【手続補正書】
【提出日】令和3年11月16日(2021.11.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生体分析物の処理方法であって、
（ａ）該生体分析物を固定したアレイを含み、中心軸に対して回転可能である基板を提供する段階と、
（ｂ）前記基板の回転中に、複数のプローブを含む溶液を、前記基板の全体に前記生体分析物に接触するように導く段階であって、前記溶液が前記中心軸から離れる方向に沿って遠心力により導かれる段階と、
（ｃ）前記生体分析物を、前記複数のプローブのうちの少なくとも１つのプローブと前記生体分析物との間の反応を行うのに十分な条件にさらして、前記少なくとも１つのプローブを前記生体分析物に結合させる段階と、
（ｄ）前記生体分析物に結合した前記少なくとも１つのプローブから１又はそれ以上のシグナルを検出することにより、前記生体分析物を分析する段階と、
を含む方法。
【請求項２】
前記生体分析物が核酸分子であり、前記生体分析物を分析する段階が、該核酸分子の配列を識別することを含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記複数のプローブが複数のヌクレオチドである、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
段階（ｃ）が、前記複数のヌクレオチドからの少なくとも１つのヌクレオチドを前記核酸分子に対して相補的である伸長鎖に組み込むのに十分な条件下で、前記核酸分子をプライマー伸長反応にさらすことを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
段階（ｄ）において、前記１又はそれ以上のシグナルが、前記少なくとも１つのヌクレオチドの組み込みを示す、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記複数のヌクレオチドがヌクレオチド類縁体を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項７】
前記複数のヌクレオチドが第１の正準塩基型である、請求項３に記載の方法。
【請求項８】
第２の正準塩基型のものであるさらなる複数のヌクレオチドを用いて段階（ｂ）及び段階（ｃ）を繰り返す段階をさらに含み、前記第２の正準塩基型が前記第１の正準塩基型とは異なる、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
段階（ｄ）において前記検出することが、前記基板の回転中に非線形経路に沿って前記アレイを連続的にスキャンするセンサを用いて行われる、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
段階（ｂ）の前に、
（ｉ）前記基板が静止しているときに前記基板の上に前記溶液を与える段階と、
（ｉｉ）前記基板を回転させて、前記アレイ全体に前記溶液を導く段階と、
をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
（ｉ）段階（ｂ）の前に前記基板を回転させる段階と、
（ｉｉ）前記基板が回転している間、前記溶液を前記基板の上に与える段階と、をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記生体分析物が、前記アレイに固定されたビーズに結合される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記アレイが、複数の個々にアドレス可能な位置を含み、前記生体分析物が、該複数の個々にアドレス可能な位置のうちの所与の個々にアドレス可能な位置に配置されている、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
段階（ｂ）及び／又は段階（ｃ）が、前記基板を第１の角速度で回転させながら実行され、段階（ｄ）が、前記基板を前記第１の角速度とは異なる第２の角速度で回転させながら実行される、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記基板が、前記中心軸に対して移動可能であり、段階（ｂ）及び／又は段階（ｃ）は、前記基板が前記中心軸の第１の位置にあるときに実行され、段階（ｄ）は、前記基板が、前記中心軸の前記第１の位置とは異なる第２の位置にあるときに実行され、
前記基板が前記第１の位置において第１の角速度で回転し、前記基板が前記第２の位置において第２の角速度で回転する、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
生体分析物の処理方法であって、
（ａ）該生体分析物を固定した実質的に平らなアレイを含み、中心軸に対して回転可能である基板を提供する段階と、
（ｂ）複数のプローブを含む溶液を、前記基板の回転中に、前記実質的に平らなアレイの全体に前記生体分析物に接触するように導く段階と、
（ｃ）前記生体分析物を、前記複数のプローブのうちの少なくとも１つのプローブと前記生体分析物との間の反応を行うのに十分な条件にさらして、前記少なくとも１つのプローブを前記生体分析物に結合させる段階と、
（ｄ）前記生体分析物に結合した前記少なくとも１つのプローブから１又はそれ以上のシグナルを検出することにより、前記生体分析物を分析する段階と、
を含む方法。
【請求項１７】
前記生体分析物が核酸分子であり、前記生体分析物を分析する段階が、前記核酸分子の配列を識別することを含む、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
段階（ｄ）において前記検出することが、前記基板の回転中に非線形経路に沿って前記実質的に平らなアレイを連続的にスキャンするセンサを用いて行われる、請求項１６に記載の方法。
【請求項１９】
前記実質的に平らなアレイが複数の個々にアドレス可能な位置を含み、前記生体分析物が、前記複数の個々にアドレス可能な位置のうちの所与の個々にアドレス可能な位置に配置される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
生体分析物を分析するシステムであって、
前記生体分析物を固定するように構成されたアレイを含み、中心軸に対して回転するように構成された基板と、
複数のプローブを含む溶液を前記アレイに与えるように構成された流体チャネルを含む液流ユニットであって、前記基板の回転中に、前記溶液が、前記中心軸から遠ざかる方向に沿って遠心力により導かれ、前記複数のプローブのうちの少なくとも１つのプローブを前記生体分析物に結合させるのに十分な条件下で該生体分析物に接触するようになっている、液流ユニットと、
前記アレイに光学的に接続され、前記生体分析物に結合した前記少なくとも１つのプローブから１又はそれ以上のシグナルを検出するように構成された検出器と、
前記液流ユニット及び前記検出器に動作可能に結合された１又はそれ以上のコンピュータプロセッサであって、
（ｉ）前記溶液を流体チャネルを通って前記アレイに与えるように、前記液流ユニットに命令して、前記複数のプローブを含む前記溶液が、前記基板の回転中に、前記中心軸から遠ざかる方向に沿って遠心力により導かれ前記生体分析物に接触するようにし、
（ｉｉ）前記検出器を用いて前記生体分析物に結合した前記少なくとも１つのプローブから前記１又はそれ以上のシグナルを検出する、ように、個別に又は全体的にプログラムされている、１又はそれ以上のコンピュータプロセッサと、
を具備するシステム。
【請求項２１】
付加的な溶液を前記アレイに与えるように構成された付加的な流体チャネルをさらに具備し、前記流体チャネル及び前記付加的な流体チャネルが、前記流体チャネル及び前記付加的な流体チャネルの出口の上流において相互に流体的に分離されている、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２２】
前記基板に接触している流体に少なくとも部分的に浸漬されるよう構成され、前記検出器に光学的に接続された光学撮像対物レンズをさらに具備する、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２３】
前記光学撮像対物レンズを囲み、前記流体の少なくとも一部を保持するように構成された容器をさらに具備する、請求項２２に記載のシステム。
【請求項２４】
前記検出器は、前記基板の回転中に前記１又はそれ以上のシグナルを検出するように構成されている、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２５】
前記アレイが複数の個々にアドレス可能な位置を含む、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２６】
前記基板を含む容器をさらに具備する、請求項２０に記載のシステム。
【請求項２７】
前記容器の環境の温度又は湿度を制御するように構成された環境ユニットをさらに具備する、請求項２６に記載のシステム。
【請求項２８】
生体分析物分析システムであって、
前記生体分析物を固定するように構成された実質的に平らなアレイを含み、中心軸に対して回転するように構成された基板と、
前記実質的に平らなアレイに複数のプローブを含む溶液を与えるよう構成されている流体チャネルを含む液流ユニットであって、前記基板の回転中に、前記溶液は、前記実質的に平らなアレイの全体に導かれ前記複数のプローブのうちの少なくとも１つのプローブを前記生体分析物に結合させるのに十分な条件下において該生体分析物に接触するようになっている液流ユニットと、
前記実質的に平らなアレイに光学的に接続され、前記生体分析物に結合した前記少なくとも１つのプローブから１又はそれ以上のシグナルを検出するよう構成されている検出器と、
前記液流ユニット及び前記検出器に動作可能に結合された１又はそれ以上のコンピュータプロセッサであって、
（ｉ）前記溶液を前記流体チャネルを通って前記アレイに与えるように前記液流ユニットに命令して、前記複数のプローブを含む前記溶液が、前記基板の回転中に、前記実質的に平らなアレイの全体に導かれ、前記生体分析物に接触するようにし、
（ｉｉ）前記検出器を用いて前記生体分析物に結合した前記少なくとも１つのプローブから前記１又はそれ以上のシグナルを検出する、
ように、個別に又は全体的にプログラムされている、１又はそれ以上のコンピュータプロセッサと、
を具備するシステム。
【請求項２９】
前記基板に接触する流体に少なくとも部分的に浸漬されるように構成され、前記検出器と光学的に接続される光学撮像対物レンズをさらに具備する、請求項２８に記載のシステム。
【請求項３０】
前記検出器が、時間遅延積分（ＴＤＩ）センサ又は疑似ＴＤＩ急速フレームレートセンサを含む、請求項２８に記載のシステム。
【請求項３１】
前記検出器が、前記基板の回転中に前記１又はそれ以上のシグナルを検出するように構成されている、請求項２８に記載のシステム。
【請求項３２】
前記検出器が、前記基板の回転中に非線形経路に沿って前記アレイを連続的にスキャンするように構成されている、請求項３１に記載のシステム。