(57)【要約】【課題】試料中の血漿由来タンパク質と組換えタンパク質を区別するための方法の提供。【解決手段】本発明は一般に、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質が基本的に同じタンパク質である場合に、血漿タンパク質と組換えタンパク質との間のグリコシル化パターンの差を利用することにより、試料中の血漿由来タンパク質の存在を試料中の組み換え的に産生されたタンパク質から区別するための方法に関する。本発明は、特定の炭化水素部分の発現を用いて試料中の血漿由来タンパク質のレベルを定量する方法も提供する。【選択図】図１
2018017736.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
図面に記載された発明。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
この出願は、２００７年１２月２７日に出願された米国仮出願第６１／０１７，０９１号（これは、その全体が参考として本明細書に援用される）の優先権の利益を主張する。
【０００２】
発明の分野
本発明は、一般に、グリコシル化−特異的結合アッセイを用いて、試料中の血漿由来タンパク質と組換えタンパク質とを区別および定量する方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
グリコシル化は、タンパク質および脂質に炭水化物（糖類）が付加するプロセスまたは結果である。グリコシル化プロセスは、膜の合成およびタンパク質分泌の間に生じる、同時翻訳および翻訳後修飾である。粗面小胞体（ＥＲ）において合成される大半のタンパク質が、グリコシル化を経る（非特許文献１）。グリコシル化は、Ｎ−結合型グリコシル化およびＯ−結合型グリコシル化の二つの特定のタイプの付加を有する、酵素により誘導される部位特異的プロセスである。Ｎ−結合炭水化物は、アミノ酸コンセンサス配列「Ａｓｎ−Ｘ−Ｓｅｒ／Ｔｈｒ」のアミノ酸アスパラギンに結合されるＮ−アセチルグルコサミンを介して付加される。周囲のアミノ酸により、グリコシル化が生じる場合にはいずれのタイプのグリコシル化が生じるかが決定されることが多い。例えば、コンセンサス配列の真ん中のアミノ酸がプロリン（Ｐｒｏ）である場合には、Ｎ−結合型グリコシル化は生じない。タンパク質に対するほとんどのＯ−結合炭水化物共有結合は、単糖Ｎ−アセチルガラクトサミンとアミノ酸セリンまたはスレオニンと間の結合を伴う（非特許文献２）。Ｏ−結合型グリコシル化には、コンセンサス配列はない。
【０００４】
タンパク質のグリコシル化の結果、マンノースおよびグルコース等の単糖残基の付加、または、シアル酸およびフコース等のより複合型の糖残基の付加（非特許文献１）、および分枝糖鎖が生じうる。タンパク質グリコシル化は、ｉｎ  ｖｉｖｏで、細胞質におけるタンパク質の安定化、タンパク質半減期の増加、ならびにグリコシル残基を有するタンパク質または酵素の活性の調節を含むいくつかの機能を果たす（非特許文献２）。したがって、タンパク質が適切なグリコシル化を発現するようにすることが重要であり、さもないとタンパク質活性が損なわれ、または失われうる。タンパク質のグリコシル化のタイプは、タンパク質が合成される細胞の細胞型、ならびにタンパク質を合成する細胞の種によって決まることが多い（非特許文献２；非特許文献１）。例えば、細菌およびイーストは、高等真核生物のタンパク質に典型的に見られる複合グリカンを合成しない（非特許文献１）。哺乳類種の間（例えばヒトとハムスター）でも、腫瘍細胞から正常細胞、非−悪性細胞で、グリコシル化パターンが異なりうる（非特許文献２）。したがって、タンパク質が産生される細胞系の種類が、生じるグリコシル化産物に有意な影響をもつ（非特許文献２）。
【０００５】
組み換え産生されたタンパク質が、臨床および研究の場面の両方において、タンパク質の研究に有意な改善を提供している。組換えタンパク質の大量産生により、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのタンパク質活性の研究が可能になり、最近では組換えタンパク質が治療剤として臨床場面において使用されている。例えば、組換えインターロイキン−２が、化学療法後の免疫系を強化するために癌患者に投与されており、ヒト成長ホルモン、エリスロポイエチンおよび顆粒球コロニー刺激因子等の組換え成長因子、および第ＶＩＩＩ因子および第ＶＩＩ因子等の血液因子が、様々な障害の治療において使用される。
【０００６】
組換えタンパク質は、治療タンパク質として利益を提供するが、一定の欠点もみられる。ヒト細胞において費用効率的な様式で十分な量の治療用途の組換えタンパク質を産生することは困難であり得、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉおよび他の細菌のような細胞において作られる組換えタンパク質は、必ずしも適切にフォールディングせず、グリコシル化されず、および／または、人体内で活性の形態のタンパク質を製造するために、単離後に操作しなければならない。さらに、ヒト細胞におけるタンパク質のグリコシル化は、細菌、昆虫、および高等哺乳類も含めて一般的に使用されるタンパク質発現系において見られるものよりも複雑であることが多い。例えば、Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ等の昆虫細胞は、哺乳類において産生される種類の高次糖構造を有するタンパク質をほとんど生成しない（非特許文献３）。さらに、ほとんど哺乳類はフコースおよびシアル酸残基のような構造を含む高次糖類を発現するが、これらの糖部分は、ヒト細胞において産生されるタンパク質における糖類と同じ様式では化学的に結合されない可能性がある（非特許文献４；特許文献１）。
【０００７】
内因的に発現されるタンパク質の欠損または機能的欠損を修正するために、治療タンパク質の投与が多くの場合に用いられる。組換えインシュリンおよびインシュリンアナログ（非特許文献５）は、自然に産生されるインシュリン組換え第ＶＩＩＩ因子の欠如を補うために糖尿病患者に投与され、第ＶＩＩＩ因子の配列アナログは、血液凝固異常をもたらす第ＶＩＩＩ因子レベルの欠損を修正するために、血友病Ａを患う患者に投与される（非特許文献６）。これらの種類の組換え療法においては、患者における薬物の半減期および吸収等の他の薬物動態を決定するために、血清または他の試料中の組換えタンパク質のレベルを決定することが有用である。しかし、内因性タンパク質と組換えタンパク質との間の差を決定することは、それらが基本的に同じタンパク質であるために困難でありうる。
【０００８】
したがって、治療計画を最適化できるように、試料中の天然由来のタンパク質の量を外因性タンパク質から区別し、内因性および患者に投与される外因性組換えタンパク質のレベルを検出する方法を開発することが当技術分野で求められている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００９】
【特許文献１】米国特許第５，０４７，３３５号明細書
【非特許文献】
【００１０】
【非特許文献１】Ｂｒｏｏｋｓ等，Ｅｘｐｅｒｔ  Ｒｅｖ  Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ（２００６）３：３４５−５９
【非特許文献２】Ｗｅｒｎｅｒ等，Ａｃｔａ  Ｐｅｄｉａｔｒｉｃａ（２００７）９６：１７−２２
【非特許文献３】Ａｌｔｍａｎｎ等，Ｇｌｙｃｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｊ（１９９９）１６：１０９−１２３
【非特許文献４】Ｊｅｎｋｉｎｓ等，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（１９９６）１４：９７５−９８１
【非特許文献５】Ｖａｊｏ等，Ｐｈａｒｍａｃｏｌ  Ｒｅｖ．（２０００）５２：１−９
【非特許文献６】Ｇｒｕｐｐｏ等，Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｉａ．（２００３）９：２５１−６０
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明は一般に、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質が基本的に同じタンパク質である場合に、血漿タンパク質と組換えタンパク質との間のグリコシル化パターンの差を利用することにより、試料中の血漿由来タンパク質の存在を試料中の組み換え的に産生されたタンパク質から区別するための方法に関する。本発明は、特定の炭化水素部分の発現を用いて試料中の血漿由来タンパク質のレベルを定量する方法も提供する。
【００１２】
一態様では、本発明は、試料中の血漿由来タンパク質（ｐｄＰ）および組換えタンパク質（ｒＰ）の量を定量する方法であり、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質が、異なるグリコシル化パターンを伴う同じタンパク質であり、当該異なるグリコシル化パターンにより、血漿由来タンパク質につき組換えタンパク質と比較して異なる程度のレクチン結合が生じており、当該試料中の総タンパク質（ｔＰ）が予め決定され、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質をあわせた量（ｐｄＰ＋ｒＰ）に等しく、当該方法が、（ａ）当該試料についてのレクチン結合と、ｔＰに等しいタンパク質量を有する等しい体積の仮定的試料についての予想されるレクチン結合との間の差を計算するステップであり、予想されるレクチン結合が、組換えタンパク質の量の増加に対するレクチン結合の標準曲線から決定される、ステップと、（ｂ）当該試料中の組換えタンパク質の量（ｒＰ）を決定するために、（ａ）からの差を検量線上にプロットするステップであり、検量線が、（ａ）のように計算した予想レクチン結合と、既知量のｐｄＰおよびｒＰを含む混合物で観察されるレクチン結合との間の差の、当該混合物中の組換えタンパク質の増加する量（ｒＰ）の関数としての、プロットであり、当該混合物がそれぞれ一定量のｐｄＰを有する、ステップを含む、方法を提供する。
【００１３】
一実施形態では、計算するステップには、試料をレクチン組成物と接触させるステップであり、レクチンが、検出可能な標識で標識される、ステップが含まれる。計算するステップには、本明細書の詳細な記載に説明される方法を用いて、標識されたレクチン組成物を検出するステップが、さらに含まれる。
【００１４】
さらなる実施形態においては、方法により、試料中の組換えタンパク質および血漿由来タンパク質の量を測定することにより、総タンパク質の量が予め決定される。総タンパク質の量は、一態様では酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）等、当技術分野において周知の方法を用いて測定される。関連の実施形態においては、試料中の総タンパク質量が、全て血漿由来タンパク質であると仮定し、その血漿由来タンパク質の量に基づいて予想されるレクチン結合の量を推定することにより、試料の予想レクチン結合が決定される。
【００１５】
追加的な実施形態においては、方法により、試料中の血漿由来および組換えタンパク質の量を定量する前に、検量線が準備される。検量線が、ｉ）既知の総量の組換えおよび血漿由来タンパク質を含む試料の予想レクチン結合と、ｉｉ）既知量のｐｄＰおよびｒＰを含む混合物につき観察されるレクチン結合との間の差として、当該混合物中のｒＰの増加する量の関数としてプロットされ、当該混合物がそれぞれ一定量のｐｄＰを有することが予定される。
【００１６】
関連の実施形態においては、レクチンは、ヒト血漿由来タンパク質に見られ組換えタンパク質には見られない糖部分に対する特異的結合を示す、本明細書に記載される任意のレクチンである。特定の実施態様においては、レクチンは、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  Ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）である。
【００１７】
レクチンが検出可能な標識により標識されることが、さらに予定される。一実施形態においては、検出可能な標識は、フルオロフォア、放射性標識、高電子密度試薬、酵素、ビオチン、ジゴキシゲニン、ハプテン、または化学発光剤からなる群より選択される。関連の実施形態においては、標識はビオチンである。
【００１８】
試料が対象の生体試料から得られることが、さらに予定される。一実施形態においては、試料は血液試料である。関連の実施形態においては、試料は血漿である。さらなる実施形態においては、試料は血清である。
【００１９】
本発明によればさらに、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質は基本的に同じタンパク質である、すなわち一般に同じアミノ酸構造および機能を有する。一実施形態においては、タンパク質は治療タンパク質であり、様々な態様においてタンパク質は、サイトカイン、成長因子、血液凝固因子、酵素、ケモカイン、可溶性細胞表面受容体、細胞接着分子、抗体、ホルモン、細胞骨格タンパク質、基質タンパク質、シャペロンタンパク質、構造タンパク質、代謝タンパク質、および当業者に知られる任意の他の治療タンパク質からなる群より選択される。さらなる実施形態においては、タンパク質は血液凝固因子である。さらなる実施形態においては、血液凝固因子は、フォンウィルブランド因子（ｖＷＦ）、第ＶＩＩＩ因子（ＦＶＩＩＩ）、第ＶＩＩ因子、および第ＩＸ因子（ＦＩＸ）からなる群より選択される。
【００２０】
本発明の別の態様においては、組換えタンパク質が血漿由来タンパク質のグリコシル化パターンと比較して異なるグリコシル化パターンを呈するように、一つ以上のグリコシルトランスフェラーゼを欠く宿主細胞において、組換えタンパク質が産生される。様々な実施形態において、宿主細胞は、細菌細胞、イースト細胞、昆虫細胞、植物細胞、または哺乳類細胞である。関連の実施形態においては、哺乳類細胞はチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である。
【００２１】
本発明の方法は、組み換え的に産生されたタンパク質と、天然の血漿由来タンパク質との間のグリコシル化パターンにおける差の検出を提供する。一実施形態においては、血漿由来タンパク質は、組換えタンパク質には見られない炭化水素部分を含み、炭化水素部分は、当技術分野で公知であり本明細書の詳細な記載で示される炭化水素部分から選択される。関連の実施形態においては、血漿由来タンパク質はα２，６−ノイラミン酸を含み、組換えタンパク質はα２，６−ノイラミン酸を欠く。
【００２２】
本発明のさらなる態様においては、方法は、試料をレクチン組成物と接触させる前に、試料をタンパク質に特異的な結合剤と接触させるステップを任意に含む。一実施形態においては、結合剤は、リガンド、可溶性受容体、抗体、モノクローナル抗体、補因子、または血漿由来タンパク質または組換えタンパク質に特異性をもって結合する他のタンパク質である。
【００２３】
関連の態様においては、方法によれば、結合剤または血漿由来タンパク質が固体支持体に結合される。様々な実施形態において、固体支持体は、フィルタ、ポリビニルコロライド（ｐｏｌｙｖｉｎｙｌ  ｃｈｏｌｏｒｉｄｅ）（ＰＶＣ）膜、ポリフッ化ビニリデン（ＰＤＶＦ）膜、ポリアミド膜を含む膜、ＰＶＣプレート、ポリスチレンプレート、およびタンパク質を結合する任意の他のプレートを含むプレート、マイクロキャリア、マクロ固相ビーズ、磁気ビーズ、およびポリシロキサン／ポリビニルアルコールビーズからなる群より選択される。
【００２４】
さらなる態様においては、タンパク質結合剤または血漿由来タンパク質は、溶液中にある。
【００２５】
本発明の方法は、試料に対するレクチンタンパク質の非特異的結合を防止するための、遮断剤の使用を任意に含む。方法は、試料の結合剤との接触後に、試料が遮断剤と接触させられることを予定する。一実施形態においては、遮断剤は、血清アルブミン、ゼラチン、グリコシダーゼ溶液、アセチル化剤またはメチル化剤等の炭水化物−修飾剤、および炭水化物酸化溶液からなる群より選択される。一実施形態においては、炭水化物酸化溶液は、過ヨウ素酸塩溶液である。
【００２６】
本発明の別の態様では、本明細書に記述される方法が、血漿由来タンパク質のフラグメント、変異体またはアナログである組換えタンパク質を利用することが予定される。
【００２７】
本発明は、試料中の血漿由来タンパク質を組換えタンパク質から区別する方法であり、血漿由来タンパク質上の炭化水素部分に特異的なレクチンを含む組成物と、試料を接触させるステップと；血漿由来タンパク質に対するレクチンの結合を検出するステップと；試料中のタンパク質−結合レクチンの結合量を、レクチン：タンパク質結合曲線と比較して、試料中の血漿由来タンパク質の量を決定するステップとを含む、方法も提供する。
【００２８】
一実施形態においては、レクチンは、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）タンパク質である。関連の実施形態においては、レクチンは、本明細書に記載の検出可能な標識により標識される。
【００２９】
さらに別の態様においては、本発明は、試料中の血漿由来タンパク質および組換えタンパク質のレベルを定量するためのキットであり、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質が同じタンパク質をコードし、キットが、結合剤と；血漿由来タンパク質上の炭水化物に特異的なレクチンと検出可能な標識とを含む組成物と；タンパク質標準を含む、キットを提供する。一実施形態においては、キットは任意に遮断剤を含む。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
試料中の血漿由来タンパク質（ｐｄＰ）および組換えタンパク質（ｒＰ）の量を定量する方法であり、該血漿由来タンパク質および組換えタンパク質が、異なるグリコシル化パターンを伴う同じタンパク質であり、該異なるグリコシル化パターンにより、該血漿由来タンパク質につき該組換えタンパク質と比較して異なる程度のレクチン結合が生じており、該試料中の総タンパク質（ｔＰ）が予め決定され、かつこれが該血漿由来タンパク質および組換えタンパク質の量（ｐｄＰ＋ｒＰ）に等しく、該方法が、
（ａ）該試料についてのレクチン結合と、ｔＰに等しいタンパク質の量を有する等しい体積の仮定的試料についての予想されるレクチン結合との間の差を計算するステップであり、予想されるレクチン結合が、組換えタンパク質の増加する量に対するレクチン結合の標準曲線から決定される、ステップと、
（ｂ）該試料中の組換えタンパク質（ｒＰ）の量を決定するために、（ａ）からの該差を検量線上にプロットするステップであり、該検量線が、（ａ）のように計算した予想されるレクチン結合と、既知量のｐｄＰおよびｒＰを含む混合物につき観察されるレクチン結合との間の差の、該混合物中の組換えタンパク質（ｒＰ）の増加する量の関数としてのプロットであり、該混合物が、それぞれ一定量のｐｄＰを有する、ステップと
を含む、方法。
（項目２）
前記計算するステップが、前記試料をレクチン組成物と接触させるステップと、該レクチン組成物へのタンパク質結合を検出するステップとを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記レクチンが、検出可能な標識で標識される、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記標識が、ビオチンである、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記レクチンが、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  Ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）である、項目１に記載の方法。
（項目６）
前記試料が、血清である、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記タンパク質が、血液凝固因子である、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記血液凝固因子が、フォンビルブラント因子（ｖＷＦ）、第ＶＩＩＩ因子（ＦＶＩＩＩ）、第ＶＩＩ因子（ＦＶＩＩ）、および第ＩＸ因子（ＦＩＸ）からなる群より選択される、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記組換えタンパク質が、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞により産生される、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記組換えタンパク質が、昆虫細胞において産生される、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記血漿由来タンパク質が、α２，６−ノイラミン酸を含み、前記組換えタンパク質が、α２，６−ノイラミン酸を欠く、項目１に記載の方法。
（項目１２）
前記試料が、前記レクチン組成物との接触の前に、前記タンパク質に特異的な結合剤と接触させられる、項目１に記載の方法。
（項目１３）
前記タンパク質結合剤が、固体支持体上に結合される、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記タンパク質結合剤が、溶液中にある、項目１２に記載の方法。
（項目１５）
前記タンパク質結合剤が、抗体である、項目１２に記載の方法。
（項目１６）
前記抗体が、モノクローナル抗体である、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記結合剤との接触の後に、前記試料を過ヨウ素酸塩溶液と接触させるステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１８）
前記組換えタンパク質が、前記血漿由来タンパク質のフラグメント、変異体またはアナログである、項目１に記載の方法。
（項目１９）
試料中の血漿由来タンパク質と組換えタンパク質とを区別する方法であり、
該試料を、レクチンタンパク質を含む組成物と接触させるステップと；
該タンパク質に対する該レクチンの結合を検出するステップと；
該試料中の血漿由来タンパク質の量を決定するために、該試料中のタンパク質−結合レクチンの結合の量を、レクチン：タンパク質結合曲線と比較するステップと
を含む、方法。
（項目２０）
前記レクチンが、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）である、項目１８に記載の方法。
（項目２１）
試料中の血漿由来タンパク質および組換えタンパク質のレベルを定量するためのキットであり、該血漿由来タンパク質および該組換えタンパク質が、同じタンパク質をコードし、該キットが、
タンパク質結合剤；
該血漿由来タンパク質上の炭水化物に特異的なレクチンと検出可能な標識とを含む組成物；および
タンパク質標準
を含む、キット。
（項目２２）
前記結合剤が、抗体である、項目２１に記載のキット。
（項目２３）
前記抗体が、モノクローナル抗体である、項目２２に記載のキット。
（項目２４）
前記レクチンが、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）である、項目２１に記載のキット。
（項目２５）
前記検出可能な標識が、ビオチンである、項目２１に記載のキット。
（項目２６）
遮断試薬を任意に含む、項目２１に記載のキット。
（項目２７）
前記遮断剤が、過ヨウ素酸塩溶液である、項目２６に記載のキット。
（項目２８）
前記タンパク質が、血液凝固因子である、項目２１に記載のキット。
（項目２９）
前記血液凝固因子が、フォンビルブラント因子、第ＶＩＩＩ因子、第ＶＩＩ因子、および第ＩＸ因子からなる群より選択される、項目２８に記載のキット。
【００３０】
本発明の他の特徴および効果は、以下の詳細な記載から明らかになる。しかし、当然のことながら、詳細な記載および具体的実施例は本発明の具体的な実施形態を示すものの、例示のみを目的として与えられるにすぎず、この詳細な記載から本発明の精神と範囲内の様々な変更および修正が当業者に明らかとなる。
【図面の簡単な説明】
【００３１】
【図１】試料中の予想および観察ＳＮＡ結合の差を組換えタンパク質の量に相関づける、４−点検量線のプロットである。
【図２】試料中の予想および観察ＳＮＡ結合の差を組換えタンパク質の量に相関づける、８−点検量線のプロットである
【発明を実施するための形態】
【００３２】
本発明は一般に、二つの種類のタンパク質の間のタンパク質グリコシル化の差に基づいて、試料中の血漿由来タンパク質を組み換え的に産生されたタンパク質から区別する方法に関する。本発明はさらに、組換えタンパク質および血漿由来タンパク質の両方を含む試料中の血漿由来タンパク質の量を定量する方法であり、血漿由来タンパク質および組換えタンパク質が、同じまたは基本的に同じアミノ酸配列を含む、方法を予定する。
【００３３】
別の定めがない限り、本明細書において用いられる全ての専門および科学的用語は、本発明が属する技術の当業者により一般に理解されるのと同じ意味を有する。以下の参考文献は、当業者に本発明で使用する用語の多くの一般的な定義を提供する。Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎ等，ＤＩＣＴＩＯＮＡＲＹ  ＯＦ  ＭＩＣＲＯＢＩＯＬＯＧＹ  ＡＮＤ  ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ  ＢＩＯＬＯＧＹ（第２版．１９９４）；ＴＨＥ  ＣＡＭＢＲＩＤＧＥ  ＤＩＣＴＩＯＮＡＲＹ  ＯＦ  ＳＣＩＥＮＣＥ  ＡＮＤ  ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ（Ｗａｌｋｅｒ編，１９８８）；ＴＨＥ  ＧＬＯＳＳＡＲＹ  ＯＦ  ＧＥＮＥＴＩＣＳ，第５版，Ｒ．Ｒｉｅｇｅｒ等（編），Ｓｐｒｉｎｇｅｒ  Ｖｅｒｌａｇ（１９９１）；およびＨａｌｅおよびＭａｒｈａｍ，ＴＨＥ  ＨＡＲＰＥＲ  ＣＯＬＬＩＮＳ  ＤＩＣＴＩＯＮＡＲＹ  ＯＦ  ＢＩＯＬＯＧＹ（１９９１）。
【００３４】
各刊行物、特許出願、特許、および本明細書中の他の引用文献は、本開示と矛盾しない範囲において参照により全体として本明細書に組み込まれる。
【００３５】
本明細書および添付の請求の範囲において使用されるところの、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」には、文脈により別の示唆がない限り複数の指示物も含まれることに留意されたい。
【００３６】
本明細書で使用されるところの、以下の用語は、特に明記しない限りそれらに属すると考えられる意味を有する。
【００３７】
本明細書で使用されるところの、「ポリペプチド」は、ペプチド結合を介して連結されたアミノ酸残基で構成されるポリマーをさす。合成ポリペプチドは、例えば、自動ポリペプチド合成器を用いて合成されうる。「タンパク質」という用語は、典型的に、大きなポリペプチドをさす。「ペプチド」という用語は、典型的に、短いポリペプチドをさす。本明細書で使用されるところの、ポリペプチドタンパク質およびペプチドは、互換可能に使用される。
【００３８】
本明細書で使用されるところの、ポリペプチドの「フラグメント」は、完全長ポリペプチドまたはタンパク質発現産物より小さい、ポリペプチドの任意の部分をさす。フラグメントは、典型的に、一つ以上のアミノ酸残基が完全長ポリペプチドのアミノ末端および／またはカルボキシ末端から除去されている、完全長ポリペプチドの欠失アナログである。したがって「フラグメント」は、以下に記載される欠失アナログのサブセットである。
【００３９】
本明細書で使用されるところの、「アナログ」は、一定の場合においてではあるが天然の分子に対して様々な程度に構造が実質的に類似し、同じ生物活性を有するポリペプチドをさす。アナログは、（ｉ）ポリペプチドの一つ以上の末端および／または天然のポリペプチド配列の一つ以上の内部領域での一つ以上のアミノ酸残基の欠失、（ｉｉ）ポリペプチドの一つ以上の末端（典型的に「付加」アナログ）および／または天然のポリペプチド配列の一つ以上の内部領域（典型的に「挿入」アナログ）での一つ以上のアミノ酸の挿入または付加、または（ｉｉｉ）天然のポリペプチド配列における一つ以上のアミノ酸による他のアミノ酸の置換を伴う一つ以上の変異に基づき、そのアナログが由来する天然のポリペプチドと比較して、そのアミノ酸配列の組成において異なる。置換は、置換されるアミノ酸およびそれを置換するアミノ酸の物理化学的または機能的関係性にもとづき、保存的または非保存的でありうる。
【００４０】
本明細書で使用されるところの、「変異体」は、通常は分子の一部でない追加的な化学的部分を含むように修飾されたタンパク質またはそのアナログをさす。このような部分は、分子の溶解性、吸収、生物学的半減期等を改善しうる。あるいは、部分は分子の毒性を減少させ、分子の任意の有害な副作用を排除または減じる等することができる。そのような効果を媒介できる部分は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（１９８０）に開示される。このような部分を分子にカップリングするための手順は、従来技術において周知である。例えば、変異体は、ｉｎ  ｖｉｖｏでタンパク質により長い半減期を与える化学修飾を有する血液凝固因子でありうる。ある態様においては、変異体は、グリコシル化、ペグ化、またはポリシアリル化により修飾されるポリペプチドである。
【００４１】
本明細書で使用されるところの、タンパク質またはポリペプチドに適用される「天然」とは、タンパク質が自然に見られるという事実をさす。例えば、自然の源から単離でき、実験室において人為的に修飾されていない、生物（ウィルスを含む）に存在するポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列は、天然である。「天然」および「野生型」という用語は、全体で互換可能に使用される。
【００４２】
本明細書で用いられるところの、タンパク質またはポリペプチドに適用される「血漿由来」とは、対象の血漿または血清中に見られる天然のポリペプチドまたはそのフラグメントをさす。血漿由来タンパク質は、天然のタンパク質および野生型タンパク質でもありうる。
【００４３】
本明細書で使用されるところの「同じタンパク質または基本的に同じタンパク質である」とは、遺伝子操作により組み換え的に発現されて、天然由来のタンパク質と同じまたは基本的に同じアミノ酸配列を有する組換えタンパク質をもたらすこともできる、天然のタンパク質（例えば血漿由来タンパク質）をさす。自然に産生された血漿由来タンパク質と同じタンパク質である組換えタンパク質には、完全長組換えタンパク質のフラグメント、アナログおよび変異体が含まれる。
【００４４】
本明細書で使用されるところの、「予想レクチン結合」は、試料中の総タンパク質量が全て血漿由来タンパク質であると仮定し、レクチン：タンパク質標準結合曲線と比較したときに仮定の血漿由来タンパク質量に基づいて予想されるレクチン結合の量を推定することにより決定される、試料の仮定的レクチン結合をさす。
【００４５】
本明細書で使用されるところの、「検出可能な部分」、「検出可能な標識」または「標識」とは、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的手段により検出可能な組成物をさす。例えば、有用な標識には、３２Ｐ、３５Ｓ、蛍光染料、高電子密度試薬、酵素（例えば、ＥＬＩＳＡにおいて一般に使用されるもの）、ビオチン−ストレプトアビジン、ジオキシゲニン、ハプテン、および、抗血清またはモノクローナル抗体が利用可能であるタンパク質、または標的に相補的な配列を有する核酸分子を含む。検出可能な部分は、多くの場合、試料中の結合した検出可能部分の量を定量するために用いうる、放射性シグナル、発色シグナル、または蛍光シグナル等の測定可能なシグナルを生成する。
【００４６】
本明細書で使用されるところの、「発現する」、「発現している」および「発現」という用語は、例えば対応する遺伝子またはＤＮＡ配列の転写および翻訳に関わる細胞機能を活性化することによりタンパク質を産生することにより、遺伝子またはＤＮＡ配列中の情報が明らかになるのを可能にし、または引き起こすことをさす。ＤＮＡ配列が、宿主細胞に、または宿主細胞により、発現されて、タンパク質等の「発現産物」が形成される。発現産物、例えば結果として生じたタンパク質自体も、宿主細胞により「発現され」または「産生される」ということができる。
【００４７】
フラグメント、変異体およびアナログ
本発明の方法は、試料中の組換えタンパク質、ならびに組換えタンパク質のフラグメント、変異体またはアナログを速やかに検出するために有用であり、さらに、ｉｎ  ｖｉｖｏでフラグメントまたは対立遺伝子変異体として存在しうる天然のタンパク質を検出するために有用であり得、グリコシル化の差を検出しうる。
【００４８】
ポリペプチドフラグメント、変異体またはアナログを調製する方法は、当技術分野において周知である。ポリペプチドのフラグメントは、酵素的切断（例えばトリプシン、キモトリプシン）を含む公知技術の方法を用い、特定のアミノ酸配列を有するポリペプチドフラグメントを生成するために組換え手段も用いて、調製される。フラグメントは、リガンド結合ドメイン、受容体結合ドメイン、二量体化または多量体化ドメイン、または当技術分野で公知の任意の他の同定可能ドメインを含むように生成されうる。
【００４９】
ポリペプチドアナログを作製する方法も、周知である。アナログは、アナログが由来する天然のポリペプチドと実質的に相同または実質的に同一であり得、本発明で予定されるアナログは、天然のポリペプチドの生物活性の少なくともいくつかを保持するものである。
【００５０】
置換アナログは、典型的に、野生型の一つのアミノ酸を別のものとタンパク質内の一つ以上の部位で置換し、タンパク質分解的切断に対する安定性等のポリペプチドの一つ以上の特性を、他の機能または特性の喪失を伴わずに調節するように設計されうる。この種類の置換は、一般に保存的である。「保存的アミノ酸置換」とは、類似の化学的特性の側鎖を有するアミノ酸によるアミノ酸の置換を意味する。保存的置換を行うための類似のアミノ酸は、酸性側鎖（グルタミン酸、アスパラギン酸）；塩基性側鎖（アルギニン、リシン、ヒスチジン）；極性アミド側鎖（グルタミン、アスパラギン）；疎水性、脂肪族側鎖（ロイシン、イソロイシン、バリン、アラニン、グリシン）；芳香族側鎖（フェニルアラニン、トリプトファン、チロシン）；低分子側鎖（グリシン、アラニン、セリン、スレオニン、メチオニン）；または脂肪族ヒドロキシル側鎖（セリン、スレオニン）を有するものを含む。
【００５１】
ポリヌクレオチドアナログおよびフラグメントは、天然の分子と同じまたは類似の生物活性を持つ天然の分子の生物学的に活性のフラグメント、変異体、または変異体をコードするように、当業者により容易に生成されうる。ルーチン的に実施される方法には、ＰＣＲ技術、タンパク質分子をコードするＤＮＡの酵素消化、および異種ポリヌクレオチド配列に対する連結等が含まれる。例えば、ＰＣＲおよび当技術分野で周知の他の技術を用いた点変異誘発を利用して、タンパク質活性と関係する特定の活性においていずれのアミノ酸残基が重要であるかを、特異性をもって同定しうる。したがって、当業者は、コドンの変化およびミスセンス変異を生じる、ＤＮＡ鎖中の一塩基の変化を生成することが可能である。
【００５２】
タンパク質またはポリペプチドが、ポリペプチドである第二薬剤を含む融合タンパク質であるアナログを作成するために修飾されうることが、さらに意図される。一実施形態においては、ポリペプチドである第二薬剤は、酵素、成長因子、サイトカイン、ケモカイン、細胞−表面受容体、細胞表面受容体の細胞外ドメイン、細胞接着分子、または上記のタンパク質または公知技術の任意の他のタイプのタンパク質のフラグメントまたは活性ドメインである。関連の実施形態においては、第二薬剤は、第ＶＩＩＩ因子、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子およびフォンビルブラント因子等の血液凝固因子である。意図される融合タンパク質は、当技術分野で周知の化学技術または組換え技術により作成される。
【００５３】
意図されるタンパク質変異体は、ユビキチン結合、グリコシル化、治療または診断薬剤への接合、標識（例えば、放射性核種または様々な酵素による）、ペグ化（ポリエチレングリコールによる誘導体化）等の共有結合によるポリマー結合、非加水分解性結合の導入、およびヒトタンパク質では通常生じないオルニチン等のアミノ酸の化学合成による挿入または置換等の技術により化学的に修飾されたポリペプチドを含む。変異体は、本発明の非修飾分子の結合特性を保持する。
【００５４】
ポリペプチド、フラグメントまたはアナログのペグ化変異体の調製は一般に、（ａ）結合コンストラクトポリペプチドが一つ以上のＰＥＧ基に結合する条件下で、ポリペプチドをポリエチレングリコール（ＰＥＧの反応性エステルまたはアルデヒド誘導体等）と反応させるステップと、（ｂ）反応生成物（単数または複数）を得るステップとを含む。一般に、アシル化反応のための最適な反応条件は、公知のパラメータおよび所望の結果に基づいて決定される。例えば、ＰＥＧ：タンパク質の比が大きいほど、ポリ−ペグ化産物の割合は大きくなる。いくつかの実施形態においては、結合コンストラクトは、Ｎ−末端に単一のＰＥＧ部分を有する。ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）がタンパク質に結合されて、より長いｉｎ  ｖｉｖｏの半減期を提供しうる。ＰＥＧ基は、任意の都合のよい分子量であればよく、直鎖または分枝でありうる。ＰＥＧの平均分子量は、約２キロダルトン（「ｋＤａ」）〜約１００ｋＤａの範囲となり、より多くは約５ｋＤａ〜約５０ｋＤａ、最も多くは約５ｋＤａ〜約１０ｋＤａの範囲となる。ＰＥＧ基は一般に、血液凝固因子上の反応基（例えばアルデヒド、アミノまたはエステル基）に対する、ＰＥＧ部分上の天然または人工の反応性部分（例えばアルデヒド、アミノ、チオール、またはエステル基）を通じたアシル化または還元的アルキル化を介して血液凝固因子に結合される。
【００５５】
本発明の方法で有用な追加的なポリペプチド変異体には、ポリシアリル化（ＰＳＡ）部分を含むポリペプチドが含まれる。ポリシアリル化ポリペプチドを調製する方法は、米国特許出願公開第２００６０１６０９４８号およびＳａｅｎｋｏ等，Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｉａ  １２：４２−５１，２００６に記載される。
【００５６】
グリコシル化
ヒトタンパク質におけるグリコシル化は、単糖および複合糖の組み合わせからなる。マンノース、グルコース、フコース、ガラクトース、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎ−アセチルグルコサミン、およびシアル酸／ノイラミン酸等の単糖が、約２〜最高１２またはそれ以上の単糖の直鎖または分枝鎖に組み合わせられる（Ｂｒｏｏｋｓ等，Ｅｘｐｅｒｔ  Ｒｅｖ  Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ  ３：３４５−５９，２００６）。次の構造上の炭素のいずれかでのアルファまたはベータ結合、例えば第一糖の第一炭素と次の糖の第三炭素の間とのα１−３結合により、各単糖が別の糖部分に連結されうる。特異的グリコシルトランスフェラーゼにより糖部分の付加が行われ、糖−特異的グリコシダーゼタンパク質により糖類が除去される。
【００５７】
Ｎ−グリコシル化においては、９つのマンノース残基、２つのＮ−アセチルガラクトサミン残基および３つのグルコース残基を含む基本的糖部分（ＧａｌＮａｃ２Ｍａｎ９Ｇｌｃ３）が、タンパク質のアスパラギン残基に付加される。タンパク質に付加されるとオリゴ糖は切断されて、末端の３つのグルコース残基およびマンノース残基が除去される。それからタンパク質は、ゴルジ装置へ輸送され、さらなる翻訳後修飾が起こる。例えばさらに３つのマンノース部分が除去されて、５つのマンノースおよび２つのＮ−アセチルグルコサミンの核糖鎖（Ｍａｎ５ＧｌｃＮａｃ２）が残される。この部分は、さらに切断され、または追加的な残基が加えられうる。いくつかの高次のオリゴ糖は、３つのマンノースおよび２つのＮ−アセチルグルコサミン糖を有する核構造に基づく。高マンノースは、核構造に連結された５〜９のマンノース残基を含む。複合型オリゴ糖は、α１，３−およびα１，６結合マンノース残基と置換されたＮ−アセチルグルコサミン残基を含む。ハイブリッド型オリゴ糖は、α１，３−結合マンノース残基に置換されたＮ−アセチルグルコサミン残基を含む。ハイブリッドおよび複合型Ｎ−結合型オリゴ糖は、イーストおよび細菌等の単純生物によっては合成されない。
【００５８】
Ｏ−グリコシル化は、ゴルジ装置において起こる翻訳後イベントであり、典型的にＮ−アセチルガラクトサミンであるが、マンノースまたはフコースでもありうる単一の単糖の、セリンまたはスレオニン残基のＯＨ基への付加により開始する。段階的様式でさらなる鎖延長が行われるが、Ｎ−結合型グリコシル化のように付加に必要とされる核構造はない（Ｂｒｏｏｋｓ等，上記）。
【００５９】
細菌は、ゴルジ装置他のオルガネラの欠如により、哺乳類細胞におけるプロセスとは全く異なる様式で糖残基をタンパク質に付加する。ほとんどの細菌糖タンパク質は、Ｎ−グリコシル化タンパク質にシアル酸部分を欠き、またはシアル酸が存在する場合には、典型的な糖タンパク質においてではなく、ヒト神経細胞タンパク質において産生されるものと類似のポリシアル酸鎖で残基が生じることが多い（Ｂｒｏｏｋｓ等，上記）。α２，３シアル酸の付加を担う酵素α２，３シアリルトランスフェラーゼが、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅにおいて単離されている。ヒトタンパク質のものにより類似したグリコシル化を有するタンパク質を産生する試みにおいて、細菌またはヒトグリコシルトランスフェラーゼを細菌細胞に導入するために、遺伝子操作が試みられている。Ｏ−結合型グリコシル化においては、細菌Ｏ−グリカンは高度にメチル化され、ヒトにおいて見られない糖ラムノースを含む。また、付加される第一単糖は、ＧａｌＮａｃである必要はない。
【００６０】
イースト（例えばＰｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ，Ｓ  Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）は、ヒト細胞と類似のＮ−グリコシル化の第一段階を行い、９つのマンノース、３つのグルコース、２つのＮ−アセチルグルコサミン核オリゴ糖を生成し、これをタンパク質に付加する。それから９−マンノース核が、８つのマンノース、２つのＮ−アセチルグルコサミンだけの核に切断される。この８−マンノース構造は、ヒト細胞のように切断されないが、最大１００のマンノース残基を含むようにさらにマンノシル化されうる（Ｂｒｏｏｋｓ等，上記）。ヒトタンパク質における付加により類似した様式で糖残基を付加するグリコシルトランスフェラーゼ酵素を発現する、遺伝子操作Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ細胞が開発されている（Ｂｒｏｏｋｓ等，．上記，Ｇｅｒｎｇｒｏｓｓ等，Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２２：１４０９−１４，２００４；Ｗｉｌｄｔ等．，Ｎａｔ  Ｒｅｖ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  ３：１１９−１２８，２００５）。しかし、シアリルトランスフェラーゼ酵素の良好な導入は達成されておらず、イースト細胞において産生されるほとんどのタンパク質がシアリル残基を欠いたままである（Ｂｒｏｏｋｓ等，上記）。イーストＯ−グリコシル化は、マンノース残基のセリンまたはスレオニン残基への付加により開始し、直鎖または分枝構造において最高５マンノース残基に延長されうる。マンノース−結合Ｏ−グリコシル化は、ヒトでは生じない。
【００６１】
植物細胞のタンパク質グリコシル化は、ヒトにおけるものと大きく異なる。植物細胞におけるＮ−グリコシル化は、ヒト細胞におけるもののように開始し、核オリゴ糖ＧａｌＮａｃ２Ｍａｎ９Ｇｌｃ３が形成される。それから核コア構造が、５〜９のマンノース残基および２つのＮ−アセチルグルコサミン残基を有する部分（Ｍａｎ５−９ＧｌｃＮａｃ２）に切断され、ヒト細胞において発現されず、ヒトに対して免疫原性でありうる連結配列におけるフコースおよびキシロース（非ヒト糖）等の糖類を用いてさらに延長されうる。植物糖タンパク質は、シアリル化されないと一般に考えられるが、シアリル基を付加するために培養において誘導されうる（Ｓａｉｎｔ−Ｊｏｒｅ−Ｄｕｐａｓ等，Ｔｒｅｎｄｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  ２５：３１７−２３，２００７）。最近、シアリル化タンパク質を産生するために必要な機構を発現する遺伝子操作植物細胞を作製する試みがなされている（Ｐａｃｃａｌｅｔ等，Ｐｌａｎｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｊ  ５：１６−２５，２０７）。植物がシアル酸を発現するために、シアル酸シンセターゼ、グリコシルトランスフェラーゼおよび輸送体を含めて、このグリコシル化に関与するヒト遺伝子群全体が、植物細胞に形質導入されなければならず、シアリル化植物タンパク質の発現を困難にしている。植物Ｏ−結合型グリコシル化は、セリン、スレオニンまたはヒドロキシプロリン残基で付加されうる。植物におけるＯ−結合型グリカンには、ヒトには見られない糖ラムノース、アラビノースおよびグルクロン酸、ならびにＧａｌＮａｃ等、より哺乳類タイプである構造が含まれる。
【００６２】
昆虫細胞におけるグリコシル化は、植物細胞におけるものと同様に進行する。Ｎ−グリカン前駆体核が合成され、タンパク質に加えられ、トリマンノース核構造に切断される。しかし、さらなる修飾は、一般にマンノースまたはフコース残基の付加に制限される（Ｂｒｏｏｋｓ等．上記，Ａｌｔｍａｎｎ等，Ｇｌｙｃｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｊ  １６：１０９−１２３，１９９９）。昆虫細胞は、非シアリル化タンパク質を特徴的に産生するが、一定の培養条件において、発達の一定の段階の間にシアリル酸を産生するように誘導されうる（Ｂｒｏｏｋｓ等，上記；Ｔｏｍｉｙａ等，Ｇｌｙｃｏｃｏｎｊ  Ｊ．２１：３４３−３６０，２００４）。ヒトシアリルトランスフェラーゼ遺伝子を発現させるために昆虫細胞が操作されており、シアリル化タンパク質の生成に中程度に成功している（Ａｕｍｉｌｌｅｒ等，Ｇｌｙｃｏｂｉｏｌｏｇｙ  １３：４９７−５０７，２００３）。しかし、昆虫細胞は、タンパク質に付加される任意のシアル酸部分を切断しうるシアリダーゼ酵素を分泌する。Ｏ−結合型グリコシル化は、ヒトのものと類似である。
【００６３】
治療タンパク質を大量に産生するための最も一般的な細胞系統であるベビーハムスター腎臓（ＢＨＫ）およびチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞等、非ヒト哺乳類細胞におけるグリコシル化は、ヒトタンパク質と類似するが必ずしも同一でないグリコシル化部分を伴う、タンパク質を産生することが多い。例えば、ＣＨＯ細胞は、異なるシアル酸様糖部分を発現し、したがって、ヒト細胞において産生されるようにシアル酸を産生しない（Ｂｒｏｏｋｓ等，Ｅｘｔ  Ｒｅｖ  Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ  ３：３４５−５９，２００６）；Ｃｈｅｎｕ等，Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ａｃｔａ  １６２２：１３３−４４，２００３）。さらに、ＣＨＯ細胞は、ヒト細胞においては発現されないα２，３構造においてシアル酸様糖を構築する。ヒトα２，６シアリルトランスフェラーゼを発現するように操作された改変ＣＨＯ細胞は、ヒト型α２，６シアル酸およびハムスター−由来α２，３シアル酸の両方を発現するタンパク質を良好に産生する（Ｂｒａｇｏｎｚｉ等，Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ａｃｔａ  １４７４：２７３−８２，２０００）。昆虫におけるＯ−グリコシル化については、ほとんど知られていない。昆虫は、スレオニン残基をＯ−グリコシル化すると考えられており、ＧａｌＮａｃ、および二糖のＧａｌＮａｃとガラクトース等のような哺乳類様糖類を含みうる。
【００６４】
レクチンタンパク質
糖部分は、特定の糖部分に高度に特異的である炭水化物−結合タンパク質または糖タンパク質であるレクチンタンパク質により特異的に結合される。レクチンタンパク質は、最初に植物種から単離された。例えば、レクチンＳａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）はニワトコの木の木から単離され、α２，６シアル酸部分を特異的に結合する（Ｂｒｉｎｋｍａｎ−Ｖａｎ  ｄｅｒ  Ｌｉｎｄｅｎ等，Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３０３：９８−１０４，２００２）。レクチンタンパク質が、ほぼすべての種に見られることも現在知られている。
【００６５】
レクチンの対応する炭水化物への結合は、Ｃａ２＋−依存的またはＣａ２＋−非依存的でありうる。米国特許第５，２２５，５４２号を参照。炭水化物のレクチン認識の特異性は、高度に特異的であり、したがって抗体の抗原特異性または酵素の基質特異性と同等である。例えば、いくつかのＣａ２＋−非依存レクチンが、ウシの膵臓から単離されており、特異的にβ−ガラクトシドラクトースおよびアシアロフェチュインおよびα−ガラクトシドメリビオース、およびＣａ２＋−依存フスコース（ｆｕｓｃｏｓｅ）に対しても結合レクチンが同定されている。
【００６６】
レクチンＭａａｃｋｉａ  ａｍｕｒｅｎｓｉｓ凝集素（ＭＡＡ、ＭＡＬ）は、α２，３シアル酸を結合し、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）は、α２，６シアル酸を結合し、Ａｌｅｕｒｉａ  ａｕｒａｎｔｉａレクチン（ＡＡＬ）（ＫｏｂａｔａおよびＹａｍａｓｈｉｔａ，１９９３）およびＬｅｎｓ  ｃｕｌｉｎａｒｉｓ（ＬｃＨ）（Ｙａｍａｓｈｉｔａ等，１９９３）は、フコース残基を結合する。いくつかの植物レクチンが、血液型特異的炭水化物であり、血液型タイピングにおいて使われる、Ｎ−アセチル−β−Ｄ−ガラクトサミンに特異的である。Ｃ−型動物レクチンは、Ｎ−アセチルガラクトサミンを結合する。リムリンおよびＬｉｍａｘ  ｆｌａｖｕｓ凝集素（ＬＦＡ）は、Ｏ−鎖糖タンパク質と強く相互作用する（Ｆｉｓｃｈｅｒ等，Ｇｌｙｃｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｊ．１２：７０７−１３，２００４）。さらに、天然のアナログの作用をより大きな特異性を伴いつつ模倣するために、レクチンアナログが開発されている（Ｆｅｒｒａｎｄ等，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３１８：６１９−６２２，２００７）。
【００６７】
下表＊は本発明の方法で有用な公知のレクチンおよびその結合特異性の詳細を示す。
【００６８】
【表５−１】
2018017736.tif 000003
【００６９】
【表５−２】
2018017736.tif 000004
【００７０】
【表５−３】
2018017736.tif 000005
＊表の出典は、Ｇａｂｉｕｓ，Ｈ．−Ｊ．；Ｇａｂｉｕｓ，Ｓ．（編）：Ｇｌｙｃｏｓｃｉｅｎｃｅｓ−Ｓｔａｔｕｓ  ａｎｄ  Ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓ．Ｗｅｉｎｈｅｉｍ：Ｃｈａｐｍａｎ  ＆  Ｈａｌｌ，１９９７；Ｇｏｌｄｓｔｅｉｎ，等，Ｓｈａｒｏｎ，Ｎ．；Ｇｏｌｄｓｔｅｉｎ，Ｉ．Ｊ．（編）Ｔｈｅ  Ｌｅｃｔｉｎｓ−Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ，Ｆｕｎｃｔｉｏｎｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ．Ｏｒｌａｎｄｏ：Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，１９８６，Ｓ．３３−２４３；Ｄｅｂｒａｙ等，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１１７，４１−５５，１９８１を引用するＧａｌａｂ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  ＧｍｂＨ，Ｇｅｒｍａｎｙである。
【００７１】
上記のレクチンが、タンパク質の発現源に依存しうる二つの異なるタンパク質のグリコシル化パターンを区別するために、本発明の方法において使用されうる。例えば、以下の実施例において例示されるＳＮＡタンパク質は、α２，６シアル酸残基を発現するタンパク質を特異的に結合するのに有用であり、ＭＡＡタンパク質はα２，３シアル酸残基を特異的に結合する。
【００７２】
組換えタンパク質
組換えタンパク質を作製する方法は、従来技術において周知である。組換えタンパク質をコードするＤＮＡまたはＲＮＡを発現する、哺乳類細胞を含む細胞を産生する方法は、米国特許第６，０４８，７２９号、第５，９９４，１２９号、および第６，０６３，６３０号に記載される。これらの出願の教示のそれぞれが、参照により全体として特に本明細書に組み込まれる。
【００７３】
ポリペプチドまたはそのフラグメント、変異体またはアナログを発現するために用いられる核酸コンストラクトは、トランスフェクションされた哺乳類細胞において染色体外的に（エピソーム的に）発現されるもの、または、相同的組み換えにより受容細胞のゲノムにランダムに、または予め選択された標的部位で組み込まれるものでありうる。染色体外的に発現されるコンストラクトには、ポリペプチドをコードする配列に加えて、細胞内のタンパク質の発現のため、および任意にコンストラクトの複製のために十分な配列を含む。これには、プロモータ、ポリペプチドをコードするＤＮＡ配列、およびポリアデニル化部位が典型的に含まれる。タンパク質をコードするＤＮＡはその発現がプロモータの制御下にあるような様式で、コンストラクト内に配置される。任意に、コンストラクトは、以下の一つ以上等の、追加的な構成成分を含みうる：スプライス部位、エンハンサ配列、適切なプロモータの制御下の選択可能マーカー遺伝子、および適切なプロモータの制御下の増幅可能マーカー遺伝子。
【００７４】
ＤＮＡコンストラクトが細胞のゲノムに組み込まれる実施形態においては、ポリペプチドをコードする核酸配列だけが含まれれば足りる。任意に、プロモータおよびエンハンサ配列、ポリアデニル化部位（単数または複数）、スプライス部位（単数または複数）、選択可能マーカー（単数または複数）をコードする核酸配列、増幅可能なマーカーをコードする核酸配列、および／またはＤＮＡ組み込みをゲノム中の選択された部位に標的化するための、受容細胞におけるゲノムＤＮＡに相同のＤＮＡ（ターゲティングＤＮＡまたはＤＮＡ配列）が含まれうる。
【００７５】
組換えタンパク質を産生するために用いられる宿主細胞は、細菌、イースト、昆虫、非哺乳類脊椎動物、または哺乳類細胞であり；哺乳類細胞には、ハムスター、サル、チンパンジ、イヌ、ネコ、ウシ、ブタ、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジおよびヒト細胞が含まれるがこれに限られない。宿主細胞は、不死化細胞（細胞系統）または非不死化（一次または二次）細胞であり得、繊維芽細胞、ケラチノサイト、上皮細胞（例えば乳腺上皮細胞、腸管上皮細胞）、卵巣細胞（例えばチャイニーズハムスター卵巣すなわちＣＨＯ細胞）、内皮細胞、グリア細胞、神経細胞、血液の固形成分（例えばリンパ球、骨髄細胞）、筋細胞、肝細胞およびこれらの体性細胞型の前駆体等の多様な細胞型のいずれかでありうる。
【００７６】
一般に使用される宿主細胞には、グラム陰性またはグラム陽性細菌、すなわちＥ．ｃｏｌｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａなどの任意の菌種等の原核細胞；ＣＨＯ（チャイニーズハムスター卵巣）細胞等の真核細胞；ベビーハムスター腎臓（ＢＨＫ）細胞；ヒト腎臓２９３細胞；ＣＯＳ−７細胞；Ｄ．Ｍｅｌ−２、Ｓｆ４、Ｓｆ５、Ｓｆ９、およびＳｆ２１およびＨｉｇｈ５等の昆虫細胞；植物細胞およびＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｉｃｈｉａ等の様々なイースト細胞が含まれる。
【００７７】
ポリペプチドをコードするＤＮＡまたはＲＮＡを含む宿主細胞は、細胞の増殖およびＤＮＡまたはＲＮＡの発現に適切な条件下で培養される。ポリペプチドを発現する細胞は、公知の方法を用いて同定でき、組換えタンパク質が、ポリペプチド産生の増幅を伴って、または伴わずに、公知の方法を用いて単離および精製される。同定は、例えばタンパク質をコードするＤＮＡまたはＲＮＡの存在を表す表現型を発現する遺伝子操作された哺乳類細胞をスクリーニングすることにより、例えばＰＣＲスクリーニング、サザンブロット分析によるスクリーニング、またはタンパク質の発現のスクリーニングなどにより、行われうる。組み込まれたタンパク質コードするＤＮＡを有する細胞の選択は、選択可能なマーカーをＤＮＡコンストラクトに含ませ、選択可能なマーカー遺伝子を含むトランスフェクションまたは感染細胞を、選択可能マーカー遺伝子を発現する細胞の生存だけに適切な条件下で培養することにより達成されうる。導入されたＤＮＡコンストラクトのさらなる増幅は、遺伝子操作された細胞を増幅に適切な条件下で培養する（例えば、増幅可能マーカー遺伝子の複数の複製を含む細胞だけが生存できる濃度の薬物の存在下で、増幅可能マーカー遺伝子を含む遺伝子操作された細胞を培養する）ことにより行われうる。
【００７８】
治療タンパク質でありうる組換えタンパク質には、サイトカイン、成長因子、血液凝固因子、酵素、ケモカイン、可溶性細胞表面受容体、細胞接着分子、抗体、ホルモン、細胞骨格タンパク質、基質タンパク質、シャペロンタンパク質、構造タンパク質、代謝タンパク質、および当業者に知られる他の治療タンパク質が含まれるがこれに限られない。治療剤として使用される／されうる例示的な組み換えタンパク質には、第ＶＩＩＩ因子、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子およびフォンビルブラント因子、エリスロポイエチン、インターフェロン、インシュリン、ＣＴＬＡ４−Ｉｇ、アルファ−グルコセレブロシダーゼ、アルファ−グルコシダーゼ、卵胞刺激ホルモン、抗−ＣＤ２０抗体、抗−ＨＥＲ２抗体、抗−ＣＤ５２抗体、ＴＮＦ受容体、およびその他当技術分野で公知のものが含まれるがこれに限られない。例えばＰｈｙｓｉｃｉａｎｓ  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ，第６２版，２００８，Ｔｈｏｍｓｏｎ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ，Ｍｏｎｔｖａｌｅ，ＮＪを参照。
【００７９】
試料中のタンパク質を検出する方法
治療タンパク質は、内因的に産生される天然のタンパク質との類似性により、血清試料中に検出するのが困難であることが多い。しかし、治療タンパク質がより高い溶解性または安定性、酵素消化に対する抵抗性、生物学的半減期の改善、および当業者に公知の他の特徴等、所望の特性を呈するかを評価するために、投与された治療ポリペプチド、そのフラグメント、変異体またはアナログの量を決定することが、多くの場合に有益である。方法は、知的財産権により保護されうる認可された治療タンパク質の使用の検出も可能にする。
【００８０】
本発明は、試料中の血漿由来の天然のタンパク質を組換えタンパク質と区別する方法を提供し、これにより試料中の各タイプのタンパク質の定量を可能にする。時間に対して試料中の組換えタンパク質の量を同定する能力は、半減期、吸収、安定性等に基づく最適な治療の決定を助ける。検出アッセイは、酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、シンチレーション近接アッセイ（ＳＰＡ）、表面プラズマ共鳴（ＳＰＲ）、または公知技術の他の結合アッセイでありうる。
【００８１】
本明細書に提示される検出方法は、上記のように、血漿由来タンパク質と多くの組み換え的に産生されたタンパク質との間のグリコシル化パターンの差を利用する。
【００８２】
試料中の血漿由来タンパク質を検出するために、血漿由来タンパク質上の炭化水素部分に特異的な本明細書に記載のレクチンタンパク質を含む組成物と試料が接触させられ、レクチンと結合した血漿由来タンパク質の量が測定される。一態様では、接触ステップは、リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）、マグネシウム／カルシウムフリーＰＢＳ、または当技術分野で周知の他の適切なバッファー等の水性バッファー等の液体環境で行われる。例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｃｏｌｉｇａｎ等，編，１９９８，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ，Ｈｏｂｏｋｅｎ，ＮＪを参照。本発明の方法における接触は、結合が平衡に達するに十分な期間行われ、典型的には１５分〜一晩の範囲の時間行われることが意図される。例えば、試料は、結合剤またはレクチンタンパク質と、１５分、３０分、４５分、１時間、２時間、３時間、４時間、６時間、８時間、１２時間、１４時間、１６時間、１８時間、２０時間、２４時間、または結合剤またはレクチンの血漿由来タンパク質に対する十分な結合に適切な時間、接触させられる。
【００８３】
方法は、少なくとも一つ以上の洗浄ステップを任意に含み、タンパク質結合を測定する前に、非結合ポリペプチドにより生じるバックグラウンド測定を減らすために、結合したレクチン：タンパク質組成物が洗浄される。ポリペプチド組成物のインキュベーション後、およびレクチン：タンパク質結合の検出前のレクチンの洗浄は、適切なバッファーと界面活性剤中において行われる。適切な界面活性剤には、アルキルジメチルアミンオキシド、アルキルグルコシド、アルキルマルトシド、アルキルスルフェート（ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）等）、ＮＰ−４０、アルキルチオグルコシド、ベタイン、胆汁酸、ＣＨＡＰシリーズ、ジギトニン、グルカミド、レシチン／リゾレシチン、ＴＲＩＴＯＮ−Ｘ、ＴＷＥＥＮ（登録商標）２０およびＴＷＥＥＮ（登録商標）８０等のポリソルベート、ＢＲＩＪ（登録商標）、ＧＥＮＡＰＯＬ（登録商標）、およびＴＨＥＳＩＴ（登録商標）を含む非イオン性ポリオキシエチレン−ベース界面活性剤、第四アンモニウム化合物などが含まれるがこれに限られない。Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ａｐｐｅｎｄｉｘ  １Ｂ，Ｓｕｐｐｌ．１１，１９９８，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ，Ｈｏｂｏｋｅｎ，ＮＪも参照。適切な界面活性剤は、ルーチン試験を用いて決定されうる（Ｎｅｕｇｅｂａｕｅｒ，Ｊ．，Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  ｔｈｅ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  ｏｆ  Ｄｅｔｅｒｇｅｎｔｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ−Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ  Ｃｏｒｐ．，Ｌａ  Ｊｏｌｌａ，Ｃａｌｉｆ．，１９８８参照）。
【００８４】
上述のように、レクチンタンパク質は、検出可能な部分または検出可能な標識に連結されうる。検出可能な部分または標識とは、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的手段により検出可能な組成物をさす。検出可能な部分は多くの場合、試料中の結合した検出可能部分の量を定量するために用いうる、放射性シグナル、発色シグナル、または蛍光シグナル等の測定可能シグナルを生成する。検出可能な部分は、例えば、放射性ヌクレオチド、またはストレプトアビジンにより認識されるビオチン化ヌクレオチドの取り込みなど、共有結合的に、またはイオン結合、ファンデルワールス結合または水素結合により、タンパク質に取り込まれ、または結合されうる。検出可能な部分は、直接または間接的に検出可能でありうる。間接的検出は、検出可能な部分に対する第二の直接または間接的に検出可能な部分の結合を伴いうる。例えば、検出可能な部分は、ストレプトアビジンの結合パートナーであるビオチン等、結合パートナーのリガンドでありうる。結合パートナーはそれ自体が直接検出可能であり得、例えば、抗体が蛍光分子により標識されうる。シグナルの定量化方法の選択は、例えば、シンチレーション計数、デンシトメトリ、またはフローサイトメトリにより達成される。
【００８５】
本発明のアッセイ法における使用に適する標識の例には、放射性標識、フルオロフォア、高電子密度試薬、酵素（例えば、ＥＬＩＳＡにおいて一般に使用されるもの）、ビオチン、ジゴキシゲニン、または、例えばハプテンまたはペプチドに放射標識を取り込むことによって検出可能にできる、またはハプテンまたはペプチドに特異的に反応する抗体を検出するために用いられる、ハプテンならびにタンパク質が含まれる。抗血清またはモノクローナル抗体が利用可能であるタンパク質、または標的に相補的な配列を伴う核酸分子、ナノタグ、分子量ビーズ、磁性薬剤、蛍光染料を含むナノビーズまたはマイクロビーズ、量子ドット、量子ビーズ、蛍光タンパク質、蛍光標識を伴うデンドリマー、マイクロトランスポンダ、電子供与体分子または分子構造、あるいは光反射性粒子も予定される。
【００８６】
本発明の用途に予定される追加的な標識には、蛍光染料（例えばフルオレセインイソチオシアネート、テキサスレッド、ローダミンなど）、放射標識（例えば３Ｈ、１２５Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ、または３２Ｐ）、酵素（例えばワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼおよびその他ＥＬＩＳＡにおいて一般に使用されるもの）、およびコロイド金、着色ガラスまたはプラスチックビーズ（例えばポリスチレン、ポリプロピレン、ラテックス等）等の比色標識、および発光または化学発光標識（例えばＥｕｒｏｐｉｕｍ（Ｅｕ）、ＭＳＤ  Ｓｕｌｆｏ−Ｔａｇ）が含まれるがこれに限られない。
【００８７】
標識は、公知技術の方法にしたがって、アッセイの所望の成分に直接または間接的に連結されうる。特定の実施態様においては、本発明による活性薬剤の接合のためにイソシアネートまたはＮ−ヒドロキシスクシンイミドエステル試薬を用いて、標識が成分に共有結合される。本発明の一態様においては、標識をバイオポリマーに接合して、活性薬剤の結合を伴わない標識バイオポリマー接合体を形成するために、二機能性イソシアネート試薬が用いられる。標識バイオポリマー接合体は、本発明による標識接合体の合成における中間体として用いられてよく、または、バイオポリマー接合体を検出するために用いられてもよい。上記のように、多様な標識が使用でき、標識の選択は、求められる感度、アッセイの所望の成分との接合の容易性、安定性要件、利用可能な機器、および処理設備による。非放射性標識は、間接的手段により付着されることが多い。一般に、リガンド分子（例えばビオチン）が分子に共有結合される。そしてリガンドが、本来的に検出可能であるか、または検出可能な酵素、蛍光化合物または化学発光化合物等のシグナル系に共有結合する、別の分子（例えばストレプトアビジン）分子に結合する。
【００８８】
本発明の方法において有用な化合物は、例えば酵素またはフルオロフォアとの接合により、シグナル生成化合物に直接接合されてもよい。標識としての使用に適切な酵素には、ヒドロラーゼ、特にホスファターゼ、エステラーゼおよびグリコシダーゼ、またはオキシドターゼ（ｏｘｉｄｏｔａｓｅｓ）、特にペルオキシダーゼが含まれるがこれに限られない。標識としての使用に適する蛍光化合物には、上に列挙されるもの、ならびにフルオレセイン誘導体、ローダミンおよびその誘導体、ダンシル、ウンベリフェロン、エオシン、ＴＲＩＴＣ−アミン、キニーネ、フルオレセインＷ、アクリジンイエロー、リサミンローダミン、Ｂスルホニルクロリドエリスロセイン（ｅｒｙｔｈｒｏｓｃｅｉｎ）、ルテニウム（トリス、ビピリジニウム）、ユウロピウム、テキサスレッド、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド、フラビンアデニンジヌクレオチド等が含まれるがこれに限られない。標識としての使用に適切な化学発光化合物には、ＭＳＤ  Ｓｕｌｆａ−ＴＡＧ、Ｅｕｒｏｐｉｕｍ（Ｅｕ）、Ｓａｍａｒｉｕｍ（Ｓｍ）、ルシフェリンおよび２，３−ジヒドロフタルアジネジオン、例えばルミノールが含まれるがこれに限られない。本発明の方法において使用できる様々な標識またはシグナル生成系の概観については、米国特許第４，３９１，９０４号を参照。
【００８９】
標識を検出するための手段は当業者に周知であり、検出される標識のタイプにより決定される。したがって、例えば、標識が放射性である場合には、検出のための手段には、シンチレーションカウンタ（例えばラジオイムノアッセイ、シンチレーション近接アッセイ）（Ｐｉｔａｓ等，Ｄｒｕｇ  Ｍｅｔａｂ  Ｄｉｓｐｏｓ．３４：９０６−１２，２００６）またはオートラジオグラフィのような写真フィルムが含まれる。標識が蛍光標識である場合には、適切な波長の光で蛍光色素を励起し、生じた蛍光を検出することにより検出されうる（例えばＥＬＩＳＡ、フローサイトメトリ、または公知技術の他の方法）。蛍光は、電荷結合素子（ＣＣＤ）または光電子増倍管等の電子的検出器を用いて、視覚的に検出されうる。同様に、酵素標識は、酵素に適切な基質を提供し、生じた反応生成物を検出することにより検出されうる。比色または化学発光標識は、単に標識に伴う色を観察することにより検出されうる。本発明の方法の使用に適する他の標識および検出系は、当業者に直ちに明らかとなる。このような標識モジュレータおよびリガンドが、疾患または健康状態の診断において使用されうる。
【００９０】
別の実施形態においては、血漿由来タンパク質を含む試料がまず、目的のタンパク質を結合する結合剤（レクチンタンパク質ではない）と接触させられる。結合剤は、抗体、可溶性受容体、リガンド、補因子、または特異性をもって血漿由来タンパク質または組換えタンパク質を結合する他のタンパク質でありうる。「特異性をもって」とは、結合剤が特定性もってタンパク質を結合しうるが、標的分子または部分を排他的に結合しないことを意味する。「特異的に結合する」とは、特定の標的タンパク質または他の部分（例えば炭水化物）を認識し、優先的に結合する結合剤の能力をさす。
【００９１】
方法は、タンパク質を捕捉または結合するために使用されるタンパク質結合剤から任意の不要な糖部分を除去するために、結合剤が試料との接触前に遮断剤と接触させられる、遮断のステップも任意に含む。例示的な遮断剤には、血清アルブミン、ゼラチン、特定の糖残基を切断するグリコシダーゼ溶液、例えば炭水化物を修飾するアセチル化剤またはメチル化剤等の炭水化物修飾剤、過ヨウ素酸塩溶液等の炭水化物酸化溶液、および当技術分野で公知の他の遮断剤が含まれるがこれに限られない。
【００９２】
一実施形態においては、本発明の方法において有用な標識された組成物または結合剤が、フィルタ、プレートまたは膜を含むがこれに限られない固体支持体に連結される。標識化合物および結合剤が標識され、溶液中で相互作用しうることが、さらに予定される。例えば、結合が生じるときに分子が近くあるように、捕捉抗体が蛍光共鳴エネルギー転移（ＦＲＥＴ）ドナー分子で標識され、レクチンタンパク質等の第二結合剤がＦＲＥＴアクセプター分子で標識されうる。あるいは、レクチンタンパク質がＦＲＥＴドナーで標識され、タンパク質分子がＦＲＥＴアクセプターで標識されうる。別の可能性は、標的と抗体がハイブリダイズするときに抗体または標的上にともに存在するクエンチング分子および蛍光分子を分離することである。分子は、関連の試薬と相互作用した場合に標識が発光するために十分に近接しているにとどまる。これにより、分子が試薬と相互作用した時だけ発光するシステムが産生される（直接モニタリング）。分子の標識のものを除く全ての波長を遮断するために、狭帯域バンドパスフィルタが使用されうる。ＦＲＥＴ分子対は、当技術分野において市販されており（例えばＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎから）、製造業者のプロトコルに従って使用されうる。ＦＲＥＴ発光は、光学映像技術、例えばＣＣＤカメラを用いて検出される。
【００９３】
レクチン−血漿由来タンパク質相互作用を検出する別の方法は、電子供与体により標識することである。この供与体標識は、試薬が結合される電気的接触に電子を与える。例えば、において有用な酵素および電気イムノアッセイのための方法を記載するＧｈｉｎｄｉｌｉｓ，Ａ．（Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｓｏｃ  Ｔｒａｎｓ．２８：８４−９，２０００）およびＤａｉ等（Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｅｔｅｃｔ  Ｐｒｅｖ．２９：２３３−４０，２００５）を参照。それから電子接触が、Ａ〜Ｄ（アナログ−デジタル）コンバータにより読み取られ、定量される。電子数が多いほど、より多くの相互作用があったということである。
【００９４】
単一分子の検出が可能な標識の一実施形態は、参照により本明細書に組み込まれる、Ｓｃｈｕｌｔｚ等，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ  Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，９７：９９６−１００１（２０００）に記載される、光学リポータとしてのプラズモン共鳴粒子（ＰＲＰ）の使用である。ＰＲＰは、典型的に直径４０〜１００ｎｍの金属のナノ粒子であり、金属中の伝導電子の集合的共鳴（すなわち、表面プラズモン共鳴）により、著しい効率で光を弾力的に散乱させる。ナノ粒子に伴うプラズモン共鳴のマグニチュード、ピーク波長、およびスペクトル帯幅は、粒子の大きさ、形、および材料組成、ならびに局所環境に依存する。調製の間にこれらのパラメータに影響を与えることにより、スペクトルの可視域の任意の場所に散乱ピークを有するＰＲＰが形成されうる。球状ＰＲＰでは、ピーク散乱波長および散乱効率の両方が、半径の増大とともに増加し、異なる色の標識を産生する手段を提供する。例えば、銀粒子の集団は、調製の間に粒子の最終半径を調節することにより、ピーク散乱波長が標的波長の数ナノメートル以内であるように、再現的に調製されうる。ＰＲＰは明るいがナノサイズであるため、単一分子検出のための指標として用いられる。すなわち、視野中の結合ＰＲＰの存在が、単一結合イベントを示しうる。
【００９５】
レクチン：血漿由来タンパク質複合体も、ナノ粒子派生技術を用いて検出される。例えば、金ナノ粒子クエンチングを記載するＡｏ等（Ａｎａｌ  Ｃｈｅｍ．７８：１１０４−６，２００６）、抗体検出におけるＳｉＯ（２）／Ａｕナノ粒子表面を記載するＣｈｅｎ等，（Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓ  ２７：２３１３−２１，２００６）、および、固形基質−室温リン光イムノアッセイ（ＳＳ−ＲＴＰ−ＩＡ）において使用するためのジブロモフルオレセインを含む二酸化ケイ素ナノ粒子を記載するＬｉｅｕ等（Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ
Ｍｅｔｈｏｄｓ．３０７：３４−４０，２００５）を参照。
【００９６】
本発明の方法では、結合剤または血漿由来タンパク質が、フィルタ、ＰＶＣ膜、ＰＤＶＦ膜、タンパク質を結合するＰＶＣプレートおよび他のプレート、マイクロキャリア、マクロ固相ビーズ、例えばポリスチレンで作られた磁気ビーズ、二金属銀−金ナノ粒子（Ｙａｎ  Ｃｕｉ等，Ｊ．Ｐｈｙｓ．Ｃｈｅｍ．Ｂ，１１０：４００２−０６，２００６）等のナノ粒子、ポリアミド膜（ＰＡＭ）シート（Ｓｕｎ等，Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｌｅｔｔｅｒｓ  ３４：１６２７−３７，２００１）およびポリシロキサン／ポリビニルアルコールビーズ（Ｃｏｅｌｈｏ等，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ  ２４：１７０５−１７０８，２００２）を含むがこれに限られない様々な固体支持体に結合されうる。
【００９７】
例えば、複数の蛍光分子充填物、異なる材料、表面組織、表面パターン等を伴うミクロスフィアが、識別タグとして利用されうる。捕捉抗体またはリソソーム酵素をビーズに共有結合させ、反対の結合パートナーに対して反応させて、血清中のリソソーム−酵素特異的抗体の量がアッセイされることが予定される。例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｕｎｉｔ  ６．１１）を参照。蛍光材料が充填されたミクロスフィアは現在、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．および他の会社から利用可能である。直径２０ｎｍポリスチレンビーズ大のミクロスフィアが、現在利用可能である。
【００９８】
血漿由来タンパク質または結合剤は、例えば担体の製造業者によって説明される当技術分野の標準的なプロトコルを用いて、または当技術分野で公知の標準的な化学架橋技術を用いて、固体支持体に付着される。例えば、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．（Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）の架橋キットを参照。
【００９９】
キット
キットも、本発明の範囲内に予定される。典型的なキットは、検出可能な標識に任意に連結された、血液凝固因子等の血漿由来タンパク質に特異的に結合するレクチンタンパク質と、既知量のタンパク質を含むタンパク質標準を含みうる。一実施形態においては、キットは、血漿由来タンパク質を特異的に結合する結合剤をさらに含み、結合剤は、血漿由来タンパク質を特異的に結合する抗体、可溶性受容体、リガンド、補助因子（例えば第二血液凝固因子またはシャペロンタンパク質）または別の薬剤である。キットは、血漿由来タンパク質またはレクチンタンパク質に結合する検出可能な標識に連結された第二結合剤等のイムノアッセイを行うための試薬を任意に含みうる。標識が酵素である場合には、キットは、酵素が検出可能なシグナルを放出する基質も含みうる。キットが、レクチン組成物の非特異的結合を防止するための遮断剤を含むことも、さらに予定される。
【０１００】
本発明の追加的な態様および詳細は、制限ではなく例示を目的とした以下の実施例から明らかとなる。
【実施例】
【０１０１】
（実施例１）
血漿ＶＷＦおよび組換えＣＨＯ細胞由来ＶＷＦ（ｒＶＷＦ）のＳａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）結合
ヒトタンパク質は、他の生物において産生されるタンパク質と比較して固有のグリコシル化パターンを発現し、これがタンパク質機能においてグリコシル化が重要である場合に組換えタンパク質を産生する上で困難をもたらす。組換えヒトタンパク質を産生するために最も一般的な細胞系統の一つであるチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞は、複合糖タンパク質へのα２，６−シアル酸の付加をもたらす酵素α２，６シアリルトランスフェラーゼを欠く。タンパク質活性への妨げに関しては、この差による影響はわずかでありうるが、このグリコシル化における差を用いて、組み換え的に産生されたタンパク質、あるいは自然に産生、分泌されたヒトタンパク質を区別できる。異なるグリコシル化パターンを区別するレクチンタンパク質を結合アッセイにおいて用いて、生体試料中の組換えまたは天然のタンパク質のレベルを決定できる。例えば、Ｓａｍｂｕｃｕｓ  ｎｉｇｒａ凝集素（ＳＮＡ）は、α２，６結合ノイラミン酸（シアル酸）を結合するが、α２，３ノイラミン酸を結合しない。
【０１０２】
ＳＮＡ結合により天然のヒトタンパク質をＣＨＯ細胞において組み換え的に産生されたタンパク質から区別できるかを決定するために、血漿由来ｖＷＦ（ｐＶＷＦ）および組み換え的に産生されたｖＷＦ（ｒＶＷＦ）を、ＳＮＡ結合アッセイにおいて用いた。
【０１０３】
酵素結合抗体免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）は、フォンビルブラント因子抗原（ｖＷＦ：Ａｇ）を検出する一つの方法であり、第ＶＩＩＩ因子と複合したｖＷＦを通常構成するｖＷＦの量を、ｖＷＦ機能から独立して測定する。しかし、このアッセイは血漿由来または組換えタンパク質を区別できない。したがって、このアッセイの改変形を用いて、グリコシル化ｖＷＦを検出する。
【０１０４】
簡潔にいうと、グリコシル化検出アッセイでは一般に、ポリクローナルまたはモノクローナル抗−ヒトＶＷＦ抗体調製物が、ややアルカリ性の条件でポリスチレンマイクロプレートに結合される。不活性の非グリコシル化タンパク質溶液によるブロッキングの後、過ヨウ素酸酸化を伴う試料のインキュベーションにより、抗体タンパク質上のシアル酸残基を除去することにより、ＳＮＡを結合するコーティング抗体の能力が減じられる。それからヒト血漿またはｒＶＷＦ調製物の数倍希釈物をウェルにロードする。未結合の試料成分を除去する洗浄ステップの後、抗体−結合ＶＷＦ／ｒＶＷＦを、ビオチン化ＳＮＡと反応させる。それから、ストレプトアビジン−ペルオキシダーゼ調製物と反応させて、適切な基質によりペルオキシダーゼ活性を測定することにより、結合したレクチン（ＳＮＡ）を検出する。
【０１０５】
以下の実験条件を用いて、別々のアッセイにおいて血漿由来ｖＷＦまたはｒＶＷＦを測定した：１００μＬコーティング溶液（コーティングバッファー０．１Ｍ  Ｎａ２ＣＯ３、０．１Ｍ  ＮａＨＣＯ３、ｐＨ９．５において１／５００に希釈された抗−ヒトＶＷＦ、（Ｄａｋｏ，Ｄｅｎｍａｒｋ）；あるいは適切な希釈の任意のモノクローナル抗体が使用されてもよい）を、４℃で１６時間、または３７℃で１時間、ＭＡＸＩＳＯＲＰＴＭＦ９６（ＮＵＮＣ，Ｇｅｒｍａｎｙ）マイクロプレートのウェルにおいてインキュベートした。洗浄バッファー（０．８％ＮａＣｌ、０．０２％ＫＣｌ、０．０２％ＫＨ２ＰＯ４、０．１２６％Ｎａ２ＨＰＯ４・２Ｈ２Ｏ、０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０［ＥＩＡ−グレード、Ｂｉｏ−Ｒａｄ，Ｈｅｒｃｕｌｅｓ，ＣＡ］、ｐＨ７．０〜７．４）中で洗浄後、希釈バッファー（洗浄バッファー中０．１％ゼラチン［Ｂｉｏ−Ｒａｄ，ＥＩＡ−グレード］または０．１％ウシ血清アルブミン［ＳＩＧＭＡ，ＥＩＡ−グレード，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ］、２ｍＭベンズアミジンヒドロクロリド）でのインキュベーションにより、２００μＬ／ウェルを３０分間３７℃で用いて、ウェルをブロックした。洗浄後、２００μＬ／ウェルの過ヨウ素酸塩溶液（５０ｍＭ酢酸ナトリウム中１０ｍＭ過ヨウ素酸ソーダ、ｐＨ５．５）とウェルを３０分間室温（ＲＴ）でインキュベートすることにより過ヨウ素酸酸化を行った。それから洗浄したプレートを、２００μｌ／ウェルのエタノールアミン溶液（水中１％エタノールアミン）と、５分間ＲＴでインキュベートし、再び洗浄した。
【０１０６】
希釈バッファーを用いて試料希釈物を調製した。ヒト血漿プールで、２．８８〜０．１８ｍＵ  ＶＷＦ：Ａｇ／ｍＬの範囲のＶＷＦ：Ａｇ濃度に対応する１／４００、１／８００、１／１６００、１／３２００および１／６４００希釈を含む階段希釈系列を調製した。ｒＶＷＦを含む試料では、ｒＶＷＦ調製物をより高い濃度（３１１〜１９ｍＵ／ｍＬ）で用いた。１００μＬ／ウェルを、ウェルに二組でロードし、６０分間ＲＴでインキュベートした。それからプレートを洗浄し、１００μＬ／ウェルのビオチン化ＳＮＡ（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｂｕｒｌｉｎｇａｍｅ，ＣＡ）を２μｇ／ｍＬの濃度で加えた。プレートを６０分間ＲＴでインキュベートし、洗浄し、１００μｌ／ウェルのストレプトアビジン−ペルオキシダーゼ（Ｄａｋｏ，１／４０００希釈）を加え、３０分間ＲＴでインキュベートした。洗浄ステップによりインキュベーションを終了させた。結合したペルオキシダーゼを、ペルオキシダーゼ基質ＳＵＲＥＢＬＵＥＴＭ（ＫＰＬ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）による発色反応により検出した。１００μＬ／ウェルの試料を、１０〜１５分間ＲＴでインキュベートした。１００μＬ／ウェルの１．５Ｍ  Ｈ２ＳＯ４を加えて反応を止めた。その後、ＥＬＩＳＡリーダーにより、参照波長を６２０ｎｍにセットして４５０ｎｍでプレートを測定した。さらなるデータ評価のために、ブランク補正した測定された光学濃度の平均値および血漿プール希釈物のＶＷＦ：Ａｇ濃度を用いて線形回帰分析を行った。得られた検量線を用いて、１００％に設定した血漿プールにつき得られたものに対して未知物のＳＮＡ結合を計算する。
【０１０７】
血漿ＶＷＦの分析の結果、ＶＷＦ：Ａｇ濃度と測定されたＳＮＡ−結合の間に明らかな用量依存的関係がみられた。この関係は０．２〜２．９ｍＵ  ＶＷＦ：Ａｇ／ｍｌの規定範囲内で高度に線形（Ｒ２＝０．９９９６）であり、線形の検量線が構築できた。血漿ＶＷＦと対照的に、ＣＨＯ細胞−由来ｒＶＷＦは、１００倍高い濃度を用いてもＳＮＡに対する結合が見られなかった。したがって、ＳＮＡとの反応性の差により調製物を区別できる。モノクローナル抗−ヒトＶＷＦを、ヒトＶＷＦのＡ１ドメインにおける規定の結合エピトープとともに用いて、類似の結果が得られた。ＳＮＡに対する反応性におけるこれらの差は、ＣＨＯ細胞−由来ｒＶＷＦが、ＳＮＡに対する結合に特に必要とされるグリカン構造であるα２，６−結合ノイラミン酸を含まないという事実を反映する。
【０１０８】
（実施例２）
血漿第ＩＸ因子（ｐＦＩＸ）および組換えＣＨＯ−細胞由来第ＩＸ因子（ｒＦＩＸ）のＳＮＡ結合
血漿由来ＶＷＦ：ＡｇのＳＮＡとの反応性が血漿ＶＷＦに固有であるかを決定するために、第二ＣＨＯ−由来血液凝固因子である第ＩＸ因子（ＦＩＸ）を、ＳＮＡ結合アッセイにおいて分析した。
【０１０９】
ポリクローナル性抗−ヒトＦＩＸ抗体調製物を、上記のようにポリスチレンマイクロプレートに結合させた。ヒト血漿プールでは、３．０９〜０．１９ｍＵ  ＦＩＸ：Ａｇ／ｍＬの範囲のＦＩＸ：Ａｇ濃度に対応する１／３２０、１／６４０、１／１２８０、１／２５６０および１／５１２０希釈を用いて、希釈バッファーにおいて幾何学的希釈系列を調製した。ｒＦＩＸ調製物は、より高い濃度（７８〜４．９ｍＵ／ｍＬ）で調査した。１００μＬ／ウェルを二組でウェルにロードし、６０分間ＲＴでインキュベートし、先に記載のように展開した。
【０１１０】
血漿ＶＷＦタンパク質での結果と同様に、血漿ＦＩＸ：Ａｇ濃度と測定されたＳＮＡ結合との間に明らかな用量依存的関係があった。この関係は０．２〜３．１ｍＵ  ＦＩＸ：Ａｇ／ｍｌの規定範囲内で線形（Ｒ２＝０．９９６３）であり、検量線を構築できた。血漿ＦＩＸと対照的に、ＣＨＯ細胞−由来ｒＦＩＸは、１０倍高い濃度で調べてもＳＮＡに対する結合が見られなかった。したがって、ＳＮＡとの反応性の差により、両調製物を区別できる。
【０１１１】
（実施例３）
ノイラミニダーゼ処置後の血漿ＶＷＦおよびＣＨＯ細胞−由来ｒＶＷＦのＳＮＡ結合の測定
ＳＮＡに対する結合がＳＮＡに特異的であることを確認するために、オリゴ糖からα２，６およびα２，３ノイラミン酸の両方を切断または脱シアリル化する酵素ノイラミニダーゼを用いて、ＳＮＡに対する結合の特異性を調べた。マイクロタイタープレート上でノイラミニダーゼのレベルの増加を伴って抗体−結合血漿ＶＷＦおよびｒＶＷＦをインキュベートした後、ｐＶＷＦおよびｒＶＷＦのＳＮＡ結合に対するノイラミニダーゼ脱シアリル化の効果を測定した。
【０１１２】
前述のように、分析のために抗−ＶＷＦマイクロタイタープレートを調製した。ヒト血漿プールおよびｒＶＷＦ調製物の両方を希釈して、５ｍＵ／ｍＬおよび２．５ｍＵ／ｍＬのＶＷＦ：Ａｇ濃度を得た。１００μＬ／ウェルのこれらの希釈物を、コートされた過ヨウ素酸酸化プレートにロードし、６０分間ＲＴでインキュベートし、その後洗浄した。それから、血漿由来ｖＷＦおよびｒＶＷＦが結合抗体により固定されたプレート上でノイラミニダーゼ消化を行った。ノイラミニダーゼ（Ｓｉｇｍａ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を、酵素を２ｍｇ／ｍＬウシ血清アルブミンを含む２０ｍＭのＢｉｓ−Ｔｒｉｓ−Ｐｒｏｐａｎｅで希釈することにより得た０、１、５、１０および２０  ｍＵ／ｍＬの濃度で用いた。１００μＬ／ウェルのノイラミニダーゼ溶液を、２時間３７℃でインキュベートした。その後プレートを洗浄し、ビオチン化ＳＮＡ（Ｖｅｃｔｏｒ；２μｇ／ｍＬ；１００μＬ／ウェル）と６０分間ＲＴでインキュベートした。洗浄によりこのインキュベーションを終了させた後、ストレプトアビジンペルオキシダーゼ（Ｄａｋｏ，１／４０００）とプレートを３０分ＲＴでインキュベートした。最終洗浄ステップの後、上記のように、結合したペルオキシダーゼ活性をペルオキシダーゼ基質ＳＵＲＥＢＬＵＥＴＭにより測定した。
【０１１３】
結果は、ＳＮＡアッセイにおいてＣＨＯ−細胞由来ＶＷＦがＳＮＡに対する結合を示さない一方、この結合はノイラミニダーゼでの処置後に変わらないが、血漿ＶＷＦのＳＮＡ結合は適用されるノイラミニダーゼの濃度に比例して減少することを示す。調べた両方のＶＷＦ：Ａｇ濃度でこの結果が観察された。２０ｍＵ／ｍＬのノイラミニダーゼ濃度および適用した実験条件下において、ＳＮＡ結合は最初に測定した濃度の９５％未満である。
【０１１４】
血漿由来タンパク質からのノイラミン酸の除去により結合の減少が生じたため、これらの結果は、ＳＮＡタンパク質がα２，６Ｎ−アセチルノイラミン酸に特異的に結合したことを示した。ＣＨＯ細胞由来ｒＶＷＦは、ＳＮＡにより認識されず、またはノイラミニダーゼにより加水分解されない結合においてのみノイラミン酸が存在するため、ノイラミニダーゼ処理を伴っても伴わなくても、ＳＮＡに対する結合は見られなかった。
【０１１５】
（実施例４）
レクチンＭａａｃｋｉａ  ａｍｕｒｅｎｓｉｓ凝集素（ＭＡＡ）に対するノイラミニダーゼ処理後の血漿ＶＷＦおよびＣＨＯ細胞由来ｒＶＷＦの結合の測定
ｒＶＷＦはα２，６−結合ノイラミン酸の欠如によりＳＮＡに結合しないため、ノイラミン酸を除去することにより、ｒＶＷＦに対するＳＮＡの結合が変化することは期待されなかった。組換えタンパク質がシアル酸部分を発現はするが血漿由来シアル酸とは異なる構造において発現することを確認するために、α２，３−結合ノイラミン酸に対するタンパク質の結合を測定する結合アッセイを用いて、組換えタンパク質上の組み換え的に発現されたα２，３−結合ノイラミン酸を検出した。α２，３−結合ノイラミン酸を結合するレクチンＭａａｃｋｉａ  ａｍｕｒｅｎｓｉｓ凝集素（ＭＡＡ）を用いて、ノイラミニダーゼの存在下でｒＶＷＦの脱シアリル化が生じたかを決定した。ノイラミニダーゼのレベルの増加を伴って抗体−結合血漿ＶＷＦおよびｒＶＷＦをインキュベートした後、ＭＡＡに対するタンパク質の結合を測定した。
【０１１６】
抗−ｖＷＦプレートを、上記のように調製した。ヒト血漿プールおよびｒＶＷＦ調製物の両方を希釈して、５ｍＵ／ｍＬおよび２．５ｍＵ／ｍＬのＶＷＦ：Ａｇ濃度を得た。１００μＬ／ウェルの試料希釈物を、コートされた過ヨウ素酸酸化プレートにロードし、６０分間ＲＴでインキュベートし、その後洗浄した。それから、プレート上でノイラミニダーゼ消化を行った。ノイラミニダーゼ（Ｓｉｇｍａ）を、０、１、５、１０および２０ｍＵ／ｍＬの濃度で用いた。その後プレートを洗浄し、ビオチン化ＭＡＡ（Ｖｅｃｔｏｒ，１μｇ／ｍＬ）とともに６０分間ＲＴでインキュベートした。洗浄によりインキュベーションを終了し、その後ストレプトアビジンペルオキシダーゼ（ＤａｋｏＣｙｔｏｍａｔｉｏｎ，１／４０００）とプレートを３０分ＲＴでインキュベートした。最終洗浄ステップの後、結合したペルオキシダーゼを前述のように測定した。
【０１１７】
組換えｖＷＦがＭＡＡレクチンにより結合され、組換えタンパク質上のシアル酸の存在を示した。培養ウェルへのノイラミニダーゼの添加により、α２，３−結合において存在するときにノイラミン酸を認識するＭＡＬに対する、血漿ＶＷＦおよびｒＶＷＦの両方の結合がなくなった。テストした最も低い酵素濃度でも、ＭＡＬ結合の９５％超の減少が見られた。ＶＷＦを２．５ｍＵ／ｍＬの濃度で用いたときにも、類似のデータが得られた。したがって、ＭＡＬを用いた場合にだけ検出可能であるがＳＮＡを適用した場合には検出不可能である、有効な脱シアリル化がｒＶＷＦ調製物でも生じ、組換えＶＷＦに対してはない、血漿ＶＷＦに対してのＳＮＡ結合の特異性を示した。
【０１１８】
（実施例５）
６’−シアリルラクトースによる血漿ＶＷＦおよびＣＨＯ細胞由来組換えＶＷＦ（ｒＶＷＦ）に対するＳＮＡ結合の阻害
レクチンは、溶液中に遊離しても、糖タンパク質、糖脂質または他の複合糖質上に見られるより大きなオリゴ糖の一部でもありうる、単糖またはオリゴ糖に特異的に結合する。競争結合アッセイにおいてこれらの単糖またはオリゴ糖を用いた阻害研究により、レクチン結合の特異性を調べることができる。三糖６’−シアリルラクトースは、レクチンＳＮＡの結合の強力な阻害剤であることが知られており、血漿ＶＷＦに対するＳＮＡの結合の特異性を確認するために用いた。
【０１１９】
抗−ｖＷＦプレートを上記のようにコートし、調製した。ヒト血漿プール試料を希釈して、５ｍＵ／ｍＬのＶＷＦ：Ａｇ濃度を得た。１００μＬ／ウェルをロードし、６０分間ＲＴでインキュベートした。５０μＬの６−シアリルラクトース（Ｓｉｇｍａ，Ａ−９２０４）を、２．１〜１５０μＭの範囲の濃度でプレートに加えてから、５０μＬのビオチン化ＳＮＡ（Ｖｅｃｔｏｒ，１μｇ／ｍＬ）を加え、ＲＴで６０分間インキュベートした。洗浄によりインキュベーションを終了し、その後、ストレプトアビジンペルオキシダーゼ（ＤａｋｏＣｙｔｏｍａｔｉｏｎ，１／４０００）とともに、プレートを３０分ＲＴでインキュベートした。最終洗浄ステップの後、結合したペルオキシダーゼを前述のように測定した。
【０１２０】
三糖６’−シアリルラクトースは、使用した実験条件下で血漿ＶＷＦに対するＳＮＡの結合の濃度依存的な阻害が見られ、１０μＭの６’−シアリルラクトースで約２５％の阻害、１００μＭの６’−シアリルラクトースで７５％の阻害が見られた。この観察により、測定された結合が血漿ＶＷＦのＮ−グリカン構造に依存し、他の反応によっては引き起こされなかったことが確認された。
【０１２１】
（実施例６）
３’−シアリルラクトースによる血漿ＶＷＦおよびＣＨＯ細胞由来組換えＶＷＦ（ｒＶＷＦ）に対するＳＮＡ結合の阻害
血漿ＶＷＦはα２，３シアル酸を欠くため、ノイラミン酸がラクトースのガラクトース残基にα２，３結合される別の三糖３’−シアリルラクトースは、血漿ＶＷＦに対するＳＮＡの結合への影響が見られないことが期待されるであろう。結合の特異性を検査するために、血漿由来タンパク質およびＣＨＯ由来組換えタンパク質に対する３’−シアリルラクトースの効果を測定した。
【０１２２】
ＶＷＦ−Ａｇ特異的プレートを上記のように調製し、３’−シアリルラクトース阻害アッセイを、上記の実施例５で６’−シアリルラクトースのアッセイにつき記載されるように行った。結果は、３’−シアリルラクトースが血漿ＶＷＦに対するＳＮＡの結合に影響しないことを示し、ＳＮＡがα２，６−結合において存在する場合にのみノイラミン酸と結合することが確認された。
【０１２３】
（実施例７）
血漿ＶＷＦの存在下でのＣＨＯ細胞由来組換えＶＷＦ（ｒＶＷＦ）の測定のための４−点検量線
ＳＮＡ結合アッセイにより、単一の試料中の組換えタンパク質と比較して血漿由来タンパク質の量を定量できるかを決定するために、血漿ＶＷＦおよび組換えＶＷＦの両方を含むテスト試料をＳＮＡ結合につき分析し、試料中のｒＶＷＦの定量のために検量線を作成した。
【０１２４】
簡潔にいうと、約１Ｕ／ｍＬの濃度のＶＷＦ：Ａｇを含むヒト正常血漿プールを、０、０．２、０．５、１．０および２．０ＵのｒＶＷＦでスパイクした。これらの試料のＶＷＦ：Ａｇ濃度およびＳＮＡ結合を、６つの独立したテスト単位で測定した。別個のスパイクしていないヒト血漿プールにつき測定したＳＮＡ結合を基礎として用いて、スパイクした試料の予想される仮定的ＳＮＡ結合を、これらの試料中に存在するＶＷＦ：Ａｇが血漿ＶＷＦだけであるという仮定の下で、計算した。これらの仮定的に計算されたＳＮＡ結合値と測定値との間の差を計算した。これは、血漿ＶＷＦとの混合物中のｒＶＷＦの量を反映する。この仮定を検証するために、これらの試料に含まれるｒＶＷＦの量に対して結合の差をプロットし、線形回帰分析を行った。こうして検量線が得られ、血漿ＶＷＦの存在下でのｒＶＷＦの濃度を決定できた。
【０１２５】
抗−ｖＷＦマイクロタイタープレートを、上記のように調製した。検量線のために、ヒト血漿プールを用いて１／１００、１／２００、１／４００、１／８００および１／１６００希釈を含む試料希釈系列を調製した。試料を希釈して、この検量線によりカバーされる範囲内のＶＷＦ：Ａｇ濃度を得た。１００μＬ／ウェルのこれらの希釈物をロードし、１５分間ＲＴでインキュベートした後、１００μｌ／ウェルの検出抗体（ウサギ抗−ヒトＶＷＦ−ペルオキシダーゼ，Ｄａｋｏ，１／２０００）を加えた。このインキュベーションを６０分間ＲＴで行い、洗浄により終了させた。結合したペルオキシダーゼ活性を、ＳＵＲＥＢＬＵＥＴＭペルオキシダーゼ基質により測定した。１．５Ｍの硫酸を用いて、発色反応を止めた。その後、参照波長を６５０ｎｍに設定して４５０ｎｍでＥＬＩＳＡリーダーによりプレートを測定した。そして検量線に外挿後、これらの試料のＶＷＦ：Ａｇ濃度をＵ／ｍＬで得た。
【０１２６】
上記のように調製した抗−ｖＷＦプレートを用いて、試料のＳＮＡ結合を測定した。希釈バッファーを用いて試料希釈物を調製された。検量線のために、ヒト血漿プールを用いて１／４００、１／８００、１／１６００、１／３２００および１／６４００希釈を含む希釈系列を調製した。試料を希釈して、この検量線によりカバーされる濃度範囲内のＳＮＡ結合を得た。１００μＬ／ウェルの各希釈物を、コートされた過ヨウ素酸酸化プレートにロードし、６０分間ＲＴでインキュベートした。その後プレートを洗浄し、ビオチン化ＳＮＡとインキュベートし、前述のようにＳＮＡ結合を測定した。
【０１２７】
表１は、６つの独立したテスト単位で得られたＶＷＦ：Ａｇ濃度およびこれらの試料のＳＮＡ結合のデータを示す。
【０１２８】
【表１】
2018017736.tif 000006
ＳＮＡ：タンパク質結合検量線からの外挿後、試料のＳＮＡ結合が得られ、１００％ＳＮＡ結合として定義される、組換えタンパク質でスパイクしないヒト血漿プールのものに対してレベルが表される。０．９２Ｕの平均濃度での血漿ＶＷＦは、ヒト血漿プールにつき測定されるものの１３７．２％に対応する平均ＳＮＡ結合を有した。ｒＶＷＦを含まないヒト血漿試料につき測定されたこの平均ＳＮＡ結合を用いて、測定されたＶＷＦ：Ａｇが血漿ＶＷＦだけであったという仮定の下で、スパイクした試料につき仮定的ＳＮＡ結合を計算した。結果を表２に示す。
【０１２９】
【表２】
2018017736.tif 000007
計算された結合と予想ＳＮＡ結合との間の差は、本実験で調べた範囲においてヒト血漿試料にスパイクされたＣＨＯ細胞由来ｒＶＷＦの濃度と良く相関した。０．２〜２．０ＵのｒＶＷＦを１ＵのＶＷＦ：Ａｇを既に含む試料に加えると、良好な直線関係が観察され、試料中の組換えｖＷＦの濃度の増加により、予想される結合のより大きな差が生じた。ＳＮＡ結合の差を組換えタンパク質の量と相関させる検量線のプロットが、図１に示される。これらの結果は、アッセイが、試料中の血漿由来および組換えタンパク質を区別し、単一の試料中の各タイプのタンパク質のレベルを決定するための信頼性の高い方法を提供することを示す。
【０１３０】
（実施例８）
血漿ＶＷＦの存在下でのＣＨＯ細胞由来組換えＶＷＦ（ｒＶＷＦ）の測定のための８−点検量線
試料中の血漿由来タンパク質および組換えタンパク質の量を測定する上での感度を高めるために、追加的な定量アッセイを開発した。
【０１３１】
約１Ｕ／ｍＬの濃度のＶＷＦ：Ａｇを含むヒト正常血漿プールを、０、０．２、０．４、０．５、０．６、０．８、１．０、１．２および１．５ＵのｒＶＷＦによりスパイクした。これらの試料のＶＷＦ：Ａｇ濃度およびＳＮＡ結合を、６つの独立のテスト単位において測定した。実施例７のようにスパイクしないヒト血漿プールにつき測定したＳＮＡ結合を基礎として用いて、スパイクした試料につき予想される仮定的ＳＮＡ結合を計算した。
【０１３２】
ＶＷＦ−特異的プレートを、上記のように調製した。検量線のために、ヒト血漿プールを用いて１／１００、１／２００、１／４００、１／８００および１／１６００希釈を含む希釈系列を調製し、ＶＷＦ：Ａｇ濃度およびＳＮＡ結合を実施例７のように測定した。検量線への外挿後、試料のＳＮＡ結合を得、１００％ＳＮＡ結合として定義されるヒト血漿プールのものに対してレベルを表す。表３は、これらの試料のＶＷＦ：Ａｇ濃度およびＳＮＡ結合についての、６つの独立テスト単位において得た測定データを示す。
【０１３３】
【表３】
2018017736.tif 000008
０．９６Ｕの濃度の血漿ＶＷＦは、参照血漿プールにつき測定されるものの１２３．５％に対応する平均ＳＮＡ結合を有した。ＣＨＯ細胞由来ｒＶＷＦを含まないヒト血漿試料につき測定したこの平均ＳＮＡ結合を用いて、測定されたＶＷＦ：Ａｇが血漿ＶＷＦだけであったという仮定の下で、スパイクした試料につき仮定的ＳＮＡ結合を計算した。これらのデータは、表４に示される。
【０１３４】
【表４】
2018017736.tif 000009
上記の４−点検量アッセイと同様に、予想ＳＮＡ結合に対する差は、より狭いスパイキング範囲の８つの濃度を調べた場合にも、ヒト血漿にスパイクしたＣＨＯ細胞由来ｒＶＷＦの濃度とよく相関した。ＳＮＡ結合の差を組換えタンパク質の量と相関させる８−点検量線のプロットが、図２に示される。
【０１３５】
これらの結果は、炭化水素部分の異なる発現に基づいて、ヒト血漿試料中の組換えタンパク質の量を、試料中の自然に産生されたタンパク質から容易に区別できることを示す。この種のアッセイは、自然に産生されたタンパク質の量と比較した、投与されている外来／治療タンパク質の量、および血流へのその浸透を決定するために、臨床場面において有用である。このアッセイは、ｉｎ  ｖｉｖｏで血中半減期を比較することにより一つの治療剤の効力を他の治療剤に対して比較するためにも有用である。
【０１３６】
上記の例示的実施例に記載の本発明の、多数の修正および変更が生じることが当業者により期待される。従って、添付の請求の範囲において示される制限だけが、本発明に設けられねばならない。
【図１】
2018017736.tif 000010
【図２】
2018017736.tif 000011