(57)【要約】1種以上のMAPK経路阻害剤（例えば、BRAF阻害剤および/またはMEK阻害剤）と組み合わせて治療（特にメラノーマの治療）に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体-薬物コンジュゲート(ADC)。2019509257.tif 000061
2019509257.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
MAPキナーゼ(MAPK)経路の1種以上の阻害剤と組み合わせて対象におけるメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体を含む抗体-薬物コンジュゲート(ADC)。
【請求項２】
前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、B-RAF(BRAF)阻害剤、MEK阻害剤、ERK阻害剤、またはそれらのうちのいずれか2つ以上の組み合わせを含む、請求項1記載の使用のためのADC。
【請求項３】
前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、チロシンキナーゼ阻害剤、または両方を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４】
前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、BRAF阻害剤を含むか、またはBRAF阻害剤からなる、請求項1〜3のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項５】
前記BRAF阻害剤が、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、PLX4720、GDC-0879、RAF265、SB590885、AZ628、AB-024、TAK-580、BAL-3833、BGB-283、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択され、任意で、前記メラノーマがBRAFに変異を示し、該変異が該BRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらす、請求項4記載の使用のためのADC。
【請求項６】
前記BRAF阻害剤が、ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項5記載の使用のためのADC。
【請求項７】
前記BRAF阻害剤が、ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項5記載の使用のためのADC。
【請求項８】
前記BRAF阻害剤が、エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項5記載の使用のためのADC。
【請求項９】
前記BRAF阻害剤が、ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項5記載の使用のためのADC。
【請求項１０】
前記メラノーマがBRAFに変異を示す、請求項5〜9のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項１１】
前記変異がV600、L597およびK601から選択されるBRAF残基にあり、例えばV600にある、請求項10記載の使用のためのADC。
【請求項１２】
BRAFにおける前記変異がV600E、V600K、V600D、L597RおよびK601Eから選択され、例えばV600Eである、請求項11記載の使用のためのADC。
【請求項１３】
前記メラノーマが、残基Q61、G12およびG13から選択されるNRASにおける変異を示さない、請求項5〜12のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項１４】
前記メラノーマが、NRASにおける活性化変異を示さない、請求項13記載の使用のためのADC。
【請求項１５】
前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、MEK阻害剤を含むか、またはMEK阻害剤からなる、請求項1〜3のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項１６】
前記MEK阻害剤が、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、レファメチニブ、ピマセルチブ、U0126-EtOH、PD184352、BIX 02189、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される、請求項15記載の使用のためのADC。
【請求項１７】
前記MEK阻害剤が、トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項16記載の使用のためのADC。
【請求項１８】
前記MEK阻害剤が、コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項16記載の使用のためのADC。
【請求項１９】
前記MEK阻害剤が、ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項16記載の使用のためのADC。
【請求項２０】
前記MEK阻害剤が、セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である、請求項16記載の使用のためのADC。
【請求項２１】
前記メラノーマが、NRASに変異を示し、例えばQ61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えばQ61に、変異を示す、請求項15〜20のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項２２】
前記NRASにおける変異が、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択される、請求項21記載の使用のためのADC。
【請求項２３】
前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、ERK阻害剤を含むか、またはERK阻害剤からなる、請求項1〜3のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項２４】
前記ERK阻害剤が、LTT-462、ウリキセルチニブ、SCH772984、VTX11E、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される、請求項23記載の使用のためのADC。
【請求項２５】
BRAF阻害剤およびMEK阻害剤との組み合わせでの、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項２６】
(a) 前記BRAF阻害剤が、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、GDC-0879、RAF265、SB590885、AZ628、AB-024、TAK-580、BAL-3833、BGB-283、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択され；かつ/または
(b) 前記MEK阻害剤が、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、レファメチニブ、ピマセルチブ、U0126-EtOH、PD184352、BIX 02189、またはそれらの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される
請求項25記載の使用のためのADC。
【請求項２７】
任意で、前記メラノーマが、前記BRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらすBRAF変異を示す、
(a) ベムラフェニブおよびトラメチニブ；
(b) ベムラフェニブおよびコビメチニブ；
(c) ベムラフェニブおよびビニメチニブ；
(d) ベムラフェニブおよびセルメチニブ；
(e) ダブラフェニブおよびトラメチニブ；
(f) ダブラフェニブおよびコビメチニブ；
(g) ダブラフェニブおよびビニメチニブ；
(h) ダブラフェニブおよびセルメチニブ；
(i) エンコラフェニブおよびトラメチニブ；
(j) エンコラフェニブおよびコビメチニブ；
(k) エンコラフェニブおよびビニメチニブ；
(l) エンコラフェニブおよびセルメチニブ；
(m) ソラフェニブおよびトラメチニブ；
(n) ソラフェニブおよびコビメチニブ；
(o) ソラフェニブおよびビニメチニブ；または
(p) ソラフェニブおよびセルメチニブ
との組み合わせでの、請求項25および26のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項２８】
ベムラフェニブおよびトラメチニブとの組み合わせでの、請求項27記載の使用のためのADC。
【請求項２９】
ダブラフェニブおよびトラメチニブとの組み合わせでの、請求項27記載の使用のためのADC。
【請求項３０】
前記BRAF変異が、V600、L597およびK601から選択されるBRAF残基にあり、例えばV600にある、請求項26〜28のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項３１】
前記BRAF変異が、V600E、V600K、V600D、L597RおよびK601Eから選択され、例えばV600Eである、請求項30記載の使用のためのADC。
【請求項３２】
前記メラノーマが、Q61、G12およびG13から選択される残基にNRAS変異を示さない、請求項26〜28のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項３３】
前記メラノーマが活性化NRAS変異を示さない、請求項32記載の使用のためのADC。
【請求項３４】
前記ADCおよび前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、同時に、別々に、または逐次的に投与される、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項３５】
前記メラノーマが、前記少なくとも1種の阻害剤で以前に治療されたことがない、請求項34記載の使用のためのADC。
【請求項３６】
前記メラノーマが、前記MAPK経路の1種以上の阻害剤による治療を受けている、請求項1〜34のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項３７】
前記メラノーマが、前記MAPK経路の1種以上の阻害剤で以前に治療されたことがある、請求項1〜34のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項３８】
前記メラノーマが、前記MAPK経路の1種以上の阻害剤に耐性である、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項３９】
前記メラノーマが、前記MAPK経路の1種以上の阻害剤に対して内因性耐性を有する、請求項38記載の使用のためのADC。
【請求項４０】
前記メラノーマが、前記MAPK経路の1種以上の阻害剤に対して獲得耐性を有する、請求項38記載の使用のためのADC。
【請求項４１】
前記メラノーマが再発したメラノーマである、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４２】
前記メラノーマが、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブのうちの少なくとも1つに耐性である、請求項38〜41のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４３】
前記メラノーマが、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブおよびセルメチニブのうちの少なくとも1つに耐性である、請求項38〜41のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４４】
前記メラノーマが前記1種以上の阻害剤に対して耐性でない、請求項1〜37のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４５】
1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、または4週間にわたって3回投与される、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４６】
0.02〜30mg/kg、例えば約0.05〜10mg/kgの用量で投与される、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４７】
前記抗体に連結された細胞傷害性物質、化学療法剤、または放射性同位体を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４８】
治療部分が、任意でリンカーを用いて前記ADCに連結された、細胞傷害性物質である、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項４９】
前記リンカーがmc-vc-PABであり、前記細胞傷害性物質がMMAEである、請求項48記載の使用のためのADC。
【請求項５０】
前記抗体が、ヒトAXLへの結合についてGrowth Arrest-Specific 6（Gas6）と競合しない、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項５１】
ヒトAXLに結合する前記抗体とGas6との間の競合をGas6と共におよびGas6なしでプレインキュベートされたA431細胞で測定する競合アッセイによって測定した場合に、Gas6の存在下でのヒトAXLへの最大抗体結合が、Gas6の非存在下での結合の少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％、例えば100％である、請求項50記載の使用のためのADC。
【請求項５２】
以下からなる群より選択されるVH領域およびVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC：
(a) それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [107]；
(b) それぞれSEQ ID No:46、47および48のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:49、AAS、およびSEQ ID No:50のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [148]；
(c) それぞれSEQ ID No:114、115および116のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:117、DAS、およびSEQ ID No:118のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [733]；
(d) それぞれSEQ ID No:51、52および53のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:55、GAS、およびSEQ ID No:SEQ ID No:56のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [154]；
(e) それぞれSEQ ID No:51、52および54のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:55、GAS、およびSEQ ID No:56のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [154-M103L]；
(f) それぞれSEQ ID No:57、58および59のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:60、GAS、およびSEQ ID No:61のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [171]；
(g) それぞれSEQ ID No:62、63および64のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:65、GAS、およびSEQ ID No:66のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [172]；
(h) それぞれSEQ ID No:67、68および69のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:70、GAS、およびSEQ ID No:71のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [181]；
(i) それぞれSEQ ID No:72、73および75のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:76、ATS、およびSEQ ID No:77のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [183]；
(j) それぞれSEQ ID No:72、74および75のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:76、ATS、およびSEQ ID No:77のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [183-N52Q]；
(k) それぞれSEQ ID No:78、79および80のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:81、AAS、およびSEQ ID No:82のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [187]；
(l) それぞれSEQ ID No:83、84および85のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:86、GAS、およびSEQ ID No:87のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [608-01]；
(m) それぞれSEQ ID No:88、89および90のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:91、GAS、およびSEQ ID No:92のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [610-01]；
(n) それぞれSEQ ID No:93、94および95のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:96、GAS、およびSEQ ID No:97のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [613]；
(o) それぞれSEQ ID No:98、99および100のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:101、DAS、およびSEQ ID No:102のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [613-08]；
(p) それぞれSEQ ID No:103、104および105のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:106、GAS、およびSEQ ID No:107のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [620-06]；
(q) それぞれSEQ ID No:108、109および110のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:112、AAS、およびSEQ ID No:113のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [726]；
(r) それぞれSEQ ID No:108、109および111のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:112、AAS、およびSEQ ID No:113のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [726-M101L]；
(s) それぞれSEQ ID No:41、42および43のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:44、AAS、およびSEQ ID No:45のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [140]；
(t) それぞれSEQ ID No:93、94および95のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:128、XAS（配列中、XはDまたはG）、およびSEQ ID No:129のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [613/613-08]；
(u) それぞれSEQ ID No:46、119および120のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:49、AAS、およびSEQ ID No:50のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [148/140]；
(v) それぞれSEQ ID No:123、124および125のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:60、GAS、およびSEQ ID No:61のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [171/172/181]；
(w) それぞれSEQ ID No:121、109および122のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:112、AAS、およびSEQ ID No:113のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [726/187]；ならびに
(x) それぞれSEQ ID No:93、126および127のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:96、GAS、およびSEQ ID No:97のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [613/608-01/610-01/620-06]。
【請求項５３】
以下を含む少なくとも1つの結合領域を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC：
(a) それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域、ならびに
(b) それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [107]。
【請求項５４】
前記抗体が、以下からなる群より選択されるVH領域およびVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC：
(a) SEQ ID No: 1と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No: 2と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [107]；
(b) SEQ ID No: 5と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No: 6と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [148]；
(c) SEQ ID No:34と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:35と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [733]；
(d) SEQ ID No: 7と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No: 9と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [154]；
(e) SEQ ID No:10と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:11と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [171]；
(f) SEQ ID No:16と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:18と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [183]；
(g) SEQ ID No:25と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:26と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [613]；
(h) SEQ ID No:31と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:33と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [726]；
(i) SEQ ID No: 3と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No: 4と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [140]；
(j) SEQ ID No: 8と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No: 9と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [154-M103L]；
(k) SEQ ID No:12と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:13と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [172]；
(l) SEQ ID No:14と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:15と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [181]；
(m) SEQ ID No:17と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:18と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [183-N52Q]；
(n) SEQ ID No:19と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:20と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [187]；
(o) SEQ ID No:21と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:22と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [608-01]；
(p) SEQ ID No:23と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:24と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [610-01]；
(q) SEQ ID No:27と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:28と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [613-08]；
(r) SEQ ID No:29と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:30と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [620-06]；ならびに
(s) SEQ ID No:32と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVH領域、およびSEQ ID No:33と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVL領域 [726-M101L]。
【請求項５５】
前記少なくとも1つの結合領域が、以下からなる群より選択されるVH領域およびVL領域を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC：
(a) SEQ ID No: 1を含むVH領域およびSEQ ID No: 2を含むVL領域 [107]；
(b) SEQ ID No: 5を含むVH領域およびSEQ ID No: 6を含むVL領域 [148]；
(c) SEQ ID No:34を含むVH領域およびSEQ ID No:35を含むVL領域 [733]；
(d) SEQ ID No: 7を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域 [154]；
(e) SEQ ID No:10を含むVH領域およびSEQ ID No:11を含むVL領域 [171]；
(f) SEQ ID No:16を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域 [183]；
(g) SEQ ID No:25を含むVH領域およびSEQ ID No:26を含むVL領域 [613]；
(h) SEQ ID No:31を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域 [726]；
(i) SEQ ID No: 3を含むVH領域およびSEQ ID No: 4を含むVL領域 [140]；
(j) SEQ ID No: 8を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域 [154-M103L]；
(k) SEQ ID No:12を含むVH領域およびSEQ ID No:13を含むVL領域 [172]；
(l) SEQ ID No:14を含むVH領域およびSEQ ID No:15を含むVL領域 [181]；
(m) SEQ ID No:17を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域 [183-N52Q]；
(n) SEQ ID No:19を含むVH領域およびSEQ ID No:20を含むVL領域 [187]；
(o) SEQ ID No:21を含むVH領域およびSEQ ID No:22を含むVL領域 [608-01]；
(p) SEQ ID No:23を含むVH領域およびSEQ ID No:24を含むVL領域 [610-01]；
(q) SEQ ID No:27を含むVH領域およびSEQ ID No:28を含むVL領域 [613-08]；
(r) SEQ ID No:29を含むVH領域およびSEQ ID No:30を含むVL領域 [620-06]；ならびに
(s) SEQ ID No:32を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域 [726-M101L]。
【請求項５６】
前記少なくとも1つの結合領域が、SEQ ID No: 1を含むVH領域およびSEQ ID No: 2を含むVL領域 [107] を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項５７】
前記抗体が、それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [107] を含む少なくとも1つの結合領域を含み、
前記リンカーがmc-vc-PABであり、かつ
前記細胞傷害性物質がMMAEである、
前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項５８】
前記抗体が、それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [107] を含む少なくとも1つの結合領域を含み、
前記リンカーがSSPであり、かつ
前記細胞傷害性物質がDM1である、
請求項1〜56のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項５９】
前記抗体がAXL上のエピトープに結合し、該エピトープが、請求項55において定義される抗体のうちのいずれかによって認識される、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６０】
前記抗体がAXLのIg1ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープが、ヒトAXLの位置L121〜Q129またはT112〜Q124に対応する1つまたは複数のアミノ酸を含むかまたは必要とする、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６１】
前記抗体がAXLのIg2ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープが、ヒトAXLの位置D170またはD179の組み合わせに対応するアミノ酸、および位置T182〜R190に対応する1つまたは複数のアミノ酸を含むかまたは必要とする、請求項1〜55のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６２】
前記抗体がヒトAXLのFN1ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープが、ヒトAXLの位置Q272〜A287およびG297〜P301に対応する1つまたは複数のアミノ酸を含むかまたは必要とする、請求項1〜55のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６３】
前記抗体がヒトAXLのFN2ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープが、ヒトAXLの位置A359、R386に対応するアミノ酸、および位置Q436〜K439に対応する1つまたは複数のアミノ酸を含むかまたは必要とする、請求項1〜55のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６４】
前記抗体が、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4からなる群より選択されるアイソタイプの重鎖を含む、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６５】
前記アイソタイプが、IgG1、任意でアロタイプIgG1m(f)である、請求項64記載の使用のためのADC。
【請求項６６】
完全長モノクローナル抗体、例えば完全長モノクローナルIgG1,κ抗体である、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６７】
前記抗体が、薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物中に含まれる、前記請求項のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項６８】
BRAF阻害剤およびMEK阻害剤から選択される阻害剤と組み合わせて対象におけるメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体を含むADCであって、
該ADCが、mc-vc-PABリンカーを介してMMAEに連結された、それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびにそれぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [107] を含む少なくとも1つの結合領域を含む抗体を含み、
該AXL-ADCおよび該阻害剤が、同時に、別々に、または逐次的に投与される、
前記ADC。
【請求項６９】
BRAF阻害剤およびMEK阻害剤と組み合わせて対象におけるメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体を含むADCであって、
該ADCが、MMAEにmc-vc-PABリンカーを介して連結された、それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域 [107] を含む少なくとも1つの結合領域を含む抗体を含み、
該AXL-ADC、該BRAF阻害剤、および該MEK阻害剤が、同時に、別々に、または逐次的に投与される、
前記ADC。
【請求項７０】
前記BRAF阻害剤が、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、およびそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体または誘導体からなる群より選択され、前記メラノーマが、V600、L597およびK601から選択されるBRAF残基に、例えばV600に、変異を示す、請求項68および69のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項７１】
前記メラノーマが、V600E、V600K、V600D、L597RおよびK601Eから選択されるBRAFにおける変異、例えばV600E、を示す、請求項70記載の使用のためのADC。
【請求項７２】
前記MEK阻害剤が、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、およびそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体または誘導体からなる群より選択される、請求項68〜71のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項７３】
前記組み合わせが、以下からなる群より選択されるBRAF阻害剤およびMEK阻害剤を含む、請求項69〜72のいずれか一項記載の使用のためのADC：
(a) ベムラフェニブおよびトラメチニブ；
(b) ベムラフェニブおよびコビメチニブ；
(c) ベムラフェニブおよびビニメチニブ；
(d) ベムラフェニブおよびセルメチニブ；
(e) ダブラフェニブおよびトラメチニブ；
(f) ダブラフェニブおよびコビメチニブ；
(g) ダブラフェニブおよびビニメチニブ；
(h) ダブラフェニブおよびセルメチニブ；
(i) エンコラフェニブおよびトラメチニブ；
(j) エンコラフェニブおよびコビメチニブ；
(k) エンコラフェニブおよびビニメチニブ；
(l) エンコラフェニブおよびセルメチニブ；
(m) ソラフェニブおよびトラメチニブ；
(n) ソラフェニブおよびコビメチニブ；
(o) ソラフェニブおよびビニメチニブ；ならびに
(p) ソラフェニブおよびセルメチニブ。
【請求項７４】
ベムラフェニブおよびトラメチニブとの組み合わせでの、請求項73記載の使用のためのADC。
【請求項７５】
ダブラフェニブおよびトラメチニブとの組み合わせでの、請求項73記載の使用のためのADC。
【請求項７６】
前記メラノーマが、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示さない、請求項68〜75のいずれか一項記載の使用のためのADC。
【請求項７７】
前記メラノーマがNRASにおける活性化変異を示さない、請求項76記載の使用のためのADC。
【請求項７８】
(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)MAPK経路の1種以上の阻害剤を含むキットであって、該ADCおよび該1種以上の阻害剤が同時に、別々に、または逐次的に投与されるためのものである、前記キット。
【請求項７９】
対象におけるメラノーマを治療する方法であって、該対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)MAPK経路の1種以上の阻害剤を投与することを含み、該ADCおよび該1種以上の阻害剤が、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される、前記方法。
【請求項８０】
前記MAPK経路の1種以上の阻害剤が、B-RAF(BRAF)阻害剤、MEK阻害剤、ERK阻害剤、またはそれらのうちのいずれか2つ以上の組み合わせを含むかまたはそれらからなる、請求項79記載の方法。
【請求項８１】
対象におけるメラノーマを治療する方法であって、該対象に、
- ヒトAXLに結合する抗体を含むADC；
- BRAF阻害剤；および
- MEK阻害剤
を投与することを含み、
該ADC、該BRAF阻害剤、および該MEK阻害剤が、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される、
前記方法。
【請求項８２】
対象におけるメラノーマを治療する方法であって、該対象に、
- ヒトAXLに結合する抗体を含むADC；および
- ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるBRAF阻害剤
を投与することを含み、
該メラノーマが、該BRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらすBRAFにおける変異を示し、かつ
該ADCおよびBRAF阻害剤が、治療に有効な量で同時に、別々にまたは逐次的に投与される、
前記方法。
【請求項８３】
対象におけるメラノーマを治療する方法であって、該対象に、
- ヒトAXLに結合する抗体を含むADC；
- ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるBRAF阻害剤；および
- トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるMEK阻害剤
を投与することを含み、
該メラノーマが、該BRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらすBRAFにおける変異を示し、かつ
該ADC、該BRAF阻害剤、および該MEK阻害剤が、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される、
前記方法。
【請求項８４】
前記変異が、V600、L597およびK601から選択されるBRAF残基にあり、例えば、V600E、V600K、V600D、L597RおよびK601Eから選択される変異、例えばV600Eである、請求項82および83のいずれか一項記載の方法。
【請求項８５】
対象におけるメラノーマを治療する方法であって、該対象に、
- ヒトAXLに結合する抗体を含むADC；および
- トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるMEK阻害剤
を投与することを含み、
該ADCおよび該MEK阻害剤が、同時に、別々に、または逐次的に投与される、
前記方法。
【請求項８６】
前記メラノーマが、NRASに変異を示し、例えば、Q61、G12、およびG13から選択されるNRAS残基に変異を示し、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13D、およびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す、請求項85記載の方法。
【請求項８７】
前記メラノーマが、前記AXL-ADCの投与前において、少なくとも1種のBRAF阻害剤、MEK阻害剤、または両方に耐性である、請求項79〜86のいずれか一項記載の方法。
【請求項８８】
請求項1〜77のいずれか一項記載の特徴をさらに含む、請求項78記載のキットまたは請求項79〜87のいずれか一項記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
発明の分野
本発明は、少なくとも1種の治療剤と組み合わせて治療に使用するための、特にメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体-薬物コンジュゲート(ADC)に関する。
【背景技術】
【０００２】
発明の背景
AXLは、哺乳動物の受容体型チロシンキナーゼ(RTK)のTAMサブファミリーに属する104〜140kDaの膜貫通タンパク質であり、形質転換する能力がある(Paccez et al., 2014)。AXLの高度発現またはデノボ(de novo)発現は胃癌、前立腺癌、卵巣癌、肺癌などの様々な癌において報告されている(Paccez et al., 2014)。注目すべきことに、チロシンキナーゼ阻害剤、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤および/または化学療法に対して耐性を示す数種類の癌は、AXLタンパク質の高度発現またはデノボ発現を示すことが見出されている(Wilson et al., 2014; Brand et al., 2015; Zhang et al., 2012; Blakely et al., 2012)。特に、セリン/トレオニンキナーゼB-raf (BRAF)、MEKおよびERK (MEKはチロシンキナーゼでもある)の阻害剤に対する耐性を有するメラノーマ細胞は、増大したまたはデノボのAXL発現を示した(Mueller et al., 2014; Konieczkowski et al., 2014)。BRAF、MEKおよびERKは全て、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)経路の一部である。悪性メラノーマの大部分は、BRAFまたはNRASに発癌性の変異を有しており、これは構成的に活性なMAPK経路をもたらし得る(Sullivan et al., 2016)。
【０００３】
AXLの細胞外ドメインは、2つの膜遠位N末端免疫グロブリン(Ig)様ドメイン(Ig1およびIg2ドメイン)と、2つの膜近位フィブロネクチンIII型(FNIII)反復配列(FN1およびFN2ドメイン)との組み合わせから構成される(Paccez et al., 2014)。AXLは、そのリガンドであるビタミンK依存性のGas6 (growth arrest-specific factor 6：増殖停止特異的因子6)の結合時に活性化され得る。AXLへのGas6結合は、AXLの二量体化、細胞内シグナル伝達経路、例えばPI3K/AKT、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)、STATおよびNF-κBカスケードなど、の自己リン酸化とその後の活性化をもたらす(Leconet et al., 2013)。癌細胞において、AXLの発現は、腫瘍細胞の運動性、浸潤、遊走に関連しており、かつ上皮-間葉移行(EMT)に関わっている(Linger et al., 2010)。抗AXL抗体は、受容体発現のダウンレギュレーション、腫瘍細胞増殖の低減、およびアポトーシスの誘導によって、インビボでのNSCLCおよび乳癌異種移植片の成長を減弱させることが記載されている(Li et al., 2009; Ye et al., 2010; WO 2011/159980, Genentech社)。様々な他の抗AXL抗体も報告されており(Leconet et al., 2013; Iida et al., 2014; WO 2012/175691, INSERM社; WO 2012/175692, INSERM社; WO 2013/064685, Pierre Fabre Medicaments社; WO 2013/090776, INSERM社; WO 2009/063965, 中外製薬; WO 2010/131733およびWO 2016/005593)、例えば、抗AXL抗体とピロロベンゾジアゼピン(PBD)二量体に基づくADCなどがある(WO 2014/174111, Pierre Fabre Medicament社およびSpirogen Sarl社)。
【０００４】
しかしながら、特にMAPK阻害剤に対する耐性を考慮すると、メラノーマを治療するための改善されたAXL-ADCベースの方法の必要性が依然として残されている。
【発明の概要】
【０００５】
本発明者らは、MAPK経路の1種以上の阻害剤と組み合わせてメラノーマを効果的に治療するために、抗AXL抗体に基づくADC(本明細書では「AXL-ADC」とも呼ばれる)を使用できることを見出した。
【０００６】
したがって、一局面において、本発明は、MAPK経路の1種以上の阻害剤と組み合わせてメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体を含むADCに関する。一態様では、MAPK経路の1種以上の阻害剤は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤、ERK阻害剤、またはそれらのうちのいずれか2つ以上の組み合わせを含む。該ADCおよび1種以上の阻害剤は、例えば、同時に、別々に、または逐次的に投与することができる。
【０００７】
一局面において、本発明は、BRAF阻害剤およびMEK阻害剤と組み合わせてメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体を含むADCに関する。該ADC、BRAF阻害剤およびMEK阻害剤は、例えば、同時に、別々に、または逐次的に投与することができる。
【０００８】
一局面において、本発明は、対象におけるメラノーマを治療する方法に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)MAPK経路の1種以上の阻害剤を投与することを含み、その際、該ADCおよび1種以上の阻害剤は、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、MAPK経路の1種以上の阻害剤は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤、ERK阻害剤、またはそれらのうちのいずれか2つ以上の組み合わせを含む。
【０００９】
一局面において、本発明は、対象におけるメラノーマを治療する方法に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)BRAF阻害剤、および(iii)MEK阻害剤を投与することを含み、その際、該ADC、BRAF阻害剤およびMEK阻害剤は、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される。
【００１０】
これらおよび他の局面ならびに態様は、抗原結合特性または配列により特徴付けられる抗AXL抗体に基づくAXL-ADCの使用、該ADCに適する治療部分、該ADCと特定の阻害剤との組み合わせ、およびメラノーマを治療する関連方法を含めて、以下でさらに詳細に説明される。実際、本発明に従って1種以上の阻害剤と組み合わせてメラノーマの治療に使用するためのAXL-ADCに関するありとあらゆる局面または態様は、AXL-ADCと1種以上の阻害剤を投与することによってメラノーマを治療する方法に関する局面または態様と同じように適用可能であり、逆の場合も同様である。さらに、本明細書中のいずれかの局面または態様で定義されるAXL-ADCはどれも、本明細書に記載するようなMAPK経路の1種以上の阻害剤、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、と組み合わせて使用することができる。
【図面の簡単な説明】
【００１１】
【図１】（A）ヒトAXL-ECD、（B）カニクイザルAXL-ECD、または（C）マウスAXL-ECDをトランスフェクトしたHEK293細胞に対する、抗AXL抗体の結合曲線。示したデータは、実施例2に記載されているような1つの代表的な実験の平均蛍光強度（MFI）である。
【図２】マウス-ヒトAXLキメラに対する抗AXL抗体の結合を、実施例3に記載されているように行った。以下のホモ・サピエンス（Homo sapiens）AXL（hsAXL）およびハツカネズミ（Mus musculus）AXL（mmAXL）キメラタンパク質を試験した：（A）hsAXLおよびモック、（B）hsAXL-mmECD、（C）hsAXL-mmIg1、（D）hsAXL-mmIg2、（E）hsAXL-mmFN1、（F）hsAXL-mmFN2。
【図３】A431細胞における抗AXL抗体依存性細胞媒介性細胞傷害。A431細胞における抗AXL抗体による抗体依存性細胞媒介性細胞傷害を、実施例4に記載されているように測定した。
【図４】AXL抗体-薬物コンジュゲート（AXL-ADC）の結合特性。ヒトAXLを一過性にトランスフェクトしたHEK293T細胞に対するAXL-ADCの結合を、実施例5に記載されているように測定した。示したデータは、1つの代表的な実験の平均蛍光強度（MFI）である。
【図５】AXL抗体-薬物コンジュゲートにより誘導されるインビトロ細胞傷害。AXL抗体-薬物コンジュゲートによる細胞傷害の誘導を、実施例6に説明されているように測定した。
【図６】AXLに対する結合を可能にする抗体VHおよびVLのバリアント。同一のVLまたはVH領域を有する抗体を整列させ、それぞれ、VH（図A〜D）またはVL（図E）配列における差を特定して、図において四角により示した。CDR領域に下線を引いている。
【図７】LCLC-103H細胞におけるADCによる細胞傷害の誘導を、実施例8に記載されているように測定した。
【図８】実施例9に記載されているような、治療的LCLC-103H異種移植モデルにおけるMMAEコンジュゲートAXL抗体による抗腫瘍活性。
【図９】実施例10に記載されているような、AXLモノクローナル抗体のプールを用いた凍結PAXF1657腫瘍切片（膵臓癌PDXモデル）の免疫組織化学染色。
【図１０Ａ】（A）PAXF1657モデルのAXL-ADCでの治療的処置後の平均腫瘍サイズ。コンジュゲートされていないAXL Humab（C）および標的化されていないADC（D）は、抗腫瘍活性を示さず、AXL-ADCの治療能力が、MMAEの細胞傷害活性および標的結合に依存していたことが示される。エラーバーは標準誤差を表す。
【図１０Ｂ】（A）PAXF1657モデルのAXL-ADCでの治療的処置後の平均腫瘍サイズ。コンジュゲートされていないAXL Humab（C）および標的化されていないADC（D）は、抗腫瘍活性を示さず、AXL-ADCの治療能力が、MMAEの細胞傷害活性および標的結合に依存していたことが示される。エラーバーは標準誤差を表す。
【図１０Ｃ】（A）PAXF1657モデルのAXL-ADCでの治療的処置後の平均腫瘍サイズ。コンジュゲートされていないAXL Humab（C）および標的化されていないADC（D）は、抗腫瘍活性を示さず、AXL-ADCの治療能力が、MMAEの細胞傷害活性および標的結合に依存していたことが示される。エラーバーは標準誤差を表す。
【図１１】マウス-ヒトAXLキメラに対する抗AXL抗体の結合を、実施例11に記載されているように行った。以下のホモ・サピエンスAXL（hsAXL）およびハツカネズミAXL（mmAXL）キメラタンパク質を試験した：（A）hsAXLおよびモック、（B）hsAXL-mmECD、（C）hsAXL-mmIg1、（D）hsAXL-mmIg2、（E）hsAXL-mmFN1、（F）hsAXL-mmFN2。
【図１２】AXLのIg1ドメインに結合する抗体とプレインキュベートしていたA431細胞に対するヒトGas6（hGas6）の結合。示したデータは、1つの代表的な実験の平均蛍光強度（MFI）である。
【図１３】実施例13に記載されているような、高レベルの内在性Gas6を産生する治療的A431異種移植モデルにおける、MMAEコンジュゲートAXL抗体の抗腫瘍活性。パネルAおよびBは、2つの独立した実験からの結果を示す。
【図１４】実施例13に記載されているような、低レベルの内在性Gas6を発現する治療的LCLC-103H異種移植モデルにおける、MMAEコンジュゲートAXL抗体の抗腫瘍活性。パネルAおよびBは、2つの独立した実験からの結果を示す。
【図１５】A431細胞（A）およびMDA-MB231細胞（B）におけるAXL-ADCによる細胞傷害の誘導を、実施例8に記載されているように測定した。
【図１６】甲状腺癌、食道癌、卵巣癌、乳癌、肺癌、膵臓癌、子宮頸癌、および子宮内膜癌におけるAXL染色。AXL陽性細胞の平均AXL染色強度（OD）をX軸上にプロットし、AXL陽性腫瘍細胞のパーセンテージをY軸上にプロットしている。各ドットは、個々の患者に由来する腫瘍コアを表す。
【図１７】様々な腫瘍徴候についてAXL免疫染色した腫瘍コアの代表的な例。
【図１８−１】AXL抗体はAXLに特異的に結合するが、他のTAM受容体ファミリーメンバーには結合しない。ヒトAXL（A）、ヒトMER（B）、ヒトTYRO3（C）をトランスフェクトしたHEK293細胞、またはトランスフェクトしていないHEK293細胞（D）に対するHuMab-AXL抗体の結合。示したデータは、実施例15に記載されているような1つの代表的な実験の平均蛍光強度（MFI）である。
【図１８−２】AXL抗体はAXLに特異的に結合するが、他のTAM受容体ファミリーメンバーには結合しない。トランスフェクトした細胞の妥当な発現を確認するために、トランスフェクトしていないHEK293F細胞、およびAXL（E）、MER（F）、またはTYRO3（G）をトランスフェクトした細胞を、MER特異的抗体およびTYRO3特異的抗体で染色した。示したデータは、実施例15に記載されているような1つの代表的な実験の平均蛍光強度（MFI）である。
【図１９−１】AXL抗体と1時間4℃でインキュベートし、その後、4℃または37℃で一晩インキュベーションを行った腫瘍細胞株の形質膜上のAXL抗体の検出。MDA-MB-231細胞において、37℃でインキュベートしていた細胞上よりも、4℃でインキュベートしていた細胞の形質膜上により多くの抗体が検出され、37℃での膜結合抗体の内部移行が示された。
【図１９−２】AXL抗体と1時間4℃でインキュベートし、その後、4℃または37℃で一晩インキュベーションを行った腫瘍細胞株の形質膜上のAXL抗体の検出。Calu-1細胞において、37℃でインキュベートしていた細胞上よりも、4℃でインキュベートしていた細胞の形質膜上により多くの抗体が検出され、37℃での膜結合抗体の内部移行が示された。
【図２０】Fab-TAMRA/QSY7と複合体形成させたAXL抗体とのインキュベーション後の、LCLC-103H細胞の幾何平均蛍光強度。IgG1-b12およびFab-TAMRA/QSY7単独を、陰性対照として含めた。
【図２１】樹立メラノーマ細胞株および患者由来の低継代初代メラノーマ株(PDX)におけるAXL発現。(A) 樹立メラノーマ細胞株では可変レベルのAXL発現が観察された。AXLの高度発現またはデノボ発現は、PLX4720耐性細胞株(A375-R、SKMEL28R、SKMEL147)において観察された。(B) AXL発現は、15例のうち8例の患者由来初代メラノーマ株において観察された。樹立メラノーマ細胞株と低継代PDX培養物の両方において、AXL発現はMITF発現と逆の相関関係があった。
【図２２】細胞表面上のAXLタンパク質発現。定量的フローサイトメトリーによって測定された、Axl陰性およびAxl陽性メラノーマ細胞株におけるAXL発現の例。明るい灰色のプロットはAXL特異的抗体による染色を表し、濃い灰色のプロットはアイソタイプ対照抗体による染色を表す。
【図２３】樹立メラノーマ細胞株のIgG1-AXL-107-vcMMAEに対する感受性。メラノーマ細胞株(A〜F；CDX)をIgG1-AXL-107-vcMMAEまたはアイソタイプ対照ADCのIgG1-b12-vcMMAEにより3つ組(triplicate)で5日間処理した。細胞生存率をCellTiter-Gloアッセイで評価し、ADC濃度に対してプロットした。
【図２４】初代メラノーマ細胞培養物のIgG1-AXL-107-vcMMAEに対する感受性。低継代初代メラノーマ細胞株(A〜C；PDX)をIgG1-AXL-107-vcMMAEまたはアイソタイプ対照ADCのIgG1-b12-vcMMAEにより3つ組で8日間処理した。細胞生存率をCellTiter-Gloアッセイで評価し、ADC濃度に対してプロットした。
【図２５】メラノーマモデルSKMEL147におけるIgG1-AXL-107-vcMMAEの抗腫瘍効果。IgG1-b12、IgG1-b12-vcMMAE、IgG1-AXL-107、またはIgG1-AXL-107-vcMMAEによる治療的処置後の平均腫瘍サイズを示す(A)。観察された(n＝2)またはIgG1-AXL-107-vcMMAEで再処置された(n＝4) IgG1-AXL-107-vcMMAEマウスの腫瘍サイズを(B)に示す。
【図２６】SKMEL28野生型細胞(赤色)とPLX4720耐性SKMEL28-R細胞(緑色)を1：1で混合し、IgG1-AXL-107-vcMMAE (AXL-ADC)、IgG1-b12-MMAE (b12-ADC)、PLX4720 (PLX)、ダブラフェニブ(dabr)、トラメチニブ(tram)、または示されている組み合わせで処置した。(A) 未処置の細胞に対する総細胞数。(B) SKMEL28-R/SKMEL28細胞の比に対応するGFP/mCherry比。
【図２７】初代メラノーマサンプルにおいて免疫組織化学により検出されたAxl発現の例。(A) 陽性+++Axl染色強度を有するメラノーマの例、(B) +と++の間の陽性Axl染色強度を有するメラノーマの例、(C) ベムラフェニブでの処置前および処置後の同じ患者由来のメラノーマ組織におけるAxl発現の例；左＝ベムラフェニブ処置前、Axl染色強度：弱く+；右＝ベムラフェニブ処置後、Axl染色強度：弱く+ないし++、(D) 初代メラノーマ組織内の++強度を有する不均一なAxl発現の例。
【図２８Ａ】メラノーマ異種移植片モデルM019RにおけるIgG1-AXL-107-vcMMAE処置の効果；これは実施例18および19に記載される。(A) IgG1-AXL-107-vcMMAE、IgG1-b12-vcMMAE、またはダブラフェニブ＋トラメチニブによる治療的処置後の平均腫瘍サイズ。
【図２８Ｂ】メラノーマ異種移植片モデルM019RにおけるIgG1-AXL-107-vcMMAE処置の効果；これは実施例18および19に記載される。(B) 腫瘍細胞接種後33日目の個々のマウスにおける腫瘍サイズ。****, p<0.0001。
【図２８Ｃ】メラノーマ異種移植片モデルM019RにおけるIgG1-AXL-107-vcMMAE処置の効果；これは実施例18および19に記載される。(C) 示されているように最初にダブラフェニブ＋トラメチニブの組み合わせ(dab/tram)で30日間処置した後に、dab/tram、IgG1-AXL-107-vcMMAE、またはdab/tramとIgG1-AXL-107-vcMMAEの3剤併用で再処置したグループのKaplan-Meyerグラフ。
【図２９】メラノーマ異種移植片モデルM009RにおけるIgG1-AXL-107-vcMMAE処置の効果；これは実施例18および20に記載される。(A) IgG1-b12-vcMMAE (対照ADC)、IgG1-AXL-107-vcMMAE、IgG1-b12-vcMMAE＋ダブラフェニブ＋トラメチニブ、またはIgG1-AXL-107-vcMMAE＋ダブラフェニブ＋トラメチニブによる治療的処置後の平均腫瘍サイズ。(B)最初の処置後14日目の個々のマウスにおける腫瘍サイズ。**, p＜0.01; ***, p＜0.001。
【図３０】NRAS変異型メラノーマ細胞株におけるIgG1-AXL-107-vcMMAEにより誘導されたインビトロ細胞傷害性。AXL抗体-薬物コンジュゲートによる細胞傷害性の誘導を、実施例21で説明するように測定した。
【図３１】NRAS変異型メラノーマ組織におけるAxlの発現を、免疫組織化学によって測定した。各サンプルのHスコアは、実施例22に記載するように、Axl陽性腫瘍細胞の割合およびAxl陽性腫瘍細胞の染色強度(1+, 2+, 3+)に基づいて算出した。
【発明を実施するための形態】
【００１２】
発明の詳細な開示
本発明は、少なくとも一部には、次のような驚くべき発見に基づいている：すなわち、BRAF阻害剤に対して耐性のメラノーマのインビボ腫瘍モデルにおいて、AXL-ADCとBRAF阻害剤(ダブラフェニブ)とMEK阻害剤(トラメチニブ)の3剤併用は、例えば、AXL-ADC単独、BRAF阻害剤とMEK阻害剤のみの組み合わせ(実施例19)、またはBRAF阻害剤とMEK阻害剤と対照ADCとの組み合わせ(実施例20)よりも効果的であった。このことは、該メラノーマモデルが、インビトロ(1μg/mL)でまたはインビボ(実施例20)で、単一の薬剤としてのAXL-ADCによる処置に感受性でなかった場合でも、そうであった。さらに、BRAF阻害剤感受性メラノーマ細胞とBRAF阻害剤(PLX4720)耐性メラノーマ細胞との混合物のインビトロ研究は、AXL-ADCとBRAF阻害剤(PLX4720もしくはダブラフェニブ)の併用、またはAXL-ADCとBRAF阻害剤(ダブラフェニブ)とMEK阻害剤(トラメチニブ)の3剤併用が、BRAF阻害剤感受性細胞とBRAF阻害剤耐性細胞の両方を根絶したことを示した(実施例17)。最後に、進行期のNRAS変異型メラノーマ患者からの10個の腫瘍サンプルのうち9個において、AXL発現が該腫瘍細胞の少なくとも一部で検出された(実施例22）。
【００１３】
本明細書に報告されるこれらおよび他の結果は、AXL-ADCとMAPK経路キナーゼの1種以上の阻害剤（例えば、BRAF、MEK、およびERKなどのキナーゼの阻害剤）との組み合わせがメラノーマの治療に適していることを示す。
【００１４】
治療的適用
本発明は、MAPK経路の1種以上の阻害剤（例えば、1種以上のセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ阻害剤）と組み合わせて対象のメラノーマの治療に使用するためのAXL-ADC（例えば、HuMax-AXL-ADC）を提供する。特定の態様において、1種以上のセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ阻害剤は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤、およびBRAF阻害剤とMEK阻害剤の組み合わせから選択される。AXL-ADCと阻害剤は、同時に、別々に、または逐次的に投与することができる。しかしながら、典型的には、それらは異なる投薬レジメンに従って別々に投与される。投薬レジメンの例が本明細書に記載される。しかし、本開示および当分野の技術レベルに基づいて、当業者、例えば医師、が他の適切な投薬レジメンを計画して実施することもできる。
【００１５】
本明細書で使用する「MAPキナーゼ経路阻害剤」、「MAPK経路阻害剤」、「MAPK経路の阻害剤」または「MAPK阻害剤」は、MAPK経路における少なくとも1つの酵素を阻害して、そのセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ活性をブロックする化合物、典型的には医薬化合物を指す。MAPK経路は、細胞の表面上のチロシンキナーゼ受容体からのシグナルを細胞の核内のDNAに伝える、一連のタンパク質からなる周知の細胞内シグナル伝達経路である。該経路の活性化には、多くのセリン/トレオニン/チロシンキナーゼのその後のリン酸化が含まれる。これらは、一般にMAPKKK (例：RAF)、MAPKK (例：MEK)およびMAPK (例：ERK)と名付けられる。RAFプロテインキナーゼファミリーは、セリン/トレオニンキナーゼA-RAF、B-RAF (BRAF)およびC-RAFを含み、全てが共通の上流アクチベータとしてRASを共有する。MEK1およびMEK2は二重特異性キナーゼであり、例えばERK1およびERK2上の、チロシンとトレオニンの両方のリン酸化を触媒する。ERK1およびERK2は、次に、細胞質内基質と核基質のリン酸化を触媒する。MAPK経路の1つ以上の酵素の阻害剤は、公知であり、かつ/またはメラノーマおよび他の悪性腫瘍の治療に向けて臨床開発中である(例えば、表1およびそこに引用される参考文献を参照されたい）。MAPK経路の阻害剤の例は、表1に示され、セリン/トレオニン/チロシンキナーゼBRAF、MEKおよびERKの阻害剤を含む。
【００１６】
本明細書で使用する「セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤」または「S/Th KI」は、BRAF、MEKまたはERKのようなセリン/トレオニン/チロシンキナーゼの少なくともセリン/トレオニンキナーゼ活性を阻害する化合物、典型的には医薬品を指す。セリン/トレオニンキナーゼは、S/Th KIが直接または間接的に阻害するステップである、セリンまたはトレオニン残基のヒドロキシル基のリン酸化を担う酵素である。セリンまたはトレオニンのリン酸化は、細胞内シグナル伝達カスケードの活性化をもたらす。癌治療に有用なS/Th KIおよびそれらの標的の例は、以下の表1に示され、BRAF阻害剤、例えば、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブおよびそれらの類似体または誘導体、ならびにMEK阻害剤、例えば、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブおよびそれらの類似体または誘導体が含まれる。一態様では、本明細書で使用する用語「セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤」は、セリン/トレオニンキナーゼのタンパク質リン酸化活性（例えば、MEK、ERK、BRAFおよび/またはその変異体（例えば、BRAF V600変異体）のセリン/トレオニンキナーゼ活性）を特異的に阻害する化合物を指す。
【００１７】
本明細書で使用する「セリン/トレオニン/チロシンキナーゼ阻害剤」または「S/Th/T KI」は、セリン/トレオニンキナーゼ活性とチロシンキナーゼ活性の両タイプのキナーゼ活性を有するキナーゼ、例えばMEK、の一方または両方のキナーゼ活性を阻害する化合物、典型的には医薬品を指す。
【００１８】
本明細書で使用する「BRAF阻害剤」または「BRAFi」は、ヒトBRAF (UniProtKB - P15056 (BRAF_HUMAN))の、任意で、さらにその変異体および/またはそのアイソフォームの、セリン/トレオニンキナーゼ活性の阻害剤である。一態様では、BRAF阻害剤は、ヒトBRAFの1つ以上の変異体、例えば、残基V600、L597またはK601に変異(V600Eなど)を有するもの、のセリン/トレオニンキナーゼ活性を阻害する。例えば、BRAFiは、それらが天然のヒトBRAFを阻害するよりも効果的に変異型BRAFのセリン/トレオニンキナーゼ活性を阻害することができ、したがって、変異型BRAFに選択的である(本明細書では「mutBRAFi」とも呼ばれる)。別の態様では、BRAF阻害剤は、A-RAF (UniProtKB P10398 (ARAF_HUMAN))とC-RAF (UniProtKB P04049 (RAF1_HUMAN))の一方もしくは両方、および/またはそれらの変異体のセリン/トレオニンキナーゼ活性を阻害する(本明細書では「RAF阻害剤」または「Pan-RAF阻害剤」または「Pan-RAFi」とも呼ばれる)。BRAF阻害剤の好ましいが非限定的な例を表1に挙げる。
【００１９】
本明細書で使用する「MEK阻害剤」または「MEKi」は、MEK1 (UniProtKB Q02750 (MP2K1_HUMAN))、MEK2 (UniProtKB P36507 (MP2K2_HUMAN))、または両方の少なくともセリン/トレオニンキナーゼ活性、チロシンキナーゼ活性、または両活性の阻害剤であり、さらに、またはその代わりに、MEK5 (UniProtKB Q13163 (MP2K5_HUMAN))などの他のMEKタンパク質を阻害してもよい。文脈と矛盾しない限り、本明細書でMEKのセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤またはS/Th KIに言及する場合、該阻害剤は任意でMEKのチロシンキナーゼ活性を阻害することもできる。好ましくは、MEK阻害剤は、MEK1、MEK2またはその両方のセリン/トレオニンキナーゼ活性を阻害する。BRAF阻害剤の好ましいが非限定的な例を表1に挙げる。
【００２０】
本明細書で使用する「ERK阻害剤」は、ERK1 (UniProtKB P27361 (MK03_HUMAN))、ERK2 (UniProtKB P28482 (MK01_HUMAN))または両方のセリン/トレオニンキナーゼ活性の阻害剤である。ERK阻害剤は、ERK1およびERK2の1つ以上を特異的に阻害することができ、さらに、またはその代わりに、他のERKアイソフォームを特異的に阻害することもできる。好ましくは、ERKiは、ERK1およびERK2の少なくとも一方のセリン/トレオニンキナーゼ活性を阻害する。ERK阻害剤の好ましいが非限定的な例を表1に挙げる。
【００２１】
（表１）MAPK経路阻害剤の例
2019509257.tif 000003
2019509257.tif 000004
2019509257.tif 000005
2019509257.tif 000006
＊ PLX4032のツール化合物
【００２２】
一局面において、本発明は、MAPK経路の1種以上の阻害剤と組み合わせて対象におけるメラノーマの治療に使用するための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。一態様では、1種以上の阻害剤は表1に挙げた阻害剤を含む。好ましくは、本発明に従って使用するための阻害剤は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤およびERK阻害剤から選択される。特定の態様では、1種以上の阻害剤は、表1に挙げた阻害剤、例えばBRAF、MEKまたはERK阻害剤からなる。
【００２３】
あるいは、本明細書中のいずれかの局面または態様では、AXL-ADCは、BRAF阻害剤、MEK阻害剤およびERK阻害剤から選択される2種以上の阻害剤と組み合わせて使用することができ、例えば、BRAF阻害剤とMEK阻害剤；BRAF阻害剤とERK阻害剤；MEK阻害剤とERK阻害剤；またはBRAF阻害剤とMEK阻害剤とERK阻害剤と組み合わせて使用される。特定の態様では、2種以上の阻害剤の少なくとも1種は、表1に挙げた阻害剤である。別の特定の態様では、AXL-ADCは、BRAF阻害剤、MEK阻害剤およびERK阻害剤から選択される2種の阻害剤と組み合わせて使用され、例えば、両方の阻害剤が表1に挙げた阻害剤である。
【００２４】
一態様において、MAPK経路の1種以上の阻害剤は、BRAF阻害剤を含むか、またはBRAF阻害剤からなる。
【００２５】
特定の態様において、BRAF阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、PLX4720、GDC-0879、RAF265、SB590885、AZ628、またはそれらの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される。別の態様では、BRAF阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはそれらの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される。好ましくは、BRAF阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、またはそれらの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される。
【００２６】
一つの好ましい態様では、BRAF阻害剤は、ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である。一態様では、BRAF阻害剤はベムラフェニブである。ベムラフェニブ(PLX4032)は、経口投与可能な、ATP競合性の、低分子のBRAFキナーゼ阻害剤であり、例えば、残基V600 (例：V600E)、残基L597 (例：L597R; Bahadoran et al., 2013)、残基K601 (Dahlman et al., 2012)でのアミノ酸置換を含むがこれらに限定されない、特定の変異を含むBRAFに特に結合して、それを阻害する。例えば、ベムラフェニブは、無細胞アッセイにおいて、例えば、本明細書またはBollag et al., 2010 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載されるアッセイにおいて、BRAF(V600E)キナーゼ活性の阻害について約31nMのIC50を有し得る。
【００２７】
別の好ましい態様では、BRAF阻害剤は、ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である。一態様では、BRAF阻害剤はダブラフェニブである。ダブラフェニブは、BRAFキナーゼの阻害剤であり、V600EなどのV600での変異を含むがこれに限定されない、特定の変異を含むBRAFに特に結合して、それを阻害する。ダブラフェニブは、例えば、本明細書またはLaguerre et al., 2009 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、BRAF(V600E)キナーゼ活性の阻害について約0.8nMのIC50を有し得る。
【００２８】
別の好ましい態様では、BRAF阻害剤は、エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である。一態様では、BRAF阻害剤はエンコラフェニブである。エンコラフェニブは、BRAFキナーゼの阻害剤であり、V600Eを含むがこれに限定されない特定の変異を含むBRAFに特に結合して、それを阻害する。エンコラフェニブは、例えば、本明細書またはStuart et al., 2012 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、BRAF(V600E)キナーゼ活性の阻害について約4nMのIC50を有し得る。
【００２９】
別の好ましい態様では、BRAF阻害剤は、ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である。一態様では、BRAF阻害剤はソラフェニブである。ソラフェニブは、BRAFキナーゼの阻害剤であ、BRAFに特に結合して、それを阻害する。ソラフェニブは、例えば、本明細書またはWilhelm et al., 2004 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、BRAFキナーゼ活性の阻害について約22nMのIC50を有し得る。
【００３０】
一態様では、BRAFiは、AB-024、TAK-580、BAL-3833、BGB-283、またはそれらの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される。
【００３１】
一態様において、MAPK経路の1種以上の阻害剤は、MEK阻害剤を含むか、またはMEK阻害剤からなる。
【００３２】
一態様では、MEK阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、レファメチニブ、ピマセルチブ、U0126-EtOH、PD184352、BIX 02189、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体である。一態様では、MEK阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、レファメチニブ、ピマセルチブ、U0126-EtOH、PD184352、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体である。好ましくは、MEK阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体である。
【００３３】
最も好ましくは、MEK阻害剤は、トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体である。一態様では、MEK阻害剤はトラメチニブである。トラメチニブはMEK1/2阻害剤であり、例えば、本明細書またはYamaguchi et al., 2011 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、MEK1およびMEK2のセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ活性の阻害について、それぞれ約0.92nMおよび1.8nMのIC50を有し得る。
【００３４】
一態様では、MEK阻害剤は、ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、例えば、ビニメチニブである。ビニメチニブはMEK1/2阻害剤であり、例えば、本明細書またはPheneger et al., 2006 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、MEK1およびMEK2のセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ活性の阻害について約12nMのIC50を有し得る。
【００３５】
一態様では、MEK阻害剤は、コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、例えば、コビメチニブである。コビメチニブはMEK1阻害剤であり、例えば、本明細書またはHoeflich et al., 2012 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、MEK1のセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ活性の阻害について約4.2nMのIC50を有し得る。
【００３６】
一態様では、MEK阻害剤は、セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、例えば、セルメチニブである。セルメチニブはMEK1阻害剤であり、例えば、本明細書またはHuynh et al., 2007 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、MEK1のセリン/トレオニン/チロシンキナーゼ活性の阻害について約14nMのIC50を有し得る。
【００３７】
一態様では、MAPK経路の1種以上の阻害剤は、ERK阻害剤を含むか、またはERK阻害剤からなる。
【００３８】
一態様では、ERK阻害剤は、LTT-462、ウリキセルチニブ(ulixertinib)(BVD-523)、VTX11E、SCH772984、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体である。
【００３９】
ウリキセルチニブは、ERK1/2阻害剤であり、例えば、本明細書またはWard et al., 2015 (その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に記載される無細胞アッセイにおいて、ERK2キナーゼ活性の阻害について約＜0.3nMのIC50を有し得る。
【００４０】
本明細書で使用する場合、薬物の「誘導体」とは、基準薬物から直接的な化学反応によって誘導されるまたは誘導可能な化合物である。本明細書で使用する場合、基準薬物の「類似体」または「構造類似体」とは、その薬物と類似した構造および/または作用機序を有するが、少なくとも1つの構造要素において異なっている化合物のことである。例えば、「ベムラフェニブ」、「ダブラフェニブ」または「トラメチニブ」などの基準薬物の「治療上活性な」または「治療上有効な」類似体もしくは誘導体は、その薬物と比較して、類似したまたは改善された治療効果を有するが、例えば、安定性、標的特異性(すなわち、それがどのタイプのキナーゼを阻害するか)、選択性(すなわち、それが該キナーゼのどのアイソフォームまたは変異体を阻害するか)、阻害活性、溶解性、毒性などの1つ以上の点で異なっていてよい。表1は、同様の特異性(すなわち、BRAF、MEK、ERKなどの阻害)、同様の選択性、またはその他の作用機序の類似性を有する、BRAF、MEK、ERKなどの阻害剤を示す。
【００４１】
特定の態様において、本発明によるキナーゼ阻害剤(例えば、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤)の類似体または誘導体は、適切なアッセイにおいて、基準薬物と同じまたは同様のキナーゼ特異性、任意で選択性をも有し、キナーゼ活性を阻害する上で同様のまたは改善されたIC50を有する。例えば、該類似体または誘導体は、適切なアッセイにおいて、基準薬物のIC50の約1000％未満、例えば、約300％未満、約200％未満、約120％未満、約100％未満、約80％未満、約50％未満などであるIC50を有し、場合により、約1％を超える、例えば、約10％、約20％または約40％を超えるIC50を有し得る。あるいは、該類似体または誘導体は、適切なアッセイにおいて、約5μM未満、例えば、約1μM未満、約500nM未満、約200nM未満、100nM未満、約50nM未満、0.01nM〜1μM、0.05nM〜200nM、または0.1nM〜100nMであるIC50を有し得る。
【００４２】
プロテインキナーゼ阻害剤の特異性、選択性および活性を測定するための適切なアッセイは、当技術分野で周知である(例えば、Lynette et al. 2009およびUitdehaag 2012を参照されたい)。例えば、本明細書に記載のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブ、の類似体もしくは誘導体のBRAF阻害活性；本明細書に記載のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブまたはセルメチニブ、の類似体もしくは誘導体のMEK阻害活性；あるいは本明細書に記載のERK阻害剤、例えばVTX11E、LTT-462またはウリキセルチニブ、の類似体もしくは誘導体のERK阻害活性は、Tsaiら(Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Feb 26; 105(8): 3041-3046；その全体が参照により本明細書に組み入れられる)により記載されたアッセイにおいて評価され得る。具体的には、選択されたキナーゼ、キナーゼ変異体および/またはキナーゼアイソフォームは、Z'-LYTE生化学アッセイフォーマット(SelectScreen; Invitrogen社)をメーカーの指示に従って用いて、親薬物と比較して、その類似体または誘導体による阻害についてプロファイリングされ得る。
【００４３】
簡単に説明すると、BRAF変異体、例えばBRAF(V600E)、に対するBRAFi(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)のIC50値は、例えば以下のように、RAFキナーゼ活性の測定によって決定することができる：
野生型RAFおよび変異体のキナーゼ活性は、ビオチン化BADタンパク質(Bcl2-Associated Agonist Of Cell Death)のリン酸化を測定することによって決定される。各酵素(0.01ng)について、20μLの反応物を、20mM Hepes (pH7.0)、10mM MgCl2、1mM DTT、0.01％(v/v)Tween-20、50nMビオチン-BADタンパク質、および1mM ATP中にて室温で実施する。20mM Hepes (pH7.0)、200mM NaCl、80mM EDTA、0.3％(w/v)ウシ血清アルブミン(BSA)を含有する溶液5μLを用いて、反応を5分で停止させる。停止溶液には、ホスホ-BAD (Ser112)抗体、ストレプトアビジン被覆ドナービーズ、およびプロテインAアクセプタービーズも含まれる。抗体およびビーズを停止溶液中で暗所にて室温で30分間プレインキュベートする。抗体の最終希釈は1/2000であり、各ビーズの最終濃度は10μg/mLである。アッセイプレートを室温で1時間インキュベートし、次いでPerkinElmer AlphaQuestリーダーで読み取る。変異体の活性は、3つの異なる実験において2つ組でアッセイされた精製タンパク質の2つの異なるバッチの平均である。あるいは、絶対IC50値を決定する代わりに、基準化合物(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を対照として使用して、基準薬物の阻害活性と比較した相対的阻害活性を、典型的には％で、算出することができる。
【００４４】
簡単に説明すると、MEK、例えばMEK1、に対するMEKi(例えば、トラメチニブ)のIC50値は、例えば以下のように、MEKキナーゼ活性の測定によって決定することができる：
抗MEK1抗体を用いてMEK1分子を免疫沈降させる。MEKキナーゼ活性は、アッセイのエンドポイントとしてMBP(ミエリン塩基性タンパク質)を用いた結合アッセイにおいて、免疫分離したMEK1が組換えERK1を活性化する能力として測定される。リン酸化MBPを14％SDS-PAGEゲル上で分離し、真空乾燥してからX線フィルムに感光させる。あるいは、絶対IC50値を決定する代わりに、基準化合物(例えば、トラメチニブ)を対照として使用して、基準薬物の阻害活性と比較した相対的阻害活性を、典型的には％で、算出することができる。MBPよりも特異的な基質、例えば、精製された組換えRSK、MNKまたはElk1、およびこのタンパク質のリン酸化部位に従って作製されたペプチド、を使用することもできる。
【００４５】
一局面において、本発明は、対象におけるメラノーマを治療する方法で使用するためのAXL-ADCを提供し、該方法は、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤である少なくとも1種の治療剤と組み合わせてAXL-ADCを投与することを含み、その際、該ADCおよびセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤は、同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、少なくとも1種の治療剤は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤またはそれらの組み合わせであるS/Th KIからなるか、またはそれを含む。一態様では、S/Th KIは、BRAF阻害剤、例えば、ベムラフェニブ(PLX4032)またはその治療上有効な誘導体もしくは類似体、例えばPLX4720もしくはダブラフェニブ；またはVTXKIIEである。一態様では、S/Th KIは、MEK阻害剤、例えば、セルメチニブ(AZD6244)またはトラメチニブである。
【００４６】
一態様において、AXL-ADCは、BRAF阻害剤、MEK阻害剤、ERK阻害剤、またはそれらのうちのいずれか2つ以上の組み合わせから選択される1種以上のS/Th KIと組み合わせてメラノーマを治療する方法で使用するためのものである。一態様では、1種以上のS/Th KIは、BRAF阻害剤、例えば、ベムラフェニブ(PLX4032)、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはその治療上有効な誘導体もしくは類似体、例えばPLX4720を含む。一態様では、1種以上のS/Th KIは、MEK阻害剤、例えば、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ(AZD6244)、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体を含む。一態様では、1種以上のS/Th KIは、ERK阻害剤、例えば、VTXKIIE、LTT-462、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体を含む。一態様では、1種以上のS/Th KIは、BRAF阻害剤、例えば、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、またはソラフェニブからなる。一態様では、少なくとも1種のS/Th KIは、MEK阻害剤、例えば、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、またはセルメチニブからなる。一態様では、1種以上のS/Th KIは、ERK阻害剤、例えば、ウリキセルチニブ、VTXIIE、SCH772984、またはLTT-462からなる。以下は、本明細書中のいずれかの局面または態様に従ってメラノーマを治療するための特定の実施態様である：
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはベムラフェニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはダブラフェニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはエンコラフェニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはソラフェニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはトラメチニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはコビメチニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはビニメチニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはセルメチニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはウリキセルチニブである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはVTXKIIEである。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはLTT-462である。
一つの特定の実施態様において、S/Th KIはPLX4720である。
【００４７】
実施例19および20に記載するように、HuMax-AXL-ADCとBRAF阻害剤とMEK阻害剤の組み合わせは、インビボで耐性のBRAF変異型メラノーマモデルを治療するのに有効であった。したがって、一局面では、本発明は、MAPK経路の2種の阻害剤と組み合わせて対象におけるメラノーマの治療に使用するための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。一態様では、2種の阻害剤(本明細書では「第1」および「第2」阻害剤と呼ばれる)の少なくとも一方、任意で両方は、表1に挙げた阻害剤、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択される。例えば、別の態様では、第1の阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、LTT-462、ウリキセルチニブ、SCH772984およびVTXKIIEから選択され、第2の阻害剤は、表1中の第1の阻害剤以外の阻害剤から独立して選択される。より好ましくは、第1の阻害剤および第2の阻害剤は、両方とも、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、LTT-462、ウリキセルチニブ、SCH772984およびVTXKIIEから選択される。好ましくは、本発明に従って使用するための第1および第2の阻害剤の両方は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤およびERK阻害剤から独立して選択される。より好ましくは、第1の阻害剤と第2の阻害剤の組み合わせは、BRAF阻害剤とMEK阻害剤、BRAF阻害剤とERK阻害剤、MEK阻害剤とERK阻害剤から選択される。最も好ましくは、AXL-ADCは、BRAF阻害剤およびMEK阻害剤と組み合わせてメラノーマの治療に使用するためのものである。
【００４８】
一態様において、第1の阻害剤はBRAF阻害剤であり、第2の阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの類似体もしくは誘導体から選択されるMEK阻害剤である。
【００４９】
一態様において、第1の阻害剤はBRAF阻害剤であり、第2の阻害剤は、VTXKIIEおよびLTT-462、またはそれらのうちのいずれかの類似体もしくは誘導体から選択されるERK阻害剤である。
【００５０】
一態様において、第1の阻害剤はMEK阻害剤であり、第2の阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブ、またはそれらのうちのいずれかの類似体もしくは誘導体から選択されるBRAF阻害剤である。
【００５１】
一態様において、第1の阻害剤はMEK阻害剤であり、第2の阻害剤は、VTXKIIEおよびLTT-462、またはそれらのうちのいずれかの類似体もしくは誘導体から選択されるERK阻害剤である。
【００５２】
一態様において、第1の阻害剤はERK阻害剤であり、第2の阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブ、またはそれらのうちのいずれかの類似体もしくは誘導体から選択されるBRAF阻害剤である。
【００５３】
一態様において、第1の阻害剤はERK阻害剤であり、第2の阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの類似体もしくは誘導体から選択されるMEK阻害剤である。
【００５４】
一態様において、AXL-ADCは、以下の(a)〜(p)から選択されるBRAF阻害剤とMEK阻害剤の組み合わせと組み合わせて対象におけるメラノーマの治療に用いるためのものである：
(a) ベムラフェニブおよびトラメチニブ；
(b) ベムラフェニブおよびコビメチニブ；
(c) ベムラフェニブおよびビニメチニブ；
(d) ベムラフェニブおよびセルメチニブ；
(e) ダブラフェニブおよびトラメチニブ；
(f) ダブラフェニブおよびコビメチニブ；
(g) ダブラフェニブおよびビニメチニブ；
(h) ダブラフェニブおよびセルメチニブ；
(i) エンコラフェニブおよびトラメチニブ；
(j) エンコラフェニブおよびコビメチニブ；
(k) エンコラフェニブおよびビニメチニブ；
(l) エンコラフェニブおよびセルメチニブ；
(m) ソラフェニブおよびトラメチニブ；
(n) ソラフェニブおよびコビメチニブ；
(o) ソラフェニブおよびビニメチニブ；または
(p) ソラフェニブおよびセルメチニブ。
【００５５】
特定の態様では、(a)〜(p)のいずれか1つのBRAF阻害剤は、指定したBRAF阻害剤の治療上有効な類似体または誘導体である。
【００５６】
特定の態様では、(a)〜(p)のいずれか1つのMEK阻害剤は、指定したMEK阻害剤の治療上有効な類似体または誘導体である。
【００５７】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ベムラフェニブおよびトラメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００５８】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ベムラフェニブおよびコビメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００５９】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ベムラフェニブおよびビニメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６０】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ベムラフェニブおよびセルメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６１】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ダブラフェニブおよびトラメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６２】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ダブラフェニブおよびコビメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６３】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ダブラフェニブおよびビニメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６４】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ダブラフェニブおよびセルメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６５】
一つの特定の実施態様では、本発明は、エンコラフェニブおよびトラメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６６】
一つの特定の実施態様では、本発明は、エンコラフェニブおよびコビメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６７】
一つの特定の実施態様では、本発明は、エンコラフェニブおよびビニメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６８】
一つの特定の実施態様では、本発明は、エンコラフェニブおよびセルメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００６９】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ソラフェニブおよびトラメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００７０】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ソラフェニブおよびコビメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００７１】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ソラフェニブおよびビニメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００７２】
一つの特定の実施態様では、本発明は、ソラフェニブおよびセルメチニブと組み合わせて対象のメラノーマの治療に用いるための、HuMax-AXL-ADCなどの、ヒトAXLに結合する抗体を含むAXL-ADCを提供する。
【００７３】
これらの実施態様の一つ一つは、特定の阻害剤と組み合わせて、AXL-ADCを（典型的には治療に有効な量で）投与することを含む、対象におけるメラノーマを治療する方法として代替的に表現され得る。
【００７４】
本明細書で使用する用語「対象」は、典型的には、AXL-ADCおよび1種以上のMAPK経路阻害剤を投与されるヒトであり、典型的には、メラノーマを有するかまたはメラノーマを発症するリスクがあると診断されたヒト患者である。いくつかの態様では、対象は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤またはERK阻害剤などのMAPK経路阻害剤によるメラノーマの治療を以前に受けたことがない。他の態様では、対象は、本発明に従ってAXL-ADCと組み合わせて使用するために、1種以上のMAPK経路阻害剤、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤などの1種以上のMAPK経路阻害剤によるメラノーマの治療を既に受けているか、または以前に受けたことがある。
【００７５】
本明細書に示すように、メラノーマにおける耐性の発生は、AXLの増加した発現またはデノボ発現と関連している(例えば、実施例17および21参照)。例えば、ベムラフェニブ、ダブラフェニブおよびトラメチニブのうちの1つ以上に対する耐性は、腫瘍細胞によるAXLのデノボ発現または増加した発現に関連し得る。したがって、メラノーマは、これらおよび他のMAPK経路阻害剤とAXL特異的ADCの組み合わせによる治療の対象となる。メラノーマは、当技術分野で周知であるメラノーマの確立された分類基準に従って、ステージI、ステージII、ステージIIIまたはステージIVのメラノーマであり得る。いくつかの態様において、本明細書中のいずれかの局面または態様に従って治療されるメラノーマは、ステージIVのメラノーマである。
【００７６】
いくつかの態様において、メラノーマはBRAFに変異を有し、該変異は1種以上のBRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらす。メラノーマなどのヒト癌で同定されたBRAF変異は、一般に、キナーゼドメイン内のNローブのグリシンリッチPループならびに活性化セグメントおよび隣接領域に位置しており、典型的には、変異型BRAFキナーゼを発現する腫瘍細胞内で下流に過剰活性化MAPKシグナル伝達経路を生じる。BRAFにおいて、そのような変異の特定の残基としては、限定するものではないが、V600 (例えば、V600E、V600K、V600D、V600R)、残基L597 (例えば、L597R)、および残基K601 (K601E）が挙げられる。一態様では、その変異はV600にある。一態様では、BRAFにおける変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。特定の態様では、その変異はV600Eである。そのようなBRAF変異を同定する方法は、当技術分野で周知であり、例えば、実施例およびColombino et al. (2012)を参照されたい。このようなBRAF変異を有するメラノーマは、BRAFi、特にベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、およびそれらのうちのいずれかの類似体または誘導体などのmutBRAFiを含む、本発明のいずれかの局面または態様に特に適している。
【００７７】
いくつかの態様において、メラノーマはNRAS (UniProtKB - P01111 (RASN_HUMAN))に変異を有する。そのような変異は、当技術分野で周知である(例えば、Colombino et al., 2012を参照されたい)。例えば、その変異は、MAPK経路を構成的に活性化する変異(本明細書では「活性化」変異と称する)であり、発癌性の変異であり得る。非限定的な変異には、アミノ酸の置換、欠失または挿入が含まれる；好ましくは、変異はアミノ酸置換である。そのような変異の特定の残基としては、限定するものではないが、Q61 (例えば、Q61R、Q61K、Q61L)、G12 (例えば、G12D、G12S、G12C、G12V)、およびG13 (G13D、G13R)が挙げられる。一態様では、メラノーマは、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択される少なくとも1つの変異を有する。そのようなNRAS変異を同定する方法は、当技術分野で周知であり、例えば、実施例およびColombino et al. (2012)を参照されたい。このようなNRAS変異を有するメラノーマは、MEKi、特にトラメチニブ、ビニメチニブ、コビメチニブまたはセルメチニブ、およびそれらのうちのいずれかの類似体または誘導体などのMEKiを含む、本発明のいずれかの局面または態様に特に適している。任意で、その局面または態様には、mutBRAFiの投与が含まれない。
【００７８】
いくつかの態様では、本明細書中のいずれかの局面または態様に従って治療されるメラノーマは、MAPK経路の1種以上の阻害剤、例えば、少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤に耐性である。メラノーマは、例えば、BRAF阻害剤であるベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブのうちの1つ以上に、MEKiであるトラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブおよびセルメチニブのうちの1つ以上に、かつ/またはERK阻害剤であるウリキセルチニブ、LTT-462、VTX11EおよびSCH772984のうちの1つ以上に耐性であり得る。
【００７９】
本明細書で使用する場合、1種以上の治療剤に関して「耐性」、「治療抵抗性」または「不応性」のメラノーマとは、メラノーマが治療剤による処置に応答しないことを意味する。メラノーマは、例えば、処置開始時から治療剤による処置に応答しないという点で「自然耐性」(本明細書では「内因性耐性」とも呼ばれる)を有し得る。あるいは、メラノーマは、治療剤による処置に、例えば疾患の寛解または安定化によって、最初に応答したが、一定期間の処置の後またはメラノーマの再発後に治療剤に対して非応答性または低応答性になり、典型的には進行性の疾患を生じるという点で「獲得耐性」を有し得る。その他の耐性の指標には、治療剤による処置にもかかわらず、メラノーマのぶり返しまたは再発、腫瘍組織量の増加、新たに確認された転移などが含まれる。メラノーマが治療剤に耐性であるか、または耐性になるリスクがあるかどうかは、当業者によって判定され得る。例えば、全米総合がん情報ネットワーク(National Comprehensive Cancer Network：NCCN, www.nccn.org)と欧州臨床腫瘍学会(European Society for Medical Oncology：ESMO, www.esmo.org/Guidelines)は、特定の癌が治療（処置）に応答するかどうかを評価するためのガイドラインを提供している。
【００８０】
こうして、いくつかの態様では、メラノーマは、どのようなMAPK経路阻害剤によっても以前に治療（処置）されたことがない。いくつかの態様では、メラノーマは、本明細書中のいずれかの局面または態様に従う1種以上のMAPK経路阻害剤のいずれによっても以前に治療（処置）されたことがない。例えば、特定の態様では、メラノーマは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、トラメチニブ、ビニメチニブ、コビメチニブおよびセルメチニブのいずれか1つ以上によって以前に治療（処置）されたことがない。
【００８１】
いくつかの態様において、メラノーマは、少なくとも1つのMAPK経路阻害剤に耐性である。いくつかの態様では、メラノーマは、本明細書中のいずれかの局面または態様に従う1種以上のMAPK経路阻害剤のうちの少なくとも1つに耐性である。例えば、特定の態様では、メラノーマは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、トラメチニブ、ビニメチニブ、コビメチニブおよびセルメチニブのいずれか1つ以上に耐性である。
【００８２】
いくつかの態様において、メラノーマは、少なくとも1つのMAPK経路阻害剤に対する自然(内因性)耐性を有する。いくつかの態様では、メラノーマは、本明細書中のいずれかの局面または態様に従う1種以上のMAPK経路阻害剤のうちの少なくとも1つに対する自然(内因性)耐性を有する。例えば、特定の態様では、メラノーマは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、トラメチニブ、ビニメチニブ、コビメチニブおよびセルメチニブのいずれか1つ以上に対する自然(内因性)耐性を有する。
【００８３】
いくつかの態様において、メラノーマは、前記1種以上の阻害剤のうちの少なくとも1つに対する獲得耐性を有する。メラノーマは、例えば、本明細書中のいずれかの局面または態様に従う1種以上の阻害剤のうちの少なくとも1つによる治療（処置）を受けているか、以前に治療（処置）を受けたことがある。任意で、メラノーマは再発性メラノーマまたは再発したメラノーマであり得る。
【００８４】
一態様では、メラノーマは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブのうちの少なくとも1つに耐性または不応性である。例えば、対象は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブによる治療（処置）を、少なくとも2ヶ月間、例えば、少なくとも3ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも12ヶ月またはそれ以上の期間にわたって、受けたことがある。
【００８５】
一態様では、メラノーマは、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブおよびセルメチニブのうちの少なくとも1つに耐性または不応性である。例えば、対象は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブまたはセルメチニブによる治療（処置）を、少なくとも2ヶ月間、例えば、少なくとも3ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも12ヶ月またはそれ以上の期間にわたって、受けたことがある。
【００８６】
一態様では、メラノーマは、ダブラフェニブまたはトラメチニブの少なくとも一方に、任意で両方に、耐性または不応性である。例えば、対象は、トラメチニブとダブラフェニブの組み合わせによる治療（処置）を、少なくとも2ヶ月間、例えば、少なくとも3ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも12ヶ月またはそれ以上の期間にわたって、受けたことがある。
【００８７】
一態様では、メラノーマは、ベムラフェニブまたはトラメチニブの少なくとも一方に、任意で両方に、耐性または不応性である。例えば、対象は、ベムラフェニブとダブラフェニブの組み合わせによる治療（処置）を、少なくとも2ヶ月間、例えば、少なくとも3ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも12ヶ月またはそれ以上の期間にわたって、受けたことがあってよい。
【００８８】
他の態様では、本明細書中のいずれかの局面または態様に従って治療されるメラノーマは、前記1種以上の阻害剤のいずれにも耐性でない。メラノーマは、例えば、本明細書中のいずれかの局面または態様に従う1種以上の阻害剤によるどのような治療も受けたことがない。しかし、メラノーマは、1種以上のそのような阻害剤による治療（処置）を受けているか、または1種以上の阻害剤のいずれかで治療（処置）されたことがあるが、耐性が生じていない可能性もある。そのような態様では、対象は、例えば、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、トラメチニブ、ビニメチニブ、コビメチニブまたはセルメチニブによる治療（処置）を、少なくとも2ヶ月間、例えば、少なくとも3ヶ月、少なくとも7ヶ月、少なくとも9ヶ月、少なくとも12ヶ月またはそれ以上の期間にわたって、受けていてもよい。
【００８９】
特定の一態様において、本開示によって提供されるAXL-ADCは、メラノーマが治療されているかまたは治療されたことのある治療剤に対して耐性であるAXL発現メラノーマの治療に使用するためのものであり、ここで、その治療剤はベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体であり、メラノーマはBRAFに変異を示す。特に、メラノーマは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体による阻害に対してBRAFを感受性にするBRAFにおける変異を示す。好ましくは、その変異はアミノ酸置換である。そのような変異の具体的な残基としては、限定するものではないが、V600 (例えば、V600E、V600K、およびV600D)、残基L597 (例えば、L597R)、および残基K601 (K601E）が挙げられる。一態様では、その変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。
【００９０】
特定の一態様において、本開示によって提供されるAXL-ADCは、メラノーマが治療されているかまたは治療されたことのある治療剤に対して耐性であるAXL発現メラノーマの治療に使用するためのものであり、ここで、その治療剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体である。メラノーマは、NRASに活性化変異のような変異を有し得る。例えば、NRASは、変異をQ61 (例えば、Q61R、Q61K、Q61L)、G12 (例えば、G12D、G12S、G12C、G12V)、またはG13 (G13D、G13R)に有し得る。一態様では、メラノーマは、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択される少なくとも1つの変異を有する。
【００９１】
特定の一態様において、本開示によって提供されるAXL-ADCは、メラノーマが治療されているかまたは治療されたことのある治療剤に対して耐性であるAXL発現メラノーマの治療に使用するためのものであり、ここで、その治療剤は、LTT-462、ウリキセルチニブ、VTXKIIE、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体である。
【００９２】
AXL-ADCに関して、当技術分野で通常の知識を有する医師は、必要とされる薬学的組成物の有効量を容易に決定し、処方することができる。これに関連して、薬学的組成物に言及する場合、組成物をそのようなものとして含み、逆もまた同様であることも理解されるべきである。例えば、医師は、薬学的組成物中で用いられるAXL-ADCの用量を、所望の治療効果を達成するために必要とされるレベルよりも低いレベルで開始し、所望の効果が達成されるまで徐々に用量を増加させることができる。一般的に、適切な用量は、特定の投薬レジメンに従って治療効果を奏するのに有効な最低用量である化合物の量である。そのような有効用量は、一般的に、上述した要因に依存するであろう。
【００９３】
例えば、治療的使用のための「有効量」は、疾患の進行を安定させるその能力によって測定され得る。癌を抑制する化合物の能力は、例えば、ヒト腫瘍における有効性を予測する動物モデル系で評価される。あるいは、組成物のこの特性は、当業者に公知のインビトロアッセイで、細胞増殖を阻害するかまたは細胞傷害性を誘発する化合物の能力を調べることによって、評価することができる。治療用化合物の治療上有効な量は、腫瘍サイズを縮小させるか、さもなければ対象の症状を改善し得る。当業者は、そのような量を、対象のサイズ、対象の症状の重篤度、および選択される特定の組成物または投与経路などの要因に基づいて、決定することができよう。例えば、すでに示したように、全米総合癌センターネットワーク(National Comprehensive Cancer Network: NCCN, www.nccn.org)および欧州臨床腫瘍学会(European Society for Medical Oncology: ESMO, www.esmo.org/Guidelines)の癌治療を評価するためのガイドラインを使用することができる。
【００９４】
本発明のAXL-ADCの治療上有効な量の非限定的な例示的範囲は、0.02〜100mg/kgであり、例えば、約0.02〜30mg/kg、約0.05〜10mg/kg、0.1〜5mg/kgまたは0.1〜3mg/kgなど、例えば約0.5〜3mg/kgまたは0.5〜2mg/kgである。
【００９５】
投与は、例えば、静脈内、筋肉内、腹腔内、または皮下であってよく、場合によっては、標的部位の近位に投与することができる。
【００９６】
上記の治療方法および使用における投薬レジメンは、最適な所望の応答(例えば、治療応答)が得られるように調整される。例えば、単回ボーラスを投与するか、いくつかの分割用量を経時的に投与するか、または用量を治療状況の緊急性によって示されているように比例的に増減することができる。
【００９７】
一態様において、有効性-安全性ウィンドウは、例えば薬物-抗体比(DAR)を低下させることによって、および/またはAXL-ADCを未標識抗AXL抗体と混合することによって、比毒性を低下させることにより最適化される。
【００９８】
一態様において、治療の有効性は、治療中に、例えば所定の時点で、モニターされる。有効性を測定するための方法は、一般的に、特定の癌のタイプに依存しており、当業者には周知である。一態様では、有効性は、患部の視覚化によって、または本明細書にさらに記載される他の診断方法によって、例えば、標識された抗AXL抗体、フラグメントまたはAXL特異的抗体に由来するミニ抗体を用いて、1回以上のPET-CTスキャンを実施することによって、モニターすることができる。
【００９９】
必要に応じて、AXL-ADCの有効1日量は、1日を通して適切な間隔で、任意に単位剤形で、別々に投与される2、3、4、5、6またはそれ以上の分割用量とすることができる。別の態様では、AXL-ADCは、望ましくない副作用を最小限に抑えるために、長時間、例えば24時間以上にわたって、低速の連続注入により投与される。
【０１００】
AXL-ADCの有効用量はまた、週1回、週2回または週3回の投薬期間を用いて投与することもできる。投薬期間は、例えば、8週間、12週間または臨床的進行が確立されるまでに制限され得る。一態様では、AXL-ADCを3週に1回(1Q3W)または4週にわたって3回(3Q4W)投与して、患者がAXL-ADCの16または12サイクルを3週または4週間隔で、例えば48週間、受け取り、必要に応じてこのレジメンを延長または反復するようにする。
【０１０１】
例えば、一態様では、AXL-ADCを10〜500mg/m2、例えば200〜400mg/m2の週1回用量で、注入によって投与することができる。こうした投与は、例えば1〜8回、例えば3〜5回、繰り返すことができる。投与は、1〜24時間、例えば1〜12時間にわたって、連続注入により行うことができる。
【０１０２】
別の態様では、AXL-ADCを10〜500mg/m2、例えば50〜200mg/m2の投与量で、3週間ごとに注入によって投与する。こうした投与は、例えば1〜8回、例えば3〜5回、繰り返すことができる。投与は、1〜24時間、例えば1〜12時間にわたって、連続注入により行うことができる。
【０１０３】
一態様では、AXL-ADCは、約0.1〜10mg/kg、例えば約1〜3mg/kgの単回投与として、週にまたは3週ごとに1回、12回まで、8回まで、または臨床的進行まで投与される。投与は、1〜24時間、例えば1〜12時間にわたって、連続注入により行うことができる。
【０１０４】
一態様では、AXL-ADCは、約0.02〜100 mg/kg、例えば約0.02〜30 mg/kg、例えば約0.05〜10 mg/kgの量で、週に1回(1Q1W)、2週に1回(1Q2W)、または3週に1回(1Q3W)、または4週にわたって3回(3Q4W)のいずれかで投与される。典型的には、患者は、3週または4週間隔でAXL-ADCの16または12サイクルを例えば48週間受け取り、このレジメンを医師の決定通りに延長または反復してもよい。投与は、1〜24時間、例えば1〜12時間にわたって、連続注入により行うことができる。
【０１０５】
このようなレジメンは、例えば6ヶ月または12ヶ月後に、必要に応じて1回以上繰り返してもよい。投与量は、例えば生体サンプルを採取して、抗AXL抗体の抗原結合領域を標的とする抗イディオタイプ抗体を使用することにより、投与時の血液中の本発明の化合物の量を測定することによって決定または調整することができる。
【０１０６】
一態様では、AXL-ADCは、維持療法として、例えば6ヶ月以上にわたって週1回、投与される。本明細書で使用する「維持療法」とは、癌の進行または再発を回避するかまたは遅延させるための療法を意味する。典型的には、癌が最初の処置の後で完全寛解している場合、癌の再発を回避または遅延させるために維持療法が用いられる。癌が進行しており、最初の処置の後で完全寛解が達成されていない場合は、癌の成長を遅らせるために、例えば患者の寿命を延ばすために、維持療法が使用され得る。
【０１０７】
他の非限定的な例として、本発明による治療的処置は、本発明の化合物の1日投与量として、1日あたり約0.1〜100mg/kg、例えば約0.1〜50mg/kg、例えば約0.2、0.5、0.9、1.0、1.1、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、45、50、60、70、80、90または100mg/kgの量で、治療の開始後1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39もしくは40日目のうちの1日以上に、あるいは1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19もしくは20週目のうちの1週以上に、またはこれらの任意に組み合わせた日もしくは週に、24、12、8、6、4または2時間ごとの単回投与もしくは分割投与、またはこれらの任意の組み合わせを使用して、提供され得る。
【０１０８】
非経口組成物は、投与のしやすさおよび投与量の均一性のために、単位剤形として製剤化することができる。ここで使用される単位剤形とは、治療される対象のための単位投与量として適した物理的離散単位を指す；各単位は、必要とされる薬学的担体と共同して所望の治療効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含有する。本発明の単位剤形の仕様は、(a)活性化合物の特有の性質および達成すべき特定の治療効果、ならびに(b)そのような活性化合物を配合する分野に固有の、個体における感受性の処置のための制限、によって決定づけられ、かつそれらに直接依存する。
【０１０９】
本明細書に記載するように、AXL-ADCは、1種以上のMAPK経路阻害剤と組み合わせて使用され、例えば、1種以上のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、任意でメラノーマが耐性である少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、と組み合わせて使用される。
【０１１０】
AXL-ADCと、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤などの1種以上のMAPK経路阻害剤は、同時に、別々に、または逐次的に投与することができる。例えば、一態様では、該組み合わせは、該阻害剤による、任意でセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤による、前治療を受けたことがないメラノーマ患者を治療するために使用される。別の態様では、該組み合わせは、該阻害剤、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤による前治療に失敗したメラノーマ患者を治療するために使用される。AXL-ADCおよび阻害剤の効果的な投与量および投薬レジメンは、治療されるメラノーマおよび患者ごとに異なり、当業者によって決定され得る。
【０１１１】
一態様において、AXL-ADCと共に使用される1種以上のMAPK経路阻害剤、例えば1種以上のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、の投与量および投薬レジメンは、1種以上のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤を用いてメラノーマなどの癌を治療する際に通常使用されるものと同じであるか、または本質的に類似している。
【０１１２】
ベムラフェニブは、例えば、約200〜2000mg、500〜1500mg、例えば約1000mg/日の用量で経口的に投与することができ、例えば、960mgを4×240mg錠剤としてq12hr(約12時間おき)に投与する。
【０１１３】
ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。
【０１１４】
エンコラフェニブは、例えば、600mg、例えば400mg、300mg、200mg、100mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、300mgを1日1回(QD)投与する。
【０１１５】
ソラフェニブは、例えば、200〜1600mg、例えば1200mg、800mg、600mg、400mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、200mg錠剤2錠を1日2回投与する(総1日量800mgに相当)。
【０１１６】
トラメチニブは、例えば、対象に、約0.1〜10mg、例えば約0.5〜5mg、約2mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、トラメチニブは、2mgを経口的に1日1回として、例えば、何も食べずに毎日同様の時間に、食事の少なくとも1時間前または2時間後に、投与する。
【０１１７】
コビメチニブは、例えば、対象に、約10〜100mg、例えば約30〜80mg、約60mg/日の用量で、場合により2〜4回に分けて、経口投与することができる。好ましくは、コビメチニブは、1日60mg (20mgを3錠)の用量を28日サイクルで投与し、その場合、薬物を21日間連続して服用し、その後7日間の休薬期間をとる。
【０１１８】
ビニメチニブは、例えば、対象に、約10〜200mg、例えば150mg、100mg、90mg、45mg、30mg、20mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、経口投与することができ、例えば、45mgを1日2回投与する。
【０１１９】
セルメチニブは、例えば、約50〜225mgの用量で、例えば75mg、100mg、125mg、150mg、175mg、200mgまたは225mgで1日1〜2回、例えば1日2回、場合により、4週間のサイクルでそれを3日間投与し、その後4日間休薬するレジメンで、経口投与することができる。
【０１２０】
一態様において、MAPK経路阻害剤、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、の投与量は、通常使用されるものよりも低いが、投薬レジメンはその他の点では類似している。一態様では、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤などのMAPK経路阻害剤の投与量は、通常使用されるものと同様であるが、投与回数がより少なくなるように投薬レジメンを調整する。一態様では、セリン/トレオニンキナーゼ阻害剤の投与量を、通常使用されるものよりも低くし、かつ投与回数がより少なくなるように投薬レジメンを調整する。
【０１２１】
一局面において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、任意でHuMax-AXL-ADC、および(ii)1種以上のMAPK経路阻害剤、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、を投与することを含み、その際、該ADCと該少なくとも1種の阻害剤は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、MAPK経路の1種以上の阻害剤は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤、ERK阻害剤、またはそれらのうちのいずれか2種以上の組み合わせ、例えば、BRAF阻害剤とMEK阻害剤、BRAF阻害剤とERK阻害剤、またはMEK阻害剤とERK阻害剤、を含むか、またはそれ(ら)からなる。一態様では、該メラノーマはAXLを発現するメラノーマである。一態様では、該メラノーマは、該1種以上の阻害剤のうちの少なくとも1つに対して耐性である。一態様では、該阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるBRAF阻害剤であり、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がBRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらす。一態様では、該阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるMEK阻害剤である。AXL-ADCは、例えば、上でより詳細に説明した投薬レジメンに従って、治療に有効な量で投与され得る。例えば、非限定的な例として、AXL-ADCは、約0.02〜100mg/kg、例えば約0.02〜30mg/kg、約0.05〜10mg/kgの量で、週に1回(1Q1W)、2週に1回(1Q2W)もしくは3週に1回(1Q3W)または4週にわたって3回の投与(3Q4W)のいずれかで投与することができ、その結果、患者は、例えば48週間に、3週または4週間隔でAXL-ADCの16サイクルまたは12サイクルを受け取り、該レジメンを、主治医が決定するように延長するか、短縮するか、または繰り返す。
【０１２２】
一局面において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC；(ii)ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるBRAF阻害剤；および(iii)トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブおよびセルメチニブ、またはそれらのうちのいずれかの治療上有効な類似体もしくは誘導体から選択されるMEK阻害剤、を投与することを含み、ここで、該メラノーマは、BRAF阻害剤による変異型BRAFのキナーゼ活性の阻害をもたらすBRAFにおける変異を示し、該ADCとBRAF阻害剤とMEK阻害剤は、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該変異は、V600、L597およびK601から選択されるBRAF残基にあり、例えば、V600E、V600K、V600D、L597RおよびK601Eから選択される変異、例えばV600Eである。特定の態様では、該メラノーマは活性化NRAS変異を示さない。
【０１２３】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がベムラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはベムラフェニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、ベムラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、ベムラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、例えばダブラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のBRAF阻害剤、例えばダブラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはベムラフェニブに耐性ではなく、かつ/またはベムラフェニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ベムラフェニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。例えば、ベムラフェニブは、約200〜2000mg、500〜1500mg、例えば約1000mg/日の用量で経口的に投与することができ、例えば、960mgを4×240mg錠剤としてq12hr(約12時間おき)に投与する。
【０１２４】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がダブラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはダブラフェニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、ダブラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、ダブラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはダブラフェニブに耐性ではなく、かつ/またはダブラフェニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ダブラフェニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。
【０１２５】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がエンコラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはエンコラフェニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、エンコラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、エンコラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、ダブラフェニブまたはソラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、ダブラフェニブまたはソラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはエンコラフェニブに耐性ではなく、かつ/またはエンコラフェニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。エンコラフェニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。エンコラフェニブは、例えば、600mg、例えば400mg、300mg、200mg、100mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、300mgを1日1回投与する。
【０１２６】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、任意で、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはソラフェニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、ソラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、ソラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、ダブラフェニブまたはエンコラフェニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のBRAF阻害剤、例えばベムラフェニブ、ダブラフェニブまたはエンコラフェニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはソラフェニブに耐性ではなく、かつ/またはソラフェニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ソラフェニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。ソラフェニブは、例えば、200〜1600mg、例えば1200mg、800mg、600mg、400mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、200mg錠剤2錠を1日2回投与する(総1日量800mgに相当)。
【０１２７】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはトラメチニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、トラメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、トラメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のMEK阻害剤、例えばビニメチニブ、コビメチニブまたはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のMEK阻害剤、例えばビニメチニブ、コビメチニブまたはセルメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはトラメチニブに耐性ではなく、かつ/またはトラメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該メラノーマはNRASに変異を示し、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す。トラメチニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。
【０１２８】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはコビメチニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、コビメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、コビメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、ビニメチニブまたはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、ビニメチニブまたはセルメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはコビメチニブに耐性ではなく、かつ/またはコビメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該メラノーマはNRASに変異を示し、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す。コビメチニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。コビメチニブは、例えば、対象に、約10〜100mg、例えば約30〜80mg、約60mg/日の用量で、場合により2〜4回に分けて、経口投与することができる。好ましくは、コビメチニブは、1日60mg (20mgを3錠)の用量を28日サイクルで投与し、その場合、薬物を21日間連続して服用し、その後7日間の休薬期間をとる。
【０１２９】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはビニメチニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、ビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、ビニメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、コビメチニブまたはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、コビメチニブまたはセルメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはビニメチニブに耐性ではなく、かつ/またはビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該メラノーマはNRASに変異を示し、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す。ビニメチニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。ビニメチニブは、例えば、対象に、約10〜200mg、例えば150mg、100mg、90mg、45mg、30mg、20mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、経口投与することができ、例えば、45mgを1日2回投与する。
【０１３０】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、および(ii)セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含み、その際、(i)と(ii)は同時に、別々に、または逐次的に投与される。一態様では、該メラノーマはセルメチニブに耐性である。例えば、該メラノーマは、セルメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、セルメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、コビメチニブまたはビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがあるか、別のMEK阻害剤、例えばトラメチニブ、コビメチニブまたはビニメチニブによる治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはセルメチニブに耐性ではなく、かつ/またはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該メラノーマはNRASに変異を示し、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す。セルメチニブは、典型的には、適切な投薬レジメンに従って治療に有効な量で投与される。セルメチニブは、例えば、約50〜225mg、例えば75mg、100mg、125mg、150mg、175mg、200mgまたは225mgの用量で1日1〜2回、例えば1日2回、場合により、4週間のサイクルでそれを3日間投与し、その後4日間休薬するレジメンで、経口投与することができる。
【０１３１】
前述の態様のいずれか1つによる方法で使用するためのAXL-ADCの一態様では、該メラノーマはNRASに変異、例えば活性化NRAS変異を示し、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す。
【０１３２】
一局面において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)BRAF阻害剤、および(iii)MEK阻害剤を投与することを含み、その際、該ADCとBRAF阻害剤とMEK阻害剤は、治療に有効な量で同時に、別々に、または逐次的に投与される。
【０１３３】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がダブラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマは、ダブラフェニブ、トラメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ダブラフェニブ、トラメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ダブラフェニブ、トラメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方で以前に治療（処置）された可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはダブラフェニブもしくはトラメチニブに耐性ではなく、かつ/またはダブラフェニブもしくはトラメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該BRAF変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。トラメチニブは、例えば、約0.5〜5mg、例えば約1〜4mg、約2〜3mg、約2mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回、経口投与することができる。
【０１３４】
一態様において、本発明は、対象におけるダブラフェニブ、トラメチニブまたは両方に耐性のメラノーマを治療する方法に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がダブラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、その癌はAXLを発現する癌である。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。トラメチニブは、例えば、約0.5〜5mg、例えば約1〜4mg、約2〜3mg、約2mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回、経口投与することができる。
【０１３５】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がベムラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはベムラフェニブ、トラメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ベムラフェニブ、トラメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ベムラフェニブ、トラメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方で以前に治療（処置）された可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはベムラフェニブもしくはトラメチニブに耐性ではなく、かつ/またはベムラフェニブもしくはトラメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ベムラフェニブは、例えば、約200〜2000mg、500〜1500mg、例えば約1000mg/日の用量で経口的に投与することができ、例えば、960mgを4×240mg錠剤としてq12hr(約12時間おき)に投与する。トラメチニブは、例えば、約0.5〜5mg、例えば約1〜4mg、約2〜3mg、約2mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回、経口投与することができる。
【０１３６】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がエンコラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはエンコラフェニブ、トラメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、エンコラフェニブ、トラメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、エンコラフェニブ、トラメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方で以前に治療（処置）された可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはエンコラフェニブもしくはトラメチニブに耐性ではなく、かつ/またはエンコラフェニブもしくはトラメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。エンコラフェニブは、例えば、600mg、例えば400mg、300mg、200mg、100mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回(QD)、経口投与することができる。トラメチニブは、例えば、約0.5〜5mg、例えば約1〜4mg、約2〜3mg、約2mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回、経口投与することができる。
【０１３７】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、任意で該メラノーマはBRAFに変異を示し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)トラメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはソラフェニブ、トラメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ソラフェニブ、トラメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ソラフェニブ、トラメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方で以前に治療（処置）された可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはソラフェニブもしくはトラメチニブに耐性ではなく、かつ/またはソラフェニブもしくはトラメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ソラフェニブは、例えば、200〜1600mg、例えば1200mg、800mg、600mg、400mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、200mg錠剤2錠を1日2回投与する(総1日量800mgに相当)。トラメチニブは、例えば、約0.5〜5mg、例えば約1〜4mg、約2〜3mg、約2mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回、経口投与することができる。
【０１３８】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がダブラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはダブラフェニブ、コビメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ダブラフェニブ、コビメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ダブラフェニブ、コビメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療（処置）を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはダブラフェニブもしくはコビメチニブに耐性ではなく、かつ/またはダブラフェニブもしくはコビメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該BRAF変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。
【０１３９】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がベムラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはベムラフェニブ、コビメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ベムラフェニブ、コビメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ベムラフェニブ、コビメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはベムラフェニブもしくはコビメチニブに耐性ではなく、かつ/またはベムラフェニブもしくはコビメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該BRAF変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ベムラフェニブは、例えば、約200〜2000mg、500〜1500mg、例えば約1000mg/日の用量で経口的に投与することができ、例えば、960mgを4×240mg錠剤としてq12hr(約12時間おき)に投与する。
【０１４０】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がエンコラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはエンコラフェニブ、コビメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、エンコラフェニブ、コビメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、エンコラフェニブ、コビメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはエンコラフェニブもしくはコビメチニブに耐性ではなく、かつ/またはエンコラフェニブもしくはコビメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。エンコラフェニブは、例えば、600mg、例えば400mg、300mg、200mg、100mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回(QD)、経口投与することができる。
【０１４１】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、任意で該メラノーマはBRAFに変異を示し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)コビメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはソラフェニブ、コビメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ソラフェニブ、コビメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ソラフェニブ、コビメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはソラフェニブもしくはコビメチニブに耐性ではなく、かつ/またはソラフェニブもしくはコビメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ソラフェニブは、例えば、200〜1600mg、例えば1200mg、800mg、600mg、400mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、200mg錠剤2錠を1日2回投与する(総1日量800mgに相当)。
【０１４２】
コビメチニブは、例えば、対象に、約10〜100mg、例えば約30〜80mg、約60mg/日の用量で、場合により2〜4回に分けて、経口投与することができる。好ましくは、コビメチニブは、1日60mg (20mgを3錠)の用量を28日サイクルで投与し、その場合、薬物を21日間連続して服用し、その後7日間の休薬期間をとる。
【０１４３】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がダブラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはダブラフェニブ、ビニメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ダブラフェニブ、ビニメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ダブラフェニブ、ビニメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはダブラフェニブもしくはビニメチニブに耐性ではなく、かつ/またはダブラフェニブもしくはビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。
【０１４４】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がベムラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはベムラフェニブ、ビニメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ベムラフェニブ、ビニメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ベムラフェニブ、ビニメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはベムラフェニブもしくはビニメチニブに耐性ではなく、かつ/またはベムラフェニブもしくはビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ベムラフェニブは、例えば、約200〜2000mg、500〜1500mg、例えば約1000mg/日の用量で経口的に投与することができ、例えば、960mgを4×240mg錠剤としてq12hr(約12時間おき)に投与する。
【０１４５】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がエンコラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはエンコラフェニブ、ビニメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、エンコラフェニブ、ビニメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、エンコラフェニブ、ビニメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはエンコラフェニブもしくはビニメチニブに耐性ではなく、かつ/またはエンコラフェニブもしくはビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。エンコラフェニブは、例えば、600mg、例えば400mg、300mg、200mg、100mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回(QD)、経口投与することができる。
【０１４６】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、任意で該メラノーマはBRAFに変異を示し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)ビニメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはソラフェニブ、ビニメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ソラフェニブ、ビニメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ソラフェニブ、ビニメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはソラフェニブもしくはビニメチニブに耐性ではなく、かつ/またはソラフェニブもしくはビニメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該BRAF変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ソラフェニブは、例えば、200〜1600mg、例えば1200mg、800mg、600mg、400mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、200mg錠剤2錠を1日2回投与する(総1日量800mgに相当)。
【０１４７】
ビニメチニブは、例えば、対象に、約10〜200mg、例えば150mg、100mg、90mg、45mg、30mg、20mgの用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、経口投与することができ、例えば、45mgを1日2回投与する。
【０１４８】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がダブラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ダブラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはダブラフェニブ、セルメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ダブラフェニブ、セルメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ダブラフェニブ、セルメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはダブラフェニブもしくはセルメチニブに耐性ではなく、かつ/またはダブラフェニブもしくはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該BRAF変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ダブラフェニブは、例えば、対象に、約50〜300mg、例えば約100〜200mg、約150mgの用量で、1日1〜2回または2〜3日ごとに、経口投与することができる。好ましくは、ダブラフェニブは、150mgを経口的に1日2回として、例えば、食事の少なくとも1時間前または食事の少なくとも2時間後に、投与する。
【０１４９】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がベムラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはベムラフェニブ、セルメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ベムラフェニブ、セルメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ベムラフェニブ、セルメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはベムラフェニブもしくはセルメチニブに耐性ではなく、かつ/またはベムラフェニブもしくはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ベムラフェニブは、例えば、約200〜2000mg、500〜1500mg、例えば約1000mg/日の用量で経口的に投与することができ、例えば、960mgを4×240mg錠剤としてq12hr(約12時間おき)に投与する。
【０１５０】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、ここで、該メラノーマはBRAFに変異を示し、該変異がエンコラフェニブによる変異型BRAFのBRAFキナーゼ活性の阻害をもたらすものであり、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)エンコラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはエンコラフェニブ、セルメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、エンコラフェニブ、セルメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、エンコラフェニブ、セルメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはエンコラフェニブもしくはセルメチニブに耐性ではなく、かつ/またはエンコラフェニブもしくはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該BRAF変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。エンコラフェニブは、例えば、600mg、例えば400mg、300mg、200mg、100mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに、例えば1日1回(QD)、経口投与することができる。
【０１５１】
一態様において、本発明は、対象のメラノーマを治療する方法におけるAXL-ADCの使用に関し、任意で該メラノーマはBRAFに変異を示し、該方法は、対象に、(i)ヒトAXLに結合する抗体を含むADC、(ii)ソラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、および(iii)セルメチニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、を投与することを含む。一態様では、該メラノーマはソラフェニブ、セルメチニブまたは両方に耐性である。例えば、該メラノーマは、ソラフェニブ、セルメチニブまたは両方で以前に治療（処置）されたことがあるか、ソラフェニブ、セルメチニブまたは両方による治療（処置）を受けている可能性がある。あるいは、該メラノーマは、別のBRAF阻害剤、MEK阻害剤または両方を用いて、以前に治療（処置）されたことがあるか、治療を受けている可能性がある。該メラノーマは、例えば、再発したメラノーマであり得る。一態様では、該メラノーマはAXL発現メラノーマである。別の態様では、該メラノーマはソラフェニブもしくはセルメチニブに耐性ではなく、かつ/またはソラフェニブもしくはセルメチニブで以前に治療（処置）されたことがない。一態様では、該変異は、残基V600、L597および/またはK601におけるアミノ酸置換である。一態様では、該変異は、V600E、V600D、V600K、L597RおよびK601Eから選択される。ソラフェニブは、例えば、200〜1600mg、例えば1200mg、800mg、600mg、400mgの総用量で、1日1〜2回または2、3もしくは4日ごとに経口投与することができ、例えば、200mg錠剤2錠を1日2回投与する(総1日量800mgに相当)。
【０１５２】
セルメチニブは、例えば、約50〜225mg、例えば75mg、100mg、125mg、150mg、175mg、200mgまたは225mgの用量で1日1〜2回、例えば1日2回、場合により、4週間のサイクルでそれを3日間投与し、その後4日間休薬するレジメンで、経口投与することができる。
【０１５３】
前述の態様のいずれか1つによる方法で使用するためのAXL-ADCの一態様では、該メラノーマはNRASに変異を示さず、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えばQ61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示さない。そのような態様では、MAPK経路の1種以上の阻害剤のうちの1つ、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤は、BRAFi、例えば、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブまたはソラフェニブを含むか、またはそれからなり得る。
【０１５４】
前述の局面の特定の態様において、AXL-ADCは、対象における再発性メラノーマ(該メラノーマはセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤による初期治療後に再発した)を治療するために、1種以上のMAPK経路阻害剤、例えば少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤と組み合わせて使用される。その癌がAXL-ADCによる初期治療後にもう一度再発した場合には、その再発癌を治療するために、該AXL-ADCを、少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤と一緒に、再度使用することができる。
【０１５５】
一局面において、本発明は、AXL-ADCと少なくとも1種のS/Th KIとの組み合わせで治療するための、メラノーマに罹患している対象を選択する方法に関し、該方法は、以下の段階を含む：
(a) 対象がS/Th KIによる治療（処置）の基準を満たすかどうかを判定する段階；
(b) メラノーマにおけるAXL発現がS/Th KIに対する耐性と関連するかどうかを判定する段階；および
(c) S/Th KIによる治療（処置）の基準を満たしており、かつAXL発現がS/Th KIに対する耐性と関連するメラノーマに罹患している対象を選択する段階。
【０１５６】
一局面において、本発明は、ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体に耐性であるかまたは耐性になる傾向が高い、メラノーマを有すると診断された対象を治療する方法に関し、該方法は、治療に有効な量の、ヒトAXLに結合する抗体を含むADCおよび少なくとも1種のMAPK経路阻害剤、例えばセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、を投与することを含む。
【０１５７】
一局面において、本発明は、メラノーマに罹患している対象が、(i)BRAFi、例えばベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体と、(ii)MEKi、例えばダブラフェニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、またはその治療上有効な類似体もしくは誘導体と、(iii)ヒトAXLに結合する抗体を含むADCと、の組み合わせによる治療（処置）に適しているかどうかを判定する方法に関し、ここにおいて、該対象はBRAFi、MEKiまたは両方による治療（処置）を受けているか、または受けたことがあり、かつBRAFi、MEKiまたは両方に耐性であると判定されるか、または耐性の疑いがあり、その結果として、該対象は該治療（処置）に適していると判定される。さらなる局面では、該メラノーマがAXLを発現するかどうかが判定され得る。
【０１５８】
一態様において、抗AXL-ADCで治療される耐性のメラノーマは、AXLを発現すると判定されたものである。
【０１５９】
特定の一態様において、これは、患者から採取したサンプル（例えば、生検などの腫瘍サンプル）中のAXL抗原のレベル、またはAXLを細胞表面上に発現する細胞のレベルを検出することによって達成される。患者は、例えば、メラノーマに罹患している可能性があるか、またはメラノーマ発症リスクがある。検出されるAXL抗原は、可溶性AXL抗原、細胞結合型AXL抗原、またはその両方であり得る。例えば、試験されるサンプルを、抗AXL抗体のAXLへの結合を可能にする条件下で抗AXL抗体に、任意で対照サンプルおよび/または無関係の抗原に結合する対照抗体と共に、接触させる。その後、該抗体のAXLへの結合を(例えば、ELISAを用いて)検出することができる。対照サンプルを試験サンプルと一緒に使用する場合、抗AXL抗体または抗AXL抗体-AXL複合体のレベルを両方のサンプルで分析し、対照サンプルと比較して、試験サンプル中の抗AXL抗体または抗AXL抗体-AXL複合体の統計的に有意な高レベルは、試験サンプル中のAXLのより高いレベルを示し、これによりAXLのより高い発現が示される。このような目的に有用な従来のイムノアッセイの例としては、限定するものではないが、ELISA、RIA、FACSアッセイ、プラズモン共鳴アッセイ、クロマトグラフィーアッセイ、組織免疫組織化学、ウェスタンブロット、および/または免疫沈降が挙げられる。
【０１６０】
組織サンプルは、AXL抗原および/またはAXLを発現する細胞を含むことが知られているか、または含むと予想される組織から採取することができる。例えば、インサイチューでのAXL発現の検出は、患者から腫瘍生検または血液サンプルなどの組織学的検体を取り出し、該検体の適切な調製後に、そのような検体に抗AXL抗体を供給することによって達成され得る。該検体に該抗体をアプライするか、または重層することによって該抗体を供給し、次いで適切な手段を用いて該抗体を検出する。
【０１６１】
上記のアッセイにおいて、抗AXL抗体は、AXLに結合した抗体を検出できるようにする検出可能物質で標識され得る。
【０１６２】
サンプル中の細胞上に発現されたAXLのレベルもまた、実施例17に記載の方法に従って測定することができ、そこでは、ヒト腫瘍細胞株の形質膜上のAXL発現が、モノクローナル抗AXL抗体(ここでは、マウスモノクローナル抗体ab89224; Abcam社, Cambridge, 英国)を用いて、QIFIKIT分析(DAKO社, カタログ番号K0078)を用いた間接免疫蛍光法によって定量化された。簡潔に述べると、単細胞懸濁液を調製し、任意で洗浄する。次の工程は氷上で実施する。該細胞を、例えば100,000細胞/ウェルまたはチューブで、播種し、その後ペレット化し、10μg/mLの濃度の抗体サンプル50μL中に再懸濁させる。任意で、対照抗体を並行サンプルに添加する。4℃で30分間インキュベートした後、細胞をペレット化し、FACS緩衝液150μL中に再懸濁させ、AXLの量を、例えば抗AXL抗体および対照抗体に結合する二次FITC標識抗体を用いた、FACS分析によって測定する。各細胞株について、形質膜上に発現されたAXL分子の数の推定値である抗体結合能(ABC)は、実施例23に記載されるキャリブレーション曲線の式(標準曲線からの未知数の補間)に基づいて、AXL抗体染色細胞の平均蛍光強度を用いて算出された。一態様では、実施例23の方法を用いて、AXL発現細胞上のAXLのレベルは、少なくとも5000、例えば少なくとも8000、例えば少なくとも13000と推定される。
【０１６３】
特定の一態様において、メラノーマにおけるAXL発現細胞の存在またはレベルは、当技術分野で公知の方法に従って、検出可能に標識された抗AXL抗体のインビボイメージングにより評価される。バックグラウンドまたは他の対照よりも有意に高い部位（例えば、既知のまたは疑わしいメラノーマ腫瘍部位）からのシグナルは、当該腫瘍におけるAXLの過剰発現を示している。
【０１６４】
AXL-ADC
本発明において使用するのに適したADCは、任意の抗AXL抗体から調製することができ、典型的には、ヒトAXLの細胞外領域に結合する抗体から調製することができる。一態様において、AXL抗体は、カニクイザルAXLの細胞外領域にも結合する。好ましい抗AXL抗体は、以下の局面および態様に示される、AXL結合特性、可変もしくは超可変配列、または結合特性と配列特性の組み合わせのうちの1つ以上によって特徴付けられる。特定の局面では、該抗体はAXLに結合するが、そのリガンドであるGrowth Arrest-Specific 6 (Gas6)とAXL結合について競合しない。最も好ましいのは、表2に配列が記載される特定の抗AXL抗体、特に107と表示された抗体、ならびに抗体107と1つ以上のAXL結合特性またはCDR、VHおよび/またはVL配列を共有する抗体である。
【０１６５】
したがって、前述の局面または態様の特定の一態様において、抗AXL抗体は、VH領域とVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含み、ここで、VH領域はSEQ ID No: 36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含み、VL領域はSEQ ID No: 39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む。
【０１６６】
好ましい態様において、ADCは、アウリスタチンまたはその機能性ペプチド類似体もしくは誘導体、例えばモノメチルアウリスタチンEなどである細胞傷害性薬剤に、好ましくはマレイミドカプロイル-バリン-シトルリン-p-アミノベンジルオキシカルボニル(mc-vc-PAB)リンカーを介して、連結された抗AXL抗体を含む。
【０１６７】
本明細書における局面および態様に特に好ましいのは、抗AXL抗体がVH領域とVL領域を含む完全長IgG1抗体であり、VH領域がSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含み、VL領域がSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含み、任意で、該VHおよびVL領域がそれぞれSEQ ID NO:1およびSEQ ID NO:2を含み、マレイミドカプロイル-バリン-シトルリン-p-アミノベンジルオキシカルボニル(mc-vc-PAB)リンカーを介してモノメチルアウリスタチンEに連結されている、AXL-ADCである。このようなAXL-ADCは、本明細書では「HuMax-AXL-ADC」または「IgG1-AXL-107-vcMMAE」とも呼ばれる。
【０１６８】
本明細書において使用される「抗体」という用語は、典型的な生理学的および／または腫瘍特異的条件下で、少なくとも約30分、少なくとも約45分、少なくとも約1時間、少なくとも約2時間、少なくとも約4時間、少なくとも約8時間、少なくとも約12時間、約24時間もしくはそれより長い時間、約48時間もしくはそれより長い時間、約3、4、5、6、7日もしくはそれより長い日数などのような有意な期間の半減期、または任意の他の関連する機能的に定義される期間（抗原に対する抗体結合と関連する生理学的応答を誘導、促進、増強、および／もしくは調節するのに十分な時間、ならびに／または抗体が内部移行するのに十分な時間）を伴い、抗原に特異的に結合する能力を有する、免疫グロブリン分子、免疫グロブリン分子の断片、またはそのいずれかの誘導体を指すように意図される。抗原と相互作用する結合領域（または本明細書において使用され得る結合ドメイン、両方は同じ意味を有する）は、免疫グロブリン分子の重鎖および軽鎖の両方の可変領域を含む。抗体（Ab）の定常領域は、免疫系の種々の細胞（エフェクター細胞など）、および、補体活性化の古典経路における第1の構成要素であるC1qなどの補体系の構成要素を含む、宿主組織または因子に対する免疫グロブリンの結合を媒介し得る。上記で示されているように、本明細書において使用される抗体という用語は、別の方法で述べられるか、または文脈によって明確に否定されない限り、抗原に対して特異的に相互作用する、例えば結合する能力を保持する抗体の断片を含む。抗体の抗原結合機能は、完全長抗体の断片によって行われ得ることが示されている。「抗体」という用語内に包含される結合断片の例は、（i）VL、VH、CL、およびCH1ドメインからなる一価断片、またはWO 2007/059782に記載されている一価抗体である、Fab'またはFab断片；（ii）ヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結されている2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab')2断片；（iii）VHおよびCH1ドメインから本質的になるFd断片；（iv）抗体の単一アームのVLおよびVHドメインから本質的になるFv断片；（v）VHドメインから本質的になり、ドメイン抗体（Holt et al., 2003）とも呼ばれる、dAb断片（Ward et al., 1989）；（vi）ラクダ科動物またはナノボディ（Revets et al., 2005）、ならびに（vii）単離された相補性決定領域（CDR）を含む。さらに、Fv断片の2つのドメインであるVLおよびVHは、別々の遺伝子によりコードされているが、組み換え法を用いて、VLおよびVH領域が対形成して一価分子を形成している単一のタンパク質鎖（一本鎖抗体または一本鎖Fv（scFv）として公知である、例としてBird et al., 1988およびHuston et al., 1988を参照されたい）として作製されることを可能にする合成リンカーにより接続されていてもよい。そのような一本鎖抗体は、別の方法で言及されるか、または文脈によって明確に示されない限り、抗体という用語内に包含される。そのような断片は、概して、抗体の意味の内に含まれるが、それらは、集合的におよび各々独立的に、本発明の独特の特徴であり、異なる生物学的特性および有用性を呈する。本発明の文脈におけるこれらのおよび他の有用な抗体断片は、本明細書においてさらに議論される。抗体という用語は、別の方法で特定されない限り、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体（mAb）、抗体様ポリペプチド、例えばキメラ抗体およびヒト化抗体、ならびに、酵素的切断、ペプチド合成、および組み換え技術などの任意の公知の技術によって提供され、かつ毒素にコンジュゲートされる能力を保持する、抗原に特異的に結合する能力を保持する「抗体断片」または「その断片」（抗原結合断片）も含むこともまた、理解されるべきである。生成される抗体は、任意のアイソタイプを所有することができる。
【０１６９】
本明細書において使用される「免疫グロブリン重鎖」または「免疫グロブリンの重鎖」という用語は、免疫グロブリンの重鎖のうちの1つを指すように意図される。重鎖は、典型的に、重鎖可変領域（本明細書においてVHと省略される）、および免疫グロブリンのアイソタイプを定義する重鎖定常領域（本明細書においてCHと省略される）から構成される。重鎖定常領域は、典型的に、CH1、CH2、およびCH3の3つのドメインから構成される。本明細書において使用される「免疫グロブリン」という用語は、1対の低分子量の軽（L）鎖および1対の重（H）鎖の、2対のポリペプチド鎖からなり、すべての4つがジスルフィド結合によって潜在的に相互接続されている、構造的に関連する糖タンパク質のクラスを指すように意図される。免疫グロブリンの構造は、十分に特徴決定されている（例として、Fundamental Immunology Ch. 7 (Paul, W., ed., 2nd ed. Raven Press, N.Y. (1989)を参照されたい）。免疫グロブリンの構造内で、2つの重鎖は、いわゆる「ヒンジ領域」においてジスルフィド結合を介して相互接続されている。重鎖と同等に、各軽鎖は、典型的に、いくつかの領域；軽鎖可変領域（本明細書においてVLと省略される）、および軽鎖定常領域から構成される。軽鎖定常領域は、典型的に、1つのドメインCLから構成される。さらに、VHおよびVL領域は、フレームワーク領域（FR）と呼ばれる、より保存されている領域で分散される、相補性決定領域（CDR）とも呼ばれる、超可変性の領域（または、構造的に定義されたループの配列および／もしくは形態において超可変的であり得る超可変領域）にさらに細分され得る。各VHおよびVLは、典型的に、以下の順序でアミノ末端からカルボキシ末端へ配置される、3つのCDRおよび4つのFRから構成される：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。CDR配列は、IMGTにしたがって定義される（Lefranc MP. et al. (1999)およびBrochet et al. (2008)を参照されたい）。
【０１７０】
本明細書において使用される「抗原結合領域」または「結合領域」という用語は、抗原に結合することができる抗体の領域を指す。抗原は、例えば、細胞、細菌、またはビリオン上に存在する、ポリペプチドなどの任意の分子であることができる。「抗原」および「標的」という用語は、文脈によって明確に否定されない限り、本発明の文脈において互換的に使用され得る。
【０１７１】
本明細書において使用される「結合」という用語は、所定の抗原または標的に対する抗体の結合を指し、当該結合は典型的には、例えばBIAcore 3000機器において抗原をリガンドとして用い抗体を分析物として用いた表面プラズモン共鳴（SPR）により決定した場合に、約10-6 M未満、例えば10-7 M未満、例えば約10-8 M未満、例えば約10-9 M未満、約10-10 M未満、または約10-11 Mもしくはさらにそれより低いKDに対応する結合親和性での結合であり、所定の抗原または密接に関連する抗原以外の非特異的抗原（例えば、BSA、カゼイン）に対する結合のKDよりも例えば少なくとも10倍低い、例えば少なくとも100倍低い、例えば少なくとも1,000倍低い、例えば少なくとも10,000倍低い、例えば少なくとも100,000倍低いKDに対応する親和性で、所定の抗原に結合する。親和性がより低い量は、抗体のKDに依存するため、抗体のKDが非常に低い（すなわち、抗体が高度に特異的である）場合、抗原に対する親和性が非特異的抗原に対する親和性より低い量は、少なくとも10,000倍であり得る。本明細書において使用される「KD」（M）という用語は、特定の抗体-抗原相互作用の解離平衡定数を指し、kdをkaで割ることによって得られる。本明細書において使用される親和性およびKDは逆相関し、すなわち、高い親和性は低いKDを指すことを意図しており、低い親和性は高いKDを指すことを意図している。
【０１７２】
本明細書において使用される「kd」（秒-1）という用語は、特定の抗体-抗原相互作用の解離速度定数を指す。前記値は、kオフ値またはオフ速度とも呼ばれる。
【０１７３】
本明細書において使用される「ka」（M-1×秒-1）という用語は、特定の抗体-抗原相互作用の会合速度定数を指す。前記値は、kオン値またはオン速度とも呼ばれる。
【０１７４】
本明細書において使用される「KA」（M-1）という用語は、特定の抗体-抗原相互作用の会合平衡定数を指し、kaをkdで割ることによって得られる。
【０１７５】
本明細書において使用される「AXL」という用語は、哺乳動物TAM受容体チロシンキナーゼ（RTK）のサブファミリーの一部である104〜140 kDaの分子量を有する894アミノ酸タンパク質であり、UFOまたはJTK11とも呼ばれる、AXLという名称のタンパク質を指す。分子量は、タンパク質のグリコシル化における可能性のある差のために可変である。AXLタンパク質は、タンパク質のN末端上の2つの細胞外免疫グロブリン様（Ig様）ドメイン、2つの膜近位の細胞外フィブロネクチンIII型（FNIII）ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内キナーゼドメインからなる。AXLは、そのリガンドGas6の結合時に、AXL細胞外ドメイン間のリガンド非依存性同種親和性相互作用により、活性酸素種の存在下での自己リン酸化により（Korshunov et al., 2012）、またはEGFRを通したトランス活性化により（Meyer et al., 2013）活性化され、いくつかの腫瘍タイプにおいて異常に発現している。ヒトにおいて、AXLタンパク質は、SEQ ID N0:130に示されるアミノ酸配列をコードする核酸配列によってコードされている（ヒトAXLタンパク質：Swissprot P30530；カニクイザルAXLタンパク質：GenbankアクセッションHB387229.1（SEQ ID NO:147））。
【０１７６】
本明細書において使用される「リガンド非依存性同種親和性相互作用」という用語は、リガンドの非存在下で起こる（近隣細胞上に発現した）2つのAXL分子間の会合を指す。
【０１７７】
本明細書において使用される「AXLに結合する抗体」という用語は、AXLの細胞外部分上のエピトープに結合する任意の抗体を指す。
【０１７８】
「エピトープ」という用語は、抗体に特異的に結合することができるタンパク質決定基を意味する。エピトープは、通常、アミノ酸、糖側鎖、またはそれらの組み合わせなどの分子の表面グルーピングからなり、通常、特異的な3次元構造特性、および特異的な電荷特性を有する。コンフォメーションエピトープおよび非コンフォメーションエピトープは、変性溶媒の存在下で前者に対する結合が失われるが、後者に対する結合は失われないという点で区別される。エピトープは、結合に直接関与しているアミノ酸残基、および、特異的な抗原結合ペプチドによって有効に遮断されるかまたは覆われるアミノ酸残基（換言すると、アミノ酸残基が特異的な抗原結合ペプチドの占有面積内である）などの、結合に直接関与していない他のアミノ酸残基を含み得る。
【０１７９】
本明細書において使用される「リガンド」という用語は、受容体などの別のタンパク質に特異的にかつ可逆的に結合して、より大きな複合体を形成する、ホルモン、ペプチド、イオン、薬物、またはタンパク質などの物質を指す。受容体に対するリガンド結合は、その化学的コンフォメーションを変更し得、その機能状態を決定する。例として、リガンドは、アゴニストまたはアンタゴニストとして機能し得る。
【０１８０】
本明細書において使用される「Growth Arrest-Specific 6」または「Gas6」という用語は、AXLを含むTAMファミリーの受容体に対するリガンドとして機能する、75〜80 kDaの分子量を有する721アミノ酸タンパク質を指す。Gas6は、負に荷電したリン脂質膜との特異的相互作用を担う、複数のγ-カルボキシグルタミン酸残基（Gla）を含有するN末端領域から構成される。Glaドメインは、Gas6のAXLに対する結合には必要ではないが、AXLの活性化に必要とされる。Gas6はまた、「AXLに対するリガンド」とも呼ばれ得る。
【０１８１】
本明細書において使用される「モノクローナル抗体」、「モノクローナルAb」、「モノクローナル抗体組成物」、「mAb」などの用語は、単一分子組成物の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性および親和性を提示する。したがって、「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域および定常領域を有する、単一の結合特異性を提示する抗体を指す。ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞に融合させた、トランスジェニック非ヒト動物または染色体導入（transchromosomal）非ヒト動物、例えば、ヒト重鎖導入遺伝子および軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有するトランスジェニックマウスから取得されたB細胞を含むハイブリドーマによって、産生され得る。
【０１８２】
本発明の文脈において、用語「ADC」は、抗体薬物コンジュゲートを指し、本発明においては、治療部分（例えば、本出願に記載される細胞傷害性部分）に連結されている抗AXL抗体を指す。それは、例えば、システインにリンカーで連結されるか、または他のアミノ酸に他のコンジュゲーション法で連結され得る。該部分は、例えば、薬物または毒素などであり得る。
【０１８３】
本明細書で使用する「治療部分」とは、対象に投与された場合、特に本明細書に記載のADCとして送達された場合に、治療効果または予防効果を発揮する化合物を意味する。「細胞傷害性」または「細胞増殖抑制性」部分は、細胞に有害な(例えば、細胞を死滅させる)化合物である。ADCで使用するための、いくつかの細胞傷害性または細胞増殖抑制性部分は疎水性であり、これは、それらの水中での溶解度が全くないかまたはわずかしかなく、例えば、1g/L以下(ごくわずかに可溶性)、例えば0.8g/L以下、0.6g/L以下、0.4g/L以下、0.3g/L以下、0.2g/L以下、0.1g/L以下(事実上不溶性)であることを意味する。例示的な疎水性の細胞傷害性または細胞増殖抑制性部分としては、限定するものではないが、ある種のミクロチューブリン阻害剤、例えばアウリスタチンとその誘導体、例えばMMAFおよびMMAE、ならびにメイタンシンとその誘導体、例えばDM1などが挙げられる。
【０１８４】
一態様において、該抗体はAXLに対して0.3×10-9〜63×10-9Mの範囲の結合親和性(KD)を有し、その結合親和性は可溶性AXL細胞外ドメインを用いてバイオレイヤー干渉法(Bio-layer Interferometry)により測定される。
【０１８５】
結合親和性は、実施例2に記載するように測定することができる。したがって、一態様では、該抗体は抗原に対して0.3×10-9〜63×10-9Mの結合親和性を有し、その結合親和性は以下の工程を含む方法により測定される：
i) 抗ヒトFc Captureバイオセンサに抗AXL抗体をロードする工程；および
ii) 可溶性組み換えAXL細胞外ドメインの会合および解離を様々な濃度でバイオレイヤー干渉法により測定する工程。
【０１８６】
本明細書で使用する用語「可溶性組み換えAXL細胞外ドメイン」とは、組み換えにより発現された完全長タンパク質(SEQ ID NO:130；実施例1参照)のアミノ酸1-447に対応するAXL細胞外ドメインを指す。膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインが存在しないため、組み換えAXL細胞外ドメインは、例えば細胞表面に、結合されず、溶液中にとどまる。タンパク質を組み換えにより発現させる方法は周知であり、Sambrook (1989)を参照されたい。したがって、そのような組み換えAXL細胞外ドメインを提供することは、当業者の知識の範囲内である。
【０１８７】
一態様において、該抗体はAXLに対して6.9×10-5 s-1〜9.7×10-3 s-1の解離速度を有し、その解離速度は可溶性組み換えAXL細胞外ドメインを用いるバイオレイヤー干渉法により測定される。
【０１８８】
任意で、該抗体はAXLに対して9.7×10-5 s-1〜4.4×10-3 s-1の解離速度を有し、その解離速度は可溶性組み換えAXL細胞外ドメインを用いるバイオレイヤー干渉法により測定される。
【０１８９】
結合親和性は、上記のように(および実施例2に記載のように)測定することができる。したがって、一態様では、該抗体はAXLに対して6.9×10-5 s-1〜9.7×10-3 s-1の解離速度を有し、解離速度は以下の工程を含む方法により測定される：
i) 抗ヒトFc Captureバイオセンサに抗AXL抗体をロードする工程；および
ii) 組み換えAXL細胞外ドメインの会合および解離を様々な濃度でバイオレイヤー干渉法により測定する工程。
【０１９０】
本明細書で使用する用語「解離速度」は、抗原に結合した抗原特異的抗体がその抗原から解離する速度を指し、s-1として表される。したがって、AXLに結合している抗体の文脈において、用語「解離速度」は、AXLに結合している抗体がAXLの組み換え細胞外ドメインから解離することを指し、s-1として表される。
【０１９１】
一局面において、本発明で使用するためのADCは、AXLへのGas6結合に競合または干渉することなく、AXLの細胞外ドメインに結合する抗体部分を含む。特定の態様では、該抗体は、AXLへのGas6結合に競合または干渉することなく、細胞外ドメインIg1ドメインに結合する。一態様では、該抗体は細胞外ドメインIg1に結合し、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は20％以下である。一態様では、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は15％以下である。一態様では、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は10％以下である。一態様では、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は5％以下である。一態様では、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は4％以下である。一態様では、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は2％以下である。一態様では、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は1％以下である。一態様では、該抗体は、AXLへのGas6結合に競合または干渉することなく、AXL細胞外ドメイン中のIg2ドメインに結合する。一態様では、該抗体はAXL細胞外ドメイン中のIg2ドメインに結合し、該抗体が示すAXLへの最大Gas6結合の減少は、20％以下、例えば、15％以下、10％以下、5％以下、4％以下、2％以下、1％以下である。この態様がGas6結合に競合するまたは該結合を低減させる能力は、実施例2または実施例12に開示されているように測定され得る。一態様では、該抗体は、AXLへの最大Gas6結合に競合または干渉することなく、AXL細胞外ドメイン中のIg2ドメインに結合する。
【０１９２】
一態様において、Gas6の存在下での最大抗体結合は、競合アッセイにより測定した場合に、Gas6の非存在下での結合の少なくとも90％、例えば少なくとも95％、少なくとも97％、少なくとも99％、例えば100％であり、この場合、ヒトAXLに結合する抗体とGas6との間の競合は、Gas6と共におよびGas6なしでプレインキュベートされたA431細胞で測定される。
【０１９３】
AXLに対する抗AXLとリガンドGas6との間の競合は、「Gas6結合による抗AXL結合の干渉」の見出しの下で実施例2に記載されるように測定され得る。したがって、一態様では、該抗体はAXL結合についてリガンドGas6と競合せず、この場合、結合についての競合は、以下の工程を含むアッセイにより測定される：
i) AXL発現細胞をGas6と共にインキュベートする工程；
ii) 試験すべき抗AXL抗体を添加する工程；
iii) 抗AXL抗体を検出する蛍光標識二次試薬を添加する工程；および
iv) FACSにより該細胞を分析する工程。
【０１９４】
別の態様では、該抗体は結合についてリガンドGas6と競合せず、この場合、結合についての競合は、以下の工程を含むアッセイにより測定される：
i) AXL発現細胞を抗AXL抗体と共にインキュベートする工程；
ii) Gas6を添加する工程；
iii) Gas6を検出する蛍光標識二次試薬を添加する工程；および
iv) FACSにより該細胞を分析する工程。
【０１９５】
一態様において、該抗体は、AXL発現細胞が該抗体と接触したときに、該細胞におけるAXL関連シグナル伝達をモジュレートする。
【０１９６】
一態様において、該抗体は、AXL発現細胞が該抗体と接触したときに、該細胞におけるAXL関連シグナル伝達をモジュレートしない。
【０１９７】
AXL関連シグナル伝達のモジュレーションの非限定的な例には、PI3K/AKT、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)、STATまたはNF-κBカスケードなどの細胞内シグナル伝達経路のモジュレーションが含まれる。
【０１９８】
一態様において、抗AXL抗体またはAXL-ADCは、以下からなる群より選択される可変重鎖(VH)領域と可変軽鎖(VL)領域を含む抗体とAXLへの結合について競合する：
(a) SEQ ID No: 1を含むVH領域およびSEQ ID No: 2を含むVL領域[107]；
(b) SEQ ID No: 5を含むVH領域およびSEQ ID No: 6を含むVL領域[148]；
(c) SEQ ID No:34を含むVH領域およびSEQ ID No:35を含むVL領域[733]；
(d) SEQ ID No: 7を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域[154]；
(e) SEQ ID No:10を含むVH領域およびSEQ ID No:11を含むVL領域[171]；
(f) SEQ ID No:16を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域[183]；
(g) SEQ ID No:25を含むVH領域およびSEQ ID No:26を含むVL領域[613]；
(h) SEQ ID No:31を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域[726]；
(i) SEQ ID No: 3を含むVH領域およびSEQ ID No: 4を含むVL領域[140]；
(j) SEQ ID No: 8を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域[154-M103L]；
(k) SEQ ID No:12を含むVH領域およびSEQ ID No:13を含むVL領域[172]；
(l) SEQ ID No:14を含むVH領域およびSEQ ID No:15を含むVL領域[181]；
(m) SEQ ID No:17を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域[183-N52Q]；
(n) SEQ ID No:19を含むVH領域およびSEQ ID No:20を含むVL領域[187]；
(o) SEQ ID No:21を含むVH領域およびSEQ ID No:22を含むVL領域[608-01]；
(p) SEQ ID No:23を含むVH領域およびSEQ ID No:24を含むVL領域[610-01]；
(q) SEQ ID No:27を含むVH領域およびSEQ ID No:28を含むVL領域[613-08]；
(r) SEQ ID No:29を含むVH領域およびSEQ ID No:30を含むVL領域[620-06]；ならびに
(s) SEQ ID No:32を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域[726-M101L]。
【０１９９】
抗体およびGas6リガンドの文脈において、または2つ以上の抗体の文脈において本明細書で使用する場合、用語「と競合する」または「と交差競合する」は、抗体が抗原への結合においてリガンドまたは別の抗体(例えば、「参照」抗体)とそれぞれ競合することを示す。実施例2は、抗AXL抗体とAXLリガンドGas6との競合を試験する方法の例を記載している。2つの抗体間の交差競合のための好ましい参照抗体は、表4に示されるような、本明細書中で107、148、733、154、171、183、613、726、140、154-M103L、172、181、183-N52Q、187、608-01、610-01、613-08、620-06または726-M101Lと呼ばれる抗体のVH領域とVL領域を含む結合領域を含む。特に好ましい参照抗体は、107と呼ばれる抗体である。
【０２００】
一態様において、抗AXL抗体は、そのVHおよびVL配列、例えばSEQ ID No:1を含むVH領域とSEQ ID No:2を含むVL領域[107]、によって定義されるような、上記態様に従う抗体のいずれか1つ以上と同じAXL上のエピトープに結合する。
【０２０１】
抗体が結合するエピトープの決定方法は、当技術分野で周知である。したがって、当業者は、そのようなエピトープの決定の仕方を知っているであろう。しかしながら、抗体が本明細書に記載されるエピトープに結合するか否かを決定する1つの例は、例えば抗原への抗体結合に関与するアミノ酸を同定するために、AXL細胞外ドメインの細胞外ドメイン中に点変異を導入することによるものである。点変異が全体的な3D構造に及ぼす影響は最小限であると予想されるので、AXL細胞外ドメインに点変異を導入して、点変異導入AXL細胞外ドメインへの抗体結合を試験することは、当業者の知識の範囲内である。
【０２０２】
代替方法が実施例3で使用された。この方法では、ヒトIg1、Ig2、FN1またはFN2ドメインがマウス類似体によって置き換えられたヒト-マウスキメラAXL変異体のパネルを作製し、抗AXL抗体がどの変異体に結合したかを判定することによって、AXLドメイン特異性がマッピングされた。この方法は、これらのヒトAXL特異的抗体がヒトAXLを認識するが、マウスAXLを認識しないという原理に基づいていた。したがって、別の特定の態様では、該抗体は、AXLのIg1ドメイン、AXLのIg2ドメイン、AXLのFN1ドメイン、またはAXLのFN2ドメインに結合する。
【０２０３】
抗体結合に関与するAXL細胞外ドメインのアミノ酸を同定する、より高分解能のエピトープマッピング法もまた、この実施例で使用された。具体的には、この方法では、細胞外ドメイン中のヒトAXL配列(SEQ ID NO:130)と様々なレベルの相同性を有する種に由来するAXL配列の組み換えにより作製されたAXL配列バリアントのライブラリーへの抗AXL抗体の結合が分析された。この方法は、これらのヒトAXL特異的抗体がヒトAXLを認識するが、この実施例で使用された他の種に由来するAXLを認識しないという原理に基づいていた。
【０２０４】
したがって、一態様では、該抗体はAXLのIg1ドメイン内のエピトープに結合し、その抗体結合は、ヒトAXLの位置L121〜Q129に対応するアミノ酸のうちの1つもしくは複数もしくは全て、またはT112〜Q124のうちの1つもしくは複数もしくは全てに依存する；ここで、アミノ酸残基のナンバリングは、ヒトAXL(SEQ ID NO:130)中のそれらのそれぞれの位置を指す。一態様では、該抗体はAXLのIg1ドメイン内のエピトープに結合し、その抗体結合はヒトAXLの位置L121〜Q129またはT112〜Q124に対応するアミノ酸に依存する。好ましい態様では、抗体結合は、本明細書で107と呼ばれる抗体の結合に関与するアミノ酸に対応する、位置L121、G122、H123、Q124、T125、F126、V127、S128およびQ129のうちの1つまたは複数または全てのアミノ酸に依存する。一態様では、抗体結合は、位置T112、G113、Q114、Y115、Q116、C117、L118、V119、F120、L121、G122、H123およびQ124のうちの1つまたは複数または全てのアミノ酸に依存する。
【０２０５】
別の態様において、該抗体はAXLのIg2ドメイン内のエピトープに結合し、抗体結合は、ヒトAXLの位置D170もしくはD179の組み合わせに対応するアミノ酸のうちの1つもしくは複数もしくは全て、または位置T182〜R190のアミノ酸のうちの1つもしくは複数もしくは全てに依存する。一態様では、抗体結合は、位置T182、A183、P183、G184、H185、G186、P187、Q189およびR190のアミノ酸に依存する。
【０２０６】
別の態様において、該抗体はヒトAXLのFN1ドメインに結合し、抗体結合は、ヒトAXLの位置Q272〜A287およびG297〜P301に対応するアミノ酸のうちの1つまたは複数または全てに依存する。一態様では、抗体結合は、ヒトAXLの位置Q272〜A287およびG297〜P301に対応するアミノ酸に依存する。
【０２０７】
別の態様において、該抗体はヒトAXLのFN2ドメインに結合し、抗体結合は、ヒトAXLの位置A359、R386、およびQ436〜K439に対応するアミノ酸のうちの1つまたは複数または全てに依存する。
【０２０８】
さらに別の態様において、該抗体はAXLのIg1ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープは、ヒトAXLの位置L121〜Q129に対応するアミノ酸のうちの1つもしくは複数もしくは全て、またはT112〜Q124のうちの1つもしくは複数もしくは全てを含むかまたは必要とする；ここで、アミノ酸残基のナンバリングは、ヒトAXL(SEQ ID NO:130)中のそれらのそれぞれの位置を指す。一態様では、該抗体はAXLのIg1ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープは、ヒトAXLの位置L121〜Q129またはT112〜Q124に対応するアミノ酸を含むかまたは必要とする。好ましい態様では、該エピトープは、本明細書で107と呼ばれる抗体の結合に関与するアミノ酸に対応する、位置L121、G122、H123、Q124、T125、F126、V127、S128およびQ129のうちの1つまたは複数または全てのアミノ酸を含む。一態様では、該エピトープは、位置T112、G113、Q114、Y115、Q116、C117、L118、V119、F120、L121、G122、H123およびQ124のうちの1つまたは複数または全てのアミノ酸を含む。
【０２０９】
別の態様において、該抗体はAXLのIg2ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープは、ヒトAXLの位置D170、もしくはD179の組み合わせに対応するアミノ酸のうちの1つもしくは複数もしくは全て、または位置T182〜R190のアミノ酸の1つもしくは複数もしくは全てを含むかまたは必要とする。一態様では、該エピトープは、位置T182、A183、P183、G184、H185、G186、P187、Q189およびR190のうちのアミノ酸を含むかまたは必要とする。
【０２１０】
別の態様において、該抗体はヒトAXLのFN1ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープは、ヒトAXLの位置Q272〜A287およびG297〜P301に対応するアミノ酸のうちの1つまたは複数または全てを含むかまたは必要とする。一態様では、該エピトープは、ヒトAXLの位置Q272〜A287およびG297〜P301に対応するアミノ酸を含むかまたは必要とする。
【０２１１】
別の態様において、該抗体はヒトAXLのFN2ドメイン内のエピトープに結合し、該エピトープは、ヒトAXLの位置A359、R386、およびQ436〜K439に対応するアミノ酸のうちの1つまたは複数または全てを含むかまたは必要とする。
【０２１２】
一態様において、該抗体はヒトAXLのFN1様ドメイン内のエピトープに結合する。
【０２１３】
一態様において、抗体は、AXL上のエピトープに結合し、該エピトープは、以下により定義される抗体のいずれか1つによって認識される：
（a）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [107]；
（b）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [148]；
（c）それぞれ、SEQ ID NO:114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [733]；
（d）それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および53のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [154]；
（e）それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および54のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [154-M103L]；
（f）それぞれ、SEQ ID NO:57、58、および59のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [171]；
（g）それぞれ、SEQ ID NO:62、63、および64のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:65、GAS、およびSEQ ID NO:66のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [172]；
（h）それぞれ、SEQ ID NO:67、68、および69のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:70、GAS、およびSEQ ID NO:71のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [181]；
（i）それぞれ、SEQ ID NO:72、73、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [183]；
（j）それぞれ、SEQ ID NO:72、74、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [183-N52Q]；
（k）それぞれ、SEQ ID NO:78、79、および80のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:81、AAS、およびSEQ ID NO:82のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [187]；
（l）それぞれ、SEQ ID NO:83、84、および85のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:86、GAS、およびSEQ ID NO:87のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [608-01]；
（m）それぞれ、SEQ ID NO:88、89、および90のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:91、GAS、およびSEQ ID NO:92のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [610-01]；
（n）それぞれ、SEQ ID NO:93、94、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613]；
（o）それぞれ、SEQ ID NO:98、99、および100のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:10、DAS、およびSEQ ID NO:102のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613-08]；
（p）それぞれ、SEQ ID NO:103、104、および105のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:106、GAS、およびSEQ ID NO:107のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [620-06]；
（q）それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および110のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [726]；
（r）それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および111のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [726-M101L]；
（s）それぞれ、SEQ ID NO:41、42、および43のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:44、AAS、およびSEQ ID NO:45のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [140]；
（t）それぞれ、SEQ ID NO:93、94、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:128、XAS（配列中、XはDまたはGである）、およびSEQ ID NO:129のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613 / 613-08]；
（u）それぞれ、SEQ ID NO:46、119、および120のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [148 / 140]；
（v）それぞれ、SEQ ID NO:123、124、および125のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [171 / 172 / 181]；ならびに
（w）それぞれ、SEQ ID NO:121、109、および122のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [726 / 187]；ならびに
（x）それぞれ、SEQ ID NO:93、126、および127のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613 / 608-01 / 610-01 / 620-06]。
【０２１４】
特定の態様において、抗体はAXL上のエピトープに結合し、該エピトープは、本明細書において107、061、137、148、154-M103L、171、183-N52Q、511、613、726-M102Lおよび733と称される抗体から選択される抗体のVHおよびVL配列を含む結合領域を含むことにより定義される抗体のいずれか1つによって認識される。実施例16において示すように、これらの抗AXL抗体は内部移行し、したがってADCアプローチに適している。
【０２１５】
一態様において、抗体は、以下からなる群より選択されるVH領域およびVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む：
（a）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [107]；
（b）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [148]；
（c）それぞれ、SEQ ID NO:114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [733]；
（d）それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および53のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [154]；
（e）それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および54のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [154-M103L]；
（f）それぞれ、SEQ ID NO:57、58、および59のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [171]；
（g）それぞれ、SEQ ID NO:62、63、および64のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:65、GAS、およびSEQ ID NO:66のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [172]；
（h）それぞれ、SEQ ID NO:67、68、および69のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:70、GAS、およびSEQ ID NO:71のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [181]；
（i）それぞれ、SEQ ID NO:72、73、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [183]；
（j）それぞれ、SEQ ID NO:72、74、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [183-N52Q]；
（k）それぞれ、SEQ ID NO:78、79、および80のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:81、AAS、およびSEQ ID NO:82のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [187]；
（l）それぞれ、SEQ ID NO:83、84、および85のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:86、GAS、およびSEQ ID NO:87のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [608-01]；
（m）それぞれ、SEQ ID NO:88、89、および90のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:91、GAS、およびSEQ ID NO:92のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [610-01]；
（n）それぞれ、SEQ ID NO:93、94、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613]；
（o）それぞれ、SEQ ID NO:98、99、および100のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:101、DAS、およびSEQ ID NO:102のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613-08]；
（p）それぞれ、SEQ ID NO:103、104、および105のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:106、GAS、およびSEQ ID NO:107のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [620-06]；
（q）それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および110のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [726]；
（r）それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および111のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [726-M101L]；
（s）それぞれ、SEQ ID NO:41、42、および43のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:44、AAS、およびSEQ ID NO:45のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [140]；
（t）それぞれ、SEQ ID NO:93、94、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:128、XAS（配列中、XはDまたはGである）、およびSEQ ID NO:129のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613 / 613-08]；
（u）それぞれ、SEQ ID NO:46、119、および120のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [148 / 140]；
（v）それぞれ、SEQ ID NO:123、124、および125のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [171 / 172 / 181]；ならびに
（w）それぞれ、SEQ ID NO:121、109、および122のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [726 / 187]；ならびに
（x）それぞれ、SEQ ID NO:93、126、および127のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含むVL領域 [613 / 608-01 / 610-01 / 620-06]。
【０２１６】
一態様において、抗体は、以下からなる群より選択されるVH領域およびVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む：
（a）SEQ ID NO:1を含むVH領域、およびSEQ ID NO:2を含むVL領域 [107]；
（b）SEQ ID NO:5を含むVH領域、およびSEQ ID NO:6を含むVL領域 [148]；
（c）SEQ ID NO:34を含むVH領域、およびSEQ ID NO:35を含むVL領域 [733]；
（d）SEQ ID NO:7を含むVH領域、およびSEQ ID NO:9を含むVL領域 [154];
（e）SEQ ID NO:10を含むVH領域、およびSEQ ID NO:11を含むVL領域 [171]；
（f）SEQ ID NO:16を含むVH領域、およびSEQ ID NO:18を含むVL領域 [183]；
（g）SEQ ID NO:25を含むVH領域、およびSEQ ID NO:26を含むVL領域 [613]；
（h）SEQ ID NO:31を含むVH領域、およびSEQ ID NO:33を含むVL領域 [726]；
（i）SEQ ID NO:3を含むVH領域、およびSEQ ID NO:4を含むVL領域 [140]；
（j）SEQ ID NO:8を含むVH領域、およびSEQ ID NO:9を含むVL領域 [154-M103L]；
（k）SEQ ID NO:12を含むVH領域、およびSEQ ID NO:13を含むVL領域 [172]；
（l）SEQ ID NO:14を含むVH領域、およびSEQ ID NO:15を含むVL領域 [181]；
（m）SEQ ID NO:17を含むVH領域、およびSEQ ID NO:18を含むVL領域 [183-N52Q]；
（n）SEQ ID NO:19を含むVH領域、およびSEQ ID NO:20を含むVL領域 [187]；
（o）SEQ ID NO:21を含むVH領域、およびSEQ ID NO:22を含むVL領域 [608-01]；
（p）SEQ ID NO:23を含むVH領域、およびSEQ ID NO:24を含むVL領域 [610-01]；
（q）SEQ ID NO:27を含むVH領域、およびSEQ ID NO:28を含むVL領域 [613-08]；
（r）SEQ ID NO:29を含むVH領域、およびSEQ ID NO:30を含むVL領域 [620-06]；ならびに
（s）SEQ ID NO:32を含むVH領域、およびSEQ ID NO:33を含むVL領域 [726-M101L]。
【０２１７】
本発明はまた、上記抗体のVL領域、VH領域または1つ以上のCDRの機能的バリアントを含む抗体を提供する。AXL抗体との関連で使用されるVL、VHまたはCDRの機能的バリアントは、該抗体が親抗体の親和性/結合活性および/または特異性/選択性のかなり大きな割合(少なくとも約50％、60％、70％、80％、90％、95％、99％またはそれ以上)を保持することを依然として可能にし、場合によっては、このようなAXL抗体は、親抗体よりも高い親和性、選択性および/または特異性を伴っていることがある。
【０２１８】
このような機能的バリアントは、典型的には、親抗体に対する顕著な配列同一性を保持する。2つの配列間の同一性パーセントは、2つの配列の最適なアラインメントのために導入する必要があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮して、それらの配列によって共有される同一位置の数の関数(すなわち、相同性％＝同一位置の数/位置の総数×100)である。配列の比較および2つの配列間の同一性パーセントの決定は、当技術分野で周知の数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。
【０２１９】
2つのアミノ酸配列間の配列同一性は、例えば、EMBOSSパッケージ(EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277)のNeedleプログラム、好ましくはバージョン5.0.0以降、により実行されるNeedleman-Wunschアルゴリズム(Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48: 443-453)を用いて決定することができる。使用されるパラメータは、ギャップオープンペナルティ10、ギャップ伸長ペナルティ0.5、およびEBLOSUM62 (BLOSUM62のEMBOSSバージョン)置換マトリックスである。「最長同一性」(-nobriefオプションを用いて取得)と表示されたNeedleの出力は、同一性パーセントとして使用され、次のように計算される。
(同一残基×100)/(アラインメントの長さ-アラインメント中のギャップの総数）
【０２２０】
バリアントのVH、VLおよび/またはCDR配列は、主に保存的な置換により親抗体配列のものと異なり得る；例えば、バリアントにおける置換の少なくとも約35％、約50％以上、約60％以上、約70％以上、約75％以上、約80％以上、約85％以上、約90％以上(例えば、約65〜95％、例えば約92％、93％または94％)は、保存的アミノ酸残基置換である。
【０２２１】
バリアントのVH、VLおよび/またはCDR配列は、主に保存的な置換により親抗体配列のものと異なり得る；例えば、バリアントにおける置換の10以下、例えば、9以下、8以下、7以下、6以下、5以下、4以下、3以下、2以下または1つは、保存的アミノ酸残基置換である。
【０２２２】
また、上記の態様の可変重鎖および/または可変軽鎖の3つのCDR配列にわたって5つまでの変異または置換が可能である実施態様も提供される。5つまでの変異または置換は、可変重鎖の3つのCDR配列および可変軽鎖の3つのCDR配列にわたって分布し得る。5つまでの変異または置換は、結合領域の6つのCDR配列にわたって分布していてもよい。変異または置換は、変異または置換がエピトープを変化させないように、好ましくはエピトープに対する結合親和性を30％より大きく改変しないように、例えば20％より大きく改変しないように、例えば10％より大きく改変しないように、保存的な物理的または機能的アミノ酸のものであり得る。保存的な物理的または機能的アミノ酸は、存在する20種の天然アミノ酸、すなわち、Arg、His、Lys、Asp、Glu、Ser、Thr、Asn、Gln、Cys、Gly、Pro、Ala、Ile、Leu、Met、Phe、Trp、TyrおよびValから選択される。
【０２２３】
したがって、一態様において、前記抗体は、以下のVH領域およびVL領域と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一であるVHおよびVL配列からなる群より選択されるVH領域とVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む：
(a) SEQ ID No: 1を含むVH領域およびSEQ ID No: 2を含むVL領域[107]；
(b) SEQ ID No: 5を含むVH領域およびSEQ ID No: 6を含むVL領域[148]；
(c) SEQ ID No:34を含むVH領域およびSEQ ID No:35を含むVL領域[733]；
(d) SEQ ID No: 7を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域[154]；
(e) SEQ ID No:10を含むVH領域およびSEQ ID No:11を含むVL領域[171]；
(f) SEQ ID No:16を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域[183]；
(g) SEQ ID No:25を含むVH領域およびSEQ ID No:26を含むVL領域[613]；
(h) SEQ ID No:31を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域[726]；
(i) SEQ ID No: 3を含むVH領域およびSEQ ID No: 4を含むVL領域[140]；
(j) SEQ ID No: 8を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域[154-M103L]；
(k) SEQ ID No:12を含むVH領域およびSEQ ID No:13を含むVL領域[172]；
(l) SEQ ID No:14を含むVH領域およびSEQ ID No:15を含むVL領域[181]；
(m) SEQ ID No:17を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域[183-N52Q]；
(n) SEQ ID No:19を含むVH領域およびSEQ ID No:20を含むVL領域[187]；
(o) SEQ ID No:21を含むVH領域およびSEQ ID No:22を含むVL領域[608-01]；
(p) SEQ ID No:23を含むVH領域およびSEQ ID No:24を含むVL領域[610-01]；
(q) SEQ ID No:27を含むVH領域およびSEQ ID No:28を含むVL領域[613-08]；
(r) SEQ ID No:29を含むVH領域およびSEQ ID No:30を含むVL領域[620-06]；ならびに
(s) SEQ ID No:32を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域[726-M101L]。
【０２２４】
本発明はまた、これらの例の抗体のVL領域、VH領域または1つ以上のCDRの機能的バリアントを含む抗体を提供する。AXL抗体との関連で使用されるVL、VHまたはCDRの機能的バリアントは、該抗体が親抗体の親和性/結合活性および/または特異性/選択性のかなり大きな割合(少なくとも約50％、60％、70％、80％、90％、95％、99％またはそれ以上)を保持することを依然として可能にし、場合によっては、このようなAXL抗体は、親抗体よりも高い親和性、選択性および/または特異性を伴っていることがある。
【０２２５】
このような機能的バリアントは、典型的には、親抗体に対する顕著な配列同一性を保持する。2つの配列間の同一性パーセントは、2つの配列の最適なアラインメントのために導入する必要があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮して、それらの配列によって共有される同一位置の数の関数(すなわち、相同性％＝同一位置の数/位置の総数×100)である。配列の比較および2つの配列間の同一性パーセントの決定は、当技術分野で周知の数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。
【０２２６】
バリアントのVH、VLおよび/またはCDR配列は、主に保存的な置換により親抗体配列のものと異なり得る；例えば、バリアントにおける置換の少なくとも約35％、約50％以上、約60％以上、約70％以上、約75％以上、約80％以上、約85％以上、約90％以上(例えば、約65〜95％、例えば約92％、93％または94％)は、保存的アミノ酸残基置換である。
【０２２７】
バリアントのVH、VLおよび/またはCDR配列は、主に保存的な置換により親抗体配列のものと異なり得る；例えば、バリアントにおける置換の10以下、例えば、9以下、8以下、7以下、6以下、5以下、4以下、3以下、2以下または1つは、保存的アミノ酸残基置換である。
【０２２８】
また、上記の態様の可変重鎖および/または可変軽鎖の3つのCDR配列にわたって5つまでの変異または置換が可能である実施態様も提供される。5つまでの変異または置換は、可変重鎖の3つのCDR配列および可変軽鎖の3つのCDR配列にわたって分布し得る。5つまでの変異または置換は、結合領域の6つのCDR配列にわたって分布していてもよい。変異または置換は、変異または置換がエピトープを変化させないように、好ましくはエピトープに対する結合親和性を30％以上、例えば20％以上、例えば10％以上改変しないように、保存的な物理的または機能的アミノ酸のものであり得る。保存的な物理的または機能的アミノ酸は、存在する20種の天然アミノ酸、すなわち、Arg、His、Lys、Asp、Glu、Ser、Thr、Asn、Gln、Cys、Gly、Pro、Ala、Ile、Leu、Met、Phe、Trp、TyrおよびValから選択される。
【０２２９】
一態様において、前記抗体は、以下のVH領域およびVL領域と少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例えば少なくとも97％、例えば少なくとも99％同一のVHおよびVL配列からなる群より選択されるVH領域とVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む：
(t) SEQ ID No: 1を含むVH領域およびSEQ ID No: 2を含むVL領域[107]；
(u) SEQ ID No: 5を含むVH領域およびSEQ ID No: 6を含むVL領域[148]；
(v) SEQ ID No:34を含むVH領域およびSEQ ID No:35を含むVL領域[733]；
(w) SEQ ID No: 7を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域[154]；
(x) SEQ ID No:10を含むVH領域およびSEQ ID No:11を含むVL領域[171]；
(y) SEQ ID No:16を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域[183]；
(z) SEQ ID No:25を含むVH領域およびSEQ ID No:26を含むVL領域[613]；
(aa) SEQ ID No:31を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域[726]；
(bb) SEQ ID No: 3を含むVH領域およびSEQ ID No: 4を含むVL領域[140]；
(cc) SEQ ID No: 8を含むVH領域およびSEQ ID No: 9を含むVL領域[154-M103L]；
(dd) SEQ ID No:12を含むVH領域およびSEQ ID No:13を含むVL領域[172]；
(ee) SEQ ID No:14を含むVH領域およびSEQ ID No:15を含むVL領域[181]；
(ff) SEQ ID No:17を含むVH領域およびSEQ ID No:18を含むVL領域[183-N52Q]；
(gg) SEQ ID No:19を含むVH領域およびSEQ ID No:20を含むVL領域[187]；
(hh) SEQ ID No:21を含むVH領域およびSEQ ID No:22を含むVL領域[608-01]；
(ii) SEQ ID No:23を含むVH領域およびSEQ ID No:24を含むVL領域[610-01]；
(jj) SEQ ID No:27を含むVH領域およびSEQ ID No:28を含むVL領域[613-08]；
(kk) SEQ ID No:29を含むVH領域およびSEQ ID No:30を含むVL領域[620-06]；ならびに
(ll) SEQ ID No:32を含むVH領域およびSEQ ID No:33を含むVL領域[726-M101L]。
【０２３０】
一態様において、前記抗体は、当技術分野で公知の抗AXL抗体のVHおよびVL CDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む、少なくとも1つの結合領域を含むが、公知の抗AXL抗体としては、例えば、Leconet et al. (2013); Li et al. (2009); Ye et al. (2010); Iida et al. (2014); WO 2012/175691 (INSERM社); WO 2012/175692 (INSERM社); WO 2013/064685 (Pierre Fabre Medicaments社); WO 2013/090776 (INSERM社); WO 2009/063965 (中外製薬); WO 2010/131733; WO 2011/159980 (Genentech社); WO09062690 (U3 Pharma社); WO2010130751 (U3 Pharma社); WO2014093707 (Stanford大学)およびEP2228392A1 (中外)に記載される抗体があり、これらの全ては参照によりその全体が本明細書に組み入れられる。特定の一態様では、該抗体はWO2014174111 (Pierre Fabre Medicament社)に記載されるマウス抗体1613F12またはそのキメラもしくはヒト化バリアントであり、マウス抗体1613F12のVHおよびVL配列は、それぞれ、SEQ ID NO:8およびSEQ ID NO:7として提示される。1613F12のヒト化抗体バリアントのVH配列は、SEQ ID NO:29〜49およびSEQ ID NO:82としてそこに開示された配列から選択され、1613F12のヒト化抗体バリアントのVL配列は、SEQ ID NO:17〜28およびSEQ ID NO:81としてそこに開示された配列から選択される。1つの特定の抗体は、それぞれSEQ ID NO:29および17としてそこに開示されたVHおよびVL配列を含む。マウス、キメラおよびヒト化1613F12のVH CDR1、CDR2およびCDR3配列は、それぞれSEQ ID NO:4、5および6であり、マウスおよびヒト化1613F12のVL CDR1、CDR2およびCDR3配列は、それぞれSEQ ID NO:1、2および3としてそこに開示される。特定の一態様では、該抗体は、その全体が参照により本明細書に組み入れられるWO2011159980 (Hoffman-La Roche社)、特に段落[0127]〜[0229](28〜52ページ)に記載される。例えば、該抗体は、抗体YW327.6S2のVHおよびVL超可変領域(HVR)、またはVHおよびVL領域を含むことができ、それらはSEQ ID NO:7、8および9 (それぞれVH HVR1、2および3)、SEQ ID NO:10、11および12 (それぞれVL HVR1、2および3)、ならびにSEQ ID NO:103および104 (それぞれVHおよびVL配列)としてそこに開示される。
【０２３１】
一態様において、該抗体は、細胞の表面上のAXL分子の抗体媒介性の架橋またはクラスタリング(例えば、FcR発現細胞に結合するAXL結合抗体のFc領域による)を媒介し、その細胞のアポトーシスを引き起こすことができる。
【０２３２】
一態様において、該抗体は、Fc依存性細胞応答、例えば、エフェクター細胞の存在下で該AXL特異的抗体がAXL発現細胞の形質膜に結合した後に、AXL発現細胞に対するADCCまたはADCPを誘導する。この態様では、該抗体の抗体部分は、典型的には完全長であり、例えばIgG1、κアイソタイプのような、ADCCまたはADCP応答をもたらすアイソタイプのものである。
【０２３３】
一態様において、該抗体は、正常ヒト血清中に存在する補体タンパク質のような、活性化され得る補体タンパク質の存在下で、AXL発現細胞の形質膜にAXL特異的抗体が結合した後に、AXL発現細胞に対するCDC応答を誘導する。この態様では、該抗体の抗体部分は、典型的には完全長であり、例えばIgG1、κアイソタイプのような、補体系の活性化を誘導することが可能なアイソタイプのものである。
【０２３４】
前記抗体および/またはADCは、AXLへの結合時の内在化(internalization)によってさらに特徴付けられる。したがって、一態様では、該抗体および/またはADCは、内在化されて、抗AXL抗体-リンカー-薬物複合体の特異的(すなわち切断可能なリンカー)または非特異的(切断不能なリンカー)タンパク分解切断のためにリソソームに輸送される。
【０２３５】
一態様において、該抗体は、例えば、AXLを発現するマクロファージ、樹状細胞またはNK細胞への該抗体の結合により、先天性免疫応答または適応免疫応答のAXL媒介調節を妨げる。
【０２３６】
一態様において、ADCの治療部分は、リンカーを介して抗体部分に連結されるが、該リンカーは、例えばpHの変化または還元条件によってADCが内在化されると、薬物の放出を可能にする。適切なリンカー技術は、本明細書に記載されるように、当技術分野で公知である。
【０２３７】
一態様において、該抗体は、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4からなる群より選択されるアイソタイプの重鎖を含む。さらなる態様において、該抗体は、ヒトIgG1、IgG2、IgG3およびIgG4からなる群より選択されるアイソタイプの重鎖を含む。
【０２３８】
本明細書において使用される「アイソタイプ」という用語は、重鎖定常領域遺伝子によりコードされる、免疫グロブリンクラス（例として、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgD、IgA、IgE、もしくはIgM、または任意のそのアロタイプ、例えば、IgG1m(za)およびIgG1m(f)）を指す。さらに、各重鎖アイソタイプは、カッパ（κ）またはラムダ（λ）軽鎖のいずれかと組み合わせることができる。
【０２３９】
一態様において、アイソタイプはIgG1、例えばヒトIgG1、任意でアロタイプIgG1m(f)である。
【０２４０】
一態様において、抗体は、完全長モノクローナル抗体、任意で完全長ヒトモノクローナルIgG1,κ抗体である。
【０２４１】
本明細書において使用される場合の「完全長抗体」という用語は、そのアイソタイプの野生型抗体において普通に見出されるものに対応するすべての重鎖および軽鎖の定量ドメインおよび可変ドメインを含有する抗体（例えば、親抗体またはバリアント抗体）を指す。本発明による完全長抗体は、（i）CDR配列を、完全な重鎖配列および完全な軽鎖配列を含む適しているベクター中にクローニングする工程、および（ii）適している発現系において完全な重鎖および軽鎖配列を発現させる工程を含む方法によって産生され得る。CDR配列または完全な可変領域配列のいずれかから出発する場合に、完全長抗体を産生することは、当業者の知識の範囲内である。したがって、当業者は、本発明による完全長抗体を生成する方法を承知しているであろう。
【０２４２】
一態様において、抗体はヒト抗体である。
【０２４３】
本明細書において使用される「ヒト抗体」という用語は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域およびフレームワーク領域、ならびにヒト免疫グロブリン定常ドメインを有する抗体を含むように意図される。本発明のヒト抗体は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列によりコードされていないアミノ酸残基（例えば、インビトロのランダムもしくは部位特異的な変異誘発によって、またはインビボでの体細胞変異によって導入される変異、挿入、または欠失）を含み得る。しかし、本明細書において使用される「ヒト抗体」という用語は、マウスなどの別の非ヒト種の生殖細胞系列に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列上に移植されている抗体を含むようには意図されない。
【０２４４】
本明細書において使用される際、抗体が、例として、ヒト免疫グロブリン遺伝子を保有するトランスジェニックマウスを免疫化することによって、またはヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリーをスクリーニングすることによって、ヒト免疫グロブリン配列を用いた系から取得され、選択されたヒト抗体が、生殖細胞系列免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも90％、例えば少なくとも95％、例として少なくとも96％、例えば少なくとも97％、例として少なくとも98％、または例えば少なくとも99％、アミノ酸配列が同一である場合に、ヒト抗体は、特定の生殖細胞系列配列「に由来する」。典型的に、特定のヒト生殖細胞系列配列に由来するヒト抗体は、重鎖CDR3の外側で、生殖細胞系列免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列と、20個以下のアミノ酸の差、例えば、10個以下のアミノ酸の差、例えば9個以下、8個以下、7個以下、6個以下、または5個以下、例として4個以下、3個以下、2個以下、または1個以下のアミノ酸の差を提示することになる。
【０２４５】
本発明による抗体は、免疫グロブリン重鎖および／または軽鎖においてアミノ酸改変を含み得る。特定の態様において、抗体のFc領域中のアミノ酸が改変され得る。
【０２４６】
本明細書において使用される「Fc領域」という用語は、抗体のN末端からC末端への方向で、少なくともヒンジ領域、CH2領域、およびCH3領域を含む領域を指す。抗体のFc領域は、免疫系の種々の細胞（エフェクター細胞など）および補体系の構成要素を含む、宿主組織または因子に対する免疫グロブリンの結合を媒介し得る。
【０２４７】
本明細書において使用される「ヒンジ領域」という用語は、免疫グロブリン重鎖のヒンジ領域を指す。したがって、例えば、ヒトIgG1抗体のヒンジ領域は、Kabat et al. (1991)に示されているようなEuナンバリングによるアミノ酸216〜230に対応する。しかし、ヒンジ領域はまた、本明細書に記載される他のサブタイプのいずれかであってもよい。
【０２４８】
本明細書において使用される「CH1領域」または「CH1ドメイン」という用語は、免疫グロブリン重鎖のCH1領域を指す。したがって、例えば、ヒトIgG1抗体のCH1領域は、Kabat et al. (1991)に示されているようなEuナンバリングによるアミノ酸118〜215に対応する。しかし、CH1領域はまた、本明細書に記載される他のサブタイプのいずれかであってもよい。
【０２４９】
本明細書において使用される「CH2領域」または「CH2ドメイン」という用語は、免疫グロブリン重鎖のCH2領域を指す。したがって、例えば、ヒトIgG1抗体のCH2領域は、Kabat et al. (1991)に示されているようなEuナンバリングによるアミノ酸231〜340に対応する。しかし、CH2領域はまた、本明細書に記載される他のサブタイプのいずれかであってもよい。
【０２５０】
本明細書において使用される「CH3領域」または「CH3ドメイン」という用語は、免疫グロブリン重鎖のCH3領域を指す。したがって、例えば、ヒトIgG1抗体のCH3領域は、Kabat et al. (1991)に示されているようなEuナンバリングによるアミノ酸341〜447に対応する。しかし、CH3領域はまた、本明細書に記載される他のサブタイプのいずれかであってもよい。
【０２５１】
別の態様において、抗体は、エフェクター機能欠損抗体、安定化IgG4抗体、または一価抗体である。
【０２５２】
1つの特定の態様において、重鎖は、全ヒンジ領域が欠失しているように改変されている。
【０２５３】
一態様において、抗体の配列は、N結合型グリコシル化のためのいかなるアクセプター部位も含まないように改変されている。
【０２５４】
一態様において、抗体は一本鎖抗体である。
【０２５５】
さらなる局面において、本発明は、少なくとも、本明細書に記載されるいずれかの局面または態様による抗体の第1の結合領域、および第1の結合領域とは異なる標的またはエピトープに結合する第2の結合領域を含む、多重特異性抗体に関する。本明細書において使用される「多重特異性抗体」という用語は、結合領域が、少なくとも2つ、例えば少なくとも3つの異なる抗原、または、同じ抗原上の少なくとも2つ、例えば少なくとも3つの異なるエピトープに結合する抗体を指す。
【０２５６】
一態様において、本発明は、本明細書に記載されるいずれかの局面または態様による抗体の第1の結合領域と、第1の結合領域とは異なる標的またはエピトープに結合する第2の結合領域とを含む二重特異性抗体を含むADCの使用に関する。
【０２５７】
本明細書において使用される「二重特異性」という用語は、結合分子の結合領域が、2つの異なる抗原、または同じ抗原上の2つの異なるエピトープに結合する、抗体などの結合分子を指す。
【０２５８】
「二重特異性抗体」という用語は、少なくとも2つの異なる、典型的にはオーバーラップしないエピトープに対して特異性を有する抗体を指す。そのようなエピトープは、同じ標的または異なる標的上にあってもよい。エピトープが異なる標的上にある場合、そのような標的は、同じ細胞または異なる細胞、細胞タイプもしくは構造、例えば細胞外組織上にあってもよい。
【０２５９】
本明細書において使用される「異なる標的」という用語は、AXLまたはAXL断片以外の別のタンパク質、分子などを指す。
【０２６０】
本発明において使用され得る二重特異性抗体分子の例は、（i）異なる抗原結合領域を含む2つのアームを有する単一抗体；（ii）例えば、余分のペプチドリンカーにより直列に連結された2つのscFvを介して、2つの異なるエピトープに対して特異性を有する一本鎖抗体；（iii）各軽鎖および重鎖が、短いペプチド連結を通して直列に2つの可変ドメインを含有する、デュアル可変ドメイン抗体（DVD-Ig（商標））（Wu et al., 2010）；（iv）化学的に連結された二重特異性(Fab')2断片；（v）2つの一本鎖ダイアボディの融合物であり、標的抗原の各々に対して2つの結合部位を有する四価の二重特異性抗体を結果として生じるTandab（登録商標）；（vi）scFvとダイアボディとの組み合わせであり、多価の分子を結果として生じるフレキシボディ（flexibody）；（vii）タンパク質キナーゼAにおける「二量体化およびドッキングドメイン」に基づき、Fabに適用した場合には、異なるFab断片に連結された2つの同一のFab断片からなる三価の二重特異性結合タンパク質を生じることができる、いわゆる「ドックおよびロック」分子（Dock-and-Lock（登録商標））；（viii）例えば、ヒトFabアームの両方の末端に融合された2つのscFvを含む、いわゆるScorpion分子；ならびに（ix）ダイアボディを含む。
【０２６１】
一態様において、本発明の二重特異性抗体は、ダイアボディ、CrossMabなどのクロスボディ、または、制御されたFabアーム交換を介して取得される二重特異性抗体（例えばWO 2011/131746, Genmab A/Sに記載されている）である。
【０２６２】
二重特異性抗体の様々なクラスの例は、（i）ヘテロ二量体化を強いる相補的CH3ドメインを有するIgG様分子；（ii）分子の2つの側面が各々、少なくとも2つの異なる抗体のFab断片またはFab断片の一部を含有する、組み換えIgG様二重標的分子；（iii）完全長IgG抗体が、余分のFab断片またはFab断片の一部に融合されている、IgG融合分子；（iv）一本鎖Fv分子または安定化ダイアボディが、重鎖定常ドメイン、Fc領域、またはその一部に融合されている、Fc融合分子；（v）様々なFab断片が、互いに融合され、重鎖定常ドメイン、Fc領域、またはその一部に融合されている、Fab融合分子；ならびに、（vi）様々な一本鎖Fv分子または様々なダイアボディまたは様々な重鎖抗体（例えば、ドメイン抗体、Nanobodies（登録商標））が、互いに融合されているか、または、重鎖定常ドメイン、Fc領域、またはその一部に融合されている別のタンパク質または担体分子に融合されている、ScFvベースおよびダイアボディベース、および重鎖抗体（例えば、ドメイン抗体、Nanobodies（登録商標））を含むが、これらに限定されない。
【０２６３】
相補的CH3ドメイン分子を含むIgG様分子の例としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：Triomab(登録商標)(Trion Pharma/Fresenius Biotech社, WO/2002/020039)、Knobs-into-Holes (Genentech社, WO9850431)、CrossMAb (Roche社, WO 2009/080251, WO 2009/080252, WO 2009/080253)、静電的に適合したFcヘテロ二量体分子(Amgen社, EP1870459およびWO2009089004; 中外, US201000155133; Oncomed社, WO2010129304)、LUZ-Y (Genentech社)、DIG-body、PIG-bodyおよびTIG-body (Pharmabcine社)、Strand Exchange Engineered Domain body (SEEDbody)(EMD Serono社, WO2007110205)、二重特異性IgG1およびIgG2 (Pfizer/Rinat社, W011143545)、Azymetric scaffold (Zymeworks/Merck社, WO2012058768)、mAb-Fv (Xencor社, WO2011028952)、XmAb (Xencor社)、二価二重特異性抗体(Roche社, WO2009/080254)、二重特異性IgG (Eli Lilly社)、DuoBody(登録商標)分子(Genmab A/S社, WO 2011/131746)、DuetMab (Medimmune社, US2014/0348839)、Biclonics (Merus社, WO 2013/157953)、Novlmmune社(κλBody, WO 2012/023053)、FcΔAdp (Regeneron社, WO 2010/151792)、(DT)-Ig (GSK/Domantis社)、Two-in-one抗体またはDual Action Fab (Genentech社, Adimab社)、mAb2 (F-Star社, WO2008003116)、Zybody(商標)(Zyngenia社)、CovX-body (CovX/Pfizer社)、FynomAb (Covagen/Janssen Cilag社)、DutaMab (Dutalys/Roche社)、iMab (Medimmune社)、二重可変ドメイン(DVD)-IgTM (Abbott社, US 7,612,18)、二重ドメイン二重ヘッド抗体(Unilever社; Sanofi Aventis社, WO20100226923)、Ts2Ab (Medimmune/AZ社)、BsAb (Zymogenetics社)、HERCULES (Biogen Idec社, US007951918)、scFv融合体(Genentech/Roche社, Novartis社, Immunomedics社, Changzhou Adam Biotech社, CN 102250246)、TvAb (Roche社, WO2012025525, WO2012025530)、ScFv/Fc融合体、SCORPION (Emergent BioSolutions/Trubion社, Zymogenetics/BMS社)、Interceptor (Emergent社)、Dual Affinity Retargeting Technology (Fc-DARTTM)(MacroGenics社, WO2008/157379, WO2010/080538)、BEAT (Glenmark社)、Di-Diabody (Imclone/Eli Lilly社)、ならびに化学的に架橋されたmAbs (Karmanos Cancer Center)および共有結合で融合されたmAbs (AIMM therapeutics社)。
【０２６４】
組み換えIgG様二重標的分子の例としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：Dual Targeting (DT)-Ig (GSK/Domantis社)、Two-in-one抗体(Genentech社)、架橋Mab (Karmanos Cancer Center)、mAb2 (F-Star社, WO2008003116)、Zybody(商標)(Zyngenia社)、共通の軽鎖を用いるアプローチ(Crucell/Merus社, US 7,262,028)、κλBody (Novlmmune社)およびCovX-body (CovX/Pfizer社)。
【０２６５】
IgG融合分子の例としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：二重可変ドメイン(DVD)-Ig(商標)(Abbott社, US 7,612,181)、二重ドメイン二重ヘッド抗体(Unilever社; Sanofi Aventis社, WO20100226923)、IgG様二重特異性(ImClone/Eli Lilly社)、Ts2Ab (MedImmune/AZ社)およびBsAb (Zymogenetics社)、HERCULES (Biogen Idec社, US 7,951,918)、scFv融合体(Novartis社)、scFv融合体(Changzhou Adam Biotech社, CN 102250246)およびTvAb (Roche社, WO2012025525, WO2012025530)。
【０２６６】
Fc融合分子の例としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：ScFv/Fc融合体(大学研究機関)、SCORPION (Emergent BioSolutions/Trubion社, Zymogenetics/BMS社)、Dual Affinity Retargeting Technology (Fc-DART(商標))(MacroGenics社, WO2008157379およびWO2010080538)および二重(ScFv)2-Fab (National Research Center for Antibody Medicine - 中国)。
【０２６７】
Fab融合二重特異性抗体の例としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：F(ab)2 (Medarex/AMGEN社)、Dual-ActionまたはBis-Fab (Genentech社)、Dock-and-Lock (登録商標) (DNL) (ImmunoMedics社)、二価二重特異性(Biotecnol社)およびFab-Fv (UCB-Celltech社)。
【０２６８】
ScFvベースの抗体、ダイアボディベースの抗体およびドメイン抗体の例としては、限定するものではないが、以下が挙げられる：二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE(登録商標))(Micromet社)、タンデムダイアボディ(Tandab(商標))(Affimed社)、Dual Affinity Retargeting Technology (DART) (MacroGenics社)、一本鎖ダイアボディ(大学)、TCR様抗体(AIT社, ReceptorLogics社)、ヒト血清アルブミンScFv融合体(Merrimack社)およびCOMBODY (Epigen Biotech社)、二重標的ナノボディ(dual targeting nanobodies(登録商標))(Ablynx)、二重標的重鎖のみのドメイン抗体。
【０２６９】
本発明によるADCとして使用するための二重特異性抗体は、その抗体の定常領域に改変を導入することによって作製することができる。
【０２７０】
特定の一態様において、二重特異性抗体は第1および第2の重鎖を含み、第1および第2の重鎖のそれぞれは少なくともヒンジ領域、CH2およびCH3領域を含み、ここで、第1の重鎖において、ヒトIgG1重鎖中のK409、T366、L368、K370、D399、F405およびY407からなる群より選択される位置に対応するアミノ酸のうちの少なくとも1つが置換されており、かつ第2の重鎖において、ヒトIgG1重鎖中のF405、T366、L368、K370、D399、Y407およびK409からなる群より選択される位置に対応するアミノ酸のうちの少なくとも1つが置換されており、第1および第2の重鎖は同じ位置で置換されない。
【０２７１】
一態様では、第1の重鎖において、ヒトIgG1重鎖のK409に対応する位置のアミノ酸はK、LまたはMではなく、かつ任意でヒトIgG1重鎖のF405に対応する位置のアミノ酸はFであり、第2の重鎖において、ヒトIgG1重鎖のF405に対応する位置のアミノ酸はFではなく、かつヒトIgG1重鎖のK409に対応する位置のアミノ酸はKである。
【０２７２】
一態様では、第1の重鎖において、ヒトIgG1重鎖のF405に対応する位置のアミノ酸はF、RまたはGではなく、第2の重鎖において、ヒトIgG1重鎖のT366、L368、K370、D399、Y407およびK409からなる群より選択される位置に対応するアミノ酸は置換されている。
【０２７３】
一態様では、ヒトIgG1重鎖のK409に対応する位置のアミノ酸は、第1の重鎖においてK、LまたはM以外であり、第2の重鎖において、ヒトIgG1重鎖のF405に対応する位置のアミノ酸はFではなく、かつ任意でヒトIgG1重鎖のK409に対応する位置のアミノ酸はKである。
【０２７４】
一態様では、ヒトIgG1重鎖のF405に対応する位置のアミノ酸は、第1の重鎖においてLであり、ヒトIgG1重鎖のK409に対応する位置のアミノ酸は、第2の重鎖においてRであり、またはその逆である。
【０２７５】
したがって、一態様では、ヒトIgG1重鎖のK409に対応する位置のアミノ酸は、第1の重鎖においてRであり、かつヒトIgG1重鎖のF405に対応する位置のアミノ酸は、第2の重鎖においてLである。
【０２７６】
別の方法で述べるかまたは文脈によって否定されない限り、定常領域配列のアミノ酸は、本明細書においてEuインデックスのナンバリング（Kabat, 1991に記載されている）にしたがって、ナンバリングされている。「Euインデックスのナンバリング」および「Kabatに示されているEuナンバリング」という用語は、互換的に使用され、同じ意味および目的を有し得る。したがって、別の配列におけるアミノ酸またはセグメントに「対応する」1つの配列におけるアミノ酸またはセグメントとは、ALIGN、ClustalW、または同様のものなどの標準的な配列アラインメントプログラムを用いて、典型的にはデフォルトの設定で他のアミノ酸またはセグメントと整列し、ヒトIgG1重鎖に対して少なくとも50％、少なくとも80％、少なくとも90％、または少なくとも95％の同一性を有するものである。配列または配列中のセグメントを整列させ、それにより、本発明によるアミノ酸位置に対応する配列中の位置を決定する方法は、当技術分野において周知である。
【０２７７】
本明細書において使用される「位置に対応するアミノ酸」という用語は、ヒトIgG1重鎖におけるアミノ酸位置番号を指す。
【０２７８】
「アミノ酸」および「アミノ酸残基」という用語は、本明細書において互換的に使用され得、限定するように理解されるべきではない。
【０２７９】
本発明の文脈において、アミノ酸は、保存的アミノ酸または非保存的アミノ酸によって定義され得、そのため、それに応じて分類され得る。アミノ酸残基はまた、代替の物理的および機能的特性によって定義されるクラスに分けられ得る。したがって、アミノ酸のクラスは、以下のリストのうちの一方または両方において反映され得る。
【０２８０】
保存的クラスのアミノ酸残基
2019509257.tif 000007
2019509257.tif 000008
【０２８１】
アミノ酸残基の代替の物理的および機能的分類
2019509257.tif 000009
【０２８２】
本発明の文脈において、抗体における置換は、以下のように示される：
元のアミノ酸-位置-置換されたアミノ酸。
【０２８３】
アミノ酸の十分に認識されている命名法に言及すると、3文字コードまたは1文字コードが使用され、任意のアミノ酸残基を示すコード「Xaa」または「X」を含む。したがって、XaaまたはXは、典型的に、20種の天然に存在するアミノ酸の任意を表し得る。本明細書において使用される「天然に存在する」という用語は、以下のアミノ酸残基；グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、トレオニン、リジン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、アスパラギン、グルタミン酸、グルタミン、プロリン、トリプトファン、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、およびシステインのいずれか1つを指す。それに応じて、「K409R」または「Lys409Arg」という表示法は、抗体が、アミノ酸位置409にリジンのアルギニンでの置換を含むことを意味する。
【０２８４】
所定の位置でのアミノ酸の任意の他のアミノ酸への置換は、以下のように言及される：
元のアミノ酸-位置；または例えば「K409」。
【０２８５】
元のアミノ酸および／または置換されたアミノ酸が、1つより多いが、すべてではないアミノ酸を含み得る改変について、1つより多いアミノ酸は、「,」または「/」によって分離され得る。例えば、位置409でのリジンのアルギニン、アラニン、またはフェニルアラニンでの置換は、以下である：
「Lys409Arg,Ala,Phe」または「Lys409Arg/Ala/Phe」または「K409R,A,F」または「K409R/A/F」または「K409をR、A、またはFへ」。
【０２８６】
そのような呼称は、本発明の文脈において互換的に使用され得るが、同じ意味および目的を有する。
【０２８７】
さらに、「置換」という用語は、任意の1種または残りの19種の天然アミノ酸への、または非天然アミノ酸などの他のアミノ酸への置換を包含する。例えば、位置409のアミノ酸Kの置換は、以下の置換：409A、409C、409D、409E、409F、409G、409H、409I、409L、409M、409N、409Q、409R、409S、409T、409V、409W、409P、および409Yの各々を含む。なお、これは、Xが元のアミノ酸以外の任意のアミノ酸を称する呼称409Xと同等である。これらの置換はまた、K409A、K409Cなど、またはK409A,C,など、またはK409A/C/などと称され得る。同じことが、類推により本明細書において述べられる各々のおよびあらゆる位置に、そのような置換のうちのいずれか1つを本明細書において具体的に含むようにあてはまる。
【０２８８】
本発明による抗体はまた、アミノ酸残基の欠失を含み得る。そのような欠失は、「del」と表示され得、例えば、K409delとの表記を含む。したがって、そのような態様において、位置409のリジンは、アミノ酸配列から欠失している。
【０２８９】
一態様において、二重特異性抗体の第1および第2の結合領域の両方が、AXLに結合する。しかし、第1の結合領域は、第2の結合領域とは異なるCDR配列のセットを含む。したがって、特定の態様において、二重特異性抗体は、第1および第2の結合領域、ならびに第1および第2の重鎖を含み、第1および第2の結合領域は、以下からなる群より選択されるVHおよびVL領域を各々含む；
（a）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [148]；
（b）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [733]；
（c）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:41、42、および43のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:44、AAS、およびSEQ ID NO:45のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [140]；
（d）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および55のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [154]；
（e）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および54のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [154-M103L]；
（f）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:57、58、および59のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [171]；
（g）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:62、63、および64のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:65、GAS、およびSEQ ID NO:66のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [172]；
（h）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:67、68、および69のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:70、GAS、およびSEQ ID NO:71のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [181]；
（i）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:72、73、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [183]；
（j）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:72、74、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [183-N52Q]；
（k）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:78、79、および80のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:81、AAS、およびSEQ ID NO:82のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [187]；
（l）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:83、84、および85のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:86、GAS、およびSEQ ID NO:87のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [608-01]；
（m）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:88、89、および90のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:91、GAS、およびSEQ ID NO:92のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [610-01]；
（n）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:94、95、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [613]；
（o）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:98、99、および100のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:101、DAS、およびSEQ ID NO:102のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [613-08]；
（p）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:103、104、および105のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:106、GAS、およびSEQ ID NO:107のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [620-06]；
（q）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および110のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [726]；
（r）それぞれ、SEQ ID NO:36、37、および38のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:39、GAS、およびSEQ ID NO:40のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [107]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および111のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [726-M101L]；
（s）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [733]；
（t）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:41、42、および43のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:44、AAS、およびSEQ ID NO:45のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [107]；
（u）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および55のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [154]；
（v）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:51、52、および54のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [154-M103L]；
（w）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:57、58、および59のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [171]；
（x）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:62、63、および64のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:65、GAS、およびSEQ ID NO:66のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [172]；
（y）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:67、68、および69のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:70、GAS、およびSEQ ID NO:71のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [181]；
（z）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:72、73、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [183]；
（aa）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:72、74、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [183-N52Q]；
（bb）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:78、79、および80のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:81、AAS、およびSEQ ID NO:82のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [187]；
（cc）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:83、84、および85のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:86、GAS、およびSEQ ID NO:87のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [608-01]；
（dd）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:88、89、および90のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:91、GAS、およびSEQ ID NO:92のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [610-01]；
（ee）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:94、95、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [613]；
（ff）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:98、99、および100のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:101、DAS、およびSEQ ID NO:102のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [613-08]；
（gg）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:103、104、および105のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:106、GAS、およびSEQ ID NO:107のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [620-06]；
（hh）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および110のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [726]；
（ii）それぞれ、SEQ ID NO:46、47、および48のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:49、AAS、およびSEQ ID NO:50のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [148]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:108、109、および111のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [726-M101L]；
（jj）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 41、42、および43のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:44、AAS、およびSEQ ID NO:45のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [140]；
（kk）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 51、52、および55のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [154]；
（ll）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 51、52、および54のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:55、GAS、およびSEQ ID NO:56のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [154-M103L]；
（mm）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 57、58、および59のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:60、GAS、およびSEQ ID NO:61のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [171]；
（nn）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 62、63、および64のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:65、GAS、およびSEQ ID NO:66のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [172]；
（oo）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 67、68、および69のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:70、GAS、およびSEQ ID NO:71のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [181]；
（pp）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 72、73、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [183]；
（qq）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 72、74、および75のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:76、ATS、およびSEQ ID NO:77のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [183-N52Q]；
（rr）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 78、79、および80のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:81、AAS、およびSEQ ID NO:82のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [187]；
（ss）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 83、84、および85のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:86、GAS、およびSEQ ID NO:87のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [608-01]；
（tt）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 88、89、および90のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:91、GAS、およびSEQ ID NO:92のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [610-01]；
（uu）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 94、95、および95のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:96、GAS、およびSEQ ID NO:97のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [613]；
（vv）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 98、99、および100のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:101、DAS、およびSEQ ID NO:102のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [613-08]；
（ww）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 103、104、および105のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:106、GAS、およびSEQ ID NO:107のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [620-06]；
（xx）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 108、109、および110のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [726]；ならびに
（yy）それぞれ、SEQ ID NO: 114、115、および116のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:117、DAS、およびSEQ ID NO:118のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第1のVL領域 [733]；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO: 108、109、および111のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVH領域；ならびに、それぞれ、SEQ ID NO:112、AAS、およびSEQ ID NO:113のCDR1、CDR2、およびCDR3配列を含む第2のVL領域 [726-M101L]。
【０２９０】
細胞傷害性薬剤、薬物などにコンジュゲートされた抗体は、抗体-薬物コンジュゲート（ADC）としても公知である。ADCは、抗体-薬物コンジュゲートが内部移行され、分解され、放出された毒素により細胞殺傷を誘導するのに十分な期間の半減期を有し得る。
【０２９１】
したがって、ADCは、抗AXL抗体または二重特異性抗体、および、細胞傷害性薬剤や化学療法薬などの治療部分を含む。細胞傷害性薬剤や化学療法薬などは、リンカーを介して抗体または二重特異性抗体にコンジュゲートされ得る。
【０２９２】
ADCはしばしば、細胞傷害性ペイロードが、抗体にコンジュゲートされている際には不活性であるように設計される。細胞傷害性ペイロードは、細胞の形質膜への結合後のADCの内部移行時に細胞内で、あるいは、腫瘍微小環境中のタンパク質分解活性に応答して、放出され得る。本明細書において使用される「内部移行される」または「内部移行」という用語は、AXL-ADCなどの分子が、細胞膜により包み込まれて、細胞の内部中に引き込まれる生物学的プロセスを指す。それはまた、「エンドサイトーシス」とも呼ばれ得る。
【０２９３】
したがって、いくつかの事例において、内部移行を受ける抗体を使用することが望ましい場合がある。良好な内部移行特性を有するそのような抗体は、任意で、細胞内で切断されるように設計されているリンカーを介した、細胞傷害性薬剤、薬物などへのコンジュゲーションに適していてもよい。
【０２９４】
ADCは、ひとたび内部移行すると、多くの場合リソソームへ送達され得、有効な薬物放出は、これらのオルガネラで見出される異化環境を利用する。抗体を細胞傷害性薬剤と接続するのは、典型的にはリンカーである。したがって、専門のリンカーが、標的腫瘍細胞中もしくは標的腫瘍細胞上、または腫瘍微小環境中に見出される特異的な微小環境においてのみ切断されるように設計されている。例は、酸性条件、還元条件、または特異的なプロテアーゼによって切断されるリンカーを含む。
【０２９５】
循環における抗体-リンカー-薬物の安定性は、これにより特異的な標的細胞への薬物の抗体媒介性送達が可能になるため、重要である。加えて、ADCの長い循環半減期により、注射後数日間から数週間の曝露が提供される。切断不可能なリンカーおよびプロテアーゼで切断可能なリンカーを通してコンジュゲートされている薬物は、ジスルフィドリンカーおよびヒドラゾンリンカーよりも、循環において概してより安定であるが、後者の2つのリンカーの安定性は、近隣の化学構造の変更によって調整することができる（Alley et al., 2010）。
【０２９６】
一態様において、治療部分は細胞傷害性薬剤である。細胞毒素または細胞傷害性薬剤は、細胞に対して有害である（例えば、殺傷する）任意の作用物質を含む。本発明において用いるためのADCを形成するのに適している細胞傷害性薬剤は、taxol、ツブリシン、デュオスタチン（duostatin）、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド（tenoposide）、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン（dihydroxy anthracin dione）、メイタンシンまたはその類似体もしくは誘導体、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1-デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、およびピューロマイシン；カリケアマイシンまたはその類似体もしくは誘導体；抗代謝剤（メトトレキサート、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、シタラビン、フルダラビン、5-フルオロウラシル、ダカルバジン（decarbazine）、ヒドロキシ尿素、アスパラギナーゼ、ゲムシタビン、クラドリビンなど）、アルキル化剤（メクロレタミン、チオテパ（thioepa）、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（BSNU）、ロムスチン（CCNU）、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、ダカルバジン（DTIC）、プロカルバジン、マイトマイシンC、シスプラチン、およびカルボプラチンなどの他の白金誘導体；ならびにデュオカルマイシンA、デュオカルマイシンSA、CC-1065（ラシェルマイシンとしても公知である）、またはCC-1065の類似体もしくは誘導体など）、ドラスタチン、アウリスタチン、ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン（PDB）、インドリノベンゾジアゼピン（IGN）またはその類似体、抗生物質（ダクチノマイシン（以前はアクチノマイシン）、ブレオマイシン、ダウノルビシン（以前はダウノマイシン）、ドキソルビシン、イダルビシン、ミトラマイシン、マイトマイシン、ミトキサントロン、プリカマイシン、アントラマイシン（AMC）など）、抗有糸分裂作用物質（例えば、チューブリンを標的とする薬剤）、例えば、ジフテリア毒素および関連分子（ジフテリアA鎖およびその活性断片およびハイブリッド分子など）；リシン毒素（リシンAまたは脱グリコシル化リシンA鎖毒素）、コレラ毒素、志賀様毒素（SLT-I、SLT-II、SLT-IIV）、LT毒素、C3毒素、志賀毒素、百日咳毒素、破傷風毒素、大豆ボーマン・バークプロテアーゼ阻害剤、緑膿菌（Pseudomonas）外毒素、アロリン、サポリン、モデシン、ゲラニン（gelanin）、アブリンA鎖、モデシンA鎖、α-サルシン、シナアブラギリ（Aleurites fordii）タンパク質、ジアンチンタンパク質、ヨウシュヤマゴボウ（Phytolacca americana）タンパク質（PAPI、PAPII、およびPAP-S）、ニガウリ（momordica charantia）阻害剤、クルシン、クロチン、サボンソウ（sapaonaria officinalis）阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン（mitogellin）、レストリクトシン、フェノマイシン（phenomycin）、およびエノマイシン毒素を含む。他の適しているコンジュゲート分子は、CLIP、マガイニン2、メリチン、セクロピン、およびP18などの抗微生物／溶菌ペプチド；リボヌクレアーゼ（RNアーゼ）、DNアーゼI、ブドウ球菌腸毒素-A、ヨウシュヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、ジフテリア毒素、および緑膿菌内毒素を含む。例えば、Pastan et al., Cell 47, 641 (1986)およびGoldenberg, Calif. A Cancer Journal for Clinicians 44, 43 (1994)を参照されたい。例えば抗癌サイトカインまたはケモカインなどの、本明細書において別の場所に記載されるような、本発明にしたがって使用するための抗AXL抗体または抗体-薬物コンジュゲートと組み合わせて投与され得る治療用作用物質もまた、本発明にしたがって使用するための抗体へのコンジュゲーションに有用な治療部分のための候補である。
【０２９７】
本明細書において使用される「細胞傷害性薬剤」という用語は、細胞に対して有害である（例えば、殺傷する）任意の作用物質を指す。当技術分野において周知であるこれらのクラスの薬物、およびそれらの作用機構の説明のためには、Goodman et al. (1990)を参照されたい。抗体免疫毒素の調製に関連する追加の技術は、例としてVitetta et al. (1993)およびUS 5,194,594に提供されている。
【０２９８】
一態様において、細胞傷害性薬剤は、N-スクシンイミジル4-(2-ピリジルジチオ)-ペンタノアート（SSP）、マレイミドカプロイル-バリン-シトルリン-p-アミノベンジルオキシカルボニル（mc-vc-PAB）、またはAV-1 K-lockバリン-シトルリンなどの切断可能なリンカーで、前記抗体またはその断片に連結されている。
【０２９９】
本明細書において使用される「切断可能なリンカー」という用語は、標的とされる細胞または腫瘍微小環境において特異的なプロテアーゼによって触媒され、細胞傷害性薬剤の放出を結果としてもたらす、リンカーのサブセットを指す。切断可能なリンカーの例は、ジスルフィド、ヒドラゾン、またはペプチドを含む化学モチーフに基づくリンカーである。切断可能なリンカーの別のサブセットは、細胞傷害性薬剤と主要リンカーとの間、すなわち、リンカー-薬物の組み合わせを抗体に付着させる部位に、余分のリンカーモチーフが加わる。いくつかの態様において、余分のリンカーモチーフは、細胞内環境中（例えば、リソソームまたはエンドソームまたは小胞内）に存在する切断可能な作用物質によって切断可能である。リンカーは、例えば、リソソームまたはエンドソームのプロテアーゼを含むがこれらに限定されない、細胞内ペプチダーゼまたはプロテアーゼ酵素によって切断されるペプチジルリンカーであることができる。いくつかの態様において、ペプチジルリンカーは、少なくとも2アミノ酸長または少なくとも3アミノ酸長である。切断作用物質は、カテプシンBおよびD、ならびにプラスミンを含むことができ、これらのすべては、ジペプチド薬物誘導体を加水分解して、標的細胞の内側で活性薬物の放出を結果としてもたらすことが公知である（例えば、Dubowchik and Walker, 1999, Pharm. Therapeutics 83:67-123を参照されたい）。具体的な態様において、細胞内プロテアーゼによって切断可能なペプチジルリンカーは、Val-Cit（バリン-シトルリン）リンカーまたはPhe-Lys（フェニルアラニン-リジン）リンカーである（Val-Citリンカーを有するドキソルビシンの合成を記載している米国特許第6214345号を参照されたい）。治療用作用物質の細胞内タンパク質分解性放出を用いる利点は、作用物質が、コンジュゲートされている際には典型的に減衰されており、コンジュゲートの血清安定性が、典型的に高いことである。
【０３００】
別の態様において、細胞傷害性薬剤は、スクシンイミジル-4(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシラート（MCC）またはマレイミドカプロイル（MC）などの切断不可能なリンカーで、前記抗体またはその断片に連結されている。
【０３０１】
本明細書において使用される「切断不可能なリンカー」という用語は、切断可能なリンカーとは対照的に、細胞内または細胞外のプロテアーゼによって特異的にかつ予想通りに認識されるモチーフを含まない、リンカーのサブセットを指す。したがって、切断不可能なリンカーに基づくADCは、完全な抗体-リンカー-薬物複合体がリソソーム区画において分解されるまで、抗体から放出または切断されない。切断不可能なリンカーの例は、チオエーテルである。さらに別の態様において、リンカー単位は切断可能ではなく、薬物は抗体分解によって放出される（US 2005/0238649を参照されたい）。典型的に、そのようなリンカーは、細胞外環境に対して実質的に感受性がない。本明細書において使用される際、リンカーの文脈における「細胞外環境に対して実質的に感受性がない」とは、抗体薬物コンジュゲート化合物の試料において、リンカーの20％以下、典型的には約15％以下、より典型的には約10％以下、およびさらにより典型的には約5％以下、約3％以下、または約1％以下が、抗体薬物コンジュゲート化合物が細胞外環境（例えば、血漿）中に存在する際に切断されることを意味する。リンカーが細胞外環境に対して実質的に感受性がないかどうかは、例えば、抗体薬物コンジュゲート化合物をあらかじめ設定された時間（例えば、2、4、8、16、または24時間）、血漿とインキュベートし、次いで、血漿中に存在する遊離の薬物の量を定量することによって判定することができる。
【０３０２】
一態様において、細胞傷害性薬剤は、DNAを標的とする薬剤、例えば、カリケアマイシン、デュオカルマイシン、ラシェルマイシン（CC-1065）、ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン（PBD）、およびインドリノベンゾジアゼピン（IGN）などのDNAアルキル化剤および架橋剤；微小管を標的とする薬剤、例えばデュオスタチン、例えばデュオスタチン-3、アウリスタチン、例えばモノメチルアウリスタチンE（MMAE）およびモノメチルアウリスタチンF（MMAF）、ドラスタチン、メイタンシン、N(2')-デアセチル-N(2')-(3-マルカプト-1-オキソプロピル)-メイタンシン（DM1）、およびツブリシン；ならびにヌクレオシド類似体；またはそれらの類似体、誘導体、もしくはプロドラッグの群から選択される。
【０３０３】
一態様において、AXL-ADCは、以下の組み合わせを含む；
i）バイスタンダー殺傷能力を有する、切断可能なリンカーおよび細胞傷害性薬剤；
ii）バイスタンダー殺傷能力を有さない、切断可能なリンカーおよび細胞傷害性薬剤；
iii）バイスタンダー殺傷能力を有する、切断不可能なリンカーおよび細胞傷害性薬剤；または
iv）バイスタンダー殺傷能力を有さない、切断不可能なリンカーおよび細胞傷害性薬剤。
【０３０４】
本明細書において使用される「バイスタンダー殺傷効果」、「バイスタンダー殺傷」、「バイスタンダー殺傷能力」、または「バイスタンダー細胞傷害」という用語は、切断可能なリンカーまたは切断不可能なリンカーのいずれかにより抗体にコンジュゲートされている細胞傷害性薬剤が、抗体からの放出後に細胞膜を横切って拡散する能力を有し、それにより近隣細胞の殺傷を引き起こす効果を指す。細胞傷害性薬剤が切断可能なリンカーまたは切断不可能なリンカーによりコンジュゲートされている場合、バイスタンダー殺傷能力を有するのは、細胞傷害性薬剤のみまたはリンカーの一部を有する細胞傷害性薬剤のいずれかであり得る。細胞膜を横切って拡散する能力は、細胞傷害性薬剤または細胞傷害性薬剤とリンカーとの組み合わせの疎水性に関連する。そのような細胞傷害性薬剤は、有利には、プロテアーゼにより抗体から放出されているMMAEなどの膜透過性毒素であり得る。特に、不均質な標的発現を有する腫瘍および抗体浸透が限定され得る固形腫瘍において、バイスタンダー殺傷効果が望ましい場合がある。
【０３０５】
本明細書において使用される「非バイスタンダー殺傷能力」、「非バイスタンダー殺傷効果」、「非バイスタンダー殺傷」、または「非バイスタンダー細胞傷害」という用語は、切断可能なリンカーまたは切断不可能なリンカーのいずれかにより抗体にコンジュゲートされている細胞傷害性薬剤が、抗体からの放出後に細胞膜を横切って拡散する能力を有さない効果を指す。したがって、そのような細胞傷害性薬剤または細胞傷害性薬剤とリンカーとの組み合わせは、抗体からの放出時に近隣細胞を殺傷することができないことになる。理論により縛られることなく、細胞傷害性薬剤と切断可能なリンカーまたは切断不可能なリンカーのいずれかとのそのような組み合わせは、抗体が結合する標的を発現する細胞のみを殺傷することになると確信される。
【０３０６】
抗体と細胞傷害性薬剤との間の安定な連結は、ADCの重要な要因である。切断可能なタイプおよび切断不可能なタイプの両方のリンカーが、前臨床試験および臨床試験において安全であることが判明している。
【０３０７】
一態様において、細胞傷害性薬剤は、アウリスタチンおよびメイタンシノイドなどの微小管を標的とする薬剤の群から選択される。
【０３０８】
本明細書において使用される「微小管を標的とする薬剤」という用語は、有糸分裂（細胞分裂）を阻害する作用物質または薬物を指す。微小管は、細胞分裂中のDNAの妥当な分離に不可欠な構造であり、微小管機能は、「動的不安定性」、すなわち微小管構造が連続的に伸長および短縮するプロセスに決定的に依存する。微小管を標的とする薬剤は、微小管を破壊または安定化して、有糸分裂紡錘体の形成を阻止し、有糸分裂の停止およびアポトーシスを結果としてもたらす。微小管を標的とする薬剤は、例えば、植物アルカロイドなどの天然物質に由来することができ、微小管の重合を破壊または安定化し、かくして有糸分裂紡錘体の形成およびその後の細胞分裂を阻止することによって細胞が有糸分裂を経験するのを阻止し、癌性増殖の阻害を結果としてもたらす。微小管を標的とする薬剤の例は、パクリタキセル、ドセタキセル、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、デュオスタチン、アウリスタチン、メイタンシノイド、ツブリシン、およびドラスタチンである。
【０３０９】
一態様において、細胞傷害性薬剤は、アウリスタチンまたはアウリスタチンペプチド類似体および誘導体である（US 5,635,483；US 5,780,588）。アウリスタチンは、微小管動態、GTP加水分解、ならびに核分裂および細胞分裂を干渉し（Woyke et al., 2001）、抗癌活性（US 5,663,149）および抗真菌活性（Pettit, 1998）を有することが示されている。アウリスタチン薬物部分は、ペプチド薬物部分のN（アミノ）末端またはC（末端）を通して、リンカーを介して抗体に付着され得る。
【０３１０】
例示的なアウリスタチン態様は、Senter et al. (2004)に開示され、US 2005/0238649に記載されている、N末端連結モノメチルアウリスタチン薬物部分DEおよびDFを含む。
【０３１１】
特定の態様において、細胞傷害性薬剤は、モノメチルアウリスタチンE（MMAE）；
2019509257.tif 000010
であり、抗体は、適切なリンカーにより上記の化学構造の左側の窒素（N）でMMAEに連結されている。
【０３１２】
一態様において、細胞傷害性薬剤モノメチルアウリスタチンE（MMAE）は、バリン-シトルリン（VC）リンカーを介して抗体に連結されている。
【０３１３】
別の態様において、細胞傷害性薬剤モノメチルアウリスタチンE（MMAE）は、バリン-シトルリン（VC）リンカーおよびマレイミドカプロイル（MC）リンカーを介して抗体に連結されており、細胞傷害性薬剤とリンカーとの組み合わせは、化学構造；
2019509257.tif 000011
を有し、式中、MAbは抗体である。
【０３１４】
一態様において、細胞傷害性薬剤は、モノメチルアウリスタチンF（MMAF）；
2019509257.tif 000012
であり、抗体は、適切なリンカーにより上記の化学構造の左側の窒素（N）でMMAFに連結されている。
【０３１５】
一態様において、細胞傷害性薬剤モノメチルアウリスタチンF（MMAF）は、マレイミドカプロイル（mc）リンカーを介して抗体に連結されており、細胞傷害性薬剤とリンカーとの組み合わせは、化学構造；
2019509257.tif 000013
を有し、式中、MAbは抗体である。
【０３１６】
一態様において、細胞傷害性薬剤はデュオスタチン3である。
【０３１７】
別の特定の態様において、細胞傷害性薬剤はDNAを標的とする薬剤である。
【０３１８】
本明細書において使用される「DNAを標的とする薬剤」という用語は、DNAをアルキル化および／または架橋することができる特定のクラスの細胞傷害性薬剤を指す。そのようなDNA作用剤の例は、DNAをアルキル化および架橋するそれらの能力のおかげで非常に強力である、インドリノ-ベンゾジアゼピン二量体およびピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン（PBD）を含むIGN剤である。別の例は、DNAをアルキル化のみする能力のおかげで非常に強力である、インドリノ-ベンゾジアセピン単量体を含むIGN剤である。デュオカルマイシンは、別のクラスのDNA作用剤である。デュオカルマイシンは、低分子の合成DNA副溝結合アルキル化剤である。これらの化合物は、固形腫瘍および血液腫瘍を標的とするのに適している。
【０３１９】
一態様において、AXL-ADCは、抗体あたり2〜4個の細胞傷害性分子を含む。毒素およびリンカー-毒素の組み合わせの化学的特性に応じて、抗体あたり2〜4個の細胞傷害性薬剤は、より少量が負荷されているコンジュゲートよりも循環からより急速に浄化される、より多量に負荷されたコンジュゲートよりも優れている場合がある。細胞傷害性薬剤の負荷は、pにより表され、分子における抗体あたりの細胞傷害性薬剤部分の平均数（薬物対抗体の比、DARとも称される）である。細胞傷害性薬剤の負荷は、抗体あたり1〜20個の薬物部分の範囲にわたり得、リジンまたはシステイン中のような、アミノ基またはスルフヒドリル基などであるがこれらに限定されない、有用な官能基を有するアミノ酸上で起こり得る。
【０３２０】
一態様において、抗体あたりの細胞傷害性薬剤の数は、1〜8個、例えば2〜7個、例えば2〜6個、例えば2〜5個、例えば2〜4個、および例えば2〜3個である。
【０３２１】
別の態様において、AXL-ADCは、抗体あたり4〜8個の細胞傷害性分子を含む。別の態様において、AXL-ADCは、抗体あたり6〜10個の細胞傷害性分子を含む。さらに別の態様において、AXL-ADCは、抗体あたり10〜30個、例えば15〜25個、例えば20個の細胞傷害性分子を含む。
【０３２２】
コンジュゲーションの方法に応じて、pは、抗体上の付着部位の数によって限定され得、例えば、付着はシステインチオールまたはリジンである。概して、抗体は、薬物部分に連結され得る多くの遊離かつ反応性のシステインチオール基を含有しておらず、なぜなら、抗体中のたいていのシステインチオール残基は、ジスルフィド架橋として存在するからである。そのため、細胞傷害性薬剤がシステインチオールを介してコンジュゲートされているそれらの態様において、抗体は、反応性のシステインチオール基を生成するために、部分的または完全な還元条件下で、ジチオスレイトール（DTT）またはトリカルボニルエチルホスフィン（TCEP）などの還元剤で還元され得る。ある特定の態様において、最大で8個の遊離システインチオール基が、抗体の（部分的）還元後に利用可能になる（鎖間ジスルフィド結合に関与する8個のシステインが存在する）ため、本発明のADCについての薬物負荷は、1〜約8個の範囲にわたる。
【０３２３】
一態様において、薬物リンカー部分はvcMMAEである。vcMMAE薬物リンカー部分およびコンジュゲーション法は、WO 2004/010957；US 7,659,241；US 7,829,531；およびUS 7,851,437（Seattle Genetics；それぞれ参照により本明細書に組み入れられる）に開示されており、vcMMAEは、リンカーmc-vc-PABと細胞傷害性部分MMAEとのコンジュゲーションによって形成され、vcMMAE薬物リンカー部分は、それらにおいて開示されているものと同様の方法（例えば、実施例8に記載されている方法）を用いて、システイン残基で抗AXL抗体に結合されている。
【０３２４】
一態様において、薬物リンカー部分はmcMMAFである。mcMMAF薬物リンカー部分およびコンジュゲーション法は、US 7,498,298；US 11/833,954；およびWO 2005/081711（Seattle Genetics；それぞれ参照により本明細書に組み入れられる）に開示されており、mcMMAF薬物リンカー部分は、その中に開示されているものと同様の方法を用いて、システイン残基で抗AXL抗体に結合されている。
【０３２５】
一態様において、細胞傷害性薬剤は、WO 2013/173391、WO 2013/173392、およびWO 2013/173393（Concortis Biosystems）に記載されているように、K-Lock（商標）コンジュゲーションによって抗体アミノ酸配列内の1または2個のリジンに連結されている。デュオスタチン3（Duo3としても公知である）もまた、その中に記載されているものと同様の方法を用いて、リジン残基で抗AXL抗体に結合されていてもよい。
【０３２６】
ヒドロキシル基を含むリンカーなどの他のリンカー技術が、本発明の使用のための抗AXL抗体薬物コンジュゲートにおいて使用され得る。
【０３２７】
一態様において、リンカーは、抗AXL抗体の（部分的）還元によって取得される抗AXL抗体の遊離システイン残基に付着される。
【０３２８】
特定の態様において、リンカーはmc-vc-PABであり、細胞傷害性薬剤はMMAEであるか；またはリンカーはSSPであり、細胞傷害性薬剤はDM1である。
【０３２９】
特定の態様において、リンカーはMMCであり、細胞傷害性薬剤はDM1であるか；またはリンカーはMCであり、細胞傷害性薬剤はMMAFである。
【０３３０】
特定の態様において、リンカーは切断可能なリンカーAV1-K lockであり、細胞傷害性薬剤はデュオスタチン3である。
【０３３１】
一態様において、AXL-ADCは、リンカーmc-vc-PAB、細胞傷害性薬剤MMAE、ならびに、少なくとも1つの結合領域が、以下からなる群より選択されるVH領域およびVL領域を含む抗体を含む。
【０３３２】
一態様において、前記抗体は、以下からなる群より選択されるVH領域とVL領域を含む少なくとも1つの結合領域を含む：
(a) それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[107]；
(b) それぞれSEQ ID No:46、47および48のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:49、AAS、およびSEQ ID No:50のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[148]；
c) それぞれSEQ ID No:114、115および116のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:117、DAS、およびSEQ ID No:118のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[733]；
(d) それぞれSEQ ID No:51、52および53のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:55、GAS、およびSEQ ID No:56のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[154]；
(e) それぞれSEQ ID No:51、52および54のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:55、GAS、およびSEQ ID No:56のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[154-M103L]；
(f) それぞれSEQ ID No:57、58および59のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:60、GAS、およびSEQ ID No:61のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[171]；
(g) それぞれSEQ ID No:62、63および64のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:65、GAS、およびSEQ ID No:66のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[172]；
(h) それぞれSEQ ID No:67、68および69のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:70、GAS、およびSEQ ID No:71のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[181]；
(i) それぞれSEQ ID No:72、73および75のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:76、ATS、およびSEQ ID No:77のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[183]；
(j) それぞれSEQ ID No:72、74および75のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:76、ATS、およびSEQ ID No:77のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[183-N52Q]；
(k) それぞれSEQ ID No:78、79および80のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:81、AAS、およびSEQ ID No:82のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[187]；
(l) それぞれSEQ ID No:83、84および85のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:86、GAS、およびSEQ ID No:87のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[608-01]；
(m) それぞれSEQ ID No:88、89および90のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:91、GAS、およびSEQ ID No:92のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[610-01]；
(n) それぞれSEQ ID No:93、94および95のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:96、GAS、およびSEQ ID No:97のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[613]；
(o) それぞれSEQ ID No:98、99および100のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:101、DAS、およびSEQ ID No:102のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[613-08]；
(p) それぞれSEQ ID No:103、104および105のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:106、GAS、およびSEQ ID No:107のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[620-06]；
(q) それぞれSEQ ID No:108、109および110のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:112、AAS、およびSEQ ID No:113のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[726]；
(r) それぞれSEQ ID No:108、109および111のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:112、AAS、およびSEQ ID No:113のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[726-M101L]；
(s) それぞれSEQ ID No:41、42および43のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:44、AAS、およびSEQ ID No:45のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[140]；
(t) それぞれSEQ ID No:93、94および95のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:128、XAS（配列中、XはDまたはGである）、およびSEQ ID No:129のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[613/613-08]；
(u) それぞれSEQ ID No:46、119および120のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:49、AAS、およびSEQ ID No:50のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[148/140]；
(v) それぞれSEQ ID No:123、124および125のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:60、GAS、およびSEQ ID No:61のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[171/172/181]；
(w) それぞれSEQ ID No:121、109および122のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:112、AAS、およびSEQ ID No:113のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[726/187]；ならびに
(x) それぞれSEQ ID No:93、126および127のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域；ならびに、それぞれSEQ ID No:96、GAS、およびSEQ ID No:97のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域[613/608-01/610-01/620-06]。
【０３３３】
別の代替的な態様において、抗AXL抗体-薬物コンジュゲートは、コンジュゲートされた核酸または核酸関連分子を含む。このような態様では、コンジュゲートされた核酸は、細胞傷害性リボヌクレアーゼ、アンチセンス核酸、阻害性RNA分子(例えば、siRNA分子)、または免疫刺激性核酸(例えば、免疫刺激性CpGモチーフ含有DNA分子)である。
【０３３４】
別の代替的態様において、抗AXL抗体は、アプタマーもしくはリボザイム、またはその機能的ペプチド類似体もしくは誘導体にコンジュゲートされる。
【０３３５】
別の代替的態様においては、1つ以上の放射性標識アミノ酸を含む抗AXL抗体-薬物コンジュゲートが提供される。放射性標識された抗AXL抗体は、診断目的および治療目的の両方に使用することができる(放射性標識分子へのコンジュゲーションは考えられる別の特徴である)。ポリペプチド用の標識の非限定的な例には、3H、14C、15N、35S、90Y、99Tc、125I、131I、および186Reが含まれる。放射性標識されたアミノ酸および関連するペプチド誘導体を調製するための方法は、当技術分野で公知である(例えば、Junghans et al. (1996); US 4,681,581; US 4,735,210; US 5,101,827; US 5,102,990; US 5,648,471; およびUS 5,697,902を参照されたい)。例えば、ハロゲン放射性同位体は、クロラミンT法によってコンジュゲートすることができる。
【０３３６】
一態様において、該抗体は、放射性同位体または放射性同位体含有キレートにコンジュゲートされる。例えば、該抗体をキレート剤リンカー、例えばDOTA、DTPAまたはチウキセタン(tiuxetan)にコンジュゲートすることができ、該リンカーは、該抗体が放射性同位体と複合体形成することを可能にする。該抗体は、1つ以上の放射性標識アミノ酸または他の放射性標識分子を追加的にまたは代替的に含むか、それらにコンジュゲートされ得る。放射性標識された抗AXL抗体は、診断目的と治療目的の両方に使用することができる。放射性同位体の非限定的な例としては、3H、14C、15N、35S、90Y、99Tc、125I、111In、131I、186Re、213Bs、225Acおよび227Thが挙げられる。
【０３３７】
抗AXL抗体はまた、例えばその循環半減期を増加させるために、ポリマーへの共有結合によって化学修飾することができる。例示的なポリマーおよびそれらをペプチドに結合させる方法は、例えば、US 4,766,106; US 4,179,337; US 4,495,285およびUS 4,609,546に説明されている。さらなるポリマーには、ポリオキシエチル化ポリオールおよびポリエチレングリコール(PEG)(例えば、約1,000〜約40,000、例えば約2,000〜約20,000の分子量を有するPEG)が含まれる。これは、例えば、抗AXL抗体がフラグメントである場合に使用することができる。
【０３３８】
上記のようなコンジュゲートされる分子に抗AXL抗体をコンジュゲートするための当技術分野で公知の方法は、例えば、Hunter et al. (1974)、Pain et al. (1981)およびNygren (1982)に記載される方法を含めて、どれも使用することができる。このような抗体は、抗AXL抗体(例えば、抗AXL抗体のH鎖またはL鎖)のN末端側またはC末端側に他の成分を化学的にコンジュゲートすることによって作製され得る(例えば、Kanemitsu, 1994を参照されたい)。このようなコンジュゲートされた抗体誘導体はまた、内部残基もしくは糖でのコンジュゲーションによって、または必要に応じて抗体定常ドメインに導入された非天然アミノ酸もしくは追加のアミノ酸でのコンジュゲーションによっても作製され得る。
【０３３９】
これらの物質は、抗AXL抗体に直接または間接的にカップリングすることができる。第2の物質の間接的カップリングの一例は、スペーサー部分を介した抗体中のシステインまたはリシン残基へのカップリングである。一態様では、抗AXL抗体は、インビボで治療薬物に活性化され得るプロドラッグ分子に、スペーサーまたはリンカーを介して、コンジュゲートされる。投与後、該スペーサーまたはリンカーは、腫瘍細胞関連酵素または他の腫瘍特異的状態によって切断され、それにより活性薬物が形成される。そのようなプロドラッグ技術およびリンカーの例は、WO 2002/083180、WO 2004/043493、WO 2007/018431、WO 2007/089149、WO 2009/017394およびWO 2010/62171 (Syngenta BV社；これらの各々は参照により本明細書に組み入れられる)に記載されている。適切な抗体-プロドラッグ技術およびデュオカルマイシン類似体はまた、US 6,989,452 (Medarex社；参照により本明細書に組み入れられる)に見ることができる。
【０３４０】
一態様において、抗AXL抗体は、該抗体が放射性同位体とコンジュゲートすることを可能にする、キレート剤リンカー、例えばチウキセタンに結合される。
【０３４１】
一局面において、本発明は、BRAF阻害剤、MEK阻害剤、またはBRAF阻害剤とMEK阻害剤の組み合わせと組み合わせて対象のメラノーマの治療に使用するための、ヒトAXLに結合する抗体を含むADCに関し、ここで、該ADCは、MMAEにmc-vc-PABリンカーを介して連結された、それぞれSEQ ID No:36、37および38のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVH領域と、それぞれSEQ ID No:39、GAS、およびSEQ ID No:40のCDR1、CDR2およびCDR3配列を含むVL領域とを含む[107]、少なくとも1つの結合領域を含む抗体を含む；該AXL-ADCと少なくとも1種の阻害剤は、同時に、別々に、または逐次的に投与される。
【０３４２】
一態様において、該少なくとも1つの結合領域は、SEQ ID NO:1を含むVH領域およびSEQ ID NO:2を含むVL領域を含む。任意で、該抗体のアイソタイプは、IgG1、例えばアロタイプIgG1m(f)である。該抗体は完全長モノクローナル抗体、例えば完全長モノクローナルIgG1,κ抗体であり得る。
【０３４３】
一態様において、BRAF阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブおよびソラフェニブからなる群より選択され、メラノーマは、V600、L597およびK601から選択されるBRAF残基に変異を示し、例えば、V600E、V600K、V600D、L597RおよびK601Eから選択されるBRAFにおける変異を示す。一態様では、BRAF阻害剤はベムラフェニブである。一態様では、BRAF阻害剤はダブラフェニブである。一態様では、BRAF阻害剤はエンコラフェニブである。一態様では、BRAF阻害剤はソラフェニブである。
【０３４４】
一態様において、メラノーマは、NRASに変異を示し、例えば、Q61、G12およびG13から選択されるNRAS残基に、例えば、Q61R、Q61K、Q61L、G12D、G12S、G12C、G12V、G13DおよびG13Rから選択されるNRASにおける変異を示す。
【０３４５】
一態様において、MEK阻害剤は、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブおよびセルメチニブからなる群より選択される。一態様では、MEK阻害剤はトラメチニブである。一態様では、MEK阻害剤はコビメチニブである。一態様では、MEK阻害剤はビニメチニブである。一態様では、MEK阻害剤はセルメチニブである。
【０３４６】
一態様において、AXL-ADCは、以下の(a)〜(p)から選択されるBRAF阻害剤およびMEK阻害剤と組み合わせて使用される：
(a) ベムラフェニブおよびトラメチニブ；
(b) ベムラフェニブおよびコビメチニブ；
(c) ベムラフェニブおよびビニメチニブ；
(d) ベムラフェニブおよびセルメチニブ；
(e) ダブラフェニブおよびトラメチニブ；
(f) ダブラフェニブおよびコビメチニブ；
(g) ダブラフェニブおよびビニメチニブ；
(h) ダブラフェニブおよびセルメチニブ；
(i) エンコラフェニブおよびトラメチニブ；
(j) エンコラフェニブおよびコビメチニブ；
(k) エンコラフェニブおよびビニメチニブ；
(l) エンコラフェニブおよびセルメチニブ；
(m) ソラフェニブおよびトラメチニブ；
(n) ソラフェニブおよびコビメチニブ；
(o) ソラフェニブおよびビニメチニブ；および
(p) ソラフェニブおよびセルメチニブ。
【０３４７】
組成物およびキット
本発明に従って使用されるAXL-ADCは、組成物の形態で投与することができる。一局面において、該組成物は、AXL-ADCおよび薬学的担体を含む薬学的組成物である。
【０３４８】
一態様において、AXL-ADCまたはAXL-ADCを含む薬学的組成物は、前述の局面または態様のいずれかに従って、少なくとも1種のMAPK経路阻害剤、例えば少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、と組み合わせてメラノーマの治療に使用するためのものである。典型的には、該組み合わせのAXL-ADCと阻害剤は、別々に投与され、別個の薬学的組成物として製剤化される。
【０３４９】
しかし、一態様において、AXL-ADCを含む薬学的組成物は、新生物が治療されているかまたは治療されたことがある少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤、例えばBRAF阻害剤、MEK阻害剤またはその組み合わせをさらに含む。少なくとも1種のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤と組み合わせて本発明に従って使用するためのAXL-ADCは、同時に、別々に、または逐次的に投与するためのキットの形態で提供することもでき、該キットは使用説明書をさらに含み得る。
【０３５０】
一態様において、前記組み合わせ、組成物またはキット中のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、PLX4720、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、VTX11EおよびLTT-4620から選択される。
【０３５１】
一態様において、前記組み合わせ、組成物またはキット中のBRAF阻害剤は、ベムラフェニブまたはその治療上有効な類似体もしくは誘導体、例えば、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブまたはPLX4720である。一態様では、BRAF阻害剤はベムラフェニブである。一態様では、BRAF阻害剤はダブラフェニブである。一態様では、BRAF阻害剤はエンコラフェニブである。一態様では、BRAF阻害剤はソラフェニブである。
【０３５２】
一態様において、前記組み合わせ、組成物またはキット中のセリン/トレオニンキナーゼ阻害剤は、少なくとも1種のBRAF阻害剤および少なくとも1種のMEK阻害剤を含み、ここで、該少なくとも1種のBRAF阻害剤は、ベムラフェニブ、ダブラフェニブおよびそれらの組み合わせから選択され、MEK阻害剤は、セルメチニブ(AZD6244)、トラメチニブおよびそれらの組み合わせから選択される。例えば、該組み合わせ、組成物またはキットは、ダブラフェニブおよびトラメチニブ；ベムラフェニブおよびトラメチニブ；ダブラフェニブ、ベムラフェニブおよびトラメチニブ；ダブラフェニブおよびセルメチニブ；またはベムラフェニブおよびセルメチニブを含み得る。あるいは、該組み合わせ、組成物またはキットは、以下を含むことができる：
(a) ベムラフェニブおよびトラメチニブ；
(b) ベムラフェニブおよびコビメチニブ；
(c) ベムラフェニブおよびビニメチニブ；
(d) ベムラフェニブおよびセルメチニブ；
(e) ダブラフェニブおよびトラメチニブ；
(f) ダブラフェニブおよびコビメチニブ；
(g) ダブラフェニブおよびビニメチニブ；
(h) ダブラフェニブおよびセルメチニブ；
(i) エンコラフェニブおよびトラメチニブ；
(j) エンコラフェニブおよびコビメチニブ；
(k) エンコラフェニブおよびビニメチニブ；
(l) エンコラフェニブおよびセルメチニブ；
(m) ソラフェニブおよびトラメチニブ；
(n) ソラフェニブおよびコビメチニブ；
(o) ソラフェニブおよびビニメチニブ；または
(p) ソラフェニブおよびセルメチニブ。
【０３５３】
前記キットは、必要に応じて、様々な従来の医薬キット構成要素の1つ以上、例えば、1種以上の薬学的に許容される担体を含む容器、追加の容器など、をさらに含むことができ、当業者には容易に明らかになるであろう。投与される成分の量、投与に関するガイドライン、および/または諸成分を混合するためのガイドラインを示す、インサートまたはラベルとしての、印刷された説明書もキットに含めることができる。
【０３５４】
薬学的組成物は、Remington: The Science and Practice of Pharmacy (1995)に開示されているものなどの従来の技術にしたがって、薬学的に許容される担体または希釈剤、ならびに任意の他の公知のアジュバントおよび賦形剤とともに製剤化され得る。
【０３５５】
薬学的に許容される担体または希釈剤、ならびに任意の他の公知のアジュバントおよび希釈剤は、AXL-ADCおよび選択された投与の様式に適しているべきである。薬学的組成物の担体および他の構成要素の適合性は、選択された化合物または薬学的組成物の望ましい生物学的特性に対して有意な負の影響がない（例えば、抗原結合時に実質的な影響に満たない（10％以下の相対的阻害、5％以下の相対的阻害など））ことに基づいて決定される。
【０３５６】
薬学的組成物はまた、希釈剤、充填剤、塩、緩衝剤、界面活性剤（例えば、Tween-20またはTween-80などの非イオン性界面活性剤）、安定剤（例えば、糖またはタンパク質を含まないアミノ酸）、保存剤、組織固定剤、可溶化剤、および／または薬学的組成物中に含まれるのに適している他の材料も含み得る。
【０３５７】
薬学的組成物における活性成分の実際の投薬レベルは、患者に対して毒性であることなく、特定の患者、組成物、および投与の様式にとって望ましい治療応答を達成するのに有効である活性成分の量を得るために、変動し得る。選択される投薬レベルは、特定の組成物の活性、投与の経路、投与の時間、使用される特定の化合物の排出の速度、処置の持続期間、使用される特定の組成物と組み合わせて用いられる他の薬物、化合物、および／または材料、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、一般的な健康、および事前の病歴、ならびに医学分野において周知である同様の要因を含む、様々な薬物動態学的要因に依存することになる。
【０３５８】
薬学的組成物は、任意の適している経路および様式によって投与され得る。インビボおよびインビトロで本発明の化合物を投与するのに適している経路は、当技術分野において周知であり、当業者によって選択され得る。
【０３５９】
一態様において、薬学的組成物は、非経口的に投与される。
【０３６０】
本明細書において使用される「非経口投与」および「非経口的に投与される」という用語は、通常注射による、経腸および局所投与以外の投与の様式を指し、表皮、静脈内、筋肉内、動脈内、クモ膜下腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、腱内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内、頭蓋内、胸腔内、硬膜外、および胸骨内の注射および注入を含む。
【０３６１】
一態様において、薬学的組成物は、静脈内または皮下の注射または注入によって投与される。
【０３６２】
薬学的に許容される担体は、本発明にしたがって使用するためのAXL-ADCまたは治療用作用物質と生理学的に適合性である、任意およびすべての適している溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌剤および抗真菌剤、等張剤、抗酸化剤、ならびに吸収遅延剤などを含む。
【０３６３】
薬学的組成物において使用され得る、適している水性および非水性の担体の例は、水、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、エタノール、デキストロース、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど）、およびそれらの適している混合物、オリーブ油、コーン油、落花生油、綿実油、およびゴマ油などの植物油、カルボキシメチルセルロースコロイド溶液、トラガカントガム、およびオレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステル、ならびに／または種々の緩衝剤を含む。他の担体が、薬学分野において周知である。
【０３６４】
薬学的に許容される担体は、無菌の注射可能な溶液および分散系の即時調製のための、無菌の水性溶液または分散系および無菌の粉末を含む。薬学的活性物質のためのそのような媒体および作用物質の使用は、当技術分野において公知である。いずれかの従来の媒体または作用物質が活性化合物と不適合性である限りを除いて、薬学的組成物におけるそれらの使用が企図される。
【０３６５】
妥当な流動性が、例えば、レシチンなどのコーティング材料の使用によって、分散系の場合には必要とされる粒子サイズの維持によって、および界面活性剤の使用によって維持され得る。
【０３６６】
薬学的組成物はまた、薬学的に許容される抗酸化剤、例として（1）アスコルビン酸、塩酸システイン、重硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなどのような水溶性抗酸化剤；（2）アスコルビルパルミタート、ブチル化ヒドロキシアニソール（BHA）、ブチル化ヒドロキシトルエン（BHT）、レシチン、プロピルガラート、α-トコフェロールなどのような油溶性抗酸化剤；および（3）クエン酸、エチレンジアミン四酢酸（EDTA）、ソルビトール、酒石酸、リン酸などのような金属キレート剤も含み得る。
【０３６７】
薬学的組成物はまた、組成物中に、糖、ポリアルコール、例えばマンニトール、ソルビトール、グリセロール、または塩化ナトリウムなどの等張剤も含み得る。
【０３６８】
薬学的組成物はまた、薬学的組成物の貯蔵寿命または有効性を増強し得る、保存剤、湿潤剤、乳化剤、分散剤、保存剤または緩衝剤などの、選択される投与の経路に適切な1つまたは複数のアジュバントも含有し得る。本発明にしたがって使用するためのAXL-ADCまたは治療用作用物質は、インプラント、経皮貼付剤、およびマイクロカプセル化送達システムを含む、制御放出製剤などの、急速な放出から化合物を保護することになる担体とともに調製され得る。そのような担体は、ゼラチン、グリセリルモノステアラート、グリセリルジステアラート、生分解性生体適合性のポリマー、例えばエチレンビニルアセタート、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリ-オルト-エステル、および単独もしくはワックスを伴うポリ乳酸、または当技術分野において周知である他の材料を含み得る。そのような製剤の調製のための方法は、概して、当業者に公知である。例えば、Robinson: Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems (1978)を参照されたい。
【０３６９】
一態様において、化合物は、インビボでの妥当な分布を確実にするように製剤化され得る。非経口投与のための薬学的に許容される担体は、無菌の注射可能な溶液または分散系の即時調製のための、無菌の水性溶液または分散系および無菌の粉末を含む。薬学的活性物質のためのそのような媒体および作用物質の使用は、当技術分野において公知である。いずれかの従来の媒体または作用物質が活性化合物と不適合性である限りを除いて、薬学的組成物におけるそれらの使用が企図される。他の活性化合物または治療用化合物もまた、組成物中に組み入れられ得る。
【０３７０】
注射用の薬学的組成物は、典型的に、製造および保存の条件下で無菌および安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルジョン、リポソーム、または高い薬物濃度に適している他の規則正しい構造として製剤化され得る。担体は、例として、水、エタノール、ポリオール（例えばグリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど）、およびそれらの適している混合物、オリーブ油などの植物油、ならびに、オレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステルを含有する、水性または非水性の溶媒、または分散媒であってもよい。妥当な流動性が、例えば、レシチンなどのコーティングの使用によって、分散系の場合には必要とされる粒子サイズの維持によって、および界面活性剤の使用によって維持され得る。多くの場合に、等張剤、例えば、糖、ポリアルコール、例えばグリセロール、マンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムを組成物中に含むことが、好ましいと考えられる。注射可能な組成物の長期にわたる吸収は、吸収を遅延させる作用物質、例えば、モノステアラート塩およびゼラチンを組成物中に含むことによってもたらされ得る。無菌の注射可能な溶液は、必要とされる量の活性化合物を、例えば上記で列挙されたような成分のうちの1つまたは組み合わせとともに適切な溶媒中に組み込むこと、必要とされる際には、その後の滅菌マイクロ濾過によって調製され得る。概して、分散系は、活性化合物を、基本の分散媒、および、例えば上記で列挙されたもの由来の必要とされる他の成分を含有する無菌ビヒクル中に組み込むことによって調製される。無菌の注射可能な溶液の調製のための無菌の粉末の場合、調製の方法の例は、事前に滅菌濾過されたその溶液から、活性成分プラス任意の追加の望ましい成分の粉末を生じる、真空乾燥および冷凍乾燥（凍結乾燥）である。
【０３７１】
無菌の注射可能な溶液は、必要とされる量の活性化合物を、上記で列挙された成分のうちの1つまたは組み合わせとともに適切な溶媒中に組み込むこと、必要とされる際には、その後の滅菌マイクロ濾過によって調製され得る。概して、分散系は、活性化合物を、基本の分散媒、および上記で列挙されたもの由来の必要とされる他の成分を含有する無菌ビヒクル中に組み込むことによって調製される。無菌の注射可能な溶液の調製のための無菌の粉末の場合、調製の方法の例は、事前に滅菌濾過されたその溶液から、活性成分プラス任意の追加の望ましい成分の粉末を生じる、真空乾燥および冷凍乾燥（凍結乾燥）である。
【０３７２】
抗AXL抗体の産生
本発明によるADCとして使用するための抗体は、典型的には1つ以上の発現ベクターの形態の核酸構築物を用いて、宿主細胞において組み換え的に調製することができる。一態様では、該核酸構築物は表1に示す1つ以上の配列をコードする。さらなる態様では、該発現ベクターは、抗体、例えばヒトIgG1,κモノクローナル抗体、の軽鎖、重鎖、または軽鎖と重鎖の両方の定常領域をコードする核酸配列をさらに含む。
【０３７３】
発現された抗AXL抗体は、その後、本明細書に記載されるような部分にコンジュゲートされ得る。別の態様において、コンジュゲーションの前に、抗AXL抗体は、その後、本明細書に記載されるような二重特異性抗体を生成するために使用され得る。
【０３７４】
発現ベクターは、染色体、非染色体、および合成核酸ベクター（発現制御エレメントの適しているセットを含む核酸配列）を含む、任意の適しているベクターであり得る。そのようなベクターの例は、SV40の誘導体、細菌プラスミド、ファージDNA、バキュロウイルス、酵母プラスミド、プラスミドとファージDNAとの組み合わせに由来するベクター、ならびにウイルス核酸（RNAまたはDNA）ベクターを含む。一態様において、抗AXL抗体をコードする核酸は、例えば、直鎖状発現エレメント（例として、Sykes and Johnston (1997)に記載されている）を含む裸のDNAもしくはRNAベクター、コンパクト核酸ベクター（例として、US 6,077, 835 および／もしくは WO 00/70087 に記載されている）、pBR322、pUC19/18、もしくはpUC118/119などのプラスミドベクター、「midge」最小サイズの核酸ベクター（例として、Schakowski et al., (2001)に記載されている）中に、または、リン酸カルシウム沈殿構築物などの沈殿核酸ベクター構築物（例としてWO 00/46147、Benvenisty and Reshef, 1986、Wigler et al., 1978、およびCoraro and Pearson, 1981に記載されている）として含まれる。そのような核酸ベクターおよびその使用法は、当技術分野において周知である（例として、US 5,589,466 および US 5,973,972 を参照されたい）。
【０３７５】
一態様において、ベクターは、細菌細胞における抗AXL抗体の発現に適している。そのようなベクターの例は、BlueScript（Stratagene）、pINベクター（Van Heeke & Schuster, 1989）、pETベクター（Novagen, Madison WI）など）のような発現ベクターを含む。
【０３７６】
発現ベクターは、またもしくは代替的に、酵母システムにおける発現に適しているベクターであり得る。酵母システムにおける発現に適している任意のベクターが、使用され得る。適しているベクターは、例えば、α因子、アルコールオキシダーゼ、およびPGHなどの構成性または誘導性のプロモーターを含むベクター（F. Ausubel et al., 1987 および Grant et al., 1987 に概説されている）を含む。
【０３７７】
核酸構築物および／またはベクターはまた、新生ポリペプチド鎖などのポリペプチドを、ペリプラズム腔へまたは細胞培養培地中に標的化することができる、分泌／局在化配列をコードする核酸配列も含み得る。そのような配列は、当技術分野において公知であり、分泌リーダーまたはシグナルペプチド、オルガネラ標的配列（例えば、核局在化配列、ER保持シグナル、ミトコンドリア移行配列、葉緑体移行配列）、膜局在化／アンカー配列（例えば、輸送停止配列、GPIアンカー配列）などを含む。
【０３７８】
発現ベクターにおいて、抗AXL抗体をコードする核酸は、任意の適しているプロモーター、エンハンサー、および他の発現促進エレメントを含み得るか、またはそれらと関連し得る。そのようなエレメントの例は、強い発現プロモーター（例えば、ヒトCMV IEプロモーター／エンハンサー、ならびにRSV、SV40、SL3-3、MMTV、およびHIV LTRプロモーター）、有効なポリ(A)終結配列、大腸菌（E.coli）におけるプラスミド産物用の複製開始点、選択可能マーカーとしての抗生物質耐性遺伝子、および／または好都合なクローニング部位（例えば、ポリリンカー）を含む。核酸はまた、CMV IEなどの構成性プロモーターとは対照的に誘導性プロモーターも含み得る（そのような用語が、ある一定の条件下での遺伝子発現の程度の実質的な記述子であることを、当業者は認識するであろう）。
【０３７９】
一態様において、抗AXL抗体をコードする発現ベクターは、ウイルスベクターを介して、宿主細胞もしくは宿主動物中に位置づけられ得るか、および／または送達され得る。
【０３８０】
宿主細胞は、本明細書において定義される抗AXL抗体、または本明細書において定義される本発明の二重特異性分子を産生する、トランスフェクトーマなどの組み換え真核生物または原核生物の宿主細胞でありうる。宿主細胞の例は、酵母、細菌および哺乳動物細胞、例えば、CHOもしくはHEK細胞、またはその誘導体を含む。例えば、一態様において、細胞は、抗AXL抗体の発現をコードする配列を含む、細胞ゲノム中に安定に組み込まれた核酸を含む。別の態様において、宿主細胞は、抗AXL抗体の発現をコードする配列を含む、プラスミド、コスミド、ファージミド、または直鎖状発現エレメントなどの組み込まれていない核酸を含む。
【０３８１】
本明細書において使用される「組み換え宿主細胞」（または単純に「宿主細胞」）という用語は、発現ベクターがその中に導入されている細胞を指すように意図される。そのような用語は、特定の対象細胞だけではなく、そのような細胞の子孫もまた指すように意図されることが、理解されるべきである。変異または環境の影響のいずれかにより、ある一定の改変が次の世代において起こり得るため、そのような子孫は、実際のところ親細胞と同一ではない場合があるが、本明細書において使用される「宿主細胞」という用語の範囲内に依然として含まれる。組み換え宿主細胞は、例えば、CHO細胞、HEK-293細胞、PER.C6、NSO細胞、およびリンパ球細胞などのトランスフェクトーマ、ならびに大腸菌などの原核生物細胞、ならびに、植物細胞および真菌などの他の真核生物宿主を含む。
【０３８２】
本明細書において使用される「トランスフェクトーマ」という用語は、CHO細胞、PER.C6、NS0細胞、HEK-293細胞、植物細胞、または酵母細胞を含む真菌などの、抗体または標的抗原を発現する、組み換え真核生物宿主細胞を含む。
【０３８３】
あるいは、抗体は、例として表面上に抗原を発現する細胞の形態の、AXLの細胞外領域、または関心対象の抗原をコードする核酸で免疫化されたマウスから取得されたマウス脾臓B細胞より調製されたハイブリドーマから産生され得る。モノクローナル抗体はまた、免疫化されたヒト、または、ウサギ、ラット、イヌ、霊長類などのような非ヒト哺乳動物の抗体発現細胞に由来するハイブリドーマから取得され得る。
【０３８４】
ヒト抗体は、マウス免疫系ではなくヒト免疫系の一部を保有するトランスジェニックマウスまたはトランスクロモソーマルマウス、例えばHuMAbマウス、を用いて作製することができる。HuMAbマウスは、内因性のμおよびκ鎖遺伝子座を不活性化する標的変異と共に、再配列されていないヒト重鎖(μおよびγ)およびκ軽鎖免疫グロブリン配列をコードするヒト免疫グロブリン遺伝子ミニ遺伝子座を含む(Lonberg et al., 1994a)。その結果、このマウスは、免疫化されるとヒト抗体応答を開始し、導入されたヒト重鎖および軽鎖トランスジーンは、高親和性ヒトIgG,κモノクローナル抗体を生成するためのクラススイッチおよび体細胞変異を受ける(Lonberg et al., 1994b; Lonberg and Huszar, 1995; Harding and Lonberg, 1995)。HuMAbマウスの作製は、Taylor et al., 1992; Chen et al., 1993; Tuaillon et al., 1994; およびFishwild et al., 1996に詳しく記載されている。さらに、US 5,545,806; US 5,569,825; US 5,625,126; US 5,633,425; US 5,789,650; US 5,877,397; US 5,661,016; US 5,814,318; US 5,874,299; US 5,770,429; US 5,545,807; WO 98/024884; WO 94/025585; WO 93/001227; WO 92/022645; WO 92/003918; およびWO 01/009187も参照されたい。これらのトランスジェニックマウス由来の脾細胞を用いて、周知の技術に従ってヒトモノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを作製することができる。さらに、ヒト抗体は、完全なヒトモノクローナル抗体の組み換え生産のための供給源として使用できる、ヒト-ラットキメラ抗体を産生するトランスジェニックマウスまたはラットから作製することができる。
【０３８５】
さらに、ヒト抗体は、ディスプレイタイプの技術によって同定することができ、こうした技術には、限定するものではないが、ファージディスプレイ、レトロウイルスディスプレイ、リボソームディスプレイ、哺乳動物ディスプレイ、酵母ディスプレイおよび当技術分野で公知の他の技術が含まれる。得られた分子は、親和性成熟などの、さらなる成熟に供することができ、このような技術は当技術分野で周知である。
【０３８６】
（表２）配列
2019509257.tif 000014
2019509257.tif 000015
2019509257.tif 000016
2019509257.tif 000017
2019509257.tif 000018
2019509257.tif 000019
2019509257.tif 000020
2019509257.tif 000021
2019509257.tif 000022
【０３８７】
本発明は、以下の実施例によってさらに説明されるが、これらの実施例はさらなる限定として解釈されるべきでない。
【実施例】
【０３８８】
実施例1 - AXLおよびAXL ADCの作製
第1のセットのAXL特異的抗体
第1のセットのAXL特異的モノクローナル抗体（抗体IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-107、IgG1-AXL-183、IgG1-AXL-613、IgG1-AXL-726、IgG1-AXL-511、IgG1-AXL-137、IgG1-AXL-148、IgG1-AXL-154、IgG1-AXL-171、IgG1-AXL-733）は、以下に記載されるAXLタンパク質構築物または細胞でトランスジェニックマウスを免疫することによって産生された。免疫化の手順、ハイブリドーマの作製、および精製抗体の質量分析法の詳細については、WO 2016/005593 A1の実施例1を参照されたい。
【０３８９】
AXL用の発現構築物
種々の完全長AXLバリアントの発現用の以下のコドン最適化構築物を生成した：ヒト（ホモ・サピエンス）AXL（Genbankアクセッション番号NP_068713.2）、ヒト細胞外ドメイン（ECD）がカニクイザル（マカカ・ファスシクラリス（Macaca fascicularis））AXLのECD（GenbankアクセッションHB387229.1の翻訳；アミノ酸1〜447）で置き換えられたヒト-カニクイザルキメラAXL、ヒトECDがマウス（ハツカネズミ）AXLのECD（GenbankアクセッションNP_033491.2；アミノ酸1〜441）で置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトIg様ドメインI（アミノ酸1〜134、本明細書において「Ig1ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのIg様ドメインIで置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトIg様ドメインII（アミノ酸148〜194、本明細書において「Ig2ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのIg様ドメインIIにより置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトFNIII様ドメインI（アミノ酸227〜329、本明細書において「FN1ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのFNIII様ドメインIで置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトFNIII様ドメインII（アミノ酸340〜444、本明細書において「FN2ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのFNIII様ドメインIIにより置き換えられたヒト-マウスキメラAXL。加えて、種々のAXL ECDバリアント用の以下のコドン最適化構築物を生成した：C末端Hisタグを有するヒトAXLの細胞外ドメイン（ECD）（アミノ酸1〜447）（AXLECDHis）、N末端シグナルペプチドおよびC末端Hisタグを有するヒトAXLのFNIII様ドメインII（アミノ酸327〜447）（AXL-FN2ECDHis）、ならびに、C末端Hisタグを有するヒトAXLのIg1ドメインおよびIg2ドメイン（アミノ酸1〜227）（AXL-Ig12ECDHis）。
【０３９０】
構築物は、クローニングに適している制限酵素部位および最適コザック（GCCGCCACC）配列を含有した（Kozak et al., 1999）。構築物を、哺乳動物発現ベクターpcDNA3.3（Invitrogen）にクローニングした。
【０３９１】
EL4細胞におけるAXL発現
EL4細胞に、完全ヒトAXLコード配列を含有するpcDNA3.3ベクターを安定にトランスフェクトして、抗生剤G418（Geneticin）での選択後に、安定なクローンを選択した。
【０３９２】
Hisタグ付加AXLの精製
AXLECDHis、AXL-FN2ECDHis、およびAXL-Ig12ECDHisを、HEK-293F細胞において発現させた。Hisタグにより、固定化金属親和性クロマトグラフィーでの精製が可能になる。このプロセスにおいて、クロマトグラフィー樹脂上に固定されたキレーターは、Co2+カチオンを充填している。Hisタグ付加タンパク質を含有する上清を、バッチモード（すなわち、溶液）において樹脂とインキュベートした。Hisタグ付加タンパク質は、樹脂ビーズに強く結合し、他方、培養上清中に存在する他のタンパク質は結合しないか、またはHisタグ付加タンパク質と比較して弱く結合する。インキュベーション後に、ビーズを上清から回収して、カラム中に詰める。弱く結合したタンパク質を除去するために、カラムを洗浄する。次いで、強く結合したHisタグ付加タンパク質を、Co2+に対するHisの結合と競合するイミダゾールを含有する緩衝液で溶出する。脱塩カラム上の緩衝液交換により、溶出剤をタンパク質から除去する。
【０３９３】
均質抗原特異的スクリーニングアッセイ
免疫化マウスの血清中、またはHuMab（ヒトモノクローナル抗体）ハイブリドーマもしくはトランスフェクトーマの培養上清中の抗AXL抗体の存在を、Fluorometric Micro volume Assay Technology（FMAT; Applied Biosystems, Foster City, CA, USA）を用いた均質抗原特異的スクリーニングアッセイによって判定した。このために、4細胞ベースアッセイまたは8細胞ベースアッセイのいずれかの組み合わせを有する、2つの異なる試験設計を使用した。
【０３９４】
4細胞ベースアッセイ試験設計を、免疫化マウス由来の血清の試験のために、および、ハイブリドーマまたはトランスフェクトーマの培養上清用の一次スクリーニング試験として使用した。4アッセイ試験設計においては、試料を、それぞれ、A431（DSMZ）およびMDA-MB-231細胞（両方とも細胞表面にAXLを発現する）に対するヒト抗体の結合、ならびに、TH1021-AXL（完全長ヒトAXLを一過性に発現するHEK-293F細胞；上記のように産生される）およびHEK293野生型細胞（AXLを発現しない陰性対照）に対する結合について解析した。
【０３９５】
ハイブリドーマまたはトランスフェクトーマの培養上清試料を、追加的に、8細胞ベースアッセイ試験設計に供した。8アッセイ試験設計においては、試料を、それぞれ、TH1021-hAXL（ヒトAXLを一過性に発現するHEK-293F細胞）、TH1021-cAXL（ヒトECDがカニクイザルAXLのECDで置き換えられているヒト-カニクイザルAXLキメラを一過性に発現するHEK-293F細胞）、TH1021-mAXL（ヒトECDがマウスAXLのECDで置き換えられているヒト-マウスAXLキメラを一過性に発現するHEK-293F細胞）、TH1021-mIg1（マウスAXLのIg様ドメインIにより置き換えられているIg様ドメインIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK-293F細胞）、TH1021-mIg2（マウスAXLのIg様ドメインIIにより置き換えられているIg様ドメインIIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK-293F細胞）、TH1021-mFN1（マウスAXLのFNIII様ドメインIにより置き換えられているFNIII様ドメインIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK-293F細胞）、TH1021-mFN2（マウスAXLのFNIII様ドメインIIにより置き換えられているFNIII様ドメインIIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK-293F細胞）、およびHEK293野生型細胞（AXLを発現しない陰性対照）に対するヒト抗体の結合について解析した。
【０３９６】
試料を、細胞に添加して、AXLに結合させた。その後、HuMabの結合を、蛍光コンジュゲート（ヤギ抗ヒトIgG Fcγ-DyLight649；Jackson ImmunoResearch）を用いて検出した。AXL特異的なヒト化マウス抗体A0704P（HEK-293F細胞において産生）を陽性対照として使用し、HuMabマウスのプールした血清およびChromPureヒトIgG、全分子（Jackson ImmunoResearch）を、それぞれ、陰性対照として使用した。試料を、Applied Biosystems 8200 Cellular Detection System（8200 CDS）を用いてスキャンし、平均蛍光を読み取り値として使用した。カウントが50よりも高く、カウント×蛍光が陰性対照より少なくとも3倍高かった場合に、試料を陽性と述べた。
【０３９７】
AXL抗体可変ドメインの配列解析および発現ベクターにおけるクローニング
全RNAを0.2〜5×106個のハイブリドーマ細胞から調製して、5'-RACE-相補DNA（cDNA）を、SMART RACE cDNA Amplificationキット（Clontech）を用い、製造業者の説明書にしたがって100 ng全RNAから調製した。VHおよびVLをコードする領域を、PCRにより増幅し、ライゲーション非依存性クローニング（Aslanidis, C. and P.J. de Jong, Nucleic Acids Res 1990;18(20): 6069-74）によってpG1fおよびpKappa発現ベクターにインフレームで直接クローニングした。各抗体について、12種のVLクローンおよび12種のVHクローンを配列決定した。結果として生じた配列を、表2に示す。CDR配列を、IMGT（Lefranc MP. et al., 1999 および Brochet, 2008）にしたがって定義した。正確なオープンリーディングフレーム（ORF）を有するクローンを、さらなる研究および発現のために選択した。見出された重鎖および軽鎖のすべての組み合わせのベクターを、293fectinを用いてFreestyle 商標 293-F細胞に、一過性に共発現させた。
【０３９８】
抗体IgG1-AXL-154、IgG1-AXL-183、およびIgG1-AXL-726について、可変ドメイン中に点変異を有する以下のバリアントを生成した：IgG1-AXL-154-M103L、IgG1-AXL-183-N52Q、およびIgG1-AXL-726-M101L。変異体は、Quickchange II変異導入キット（Stratagene）を用いた部位特異的変異導入によって生成した。
【０３９９】
AXL対照抗体
実施例のいくつかにおいて、以前に記載されている、AXLに対する比較抗体（IgG1-YW327.6S2）を使用した（EP 2 220 131, U3 Pharma；WO 2011/159980, Genentech）。これらのAXL特異的抗体のVHおよびVLの配列を、pG1fおよびpKappa発現ベクター中にクローニングした。
【０４００】
b12抗体
実施例のいくつかにおいて、gp120特異的抗体である抗体b12（Barbas, 1993）を、陰性対照として使用した。
【０４０１】
発現
抗体を、IgG1,κとして発現させた。抗体の重鎖および軽鎖の両方をコードするプラスミドDNA混合物を、293fectin（Invitrogen, US）を用いてFreestyle HEK293F細胞（Invitrogen, US）に、本質的に製造業者により記載されているように、一過性にトランスフェクトした。
【０４０２】
抗体の精製
培養上清を、0.2μmデッドエンドフィルターを通して濾過し、5 mL MabSelect SuReカラム（GE Health Care）上にロードして、0.1 M酢酸ナトリウム-NaOH、pH 3で溶出した。溶出液を、直ちに2Mトリス-HCl、pH 9で中和し、12.6 mM NaH2PO4、140 mM NaCl、pH 7.4（B.Braun）に対して一晩透析した。あるいは、精製に続いて、溶出液をHiPrep脱塩カラム上にロードして、抗体を12.6 mM NaH2PO4、140 mM NaCl、pH 7.4（B.Braun）緩衝液中に交換した。透析または緩衝液の交換の後、試料を、0.2μmデッドエンドフィルターを通して滅菌濾過した。純度をSDS-PAGEにより測定し、IgG濃度をOctet（Fortebio, Menlo Park, USA）を用いて測定した。精製抗体は、4℃で保存した。
【０４０３】
AXL特異的抗体511
抗体IgG1-AXL-511は、後述の選択手順を用いて、以下に記載されるAXLタンパク質構築物または細胞でトランスジェニックマウスを免疫化することによって産生された。免疫化の手順、ハイブリドーマの作製、脾臓細胞からのRNAの分離、プライマー配列、LEE PCR、ならびにHCおよびLC配列の決定と選択の詳細については、WO 2016/005593 A1を参照されたい。
【０４０４】
AXL用の発現構築物
種々の完全長AXLバリアントの発現用の以下のコドン最適化構築物を生成した：ヒト（ホモ・サピエンス）AXL（Genbankアクセッション番号NP_068713.2）、ヒト細胞外ドメイン（ECD）がカニクイザル（マカカ・ファスシクラリス）AXLのECD（GenbankアクセッションHB387229.1の翻訳；アミノ酸1〜447）で置き換えられたヒト-カニクイザルキメラAXL、ヒトECDがマウス（ハツカネズミ）AXLのECD（GenbankアクセッションNP_033491.2；アミノ酸1〜441）で置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトIg様ドメインI（アミノ酸1〜147、本明細書において「Ig1ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのIg様ドメインIで置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトIg様ドメインII（アミノ酸148〜227、本明細書において「Ig2ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのIg様ドメインIIにより置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトFNIII様ドメインI（アミノ酸228〜326、本明細書において「FN1ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのFNIII様ドメインIで置き換えられたヒト-マウスキメラAXL、ヒトFNIII様ドメインII（アミノ酸327〜447、本明細書において「FN2ドメイン」とも呼ばれる）がマウスAXLのFNIII様ドメインIIにより置き換えられたヒト-マウスキメラAXL。加えて、種々のAXL ECDバリアント用の以下のコドン最適化構築物を生成した：C末端Hisタグを有するヒトAXLの細胞外ドメイン（ECD）（アミノ酸1〜447）（AXLECDHis）、N末端シグナルペプチドおよびC末端Hisタグを有するヒトAXLのFNIII様ドメインII（アミノ酸327〜447）（AXL-FN2ECDHis）、ならびに、C末端Hisタグを有するヒトAXLのIg1ドメインおよびIg2ドメイン（アミノ酸1〜227）（AXL-Ig12ECDHis）。
【０４０５】
構築物は、クローニングに適している制限酵素部位および最適コザック（GCCGCCACC）配列を含有した（Kozak et al. (1999) Gene 234: 187-208）。構築物を、哺乳動物発現ベクターpcDNA3.3（Invitrogen）にクローニングした。
【０４０６】
EL4細胞におけるAXL発現
EL4細胞に、完全長ヒトAXLコード配列を含有するpcDNA3.3ベクターを安定にトランスフェクトして、抗生剤G418（Geneticin）での選択後に、安定なクローンを選択した。
【０４０７】
Hisタグ付加AXLの精製
AXLECDHis、AXL-FN2ECDHis、およびAXL-Ig12ECDHisを、HEK293F細胞において発現させ、固定化金属親和性クロマトグラフィーで精製した。
【０４０８】
HEK-293細胞における一過性発現
抗体を、IgG1,κとして発現させた。抗体の重鎖および軽鎖の両方をコードするプラスミドDNA混合物を、本質的にVink, T., et al. (2014) ('A simple, robust and highly efficient transient expression system for producing antibodies', Methods, 65 (1), 5-10)により記載されているように、293fectin（Life technologies）を用いてFreestyle 293-F（HEK293F）細胞（Life technologies, USA）に、一過性にトランスフェクトした。
【０４０９】
AbのLEE発現のために、1μlのHC LEE PCR反応混合物、1μlのLC PCR反応混合物、および、1μlの、Vink, T., et al. (2014)に記載されている3種の発現増強プラスミドのミックスを含有する30 ng/μl増強ミックスを混合して、本質的に上に記載されているように、容器として96ウェルプレートを用いて、トランスフェクション試薬として293fectinを用い、製造業者（Life technologies）の説明書にしたがって、100μlの総体積においてHEK293F細胞にトランスフェクトした。
【０４１０】
AXLECDHis ELISA
ELISAプレート（Greiner, オランダ）を、100μl／ウェルのリン酸緩衝生理食塩水（PBS）中の0.5μg/ml AXLECDHisでコーティングし、室温（RT）で16時間インキュベートした。コーティング溶液を除去して、150μl PBSTC（0.1％ tween-20および2％ニワトリ血清を含有するPBS）をウェルに添加し、RTで1時間インキュベートすることによって、ウェルをブロッキングした。プレートを、300μl PBST（0.1％ tween-20を含有するPBS）／ウェルで3回洗浄して、100μlの試験溶液を添加し、その後RTで1時間のインキュベーションを行った。300μlのPBST／ウェルで3回洗浄した後、100μlの西洋ワサビペルオキシダーゼとカップリングした抗体ヤギ抗ヒトIgG（1/3000に希釈）を添加して、RTで1時間インキュベートした。300μlのPBST／ウェルで3回洗浄した後、100μlのABTS（1mg/ml）溶液を添加し、十分なシグナルが観察されるまでRTでインキュベートして、100μlの2％シュウ酸溶液を添加することによって反応を停止した。96ウェルプレートを、ELISAリーダー上で405 nmで測定した。
【０４１１】
多様性スクリーニング
試料を、それぞれ、TH1021-hAXL（ヒトAXLを一過性に発現するHEK293F細胞）、TH1021-cAXL（ヒトECDがカニクイザルAXLのECDで置き換えられているヒト-カニクイザルAXLキメラを一過性に発現するHEK293F細胞）、TH1021-mAXL（ヒトECDがマウスAXLのECDで置き換えられているヒト-マウスAXLキメラを一過性に発現するHEK293F細胞）、TH1021-mIg1（マウスAXLのIg様ドメインIにより置き換えられているIg様ドメインIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK293F細胞）、TH1021-mIg2（マウスAXLのIg様ドメインIIにより置き換えられているIg様ドメインIIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK293F細胞）、TH1021-mFN1（マウスAXLのFNIII様ドメインIにより置き換えられているFNIII様ドメインIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK293F細胞）、TH1021-mFN2（マウスAXLのFNIII様ドメインIIにより置き換えられているFNIII様ドメインIIを有するヒトAXLを一過性に発現するHEK293F細胞）、およびHEK293F細胞（AXLを発現しない陰性対照）に対する抗体の結合について解析した。
【０４１２】
LEE発現由来の試料を、細胞に添加して、種々のAXL構築物に結合させた。その後、抗体の結合を、蛍光コンジュゲート（ヤギ抗ヒトIgG Fcγ-DyLight649；Jackson ImmunoResearch）を用いて検出した。試料を、Applied Biosystems 8200 Cellular Detection System（8200 CDS）を用いてスキャンし、平均蛍光を読み取り値として使用した。カウントが50よりも高く、カウント×蛍光が陰性対照より少なくとも3倍高かった場合に、試料を陽性と述べた。
【０４１３】
抗体511の結合親和性
1つの抗AXL抗体（クローン511）の親和性を測定した。
【０４１４】
親和性を、ForteBio OctetRED384上でバイオレイヤー干渉法を用いて測定した。抗ヒトFc Capture（AHC）バイオセンサー（ForteBio, Portsmouth, UK; カタログ番号18-5064）に、1 nmの負荷応答を目標にして、hIgG（1μg/mL）を150秒間負荷した。ベースライン（150秒）後に、AXLECDHis（実施例1に記載されている）の会合（1000秒）および解離（2000秒）を、2倍希釈工程で10μg/mL〜0.16μg/mL（218 nM〜3 nM）の濃度範囲を用いて測定した。算出のために、アミノ酸配列に基づくAXLECDHisの理論的な分子量、すなわち46 kDaを使用した。実験を、1000 rpmで振盪しながら、30℃で、OctetRED384上で実施した。各抗体を、3回の独立した実験において試験した。
【０４１５】
データを、別の方法で述べない限り、1000秒の会合時間および1000秒の解離時間での1:1モデルおよびグローバルフルフィットを用いて、ForteBio Data Analysis Software v7.0.3.1で解析した。（獲得された2000秒の解離時間の代わりに）1000秒の解離時間を、これがより良好なフィットを結果としてもたらしたために使用した。データ追跡を、参照曲線（AXLECDHisを含まない抗体）を引くことによって補正し、Y軸をベースラインの最後の5秒に整列させ、工程間（interstep）補正およびサビツキー・ゴーレイ（Savitzky-Golay）フィルタリングを適用した。
【０４１６】
クローン511のAXLに対する親和性（KD）は、23*10-9M（kオン 1.7*105 1/Msおよび3.9*10-3 1/sのk解離）であった。
【０４１７】
デュオスタチン-3合成
化合物3の調製：
2019509257.tif 000023
30 mLの塩化メチレン（DCM）中のBoc-L-フェニルアラニン1（5.36 g、20.2 mmol）の溶液に、カルボニルジイミダゾール（CDI、4.26 g、26.3 mmol）を添加して、1時間撹拌した。次いで、15 mLのDCM中の2（3.67 g、30.3 mmol）および2,4-ジアミノ酪酸（DBU、4.5 mL、30 mmol）の溶液を添加した。混合物を、40℃で16時間加熱した、混合物を、60 mLのDCMおよび40 mLの水で希釈し、次いで、濃HClでpH 7に中和した。DCM抽出物を収集して、0.2M HCl（60 mL）で、次いで塩水（60 mL）で洗浄し、Na2SO4の上で乾燥し、蒸発させて、7.47 gのBoc保護されたスルホンアミドを生み出した。この材料を、40 mLのメタノールに懸濁し、次いで、200 mLの6N HCl／イソプロパノールを添加して、混合物を2時間撹拌した。溶媒を、真空下で蒸発させ、次いで、100 mLのエーテルを添加した。沈殿を、濾過により収集し、乾燥して、化合物3をHCl塩（5.93 g、96％）；MS m/z 269.1（M+H）として生み出した。
【０４１８】
化合物5の調製：
2019509257.tif 000024
10 mLのN,N-ジメチルホルムアミド（DMF）中の化合物4（1.09 g、1.6 mmol）の溶液に、2-(1H-7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウラニウムヘキサフルオロホスファート（HATU、0.61 g、1.6 mmol）、ジイソプロピルエチルアミン（DIEA、0.56 mL）、および化合物3（0.49 g、1.6 mmol）をその順序で添加した。混合物を1時間撹拌して、100 mLの水および4 mLの酢酸で希釈した。沈殿を、濾過により収集し、真空下で乾燥して、10 mLの4M HCl／ジオキサンに添加した。30分後、200 mLのエーテルを添加して、不溶性沈殿を収集し、HPLCにより精製して、化合物5をテトラヒドロフラン塩（TFA、1.3 g、88％）；MS m/z 835.5 (M+H)として生み出した。化合物5を、本原稿を通してデュオスタチン-3と呼ぶ。
【０４１９】
化合物7の調製：
2019509257.tif 000025
5 mLのDMF中の化合物5（500 mg、0.527 mmol）の溶液に、化合物6（483 mg、0.631 mmol）、N-ヒドロキシベンゾトリアゾール（HOBt、40 mg、0.296 mmol）、およびDIEA（0.27 mL）を添加した。混合物を16時間撹拌し、その後、0.4 mLのピペリジンを添加した。1時間後、混合物を100 mLのエーテルで希釈して、沈殿を収集し、乾燥して、化合物7をHCl塩（640 mg、95％）；MS m/z 1240.7 (M+H)として生み出した。
【０４２０】
化合物9の調製：
2019509257.tif 000026
5 mLのDMF中の化合物8（219 mg、0.62 mmol）の溶液に、HATU（236 mg、0.62 mmol）、DIEA（0.15 mL）、および化合物7（316 mg、1.6 mmol）をそれぞれ添加した。1時間後、0.2 mLのピペリジンを添加して、混合物を30分間撹拌し、次いで、HPLCにより精製して、化合物9をTFA塩（235 mg、64％）；MS m/z 1353.8 (M+H)として生み出した。
【０４２１】
化合物11の調製：
2019509257.tif 000027
2 mLのメタノールおよび1 mLの水中の化合物9（235 mg、0.16 mmol）の溶液に、ジアルデヒド10（1.6 mLのiPrOH中0.3M）およびNaCNBH3（180 mg、2.85 mmol）の溶液を添加した。混合物をRTで2時間撹拌し、次いで、HPLCにより精製して、化合物11をTFA塩（126 mg、50％）；MS m/z 1465.8 (M+H)として生じさせた。
【０４２２】
AXL特異的抗体-薬物コンジュゲート（ADC）の生成
精製AXL抗体IgG1-AXL-148、IgG1-AXL-183、およびIgG1-AXL-726、ならびに陰性対照抗体IgG1-b12を、K-lock AV1-バリン-シトルリン（vc）リンカーを用いた共有結合性コンジュゲーションを通して、Concortis Biosystems, Inc.（San Diego, CA）によりデュオスタチン-3とコンジュゲートした（Concortis Biosystemsによる、WO 2013/173391、WO 2013/173392、および WO 2013/173393）。
【０４２３】
抗AXL抗体薬物コンジュゲートを、その後、濃度（280 nmでの吸光度により）、逆相クロマトグラフィー（RP-HPLC）および疎水性相互作用クロマトグラフィー（HIC）により薬物対抗体の比（「DAR」）、コンジュゲートされていない薬物の量（逆相クロマトグラフィーにより）、凝集のパーセンテージ（サイズ排除クロマトグラフィー、SEC-HPLCにより）、ならびにエンドドキシンレベル（LALにより）について解析した。結果は、以下のようであった（表3）。
【０４２４】
（表３）
2019509257.tif 000028
【０４２５】
実施例2‐AXL抗体の結合特性
AXL抗体の結合親和性
9種の抗AXL抗体、ならびに可変ドメイン中に単一のアミノ酸変異を有するこれらの抗体の3種のバリアント（IgG1-AXL-154-M103L、IgG1-AXL-183-N52Q、IgG1-AXL-726-M101L）のパネルの親和性を測定した。
【０４２６】
親和性を、ForteBio OctetRED384上でバイオレイヤー干渉法を用いて測定した。抗ヒトFc Capture（AHC）バイオセンサー（ForteBio, Portsmouth, UK；カタログ番号18-5064）に、1 nmの負荷応答を目標にして、hIgG（1μg/mL）を150秒間負荷した。ベースライン（150秒）後に、AXLECDHis（実施例1に記載されている）の会合（1000秒）および解離（2000秒）を、2倍希釈工程で10μg/mL〜0.16μg/mL（218 nM〜3 nM）の濃度範囲を用いて測定した。算出のために、アミノ酸配列に基づくAXLECDHisの理論的な分子量、すなわち46 kDaを使用した。実験を、1000 rpmで振盪しながら30℃で、OctetRED384上で実施した。各抗体を、3回の独立した実験において試験した。
【０４２７】
データを、別の方法で述べない限り、1000秒の会合時間および1000秒の解離時間での1:1モデルおよびグローバルフルフィットを用いて、ForteBio Data Analysis Software v7.0.3.1で解析した。（獲得された2000秒の解離時間の代わりに）1000秒の解離時間を、これがより良好なフィットを結果としてもたらしたために使用した。抗体IgG1-AXL-154およびIgG1-AXL-154-M103Lについては、500秒の解離時間を使用した。IgG1-AXL-012およびIgG1-AXL-094については、200秒の解離時間を使用した。データ追跡を、参照曲線（AXLECDHisを含まない抗体）を引くことによって補正し、Y軸をベースラインの最後の5秒に整列させ、工程間補正およびサビツキー-ゴーレイフィルタリングを適用した。
【０４２８】
抗AXL抗体の親和性（KD）は、0.3*10-9M〜63*10-9Mの範囲であった（表4）。変異体IgG1-AXL-183-N52Qについて、KDは、およそ2.5倍高い解離速度のために、野生型IgG1-AXL-183よりも低かった。他の2種の変異体の観察された速度論は、野生型IgGの速度論に類似していた。
【０４２９】
（表４）
2019509257.tif 000029
【０４３０】
ヒト、マウス、およびカニクイザルAXLに対するAXL抗体の結合
HEK293T細胞に、完全長ヒトAXL、カニクイザル細胞外ドメイン（ECD）を有するヒトAXL、またはマウスECDを有するヒトAXL用の発現構築物を一過性にトランスフェクトした（実施例1を参照されたい）。これらの細胞に対するHuMab-AXL抗体の結合を、フローサイトメトリーにより評定した。トランスフェクトしたHEK293細胞を、AXL抗体の連続希釈液（最終濃度範囲0.0024〜10μg/mL）と4℃で30分間インキュベートした。PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で3回洗浄した後、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で1/100に希釈したR-フィコエリスリン(PE)コンジュゲートヤギ抗ヒトIgG F(ab')2（Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc., West Grove, PA；カタログ番号109-116-098）とインキュベートした（最終体積100μL）。次に、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で2回洗浄し、120μL PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中に再懸濁して、FACS Cantoll（BD Biosciences）上で解析した。
【０４３１】
結合曲線を、GraphPad Prism V5.04ソフトウェア（GraphPad Software, San Diego, CA, USA）を使用し、非線形回帰（可変の勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて解析した。
【０４３２】
図1Aは、HuMab-AXL抗体が、ヒトAXL-ECDを発現するHEK293細胞に対して用量依存性結合を示したことを示す。さらに、HuMab-AXL抗体は、完全ヒトAXLについてと同じ範囲のEC50値で、カニクイザルECDを有するAXLを認識した（図1B）。対照的に、マウスECDを有するAXLに対するHuMabの結合は低かった（IgG1-AXL-107、IgG1-AXL-154、IgG1-AXL-154-M103L、IgG1-AXL-733、IgG1-AXL-183、IgG1-AXL-183-N52Q）か、または検出可能でなかった（IgG1-AXL-171、IgG1-AXL-613、IgG1-AXL-726、IgG1-AXL-726-M101L、IgG1-AXL-148；図1C）。期待されたように、陰性対照抗体IgG1-b12は、AXLバリアントのいずれを発現する細胞に対しても結合を示さなかった（図1）。表7は、ヒトAXLまたはカニクイザルAXL ECDを有するヒトAXLに対する抗AXL抗体の結合についてのEC50値および標準偏差（少なくとも3回の実験において決定された）を示す。マウスAXL ECDを有するヒトAXLに対する結合についてのEC50値は、非常に低いか、または欠如している結合のために決定できなかった。
【０４３３】
（表５）
2019509257.tif 000030
【０４３４】
AXL結合についてのAXL抗体とGas6との間の競合
AXLリガンドであるGas6が、AXLに対するAXL抗体の結合を干渉するかどうかを試験した。そのために、AXL陽性A431細胞を、10μg/mLの組み換えヒトGas6（R&D Systems, Abingdon, UK；カタログ番号885-GS）と4℃で15分間インキュベートした。その後、AXL抗体の連続希釈液を調製し（最終濃度範囲0.014〜10μg/mL）、細胞に添加して、4℃で30分間インキュベートした。PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で3回洗浄した後、細胞を、100μLにおいて二次抗体と4℃で30分間、暗所でインキュベートした。Fc領域に結合する二次抗体として、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で1/100に希釈したR-フィコエリスリン(PE)コンジュゲートヤギ抗ヒトIgG F(ab')2（Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc., West Grove, PA；カタログ番号109-116-098）を使用した。次に、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で2回洗浄し、120μL PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中に再懸濁して、FACS Cantoll（BD Biosciences）上で解析した。
【０４３５】
あるいは、AXLリガンドであるGas6が、AXL抗体の存在下で依然として結合できるかどうかを評価するために、A431細胞を、10μg/mLのAXL抗体とプレインキュベート（15分、4℃）した。抗体のプレインキュベーション後に、組み換えヒトGas6（R&D Systems, Abingdon, UK；カタログ番号885-GS）の連続希釈液を、0.001〜20μg/mLの最終濃度で細胞に添加して、4℃で30分間インキュベートした。PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で3回洗浄した後、細胞を、マウス抗Gas6 IgG2a（R&D Systems；カタログ番号MAB885）と4℃で30分間インキュベートした。PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で3回洗浄した後、細胞を、FITC標識ヤギ抗マウスIgG（Dako, Heverlee, ベルギー；カタログ番号F049702）と4℃で30分間、暗所でインキュベートした。次に、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で2回洗浄し、120μL PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中に再懸濁して、FACS Cantoll（BD Biosciences）上で解析した。
【０４３６】
結合曲線を、GraphPad Prism V5.04ソフトウェア（GraphPad Software, San Diego, CA, USA）を使用し、非線形回帰（可変の勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて解析した。
【０４３７】
A431細胞をGas6とプレインキュベートした実験（n＝3）において、抗AXL抗体の最大結合値は、Gas6の非存在下での抗体結合に匹敵していた（Gas6プレインキュベーション後の最大結合は、Gas6プレインキュベーションを伴わない結合の90〜108％であった）（表6）。Gas6プレインキュベーションを伴うかまたは伴わないAXL抗体結合についてのEC50値は、同じ範囲であったか、または、Gas6プレインキュベーション後にいくらか増強されていた（表6）。
【０４３８】
A431細胞に対する対照AXL抗体YW327.6S2の結合は、Gasを伴わない結合と比較して、Gas6の存在下で大きく低減した。Gas6の存在下でのYW327.6S2の最大結合は、Gas6を伴わない結合の19％であり、A431細胞に対する結合についてのEC50値は、細胞をGas6とプレインキュベートしていた際に21倍高かった。
【０４３９】
A431細胞を抗AXL抗体とプレインキュベートした実験において、Gas6結合を評定した（n＝3）。A431細胞に対するGas6の結合は、HuMab-AXL抗体とのプレインキュベーションを伴うかまたは伴わない場合で類似していた。細胞をHuMab（0.34〜0.83μg/mL）とプレインキュベートした際のGas6結合の平均EC50濃度、および最大Gas6結合は、陰性対照抗体b12の存在下でのGas6結合に類似していた（EC50濃度：0.40μg/mL；b12対照抗体の存在下でのGas6結合の95〜115％）。A431細胞に対するGas6の結合は、b12とのプレインキュベーションと比較して、対照AXL抗体YW327.6S2の存在下で大きく低減した（EC50濃度は14倍高かった）。対照抗体YW327.6S2の存在下でのGas6の最大結合は、陰性対照抗体b12の存在下での結合の17％であった。
【０４４０】
（表６）
2019509257.tif 000031
an.a.、適用不可能
*低い結合のためにEC50は精度が低い値である。
【０４４１】
実施例3‐抗AXL抗体パネルのエピトープマッピング研究
ヒト-マウスAXLキメラ分子を用いたAXLドメイン特異性の測定
AXL抗体のAXLドメイン特異性を、ヒト-マウスキメラAXL変異体のパネルを用いて測定した。ヒトIg様ドメインI（Ig1）、Ig様ドメインII（Ig2）、ヒトFNIII様ドメインI（FN1）、またはヒトFNIII様ドメインIIドメイン（FN2）のいずれかがそれらのマウスホモログで置き換えられた、5種の異なるキメラAXL分子を生成した。
【０４４２】
実施例1に記載されているように、AXLヒト-マウスキメラの発現用の以下のコドン最適化構築物を生成して、HEK293F細胞において発現させた。
ヒト（Homo sapiens）AXL（p33-HAHs-AXL）：（SEQ ID NO: 148）
2019509257.tif 000032
マウス（Mus musculus）AXL（p33-HAMm-AXL）：（SEQ ID NO: 149）
2019509257.tif 000033
ヒト（Homo sapiens）AXL - マウス（Mus musculus）Ig1ドメイン（p33-AXL-mIg1）：（SEQ ID NO: 150）
2019509257.tif 000034
ヒト（Homo sapiens）AXL - マウス（Mus musculus）Ig2ドメイン（p33-AXL-mIg2）：（SEQ ID NO: 151）
2019509257.tif 000035
ヒト（Homo sapiens）AXL - マウス（Mus musculus）FN1ドメイン（p33-AXL-mFN1）：（SEQ ID NO: 152）
2019509257.tif 000036
ヒト（Homo sapiens）AXL - マウス（Mus musculus）FN2ドメイン（p33-AXL-mFN2）：（SEQ ID NO: 153）
2019509257.tif 000037
【０４４３】
実施例2に記載されているように、ヒト-マウスAXLキメラに対する1μg/mL抗AXL抗体の結合を、フローサイトメトリーにより測定した。IgG1-b12を、アイソタイプ対照IgG1として含めた。
【０４４４】
すべての抗AXL抗体が、ヒトAXLに対する結合を示した（図2A）のに対して、ヒトAXL ECDがそのマウスホモログで置き換えられた際には、結合は撤廃されたか、または強く低減した（図2B）。ヒト-マウス交差反応性モノクローナルAXL抗体であるYW327.6S2を、hsAXL-mmECDの発現を確認するために含めた。
【０４４５】
抗AXL抗体107および613は、hsAXL-mmIg1に対して強く低減した結合を示し（図2C）、AXL Ig1ドメイン中のエピトープの認識が示された。IgG1-AXL-148およびIgG1-AXL-171は、hsAXL-mmIg2に対して強く低減した結合を示し（図2D）、AXL Ig2ドメイン中のエピトープの認識が示された。IgG1-AXL-154、IgG1-AXL-183、およびIgG1-AXL-733は、hsAXL-mmFN1に対して低減した結合を示し（図2E）、AXL FN1ドメイン中の結合エピトープを示した。最後に、IgG1-AXL-726の結合は、hsAXL-mmFN2において失われ（図2F）、FN2ドメイン内のエピトープの認識が示された。
【０４４６】
すべての抗AXL抗体についてのAXLドメイン特異性を、表7に要約する。
【０４４７】
（表７）
2019509257.tif 000038
an.d.、未決定
【０４４８】
AXL抗体の結合に関与するAXL細胞外ドメイン中のアミノ酸を特定するための高分解能エピトープマッピング
抗AXL抗体の結合に関与するAXL細胞外ドメイン中のアミノ酸を特定するために、細胞外ドメイン中にヒトAXL配列と変動するレベルの相同性を有する種に由来するAXL配列の組み換えによって、AXL配列バリアントのライブラリーを生成した。簡潔に言うと、ヒトAXL（Hs）をコードする発現プラスミドを、ハツカネズミ（Mm）、ハイイロジネズミオポッサム（Monodelphis domestica）（Md；フクロネズミ）、グリーンアノール（Anolis carolinensis）（Ac；トカゲ）、およびミドリフグ（Tetraodon nigroviridis）（Tn；フグ）のAXLホモログをコードするクローニングプラスミドと混合するか、またはその逆を行った。クローニングベクターまたは発現ベクターのいずれかに特異的な2種のプライマーの組み合わせを使用して、PCRサイクリング中に新生DNA複製鎖の融解およびリアニーリングを強要する、伸長時間が省略された、AXL細胞外ドメイン（ECD）を増幅するPCRを行った。両方のベクターから生じた終端を含有する組み換え産物に再び特異的な、ネスティッドPCRを用いて、完全長ECDを増幅した。
【０４４９】
結果として生じたAXL ECD PCR産物を、完全長AXLを創り出す発現ベクター中にクローニングし、結果として生じたプラスミドを、配列決定し、鋳型ベクターに対する最大の差によってランク付けし、最大の差別化力を有する最小の集合を創り出すように選択した。Hs、Mm、Md、Ac、およびTn由来のAXLホモログをコードするプラスミド、マウスIg1、Ig2、Fn1、またはFn2ドメインを有するHs AXLをコードする4種のヒト／マウスキメラプラスミド、ならびに組み換えライブラリー由来の16種の最も差別化するプラスミドを、製造業者（Life technologies）により供給された仕様書にしたがって、HEK293-F細胞中にトランスフェクトした。1μg/mLの抗AXL抗体を用いたFACS結合データを、変異が結合の喪失と相関した（+1）か、または相関しなかった（-1）かをアミノ酸あたりでスコア化することによってデコンボリューションし、その後、ベースライン補正および-5〜+5のスケールへの正規化を適用して、完全ECDにわたるアミノ酸あたりのインパクトスコアを結果として生じた。
【０４５０】
デコンボリューションした結合データを、結合に関与するアミノ酸として表9に要約する。結合部位の近傍での組み換え事象が欠如していたために、結合部位を高分解能でマップできなかった抗体を、分離されていないとして示す。
【０４５１】
実施例4‐Fc媒介性エフェクター機能
抗体依存性細胞媒介性細胞傷害（ADCC）
A431類表皮癌細胞のADCCを誘導する抗AXL抗体の能力を、下記に説明するように測定した。エフェクター細胞として、健常ボランティア由来の末梢血単核細胞（UMC Utrecht, オランダ）を使用した。
【０４５２】
標的細胞の標識
A431細胞を、培養培地（10％ウシ胎児血清（FSC）を補給したRPMI 1640培養培地）中に収集（5×106細胞）して、それに100μCi 51Cr（クロム-51；Amersham Biosciences Europe GmbH, Roosendaal, オランダ）を添加し、混合物を、37℃の水浴において1時間（hr）、振盪しながらインキュベートした。細胞の洗浄（PBS中で2回、1200 rpm、5分）後に、細胞を、RPMI1640/10％ FSC中に再懸濁して、トリパンブルー排除により計数した。細胞を、1×105細胞／mLの密度に希釈した。
【０４５３】
エフェクター細胞の調製
末梢血単核細胞（健常ボランティア、UMC Utrecht, Utrecht, オランダ）を、Ficoll（Bio Whittaker；リンパ球分離媒体、カタログ17-829E）により製造業者の説明書にしたがって、45 mLの新しく採取したヘパリン血から単離した。細胞のRPMI1640/10％ FSC中への再懸濁後に、細胞を、トリパンブルー排除により計数し、1×107細胞／mLの密度に希釈した。
【０４５４】
ADCCの設定
50μlの51Cr標識標的細胞を、96ウェルプレート中にピペットで移し、RPMI1640/10％ FSC中に希釈した（最終濃度範囲0.01〜10μg/mLの3倍希釈液）50μLの抗体を添加した。細胞をインキュベート（室温（RT）、15分）して、50μlのエフェクター細胞を添加し、100:1のエフェクター対標的比を結果として生じた（最大溶解の決定のために、エフェクター細胞の代わりに100μlの5％ Triton-X100を添加し；自然溶解の決定のために、50μLの標的細胞および100μLのRPMI1640/10％ FSCを使用した）。細胞を、37℃および5％ CO2で一晩インキュベートした。細胞をスピンダウン（1200 rpm、10分）した後、70μLの上清をmicronicチューブ中に採集して、γカウンターにおいてカウントした。特異的溶解のパーセンテージを、以下のように算出した：
特異的溶解％＝（試料のcpm-標的細胞のみのcpm）／（最大溶解のcpm-標的細胞のみのcpm）
式中、cpmは1分あたりのカウント数である。
【０４５５】
IgG1-AXL-183-N52QおよびIgG1-AXL-733は、10μg/mLの濃度でA431細胞において15〜21％のADCCを誘導した（図3）。IgG1-AXL-148、IgG1-AXL-726-M101L、IgG1-AXL-171、IgG1-AXL-613、IgG1-AXL-107、およびIgG1-AXL-154-M103Lは、10μg／mLまでの濃度でA431細胞において有意なADCCを誘導しなかった（図3）。
【０４５６】
実施例5‐AXL抗体-薬物コンジュゲート（AXL-ADC）の結合特性
HEK293T細胞に、完全長ヒトAXL用の発現構築物を一過性にトランスフェクトした（実施例1を参照されたい）。これらの細胞に対する抗AXL抗体およびAXL-ADCの結合を、フローサイトメトリーにより評定した。一過性にトランスフェクトしたHEK293細胞を、抗AXL抗体またはAXL-ADCの連続希釈液（4倍希釈液；最終濃度範囲0.003〜10μg/mL）と4℃で30分間インキュベートした。PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で3回洗浄した後、細胞を、100μLにおいて二次抗体と4℃で30分間、暗所でインキュベートした。二次抗体としては、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で1/100に希釈したR-フィコエリスリン(PE)コンジュゲートヤギ抗ヒトIgG F(ab')2（Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc., West Grove, PA；カタログ番号109-116-098）を使用した。次に、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で2回洗浄し、120μL PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中に再懸濁して、FACS Cantoll（BD Biosciences）上で解析した。
【０４５７】
結合曲線を、GraphPad Prism V5.04ソフトウェア（GraphPad Software, San Diego, CA, USA）を使用し、非線形回帰（可変の勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて解析した。
【０４５８】
図4は、ヒトAXL-ECDを発現するHEK293細胞に対する抗AXL抗体の結合が、AXL-ADCの結合に類似していたことを示す。
【０４５９】
実施例6‐AXL特異的抗体薬物コンジュゲートにより誘導されるインビトロ細胞傷害
LCLC-103H細胞（ヒト大細胞肺癌）細胞を、10％（体積／体積）熱不活化Cosmic Calf Serum（Perbio；カタログ番号SH30087.03）、2 mM L-グルタミン（Cambrex；カタログ番号US17-905C）、50 IU/mLペニシリン、および50μg/mLストレプトマイシン（Cambrex；カタログ番号DE17-603E）を補給した、L-グルタミンを含むRPMI1640（Cambrex；カタログ番号BE12-115F）中で培養した。MDA-MB-231細胞（ヒト乳癌）を、10％（体積／体積）熱不活化Cosmic Calf Serum（Perbio；カタログ番号SH30087.03）、1 mMピルビン酸ナトリウム（Cambrex；カタログ番号BE13-115E）、2 mM L-グルタミン（Cambrex；カタログ番号US17-905C）、100μM MEM NEAA（Invitrogen；カタログ番号11140）、50 IU/mLペニシリン、および50μg/mLストレプトマイシン（Cambrex；カタログ番号DE17-603E）を補給した、DMEM（Cambrex；カタログ番号BE12-709F）中で培養した。細胞株は、37℃で、5％（体積／体積）CO2加湿インキュベーターにおいて維持した。LCLC-103HおよびMDA-MB-231細胞を、コンフルエント近くまで培養し、その後、細胞をトリプシン処理して、培養培地中に再懸濁し、セルストレーナー（BD Falcon、カタログ番号352340）を通過させて、単一細胞懸濁液を取得した。1×103細胞を、96ウェル培養プレートの各ウェルに播種し、細胞を、室温で30分間、その後37℃、5％ CO2で5時間インキュベートして、プレートに接着させた。
【０４６０】
AXL抗体薬物コンジュゲート（AXL-ADC；実施例1を参照されたい）の連続希釈液（4倍；0.00015〜10μg/mLの範囲にわたる最終濃度）を培養培地中で調製し、プレートに添加した。細胞と1μMスタウロスポリン（#S6942-200, Sigma）とのインキュベーションを、100％腫瘍細胞殺傷用の参照として使用した。無処置の細胞を、0％腫瘍細胞殺傷用の参照として使用した。プレートを、37℃、5％ CO2で5日間インキュベートした。次に、CellTiter-Glo Reagent（Promega；カタログ番号G7571）をウェルに添加して（ウェルあたり20μL）、プレートを37℃、5％ CO2で1.5時間インキュベートした。その後、ウェルあたり180μLを、白色96ウェルOptiplate（商標）プレート（PerkinElmer, Waltham, MA；カタログ番号6005299）に移して、室温で30分間インキュベートした。最後に、発光を、EnVisionマルチプレートリーダー（Envision, Perkin Elmer）上で測定した。
【０４６１】
AXL-ADCであるIgG1-AXL-148-vcDuo3、IgG1-AXL-183-vcDuo3、およびIgG1-AXL-726-vcDuo3は、図5Aに示されているように、0.01〜0.06μg/mLの間のIC50値で、LCLC-103H細胞において細胞傷害を誘導した。同様に、図5Bは、これらのAXL-ADCが、0.005〜0.015μg/mLの間のIC50値でMDA-MB-231細胞の細胞傷害を誘導したことを示す。
【０４６２】
実施例7‐AXLに対する結合を可能にする抗体VHおよびVLのバリアント
VHまたはVL領域におけるアミノ酸残基の決定的または許容的な変化を特定するために、（実施例1に記載されている）抗AXL抗体パネルのVHおよびVL領域のタンパク質配列を、整列させて、AXL結合について比較した。そのために、同一のVHまたはVL領域を有する抗体を、グループ化して、それぞれ、ヒトAXLに対する結合およびVLまたはVH配列における差について比較した。HEK-293F細胞により一過性に発現されるヒトAXLに対する結合を、実施例1に記載されているような均質抗原特異的スクリーニングアッセイにおいて評価した。本実施例において行われたアラインメントについてのアミノ酸位置のナンバリングは、図6に提示される配列に基づいて行われ、すなわち、示される配列における1番目のアミノ酸を位置「1」とナンバリングし、2番目を位置「2」とする、などであった。
【０４６３】
最初に、同一のVL配列を有する抗体をグループ化した。
【０４６４】
IgG1-AXL-148およびIgG1-AXL-140は、同一のVL配列を有することが見出され、HC CDR3領域中に1個のアミノ酸の差を示した（アミノ酸位置109でIに対してF；図6A）。抗体は両方ともヒトAXLに結合して（表8）、位置109のアミノ酸は抗体結合にとって不可欠ではないことが示され、CDR2領域において特定された変異（アミノ酸位置56でAに対してG）は結合の喪失を補償しないことが仮定された（図6A）。
【０４６５】
IgG1-AXL-726およびIgG1-AXL-187は、同一のVL配列を有することが見出され、抗体は両方ともヒトAXLに結合した（表8）。HC CDR3領域中の2個のアミノ酸残基の変化（位置97でSに対してR、および位置105でTに対してA；図6B）が、結合を失うことなく可能とされ、CDR1において特定された変異（位置32でHに対してY）および／またはフレームワーク領域において特定された変異（P3Q、V24I、Y25D、T86A、およびT117A）は、結合の喪失を補償しないことが仮定された（図6B）。
【０４６６】
IgG1-AXL-171、IgG1-AXL-172、およびIgG1-AXL-181は、同一のVL配列を有することが見出され、すべての抗体はヒトAXLに結合した（表8）。これらの3種の抗体のCDR3領域は同一であったが、HC CDR1中のアミノ酸残基の変化（位置31でNに対してS）またはフレームワーク領域中のアミノ酸残基の変化（位置82でQに対してH）が、結合を失うことなく可能とされた（図6C）。
【０４６７】
IgG1-AXL-613、IgG1-AXL-608-01、IgG1-AXL-610-01、およびIgG1-AXL-620-06は、同一のVL配列を有することが見出され、HC CDR3領域中に1個のアミノ酸の差を示した（アミノ酸位置101でDに対してN；図6D）。すべての抗体はヒトAXLに結合して（表8）、位置101のアミノ酸は不可欠ではないことが示され、HC CDR2において特定された変異（位置58でAに対してV）および／またはフレームワーク領域において特定された変異（N35S、M37V、A61V、L70I、S88A）は、結合の喪失を補償しないことが仮定された（図6D）。
【０４６８】
次に、同一のVH配列を有する抗体をグループ化した。
【０４６９】
IgG1-AXL-613およびIgG1-AXL-613-08は、同一のVH配列を有することが見出され、LCのCDR3領域中に5個のアミノ酸の差を示した（位置92〜96でYGSSYに対してRSNWL；図6E）。抗体は両方ともヒトAXLに結合して（表8）、位置92〜96でのアミノ酸の変動が可能とされ、抗体結合に影響を及ぼさないことが示され、CDR1において特定された変異（位置30でSの欠失）、CDR2において特定された変異（G51D）、および／またはフレームワーク領域において特定された変異（G9A、S54N、R78S、Q100G、L104V）は、結合の喪失を補償しないことが仮定された（図6E）。
【０４７０】
（表８）
2019509257.tif 000039
【０４７１】
実施例8‐抗AXL抗体へのMMAEのコンジュゲーションおよびMMAEコンジュゲートAXL抗体により誘導されるインビトロ細胞傷害
抗AXL抗体へのMMAEのコンジュゲーション
抗AXL抗体を、標準的な手順にしたがってプロテインAクロマトグラフィーにより精製し、vcMMAEにコンジュゲートした。文献に記載されている手順にしたがって（Sun et al., 2005、McDonagh et al., 2006、および Alley et al., 2008 を参照されたい）、薬物-リンカーvcMMAEを、還元された抗体のシステインにアルキル化した。過剰量のN-アセチルシステインの添加によって、反応を終息させた。いずれの残りのコンジュゲートされていない薬物も、精製によって除去し、最終的な抗AXL抗体薬物コンジュゲートを、PBSにおいて製剤化した。抗AXL抗体薬物コンジュゲートを、その後、濃度（280 nmでの吸光度により）、逆相クロマトグラフィー（RP-HPLC）および疎水性相互作用クロマトグラフィー（HIC）により薬物対抗体の比（DAR）、コンジュゲートされていない薬物の量（逆相クロマトグラフィーにより）、凝集のパーセンテージ（サイズ排除クロマトグラフィー、SEC-HPLCにより）、ならびにエンドトキシンレベル（LALにより）について解析した。結果を、下記の表9に示す。
【０４７２】
（表９）抗体-薬物コンジュゲートの様々な特性の概要
2019509257.tif 000040
【０４７３】
細胞培養
LCLC-103H細胞（ヒト大細胞肺癌）およびA431細胞（DMSZ, Braunschweig, ドイツ）を、10％（体積／体積）熱不活化Cosmic Calf Serum（Perbio；カタログ番号SH30087.03）、2 mM L-グルタミン（Cambrex；カタログ番号US17-905C）、50 IU/mLペニシリン、および50μg/mLストレプトマイシン（Cambrex；カタログ番号DE17-603E）を補給した、L-グルタミンを含むRPMI1640（Cambrex；カタログ番号BE12-115F）中で培養した。MDA-MB231細胞を、高グルコースおよびHEPESを含むDMEM（Lonza #BE12-709F）、Donor Bovine Serum with Iron（Life Technologies #10371-029）、2 mM L-グルタミン（Lonza #BE17-605E）、1 mMピルビン酸ナトリウム（Lonza #BE13-115E）、およびMEM Non-Essential Amino Acids Solution（Life Technologies #11140）中で培養した。細胞株は、37℃で、5％（体積／体積）CO2加湿インキュベーターにおいて維持した。LCLC-103H、A431、およびMDA-MB231細胞を、コンフルエント近くまで培養し、その後、細胞をトリプシン処理して、培養培地中に再懸濁し、セルストレーナー（BD Falcon、カタログ番号352340）を通過させて、単一細胞懸濁液を取得した。1×103細胞を、96ウェル培養プレートの各ウェルに播種し、細胞を、室温で30分間、その後37℃、5％ CO2で5時間インキュベートして、プレートに接着させた。
【０４７４】
細胞傷害アッセイ
MMAEコンジュゲートAXL抗体の連続希釈液（0.00015〜10μg/mLの範囲にわたる最終濃度）を培養培地中で調製し、プレートに添加した。細胞と1μMスタウロスポリン（#S6942-200, Sigma）とのインキュベーションを、100％腫瘍細胞殺傷用の参照として使用した。無処置の細胞を、100％細胞成長用の参照として使用した。プレートを、37℃、5％ CO2で5日間インキュベートした。次に、CellTiter-Glo Reagent（Promega；カタログ番号G7571）をウェルに添加して（ウェルあたり20μL）、プレートを37℃、5％ CO2で1.5時間インキュベートした。その後、ウェルあたり180μLを、白色96ウェルOptiplate（商標）プレート（PerkinElmer, Waltham, MA；カタログ番号6005299）に移して、室温で30分間インキュベートした。最後に、発光を、EnVisionマルチプレートリーダー（Envision, Perkin Elmer）上で測定した。
【０４７５】
MMAEコンジュゲートAXL抗体は、表10および図7に示されているように、0.004〜0.219μg/mLの間の濃度で、LCLC-103H細胞において50％細胞殺傷を誘導した。
【０４７６】
同様に、AXL-ADCは、A431細胞（表11および図15A）ならびにMDA-MB231細胞（表11および図15B）において細胞傷害を効率的に誘導した。
【０４７７】
（表１０）LCLC-103H細胞におけるMMAEコンジュゲートAXL抗体の細胞傷害（EC50値）
2019509257.tif 000041
【０４７８】
（表１１）A431およびMDA-MB-231細胞におけるMMAEコンジュゲートAXL抗体の細胞傷害（EC50値）
2019509257.tif 000042
*IgG1-AXL-vcMMAEは、本明細書では「HuMax-AXL-ADC」とも呼ばれる。
【０４７９】
実施例9‐SCIDマウスにおけるLCLC-103H腫瘍異種移植片のMMAEコンジュゲート抗AXL抗体での治療的処置
MMAEコンジュゲート抗AXL抗体のインビボ効力を、確立されたSCIDマウスにおける皮下（SC）LCLC-103H異種移植腫瘍において測定した。200μL PBS中の5×106個のLCLC-103H（大細胞肺癌）腫瘍細胞（Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ)から取得）を、雌SCIDマウスの右側腹部の皮下に注射した。平均腫瘍サイズが100〜200 mm3よりも大きく、明瞭な腫瘍成長が観察された、腫瘍細胞接種の14〜21日後に開始して、1 mg/kg（20μg／マウス）のIgG1-AXL-vcMMAE抗体（補足的な実施例1に記載されている）または対照（コンジュゲートされていないIgG1-b12）での単回注射を、腹腔内に与えた（100μL／マウス）。腫瘍体積を、少なくとも週あたり2回測定した。腫瘍体積（mm3）を、キャリパー（PLEXX）測定値から0.52×（長さ）×（幅）2として算出した。
【０４８０】
抗AXL-vcMMAE抗体のパネルは、確立されたSC LCLC-103H腫瘍において広範囲の抗腫瘍活性を示した（図8）。クローンIgG1-AXL-733-vcMMAE、IgG1-AXL-107-vcMMAE、およびIgG1-AXL-148-vcMMAEは、腫瘍退縮を誘導し、クローンAXL-171-vcMMAE、IgG1-AXL-511-vcMMAE、およびIgG1-AXL-613-vcMMAEは、腫瘍成長阻害を誘導し、クローンIgG1-AXL-154-M103L-vcMMAE、IgG1-AXL-183-N52Q-vcMMAE、およびIgG1-AXL-726-M101L-vcMMAEは、腫瘍成長阻害を示さなかったか、または軽微の腫瘍成長阻害のみを示した。
【０４８１】
一元配置分散分析（対照IgG1-b12に対するダネットの多重比較検定）を用いた、すべての群が無傷であった最後の日（30日目）の統計解析により、IgG1-b12対IgG1-AXL-733-vcMMAE、IgG1-AXL-107-vcMMAE、およびIgG1-AXL-148-vcMMAEの間で腫瘍体積における非常に有意な差（p＜0.0001）が示された。これらのクローンでの処置は、これらの群内のいくつかのマウスにおいて、完全な腫瘍低減につながった。クローンIgG1-AXL-171-vcMMAE、IgG1-AXL-511-vcMMAE、およびIgG1-AXL-613-vcMMAEでの処置もまた、IgG1-b12と比較して有意な腫瘍成長阻害を示したが、差はさほど明白ではなかった（p＜0.05〜p＜0.001）。クローンIgG1-AXL-154-M103L-vcMMAE、IgG1-AXL-183-N52Q-vcMMAE、およびIgG1-AXL-726-M101L-vcMMAEで処置したマウスの腫瘍成長は、IgG1-b12対照と比較して有意に影響を受けなかった。
【０４８２】
抗AXL-vcMMAE抗体の抗腫瘍活性は、種々の他のインビボ腫瘍モデルにおいて観察された。2種の細胞株由来の異種移植モデル（A431；類表皮腺癌、およびMDA-MB-231；乳癌）において、抗AXL-vcMMAE抗体は腫瘍成長阻害を誘導し、腫瘍退縮が、膵臓癌および子宮頸癌を有する患者からの2種の患者由来の異種移植モデルにおいて、抗AXL-vcMMAE抗体により誘導された。
【０４８３】
実施例10‐不均質な標的発現を有する膵臓癌患者由来の異種移植（PDX）モデルにおけるAXL-ADCの抗腫瘍効力
IgG1-AXL-107-vcMMAE、IgG1-AXL-148-vcMMAE、およびIgG1-AXL-733-vcMMAEの抗腫瘍活性を、PAXF1657膵臓癌PDXモデルにおいて測定した（Oncotest, Freiburg, ドイツにより行われた実験）。ヒト膵臓腫瘍組織を、5〜7週齢の雌NMRI nu/nuマウスの左側腹部の皮下に移植した。動物の無作為化を、以下のように行った：50〜250 mm3、好ましくは80〜200 mm3の間の体積の腫瘍を有する動物を、群腫瘍体積の比較可能な中央値および平均値を考慮して、7種の実験群（群あたり8匹の動物）に分配した。無作為化の日（0日目）に、3種のADCを、4 mg/kgまたは2 mg/kgのいずれかで静脈内に（i.v.）投与し、対照群は、単一用量のIgG1-b12（4 mg/kg）を受けた。腫瘍体積（mm3）を、週に2回モニターして、キャリパー（PLEXX）測定値から0.52×（長さ）×（幅）2として算出した。
【０４８４】
PAXF1657腫瘍の染色を、標準的な免疫組織化学技術で行った。簡潔に言うと、凍結組織を、アセトンで10分間固定化し、内在性ペルオキシダーゼを、過酸化水素を用いて消耗させた。その後、組織切片を正常マウス血清でブロッキングし、5μg/mLの、5種のIgG1-AXL抗体（IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-137、IgG1-AXL-148、IgG1-AXL-183、IgG1-AXL-726）のプールとのインキュベーションによって染色を行った。西洋ワサビペルオキシダーゼ（HRP）コンジュゲートの二次抗体とのインキュベーション後に、HRPを、アミノエチルカルバゾール（AEC；赤色を結果として生じる）で可視化した。各スライドを、核を特定するためにヘマトキシリン（青色）で対比染色し、glycergel中にカバーガラスをかけた。免疫染色した組織切片を、手動Zeiss顕微鏡（AxioSkop）上で10倍および40倍の倍率でデジタル化した。
【０４８５】
図9は、PAXF1657腫瘍における不均質なAXL発現を示す。強いAXL染色が、いくつかの腫瘍細胞において観察されるが、他の細胞はAXL染色を示していない。白黒写真において、AXL染色は濃い灰色として見える。ヘマトキシリン染色（核）は、薄い灰色として見える。
【０４８６】
図10Aは、2 mg/kgのIgG1-AXL-107-vcMMAE、IgG1-AXL-148-vcMMAE、およびIgG1-AXL-733-vcMMAEでのマウスの処置が、対照群と比較して、PAXF1657腫瘍の成長を有意に低減させたことを示す。4 mg/kgの用量で、IgG1-AXL-107-vcMMAE、IgG1-AXL-148-vcMMAE、およびIgG1-AXL-733-vcMMAEは、PAXF1657腫瘍の腫瘍退縮を誘導した。処置後の14日目に、2 mg/kgまたは4 mg/kgのIgG1-AXL-107-MMAE、IgG1-AXL-148-MMAE、またはIgG1-AXL-733-MMAEで処置していたマウスにおける平均腫瘍サイズは、アイソタイプ対照IgG（IgG1-b12）で処置していたマウスにおけるよりも有意に小さかった（p＜0.001；チューキーの多重比較検定）。
【０４８７】
コンジュゲートされていないIgG1-AXL-148でのマウスの処置は、PAXF1657モデルにおいて抗腫瘍活性を結果としてもたらさなかった（図10B）。しかし、コンジュゲートされたIgG1-AXL-148-vcMMAEは、このモデルにおいて用量依存性抗腫瘍活性を誘導し（図10B）、AXL-ADCの治療能力はMMAEの細胞傷害活性に依存していることが示された。
【０４８８】
さらに、標的化されていないADCであるIgG1-b12-vcMMAEでのマウスの処置は、PAXF1657モデルにおいて抗腫瘍活性を示さず（図10C）、AXL-ADCの治療能力は特異的な標的結合にも依存することが示された。
【０４８９】
実施例11‐Ig1ドメインに結合するAXL抗体
AXL抗体IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-107、IgG1-AXL-137、およびIgG1-AXL-613のAXLドメイン特異性を、ヒト-マウスキメラAXL変異体のパネルを用いて測定した。ヒト-マウス交差反応性モノクローナルAXL抗体であるYW327.6S2を、hsAXL-mmECDの発現を確認するために含めた。IgG1-b12を、アイソタイプ対照抗体として含めた。実施例3に記載されているように、5種の異なるキメラAXL分子を生成して、HEK293Fにおいて発現させた。簡潔に言うと、ヒトIg様ドメインI（Ig1）、Ig様ドメインII（Ig2）、ヒトFNIII様ドメインI（FN1）、またはヒトFNIII様ドメインIIドメイン（FN2）を、それらのマウスホモログで置き換えた。実施例2に記載されているように、ヒト-マウスAXLキメラに対する1μg/mL抗AXL抗体の結合を、フローサイトメトリーにより測定した。
【０４９０】
すべての抗AXL抗体が、ヒトAXLに対する結合を示した（図11A）のに対して、ヒトAXL ECDがそのマウスホモログで置き換えられた際には、結合は撤廃された（図11B）。期待されたように、ヒト-マウス交差反応性モノクローナルAXL抗体YW327.6S2は、hsAXL-mmECDに対する結合を示し、hsAXL-mmECDの妥当な発現が確認された。
【０４９１】
AXL抗体IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-107、IgG1-AXL-137、およびIgG1-AXL-613は、hsAXL-mmIg1に対して強く低減した結合を示し（図11C）、AXL Ig1ドメイン中のエピトープの認識が示された。これと合致して、IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-107、IgG1-AXL-137、およびIgG1-AXL-613のhsAXL-mmIg2（図11D）、hsAXL-mmFN1（図11E）、またはhsAXL-mmFN2（図11F）に対する結合は、影響を受けなかった。ヒト-マウス交差反応性モノクローナルAXL抗体YW327.6S2は、すべてのキメラAXLバリアントに対する結合を示し、これらのタンパク質の妥当な発現が確認された。
【０４９２】
実施例12‐AXL抗体IgG1-AXL-107およびIgG1-AXL-613はIg1ドメインに結合するが、Gas6結合と競合しない
AXL抗体IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-107、IgG1-AXL-137、またはIgG1-AXL-613の結合が、AXLリガンドであるGas6のAXLに対する結合を干渉するかどうかを試験した。そのために、実施例2に記載されているように、10μg/mL AXL抗体とプレインキュベートしていたA431細胞に対するGas6の結合を試験した。AXL結合についてGas6と競合することが記載されたAXL抗体YW327.6S2、IgG1-b12（アイソタイプ対照）、または培地（陰性対照）とのプレインキュベーションを、対照として含めた。
【０４９３】
結合曲線を、GraphPad Prism V5.04ソフトウェア（GraphPad Software, San Diego, CA, USA）を使用した非線形回帰（可変の勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて解析した。
【０４９４】
図12および表12は、IgG1-AXL-107およびIgG1-AXL-613抗体とプレインキュベートしていたA431細胞に対するGas6の結合が、IgG1-b12および培地対照に類似していたことを示す。これは、実施例2に示されているように、AXLに対するIgG1-AXL-107およびIgG1-AXL-613の結合が、Gas6結合を干渉しないことを示す。A431細胞に対するGas6の結合は、IgG1-b12および培地対照と比較して、IgG1-AXL-061、IgG1-AXL-137、および対照AXL抗体YW327.6S2の存在下で大きく低減した。
【０４９５】
A431細胞をGas6とプレインキュベートした実験において、IgG1-AXL-107およびIgG1-AXL-613の最大結合値は、Gas6の非存在下での抗体結合に匹敵していた（Gas6プレインキュベーション後の最大結合は、Gas6プレインキュベーションを伴わない結合の91〜108％であった）（表12）。Gas6プレインキュベーションを伴うかまたは伴わない、IgG1-AXL-107およびIgG1-AXL-613結合についてのEC50値は、同じ範囲であったか、またはGas6プレインキュベーション後にいくらか高く（表12）、IgG1-AXL-107およびIgG1-AXL-613がGas6結合と競合しないことが示された。
【０４９６】
対照抗体YW327.6S2と同様に、A431細胞に対するIgG1-AXL-061およびIgG1-AXL-137の結合は、Gas6を伴わない結合と比較して、Gas6の存在下で大きく低減した（Gas6プレインキュベーション後の最大結合は、Gas6プレインキュベーションを伴わない結合の40〜43％であった；表12）。IgG1-AXL-061およびIgG1-AXL-137についてのEC50値は、Gas6プレインキュベーション後には妥当に決定できなかった（表12）。これは、IgG1-AXL-061およびIgG1-AXL-137がAXLへの結合についてGas6と競合することを示す。
【０４９７】
これらのデータは、AXL Ig1ドメインに結合する抗体が、Gas6結合に対して差別的な効果を有することを実証する。
【０４９８】
（表１２）
2019509257.tif 000043
an.a.、適用不可能
*低い結合のためにEC50は精度が低い値である。
【０４９９】
実施例13‐自己分泌（内在性）Gas6産生を伴うおよび伴わない異種移植モデルにおけるAXL-ADCのインビボ抗腫瘍効力
A431およびLCLC-103H腫瘍細胞のGas6産生
A431細胞およびLCLC-103H細胞がGas6を産生するかどうかを試験した。そのために、細胞を、完全培養培地中で3日間成長させた。上清中のGas6レベルを、Quantikine Human Gas6 ELISA（R&D Systems, Minneapolis, MN）を用い、製造業者の説明書にしたがって決定した。このアッセイは、定量的サンドイッチELISA技術を使用する。ヒトGas6に特異的なモノクローナルAbが、マイクロプレート上にプレコーティングされている。標準品および試料をウェル中にピペットで移すと、存在する任意のヒトGas6が、固定されたAbによって結合される。任意の結合していない物質を洗浄して除去した後、ヒトGas6に特異的な酵素連結ポリクローナルAbをウェルに添加する。任意の結合していないAb-酵素試薬を除去するための洗浄後に、基質をウェルに添加すると、最初の工程において結合したヒトGas6の量に比例して色が顕出する。顕色を停止して、色の強度を測定する。
【０５００】
A431細胞によって調整された細胞培養培地は、2576 ng/mLのGas6を含有することが見出され、他方、LCLC-103H細胞によって調整された培地中のGas6の濃度は、20倍より大きく、低かった（表13）。
【０５０１】
（表１３）腫瘍細胞調整培地中のGas6産生
2019509257.tif 000044
【０５０２】
インビボでのAXL-ADCの抗腫瘍活性
IgG1-AXL-061-vcMMAE（Ig1結合剤）、IgG1-AXL-107-vcMMAE（Ig1結合剤）、IgG1-AXL-137-vcMMAE（Ig1結合剤）、IgG1-AXL-148-vcMMAE（Ig2結合剤）、IgG1-AXL-183-vcMMAE（FN1結合剤）、およびIgG1-AXL-726-vcMMAE（FN2結合剤）のインビボ抗腫瘍活性を、高レベルのGas6を産生するA431（類表皮癌）腫瘍モデル、および、低レベルのGas6を産生するLCLC-103H（大細胞肺癌）腫瘍モデルにおいて測定した。
【０５０３】
腫瘍誘導を、200μL PBS中の5×106個のA431またはLCLC-103H腫瘍細胞（両方ともLeibniz-Institut - Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ)から取得）の、雌SCIDマウスの右側腹部における皮下注射によって行った。処置は、平均腫瘍サイズが100〜200 mm3よりも大きく、明瞭な腫瘍成長が観察された、腫瘍細胞接種の14〜21日後に開始した。マウスは、示されているように、IgG1-AXL-vcMMAE ADCまたは対照抗体（コンジュゲートされていないIgG1-b12）での単回注射、または合計で4回の週2回の腹腔内注射を受けた。腫瘍体積を、少なくとも週あたり2回測定した。腫瘍体積（mm3）を、キャリパー（PLEXX）測定値から0.52×（長さ）×（幅）2として算出した。
【０５０４】
図13Aは、3 mg/kgのIgG1-AXL-107-vcMMAE、IgG1-AXL-148-vcMMAE、およびIgG1-AXL-733-vcMMAEでのマウスの処置が、A431腫瘍の成長阻害を誘導したことを示す。
【０５０５】
図13Bは、3 mg/kgのIgG1-AXL-148-vcMMAE、IgG1-AXL-183-vcMMAE（FN1結合剤）、およびIgG1-AXL-726-vcMMAE（FN2結合剤）でのマウスの処置が、A431腫瘍の成長阻害を誘導したことを示す。対照的に、クローンIgG1-AXL-061-vcMMAEおよびIgG1-AXL-137-vcMMAEは、A431異種移植モデルにおいて抗腫瘍活性を示さなかった。
【０５０６】
図14Aは、3 mg/kgのIgG1-AXL-061-vcMMAE、IgG1-AXL-137-vcMMAE、IgG1-AXL-148-vcMMAE、IgG1-AXL-183-vcMMAE、およびIgG1-AXL-726-vcMMAEでのマウスの処置が、LCLC-103H異種移植モデルにおいて腫瘍退縮を誘導したことを示す。同様に、1 mg/kgのIgG1-AXL-107-vcMMAEまたは1 mg/kgのIgG1-AXL-613-vcMMAEでのマウスの処置は、LCLC-103H腫瘍の退縮を誘導した（図14B）。
【０５０７】
要約すると、すべてのAXL-ADCは、低レベルのGas6を産生するLCLC-103H異種移植モデルにおいて抗腫瘍活性を示した。高レベルのGas6を産生するA431異種移植モデルにおいて、抗腫瘍活性は、AXLリガンドであるGas6と競合しなかったAXL-ADCについてのみ観察された。
【０５０８】
実施例14‐様々な腫瘍徴候におけるAXL発現
AXLの発現を、甲状腺癌、食道癌、卵巣癌、膵臓癌、肺癌、乳癌、子宮頸癌もしくは子宮内膜癌、または悪性メラノーマを有する患者由来の組織コアを含む、新しく切ったパラフィン包埋、ホルマリン固定（FFPE）の腫瘍組織マイクロアレイ（TMA）において評定した。TMAは、US BioMaxから取得した。
【０５０９】
FFPE腫瘍アレイスライドを、脱パラフィン化して抗原復旧（pH 6）に供し、内在性ペルオキシダーゼを、クエン酸／リン酸緩衝液中の0.1％ H2O2とのインキュベーションによって消耗させた。AXL発現を検出するために、TMAを、1μg/mLの濃度のウサギ抗AXL（Santa Cruz、カタログ番号：sc-20741）と60分間インキュベート（室温（RT））した。上皮起源の（腫瘍）細胞を特定するために、TMAを、1:50の希釈のウサギ抗サイトケラチン（Abcam、カタログ番号ab9377）と60分間インキュベート（RT）した。洗浄工程後に、TMAを、ペルオキシダーゼコンジュゲートの抗ウサギIgGデキストランポリマー（ImmunoLogic、カタログ番号：DPVR55HRP）とインキュベートして、ウサギ抗AXL抗体およびウサギ抗サイトケラチン抗体の結合を検出した。最後に、抗ウサギIgGデキストランポリマーの結合を、ジアミノベンジジン（DAB；茶色；DAKO、カタログ番号：K346811）で可視化した。悪性メラノーマ組織コアを有するTMAにおいては、抗ウサギIgGデキストランポリマーの結合を、アミノエチルカルバゾール（AEC；赤色；Vector、SK4200）で可視化した。TMAにおける核を、ヘマトキシリン（青色）で可視化した。
【０５１０】
AXLおよびサイトケラチンを免疫染色したTMAを、Aperioスライドスキャナーで20倍の倍率でデジタル化し、免疫染色を、細胞ベースのアルゴリズムを用いて、組織画像解析ソフトウェア（Definiens Tissue Studioソフトウェア、バージョン3.6.1）で定量した。アルゴリズムは、生検材料におけるAXLまたはサイトケラチンの陽性細胞のパーセンテージ（範囲0〜100％）を特定および定量するように、ならびに、各腫瘍コアにおけるAXL陽性腫瘍細胞のAXL染色強度（光学密度（OD）；範囲0〜3）を定量するように、設計された。AXL ODが少なくとも0.1であった場合に、腫瘍細胞をAXL陽性とスコア化した。腫瘍コアあたりのAXL陽性腫瘍細胞のパーセンテージ（範囲0〜100％）は、連続した腫瘍コアにおいて、AXL陽性細胞の総数をサイトケラチン陽性細胞の総数で割ることによって算出した。各腫瘍コアにおける平均AXL染色強度（OD）は、すべてのAXL陽性腫瘍細胞のAXL ODの和を、AXL陽性腫瘍細胞の数で割ることによって算出した。
【０５１１】
悪性メラノーマを有する患者由来の腫瘍アレイは、手動でスコア化した。AXL染色強度を、弱（1+）、中（2+）、または強（3+）のいずれかとしてスコア化し、AXL陽性メラノーマ細胞のパーセンテージを、10％間隔でスコア化した（範囲0〜100％）。
【０５１２】
図16は、甲状腺癌、食道癌、卵巣癌、乳癌、肺癌、膵臓癌、子宮頸癌、および子宮内膜癌の腫瘍コアにおけるAXL発現のグラフによる表示を提供する。表14は、各徴候について、腫瘍細胞の10％より多くにおいてAXL発現を示した腫瘍コアのパーセンテージを示す。図17は、各徴候について、AXLを免疫染色した組織コアの代表的な例を示す。図は、腫瘍組織におけるAXLの不均質な発現を示す。
【０５１３】
（表１４）
2019509257.tif 000045
使用した略語：NSCLC、非小細胞肺癌；SLCL、小細胞肺癌；TNBC、トリプルネガティブ乳癌
【０５１４】
実施例15‐AXL抗体はAXLに特異的に結合するが、他のTAM受容体ファミリーメンバーには結合しない
HEK-293F細胞におけるヒトAXL、MER、およびTYRO3の発現
種々の完全長タンパク質の発現用の以下のコドン最適化構築物を生成した：ヒト（ホモ・サピエンス）AXL（Genbankアクセッション番号NP_068713.2）、ヒトMER（Genbankアクセッション番号EAW52096.1）、およびヒトTYRO3（Genbankアクセッション番号Q06418.1）。  構築物は、クローニングに適している制限酵素部位および最適コザック（GCCGCCACC）配列（Kozak et al., 1999）を含有した。構築物を、哺乳動物発現ベクターpcDNA3.3（Invitrogen）にクローニングした。
【０５１５】
Freestyle商標293-F（浮遊増殖および化学的に定義されたFreestyle培地に適応したHEK-293サブクローン、（HEK-293F））細胞を、Invitrogenから取得して、293fectin（Invitrogen）を用い、製造業者の説明書にしたがって発現プラスミドをトランスフェクトして、24〜48時間増殖させた。
【０５１６】
ヒトAXL、ヒトMER、またはヒトTYRO3に対するAXL抗体の結合研究
完全長ヒトAXL、MER、またはTYRO3用の発現構築物を一過性にトランスフェクトしたHEK-293F細胞を、HuMab-AXL抗体の結合についてフローサイトメトリーにより評定した。トランスフェクトしたHEK-293F細胞を、AXL抗体の連続希釈液（4倍希釈液；最終濃度範囲0.002〜10μg/mL）と4℃で30分間インキュベートした。PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で3回洗浄した後、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で1/100に希釈したR-フィコエリスリン(PE)コンジュゲートヤギ抗ヒトIgG F(ab')2（Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc., West Grove, PA；カタログ番号109-116-098）とインキュベートした（最終体積100μL）。次に、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で2回洗浄し、120μL PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中に再懸濁して、FACS Cantoll（BD Biosciences）上で解析した。マウス抗ヒトMer（R&D Systems、カタログMab8912）およびマウス抗ヒトTyro3（Dtk）（R&D Systems、カタログMAB859）での染色を、発現についての対照として含め、IgG1-b12を、非結合アイソタイプ対照抗体として含めた。結合曲線を、GraphPad Prism V5.04ソフトウェア（GraphPad Software, San Diego, CA, USA）を使用し、非線形回帰（可変の勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて解析した。
【０５１７】
図18Aは、Humab-AXL抗体が、ヒトAXLを発現するHEK293細胞に対して用量依存性結合を示したことを示す。対照的に、MERを発現する細胞（図18B）もしくはTYRO3を発現する細胞（図18C）、またはトランスフェクトしていないHEK293細胞（図18D）に対するHuMab-AXL抗体の非結合が観察された。MERおよびTyro3に特異的な抗体での染色により、トランスフェクトした細胞は、それぞれ、MER（図18F）またはTYRO3（図18G）の妥当な発現を示したことが確認された。
【０５１８】
実施例16‐細胞表面に結合したAXL抗体の内部移行
フローサイトメトリーにより評定した、細胞表面に結合したHuMab-AXLの内部移行
MDA-MB-231およびCalu-1細胞（ヒト肺癌細胞株；ATCC、カタログ番号HTB-54）に対する、細胞表面に結合したHuMab-AXL抗体の内部移行を、フローサイトメトリーにより評定した。50,000細胞を、96ウェル組織培養プレートに播種して、37℃で6時間付着させた。プレートを、AXL抗体の連続希釈液（最終濃度範囲0.0032〜10μg/mL）との4℃で1時間のインキュベーション前に、4℃で30分間インキュベートした。その後、培地を、抗体を含まない組織培養培地により置き換え、細胞を、37℃または4℃で一晩（16〜18時間）インキュベートした。その後、細胞表面上のAXL抗体を検出するために、細胞を、40μLの温かいトリプシン溶液で剥離し、氷冷PBS/0.1％ BSA/0.02％アジドで洗浄し、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で1/100に希釈したR-フィコエリスリン(PE)コンジュゲートヤギ抗ヒトIgG F(ab')2（Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc., West Grove, PA；カタログ番号109-116-098）と4℃で30分間インキュベートした（最終体積100μL）。最後に、細胞を、PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中で2回洗浄し、120μL PBS/0.1％ BSA/0.02％アジド中に再懸濁して、FACS Cantoll（BD Biosciences）上で解析した。
【０５１９】
結合曲線を、GraphPad Prism V5.04ソフトウェア（GraphPad Software, San Diego, CA, USA）を使用し、非線形回帰（可変の勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて解析した。
【０５２０】
図19は、試験したすべてのAXL HuMab抗体についておよびすべての濃度で、抗体結合後に4℃でインキュベートしていた細胞の形質膜上に、37℃でインキュベートしていた細胞と比較してより多くの抗体が検出されたことを示す。これは、37℃で、AXL抗体が、形質膜への結合時に内部移行されることを示す。
【０５２１】
Fab-TAMRA/QSY7内部移行および細胞内分解アッセイ
AXL抗体の内部移行を、Fab-TAMRA/QSY7内部移行アッセイにおいて評価した。このアッセイは、蛍光体（TAMRA）と消光剤（QSY7）のペアを使用する。きわめて接近すると、例えば、同じタンパク質へのコンジュゲーション時に、TAMRA蛍光はQSY7によって消光される。この実施例においては、ヤギ抗ヒトIgG Fab断片（Jackson Immunoresearch）を、記載されているように（Ogawa et al. Mol Pharm 2009;6(2):386-395）TAMRA/QSY7とコンジュゲートして（Fab-TAMRA/QSY7）、AXL HuMab（1.5μg/mL）を、Fab-TAMRA/QSY7とプレインキュベートした（12μg/mL；30分、4℃）。複合体をその後、LCLC-103H細胞に添加して、振盪条件（200 rpm、37℃）下で、24時間のインキュベートの間、暗所でインキュベートした。HuMab-Fab-TAMRA/QSY7複合体の内部移行、ならびにエンドソームおよびリソソームにおける細胞内分解は、TAMRA/QSY7の解離を引き起こし、TAMRAの脱消光（dequenching）を結果としてもたらす。Fab-TAMRA/QSY7と複合体形成したAXL抗体とインキュベートしていたLCLC-103H細胞のTAMRA蛍光を、FACS CantoII（BD Biosciences）上で測定した。
【０５２２】
図20に示されているように、LCLC-103H細胞の蛍光強度は、AXL抗体-Fab-TAMRA/QSY7複合体とのインキュベーション時に、IgG1-b12-Fab-TAMRA/QSY7またはFab-TAMRA/QSY7単独と比較して増強された。これは、AXL抗体が、LCLC-103H細胞への結合時に内部移行されることを示す。
【０５２３】
実施例17 - インビトロおよびインビボにおいて、BRAF阻害剤PLX4720に対する耐性は、アップレギュレートされたAxlタンパク質発現およびIgG1-AXL-107-vcMMAEに対する高い感受性と関連している
樹立ヒトメラノーマ細胞株(CDX)および患者由来の低継代メラノーマ細胞株(PDX)のパネルにおいて、Axlタンパク質の発現レベルを、BRAF阻害剤PLX4720(臨床的に承認されたBRAF阻害剤ベムラフェニブの類似体)での処置による増殖抑制に対するそれらの内因性耐性または獲得耐性との関連で、評価した。さらに、IgG1-AXL-107-vcMMAEでの処置に対するメラノーマ細胞の感受性をインビトロおよびインビボにおいて評価した。
【０５２４】
細胞培養
SKMEL147は、オランダ癌研究所(Netherlands Cancer Institute)のReuven Agami研究室から入手した。A875はThermo Fisher社から、COLO679はSigma社から、SKMEL28およびA375細胞はATCCから入手した。メラノーマ細胞株は、10％ウシ胎仔血清(Sigma社)、100U/mlペニシリンおよび0.1mg/mlストレプトマイシン(全てGibco社)を補充したDMEM中で培養した。これらの細胞株は、5％(vol/vol)CO2加湿インキュベータ内で37℃に維持した。
【０５２５】
PLX4720耐性細胞株の作製
BRAF阻害剤感受性細胞株(SKMEL28およびA375)を3μMまでの漸増濃度のBRAF阻害剤PLX4720(会社: Selleck Chemicals, Houston, TX, 米国, カタログ番号: S1152)の存在下で培養して、対応するPLX4720耐性SKMEL28RおよびA375Rを樹立した。全ての薬剤耐性細胞株は、3μMのPLX4720の存在下で永続的に培養した。
【０５２６】
患者由来の低継代(PDX)メラノーマ細胞株の作製
オランダ癌研究所のAntoni van Leeuwenhoek病院の医療倫理委員会は、ヒト組織の採取と使用を承認した。動物実験は、同研究所の動物実験委員会によって承認され、適用すべき規則および法規に従って実施した。ヒト腫瘍材料は、手術中に取得するか、または14ゲージ針を用いて悪性メラノーマ患者から腫瘍生検を採ることによって得た。約5mm3の腫瘍断片をNOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1wjl/SzJマウスの皮下移植に使用し、移植を麻酔下で行った。腫瘍の成長をキャリパーで週2回測定した。腫瘍サイズが1000mm3に達する前に、マウスを犠牲にし、腫瘍を摘出し、腫瘍片を単細胞懸濁液へと解離させ、10cm培養皿上にプレーティングして、DMEM＋10％FBS(Sigma社)＋100U/mlペニシリンおよび0.1mg/mlストレプトマイシン(全てGibco社)中で初代細胞培養物として増殖させた。
【０５２７】
ウェスタンブロット分析
AxlおよびMITFの発現を、ウェスタンブロット分析を用いて測定した。細胞溶解物中のタンパク質を4〜12％のSDS-PAGEゲル上で分離し、PVDFメンブレンに移した後、PBS-Tween中の5％BSA中でAxlに特異的な抗体(sc-1096, Santa Cruz社)により染色するか、またはニトロセルロース膜に移して、PBS-Tween中の5％無脂肪粉乳中でMITF (abl2039, Abcam社)により染色した。ゲルローディングを調整するために、ビンキュリンまたはβ-アクチンに対する抗体を使用した。
【０５２８】
メラノーマ細胞株の形質膜上のAXL発現の定量
ヒト腫瘍細胞株の形質膜上のAXL発現は、QIFIKIT分析(DAKO社, カタログ番号K0078)を用いた間接免疫蛍光法により定量した。マウスモノクローナル抗体ab89224(Abcam社, Cambridge, 英国)を用いてAxlを検出した。接着細胞をトリプシン処理し、細胞ストレーナーに通して単細胞懸濁液を得た。細胞を1200rpmで5分間遠心分離してペレット化し、PBSで洗浄し、1×106細胞/mLの濃度で再懸濁した。次の工程は氷上で行った。100μLの単細胞懸濁液(ウェルあたり100,000細胞)をポリスチレン96ウェル丸底プレート(Greiner Bio-One社, カタログ番号650101)に播種した。細胞を300×gで3分間遠心分離してペレット化し、10μg/mLの濃度の抗体サンプルまたはマウスIgG1アイソタイプ対照サンプル(カタログ番号QF2040741, ロット番号MA1-10406, Pierce社)50μL中に再懸濁した。4℃で30分間インキュベートした後、細胞をペレット化し、150μLのFACS緩衝液(0.1％BSAを含むPBS)に再懸濁した。セットアップ用およびキャリブレーション用ビーズをメーカーの説明書に従ってプレートに添加した。並行して細胞およびビーズを150μLのFACS緩衝液で2回以上洗浄し、50μLのFITC結合ヤギ抗マウスIgG (1/50; DAKO社, カタログ番号K0078)に再懸濁した。二次抗体を暗所にて4℃で30分間インキュベートした。細胞およびビーズを150μLのFACS緩衝液で2回洗浄し、100μLのFACS緩衝液に再懸濁した。生細胞ゲート内で10,000事象を記録することにより、FACS Calibur (BD Biosciences社)上で免疫蛍光を測定した。キャリブレーション用ビーズの平均蛍光強度は、GraphPad Prismソフトウェア(GraphPad Software社, San Diego, CA, 米国)を用いてキャリブレーション曲線を作成するために使用した。各細胞株について、形質膜上に発現されたAXL分子の数の推定値である抗体結合能(ABC)は、キャリブレーション曲線の式(GraphPadソフトウェアを用いて、標準曲線からの未知数の補間)に基づいて、AXL抗体で染色された細胞の平均蛍光強度を用いて算出した。
【０５２９】
インビトロ細胞傷害性
細胞をほぼコンフルエントになるまで培養した後、細胞をトリプシン処理し、培地に再懸濁し、細胞ストレーナー(BD Falcon社, カタログ番号352340)に通して単細胞懸濁液を得た。細胞を、次の播種密度を用いて96ウェルフォーマットで培養した：樹立細胞株については2000細胞/ウェル、PDX由来細胞株については4000細胞/ウェル。播種の4時間後にIgG1-AXL-107-vcMMAEを添加した。IgG1-AXL-107-vcMMAEの連続希釈液(10倍;最終濃度0.0001〜10μg/mLの範囲)を培地中に調製して、プレートに添加した。37℃、5％CO2での5日間(CDサンプルについて)または8日間(PDXサンプル)のインキュベーション後に、CellTiter-Glo試薬(Promega社; カタログ番号G7571)をウェルに加え、発光細胞生存率アッセイ(Luminescent Cell Viability Assay; Promega社, Madison, WI)をメーカーのプロトコルに従って行った。発光(ルミネセンス)をInfinite M200マイクロプレートリーダー(Tecan社)で測定し、生存率を次のように計算した：生存率％＝(ルミネセンス対象サンプル-ルミネセンスPAO)/(処理された対照ビヒクルの平均ルミネセンス-ルミネセンスPAO)、ここでPAOは100％細胞死滅のための5μMフェニルアルシンオキシドを表す。
【０５３０】
SKMEL147メラノーマ異種移植片モデル
IgG1-AXL-107-vcMMAEの抗腫瘍活性は、NMRIヌードマウスの皮下メラノーマモデルSKMEL147において評価した。マウスの左脇腹に、マトリゲル中1：1に再懸濁した2.5×105個のSKMEL147メラノーマ細胞(高レベルのAxlを発現する；図21および表15参照)を全量100μLで皮下注入した。腫瘍をキャリパーで週3回測定し、腫瘍が100mm3になったとき、動物を次の処置群に無作為化した：IgG1-b12 (4mg/kg)、IgG1-b12-vcMMAE (4mg/kg)、IgG1-107 (4mg/kg)、IgG1-107-vcMMAE (2mg/kg)、およびIgG1-107-vcMMAE (4mg/kg)。
【０５３１】
腫瘍細胞注入後12日目および19日目(無作為化の1日目および8日目)に、試験化合物を全量100μlで動物の尾静脈に注入した。腫瘍サイズが1000mm3を超えたとき、動物を犠牲にした。
【０５３２】
SKMEL28野生型細胞とPLX4720耐性SKMEL28細胞との混合集団の、AXL-ADC、BRAF阻害剤、および/またはMEK阻害剤による処置
SKMEL28野生型細胞およびPLX4720に耐性のSKMEL28細胞(SKMEL28-R)を、それぞれ、蛍光色素分子mCherry(赤色)またはGFP(緑色)の発現ベクターでトランスフェクトした。続いて、6ウェルプレートに各細胞株50,000個(合計で100,000細胞/ウェル)を用いて、1：1の比で細胞を播種した。3時間後、次の化合物をウェルに加えた：IgG1-AXL-107-vcMMAE (1μg/mL)、IgG1-b12-MMAE (1μg/mL; アイソタイプ対照ADC)、PLX4720 (10μM; BRAF阻害剤)、ダブラフェニブ(1μM; BRAF阻害剤)、および/またはトラメチニブ(0.1μM; MEK阻害剤)。4日後、細胞をトリプシン処理し、PBS＋1％BSAで1回洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。
【０５３３】
免疫組織化学
AXLの発現は、新たに切除してパラフィン包埋し、ホルマリン固定した(FFPE)、悪性メラノーマを含む全組織(WT)において評価した。染色はSequenzaスライドラック(Ted Pella社, Redding, CA, 米国; カタログ番号36105)で手作業により行った。
【０５３４】
染色前に、FFPE組織スライドを、室温にて、100％キシレン(Sigma-Aldrich社, カタログ番号16446; 3回、5分)中で脱パラフィンし、96％エタノール(Sigma-Aldrich社, カタログ番号32294; 2回、5分)中で脱水した。その後、抗原回復を行った。IHCスライドをクエン酸緩衝液(pH6; DAKO社; カタログ番号S2369)中で5分間インキュベートし、クエン酸/リン酸緩衝液(0.43Mクエン酸, 0.35M Na2HPO4・2H2O; pH5.8)中で内因性ペルオキシダーゼを室温で15分間ブロックした。スライドを、一次抗体とのインキュベーションの前に、PBS中の10％正常ヒト血清(CLB/Sanquin社, カタログ番号K1146)中でインキュベートした。Axl発現は、2％正常ヒト血清を補充したPBS中の3μg/mLのウサギポリクローナル抗ヒトAxl抗体H-124と共に室温で60分間インキュベートすることにより測定した。スライドを0.1％Tween-20を補充したPBSで洗浄し(2回、3分)、Axlに特異的なウサギ抗体の結合を、未希釈のBright VisionポリHRP抗ウサギIgGにより検出した。HRPを3-アミノ-9-エチルカルバゾール(AEC)発色団(赤色; Sigma社, カタログ番号A6926-100TAB)で可視化した；核をヘマトキシリン(DAKO社, カタログ番号S3309)で対比染色した。オランダ癌研究所(NKI, Amsterdam, オランダ)の認定病理学者がスライドを分析して、各サンプルにおけるAxl染色の強度および局在を評価した。例を図27に示す。
【０５３５】
結果
AXL発現：
AXL発現は、樹立メラノーマ細胞株(表15)および低継代初代メラノーマ株(PDX、表16)のパネルにおいて評価した。ウェスタンブロットで測定されたAXL発現(図21)は、樹立細胞株(図21A)でも臨床患者由来サンプル(図21B)でもMITF発現に逆相関した。樹立細胞株のパネルでは、Axl発現を定量的フローサイトメトリーによっても測定した。AXL陰性および陽性細胞株の例を図22に示す。全ての細胞株についてのAxl発現レベル(ABCとして表される)を、これらの細胞株のBRAF変異状態と共に、表15に示す。
【０５３６】
AXL-ADCのインビトロ細胞傷害：
次に、樹立メラノーマ細胞株およびPDXのパネルのIgG1-AXL-107-vcMMAEに対する感受性を生存率アッセイで評価した。細胞をIgG1-AXL-107-vcMMAEの漸増濃度(範囲1×10-4〜10μg/mL)に5日間曝露した後、細胞生存率を測定した。結果を表15および16に要約し、用量応答曲線を図23および24に示す。図23は、4つ全てのAXL発現細胞株(SKMEL147、A875、A375R、SKMEL28R)が、そのうちの3つはPLX4720に耐性であったものの、IgG1-AXL-107-vcMMAE処置に感受性であることを示す。2つのAXL陰性細胞株COL0679およびSKMEL28は、IgG1-AXL-107-vcMMAEで処置した際に生存率の変化を示さなかった。3つのPLX4720耐性PDXサンプルを、IgG1-AXL-107-vcMMAEを用いて生存率アッセイで試験した。図24に示すように、2つのAXL高発現PDX培養物MO16およびMO19RはIgG1-AXL-107-vcMMAEによる処置に感受性であったのに対し、AXL低発現PDX培養物M082はIgG1-b12-vcMMAE対照処置で見られた応答と異なる応答を示さなかった。
【０５３７】
（表１５）メラノーマ細胞株パネルの特性
2019509257.tif 000046
*BLQ＝定量下限値未満(＜3300、キャリブレーションビーズの最低ABC値)
【０５３８】
（表１６）患者由来メラノーマ培養物の特性
2019509257.tif 000047
【０５３９】
インビボでのAXL-ADCによる処置：
SKMEL147メラノーマ異種移植片モデルにおいて、IgG1-b12、IgG1-b12-vcMMAE、またはIgG1-AXL-107で処置したマウスは腫瘍増殖の抑制を示さなかった。IgG1-AXL-107-vcMMAEは2mg/kgで腫瘍増殖の抑制を誘導し、4mg/kgの用量では強い腫瘍退縮を誘導し、これは50日目頃まで持続した(図25A)。
【０５４０】
こうして、4mg/kgの用量でのHuMax-AXL-ADCは顕著な抗腫瘍効果を示したが、腫瘍は50日目以後に再び増殖を開始した。4mg/kgのIgG1-AXL-107-vcMMAEによる初期の腫瘍退縮後に腫瘍の再増殖を示した4匹のマウスを、55日目に4mg/kgのIgG1-AXL-107-vcMMAEの単回投与で再処置し、その間比較のために他の2匹のマウスを観察した。
【０５４１】
4mg/kgのIgG1-AXL-107-vcMMAEによる再処置は、4匹全てのマウスにおいて腫瘍退縮をもたらしたが、観察された2匹のマウスは腫瘍増殖を示した(図25B)。再処置した4匹のマウスのうち2匹は少なくとも80日目まで続く腫瘍退縮を示したが、他の2匹の再処置マウスでは70日目頃に腫瘍の再増殖が観察された(図25B)。
【０５４２】
組み合わせによる処置：
SKMEL28野生型(wt)細胞とSKMEL28 PLX4720耐性細胞の混合集団では、細胞混合物をIgG1-AXL-107-vcMMAE、PLX4720、またはダブラフェニブで処置した場合に、未処置の対照と比較して、総細胞数が74〜62％減少した(図26A)。細胞混合物をIgG1-AXL-107-vcMMAEとPLX4720、IgG1-AXL-107-vcMMAEとダブラフェニブ、ダブラフェニブとトラメチニブ、またはダブラフェニブとトラメチニブとIgG1-AXL-107-vcMMAEの組み合わせで処置すると、未処置の細胞と比較して、総細胞数の81〜92％の減少が誘導された(図26A)。
【０５４３】
特定の細胞集団が根絶されたかどうかを評価するために、緑色(GFP陽性SKMEL28-R細胞)と赤色(mCherry陽性SKMEL28細胞)の比を求めた。予想通り、未処置およびIgG1-b12-vcMMAE処置はGFP/mCherry比に影響を及ぼさず、同様に総細胞数も影響を受けなかった(図26B)。IgG1-AXL-107-vcMMAEによる処置はGFP/mCherry比の大幅な低下をもたらし(図26B)、SKMEL28-R細胞の特異的死滅を示した。反対に、BRAF阻害剤であるPLX4720またはダブラフェニブによる処置はGFP/mCherry比を増加させ(図26B)、SKMEL28細胞の特異的死滅を示した。IgG1-AXL-107-vcMMAEとPLX4720、ダブラフェニブとトラメチニブ、またはダブラフェニブとトラメチニブとIgG1-AXL-107-vcMMAEの組み合わせは、1に近い比を示し(図26B)、両方の細胞型が同様の効力で死滅したことを示した。IgG1-AXL-107-vcMMAEとダブラフェニブとの組み合わせによる処置は、GFP/mCherry比を大きく低下させ(図26B)、使用濃度でのSKMEL28-R細胞のより効率的な死滅を示した。
【０５４４】
免疫組織化学：
全部で45個のサンプルを分析し、そのうちの3個は腫瘍材料を含まなかったので、分析から除外した。さらに、同じ患者からの対応するベムラフェニブ処置前および処置後のサンプル7つと、対応するダブラフェニブ/トラメチニブ処置前および処置後のサンプル1つが含まれていた。42個のうちの41個のサンプルにおいて、Axl発現がメラノーマ領域のサブセットで検出された。染色強度は患者腫瘍ごとに異なっていた(表17)。
【０５４５】
さらに、対応するベムラフェニブ処置前後のサンプル7つのうち4つにおいて、Axl発現のアップレギュレーション（病理学者が染色強度の増加により測定した）が観察された(表17）。
【０５４６】
（表１７）メラノーマ患者由来の腫瘍組織におけるAxl染色
2019509257.tif 000048
2019509257.tif 000049
a -：陰性；陽性染色強度：弱く+＜+＜++＜+++；陽性染色領域：散発的＜限局的＜局所的＜部分的；NA：入手不可
【０５４７】
実施例18 - PDX由来のBRAF変異型メラノーマモデルの作製および特性評価
患者由来の低継代(PDX)メラノーマ細胞培養物の作製
オランダ癌研究所のAntoni van Leeuwenhoek病院の医療倫理委員会は、ヒト組織の採取と使用を承認した。動物実験は、同研究所の動物実験委員会によって承認され、適用すべき規則および法規に従って実施した。ヒト腫瘍材料は、手術中に取得するか、または14ゲージ針を用いて悪性メラノーマ患者から腫瘍生検を採取することによって得た。約5mm3の腫瘍断片をNOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJマウスの皮下移植に用いたが、移植は麻酔下で行った。腫瘍の成長をキャリパーで週2回測定した。腫瘍サイズが1000mm3に達する前に、マウスを犠牲にし、腫瘍を摘出し、腫瘍片を単細胞懸濁液へと解離させ、10cm培養皿上に播種して、DMEM＋10％FBS(Sigma社)＋100U/mlペニシリンおよび0.1mg/mlストレプトマイシン(全てGibco社)中で初代細胞培養物として増殖させた。M019R細胞培養物は、もともとベムラフェニブに耐性であったBRAF V600E変異を含むメラノーマ患者の腫瘍材料に由来した。
【０５４８】
メラノーマ細胞株の形質膜上のAXL発現の定量
ヒト腫瘍細胞株の形質膜上のAXL発現は、QIFIKIT分析(DAKO社, カタログ番号K0078)を用いた間接免疫蛍光法により定量した。マウスモノクローナル抗体ab89224 (Abcam社, Cambridge, 英国)を用いてAxlを検出した。接着細胞をトリプシンで処理し、細胞ストレーナーに通して単細胞懸濁液を得た。細胞を1200rpmで5分間遠心分離してペレット化し、PBSで洗浄し、1×106細胞/mLの濃度で再懸濁した。次の工程は氷上で行った。100μLの単細胞懸濁液(ウェルあたり100,000細胞)をポリスチレン96ウェル丸底プレート(Greiner Bio-One社, カタログ番号650101)に播種した。細胞を300×gで3分間遠心分離してペレット化し、10μg/mLの濃度の抗体サンプルまたはマウスIgG1アイソタイプ対照サンプル(カタログ番号QF2040741, ロット番号MA1-10406, Pierce社)50μL中に再懸濁した。4℃で30分間インキュベートした後、細胞をペレット化し、150μLのFACS緩衝液(0.1％BSAを含むPBS)に再懸濁した。セットアップ用およびキャリブレーション用ビーズをメーカーの説明書に従ってプレートに添加した。並行して細胞およびビーズを150μLのFACS緩衝液で2回以上洗浄し、50μLのFITC結合ヤギ抗マウスIgG (1/50; DAKO社, カタログ番号K0078)に再懸濁した。二次抗体を暗所にて4℃で30分間インキュベートした。細胞およびビーズを150μLのFACS緩衝液で2回洗浄し、100μLのFACS緩衝液に再懸濁した。生細胞ゲート内で10,000事象を記録することにより、FACS Calibur (BD Biosciences社)上で免疫蛍光を測定した。キャリブレーション用ビーズの平均蛍光強度は、GraphPad Prismソフトウェア(GraphPad Software社, San Diego, CA, 米国)を用いてキャリブレーション曲線を作成するために使用した。各細胞株について、形質膜上に発現されたAXL分子の数の推定値である抗体結合能(ABC)は、キャリブレーション曲線の式(GraphPadソフトウェアを用いて、標準曲線からの未知数の補間)に基づいて、AXL抗体で染色された細胞の平均蛍光強度を用いて算出した。
【０５４９】
インビトロ細胞傷害性
細胞をほぼコンフルエントになるまで培養した後、細胞をトリプシンで処理し、培地に再懸濁し、細胞ストレーナー(BD Falcon社, カタログ番号352340)に通して単細胞懸濁液を得た。PDX由来の細胞培養物を96ウェルフォーマットで4000細胞/ウェルの密度にて播種した。播種の4時間後にIgG1-AXL-107-vcMMAE、PLX4720 (Selleck Chemicals社, Houston, TX, 米国；カタログ番号：S1152)、またはトラメチニブ(Selleck Chemicals社；カタログ番号S2673)を添加した。テスト試薬の連続希釈物を培地中に調製して、プレートに添加した。37℃、5％CO2での8日間のインキュベーション後に、CellTiter-Glo試薬(Promega社; カタログ番号G7571)をウェルに加え、発光細胞生存率アッセイ(Luminescent Cell Viability Assay; Promega社, Madison, WI)をメーカーのプロトコルに従って行った。発光(ルミネセンス)をInfinite M200マイクロプレートリーダー(Tecan社)で測定し、生存率を次のように計算した：生存率％＝(対象サンプルのルミネセンス-PAOのルミネセンス)/(処理された対照ビヒクルの平均ルミネセンス-PAOのルミネセンス)、ここでPAOは100％細胞死滅のための5μMフェニルアルシンオキシドによる処理を表す。
【０５５０】
結果
PDX由来メラノーマ細胞培養物M019RおよびM009Rを上記のように取得して、Axl発現レベル、BRAFおよびNRAS変異状態、ならびにPLX4720、トラメチニブまたはIgG1-AXL-107-vcMMAEに対するインビトロ感受性について特性評価した。結果を表18に要約する。M009RにおけるAxl発現レベルは不均一であり、これは、フローサイトメトリーで評価して、細胞の部分集団のみがAxlの検出可能なレベルを有したことを意味する。
【０５５１】
（表１８）BRAF変異型メラノーマ細胞培養物の特性評価
2019509257.tif 000050
使用略語：FACS，蛍光活性化セルソーティング；ABC，抗体結合能；wt，野生型；n.a.
a感受性のない細胞株は3μMのPLX4720または0.1μMのトラメチニブの濃度で有意な細胞死を示さない。
b感受性のない細胞株は、1μg/mLのIgG1-AXL-107-vcMMAE濃度で、有意な細胞死またはIgG1-b12-vcMMAEに匹敵する細胞死を示さない。
【０５５２】
実施例19 - インビボでの耐性BRAF変異型メラノーマモデル(M019R)におけるIgG1-AXL-107-vcMMAEの単独およびBRAFi/MEKiとの組み合わせでの抗腫瘍活性
悪性メラノーマ患者由来のBRAF変異型M019R異種移植片モデル
IgG1-AXL-107-vcMMAEの抗腫瘍活性を、NMRIヌードマウスの皮下メラノーマモデルM019Rにおいて評価した。マウスの左脇腹に、マトリゲル中に1：1で再懸濁した2.5×105個のM019Rメラノーマ細胞を全量100μLで皮下注入した。腫瘍をキャリパーで週2回測定し、腫瘍細胞の接種後62日目に腫瘍が100mm3になったとき、動物を無作為に次の3つの処置群(1群7または8匹のマウス)に分けた：IgG1-b12-vcMMAE (「対照ADC」; 4mg/kg, i.v.)、IgG1-AXL-107-vcMMAE (4mg/kg, i.v.)、およびBRAF阻害剤ダブラフェニブ(30mg/kg，強制経口投与)＋MEK阻害剤トラメチニブ(0.1mg/kg，強制経口投与)。
【０５５３】
無作為化後0日目および7日目に、ADCを全量100μlで動物の尾静脈に注入した。無作為化の当日に開始して、ダブラフェニブおよびトラメチニブを2回目の無作為化まで毎日経口投与した。腫瘍サイズが1000mm3を超えたとき、動物を犠牲にした。
【０５５４】
最初の無作為化後30日目に、ダブラフェニブ＋トラメチニブの組み合わせで処置したマウスを、3つの処置群に分けた：ダブラフェニブ＋トラメチニブ(n＝3)、IgG1-AXL-107-vcMMAE (n＝5)、またはダブラフェニブとトラメチニブとIgG1-AXL-107-vcMMAEの3剤併用(n＝5)。無作為化後0日目および7日目に、ADCを全量100μlで動物の尾静脈に注入した。ダブラフェニブとトラメチニブを投与された群は、無作為化の当日に開始してこの研究が終了するまで毎日処置した。腫瘍サイズが1000mm3を超えたとき、動物を犠牲にした。900mm3の腫瘍サイズカットオフを用いてGraphpad Prismソフトウェアにより生存を分析した。群間の生存の差は、Mantel-Cox検定を用いて分析した。
【０５５５】
結果
インビトロデータは、BRAF変異型PDX由来細胞培養物M019RがAxlを細胞表面上に発現し(実施例17)、かつBRAF阻害剤PLX4720に耐性であることを示した；これは、このモデルの由来となった患者のベムラフェニブに対する臨床的耐性と一致する。さらに、IgG1-AXL-107-vcMMAEはインビトロでM019R細胞の死滅を効率的に誘導した(実施例17)。
【０５５６】
M019R細胞をヌードマウスに移植し、IgG1-AXL-107-vcMMAEの抗腫瘍効果を評価した。IgG1-b12-vcMMAEまたはダブラフェニブ＋トラメチニブ(組み合わせ)を用いた対照処置は、このモデルにおいて有意な腫瘍増殖阻害をもたらさなかった(図28)。ところが、IgG1-AXL-107-vcMMAE (4mg/kg)は腫瘍退縮を誘導し、腫瘍の成長は処置中止後25日目(無作為化後39日目)まで観察されなかった(図28)。33日目に行ったMann-Whitney検定を用いて、IgG1-AXL-107-vcMMAE処置とIgG1-b12-vcMMAE処置との間(p＝0.0005)、およびIgG1-AXL-107-vcMMAE処置とダブラフェニブ/トラメチニブ処置との間(p＜0.0001)の腫瘍サイズの差は非常に大きいことが示された。
【０５５７】
ダブラフェニブ＋トラメチニブによる最初の処置を受けて、ダブラフェニブ＋トラメチニブによる処置を継続したマウス、またはIgG1-AXL-107-vcMMAE単独で処置したマウスは、ダブラフェニブとトラメチニブとIgG1-AXL-107-vcMMAEの3剤併用による処置と比較して、大幅に短期の生存を示した(それぞれp＝0.0042およびp＝0.0403；図28C)。さらに、ダブラフェニブ＋トラメチニブによる最初の処置後にIgG1-AXL-107-vcMMAEで処置したマウスも、ダブラフェニブ＋トラメチニブによる処置を継続したマウスと比較して、かなり長期の生存を示した(p＝0.0462；図28C)。
【０５５８】
実施例20 - インビボでの耐性BRAF変異型メラノーマモデル(M009R)におけるBRAFi/MEKiと組み合わせた（併用した）IgG1-AXL-107-vcMMAEの抗腫瘍活性
悪性メラノーマ患者由来のBRAF変異型M009R異種移植片モデル
IgG1-AXL-107-vcMMAEの抗腫瘍活性を、NMRIヌードマウスの皮下メラノーマモデルM009Rにおいて評価した。M009R PDX由来細胞培養物を実施例18に記載したようにして取得した；該培養物は、初めはベムラフェニブに対する応答を示したが、ベムラフェニブに対する耐性を獲得した、BRAF V600E変異を有するメラノーマ患者の腫瘍材料に由来した。マウスの左脇腹に、マトリゲル中に1：1で再懸濁した2.5×105個のM009Rメラノーマ細胞を全量100μLで皮下注入した。腫瘍をキャリパーで週2回測定し、腫瘍細胞の接種後62日目に腫瘍が100mm3になったとき、動物を無作為に次の4つの処置群(1群7または8匹のマウス)に分けた：IgG1-b12-vcMMAE (「対照ADC」; 4mg/kg, i.v.)、IgG1-AXL-107-vcMMAE (4mg/kg, i.v.)、BRAF阻害剤ダブラフェニブ(30mg/kg，強制経口投与)＋MEK阻害剤トラメチニブ(0.1mg/kg，強制経口投与)＋IgG1-b12-vcMMAE (「対照ADC」; 4mg/kg, i.v.)、およびダブラフェニブ(30mg/kg，強制経口投与)＋トラメチニブ(0.1mg/kg，強制経口投与)＋IgG1-AXL-107-vcMMAE (4mg/kg, i.v.)。
【０５５９】
無作為化後0日目および7日目に、ADCを全量100μlで動物の尾静脈に注入した。無作為化の当日に開始して、この研究が終了するまで毎日、ダブラフェニブとトラメチニブを経口投与した。腫瘍サイズが1000mm3を超えたとき、動物を犠牲にした。
【０５６０】
結果
M009R細胞は不均一なAxl発現を示し(実施例18)、このモデルの由来となった患者の臨床的耐性と一致している。さらに、IgG1-AXL-107-vcMMAEは、1μg/mLの濃度でM009R細胞の死滅をインビトロで誘導しなかった。
【０５６１】
M009R細胞をヌードマウスの皮下に移植し、IgG1-AXL-107-vcMMAE単独の抗腫瘍効果、またはダブラフェニブ＋トラメチニブとIgG1-AXL-107-vcMMAEとの組み合わせ（併用）の抗腫瘍効果を評価した。対照ADC (IgG1-b12-vcMMAE, 4mg/kg)またはIgG1-AXL-107-vcMMAE (4mg/kg)による処置は、このモデルにおいて顕著な腫瘍成長の抑制をもたらさなかった(図29A)。ダブラフェニブ＋トラメチニブ(組み合わせ)と対照ADCとの組み合わせ（併用）による処置は、腫瘍成長の抑制を誘導した一方で、ダブラフェニブ＋トラメチニブとIgG1-AXL-107-vcMMAEとの組み合わせ（併用）は、部分的な腫瘍退縮を誘導した(図29A)。14日目に行ったMann-Whitney検定を用いて、IgG1-AXL-107-vcMMAEとダブラフェニブ＋トラメチニブとの組み合わせで処置したマウスの平均腫瘍サイズは、対照ADC (p＝0.003)、IgG1-AXL-107-vcMMAE (p＝0.0002)、ダブラフェニブ＋トラメチニブと対照ADCとの組み合わせ（併用） (p＝0.0034)で処置したマウスよりも有意に小さいことが示された(図29B)。
【０５６２】
実施例21 - IgG1-AXL-107-vcMMAEはNRAS変異型、MEKi耐性の腫瘍細胞株において細胞毒性を誘導する
細胞培養
SKMEL2、FM6およびBLM細胞株は、全てがNRASコドン61に変異を有するものであり(表19)、Thermo Fischer社またはATCCから入手した。メラノーマ細胞株を、10％ウシ胎仔血清(Sigma社)、100U/mlのペニシリンおよび0.1mg/mlのストレプトマイシン(全てGibco社)を補充したDMEM中で培養した。これらの細胞株を5％(vol/vol)CO2加湿インキュベータ内で37℃に維持した。
【０５６３】
トラメチニブ耐性細胞株の作製
MEK阻害剤感受性細胞株SKMEL2は、対応するトラメチニブ耐性SKMEL2R細胞株を樹立するために、濃度0.1μMまで次第に増加させた濃度のMEK阻害剤トラメチニブ(Selleck Chemicals社；カタログ番号：S2673)の存在下で2〜3ヶ月間培養した。
【０５６４】
メラノーマ細胞株の形質膜上のAxl発現の定量
ヒト腫瘍細胞株の形質膜上のAxl発現は、QIFIKIT分析(DAKO社, カタログ番号K0078)を用いた間接免疫蛍光法により定量した。マウスモノクローナル抗体ab89224(Abcam社, Cambridge, 英国)を用いてAxlを検出した。接着細胞をトリプシンで処理し、細胞ストレーナーに通して単細胞懸濁液を得た。細胞を1200rpmで5分間遠心分離してペレット化し、PBSで洗浄し、1×106細胞/mLの濃度で再懸濁した。次の工程は氷上で行った。100μLの単細胞懸濁液(ウェルあたり100,000細胞)をポリスチレン96ウェル丸底プレート(Greiner Bio-One社, カタログ番号650101)に播種した。細胞を300×gで3分間遠心分離してペレット化し、10μg/mLの濃度の抗体サンプルまたはマウスIgG1アイソタイプ対照サンプル(カタログ番号QF2040741, ロット番号MA1-10406, Pierce社)50μL中に再懸濁した。4℃で30分間インキュベートした後、細胞をペレット化し、150μLのFACS緩衝液(0.1％BSAを含むPBS)に再懸濁した。セットアップ用およびキャリブレーション用ビーズをメーカーの説明書に従ってプレートに添加した。並行して細胞およびビーズを150μLのFACS緩衝液で2回以上洗浄し、50μLのFITC結合ヤギ抗マウスIgG (1/50; DAKO社, カタログ番号K0078)に再懸濁した。二次抗体を暗所にて4℃で30分間インキュベートした。細胞およびビーズを150μLのFACS緩衝液で2回洗浄し、100μLのFACS緩衝液に再懸濁した。免疫蛍光は、FACS Calibur (BD Biosciences社)上で、生細胞ゲート内の10,000事象を記録することにより測定した。キャリブレーション用ビーズの平均蛍光強度は、GraphPad Prismソフトウェア(GraphPad Software社, San Diego, CA, 米国)を用いてキャリブレーション曲線を作成するために使用した。各細胞株について、形質膜上に発現されたAxl分子の数の推定値である抗体結合能(ABC)は、キャリブレーション曲線の式(GraphPadソフトウェアを用いて、標準曲線からの未知数の補間)に基づいて、Axl抗体で染色された細胞の平均蛍光強度を用いて算出した。
【０５６５】
インビトロ細胞傷害性
細胞をほぼコンフルエントになるまで培養した後、細胞をトリプシンで処理し、培地に再懸濁し、細胞ストレーナー(BD Falcon社, カタログ番号352340)に通して単細胞懸濁液を得た。細胞を96ウェルフォーマットに2000細胞/ウェルで播種し、播種の4時間後にIgG1-AXL-107-vcMMAEを添加した。IgG1-AXL-107-vcMMAEの連続希釈物(10倍；最終濃度0.0001〜10μg/mLの範囲)を培地中に調製して、プレートに添加した。37℃、5％CO2での5日間のインキュベーション後に、CellTiter-Glo試薬(Promega社; カタログ番号G7571)をウェルに加え、発光細胞生存率アッセイ(Promega社, Madison, WI)をメーカーのプロトコルに従って行った。発光(ルミネセンス)をInfinite M200マイクロプレートリーダー(Tecan社)で測定し、生存率を次のように算出した：生存率％＝(対象サンプルのルミネセンス-PAOのルミネセンス)/(処理された対照ビヒクルの平均ルミネセンス-PAOのルミネセンス)、ここでPAOは100％細胞死滅のための5μMフェニルアルシンオキシドによる処置を表す。
【０５６６】
結果
Axl発現は、ウェスタンブロッティングまたはフローサイトメトリーで測定したとき、3つのうち2つのNRAS変異型細胞株に認められた(表19)。興味深いことに、第4の細胞株(SKMEL2R)は、インビトロでMEK阻害剤トラメチニブに連続曝露することによってSKMEL2細胞株に由来したものであった。トラメチニブ耐性を獲得したSKMEL2R細胞株は強いAxl発現を示したが、トラメチニブに感受性であった親SKMEL2細胞は細胞表面上に検出可能なレベルのAxlを発現しなかった(表19)。図30は、IgG1-AXL-107-vcMMAEがAxl発現の高いメラノーマ細胞株SKMEL2R、FM6およびBLMを特異的に死滅させたが、Axl発現を欠くSKMEL2細胞はIgG1-AXL-107-vcMMAEによる処置に感受性でなかったことを示している。
【０５６７】
こうして、Axl発現は、MEK阻害剤トラメチニブへの耐性を獲得した細胞株を含めて、NRAS変異型の悪性メラノーマ細胞株において観察された。さらに、IgG1-AXL-107-vcMMAEは、Axlを発現するNRAS変異型メラノーマ細胞株において細胞傷害性を誘導した；このことは、これらの細胞におけるAxl発現レベルがインビトロでIgG1-AXL-107-vcMMAEによる細胞傷害性の誘導を可能にするのに十分であったことを実証している。
【０５６８】
（表１９）NRAS変異型メラノーマ細胞株の特性評価
2019509257.tif 000051
使用略語：FACS，蛍光活性化セルソーティング；ABC，抗体結合能；BLQ，定量下限値未満(＜3300，キャリブレーションビーズの最低ABC値)；wt，野生型；n.a.，評価せず
a感受性のない細胞株は3μMのPLX4720または0.1μMのトラメチニブの濃度で有意な細胞死を示さない。
b感受性のない細胞株は、1μg/mLのIgG1-AXL-107-vcMMAE濃度で、有意な細胞死またはIgG1-b12-vcMMAEに匹敵する細胞死を示さない。
【０５６９】
実施例22 - 進行期悪性メラノーマ組織におけるAxl発現のIHC解析
免疫組織化学
Axlの発現は、NRAS変異を含む進行期悪性メラノーマ患者(n＝10)から得られた新鮮なホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)全組織切片において評価した。染色はSequenzaスライドラック(Ted Pella社, Redding, CA, 米国; カタログ番号36105)で手作業により行った。
【０５７０】
染色前に、FFPE組織スライドを、室温にて、100％キシレン(Sigma-Aldrich社, カタログ番号16446; 3回、5分)中で脱パラフィンし、96％エタノール(Sigma-Aldrich社, カタログ番号32294; 2回、5分)中で脱水した。その後、抗原賦活化(antigen retrieval)を行った。IHCスライドをクエン酸緩衝液(pH6; DAKO社; カタログ番号S2369)中で5分間インキュベートし、クエン酸/リン酸緩衝液(0.43Mクエン酸, 0.35M Na2HPO4・2H2O; pH5.8)中で内因性ペルオキシダーゼを室温で15分間ブロックした。スライドをPBS中の10％正常ヒト血清(CLB/Sanquin社, カタログ番号K1146)中でインキュベートし、その後一次抗体とインキュベートした。Axl発現は、2％正常ヒト血清を補充したPBS中の3μg/mLのウサギポリクローナル抗ヒトAxl抗体H-124と共に室温で60分間インキュベートすることにより測定した。スライドを0.1％Tween-20を補充したPBSで洗浄し(2回、3分)、Axlに特異的なウサギ抗体の結合を、未希釈のBright VisionポリHRP抗ウサギIgGにより検出した。HRPを3-アミノ-9-エチルカルバゾール(AEC)発色団(赤色; Sigma社, カタログ番号A6926-100TAB)で可視化した；核をヘマトキシリン(DAKO社, カタログ番号S3309)で対比染色した。スライドは、認定病理学者が盲検様式で分析し、各サンプル中のAxl陽性腫瘍細胞の割合およびAxl陽性腫瘍細胞の染色強度(1+、2+、3+)をスコア化した。各組織について、Hスコアを以下の式に従って算出した：
Hスコア＝(1+細胞の％×1)＋(2+細胞の％×2)＋(3+細胞の％×3)
【０５７１】
結果
Axl発現は、少なくとも腫瘍細胞のサブセットにおいて、進行期NRAS変異型メラノーマ組織の9/10に検出された(表20；図31)。Axl陽性腫瘍細胞の染色強度および割合は、患者間で異なっていた。
【０５７２】
（表２０）進行期NRAS変異型メラノーマ組織のサンプルパネルにおけるAxl発現
2019509257.tif 000052
【０５７３】
参照文献
2019509257.tif 000053
2019509257.tif 000054
2019509257.tif 000055
2019509257.tif 000056
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2019509257.tif 000058
2019509257.tif 000059
2019509257.tif 000060
【図１】
2019509257.tif 000062
【図２】
2019509257.tif 000063
【図３】
2019509257.tif 000064
【図４】
2019509257.tif 000065
【図５】
2019509257.tif 000066
【図６】
2019509257.tif 000067
【図７】
2019509257.tif 000068
【図８】
2019509257.tif 000069
【図９】
2019509257.tif 000070
【図１０Ａ】
2019509257.tif 000071
【図１０Ｂ】
2019509257.tif 000072
【図１０Ｃ】
2019509257.tif 000073
【図１１】
2019509257.tif 000074
【図１２】
2019509257.tif 000075
【図１３】
2019509257.tif 000076
【図１４】
2019509257.tif 000077
【図１５】
2019509257.tif 000078
【図１６】
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【図１７】
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【図１８−１】
2019509257.tif 000081
【図１８−２】
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【図１９−１】
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【図１９−２】
2019509257.tif 000084
【図２０】
2019509257.tif 000085
【図２１】
2019509257.tif 000086
【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
2019509257.tif 000089
【図２５】
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【図２６】
2019509257.tif 000091
【図２７】
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【図２８Ａ】
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【図２８Ｂ】
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【図２８Ｃ】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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