテプシンＫインヒビターの非限定的な例としては、４−アミノ−ピリミジン−２−カルボニトリル誘導体（Ｎｏｖａｒｔｉｓ  Ｐｈａｒｍａ  ＧＭＢＨの名称における国際特許出願ＷＯ０３／０２０２７８に記載されている）、公報ＷＯ０３／０２０７２１（Ｎｏｖａｒｔｉｓ  Ｐｈａｒｍａ  ＧＭＢＨ）および公報ＷＯ０４／０００８４３（ＡＳＴＲＡＺＥＮＥＣＡ  ＡＢ）に記載されているピロロ−ピリミジン、ならびにＡｘｙｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓの公報ＰＣＴ  ＷＯ００／５５１２６、Ｍｅｒｃｋ  Ｆｒｏｓｓｔ  Ｃａｎａｄａ  ＆  Ｃｏ．およびＡｘｙｓ  ＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓのＷＯ０１／４９２８８に記載されているインヒビターが挙げられる。
・本明細書中で使用されるとき「ＤＫＫ−１（Ｄｉｃｋｋｏｐｆ−１）インヒビター」は、ＤＫＫ−１活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。ＤＫＫ−１は、主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギュレートされる、可溶性Ｗｎｔ経路アンタゴニストである。ＤＫＫ−１を標的化する薬剤は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患を予防する際に役割を果たし得る。Ｎｏｖａｒｔｉｓ製のＢＨＱ８８０は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗ＤＫＫ−１中和抗体である。前臨床試験は、ＢＨＱ８８０が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している（Ｅｔｔｅｎｂｅｒｇ  Ｓ．ら、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ
Ａｎｎｕａｌ  Ｍｅｅｔｉｎｇ．Ａｐｒｉｌ  １２−１６，２００８；Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．Ａｂｓｔｒａｃｔ）。
・本明細書中で使用されるとき「ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター」は、ＭＥＴによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、ＭＥＴ経路およびＶＥＧＦ経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。ＭＥＴは、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞（骨を形成する細胞）および破骨細胞（骨を除去する細胞）においても発現される。ＨＧＦは、これらの細胞型のすべてにおけるＭＥＴに結合し、ＭＥＴ経路に複数のオートクラインループおよびパラクリンループにおける重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるＭＥＴの活性化は、転移性の骨病変の確立において重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるＭＥＴ経路の活性化は、異常な骨の成長（すなわち、芽細胞性の病変）または破壊（すなわち、溶解性の病変）を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、ＭＥＴ経路の標的化は、転移性の骨病変の確立および進行を予防する際の実行可能なストラテジーであり得る。以前はＸＬ１８４（ＣＡＳ８４９２１７−６８−１）として知られていたＣａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂ（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ，Ｉｎｃ）は、ＭＥＴによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、ＭＥＴ経路およびＶＥＧＦ経路の強力な二重インヒビターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を殺し、転移を減少させ、血管新生（腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成）を阻害すると示されている。別の好適な二重インヒビターは、Ｅ７０５０（Ｎ−［２−フルオロ−４−（｛２−［４−（４−メチルピペラジン−１−イル）ピペリジン−１−イル］カルボニルアミノピリジン−４−イル｝オキシ）フェニル］−Ｎ’−（４−フルオロフェニル）シクロプロパン−１，１−ジカルボキサミド（２Ｒ，３Ｒ）−タルトレート）（ＣＡＳ９２８０３７−１３−２）またはＦｏｒｅｔｉｎｉｂ（ＧＳＫ１３６３０８９、ＸＬ８８０、ＣＡＳ８４９２１７−６４−７としても知られる）である。
・本明細書中で使用されるとき「ＲＡＮＫＬインヒビター」は、ＲＡＮＫ活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。ＲＡＮＫＬは、ストローマ細胞およびＴ−リンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見られ、これらのＴ−リンパ球細胞は、それを分泌する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞である破骨細胞の活性化である。ＲＡＮＫＬインヒビターは、ＲＡＮＫＬがそのレセプター（ＲＡＮＫ）に結合するのを阻止すること、ＲＡＮＫ媒介性シグナル伝達を阻止すること、またはＲＡＮＫＬの転写もしくは翻訳を阻止することによってＲＡＮＫＬの発現を減少させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したＲＡＮＫＬアンタゴニストまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
・ＲＡＮＫＬに結合することができ、ＲＡＮＫタンパク質の細胞外ドメインの全体またはフラグメントを含む、好適なＲＡＮＫタンパク質。可溶性ＲＡＮＫは、マウスもしくはヒトＲＡＮＫポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、またはあるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはＲＡＮＫＬ結合能を有するそのバリアント。
・ＲＡＮＫＬ特異的アンチセンス分子。
・ＲＡＮＫＬの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗ＲＡＮＫＬ抗体。「抗ＲＡＮＫＬ抗体またはＲＡＮＫＬに対する抗体」は、１つまたは複数のＲＡＮＫＬの機能を阻害する、核因子κＢに対する活性化レセプターのリガンド（ＲＡＮＫＬ）に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ，Ｍｉｌｓｔｅｉｎら（Ｎａｔｕｒｅ，１９７５，２５６：４９５）に記載されている方法を用いて調製される。本発明の文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、フラグメント「Ｆａｂ」、「Ｆ（ａｂ’）２」および「Ｆａｂ’」、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗ＲＡＮＫＬナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療的タンパク質である。ナノボディ技術は、ラクダ科動物（ラクダおよびラマ）が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
ＦＲ１−ＣＤＲ１−ＦＲ２−ＣＤＲ２−ＦＲ３−ＣＤＲ３−ＦＲ４
であり、ここで、ＦＲ１からＦＲ４は、フレームワーク領域１〜４であり、ＣＤＲ１からＣＤＲ３は、相補性決定領域１〜３である。これらの重鎖抗体は、１つの可変ドメイン（ＶＨＨ）および２つの定常ドメイン（ＣＨ２およびＣＨ３）を含む。重要なことには、クローニングされ、単離されたＶＨＨドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有する完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新しく発見されたＶＨＨドメインは、Ａｂｌｙｎｘがナノボディと名付けた治療用抗体の新時代の基礎を形成している。
【０２０７】
１つの実施形態において、ＲＡＮＫＬインヒビターは、ＲＡＮＫＬ特異的抗体、ＲＡＮＫＬ特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される。具体的な実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、モノクローナル抗体である。なおもより具体的な実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、デノスマブ（Ｐａｇｅａｕ，Ｓｔｅｖｅｎ  Ｃ．（２００９）．ｍＡｂｓ  １（３）：２１０−２１５、ＣＡＳ番号６１５２５８−４０−７）（その全内容が本明細書によって参照により援用される）である。デノスマブは、ＲＡＮＫＬに結合して、その活性化を妨げる完全にヒトのモノクローナル抗体である（これは、ＲＡＮＫレセプターには結合しない）。デノスマブの様々な態様が、米国特許第６，７４０，５２２号；同第７，４１１，０５０号；同第７，０９７，８３４号；同第７，３６４，７３６号（これらの各々の全内容が本明細書によって参照により援用される）によって包含されている。別の実施形態において、ＲＡＮＫＬインヒビターは、デノスマブと同じエピトープに結合する抗体、抗体フラグメントまたは融合構築物。
【０２０８】
好ましい実施形態において、抗ＲＡＮＫＬナノボディは、ＷＯ２００８１４２１６４（その内容は参照により本願に援用される）に記載されているようなナノボディのいずれかである。なおもより好ましい実施形態において、抗ＲＡＮＫＬ抗体は、ＡＬＸ−０１４１（Ａｂｌｙｎｘ）である。ＡＬＸ−０１４１は、閉経後の骨粗鬆症、関節リウマチ、がんおよびある特定の薬剤に関連する骨減少を阻害するように、および健常な骨代謝のバランスを再建するように、デザインされた。
【０２０９】
好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネート、ＲＡＮＫＬインヒビター、ＰＴＨおよびＰＴＨＬＨインヒビターまたはＰＲＧアナログ、ラネル酸ストロンチウム、ＤＫＫ−１インヒビター、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、ラジウム−２２３カルシトニンならびにカテプシンＫインヒビターからなる群より選択される。より好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネートである。なおもより好ましい実施形態において、ビスホスホネートは、ゾレドロン酸である。
【０２１０】
１つの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、骨への原発性乳がん腫瘍の転移を予防するためまたは阻害するために投与される。１つの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、大分子である。別の実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、小分子である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、Ｍａｒａｖｉｒｏｃ（Ｖｅｌａｓｃｏ−Ｖｅｌａ’ｑｕｅｚ，Ｍ．ら、２０１２．ＣＣＲ５  Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ  Ｂｌｏｃｋｓ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｏｆ  Ｂａｓａｌ  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌｓ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．７２：３８３９−３８５０）である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、Ｖｉｃｒｉｖｉｒｏｃ（Ｖｅｌａｓｃｏ−Ｖｅｌａ’ｑｕｅｚ，Ｍ．ら、２０１２．ＣＣＲ５  Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ  Ｂｌｏｃｋｓ  Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｏｆ  Ｂａｓａｌ  Ｂｒｅａｓｔ
Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌｓ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．７２：３８３９−３８５０）である。いくつかの態様において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、Ａｐｌａｖｉｒｏｃ（Ｄｅｍａｒｅｓｔ  Ｊ．Ｆ．ら、２００５．Ｕｐｄａｔｅ  ｏｎ  Ａｐｌａｖｉｒｏｃ：Ａｎ  ＨＩＶ  Ｅｎｔｒｙ  Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ  Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  ＣＣＲ５．Ｒｅｔｒｏｖｉｒｏｌｏｇｙ  ２（Ｓｕｐｐｌ．１）：Ｓ１３）である。いくつかの態様において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、スピロピペリジンＣＣＲ５アンタゴニスト（Ｒｏｔｓｔｅｉｎ  Ｄ．Ｍ．ら、２００９．Ｓｐｉｒｏｐｉｐｅｒｉｄｉｎｅ  ＣＣＲ５  ａｎｔａｇｏｎｉｓｔｓ．Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ．１９（１８）：５４０１−５４０６）である。いくつかの実施形態において、ＣＣＲ５アンタゴニストは、ＩＮＣＢ００９４７１（Ｋｕｒｉｔｚｋｅｓ，Ｄ．Ｒ．２００９．ＨＩＶ−１  ｅｎｔｒｙ  ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ：ａｎ  ｏｖｅｒｖｉｅｗ．Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．ＨＩＶ  ＡＩＤＳ．４（２）：８２−７）である。
【０２１１】
好ましい実施形態において、ＭＥＴおよびＶＥＧＦＲ２の二重インヒビターは、Ｃａｂｏｚａｎｔｉｎｉｂ、ＦｏｒｅｔｉｎｉｂおよびＥ７０５０からなる群より選択される。
【０２１２】
好ましい実施形態において、ラジウム２２３治療は、アルファラディンである。
【０２１３】
あるいは、転移を処置するためおよび／もしくは予防するために上で述べられた薬剤のうちの２つ以上の薬剤が組み合わされる組合せ処置が行われ得るか、または上記薬剤は、他のサプリメント（例えば、カルシウムまたはビタミンＤ）もしくはホルモン処置と組み合わされ得る。
【０２１４】
ｃ−ＭＡＦ阻害剤を使用して、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんからの骨転移を処置するための方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんからの骨転移の処置または予防において使用するためのｃ−ＭＡＦ阻害剤（本明細書中以後、本発明の阻害剤）に関する。
【０２１５】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんからの骨転移の処置または予防のための医薬を製造するための、ｃ−ＭＡＦ阻害剤の使用に関する。
【０２１６】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんからの骨転移の処置または予防を必要とする被験体へのｃ−ＭＡＦ阻害剤の投与を含む、上記被験体におけるそのような処置または予防のための方法に関する。
【０２１７】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを予防するためまたは減少させるための方法に関し、上記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を上記被験体に投与する工程を含み、ここで、上記薬剤は、上記被験体におけるｃ−ＭＡＦの発現レベルの定量から決定された処置レジメンに従って投与される。
【０２１８】
非限定的な例証として、本発明における使用に適したｃ−ＭＡＦ阻害剤としては、アンチセンスオリゴヌクレオチド、干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、触媒ＲＮＡ、特異的なリボザイム、阻害性抗体もしくはナノボディ、ドミナントネガティブｃ−ＭＡＦバリアント、または表１もしくは表２の化合物が挙げられる。
【０２１９】
アンチセンスオリゴヌクレオチド
本発明のさらなる態様は、発現を阻害する、例えば、活性が阻害されるべきであるｃ−ＭＡＦをコードする核酸の転写および／または翻訳を阻害するための、単離された「アンチセンス」核酸の使用に関する。アンチセンス核酸は、従来の塩基相補性によって、または、例えば、二重らせんの主溝（ｌａｒｇｅ  ｇｒｏｏｖｅ）における特異的な相互作用を介して二本鎖ＤＮＡに結合する場合、薬物の潜在的な標的に結合し得る。通常、これらの方法は、当該分野において通常使用される一連の技法のことを指し、それらには、オリゴヌクレオチド配列への特異的結合に基づく任意の方法が含まれる。
【０２２０】
本発明のアンチセンス構築物は、例えば、細胞において転写されるときに、ｃ−ＭＡＦをコードする細胞ｍＲＮＡの少なくとも１つの独特の部分に相補的なＲＮＡを生成する発現プラスミドとして、分配され得る。あるいは、アンチセンス構築物は、細胞に導入されたら、標的核酸のｍＲＮＡおよび／または遺伝子配列とハイブリダイズして遺伝子発現の阻害をもたらす、エキソビボにおいて生成されたオリゴヌクレオチドプローブである。そのようなオリゴヌクレオチドプローブは、好ましくは、内因性ヌクレアーゼ、例えば、エキソヌクレアーゼおよび／またはエンドヌクレアーゼに抵抗性であるがゆえにインビボにおいて安定である、改変されたオリゴヌクレオチドである。アンチセンスオリゴヌクレオチドとしてそれらを使用するための核酸分子の例は、ホスホルアミデート、ホスホチオネートおよびメチルホスホネートのＤＮＡアナログである（米国特許第５，１７６，９９６号；同第５，２６４，５６４号；および同第５，２５６，７７５号も参照のこと）（これらの各々は、その全体が参照により本明細書中に援用される）。さらに、アンチセンス治療において有用なオリゴマーを構築するための一般的なアプロキシメーション（ａｐｐｒｏｘｉｍａｔｉｏｎｓ）は、例えば、Ｖａｎ  ｄｅｒ  Ｋｒｏｌら、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ６：９５８−９７６，１９８８；およびＳｔｅｉｎら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ
４８：２６５９−２６６８，１９８８に概説されている。
【０２２１】
アンチセンスオリゴヌクレオチドに関して、標的遺伝子の翻訳開始部位由来のオリゴデオキシリボヌクレオチド領域、例えば、−１０〜＋１０が、好ましい。アンチセンスアプロキシメーションは、標的ポリペプチドをコードするｍＲＮＡに相補的なオリゴヌクレオチドのデザイン（ＤＮＡまたはＲＮＡのいずれか）を含む。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、転写されたｍＲＮＡに結合して、翻訳が妨げられる。
【０２２２】
ｍＲＮＡの５’末端、例えば、開始コドンＡＵＧを含むそこまでの非翻訳５’配列に相補的なオリゴヌクレオチドは、翻訳を阻害するために最も効率的な様式で機能するに違いない。それにもかかわらず、ｍＲＮＡの非翻訳３’配列に相補的な配列もまた、ｍＲＮＡ翻訳を阻害するために効率的であることが最近示された（Ｗａｇｎｅｒ，Ｎａｔｕｒｅ  ３７２：３３３，１９９４）。ゆえに、ｍＲＮＡの翻訳を阻害するアンチセンスアプロキシメーションでは、遺伝子の非コード領域である非翻訳５’または３’領域において相補的なオリゴヌクレオチドが、使用され得る。ｍＲＮＡの非翻訳５’領域に相補的なオリゴヌクレオチドは、開始コドンＡＵＧの相補体を含まなければならない。ｍＲＮＡのコード領域に相補的なオリゴヌクレオチドは、それほど効率的な翻訳インヒビターでないが、それらも、本発明に従って使用され得る。それらが、ｍＲＮＡの５’領域、３’領域またはコード領域とハイブリダイズするようにデザインされる場合、アンチセンス核酸は、少なくとも６ヌクレオチド長を有しなければならず、好ましくは、およそ１００未満、より好ましくは、およそ５０、２５、１７または１０未満のヌクレオチド長を有しなければならない。
【０２２３】
好ましくは、まず、アンチセンスオリゴヌクレオチドが遺伝子発現を阻害する能力を定量するインビトロ研究を行う。好ましくは、これらの研究は、オリゴヌクレオチドのアンチセンス遺伝子阻害と非特異的な生物学的作用とを識別するコントロールを使用する。また、好ましくは、これらの研究は、標的ＲＮＡまたはタンパク質のレベルをＲＮＡまたはタンパク質の内部コントロールのレベルと比較した。アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用して得られる結果は、コントロールオリゴヌクレオチドを使用して得られる結果と比較され得る。好ましくは、コントロールオリゴヌクレオチドは、アッセイされるオリゴヌクレオチドとほぼ同じ長さであり、オリゴヌクレオチド配列は、標的配列への特異的なハイブリダイゼーションを妨げるために必要であると考えられるアンチセンス配列にすぎないものと異ならない。
【０２２４】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、一本鎖もしくは二本鎖のＤＮＡもしくはＲＮＡ、またはそれらのキメラ混合物もしくは誘導体もしくは修飾されたバージョンであり得る。オリゴヌクレオチドは、例えば、分子の安定性、そのハイブリダイゼーション能力などを改善するために、塩基の基、糖の基またはリン酸骨格において修飾され得る。オリゴヌクレオチドは、他の結合基（例えば、ペプチド（例えば、オリゴヌクレオチドを宿主細胞のレセプターに導くためのペプチド）または細胞膜を通じた輸送を促進するための物質（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８６：６５５３−６５５６，１９８９；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８４：６４８−６５２，１９８７；ＰＣＴ公開番号ＷＯ８８／０９８１０を参照のこと）もしくは血液脳関門を通じた輸送を促進するための物質（例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ８９／１０１３４を参照のこと）、挿入剤（例えば、Ｚｏｎ，Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．５：５３９−５４９，１９８８を参照のこと））を含み得る。このために、オリゴヌクレオチドは、別の分子、例えば、ペプチド、輸送剤（ｔｒａｎｓｐｏｒｔｉｎｇ  ａｇｅｎｔ）、ハイブリダイゼーションによって惹起される切断剤などに結合体化され得る。
【０２２５】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、修飾された塩基の少なくとも１つの基を含み得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アラビノース、２−フルオロアラビノース、キシルロースおよびヘキソースを含むがこれらに限定されない群から選択される少なくとも１つの修飾された糖の基も含み得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、中性ペプチドに類似の骨格も含み得る。そのような分子は、ペプチド核酸（ＰＮＡ）オリゴマーとして知られており、例えば、Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９３：１４６７０，１９９６およびＥｇｌｏｍら、Ｎａｔｕｒｅ  ３６５：５６６，１９９３に記載されている。
【０２２６】
なおも別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾されたリン酸骨格を含む。なおも別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アルファ−アノマーオリゴヌクレオチドである。
【０２２７】
標的ｍＲＮＡ配列のコード領域に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを使用することができるが、転写される非翻訳領域に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを使用することもできる。
【０２２８】
場合によっては、内因性のｍＲＮＡ翻訳を抑制するのに十分な細胞内濃度のアンチセンスに到達することが難しいことがある。ゆえに、好ましいアプロキシメーションは、アンチセンスオリゴヌクレオチドを強力なｐｏｌ  ＩＩＩまたはｐｏｌ  ＩＩプロモーターの支配下に配置した組換えＤＮＡ構築物を使用する。
【０２２９】
あるいは、遺伝子制御領域（すなわち、プロモーターおよび／またはエンハンサー）に相補的なデオキシリボヌクレオチド配列に、体内の標的細胞において遺伝子転写を妨げる三重らせん構造を形成するように指示することによって、標的遺伝子発現を減少させることができる（Ｈｅｌｅｎｅ，Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｓ．６（６）：５６９−８４，１９９１を広く参照のこと）。ある特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アンチセンスモルホリンである。
【０２３０】
ｓｉＲＮＡ
低分子干渉ＲＮＡまたはｓｉＲＮＡは、ＲＮＡ干渉によって標的遺伝子の発現を阻害することができる物質である。ｓｉＲＮＡは、化学的に合成され得るか、インビトロ転写によって得ることができるか、または標的細胞においてインビボで合成され得る。代表的には、ｓｉＲＮＡは、１５〜４０ヌクレオチド長の二本鎖ＲＮＡからなり、１〜６ヌクレオチドの３’および／または５’突出領域を含み得る。その突出領域の長さは、ｓｉＲＮＡ分子の全長と無関係である。ｓｉＲＮＡは、転写後の標的メッセンジャーの分解またはサイレンシングによって作用する。
【０２３１】
本発明のｓｉＲＮＡは、ｃ−ＭＡＦをコードする遺伝子のｍＲＮＡまたは上記タンパク質をコードする遺伝子配列と実質的に相同である。「実質的に相同」は、ｓｉＲＮＡが、ＲＮＡ干渉によって後者を分解することができるほど、標的ｍＲＮＡと十分に相補的または類似である配列を有すると理解される。上記干渉を引き起こすために適したｓｉＲＮＡとしては、ＲＮＡによって形成されるｓｉＲＮＡ、ならびに種々の化学修飾を含むｓｉＲＮＡ、例えば：
・ヌクレオチド間の結合が天然に見られる結合と異なる（例えば、ホスホロチオネート結合）ｓｉＲＮＡ
・フルオロフォアなどの機能的な試薬とＲＮＡ鎖の結合体
・２’位の種々のヒドロキシル官能基での修飾による、ＲＮＡ鎖の末端、特に３’末端の修飾
・２’−Ｏ−メチルリボースまたは２’−Ｏ−フルオロリボースのような２’位におけるＯ−アルキル化残基などの改変された糖を有するヌクレオチド
・ハロゲン化された塩基（例えば、５−ブロモウラシルおよび５−ヨードウラシル）、アルキル化された塩基（例えば、７−メチルグアノシン）などの改変された塩基を有するヌクレオチド
が挙げられる。
【０２３２】
ｓｉＲＮＡは、そのままで、すなわち、上述の特徴を有する二本鎖ＲＮＡの形態で、使用され得る。あるいは、ｓｉＲＮＡのセンス鎖配列およびアンチセンス鎖配列を含むベクターを、目的の細胞におけるその発現に好適なプロモーターの支配下で使用することが、可能である。
【０２３３】
ｓｉＲＮＡの発現に適したベクターは、ｓｉＲＮＡの２本の鎖をコードする２つのＤＮＡ領域が、転写の際にループを形成するスペーサー領域によって分断された１本の同じＤＮＡ鎖においてタンデムに配置されているベクターであり、単一のプロモーターが、ｓｈＲＮＡを生じるＤＮＡ分子の転写を指示する。
【０２３４】
あるいは、ｓｉＲＮＡを形成する各鎖が、異なる転写単位の転写から形成されるベクターを使用することも可能である。これらのベクターは、その後、分岐（ｄｉｖｅｒｇｅｎｔ）転写ベクターと収束（ｃｏｎｖｅｒｇｅｎｔ）転写ベクターとに分割される。分岐転写ベクターでは、ｓｉＲＮＡを形成する各ＤＮＡ鎖の転写が、同じであっても異なってもよいそれ自体のプロモーターに依存するように、その各ＤＮＡ鎖をコードする転写単位が、ベクター内でタンデムに配置される（Ｗａｎｇ，Ｊ．ら、２００３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．，１００：５１０３−５１０６およびＬｅｅ，Ｎ．Ｓ．ら、２００２，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０：５００−５０５）。収束転写ベクターでは、ｓｉＲＮＡを生じるＤＮＡ領域は、２つの逆方向のプロモーターに隣接したＤＮＡ領域のセンス鎖およびアンチセンス鎖を形成する。センスおよびアンチセンスのＲＮＡ鎖の転写の後、後者は、機能的ｓｉＲＮＡを形成するためにハイブリッドを形成する。２つのＵ６プロモーター（Ｔｒａｎ，Ｎ．ら、２００３，ＢＭＣ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，３：２１）、マウスＵ６プロモーターおよびヒトＨ１プロモーター（Ｚｈｅｎｇ，Ｌ．ら、２００４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．，１３５−１４０およびＷＯ２００５０２６３２２）ならびにヒトＵ６プロモーターおよびマウスＨ１プロモーター（Ｋａｙｋａｓ，Ａ．ａｎｄ  Ｍｏｏｎ，Ｒ．，２００４，ＢＭＣ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．，５：１６）が使用される逆方向プロモーター系を有するベクターが記載されている。
【０２３５】
収束発現ベクターまたは分岐発現ベクターからのｓｉＲＮＡの発現におけるその使用に適したプロモーターには、ｓｉＲＮＡを発現させようとする細胞と適合性の任意のプロモーターまたはプロモーター対が含まれる。したがって、本発明に適したプロモーターとしては、構成的プロモーター（例えば、真核生物ウイルス（例えば、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、ＳＶ４０、ＣＭＶ、トリ肉腫ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス）のゲノムに由来するプロモーター）、メタロチオネイン遺伝子プロモーター、単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼ遺伝子プロモーター、レトロウイルスＬＴＲ領域、免疫グロブリン遺伝子プロモーター、アクチン遺伝子プロモーター、ＥＦ−１アルファ遺伝子プロモーター、ならびにタンパク質発現が分子または外来性シグナルの添加に依存する誘導性プロモーター、例えば、テトラサイクリンシステム、ＮＦカッパーＢ／ＵＶ光システム、Ｃｒｅ／Ｌｏｘシステムおよび熱ショック遺伝子プロモーター、ＷＯ／２００６／１３５４３６に記載されている制御可能なＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターならびに組織特異的プロモーター（例えば、ＷＯ２００６０１２２２１に記載されているＰＳＡプロモーター）が挙げられるが、必ずしもこれらに限定されない。好ましい実施形態において、プロモーターは、恒常的に作用するＲＮＡポリメラーゼＩＩＩプロモーターである。ＲＮＡポリメラーゼＩＩＩプロモーターは、限られた数の遺伝子（例えば、５Ｓ  ＲＮＡ、ｔＲＮＡ、７ＳＬ  ＲＮＡおよびＵ６  ｓｎＲＮＡ）にしか見られない。他のＲＮＡポリメラーゼＩＩＩプロモーターとは異なり、ＩＩＩ型プロモーターは、いかなる遺伝子内配列も必要とせず、むしろ、−３４および−２４位におけるＴＡＴＡボックス、−６６〜−４７の近位配列エレメントすなわちＰＳＥ、および場合によっては、−２６５〜−１４９位の遠位配列エレメントすなわちＤＳＥを含む５’方向の配列を必要とする。好ましい実施形態において、ＩＩＩ型ＲＮＡポリメラーゼＩＩＩプロモーターは、ヒトまたはマウスのＨ１遺伝子およびＵ６遺伝子のプロモーターである。なおもより好ましい実施形態において、プロモーターは、２つのヒトまたはマウスのＵ６プロモーター、マウスＵ６プロモーターおよびヒトＨ１プロモーターまたはヒトＵ６プロモーターおよびマウスＨ１プロモーターである。本発明の文脈において、ＥＲアルファ遺伝子プロモーターまたはサイクリンＤ１遺伝子プロモーターは、特に好適であり、ゆえに、乳房腫瘍、好ましくは、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳房腫瘍において目的の遺伝子を特異的に発現させるために特に好ましい。
【０２３６】
ｓｉＲＮＡは、ｓｉＲＮＡを形成する逆平行鎖がループまたはヘアピン領域によって接続されていることを特徴とするいわゆるｓｈＲＮＡ（短ヘアピンＲＮＡ）から細胞内に産生され得る。ｓｈＲＮＡは、プラスミドまたはウイルス、特にレトロウイルスによってコードされ得、プロモーターの支配下にある。ｓｈＲＮＡの発現に適したプロモーターは、ｓｉＲＮＡの発現についての上記のパラグラフにおいて示されたプロモーターである。
【０２３７】
ｓｉＲＮＡおよびｓｈＲＮＡの発現に適したベクターとしては、原核生物発現ベクター（例えば、ｐＵＣ１８、ｐＵＣ１９、Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔおよびそれらの誘導体、ｍｐ１８、ｍｐ１９、ｐＢＲ３２２、ｐＭＢ９、ＣｏＩＥｌ、ｐＣＲｌ、ＲＰ４）、ファージベクターおよびシャトルベクター（例えば、ｐＳＡ３およびｐＡＴ２８）、酵母発現ベクター（例えば、２−ミクロンプラスミドタイプのベクター、インテグレーションプラスミド、ＹＥＰベクター、セントロメアプラスミドなど）、昆虫細胞発現ベクター（例えば、ｐＡＣシリーズベクターおよびｐＶＬシリーズベクター）、植物発現ベクター（例えば、ｐＩＢＩ、ｐＥａｒｌｅｙＧａｔｅ、ｐＡＶＡ、ｐＣＡＭＢＩＡ、ｐＧＳＡ、ｐＧＷＢ、ｐＭＤＣ、ｐＭＹ、ｐＯＲＥシリーズベクターなど）およびウイルスベクターベース（アデノウイルス、アデノウイルス随伴ウイルスならびにレトロウイルス、特にレンチウイルス）の高等真核生物細胞発現ベクターまたは非ウイルスベクター（例えば、ｐｃＤＮＡ３、ｐＨＣＭＶ／Ｚｅｏ、ｐＣＲ３．１、ｐＥＦｌ／Ｈｉｓ、ｐＩＮＤ／ＧＳ、ｐＲｃ／ＨＣＭＶ２、ｐＳＶ４０／Ｚｅｏ２、ｐＴＲＡＣＥＲ−ＨＣＭＶ、ｐＵＢ６／Ｖ５−Ｈｉｓ、ｐＶＡＸｌ、ｐＺｅｏＳＶ２、ｐＣＩ、ｐＳＶＬおよびｐＫＳＶ−１０、ｐＢＰＶ−１、ｐＭＬ２ｄおよびｐＴＤＴｌ）が挙げられる。好ましい実施形態において、ベクターは、レンチウイルスベクターである。
【０２３８】
本発明のｓｉＲＮＡおよびｓｈＲＮＡは、当業者に公知の一連の技法を用いて得ることができる。ｓｉＲＮＡをデザインするための基礎と考えられるヌクレオチド配列の領域は、限定的でなく、それは、コード配列（開始コドンと終止コドンの間）の領域を含み得るか、またはあるいは、好ましくは、２５〜５０ヌクレオチド長で、開始コドンに対して３’方向の任意の位置の非翻訳５’または３’領域の配列を含み得る。ｓｉＲＮＡをデザインする１つの方法は、ＡＡ（Ｎ１９）ＴＴモチーフの識別（ここで、Ｎは、ｃ−ＭＡＦ遺伝子配列内の任意のヌクレオチドであり得る）および高Ｇ／Ｃ含有量を有するそれらのモチーフの選択を含む。上記モチーフが見つからない場合、ＮＡ（Ｎ２１）モチーフ（ここで、Ｎは、任意のヌクレオチドであり得る）を識別することができる。
【０２３９】
ｃ−ＭＡＦ特異的ｓｉＲＮＡには、ＷＯ２００５０４６７３１に記載されているｓｉＲＮＡが含まれ、その鎖のうちの一方は、ＡＣＧＧＣＵＣＧＡＧＣＡＧＣＧＡＣＡＡ（配列番号６）である。他のｃ−ＭＡＦ特異的ｓｉＲＮＡ配列としては、ＣＵＵＡＣＣＡＧＵＧＵＧＵＵＣＡＣＡＡ（配列番号７）、ＵＧＧＡＡＧＡＣＵＡＣＵＡＣＵＧＧＡＵＧ（配列番号８）、ＡＵＵＵＧＣＡＧＵＣＡＵＧＧＡＧＡＡＣＣ（配列番号９）、ＣＡＡＧＧＡＧＡＡＡＵＡＣＧＡＧＡＡＧＵ（配列番号１０）、ＡＣＡＡＧＧＡＧＡＡＡＵＡＣＧＡＧＡＡＧ（配列番号１１）およびＡＣＣＵＧＧＡＡＧＡＣＵＡＣＵＡＣＵＧＧ（配列番号１２）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２４０】
ＤＮＡ酵素
他方で、本発明は、本発明のｃ−ＭＡＦ遺伝子の発現を阻害するＤＮＡ酵素の使用も企図する。ＤＮＡ酵素は、アンチセンス技術とリボザイム技術の両方の機構的な特色のいくつかを組み込んでいる。ＤＮＡ酵素は、アンチセンスオリゴヌクレオチドと同様の特定の標的核酸配列を認識するが、それにもかかわらず、リボザイムと同様に触媒性であり、標的核酸を特異的に切断するように、デザインされる。
【０２４１】
リボザイム
活性が阻害されるべきであるｃ−ＭＡＦをコードするｍＲＮＡの翻訳を妨げるために標的ｍＲＮＡの転写産物を触媒的に切断するためにデザインされたリボザイム分子もまた、使用され得る。リボザイムは、特定のＲＮＡの切断を触媒することができる酵素的ＲＮＡ分子である（概説として、Ｒｏｓｓｉ，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ４：４６９−４７１，１９９４を参照のこと）。リボザイムの作用機序は、相補的な標的ＲＮＡへのリボザイム分子配列の特異的なハイブリダイゼーションとその後のエンドヌクレアーゼによる切断事象を含む。リボザイム分子の組成は、好ましくは、標的ｍＲＮＡに相補的な１つまたは複数の配列およびｍＲＮＡの切断を担う周知の配列または機能的に等価な配列を含む（例えば、米国特許第５０９３２４６号を参照のこと）。
【０２４２】
本発明において使用されるリボザイムは、エンドリボヌクレアーゼＲＮＡであるハンマーヘッド型リボザイム（本明細書中以後、「Ｃｅｃｈ型リボザイム」）（Ｚａｕｇら、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２４：５７４−５７８，１９８４を含む。
【０２４３】
リボザイムは、改変されたオリゴヌクレオチド（例えば、安定性、標的化などを改善するように改変されたオリゴヌクレオチド）によって形成され得、そしてそれらはインビボで標的遺伝子を発現する細胞に分配されるべきである。好ましい分配方法は、トランスフェクトされた細胞が、内因性の標的メッセンジャーを破壊して翻訳を阻害するのに十分な量のリボザイムを産生するように、強力な構成的ｐｏｌ  ＩＩＩまたはｐｏｌ  ＩＩプロモーターの支配下においてリボザイムを「コードする」ＤＮＡ構築物を使用することを含む。リボザイムは、触媒的であるので、他のアンチセンス分子とは異なり、その効率のために、低い細胞内濃度しか必要ない。
【０２４４】
阻害性抗体
本発明の文脈において、「阻害性抗体」は、ｃ−ＭＡＦタンパク質に特異的に結合して、上記タンパク質の機能の１つまたは複数、好ましくは、転写に関連する機能を阻害することができる任意の抗体と理解される。それらの抗体は、当業者に公知である任意の方法（そのうちのいくつかが上で述べられた）を使用して、調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ，Ｍｉｌｓｔｅｉｎら（Ｎａｔｕｒｅ，１９７５，２５６：４９５）によって記載された方法を用いて調製される。本発明の文脈において、好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、「Ｆａｂ」、「Ｆ（ａｂ’）２」および「Ｆａｂ’」、Ｆｖ、ｓｃＦｖフラグメント、ダイアボディ、二重特異性抗体、アルファボディ、シクロペプチドおよびステープルドペプチドが挙げられる。いったん、ｃ−ＭＡＦタンパク質結合能を有する抗体が同定されたら、このタンパク質の活性を阻害することができる抗体が、阻害剤識別アッセイを用いて選択される。
【０２４５】
阻害性ペプチド
本明細書中で使用されるとき、用語「阻害性ペプチド」とは、上で説明されたようにｃ−ＭＡＦタンパク質に結合してその活性を阻害することができる、すなわち、ｃ−ＭＡＦの遺伝子転写を活性化させることができることを妨げる、ペプチドのことを指す。
【０２４６】
ネガティブｃ−ＭＡＦドミナント
ＭＡＦファミリーのタンパク質は、ホモ二量体化およびＡＰ−１ファミリーの他のメンバー（例えば、ＦｏｓおよびＪｕｎ）とのヘテロ二量体化をすることができるので、ｃ−ＭＡＦ活性を阻害する１つの方法は、ｃ−ＭＡＦと二量体化することができるが転写を活性化させる能力を欠くネガティブドミナントの使用によるものである。したがって、ネガティブｃ−ＭＡＦドミナントは、細胞に存在し、トランス活性化ドメイン（例えば、ｍａｆＫ、ｍａｆＦ、ｍａｆｇおよびｐｉ８）を含むアミノ末端の３分の２を欠く、任意の小さいｍａｆタンパク質であり得る（Ｆｕｊｉｗａｒａら（１９９３）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  ８，２３７１−２３８０；Ｉｇａｒａｓｈｉら（１９９５）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７０，７６１５−７６２４；Ａｎｄｒｅｗｓら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０，１１４８８−１１４９２；Ｋａｔａｏｋａら（１９９５）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１５，２１８０−２１９０）（Ｋａｔａｏｋａら（１９９６）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  １２，５３−６２）。
【０２４７】
あるいは、ネガティブｃ−ＭＡＦドミナントには、他のタンパク質と二量体化する能力を維持しているが転写を活性化する能力を欠くｃ−ＭＡＦバリアントが含まれる。これらのバリアントは、例えば、タンパク質のＮ末端に位置するｃ−ＭＡＦトランス活性化ドメインを欠いているバリアントである。したがって、例証的な様式では、ネガティブｃ−ＭＡＦドミナントバリアントには、少なくともアミノ酸１〜１２２、少なくともアミノ酸１〜１８７または少なくともアミノ酸１〜２５７（米国特許第６２７４３３８号に記載されているようなヒトｃ−ＭＡＦのナンバリングを考慮することによって）が除去されているバリアントが含まれる。
【０２４８】
本発明は、ネガティブｃ−ＭＡＦドミナントバリアントと、標的細胞における発現に適したプロモーターの作動性の支配下のｃ−ＭＡＦをコードするポリヌクレオチドとの両方の使用を企図する。本発明のポリヌクレオチド転写を制御するために使用され得るプロモーターは、構成的プロモーター、すなわち、基底レベルの転写を指示するプロモーター、または転写活性に外部のシグナルが必要である誘導性プロモーターであり得る。転写の制御に適した構成的プロモーターは、とりわけ、ＣＭＶプロモーター、ＳＶ４０プロモーター、ＤＨＦＲプロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルス（ＭＭＴＶ）プロモーター、１ａ伸長因子（ＥＦ１ａ）プロモーター、アルブミンプロモーター、ＡｐｏＡ１プロモーター、ケラチンプロモーター、ＣＤ３プロモーター、免疫グロブリン重鎖または軽鎖プロモーター、ニューロフィラメントプロモーター、ニューロン特異的エノラーゼプロモーター、Ｌ７プロモーター、ＣＤ２プロモーター、ミオシン軽鎖キナーゼプロモーター、ＨＯＸ遺伝子プロモーター、チミジンキナーゼプロモーター、ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーター、ＭｙｏＤ遺伝子プロモーター、ホスホグリセリン酸キナーゼ（ＰＧＫ）遺伝子プロモーター、低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）プロモーター、アクチン遺伝子プロモーターである。好ましい実施形態において、トランス活性化因子の発現を制御するプロモーターは、ＰＧＫ遺伝子プロモーターである。好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド転写を制御するプロモーターは、Ｔ７ファージのＲＮＡポリメラーゼプロモーターである。
【０２４９】
好ましくは、本発明の文脈において使用され得る誘導性プロモーターは、誘導剤（inducer  agent）の非存在下ではゼロまたは無視できる基底発現を示す誘導剤に応答するプロモーターであり、３’位に位置する遺伝子の活性化を促進することができる。誘導剤のタイプに応じて、誘導性プロモーターは、Ｔｅｔ  ｏｎ／ｏｆｆプロモーター（Ｇｏｓｓｅｎ，Ｍ．ａｎｄ  Ｈ．Ｂｕｊａｒｄ（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：５５４７−５５５１；Ｇｏｓｓｅｎ，Ｍ．ら、１９９５，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６８：１７６６−１７６９；Ｒｏｓｓｉ，Ｆ．Ｍ．Ｖ．ａｎｄ  Ｈ．Ｍ．Ｂｌａｕ，１９９８，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．９：４５１−４５６）；Ｐｉｐ  ｏｎ／ｏｆｆプロモーター（米国特許第６２８７８１３号）；抗黄体ホルモン依存性プロモーター（ＵＳ２００４１３２０８６）、エクジソン依存性プロモーター（Ｃｈｒｉｓｔｏｐｈｅｒｓｏｎら、１９９２，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：６３１４−６３１８；Ｎｏら、１９９６，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９３：３３４６−３３５１，Ｓｕｈｒら、１９９８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９５：７９９９−８００４およびＷＯ９７３８１１７）、メタロチオネイン依存性プロモーター（ＷＯ８６０４９２０）およびラパマイシン依存性プロモーター（Ｒｉｖｅｒａら、１９９６，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．２：１０２８−３２）として分類される。
【０２５０】
ネガティブｃ−ＭＡＦドミナントバリアントをコードするポリヌクレオチドの発現に適したベクターとしては、原核生物発現ベクター由来のベクター（例えば、ｐＵＣ１８、ｐＵＣ１９、Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔおよびそれらの誘導体、ｍｐ１８、ｍｐ１９、ｐＢＲ３２２、ｐＭＢ９、ＣｏｌＥｌ、ｐＣＲｌ、ＲＰ４）、ファージおよびシャトルベクター（例えば、ｐＳＡ３およびｐＡＴ２８）、酵母発現ベクター（例えば、２−ミクロンタイプのプラスミドベクター、インテグレーションプラスミド、ＹＥＰベクター、セントロメアプラスミドなど）、昆虫細胞発現ベクター（例えば、ｐＡＣシリーズベクターおよびｐＶＬシリーズベクター）、植物発現ベクター（例えば、ｐＩＢＩ、ｐＥａｒｌｅｙＧａｔｅ、ｐＡＶＡ、ｐＣＡＭＢＩＡ、ｐＧＳＡ、ｐＧＷＢ、ｐＭＤＣ、ｐＭＹ、ｐＯＲＥシリーズベクターなど）およびウイルスベクターベース（アデノウイルス、アデノウイルス随伴ウイルスならびにレトロウイルスおよび特にレンチウイルス）の高等真核生物細胞発現ベクターまたは非ウイルスベクター（例えば、ｐＳｉｌｅｎｃｅｒ  ４．１−ＣＭＶ（Ａｍｂｉｏｎ）、ｐｃＤＮＡ３、ｐｃＤＮＡ３．１／ｈｙｇ  ｐＨＣＭＶ／Ｚｅｏ、ｐＣＲ３．１、ｐＥＦｌ／Ｈｉｓ、ｐＩＮＤ／ＧＳ、ｐＲｃ／ＨＣＭＶ２、ｐＳＶ４０／Ｚｅｏ２、ｐＴＲＡＣＥＲ−ＨＣＭＶ、ｐＵＢ６／Ｖ５−Ｈｉｓ、ｐＶＡＸｌ、ｐＺｅｏＳＶ２、ｐＣＩ、ｐＳＶＬおよびｐＫＳＶ−１０、ｐＢＰＶ−１、ｐＭＬ２ｄおよびｐＴＤＴｌ）が挙げられる。
【０２５１】
小分子
本発明における使用に適した他のｃ−ＭＡＦ阻害性化合物としては：
【表１−１】
2018102316.tif 000002
【表１−２】
2018102316.tif 000003
【表１−３】
2018102316.tif 000004
【表１−４】
2018102316.tif 000005
【表１−５】
2018102316.tif 000006
【０２５２】
他のｃ−ＭＡＦインヒビターは、特許出願ＷＯ２００５０６３２５２（その全体が本明細書中に参照により援用される）に記載されている（例えば、以下の表（表２）に示されるもの）。
【表２−１】
2018102316.tif 000007
【表２−２】
2018102316.tif 000008
【表２−３】
2018102316.tif 000009
【０２５３】
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０２５４】
ｃ−ＭＡＦ阻害剤は、代表的には、薬学的に許容され得るキャリアとともに投与される。
【０２５５】
用語「キャリア」とは、希釈剤または賦形剤のことを指し、それによって、活性成分が投与される。そのような薬学的キャリアは、滅菌された液体（例えば、水および油（石油、動物、植物または合成起源のものを含む（例えば、落花生油、大豆油、鉱油、ゴマ油など）））であり得る。特に注射可能な溶液用の、水または食塩水溶液ならびにデキストロース水溶液およびグリセロール水溶液が、キャリアとして使用されるのが好ましい。好適な薬学的キャリアは、Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎ，１９９５によって「Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ」に記載されている。好ましくは、本発明のキャリアは、州政府もしくは連邦政府の規制当局によって承認されたものであるか、または米国薬局方、もしくは動物、より具体的には人間におけるその使用について一般に認識されている他の薬局方に列挙されているものである。
【０２５６】
本発明の薬学的組成物の所望の薬学的剤形を製造するために必要なキャリアおよび補助物質は、他の因子のなかでも、選択される薬学的剤形に依存する。薬学的組成物の前記薬学的剤形は、当業者に公知の従来の方法に従って製造されるだろう。活性成分を投与するための種々の方法、使用されるべき賦形剤およびそれらを生成するためのプロセスの概説は、「Ｔｒａｔａｄｏ  ｄｅ  Ｆａｒｍａｃｉａ  Ｇａｌｅｎｉｃａ」，Ｃ．Ｆａｕｌｉ
ｉ  Ｔｒｉｌｌｏ，Ｌｕｚａｎ  ５，Ｓ．Ａ．１９９３  Ｅｄｉｔｉｏｎに見られる。薬学的組成物の例としては、経口投与、局所投与または非経口投与用の、任意の固体組成物（錠剤、丸剤、カプセル剤、顆粒剤など）または液体組成物（溶液、懸濁液またはエマルジョン）が挙げられる。さらに、薬学的組成物は、必要であると見なされる場合、安定剤、懸濁剤、保存剤、界面活性剤などを含み得る。
【０２５７】
医薬において使用するために、ｃ−ＭＡＦ阻害剤は、単離されたものとして、またはさらなる活性剤とともに、プロドラッグ、塩、溶媒和化合物もしくは包接化合物の形態で見出され得、薬学的に許容され得る賦形剤とともに製剤化され得る。本発明におけるその使用にとって好ましい賦形剤としては、糖、デンプン、セルロース、ゴムおよびタンパク質が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の薬学的組成物は、固体の薬学的剤形（例えば、錠剤、カプセル剤、丸剤、顆粒剤、坐剤、液体の形態を得るために再構成され得る滅菌された結晶または無定形固体など）、液体の薬学的剤形（例えば、溶液、懸濁液、エマルジョン、エリキシル剤、ローション、軟膏など）または半固体の薬学的剤形（ゲル、軟膏、クリームなど）として製剤化されるだろう。本発明の薬学的組成物は、経口経路、静脈内経路、筋肉内経路、動脈内経路、髄内（ｉｎｔｒａｍｅｄｕｌａｒｒｙ）経路、鞘内経路、心室内経路（ｉｎｔｒａｖｅｎｔｒｉｃｕｌａｒ  ｒｏｕｔｅｒ）、経皮的経路、皮下経路、腹腔内経路、鼻腔内経路、腸管経路、局所経路、舌下経路または直腸経路が挙げられるがこれらに限定されない任意の経路によって投与され得る。活性成分を投与するための種々の方法、使用されるべき賦形剤およびそれらの製造プロセスの概説は、Ｔｒａｔａｄｏ  ｄｅ  Ｆａｒｍａｃｉａ  Ｇａｌｅｎｉｃａ，Ｃ．Ｆａｕｌｉ  ｉ  Ｔｒｉｌｌｏ，Ｌｕｚａｎ  ５，Ｓ．Ａ．，１９９３  ＥｄｉｔｉｏｎおよびＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ，Ｅｄ．），２０ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ  ＰＡ，ＵＳＡ（２０００）に見られる。薬学的に許容され得るキャリアの例は、当該分野において公知であり、それらとしては、リン酸緩衝食塩水溶液、水、エマルジョン（例えば、油／水エマルジョン）、種々のタイプの湿潤剤、滅菌された溶液などが挙げられる。前記キャリアを含む組成物は、当該分野で公知の従来のプロセスによって製剤化され得る。
【０２５８】
核酸（ｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡもしくはｓｈＲＮＡをコードするポリヌクレオチド、またはネガティブｃ−ＭＡＦドミナントをコードするポリヌクレオチド）が投与される場合、本発明は、前記核酸を投与するために個々に調製された薬学的組成物を企図する。その薬学的組成物は、前記裸の核酸、すなわち、身体のヌクレアーゼによる分解から核酸を保護する化合物の非存在下の核酸を含み得、それは、トランスフェクションのために使用される試薬に関連する毒性が排除されるという利点を必要とする。裸の化合物に適した投与経路としては、血管内経路、腫瘍内経路、頭蓋内経路、腹腔内経路、脾臓内経路、筋肉内経路、網膜下経路、皮下経路、粘膜経路、局所経路および経口経路が挙げられる（Ｔｅｍｐｌｅｔｏｎ，２００２，ＤＮＡ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．，２１：８５７−８６７）。あるいは、それらの核酸は、コレステロールに結合体化された、または細胞膜を通過して転座を促進することができる化合物（例えば、ＨＩＶ−１  ＴＡＴタンパク質由来のＴａｔペプチド、Ｄ．ｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒアンテナペディアタンパク質のホメオドメインの３番目のらせん、単純ヘルペスウイルスＶＰ２２タンパク質、アルギニンオリゴマー、およびＷＯ０７０６９０９０に記載されているようなペプチド）に結合体化された、リポソームの一部を形成して、投与され得る（Ｌｉｎｄｇｒｅｎ，Ａ．ら、２０００，Ｔｒｅｎｄｓ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｓｃｉ，２１：９９−１０３、Ｓｃｈｗａｒｚｅ，Ｓ．Ｒ．ら、２０００，Ｔｒｅｎｄｓ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｓｃｉ．，２１：４５−４８、Ｌｕｎｄｂｅｒｇ，Ｍら、２００３，Ｍｏｌ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ８：１４３−１５０およびＳｎｙｄｅｒ，Ｅ．Ｌ．ａｎｄ  Ｄｏｗｄｙ，Ｓ．Ｆ．，２００４，Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．２１：３８９−３９３）。あるいは、そのポリヌクレオチドは、アデノ随伴ウイルスまたはレトロウイルス（例えば、マウス白血病ウイルス（ＭＬＶ）またはレンチウイルス（ＨＩＶ、ＦＩＶ、ＥＩＡＶ）に基づくウイルス）において、プラスミドベクターまたはウイルスベクター、好ましくは、アデノウイルスベースのベクターの一部を形成して、投与され得る。
【０２５９】
ｃ−ＭＡＦ阻害剤またはそれらを含む薬学的組成物は、体重１キログラムあたり１０ｍｇ未満、好ましくは、体重１ｋｇあたり５、２、１、０．５、０．１、０．０５、０．０１、０．００５、０．００１、０．０００５、０．０００１、０．００００５または０．００００１ｍｇ未満の用量で投与され得る。単位用量は、注射、吸入または局所投与によって投与され得る。
【０２６０】
用量は、処置される状態の重症度および応答に依存し、それは、数日間〜数ヶ月間またはその状態が鎮静するまで、変動し得る。患者の身体におけるその薬剤の濃度を定期的に測定することによって、最適な投与量が決定され得る。動物モデルにおける事前のインビトロまたはインビボアッセイによって得られるＥＣ５０値から、最適な用量が決定され得る。単位用量は、１日に１回または１日に１回未満、好ましくは、２、４、８または３０日ごとに１回未満で投与され得る。あるいは、開始用量の後、１回または数回の維持用量（通常、開始用量よりも少ない量）を投与することが可能である。維持レジメンは、０．０１μｇ〜１．４ｍｇ／ｋｇ体重／日、例えば、１０、１、０．１、０．０１、０．００１または０．００００１ｍｇ／ｋｇ体重／日の用量範囲での患者の処置を含み得る。維持用量は、好ましくは、５、１０または３０日ごとにせいぜい１回投与される。処置は、患者が罹患している障害のタイプ、その重症度および患者の状態に従って変動する時間にわたって継続されなければならない。処置の後、その疾患がその処置に応答しない場合、用量を増加すべきかどうか、またはその疾患の改善がみとめられる場合もしくは望まれない副作用がみとめられる場合、用量を減少させるかどうかを決定するために、患者の進行をモニターしなければならない。
【０２６１】
上昇したｃ−ＭＡＦレベルを有する、骨転移を伴う乳がん患者における骨分解の処置または予防
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したｃ−ＭＡＦレベルを有する被験体における骨転移の処置において使用するための、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができる薬剤に関する。
【０２６２】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したｃ−ＭＡＦレベルを有する被験体における骨転移の処置のための医薬を製造するための、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができる薬剤の使用に関する。
【０２６３】
あるいは、本発明は、乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したｃ−ＭＡＦレベルを有する被験体における分解の予防および／または処置の方法に関し、その方法は、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、または骨分解を回避するためもしくは予防するための薬剤を前記被験体に投与する工程を含む。
【０２６４】
特定の実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
【０２６５】
本発明に記載される治療方法に適した、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、および骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤は、個別化治療法の文脈において、上で詳細に記載されている。
【０２６６】
参照サンプルまたはコントロールサンプルは、転移に罹患していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんもしくはあるいはＥＲ＋乳がんを有する被験体のサンプル、または転移に罹患していないトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて計測されたｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
【０２６７】
ｃ−ＭＡＦレベルがコントロールサンプルと比較して上昇しているかどうかを決定するためまたは定量するための方法は、本発明の第１の方法に関して詳細に記載されてきたが、骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤にも等しく適用可能である。
【０２６８】
あるいは、骨分解を回避するためまたは予防するための、上で述べられた薬剤のうちの２つ以上の薬剤が組合わされることにより転移が処置されるおよび／もしくは予防される組合わせ処置が行われ得るか、または前記薬剤が、他のサプリメント（例えば、カルシウムまたはビタミンＤ）もしくはホルモンと組合わされ得る。
【０２６９】
骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤は、代表的には、薬学的に許容され得るキャリアとともに投与される。用語「キャリア」およびキャリアのタイプは、ｃ−ＭＡＦ阻害剤、ならびにそれらが投与され得る形態および用量について上で定義されてきたが、骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤にも等しく適用可能である。
【０２７０】
以下の例は、本発明を例証するものであって、その範囲を限定しない。
【０２７１】
本発明のキット
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのキットに関し、そのキットは：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；およびｂ）前記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段を備える。
【０２７２】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブの基底細胞様乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するためのキットに関し、そのキットは：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；およびｂ）前記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段を備える。
【０２７３】
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するためのキットに関し、そのキットは：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段；ｂ）前記サンプル中の定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルを参照ｃ−ＭＡＦ発現レベルと比較するための手段；およびｃ）定量された発現レベルと参照発現レベルとの比較に基づいて、前記被験体において骨転移を予防するためおよび／または減少させるための治療を決定するための手段を備える。
【０２７４】
別の態様において、本発明は、ｉ）トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはあるいはＥＲ＋乳がんに罹患している被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための試薬、およびｉｉ）骨転移のリスクと相関するように予め決定されている１つまたは複数のｃ−ＭＡＦ遺伝子発現レベル指標を備えるキットに関する。
【０２７５】
１６ｑ２３および１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅および転座を含む前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段は、先に詳細に記載された。
【０２７６】
好ましい実施形態において、発現を定量するための手段は、ｃ−ＭＡＦ遺伝子に特異的に結合および／または増幅するプローブおよび／またはプライマーのセットを含む。
【０２７７】
特定の実施形態において、乳がんは、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんである。
【０２７８】
本発明の方法の特定の実施形態のすべてが、本発明のキットおよびそれらの使用に適用可能である。
【０２７９】
乳がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするための方法
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするためのインビトロでの方法に関し、その方法は：
ａ）前記被験体からサンプルを提供する工程；
ｂ）前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量する工程；
ｃ）定量されたｃ−ＭＡＦの発現レベルをｃ−ＭＡＦ発現の所定の参照レベルと比較することによって前記サンプルをタイプ分けする工程；
を含み、ここで、前記タイプ分けは、前記被験体における骨転移のリスクに関する予後情報を提供する。
【０２８０】
１６ｑ２３および１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅および転座を含む、前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段は、先に詳細に記載された。
【０２８１】
特定の実施形態において、乳がんは、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんである。
【０２８２】
好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【０２８３】
乳がんに罹患している被験体を分類するための方法
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体をコホートに分類するための方法に関し、その方法は：ａ）前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを決定する工程；ｂ）前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルをｃ−ＭＡＦ発現の所定の参照レベルと比較する工程；およびｃ）そのサンプル中のｃ−ＭＡＦの前記発現レベルに基づいて、前記被験体をコホートに分類する工程を含む。
【０２８４】
１６ｑ２３および１６ｑ２２−２４遺伝子座の増幅および転座を含む、前記被験体のサンプル中のｃ−ＭＡＦの発現レベルを定量するための手段は、先に詳細に記載された。
【０２８５】
特定の実施形態において、乳がんは、トリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がんまたはＥＲ＋（ルミナルＡおよびＢを含む）乳がんである。
【０２８６】
好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【０２８７】
好ましい実施形態において、前記コホートは、前記参照発現レベルと比較して、匹敵するｃ−ＭＡＦ発現レベルを有すると判定された少なくとも１つの他の個体を含む。
【０２８８】
別の好ましい実施形態において、前記サンプル中のｃ−ＭＡＦの前記発現レベルは、前記所定の参照レベルと比べて上昇しており、コホートのメンバーは、骨転移の上昇したリスクを有すると分類される。別の好ましい実施形態において、前記コホートは、臨床試験を行うためのコホートである。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
【実施例】
【０２８９】
コホートＩ．乳がん原発腫瘍コホートの発見
ヒト乳房腫瘍を、ＰＡＭ５０  Ｂｒｅａｓｔ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｔｒｉｎｓｉｃ  Ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒに記載されているような５つのサブタイプに分類し、次いで、これらの腫瘍におけるｃ−ＭＡＦ（ＭＡＦ）発現が所与のサブタイプのいくつかにおいて骨転移事象と相関するかを確かめるために、適切な統計解析を行った。ＰＡＭ５０は、基底細胞様と命名されたサブタイプを有する。その代わりに、トリプルネガティブの群を使用した。患者の情報は、ＧＥＯ（Ｔ．Ｂａｒｒｅｔｔ，Ｄ．Ｂ．Ｔｒｏｕｐ，Ｓ．Ｅ．Ｗｉｌｈｉｔｅ，Ｐ．Ｌｅｄｏｕｘ，Ｄ．Ｒｕｄｎｅｖ，Ｃ．Ｅｖａｎｇｅｌｉｓｔａ，Ｉ．Ｆ．Ｋｉｍ，Ａ．Ｓｏｂｏｌｅｖａ，Ｍ．Ｔｏｍａｓｈｅｖｓｋｙ，ａｎｄ  Ｒ．Ｅｄｇａｒ．ＮＣＢＩ  ＧＥＯ：ｍｉｎｉｎｇ  ｔｅｎｓ  ｏｆ  ｍｉｌｌｉｏｎｓ  ｏｆ  ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｐｒｏｆｉｌｅｓ−ｄａｔａｂａｓｅ  ａｎｄ  ｔｏｏｌｓ  ｕｐｄａｔｅ．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，３５，Ｊａｎｕａｒｙ  ２００７．ＩＳＳＮ  １３６２−４９６２））からダウンロードした。以下のデータセットを使用した：ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６の組み合わせ。この組み合わせコホートは、５６０人の患者を有した。体系的なバイアス（systematic  biase
）を排除するために、マージする前に、すべての遺伝子の発現の測定値をｚ−スコアに変換した。すべての統計解析を、Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒ（Ｒ．Ｃ．Ｇｅｎｔｌｅｍａｎ，Ｖ．Ｊ．Ｃａｒｅｙ，Ｄ．Ｍ．Ｂａｔｅｓ，Ｂ．Ｂｏｌｓｔａｄ，Ｍ．Ｄｅｔｔｌｉｎｇ，ｏＳ．Ｄｕ−ｄｏｉｔ，Ｂ．Ｅｌｌｉｓ，Ｌ．Ｇａｕｔｉｅｒ，Ｙ．Ｇｅ，Ｊ．Ｇｅｎｔｒｙ，Ｋ．Ｈｏｒｎｉｋ，Ｔ．Ｈｏｔｈｏｒｎ，Ｗ．Ｈｕｂｅｒ，Ｓ．Ｉａｃｕｓ，Ｒ．Ｉｒｉｚａｒｒｙ，Ｆ．Ｌｅｉｓｃｈ，Ｃ．Ｌｉ，Ｍ．Ｍａｅｃｈｌｅｒ，  Ａ．Ｊ．Ｒｏｓｓｉｎｉ，Ｇ．Ｓａｗｉｔｚｋｉ，Ｃ．Ｓｍｉｔｈ，Ｇ．Ｓｍｙｔｈ，Ｌ．Ｔｉｅｒｎｅｙ，Ｊ．Ｙ．Ｈ．Ｙａｎｇ，ａｎｄ  Ｊ．Ｚｈａｎｇ．Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒ：Ｏｐｅｎ  ｓｏｆｔｗａｒｅ  ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  ｆｏｒ  ｃｏｍｐｕｔａ−ｔｉｏｎａｌ  ｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．Ｇｅｎｏｍｅ
Ｂｉｏｌｏｇｙ，５：Ｒ８０，２００４．ＵＲＬ  ｈｔｔｐ：／／ｇｅｎｏｍｅｂｉｏｌｏｇｙ．ｃｏｍ／２００４／５／１０／Ｒ８０）を使用して行った。
【０２９０】
コホートＩＩ．乳がん原発腫瘍サンプルコホートの検証：
【０２９１】
上記の患者腫瘍サンプルコホートＩで見出された仮説を検証するために、第２のヒト乳房腫瘍コホートを使用した。独立した検証セットは、ステージＩ、ＩＩまたはＩＩＩ  ＢＣを有し、追跡の注釈が付けられている患者由来の３８０個より多くの原発乳がん検体から構成される（Ｒｏｊｏ  Ｆ．，Ａｎｎ  Ｏｎｃｏｌ（２０１２）２３（５）：１１５６−１１６４）。組織マイクロアレイを標準的な手順に従って処理した。腫瘍を、ＥＲ＋、トリプルネガティブおよびＨＥＲ２＋に従って３つのサブタイプに分類し、次いで、これらの腫瘍におけるｃ−ＭＡＦ（ＭＡＦ）発現および１６ｑ２２−２４増幅が所与のサブタイプのいくつかにおいて骨転移事象と相関するかを確かめるために、適切な統計解析を行った。
【０２９２】
この第２のコホートにおける統計解析は、以下の前提に基づいた：
【０２９３】
ｉ）ベースラインの特徴の比較（表３および６）。
【０２９４】
年齢の分散の一様性を、Ｆｏｌｄｅｄ  Ｆ検定を用いて検定する。年齢の平均値の差異を、分散の一様性に応じて、プールされた（ｐｏｏｌｅｄ）ｔ検定またはＳａｔｔｅｒｈｗａｉｔｅ  ｔ検定（複数のカテゴリーを比較するための、ＡＮＯＶＡまたはＫｒｕｓｋａｌ−Ｗａｌｌｉｓ）を用いて検定する。適用できる場合、分類変数を、カイ二乗検定またはＦｉｓｈｅｒ検定を用いて比較する。
【０２９５】
ｉｉ）ＦＩＳＨおよびＩＨＣの診断性能
【０２９６】
ｐ＜０：２の変数を算入するためのｐ値の判定基準および調整後のモデルにおいてｐ＜０．１０の変数を保持するための判定基準を用いるステップワイズ選択（ｓｔｅｐｗｉｓｅ  ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ）を介して、多変量解析を行う。診断性能は、ＲＯＣ曲線のＡＵＣを比較することによって評価される。モデルの適合度は、Ｈｏｓｍｅｒ−Ｌｅｍｅｓｈｏｗ検定を用いて評価される（有意である場合、さらなる解析は行わない）。
【０２９７】
最も予測的な変数（１６ｑ２３  ＦＩＳＨおよびＭＡＦ  ＩＨＣ）に基づいて、各分類カテゴリーに対して感度（Ｓｅ）、特異度（Ｓｐ）、陽性予測値（ＰＰＶ）および陰性予測値（ＮＰＶ）を計算する。データの過適合の問題を克服するために、ＰＰＶおよびＮＰＶのブートストラッピングを行う。
【０２９８】
ｉｉｉ）予後診断の役割
【０２９９】
骨転移までの結果時間（ｏｕｔｃｏｍｅ  ｔｉｍｅ）のＣｏｘ回帰モデリングを、同順位の「ｅｆｒｏｎ」マネジメントを用いて行う。事象の数は、それらのモデルに入れられる変数の数を操る（各５〜１０事象につき約１変数）。
【０３００】
比例ハザード仮説は、ＳＡＳ９．３に実装されているように、比例ハザード仮説について上限検定（ｓｕｐｒｅｍｕｍ  ｔｅｓｔ）を用いて調べられる。この仮説が棄却される場合、この検定は、有意なｐ値をもたらす。
【０３０１】
乳がんサブタイプの分類
組み合わせコホート（発見コホートＩ）のＰＡＭ５０遺伝子を、ＰＡＭ５０遺伝子シグネチャにおいてコントロール遺伝子として記載されている遺伝子に対して正規化した。各患者について、その同じ患者に対するコントロール遺伝子の平均値を減算することによって、発現の推定値を正規化した。
【０３０２】
５つのスコアを計算することにより、患者を分類した：
・ＥＳＲ１の状態：遺伝子ＥＳＲ１の分布は、双峰性を示した（図１）。それらの２つのモードは、ＥＳＲ１低の患者およびＥＳＲ１高の患者を識別する。パッケージ「ｍｃｌｕｓｔ」を使用して、正規分布の混合物を２成分に当てはめ、各患者がＥＳＲ１低およびＥＳＲ１高の成分に属する事後確率を得た。この群に属する事後確率が８０％より高い場合、患者をＥＳＲ１低と見なした。同じ判定基準をＥＳＲ１高に対しても使用した。患者が、ＥＳＲ１高でもＥＳＲ１低でもない場合、ＥＳＲ１中間と見なした。
・管腔の状態：各患者について、ルミナル遺伝子リストにおけるすべての遺伝子の発現を平均することによって、ルミナルスコアを計算した。ルミナルスコアの分布は、双峰性を示した（図１）ので、ルミナルの状態は、ＥＳＲ１の状態と同じように記載された。
・増殖の状態；各患者について、ルミナル遺伝子リストにおけるすべての遺伝子の発現を平均することによって、増殖スコアを計算した。増殖遺伝子の平均値は、双峰性を示さなかった（図１）。ゆえに、最も低い平均値を有する患者の半数を、増殖少と見なした。残りは、増殖多と見なした。
・ＰＧＲ１の状態：遺伝子ＰＧＲ１は、双峰分布を示す（図１）ので、ＰＧＲ１の状態は、ルミナルの状態と同じように記載された。
・ＥＲＢＢ２の状態：遺伝子ＥＲＢＢ２は、双峰分布を示さない（図１）。ＥＲＢＢ２の発現値が、ＥＲＢＢ２の平均値＋ＥＲＢＢ２の１標準偏差より高いとき、サンプルをＥＲＢＢ２高と記載した。その他の場合は、サンプルをＥＲＢＢ２低と見なした。
【０３０３】
２つのルミナル遺伝子および１つの増殖遺伝子は、組み合わせコホートに存在しなかった。それらを使用しなかった。すべての患者をＰＡＭ５０に従ってサブタイプに割り当てた。
【０３０４】
ＰＡＭ５０の分類に従っていずれのサブタイプにも割り当てることができない患者が５８人いた。本発明者らは、２つ以上のサブタイプに属する患者を見出さなかった。
【０３０５】
エストロゲンレセプター陽性（ＥＲ＋）腫瘍は、ＥＳＲ１高と定義される。
【０３０６】
トリプルネガティブ腫瘍は、ＥＳＲ１、ＰＧＲ１およびＥＲＢＢ２低と定義される。
【０３０７】
検証コホートＩＩの場合、患者の分類は、診断目的に従う通例の病理学者スコアに基づいた。ＥＲ＋腫瘍は、ＥＳＲ１を発現する腫瘍と定義された。トリプルネガティブ乳がん腫瘍は、ＥＳＲ１、ＰＲおよびＨＥＲ２を発現しない腫瘍と定義された。ＨＥＲ２＋腫瘍は、病理学者スコアに従って２＋および３＋ＨＥＲ２腫瘍と定義された。上記サブタイプのいずれにも割り当てることができない患者が６人いた。本発明者らは、２つ以上のサブタイプに属する患者を見出さなかった。
【０３０８】
トリプルネガティブ乳がんのコホートにおける、転移、骨転移を予測するｃ−ＭＡＦ遺伝子発現の能力の解析
コホートＩにおいて骨転移を解析するとき、骨転移と別の転移を同時に有することに起因して、３３人の患者が除外され、事象までの１つの時間だけを報告した。本発明者らは、最初の転移に関心があり、どの転移が最初であるかを知る方法がない場合、本発明者らは、２つの転移部位の注釈を有する患者を解析から除外した。
【０３０９】
いったん、本発明者らは、目的のサブタイプであるトリプルネガティブ（これには、基底細胞様乳がんの大部分が含まれる）を識別し、その患者を選択したら、調整変数（ａｄｊｕｓｔｍｅｎｔ  ｖａｒｉａｂｌｅ）としてのコホートを含めて、Ｃｏｘ比例ハザードモデル（Ｐａｃｋａｇｅｄ  ｓｕｒｖｉｖａｌのＲ関数ｃｏｘｐｈを使用する）を調整して、サブタイプおよびｃ−ＭＡＦ発現によって各表現型（骨転移）を説明できるかを確かめた。ｃ−ＭＡＦは、サブタイプと統計学的に有意な相互作用を有した（ｐ＝０．０４３）。これは、本発明者らに、ｃ−ＭＡＦと生存率との関連性が、患者のサブタイプに従って有意に異なることを知らせた。トリプルネガティブ乳がん原発腫瘍におけるｃ−ＭＡＦの遺伝子発現は、骨転移と有意に相関した（表３および図２）。
【表３】
2018102316.tif 000010
【０３１０】
ｃ−ＭＡＦは、トリプルネガティブ乳がん（これには、基底細胞様乳がんの大部分が含まれる）を有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断を決定するために使用することができる（表３および図２）。
【０３１１】
ＥＲ＋乳がん腫瘍における転移、骨転移を予測するｃ−ＭＡＦ遺伝子発現の能力の解析
本発明者らは、ＥＲ＋乳がん（これには、ＡおよびＢサブタイプを含むルミナル乳がんの大部分が含まれる）に焦点を当てた。本発明者らは、Ｃｏｘ比例ハザードモデル（Ｐａｃｋａｇｅｄ  ｓｕｒｖｉｖａｌのＲ関数ｃｏｘｐｈを使用する）を調整して、ｃ−ＭＡＦ発現によって各表現型（骨転移、肺転移または脳転移）を説明できるかを確かめた。ＥＲ＋乳がん原発腫瘍におけるｃ−ＭＡＦの遺伝子発現は、骨転移と有意に相関した（表４および図３）。
【表４】
2018102316.tif 000011
【０３１２】
ｃ−ＭＡＦは、ＥＲ＋乳がん（これには、ＡおよびＢサブタイプを含むルミナル乳がんの大部分が含まれる）を有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断を決定するために使用することができる（表４および図３）。
【０３１３】
コホートＩＩ、特にＥＲ＋およびＴＮにおいて、ｃ−ＭＡＦが乳がんの骨転移に対する臨床的バイオマーカーであることの免疫組織化学による検証
【０３１４】
Ｄａｋｏ  Ｌｉｎｋプラットフォームにおいて正に帯電したスライドガラス上に置かれた３μｍヒトＢＣ腫瘍組織切片を使用して、ｃ−ＭＡＦ免疫染色を行った。脱パラフィン後、ｐＨ６．１，０．０１ｍｏｌ／Ｌクエン酸ベース緩衝液（Ｄａｋｏ）中で加熱抗原回復を行った。内因性ペルオキシダーゼをクエンチした。ウサギポリクローナル抗ＭＡＦ抗体を、室温において３０分間１：１００希釈で使用し、その後、ペルオキシダーゼと結合した抗ウサギＩｇデキストランポリマー（Ｆｌｅｘ＋，Ｄａｋｏ）とともにインキュベーションした。次いで、３，３’−ジアミノベンジジン（ＤＡＢ）を用いて切片を可視化し、ヘマトキシリンで対比染色した。
【０３１５】
ｃ−ＭＡＦ抗体感度（１：１００）は、１：１０から１：１０００まで一次抗体のクレセント希釈度（crescent  dilution）の範囲において算出された。親ＭＣＦ７およびＴ４７ＤヒトＢＣ細胞ならびにｃ−ＭＡＦを過剰発現する（＋ｃ−ＭＡＦ長／短）ＭＣＦ７およびＴ４７ＤヒトＢＣ細胞を使用して、特異度を決定した。ホルマリン固定された細胞ペレットを、ＩＨＣについて記載されたように処理し、全溶解産物からのウエスタンブロットによって結果を確認した。特異度は、ＢＡＬＢ−ｃヌードマウスにおける異所性ＭＣＦ７およびｃ−ＭＡＦ過剰発現ＭＣＦ７の異種移植でも示された。一次抗体の代わりに正常なウサギＩｇＧ２（ＩＳ６００，Ｄａｋｏ）とインキュベートされた同じ検体からの切片を、ネガティブコントロールとして使用した。
【０３１６】
ＭＡＦ免疫染色を、コンピュータ処理された測定値によってスコア付けした。各検体の９つの代表的な画像を、Ｎｕａｎｃｅ  ＦＸ  Ｍｕｌｔｉｓｐｅｃｔｒａｌ  Ｉｍａｇｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＣＲＩ  Ｉｎｃ）を備えたＤＭ２０００Ｌｅｉｃａ顕微鏡を使用して４２０〜７００ｎｍにおいて１０ｎｍ波長の間隔で取得した。画像のスペクトルデータセットを取得する前に、各波長においてデバイスのウェルをおよそ９０％満たすのに必要な露出時間を決定するためにスライドのブランク領域をイメージングしつつ、自動露出ルーチンを行い、線源強度、フィルター透過効率およびカメラ感度のばらつきを補償した。純粋なＤＡＢおよびヘマトキシリン色素の色のライブラリーを作製し、Ｎｕａｎｃｅ１．６．４ソフトウェアを使用してそれらの色を分離（ｕｎｍｉｘ）するために使用した。次いで、参照のキューブ（種々の波長において撮影された大量の画像）を、各新規症例に対して取得した後、同じ露出時間を使用して３つの代表的な組織の視野のスペクトルイメージングを得た。画像の逆重畳の後、照明の不均一を補償するためにスペクトルデータをフラットフィールド処理し（ｆｌａｔ  ｆｉｅｌｄｅｄ）、バックグラウンドにフィルターにかけた。ベールの法則の変換を使用して、参照キューブで除算したサンプルの比の負のｌｏｇを得ることによって、陽性シグナルを透過濃度から光学密度単位に変換した。コンピュータ支援閾値（ｃｏｍｐｕｔｅｒ−ａｉｄｅｄ  ｔｈｒｅｓｈｏｌｄ）を設定した。それにより、すべての陽性シグナルを強調する疑似カラー画像が生成される。解析によって、目的の領域の平均強度からｃ−ＭＡＦの定量的データが得られた。上皮細胞（正常および悪性）の核だけが、異なるサイズ閾値を設定することによって自動的に検出され、ストローマ細胞またはリンパ球の核はそうではなく、それらは、病理学者によって確認された。各症例を、統計解析のために目的の全領域のシグナル強度の平均値について算出した。コンピュータ処理された測定値の出力によって、ｃ−ＭＡＦ発現について５６〜７０，３６７の範囲の連続データが生成された。
【０３１７】
原発性乳がん組織の代表的なｃ−ＭＡＦ免疫染色（ＩＨＣ）が示されている（図４ａ）。症例１は、ｃ−ＭＡＦ陰性腫瘍を表す（ＯＤ＜１０００）。症例２および３は、ｃ−ＭＡＦ陽性腫瘍である（それぞれＯＤ＞１０００および＞２５０００）（図４ａ）。次に、３８０個の原発性乳がん腫瘍のコホートにおけるｃ−ＭＡＦタンパク質の発現（コンピュータ処理された測定値、光学密度の任意単位，ＯＤとして表現されている）を表しているプロットから、すべての腫瘍ＩＨＣシグナルの定量が要約された。ＢＣサブタイプ（ＥＲ＋、ＨＥＲ２＋およびＴＮ）に従って腫瘍を分けた（図４ｂ）。上記のＩＨＣ染色に基づいて、ｃ−ＭＡＦ（陽性または陰性）層別化に従って、３８０個の原発性乳がん腫瘍（ステージＩ、ＩＩおよびＩＩＩ）のコホートにおける、無病生存率（図４ｃ）および無骨転移生存率（図４ｄ）のカプラン・マイヤー曲線を描いた。また、種々のＢＣサブタイプ（ＥＲ＋、ＨＥＲ２＋およびＴＮ）におけるｃ−ＭＡＦの診断性能（図４ｅ）も計算した。ベースラインの特徴およびＣｏｘ多変量解析を、上で定義されたように行うことにより、他の任意の臨床的な病理学的パラメータの原発性乳がん腫瘍における骨転移予測に対する層別化基準としてのｃ−ＭＡＦに対する影響を決定した（表５および６）。示されるように、９つを超えるリンパ節陽性を有する場合を除いて、他の任意のパラメータとの有意な関連はない。
【表５】
2018102316.tif 000012
【表６−１】
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【表６−２】
2018102316.tif 000014
【０３１８】
骨転移増殖アッセイ（ｂｏｎｅ  ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ  ｃｏｌｏｎｉｚａｔｉｏｎ  ａｓｓａｙ）におけるｃ−ＭＡＦの機能的検証
ｃ−ＭＡＦの因果的寄与は、前臨床実験的異種移植マウスモデルを使用した骨転移増殖アッセイにおいて機能的に検証された。ＧＦＰ／ルシフェラーゼベクターで標識されたＥＲ＋ヒト乳腺細胞系、すなわち、ＭＣＦ７およびＴ４７Ｄを使用し、心室内または尾静脈注射によって免疫不全マウスに接種した。これらのマウスは、異種移植モデルにおいて近接した腫瘍細胞に確実にホルモンを供給するためにエストロゲンペレット剤を有しなければならない。
【０３１９】
標準的なアプローチは、機能喪失および機能獲得実験であった。ＭＣＦ７親、Ｔ４７Ｄ、または高レベルのｃ−ＭＡＦ発現について選択された高度に骨転移性の細胞派生物（ＢｏＭ２）において、ｃ−ＭＡＦを発現させるかまたはサイレンシングすることにより、転移におけるその機能を検証した（図５および６）。ｃ−ＭＡＦ遺伝子の骨転移機能を、マウスの心臓内に接種された転移細胞の生物発光検出を使用してインビボにおいて決定した。本発明者らは、ＢｏＭ２細胞において、内因性ｃ−ＭＡＦのレベルを８０％超低下させ、ｃ−ＭＡＦの外来性過剰発現によってレスキューされ得る、ｓｈＲＮＡ媒介性ｃ−ＭＡＦノックダウンを生じさせた（図６）。さらに、本発明者らは、各ｃ−ＭＡＦアイソフォームを個別にまたは集合的に発現する細胞も作製し、レポーターアッセイにおいて転写活性化因子としてのその機能性を試験した（図６）。親ＭＣＦ７細胞、ｃ−ＭＡＦ（集合的にまたは独立して、短および長アイソフォーム）を有するかまたは有しない親Ｔ４７Ｄ細胞、およびｃ−ＭＡＦ（短および長アイソフォーム）の発現が枯渇したまたはレスキューされたＢｏＭ２骨転移性ＭＣＦ７細胞派生物を、マウスの左心室に注射し、骨転移増殖をインビボ生物発光イメージングによって解析した。すべての場合において、対応するコントロールを接種した（図５、６、７および８）。
【０３２０】
注射後５２日目における、ｓｈＣｏｎｔｒｏｌ  ＢｏＭ２細胞（すなわち、ｃ−ＭＡＦを発現する細胞）における９０％またはレスキュー群における５０％（図５ｃおよび８）と比べて、ＢｏＭ２  ｃ−ＭＡＦノックダウン細胞を接種されたマウスのわずか２３％しか骨転移を起こさなかった。ｃ−ＭＡＦ枯渇細胞における骨転移の減少は、後肢の溶骨性病変の範囲の急激な減少を伴った（図５ｃ）。それどころか、ＭＡＦ過剰発現（各アイソフォームの個別または集団的）は、心臓内注射後に骨に転移するＥＲ＋乳がん細胞（ＭＣＦ７およびＴ４７Ｄ）の能力を高め、転移量を増加させた（図５ａ，ｂおよび７）。興味深いことに、ＭＡＦを発現する細胞は、親ＭＣＦ７細胞と比べてより溶骨性の骨転移をもたらし（図５ａ、６および９ａ）、転移性病変の周囲の長さにおける酒石酸耐性酸性ホスファターゼ（ＴＲＡＰ＋）破骨細胞の数の増加が検出され得る（図９ｂ，ｃ，ｄ）。ＭＡＦ過剰発現は、皮下に植え込まれたとき、親ＭＣＦ７細胞の固有の増殖活性を増加させなかった（図１０）。高レベルのＭＡＦ発現は、肺転移増殖を助けなかった（図５ｄ）。
【０３２１】
機能喪失実験および機能獲得実験は、乳がん原発腫瘍における臨床的検証とともに、エストロゲンレセプター陽性（ルミナルＡおよびＢ分子サブタイプを含む）およびトリプルネガティブ（基底細胞様分子サブタイプを含む）乳がんサブタイプにおける骨転移プロセスにおける、予後マーカーおよび予測マーカーならびに原因となる標的遺伝子としてのｃ−ＭＡＦの機能的検証に至った。
【０３２２】
ＭＡＦは、破骨細胞分化の腫瘍細胞刺激、例えば、ＰＴＨＬＨサイトカインの転写調節を介して、溶骨性骨転移を媒介する
乳がん細胞に骨転移機能を提供する際にｃ−ＭＡＦの直接的な活性はなく、その代わりにｃ−ＭＡＦは、ホーミング能および骨リモデリング能を高める遺伝子の活性を転写的に調節することにより、骨に転移増殖させ得る。ＰＴＨＬＨの発現は、ｃ−ＭＡＦの支配下だった。所見は、ｑＰＣＲ解析によって確かめられた（図１１ａ）。さらに、骨において成長している患者の乳がん転移（ＧＳＥ１４０２０）は、他の箇所の転移と比べて、ｃ−ＭＡＦ発現を保持した（図１１ｂ）。さらに、平均より高いＭＡＦおよびＰＴＨＬＨを発現している転移の７７％が、骨転移だった（図１１ｂ）。ＰＴＨＬＨは、悪性の体液性高カルシウム血症に関与する因子として同定された。さらに、それは、部分的に破骨細胞分化の刺激に起因して、溶骨性骨転移において基本的役割を果たすことが示された。実際に、ｃ−ＭＡＦを発現している細胞からの馴化培地は、ＰＴＨＬＨアンタゴニストペプチド（７−３４Ａａ、ＰＴＨＬＨ−ＡＮ）との同時インキュベーションの際には妨げられるプロセスである、破骨細胞分化の誘導をインビトロにおいて増加させた（図１１ｃ）。
【０３２３】
ＰＴＨＬＨが、乳がん細胞において、ｃ−ＭＡＦによって駆動される骨転移を媒介するかを試験するために、本発明者らは、ｃ−ＭＡＦを発現しているＭＣＦ７乳がん細胞を心臓内に注射し、ＰＴＨＬＨ−ＡＮの存在下または非存在下において骨転移を確立し、成長する能力を４７日間にわたって評価した。インビボにおいてＰＴＨＬＨ活性を阻止するために、ＰＢＳに溶解された６μｇの（７−３４Ａａ）ＰＴＨＬＨ−ＡＮを１日に２回、動物に投与した。コントロール群は、ＰＢＳで処置した。ｃ−ＭＡＦを発現している細胞は、類似の浸透度で骨転移を起こすが、ＰＴＨＬＨ−ＡＮでの処置は、後肢の溶骨性病変の範囲を劇的に減少させる（図１１ｄ，ｅ）。この減少は、転移性病変の周囲の長さにおける破骨細胞（ＴＲＡＰ＋細胞）の数の減少を伴った（図１１ｄ，ｅ）。これらの結果は、ｃ−ＭＡＦが、乳がんの溶骨性骨転移を駆動することを示す。さらに、ＰＴＨＬＨの発現は、ｃ−ＭＡＦによって駆動される乳がんの溶骨性骨転移にとって必要な因子である。最後に、破骨細胞分化プロセスを阻止することによって、ｃ−ＭＡＦによって駆動される乳がんの骨転移が妨げられる。
【０３２４】
骨への転移を予測するｃ−ＭＡＦの能力は用量依存的である
まず、本発明者らは、骨転移を予測するｃ−ＭＡＦ発現の能力が用量依存的であるかを評価した。
【０３２５】
患者の情報は、ＧＥＯ（Ｂａｒｒｅｔｔら（２００７））からダウンロードした。以下のデータセットを使用した：ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６の組み合わせ。この組み合わせコホートは、５６０人の患者を有した。体系的なバイアスを排除するために、マージする前に、すべての遺伝子の発現の測定値をｚ−スコアに変換した。
【０３２６】
すべての統計解析を、Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒ（Ｇｅｎｔｌｅｍａｎ  ＲＣら、Ｇｅｎｏｍｅ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，５：Ｒ８０，２００４．ＵＲＬ  ｈｔｔｐ：／／ｇｅｎｏｍｅｂｉｏｌｏｇｙ．ｃｏｍ／２００４／５／１０／Ｒ８０）を使用して行った。
【０３２７】
本発明者らは、四次スプライン（パッケージｐｈｅｎｏＴｅｓｔにおけるｓｍｏｏｔｈＣｏｘｐｈ関数）を用いるＣｏｘ回帰モデルによる、ｃ−ＭＡＦの発現と骨転移のハザード比との関係の滑らかな推定値を得た。パッケージｐｈｅｎｏＴｅｓｔにおけるｓｍｏｏｔｈＣｏｘｐｈ関数は、遺伝子発現レベルによって平滑化されたＣｏｘ比例ハザードをプロットする。したがって、ハザードが所与の遺伝子の種々の発現レベルにわたってどのように挙動するのかを示すプロットが構築される。信頼区間もまた提供される（使用法：ｓｍｏｏｔｈＣｏｘｐｈ（時間、事象、ｘ、ｘｌｉｍ、ｙｌｉｍ、その他）。アーギュメント：時間）変数（ここで、生存時間が保存される）；事象）変数（ここで、生存事象が保存される）；ｘ）所与の遺伝子の発現レベルを含む数；Ｘｌｉｍ）プロット用のｘｌｉｍ；Ｙｌｉｍ）プロット用のｙｌｉｍ；その他）プロットするためにパスされる他のアーギュメント）。
【０３２８】
四次スプラインを用いるＣｏｘ回帰モデルによる、ｃ−ＭＡＦの発現と骨転移のハザード比との関係性は、図１２に見られ得る。組み合わせコホートに存在するすべての乳がん腫瘍、組み合わせコホートにおけるエストロゲンレセプター陽性乳がん腫瘍および組み合わせコホートにおけるトリプルネガティブ腫瘍。その解析を行い、ｃ−ＭＡＦ発現レベルが平均（０と命名）より高い腫瘍における骨転移を予測するｃ−ＭＡＦの能力のハザード比（ＨＲ）およびｐ値が示された。発現レベルにおける１は、１標準偏差を示し、次いで、それに続くなど。
【０３２９】
本発明者らは、「高ｃ−ＭＡＦ」を発現している乳がん原発腫瘍を、乳がん原発腫瘍の代表的なコホートにおいて平均発現を超えてｃ−ＭＡＦを発現する腫瘍の群と定義した。本発明者らは、「低ｃ−ＭＡＦ」を発現している乳がん原発腫瘍を、乳がん原発腫瘍の代表的なコホートにおいて得られる平均を下回ってｃ−ＭＡＦを発現する腫瘍の群と定義した。
【０３３０】
高ｃ−ＭＡＦ発現レベルを有する乳がん腫瘍では、ｃ−ＭＡＦ発現は、用量依存的様式で骨転移のリスクを予測する（図１２）。同様に、ＥＲ陽性（ルミナルＡおよびＢ分子サブタイプを含む）およびトリプルネガティブ（基底細胞様分子サブタイプを含む）乳がんサブタイプにおいても、本発明者らは、同じ挙動をみとめた（図１２）。
【０３３１】
結論として、ｃ−ＭＡＦ発現レベルが高くなるほど、骨転移に対するハザードリスクが、代表的な乳がん腫瘍セットの平均値を超えてｃ−ＭＡＦレベルを発現したＥＲ＋およびＴＮ乳がん腫瘍において高くなる。
【０３３２】
本発明者らは、どこまでｃ−ＭＡＦの用量が高くなると骨再発のリスクが高くなるかを検証コホートＩＩにおいてアッセイした。この目的を達成するために、本発明者らは、上に記載されたようなコンピュータ処理システムを使用した染色の光学密度の決定（図４ａ，ｂ）を用いて免疫組織化学（ＩＨＣ）によってｃ−ＭＡＦ発現を定量した。ｃ−ＭＡＦ染色は、腫瘍細胞に特異的である（図４ａ）。染色に基づくと、本発明者らは、２つのタイプのｃ−ＭＡＦ陽性乳がん腫瘍（症例２および３，図４ａ、ｂ）をみとめることができる。ｃ−ＭＡＦ陽性乳がん腫瘍におけるこれらの２つのタイプのｃ−ＭＡＦ  ＩＨＣ染色に従って、それらが双峰性の挙動を有するとき、本発明者らは、それらを２群に分離し得る（図１３，左パネル）。これらの２つのカテゴリーを基礎にして、本発明者らは、ｃ−ＭＡＦの染色が強いほど、骨転移のリスクが高く（ＨＲ（骨転移）＝１９．４５；ｐ値＜０．００１）、より早く骨転移が生じる（図１３，右パネル）という観察結果を検証した。
【０３３３】
早期の骨転移を予測するｃ−ＭＡＦの能力
乳がん腫瘍を、原発腫瘍の検出および外科的切除と遠位再発の観察時点との間の期間に応じて、早期（＜５年）の再発性腫瘍と遅発性（＞５年）の再発性腫瘍とに分類した。実際に、ある特定の状況下において、早期の遠位再発は、より短い期間にさらに限定された。ＥＲ陽性腫瘍およびＥＲ陰性腫瘍が、早期の骨再発に関して異なって挙動すると記載されるなら、この分類は、臨床的に重要である。詳細には、トリプルネガティブおよび基底細胞様腫瘍を含むＥＲ陰性腫瘍は、早い時点において再発する一方で、ＥＲ陽性腫瘍は、遅い時点と早い時点とで再発する傾向は同じである（Ｋｎｉｇｈｔ  ＷＡら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  １９９７：３７，４６６９−４６７１，Ｇｏｓｓ  ＰＥ  Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖ  Ｃａｎｃｅｒ  ２０１０：１０，８７１−８７７）。
【０３３４】
本発明者らは、ｃ−ＭＡＦ発現が、乳がん、ＥＲ陽性（ルミナルＡおよびＢを含む）およびトリプルネガティブ（基底細胞様を含む）乳がん原発腫瘍において早期の骨転移を予測し得るかを評価した。
【０３３５】
患者の情報は、ＧＥＯからダウンロードした。以下のデータセットを使用した：ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６の組み合わせ。この組み合わせコホートは、５６０人の患者を有する。体系的なバイアスを除去するために、マージする前に、すべての遺伝子の発現の測定値をｚ−スコアに変換した。すべての統計解析を、Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒを使用して行った。
【０３３６】
本発明者らは、種々の時点におけるｃ−ＭＡＦと骨転移との非依存を検定するためにフィッシャーの正確検定を行った。分割表の比率およびフィッシャー検定ｐ値は、図１４に見られ得る。
【０３３７】
本発明者らは、「非常に高いｃ−ＭＡＦ」を発現している乳がん原発腫瘍を、平均値＋１標準偏差を超えてｃ−ＭＡＦを発現する腫瘍の群と定義する。本発明者らは、「低いｃ−ＭＡＦ」を発現している乳がん原発腫瘍を、乳がん原発腫瘍の代表的なコホートにおいて平均値＋１標準偏差を下回ってｃ−ＭＡＦを発現する腫瘍の群と定義した。
【０３３８】
乳がん原発腫瘍において、非常に高いｃ−ＭＡＦレベル（ＲＮＡまたはタンパク質）は、乳がん原発腫瘍の手術の３年後と５年後の両方において早期の骨転移を予測する（図１４）。
【０３３９】
特に、エストロゲンレセプター陽性（ルミナルＡおよびＢ分子サブタイプを含む）において、ｃ−ＭＡＦレベル（ＲＮＡまたはタンパク質）が、それぞれ手術の３年後と５年後の両方において早期の骨転移を有する腫瘍の比率を有意に定義する（図１４）ことが示される。
【０３４０】
結論として、高レベルのｃ−ＭＡＦ発現は、早期の乳がん骨転移を含む骨転移のリスクが高い乳がん原発腫瘍を区別するためまたは予測するために使用することができる。
【０３４１】
表７は、乳がん原発腫瘍（ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６の組み合わせ）、エストロゲンレセプター陽性（ルミナルＡおよびＢ分子サブタイプを含む）乳がん原発腫瘍およびトリプルネガティブ（基底細胞様分子サブタイプを含む）乳がんサブタイプにおける骨転移、早期の骨転移および非常に早期の骨転移の予測を示している。
【表７】
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【０３４２】
ｃ−ＭＡＦを含む１６ｑ２２−ｑ２４に位置する染色体領域の増幅は骨転移と関連する
本発明者らは、ＡＣＥアルゴリズムを適用することによって、転移のリスクに関連する原発性乳がん検体においてコピー数の変化（ＣＮＡ）を同定した（発現データによるＣＮＡの解析）（図１５ａ）。中でも、染色体１６ｑ２２−ｑ２４に位置する増幅された領域は、転移のリスクと有意に（ｐ＜０．０５）関連し、その発現の増加が、個別におよび独立して、ＥＲ＋ヒト乳がんにおける骨転移のリスクと関連する遺伝子であるｃ−ＭＡＦを含んだ（ＨＲ＝１．２２  ｐ＝０．０３２、ＧＳＥ２６０３、ＧＳＥ２０３４およびＧＳＥ１２２７６の組み合わせに基づく乳がん原発腫瘍データセット）。同様に、ＦＩＳＨ（１６ｑ２３）および比較ゲノムハイブリダイゼーション（ＣＧＨ）によって親ＭＣＦ７（ＥＲ＋）を骨転移性ＭＣＦ７派生物（ＢｏＭ２）細胞と比較したとき、本発明者らは、１６ｑ２２−２４染色体領域の獲得を確認した（図１５ｂ，ｃ）。親細胞のサブセット（３２．７％）が、このゲノム増幅を保有していたが、インビボでの骨転移選択により、この残余集団がその残りを引き継ぐこととなった（８８．６％）。したがって、本発明者らは、１６ｑ２２−ｑ２４が、転移、特に骨転移のリスクを有する乳がんにおいて増幅されており、インビボにおいて選択された細胞において、骨に転移する能力について裏付けられることを示す。
【０３４３】
コホートＩＩにおける、ＦＩＳＨ決定による１６ｑ２２−２４ＤＮＡゲノム増幅の骨転移を予測する予後診断能力の検証
１６ｑ２２−２４ゲノム増幅が骨転移リスクを特異的に予測する能力をさらに検証するために、本発明者らは、ステージＩ、ＩＩまたはＩＩＩのＢＣを有し、追跡の注釈が付けられている患者由来の３３４個の原発性乳がん検体から構成される独立した検証セットにおいて、ＦＩＳＨによって（本発明者らは、１６ｑ２３ゲノム領域を決定する商業的に入手可能な診断プローブ，ＩＧＨ／ＭＡＦ  Ａｂｂｏｔ  Ｖｙｓｉｓプローブを使用した）、１６ｑ２２−２４染色体領域ゲノムの獲得を解析した（Ｒｏｊｏ  Ｆ．，Ａｎｎ  Ｏｎｃｏｌ（２０１２）２３（５）：１１５６−１１６４）。組織マイクロアレイを標準的な手順に従って処理した。スライドを、ＭＡＦ（１６ｑ２３）およびＩＧＨ（１４ｑ３２）プローブ混合物（Ａｂｂｏｔ  ｖｙｓｉｓプローブ）とともにインキュベートした。ＤＡＰＩ対比染色を適用し、適切な顕微鏡を用いて画像を取得した。
【０３４４】
ステージＩ、ＩＩおよびＩＩＩのＢＣヒト原発腫瘍セット（ｎ＝３３４）における無骨転移生存率（図１６ａ）または全生存率（図１６ｂ）のカプラン・マイヤー曲線を決定した。腫瘍１つあたり３つのコアを使用して、平均として細胞１つあたり２．５コピーの１６ｑ２３というカットオフに基づく１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陰性群および１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陽性群に従って、患者を層別化した（図１６ａおよびｂ）。骨転移を予測するマーカーのハザード比（ｈａｚａｒｄ  ｒａｔｉｏｎ）（骨転移）、特異度および感度を算出した。データセットのベースラインの特徴および乳がん全体に対するＣｏｘ多変量解析を、上に記載されたように行った（表８および９）。
【０３４５】
Ｉ、ＩＩおよびＩＩＩのＢＣヒト原発腫瘍セットにおけるＥＲ陽性患者（左）またはトリプルネガティブ患者（右）に対する無骨転移生存率のカプラン・マイヤー曲線（それぞれｎ＝２５０およびｎ＝４３）（図１６ｃ）も決定した。腫瘍１つあたり３つのコアを使用して、平均として細胞１つあたり２．５コピーの１６ｑ２３というカットオフに基づいて、患者を１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陰性群および１６ｑ２３  ＦＩＳＨ陽性群に分けた。ＥＲ＋乳がんに対するＣｏｘ多変量解析を上に記載されたように行った（表１０）。
【表８】
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【表９】
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【表１０】
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【０３４６】
乳がん全体（図１６ｄ）およびＥＲ＋乳がん（図１６ｅ）における１６ｑ２３増幅の診断性能に対する受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線も、診断性能を推定するために算出した。ＲＯＣ曲線において、真陽性率（感度）は、種々のカットオフ点に対する偽陽性率（１００−特異度）の関数としてプロットされる。ＲＯＣ曲線上の各点は、特定の決定閾値に対応する感度／特異度対を表す。
【０３４７】
要約すると、１６ｑ２３  ＦＩＳＨプローブを用いて本明細書中で測定された１６ｑ２２−２４増幅は、乳がん原発腫瘍、特に、ＴＮおよびＥＲ＋乳がんサブタイプにおける骨転移のリスクを有意に予測する。
【０３４８】
ｃ−ＭＡＦ発現レベルに基づいてトリプルネガティブ乳がんと診断された被験体における処置レジメンの決定
腫瘍組織サンプルを、トリプルネガティブ乳がんを有すると診断された被験体から得る。そのサンプルを、組織の薄切片に切断し、パラフィンに包埋する。各パラフィン切片をスライドの上に載せる。そのスライドを抗ＭＡＦ抗体とともにインキュベートする。ＭＡＦに結合した抗体の可視化および検出のために、蛍光色素と結合体化された抗体を使用する。その蛍光色素に励起ビームを提供することによって、スライドを可視化する。蛍光顕微鏡によって蛍光シグナルの画像を得る。その腫瘍サンプル中の蛍光シグナルを参照サンプルの蛍光シグナルと比較することによって、腫瘍サンプルにおけるｃ−ＭＡＦの相対的な発現レベルを得る。腫瘍サンプルにおける強度は、参照サンプルにおける強度と相関し、ここで、参照サンプルと比べて腫瘍サンプルにおけるより高い強度は、原発性乳がんを有する被験体の骨への転移の上昇したリスクと相関する。あるいは、１６ｑ２２−２４遺伝子座、１６ｑ２３遺伝子座またはｃ−ＭＡＦ遺伝子の増幅または転座が、インサイチュハイブリダイゼーション技法または類似のものを用いて決定される。
【０３４９】
上昇した骨転移のリスクの予後診断に基づいて、骨転移に対する予防的処置として抗ＲＡＮＫＬ抗体デノスマブを被験体に投与する。１２０ｍｇのデノスマブを６ヶ月間にわたって１ヶ月に１回、被験体の皮下に（ＳＣ）投与する。次の４年半にわたって、１２０ｍｇのＳＣを３ヶ月ごとに投与する。５年間にわたって、経口カルシウム（少なくとも５００ｍｇ）およびビタミンＤ（少なくとも４００ＩＵ）。５年後、被験体は、骨転移のいかなる証拠もない。上昇していない骨転移のリスクの予後診断に基づいて、患者は、この抗ＲＡＮＫＬ抗体を投与されない。
【０３５０】
本明細書中に記載される例および実施形態は、単なる例証目的であり、それを考慮した様々な改変または変更が、当業者に示唆され、本願の精神および範囲とともに含められるべきであることが理解される。
【０３５１】
本明細書に引用されたすべての刊行物、特許、特許出願、インターネットサイトおよびアクセッション番号／データベース配列（ポリヌクレオチド配列とポリペプチド配列の両方を含む）は、各個別の刊行物、特許、特許出願、インターネットサイトまたはアクセッション番号／データベース配列が、参照により援用されると具体的かつ個別に示されたのと同程度にすべての目的のためにそれらの全体が本明細書中に参照により援用される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図５Ｃ】
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【図５Ｄ】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９ａ−ｃ】
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【図９ｄ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２−１】
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【図１２−２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５ａ−ｂ】
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【図１５ｃ】
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【図１６】
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【配列表】
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【外国語明細書】
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