(57)【要約】本開示は、関節リウマチ（ＲＡ）治療のための臨床的バイオマーカーとしての抗ＰＡＤ４自己抗体の使用に関する。本開示はさらに、抗ＰＡＤ４自己抗体を検出するためのアッセイ、抗ＰＡＤ４自己抗体の検出のためのアッセイキット、並びに、コンピュータ実装診断方法を提供する。【選択図】図１
2019523759.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
関節リウマチ患者を治療する方法であって、前記患者から得られた試料における抗ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４（抗ＰＡＤ４）自己抗体のレベルがアッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）を下回る場合に、ヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体アルファ（ＧＭ−ＣＳＦＲα）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を、前記患者に投与することを含む、方法。
【請求項２】
前記患者から得られた前記試料が、前記試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために提出される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
関節リウマチを有する患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること；
前記試料中の前記患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回るか下回るかを判定すること；及び
前記患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を前記患者に投与するように医療提供者に助言すること、または前記患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが前記ＬＬＯＱを上回る場合、前記患者の治療を中断するように医療提供者に助言すること
をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
関節リウマチと診断された患者を、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで治療するかどうかを決定する方法であって、
関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び
前記試料中の前記患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで前記患者を治療すること、もしくは治療するように医療提供者に指示すること、または、前記試料中の前記患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンによる前記患者の治療を中断するように医療提供者に指示すること
を含む、方法。
【請求項５】
ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する前記抗体またはその抗原結合性断片が、配列番号６〜１１に記載のアミノ酸配列またはその抗原結合性断片を有する相補性決定領域を含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する前記抗体またはその抗原結合性断片が、配列番号４に記載のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域及び／または配列番号５に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記患者が、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与前、投与中、または投与後に、一種類以上の追加の疾患修飾性抗リウマチ薬（ＤＭＡＲＤ）で治療されたことがある、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記患者から得られた前記試料が、全血、血清、血漿、または滑液のうちの一つ以上を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記患者から得られた前記試料が血清である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
一つもしくは複数の追加のバイオマーカーの発現レベルもしくは活性を決定すること、もしくは少なくとも一つの臨床状態マーカーを決定すること、もしくはそれらの組み合わせ、これらの決定のために前記患者から採取した試料を提出すること、またはこれらを決定するように臨床検査室に指示すること、をさらに含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する前記抗体またはその抗原結合性断片が固定用量で投与される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、イムノアッセイ、凝集アッセイ、または均一系アッセイにおいて測定される、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記アッセイがイムノアッセイであり、前記イムノアッセイが検出可能に標識されたＰＡＤ４を使用する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記検出可能に標識されたＰＡＤ４がルテニル化（ｒｕｔｈｅｎｙｌａｔｅｄ）ＰＡＤ４である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記イムノアッセイが、ＰＡＤ４に結合した抗ＰＡＤ４−自己抗体を検出する、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
抗ＰＡＤ４自己抗体によって認識され得る第一のＰＡＤ４分子またはその断片、及び抗ＰＡＤ４自己抗体を認識し得る第二のＰＡＤ４分子またはその断片を含む、抗ＰＡＤ４自己抗体の検出のためのアッセイであって、前記第二のＰＡＤ４が検出可能である、アッセイ。
【請求項１７】
蛍光部分が前記検出可能なＰＡＤ４に組み込まれている、請求項１６に記載のアッセイ。
【請求項１８】
前記蛍光部分がルテニウムである、請求項１７に記載のアッセイ。
【請求項１９】
抗ＰＡＤ４自己抗体によって認識され得る第一のＰＡＤ４分子またはその断片、及び抗ＰＡＤ４自己抗体を認識することができる第二のＰＡＤ４分子またはその断片を含み、前記第二のＰＡＤ４が検出可能である、ＰＡＤ４の検出のためのキット。
【請求項２０】
関節リウマチ患者を治療する方法であって、
請求項１６〜１８のいずれか一項に記載のアッセイを使用することによって、前記患者からの試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること；及び
前記患者からの前記試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の前記レベルがアッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）を下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を前記患者に投与すること
を含む、方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
電子的に提出された配列表への参照
本願とともに提出されたＡＳＣＩＩテキストファイル（名前：ＧＭＣＳＦ−４００Ｐｌ＿ＳｅｑｕｅｎｃｅＬｉｓｔｉｎｇ＿ａｓｃｉｉ＿ＳＴ２５．ｔｘｔ；サイズ：１８，３５６バイト及び作製日：２０１５年６月１日）における電子的に提出された配列表の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
関節リウマチ（ＲＡ）は、世界人口の約１％に影響を及ぼす慢性自己免疫疾患である。これは、軟骨及び骨の破壊、関節の変形及び運動性の喪失を最終的に生じさせ得る、関節の滑膜内層における炎症及び細胞増殖を特徴とする。ＲＡは、通常、同時に複数の関節で問題を引き起こし、多くの場合、対称性の様式で問題が発生する。早期ＲＡは、手首、手、足首及び足の関節のような小さい関節に最初に影響する傾向がある。病気が進行するにつれて、肩、肘、膝、腰、顎及び首の関節もまた関わり得る。関節内または関節周囲の領域のみに影響を及ぼす他の関節炎状態とは異なり、ＲＡは、皮膚、血管、心臓、肺及び筋肉を含む身体全体の関節外組織に炎症を引き起こす可能性のある全身性疾患である。したがって、ＲＡは社会に重大な経済的負担を課す。多くのデータは、ＲＡが寿命の低下に関連していることも示唆している。
【０００３】
ＲＡは不均一性疾患であり、すべての患者において非常に有効である承認された治療オプションは存在しない。現在のところ、ＲＡの治療法はなく、治療は本質的には痛みの緩和、炎症の軽減、関節の損傷及び骨破壊の停止または減速に向けられている。現在の治療アプローチは、早期にこのような薬物で治療されたＲＡ患者がより良好な結果をもたらし、機能がより維持され、仕事の障害及び早期死亡のリスクがより低いため、疾患修飾型抗リウマチ薬（ＤＭＡＲＤ）を早期に処方することである。
【０００４】
ＲＡは、いくつかのタイプの自己抗体の存在によって特徴付けられる。ＲＡ患者に存在する自己抗体の最も一般的な形態には、リウマチ因子及び抗シトルリン化タンパク質抗体が含まれる。限られた出版物に基づくと、ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４（ＰＡＤ４）に対する自己抗体はＲＡ患者の約３分の１に存在する。しかしながら、抗ＰＡＤ４自己抗体がＲＡにおいて有するかもしれない機能及び潜在的な病因的役割の理解が不十分である。
【０００５】
マブリリムマブ（ｍａｖｒｉｌｉｍｕｍａｂ）を含む新しい治療選択肢は、ＲＡ患者の満たされていない医療ニーズに対処する可能性を秘めている。したがって、マブリリムマブ（例えば、診断バイオマーカー）に対する臨床応答が陽性である可能性が高いＲＡ患者を同定する手段は、この新規な治療薬の有用性を大幅に高めることができる。同様に、抗ＰＡＤ４自己抗体を検出するための信頼性の高い方法は、ＲＡ集団にとって大きな利益をもたらすであろう。
【発明の概要】
【０００６】
本開示は、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを決定するためのアッセイを提供する。いくつかの実施形態では、抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを決定するためのアッセイは、試料中に存在する抗ＰＡＤ４自己抗体を組み換えＰＡＤ４に結合させること、ルテニル化（ｒｕｔｈｅｎｙｌａｔｅｄ）組換えＰＡＤ４をＰＡＤ４に結合した抗ＰＡＤ４自己抗体に結合させること、抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを検出すること、及び試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを決定することを含む。いくつかの態様では、抗ＰＡＤ４自己抗体のアッセイ定量下限（ＬＬＯＱ）は５０００Ｕ／ｍＬである。いくつかの実施形態では、アッセイは、凝集アッセイまたは均一系アッセイであり得る。
【０００７】
本開示は、とりわけ、患者由来の試料中の抗ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４（抗ＰＡＤ４）自己抗体のレベルがアッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）を下回る場合に、ヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体アルファ（ＧＭ−ＣＳＦＲα）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、関節リウマチ（ＲＡ）患者を治療する方法を提供する。また、患者からの試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合、及び所定のバイオマーカー閾値レベルを上回るか下回る、または一つもしくは複数の対照試料におけるバイオマーカーレベルを上回るか下回る、患者から採取された試料中の少なくとも一つのＲＡバイオマーカーのレベルを患者が提示する場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、ＲＡ患者を治療する方法も提供される。いくつかの態様では、試料は患者から得られる。いくつかの態様では、試料は患者から得られ、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために提出される。
【０００８】
本開示はまた、ＲＡ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために患者からの試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む方法を提供する。また、ＲＡ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために患者からの試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断することを含む方法も提供する。
【０００９】
本開示はまた、ＲＡを有する患者から得られた試料における抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること；試料における患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回るか下回るかを判定すること；及び患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与するように医療提供者に助言することを含む、ＲＡ患者を治療する方法を提供する。また、ＲＡを有する患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること；試料中の該患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが該アッセイのＬＬＯＱを上回るか下回るかを判定すること；及び患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断するように医療提供者に助言することを含む、ＲＡ患者を治療する方法も提供する。
【００１０】
本開示はまた、ＲＡ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む方法を提供する。
【００１１】
また、ＲＡ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断することを含む方法も提供される。また、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンでＲＡと診断された患者を治療するかどうかを決定する方法であって、ＲＡと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで患者を治療すること、または治療するように医療提供者に指示することを含む方法も提供される。場合によっては、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルは、本発明のアッセイを用いて測定される。
【００１２】
本開示はまた、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンでＲＡと診断された患者を治療するかどうかを決定する方法を提供であって、ＲＡと診断された患者由来の試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンでの患者の治療を治療を中断すること、または中断するように医療提供者に指示することを含む方法も提供する。
【００１３】
また、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の候補としてＲＡと診断された患者を選択する方法であって、ＲＡと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片で患者を治療すること、または治療するように医療提供者に指示することを含む方法も提供される。
【００１４】
本開示はまた、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の候補としてＲＡと診断された患者を選択する方法であって、ＲＡと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること、または測定ように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での患者の治療を中断すること、もしくは中断するように医療提供者に指示するか、または代替療法を選択することを含む方法も提供する。
【００１５】
上記に開示された方法のいくつかの態様において、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、マブリリムマブまたはその抗原結合性断片を含む。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、マブリリムマブまたはその抗原結合性断片からなる。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、マブリリムマブと同じエピトープに特異的に結合する。
【００１６】
いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、同じエピトープへの結合について、マブリリムマブと特異的に競合する。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域（ＶＨ）及び／または配列番号５に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域（ＶＬ）を含む。これらは、マブリリムマブの重鎖及び軽鎖可変領域である。
【００１７】
いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号６〜１１に示される相補性決定領域の少なくとも一つを含む。いくつかの態様では、患者は、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与前、投与中、または投与後のいずれかで、一つまたは複数のさらなる疾患修飾性抗リウマチ薬（ＤＭＡＲＤ）で治療されたことがある。いくつかの態様では、ＤＭＡＲＤは、アバタセプト、アダリムマブ、アザチオプリン、クロロキン、ヒドロキシクロロキン、シクロスポリン、Ｄ−ペニシラミン、エタネルセプト、ゴリムマブ、インフリキシマブ、レフルノミド、メトトレキサート、ミノサイクリン、リツキシマブ、スルファサラジン、及びそれらの組み合わせから選択される。いくつかの態様では、患者から得られる試料は、全血、血清、血漿、または滑液の一つ以上を含む。いくつかの態様では、患者から得られた試料は、血清である。
【００１８】
いくつかの態様では、上記に開示された方法は、一つ以上のさらなるバイオマーカー（例えば、生物学的バイオマーカーもしくは臨床的バイオマーカー）の発現レベルもしくは活性を決定すること、少なくとも一つの臨床状態マーカーを決定すること、もしくはそれらの組み合わせ、これらの決定のために患者からの試料を提出すること、またはこれらを決定するように臨床検査室に指示すること、をさらに含む。
【００１９】
いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、固定用量で投与される。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、約３０ｍｇ／用量、約１００ｍｇ／用量、または約１５０ｍｇ／用量の固定用量で投与される。
【００２０】
いくつかの態様では、患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルをイムノアッセイで測定する。いくつかの態様では、イムノアッセイは、検出可能に標識されたＰＡＤ４を使用する。いくつかの態様では、検出可能に標識されたＰＡＤ４は、ルシニル化ＰＡＤ４である。いくつかの態様では、イムノアッセイは、抗ＰＡＤ４誘導ＰＡＤ４架橋を検出する。
【図面の簡単な説明】
【００２１】
【図１】図は、マブリリムマブを用いた三つの異なる臨床試験（試験Ａ、Ｂ、及びＣ）からの、ＲＡ対象において測定された抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを示す。
【発明を実施するための形態】
【００２２】
詳細な説明
本開示は、ＲＡ患者からの試料中の抗ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４（抗ＰＡＤ４）自己抗体の存在または非存在をバイオマーカーとして使用して、適切な治療過程、例えば、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体アルファ（ＧＭ−ＣＳＦＲα）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を投与するか否か、を決定することに関する。したがって、本開示は、患者を診断するための方法、患者を（例えば、マブリリムマブなどの抗体を用いて）治療する方法、（例えば、マブリリムマブなどの抗体を用いて）治療する患者を選択もしくは非選択する、特定の治療（例えば、マブリリムマブ）を選択する、一時的もしくは永続的に治療を中断する、患者の予後を判定する、または治療の効果をモニターする方法を提供し、これらの方法は、抗ＰＡＤ４自己抗体の存在または非存在を決定すること、及び／または患者から採取した試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを定量することを含む。特定の実施形態において、抗ＰＡＤ４の存在または非存在は、本明細書に教示されるアッセイを用いて決定される。
【００２３】
本開示がより容易に理解され得るように、特定の用語が最初に定義される。さらなる定義は、詳細な説明の全体を通して説明される。
【００２４】
Ｉ．定義
本明細書及び添付の特許請求の範囲において、単数形「一つ（ａ）」、「一つ（ａｎ）」及び「その（ｔｈｅ）」は、文脈上他に明確に指示されない限り、複数の指示対象を含む。用語「一つ（ａ）（または一つ（ａｎ））」並びに、「一つ以上」及び「少なくとも一つの」は、本明細書では交換可能に使用することができる。
【００２５】
さらに、本明細書で使用される「及び／または」は、二つの特定された特徴または構成要素のそれぞれが、他の特定された特徴または構成要素を有するか否かの具体的な開示として解釈されるべきである。したがって、本明細書中の「Ａ及び／またはＢ」のような語句で使用される「及び／または」という用語は、「Ａ及びＢ」、「ＡまたはＢ」、「Ａ」（単独）及び「Ｂ」（単独）を含むことが意図されている。同様に、「Ａ、Ｂ及び／またはＣ」のような語句で使用される「及び／または」という用語は、以下の態様のそれぞれを包含するように意図されている：Ａ、Ｂ及びＣ；Ａ、ＢまたはＣ；ＡまたはＣ；ＡまたはＢ；ＢまたはＣ；Ａ及びＣ；Ａ及びＢ；Ｂ及びＣ；Ａ（単独）；Ｂ（単独）；Ｃ（単独）。
【００２６】
用語「含む」を用いて本明細書に記載されているいかなる態様も、「からなる」及び／または「から本質的になる」という用語で記載された他の類似の態様もまた提供される。
【００２７】
本明細書及び特許請求の範囲を通じて数値と関連して使用される「約」という用語は、当業者によく知られていて許容される精度の間隔を示す。一般に、そのような精度の間隔は±１５％である。
【００２８】
他に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本開示が関係する当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。例えば、Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｂｉｏｍｅｄｉｃｉｎｅ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｕｏ，Ｐｅｉ−  Ｓｈｏｗ，２ｎｄ  ｅｄ．，２００２，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ；Ｔｈｅ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｃｅｌｌ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，３ｒｄ  ｅｄ．，１９９９，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ；及びｔｈｅ  Ｏｘｆｏｒｄ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  Ｏｆ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｒｅｖｉｓｅｄ，２０００，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓは、本開示において使用される一般的な辞書の多くの用語を当業者に提供する。
【００２９】
単位、接頭辞、及び記号は、Ｓｙｓｔｅｍｅ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ｄｅ  Ｕｎｉｔｅｓ（ＳＩ）に受け入れられる形式で示される。数値範囲は、範囲を定義する数字を含む。別途の表示がない限り、アミノ酸配列は、アミノからカルボキシの向きで左から右に書かれている。本明細書で提供される見出しは、本明細書全体を参照することによって得ることができる本開示の態様または様々な態様の限定ではない。したがって、すぐ下に定義された用語は、明細書全体を参照することにより完全に定義される。
【００３０】
本明細書中で使用される場合、用語「抗体」は、例えば、Ｂ細胞によって産生される典型的な抗体との関連で、抗原、少なくとも重鎖（ＶＨ）の可変ドメイン及び軽鎖の可変ドメイン（ＶＬ）に結合することができる抗体の少なくとも最小部分を指す。脊椎動物系における基本的な抗体構造は比較的よく理解されている。例えば、Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，２ｎｄ  ｅｄ．１９８８）を参照されたい。抗体またはその抗原結合性断片、変異体または誘導体には、ポリクローナル、モノクローナル、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、一本鎖抗体、エピトープ結合断片、例えばＦａｂ、Ｆａｂ’及びＦ（ａｂ’）２、Ｆｄ、Ｆｖｓ、一本鎖Ｆｖｓ（ｓｃＦｖ）、一本鎖抗体、ジスルフィド結合Ｆｖｓ（ｓｄＦｖ）、ＶＬまたはＶＨドメインのいずれかを含む断片、Ｆａｂ発現ライブラリーによって産生された断片を含むが、これらに限定されない。ＳｃＦｖ分子は当該分野で公知であり、例えば、米国特許第５，８９２，０１９号に記載されている。本開示に包含される免疫グロブリンまたは抗体分子は、免疫グロブリンのサブクラスまたは任意のタイプ（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ及びＩｇＹ）、クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２）であり得る。したがって、「抗体」という用語のこの定義がマブリリムマブのような抗体への参照は、マブリリムマブ抗体及びその抗原結合性断片、変異体及び誘導体を指す。
【００３１】
「特異的に結合する」とは、概して、その抗体またはその断片、変異体または誘導体が、その抗原結合ドメインを介してエピトープに結合すること、及びその結合が抗原結合ドメインとエピトープとの間にいくらかの相補性を伴うことを意味する。この定義によれば、抗体は、抗原結合ドメインを介してそのエピトープに、ランダムに、関連性のないエピトープに結合するよりも容易に結合するとき、エピトープに「特異的に結合する」と言われる。
【００３２】
抗体またはその抗原結合性断片、変異体または誘導体は、参照抗体または抗原結合性断片のエピトープへの結合をある程度阻害する程度まで、そのエピトープに優先的に結合する場合には、参照抗体または抗原結合性断片が所与のエピトープに結合するのを競合的に阻害すると言われている。競合的阻害は、当技術分野で公知の任意の方法、例えば競合ＥＬＩＳＡアッセイによって決定することができる。結合分子は、少なくとも９０％、少なくとも８０％、少なくとも７０％、少なくとも６０％、または少なくとも５０％まで、所与のエピトープへの参照抗体または抗原結合性断片の結合を競合的に阻害するといえる。
【００３３】
本明細書で開示される抗体またはその抗原結合性断片、変異体または誘導体は、抗原のエピトープまたは部分（例えば、それらが認識または特異的に結合する標的多糖類）に関して記載または特定することができる。例えば、抗ＧＭ−ＣＳＦＲ抗体（例えば、マブリリムマブ）の抗原結合ドメインと特異的に相互作用するＧＭ−ＣＳＦＲの部分は、「エピトープ」である。
【００３４】
本明細書で使用される用語「自己抗体」（例えば、抗ＰＡＤ４自己抗体を指す）は、対象の免疫系によって産生され、自己抗原に対して指向される抗体を指す。自己抗体は、自己の細胞、組織、及び／または器官を攻撃し、炎症及び損傷を引き起こす可能性がある。本明細書で使用される「自己抗原」という用語は、自己免疫反応におけるように、対象の体内で自己抗体の産生を刺激する内因性抗原（例えば、ＰＡＤ４）またはその活性断片を指す。この用語はまた、対象または対象から得られる生物学的試料中に存在する自己抗体と抗原−抗体複合体を形成し得る任意の物質を包含する。
【００３５】
「治療」という用語は、本明細書では、疾患または状態（例えば、ＲＡ）の発症を遅延または防止すること、状態の症状の進行、増悪または悪化を減速または停止させること、状態の症状または改善をもたらすこと、及び／または該状態を治癒することを目的とする方法を特徴付けるために使用される。予防的または防止的処置のために、疾患の発症前に治療を施すことができる。それは、治療作用のために、疾患の開始後に投与されてもよい。
【００３６】
本明細書中で使用される「対象」または「患者」という用語は、ＲＡの診断、予後または治療が望まれる任意の対象、特に哺乳動物対象を指す。本明細書中で使用される場合、用語「対象」または「患者」は、任意のヒトまたは非ヒト動物を含む。「非ヒト動物」という用語には、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、クマ、ニワトリ、両生類、爬虫類などの哺乳類及び非哺乳動物などの全ての脊椎動物が含まれる。
【００３７】
本明細書中で使用される場合、「関節リウマチ炎患者」または「ＲＡ患者」のような語句は、ＲＡの治療、診断処置または予防処置の投与から利益を得る哺乳動物対象などの対象を含む。いくつかの態様では、「ＲＡ患者」という用語は、ＲＡ（例えば、関節の痛み、硬直または腫脹）を示す一つ以上の症状を示す対象、またはＲＡについてスクリーニングされる対象（例えば、身体検査中）を指す。代替的または追加的に、用語「ＲＡ患者」は、ＲＡを有する疑いのある対象または一つまたは複数の危険因子（例えば、年齢、性別、家族歴、喫煙など）を有し得る対象を包含する。この用語は、ＲＡについて試験されていない対象及び初期診断を受けた対象を包含する。
【００３８】
本開示のいくつかの態様では、対象はナイーブな対象である。ナイーブ対象は、ＲＡ療法、例えばＤＭＡＲＤのような治療薬を投与されていない対象である。いくつかの態様では、ナイーブ対象は、ＲＡと診断される前に治療薬で治療されていない。別の態様において、対象は、ＲＡを有すると診断される前に、治療及び／または一つ以上の用量の治療剤（例えば、ＤＭＡＲＤ）を受けている。治療剤は、小分子薬物、抗体、融合タンパク質、コルチコステロイド、ＮＳＡＩＤ（例えば、イブプロフェン、ナプロキセンなど）、ＤＭＡＲＤ（例えば、メトトレキセート、レフルノミド、クロロキン、ヒドロキシクロロキン、アザチオプリン、シクロスポリン、Ｄ−ペニシラミン、スルファサラジン、ミノサイクリンなど）、生物学的物質（例えば、アバタセプト、アダリムマブ、アナキンラ、セツリズマブ、エタネルセプト、ゴリムマブ、インフリキシマブ、リツキシマブ、トファシチニブ、またはメブラリムナブ）、またはそれらの組み合わせであり得る。
【００３９】
一態様では、本明細書に開示される方法に従って使用される治療剤は、抗体、例えばマブリリムマブなどの抗ＧＭ−ＣＳＦＲα抗体である。したがって、いくつかの態様では、対象は、抗体（例えば、マリブリムマブ）の少なくとも一つの治療的に有効な用量を投与されたことがあるか、またはそれを投与される候補である。対象の抗ＰＡＤ４レベルが所定の抗ＰＡＤ４閾値レベルを下回る場合、または抗ＰＡＤ４自己抗体が存在しないかもしくはそれらのレベルが一つもしくは複数の対照試料における抗ＰＡＤ４レベルと比較して低い場合、対象は、少なくとも一つの治療上有効な用量の抗ＧＭ−ＣＳＦＲα抗体を投与され得る。また、対象の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが所定の抗ＰＡＤ４自己抗体閾値レベルを下回る場合、または抗ＰＡＤ４自己抗体が存在しないかもしくはそれらのレベルが一つもしくは複数の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して低い場合、対象は、本明細書中に開示される抗ＧＭ−ＣＳＦＲα抗体の少なくとも一つの治療上有効な用量を投与されるのに適格であるとみなされ得る。
【００４０】
いくつかの態様では、抗ＰＡＤ４自己抗体の存在または非存在は、使用されるアッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）に基づく。いくつかの実施形態では、本明細書で使用されるアッセイが教示される。生物分析のパラメータである「定量下限」または「ＬＬＯＱ」は、「適切な正確さ及び精度で定量的に測定できる試料中の分析物の最低量」として定義される（ＦＤＡ．：Ｇｕｉｄａｎｃｅ  ｆｏｒ  Ｉｎｄｕｓｔｒｙ，Ｂｉｏａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄ  Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ，Ｍａｙ  ２００１）。
【００４１】
対象に適用される場合の用語「正常」及び「健康な」は、本明細書では交換可能に使用される。それらは、ＲＡ症状を示さず、ＲＡまたは軟骨または骨損傷と診断されていない対象を指す。好ましくは、正常な対象は、ＲＡに影響を与える薬物を飲んでおらず、他の疾患（特に、自己免疫炎症性疾患）と診断されていない。特定の実施形態では、正常な対象は、試験されるべき生物学的試料が得られた対象と比較して、類似の性別、年齢、及び／または肥満度指数を有し得る。「正常」という用語はまた、健常な対象から得られた試料を識別するために本明細書中で使用される。
【００４２】
本明細書で使用される「治療」という用語は、例えば、治療剤、器具、支持措置、及び外科手術またはリハビリテーション処置を含む、ＲＡを治癒、緩和または予防するための任意の手段を含む。この点において、治療という用語は、ＲＡの予防、管理、治療及び／または改善に使用することができる任意のプロトコル、方法及び／または治療または診断を包含する。
【００４３】
本明細書で使用される「治療剤」という用語は、ＲＡを有する対象に投与されて所望の、通常有益な効果を生じる任意の治療的に活性な物質を指す。治療薬という用語は、例えば、小分子薬物及び生物製剤（抗体またはその活性断片、ペプチド、タンパク質薬物、タンパク質複合体薬物などを含むがこれらに限定されない）と一般に呼ばれる古典的低分子量治療薬を含む。治療剤は、対象に投与されたときに所望の治療活性物質に代謝されるプロドラッグであってもよい。いくつかの態様では、治療剤は予防剤である。加えて、治療剤を薬学的に製剤化することができる。
【００４４】
本明細書で使用される「治療上有効な」量は、ＲＡを有する対象にいくらかの改善または利益をもたらす治療薬の量である。したがって、「治療上有効な」量は、ＲＡの少なくとも一つの臨床症状においていくらか緩和、鎮静及び／または減少をもたらす量である。本開示の方法及びシステムによって治療することができるＲＡに関連する臨床症状は、当業者に周知である。さらに、当業者は、何らかの利益が対象に提供される限り、治療効果が完全である必要はなく、治癒的である必要もないことを理解するであろう。
【００４５】
本明細書中で使用される場合、ＲＡを有する患者における特定の結果を達成するための「十分量」または「〜に対して十分な量」は、任意に治療効果（すなわち、治療有効量の投与による）である所望の効果を生じるのに有効な治療薬（例えば、マブリリムマブなどの抗体）の量をいう。
【００４６】
「生物学的試料」という用語は、本明細書中で最も広い意味で使用される。生物学的試料は、一般に、対象から得られる。試料は、本開示のバイオマーカーをアッセイすることができる任意の生物学的組織または体液であり得る。しばしば、試料は「臨床試料」、すなわち患者由来の試料である。そのような試料には、例えば、血液（例えば、全血、血清または血漿）、尿、滑液、唾液、組織または細針生検試料などの細胞を含むまたは含まない体液、及び既知の診断、治療及び／または結果の履歴を有するアーカイブ試料が含まれるが、これらに限定されない。生物学的試料は、組織学的目的のために採取された凍結切片などの組織切片も含むことができる。「生物学的試料」という用語はまた、生物学的試料を処理することによって得られる任意の物質を包含する。得られた物質には、試料から抽出されたタンパク質が含まれるが、これに限定されない。生物学的試料の処理は、濾過、蒸留、抽出、濃縮、干渉成分の不活性化、試薬の添加などのうちの一つ以上を含み得る。いくつかの態様では、生物学的試料は血清学的試料であり、対象から得られた全血、血清または血漿である（またはそれに由来する）。
【００４７】
本明細書中で使用される場合、用語「対照」は、対象を特徴付けるために使用される場合、健康である対象、またはＲＡ以外の特定の疾患と診断された対象をいう。用語「対照試料」は、健康な対象またはＲＡ以外の疾患と診断された患者から得られた一つまたは複数の生物学的試料を指す。
【００４８】
本開示の方法及びシステムを適用するために、患者からの試料は、ＲＡを治療するための療法の投与の前または後に得ることができる。場合によっては、治療が開始された後または治療が終了した後に、連続した試料を患者から得ることができる。試料は、例えば、医療提供者（例えば、医師）または医療給付提供者によって要求され得、同じまたは異なる医療提供者（例えば、看護師、病院）または臨床検査室によって採取され及び／または処理され、処理後、結果が元の医療提供者もしくはさらに別の医療提供者、医療給付提供者、または患者に送付され得る。同様に、バイオマーカーの存在または非存在（例えば、抗ＰＡＤ４自己抗体の非存在または存在）の決定は、及び／またはバイオマーカーのレベルの定量（例えば、抗ＰＡＤ４自己抗体の量の定量化）、バイオマーカーのレベル間の比較、バイオマーカーの非存在／存在またはレベルの評価、並びに治療の決定を、一人または複数の医療提供者、医療給付提供者、及び／または臨床検査室によって行うことができる。
【００４９】
本明細書で使用される場合、「医療提供者」という用語は、生きている対象、例えばヒト患者に直接的に相互作用し投与する個人または施設を指す。医療提供者の非限定的な例には、医師、看護師、技術者、セラピスト、薬剤師、カウンセラー、代替医療従事者、医療施設、医院、病院、救急室、クリニック、緊急ケアセンター、代替医療クリニック／施設、一般治療、専門治療、外科的、及び／または他のタイプの治療、評価、維持、セラピー、投薬及び／またはアドバイスを含むが、これらに限定されない、すべてのまたは患者の健康状態の任意の部分に関する、一般及び／または専門治療、評価、維持、セラピー、投薬及び／またはアドバイスを提供する他の任意の存在を含む。
【００５０】
本明細書で使用される場合、用語「臨床検査室」は、例えば、ヒトなどの生体由来の物質の検査または処理のための施設を指す。処理の非限定的な例は、ヒトなどの生存対象の、任意の疾患または障害の診断、予防または治療、または健康の評価についての情報を提供する目的で、人体由来の材料の生物学的、生化学的、血清学的、化学的、免疫学的、血液学的、生物物理学的、細胞学的、病理学的、遺伝学的または他の検査を含む。これらの検査はまた、試料の収集や採取、準備、決定、測定、あるいはそうでなければ生きている対象、例えばヒトの体内の様々な物質の存在または不存在、もしくは生きている対象の身体、例えば人間から得られた試料を記述するための手順を含むことができる。
【００５１】
本明細書で使用される場合、「医療給付提供者」という用語は、その全体または一部を提供し、提示し、オファーし、支払っている個々の当事者、組織、またはグループ、あるいはそうでなければ患者が一つまたは複数の医療給付、給付計画、健康保険、及び／または医療費経費プログラムにアクセスできるようにすることに関連するものを含む。
【００５２】
いくつかの態様では、医療提供者は、ＲＡを治療するための療法を投与するために他の医療提供者を管理または指示することができる。医療提供者は、以下の行為の実施を実行または別の医療提供者または患者に指示することができる：試料を採取する、試料を処理する、試料を提出する、試料を受け取る、試料を移す、試料を分析または測定する、試料を定量化する、試料を分析／測定／定量した後に得られた結果を提供する、試料を分析／測定／定量した後に得られた結果を受け取る、一つ以上の試料を分析／測定／定量した後に得られた結果を比較／スコアリングする、一つまたは複数の試料からの比較／スコアを提供する、一つまたは複数の試料からの比較／スコアを得る、治療（例えば、ＲＡを治療する治療薬）を投与する、治療の投与を開始する、治療の投与を中止する、治療の投与を継続する、一時的に治療の投与を中断する、投与される治療剤の量を増加させる、投与される治療剤の量を減少させる、ある量の治療剤の投与を継続する、治療剤の投与頻度を増加させる、治療剤の投与頻度を減少させる、治療剤に同じ投薬頻度を維持する、療法または治療剤を少なくとももう一つの療法または治療剤で置き換える、療法または治療剤を少なくとももう一つの療法または追加の治療剤と組み合わせる。
【００５３】
いくつかの態様では、医療提供者は、例えば、試料の収集、試料の処理、試料の提出、試料の受領、試料の移送、試料の分析または測定、試料の定量化、試料の分析／測定／定量後に得られた結果の提供、試料の分析／測定／定量後に得られた結果の転送、一つ以上の試料を分析／測定／定量化した後に得られた結果の比較／スコア化、一つもしくは複数の試料からの比較／スコアの転送、療法もしくは治療剤の投与、療法もしくは治療剤の投与の開始、療法もしくは治療剤の投与の中断、療法もしくは治療剤の投与の継続、療法もしくは治療剤の投与の一時的中断、投与される治療剤の量の増加、投与された治療剤の量の減少、ある量の治療剤の投与の継続、治療剤の投与頻度の増加、治療剤の投与頻度の減少、治療剤での同じ投薬頻度を維持、療法または治療剤を少なくとも別の療法または治療剤で置き換え、または療法もしくは治療剤を少なくとも別の治療剤または追加の治療剤と組み合わせることを認可または拒否することができる。
【００５４】
さらに、医療給付提供者は、例えば、療法の処方を許可または却下する、療法の適用範囲を認可または却下する、治療費の払戻しを認可または却下する、治療等の適格性を決定または拒否すること等ができる。
【００５５】
いくつかの態様では、臨床検査室は、例えば、試料を収集または取得する、試料を処理する、試料を提出する、試料を受け取る、試料を転送する、試料を分析または測定する、試料を定量化する、試料を分析／測定／定量した後に得られた結果を提供する、試料を分析／測定／定量した後に得られた結果を受け取る、一つ以上の試料を分析／測定／定量した後に得られた結果を比較／スコア化する、一つ以上の試料から比較／スコアを提供する、一つ以上の試料から比較／スコアを得る、または他の関連する活動を提供することができる。
【００５６】
用語「バイオマーカー」及び「マーカー」は、本明細書では交換可能に使用される。それらは、生物学的プロセス、生物学的事象、及び／または病的状態の特徴的な指標である予測因子を指す。本明細書では、バイオマーカーという用語は、臨床マーカー及び生物学的マーカーの両方を包含する。したがって、本発明の文脈において、「バイオマーカー」という用語は、抗ＰＡＤ４自己抗体並びにカルパスタチン、ＢＲＡＦ、Ｃ反応性タンパク質、血清アミロイドＡ、インターロイキン６、Ｓ１００タンパク質、オステオポンチン、リウマチ因子、マトリックスメタロプロテアーゼ１、マトリックスメタロプロテアーゼ３、ヒアルロン酸、ｓＣＤ１４、血管新生マーカー、骨、軟骨、または滑膜代謝の産物、血液または滑膜中のＥＹＡ４、ＰＤＺＤ２、ＴＮＦ、ＩＬ−１ｂ、ＩＬ−１７、リウマチ因子（ＲＦ）、抗シトルリン化ペプチド抗体（ＡＣＰＡ）及びそれらの組み合わせなどのタンパク質を含む他のＲＡ「生物学的バイオマーカー」を包含する。本明細書に開示される生物学的マーカーには、これらのタンパク質（ＤＮＡ及び／またはＲＮＡ）並びに代謝産物をコードする遺伝子も含まれる。
【００５７】
「標識された」、「検出可能に標識された」、「検出可能な試薬で標識された」及び「検出可能な部分で標識された」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。これらの用語は、例えば、別の実体（例えば、抗ＰＡＤ４自己抗体）への結合後に実体（例えば、全長ＰＡＤ４または自己抗体により標的とされるＰＡＤ４−ペプチド）を視覚化することを特定するために使用される。好ましくは、検出可能な作用物質または部分は、測定可能なシグナルを生成し、その強度が結合した実体の量に関連するように選択される。アレイに基づく方法では、検出可能な作用物質または部分も好ましくは、局在化シグナルを生成するように選択され、アレイ上の各スポットからのシグナルの空間分解能を可能にする。タンパク質及びポリペプチドを標識するための方法は、当技術分野で周知である。標識されたポリペプチド、例えば、標識されたＰＡＤ４またはその断片は、標識の組み込みまたは結合によって調製され得、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、電気的、光学的または化学的手段、または任意の他の適切な手段によって直接的または間接的に検出可能である。適切な検出可能な試薬には、種々のリガンド、放射性核種、蛍光色素、化学発光剤、微粒子、酵素、比色標識、磁気標識及びハプテンが含まれるが、これらに限定されない。本開示のいくつかの態様では、組換えＰＡＤ４またはその断片をルテニウムで標識して発光Ｒｕ（ＩＩ）金属錯体を得ることができる。
【００５８】
「マブリリムマブ」という用語は、その全てがそれらの全体において参照により組み込まれる、例えば、米国特許第８２６３０７５号及び米国特許第８５０６９６０号、並びに米国公開公報のＵＳ２００９０１３００９３、ＵＳ２０１２０１４１４６４、及びＵＳ２０１４００７９７０８に記載されているように、ＧＭ−ＣＳＦＲαを標的とすることによってマクロファージの活性化、分化及び生存を調節するように設計されたヒトＩｇＧ４モノクローナル抗体を指す。ＵＳ２０１４０３３５０８１は、ＲＡを治療するためのマブリリムマブの使用を記載している。本明細書中で使用される場合、マブリリムマブは、配列番号２の重鎖及び配列番号３の軽鎖を含むマブリリムマブ抗体、並びにその抗原結合性断片を包含する。
【００５９】
マブリリムマブは、ＧＭ−ＣＳＦＲαの生物活性の強力な中和剤であり、理論に縛られることを望むものではないが、ＲＡ患者の滑膜関節内の白血球上のＧＭ−ＣＳＦＲαに結合することによって治療効果を発揮することができ、減少した細胞生存及び活性化を導く。米国特許第８２６３０７５号は、ＧＭ−ＣＳＦＲαの生物学的活性を高い効力で中和する能力を共有するマブリリムマブ及びその変異体の単離及び特徴付けを報告している。これらの抗体の機能的特性は、少なくとも部分的に、ヒトＧＭ−ＣＳＦＲαの２２６位〜２３０位のＴｙｒ−Ｌｅｕ−Ａｓｐ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎモチーフ（このアミノ酸配列は配列番号１２に記載されている）に結合し、それによってＧＭ−ＣＳＦＲαとそのリガンドでるＧＭ−ＣＳＦとの間の会合を阻害することの結果であると考えられる。マブリリムマブ重鎖（ＨＣ；配列番号２に記載）のアミノ酸配列；軽鎖（ＬＣ；配列番号３に記載）；重鎖可変領域（ＶＨ；配列番号４に記載）；軽鎖可変領域（ＶＬ；配列番号５に記載）；重鎖可変領域相補性決定領域（それぞれ、配列番号６，７及び８に示されるＶＨ−ＣＤＲ１、ＶＨ−ＣＤＲ２及びＶＨ−ＣＤＲ３）及び軽鎖可変領域ＣＤＲ（ＶＬ−ＣＤＲ１、ＶＬ−ＣＤＲ２及びＶＬ−ＣＤＲ３；それぞれ配列番号９、１０及び１１に示される）。
【００６０】
本明細書で使用される「ＰＡＤ４」という用語は、ペプチジルアルギニンデイミナーゼ、ＩＶ型及びそのアイソフォームを指す。ヒトＰＡＤ４のアミノ酸配列はＵｎｉｐｒｏｔ：Ｑ９ＵＭ０７に見出され、配列番号１３に記載されている。ヒトでは、このタンパク質はＰＡＤＩ４遺伝子及びその断片によってコードされる（Ｊｏｎｅｓ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖ  Ｄｅｖｅｌ．１２：６１６  ６２７（２００９））。ＲＡにおける重要な自己抗体は、フィブリン、フィラグリン、フィブロネクチン、エノラーゼ及びビメンチンなどの異なるタンパク質上のシトルリン化残基に向けられる。シトルリン化タンパク質は、カルシウム依存性ペプチジルアルギニンデイミナーゼ（ＰＡＤ）によって触媒されるプロセスである、アルギニン残基のシトルリンへの翻訳後変換によって生成される。
【００６１】
ＰＡＤ４遺伝子のＲＡ関連変異は様々な集団において同定されているため、ＰＡＤ４はＲＡ疾患発症及び進行において役割を果たすと広く考えられている。例えば、Ｓｕｚｕｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．３４：３９５−４０２（２００３，）；Ｉｗａｍｏｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ  ４５：８０４−８０７（２００６）；Ｈａｒｎｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ  ４４：８６９−８７２（２００５）；及びＣａｎｔａｅｒｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｈｅｕｍ．Ｄｉｓ．６４：１３１６−１３２０（２００５）を参照されたい。ＰＡＤ４は、シトルリン化エピトープの生成に関与するばかりでなく、それ自体がＲＡ特異的抗体の標的である。ＲＡ患者におけるＰＡＤ４に対する自己抗体が記載されている。例えば、Ｔａｋｉｚａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃａｎｄ．Ｊ．Ｒｈｅｕｍａｔｏｌ．３：２１２−２１５（２００５）；Ｒｏｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｒｈｅｕｍａｔｏｌ．１：１２−１８（２００６）；Ｈａｌｖｏｒｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｈｅｕｍａｔｏｌ．Ｄｉｓ．６７：４１４−４１７（２００８）；ａｎｄ  Ｚｈａｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｒｈｅｕｍａｔｏｌ．，３５：９６９−９７４（２００８）を参照されたい。
【００６２】
本明細書で使用される「ＰＡＤ３」という用語は、タンパク質アルギニンデイミナーゼ３型及びそのアイソフォームを指す。ヒトＰＡＤ３のアミノ酸配列はＵｎｉｐｒｏｔ  Ｑ９ＵＬＷ８に見出される。このタンパク質は、ヒトにおいてＰＡＤＩ３遺伝子によってコードされる。
【００６３】
本明細書中で使用される「ＧＭ−ＣＳＦＲ」という用語は、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）受容体を指す。ＧＭ−ＣＳＦＲは、高度に保存されたサイトカイン受容体スーパーファミリーのメンバーである。ＧＭ−ＣＳＦＲは、いくつかの造血細胞で観察されるＧＭ−ＣＳＦに対して異なる親和性をもたらす二つのサブユニットを含む。第一のサブユニットは一般にα１サブユニットと呼ばれ、それ自身でＧＭ−ＣＳＦと低親和性で結合することができる８５Ｋｄのタンパク質である。ＧＭ−ＣＳＦＲα鎖のいくつかの他のアイソフォーム、いくつかの膜結合型及びいくつかの可溶性型が記載されているが、α１アイソフォームは好中球及びマクロファージの細胞表面上に発現する優性型であるようである（Ｃｒｏｓｉｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｒ  Ｊ  Ｈａｅｍａｔｏｌ．９８：５４０−５４８（１９９７））。ＧＭ−ＣＳＦＲα１の細胞外部分は高度にグリコシル化されている。この受容体は第二のサブユニットであるβ鎖を有し、これはそれ自身ではＧＭ−ＣＳＦに結合しない。むしろ、それがα１受容体に結合しているときにＧＭ−ＣＳＦに結合する。用語「ＧＭ−ＣＳＦＲａ」、「ＧＭ−ＣＳＦＲα」、「ＧＭ−ＣＳＦＲアルファ」及びそれらの文法上の変異体はＧＭ−ＣＳＦＲのα１サブユニットを指し、このタンパク質は配列番号１に記載のアミノ酸配列を有し得る。
【００６４】
ＩＩ．臨床応答バイオマーカーとしての抗ＰＡＤ４自己抗体
ＲＡは、いくつかのタイプの自己抗体の存在によって特徴付けられる。ＰＡＤ４に対する自己抗体は、ＲＡ患者の約３分の１に存在する。しかしながら、現在のところ、抗ＰＡＤ４自己抗体がＲＡにおいて有するかもしれない機能及び潜在的な病因的役割の理解が不十分である。マブリリムマブのようなヒトＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する治療抗体を含む新しい治療選択肢は、ＲＡ患者の満たされていない医学的ニーズに対処するために重要である。これらの抗体、すなわち診断または臨床応答バイオマーカーに対する良好な臨床応答を有する可能性が高いＲＡ患者を同定する手段は、この新規な治療薬の有用性を大幅に増強することができる。
【００６５】
本発明者らは、マブリリムマブによる治療の開始前にＲＡ対象の血清中に抗ＰＡＤ４自己抗体が存在することが臨床応答の予測因子であることを見出した。抗ＰＡＤ４自己抗体レベルは、ＰＡＤ４に結合する能力によって抗ＰＡＤ４抗体を検出する新規アッセイを用いて血清中で測定されている。このアッセイを使用して、臨床試験に入ったＲＡ対象のベースライン血清試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを定量化した。統計学的分析は、アッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）未満の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを有するＲＡ対象が、プラセボと比較してマブリリムマブに対する臨床応答が有意に増加したことを示し、一方、検出可能な抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを有する対象によるマブリリムマブへの応答は、プラセボに対する応答に、より類似した。この知見は、マブリリムマブ療法の開始前に抗ＰＡＤ４自己抗体の存在を試験することの有用性を支持し、ＤＭＡＲＤ標準治療と比較してマブリリムマブで治療した場合に陽性の臨床転帰を有する患者を同定する。さらに、ＲＡ患者を治療するための選択肢の選択を支援するリウマチ専門医の診断テストは現在のところ行われていない。ＤＭＡＲＤのみで治療した場合よりもマブリリムマブで治療した場合、患者がより良い結果を示す可能性が高いことを示すために、抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを（血液検査を介して）測定することは、この疾患の治療パラダイムにおいて著しい進歩である。いくつかの実施形態において、抗ＰＡＤ４自己抗体レベルは、本明細書に教示された新規な方法を用いて測定される。
【００６６】
「抗ＰＡＤ４自己抗体レベル」、「抗ＰＡＤ４自己抗体レベル」、「抗ＰＡＤ４自己抗体のレベル」、「患者の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベル」などの用語「レベル」、及びその文法上の変化形は、生物学的試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在または発現を検出するための任意の分析方法を用いて成された測定を指し、生物学的試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体またはそれに対応するものの存在、非存在、絶対量または濃度、相対量または濃度、力価、発現レベル、測定レベルの比などを示す。「値」または「レベル」の正確な性質は、抗ＰＡＤ４自己抗体を検出するために用いられる特定の分析方法の特定の設計及び成分に依存する。
【００６７】
対象から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の検出に関して本明細書で使用される場合、用語「存在しない」または「存在する」は、抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが、生物学的試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体を検出するために使用される分析方法の定量下限値（ＬＬＯＱ）を下回るか上回るかどうかを指す。
【００６８】
抗ＰＡＤ４自己抗体に関して本明細書中で使用される場合、用語「上昇したレベル」、「高レベル」及びそれらの改変体は、対照レベルまたは範囲よりも高い生物学的試料（例えば、血清）におけるレベルを指す。したがって、特定の生物学的試料において測定されたレベルは、同様の対照試料において決定されたレベルまたはレベルの範囲と比較され得る。いくつかの態様では、対照試料は、検出可能なＲＡ症状のない対象から得られた試料である。他の態様では、対照試料は、抗ＰＡＤ４自己抗体（例えば、マブリリムマブによる治療に対して反応しないと判定された血清中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを有する対象）に対して血清反応陽性である対象から得られた試料である。抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルは、抗ＰＡＤ４自己抗体が対照試料中よりも高いレベルまたは範囲で試験試料中に存在する場合に上昇すると言われている。逆に、抗ＰＡＤ４自己抗体に関連して本明細書で使用される「より低レベル」、「低レベル」及びそれらの変化形の用語は、対照レベルまたは範囲よりも低い生物学的試料（例えば、血清）におけるレベルを指す。したがって、抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルは、低レベルまたはより低レベルであると言われ、ここで、抗ＰＡＤ４自己抗体は、対照試料よりも低いレベルまたは範囲で試験試料中に存在する。
【００６９】
本明細書に開示される方法は、抗ＰＡＤ４自己抗体を含み得る任意の試料を用いて実施することができる。利用しやすい試料には、例えば、全血、血清、血漿、末梢血単核球試料、または滑液または滑膜組織が含まれる。いくつかの態様では、滑膜組織試料は、膝関節または足首関節から得ることができる。いくつかの態様では、抗ＰＡＤ４自己抗体は、血清試料中で測定される。
【００７０】
いくつかの態様において、試料は、生理学的ｐＨで、リン酸、トリスなどの適切な緩衝液中での濃縮または希釈によって、必要に応じて前処理することができる。
【００７１】
抗ＰＡＤ４自己抗体は、当業者に周知の多くの方法のいずれかによって検出及び定量することができる。これらの方法には、電気泳動、キャピラリー電気泳動、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）、薄層クロマトグラフィー（ＴＬＣ）、高ジフルフュージョンクロマトグラフィー、質量分光法などの分析的生化学的方法、または流体またはゲル沈降反応、免疫拡散（一重または二重）、免疫組織化学、アフィニティークロマトグラフィー、免疫電気泳動法、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、酵素結合イムノソルベントアッセイ（ＥＬＩＳＡ）、免疫蛍光アッセイ、ウェスタンブロッティングなどの種々の免疫学的方法が挙げられる。
【００７２】
特定の態様において、抗ＰＡＤ４自己抗体は、イムノアッセイを用いて生物学的試料中で検出及び／または定量される。抗ＰＡＤ４自己抗体を検出するためのイムノアッセイは当技術分野で公知であるが、抗ＰＡＤ４自己抗体の検出のためのイムノアッセイが本明細書に記載されている。
【００７３】
特定の態様において、イムノアッセイは、サンドイッチイムノアッセイ、例えば酵素結合イムノソルベントアッセイ（ＥＬＩＳＡ）またはサンドイッチ電気化学発光（ＥＣＬ）アッセイを含み、第一のＰＡＤ４分子（「捕捉ＰＡＤ４」）を固体支持体に結合させ、試料または標準からの抗ＰＡＤ４自己抗体を捕捉ＰＡＤ４に結合させ、そして次いで第二のＰＡＤ４分子（「検出ＰＡＤ４」）が添加され、酵素反応、ＥＣＬ反応、放射能、または他の検出方法のいずれかによって検出される。したがって、イムノアッセイは、「捕捉ＰＡＤ４」及び「検出ＰＡＤ４」の抗ＰＡＤ４自己抗体誘発性架橋を測定するであろう。イムノアッセイの特定の態様では、捕捉ＰＡＤ４分子は固体支持体に結合していない。
【００７４】
「固体支持体に結合した」という用語は、吸着、共有結合または特異的結合対により、例えば、ビオチン／アビジンのような適切な特異的結合対の特異的相互作用により、基材（例えば、プレート中のウェルの表面）への付着によって起こる固定化を指す。
【００７５】
検出ＰＡＤ４は酵素、例えば西洋ワサビペルオキシダーゼまたはアルカリホスファターゼで直接標識することができ、または酵素を結合させることができるタグで標識することができる。酵素標識の例は、例えば、アルカリホスファターゼ、ペルオキシダーゼ及びガラクトシダーゼである。例えば、検出ＰＡＤ４をビオチンに結合させることができ、酵素結合ストレプトアビジンをビオチンタグに結合させることにより、酵素を次の工程で結合させることができる。あるいは、検出ＰＡＤ４を化学発光性、蛍光性、またはＥＣＬタグに結合させることができる。後者の例は、ルテニウムキレートである。インキュベーション後、プレートを洗浄して、結合していない検出ＰＡＤ４を除去することができる。
【００７６】
検出ＰＡＤ４の検出は、使用される検出システムのタイプに基づいて変化する方法によって達成され得る。検出ＰＡＤ４がビオチンで標識されている場合には、酵素結合ストレプトアビジンを添加し、結合していないストレプトアビジンを洗い流し、例えば分光光度計で読み取ることができる比色反応を示す基質を添加する。
【００７７】
発光金属キレートは、検出可能な発光反応を生成する金属キレートである。この発光反応の検出は、例えば、蛍光の測定（すなわち、検出ＰＡＤ４がルテニウムキレートにコンジュゲートされている場合、蛍光が測定される）による、または電気化学発光（すなわち、検出ＰＡＤ４がルテニウムキレートにコンジュゲートされている場合、プレートに電流が印加され、発光が測定される）によるものである。
【００７８】
これらの金属キレートの金属は、例えば、遷移金属または希土類金属である。金属は、例えば、ルテニウム、オスミウム、レニウム、イリジウム、ロジウム、白金、インジウム、パラジウム、モリブデン、テクネチウム、銅、クロムまたはタングステンであり得る。金属と一緒に金属キレートを形成する配位子は、通常、多座配位子、すなわち、いくつかの配位位置を有する配位子である。多座配位子は、例えば、芳香族及び脂肪族配位子を含む。
【００７９】
特定の態様では、この方法は、患者試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを直接測定し、イムノアッセイ結果を標準曲線上にプロットすることによって絶対レベルを計算する。次いで、検出されたシグナルは、様々な標準及び／または対照に基づいて定量化され得る。結果を標準曲線上にプロットすることにより、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の絶対レベルを、例えば、ｎｇ抗ＰＡＤ４／ｍＬまたは抗ＰＡＤ４ユニット／ｍＬ（Ｕ／ｍＬ）で計算することができる。
【００８０】
既知の対照試料との比較に基づいて、「閾値レベル」を測定することができ、その抗ＰＡＤ４自己抗体閾値レベルを上回る試験試料は、例えば、試料を採取した患者が、マブリリムマブのようなＧＭ−ＣＳＦＲに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の恩恵を受ける可能性があることを示す。抗ＰＡＤ４自己抗体閾値レベルは、予め決定することができ、その場合、それらは試料のタイプ（例えば、血清または滑液）、ＲＡのタイプ（例えば血清陽性または血清陰性ＲＡ）、及び場合によっては使用されるアッセイに関してマッチされなければならない。
【００８１】
いくつかの態様では、所定の閾値レベルは、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在を検出するために用いられるアッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）である。いくつかの態様では、ＬＬＯＱは、本開示の実施例１に提示されるアッセイのＬＬＯＱである。いくつかの態様では、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在を検出するために用いられるアッセイのＬＬＯＱは、少なくとも１，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，１００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，２００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，３００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，４００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，５００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，６００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，７００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，８００Ｕ／ｍＬ、少なくとも１，９００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，１００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，２００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，３００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，４００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，５００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，６００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，７００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，８００Ｕ／ｍＬ、少なくとも２，９００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，１００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，２００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，３００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，４００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，５００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，６００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，７００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，８００Ｕ／ｍＬ、少なくとも３，９００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，１００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，２００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，３００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，４００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，５００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，６００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，７００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，８００Ｕ／ｍＬ、少なくとも４，９００Ｕ／ｍＬ、少なくとも５０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも５５００Ｕ／ｍＬ、少なくとも６０００Ｕ／ｍＬ、または少なくとも６５００Ｕ／ｍＬである。
【００８２】
いくつかの態様では、試料、例えば血清試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の所定の閾値レベルは、イムノアッセイを用いて試料（例えば、血清）で測定される際、少なくとも約５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約３０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約３５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約４０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約４５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約５０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約５５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約６０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約６５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約７０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約７５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約８０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約８５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約９０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約９５，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１００，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１１０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１２０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１３０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１４０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１５０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１６０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１７０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１８０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約１９０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２００，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２１０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２２０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２３０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２４０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２５０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２６０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２７０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２８０，０００Ｕ／ｍＬ、少なくとも約２９０，０００Ｕ／ｍＬ、または少なくとも約３００，０００Ｕ／ｍＬであり得る。いくつかの態様では、イムノアッセイは、本開示の実施例１に提示されるアッセイである。
【００８３】
抗ＰＡＤ４自己抗体閾値レベルは、アッセイの性質、例えば、使用される捕捉ＰＡＤ４及び検出ＰＡＤ４、標準の供給源、純度及び組成などに基づいて変化し得る。一つの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片（例えば、マブリリムマブ）での治療から恩恵を受けることができるかどうかを決定するためのアッセイの任意の閾値レベルまたはＬＬＯＱを使用する代わりに、患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを一つ以上の対照抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較することができる。この態様によれば、試験試料（例えば、ＲＡに罹患している患者由来の試料）を一つ以上の対照試料（例えば、正常な健康な個体から採取された試料、同じ患者から採取された初期の試料、患者の疾患のサブセットを有する患者から採取された試料、単離された抗ＰＡＤ４抗体の所定の標準量、またはそれらの組み合わせ）と比較する。
【００８４】
いくつかの態様では、対照レベルと比較した対象の抗ＰＡＤ４抗体レベルの変動を決定するために、結果を対照試料との比として表すことができる。この態様によれば、対照試料は、例えば患者試料が全血である場合は全血、患者試料が血清である場合は血清、患者試料が血漿である場合は血漿、または患者試料が滑液である場合は滑液、のうちの一つまたは複数である、患者試料と一致した対であり得る。
【００８５】
抗ＰＡＤ４抗体検出アッセイは、当業者に周知の標準的な方法に従って（陽性または陰性または検体の量として）スコアリングすることができる。特定のスコアリングの方法は、アッセイ形式および標識の選択に依存する。例えば、イムノアッセイは、検出可能に標識された成分（例えば、実施例１に記載のイムノアッセイにおいてルテニル化ＰＡＤ４）を視覚化することによりスコアリングすることができる。検出可能なシグナル（例えば、対照レベルまたはバックグラウンドレベルを上回る発光シグナル）は、陽性結果としてスコア化されるが、明確に検出可能なシグナルの非存在は、陰性としてスコア化され、アッセイのＬＬＯＱとして知られる。検出可能なシグナルの強度は、分析物濃度の定量的尺度を提供することができる。
【００８６】
一度決定されると、抗ＰＡＤ４抗体レベルを患者の医療記録に記録することができる。いくつかの態様では、本明細書に開示される方法は、抗ＰＡＤ４抗体レベルに少なくとも部分的に基づいて、診断（しばしば鑑別診断）を行うことを含む。
【００８７】
本明細書で使用される場合、用語「鑑別診断」は、患者が治療可能であるかどうか、治療に反応する可能性が高いかどうか、または患者試料由来の試料中の測定された抗ＰＡＤ４抗体レベルが所定の閾値レベルを下回るかどうか、または一つもしくは複数の対照試料中の抗ＰＡＤ４抗体レベルと比較して低いかどうかに応じて、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の候補であるかどうか（例えば、いくつかの態様では、抗ＰＡＤ４抗体のレベルが所定の閾値レベル未満である限り、患者が抗ＰＡＤ４抗体について陽性であるとしても、患者はマブリリムマブ治療に応答し得る）、の判定を指す。特定の態様において、抗ＰＡＤ４自己抗体の所定の閾値レベルは、アッセイのＬＬＯＱである。
【００８８】
特定の態様において、本明細書中に開示される方法は、抗ＰＡＤ４抗体を検出するアッセイの結果及び／または抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルに少なくとも部分的に基づく診断を対象に通知することを含む。口頭で、書面で、及び／または電子的に、患者に通知することができる。
【００８９】
この診断は、患者の医療記録に記録することもできる。例えば、様々な態様において、ＲＡ患者が、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する特定の抗体またはその抗原結合性断片による治療によって利益を得るかどうかの診断は、医療記録に記録される。用語「医療記録」または「患者医療記録」は、典型的には以下の一つまたは複数を含む患者の検査及び／または治療の記述を指す：患者の病歴及び苦情、医師の身体的所見、診断テストの手順と結果、及び患者の薬物療法及び治療手順。医療記録は、典型的には一人以上の医師及び／または医師の助手によってなされ、医療を必要とする様々な病気または怪我の記録及び／または履歴、及び／または接種、及び／またはアレルギー、及び／または治療、及び／または予後、及び／または親、兄弟に関する健康情報、及び／または職業を記載され、書き写され、そうでなければ記録される。記録は、状態を診断する際に医師によって見直されてもよい。
【００９０】
医療記録は、紙の形態であってもよく、及び／またはコンピュータ可読媒体で維持されてもよい。医療記録は、検査室、医院、病院、医療保守組織、保険会社、及び／または個人医療記録ウェブサイトによって維持することとしてもよい。いくつかの態様では、患者からの試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルに少なくとも部分的に基づいて、診断は、カード、着用物品、及び／または無線周波数識別（ＲＦＩＤ）タグなどのメディカルアラート物品上またはそれらの中に記録される。本明細書で使用される場合、用語「着物品」は、タグ、ブレスレット、ネックレス、アームバンド、またはヘッドバンドを含むがこれに限定されない対象の身体に着用することができる任意の物品を指す。
【００９１】
また、本明細書中に開示される方法は、ＲＡの予防及び／または治療を処方、開始、及び／または変更することを含む（特に、患者が試験で抗ＰＡＤ４自己抗体などの自己抗体の存在についてそれぞれ陽性または陰性である血清陽性ＲＡまたは血清陰性ＲＡなどのＲＡのサブタイプに関する）。いくつかの実施形態において、抗ＰＡＤ４自己抗体の存在は、本明細書に教示される方法を用いて決定される。
【００９２】
特定の態様では、方法は、一つまたは複数のさらなるアッセイの順序付け及び／または実行を伴い得る。例えば、アッセイが、患者の試料が抗ＰＡＤ４自己抗体の存在について陰性であることを示す場合、アッセイは、偽陰性の結果を除外するために反復されてもよく、及び／または対象の状態を確認するために、抗ＰＡＤ４自己抗体の存在または非存在を決定するための一つ以上のさらなるアッセイを実施してもよい。逆に、抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが上昇していると判定された場合、偽陽性の結果を除外するためにアッセイを繰り返すことが望ましい場合がある。
【００９３】
当業者は、抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、（ｉ）ポジティブセレクター、すなわち、患者から採取された試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが、使用される検出アッセイのＬＬＯＱを下回り、所定の閾値レベルを下回る場合、もしくは、一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して低い場合、特定のアクションが行われる（例えば、ＲＡを有する患者をマブリリムマブで治療する）、または、（ｉｉ）ネガティブセレクター、すなわち、患者から採取された試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが、使用される検出アッセイのＬＬＯＱを上回り、所定の閾値レベルを上回る場合、もしくは、一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して高い場合、特定のアクションが行われる（例えば、ＲＡを有する患者をマブリリムマブで治療することを中断する）、または、（ｉｉｉ）ポジティブセレクターとネガティブセレクターの両方、例えば、患者から採取された試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、使用される検出アッセイのＬＬＯＱを上回る／下回る、所定の閾値レベルを上回る／下回る場合、もしくは、一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルに対して高い／低い場合、特定の治療を中断することができ（例えば、ＤＭＡＲＤ）、異なる治療を開始することができる（例えば、マブリリムマブによる治療）ことができる、として、治療、診断及びモニタリング方法を含むがこれらに限定されない本明細書中に開示される方法に従って使用され得ることを理解するであろう。
【００９４】
ＩＩＩ．抗ＰＡＤ４バイオマーカーレベルに基づくＲＡの診断及び治療の方法
この開示は、ＲＡ患者（またはＲＡに罹患している疑いのある対象）を治療する方法であって、患者から採取された試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが、使用される検出アッセイ（例えば、イムノアッセイ）の定量下限（ＬＬＯＱ）を下回る場合、所定の閾値レベルを下回る場合、または一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して低い場合、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む方法を提供する。また、（ａ）患者から採取された試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが、使用された検出アッセイのＬＬＯＱを下回る場合、所定の閾値レベルを下回る場合、または一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して低い場合、及び（ｂ）所定のバイオマーカー閾値レベルを上回るか下回る、または一つ以上の対照試料のバイオマーカーレベルを上回るか下回る、患者から採取された試料中における少なくとも一つの追加のバイオマーカーのレベルを患者が提示する場合、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、ＲＡ患者（またはＲＡに罹患していると疑われる対象）を治療する方法も提供される。いくつかの態様では、本方法は、患者から試料を得ること、及び試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために試料を提出することをさらに含む。一態様では、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在または非存在を、イムノアッセイ、例えば基質及び検出可能に標識されたＰＡＤ４（例えば、ルテニル化ＰＡＤ４）に結合したＰＡＤ４を用いる化学発光アッセイで測定する。
【００９５】
この開示はまた、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の恩恵を患者が受けるかどうかについて、医療提供者、医療給付提供者、または臨床検査機関による決定を容易にする方法、アッセイ、及びキットを提供する。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片は、マブリリムマブ、マブリリムマブと同じＧＭ−ＣＳＦＲαエピトープに結合する抗体もしくはその断片、またはＧＭ−ＣＳＦＲαに対するマブリリムマブの結合を競合的に阻害する抗体もしくは断片である。本明細書で提供される方法、アッセイ及びキットはまた、患者が、本明細書中に開示されるＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合するか、または当業者に公知である抗体またはその抗原結合性断片での治療から利益を受けるかどうかについて、医療提供者、医療給付提供者、または臨床検査機関による決定を容易にするであろう。
【００９６】
本開示は、ＲＡ患者（またはＲＡに罹患していると疑われる対象）を治療する方法であって、ＲＡを有する患者から得られた試料（例えば、血清試料）中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること；試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、アッセイ（例えば、イムノアッセイ）のＬＬＯＱを上回るか下回るかを判定すること；及び患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与するように医療提供者に助言することを含む方法を提供する。逆に、本方法は、患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断するように医療提供者に助言することを含む。特定の実施形態において、抗ＰＡＤ４自己抗体レベルは、本明細書に教示されるアッセイを用いて決定される。
【００９７】
本開示はまた、ＲＡ患者（またはＲＡに罹患している疑いのある対象）を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む方法も提供する。また、ＲＡ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断することを含む方法も提供する。
【００９８】
本開示はまた、ＲＡと診断された患者（またはＲＡに罹患している疑いのある患者）をＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで治療するかどうかを決定する方法であって、ＲＡと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで患者を治療すること、または治療するように医療提供者に指示することを含む方法も提供する。また、ＲＡと診断された患者をＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで治療するかどうかを決定する方法であって、関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンによる患者の治療を中断すること、または治療を中断するように医療提供者に指示することを含む方法も提供される。
【００９９】
本開示はまた、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片による治療の候補として、ＲＡと診断された患者（またはＲＡに罹患している疑いのある対象）を選択する方法であって、ＲＡと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片により患者を治療すること、または治療するように医療提供者に指示することを含む方法も提供する。また、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片による治療のための候補または代替的なＲＡ治療のための候補として、ＲＡと診断された患者を選択する方法であって、関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片による患者の治療を中断するか、または代替療法を選択するように医療提供者に指示することを含む方法も提供される。
【０１００】
上記の方法のいくつかの態様において、治療の決定を行う基準としてアッセイのＬＬＯＱを使用する代わりに、抗ＰＡＤ４自己抗体の測定レベルが所定の閾値レベルを上回るか下回るか、またはそれらが一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して高いか低いかを決定するような別の基準を使用することができる。
【０１０１】
いくつかの態様では、ＲＡ患者またはＲＡを有すると疑われる対象から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルをイムノアッセイで測定する。特定の態様では、例えば、「ポイントオブケア」診断キットとして処方された、本明細書に記載のイムノアッセイを使用して、患者または対象を治療する医療従事者によって、イムノアッセイは、ＲＡを有すると疑われる患者または対象から得られた試料に対して実施される。いくつかの態様では、試料は、患者から得られ、例えば、本明細書に記載されているイムノアッセイを使用して、医療従事者の指示に従って試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定するために、例えば臨床検査室に提出される。特定の態様では、アッセイを実施する臨床検査室は、患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがイムノアッセイのＬＬＯＱを上回るか下回るか、所定の抗ＰＡＤ４自己抗体閾値を上回るか下回るか、または一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルと比較して上昇しているかどうかに基づいて、患者が、ＧＭ−ＣＳＦＲ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片による治療から利益を得ることができるかどうかについて医療提供者に助言するか、または代替的な治療を選択するであろう。
【０１０２】
特定の態様において、本開示は、ＲＡ患者またはＲＡを有すると疑われる対象をある期間にわたって治療する方法であって、患者／対象から採取された第一の試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の第一レベルを測定すること、または、抗ＰＡＤ４の第一レベルの測定のために患者／対象から採取された第一の試料を提出すること、及び患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがイムノアッセイのＬＬＯＱよりも上回るか下回る場合、所定の抗ＰＡＤ４自己抗体閾値を上回るか下回る場合、または一つ以上の対照試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと比較して上昇している場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を投与することを含む方法を提供する。この試験は、上記のように、医療提供者または臨床検査室によって行うことができる。
【０１０３】
本態様によれば、方法は、さらに、患者から採取された第二の試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の第二レベルを測定すること、または試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の第二レベルの測定のために患者から採取された第二試料を提出すこと（ここで、患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルは、患者における抗ＰＡＤ４自己抗体の第一及び第二のレベルを比較することによって得られる）、及び用量を変化させること、例えば、患者に投与されるＧＭ−ＣＳＦＲ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片の量もしくは頻度を増加もしくは維持すること、または第二の試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが第一の試料中の対応するレベルより高い場合には、ＧＭ−ＣＳＦＲ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片による治療を中断さえすること、または第二の試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが第一の試料中の対応するレベルよりも低いかまたはほぼ同じである場合は、患者に投与されるＧＭ−ＣＳＦＲ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体もしくはその抗原結合性断片の量もしくは頻度を維持もしくは減少させること、をさらに含み得る。
【０１０４】
特定の態様では、本明細書で提供されるイムノアッセイの結果は、患者の保険がＧＭ−ＣＳＦＲ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片による治療をカバーするかどうかを決定するために、医療給付提供者に提出することができる。
【０１０５】
特定の態様では、患者は、ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与前、投与中、または投与後のいずれかで、一つまたは複数の追加の薬物（例えば、ＤＭＡＲＤＳ）で治療されたことがあるか、または治療中である。ＲＡの治療に有用な種々の他の薬剤は、本明細書の他の箇所に記載されているか、または当該分野で公知である。特定の態様では、患者は、例えば、ＤＭＡＲＤまたはその組み合わせを含む一つまたは複数の追加の薬物で治療されたことがある、または治療され続けている、または治療される予定である。いくつかの態様では、ＤＭＡＲＤは、アバタセプト、アダリムマブ、アザチオプリン、クロロキン、ヒドロキシクロロキン、シクロスポリン、Ｄ−ペニシラミン、エタネルセプト、ゴリムマブ、インフリキシマブ、レフルノミド、メトトレキサート、ミノサイクリン、リツキシマブ、スルファサラジン、及びそれらの組み合わせから選択される。
【０１０６】
いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、マブリリムマブまたはその抗原結合性断片を含む。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、マブリリムマブまたはその抗原結合性断片からなるかまたは本質的にそれからなる。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、マブリリムマブと同じエピトープに特異的に結合する。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、同じエピトープへの結合について、マブリリムマブマブリリムマブと特異的に競合する。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＶＨ）、及び／または配列番号５に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）を含む。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、そのアミノ酸配列が配列番号６〜１１に示される相補性決定領域の少なくとも一つを含む。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、そのアミノ酸配列が配列番号６〜１１に示されるＣＤＲを含む。
【０１０７】
いくつかの態様では、本明細書に開示される方法において使用される試料は、患者から採取され、全血、血清、血漿、または滑液のうちの一つ以上を含む。
【０１０８】
いくつかの態様では、抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの決定に加えて、本明細書に開示される方法は、一つもしくは複数の生物学的バイオマーカーの発現レベルもしくは活性を決定すること、一つ以上の臨床バイオマーカー（臨床状態マーカー）を決定すること、もしくはそれらの組み合わせ、これらの決定のために患者から採取された試料を提出すること、またはこれらを決定するように臨床検査室に指示すること、をさらに含み得る。
【０１０９】
いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、固定用量で投与される。いくつかの特定の態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片はマブリリムマブであり、固定用量は少なくとも３０ｍｇ／用量、少なくとも１００ｍｇ／用量、または少なくとも１５０ｍｇ／用量である。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲα、例えばマブリリムマブに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、２種類以上の用量で投与される。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲα、例えばマブリリムマブに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、毎週、隔週または毎月投与される。いくつかの態様では、ＧＭ−ＣＳＦＲα、例えばマブリリムマブに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、静脈内、筋肉内、皮下、またはそれらの組み合わせで投与される。
【０１１０】
ＩＶ．抗ＰＡＤ４自己抗体検出アッセイ及びキット
この開示はまた、ＲＡ患者からの試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体を、例えばイムノアッセイ法によって検出するためのキットを提供する。このようなキットは、例えば、標識ＰＡＤ４及び非標識ＰＡＤ４及び抗ＰＡＤ４自己抗体コントロールを含む、本方法で利用される（例えば、濃縮形態の）一つまたは複数の様々な試薬をそれぞれ有する容器を含むことができる。
【０１１１】
抗ＰＡＤ４自己抗体に結合することができるＰＡＤ４またはその断片は、既に固体支持体に付着して提供され得る。抗ＰＡＤ４自己抗体に結合することができる標識されたＰＡＤ４またはその断片は、検出可能な標識、例えばビオチンまたはルテニウムキレートに既にコンジュゲートして提供することができる。キットはまた、本明細書で提供されるアッセイの実施を支援する、抗ＰＡＤ４自己抗体（並びに標識自体）に結合することができるＰＡＤ４またはその断片に検出可能な標識をカップリングするための試薬、バッファー及び／または試薬、及び機器を提供することもできる。本開示に従って提供されるキットは、本明細書で提供されるアッセイを実施するのに必要な適切な容器、プレート、及び任意の他の試薬または材料をさらに含み得る。
【０１１２】
本開示によるキットはまた、プロセスを記述するパンフレットまたは説明書を含み得る。抗ＰＡＤ４自己抗体検出イムノアッセイの場合、イムノアッセイプロセスは、抗ＰＡＤ４自己抗体によって認識され得る第一のＰＡＤ４分子またはその断片（「捕捉ＰＡＤ４」）、及び抗ＰＡＤ４自己抗体によって認識され得る第二のＰＡＤ４分子またはその断片を含み、第二のＰＡＤ４は、例えば、蛍光部分（「検出ＰＡＤ４」）を組み込むことによって検出可能となる。
【０１１３】
イムノアッセイは、本明細書で提供される方法、または当業者に周知及び理解される方法によって実施することができる。一つの態様では、イムノアッセイは、捕捉ＰＡＤ４を支持体に取り付けること；試験試料または対照試料を適用すること；試料中に存在する場合、抗ＰＡＤ４自己抗体を捕捉ＰＡＤ４に結合させること；捕捉ＰＡＤ４に既に結合している抗ＰＡＤ４自己抗体に結合することができる検出ＰＡＤ４を適用すること；及び抗ＰＡＤ４自己抗体に結合した検出ＰＡＤ４の量を測定することを含む。特定の態様では、アッセイは、洗浄ステップ、ブロッキングステップ及びインキュベーションステップをさらに含むことができる。
【０１１４】
試験キットは、一つ以上の抗ＰＡＤ４自己抗体検出アッセイ、例えば、イムノアッセイを実施するための説明書を含むことができる。キットに含まれる説明書は、包装材料に添付することも、添付文書として含めることもできる。説明書は、典型的には書面または印刷物であるが、これらに限定されるものではない。そのような命令を記憶し、それらをエンドユーザに伝達することができる任意の媒体が企図される。そのような媒体には、電子記憶媒体（例えば、磁気ディスク、テープ、カートリッジ、チップ）、光学媒体（例えば、ＣＤ−ＲＯＭ）などが含まれるが、これらに限定されない。本明細書で使用する「説明書」という用語は、説明書を提供するインターネットサイトのアドレスを含むことができる。
【０１１５】
Ｖ．コンピュータの方法及びソフトウェア
本明細書中に開示される方法は、生物学的試料を採取するかまたは別の方法で入手すること、及び単独または他のバイオマーカー、例えば生物学的バイオマーカーまたは臨床的バイオマーカーと組み合わせて抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを検出及び測定する分析方法を実施することを含むことができる。
【０１１６】
抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと組み合わせることができる生物学的バイオマーカーは、カルパスタチン、ＢＲＡＦ、Ｃ反応性タンパク質、血清アミロイドＡ、インターロイキン６、Ｓ１００タンパク質、オステオポンチン、リウマチ因子、マトリックスメタロプロテアーゼ１、マトリックスメタロプロテアーゼ３、ヒアルロン酸、ｓＣＤ１４、血管新生マーカー、骨、軟骨または滑膜代謝産物、ＥＹＡ４、ＰＤＺＤ２、血液または滑膜中のＴＮＦ、ＩＬ−１ｂ、ＩＬ−１７、リウマチ因子（ＲＦ）、抗ルシリン化ペプチド抗体（ＡＣＰＡ）及びそれらの組み合わせを含む。いくつかの態様では、抗ＰＡＤ４自己抗体レベルと組み合わせることができる生物学的バイオマーカーは、ＴＮＦＲＳＦ１７；免疫グロブリンＪポリペプチド、免疫グロブリンアルファ及びミューポリペプチド（ＩＧＪ）のためのリンカータンパク質；ＰＯＵクラス２関連因子１（ＰＯＵ２ＡＦ１）；デリ様ドメインファミリー、メンバー３（ＤＥＲＬ３）；Ｆｃ受容体様５（ＦＣＲＬ５）；血漿細胞誘導性ＥＲタンパク質１（ＰＡＣＡＰ）；プレプロロシセプチン（ＰＮＯＣ）；分泌型リンタンパク質１（ＳＰＰ１）；インターフェロン調節因子４（ＩＲＦ４）；リンパ球膜貫通アダプター１（ＬＡＸ１）；ＥＬＬ関連因子２（ＥＡＦ２）；ｐｉｍ−２癌遺伝子（ＰＩＭ２）；アクチン、アルファ１、骨格筋（ＡＣＴＡ１）；ミオシン、重鎖３、骨格筋、胚（ＭＹＨ２）；ミオシン、重鎖１、骨格筋、成人（ＭＹＨ１）；システイン及びグリシン−リッチタンパク質３（ＣＳＲＰ３）；アクチニン、アルファ２（ＡＣＴＮ２）；トロポニンＩ型２（ＴＮＮＩ２）；シトクロムＰ４５０、ファミリー２６、サブファミリーＢ、ポリペプチド１（ＣＹＰ２６Ｂ１）、タイチンキャップ（ＴＣＡＰ）、及びそれらの組み合わせを含む。例えば、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開ＵＳ２００３００２７１３６、ＵＳ２００７０２３１７９１を参照されたい。
【０１１７】
測定された抗ＰＡＤ４自己抗体レベルに由来する抗ＰＡＤ４自己抗体レベルまたは正規化スコアは、単独で（例えば、治療、診断、予後またはモニタリングの目的のために）または他のバイオマーカー（例えば、遺伝子シグネチャーを誘導するために使用される遺伝子パネル）から得られたレベルまたは正規化されたスコアと組み合わせて使用され得る。これらのスコアは、例えば、診断スコアを得るための（ｉ）性別、（ｉｉ）年齢、（ｉｉｉ）体格指数、（ｉｖ）喫煙状況、（ｖ）付随する薬物、（ｖｉ）健康アセスメント品質（ＨＡＱ）、（ｖｉｉ）疾患活動性スコア２８関節（ＤＡＳ２８）、または二つ以上の組み合わせなどの臨床バイオマーカーに対応するスコアと組み合わせることもできる。このアプローチでは、診断スコアは、疾患の有無の指標である、予め設定された抗ＰＡＤ４自己抗体閾値と比較されるすべてのマーカー計算の合計から決定される単一の数であり得る。あるいは、診断スコアは、それぞれがバイオマーカー値を表す一連のバーであってもよく、反応のパターンは、疾患の有無の判定のために予め設定されたパターンと比較されてもよい。
【０１１８】
本明細書に記載の方法の少なくともいくつかの態様では、関係する計算の複雑さは、バイオマーカーとしての抗ＰＡＤ４自己抗体の使用を含む方法がコンピュータの使用によって実施されることを必要とすることがある。いくつかの態様では、コンピュータシステムは、プロセッサ、入力装置、出力装置、記憶装置、コンピュータ可読記憶媒体読取装置、通信システム、処理アクセラレーション（例えば、ＤＳＰまたは専用プロセッサ）、及びメモリを含む、バスを介して電気的に結合されるハードウェア要素を備える。コンピュータ可読記憶媒体リーダは、記憶装置、メモリ及び／または他のそのようなアクセス可能なシステム資源を含むことができる、一時的及び／またはより永続的にコンピュータ可読情報を含むために、コンピュータ可読記憶媒体、リモート、ローカル、固定及び／またはリムーバブルストレージデバイスとストレージメディア、メモリなどを包括的に表す組み合わせにさらに結合することができる。
【０１１９】
単一のアーキテクチャを利用して、現在望ましいプロトコル、プロトコルのバリエーション、拡張などに従ってさらに構成することができる一つまたは複数のサーバを実装することができる。しかしながら、より具体的なアプリケーション要件に従って実施形態を利用することができることは、当業者には明らかであろう。カスタマイズされたハードウェアもまた利用されてもよく、及び／または特定の要素がハードウェア、ソフトウェア、またはその両方で実装されてもよい。さらに、ネットワーク入出力デバイス（図示せず）のような他のコンピューティングデバイスへの接続を使用することができるが、一方、有線、無線、モデム、及び／または他のコンピューティングデバイスへの他の接続（一つ）または接続（複数）も利用できることを理解されたい。
【０１２０】
一態様では、システムは、入力データを一つまたは複数のプロセッサに提供するための一つまたは複数のデバイスをさらに備える。システムはさらに、ランク付けされたデータ要素のデータセットを記憶するためのメモリを含む。別の態様では、入力データを提供するための装置は、例えば、蛍光プレートリーダー、質量分析計、または遺伝子チップリーダーのようなデータ要素の特性を検出するための検出器を含む。
【０１２１】
システムはさらに、データベース管理システムを含むことができる。トレーニングセットのデータベースから関連情報を抽出するためにクエリを処理するデータベース管理システムによって理解される適切な言語で、ユーザ要求またはクエリをフォーマットすることができる。システムは、ネットワークサーバと一つまたは複数のクライアントが接続されているネットワークに接続可能であってもよい。ネットワークは、当技術分野で知られているように、ローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）またはワイドエリアネットワーク（ＷＡＮ）であってもよい。好ましくは、サーバは、ユーザ要求を処理するためのデータベースデータにアクセスするためのコンピュータプログラム製品（例えば、ソフトウェア）を実行するために必要なハードウェアを含む。システムは、データ要素に関するデータ（例えば、発現値）をシステムに提供するために、入力装置と通信することができる。一態様では、入力装置は、例えば、質量分析計、遺伝子チップまたはアレイリーダーなどを含む遺伝子発現プロファイリングシステムを含むことができる。
【０１２２】
本明細書に記載されたいくつかの態様は、コンピュータプログラム製品を含むように実施することができる。コンピュータプログラム製品は、アプリケーションプログラムにデータベースを有するコンピュータ上で実行させるために、媒体に埋め込まれたコンピュータ可読プログラムコードを有するコンピュータ可読媒体を含むことができる。本明細書で使用される場合、「コンピュータプログラム製品」は、あらゆる性質（例えば、書面、電子、磁気、光学またはその他）の物理的媒体に含まれ、かつ、コンピュータまたは他の自動データ処理システムと共に使用することができる自然言語またはプログラミング言語の文の形式で編成された一連の指示を指す。そのようなプログラミング言語ステートメントは、コンピュータまたはデータ処理システムによって実行されると、コンピュータまたはデータ処理システムがステートメントの特定の内容に従って動作する。
【０１２３】
コンピュータプログラム製品は、限定はしないが、ソースコード及びオブジェクトコードのプログラム、及び／またはコンピュータ可読媒体に埋め込まれたテストまたはデータライブラリを含む。さらに、コンピュータシステムまたはデータ処理機器装置があらかじめ選択された方法で動作することを可能にするコンピュータプログラム製品は、元のソースコード、アセンブリコード、オブジェクトコード、機械言語、上記の暗号化されたバージョン、及び任意の及びすべての同等物を含むがこれに限定されない、いくつかの形態で提供されてもよい。
【０１２４】
一態様では、本明細書に開示される治療、診断、予後、またはモニタリング方法を実施するためのコンピュータプログラム製品が提供され、例えば、抗ＰＡＤ４自己抗体が患者から採取した試料中に存在する場合、または患者から採取した試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが所定の抗ＰＡＤ４自己抗体閾値レベルを上回る場合には、ＧＭ−ＣＳＦＲａ（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を、それを必要とする患者に投与するかどうかを決定する。
【０１２５】
コンピュータプログラム製品は、コンピューティングデバイスまたはシステムのプロセッサによって実行可能なプログラムコードを具現化するコンピュータ可読媒体を含み、該プログラムコードは、
・対象の生体試料に起因するデータを取得するコードであって、データは、単独で、または生物学的試料中の他のバイオマーカー（例えば、生物学的マーカーまたは臨床マーカー）に対応する値と組み合わせて、抗ＰＡＤ４自己抗体レベル値（存在／不存在、量、またはそうでなければ、これらのレベル値に由来するデータ）を含む、コードと、
・ＧＭ−ＣＳＦＲα（例えば、マブリリムマブ）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を、それを必要とする患者に投与するかどうかを示す分類方法を実行するコードと、を含む。
【０１２６】
様々な態様が方法または装置として説明されているが、態様は、コンピュータに結合されたコード、例えばコンピュータ上に常駐するコードまたはコンピュータによってアクセス可能なコードを介して実施できることを理解されたい。例えば、上述の方法の多くを実現するために、ソフトウェア及びデータベースを利用することができる。したがって、ハードウェアによって達成される態様に加えて、これらの態様は、そこに具体化されたコンピュータ可読プログラムコードを有するコンピュータ使用可能媒体からなる製品を使用することによって達成され得、このことが本明細書に開示された機能の実行を可能にすることにも留意されたい。したがって、態様は、それらのプログラムコード手段においても本特許により保護されていると考えられることが望まれる。
【０１２７】
さらに、いくつかの態様は、ＲＡＭ、ＲＯＭ、磁気媒体、光媒体、または光磁気媒体を含むが、これらに限定されない、事実上あらゆる種類のコンピュータ可読メモリにコードを格納することができる。さらにより一般的には、いくつかの態様は、汎用プロセッサ、マイクロコード、ＰＬＡ、またはＡＳＩＣ上で動作するソフトウェアを含むが、これに限定されないソフトウェアで、もしくはハードウェアで、またはこれらの任意の組み合わせで実施することができる。
【０１２８】
いくつかの態様は、伝送媒体を介して伝播される信号（例えば、電気的及び光学的）だけでなく、搬送波に具現化されるコンピュータ信号として達成され得ることも想定される。したがって、上述の様々なタイプの情報は、データ構造などの構造でフォーマットされ、伝送媒体を介して電気信号として送信されるか、またはコンピュータ可読媒体に格納される。
【０１２９】
特定の実施形態
実施形態１：関節リウマチ患者を治療する方法であって、患者から採取した試料中の抗ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４（抗ＰＡＤ４）自己抗体のレベルがアッセイの下限値（ＬＬＯＱ）を下回る場合に、ヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体アルファ（ＧＭ−ＣＳＦＲα）に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、方法。
【０１３０】
実施形態２：関節リウマチ患者を治療する方法であって、患者から採取した試料中の抗ＰＡＤ４のレベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合、及び所定のバイオマーカー閾値レベルを上回るか下回る、または一つもしくは複数の対照試料におけるバイオマーカーレベルを上回るか下回る、患者から採取された試料中の少なくとも一つの追加的なバイオマーカーのレベルを患者が提示する場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、方法。
【０１３１】
実施形態３：試料が患者から得られ、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルの測定のために提出される、実施形態１または２に記載の方法。
【０１３２】
実施形態４：関節リウマチ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、方法。
【０１３３】
実施形態５：関節リウマチ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断することを含む、方法。
【０１３４】
実施形態６：関節リウマチ患者を治療する方法であって、関節リウマチを有する患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること；試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、アッセイの前記ＬＬＯＱを上回るか下回るかを判定すること；及び患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与するように医療提供者に助言することを含む、方法。
【０１３５】
実施形態７：関節リウマチ患者を治療する方法であって、関節リウマチを有する患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること；試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、アッセイのＬＬＯＱを下回るかどうかを決定すること；及び患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断するように医療提供者に助言することを含む、方法。
【０１３６】
実施形態８：関節リウマチ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、方法。
【０１３７】
実施形態９：関節リウマチ患者を治療する方法であって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルの測定のために患者から採取した試料を提出すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の患者への投与を中断することを含む、方法。
【０１３８】
実施形態１０：関節リウマチと診断された患者を、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで治療するかどうかを決定する方法であって、関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンにより患者を治療すること、または治療するように医療提供者に指示することを含む、方法。
【０１３９】
実施形態１１：関節リウマチと診断された患者を、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンで治療するかどうかを決定する方法であって、関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与を含む治療レジメンによる患者の治療を中断すること、または治療を中断するように医療提供者に指示することを含む、方法。
【０１４０】
実施形態１２：関節リウマチと診断された患者を、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の候補として選択する方法であって、関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４レベルがアッセイのＬＬＯＱを下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片で患者を治療すること、または治療するように医療提供者に指示することを含む、方法。
【０１４１】
実施形態１３：関節リウマチと診断された患者を、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片での治療の候補として選択する方法であって、関節リウマチと診断された患者から得られた試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを測定すること、または測定するように臨床検査室に指示すること；及び試料中の患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルがアッセイのＬＬＯＱを上回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片による患者の治療を中断するか、または代替治療を選択するように医療提供者に指示することを含む、方法。
【０１４２】
実施形態１４：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、マブリリムマブまたはその抗原結合性断片を含む、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４３】
実施形態１５：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、マブリリムマブまたはその抗原結合性断片からなる、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４４】
実施形態１６：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、マブリリムマブと同じエピトープに特異的に結合する、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４５】
実施形態１７：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、同じエピトープへの結合についてマブリリムマブと特異的に競合する、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４６】
実施形態１８：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、配列番号４に記載のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域及び／または配列番号５に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４７】
実施形態１９：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、配列番号６〜１１に記載のアミノ酸配列を有する相補性決定領域の少なくとも一つを含む、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４８】
実施形態２０：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合するその抗原結合性断片の抗体が、配列番号６〜１１に記載のアミノ酸配列を有するＣＤＲを含む、実施形態１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【０１４９】
実施形態２１：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片の投与前、投与中、または投与後に、一種類以上の追加の疾患修飾抗リウマチ薬（ＤＭＡＲＤ）で患者が治療されたことがある、実施形態１〜２０のいずれか一つに記載の方法。
【０１５０】
実施形態２２：ＤＭＡＲＤが、アバタセプト、アダリムマブ、アザチオプリン、クロロキン、ヒドロキシクロロキン、シクロスポリン、Ｄ−ペニシラミン、エタネルセプト、ゴリムマブ、インフリキシマブ、レフルノミド、メトトレキセート、ミノサイクリン、リツキシマブ、スルファサラジン、及びそれらの組み合わせから選択される、実施形態２１に記載の方法。
【０１５１】
実施形態２３：患者から得られた試料が、全血、血清、血漿、または滑液のうちの一つ以上を含む、実施形態１〜２２のいずれか一つに記載の方法。
【０１５２】
実施形態２４：患者から得られた試料が血清である、実施形態２３に記載の方法。
【０１５３】
実施形態２５：一つもしくは複数の追加のバイオマーカーの発現レベルもしくは活性を決定すること、もしくは少なくとも一つの臨床状態マーカーを決定すること、もしくはそれらの組み合わせ、これらの決定のために患者から採取した試料を提出すること、またはこれらを決定するように臨床検査室に指示すること、をさらに含む、実施形態１〜２４のいずれか一つに記載の方法。
【０１５４】
実施形態２６：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が固定用量で投与される、実施形態１〜２５のいずれか一つに記載の方法。
【０１５５】
実施形態２７：ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片が、少なくとも１５０ｍｇ／用量の固定用量で投与される、実施形態２６に記載の方法。
【０１５６】
実施形態２８：患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、イムノアッセイ、凝集アッセイまたは均一系アッセイにおいて測定される、実施形態１〜２７に記載の方法。
【０１５７】
実施形態２９：患者の抗ＰＡＤ４自己抗体レベルが、イムノアッセイで測定され、イムノアッセイが検出可能に標識されたＰＡＤ４を使用する、実施形態２８に記載の方法。
【０１５８】
実施形態３０：検出可能に標識されたＰＡＤ４がルテニル化ＰＡＤ４である、実施形態２９に記載の方法。
【０１５９】
実施形態３１：イムノアッセイが、ＰＡＤ４に結合した抗ＰＡＤ４−自己抗体を検出する、実施形態２８〜３０のいずれか一つに記載の方法。
【０１６０】
実施形態３２：抗ＰＡＤ４自己抗体の検出のためのアッセイであって、抗ＰＡＤ４自己抗体によって認識され得る第一のＰＡＤ４分子またはその断片と、抗ＰＡＤ４自己抗体を認識することができる第二のＰＡＤ４分子またはその断片とを含み、第二のＰＡＤ４分子が検出可能である、アッセイ。
【０１６１】
実施形態３３：蛍光部分が検出可能なＰＡＤ４に組み込まれている、実施形態３２に記載のアッセイ。
【０１６２】
実施形態３４：蛍光部分がルテニウムである、実施形態３３に記載のアッセイ。
【０１６３】
実施形態３５：関節リウマチ患者を治療する方法であって、実施形態３２〜３４のいずれか一つに記載のアッセイを用いることにより、患者からの試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルを測定すること；及び患者からの試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体のレベルが、アッセイの定量下限（ＬＬＯＱ）を下回る場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、方法。
【０１６４】
実施形態３６：関節リウマチ患者を治療する方法であって、患者から採取した試料中の抗ＰＡＤ４のレベルが実施形態３２〜３４のいずれか一つのアッセイのＬＬＯＱを下回る場合、及び所定のバイオマーカー閾値レベルを上回るか下回る、または一つ以上の対照試料におけるバイオマーカーレベルを上回るか下回る、患者から採取された試料中の少なくとも一つの追加のバイオマーカーのレベルを患者が提示する場合に、ＧＭ−ＣＳＦＲαに特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片を患者に投与することを含む、方法。
【０１６５】
実施形態３７：捕捉ＰＡＤ４を試験試料または対照試料に接触させること、試料中に存在する場合、抗ＰＡＤ４自己抗体を捕捉ＰＡＤ４に結合させること；捕捉ＰＡＤ４にすでに結合している抗ＰＡＤ４自己抗体に結合することができる検出ＰＡＤ４を適用すること；及び抗ＰＡＤ４自己抗体に結合した検出ＰＡＤ４の量を測定することによって、試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の量を決定するための方法。特定の態様では、アッセイは、洗浄ステップ、ブロッキングステップ及びインキュベーションステップをさらに含むことができる。
【０１６６】
本明細書で言及されるすべての特許及び刊行物は、その全体が参照により明示的に組み込まれる。
【０１６７】
本開示の態様は、抗ＰＡＤ４自己抗体の検出のためのアッセイ及び臨床検体中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在を検出するためのアッセイの使用を詳細に記載する以下の非限定的な実施例を参照することによってさらに定義することができる。本開示の範囲から逸脱することなく、材料及び方法の両方に対する多くの改変が実施され得ることは、当業者には明らかであろう。
【実施例】
【０１６８】
実施例１
抗ＰＡＤ４自己抗体アッセイプロトコル
ＭＳＤ標準プレート（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙから入手可能）を組換えＰＡＤ４（ＰＢＳ中２μｇ／ｍＬ；５０μＬ／ウェル；Ｃａｙｍａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏｍｐａｎｙ、Ａｎｎ  Ａｒｂｏｒ、ＭＩから入手可能）でコーティングし、４℃で一晩インキュベートした。プレートを２００μＬ／ウェルの洗浄緩衝液（ＰＢＳ／０．０５％ＴＷＥＥＮ−２０（登録商標））で三回洗浄した。洗浄後、１５０μＬ／ウェルのブロック緩衝液（例えば、ＰＢＳ／０．０５％ＴＷＥＥＮ−２０（登録商標）／０．２％Ｉ−ブロック緩衝液（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡから入手可能）を各ウェルに添加し、プレートを室温で１〜４時間インキュベートした。次いで、プレートを上記のように三回洗浄した。
【０１６９】
標準曲線については、抗ＰＡＤ４自己抗体ＥＩＡ標準（Ｃａｙｍａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏｍｐａｎｙから入手可能）をブロック緩衝液中に連続希釈した。抗ＰＡＤ４自己抗体レベルについて試験される血清試料をブロック緩衝液で希釈した。例えば、対象由来の血清試料をブロック緩衝液中に例えば１：１６に希釈した。２５マイクロリットル（２５μＬ）の各標準試料または希釈試料をプレートに添加し、プレートを振とう機上で穏やかに振とうしながら室温で１時間インキュベートした。再度、プレートを上記のように三回洗浄した。洗浄後、ルテニル化組換えＰＡＤ４（２５μＬの２μｇ／ｍｌ溶液）を各ウェルに添加し、プレートを振とう機上で穏やかに振とうしながら室温で１時間インキュベートした。再度、プレートを上記のように三回洗浄した。洗浄後、１Ｘ  ＭＳＤ読み取りバッファー（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ、Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ、ＭＤから入手可能）１５０μＬを各ウェルに添加した。最後に、プレートをＭＳＤプレートリーダー（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙから入手可能）で読み取った。
【０１７０】
実施例２
関節リウマチ対象の血清中の抗ＰＡＤ４自己抗体の検出
この実施例は、本開示において提供される抗ＰＡＤ４自己抗体アッセイが、関節リウマチを有する対象の血清中の抗ＰＡＤ４自己抗体を検出するために使用され得ることを実証する。マブリリムマブの三回の独立した臨床試験における対象のベースライン時（試験開始時）に集めた血清試料を、実施例１の抗ＰＡＤ４自己抗体アッセイを用いて試験した。図は、三つの臨床試験のそれぞれからの、試験したすべての対象における抗ＰＡＤ４自己抗体の測定されたレベルを示す。同様の頻度の対象が、三つの試験において検出可能な抗ＰＡＤ４自己抗体（アッセイのＬＬＯＱである５０００Ｕ／ｍＬを上回るとして定義される）を有しており、３２％（試験Ａ）、３９％（試験Ｂ）及び４２％（試験Ｃ）の対象が、以下の表１に示すように試験で陽性と判定された。
【０１７１】
（表１）ＲＡ対象の血清中の抗ＰＡＤ４自己抗体レベル
2019523759.tif 000003
【０１７２】
実施例３
抗ＰＡＤ３自己抗体アッセイプロトコル
組換えＰＡＤ３（ＰＢＳ中２μｇ／ｍＬ；２５μＬ／ウェル；ＳｉｇｎａｌＣｈｅｍ、Ｒｉｃｈｍｏｎｄ、Ｂｒｉｔｉｓｈ  Ｃｏｌｕｍｂｉａ、Ｃａｎａｄａから入手可能）を用いてＭＳＤ標準プレート（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙから入手可能）をコーティングし、４℃で一晩インキュベートした。プレートを２００μＬ／ウェルの洗浄緩衝液（ＰＢＳ／０．０５％ＴＷＥＥＮ−２０（登録商標））で三回洗浄した。洗浄後、１５０μＬ／ウェルのブロック緩衝液（例えば、ＰＢＳ／０．０５％ＴＷＥＥＮ−２０（登録商標）／０．２％Ｉ−ブロック緩衝液（Ａｐｐｌｉｅｄ  ＢｉｏＳｙｓｔｅｍｓ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡから入手可能）を各ウェルに添加し、プレートを室温で１〜４時間インキュベートした。次いで、プレートを上記のように三回洗浄した。
【０１７３】
標準では、抗ＰＡＤ３自己抗体陽性のＲＡ血清試料をブロック緩衝液で１：６４に希釈した。抗ＰＡＤ３自己抗体レベルについて試験される血清試料をブロック緩衝液中に希釈した。例えば、対象からの血清試料をブロック緩衝液で１：４または１：６４または１：１０２４に希釈した。２５マイクロリットル（２５μＬ）の各標準または希釈試料をプレートに添加し、プレートを振とう機上で穏やかに振とうしながら室温で１時間インキュベートした。再度、プレートを上記のように三回洗浄した。洗浄後、ビオチン化ヒトＨｉｓ１０ｘＡｖｉｔａｇ＿Ｈｕｍａｎ  ＰＡＤ３（２５μＬの２μｇ／ｍｌ溶液）を各ウェルに添加し、プレートを振とう機上で穏やかに振とうしながら室温で１時間インキュベートした。再度、プレートを上記のように三回洗浄した。洗浄後、ストレプトアビジンスルホタッグ（１５μＬの０．５μｇ／ｍｌ溶液）を各ウェルに加え、室温で３０分間インキュベートした。再度、プレートを上記のように三回洗浄した。洗浄後、１５０μＬの１Ｘ  ＭＳＤ  Ｒｅａｄ  Ｂｕｆｆｅｒ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ、Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ、ＭＤから入手可能）を各ウェルに添加した。最後に、プレートをＭＳＤプレートリーダー（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙから入手可能）で読み取った。試験試料は、その試料について検出されたＥＣＬカウントがアッセイのＬＬＯＱを上回っていれば陽性であると判定された（試験した血清試料中の検出されたＥＣＬカウント：陰性対照試料中のＥＣＬカウントの比≧１．３７）。
【０１７４】
実施例４
関節リウマチ対象の血清中の抗ＰＡＤ３自己抗体の検出
この実施例は、本開示において提供される抗ＰＡＤ３自己抗体アッセイが、関節リウマチを有する対象の血清中の抗ＰＡＤ３自己抗体を検出するために使用され得ることを実証する。マブリリムマブの三回の独立した臨床試験における対象のベースライン時（試験開始時）に収集した血清試料を、実施例３の抗ＰＡＤ３自己抗体アッセイを用いて試験した。表２は、三つの臨床試験のそれぞれからの、試験した全ての対象における抗ＰＡＤ３自己抗体検出の結果を示す。これらの試験の三つ全てにおいて、試験された対象のうち少数が、検出可能な抗ＰＡＤ３自己抗体（アッセイのＬＬＯＱを上回るとして定義され、試験した血清試料中の検出されたＥＣＬカウント：陰性対照試料中のＥＣＬカウントの比が≧１．３７）を有しており、１６％（試験Ａ）、２４％（試験Ｂ）及び３１％（試験Ｃ）の対象が、以下の表２に示すように試験で陽性と判定された。
【０１７５】
（表２）ＲＡ対象血清中の抗ＰＡＤ３自己抗体検出
2019523759.tif 000004
【０１７６】
実施例５
中程度から重度の関節リウマチの対象におけるマブリリムマブの有効性と安全性を評価するためのフェーズ２ｂ、無作為化二重盲検試験
試験Ａは、成人発症ＲＡ（２０１０年米国リウマチ学会（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃｏｌｌｅｇｅ  ｏｆ  Ｒｈｅｕｍａｔｏｌｏｇｙ［ＡＣＲ］）及び欧州リウマチ学会（Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｌｅａｇｕｅ  Ａｇａｉｎｓｔ  Ｒｈｅｕｍａｔｉｓｍ［ＥＵＬＡＲ］）分類基準によって定義される）を有し、一つ以上の従来の疾患修飾抗リウマチ薬（ＤＭＡＲＤ）に対する不適切な応答、並びにＭＴＸによる治療にもかかわらず少なくとも中程度に活性な疾患（２８関節における疾患活動性スコア［ＤＡＳ２８］≧３．２  Ｃ−反応性タンパク質［ＣＲＰ］／赤血球沈降速度［ＥＳＲ］によって定義される）及び少なくとも四つの関節腫脹を有する、１８〜８０歳の対象において、メトトレキセート（ＭＴＸ）と併用した三回の皮下（ＳＣ）用量のマビリムマブの有効性及び安全性を評価する、フェーズ２ｂ無作為化二重盲検プラセボ対照並行群間多施設共同試験であった。
【０１７７】
選択基準は、以下であった。
・２０１０年のＡＣＲ／ＥＵＬＡＲ分類基準（Ａｌｅｔａｈａ  ｅｔ  ａｌ、２０１０）によって定義される成人発症ＲＡの診断
・スクリーニング時にＤＡＳ２８（ＣＲＰ）≧３．２、１日目にＤＡＳ２８（ＥＳＲ）≧３．２（ｖａｎ  Ｇｅｓｔｅｌ  ｅｔ  ａｌ、１９９８）によって定義される、少なくとも中程度に活動性の疾患
・スクリーニング及び１日目に少なくとも四つの関節腫脹
・一つまたは複数の従来のＤＭＡＲＤに不適切な応答を持つ対象
・安定した用量でスクリーニングする前の少なくとも最後の４週間のスクリーニングの前に、経口または注射可能なＭＴＸ（７．５〜２５．０ｍｇ／週）を１２週間投与する
【０１７８】
合計３２６人の対象を１：１：１：１の比率で無作為化して、マブリリムマブの３種類のＳＣ用量（３０、１００、または１５０ｍｇ）のうちの一つ、またはプラセボをＱ２Ｗで２４週間、固定用量の経口または注射可能なＭＴＸ（７．５  ２５．０ｍｇ／週）と共に以下のように投与した：
・治療アーム１：３０ｍｇＳＣマブリリムマブＱ２Ｗ＋ＭＴＸ（ｎ＝７０）
・治療アーム２：１００ｍｇＳＣマブリリムマブＱ２Ｗ＋ＭＴＸ（ｎ＝７０）
・治療アーム３：１５０ｍｇＳＣマブリリムマブＱ２Ｗ＋ＭＴＸ（ｎ＝７０）
・治療アーム４：ＳＣプラセボＱ２Ｗ＋ＭＴＸ（ｎ＝７０）
【０１７９】
対象は、ＳＣ注射による治験薬（マブリリムマブまたはプラセボ）の投与が０週目（一日目）から開始され、治験薬の投与はＱ２Ｗで２４週間続いた。この試験の主要な解析は、試験の最後の対象が２４週目の来院を完了した時に実施された。この試験の主要評価項目は、１２週目（８５日目）での１日目ＤＡＳ２８（ＣＲＰ）スコアからの変化及び２４週目（１６９日目）でのＡＣＲ２０％改善基準（ＡＣＲ２０）であった。１２週目（８５日目）でのベースラインＤＡＳ２８（ＣＲＰ）からの変化を、１日目のＤＡＳ２８（ＣＲＰ）のために調整した反復測定モデルを用いて分析した。ロジスティック回帰を用いて、各来院時のＡＣＲ２０、ＡＣＲ５０％改善基準（ＡＣＲ５０）、及びＡＣＲ７０％改善基準（ＡＣＲ７０）の応答率によって有効性を評価した。
【０１８０】
サブグループ解析：ベースライン抗ＰＡＤ４自己抗体
マブリリムマブに対する臨床応答と好中球及びマクロファージ生物学に関連する末梢血バイオマーカーとの関係を調べるために、検出可能な抗ＰＡＤ４自己抗体のベースラインの陽性または陰性によって定義されるサブグループを分析した。抗ＰＡＤ４自己抗体の陽性は、アッセイのＬＬＯＱを上回る測定された抗ＰＡＤ４自己抗体レベルを有するとして定義された。ベースライン血清試料は、試験中の３２６人の対象のうちの３２３人から入手可能であり、これらを抗ＰＡＤ４自己抗体について試験した。全体として、対象の３２％が抗ＰＡＤ４自己抗体について陽性であり、以下の表３に示すように、各治療アームにおいて、同様の割合で陽性であった。
【０１８１】
（表３）抗ＰＡＤ４自己抗体解析のサマリー
2019523759.tif 000005
【０１８２】
２４週間の治療後の主要評価項目の時点でのＡＣＲ２０、ＡＣＲ５０、ＡＣＲ７０及びＤＡＳ２８（ＣＲＰ）を含む、各臨床エンドポイントについて、サブグループ分析を実施した。これらの臨床エンドポイントにわたって、有意な治療＊バイオマーカー相互作用が観察された。ＡＣＲ２０エンドポイントについて、抗ＰＡＤ４陰性サブグループは、プラセボと比較してマブリリムマブに対する応答がはるかに優れているような有意な治療＊バイオマーカー相互作用（ｐ＝０．０４５）を示し、一方、抗ＰＡＤ４陽性サブグループは、全ての用量群にわたって、プラセボと比較したマブリリムマブに対する応答に小さな差を示した（表４の結果を参照）。例えば、抗ＰＡＤ４陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＡＣＲ２０応答は７７％（プラセボと比較してΔ＝６０％）であり、一方、抗ＰＡＤ４陽性サブグループでは、ＡＣＲ２０応答は６７％であった（プラセボと比較してΔ＝２７％）。
【０１８３】
（表４）２４週目での、抗ＰＡＤ４自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＡＣＲ２０応答（％）
2019523759.tif 000006
【０１８４】
ＡＣＲ５０応答についても同様の効果が観察され、ここでも有意な治療＊バイオマーカー相互作用が存在した（ｐ＝０．０２４）。例えば、抗ＰＡＤ４陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＡＣＲ５０応答は４０％（プラセボと比較してΔ＝３７％）であり、一方、抗ＰＡＤ４陽性サブグループでは、ＡＣＲ５０応答は４１％であった（プラセボと比較してΔ＝９％、以下の表５６、を参照）。
【０１８５】
（表５）２４週目での、抗ＰＡＤ４自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＡＣＲ５０応答（％）
2019523759.tif 000007
【０１８６】
同様の効果がＡＣＲ７０応答についても観察された。例えば、抗ＰＡＤ４陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＡＣＲ７０応答は１５％であり（プラセボと比較してΔ＝１５％）、一方、抗ＰＡＤ４陽性サブグループでは、ＡＣＲ７０応答は１１％であった（プラセボと比較してΔ＝−１％、表６）。したがって、プラセボと比較したマブリリムマブに対する応答の差は、ＡＣＲ２０、ＡＣＲ５０及びＡＣＲ７０のエンドポイントにわたって一貫していた。さらに、マブリリムマブ治療群におけるプラセボに対する応答率の差は、より大きな規模の臨床応答尺度（すなわち、ＡＣＲ５０及びＡＣＲ７０）において大きさが増加した。
【０１８７】
（表６）２４週目での、抗ＰＡＤ４自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＡＣＲ７０応答（％）
2019523759.tif 000008
【０１８８】
このバイオマーカーの効果は、臨床応答の第四の尺度であるＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化を用いても試験した。有意な治療＊バイオマーカー相互作用（ｐ＝０．００２）が、ＤＡＳ２８（ＣＲＰ）エンドポイントのベースライン抗ＰＡＤ４自己抗体レベルについて観察された。例えば、抗ＰＡＤ４陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化は−２．１５（プラセボと比較してΔ＝−１．４４）であり、一方、抗ＰＡＤ４陽性サブグループでは、ＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化は−２．２４（プラセボと比較してΔ＝−０．７１）であった。下の表７を参照されたい。
【０１８９】
（表７）２４週目での、抗ＰＡＤ４自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化
2019523759.tif 000009
【０１９０】
試験Ａで見られたものと同様の傾向が試験Ｂで見られた。
【０１９１】
サブグループ解析：ベースライン抗ＰＡＤ３自己抗体  
マブリリムマブに対する臨床応答と、タンパク質−アルギニンデイミナーゼファミリーにおける第二のタンパク質であるＰＡＤ３に対する自己抗体との関係を調べるために、検出可能な抗ＰＡＤ３自己抗体のベースラインの陽性または陰性によって定義されるサブグループを分析した。抗ＰＡＤ３自己抗体の陽性は、アッセイのＬＬＯＱを上回る測定された抗ＰＡＤ３自己抗体レベルを有するとして定義した。ベースライン血清試料は、試験中の３２６人の対象のうち３２３人から入手可能であり、これらを抗ＰＡＤ３自己抗体について試験した。以下の表８に示されるように、全体として対象の１６％が抗ＰＡＤ３自己抗体について陽性であり、各治療アームにおいて、同様の割合で陽性であった。
【０１９２】
（表８）抗ＰＡＤ３自己抗体解析のサマリー
2019523759.tif 000010
【０１９３】
２４週間の治療後の主要評価項目の時点でのＡＣＲ２０、ＡＣＲ５０、ＡＣＲ７０及びＤＡＳ２８（ＣＲＰ）を含む、各臨床エンドポイントについて、サブグループ分析を実施した。これらの臨床エンドポイントにわたって、有意な治療＊バイオマーカー相互作用は観察されなかった。以下の表９に示すように、ＡＣＲ２０エンドポイントについて、抗ＰＡＤ３陽性及び陰性サブグループがプラセボと比較してマブリリムマブと同様の応答を示すように、有意な治療＊バイオマーカー相互作用は存在しなかった。例えば、抗ＰＡＤ３陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＡＣＲ２０応答は、７４％（プラセボと比較してΔ＝５０％）であり、一方、抗ＰＡＤ３陽性サブグループでは、ＡＣＲ２０応答は７３％であった（プラセボと比較してΔ＝５０％）。
【０１９４】
（表９）２４週目での抗ＰＡＤ３自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＡＣＲ２０応答（％）
2019523759.tif 000011
【０１９５】
以下の表１０に示すように、ＡＣＲ５０応答について同様の効果が観察され、ここでも有意な治療＊バイオマーカー相互作用は存在しなかった。例えば、抗ＰＡＤ３陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＡＣＲ５０応答は４０％（プラセボと比較してΔ＝２８％）であり、一方、抗ＰＡＤ３陽性サブグループでは、ＡＣＲ５０応答は４５％であった（プラセボと比較してΔ＝３０％）。
【０１９６】
（表１０）２４週目での抗ＰＡＤ３自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＡＣＲ５０応答（％）
2019523759.tif 000012
【０１９７】
以下の表１１に示すように、ＡＣＲ７０応答について同様の効果が観察された。例えば、抗ＰＡＤ３陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療アームにおけるＡＣＲ７０応答は１５％（プラセボと比較してΔ＝１０％）であり、一方、抗ＰＡＤ３陽性サブグループでは、ＡＣＲ７０応答は９％であった（プラセボと比較してΔ＝９％）。したがって、プラセボと比較したマブリリムマブに対する応答の差は、ＡＣＲ２０、ＡＣＲ５０及びＡＣＲ７０のエンドポイントにわたって一貫していた。さらに、マブリリムマブ治療群のプラセボに対する応答率の差は、より大きな規模の臨床応答尺度（すなわち、ＡＣＲ５０及びＡＣＲ７０）において大きさが変化しなかった。
【０１９８】
（表１１）第２４週での抗ＰＡＤ３自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＡＣＲ７０応答（％）
2019523759.tif 000013
【０１９９】
このバイオマーカーの効果はまた、臨床応答の第四の尺度であるＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化を用いても試験した。以下の表１２に示すように、ＤＡＳ２８（ＣＲＰ）エンドポイントのベースライン抗ＰＡＤ３自己抗体レベルについては有意な治療＊バイオマーカー相互作用は観察されなかった。例えば、抗ＰＡＤ３陰性サブグループにおける１５０ｍｇのマブリリムマブ治療群におけるＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化は−２．１３（プラセボと比較してΔ＝−１．１５）であり、一方、抗ＰＡＤ３陽性サブグループでは、ＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化は−２．４７（プラセボと比較してΔ＝−１．７３）であった。これらの結果は、抗ＰＡＤ４抗体について得られた治療＊バイオマーカー相互作用が抗ＰＡＤ４抗体反応性に特異的であり、タンパク質−アルギニンデイミナーゼファミリーの全メンバーに及ぶ一般的な効果ではないことを示している。
【０２００】
（表１２）２４週目での抗ＰＡＤ３自己抗体陽性及び陰性サブグループにおけるＤＡＳ２８（ＣＲＰ）の変化
2019523759.tif 000014
【０２０１】
概要及び要約書の部分ではなく、詳細な説明の部分は、特許請求の範囲を解釈するために使用されることが意図されていることを理解されたい。概要及び要約書の部分は、発明者によって検討された本発明の一つまたは複数の例示的な実施形態を示すが、本発明及び添付の特許請求の範囲を限定することを意図するものではない。
【０２０２】
本発明は、特定の機能の実装及びその関係を示す機能的な構成ブロックの助けを借りて上記で説明されている。これらの機能的ビルディングブロックの境界は、説明の便宜上、本明細書において任意に定義されている。指定された機能とその関係が適切に実行されている限り、代替境界を定義することができる。
【０２０３】
特定の実施形態の前述の説明は、本発明の一般的な性質を完全に明らかにするであろうし、他の人が、当業者の知識の範囲内で知識を適用することによって、過度の実験をすることなく、本発明の一般的な概念から逸脱することなく、このような特定の実施形態を様々な用途に容易に変更及び／または適合させることができる。したがって、そのような適応及び変更は、本明細書に提示された教示及びガイダンスに基づいて、開示された実施形態の均等物の意味及び範囲内にあるものとする。本明細書の表現または用語は、本明細書の用語または表現が教示及びガイダンスに照らして当業者によって解釈されるように、限定ではなく説明のためのものであることを理解されたい。
【０２０４】
本発明の広さ及び範囲は、上記の例示的な実施形態のいずれかによって限定されるべきではなく、添付の特許請求の範囲及びそれらの等価物に従ってのみ規定されるべきである。
【０２０５】
（表１３）アミノ酸配列
2019523759.tif 000015
【図１】
2019523759.tif 000016
【手続補正書】
【提出日】令和1年5月22日(2019.5.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2019523759000001.app
【国際調査報告】
2019523759.tif 000017
2019523759.tif 000018