(57)【要約】      （修正有）【課題】それぞれの被験者について、バストサイズの傾向を網羅的に把握する方法の提供。【解決手段】被験者由来のDNA含有試料において、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている特定の群から選択される一以上の一塩基多型、及び／或いは、該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は、塩基繰り返し多型を検出する工程を含む。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法であって、検出する遺伝子多型が米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される一以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である、被験者のバストサイズの傾向を判定する方法。
【請求項２】
被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法であって、検出の対象となる一塩基多型がrs6557160、rs11155805、rs7740686、rs7763637、rs6913578、rs6900157、rs60705924、rs6930633、rs3734806、rs3757322、rs9383935、rs6557161、rs11155802、rs11155803、rs6929137、rs58164038、rs2046210、rs9397436、rs9397437、rs58343273、rs9383590、rs9397068、rs60954078、rs9383937、rs12173562、rs6912323、rs9397435、rs3734805、rs12665607、rs75859313、rs74295874、rs11155804、rs9383936、rs1293960、rs17081533、rs12173570、rs852003、rs865898、rs9383589、rs9371545、rs77275268、rs9478232、rs7774781、rs34020664、rs6917575、rs6901351、rs1293964、rs6906130、rs1293961、rs851974、rs7752591、rs3734804、rs4591859、rs10872676、rs6932260、rs6932603、rs9371225、rs7776340、rs1038304、rs1023940、rs6915267、rs9397069、rs9371547、rs9397441、rs78517863、rs9397440、rs10484919、rs9371226、rs79475117、rs79416523、rs17081488、rs12662670、rs1110776、rs12663827、rs77334499、rs12663501、rs58893329、rs10110651、rs28735403、rs16885613、rs10096213、rs10095380、rs10092900、rs10087804、rs13365225、rs10086016、rs75772194、rs4286946、rs10955009、rs7816345、rs12681990、rs57935934、rs56687477、rs933116、rs3015739、rs2970637、rs2970638、rs2040115、rs2970634、rs933114、rs2970631、rs1539752、rs2154458、rs3015749、rs3015748、rs3015746、rs3015744、rs3015743、rs3015742、rs2032072、rs3015738、rs3015737、rs2000439、rs59697834、rs10095600、rs2970673、rs933115、rs3015751、rs2970722、rs2970729、rs2970620、rs2970724、rs3015790、rs2970721、rs3015775、rs2970716、rs2211710、rs3015730、rs2970636、rs3015763、rs3015761、rs2000438、rs2970725、rs1111391及びrs3015758からなる群から選択される一以上の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
rs6557160のアレルCを保有する遺伝型、
rs11155805のアレルGを保有する遺伝型、
rs7740686のアレルTを保有する遺伝型、
rs7763637のアレルAを保有する遺伝型、
rs6913578のアレルC保有する遺伝型、
rs6900157のアレルCを保有する遺伝型、
rs60705924のアレルGを保有する遺伝型、
rs6930633のアレルGを保有する遺伝型、
rs3734806のアレルAを保有する遺伝型、
rs3757322のアレルGを保有する遺伝型、
rs9383935のアレルTを保有する遺伝型、
rs6557161のアレルGを保有する遺伝型、
rs11155802のアレルTを保有する遺伝型、
rs11155803のアレルCを保有する遺伝型、
rs6929137のアレルAを保有する遺伝型、
rs58164038のアレルGを保有する遺伝型、
rs2046210のアレルAを保有する遺伝型、
rs9397436のアレルGを保有する遺伝型、
rs9397437のアレルAを保有する遺伝型、
rs58343273のアレルGを保有する遺伝型、
rs9383590のアレルCを保有する遺伝型、
rs9397068のアレルAを保有する遺伝型、
rs60954078のアレルGを保有する遺伝型、
rs9383937のアレルCを保有する遺伝型、
rs12173562のアレルTを保有する遺伝型、
rs6912323のアレルTを保有する遺伝型、
rs9397435のアレルGを保有する遺伝型、
rs3734805のアレルCを保有する遺伝型、
rs12665607のアレルAを保有する遺伝型、
rs75859313のアレルCを保有する遺伝型、
rs74295874のアレルTを保有する遺伝型、
rs11155804のアレルAを保有する遺伝型、
rs9383936のアレルAを保有する遺伝型、
rs1293960のアレルCを保有する遺伝型、
rs17081533のアレルCを保有する遺伝型、
rs12173570のアレルTを保有する遺伝型、
rs852003のアレルTを保有する遺伝型、
rs865898のアレルTを保有する遺伝型、
rs9383589のアレルGを保有する遺伝型、
rs9371545のアレルAを保有する遺伝型、
rs77275268のアレルTを保有する遺伝型、
rs9478232のアレルGを保有する遺伝型、
rs7774781のアレルCを保有する遺伝型、
rs34020664のアレルTを保有する遺伝型、
rs6917575のアレルCを保有する遺伝型、
rs6901351のアレルAを保有する遺伝型、
rs1293964のアレルTを保有する遺伝型、
rs6906130のアレルTを保有する遺伝型、
rs1293961のアレルCを保有する遺伝型、
rs851974のアレルAを保有する遺伝型、
rs7752591のアレルAを保有する遺伝型、
rs3734804のアレルAを保有する遺伝型、
rs4591859のアレルCを保有する遺伝型、
rs10872676のアレルTを保有する遺伝型、
rs6932260のアレルCを保有する遺伝型、
rs6932603のアレルCを保有する遺伝型、
rs9371225のアレルGを保有する遺伝型、
rs7776340のアレルTを保有する遺伝型、
rs1038304のアレルGを保有する遺伝型、
rs1023940のアレルGを保有する遺伝型、
rs6915267のアレルAを保有する遺伝型、
rs9397069のアレルCを保有する遺伝型、
rs9371547のアレルTを保有する遺伝型、
rs9397441のアレルCを保有する遺伝型、
rs78517863のアレルCを保有する遺伝型、
rs9397440のアレルCを保有する遺伝型、
rs10484919のアレルTを保有する遺伝型、
rs9371226のアレルTを保有する遺伝型、
rs79475117のアレルTを保有する遺伝型、
rs79416523のアレルGを保有する遺伝型、
rs17081488のアレルAを保有する遺伝型、
rs12662670のアレルGを保有する遺伝型、
rs1110776のアレルAを保有する遺伝型、
rs12663827のアレルAを保有する遺伝型、
rs77334499のアレルAを保有する遺伝型、
rs12663501のアレルCを保有する遺伝型、
rs58893329のアレルAを保有する遺伝型、
rs10110651のアレルTを保有する遺伝型、
rs28735403のアレルTを保有する遺伝型、
rs16885613のアレルTを保有する遺伝型、
rs10096213のアレルCを保有する遺伝型、
rs10095380のアレルGを保有する遺伝型、
rs10092900のアレルTを保有する遺伝型、
rs10087804のアレルCを保有する遺伝型、
rs13365225のアレルAを保有する遺伝型、
rs10086016のアレルTを保有する遺伝型、
rs75772194のアレルAを保有する遺伝型、
rs4286946のアレルCを保有する遺伝型、
rs10955009のアレルCを保有する遺伝型、
rs7816345のアレルCを保有する遺伝型、
rs12681990のアレルTを保有する遺伝型、
rs57935934のアレルAを保有する遺伝型、
rs56687477のアレルGを保有する遺伝型、
rs933116のアレルTを保有する遺伝型、
rs3015739のアレルGを保有する遺伝型、
rs2970637のアレルAを保有する遺伝型、
rs2970638のアレルGを保有する遺伝型、
rs2040115のアレルCを保有する遺伝型、
rs2970634のアレルCを保有する遺伝型、
rs933114のアレルGを保有する遺伝型、
rs2970631のアレルCを保有する遺伝型、
rs1539752のアレルTを保有する遺伝型、
rs2154458のアレルGを保有する遺伝型、
rs3015749のアレルAを保有する遺伝型、
rs3015748のアレルAを保有する遺伝型、
rs3015746のアレルTを保有する遺伝型、
rs3015744のアレルCを保有する遺伝型、
rs3015743のアレルCを保有する遺伝型、
rs3015742のアレルCを保有する遺伝型、
rs2032072のアレルTを保有する遺伝型、
rs3015738のアレルTを保有する遺伝型、
rs3015737のアレルGを保有する遺伝型、
rs2000439のアレルCを保有する遺伝型、
rs59697834のアレルCを保有する遺伝型、
rs10095600のアレルGを保有する遺伝型、
rs2970673のアレルAを保有する遺伝型、
rs933115のアレルCを保有する遺伝型、
rs3015751のアレルCを保有する遺伝型、
rs2970722のアレルCを保有する遺伝型、
rs2970729のアレルGを保有する遺伝型、
rs2970620のアレルAを保有する遺伝型、
rs2970724のアレルGを保有する遺伝型、
rs3015790のアレルTを保有する遺伝型、
rs2970721のアレルCを保有する遺伝型、
rs3015775のアレルCを保有する遺伝型、
rs2970716のアレルGを保有する遺伝型、
rs2211710のアレルAを保有する遺伝型、
rs3015730のアレルGを保有する遺伝型、
rs2970636のアレルTを保有する遺伝型、
rs3015763のアレルGを保有する遺伝型、
rs3015761のアレルCを保有する遺伝型、
rs2000438のアレルCを保有する遺伝型、
rs2970725のアレルTを保有する遺伝型、
rs1111391のアレルGを保有する遺伝型、
又は、rs3015758のアレルAを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者はバストサイズが大きくなりやすいと判定する工程を含む、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法であって、検出の対象となる挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型がrs146723925、rs373519607、rs11359657、rs5880935、rs146992477、rs56853912、rs61146997、rs112010004、rs33934610、rs375306275及びrs5890910からなる群から選択される一以上の挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
rs146723925のアレルGを保有する遺伝型、
rs373519607のアレルCTを保有する遺伝型、
rs11359657のアレルGCを保有する遺伝型、
rs5880935のアレルTを保有する遺伝型、
rs146992477のアレルTを保有する遺伝型、
rs56853912のアレルGTを保有する遺伝型、
rs61146997のアレルCを保有する遺伝型、
rs112010004のアレルAを保有する遺伝型、
rs33934610のアレルGCを保有する遺伝型、
rs375306275のアレルAを保有する遺伝型、
又は、rs5890910のアレルCTを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者はバストサイズが大きくなりやすいと判定する工程を含む、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
請求項１〜５のいずれかに記載の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を検出するためのプローブ又はプライマーとして用いることができる、被験者のバストサイズの傾向判定用ポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項６に記載のポリヌクレオチドからなるプローブ及び／又はプライマーを含む、被験者のバストサイズの傾向判定用キット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法に関する。さらに詳しくは、被験者由来のDNA含有試料において特定の遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
バストサイズはヒトによって異なり、同じ人種でも必ずしも一致するとは言えない。その要因として、食事や生活習慣等が考えられてきたが、近年では遺伝的な要因についても検討されている。
【０００３】
例えば、非特許文献１では、メキシコの女性を対象とした研究において、FTO遺伝子におけるrs17817449遺伝子変異体（T>G多型）が胸部及び乳房の周囲の寸法に関連することが開示されている。また、非特許文献２では、欧州女性を対象とした研究において、胸部の大きさに関連した7つの一塩基多型を同定し、これらのうち3遺伝子座が乳癌、エストロゲン調節、及び乳房の発達への強いつながりを有していることが開示されている。
【０００４】
しかし、これらの開示されている情報はバストサイズと特定の遺伝子やその遺伝型との関連のみを対象とするものであり、バストサイズの傾向を網羅的に把握できる方法は提供されていなかった。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００５】
【非特許文献１】Zermeno-Rivera JJ1, Astocondor-Perez JP1, Valle Y2, Padilla-Gutierrez JR2, Orozco-Castellanos R3, Figuera LE4, Gutierrez-Amavizca BE5. (2014) Association of the FTO gene SNP rs17817449 with body fat distribution in Mexican women. Genet Mol Res. 13(4):8561-7.
【非特許文献２】Eriksson N1, Benton GM, Do CB, Kiefer AK, Mountain JL, Hinds DA, Francke U, Tung JY. (2012) Genetic variants associated with breast size also influence breast cancer risk. BMC Med Genet. 13:53. doi: 10.1186/1471-2350-13-53.
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
それぞれの被験者について、バストサイズの傾向を網羅的に把握できる方法の提供を課題とする。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本発明者らは、前記課題を解決するために鋭意研究を行い、複数のヒトのバストサイズと遺伝型との関連を調べた結果、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される一以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を対象として解析することにより、網羅的に被験者のバストサイズの傾向を判定できることを見出し、本発明を完成するに至った。
【０００８】
さらに本発明者らは、これらの遺伝子多型を含む遺伝子か該遺伝子の近傍の遺伝子としてCCDC170遺伝子を見出し、この遺伝子の発現や合成されたタンパク質の作用がバストサイズに関連することを見出した。
【０００９】
すなわち、本発明は次の（１）〜（７）の被験者のバストサイズの傾向を判定する方法等に関する。
（１）被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法であって、検出する遺伝子多型が米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される一以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である、被験者のバストサイズの傾向を判定する方法。
（２）被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法であって、検出の対象となる一塩基多型がrs6557160、rs11155805、rs7740686、rs7763637、rs6913578、rs6900157、rs60705924、rs6930633、rs3734806、rs3757322、rs9383935、rs6557161、rs11155802、rs11155803、rs6929137、rs58164038、rs2046210、rs9397436、rs9397437、rs58343273、rs9383590、rs9397068、rs60954078、rs9383937、rs12173562、rs6912323、rs9397435、rs3734805、rs12665607、rs75859313、rs74295874、rs11155804、rs9383936、rs1293960、rs17081533、rs12173570、rs852003、rs865898、rs9383589、rs9371545、rs77275268、rs9478232、rs7774781、rs34020664、rs6917575、rs6901351、rs1293964、rs6906130、rs1293961、rs851974、rs7752591、rs3734804、rs4591859、rs10872676、rs6932260、rs6932603、rs9371225、rs7776340、rs1038304、rs1023940、rs6915267、rs9397069、rs9371547、rs9397441、rs78517863、rs9397440、rs10484919、rs9371226、rs79475117、rs79416523、rs17081488、rs12662670、rs1110776、rs12663827、rs77334499、rs12663501、rs58893329、rs10110651、rs28735403、rs16885613、rs10096213、rs10095380、rs10092900、rs10087804、rs13365225、rs10086016、rs75772194、rs4286946、rs10955009、rs7816345、rs12681990、rs57935934、rs56687477、rs933116、rs3015739、rs2970637、rs2970638、rs2040115、rs2970634、rs933114、rs2970631、rs1539752、rs2154458、rs3015749、rs3015748、rs3015746、rs3015744、rs3015743、rs3015742、rs2032072、rs3015738、rs3015737、rs2000439、rs59697834、rs10095600、rs2970673、rs933115、rs3015751、rs2970722、rs2970729、rs2970620、rs2970724、rs3015790、rs2970721、rs3015775、rs2970716、rs2211710、rs3015730、rs2970636、rs3015763、rs3015761、rs2000438、rs2970725、rs1111391及びrs3015758からなる群から選択される一以上の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型である、上記（１）に記載の方法。
（３）rs6557160のアレルCを保有する遺伝型、rs11155805のアレルGを保有する遺伝型、rs7740686のアレルTを保有する遺伝型、rs7763637のアレルAを保有する遺伝型、rs6913578のアレルCを保有する遺伝型、rs6900157のアレルCを保有する遺伝型、rs60705924のアレルGを保有する遺伝型、rs6930633のアレルGを保有する遺伝型、rs3734806のアレルAを保有する遺伝型、rs3757322のアレルGを保有する遺伝型、rs9383935のアレルTを保有する遺伝型、rs6557161のアレルGを保有する遺伝型、rs11155802のアレルTを保有する遺伝型、rs11155803のアレルCを保有する遺伝型、rs6929137のアレルAを保有する遺伝型、rs58164038のアレルGを保有する遺伝型、rs2046210のアレルAを保有する遺伝型、rs9397436のアレルGを保有する遺伝型、rs9397437のアレルAを保有する遺伝型、rs58343273のアレルGを保有する遺伝型、rs9383590のアレルCを保有する遺伝型、rs9397068のアレルAを保有する遺伝型、rs60954078のアレルGを保有する遺伝型、rs9383937のアレルCを保有する遺伝型、rs12173562のアレルTを保有する遺伝型、rs6912323のアレルTを保有する遺伝型、rs9397435のアレルGを保有する遺伝型、rs3734805のアレルCを保有する遺伝型、rs12665607のアレルAを保有する遺伝型、rs75859313のアレルCを保有する遺伝型、rs74295874のアレルTを保有する遺伝型、rs11155804のアレルAを保有する遺伝型、rs9383936のアレルAを保有する遺伝型、rs1293960のアレルCを保有する遺伝型、rs17081533のアレルCを保有する遺伝型、rs12173570のアレルTを保有する遺伝型、rs852003のアレルTを保有する遺伝型、rs865898のアレルTを保有する遺伝型、rs9383589のアレルGを保有する遺伝型、rs9371545のアレルAを保有する遺伝型、rs77275268のアレルTを保有する遺伝型、rs9478232のアレルGを保有する遺伝型、rs7774781のアレルCを保有する遺伝型、rs34020664のアレルTを保有する遺伝型、rs6917575のアレルCを保有する遺伝型、rs6901351のアレルAを保有する遺伝型、rs1293964のアレルTを保有する遺伝型、rs6906130のアレルTを保有する遺伝型、rs1293961のアレルCを保有する遺伝型、rs851974のアレルAを保有する遺伝型、rs7752591のアレルAを保有する遺伝型、rs3734804のアレルAを保有する遺伝型、rs4591859のアレルCを保有する遺伝型、rs10872676のアレルTを保有する遺伝型、rs6932260のアレルCを保有する遺伝型、rs6932603のアレルCを保有する遺伝型、rs9371225のアレルGを保有する遺伝型、rs7776340のアレルTを保有する遺伝型、rs1038304のアレルGを保有する遺伝型、rs1023940のアレルGを保有する遺伝型、rs6915267のアレルAを保有する遺伝型、rs9397069のアレルCを保有する遺伝型、rs9371547のアレルTを保有する遺伝型、rs9397441のアレルCを保有する遺伝型、rs78517863のアレルCを保有する遺伝型、rs9397440のアレルCを保有する遺伝型、rs10484919のアレルTを保有する遺伝型、rs9371226のアレルTを保有する遺伝型、rs79475117のアレルTを保有する遺伝型、rs79416523のアレルGを保有する遺伝型、rs17081488のアレルAを保有する遺伝型、rs12662670のアレルGを保有する遺伝型、rs1110776のアレルAを保有する遺伝型、rs12663827のアレルAを保有する遺伝型、rs77334499のアレルAを保有する遺伝型、rs12663501のアレルCを保有する遺伝型、rs58893329のアレルAを保有する遺伝型、rs10110651のアレルTを保有する遺伝型、rs28735403のアレルTを保有する遺伝型、rs16885613のアレルTを保有する遺伝型、rs10096213のアレルCを保有する遺伝型、rs10095380のアレルGを保有する遺伝型、rs10092900のアレルTを保有する���伝型、rs10087804のアレルCを保有する遺伝型、rs13365225のアレルAを保有する遺伝型、rs10086016のアレルTを保有する遺伝型、rs75772194のアレルAを保有する遺伝型、rs4286946のアレルCを保有する遺伝型、rs10955009のアレルCを保有する遺伝型、rs7816345のアレルCを保有する遺伝型、rs12681990のアレルTを保有する遺伝型、rs57935934のアレルAを保有する遺伝型、rs56687477のアレルGを保有する遺伝型、rs933116のアレルTを保有する遺伝型、rs3015739のアレルGを保有する遺伝型、rs2970637のアレルAを保有する遺伝型、rs2970638のアレルGを保有する遺伝型、rs2040115のアレルCを保有する遺伝型、rs2970634のアレルCを保有する遺伝型、rs933114のアレルGを保有する遺伝型、rs2970631のアレルCを保有する遺伝型、rs1539752のアレルTを保有する遺伝型、rs2154458のアレルGを保有する遺伝型、rs3015749のアレルAを保有する遺伝型、rs3015748のアレルAを保有する遺伝型、rs3015746のアレルTを保有する遺伝型、rs3015744のアレルCを保有する遺伝型、rs3015743のアレルCを保有する遺伝型、rs3015742のアレルCを保有する遺伝型、rs2032072のアレルTを保有する遺伝型、rs3015738のアレルTを保有する遺伝型、rs3015737のアレルGを保有する遺伝型、rs2000439のアレルCを保有する遺伝型、rs59697834のアレルCを保有する遺伝型、rs10095600のアレルGを保有する遺伝型、rs2970673のアレルAを保有する遺伝型、rs933115のアレルCを保有する遺伝型、rs3015751のアレルCを保有する遺伝型、rs2970722のアレルCを保有する遺伝型、rs2970729のアレルGを保有する遺伝型、rs2970620のアレルAを保有する遺伝型、rs2970724のアレルGを保有する遺伝型、rs3015790のアレルTを保有する遺伝型、rs2970721のアレルCを保有する遺伝型、rs3015775のアレルCを保有する遺伝型、rs2970716のアレルGを保有する遺伝型、rs2211710のアレルAを保有する遺伝型、rs3015730のアレルGを保有する遺伝型、rs2970636のアレルTを保有する遺伝型、rs3015763のアレルGを保有する遺伝型、rs3015761のアレルCを保有する遺伝型、rs2000438のアレルCを保有する遺伝型、rs2970725のアレルTを保有する遺伝型、rs1111391のアレルGを保有する遺伝型、又は、rs3015758のアレルAを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者はバストサイズが大きなりやすいと判定する工程を含む、上記（２）に記載の方法。
（４）被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法であって、検出の対象となる挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型がrs146723925、rs373519607、rs11359657、rs5880935、rs146992477、rs56853912、rs61146997、rs112010004、rs33934610、rs375306275及びrs5890910からなる群から選択される一以上の挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である、上記（１）に記載の方法。
（５）rs146723925のアレルGを保有する遺伝型、rs373519607のアレルCTを保有する遺伝型、rs11359657のアレルGCを保有する遺伝型、rs5880935のアレルTを保有する遺伝型、rs146992477のアレルTを保有する遺伝型、rs56853912のアレルGTを保有する遺伝型、rs61146997のアレルCを保有する遺伝型、rs112010004のアレルAを保有する遺伝型、rs33934610のアレルGCを保有する遺伝型、rs375306275のアレルAを保有する遺伝型、又は、rs5890910のアレルCTを保有する遺伝型のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者はバストサイズが大きなりやすいと判定する工程を含む、上記（４）に記載の方法。
（６）上記（１）〜（５）のいずれかに記載の一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を検出するためのプローブ又はプライマーとして用いることができる、被験者のバストサイズの傾向判定用ポリヌクレオチド。
（７）上記（６）に記載のポリヌクレオチドからなるプローブ及び／又はプライマーを含む、被験者のバストサイズの傾向判定用キット。
【発明の効果】
【００１０】
本発明の方法により、対象となるヒトそれぞれのバストサイズの傾向を網羅的に把握することができる。また、判定用ポリヌクレオチドや判定用キットの使用により、バストサイズの傾向を簡便に把握することも可能となる。
【発明を実施するための形態】
【００１１】
本発明の「被験者のバストサイズの傾向を判定する方法」とは、被験者由来のDNA含有試料において遺伝子多型を検出する工程を含む被験者のバストサイズの傾向を判定する方法のことをいう。本発明の方法はさらに、被験者のバストサイズの傾向を判定するために有用なその他の工程を含むものであっても良い。
ここで検出する一塩基多型とは、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜５に示される群から選択される一以上の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型のことを指す。
なお、表１〜５において“他のrs番号”とは“rs番号”で特定されるある遺伝子多型を他の番号で示したものであり、実質的に同一な遺伝子多型を示すもののことをいう。例えば遺伝子多型がrs11155805である場合、“他のrs番号”に示されるrs61424936も同じ遺伝子多型を示すものである。
【００１２】
なお、本発明における一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphism、SNP)とは、ヒトのゲノム配列において、国際標準配列と比較して母集団中１％以上の頻度で存在する、一つの塩基が他の塩基に置換変異したものを指す。
また、本発明において連鎖不平衡にある一塩基多型とは、ｒｓ番号で特定される本発明のいずれかの一塩基多型との間の連鎖不平衡係数(r2)が0.8以上である一塩基多型をいう。
【００１３】
検出の対象となる一塩基多型として、例えば、表１〜４に示されるrs6557160、rs11155805（rs61424936）、rs7740686（rs58031606）、rs7763637（rs56536982或いはrs57402640）、rs6913578、rs6900157（rs17825842或いはrs60785330）、rs60705924、rs6930633（rs58600145）、rs3734806（rs59209803）、rs3757322、rs9383935、rs6557161（rs61461688）、rs11155802、rs11155803、rs6929137（rs57948778）、rs58164038、rs2046210（rs56495018、rs60322202或いはrs60621149）、rs9397436（rs57078738）、rs9397437、rs58343273（rs74295875）、rs9383590、rs9397068、rs60954078、rs9383937、rs12173562、rs6912323（rs58116491）、rs9397435、rs3734805（rs61675160）、rs12665607（rs56447285）、rs75859313、rs74295874、rs11155804、rs9383936、rs1293960（rs1738367、rs2006353或いはrs9478234）、rs17081533（rs59945467）、rs12173570、rs852003（rs1293968、rs57336842或いはrs386617435）、rs865898（rs60737283或いはrs61264585）、rs9383589、rs9371545、rs77275268、rs9478232、rs7774781（rs59653988）、rs34020664、rs6917575、rs6901351、rs1293964（rs1738371、rs9478233或いはrs59618549）、rs6906130（rs58425510或いはrs74295873）、rs1293961（rs1738368或いはrs58071087）、rs851974、rs7752591（rs56534244或いはrs60712482）、rs3734804（rs17855719、rs52806953或いはrs57580983）、rs4591859、rs10872676、rs6932260（rs57796066）、rs6932603（rs60554136）、rs9371225、rs7776340（rs61206871）、rs1038304（rs56415842、rs61543362或いはrs74295872）、rs1023940、rs6915267（rs61367026）、rs9397069、rs9371547（rs59533658）、rs9397441（rs59105940）、rs78517863、rs9397440、rs10484919（rs60411367）、rs9371226、rs79475117、rs79416523、rs17081488（rs56517956或いはrs58412621）、rs12662670、rs1110776（rs59322557）、rs12663827、rs77334499、rs12663501、rs58893329、rs10110651（rs13364397或いはrs56888374）、rs28735403、rs16885613、rs10096213（rs58520975）、rs10095380（rs58751084）、rs10092900、rs10087804、rs13365225（rs58142334或いはrs59333862）、rs10086016（rs13364552或いはrs386509630）、rs75772194、rs4286946（rs16885619或いはrs57539463）、rs10955009（rs57609343或いはrs60309742）、rs7816345（rs17840558或いはrs60999146）、rs12681990（rs58194228）、rs57935934、rs56687477、rs933116（rs17401982或いはrs60516327）、rs3015739（rs57355240）、rs2970637（rs59649387）、rs2970638（rs57230304）、rs2040115（rs17318013、rs59161930或いはrs386554179）、rs2970634（rs17402125）、rs933114（rs17402188、rs57392667或いはrs59044959）、rs2970631（rs56607389或いはrs58950202）、rs1539752（rs17311020）、rs2154458（rs17311132）、rs3015749、rs3015748（rs60882877或いはrs74302855）、rs3015746（rs17402395）、rs3015744（rs56816784）、rs3015743（rs17311195）、rs3015742（rs17402423）、rs2032072（rs117736995）、rs3015738（rs60335863）、rs3015737（rs17317950或いはrs59244813）、rs2000439（rs59799089或いはrs111180228）、rs59697834、rs10095600、rs2970673、rs933115（rs57333130或いはrs57801539）、rs3015751（rs57861187）、rs2970722（rs56555253或いはrs59156258）、rs2970729（rs9642763）、rs2970620（rs59954537）、rs2970724（rs56776736）、rs3015790、rs2970721（rs17317769或いはrs60132873）、rs3015775（rs59263307或いはrs74302856）、rs2970716（rs60338756）、rs2211710（rs74302858）、rs3015730（rs59734071）、rs2970636（rs17310845或いはrs57125853）、rs3015763、rs3015761（rs61424932）、rs2000438、rs2970725（rs58747236）、rs1111391（rs57082093）及びrs3015758（rs59728720、rs60662129、rs111173145或いはrs386578573）等が挙げられる。
【００１４】
このうち一塩基多型がrs6557160の場合ではアレルがCかAであり、ターゲットアレルがCである。従って、遺伝型がC/C＞A/C＞A/Aの順番で被験者はバストサイズが大きくなりやすいと判定される。また、rs11155805の場合ではアレルがGかAであり、ターゲットアレルがGである。従って、遺伝型がG/G＞A/G＞A/Aの順番で被験者はバストサイズが大きくなりやすいと判定される。
なお、対応するアレルがGかCまたはAかTである一塩基多型については、ターゲットアレルを判定するための配列情報を表６に示した。本発明において“rs番号”で特定される遺伝子多型で記載しているアレルのストランドはいずれもNCBI SNPデータベースのバージョンGRCh37または米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校（UCSC）データベースのバージョンhg19のリファレンスストランドに等しい。
【００１５】
即ち、本発明の検出対象が次の一塩基多型である場合、１）〜１３５）のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者であればバストサイズが大きくなりやすいと判定されることになる。
１）rs6557160のアレルCを保有する遺伝型、２）rs11155805のアレルGを保有する遺伝型、３）rs7740686のアレルTを保有する遺伝型、４）rs7763637のアレルAを保有する遺伝型、５）rs6913578のアレルCを保有する遺伝型、６）rs6900157のアレルCを保有する遺伝型、７）rs60705924のアレルGを保有する遺伝型、８）rs6930633のアレルGを保有する遺伝型、９）rs3734806のアレルAを保有する遺伝型、１０）rs3757322のアレルGを保有する遺伝型、１１）rs9383935のアレルTを保有する遺伝型、１２）rs6557161のアレルGを保有する遺伝型、１３）rs11155802のアレルTを保有する遺伝型、１４）rs11155803のアレルCを保有する遺伝型、１５）rs6929137のアレルAを保有する遺伝型、１６）rs58164038のアレルGを保有する遺伝型、１７）rs2046210のアレルAを保有する遺伝型、１８）rs9397436のアレルGを保有する遺伝型、１９）rs9397437のアレルAを保有する遺伝型、２０）rs58343273のアレルGを保有する遺伝型、２１）rs9383590のアレルCを保有する遺伝型、２２）rs9397068のアレルAを保有する遺伝型、２３）rs60954078のアレルGを保有する遺伝型、２４）rs9383937のアレルCを保有する遺伝型、２５）rs12173562のアレルTを保有する遺伝型、２６）rs6912323のアレルTを保有する遺伝型、２７）rs9397435のアレルGを保有する遺伝型、２８）rs3734805のアレルCを保有する遺伝型、２９）rs12665607のアレルAを保有する遺伝型、３０）rs75859313のアレルCを保有する遺伝型、３１）rs74295874のアレルTを保有する遺伝型、３２）rs11155804のアレルAを保有する遺伝型、３３）rs9383936のアレルAを保有する遺伝型、３４）rs1293960のアレルCを保有する遺伝型、３５）rs17081533のアレルCを保有する遺伝型、３６）rs12173570のアレルTを保有する遺伝型、３７）rs852003のアレルTを保有する遺伝型、３８）rs865898のアレルTを保有する遺伝型、３９）rs9383589のアレルGを保有する遺伝型、４０）rs9371545のアレルAを保有する遺伝型、４１）rs77275268のアレルTを保有する遺伝型、４２）rs9478232のアレルGを保有する遺伝型、４３）rs7774781のアレルCを保有する遺伝型、４４）rs34020664のアレルTを保有する遺伝型、４５）rs6917575のアレルCを保有する遺伝型、４６）rs6901351のアレルAを保有する遺伝型、４７）rs1293964のアレルTを保有する遺伝型、４８）rs6906130のアレルTを保有する遺伝型、４９）rs1293961のアレルCを保有する遺伝型、５０）rs851974のアレルAを保有する遺伝型、５１）rs7752591のアレルAを保有する遺伝型、５２）rs3734804のアレルAを保有する遺伝型、５３）rs4591859のアレルCを保有する遺伝型、５４）rs10872676のアレルTを保有する遺伝型、５５）rs6932260のアレルCを保有する遺伝型、５６）rs6932603のアレルCを保有する遺伝型、５７）rs9371225のアレルGを保有する遺伝型、５８）rs7776340のアレルTを保有する遺伝型、５９）rs1038304のアレルGを保有する遺伝型、６０）rs1023940のアレルGを保有する遺伝型、６１）rs6915267のアレルAを保有する遺伝型、６２）rs9397069のアレルCを保有する遺伝型、６３）rs9371547のアレルTを保有する遺伝型、６４）rs9397441のアレルCを保有する遺伝型、６５）rs78517863のアレルCを保有する遺伝型、６６）rs9397440のアレルCを保有する遺伝型、６７）rs10484919のアレルTを保有する遺伝型、６８）rs9371226のアレルTを保有する遺伝型、６９）rs79475117のアレルTを保有する遺伝型、７０）rs79416523のアレルGを保有する遺伝型、７１）rs17081488のアレルAを保有する遺伝型、７２）rs12662670のアレルGを保有する遺伝型、７３）rs1110776のアレルAを保有する遺伝型、７４）rs12663827のアレルAを保有する遺伝型、７５）rs77334499のアレルAを保有する遺伝型、７６）rs12663501のアレルCを保有する遺伝型、７７）rs58893329のアレルAを保有する遺伝型、７８）rs10110651のアレルTを保有する遺伝型、７９）rs28735403のアレルTを保有する遺伝型、８０）rs16885613のアレルTを保有する遺伝型、８１）rs10096213のアレルCを保有する遺伝型、８２）rs10095380のアレルGを保有する遺伝型、８３）rs10092900のアレルTを保有する遺伝型、８４）rs10087804のアレルCを保有する遺伝型、８５）rs13365225のアレルAを保有する遺伝型、８６）rs10086016のアレルTを保有する遺伝型、８７）rs75772194のアレルAを保有する遺伝型、８８）rs4286946のアレルCを保有する遺伝型、８９）rs10955009のアレルCを保有する遺伝型、９０）rs7816345のアレルCを保有する遺伝型、９１）rs12681990のアレルTを保有する遺伝型、９２）rs57935934のアレルAを保有する遺伝型、９３）rs56687477のアレルGを保有する遺伝型、９４）rs933116のアレルTを保有する遺伝型、９５）rs3015739のアレルGを保有する遺伝型、９６）rs2970637のアレルAを保有する遺伝型、９７）rs2970638のアレルGを保有する遺伝型、９８）rs2040115のアレルCを保有する遺伝型、９９）rs2970634のアレルCを保有する遺伝型、１００）rs933114のアレルGを保有する遺伝型、１０１）rs2970631のアレルCを保有する遺伝型、１０２）rs1539752のアレルTを保有する遺伝型、１０３）rs2154458のアレルGを保有する遺伝型、１０４）rs3015749のアレルAを保有する遺伝型、１０５）rs3015748のアレルAを保有する遺伝型、１０６）rs3015746のアレルTを保有する遺伝型、１０７）rs3015744のアレルCを保有する遺伝型、１０８）rs3015743のアレルCを保有する遺伝型、１０９）rs3015742のアレルCを保有する遺伝型、１１０）rs2032072のアレルTを保有する遺伝型、１１１）rs3015738のアレルTを保有する遺伝型、１１２）rs3015737のアレルGを保有する遺伝型、１１３）rs2000439のアレルCを保有する遺伝型、１１４）rs59697834のアレルCを保有する遺伝型、１１５）rs10095600のアレルGを保有する遺伝型、１１６）rs2970673のアレルAを保有する遺伝型、１１７）rs933115のアレルCを保有する遺伝型、１１８）rs3015751のアレルCを保有する遺伝型、１１９）rs2970722のアレルCを保有する遺伝型、１２０）rs2970729のアレルGを保有する遺伝型、１２１）rs2970620のアレルAを保有する遺伝型、１２２）rs2970724のアレルGを保有する遺伝型、１２３）rs3015790のアレルTを保有する遺伝型、１２４）rs2970721のアレルCを保有する遺伝型、１２５）rs3015775のアレルCを保有する遺伝型、１２６）rs2970716のアレルGを保有する遺伝型、１２７）rs2211710のアレルAを保有する遺伝型、１２８）rs3015730のアレルGを保有する遺伝型、１２９）rs2970636のアレルTを保有する遺伝型、１３０）rs3015763のアレルGを保有する遺伝型、１３１）rs3015761のアレルCを保有する遺伝型、１３２）rs2000438のアレルCを保有する遺伝型、１３３）rs2970725のアレルTを保有する遺伝型、１３４）rs1111391のアレルGを保有する遺伝型、又は、１３５）rs3015758のアレルAを保有する遺伝型。
【００１６】
また、本発明の検出の対象には挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型も含まれる。このような多型が例えば、表５に示されるrs146723925（rs371038603、rs374402016、rs542215671、rs560565029或いはrs796963727）、rs373519607、rs11359657（rs140351123或いはrs373301556）、rs5880935（rs36225442）、rs146992477、rs56853912（rs148645249或いはrs374105067）、rs61146997（rs74392153或いはrs139622603）、rs112010004（rs140715456）、rs33934610（rs35856461、rs78620347、rs140898157、rs371051053或いはrs375335013）、rs375306275及びrs5890910（rs61073658、rs151336633或いはrs368542696）等が挙げられる。
【００１７】
このうち、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型がrs146723925の場合では、アレルがGかGAAであり、ターゲットアレルがGである。従って、遺伝型がG/G＞GAA/G＞GAA/GAAの順番で被験者はバストサイズが大きくなりやすいと判定される。また、rs373519607の場合ではアレルがCTかCであり、ターゲットアレルがCTである。従って、遺伝型がCT/CT＞C/CT＞C/Cの順番で被験者はバストサイズが大きくなりやすいと判定することになる。
【００１８】
即ち、本発明の検出対象が次の挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型である場合、１）〜１１）のいずれか１以上の遺伝型を示す被験者であればバストサイズが大きくなりやすいと判定されることになる。
１）rs146723925のアレルGを保有する遺伝型、２）rs373519607のアレルCTを保有する遺伝型、３）rs11359657のアレルGCを保有する遺伝型、４）rs5880935のアレルTを保有する遺伝型、５）rs146992477のアレルTを保有する遺伝型、６）rs56853912のアレルGTを保有する遺伝型、７）rs61146997のアレルCを保有する遺伝型、８）rs112010004のアレルAを保有する遺伝型、９）rs33934610のアレルGCを保有する遺伝型、１０）rs375306275のアレルAを保有する遺伝型、又は、１１）rs5890910のアレルCTを保有する遺伝型。
【００１９】
本発明の方法の判定対象となる被験者はヒト（女性）であれば良く、アジア人種、特に東アジア人、さらには日本人であることが好ましい。
また「被験者由来のDNA試料」とは、ゲノムDNA、cDNA、又はmRNAのいずれであっても良く、バストサイズの傾向を判定する対象の被験者から得られるものであれば良い。例えば、唾液、唾、髪の毛、血液、リンパ液、骨髄液、精液、腹腔液、尿等の体液、髪の毛等を由来として調製される試料等が挙げられる。
【００２０】
本発明の一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型の検出にあたり、従来知られているいずれの方法を用いても良く、例えばTaqMan（登録商標）PCR、LAMP法等のPCRによってこれらの遺伝子多型を含む断片を増幅する方法やDNAシーケンサー等で塩基配列を直接決定し、これらの遺伝子多型を検出する方法等が挙げられる。また、DNAチップやGeneチップ等のマイクロアレイによる検出方法を使用しても良い。
【００２１】
本発明の「被験者のバストサイズの傾向判定用ポリヌクレオチド」とは、本発明の検出対象として特定されている一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型の塩基配列を含み得るポリヌクレオチドを指す。
例えば検出対象となる遺伝子多型が一塩基多型であるrs6557160の場合は、C/C、A/C、A/Aのいずれに該当するか検出するために、その箇所の塩基配列を含むポリヌクレオチドとなる。このポリヌクレオチドは検出対象となる一塩基多型及びこれに連続する少なくとも15〜30塩基対からなる塩基配列であることが好ましく、これに相補的な塩基配列も本発明の「被験者のバストサイズの傾向判定用ポリヌクレオチド」に該当し得る。
そして、この「被験者のバストサイズの傾向判定用ポリヌクレオチド」は、一塩基多型及び／又は該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型を検出するためのプローブ又はプライマーとして用いることができる。
【００２２】
本発明の「被験者のバストサイズの傾向判定用キット」とは、「被験者のバストサイズの傾向判定用ポリヌクレオチド」からなるプローブ及び／又はプライマーを少なくとも含むキットのことをいう。このキットはさらに、一塩基多型及び／或いは該一塩基多型と連鎖不平衡にある一塩基多型、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を検出する各方法に適した試薬等を含むものであっても良く、支持体に固定化されたマイクロアレイ等としてキットに含まれても良い。
【００２３】
以下、実施例をあげて本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
【実施例】
【００２４】
１．DNAサンプル
株式会社エムティーアイの女性のヘルスケアに関するウェブサイト及びアプリの使用者であり、かつ、任意に募集したバストサイズの傾向（形質）に関するアンケートに回答した者をDNAサンプル提供の対象者とした。募集では14407名が集まった。
このうち、eメールアドレス、個人情報等によるスクリーニングを経て、9321名がサンプル提供の対象者となった。
なお、バストサイズの傾向に関するアンケートはSurvey Monkey（http://www.surveymonkey.com）によって作成され、オンラインにより対象者から回答を受けた。
【００２５】
DNAサンプルは、唾液採取キット（OraGene(登録商標） DNA；DNA Genotek社）により2015年9月から2016年4月の間に集められた（n=5783）。
本発明にあたり、同意書、アンケート項目、及び遺伝型判定について、つくば国際臨床薬理クリニックの倫理審査委員会によって承認を受けた。同意書のサインにて同意を受けたサンプル提供者よりサンプル収集を行い、遺伝型判定、バストサイズの傾向についてのアンケート、及びゲノムワイド関連解析による形質分析を行った。
【００２６】
２．遺伝型の決定
サンプル提供の対象者から得た唾液サンプルはタカラバイオ株式会社によって処理された。
サンプルはそれぞれ、エバージーン株式会社によって東アジア人を対象とするようにカスタムされたAxiom（登録商標）アレイ（EverGen1）によって遺伝型の決定が行われた。
このEverGen1チップは合計610093の多型を含む。そのうち569104多型は1000 Genomesプロジェクトの日本人系統サンプルにおいてMAF0.01を有したAxiom CHB-1チップのSNPから選ばれ、疾患上又は表現型上の既知の関連性を有する40989多型を追加したものである。
遺伝型データは、Affymetrix（登録商標） Analysis Suite 1.1.0616によって得た。
【００２７】
３．IBD解析によるサンプルQC
解析対象として適したサンプルを選択するため、遺伝型データを利用して同一個体及び近縁関係にある2個体を抽出した。PLINK2 ver. 1.90p（2016年8月16日リリース）｛Purcell et al.、2007、 #42652｝を利用して、総当りの2個体のPIHAT値を算出し、個体Call Rate値の悪い個体を解析対象から除外した。
【００２８】
４．PCA解析によるサンプルQC
PCA解析を利用して解析対象から日本人由来の個体を選択した。
1000 GenomesプロジェクトのPhase 3サンプル集団から2504個体のサンプルの遺伝型データ（ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/release/20130502/）をダウンロードし、人種の教師データとした。
教師データと解析対象集団、更にPCA解析の精度を上げるために別時期に募集した集団を加え、PCA解析を行なった。PCA解析に利用したSNPは121595座位で、これらはPLINK2 v1.90pにより連鎖不平衡の低いSNPとして選択した。選択基準はr2<0.2とした{Purcell et al.、2007、 #42652; Chang et al.、2015、 #66208}。
第1主成分得点、第２主成分得点をそれぞれ横軸、縦軸にとった散布図を描画し、日本人教師データの近傍にある個体を解析対象として選択した{Yamaguchi-Kabata et al.、 2008、 #51107; Tian et al.、 2008、 #28781}。
バストサイズに関するアンケートデータと遺伝型データの両方を有するサンプルで、IBD解析及びPCA解析により解析対象として選択した個体数は5628個体であった。
【００２９】
５．SNPのQC
解析対象SNPの選択基準は、1) SNPコールレート≧99%以上、2) MAF≧0.01、3) HWE P値≧1x10-6とした。
さらに、別時期に募集した集団との重複個体（329個体）について、それぞれで決定されたSNPの遺伝型の一致率を算出し、一致率が90%以上のSNPを解析対象とした。
その結果、536506個のSNPが解析対象として選択された。そのうち2417個は挿入-欠失多型（INDEL）であった。
【００３０】
６．表現型データの処理
バストサイズの傾向の形質についてのアンケート項目は、「バストサイズをお答えください。妊娠・出産経験のある方は、それ以前のサイズをお答えください。」という質問に対して、「AAカップ」〜「Gカップ以上」の八つの選択肢から回答するものであり、この回答からバストサイズの大きさを数値化（AA=0、A=1、B=2、C=3、D=4、E=5、F=6、G以上=7）して評価した。
【００３１】
７．統計解析及び遺伝型予測
マイナーアレルに傾向性様式を仮定し、関連性の有無をロジスティック回帰分析法を用いて評価した。ソフトウェアはPLINK2 v1.90pを利用し、有意水準を5x10-8 とした。
【００３２】
８．ゲノムインピュテーションによる評価
関連候補遺伝子多型周辺の未観測遺伝子多型の遺伝型を擬似的に推定するため、先ずBEAGLE 4.1{Browning and Browning、 2007、 #74753}を用いて遺伝型判定データセットをプレフェージング（pre-phasing）し、次にBEAGLE 4.1を用い、1000Genomes Phase 3の参照ハプロタイプを用いて遺伝型をインピュテーションした{Browning and Browning、 2016、 #55674}。
ゲノムインピュテーションにより擬似的に推定された遺伝型を用いて、関連解析を行った。マイナーアレルに傾向性様式を仮定し、関連性の有無をロジスティック回帰分析法で評価した。ソフトウェアはPLINK2 v1.90pを利用し、有意水準を5x10-8 として評価した。
【００３３】
９．機能解析(In Silico)
HaploReg 4.1{Ward and Kellis、 2012、 #42668}を用いて多型のアノテーション付けを行った。これは、転写因子結合部位（TFBS）についての制御系アノテーション、DNase高感受性部位（DHS）、DNAメチル化、進化的な保存度のスコア（GERP）、遺伝子オーバーラップ、及びeQTL アノテーションを含むものであった。
【００３４】
１０．結果
上記１．〜９．の解析の結果、ヒトのバストサイズの傾向を判定するために有用な遺伝子多型として、米国バイオテクノロジー情報センター（NCBI）SNPデータベースに登録されている表１〜４に示される一塩基多型を特定した。また、表５に示される挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型を特定した。そして、これらの遺伝子多型を含む遺伝子、又は該遺伝子の近傍の遺伝子としてCCDC170遺伝子を見出した。
【００３５】
【表１】
2018186804.tif 000002
【００３６】
【表２】
2018186804.tif 000003
【００３７】
【表３】
2018186804.tif 000004
【００３８】
【表４】
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【００３９】
【表５】
2018186804.tif 000006
【００４０】
【表６】
2018186804.tif 000007
【００４１】
表１〜４に示される一塩基多型及び表５に示される挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型において、ターゲットアレルを含む遺伝型ほど“バストサイズが大きくなりやすい”と判定され得た。即ち、一塩基多型であれば次の１）〜１３５）に示される遺伝型である場合に“バストサイズが大きくなりやすい”と判定され得た。また、挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型であれば次の１）〜１１）に示される遺伝型である場合に“バストサイズが大きくなりやすい”と判定され得た。さらにCCDC170遺伝子はバストサイズの傾向に関連し得る遺伝子と推定された。
【００４２】
＜一塩基多型＞
１）rs6557160のアレルCを保有する遺伝型、２）rs11155805のアレルGを保有する遺伝型、３）rs7740686のアレルTを保有する遺伝型、４）rs7763637のアレルAを保有する遺伝型、５）rs6913578のアレルCを保有する遺伝型、６）rs6900157のアレルCを保有する遺伝型、７）rs60705924のアレルGを保有する遺伝型、８）rs6930633のアレルGを保有する遺伝型、９）rs3734806のアレルAを保有する遺伝型、１０）rs3757322のアレルGを保有する遺伝型、１１）rs9383935のアレルTを保有する遺伝型、１２）rs6557161のアレルGを保有する遺伝型、１３）rs11155802のアレルTを保有する遺伝型、１４）rs11155803のアレルCを保有する遺伝型、１５）rs6929137のアレルAを保有する遺伝型、１６）rs58164038のアレルGを保有する遺伝型、１７）rs2046210のアレルAを保有する遺伝型、１８）rs9397436のアレルGを保有する遺伝型、１９）rs9397437のアレルAを保有する遺伝型、２０）rs58343273のアレルGを保有する遺伝型、２１）rs9383590のアレルCを保有する遺伝型、２２）rs9397068のアレルAを保有する遺伝型、２３）rs60954078のアレルGを保有する遺伝型、２４）rs9383937のアレルCを保有する遺伝型、２５）rs12173562のアレルTを保有する遺伝型、２６）rs6912323のアレルTを保有する遺伝型、２７）rs9397435のアレルGを保有する遺伝型、２８）rs3734805のアレルCを保有する遺伝型、２９）rs12665607のアレルAを保有する遺伝型、３０）rs75859313のアレルCを保有する遺伝型、３１）rs74295874のアレルTを保有する遺伝型、３２）rs11155804のアレルAを保有する遺伝型、３３）rs9383936のアレルAを保有する遺伝型、３４）rs1293960のアレルCを保有する遺伝型、３５）rs17081533のアレルCを保有する遺伝型、３６）rs12173570のアレルTを保有する遺伝型、３７）rs852003のアレルTを保有する遺伝型、３８）rs865898のアレルTを保有する遺伝型、３９）rs9383589のアレルGを保有する遺伝型、４０）rs9371545のアレルAを保有する遺伝型、４１）rs77275268のアレルTを保有する遺伝型、４２）rs9478232のアレルGを保有する遺伝型、４３）rs7774781のアレルCを保有する遺伝型、４４）rs34020664のアレルTを保有する遺伝型、４５）rs6917575のアレルCを保有する遺伝型、４６）rs6901351のアレルAを保有する遺伝型、４７）rs1293964のアレルTを保有する遺伝型、４８）rs6906130のアレルTを保有する遺伝型、４９）rs1293961のアレルCを保有する遺伝型、５０）rs851974のアレルAを保有する遺伝型、５１）rs7752591のアレルAを保有する遺伝型、５２）rs3734804のアレルAを保有する遺伝型、５３）rs4591859のアレルCを保有する遺伝型、５４）rs10872676のアレルTを保有する遺伝型、５５）rs6932260のアレルCを保有する遺伝型、５６）rs6932603のアレルCを保有する遺伝型、５７）rs9371225のアレルGを保有する遺伝型、５８）rs7776340のアレルTを保有する遺伝型、５９）rs1038304のアレルGを保有する遺伝型、６０）rs1023940のアレルGを保有する遺伝型、６１）rs6915267のアレルAを保有する遺伝型、６２）rs9397069のアレルCを保有する遺伝型、６３）rs9371547のアレルTを保有する遺伝型、６４）rs9397441のアレルCを保有する遺伝型、６５）rs78517863のアレルCを保有する遺伝型、６６）rs9397440のアレルCを保有する遺伝型、６７）rs10484919のアレルTを保有する遺伝型、６８）rs9371226のアレルTを保有する遺伝型、６９）rs79475117のアレルTを保有する遺伝型、７０）rs79416523のアレルGを保有する遺伝型、７１）rs17081488のアレルAを保有する遺伝型、７２）rs12662670のアレルGを保有する遺伝型、７３）rs1110776のアレルAを保有する遺伝型、７４）rs12663827のアレルAを保有する遺伝型、７５）rs77334499のアレルAを保有する遺伝型、７６）rs12663501のアレルCを保有する遺伝型、７７）rs58893329のアレルAを保有する遺伝型、７８）rs10110651のアレルTを保有する遺伝型、７９）rs28735403のアレルTを保有する遺伝型、８０）rs16885613のアレルTを保有する遺伝型、８１）rs10096213のアレルCを保有する遺伝型、８２）rs10095380のアレルGを保有する遺伝型、８３）rs10092900のアレルTを保有する遺伝型、８４）rs10087804のアレルCを保有する遺伝型、８５）rs13365225のアレルAを保有する遺伝型、８６）rs10086016のアレルTを保有する遺伝型、８７）rs75772194のアレルAを保有する遺伝型、８８）rs4286946のアレルCを保有する遺伝型、８９）rs10955009のアレルCを保有する遺伝型、９０）rs7816345のアレルCを保有する遺伝型、９１）rs12681990のアレルTを保有する遺伝型、９２）rs57935934のアレルAを保有する遺伝型、９３）rs56687477のアレルGを保有する遺伝型、９４）rs933116のアレルTを保有する遺伝型、９５）rs3015739のアレルGを保有する遺伝型、９６）rs2970637のアレルAを保有する遺伝型、９７）rs2970638のアレルGを保有する遺伝型、９８）rs2040115のアレルCを保有する遺伝型、９９）rs2970634のアレルCを保有する遺伝型、１００）rs933114のアレルGを保有する遺伝型、１０１）rs2970631のアレルCを保有する遺伝型、１０２）rs1539752のアレルTを保有する遺伝型、１０３）rs2154458のアレルGを保有する遺伝型、１０４）rs3015749のアレルAを保有する遺伝型、１０５）rs3015748のアレルAを保有する遺伝型、１０６）rs3015746のアレルTを保有する遺伝型、１０７）rs3015744のアレルCを保有する遺伝型、１０８）rs3015743のアレルCを保有する遺伝型、１０９）rs3015742のアレルCを保有する遺伝型、１１０）rs2032072のアレルTを保有する遺伝型、１１１）rs3015738のアレルTを保有する遺伝型、１１２）rs3015737のアレルGを保有する遺伝型、１１３）rs2000439のアレルCを保有する遺伝型、１１４）rs59697834のアレルCを保有する遺伝型、１１５）rs10095600のアレルGを保有する遺伝型、１１６）rs2970673のアレルAを保有する遺伝型、１１７）rs933115のアレルCを保有する遺伝型、１１８）rs3015751のアレルCを保有する遺伝型、１１９）rs2970722のアレルCを保有する遺伝型、１２０）rs2970729のアレルGを保有する遺伝型、１２１）rs2970620のアレルAを保有する遺伝型、１２２）rs2970724のアレルGを保有する遺伝型、１２３）rs3015790のアレルTを保有する遺伝型、１２４）rs2970721のアレルCを保有する遺伝型、１２５）rs3015775のアレルCを保有する遺伝型、１２６）rs2970716のアレルGを保有する遺伝型、１２７）rs2211710のアレルAを保有する遺伝型、１２８）rs3015730のアレルGを保有する遺伝型、１２９）rs2970636のアレルTを保有する遺伝型、１３０）rs3015763のアレルGを保有する遺伝型、１３１）rs3015761のアレルCを保有する遺伝型、１３２）rs2000438のアレルCを保有する遺伝型、１３３）rs2970725のアレルTを保有する遺伝型、１３４）rs1111391のアレルGを保有する遺伝型、又は、１３５）rs3015758のアレルAを保有する遺伝型
【００４３】
＜挿入型多型、欠失型多型、又は塩基繰り返し多型＞
１）rs146723925のアレルGを保有する遺伝型、２）rs373519607のアレルCTを保有する遺伝型、３）rs11359657のアレルGCを保有する遺伝型、４）rs5880935のアレルTを保有する遺伝型、５）rs146992477のアレルTを保有する遺伝型、６）rs56853912のアレルGTを保有する遺伝型、７）rs61146997のアレルCを保有する遺伝型、８）rs112010004のアレルAを保有する遺伝型、９）rs33934610のアレルGCを保有する遺伝型、１０）rs375306275のアレルAを保有する遺伝型、又は、１１）rs5890910のアレルCTを保有する遺伝型
【産業上の利用可能性】
【００４４】
本発明の方法により、対象となるヒトそれぞれのバストサイズの傾向を網羅的に把握することができる。また、判定用ポリヌクレオチドや判定用キットの使用により、バストサイズの傾向を簡便に把握することも可能となる。