【手続補正書】
【提出日】令和2年9月18日(2020.9.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
融合タンパク質を発現している組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを植物生育環境へと導入すること、または、融合タンパク質を発現している組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを植物、植物種子、または植物もしくは植物種子の周辺域へと適用することを含む、病原体から植物を防御する方法であって、
ここで、前記融合タンパク質は：
病原体から植物を防御する少なくとも一つのタンパク質またはペプチド；および
標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片、ここで、これらは、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる、
を含有するものであり、
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、組換えバチルス・セレウスファミリーのメンバーのエキソスポリウムに物理的に付加されているものである、
方法。
【請求項２】
（ｉ）組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーおよび（ｉｉ）農学的に受容可能な担体を含む種子コーティング製剤でコーティングされた植物種子であって、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーは融合タンパク質を発現し、
前記融合タンパク質は：
病原体から植物を防御する少なくとも一つのタンパク質またはペプチド；および
標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片、ここで、これらは組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる、
を含有するものであり、
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムに物理的に付加されるものである、
植物種子。
【請求項３】
融合タンパク質を発現する組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであって、
前記融合タンパク質は：
病原体から植物を防御する少なくとも一つのタンパク質またはペプチド；および
標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片、ここで、これらは組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる、
を含有し、
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、組換えバチルス・セレウスファミリーのメンバーのエキソスポリウムに物理的に付加されるものである、
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項４】
融合タンパク質が：
（ａ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも８１％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する標的化配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は少なくとも９０％である、前記標的化配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｄ）配列番号１を含有する標的化配列；
（ｅ）配列番号２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｆ）配列番号３のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ｇ）配列番号３のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ｈ）配列番号３を含有する標的化配列；
（ｉ）配列番号４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｊ）配列番号５のアミノ酸１〜３８を含有する標的化配列；
（ｋ）配列番号５のアミノ酸２３〜３８を含有する標的化配列；
（ｌ）配列番号５を含有する標的化配列；
（ｍ）配列番号６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｎ）配列番号７のアミノ酸１〜２８を含有する標的化配列；
（ｏ）配列番号７のアミノ酸１３〜２８を含有する標的化配列；
（ｐ）配列番号７を含有する標的化配列；
（ｑ）配列番号８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｒ）配列番号９のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｓ）配列番号９のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｔ）配列番号９を含有する標的化配列；
（ｕ）配列番号１０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｖ）配列番号１１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｗ）配列番号１１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｘ）配列番号１１を含有する標的化配列；
（ｙ）配列番号１２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｚ）配列番号１３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａａ）配列番号１３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｂ）配列番号１３を含有する標的化配列；
（ａｃ）配列番号１４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｄ）配列番号１５のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ａｅ）配列番号１５のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ａｆ）配列番号１５を含有する標的化配列；
（ａｇ）配列番号１６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｈ）配列番号１７のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ａｉ）配列番号１７のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ａｊ）配列番号１７を含有する標的化配列；
（ａｋ）配列番号１８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｌ）配列番号１９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｍ）配列番号１９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｎ）配列番号１９を含有する標的化配列；
（ａｏ）配列番号２０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｐ）配列番号２１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｑ）配列番号２１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｒ）配列番号２１を含有する標的化配列；
（ａｓ）配列番号２２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｔ）配列番号２３のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｕ）配列番号２３のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｖ）配列番号２３を含有する標的化配列；
（ａｗ）配列番号２４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｘ）配列番号２５のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｙ）配列番号２５のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｚ）配列番号２５を含有する標的化配列；
（ｂａ）配列番号２６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｂ）配列番号２７のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｃ）配列番号２７のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｄ）配列番号２７を含有する標的化配列；
（ｂｅ）配列番号２８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｆ）配列番号２９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｇ）配列番号２９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｈ）配列番号２９を含有する標的化配列；
（ｂｉ）配列番号３０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｊ）配列番号３１のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｋ）配列番号３１のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｌ）配列番号３１を含有する標的化配列；
（ｂｍ）配列番号３２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｎ）配列番号３３のアミノ酸１〜１５を含有する標的化配列；
（ｂｏ）配列番号３３を含有する標的化配列；
（ｂｐ）配列番号３４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｑ）配列番号３５のアミノ酸１〜１６を含有する標的化配列；
（ｂｒ）配列番号３５を含有する標的化配列；
（ｂｓ）配列番号３６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｔ）配列番号４３のアミノ酸１〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｕ）配列番号４３のアミノ酸１４〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｖ）配列番号４３を含有する標的化配列；
（ｂｗ）配列番号４４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｘ）配列番号４５のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｙ）配列番号４５のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｚ）配列番号４５を含有する標的化配列；
（ｃａ）配列番号４６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｂ）配列番号４７のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｃ）配列番号４７のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｄ）配列番号４７を含有する標的化配列；
（ｃｅ）配列番号４８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｆ）配列番号４９のアミノ酸１〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｇ）配列番号４９のアミノ酸１７〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｈ）配列番号４９を含有する標的化配列；
（ｃｉ）配列番号５０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｊ）配列番号５１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｋ）配列番号５１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｌ）配列番号５１を含有する標的化配列；
（ｃｍ）配列番号５２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｎ）配列番号５３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｏ）配列番号５３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｐ）配列番号５３を含有する標的化配列；
（ｃｑ）配列番号５４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｒ）配列番号５５のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｓ）配列番号５５のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｔ）配列番号５５を含有する標的化配列；
（ｃｕ）配列番号５６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｖ）配列番号５７のアミノ酸１〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｗ）配列番号５７のアミノ酸１１５〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｘ）配列番号５７を含有する標的化配列；
（ｃｙ）配列番号５８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｚ）配列番号５９と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質断片；
（ｄａ）配列番号６０を含有する標的化配列；
（ｄｂ）配列番号６１を含有する標的化配列；
（ｄｃ）配列番号６２を含有する標的化配列；
（ｄｄ）配列番号６３を含有する標的化配列；
（ｄｅ）配列番号６４を含有する標的化配列；
（ｄｆ）配列番号６５を含有する標的化配列；
（ｄｇ）配列番号６６を含有する標的化配列；
（ｄｈ）配列番号６７を含有する標的化配列；
（ｄｉ）配列番号６８を含有する標的化配列；
（ｄｊ）配列番号６９を含有する標的化配列；
（ｄｋ）配列番号７０を含有する標的化配列；
（ｄｌ）配列番号７１と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｍ）配列番号７２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｎ）配列番号７３と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｏ）配列番号７４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｐ）配列番号７５と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｑ）配列番号７６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｒ）配列番号７７と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｓ）配列番号７８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｔ）配列番号７９と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｕ）配列番号８０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｖ）配列番号８１と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｗ）配列番号８２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｘ）配列番号８３と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｙ）配列番号８４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｚ）配列番号１のアミノ酸２２〜３１を含有する標的化配列；
（ｅａ）配列番号１のアミノ酸２２〜３３を含有する標的化配列；
（ｅｂ）配列番号１のアミノ酸２０〜３１を含有する標的化配列；
（ｅｃ）配列番号３のアミノ酸１４〜２３を含有する標的化配列；
（ｅｄ）配列番号３のアミノ酸１４〜２５を含有する標的化配列；または、
（ｅｅ）配列番号３のアミノ酸１２〜２３を含有する標的化配列、
を含有する、
請求項１に記載の方法。
【請求項５】
融合タンパク質が：
（ａ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも８１％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する標的化配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は少なくとも９０％である、前記標的化配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｄ）配列番号１を含有する標的化配列；
（ｅ）配列番号２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｆ）配列番号３のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ｇ）配列番号３のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ｈ）配列番号３を含有する標的化配列；
（ｉ）配列番号４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｊ）配列番号５のアミノ酸１〜３８を含有する標的化配列；
（ｋ）配列番号５のアミノ酸２３〜３８を含有する標的化配列；
（ｌ）配列番号５を含有する標的化配列；
（ｍ）配列番号６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｎ）配列番号７のアミノ酸１〜２８を含有する標的化配列；
（ｏ）配列番号７のアミノ酸１３〜２８を含有する標的化配列；
（ｐ）配列番号７を含有する標的化配列；
（ｑ）配列番号８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｒ）配列番号９のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｓ）配列番号９のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｔ）配列番号９を含有する標的化配列；
（ｕ）配列番号１０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｖ）配列番号１１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｗ）配列番号１１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｘ）配列番号１１を含有する標的化配列；
（ｙ）配列番号１２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｚ）配列番号１３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａａ）配列番号１３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｂ）配列番号１３を含有する標的化配列；
（ａｃ）配列番号１４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｄ）配列番号１５のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ａｅ）配列番号１５のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ａｆ）配列番号１５を含有する標的化配列；
（ａｇ）配列番号１６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｈ）配列番号１７のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ａｉ）配列番号１７のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ａｊ）配列番号１７を含有する標的化配列；
（ａｋ）配列番号１８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｌ）配列番号１９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｍ）配列番号１９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｎ）配列番号１９を含有する標的化配列；
（ａｏ）配列番号２０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｐ）配列番号２１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｑ）配列番号２１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｒ）配列番号２１を含有する標的化配列；
（ａｓ）配列番号２２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｔ）配列番号２３のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｕ）配列番号２３のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｖ）配列番号２３を含有する標的化配列；
（ａｗ）配列番号２４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｘ）配列番号２５のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｙ）配列番号２５のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｚ）配列番号２５を含有する標的化配列；
（ｂａ）配列番号２６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｂ）配列番号２７のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｃ）配列番号２７のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｄ）配列番号２７を含有する標的化配列；
（ｂｅ）配列番号２８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｆ）配列番号２９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｇ）配列番号２９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｈ）配列番号２９を含有する標的化配列；
（ｂｉ）配列番号３０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｊ）配列番号３１のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｋ）配列番号３１のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｌ）配列番号３１を含有する標的化配列；
（ｂｍ）配列番号３２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｎ）配列番号３３のアミノ酸１〜１５を含有する標的化配列；
（ｂｏ）配列番号３３を含有する標的化配列；
（ｂｐ）配列番号３４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｑ）配列番号３５のアミノ酸１〜１６を含有する標的化配列；
（ｂｒ）配列番号３５を含有する標的化配列；
（ｂｓ）配列番号３６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｔ）配列番号４３のアミノ酸１〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｕ）配列番号４３のアミノ酸１４〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｖ）配列番号４３を含有する標的化配列；
（ｂｗ）配列番号４４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｘ）配列番号４５のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｙ）配列番号４５のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｚ）配列番号４５を含有する標的化配列；
（ｃａ）配列番号４６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｂ）配列番号４７のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｃ）配列番号４７のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｄ）配列番号４７を含有する標的化配列；
（ｃｅ）配列番号４８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｆ）配列番号４９のアミノ酸１〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｇ）配列番号４９のアミノ酸１７〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｈ）配列番号４９を含有する標的化配列；
（ｃｉ）配列番号５０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｊ）配列番号５１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｋ）配列番号５１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｌ）配列番号５１を含有する標的化配列；
（ｃｍ）配列番号５２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｎ）配列番号５３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｏ）配列番号５３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｐ）配列番号５３を含有する標的化配列；
（ｃｑ）配列番号５４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｒ）配列番号５５のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｓ）配列番号５５のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｔ）配列番号５５を含有する標的化配列；
（ｃｕ）配列番号５６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｖ）配列番号５７のアミノ酸１〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｗ）配列番号５７のアミノ酸１１５〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｘ）配列番号５７を含有する標的化配列；
（ｃｙ）配列番号５８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｚ）配列番号５９と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質断片；
（ｄａ）配列番号６０を含有する標的化配列；
（ｄｂ）配列番号６１を含有する標的化配列；
（ｄｃ）配列番号６２を含有する標的化配列；
（ｄｄ）配列番号６３を含有する標的化配列；
（ｄｅ）配列番号６４を含有する標的化配列；
（ｄｆ）配列番号６５を含有する標的化配列；
（ｄｇ）配列番号６６を含有する標的化配列；
（ｄｈ）配列番号６７を含有する標的化配列；
（ｄｉ）配列番号６８を含有する標的化配列；
（ｄｊ）配列番号６９を含有する標的化配列；
（ｄｋ）配列番号７０を含有する標的化配列；
（ｄｌ）配列番号７１と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｍ）配列番号７２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｎ）配列番号７３と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｏ）配列番号７４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｐ）配列番号７５と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｑ）配列番号７６と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｒ）配列番号７７と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｓ）配列番号７８と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｔ）配列番号７９と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｕ）配列番号８０と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｖ）配列番号８１と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｗ）配列番号８２と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｘ）配列番号８３と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｙ）配列番号８４と少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｚ）配列番号１のアミノ酸２２〜３１を含有する標的化配列；
（ｅａ）配列番号１のアミノ酸２２〜３３を含有する標的化配列；
（ｅｂ）配列番号１のアミノ酸２０〜３１を含有する標的化配列；
（ｅｃ）配列番号３のアミノ酸１４〜２３を含有する標的化配列；
（ｅｄ）配列番号３のアミノ酸１４〜２５を含有する標的化配列；または、
（ｅｅ）配列番号３のアミノ酸１２〜２３を含有する標的化配列、
を含有する、
請求項２に記載の植物種子または請求項３に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項６】
前記標的化配列が、
（ａ）１６アミノ酸からなり、および、配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも８１％の同一性を有するアミノ酸配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は、少なくとも９０％である、前記アミノ酸配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５；
（ｄ）配列番号１；または、
（ｅ）配列番号６０、
からなる、請求項４に記載の方法。
【請求項７】
前記標的化配列が、
（ａ）１６アミノ酸からなり、および、配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも８１％の同一性を有するアミノ酸配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は、少なくとも９０％である、前記アミノ酸配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５；
（ｄ）配列番号１；または、
（ｅ）配列番号６０、
からなる、請求項５に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項８】
融合タンパク質が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、５９、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、または、８４と少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有する、請求項４に記載の方法。
【請求項９】
融合タンパク質が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、５９、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、または、８４と少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有する、請求項５に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項１０】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、植物免疫システム増強タンパク質またはペプチド、を含有する、請求項１、４、６および８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記植物免疫システム増強タンパク質またはペプチドが、ハーピン（ｈａｒｐｉｎ）、αエラスチン、βエラスチン、システミン、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ、エリシチン、ディフェンシン、クリプトゲイン、フラジェリンタンパク質、またはフラジェリンペプチドである、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、植物免疫システム増強タンパク質またはペプチド、を含有する、請求項２、５、７および９のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７および９のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項１３】
前記植物免疫システム増強タンパク質またはペプチドが、ハーピン（ｈａｒｐｉｎ）、αエラスチン、βエラスチン、システミン、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ、エリシチン、ディフェンシン、クリプトゲイン、フラジェリンタンパク質、またはフラジェリンペプチドである、請求項１２に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項１４】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、抗菌活性、抗真菌活性、または抗菌活性と抗真菌活性の両方を有するタンパク質またはペプチドである、請求項２、５、７および９のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７および９のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項１５】
前記タンパク質またはペプチドが、バクテリオシン、リゾチーム、リゾチームペプチド、非リボソーム活性ペプチド、コンアルブミン、アルブミン、ラクトフェリン、ラクトフェリンペプチド、またはＴａｓＡである、請求項１４に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項１６】
リゾチームペプチドがＬｙｓＭを含む、またはラクトフェリンペプチドがＬｆｃｉｎＢを含む、請求項１５に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項１７】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、抗菌活性、抗真菌活性、または抗菌活性と抗真菌活性の両方を有するタンパク質またはペプチドである、請求項１、４、６および８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
前記タンパク質またはペプチドが、バクテリオシン、リゾチーム、リゾチームペプチド、シデロフォア、非リボソーム活性ペプチド、コンアルブミン、アルブミン、ラクトフェリン、ラクトフェリンペプチド、またはＴａｓＡを含有する、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
リゾチームペプチドがＬｙｓＭを含む、またはラクトフェリンペプチドがＬｆｃｉｎＢを含む、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、殺虫活性、殺蠕虫活性を有するか、または、昆虫もしくは蠕虫の捕食を抑制するか、またはそれらの組み合わせである、請求項２、５、７および９のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７および９のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２１】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、殺虫性細菌毒素、エンドトキシン、Ｃｒｙ毒素、プロテアーゼ阻害タンパク質またはペプチド、システインプロテアーゼ、またはキチナーゼを含有する、請求項２０に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２２】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが殺虫性細菌毒素を含有し、前記殺虫性細菌毒素がＶＩＰ殺虫タンパク質を含有する；前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドがプロテアーゼ阻害タンパク質またはペプチドを含有し、前記プロテアーゼ阻害タンパク質またはペプチドがトリプシンインヒビター、または、クワイプロテアーゼインヒビターを含有する；または前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドがＣｒｙ毒素を含有し、前記Ｃｒｙ毒素がバチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）由来のＣｒｙ毒素含有する、請求項２１に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２３】
前記Ｃｒｙ毒素が、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）由来のＣｒｙ毒素を含有し、さらにＣｒｙ毒素が、Ｃｒｙ５Ｂタンパク質またはＣｒｙ２１Ａタンパク質を含有する、請求項２２に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２４】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、殺虫活性、殺蠕虫活性を有するか、または、昆虫もしくは蠕虫の捕食を抑制するか、またはそれらの組み合わせである、請求項１、４、６および８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２５】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、殺虫性細菌毒素、エンドトキシン、Ｃｒｙ毒素、プロテアーゼ阻害タンパク質またはペプチド、システインプロテアーゼ、またはキチナーゼを含有する、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが殺虫性細菌毒素を含有し、前記殺虫性細菌毒素がＶＩＰ殺虫タンパク質を含有する；前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドがプロテアーゼ阻害タンパク質またはペプチドを含有し、前記プロテアーゼ阻害タンパク質またはペプチドがトリプシンインヒビター、または、クワイプロテアーゼインヒビターを含有する；または前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、Ｃｒｙ毒素を含有し、前記Ｃｒｙ毒素がバチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）由来のＣｒｙ毒素含有する、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記Ｃｒｙ毒素が、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ由来のＣｒｙ毒素を含有し、さらにＣｒｙ毒素が、Ｃｒｙ５Ｂタンパク質またはＣｒｙ２１Ａタンパク質を含有する、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記病原体から植物を防御するタンパク質が、酵素を含有する、請求項２、５、７および９のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７および９のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２９】
前記酵素がプロテアーゼまたはラクトナーゼである、請求項２８に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３０】
前記酵素がラクトナーゼを含有し、前記ラクトナーゼが、１，４−ラクトナーゼ、２−ピロン−４，６−ジカルボキシレートラクトナーゼ、３−オキソアジペートエノールラクトナーゼ、アクチノマイシンラクトナーゼ、デオキシリモネートＡ環−ラクトナーゼ、グルコノラクトナーゼＬ−ラムノノ−１、４−ラクトナーゼ、リモニン−Ｄ環−ラクトナーゼ、ステロイド−ラクトナーゼ、トリアセテート−ラクトナーゼ、または、キシロノ−１，４−ラクトナーゼを含有する、請求項２９に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３１】
前記酵素が、β−１，３−グルカナーゼ、β−１，４−グルカナーゼ、β−１，６−グルカナーゼ、キトシナーゼ、キチナーゼ、キトシナーゼ様酵素、リチカーゼ、ペプチダーゼ、プロテイナーゼ、プロテアーゼ、ムタノリシン（ｍｕｔａｎｏｌｙｓｉｎ）、スタホリシン（ｓｔａｐｈｏｌｙｓｉｎ）、またはリゾチームを含有する、請求項２８に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３２】
前記プロテアーゼが、アルカリプロテアーゼ、酸プロテアーゼ、または中性プロテアーゼを含有する、請求項３１に記載の植物種子または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３３】
前記病原体から植物を防御するタンパク質が、酵素を含有する、請求項１、４、６および８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
前記酵素がプロテアーゼまたはラクトナーゼである、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記酵素がラクトナーゼを含有し、前記ラクトナーゼが、１，４−ラクトナーゼ、２−ピロン−４，６−ジカルボキシレートラクトナーゼ、３−オキソアジペートエノールラクトナーゼ、アクチノマイシンラクトナーゼ、デオキシリモネートＡ環−ラクトナーゼ、グルコノラクトナーゼＬ−ラムノノ−１、４−ラクトナーゼ、リモニン−Ｄ環−ラクトナーゼ、ステロイド−ラクトナーゼ、トリアセテート−ラクトナーゼ、または、キシロノ−１，４−ラクトナーゼを含有する、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
前記酵素が、β−１，３−グルカナーゼ、β−１，４−グルカナーゼ、β−１，６−グルカナーゼ、キトシナーゼ、キチナーゼ、キトシナーゼ様酵素、リチカーゼ、ペプチダーゼ、プロテイナーゼ、プロテアーゼ、ムタノリシン（ｍｕｔａｎｏｌｙｓｉｎ）、スタホリシン（ｓｔａｐｈｏｌｙｓｉｎ）、またはリゾチームを含有する、請求項３３に記載の方法。
【請求項３７】
前記プロテアーゼが、アルカリプロテアーゼ、酸プロテアーゼ、または中性プロテアーゼを含有する、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記融合タンパク質がさらに、前記標的化配列、前記エキソスポリウムタンパク質、または、前記エキソスポリウムタンパク質断片と、前記病原体から植物を防御するタンパク質もしくはペプチド、との間にアミノ酸リンカーを含有し、
任意に、前記リンカーが、ポリアラニンリンカー、ポリグリシンリンカー、または、アラニン残基とグリシン残基の両方の混合物；および／またはプロテアーゼ認識部位を含有する、
請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６および３７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
前記融合タンパク質がさらに、前記標的化配列、前記エキソスポリウムタンパク質、または、前記エキソスポリウムタンパク質断片と、前記病原体から植物を防御するタンパク質もしくはペプチド、との間にアミノ酸リンカーを含有し、
任意に、前記リンカーが、ポリアラニンリンカー、ポリグリシンリンカー、または、アラニン残基とグリシン残基の両方の混合物；および／またはプロテアーゼ認識部位を含有する、
請求項２、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１および３２のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１および３２のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項４０】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、バチルス・アントラキス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｎｔｈｒａｃｉｓ）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）、バチルス・シュードマイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｓｅｕｄｏｍｙｃｏｉｄｅｓ）、バチルス・サマニィ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｍａｎｉｉ）、バチルス・ガエモケンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｅｍｏｋｅｎｓｉｓ）、バチルス・ウェイヘンステフェンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｗｅｉｈｅｎｓｔｅｐｈｅｎｓｉｓ）、またはそれらの組み合わせが含まれる、請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７および３８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、バチルス・アントラキス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｎｔｈｒａｃｉｓ）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）、バチルス・シュードマイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｓｅｕｄｏｍｙｃｏｉｄｅｓ）、バチルス・サマニィ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｍａｎｉｉ）、バチルス・ガエモケンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｅｍｏｋｅｎｓｉｓ）、バチルス・ウェイヘンステフェンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｗｅｉｈｅｎｓｔｅｐｈｅｎｓｉｓ）、またはそれらの組み合わせが含まれる、請求項２、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２および３９のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２および３９のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項４２】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、植物生育促進細菌株が含まれ、任意に、前記植物生育促進細菌株は：殺虫性毒素（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺真菌性化合物（任意にβ−１，３−グルカナーゼ、キトシナーゼ、リチカーゼ、またはそれらの組み合わせ）を産生する、殺線虫性化合物（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺菌性化合物を産生する、１以上の抗生物質に対して抵抗性である、１以上の遊離複製プラスミドを含有する、植物の根に結合する、植物の根にコロニー形成する、バイオフィルムを形成する、栄養素を可溶化する、有機酸を分泌する、またはそれらの組み合わせである、
請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８および４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、植物生育促進細菌株が含まれ、任意に、前記植物生育促進細菌株は：殺虫性毒素（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺真菌性化合物（任意にβ−１，３−グルカナーゼ、キトシナーゼ、リチカーゼ、またはそれらの組み合わせ）を産生する、殺線虫性化合物（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺菌性化合物を産生する、１以上の抗生物質に対して抵抗性である、１以上の遊離複製プラスミドを含有する、植物の根に結合する、植物の根にコロニー形成する、バイオフィルムを形成する、栄養素を可溶化する、有機酸を分泌する、またはそれらの組み合わせである、
請求項２、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２、３９および４１のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２、３９および４１のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項４４】
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ１５５（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２１）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１１８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１８）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１４１（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１６）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ４６−３（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２２）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ１２８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１７）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）  ＢＴ０１３Ａ（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２４）、または、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ３４９（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２８）が含まれる、請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０および４２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ１５５（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２１）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１１８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１８）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１４１（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１６）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ４６−３（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２２）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ１２８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１７）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）  ＢＴ０１３Ａ（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２４）、または、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ３４９（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２８）が含まれる、請求項２、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２、３９および４１のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２、３９および４１のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項４６】
前記融合タンパク質は、前記融合タンパク質の標的化配列、エキソスポリウムタンパク質、またはエキソスポリウムタンパク質断片に対して天然型である芽胞形成プロモーターおよび／または高発現芽胞形成プロモーターの制御下で発現され、任意に：
前記高発現芽胞形成プロモーターには、シグマ−Ｋ芽胞形成特異的ポリメラーゼプロモーター配列が含まれるか、または前記シグマ−Ｋ芽胞形成特異的ポリメラーゼプロモーター配列（複数含む）は、配列番号８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０２、または１０３の相当するヌクレオチドと１００％の同一性を有する；および／または
前記芽胞形成プロモーターは、配列番号８５〜１０３のいずれか１つの核酸配列と少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有する核酸配列を含有する、
請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０、４２および４４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
前記融合タンパク質は、前記融合タンパク質の標的化配列、エキソスポリウムタンパク質、またはエキソスポリウムタンパク質断片に対して天然型である芽胞形成プロモーターおよび／または高発現芽胞形成プロモーターの制御下で発現され、任意に：
前記高発現芽胞形成プロモーターには、シグマ−Ｋ芽胞形成特異的ポリメラーゼプロモーター配列が含まれるか、または前記シグマ−Ｋ芽胞形成特異的ポリメラーゼプロモーター配列（複数含む）は、配列番号８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０２、または１０３の相当するヌクレオチドと１００％の同一性を有する；および／または
前記芽胞形成プロモーターは、配列番号８５〜１０３のいずれか１つの核酸配列と少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有する核酸配列を含有する、
請求項２、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２、３９、４１、４３および４５のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項３、５、７、９、１２、１３、１４、１５、１６、２０、２１、２２、２３、２８、２９、３０、３１、３２、３９、４１、４３および４５のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項４８】
植物生育環境へ導入する前に、または、植物、植物種子、または植物もしくは植物種子の周辺域に適用する前に、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを不活性化すること、任意に、不活性化は加熱処置；ガンマ線照射；ｘ線照射；ＵＶ−Ａ照射；ＵＶ−Ｂ照射；グルタルアルデヒド（ｇｌｕｔｅｒａｌｄｅｈｙｄｅ）、ホルムアルデヒド、過酸化水素、酢酸、漂白、またはそれらの組み合わせを用いた処置、または、それらの組み合わせによる、をさらに含む、請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０、４２、４４および４６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
植え付けの前に、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを含有する製剤を用いて種子をコーティングすることを含有する、請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０、４２、４４、４６および４８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５０】
植物の空中部分に前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーまたは製剤を適用することを含む、請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０、４２、４４、４６および４８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
前記植物生育環境に前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを導入することには、前記環境に前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを含有する液体製剤または固形製剤を適用することを含む、請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０、４２、４４、４６および４８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
植物生育環境中に少なくとも１つの農薬を導入すること、または、植物もしくは種子に少なくとも１つの農薬を適用することをさらに含有し、前記農薬は、肥料、微量栄養素肥料物質、殺虫剤、除草剤、防かび剤、軟体動物駆除剤、殺藻剤、植物生育改善物質、細菌接種剤、真菌接種剤、またはそれらの組み合わせを含有する；
前記肥料が、液体肥料を含有する；
前記微量栄養素肥料物質がホウ酸、ホウ酸塩、ホウ素フリット、硫酸銅、銅フリット、銅キレート、四ホウ酸ナトリウム十水和物、硫酸鉄、酸化鉄、硫酸鉄アンモニウム、鉄フリット、鉄キレート、硫酸マンガン、酸化マンガン、マンガンキレート、塩化マンガン、マンガンフリット、モリブデン酸ナトリウム、モリブデン酸、硫酸亜鉛、酸化亜鉛、炭酸亜鉛、亜鉛フリット、リン酸亜鉛、亜鉛キレート、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記殺虫剤が有機リン酸塩、カルバミン酸塩、ピレスロイド、ダニ駆除剤、フタル酸アルキル、ホウ酸、ホウ酸塩、フッ化物、硫黄、ハロ芳香族置換尿素、炭化水素エステル、生物ベースの殺虫剤、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記除草剤がクロロフェノキシ化合物、ニトロフェノール化合物、ニトロクレゾール化合物、ジピリジル化合物、アセトアミド、脂肪酸、アニリド、ベンズアミド、安息香酸、安息香酸誘導体、アニス酸、アニス酸誘導体、ベンゾニトリル、ベンゾチアジアジノン二酸化物、チオカルバミド酸塩、カルバミン酸塩、カルバニレート、クロロピリジニル、シクロヘキセノン誘導体、ジニトロアミノベンゼン誘導体、フルオロジニトロトルイジン化合物、イソキサゾリジノン、ニコチン酸、イソプロピルアミン、イソプロピルアミン誘導体、オキサジアゾリノン、リン酸塩、フタル酸塩、ピコリン酸化合物、トリアジン、トリアゾール、ウラシル、尿素誘導体、エンドサル、塩素酸ナトリウム、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記防かび剤が、置換ベンゼン、チオカルバマート、エチレンビスジチオカルバマート、チオフタリドアミド、銅化合物、有機水銀化合物、有機スズ化合物、カドミウム化合物、アニラジン、ベノミル、シクロへキサミド、ドジン、エトリジアゾール、イプロジオン、メトラキシル、チアミメホン、トリホリン、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記真菌接種剤は、グロメラセア（Ｇｌｏｍｅｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、クラロイドグロメラセア（Ｃｌａｒｏｉｄｏｇｌｏｍｅｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ギガスポラセア（Ｇｉｇａｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、アカウロスポラセア（Ａｃａｕｌｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、サッキュロスポラセア（Ｓａｃｃｕｌｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、エンテロホスポラセア（Ｅｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、パシドスポラセア（Ｐａｃｉｄｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ダイバーシスポラセア（Ｄｉｖｅｒｓｉｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、パラグロメラセア（Ｐａｒａｇｌｏｍｅｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、アカエオスポラセア（Ａｒｃｈａｅｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ゲオシフォナセア（Ｇｅｏｓｉｐｈｏｎａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、アンビスポラセア（Ａｍｂｉｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、スクテロスポラセア（Ｓｃｕｔｅｌｌｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、デンティスクルタタセア（Ｄｅｎｔｉｓｃｕｌｔａｔａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ラコセトラセア（Ｒａｃｏｃｅｔｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、バシディオマイコタ科（ｐｈｙｌｕｍ  Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｏｔａ）の真菌接種剤、（アスコマイコタ科（ｐｈｙｌｕｍ  Ａｓｃｏｍｙｃｏｔａ）の真菌接種剤、ジゴマイコタ科（ｐｈｙｌｕｍ  Ｚｙｇｏｍｙｃｏｔａ）の真菌接種剤、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記細菌接種剤は、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、ブラジリゾビウム（Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、メソリゾビウム（Ｍｅｓｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、アゾリゾビウム（Ａｚｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、アロリゾビウム（Ａｌｌｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、シノリゾビウム（Ｓｉｎｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、クルイベラ（Ｋｌｕｙｖｅｒａ）属の細菌接種剤、アゾトバクター（Ａｚｏｔｏｂａｃｔｅｒ）属の細菌接種剤、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属の細菌接種剤、アゾスピリリウム（Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｉｕｍ）属の細菌接種剤、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）属の細菌接種剤、ストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）属の細菌接種剤、パニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）属の細菌接種剤、パラコッカス（Ｐａｒａｃｏｃｃｕｓ）属の細菌接種剤、エンテロバクター（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ）属の細菌接種剤、アルカリゲネス（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）属の細菌接種剤、マイコバクテリウム（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属の細菌接種剤、トリコデルマ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）属の細菌接種剤、グリオクラジウム（Ｇｌｉｏｃｌａｄｉｕｍ）属の細菌接種剤、グロムス（Ｇｌｏｍｕｓ）属の細菌接種剤、クレブシエラ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ）属の細菌接種剤、もしくはそれらの組み合わせを含有する；および／または
前記肥料が、硫酸アンモニウム、硝酸アンモニウム、硫酸硝酸アンモニウム、塩化アンモニウム、重硫酸アンモニウム、ポリ硫化アンモニウム、チオ硫化アンモニウム、アンモニア水、無水アンモニア、ポリリン酸アンモニウム、硫酸アルミニウム、硝酸カルシウム、カルシウム硝酸アンモニウム、硫酸カルシウム、か焼マグネサイト、方解石質石灰岩、酸化カルシウム、硝酸カルシウム、ドロマイト質石灰石、消石灰、炭酸カルシウム、リン酸２アンモニウム、リン酸１アンモニウム、硝酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、硝酸カリウム、塩化カリウム、硫酸カリウムマグネシウム、硫酸カリウム、硝酸ナトリウム、苦灰質石灰岩、マグネシア、尿素、尿素−ホルムアルデヒド、尿素硝酸アンモニウム、硫黄被覆尿素、ポリマー被覆尿素、イソブチリデンジウレア、Ｋ２ＳＯ４−２ＭｇＳＯ４、カイナイト、シルビナイト、キーゼル石、Ｅｐｓｏｍ塩、元素状硫黄、泥灰土、粉末牡蠣、魚粉、油かす、魚肥料、血粉、リン鉱石、過リン酸肥料、スラグ、骨粉、木灰、肥料、バットグアノ、ピートモス、堆肥、生砂、綿実粉、羽毛粉、蟹粉、魚乳濁液、フミン酸、またはそれらの組み合わせを含有する、
請求項１、４、６、８、１０、１１、１７、１８、１９、２４、２５、２６、２７、３３、３４、３５、３６、３７、３８、４０、４２、４４、４６および４８〜５１のいずれか１項に記載の方法。