(57)【要約】本発明は、血液障害の診断および処置のための方法に関する。特に本発明は、血液障害の感覚に関連する組織において、正常状態、または非血液障害疾患状態における発現と比較して、および／または血液障害に適切な操作に対する応答において、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子および１３２４９遺伝子の差次的な発現を同定する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
血液障害を処置することが可能な化合物を同定する方法であって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸発現あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチド活性を調節する該化合物の能力を評価する工程を包含し、それによって、血液障害を処置することが可能な化合物を同定する、方法。
【請求項２】
造血を調節することが可能な化合物を同定する方法であって、以下の工程：
ａ）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を発現する細胞を試験化合物と接触させる工程：および
ｂ）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸発現あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチド活性を調節する該試験化合物の能力を評価し、それによって、造血を調節することが可能な化合物を同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項３】
細胞における造血を調節する方法であって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子と細胞とを接触する工程を包含し、それによって、該細胞における造血を調節する、方法。
【請求項４】
請求項２に記載の方法であって、ここで、前記細胞が造血細胞である、方法。
【請求項５】
請求項３に記載の方法であって、ここで前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子が、有機低分子、ペプチド、抗体またはアンチセンス核酸分子である、方法。
【請求項６】
請求項３に記載の方法であって、ここで前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチド活性を調節することが可能である、方法。
【請求項７】
請求項６に記載の方法であって、ここで前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子は、有機低分子、ペプチド、抗体またはアンチセンス核酸分子である、方法。
【請求項８】
請求項６に記載の方法であって、ここで前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸発現を調節することが可能である、方法。
【請求項９】
異常な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチド活性あるいは異常な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸発現によって特徴付けられる血液障害を有する被験体を処置する方法であって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子を該被験体に投与する工程を包含し、それによって、血液障害を有する該被験体を処置する、方法。
【請求項１０】
請求項９に記載の方法であって、ここで前記血液障害は、癌に対する骨髄照射または化学的療法処置の結果生じる障害、悪性貧血、出血性貧血、溶血性貧血、再生不良性貧血、鎌状赤血球性貧血、鉄芽球性貧血、マラリア、トリパノソーマ症、ＨＩＶ、肝炎ウイルスまたは他のウイルスのような慢性感染に関連する貧血、骨髄不全によって引き起こされる骨髄障害性貧血、貧血の結果生じる腎不全、貧血、赤血球増加症、伝染性単核球症（ＩＭ）、急性非リンパ性白血病（ＡＮＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性前骨髄性白血病（ＡＰＬ）、急性骨髄単球性白血病（ＡＭＭｏＬ）、真性赤血球増加症、リンパ腫、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病、ウィルムス腫、ユーイング肉腫、網膜芽細胞腫、血友病、血栓症の増加した危険に関連する障害、疱疹、サラセミア、輸血反応および赤芽球症のような抗体媒介障害、細血管異常性溶血性貧血のような赤血球に対する機械的外傷、血栓性血小板減少性紫斑病および汎発性血管内凝固症候群、プラスモディウム属のような寄生生物による感染、化学的損傷（例えば、鉛中毒からの化学的損傷）、および脾機能亢進からなる群から選択される、方法。
【請求項１１】
請求項９に記載の方法であって、ここで、前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子が、薬学的に受容可能な処方物において投与される、方法。
【請求項１２】
請求項９に記載の方法であって、ここで前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子が、有機低分子、ペプチド、抗体またはアンチセンス核酸分子である、方法。
【請求項１３】
請求項９に記載の方法であって、ここで前記１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の調節因子が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチド活性を調節することが可能である、方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願）
本願は、米国仮特許出願番号６０／３５４，３３３（２００２年２月４日出願）、米国仮特許出願番号６０／３６０，２５８（２００２年２月２８日出願）、米国仮特許出願番号６０／３６４，４７６（２００２年３月１５日出願）、米国仮特許出願番号６０／３７５，６２６（２００２年４月２６日出願）、米国仮特許出願番号６０／３８６，４９４（２００２年６月６日出願）、米国仮特許出願番号６０／３９０，９６５（２００２年６月２４日出願）、米国仮特許出願番号６０／３９２，４８０（２００２年６月２８日出願）、米国仮特許出願番号６０／３９４，１２８（２００２年７月３日出願）、米国仮特許出願番号６０／３９９，７８３（２００２年７月３１日出願）、米国仮特許出願番号６０／４０３，２２１（２００２年８月１３日出願）、米国仮特許出願番号６０／４０７，０４５（２００２年８月３０日出願）、米国仮特許出願番号６０／４２９，０４８（２００２年１１月２５日出願）の利益を主張する。これらの仮特許出願の全体の内容は、本明細書中で参考として援用される。
【背景技術】
【０００２】
骨髄発達の調節に関与する標的は、第１に、骨髄不全および骨髄機能不全、第２に毒性障害（ｔｏｘｉｃ  ｉｎｓｕｌｔ）（最も明白な化学治療誘導性血球減少症）の処置のための新規の治療アプローチを提供する。重篤なまだ対処されていないこの領域において必要な医療が存在し、現在利用可能なわずかな治療は組換えタンパク質であり、この組換えタンパク質は、系統分化の比較的後期で作用する。
【０００３】
造血（ｈｅｍａｔｏｐｏｅｔｉｃ）幹細胞が富化されたヒト起源およびマウス起源の骨髄集団ならびに骨髄ストローマ細胞集団は、前駆体集団の増殖および成熟に関与する遺伝子発見および標的に注釈のための物質の有用な供給源を提供する。種々の境遇下で培養され、インビボでヒトからか、またはインビボで動物モデルから単離された造血細胞は、血液障害に有用な新規な治療剤の同定をもたらす遺伝子発現分析のための原料物質の豊富な供給源を提供する。
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
（発明の詳細な説明）
本発明は、血液障害を有する患者の診断および処置のための方法および組成物を提供する。
【０００５】
本明細書中で使用される場合、「処置」は、疾患または障害、少なくとも１つの疾患または障害の症状あるいは疾患または障害に向かう素因を治癒（ｃｕｒｉｎｇ）する、治癒（ｈｅａｌｉｎｇ）する、緩和する、軽減（ｒｅｌｉｅｖｅ）する、変化させる、軽減（ｒｅｍｅｄｙ）する、回復する、改善するまたは影響する目的で、患者への治療剤の適用または投与、あるいは患者から単離された組織または細胞株への治療剤の適用または投与として規定され、患者は、疾患または障害、疾患または障害の症状あるいは疾患または障害に向かう素因を有する。治療剤としては、低分子、ペプチド、抗体、リボザイム、およびアンチセンスオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書中で使用される場合、治療剤はまた、調節因子としても知られる。代表的な分子は、本明細書中に記載される。
【０００６】
本明細書中で使用される場合、血液障害としては、赤血球関連障害が挙げられるが、これに限定されない。本明細書中で使用される場合、用語「赤血球関連障害」は、異常な（増大したかまたは欠損した）赤芽球増殖（例えば、赤白血病）および異常な（増大したかまたは欠損した）赤芽球分化（例えば、貧血）を含む障害を含む。赤血球関連障害としては、以下が挙げられる：貧血（例えば、薬物（化学療法）誘導性貧血、遺伝的な細胞膜異常に起因する溶血性貧血（例えば、遺伝性球状赤血球症、遺伝性楕円赤血球症および遺伝性熱変形赤血球症）；後天的な細胞膜欠損に起因する溶血性貧血（例えば、発作性夜間血色素尿症および有棘細胞貧血）；抗体反応によって引き起こされる溶血性貧血（例えば、ＲＢＣ抗原に対する抗体、またはＡＢＯ系、Ｌｅｗｉｓ系、Ｉｉ系、Ｒｈ系、Ｋｉｄｄ系、Ｄｕｆｆｙ系およびＫｅｌｌ系の抗原に対する抗体）；メトヘモグロビン血症；赤血球生成の不全（例えば、再生不良性貧血、赤芽球癆、骨髄異形成症候群、鉄芽球性貧血および先天性異常赤血球生成貧血の結果としてのもの）；非溶血性障害における二次的貧血（例えば、化学療法、アルコール中毒症または肝臓疾患の結果としてのもの）；慢性疾患の貧血（例えば、慢性腎不全）；ならびに内分泌欠損疾患。
【０００７】
本発明のポリペプチドまたは核酸の活性または発現を調節する薬剤を使用して、貧血、特に、薬物誘導性貧血または癌化学療法、慢性腎不全、悪性疾患、成人性または若年性の慢性関節リウマチ、ヘモグロビン合成の障害、早熟およびＨＩＶ感染のジドブジン処置に関連する貧血を処置し得る。処置を受ける被験体は、さらに二次薬剤（例えば、エリスロポイエチン）でさらなる少なくとも１つの状態の症状まで処置され得る。処置のオーダーは、逆にされ得る。この２つの処置は、同時に投与され得る。処置の間のタイミングは、変化され得る。
【０００８】
本明細書中で使用される場合、用語「エリスロポイエチン」または「ＥＰＯ」は、腎臓において生産される糖タンパク質をいい、これは、赤血球生成（赤血球生成：ｅｒｙｔｈｒｏｇｅｎｅｓｉｓ）を刺激するのに責任がある主要なホルモンである。ＥＰＯは、骨髄における拘束された（ｃｏｍｍｉｔｔｅｄ）赤血球先祖の分裂および分化を刺激する。正常な血漿エリスロポイエチンレベルは、０．０１〜０．０３単位／ｍＬの範囲であり、そして低酸素症または貧血の間、１００〜１，０００倍まで上昇し得る。ＧｒａｂｅｒおよびＫｒａｎｔｚ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．２９：５１（１９７８）；ＥｓｃｈｂａｃｈおよびＡｄａｍｓｏｎ，Ｋｉｄｎｅｙ  Ｉｎｔｌ．２８：１（１９８５）。組換えヒトエリスロポイエチン（ｒＨｕＥｐｏまたはエポエチン（ｅｐｏｉｅｔｉｎ）α）は、ＥＰＯＧＥＮ．ＲＴＭ．（エポエチンα、組換えヒトエリスロポイエチン）（Ａｍｇｅｎ  Ｉｎｃ．，Ｔｈｏｕｓａｎｄ  Ｏａｋｓ，Ｃａｌｉｆ．）およびＰＲＯＣＲＩＴ．ＲＴＭ．（エポエチンα、組換えヒトエリスロポイエチン）（Ｏｒｔｈｏ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  Ｉｎｃ．，Ｒａｒｉｔａｎ，Ｎ．Ｊ．）として市販される。
【０００９】
赤血球関連障害の別の例は、赤血球増加症である。赤血球造血症（過剰および／または異所性のエリスロポイエチン生成によって引き起こされる赤血球過剰生産の障害）は、癌（例えば、腎細胞癌、悪性肝細胞癌および中枢神経系癌）によって引き起こされ得る。赤血球増加症（ｅｒｙｔｈｒｏｃｙｔｏｓｉｓ）に関連する疾患としては、赤血球増加症（ｐｏｌｙｃｙｔｈｅｍｉａ）（例えば、真性赤血球増加症、二次赤血球増加症および相対的赤血球増加症）が挙げられる。
【００１０】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、Ｂ細胞に関与する障害を含み、これらとしては、前駆体Ｂ細胞新生物（例えば、リンパ芽球性白血病／リンパ芽球性リンパ腫）が挙げられるが、これに限定されない。末梢Ｂ細胞新生物としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：慢性リンパ性白血病／小リンパ球性リンパ種、濾胞性リンパ腫、びまん性大Ｂ細胞リンパ腫（ｄｉｆｆｕｓｅ  ｌａｒｇｅ  Ｂ−ｃｅｌｌ  ｌｙｍｐｈｏｍａ）、バーキットリンパ腫、プラスマ細胞新生物、多発性骨髄腫および関連要素、リンパプラスマ細胞リンパ腫（ｌｙｍｐｈｏｐｌａｓｍａｃｙｔｉｃ  ｌｙｍｐｈｏｍａ）（ヴァルデンストレームマクログロブリン血症）、成熟細胞性リンパ腫、辺縁層リンパ腫（ＭＡＬＴｏｍａ）ならびに毛様細胞白血病。
【００１１】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、骨髄の障害を含み、これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：造血性（ｈｅｍａｔｏｐｏｅｉｔｉｃ）幹細胞に関与する疾患；拘束されたリンパ先祖細胞；Ｂ細胞およびＴ細胞を含むリンパ細胞；拘束された骨髄様先祖（単球、顆粒球および巨核球を含む）；および拘束された赤血球先祖。これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：白血病（Ｂ−リンパ性白血病、Ｔ−リンパ性白血病、未分化型白血病を含む）；赤白血病、巨核芽球白血病、単球；［白血病は、分化状態であるか分化状態でない］；慢性および急性リンパ芽球性白血病、慢性および急性リンパ性白血病、慢性および急性骨髄性白血病、リンパ腫、骨髄異形成症候群、慢性および急性骨髄性白血病、骨髄単球性白血病；慢性および急性骨髄芽球性白血病、慢性および急性骨髄性白血病、慢性および急性の前骨髄性白血病、慢性および急性の骨髄球白血病、単球マクロファージ直系の血液悪性疾患（例えば、若年性慢性骨髄性白血病）；二次ＡＭＬ、前駆体血液障害；不応性貧血；再生不良性貧血；反応性皮膚（ｒｅａｃｔｉｖｅ  ｃｕｔａｎｅｏｕｓ）血管内皮細胞腫症；樹状細胞における改変された発現に関与する線維性障害、全身性硬化症、Ｅ−Ｍ症候群、流行性毒性油症候群（ｅｐｉｄｅｍｉｃ  ｔｏｘｉｃ  ｏｉｌ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、強皮症の好酸球性筋膜炎の限局性形態、ケロイドおよび線維性大腸症を含む障害；血管腫様悪性線維性組織球腫；癌（原発性の頭部および頚部の扁平上皮細胞癌を含む）；肉腫（カポージ肉腫を含む）；線維腺腫および葉状腫瘍（乳房線維腺腫を含む）；間質腫瘍；葉状腫瘍（組織球腫を含む）；赤芽球症；神経線維腫症；血管内皮の疾患；古い外傷における粒状の脱髄；神経膠症、血管原性水腫、脈管性疾患、アルツハイマー病およびパーキンソン病；Ｔ細胞リンパ腫；Ｂ細胞リンパ腫。
【００１２】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、血小板障害を含み得、これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：減少した血小板の数に関する障害、血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病（急性特発性血小板減少性紫斑病を含む）、薬物誘導性血小板減少症、ＨＩＶ関連血小板減少症および血栓性細小血管症を含む）：血栓性血小板減少性紫斑病および溶血性尿毒症症候群。
【００１３】
血液障害はまた、血栓症を含み得る。血栓症は、血小板機能不全を生じ得る（例えば、心筋梗塞において見られる）、アンギナ、高血圧、脂質障害；真性糖尿病；骨髄異形成症候群；骨髄増殖性症候群（真性赤血球増加症および血小板血症（ｔｈｏｍｂｏｃｙｔｈｅｍｉａ）を含む）；血栓性血小板減少性紫斑病；ＨＩＶ誘導性血小板障害（ＡＩＤＳ血小板減少症）；ヘパリン誘導性血小板減少症；血小板凝集／脱顆粒をもたらす壁細胞の改変／相互作用、血管内皮細胞活性化／損傷、単球／マクロファージの溢血および平滑筋細胞の増殖；自己免疫疾患（例えば、これらに限定されないが、脈管炎、抗リン脂質症候群、全身性エリテマトーデス）；炎症性疾患（例えば、これらに限定されないが、免疫活性化）；対宿主性移植片病；放射線誘導性過剰凝固（ｈｙｐｅｒｃｏａｇｕｌａｔｉｏｎ）；遺伝性（常染色体優性または劣性）（例えば、限定されないが、タンパク質Ｃ／Ｓ、抗トロンビンＩＩＩ欠損およびＬｅｉｄｅｎ変異第Ｖ因子を含む凝固因子の経路）または後天性（例えば、限定されないが、凝固因子の自己免疫、癌関連異常調節（ｄｙｓｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ）および薬物誘導性異常調節）のいずれかの凝固因子の異常調節。
【００１４】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、赤血球障害を含み得、これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：貧血（例えば、溶血性貧血（遺伝性球状赤血球症、赤血球酵素欠損：グルコース−６−ホスフェートデヒドロゲナーゼ欠損に起因する溶血性疾患を含む））、鎌状赤血球疾患、セラサミア症候群、発作性夜間血色素尿症、免疫溶血性貧血、および外傷から赤血球を生じる溶血性貧血；ならびに減少した赤血球生成の貧血（巨赤芽球性貧血を含む）（例えば、ビタミンＢ１２欠損の貧血）：悪性貧血および葉酸欠損の貧血、鉄欠損貧血、慢性疾患の貧血、再生不良性貧血、赤芽球癆および骨髄不全の他の形態。
【００１５】
本明細書中で使用される場合、血液障害としては、Ｔ細胞の疾患が挙げられ得、これには、以下が挙げられるが、これらに限定されない：細胞媒介性過敏症（例えば、遅延型過敏症およびＴ細胞媒介性細胞傷害性）および移植拒絶；自己免疫疾患（例えば、全身性エリテマトーデス、シェーグレン症候群、全身性硬化症、炎症性ミオパシー、混合型結合組織疾患および結節性多発性動脈炎）および他の脈管炎（ｖａｓｃｕｌｉｔｉｄｅｓ）；免疫欠損症候群（原発性免疫欠損（例えば、胸腺発育不全、重症複合型免疫不全疾患およびＡＩＤＳ）が挙げられるが、これらに限定されない）；白血球減少症；白血球の反応性（炎症性）増殖（白血球増加症、急性非特異的リンパ節炎および慢性非特異的リンパ節炎が挙げられるが、これらに限定されない）；白血球の腫瘍性増殖（リンパ新生物（例えば、前駆体Ｔ細胞新生物（例えば、急性リンパ芽球性白血病／リンパ腫、末梢Ｔ細胞およびナチュラルキラー細胞の新生物）（これには、末梢Ｔ細胞リンパ腫、不特定の成体Ｔ細胞白血病／リンパ腫、菌状息肉腫およびセザリー症候群が挙げられる））ならびにホジキン病が挙げられるが、これらに限定されない）。
【００１６】
本発明の１つの局面は、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９媒介性障害または関連障害（例えば、造血障害（例えば、赤血球関連障害））を処置および診断するために適用可能なアッセイにおける試薬または標的として有用である１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドおよびその生物学的に活性なフラグメントまたは抗原性フラグメントを特徴とする。別の実施形態において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を有する１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチドを提供する。好ましいポリペプチドは、少なくとも１つの二重特異的ホスファターゼ触媒ドメインを含む、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質であり、好ましくは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性（例えば、本明細書中に記載されるような１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性）を有する１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質である。
【００１７】
関連する局面において、本発明は、融合タンパク質を形成するために１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドに作動可能に連結される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドまたはフラグメントを提供する。
【００１８】
別の局面において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドと反応する、またはより好ましくはそれらを特異的に結合する、抗体およびそれらの抗原結合フラグメントを特徴とする。
【００１９】
別の局面において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９のポリペプチドまたは核酸の発現または活性を調節する化合物をスクリーニングする方法を提供する。
【００２０】
さらに別の局面において、本発明は、例えば、スクリーニングされた化合物を用いて、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９ポリペプチドまたは核酸の発現あるいは活性を調節するためのプロセスを提供する。特定の実施形態において、本方法は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９のポリペプチドまたは核酸の減少した活性または発現に関連する状態（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球））の異常な細胞増殖を含む状態）の処置を含む。状態としては、白血病（例えば、赤白血病）の場合のような造血細胞の活性または増殖の増加；または例えば、貧血の場合のような、造血細胞の分化の減少が挙げられ得る。
【００２１】
さらに別の局面において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球））の増殖、生存および／または分化を調節（例えば、増強または阻害）するための方法を提供する。本方法は、その細胞を、細胞の増殖および／または分化を調節するのに有効な量の薬剤（この薬剤は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドまたは核酸の活性または発現を調節する）と接触させる工程を包含する。
【００２２】
好ましい実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８または６０と同一または実質的に同一なアミノ酸配列を有する。他の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のポリペプチドは、配列番号配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８または６０の、少なくとも１５、２０、５０、１００、１５０、１８０、２００またはそれ以上連続するアミノ酸のフラグメントである。
【００２３】
好ましい実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９または６１と同一または実質的に同一なヌクレオチド配列を有する。他の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９または６１の、少なくとも５０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００またはそれ以上連続するヌクレオチドのフラグメントである。
【００２４】
好ましい実施形態において、薬剤は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸の発現を、例えば、転写、ｍＲＮＡ安定性などを調節することによって、調節（例えば、増大または減少）する。
【００２５】
好ましい実施形態において、この薬剤は、ペプチド、ホスホペプチド、低分子（例えば、コンビナトリアルライブラリーのメンバー）または抗体、あるいはこれらの任意の組み合わせである。この抗体は、細胞毒、細胞傷害性剤および反応性金属イオンからなる群より選択される治療部分に結合体化され得る。
【００２６】
さらなる好ましい実施形態において、この薬剤は、アンチセンス、リボザイムまたは三重らせん分子、あるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸、あるいはこれらの任意の組み合わせである。
【００２７】
好ましい実施形態において、この薬剤は、細胞傷害性剤と合わせて投与される。
【００２８】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を発現する細胞）は、造血細胞（例えば、骨髄細胞、リンパ細胞または赤血球細胞、あるいはその前駆細胞）である。このような細胞の例としては、骨髄細胞（多形核細胞）、赤血球細胞、リンパ球、単球、細網細胞、プラスマ細胞および巨核球、ならびに異なる系統への幹細胞、そして約束された先祖細胞への前駆体（例えば、赤血球細胞の前駆体（赤芽球）、マクロファージの前駆体（単芽球）、血小板の前駆体（巨核球）、多形核白血球の前駆体（骨髄芽球）およびリンパ球の前駆体（リンパ芽球））が挙げられる。
【００２９】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を発現する細胞）は、骨髄細胞（例えば、骨髄ＣＤ３４発現細胞）である。ＣＤ３４発現細胞の例としては、未成熟造血前駆細胞、骨髄中の造血コロニー形成細胞（単能性（ＣＦＵ−ＧＭ、ＢＦＵ−Ｅ）および多能性祖先細胞（ＣＦＵ−ＧＥＭＭ、ＣＦＵ−ＭｉｘおよびＣＦＵ−芽細胞））；ならびに間質細胞前駆体、末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ（ＴｄＴ）発現Ｂリンパ前駆体およびＴリンパ前駆体、初期骨髄細胞および初期赤血球細胞、が挙げられる。
【００３０】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を発現する細胞）は、骨髄赤血球系細胞（例えば、赤血球祖先細胞（例えば、ＧＰＡ（低）ＣＤ７１＋細胞）または分化した細胞（例えば、赤血球または巨核球））である。
【００３１】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９を発現する細胞）は、タンパク質（例えば、サイトカイン）と、さらに接触される。好ましくは、このタンパク質は、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、幹細胞因子および好ましくはエリトロポイエチンからなる群より選択される。このタンパク質接触工程は、薬剤が接触される前か、それと同時か、またはその後で、生じ得る。このタンパク質接触工程は、インビトロまたはエキソビボで影響を与え得る。例えば、細胞（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９を発現する細胞）は、被験体（例えば、患者）から獲得され、そしてタンパク質とエキソビボで接触される。処理された細胞は、被験体に再び導入され得る。あるいは、このタンパク質接触工程は、インビボで生じ得る。
【００３２】
好ましい実施形態において、この薬剤と、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のポリペプチドまたは核酸とは、インビトロまたはエキソビボで接触される。
【００３３】
好ましい実施形態において、この接触工程は、例えば、治療プロトコルまたは予防プロトコルの一部として、被験体においてインビボでもたらされる。好ましくは、被験体は、ヒト（例えば、造血障害（例えば、白血病または赤血球関連障害）を有する患者）である。例えば、この被験体は、貧血（例えば、溶血性貧血、異常な赤血球生成、非造血障害における二次的貧血、慢性疾患（例えば、慢性腎不全）の貧血）；内分泌欠損疾患；および／または赤血球増加症（例えば、多血症）を有する患者であり得る。あるいは、被験体は、癌患者（例えば、白血病性の癌（例えば、赤血球白血病）または癌腫（例えば、腎臓癌腫）を有する患者）であり得る。他の実施形態において、この被験体は、非ヒト動物（例えば、実験動物）である。
【００３４】
接触工程は、反復され得る。
【００３５】
好ましい実施形態において、この薬剤は、細胞（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球系細胞、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球）））の増殖を減少し、そして／またはこれらの分化を増強する。このような薬剤は、癌（例えば、白血病性癌）を処置または予防するために使用され得る。
【００３６】
好ましい実施形態において、この薬剤は、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球系細胞、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球）の数を、前駆細胞の増殖、生存を増大すること、そして／またはその分化を刺激することによって、増大させる。このような薬剤は、造血障害（例えば、貧血（例えば、溶血性貧血、異常な赤血球生成、非造血障害における二次的貧血、慢性疾患（例えば、慢性腎不全）の貧血）；内分泌欠損疾患；および／または赤血球増加症（例えば、多血症））を処置または予防するために使用され得る。
【００３７】
別の局面において、本発明は、造血（例えば、赤血球生成）を調節する方法を特徴とし、この方法は、１３１発現細胞、１４８発現細胞、１９９発現細胞、１２３０３発現細胞、１３９０６発現細胞、１５５１３発現細胞、１７８２２発現細胞、３０２発現細胞、５６７７発現細胞、１９４発現細胞、１４３９３発現細胞、２８０５９発現細胞、７３６６発現細胞、１２２１２発現細胞、１９８１発現細胞、２６１発現細胞、１２４１６発現細胞、２７０発現細胞、１４１０発現細胞、１３７発現細胞、１８７１発現細胞、１３０５１発現細胞、１８４７発現細胞、１８４９発現細胞、１５４０２発現細胞、３４０発現細胞、１０２１７発現細胞、８３７発現細胞、１７６１発現細胞、８９９０発現細胞、または１３２４９発現細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄性（好中球）細胞、単球、赤血球、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球）と、１３１ポリペプチド、１４８ポリペプチド、１９９ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、１３９０６ポリペプチド、１５５１３ポリペプチド、１７８２２ポリペプチド、３０２ポリペプチド、５６７７ポリペプチド、１９４ポリペプチド、１４３９３ポリペプチド、２８０５９ポリペプチド、７３６６ポリペプチド、１２２１２ポリペプチド、１９８１ポリペプチド、２６１ポリペプチド、１２４１６ポリペプチド、２７０ポリペプチド、１４１０ポリペプチド、１３７ポリペプチド、１８７１ポリペプチド、１３０５１ポリペプチド、１８４７ポリペプチド、１８４９ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、３４０ポリペプチド、１０２１７ポリペプチド、８３７ポリペプチド、１７６１ポリペプチド、８９９０ポリペプチド、もしくは１３２４９ポリペプチド、または１３１核酸、１４８核酸、１９９核酸、１２３０３核酸、１３９０６核酸、１５５１３核酸、１７８２２核酸、３０２核酸、５６７７核酸、１９４核酸、１４３９３核酸、２８０５９核酸、７３６６核酸、１２２１２核酸、１９８１核酸、２６１核酸、１２４１６核酸、２７０核酸、１４１０核酸、１３７核酸、１８７１核酸、１３０５１核酸、１８４７核酸、１８４９核酸、１５４０２核酸、３４０核酸、１０２１７核酸、８３７核酸、１７６１核酸、８９９０核酸、もしくは１３２４９核酸の活性または発現を増大または減少させる薬剤とを接触させ、それにより、造血細胞の分化を調節する工程を包含する。
【００３８】
なお別の局面において、本発明は、被験体における造血障害（例えば、赤血球関連障害）を処置または予防する方法を特徴とする。この方法は、１３１ポリペプチド、１４８ポリペプチド、１９９ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、１３９０６ポリペプチド、１５５１３ポリペプチド、１７８２２ポリペプチド、３０２ポリペプチド、５６７７ポリペプチド、１９４ポリペプチド、１４３９３ポリペプチド、２８０５９ポリペプチド、７３６６ポリペプチド、１２２１２ポリペプチド、１９８１ポリペプチド、２６１ポリペプチド、１２４１６ポリペプチド、２７０ポリペプチド、１４１０ポリペプチド、１３７ポリペプチド、１８７１ポリペプチド、１３０５１ポリペプチド、１８４７ポリペプチド、１８４９ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、３４０ポリペプチド、１０２１７ポリペプチド、８３７ポリペプチド、１７６１ポリペプチド、８９９０ポリペプチド、もしくは１３２４９ポリペプチド、または１３１核酸、１４８核酸、１９９核酸、１２３０３核酸、１３９０６核酸、１５５１３核酸、１７８２２核酸、３０２核酸、５６７７核酸、１９４核酸、１４３９３核酸、２８０５９核酸、７３６６核酸、１２２１２核酸、１９８１核酸、２６１核酸、１２４１６核酸、２７０核酸、１４１０核酸、１３７核酸、１８７１核酸、１３０５１核酸、１８４７核酸、１８４９核酸、１５４０２核酸、３４０核酸、１０２１７核酸、８３７核酸、１７６１核酸、８９９０核酸、もしくは１３２４９核酸の活性または発現を調節する薬剤の有効量を、その被験体に投与し、その結果、この造血障害が緩和されるか、または血液障害の少なくとも１つの症状を低減させる工程を包含する。
【００３９】
（本発明の分子）
（遺伝子番号１３１）
ヒト１３１配列（配列番号１）（ＧＩ：１８１８２８、ヒトドーパミン２レセプター（ＤＲＤ２）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１３３２ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号１の核酸約１〜１３３２に位置する）は、４４３アミノ酸のタンパク質（配列番号２）（ＧＩ：１８１８２９）をコードする。
【００４０】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１３１  ｍＲＮＡは、ヒト脳、腎臓およびＧＰＡ＋赤血球系細胞において非常に特異的に発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析により、発現はまた、培養好中球、培養赤血球系細胞および巨核球においても見られた。試験した他の全ての組織および細胞型において、発現は非常に低かった。
【００４１】
１３１は、ドーパミンＤ２レセプターである。それは、ドーパミン媒介神経生存において重要であることが知られている。１３１は、神経分裂病および他の脳疾患に関与することが知られている。
【００４２】
ドーパミンもまた、いくつかの細胞型において、増殖およびアポトーシスの誘導を阻害することが知られている。１３１の活性を調節することによるドーパミン媒介シグナル伝達の阻害は、赤血球系統を拡大するために役立つ。１３１活性の調節は、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において、有用である。１３１ポリペプチドは、１３１活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００４３】
（遺伝子番号１４８）
ヒト１４８配列（配列番号３）（ＧＩ：３２０４８、ヒトＤ５ドーパミン２レセプター（ＨＤ５ＤＲ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１４３４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号３の核酸約１〜１４３４に位置する）は、４７７アミノ酸のタンパク質（配列番号４）（ＧＩ：３２０４９）をコードする。
【００４４】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１４８  ｍＲＮＡは、ヒト脳、腎臓およびＧＰＡ＋赤血球系細胞において非常に特異的に発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析により、発現はまた、培養好中球、培養赤血球系細胞および巨核球においても見られた。試験した他の全ての組織および細胞型において、発現は非常に低かった。
【００４５】
１４８は、ドーパミンＤ５レセプターである。それは、ドーパミン媒介性神経生存において重要であることが知られている。１４８は、神経分裂病および他の脳疾患に関与することが知られている。
【００４６】
ドーパミンもまた、いくつかの細胞型において、増殖およびアポトーシスの誘導を阻害することが知られている。１４８の活性を調節することによるドーパミン媒介シグナル伝達の阻害は、赤血球系統を拡大するために役立つ。１４８活性の調節は、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において、有用である。１４８ポリペプチドは、１４８活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００４７】
（遺伝子番号１９９）
ヒト１９９配列（配列番号５）（ＧＩ：３０７４１９、ヒトセロトニンレセプターとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１１４１ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号５の核酸約２７〜１１２７に位置する）は、３６６アミノ酸のタンパク質（配列番号６）（ＧＩ：３０７４２０）をコードする。
【００４８】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１９９  ｍＲＮＡは、非常に制限された発現パターンを示した。発現の高いレベルは、ＣＤ３４＋前駆細胞において見られた。発現の低いレベルは、脳において見られた。発現の非常に低いレベルは、胎盤および肺において見られた。
【００４９】
１９９は、ニューロン機能において重要である知られている、セロトニンレセプターの１つである。より具体的には、アゴニストは、神経原性硬膜炎症を阻害することが示されている。動脈の血管収縮におけるセロトニンレセプターの役割もまた想定されている。１９９および他のセロトニンレセプターを介したシグナル伝達は、分裂促進的であると知られている。
【００５０】
１９９の活性を調節することにより、ＣＤ３４＋前駆細胞の増殖が増加する。これは、造血系の全系統の細胞数の増加を生じる。１９９活性のモジュレーターは、血液障害（血球減少が挙げられるが、これに限定されない）の処置において有用である。
【００５１】
（遺伝子番号１２３０３）
ヒト１２３０３配列（配列番号７）（ＧＩ：７５７６９３４、２細孔カリウムチャネル（ＫＴ４．１ｂ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１４０８ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号７の核酸約８４〜１３４３に位置する）は、４１９アミノ酸のタンパク質（配列番号８）（ＧＩ：７５７６９３５）をコードする。
【００５２】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１２３０３  ｍＲＮＡは、非常に限られた発現パターンを示した。それは、ヒト脳およびＧＰＡ  ｈｉ細胞においてのみ発現し、好中球、巨核球、および赤血球系細胞培養物においてより低い発現レベルであった。ヒト器官の幅広い範囲で実施した、さらなるＴａｑＭａｎ分析は、前立腺における１２３０３  ｍＲＮＡ発現の低いレベルを示した。
【００５３】
１２３０３は、ＴＷＩＫレセプターである。ＴＷＩＫレセプターは、細胞内カリウム交換を介したシグナル伝達を容易にすることが知られている。１２３０３トランスポーターの遮断は、ニューロン細胞の細胞保護作用を引き起こすことを示した。１２３０３をアゴナイズすることは、細胞死を引き起こす。
【００５４】
インビボにおいて、１２３０３は、成熟赤血球において非常に特異的に発現する。１２３０３活性を調節することにより、赤血球生成が刺激され、そして最終結果としては、細胞保護経路の誘導を介した多くの赤血球となる。従って、１２３０３活性のモジュレーターは、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において、有用である。
【００５５】
（遺伝子番号１３９０６）
ヒト１３９０６配列（配列番号９）（セリンプロテアーゼ（Ｏｍｉ／Ｈｔｒａ２プロテアーゼ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１５９７ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号９の核酸約１８〜１３９４に位置する）は、４５８アミノ酸のタンパク質（配列番号１０）をコードする。
【００５６】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１３９０６  ｍＲＮＡは、インビトロおよびインビボの両方で、赤血球系細胞において特異的にアップレギュレートされた。１３９０６  ｍＲＮＡの高いレベルの発現は、骨髄に由来するＧＰＡ  ｈｉおよびｌｏ発現細胞ならびにインビトロの分化赤血球系細胞（６日目に増加する）において見られた。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、インビボの、赤血球生成器官、胎児肝臓において高レベルの発現を示した。
【００５７】
１３９０６は、Ｏｍｉ／Ｈｔｒａ２プロテアーゼである。このプロテアーゼは、アポトーシスを阻害することが知られている、アポトーシスのインヒビター（ＩＡＰ）タンパク質と相互作用し、そして分解することが知られている。１３９０６タンパク質は、活性化の際、ミトコンドリアから細胞質に移行する。
【００５８】
その発現パターンおよび機能的役割に起因して、１３９０６のモジュレーターは、インビボの赤血球系細胞において、高レベルのＩＡＰを生じ、これは、赤血球系細胞においてアポトーシスを阻害した。これは、末梢における赤血球の数を効率的に増加する。１３９０６活性のモジュレーターは、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において、有用である。
【００５９】
（遺伝子番号１５５１３）
ヒト１５５１３配列（配列番号１１）（ＧＩ：１７９４２０６、ヒトキナーゼ（Ｍｙｔｌ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１８８１ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号１１の核酸約２１４〜１７１３に位置する）は、４９９アミノ酸のタンパク質（配列番号１２）（ＧＩ：１７９４２０７）をコードする。
【００６０】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１５５１３  ｍＲＮＡは、インビトロおよびインビボの赤血球系細胞において、非常に特異的に発現された。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、インビボのＧＰＡ高赤血球およびインビトロの分化赤血球系細胞における、高レベルの１５５１３  ｍＲＮＡを示した。
【００６１】
１５５１３は、Ｍｙｔｌキナーゼである。それは、Ｃｄｃ２をリン酸化し、そしてＣｄｃ２がサイクリンＢ１と複合体形成することを妨げる。１５５１３タンパク質の過剰生産は、細胞周期のＧ２期における細胞周期遅延を誘導する。
【００６２】
１５５１３活性の調節は、Ｃｄｃ２の活性化の増加を生じ、従って、細胞増殖を引き起こす。分化赤血球系細胞の増殖の増加は、より多い赤血球を生じる。分化赤血球における１５５１３のｍＲＮＡ発現パターンおよび増殖に影響を及ぼすその役割に起因して、１５５１３活性のモジュレーターは、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において、有用である。１５５１３ポリペプチドは、１５５１３活性のモジュレーターのスクリーニングにおいて、有用である。
【００６３】
（遺伝子番号１７８２２）
ヒト１７８２２配列（配列番号１３）（ＧＩ：１０３３４９８９、ヒトジペプチダーゼとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１７００ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号１３の核酸約１２５〜１５８５に位置する）は、４８６アミノ酸のタンパク質（配列番号１４）（ＧＩ：１４７１７３９６）をコードする。
【００６４】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１７８２２  ｍＲＮＡは、インビボの全ての造血性系統において、広く発現することが示された。発現は、ＣＤ３４＋細胞ならびに赤血球系細胞（ＧＰＡ＋）、好中球（ＣＤ１５＋）および巨核球（ＣＤ６１＋）細胞系統において高かった。インビトロにおいて、赤血球系細胞における発現は、高いレベルで維持された。発現は、大部分の他の組織（リンパ器官（脾臓、リンパ節）および生じるＴ細胞を除く）において低かった。
【００６５】
この遺伝子は、ジペプチダーゼであり、そして腎性ジペプチダーゼに関連する。腎性ジペプチダーゼおよびこのファミリーのメンバーは、特にロイコトリエンＤ４をロイコトリエンＥ４に変換することが知られている。ロイコトリエンＤ４は、ＣＤ３４＋細胞増殖および骨髄における転移の公知の刺激因子である。
【００６６】
１７８２２活性を調節することは、骨髄においてより高いレベルのロイコトリエンＤ４を生じ、これは、骨髄ＣＤ３４＋前駆細胞増加に対するポジティブな効果を有する。１７８２２  ｍＲＮＡの発現パターンおよびロイコトリエンＤ４を刺激するその能力に起因して、１７８２２活性のモジュレーターは、血液障害（血球減少が挙げられるが、これに限定されない）の処置において有用である。１７８２２ポリペプチドは、１７８２２活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００６７】
（遺伝子番号３０２）
ヒト３０２配列（配列番号１５）（ＧＩ：１３２３６４９６、ヒト５−ヒドロキシトリプタミン（セロトニン）レセプター５Ａ（ＨＴＲ５Ａ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１１５９ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号１５の核酸約６４〜１１３７に位置する）は、３５７アミノ酸のタンパク質（配列番号１６）（ＧＩ：１３２３６４９７）をコードする。
【００６８】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、３０２  ｍＲＮＡは、インビボの赤血球系統の細胞において特異的に発現した。高レベルの発現は、脳、脊髄、後根神経節（ＤＲＧ）およびＧＰＡ高細胞において、見られた。
【００６９】
３０２は、セロトニンレセプターの１つである。セロトニンレセプターは、ニューロン機能において重要であることが知られている。より特異的には、アゴニストは、神経原性硬膜炎症を阻害することが示される。動脈の血管収縮におけるセロトニンレセプターの役割もまた想定されている。さらに、３０２を介したシグナル伝達は、分裂促進的であると知られている。３０２活性のモジュレーターは、赤血球前駆細胞の増殖を増加する。これは、より多い全ての血液系統細胞を生じ、そして血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の有効な処置である。従って、インビボにおけるその発現パターンおよび機能的役割に起因して、３０２活性のモジュレーターは、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）において有用である。本発明の３０２ポリペプチドは、３０２活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００７０】
（遺伝子番号５６７７）
ヒト５６７７配列（配列番号１７）（ＧＩ：８９１９６２７、ヒトロイコトリエンＢ４レセプター２（ＢＬＴＲ２）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１０７７ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号１７の核酸約１〜１０７７に位置する）は、３５８アミノ酸のタンパク質（配列番号１８）（ＧＩ：８９１９６２８）をコードする。
【００７１】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、５６７７  ｍＲＮＡの発現は、赤血球系統および脊髄系統の細胞に制限された。高レベルの５６７７  ｍＲＮＡ発現はまた、ヒト神経および皮膚において見られる。さらなるＴａｑＭａｎ研究は、５６７７  ｍＲＮＡのレベルが、赤血球発達の間増加したことを示した。高レベルの５６７７  ｍＲＮＡ発現は、インビボのＧＰＡ＋細胞において見られた。
【００７２】
５６７７は、ロイコトリエンＢ４の代替的なレセプターである。５６７７  ｍＲＮＡは、Ｔ細胞において発現することが示され、そしてそれは、それらの細胞において、走化性／接着を調節するように機能する。ロイコトリエンＢ４は、インビトロにおける赤血球コロニー形成を阻害することが示されている。ロイコトリエンシグナル伝達を阻害することは、赤血球生成の速度を増加する。５６７７活性のモジュレーターは、赤血球生成の速度を増加するために有用であり、従って、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の有効的な処置となる。本発明の５６７７ポリペプチドは、５６７７活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００７３】
（遺伝子番号１９４）
ヒト１９４配列（配列番号１９）（ヒトソマトスタチンレセプターＩ型（ＳＳＩＲ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１６３４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号１９の核酸約１００〜１２７５に位置する）は、３９１アミノ酸のタンパク質（配列番号２０）をコードする。
【００７４】
１９４は、ソマトスタチンＳＳＲ−１である。ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１９４  ｍＲＮＡは、ヒト組織中、脳皮質および視床下部において高レベルで検出された。それはまた、後根神経節および小腸においても検出されたが、低いレベルであった。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、１９４  ｍＲＮＡがインビトロの巨核球増殖において発現することを示した。
【００７５】
ソマトスタチンは、ニューロン活性の公知のエフェクターである。さらに、ソマトスタチンは、いくつかの異なる器官において、少なくとも２つの特異的なＧタンパク質共役型レセプター（ＳＳＲ−１およびＳＳＲ−２）（ＰＮＡＳ．１９９２．８９（１）：２５１−２５５）を介する作用に関連する。１９４のｍＲＮＡ発現は、１９４が巨核球および血小板において、機能的役割を有することを示す。１９４は、アデニリル酸シクラーゼ（血小板凝集の重要メディエータ）の制御に関連する。その機能的役割および発現パターンに起因して、１９４は血小板凝集の制御において役割を果たし得る。従って、１９４活性のモジュレーターは、血液障害（血栓症および異常血液凝固により特徴付けられる状態が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１９４ポリペプチドは、１９４活性のモジュレーターのスクリーニングのために有用である。
【００７６】
（遺伝子番号１４３９３）
ヒト１４３９３配列（配列番号２１）（ヒトオレキシンレセプターＩ型（ＯＸＩＲ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１５６４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号２１の核酸約１５４〜１４３１に位置する）は、４２５アミノ酸のタンパク質（配列番号２２）をコードする。
【００７７】
１４３９３は、ヒトオレキシン１レセプターＯＲ−１である。ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１４３９３  ｍＲＮＡは、脳皮質および視床下部において最も高く発現した。１４３９３  ｍＲＮＡはまた、インビトロ分化により生成された巨核球、骨髄巨核球および正常血小板において発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、冠状動脈疾患のみを有する患者および正常血小板と比較して、冠状動脈疾患および糖尿病の両方と診断された患者の血小板において、減少した１４３９３レベルを検出した。
【００７８】
糖尿病は、急性冠状動脈症候群、心筋梗塞および不安定狭心症の危険因子である。血小板における１４３９３  ｍＲＮＡの発現は、糖尿病において高められた血小板反応に関連する。オレキシンは、摂食行動を制御する、公知の神経ペプチドである。オレキシンレセプターは、糖尿病動物モデル（肥満ズッカーラット（ＢＢＲＣ．２００１．２４；２８６（３）：５１８−５２３））の視床下部において逆に制御される証拠が存在する。その機能的役割および発現パターンに起因して、１４３９３は、血小板凝集において役割を有することが示され得る。従って、１４３９３活性のモジュレーターは、血液障害（血栓症および異常血液凝固により特徴付けられる状態が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１４３９３ポリペプチドは、１４３９３活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００７９】
（遺伝子番号２８０５９）
ヒト２８０５９配列（配列番号２３）（ヒトイオンチャネル）は、非翻訳領域も含めて、約４６３２ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号２３の核酸約２２５〜３５８１に位置する）は、１１１８アミノ酸のタンパク質（配列番号２４）をコードする。
【００８０】
２８０５９は、新規ＳＬＡＣＫチャネル（カルシウム活性化カリウムチャネル）である。ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、２８０５９  ｍＲＮＡは、脳および胎児肝臓において、比較的高いレベルで発現した。２８０５９  ｍＲＮＡはまた、インビトロで生成される巨核球および正常血小板において検出された。２８０５９は、冠状動脈疾患（心筋梗塞、不安定狭心症および安定狭心症を含む）を有する患者において発現された。
【００８１】
ＳＬＡＣＫチャネルは、ニューロン細胞興奮およびニューロン細胞分泌において同定された役割を有する。ＳＬＡＣＫチャネルは、ニューロン細胞中の細胞内カルシウムにより制御される（Ｎａｔｕｒｅ  Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ．１９９８．（６）：４６２−４６９）。２８０５９発現データは、ＳＬＡＣＫが血小板におけるカルシウム流動化において重要な役割を果たすことを示す。カルシウム流動化は、血小板分泌および血小板凝集の重要なレギュレーターであり、従って、２８０５９は血小板活性化を制御するカルシウムシグナル伝達経路の成分である。
【００８２】
従って、２８０５９活性のモジュレーターは、血液障害（血栓症および異常血液凝固により特徴付けられる状態が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の２８０５９ポリペプチドは、２８０５９活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００８３】
（遺伝子番号７３６６）
ヒト７３６６配列（配列番号２５）（ヒト塩素イオンチャネルタンパク質４（ＣＬＣ−４）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約４４５４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号２５の核酸約２７６〜２５５８に位置する）は、７６０アミノ酸のタンパク質（配列番号２６）をコードする。
【００８４】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、７３６６  ｍＲＮＡの発現は、脳、骨格筋および赤血球系統の造血性細胞に制限された。インビトロにおける７３６６  ｍＲＮＡの発現は、巨核球および赤血球系統分化とともに増加した。インビボにおける７３６６  ｍＲＮＡの発現は、活性増殖性の赤血球細胞であるＧＰＡ低細胞において高かった。７３６６  ｍＲＮＡの発現はまた、インビトロのＢＦＵ−Ｅ細胞において見られた。
【００８５】
７３６６は、塩素イオンチャネルＣＬＣ−４である。塩素イオンチャネルは、膜分極化ならびに細胞容量の調節において重要な役割を果たすことが知られている。塩素イオンチャネルの遮断は、細胞増殖を阻害することが知られている。従って、７３６６をアゴナイズすることは、赤血球前駆細胞の増加した増殖を引き起こす。７３６６  ｍＲＮＡはまた、ＣＤ３４＋細胞において低いレベルで発現されたので、複数の系統における増加が生じる。７３６６活性のモジュレーターは、血液障害（汎血球減少が挙げられるが、これに限定されない）の処置において有用である。本発明の７３６６ポリペプチドは、７３６６活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００８６】
（遺伝子番号１２２１２）
ヒト１２２１２配列（配列番号２７）（ヒトカリウム中間体／小伝導性カルシウム活性化チャネル、サブファミリーメンバー４としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１２８４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号２７の核酸約１〜１２８４に位置する）は、４２７アミノ酸のタンパク質（配列番号２８）をコードする。
【００８７】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１２２１２  ｍＲＮＡの発現は、ヒト胸部、結腸腫瘍、および赤血球系統の造血性細胞に制限された。１２２１２  ｍＲＮＡ発現は、インビボにおけるＧＰＡ  ｌｏ細胞およびＧＰＡ高細胞の両方において高く、そしてｍＲＮＡ発現は、インビトロの赤血球分化とともに増加される。
【００８８】
１２２１２は、カルシウム活性化Ｋ＋チャネルである。このチャネルの一般的なインヒビターであるクロトリマゾールは、マウスのインビトロ系における赤血球分化を阻害する。膜電位に対する影響に一般的に関与するが、この遺伝子内の変異はまた、貧血の稀な遺伝形態（ダイアモンドブラックファン貧血）に関連する。この形態の貧血は、混乱した赤血球生成、特に赤血球前駆増殖／拘束における遮断を生じることが知られている。
【００８９】
このチャネルをアゴナイズすることは、赤血球前駆細胞の増殖を増加する。従って、１２２１２活性のモジュレーターは、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において有用である。本発明の１２２１２ポリペプチドは、１２２１２活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００９０】
（遺伝子番号１９８１）
ヒト１９８１配列（配列番号２９）（ヒトグルタミン酸レセプター（ＫＡ−１）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２８７１ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号２９の核酸約１〜２８７１に位置する）は、９５６アミノ酸のタンパク質（配列番号３０）をコードする。
【００９１】
１９８１は、リガンドゲート化イオンチャネルを形成するヒトカイニン酸レセプターＫＡ−１である。ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１９８１  ｍＲＮＡは、脳、インビトロ生成巨核球および正常血小板において、ほとんど独占的に発現された。脳および巨核球における発現は、実験した他の器官および組織における発現よりも１０以上高かった。さらなるＴａｑＭａｎ分析において、１９８１  ｍＲＮＡはまた、冠状動脈疾患を有する患者の血小板において検出され、そして１９８１  ｍＲＮＡレベルは、心筋梗塞を被る患者の大部分で減少した。
【００９２】
グルタミン酸レセプターは、ニューロンシナプス興奮において、公知の役割を有する。さらに、グルタミン酸は、アラキドン酸誘導血小板凝集をアンタゴナイズすることが示されている（Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ  ａｎｄ  Ｈｅｍｏｓｔａｓｉｓ．１９９６．７６（１）：８４−８７）。その機能および発現パターンに起因して、１９８１は、急性冠状動脈症候群、心筋梗塞間の血小板凝集の制御に関与する。１９８１活性のモジュレーターは、血液障害（血栓症および異常血液凝固により特徴付けられる状態が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１９８１ポリペプチドは、１９８１活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００９３】
（遺伝子番号２６１）
ヒト２６１配列（配列番号３１）（ヒトＧタンパク質共役型レセプターとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２５３４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号３１の核酸約１１８〜１２３０に位置する）は、３７０アミノ酸のタンパク質（配列番号３２）をコードする。
【００９４】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、２６１  ｍＲＮＡの発現は、脳および造血性系統の細胞に制限された。２６１  ｍＲＮＡの発現は、インビボおよびインビトロの両方で、骨髄のＣＤ３４＋細胞、血液および好中球において高かった。
【００９５】
２６１は、カルシウム活性化Ｋ＋チャネルである。膜電位に対する影響に一般的に関与するが、この遺伝子内の変異はまた、貧血の稀な遺伝形態（ダイアモンドブラックファン貧血）に関連する。この形態の貧血は、混乱した赤血球生成、特に赤血球前駆増殖／拘束における遮断を生じることが知られている。この形態の貧血は、混乱した赤血球生成、特に赤血球前駆増殖／拘束における遮断を生じることが知られている。このチャネルをアゴナイズすることは、赤血球前駆細胞の増殖における増加を引き起こす。その機能および発現パターンに起因して、２６１は、急性冠状動脈症候群、心筋梗塞間の血小板凝集の制御に関与する。２６１活性のモジュレーターは、血液障害（貧血および血栓症が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の２６１ポリペプチドは、２６１活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００９６】
（遺伝子番号１２４１６）
ヒト１２４１６配列（配列番号３３）（ＡＤＰレセプターＰ２Ｙｌ３（ＧＰＲ８６）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２８５７ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号３３の核酸約１７４〜１１７５に位置する）は、３３３アミノ酸のタンパク質（配列番号３４）をコードする。
【００９７】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１２４１６  ｍＲＮＡは、脳、脾臓、顆粒球およびＧＰＡ高赤血球において発現された。さらなる分析は、１２４１６が高レベルで、好中球系統の様々な細胞（インビボおよびインビトロの両方で）およびマウス骨髄単核細胞（ｍＢＭ  ＭＮＣ）において発現することを示した。１２４１６は、ＣＤ１５＋  ｌｌｂ＋細胞およびＣＤ１５＋  １ｌｂ−細胞ならびにＣＤ３４＋細胞において発現され、そして、好中球のインビトロ分化の間に増加するが、巨核球においても赤血球系統においても増加しない。
【００９８】
１２４１６は、Ｐ２Ｙレセプターファミリーの新しいメンバーである。Ｐ２Ｙレセプターは、ホスホイノシチド経路またはアデニル酸シクラーゼのいずれかに共役する。公開文献は、１２４１６でトランスフェクトされた細胞が、ＡＤＰに曝露された場合ＩＰ３の蓄積を生じ、そしてアデニル酸シクラーゼ活性に対する二相性効果を有することを示している。ＡＤＰでの１２４１６の刺激はまた、ＭＡＰキナーゼＥｒｋｌおよびＥｒｋ２のリン酸化を引き起こす。Ｐ２Ｙ１レセプターへのＡＤＰ結合はまた、ＭＡＰキナーゼのリン酸化およびアポトーシスの誘導を引き起こす。従って、１２４１６は、アポトーシスの誘導阻害において、機能的な役割を有する。脳および脾臓における、その機能的役割および発現パターンに起因して、１２４１６は、血液障害に関連する疾患の制御において役割を果たす。従って、１２４１６活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数の増加により特徴付けられる疾患が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１２４１６ポリペプチドは、１２４１６活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【００９９】
（遺伝子番号２７０）
ヒト２７０配列（配列番号３５）（プロスタグランジンＥ２レセプター、ＥＰ２サブタイプとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２３７２ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号３５の核酸約１５７〜１２３３に位置する）は、３５８アミノ酸のタンパク質（配列番号３６）をコードする。
【０１００】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、２７０  ｍＲＮＡ発現は、心臓、脾臓、卵巣および前立腺において見られた。さらなる分析は、好中球系統前駆における発現の最も高いレベルを有する骨髄の造血性前駆細胞集団において、２７０発現のアップレギュレーションを示した。
【０１０１】
２７０は、造血性前駆細胞のサイトカイン誘導性増殖に対して阻害効果を有することを示す分子であるプロスタグランジンＥのレセプターである。造血性前駆細胞集団において、プロスタグランジンＥ２レセプター（ＥＰ２サブタイプ）遺伝子の機能を阻害することは、そのリガンド、プロスタグランジンＥの阻害効果をブロックし、そしてこれらの細胞の増殖を刺激して、全ての系統（特に、神経向性（ｎｅｕｒｏｐｈｉｌ）系統）の細胞数の増加を引き起こす。従って、心臓、脾臓、卵巣、前立腺および骨髄の造血性前駆細胞集団における２７０  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能的役割とともに、２７０活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数増加が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の２７０ポリペプチドは、２７０活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１０２】
（遺伝子番号１４１０）
ヒト１４１０配列（配列番号３７）（死関連タンパク質キナーゼ１（ＤＡＰキナーゼ１としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約５９１０ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号３７の核酸約３３７〜４６３２に位置する）は、１４３１アミノ酸のタンパク質（配列番号３８）をコードする。
【０１０３】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１４１０  ｍＲＮＡは、骨髄および臍帯血の造血性前駆体ＣＤ３４＋細胞、および胎児肝臓において、高いレベルで発現した。さらなる分析は、１４１０がまた、インビトロの分化赤血球系細胞において発現されることを示した。
【０１０４】
死関連タンパク質キナーゼ１（ＤＡＰキナーゼ１）または１４１０は、インターフェロンγ誘導性ＨｅＬａ細胞死に関連する、プロアポトーシス遺伝子である。インビトロにおける１４１０の過剰発現は、ＰＣ１２細胞のアポトーシスを引き起こす。１４１０は、プロアポトーシス遺伝子であり、そのプロモーターは、ＴＧＦ媒介アポトーシスを起こす細胞において、ＴＧＦ−βにより活性化される。１４１０活性の阻害は、ＴＧＦ−β誘導性アポトーシスからへパトーム細胞を保護する。造血性前駆細胞における１４１０の阻害は、これらの細胞において、アポトーシスの減少を潜在的に引き起こす。アポトーシスをブロックされた造血性細胞は、増殖し続け、そして新しい造血性細胞の数の増加を引き起こし得る。従って、１４１０は、アポトーシスの誘導を阻止する、機能的な役割を、潜在的に有する。骨髄、臍帯血および胎児肝臓におけるその機能的役割および発現パターンに起因して、１４１０は、血液障害に関連する疾患の調節において役割を果たし得る。従って、１４１０活性のモジュレーターは、血液障害（貧血が挙げられるが、これに限定されない）の処置において、有用である。本発明の１４１０ポリペプチドは、１４１０活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１０５】
（遺伝子番号１３７）
ヒト１３７配列（配列番号３９）、（ムスカリン性アセチルコリンレセプターＭ３としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約３９０６ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号３９の核酸約２０２〜１９７４に位置する）は、５９０アミノ酸のタンパク質（配列番号４０）をコードする。
【０１０６】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１３７  ｍＲＮＡは、骨髄および臍帯血および末梢血においての造血性前駆細胞ならびに脳内において発現された。この遺伝子の発現レベルは、造血性前駆細胞の、好中球、巨核球および赤血球系統へのインビトロでの分化の際に減少した。
【０１０７】
ムスカリン性アセチルコリンレセプターＭ３または１３７は、種々の細胞内応答（アデニル酸シクラーゼの阻害、ホスホイノシチドの分解およびカリウムイオンチャネルの調節を含む）を媒介する。１３７のアゴニストは、インビトロにおける神経性幹細胞およびオリゴデンドロサイト前駆細胞の増殖を引き起こし、このことは、このレセプターの刺激が、ＣＤ３４＋造血性幹細胞の増殖を増し、全ての造血性系統の細胞数の増加を引き起こすことを示唆する。従って、骨髄、臍帯血および脳における１３７  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能的役割とともに、１３７活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少、血小板減少および貧血、ならびに／または数が増加したか、または異常な好中球、血小板または赤血球により特徴付けられる状態が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において、有用である。本発明の１３７ポリペプチドは、１３７活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１０８】
（遺伝子番号１８７１）
ヒト１８７１配列（配列番号４１）、（Ｇタンパク質共役型レセプターとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２４１６ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号４１の核酸約２１７〜１２３３に位置する）は、３３８アミノ酸のタンパク質（配列番号４２）をコードする。
【０１０９】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１８７１  ｍＲＮＡは、脳、胎盤およびＣＤ３４＋前駆細胞において、有意なレベルで発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、１８７１  ｍＲＮＡが、インビトロで、赤血球培養増殖物、巨核球培養増殖物、および好中球培養増殖物において発現されることを示した。
【０１１０】
１８７１に対するリガンド、Ｇタンパク質共役型レセプターは、ＵＤＰ−グルコースであり、このＵＤＰ−グルコースは、エタノール処理ラットの再生肝臓における脂質細胞増殖の修復に関連する（Ｆｕｎａｋｉら、Ｊ  Ｈｅｐａｔｏｌ  １９２  １５（３）：３６７−７１）。１８７１に対するリガンドは、細胞増殖を誘導する。従って、このレセプターを苦しめることは、造血性前駆細胞の増殖の増加を引き起こし、赤血球系好中球および巨核球細胞の数の増加を引き起こす。脳、胎盤およびＣＤ３４＋前駆細胞における１８７１  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能的役割とともに、１８７１のモジュレーターは、血液障害（好中球減少、血小板減少および貧血、ならびに／または数が増加したかまたは異常な好中球、血小板または赤血球により特徴付けられる状態が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において、有用である。１８７１活性のモジュレーターは、血液障害の処置において有用である。本発明の１８７１ポリペプチドは、１８７１活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１１１】
（遺伝子番号１３０５１）
ヒト１３０５１配列（配列番号４３）、（脂肪酸アミドヒドロラーゼとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２０６３ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号４３の核酸約３６〜１７７５に位置する）は、５７９アミノ酸のタンパク質（配列番号４４）をコードする。
【０１１２】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１３０５１  ｍＲＮＡは、造血性前駆体ＣＤ３４＋細胞において発現され、赤血球系培養物、巨核球培養物および好中球培養物のインビトロでの分化の間にダウンレギュレートされた。１３０５１  ｍＲＮＡは、ｌｌｂ＋好中球前駆体においてよりも１ｌｂ−好中球前駆体において有意に高いレベルで発現された。
【０１１３】
１３０５１は脂肪酸アミドヒドロラーゼである。脂肪酸アミドヒドロラーゼは、ヒト乳癌細胞において抗増殖効果を有する、アラキドン酸エタノールアミド（ＡＥＡ）の分解を触媒する主要な酵素である。脂肪酸アミドヒドロラーゼの阻害は、ＡＥＡの抗増殖効果を高める。従って、１３０５１の阻害は、赤血球系統、巨核球系統および好中球系統の拡大を生じる造血性前駆細胞の増殖の増加を引き起こす。造血性（ｈｅｍａｔｉｏｐｏｉｅｔｉｃ）前駆体ＣＤ３４＋細胞におけるその機能的役割および発現パターンに起因して、１３０５１は、血液障害に関連する疾患の調節において、役割を果たす。従って、１３０５１活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数の増加により特徴付けられる障害が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１３０５１ポリペプチドは、１３０５１活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１１４】
（遺伝子番号１８４７）
ヒト１８４７配列（配列番号４５）、（トリプターゼ１としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１１５４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号４５の核酸約１８〜８４５に位置する）は、２７５アミノ酸のタンパク質（配列番号４６）をコードする。
【０１１５】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１８４７  ｍＲＮＡは、造血性前駆細胞、非照射間質細胞、肥満細胞およびインビトロで生成された赤血球ならびに巨核球細胞において、最も高いレベルで発現された。
【０１１６】
１８４７またはトリプターゼ１（αトリプターゼ）は、肥満細胞に存在する主要な中性プロテアーゼである。１８４７は、肥満細胞の活性化の際に分泌される。造血性前駆体および間質細胞における顕著な発現を想定すると、１８４７の機能的役割は、造血を刺激するホルモン分解である。従って、１８４７を阻害することは、インビボでの造血性前駆体増殖を刺激する。造血性前駆細胞、非照射間質細胞、肥満細胞およびインビトロで生成された赤血球細胞および巨核球細胞におけるその機能的役割および発現パターンに起因して、１８４７は、血液障害に関連する疾患の調節において役割を果たす。従って、１８４７活性のモジュレーターは、血液障害の処置において有用である。本発明の１８４７ポリペプチドは、１８４７活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１１７】
（遺伝子番号１８４９）
ヒト１８４９配列（配列番号４７）、（トリプターゼ２としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１１４３ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号４７の核酸約６〜８３３に位置する）は、２７５アミノ酸のタンパク質（配列番号４８）をコードする。
【０１１８】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１８４９  ｍＲＮＡは、造血性前駆細胞、非照射間質細胞、肥満細胞およびインビトロで生成された赤血球細胞および巨核球細胞ならびに肺組織において、最も高いレベルで発現された。
【０１１９】
１８４９遺伝子またはトリプターゼ２（βトリプターゼ）遺伝子は、肥満細胞に存在する主要な中性プロテアーゼである。１８４９は、脂肪細胞の活性化の際に分泌される。造血性前駆体および間質細胞における顕著な発現を想定すると、１８４９の機能的役割は、造血を刺激するホルモン分解である。従って、１８４９を阻害することは、インビボにおける造血性前駆増殖を刺激する。造血性前駆細胞、非照射間質細胞、肥満細胞ならびにインビトロで生成された赤血球細胞および巨核球細胞ならびに肺組織におけるその機能的役割および発現パターンに起因して、１８４９は、血液障害に関連する疾患の調節において役割を果たす。従って、１８４９活性のモジュレーターは、血液障害の処置において有用である。本発明の１８４９ポリペプチドは、１８４９活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１２０】
（遺伝子番号１５４０２）
ヒト１５４０２配列（配列番号４９）（スルホトランスフェラーゼ（ＨＮＫ−１）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２８７７ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号４９の核酸約３８７〜１４５７に位置する）は、３５６アミノ酸のタンパク質（配列番号５０）をコードする。
【０１２１】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１５４０２  ｍＲＮＡは、脳、造血前駆細胞、インビトロで生成された赤血球系細胞および赤血球系細胞株Ｋ５６２において発現された。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、１５４０２  ｍＲＮＡ発現は、グリコホリンＡ（ＧＰＡ）高細胞と比較して、ＧＰＡ低細胞においてより高かった。さらに、１５４０２  ｍＲＮＡは、造血細胞のインビトロで生成される間、アップレギュレートされたが、１５４０２  ｍＲＮＡ発現は、好中球および巨核球のインビトロで生成される間、ダウンレギュレートされた。
【０１２２】
１５４０２またはＨＮＫ−１は、細胞接着分子上の、ＨＮＫ−１炭水化物エピトープの合成を指向する。ＨＮＫ−１炭水化物エピトープは、細胞相互作用に関与する（Ｂａｋｋｅｒら、ＪＢＣ  ２７２：２９９４２−２９９４６）。ＣＡＭを介した細胞間相互作用は、「造血の強力なネガティブレギュレーター」として働くことが知られている（Ｚａｎｎｅｔｔｉｎｏら、Ｂｌｏｏｄ  ８：２６１３−２６２８）。１５４０２は、造血性前駆体において見出される、細胞接着分子上のＨＮＫ−１炭水化物エピトープの合成を指向することにより、造血性増殖を阻害するよう働く。従って、１５４０２の活性を阻害することは、造血性細胞数の増加を引き起こす。脳、造血性前駆細胞、インビトロで生成された赤血球系細胞および赤血球細胞株Ｋ５６２における、１５４０２  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能的役割とともに、１５４０２のモジュレーターは、血液障害の処置において、有用である。１５４０２活性のモジュレーターは、血液障害の処置において、有用である。本発明の１５４０２ポリペプチドは、１５４０２活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１２３】
（遺伝子番号３４０）
ヒト３４０配列（配列番号５１）（Ｇタンパク質結合レセプター（プロテイナーゼ活性化レセプター２、ＰＡＲ−２）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１４５１ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号５１の核酸約１４８〜１３４１に位置する）は、３９７アミノ酸のタンパク質（配列番号５２）をコードする。
【０１２４】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、３４０  ｍＲＮＡは、腎臓ならびに造血性前駆細胞において発現した。３４０は、デオーファン（ｄｅ−ｏｒｐｈａｎｅｄ）Ｇタンパク質共役型レセプターＰＡＲ−２（プロテイナーゼ活性化レセプター２）である。公知のプロテナーゼによる３４０遺伝子の切断は、この遺伝子を活性化し、そして細胞増殖を引き起こす。従って、３４０またはＰＡＲ−２をアゴナイズすることは、このレセプターを活性化し、そして造血性前駆細胞の増殖を引き起こし、その結果、造血性細胞数の増加を生じる。腎臓および造血性前駆細胞における３４０  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能的役割と共に、３４０のモジュレーターは、血液障害の処置に有用である。本発明の３４０ポリペプチドは、３４０活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１２５】
（遺伝子番号１０２１７）
ヒト１０２１７配列（配列番号５３）（Ｐ２Ｘ１  ＡＴＰレセプターとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２６４３ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号５３の核酸約１７４〜１３７３に位置する）は、３９９アミノ酸のタンパク質（配列番号５４）をコードする。
【０１２６】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１０２１７  ｍＲＮＡは、造血前駆細胞、インビトロ生成巨核球およびインビボの好中球において発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、１０２１７  ｍＲＮＡ発現が、赤血球系統へのインビトロ分化の間、ＣＤ３４＋前駆体において高いレベルからダウンレギュレートされることを示した。
【０１２７】
１０２１７またはＰ２Ｘ１  ＡＴＰレセプターの活性をブロックすることは、胸腺細胞における、ＡＴＰ誘導性アポトーシスを阻害することを示した（Ｎａｇｙら、Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｌｅｔｔ  ７２：２３−３０，２０００）。従って、造血性前駆細胞における１０２１７の作用をアンタゴナイズすることは、ＡＴＰ誘導性アポトーシスを阻害し、造血性前駆細胞数の増加を引き起こす。造血性前駆細胞、巨核細胞および好中球における、その機能的役割および発現パターンに起因して、１０２１７は、血液障害関連疾患の調節において役割を果たす。従って、１０２１７活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数の増加に特徴付けられる疾患が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１０２１７ポリペプチドは、１０２１７活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１２８】
（遺伝子番号８３７）
ヒト８３７配列（配列番号５５）（ニコチン性アセチルコリンレセプターα７としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約２０８７ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号５５の核酸約１０４〜１６１２に位置する）は、５０２アミノ酸のタンパク質（配列番号５６）をコードする。
【０１２９】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、８３７  ｍＲＮＡは、脳、造血性前駆細胞およびＣＤ１ｌｂ−１５＋好中球において、高いレベルで発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、８３７  ｍＲＮＡ発現は、初期ＣＤ１ｌｂ−１５＋細胞と比較した場合、インビボにおいて、ＣＤｌｌｂ＋１５＋細胞をダウンレギュレートすることを示した。この発現は、インビトロにおける好中球系統への分化の間、維持された。さらに、８３７  ｍＲＮＡ発現は、インビトロにおける、巨核球系統および造血性系統の生成の間、ダウンレギュレートされた。
【０１３０】
８３７は、ニコチン性アセチルコリンレセプターα７である。８３７のアンタゴニストは、細胞増殖を阻害することが示された（Ｃｏｄｉｇｎｏｌａら  ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ  ３４２：２８６−２９０）。８３７はまた、増殖を阻害するアンタゴニストを有する、異なる細胞型の増殖に重要である。従って、８３７をアゴナイズすることは、造血性前駆細胞（特に、好中球）の増殖を増加する。脳、造血性前駆細胞およびＣＤ１ｌｂ−１５＋好中球におけるその機能的役割および発現パターンに起因して、８３７は、血液障害に関連する疾患の調節において役割を果たす。従って、８３７活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数の増加に特徴付けられる疾患が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の８３７ポリペプチドは、８３７活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１３１】
（遺伝子番号１７６１）
ヒト１７６１配列（配列番号５７）（カテプシンＧとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約８５７ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号５７の核酸約９〜７７６に位置する）は、２５５アミノ酸のタンパク質（配列番号５８）をコードする。
【０１３２】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１７６１  ｍＲＮＡは、造血性前駆細胞、ＣＤ１ｌｂ−１５＋好中球、グリコホリンＡ＋細胞およびインビトロ分化好中球において、高レベルで発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、１７６１  ｍＲＮＡが、後期ＣＤ１１ｂ＋１５ｂ＋細胞よりも、初期ＣＤ１１ｂ−１５＋好中球において高く発現することを示した。さらに、１７６１  ｍＲＮＡは、インビトロ生成巨核球および赤血球においてアップレギュレートされ、次いでこれらの培養物中で、１２日でダウンレギュレートされる。インビトロ好中球培養物においては、１７６１  ｍＲＮＡはアップレギュレートされたままである。
【０１３３】
１７６１は、好中球において発現されることが公知のプロテアーゼである。１７６１は、間質細胞由来因子ＳＤＦ−１を切断し、かつ不活性化する（Ｅｕｒ  Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ（３）：６９９−７０７，２００１）。ＳＤＦ−１は、造血の重要なレギュレーターであることが知られている増殖因子であり、造血性前駆細胞のアポトーシスを抑制する（Ｌａｔａｉｌｌａｄｅら，Ｂｌｏｏｄ  ４：１１１７−２９，２００２）。従って、造血性前駆細胞において１７６１プロテアーゼの機能を阻害することは、ＳＤＦ−１の活性の増加を引き起こし、これは、造血細胞数の増加を引き起こす、初期造血をポジティブに調節する。造血性前駆細胞、ＣＤ１ｌｂ−１５＋好中球、グリコホリンＡ＋細胞およびインビトロ分化好中球における１７６１  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能と共に、１７６１活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数の増加が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において有用である。本発明の１７６１ポリペプチドは、１７６１活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１３４】
（遺伝子番号８９９０）
ヒト８９９０配列（配列番号５９）（アルギナーゼＩＩとしても公知）は、非翻訳領域も含めて、約１３５４ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号５９の核酸約２１〜１０８５に位置する）は、３５４アミノ酸のタンパク質（配列番号６０）をコードする。
【０１３５】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、８９９０  ｍＲＮＡは、赤血球および巨核球細胞の成熟によりアップレギュレートされた。８９９０  ｍＲＮＡは、インビトロ分化赤血球において、迅速にアップレギュレートされ、プールされた赤血球培養物においては、０日目、１日目、２日目、６日目で低く、そしてプールされた赤血球培養物においては、１０日目／１２日目で非常に高かった。８９９０  ｍＲＮＡはまた、ＣＦＵ−Ｅ細胞において、ＥＰＯ刺激への応答の際にアップレギュレートされた。
【０１３６】
アルギナーゼＩＩの阻害は、赤血球におけるアポトーシスをポジティブに阻害する。アルギナーゼＩＩアップレギュレーションは、赤血球系統の分化に関し、そして、初期サイクル期に細胞を維持するための能力は、長期間、赤血球のプールの増殖を引き起こす。赤血球および巨核球細胞にけるその機能的役割および発現パターンに起因して、８９９０は、血液障害に関連する疾患の調節において役割を果たす。従って、８９９０活性のモジュレーターは、血液障害の処置において有用である。本発明の８９９０ポリペプチドは、８９９０活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１３７】
（遺伝子番号１３２４９）
ヒト１３２４９配列（配列番号６１）（セリンスレオニンキナーゼ（ＪＩＫ）としても公知）は、非翻訳領域も含めて、約３０３２ヌクレオチド長である。このコード配列（配列番号６１の核酸約２９６〜２９９２に位置する）は、８９８アミノ酸のタンパク質（配列番号６２）をコードする。
【０１３８】
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１３２４９  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４前駆細胞、インビトロ分化赤血球および巨核球細胞ならびに好中球において発現された。さらなるＴａｑＭａｎ分析は、１３２４９  ｍＲＮＡレベルがまた、初期（ＧＰＡ高発現集団およびＧＰＡ低発現集団）赤血球およびインビトロ培養赤血球において、分化の全ての段階で、高く、大部分の成熟赤血球においては、わずかに上昇することを示した。
【０１３９】
１３２４９はまた、ＪＮＫを阻害する、ＪＮＫ阻害キナーゼ（ＪＩＫ）として知られている。ＪＮＫは、ＥＰＯレセプターの下流で作用する。ＥＰＯレセプターは、赤血球増殖および分化に重要である。１３２４９すなわちＪＩＫは、基礎ＪＮＫ活性を阻害し、そしてＥＧＦ活性化に対する反応を減少する。ここで、１３２４９すなわちＪＩＫは、ＥＲＫ２、ＥＲＫ５、ＥＲＫ６またはｐ３８  ＭＡＰキナーゼを阻害しない（Ｔａｓｓｉ，Ｅら  ＪＢＣ，２７４，１９９９，３３２８７−９５）。従って、１３２４９すなわちＪＩＫの阻害は、ＪＮＫ活性の増加およびＥＰＯレセプターを介したシグナル伝達の増加を引き起こし、これは、赤血球の増殖の増加を引き起こす。ＣＤ３４前駆細胞、インビトロ分化赤血球および巨核球細胞ならびに好中球におけるその機能的役割および発現パターンに起因して、１３２４９は、血液障害関連疾患の調節において役割を果たす。従って、１３２４９活性のモジュレーターは、血液障害（好中球減少および／または好中球数増加により特徴付けられる疾患が挙げられるが、これらに限定されない）の処置において、有用である。本発明の１３２４９ポリペプチドは、１３２４９活性のモジュレーターのスクリーニングに有用である。
【０１４０】
本発明の種々の局面は、以下の小節において、さらに詳細に記載される：
（スクリーニングアッセイ：）
本発明は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質に結合するか、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の発現あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の活性に対して刺激効果または阻害効果を有するか、あるいは例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の基質の発現または活性に対して刺激効果または阻害効果を有する、モジュレーター（すなわち、候補化合物もしくは試験化合物または候補薬剤もしくは試験薬剤（例えば、ペプチド、ペプチド模倣物、低分子（有機または無機）または他の薬物））を同定するための方法（これは、本明細書中で「スクリーニングアッセイ」とも呼ばれる）を提供する。本明細書中に記載のアッセイを使用して同定される化合物は、血液障害を処置するのに有用であり得る。
【０１４１】
これらのアッセイは、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質に結合する化合物、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質と相互作用する他の細胞内タンパク質または細胞外タンパク質に結合する化合物、および他の細胞内タンパク質または細胞外タンパク質と１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質との相互作用を妨害する化合物を同定するように設計されている。例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質（これは、膜貫通レセプター型タンパク質である）の場合、このような技術は、このようなレセプターのためのリガンドを同定し得る。１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質のリガンドまたは基質は、例えば、血液障害の少なくとも１つの症状に対して使用され得る。このような化合物としては、ペプチド、抗体、または有機低分子化合物もしくは無機低分子化合物が挙げられ得るがこれらに限定されない。このような化合物はまた、他の細胞性タンパク質を含み得る。
【０１４２】
アッセイによって同定される化合物（例えば、本明細書に記載の化合物）は、例えば、血液障害を処置するのに有用であり得る。血液障害状態が、細胞または組織における、全体的に低いレベルの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の遺伝子発現および／あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のタンパク質により生じる場合、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のタンパク質と相互作用する化合物は、結合した１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のタンパク質の活性を強調するかまたは増幅する化合物を含み得る。このような化合物は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のタンパク質活性のレベルの効果的な増大を引き起し、したがって、症状を改善する。
【０１４３】
他の例において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の遺伝子における変異は、血液障害に至る有害な効果を有する、異常型または過剰量の、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質を生じさせ得る。同様に、生理学的状態は、血液障害に至る、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の遺伝子発現の過剰な増大を引き起こし得る。このような場合、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質に結合する化合物は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質の活性を阻害するタンパク質として同定され得る。本節で記載されるような技術によって同定される化合物の有効性を試験するためのアッセイは、本明細書中に議論されている。
【０１４４】
１つの実施形態において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のタンパク質またはポリペプチドあるいはそれらの生物学的に活性な部分の基質である候補化合物または試験化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。別の実施形態において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のタンパク質またはポリペプチドまたはその生物学的活性な部分に結合するかまたはその活性を調節する候補化合物または試験化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。本発明の試験化合物は、以下に挙げられる当該分野で公知のコンビナトリアルライブラリー法における多くのアプローチのうちの任意のものを使用して得られ得る：生物学的ライブラリー；空間的にアドレス可能な並列固相ライブラリーまたは液相ライブラリー；デコンボルーション処理を必要とする合成ライブラリー法；「１ビーズ１化合物」ライブラリー法；およびアフィニティクロマトグラフィー選択を使用する合成ライブラリー法。生物学的ライブラリーアプローチは、ペプチドライブラリーに限定されるが、他の４つのアプローチは、化合物の、ペプチドライブラリー、非ペプチドオリゴマーライブラリー、または低分子ライブラリーに適用可能である（Ｌａｍ，Ｋ．Ｓ．（１９９７）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｓ．１２：１４５）。
【０１４５】
分子ライブラリーの合成のための方法の例は、例えば、以下において、当該分野で見出され得る：ＤｅＷｉｔｔら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９０：６９０９；Ｅｒｂら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：１１４２２；Ｚｕｃｋｅｒｍａｎｎら（１９９４）、Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３７：２６７８；Ｃｈｏら（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６１：１３０３；Ｃａｒｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３３：２０５９；Ｃａｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３３：２０６１；およびＧａｌｌｏｐら（１９９４）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３７：１２３３。
【０１４６】
化合物のライブラリーは、溶液中（例えば、Ｈｏｕｇｈｔｅｎ（１９９２）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １３：４１２〜４２１）、またはビーズ上（Ｌａｍ（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ  ３５４：８２〜８４）、チップ上（Ｆｏｄｏｒ（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ  ３６４：５５５〜５５６）、細菌上（Ｌａｄｎｅｒ、米国特許第５，２２３，４０９号）、芽胞上（Ｌａｄｎｅｒ、ＵＳＰ’４０９号）、プラスミド上（Ｃｕｌｌら（１９９２）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ８９：１８６５〜１８６９）またはファージ上（ＳｃｏｔｔおよびＳｍｉｔｈ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：３８６〜３９０）；（Ｄｅｖｌｉｎ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：４０４〜４０６）；（Ｃｗｉｒｌａら（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８７：６３７８〜６３８２）；（Ｆｅｌｉｃｉ（１９９１）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：３０１〜３１０）；（Ｌａｄｎｅｒ  前出）に提示され得る。
【０１４７】
１つの実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、ここで１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、もしくは１３２４９タンパク質またはその生物学的に活性な部分を発現する細胞を、試験化合物と接触させ、そして試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の活性を調節する能力を決定する。試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の活性を調節する能力の決定を、例えば、細胞内カルシウム、ＩＰ３、ｃＡＭＰ、またはジアシルグリセロール濃度、細胞内タンパク質のリン酸化プロフィール、細胞増殖および／または移動、例えば、細胞表面接着分子もしくは造血に関連する遺伝子の遺伝子発現、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９により調節される転写因子の活性をモニタリングすることによって達成し得る。この細胞は、哺乳動物由来（例えば、神経細胞由来）であり得る。１つの実施形態において、レセプタードメインと相互作用する化合物が、リガンドとして（すなわち、レセプターに結合し、シグナル伝達経路を調節するよう）機能するそれらの能力についてスクリーニングされ得る。リガンドの同定、およびリガンド−レセプター複合体の活性の測定は、この相互作用のモジュレーター（例えば、アンタゴニスト）の同定を導く。このようなモジュレーターは、血液障害の処置に有用であり得る。
【０１４８】
基質への１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の結合を調節する試験化合物の能力、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９に結合する試験化合物の能力もまた、決定され得る。基質への１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の結合を調節する試験化合物の能力の決定は、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の基質を、放射性同位体または酵素標識とカップリングさせることによって達成され得、その結果、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９への、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の基質の結合は、複合体中の標識された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の基質を検出することによって、決定され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９はまた、放射性同位体または酵素標識とカップリングされて、複合体中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の基質への１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の結合を調節する試験化合物の能力をモニタリングし得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９と結合する試験化合物の能力の決定は、例えば、その化合物と、放射性同位体または酵素標識とをカップリングさせることによって達成され、その結果、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９へのこの化合物の結合は、複合体中の標識された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の化合物を検出することによって決定され得る。例えば、化合物（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のリガンドまたは基質）を、１２５Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ、または３Ｈで、直接的または間接的のいずれかで標識し得、そしてこの放射性同位体が、放射線の直接的な計数によってか、またはシンチレーション計数によってかで検出され得る。化合物はさらに、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはルシフェラーゼで酵素標識され得、そして適切な基質の産物への変換を測定することによって、この酵素標識を検出し得る。
【０１４９】
相互作用するもののいずれも標識することなく、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９と相互作用する化合物（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のリガンドまたは基質）の能力を決定することもまた、本発明の範囲内である。例えば、微視的生理機能測定器を使用して、化合物も１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９のいずれも標識することなく、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９との化合物の相互作用を検出し得る（ＭｃＣｏｎｎｅｌｌ，Ｈ．Ｍ．ら（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５７：１９０６−１９１２）。本明細書中で使用される場合、「微視的生理機能測定器（ｍｉｃｒｏｐｈｙｓｉｏｍｅｔｅｒ）」（例えば、細胞センサー（Ｃｙｔｏｓｅｎｓｏｒ））は、光アドレス可能な電位差計センサー（ＬＡＰＳ）を使用して、細胞がその環境を酸性化する速度を測定する分析機器である。この酸性化速度の変化を、化合物と１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９との間の相互作用の指標として使用し得る。
【０１５０】
別の実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、これは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の標的分子（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の基質）を発現する細胞を、試験化合物と接触させる工程、ならびにこの試験化合物が、この１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の標的分子の活性を調節（例えば、刺激または阻害）する能力を決定する工程を包含する。この試験化合物が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の標的分子の活性を調節する能力の決定は、例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の標的分子と結合または相互作用する能力を決定することによって、達成され得る。
【０１５１】
１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質あるいはこれらの生物学的に活性なフラグメントが、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の標的分子と結合または相互作用する能力の決定は、直接結合の決定に関して上記の方法の１つによって、達成され得る。好ましい実施形態において、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９の標的分子と結合または相互作用する能力の決定は、その標的分子の活性を決定することによって、達成され得る。例えば、この標的分子の活性は、その標的の細胞セカンドメッセンジャー（すなわち、細胞内Ｃａ２＋、ジアシルグリセロール、ＩＰ３、ｃＡＭＰ）の誘導を検出すること、適切な基質への標的の触媒活性／酵素活性を検出すること、レポーター遺伝子（検出可能なマーカー（例えば、ルシフェラーゼ）をコードする核酸に作動可能に連結された標的応答性調節エレメントを含む）の誘導を検出すること、または標的で調節された細胞応答（例えば、遺伝子発現）を検出することにより、決定され得る。
【０１５２】
なお別の実施形態において、本発明のアッセイは無細胞アッセイであり、ここで、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質またはこれらの生物学的に活性な部分は、試験化合物と接触され、そして試験化合物が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質またはこれらの生物学的に活性な部分に結合する能力が決定される。本発明のアッセイにおいて使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質の好ましい生物学的に活性な部分は、非１３１分子、非１４８分子、非１９９分子、非１２３０３分子、非１３９０６分子、非１５５１３分子、非１７８２２分子、非３０２分子、非５６７７分子、非１９４分子、非１４３９３分子、非２８０５９分子、非７３６６分子、非１２２１２分子、非１９８１分子、非２６１分子、非１２４１６分子、非２７０分子、非１４１０分子、非１３７分子、非１８７１分子、非１３０５１分子、非１８４７分子、非１８４９分子、非１５４０２分子、非３４０分子、非１０２１７分子、非８３７分子、非１７６１分子、非８９９０分子、もしくは非１３２４９分子との相互作用に関与するフラグメント（例えば、高い表面確立スコアを有するフラグメント）を含む。試験化合物の、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質への結合は、上記のように直接的にかまたは間接的にかのいずれかで測定され得る。好ましい実施形態において、このアッセイは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質またはこれらの生物学的に活性な部分を、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９に結合する既知の化合物と接触させ、アッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物を試験化合物と接触させる工程、および試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程を包含し、ここで、試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程は、試験化合物が、既知の化合物と比較して優先的に１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９あるいはこれらの生物学的に活性な部分に結合する能力を決定する工程を含む。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の、既知の標的タンパク質との相互作用を調節する化合物は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質（特に、変異体１３１タンパク質、変異体１４８タンパク質、変異体１９９タンパク質、変異体１２３０３タンパク質、変異体１３９０６タンパク質、変異体１５５１３タンパク質、変異体１７８２２タンパク質、変異体３０２タンパク質、変異体５６７７タンパク質、変異体１９４タンパク質、変異体１４３９３タンパク質、変異体２８０５９タンパク質、変異体７３６６タンパク質、変異体１２２１２タンパク質、変異体１９８１タンパク質、変異体２６１タンパク質、変異体１２４１６タンパク質、変異体２７０タンパク質、変異体１４１０タンパク質、変異体１３７タンパク質、変異体１８７１タンパク質、変異体１３０５１タンパク質、変異体１８４７タンパク質、変異体１８４９タンパク質、変異体１５４０２タンパク質、変異体３４０タンパク質、変異体１０２１７タンパク質、変異体８３７タンパク質、変異体１７６１タンパク質、変異体８９９０タンパク質、もしくは変異体１３２４９タンパク質）の活性を調節するのに有用であり得る。
【０１５３】
別の実施形態において、アッセイは、無細胞アッセイであり、ここで、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質、またはその生物学的に活性な部分が試験化合物と接触され、そしてその試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパクまたはその生物学的に活性な部分の活性を調節（例えば、刺激または阻害）する能力が決定される。この試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質の活性を調節する能力の決定は、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的分子に結合する能力を、直接的結合の決定のための上記方法の１つによって決定することにより、達成され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的分子に結合する能力を決定することはまた、リアルタイムのＢｉｏｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ  Ａｎａｌｙｓｉｓ（ＢＩＡ）のような技術を用いて達成され得る（Ｓｊｏｌａｎｄｅｒ，Ｓ．およびＵｒｂａｎｉｃｚｋｙ，Ｃ．（１９９１）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．６３：２３３８〜２３４５およびＳｚａｂｏら（１９９５）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．５：６９９〜７０５）。本明細書において用いる場合、「ＢＩＡ」は、いずれの相互作用物（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ）も標識することなく、リアルタイムで生体特異的相互作用を研究するための技術である。表面プラズモン共鳴（ｓｕｒｆａｃｅ  ｐｌａｓｍｏｎ  ｒｅｓｏｒｎａｎｃｅ）（ＳＰＲ）の光学的現象（ｏｐｔｉｃａｌ  ｐｈｅｎｏｍｅｎｏｎ）における変化は、生物学的分子の間のリアルタイム反応の指標として用いられ得る。
【０１５４】
別の実施形態において、この試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質の活性を調節する能力の決定は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的分子の下流エフェクター活性をさらに調節する能力を決定することにより、達成され得る。例えば、このエフェクター分子の適切な標的に対する活性が決定され得るかまたはこのエフェクターの適切な標的に対する結合が、上に記載のように決定され得る。
【０１５５】
なお別の実施形態において、無細胞アッセイは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質またはその生物学的に活性な部分に、この１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質に結合する既知の化合物を接触させてアッセイ混合物を形成させる工程、このアッセイ混合物を、試験化合物と接触させる工程、およびこの試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程を包含し、ここで、この試験化合物が１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的分子と優先的に結合するか、またはその１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的分子の活性を優先的に調節する能力を決定する工程を包含する。
【０１５６】
本発明の上記アッセイ方法の１つより多い実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９またはその標的分子のいずれかを固定して、そのタンパク質の一方または両方の非複合体化形態からの複合体化形態の分離を促進し、そしてそのアッセイの自動化に適用させることが、望ましくあり得る。試験化合物の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質への結合、または候補化合物の存在下および非存在下での１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質の標的分子との相互作用は、これらの反応物を収容するために適切な任意の容器内で、達成され得る。このような容器の例には、マイクロタイタープレート、試験管、および微小遠心管が挙げられる。１つの実施形態において、そのタンパク質の一方または両方がマトリックスに結合することを可能にするドメインを付加する融合タンパク質が、提供され得る。例えば、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の融合タンパク質またはグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／標的融合タンパク質は、グルタチオンセファロースビーズ（Ｓｉｇｍａ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）またはグルタチオン誘導体化マイクロタイタープレート上に吸着され得、次いで、これらは、試験化合物と合わせられるか、あるいは試験化合物および非吸着の標的タンパク質または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質のいずれかと合わせられ、そしてこの混合物が、複合体形成に貢献する条件下（例えば、塩および���Ｈに関して生理学的条件）でインキュベートされる。インキュベーションに続いて、ビーズまたはマイクロタイタープレートウェルを洗浄して、結合していないあらゆる成分を除去し、ビーズの場合にはマトリックスを固定し、例えば、上記のように、複合体を直接的または間接的のいずれかで決定する。あるいは、複合体がマトリックスから解離され得、そして１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の結合レベルまたは活性レベルを、標準的な技術を使用して決定し得る。
【０１５７】
タンパク質をマトリックス上に固定するための他の技術もまた、本発明のスクリーニングアッセイにおいて使用され得る。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的分子のいずれかが、ビオチンとストレプトアビジンとの結合体化を利用して固定され得る。ビオチン化された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質または標的分子は、当該分野において公知の技術を使用して、ビオチンＮＨＳ（Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド）から調製され得（例えば、ビオチン化キット、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ、Ｒｏｃｋｆｏｒｄ、ＩＬ）、そしてストレプトアビジン被覆した９６ウェルのプレート（Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ）のウェルに固定され得る。あるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質または標的分子と反応性であるが、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質の標的分子への結合を妨害しない抗体が、そのプレートのウェルに誘導体化され得、そして結合していない標的またはタンパク質が、抗体の結合体化によってウェル内にトラップされ得る。このような複合体を検出するための方法には、ＧＳＴ固定複合体に関しての上記のものに加えて、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９��１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質または標的分子と反応性の抗体を使用する複合体の免疫検出、ならびに１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質または標的分子に関する酵素活性の検出に依存する酵素結合アッセイが挙げられる。
【０１５８】
別の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の発現のモジュレーターは、細胞が候補化合物と接触され、そして細胞中での１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が決定される方法において同定される。候補化合物の存在下での１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のレベルは、候補化合物の非存在下での１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のレベルと比較される。次いで、候補化合物は、この比較に基づき、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の発現のモジュレーターとして同定され得る。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が、候補化合物の非存在下よりも存在下で多い（統計的に有意に多い）場合、候補化合物は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質発現の刺激物質として同定される。あるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が、候補化合物の非存在下よりも存在下でより低い（統計学的に有意に低い）場合、候補化合物は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質発現のインヒビターとして同定される。細胞中での１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡ発現またはタンパク質発現のレベルは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のｍＲＮＡまたはタンパク質の検出について本明細書中に記載される方法により決定され得る。
【０１５９】
本発明のなお別の局面において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質は、ツーハイブリッドアッセイまたはスリーハイブリッドアッセイ（例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら、（１９９３）Ｃｅｌｌ  ７２：２２３〜２３２；Ｍａｄｕｒａら（１９９３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：１２０４６〜１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら（１９９３）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １４：９２０〜９２４；Ｉｗａｂｕｃｈｉら（１９９３）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  ８：１６９３−１６９６；およびＢｒｅｎｔ  ＷＯ９４／１０３００を参照のこと）において「ベイト（ｂａｉｔ）タンパク質」として使用されて、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９（「１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の結合タンパク質」または「１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９−ｂｐ」）と結合または相互作用し、そして１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の活性に関与する他のタンパク質を同定し得る。このような１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の結合タンパク質はまた、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２���０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の媒介性シグナル伝達経路の下流エレメントとして、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の標的によるシグナル伝達に関与する可能性がある。あるいは、このような１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の結合タンパク質は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のインヒビターである可能性がある。
【０１６０】
ツーハイブリッドシステムは、別個のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインからなる大半の転写因子のモジュラー性質に基づく。手短には、このアッセイは、２つの異なるＤＮＡ構築物を利用する。１つの構築物において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質をコードする遺伝子は、公知の転写因子（例えば、ＧＡＬ−４）のＤＮＡ結合ドメインをコードする遺伝子に融合される。もう一方の構築物において、同定されていないタンパク質（「プレイ（ｐｒｅｙ）」または「サンプル」）をコードするＤＮＡ配列のライブラリー由来のＤＮＡ配列は、公知の転写因子の活性化ドメインをコードする遺伝子に融合される。「ベイト」タンパク質および「プレイ」タンパク質がインビボで相互作用して１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９に依存性の複合体を形成し得る場合、転写因子のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインは、近接する。このように近接することにより、転写因子に応答性の転写調節部位に作動可能に連結したレポーター遺伝子（例えば、ＬａｃＺ）の転写が可能になる。レポーター遺伝子の発現が、検出され得、そして機能的転写因子を含む細胞コロニーは、単離され得、そして１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質と相互作用するタンパク質をコードするクローン化遺伝子を得るために使用され得る。
【０１６１】
別の局面において、本発明は、本明細書中に記載されるアッセイの２つ以上の組み合わせに関する。例えば、調節剤は、細胞ベースのアッセイまたは無細胞アッセイを用いて同定され得、そして１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９のタンパク質の活性を調節する因子の能力は、例えば、動物（例えば、本明細書中に記載される、血液障害の動物モデル）においてインビボで確認され得る。
【０１６２】
本発明はさらに、上記のスクリーニングアッセイによって同定される新規薬剤に関する。従って、適切な動物モデルにおいて、本明細書中で記載されるように同定された薬剤をさらに使用することは本発明の範囲内である。例えば、本明細書中に記載されるように同定された薬剤（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の調節剤、アンチセンスの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の核酸分子、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９に特異的な抗体、または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、もしくは１３２４９の結合パートナー）は、このような薬剤を用いる処置の効果、毒性、または副作用を決定するために、動物モデルにおいて使用され得る。あるいは、本明細書中に記載されるように同定される薬剤は、このような薬剤の作用の機構を決定するために、動物モデルにおいて使用され得る。さらに、本発明は、本明細書中に記載されるような処置についての上記スクリーニングアッセイによって同定された新規薬剤の使用に関する。
【０１６３】
任意の化合物（上記アッセイ系において同定されるような化合物が挙げられるがこれらに限定されない）が、血液障害を処置する能力について試験され得る。血液障害の少なくとも１つの症状に対するこのような能力を示す化合物の同定のための細胞ベースのアッセイおよび動物モデルベースのアッセイは、本明細書中に記載される。
【０１６４】
さらに、血液障害の動物ベースのモデル（例えば、本明細書中に記載されるようなモデル）は、血液障害を処置し得る化合物を同定するために使用され得る。このような動物モデルは、血液障害を処置する上で有効であり得る薬物、医薬品、治療、および介入の同定のための試験基質として使用され得る。例えば、動物モデルは、血液障害を処置する能力を示すことが予測される化合物に対して、曝露された動物における血液障害のこのような改善を導くのに十分な濃度および十分な時間、曝露され得る。この曝露に対する動物の応答は、処置の前および後の血液障害の症状の逆転を評価することによりモニタリングされ得る。
【０１６５】
介入に関して、血液障害の任意の局面を逆転する任意の処置が、ヒト血液障害治療介入の候補として考慮されるべきである。試験薬剤の投薬量は、用量応答曲線を得ることによって決定され得る。
【０１６６】
さらに、遺伝子発現パターンは、血液障害の少なくとも１つの症状に対する化合物の能力を評価するために使用され得る。例えば、１つ以上の遺伝子の発現パターンは、「遺伝子発現プロフィール」または「転写プロフィール」の一部を形成し得、次いで、このような評価において使用され得る。本明細書中で使用される場合、「遺伝子発現プロフィール」または「転写プロフィール」は、所定のセットの条件下で、所定の組織または細胞型について獲得されるｍＲＮＡ発現のパターンを含む。遺伝子発現プロフィールは、例えば、ディファレンシャルディスプレイ手順、ノーザン分析、および／またはＲＴ−ＰＣＲを使用することによって、作製され得る。１つの実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列は、このような遺伝子発現プロフィールの作製および確証のためのプローブおよび／またはＰＣＲプライマーとして使用され得る。
【０１６７】
遺伝子発現プロフィールは、細胞および／または動物ベースのモデル系における、既知の状態（心臓血管疾患または正常のいずれか）について特徴付けられ得る。その後、これらの既知の遺伝子発現プロフィールは、効果を確認するために比較され得、試験化合物は、このような遺伝子発現プロフィールを改変する必要があり、そしてそのプロフィールをより望ましいプロフィールの化合物とより緊密に類似させる必要がある。
【０１６８】
例えば、化合物の投与は、血液障害疾患モデル系の遺伝子発現プロフィールを、コントロール系とより緊密に類似させ得る。あるいは、化合物の投与は、コントロール系の遺伝子発現プロフィールに、血液障害または血液障害疾患状態を模倣させ始め得る。このような化合物は、例えば、目的の化合物のさらなる特徴付けにおいて使用され得るか、または、さらなる動物モデルの作製において使用され得る。
【０１６９】
（細胞ベースおよび動物ベースのモデル系）
血液障害のためのモデルとして作用する、細胞ベースおよび動物ベースの系が、本明細書中に記載される。これらの系は、種々の適用において使用され得る。例えば、細胞ベースおよび動物ベースのモデル系を使用して、心臓血管疾患に関連する、差次的に発現される遺伝子（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９）をさらに特徴付けし得る。さらに動物ベースおよび細胞ベースのアッセイは、以下に記載されるような血液障害を回復させ得る化合物を同定するように設計された、スクリーニングストラテジーの一部として使用され得る。従って、動物ベースおよび細胞ベースのモデルを使用して、血液障害を処置する際に有効であり得る薬物、医薬品、治療および介入を同定し得る。さらに、このような動物モデルを使用して、動物被験体におけるＬＤ５０およびＥＤ５０を決定し得、そしてこのようなデータを使用して、潜在的な血液障害処置のインビボでの効力を決定し得る。
【０１７０】
（動物ベースの系）
血液障害の動物ベースのモデル系としては、非組換え動物および操作されたトランスジェニック動物が挙げられ得るがこれらに限定されない。
【０１７１】
血液障害についての非組換え動物モデルとしては、例えば、遺伝的モデルが挙げられ得る。
【０１７２】
さらに、血液障害を示す動物モデルは、例えば、当業者に周知であるトランスジェニック動物を作製するための技術とともに、上記の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列を使用することによって、操作され得る。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列が、目的の動物のゲノムに導入され得、そしてこの目的の動物のゲノムにおいて過剰発現され得るか、あるいは内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列が存在する場合、これらは、過剰発現され得るか、また、あるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子発現を過少発現させるかまたはこれらの遺伝子発現を不活化させるために破壊され得るかのいずれかであり得る。
【０１７３】
本発明の宿主細胞をまた使用して、非ヒトトランスジェニック動物を作製し得る。例えば、１つの実施形態において、本発明の宿主細胞は、受精卵または胚性幹細胞であり、この細胞に、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のコード配列が導入されている。次いで、このような宿主細胞を使用して、非ヒトトランスジェニック動物を作製し得、ここで、外因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の配列が、それらのゲノムまたは相同組換え動物に導入され、ここで、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の配列が、変更されている。このような動物は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の機能および／または活性を研究するため、ならびに１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性のモジュレーターを同定および／または評価するために、有用である。本明細書中で使用される場合、「トランスジェニック動物」は、非ヒト動物であり、好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは、ラットまたはマウスのようなげっ歯類であり、ここで、これらの動物の１つ以上の細胞が、導入遺伝子を含む。トランスジェニック動物の他の例としては、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワトリ、両生類などが挙げられる。導入遺伝子は、外因性ＤＮＡであり、この外因性ＤＮＡは、トランスジェニック動物が成長する細胞のゲノムに取り込まれ、かつ成熟動物のゲノムにおいて維持され、それによってこのトランスジェニック動物の１つ以上の細胞型または組織における、コードされた遺伝子産物の発現を指向する。本明細書中で使用される場合、「相同組換え動物」は、非ヒト動物であり、好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは、マウスであり、ここで、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子は、この内因性遺伝子と、その動物の成長前にこの動物の細胞（例えば、動物の胎児性細胞）に導入された外因性ＤＮＡ分子との間の相同組換えによって変更されている。
【０１７４】
本発明の方法において使用されるトランスジェニック動物は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のコード核酸を、受精卵の雄前核に、例えば、マイクロインジェクション、レトロウイルス感染によって導入し、そして卵母細胞を偽妊娠雌養母動物において成長させることによって作製され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｃＤＮＡ配列は、導入遺伝子として、非ヒト動物のゲノムに導入され得る。あるいは、ヒトの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の非ヒトホモログ（例えば、マウスまたはラットの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子）が、導入遺伝子として使用され得る。あるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子ホモログ（例えば、別の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のファミリーメンバー）は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｃＤＮＡ配列へのハイブリダイゼーションに基づいて単離され得、そして導入遺伝子として使用され得る。イントロン配列およびポリアデニル化シグナルもまた、導入遺伝子の発現の効力を増加させるように、この導入遺伝子に含まれ得る。組織特異的調節配列は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の導入遺伝子に作動可能に連結されて、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の発現を特定の細胞に指向し得る。胚操作およびマイクロインジェクションを介して、トランスジェニック動物（特に、マウスのような動物）を作製するための方法は、当該分野において慣習的であり、例えば、以下に記載されている：米国特許第４，７３６，８６６号および同第４，８７０，００９号（両方とも、Ｌｅｄｅｒらによる）、米国特許第４，８７３，１９１号（Ｗａｇｎｅｒらによる）、ならびにＨｏｇａｎ，Ｂ．，Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｍｏｕｓｅ  Ｅｍｂｒｙｏ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８６）。類似の方法が、他のトランスジェニック動物の作製のために使用される。トランスジェニック始原（ｆｏｕｎｄｅｒ）動物は、そのゲノムにおける１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の導入遺伝子の存在、および／あるいは動物の組織または細胞における１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡの発現に基づいて、同定され得る。次いで、トランスジェニック始原動物を使用して、導入遺伝子を保有するさらなる動物を育種し得る。さらに、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質をコードする導入遺伝子を有するトランスジェニック動物はさらに、他の導入遺伝子を有する他のトランスジェニック動物を産出し得る。
【０１７５】
相同組換え動物を作製するために、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の少なくとも一部を含むベクターが調製され、このベクターに、欠失、付加または置換が導入されて、それによって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子が変更される（例えば、機能的に破壊される）。この１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子は、ヒト遺伝子であり得るが、より好ましくは、ヒトの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の非ヒトホモログである。例えば、ラットの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子を使用して、マウスゲノムにおいて内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子を変更するのに適切な、相同組換え核酸分子（例えば、ベクター）を構築し得る。好ましい実施形態において、相同組換え核酸分子は、相同組換えの際に、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子が機能的に破壊される（すなわち、もはや機能的タンパク質をコードしない；「ノックアウト」ベクターとも呼ばれる）ように、設計される。あるいは、相同組換え核酸分子は、相同組換えの際に、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子が変異されるか、さもなければ変更されるが依然として機能的タンパク質をコードする（例えば、上流の調節領域が変更され、それによって内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の発現を変更し得る）ように、設計され得る。相同組換え核酸分子において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の変更された部分は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子のさらなる核酸配列によって、その５’末端および３’末端に隣接され、相同組換え核酸分子によって保有される外因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子と、細胞（例えば、胚性幹細胞）中の内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子との間に、相同組換えが生じることを可能にする。隣接するさらなる１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸配列は、内因性遺伝子との首尾よい相同組換えに十分な長さの核酸配列である。代表的には、隣接したＤＮＡ（５’末端と３’末端の両方）の数キロベースが、この相同組換え核酸分子に含まれる（例えば、相同組換えベクターの記載については、Ｔｈｏｍａｓ，Ｋ．Ｒ．およびＣａｐｅｃｃｈｉ，Ｍ．Ｒ．（１９８７）Ｃｅｌｌ  ５１：５０３を参照のこと）。相同組換え核酸分子は、細胞（例えば、胚性幹細胞株）に（例えば、エレクトロポレーションによって）導入され、そして導入された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子が、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子と相同に組み換わる細胞が、選択される（例えば、Ｌｉ，Ｅ．ら（１９９２）Ｃｅｌｌ  ６９：９１５を参照のこと）。次いで、これらの選択された細胞は、動物（例えば、マウス）の胚盤胞に注射され、凝集キメラを形成し得る。（例えば、Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．Ｔｅｒａｔｏｃａｒｃｉｎｏｍａｓ  ａｎｄ  Ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ  Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅ．Ｊ．Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ編（ＩＲＬ，Ｏｘｆｏｒｄ，１９８７）１１３−１５２頁）を参照のこと）。次いで、キメラ胚は、適切な偽妊娠雌養母動物に移植され得、そしてこの胚は、生殖（ｔｅｒｍ）され得る。生殖細胞において相同組換えされたＤＮＡを含む子孫を使用して、動物を繁殖させ得、ここで、この動物の全ての細胞は、導入遺伝子の生殖系列伝達によって相同組換えされたＤＮＡを含む。相同組換え核酸分子（例えば、ベクター）または相同組換え動物を構築するための方法は、以下にさらに記載される：Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．（１９９１）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２：８２３−８２９、およびＬｅ  Ｍｏｕｅｌｌｅｃらによる、ＰＣＴ国際公開番号：ＷＯ  ９０／１１３５４；Ｓｍｉｔｈｉｅｓらによる、ＷＯ  ９１／０１１４０；Ｚｉｊｌｓｔｒａらによる、ＷＯ  ９２／０９６８；およびＢｅｒｎｓらによる、ＷＯ  ９３／０４１６９。
【０１７６】
別の実施形態において、本発明の方法において使用するためのトランスジェニック非ヒト動物が作製され得、この動物は、導入遺伝子の調節された発現を可能にする、選択された系を含む。このような系の１つの例は、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系である。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系の記載については、例えば、Ｌａｋｓｏら（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：６２３２−６２３６を参照のこと。リコンビナーゼ系の別の例は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＦＬＰリコンビナーゼ系である（Ｏ’Ｇｏｒｍａｎら（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５１：１３５１−１３５５）。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系を使用して導入遺伝子の発現を調節する場合、Ｃｒｅリコンビナーゼおよび選択されたタンパク質の両方をコードする導入遺伝子を含む動物が、必要とされる。このような動物は、「二重」トランスジェニック動物の構築によって（例えば、２種のトランスジェニック動物（一方は、選択されたタンパク質をコードする導入遺伝子を含み、他方は、リコンビナーゼをコードする導入遺伝子を含む）を交配させることによって）提供され得る。
【０１７７】
本明細書中に記載される非ヒトトランスジェニック動物のクローンはまた、以下に記載される方法に従って作製され得る：Ｗｉｌｍｕｔ，Ｉ．ら（１９９７）Ｎａｔｕｒｅ  ３８５：８１０−８１３およびＰＣＴ国際公開番号ＷＯ  ９７／０７６６８およびＷＯ  ９７／０７６６９。簡潔には、トランスジェニック動物由来の細胞（例えば、体細胞）が単離され得、そして増殖周期を出てＧｏ期に入るように誘導され得る。次いで、休止細胞が、例えば、電気パルスの使用を介して、この休止細胞が単離される同じ種の動物由来の除核された卵母細胞に融合され得る。次いで、この再構築された卵母細胞は、桑実胚または未分化胚芽細胞が成長するように培養され、次いで、偽妊娠雌養母動物に移される。この雌養母動物に由来する子孫は、細胞（例えば、体細胞）が単離される動物のクローンである。
【０１７８】
次いで、容易に検出可能なレベルの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡあるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のペプチド（１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のエピトープに対する抗体を使用して、免疫細胞化学的に検出される）を発現する、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のトランスジェニック動物は、特徴的な血液障害を示す動物を同定するために、さらに評価されるべきである。
【０１７９】
（細胞ベースの系）
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質をコードする、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列を含み、かつこれらを発現し、そしてさらに例えば、造血（ｈｅｍａｔｏｐｏｉｅｓｉｓ）に関連する細胞表現型を示す細胞を使用して、効果を示す化合物を同定し得る。このような細胞としては、以下が挙げられ得る：非組換え単球細胞株（例えば、Ｕ９３７（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１５９３）、ＴＨＰ−１（ＡＴＣＣ番号ＴＩＢ−２０２）、およびＰ３８８Ｄ１（ＡＴＣＣ番号ＴＩＢ−６３））；内皮細胞（例えば、ヒト臍静脈内皮細胞（ＨＵＶＥＣ）、ヒト微小血管内皮細胞（ＨＭＶＥＣ）、およびウシ大動脈内皮細胞（ＢＡＥＣ））；ならびに、一般的な哺乳動物細胞株（例えば、ＨｅＬａ細胞およびＣＯＳ細胞（例えば、ＣＯＳ−７（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１６５１）、血液学に関連する細胞を構成する上記の細胞））。さらに、このような細胞としては、組換えトランスジェニック細胞株が挙げられ得る。例えば、上で議論される、本発明の血液障害の動物モデルを使用して、この障害に対する細胞培養モデルとして使用され得る細胞株（これは、例えば、造血に関与する１種以上の細胞型を含む）を作製し得る。本発明の血液障害モデルのトランスジェニック動物由来の一次培養物が利用され得るが、連続した細胞株の作製が、好ましい。トランスジェニック動物から連続した細胞株を誘導するために使用され得る技術の例については、Ｓｍａｌｌら（１９８５）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．５：６４２−６４８を参照のこと。
【０１８０】
あるいは、例えば、造血に関与することが知られている細胞型の細胞は、細胞内での１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子発現の量を増加または減少させ得る配列でトランスフェクトされ得る。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列は、目的の細胞のゲノムに導入され得、そしてこの目的の細胞のゲノムにおいて過剰発現され得るか、あるいは内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列が存在する場合、これらは、過剰発現され得るか、またはあるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子を過少発現させるかまたはこれらの遺伝子発現を不活化させるために破壊され得るかのいずれかであり得る。
【０１８１】
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子を過剰発現させるために、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子のコード部分は、目的の細胞型（例えば、内皮細胞）において遺伝子発現を駆動し得る調節配列に連結され得る。このような調節領域は、当業者に周知であり、そして過度な実験を行うことなく利用され得る。標的遺伝子を発現させるための組換え方法は、上に記載されている。
【０１８２】
内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列の過少発現のために、このような配列は、単離され得、そして目的の細胞型のゲノムに再導入された場合、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の対立遺伝子が不活性化されるように、操作され得る。好ましくは、この操作された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の配列は、遺伝子ターゲティングを介して導入され、その結果、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の配列は、操作された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の配列を、細胞のゲノムに組み込む際に破壊される。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９遺伝子を用いた、宿主細胞のトランスフェクションは、上に記載されている。
【０１８３】
化合物で処置されたかあるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９遺伝子を用いてトランスフェクトされた細胞は、例えば、造血に関連する表現型について試験され得る。
【０１８４】
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸のトランスフェクションは、標準的な技術（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ（１９８９）前出、に記載される）を使用することによって、達成され得る。トランスフェクトされた細胞は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の組換え遺伝子配列の存在について、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡの発現および蓄積について、ならびに１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の組換えタンパク質産物の存在について、評価されるべきである。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子発現の減少が望ましい例において、標準的な技術を使用して、内因性の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子発現および／あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質産生の低下が達成されるか否かを、実証し得る。
【０１８５】
（予測医学）
本発明はまた、予測医学の分野に関し、ここにおいて、診断アッセイ、予後アッセイ、およびモニタリング臨床試験が、診断（予測）目的のために使用され、それによって個体を予防的に処置する。従って、本発明の１つの局面は、生物学的サンプル（例えば、血液、血清、細胞（例えば、内皮細胞）、または組織（例えば、血管組織））の状況において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質および／または核酸の発現、ならびに１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を決定し、それによって、個体が、血液障害の素因に罹患しているかまたは血液障害を被っているか否かを決定するための診断アッセイに関する。本発明はまた、個体が血液障害を発病する危険性があるか否かを決定するための、診断（または予測）アッセイを提供する。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９遺伝子における変異が、生物学的サンプルにおいてアッセイされ得る。このようなアッセイは、診断目的または予測目的のために使用され得、それによって個体は、血液障害の発症前に、予防的に（ｐｈｏｐｈｙｌａｃｔｉｃａｌｌｙ）処置される。
【０１８６】
本発明の別の局面は、臨床試験における、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性に対する、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーター（例えば、抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体または抗１３２４９抗体、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のリボザイム）の影響のモニタリングに関する。
【０１８７】
これらの因子および他の因子は、以下の節で、さらに詳細に記載される。
【０１８８】
（Ａ．診断アッセイ）
被験体が疾患に罹患しているか否かを決定するために、生物学的サンプルが被験体から得られ得、そしてこの生物学的サンプルは、この生物学的サンプル中で、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質をコードする核酸（例えば、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡ）を検出することができる、化合物または因子と接触され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出するために好ましい因子は、標識核酸プローブであり、このプローブは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡにハイブリダイズし得る。この核酸プローブは、例えば、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９もしくは配列番号６１に示される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の核酸またはそれらの一部（例えば、少なくとも１５ヌクレオチド長、２０ヌクレオチド長、２５ヌクレオチド長、３０ヌクレオチド長、３５ヌクレオチド長、４０ヌクレオチド長、４５ヌクレオチド長、５０ヌクレオチド長、１００ヌクレオチド長、２５０ヌクレオチド長または５００ヌクレオチド長であり、かつストリンジェントな条件下で、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡに特異的にハイブリダイズするに十分であるオリゴヌクレオチド）であり得る。本発明の診断アッセイにおいて使用するのに適切な他のプローブが、本明細書中に記載されている。
【０１８９】
サンプル中で、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質を検出するのに好ましい因子は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質に結合し得る抗体であり、好ましくは、検出可能な標識を有する抗体である。抗体は、ポリクローナル抗体であり得るかまたは、より好ましくは、モノクローナル抗体であり得る。インタクトな抗体、またはそのフラグメント（例えば、ＦａｂまたはＦ（ａｂ’）２）が、使用され得る。プローブまたは抗体に関して、用語「標識（された）」は、検出可能な物質をそのプローブまたは抗体にカップリング（すなわち、物理的に連結する）し、そして直接的に標識される別の試薬との反応性によってこのプローブまたは抗体を間接的に標識することによる、プローブまたは抗体の直接的な標識を含むことが意図される。間接的な標識の例は、蛍光標識されたストレプトアビジンで検出され得るように、蛍光標識された二次抗体を使用し、そしてビオチンでＤＮＡプローブを末端標識する、一次抗体の検出を含む。
【０１９０】
用語「生物学的サンプル」は、被験体から単離された組織、細胞、および生物学的流体、ならびに被験体内に存在する組織、細胞、および流体を含むことが意図される。すなわち、本発明の検出方法を使用して、インビトロおよびインビボで、生物学的サンプル中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡ、タンパク質、またはゲノムＤＮＡを検出し得る。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のｍＲＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、ノーザンハイブリダイゼーションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質を検出するためのインビトロ技術としては、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）、ウエスタンブロット、免疫沈降および免疫蛍光検査法が挙げられる。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のゲノムＤＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、サザンハイブリダイゼーションが挙げられる。さらに、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質を検出するためのインビボ技術は、標識された抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体または抗１３２４９抗体を、被験体に導入することを含む。例えば、抗体は、被験体における存在および位置が、標準的な画像化技術によって検出され得る放射標識マーカーで、標識され得る。
【０１９１】
別の実施形態において、本方法はさらに、以下の工程を包含する：コントロール被験体から、コントロールの生物学的サンプルを得る工程；このコントロールサンプルを、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出することができる化合物または因子と接触させる工程であって、その結果、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在が、生物学的サンプル中で検出される、工程；ならびに、コントロールサンプルにおける１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在を、試験サンプルにおける１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在と比較する工程。
【０１９２】
（予後アッセイ）
本発明はさらに、異常な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性に関連する疾患を有するかまたはそのような疾患を発症する危険性のある被験体を同定するための方法に関する。
【０１９３】
本明細書中で使用される場合、用語「異常な」は、野生型の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性から逸脱した、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性を含む。異常な発現または活性は、発現または活性の増加または減少、ならびに野生型の発生的な発現パターンまたは亜細胞の発現パターンに従わない、発現または活性を含む。例えば、異常な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性は、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における変異により、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子が、過少発現または過剰発現される場合、ならびにこのような変異によって、非機能的な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質または野生型様式で機能しないタンパク質（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の基質と相互作用しないタンパク質、あるいは非１３１基質、非１４８基質、非１９９基質、非１２３０３基質、非１３９０６基質、非１５５１３基質、非１７８２２基質、非３０２基質、非５６７７基質、非１９４基質、非１４３９３基質、非２８０５９基質、非７３６６基質、非１２２１２基質、非１９８１基質、非２６１基質、非１２４１６基質、非２７０基質、非１４１０基質、非１３７基質、非１８７１基質、非１３０５１基質、非１８４７基質、非１８４９基質、非１５４０２基質、非３４０基質、非１０２１７基質、非８３７基質、非１７６１基質、非８９９０基質または非１３２４９基質と相互作用するタンパク質）が生じる状況、を含むことが意図される。
【０１９４】
本明細書中に記載されるアッセイ（例えば、前述の診断アッセイまたは以下のアッセイ）を使用して、疾患を有する被験体または疾患が発症する危険性のある被験体を同定し得る。生物学的サンプルを、被験体より取得し得、そして遺伝的変更の存在または非存在について試験し得る。例えば、このような遺伝的変更は、以下の少なくとも１つの存在を確認することにより検出され得る：１）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子由来の１つ以上のヌクレオチドの検出、２）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子への１つ以上のヌクレオチドの付加、３）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子の１つ以上のヌクレオチドの置換、４）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子の染色体再構築、５）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物のレベルにおける変更、６）ゲノムＤＮＡのメチル化パターンのような、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子の異常な改変、７）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物の非野生型スプライシングパターンの存在、８）１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の非野生型レベル、９）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子の対立遺伝子喪失、および１０）１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の不適切な翻訳後修飾。
【０１９５】
本明細書中で記載されるように、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における遺伝的変更を検出するために使用され得る当該分野において公知の多くのアッセイが存在する。例えば、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における遺伝的変更は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（例えば、米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号を参照のこと）（例えば、アンカーＰＣＲまたはＲＡＣＥ  ＰＣＲ）あるいは、ライゲーション連鎖反応（ＬＣＲ）（例えば、Ｌａｎｄｅｇｒａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４１：１０７７−１０８０；およびＮａｋａｚａｗａら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：３６０−３６４を参照のこと）においてプローブ／プライマーを使用して検出され得、これらのうちの後者は、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における点変異を検出するために特に有用であり得る（Ａｂｒａｖａｙａら（１９９５）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２３：６７５−６８２を参照のこと）。この方法は、被験体から生物学的サンプルを収集する工程、このサンプルから核酸（例えば、ゲノムＤＮＡ、ｍＲＮＡまたはこれらの両方）を単離する工程、（存在するならば）１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０��伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子のハイブリダイゼーションおよび増幅が生じるような条件下で、この核酸サンプルを、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子に特異的にハイブリダイズする１つ以上のプライマーと接触させる工程；ならびに増幅産物の存在または非存在を検出するかあるいは増幅産物のサイズを検出しそしてコントロールサンプルと長さを比較する工程を包含する。ＰＣＲおよび／またはＬＣＲが、本明細書中に記載される変異を検出するために使用される任意の技術と組合わせて予備的増幅工程として使用するに望ましくあり得ることは、明白である。
【０１９６】
代替の増幅法としては以下が挙げられる：持続的配列増幅（Ｇｕａｔｅｌｌｉ，Ｊ．Ｃ．ら（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８７：１８７４−１８７８）、転写増幅系（Ｋｗｏｈ，Ｄ．Ｙ．ら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：１１７３−１１７７）、Ｑ−βレプリカーゼ（Ｌｉｚａｒｄｉ，Ｐ．Ｍ．ら（１９８８）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ６：１１９７）、または他の核酸増幅法のいずれか、その後の当業者に周知の技術を使用する増幅分子の検出。これらの検出スキームは、このような分子が非常に少数で存在する場合に、核酸分子の検出に特に有用である。
【０１９７】
代替の実施形態において、生物学的サンプル由来の１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における変異は、制限酵素切断パターンにおける変更によって同定され得る。例えば、サンプルおよびコントロールＤＮＡが、単離され、（必要に応じて）増幅され、１つ以上の制限エンドヌクレアーゼで消化され、そしてフラグメント長サイズが、ゲル電気泳動によって決定され、そして比較される。サンプルとコントロールＤＮＡとの間のフラグメント長サイズの差異は、サンプルＤＮＡ中の変異を示す。さらに、配列特異的リボザイム（例えば、米国特許第５，４９８，５３１号を参照のこと）の使用は、リボザイム切断部位の発生または喪失によって、特異的変異の存在についてスコア付けするために使用され得る。
【０１９８】
他の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９における遺伝的変異は、生物学的サンプル由来の核酸およびコントロール核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を、何百個または何千個のオリゴヌクレオチドプローブを含む高密度アレイにハイブリダイズさせることによって同定され得る（Ｃｒｏｎｉｎ，Ｍ．Ｔ．ら（１９９６）Ｈｕｍａｎ  Ｍｕｔａｔｉｏｎ  ７：２４４−２５５；Ｋｏｚａｌ，Ｍ．Ｊ．ら（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ  ２：７５３−７５９）。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９における遺伝的変異は、Ｃｒｏｎｉｎ，Ｍ．Ｔ．ら（１９９６）（上述）に記載されるような光生成ＤＮＡプローブを含む２次元アレイにおいて同定され得る。簡単には、プローブの第１のハイブリダイゼーションアレイを使用して、連続的で重複するプローブの線状アレイを作製することによって、サンプルおよびコントロールにおけるＤＮＡの長鎖を通して走査して配列間の塩基変化を同定し得る。この工程は、点変異の同定を可能とする。この工程の後、検出される全ての改変体または変異に相補的なより小さな特定化されたプローブアレイを使用することによって、特異的変異の特徴付けを可能にする第２のハイブリダイゼーションアレイが続く。各変異アレイは、パラレルプローブセット、野生型遺伝子に対するある相補体および変異遺伝子に対する他の相補体から構成される。
【０１９９】
なお別の実施形態において、当該分野において公知の種々の配列決定反応のいずれかを使用して、生物学的サンプル中の１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子を直接的に配列決定し得、そして生物学的サンプル中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の配列を、対応する野生型（コントロール）配列と比較することによって変異を検出し得る。配列決定反応の例としては、ＭａｘａｍおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７４：５６０またはＳａｎｇｅｒ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７４：５４６３によって開発された技術に基く反応が挙げられる。種々の自動化配列決定手順のいずれかが、質量分析法による配列決定（例えば、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９４／１６１０１；Ｃｏｈｅｎら（１９９６）Ａｄｖ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．３６：１２７−１６２；およびＧｒｉｆｆｉｎら（１９９３）Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３８：１４７−１５９を参照のこと）を含む診断アッセイ（Ｎａｅｖｅ，Ｃ．Ｗ．（１９９５）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １９：４４８−５３）を行う場合に利用され得ることもまた、企図される。
【０２００】
１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における変異を検出するための他の方法としては、切断剤からの保護がＲＮＡ／ＲＮＡ異種二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡ異種二重鎖中でミスマッチした塩基を検出するために使用される方法が挙げられる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３０：１２４２）。一般に、「ミスマッチ切断」の分野の技術は、野生型１３１配列、野生型１４８配列、野生型１９９配列、野生型１２３０３配列、野生型１３９０６配列、野生型１５５１３配列、野生型１７８２２配列、野生型３０２配列、野生型５６７７配列、野生型１９４配列、野生型１４３９３配列、野生型２８０５９配列、野生型７３６６配列、野生型１２２１２配列、野生型１９８１配列、野生型２６１配列、野生型１２４１６、野生型２７０、野生型１４１０、野生型１３７、野生型１８７１、野生型１３０５１、野生型１８４７配列、野生型１８４９配列、野生型１５４０２配列、野生型３４０配列、野生型１０２１７配列、野生型８３７配列、野生型１７６１配列、野生型８９９０配列または野生型１３２４９配列を含む（標識された）ＲＮＡまたはＤＮＡを、組織サンプルより得られた潜在的変異ＲＮＡまたはＤＮＡとハイブリダイズさせることによって形成される異種二重鎖を提供することによって開始する。二本鎖二重鎖は、コントロール鎖とサンプル鎖との間の塩基対ミスマッチに起因して存在するような二本鎖の一本鎖領域を切断する因子で処理される。例えば、ミスマッチ領域を酵素的に消化するために、ＲＮＡ／ＤＮＡ二重鎖はＲＮａｓｅで処理され得、ＤＮＡ／ＤＮＡハイブリッドはＳ１ヌクレアーゼで処理され得る。他の実施形態において、ＤＮＡ／ＤＮＡ二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡ二本鎖のいずれかが、ヒドロキシルアミンまたは四酸化オスミウムで処理され、そして、ミスマッチ領域を消化するためにピペリジンで処理される。ミスマッチ領域の消化後、次いで、生じた物質が、変異部位を決定するために変性ポリアクリルアミドゲル上でサイズで分けられる。例えば、Ｃｏｔｔｏｎら（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：４３９７およびＳａｌｅｅｂａら（１９９２）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：２８６−２９５を参照のこと。好ましい実施形態において、コントロールＤＮＡまたはＲＮＡが、検出のために標識され得る。
【０２０１】
さらに別の実施形態において、ミスマッチ切断反応は、細胞のサンプルより得られた１３１ｃＤＮＡ、１４８ｃＤＮＡ、１９９ｃＤＮＡ、１２３０３ｃＤＮＡ、１３９０６ｃＤＮＡ、１５５１３ｃＤＮＡ、１７８２２ｃＤＮＡ、３０２ｃＤＮＡ、５６７７ｃＤＮＡ、１９４ｃＤＮＡ、１４３９３ｃＤＮＡ、２８０５９ｃＤＮＡ、７３６６ｃＤＮＡ、１２２１２ｃＤＮＡ、１９８１ｃＤＮＡ、２６１ｃＤＮＡ、１２４１６ｃＤＮＡ、２７０ｃＤＮＡ、１４１０ｃＤＮＡ、１３７ｃＤＮＡ、１８７１ｃＤＮＡ、１３０５１ｃＤＮＡ、１８４７ｃＤＮＡ、１８４９ｃＤＮＡ、１５４０２ｃＤＮＡ、３４０ｃＤＮＡ、１０２１７ｃＤＮＡ、８３７ｃＤＮＡ、１７６１ｃＤＮＡ、８９９０ｃＤＮＡまたは１３２４９ｃＤＮＡ中の点変異を検出およびマッピングするために規定された系において二本鎖ＤＮＡ中のミスマッチ塩基対を認識する１つ以上のタンパク質（「ＤＮＡミスマッチ修復」酵素と呼ばれる）を使用する。例えば、Ｅ．ｃｏｌｉのｍｕｔＹ酵素は、Ｇ／ＡミスマッチでＡを切断し、そしてＨｅＬａ細胞由来のチミジンＤＮＡグリコシラーゼは、Ｇ／ＴミスマッチでＴを切断する（Ｈｓｕら（１９９４）Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ  １５：１６５７−１６６２）。例示的実施形態に従って、１３１配列、１４８配列、１９９配列、１２３０３配列、１３９０６配列、１５５１３配列、１７８２２配列、３０２配列、５６７７配列、１９４配列、１４３９３配列、２８０５９配列、７３６６配列、１２２１２配列、１９８１配列、２６１配列、１２４１６配列、２７０配列、１４１０配列、１３７配列、１８７１配列、１３０５１配列、１８４７配列、１８４９配列、１５４０２配列、３４０配列、１０２１７配列、８３７配列、１７６１配列、８９９０配列または１３２４９配列（例えば、野生型の１３１配列、１４８配列、１９９配列、１２３０３配列、１３９０６配列、１５５１３配列、１７８２２配列、３０２配列、５６７７配列、１９４配列、１４３９３配列、２８０５９配列、７３６６配列、１２２１２配列、１９８１配列、２６１配列、１２４１６配列、２７０配列、１４１０配列、１３７配列、１８７１配列、１３０５１配列、１８４７配列、１８４９配列、１５４０２配列、３４０配列、１０２１７配列、８３７配列、１７６１配列、８９９０配列または１３２４９配列）に基くプローブは、試験細胞からのｃＤＮＡ産物または他のＤＮＡ産物にハイブリダイズされる。二重鎖は、ＤＮＡミスマッチ修復酵素で処理され、そして存在する場合、切断産物は、電気泳動的プロトコルなどから検出され得る。例えば、米国特許第５，４５９，０３９号を参照のこと。
【０２０２】
他の実施形態において、電気泳動的移動度の変更を使用して、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子における変異を同定する。例えば、一本鎖コンフォーメーション多型（ＳＳＣＰ）を使用して、変異体核酸と野生型核酸との間の電気泳動的移動度の差異を検出し得る（Ｏｒｉｔａら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ：８６：２７６６；Ｃｏｔｔｏｎ（１９９３）Ｍｕｔａｔ．Ｒｅｓ．２８５：１２５−１４４およびＨａｙａｓｈｉ（１９９２）Ｇｅｎｅｔ．Ａｎａｌ．Ｔｅｃｈ．Ａｐｐｌ．９：７３−７９もまた参照のこと）。サンプルおよびコントロールの１３１核酸、１４８核酸、１９９核酸、１２３０３核酸、１３９０６核酸、１５５１３核酸、１７８２２核酸、３０２核酸、５６７７核酸、１９４核酸、１４３９３核酸、２８０５９核酸、７３６６核酸、１２２１２核酸、１９８１核酸、２６１核酸、１２４１６核酸、２７０核酸、１４１０核酸、１３７核酸、１８７１核酸、１３０５１核酸、１８４７核酸、１８４９核酸、１５４０２核酸、３４０核酸、１０２１７核酸、８３７核酸、１７６１核酸、８９９０核酸または１３２４９核酸の一本鎖ＤＮＡフラグメントは変性され、そして再生される。一本鎖核酸の二次構造は、配列に従って変化し、電気泳動的移動度において生じた変更は、単一の塩基変化の検出さえ可能にする。ＤＮＡフラグメントは、標識されたプローブで標識されても検出されてもよい。このアッセイの感度は、（ＤＮＡではなく）ＲＮＡを用いることにより増強され、ここで二次構造は、配列の変化により感受性である。好ましい実施形態において、目的の方法は、電気泳動的移動度の変化に基いて二本鎖へテロ二重鎖分子を分離するためにヘテロ二重鎖分析を利用する（Ｋｅｅｎら（１９９１）Ｔｒｅｎｄｓ  Ｇｅｎｅｔ  ７：５）。
【０２０３】
なお別の実施形態において、変性剤の勾配を含むポリアクリルアミドゲルにおける変異体または野生型フラグメントの移動は、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）を使用してアッセイされる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ  ３１３：４９５）。ＤＧＧＥが分析の方法として使用される場合、ＤＮＡは、例えば、ＰＣＲによって約４０ｂｐの高融解ＧＣリッチＤＮＡのＧＣクランプを付加することによって、完全には変性しないことを保証するために改変される。さらなる実施形態において、温度勾配は、コントロールＤＮＡおよびサンプルＤＮＡの移動度における差異を同定するために、変性勾配の代わりに使用される（ＲｏｓｅｎｂａｕｍおよびＲｅｉｓｓｎｅｒ（１９８７）Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｃｈｅｍ  ２６５：１２７５３）。
【０２０４】
点変異を検出するための他の技術の例としては、選択的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、選択的増幅、または選択的プライマー伸張が挙げられるがこれらに限定されない。例えば、オリゴヌクレオチドプライマーが調製され得、ここで、公知の変異が中心的におきかえられ、次いで完全な一致が見出される場合のみハイブリダイゼーションが可能となる条件下で標的ＤＮＡにハイブリダイズされる（Ｓａｉｋｉら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ  ３２４：１６３；Ｓａｉｋｉら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：６２３０）。このような対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドは、このオリゴヌクレオチドがハイブリダイズする膜に結合され、標識された標的ＤＮＡとハイブリダイズされる場合に、ＰＣＲ増幅した標的ＤＮＡまたは多数の異なる変異にハイブリダイズされる。
【０２０５】
あるいは、選択的ＰＣＲ増幅に依存する対立遺伝子特異的増幅技術は、本発明と組み合わせて使用され得る。特異的増幅のためのプライマーとして使用されるオリゴヌクレオチドは、分子の中心において（その結果、増幅は差次的ハイブリダイゼーションに依存する）（Ｇｉｂｂｓら、（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１７：２４３７−２４４８）、または適切な条件下でミスマッチがポリメラーゼ伸張を防ぐかまたは減少し得る１つのプライマーの最も３’末端にて（Ｐｒｏｓｓｎｅｒ（１９９３）Ｔｉｂｔｅｃｈ  １１：２３８）目的の変異をもたらし得る。さらに、変異の領域に新規な制限部位を導入して、切断に基づく検出をおこすことが望ましくあり得る（Ｇａｓｐａｒｉｎｉら、（１９９２）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ  ６：１）。特定の実施形態において、増幅はまた、増幅のためのＴａｑリガーゼを使用して行われ得ることが予期される（Ｂａｒａｎｙ（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：１８９）。このような場合において、連結は、増幅の存在または非存在について探索することによって特定の部位での既知の変異の存在を検出することを可能にする５’配列の３’末端にて、完全な一致が存在する場合にのみ生じる。
【０２０６】
さらに、本明細書中に記載される予後アッセイは、疾患を有効に処置するために１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーター（例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核酸、または低分子）を被験体に投与し得るか否かを決定するために使用され得る。
【０２０７】
（臨床試験の間の効果のモニタリング）
本発明はさらに、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーター（例えば、本明細書中において同定された１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーター）の、疾患の処置における有効性を決定するための方法を提供する。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の発現増加、タンパク質レベル増加、または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性のアップレギュレートにおける、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーターの有効性は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の発現減少、タンパク質レベル減少、または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性のダウンレギュレートを示す被験体の臨床試験においてモニタリングされ得る。あるいは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の発現減少、タンパク質レベル減少、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性のダウンレギュレートにおける１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーターの有効性は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子の発現の増加、タンパク質レベル増加、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性の増加を示す被験体の臨床試験においてモニタリングされ得る。このような臨床試験において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子、および好ましくは、例えば、造血に関与した他の遺伝子の発現または活性が、「読み出し」すなわち特定の細胞の表現型のマーカーとして使用され得る。
【０２０８】
例えば（限定としてではなく）、（例えば、本明細書中に記載されるようなスクリーニングアッセイにおいて同定される）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子での処置によって細胞において調節される、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を含む遺伝子が、同定され得る。従って、血液障害に罹患した被験体に対する１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子の効果を（例えば、臨床試験において）研究するために、細胞が単離され得、そしてＲＮＡが調製され得、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９、および血液障害に関連する他の遺伝子の発現レベルについて分析され得る。遺伝子発現レベル（例えば、遺伝子発現パターン）は、本明細書中に記載されるようなノザンブロット分析またはＲＴ−ＰＣＲによって、あるいは本明細書中に記載される方法の１つによって生成されるタンパク質の量を測定することによって、または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９もしくは他の遺伝子の活性レベルを測定することによって、定量され得る。この方法において、遺伝子発現パターンは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子に対する細胞の生理学的応答を示すマーカーとして作用し得る。この応答状態は、個体を１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子で処置する前、およびその間の種々の時点で決定され得る。
【０２０９】
好ましい実施形態において、本発明は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子（例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核酸、または本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定される低分子）での被験体の処置の有効性をモニタリングするための方法を提供し、以下の工程を包含する：（ｉ）この因子の投与前に被験体由来の投与前サンプルを得る工程；（ｉｉ）この投与前サンプル中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルを検出する工程；（ｉｉｉ）投与後の被験体由来の１つ以上のサンプルを得る工程；（ｉｖ）これらの投与後のサンプル中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルを検出する工程；（ｖ）投与前サンプル中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルを、投与後サンプル中の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルと比較する工程；ならびに（ｖｉ）被験体に対するこの因子の投与を適宜変更する工程。例えば、因子の投与増加は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性を、検出された（すなわち、因子の有効性を増加させる）レベルよりも高いレベルに増加することが、好ましくあり得る。あるいは、因子の投与減少は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性を、検出された（すなわち、因子の有効性を減少させる）レベルよりも低いレベルに減少することが、望ましくあり得る。このような実施形態に従って、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現または活性は、観察可能な表現型応答の非存在下ですら、因子の有効性の指標として使用され得る。
【０２１０】
（処置方法）
本発明は、被験体（例えば、疾患の危険性のある（または疾患に罹患している疑いのある）ヒト）を処置する予防法および治療法の両方を提供する。処置の予防法および治療法の両方の観点で、このような処置は、薬理ゲノム学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ）の分野から得られる知識に基づいて、特異的に仕立てられ（ｔａｉｌｏｒｅ）得るかまたは改変され得る。「薬理ゲノム学」は、本明細書中で使用される場合、遺伝子配列決定、統計的遺伝学および遺伝子発現分析のようなゲノム技術の、臨床開発および市場での薬物に対する適用をいう。より詳細には、この用語は、患者の遺伝子がどのように薬物に対する患者の応答（例えば、患者の「薬物応答表現型」または「薬物応答遺伝子型」）を決定するのかについての研究をいう。
【０２１１】
従って、本発明の別の局面は、個々の薬物応答遺伝子型に従って、本発明の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９の分子、または、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のモジュレーターのいずれかを用いる被験体の予防処置または治療処置を仕立てるための方法を提供する。薬理ゲノム学によって、臨床医（ｃｌｉｎｉｃｉａｎ）または内科医（ｐｈｙｓｉｃｉａｎ）は、この処置から最も利益を得る患者に対して予防処置または治療処置を標的化することが可能になり、そして毒性薬物関連副作用を被る患者の処置を避けることが可能になる。
【０２１２】
（予防方法）
一局面において、本発明は１３１発現、１４８発現、１９９発現、１２３０３発現、１３９０６発現、１５５１３発現、１７８２２発現、３０２発現、５６７７発現、１９４発現、１４３９３発現、２８０５９発現、７３６６発現、１２２１２発現、１９８１発現、２６１発現、１２４１６発現、２７０発現、１４１０発現、１３７発現、１８７１発現、１３０５１発現、１８４７発現、１８４９発現、１５４０２発現、３４０発現、１０２１７発現、８３７発現、１７６１発現、８９９０発現または１３２４９発現あるいは１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性を調節する薬剤を患者に投与することによって、患者における疾患を防ぐ方法を提供する。血液障害に対する危険性のある患者は、例えば、本明細書中に記載の任意の診断的または予後的なアッセイまたはそれらの組み合わせによって同定され得る。予防薬の投与は、異常な１３１発現、１４８発現、１９９発現、１２３０３発現、１３９０６発現、１５５１３発現、１７８２２発現、３０２発現、５６７７発現、１９４発現、１４３９３発現、２８０５９発現、７３６６発現、１２２１２発現、１９８１発現、２６１発現、１２４１６発現、２７０発現、１４１０発現、１３７発現、１８７１発現、１３０５１発現、１８４７発現、１８４９発現、１５４０２発現、３４０発現、１０２１７発現、８３７発現、１７６１発現、８９９０発現または１３２４９発現あるいは異常な１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性の特徴的症状の発生に先立って生じ得、これのよって疾患が予防されるか、あるいは、その進行が遅延される。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の異常の型に依存して、例えば、１３１アゴニスト、１４８アゴニスト、１９９アゴニスト、１２３０３アゴニスト、１３９０６アゴニスト、１５５１３アゴニスト、１７８２２アゴニスト、３０２アゴニスト、５６７７アゴニスト、１９４アゴニスト、１４３９３アゴニスト、２８０５９アゴニスト、７３６６アゴニスト、１２２１２アゴニスト、１９８１アゴニスト、２６１アゴニスト、１２４１６アゴニスト、２７０アゴニスト、１４１０アゴニスト、１３７アゴニスト、１８７１アゴニスト、１３０５１アゴニスト、１８４７アゴニスト、１８４９アゴニスト、１５４０２アゴニスト、３４０アゴニスト、１０２１７アゴニスト、８３７アゴニスト、１７６１アゴニスト、８９９０アゴニストまたは１３２４９アゴニストあるいは１３１アンタゴニスト薬剤、１４８アンタゴニスト薬剤、１９９アンタゴニスト薬剤、１２３０３アンタゴニスト薬剤、１３９０６アンタゴニスト薬剤、１５５１３アンタゴニスト薬剤、１７８２２アンタゴニスト薬剤、３０２アンタゴニスト薬剤、５６７７アンタゴニスト薬剤、１９４アンタゴニスト薬剤、１４３９３アンタゴニスト薬剤、２８０５９アンタゴニスト薬剤、７３６６アンタゴニスト薬剤、１２２１２アンタゴニスト薬剤、１９８１アンタゴニスト薬剤、２６１アンタゴニスト薬剤、１２４１６アンタゴニスト薬剤、２７０アンタゴニスト薬剤、１４１０アンタゴニスト薬剤、１３７アンタゴニスト薬剤、１８７１アンタゴニスト薬剤、１３０５１アンタゴニスト薬剤、１８４７アンタゴニスト薬剤、１８４９アンタゴニスト薬剤、１５４０２アンタゴニスト薬剤、３４０アンタゴニスト薬剤、１０２１７アンタゴニスト薬剤、８３７アンタゴニスト薬剤、１７６１アンタゴニスト薬剤、８９９０アンタゴニスト薬剤または１３２４９アンタゴニスト薬剤が、患者の処置に関して使用され得る。適切な薬剤は、本明細書中に記載のスクリーニングアッセイに基づいて決定され得る。
【０２１３】
（治療的方法）
本明細書中に記載したのは、血液障害を回復し得る方法および組成物である。特定の血液障害は、少なくとも部分的に遺伝子産物の過度のレベルによって、あるいは異常または過剰な活性を示す遺伝子産物の存在によってもたらされる。このように、このような遺伝子産物のレベルおよび／または活性の減少は、血液障害の回復をもたらす。遺伝子発現のレベルまたはタンパク質の活性の減少に関する技術は、以下に議論される。
【０２１４】
あるいは、特定の他の血液障害は、少なくとも一部、遺伝子発現のレベルの欠損または減少、あるいはタンパク質の活性のレベルの減少によってもたらされる。このように、遺伝子の発現および／またはこのようなタンパク質の活性のレベルの増加は、血液障害の回復をもたらす。
【０２１５】
いくつかの場合において、疾患状態における遺伝子のアップレギュレーションは、疾患状態に対しての応答において、その遺伝子産物に対する保護的な役割を反映する。このような遺伝子発現または遺伝子産物の活性の促進は、それが影響する保護的な効果を強固にする。いくつかの血液障害の状態は、このような保護的遺伝子の活性の異常に低いレベルに起因し得る。これらの場合において、また、遺伝発現のレベルおよび／またはこのような遺伝子産物の活性の増加は、血液障害の回復をもたらす。標的遺伝子発現レベルまたは標的遺伝子産物活性レベルを増加させるための技術は本明細書中に議論される。
【０２１６】
従って、本発明の別の局面は、処置目的のために、１３１発現、１４８発現、１９９発現、１２３０３発現、１３９０６発現、１５５１３発現、１７８２２発現、３０２発現、５６７７発現、１９４発現、１４３９３発現、２８０５９発現、７３６６発現、１２２１２発現、１９８１発現、２６１発現、１２４１６発現、２７０発現、１４１０発現、１３７発現、１８７１発現、１３０５１発現、１８４７発現、１８４９発現、１５４０２発現、３４０発現、１０２１７発現、８３７発現、１７６１発現、８９９０発現もしくは１３２４９発現、または１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性もしくは１３２４９活性を調節する方法に関係する。従って、例示的な実施例において、本発明の調節方法は、細胞と１３１、１４８、
１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９との接触、あるいは、その細胞（例えば、内皮細胞または卵巣細胞）に関連した、１３１タンパク質活性、１４８タンパク質活性、１９９タンパク質活性、１２３０３タンパク質活性、１３９０６タンパク質活性、１５５１３タンパク質活性、１７８２２タンパク質活性、３０２タンパク質活性、５６７７タンパク質活性、１９４タンパク質活性、１４３９３タンパク質活性、２８０５９タンパク質活性、７３６６タンパク質活性、１２２１２タンパク質活性、１９８１タンパク質活性、２６１タンパク質活性、１２４１６タンパク質活性、２７０タンパク質活性、１４１０タンパク質活性、１３７タンパク質活性、１８７１タンパク質活性、１３０５１タンパク質活性、１８４７タンパク質活性、１８４９タンパク質活性、１５４０２タンパク質活性、３４０タンパク質活性、１０２１７タンパク質活性、８３７タンパク質活性、１７６１タンパク質活性、８９９０タンパク質活性または１３２４９タンパク質活性の１つ以上の活性を調節する試薬との接触を含む。１３１タンパク質活性、１４８タンパク質活性、１９９タンパク質活性、１２３０３タンパク質活性、１３９０６タンパク質活性、１５５１３タンパク質活性、１７８２２タンパク質活性、３０２タンパク質活性、５６７７タンパク質活性、１９４タンパク質活性、１４３９３タンパク質活性、２８０５９タンパク質活性、７３６６タンパク質活性、１２２１２タンパク質活性、１９８１タンパク質活性、２６１タンパク質活性、１２４１６タンパク質活性、２７０タンパク質活性、１４１０タンパク質活性、１３７タンパク質活性、１８７１タンパク質活性、１３０５１タンパク質活性、１８４７タンパク質活性、１８４９タンパク質活性、１５４０２タンパク質活性、３４０タンパク質活性、１０２１７タンパク質活性、８３７タンパク質活性、１７６１タンパク質活性、８９９０タンパク質活性または１３２４９タンパク質活性を調節する試薬は、本明細書で記載されるように、例えば、核酸またはタンパク質、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の天然に存在する標的分子（例えば、１３１リガンド、１４８リガンド、１９９リガンド、１２３０３リガンド、１３９０６リガンド、１５５１３リガンド、１７８２２リガンド、３０２リガンド、５６７７リガンド、１９４リガンド、１４３９３リガンド、２８０５９リガンド、７３６６リガンド、１２２１２リガンド、１９８１リガンド、２６１リガンド、１２４１６リガンド、２７０リガンド、１４１０リガンド、１３７リガンド、１８７１リガンド、１３０５１リガンド、１８４７リガンド、１８４９リガンド、１５４０２リガンド、３４０リガンド、１０２１７リガンド、８３７リガンド、１７６１リガンド、８９９０リガンドもしくは１３２４９リガンドまたは１３１基質、１４８基質、１９９基質、１２３０３基質、１３９０６基質、１５５１３基質、１７８２２基質、３０２基質、５６７７基質、１９４基質、１４３９３基質、２８０５９基質、７３６６基質、１２２１２基質、１９８１基質、２６１基質、１２４１６基質、２７０基質、１４１０基質、１３７基質、１８７１基質、１３０５１基質、１８４７基質、１８４９基質、１５４０２基質、３４０基質、１０２１７基質、８３７基質、１７６１基質、８９９０基質もしくは１３２４９基質）、１３１抗体、１４８抗体、１９９抗体、１２３０３抗体、１３９０６抗体、１５５１３抗体、１７８２２抗体、３０２抗体、５６７７抗体、１９４抗体、１４３９３抗体、２８０５９抗体、７３６６抗体、１２２１２抗体、１９８１抗体、２６１抗体、１２４１６抗体、２７０抗体、１４１０抗体、１３７抗体、１８７１抗体、１３０５１抗体、１８４７抗体、１８４９抗体、１５４０２抗体、３４０抗体、１０２１７抗体、８３７抗体、１７６１抗体、８９９０抗体または１３２４９抗体、１３１アゴニスト、１４８アゴニスト、１９９アゴニスト、１２３０３アゴニスト、１３９０６アゴニスト、１５５１３アゴニスト、１７８２２アゴニスト、３０２アゴニスト、５６７７アゴニスト、１９４アゴニスト、１４３９３アゴニスト、２８０５９アゴニスト、７３６６アゴニスト、１２２１２アゴニスト、１９８１アゴニスト、２６１アゴニスト、１２４１６アゴニスト、２７０アゴニスト、１４１０アゴニスト、１３７アゴニスト、１８７１アゴニスト、１３０５１アゴニスト、１８４７アゴニスト、１８４９アゴニスト、１５４０２アゴニスト、３４０アゴニスト、１０２１７アゴニスト、８３７アゴニスト、１７６１アゴニスト、８９９０アゴニストもしくは１３２４９アゴニスト、または１３１アンタゴニスト、１４８アンタゴニスト、１９９アンタゴニスト、１２３０３アンタゴニスト、１３９０６アンタゴニスト、１５５１３アンタゴニスト、１７８２２アンタゴニスト、３０２アンタゴニスト、５６７７アンタゴニスト、１９４アンタゴニスト、１４３９３アンタゴニスト、２８０５９アンタゴニスト、７３６６アンタゴニスト、１２２１２アンタゴニスト、１９８１アンタゴニスト、２６１アンタゴニスト、１２４１６アンタゴニスト、２７０アンタゴニスト、１４１０アンタゴニスト、１３７アンタゴニスト、１８７１アンタゴニスト、１３０５１アンタゴニスト、１８４７アンタゴニスト、１８４９アンタゴニスト、１５４０２アンタゴニスト、３４０アンタゴニスト、１０２１７アンタゴニスト、８３７アンタゴニスト、１７６１アンタゴニスト、８９９０アンタゴニストもしくは１３２４９アンタゴニスト、１３１アゴニストのペプチド模放物、１４８アゴニストのペプチド模放物、１９９アゴニストのペプチド模放物、１２３０３アゴニストのペプチド模放物、１３９０６アゴニストのペプチド模放物、１５５１３アゴニストのペプチド模放物、１７８２２アゴニストのペプチド模放物、３０２アゴニストのペプチド模放物、５６７７アゴニストのペプチド模放物、１９４アゴニストのペプチド模放物、１４３９３アゴニストのペプチド模放物、２８０５９アゴニストのペプチド模放物、７３６６アゴニストのペプチド模放物、１２２１２アゴニストのペプチド模放物、１９８１アゴニストのペプチド模放物、２６１アゴニストのペプチド模放物、１２４１６アゴニストのペプチド模放物、２７０アゴニストのペプチド模放物、１４１０アゴニストのペプチド模放物、１３７アゴニストのペプチド模放物、１８７１アゴニストのペプチド模放物、１３０５１アゴニストのペプチド模放物、１８４７アゴニストのペプチド模放物、１８４９アゴニストのペプチド模放物、１５４０２アゴニストのペプチド模放物、３４０アゴニストのペプチド模放物、１０２１７アゴニストのペプチド模放物、８３７アゴニストのペプチド模放物、１７６１アゴニストのペプチド模放物、８９９０アゴニストのペプチド模放物もしくは１３２４９アゴニストのペプチド模放物、１３１アンタゴニストのペプチド模放物、１４８アンタゴニストのペプチド模放物、１９９アンタゴニストのペプチド模放物、１２３０３アンタゴニストのペプチド模放物、１３９０６アンタゴニストのペプチド模放物、１５５１３アンタゴニストのペプチド模放物、１７８２２アンタゴニストのペプチド模放物、３０２アンタゴニストのペプチド模放物、５６７７アンタゴニストのペプチド模放物、１９４アンタゴニストのペプチド模放物、１４３９３アンタゴニストのペプチド模放物、２８０５９アンタゴニストのペプチド模放物、７３６６アンタゴニストのペプチド模放物、１２２１２アンタゴニストのペプチド模放物、１９８１アンタゴニストのペプチド模放物、２６１アンタゴニストのペプチド模放物、１２４１６アンタゴニストのペプチド模放物、２７０アンタゴニストのペプチド模放物、１４１０アンタゴニストのペプチド模放物、１３７アンタゴニストのペプチド模放物、１８７１アンタゴニストのペプチド模放物、１３０５１アンタゴニストのペプチド模放物、１８４７アンタゴニストのペプチド模放物、１８４９アンタゴニストのペプチド模放物、１５４０２アンタゴニストのペプチド模放物、３４０アンタゴニストのペプチド模放物、１０２１７アンタゴニストのペプチド模放物、８３７アンタゴニストのペプチド模放物、１７６１アンタゴニストのペプチド模放物、８９９０アンタゴニストのペプチド模放物または１３２４９アンタゴニストのペプチド模放物、あるいは他の低分子のような試薬であり得る。１つの実施形態において、試薬は、１つ以上の１３１活性、１４８活性、１９９活性、
１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性を刺激する。そのような刺激試薬の例としては、活性化１３１タンパク質、活性化１４８タンパク質、活性化１９９タンパク質、活性化１２３０３タンパク質、活性化１３９０６タンパク質、活性化１５５１３タンパク質、活性化１７８２２タンパク質、活性化３０２タンパク質、活性化５６７７タンパク質、活性化１９４タンパク質、活性化１４３９３タンパク質、活性化２８０５９タンパク質、活性化７３６６タンパク質、活性化１２２１２タンパク質、活性化１９８１タンパク質、活性化２６１タンパク質、活性化１２４１６タンパク質、活性化２７０タンパク質、活性化１４１０タンパク質、活性化１３７タンパク質、活性化１８７１タンパク質、活性化１３０５１タンパク質、活性化１８４７タンパク質、活性化１８４９タンパク質、活性化１５４０２タンパク質、活性化３４０タンパク質、活性化１０２１７タンパク質、活性化８３７タンパク質、活性化１７６１タンパク質、活性化８９９０タンパク質、または活性化１３２４９タンパク質および細胞に導入される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９をコードする核酸分子が挙げられる。別の実施形態において、試薬は１つ以上の１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性もしくは１３２４９活性を阻害する。そのような阻害剤の例としては、アンチセンス１３１核酸分子、アンチセンス１４８核酸分子、アンチセンス１９９核酸分子、アンチセンス１２３０３核酸分子、アンチセンス１３９０６核酸分子、アンチセンス１５５１３核酸分子、アンチセンス１７８２２核酸分子、アンチセンス３０２核酸分子、アンチセンス５６７７核酸分子、アンチセンス１９４核酸分子、アンチセンス１４３９３核酸分子、アンチセンス２８０５９核酸分子、アンチセンス７３６６核酸分子、アンチセンス１２２１２核酸分子、アンチセンス１９８１核酸分子、アンチセンス２６１核酸分子、アンチセンス１２４１６核酸分子、アンチセンス２７０核酸分子、アンチセンス１４１０核酸分子、アンチセンス１３７核酸分子、アンチセンス１８７１核酸分子、アンチセンス１３０５１核酸分子、アンチセンス１８４７核酸分子、アンチセンス１８４９核酸分子、アンチセンス１５４０２核酸分子、アンチセンス３４０核酸分子、アンチセンス１０２１７核酸分子、アンチセンス８３７核酸分子、アンチセンス１７６１核酸分子、アンチセンス８９９０核酸分子、またはアンチセンス１３２４９核酸分子、抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体、または抗１３２４９抗体、および１３１インヒビター、１４８インヒビター、１９９インヒビター、１２３０３インヒビター、１３９０６インヒビター、１５５１３インヒビター、１７８２２インヒビター、３０２インヒビター、５６７７インヒビター、１９４インヒビター、１４３９３インヒビター、２８０５９インヒビター、７３６６インヒビター、１２２１２インヒビター、１９８１インヒビター、２６１インヒビター、１２４１６インヒビター、２７０インヒビター、１４１０インヒビター、１３７インヒビター、１８７１インヒビター、１３０５１インヒビター、１８４７インヒビター、１８４９インヒビター、１５４０２インヒビター、３４０インヒビター、１０２１７インヒビター、８３７インヒビター、１７６１インヒビター、８９９０インヒビターまたは１３２４９インヒビターが挙げられる。これらの調節方法は、インビトロで（例えば、試薬と一緒の細胞培養によって）、あるいは、インビボで（例えば、試薬を被験体に投与することによって）行われ得る。このように、本発明は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質もしくは１３２４９タンパク質、または１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子もしくは１３２４９核酸分子の異常なまたは望まない発現または活性によって特徴付けられた疾患または障害に罹患した個体の処置方法を提供する。１つの実施形態において、この方法は、試薬（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定された試薬）、または１３１発現、１４８発現、１９９発現、１２３０３発現、１３９０６発現、１５５１３発現、１７８２２発現、３０２発現、５６７７発現、１９４発現、１４３９３発現、２８０５９発現、７３６６発現、１２２１２発現、１９８１発現、２６１発現、１２４１６発現、２７０発現、１４１０発現、１３７発現、１８７１発現、１３０５１発現、１８４７発現、１８４９発現、１５４０２発現、３４０発現、１０２１７発現、８３７発現、１７６１発現、８９９０発現もしくは１３２４９発現または１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性を調節する（例えば、アップレギュレートするかまたはダウンレギュレートする）試薬の組合せの投与を包含する。別の実施形態において、この方法は、減少した、異常な、または望まない１３１発現、１４８発現、１９９発現、１２３０３発現、１３９０６発現、１５５１３発現、１７８２２発現、３０２発現、５６７７発現、１９４発現、１４３９３発現、２８０５９発現、７３６６発現、１２２１２発現、１９８１発現、２６１発現、１２４１６発現、２７０発現、１４１０発現、１３７発現、１８７１発現、１３０５１発現、１８４７発現、１８４９発現、１５４０２発現、３４０発現、１０２１７発現、８３７発現、１７６１発現、８９９０発現もしくは１３２４９発現、または１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性もしくは１３２４９活性を補うための処置として、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質もしく１３２４９タンパク質、または１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子もしくは１３２４９核酸分子の投与を包含する。  
【０２１７】
１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性の刺激は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９が、異常にダウンレギュレートするおよび／または増加１３１活性、増加１４８活性、増加１９９活性、増加１２３０３活性、増加１３９０６活性、増加１５５１３活性、増加１７８２２活性、増加３０２活性、増加５６７７活性、増加１９４活性、増加１４３９３活性、増加２８０５９活性、増加７３６６活性、増加１２２１２活性、増加１９８１活性、増加２６１活性、増加１２４１６活性、増加２７０活性、増加１４１０活性、増加１３７活性、増加１８７１活性、増加１３０５１活性、増加１８４７活性、増加１８４９活性、増加１５４０２活性、増加３４０活性、増加１０２１７活性、増加８３７活性、増加１７６１活性、増加８９９０活性、もしくは増加１３２４９活性が、有用な効果を有するようである状況において所望である。同様に、１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性の阻害は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９が、異常にアップレギュレートされるおよび／または減少１３１活性、減少１４８活性、減少１９９活性、減少１２３０３活性、減少１３９０６活性、減少１５５１３活性、減少１７８２２活性、減少３０２活性、減少５６７７活性、減少１９４活性、減少１４３９３活性、減少２８０５９活性、減少７３６６活性、減少１２２１２活性、減少１９８１活性、減少２６１活性、減少１２４１６活性、減少２７０活性、減少１４１０活性、減少１３７活性、減少１８７１活性、減少１３０５１活性、減少１８４７活性、減少１８４９活性、減少１５４０２活性、減少３４０活性、減少１０２１７活性、減少８３７活性、減少１７６１活性、減少８９９０活性もしくは減少１３２４９活性が、有用な効果を有するようである状況において所望である。
【０２１８】
（標的遺伝子の発現、合成、または活性を阻害する方法）
上記で述べたように、循環器疾患に関係する遺伝子は、遺伝子活性の増加レベルを介して、このような異常を引き起こし得る。いくつかのケースでは、そのようなアップレギュレーションは、疾患状態における原因効果または増悪効果を有し得る。種々の技術が、そのような遺伝子および／またはタンパク質の発現、合成、または活性を阻害するために使用され得る。
【０２１９】
例えば、阻害活性を示す化合物（例えば、上記に記載したアッセイで同定された化合物）は、血液疾患の少なくとも１つの徴候に対して、本発明に従って使用され得る。このような分子としては、有機低分子、ペプチド、抗体などが挙げられるが、それらに制限されない。
【０２２０】
例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質に対する内因性リガンドと競合する化合物が投与され得る。リガンドに結合した１３１タンパク質、リガンドに結合した１４８タンパク質、リガンドに結合した１９９タンパク質、リガンドに結合した１２３０３タンパク質、リガンドに結合した１３９０６タンパク質、リガンドに結合した１５５１３タンパク質、リガンドに結合した１７８２２タンパク質、リガンドに結合した３０２タンパク質、リガンドに結合した５６７７タンパク質、リガンドに結合した１９４タンパク質、リガンドに結合した１４３９３タンパク質、リガンドに結合した２８０５９タンパク質、リガンドに結合した７３６６タンパク質、リガンドに結合した１２２１２タンパク質、リガンドに結合した１９８１タンパク質、リガンドに結合した２６１タンパク質、リガンドに結合した１２４１６タンパク質、リガンドに結合した２７０タンパク質、リガンドに結合した１４１０タンパク質、リガンドに結合した１３７タンパク質、リガンドに結合した１８７１タンパク質、リガンドに結合した１３０５１タンパク質、リガンドに結合した１８４７タンパク質、リガンドに結合した１８４９タンパク質、リガンドに結合した１５４０２タンパク質、リガンドに結合した３４０タンパク質、リガンドに結合した１０２１７タンパク質、リガンドに結合した８３７タンパク質、リガンドに結合した１７６１タンパク質、リガンドに結合した８９９０タンパク質またはリガンドに結合した１３２４９タンパク質の得られた量の減少は、内皮細胞の生理学を調節する。この目的で特に有用であり得る化合物としては、例えば、可溶性タンパク質またはペプチド（例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の１つ以上の細胞外ドメイン、または部分および／またはそのアナログを含むペプチド（例えば、Ｉｇ標識融合タンパク質のような可溶性融合タンパク質が挙げられる））が挙げられる。（Ｉｇ標識融合タンパク質の産生の議論については、例えば、米国特許第５，１１６，９６４号を参照のこと）。あるいは、１３１レセプター部位、１４８レセプター部位、１９９レセプター部位、１２３０３レセプター部位、１３９０６レセプター部位、１５５１３レセプター部位、１７８２２レセプター部位、３０２レセプター部位、５６７７レセプター部位、１９４レセプター部位、１４３９３レセプター部位、２８０５９レセプター部位、７３６６レセプター部位、１２２１２レセプター部位、１９８１レセプター部位、２６１レセプター部位、１２４１６レセプター部位、２７０レセプター部位、１４１０レセプター部位、１３７レセプター部位、１８７１レセプター部位、１３０５１レセプター部位、１８４７レセプター部位、１８４９レセプター部位、１５４０２レセプター部位、３４０レセプター部位、１０２１７レセプター部位、８３７レセプター部位、１７６１レセプター部位、８９９０レセプター部位または１３２４９レセプター部位と結合するが、タンパク質を活性化しない（例えば、レセプター−リガンドアンタゴニスト）化合物は（例えば、リガンドアナログまたは抗体）、１３１タンパク質活性、１４８タンパク質活性、１９９タンパク質活性、１２３０３タンパク質活性、１３９０６タンパク質活性、１５５１３タンパク質活性、１７８２２タンパク質活性、３０２タンパク質活性、５６７７タンパク質活性、１９４タンパク質活性、１４３９３タンパク質活性、２８０５９タンパク質活性、７３６６タンパク質活性、１２２１２タンパク質活性、１９８１タンパク質活性、２６１タンパク質活性、１２４１６タンパク質活性、２７０タンパク質活性、１４１０タンパク質活性、１３７タンパク質活性、１８７１タンパク質活性、１３０５１タンパク質活性、１８４７タンパク質活性、１８４９タンパク質活性、１５４０２タンパク質活性、３４０タンパク質活性、１０２１７タンパク質活性、８３７タンパク質活性、１７６１タンパク質活性、８９９０タンパク質活性または１３２４９タンパク質活性の阻害において効果的であり得る。
【０２２１】
さらに、１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子の発現を阻害するアンチセンス分子およびリボザイム分子はまた、異常な１３１遺伝子活性、１４８遺伝子活性、１９９遺伝子活性、１２３０３遺伝子活性、１３９０６遺伝子活性、１５５１３遺伝子活性、１７８２２遺伝子活性、３０２遺伝子活性、５６７７遺伝子活性、１９４遺伝子活性、１４３９３遺伝子活性、２８０５９遺伝子活性、７３６６遺伝子活性、１２２１２遺伝子活性、１９８１遺伝子活性、２６１遺伝子活性、１２４１６遺伝子活性、２７０遺伝子活性、１４１０遺伝子活性、１３７遺伝子活性、１８７１遺伝子活性、１３０５１遺伝子活性、１８４７遺伝子活性、１８４９遺伝子活性、１５４０２遺伝子活性、３４０遺伝子活性、１０２１７遺伝子活性、８３７遺伝子活性、１７６１遺伝子活性、８９９０遺伝子活性または１３２４９遺伝子活性を阻害するために、本発明に従って使用され得る。なおさらに、三重らせん分子が、異常な１３１遺伝子活性、１４８遺伝子活性、１９９遺伝子活性、１２３０３遺伝子活性、１３９０６遺伝子活性、１５５１３遺伝子活性、１７８２２遺伝子活性、３０２遺伝子活性、５６７７遺伝子活性、１９４遺伝子活性、１４３９３遺伝子活性、２８０５９遺伝子活性、７３６６遺伝子活性、１２２１２遺伝子活性、１９８１遺伝子活性、２６１遺伝子活性、１２４１６遺伝子活性、２７０遺伝子活性、１４１０遺伝子活性、１３７遺伝子活性、１８７１遺伝子活性、１３０５１遺伝子活性、１８４７遺伝子活性、１８４９遺伝子活性、１５４０２遺伝子活性、３４０遺伝子活性、１０２１７遺伝子活性、８３７遺伝子活性、１７６１遺伝子活性、８９９０遺伝子活性または１３２４９遺伝子活性を阻害するために使用され得る。
【０２２２】
本発明の方法で使用されるアンチセンス核酸分子は、被験体に代表的に投与されるかインサイチュで生成され、その結果、それらの分子は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質をコードする細胞性ｍＲＮＡおよび／またはゲノムＤＮＡとハイブリダイズするか結合し、それによって（例えば、転写および／または翻訳を阻害することによって）、タンパク質の発現を阻害する。ハイブリダイゼーションは、安定な二本鎖を形成するための従来のヌクレオチド相補性によって、または、例えば、ＤＮＡ二本鎖に結合するアンチセンス核酸分子の場合には、二重らせんの主要な溝における特異的な相互作用を介して、行われ得る。本発明のアンチセンス核酸分子の投与経路の例は、組織部位における直接注射を包含する。あるいは、アンチセンス核酸分子は、選択された細胞を標的にするために修飾され得、次に全身に投与され得る。例えば、全身投与では、アンチセンス分子が修飾され得、その結果、その分子は、例えば、アンチセンス核酸分子を、細胞表面レセプターまたは細胞表面抗原と結合するペプチドまたは抗体を結合することによって、選択された細胞表面に発現するレセプターまたは抗原と、特異的に結合する。アンチセンス核酸分子はまた、本明細書中で記載されるベクターを用いて、細胞に送達され得る。アンチセンス分子の十分な細胞内濃度を達成するために、アンチセンス核酸分子が、強力なｐｏｌ  ＩＩプロモーターまたは強力なｐｏｌ  ＩＩＩプロモーターの制御下に置かれるベクター構築物が好ましい。
【０２２３】
さらなる別の実施形態において、本発明の方法で使用されるアンチセンス核酸分子は、α−アノマー核酸分子である。α−アノマー核酸分子は、相補的ＲＮＡと特異的な二重鎖ハイブリッドを形成し、ここで、通常のβ−ユニットとは対照的に、これらの鎖は、互いに平行に並ぶ（Ｇａｕｌｔｉｅｒら（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．１５：６６２５〜６６４１）。アンチセンス核酸分子はまた、２’−Ｏ−メチルリボヌクレオチドを含み得る（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１５：６１３１〜６１４８）またはキメラＲＮＡ−ＤＮＡアナログ（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．２１５：３２７〜３３０）。
【０２２４】
さらに別の実施形態において、本発明の方法で使用されるアンチセンス核酸は、リボザイムである。リボザイムは、それらが相補的領域を有する一本鎖核酸（例えば、ｍＲＮＡ）を切断することができるリボヌクレアーゼ活性を有する触媒ＲＮＡ分子である。このように、リボザイム（例えば、ハンマーヘッドリボザイム（ＨａｓｅｌｈｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ  ３３４：５８５〜５９１に記載される））は、１３１ｍＲＮＡ転写産物、１４８ｍＲＮＡ転写産物、１９９ｍＲＮＡ転写産物、１２３０３ｍＲＮＡ転写産物、１３９０６ｍＲＮＡ転写産物、１５５１３ｍＲＮＡ転写産物、１７８２２ｍＲＮＡ転写産物、３０２ｍＲＮＡ転写産物、５６７７ｍＲＮＡ転写産物、１９４ｍＲＮＡ転写産物、１４３９３ｍＲＮＡ転写産物、２８０５９ｍＲＮＡ転写産物、７３６６ｍＲＮＡ転写産物、１２２１２ｍＲＮＡ転写産物、１９８１ｍＲＮＡ転写産物、２６１ｍＲＮＡ転写産物、１２４１６ｍＲＮＡ転写産物、２７０ｍＲＮＡ転写産物、１４１０ｍＲＮＡ転写産物、１３７ｍＲＮＡ転写産物、１８７１ｍＲＮＡ転写産物、１３０５１ｍＲＮＡ転写産物、１８４７ｍＲＮＡ転写産物、１８４９ｍＲＮＡ転写産物、１５４０２ｍＲＮＡ転写産物、３４０ｍＲＮＡ転写産物、１０２１７ｍＲＮＡ転写産物、８３７ｍＲＮＡ転写産物、１７６１ｍＲＮＡ転写産物、８９９０ｍＲＮＡ転写産物または１３２４９ｍＲＮＡ転写産物を触媒的に切断するために使用され得、それによって、１３１ｍＲＮＡ、１４８ｍＲＮＡ、１９９ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、１３９０６ｍＲＮＡ、１５５１３ｍＲＮＡ、１７８２２ｍＲＮＡ、３０２ｍＲＮＡ、５６７７ｍＲＮＡ、１９４ｍＲＮＡ、１４３９３ｍＲＮＡ、２８０５９ｍＲＮＡ、７３６６ｍＲＮＡ、１２２１２ｍＲＮＡ、１９８１ｍＲＮＡ、２６１ｍＲＮＡ、１２４１６ｍＲＮＡ、２７０ｍＲＮＡ、１４１０ｍＲＮＡ、１３７ｍＲＮＡ、１８７１ｍＲＮＡ、１３０５１ｍＲＮＡ、１８４７ｍＲＮＡ、１８４９ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、３４０ｍＲＮＡ、１０２１７ｍＲＮＡ、８３７ｍＲＮＡ、１７６１ｍＲＮＡ、８９９０ｍＲＮＡまたは１３２４９ｍＲＮＡの翻訳を阻害する。５７７をコードする核酸、２０７３９をコードする核酸、または５７１４５をコードする核酸に特異性を有するリボザイムは、本明細書中で開示する１３１ｃＤＮＡ、１４８ｃＤＮＡ、１９９ｃＤＮＡ、１２３０３ｃＤＮＡ、１３９０６ｃＤＮＡ、１５５１３ｃＤＮＡ、１７８２２ｃＤＮＡ、３０２ｃＤＮＡ、５６７７ｃＤＮＡ、１９４ｃＤＮＡ、１４３９３ｃＤＮＡ、２８０５９ｃＤＮＡ、７３６６ｃＤＮＡ、１２２１２ｃＤＮＡ、１９８１ｃＤＮＡ、２６１ｃＤＮＡ、１２４１６ｃＤＮＡ、２７０ｃＤＮＡ、１４１０ｃＤＮＡ、１３７ｃＤＮＡ、１８７１ｃＤＮＡ、１３０５１ｃＤＮＡ、１８４７ｃＤＮＡ、１８４９ｃＤＮＡ、１５４０２ｃＤＮＡ、３４０ｃＤＮＡ、１０２１７ｃＤＮＡ、８３７ｃＤＮＡ、１７６１ｃＤＮＡ、８９９０ｃＤＮＡまたは１３２４９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（すなわち、配列番号１、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配���番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、または配列番号６１）に基づいて設計され得る。例えば、Ｔｅｔｒａｈｙｍｅｎａ  Ｌ−１９  ＩＶＳ  ＲＮＡ誘導体が構築され得、ここで、活性部位のヌクレオチド配列は、５７７をコードするｍＲＮＡ、２０７３９をコードするｍＲＮＡまたは５７１４５をコードするｍＲＮＡにおいて切断されるヌクレオチド配列に相補的である（例えば、Ｃｅｃｈら、米国特許第４，９８７，０７１号；およびＣｅｃｈら、米国特許第５，１１６，７４２号を参照のこと）。あるいは、１３１ｍＲＮＡ、１４８ｍＲＮＡ、１９９ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、１３９０６ｍＲＮＡ、１５５１３ｍＲＮＡ、１７８２２ｍＲＮＡ、３０２ｍＲＮＡ、５６７７ｍＲＮＡ、１９４ｍＲＮＡ、１４３９３ｍＲＮＡ、２８０５９ｍＲＮＡ、７３６６ｍＲＮＡ、１２２１２ｍＲＮＡ、１９８１ｍＲＮＡ、２６１ｍＲＮＡ、１２４１６ｍＲＮＡ、２７０ｍＲＮＡ、１４１０ｍＲＮＡ、１３７ｍＲＮＡ、１８７１ｍＲＮＡ、１３０５１ｍＲＮＡ、１８４７ｍＲＮＡ、１８４９ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、３４０ｍＲＮＡ、１０２１７ｍＲＮＡ、８３７ｍＲＮＡ、１７６１ｍＲＮＡ、８９９０ｍＲＮＡまたは１３２４９ｍＲＮＡは、ＲＮＡ分子プールから特異的リボヌクレアーゼ活性を有する触媒ＲＮＡを選択するために使用され得る（例えば、Ｂａｒｔｅｌ，ＤおよびＳｚｏｓｔａｋ，Ｊ．Ｗ．（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６１：１４１１〜１４１８を参照のこと）。
【０２２５】
１３１遺伝子発現、１４８遺伝子発現、１９９遺伝子発現、１２３０３遺伝子発現、１３９０６遺伝子発現、１５５１３遺伝子発現、１７８２２遺伝子発現、３０２遺伝子発現、５６７７遺伝子発現、１９４遺伝子発現、１４３９３遺伝子発現、２８０５９遺伝子発現、７３６６遺伝子発現、１２２１２遺伝子発現、１９８１遺伝子発現、２６１遺伝子発現、１２４１６遺伝子発現、２７０遺伝子発現、１４１０遺伝子発現、１３７遺伝子発現、１８７１遺伝子発現、１３０５１遺伝子発現、１８４７遺伝子発現、１８４９遺伝子発現、１５４０２遺伝子発現、３４０遺伝子発現、１０２１７遺伝子発現、８３７遺伝子発現、１７６１遺伝子発現、８９９０遺伝子発現または１３２４９遺伝子発現はまた、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の制御領域と相補的なヌクレオチド配列（例えば、１３１プロモーターおよび／またはエンハンサー、１４８プロモーターおよび／またはエンハンサー、１９９プロモーターおよび／またはエンハンサー、１２３０３プロモーターおよび／またはエンハンサー、１３９０６プロモーターおよび／またはエンハンサー、１５５１３プロモーターおよび／またはエンハンサー、１７８２２プロモーターおよび／またはエンハンサー、３０２プロモーターおよび／またはエンハンサー、５６７７プロモーターおよび／またはエンハンサー、１９４プロモーターおよび／またはエンハンサー、１４３９３プロモーターおよび／またはエンハンサー、２８０５９プロモーターおよび／またはエンハンサー、７３６６プロモーターおよび／またはエンハンサー、１２２１２プロモーターおよび／またはエンハンサー、１９８１プロモーターおよび／またはエンハンサー、２６１プロモーターおよび／またはエンハンサー、１２４１６プロモーターおよび／またはエンハンサー、２７０プロモーターおよび／またはエンハンサー、１４１０プロモーターおよび／またはエンハンサー、１３７プロモーターおよび／またはエンハンサー、１８７１プロモーターおよび／またはエンハンサー、１３０５１プロモーターおよび／またはエンハンサー、１８４７プロモーターおよび／またはエンハンサー、１８４９プロモーターおよび／またはエンハンサー、１５４０２プロモーターおよび／またはエンハンサー、３４０プロモーターおよび／またはエンハンサー、１０２１７プロモーターおよび／またはエンハンサー、８３７プロモーターおよび／またはエンハンサー、１７６１プロモーターおよび／またはエンハンサー、８９９０プロモーターおよび／またはエンハンサーあるいは１３２４９プロモーターおよび／またはエンハンサー）を標的することによって阻害され得、標的細胞中で１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子、１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子の転写を防ぐ三重らせん構造を形成する（例えば、Ｈｅｌｅｎｅ，Ｃ（１９９１）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｓ．６（６）：５６９〜８４；Ｈｅｌｅｎｅ，Ｃら（１９９２）Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６６０：２７〜３６；およびＭａｈｅｒ，Ｌ．Ｊ．（１９９２）Ｂｉｏａｓｓａｙｓ  １４（１２）：８０７〜１５を参照のこと）。
【０２２６】
１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質に特異的であり、その活性を妨害する抗体はまた、１３１タンパク質機能、１４８タンパク質機能、１９９タンパク質機能、１２３０３タンパク質機能、１３９０６タンパク質機能、１５５１３タンパク質機能、１７８２２タンパク質機能、３０２タンパク質機能、５６７７タンパク質機能、１９４タンパク質機能、１４３９３タンパク質機能、２８０５９タンパク質機能、７３６６タンパク質機能、１２２１２タンパク質機能、１９８１タンパク質機能、２６１タンパク質機能、１２４１６タンパク質機能、２７０タンパク質機能、１４１０タンパク質機能、１３７タンパク質機能、１８７１タンパク質機能、１３０５１タンパク質機能、１８４７タンパク質機能、１８４９タンパク質機能、１５４０２タンパク質機能、３４０タンパク質機能、１０２１７タンパク質機能、８３７タンパク質機能、１７６１タンパク質機能、８９９０タンパク質機能または１３２４９タンパク質機能を調節するかまたは阻害するために使用され得る。そのような抗体は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質自体に対して、あるいはそのタンパク質の部分に対応するペプチドに対して、本明細書中に記載される標準的技術を用いて生成され得る。そのような抗体としては、ポリクローナル、モノクローナル、Ｆａｂフラグメント、単鎖抗体、またはキメラ抗体が挙げられるが、それらに制限されない。
【０２２７】
標的遺伝子タンパク質が細胞内であり、そして全抗体が使用される場合において、内在化抗体が好ましくあり得る。リポフェクチンリポソームが、抗体または標的エピトープに結合させるＦａｂ領域のフラグメントを細胞内に送達するために使用され得る。抗体のフラグメントが使用される場合、標的タンパク質の結合ドメインと結合する最小の阻害フラグメントが好ましい。例えば、標的遺伝子タンパク質に結合する抗体の可変領域のドメインに対応するアミノ酸配列を有するペプチドが使用され得る。そのようなペプチドは、化学合成され得るかまたは当該分野において周知の方法を用いる組み換えＤＮＡ技術を介して産生され得る（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ（１９８３）、前出；およびＳａｍｂｒｏｏｋら（１９８９）前出に記載されている）。細胞内標的遺伝子エピトープと結合する単鎖中和抗体がまた、投与され得る。そのような単鎖抗体は、例えば、Ｍａｒａｓｃｏら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９０：７８８９〜７８９３）に記載されるような技術を用いて、例えば、標的細胞集団内の単鎖抗体をコードするヌクレオチド配列を発現することによって投与され得る。
【０２２８】
いくつかの例では、標的遺伝子タンパク質は、細胞外であるか、あるいは、膜貫通タンパク質（例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質）である。例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の１つ以上の細胞外ドメインに特異的であり、そしてその活性を妨害する抗体は、血液疾患または血液障害の治療に特に有益である。そのような抗体は、その抗体が血流から標的ドメインに直接アクセスできるので、特に有用である。ペプチド投与に適切な下記に記載ある任意の投与技術は、阻害的標的遺伝子抗体を、それらの作用部位に効果的に投与するために使用され得る。
【０２２９】
（標的遺伝子活性を再生または増大させる方法）
血液障害を生じる遺伝子は、疾患状況内で過小発現され得る。あるいは、このような遺伝子のタンパク質産物の活性は、低下され得、血液障害の発症を導く。このような遺伝子発現のダウンレギュレートまたはタンパク質活性の低下は、疾患状態に対する原因的影響または悪化させる影響を有し得る。
【０２３０】
いくつかの場合、疾患状態においてアップレギュレートされる遺伝子は、予防効果を発揮し得る。種々の技術が、血液障害状態に対する予防効果を発揮する、遺伝子および／またはタンパク質の発現、合成、または活性を増大させるために用いられ得る。
【０２３１】
この節に記載されるものは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性のレベルを血液障害が改善されるレベルまで、増大させ得る方法である。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性のレベルは、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子発現のレベルを増加させるか、あるいは存在する活性な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質のレベルを増加させることのいずれかによって、増加され得る。
【０２３２】
例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質は、血液障害の少なくとも１つの症状に対して十分なレベルで、このような症状を示す患者に投与され得る。以下で議論される技術のいずれかが、このような投与のために用いられ得る。当業者は、以下に記載されるような技術を利用して、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の有効な、非毒性用量の濃度を決定する方法を容易に知る。
【０２３３】
さらに、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質をコードするＲＮＡ配列は、血液障害を示す患者に、血液障害が改善されるような１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質のレベルを生じるのに十分な濃度で、直接投与され得る。化合物の細胞内投与を達成する、以下に議論される技術（例えば、リポソーム投与）のいずれかは、このようなＲＮＡ分子の投与のために用いられ得る。ＲＮＡ分子は、例えば、本明細書中に記載されるような組換え技術により作製され得る。
【０２３４】
さらに、被験体は、遺伝子置換治療により処置され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の機能を有する、正常な１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の産生を指向する、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子、あるいはその一部の１以上のコピーは、ＤＮＡを細胞へと導入する他の粒子（例えば、リポソーム）に加えて、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、およびレトロウイルスベクターを含むが、これらに限定されない、ベクターを用いて細胞へと挿入され得る。さらに、上記のような技術は、ヒト細胞への、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の遺伝子配列の導入のために用いられ得る。
【０２３５】
次いで、細胞、好ましくは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９発現遺伝子配列を含む自系の細胞は、血液障害の改善を可能にする位置で被験体へと導入または再導入され得る。このような細胞置換技術は、例えば、遺伝子産物が、分泌された、細胞外遺伝子産物である場合、好ましくあり得る。
【０２３６】
（薬学的組成物）
本発明の別の局面は、疾患に罹患した被験体を処置するための方法に関する。これらの方法は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９の発現または活性を調節する因子（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイにより同定される因子）、またはこのような因子の組み合わせを、被験体に投与することを包含する。別の実施形態では、この方法は、低下した、異常な、または望ましくない、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９の発現または活性を補償するための治療として、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９のタンパク質または核酸分子を、被験体に投与することを包含する。
【０２３７】
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性の刺激は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９が異常にダウンレギュレートされる、そして／あるいは上昇した１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性が、有益な効果を有すると考えられる状況において望ましい。同様に、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性の阻害は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９が、異常にアップレギュレートされる、そして／あるいは減少した１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性が、有益な効果を有すると考えられる状況において望ましい。
【０２３８】
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子は、このような投与に適切な薬学的組成物を用いて、被験体に投与され得る。このような組成物は、代表的には、因子（例えば、核酸分子、タンパク質、または抗体）および薬学的に受容可能なキャリアを含む。本明細書中で使用される場合、語「薬学的に受容可能なキャリア」は、薬学的投与に適合性の、任意および全ての溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌性および抗真菌性の薬剤、等張剤および吸収遅延剤などを含むことが意図される。このような媒体および薬剤の、薬学的に活性な物質のための使用は、当該分野で周知である。この活性な化合物と非適合性である任意の従来の媒体または薬剤の範囲を除いて、組成物におけるそれらの使用が企図される。補助的な活性化合物もまた、この組成物に組み込まれ得る。
【０２３９】
本発明の治療方法において使用される薬学的組成物は、その意図される投与経路と適合性となるように処方される。投与経路の例としては、非経口的（例えば、静脈内、皮内、皮下）、経口（例えば、吸入）、経皮（局所的）、経粘膜、および直腸投与が挙げられる。非経口、皮内、または皮下適用のために使用される溶液または懸濁液は、以下の成分を含み得る：滅菌希釈剤（例えば、注射のための水、生理食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒）；抗菌剤（例えば、ベンジルアルコールまたはメチルパラベン）；抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸または亜硫酸水素ナトリウム）；キレート試薬（例えば、エチレンジアミン四酢酸）；緩衝液（例えば、酢酸塩、クエン酸塩、またはリン酸塩）、および張性を調整するための薬剤（例えば、塩化ナトリウムまたはブドウ糖）。ｐＨは、酸または塩基（例えば、塩酸または水酸化ナトリウム）を用いて調整され得る。非経口的調製物は、ガラスまたはプラスチックから作製されるアンプル、使い捨てシリンジ、または複数用量のバイアルに封入され得る。
【０２４０】
注入用途のために適切な薬学的組成物としては、滅菌水溶液（水溶性の場合）または分散体、および滅菌注射可能な溶液または分散体の即席調製のための滅菌粉末が挙げられる。静脈内投与のために適切なキャリアとしては、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ  ＥＬＴＭ（ＢＡＳＦ，Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ，ＮＪ）またはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、この組成物は、無菌でなければならず、そして容易な注入性（ｓｙｒｉｎｇａｂｉｌｉｔｙ）が存在する程度に流動性であるべきである。この組成物は、製造および貯蔵の条件下で安定でなければならず、そして細菌および真菌のような微生物の混入作用に対して保護されなければならない。このキャリアは、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、ならびにこれらの適切な混合物を含む溶媒または分散媒体であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンのようなコーティングの使用によって、分散体の場合において要求される粒子サイズを維持することによって、および界面活性剤の使用によって、維持され得る。微生物の作用の予防は、種々の抗菌剤および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなど）によって達成され得る。多くの場合、組成物中に等張剤（例えば、糖類、マンニトール、ソルビトールのようなポリアルコール、塩化ナトリウム）を含むことが好ましい。注入可能組成物の長期の吸収は、この組成物中に吸収を遅延する薬剤（例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチン）を含むことによってもたらされ得る。
【０２４１】
滅菌の注入可能な溶液は、上記に列挙された成分のうちの１つまたは組み合わせと共に、必要とされる量の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する因子（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９のタンパク質のフラグメントまたは抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体もしくは抗１３２４９抗体）を適切な溶媒に取り込み、続いて、必要に応じて濾過滅菌することによって調製され得る。一般に、分散体は、基礎分散媒体および上記に列挙される成分のうちの必要とされる他の成分を含む滅菌ビヒクルに、この活性化合物を取り込むことによって調製される。滅菌の注入可能な溶液の調製のための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、活性成分の粉末および以前に滅菌濾過されたその溶液からの任意のさらなる所望の成分を得る、真空乾燥および凍結乾燥である。
【０２４２】
経口組成物は、一般に、不活性希釈剤または食用キャリアを含む。これらは、ゼラチンカプセルに封入され得るか、または錠剤に加圧され得る。経口治療投与の目的で、この活性化合物は、賦形剤と共に組み込まれ、そして錠剤、トローチ、またはカプセルの形態で使用される。経口組成物はまた、うがい薬としての使用のための流体キャリアを使用して調製され得、ここで、流体キャリア中の化合物は、経口的に適用され、そしてスウィッシュ（ｓｗｉｓｈ）され、そして吐き出されるかまたは飲み込まれる。薬学的に適合性の結合剤、および／またはアジュバント材料が、この組成物の一部として含まれ得る。錠剤、丸剤、カプセル剤、トローチ剤などが、以下の成分のいずれかまたは同様の性質を有する化合物を含み得る：結合剤（例えば、微結晶セルロース、ガムトラガントまたはゼラチン）；賦形剤（例えば、デンプンまたはラクトース）、崩壊剤（例えば、アルギン酸、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、またはコーンスターチ）；滑沢剤（例えば、ステアリン酸マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓ）；グライダント（ｇｌｉｄａｎｔ）（例えば、コロイド状二酸化ケイ素）；甘味剤（例えば、スクロースまたはサッカリン）；あるいは矯味矯臭剤（例えば、ペパーミント、サリチル酸メチル、またはオレンジフレーバー）。
【０２４３】
吸入による投与について、この化合物は、適切な噴霧剤（例えば、二酸化炭素のような気体）を含む圧縮容器またはディスペンサー、あるいは噴霧器から、エアロゾルスプレーの形態で送達される。
【０２４４】
全身的投与はまた、経粘膜手段または経皮手段により得る。経粘膜投与または経皮投与について、浸透されるバリアに対して適切な浸透剤が、処方物中で使用される。このような浸透剤は、一般的に、当該分野で公知であり、そして、例えば、経粘膜投与については、界面活性剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与は、鼻スプレーまたは坐剤の使用によって達成され得る。経皮投与については、この活性化合物は、当該分野で一般的に公知である軟膏剤、軟膏、ゲル、またはクリーム剤へ処方される。
【０２４５】
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する薬剤はまた、直腸送達のための坐剤（例えば、ココアバターおよび他のグリセリドのような従来の坐剤ベースと共に）または保持浣腸の形態で調製され得る。
【０２４６】
１つの実施形態において、この１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する薬剤は、身体からの迅速な排出に対してこの化合物を保護するキャリアを用いて調製され（例えば、制御放出処方物）、これには、移植片およびマイクロカプセル化された送達系が挙げられる。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸のような、生分解性、生体適合性ポリマーが使用され得る。このような処方物の調製のための方法は、当業者には明らかである。これらの材料はまた、Ａｌｚａ  ＣｏｒｐｏｒａｔｉｏｎおよびＮｏｖａ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．から商業的に入手可能である。リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体を用いて、感染させた細胞へ標的化されるリポソームを含む）がまた、薬学的に受容可能なキャリアとして使用され得る。これらは、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載されるような、当業者に公知の方法に従って調製され得る。
【０２４７】
投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位形態で、経口組成物または非経口組成物を処方することが、特に有益である。本明細書で使用される場合、投薬単位形態は、処置される被験体のための単位投薬量として適切な、物理的に個々の単位をいい；各単位は、必要とされる薬学的キャリアと関連して、所望の治療的効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含む。本発明の投薬単位形態についての詳細は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を調節する薬剤の固有の特性、および達成される特定の治療効果、ならびに被験体の処置のためのこのような薬剤を調合する当該分野に固有の制限によって影響を受け、これらに直接依存する。
【０２４８】
そのような薬剤の毒性および治療効力は、例えば、ＬＤ５０（集団の５０％に対して致死性である用量）およびＥＤ５０（集団のうちの５０％において治療上有効な用量）を決定するための、細胞培養物または実験動物における標準的薬学的手順によって決定され得る。毒性効果と治療効果との間の用量比は、治療指数であり、そしてそれは、比ＬＤ５０／ＥＤ５０として表され得る。大きな治療指数を示す薬剤が、好ましい。毒性副作用を示す薬剤が使用され得るが、非感染細胞に対して生じ得る損傷を最小にして副作用を低減するために、罹患した組織部位にそのような薬剤を標的化する送達システムを設計するために注意が払われるべきである。
【０２４９】
細胞培養アッセイおよび動物実験から得られるデータは、ヒトにおける使用のために一定範囲の投与量を処方する際に使用され得る。そのような１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９調節剤の投薬量は、好ましくは、毒性をほとんど伴わないかまたは全く伴わない、ＥＤ５０を含む一定範囲の循環濃度内に入る。その投薬量は、使用される投薬形態および利用される投与経路に依存して、この範囲内で変動し得る。本発明の治療方法において使用されるどの薬剤についても、治療上有効な用量は、細胞培養アッセイからまず推定され得る。細胞培養において決定されるようなＩＣ５０（すなわち、症状の最大阻害半分を達成する試験化合物濃度）を含む循環血漿濃度範囲を達成するための用量が、動物モデルにおいて処方され得る。そのような情報は、ヒトにおいて有用な用量をより正確に決定するために、使用され得る。血漿中のレベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーによって測定され得る。
【０２５０】
本明細書中で規定される場合、タンパク質またはポリペプチドの治療上有効な量（すなわち、有効投薬量）は、約０．００１〜３０ｍｇ／ｋｇ体重、好ましくは、約０．０１〜２５ｍｇ／ｋｇ体重、より好ましくは、約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重、およびなおより好ましくは、約１〜１０ｍｇ／ｋｇ体重、２〜９ｍｇ／ｋｇ体重、３〜８ｍｇ／ｋｇ体重、４〜７ｍｇ／ｋｇ体重、または５〜６ｍｇ／ｋｇ体重の範囲である。特定の要因が、被験体を有効に処置するために必要な投薬量に影響し得ることを当業者は認識し、そのような要因としては、疾患もしくは障害の重篤度、以前の処置、被験体の全身の健康および／または年齢、ならびに存在する他の疾患が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、治療上有効な量のタンパク質、ポリペプチド、または抗体を用いる被験体の処置は、単回処置を包含し得るか、または好ましくは、一連の処置を包含し得る。
【０２５１】
好ましい例において、被験体は、約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重の間の範囲にある抗体、タンパク質、またはポリペプチドを用いて、１週間に１回、約１〜１０週間の間、好ましくは２〜８週間の間、より好ましくは約３〜７週間の間、そしてなおより好ましくは約４週間、５週間、または６週間の間、処置される。処置に使用される抗体、タンパク質、またはポリペプチドの有効投薬量は、特定の処置経過にわたって増加または減少し得ることもまた、認識される。投薬量の変化は、本明細書中に記載される診断アッセイの結果から生じ得、そしてその結果から明らかになり得る。
【０２５２】
本発明は、発現または活性を調節する薬剤を包含する。薬剤は、例えば、低分子であり得る。例えば、そのような低分子としては、ペプチド、ペプチド模倣物、アミノ酸、アミノ酸アナログ、ポリヌクレオチド、ポリヌクレオチドアナログ、ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ、約１０，０００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物（すなわち、ヘテロ有機化合物および有機金属化合物を含む）、約５，０００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物、約１，０００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物、約５００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物、ならびにそのような化合物の塩、エステル、および他の薬学的に受容可能な形態が挙げられるが、これらに限定されない。低分子薬剤の適切な用量は、当業者である医師、獣医師、または研究者の知識内にある多数の要因に依存することが理解される。この低分子の用量は、例えば、処置される被験体またはサンプルの身元、サイズおよび状態に依存して変化し、さらに、該当する場合は、その組成物が投与される経路、ならびに本発明の核酸もしくはポリペプチドに対してその低分子が有することを実施者が望む効果に依存して変化する。
【０２５３】
例示的な用量としては、被験体またはサンプルの重量１ｋｇあたり、ミリグラム量またはマイクログラム量の低分子（例えば、約１μｇ／ｋｇ〜約５００ｍｇ／ｋｇ、約１００μｇ／ｋｇ〜約５ｍｇ／ｋｇ、または約１μｇ／ｋｇ〜約５０μｇ／ｋｇ）が挙げられる。低分子の適切な用量は、調節されるべき発現または活性に関するその低分子の能力に依存することが、さらに理解される。そのような適切な用量は、本明細書中に記載されるアッセイを使用して決定され得る。これらの低分子のうちの１つ以上が、本発明のポリペプチドまたは核酸の発現もしくは活性を調節するために動物（例えば、ヒト）に投与される場合、医師、獣医師、または研究者は、例えば、最初に比較的低用量を処方し、その後、適切な応答が得られるまでその用量を増加させ得る。さらに、特定の任意の動物被験体についての特定の用量レベルは、種々の要因（使用される特定の化合物の活性、被験体の年齢、被験体の体重、被験体の全身の健康、被験体の性別、および被験体の食餌、投与時期、投与経路、排出速度、任意の薬物組み合わせ、ならびに調節されるべき発現または活性の程度を含む）に依存することが、理解される。
【０２５４】
さらに、抗体（またはそのフラグメント）は、治療部分（例えば、細胞毒）、治療剤、または放射性金属イオンに結合体化され得る。細胞毒または細胞傷害性薬剤は、細胞に対して有害な任意の薬剤を包む。例としては、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロパロノール、およびピューロマイシン、ならびにそれらのアナログまたはホモログが挙げられる。治療剤としては、代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルダカルバジン（ｄｅｃａｒｂａｚｉｎｅ））、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオエパクロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）、およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド（ｃｙｃｌｏｔｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、およびｃｉｓ−ジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（前名ダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（前名アクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン（ＡＭＣ））、ならびに抗有糸分裂薬（例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２５５】
本発明の結合体は、所定の生物学的応答を改変するために使用され得、その薬物部分は、古典的な化学的治療剤に限定するように解釈されるべきではない。例えば、その薬物部分は、所望の生物学的活性を保有するタンパク質またはポリペプチドであり得る。そのようなタンパク質としては、例えば、トキシン（例えば、アブリン、リシンＡ、シュードモナス外毒素、またはジフテリアトキシン）；タンパク質（例えば、腫瘍壊死因子、α−インターフェロン、β−インターフェロン、神経成長因子、血小板由来増殖因子、組織プラスミノゲン活性化因子）；または生物学的応答改変因子（例えば、リンホカイン、インターロイキン−１（「ＩＬ−１」）、インターロイキン−２（「ＩＬ−２」）、インターロイキン−６（「ＩＬ−６」）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（「ＧＭ−ＣＳＦ」）、顆粒球コロニー刺激因子（「Ｇ−ＣＳＦ」）、あるいは他の増殖因子が挙げられ得る。
【０２５６】
そのような治療部分を抗体に結合体化するための技術は、周知である。例えば、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｒｅｉｓｆｅｌｄら編（Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，１９８５）、ｐｐ．２４３〜５６のＡｒｎｏｎら、「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ  Ｏｆ  Ｄｒｕｇｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ」；Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ（第２版）、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら編（Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，１９８７）ｐｐ．６２３〜５３のＨｅｌｌｓｔｒｏｍら「Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ」；Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｐｉｎｃｈｅｒａら編，ｐｐ．４７５〜５０６（１９８５）のＴｈｏｒｐｅ，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｃａｒｒｉｅｒｓ  Ｏｆ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ａｇｅｎｔｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ：Ａ  Ｒｅｖｉｅｗ」；Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｂａｌｄｗｉｎら編（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９８５）ｐｐ．３０３〜１６の「Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｓｕｌｔｓ，Ａｎｄ  Ｆｕｔｕｒｅ  Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ  Ｏｆ  Ｔｈｅ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｕｓｅ  Ｏｆ  Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ」；ならびにＴｈｏｒｐｅら「Ｔｈｅ  Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  Ｏｆ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｔｏｘｉｎ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ」Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．６２：１１９〜５８（１９８２）を参照のこと。あるいは、抗体は、Ｓｅｇａｌによって米国特許第４，６７６，９８０号中に記載されるように、抗体へテロ結合体を形成するために二次抗体と結合され得る。
【０２５７】
本発明の方法において使用される核酸分子は、ベクター中に挿入され得、そして遺伝子治療ベクターとして使用され得る。遺伝子治療ベクターは、例えば、静脈内注射、局所投与（米国特許第５，３２８，４７０号を参照のこと）または定位注射（例えば、Ｃｈｅｎら、（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：３０５４〜３０５７を参照のこと）によって、被験体に送達され得る。その遺伝子治療ベクターの薬学的調製物は、受容可能な希釈剤中に遺伝子治療ベクターを含み得るか、または遺伝子送達ビヒクルが組み込まれた徐放マトリクスを含み得る。あるいは、完全な遺伝子送達ベクター（例えば、レトロウイルスベクター）が組換え細胞からインタクトで産生され得る場合、その薬学的調製物は、遺伝子送達系を産生する１つ以上の細胞を含み得る。
【０２５８】
（薬理ゲノム学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ））
本発明の治療法と組み合わせて、薬理ゲノム学（すなわち、被験体の遺伝子型と、外来化合物または外来薬物に対するその被験体の応答との間の関連性の研究）が、考慮され得る。治療剤の代謝における差異は、薬理学的に活性な薬物の用量と血液濃度との間の関係を変更することによって、重篤な毒性または治療の失敗をもたらし得る。従って、医師または臨床医は、１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性を調節する薬剤を投与するか否か、ならびに１３１活性、１４８活性、１９９活性、１２３０３活性、１３９０６活性、１５５１３活性、１７８２２活性、３０２活性、５６７７活性、１９４活性、１４３９３活性、２８０５９活性、７３６６活性、１２２１２活性、１９８１活性、２６１活性、１２４１６活性、２７０活性、１４１０活性、１３７活性、１８７１活性、１３０５１活性、１８４７活性、１８４９活性、１５４０２活性、３４０活性、１０２１７活性、８３７活性、１７６１活性、８９９０活性または１３２４９活性を調節する薬剤を用いる処置の投薬量および／もしくは治療レジメンを調整するか否かを決定する際に、適切な薬理ゲノム学研究において得られる知識を適用することを考慮し得る。
【０２５９】
薬理ゲノム学は、罹患した個人における変化した薬物の性質および異常な作用に起因する、薬物に対する応答における臨床学的に有意な遺伝的変動を取り扱う。例えば、Ｅｉｃｈｅｌｂａｕｍ，Ｍ．ら、（１９９６）Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．２３（１０〜１１）：９８３〜９８５およびＬｉｎｄｅｒ，Ｍ．Ｗ．ら、（１９９７）Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．４３（２）：２５４〜２６６を参照のこと。一般に、２つの型の薬理ゲノム学的条件は、区別され得る。遺伝的条件は、薬物が身体に作用する様式を変更する（変化した薬物作用）単一因子として伝達したか、または遺伝的条件は、身体が薬物に作用する様式を変更する（変化した薬物代謝）単一因子として伝達した。これらの薬理ゲノム学的条件は、稀な遺伝子欠損または天然に存在する多型のいずれかとして、存在し得る。例えば、グルコース−６−リン酸アミノペプチダーゼ欠損（Ｇ６ＰＤ）は、一般的な遺伝性酵素病であり、ここで、主な臨床学的合併症は、酸化剤薬物（抗マラリア薬、スルホンアミド、鎮痛薬、ニトロフラン）の摂取後およびソラマメの消費後の溶血である。
【０２６０】
「ゲノムワイド相関解析（ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ  ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）」として知られている、薬物応答を予測する遺伝子を同定するための１つの薬理ゲノム学的アプローチは、すでに知られている遺伝子関連マーカー（例えば、「二座対立遺伝子」マーカーマップ（これは、ヒトゲノム上の６０，０００〜１００，０００の多型部位または変動部位からなり、その部位の各々は、２つの改変体を有する））からなるヒトゲノムの高分解能マップに、主に依存する。このような高分解能ゲノムマップは、特定の観察された薬物応答または副作用に関連したマーカーを同定するために、フェーズＩＩ／フェーズＩＩＩの薬物試験に参加した統計学的に有意な数の患者の各々のゲノムのマップと比較され得る。あるいは、このような高分解能マップは、ヒトゲノムにおいて、数千万個の公知の一塩基多型（ＳＮＰ）の組み合わせから生じ得る。本明細書中で使用される場合、「ＳＮＰ」とは、ＤＮＡストレッチにおいて、単一のヌクレオチド塩基において生じる共通の変化である。例えば、ＳＮＰは、１０００塩基のＤＮＡごとに１回生じ得る。ＳＮＰは、疾患プロセスに関与し得るが、大部分は、疾患に関連していないかもしれない。このようなＳＮＰの発生に基づく遺伝マップを考慮すると、個体は、個々のゲノムにおける特定のＳＮＰパターンに依存して、遺伝カテゴリーへと分類され得る。このような様式において、処置レジメンは、遺伝的に類似する個体の間で共通であり得る特性を考慮して、そのような遺伝的に類似する個体の群に合わせて変更され得る。
【０２６１】
あるいは、「候補遺伝子アプローチ」と呼ばれる方法が、薬物応答を予測する遺伝子を同定するために用いられ得る。この方法に従って、薬物標的をコードする遺伝子が既知である場合（例えば、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質）、その遺伝子の共通のすべての改変体は、その集団においてかなり容易に同定され得、そして別の遺伝子バージョンに対する１つの遺伝子バージョンを有することが特定の薬物応答に関連するか否かが決定され得る。
【０２６２】
例示的実施形態として、薬物代謝酵素の活性は、薬物作用の強度および持続時間の両方の主要な決定因子である。薬物代謝酵素（例えば、Ｎ−アセチルトランスフェラーゼ２（ＮＡＴ２）およびシトクロムＰ４５０酵素であるＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９）の遺伝子多型の発見は、標準的かつ安全な用量の薬物を摂取した後に、患者が予測される薬物効果を得ることも過大な薬物応答および重篤な毒性を示すこともない理由に関する説明を提供した。これらの多型は、その集団中で２つの表現型（代謝が速い者（ＥＭ）および代謝が遅い者（ＰＭ））の状態で発現される。ＰＭの普及率は、種々の集団間で異なる。例えば、ＣＹＰ２Ｄ６をコードする遺伝子は、非常に多型性であり、いくつかの変異が、ＰＭにおいて同定されており、そのすべてが、機能的ＣＹＰ２Ｄ６の不在をもたらす。ＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９の代謝速度が遅い者は、標準的用量を受けたときに、過大な薬物応答および副作用を非常に頻繁に経験する。代謝物が活性な治療部分である場合、ＰＭは、ＣＹＰ２Ｄ６が形成した代謝物であるモルヒネにより媒介されるコデインの鎮痛効果について示されるような、治療応答を示さない。その他の極端な者は、標準的用量に対して応答しない、いわゆる代謝が著しく速い者である。最近、著しく速い代謝の分子的基礎が、ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子増幅に起因することが同定された。
【０２６３】
あるいは、「遺伝子発現プロファイリング」と呼ばれる方法が、薬物応答を予測する遺伝子を同定するために用いられ得る。例えば、薬物（例えば、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９分子または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９モジュレーター）を投薬された動物の遺伝子発現は、毒性に関連する遺伝子経路が作動するかの指標を与え得る。
【０２６４】
上記薬理ゲノム学的アプローチのうちの１つより多くから得られる情報が、被験体の予防的処置または治療的処置のための、適切な投薬量および処置レジメンを決定するために使用され得る。この知識は、投薬または薬物選択に適用される場合、有害な反応または治療の失敗を回避し得、それによって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９活性を調節する薬剤で、心血管疾患（例えば、アテローム性動脈硬化症）に罹患している被験体を処置する場合、治療効果または予防効果を増強し得る。
【０２６５】
（本発明の方法において使用される、組換え発現ベクターおよび宿主細胞）
本発明の方法（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイ）は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質（またはその一部）をコードする核酸を含むベクター（好ましくは発現ベクター）の使用を包含する。本明細書中で使用される場合、用語「ベクター」とは、これが連結された別の核酸を輸送可能である、核酸分子を指す。１つの型のベクターは、「プラスミド」であり、「プラスミド」とは、さらなるＤＮＡセグメントが連結され得る、環状の二本鎖ＤＮＡのループを指す。別の型のベクターは、ウイルスベクターであり、そのベクターにおいて、さらなるＤＮＡセグメントが、ウイルスゲノム中に連結され得る。特定のベクターは、これらが導入される宿主細胞中で自律複製可能である（例えば、細菌複製起点を有する細菌ベクター、およびエピソーム性哺乳動物ベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム性哺乳動物ベクター）は、宿主細胞中に導入された際に、宿主細胞のゲノム中に組み込まれ、それによって、その宿主ゲノムとともに複製される。さらに、特定のベクターは、これらが作動可能に連結された遺伝子の発現を指向可能である。そのようなベクターは、本明細書中で「発現ベクター」と呼ばれる。一般に、組換えＤＮＡ技術において有用な発現ベクターは、しばしば、プラスミドの形態である。本明細書において、「プラスミド」と「ベクター」とは、互換可能に使用され得る。なぜなら、プラスミドは、ベクターの最も一般的に使用される形態であるからである。しかし、本発明は、等価な機能を提供する、そのような他の形態の発現ベクター（例えば、ウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス））を包含することが意図される。
【０２６６】
本発明の方法において使用される組換え発現ベクターは、宿主細胞中での核酸の発現に適切な形態にある本発明の核酸を含む。このことは、その組換え発現ベクターが、発現されるべき核酸配列に作動可能に連結された１つ以上の調節配列（発現のために使用される宿主細胞に基づいて選択される）を含むことを意味する。組換え発現ベクターにおいて、「作動可能に連結された」とは、目的のヌクレオチド配列が、（例えば、インビトロでの転写／翻訳系において、またはそのベクターが宿主細胞中に導入される場合は、その宿主細胞において）そのヌクレオチド配列の発現を可能にする様式で調節配列に連結されていることを意味することが意図される。用語「調節配列」は、プロモーター、エンハンサー、および他の発現制御エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）を含むことが意図される。そのような調節配列は、例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ（１９９０）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８５：３〜７に記載される。調節配列とは、多くの型の宿主細胞においてヌクレオチド配列の構成的発現を指向する配列、および特定の宿主細胞においてのみそのヌクレオチド配列の発現を指向する配列（例えば、組織特異的調節配列）を包含する。発現ベクターの設計は、形質転換される宿主細胞の選択、所望されるタンパク質発現レベルなどのような因子に依存し得ることが、当業者により認識される。本発明の発現ベクターは、宿主細胞内に導入され得、それにより本明細書中に記載されるような核酸によってコードされるタンパク質またはペプチド（融合タンパク質または融合ペプチドを含む）（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の変異体形態、融合タンパク質など）を産生し得る。
【０２６７】
本発明の方法において使用される組換え発現ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞における１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の発現のために設計され得る。例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質は、Ｅ．ｃｏｌｉのような細菌細胞、昆虫細胞（バキュロウイルス発現ベクターを使用する）、酵母細胞、または哺乳動物細胞において発現され得る。適切な宿主細胞は、Ｇｏｅｄｄｅｌ（１９９０）前出においてさらに記載される。あるいは、組換え発現ベクターは、例えば、Ｔ７プロモーター調節配列およびＴ７ポリメラーゼを使用して、インビトロで転写および翻訳され得る。
【０２６８】
原核生物におけるタンパク質の発現は、融合タンパク質または非融合タンパク質のいずれかの発現を指向する構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターを含むベクターを使用して、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて最も頻繁に行われる。融合ベクターは、ベクター中にコードされるタンパク質に、通常は、組換えタンパク質のアミノ末端に、多くのアミノ酸を付加する。このような融合ベクターは、代表的には、３つの目的を果たす：１）組換えタンパク質の発現を増大させること；２）組換えタンパク質の可溶性を増大させること；および３）アフィニティー精製におけるリガンドとして作用することにより、組換えタンパク質の精製を補助すること。しばしば、融合発現ベクターにおいて、タンパク質分解性切断部位は、融合部分と組換えタンパク質の接合部に導入され、融合タンパク質の精製に続いて、組換えタンパク質を融合部分から分離することが可能になる。このような酵素、およびそれらのコグネイト認識配列は、第Ｘａ因子、トロンビンおよびエンテロキナーゼを含む。代表的な融合発現ベクターとしては、それぞれ、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合タンパク質、またはプロテインＡを、標的組換えタンパク質に融合させる、ｐＧＥＸ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  Ｉｎｃ；Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｂ．およびＪｏｈｎｓｏｎ，Ｋ．Ｓ．（１９８８）Ｇｅｎｅ  ６７：３１−４０）、ｐＭＡＬ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）およびｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）が挙げられる。
【０２６９】
精製融合タンパク質は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９活性アッセイ（例えば、以下に詳細に記載される直接的アッセイまたは競合アッセイ）において、または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質に特異的な抗体を生成するために利用され得る。好ましい実施形態において、本発明のレトロウイルス発現ベクターにおいて発現される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質は、骨髄細胞に感染させるために利用され得る。続いて、この骨髄細胞は、照射されたレシピエントに移植される。次いで、被験体レシピエントの病態は、十分な時間（例えば、６週間）が経過した後に試験される。
【０２７０】
別の実施形態において、本発明の核酸は、哺乳動物発現ベクターを使用して、哺乳動物細胞において発現される。哺乳動物発現ベクターの例としては、ｐＣＤＭ８（Ｓｅｅｄ，Ｂ．（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ  ３２９：８４０）およびｐＭＴ２ＰＣ（Ｋａｕｆｍａｎら（１９８７）ＥＭＢＯ  Ｊ．６：１８７−１９５）が挙げられる。哺乳動物細胞において使用される場合、発現ベクターの制御機能は、しばしば、ウイルス調節エレメントにより提供される。例えば、一般に使用されるプロモーターは、ポリオーマウイルス、アデノウイルス２、サイトメガロウイルスおよびシミアンウイルス４０に由来する。原核生物細胞および真核生物細胞両方について適切な他の発現系については、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９の第１６章および第１７章を参照のこと。
【０２７１】
別の実施形態において、組換え哺乳動物発現ベクターは、特定の細胞型においてこの核酸の発現を優先的に指向し得る（例えば、組織特異的調節エレメントがこの核酸を発現させるために使用される）。
【０２７２】
本発明の方法は、本発明のＤＮＡ分子を含む組換え発現ベクター（このＤＮＡ分子は、この発現ベクターにアンチセンス方向にてクローニングされる）をさらに使用し得る。すなわち、このＤＮＡ分子は、（このＤＮＡ分子の転写による）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ｍＲＮＡに対してアンチセンスであるＲＮＡ分子の発現を可能にする様式にて、調節配列に作動可能に連結される。種々の細胞型におけるアンチセンスＲＮＡ分子の連続的発現を指向する、アンチセンス方向にクローニングされる核酸に作動可能に連結される調節配列（例えば、ウイルスプロモーターおよび／またはエンハンサー）が選択され得るか、あるいはアンチセンスＲＮＡの構成的発現、組織特異的発現、または細胞型特異的発現を指向する調節配列が、選択され得る。このアンチセンス発現ベクターは、組換えプラスミド、ファージミド、または弱毒化ウイルスの形態にあり得、この中でアンチセンス核酸は、高効率調節領域の制御下で生成され、その活性は、ベクターが導入される細胞型により決定され得る。アンチセンス遺伝子を使用する遺伝子発現の調節の議論については、Ｗｅｉｎｔｒａｕｂ，Ｈ．ら，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  ＲＮＡ  ａｓ  ａ  ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｔｏｏｌ  ｆｏｒ  ｇｅｎｅｔｉｃ  ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｖｉｅｗｓ−Ｔｒｅｎｄｓ  ｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．１（１）１９８６を参照のこと。
【０２７３】
本発明の別の局面は、本発明の１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子（例えば、組換え発現ベクター内の１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子、あるいは宿主細胞ゲノムの特定の部位への相同組換えを可能にする配列を含む、１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子）が導入される宿主細胞の使用に関する。用語「宿主細胞」および「組換え宿主細胞」は、本明細書中で交換可能に使用される。このような用語は、特定の被験体細胞のみならず、このような細胞の子孫または潜在的子孫もまた言及することが理解される。特定の改変が、変異または環境的影響のいずれかに起因して、次の世代に生じ得るので、このような子孫は、実際に、親細胞と同一でなくてもよいが、本明細書中で使用される用語の範囲内になお含まれる。
【０２７４】
宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞、酵母または哺乳動物細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）またはＣＯＳ細胞）で発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である。
【０２７５】
ベクターＤＮＡは、従来の形質転換技術またはトランスフェクション技術を介して、原核生物細胞または真核生物細胞に導入され得る。本明細書中で使用される場合、用語「形質転換」および「トランスフェクション」とは、外来性の核酸（例えば、ＤＮＡ）を宿主細胞中に導入するための当該分野で認識される種々の技術をいうことを意図し、これらとしては、リン酸カルシウムまたは塩化カルシウムの共沈殿、ＤＥＡＥデキストラン媒介性トランスフェクション、リポフェクション、またはエレクトロポレーションが挙げられる。宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトするための適切な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９）および他の実験室マニュアルに見出され得る。
【０２７６】
本発明の方法において使用される宿主細胞（例えば、培養物中の原核生物宿主細胞または真核生物宿主細胞）を使用して、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質を生成（すなわち、発現）し得る。従って、本発明はさらに、本発明の宿主細胞を使用して１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質を生成するための方法を提供する。１つの実施形態において、本方法は、本発明の宿主細胞（この細胞中に１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質をコードする組換え発現ベクターが導入されている）を適切な培地中で培養する工程、その結果１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質を生成する工程を、包含する。別の実施形態において、本方法はさらに、培地または宿主細胞から１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質を単離する工程を包含する。
【０２７７】
（本発明の方法において使用される、単離された核酸分子）
本発明の方法は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質もしくは１３２４９タンパク質、またはその生物学的に活性な部分をコードする、単離された核酸分子、ならびに、１３１をコードする核酸分子、１４８をコードする核酸分子、１９９をコードする核酸分子、１２３０３をコードする核酸分子、１３９０６をコードする核酸分子、１５５１３をコードする核酸分子、１７８２２をコードする核酸分子、３０２をコードする核酸分子、５６７７をコードする核酸分子、１９４をコードする核酸分子、１４３９３をコードする核酸分子、２８０５９をコードする核酸分子、７３６６をコードする核酸分子、１２２１２をコードする核酸分子、１９８１をコードする核酸分子、２６１をコードする核酸分子、１２４１６をコードする核酸分子、２７０をコードする核酸分子、１４１０をコードする核酸分子、１３７をコードする核酸分子、１８７１をコードする核酸分子、１３０５１をコードする核酸分子、１８４７をコードする核酸分子、１８４９をコードする核酸分子、１５４０２をコードする核酸分子、３４０をコードする核酸分子、１０２１７をコードする核酸分子、８３７をコードする核酸分子、１７６１をコードする核酸分子、８９９０をコードする核酸分子もしくは１３２４９をコードする核酸分子（例えば、１３１ｍＲＮＡ、１４８ｍＲＮＡ、１９９ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、１３９０６ｍＲＮＡ、１５５１３ｍＲＮＡ、１７８２２ｍＲＮＡ、３０２ｍＲＮＡ、５６７７ｍＲＮＡ、１９４ｍＲＮＡ、１４３９３ｍＲＮＡ、２８０５９ｍＲＮＡ、７３６６ｍＲＮＡ、１２２１２ｍＲＮＡ、１９８１ｍＲＮＡ、２６１ｍＲＮＡ、１２４１６ｍＲＮＡ、２７０ｍＲＮＡ、１４１０ｍＲＮＡ、１３７ｍＲＮＡ、１８７１ｍＲＮＡ、１３０５１ｍＲＮＡ、１８４７ｍＲＮＡ、１８４９ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、３４０ｍＲＮＡ、１０２１７ｍＲＮＡ、８３７ｍＲＮＡ、１７６１ｍＲＮＡ、８９９０ｍＲＮＡまたは１３２４９ｍＲＮＡ）を同定するための、ハイブリダイゼーションプローブとしての使用に足りる核酸フラグメント、および１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子を増幅または変異誘発するためのＰＣＲプライマーとしての使用のためのフラグメントの使用を、包含する。本明細書中で使用される場合、用語「核酸分子」は、ＤＮＡ分子（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）およびＲＮＡ分子（例えば、ｍＲＮＡ）、ならびにヌクレオチドアナログを使用して作製されたＤＮＡアナログまたはＲＮＡアナログを含むことを意図される。この核酸分子は一本鎖または二本鎖であり得るが、好ましくは二本鎖ＤＮＡである。
【０２７８】
本発明の方法において使用される核酸分子（例えば、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９もしくは配列番号６１、またはその部分のヌクレオチド配列を有する核酸分子）を、標準的な分子生物学的技術および本明細書中に提供される配列情報を使用して単離し得る。ハイブリダイゼーションプローブとして、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９もしくは配列番号６１の核酸配列の全部または一部を使用して、１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子を、（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．Ｆｒｉｔｓｈ，Ｅ．Ｆ．，およびＭａｎｉａｔｉｓ，Ｔ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９に記載されるような）標準的なハイブリダイゼーション技術およびクローニング技術を使用して単離し得る。
【０２７９】
さらに、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９もしくは配列番号６１の全部または一部を含有する核酸分子を、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９または配列番号６１の配列に基づいて設計した合成オリゴヌクレオチドプライマーを使用するポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって、単離し得る。
【０２８０】
本発明の方法において使用される核酸を、標準的なＰＣＲ増幅技術に従って、テンプレートとしてのｃＤＮＡ、ｍＲＮＡあるいはゲノムＤＮＡ、および適切なオリゴヌクレオチドプライマーを使用して、増幅し得る。さらに、１３１ヌクレオチド配列、１４８ヌクレオチド配列、１９９ヌクレオチド配列、１２３０３ヌクレオチド配列、１３９０６ヌクレオチド配列、１５５１３ヌクレオチド配列、１７８２２ヌクレオチド配列、３０２ヌクレオチド配列、５６７７ヌクレオチド配列、１９４ヌクレオチド配列、１４３９３ヌクレオチド配列、２８０５９ヌクレオチド配列、７３６６ヌクレオチド配列、１２２１２ヌクレオチド配列、１９８１ヌクレオチド配列、２６１ヌクレオチド配列、１２４１６ヌクレオチド配列、２７０ヌクレオチド配列、１４１０ヌクレオチド配列、１３７ヌクレオチド配列、１８７１ヌクレオチド配列、１３０５１ヌクレオチド配列、１８４７ヌクレオチド配列、１８４９ヌクレオチド配列、１５４０２ヌクレオチド配列、３４０ヌクレオチド配列、１０２１７ヌクレオチド配列、８３７ヌクレオチド配列、１７６１ヌクレオチド配列、８９９０ヌクレオチド配列または１３２４９ヌクレオチド配列に対応するオリゴヌクレオチドを、標準的な合成技術（例えば、自動ＤＮＡ合成機を使用すること）によって、調製し得る。
【０２８１】
好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される単離された核酸分子は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列の相補体、またはこれらのヌクレオチド配列の任意の部分を含む。配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列に相補的である核酸分子とは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列に十分に相補的である核酸分子であり、その結果、この核酸分子は配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列にハイブリダイズし得、それによって安定な二重鎖を形成する。
【０２８２】
なお別の好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される単離された核酸分子は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列の全長、またはこのヌクレオチド配列の任意の部分に、少なくとも約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％以上同一であるヌクレオチド配列を含有する。
【０２８３】
さらに、本発明の方法において使用される核酸分子は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１の核酸配列の部分（例えば、プローブもしくはプライマーとして使用され得るフラグメント）、または１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の部分（例えば、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の生物学的に活性な部分）をコードするフラグメント）のみを含み得る。代表的に、プローブ／プライマーは、実質的に精製されたオリゴヌクレオチドを含む。代表的に、オリゴヌクレオチドは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１のセンス配列、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１のアンチセンス配列、あるいは配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１の天然に存在する対立遺伝子の改変体または変異体の少なくとも約１２または１５、好ましくは約２０または２５、より好ましくは約３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５または７５個連続したヌクレオチドにストリンジェントな条件下で、ハイブリダイズするヌクレオチド配列の領域を含む。１つの実施形態において、本発明の方法において使用される核酸分子は、１００、１００〜２００、２００〜３００、３００〜４００、４００〜５００、５００〜６００、６００〜７００、７００〜８００、８００〜９００、９００〜１０００、１０００〜１１００、１１００〜１２００、１２００〜１３００以上のヌクレオチド長よりも長く、かつストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１の核酸分子にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【０２８４】
本明細書中で使用される場合、用語「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする」は、お互いに有意に同一または相同であるヌクレオチ配列が、お互いにハイブリダイズされたままである状態でハイブリダイゼーションおよび洗浄するための条件を記載することを意図する。好ましくは、この条件は、少なくとも約７０％、より好ましくは少なくとも約８０％、なおより好ましくは少なくとも約８５％または９０％で、互いに同一な配列が、互いにハイブリダイズしたままであるような条件である。このようなストリンジェントな条件は、当業者に公知であり、そしてＣｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（１９９５），２節，４節および６節に見出され得る。さらなストリンジェントな条件は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ（１９８９），７章、９章および１１章に見出され得る。好ましい、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約６５〜７０℃での、４×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）中でハイブリダイゼーション（または約４２〜５０℃での、４×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中でハイブリダイゼーション）、次いで約６５〜７０℃での、１×ＳＳＣで１回以上の洗浄が挙げられる。好ましい、高度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約６５〜７０℃での、１×ＳＳＣ中でハイブリダイゼーション（または約４２〜５０℃での、１×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中でハイブリダイゼーション）、次いで約６５〜７０℃での、０．３×ＳＳＣで１回以上の洗浄が挙げられる。好ましい、低いストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約５０〜６０℃での、４×ＳＳＣ中でハイブリダイゼーション（あるいは、約４０〜４５℃での、６×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中でハイブリダイゼーション）、次いで約５０〜６０℃での、２×ＳＳＣで１回以上の洗浄が挙げられる。上記の値の中間の範囲（例えば、６５〜７０℃または４２〜５０℃）もまた、本発明に含まれることが意図される。ＳＳＰＥ（１×ＳＳＰＥは、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、１０ｍＭ  ＮａＨ２ＰＯ４および１．２５ｍＭ  ＥＤＴＡ、ｐＨ  ７．４である）は、ハイブリダイゼーションおよび洗浄緩衝液中でＳＳＣ（１×ＳＳＣは、０．１５Ｍ  ＮａＣｌおよび１５ｍＭクエン酸ナトリウムである）に置き換わり得る；洗浄は、各ハイブリダイゼーションが終了した後で、１５分間実行される。５０塩基対長未満であることが予測されるハイブリッドのハイブリダイゼーション温度は、ハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）より５〜１０℃低くあるべきであり、ここでＴｍが以下の式に従って決定される。１８塩基対長未満であるハイブリッドについて、Ｔｍ（℃）＝２（Ａ塩基＋Ｔ塩基の数）＋４（Ｇ塩基＋Ｃ塩基の数）。１８塩基対長と４９塩基対長の間のであるハイブリッドについて、Ｔｍ（℃）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ１０［Ｎａ＋］）���０．４１（％Ｇ＋Ｃ）−（６００／Ｎ）、ここで、Ｎはハイブリッド中の塩基の数であり、そして［Ｎａ＋］は、ハイブリダイゼーション緩衝液中のナトリウムイオンの濃度である（１×ＳＳＣに対する［Ｎａ＋］＝０．１６５Ｍ）。膜（例えば、ニトロセルロース膜、またはナイロン膜）への核酸分子の非特異的ハイブリダイゼーションを減少させるために、さらなる試薬が、ハイブリダイゼーションおよび／または洗浄緩衝液に添加され得ることが当業者によってまた認識され、この試薬としては、限定されないが以下が挙げられる：ブロッキング剤（例えば、ＢＳＡ、もしくはサケまたはニシンの精子キャリアＤＮＡ）、界面活性剤（例えば、ＳＤＳ）、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）、Ｆｉｃｏｌｌ、ＰＶＰなど。ナイロン膜が使用される場合、特にさらなる好ましい、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約６５℃での、０．２５〜０．５Ｍ  ＮａＨ２ＰＯ４、７％  ＳＤＳ中でハイブリダイゼーション、次いで６５℃での、０．０２Ｍ  ＮａＨ２ＰＯ４、１％  ＳＤＳで１回以上の洗浄である（例えば、ＣｈｕｒｃｈおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９８４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８１：１９９１−１９９５，（または代替的に０．２×ＳＳＣ、１％  ＳＤＳ）。
【０２８５】
好ましい実施形態において、プローブは、プローブに結合した標識基をさらに含む（例えば、標識基は、放射性同位元素、蛍光化合物、酵素または酵素補因子であり得る）。このようなプローブは、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質を誤発現する（ｍｉｓｅｘｐｒｅｓｓ）細胞または組織を同定するための診断的試験キットの一部として使用され得る（例えば、被験体由来の細胞サンプル中の１３１コード核酸、１４８コード核酸、１９９コード核酸、１２３０３コード核酸、１３９０６コード核酸、１５５１３コード核酸、１７８２２コード核酸、３０２コード核酸、５６７７コード核酸、１９４コード核酸、１４３９３コード核酸、２８０５９コード核酸、７３６６コード核酸、１２２１２コード核酸、１９８１コード核酸、２６１コード核酸、１２４１６コード核酸、２７０コード核酸、１４１０コード核酸、１３７コード核酸、１８７１コード核酸、１３０５１コード核酸、１８４７コード核酸、１８４９コード核酸、１５４０２コード核酸、３４０コード核酸、１０２１７コード核酸、８３７コード核酸、１７６１コード核酸、８９９０コード核酸または１３２４９コード核酸のレベルを測定すること、例えば、１３１  ｍＲＮＡレベル、１４８  ｍＲＮＡレベル、１９９  ｍＲＮＡレベル、１２３０３  ｍＲＮＡレベル、１３９０６  ｍＲＮＡレベル、１５５１３  ｍＲＮＡレベル、１７８２２  ｍＲＮＡレベル、３０２  ｍＲＮＡレベル、５６７７  ｍＲＮＡレベル、１９４  ｍＲＮＡレベル、１４３９３  ｍＲＮＡレベル、２８０５９  ｍＲＮＡレベル、７３６６  ｍＲＮＡレベル、１２２１２  ｍＲＮＡレベル、１９８１  ｍＲＮＡレベル、２６１  ｍＲＮＡレベル、１２４１６  ｍＲＮＡレベル、２７０  ｍＲＮＡレベル、１４１０  ｍＲＮＡレベル、１３７  ｍＲＮＡレベル、１８７１  ｍＲＮＡレベル、１３０５１  ｍＲＮＡレベル、１８４７  ｍＲＮＡレベル、１８４９  ｍＲＮＡレベル、１５４０２  ｍＲＮＡレベル、３４０  ｍＲＮＡレベル、１０２１７  ｍＲＮＡレベル、８３７  ｍＲＮＡレベル、１７６１  ｍＲＮＡレベル、８９９０  ｍＲＮＡレベルまたは１３２４９  ｍＲＮＡレベルを検出するか、またはゲノムの１３１遺伝子、１４８遺伝子、１９９遺伝子、１２３０３遺伝子、１３９０６遺伝子、１５５１３遺伝子、１７８２２遺伝子、３０２遺伝子、５６７７遺伝子、１９４遺伝子、１４３９３遺伝子、２８０５９遺伝子、７３６６遺伝子、１２２１２遺伝子、１９８１遺伝子、２６１遺伝子、１２４１６遺伝子、２７０遺伝子、１４１０遺伝子���１３７遺伝子、１８７１遺伝子、１３０５１遺伝子、１８４７遺伝子、１８４９遺伝子、１５４０２遺伝子、３４０遺伝子、１０２１７遺伝子、８３７遺伝子、１７６１遺伝子、８９９０遺伝子または１３２４９遺伝子が変異されているか除去されているかを測定することによって）。
【０２８６】
本発明の方法は、遺伝暗号の縮重に起因して、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列とは異なり、従って、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１に示されるヌクレオチド配列によってコードされるタンパク質と同じ１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質をコードする核酸分子の使用をさらに含む。別の実施形態において、本発明の方法に含まれる単離された核酸分子は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、もしくは配列番号６０に示されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を有する。
【０２８７】
本発明の方法は、ヒト１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の対立遺伝子改変体（例えば、機能的対立遺伝子改変体および非機能的対立遺伝子改変体）の使用をさらに含む。機能的対立遺伝子改変体は、ヒト１３１タンパク質、ヒト１４８タンパク質、ヒト１９９タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト１３９０６タンパク質、ヒト１５５１３タンパク質、ヒト１７８２２タンパク質、ヒト３０２タンパク質、ヒト５６７７タンパク質、ヒト１９４タンパク質、ヒト１４３９３タンパク質、ヒト２８０５９タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト１２２１２タンパク質、ヒト１９８１タンパク質、ヒト２６１タンパク質、ヒト１２４１６タンパク質、ヒト２７０タンパク質、ヒト１４１０タンパク質、ヒト１３７タンパク質、ヒト１８７１タンパク質、ヒト１３０５１タンパク質、ヒト１８４７タンパク質、ヒト１８４９タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト３４０タンパク質、ヒト１０２１７タンパク質、ヒト８３７タンパク質、ヒト１７６１タンパク質、ヒト８９９０タンパク質またはヒト１３２４９タンパク質の天然に存在するアミノ酸配列改変体であって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を維持するアミノ酸配列改変体である。機能的対立遺伝子改変体は、代表的に、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、もしくは配列番号６０の１つ以上のアミノ酸の保存的置換、またはそのタンパク質の非必須領域における非必須残基の置換、欠失、もしくは挿入のみを含む。
【０２８８】
非機能的対立遺伝子改変体は、ヒト１３１タンパク質、ヒト１４８タンパク質、ヒト１９９タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト１３９０６タンパク質、ヒト１５５１３タンパク質、ヒト１７８２２タンパク質、ヒト３０２タンパク質、ヒト５６７７タンパク質、ヒト１９４タンパク質、ヒト１４３９３タンパク質、ヒト２８０５９タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト１２２１２タンパク質、ヒト１９８１タンパク質、ヒト２６１タンパク質、ヒト１２４１６タンパク質、ヒト２７０タンパク質、ヒト１４１０タンパク質、ヒト１３７タンパク質、ヒト１８７１タンパク質、ヒト１３０５１タンパク質、ヒト１８４７タンパク質、ヒト１８４９タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト３４０タンパク質、ヒト１０２１７タンパク質、ヒト８３７タンパク質、ヒト１７６１タンパク質、ヒト８９９０タンパク質またはヒト１３２４９タンパク質の天然に存在するアミノ酸配列改変体であって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を有さないアミノ酸配列改変体である。非機能的対立遺伝子改変体は、代表的には、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、もしくは配列番号６０のアミノ酸配列の非保存的な置換、欠失、もしくは挿入または未成熟短縮化（ｐｒｅｍａｔｕｒｅ  ｔｒｕｎｃａｔｉｏｎ）、あるいはこのタンパク質の必須残基または必須領域の置換、挿入、または欠失を含む。
【０２８９】
本発明の方法は、ヒト１３１タンパク質、ヒト１４８タンパク質、ヒト１９９タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト１３９０６タンパク質、ヒト１５５１３タンパク質、ヒト１７８２２タンパク質、ヒト３０２タンパク質、ヒト５６７７タンパク質、ヒト１９４タンパク質、ヒト１４３９３タンパク質、ヒト２８０５９タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト１２２１２タンパク質、ヒト１９８１タンパク質、ヒト２６１タンパク質、ヒト１２４１６タンパク質、ヒト２７０タンパク質、ヒト１４１０タンパク質、ヒト１３７タンパク質、ヒト１８７１タンパク質、ヒト１３０５１タンパク質、ヒト１８４７タンパク質、ヒト１８４９タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト３４０タンパク質、ヒト１０２１７タンパク質、ヒト８３７タンパク質、ヒト１７６１タンパク質、ヒト８９９０タンパク質またはヒト１３２４９タンパク質の非ヒトオルソログをさらに使用し得る。ヒト１３１タンパク質、ヒト１４８タンパク質、ヒト１９９タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト１３９０６タンパク質、ヒト１５５１３タンパク質、ヒト１７８２２タンパク質、ヒト３０２タンパク質、ヒト５６７７タンパク質、ヒト１９４タンパク質、ヒト１４３９３タンパク質、ヒト２８０５９タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト１２２１２タンパク質、ヒト１９８１タンパク質、ヒト２６１タンパク質、ヒト１２４１６タンパク質、ヒト２７０タンパク質、ヒト１４１０タンパク質、ヒト１３７タンパク質、ヒト１８７１タンパク質、ヒト１３０５１タンパク質、ヒト１８４７タンパク質、ヒト１８４９タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト３４０タンパク質、ヒト１０２１７タンパク質、ヒト８３７タンパク質、ヒト１７６１タンパク質、ヒト８９９０タンパク質またはヒト１３２４９タンパク質のオルソログは、非ヒト生物から単離され、そして同じ１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の活性を有するタンパク質である。
【０２９０】
本発明の方法は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１のヌクレオチド配列またはそれらの一部を含む核酸分子であって、変異が導入されている核酸分子の使用をさらに包含する。変異は、「非必須」アミノ酸残基または「必須」アミノ酸残基でのアミノ酸置換を導き得る。「非必須」アミノ酸残基とは、その生物学的活性を変化することなく１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の野生型配列（例えば、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、もしくは配列番号６０の配列）から変化され得る残基であり、一方、「必須」アミノ酸残基は、生物学的活性のために必要とされる。例えば、本発明の１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の間で保存されたアミノ酸残基は、変化を受容する可能性は低い。
【０２９１】
変異は、標準技術（例えば、部位特異的変異誘発およびＰＣＲ媒介変異誘発）により配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、もしくは配列番号６０に導入され得る。好ましくは、保存的アミノ酸置換が、１つ以上の予想される非必須アミノ酸残基でなされる。「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるアミノ酸置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが、当該分野において規定されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、無荷電の極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β−分枝側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が挙げられる。従って、好ましくは、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質において予想される非必須アミノ酸残基は、同じ側鎖のファミリーからの別のアミノ酸残基で置換される。あるいは、別の実施形態において、変異は、例えば、飽和変異誘発（ｓａｔｕｒａｔｉｏｎ  ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）によって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のコード配列の全てまたは一部に沿って、ランダムに導入され得、そして得られた変異体は、活性を保持する変異体を同定するために、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１��５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の生物学的活性についてスクリーニングされ得る。配配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１の変異誘発の後、コードされたタンパク質が、組換え発現され得、そしてそのタンパク質の活性が、本明細書中に記載されたアッセイを用いて決定され得る。
【０２９２】
本発明の別の局面は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、もしくは配列番号６１のヌクレオチド配列に対するアンチセンスである単離された核酸分子の使用に関する。「アンチセンス」核酸は、タンパク質をコードする「センス」核酸に相補的である（例えば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的であるかまたはｍＲＮＡ配列に相補的である）ヌクレオチド配列を含む。従って、アンチセンス核酸は、センス核酸に水素結合し得る。アンチセンス核酸は、全長１３１コード鎖、全長１４８コード鎖、全長１９９コード鎖、全長１２３０３コード鎖、全長１３９０６コード鎖、全長１５５１３コード鎖、全長１７８２２コード鎖、全長３０２コード鎖、全長５６７７コード鎖、全長１９４コード鎖、全長１４３９３コード鎖、全長２８０５９コード鎖、全長７３６６コード鎖、全長１２２１２コード鎖、全長１９８１コード鎖、全長２６１コード鎖、全長１２４１６コード鎖、全長２７０コード鎖、全長１４１０コード鎖、全長１３７コード鎖、全長１８７１コード鎖、全長１３０５１コード鎖、全長１８４７コード鎖、全長１８４９コード鎖、全長１５４０２コード鎖、全長３４０コード鎖、全長１０２１７コード鎖、全長８３７コード鎖、全長１７６１コード鎖、全長８９９０コード鎖または全長１３２４９コード鎖または、それらの一部のみに相補的であり得る。一つの実施形態において、アンチセンス核酸分子は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９をコードするヌクレオチド配列のコード鎖の「コード領域」に対するアンチセンスである。用語「コード領域」とは、アミノ酸残基に翻訳されるコドンを含むヌクレオチド配列の領域をいう。別の実施形態において、このアンチセンス核酸分子は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９をコードするヌクレオチド配列のコード鎖の「非コード領域」に対するアンチセンスである。用語「非コード領域」とは、コード領域に隣接する５’配列および３’配列であって、アミノ酸に翻訳されない配列をいう（５’および３’の非翻訳領域ともいう）。
【０２９３】
本明細書中に開示される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９をコードするコード鎖配列を考慮して、本発明のアンチセンス核酸は、ＷａｔｓｏｎおよびＣｒｉｃｋの塩基対形成の法則に従って、設計され得る。アンチセンス核酸分子は、１３１  ｍＲＮＡ、１４８  ｍＲＮＡ、１９９  ｍＲＮＡ、１２３０３  ｍＲＮＡ、１３９０６  ｍＲＮＡ、１５５１３  ｍＲＮＡ、１７８２２  ｍＲＮＡ、３０２  ｍＲＮＡ、５６７７  ｍＲＮＡ、１９４  ｍＲＮＡ、１４３９３  ｍＲＮＡ、２８０５９  ｍＲＮＡ、７３６６  ｍＲＮＡ、１２２１２  ｍＲＮＡ、１９８１  ｍＲＮＡ、２６１  ｍＲＮＡ、１２４１６  ｍＲＮＡ、２７０  ｍＲＮＡ、１４１０  ｍＲＮＡ、１３７  ｍＲＮＡ、１８７１  ｍＲＮＡ、１３０５１  ｍＲＮＡ、１８４７  ｍＲＮＡ、１８４９  ｍＲＮＡ、１５４０２  ｍＲＮＡ、３４０  ｍＲＮＡ、１０２１７  ｍＲＮＡ、８３７  ｍＲＮＡ、１７６１  ｍＲＮＡ、８９９０  ｍＲＮＡまたは１３２４９  ｍＲＮＡの全コード領域に相補的であり得るが、より好ましくは１３１  ｍＲＮＡ、１４８  ｍＲＮＡ、１９９  ｍＲＮＡ、１２３０３  ｍＲＮＡ、１３９０６  ｍＲＮＡ、１５５１３  ｍＲＮＡ、１７８２２  ｍＲＮＡ、３０２  ｍＲＮＡ、５６７７  ｍＲＮＡ、１９４  ｍＲＮＡ、１４３９３  ｍＲＮＡ、２８０５９  ｍＲＮＡ、７３６６  ｍＲＮＡ、１２２１２  ｍＲＮＡ、１９８１  ｍＲＮＡ、２６１  ｍＲＮＡ、１２４１６  ｍＲＮＡ、２７０  ｍＲＮＡ、１４１０  ｍＲＮＡ、１３７  ｍＲＮＡ、１８７１  ｍＲＮＡ、１３０５１  ｍＲＮＡ、１８４７  ｍＲＮＡ、１８４９  ｍＲＮＡ、１５４０２  ｍＲＮＡ、３４０  ｍＲＮＡ、１０２１７  ｍＲＮＡ、８３７  ｍＲＮＡ、１７６１  ｍＲＮＡ、８９９０  ｍＲＮＡまたは１３２４９  ｍＲＮＡのコード領域または非コード領域の一部のみに対してアンチセンスであるオリゴヌクレオチドである。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、１３１  ｍＲＮＡ、１４８  ｍＲＮＡ、１９９  ｍＲＮＡ、１２３０３  ｍＲＮＡ、１３９０６  ｍＲＮＡ、１５５１３  ｍＲＮＡ、１７８２２  ｍＲＮＡ、３０２  ｍＲＮＡ、５６７７  ｍＲＮＡ、１９４  ｍＲＮＡ、１４３９３  ｍＲＮＡ、２８０５９  ｍＲＮＡ、７３６６  ｍＲＮＡ、１２２１２  ｍＲＮＡ、１９８１  ｍＲＮＡ、２６１  ｍＲＮＡ、１２４１６  ｍＲＮＡ、２７０  ｍＲＮＡ、１４１０  ｍＲＮＡ、１３７  ｍＲＮＡ、１８７１  ｍＲＮＡ、１３０５１  ｍＲＮＡ、１８４７  ｍＲＮＡ、１８４９  ｍＲＮＡ、１５４０２  ｍＲＮＡ、３４０  ｍＲＮＡ、１０２１７  ｍＲＮＡ、８３７  ｍＲＮＡ、１７６１  ｍＲＮＡ、８９９０  ｍＲＮＡまたは１３２４９  ｍＲＮＡの翻訳開始部位の周辺領域に相補的であり得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５または５０ヌクレオチド長であり得る。本発明のアンチセンス核酸は、当該分野で公知の手順を使用して、化学的合成および酵素的連結反応を使用して構築され得る。例えば、アンチセンス核酸（例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド）は、天然に存在するヌクレオチド、あるいは分子の生物学的安定性を増大するように、またはアンチセンス核酸とセンス核酸との間に形成される二重鎖の物理的安定性を増大するように設計された、種々に改変されたヌクレオチドを使用して、化学的に合成され得る。例えば、ホスホロチオエート誘導体およびアクリジン置換ヌクレオチドが使用され得る。アンチセンス核酸を生成するために使用され得る改変ヌクレオチドの例としては、以下が挙げられる：５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−クロロウラシル、５−ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、４−アセチルシトシン、５−（カルボキシヒドロキシルメチル）ウラシル、５−カルボキシメチルアミノメチル−２−チオウリジン、５−カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、β−Ｄ−ガラクトシルキューオシン、イノシン、Ｎ６−イソペンテニルアデニン、１−メチルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチルグアニン、２−メチルアデニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−アデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキシアミノメチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルキューオシン、５’−メトキシカルボキシメチルウラシル、５−メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、ワイブトキソシン（ｗｙｂｕｔｏｘｏｓｉｎｅ）、プソイドウラシル、キューオシン、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、ウラシル−５−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、５−メチル−２−チオウラシル、３−（３−アミノ−３−Ｎ−２−カルボキシプロピル）ウラシル、（ａｃｐ３）ｗおよび２，６−ジアミノプリン。あるいは、アンチセンス核酸は、核酸がアンチセンス方向でサブクローニングされた発現ベクターを使用して、生物学的に生成され得る（すなわち、挿入された核酸から転写されるＲＮＡは、目的の標的核酸に対してアンチセンス方向のＲＮＡである）。本発明の方法において使用されるアンチセンス核酸分子は、さらに、上記の第ＩＶ節において記載される。
【０２９４】
なお別の実施形態において、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９核酸分子は、塩基部分、糖部分またはリン酸骨格において改変されて、例えば、分子の安定性、ハイブリダイゼーションまたは可溶性を改善し得る。例えば、核酸分子のデオキシリボースリン酸骨格は、ペプチド核酸を生成するために改変され得る（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ４（１）：５−２３を参照のこと）。本明細書中で使用される場合、用語「ペプチド核酸」すなわち「ＰＮＡ」は、核酸模倣物（例えば、ＤＮＡ模倣物）をいい、ここで、デオキシリボースリン酸骨格は、偽ペプチド骨格によって置換され、そして４種の天然の核酸塩基だけが維持される。ＰＮＡの中性の骨格は、低イオン強度の条件下で、ＤＮＡおよびＲＮＡへの特異的ハイブリダイゼーションを可能にすることが示されている。ＰＮＡオリゴマーの合成は、標準的な固相ペプチド合成プロトコルを使用して、Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、（１９９６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９３：１４６７０−６７５に記載されるように実施され得る。
【０２９５】
１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９核酸分子のＰＮＡは、本明細書中に記載される治療適用および診断適用において使用され得る。例えば、ＰＮＡは、例えば、転写もしくは翻訳の停止を誘導するか、または複製を阻害することによって、遺伝子発現の配列特異的調節のためのアンチセンス因子またはアンチ遺伝子（ａｎｔｉｇｅｎｅ）因子として使用され得る。１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子のＰＮＡはまた、遺伝子中の単一塩基対の変異の分析において（例えば、ＰＮＡ指向性のＰＣＲクランピングによって）；他の酵素と組み合わせて使用する場合には、「人工制限酵素」として（例えば、Ｓ１ヌクレアーゼ（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出））；またはＤＮＡ配列決定もしくはハイブリダイゼーションのためのプローブもしくはプライマーとして（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、（１９９６）前出）、使用され得る。
【０２９６】
別の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のＰＮＡは、（例えば、ＰＮＡの安定性または細胞取り込みを増強するために）、ＰＮＡに親油性もしくは他のヘルパー基を結合させることによってか、ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの形成によってか、またはリポソームもしくは当該分野で公知の他の薬物送達技術の使用によって、改変され得る。例えば、ＰＮＡおよびＤＮＡの有利な特性を組み合わせ得る１３１核酸分子、１４８核酸分子、１９９核酸分子、１２３０３核酸分子、１３９０６核酸分子、１５５１３核酸分子、１７８２２核酸分子、３０２核酸分子、５６７７核酸分子、１９４核酸分子、１４３９３核酸分子、２８０５９核酸分子、７３６６核酸分子、１２２１２核酸分子、１９８１核酸分子、２６１核酸分子、１２４１６核酸分子、２７０核酸分子、１４１０核酸分子、１３７核酸分子、１８７１核酸分子、１３０５１核酸分子、１８４７核酸分子、１８４９核酸分子、１５４０２核酸分子、３４０核酸分子、１０２１７核酸分子、８３７核酸分子、１７６１核酸分子、８９９０核酸分子または１３２４９核酸分子のＰＮＡ−ＤＮＡキメラが、生成され得る。このようなキメラは、ＤＮＡ認識酵素（例えば、ＲＮＡｓｅ  ＨおよびＤＮＡポリメラーゼ）に、ＤＮＡ部分と相互作用させ、一方、ＰＮＡ部分は、高い結合親和性および結合特異性を提供する。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラは、塩基スタッキング、核酸塩基間の結合の数および方向に関して選択される、適切な長さのリンカーを使用して、連結され得る（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出）。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの合成は、Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出およびＦｉｎｎ  Ｐ．Ｊ．ら、（１９９６）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２４（１７）：３３５７−６３に記載されるように実施され得る。例えば、ＤＮＡ鎖は、標準的なホスホロアミダイトカップリング化学および改変ヌクレオシドアナログを使用して、固体支持体上で合成され得る。例えば、５’−（４−メトキシトリチル）アミノ−５’−デオキシ−チミジンホスホラミダイトが、ＰＮＡとＤＮＡの５’末端との間として使用され得る（Ｍａｇ、Ｍ．ら、（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１７：５９７３−８８）。次いで、ＰＮＡモノマーは、段階的な様式でカップリングされて、５’ＰＮＡセグメントおよび３’ＤＮＡセグメントを有するキメラ分子を生成する（Ｆｉｎｎ  Ｐ．Ｊ．ら、（１９９６）前出）。あるいは、キメラ分子は、５’ＤＮＡセグメントおよび３’ＰＮＡセグメントを用いて合成され得る（Ｐｅｔｅｒｓｅｒ、Ｋ．Ｈ．ら、（１９７５）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．５：１１１９−１１１２４）。
【０２９７】
他の実施形態において、本発明の方法において使用されるオリゴヌクレオチドは、他の付随的な基（例えば、（例えば、インビボで宿主細胞レセプターを標的化するための）ペプチド、または細胞膜を通る輸送を促進するための因子（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら、（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：６５５３−６５５６；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：６４８−６５２；ＰＣＴ公開番号ＷＯ８８／０９８１０を参照のこと）もしくは血液脳関門を通る輸送を促進するための因子（例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ８９／１０１３４を参照のこと）を含み得る。さらに、オリゴヌクレオチドは、ハイブリダイゼーション誘発性切断因子（例えば、Ｋｒｏｌら、（１９８８）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ６：９５８−９７６を参照のこと）またはインターカレート剤（例えば、Ｚｏｎ（１９８８）Ｐｈａｒｍ．  Ｒｅｓ．５：５３９−５４９を参照のこと）を用いて改変され得る。この目的で、オリゴヌクレオチドは、別の分子（例えば、ペプチド、ハイブリダイゼーション誘発性架橋剤、輸送因子またはハイブリダイゼーション誘発性切断因子）に結合体化され得る。
【０２９８】
（本発明の方法において使用される、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の単離タンパク質、および抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体または抗１３２４９抗体）
本発明の方法は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９単離タンパク質およびこれらの生物学的に活性な部分、ならびに抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体または抗１３２４９抗体を惹起するための免疫原として使用されるのに適切なポリペプチドフラグメントの使用を包含する。１つの実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のネイティブタンパク質は、標準的なタンパク質精製技術を使用する、適切な精製スキームによって、細胞供給源または組織供給源から単離され得る。別の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質は、組換えＤＮＡ技術によって生成される。組換え発現と代替的に、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチドは、標準的なペプチド合成技術を使用して、化学的に合成され得る。
【０２９９】
本明細書中で使用する場合、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の「生物学的に活性な部分」は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９活性を有する、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質のフラグメントを含む。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の生物学的に活性な部分は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質のアミノ酸配列に十分に同一であるかまたはこれらに由来する、アミノ酸配列（例えば、全長の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質より少ないアミノ酸を含み、かつ１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の少なくとも１つの活性を示す、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８または配列番号６０に示されるアミノ酸配列）を含むペプチドを含む。代表的には、生物学的に活性な部分は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の少なくとも１つの活性を有するドメインまたはモチーフ（例えば、アポトーシス活性の調節に関与すると考えられている、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質のＮ末端領域）を含む。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の生物学的に活性な部分は、例えば、２５、５０、７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２５０、３００アミノ酸長以上である、ポリペプチドであり得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の生物学的に活性な部分は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９活性を調節する薬剤を開発するための標的として使用され得る。
【０３００】
好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８または配列番号６０に示されるアミノ酸配列を有する。他の実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８または配列番号６０に対して実質的に同一であり、そして配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８または配列番号６０のタンパク質の機能的活性を保持するが、上記第Ｖ節において詳細に記載されるように、天然の対立遺伝子バリエーションまたは変異誘発に起因して、アミノ酸配列が異なる。従って、別の実施形態において、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８または配列番号６０に対して少なくとも約５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ以上同一なアミノ酸配列を含むタンパク質である。
【０３０１】
２つのアミノ酸配列または２つの核酸配列の同一性パーセントを決定するために、これらの配列は、最適比較目的で整列される（例えば、ギャップが、最適な整列のために、第１および第２のアミノ酸配列または核酸配列の一方または両方に導入され得、そして非同一配列は、比較目的で無視され得る）。好ましい実施形態において、比較目的で整列される参照配列の長さは、参照配列の少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、およびさらにより好ましくは少なくとも７０％、８０％または９０％の長さである（例えば、５００アミノ酸残基を有する、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８または配列番号６０の１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９アミノ酸配列に、第二の配列を整列させる場合、少なくとも７５、好ましくは少なくとも１５０、より好ましくは少なくとも２２５、なおより好ましくは少なくとも３００およびなおより好ましくは少なくとも４００またはそれ以上のアミノ酸残基が整列される）。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが、比較される。第１の配列における位置が、第２の配列の対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められる場合、これらの分子は、その位置で同一である（本明細書中で使用される場合、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と等しい）。２つの配列間の同一性パーセントは、それらの配列により共有される同一の位置の数の関数である（２つの配列の最適なアラインメントのために導入される必要のある、ギャップの数、および、各ギャップの長さが考慮される）。
【０３０２】
配列の比較および２つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。好ましい実施形態において、２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムに組み込まれたＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４４−４５３（１９７０））のアルゴリズムを用い、Ｂｌｏｓｕｍ  ６２マトリクスまたはＰＡＭ２５０マトリクスのいずれか、ならびにギャップウェイト１６、１４、１２、１０、８、６、または４およびレングスウェイト（ｌｅｎｇｔｈ  ｗｅｉｇｈｔ）１、２、３、４、５、または６を用いて決定される。さらに別の好ましい実施形態において、２つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムを用い、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリクスならびにギャップウェイト４０、５０、６０、７０、または８０およびレングスウェイト１、２、３、４、５、または６を用いて決定される。別の実施形態において、２つのアミノ酸配列間または２つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０または２．０Ｕ）に組みこまれたＥ．ＭｅｙｅｒｓおよびＷ．Ｍｉｌｌｅｒ（Ｃｏｍｐｕｔ．Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｓｃｉ．４：１１−１７（１９８８））のアルゴリズムを使用し、ＰＡＭ１２０ウェイトレジデューテーブル（ｗｅｉｇｈｔ  ｒｅｄｉｄｕｅ  ｔａｂｌｅ）、ギャップレングスペナルティー１２、およびギャップペナルティー４を用いて決定され得る。
【０３０３】
本発明の方法はまた、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９キメラタンパク質、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質を使用し得る。本明細書中で使用される場合、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の「キメラタンパク質」または「融合タンパク質」は、非１３１ポリペプチド、非１４８ポリペプチド、非１９９ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非１３９０６ポリペプチド、非１５５１３ポリペプチド、非１７８２２ポリペプチド、非３０２ポリペプチド、非５６７７ポリペプチド、非１９４ポリペプチド、非１４３９３ポリペプチド、非２８０５９ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非１２２１２ポリペプチド、非１９８１ポリペプチド、非２６１ポリペプチド、非１２４１６ポリペプチド、非２７０ポリペプチド、非１４１０ポリペプチド、非１３７ポリペプチド、非１８７１ポリペプチド、非１３０５１ポリペプチド、非１８４７ポリペプチド、非１８４９ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非３４０ポリペプチド、非１０２１７ポリペプチド、非８３７ポリペプチド、非１７６１ポリペプチド、非８９９０ポリペプチドまたは非１３２４９ポリペプチドに作動可能に連結された、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチドを含む。「１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチド」は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９分子に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドをいうが、一方、「非１３１ポリペプチド、非１４８ポリペプチド、非１９９ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非１３９０６ポリペプチド、非１５５１３ポリペプチド、非１７８２２ポリペプチド、非３０２ポリペプチド、非５６７７ポリペプチド、非１９４ポリペプチド、非１４３９３ポリペプチド、非２８０５９ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非１２２１２ポリペプチド、非１９８１ポリペプチド、非２６１ポリペプチド、非１２４１６ポリペプチド、非２７０ポリペプチド、非１４１０ポリペプチド、非１３７ポリペプチド、非１８７１ポリペプチド、非１３０５１ポリペプチド、非１８４７ポリペプチド、非１８４９ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非３４０ポリペプチド、非１０２１７ポリペプチド、非８３７ポリペプチド、非１７６１ポリペプチド、非８９９０ポリペプチドまたは非１３２４９ポリペプチド」は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質に実質的に相同でないタンパク質に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチド（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質とは異なり、かつ同じ生物または異なる生物由来のタンパク質）をいう。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチドは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の全てまたは一部に対応し得る。好ましい実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の少なくとも１つの生物学的に活性な部分を含む。別の好ましい実施形態において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の少なくとも２つの生物学的に活性な部分を含む。融合タンパク質において、用語「作動可能に連結した」は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチドおよび非１３１ポリペプチド、非１４８ポリペプチド、非１９９ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非１３９０６ポリペプチド、非１５５１３ポリペプチド、非１７８２２ポリペプチド、非３０２ポリペプチド、非５６７７ポリペプチド、非１９４ポリペプチド、非１４３９３ポリペプチド、非２８０５９ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非１２２１２ポリペプチド、非１９８１ポリペプチド、非２６１ポリペプチド、非１２４１６ポリペプチド、非２７０ポリペプチド、非１４１０ポリペプチド、非１３７ポリペプチド、非１８７１ポリペプチド、非１３０５１ポリペプチド、非１８４７ポリペプチド、非１８４９ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非３４０ポリペプチド、非１０２１７ポリペプチド、非８３７ポリペプチド、非１７６１ポリペプチド、非８９９０ポリペプチドまたは非１３２４９ポリペプチドは、互いにインフレームで融合されることを示すことが意図される。非１３１ポリペプチド、非１４８ポリペプチド、非１９９ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非１３９０６ポリペプチド、非１５５１３ポリペプチド、非１７８２２ポリペプチド、非３０２ポリペプチド、非５６７７ポリペプチド、非１９４ポリペプチド、非１４３９３ポリペプチド、非２８０５９ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非１２２１２ポリペプチド、非１９８１ポリペプチド、非２６１ポリペプチド、非１２４１６ポリペプチド、非２７０ポリペプチド、非１４１０ポリペプチド、非１３７ポリペプチド、非１８７１ポリペプチド、非１３０５１ポリペプチド、非１８４７ポリペプチド、非１８４９ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非３４０ポリペプチド、非１０２１７ポリペプチド、非８３７ポリペプチド、非１７６１ポリペプチド、非８９９０ポリペプチドまたは非１３２４９ポリペプチドは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９ポリペプチドのＮ末端またはＣ末端に融合され得る。
【０３０４】
例えば、１つの実施形態において、融合タンパク質は、ＧＳＴ−１３１融合タンパク質、ＧＳＴ−１４８融合タンパク質、ＧＳＴ−１９９融合タンパク質、ＧＳＴ−１２３０３融合タンパク質、ＧＳＴ−１３９０６融合タンパク質、ＧＳＴ−１５５１３融合タンパク質、ＧＳＴ−１７８２２融合タンパク質、ＧＳＴ−３０２融合タンパク質、ＧＳＴ−５６７７融合タンパク質、ＧＳＴ−１９４融合タンパク質、ＧＳＴ−１４３９３融合タンパク質、ＧＳＴ−２８０５９融合タンパク質、ＧＳＴ−７３６６融合タンパク質、ＧＳＴ−１２２１２融合タンパク質、ＧＳＴ−１９８１融合タンパク質、ＧＳＴ−２６１融合タンパク質、ＧＳＴ−１２４１６融合タンパク質、ＧＳＴ−２７０融合タンパク質、ＧＳＴ−１４１０融合タンパク質、ＧＳＴ−１３７融合タンパク質、ＧＳＴ−１８７１融合タンパク質、ＧＳＴ−１３０５１融合タンパク質、ＧＳＴ−１８４７融合タンパク質、ＧＳＴ−１８４９融合タンパク質、ＧＳＴ−１５４０２融合タンパク質、ＧＳＴ−３４０融合タンパク質、ＧＳＴ−１０２１７融合タンパク質、ＧＳＴ−８３７融合タンパク質、ＧＳＴ−１７６１融合タンパク質、ＧＳＴ−８９９０融合タンパク質またはＧＳＴ−１３２４９融合タンパク質であり、ここで、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９配列が、ＧＳＴ配列のＣ末端に融合されている。このような融合タンパク質は、組換えの１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の精製を容易にし得る。
【０３０５】
別の実施形態において、この融合タンパク質は、そのＮ末端において異種シグナル配列を含む１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質である。特定の宿主細胞（例えば、哺乳動物宿主細胞）において、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の発現および／あるいは分泌は、異種シグナル配列の使用によって増大され得る。
【０３０６】
本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質は、薬学的組成物中に組み込まれ得、そして被験体にインビボで投与され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９基質のバイオアベイラビリティーに影響を与えるために使用され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質の使用は、例えば、以下によって引き起こされる障害の処置のために治療的に有用であり得る：（ｉ）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質をコードする遺伝子の異常な改変または変異；（ｉｉ）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９遺伝子の誤調節；ならびに（ｉｉｉ）１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質の異常な翻訳後修飾。
【０３０７】
さらに、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９融合タンパク質は、被験体において抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体または抗１３２４９抗体を産生するための免疫原として、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９リガンドを精製するために、そして１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９と、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９基質との相互作用を阻害する分子を同定するためのスクリーニングアッセイにおいて、使用され得る。
【０３０８】
好ましくは、本発明の方法において使用される１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９キメラタンパク質または１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０もしくは１３２４９融合タンパク質は、標準的な組換えＤＮＡ技術によって産生される。例えば、異なるポリペプチド配列をコードするＤＮＡフラグメントは、従来技術に従って、例えば、連結のために平滑末端または付着末端を使用し、適切な末端を提供するための制限酵素消化を使用し、適切な場合粘着末端をフィルイン（ｆｉｌｌ−ｉｎ）し、所望でない連結を回避するためのアルカリホスファターゼ処理を使用し、そして酵素的連結を使用することによって一緒にインフレームで連結される。別の実施形態において、融合遺伝子は、自動化ＤＮＡ合成機を含む従来技術によって合成され得る。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ増幅は、引き続いてアニーリングおよび再増幅されてキメラ遺伝子配列を生成し得る２つの連続遺伝子フラグメント間の相補的突出を生じるアンカープライマーを使用して実施され得る（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ａｕｓｕｂｅｌら、編、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ：１９９２を参照のこと）。さらに、すでに融合部分（例えば、ＧＳＴポリペプチド）をコードしている多くの発現ベクターが市販されている。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９コード核酸は、この融合部分が、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質にインフレームで連結されるように、このような発現ベクター中にクローニングされ得る。
【０３０９】
本発明はまた、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のアゴニスト（模倣物）、あるいは１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のアンタゴニストのいずれかとして機能する、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の改変体の使用に関する。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の改変体は、変異誘発（例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の別個の点変異または短縮）によって生成され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９タンパク質のアゴニストは、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の天然に存在する形態の生物学的活性と実質的に同じ生物学的活性またはそのサブセットを保持し得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質のアンタゴニストは、例えば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の媒介性の活性を拮抗的に調節することによって、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の天然に存在する形態の活性の１以上を阻害し得る。従って、特定の生物学的効果は、機能が限定された改変体を用いる処置によって誘発され得る。１つの実施形態において、タンパク質の天然に存在する形態の生物学的活性のサブセットを有する改変体を用いる被験体の処置は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質の天然に存在する形態を用いた処置と比較して、被験体における副作用がより小さい。
【０３１０】
１つの実施形態において、１３１アゴニスト、１４８アゴニスト、１９９アゴニスト、１２３０３アゴニスト、１３９０６アゴニスト、１５５１３アゴニスト、１７８２２アゴニスト、３０２アゴニスト、５６７７アゴニスト、１９４アゴニスト、１４３９３アゴニスト、２８０５９アゴニスト、７３６６アゴニスト、１２２１２アゴニスト、１９８１アゴニスト、２６１アゴニスト、１２４１６アゴニスト、２７０アゴニスト、１４１０アゴニスト、１３７アゴニスト、１８７１アゴニスト、１３０５１アゴニスト、１８４７アゴニスト、１８４９アゴニスト、１５４０２アゴニスト、３４０アゴニスト、１０２１７アゴニスト、８３７アゴニスト、１７６１アゴニスト、８９９０アゴニストまたは１３２４９アゴニスト（模倣物）、あるいは１３１アンタゴニスト、１４８アンタゴニスト、１９９アンタゴニスト、１２３０３アンタゴニスト、１３９０６アンタゴニスト、１５５１３アンタゴニスト、１７８２２アンタゴニスト、３０２アンタゴニスト、５６７７アンタゴニスト、１９４アンタゴニスト、１４３９３アンタゴニスト、２８０５９アンタゴニスト、７３６６アンタゴニスト、１２２１２アンタゴニスト、１９８１アンタゴニスト、２６１アンタゴニスト、１２４１６アンタゴニスト、２７０アンタゴニスト、１４１０アンタゴニスト、１３７アンタゴニスト、１８７１アンタゴニスト、１３０５１アンタゴニスト、１８４７アンタゴニスト、１８４９アンタゴニスト、１５４０２アンタゴニスト、３４０アンタゴニスト、１０２１７アンタゴニスト、８３７アンタゴニスト、１７６１アンタゴニスト、８９９０アンタゴニストまたは１３２４９アンタゴニストのいずれかとして機能する、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の改変体は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質のアゴニスト活性またはアンタゴニスト活性について、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の変異体（例えば、短縮変異体）のコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって、同定され得る。１つの実施形態において、１３１改変体、１４８改変体、１９９改変体、１２３０３改変体、１３９０６改変体、１５５１３改変体、１７８２２改変体、３０２改変体、５６７７改変体、１９４改変体、１４３９３改変体、２８０５９改変体、７３６６改変体、１２２１２改変体、１９８１改変体、２６１改変体、１２４１６改変体、２７０改変体、１４１０改変体、１３７改変体、１８７１改変体、１３０５１改変体、１８４７改変体、１８４９改変体、１５４０２改変体、３４０改変体、１０２１７改変体、８３７改変体、１７６１改変体、８９９０改変体または１３２４９改変体の多様なライブラリーは、核酸レベルでのコンビナトリアル変異誘発によって生成され、そして多様な遺伝子ライブラリーによってコードされる。１３１改変体、１４８改変体、１９９改変体、１２３０３改変体、１３９０６改変体、１５５１３改変体、１７８２２改変体、３０２改変体、５６７７改変体、１９４改変体、１４３９３改変体、２８０５９改変体、７３６６改変体、１２２１２改変体、１９８１改変体、２６１改変体、１２４１６改変体、２７０改変体、１４１０改変体、１３７改変体、１８７１改変体、１３０５１改変体、１８４７改変体、１８４９改変体、１５４０２改変体、３４０改変体、１０２１７改変体、８３７改変体、１７６１改変体、８９９０改変体または１３２４９改変体の多様なライブラリーは、例えば、合成オリゴヌクレオチドの混合物を遺伝子配列に酵素的に連結することによって生成され得、その結果、潜在的な１３１配列、１４８配列、１９９配列、１２３０３配列、１３９０６配列、１５５１３配列、１７８２２配列、３０２配列、５６７７配列、１９４配列、１４３９３配列、２８０５９配列、７３６６配列、１２２１２配列、１９８１配列、２６１配列、１２４１６配列、２７０配列、１４１０配列、１３７配列、１８７１配列、１３０５１配列、１８４７配列、１８４９配列、１５４０２配列、３４０配列、１０２１７配列、８３７配列、１７６１配列、８９９０配列または１３２４９配列の縮重セットは、個々のポリペプチドとしてか、あるいはその中に１３１配列、１４８配列、１９９配列、１２３０３配列、１３９０６配列、１５５１３配列、１７８２２配列、３０２配列、５６７７配列、１９４配列、１４３９３配列、２８０５９配列、７３６６配列、１２２１２配列、１９８１配列、２６１配列、１２４１６配列、２７０配列、１４１０配列、１３７配列、１８７１配列、１３０５１配列、１８４７配列、１８４９配列、１５４０２配列、３４０配列、１０２１７配列、８３７配列、１７６１配列、８９９０配列または１３２４９配列のセットを含むより大きい融合タンパク質のセットとして（例えば、ファージディスプレイについて）発現可能である。縮重オリゴヌクレオチド配列から潜在的な１３１改変体、１４８改変体、１９９改変体、１２３０３改変体、１３９０６改変体、１５５１３改変体、１７８２２改変体、３０２改変体、５６７７改変体、１９４改変体、１４３９３改変体、２８０５９改変体、７３６６改変体、１２２１２改変体、１９８１改変体、２６１改変体、１２４１６改変体、２７０改変体、１４１０改変体、１３７改変体、１８７１改変体、１３０５１改変体、１８４７改変体、１８４９改変体、１５４０２改変体、３４０改変体、１０２１７改変体、８３７改変体、１７６１改変体、８９９０改変体または１３２４９改変体のライブラリーを生成するために使用され得る、種々の方法が存在する。縮重遺伝子配列の化学的合成は、自動化ＤＮＡ合成機において実施され得、次いで、この合成遺伝子は、適切な発現ベクター中に連結され得る。遺伝子の縮重セットの使用は、潜在的な１３１配列、１４８配列、１９９配列、１２３０３配列、１３９０６配列、１５５１３配列、１７８２２配列、３０２配列、５６７７配列、１９４配列、１４３９３配列、２８０５９配列、７３６６配列、１２２１２配列、１９８１配列、２６１配列、１２４１６配列、２７０配列、１４１０配列、１３７配列、１８７１配列、１３０５１配列、１８４７配列、１８４９配列、１５４０２配列、３４０配列、１０２１７配列、８３７配列、１７６１配列、８９９０配列または１３２４９配列の所望のセットをコードする全ての配列を１つの混合物中で提供することを可能にする。縮重オリゴヌクレオチドを合成するための方法は、当該分野で公知である（例えば、Ｎａｒａｎｇ、Ｓ．Ａ．（１９８３）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  ３９：３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５３：３２３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ  １９８：１０５６；Ｉｋｅら、（１９８３）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１１：４７７を参照のこと）。
【０３１１】
さらに、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のタンパク質コード配列のフラグメントのライブラリーは、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質の改変体のスクリーニングおよび引き続く選択のために、１３１フラグメント、１４８フラグメント、１９９フラグメント、１２３０３フラグメント、１３９０６フラグメント、１５５１３フラグメント、１７８２２フラグメント、３０２フラグメント、５６７７フラグメント、１９４フラグメント、１４３９３フラグメント、２８０５９フラグメント、７３６６フラグメント、１２２１２フラグメント、１９８１フラグメント、２６１フラグメント、１２４１６フラグメント、２７０フラグメント、１４１０フラグメント、１３７フラグメント、１８７１フラグメント、１３０５１フラグメント、１８４７フラグメント、１８４９フラグメント、１５４０２フラグメント、３４０フラグメント、１０２１７フラグメント、８３７フラグメント、１７６１フラグメント、８９９０フラグメントまたは１３２４９フラグメントの多様な集団を生成するために使用され得る。１つの実施形態において、コード配列フラグメントのライブラリーは、１３１コード配列、１４８コード配列、１９９コード配列、１２３０３コード配列、１３９０６コード配列、１５５１３コード配列、１７８２２コード配列、３０２コード配列、５６７７コード配列、１９４コード配列、１４３９３コード配列、２８０５９コード配列、７３６６コード配列、１２２１２コード配列、１９８１コード配列、２６１コード配列、１２４１６コード配列、２７０コード配列、１４１０コード配列、１３７コード配列、１８７１コード配列、１３０５１コード配列、１８４７コード配列、１８４９コード配列、１５４０２コード配列、３４０コード配列、１０２１７コード配列、８３７コード配列、１７６１コード配列、８９９０コード配列または１３２４９コード配列の二本鎖ＰＣＲフラグメントを、ニック形成が１分子当たりほぼ１回だけ生じるような条件下でヌクレアーゼで処理し、二重鎖ＤＮＡを変性し、異なるニック形成産物由来のセンス／アンチセンス対を含み得る二本鎖ＤＮＡを形成するためにＤＮＡを再生し、Ｓ１ヌクレアーゼでの処理によって、再形成された二重鎖から一本鎖部分を除去し、そして得られたフラグメントライブラリーを発現ベクター中に連結することによって、生成され得る。この方法によって、種々のサイズの１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質のＮ末端フラグメント、Ｃ末端フラグメントおよび内部フラグメントをコードする、発現ライブラリーが誘導され得る。
【０３１２】
点変異または短縮によって作成されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産物をスクリーニングするためのいくつかの技術、および選択された特性を有する遺伝子産物についてのｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングするためのいくつかの技術が、当該分野で公知である。このような技術は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質のコンビナトリアル変異誘発によって生成された遺伝子ライブラリーの迅速なスクリーニングのために適合可能である。大きい遺伝子ライブラリーをスクリーニングするための高スループットの分析に使用されやすい、最も広く使用される技術は、代表的に、遺伝子ライブラリーを複製可能な発現ベクター中にクローニングする工程、ベクターの得られたライブラリーで適切な細胞を形質転換する工程、および所望の活性の検出が、産物が検出された遺伝子をコードするベクターの単離を容易にする条件下でコンビナトリアル遺伝子を発現する工程を包含する。再帰的アンサンブル変異誘発（ｒｅｃｕｒｓｉｖｅ  ｅｎｓｅｍｂｌｅ  ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ（ＲＥＭ））（これは、ライブラリー中の機能的変異体の頻度を増強する新たな技術である）は、１３１改変体、１４８改変体、１９９改変体、１２３０３改変体、１３９０６改変体、１５５１３改変体、１７８２２改変体、３０２改変体、５６７７改変体、１９４改変体、１４３９３改変体、２８０５９改変体、７３６６改変体、１２２１２改変体、１９８１改変体、２６１改変体、１２４１６改変体、２７０改変体、１４１０改変体、１３７改変体、１８７１改変体、１３０５１改変体、１８４７改変体、１８４９改変体、１５４０２改変体、３４０改変体、１０２１７改変体、８３７改変体、１７６１改変体、８９９０改変体または１３２４９改変体を同定するために、スクリーニングアッセイと組み合わせて使用され得る（ＡｒｋｉｎおよびＹｏｕｒｖａｎ（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：７８１１−７８１５；Ｄｅｌｇｒａｖｅら、（１９９３）Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ６（３）：３２７−３３１）。
【０３１３】
本発明の方法はさらに、抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体または抗１３２４９抗体の使用を包含する。単離された１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質もしくは１３２４９タンパク質、またはその部分もしくはそのフラグメントは、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の調製のための標準的技術を用いて、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９と結合する抗体を生成するための免疫原として使用され得る。全長の１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質が使用され得るか、あるいは、代わりに１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の抗原性ペプチドフラグメントが、免疫原として使用され得る。１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の抗原性ペプチドは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８および配列番号６０に示されるアミノ酸配列の少なくとも８つのアミノ酸残基を含み、そしてそのペプチドに対して励起される抗体が、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質と特異的免疫複合体を形成するように、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のエピトープを含む。好ましくは、この抗原性ペプチドは、少なくとも１０個のアミノ酸残基を含み、より好ましくは、少なくとも１５個のアミノ酸残基を含み、よりさらに好ましくは、少なくとも２０個のアミノ酸残基を含み、そして、最も好ましくは、少なくとも３０個のアミノ酸残基を含む。
【０３１４】
抗原性ペプチドによって含まれる好ましいエピトープは、タンパク質の表面（例えば、親水性領域、および高い抗原性を有する領域）に位置する１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の領域である。
【０３１５】
１３１免疫原、１４８免疫原、１９９免疫原、１２３０３免疫原、１３９０６免疫原、１５５１３免疫原、１７８２２免疫原、３０２免疫原、５６７７免疫原、１９４免疫原、１４３９３免疫原、２８０５９免疫原、７３６６免疫原、１２２１２免疫原、１９８１免疫原、２６１免疫原、１２４１６免疫原、２７０免疫原、１４１０免疫原、１３７免疫原、１８７１免疫原、１３０５１免疫原、１８４７免疫原、１８４９免疫原、１５４０２免疫原、３４０免疫原、１０２１７免疫原、８３７免疫原、１７６１免疫原、８９９０免疫原または１３２４９免疫原は、代表的には、適切な被験体（例えば、ウサギ、ヤギ、マウス、または他の哺乳動物）をその免疫原で免疫することによって抗体を調製するために使用される。適切な免疫原性製調製物は、例えば、組み換え発現される１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質、あるいは化学合成される１３１ポリペプチド、１４８ポリペプチド、１９９ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、１３９０６ポリペプチド、１５５１３ポリペプチド、１７８２２ポリペプチド、３０２ポリペプチド、５６７７ポリペプチド、１９４ポリペプチド、１４３９３ポリペプチド、２８０５９ポリペプチド、７３６６ポリペプチド、１２２１２ポリペプチド、１９８１ポリペプチド、２６１ポリペプチド、１２４１６ポリペプチド、２７０ポリペプチド、１４１０ポリペプチド、１３７ポリペプチド、１８７１ポリペプチド、１３０５１ポリペプチド、１８４７ポリペプチド、１８４９ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、３４０ポリペプチド、１０２１７ポリペプチド、８３７ポリペプチド、１７６１ポリペプチド、８９９０ポリペプチドまたは１３２４９ポリペプチドを含み得る。調製物はさらに、フロインドの完全アジュバントまたは不完全アジュバント、あるいは同様な免疫刺激性試薬のようなアジュバントを含み得る。適切な被験体を、免疫原性の１３１調製物、１４８調製物、１９９調製物、１２３０３調製物、１３９０６調製物、１５５１３調製物、１７８２２調製物、３０２調製物、５６７７調製物、１９４調製物、１４３９３調製物、２８０５９調製物、７３６６調製物、１２２１２調製物、１９８１調製物、２６１調製物、１２４１６調製物、２７０調製物、１４１０調製物、１３７調製物、１８７１調製物、１３０５１調製物、１８４７調製物、１８４９調製物、１５４０２調製物、３４０調製物、１０２１７調製物、８３７調製物、１７６１調製物、８９９０調製物または１３２４９調製物で免疫することによって、ポリクローナル抗１３１抗体応答、ポリクローナル抗１４８抗体応答、ポリクローナル抗１９９抗体応答、ポリクローナル抗１２３０３抗体応答、ポリクローナル抗１３９０６抗体応答、ポリクローナル抗１５５１３抗体応答、ポリクローナル抗１７８２２抗体応答、ポリクローナル抗３０２抗体応答、ポリクローナル抗５６７７抗体応答、ポリクローナル抗１９４抗体応答、ポリクローナル抗１４３９３抗体応答、ポリクローナル抗２８０５９抗体応答、ポリクローナル抗７３６６抗体応答、ポリクローナル抗１２２１２抗体応答、ポリクローナル抗１９８１抗体応答、ポリクローナル抗２６１抗体応答、ポリクローナル抗１２４１６抗体応答、ポリクローナル抗２７０抗体応答、ポリクローナル抗１４１０抗体応答、ポリクローナル抗１３７抗体応答、ポリクローナル抗１８７１抗体応答、ポリクローナル抗１３０５１抗体応答、ポリクローナル抗１８４７抗体応答、ポリクローナル抗１８４９抗体応答、ポリクローナル抗１５４０２抗体応答、ポリクローナル抗３４０抗体応答、ポリクローナル抗１０２１７抗体応答、ポリクローナル抗８３７抗体応答、ポリクローナル抗１７６１抗体応答、ポリクローナル抗８９９０抗体応答またはポリクローナル抗１３２４９抗体応答が誘導される。
【０３１６】
本明細書中で使用される用語「抗体」は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫的に活性な部分（すなわち、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９のような抗原と特異的に結合する（免疫反応する）抗原結合部位を含む分子）をいう。免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分の例は、ペプシンのような酵素で抗体を処理することによって生成され得る、Ｆ（ａｂ）フラグメントおよびＦ（ａｂ’）２フラグメントを包含する。本発明は、１３１分子、１４８分子、１９９分子、１２３０３分子、１３９０６分子、１５５１３分子、１７８２２分子、３０２分子、５６７７分子、１９４分子、１４３９３分子、２８０５９分子、７３６６分子、１２２１２分子、１９８１分子、２６１分子、１２４１６分子、２７０分子、１４１０分子、１３７分子、１８７１分子、１３０５１分子、１８４７分子、１８４９分子、１５４０２分子、３４０分子、１０２１７分子、８３７分子、１７６１分子、８９９０分子または１３２４９分子と結合するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を提供する。本明細書中で使用される場合、用語「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９の特定エピトープと免疫反応することができる抗原結合部位の１つの種のみを含む抗体分子の集団をいう。従って、モノクローナル抗体組成物は、代表的には、それが免疫反応する特定の１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質または１３２４９タンパク質に対して単一の結合親和性を示す。
【０３１７】
ポリクローナル抗１３１抗体、ポリクローナル抗１４８抗体、ポリクローナル抗１９９抗体、ポリクローナル抗１２３０３抗体、ポリクローナル抗１３９０６抗体、ポリクローナル抗１５５１３抗体、ポリクローナル抗１７８２２抗体、ポリクローナル抗３０２抗体、ポリクローナル抗５６７７抗体、ポリクローナル抗１９４抗体、ポリクローナル抗１４３９３抗体、ポリクローナル抗２８０５９抗体、ポリクローナル抗７３６６抗体、ポリクローナル抗１２２１２抗体、ポリクローナル抗１９８１抗体、ポリクローナル抗２６１抗体、ポリクローナル抗１２４１６抗体、ポリクローナル抗２７０抗体、ポリクローナル抗１４１０抗体、ポリクローナル抗１３７抗体、ポリクローナル抗１８７１抗体、ポリクローナル抗１３０５１抗体、ポリクローナル抗１８４７抗体、ポリクローナル抗１８４９抗体、ポリクローナル抗１５４０２抗体、ポリクローナル抗３４０抗体、ポリクローナル抗１０２１７抗体、ポリクローナル抗８３７抗体、ポリクローナル抗１７６１抗体、ポリクローナル抗８９９０抗体またはポリクローナル抗１３２４９抗体は、上記に記載のように、適切な被験体を、１３１免疫原、１４８免疫原、１９９免疫原、１２３０３免疫原、１３９０６免疫原、１５５１３免疫原、１７８２２免疫原、３０２免疫原、５６７７免疫原、１９４免疫原、１４３９３免疫原、２８０５９免疫原、７３６６免疫原、１２２１２免疫原、１９８１免疫原、２６１免疫原、１２４１６免疫原、２７０免疫原、１４１０免疫原、１３７免疫原、１８７１免疫原、１３０５１免疫原、１８４７免疫原、１８４９免疫原、１５４０２免疫原、３４０免疫原、１０２１７免疫原、８３７免疫原、１７６１免疫原、８９９０免疫原または１３２４９免疫原で免疫することによって、調製され得る。免疫される被験体中における抗１３１抗体力価、抗１４８抗体力価、抗１９９抗体力価、抗１２３０３抗体力価、抗１３９０６抗体力価、抗１５５１３抗体力価、抗１７８２２抗体力価、抗３０２抗体力価、抗５６７７抗体力価、抗１９４抗体力価、抗１４３９３抗体力価、抗２８０５９抗体力価、抗７３６６抗体力価、抗１２２１２抗体力価、抗１９８１抗体力価、抗２６１抗体力価、抗１２４１６抗体力価、抗２７０抗体力価、抗１４１０抗体力価、抗１３７抗体力価、抗１８７１抗体力価、抗１３０５１抗体力価、抗１８４７抗体力価、抗１８４９抗体力価、抗１５４０２抗体力価、抗３４０抗体力価、抗１０２１７抗体力価、抗８３７抗体力価、抗１７６１抗体力価、抗８９９０抗体力価または抗１３２４９抗体力価は、標準的技術（例えば、免疫化した１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９を用いる、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ））によって経時的にモニターされ得る。所望であれば、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９に対する抗体分子は、哺乳動物から（例えば、血液から）単離され得、さらに、ＩｇＧ画分を得るために、プロテインＡクロマトグラフィーのような、周知の技術によって精製され得る。免疫後の適切な時間で、例えば、抗１３１抗体力価、抗１４８抗体力価、抗１９９抗体力価、抗１２３０３抗体力価、抗１３９０６抗体力価、抗１５５１３抗体力価、抗１７８２２抗体力価、抗３０２抗体力価、抗５６７７抗体力価、抗１９４抗体力価、抗１４３９３抗体力価、抗２８０５９抗体力価、抗７３６６抗体力価、抗１２２１２抗体力価、抗１９８１抗体力価、抗２６１抗体力価、抗１２４１６抗体力価、抗２７０抗体力価、抗１４１０抗体力価、抗１３７抗体力価、抗１８７１抗体力価、抗１３０５１抗体力価、抗１８４７抗体力価、抗１８４９抗体力価、抗１５４０２抗体力価、抗３４０抗体力価、抗１０２１７抗体力価、抗８３７抗体力価、抗１７６１抗体力価、抗８９９０抗体力価または抗１３２４９抗体力価が最高のときに、抗体産生細胞は、被験体から得られ得、そして例えば、ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ（１９７５）Ｎａｔｕｒｅ２５６；４９５−４９７に初めに記載されるハイブリドーマ技術（Ｂｒｏｗｎら（１９８１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１２７；５３９−４６；Ｂｒｏｗｎら（１９８０）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５５：４９８０−８３；Ｙｅｈら（１９７６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７６：２９２７−３１；およびＹｅｈら（１９８２）Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ  ２９：２６９−７５）もまた参照のこと）、より最近のヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｚｂｏｒら（１９８３）Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｔｏｄａｙ  ４：７２）、ＥＢＶハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅら（１９８５）Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ、Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，７７−９６頁）またはトリオーマ技術のような標準的技術によって、モノクローナル抗体を調製するために使用され得る。モノクローナル抗体ハイブリドーマを産生するための技術は周知である（一般的に、Ｋｅｎｎｅｔｈ，Ｒ．Ｈ．Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｎｅｗ  Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎ  Ｉｎ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｓｅｓ，Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｒｐ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９８０）；Ｌｅｒｎｅｒ，Ｅ．Ａ．（１９８１）Ｙａｌｅ  Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｍｅｄ．５４：３８７−４０２；Ｇｅｆｔｅｒ，Ｍ．Ｌ．ら（１９７７）Ｓｏｍａｔｉｃ  Ｃｅｌｌ  Ｇｅｎｅｔ．３：２３１−３６を参照のこと）。要するに、不死化細胞株（代表的には骨髄腫細胞）が、上記に記載のように、１３１免疫原、１４８免疫原、１９９免疫原、１２３０３免疫原、１３９０６免疫原、１５５１３免疫原、１７８２２免疫原、３０２免疫原、５６７７免疫原、１９４免疫原、１４３９３免疫原、２８０５９免疫原、７３６６免疫原、１２２１２免疫原、１９８１免疫原、２６１免疫���、１２４１６免疫原、２７０免疫原、１４１０免疫原、１３７免疫原、１８７１免疫原、１３０５１免疫原、１８４７免疫原、１８４９免疫原、１５４０２免疫原、３４０免疫原、１０２１７免疫原、８３７免疫原、１７６１免疫原、８９９０免疫原または１３２４９免疫原で免疫された哺乳動物からのリンパ球（代表的には脾臓細胞）と融合され、そして得られるハイブリドーマ細胞の培養物上清は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９と結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを同定するために、スクリーニングされる。
【０３１８】
リンパ球と不死化細胞株とを融合するために使用される任意の多くの周知のプロトコルが、抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体、または抗１３２４９抗体を生成する目的で使用され得る（例えば、Ｇ．Ｇａｌｆｒｅら（１９７７）Ｎａｔｕｒｅ  ２６６：５５０５２；Ｇｅｆｔｅｒら（１９７７）前述；Ｌｅｒｎｅｒ（１９８１）前述；およびＫｅｎｎｅｔｈ（１９８０）前述を参照のこと）。さらに、当業者は、これもまた有用であるような方法の多くのバリエーションがあることを認識する。代表的には、不死化細胞株（例えば、骨髄腫細胞）は、リンパ球と同じ哺乳動物種に由来する。例えば、マウスハイブリドーマは、本発明の免疫原性調製物で免疫されたマウスからのリンパ球と、不死化マウス細胞株とを融合することによって作製され得る。好ましい不死化細胞株は、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含む培養培地「ＨＡＴ培地」に感受性であるマウス骨髄細胞株である。任意の多くの骨髄細胞株（例えば、Ｐ３−ＮＳ１／１−Ａｇ４−１、Ｐ３−ｘ６３−Ａｇ８．６５３またはＳｐ２／Ｏ−Ａｇ１４骨髄細胞株）は、標準的技術に従って、融合パートナーとして使用され得る。このような骨髄細部株は、ＡＴＣＣから入手可能である。代表的に、ＨＡＴ感受性マウス骨髄細胞は、ポリエチレングリコール（「ＰＥＧ」）を用いて、マウス脾臓細胞と融合される。その融合から生じるハイブリドーマ細胞は、次にＨＡＴ培地を用いて選択され、その培地は、融合されない骨髄腫細胞および非増殖的に融合した骨髄細胞を殺す（融合しなかった脾臓細胞は、形質転換されていないので、数日後に死ぬ）。本発明のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞は、例えば、標準的なＥＬＩＳＡアッセイを用いて、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９と結合する抗体のハイブリドーマ培養上清をスクリーニングすることによって、検出される。
【０３１９】
モノクローナル抗体分泌ハイブリドーマを調製する代わりに、抗１３１モノクローナル抗体、抗１４８モノクローナル抗体、抗１９９モノクローナル抗体、抗１２３０３モノクローナル抗体、抗１３９０６モノクローナル抗体、抗１５５１３モノクローナル抗体、抗１７８２２モノクローナル抗体、抗３０２モノクローナル抗体、抗５６７７モノクローナル抗体、抗１９４モノクローナル抗体、抗１４３９３モノクローナル抗体、抗２８０５９モノクローナル抗体、抗７３６６モノクローナル抗体、抗１２２１２モノクローナル抗体、抗１９８１モノクローナル抗体、抗２６１モノクローナル抗体、抗１２４１６モノクローナル抗体、抗２７０モノクローナル抗体、抗１４１０モノクローナル抗体、抗１３７モノクローナル抗体、抗１８７１モノクローナル抗体、抗１３０５１モノクローナル抗体、抗１８４７モノクローナル抗体、抗１８４９モノクローナル抗体、抗１５４０２モノクローナル抗体、抗３４０モノクローナル抗体、抗１０２１７モノクローナル抗体、抗８３７モノクローナル抗体、抗１７６１モノクローナル抗体、抗８９９０モノクローナル抗体、または抗１３２４９モノクローナル抗体は、１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９を用いて組み換えコンビナトリアル免疫グロブリンライブラリー（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリー）をスクリーニングすることによって、同定および単離され得、それによって１３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０、または１３２４９と結合する免疫グロブリンライブラリーメンバーを単離する。ファージディスプレイライブラリーを生成およびスクリーニングするためのキットは、市販されている（例えば、Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  Ｐｈａｇｅ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｓｙｓｔｅｍ，カタログ番号２７−９４００−０１；およびＳｔｒａｔａｇｅｎｅ  ＳｕｒｆＺＡＰ（登録商標）Ｐｈａｇｅ  Ｄｉｓｐｌａｙ  Ｋｉｔ，カタログ番号２４０６１２）。さらに、抗体ディスプレイライブラリーを生成およびスクリーニングする使用のために特に適した方法および試薬の例は、例えば、Ｌａｄｎｅｒら、米国特許第５，２２３，４０９号；Ｋａｎｇら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／１８６１９；ＤｏｗｅｒらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９１／１７２７１；ＷｎｔｅｒらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／２０７９１；ＭａｒｋｌａｎｄらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／１５６７９；ＢｒｅｉｔｌｉｎｇらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９３／０１２８８；ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら，ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／０１０４７；ＧａｒｒａｒｄらＰＣＴ国���公開番号ＷＯ９２／０９６９０；ＬａｄｎｅｒらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９０／０２８０９；Ｆｕｃｈｓら（１９９１）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ９：１３７０−１３７２；Ｈａｙら（１９９２）Ｈｕｍ．Ａｎｔｉｂｏｄ．Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ  ３：８１−８５；Ｈｕｓｅら（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４６：１２７５−１２８１；Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓら（１９９３）ＥＭＢＯ  Ｊ  １２：７２５−７３４；Ｈａｗｋｉｎｓら（１９９２）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２６：８８９−８９６；Ｃｌａｒｋｓｏｎら（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ  ３５２：６２４−６２８；Ｇｒａｍら（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：３５７６−３５８０；Ｇａｒｒａｄら（１９９１）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ９：１３７３−１３７７；Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍら（１９９１）Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１９：４１３３−４１３７；Ｂａｒｂａｓら（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：７９７８−７９８２；およびＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら（１９９０）Ｎａｔｕｒｅ  ３４８：５５２−５５４）において見られ得る。
【０３２０】
さらに、キメラ抗体およびヒト化モノクローナル抗体のような、ヒト部分および非ヒト部分の両方を包含し、標準的な組み換えＤＮＡ技術を用いて作製され得る、組み換え抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体、または抗１３２４９抗体は、本発明の方法の範囲内である。そのようなキメラ抗体およびヒト化モノクローナル抗体は、当該分野で公知の組み換えＤＮＡ技術、例えば、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ８６／０２２６９；Ａｋｉｒａら、欧州特許出願第１８４，１８７号；Ｔａｎｉｇｕｃｈｉ，Ｍ．，欧州特許出願第１７１，４９６号；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら，欧州特許出願第１７３，４９４号；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら，ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ８６／０１５３３；Ｃａｂｉｌｌｙら，米国特許第４，８１６，５６７号；Ｃａｂｉｌｌｙら，欧州特許出願第１２５，０２３号；Ｂｅｔｔｅｒら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４０：１０４１−１０４３；Ｌｉｕら（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：３４３９−３４４３；Ｌｉｕら（１９８７）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３９：３５２１−３５２６；Ｓｕｎら（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：２１４−２１８；Ｎｉｓｈｉｍｕｒａら（１９８７）Ｃａｎｃ．Ｒｅｓ．４７：９９９−１００５；Ｗｏｏｄら（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ  ３１４：４４６−４４９；Ｓｈａｗら（１９８８）Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．８０：１５５３−１５５９；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓ．Ｌ．（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２９：１２０２−１２０７；Ｏｉら（１９８６）ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ４：２１４；Ｗｉｎｔｅｒ米国特許第５，２２５，５３９号；Ｊｏｈｎｅｓら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ  ３２１：５５２−５２５；Ｖｅｒｈｏｅｙａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３９：１５３４；およびＢｅｉｄｌｅｒら（１９８８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４１：４０５３−４０６０に記載される方法を用いて産生され得る。
【０３２１】
抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体、または抗１３２４９抗体は、１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質の存在量および発現パターンを評価するために、（例えば、細胞溶解物または細胞上清中の）１３１タンパク質、１４８タンパク質、１９９タンパク質、１２３０３タンパク質、１３９０６タンパク質、１５５１３タンパク質、１７８２２タンパク質、３０２タンパク質、５６７７タンパク質、１９４タンパク質、１４３９３タンパク質、２８０５９タンパク質、７３６６タンパク質、１２２１２タンパク質、１９８１タンパク質、２６１タンパク質、１２４１６タンパク質、２７０タンパク質、１４１０タンパク質、１３７タンパク質、１８７１タンパク質、１３０５１タンパク質、１８４７タンパク質、１８４９タンパク質、１５４０２タンパク質、３４０タンパク質、１０２１７タンパク質、８３７タンパク質、１７６１タンパク質、８９９０タンパク質、または１３２４９タンパク質を検出するために使用され得る。抗１３１抗体、抗１４８抗体、抗１９９抗体、抗１２３０３抗体、抗１３９０６抗体、抗１５５１３抗体、抗１７８２２抗体、抗３０２抗体、抗５６７７抗体、抗１９４抗体、抗１４３９３抗体、抗２８０５９抗体、抗７３６６抗体、抗１２２１２抗体、抗１９８１抗体、抗２６１抗体、抗１２４１６抗体、抗２７０抗体、抗１４１０抗体、抗１３７抗体、抗１８７１抗体、抗１３０５１抗体、抗１８４７抗体、抗１８４９抗体、抗１５４０２抗体、抗３４０抗体、抗１０２１７抗体、抗８３７抗体、抗１７６１抗体、抗８９９０抗体、または抗１３２４９抗体は、臨床試験手順（例えば、所定の処置レジメンの効率を決定するために）の一部として、組織におけるタンパク質のレベルをモニタリングするために診断的に使用され得る。検出は、検出可能な物質に抗体を結合させる（すなわち、物理的連結）ことによって促進され得る。検出可能な物質の例としては、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、および放射性物質が挙げられる。適切な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、−ガラクトシダーゼまたはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ；適切な補欠分子団複合体の例としては、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられ；適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンが挙げられ；発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ；生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられ；そして適切な放射活物質の例としては、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓまたは３Ｈが挙げられる。
【０３２２】
本発明はさらに、限定と解釈されるべきではない以下の実施例によって例示される。本願、ならびに図面および配列表を通して引用される全ての参考文献、特許および公開された特許出願の内容は、本明細書中に参考として援用される。
【実施例】
【０３２３】
（実施例１）ＴＡＱＭＡＮＴＭ分析を使用しての組織配置
この実施例は、ＴａｑＭａｎＴＭの方法を記載する。ＴａｑＭａｎＴＭの方法は、定量的であり、ｍＲＮＡ検出に関して逆転写ＰＣＲに基づく研究方法である。ＲＴ−ＰＣＲ反応は、ＰＣＲの間、ＴａｑＭａｎＴＭのプローブを切断するために、ＡｍｐｌｉＴａｑ  ＧｏｌｄＴＭ  ＤＮＡポリメラーゼの５’ヌクレア−ゼ活性を活用する。簡単にいうと、ｃＤＮＡを、目的のサンプル（例えば、心臓、腎臓、肝臓、骨格筋および種々の血管）から生成し、そしてＰＣＲ増幅反応の開始材料として使用した。５’および３’の遺伝子特異的プライマーに加えて、遺伝子特異的オリゴヌクレオチドプローブ（増幅した領域に相補的）を反応に加えた（すなわち、ＴａｑＭａｎＴＭプローブ）。ＴａｑＭａｎＴＭプローブは、プローブの５’末端に共有結合した蛍光レポーター色素（例えば、ＦＡＭ（６−カルボキシフルオレセイン）、ＴＥＴ（６−カルボキシ−４，７，２’，７’−テトラクロロフルオレセイン）、ＪＯＥ（６−カルボキシ−４，５−ジクロロ−２，７−ジメトキシフルオレセイン）、またはＶＩＣ）、およびプローブの３’末端に失活色素（ＴＡＭＡＲＡ（６−カルボキシ−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルローダミン））を有するオリゴヌクレオチドが挙げられる。
【０３２４】
ＰＣＲ反応の間、プローブの切断は、レポーター色素および失活色素を分離し、レポーターの蛍光の増加が生じる。ＰＣＲ産物の蓄積は、レポーター色素の蛍光の増加をモニタリングすることによって検出する。プローブが未処理の場合、レポーター色素が失活色素の近傍にあるのでレポーターの蛍光の制御が生じる。ＰＣＲの間、目的の標的が存在する場合、このプローブは、順方向プライマー部位と、逆方向プライマー部位との間に特異的にアニールする。ＡｍｐｌｉＴａｑ  ＧｏｌｄＴＭ  ＤＮＡポリメラーゼの５’−３’核酸分解活性は、プローブが標的にハイブリダイズする場合のみ、レポーターと失活剤との間のプローブを切断する。プローブ断片は、その後、標的からはがれ、そして鎖の重合が続く。プローブの３’末端は、ＰＣＲの間のプローブの伸長を防止するようブロックされる。この工程は、各サイクルで起こり、そして産物の指数関数的な蓄積を妨げない。ＲＮＡをトリゾール法を使用して調製し、そしてゲノムＤＮＡの混入を除くためにＤＮａｓｅで処置した。ｃＤＮＡを、標準的な技術を使用して合成した。逆転写酵素の非存在下でのモックｃＤＮＡ合成で、サンプル中にコントロール遺伝子のＰＣＲ増幅が検出されないことから、ゲノムＤＮＡの混入の除去が効果的であることを確認する。
【０３２５】
（等価物）
当業者は、過剰な実験を行うことなく、本発明の明細書中に記載の特定の実施例に対する多くの等価物を認識し、確認することができる。添付の特許請求の範囲は、このような等価物を包含する。
【配列表】
2005516604.tif 000002
2005516604.tif 000003
2005516604.tif 000004
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2005516604.tif 000102
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【国際調査報告】
2005516604.tif 000104
2005516604.tif 000105
2005516604.tif 000106
2005516604.tif 000107