(57)【要約】  ＤＮＡハイブリダイゼーションのための装置および方法を提供する。これらの装置および方法は、プローブを有する上面を備えた担体と共に機能する。この装置は、少なくとも一部分が柔軟な、担体と当接する部材を備えることが可能である。この部材および担体は複数のチャンバを形成し、各チャンバは、前記上面の少なくとも一部分を含んだ底部、少なくとも１つの側壁、および開口部を有する。この装置は、チャンバの開口部を閉じることによってチャンバを密閉するための機構をさらに備える。
2005515773.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
担体の上面にあるプローブのＤＮＡハイブリダイゼーションのための装置であって、
前記担体に当接する少なくとも一部分が柔軟な部材と、該部材と該担体とが複数のチャンバを形成し、各チャンバが前記上面の少なくとも一部を含む底部、少なくとも１つの側壁、および開口部を有することと、
該チャンバの開口部を閉じることによってチャンバを密閉する機構と
を備える装置。
【請求項２】
担体の上面が、プローブを有する複数の領域を備え、
形成されたチャンバが、該プローブ領域のうち少なくとも１つを含む底部を有する
ことを特徴とする請求項１に記載の装置。
【請求項３】
側壁が、少なくとも部分的に湾曲していることを特徴とする請求項１に記載の装置。
【請求項４】
チャンバが少なくとも２つの側壁を備え、
側壁が、側壁同士ぶつかる場所で少なくとも部分的に湾曲している
ことを特徴とする請求項３に記載の装置。
【請求項５】
部材が、チャンバの開口部から内部部分に至る流体のための管路を提供するネック部分をさらに備え、
該ネック部分が、開口部に連絡する第１の端部および内部部分に連絡する第２の端部を有する
ことを特徴とする請求項１に記載の装置。
【請求項６】
ネック部分の角度が１８０度未満である請求項５に記載の装置。
【請求項７】
ネック部分の角度が９０度より大きく１８０度未満である請求項６に記載の装置。
【請求項８】
ネック部分の第２の端部の中心が、少なくとも１つの側壁に囲まれた領域の幾何学的中心の真上でない点にある請求項５に記載の装置。
【請求項９】
ネック部分の角度が９０度より大きく１８０度未満である請求項８に記載の装置。
【請求項１０】
側壁の少なくとも一部分が担体の上面に対して垂直ではない請求項１に記載の装置。
【請求項１１】
側壁の少なくとも一部分が湾曲している請求項１０に記載の装置。
【請求項１２】
担体の上面がプローブを有する複数の領域を有し、
部材が、プローブを有する領域のうち少なくとも１つの外周に密閉をなすために、担体の上面に接触する少なくとも１つの圧縮リブをさらに備える
ことを特徴とする請求項１に記載の装置。
【請求項１３】
部材が第１の圧縮リブおよび第２の圧縮リブをさらに備え、
第１の圧縮リブが、プローブを有する第１の領域の外周に密閉をなし、
第２の圧縮リブが、プローブを有する第１の領域に隣接している、プローブを有する第２の領域の外周に密閉をなし、
第１の圧縮リブ、第２の圧縮リブおよび担体の上面の間に空隙が形成される
ことを特徴とする請求項１２に記載の装置。
【請求項１４】
部材がシリコーンをベースとする材料からなる請求項１に記載の装置。
【請求項１５】
前記部材の少なくとも一部分と当接する剛性部材をさらに備える請求項１に記載の装置。
【請求項１６】
前記剛性部材と前記部材との間に形成される空隙をさらに備える請求項１５に記載の装置。
【請求項１７】
少なくとも１つの側壁と剛性部材との間に空隙が形成され、
少なくとも１つの側壁がチャンバ内の圧力を下げるために空隙に向けて拡張する
ことを特徴とする請求項１６に記載の装置。
【請求項１８】
部材が開口部と隣接している開口部縁をさらに備え、
剛性部材が開口部縁の少なくとも一部分と当接する
ことを特徴とする請求項１５に記載の装置。
【請求項１９】
チャンバの側壁の間の部材にレッジが形成され、
剛性部材が、該部材のレッジの少なくとも一部分と当接する
ことを特徴とする請求項１５に記載の装置。
【請求項２０】
剛性部材が梁を備え、
梁が、前記部材のレッジの少なくとも一部分と当接する
ことを特徴とする請求項１９に記載の装置。
【請求項２１】
担体の少なくとも一部分と当接する剛性部材をさらに備える請求項１に記載の装置。
【請求項２２】
剛性部材が担体ホルダを構成する請求項２１に記載の装置。
【請求項２３】
担体ホルダが少なくとも１つのバネおよび基準点を備え、該少なくとも１つのバネは担体の１部分を担体ホルダの基準点に配置するためのものである請求項２２に記載の装置。
【請求項２４】
担体ホルダが所定の位置に担体を配置するための手段を備える請求項２３に記載の装置。
【請求項２５】
前記部材の少なくとも一部分と当接する剛性部材をさらに備え、
部材の少なくとも一部分と当接する該剛性部材が、担体ホルダに連結されている
ことを特徴とする請求項２２に記載の装置。
【請求項２６】
部材の少なくとも一部分と当接する該剛性部材が、担体ホルダに締め付け固定されている請求項２５に記載の装置。
【請求項２７】
開口部を閉じるための機構によって開口部が個々に閉じられることを特徴とする請求項１に記載の装置。
【請求項２８】
開口部を閉じるための機構が、開口部に挿入されることによってチャンバを密閉することが可能な突出部を備えている請求項１に記載の装置。
【請求項２９】
部材の少なくとも一部分と当接する剛性部材をさらに備え、
突出部が剛性部材に連結されている
ことを特徴とする請求項２８に記載の装置。
【請求項３０】
少なくとも２つの突出部が互いに連結されている請求項２８に記載の装置。
【請求項３１】
開口部を閉じるための機構が、開口部を挟むことによってチャンバを密閉することを特徴とする請求項１に記載の装置。
【請求項３２】
開口部を閉じるための機構がｖ字型溝を有する剛性部材からなる請求項３１に記載の装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ハイブリダイゼーションに関する。さらに詳細には、本発明はＤＮＡのハイブリダイゼーションのための方法および装置を提供する。
【背景技術】
【０００２】
本特許出願は、２００２年１月２８日に出願された、「ＤＮＡ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  Ｄｅｖｉｃｅ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄ．」という題名の米国特許出願第６０／３５２，３４６号の優先権を主張する。本特許出願はまた、２００２年１１月１４日に出願された、「ＤＮＡ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  Ｄｅｖｉｃｅ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄ．」という題名の米国特許出願第６０／４２６，３１６号の優先権を主張する。米国特許出願第６０／３５２，３４６号明細書と米国特許出願第６０／４２６，３１６号明細書の全体を、本願明細書に援用する。
【０００３】
配列選択的なＤＮＡ検出は、科学者が疾患の遺伝的な根拠を解明し、この新しい情報を用いて医学的診断や治療を向上させる場合に、ますます重要になってきている。オリゴヌクレオチドで修飾した担体上でのＤＮＡハイブリダイゼーション試験は、溶液中の特定のＤＮＡ配列の存在を検出するために一般に使用される。遺伝情報を探索するためのコンビナトリアルＤＮＡアレイの発展の兆しは、将来の科学に対するこうした異種（ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓ）配列アッセイの重要性を示している。
【０００４】
典型的には、ハイブリダイゼーション試験を容易にする担体部材にサンプルをのせるかまたは入れる。こうした担体部材は、ガラスもしくはポリマーのスライドグラスまたはガラスもしくはポリマーのマイクロタイタープレートであり得る。プローブの１例には、ＤＮＡ捕捉プローブなどの捕捉プローブがある。担体上での試験の準備は、大きさがわずか１００μｍ（ミクロン）〜５００μｍの濃縮された捕捉鎖ＤＮＡの循環パターンの領域を配置することによって行うことが可能である。図１に示すように、担体上に１０個の領域が存在する。実験の必要性に応じて、より多いまたはより少ない領域を使用することも可能である。同じサンプルに暴露される共通の領域に、種々の合成ＤＮＡ配列のスポットを置くことによって、さらに別の準備も可能である。具体的には、担体上の領域内に複数の同一または異なる種類のプローブが存在し得る。
【０００５】
したがって、ＤＮＡハイブリダイゼーション試験には、担体に固定した合成ＤＮＡ捕捉鎖、標的ＤＮＡ鎖、およびプローブが含まれうる。具体的には、ＤＮＡハイブリダイゼーションのためのある技術は、プローブを使用するチップベースのＤＮＡ検出法である。プローブは、特定の標的に相補的な合成ＤＮＡ鎖を用いることが可能である。合成ＤＮＡ鎖に取り付けられるのがシグナル機構である。シグナルが存在する（すなわち、シグナル機構が存在する）場合、合成鎖がサンプル中のＤＮＡに結合しているのでサンプル中に標的ＤＮＡが存在すると判定することができる。同様に、シグナル結果がない（すなわち、シグナル機構が存在しない）ということは、サンプル中に標的ＤＮＡが存在しないことを示す。したがって、シグナルを確実に検出し、結果を正確に報告するシステムが必要である。
【０００６】
シグナル機構の１例は、３成分サンドイッチアッセイ法において担体上にハイブリダイズした特定のＤＮＡ配列の存在を示すための、直径が比較的小さく（１０〜４０ｎｍ）、オリゴヌクレオチドで修飾された金ナノ粒子プローブである。「オリゴヌクレオチドが結合したナノ粒子とその利用（Nanoparticles having oligonucleotides attached thereto
and uses therefore ）」という題名の特許文献１（その内容全体を本願明細書に援用す
る）を参照のこと。また、非特許文献１も参照のこと。ハイブリダイズさせたこれらのナノ粒子プローブの相補性に関するミスマッチのＤＮＡ配列に対する選択性は、アレイ表面からのナノ粒子独自の急激な分離（または「融解」）により、フルオロフォア標識プローブの選択性よりも本質的に高い。さらに、銀（Ｉ）の金促進型還元によってアレイに結合しているナノ粒子を増大させることにより、蛍光標識された遺伝子チップの共焦点蛍光イメージングで通常観察されるよりも高い感度で、アレイをフラットベッドスキャナにより白黒でイメージングできるようになる。スキャン測定による（ｓｃａｎｏｍｅｔｒｉｃ）この方法は、ＤＮＡミスマッチの特定にうまく適用された。
【０００７】
ＤＮＡハイブリダイゼーションを実施するためには、使用者は、相補的な合成ＤＮＡ鎖を標的ＤＮＡと共に特定の温度および湿度に置かねばならない。温度は、選り抜きのＤＮＡのみがハイブリダイズするように厳密に制御するべきであり、そうすることによって試験の選択性が増す。試験に使用される流体の体積が、マイクロリットルの範囲であるので、湿度の制御は重要である。
【０００８】
試験を進行するためには、使用者は、非常に体積の小さないくつかの試薬を扱わねばならない。試薬をその保管容器から混合容器に移すためには、マイクロピペットを用いることが可能である。遠心分離の工程ではすべての溶液を容器の１つの領域に集める必要があるので、混合容器は使用される流体の体積よりもかなり大きい。この混合容器はまた湿度および温度が制御されなければならないので、所望のハイブリダイゼーション温度に維持された媒体の中に浸したり置いたりできる閉鎖された環境でなければならない。この工程を実施するために、マイクロチューブ、ラック、恒温恒湿チャンバ（ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  ｃｈａｍｂｅｒ）、水浴、ボルテックス（渦流混合）装置、および小型遠心機を使用することが可能である。
【０００９】
従来の技術では、ハイブリダイズした標的ＤＮＡ／シグナル機構（金ナノ粒子ＤＮＡなど）は、溶液を混合容器からスライドに移すためのマイクロピペットを用いてスライドに加えられる。この従来技術の方法では、ガスケットが接着剤を用いて手作業でスライドグラスに装着される。ここで、スライドの温度および湿度を保つために恒温恒湿チャンバに挿入されたスライド上で、該溶液を用いて第２のハイブリダイゼーションステップを行う。この第２のハイブリダイゼーション後にスライドを恒温恒湿チャンバから取り出し、水をベースとする洗浄液でスライドを洗浄することによって、過剰な流体／未結合ＤＮＡを取り除く。
【００１０】
最終工程はシグナル増幅溶液の添加であってよく、該工程によってシグナル機構に金属を沈着させることができる。この溶液は光および温度に対して非常に反応性が高いので、この処理工程は温度、湿度、および光条件を制御して行うべきである。この工程が完了したら、水をベースとする第２の洗浄液によってスライドから金属沈着溶液を取り除く。
【特許文献１】米国特許第６，３６１，９４４号明細書
【非特許文献１】ティー．エイ．タトン（Ｔ．Ａ．Ｔａｔｏｎ）、シー．エイ．マーキン（Ｃ．Ａ．Ｍｉｒｋｉｎ）、アール．エル．レッチンガー（Ｒ．Ｌ．Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ）、Ｓｃｉｅｎｃｅ、第２８９巻、１７５７ページ（２０００年）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１１】
従来の技術で使用されるこれらの工程は複雑であるが、単一のサンプルのみを試験するときはこの処理工程を手動で制御することが可能である。しかし、一般的な計画は、同時にこの処理工程にかけようとする多くの異なるサンプルについて立てられる。この場合、ラックシステムに並べられた多くの試験管について、各試験管から正確な体積の溶液を連続的に取り出し、これを別の対応する試験管に入れる、あるいはハイブリダイゼーション
スライドの特定の領域にのせるということについて使用者がすべて見守る必要があるので、非常に複雑になる。ＤＮＡハイブリダイゼーション試験を無駄にしてしまうような、マイクロピペット操作、空間的な配置構成（マッピング）、または作業手順の誤りは、よくあることである。従来技術の手作業による処理工程も、温度制御が難しい。
【００１２】
したがって、上記の処理工程を簡単にする装置および方法を有することは有利となるだろう。
【課題を解決するための手段】
【００１３】
本発明の１実施形態では、ＤＮＡハイブリダイゼーションのための装置が提供される。この装置は、プローブを有する上面を備えた担体と併用されて機能する。この装置は、担体に当接し、少なくとも部分的に柔軟な部材を備えていてもよい。部材と担体とが複数のチャンバを形成し、各チャンバは、少なくとも一部分の前記上面を含めた底部、少なくとも１つの側壁、および開口部を有する。この装置は、チャンバの開口部を閉じることによってチャンバを密閉するための機構をさらに備える。
【００１４】
１態様では、側壁同士が接触する場所などでは、側壁は少なくとも部分的に湾曲していてもよい。側壁は、担体の表面に対して垂直であってもよいし、（湾曲しているなど）垂直でなくてもよい。さらに、該部材が流体にチャンバの開口部から内部までの管路を提供するネック部分をさらに備え、該ネック部分が開口部に連絡する第１の末端と、内部に連絡する第２の末端とを有していてもよい。ネック部分の角度は、１８０度未満（例えば９０度超１８０度未満の角度など）であり得る。さらに、ネック部分の第２の末端は、側壁に囲まれた領域に対して中心がはずれていてもよい（すなわち、側壁に囲まれた領域の幾何学的中心の真上ではない点に中心があってもよい）。
【００１５】
さらに、部分的に柔軟な部材は、シリコーンをベースとする材料で構成されてもよい。この部分的に柔軟な部材は、プローブを有する領域のうち少なくとも１つの周囲に密閉をなすために担体の上面と接触する、少なくとも１つの圧縮リブをさらに含むことが可能である。
【００１６】
少なくとも部分的に柔軟な部材は、様々な方法で担体と当接することが可能である。１つの方法は、部分的に柔軟な部材と当接する剛性部材を配置することによるものである。次いでこの剛性部材を、担体と、あるいは、担体ホルダなどの担体を保持する別の部材と（恒久的または一時的に）付着させて、柔軟部材が担体の上面と密閉をなすことが可能である。剛性部材は、１実施形態において、柔軟部材のカバーとしての役割をすることも、同部材の１部分のみと当接することも可能である。例えば、剛性部材と少なくとも部分的に柔軟な部材との間（例えば、側壁の１つと剛性部材との間など）に空隙が形成され得る。このように、側壁がチャンバ内の圧力を下げるためにこの空隙に向けて膨張することが可能である。剛性部材は、チャンバの開口部のための構造をさらに提供することが可能である。柔軟部材は、開口部と隣接している開口部縁を含むことが可能であり、その結果、剛性部材が開口部縁の少なくとも一部分と接し、開口部の構造を提供することが可能である。
【００１７】
さらに、剛性部材が担体の少なくとも一部分と接していてもよい。１態様では、剛性部材は担体ホルダをさらに備えることが可能である。担体ホルダは、担体を、ｘ、ｙおよび／またはｚ方向に配置することが可能である。例えば、担体ホルダは、バネを介して、基準点などの所定の位置に担体を配置することが可能である。１態様では、担体ホルダを、一時的（例えばスナップを介して）または恒久的に（例えば蝶番を介して）カバーに連結させることが可能である。
【００１８】
開口部を閉じるための機構は、開口部に挿入することによってチャンバを塞ぐことが可能な突出部を備えていてもよい。突出部は互いに付着されていてもよく（例えば、２つ以上の突出部が付着される）、カバーに付着されていてもよい。あるいは、開口部を閉じるための機構は、開口部を挟むことによってチャンバを密閉してもよい。開口部を挟む１例は、開口部をｖ字溝に差し入れるものである。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１９】
背景技術の項で述べた通り、ハイブリダイゼーションは厳密な温度および湿度条件下で実施するべきである。ハイブリダイゼーションは、１態様では、担体に結合させた捕捉プローブを含んでもよい。捕捉プローブは、背景技術の項で述べた通り、ＤＮＡ捕捉プローブであり得る。あるいは、捕捉プローブは、ＲＮＡ捕捉プローブでもよい。捕捉プローブは、標的分析物との複合体を形成し得る。標的分析物は、核酸であっても核酸でなくてもよい。標的分析物は、背景技術の項で述べた通り、ナノ粒子検出プローブなどの検出プローブにさらに結合し得る。ハイブリダイゼーションは、別の態様では、担体に結合した１種または複数の標的分析物を含んでもよい。このように、標的分析物（例えば核酸または非核酸）は、捕捉プローブとの複合体を形成することが可能であり、さらにナノ粒子検出プローブなどの検出プローブと結合することが可能である。
【００２０】
担体のハイブリダイゼーションに使用される従来技術の装置は、ハイブリダイゼーションに効果的な条件を制御するのが困難であったり、担体上の異なる領域の相互汚染の可能性があったりした。したがって、本発明の１実施形態は、担体の表面の少なくとも一部が囲まれたあるいは密閉されたチャンバを提供するハイブリダイゼーション装置を対象とする。担体の表面の一部の１例は、捕捉プローブを含有する担体上の領域の１つを含んでもよい。形成されるハイブリダイゼーションチャンバは、担体の表面の一部、側壁、および最上部を備えてもよい。ハイブリダイゼーションチャンバの設計およびハイブリダイゼーションチャンバの材料は、ＤＮＡハイブリダイゼーション試験を含む、効率的かつ有効なハイブリダイゼーション試験を手助けするためのものであるべきである。ハイブリダイゼーションチャンバの目標には、それだけには限らないが以下が含まれる：（１）物理的損傷から担体を保護すること；（２）ウェルの中身を見えるようにすること；（３）処理工程全体を通して担体の取り扱いを簡単にすること；（４）ウェルの中身を急速に加熱すること；（５）ハイブリダイゼーションチャンバの他の部分ではなくスライドに流体を入れること；（６）スライドとハイブリダイゼーションチャンバの側壁との間に密閉がなされること；（７）ハイブリダイゼーションチャンバを気密またはほぼ気密にすること。
【００２１】
ここで、本発明の目下好ましい実施形態について添付の図を参照しながら述べるが、図中、類似の要素は類似の数字で表されている。図１に示す通り、担体２０は、試験の対象である複数の領域２４を含有しうる。例えば、領域２４は、ＤＮＡまたはＲＮＡ捕捉プローブなど、担体に結合したプローブ２２を含有しうる。あるいは、担体上の領域２４は、担体に結合した標的分析物を含有してもよい。通常、領域２４は、担体（スライドなど）の表面に、一定の間隔をあけて配置される。ハイブリダイゼーション装置は担体と併用されて機能し、複数の領域が囲まれたあるいは密閉されたチャンバを提供する。チャンバは、一部は担体上の領域によって、一部はハイブリダイゼーション装置によって形成される。単なる１例としては、領域２４は各々正方形（７ｍｍ×７ｍｍ）であり得る。プローブ２２が、約４．５ｍｍ×４．５ｍｍの寸法で、領域２４の中央に配置されてもよい。領域２４内のプローブ２２の数は、設計によって変わりうる。１実施形態では、プローブは６×６（１領域内に６行６列の合計３６プローブ）であり得る。
【００２２】
１態様では、チャンバは、チャンバの底部（担体２０の領域２４の１つなど、担体の表面の少なくとも一部を含む）、側壁、開口部、および開口部を密閉する機構（開口部を密閉するための突出部や、開口部を挟んで閉じるための装置など）で形成される。１実施形
態では、１つまたは複数のチャンバは、担体を保持するための装置と担体に当接する柔軟部材とを含むハイブリダイゼーション装置を用いて形成することが可能である。担体を保持するための装置は、担体ホルダからなるものでもよく、その例を図２ａ〜２ｄおよび９ａに示す。
【００２３】
担体と当接する柔軟部材は、ガスケットを備えてもよく、その例を図３ａ〜ｃおよび９ａに示す。この柔軟部材は、少なくとも１つの側壁（１つの連続した湾曲した側壁の形態または複数の側壁の形態のいずれか）と開口部を備えてもよい。開口部は、図６ｂまたは１４ａに示す通り、ハイブリダイゼーションチャンバの最も上の部分であり得る。あるいは、開口部は、側壁の１つなど、ハイブリダイゼーションチャンバの別の部分に位置してもよい。
【００２４】
柔軟部材は、担体と接して担体とともに様々な方式で密閉をなすことが可能である。１実施形態では、以下でより詳細に述べる通り、柔軟部材が剛性部材を用いて担体に押しつけられてもよい。この剛性部材の１例は、例えば図４ｂおよび５に示す通り、ガスケットを担体に押しつけるカバーであり得る。この剛性部材の別例には、図９ａ〜９ｂに示される剛性部材４０などの剛性部材がある。あるいは、柔軟部材が担体に接着されてもよい。
【００２５】
ハイブリダイゼーション装置は、チャンバの１つまたは複数の開口部を密閉するための機構をさらに備えることが可能である。開口部を密閉するための機構は突出部（キャップなど）でありうるが、この突出部を開口部に挿入して開口部を埋め、したがってチャンバを密閉あるいは囲いこむことができる。あるいは、開口部を密閉するための機構は、開口部を挟むあるいは閉じるために使用可能な剛性部材でもよい。このようにして担体上の領域を囲むことが可能であり、これにより、後にさらに詳述する通り、湿度調節を含めたより容易な処理が可能になる。このように、ハイブリダイゼーション装置は、担体上の領域の少なくとも一部（好ましくは全部）を囲むチャンバを提供することが可能である。
【００２６】
１実施形態では、ハイブリダイゼーション装置は、担体ホルダ、ガスケット、カバー、およびガスケット内の開口部を密閉する機構（図５に示す表面封止部品や、図７ｂに示される細長キャップなど）を備えてもよい。あるいは、ハイブリダイゼーション装置は、担体ホルダ、ガスケット、およびカバー（カバーに組み込まれたガスケット内の開口部を密閉するための機構を備える）（図４ｂに示されるピンチシール（挟み込み密閉）部品など）を備えてもよい。
【００２７】
図２ａ〜２ｂを参照すると、担体ホルダ３０の斜視図および上面図が示されている。担体ホルダ３０により、（１）担体のより容易な扱い；（２）損傷（破損や傷および／または不注意によって手で触れることが原因の汚染など）からの担体の保護；（３）担体の適切な配列（担体の表面での結合事象を判定するために分析機器を使用する場合など）；ならびに（４）光学イメージング（画像化）システムなどの分析機器と、光学イメージングを妨げることなく一体化できる可能性が可能となる。通常、担体２０はガラスの薄片であり、図１８ａ〜１８ｅに示すようにサンプルを処理しようとする場合、あるいは、図１８ｆに示すようにサンプルを分析しようとする場合には、扱いが難しい。担体ホルダ３０は、ポリカーボネートなどの剛性材料で構成されてもよく、これにより担体２０を取り扱い易くなる可能性がある。さらに、担体ホルダは、担体２０を損傷からさらに十分に保護することが可能である。例えばプローブを手で触れることなどにより担体２０上のプローブ２２と接触すると、実験の結果に悪影響を与える可能性がある。担体ホルダを用いることにより、担体上のプローブに直接接触する可能性が低減される。最後に、担体ホルダは、所定の位置（例えばｘ、ｙ、および／またはｚ方向について所定の位置）に担体を配置することが可能である。１実施形態では、この位置は、ｘ、ｙ、およびｚ方向についてあらかじめ定められる。あるいは、この位置を、３つの異なる方向のうちの任意の１つまたは
任意の組み合わせであらかじめ定めることも可能である。配置をあらかじめ定めることによってその分析装置に対する適切な配置を補助し、担体２０の領域２２の周囲にウェルを提供することが可能になる。
【００２８】
担体ホルダ３０には、担体ホルダ３０をつかむために湾曲部３２が含まれる。担体ホルダには、担体ホルダ３０の一端をつかむことを可能にするリッジ（隆線部）３４がさらに含まれる。担体ホルダはまた、図１８ｅに示すように、担体の積み重ねを可能にする。隆起部分３６は、担体ホルダを重ねて積むのを補助することが可能である。さらに、隆起部分３６は、担体ホルダ３０に保持される担体を、損傷から保護することも補助可能である。さらに、取り付け具３８も、担体ホルダの積み重ねを可能にする。取り付け具３８はまた、担体ホルダ３０内における担体２０の位置決めも可能にするが、これは後述する。
【００２９】
担体ホルダ３０には、担体ホルダ３０に置かれても担体が遮られず見えるようにするための開口部４０が含まれる。強度のために担体ホルダには補強条片４２が含まれ、この補強条片が担体ホルダ３０を構造的に強化し、かつ後述する通りカバーを取り付けるために使用することが可能である。
【００３０】
担体２０は、様々な方法で担体ホルダ３０に挿入することが可能である。ある方法は、後述する通り、担体２０を担体３０の一端５１から該担体がハードストップ４８に接触するまで摺動させることによるものである。リッジ４４は、担体ホルダ３０を通して担体２０を摺動させる際に、担体２０の担体ホルダ３０内の位置決めを助けるのに役立つ。リッジは、担体ホルダ３０内の担体２０をより均一に加熱するのにさらに役立つ。担体２０を担体ホルダ内へ摺動させる際、リッジ４４により抵抗が小さくなる。リッジ４４は、上の部分が部分的に湾曲し、担体の片側が担体ホルダと接触する表面積を小さくしていてもよい。さらに、リッジ４４により空気または水が担体の下面に入り易くなっており（図１８ｃに示す通り）、担体のより均一な加熱を可能としている。
【００３１】
担体ホルダ３０の中を通して担体２０を摺動させるので、担体を担体ホルダ内で配置することが可能な様々な締め付け具（クランプ）、ガイド、ピン（以下で述べるガイドピン１６０など）を取り付けることが可能である。ガイドの１例は、担体保持スナップ４５である。担体保持スナップ４５は一方の端部がｖ字型の４７である。他方の端部では、担体保持スナップ４５は、担体を所定の位置に止める歯止め４９を有する。担体がｘ方向に押されると、担体保持スナップ４５の歯止め４９が係合される。担体２０に対する歯止め４９の力は、ｖ字型端部４７のバネ様作用によって維持される。これにより、担体がｘ方向におけるその位置を保てるようになる。
【００３２】
別のガイドを図２ｃに示すが、図２ｃは図２ａの担体ホルダの一端の斜視図である。図２ｃは、可撓性取り付け具４６の側面図を示す。この可撓性取り付け具は、バネ様作用を有する。可撓性取り付け具４６は、担体２０が可撓性取り付け具４６と接触する場所とは異なる場所で、担体ホルダ３０に連結される。このように、可撓性取り付け具は担体に対して垂直方向に動くことが可能である。これは、担体に対して垂直な方向に動かない（あるいはそれほど動かない）取り付け具３８とは対照的である。取り付け具３８は、以下で述べるハードストップ４８と同様に、担体２０が取り付け具３８と接触する場所で担体ホルダ３０に連結される。したがって、取り付け具３８はｙ方向にそれほど動かないこととなる。可撓性取り付け具４６は、１方向または数方向に面取り部を含むことが可能である。図２ｃに示す通り、可撓性取り付け具４６は、２方向に面取り部を含んでもよい。下方向に傾斜している面取り部５３は、担体をｚ方向に下向きに導く。同様に、担体ホルダ３０の開口部４０に対して内向きに傾斜している面取り部５５は、担体をｙ方向に内向きに導く。このように、可撓性取り付け具４６を用いて担体２０を導くことが可能である。面取り部は、取り付け具３８、ハードストップ４８、および可撓性取り付け具５２にも用い
られ得る。担体を導くために他の手段を使用することも可能である。例えば、取り付け具３８、４６、５２、またはハードストップ４８がウィッシュボーン型条片を含んでもよい。ウィッシュボーン型条片は、担体を、ｚ方向など１方向に導くことが可能である。例えば、ウィッシュボーン型条片がバネ作用を有し、これによって、担体がｘ方向に押されるときに該担体を下方向（ｚ方向）に押すことも可能である。
【００３３】
図２ｄを参照すると、図２ａの担体ホルダの他の端部の斜視図が示されている。図２ｄに示す通り、担体ホルダ３０の一端はハードストップ４８を備える。ハードストップ４８は、担体が押されるべき部分である。ハードストップは基準点として作用し得る。ハードストップは、可撓性のない材料で構成され得る。ハードストップ４８は、担体の上面が接触するための上方縁部５０をさらに含んでもよい。上で述べた通り、ハードストップは担体を導くための面取り部５７を含んでもよい。これに対して、図２ｄに示す通りハードストップ４８の向かい側の可撓性取り付け具５２は、１方向（図２ｄに示す場合、ｙ方向）に動くことができる。可撓性取り付け具５２は、可撓性取り付け具５２が担体２０と接触する点よりも低い担体ホルダ３０の部分で連結される。このように、可撓性取り付け具５２は動くことが可能であり、担体２０をハードストップ３８に向けて押し付ける。さらに、可撓性取り付け具５２は、ｚ方向における適切な配置を可能にする上方縁部５４を含む。したがって、可撓性取り付け具４６と同様、可撓性取り付け具５２は担体をｙ方向に押す。
【００３４】
図３ａ〜３ｃを参照すると、ガスケット６２の上方および下方から見た斜視図ならびに断面図が示されている。ガスケット６２は、少なくとも１部分が（１実施形態では全体が）天然または合成エラストマーなどの柔軟材料で構成されてもよく、担体２０とともに密閉をなすのに使用することができる。特に、担体２０とガスケット６２との接点は、密閉がなされるように柔軟であるとよい。ガスケット６２は、複数の区分を含んでもよく、各区分は側壁６４、ネック部分６６、および少なくとも１つの開口部６８を含んでもよい。図３ａ〜３ｂは、領域２２のそれぞれに対する合計１０個のハイブリダイゼーションチャンバが提供されるように１０個の区分を備えるガスケット６２を示す。
【００３５】
側壁６４は、例えば、担体２０上の領域２４（正方形の形）に対して垂直な４つの側壁からなってもよい。さらに、側壁６４は、側壁が当接する部分で液体が捕捉されないように、側壁がぶつかる部分６５で湾曲していてもよい。あるいは、側壁は、連続的に湾曲していてもよい。
【００３６】
前記複数の区分は、図３ｂに示す通り、ネック部分６６をさらに含むことが可能である。ネック部分６６は、開口部６８から、担体２０および側壁６４を境界とする内部部分７０への管路を提供する。具体的には、ネック部分６６は、開口部６８に連絡する第１の端部７２と、内部部分７０に連絡する第２の端部７４とを有する。ネック部分６６は、図３ｂに示すように曲がっていてもよいし（鋭角または曲線状）、図１５ａ〜ｃに示すようにまっすぐでもよい。あるいは、図１４ａ〜ｃに示すように、ネック部分が含まれなくてもよい。ネック部分の角度は、（図１５ａ〜ｃで示すように）１８０°であり得る。あるいは、ネック部分６６の角度は１８０°未満でもよい。角度は、担体２０に垂直なベクトルと、ネック部分６６と共軸のもう１つのベクトルとを用いて測定することが可能である。１実施形態では、その角度は、図３ｂで示すように、９０°と１８０°の間であり得る。さらに、ネック部分６６の第２の端部７４の、内部部分７０に対する連結点は様々であってよい。例えば、ネック部分６６の第２の端部７４は、側壁に囲まれた領域２２の幾何学的中心の上に中心があってもよい（図１５ａ〜ｃに示す通り）。あるいは、ネック部分６６の第２の端部７４は、側壁に囲まれた領域２２の幾何学的中心の真上ではない点に中心があってもよい（図３ｃに示す通り）。開口部６８に隣接して、開口部縁６９が含まれてもよい。縁６９は、図３ａに示す通り開口部６８全体に隣接してもよい。あるいは、縁は
、開口部６８の一部にのみ隣接してもよい。後に述べる通り、縁６９は、開口部６８に支えを提供するためにカバー８６と係合する。さらに、ガスケット６２は、レッジ（張り出し部）７１を備えてもよい。後に述べる通り、レッジ７１の一部分（または全部）を、カバー８６の梁９０など、剛性部材と当接させるために使用することが可能である。したがって、担体２０を密閉するためのガスケット６２に圧力をかけるために、カバー８６を、担体２０または担体ホルダ３０のいずれかに付着させてもよい。
【００３７】
側壁６４の高さは様々であってよい。図３ｂに示す通り、側壁６４の高さは領域２２の幅とほぼ同じである。これにより、領域２２と側壁６４との境界あたりの表面張力が低下し、内部部分７０に挿入される流体をより多く領域２２の表面により均一に分配させることが可能となる。あるいは、以下でより詳細に述べる通り、側壁６４の高さは、図１５ａ〜ｃに示す通り、領域２２の幅よりもかなり小さくてもよい。さらに、側壁６４は、湾曲していてもよい。図２ｃに示す通り、側壁６４は、担体２０に垂直な部分７３を含んでもよいし、湾曲していて担体とは垂直でないドーム型部分７５をさらに含んでもよい。このドーム型部分７５は、側壁が担体２０に平行（あるいは、図２ｃに示すように、ほぼ平行）というところまで湾曲していてもよい。
【００３８】
別の態様では、ガスケット６２と担体２０との接触領域は、チャンバからの漏れを減らす。漏れを減らすために、ガスケット６２が、図３ｂおよび３ｃに示す通り圧縮リブ７６を含んでもよい。圧縮リブ７６は担体２０と接触して領域２２の外周に密閉をなす。圧縮リブ７６は、成形された表面であり得る。例えば、圧縮リブ７６は、最底部８０へと達する傾斜部７８を含んでもよい。最底部８０は、とがった先端、丸みのあるへり、または平らな表面の形であり得る。最底部８０は担体に押しつけられると変形し、それによって密閉がなされる。さらに、図３ｂに示す通り、空隙８２が最底部８０とハイブリダイゼーションチャンバの間にあってもよい。この空隙８２は、湾曲部分によって形成され得る。空隙８２は、相互汚染の可能性を低下させる。液体がハイブリダイゼーションチャンバから漏れた場合、同液体が空隙８２に捕捉され、隣接するハイブリダイゼーションチャンバへと移動せず、これにより相互汚染が避けられる可能性がある。
【００３９】
上で述べた通り、剛性部材は、少なくとも部分的に柔軟な部材（ガスケット６２など）と組み合わせて使用され得る。剛性部材の１例を、カバー８６の１実施形態の上面および底面から見た斜視図として図４ａおよび４ｂに示す。後に述べる通り、剛性部材の別の実施形態を、例えば１４０として図９ａに示す。上で述べた通り、カバー８６は、担体２０または（担体２０を保持する）担体ホルダ３０に、恒久的または一時的に連結され得る。この連結によって、カバー６８がガスケット６２に圧力をかけて担体２０とともに密閉をなすことが可能となる。ガスケット６２に圧力をかけて密閉をなすために、カバー８６を担体ホルダ３０に一時的に連結してもよい。一時的な連結の１つの方式は、カバー８６のスロット８８による。スロット８８は、担体ホルダ３０の補強条片４２と係合することが可能である。担体ホルダ３０へのカバー８６の連結の他の方式には、締め付け具が含まれる。あるいは、担体ホルダが、図９ａおよび９ｂに示されるように、例えば蝶番を介する２つの部品の連結などによって担体ホルダ３０により恒久的に連結されてもよい。
【００４０】
カバー８６は、ガスケット６２に堅固な構造を提供する。カバー８６は、ポリカーボネートなどの任意の剛性材料で構成され得る。図６ａおよび６ｂにおいてより詳細に示す通り、ガスケット６２は、カバー８６の内部にぴったり嵌合する。カバー８６は、図４ｂに示す通り、同カバーを縦横に走る梁９０を含む。梁９０はガスケットの一部分（レッジ７１など）と当接して圧縮リブ７６に堅固な支えを供する。したがって、カバー８６がスロット８８を介して担体ホルダに取り付けられると、梁９０が圧縮リブ７６を担体２０に押しつける。カバー８６は、開口部６８のための構造をさらに提供する。開口部６８は、開口部縁６９を含んでもよい。カバー８６は、開口部縁６９に当接する湾曲した剛性部分９
２を含んで開口部縁６９に堅固な支えを提供してもよい。図４ａに示す通り、湾曲した剛性部分９２は半円形であり、開口部縁６９の一部のみに堅固な支えを提供する。表面封止部品９８は、後に述べる通り、開口部縁６９に追加の堅固な支えを提供することが可能である。あるいは、カバー８６が開口部縁６９の全体またはほとんど全体に支えを提供してもよい。
【００４１】
カバー８６は、開口部９４をさらに含む。開口部９４は、図５を参照して後に述べる通り、表面封止部品の取り付けが可能である。さらに、開口部９４は空気の流れを可能にし、担体２０がハイブリダイゼーション装置に取り付けられている際の担体２０の均一な加熱を促す。図４ａに示す通り、カバー８６はドーム型の最上部を備え得る。あるいは、この剛性部材は、図９ａに示す通り平坦な構造を有しても良い。
【００４２】
上で述べた通り、開口部６８の密閉は、キャップなどの突出部を開口部に挿入することによって実現可能である。この１例を、ガスケット６２の開口部６８を密閉するための、図４ａのカバーと組み合わせて使用される表面封止部品の斜視図である図５に示す。表面封止部品は複数のキャップ１００を備え、該キャップはそれぞれ開口部６８に挿入するための突出部１０２を有する。キャップ１００は、使い易くするためのタブ１０４を備える。さらに、キャップ１００は保持クリップ１０６を介してカバー８６に連結されてもよい。このキャップは、開口部６８に挿入したり、開口部６８から外したりするために蝶番１０７で動かすことができる。保持クリップ１０６を、図６ａに示す通りカバー８６に挿入してもよい。保持クリップ１０６は、ガスケット６２の開口部６８を支持するための構造を含んでもよい。単なる１例として、保持クリップが、開口部６８の下側を支持するための湾曲部分１０８を備えていてもよい。
【００４３】
突出部を開口部に挿入する代替法を、図４ａのカバーと細長キャップ１１０の分解組立図および斜視図である図７ａおよび７ｂに示す。細長キャップは複数の突出部１１２を備えてもよく、１１４でカバー８６の片端に蝶番で取り付けることが可能である。操作時には、細長キャップ１１０のタブ１１６を下向きに押して突出部１１２を開口部６８に挿入する。細長キャップは、射出成形されたポリカーボネートまたは同様の高強度プラスチックであり得る。図７ａに示す通り、ハイブリダイゼーション装置の片側の一連のキャップを同時に開閉することが可能である。あるいは、キャップを個々に開閉することも可能である。
【００４４】
開口部を密閉するさらなる別法を、密閉機構を備えたカバーの別の実施形態の分解組立図および斜視図である図８ａ〜ｃに示す。カバー１１８は、密閉機構以外はカバー８６と同様に機能する。図５および７ｂに関して上で述べた通り、カバー８６は、開口部６８を密閉するための別個のキャップなど、追加のデバイスと併用して機能させることが可能である。カバー１１８は、一体化型の密閉機構を備える。この密閉機構はｖ字溝１２０の形態の溝を備え、これを通してネック部分６６を挿入することが可能である。ｖ字溝１２０はネック部分６６を挟むように作用し、それによって開口部６８を密閉する。図８ｃに示す通り、ネック部分６６をｖ字溝１２０に挿入することによって開口部６８を個々に密閉することが可能である。
【００４５】
図６ａを参照すると、担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品の斜視図が示されている。担体２０は、担体保持スナップ４５を用いて担体ホルダ３０に取り付けられている。図６ａに示す通り、担体２０は担体保持スナップ４７の一番上の歯４９に差し入れられる。さらに、担体２０は可撓性の取り付け具４６および取り付け具３８によって保持される。さらに、カバー８６は補強条片４２を介して担体ホルダ３０に取り付けられる。図６ａは、開口部６８に挿入されるキャップ１００をさらに示す。
【００４６】
図６ｂは、担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品の垂直断面図である。図６ｃは、担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品の断面図を示す。さらに、図６ｂは、マイクロピペット１２２の先端部分を示す。マイクロピペットまたは他のこうしたデバイスは、流体を内部部分７０に導入する。これは、例えば図１８ｂに示される。しかし、流体をチャンバに導入する場合、担体２０上の領域２２の汚染を避けるべく注意を払わなければならない。ネック部分６６の角度によって、マイクロピペット１２２のチップが担体２０上の領域２２と接触する可能性が低下し、それによって汚染が回避される。さらに、側壁に囲まれる領域２２の幾何学的中心の真上ではない点を中心としてネック部分６６の第２の端部７４を配置することにより、マイクロピペット１２２のチップが担体２０上の領域２２と接触する可能性をさらに低下させることが可能である。
【００４７】
図６ｂおよび６ｃは、ガスケット６２とカバー６８との間の空隙１２４も示している。ハイブリダイゼーションチャンバ間の流体の漏れは、望ましくない可能性がある。漏れは、ハイブリダイゼーションチャンバ内の圧力が高くなり過ぎたときに起こり得る。圧力は、例えば高温が原因で生じる可能性がある。圧力を低下させるために、図６ｂに示すようにガスケット６２とカバー６８との間に空隙またはギャップ１２４を形成する。ギャップ１２４は完全に囲まれていてもよいし、側壁６４などガスケット６２の少なくとも一部分について、ガスケット６２がカバー６８と隣り合わないようにされてもよい。例えば、担体２０および／またはドーム型部分７５に対して垂直な縦部分７３など側壁の一部分は、これに隣接するギャップ１２４を有することが可能である。このように、ハイブリダイゼーションチャンバ内で圧力が上がると、ガスケット６２（側壁６４など）の柔軟部材は、カバー６８の剛性部材に向かって、矢印の方向へ、外向きに動くことが可能である。このように、柔軟なガスケット部材は、圧力下で外向きに拡張することが可能であり、高圧力下での漏れの可能性を低下させる。
【００４８】
図７ａおよび７ｂを参照すると、担体および担体ホルダ、ガスケット、図４ａのカバー、ならびに図５ｂの細長キャップの分解組立図および斜視図が示されている。組み立てに際し、ガスケット６２をカバー６８に挿入することが可能である。その後、ガスケット６２、カバー（表面封止部品や細長キャップなどの密閉機構を有する）の組み合わせを、担体ホルダ３０（担体２０が入っている）に連結することが可能である。
【００４９】
図９ａおよび９ｂを参照すると、開いた状態のハイブリダイゼーション装置の別の実施形態の斜視図が示されている。ハイブリダイゼーション装置１３０は、蝶番１３６で連結された２つの主要な部分１３２、１３４を含みうる。上で述べた通り、これらの２つの部分は蝶番で連結されている必要はない（カバー６８、およびガスケット６２は、担体ホルダ３０と締め付け具またはプレス嵌めを介して連結される）。第１の部分１３２は、柔軟部材１３８および剛性部材１４０を含む。ガスケット６２と同様、柔軟部材１３８は天然または合成エラストマーで構成可能であり、後により詳細に述べる通り、担体とともに密閉をなすために使用される。剛性部材１４０は、ナイロン（ガラスまたは非ガラス入り）、ポリプロピレン、またはポリカーボネートなどのプラスチック材料で構成され得る。柔軟部材１３８は、剛性部材１４０の一部分にプレス嵌めされても一体成形されてもよい。あるいは、柔軟部材１３８は剛性部材１４０に接着されてもよい。第２の部分１３４は、剛性部材１４２を含んでもよい。剛性部材１４２は、剛性部材１４０と同じ材料で構成されてもよいし、あるいは異なる材料で構成されてもよい。第１の部分１３２と第２の部分１３４はいずれも穴１４４、１４６を備えうる。図１０ａに示す通り、ハイブリダイゼーション装置１３０を閉じるとき、穴１４４を用いてハイブリダイゼーション装置をより容易に支えることが可能である。さらに、ハイブリダイゼーション装置１３０内の担体のエッジ（縁部）を、穴１４４、１４６を用いてより容易に調べることが可能である。例えば
、担体２０のエッジの近くのバーコードをバーコードリーダーで読み、担体に結合しているプローブまたは実施すべき試験を判定することが可能である。第１の部分１３２および第２の部分１３４は、スレート１４８をさらに含んでもよい。スレート１４８は、ハイブリダイゼーション装置を閉じた後に、ハイブリダイゼーション装置１３０の剛性のための付加構造を提供する。スレートの間隔は一定でもよいし（図９ａに示す通り）、間隔が一定でなくてもよい。さらに、スレート１４８は、第１の部分１３２、第２の部分１３４、あるいは第１の１３２と第２の部分１３４の両方（図９ａに示す通り）の上に存在し得る。
【００５０】
図９ａおよび９ｂに示す通り、柔軟部材１３８は開口部１５２を含む。図１４ａ〜１４ｃおよび１５ａ〜１５ｃにおいてより詳細に述べる通り、ハイブリダイゼーションチャンバは、１つまたは複数の側壁１５０および開口部１５２を含む。開口部１５２に突出部を挿入し、それによって開口部を密閉することが可能である。このように、開口部および柔軟部材／担体の接触面が密封され、ハイブリダイゼーションチャンバが密閉される。上で述べた通り、突出部の１例はキャップ１５４である。キャップ１５４は、開口部１５２と密閉をなすように設計され得る。キャップ１５４は、柔軟材料、剛性材料、または柔軟材料と剛性材料の組み合わせで構成され得る。例えば、キャップ１５４が剛性部材１４０と同じ材料で構成されてもよい。あるいは、キャップが柔軟部材１３８と同じ材料で構成されてもよい。キャップは、キャップに付着したタブ１５６をさらに含んでもよい。タブ１５６は、剛性材料または柔軟材料で構成され得る。さらに、キャップ１５４またはタブ１５６が、１つまたは複数の文字や数字など、識別記号を含んでもよい。この識別記号により、ある特定のハイブリダイゼーションチャンバにおけるある特定の実験を識別することが可能となり、記録保管および探査がし易くなる。したがって、キャップおよびタブは、ハイブリダイゼーションチャンバへの個々のアクセスを可能にする。あるいは、図１３に示す１列のキャップなど複数のキャップを、共通のタブ１５５を用いて互いに連結することが可能である。キャップ１５４を、ハイブリダイゼーション装置の本体に付着させることが可能である。例えば、キャップ１５４を連結部分５８によって第１の部分１３２に付着させることが可能である。上で述べた通り、堅固なカバー（カバーなど）を柔軟なガスケット上に押し付けることによって密閉を実現することも可能である。
【００５１】
使用者は、担体上の領域が柔軟な面に向かって位置づけられるように、担体を柔軟部材１３８の上に伏せて置けばよい。ハイブリダイゼーション装置が付属の締め付け具で閉じられると、図１０ａに示す通り、担体と柔軟部材は互いに当接する。担体は、開口部１５２を備えたハイブリダイゼーションチャンバが担体上の領域に対して適切な向きに位置づけられるように、ハイブリダイゼーション装置内で固定することが可能である。例えば１実施形態では、開口部１５２は担体上の領域の上方に位置付けられる。したがって、チャンバの位置は、各開口部１５２の下方に領域の中心があるような場所である。ハイブリダイゼーション装置内における担体の適切な配置は、いくつかの方法で実現可能である。上で述べた通り、バネ（プラスチックのバネなど）および／または取り付け具を使用することが可能である。別の実施形態では、担体を適切なｘおよびｙ位置に配置させるためにガイドピン１６０を使用することが可能である。例えば、柔軟部材１３８に対する担体の位置を定めるために、担体の角の近接部など担体の各エッジに沿ってガイドピン１６０を配置することが可能である。あるいは、担体のエッジが当接する一段高い壁を用いて担体を導くことも可能である。具体的には、一段高い壁は、担体の１つ、２つ、またはそれ以上のエッジに沿っていてもよい。さらなる別の実施形態では、担体を導くためにスロットを使用することが可能である。担体を適切に方向付けるために、担体のエッジまたは角をスロットの下部に摺動させてもよい。
【００５２】
上で述べた通り、ハイブリダイゼーションチャンバは、担体の少なくとも一方の側の一部分とともに密閉をなすために、柔軟部材を担体と隣り合わせることによって形成される
。例えば、図１０ａに示す通り、使用者はハイブリダイゼーション装置を閉じてこれをスナップ留めし、該ハイブリダイゼーション装置がスライドの両側と当接するスライドホルダとともにスライドをはさんでハイブリダイゼーションチャンバを形成するようにすることが可能である。あるいは、ハイブリダイゼーション装置が担体の片側のみと当接していてもよい。
【００５３】
柔軟部材を押しつけるための方式の１例は、締め付け具、クリップなどを用いることである。締め付け具または一連の締め付け具により堅固な部分を相互に連結することが可能であり、それによって柔軟部材が担体に押しつけられる。図１０ａに示す通り、第１の部分１３２は締め付け具１６８によって第２の部分１３４に連結され、一体化される。図９ａ〜９ｃに示す通り、締め付け具１６８は第２の部分１３４に連結される。ハイブリダイゼーション装置１３０を閉じるとき、締め付け具１６８は縁部１７０を乗り越えることによって第１の部分にスナップ装着される。あるいは、締め付け具が第１の部分１３２に連結されていて第２の部分１３４にスナップ装着されてもよい。さらに別の実施形態では、締め付け具は第１の部分１３２または第２の部分１３４のいずれとも一体化されない。代わりに、締め付け具は第１の部分１３２と第２の部分１３４を連結する独立した部品である。このような締め付け具の１例を図１２および１６に示す。締め付け具１７２は後壁１７４を備え、該後壁を背にして第１の部分１３２と第２の部分１３４のエッジが当接することができる。さらに、締め付け具１７２は割れ目１７６を含む。図１２に示す通り、割れ目１７６は連結する部分１５８を締め付け具１７２と一体化させることが可能である。締め付け具１７２は、傾斜部分１７８、１８０をさらに含む。傾斜部分１７８、１８０により、締め付け具１７２を定位置にスナップ装着させることが可能となる。図１２に示す通り、第１の部分１３２および第２の部分１３４の向かい合うエッジに沿って２つの締め付け具が使用される。あるいは、片方のエッジに沿って締め付け具を１つだけ使用することも可能である。さらに、図１２に示す通り、１つの締め付け具１７２が、第１の部分１３２および第２の部分１３４のエッジの一部に沿っている。あるいは、一連の別個の締め付け具が、第１の部分１３２および第２の部分１３４のエッジの一部に沿っていてもよい。別の実施形態では、柔軟部材の押しつけは、接着剤を使用することによって実現可能である。接着剤は、担体と当接する柔軟部材３８の部分に塗布すればよい。以上述べた通り、締め付け具は、ガスケットの最上部または底部の一部分を成していてもよく、別の部品のスロットにスナップ装着することが可能である。
【００５４】
ハイブリダイゼーション装置が閉じているとき、片端の湾曲部分１４９と湾曲部分１５１および１５３とにより、ハイブリダイゼーション装置をつかみ易くなっている。例えば、閉じられているハイブリダイゼーション装置を、湾曲部分１４９で、親指と他の指との間でつかんで支えることが可能である。あるいは、閉じられたハイブリダイゼーション装置を、湾曲部分１５１および１５３で、親指と他の指との間でつかんで支えることが可能である。さらに、湾曲部分１４９、１５１、および１５３によって、ハイブリダイゼーション装置の本体（湾曲部分と湾曲部分の間のハイブリダイゼーション装置の部分）を、ハイブリダイゼーション装置が置かれる平らな表面よりも上に上げることにより、取り扱いが容易になる。
【００５５】
図１０ｂを参照すると、ハイブリダイゼーション装置の第２の部分１３４の別の実施形態の斜視図が示されている。第２の部分１３４は、第２の部分を縦横に走るスレート１６０を備えてもよい。スレート１６０は、第２の部分１３４に剛性を与える。さらに、スレート１６２は第２の部分にポケット１６４を形成するが、該ポケットはその中に空気を捕捉することが可能である。ハイブリダイゼーション装置の浮揚性が求められる場合は、その空気によって、液浴に入れたときにハイブリダイゼーション装置を浮かせることが可能となる。さらに、図１０ｂに示す通り、第２の部分１３４は穴１６６を含んでもよい。穴１６６は、第１の部分１３２が第２の部分１３４に対して平らに押しつけられるときにガ
イドピンをはめ込ませることができる。そうでないと、隆起しているガイドピンは破壊される可能性がある。
【００５６】
別の実施形態では、ハイブリダイゼーションチャンバは完全に閉ざされるように設計される。閉ざされたハイブリダイゼーションチャンバによって、試料の混合がより容易になる。特に、（後に図１７で述べる通り）別個のボルテックス混合装置を必要とせず、手動で混合することが可能である。ハイブリダイゼーションチャンバを混合のためにボルテックス混合装置に乗せることも可能である。さらに、閉ざされたハイブリダイゼーションチャンバでは、液体がハイブリダイゼーションチャンバから蒸発したり漏れたりする可能性が低くなる。１態様では、ハイブリダイゼーションチャンバは、アクセスキャップによりハイブリダイゼーションチャンバの開口部を密閉することが可能なように、アクセスキャップを伴って設計される。これは、担体、ハイブリダイゼーションチャンバ、開口部、およびキャップの、図１４ｂの断面図に示されている。剛性部材１４０は、キャップが入るための開口部１８４を有する。同様に、柔軟部材は開口部１５２を有する。開口部１８４は内側に向かって先細りしており、キャップ１５４が入り易くなっている。開口部１５２も先細りしており、傾斜部分１８６および垂直部分１８８を有する。図１４ｂに示す通り、キャップ１５４を挿入した後、開口部１８４はその形状を維持する。対照的に、開口部１５２の形状は変化し、開口部が外向きに押される。これによって、流体が開口部１５２からチャンバを出ていかないように、密閉がなされる。別の態様では、柔軟部材１３８と担体の接触領域がチャンバからの漏れを低減させる。例えば、図１４ａに示す通り、柔軟部材は最底部１９２に達する傾斜部分１９０を備える。最底部１９２は、とがった先端、丸みのあるへり、または平らな表面の形であり得る。図９ａに示す通り、最底部１９２は柔軟部材の外周に沿って狭いエッジを形成する。この最底部１９２は担体に押しつけられると変形し、それによって密閉がなされる。さらに、図１４ｃに示す通り、最底部１９２とハイブリダイゼーションチャンバの間に空隙１９３が形成される。この空隙１９３は湾曲部分１９５によって形成され得る。空隙１９３によって、相互汚染の可能性が低下する。液体がハイブリダイゼーションチャンバから漏れた場合、空隙１９３に捕捉され、隣接するハイブリダイゼーションチャンバには移動しないので、相互汚染が回避される。
【００５７】
別の実施形態では、ハイブリダイゼーションチャンバは、側壁または最上部の流体を最小限にし、スライド上の流体を最大限にするための形態となっている。ハイブリダイゼーションチャンバを、スライドの表面積がチャンバ最上部の表面積よりも大きくなるように形成してもよい。例えば、ハイブリダイゼーションチャンバは、試薬などの流体を挿入するために使用される最上部と、スライド部分の底部とを有するドームの形態であり得る。これを、担体、ハイブリダイゼーションチャンバ、および開口部の、図１４ａの断面図に示す。これを、担体、複数のハイブリダイゼーションチャンバ、開口部、およびキャップの、図１４ｃの断面図にも示す。このように、流体がハイブリダイゼーションチャンバにピペットで注入される場合、流体が壁面に集まる可能性は低く、ハイブリダイゼーションチャンバの底部に落ち着く可能性が高い。これは、下から上までチャンバの断面が同じであるハイブリダイゼーションチャンバとは対照的である。このようなハイブリダイゼーションチャンバの最上部で挿入された流体は、流体のすべてが底部に落ち着く可能性が低い。図１４ａに示す通り、側壁１５０は、チャンバの上方部分が担体と接触する下方部分よりも狭くなるように傾斜している。図９ａでは、４つの平らな側壁が存在する。側壁がぶつかる場所では、流体が捕捉される可能性を低下させるために、交差部分が湾曲している。あるいは、側壁は円錐形の側壁であってもよい。
【００５８】
図１５ａ〜ｃを参照すると、ハイブリダイゼーションチャンバの別の実施形態が示されている。ハイブリダイゼーションチャンバからの流体の漏れの減少は、柔軟部材１３８の設計を通して実現可能である。柔軟部材は、下方の湾曲部分１９４および上方のネック部分１９６を含む。ネック部分１９６は、円筒形であり得る。さらに、柔軟部材１３８と剛
性部材１４０の間に、穴または空隙２００が形成される。このようにして、ハイブリダイゼーションチャンバ内で圧力が上がると、柔軟部材が剛性部材に向かって矢印の方向へ外向きに動くことが可能である。柔軟部材のこの外向きの移動によって、圧力が低下する。図１５ａは、剛性部材１４０の上方に隆起された柔軟部材１３８をさらに示す。柔軟部材のこの隆起部分は、開口部２０２を備える。この開口部は、図１５ｂおよび１５ｃに示す通り、キャップと係合することが可能な環状リング１９８を含む。キャップは、環状リング１９８と係合するこぶ部分１９９を含んでもよい。ネック部分１９６は、流体がネック部分１９６の表面に付着しないように十分に広くてもよい。例えば、ネック部分１９６は直径が２．５から３ｍｍであり得る。さらに、ネック部分の上方の部分の直径が小さくなっていてもよい（例えば１．５ｍｍ）。このようにして、マイクロピペット使用時にマイクロピペットをハイブリダイゼーションチャンバに完全に挿入できないようにすることで、担体の表面へのマイクロピペットのチップの接触を回避することができる。これにより、マイクロピペットのチップによる担体上の領域の相互汚染の可能性を低減することが可能である。
【００５９】
さらに、１実施形態では、スライド上の液体の量を最大限にするように材料を選択することが可能である。例えば、ハイブリダイゼーションチャンバの少なくとも一部分を疎水性の材料で作製してもよい。１態様では、ハイブリダイゼーションチャンバの側壁は、液体が側壁からはじかれてスライドグラス上に置かれるように、疎水性の材料を用いて作られる。別の態様では、ハイブリダイゼーションチャンバの側壁も最上部も、疎水性の材料で作られ得る。疎水性の材料は、液体をはじく任意の種類のものでよい。疎水性の材料の１例は、熱可塑性エラストマーである。後述の通り、装置の一部分は熱可塑性エラストマーで作製され得る（側壁など）のに対し、アクセスキャップおよび構造的土台などの他の部分は、ポリプロピレンやポリカーボネートなど別の材料で作製され得る。さらに、材料は、装置と担体の底部との間の適切な密閉を確かなものにするために選択することが可能である。ハイブリダイゼーション装置は担体の底部と当接するので、チャンバ内の液体が漏れないように、優れた密閉が維持されるべきである。優れた密閉を提供する、ハイブリダイゼーション装置用の材料は、シリコーンまたは熱可塑性エラストマーである。したがって、該装置の、スライド（１態様では側壁）と接触する部分は、スライドと装置との間の十分な密閉がなされるように、ゴムをベースにした生成物などで作ることが可能である。−４０℃〜９５℃で、キャップとスライドのいずれにおいても、１０個それぞれのチャンバにおける密閉が維持される設計であるべきである。ゴム製のチャンバ壁は疎水性であり、試薬混合物をスライド表面上へとはじくことになる。図１４ａ〜１４ｃにおけるチャンバの体積は約２００マイクロリットルであり、これは試薬が完全に混合しない可能性を最小限にするのを助けるはずである。同様に、図１５ａ〜１５ｃにおけるチャンバの体積は約１００マイクロリットルであり、これは試薬が完全に混合しない可能性を最小限にするのを助ける可能性がある。
【００６０】
（ハイブリダイゼーション装置を使用する処理工程）
図６ａ、７ｂ、８ｂ、および９ａに示される装置などのハイブリダイゼーション装置内に担体を置いた後、使用者は、第１のチャンバ用の試薬を加え、（例えばアクセスキャップを挿入することによって）開口部を閉じればよい。試薬を加えた後に個々のアクセスキャップを閉じることは、使用者が進行を把握する助けとなる。１度キャップを閉じると、その標的を含む各チャンバは密閉される。その後、試験を行うために、担体／ハイブリダイゼーション装置を水浴やドライオーブンなどの温度制御された環境に置けばよい。ＤＮＡハイブリダイゼーション試験には２〜３種の異なる温度を必要とする可能性があるので、環境温度を変える必要があるというよりも、より迅速な温度変化を実施するために既に制御されている温度環境へのスライドホルダの移動が容易になるように設計される。水浴は、表面加熱器（ｓｕｒｆａｃｅ  ｈｅａｔｅｒ）などの他の加熱装置よりも優れた温度制御が可能にする。特に、表面加熱器はスライドの一部分を不均一に加熱する可能性があ
り、それによって信頼度の低い結果がもたらされる可能性がある。スライドホルダを用いると、水浴を使用してスライドの温度を制御することが可能となり、それによって試験の信頼度がより高くなる。
【００６１】
ハイブリダイゼーション後、使用者は、溶液中のハイブリダイズしなかったＤＮＡをハイブリダイゼーションチャンバから洗い流すために、アクセスキャップを１つ１つ、あるいはすべて同時に開けることが可能である。この洗浄は、水浴中で使用者がスライドホルダを挿入し、これを前後に動かして不必要な溶液を洗い流すことによっても行うことが可能である。
【００６２】
ここでＤＮＡハイブリダイゼーションの工程が行われ、存在する場合は標的ＤＮＡが担体の表面上に捕捉される。測定し易くするために、シグナル増幅工程が実施される場合もある。スライドホルダが不透明でありスライドのチャンバを密閉することが可能である設計により、シグナル増幅の処理工程が容易になる。実施のためには、使用者はアクセスポート（ａｃｃｅｓｓ  ｐｏｒｔ）を介してシグナル増幅液をハイブリダイゼーションチャンバにマイクロピペット注入し、アクセスキャップを閉じる。ここで、シグナル増幅液を周辺光から隔離し、温度制御された環境にスライドホルダを挿入することによって特定の温度にすることが可能である。
【００６３】
シグナル増幅工程の終わりに、使用者は、温度制御された環境からスライドホルダを取り出し、アクセスキャップを開け、場合によってはマイクロピペットで停止液を加え、次いでＤＮＡハイブリダイゼーションの洗浄技法と同様の洗浄処理工程によりハイブリダイゼーションチャンバから溶液を洗い流す。カバーを取り除き、担体ホルダに入った担体を測定用の装置に挿入することが可能である。別の設計の場合は、スライドホルダをここで開けることが可能であり、測定および保管のためにスライドを取り出す。
【００６４】
図１７ａ〜ｄを参照すると、ハイブリダイゼーションチャンバを使用する工程と従来技術の工程とを比較するフローチャートが示されている。図１７ａ〜ｄは、試験手順の容易さおよび信頼性を増すいくつかの態様を図示する。片側には、上で述べた現行の処理工程を述べる。もう片方の側には、本発明のいくつかの態様の改変された処理工程を述べる。改変された処理工程によって、従来の処理工程におけるいくつかの工程が廃止され、他の工程が簡略化されている。図中、「Ｘ」は工程の廃止を表し、「Ｍ」は工程の改変を表し、「Ｕ」は変化のない工程を表す。例えば、図１７ａに示す通り、ハイブリダイゼーション装置によって、試験用チューブをチューブトレイに配列する必要がなくなった。代わりに、事前準備によりチューブをあらかじめ配列された１つのネストにする。同様に、担体へゴム製ガスケットを取り付ける必要がなくなった。図１７ｂ〜ｃを参照すると、１つのネストという概念のハイブリダイゼーション装置により、試験用チューブを１つ１つ混合し、加熱し、冷却するのではなく、ハイブリダイゼーションチャンバを一緒に混合し、加熱し、冷却することが可能になっている。同様に、別々のハイブリダイゼーションチャンバを用いて、それぞれのチャンバを洗浄することにより、チャンバの相互汚染の可能性が低下する。それに対して、ふたのないゴム製ガスケットを使用すると、図１０ｄに示すように、洗浄のときに担体が汚染してしまう可能性がある。
【００６５】
図１８ａ〜ｆを参照すると、ハイブリダイゼーション装置を用いて実施することが可能なＤＮＡ診断試験の１例が示されている。効率を良くするために、複数のハイブリダイゼーションユニットを使用することが可能である。図１８ａに示される例では、６つのハイブリダイゼーションユニットが存在する。これより多い、または少ないハイブリダイゼーションユニットを使用することも可能である。ハイブリダイゼーションユニットは、１キットでいくつかの試験を実施することが可能である。各ハイブリダイゼーションユニットが１０個のウェルを有する場合、合計６０通りの試験を実施することが可能である。ハイ
ブリダイゼーションユニットを、より多い、または少ないウェルとして設計することも可能である。４８通りの試験が所望される場合、８個のウェルを有するハイブリダイゼーションユニットを使用することが可能である。あるいは、１０ウェルハイブリダイゼーションユニットの１０個のウェルのうちの８個のみを使用してもよい。この実施例では、６個のハイブリダイゼーションユニットを、ＰＣＲトレイの各列が１つのハイブリダイゼーションユニットを備える１２×８ＰＣＲトレイと一体化することが可能である。さらに、本実施例では、標準のマルチピペットと一体化するために、ハイブリダイゼーションユニットのウェルを工業規格のマルチピペットに適合するように８．５ｍｍ間隔としてもよい。
【００６６】
さらに、ＰＣＲを実施する場合、ＰＣＲプライマーを、その試験を実施するのに十分な材料と共に使用すればよい。４８通りの試験のこの例では、１本のチューブが十分な材料を含有する。この試験を実施するためにはハイブリダイゼーションプローブも必要であり、１本のチューブが４８通りの試験を実施するのに十分な材料を含有する。試験／パネルに共通な他の消耗材料には、純水；シグナル増強液ＡおよびＢ；シグナル増強停止液；洗浄液；およびハイブリダイゼーションバッファーがある。試験には他の材料も使用することが可能である。
【００６７】
この例における診断試験では、消耗材料の他に、次のものを含めた装置も使用することが可能である：２種の水槽が使用される（１つは９５℃の変性用、もう１つは３０〜６０℃ハイブリダイズ用）；噴水式洗浄器（ｗａｓｈ  ｆｏｕｎｔａｉｎ）；４種の洗浄浴；１つまたは複数のピペット；遠心分離器；およびイメージングシステム（その内容全体が本願明細書に援用される米国特許出願第１０／２１０，９５９号に開示されているイメージングシステムなど）。
【００６８】
図１８ｂを参照すると、ハイブリダイゼーションユニットを準備する順序が示されている。米国特許出願第１０／２１０，９５９号に開示されているものなどのイメージングシステムは、使用者のためのワークシートを印刷することが可能であり、該ワークシートは使用者が患者の識別番号を記録し、該番号を試験スライドおよび試験スライド上の位置に相関させるのを助けることとなる。使用者は、ＤＮＡ診断試験の前にＤＮＡサンプルについてＰＣＲを実施する場合、患者の識別番号およびＰＣＲトレイの位置を入力することが可能である。あるいは、患者のＩＤ番号／ＰＣＲトレイの位置を、例えばバーコード標識を用いることによって自動的に入力することが可能である。使用者は、ハイブリダイゼーションユニットを手にとり、スライドの一部分（スライドラベルの見える部分など）に、イメージングシステムのワークシートから得られた固有の試験識別子を付けることが可能であり、これによって使用者はＰＣＲトレイの位置からハイブリダイゼーションユニットのウェル位置およびスライド位置まで、患者の識別情報を追跡可能になる。
【００６９】
図１８ｂの区画１で示す通り、使用者はハイブリダイゼーションユニットのウェルカバーのいくつかまたはすべてを開けることが可能である。区画２で示す通り、使用者はウェルのうちいくつか（またはすべて）にハイブリダイゼーションバッファーを加えることが可能である。例えば、使用者は各ウェルに約４０マイクロリットルのハイブリダイゼーション溶液を加えることが可能である。実施される実験およびハイブリダイゼーションウェルの大きさに応じて、より多い、または少ないハイブリダイゼーション溶液を用いることも可能である。空間的マッピングを助け、またどのウェルにプローブ溶液が装入されたか使用者が特定するのを助けるために、ハイブリダイゼーション溶液を着色することも可能である。区画３で示す通り、次に使用者はこれらのウェルのうちいくつか（またはすべて）にプローブを加えることが可能である。例えば、使用者は各ウェルに約２０マイクロリットルのプローブを加えることが可能である。プローブ溶液を赤色に着色し、どのウェルにプローブ溶液が装入されたか使用者が特定するのを助けることも可能である。区画４および５で示す通り、これらのウェルに、標的（サンプル）を加えることが可能である。具
体的には、患者のＤＮＡサンプルがＰＣＲトレイからハイブリダイゼーションユニットに移動される場合がある。この移動は、マルチピペットまたはシングルピペットを用いて実施することが可能である。区画４および５で示す通り、ＤＮＡサンプルをハイブリダイゼーションユニットの片側に移動させてウェルのキャップを閉じる。これによって、ウェルに２つのＤＮＡサンプルが二重装入される可能性が最小限になる。さらに、キャップを閉じることにより、使用者がＤＮＡサンプルを移動するための適切なウェルを正しく見定めるのを助けることになる。ウェルのキャップを閉じた後、ハイブリダイゼーションユニットを振ることによってウェルの中身を混合することが可能である。
【００７０】
図１８ｃを参照すると、本実施例において水槽を使用する順序が示されている。区画１に示す通り、試薬をハイブリダイゼーションウェルに装入した後、使用者がハイブリダイゼーションユニットを変性用水槽に入れる。ハイブリダイゼーション用水槽の温度は、試験／パネルに固有である。さらに、ハイブリダイゼーションの時間的要件および時間的許容範囲も、試験／パネルに固有である。通常、変性用水槽は９５℃である。さらに、通常は１〜２分後に、使用者がトングを用いてハイブリダイゼーションユニットを変性用水槽からハイブリダイゼーション用水槽に移動させる。先に述べた通り、ハイブリダイゼーションユニットは空気を捕捉するためのポケット６４を備えている。このようにして、ハイブリダイゼーションユニットは浮揚し、取り扱いがより容易になる。区画２で示す通り、変性用水槽からハイブリダイゼーションユニットを取り出した後、使用者はハイブリダイゼーションユニットをハイブリダイゼーション用水槽に入れる。通常、ハイブリダイゼーション用水槽は３０〜５０℃であり、ハイブリダイゼーションはこの水槽の中で１０〜６０分間保持される。区画３で示す通り、ハイブリダイゼーション用水槽からハイブリダイゼーションユニットを取り出した後、ウェルを洗浄液で洗い流す。具体的には、使用者はウェルのキャップを開けてユニットを噴水式洗浄器に入れる。噴水式洗浄器は、ハイブリダイゼーションユニットを同洗浄器に入れるとスイッチが入り、ウェルに洗浄液を吹きつけてウェルのＤＮＡおよびハイブリダイゼーション溶液をすすぐ。洗浄液は通常２０〜２５℃であり、ウェルの洗浄は３０秒間実施される。
【００７１】
図１８ｄを参照すると、この実施例におけるハイブリダイゼーション浴の準備が示されている。使用者は、噴水式洗浄器および４種の洗浄用水槽を適切な溶液で満たせばよい。例えば、噴水式洗浄器には洗浄液を入れることが可能である。洗浄用水槽には洗浄液を入れればよい。シグナル増強用水槽にはシグナル増強液を入れればよい。増強停止用水槽には増強停止液を入れればよい。そして、純水用水槽には純水液を入れればよい。通常、シグナル増強液は４℃で保管される。洗浄液、増強停止液、および純水は室温で保管すればよい。さらに、噴水式洗浄器および洗浄用水槽は、１５０ｍＬの溶液が使用できるように設計するとよい。噴水式洗浄器は一度に１枚のスライドを処理することが可能である。それに対し、各洗浄用水槽は一度に６枚までのスライドを入れておくことが可能である。
【００７２】
図１８ｅを参照すると、この実施例におけるスライドのハイブリダイゼーション用水槽が示されている。水槽１を用いた噴水式洗浄器中での洗浄すすぎが完了した後、使用者はハイブリダイゼーションユニットを開け、スライドの入った担体ホルダを取り出すことが可能である。担体ホルダ（スライド入り）は、他の担体ホルダの上に積み重ねることが可能であり、満たされた洗浄液用水槽２の中に置かれたキャリアに直ちに挿入することが可能である。あるいは、スライドを担体ホルダから取り出して、１つ１つまたはキャリアを用いて他のスライドと共に処理することが可能である。スライドは、洗浄液用水槽２の中に少なくとも３０秒留めるべきである。しかし、スライドを洗浄液用水槽２の中にもっと長時間置くことも可能である。洗浄液用水槽２は回収バッファーの役割をし、その試験作業におけるすべてのスライド（例えば、最大で６個まで）が洗浄液用水槽２の中に置かれたスライドキャリアに挿入されるまで、各スライドを回収する。使用者は、最後のスライドが洗浄液用水槽２の中のキャリアに入れられてから、少なくとも３０秒間待つ。これ以
降のスライドの並行処理（水槽３、４、および５を使用する）は、別の試験から続くものであってもよい。
【００７３】
使用者は、スライドの入った担体ホルダを積み重ねたものを、洗浄液用水槽２からシグナル増強用水槽３へ移動することが可能である。すべてのスライドの入ったキャリアを、シグナル増強用水槽３中に１０分間置けばよい。次いで、使用者はキャリアをシグナル増強用水槽３から増強停止用水槽４へ移動させればよい。３０秒後、使用者はキャリアを増強停止用水槽４から純水用水槽５へ移動させればよい。その後、以下の図に示す通り、使用者が１度に１枚のスライドを取り出し、これを遠心して脱水する間、キャリアを純水用水槽中に置いておくことが可能である。
【００７４】
その後、スライドを乾燥させればよい。スライドを、遠心脱水機にかけることが可能である。スライドを、ある一定の時間（例えば１５秒）脱水させればよい。図１８ｆを参照すると、脱水の終了後、それだけには限らないが、試験の種類および記録保管のための固有の通し番号の入力など、スライドに関する情報を得ることが可能なバーコード用スキャナを用いて、スライドのバーコードを読み取る（スキャンする）ことが可能である。イメージングシステムが、記録保管のために使用者に彼／彼女の名札の彼／彼女のバーコードを読み取るように促すことが可能である。さらに、イメージングシステムが使用者にスライドを装填するように指示し、次いでウェル１中のＤＮＡの内容について患者の識別情報を読み取りまたは入力するように促すことも可能である。患者の識別情報は様々な方法で入力することができる。ある入力方法は、バーコードおよびバーコードリーダーを介するものである。別の方法は、イメージングシステム上のテンキーを使用する手入力によるものである。ウェル１についての患者ＩＤの読み取りにより、イメージングシステムがビープ音を伴って使用者に情報をフィードバックし、読み取った情報を画面上にフィードバックするようにさせることが可能である。使用者が適切な読み取りであることを検証できる適切な長さの時間の後、イメージングシステムが使用者にスライド上の他のウェル（ウェル２、ウェル３、．．．およびウェル８など）について患者の識別情報を読み取るよう促すことが可能である。イメージングシステムは、患者の読み取りと並行して、スライド上の試験結果を自動的に処理することが可能である。そのため、使用者が患者の識別情報の入力を完了するときまでに、イメージングシステムがスライドの読み取りを実施して分析を完了している可能性がある。イメージングシステムは、作業者の識別情報および患者の識別情報を、試験結果、試験時間、試験日、通し番号などと相関させたレポート（例えば、印刷された形態で）を使用者に提供することも可能である。イメージングシステムは、印刷されたレポートに加えて（あるいは、印刷されたレポートの代わりに）、電子的なレポートを提供することも可能である。その後、使用者はスライドを標準的なスライドボックスに入れ、純水用水槽中に置かれたキャリアから第２のスライドを取り出して脱水し、イメージングすることが可能である。
【００７５】
したがって、本発明の設計は、以下の機能、すなわち：空間的マッピングおよび作業手順を最小限にすること；独立した混合容器がなくても済むようにすること；加熱による流体損失を最小限にするための閉じられた環境を提供すること；スライド上の複数の試験領域を分離し密閉すること；担体を不慮の破壊から保護すること；使用者による取り扱いを容易にすること；各試験を個別に操作する際の誤りを最小限にすること；迅速な温度変化を可能にすること；流体を１つの領域に集めるための遠心分離の必要性を排除すること；光を遮断することによってシグナル増幅を促進すること；ならびに、γ線または電子線で滅菌すること、のうちの１つ、いくつか、またはすべてを可能にするものである。
【００７６】
本発明の現時点で好ましいある種の実施形態について本明細書で述べてきたが、本発明の趣旨および範囲を逸脱することなく、記述した実施形態の変形および改変を行うことが可能であることは、本発明に関わる技術分野の技術者には明らかであろう。
【図面の簡単な説明】
【００７７】
【図１】プローブを含有する複数の領域を備えた担体の上面図。
【図２ａ】担体ホルダの斜視図。
【図２ｂ】担体を保持している図２ａの担体ホルダの上面図。
【図２ｃ】図２ａの担体ホルダの取り付け具の斜視図。
【図２ｄ】担体を保持している担体ホルダの一方の端部の斜視図。
【図３ａ】ガスケットの上方から見た斜視図。
【図３ｂ】ガスケットの底面から見た斜視図。
【図３ｃ】ガスケットの断面図。
【図４ａ】カバーの１実施形態の上方から見た斜視図。
【図４ｂ】図４ａのカバーの１実施形態の底面から見た斜視図。
【図５】ガスケットの開口部を密閉するための、図４ａのカバーと組み合わせて使用される表面封止部品の斜視図。
【図６ａ】担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品の斜視図。
【図６ｂ】担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品について、該装置の一方の端部の断面とともに示した斜視図。
【図６ｃ】担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品の断面図。
【図７ａ】担体および担体ホルダ、ガスケット、図４ａのカバー、ならびに図５ｂの細長キャップの分解組立図。
【図７ｂ】担体および担体ホルダ、ガスケット、図４ａのカバー、ならびに図５ｂの細長キャップの斜視図。
【図８ａ】担体および担体ホルダ、ガスケット、および図４ｂのカバーの分解組立図。
【図８ｂ】担体および担体ホルダ、ガスケット、および図４ｂのカバーの斜視図。
【図８ｃ】ガスケットおよび図４ｂのカバーの斜視図。
【図９ａ】ハイブリダイゼーション装置の片側から見た１実施形態の斜視図。
【図９ｂ】図９ａに示したハイブリダイゼーション装置の反対側から見た斜視図。
【図１０ａ】担体を係合しているハイブリダイゼーション装置の１実施形態の、ハイブリダイゼーションチャンバの開口部が密閉されていない状態の斜視図。
【図１０ｂ】担体を係合しているハイブリダイゼーション装置の反対側から見た代替実施形態の、ハイブリダイゼーションチャンバの開口部が密閉されていない状態の斜視図。
【図１１】担体を係合しているハイブリダイゼーション装置の１実施形態の、ハイブリダイゼーションチャンバのいくつかの開口部が密閉されている状態の斜視図。
【図１２】担体を係合しているハイブリダイゼーション装置の別の実施形態の、独立した締め付けデバイスが備え付けられた状態の斜視図。
【図１３】担体を係合しているハイブリダイゼーション装置の１実施形態の、ハイブリダイゼーションチャンバのすべての開口部が共通のタブを備えたキャップによって密閉されている状態の斜視図。
【図１４ａ】担体、ハイブリダイゼーションチャンバの１実施形態、および開口部の断面図。
【図１４ｂ】担体、ハイブリダイゼーションチャンバの１実施形態、開口部、および突出部の断面図。
【図１４ｃ】担体、ならびに複数のハイブリダイゼーションチャンバ、担体、開口部、および突出部の断面図。
【図１５ａ】担体、ハイブリダイゼーションチャンバの別の実施形態、および開口部の断面図。
【図１５ｂ】担体、ハイブリダイゼーションチャンバの別の実施形態、開口部、および突出部の断面図。
【図１５ｃ】担体、ならびに複数のハイブリダイゼーションチャンバ、担体、開口部、および突出部の断面図。
【図１６】図１２に示した締め付けデバイスの斜視図。
【図１７ａ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する処理工程と従来技術の処理工程を比較するフローチャート。
【図１７ｂ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する処理工程と従来技術の処理工程を比較するフローチャート。
【図１７ｃ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する処理工程と従来技術の処理工程を比較するフローチャート。
【図１７ｄ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する処理工程と従来技術の処理工程を比較するフローチャート。
【図１８ａ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する１処理工程のフローチャート。
【図１８ｂ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する１処理工程のフローチャート。
【図１８ｃ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する１処理工程のフローチャート。
【図１８ｄ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する１処理工程のフローチャート。
【図１８ｅ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する１処理工程のフローチャート。
【図１８ｆ】ハイブリダイゼーションチャンバを使用する１処理工程のフローチャート。
【図１】
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【図２ａ】
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【図２ｂ】
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【図２ｃ】
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【図２ｄ】
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【図３ａ】
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【図３ｂ】
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【図３ｃ】
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【図４ａ】
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【図４ｂ】
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【図５】
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【図６ａ】
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【図６ｂ】
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【図６ｃ】
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【図７ａ】
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【図７ｂ】
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【図８ａ】
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【図８ｂ】
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【図８ｃ】
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【図９ａ】
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【図９ｂ】
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【図１０ａ】
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【図１０ｂ】
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【図１１】
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【図１２】
2005515773.tif 000027
【図１３】
2005515773.tif 000028
【図１４ａ】
2005515773.tif 000029
【図１４ｂ】
2005515773.tif 000030
【図１４ｃ】
2005515773.tif 000031
【図１５ａ】
2005515773.tif 000032
【図１５ｂ】
2005515773.tif 000033
【図１５ｃ】
2005515773.tif 000034
【図１６】
2005515773.tif 000035
【図１７ａ】
2005515773.tif 000036
【図１７ｂ】
2005515773.tif 000037
【図１７ｃ】
2005515773.tif 000038
【図１７ｄ】
2005515773.tif 000039
【図１８ａ】
2005515773.tif 000040
【図１８ｂ】
2005515773.tif 000041
【図１８ｃ】
2005515773.tif 000042
【図１８ｄ】
2005515773.tif 000043
【図１８ｅ】
2005515773.tif 000044
【図１８ｆ】
2005515773.tif 000045
【手続補正書】
【提出日】平成15年5月7日(2003.5.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３８】
別の態様では、ガスケット６２と担体２０との接触領域は、チャンバからの漏れを減らす。漏れを減らすために、ガスケット６２が、図３ｂおよび３ｃに示す通り圧縮リブ７６を含んでもよい。圧縮リブ７６は担体２０と接触して領域２２の外周に密閉をなす。圧縮リブ７６は、成形された表面であり得る。例えば、圧縮リブ７６は、最底部８０へと達する傾斜部７８を含んでもよい。最底部８０は、とがった先端、丸みのあるへり、または平らな表面の形であり得る。最底部８０は担体に押しつけられると変形し、それによって密閉がなされる。さらに、図３ｃに示す通り、空隙８２が最底部８０とハイブリダイゼーションチャンバの間にあってもよい。この空隙８２は、湾曲部分によって形成され得る。空隙８２は、相互汚染の可能性を低下させる。液体がハイブリダイゼーションチャンバから漏れた場合、同液体が空隙８２に捕捉され、隣接するハイブリダイゼーションチャンバへと移動せず、これにより相互汚染が避けられる可能性がある。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３９】
上で述べた通り、剛性部材は、少なくとも部分的に柔軟な部材（ガスケット６２など）と組み合わせて使用され得る。剛性部材の１例を、カバー８６の１実施形態の上面および底面から見た斜視図として図４ａおよび４ｂに示す。後に述べる通り、剛性部材の別の実施形態を、例えば１４０として図９ａに示す。上で述べた通り、カバー８６は、担体２０または（担体２０を保持する）担体ホルダ３０に、恒久的または一時的に連結され得る。この連結によって、カバー８６がガスケット６２に圧力をかけて担体２０とともに密閉をなすことが可能となる。ガスケット６２に圧力をかけて密閉をなすために、カバー８６を担体ホルダ３０に一時的に連結してもよい。一時的な連結の１つの方式は、カバー８６のスロット８８による。スロット８８は、担体ホルダ３０の補強条片４２と係合することが可能である。担体ホルダ３０へのカバー８６の連結の他の方式には、締め付け具が含まれる。あるいは、担体ホルダが、図９ａおよび９ｂに示されるように、例えば蝶番を介する
２つの部品の連結などによって担体ホルダ３０により恒久的に連結されてもよい。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４５】
図６ａを参照すると、担体、担体ホルダ、ガスケットおよび図４ａのカバー、ならびに表面封止部品の斜視図が示されている。担体２０は、担体保持スナップ４５を用いて担体ホルダ３０に取り付けられている。図６ａに示す通り、担体２０は担体保持スナップ４７の一番上の歯４９に差し入れられる。さらに、担体２０は可撓性の取り付け具４６および取り付け具３８によって保持される。さらに、カバー８６は補強条片４２を介して担体ホルダ３０に取り付けられる。図６ａは、開口部６８を密閉するキャップ１００をさらに示す。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４７】
図６ｂおよび６ｃは、ガスケット６２とカバー８６との間の空隙１２４も示している。ハイブリダイゼーションチャンバ間の流体の漏れは、望ましくない可能性がある。漏れは、ハイブリダイゼーションチャンバ内の圧力が高くなり過ぎたときに起こり得る。圧力は、例えば高温が原因で生じる可能性がある。圧力を低下させるために、図６ｂに示すようにガスケット６２とカバー８６との間に空隙またはギャップ１２４を形成する。ギャップ１２４は完全に囲まれていてもよいし、側壁６４などガスケット６２の少なくとも一部分について、ガスケット６２がカバー８６と隣り合わないようにされてもよい。例えば、担体２０および／またはドーム型部分７５に対して垂直な縦部分７３など側壁の一部分は、これに隣接するギャップ１２４を有することが可能である。このように、ハイブリダイゼーションチャンバ内で圧力が上がると、ガスケット６２（側壁６４など）の柔軟部材は、カバー８６の剛性部材に向かって、矢印の方向へ、外向きに動くことが可能である。このように、柔軟なガスケット部材は、圧力下で外向きに拡張することが可能であり、高圧力下での漏れの可能性を低下させる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４８】
図７ａおよび７ｂを参照すると、担体および担体ホルダ、ガスケット、図４ａのカバー、ならびに図５ｂの細長キャップの分解組立図および斜視図が示されている。組み立てに際し、ガスケット６２をカバー８６に挿入することが可能である。その後、ガスケット６２、カバー（表面封止部品や細長キャップなどの密閉機構を有する）の組み合わせを、担体ホルダ３０（担体２０が入っている）に連結することが可能である。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
図９ａおよび９ｂを参照すると、開いた状態のハイブリダイゼーション装置の別の実施形態の斜視図が示されている。ハイブリダイゼーション装置１３０は、蝶番１３６で連結された２つの主要な部分１３２、１３４を含みうる。上で述べた通り、これらの２つの部分は蝶番で連結されている必要はない（カバー８６、およびガスケット６２は、担体ホルダ３０と締め付け具またはプレス嵌めを介して連結される）。第１の部分１３２は、柔軟部材１３８および剛性部材１４０を含む。ガスケット６２と同様、柔軟部材１３８は天然または合成エラストマーで構成可能であり、後により詳細に述べる通り、担体とともに密閉をなすために使用される。剛性部材１４０は、ナイロン（ガラスまたは非ガラス入り）、ポリプロピレン、またはポリカーボネートなどのプラスチック材料で構成され得る。柔軟部材１３８は、剛性部材１４０の一部分にプレス嵌めされても一体成形されてもよい。あるいは、柔軟部材１３８は剛性部材１４０に接着されてもよい。第２の部分１３４は、剛性部材１４２を含んでもよい。剛性部材１４２は、剛性部材１４０と同じ材料で構成されてもよいし、あるいは異なる材料で構成されてもよい。第１の部分１３２と第２の部分１３４はいずれも穴１４４、１４６を備えうる。図１０ａに示す通り、ハイブリダイゼーション装置１３０を閉じるとき、穴１４４を用いてハイブリダイゼーション装置をより容易に支えることが可能である。さらに、ハイブリダイゼーション装置１３０内の担体のエッジ（縁部）を、穴１４４、１４６を用いてより容易に調べることが可能である。例えば、担体２０のエッジの近くのバーコードをバーコードリーダーで読み、担体に結合しているプローブまたは実施すべき試験を判定することが可能である。第１の部分１３２および第２の部分１３４は、スレート１４８をさらに含んでもよい。スレート１４８は、ハイブリダイゼーション装置を閉じた後に、ハイブリダイゼーション装置１３０の剛性のための付加構造を提供する。スレートの間隔は一定でもよいし（図９ａに示す通り）、間隔が一定でなくてもよい。さらに、スレート１４８は、第１の部分１３２、第２の部分１３４、あるいは第１の１３２と第２の部分１３４の両方（図９ａに示す通り）の上に存在し得る。
【手続補正７】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】全図
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１】
2005515773.tif 000046
【図２ａ】
2005515773.tif 000047
【図２ｂ】
2005515773.tif 000048
【図２ｃ】
2005515773.tif 000049
【図２ｄ】
2005515773.tif 000050
【図３ａ】
2005515773.tif 000051
【図３ｂ】
2005515773.tif 000052
【図３ｃ】
2005515773.tif 000053
【図４ａ】
2005515773.tif 000054
【図４ｂ】
2005515773.tif 000055
【図５】
2005515773.tif 000056
【図６ａ】
2005515773.tif 000057
【図６ｂ】
2005515773.tif 000058
【図６ｃ】
2005515773.tif 000059
【図７ａ】
2005515773.tif 000060
【図７ｂ】
2005515773.tif 000061
【図８ａ】
2005515773.tif 000062
【図８ｂ】
2005515773.tif 000063
【図８ｃ】
2005515773.tif 000064
【図９ａ】
2005515773.tif 000065
【図９ｂ】
2005515773.tif 000066
【図１０ａ】
2005515773.tif 000067
【図１０ｂ】
2005515773.tif 000068
【図１１】
2005515773.tif 000069
【図１２】
2005515773.tif 000070
【図１３】
2005515773.tif 000071
【図１４ａ】
2005515773.tif 000072
【図１４ｂ】
2005515773.tif 000073
【図１４ｃ】
2005515773.tif 000074
【図１５ａ】
2005515773.tif 000075
【図１５ｂ】
2005515773.tif 000076
【図１５ｃ】
2005515773.tif 000077
【図１６】
2005515773.tif 000078
【図１７ａ】
2005515773.tif 000079
【図１７ｂ】
2005515773.tif 000080
【図１７ｃ】
2005515773.tif 000081
【図１７ｄ】
2005515773.tif 000082
【図１８ａ】
2005515773.tif 000083
【図１８ｂ】
2005515773.tif 000084
【図１８ｃ】
2005515773.tif 000085
【図１８ｄ】
2005515773.tif 000086
【図１８ｅ】
2005515773.tif 000087
【図１８ｆ】
2005515773.tif 000088
【国際調査報告】
2005515773.tif 000089