(57)【要約】      （修正有）【課題】試料中に含まれる分析対象化合物の定性及び／又は定量を行う際に、夾雑成分の影響を受けない基準イオンを容易に決定することが出来るクロマトグラフ質量分析方法及び装置を提供する。【解決手段】分析対象化合物から生成されるイオンのうちの１乃至複数個のイオンを基準イオンとし、該基準イオンについて得たマスクロマトグラムを用いて試料中に含まれる前記分析対象化合物の定性及び／又は定量を行う質量分析方法において、前記１乃至複数個の基準イオンのそれぞれについて、１乃至複数個の基準イオン候補を設定し、前記設定された基準イオン候補のそれぞれについて前記試料のマスクロマトグラムを取得し、前記マスクロマトグラム上の所定位置に現れるピークと、予め設定されたモデルピークとの形状類似度を求め、前記形状類似度が所定値以上であるピークに対応する基準イオン候補を前記基準イオンとして決定する。【選択図】図３
2018031791.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
分析対象化合物から生成されるイオンのうちの１乃至複数個のイオンを基準イオンとし
、該基準イオンについて得たマスクロマトグラムを用いて試料中に含まれる前記分析対象
化合物の定性及び／又は定量を行う質量分析方法であって、
a) 前記１乃至複数個の基準イオンのそれぞれについて、１乃至複数個の基準イオン候
補を設定し、
b) 前記設定された基準イオン候補の優先順位が高い順に前記試料のマスクロマトグラムを取得し、前記マスクロマトグラム上の所定位置に現れるピークと、所定の関数で表される予め決められたモデルピーク、又は分析対象化合物の標品を測定することにより取得されたマスクロマトグラムのピークであるモデルピークとの形状類似度を求め、 
c)前記形状類似度が所定値以上である場合に、その所定値以上であるピークに対応する基準イオン候補を前記基準イオンとして決定し、形状類似度が所定値以下である場合に、前記bの処理を繰り返す
ことを特徴とする質量分析方法。
【請求項２】
前記基準イオンが定量イオン及び／又は確認イオンであることを特徴とする請求項１に
記載の質量分析方法。
【請求項３】
前記基準イオンがプリカーサイオンとプロダクトイオンの組であることを特徴とする請
求項１に記載の質量分析方法。
【請求項４】
前記マスクロマトグラム上のピークの強度又は面積値が所定値以上である基準イオン候
補を前記基準イオンとして決定することを特徴とする請求項１から３のいずれかに記載の
質量分析方法。
【請求項５】
前記形状類似度が所定値以下である場合に、分析条件を変更してマスクロマトグラムを
取得し、そのマスクロマトグラムについて形状類似度を求めることを特徴とする請求項１
から４のいずれかに記載の質量分析方法。
【請求項６】
前記変更する分析条件が、質量分離部の分解能に関するものであることを特徴とする請
求項５に記載の質量分析方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、分析対象化合物から生成されるイオンのうち１乃至複数個のイオンを、定量
イオンや確認イオンなどの基準イオンとし、該基準イオンについて取得したマスクロマト
グラムを用いて試料に含まれる前記分析対象化合物の定性及び／又は定量を行う質量分析
方法及び装置に関する。
【背景技術】
【０００２】
試料に含まれる成分の定性分析や定量分析を行うために、ガスクロマトグラフ（ＧＣ）
や液体クロマトグラフ（ＬＣ）等のクロマトグラフと、四重極型質量分析計等の質量分析
装置とを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置が広く用いられている。
クロマトグラフ質量分析装置では、クロマトグラフによって時間的に分離された、試料
中の複数の成分を順に質量分析装置に導入し、それらの定性分析や定量分析を行う。
【０００３】
クロマトグラフ質量分析装置を用いて試料の定性分析や定量分析を行う際には、予め分
析対象化合物を特徴づけるイオンを、定量イオン及び確認イオンとして設定する。種々の
化合物にそれぞれ対応する定量イオンと確認イオンは、該化合物の標品を質量分析した結
果に基づいて１乃至複数組設定され、データベースに保存されている。そこで、分析者は
該データベースを参照して定量イオン及び確認イオンを設定する。そして、試料をクロマ
トグラフ質量分析して得られる定量イオンのマスクロマトグラムのピークと確認イオンの
マスクロマトグラムのピークの強度比（あるいは面積比）を用いて化合物を同定（定性）
し、定量イオンのマスクロマトグラムのピークの強度（面積）から化合物を定量する（例
えば特許文献１、２）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】特開2011-242255号公報
【特許文献２】特開2012-132799号公報
【特許文献３】特開2013-15485号公報
【特許文献４】特開2012-104389号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
データベースに保存されている、種々の化合物に対応する定量イオンと確認イオンは、
該化合物以外の成分を含まない標品の質量分析の結果に基づいて決められている。しかし
、実際の試料には複数の成分が含まれており、夾雑成分が分析対象化合物とほぼ同じ保持
時間で溶出し、そのイオンが分析対象化合物とほぼ同じ質量電荷比を有する場合がある。
この場合には、マスクロマトグラム上で、夾雑成分由来のイオンのピークが分析対象化合
物由来のイオンのピークと重なってしまい、夾雑成分の含有量を含む、誤った値を分析対
象化合物の定量値としてしまうことになる。
【０００６】
そのため、分析者は、試料の定量イオンや確認イオンについて得たマスクロマトグラム
に、夾雑成分から生成したイオンのピークが重なっていないかをピーク形状等から確認し
、重なっている場合には別のイオンを定量イオンや確認イオンとして設定し直す、という
作業を行っている。しかし、こうした作業には時間がかかり、また、分析者への負荷も大
きい、という問題があった。
こうした問題は、上記以外に、ＭＳ／ＭＳ装置を用いた多重反応モニタリング（ＭＲＭ
：Multiple Reaction Monitoring）分析において、上記定量イオンに対応するプリカーサ
イオンとプロダクトイオンの組である定量ＭＲＭトランジションや、上記確認イオンに対
応する確認ＭＲＭトランジションを設定する場合にも生じる。
なお、以降の説明において、定量イオン、確認イオン、定量ＭＲＭトランジション、及
び確認ＭＲＭトランジションを適宜、「基準イオン」と呼ぶ。
【０００７】
本発明が解決しようとする課題は、試料中に含まれる分析対象化合物の定性及び／又は
定量を行う際に、夾雑成分の影響を受けない基準イオンを容易に決定することができるク
ロマトグラフ質量分析方法及び装置を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
上記課題を解決するために成された本発明は、分析対象化合物から生成されるイオンのうちの１乃至複数個のイオンを基準イオンとし
、該基準イオンについて得たマスクロマトグラムを用いて試料中に含まれる前記分析対象
化合物の定性及び／又は定量を行う質量分析方法であって、
a) 前記１乃至複数個の基準イオンのそれぞれについて、１乃至複数個の基準イオン候
補を設定し、
b) 前記設定された基準イオン候補の優先順位が高い順に前記試料のマスクロマトグラムを取得し、前記マスクロマトグラム上の所定位置に現れるピークと、所定の関数で表される予め決められたモデルピーク、又は分析対象化合物の標品を測定することにより取得されたマスクロマトグラムのピークであるモデルピークとの形状類似度を求め、 
c)前記形状類似度が所定値以上である場合に、その所定値以上であるピークに対応する基準イオン候補を前記基準イオンとして決定し、形状類似度が所定値以下である場合に、前記bの処理を繰り返す
ことを特徴とする。
【０００９】
基準イオンとしては、例えば、上述した定量イオンや確認イオンのほか、プリカーサイ
オンとプロダクトイオンの組である定量ＭＲＭトランジションや、確認ＭＲＭトランジシ
ョンを挙げることができる。また、上記マスクロマトグラム上の所定位置とは、分析対象
化合物の保持時間に対応する位置をいう。
【００１０】
本発明に係る質量分析方法では、マスクロマトグラム上の所定位置に現れるピークと、
予め設定されたモデルピークとの形状類似度を求め、その値が所定値以上であるピークに
対応するイオンを基準イオンとして決定する。マスクロマトグラム上に存在するピークが
、単一のイオンのみによるピークである場合、その形状は例えばガウス関数で表されるモ
デルピークの形状に近くなる。一方、夾雑成分由来のイオンのピークが重なっている場合
には、ピーク形状が崩れ、モデルピークとの形状類似度が低くなる。そのため、形状類似
度が所定値以上であるピークが得られるイオンを基準イオンとすることにより、夾雑成分
の影響を受けない基準イオンを決定することができる。本発明に係るクロマトグラフ質量
分析方法を用いると、分析者は、マスクロマトグラムのピークの形状を自ら確認すること
なく、夾雑成分の影響を受けない基準イオンを容易に決定することができる。
【００１１】
上記モデルピークとしては、例えば、ガウス関数等の関数で表されるピークや、測定対
象化合物の標品を実際に分析して得たピークを用いることができる。また、形状類似度は
、例えばピアソン相関法により求めることができる。
【発明の効果】
【００１２】
本発明に係る質量分析方法及び装置を用いることにより、質量分析によって試料中に含
まれる分析対象化合物の定性及び／又は定量を行う際に、夾雑成分の影響を受けない基準
イオンを容易に決定することができる。
【図面の簡単な説明】
【００１３】
【図１】実施例１の質量分析装置の要部構成図。
【図２】実施例１において用いられる化合物情報の例。
【図３】実施例１の質量分析方法におけるフローチャート。
【図４】実施例１におけるピーク形状とピーク強度を説明する図。
【図５】実施例２の質量分析装置のデータ処理部の構成を説明する図。
【図６】実施例２において用いられる化合物情報の例。
【図７】実施例２の質量分析方法におけるフローチャート。
【図８】実施例３の質量分析装置のデータ処理部の構成を説明する図。
【図９】実施例３において用いられる化合物情報の例。
【図１０】実施例３の質量分析方法におけるフローチャート。
【図１１】プロダクトイオンスキャン測定により取得したマスクロマトグラムの例。
【図１２】従来の方法により決定したＭＲＭトランジションについて取得したマスクロマトグラムにおけるピーク形状の例。
【図１３】ＣＥ値に対するプロダクトイオン強度の変化を説明するグラフ。
【図１４】実施例４の質量分析装置のデータ処理部の構成を説明する図。
【図１５】実施例４の質量分析方法におけるフローチャート。
【図１６】実施例４においてプロダクトイオン強度グラフの形状類似度が高い範囲の例を説明する図。
【発明を実施するための形態】
【００１４】
以下、本発明に係る質量分析装置及び質量分析方法の実施例について、図面を参照して
説明する。
【実施例１】
【００１５】
図１に、実施例１の液体クロマトグラフ質量分析装置の要部構成図を示す。
本実施例の液体クロマトグラフ質量分析装置において、液体クロマトグラフ部１は、移
動相が貯留された移動相容器１１０と、移動相を吸引して一定流量で送給するポンプ１１
１と、移動相中に予め用意された所定量の試料を注入するインジェクタ１１２と、試料に
含まれる各種化合物を時間方向に分離するカラム１１３と、を備えている。ポンプ１１１
は移動相容器１１０から移動相を吸引して一定流量でカラム１１３に送給する。インジェ
クタ１１２から一定量の試料液が移動相中に導入されると、移動相の流れに乗って試料は
カラム１１３に導入され、カラム１１３を通過する間に試料中の各種化合物が時間方向に
分離されてカラム１１３出口から溶出し、質量分析装置２に導入される。
【００１６】
質量分析装置２は、略大気圧であるイオン化室２０と、真空ポンプ（図示なし）により
真空排気される高真空の分析室２３との間に、段階的に真空度が高められた第１、第２中
間真空室２１、２２を備えた多段差動排気系の構成を有している。イオン化室２０には、
試料溶液に電荷を付与しながら噴霧するエレクトロスプレイイオン化用（ＥＳＩ）プロー
ブ２０１が設置され、イオン化室２０と次段の第１中間真空室２１との間は細径の加熱キ
ャピラリ２０２を通して連通している。第１中間真空室２１と第２中間真空室２２の間は
頂部に小孔を有するスキマー２１２で隔てられ、第１中間真空室２１と第２中間真空室２
２にはそれぞれ、イオンを収束させつつ後段へ輸送するためのイオンガイド２１１、２２
１が設置されている。分析室２３には、多重極イオンガイド２３３が内部に設置されたコ
リジョンセル２３２を挟んで、イオンを質量電荷比に応じて分離可能な前段四重極マスフ
ィルタ（Ｑ１）２３１と、同じくイオンを質量電荷比に応じて分離可能な後段四重極マス
フィルタ（Ｑ３）２３４が配置され、さらに、後段四重極マスフィルタ２３４に続いてイ
オン検出器２３５が設置されている。ＥＳＩプローブ２０１、イオンガイド２１１、２２
１、２３３、四重極マスフィルタ２３１、２３４などには、それぞれ電源部３から所定の
電圧が印加される。なお、四重極マスフィルタ２３１、２３４はそれぞれ、メインロッド
電極の前段に、入口端での電場の乱れを補正するためのプリロッド電極を有しており、プ
リロッド電極にはメインロッド電極とは異なる電圧が印加できるようになっている。
【００１７】
質量分析装置２は、ＭＳ／ＭＳ分析を実行可能な構成を有しているが、実施例１ではＭ
Ｓ分析を行うため、前段四重極マスフィルタ２３１のみを質量分離部として使用し、コリ
ジョンセル２３２内にはＣＩＤガスを供給せず、また、多重極イオンガイド２３３や後段
四重極マスフィルタ２３４には、前段四重極マスフィルタ２３１において質量分離された
イオンがそのまま通過するような電圧が印加される。本実施例のＬＣ／ＭＳ／ＭＳ装置の
代わりに、ＭＳ分析に特化した構成の質量分析装置を組み合わせたＬＣ／ＭＳ装置を用い
てもよい。
【００１８】
質量分析装置２において、カラム１１３からの溶出液がエレクトロスプレイイオン化用
プローブ２０１に到達すると、該プローブ２０１先端において電荷が付与されながら溶出
液が噴霧される。噴霧により形成された帯電液滴は付与された電荷による静電気力の作用
によって分裂しながら微細化され、その過程で溶媒は気化し化合物由来のイオンが飛び出
す。こうして生成されたイオンは加熱キャピラリ２０２を通して第１中間真空室２１に送
られ、イオンガイド２１１で収束されてスキマー２１２頂部の小孔を経て第２中間真空室
２２に送られる。そして、化合物由来のイオンはイオンガイド２２１で収束されて分析室
２３に送られ、前段四重極マスフィルタ２３１の長軸方向の空間に導入される。なお、イ
オン化法としてはエレクトロスプレイイオン化法に限らず、大気圧化学イオン化法や大気
圧光イオン化法などを用いてもよい。
【００１９】
ＭＳ分析を行う前段四重極マスフィルタ２３１の各ロッド電極には、電源部３から所定
の電圧（高周波電圧と直流電圧とが重畳された電圧）が印加される。前段四重極マスフィ
ルタ２３１に送り込まれた各種イオンの中で、前段四重極マスフィルタ２３１の各ロッド
電極に印加されている電圧に応じた特定の質量電荷比を有するイオンのみが該フィルタ２
３１を通過する。そして、コリジョンセル２３２及び後段四重極マスフィルタ２３４を通
過してイオン検出器２３５で検出される。イオン検出器２３５は例えばパルスカウント型
検出器であり、入射したイオンの数に応じた個数のパルス信号を検出信号としてデータ処
理部４へと出力する。
【００２０】
データ処理部４は、記憶部４１を有するとともに、機能ブロックとして、基準イオン候
補設定部４２、マスクロマトグラム取得部４３、形状類似度算出部４４、及び基準イオン
決定部４５を備えている。記憶部４１には、ガウス関数、EMG関数、Bigaussian関数、Ske
w Normal関数等のモデルピーク関数情報と、分析対象化合物に関する保持時間（又は保持
指標）、基準イオン候補の質量電荷比とピーク強度に関する化合物情報が保存されている
。図２に、記憶部４１に保存される化合物Ａの化合物情報の一例を示す。化合物情報は、
該化合物の標品を質量分析した結果に基づいて予め作成されたものである。
【００２１】
また、データ処理部４は、液体クロマトグラフ部１のポンプ１１１やインジェクタ１１
２、質量分析装置２の電源部３やＣＩＤガス供給部（図示せず）などの各部の動作をそれ
ぞれ制御する制御部５との間で適宜に信号を送受信するように構成されている。データ処
理部４の実体はパーソナルコンピュータであり、該コンピュータに予めインストールされ
たデータ処理用ソフトウェアを実行することにより、データ処理部４としての機能を発揮
させるようにすることができる。また、データ処理部４には、入力部６、表示部７が接続
されている。
【００２２】
以下、実施例１の質量分析方法について、図３のフローチャートを参照して説明する。
分析者が、記憶部４１に保存されている化合物Ａの化合物情報を参照して、化合物Ａに
対する基準イオン候補を複数入力すると、基準イオン候補設定部４２はそれらを基準イオ
ン候補として設定する（ステップＳ１）。あるいは、基準イオン候補設定部４２が記憶部
４１から化合物情報を読み出し、該情報に基づいて自動的に基準イオン候補を設定するよ
うにしてもよい。
【００２３】
続いて、マスクロマトグラム取得部４３は、制御部５に対して所定の信号を出力し、液
体クロマトグラフ部１及び質量分析装置２を動作させて、複数の基準イオン候補のそれぞ
れについてマスクロマトグラムを取得する（ステップＳ２）。具体的には、分析対象化合
物である化合物Ａを含む試料を液体クロマトグラフ部のインジェクタ１１２から注入して
所定の移動相の流れに乗せ、カラム１１３を通過させて質量分析装置２に導入する。質量
分析装置２では、電源部３から所定の電圧が印加された四重極マスフィルタ２３１におい
て基準イオン候補に設定されたイオンが選別され、イオン検出器２３５で検出される。マ
スクロマトグラム取得部４３は、イオン検出器２３５からの検出信号に基づいて基準イオ
ン候補のマスクロマトグラムを作成し、記憶部４１に保存するとともに表示部７の画面上
に表示する。
【００２４】
全ての基準イオン候補についてマスクロマトグラムを取得すると、形状類似度算出部４
４は、各マスクロマトグラムにおいて化合物Ａの保持時間taに対応する位置のピークを抽
出し、モデルピークとの形状類似度を算出する（ステップＳ３）。本実施例のように複数
のモデルピーク関数が存在する場合には、分析者に使用する関数を指定させ、その関数を
用いて形状類似度を計算する。形状類似度は、ピアソン相関係数や、コサイン類似度、ス
ピアマンの順位相関係数、ケンドールの順位相関係数、Jaccard係数、Dice係数、Simpson
係数を用いる方法等、種々の方法により算出することができる。あるいは、ベクトル同士
の距離（ユークリッド距離、マンハッタン距離、チェビシェフ距離、ミンコフスキー距離
等）を用いてモデルピークとの相違度を求めることにより類似度を算出してもよい。
【００２５】
図４(a)〜(d)に、それぞれ基準イオン候補a〜dについて取得したマスクロマトグラムの
ピークと、形状類似度、及び強度値を示す。基準イオン決定部４５は、まず、ピークの計
所類似度が所定値（本実施例では80）以上である基準イオン候補a, c, dを選出する。そ
して、これらの基準イオン候補の中から強度値が大きい順に基準イオン候補a, cを選出し
て、これらを定量イオン、確認イオンに決定する（ステップＳ４）。なお、基準イオンと
して定量イオンのみを決定する場合には、強度値が最も大きい基準イオン候補aのみを選
出し、定量イオンとして決定する。
【００２６】
図４(b)に示すように、基準イオン候補bのピークには、ピークの裾に別のピークが現れ
ており、目的化合物のピークに夾雑成分のピークが重なっている。こうしたピークの場合
、モデルピークとの形状類似度が低く算出される。従って、形状類似度が所定値以上であ
る基準イオン候補のみを選出することにより、夾雑成分の影響を受けない基準イオンを決
定することができる。
【実施例２】
【００２７】
次に、実施例２のクロマトグラフ質量分析装置及び方法について説明する。本実施例の
クロマトグラフ質量分析装置は、データ処理部１４を除いて実施例１のクロマトグラフ質
量分析装置と同様の構成を有しているため、データ処理部１４の構成のみを図５に示す。
【００２８】
データ処理部１４は、記憶部１４１を有するとともに、機能ブロックとして、イオン候
補組設定部１４２、マスクロマトグラム取得部１４３、ピーク比算出部１４４、及びイオ
ン組決定部１４５を備えている。記憶部１４１には、各種の化合物に関する保持時間（又
は保持指標）、定量イオン候補と確認イオン候補それぞれの質量電荷比と、両イオン候補
のピーク強度比（又は面積比）に関する化合物情報が保存されている（図６参照）。
【００２９】
以下、本実施例の液体クロマトグラフ質量分析装置の動作について、図７のフローチャ
ートを参照して説明する。
まず、イオン候補組設定部１４２は、分析者の入力に基づいて、あるいは記憶部１４１
に保存されている化合物情報に基づいて自動的に、定量イオン候補と確認イオン候補の組
を設定する（ステップＳ１１）。
【００３０】
続いて、マスクロマトグラム取得部１４３は、制御部５に対して所定の信号を出力し、
液体クロマトグラフ部１及び質量分析装置２を動作させ、全ての定量イオン候補及び確認
イオン候補についてマスクロマトグラムを取得し（ステップＳ１２）、記憶部１４１に保
存するとともに表示部７の画面上に表示する。
【００３１】
全てのイオン候補についてマスクロマトグラムを取得すると、ピーク比算出部１４４は
、各イオン候補組について、それぞれピーク強度比（あるいは面積比）を算出する（ステ
ップＳ１３）。そして、イオン組決定部１４５は、全イオン候補組の中から、算出された
ピーク強度比が、記憶部１４１に保存されている化合物情報の強度比に対して所定の範囲
内（例えば±20%の範囲内）に収まっているイオン候補組を選出する。選出したイオン候
補組の中から、ピーク強度の合計値が最も大きいものをさらに選出して、該イオン候補組
を定量イオンと確認イオンの組として決定する（ステップＳ１４）。
【００３２】
ここで、具体的な例として、定量イオン候補及び／又は確認イオン候補として設定され
たイオンa〜dについて、図４(a)〜(d)に示すピークが得られた場合について説明する。
【００３３】
図６に示すように、化合物情報では、化合物Ａに対するイオン候補組が６組設定されて
いるため、これら全てに対応するピーク強度比を算出する。上述したように、イオン候補
bについて取得したマスクロマトグラムでは、化合物Ａのピークに夾雑成分のピークが重
なっているため、化合物Ａのピーク強度に夾雑成分のピーク強度が加算される。その結果
、イオン候補bを含むイオン候補組のピーク強度比は、化合物情報に含まれるピーク強度
比の値からずれた値になる。従って、イオン候補組のそれぞれについて、マスクロマトグ
ラムのピーク強度比の値が、化合物情報に含まれるピーク強度比に対して所定の範囲内に
含まれるイオン候補組を選出することによって、夾雑成分の影響を受けないイオンの組を
定量イオンと確認イオンとして決定することができる。
ここでは、ピーク強度の合計値が最も大きいイオンを選出して定量イオンと確認イオン
を決定したが、算出されたピーク強度比が化合物情報のピーク強度比に最も近いものを定
量イオンと確認イオンの組として選ぶようにしても良い。
【実施例３】
【００３４】
続いて、実施例３の質量分析装置及び方法について説明する。
実施例１では、ＭＳ分析により定量イオン及び確認イオンを決定したのに対し、実施例
３では、ＭＳ／ＭＳ分析により定量ＭＲＭトランジション及び確認ＭＲＭトランジション
を決定する。実施例３の液体クロマトグラフ質量分析装置の各部の構成はデータ処理部２
４を除いて実施例１と同様であるため、データ処理部２４の構成のみを図８に示す。
【００３５】
データ処理部２４は、記憶部２４１を有するとともに、機能ブロックとして、イオン候
補組設定部２４２、マスクロマトグラム取得部２４３、形状類似度算出部２４４、ＭＳ／
ＭＳ分析条件変更部２４５、及びイオン組決定部２４６を備えている。記憶部２４１には
、実施例１において説明したモデルピーク関数情報と、分析対象化合物に関する保持時間
（又は保持指標）、基準ＭＲＭトランジション候補（プリカーサイオンとプロダクトイオ
ンの組）の質量電荷比、該基準ＭＲＭトランジション候補に対応する衝突エネルギー（Ｃ
Ｅ）の値、及びピーク強度に関する化合物情報が保存されている。図９に、記憶部２４１
に保存される化合物情報の一例を示す。化合物情報は、標品を質量分析した結果に基づい
て予め作成される。
【００３６】
実施例３の質量分析方法について、図１０のフローチャートを参照して説明する。
まず、イオン候補組設定部２４２は、化合物情報において、最上位に位置する基準ＭＲ
Ｍトランジション候補（本実施例ではトランジションa）を読み出して、基準ＭＲＭトラ
ンジション候補に設定する（ステップＳ２１）。
【００３７】
続いて、マスクロマトグラム取得部２４３は、制御部５に対して所定の信号を出力し、
液体クロマトグラフ部１及び質量分析装置２を動作させて基準ＭＲＭトランジション候補
のマスクロマトグラムを取得する（ステップＳ２２）。このときの各部の動作は以下の通
りである。
【００３８】
液体クロマトグラフ部１では、分析対象化合物である化合物Ａを含む試料をインジェク
タ１１２から注入し、所定の移動相の流れに乗せてカラム１１３を通過させて質量分析装
置２に導入する。
【００３９】
質量分析装置２では、前段四重極マスフィルタ２３１に送り込まれた各種イオンの中で
、基準ＭＲＭトランジション候補として設定されたプリカーサイオンが前段四重極マスフ
ィルタ２３１を通過するように、前段四重極マスフィルタ２３１の各ロッド電極に所定の
電圧（高周波電圧と直流電圧とが重畳された電圧）を印加する。また、コリジョンセル２
３２にはＣＩＤガスを供給するとともに、化合物情報のＣＥ値に基づく電圧を印加する。
さらに、後段四重極マスフィルタ２３４には、コリジョンセル２３２で開裂したプリカー
サイオンから生成した種々のプロダクトイオンのうち、基準ＭＲＭトランジション候補に
設定されたプロダクトイオンのみを選別するように所定の電圧（高周波電圧と直流電圧と
が重畳された電圧）を印加する。イオン検出器２３５は、後段四重極マスフィルタ２３４
を通過したイオンを検出し、その数に応じた個数のパルス信号を検出信号としてデータ処
理部４へと出力する。前段四重極マスフィルタ（Ｑ１）２３１及び後段四重極マスフィル
タ（Ｑ３）の質量分解能等のＭＳ／ＭＳ分析条件のパラメータは標準的な値（例えば初期
値）に設定する。
【００４０】
マスクロマトグラム取得部２４３は、イオン検出器２３５からの検出信号に基づいて基
準ＭＲＭトランジション候補のマスクロマトグラムを作成し、記憶部４１に保存するとと
もに表示部７の画面上に表示する。
【００４１】
次に、形状類似度算出部２４４は、マスクロマトグラムにおいて化合物Ｂの保持時間tb
に対応する位置のピークを抽出し、モデルピーク形状との形状類似度を算出する（ステッ
プＳ２３）。形状類似度の算出方法は上述したとおりである。
【００４２】
イオン組決定部２４６は、算出された形状類似度が所定値以上である場合（ステップＳ
２４でＹＥＳ）に、この基準ＭＲＭトランジション候補をＭＲＭトランジションに決定し
（ステップＳ２９）、マスクトマトグラムを取得した時のＭＳ／ＭＳ分析条件（標準的な
四重極マスフィルタの分解能の設定等）を含めてＭＲＭメソッドを作成する（ステップ３
０）。
【００４３】
一方、算出された形状類似度が所定値未満である場合（ステップＳ２４でＮＯ）には、
ＭＳ／ＭＳ分析条件変更部２４５にＭＳ／ＭＳ分析条件を変更させる。本実施例では、前
段四重極マスフィルタ（Ｑ１）２３１及び後段四重極マスフィルタ（Ｑ３）の質量分解能
をそれぞれ１段階ずつ高くしてＭＳ／ＭＳ分析条件を再設定する。ここでは、Ｑ１とＱ３
の両方の分解能を高くしたが、これらの片方についてのみ分解能を高くしてもよい。
【００４４】
ＭＳ／ＭＳ分析条件が再設定されると、その条件下で、再び基準ＭＲＭトランジション
候補のマスクロマトグラムを取得し（ステップＳ２６）、マスクロマトグラム上のピーク
とモデルピークの形状類似度を算出する（ステップＳ２７）。
【００４５】
イオン組決定部２４６は、ＭＳ／ＭＳ分析条件の変更後に算出した形状類似度が所定値
以上である場合（ステップＳ２８でＹＥＳ）に、この基準ＭＲＭトランジション候補をＭ
ＲＭトランジションに決定し（ステップＳ２９）、変更後のＭＳ／ＭＳ分析条件（四重極
マスフィルタの分解能を高くした設定等）を含めてＭＲＭメソッドを作成する（ステップ
３０）。
【００４６】
一方、算出された形状類似度が所定値未満である場合（ステップＳ２８でＮＯ）には、
イオン候補組設定部２４２に、別の基準ＭＲＭトランジション候補を設定させてステップ
Ｓ２２以降の処理を行って、基準ＭＲＭトランジションを決定し（ステップＳ２９）、Ｍ
ＲＭメソッドを作成する（ステップＳ３０）。
【実施例４】
【００４７】
実施例３では、化合物情報が事前に作成されていることを前提として説明したが、目的
化合物の種類によっては、化合物情報が存在しない場合がある。
実施例４の質量分析方法及び装置は、こうした場合に、ＭＲＭトランジション候補と、
該トランジション候補に対応する衝突エネルギー（ＣＥ）の値を決定する場合に用いられ
る。
【００４８】
実施例４の特徴を明確にするため、従来用いられていた方法を先に説明する。
分析者は、目的化合物から生成されるイオンの１つをプリカーサイオンとして設定し、
衝突エネルギーの大きさが異なる複数の条件下でプロダクトイオンスキャン測定を行って
プロダクトイオンスペクトルを取得する。一例として、図１１に、ＣＥを５Ｖ、１５Ｖ、
３０Ｖとする３つの条件下で取得したプロダクトイオンスペクトルを示す。プリカーサイ
オンとしては、目的化合物を質量分析して取得したマススペクトルにおいて強度が大きい
ピークに対応するイオンや、目的化合物にプロトンが付加したイオンなどが設定される。
そして、プロダクトイオンスペクトルの中から強度が大きいプロダクトイオンのピークを
選出し、該ピークに対応するプロダクトイオンと衝突エネルギーの値を決定する（特許文
献３、４参照）。図１１に示す例では、プロダクトイオンの質量電荷比m/z=204、ＣＥ：
５Ｖとなる。
【００４９】
しかし、この方法には２つの問題点が存在する。
１つ目の問題点は、決定したＭＲＭトランジションでＭＲＭ測定を行ってマスクロマト
グラムを取得した場合に、夾雑成分のピークが重なって現れる可能性があることである。
例えば、液体クロマトグラフにおいて使用する移動相由来のイオンなどが夾雑成分として
現れると、クロマトグラムのピークが図１２に示すような形状になる。実試料の測定時に
こうしたＭＲＭトランジションを用いると、夾雑成分の溶出量を含んで目的化合物を定量
してしまったり、目的化合物が含まれていないにもかかわらず、含まれていると誤判定し
てしまうことになる。
【００５０】
２つ目の問題点は、ＭＲＭ測定時のＣＥ値が決定したＣＥ値からずれたときに、プロダ
クトイオンの生成効率が大きく低下する可能性があることである。図１１から分かるよう
に、ＣＥ値が異なると、生成されるプロダクトイオンの種類や量が異なる。そして、プロ
ダクトイオンの種類によっては、図１３に示すように、わずかなＣＥ値の違いで大きく生
成効率（即ちＭＲＭ測定時のマスクロマトグラムのピーク強度）が変化してしまう場合が
ある。こうしたプロダクトイオン含むＭＲＭトランジションを用いると、実試料のＭＲＭ
測定時に十分なピーク強度が得られず、実際には目的化合物が含まれているにもかかわら
ず、含まれていないと誤判定してしまう可能性がある。
【００５１】
実施例４の質量分析方法及び質量分析装置では、このような問題点を解消してＭＲＭト
ランジション候補と該候補に対応するＣＥ値を決定する。実施例４の質量分析装置の各部
の構成はデータ処理部３４を除いて実施例１と同様であるため、データ処理部３４の構成
のみを図１４に示す。
【００５２】
データ処理部３４は、記憶部３４１を有するとともに、機能ブロックとして、プロダク
トイオンスキャン実行部３４２、イオン候補組設定部３４３、マスクロマトグラム取得部
３４４、プロダクトイオン強度解析部３４５、形状類似度算出部３４６、及びイオン組決
定部３４７を備えている。記憶部３４１には、実施例１において説明したモデルピーク関
数情報と分析対象化合物に関する保持時間（又は保持指標）に加えて、モデルピーク関数
とは別のモデル関数に関する情報が保存されている。
【００５３】
実施例４の質量分析方法について、図１５のフローチャートを参照して説明する。
分析者が目的化合物のプリカーサイオンを設定すると（ステップＳ３１）、プロダクト
イオンスキャン実行部３４２は、該プリカーサイオンについてプロダクトイオンスキャン
測定を行い、マススペクトルを取得する（ステップＳ３２）。このとき、ＣＥの値は標準
値（例えば装置の初期値）に設定される。分析者がプリカーサイオンを複数設定した場合
には、それぞれのプリカーサイオンについてプロダクトイオンスキャンを行ってマススペ
クトルを取得する。
【００５４】
続いて、イオン候補組設定部３４３は、マススペクトル上に存在する、所定値以上の強
度を有するピークに対応する複数のイオンをプロダクトイオン候補とし、使用者により設
定されたプリカーサイオンとともにＭＲＭトランジション候補に設定する（ステップＳ３
３）。
【００５５】
ＭＲＭトランジション候補が設定されると、マスクロマトグラム取得部３４４は、ＣＥ
値が異なる複数の条件下で、設定されたＭＲＭトランジションのマスクロマトグラムを取
得する（ステップＳ３４）。プロダクトイオン強度解析部３４５は、マスクロマトグラム
上のピーク強度（あるいは面積）を求め、ＣＥ値との相関をプロットしたプロダクトイオ
ン強度グラフを作成する（ステップＳ３５）。プロダクトイオン強度解析部３４５により
作成されたプロダクトイオン強度グラフの例を図１６に示す。
【００５６】
形状類似度算出部３４６は、プロダクトイオン強度グラフとモデル関数の形状類似度を
求め、ＣＥ値の変化に対して強度の変化が小さいプロダクトイオンを選出する（ステップ
Ｓ３６）。本実施例では、形状類似度算出部３４６は、ＣＥ値の変化に対して強度が変化
しない関数（即ち、y=k(kは定数)）をモデル関数とし、プロダクトイオン強度グラフとの
形状類似度を求め、その値が大きい範囲を特定し、その範囲に対応するＭＲＭトランジシ
ョンと電圧値を決定する。本実施例では、上述した関数を用いているため、図１２に示す
ように、(ii)プロダクトイオンの質量電荷比m/z=B、ＣＥ値：２０〜２８Ｖの範囲（ＣＥ
値の変化に対してプロダクトイオン強度の変化が小さい範囲）で形状類似度が高くなる。
【００５７】
形状類似度算出部３４６は、ＭＲＭトランジションと電圧値の組を決定すると、その組
について取得したマスクロマトグラム上のピークとモデルピーク関数との形状類似度を算
出し（ステップＳ３７）、その値が所定値以上であるか否かを判定する（ステップＳ３８
）。マスクロマトグラム上のピークの形状類似度の算出方法については実施例１で説明し
たとおりである。
【００５８】
イオン組決定部３４７は、形状類似度算出部３４６が算出した、マスクロマトグラム上
のピークとモデルピーク関数との形状類似度が所定値以上であるＭＲＭトランジション候
補と、該候補に対応するＣＥ値を決定し（ステップＳ３９）、それらを含むＭＲＭメソッ
ドを作成する（ステップＳ４０）。こうして、目的化合物の化合物情報が作成され、記憶
部３４１に保存される。
【００５９】
ここでは、プロダクトイオン強度グラフの形状類似度を判定した後、マスクロマトグラ
ム上のピークの形状類似度を判定する順に説明したが、これらを逆の順で行うこともでき
る。また、標品を用いてＭＲＭメソッドを作成する場合には、成分を分離する必要がない
ため、カラム１１３を使用せず、フローインジェクション分析等を行ってもよい。
【００６０】
上記の各実施例では、液体クロマトグラフ質量分析装置を例に挙げたが、ガスクロマト
グラフ質量分析装置であってもよい。また、分析対象化合物が化合物ＡあるいはＢのみで
ある場合を一例として説明したが、分析対象化合物が複数ある場合には、それら複数の分
析対象化合物について上述した各ステップを実行すればよい。
上記実施例では、モデルピークを所定の関数で表されるピークとしたが、その他、標品
を実際に測定した際に得られたピークを用いてもよい。
上記実施例１の構成において、優先順位が最も高い基準イオン候補からマスクロマトグ
ラムのピーク形状類似度を判定するように構成したり、実施例３の構成において、全ての
基準ＭＲＭトランジション候補についてマスクロマトグラムを取得し、ピークの形状類似
度と強度とを考慮して基準ＭＲＭトランジションを決定するように構成してもよい。
実施例２では、マスクロマトグラムのピーク強度値から定量イオンと確認イオンの組を
決定する例を説明したが、同様に、ＭＲＭ測定により取得したマスクロマトグラムのピー
ク強度値から定量ＭＲＭトランジションと確認ＭＲＭトランジションの組を決定するよう
に構成することもできる。
【００６１】
また、上記の各実施例では、データ処理部が主体的に基準イオンを決定する例を説明し
たが、分析者が自ら基準イオンを決定するように構成し、データ処理部が、分析者により
設定された基準イオンの形状類似度（あるいはピーク強度比）が所定値以下である場合に
のみ、その旨を知らせる警告を表示部の画面に表示して分析者に基準イオンの再選出を促
すようにしてもよい。
【符号の説明】
【００６２】
１…液体クロマトグラフ部
１０…移動相容器
１１…ポンプ
１１０…移動相容器
１１１…ポンプ
１１２…インジェクタ
１１３…カラム
２…質量分析装置
２０…イオン化室
２０１…エレクトロスプレイイオン化用（ＥＳＩ）プローブ
２０２…加熱キャピラリ
２１…第１中間真空室
２１１…イオンガイド
２１２…スキマー
２２…第２中間真空室
２２１…イオンガイド
２３…分析室
２３１…前段四重極マスフィルタ
２３２…コリジョンセル
２３３…多重極イオンガイド
２３４…後段四重極マスフィルタ
２３５…イオン検出器
３…電源部
４、１４、２４、３４…データ処理部
４１、１４１、２４１、３４１…記憶部
４２…基準イオン候補設定部
４３、１４３、２４３、３４４…マスクロマトグラム取得部
４４、２４４、３４６…形状類似度算出部
４５…基準イオン決定部
１４２、２４２、３４３…イオン候補組設定部
１４３…マスクロマトグラム取得部
１４４…ピーク比算出部
１４５、２４６、３４７…イオン組決定部
２４５…ＭＳ／ＭＳ分析条件変更部
３４２…プロダクトイオンスキャン実行部
３４５…プロダクトイオン強度解析部
５…制御部
６…入力部
７…表示部
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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