【手続補正書】
【提出日】令和1年11月26日(2019.11.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）クラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）の血清型に発現される同じ外膜タンパク質（ＭＯＭＰ）の１つ又は複数の表面露出断片を含むアミノ酸配列；及び
ｂ）ａ）に定義したのと同じ配列か、又はａ）の前記血清型とは異なるクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）の血清型に発現される前記外膜タンパク質の変異型由来の対応する表面露出断片の何れかである、２つ以上の別のアミノ酸配列
を含むポリペプチドであって、前記外膜タンパク質が任意の血清型由来のＭＯＭＰであり、前記ポリペプチドがＭＯＭＰの可変ドメイン１、２、３、４の１つ又は複数を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項２】
請求項１に記載のポリペプチドにおいて、３つ以上の異なるアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列が各々、様々なクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）血清型によって異なる、同じＭＯＭＰの様々な変異型からの１つ又は複数の表面露出断片を含み、前記アミノ酸配列が、異なるクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）血清型に由来することを特徴とするポリペプチド。
【請求項３】
請求項１に記載のポリペプチドにおいて、アミノ酸配列の３回以上の反復を含み、前記アミノ酸配列が、様々なクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）血清型によって異なる、同じＭＯＭＰの１つ又は複数の表面露出断片を含み、前記アミノ酸配列が、同じクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）血清型に由来することを特徴とするポリペプチド。
【請求項４】
請求項１乃至３の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、前記外膜タンパク質が、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の血清型Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｇ、ＩａまたはＪ由来のＭＯＭＰであることを特徴とするポリペプチド。
【請求項５】
請求項１乃至４の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、前記アミノ酸配列が、直線化されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項６】
請求項４又は５に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン４（ＶＤ４）を含む前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項７】
請求項６に記載のポリペプチドにおいて、式Ｉ：
ｘｘ１−ＶＤ４−ｘｘ２  （式Ｉ）
（式中、
ＶＤ４は、配列番号１５〜２０又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｘｘ１は、
ｉ）アミノ酸配列
ＥＷＱＡＳＬＡＬＳＹＲＬＮＭＦＴＰＹＩＧＶＫＷＳＲＡＳＦＤＡＤＴＩＲＩＡＱＰＫ（配列番号２１）、又は
ｉｉ）ｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜３８個のアミノ酸残基を含み、ｉ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＫで開始するサブ配列
から構成され、
ｘｘ２は、
ｉｉｉ）アミノ酸配列
ＤＴＭＱＩＶＳＬＱＬＮＫＭＫＳＲＫＳＣＧＩＡＶＧＴＴＩＶＤＡ（配列番号２２）、又は
ｖｉ）ｉｉｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２９個のアミノ酸残基を含み、ｉｉｉ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＤで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項８】
請求項１乃至７の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン１（ＶＤ１）を含む断片をさらに含み、ＭＯＭＰのＶＤ１を含む前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項９】
請求項８に記載のポリペプチドにおいて、式ＩＩ：
ｙｙ１−ＶＤ１−ｙｙ２  （式ＩＩ）
（式中、
ＶＤ１は、配列番号１〜６又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｙｙ１は、
ｖ）アミノ酸配列
ＤＡＩＳＭＲＶＧＹＹＧＤＦＶＦＤＲＶＬＫＴＤＶＮＫＥＦＱＭＧ（配列番号７）、又は
ｖｉ）ｖ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜３０個のアミノ酸残基を含み、ｖ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＧで開始するサブ配列
から構成され、
ｙｙ２は、
ｖｉｉ）アミノ酸配列
ＮＰＡＹＧＲＨＭＱＤＡＥＭＦＴＮＡＡ（配列番号８）、又は
ｖｉｉｉ）ｖｉｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜１８個のアミノ酸残基を含み、ｖｉｉ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＮで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１０】
請求項６乃至９の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、前記配列が、配列番号９〜１４、２３〜２８、４５〜５９、６９又は７０から選択されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１１】
請求項１乃至１０の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン２（ＶＤ２）を含む断片をさらに含み、前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１２】
請求項１１に記載のポリペプチドにおいて、式ＩＩＩ：
ｚｚ１−ＶＤ２−ｚｚ２  （式ＩＩＩ）
（式中、
ＶＤ２は、配列番号２９〜３４又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｚｚ１は、
ｉｘ）アミノ酸配列
ＴＬＧＡＴＳＧＹＬＫＧＮＳＡＳＦＮＬＶＧＬＦＧ（配列番号３５）、又は
ｘ）ｉｘ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２３個のアミノ酸残基を含み、ｉｘ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＧで開始するサブ配列
から構成され、
ｚｚ２は、
ｘｉ）アミノ酸配列
ＶＶＥＬＹＴＤＴＴＦＡＷＳＶＧＡＲＡＡＬＷＥ（配列番号３６）、又は
ｘｉｉ）ｘｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２２個のアミノ酸残基を含み、ｘｉ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＶで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１３】
請求項１乃至１２の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン３（ＶＤ３）を含む断片をさらに含み、ＭＯＭＰのＶＤ３を含む前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１４】
請求項１３に記載のポリペプチドにおいて、式ＩＶ：
ｑｑ１−ＶＤ３−ｑｑ２  （式ＩＶ）
（式中、
ＶＤ３は、配列番号３７〜４２又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｑｑ１は、
ｘｉｉｉ）アミノ酸配列
ＡＴＬＧＡＳＦＱＹＡＱＳＫＰＫＶＥＥＬＮＶＬＣＮＡＡＥＦＴＩＮＫＰＫＧＹＶＧ（配列番号４３）、又は
ｘｉｖ）ｘｉｉｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２２個のアミノ酸残基を含み、ｘｉｉｉ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＧで開始するサブ配列
から構成され、
ｑｑ２は、
ｘｖ）アミノ酸配列
ＴＧＴＫＤＡＳＩＤＹＨＥＷＱＡＳＬＡＬＳＹＲＬＮＭＦＴＰＹＩＧＶＫＷＳ（配列番号４４）、又は
ｘｖｉ）ｘｖ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜３５個のアミノ酸残基を含み、ｘｖ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＴで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１５】
請求項１乃至１４の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、組み換えにより生成された場合に前記ポリペプチドの輸送を促進する部分（例えば、シグナルペプチド）、前記融合タンパク質の精製を容易にする部分（例えば、ｈｉｓタグ）及び／又は免疫原性を増強する部分（例えば、Ｔ細胞抗原）をさらに含み、免疫原性のエンハンサーが、ＣＴ０４３、ＣＴ００４、ＣＴ４１４、ＣＴ６８１又はその部分などのＣｔ抗原から選択される別のＴ細胞標的であることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１６】
請求項１５に記載のポリペプチドにおいて、前記配列が、配列番号６０〜６８から選択されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１乃至１６の何れか１項に記載のポリペプチドを含む医薬組成物であって、薬理的に許容される担体、賦形剤、アジュバント又は免疫モジュレータをさらに含むことを特徴とする医薬組成物。
【請求項１８】
請求項１７に記載の医薬組成物において、前記アジュバントが、ＤＤＡ／ＴＤＢ又はミョウバンであることを特徴とする医薬組成物。
【請求項１９】
請求項１７に記載の医薬組成物において、前記担体が、ウイルス様粒子であることを特徴とする医薬組成物。
【請求項２０】
請求項１７乃至１９の何れか１項に記載の医薬組成物において、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）又は肺炎クラミジア（Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）による感染症を含むクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）感染症に対する予防又は治療に使用するためのものであることを特徴とする医薬組成物。