(57)【要約】  本発明は、特にチロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを精製するための精製法に、および本方法により得られる生産物に関する。本方法は、チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドの生産方法を含み、この方法は、チロシンキナーゼ受容体（receptro）関連ポリペプチドを組換え発現系で発現すること、および分離工程において、発現した単量体チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを、発現したポリペプチドの多量体型（単数または複数）から分離することを含み、この分離工程は発現したチロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを生物活性型へリフォールディングさせる。【特許請求の範囲】
【請求項１】
チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドの生産方法であって、
組換え発現系でチロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを発現すること、および発現した単量体チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを前記発現したポリペプチドの多量体型（単数または複数）から分離工程で分離することを含み、
前記分離工程は、前記発現したチロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを生物活性型にリフォールディングさせる方法。
【請求項２】
前記チロシンキナーゼ受容体は、天然のＴｒｋＡ、ＴｒｋＢ、もしくはＴｒｋＣ、あるいは生物学的に活性な前記受容体の相同体、バリアント、もしくは一部、またはそれらの相同体、バリアント、もしくは一部を含む構築物である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
チロシンキナーゼ受容体の一部、または前記一部を含む構築物は発現され、かつ前記一部はそれぞれＴｒｋＡ、ＴｒｋＢ、およびＴｒｋＣ受容体のＩｇ２ドメインから選択される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記ポリペプチドは、ＴｒｋＡＩｇ２、ＴｒｋＡＩｇ２．６、ＴｒｋＢＩｇ２およびＴｒｋＣＩｇ２から選択される、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記ポリペプチドは、ＴｒｋＡＩｇ２またはＴｒｋＡＩｇ２．６である、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記ポリペプチドはヒスチジンタグ配列とともに発現される、請求項１、２、３、４、または５に記載の方法。
【請求項７】
前記ポリペプチドはヒスチジンタグ配列なしで発現される、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記チロシンキナーゼ配列はヒトのものである、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドは不溶性型で発現される、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドは細菌封入体で発現される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記多量体型は二量体を含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記ポリペプチドは、前記対応する天然のチロシンキナーゼ受容体のリガンドと高親和性で結合することができる、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記分離工程はゲル濾過を含む、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記分離工程は０ｍＭ以上かつ５００ｍＭ以下の塩濃度で行われる、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記分離工程は２５ｍＭ以上かつ２００ｍＭ以下の塩濃度で行われる、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記分離工程は約１００ｍＭの塩濃度で行われる、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記ゲル濾過工程で使用される前記ゲルは、ほぼ１２ｋＤａ〜４０ｋＤａの分子量を有する分子を分離することができる、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記ゲルはＳｅｐｈａｄｅｘ２００またはＳｕｐｅｒＤｅｘ２００である、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記ゲルはＳｕｐｅｒＤｅｘ２００である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記分離工程はｐＨ８〜９で行われる、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記分離工程はほぼｐＨ８．５で行われる、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記ポリペプチドは細菌ベースの発現系で産生される、請求項１〜２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
細菌発現系の封入体から組換えＴｒｋＡＩｇ２またはＴｒｋＡＩｇ２．６を精製する方法であって、
単量体ＴｒｋＡＩｇ２またはＴｒｋＡＩｇ２．６は、ゲル濾過工程により単量体および多量体ＴｒｋＡＩｇ２またはＴｒｋＡＩｇ２．６を含む混合物から分離されて、活性型にリフォールディングされる方法。
【請求項２４】
細菌発現系の封入体から組換えＴｒｋＢＩｇ２を精製する方法であって、
単量体ＴｒｋＢＩｇ２は、ゲル濾過工程により単量体および多量体ＴｒｋＢＩｇ２を含む混合物から分離されて、活性型にリフォールディングされる方法。
【請求項２５】
細菌発現系の封入体から組換えＴｒｋＣＩｇ２を精製する方法であって、
単量体ＴｒｋＣＩｇ２は、ゲル濾過工程により単量体および多量体ＴｒｋＣＩｇ２を含む混合物から分離されて、活性型にリフォールディングされる方法。
【請求項２６】
請求項３〜２３のいずれか一項の方法により得られる、２０％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項２７】
１０％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項２６に記載のＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項２８】
１％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項２７に記載のＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項２９】
０．１％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項２８に記載のＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項３０】
請求項３〜２３のいずれか一項の方法により得られる、８０％より多くのＴｒｋＡＩｇ２単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項３１】
請求項３〜２３のいずれか一項の方法により得られる、９０％より多くのＴｒｋＡＩｇ２単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項３２】
請求項３〜２３のいずれか一項の方法により得られる、９９％より多くのＴｒｋＡＩｇ２単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項３３】
請求項３〜２３のいずれか一項の方法により得られる、１００％のＴｒｋＡＩｇ２単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項３４】
請求項３〜２３のいずれか一項の方法により得られる、２０％未満のＴｒｋＡＩｇ２．６二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項３５】
１０％未満のＴｒｋＡＩｇ２．６二量体または二量体凝集体を含む、請求項３４に記載のＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項３６】
１％未満のＴｒｋＡＩｇ２．６二量体または二量体凝集体を含む、請求項３５に記載のＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項３７】
０．１％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項３６に記載のＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項３８】
請求項４〜２３のいずれか一項の方法により得られる、８０％より多くのＴｒｋＡＩｇ２．６単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項３９】
請求項４〜２３のいずれか一項の方法により得られる、９０％より多くのＴｒｋＡＩｇ２．６単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項４０】
請求項４〜２３のいずれか一項の方法により得られる、９９％より多くのＴｒｋＡＩｇ２．６単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物。
【請求項４１】
請求項４〜２３のいずれか一項の方法により得られる、１００％のＴｒｋＡＩｇ２．６単量体を含むＴｒｋＡＩｇ２の調製物。
【請求項４２】
請求項３、４、６〜２２および２４のいずれか一項の方法により得られる、２０％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４３】
１０％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項４２に記載のＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４４】
１％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項４３に記載のＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４５】
０．１％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項４４に記載のＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４６】
請求項３、４、６〜２２および２４のいずれか一項の方法により得られる、８０％より多くのＴｒｋＢＩｇ２単量体を含むＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４７】
請求項３、４、６〜２２および２４のいずれか一項の方法により得られる、９０％より多くのＴｒｋＢＩｇ２単量体を含むＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４８】
請求項３、４、６〜２２および２４のいずれか一項の方法により得られる、９９％より多くのＴｒｋＢＩｇ２単量体を含むＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項４９】
請求項３、４、６〜２２および２４のいずれか一項の方法により得られる、１００％のＴｒｋＢＩｇ２単量体を含むＴｒｋＢＩｇ２の調製物。
【請求項５０】
請求項３、４、６〜２２および２５のいずれか一項の方法により得られる、２０％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５１】
１０％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項５０に記載のＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５２】
１％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項５１に記載のＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５３】
０．１％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体を含む、請求項５２に記載のＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５４】
請求項３、４、６〜２２および２５のいずれか一項の方法により得られる、８０％より多くのＴｒｋＣＩｇ２単量体を含むＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５５】
請求項３、４、６〜２２および２５のいずれか一項の方法により得られる、９０％より多くのＴｒｋＣＩｇ２単量体を含むＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５６】
請求項３、４、６〜２２および２５のいずれか一項の方法により得られる、９９％より多くのＴｒｋＣＩｇ２単量体を含むＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【請求項５７】
請求項３、４、６〜２２および２５のいずれか一項の方法により得られる、１００％のＴｒｋＣＩｇ２単量体を含むＴｒｋＣＩｇ２の調製物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
［本発明の関連する分野］
本発明は、ポリペプチドを精製する方法およびその方法により得られる生産物に関する。詳細には、限定されるものではないが、本発明は、生物学的に活性になる前のフォールディングしなければならないポリペプチド、例えばチロシンキナーゼ受容体ＴｒｋＡ、ＴｒｋＢ、およびＴｒｋＣ、ならびにそれらの生物学的に活性なバリアントおよびそれらの一部（「チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチド」と総称する）を精製する方法に関する。
【０００２】
［背景］
チロシンキナーゼ受容体ＴｒｋＡ、ＴｒｋＢ、およびＴｒｋＣは、ニューロトロフィンに結合する。ＴｒｋＡは、高親和性で神経成長因子（ＮＧＦ）に結合することで、生物学的に活性になる。これはまた、高親和性でニューロトロフィン−３（ＮＴ３）に結合することで生物学的に活性になる。ＴｒｋＢおよびＴｒｋＣは、他のニューロトロフィンに結合する。ＴｒｋＢは、高親和性で脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）およびニューロトロフィン−４（ＮＴ４）に結合する。ＴｒｋＣは、高親和性でＮＴ３に結合する。ＴｒｋＢおよびＴｒｋＣの同定、クローニング、および配列決定は、米国特許第６，０２７，９２７号に記載されている。各受容体分子は、多数の領域またはドメインを含む。チロシンキナーゼ受容体分子の免疫グロブリン様ドメイン（Ｉｇ）は、治療用途で特に関心が持たれる。より詳細には、同一出願人による同時係属特許出願、第ＷＯ９９／５３０５５号に開示されるように、ＴｒｋＡＩｇ２およびバリアント（スプライスバリアントＴｒｋＡＩｇ２．６など）は、治療用途を有する。
【０００３】
特に治療へ応用するために、チロシンキナーゼ受容体に由来するポリペプチドを大規模に生産する必要がある。細菌発現系での組換えポリペプチド生産は複数の理由から有利であるが、特に比較的高収率のポリペプチドを得ることが可能である点が有利である。典型的な収率は、ヒト細胞系の１０倍より高い。
【０００４】
しかしながら、発現したポリペプチド（ＴｒｋＡの第二免疫グロブリン様ドメインであるＴｒｋＡＩｇ２など）は、それらが単量体、二量体、および凝集体（すなわち二量体の中に単量体を含んでいる可能性がある、凝集二量体）の混合物として生産される傾向がある場合には機能することが難しい。しかしながら、特に、ＴｒｋＡＩｇ２の場合（ＴｒｋＢＩｇ２およびＴｒｋＣＩｇ２の場合も同様である）、単量体のみが活性であり、したがって治療上有用である。Robertson A. G. S.等(Biochemical and Biophysical Research Communications 282 (1) : 131-141 Mar 23 2001）に記載されるように、ＴｒｋＡＩｇ２の二量体は、ＮＧＦに結合することができず、そして生物学的に活性ではない。少量の二量体または凝集体がより多くの凝集体生産の種を蒔いて（seed）、生物学的に活性な単量体の量を減少させるようである。多くのタンパク質が、単量体、二量体、さらには四量体の間の平衡状態で存在すること（例えば、ヒト成長ホルモン）は通常ない。薬学的配合物の必要条件である、長期間安定である調製物とするために二量体の除去は不可欠である。多くのタンパク質のように、チロシン受容体関連ポリペプチドの正確な立体配座は生物活性にとって重要である。細菌封入体で発現される場合、ポリペプチドは、フォールディングされているが、ただし生物学的に不活性な、誤った立体配座でフォールディングされる。組換え系での発現後、ポリペプチドは、その正確な立体配座になるために再度フォールディングされなければならない。このような発現後のさらなるフォールディングは、「リフォールディング（refolding）」と称されることがある。
【０００５】
細菌細胞で組換えＴｒｋＡＩｇ２を作製しようと試みている研究グループを、本発明者らは本発明者以外に２グループしか知らない。Ultsch等(J Mol Biol (1999) 290,149-159) は、ＴｒｋＡＩｇ２、ＴｒｋＢＩｇ２、およびＴｒｋＣＩｇ２を作製した。彼らは、封入体ではなく、イオン交換、次いで疎水的相互作用、再度イオン交換、そしてゲル濾過により精製して、ＴｒｋＡＩｇ２を可溶性タンパク質として作製した。ここでゲル濾過工程は、ポリペプチドをリフォールディングさせなかった、すなわちポリペプチドは既にその可溶性型にあるように正確にフォールディングされていると仮定されていた。ＴｒｋＢＩｇ２およびＴｒｋＣＩｇ２は、同じ方法で発現されたものの、不溶性であった。それらは、尿素で可溶化され、そして透析によりリフォールディングさせられ、そしてさらにイオン交換で精製された。得られたＴｒｋＡＩｇ２、ＴｒｋＢＩｇ２、およびＴｒｋＣＩｇ２の結晶構造解析（solution）により、鎖交換二量体、すなわち、１つの単量体の鎖Ａが別の単量体の鎖Ｂと対をなしている二量体であることが明らかになった（添付の図１を参照）。図１は、２つのＴｒｋＡＩｇ２単量体から成る鎖交換二量体を示し、この中で単量体ＸのＡ鎖はフォールディングされておらず、そして単量体ＹのＢ鎖に結合している。反対に、単量体ＹのＡ鎖はフォールディングされておらず、そして単量体ＸのＢ鎖に結合している。これらは不活性である。彼らの議論において、２９３細胞でイムノアドヘシン（immunoadhesins）として発現したドメインと対照的に、生産された二量体のどれも天然のリガンドに結合する能力がなかったことが示された（Urfer et al (1995) EMBO Journal 14,12, p2795-2805）。動物細胞におけるＴｒｋＡＩｇ２−イムノアドヘシン分子構築物の見かけ上のＮＧＦ結合活性は、おそらく、ＴｒｋＡＩｇ２領域を正確な立体配座に保持する巨大なイムノアドヘシンスカフォールド（scaffold）（ＩｇＧのＦＣ部分）によるものであり、これは過剰なグリコシル化を導き、そしてまた構築物が他の分子へ結合することに顕著に影響を及ぼすようである。
【０００６】
Windisch等（Windisch, J M. et al (1995) J. Biol Chem. 270 47 p28133-28138）は、マルトース結合タンパク質融合構築物としてＴｒｋＡＩｇ２を含むＴｒｋＡ誘導体を生成したが、これは不活性であったため、治療用途には適さなかった。マルトース結合タンパク質構築物は、「難しい（difficult）」タンパク質で使用される。この構築物は正確にフォールディングされていたと仮定されていたが、現在ではそうではないことが明らかになっている。
【０００７】
Wiesmann等（Nature, 9th September 1999 401,184-188）は、ＮＧＦ及びＴｒｋＡＩｇ１，２（すなわちＴｒｋＡのＩｇ様ドメインの両方を含むポリペプチド）を一緒に加えることにより、ＮＧＦとＴｒｋＡＩｇ２との共晶体（co-crystal）のみを生成させた。何か月もの期間をかけて、ＴｒｋＡＩｇ１領域は、「徐々に減少」して、ＮＧＦに結合したＴｒｋＡＩｇ２領域だけが残った。このような方法は、チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを市場規模で生産するには適さない。
【０００８】
エシェリヒア・コリの封入体で、チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドの生物学的に活性な部分および誘導体を生産する方法の一つが、Holden等により開示されている(Holden, P. H. et al Nature Biotechnology, 15, July 1997 page 668-672）。この方法は、封入体からポリペプチドを抽出した後、発現ポリペプチドをリフォールディングさせる透析工程を含み、わずか約１６ｍｇ／リットルの収率でポリペプチドをもたらす。第ＷＯ９９／５３０５５号は、エシェリヒア・コリ封入体からＴｒｋＡの一部および誘導体（ＴｒｋＡＩｇ２を含む）を精製する同様の方法を開示し、その方法においても抽出されたポリペプチドは透析される。この方法は、約〜５０ｍｇ／リットルの収率をもたらす。この方法は、比較的不安定な生産物を生産するので、生産後、それがさらに使用される前に急速凍結（snap frozen）されなければならい。
【０００９】
上記に記されるとおり、Ultsch等、第ＷＯ９９／５３０５５号に、およびHolden等によ
り記載される方法は透析工程を含む。透析はポリペプチドの濃度を制限するために（通常約０．１ｍｇ／ｍｌまで）、およびポリペプチドの凝集を制限するために、大量の透析緩衝液を必要とするという点で、好ましくない面がある。必要とされる透析緩衝液の量は、透析を含むチロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチド生産法を市場に有用な規模で使用することを不可能にする。
【００１０】
先行技術のプロセスと比較して収率が改善されている、ポリペプチド、特にチロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドの生産法を提供することが本発明の目的である。先行技術のプロセスと比較して安定性が改善された生産物を提供する方法を提供することが、本発明のさらなる目的である。
【００１１】
［発明の概要］
本発明の１つの態様に従って、チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドの生産法が提供され、この方法は、チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを組換え発現系で発現させること、および発現した単量体チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを、発現したポリペプチドの多量体型（単数または複数）から分離工程で分離することを含み、該分離工程は発現チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドを生物活性型へリフォールディングさせる。
【００１２】
本方法は、複数の理由から既知のプロセスよりも有利である。第一に、本方法は、既知のプロセスよりも顕著に高い収率をもたらす。第二に、本方法は拡張性があり、市場に有用な規模でのポリペプチド生産を可能にする。第三に、本方法は、別途の透析にによるリフォールディング工程を必要としない。透析は、ポリペプチドを低濃度でリフォールディングさせる必要があるために、大量の高価な透析緩衝液を必要とし、かつリフォールディングさせるために長時間を必要とする。透析工程を含む方法は、ポリペプチドを捕獲するための回収工程を必要とする。これは、例えばイオン交換またはアフィニティー分離により行われ得る。イオン交換の使用は、生産物を溶出させるためにＮａＣｌレベルを増加させる必要がある。このことは、ポリペプチドのさらなる凝集を引き起こすので好ましくない。アフィニティー分離の使用（例えば、ニッケルキレート化カラムでのＨｉｓタグの使用）もまた、比較的高いＮａＣｌレベルを必要とし、そしてイミダゾールによる溶出は、除去のためのゲル濾過を必要とする。第四に、本方法は、通常一晩かけて行われる透析を含む先行技術の方法よりも非常に迅速である。第五に、本方法の生産物は、より安定である。生産直後に急速凍結する必要はなく、普通に冷蔵して（約４℃で）保存することができ、かつ少なくとも３か月間は生物学的に活性である。生産物の二量体レベルがより低いので、二量体によりシードされる凝集が起こる傾向はより少ない。第六に、生産物は、鎖交換二量体が生産されることなく、より高濃度（上限６５０μＭ）で生産され得る。第七に、ポリペプチド産物は、透析手順において必要とされる長期間の尿素との接触がないので、よりアミド化されにくい。アミド化は、生物学的活性に影響を及ぼし得る。アミド化はまた、アミンカップリング法を使用してポリペプチドをマトリクスにカップリングすることをより困難にする可能性がある。これらのことが、本発明の方法の生産物を、特定の用途（バイオセンサーなど）でより有用にしている。
【００１３】
チロシンキナーゼ受容体は、天然のＴｒｋＡ、ＴｒｋＢ、ＴｒｋＣであってもよく、またはそれら受容体の生物学的に活性な相同体、バリアント、一部分、もしくはそれらの相同体、バリアント、一部分を含む構築物であってもよい。好ましくは、ポリペプチドは、ＴｒｋＡＩｇ２およびＴｒｋＢＩｇ２から選択される。本発明の方法による生産に特に好適なポリペプチドは、ＴｒｋＡ、ＴｒｋＢ、およびＴｒｋＣ受容体のＩｇ２サブドメインである。最も好ましくは、ポリペプチドは、ＴｒｋＡＩｇ２またはＴｒｋＡＩｇ２．６である。
【００１４】
好適な構築物は、対応する天然の受容体からの付加的Ｃ末端配列を含み得る。
【００１５】
ポリペプチドは、ヒスチジンタグ配列とともに発現され得る。チロシンキナーゼ配列は、好ましくはヒトのものである。チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドは、不溶型で発現され得る。好ましくは、チロシンキナーゼ受容体関連ポリペプチドは、細菌封入体で発現される。ポリペプチドの多量体型は、二量体を含み得る。ポリペプチドは、好ましくは、対応する天然のチロシンキナーゼ受容体のリガンドに高親和性で結合することが可能である。
【００１６】
分離工程は、好ましくはゲル濾過を含む。分離工程は、好ましくは、０ｍＭ〜５００ｍＭの塩濃度、およびより好ましくは２５ｍＭより高くかつ２００ｍＭより低い塩濃度、最も好ましくはほぼ１００ｍＭの（例えば、８０ｍＭ〜１２０ｍＭの範囲の）塩濃度で行われる。ゲル濾過工程で使用されるゲルは、好ましくは、ほぼ１２ｋＤａ〜４０ｋＤａの分子量を有する分子を分離することが可能である。ゲルは、例えば、Ｓｅｐｈａｃｒｙｌ２００、ＳｕｐｅｒＤｅｘ７５、またはＳｕｐｅｒＤｅｘ２００である。
【００１７】
分離工程は、好ましくは、アルカリ性ｐＨで行われる。好ましくは、分離工程は、変性が生じるｐＨよりも１低いｐＨで行われる。例えば、この工程は、通常ｐＨ８〜ｐＨ９の間で行われ得る。最も好ましくは、濾過工程は、約ｐＨ８．５で行われる。ＴｒｋＡの場合に意外にも、ＴｒｋＡＩｇ２は、計算に使用したプログラムによると４．６〜６．０の計算値Ｐｉを有する。
【００１８】
ＴｒｋＡＩｇ２は高レベルのβシートを有し、そしてこのようなタンパク質はほとんどがそのｐＩ近辺で凝集して沈殿する。しかしながら、ＴｒｋＡＩｇ２に関しては、生理的ｐＨ近辺のｐＨ、及びそのｐＩから顕著に異なる濃度で、かつ通常このようなタンパク質を溶液に維持しうるような塩濃度で、沈殿かつ凝集する。
【００１９】
好適な配列において、ポリペプチドは、約２．５ｍｌ／分の流速でゲル濾過工程から溶出し、そして単量体は、約９３分後に回収される（collect）。しかしながら、これは装置およびそれが操作される条件に従って変化するだろう。好ましくは、ポリペプチドは、細菌ベースの発現系で生産される。
【００２０】
本発明の好適な態様に従って、細菌発現系の封入体から組換えＴｒｋＡＩｇ２またはＴｒｋＡＩｇ２．６を精製する方法が提供され、ここで単量体ＴｒｋＡＩｇ２は、ゲル濾過工程により単量体ＴｒｋＡＩｇ２および多量体ＴｒｋＡＩｇ２を含む混合物から分離され、そして生物活性型にリフォールディングさせられる。通常、多量体ＴｒｋＡＩｇ２は二量体ＴｒｋＡＩｇ２を含む。
【００２１】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、２０％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体、より好ましくは１％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体、最も好ましくは０．１％未満のＴｒｋＡＩｇ２二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＡＩｇ２の安定な調製物を提供する。
【００２２】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、８０％より多くのＴｒｋＡＩｇ２単量体、より好ましくは９９％より多くのＴｒｋＡＩｇ２単量体、最も好ましくは１００％のＴｒｋＡＩｇ２単量体含むＴｒｋＡＩｇ２の安定な調製物を提供する。好ましくは、単量体は、実質的に全て生物学的活性型である。
【００２３】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、２０％未満のＴｒｋＡＩｇ２．６二量体または二量体凝集体、より好ましくは１％未満のＴｒｋＡＩｇ
２．６二量体または二量体凝集体、最も好ましくは０．１％未満のＴｒｋＡＩｇ２．６二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＡＩｇ２．６の調製物を提供する。
【００２４】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、８０％より多くのＴｒｋＡＩｇ２．６単量体、より好ましくは９９％より多くのＴｒｋＡＩｇ２．６単量体、最も好ましくは１００％のＴｒｋＡＩｇ２．６単量体含むＴｒｋＡＩｇ２．６の安定な調製物を提供する。好ましくは、単量体は、実質的に全て生物学的活性型である。
【００２５】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、２０％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体、より好ましくは１％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体、最も好ましくは０．１％未満のＴｒｋＢＩｇ２二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＢＩｇ２の安定な調製物を提供する。
【００２６】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、８０％より多くのＴｒｋＢＩｇ２単量体、より好ましくは９９％より多くのＴｒｋＢＩｇ２単量体、最も好ましくは１００％のＴｒｋＢＩｇ２単量体含むＴｒｋＢＩｇ２の安定な調製物を提供する。好ましくは、単量体は、実質的に全て生物学的に活性型である。
【００２７】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、２０％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体、より好ましくは１％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体、最も好ましくは０．１％未満のＴｒｋＣＩｇ２二量体または二量体凝集体を含むＴｒｋＣＩｇ２の安定な調製物を提供する。
【００２８】
本発明はまた、本発明の方法により得られる、または得ることができる、８０％より多くのＴｒｋＣＩｇ２単量体、より好ましくは９９％より多くのＴｒｋＣＩｇ２単量体、最も好ましくは１００％のＴｒｋＣＩｇ２単量体含むＴｒｋＣＩｇ２の安定な調製物を提供する。好ましくは、単量体は、実質的に全て生物学的に活性型である。
【００２９】
本発明の別の態様に従って、ポリペプチドの単量体型および多量体型の混合物から、免疫グロブリン様ポリペプチド単量体を生成する方法が提供され、この方法は、組換え発現系でポリペプチドを発現すること、およびポリペプチドの多量体型からポリペプチド単量体を分離工程で分離することを含み、該分離工程は、ポリペプチドを生物学的活性型にリフォールディングさせる。したがって、本発明は、上記に記載される利点の一部または全てを有する、免疫グロブリン様ポリペプチド精製法を提供する。分離工程は、好ましくはゲル濾過を含む。
【００３０】
本発明による方法および生産物は、添付の図２〜図２２をさらに参照して、例としてのみ記載される。
【００３１】
定義：
「ポリペプチド」：タンパク質、すなわち天然に生じる全長生物活性ポリペプチドを含む。
【００３２】
「ＴｒｋＡＩｇ２」：図２Ａにおいて太字体で示されるアミノ酸配列を有するポリペプチド（バリアントＴｒｋＡＩｇ２．６をもたらす、下線の付された６個のアミノ酸残基の有無に関わらない）、ならびに相同体（例えば、配列の１または複数のアミノ酸残基の保存的置換の結果として）、またはＨｉｓタグおよび図２Ａで太字でない書体で示されるトロンビン開裂配列などの、発現および／または精製を向上させる配列を含むバリアントである。
【００３３】
「ＴｒｋＢＩｇ２」および「ＴｒｋＣＩｇ２」は、それぞれ図２Ｂおよび図２Ｃに示される配列に関して、対応する意味を有する。
【００３４】
「ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ」は、Ｈｉｓタグを含むバリアントを表し、そして「ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓ」は、Ｈｉｓタグを含まないバリアントを表す。同様な用語が、対応するＴｒｋＢおよびＴｒｋＣのバリアントならびにそれらのタンパク質に適用される。
【００３５】
［具体的な説明］
ヒスチジンタグ付ＴｒｋＩｇの生産
組換えＴｒｋＡＩｇ２  ６ＨｉｓおよびＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓポリペプチドの生産
組換えＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを、第ＷＯ９９／５３０５５号の「ＴｒｋＡＩｇ１，２、ＴｒｋＡＩｇ１、およびＴｒｋＡＩｇ２の発現」と見出しのあるセクションに記載される方法を使用して、エシェリヒア・コリＢＬ２１（ＤＥ３）細胞で生産して、図２Ａに示されるように、ポリペプチドのＮ末端に６−ヒスチジンタグを組込んだ。組換えＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓを同様な様式で調製した。
【００３６】
ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓポリペプチドの精製およびリフォールディング
回収した（harvested）細胞を、１０％グリセロールに再懸濁させ、液体窒素中−７０℃で凍結させ、そして得られるペレットを３回、ＸＰｒｅｓｓ（AB Biox）に通した。抽出物を、４℃で３０分間、１０，０００ｒｐｍで遠心分離して、組換えポリペプチドを含む不溶性封入体をペレットにした。
【００３７】
封入体を、５００ｍｌの１％（ｖ／ｖ）ＴｒｉｔｏｎＸ−１００、１０ｍＭのＴｒｉｓＨＣｌ（ｐＨ８．０）、１ｍＭのＥＤＴＡ中で、続いて５００ｍｌの１ＭのＮａＣｌ、１０ｍＭのＴｒｉｓＨＣｌ（ｐＨ８．０）、１ｍＭのＥＤＴＡ中で、そして最後に１０ｍＭのＴｒｉｓＨＣｌ（ｐＨ８．０）、１ｍＭのＥＤＴＡ中で洗浄した。
【００３８】
次いで、封入体を、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３０ｍＭのイミダゾール、８Ｍ尿素（ｐＨ７．４）に可溶化させ、そして遠心分離により清澄にした。全体を通して８Ｍ尿素の代わりに６Ｍグアニジニウム塩（Guanidinium）を使用することもできる。
【００３９】
得られる混合物を、５ｍｌのＨｉｓＴｒａｐカラム（Pharmacia）にロードし、そして５０ｍｌの、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３０ｍＭのイミダゾール、８Ｍ尿素（ｐＨ７．４）で洗浄した。精製したＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを、２５ｍｌの、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３００ｍＭのイミダゾール、８Ｍの尿素（ｐＨ７．４）で溶出させた。
【００４０】
精製した組換えＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓポリペプチドをリフォールディングさせるために、先の工程の溶出物を、さらにＳｕｐｅｒＤｅｘ２００ゲル濾過カラムにかけ、そして、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、１００ｍＭのＮａＣｌ（ｐＨ８．５）で平衡化した。カラムは、製造元によりあらかじめ包装された時点で、高さ６５ｃｍ、幅２．６ｃｍ、および体積３４５ｍｌを有した。最大圧での流速は、２．５ｍｌ／分であった。
【００４１】
いずれの凝集体（すなわち、二量体凝集体）も、ボイド容積で溶出した。二量体は約８０分後に溶出され、そして単量体は約９３分後に溶出された。タンパク質の溶出時間は、カラムの寸法に依存する可能性があり、そしてその大きさに依存する。このことは、以下の式、
Ｒ＝ＶＯ／Ｖｅ
により表され、ここで、Ｒはタンパク質の保持係数であり、Ｖｅはタンパク質が溶出する
時の体積であり、ＶＯはボイド容積であって、
この場合、Ｖｅ＝２３２．５ｍｌ、ＶＯは１２２ｍｌであるから、
１２２／２３２．５＝０．５３となり、
ＳｕｐｅｒＤｅｘ２００ゲルでＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ単量体は保持係数０．５３を有する。
【００４２】
比較として、ポリペプチドを、まず、２０ｍＭのＴｒｉｓＨＣｌ、５０ｍＭのＮａＣｌ（ｐＨ８．５）に対して透析し、ＨｉｓＴｒａｐカラムに再捕獲させ、そして２５ｍｌの２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３００ｍＭのイミダゾール、８Ｍ尿素（ｐＨ７．４）で溶出させることによりフォールディングさせた。
【００４３】
Ｂｉｏｃａｄ  Ｓｐｒｉｎｔ  ＦＰＬＣ（Biocad）からの精製トレース（これは、様々な条件下でのＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの単量体、二量体、および凝集体の溶出を示す）を調製した。図３は、重ね合わせトレースを示し、透析によりリフォールディングしたＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ（「透析」）、および本発明による方法でカラムでリフォールディングしたＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ（「ＳｕｐｅｒＤｅｘ」）の溶出を比較する。本発明の方法は、先行技術のプロセスと比較してより高レベルの単量体を生産することがわかる。
【００４４】
スプライスバリアントＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓを、同様な様式で、調製および精製した。
【００４５】
ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの溶出におけるｐＨの影響
ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを、上記で記載されるとおりエシェリヒア・コリで発現させた。精製した封入体を、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３０ｍＭのイミダゾール、８Ｍ尿素（ｐＨ７．４）に可溶化させて、遠心分離により清澄にした。得られる変異体を、ＨｉｓＴｒａｐカラムでアフィニティー精製し、そして２５ｍｌの２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３００ｍＭのイミダゾール、８Ｍの尿素（ｐＨ７．４）で溶出させた。溶出したＴｒｋＡＩｇ２  ６ＨｉｓをＳｕｐｅｒＤｅｘ２００ゲル濾過カラム（Pharmacia）にかけ、そして２０ｍＭのリン酸ナトリウム、１００ｍＭのＮａＣｌ（ｐＨ８．５）で平衡化した。溶出速度は、２．５ｍｌ／分であった。溶出に要する時間は、タンパク質の大きさにより決定される。単量体、二量体、および凝集体のピークは、それぞれ、約９３分、８０分、および５０分に示された。結果は図４に示され、これはｐＨ７．４、ｐＨ８．０、ｐＨ８．５、およびｐＨ９．０での溶出結果を示す。示された結果より、ｐＨ８．５において、最大収率、最小量の凝集体、および最大レベルの単量体であり、最良であったことがわかる。
【００４６】
比較実施例：透析によりリフォールディングされたＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ単量体、二量体、および凝集体の分離。透析緩衝液の必要量。ＳｕｐｅｒＤｅｘ２００からの溶出に続く分析。
ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを、エシェリヒア・コリで発現させた。精製した封入体を、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３０ｍＭのイミダゾール、８Ｍの尿素（ｐＨ７．４）に可溶化させて、遠心分離により清澄にした。溶液を、ＨｉｓＴｒａｐカラムでアフィニティー精製し、そして２５ｍｌの２０ｍＭのリン酸ナトリウム、３００ｍＭのイミダゾール、８Ｍの尿素（ｐＨ７．４）で溶出させた。ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを、２０ｍＭのＴｒｉｓＨＣｌ、５０ｍＭのＮａＣｌ（ｐＨ８．５）に対して一晩透析（１リットル、２リットル、または４リットル使用）することでフォールディングさせ、ＨｉｓＴｒａｐカラムに再捕獲させ、そして２５ｍｌの２０ｍＭのリン酸ナトリウム、５０ｍＭのＥＤＴＡ、８Ｍの尿素（ｐＨ７．４）で溶出させた。最終分析は、２０ｍＭのリン酸ナトリウム、１００ｍＭのＮａＣｌ（ｐＨ８．５）で平衡化したＳｕｐｅｒＤｅｘ２００ゲル濾過カラムを
使用した。溶出速度は２．５ｍｌ／分であった。洗浄に２〜４リットル必要であった。４リットルを用いた場合に最高収率で単量体が得られた。このことは、発現したポリペプチドのリフォールディングに透析が使用される場合に、どれだけ大量の緩衝液が必要になるかを示す。
【００４７】
結果を図５に示す。
【００４８】
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ６ＨｉｓおよびＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓの特性決定
発現したＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ（Ａ）、およびＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓ（Ｂ）ポリペプチドをＭＡＬＤＩＴＯＦ質量分析した、結果を図６に示す。ポリペプチドの分子質量を、ＰＥ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ  Ｖｏｙａｇｅｒ−ＤＥ  ＳＴＲ  マトリックス支援レーザ脱離イオン化タンデム飛行時間型（Matrix-Assisted Laser Desorption Time-of-Flight）（ＭＡＬＤＩＴＯＦ）質量分析装置を使用して、３３７ｎｍで作動する窒素レーザーで求めた。マトリクス溶液は、アセトニトリルと０．１％トリフルオロ酢酸との５０：５０混合物中１ｍｇ／１００μｌの濃度で新たに調製したシナピン酸であった。０．５μｌの試料およびマトリクスを試料板上にスポットした。試料を、近接外部標準として機能するＣａｌｍｉｘ３（PE Biosystems）に対してキャリブレーションした。スペクトルは、２５，０００Ｖの加速電圧、７５０ナノ秒の抽出時間、および２７００のレーザー強度での線形条件下において、５０００Ｄａ〜８０，０００Ｄａの範囲にわたり得られた。
【００４９】
ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの分子量は、１５，７１７．９６Ｄａであることがわかった。これは、理論計算により予測される分子量とほぼ一致する（Ｎ−末端メチオニン（本発明者らは、これが発現ベクターｐＥＴ１５Ｂからの６ヒスチジンタグを組込んだタンパク質で除去されることを先に見いだしている）を失った後で１５７１６．３Ｄａ）。
【００５０】
ＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓの分子量は、１６，５７５．３Ｄａであることが見いだされた。これは、理論計算により予測される分子量とほぼ一致する（１６，５７４．４Ｄａ）。
【００５１】
安定性
上記で記載されるとおりに生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ６ＨｉｓおよびＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓは、３か月間４℃に維持された場合に安定であり続け、かつその生物活性を保持した。
【００５２】
安定性の改善は、従来の添加物（グリセロールなど）を使用することで達成され得る。
【００５３】
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの生物活性
ｉ  モルモット後肢の痛み応答
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの生物活性を、モルモットで検査した（Djouhri, L. 等(2001) J Neuroscience 21 p8722-8733）。ＣＦＡ（完全フロイントアジュバント）を、モルモットの後肢および膝に注射した。これは、ＮＧＦレベルを増加させ、炎症を引き起こす。これにより、動物は痛みをより敏感に感じるようになる。細胞内記録を、ガラス微小電極を用いてＬ６（腰椎）、およびＳｌ（仙椎）ＤＲＧニューロンの細胞体から作製し、そして１対の白金電極でＤＲＧを刺激することにより活動電位を誘発した。ＣＦＡ投与の１日、２日、および４日後に記録を行った。Ｃ線維およびＡδ線維は侵害受容性であり、すなわちそれらは痛み信号を脳へ伝達する。α線維およびβ線維は、伝達しない。外部刺激を受けることなく侵害受容性ニューロンが自発的に発火（firing）することは、ヒトの炎症および神経因性疼痛の原因であると思われる。
【００５４】
ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ（０．４５μｇ）を、２日目、３日目、および４日目にモルモットの後肢および膝に注射した。ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ（これは内因性ＮＧＦを隔離する）を添加することで、追従頻度（following frequency）および自発的な発火（firing）でＣＦＡにより誘導された増大は解消された。これは、異常な痛みが完全に停止したことを意味した。
【００５５】
したがって、ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓは、モルモットにおいてＣＦＡ誘導痛覚線維発火に応答した痛みを阻害することができた。
【００５６】
ｉｉ  ＰＣ１２細胞バイオアッセイ
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの生物活性を、ＰＣ１２神経突起伸長バイオアッセイにより検査した。ＰＣ１２細胞は、ラットクロム親和性細胞腫の細胞株であり、細胞表面に存在する受容体に結合するＮＧＦの存在に応答して神経突起を生じる。ＰＣ１２細胞を、コラーゲン被覆２４ウェルプレート上の完全ＤＭＥＭ培地（１００単位／ｍｌペニシリン、１００μｇ／ｍｌストレプトマイシン、１０％ウマ血清、１０％ウシ胎児血清（ＦＣＳ）、および２ｍＭのグルタミンを含む）に、１ウェル当たり２×１０４個の細胞を播種した。ＮＧＦを１ｎｇ／ｍｌ添加し、そしてＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを種々の濃度で添加した。結果を、図１１の４８時間後の神経突起伸長の写真に示す。撮影前に細胞を固定した。図１１Ａは、１ｎｇ／ｍｌのＮＧＦでの神経突起伸長を示し、図１１Ｂは、１．２５μｍのＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓが添加された場合には神経突起伸長がないことを示す。
【００５７】
したがって、ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓは、ＰＣ１２細胞株でＮＧＦに応答した神経突起伸長を阻止することができた。
【００５８】
ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓドメインのサブクローニング
ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質は、成熟タンパク質の残基２８６〜４３０を含み、そしてＮＨ２末端でさらに２１残基を有し、これはヒスチジン発現タグおよび付随するトロンビン開裂配列を構成する。ＴｒｋＢＩｇ２  ６ＨｉｓドメインをコードするｃＤＮＡを、λＺＡＰ−ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔｌｌＳＫ（−）／ＴｒｋＢ、本発明者らによりクローニングされたヒトＴｒｋＢの非触媒型（Allen et al (1994) Neuroscience 60 p825-834）からＰＣＲ増幅した。プライマー（MWG Biotech）には、フォワードプライマー（ＣＧＣＡＴＡＴＧＧＣＡＣＣＡＡＣＴＡＴＣＡＣＡＴＴＴＣＴＣＧＡＡＴＣＴＣ）にＮｄｅｌ部位を、および、リバースプライマー（ＧＣＧＧＡＴＣＣＣＴＡＴＴＡＡＴＧＲＲＣＣＣＧＡＣＣＧＧＴＴＴＴＡＴＣ）にＢａｍＨＩ部位を組込んだ。
【００５９】
Ｎｄｅｌ部位およびＢａｍＨＩ部位を使用して、ＰＣＲ産物をｐＥＴ１５ｂ（Novagen）中にサブクローニングして、発現ベクターｐＥＴ１５ｂ−ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓを作製した。
【００６０】
図２Ｂに示されるＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓの切断型もまた、アミノ酸２８６〜３８３を使用すること以外は全く同じ方法で生産された。この型は、そのリガンドＮＴ４と共晶を形成し（co-crystallised）、Ｘ線結晶構造解析された。
【００６１】
組換えＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓポリペプチドの生産
エレクトロコンピテント（Electro-competent）エシェリヒア・コリＢＬ２１（ＤＥ３）細胞をｐＥＴ１５ｂ−ＴｒｋＢＩｇ２で形質転換し、そしてｐＥＴ（Novagen）の説明書に従って発現させた。形質転換後、エシェリヒア・コリ細胞溶解物を、１８．５ｋＤａのタンパク質の発現についてＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉ
ｓタンパク質は、尿素溶解性フラクションでは高レベルで発現したが、他のフラクションでは発現しなかった。２ｍｌの２ＹＴブロス（２００μｇ／ｍｌのアンピシリン含有）にコロニーを接種して、３７℃で中間対数期まで増殖させた。これを、５０ｍｌの２ＹＴブロス（２００μｇ／ｍｌのアンピシリン含有）を接種するのに使用して、３７℃で中間対数期まで増殖させた。これを、５リットルの２ＹＴブロス（２００μｇ／ｍｌのアンピシリン含有）を接種するのに使用して、６００ｎｍで１．０の光学濃度に増殖させた。１ｍＭのＩＰＴＧを添加してタンパク質発現を誘導し、そして細胞を３７℃で一晩増殖させた。回収した細胞を１０％のグリセロールに再懸濁させ、そして−８０℃で凍結させた（８個のペレット）。Ｘｐｒｅｓｓに３回通してペレットを溶解させ、次いで、連続して、０．１ＭのＮａＣｌ、１％のＴｒｉｔｏｎＸ−１００、および最後に１ＭのＮａＣｌを含む２０ｍＭのリン酸ナトリウム緩衝液（ｐＨ８．５）で洗浄した。これにより、全ての可溶性物質が除去され、不溶性タンパク質を含む封入体が残った。
【００６２】
ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓポリペプチドのリフォールディング
封入体に含まれる不溶性ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質を、Ｘｐｒｅｓｓで細胞から放出させ、さらに洗浄して可溶性物質を除去した。精製した封入体を、「完全」プロテイナーゼ・インヒビター・カクテル錠剤（Roche）で、８Ｍ尿素緩衝液（２０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ８．５）、１ｍＭのβ−メルカプトエタノール）に可溶化し、そして穏やかに振盪させながら、室温で２時間インキュベートした。８Ｍ尿素を６Ｍグアニジニウム塩で置換してもよい。ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質を、還元（reducing）条件下（２０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ８．５）、８Ｍ尿素、１０ｍＭのイミダゾール）、ＨｉｓＴｒａｐニッケルカラム（Pharmacia）で精製し、そして３００ｍＭのイミダゾールを使用して溶出させた。リフォールディングは、ＳｕｐｅｒＤｅｘ２００ゲル濾過カラム（Pharmacia）上の非還元（non-reducing）条件下（２０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ８．５）、１００ｍＭのＮａＣｌ）で起こった。約１８．５ｋＤａの分子量に対応するピークからのフラクションをプールした。これらはＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓ単量体を含んでいた。
【００６３】
本発明の方法により生産されたＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓの特性決定
ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓの分子質量を、ＰＥ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ  Ｖｏｙａｇｅｒ−ＤＥ  ＳＴＲ  ＭＡＬＤＩＴＯＦ質量分析装置を使用して、３３７ｎｍで作動する窒素レーザーで求めた。マトリクス溶液は、アセトニトリルと０．１％トリフルオロ酢酸との５０：５０混合物中１ｍｇ／１００μｌの濃度で新たに調製したシナピン酸であった。０．５μｌの試料およびマトリクスを試料板上にスポットした。試料を、近接外部標準として機能するＣａｌｍｉｘ３（ＰＥ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）に対してキャリブレーションした。スペクトルは、２５，０００Ｖの加速電圧、７５０ナノ秒の抽出時間、および２７００のレーザー強度を用いる線形条件下で、５０００Ｄａ〜８０，０００Ｄａの範囲にわたり得られた。結果を図１０に示す。
【００６４】
ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓの分子量は、１８，４５１．７Ｄａであることがわかった。これは、理論計算により予測される分子量とほぼ一致する（１８，４４９．１Ｄａ）。
【００６５】
組換えＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓドメインのサブクローニング
ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質は、成熟タンパク質の残基３００〜３９９を含み、そしてＮＨ２末端でさらに２１残基を有し、これはヒスチジン発現タグおよび付随するトロンビン開裂配列を構成する。ＴｒｋＣＩｇ２  ６ＨｉｓドメインをコードするｃＤＮＡを、Ｎｄｅｌ部位を組込まれたフォワードプライマー（ＣＧＣＡＴＡＴＧＡＣＴＧＴＣＴＡＣＴＡＴＣＣＣＣＣＡＣ）およびＢａｍＨｌ部位を組込まれたリバースプライマー（ＧＣＧＧＡＴＣＣＴＴＡＴＣＡＧＧＧＣＴＣＣＴＴＧＡＧＧＡＡＧＴＧＧＣ）を使用して、ＰＣＲ増幅した。ＰＣＲ産物を、ＮｄｅｌおよびＢａｍＨｌ制限部位を使用して、ｐＥ
Ｔ１５ｂ（Novagen）にサブクローニングして発現ベクターｐＥＴ１５ｂ−ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓを作製した。
【００６６】
組換えＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓポリペプチドの生産
エレクトロコンピテント  エシェリヒア・コリＢＬ２１（ＤＥ３）細胞をｐＥＴ１５ｂ−ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓで形質転換し、そしてｐＥＴ（Novagen）説明書に従って発現させた。形質転換後、エシェリヒア・コリ細胞溶解物を、１３．８ｋＤａのタンパク質の発現についてＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質は、尿素溶解性フラクションでは高レベルで発現したが、他のフラクションでは発現しなかった。２ｍｌの２ＹＴブロス（２００μｇ／ｍｌのアンピシリン含有）にコロニーを接種して、３７℃で中間対数期まで増殖させた。これを、５０ｍｌの２ＹＴブロス（２００μｇ／ｍｌのアンピシリン含有）を接種するのに使用して、３７℃で中間対数期まで増殖させた。これを、５リットルの２ＹＴブロス（２００μｇ／ｍｌのアンピシリン含有）を接種するのに使用して、６００ｎｍで１．０の光学濃度に増殖させた。１ｍＭのＩＰＴＧを添加してタンパク質発現を誘導し、さらに細胞を３７℃で一晩増殖させた。回収した細胞を１０％グリセロールに再懸濁させ、そして−８０℃で凍結させた（８個のペレット）。Ｘｐｒｅｓｓに３回通してペレットを溶解させ、次いで、連続して、０．１ＭのＮａＣｌ、１％のＴｒｉｔｏｎＸ−１００、および最後に１ＭのＮａＣｌを含む２０ｍＭのリン酸ナトリウム緩衝液（ｐＨ８．０）で洗浄した。これにより、全ての可溶性物質が除去され、不溶性タンパク質を含む封入体が残った。洗浄は全て４℃で行った。
【００６７】
ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓポリペプチドのリフォールディング
封入体に含まれる不溶性ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質を、Ｘｐｒｅｓｓで細胞から放出させ、さらに洗浄して可溶性物質を除去した。精製した封入体を、８Ｍ尿素緩衝液（２０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ８．０）、１ｍＭのβ−メルカプトエタノール）に可溶化し、そして穏やかに振盪させながら、室温で２時間インキュベートした。８Ｍ尿素を６Ｍグアニジニウム塩で置換してもよい。ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓタンパク質を、２０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ８．０）、８Ｍ尿素、１０ｍＭのイミダゾール、１ｍＭのβ−メルカプトエタノール中、ＨｉｓＴｒａｐニッケルカラム（Pharmacia）で精製し、そして３００ｍＭのイミダゾールを使用して溶出させた。リフォールディングは、ＳｕｐｅｒＤｅｘ２００ゲル濾過カラム（Pharmacia）上、２０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ８．０）、１００ｍＭのＮａＣｌ、１ｍＭのβ−メルカプトエタノール中で起こった。約１３．８ｋＤａの分子量に対応するピークからのフラクションをプールした。これらはＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓ単量体を含んでいた。ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓの保持係数は、０．５１である。
【００６８】
本発明の方法により生産されたＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓの特性決定
ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓの分子質量を、ＰＥ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ  ｖｏｙａｇｅｒ−ＤＥ  ＳＴＲ  ＭＡＬＤＩＴＯＦ質量分析装置を使用して、３３７ｎｍで作動する窒素レーザーで求めた。マトリクス溶液は、アセトニトリルと０．１％トリフルオロ酢酸との５０：５０混合物中１ｍｇ／１００μｌの濃度で新たに調製したシナピン酸であった。０．５μｌの試料およびマトリクスを試料板上にスポットした。試料を、近接外部標準として機能するＣａｌｍｉｘ３（PE Biosystems）に対してキャリブレーションした。スペクトルは、２５，０００Ｖの加速電圧、７５０ナノ秒の抽出時間、および２７００のレーザー強度を用いる線形条件下で、５０００Ｄａ〜８０，０００Ｄａの範囲にわたり得られた。結果を図１２に示す。
【００６９】
ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓの分子量は、１３，６８１．９Ｄａであることがわかった。これは、Ｎ−末端メチオニン（本発明者らは、これが発現ベクターｐＥＴ１５Ｂからの６ヒスチジンタグを組込んだタンパク質で除去されることを先に見いだしている）を失った
ことを考慮に入れて、理論計算により予測した分子量とほぼ一致する（１３，６８５．３Ｄａ）。
【００７０】
活性研究：ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ、ＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓ、ＴｒｋＢＩｇ２
６Ｈｉｓ、およびＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓの結合活性
得られた単量体組換えＴｒｋＩｇ２は、野生型受容体と同様な親和性で、それぞれの完全長受容体の天然のリガンドに結合することを示し、従って、生物活性であることが期待され得る。対照的に、鎖交換二量体ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓは、生物不活性である可能性がある。
【００７１】
Ｔｒｋｌｇ２ドメインがそれらの対応するリガンドに結合する能力を、ＢｉａＣｏｒｅシステム（BiaCore）での表面プラスモン共鳴（plasmon surface resonance）を使用して測定した。ＴｒｋＩｇ２は、アミンカップリングにより、ＣＭ５チップのマトリクスと結合した。
【００７２】
ＴｒｋＩｇの結合活性。表面プラスモン共鳴
ｉ．ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓ
ＢＤＮＦを、０．１ｎＭ〜２５ｎＭでチップに通した。会合速度および解離速度（rates）は、１：１ラングミュア結合モデルに従って評価され、７９０ｐＭのＫＤが得られた。ＮＴ−４を、１〜１００ｎＭでチップに通した。会合速度および解離速度は、１：１ラングミュア結合モデルに従って評価され、２６０ｐＭのＫＤが得られた。結果を図７に示す。図７Ａは、０．１ｎＭ、０．２ｎＭ、０．５ｎＭ、１ｎＭ、２ｎＭ、５ｎＭ、１０ｎＭ、および２５ｎＭのＢＤＮＦを用いた実験結果を示す（全て複製する）。会合および解離は、１：１ラングミュアモデルにフィッティングされて、７９０ｐＭのＫＤが得られた（Ｃｈｉ２＝４．３９）。
【００７３】
図７Ｂは、１ｎＭ、５ｎＭ、２５ｎＭ、５０ｎＭ、７５ｎＭ、および１００ｎＭのＮＴ−４を用いた実験結果を示す（全て重ねて示している）。会合および解離は、１：１ラングミュアモデルにフィッティングされて、２６０ｐＭのＫＤが得られた（Ｃｈｉ２＝２．８５）。
【００７４】
ｉｉ．ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓ
ＮＧＦを、０．１ｎＭ〜１００ｎＭでチップに通した。会合および解離速度は、１：１ラングミュア結合モデルに従って評価され、９２．６ｐＭのＫＤが得られた。結果を図８に示す。
【００７５】
ｉｉｉ．ＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓ
ＮＧＦを、０．１ｎＭ〜１００ｎＭでチップに通した。会合および解離速度は、１：１ラングミュア結合モデルに従って評価され、７９．２ｐＭのＫＤが得られた。結果を図９に示す。これは非常に高い親和性であり、生体膜結合野生型受容体の既知の特徴と一致する。
【００７６】
Djouhri, L.等（前出）は、ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓがｉｎ  ｖｉｖｏで活性であり、侵害受容性ニューロンの異常な線維発火を阻止することを示している。
【００７７】
ｉｖ．ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓ
ＮＴ−３を、０．１ｎＭ〜１００ｎＭでチップに通した。再生は、１０μｌの１０ｍＭのグリシン（ｐＨ１．５）を用いた。会合および解離速度は、１：１ラングミュア結合モデルに従って評価され、２００μｍのＫＤが得られた。結果を図１３に示す。
【００７８】
非ヒスチジンタグ付ＴｒｋＡＩｇの生産
ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓのクローニング
ヒスチジンタグを有さないＴｒｋＡＩｇ２（ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓ）を発現させるために、ＴｒｋＡＩｇ２をｐＥＴ２４ａ中にクローニングした。修飾しない場合は、これはタンパク質を発現しない。
【００７９】
ｍＲＮＡ転写物の二次構造は、ＡＵＧ翻訳開始コドンおよび／またはリボソーム結合部位に干渉し得ることが知られている。二次構造を調査するためのソフトウェア、ＭＦＯＬＤ（http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/mfold. html）を使用して、転写開始部位が発現にとって最適（ideal）ではないことがわかった。図１４は、ｐＥＴ１５ｂ中のＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓについて予測されるｍＲＮＡ構造を示す。６ＨｉｓタグをコードするｍＲＮＡに輪郭が付けられており、リボソーム結合部位（ＲＢＳ）およびプロリン残基のコドン（ＰＲＯ）も輪郭が付けられている。図１５は、ｐＥＴ２４ａ中のＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓについて予測されるｍＲＮＡ構造を示す。開始部位は６Ｈｉｓ型よりも非常に近付きにくいことがわかる。同様な制限は、ＴｒｋＢＩｇ２  ｎｏＨｉｓおよびＴｒｋＣＩｇ２  ｎｏＨｉｓについての予測構造においても生じている。
【００８０】
ｍＲＮＡ構造を予測するコンピューターソフトウェアを使用して、ＲＢＳへのアクセスを可能にするための、様々なサイレント突然変異をＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓのＤＮＡ構造に導入にした。図１６は、得られたＤＮＡ配列の例を、野生型と比較しながら示す。突然変異した塩基は、太字で記載されている。ＭＦＯＬＤにより予測されるｍＲＮＡ構造を図１７に示す。ＴｒｋＢＩｇ２  ｎｏＨｉｓに適した突然変異配列の例を図２１に示し、ＴｒｋＣＩｇ２  ｎｏＨｉｓに適した突然変異配列の例を図２２に示す。
【００８１】
ＴｒｋＡＩｇ２を、突然変異した塩基を組込んだフォワードプライマーＧＧＡＡＴＴＣＣＡＴＡＴＧＣＣＴＧＣＴＴＣＡＧＴＡＣＡＡＴＴＡＣＡＣＡＣＧＧＣＧＧＴＣ、およびリバースプライマーＣＣＧＣＴＣＧＡＧＴＴＡＴＣＡＴＴＣＧＴＣＣＴＴＣＴＴＣＴＣＣＡＣＣＧＧＧＴＣＴＣＣＡを使用して、ｐＥＴ１５ｂ−ＴｒｋＡＩｇ２  ６ＨｉｓプラスミドからＰＣＲにより増幅させた。プライマーは、ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの５'および３'に、それぞれＮｄｅｌおよびＸｈｏＩの部位を含む。１回の反応当たり、１００ｐｍｏｌ〜１０００ｐｍｏｌのプライマーを使用した。
【００８２】
サーマルサイクラーで、３０サイクルにわたるホットスタート（Hot start）ＰＣＲを行った。最初の９４℃の変性温度で１５分間後、ＰＦＵポリメラーゼを添加し、そして「９４℃で１分間の変性、６７℃で１分間のアニーリング、および７２℃で１分間の延長」を３０サイクル行った。最後の延長は、７２℃で１０分間として、続いて４℃の保持工程を行った。ＰＣＲ産物を、アガロースゲル電気泳動により分析した。ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓ変異体を、ＮｄｅｌおよびＸｈｏＩ消化ｐＥＴ２４ａにサブクローニングして発現ベクターｐＥＴ２４ａ−ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓを作製した。
【００８３】
図１８は、エシェリヒア・コリで発現したＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓのＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析を示す。（Ｍ）マーカー、（Ｗ）全細胞抽出物、（Ｓ）可溶性抽出物、（Ｉ）不溶性抽出物である。ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓは、主に不溶性フラクションで発現されていることがわかる。
【００８４】
組換えＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓポリペプチドの生産
エレクトロコンピテント  エシェリヒア・コリＢＬ２１（ＤＥ３）細胞をｐＥＴ２４ａ−ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓで形質転換し、さらにｐＥＴ（Novagen）説明書に従って発現させた。形質転換後、エシェリヒア・コリ溶解産物を、１３．５ｋＤａのタンパク質の発現についてＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓタンパク
質は、尿素溶解性フラクションでは高レベルで発現したが、他のフラクションでは発現しなかった。２ｍｌの２ＹＴブロス（５０μｇ／ｍｌのカナマイシン含有）にコロニーを接種して、３７℃で中間対数期まで増殖させた。これを、５０ｍｌの２ＹＴブロス（５０μｇ／ｍｌのカナマイシン含有）を接種するのに使用して、３７℃で中間対数期まで増殖させた。これを、５リットルの２ＹＴブロス（５０μｇ／ｍｌのカナマイシン含有）を接種するのに使用して、６００ｎｍで１．０の光学濃度に増殖させた。１ｍＭのＩＰＴＧを添加してタンパク質発現を誘導し、そして細胞を３７℃で３時間増殖させた。回収した細胞を１０％グリセロールに再懸濁させ、そして−８０℃で凍結させた（８個のペレット）。
【００８５】
封入体調製
圧縮した（pressed）細胞を、２０ｍＭのＴｒｉｓ緩衝液（ｐＨ８．５）、１ｍＭのＰＭＳＦ、１０ｍＭのＥＤＴＡに混合し、穏やかにピペットで取り、そして２０ｍＭのＴｒｉｓ緩衝液（ｐＨ８．５）を添加した。これを９０００ｒｐｍで６０分間遠心分離し、そして上清を除去した。２０ｍＭのＴｒｉｓ緩衝液（ｐＨ８．５）、１ｍＭのＰＭＳＦ、１０ｍＭのＥＤＴＡ、および１ＭのＮａＣｌでこの手順を繰り返し、次いで１％のＴｒｉｔｏｎＸ−１００を添加した。次いで、２０ｍＭのＴｒｉｓ緩衝液（ｐＨ８．５）、１ｍＭのＰＭＳＦ、１０ｍＭのＥＤＴＡで最後の洗浄を行った。続いてこれを９０００ｒｐｍで３０分間遠心分離した。上清を除去した。洗浄は全て４℃で行った。封入体を−７０℃で凍結した。
【００８６】
封入体を、２５ｍＭのＤＴＴを添加した２０ｍＭのＴｒｉｓ緩衝液（ｐＨ８．５）中８Ｍ尿素に、１４℃で３時間かけて可溶化させた。
【００８７】
ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓポリペプチドのリフォールディング
封入体に含まれる不溶性ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓタンパク質を、Ｘｐｒｅｓｓで細胞から放出させ、さらに塩およびＴｒｉｔｏｎＸ１００で洗浄して、可溶性物質を除去した。精製した封入体を、８Ｍ尿素緩衝液（２０ｍＭのＴｒｉｓ（ｐＨ８．５）、２５ｍＭのＤＴＴ）に可溶化し、そして穏やかに振盪させながら、室温で３時間インキュベートした。
【００８８】
Ｑ  Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ  Ｆａｓｔ  Ｆｌｏｗ（Pharmacia）などのアニオン交換カラムを使用して、１０ｍＭのＤＴＴを添加した８Ｍ尿素（ｐＨ８．５）で平衡化および移動させて、精製を行った。タンパク質はＮａＣｌの勾配で溶出させ、ここでタンパク質は、約１８０ｍＭのＮａＣｌで、または２００ｍＭのＮａＣｌの段階で溶出した。溶出したタンパク質を、ゲル濾過カラム上、１００ｍＭのＮＡＣＩを含むＴｒｉｓ（ｐＨ８．５）中、１ｍｇ／ｍｌでリフォールディングさせた。
【００８９】
ゲル濾過でのリフォールディングは、様々なゲル濾過媒体（ＳｕｐｅｒＤｅｘ２００、ＳｕｐｅｒＤｅｘ７５、ＳｅｐｈａｃｒｙｌＨＲ１００、およびＳｅｐｈａｃｒｙｌＨＲ２００）で成功した。この系において、ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓは、０．５５の保持係数で移動した。予想外なことに、ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓは同条件下のＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓと比較して、予測よりも少し速く移動した。可溶化を延長させると、単量体型の増加が観察された。さらに、単量体ピークは、最終的にＰｏｒｏｓＱカラムにかけることでタンパク質濃度を濃縮させ得る。
【００９０】
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの特性決定
ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの分子質量を、ＰＥ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ  Ｖｏｙａｇｅｒ−ＤＥ  ＳＴＲ  ＭＡＬＤＩＴＯＦ質量分析装置を使用して、３３７ｎｍで作動する窒素レーザーで求めた。マトリクス溶液は、アセトニトリルと０．１％トリフルオロ酢酸との５０：５０混合物中１００ｍｇ／１００μｌの濃度で新たに調製したシナピン酸とし
た。０．５μｌの試料およびマトリクスを試料板上にスポットした。試料を、近接外部標準として機能するＣａｌｍｉｘ３（PE Biosystems）に対してキャリブレーションした。スペクトルは、２５，０００Ｖの加速電圧、７５０ナノ秒の抽出時間、および２７００のレーザー強度を用いる線形条件下、５０００Ｄａ〜８０，０００Ｄａの範囲にわたり得られた。結果を図１９に示す。
【００９１】
ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの分子量は、１３，５６１．２Ｄａであることがわかった。これは、理論計算により予測される分子量とほぼ一致する（１３，５５３Ｄａ）。
【００９２】
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの生物活性：ＰＣ１２細胞バイオアッセイ
本発明の方法により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの生物活性を、ＰＣ１２神経突起伸長バイオアッセイにより検査した。コラーゲン被覆２４ウェルプレート上の完全ＤＭＥＭ培地（１００単位／ｍｌペニシリン、１００μｇ／ｍｌストレプトマイシン、１０％ウマ血清、１０％ウシ胎児血清（ＦＣＳ）、および２ｍＭのグルタミンを含む）に、１ウェル当たり２×１０４個のＰＣ１２細胞を播種した。ＮＧＦを１ｎｇ／ｍｌ添加し、そしてＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓを様々な濃度で添加した。
【００９３】
ＳｕｐｅｒＤｅｘ２００カラムでリフォールディングしたＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓを使用した実験結果を、図２０に示す。写真は、４８時間後の神経突起伸長を示す。撮影前に細胞を固定した。図２０Ａは、１ｎｇ／ｍｌのＮＧＦを用いた場合の神経突起伸長を示す。図２０Ｂは、ＮＧＦが添加されない場合に神経突起伸長がないことを示す。図２０Ｃは、２．５μｍのＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓが添加された場合に神経突起伸長が減少することを示す。図２０Ｄは、４．５μｍのＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓが添加された場合に神経突起伸長がないことを示す。
【００９４】
同様の結果が、ＳｕｐｅｒＤｅｘ７５、ＳｅｐｈａｃｒｙｌＨＲ１００、およびＳｅｐｈａｃｒｙｌＨＲ２００カラムでリフォールディングしたＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓを使用して得られた。
【００９５】
したがって、ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓは、ＰＣ１２細胞株でＮＧＦに応答する神経突起延長を阻止することができた。
【図面の簡単な説明】
【００９６】
【図１】２つのＴｒｋＡＩｇ２単量体から成る鎖交換二量体を示す。
【図２】（Ａ）ＴｒｋＡＩｇ２およびＴｒｋＡＩｇ２．６、（Ｂ）ＴｒｋＢＩｇ２切断型および全長型（太字体で；ｐＥＴ１５ｂ配列（ＭＧＳＳＨＨＨＨＨＨ  ＳＳＧＬＶＰＲＧＳＨＭ）は太字体でない）、ならびに（Ｃ）ＴｒｋＣＩｇ２切断型および全長型（太字体で；ｐＥＴ１５ｂ配列（ＭＧＳＳＨＨＨＨＨＨ  ＳＳＧＬＶＰＲＧＳＨＭ）は太字体でない）のアミノ酸配列を示す。
【図３】ＦＰＬＣ装置からのトレースの重ね合わせであり、先行技術の透析法と本発明の方法との比較実験を図示する。
【図４】一連のトレースであり、ｐＨが変更された実験の結果を図示する。
【図５】一連のトレースであり、透析緩衝液の容量での比較実験を図示する。
【図６】本発明により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ６ＨｉｓおよびＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓに関する質量分析の結果を示す。
【図７】ＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓについての、Ａ：ＢＤＮＦ、およびＢ：ＮＴ４との結合活性研究の結果を図示する。
【図８】ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓに関するＮＧＦとの結合活性研究の結果を図示する。
【図９】ＴｒｋＡＩｇ２．６  ６Ｈｉｓに関するＮＧＦとの結合活性研究の結果を図示する。
【図１０】本発明により生産されたＴｒｋＢＩｇ２  ６Ｈｉｓに関する質量分析の結果を示す。
【図１１】ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓを使用したＰＣ１２細胞神経突起伸長バイオアッセイの結果を示す。
【図１２】本発明により生産されたＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓに関する質量分析の結果を示す。
【図１３】ＴｒｋＣＩｇ２  ６Ｈｉｓに関するＮＴ−３との結合活性研究の結果を図示する。
【図１４】ＴｒｋＡＩｇ２  ６Ｈｉｓの予測ｍＲＮＡ構造を図示する。
【図１５】ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの予測ｍＲＮＡ構造を図示する。
【図１６】ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓの発現を促進するために必要とされる突然変異の例を示す。
【図１７】図１６に示される変異体の配列の予測ｍＲＮＡ構造を図示する。
【図１８】図１６に示されるｐＥＴ２４ａ−ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓ変異体の配列を発現するエシェリヒア・コリからの細胞抽出物を示している、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルを示す。
【図１９】本発明により生産されたＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓに関する質量分析の結果を示す。
【図２０】ＴｒｋＡＩｇ２  ｎｏＨｉｓを使用したＰＣ１２細胞神経突起伸長バイオアッセイの結果を示す。
【図２１】ＴｒｋＢＩｇ２  ｎｏＨｉｓの発現を促進するのに必要とされる突然変異の例を示す。
【図２２】ＴｒｋＣＩｇ２  ｎｏＨｉｓの発現を促進するのに必要とされる突然変異の例を示す。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【国際調査報告】
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2005514914.tif 000025
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