(57)【要約】      （修正有）【課題】増幅アッセイによって対象の分析物を検出するための方法およびシステムを提供する。【解決手段】試料中に存在する低レベルの対象の分析物を検出する手段として、固体支持体にカップリングしている生体分子の高い特異性を利用し、結合剤と対象の分析物との相互作用によって生成されたシグナルをさらに増幅する。同定されるタンパク質が直接または捕捉抗体を通して不動態化した表面に結合している免疫化学（例えば、ＥＬＩＳＡもしくはＲＩＡ）または免疫蛍光アッセイについて、約１０，０００倍の増幅を達成することができる。【選択図】図１
2018054624.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
本明細書に記載の発明。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本願は、２０１２年２月２１日に出願された米国仮特許出願第６１／６０１，２４４号への優先権を主張する。米国仮特許出願第６１／６０１，２４４号はその全体が、本明細書中に参考として援用される。
【０００２】
発明の分野
本発明は、バイオアッセイのシグナル増幅のための方法およびシステムに関する。
【背景技術】
【０００３】
背景
免疫アッセイは、研究および診断アッセイ両方のために重要なツールである。このように、このようなアッセイの感度を改善することが求められている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
要旨
本発明の実施形態は、対象の分析物の検出のための増幅方法、およびこのようなアッセイを行うためのキットを含む。本発明は、種々の方法で具体化し得る。
【０００５】
一実施形態において、本発明は、対象の分析物に、対象の分析物を認識し、それに結合する結合剤の複数の分子を含む固体支持体を含む検出支持体を添加する工程と；検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを検出する工程とを含む、対象の分析物を検出する方法を含む。一実施形態において、方法は、捕捉支持体を添加する工程をさらに含み得、捕捉支持体は、捕捉支持体上に対象の分析物を固定化するために、対象の分析物を認識し、それに結合する少なくとも１種の捕捉支持体結合剤を含む。方法はまた、特定の実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤を添加する工程を含み得る。検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、いくつかの実施形態において、検出可能な部分を含み得る。
【０００６】
また他の実施形態において、本発明は、本明細書において開示されている方法を行うためのキットを含む。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
シグナル増幅のための方法であって、
対象の分析物に、該対象の分析物を認識し、それに結合する複数の結合剤の分子を含む固体支持体を含む検出支持体を添加する工程と；
該検出支持体上の該複数の結合剤分子の少なくともいくつかを検出する工程と
を含む、方法。
（項目２）
前記検出支持体が、ビーズである、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記検出支持体が、検出可能な部分の複数の分子を含む、項目１に記載の方法。
（項目４）
捕捉支持体を添加する工程をさらに含み、該捕捉支持体が、該捕捉支持体上の前記対象の分析物を固定化するために、該対象の分析物を認識し、それに結合する少なくとも１種の捕捉支持体結合剤を含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記対象の分析物が、前記検出支持体と相互作用する前に、前記捕捉支持体に結合する、項目４に記載の方法。
（項目６）
前記対象の分析物が、前記検出支持体と相互作用した後に、前記捕捉支持体に結合する、項目４に記載の方法。
（項目７）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤を添加する工程をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、検出可能な部分を含む、項目７に記載の方法。（項目９）
前記捕捉支持体が、ビーズである、項目４に記載の方法。
（項目１０）
前記捕捉支持体に結合している前記結合剤が、前記対象の分析物を認識し、それに結合することができる抗体または抗体断片である、項目４に記載の方法。
（項目１１）
前記検出支持体に結合している前記複数の前記結合剤の分子が、前記対象の分析物を認識し、それに結合する抗体または抗体断片である、項目１に記載の方法。
（項目１２）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、抗体または抗体断片である、項目７に記載の方法。
（項目１３）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、前記対象の分析物を捕捉固体支持体に結合するために使用される捕捉結合剤を認識しない、項目７に記載の方法。
（項目１４）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、可溶性結合剤を含む、項目７に記載の方法。
（項目１５）
前記検出支持体が、前記対象の分析物に対して特異的な１０，０００個超の結合剤分子を含む、項目１に記載の方法。
（項目１６）
前記検出支持体が、前記対象の分析物に対して特異的な１００，０００個超の結合剤分子を含む、項目１に記載の方法。
（項目１７）
対象の分析物をアッセイするためのキットであって、検出支持体を含み、該検出支持体が、該対象の分析物を認識し、それに結合することができる複数の結合剤の分子を含む固体支持体を含む、キット。
（項目１８）
捕捉支持体をさらに含み、該捕捉支持体が、前記対象の分析物を認識し、それに結合する少なくとも１種の捕捉支持体結合剤を含む、項目１７に記載のキット。
（項目１９）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤を認識し、それに結合することができる結合剤をさらに含む、項目１７に記載のキット。
（項目２０）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、可溶性結合剤を含む、項目１９に記載のキット。
（項目２１）
前記検出支持体が、ビーズである、項目１７に記載のキット。
（項目２２）
前記検出支持体が、検出可能な部分の複数の分子を含む、項目１７に記載のキット。
（項目２３）
前記検出支持体に結合した前記複数の結合剤分子が、前記対象の分析物を認識し、それに結合することができる抗体または抗体断片である、項目１７に記載のキット。
（項目２４）
前記捕捉支持体が、ビーズである、項目１８に記載のキット。
（項目２５）
前記捕捉支持体結合剤が、前記対象の分析物を認識し、それに結合することができる抗体または抗体断片である、項目１８に記載のキット。
（項目２６）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、前記対象の分析物を認識し、それに結合することができる抗体または抗体断片である、項目１９に記載のキット。
（項目２７）
前記検出支持体上の前記複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる前記結合剤が、検出可能な部分を含む、項目１９に記載のキット。
（項目２８）
前記検出支持体が、前記対象の分析物に対して特異的な１，０００個超の結合剤分子を含む、項目１７に記載のキット。
（項目２９）
前記検出支持体が、前記対象の分析物に対して特異的な１０，０００個超の結合剤分子を含む、項目１７に記載のキット。
（項目３０）
前記検出支持体が、前記対象の分析物に対して特異的な１００，０００個超の結合剤分子を含む、項目１７に記載のキット。
【０００７】
本発明は、下記の非限定的な図を参照することにより良好に理解し得る。
【図面の簡単な説明】
【０００８】
【図１】図１、パネルＡおよびＢは、本発明の一実施形態によるアッセイを例示し、パネルＡは、本発明の増幅された免疫アッセイの一実施形態を示し、パネルＢは、従来技術の標準的サンドイッチ免疫アッセイを示す。
【０００９】
【図２−１】図２、パネルＡ〜Ｅは、本発明の代わりの実施形態による、対象のタンパク質のための種々の検出方法を例示する。
【図２−２】図２、パネルＡ〜Ｅは、本発明の代わりの実施形態による、対象のタンパク質のための種々の検出方法を例示する。
【発明を実施するための形態】
【００１０】
発明の詳細な説明
定義
本明細書において別段の定義がない限り、本発明に関連して使用される科学用語および専門用語は、当業者が一般に理解する意味を有するべきである。さらに、他に状況によって必要とされない限り、単数の用語は、複数を含むべきであり、複数の用語は、単数を含むべきである。一般に、本明細書に記載されている細胞および組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学およびタンパク質および核酸化学およびハイブリダイゼーションとの関連で使用される命名法、ならびにこれらの技術は、当技術分野で周知であり、一般に使用されるものである。公知の方法および技術は、他に示さない限り、当技術分野で周知の通常の方法によって、および本明細書を通して考察される様々な一般のおよびより特定の参考文献において記載されているように一般に行われる。酵素反応および精製技術は、当技術分野で一般に達成されるように、または本明細書に記載のように、製造元の仕様によって行われる。本明細書に記載されている実験室の手順および技術に関連して使用される命名法は当技術分野で周知のものであり、一般に使用される。
下記の用語は、他に示さない限り、下記の意味を有すると理解すべきである。
【００１１】
本明細書において使用する場合、「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」という用語は、他に特に留意しない限り、１つまたは複数を指すことができる。
【００１２】
「または」という用語の使用は、代替物のみを言及することが明確に示されない限り、または代替物が相互排他的でない限り、「および／または」を意味するために使用されるが、本開示は、代替物のみおよび「および／または」を指す定義を支持する。本明細書において使用する場合、「別の」は、少なくとも第２またはそれ超を意味することができる。
【００１３】
本出願を通して、「約」という用語は、その値が、値を決定するために用いられているデバイス、方法についての固有の誤差の変動、または試料の間に存在する変動を含むことを示すために使用される。
【００１４】
「固体支持体」または「支持体」という用語は、その上に生体分子が結合し得る基材を提供する構造物を意味する。例えば、固体支持体は、アッセイウェル（すなわち、例えば、マイクロタイタープレート）であり得、または固体支持体は、アレイ上の位置、または移動性の支持体、例えば、ビーズであり得る。
【００１５】
「抗体」という用語は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、合成抗体およびキメラ抗体、例えば、コンビナトリアル変異誘発およびファージディスプレイによって生じたものを含む。「抗体」という用語はまた、抗体の模倣物またはペプチド模倣物を含む。ペプチド模倣物は、ペプチドおよびタンパク質に基づいた、またはペプチドおよびタンパク質に由来する化合物である。本発明のペプチド模倣物は典型的には、非天然アミノ酸、コンホメーション制限、アイソスター置換（ｉｓｏｓｔｅｒｉｃ  ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ）などを使用した、公知のペプチド配列の構造的改変によって得ることができる。
【００１６】
「結合剤」という用語は、第２の（すなわち、異なる）対象分子に特異的および選択的に結合することができる分子を指す。相互作用は、例えば、水素結合、ファンデルワールス相互作用、または静電相互作用もしくは疎水的相互作用の結果として非共有結合性であり得、あるいは相互作用は共有結合性であり得る。「可溶性結合剤」という用語は、固体支持体に会合（すなわち、共有結合または非共有結合）していない結合剤を指す。
【００１７】
本明細書において使用する場合、「分析物」は、測定される分子または化合物を指す。いくつかの実施形態において、分析物は、結合剤と相互作用する。本明細書に記載のように、「分析物」という用語は、対象のタンパク質またはペプチドを指し得る。分析物は、アゴニスト、アンタゴニスト、またはモジュレーターであり得る。または、分析物は、生物学的効果を有し得ない。分析物は、小分子、糖、オリゴ糖、脂質、ペプチド、ペプチド模倣物、有機化合物などを含み得る。
【００１８】
「検出可能な部分」または「検出可能な生体分子」または「レポーター」という用語は、定量的アッセイにおいて測定することができる分子を指す。例えば、検出可能な部分は、基材を、測定することができる産物（例えば、目に見える産物）に変換するために使用し得る酵素を含み得る。または、検出可能な部分は、定量化することができる放射性同位体であり得る。または、検出可能な部分は、フルオロフォアであり得る。または、検出可能な部分は、ルミネセンス分子であり得る。または、他の検出可能な分子を使用し得る。
【００１９】
本明細書において使用する場合、「最適比域」という用語は、抗原および抗体の濃度が最大の沈降をもたらす沈降反応における領域を示す。このように、抗原または抗体のいずれかが過剰である場合、沈降は起こらない。
【００２０】
シグナル増幅の方法
特定の態様において、本発明は、試料中に存在する低レベルの分析物（例えば、対象のタンパク質）を検出する手段として、固体支持体にカップリングしている高い特異性の生体分子を利用し、シグナルをさらに増幅する。特定の実施形態において、同定されるタンパク質が直接または捕捉抗体を通して不動態化した表面に結合している免疫化学（例えば、ＥＬＩＳＡもしくはＲＩＡ）または免疫蛍光アッセイについて、少なくとも１０，０００倍のシグナル増幅を達成し得る。
【００２１】
このように、特定の実施形態において、本発明は、対象の分析物を検出するための方法であって、対象の分析物に検出支持体を添加する工程であって、検出支持体が、対象の分析物を認識し、それに結合する結合剤の複数の分子を含む固体支持体を含む工程と；検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを検出する工程とを含む、方法を含む。特定の実施形態において、方法は、捕捉支持体を添加する工程をさらに含み得、捕捉支持体は、捕捉支持体上に対象の分析物を固定化するために、対象の分析物を認識し、それに結合する少なくとも１種の捕捉支持体結合剤を含む。一実施形態において、対象の分析物は、検出支持体と相互作用する前に、捕捉支持体に結合している。または、対象の分析物は、検出支持体と相互作用した後に、捕捉支持体に結合し得る。方法は、特定の実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤を添加する工程をさらに含み得る。一実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、可溶性結合剤である。
【００２２】
一実施形態において、捕捉固体支持体は、アッセイウェル（すなわち、例えば、マイクロタイタープレート）であり得る。または、捕捉固体支持体は、アレイ上の位置、または移動性の支持体、例えば、ビーズであり得る。一実施形態において、検出支持体は、移動性の支持体、例えば、ビーズである。特定の実施形態において、対象の分析物は、溶液中に存在し得る。または、固定によって、細胞中の巨大分子が捕捉支持体として機能するように、対象の分析物は、微生物および／または組織の内部のタンパク質であり得る。例えば、一実施形態において、免疫アッセイ増幅方法は、タンパク質のｉｎ  ｓｉｔｕでの検出のために使用し得る。
【００２３】
一実施形態において、対象の分析物を特異的に認識する結合剤の複数の分子を含む検出支持体を、対象の分析物を含む試料に過剰に添加する。また一実施形態において、検出支持体は、検出可能な部分を含む複数の分子を含む。代わりに、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤を使用する場合、可溶性結合剤は、検出可能な部分を含み得る。
【００２４】
種々の結合剤を、本発明の方法において使用し得る。例えば、検出支持体に結合した複数の結合剤は、対象の分析物を認識する抗体または抗体断片であり得る。さらにおよび／または代わりに、捕捉支持体に結合した結合剤は、対象の分析物を認識する抗体または抗体断片であり得る。さらにおよび／または代わりに、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、抗体または抗体断片であり得る。あるいは、捕捉支持体もしくは検出支持体のいずれか上の結合剤、または検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、非タンパク質の標的を結合するタンパク質を含み得る（すなわち、例えば、対象の小分子分析物に特異的に結合するタンパク質、またはタンパク質に結合する受容体）。
【００２５】
一実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、対象の分析物を捕捉固体支持体に結合させるために使用される捕捉結合剤を認識しない。
【００２６】
対象の分析物を認識する複数の結合剤を含む検出支持体の使用は、シグナルの増幅を提供する。代わりの実施形態において、検出支持体は、対象の分析物に対して特異的な、１，０００個超、または１０，０００個超、または１００，０００個超、または５００，０００個超、または１，０００，０００個超の結合剤分子を含む。このように、代わりの実施形態において、本発明の方法は、複数の検出結合剤を含む検出支持体を含まない標準的な非増幅免疫アッセイ（ｕｎａｍｐｌｉｆｉｅｄ  ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ）において認められるシグナルの１，０００、または１０，０００超、または１００，０００超、または５００，０００超、または１，０００，０００超倍の増幅を提供する。このように、代わりの実施形態において、本発明の方法は、複数の検出結合剤を含む検出支持体を含まない標準的な非増幅免疫アッセイにおいて認められるシグナルの、１，０００〜１，０００，０００，０００倍、または１，０００〜１００，０００，０００倍、または５，０００〜１０，０００，０００倍、または１０，０００〜１，０００，０００倍、または１０，０００〜５００，０００倍、または５０，０００〜５００，０００倍の範囲の増幅を提供する。または、これらの範囲内の範囲を達成し得る。
【００２７】
特定の実施形態において、対象の分析物は、タンパク質であり、結合剤は、抗体である。このように、特定の実施形態において、本発明は、免疫アッセイによるタンパク質の検出のシグナル増幅のための方法を含む。
【００２８】
検出支持体および／または捕捉支持体の使用は、種々のフォーマットを含み得る。
【００２９】
例えば、いくつかの実施形態において、対象の分析物は最初に捕捉支持体に結合し、次いで、検出支持体と相互作用することを可能にし得る。このように、方法は、対象のタンパク質に特異的に結合することができる複数の結合剤を、捕捉支持体に結合させる工程を含み得る。方法は、捕捉支持体に対象の分析物を添加する工程をさらに含み得る。次に、方法は、捕捉支持体に結合している対象の分析物に、複数の検出結合剤の検出がシグナルの増幅を提供するように、対象の分析物に対して特異的な複数の検出結合剤を含む検出支持体を添加する工程を含み得る。
【００３０】
また、特定の実施形態において、方法は、複数の検出結合剤を特異的に認識し、それに結合することができる第３の結合剤を添加する工程を含み得る。一実施形態において、複数の検出結合剤を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、可溶性結合剤である。第３の結合剤は、検出可能な部分を含み得る。このように、いくつかの実施形態において、方法の工程を行うことにより、捕捉支持体：捕捉結合剤：対象の分析物：検出結合剤：検出支持体：可溶性結合剤：検出可能な部分からなる複合体を生じる。
【００３１】
図１Ａは、上記のフォーマットによる本発明の増幅された免疫アッセイの一実施形態を示す。例えば、および図１Ａにおいて示すように、方法は、結合剤が対象のタンパク質２０６を特異的に認識および捕捉することができるように、捕捉固体支持体２１４に複数の結合剤２０８を固定する工程を含み得る。一実施形態において、タンパク質は、細胞膜から単離され、または対象の細胞から放出され、次いで、固相に添加し得る。一実施形態において、捕捉固体支持体に結合した捕捉結合剤は、タンパク質を認識する一次抗体、または抗体断片である。例えば、一実施形態において、捕捉支持体２１４は、対象のタンパク質２０６に対する抗体２０８（例えば、ウサギ抗体）でコーティングされたマイクロタイターウェルであり得る。または、他の結合剤、例えば、特定のリガンドを認識する受容体、相補的配列とハイブリッド形成し得る核酸分子、特定のリガンドを認識する多糖類、脂質、リポ多糖、タイコ酸、またはリポタイコ酸などを使用し得る。固定化された抗体２０８は、対象の分析物２０６を特異的に認識し得、一方、他のタンパク質または生体分子２０２、２０４は、結合していない。
【００３２】
次に、対象の分析物２０６をまた認識する検出結合剤２１１の複数の分子でコーティングされている検出支持体２１６（例えば、ビーズ）を添加し得る。一実施形態において、検出支持体は、数千、数万、数十万の検出結合剤を含み得る。一実施形態において、検出結合剤は、抗体である。例えば、捕捉結合剤は、対象のタンパク質を認識するウサギ抗体であり得、一方、検出結合剤は、対象のタンパク質をまた認識するモルモット一次抗体であり得る。このようにして、対象のタンパク質２０６は、捕捉固体支持体２１４上に固定化された捕捉結合剤２０８に結合した対象のタンパク質２０６を認識する複数の検出結合剤分子２１１を含む検出支持体２１６を連結する。
【００３３】
次に、検出結合剤２１１を認識する可溶性結合剤（例えば、二次抗体、例えば、抗モルモット抗体）２１２を添加し得る。一実施形態において、可溶性結合剤２１２は、検出可能な部分２１０（すなわち、レポーター）で標識される。例えば、可溶性結合剤は、蛍光性部分（例えば、ＱＤＯＴＳ（登録商標））または酵素（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ）で標識し得る。または、一実施形態において、第２の支持体上の検出結合剤は、このような検出可能な部分で標識し得る。このようにシグナルの非常に大きな増幅は、単一のタンパク質分子２０６に由来し得る。
【００３４】
このように、図１Ａに示すように、タンパク質２０６は、一次抗体（すなわち、ビーズ２１６上のモルモット抗体２１１、および捕捉支持体２１４上のウサギ抗体２０８）の両方を認識することができるため、タンパク質２０６は、ビーズ２１６の少なくとも１つ、および固体表面２１４に結合した抗体２０８の間のサンドイッチ複合体の形成を促進することができる。次いで、あらゆる非結合ビーズ２１６を洗い流した後、対象のタンパク質２０６に結合したビーズを、ビーズに結合した一次抗体２１１を認識する二次抗体２１２を使用して検出することができる。一実施形態において、二次抗体は、検出可能な部分２１０、例えば、酵素、フルオロフォア、ＱＤＯＴＳ（登録商標）などに結合している。
【００３５】
このように、方法は、結合剤が対象の分析物を特異的に認識および捕捉することができるように、複数の結合剤を固体支持体（「捕捉支持体」）へと固定する工程を含み得る。次に、方法は、第１の支持体上に固定化された少なくとも１個の分子に特異的に結合することができる数万の第２の結合剤（「検出支持体」）でコーティングされた移動性の第２の支持体（例えば、ビーズ（複数可））を添加する工程を含み得る。方法は、第２の支持体上の複数の第２の結合剤の少なくともいくつかに特異的に結合する第３の結合剤−レポーター複合体（例えば、検出可能な部分とカップリングした可溶性結合剤）を添加する工程をさらに含み得る。次に、方法は、捕捉支持体：捕捉結合剤：対象の分析物：検出結合剤：検出支持体：可溶性結合剤：検出可能な部分からなる複合体を検出する工程を含み得る。図１Ａにおいて例示するように、レポーター分子２１０を有する可溶性結合剤２１２を結合させることができる検出支持体２１６に結合した多数の結合剤分子２１１によって、シグナル（すなわち、捕捉支持体２１４上の結合剤２０８に結合したタンパク質２０６）の増幅は劇的に増加する。
【００３６】
図１Ｂは、比較のために、従来技術の非増幅免疫アッセイの例示を提供する。このように、図１Ｂの免疫アッセイは、捕捉支持体２１４：第１の一次抗体２０８：対象の分析物２０６：第２の一次抗体２１１：二次抗体２１２：検出可能な部分２１０を含むサンドイッチの形成を含む。
【００３７】
図２は、対象の分析物を検出するために使用し得る増幅された免疫アッセイのいくつかの代わりの実施形態を例示するが、様々な成分をアッセイに添加する順序は変化する。
【００３８】
図２Ａ（方法１）に示すように、いくつかの実施形態において、対象の分析物は、捕捉結合剤２３０に結合し、次いで、捕捉結合剤は捕捉支持体２４０に結合し得る。次いで、複数の検出結合剤２１１を含む検出支持体２３３を添加し得る。最後に、検出可能な部分２１０を含み、かつ検出結合剤２１１を認識する可溶性結合剤２１２を添加する。
【００３９】
例えば一実施形態において、対象の分析物２０６（例えば、対象のタンパク質）に対して特異的であり、ビオチン２０５で標識された一次抗体の分子２３０（例えば、ウサギ）を、溶液中の分析物分子２０６に結合するように添加する。ビオチン化抗体２３０は、対象の分析物２０６を特異的に認識し得、一方、他のタンパク質または生体分子２０２、２０４は、結合していない。この時点で、ストレプトアビジンでコーティングした磁気「捕捉」ビーズ（複数可）２４０（例えば、直径が約１マイクロメートル）を添加して、ビオチン化抗体−タンパク質複合体を定量的に結合し得る。一実施形態において、方法は、ビオチンおよびウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）を添加することによって、ビーズ−タンパク質複合体をブロックする工程を含み得る。
【００４０】
この時点で、対象のタンパク質２０６を認識するが、ビオチン化捕捉抗体２３０と異なる種（例えば、モルモット）において産生される第２の一次抗体２１１の数千個、数万個、数十万個の分子でコーティングした「検出」ビーズ（複数可）２３３を添加して、分析物２０６上のあいた占有されていないエピトープに結合させる。検出抗体２１１の量は、第２の一次抗体２１１を認識する二次抗体２１２（例えば、モルモット一次抗体に対する抗モルモット抗体）を使用して検出し得る。一実施形態において、二次抗体２１２は、検出可能な部分２１０で標識される。例えば、二次抗体は、蛍光性部分（例えば、ＱＤＯＴＳ（登録商標））または酵素（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ）で標識し得る。このように、シグナルの非常に大きな増幅は、単一のタンパク質分子に由来することができる。
【００４１】
図２Ｂ（方法２）は、方法１の増幅アッセイ（ａｍｐｌｉｆｉｅｄ  ａｓｓａｙ）の代わりの形態を例示するが、ここでは、検出結合剤分子２１１を含む検出支持体（複数可）２３３を、捕捉結合剤２３０を認識する捕捉支持体２４０の添加の前に、捕捉結合剤２３０と共にアッセイウェルに添加する。捕捉支持体：捕捉結合剤：対象の分析物：検出結合剤：検出支持体の複合体（複数可）が形成されると、検出可能な部分２１０で標識した可溶性結合剤２１２の分子を添加し得る。
【００４２】
図２Ｃ（方法３）は、方法１のアッセイの代わりの形態を例示するが、ここでは、複数の検出結合剤２１１を含む検出支持体（複数可）２３３はまた、別々の可溶性結合剤に結合するよりはむしろ、検出支持体の表面に（例えば、共有結合的結合または表面をコーティングすることによって）結合した検出可能な部分２１０の複数の分子を含む。一実施形態において、この方法は、検出支持体が複数の検出可能な部分を含む場合、より少ない検出結合剤の使用を可能とし得る。例えば、検出支持体上の検出可能な部分：検出結合剤の比は、１：１、または５：１、または１０：１、または１００：１、または５００：１、または１０００：１、または１０，０００：１またはそれ超であり得る。検出可能な部分は、蛍光性部分（例えば、ＱＤＯＴＳ（登録商標））または酵素（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ）を含み得る。また、この実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識し、それに結合することができる結合剤（例えば、可溶性抗体２１２）を使用する必要はないことを認めることができる。
【００４３】
図２Ｄ（方法４）は、方法３のアッセイの代わりの形態を例示するが、ここでは、検出結合剤２１１および複数の検出可能な部分２１０でコーティングされた検出支持体（複数可）２３３を、捕捉支持体２４０の添加の前に添加する。いくつかの実施形態において、検出結合剤２１１および複数の検出可能な部分２１０でコーティングされた検出支持体（複数可）２３３、ならびに捕捉結合剤２３０を同時に添加する。一実施形態において、これは、対象の分析物２０６および検出支持体２３３および捕捉結合剤２３０の間の複合体の形成を促進し得る。
【００４４】
図２Ｅ（方法５）は、方法２の代わりの形態を例示するが、ここでは、検出支持体（複数可）２３３を、捕捉結合剤２３０および捕捉支持体２４０の添加の前に添加する。一実施形態において、これは、対象の分析物２０６および検出支持体２３３の間の複合体の形成を促進し得る。
【００４５】
検出支持体および／または検出結合剤上の複数の結合剤分子の少なくともいくつかを特異的に認識および結合することができる結合剤は、捕捉支持体または捕捉支持体結合剤に結合せず、したがって、結合は、バックグラウンドをもたらすことができることは重要であり得る。このように、特定の実施形態において、検出の工程は、検出ビーズ上の検出一次抗体剤を認識する可溶性二次抗体の添加を含むが、可溶性二次抗体は、対象のタンパク質を捕捉支持体に結合するために使用される捕捉結合剤（例えば、第１の一次抗体）を認識しない。
【００４６】
特定の実施形態において、捕捉および／または検出固体支持体は、不働化剤で処理し得る。例えば、特定の実施形態において、対象の分析物は、不動態化した表面（すなわち、非特異的結合を低減させるように処理されている表面）上に捕捉し得る。１種のこのような不働化剤は、ＢＳＡである。さらにおよび／または代わりに、使用される結合剤が抗体である場合、捕捉および／または検出固体支持体は、タンパク質Ａ、タンパク質Ｇ、タンパク質Ａ／Ｇ、タンパク質Ｌ、または高親和性で結合剤抗体に結合する別の作用物質（ａｇｅｎｔ）でコーティングし得る。これらのタンパク質は、抗体のＦｃドメインを結合し、このように対象のタンパク質（複数可）を認識する抗体の結合を配向させることができる。
【００４７】
検出および／または捕捉支持体は、同様のまたは他の材料でできているポリスチレンビーズ（ｐｏｌｙｓｔｙｒｅｎｅ  ｂｅａｄｓ  ｏｒ  ｂｅａｄｓ）であり得、ビーズはタンパク質でコーティングすることができるが、アッセイにおける他の成分と反応しない。特定の実施形態において、複数の抗体分子がビーズに結合し得るように、ビーズは十分に大きい。例えば、ビーズは、直径が約０．１〜５０μｍ、または０．２〜４０μｍ、または０．３〜３０μｍ、または１〜２０μｍ、または１〜１５μｍまたは約１〜３μｍの範囲のサイズであり得る。ビーズのサイズは、行われるアッセイのサイズによって決まり得る。マイクロタイターウェルにおいて行われるアッセイについて、約１マイクロメートル（μｍ）のビーズを使用し得る。
【００４８】
代わりの実施形態において、検出支持体は、複数の検出結合剤を含み得る。例えば、代わりの実施形態において、検出支持体上の結合剤の数は、検出結合剤の１００個超、または５００個超、または１，０００個超、または５，０００個超、または１０，０００個超、または２０，０００個超、または５０，０００個超、または１００，０００個超、または５００，０００個超、または１，０００，０００個超の分子であり得る。例えば、一実施形態において、検出支持体は、数万個または数十万個の抗体分子でコーティングされているビーズを含み得る。代わりの実施形態において、直径が約１５μｍである検出支持体ビーズについて、約１０，０００〜１０，０００，０００個または約５０，０００〜５００，０００個、または約１００，０００〜１，０００，０００個の結合剤分子（例えば、一次抗体）が存在し得る。異なるサイズの検出支持体ビーズのために、対応する表面被覆率を使用することができる。または、これらの範囲内の範囲を達成し得る。
【００４９】
上記のように、酵素または蛍光性材料（ＱＤＯＴＳ（登録商標）もしくは他の蛍光性標識）と複合体化した結合剤を添加して、検出支持体上の検出結合剤として使用される多数の抗体に結合し得る。免疫化学（例えば、ＥＬＩＳＡ）アッセイ、または適切な発光イメージングシステムにおける蛍光性材料の励起および可視化を使用して、タンパク質を定量化し得る。一実施形態において、大きなシグナル増幅率への鍵は、検出結合剤の結合に適合することができる検出支持体の大きな表面積である。例えば、抗体について、約＞１０，０００個および＞１００，０００個の分子を使用して、それぞれ、１μｍおよび２．８μｍのビーズをコーティングし得る。
【００５０】
捕捉支持体上の対象の分析物の分子によって占有される面積は、検出支持体の表面への到達しやすさを満足させるべきである。例えば、捕捉支持体として機能し、１μｍのサイズを有する１，０００，０００個のビーズの二次元の集密的アレイは、約１ｍｍ２を占有し得る。一実施形態において、対象の分析物の１０６個の分子を含有する試料の段階希釈は、各試料のアプライのための別々の位置を生じさせるために、固定した（例えば、マイクロタイターウェル）捕捉支持体にアプライし得る。移動性の捕捉支持体（例えば、ビーズ）について、結合することができる特定のサイズの検出支持体の数は、立体効果によって制限することができる。固定したまたは移動性の支持体について、それぞれ、＞１０４個または＞１０５個の一次抗体でコーティングされた１μｍまたは２．８μｍのビーズに結合することができる対象の分析物の個々の分子は、標識した二次抗体の結合によって、ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡまたは免疫蛍光アッセイによりこの範囲内の増幅を提供し得る。
【００５１】
例えば、一実施形態において、本発明は、間接的免疫化学または免疫蛍光アッセイにおいて、シグナルを約１０，０００倍に増幅させる方法であって、適切なスペーシングを有する不動態化した表面上に（直接、もしくは特定の捕捉抗体を通して）固定化したタンパク質分子への、または捕捉ビーズ上に固定化したタンパク質分子への、タンパク質Ａ／Ｇおよび同定されるタンパク質に対して特異的な＞１０，０００個の抗体分子でコーティングされたポリスチレン検出ビーズ（典型的には、直径が１マイクロメートル）の結合；洗浄による非結合ビーズ−抗体複合体の除去；例えば、酵素または蛍光性材料（ＱＤＯＴＳ（登録商標））もしくは他の蛍光性標識）と複合体化された二次抗体の結合；ならびに例えば、ＥＬＩＳＡによる、または適切な発光イメージングシステムにおける蛍光性材料の励起および可視化によるタンパク質の定量化を含む、方法を含み得る。
【００５２】
さらにおよび／または代わりに、対象の分析物は、溶液中に存在していてもよく、アッセイは、分析物を検出する手段として複数の検出支持体を一緒に連結する分析物を有することを含み得る。例えば、溶液中のタンパク質を使用して、複数の検出ビーズ（例えば、直径が約１５〜２０μｍ）を連結し得、検出ビーズは、それぞれ、複数の抗体を有し、それによって２個のビーズ上の抗体への結合を介してビーズの集塊を促進する。ポリクローナル抗血清が使用される場合、抗血清は抗体が対象のタンパク質上の異なるエピトープを認識することを可能とするため、これは特に有効であり得る。抗体−ビーズおよびタンパク質の最適濃度、すなわち、最適比域を決定するために、タンパク質の段階希釈物を最大のビーズ凝集について試験し得る。抗体はビーズ上に固定化されているため、抗体過剰のプロゾン効果はありそうにない。
【００５３】
対象の分析物が微生物または組織試料中にある別の実施形態において、試料中の細胞は、適切な孔径のフィルター（例えば、典型的には、細菌について０．４５μｍのスピンフィルター）の表面に濃縮することができる。濃縮されると、試料中の細胞は本明細書に記載のような少容量の緩衝液中に溶解し得、対象の分析物の分子を放出することができる。対象の分析物を含有する細胞ライセートを、フィルター表面から、スライドガラスに、またはマイクロタイタープレートのウェルに移すことができる。この時点で、対象の分析物（例えば、タンパク質）は、タンパク質Ｇ、タンパク質Ａまたはタンパク質Ａ／Ｇおよび特異的抗体でコーティングされた約３００〜約１，０００個の大きな（典型的には、直径が１５〜２０μｍ）ポリスチレンビーズの添加に続いて、格子の形成によって同定することができる。ビーズ集塊は、直接または５０〜１００倍の拡大率の助けにより可視化することができる。再び、ビーズ上の抗体の固定化は、プロゾン効果を不要にし得る。しかし、可能性のある抗原過剰によって、ビーズ集塊を観察するのに一定の数のビーズ−抗体複合体と混合したタンパク質の段階希釈物を必要とし得る。既知の量の対象の分析物と凝集（集塊）したビーズ−タンパク質Ｇ−抗体複合体は、陽性対照としての役割を果たし得、対象の分析物のいずれも伴わない（例えば、既知の陰性対照からのライセート）緩衝液中の凝集していないビーズ−タンパク質Ｇ−抗体複合体は、陰性対照としての役割を果たし得る。
【００５４】
シグナル増幅のためのキット
代わりの実施形態において、本発明は、本発明の方法を行うためのキットを含み得る。一実施形態において、本発明は、検出支持体を含む対象の分析物をアッセイするためのキットであって、検出支持体は、対象の分析物を認識し、それに結合することができる複数の結合剤分子を含む固体支持体を含むキットを含み得る。一実施形態において、キットは、捕捉支持体を含み得、捕捉支持体は、対象の分析物を認識し、それに結合する少なくとも１種の捕捉支持体結合剤を含む。キットは、いくつかの実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤をさらに含み得る。一実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、可溶性結合剤である。
【００５５】
検出および／または捕捉支持体は、種々のフォーマットを含み得る。一実施形態において、捕捉固体支持体は、アッセイウェル（すなわち、例えば、マイクロタイタープレート）であり得る。または、捕捉固体支持体は、アレイ上の位置、または移動性の支持体、例えば、ビーズであり得る。一実施形態において、検出支持体は、移動性の支持体、例えば、ビーズである。
【００５６】
種々の結合剤を、本発明のキットにおいて使用し得る。例えば、検出支持体に結合している複数の結合剤分子は、対象の分析物を認識する抗体または抗体断片の分子のいずれかであり得る。さらにおよび／または代わりに、捕捉支持体に結合している結合剤は、対象の分析物を認識する抗体または抗体断片であり得る。さらにおよび／または代わりに、検出支持体上の複数の結合剤分子を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、抗体または抗体断片であり得る。一実施形態において、検出支持体上の複数の結合剤分子を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、捕捉固体支持体に対象の分析物を結合させるために使用される捕捉結合剤を認識しない。または、捕捉もしくは検出支持体のいずれか上の結合剤、または検出支持体上の複数の結合剤分子を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、非タンパク質の標的を結合するタンパク質を含み得る（すなわち、例えば、対象の小分子分析物に特異的に結合するタンパク質、またはタンパク質に結合する受容体）。
【００５７】
検出支持体は、複数の検出可能な部分の分子（ａ  ｐｌｕｒａｌｉｔｙ  ｏｆ  ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ  ｏｆ  ａ  ｄｅｔｅｃｔａｂｌｅ  ｍｏｉｅｔｙ）を含み得る。さらにおよび／または代わりに、検出支持体上の複数の結合剤分子を特異的に認識し、それに結合することができる結合剤は、検出可能な部分を含み得る。
【００５８】
対象の分析物を認識する複数の結合剤を含む検出支持体の使用は、シグナルの増幅を提供する。代わりの実施形態において、検出支持体は、複数の検出結合剤を含み得る。例えば、代わりの実施形態において、検出支持体上の結合剤の数は、検出結合剤の１００個超、または５００個超、または１，０００個超、または５，０００個超、または１０，０００個超、または２０，０００個超、または５０，０００個超、または１００，０００個超、または５００，０００個超、または１，０００，０００個超の分子であり得る。例えば、一実施形態において、検出支持体は、数万個または数十万個の抗体分子でコーティングされたビーズを含み得る。代わりの実施形態において、直径が約１５μｍである検出支持体ビーズについて、約１０，０００〜１０，０００，０００個または約５０，０００〜５００，０００個、または約１００，０００〜１，０００，０００個の結合剤分子（例えば、一次抗体）が存在し得る。異なるサイズの検出支持体ビーズについて、対応する表面被覆率を使用することができる。またはこれらの範囲内の範囲を達成し得る。
【００５９】
このように、代わりの実施形態において、本発明の方法は、複数の検出結合剤を含む検出支持体を含まない標準的な非増幅免疫アッセイにおいて認められるシグナルの１，０００、または１０，０００超、または１００，０００超、または５００，０００超、または１，０００，０００超倍の増幅を提供する。例えば、代わりの実施形態において、本発明のキットは、複数の検出結合剤を含む検出支持体を含まない標準的な非増幅免疫アッセイにおいて認められるシグナルの１，０００〜１，０００，０００，０００、または１，０００〜１００，０００，０００、または５，０００〜１０，０００，０００、または１０，０００〜１，０００，０００、または１０，０００〜５００，０００、または５０，０００〜５００，０００倍の範囲の増幅を提供する。または、これらの範囲内の範囲を達成し得る。
【００６０】
このように、特定の実施形態において、キットは、ビーズをベースとする免疫アッセイのための試薬を含み得る。このように、一実施形態において、検出支持体は、対象のタンパク質を認識する抗体（または抗体断片）の分子でコーティングされたビーズを含み得る。ビーズは、特定の実施形態において、多種多様のサイズで市販されている（例えば、Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ／Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ  ＣＡ）、タンパク質Ｇ、タンパク質Ａ、またはタンパク質Ａ／Ｇでコーティングされたポリスチレンビーズであり得る。有用であり得る他のビーズは、これらの同じタンパク質でコーティングされた磁気シリカビーズを含む（ＡｍｓＢｉｏ、Ｌａｋｅ  Ｆｏｒｅｓｔ、ＣＡからのＭａｇＳｉビーズ）。
【００６１】
代わりの実施形態において、直径が約１５μｍである検出支持体ビーズについて、約１０，０００〜１０，０００，０００個または約５０，０００〜１，０００，０００個、または約１００，０００〜５００，０００個の結合剤分子（例えば、一次抗体）が存在し得る。異なるサイズの検出支持体ビーズについて、対応する表面被覆率を使用することができる。特定の実施形態において、複数の結合剤分子はビーズに結合し得るように、検出支持体ビーズは十分に大きい。例えば、ビーズは、サイズが直径約０．１〜５０μｍ、または０．２〜４０μｍ、または０．５〜３０μｍ、または１〜２０μｍ、または１〜１５μｍまたは約１〜３μｍの範囲であり得る。ビーズに結合させる結合剤が抗体である場合、タンパク質Ｇ、タンパク質Ａ、またはタンパク質Ａ／Ｇで事前コーティングされた市販のビーズを使用し得る。これらのタンパク質は、抗体のＦｃドメインを結合し、Ｆａｂドメインが抗原のエピトープを自由に結合するように抗体を配向するからである。
【００６２】
ビーズをベースとする免疫アッセイのためのキットはまた、対象のタンパク質のためのさらなる一次抗体を含み得、このような抗体は、第２の種からのものである。これらの抗体は、二次抗抗体−レポーター分子複合体の特異的結合に適応するので、本明細書に記載のとおりの間接的アッセイにおいて特定の有用性を有する。さらに、これらの二次抗体−レポーター複合体は、標的タンパク質を固体表面に、またはタンパク質Ａ／Ｇビーズに固定する第１の種からの一次抗体に結合せず、偽陽性反応を不要にする。さらに、二次抗体−レポーター複合体は、タンパク質Ａ／Ｇビーズの表面に結合せず、それによって偽陽性反応を不要にする。
【００６３】
キットはまた、検出可能なマーカー、または検出可能なマーカーと複合体化することができる結合剤で標識し得る、可溶性二次抗体を含み得る。例えば、特定の実施形態において、本発明のキットは、フルオロフォアに結合する二次抗体を含み得る。一実施形態において、フルオロフォアは、ＱＤＯＴ（登録商標）を含み得る。例えば、一実施形態において、抗抗体−ＱＤＯＴ（登録商標）コンジュゲートは、複数のビーズ結合一次抗体を認識する。
【００６４】
本発明のキットにおいて使用される基材には、これらに限定されないが、ポリスチレンビーズ（Ｓｐｈｅｒｏｔｅｃｈ、Ｌｉｂｅｒｔｙｖｉｌｌｅ、Ｉｌｌ．）、磁気ビーズ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；ＡｍｓＢｉｏ）、ラテックスコーティング、メンブランフィルター、繊維フィルター、遊離繊維または多孔性固体基材が挙げられる。磁気ビーズの使用のための方法は、例えば、Ｄｙｎａｂｅａｄｓ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｇ  製造番号１０００３Ｄの添付文書と共に、Ｋａｌａら、Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２５４巻：２６３〜２６６頁（１９９７年）およびＤｕｔｔｏｎ、Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  Ｎｅｗｓ、第２２巻、１３号、２００２年７月において見出すことができる。
【００６５】
広範な粒子、特に、磁気およびポリスチレンビーズは、広範囲のサイズで市販されている。特定の実施形態のために、好ましい一連の粒子は、約１マイクロメートル（すなわち、ミクロン）の平均粒径（すなわち、粒子の最も大きな寸法）を有する。特定の実施形態のために、好ましい一連の粒子は、１０マイクロメートル（すなわち、ミクロン）以上の平均粒径（すなわち、粒子の最も大きな寸法）を有する。例示的な市販のビーズは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡから、またはＳｐｈｅｒｏｔｅｃｈ、Ｌｉｂｅｒｔｙｖｉｌｌｅ、Ｉｌｌから入手可能な、タンパク質Ｇで、タンパク質Ａで、およびタンパク質Ａ／Ｇでコーティングしたポリスチレンビーズ、ならびにストレプトアビジンでコーティングしたポリスチレンビーズである。ポリスチレンビーズおよび磁気ビーズの他のサプライヤーには、Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｐｉｅｒｃｅ、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ、ＰｏｌｙｓｃｉｅｎｃｅおよびＮｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓが挙げられる。ＡｍｓＢｉｏ、Ｌａｋｅ  Ｆｏｒｅｓｔ、ＩＬは、上に示したタンパク質コーティングの全てと共に利用可能である磁気シリカビーズのサプライヤーである。Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎはまた、抗体を共有結合するエポキシ表面磁気ビーズを供給する。ビーズは、ポリスチレン、シリカ、ガラス、またはその他、プレーン（ｐｌａｎｅ）または特定の化学基への結合のために誘導体化したものであり得る。
【実施例】
【００６６】
本発明の実施形態はまた、以下の非限定的実施例によって特徴付け得る。
【００６７】
（実施例１）
ビーズをベースとするシグナル増幅によるタンパク質の検出
対象のタンパク質またはタンパク質サブユニットは、偽陽性を最小化するために不動態化した表面、例えば、Ｎｅｕｔｒａｖｉｄｉｎ上で固定化された対象のタンパク質に対して特異的な抗体（例えば、ビオチン化ウサギ一次抗体）によって捕捉し得る（例えば、Ｊａｉｎら、Ｎａｔｕｒｅ、２０１１年、４７３巻：４８４〜４８８頁を参照されたい）。次に、サンドイッチアッセイにおいて、タンパク質Ａ／Ｇ、および第２の種（例えば、モルモット）において産生された、上記タンパク質に対して特異的な別のタイプの抗体（典型的には、それぞれ、１μｍおよび２．８μｍのビーズについて、＞１０４個および＞１０５個）でコーティングされた１μｍまたは２．８μｍのポリスチレンビーズを添加して、固定化された標的タンパク質サブユニットに結合させる。次いで、酵素、放射性タグ、または蛍光性材料、例えば、ＱＤＯＴＳ（登録商標）にコンジュゲートしている（例えば、共有結合している）二次抗体または抗体断片（例えば、抗モルモット抗体）を添加し、対象の分析物に対して特異的な複数のビーズ結合一次抗体に結合させる。非結合のタンパク質分子または抗体は、連続的添加の間の洗浄（２回）によって除去される。
【００６８】
ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡまたは免疫蛍光アッセイを使用して、対象のタンパク質またはタンパク質サブユニットを検出および定量化することができる。蛍光をアッセイするために、スポットを紫外線で励起し、カメラを有するハイパースペクトルイメージングシステムにおける適切な発光フィルターにより可視化する。
【００６９】
（実施例２）
ビーズ増幅の様々なフォーマットを使用したリボソームタンパク質の捕捉
実験を行って、図２、パネルＢ（すなわち、方法２）において示した様々なアッセイフォーマットを比較した。本質的に、Ｅ．ｃｏｌｉライセート（５００，０００個の細胞）は、細菌細胞を溶解し、６Ｍ（１０，０００個の細胞／μｌ）のチオシアン酸グアニジン中でその中のリボソームをタンパク質構成物に解離することによって調製した。次いで、チオシアン酸グアニジンの濃度を、リン酸緩衝液中への希釈（例えば、４５０μｌ中への９０，０００個の細胞の希釈）によって０．１２Ｍまたは０．６Ｍに低減させた。次いで、リボソームタンパク質は、図２（表１）に示す捕捉検出方法の１つを使用して捕捉した。結果は、最初のインプット細胞、および細胞からの推定したリボソームタンパク質について示す。１００個のＥ．ｃｏｌｉ細胞は、約２．７ｐｇのリボソームタンパク質を有する。
【表１】
2018054624.tif 000003
【００７０】
パネル２Ｅにおいて示す方法を使用してさらなる実験を行った。この方法は、ライセートへのビーズ−Ａｂ２（カルボキシビーズおよびウサギ抗リボソーム抗体）の添加を利用する。これによって、「捕捉」抗体が表面上に固定化される通常のサンドイッチＥＬＩＳＡと同様に、リボソームタンパク質がビーズに結合することが可能となる。次いで、Ａｂ１−ビオチン（モルモット）を、洗浄工程を伴わずに混合物に直接添加した。ビーズ−Ａｂ２−タンパク質−Ａｂ１複合体は、ストレプトアビジン（ＳＡ）ビーズを使用して捕捉し、Ａｂ２に対する二次抗体を使用して検出する。ウサギＡｂ−カルボキシビーズ（Ａｂ２−ビーズ）およびビオチン、モルモット抗体（Ａｂ１）が使用されたとき、このアプローチが作用したことが見出された。
【００７１】
このように、この実験において、２，５００個／５，０００個／１０，０００個／２０，０００個の細胞からのライセートを、ウサギ抗リボソーム抗体（抗ｒｉｂｏ  Ａｂ）を有する約１．３×１０８個のカルボキシビーズ（０．１μｍ）と共にインキュベートした。次いで、１０ｎｇ（４×１０１０個のＩｇＧ分子）ビオチン化モルモット、抗リボソーム抗体を添加し、さらにインキュベートした。ビーズ−Ａｂ−ｒｉｂｏタンパク質−Ａｂ複合体を、約４×１０７個のＣ１  ＳＡ  Ｄｙｎａｂｅａｄｓによって捕捉した。西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）で標識した１０ｎｇの抗ウサギ抗体によって検出を行った。試料の５分の１をマイクロプレートにロードして、ルミノメーターでＳｉｒｉｕｓ  ＨＲＰ基質による検出を行った。シグナルは、約１４ｐｇのリボソームタンパク質に対応する僅か５００個の細胞について検出されたことが認められ得る。
【００７２】
本発明の好ましい実施形態が例示および記載されてきた一方、本発明の精神および範囲から逸脱することなく、様々な変更をその中で行うことができることを理解されたい。本出願において言及した全ての印刷された特許および刊行物は、この参照によってその内容全体が本明細書に組み込まれている。
【図１】
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【図２−１】
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【図２−２】
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【外国語明細書】
2018054624000001.pdf