(57)【要約】本開示の実施形態は、がん処置のためのカドヘリン−１７特異的抗体及び細胞傷害性細胞に関する。例えば、抗体は、カドヘリン−１７に対する特異性を有し、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも７０％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでよい。【選択図】図１３
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも７０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、カドヘリン−１７に対する特異性を有する抗体。
【請求項２】
配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも８０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項３】
配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項４】
モノクローナル抗体が、マウス抗体、ヒト化抗体、又はヒト抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項５】
モノクローナル抗体が、ファージライブラリースクリーニングから単離されたヒト抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項６】
前記抗体が、軽鎖の可変領域（ＶＬ）及び重鎖の可変領域（ＶＨ）を含み、前記ＶＬが、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項７】
前記ＶＨが、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、請求項６に記載の抗体。
【請求項８】
コンジュゲートされた細胞傷害性部分をさらに含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項９】
前記コンジュゲートされた細胞傷害性部分が、イリノテカン、オーリスタチン、ＰＢＤ、マイタンシン、アマニチン、スプライソソーム阻害剤、又はそれらの組み合わせを含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項１０】
前記コンジュゲートされた細胞傷害性部分が化学療法剤を含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項１１】
前記抗体が二重特異性抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項１２】
細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞由来の細胞受容体に対する特異性を有する、請求項１１に記載の抗体。
【請求項１３】
前記抗体が、カドヘリン−１７及びＣＤ３の両方に対する特異性を有する二重特異性抗体である、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１４】
前記細胞受容体が、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ２７、ＣＤ４０、ＴＩＭ−１、ＣＤ２８、ＨＶＥＭ、ＧＩＴＲ、ＩＣＯＳ、ＩＬ１２受容体、ＩＬ１４受容体、又はそれらの誘導体又はそれらの組み合わせを含む、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１５】
前記抗体が、カドヘリン−１７に対する特異性を有する第１の１本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）及びＣＤ３に対する特異性を有する第２の１本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）を含み、前記第１のＳｃＦｖが第１のＶＨ及び第１のＶＬを含み、前記第２のＳｃＦｖが第２のＶＨ及び第２のＶＬを含む、請求項１２に記載の抗体。
【請求項１６】
前記第１のＶＨが、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１５に記載の抗体。
【請求項１７】
前記第１のＶＬが、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１５に記載の抗体。
【請求項１８】
前記第２のＶＨが、配列番号１８のアミノ酸配列の対応する部分を含む、請求項１５に記載の抗体。
【請求項１９】
前記第２のＶＬが、配列番号１８のアミノ酸配列の対応する部分を含む、請求項１５に記載の抗体。
【請求項２０】
免疫チェックポイントインヒビターに対する特異性を有する、請求項１１に記載の抗体。
【請求項２１】
前記チェックポイントインヒビターが、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＴＩＧＩＴ、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−Ｌ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、又はそれらの組み合わせを含む、請求項２０に記載の抗体。
【請求項２２】
血管新生因子に対する特異性を有する、請求項１１に記載の抗体。
【請求項２３】
前記血管新生因子がＶＥＧＦを含む、請求項２２に記載の抗体。
【請求項２４】
前記抗体が、カドヘリン−１７ドメイン６のＲＧＤ部位のインテグリンへの結合に拮抗するように構成される、請求項１に記載の抗体。
【請求項２５】
前記インテグリンがアルファ２ベータ１を含む、請求項２４に記載の抗体。
【請求項２６】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項２７】
配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択される配列を有するアミノ酸配列を含む、抗体のＩｇＧ重鎖。
【請求項２８】
配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択される配列を有するアミノ酸配列を含む、抗体の軽鎖。
【請求項２９】
配列番号１−１６から選択されるアミノ酸配列を含む、抗体の可変鎖。
【請求項３０】
配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、カドヘリン−１７に対する特異性を有するｓｃＦｖ又はＦａｂ。
【請求項３１】
細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞由来の細胞受容体に対する特異性を有する、請求項３０に記載のｓｃＦｖ又はＦａｂ。
【請求項３２】
免疫チェックポイントインヒビターに対する特異性を有する、請求項３０に記載のｓｃＦｖ又はＦａｂ。
【請求項３３】
血管新生因子に対する特異性を有する、請求項３０に記載のｓｃＦｖ又はＦａｂ。
【請求項３４】
カドヘリン−１７に対する特異性を有するＴ又はＮＫ細胞であって、前記Ｔ又はＮＫ細胞がキメラ抗原受容体を含み、前記キメラ抗原受容体が、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、Ｔ又はＮＫ細胞。
【請求項３５】
前記キメラ抗原受容体が、配列番号１−１６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３４に記載のＴ又はＮＫ細胞。
【請求項３６】
請求項１−２６に記載の抗体、請求項２７に記載のＩｇＧ重鎖、請求項２８に記載の軽鎖、請求項２９に記載の可変鎖、又は請求項３０−３３に記載のＳｃＦｖ又はＦａｂをコードする、単離された核酸。
【請求項３７】
請求項３６に記載の単離された核酸を含む発現ベクター。
【請求項３８】
前記ベクターが細胞内で発現可能である、請求項３７に記載の発現ベクター。
【請求項３９】
請求項３６に記載の核酸を含む宿主細胞。
【請求項４０】
請求項３７に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項４１】
前記宿主細胞が原核細胞又は真核細胞である、請求項４０に記載の宿主細胞。
【請求項４２】
請求項１−２６に記載の抗体及び細胞傷害性薬剤を含む、医薬組成物。
【請求項４３】
前記細胞傷害性薬剤が、シスプラチン、ゲムシタビン、イリノテカン、又は抗腫瘍抗体を含む、請求項４２に記載の医薬組成物。
【請求項４４】
請求項１−２６に記載の抗体及び医薬的に許容される担体を含む、医薬組成物。
【請求項４５】
がんを患う被験体を処置するための方法であって、有効量の請求項１−２６に記載の抗体又は請求項３４−３５に記載のＴ又はＮＫ細胞を前記被験体に投与する工程を含む、方法。
【請求項４６】
前記がんが、肝臓がん、胃がん、結腸がん、膵臓がん、肺がん、又はそれらの組み合わせである、請求項４５に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連特許出願への相互参照
本出願は、「がん処置のためのカドヘリン−１７特異的抗体及び細胞傷害性細胞」と題された米国仮出願第６２，２７６，８５５号（２０１６年１月９日出願）より優先権を主張し、この米国仮出願第６２，２７６，８５５号は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０００２】
技術分野
本開示は一般的に、がん免疫療法の技術分野に関し、より具体的には、がん処置のためのカドヘリン−１７特異的抗体及び細胞傷害性細胞に関する。
【背景技術】
【０００３】
背景
最近の創薬及び臨床イメージングの進歩にも関わらず、がんは依然として、ヒトにおいて最も致命的な疾患の１つである。どのように腫瘍が始まり、ストレス下で生存し、遠い器官及び部位に定着／転移し、薬物に対して耐性化するのかについての我々の理解は、依然として限定されている。アメリカがん協会は、２０１４年の米国の新規のがんの件数は、１６０万件であると推定した。そして、主たるタイプのがんのほとんどに対する治癒的処置は認められていない。中国では、がんは、発生率及び死亡率が増加している上位の死因に含まれ、ウイルス性／細菌性風土病（Ｂ型肝炎ウイルス［ＨＢＶ］及びヘリコバクター・ピロリ感染）、環境汚染及び食品汚染に起因すると考えられている。
【０００４】
胃がん及び肝臓がんは、世界中で最も致死的な悪性腫瘍に含まれ、発生数の半分以上が中国で診断されており、世界的な年間の死者数は１４２万を超えているが、有効な療法はない。したがって、これらの侵攻性がん、具体的には進行期のがんに対する潜在的な薬物の開発のために、新規のバイオマーカー及び治療標的が必要とされる。これらの２つのがんの成長を排除又は抑制することができる、実績のある分子標的薬剤は、重要な臨床的価値及び顕著な市場への影響を有するだろう。これらの腫瘍は、疾患が初期段階で診断された場合は、手術によって有効に切除することができる。残念なことに、そして非常に多くの場合、これらのがんのほとんどは無症候性であり、クリニックで見つかったときにはかなり進行した段階で検出される。有効な処置をしなければ、これらの患者は、診断後まもなく死ぬ、又は救済療法の後再発する。
【０００５】
ＣＡＲＴ細胞処置は、抗がん応答を命令するためのＴ細胞の生体外改変を含む一種の養子細胞療法である。ＣＡＲ改変Ｔ細胞は、実質的に任意の腫瘍関連抗原を標的とするように操作することができる。
【０００６】
ほぼ全ての初期段階のＣＡＲＴ研究は、血液がんに焦点を当てており、小児急性リンパ芽球性白血病におけるＣＡＲＴ１９（ＣＤ１９抗原を標的とするＣＡＲ−Ｔ細胞）の概念実証研究を含む。ＣＡＲ−Ｔ細胞療法及び関連技術が、肝臓がん、胃がん及び肺がんなどの固形腫瘍適応症において同じ効能を反復することができるかどうかは、まだわかっていない。現在、www.clinicaltrials.govには合計７２の臨床試験が登録されており、１５の研究が中国で登録されている。研究の半分以上は、最も一般的なＣＡＲ−Ｔ標的であるＣＤ１９を有する血液がんに焦点を当てており、脳腫瘍に特異的なＧＤ２及びＨｅｒ２、及び数々のＨｅｒ２陽性がんが続く。したがって、ＨＣＣ及びＧＣに対するＣＡＲ−Ｔ免疫療法には大きな空白が存在する。
【０００７】
今日、第三世代ＧＰＣ３標的化ＣＡＲを発現する、遺伝的に改変されたＴ細胞、ＫＪｇｐｃ３−００１を使用する、進行したＨＣＣを患う患者を処置するための登録されたＣＡＲ−Ｔ第１相試験が、１つしか存在しない。ＧＰＣ３（グリピカン−３）は、ＨＣＣでは高度に発現されるが、正常組織では発現が限られる（６３．６％対９．２％）。残念なことに、抗ＧＰＣ３  ｍＡｂ  ＧＣ３３（Ｒｏｃｈｅの子会社であるＣｈｕｇａｉによって開発された）の第Ｉ相研究において、部分的な又は完全な応答は観察されなかった。ＫＪｇｐｃ３−００１は、ＧＣ３３に由来する抗ＧＰＣ３  ｓｃＦｖ及びＣＤ２８／４−１ＢＢ／ＣＤ３ζに由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。ＫＪｇｐｃ３−００１は、レンチウイルスベクターを用いて患者のＴ細胞に形質導入され、肝臓がんを攻撃する可能性がある。前臨床研究において、ＫＪｇｐｃ３−００１で処置した全てのマウスは、６０日より長く生存したが、生理食塩水で処置したマウスの生存期間中央値は３３日であった。ＫＪｇｐｃ３−００１についての主要な関心事は、胃腺、腎尿細管、及び生殖細胞などの正常組織におけるＧＰＣ３の発現である。従来、肺組織におけるＨＥＲ２の発現に起因して、ＨＥＲ２標的化ＣＡＲでの処置後に乳がん患者１人が死亡した。この患者は、細胞注入後１５分以内に呼吸窮迫を経験し、処置の５日後に死亡した。それ故に、がん処置のためのカドヘリン−１７特異的抗体及び細胞傷害性細胞を用いるがん免疫療法が必要とされている。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
概要
本開示は、カドヘリン−１７特異的抗体及び細胞傷害性細胞を提供する。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本開示の実施形態は、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも７０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、カドヘリン−１７に対する特異性を有する抗体に関する。
【００１０】
いくつかの実施形態において、抗体は、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも８０％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでよい。
【００１１】
いくつかの実施形態において、抗体は、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでよい。
【００１２】
いくつかの実施形態において、モノクローナル抗体が、マウス抗体、ヒト化抗体、又はヒト抗体である。いくつかの実施形態において、モノクローナル抗体が、ファージライブラリースクリーニングから単離されたヒト抗体である。
【００１３】
いくつかの実施形態において、抗体は、軽鎖の可変領域（ＶＬ）及び重鎖の可変領域（ＶＨ）を含んでよく、ＶＬは、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでよい。いくつかの実施形態において、ＶＨは、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでよい。
【００１４】
いくつかの実施形態において、抗体は、コンジュゲートされた細胞傷害性部分を含んでよい。いくつかの実施形態において、コンジュゲートされた細胞傷害性部分は、イリノテカン、オーリスタチン、ＰＢＤ、マイタンシン、アマニチン、スプライソソーム阻害剤、又はそれらの組み合わせを含んでよい。いくつかの実施形態において、コンジュゲートされた細胞傷害性部分は、化学療法剤を含んでよい。
【００１５】
いくつかの実施形態において、抗体が二重特異性抗体である。
【００１６】
いくつかの実施形態において、抗体は、細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞由来の細胞受容体に対する特異性を含んでよい。いくつかの実施形態において、抗体が、カドヘリン−１７及びＣＤ３の両方に対する特異性を有する二重特異性抗体である。いくつかの実施形態において、細胞受容体は、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ２７、ＣＤ４０、ＴＩＭ−１、ＣＤ２８、ＨＶＥＭ、ＧＩＴＲ、ＩＣＯＳ、ＩＬ１２受容体、ＩＬ１４受容体、又はそれらの誘導体又はそれらの組み合わせを含んでよい。
【００１７】
いくつかの実施形態において、抗体は、カドヘリン−１７に対する特異性を有する第１の１本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）及びＣＤ３に対する特異性を有する第２の１本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）を含んでよく、第１のＳｃＦｖは、第１のＶＨ及び第１のＶＬを含んでよく、第２のＳｃＦｖは、第２のＶＨ及び第２のＶＬを含んでよい。いくつかの実施形態において、第１のＶＨは、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択されるアミノ酸配列を含んでよい。いくつかの実施形態において、第１のＶＬは、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択されるアミノ酸配列を含んでよい。
【００１８】
いくつかの実施形態において、第２のＶＨは、配列番号１８のアミノ酸配列の対応する部分を含んでよい。
【００１９】
いくつかの実施形態において、第２のＶＬは、配列番号１８のアミノ酸配列の対応する部分を含んでよい。
【００２０】
いくつかの実施形態において、抗体は、免疫チェックポイントインヒビターに対する特異性を含んでよい。いくつかの実施形態において、チェックポイントインヒビターは、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＴＩＧＩＴ、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−Ｌ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、又はそれらの組み合わせを含んでよい。
【００２１】
いくつかの実施形態において、抗体は、血管新生因子に対する特異性を含んでよい。いくつかの実施形態において、血管新生因子は、ＶＥＧＦを含んでよい。
【００２２】
いくつかの実施形態において、抗体が、カドヘリン−１７ドメイン６のＲＧＤ部位のインテグリンへの結合に拮抗するように構成される。いくつかの実施形態において、インテグリンは、アルファ２ベータ１を含んでよい。
【００２３】
いくつかの実施形態において、抗体がモノクローナル抗体である。
【００２４】
本開示のいくつかの実施形態は、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択される配列を有するアミノ酸配列を含む、抗体のＩｇＧ重鎖に関する。
【００２５】
本開示のいくつかの実施形態は、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択される配列を有するアミノ酸配列を含む、抗体の軽鎖に関する。
【００２６】
本開示のいくつかの実施形態は、配列番号１−１６から選択されるアミノ酸配列を含む、抗体の可変鎖に関する。
【００２７】
本開示のいくつかの実施形態は、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、カドヘリン−１７に対する特異性を有するｓｃＦｖ又はＦａｂに関する。
【００２８】
いくつかの実施形態において、ｓｃＦｖ又はＦａｂは、細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞由来の細胞受容体に対する特異性を含んでよい。いくつかの実施形態において、ｓｃＦｖ又はＦａｂは、免疫チェックポイントインヒビターに対する特異性を含んでよい。いくつかの実施形態において、ｓｃＦｖ又はＦａｂは、血管新生因子に対する特異性を含んでよい。
【００２９】
本開示のいくつかの実施形態は、カドヘリン−１７に対する特異性を有するＴ又はＮＫ細胞に関し、Ｔ又はＮＫ細胞は、キメラ抗原受容体を含んでよく、キメラ抗原受容体は、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでよい。
【００３０】
いくつかの実施形態において、キメラ抗原受容体は、配列番号１−１６から選択されるアミノ酸配列を含んでよい。
【００３１】
本開示のいくつかの実施形態は、上述の抗体、ＩｇＧ重鎖、軽鎖、可変鎖、又はＳｃＦｖ又はＦａｂをコードする単離された核酸に関する。
【００３２】
本開示のいくつかの実施形態は、上述の単離された核酸を含む発現ベクターに関する。いくつかの実施形態において、ベクターが細胞内で発現可能である。
【００３３】
本開示のいくつかの実施形態は、上述の核酸を含む宿主細胞に関する。
【００３４】
本開示のいくつかの実施形態は、上述の発現ベクターを含む宿主細胞に関する。
【００３５】
いくつかの実施形態において、宿主細胞が原核細胞又は真核細胞である。
【００３６】
本開示のいくつかの実施形態は、請求項１−２６に記載の抗体及び細胞傷害性薬剤を含む医薬組成物に関する。
【００３７】
いくつかの実施形態において、細胞傷害性薬剤は、シスプラチン、ゲムシタビン、イリノテカン、又は抗腫瘍抗体を含んでよい。
【００３８】
いくつかの実施形態において、医薬組成物は、上述の抗体及び医薬的に許容される担体を含んでよい。
【００３９】
本開示のいくつかの実施形態は、がんを患う被験体を処置するための方法であって、有効量の請求項１−２６に記載の抗体又は請求項３４−３５に記載のＴ又はＮＫ細胞を被験体に投与する工程を含む、方法に関する。
【００４０】
いくつかの実施形態において、がんが、肝臓がん、胃がん、結腸がん、膵臓がん、肺がん、又はそれらの組み合わせである。
【００４１】
本開示の目的及び利点は、添付の図面に関連して、その好ましい実施形態の以下の詳細な説明から明らかになるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００４２】
ここで、本開示に係る好ましい実施形態を、図を参照して説明することができる。図において、同様の参照番号は同様の要素を示す。
【００４３】
【図１】図１は、マウスのＬｉｃ３及びＬｉｃ５のＶＬ及びＶＨ配列を示す（Ｌｉｃ３配列は更新されている、すなわち、校正刷り中の配列番号１及び配列番号２は、その結果差し替える必要があることに注意されたい）。
【００４４】
【図２】図２は、ヒト化のためのヒトＶＬ  ２−３０／Ｊ１及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ３  ＶＬ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００４５】
【図３】図３は、ヒト化のためのヒトＶＬ  ２−２４／Ｊ１及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ３  ＶＬ配列の相同性、及びヒト化のためのヒトＶＨ  Ｖｋ２−２９及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ３  Ｖｋ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００４６】
【図４】図４は、ヒト化のためのヒトＶＨ  ３−１１／Ｊ４及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ３  ＶＨ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００４７】
【図５】図５は、ヒト化のためのヒトＶＨ  ３−３０／Ｊ４及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ３  ＶＨ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００４８】
【図６】図６は、ヒト化のためのヒトＶＬ  ＩＧＫＶ  ２−３０及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ５  ＶＬ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００４９】
【図７】図７は、ヒト化のためのヒトＶＬ  ｐｄｂ４Ｘ０Ｋ及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ５  ＶＬ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００５０】
【図８】図８は、ヒト化のためのヒトＶＨ  ＩＧＨＶ３−２１及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ５  ＶＨ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００５１】
【図９】図９は、ヒト化のためのヒトＶＨ  ＩＧＨＶ３−７及びＨｕｍによって示されるヒト化変異体に対するＬｉｃ５  ＶＨ配列の相同性を示しており、ここで、ドットはヒトアミノ酸を示し、逆突然変異は単一アミノ酸の注釈によって示される。
【００５２】
【図１０】図１０は、ヒトカドヘリン−１７特異的抗体を抗体ファージライブラリーから単離するプロセスを示すフローチャートを示しており、ここで、ヒトカドヘリン−１７特異的抗体を、固定化ＣＤＨ１７ドメイン１−３への複数回の結合によってファージライブラリーから単離した。
【００５３】
【図１１】図１１は、ＣＤＨ１７に結合する抗体ファージライブラリーから単離されたヒト抗体の例を示すグラフである。
【００５４】
【図１２−１】
【図１２−２】図１２は、ファージライブラリースクリーニング由来のヒトＣＤＨ１７抗体ＶＬ及びＶＨ配列を示す。
【００５５】
【図１３】図１３は、ＣＤＨ１７抗体ＶＨ及びＶＬから生成されたがん免疫療法のための例示的な機能ドメイン構成のパネルを示しており、（ａ）ＣＤＨ１７特異的抗体；（ｂ）ＣＤＨ１７抗体薬物コンジュゲート；（ｃ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ二重特異性抗体（ノブ・イン・ホール（ｋｎｏｂ  ｉｎ  ｈｏｌｅ））；（ｄ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ二重特異性抗体（ｂｉｔｅ）；及び（ｅ）ＣＡＲ  Ｔ又はＮＫ細胞、である。
【００５６】
【図１４】図１４は、例示的なＣＤＨ１７−ＣＤ３二重特異性抗体（ノブ・イン・ホール）のアミノ酸配列を示す。
【００５７】
【図１５】図１５は、ＥＬＩＳＡによるＣＤＨ１７へのＬｉｃ５  ｓｃＦｖの結合を示すグラフである。
【００５８】
【図１６】図１６は、ＥＬＩＳＡによるＣＤＨ１７へのＬｉｃ３  ｓｃＦｖの結合を示すグラフである。
【００５９】
【図１７】図１７は、ＥＬＩＳＡによって決定されるＬｉｃ３及びＬｉｃ５  ｓｃＦｖの親和性を示すグラフであり、ここで、ｓｃＦｖ  ｌｉｃ  ３（ｋｄ）：１１．８８ｎＭ、及びｓｃＦｖ  ｌｉｃ５：２２．０６ｎＭである。
【００６０】
【図１８−１】
【図１８−２】図１８は、抗体薬物コンジュゲートの候補としてのＬｉｃ５のヒト胃がん細胞への内在化を示す写真を示しており、（ａ）は、示される時間におけるＤＡＰＩ（青）及びＬｉｃ５−ＦＩＴＣ（緑）の染色を示す写真であり、（ｂ）は、示される時間におけるＤＡＰＩ（青）及びＬｉｃ５−ＦＩＴＣ（緑）の統合された染色を示す写真であり、３０分間にわたる３７℃でのＯｕｍ１ヒト胃がん細胞におけるＬｉｃ５−ＦＩＴＣ（緑）内在化は、共焦点顕微鏡法によって決定し、核はＤＡＰＩで染色した。
【００６１】
【図１９】図１９は、ＥＬＩＳＡによって決定される、ＣＤＨ１７へのヒト化Ｌｉｃ３の結合を示す。
【００６２】
【図２０】図２０は、ＥＬＩＳＡによって決定される、ＣＤＨ１７又はＣＤＨ１７トランケートに結合する、ＣＤＨ１７モノクローナル抗体の例を示す。
【００６３】
【図２１】図２１は、ＦＡＣＳによって決定される、腫瘍細胞株へ結合するＣＤＨ１７モノクローナル抗体及びヒト化Ｌｉｃ３  ｓｃＦｖＦｃ（ｈ３ｓｃＦｖ）の例を示す。驚くべきことに、多くのＣＤＨ１７モノクローナル抗体は、異なるＣＤＨ１７発現腫瘍細胞株に対し異なるパターンの結合を示した（赤のボックス）。
【００６４】
【図２２−１】
【図２２−２】図２２は、ｈＬｉｃ３  ＣＡＲ７ａ（配列番号２５）、ｈＬｉｃ３  ＣＡＲ７ｂ（配列番号２６）、ｈＬｉｃ３  ＣＡＲ８（配列番号２７）、及びｈＬｉｃ３  ＣＡＲ９（配列番号２８）のアミノ酸配列を含む、第二世代ＣＡＲの設計（ａ）及び分析（ｂ）を示す。
【００６５】
【図２３】図２３は、シグナル伝達の機能としてのＩＬ２産生を示す。
【００６６】
【図２４】図２４は、Ｌｉｃ３第二世代ＣＡＲ（Ｌｉｃ３ｓｃＦｖ−ＣＤ２８ヒンジ＋ＴＭ＋エンド−ＣＤ３ゼータエンド）のアミノ酸配列（配列番号１９）を示す。
【００６７】
【図２５】図２５は、Ｌｉｃ５第二世代ＣＡＲ（Ｌｉｃ５ｓｃＦｖ−ＣＤ２８ヒンジ＋ＴＭ＋エンド−ＣＤ３ゼータエンド）のアミノ酸配列（配列番号２０）を示す。
【００６８】
【図２６】図２６は、ＨＬｉｃ２６第二世代ＣＡＲ（Ｌｉｃ２６ｓｃＦｖ−ＣＤ２８ヒンジ＋ＴＭ＋エンド−ＣＤ３ゼータエンド）のアミノ酸配列（配列番号２１）を示す。
【００６９】
【図２７】図２７は、Ｌｉｃ３第三世代ＣＡＲ（Ｌｉｃ３ｓｃＦｖ−ＣＤ２８−４−１ＢＢ−ＣＤ３ゼータエンド）のアミノ酸配列（配列番号２２）を示す。
【００７０】
【図２８】図２８は、Ｌｉｃ５第三世代ＣＡＲ（Ｌｉｃ５ｓｃＦｖ−ＣＤ２８ヒンジ＋ＴＭ＋エンド−４−１ＢＢエンド−ＣＤ３ゼータエンド）のアミノ酸配列（配列番号２３）を示す。
【００７１】
【図２９】図２９は、ＨｕＬｉｃ２６第三世代ＣＡＲ（Ｌｉｃ２６ｓｃＦｖ−ＣＤ２８ヒンジ＋ＴＭ＋エンド−４−１ＢＢエンド−ＣＤ３ゼータエンド）のアミノ酸配列（配列番号２４）を示す。
【００７２】
【図３０】図３０は、Ｌｉｃ５の精製及び特徴付けを示す。
【００７３】
【図３１】図３１は、Ｌｉｃ５の化学療法増感効果を示す。
【００７４】
【図３２】図３２は、Ｌｉｃ５の軽鎖及び重鎖の可変領域のアミノ酸配列を示す。
【発明を実施するための形態】
【００７５】
詳細な説明
本出願は、カドヘリン−１７（ＣＤＨ１７）に特異的な抗体、腫瘍細胞を標的とする抗体及び当該抗体を使用する抗腫瘍免疫療法を提供する。当該免疫療法は、様々な異なるモードの細胞障害活性を保有する抗体又はＴ又はＮＫ細胞の細胞障害活性を刺激するキメラ抗原受容体を含む。
【００７６】
他に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術的及び科学的用語は、本開示が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものと類似の又は等価な任意の方法及び材料を、本開示の実施又は試験において使用することができるが、好ましい方法及び材料を説明する。本開示の目的のために、以下の用語を以下に定義する。
【００７７】
冠詞「ａ」及び「ａｎ」は、冠詞の文法的目的語が、１つである又は１つより多い（すなわち、少なくとも１つである）ことを指すために、本明細書で使用される。例として、「ａｎ  要素」は、１つの要素又は１つより多い要素を意味する。
【００７８】
「約」とは、参照の数量、レベル、値、数、頻度、パーセンテージ、寸法、サイズ、量、重さ又は長さに対して、３０、２５、２０、１５、１０、９、８、７、６、５、４、３、２又は１％だけ異なる数量、レベル、値、数、頻度、パーセンテージ、寸法、サイズ、量、重さ又は長さを意味する。
【００７９】
「コード配列」とは、遺伝子のポリペプチド産物のためのコードに寄与する任意の核酸配列を意味する。対照的に、用語「非コード配列」は、遺伝子のポリペプチド産物のためのコードに寄与しない任意の核酸配列を指す。
【００８０】
この明細書を通して、文脈が他の意味を必要としない限り、単語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」及び「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は、記載されているステップ又は要素、又はステップ又は要素の群を含むが、任意の他のステップ又は要素、又はステップ又は要素の群を排除しないことを意味するものとして理解されるだろう。
【００８１】
「〜から成る（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」とは、フレーズ「〜から成る」に続くものを全て含み、それらに限定されることを意味する。したがって、フレーズ「〜から成る」は、列挙された要素が必要とされる又は必須のものであり、他の要素は存在することができないことを示す。
【００８２】
「〜から本質的に成る（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ  ｏｆ）」とは、このフレーズの後に列挙された任意の要素を含み、列挙された要素についての開示において特定された活性又は作用を妨げない又はそれらに寄与しない他の要素に限定されることを意味する。したがって、フレーズ「〜から本質的に成る」は、列挙された要素は必要とされる又は必須のものであるが、他の要素は任意選択のものであり、列挙された要素の活性又は作用にそれらが影響を及ぼすかどうかによって、存在する又は存在しない可能性がある、ということを示す。
【００８３】
用語「相補性の（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ）」及び「相補性（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｉｔｙ）」は、塩基対形成規則によって関連付けられるポリヌクレオチド（すなわち、ヌクレオチドの配列）を指す。例えば、配列「Ａ−Ｇ−Ｔ」は、配列「Ｔ−Ｃ−Ａ」と相補性である。相補性は、核酸の塩基の一部のみが塩基対形成規則に従って一致する、「部分的」なものである可能性がある。あるいは、核酸間に「完全な」又は「絶対的な」相補性が存在する可能性がある。核酸鎖間の相補性の程度は、核酸鎖間のハイブリダイゼーションの効率及び強度に顕著な効果を有する。
【００８４】
「〜に対応する（ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｓ  ｔｏ）」又は「〜に対応する（ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ  ｔｏ）」とは、（ａ）ポリヌクレオチドが、参照ポリヌクレオチド配列の全部又は一部と実質的に同一又は相補性であるヌクレオチド配列を有するか、又はペプチド又はタンパク質中のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列をコードすること；又は（ｂ）ペプチド又はポリペプチドが、参照ペプチド又はタンパク質中のアミノ酸の配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有すること、を意味する。
【００８５】
本明細書で使用されるように、用語「機能（ｆｕｎｃｔｉｏｎ）」及び「機能の・機能的（ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ）」などは、生物学的機能、結合機能、又は治療的機能を指す。
【００８６】
「遺伝子」とは、染色体上の特定座位を占め、転写及び／又は翻訳調節配列及び／又はコード領域及び／又は非翻訳配列（すなわち、イントロン、５'及び３'非翻訳配列）から成る、遺伝の単位を意味する。
【００８７】
「相同性」は、同一であるか又は保存的置換を構成するアミノ酸のパーセンテージ数を指す。相同性は、ＧＡＰなどの配列比較プログラムを使用して決定することができる（Deveraux et al., 1984, Nucleic Acids Research 12, 387-395）（これは、参照により本明細書に組み込まれる）。このようにして、本明細書で引用したものと類似の又は実質的に異なる長さの配列を、ギャップをアラインメントに挿入することによって、比較することができ、そのようなギャップは、例えば、ＧＡＰによって使用される比較アルゴリズムによって決定される。
【００８８】
用語「宿主細胞」は、本開示の任意の組換えベクター又は単離されたポリヌクレオチドのレシピエントであり得る、又はそうであった、個々の細胞又は細胞培養物を含む。宿主細胞は、単一の宿主細胞の子孫を含み、この子孫は、天然の、偶然の、又は故意の突然変異及び／又は変化に起因して、元の親細胞と、（形態又は全ＤＮＡ相補体において）必ずしも完全に同一でなくてよい。宿主細胞は、インビボ又はインビトロで、本開示の組換えベクター又はポリヌクレオチドで遺伝子導入した又は感染させた細胞を含む。本開示の組換えベクターを含む宿主細胞は、組換え宿主細胞である。
【００８９】
「単離された」抗体とは、同定され、その天然環境の成分から分離された及び／又は回収された抗体である。その天然環境の夾雑成分は、抗体の診断的用途又は治療的用途を妨げる物質であり、酵素、ホルモン、及び他のタンパク質性の又は非タンパク質性の溶質を含み得る。
【００９０】
「単離された」核酸分子は、同定され、抗体核酸の天然の源において通常付随する少なくとも１つの夾雑核酸分子から分離された、核酸分子である。単離された核酸分子は、天然に見出される形態又は状況にない。それ故に、単離された核酸分子は、天然細胞中に存在しているときの核酸分子とは区別される。しかしながら、単離された核酸分子は、抗体を通常発現する細胞に含まれる核酸分子を含み、ここで、例えば、核酸分子は、天然細胞のものとは異なる染色体位置にある。
【００９１】
「制御配列」という表現は、ある特定の宿主生物において、作動可能に連結されたコード配列の発現に必要なＤＮＡ配列を指す。原核生物に適した制御配列は、例えば、プロモーター、任意選択的にオペレータ配列、及びリボソーム結合部位を含む。真核細胞は、プロモーター、ポリアデニル化シグナル、及びエンハンサーを利用することが知られている。
【００９２】
核酸は、別の核酸配列と機能的な関係に置かれた場合、「作動可能に連結されている」。例えば、プレ配列又は分泌リーダーのためのＤＮＡは、それがポリペプチドの分泌に関与するプレタンパク質として発現される場合、ポリペプチドのＤＮＡに作動可能に連結されており；プロモーター又はエンハンサーは、それが配列の転写に影響を及ぼす場合、コード配列に作動可能に連結されており；又はリボソーム結合部位は、それが翻訳を容易にするような位置にある場合、コード配列に作動可能に連結されている。一般的に、「作動可能に連結されている」とは、連結されているＤＮＡ配列が隣接していること、そして分泌リーダーの場合は、隣接していて読み出し段階にあることを意味する。しかしながら、エンハンサーは隣接している必要がない。連結は、便利な制限部位でのライゲーションによって達成される。そのような部位が存在しない場合、合成オリゴヌクレオチドアダプター又はリンカーは、従来の実務に従って使用される。
【００９３】
本明細書で使用される「ポリヌクレオチド」又は「核酸」との言及は、ｍＲＮＡ、ＲＮＡ、ｃＲＮＡ、ｒＲＮＡ、ｃＤＮＡ又はＤＮＡを示す。この用語は典型的には、少なくとも１０塩基長のヌクレオチド、リボヌクレオチド又はデオキシヌクレオチド又はいずれかのタイプのヌクレオチドの改変された形態のポリマーの形態、を指す。この用語は、一本鎖形態及び二本鎖形態のＤＮＡ及びＲＮＡを含む。
【００９４】
用語「ポリヌクレオチド変異体」及び「変異体」などは、参照ポリヌクレオチド配列と実質的な配列同一性を示すポリヌクレオチド、又は以下に定義されるストリンジェントな条件下で参照配列とハイブリダイズするポリヌクレオチドを指す。これらの用語はまた、少なくとも１つのヌクレオチドの付加、欠失又は置換によって参照ポリヌクレオチドと区別されるポリヌクレオチドを包含する。したがって、用語「ポリヌクレオチド変異体」及び「変異体」は、１又は複数のヌクレオチドが付加又は欠失しているか、又は異なるヌクレオチドで置換されているポリヌクレオチドを含む。これに関して、突然変異、付加、欠失及び置換を含むある特定の改変を、参照ポリヌクレオチドに行うことができ、それにより、改変されたポリヌクレオチドが、参照ポリヌクレオチドの生物学的機能又は活性を保持する、又は参照ポリヌクレオチドに関連して活性が増加する（すなわち、最適化される）、ということが、本分野において十分に理解されている。ポリヌクレオチド変異体は、例えば、本明細書に記載される参照ポリヌクレオチド配列と少なくとも５０％（及び少なくとも５１％から少なくとも９９％まで、及びその間の全ての整数パーセンテージ、例えば、９０％、９５％、又は９８％）の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含む。用語「ポリヌクレオチド変異体」及び「変異体」はまた、これらの酵素をコードする天然に存在する対立遺伝子変異体及びオルソログを含む。
【００９５】
「ポリペプチド」、「ポリペプチド断片」、「ペプチド」及び「タンパク質」は、本明細書において交換可能に使用されて、アミノ酸残基のポリマー及びその変異体及び合成類似体を指す。したがって、これらの用語は、天然に存在するアミノ酸ポリマーだけでなく、対応する天然に存在するアミノ酸の化学的類似体などの、１又は複数のアミノ酸残基が合成の天然に存在しないアミノ酸である、アミノ酸ポリマーに適用される。ある特定の態様において、ポリペプチドは、典型的には様々な化学反応を触媒する（すなわち、化学反応速度を増加させる）酵素的ポリペプチド、又は「酵素」を含んでよい。
【００９６】
ポリペプチド「変異体」との言及は、少なくとも１つのアミノ酸残基の付加、欠失又は置換によって参照ポリペプチド配列と区別されるポリペプチドを指す。ある実施形態において、ポリペプチド変異体は、１又は複数の置換（これは、保存的であっても非保存的であってもよい）によって、参照ポリペプチドと区別される。ある実施形態において、ポリペプチド変異体は保存的置換を含み、これに関して、ポリペプチドの活性の性質を変えることなく、いくつかのアミノ酸を、幅広く類似の特性を有する他のアミノ酸に変えてよいということが、本分野において十分に理解されている。ポリペプチド変異体はまた、１又は複数のアミノ酸が、付加又は欠失しているか、又は異なるアミノ酸残基で置換されているポリペプチドを包含する。
【００９７】
用語「参照配列」は一般的に、別の配列と比較される核酸コード配列、又はアミノ酸配列を指す。本明細書に記載される全てのポリペプチド及びポリヌクレオチド配列は、参照配列として含まれる。
【００９８】
本明細書で使用される、「配列同一性」又は、例えば、「〜と５０％同一の配列」を含む、との言及は、配列が、比較のウインドウにわたって、ヌクレオチドごと又はアミノ酸ごとの同一である程度を指す。したがって、「配列同一性のパーセンテージ」は、比較のウインドウにわたって２つの最適に整列された配列を比較し、同一の核酸塩基（例えば、Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｇ、Ｉ）又は同一のアミノ酸残基（例えば、Ａｌａ、Ｐｒｏ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｇｌｙ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｈｉｓ、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｃｙｓ及びＭｅｔ）が両方の配列に出現する位置の数を決定して一致した位置の数を求め、一致した位置の数を比較のウインドウ内の位置の総数（すなわち、ウインドウサイズ）で割り、その結果に１００を乗じて配列同一性のパーセンテージを求めることによって、計算することができる。本明細書に記載される参照配列（例えば、配列表を参照されたい）のうち任意のものと少なくとも約５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％又は１００％配列同一性を有するヌクレオチド及びポリペプチドが含まれ、ここで、典型的には、ポリペプチド変異体は、参照ポリペプチドの少なくとも１つの生物学的活性を維持する。
【００９９】
「統計学的に有意な」とは、結果が偶然に起こったものではなさそうだったことを意味する。統計的有意性は、本分野において知られる任意の方法によって決定することができる。一般的に使用される有意性の尺度には、ｐ値が含まれ、これは、帰無仮説が当てはまった場合に、観察される事象が起こる、頻度又は確率である。得られたｐ値が有意水準より小さい場合、次いで帰無仮説が棄却される。単純な場合、有意水準は、０．０５以下のｐ値で定義される。
【０１００】
「実質的に」又は「本質的に」は、ほぼ絶対的又は完全であること、例えば、ある所与の数量の９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上であることを意味する。
【０１０１】
「処置（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」又は「処置（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）」又は「緩和」は、治療的処置及び予防的又は防止的手段の両方を指し、その目的は、標的となる病理学的状態又は障害を防止する又は遅延させる（減らす）することである。例えば、がんの場合、がん細胞の数の減少又はがん細胞の非存在；腫瘍サイズの減少；腫瘍転移の阻害（すなわち、ある程度遅延させ、好ましくは停止させる）；腫瘍成長のある程度の阻害；寛解の長さの増加、及び／又は特定のがんに関連する症候の１又は複数のある程度の軽減；罹患率及び死亡率の減少、及び生活の質の問題の改善がある。疾患の兆候又は症候の減少が、患者によって感じられる可能性もある。処置は、がんの全ての兆候の消失として定義される完全な応答を、又は腫瘍のサイズが、好ましくは５０パーセント超だけ、より好ましくは７５％だけ減少する、部分的な応答を、達成することができる。患者はまた、患者が不変を経験する場合に、処置されたとみなされる。好ましい実施形態において、がん患者は、１年後、好ましくは１５ヶ月後に、がんの進行がないままである。疾患の処置及び改善の成功を評価するためのこれらのパラメーターは、本分野の適切な技能を持った医師によく知られる日常の手順によって、容易に測定可能である。
【０１０２】
用語「調節する」及び「改変する」ことは、典型的には対照と比較して統計学的に有意な又は生理学的に有意な量又は程度で、「増加させる」及び「増強する」並びに「減少させる」又は「低減する」ことを含む。特定の実施形態において、血液代用品の移植に関連する免疫学的拒絶反応は、改変されていない又は異なって改変された幹細胞と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも１００％、少なくとも１５０％、少なくとも２００％、少なくとも３００％、少なくとも４００％、少なくとも５００％、又は少なくとも１０００％だけ減少する。
【０１０３】
「増加した」量又は「増強された」量は、典型的には、「統計学的に有意な」量であり、１．１、１．２、１．３、１．４、１．５、１．６、１．７、１．８、１．９、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、３０、４０、又は５０倍以上（例えば、１００、５００、１０００倍）（これらの間の１より大きい全ての整数及び小数点、例えば、１．５、１．６、１．７、１．８、などを含む）の本明細書に記載される量又はレベルである増加を含んでよい。
【０１０４】
「減少した」量又は「低減された」量又は「より少ない」量は、典型的には、「統計学的に有意な」量であり、約１．１、１．２、１．３、１．４、１．５、１．６、１．７、１．８、１．９、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、３０、４０、又は５０倍以上（例えば、１００、５００、１０００倍）（これらの間の１より大きい全ての整数及び小数点、例えば、１．５、１．６、１．７、１．８、などを含む）の本明細書に記載される量又はレベルである減少を含んでよい。
【０１０５】
「〜から得られる」とは、例えば、ポリヌクレオチド又はポリペプチドなどのサンプルが、所望の生物又は所望の生物内の特定の組織などの、特定の源から単離されるか、又はそれに由来することを意味する。「〜から得られる」はまた、ポリヌクレオチド又はポリペプチド配列が、特定の生物又は生物内の組織から単離されるか、又はそれに由来する状況を指すこともできる。例えば、本明細書に記載される参照ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列は、様々な原核生物又は真核生物から、又はある特定の真核生物内の特定の組織又は細胞から、単離することができる。「治療的に有効量」は、被験体における疾患又は障害を「処置」するのに有効な抗体又は薬物の量を指す。がんの場合、治療的に有効量の薬物は、がん細胞の数を低減し；腫瘍サイズを低減し；末梢器官へのがん細胞浸潤を阻害し（すなわち、ある程度遅延させ、好ましくは停止させ）；腫瘍転移を阻害し（すなわち、ある程度遅延させ、好ましくは停止させ）；腫瘍成長をある程度阻害し；及び／又はがんに関連する１又は複数の症候をある程度軽減することができる。前述の「処置」の定義を参照されたい。
【０１０６】
「慢性」投与は、最初の治療的効果（活性）を長期間維持するための、急性モードに対立するものとしての連続モードでの薬剤の投与を指す。「間欠的」投与は、中断することなく連続的に行われるのではなく、周期的な性質の処置である。
【０１０７】
「ベクター」は、シャトルベクター及び発現ベクターを含む。典型的には、プラスミド構築物はまた、細菌中のプラスミドの複製及び選択のためにそれぞれ、複製起点（例えば、ＣｏｌＥ１複製起点）及び選択マーカー（例えば、アンピシリン又はテトラサイクリン抵抗性）を含むだろう。「発現ベクター」は、本開示の抗体断片を含む抗体の、細菌細胞又は真核細胞における発現に必要な制御配列又は調節要素を含むベクターを指す。適したベクターを以下に開示する。
【０１０８】
用語「抗体」は、最も幅広い意味で使用され、具体的には、モノクローナル抗体（完全長モノクローナル抗体を含む）、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、及び抗体断片（それらが所望の生物学的活性又は機能を示す限り）を包含する。
【０１０９】
「抗体断片」は、完全長抗体の一部、一般的に抗体の抗原結合又は可変領域を含む。抗体断片の例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ'、Ｆ（ａｂ'）２、及びＦｖ断片；ダイアボディ；直鎖抗体；１本鎖抗体分子；及び抗体断片から形成された多重特異性抗体が含まれる。
【０１１０】
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識及び抗原結合部位を含む最小抗体断片である。この断片は、緊密に非共有会合した１つの重鎖及び１つの軽鎖可変領域ドメインのダイマーから成る。これらの２つのドメインの折り畳みから、６つの超可変ループ（３つのループがそれぞれＨ及びＬ鎖に由来する）が生じ、この超可変ループは、抗原結合のためのアミノ酸残基に寄与し、抗原に対する結合特異性を抗体に与える。しかしながら、単一の可変ドメイン（又は抗原に特異的な３つの相補性決定領域（ＣＤＲ）のみを含むＦｖの半分）でさえ、結合部位全体よりも低い親和性でではあるが、抗原を認識してそれに結合する能力を有する。
【０１１１】
本明細書で使用される用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指す、すなわち、集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る、天然に存在する可能性のある突然変異を除いては、同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一の抗原性部位に対して向けられる。さらに、様々な異なる決定基（エピトープ）に対して向けられる様々な異なる抗体を典型的に含む、従来の（ポリクローナル）抗体調製とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対して向けられる。修飾語「モノクローナル」は、抗体の実質的に均一な集団から得られるという抗体の特性を示し、任意の特異的方法による抗体の産生を必要とするものとは解釈されない。例えば、本開示に従って使用されるモノクローナル抗体は、Kohler et al., Nature 256:495 (1975)によって最初に説明されたハイブリドーマ法によって作製することができ、又は組換えＤＮＡ法（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号を参照されたい）によって作製することができる。「モノクローナル抗体」はまた、例えば、Clackson et al., Nature 352:624-628 (1991)及びMarks et al., J. Mol. Biol. 222:581-597 (1991)において説明される技術を使用して、ファージ抗体ライブラリーから単離することもできる。
【０１１２】
用語「可変」は、可変ドメイン（Ｖドメイン）のある特定のセグメントの配列が抗体間で広範囲に異なるという事実を指す。Ｖドメインは抗原結合を媒介し、特定の抗体の、その特定の抗原に対する特異性を規定する。しかしながら、可変性は、可変ドメインの１０アミノ酸スパンにわたって均一に分布していない。代わりに、Ｖ領域は、それぞれ９−１２アミノ酸長の「超可変領域」と呼ばれる極度に可変性のより短い領域によって分離された、１５−３０アミノ酸のフレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる比較的不変のストレッチから成る。天然の重鎖及び軽鎖の可変ドメインはそれぞれ、４つのフレームワーク領域（ＦＲ）を含む。フレームワーク領域は、主にβシート構成を採用しており、３つの超可変領域に連結されており、超可変領域はループ連結を形成し、場合によってはβシート構造の一部を形成する。各鎖中の超可変領域は、ＦＲによって近接して共に保持され、他の鎖由来の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)を参照されたい）。定常ドメインは、抗原に対する抗体の結合に直接関与しないが、抗体依存性細胞性細胞障害活性（ＡＤＣＣ）における抗体の関与などの、様々なエフェクター機能を示す。
【０１１３】
本明細書で使用される場合、用語「超可変領域」は、抗原結合に関与している抗体のアミノ酸残基を指す。超可変領域は一般的に、ＣＤＲ由来のアミノ酸残基（例えば、ＶＬ中のおよそ残基２４−３４（Ｌ１）、５０−５６（Ｌ２）及び８９−９７（Ｌ３）、及びＶＨ中のおよそ残基３１−３５Ｂ（Ｈ１）、５０−６５（Ｈ２）及び９５−１０２（Ｈ３）（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)）及び／又は「超可変ループ」由来の残基（例えば、ＶＬ中の残基２６−３２（Ｌ１）、５０−５２（Ｌ２）及び９１−９６（Ｌ３）、及びＶＨ中の２６−３２（Ｈ１）、５２Ａ−５５（Ｈ２）及び９６−１０１（Ｈ３）（Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)）を含む。
【０１１４】
「キメラ」抗体（免疫グロブリン）は、特定の種に由来する又は特定の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一又は相同の重鎖及び／又は軽鎖の一部を有しており、鎖の残部は、別の種に由来する又は別の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体、及びそのような抗体の断片（それらが所望の生物学的活性を示す限り）の対応する配列と同一又は相同である（米国特許第４，８１６，５６７号；及びMorrison et al. Proc. Natl Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984)）。本明細書で使用されるヒト化抗体は、キメラ抗体のサブセットである。
【０１１５】
「ヒト化」形態の非ヒト（例えば、マウス）抗体は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限の配列を含むキメラ抗体である。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体は、レシピエントの超可変領域残基が、所望の特異性、親和性、及び能力を有するマウス、ラット、ウサギ又は非ヒト霊長類などの非ヒト種（ドナー抗体）由来の超可変領域残基によって置換されている、ヒト免疫グロブリン（レシピエント又はアクセプター抗体）である。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体は、ヒト細胞に由来する又はヒト抗体遺伝子を発現するトランスジェニック動物（典型的にはマウス）に由来する抗体である。
【０１１６】
一つの態様において、ＣＤＨ−１７に対する特異性を有する抗体又はその抗原結合断片が、本明細書において提供される。腫瘍関連抗原は、それらの腫瘍成長促進活性を阻害することによって、及び細胞傷害性活性を腫瘍細胞に向けることによって、抗腫瘍免疫療法の標的として機能し得る。カドヘリン−１７は、細胞接着分子のカドヘリンスーパーファミリーに属する、クラス１原形質膜糖タンパク質である。それは、そのエクトドメインに７つのカドヘリン又はカドヘリン様反復を保有する非古典的カドヘリンである。カドヘリン−１７（ＣＤＨ−１７）は、腫瘍成長に関与する腫瘍関連抗原である。結腸、小腸、及び膵管の腸上皮細胞に通常限定されるＣＤＨ−１７発現は、結腸腺がん、胃腺がん、肝細胞がん及び膵臓腺がんを含むいくつかの腫瘍タイプにおいて過剰発現される。腫瘍成長促進活性は、ＣＤＨ１７ドメイン６のＲＧＤモチーフと、α２β１などのインテグリンとの間の結合を伴う可能性がある。血液中及びエキソソーム中のＣＤＨ−１７レベルの異常な増加は、予後がんマーカーとして機能し得る。
【０１１７】
プロテオミクス及び腫瘍ゲノミクスアプローチを使用して、治療標的、肝臓−腸カドヘリン又はカドヘリン−１７（ＣＤＨ１７）が本明細書に開示される。この標的は、胃がん（ＧＣ）及び肝細胞がん（ＨＣＣ）の大多数において、並びに膵臓がん、結腸がん、卵巣がん及び肺がんにおいて、過剰発現される。ＣＤＨ１７遺伝子のＲＮＡｉサイレンシングは、確立されたＨＣＣマウスモデル（異種移植及び同所性の両方）において、腫瘍成長及び転移性の広がりを阻害することができた。根本的な抗腫瘍メカニズムは、腫瘍サプレッサー経路再活性化に付随するＷｎｔシグナル伝達の不活性化に基づく。
【０１１８】
本出願において提示される抗ＣＤＨ１７抗体は、肝臓がん及び胃がんの複数のインビトロ及びインビボ系において、抗腫瘍効果を示している。当該抗体は、インビトロ及びインビボ精製、検出、診断的用途及び治療的用途を有する。当該抗体は、腫瘍細胞に選択的に結合することによって抗腫瘍活性を支持し、補体結合、抗体依存性細胞障害活性、コンジュゲートされた薬物によって媒介される細胞障害活性、リンパ球媒介細胞障害活性及びＮＫ媒介細胞障害活性を刺激するように、開発され得る。本明細書では、以下に提供される対応する配列番号として記載されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む、抗体及びヒト化抗体、抗原結合断片又はキメラ抗体タンパク質が提供される。
【０１１９】
ＣＤＨ１７抗体配列は、マウス抗体（Ｌｉｃ３及びＬｉｃ５；図１）及びそれらのヒト化変異体（図２−９）、ファージライブラリースクリーニングから単離されたヒト抗体（図１０−１２）、ＡＤＣＣを支持するアイソタイプを有する単一特異性抗体、補体結合、及び細胞傷害性抗がん活性のための薬物コンジュゲート（好ましいコンジュゲート部分は、イリノテカン、オーリスタチン、ＰＢＤ、マイタンシン、アマニチン、スプライソソーム阻害剤及び他の化学療法剤である）（図１３）、様々な操作された抗体断片（Ｆａｂ、ｓｃＦｖ、ダイアボディなど）を含む二重特異性抗体などの、様々なタイプの抗体を含んでよい。好ましい形態は、ノブイントゥホール（ｋｎｏｂｓ−ｉｎｔｏ  ｈｏｌｅｓ）及び「Ｂｉｔｅ」（図１４の例の配列）を含む。
【０１２０】
いくつかの実施形態において、マウスＣＤＨ１７抗体、Ｌｉｃ５  ｓｃＦｖ及びＬｉｃ３  ｓｃＦｖは、それぞれ、ＥＬＩＳＡアッセイにおいて、ＣＤＨ１７に結合する能力を示す（図１５−１６）。Ｌｉｃ３及びＬｉｃ５  ｓｃＦｖの結合親和性もまた、ＥＬＩＳＡによって決定することができ、ＳｃＦｖ  ｌｉｃ  ３及びｓｃＦｖ  ｌｉｃ５のＫｄは、それぞれ１１．８８ｎＭ及び２２．０６ｎＭであった（図１７）。
【０１２１】
別の態様において、Ｌｉｃ５のヒト胃がん細胞への内在化は、図１８に示されるように、抗体薬物コンジュゲートの候補を示す。図１８において、（ａ）は、示される時間におけるＤＡＰＩ（青）及びＬｉｃ５−ＦＩＴＣ（緑）の染色を示す写真であり、（ｂ）は、示される時間におけるＤＡＰＩ（青）及びＬｉｃ５−ＦＩＴＣ（緑）の統合された染色を示す写真であり、３０分間にわたる３７℃でのＯｕｍ１ヒト胃がん細胞におけるＬｉｃ５−ＦＩＴＣ（緑）内在化は、共焦点顕微鏡法によって決定し、核はＤＡＰＩで染色した。
【０１２２】
いくつかの実施形態において、標準的なハイブリドーマ技術によって、２００を超えるＣＤＨ１７モノクローナル抗体を生成した。ヒト化Ｌｉｃ３  ｓｃＦｖＦｃを、４つのｃＤＮＡ発現構築クローン（ｈＬ３．１−３．４）で遺伝子導入したＣＨＯ細胞から発現させた。遺伝子導入した又はｍｏｃｋ遺伝子導入したＣＨＯからの培養培地を、ＣＤＨ１７Ｆｃでコーティングされた９６ウェルプレートに添加した。抗マウスＦｃ  ＨＲＰコンジュゲートを使用して結合を決定した。結合を、これもＣＨＯ細胞において産生されたマウスＬｉｃ３  ｓｃＦｖＦｃ（ｍＬｉｃ３  ｓｃＦｖ）の結合と比較した（図１９）。
【０１２３】
一つの態様において、改変されたヒトＩｇＧ４  Ｆｃ（ＣＤＨ１７Ｆｃ）に融合された７つのカドヘリン反復（Ｄ１−７）のエクトドメイン全体を保有する組換えＣＤＨ１７で、マウスを免疫化した。ハイブリドーマ培養培地は、ＣＤＨ１７Ｆｃへの結合及びＩｇＧ４  Ｆｃへの結合の欠如についてのスクリーンであった。標準的なＰＣＲ法によって、Ｄ１、Ｄ１−２、Ｄ１−３、Ｄ３−４、Ｄ６及びＤ５−７を保有するＣＤＨ１７Ｆｃトランケートを生成した。各トランケートに特異的に結合したＣＤＨ１７抗体が同定され、例を図２０に示している。７つ全てのエクトドメインを保有するＣＤＨ１７又はドメイン１−２、ドメイン３−４、ドメイン５−６又はドメイン６を保有するトランケートに対する結合について、１３の新規のＣＤＨ１７モノクローナル抗体のパネルをＥＬＩＳＡによって分析した。抗体エピトープは、異なるドメインに局在化した。驚くべきことに、ある特定の抗体の結合がＣＨＯ細胞において産生されたＣＤＨ１７に限定されることが見出された一方で、他の抗体の結合が２９３Ｆ細胞において産生されたＣＤＨ１７に限定されることが見出された。
【０１２４】
別の態様において、ＣＤＨ１７依存性ホモタイプ及びヘテロタイプ相互作用に関係しているＤ１、Ｄ６及びＤ１及びＤ６ドメインに結合した抗体を同定した。フローサイトメトリーによる、ＣＤＨ１７陽性腫瘍細胞株へのＣＤＨ１７抗体の結合は、予期しない結果を生じた（図２１）。多くの異なる結合プロファイルが観察され、細胞タイプ特異的に発現される異なる形態のＣＤＨ１７が存在することが示唆された。この考えは、２９３Ｆ細胞に対する、ＣＨＯ細胞において産生された組換えＣＤＨ１７へのＣＤＨ１７抗体の結合の差異によって、さらに支持される。それ故に、これらの新規のＣＤＨ１７抗体は、ある組織で発現され別の組織では発現されないＣＤＨ１７を選択的に標的化するために使用することができる。
【０１２５】
いくつかの実施形態において、第二世代ＣＡＲである、ＣＡＲ７、７ｂ、８及び９を設計し分析した。ヒト化Ｌｉｃ３  ｓｃＦｖ、ＣＤ８又はＩｇＧ１ヒンジ、ＣＤ８又はＣＤ２８膜貫通ドメイン、ＣＤ１３７又はＣＤ２８エンドドメイン及びＣＤ３ゼータ（アイソフォーム１／２又は３／４）エンドドメインで、ＣＡＲを構築した（図２２Ａ）。レンチウイルス形質導入の４日後のＪｕｒｋａｔ細胞をＦＡＣＳ分析によって分析した。これは、可溶性組換えＣＤＨ１７Ｆｃ結合によるＧＦＰ発現及びＣＡＲ発現を示す（図２２Ｂ）。抗Ｆｃ蛍光色素コンジュゲートを使用することによって、ＣＡＲへのＣＤＨ１７結合を決定した。さらに、様々な異なるＣＡＲを発現するＪｕｒｋａｔ細胞を、ＣＤＨ１７Ｆｃ、ＥＧＦＲＦｃ（対照）、又はタンパク質なし（ＮＡ）でコーティングされた９６ウェルプレートに播種した。Ｉｍｍｕｎｏｃｕｌｔ（ＣＤ３−ＣＤ２８複合体）を、Ｊｕｒｋａｔ細胞を含有するいくつかのコーティングされていないウェルに添加した。培養培地中のＩｌ−２レベルを、４８時間の刺激後に、ＥＬＩＳＡによって測定した（図２３）ところ、ＩＬ２産生はシグナル伝達の機能として評価することができることが示された。
【０１２６】
いくつかの実施形態において、ＣＤＨ１７抗体は、アルファ２ベータ１を含むインテグリンへの、ＣＤＨ１７ドメイン６のＲＧＤ部位の結合に拮抗し得る。
【０１２７】
別の態様において、ＣＤＨ１７に対する特異性を有する二重特異性抗体が開示される。この二重特異性抗体は、以下の特徴のうち少なくとも１つを有することができ、特徴としては以下のものが含まれるが、これらに限定されない。細胞性細胞障害活性を活性化させる様式で、腫瘍細胞（ＣＤＨ１７）を細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞受容体（例えばＣＤＨ１７／ＣＤ３）と連結することにより、腫瘍細胞を殺滅すること、細胞障害活性又はケモカイン産生及び免疫細胞動員を刺激する、リンパ球／ＮＫ／単核球細胞アクチベーター（例えば４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ２７、ＣＤ４０、ＴＩＭ−１、ＣＤ２８、ＨＶＥＭ、ＧＩＴＲ、ＩＣＯＳ、ＩＬ１２受容体、ＩＬ１４受容体）を結合することにより、抗がん活性を増加させること、免疫チェックポイントインヒビター（ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＴＩＧＩＴ、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−Ｌ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ）をブロックすること、血管新生因子（例えばＶＥＧＦ）をブロックすること。ＣＤＨ１７は、細胞傷害性薬物（例えばシスプラチン、ゲムシタビン、イリノテカン）又は他の抗腫瘍抗体との併用療法において使用することができる。
【０１２８】
いくつかの実施形態において、ＣＤＨ１７特異的ｓｃＦｖは、Ｔ及びＮＫ細胞媒介性腫瘍細胞の細胞障害活性を支持する第二世代又は第三世代キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）として操作される（図２４−２６の配列及び設計）。ＣＤＨ１７特異的ＣＡＲ  Ｔ細胞及びＣＡＲ  ＮＫ細胞は、様々な異なるタイプの固形腫瘍を殺滅することができ、固形腫瘍としては、肝臓、胃、結腸、膵臓、及び肺の固形腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。したがって、ＣＤＨ１７は、例えば、肝臓がん及び胃がんに関連する、様々な状態のために使用することができる。
【０１２９】
ＣＤＨ１７は、際立ったがんバイオマーカーであり、肝臓がん及び胃がんの両方において過剰発現されるが、正常で健康な成体組織においては過剰発現されない。ＣＤＨ１７は、転移表現型のがんにおいて高度に発現され、ＣＤＨ１７のブロックは、ＨＣＣの肺転移を顕著に低減する。ＣＤＨ１７マーカーを標的とするモノクローナル抗体は、肝臓腫瘍及び胃腫瘍の成長を阻害することができる。ＣＤＨ１７ヒト化抗体は、腫瘍組織中に及び／又は血清サンプル中にＣＤＨ１７バイオマーカーを示すがん患者を処置するために、臨床的に使用することができる。抗ＣＤＨ１７  ｓｃＦｖ分子は、概念実証インビボモデル研究のためのＣＡＲ  Ｔベクターを生成するように選択される。
【０１３０】
臨床サンプルに由来する腫瘍抗原を、腫瘍拘束性ＣＤＨ１７エピトープに対する特異性を有する抗体について選択した。したがって、Ｌｉｃ５  ｍＡｂ及びＬｉｃ３  ｍＡｂの両方が、ＨＣＣ及びＧＣの腫瘍細胞のみに結合することが示された。抗体親和性を（計算機モデリングを介して）低下させる及び／又は変化させることによって、ＣＤＨ１７−ＣＡＲ−Ｔ細胞の腫瘍細胞表面への結合の差異が増強されるだろう。
【０１３１】
大部分の固形腫瘍は、脈管構造及び免疫細胞に取り囲まれ、免疫抑制環境によって特徴付けられる。がんにおける、多数の調節性Ｔ細胞の存在及び免疫チェックポイント因子（ＰＤ１及びＴＩＭ−３）の遮断は、ＣＡＲ−Ｔ細胞の有効性に影響を及ぼし得る免疫寛容状態に有利に働くだろう。この問題に対処するために、ＣＡＲ−Ｔビヒクル中に抗ＰＤ１／抗Ｔｉｍ３二重特異性成分を作製し、免疫チェックポイントバリアを回避した。加えて、この抗ＰＤ１／Ｔｉｍ３成分が腫瘍微小環境に関与すると、それはＣＡＲ−Ｔ細胞の抗腫瘍細胞傷害性活性に切り替わり、効能を増強して安全性を改善する。
【０１３２】
人工Ｔ細胞受容体としても知られる、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）は、操作された免疫受容体であり、モノクローナル抗体の特異性を持ち、レトロウイルスベクターの助けによってＴ細胞に移植される。ＣＡＲによって操作されたＴ細胞は、がん細胞を認識して殺滅することができ、大幅な臨床的利益を示す。
【０１３３】
臨床用途のためのキメラＩｇＧＦｃ−融合タンパク質が本明細書中に開示される。例となるキメラＩｇＧ−融合タンパク質には、自己免疫性疾患及びウイルス感染の治療的介入のための、可溶性形態のＩＣＡＭ−１及びＩＣＡＭ−２が含まれる。ＣＡＲ−Ｔベクターは、ｍＡｂに由来するｓｃＦｖドメイン、リンカー、及び細胞質ドメインで構築され、ここで、ＣＡＲ−Ｔベクターの様々な異なる世代が、（活性化シグナル及び共刺激シグナルのための）３つのＩＴＡＭを含む単純な形態のＣＤ３−ゼータから、増殖シグナル／生存シグナルを提供するためにＣＤ２８及びＯＸ４０を含む最近の第三世代に進化してきた。ＣＡＲ−Ｔベクターに基づきレンチウイルスの第三世代にクローニングするために、本明細書中に開示されるＣＤＨ１７特異的クローン（Ｌｉｃ３及びＬｉｃ５）から、ｓｃＦｖセグメントを設計した。
【実施例】
【０１３４】
本開示は、以下の例を参照してさらに説明される。これらの例は、別段の定めがない限り、例示の目的のみのために提供され、限定することは意図されない。したがって、本開示は、以下の例に限定されるものとして解釈されるべきでは決してなく、本明細書において提供される教示の結果として明らかになる任意の及び全てのバリエーションを包含するものとして解釈されるべきである。
【０１３５】
例１．  研究設計及び方法
【０１３６】
同所性腫瘍異種移植モデルを使用して、腫瘍成長阻害及び動物生存に対する、単独での又はシスプラチン又はエピルビシンと組み合わせたときの、Ｌｉｃ５の効果を試験した。ヒトＨＣＣ細胞株ＭＨＣＣ９７−Ｌ（９７Ｌ）及びＰＬＣ／ＰＲＦ／５（ＰＬＣ）を使用した。単独のＬｉｃ５、シスプラチン及びエピルビシン処置は、細胞増殖アッセイを使用して培養されたＨＣＣ細胞の成長を阻害したが、Ｌｉｃ５と共にシスプラチン又はエピルビシンを使用した場合には、より顕著な減少が観察された。同所性腫瘍を有するヌードマウスを処置するために同じ実験群を適用した場合には、成長阻害の類似の傾向が観察された。
【０１３７】
Ｌｉｃ５の処置は、対照群と比較して、同所性腫瘍を有するヌードマウスの生存を増強した。全ての実験群の中で、Ｌｉｃ５及びエピルビシンの併用群が、最良の生存をもたらした。次の段階の抗体ヒト化のために、Ｌｉｃ５の軽鎖及び重鎖上の可変領域上の相補性決定領域（ＣＤＲ）を同定した。１０％熱不活性化ウシ胎児血清（ＦＢＳ）（Life Technologies）、１００単位／ｍｌペニシリン及びストレプトマイシン（Life Technologies）が補充されたダルベッコ変法イーグル培地（ＤＭＥＭ）（Life Technologies, Grand Island, NY, USA）中で、両方の細胞株を培養した。培養細胞を、５％二酸化炭素を含む３７℃の加湿雰囲気中に維持した。
【０１３８】
例２．  Ｌｉｃ５、ＣＤＨ１７に対する所内モノクローナル抗体の産生及び特徴付け
【０１３９】
説明されるように、Ｌｉｃ５を分泌する所内ハイブリドーマ細胞株を生成した［５］。ハイブリドーマ細胞を、１０％  ＦＢＳ及び１００単位／ｍｌペニシリン及びストレプトマイシンが補充されたＤＭＥＭ中に維持した。Ｌｉｃ５を回収するために、ハイブリドーマ細胞を、無血清ハイブリドーマ−ＳＦＭ（Life Technologies）中で６日間培養した。培養上清を回収し、タンパク質Ｇカラム（Life Technologies）を使用して精製した。精製されたＬｉｃ５の濃度を、ＲＣ  ＤＣタンパク質アッセイ（Bio-Rad, Hercules, CA, USA）を使用して推定した。還元条件下でのドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）と、それに続くクーマシーブルー染色によって、Ｌｉｃ５の純度を評価した。９７Ｌ細胞溶解物を使用するウエスタンブロットによって、及びパラフィン包埋ヒトＨＣＣ組織を使用する免疫組織化学によって、Ｌｉｃ５の免疫反応性及び特異性を確認した。研究のための臨床標本の使用は、香港大学／医院管理局香港西クラスタの施設内治験審査委員会（ＨＫＵ／ＨＡ  ＨＫＷ  ＩＲＢ）によって承認された。ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、クーマシーブルー染色及びウエスタンブロットのための手順は、日常的に実施されるものであったが、免疫組織化学のための方法は以下に説明した。
【０１４０】
例３．  インビトロ細胞増殖アッセイ
【０１４１】
所定の数の９７Ｌ及びＰＬＣ細胞を、９６ウェル培養プレート上に１日間播種した。１５０ｕｇ／ｍｌのマウスＩｇＧ（Sigma-Aldrich, St Louis, MO, USA）をＬｉｃ５の対照とした。処置後、処置した細胞の増殖を、細胞増殖キットＩ（Roche, Indianapolis, IN, USA）を使用して、説明されるように、測定した。手短に言えば、ＭＴＴ試薬を処置した細胞と共に４時間インキュベートした。次いで、１０％  ＳＤＳの添加後に、比色シグナルを測定した。結果確認のために、独立した細胞増殖ＭＴＴアッセイを少なくとも２回実施した。
【０１４２】
例４．  同所性腫瘍異種移植モデル
【０１４３】
香港の香港大学の実験動物ユニットから、オスヌードマウスを得た。動物を、１２時間の明／１２時間の暗サイクル下で、且つオートクレーブ水及び固形飼料に自由にアクセスできる状態で、個別に換気されたケージに収容した。この研究において実施された動物実験は、我々の研究所の、教育及び研究における生動物の使用に関する委員会（Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ  ｏｎ  ｔｈｅ  Ｕｓｅ  ｏｆ  Ｌｉｖｅ  Ａｎｉｍａｌｓ  ｉｎ  Ｔｅａｃｈｉｎｇ  ａｎｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ（ＣＵＬＡＴＲ））によって承認された。成長する同所性肝臓腫瘍のインビボ観察を可能にするために、すでに確立されたルシフェラーゼ標識９７Ｌ細胞株を使用した。５ｘ１０６のルシフェラーゼ標識９７Ｌ細胞をヌードマウスの皮下に注射し、皮下腫瘍を成長させた。これらの皮下腫瘍を、サイズが２００−３００ｍｍ３に達したときに採取し、腫瘍種として使用して、標準的な手順に従って、ヌードマウスの別個の群に同所性肝臓腫瘍を確立した。同所性腫瘍移植の５日後、３週間にわたる３回／週の腹腔内投与により、マウスは以下のような異なる処置を受けた（各群中に１０−１１匹のマウス）：（１）６ｍｇ／ｋｇ  Ｌｉｃ５；（２）１ｍｇ／ｋｇシスプラチン；（３）１ｍｇ／ｋｇエピルビシン；（４）Ｌｉｃ５及びシスプラチンの併用処置；（５）Ｌｉｃ５及びエピルビシンの併用処置；（６）Ｌｉｃ５対照としての６ｍｇ／ｋｇマウスＩｇＧ。１５０ｍｇ／ｋｇのルシフェリンカリウム（Gold Biotechnology, St Louis, MO, USA）の腹腔内注射の後、ＩＶＩＳ  １００インビボイメージングシステム（Perkin Elmer, Waltham, MA, USA）でのライブイメージングによって、処置後毎週、同所性腫瘍の成長及び転移をモニターした。各測定について、各腫瘍についての正味の光子カウント数を得た。実験の最後に、同所性腫瘍を回収し、ホルマリン固定及びパラフィン包埋に供した。
【０１４４】
例５．  動物生存研究
【０１４５】
９７Ｌ細胞を使用して、上記のように同所性肝臓腫瘍を確立した。同所性腫瘍を有するマウスは、腹腔内に、３週間にわたり３回／週で以下の処置を受けた（各群中に１１−１５匹のマウス）：（１）８ｍｇ／ｋｇ  Ｌｉｃ５；（２）１ｍｇ／ｋｇシスプラチン；（３）１ｍｇ／ｋｇエピルビシン；（４）Ｌｉｃ５及びシスプラチンの併用処置；（５）Ｌｉｃ５及びエピルビシンの併用処置；（６）Ｌｉｃ５対照としての８ｍｇ／ｋｇマウスＩｇＧ。処置後６週間まで、動物生存を連続してモニターした。
【０１４６】
例６．  免疫組織化学
【０１４７】
説明されるように、パラフィン包埋された同所性腫瘍異種移植片及びヒトＨＣＣ標本について、免疫組織化学を実施した。手短に言えば、脱パラフィン及び再水和のために、６ｕｍ切片を調製した。抗原回復及び過酸化水素処置の後、切片を３％ウシ血清アルブミンでブロッキングし、アルファ−カテニンに対するマウスモノクローナル抗体（1:200; BD Biosciences, San Jose, CA, USA）及びＬｉｃ５（０．０６２５ｕｇ／ｍｌ）で、一晩４℃で染色した。ＥｎＶｉｓｉｏｎ＋  Ｓｙｓｔｅｍ−ＨＲＰ標識ポリマー抗マウス（Dako, Carpinteria, CA, USA）を使用してシグナルを検出し、液体ＤＡＢ＋基質色原体システム（Dako）を使用して可視化した。ヘマトキシリンを使用して対比染色を実施した。ＤＸＭ１２００Ｆデジタルカメラ（Nikon, Melville, NY, USA）を使用して画像を捕捉した。
【０１４８】
例７．  Ｌｉｃ５の可変領域のクローニング
【０１４９】
ＴＲＩｚｏｌ試薬（Life Technologies）を使用してＬｉｃ５分泌ハイブリドーマ細胞から全ＲＮＡを抽出し、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩＩファーストストランド合成システム（Life Technologies）を使用してｃＤＮＡに変換した。Ｉｇ−プライマーセット（Novagen, Germany）及びＰｌａｔｉｎｕｍ  Ｔａｑ  ＤＮＡポリメラーゼハイフィデリティ（Life Technologies）を使用して、Ｌｉｃ５の重鎖及び軽鎖由来の可変領域ｃＤＮＡ断片を増幅した。軽鎖の可変領域を、定常領域上の５'可変領域プライマー（5'- ATGGAGACAGACACACTCCTGCTAT-3'）及び３'プライマーによって増幅し、重鎖の可変領域を、定常領域上の５'可変領域プライマー（5'- ATGAACTTYGGGYTSAGMTTGRTTT-3'、ここで、Y=C/T、S=C/G、M=A/C、及びR=A/Gである）及び３'プライマーによって得た。１．５％アガロースゲルで分離した後のＰＣＲ産物を精製し、配列決定した（BGI, Hong Kong）。
【０１５０】
例８．  Ｌｉｃ５のＣＤＲの同定
【０１５１】
Ｌｉｃ５の重鎖及び軽鎖の可変領域のヌクレオチド配列を使用してアミノ酸配列を導いた。次いで、Ｋａｂａｔナンバリングスキームに従ってこのアミノ酸配列をナンバリングした。Ｋａｂａｔ定義に従ってＣＤＲを同定した（www.bioinf.org.uk）。
【０１５２】
例９．  統計的分析
【０１５３】
ＳＰＳＳバージョン１９（SPSS Inc., Chicago, IL, USA）を使用して統計的分析を実施した。棒グラフで示されるデータは、平均±ＳＤ／ＳＥＭとして表される。スチューデントのｔ検定を使用して、細胞増殖ＭＴＴアッセイ及び動物腫瘍異種移植実験の両方における、処置群と対照群との間の差の有意性を計算した。生存分析のためにカプラン・マイヤー法を採用したが、生存の差は対数順位検定を使用して計算した。０．０５未満のｐ値を統計的に有意であるとした。
【０１５４】
例１０．  ハイブリドーマ細胞培養上清からの大量のＬｉｃ５の確立及び精製
【０１５５】
インビトロ実験及びインビボ実験のための高い純度及び数量のＬｉｃ５を得るために、無血清培地中でＬｉｃ５分泌ハイブリドーマ細胞を培養した。このように、Ｌｉｃ５の精製は、パイプラインを確立するための良好な抗体純度及び収量を大いに達成している。クーマシーブルー染色の結果は、６日目の培養上清で、抗体の重鎖及び軽鎖に対応する約５５ｋＤａ及び２７ｋＤａの２つの際立ったバンドを示したが、これらのバンドは１日目の培養上清では観察されなかった。検出可能なレベルの抗体が存在する、６日目に回収された培養上清を、抗体精製のためにタンパク質Ｇアフィニティークロマトグラフィーに供した。６日目の培養上清をカラムにローディングした後、フロースルー中で抗体の存在が検出されない場合に、タンパク質Ｇカラムへの抗体の結合が成功したことが確認された。異なる画分（溶出液Ｅ１〜Ｅ４）で実施された抗体溶出は、第２の及び第３の溶出画分が最も豊富な抗体を含有したことを示した。抗体の重鎖及び軽鎖に対応する２つの染色されたバンドは、タンパク質ゲル上で検出された主たるバンドであり、我々の抗体の純度が９０％を超えることを示す（図３０（Ａ））。我々の抗体精製パイプラインを使用して、６日目に回収された培養上清１リットルから、２３．８８±６．９６ｍｇ  Ｌｉｃ５の量で、好ましい抗体を回収した。
【０１５６】
精製されたＬｉｃ５は、ＣＤＨ１７に対して高い免疫反応性を示した。Ｌｉｃ５をウエスタンブロットの一次抗体として使用した場合、ＣＤＨ１７を発現する９７Ｌ細胞において、ＣＤＨ１７の見かけの分子量に対応する約１２０ｋＤａの単一のバンドを検出した（図３０（Ｂ））。ヒトＨＣＣ組織において、ＣＤＨ１７を検出するために、免疫組織化学にＬｉｃ５を使用した場合、細胞膜及び細胞質において、離散した染色が現れた（図３０（Ｃ））。この研究においてＬｉｃ５を使用することによって生成した免疫組織化学的染色は、免疫組織化学にＣＤＨ１７に対する市販の抗体を使用した以前の報告と類似していた。
【０１５７】
例１１．  Ｌｉｃ５の延命効果
【０１５８】
別の化学療法薬物エピルビシンに対するＬｉｃ５の化学療法増感効果を調べた。同所性腫瘍異種移植モデルにおいて、Ｌｉｃ５の有り無しで、薬物試験を実施した。
【０１５９】
精製されたＬｉｃ５で同所性腫瘍を有するマウスを処置する前に、細胞増殖ＭＴＴアッセイを使用して、インビトロの培養ＨＣＣ細胞株における、単独での又はシスプラチン又はエピルビシンと組み合わせたときの、Ｌｉｃ５の抗腫瘍効果を調べた（図３１（Ａ））。培養９７Ｌ細胞に細胞増殖アッセイを実施したところ、シスプラチン及びエピルビシンでの２日間の処置は、それぞれ、３１．６％及び２１．９％の成長阻害を生じた。Ｌｉｃ５との併用は、シスプラチンについて１．７４倍及びエピルビシンについて１．９８倍、成長阻害効果をさらに増強し、それぞれ５５．１％及び４３．３％の成長阻害をもたらした（図３１（Ａ）、左のパネル）。類似の成長阻害が培養ＰＬＣ細胞において観察された。ここで、シスプラチンでの処置は３７．６％の成長阻害をもたらし、Ｌｉｃ５との併用処置は、１．７３倍（６５．２％）、成長阻害をさらに増加させた。培養９７Ｌ細胞でのエピルビシンの有意な成長阻害とは異なり、この薬物は、培養ＰＬＣ細胞の成長を８．１％だけしか阻害しなかった。同様に、Ｌｉｃ５とのその併用は、成長阻害を４．６２倍増強し、３７．４％の有意な阻害をもたらした（図３１（Ｂ）、右のパネル）。
【０１６０】
タンパク質Ｇアフィニティークロマトグラフィーを使用して、Ｌｉｃ５分泌ハイブリドーマ細胞株の培養上清からＬｉｃ５を精製した。図３１（Ａ）は、クーマシーブルーで染色したゲル上で、６日目（Ｄ６）の培養上清（培養Ｓ／Ｎ）が１日目（Ｄ１）より高い抗体量を含有していたことを示す。抗体の重鎖及び軽鎖に対応する、約５５ｋＤａ及び２７ｋＤａのサイズを有する２つの染色されたバンドを、ゲル上で可視化した。６日目の培養上清をタンパク質Ｇカラムに通した後のフロースルー（ＦＴ）中に抗体は検出されなかった。４つの画分（Ｅ１〜Ｅ４）で抗体溶出を実施した。最も豊富な抗体は画分Ｅ２及びＥ３中に溶出され、これを回収しプールした。加えて、図３１（Ａ）は、細胞増殖ＭＴＴアッセイにおいて、２日間のＬｉｃ５、シスプラチン又はエピルビシンの単独処置が、マウスＩｇＧ処置細胞と比較して、培養９７Ｌ及びＰＬＣ細胞の成長を阻害したことを示す。培養細胞を、Ｌｉｃ５のシスプラチン又はエピルビシンとの併用処置下で処置した場合に、さらなる成長阻害が観察された。バーは平均±ＳＤを表す。
【０１６１】
図３１（Ｂ）は、９７Ｌ細胞溶解物のウエスタンブロットに精製されたＬｉｃ５を使用したときに、ＣＤＨ１７の見かけの分子量に対応する単一のバンドが示されたことを示す。図３１（Ｂ）において、ルシフェラーゼ標識９７Ｌ細胞を使用して、ヌードマウスにおいて同所性腫瘍異種移植が確立された。化学療法薬物シスプラチン及びエピルビシンの有り無しで、Ｌｉｃ５の単独及び併用処置を、これらの動物に３週間適用した。示したデータは、処置の３週間後に得られた対照ＩｇＧ群に対する正味の光子カウント数である。単独処置は腫瘍成長阻害をもたらしたが、Ｌｉｃ５をシスプラチン又はエピルビシンと併用した場合には、腫瘍成長のさらなる減少が観察された。バーは平均＋ＳＥＭを表す。
【０１６２】
図３１（Ｃ）は、ヒトＨＣＣ組織での免疫組織化学のために精製されたＬｉｃ５を使用したときに、ＣＤＨ１７の膜及び細胞質局在性に対応する離散した染色が検出されたことを示す。図３１（Ｃ）において、９７Ｌ細胞を使用して、ヌードマウスにおいて同所性腫瘍異種移植が確立された。Ｌｉｃ５及びエピルビシンの単独又は併用処置でこれらの動物を処置した。カプラン・マイヤー曲線で明らかにされたように、Ｌｉｃ５及びエピルビシンの併用処置が最も好ましい生存をもたらした。併用処置群をマウスＩｇＧ対照群と比較した場合に、生存の統計学的有意差が達せられた（ｐ＝０．０１７）。使用される略語：Ｃ、シスプラチン；Ｅ、エピルビシン。＊＊、ｐ＜０．０５；ｎｓ、統計的に有意ではない
【０１６３】
細胞増殖ＭＴＴアッセイを使用することによって、培養ＨＣＣ細胞に対する、シスプラチン及びエピルビシン処置へのＬｉｃ５の化学療法増感効果を確認した後、次のステップは、動物腫瘍異種移植実験によって、インビボ環境において、類似の成長阻害を観察することができるかどうかを調べることであった。処置のための同所性腫瘍異種移植を開発するために、ルシフェラーゼ標識９７Ｌ細胞を使用した。これにより、腫瘍成長のライブモニタリングが可能になる。ＩｇＧ対照群と比較した場合、シスプラチン処置は異種移植片成長を４８．６％阻害した。Ｌｉｃ５と併用した場合の当該処置は、異種移植片成長阻害を、１．６４倍、７９．６％まで、さらに増大させた。そのような阻害にも関わらず、併用処置データは、対照群と比較した場合に統計学的に有意な値をもたらさなかった（ｐ＝０．０８）。エピルビシンについて、そのＬｉｃ５との併用処置は、単独のエピルビシン処置の３７．９％から、８６．４％まで（すなわち２．２８倍）の異種移植片成長のさらなる減少を示した。しかしながら、異種移植片成長におけるそのような低下は依然として、統計学的に有意な値に達しなかった（ｐ＝０．０７）（図３１（Ｂ））。実験の最後に、ＣＤＨ１７の下流分子として知られ、Ｗｎｔシグナル伝達経路の重要なメンバーである、アルファ−カテニンの発現及び局在性を分析するために、同所性腫瘍を回収した。Ｌｉｃ５のシスプラチン又はエピルビシンとの併用処置は両方共、化学療法薬物の単独処置と比較した場合に、アルファ−カテニンの全体的な発現及び細胞質局在性を低減した。そのような免疫組織化学的結果は、Ｌｉｃ５によって、アルファ−カテニンの発現及び局在性の改変に対するその作用を介して媒介される腫瘍抑制効果をさらに強化する。
【０１６４】
図３１（Ｂ）に示されるように、対照群と比較した場合に、全ての処置群について、腫瘍成長減少の傾向が観察された。各処置群の同所性腫瘍を有するマウスの生存率を対照群と比較した。Ｌｉｃ５群の動物生存率は６３．６％に達し、これは対照群の動物生存率（２６．６％）よりもはるかに高かった。対照群とエピルビシン群との間で生存率は類似していた（２６．６％対２５％）が、Ｌｉｃ５及びエピルビシンの併用処置は、対照群と比較した場合に、全ての実験群の中で、生存率の８１％への最も有意な増加をもたらした（ｐ＝０．０１７）（図３１（Ｃ））。しかしながら、シスプラチン群及びシスプラチン及びＬｉｃ５の併用群についての生存のそのような有意差は、対照群と比較した場合に、統計学的に有意な値には達しなかった。まとめると、この一連の動物実験は、特にエピルビシンについての、腫瘍成長阻害及び生存率誘導に対するＬｉｃ５の化学療法増感効果を示している。
【０１６５】
例１３．  Ｌｉｃ５の可変領域上のＣＤＲの同定
【０１６６】
各モノクローナル抗体は、重鎖及び軽鎖上にその独特の可変領域を有し、これらの可変領域のそれぞれは、この抗体の抗原結合特性を決定するアミノ酸の配列から構成される。Ｌｉｃ５の重鎖及び軽鎖から可変領域配列を得るために、個別のプライマー対を使用して各可変領域を増幅した（図３２、左のパネル）。増幅産物のサンガー配列決定法の後、インシリコ法によってヌクレオチド配列をアミノ酸配列に翻訳した。推定アミノ酸配列を使用して、Ｌｉｃ５の重鎖及び軽鎖の可変領域上の３つのＣＤＲを同定するために、Ｋａｂａｔナンバリングスキーム及びＣＤＲ定義を採用した（図３２、右のパネル）。ＰＣＲと、その次にサンガー配列決定法を使用して、Ｌｉｃ５分泌ハイブリドーマ細胞から調製したｃＤＮＡから、Ｌｉｃ５の軽鎖及び重鎖の可変領域配列を得た（図３２、左のパネル）。Ｋａｂａｔナンバリングスキーム及びＣＤＲ定義に基づいて、２つの可変領域（ＶＬ：配列番号２９及びＶＨ：配列番号３０）上の６つのＣＤＲを同定し、異なる色でハイライトした（図３２、右のパネル）。
【０１６７】
本例の結果は、ＨＣＣ異種移植片の処置におけるＬｉｃ５の抗腫瘍効果及び化学療法増感効果を示しており、これは、本明細書中に開示されるモノクローナル抗体が、ＨＣＣに加えて他のがんを処置するのにも有用であり得ることを示している。Ｌｉｃ５は、ＣＤＨ１７の組換えエクトドメイン１−２を免疫原として使用して、Ｌｉｃ３と並行して産生されたモノクローナル抗体であった。Ｌｉｃ５は、ＣＤＨ１７の細胞外領域を標的とし、治療目的のために使用される場合に、ＣＤＨ１７のインタクトな形態又はカルボキシル末端トランケート型形態に結合することができる。それ故に、Ｌｉｃ５は、ＣＤＨ１７過剰発現を伴う他のがんを標的とするために使用することができる。ＨＣＣに加えて、胃腺がん、食道腺がん、及び結腸直腸がんを含む多数のがんがＣＤＨ１７を過剰発現することが見出されている。これらのがんのタイプの中でも、結腸直腸がん及び食道腺がんの大部分に、ＣＤＨ１７過剰発現が存在した。したがって、これらのＣＤＨ１７過剰発現がんは、Ｌｉｃ５の作用を受けやすい可能性がある。ＣＤＨ１７抑制を実施するいくつかの研究は、処置後に培養細胞又は腫瘍異種移植片の成長が減少したことに現れているように、腫瘍形成を妨げた。したがって、腫瘍形成を妨げるためにＣＤＨ１７を標的化することは、ＨＣＣに加えて、ＣＤＨ１７を過剰発現する他のがんにおいても良好に機能する。
【０１６８】
本例の結果は、ＣＤＨ１７がα−カテニン関連ネットワークと関連しているようであることを示している。一つの実施形態において、Ｌｉｃ５を使用してＣＤＨ１７を標的化することは、α−カテニンなどの軸成分の発現及び局在性を妨害することによって、ＣＤＨ１７／α−カテニン軸を不活性化する。別のがんのタイプにおいて、ＣＤＨ１７の内因性インテグリン結合親和性のために、結腸直腸腫瘍形成の間に、ＣＤＨ１７はインテグリン関連経路に架橋された。ＣＤＨ１７は、Ｒａｓ／Ｒａｆ／ＭＥＫ／ＥＲＫ及びＮＦγＢに関連する２つの他の腫瘍形成経路にも影響を及ぼす。そのため、その抑制は、胃がんにおいてこれらの経路を不活性化した。これらの所見を考慮すると、腫瘍形成を抑制するための手段として、Ｌｉｃ５もまたこれらの経路をブロックすることができるかどうかは、まだ決定されていない。
【０１６９】
Ｌｉｃ５の抗腫瘍効果を試験することに加えて、Ｌｉｃ５の重鎖及び軽鎖上の各可変領域上の３つのＣＤＲを同定した。これらのＣＤＲは、抗体結合親和性及び特異性の決定に関与している。
【０１７０】
医薬組成物
【０１７１】
用語「有効量」は、所望の効果を達成する、例えば、被験体において疾患を改善するのに有効な薬物の量を指す。疾患ががんである場合、有効量の薬物は、以下の特性の例のうち１又は複数を阻害する（例えば、ある程度遅延させる、阻害する又は停止させる）ことができ、特性の例としては、がん細胞成長、がん細胞増殖、がん細胞運動性、末梢器官へのがん細胞浸潤、腫瘍転移、及び腫瘍成長が含まれるが、これらに限定されない。疾患ががんである場合、有効量の薬物は、被験体に投与されたときに、以下のうち１又は複数を代替的に行うことができる：腫瘍成長を遅延又は停止させる、腫瘍サイズ（例えば、体積又は質量）を低減する、がんに関連する１又は複数の症候をある程度軽減する、進行のない生存期間を延長する、客観的応答（例えば、部分的な応答又は完全な応答を含む）をもたらす、及び全体の生存期間を増加させる。薬物が既存のがん細胞の成長を防止する及び／又は既存のがん細胞を殺滅することができる限り、その薬物は細胞増殖抑制性及び／又は細胞傷害性である。
【０１７２】
処置を必要とするヒト患者などの被験体に投与するのに適した組成物の処方に関して、本明細書中に開示される抗体は、選択された投与の経路に応じて、本分野において公知の医薬的に許容される担体と混合する又は組み合わせることができる。本明細書中に開示される抗体の適用様式には特に制限はなく、適した投与経路及び適した組成物の選択は、過度の実験をすることなく本分野において公知である。
【０１７３】
多くの形態の投与が可能であるが、投与形態の一例は、注射のための、具体的には静脈内又は動脈内注射のための溶液であろう。通常、注射に適した医薬組成物は、医薬的に適した担体又は添加剤を含んでよく、医薬的に適した担体又は添加剤には、バッファー、界面活性剤、又は安定化剤などがあるが、これらに限定されない。バッファーの例は、酢酸、リン酸又はクエン酸バッファーを含み得るが、これらに限定されない。界面活性剤の例は、ポリソルベートを含み得るが、これに限定されない。安定剤の例は、ヒトアルブミンを含み得るが、これに限定されない。
【０１７４】
同様に、当業者は、がんなどの状態を有効に処置するための、本明細書に開示される抗体の有効量又は濃度を決定する能力を有する。当業者は、過度の実験をすることなく、医薬組成物の様々な成分の割合、投与用量及び頻度などの他のパラメーターを得ることができる。例えば、注射に適した溶液は、１ｍｌあたり約１〜約２０、約１〜約１０ｍｇの抗体を含有し得るが、これらに限定されない。用量の例は、約０．１〜約２０、約１〜約５ｍｇ／Ｋｇ体重であり得るが、これらに限定されない。投与頻度の例は、１日１回又は週３回であり得るが、これらに限定されない。
【０１７５】
特定の実施形態又は例を参照して本開示を説明してきたが、実施形態は例示的なものであり、開示範囲はそれらに限定されないことが理解されよう。本開示の代替の実施形態が、本開示が属する分野の当業者には明らかとなるであろう。そのような代わりの実施形態は本開示の範囲に包含されると考えられる。したがって、本開示の範囲は添付の特許請求の範囲によって定義され、前述の説明によって支持される。
【０１７６】
要約すると、その可変ドメインがＣＤＨ１７  ｍＡｂに由来するＣＤＨ１７抗体の新規のパネルは、がん処置のための独特のＣＡＲの生成を可能にするだろう。ＣＤＨ１７抗体の細胞タイプ特異性は、正常細胞又は組織において発現されるＣＤＨ１７と比較して、ＣＤＨ１７発現腫瘍細胞のより特異的な標的化を可能にし得る。１つのＣＡＲが腫瘍細胞上のＣＤＨ１７に対してより特異的であり、第２のＣＡＲが同じ腫瘍細胞上の腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）に対して中程度に特異的である、２つのＣＡＲを発現するＴ細胞又はＮＫ細胞もまた生成され得る。コンビナトリアル特異性は、腫瘍細胞シグネチャーのより選択的な標的化を可能にしている。代替的に、ＣＤＨ１７  ＣＡＲは、異なるメカニズムを介して、中程度に特異的な腫瘍特異的ＴＡＡ  ＣＡＲのより特異的な標的化を支持し得る。例えば、中程度に特異的な結腸又は胃がんＴＡＡ  ＣＡＲは、ＣＤ３ゼータエンドドメインに融合され得る。この第一世代ＣＡＲは、頑強な殺滅応答を支持することはできず、１〜数週間の短いインビボ半減期を有する。ＣＤＨ１７  ＣＡＲは、ＣＤ２８又はＣＤ２８及びＣＤ１３７エンドドメインに融合させて共発現させることができ、これは、第一世代ＣＡＲに強い共刺激シグナルを提供するだろう。ＣＤＨ１７  ＣＡＲは、ＣＤＨ１７が通常発現されている結腸及び胃において、頑強な腫瘍殺滅応答に結合し活性化するだろう。共発現された第一世代ＣＡＲは、結腸又は胃（又はＣＤＨ１７が通常発現されている他の組織）において通常発現されていない標的を結合するために選択され、したがって、結腸又は胃がん細胞を殺滅するために選択的に活性化されるだろう。
【０１７７】
特定の実施形態を参照して本開示を説明してきたが、実施形態は例示的なものであり、開示の範囲はそれに限定されないことが理解されるだろう。本開示の代替の実施形態が、本開示が属する分野の当業者には明らかとなるであろう。そのような代わりの実施形態は、本開示の範囲に包含されると考えられる。したがって、本開示の範囲は添付の特許請求の範囲によって定義され、前述の説明によって支持される。
【０１７８】
実施形態は、本開示を説明するためのものに過ぎず、本開示の範囲を限定することを意図するものではない。本開示の原理から逸脱することなく、本開示の保護の下で、ある特定の改変及び改善がなされる可能性があり、考慮されるべきであることを、本技術分野の当業者は理解すべきである。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２−１】
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【図１２−２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８−１】
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【図１８−２】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２−１】
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【図２２−２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成31年3月7日(2019.3.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、カドヘリン−１７に対する特異性を有する抗体。
【請求項２】
前記抗体が、マウス抗体、ヒト化抗体、又はヒト抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項３】
前記抗体が、軽鎖の可変領域（ＶＬ）及び重鎖の可変領域（ＶＨ）を含み、前記ＶＬが、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項４】
前記ＶＨが、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、請求項３に記載の抗体。
【請求項５】
コンジュゲートされた細胞傷害性部分をさらに含む、請求項１に記載の抗体であって、
前記コンジュゲートされた細胞傷害性部分が、イリノテカン、オーリスタチン、ＰＢＤ、マイタンシン、アマニチン、スプライソソーム阻害剤、化学療法剤、又はそれらの組み合わせを含む、抗体。
【請求項６】
前記抗体が二重特異性モノクローナル抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項７】
細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞由来の細胞受容体に対する特異性を有する、請求項６に記載の抗体であって、
前記細胞受容体が、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ２７、ＣＤ４０、ＴＩＭ−１、ＣＤ２８、ＨＶＥＭ、ＧＩＴＲ、ＩＣＯＳ、ＩＬ１２受容体、ＩＬ１４受容体、又はそれらの誘導体又はそれらの組み合わせを含む、抗体。
【請求項８】
前記抗体が、カドヘリン−１７に対する特異性を有する第１の１本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）及びＣＤ３に対する特異性を有する第２の１本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）を含み、前記第１のＳｃＦｖが第１のＶＨ及び第１のＶＬを含み、前記第２のＳｃＦｖが第２のＶＨ及び第２のＶＬを含む、請求項６に記載の抗体。
【請求項９】
前記第１のＶＨが、配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項１０】
前記第１のＶＬが、配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項１１】
前記第２のＶＨが、配列番号１８のアミノ酸配列の対応する部分を含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項１２】
前記第２のＶＬが、配列番号１８のアミノ酸配列の対応する部分を含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項１３】
免疫チェックポイントインヒビターに対する特異性を有する、請求項６に記載の抗体であって、
前記チェックポイントインヒビターが、ＰＤ−１、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＴＩＧＩＴ、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−Ｌ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、又はそれらの組み合わせを含む、抗体。
【請求項１４】
血管新生因子に対する特異性を有する、請求項６に記載の抗体であって、前記血管新生因子がＶＥＧＦを含む、抗体。
【請求項１５】
前記抗体が、カドヘリン−１７ドメイン６のＲＧＤ部位のインテグリンへの結合に拮抗するように構成され、前記インテグリンがアルファ２ベータ１を含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項１６】
配列番号２、４、５、７、９、１１、１３、及び１５から選択される配列を有するアミノ酸配列を含む、抗体のＩｇＧ重鎖。
【請求項１７】
配列番号１、３、６、８、１０、１２、１４、及び１６から選択される配列を有するアミノ酸配列を含む、抗体の軽鎖。
【請求項１８】
配列番号１−１６から選択されるアミノ酸配列を含む、抗体の可変鎖。
【請求項１９】
配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、カドヘリン−１７に対する特異性を有するｓｃＦｖ又はＦａｂであって、
前記ｓｃＦｖ又はＦａｂが、細胞傷害性Ｔ又はＮＫ細胞由来の細胞受容体、免疫チェックポイントインヒビター、又は血管新生因子に対する特異性を有する、ｓｃＦｖ又はＦａｂ。
【請求項２０】
カドヘリン−１７に対する特異性を有するＴ又はＮＫ細胞であって、前記Ｔ又はＮＫ細胞がキメラ抗原受容体を含み、前記キメラ抗原受容体が、配列番号１−２１から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％の類似性を有するアミノ酸配列を含む、Ｔ又はＮＫ細胞。
【請求項２１】
前記キメラ抗原受容体が、配列番号１−１６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２０に記載のＴ又はＮＫ細胞。
【請求項２２】
請求項１に記載の抗体及び細胞傷害性薬剤を含む、医薬組成物であって、
前記細胞傷害性薬剤が、シスプラチン、ゲムシタビン、イリノテカン、又は抗腫瘍抗体を含む、医薬組成物。
【国際調査報告】
2019518721.tif 000038
2019518721.tif 000039