【手続補正書】
【提出日】令和2年6月22日(2020.6.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
クローディン６（ＣＬＤＮ６）に結合する人工Ｔ細胞受容体をコードする組換え核酸であって、前記人工Ｔ細胞受容体は、ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン、膜貫通ドメイン、およびＴ細胞シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
【請求項２】
前記人工Ｔ細胞受容体は、ＣＬＤＮ６抗体の一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）を含む少なくとも１つの結合ドメインを含む、請求項１に記載の組換え核酸。
【請求項３】
前記人工Ｔ細胞受容体は、二重特異性または多重特異性である、請求項２に記載の組換え核酸。
【請求項４】
前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、ＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの重鎖の可変領域（ＶＨ）（ＶＨ（ＣＬＤＮ６））、およびＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの軽鎖の可変領域（ＶＬ）（ＶＬ（ＣＬＤＮ６））を含む、請求項１〜３のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項５】
前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、
（ａ）配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列の相補性決定領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）、および
（ｂ）配列番号：３３、３８または３９によって表されるアミノ酸配列の相補性決定領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）、
を含む、請求項１〜４のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項６】
前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号３２によって表されるアミノ酸配列の相補性決定領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）、および配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列の相補性決定領域ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含む、請求項１〜５のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項７】
前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインは、配列番号：４０によって表されるアミノ酸配列を含む、請求項１〜６のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項８】
膜貫通ドメイン、Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン、および必要に応じて、新生タンパク質を小胞体内に向かわせるシグナルペプチドを含む、請求項１〜７のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項９】
前記Ｔ細胞シグナル伝達ドメインは、ＣＤ３−ζ、好ましくはＣＤ３−ζのエンドドメインを、場合によりＣＤ２８と組み合わせて含む、請求項８に記載の組換え核酸。
【請求項１０】
構造：
ＮＨ２−シグナルペプチド−ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン−スペーサー領域−膜貫通ドメイン−Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン−ＣＯＯＨ
を含む、請求項１〜９のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項１１】
配列番号：４６に従うアミノ酸配列を含む、請求項１〜１０のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項１２】
ＤＮＡまたはＲＮＡである、請求項１〜１１のいずれかに記載の組換え核酸。
【請求項１３】
自己複製ＲＮＡ、またはウイルスＤＮＡもしくはウイルスＲＮＡである、請求項１２に記載の組換え核酸。
【請求項１４】
請求項１〜１３のいずれかに記載の核酸を含むベクター。
【請求項１５】
プラスミドベクター、コスミドベクター、ファージベクター、人工染色体ベクター、ウイルスベクター、またはトランスポゾンベースのシステムである、請求項１４に記載のベクター。
【請求項１６】
レトロウイルスベクターまたはアルファウイルスベクターである、請求項１５に記載のベクター。
【請求項１７】
請求項１〜１３のいずれかに記載の組換え核酸、または請求項１４〜１６のいずれかに記載のベクターを含む、組換え細胞。
【請求項１８】
Ｔ細胞である、請求項１７に記載の組換え細胞。
【請求項１９】
請求項１〜１３のいずれかに記載の組換え核酸、請求項１４〜１６のいずれかに記載のベクター、または請求項１７または１８に記載の組換え細胞を含む、組成物。
【請求項２０】
前記組換え核酸は、裸であるか、またはリポソーム、ウイルス粒子もしくは細胞中に含まれる、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
医薬的に許容される担体を含む医薬組成物である、請求項１９または２０に記載の組成物。
【請求項２２】
Ｔ細胞を、請求項１〜１３のいずれかに記載の組換え核酸、または請求項１４〜１６のいずれかに記載のベクターでトランスフェクトまたは形質導入する工程を含む、免疫反応性細胞を作製するインビトロ方法。
【請求項２３】
ＣＬＤＮ６を発現する癌細胞により特徴付けられる癌疾患を処置または予防するための医薬の調製のための、請求項１〜１３のいずれかに記載の組換え核酸、請求項１４〜１６のいずれかに記載のベクター、または請求項１７または１８に記載の組換え細胞の使用。
【請求項２４】
ＣＬＤＮ６を発現する細胞に対する免疫応答を誘導するための医薬の調製のための、請求項１〜１３のいずれかに記載の組換え核酸、請求項１４〜１６のいずれかに記載のベクター、または請求項１７または１８に記載の組換え細胞の使用。
【請求項２５】
Ｔ細胞と、配列番号：１または２に従うアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸とインビトロで接触させる工程を含む、Ｔ細胞を刺激する、プライミングするおよび／または増殖させる方法であって、前記Ｔ細胞は、請求項１〜１３のいずれかに記載の組換え核酸、または請求項１４〜１６のいずれかに記載のベクターを含む、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３６４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３６４】
本発明を以下の図面および実施例によって詳細に説明するが、これらは説明のためにのみ使用され、限定を意図されない。説明および実施例により、同様に本発明に包含されるさらなる実施形態が当業者により理解可能である。
以下、実施形態の例を付記する。
１．  配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体を含むペプチド。
２．  １００以下、５０以下、２０以下または１０以下のアミノ酸長である、１．に記載のペプチド。
３．  配列番号：３、４および５から成る群より選択されるアミノ酸配列または前記アミノ酸配列の変異体から成る、１．または２．に記載のペプチド。
４．  １．から３．のいずれかに記載のペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
５．  組換え核酸である、４．に記載の核酸。
６．  ４．または５．に記載の核酸を含む細胞。
７．  １．から３．のいずれかに記載のペプチドまたはそのプロセシング産物を提示する細胞。
８．  １．から３．のいずれかに記載のペプチドと反応性である免疫反応性細胞。
９．  場合によりＭＨＣ分子との複合体中で、１．に記載のペプチドに結合する結合物質。
１０．  場合によりＭＨＣ分子との複合体中で、１．に記載のペプチドに結合し、および好ましくは前記ペプチドと反応性であるＴ細胞受容体、または前記Ｔ細胞受容体のポリペプチド鎖。
１１．  Ｔ細胞受容体α鎖または前記Ｔ細胞受容体α鎖を含むＴ細胞受容体であって、ここで前記Ｔ細胞受容体α鎖が、
（ｉ）配列番号：６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択されるＴ細胞受容体α鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、ならびに
（ｉｉ）配列番号：６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択されるＴ細胞受容体α鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体α鎖
から成る群より選択される、Ｔ細胞受容体α鎖または前記Ｔ細胞受容体α鎖を含むＴ細胞受容体。
１２．  Ｔ細胞受容体β鎖または前記Ｔ細胞受容体β鎖を含むＴ細胞受容体であって、ここで前記Ｔ細胞受容体β鎖が、
（ｉ）配列番号：７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７および２９から成る群より選択されるＴ細胞受容体β鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖、ならびに
（ｉｉ）配列番号：７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７および２９から成る群より選択されるＴ細胞受容体β鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体β鎖
から成る群より選択される、Ｔ細胞受容体β鎖または前記Ｔ細胞受容体β鎖を含むＴ細胞受容体。
１３．  （Ｉ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体α鎖、および
（ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖またはその変異体のＣＤＲ配列の少なくとも１つ、好ましくは２つ、より好ましくは３つ全部を含むＴ細胞受容体β鎖
［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
を含むＴ細胞受容体、ならびに
（ＩＩ）（ｉ）配列番号：ｘのＴ細胞受容体α鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体α鎖、および
（ｉｉ）配列番号：ｘ＋１のＴ細胞受容体β鎖配列もしくはそのフラグメント、または前記配列もしくはフラグメントの変異体を含むＴ細胞受容体β鎖
［ここでｘは、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６および２８から成る群より選択される］
を含むＴ細胞受容体
から成る群より選択されるＴ細胞受容体。
１４．  クローディン６（ＣＬＤＮ６）に結合する人工Ｔ細胞受容体。
１５．  ＣＬＤＮ６の細胞外ドメインに結合する、１４．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
１６．  前記結合が特異的結合である、１４．または１５．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
１７．  ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを含む、１４．から１６．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
１８．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、前記人工Ｔ細胞受容体のエキソドメインに含まれる、１７．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
１９．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、ＣＬＤＮ６抗体の一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）を含む、１７．または１８．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
２０．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、ＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの重鎖の可変領域（ＶＨ）（ＶＨ（ＣＬＤＮ６））およびＣＬＤＮ６に特異性を有する免疫グロブリンの軽鎖の可変領域（ＶＬ）（ＶＬ（ＣＬＤＮ６））を含む、１７．から１９．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２１．  前記重鎖可変領域（ＶＨ）と対応する軽鎖可変領域（ＶＬ）がペプチドリンカーによって、好ましくはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）３を含むペプチドリンカーによって連結されている、２０．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
２２．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）を含有する、１７．から２１．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２３．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３３、３８もしくは３９によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する、１７．から２２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２４．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：３２によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＨ（ＣＬＤＮ６）および配列番号：３９によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含むＶＬ（ＣＬＤＮ６）を含有する、１７．から２３．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２５．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインが、配列番号：４０によって表されるアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む、１７．から２４．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２６．  膜貫通ドメインを含む、１４．から２５．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２７．  Ｔ細胞シグナル伝達ドメインを含む、１４．から２６．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
２８．  前記Ｔ細胞シグナル伝達ドメインが、場合によりＣＤ２８と組み合わせて、ＣＤ３−ζ、好ましくはＣＤ３−ζのエンドドメインを含む、２７．に記載の人工Ｔ細胞受容体。
２９．  新生タンパク質を小胞体内に向かわせるシグナルペプチドを含む、１４．から２８．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３０．  前記ＣＬＤＮ６に対する結合ドメインを前記膜貫通ドメインに連結するスペーサー領域を含む、１４．から２９．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３１．  構造：
ＮＨ２−シグナルペプチド−ＣＬＤＮ６に対する結合ドメイン−スペーサー領域−膜貫通ドメイン−Ｔ細胞シグナル伝達ドメイン−ＣＯＯＨ
を含む、１４．から３０．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３２．  配列番号：４６に従うアミノ酸配列もしくはそのフラグメント、または前記アミノ酸配列もしくはフラグメントの変異体を含む、１４．から３１．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
３３．  １０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードする、または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
３４．  １０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体を含む、および／または前記Ｔ細胞受容体鎖もしくはＴ細胞受容体をコードするまたは前記人工Ｔ細胞受容体をコードするヌクレオチド配列を含有する核酸を含む、細胞。
３５．  ３３．に記載の核酸でＴ細胞を形質導入する工程を含む、免疫反応性細胞を作製する方法。
３６．  （ｉ）１．から３．のいずれかに記載のペプチド、
（ｉｉ）４．、５．および３３．のいずれかに記載の核酸、
（ｉｉｉ）６．、７．および３５．のいずれかに記載の細胞、
（ｉｖ）８．に記載の免疫反応性細胞、
（ｖ）９．に記載の結合物質、
（ｖｉ）１０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体、ならびに
（ｖｉ）１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体
の１つ以上を含む医薬組成物。
３７．  医薬的に許容される担体をさらに含む、３６．に記載の医薬組成物。
３８．  ３６．または３７．に記載の医薬組成物を患者に投与することを含む、癌疾患を処置するまたは予防する方法。
３９．  治療法における使用、特に癌を処置するまたは予防するうえでの使用のための、１．から３．のいずれかに記載のペプチド、４．、５．および３３．のいずれかに記載の核酸、６．、７．および３５．のいずれかに記載の細胞、８．に記載の免疫反応性細胞、９．に記載の結合物質、１０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体、または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体。
４０．  被験体において免疫応答を誘導する方法であって、３６．に記載の医薬組成物を前記被験体に投与することを含む方法。
４１．  Ｔ細胞を、１．から３．のいずれかに記載のペプチド、４．もしくは５．に記載の核酸および／または６．もしくは７．に記載の細胞の１つ以上と接触させることを含む、Ｔ細胞を刺激する、プライミングするおよび／または増殖させる方法。
４２．  被験体において癌細胞を死滅させる方法であって、１．から３．のいずれかに記載のペプチド、４．、５．および３３．のいずれかに記載の核酸、６．、７．および３５．のいずれかに記載の細胞、８．に記載の免疫反応性細胞、９．に記載の結合物質、１０．から１３．のいずれかに記載のＴ細胞受容体、または１４．から３２．のいずれかに記載の人工Ｔ細胞受容体の治療有効量を前記被験体に提供する工程を含む方法。
４３．  被験体における免疫応答を判定する方法であって、前記被験体から単離した生物学的試料中で１．から３．のいずれかに記載のペプチドと反応性のＴ細胞を測定することを含む方法。