(57)【要約】  本開示は、とりわけ、オリゴヌクレオチド合成のためのホスホラミダイトを調製及び精製するための技術を提供する。【選択図】図１
2019510087.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ホスホラミダイトを精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）前記精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、前記精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
【請求項２】
ホスホラミダイトの回復率を改善する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）前記ホスホラミダイトを前記精製媒体へ加える工程と、
ｃ）前記ホスホラミダイトを溶媒系を用いて前記精製媒体から溶出させる工程と、を含み、工程ａ）がない場合、前記回復率は基準回復率より高い、方法。
【請求項３】
改良された回復率と前記基準回復率との間の差は、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％又は５０％である、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
ホスホラミダイトが精製媒体と接触する場合に前記ホスホラミダイトの分解を減少させる方法であって、
ａ）前記精製媒体から水を除去すること、を含む方法。
【請求項５】
前記精製媒体から水を除去する前記工程は前記精製媒体を加熱することを含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
前記精製媒体から水を除去する前記工程は前記精製媒体を吸湿性溶媒系と接触させることを含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記吸湿性溶媒系は１つの吸湿性溶媒からなる、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記吸湿性溶媒は、アセトアルデヒド、酢酸、アセトン、アセトニトリル、１，２−ブタンジオール、１，３−ブタンジオール、１，４−ブタンジオール、２−ブトキシエタノール、酪酸、ジエタノールアミン、ジエチレントリアミン、ジメチルカーボネート、ジメチルホルムアミド、ジメトキシエタン、ジメチルスルホキシド、１，４−ジオキサン、エタノール、エチルアミン、エチレングリコール、ギ酸、フルフリルアルコール、グリセロール、メタノール、メチルジエタノールアミン、メチルイソシアニド、１−プロパノール、１，３−プロパンジオール、１，５−ペンタンジオール、２−プロパノール、プロパン酸、プロピレングリコール、ピリジン、テトラヒドロフラン、及びトリエチレングリコールから選択される、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記吸湿性溶媒は、場合によっては最大５０％のトリエチレンアミンと共にメタノール、アセトニトリル、及びエチルアセテート、から選択される、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記吸湿性溶媒はメタノールである、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
ａ）精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）前記精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｂ）場合によっては、前記精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
【請求項１２】
前記前処理は前記精製媒体を加熱することを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記前処理は前記精製媒体を第１の溶媒系と接触させることを含み、第１の溶媒系は吸湿性溶媒を含む、請求項１１項に記載の方法。
【請求項１４】
前記精製媒体はシリカゲルである、請求項１１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
室温よりも高い及び／又は低い温度で前記精製媒体を用いる前記ホスホラミダイトのクロマトグラフィー精製を含む、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１６】
ａ）請求項１〜１５のいずれか１項に記載の工程ａ）により前処理された精製媒体と、
ｂ）ホスホラミダイトと、を含む組成物。
【請求項１７】
ａ）吸湿性溶媒で前処理されたシリカゲルと、
ｂ）ホスホラミダイトと、を含む組成物。
【請求項１８】
前記ホスホラミダイトは式ＩＩの構造を有する、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
【請求項１９】
実施形態１〜１４４のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は２０１６年３月１３日に出願された米国仮特許出願第６２／３０７，５４２号の優先権を主張し、その全体は参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
オリゴヌクレオチドは、各疾患の治療を含む多くの目的に有益である。オリゴヌクレオチドの効率的な合成方法が求められている。
【発明の概要】
【０００３】
本開示は、ホスホラミダイトの調製のための多くの技術に関する問題の原因を認識することを含む。当該技術分野で知られているように、ホスホラミダイトはオリゴヌクレオチド合成のモノマーとしてしばしば利用される。ホスホラミダイトを調製するための多くの技術には、低い収率及び／又は低い純度の課題がある。とりわけ、本開示は、例えば、オリゴヌクレオチド調製の効率の改良及び／若しくはコストの低減に有益であるホスホラミダイト並びに／若しくは別の中間物質及び生成物を調製するための著しく改良された収率並びに／又は純度を提供する技術（例えば、化合物、組成物、方法等）を提供する。
【０００４】
本開示は、精製媒体を前処理するいくつかのプロセスが、特にホスホラミダイトを調製時に使用する場合、その媒体の有用性及び／又は有効性を驚くほど改善することができることを含むいくつかの驚くべき知見を包含する。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、不活性化プロセスであっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、媒体からの水の除去又は排除であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、１つ又は複数の吸湿性溶媒を含む吸湿性溶媒系を用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、吸湿性溶媒を用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、アルコールを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、メタノールを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、エタノールを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、イソプロパノールを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、ジメチルカーボネートを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、アセトニトリルを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、エチルアセテートを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、アセトンを用いる処理であっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、本開示は、１つ又は複数の精製媒体を劣化させるか、さもなければ損傷させると以前に理解されたていた又は予想されていたいくつかのプロセスを含むいくつかのこのようなプロセスが、実際にこのような媒体の有用性及び／又は有効性を、特にホスホラミダイトの調製において、改善し得ることを説明する。いくつかの実施形態では、本開示の教示は、シリカ媒体である、又はシリカ媒体を含む媒体に関する。いくつかの実施形態では、本開示の教示は、シリカゲルである、又はシリカゲルを含む媒体に関する。
【０００５】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトの調製におけるクロマトグラフィー精製（例えば、シリカゲル、アルミナ等を用いる精製）を利用する先行技術の問題の１つの原因は、かなりの量のホスホラミダイトがクロマトグラフィーの間に失われ得ると本開示は認識している。特定の理論に拘束されることを望まないが、本開示は、場合によっては、ホスホラミダイトが精製媒体、例えばシリカゲル、アルミナ等に不可逆的吸着（例えば、クロマトグラフィー精製中に容易に溶出できない）によって、及び／又は精製媒体と接触する場合に分解によって失われ得ることを提示する。いくつかの実施形態では、本開示は、ホスホルラミダイトの低い収率及び／又は低い純度が、オリゴヌクレオチド及び／又はその医薬組成物のコストを大幅に、特に大規模にオリゴヌクレオチドをベースとする治療用医薬品を調製するのに必要とされる医薬組成物等で、増加させる可能性があるとの認識を含む。本開示は、いくつかの実施形態では、本明細書に記載の精製媒体の処理が、ホスホラミダイトの精製におけるその性能（従って、その有用性及び／又は効能）を改善し得るという特定の洞察を与える。
【０００６】
いくつかの実施形態では、本開示は、ホスホラミダイト及び／又はオリゴヌクレオチドを調製するための新規技術、例えば、化合物、組成物、方法等を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、ホスホラミダイトを精製するための新しい技術を提供する。いくつかの実施形態では、提供された技術は、ホスホラミダイト合成の効率を大幅に改善し、並びに／又はホスホラミダイト及びそれから調製されるオリゴヌクレオチド、組成物及び医薬品のコストを著しく低下させる。
【０００７】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｂ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【０００８】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトと、精製する工程、を含む方法を提供する。
【０００９】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）シリカゲルを含む精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、を含む方法を提供する。
【００１０】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）シリカゲルを含む精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００１１】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）シリカゲルを前処理する工程と、
ｂ）シリカゲルをホスホラミダイトと接触させる工程と、を含む方法を提供する。
【００１２】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）シリカゲルを前処理する工程と、
ｂ）シリカゲルを用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００１３】
いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体から水を除去する。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体を不活性化する。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体を第１の溶媒系と接触させることを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はアルコールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はメタノールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はエタノールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はイソプロパノールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はアセトンである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はジメチルカーボネートである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はアセトニトリルである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はエチルアセテートである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は精製媒体の反応部位を不活性化する。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体を加熱することを含む。
【００１４】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトと、を精製する工程、を含む方法を提供する。
【００１５】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００１６】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００１７】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）ホスホラミダイトを精製媒体へ加える工程と、
ｃ）ホスホラミダイトを溶媒系を用いて精製媒体から溶出させる工程と、
を含み、工程ａ）がない場合、回復率は基準回復率より高い、ホスホラミダイトの回復率を改善する方法を提供する。
【００１８】
いくつかの実施形態では、本開示は、ａ）精製媒体から水を除去する工程、を含むホスホラミダイトが精製媒体と接触する場合にホスホラミダイトの分解を減少させる方法を提供する。
【００１９】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体を不活性化する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供し、不活性化された精製媒体が、不活性化されていない精製媒体よりも高い回復率をもたらす。
【００２０】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２１】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２２】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２３】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２４】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２５】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２６】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）吸湿性溶媒を用いて精製媒体を処理する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２７】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）アルコールを用いて精製媒体を処理する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２８】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）１つ又は複数のアルコールを用いて精製媒体を処理する工程と、
ｂ）精製媒体を１つ又は複数のアルコールよりも極性が小さい溶媒系を用いて再平衡化させる工程と、
ｃ）シリカゲルを用いてホスホラミダイトを精製する工程であって、溶出溶媒系は１つ又は複数のアルコールよりも極性が小さい、精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００２９】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）メタノールを用いて精製媒体を処理する工程と、
ｂ）エチルアセテート及びヘキサンを含む溶媒系を用いて精製媒体を再平衡させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程であって、溶出溶媒系はエチルアセテート、ヘキサン、及び場合によっては修飾剤を含む、精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００３０】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）メタノールを用いて精製媒体を処理する工程と、
ｂ）エチルアセテート及びヘキサンを含む溶媒系を用いて精製媒体を再平衡させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程であって、溶出溶媒系はエチルアセテートとヘキサンの混合物である、精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００３１】
いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）メタノールを用いて精製媒体を処理する工程と、
ｂ）エチルアセテート及びヘキサンを含む溶媒系を用いて精製媒体を再平衡させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程であって、溶出溶媒系はエチルアセテートとヘキサンとトリエチルアミンの混合物である、精製する工程と、を含む方法を提供する。
【００３２】
いくつかの実施形態では、本開示は、
化合物を媒体と接触させることであって、
媒体は不活性である、接触させること、を含む方法を提供する。
【００３３】
いくつかの実施形態では、本開示は、
化合物を、媒体を用いて精製することであって、
媒体は不活性である、精製すること、を含む方法を提供する。
【００３４】
いくつかの実施形態では、化合物はホスホラミダイトである。いくつかの実施形態では、化合物はヌクレオシドである。いくつかの実施形態では、化合物はヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、化合物はオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、媒体は精製媒体である。いくつかの実施形態では、媒体はシリカゲルを含む。いくつかの実施形態では、媒体はシリカゲルである。いくつかの実施形態では、媒体は本開示に記載のように機械的に不活性化される。いくつかの実施形態では、媒体は本開示に記載のように溶媒系又は溶媒を用いて不活性化される。いくつかの実施形態では、媒体は本開示に記載のように溶媒系との接触により不活性化される、又は吸湿性溶媒を含む。
【００３５】
いくつかの実施形態では、提供される方法は本開示に記載のように媒体を用いることを含むクロマトグラフィー法である。いくつかの実施形態では、媒体はシリカゲルである、又はシリカゲルを含む。いくつかの実施形態では、媒体は、例えば機械的手段、吸湿性溶媒（系）との接触等により、不活性化される。
【００３６】
いくつかの実施形態では、本開示は、ホスホラミダイトを調製するための組成物を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、
ａ）不活性化された精製媒体と、
ｂ）ホスホラミダイトと、を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは不活性化された精製媒体と接触する。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは不活性化された精製媒体に吸着される。
【００３７】
いくつかの実施形態では、精製媒体を溶媒系又は溶媒を用いて処理することは、精製媒体を溶媒系若しくは溶媒と接触させることである、又は含む。
【００３８】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトはヌクレオシドホスホラミダイトである。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載されるものであり、その各々のホスホラミダイトは、参照により本明細書に組み込まれる。
【００３９】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは立体化学的に濃縮される。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは立体化学的に純粋である。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、キラルに制御されたオリゴヌクレオチド組成物、例えば国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載のそれらを調製するために用いられ、その各々のキラルに制御されたオリゴヌクレオチド組成物は、参照により本明細書に組み込まれる。
【００４０】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは式Ｉ：
【化１】
2019510087.tif 000003
の構造を有し、式中、各変数は独立して定義され以下に記載の通りである。
【図面の簡単な説明】
【００４１】
【図１】クロマトグラム：前処理を行わないシリカ
【００４２】
【図２】クロマトグラム：前処理を行ったシリカ
【発明を実施するための形態】
【００４３】
１．  定義
本明細書中で使用される場合、他に示されない限り、以下の定義が適用される。この開示では、化学元素は、元素の周期律表、ＣＡＳ  ｖｅｒｓｉｏｎ，Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｐｈｙｓｉｃｓ，７５ｔｈ  Ｅｄ．に従って同定される。更に、有機化学の一般原則は、“Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ”，Ｔｈｏｍａｓ  Ｓｏｒｒｅｌｌ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｂｏｏｋｓ，Ｓａｕｓａｌｉｔｏ：１９９９、及び“Ｍａｒｃｈ’ｓ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ”，５ｔｈ  Ｅｄ．，Ｅｄ．Ｓｍｉｔｈ，Ｍ．Ｂ及びＭａｒｃｈ，Ｊ．，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ：２００１に記載されており、その全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【００４４】
脂肪族：本明細書で使用される場合には、「脂肪族」は、完全に飽和若しくは１つ若しくは複数の不飽和単位を含む、直鎖状の（即ち、非分枝状の）若しくは分枝状の、置換若しくは非置換の炭化水素鎖、又は、完全に飽和若しくは１つ若しくは複数の不飽和単位を含む、置換若しくは非置換の単環式、二環式若しくは多環式炭化水素環、若しくはそれらの組み合わせを意味する。特に明記しない限り、脂肪族基は１〜１００個の脂肪族炭素原子を含む。いくつかの実施形態では、脂肪族基は１〜２０個の脂肪族炭素原子を含む。別の実施形態では、脂肪族基は１〜１０個の脂肪族炭素原子を含む。別の実施形態では、脂肪族基は１〜９個の脂肪族炭素原子を含む。別の実施形態では、脂肪族基は１〜８個の脂肪族炭素原子を含む。別の実施形態では、脂肪族基は１〜７個の脂肪族炭素原子を含む。別の実施形態では、脂肪族基は１〜６個の脂肪族炭素原子を含む。更に別の実施形態では、脂肪族基は１〜５個の脂肪族炭素原子を含み、更に他の実施形態では、脂肪族基は１、２、３又は４個の脂肪族炭素原子を含む。好適な脂肪族基には、直鎖状の又は分枝状の、置換又は非置換のアルキル、アルケニル、アルキニル基及びそれらのハイブリッドが含まれるが、これらに限定されない。
【００４５】
アルキル：本明細書で使用される用語「アルキル」は、当該技術分野で通常の意味を有し、直鎖アルキル基、分枝鎖アルキル基、シクロアルキル（脂環式）基、アルキル置換シクロアルキル基、及びシクロアルキル置換アルキル基を含む飽和脂肪族基を含み得る。いくつかの実施形態では、アルキルは１〜１００個の炭素原子を有する。いくつかの実施形態では、直鎖又は分枝鎖アルキルはその主鎖中に約１〜２０個（例えば、直鎖の場合はＣ１−Ｃ２０、分枝鎖の場合はＣ２−Ｃ２０）、あるいは約１〜１０個の炭素原子を有する。いくつかの実施形態では、シクロアルキル環は、環が単環式、二環式又は多環式であるその環構造中に約３〜１０個の炭素原子、あるいは環構造中に約５、６又は７個の炭素を有する。いくつかの実施形態では、アルキル基は低級アルキル基であってもよく、低級アルキル基は１〜４個の炭素原子（例えば、直鎖低級アルキルの場合はＣ１−Ｃ４）を含む。
【００４６】
アルケニル：本明細書で使用される用語「アルケニル」は、本明細書で定義されるように１つ又は複数の二重結合を有するアルキル基を指す。
【００４７】
アルキニル：本明細書で使用される用語「アルキニル」は、本明細書で定義されるように１つ又は複数の三重結合を有するアルキル基を指す。
【００４８】
アリール：単独で、又は「アラルキル」、「アラルコキシ」若しくは「アリールオキシアルキル」内のより大きな部分の一部として使用される用語「アリール」は、総計５〜３０個の環員を有する単環式、二環式、又は多環式環系を指し、系内の少なくとも１個の環は芳香族である。いくつかの実施形態では、アリール基は、総計５〜１４個の環員を有する単環式、二環式、又は多環式環系であり、系内の少なくとも１個の環は芳香族であり、系中の各環は３〜７個の環員を含む。いくつかの実施形態では、アリール基はビアリール基である。用語「アリール」は、用語「アリール環」と互換的に使用され得る。本開示のいくつかの実施形態では、「アリール」は、フェニル、ビフェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラシル等を含み、１つ又は複数の置換基を有し得る芳香環系を指すが、これらに限定されない。また、本明細書で使用される用語「アリール」の範囲内に含まれるのは、芳香環が１個又は複数の非芳香環に縮合している基、例えばインダニル、フタルイミジル、ナフチミジル、フェナントリジニル、又はテトラヒドロナフチル等である。いくつかの実施形態では、アリール基は、芳香環上にラジカル又は結合点を有する。
【００４９】
脂環式：本明細書で使用される用語「脂環式」は、例えば３〜３０個の環員を有する飽和若しくは部分不飽和脂肪族単環式、二環式、又は多環式環系を指し、脂肪族環系は置換されていてもよい。脂環式基は、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチル、シクロヘプテニル、シクロオクチル、シクロオクテニル、ノルボルニル、アダマンチル、及びシクロオクタジエニルを含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、シクロアルキルは３〜６個の炭素を有する。用語「脂環式」はまた、１つ若しくは複数の芳香又は非芳香環、例えばデカヒドロナフチル又はテトラヒドロナフチルに縮合している脂肪族環を含むことができ、ここでラジカル又は結合点は脂肪族環上にある。いくつかの実施形態では、炭素環式基は二環式である。いくつかの実施形態では、炭素環式基は三環式である。いくつかの実施形態では、炭素環式基は多環式である。いくつかの実施形態では、「脂環式」（又は「炭素環式」又は「シクロアルキル」）は、完全に飽和している若しくは１つ若しくは複数の不飽和単位を含むが、芳香族ではなく、分子の残りの部分へ単一の結合点を有する単環式Ｃ３−Ｃ６炭化水素若しくはＣ８−Ｃ１０二環式炭化水素、又は、完全に飽和している若しくは１つ若しくは複数の不飽和単位を含むが、芳香族ではなく、分子の残りの部分へ単一の結合点を有するＣ９−Ｃ１６三環式炭化水素を指す。
【００５０】
ハロゲン：用語「ハロゲン」は、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、又はＩを意味する。
【００５１】
ヘテロ脂肪族：用語「ヘテロ脂肪族」は、当技術分野で通常の意味を有し、１個又は複数の炭素原子がヘテロ原子（例えば、酸素、窒素、硫黄、ケイ素、リン等）で置換された本明細書に記載の脂肪族基を指す。
【００５２】
ヘテロアルキル：用語「ヘテロアルキル」は、当技術分野で通常の意味を有し、１個又は複数の炭素原子がヘテロ原子（例えば、酸素、窒素、硫黄、ケイ素、リン等）で置換された本明細書に記載のアルキル基を指す。ヘテロアルキル基の例としては、アルコキシ、ポリ（エチレングリコール）−、アルキル置換アミノ、テトラヒドロフラニル、ピペリジニル、モルホリニル等が挙げられるが、これらに限定されない。
【００５３】
ヘテロアリール：単独で又はより大きい部分、例えば「ヘテロアラルキル」又は「ヘテロアラルコキシ」の一部として使用される用語「ヘテロアリール」及び「ヘテロアラルキル」は、総計５〜３０個の環員を有する単環式、二環式又は多環式環系を指し、系内の少なくとも１個の環は芳香族であり、少なくとも１個の芳香環原子はヘテロ原子である。ヘテロアリール基は、いくつかの実施形態では５〜１０個の環原子（即ち、単環式、二環式又は多環式）、いくつかの実施形態では５、６、９、又は１０個の環原子を有する基である。いくつかの実施形態では、ヘテロアリール基は、環状配列中で共有され、及び炭素原子に加えて１〜５個のヘテロ原子を有する、６、１０、又は１４個のπ電子を有する。ヘテロアリール基には、チエニル、フラニル、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、トリアゾリル、テトラゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、オキサジアゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、チアジアゾリル、ピリジル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニル、インドリジニル、プリニル、ナフチリジニル及びプテリジニルが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ヘテロアリールはヘテロビアリール基、例えばビピリジル等である。本明細書で使用される用語「ヘテロアリール」及び「ヘテロアラルキル」はまた、ヘテロ芳香環が１個若しくは複数のアリール、脂環式又はヘテロシクリル環に縮合している基を含み、ここでラジカル又は結合点はヘテロ芳香環上にある。非限定的な例としては、インドリル、イソインドリル、ベンゾチエニル、ベンゾフラニル、ジベンゾフラニル、インダゾリル、ベンズイミダゾリル、ベンズチアゾリル、キノリル、イソキノリル、シンノリニル、フタラジニル、キナゾリニル、キノキサリニル、４Ｈ−キノリジニル、カルバゾリル、アクリジニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニル、テトラヒドロキノリニル、テトラヒドロイソキノリニル、及びピリド［２，３−ｂ］−１，４−オキサジン−３（４Ｈ）−オンが挙げられる。ヘテロアリール基は、単環式、二環式又は多環式であってもよい。用語「ヘテロアリール」は、用語「ヘテロアリール環」、「ヘテロアリール基」又は「ヘテロ芳香族」と互換的に使用されることができ、これらの用語のいずれかは、置換されていてもよい環を含む。用語「ヘテロアラルキル」は、ヘテロアリール基で置換されたアルキル基を指し、アルキル部分及びヘテロアリール部分は、独立して置換されていてもよい。
【００５４】
ヘテロ原子：用語「ヘテロ原子」は炭素でも水素でもない原子を意味する。いくつかの実施形態では、ヘテロ原子は、（窒素、硫黄、リン、又はケイ素の任意の酸化形態、任意の塩基性窒素又は複素環式環の置換可能な窒素の四級化形態（例えば、３，４−ジヒドロ−２Ｈ−ピロリル中のＮ）、（ピロリジニル中の）ＮＨ、又は（Ｎ−置換ピロリジニル中の）ＮＲ＋等を含む）酸素、硫黄、窒素、リン、又はケイ素である。
【００５５】
ヘテロシクリル：本明細書で使用する「複素環」、「ヘテロシクリル」、「複素環式ラジカル」、及び「複素環式環」という用語は互換的に使用され、飽和又は部分不飽和であり、１個若しくは複数のヘテロ原子環原子を有する単環式、二環式、又は多環式環部分（例えば３〜３０員）を指す。いくつかの実施形態では、ヘテロシクリル基は、炭素原子に加えて１個又は複数の、好ましくは上で定義した１〜４個のヘテロ原子を有する飽和又は部分不飽和のいずれかの、安定な５員〜７員単環式又は７員〜１０員二環式複素環式部分である。複素環の環原子に関して使用される場合、用語「窒素」は置換された窒素を含む。例として、酸素、硫黄又は窒素から選択される０〜３個のヘテロ原子を有する飽和又は部分不飽和の環において、窒素は（３，４−ジヒドロ−２Ｈ−ピロリル中の）Ｎ、（ピロリジニルの中の）ＮＨ、又は（Ｎ−置換ピロリジニル中の）＋ＮＲであることができる。複素環式環は、安定な構造をもたらす任意のヘテロ原子又は炭素原子でそのペンダント基に結合することができ、任意の環原子は置換されていてもよい。このような飽和又は部分不飽和複素環式ラジカルの例としては、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチエニル、ピロリジニル、ピペリジニル、ピロリニル、テトラヒドロキノリニル、テトラヒドロイソキノリニル、デカヒドロキノリニル、オキサゾリジニル、ピペラジニル、ジオキサニル、ジオキソラニル、ジアゼピニル、オキサゼピニル、チアゼピニル、モルホリニル、及びキヌクリジニルが挙げられるが、これらに限定されない。用語「複素環」、「ヘテロシクリル」、「ヘテロシクリル環」、「複素環式基」、「複素環式基」、「複素環式部分」、及び「複素環式ラジカル」は、本明細書では互換的に使用され、また、ヘテロシクリル環が１つ若しくは複数のアリール、ヘテロアリール、又は脂環式環、例えばインドリニル、３Ｈ−インドリル、クロマニル、フェナントリジニル、若しくはテトラヒドロキノリニル、に縮合した基を含む。ヘテロシクリル基は、単環式、二環式、又は多環式であってもよい。用語「ヘテロシクリルアルキル」は、ヘテロシクリルで置換されたアルキル基を指し、アルキル部分及びヘテロシクリル部分は、独立して置換されていてもよい。
【００５６】
部分不飽和：本明細書で使用される用語「部分不飽和」は、少なくとも１つの二重又は三重結合を含む部分を指す。用語「部分不飽和」は、不飽和の複数の部位を有する基を含むことが意図されるが、アリール部分及びヘテロアリール部分のいずれも含むことを意図するものではない。
【００５７】
保護基  本明細書で使用される語句「保護基」は、潜在的に反応性官能基を望ましくない化学変換から保護する一時的な置換基を指す。このような保護基の例としては、カルボン酸のエステル、アルコールのシリルエーテル、アルデヒドのアセタール、及びケトンのケタールが挙げられる。「Ｓｉ保護基」は、Ｓｉ原子を含む保護基、例えばＳｉ−トリアルキル（例えば、トリメチルシリル、トリブチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル）、Ｓｉ−トリアリール、Ｓｉ−アルキル−ジフェニル（例えば、ｔ−ブチルジフェニルシリル）等、又はＳｉ−アリール−ジアルキル（例えば、Ｓｉ−フェニルジアルキル）である。一般的に、Ｓｉ保護基は酸素原子に結合している。保護基化学の分野が概説されている（Ｇｒｅｅｎｅ，Ｔ．Ｗ．；Ｗｕｔｓ，Ｐ．Ｇ．Ｍ．Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ  Ｇｒｏｕｐｓ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２ｎｄ  ｅｄ．；Ｗｉｌｅｙ：Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９９１）。このような保護基（及び関連する保護された部分）を、以下に詳細に記載する。
【００５８】
保護されたヒドロキシル基は、当該技術分野において衆知であり、Ｐｒｏｔｅｃｔｉｎｇ  Ｇｒｏｕｐｓ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｔ．Ｗ．Ｇｒｅｅｎｅ  ａｎｄ  Ｐ．Ｇ．Ｍ．Ｗｕｔｓ，３ｒｄ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，１９９９」に詳細に記載されるものを含み、その全体は参照により本明細書に組み込まれる。好適に保護されたヒドロキシル基の例としては、エステル、カーボネート、スルホネート、アリルエーテル、エーテル、シリルエーテル、アルキルエーテル、アリールアルキルエーテル、及びアルコキシアルキルエーテルが更に挙げられるが、これらに限定されない。好適なエステルの例としては、ギ酸エステル、酢酸エステル、プロピオン酸エステル、ペンタン酸エステル、クロトン酸エステル、及び安息香酸エステルが挙げられる。好適なエステルの具体例としては、ギ酸エステル、ベンゾイルギ酸エステル、クロロ酢酸エステル、トリフルオロ酢酸エステル、メトキシ酢酸エステル、トリフェニルメトキシ酢酸エステル、ｐ−クロロフェノキシ酢酸エステル、３−フェニルプロピオン酸エステル、４−オキソペンタン酸エステル、４，４−（エチレンジチオ）ペンタン酸エステル、ピバル酸（トリメチル酢酸エステル）、クロトン酸エステル、４−メトキシ−クロトン酸エステル、安息香酸エステル、ｐ−ベンゾイル安息香酸エステル、２，４，６−トリメチル安息香酸エステルが挙げられる。好適なカーボネートの例としては、９−フルオレニルメチル、エチル、２，２，２−トリクロロエチル、２−（トリメチルシリル）エチル、２−（フェニルスルホニル）エチル、ビニル、アリル、及びｐ−ニトロベンジルカーボネートが挙げられる。好適なシリルエーテルの例としては、トリメチルシリル、トリエチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル、ｔ−ブチルジフェニルシリル、トリイソプロピルシリルエーテル、及び他のトリアルキルシリルエーテルが挙げられる。好適なアルキルエーテルの例としては、メチル、ベンジル、ｐ−メトキシベンジル、３，４−ジメトキシベンジル、トリチル、ｔ−ブチル、及びアリルエーテル、又はそれらの誘導体が挙げられる。アルコキシアルキルエーテルには、アセタール、例えばメトキシメチル、メチルチオメチル、（２−メトキシエトキシ）メチル、ベンジルオキシメチル、ベータ−（トリメチルシリル）エトキシメチル、及びテトラヒドロピラン−２−イルエーテル等が含まれる。好適なアリールアルキルエーテルの例としては、ベンジル、ｐ−メトキシベンジル（ＭＰＭ）、３，４−ジメトキシベンジル、Ｏ−ニトロベンジル、ｐ−ニトロベンジル、ｐ−ハロベンジル、２，６−ジクロロベンジル、ｐ−シアノベンジル、２−及び４−ピコリルエーテルが挙げられる。
【００５９】
保護されたアミンは当該技術分野において衆知であり、Ｇｒｅｅｎｅ（１９９９）に詳細に記載されているものを含む。好適なモノ保護されたアミンには更に、アラルキルアミン、カルバメート、アリルアミン、アミド等が含まれるが、これらに限定されない。好適なモノ保護されたアミノの例としては、ｔ−ブチルオキシカルボニルアミノ（−ＮＨＢＯＣ）、エチルオキシカルボニルアミノ、メチルオキシカルボニルアミノ、トリクロロエチルオキシカルボニルアミノ、アリルオキシカルボニルアミノ（−ＮＨＡｌｌｏｃ）、ベンジルオキシカルボニルアミノ（−ＮＨＣＢＺ）、アリルアミノ、ベンジルアミノ（−ＮＨＢｎ）、フルオレニルメチルカルボニル（−ＮＨＦｍｏｃ）ホルムアミド、アセトアミド、クロロアセトアミド、ジクロロアセトアミド、トリクロロアセトアミド、フェニルアセトアミド、トリフルオロアセトアミド、ベンズアミド、ｔ−ブチルジフェニルシリル等が挙げられる。好適なジ保護されたアミンには、モノ保護されたアミンとして上に記載されたものから、独立して選択される２つの置換基で置換されたアミンが含まれ、更に環状イミド、例えばフタルイミド、マレイミド、スクシンイミド等が含まれる。好適なジ保護されたアミンにはまた、ピロール等、２，２，５，５−テトラメチル−［１，２，５］アザジシロリジン等、及びアジドが含まれる。
【００６０】
保護されたアルデヒドは当該技術分野において衆知であり、Ｇｒｅｅｎｅ（１９９９）に詳細に記載されているものを含む。好適な保護されたアルデヒドには、非環式アセタール、環状アセタール、ヒドラゾン、イミン等が更に含まれるが、これらに限定されない。このような基の例としては、ジメチルアセタール、ジエチルアセタール、ジイソプロピルアセタール、ジベンジルアセタール、ビス（２−ニトロベンジル）アセタール、１，３−ジオキサン、１，３−ジオキソラン、セミカルバゾン、及びその誘導体が挙げられる。
【００６１】
保護されたカルボン酸は当該技術分野において衆知であり、Ｇｒｅｅｎｅ（１９９９）に詳細に記載されているものを含む。好適な保護されたカルボン酸としては、更に、置換されていてもよいＣ１−６脂肪族エステル、置換されていてもよいアリールエステル、シリルエステル、活性エステル、アミド、ヒドラジド等が挙げられるが、これらに限定されない。このようなエステル基の例には、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、ベンジル、及びフェニルエステルが含まれ、各基は置換されていてもよい。更なる好適な保護されたカルボン酸には、オキサゾリン及びオルトエステルが含まれる。
【００６２】
保護されたチオールは当該技術分野において衆知であり、Ｇｒｅｅｎｅ（１９９９）に詳細に記載されているものを含む。好適な保護されたチオールは、ジスルフィド、チオエーテル、シリルチオエーテル、チオエステル、チオカーボネート、及びチオカルバメート等を更に含むが、これらに限定されない。このような基の例としては、ほんの少し例を挙げると、アルキルチオエーテル、ベンジル及び置換ベンジルチオエーテル、トリフェニルメチルチオエーテル、並びにトリクロロエトキシカルボニルチオエステルが挙げられるが、これらに限定されない。
【００６３】
置換：本明細書に記載されるように、本開示の化合物は、置換されていてもよい及び／又は置換された部分を含み得る。一般に、用語「置換された」は、用語「任意に」が前にあるか否かにかかわらず、指定された部分の１つ又は複数の水素が好適な置換基で置換されていることを意味する。特に指示しない限り、「置換されていてもよい」基は、基の各置換可能な位置に好適な置換基を有していてもよく、任意の所定の構造中の２つ以上の位置が特定の基から選択される２つ以上の置換基で置換され得る場合、その置換基はあらゆる位置で同じであっても又は異なっていてもよい。本開示によって想定される置換基の組み合わせは、好ましくは、安定又は化学的に実現可能な化合物の形成をもたらす置換基である。本明細書で使用される用語「安定な」は、化合物の産生、検出、並びに、いくつかの実施形態では、本明細書に開示される１つ又は複数の目的のためのそれらの回収、精製、及び使用を可能にする条件にさらされた場合に、実質的に改変されない化合物を指す。
【００６４】
好適な一価置換基は、ハロゲン；−（ＣＨ２）０−４Ｒ°；−（ＣＨ２）０−４ＯＲ°；−Ｏ（ＣＨ２）０−４Ｒｏ，−Ｏ−（ＣＨ２）０−４Ｃ（Ｏ）ＯＲ°；−（ＣＨ２）０−４ＣＨ（ＯＲ°）２；Ｒ°で置換されていてもよい−（ＣＨ２）０−４Ｐｈ；Ｒ°で置換されていてもよい−（ＣＨ２）０−４Ｏ（ＣＨ２）０−１Ｐｈ；Ｒ°で置換されていてもよい−ＣＨ＝ＣＨＰｈ；Ｒ°で置換されていてもよい−（ＣＨ２）０−４Ｏ（ＣＨ２）０−１−ピリジル；−ＮＯ２；−ＣＮ；−Ｎ３；−（ＣＨ２）０−４Ｎ（Ｒ°）２；−（ＣＨ２）０−４Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｏ）Ｒ°；−Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｓ）Ｒ°；−（ＣＨ２）０−４Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｏ）ＮＲ°２；−Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｓ）ＮＲ°２；−（ＣＨ２）０−４Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｏ）ＯＲ°；−Ｎ（Ｒ°）Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｏ）Ｒ°；−Ｎ（Ｒ°）Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｏ）ＮＲ°２；−Ｎ（Ｒ°）Ｎ（Ｒ°）Ｃ（Ｏ）ＯＲ°；−（ＣＨ２）０−４Ｃ（Ｏ）Ｒ°；−Ｃ（Ｓ）Ｒ°；−（ＣＨ２）０−４Ｃ（Ｏ）ＯＲ°；−（ＣＨ２）０−４Ｃ（Ｏ）ＳＲ°；−（ＣＨ２）０−４Ｃ（Ｏ）ＯＳｉＲ°３；−（ＣＨ２）０−４ＯＣ（Ｏ）Ｒ°；−ＯＣ（Ｏ）（ＣＨ２）０−４ＳＲ、−ＳＣ（Ｓ）ＳＲ°；−（ＣＨ２）０−４ＳＣ（Ｏ）Ｒ°；−（ＣＨ２）０−４Ｃ（Ｏ）ＮＲ°２；−Ｃ（Ｓ）ＮＲ°２；−Ｃ（Ｓ）ＳＲ°；−ＳＣ（Ｓ）ＳＲ°、−（ＣＨ２）０−４ＯＣ（Ｏ）ＮＲ°２；−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＯＲ°）Ｒ°；−Ｃ（Ｏ）Ｃ（Ｏ）Ｒ°；−Ｃ（Ｏ）ＣＨ２Ｃ（Ｏ）Ｒ°；−Ｃ（ＮＯＲ°）Ｒ°；−（ＣＨ２）０−４ＳＳＲ°；−（ＣＨ２）０−４Ｓ（Ｏ）２Ｒ°；−（ＣＨ２）０−４Ｓ（Ｏ）２ＯＲ°；−（ＣＨ２）０−４ＯＳ（Ｏ）２Ｒ°；−Ｓ（Ｏ）２ＮＲ°２；−（ＣＨ２）０−４Ｓ（Ｏ）Ｒ°；−Ｎ（Ｒ°）Ｓ（Ｏ）２ＮＲ°２；−Ｎ（Ｒ°）Ｓ（Ｏ）２Ｒ°；−Ｎ（ＯＲ°）Ｒ°；−Ｃ（ＮＨ）ＮＲ°２；−Ｐ（Ｏ）２Ｒ°；−Ｐ（Ｏ）Ｒ°２；−ＯＰ（Ｏ）Ｒ°２；−ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ°）２；−ＳｉＲ°３；−ＯＳｉＲ°３；−（Ｃ１−４直鎖若しくは分枝鎖のアルキレン）Ｏ−Ｎ（Ｒ°）２；又は、−（Ｃ１−４直鎖若しくは分枝鎖のアルキレン）Ｃ（Ｏ）Ｏ−Ｎ（Ｒ°）２、（式中、各Ｒ°は、以下に定義されるように置換されていてもよく、独立して、水素、Ｃ１−２０脂肪族、窒素、酸素、硫黄、ケイ素及びリンから独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有するＣ１−２０ヘテロ脂肪族、−ＣＨ２−（Ｃ６−１４アリール）、−Ｏ（ＣＨ２）０−１（Ｃ６−１４アリール）、−ＣＨ２−（５〜１４員ヘテロアリール環）、窒素、酸素、硫黄、ケイ素及びリンから独立して選択される０〜５個のヘテロ原子を有する５〜２０員の、単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環であり、又は、上記定義にかかわらず、独立して出現する２つのＲ°は、それらの介在する原子と一緒になって、窒素、酸素、硫黄、ケイ素及びリンから独立して選択される０〜５個のヘテロ原子を有する５〜２０員の、単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環を形成し、これらは以下に定義されるように置換されていてもよい）を含む。
【００６５】
好適なＲ°上の一価置換基（又は独立して出現する２つのＲ°がその介在する原子と一緒になって形成する環）は、独立して、ハロゲン、−（ＣＨ２）０−２Ｒ●、−（ハロＲ●）、−（ＣＨ２）０−２ＯＨ、−（ＣＨ２）０−２ＯＲ●、−（ＣＨ２）０−２ＣＨ（ＯＲ●）２；−Ｏ（ハロＲ●）、−ＣＮ、−Ｎ３、−（ＣＨ２）０−２Ｃ（Ｏ）Ｒ●、−（ＣＨ２）０−２Ｃ（Ｏ）ＯＨ、−（ＣＨ２）０−２Ｃ（Ｏ）ＯＲ●、−（ＣＨ２）０−２ＳＲ●、−（ＣＨ２）０−２ＳＨ、−（ＣＨ２）０−２ＮＨ２、−（ＣＨ２）０−２ＮＨＲ●、−（ＣＨ２）０−２ＮＲ●２、−ＮＯ２、−ＳｉＲ●３、−ＯＳｉＲ●３、−Ｃ（Ｏ）ＳＲ●、−（Ｃ１−４直鎖若しくは分枝鎖のアルキレン）Ｃ（Ｏ）ＯＲ●、又は−ＳＳＲ●、（式中、各Ｒ●は、非置換の、若しくは「ハロ」が前に付く場合には１つ若しくは複数のハロゲンでのみ置換され、及び、独立して、Ｃ１−４脂肪族、−ＣＨ２Ｐｈ、−Ｏ（ＣＨ２）０−１Ｐｈ、又は窒素、酸素及び硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する５〜６員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環から選択される）である。Ｒ°の飽和炭素原子上の好適な二価置換基は、＝Ｏ及び＝Ｓを含む。
【００６６】
好適な二価置換基は、＝Ｏ、＝Ｓ、＝ＮＮＲ＊２、＝ＮＮＨＣ（Ｏ）Ｒ＊、＝ＮＮＨＣ（Ｏ）ＯＲ＊、＝ＮＮＨＳ（Ｏ）２Ｒ＊、＝ＮＲ＊、＝ＮＯＲ＊、−Ｏ（Ｃ（Ｒ＊２））２−３Ｏ−、又は−Ｓ（Ｃ（Ｒ＊２））２−３Ｓ−、（式中、独立して出現する各Ｒ＊は、水素、以下に定義されるように置換されていてもよいＣ１−６脂肪族、又は、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する非置換の５〜６員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環から選択される）を含む。「置換されていてもよい」基の隣接の置換可能な炭素に結合している好適な二価置換基は、−Ｏ（ＣＲ＊２）２−３Ｏ−、（式中、独立して出現する各Ｒ＊は、水素、以下に定義されるように置換されていてもよいＣ１−６脂肪族、又は、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する非置換の５〜６員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環から選択される）を含む。
【００６７】
Ｒ＊の脂肪族基上の好適な置換基は、ハロゲン、−Ｒ●、−（ハロＲ●）、−ＯＨ、−ＯＲ●、−Ｏ（ハロＲ●）、−ＣＮ、−Ｃ（Ｏ）ＯＨ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ●、−ＮＨ２、−ＮＨＲ●、−ＮＲ●２、又は−ＮＯ２、（式中、各Ｒ●は、非置換の、又は「ハロ」が前に付く場合には１つ若しくは複数のハロゲンでのみ置換され、及び、独立して、Ｃ１−４脂肪族、−ＣＨ２Ｐｈ、−Ｏ（ＣＨ２）０−１Ｐｈ、又は窒素、酸素、若しくは硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する５〜６員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環である）を含む。
【００６８】
いくつかの実施形態では、置換可能な窒素上の好適な置換基は、−Ｒ†、−ＮＲ†２、−Ｃ（Ｏ）Ｒ†、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ†、−Ｃ（Ｏ）Ｃ（Ｏ）Ｒ†、−Ｃ（Ｏ）ＣＨ２Ｃ（Ｏ）Ｒ†、−Ｓ（Ｏ）２Ｒ†、−Ｓ（Ｏ）２ＮＲ†２、−Ｃ（Ｓ）ＮＲ†２、−Ｃ（ＮＨ）ＮＲ†２、又は−Ｎ（Ｒ†）Ｓ（Ｏ）２Ｒ†、（式中、各Ｒ†は、独立して、水素、下記に定義されるように置換されていてもよいＣ１−６脂肪族、非置換−ＯＰｈ、若しくは窒素、酸素、若しくは硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する非置換の５〜６員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環であり、又は、上記の定義にかかわらず、独立して出現する２つのＲ†は、それらの介在する原子と一緒になって、窒素、酸素、若しくは硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する非置換の３〜１２員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール単環式若しくは二環式環を形成する）を含む。
【００６９】
Ｒ†の脂肪族基上の好適な置換基は、独立してハロゲン、−Ｒ●、−（ハロＲ●）、−ＯＨ、−ＯＲ●、−Ｏ（ハロＲ●）、−ＣＮ、−Ｃ（Ｏ）ＯＨ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ●、−ＮＨ２、−ＮＨＲ●、−ＮＲ●２、又は−ＮＯ２、（式中、各Ｒ●は、非置換の、又は「ハロ」が前に付く場合には１つ若しくは複数のハロゲンでのみ置換され、及び、独立して、Ｃ１−４脂肪族、−ＣＨ２Ｐｈ、−Ｏ（ＣＨ２）０−１Ｐｈ、又は窒素、酸素、若しくは硫黄から独立して選択される０〜４個のヘテロ原子を有する５〜６員の、飽和、部分不飽和、若しくはアリール環である）である。
【００７０】
不飽和  本明細書で使用される用語「不飽和」は、部分が１つ又は複数の不飽和単位を有することを意味する。
【００７１】
２．  発明を実施するためのいくつかの形態
ホスホラミダイトには様々な用途があり、例えば、ヌクレオシドホスホラミダイトはオリゴヌクレオチド合成のためのモノマーとして広く使用されている。ホスホラミダイトを調製するための多くの技術には、低い収率及び／又は低い純度の課題がある。とりわけ、このような低い収率及び／又は低い純度は、高コスト及び／又は低品質のホスホラミダイト、並びにその下流のあらゆる産物、例えばそこから調製されるオリゴヌクレオチドをもたらし得る。
【００７２】
とりわけ、本開示は、場合によっては、ホスホラミダイトが、例えばクロマトグラフィーを介して他の物質から分離される場合、低い収率及び／又は低い純度は、精製プロセスに起因する可能性があるという認識を含む。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトの調製におけるクロマトグラフィー精製（例えば、シリカゲル、アルミナ等を用いる精製）を利用する先行技術の問題の１つの原因は、かなりの量のホスホラミダイトがクロマトグラフィーの間に失われ得ることであると本開示は認識している。特定の理論に拘束されることを望まないが、本開示は、場合によっては、ホスホラミダイトが精製媒体へ不可逆的に吸収／吸着、及び／又はクロマトグラフィーの間、精製媒体と接触する場合に分解によって失われ得ることを提示する。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、容易に溶出できないという点で、精製媒体への不可逆的な吸収／吸着によって失われる可能性がある。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、クロマトグラフィー精製中に分解し得る。例えば、実施例に記載されているように、いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、シリカゲルを精製媒体として用いて精製する間に分解する可能性がある。
【００７３】
とりわけ、ホスホラミダイトの低い収率及び／又は低い純度は、それらから製造される組成物のコストを、特に大規模なプロセス規模で大幅に増加させる可能性がある。いくつかの実施形態では、それらがオリゴヌクレオチド合成に使用される場合、ホスホラミダイトのコストが高いため、オリゴヌクレオチド、その組成物、及びその医薬品が異常に高価になる可能性がある。
【００７４】
本開示は、精製媒体を前処理するいくつかのプロセスが、特にホスホラミダイトを調製時に使用する場合、その媒体の有用性及び／又は有効性を驚くほど改善することができることを含むいくつかの驚くべき知見を包含する。いくつかの実施形態では、このようなプロセスは、不活性化プロセスであっても、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、前処理は不活性化プロセスである。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体の不活性化を含む。いくつかの実施形態では、精製媒体が不活性化される場合、このような精製媒体をホスホラミダイトの精製に用いる場合のホスホラミダイトの不可逆的な吸収／吸着及び／又は分解は、同じ不活性化された精製媒体と比較して少ない。いくつかの実施形態では、不可逆的な吸収／吸着は少ない。いくつかの実施形態では、分解は少ない。いくつかの実施形態では、不可逆的な吸収／吸着は少なく、分解も少ない。いくつかの実施形態では、前処理された媒体は、前処理されていない媒体よりもホスホラミダイトの高い収率及び／又は高い純度をもたらす。いくつかの実施形態では、前処理媒体はより高い回復収率をもたらす。いくつかの実施形態では、前処理媒体はより高い純度をもたらす。いくつかの実施形態では、前処理媒体はより高い回復収率及びより高い純度をもたらす。
【００７５】
いくつかの実施形態では、前処理は、精製媒体からの水の除去又は排除であってもよい、又は含んでもよい。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体からの水の除去又は排除を含む。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体から水を除去する。いくつかの実施形態では、前処理は精製媒体から水を排除する。
【００７６】
いくつかの実施形態では、前処理は機械的に実施される。いくつかの実施形態では、精製媒体は熱で前処理される。いくつかの実施形態では、精製媒体は真空で前処理される。いくつかの実施形態では、精製媒体は熱及び真空で前処理される。いくつかの実施形態では、このような機械的な前処理は精製媒体を不活性化する。当業者であれば認識するように、熱及び／又は真空は、とりわけ、本開示に従って、精製媒体から水又は他の溶媒を除去することができる。いくつかの実施形態では、加熱は、少なくとも５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２５０、３００、４００、又は５００℃の温度に達する。いくつかの実施形態では、真空は５０ｋＰａ、４０ｋＰａ、３０ｋＰａ、２０ｋＰａ、１０ｋＰａ、５ｋＰａ、２ｋＰａ、１ｋＰａ、０．５ｋＰａ、０．２ｋＰａ、０．１ｋＰａ、５０Ｐａ、４０Ｐａ、３０Ｐａ、２０Ｐａ、１０Ｐａ、５Ｐａ、２Ｐａ、１Ｐａ、０．５Ｐａ、０．２Ｐａ、０．１Ｐａ、０．０５Ｐａ、０．０２Ｐａ、又は０．０１Ｐａ以下である。いくつかの実施形態では、処理は長期間である。いくつかの実施形態では、処理は、５分、１０分、３０分、１時間、２時間、４時間、６時間、１０時間、１２時間、１６時間、２４時間、３６時間、４８時間、又はそれ以上続く。
【００７７】
いくつかの実施形態では、精製媒体は第１の溶媒系で前処理される。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒である、又は含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒系である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒系は、本開示に記載の第１の溶媒系である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒は吸湿性溶媒である。いくつかの実施形態では、媒体を第１の溶媒系と接触させることにより精製媒体を不活性化させる。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は水溶性溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は水溶性有機溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は水溶性溶媒である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は水溶性有機溶媒である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は２つ以上の溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は２つ以上の水溶性溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は２つ以上の水溶性有機溶媒を含む。例示的な水溶性有機溶媒としては、アセトアルデヒド、酢酸、アセトン、アセトニトリル、１，２−ブタンジオール、１，３−ブタンジオール、１，４−ブタンジオール、２−ブトキシエタノール、酪酸、ジエタノールアミン、ジエチレントリアミン、ジメチルホルムアミド、ジメトキシエタン、ジメチルスルホキシド、１，４−ジオキサン、エタノール、エチルアミン、エチレングリコール、ギ酸、フルフリルアルコール、グリセロール、メタノール、メチルジエタノールアミン、メチルイソシアニド、１−プロパノール、１，３−プロパンジオール、１，５−ペンタンジオール、２−プロパノール、プロパン酸、プロピレングリコール、ピリジン、テトラヒドロフラン、トリエチレングリコール等が挙げられる。
【００７８】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は吸湿性溶媒である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は、２つ以上の吸湿性溶媒、例えば、２つ以上の吸湿性溶媒の混合物である吸湿性溶媒系を含み、吸湿性溶媒系は、２つ以上の吸湿性溶媒及び１つ又は複数の乾燥、非吸湿性溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の吸湿性溶媒は水溶性溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は水溶性有機溶媒である。いくつかの実施形態では、当業者が認識するように、吸湿性溶媒系は、その環境から水を吸収することができ、例えば、精製媒体と接触する場合、吸湿性溶媒系は、精製媒体から水がある場合には水を吸収することができる。精製媒体で充填した固定相としてのカラムを通す場合、吸湿性溶媒は精製媒体から水を除去することができる。いくつかの実施形態では、不活性化のために使用される吸湿性溶媒は、０．５体積％、０．４体積％、０．３体積％、０．２体積％、０．１体積％、０．０９体積％、０．０８体積％、０．０７体積％、０．０６体積％、０．０５体積％、０．０４体積％、０．０３体積％、０．０２体積％、０．０１体積％、０．００９体積％、０．００８体積％、０．００７体積％、０．００６体積％、０．００５体積％、０．００４体積％、０．００３体積％、０．００２体積％、０．００１体積％、０．０００９体積％、０．０００８体積％、０．０００７体積％、０．０００６体積％、０．０００５体積％、０．０００４体積％、０．０００３体積％、０．０００２体積％、又は０．０００１体積％以下の水を含み得る。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒が、商用ベンダー（例えばＳｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ａｃｒｏｓ  Ｏｒｇａｎｉｃｓ等）から直接購入される無水溶媒として使用される。代替的に又は追加的に、当該分野で公知のプロトコルに従って、吸湿性溶媒を更に精製及び／又は乾燥することができる。
【００７９】
本開示に従って、多くの吸湿性溶媒を、提供された溶媒系、例えば、第１の溶媒系、吸湿性溶媒系等で使用することができる。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はアルコールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はメタノールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はエタノールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はイソプロピルアルコールである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はアセトンある。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はアセトニトリルある。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はジメチルカーボネートである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒はエチルアセテートである。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、クロロホルムよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、塩化メチレンよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、エチルアセテートよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、アセトンよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、アセトニトリルよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、ジメチルカーボネートよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、メタノールよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、エタノールよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、イソプロパノールよりもより吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、クロロホルムと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、塩化メチレンと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、エチルアセテートと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、アセトンと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、アセトニトリルと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、ジメチルカーボネートと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、メタノールと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、エタノールと同等の吸湿性の溶媒である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶媒は、イソプロパノールと同等の吸湿性の溶媒である。
【００８０】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアルコールである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアルコール及び別の有機溶媒を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のアルコールを含む。いくつかの実施形態では、アルコールはＣ１−６アルコールである。いくつかの実施形態では、アルコールはメタノールである。いくつかの実施形態では、アルコールはエタノールである。いくつかの実施形態では、アルコールはイソプロパノールである。いくつかの実施形態では、アルコールは１−プロパノールである。いくつかの実施形態では、アルコールはブタノールである。
【００８１】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はメタノールである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のメタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はメタノールである。
【００８２】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はエタノールである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のエタノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はエタノールである。
【００８３】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は１−プロパノールである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％の１−プロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は１−プロパノールである。
【００８４】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はイソプロパノールである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のイソプロパノールを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はイソプロパノールである。
【００８５】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアセトンである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のアセトンを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアセトンである。
【００８６】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアセトニトリルである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のアセトニトリルを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はアセトニトリルである。
【００８７】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はジメチルカーボネートである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のジメチルカーボネートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はジメチルカーボネートである。
【００８８】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はエチルアセテートである。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも１０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも２０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも３０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも４０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも５０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも６０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも７０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも８０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９０体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９５体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９６体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９７体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９８体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は少なくとも９９体積％のエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系はエチルアセテートである。
【００８９】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒は吸湿性である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒は吸湿性溶媒を含むという点で吸湿性である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒は吸湿性溶媒であるという点で吸湿性である。いくつかの実施形態では、第１の溶媒は吸湿性溶液であるという点で吸湿性である。いくつかの実施形態では、吸湿性溶液は有機溶媒及び吸湿性溶質を含む。
【００９０】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は場合によっては修飾剤を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は修飾剤を含む。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は修飾剤を全く含まない。
【００９１】
当業者は、多くの移動相修飾剤が、例えば、溶媒系の特定の特性を移動相として改変するために、本開示に従って利用され得ることを認識する。いくつかの実施形態では、修飾剤は塩基である。いくつかの実施形態では、修飾剤はアンモニアである。いくつかの実施形態では、修飾剤はトリエチルアミンである。いくつかの実施形態では、修飾剤は酸である。いくつかの実施形態では、修飾剤はギ酸である。修飾剤は、様々な量、例えば約０．０５体積％、０．１体積％、０．２体積％、０．３体積％、０．４体積％、０．５体積％、０．６体積％、０．７体積％、０．８体積％、０．９体積％、１体積％、１．５体積％、２体積％、２．５体積％、３体積％、３．５体積％、４体積％、４．５体積％、５体積％、６体積％、７体積％、８体積％、９体積％、１０体積％、２０体積％、３０体積％、４０体積％、５０体積％、又はこれ以上で添加され得る。
【００９２】
いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は精製媒体から水を除去する。いくつかの実施形態では、第１の溶媒は、精製媒体の反応部位と反応し、精製媒体を不活性化すると、化合物、例えばホスホラミダイトは、精製媒体と接触する場合に分解しにくい。いくつかの実施形態では、第１の溶媒系は、熱により前処理をもたらし得る。例えば、メタノールをシリカゲルと接触させる場合、熱を発生し得る。
【００９３】
当業者であれば、提供される方法に従って精製媒体を前処理するために様々な手順を使用することができることを認識するであろう。例えば、第１の溶媒系を、精製媒体で充填した固定相としてのカラムを通して、固定相を前処理することができる。いくつかの実施形態では、カラム容積の１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０倍又はそれ以上の第１溶媒系を、カラムを通して、精製媒体を前処理する。
【００９４】
いくつかの実施形態では、クロマトグラフィーの間に精製媒体を劣化させる、さもなければ損傷させる又は押し流すと以前は理解されていた又は予想されていたプロセスを含む提供される前処理プロセスにより、実際にこのような媒体の有用性及び／又は有効性を、特にホスホラミダイトの精製及び／又は調製において、改善することができることを本開示は説明する。例えば、本開示の時点では、高い割合の特定のアルコール、例えばメタノールは、特定の精製媒体、例えばシリカゲルで充填したカラムを通すべきではないことが一般的に教示されている。しかし、本開示によって例示されるように、純粋なメタノールは、シリカカラムを通過させることができ、メタノールで前処理されたシリカは、前処理されていないシリカと比較して予想外に高い収率及び／又は高い純度のホスホラミダイトをもたらすことができる。
【００９５】
いくつかの実施形態では、提供される方法は、前処理プロセス後の平衡化プロセスを含む。いくつかの実施形態では、平衡化プロセスは前処理された精製媒体を第２の溶媒系と接触させることを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系は、精製媒体を前処理するために使用される第１の溶媒系よりも極性が小さい。
【００９６】
いくつかの実施形態では、第２の溶媒系は、１つの溶媒と場合により修飾剤とからなる。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系は、２つ以上の溶媒と場合により修飾剤とを含む。いくつかの実施形態では、修飾剤は塩基である。いくつかの実施形態では、修飾剤はトリエチルアミンである。
【００９７】
いくつかの実施形態では、第２の溶媒系は、平衡化プロセス中にアイソクラティック系を含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系は、平衡化プロセス中にアイソクラティックである。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はグラジエント系を含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はグラジエント系である。いくつかの実施形態では、平衡化プロセスは、第１のアイソクラティックプロセス、グラジエントプロセス、及び場合により第２のアイソクラティックプロセスを含む。いくつかの実施形態では、グラジエントプロセスは、第１のアイソクラティックプロセスから始まり、第２のアイソクラティックプロセスで終了する。いくつかの実施形態では、第２のアイソクラティックプロセスは、例えばエチルアセテート／ヘキサン系の場合に、その中により多くのエチルアセテートを含む第１のプロセスより大きい極性の溶媒系を使用する。いくつかの実施形態では、第２のアイソクラティックプロセスは、例えばエチルアセテート／ヘキサン系の場合に、その中により少ないエチルアセテートを含む第１のプロセスより小さい極性の溶媒系を使用する。いくつかの実施形態では、第１のアイソクラティックプロセスは、平衡化のために第１の溶媒系と同じ溶媒システムを使用する。
【００９８】
いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はエチルアセテート及び修飾剤としてトリエチルアミンを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はヘキサンを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はヘキサン及び修飾剤としてトリエチルアミンを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はヘキサン及びエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はヘキサン及びエチルアセテートの混合物である。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンを含む。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンの混合物である。いくつかの実施形態では、第２の溶媒系は５％トリエチルアミンを含むエチルアセテート／ヘキサン中の２０％エチルアセテートである。
【００９９】
当業者は、精製媒体を平衡化させるために様々な方法を使用できることを認識している。いくつかの実施形態では、精製媒体で充填した固定相としてのカラムでは、前処理された精製媒体の平衡化のために、カラム容積の約０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、６、７、８、９、１０倍、又はそれ以上の（アイソクラティック及び／又はグラジエントを含む）第２の溶媒系を、カラムを通す。
【０１００】
いくつかの実施形態では、平衡化プロセスの後、ホスホラミダイトを前処理された及び平衡化させた精製媒体に充填し、第３の溶媒系を利用してホスホラミダイトを溶出、分離及び／又は精製する。当業者は、多くの好適な溶媒系を本開示に従って第３の溶媒系として用いることができることを認識している。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、第１の溶媒系より極性が小さい。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、平衡化では第２の溶媒系と同じである。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、平衡化プロセスの終了時では第２の溶媒系と同じである。
【０１０１】
いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、１つの溶媒と場合により修飾剤とからなる。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、２つ以上の溶媒及び場合により修飾剤を含む。いくつかの実施形態では、修飾剤は塩基である。いくつかの実施形態では、修飾剤はトリエチルアミンである。
【０１０２】
いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、溶出プロセス中にアイソクラティック系を含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系は、溶出プロセス中にアイソクラティックである。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はグラジエント系を含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はグラジエント系である。いくつかの実施形態では、溶出プロセスは、第１のアイソクラティックプロセス、グラジエントプロセス、及び場合により第２のアイソクラティックプロセスを含む。いくつかの実施形態では、グラジエントプロセスは、第１のアイソクラティックプロセスから始まり、第２のアイソクラティックプロセスで終了する。いくつかの実施形態では、第２のアイソクラティックプロセスは、例えばエチルアセテート／ヘキサン系の場合により多くのエチルアセテートを含む第１のプロセスより大きい極性の溶媒系を使用する。いくつかの実施形態では、第１のアイソクラティック溶出プロセスは、平衡化プロセスの最後では溶媒系と同じ溶媒系を使用する。いくつかの実施形態では、溶出プロセスは、実施例に例示するように、２つ以上の第１のアイソクラティック−グラジエント−第２のアイソクラティックプロセスを含む。
【０１０３】
いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はエチルアセテート及び修飾剤として塩基を含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はエチルアセテート及び修飾剤としてアミンを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はエチルアセテート及び修飾剤としてトリエチルアミンを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はヘキサンを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はヘキサン及び修飾剤としてトリエチルアミンを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はヘキサン及びエチルアセテートを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はヘキサン及びエチルアセテートの混合物である。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンを含む。いくつかの実施形態では、第３の溶媒系はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンの混合物である。溶出のための例示的な溶媒系を実施例に例示する。
【０１０４】
当業者は、ホスホラミダイトを溶出、分離及び／又は精製するために様々な方法を使用することができることを認識している。いくつかの実施形態では、精製媒体を充填した固定相としてのカラムでは、カラム容積の約０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００倍、又はそれ以上の（アイソクラティック及び／又はグラジエントを含む）第３の溶媒系を、カラムを通す。
【０１０５】
当業者は、本開示に従って様々な精製媒体を、ホスホラミダイトの精製に使用することができ、ホスホラミダイトの収率及び／又は純度を改善する提供される方法を用いて前処理、平衡化及び／又は溶出することができることを認識する。いくつかの実施形態では、精製媒体はシリカ媒体である。いくつかの実施形態では、精製媒体はシリカゲルである。いくつかの実施形態では、精製媒体はアルミナである。いくつかの実施形態では、精製媒体は塩基性アルミナである。いくつかの実施形態では、精製媒体を、精製以外の他の目的のために使用することができる。
【０１０６】
様々な粒子径の精製媒体を、本開示に従って前処理して利用することができる。いくつかの実施形態では、粒子径は直径約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００マイクロメータ、又はそれ以上である。いくつかの実施形態では、粒子径は直径約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、又は２００マイクロメータ未満である。いくつかの実施形態では、粒子径は直径約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、又は２００マイクロメータより大きい。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約１０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約１５マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約２０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約２５マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約３０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約３５マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約４０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約４５マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約５０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約６０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約７０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約８０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約９０マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約１００マイクロメータのシリカである。いくつかの実施形態では、精製媒体は直径約１００マイクロメータより大きいシリカである。
【０１０７】
いくつかの実施形態では、精製媒体は真空でカラム中に充填される。いくつかの実施形態では、精製媒体はシリカゲルである。いくつかの実施形態では、数カラム容量のメタノールを、カラムを通してシリカゲルを不活性化させる。いくつかの実施形態では、未処理のホスホラミダイトを装填する前に、数カラム容積の、修飾剤としてトリエチルアミンを加えたエチルアセテートとヘキサンとの混合物を使用して、処理されたシリカゲルを平衡化させる。いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、修飾剤としてトリエチルアミンを加えたエチルアセテートとヘキサンとの混合物を用いて溶出される。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に記載の前処理された精製媒体、及びホスホラミダイトを含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に記載の前処理された、平衡化された精製媒体、及びホスホラミダイトを含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、精製媒体はシリカゲルである。いくつかの実施形態では、シリカゲルはアルコールで前処理される。いくつかの実施形態では、シリカゲルはメタノールで前処理される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは、ヘキサンを含む溶媒系で平衡化される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは、エチルアセテートを含む溶媒系で平衡化される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは、エチルアセテート及びヘキサンを含む溶媒系で平衡化される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは、エチルアセテートとヘキサンとからなる溶媒系で平衡化される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは、エチルアセテート、ヘキサン、及びトリエチルアミンを含む溶媒系で平衡化される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは、エチルアセテート、ヘキサン、及びトリエチルアミンからなる溶媒系で平衡化される。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はヘキサンとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はエチルアセテートとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はトリエチルアミンとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はヘキサン及びエチルアセテートとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はヘキサン及びトリエチルアミンとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はエチルアセテート及びトリエチルアミンとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンとの接触を含む。いくつかの実施形態では、シリカゲルは平衡化され、平衡化はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンとの接触からなる。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトはヌクレオシドホスホラミダイトである。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは式Ｉ：
【化２】
2019510087.tif 000004
（式中、
ＢＡは、Ｒであるか、又は３〜３０員脂環式環、６〜３０員アリール環、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリル、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、天然核酸塩基部分、並びに修飾された核酸塩基部分、から選択される置換されていてもよい基であり；
ＳＵは、糖部分、修飾された糖部分、−Ｌ−Ｏ−、又は、
【化３】
2019510087.tif 000005
であり、ＳＵは酸素原子を介して式Ｉ中のリン原子に結合し；
Ｌは、共有結合であるか、又はＣ１−３０脂肪族、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族基、から選択される二価の、置換されていてもよい、直鎖状若しくは分枝状の基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、独立して置き換えられていてもよく；
Ｒ５ｓは、Ｒ’又は−ＯＲ’であり；
Ｒ２ｓは、−Ｆ、−ＣＮ、−Ｎ３、−ＮＯ、−ＮＯ２、−Ｒ’−ＯＲ’、−ＳＲ’、−Ｎ（Ｒ’）２、−Ｌ−Ｒ’、−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’、−Ｏ−Ｌ−ＳＲ’、若しくは−Ｏ−Ｌ−Ｎ（Ｒ’）２であり、又は、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４若しくはＣ５とを結合するＬであり；
−Ｃｙ−は、３〜３０員カルボシクリレン、６〜３０員アリーレン、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリーレン、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリレン、から選択される置換されていてもよい二価の環であり；
Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３のそれぞれは、独立してＲ’である、又はＲ１、Ｒ２及びＲ３の２つ若しくは３つは、それらの介在する原子と一緒になって、：を形成し；
【化４】
2019510087.tif 000006
環Ａは、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環であり；
それぞれのＲｓは独立してＲ’又は−Ｌ−Ｒ’であり；
ｔは０〜５であり；
それぞれのＲ’は独立して−Ｒ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ、−ＣＯ２Ｒ、若しくは−ＳＯ２Ｒである、又は：
２つ以上のＲ’は、それらの介在する原子と一緒になって、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環を形成し；
各Ｒは、独立して、水素であるか、又は、Ｃ１−３０脂肪族、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族、６−３０員アリール環酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員複素環式環、から選択される置換されていてもよい基である）の構造を有する。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは式Ｉ：
【化５】
2019510087.tif 000007
（式中、
ＢＡは、Ｃ１−３０脂環式、Ｃ６−３０アリール、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ３−３０ヘテロシクリル、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ５−３０ヘテロアリール環、天然核酸塩基部分、並びに修飾された核酸塩基部分、から選択される置換されていてもよい基であり；
ＳＵは、−Ｌ−Ｏ−、又は
【化６】
2019510087.tif 000008
であり、ＳＵは酸素原子を介して式Ｉのリン原子に結合し；
Ｌは、共有結合であるか、又はＣ１−３０脂肪族、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族基、から選択される二価の、置換されていてもよい、直鎖状若しくは分枝状の基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、独立して置き換えられていてもよく；
Ｒ５ｓは、Ｒ’又は−ＯＲ’であり；
Ｒ２ｓは、−Ｆ、−ＣＮ、−Ｎ３、−ＮＯ、−ＮＯ２、−Ｒ’−ＯＲ’、−ＳＲ’、−Ｎ（Ｒ’）２、−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’、−Ｏ−Ｌ−ＳＲ’、若しくは−Ｏ−Ｌ−Ｎ（Ｒ’）２であり、又は、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、若しくはＣ５とを結合するＬであり；
−Ｃｙ−は、３〜３０員カルボシクリレン、６〜３０員アリーレン、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリーレン、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリレン、から選択される置換されていてもよい二価の環であり；
Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３のそれぞれは、独立してＲ’である、又はＲ１、Ｒ２及びＲ３の２つ若しくは３つは、それらの介在する原子と一緒になって、：を形成し；
【化７】
2019510087.tif 000009
環Ａは、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環であり；
それぞれのＲｓは独立してＲ’又は−Ｌ−Ｒ’であり；
ｔは０〜５であり；
それぞれのＲ’は独立して−Ｒ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ、−ＣＯ２Ｒ、若しくは−ＳＯ２Ｒである、又は：
２つ以上のＲ’は、それらの介在する原子と一緒になって、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環を形成し；
各Ｒは、独立して、水素であるか、又は、Ｃ１−３０脂肪族、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族、Ｃ６−３０アリール、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員複素環式環、から選択される置換されていてもよい基である）の構造を有する。
【０１１２】
いくつかの実施形態では、ＢＡは、３〜３０員脂環式環、６〜３０員アリール環、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリル、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、天然核酸塩基部分、及び修飾された核酸塩基部分、から選択される置換されていてもよい基である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよいＣ１−３０脂環式である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよいＣ６−３０アリールである。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい３〜３０員ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよいＣ３−３０ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリールである。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよいＣ５−３０ヘテロアリールである。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい天然塩基部分である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい修飾された塩基部分である。いくつかの実施形態では、ＢＡは、Ｃ１−３０脂環式、Ｃ６−３０アリール、Ｃ３−３０ヘテロシクリル、及びＣ５−３０ヘテロアリールから選択される置換されていてもよい基である。いくつかの実施形態では、ＢＡは、Ｃ１−３０脂環式、Ｃ６−３０アリール、Ｃ３−３０ヘテロシクリル、Ｃ５−３０ヘテロアリール、及び天然核酸塩基部分から選択される置換されていてもよい基である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよいＡ、Ｔ、Ｃ、又はＧである。いくつかの実施形態では、ＢＡはＡ、Ｔ、Ｃ、Ｇ、又は５−ｍＣである。
【０１１３】
いくつかの実施形態では、ＢＡは芳香環を介してＳＵに結合する。いくつかの実施形態では、ＢＡはヘテロ原子を介してＳＵに結合する。いくつかの実施形態では、ＢＡは芳香環の環ヘテロ原子を介してＳＵに結合する。いくつかの実施形態では、ＢＡは芳香環の環窒素原子を介してＳＵに結合する。いくつかの実施形態では、結合は天然ヌクレオシドに見られるものと同様である。
【０１１４】
いくつかの実施形態では、ＢＡは天然核酸塩基部分である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい天然核酸塩基部分である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換天然核酸塩基部分である。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、ＢＡは、置換されていてもよい基であり、この基は、  
【化８】
2019510087.tif 000010
及び
【化９】
2019510087.tif 000011
から−Ｈを除去することによって形成される。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい基であり、この基は、
【化１０】
2019510087.tif 000012
及び
【化１１】
2019510087.tif 000013
から選択される。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい基であり、この基は、
【化１２】
2019510087.tif 000014
2019510087.tif 000015
及び
【化１３】
2019510087.tif 000016
から−Ｈを除去することによって形成される。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよい基であり、この基は、
【化１４】
2019510087.tif 000017
及び
【化１５】
2019510087.tif 000018
から選択される。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、ＢＡは、
【化１６】
2019510087.tif 000019
又は
【化１７】
2019510087.tif 000020
である。いくつかの実施形態では、ＢＡは置換されていてもよいグアニン残基であり、Ｏ６位は保護されていない。
【０１１７】
当業者は、様々な修飾された核酸塩基が、本開示に従って式Ｉに適していることを認識する。例示的な修飾された塩基としては、国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載されたものが挙げられるが、これらに限定されない。これらの各々の修飾された核酸塩基は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、ＢＡは置換核酸塩基であり、ホスホラミダイトは１つ又は複数の保護基で適切に保護され、オリゴヌクレオチド合成に使用されることができる。核酸塩基のための好適な保護基は当技術分野で広く知られており、オリゴヌクレオチド合成に有用な保護基を含み、本開示に従って使用されることができる。いくつかの実施形態では、保護基は、アセチル（Ａｃ）、フェニルアセチル、ベンゾイル（Ｂｚ）、イソブチリル（ｉＢｕ）、フェノキシアセチル（Ｐａｃ）、イソプロピル−Ｐａｃ、ｔｅｒｔブチル−Ｐａｃ、アルキル−Ｐａｃ、ジメチルホルムアミジン（ＤＭＦ）、又はジアルキルホルムアミジンである。いくつかの実施形態では、保護基はフタルイミド、９−フルドレニルメトキシカルボニル（ＦＭＯＣ）、トリフェニルメチルスルフェニル、ｔ−ＢＯＣ、４，４’−ジメトキシトリチル（ＤＭＴｒ）、４−メトキシトリチル（ＭＭＴｒ）、９−フェニルキサンチン−９−イル（Ｐｉｘｙｌ）、トリチル（Ｔｒ）、又は９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンチン−９−イル（ＭＯＸ）である。更なる好適な保護基については、Ｇｒｅｅｎ  ａｎｄ  Ｗｕｔｓ，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ  Ｇｒｏｕｐｓ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２ｎｄ  Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９９１、並びに、国際特許公開第２０１１／００５７６１号、国際特許公開第２０１３／０１２７５８号、国際特許公開第２０１４／０１２０８１号、国際特許公開第２０１５／１０７４２５号、国際特許公開第２０１０／０６４１４６号、国際特許公開第２０１４／０１０２５０号、国際特許公開第２０１１／１０８６８２号、国際特許公開第２０１２／０３９４４８号、及び国際特許公開第２０１２／０７３８５７号を参照のこと。これらの各々の保護基は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、ＳＵはオリゴヌクレオチドにおいて使用される糖部分である。いくつかの実施形態では、ＳＵはオリゴヌクレオチドにおいて使用される修飾された糖部分である。いくつかの実施形態では、ＳＵは天然ヌクレオシドの糖部分である。いくつかの実施形態では、ＳＵは天然ヌクレオシドに見られる置換されていてもよい糖部分である。いくつかの実施形態では、ＳＵは天然ヌクレオシドに見られる修飾された糖部分であり、２’位が修飾されている。いくつかの実施形態では、ＳＵは天然ヌクレオシドに見られる修飾された糖部分であり、２’位は、２’−Ｈ及び／又は２’−ＯＨをＲ２ｓで置換することによって修飾される。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｈではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＨではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｈでもなく、−ＯＨでもない。
【０１２０】
いくつかの実施形態では、ＳＵは、−Ｌ−Ｏ−である。いくつかの実施形態では、Ｌは、−Ｃｙ−である。いくつかの実施形態では、Ｌは置換されていてもよい３〜３０員カルボシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは置換されていてもよい６〜３０員アリーレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリーレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリーレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい３〜３０員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい３〜３０員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは１個の酸素原子を有する、置換されていてもよい５〜１０員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは１個の酸素原子を有する、置換されていてもよい５員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは１個の酸素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは１個又は２個の酸素原子を有する、置換されていてもよい５〜１０員二環式ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは１個又は２個の酸素原子を有する、置換されていてもよい７〜１０員二環式ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは２個の酸素原子を有する、置換されていてもよい７〜１０員二環式ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、Ｌは２個の酸素原子を有する、置換されていてもよい７員二環式ヘテロシクリレンである。
【０１２１】
いくつかの実施形態では、ＳＵはオリゴヌクレオチド合成において使用される糖部分である。提供される技術がホスホラミダイトの調製に利用される場合、様々な糖部分を有するホスホラミダイトは、改善された収率及び／又は純度によって恩恵を受けることができることを当業者は理解する。いくつかの実施形態では、ＳＵは、置換されていてもよい飽和単環式、二環式、又は多環式の飽和脂肪族環であり、１つ又は複数のメチレン単位が−Ｏ−で置換されている。いくつかの実施形態では、ＳＵは、天然ＤＮＡ又はＲＮＡ分子に見られるリボース又はデオキシリボース部分である。
【０１２２】
いくつかの実施形態では、ＳＵは、
【化１８】
2019510087.tif 000021
である。いくつかの実施形態では、ＳＵは構造：
【化１９】
2019510087.tif 000022
（式中、Ｒ５ｓは−ＯＲ’であり；及びＲ２ｓは−Ｆ、−ＣＮ、−Ｎ３、−ＮＯ、−ＮＯ２、−Ｒ’、−ＯＲ’、−ＳＲ’、−Ｎ（Ｒ’）２、−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’、−Ｏ−Ｌ−ＳＲ’、若しくは−Ｏ−Ｌ−Ｎ（Ｒ’）２であり；又は、Ｒ２ｓはＣ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、若しくはＣ５とを結合するＬである）を有する修飾された糖部分である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｈである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｆである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＭｅである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＭｅである。
【０１２３】
いくつかの実施形態では、修飾された糖は、以下の：−Ｆ、−ＣＮ、−Ｎ３、−ＮＯ、−ＮＯ２、−ＯＲ’、−ＳＲ’、又は−Ｎ（Ｒ’）２、（式中、各Ｒ’は、上記に定義され、本明細書に記載されるように独立している）；−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキル）、−Ｓ−（Ｃ１−１０アルキル）、−ＮＨ−（Ｃ１−１０アルキル）、若しくは−Ｎ（Ｃ１−１０アルキル）２；−Ｏ−（Ｃ２−１０アルケニル）、−Ｓ−（Ｃ２−１０アルケニル）、−ＮＨ−（Ｃ２−１０アルケニル）、若しくは−Ｎ（Ｃ２−１０アルケニル）２；−Ｏ−（Ｃ２−１０アルキニル）、−Ｓ−（Ｃ２−１０アルキニル）、−ＮＨ−（Ｃ２−１０アルキニル）、若しくは−Ｎ（Ｃ２−１０アルキニル）２；又は−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキレン）−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキル）、−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキレン）−ＮＨ−（Ｃ１−１０アルキル）、若しくは−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキレン）−ＮＨ（Ｃ１−１０アルキル）２、−ＮＨ−（Ｃ１−１０アルキレン）−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキル）、又は−Ｎ（Ｃ１−１０アルキル）−（Ｃ１−１０アルキレン）−Ｏ−（Ｃ１−１０アルキル）（式中、アルキル、アルキレン、アルケニル、及びアルキニルは置換若しくは非置換であってもよい）、のうちの１つを含む１つ又は複数の置換基（例えば、Ｒ２ｓ）を２’位に含む。置換基の例としては、−Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＣＨ３及び−Ｏ（ＣＨ２）ｎＮＨ２（式中、ｎは１〜約１０である）、ＭＯＥ、ＤＭＡＯＥ、並びにＤＭＡＥＯＥが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１２４】
本明細書ではまた、国際特許公開第２００１／０８８１９８号、及びＭａｒｔｉｎら、Ｈｅｌｖ，Ｃｈｉｍ，Ａｃｔａ，１９９５，７８，４８６−５０４に記載されている修飾された糖が考えられる。いくつかの実施形態では、修飾された糖は、置換シリル基、ＲＮＡ切断基、レポーター基、蛍光標識、インターカレーター、核酸の薬物動態特性を改善するための基、核酸の薬力学的特性を改善するための基、又は同様の特性を有する他の置換基から選択される１つ又は複数の基を含む。いくつかの実施形態では、修飾は、３’−末端ヌクレオチドの糖の３’位又は５’−末端ヌクレオチド５’位を含む、糖又は修飾された糖の２’、３’、４’、５’、又は６’位の１つ又は複数において修飾が行われる。
【０１２５】
修飾された糖は、ロックド核酸（ＬＮＡ）を含む。いくつかの実施形態では、糖炭素原子上の２つの置換基が一緒になって二価部分を形成する。いくつかの実施形態では、２つの置換基は、２個の異なる糖炭素原子上にある。いくつかの実施形態では、形成された二価部分は、本明細書で定義される−Ｌ−の構造を有する。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｌ−である。いくつかの実施形態では、−Ｌ−は−Ｏ−ＣＨ２−であり、−ＣＨ２−は置換されていてもよい。いくつかの実施形態では、−Ｌ−は−Ｏ−ＣＨ２−である。いくつかの実施形態では、−Ｌ−は−Ｏ−ＣＨ（Ｅｔ）−である。いくつかの実施形態では、−Ｌ−は（Ｓ）−ｃＥｔである。いくつかの実施形態では、−Ｌ−は糖部分のＣ２とＣ４との間にある。いくつかの実施形態では、ロックド核酸は、以下に示す構造を有する。ロックド核酸の構造を以下に示す。Ｂａは本明細書に記載の核酸塩基又は修飾された核酸塩基を表し、Ｒ２ｓは−ＯＣＨ２Ｃ４’−である。
【化２０】
2019510087.tif 000023
【０１２６】
いくつかの実施形態では、修飾された糖は、例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ａｍ  Ｃｈｅｍ  Ｓｏｃ．２０１０  Ｏｃｔｏｂｅｒ  ２７；１３２（４２）：１４９４２−１４９５０に記載されているようなＥＮＡである。いくつかの実施形態では、修飾された糖は、ＸＮＡ（ゼノ核酸）、例えば、アラビノース、アンヒドロヘキシトール、トレオース、２’−フルオロアラビノース、又はシクロヘキセンに見られる糖のいずれかである。
【０１２７】
修飾された糖は、ペントフラノシル糖の代わりに糖模倣物、例えばシクロブチル又はシクロペンチル部分等を含む。このような修飾された糖の構造の調製を教示する代表的な米国特許は、米国特許第４，９８１，９５７号、５，１１８，８００号、５，３１９，０８０号、及び５，３５９，０４４号であるが、これらに限定されない。考慮されるいくつかの修飾された糖は、リボース環内の酸素原子が窒素、硫黄、セレン、又は炭素で置換される糖を含む。いくつかの実施形態では、修飾された糖は、リボース環内の酸素原子が窒素で置換される修飾されたリボースであり、窒素はアルキル基（例えば、メチル、エチル、イソプロピル等）で置換されていてもよい。
【０１２８】
いくつかの実施形態では、糖部分中の１つ又は複数のヒドロキシル基は、ハロゲン、−Ｒ’、−Ｎ（Ｒ’）２、−ＯＲ’、又は−ＳＲ’で任意に独立して置き換えられていてもよい、（式中、各Ｒ’は、上記に定義され、本明細書に記載されるように独立している）。
【０１２９】
いくつかの実施形態では、ＳＵは、
【化２１】
2019510087.tif 000024
である。いくつかの実施形態では、ＳＵは、
【化２２】
2019510087.tif 000025
である。いくつかの実施形態では、ＳＵは、
【化２３】
2019510087.tif 000026
である。
【０１３０】
いくつかの実施形態では、Ｌは共有結合である。いくつかの実施形態では、Ｌは共有結合ではない。いくつかの実施形態では、Ｌは、Ｃ１−３０脂肪族基、及び酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族基、から選択される二価の、置換されていてもよい、直鎖状若しくは分枝状の基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、任意に独立して置き換えられていてもよい。いくつかの実施形態では、Ｌは、二価の、置換されていてもよい、直鎖状又は分枝状のＣ１−３０脂肪族基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、任意に独立して置き換えられていてもよい。いくつかの実施形態では、Ｌは、二価の、置換されていてもよい、直鎖状又は分枝状のＣ１−３０ヘテロ脂肪族基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、任意に独立して置き換えられていてもよい。いくつかの実施形態では、Ｌは、二価の、置換されていてもよい直鎖又は分枝鎖Ｃ１−３０ヘテロ脂肪族基である。いくつかの実施形態では、Ｌは１つ又は複数のＳｉを含む。
【０１３１】
いくつかの実施形態では、Ｒ５ｓは、Ｒ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ５ｓは、−ＯＲ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ５ｓは、オリゴヌクレオチド合成に好適な保護されたヒドロキシル基である。いくつかの実施形態では、Ｒ５ｓは、ＤＭＴｒＯ−である。本開示に従って使用の例示的な保護基は、当該分野において広く知られている。更なる例は、Ｇｒｅｅｎｅ，Ｔ．Ｗ．，Ｗｕｔｓ，Ｐ．Ｇ．Ｍ．Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ  Ｇｒｏｕｐｓ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２ｎｄ  ｅｄ．，Ｗｉｌｅｙ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９９１、及び国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号を参照のこと。これらの各々の保護基は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１３２】
いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｆである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＣＮである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｎ３である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＮＯである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＮＯ２である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｒ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＲ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＲ’であり、Ｒ’は置換されていてもよいＣ１−６脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＭｅである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＳＲ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｎ（Ｒ’）２である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｏ−（置換されていてもよいＣ１−６アルキレン）−ＯＲ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｏ−（置換されていてもよいＣ１−６アルキレン）−ＯＲ’であり、Ｒ’は置換されていてもよいＣ１−６アルキルである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＭｅである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｏ−Ｌ−ＳＲ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｏ−Ｌ−Ｎ（Ｒ’）２である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、又はＣ５とを結合するＬである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１とを結合するＬである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ２とを結合するＬである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ３とを結合するＬである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ４とを結合するＬである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ５とを結合するＬである。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、（Ｃ２）−Ｏ−（置換されていてもよいメチレン）−（Ｃ４）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、（Ｃ２）−Ｏ−（メチレン）−（Ｃ４）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、（Ｃ２）−Ｏ−（エチルメチレン）−（Ｃ４）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、（Ｃ２）−Ｏ−（（Ｒ）−エチルメチレン）−（Ｃ４）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、（Ｃ２）−Ｏ−（（Ｓ）−エチルメチレン）−（Ｃ４）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−Ｈではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＨではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＭｅではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＭｅではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２ｓは、−ＯＨ、−ＯＭｅ、及びＯＣＨ２ＣＨ２ＯＭｅから選択されるいずれの基でもない。
【０１３３】
いくつかの実施形態では、Ｃ１はＢＡに結合する。
【０１３４】
いくつかの実施形態では、−Ｃｙ−は、置換されていてもよい二価の３〜３０員カルボシクリレンである。いくつかの実施形態では、−Ｃｙ−は、置換されていてもよい二価の６〜３０員アリーレンである。いくつかの実施形態では、−Ｃｙ−は、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい二価の５〜３０員ヘテロアリーレンである。いくつかの実施形態では、−Ｃｙ−は、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい二価の３〜３０員ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、−Ｃｙ−は、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい二価の５〜３０員ヘテロアリーレンである。いくつかの実施形態では、−Ｃｙ−は、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい二価の３〜３０員ヘテロシクリレンである。
【０１３５】
いくつかの実施形態では、Ｒ１は、Ｒ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、Ｒ’である。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、Ｒ’である。
【０１３６】
いくつかの実施形態では、Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３のそれぞれは、独立してＲ’である、又はＲ１、Ｒ２、及びＲ３のうちの２つ若しくは３つは、それらの介在する原子と一緒になって形成する。
【化２４】
2019510087.tif 000027
【０１３７】
いくつかの実施形態では、環Ａの価数はｔ＋１である。
【０１３８】
いくつかの実施形態では、Ｒ１はＲである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、Ｒであり、Ｒは水素ではない。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−１０脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−１０アルキルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、置換されていてもよいメチルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、置換されていてもよいエチルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、−Ｏ（ＣＨ２）２ＣＮである。
【０１３９】
いくつかの実施形態では、Ｒ２は、Ｒである。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、Ｒであり、Ｒは水素ではない。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、置換されていてもよいＣ１−１０脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、置換されていてもよいＣ１−１０アルキルである。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、置換されていてもよいメチルである。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、置換されていてもよいエチルである。いくつかの実施形態では、Ｒ２は、イソプロピルである。
【０１４０】
いくつかの実施形態では、Ｒ３は、Ｒである。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、Ｒであり、Ｒは水素ではない。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、置換されていてもよいＣ１−１０脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、置換されていてもよいＣ１−１０アルキルである。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、置換されていてもよいメチルである。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、置換されていてもよいエチルである。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、イソプロピルである。
【０１４１】
いくつかの実施形態では、Ｒ２及びＲ３は同じである。いくつかの実施形態では、Ｒ２とＲ３とは異なっている。
【０１４２】
いくつかの実施形態では、Ｒ１及びＲ２は、それらの介在する原子と一緒になって
【化２５】
2019510087.tif 000028
を形成する。いくつかの実施形態では、Ｒ１及びＲ２は、それらの介在する原子と一緒になって
【化２６】
2019510087.tif 000029
を形成する。いくつかの実施形態では、Ｒ１及びＲ３は、それらの介在する原子と一緒になって
【化２７】
2019510087.tif 000030
を形成する。いくつかの実施形態では、Ｒ２及びＲ３は、それらの介在する原子と一緒になって
【化２８】
2019510087.tif 000031
を形成する。いくつかの実施形態では、Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３は、それらの介在する原子と一緒になって
【化２９】
2019510087.tif 000032
を形成する。
【０１４３】
いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール、３〜３０員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール、３〜３０員環である。
【０１４４】
いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール、３〜３０員環である。
【０１４５】
いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、置換されていてもよい多価の単環式、飽和、５〜７員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、置換されていてもよい多価の単環式、飽和、５員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、置換されていてもよい多価の単環式、飽和、６員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、置換されていてもよい多価の単環式、飽和、７員環である。
【０１４６】
いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の二環式、飽和、部分不飽和、又はアリール、５〜３０員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の二環式、飽和、部分不飽和、又はアリール、５〜３０員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、多価の二環式及び飽和の８〜１０員二環式環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、多価の二環式及び飽和の８員二環式環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、多価の二環式及び飽和の９員二環式環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン及び酸素原子を有し、追加のヘテロ原子を有さない、多価の二環式及び飽和の１０員二環式環である。いくつかの実施形態では、環Ａは二環式であり、５員環に縮合した５員環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは二環式であり、６員環に縮合した５員環を含む。いくつかの実施形態では、５員環は、介在する窒素、リン、及び酸素原子を環原子として含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、
【化３０】
2019510087.tif 000033
の骨格構造を有する環系を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは置換されていてもよい
【化３１】
2019510087.tif 000034
である。いくつかの実施形態では、環Ａは、
【化３２】
2019510087.tif 000035
であり、それらのそれぞれは、独立して、１〜５個のＲｓで置換されている。いくつかの実施形態では、環Ａは
【化３３】
2019510087.tif 000036
であり、それらのそれぞれは、独立して１〜５個のＲｓで置換されており、ここで、酸素原子に結合している炭素原子は１又は２個のＲｓで置換されている。いくつかの実施形態では、環Ａ、例えば
【化３４】
2019510087.tif 000037
から選択される置換基は、窒素に結合したリン原子及び第３級炭素原子以外の１つ又は複数のキラル中心を含む。いくつかの実施形態では、例えば、炭素原子において１つ又は２つのＲｓとの置換の結果として、酸素原子に結合している炭素原子はキラル中心である。いくつかの実施形態では、Ｒｓは、フェニルである。いくつかの実施形態では、Ｒｓは、アルキルである。いくつかの実施形態では、Ｒｓは、メチルである。いくつかの実施形態では、１つのＲｓはフェニルであり、１つのＲｓはメチルである。いくつかの実施形態では、環Ａは、国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載されるものから選択され、その各々のホスホラミダイトは、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、化合物、例えばホスホラミダイトはキラルであり、立体化学的に純粋である。いくつかの実施形態では、提供される化合物、例えばホスホラミダイトは、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は９９．５％以上の純度を有する。
【０１４７】
いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール、３〜３０員環である。いくつかの実施形態では、環Ａは、介在する窒素、リン、及び酸素原子に加えて、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール、３〜３０員環である。
【０１４８】
いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい５〜１０員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい５〜９員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい５〜８員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい５〜７員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい５〜６員単環式環を含む。
【０１４９】
いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい５員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい６員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい７員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい８員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい９員単環式環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子を含む置換されていてもよい１０員単環式環を含む。
【０１５０】
いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子、並びに炭素原子からなる置換されていてもよい５員環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子、並びに炭素原子からなる置換されていてもよい６員環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子、並びに炭素原子からなる置換されていてもよい７員環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子、並びに炭素原子からなる置換されていてもよい８員環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子、並びに炭素原子からなる置換されていてもよい９員環を含む。いくつかの実施形態では、環Ａは、単環式、二環式、又は多環式であり、その環原子が介在する窒素、リン、及び酸素原子、並びに炭素原子からなる置換されていてもよい１０員環を含む。
【０１５１】
いくつかの実施形態では、環Ａは、
【化３５】
2019510087.tif 000038
の骨格構造を有する環系を含む。
【０１５２】
いくつかの実施形態では、ＲｓはＲ’である。いくつかの実施形態では、ＲｓはＲである。いくつかの実施形態では、Ｒｓは、置換されていてもよいＣ１−３０ヘテロ脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒｓは１つ又は複数のケイ素原子を含む。いくつかの実施形態では、Ｒｓは、−ＣＨ２ｓｉ（Ｐｈ）２ＣＨ３である。
【０１５３】
いくつかの実施形態では、Ｒｓは−Ｌ−Ｒ’である。いくつかの実施形態では、Ｒｓは−Ｌ−Ｒ’であり、−Ｌ−は二価の置換されていてもよいＣ１−３０ヘテロ脂肪族基である。いくつかの実施形態では、Ｒｓは、−ＣＨ２ｓｉ（Ｐｈ）２ＣＨ３である。
【０１５４】
いくつかの実施形態では、ｔは０である。いくつかの実施形態では、ｔは１〜５である。いくつかの実施形態では、ｔは１である。いくつかの実施形態では、ｔは２である。いくつかの実施形態では、ｔは３である。いくつかの実施形態では、ｔは４である。いくつかの実施形態では、ｔは５である。
【０１５５】
いくつかの実施形態では、Ｒ’は−Ｒである。いくつかの実施形態では、Ｒ’は−Ｃ（Ｏ）Ｒである。いくつかの実施形態では、Ｒ’は、−ＣＯ２Ｒである。いくつかの実施形態では、Ｒ’は、−ＳＯ２Ｒである。いくつかの実施形態では、２つ以上のＲ’は、それらの介在する原子と一緒になって、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール、３〜３０員環を形成する。いくつかの実施形態では、Ｒ’は水素である。いくつかの実施形態では、Ｒ’は水素ではない。
【０１５６】
いくつかの実施形態では、Ｒは水素である。いくつかの実施形態では、Ｒは水素ではない。いくつかの実施形態では、Ｒは、Ｃ１〜３０脂肪族、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１〜３０ヘテロ脂肪族、Ｃ６−３０アリール、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、並びに酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員複素環式環、から選択される置換されていてもよい基である。
【０１５７】
いくつかの実施形態では、Ｒは水素、又はＣ１−２０脂肪族、フェニル、３〜７員飽和若しくは部分不飽和炭素環式環、８〜１０員二環式飽和、部分不飽和、若しくはアリール環、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する５〜６員単環式ヘテロアリール環、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する４〜７員飽和若しくは部分不飽和複素環式環、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する７〜１０員二環式飽和若しくは部分不飽和複素環式環、若しくは窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する８〜１０員二環式ヘテロアリール環、から選択される置換されていてもよい基である。
【０１５８】
いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ１−３０脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ１−２０脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ１−１５脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ１−１０脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ１−６脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ１−６アルキルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいヘキシル、ペンチル、ブチル、プロピル、エチル、又はメチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいヘキシルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいペンチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいブチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいプロピルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいエチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいメチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはヘキシルである。いくつかの実施形態では、Ｒはペンチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはブチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはプロピルである。いくつかの実施形態では、Ｒはエチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはメチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはイソプロピルである。いくつかの実施形態では、Ｒはｎ−プロピルである。いくつかの実施形態では、Ｒはｔｅｒｔ−ブチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはｓｅｃ−ブチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはｎ−ブチルである。
【０１５９】
いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ３−３０脂環式である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ３−２０脂環式である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいＣ３−１０脂環式である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロヘキシルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロヘキシルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロペンチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロペンチルである。
【０１６０】
いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい３〜３０員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい３〜７員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい３員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい４員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい５員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい６員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい７員飽和又は部分不飽和炭素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロヘプチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロヘプチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロヘキシルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロヘキシルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロペンチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロペンチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロブチルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロブチルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいシクロプロピルである。いくつかの実施形態では、Ｒはシクロプロピルである。
【０１６１】
いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよいＣ１−３０ヘテロ脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは１〜１０個のヘテロ原子を有する、Ｃ１−２０ヘテロ脂肪族である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、硫黄、リン、又はケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−２０ヘテロ脂肪族であり、任意に窒素、硫黄、リン、又はセレンのうちの１つ又は複数の酸化された形態を含む。いくつかの実施形態では、Ｒは、
【化３６】
2019510087.tif 000039
、−Ｎ＝、≡Ｎ、−Ｓ−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｏ−、＝Ｏ、
【化３７】
2019510087.tif 000040
から独立して選択される１〜１０の基を含むＣ１−３０ヘテロ脂肪族である。
【０１６２】
いくつかの実施形態では、Ｒは置換されていてもよいＣ６−３０アリールである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいフェニルである。いくつかの実施形態では、Ｒはフェニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されたフェニルである。
【０１６３】
いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい８〜１０員の二環式飽和、部分不飽和、又はアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい８〜１０員の二環式飽和環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい８〜１０員の二環式部分不飽和環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい８〜１０員の二環式アリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいナフチルである。
【０１６４】
いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、及び硫黄かに独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜３０員ヘテロアリール環である。
【０１６５】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜６員単環式ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、置換された５〜６員単環式ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、非置換の５〜６員単環式ヘテロアリール環である。
【０１６６】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、又は硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員単環式ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６員単環式ヘテロアリール環である。
【０１６７】
いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、及び硫黄から選択される１個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員単環式ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは置換されていてもよいピロリル、フラニル、又はチエニルから選択される。
【０１６８】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される２個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、１個の窒素原子、及び硫黄又は酸素から選択される追加のヘテロ原子を有する置換されていてもよい５員ヘテロアリール環である。例示的なＲ基としては、置換されていてもよいピラゾリル、イミダゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、オキサゾリル、又はイソオキサゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１６９】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員ヘテロアリール環である。例示的なＲ基としては、置換されていてもよいトリアゾリル、オキサジアゾリル、又はチアジアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１７０】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員ヘテロアリール環である。例示的なＲ基としては、置換されていてもよいテトラゾリル、オキサトリアゾリル、及びチアトリアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１７１】
いくつかの実施形態では、Ｒは、１〜４個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、１〜３個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、１〜２個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、４個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、３個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、２個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、１個の窒素原子を有する、置換されていてもよい６員ヘテロアリール環である。例示的なＲ基としては、置換されていてもよいピリジニル、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニル、トリアジニル、又はテトラジニルが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１７２】
いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、３〜３０員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する、３〜３０員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、３〜３０員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、３〜３０員複素環式環である。
【０１７３】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい３〜７員の飽和、又は部分不飽和複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換された３〜７員の飽和、又は部分不飽和複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、非置換の３〜７員の飽和、又は部分不飽和複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜７員の部分不飽和単環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５〜６員の部分不飽和単環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員の部分不飽和単環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６員の部分不飽和単環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい７員の部分不飽和単環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、又は硫黄から選択される１個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい３員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい４員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６員複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい７員複素環式環である。
【０１７４】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい７〜１０員の二環式飽和、又は部分不飽和複素環式環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいインドリニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいイソインドリニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい１，２，３，４−テトラヒドロキノリニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよい１，２，３，４−テトラヒドロイソキノリニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいアザビシクロ［３．２．１］オクタニルである。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい８〜１０員二環式ヘテロアリール環である。
【０１７６】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される２個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは置換されていてもよい、１，４−ジヒドロピロロ［３，２−ｂ］ピロリル、４Ｈ−フロ［３，２−ｂ］ピロリル、４Ｈ−チエノ［３，２−ｂ］ピロリル、フロ［３，２−ｂ］フラニル、チエノ［３，２−ｂ］フラニル、チエノ［３，２−ｂ］チエニル、１Ｈ−ピロロ［１，２−ａ］イミダゾリル、ピロロ［２，１−ｂ］オキサゾリル、又はピロロ［２，１−ｂ］チアゾリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは置換されていてもよいジヒドロピロロイミダゾリル、１Ｈ−フロイミダゾリル、１Ｈ−チノイミダゾリル、フロオキサゾリル、フロイソオキサゾリル、４Ｈ−ピロロオキサゾリル、４Ｈ−ピロロイソオキサゾリル、チエノオキサゾリル、チエノイソオキサゾリル、４Ｈ−ピロロチアゾリル、フロチアゾリル、チエノチアゾリル、１Ｈ−イミダゾイミダゾリル、イミダゾオキサゾリル、又はイミダゾ［５，１−ｂ］チアゾリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。
【０１７７】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。別の実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜２個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいインドリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいベンゾフラニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいベンゾ［ｂ］チエニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される２個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいアザインドリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいベンゾイミダゾリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいベンゾチアゾリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいベンゾオキサゾリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいインダゾリルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいオキサゾロピリジニル、チアゾロピリジニル、又はイミダゾピリジニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいプリニル、オキサゾロピリミジニル、チアゾロピリミジニル、オキサゾロピラジニル、チアゾロピラジニル、イミダゾピラジニル、オキサゾロピリダジニル、チアゾロピリダジニル、又はイミダゾピリダジニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい５，６−縮合ヘテロアリール環である。
【０１７８】
いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１〜２個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される１個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいキノリニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいイソキノリニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される２個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいキナゾリニル、フタラジニル、キノキサリニル、又はナフチリジニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される３個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいピリドピリミジニル、ピリドピリダジニル、ピリドピラジニル、又はベンゾトリアジニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される４個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Ｒは、置換されていてもよいピリドトリアジニル、プテリジニル、ピラジノピラジニル、ピラジノピリダジニル、ピリダジノピリダジニル、ピリミドピリダジニル、又はピリミドピリミジニルである。いくつかの実施形態では、Ｒは、窒素、酸素、及び硫黄から独立して選択される５個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい６，６−縮合ヘテロアリール環である。
【０１７９】
いくつかの実施形態では、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、又は
【化３８】
2019510087.tif 000041
は、１つ又は複数のキラル要素、例えば、キラル中心を含む。いくつかの実施形態では、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、又は
【化３９】
2019510087.tif 000042
は、非対称である。このような非対称部分を含むホスホラミダイトは、とりわけ、国際公開第２０１４／０１２０８１号、国際公開第２０１５／１０７４２５号等に記載されているようなキラル制御オリゴヌクレオチド組成物を調製するのに使用されることができる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド合成において使用される場合、このようなホスホラミダイトは、任意に、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％を超える収率と共に、新たに形成されたＰキラル中心では、約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％より大きいジアステレオ選択性をもたらすことができる。
【０１８０】
いくつかの実施形態では、
【化４０】
2019510087.tif 000043
は
【化４１】
2019510087.tif 000044
（式中、１つ又は複数のＲｓは水素ではない）である。いくつかの実施形態では、
【化４２】
2019510087.tif 000045
は
【化４３】
2019510087.tif 000046
である。いくつかの実施形態では、
【化４４】
2019510087.tif 000047
は
【化４５】
2019510087.tif 000048
である。いくつかの実施形態では、
【化４６】
2019510087.tif 000049
は
【化４７】
2019510087.tif 000050
である。
【０１８１】
当業者であれば認識するように、ホスホラミダイトは、実施例に示すように、アミノ基及びヒドロキシル基を含むものを含み、ヌクレオシド及びキラル助剤から調製されることができる。好適なキラル助剤は、国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載されたものを含むが、これらに限定されない。これらの各々のキラル助剤は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載されるものであり、その各々のホスホラミダイトは、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本開示は、これらの出願の１つに記載のオリゴヌクレオチドの調製方法を含む方法を提供し、本明細書に記載の方法を用いてホスホラミダイトを精製する。
【０１８３】
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは、
【化４８】
2019510087.tif 000051
2019510087.tif 000052
である。
いくつかの実施形態では、ホスホラミダイトは下記の表１から選択される。
表１  ホスホラミダイトの例
【表１】
2019510087.tif 000053
【表２】
2019510087.tif 000054
【０１８４】
いくつかの実施形態では、本開示は、ホスホラミダイト及び／又はオリゴヌクレオチドを調製するための新規技術、例えば、化合物、組成物、方法等を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、ホスホラミダイトを精製するための新しい技術を提供する。いくつかの実施形態では、提供された技術は、ホスホラミダイト合成の効率を大幅に改善し、並びに／又はホスホラミダイト及びそれから調製されるオリゴヌクレオチド、組成物及び医薬品のコストを著しく低下させる。とりわけ、国際公開第２０１１／００５７６１号、米国特許出願公開第２０１２／０３１６２２４号、国際公開第２０１３／０１２７５８号、米国特許出願公開第２０１４／０１９４６１０号、国際公開第２０１４／０１２０８１号、米国特許出願公開第２０１５／０２１１００６号、国際公開第２０１５／１０７４２５号、米国特許出願公開第２０１７／００３７３９９号、国際公開第２０１０／０６４１４６号、米国特許出願公開第２０１１／０２９４１２４号、国際公開第２０１４／０１０２５０号、米国特許出願公開第２０１５／０１９７５４０号、国際公開第２０１１／１０８６８２号、米国特許出願公開第２０１３／０１８４４５０号、国際公開第２０１２／０３９４４８号、米国特許出願公開第２０１３／０１７８６１２号、国際公開第２０１２／０７３８５７号、又は米国特許出願公開第２０１３／０２５３１７８号に記載のものを含むが、これらに限定されない提供された技術を利用して、様々なオリゴヌクレオチド合成方法のためのホスホラミダイトを調製することができる。これらの各々の方法は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、国際公開第２０１４／０１２０８１号、国際公開第２０１５／１０７４２５号等に記載されているようなキラル制御オリゴヌクレオチド組成物を調製するのに特に有用である。
【０１８５】
本明細書に示されるように、提供される技術は、驚くべきことに、ホスホラミダイトの収率及び／又は純度を改善することができる。いくつかの実施形態では、絶対改善は約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％であるか、又は更に大きい。いくつかの実施形態では、絶対改善は約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％より大きく、又は更に大きい。いくつかの実施形態では、提供された技術での収率は約８０％より大きく、一方、（２０％を超える絶対改善に相当して）対応する前処理なしの技術での収率は約６０％未満である。いくつかの実施形態では、対応する前処理なしの技術に対する改善は、約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％より大きく、又は更に大きい。
【０１８６】
いくつかの実施形態では、提供される技術は、室温より高い温度及び／又は低い温度で、部分的に又は全体的に実施され得る。いくつかの実施形態では、提供される技術は、室温より高い温度、例えば３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００℃、又はそれより高い温度における手順を含む。いくつかの実施形態では、提供される技術は、室温より低い温度、例えば１５、１０、５、０、−５、−１０℃、又はそれ未満の温度における手順を含む。いくつかの実施形態では、精製、例えば、（しばしば前処理された）精製媒体を用いたホスホラミダイトのクロマトグラフィー精製は、室温より高い温度で行われる。いくつかの実施形態では、精製、例えば、（しばしば前処理された）精製媒体を用いたホスホラミダイトのクロマトグラフィー精製は、室温より低い温度で行われる。いくつかの実施形態では、より高い温度及び／又は低い温度が制御されて、温度変動がある範囲内に制御される。
【０１８７】
特に明記しない限り、本明細書に示される構造はまた、構造の全ての異性体（例えば、エナンチオマー、ジアステレオマー、及び幾何学的（又は立体配座））形態、例えば、各非対称中心についてのＲ及びＳ立体配置、（Ｚ）及び（Ｅ）二重結合異性体、並びに（Ｚ）及び（Ｅ）立体配座異性体を含むことを意味する。したがって、本発明の化合物の単一の立体化学異性体、並びにエナンチオマー、ジアステレオマー、及び幾何学的（又は立体配座）混合物は、本開示の範囲内である。特に記明記しない限り、本開示の化合物の全ての互変異性体は、本開示の範囲内である。更に、特に明記しない限り、本明細書に示される構造は、１つ又は複数の同位体濃縮原子の存在下でのみ異なる化合物も含むことを意味する。例えば、重水素若しくはトリチウムによる水素の置換、又は１１Ｃ−若しくは１３Ｃ−若しくは１４Ｃ−リッチ炭素による炭素の置換を除いて、本構造を有する化合物は、本開示の範囲内である。このような化合物は、例えば生物学的アッセイにおける分析ツール又はプローブとして有用である。
【０１８８】
本明細書及び特許請求の範囲で使用される場合、文脈上他に明確に示さない限り、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、複数形を含む。したがって、例えば、「化合物」への言及は、複数のこのような化合物を含む。
【０１８９】
いくつかの実施形態では、本開示は、以下の実施形態を提供する。
１．  化合物を精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を化合物と接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
２．  化合物を精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を化合物と接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
３．  化合物を精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
４．  化合物の回復率を改善する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）化合物を精製媒体へ加える工程と、
ｃ）化合物を溶媒系を用いて精製媒体から溶出させる工程と、
を含み、工程ａ）がない場合、回復率は基準回復率より高い、方法。
５．  化合物が精製媒体と接触した場合に化合物の分解を減少させる方法であって、
精製媒体から水を除去する工程、を含む方法。
６．  
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を化合物と接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
７．  
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
８．  
精製媒体を化合物と接触させる工程と、を含み、媒体は前処理され、前処理は水を除去することを含む、方法。
９．  
前処理された精製媒体を用いて化合物を精製する工程を含み、媒体は前処理され、前処理は水を除去することを含む、方法。
１０．  
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を化合物と接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
１１．  
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を化合物と接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
１２．  
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を化合物と接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いて化合物を精製する工程と、を含む方法。
１３．  化合物がホスホラミダイトである、実施形態１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
１４．  ホスホラミダイトを精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
１５．  ホスホラミダイトを精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
１６．  ホスホラミダイトを精製する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
１７．  ホスホラミダイトの回復率を改善する方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）ホスホラミダイトを精製媒体へ加える工程と、
ｃ）ホスホラミダイトを溶媒系を用いて精製媒体から溶出させる工程と、
を含み、工程ａ）がない場合、回復率は基準回復率より高い、方法。
１８．  改良された回復率と基準回復率との間の差は、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％又は５０％である、実施形態４又は１７に記載の方法。
１９．  ホスホラミダイトが精製媒体と接触する場合にホスホラミダイトの分解を減少させる方法であって、
ａ）精製媒体から水を除去する工程、を含む方法。
２０．  
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
２１．  
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
２２．  
ａ）精製媒体から水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
２３．  
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
２４．  
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
２５．  
ａ）精製媒体から機械的に水を除去する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
２６．  精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する方法において、精製媒体から水を除去するプロセスによる精製媒体の前処理を含む改善。
２７．  精製媒体から水を除去する工程は精製媒体を加熱することを含む、実施形態１〜２６のいずれか１項に記載の方法。
２８．  精製媒体から水を除去する工程は精製媒体を吸湿性溶媒系と接触させることを含む、実施形態１〜２７のいずれか１項に記載の方法。
２９．  吸湿性溶媒系は１つの吸湿性溶媒からなる、実施形態２８に記載の方法。
３０．  吸湿性溶媒系は１つの吸湿性溶媒及び別の溶媒からなる、実施形態２８に記載の方法。
３１．  吸湿性溶媒系は２つ以上の溶媒からなり、各溶媒は独立して吸湿性溶媒である、実施形態３０に記載の方法。
３２．  吸湿性溶媒は、アセトアルデヒド、酢酸、アセトン、アセトニトリル、１，２−ブタンジオール、１，３−ブタンジオール、１，４−ブタンジオール、２−ブトキシエタノール、酪酸、ジエタノールアミン、ジエチレントリアミン、ジメチルカーボネート、ジメチルホルムアミド、ジメトキシエタン、ジメチルスルホキシド、１，４−ジオキサン、エタノール、エチルアセテート、エチルアミン、エチレングリコール、ギ酸、フルフリルアルコール、グリセロール、メタノール、メチルジエタノールアミン、メチルイソシアニド、１−プロパノール、１，３−プロパンジオール、１，５−ペンタンジオール、２−プロパノール、プロパン酸、プロピレングリコール、ピリジン、テトラヒドロフラン、及びトリエチレングリコールから選択される、実施形態１〜３１のいずれか１項に記載の方法。
３３．  吸湿性溶媒は、アセトアルデヒド、酢酸、アセトン、アセトニトリル、１，２−ブタンジオール、１，３−ブタンジオール、１，４−ブタンジオール、２−ブトキシエタノール、酪酸、ジエタノールアミン、ジエチレントリアミン、ジメチルホルムアミド、ジメトキシエタン、ジメチルスルホキシド、１，４−ジオキサン、エタノール、エチルアミン、エチレングリコール、ギ酸、フルフリルアルコール、グリセロール、メタノール、メチルジエタノールアミン、メチルイソシアニド、１−プロパノール、１，３−プロパンジオール、１，５−ペンタンジオール、２−プロパノール、プロパン酸、プロピレングリコール、ピリジン、テトラヒドロフラン、及びトリエチレングリコールから選択される、実施形態１〜３２のいずれか１項に記載の方法。
３４．  吸湿性溶媒はメタノール及びエタノールから選択される、実施形態１〜３３のいずれか１項に記載の方法。
３５．  吸湿性溶媒はメタノールである、実施形態１〜３４のいずれか１項に記載の方法。
３６．  吸湿性溶媒はエタノールである、実施形態１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
３７．  吸湿性溶媒はイソプロパノールである、実施形態１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
３８．  吸湿性溶媒はアセトンである、実施形態１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
３９．  吸湿性溶媒はアセトニトリルである、実施形態１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
４０．  吸湿性溶媒はジメチルカーボネートである、実施形態１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
４１．  吸湿性溶媒はエチルアセテートである、実施形態１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
４２．  
ａ）精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
４３．  
ａ）精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、を含む方法。
４４．  
ａ）精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
４５．  
ａ）シリカを含む精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、
ｃ）場合によっては、精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
４６．  
ａ）シリカを含む精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体をホスホラミダイトと接触させる工程と、を含む方法。
４７．  
ａ）シリカを含む精製媒体を前処理する工程と、
ｂ）精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する工程と、を含む方法。
４８．  精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する方法において、精製媒体の前処理を含む改善。
４９．  シリカを含む精製媒体を用いてホスホラミダイトを精製する方法において、精製媒体の前処理を含む改善。
５０．  前処理は精製媒体を加熱する工程を含む、実施形態４２〜４９のいずれか１項に記載の方法。
５１．  前処理は精製媒体を第１の溶媒系と接触させる工程を含む、実施形態４２〜５０のいずれか１項に記載の方法。
５２．  前処理は精製媒体を第１の溶媒系と接触させる工程を含み、第１の溶媒系は吸湿性溶媒を含む、実施形態４２〜５０のいずれか１項に記載の方法。
５３．  前処理は精製媒体を第１の溶媒系と接触させる工程を含み、第１の溶媒系はアルコールを含む、実施形態４２〜５０のいずれか１項に記載の方法。
５４．  第１の溶媒系はメタノールを含む、実施形態４２〜５３のいずれか１項に記載の方法。
５５．  吸湿性溶媒はエタノールである、実施形態４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
５６．  吸湿性溶媒はイソプロパノールを含む、実施形態４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
５７．  吸湿性溶媒はジメチルカーボネートである、実施形態４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
５８．  吸湿性溶媒はアセトンである、実施形態４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
５９．  吸湿性溶媒はアセトニトリルである、実施形態４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
６０．  吸湿性溶媒はエチルアセテートである、実施形態４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
６１．  第１の溶媒系は１つの溶媒からなる、実施形態４２〜５４のいずれか１項に記載の方法。
６２．  第１の溶媒系は修飾剤を含む、実施形態４２〜６２のいずれか１項に記載の方法。
６３．  修飾剤は最大５０体積％のトリエチルアミンである、実施形態６２に記載の方法。
６４．  
ａ１）精製系をホスホラミダイトと接触させる前に、精製媒体を第２の溶媒系で平衡化させる工程、を更に含む、実施形態１〜６３のいずれか１項に記載の方法。
６５．  第２の溶媒系は第１の溶媒系よりも極性が小さい、実施形態１〜６４のいずれか１項に記載の方法。
６６．  第２の溶媒系は第１の溶媒系と比べて低い体積％の少なくとも１つのアルコールを含む、実施形態１〜６５のいずれか１項に記載の方法。
６７．  第２の溶媒系はアルコールを含まない、実施形態１〜６６のいずれか１項に記載の方法。
６８．  第２の溶媒系はヘキサン又はエチルアセテート、及び場合によっては修飾剤を含む、実施形態１〜６７のいずれか１項に記載の方法。
６９．  第２の溶媒系はヘキサン、エチルアセテート、及び有機塩基を含む、実施形態１〜６８のいずれか１項に記載の方法。
７０．  第２の溶媒系はヘキサン、エチルアセテート、及びトリエチルアミンを含む、実施形態１〜６９のいずれか１項に記載の方法。
７１．  精製媒体はホスホラミダイトの精製に使用され、第３の溶媒系はホスホラミダイトを精製媒体から溶出するために使用される、実施形態１〜７０のいずれか１項に記載の方法。
７２．  第３の溶媒系は第１の溶媒系よりも極性が小さい、実施形態１〜７１のいずれか１項に記載の方法。
７３．  第３の溶媒系は第１の溶媒系と比べて低い体積％の少なくとも１つのアルコールを含む、実施形態１〜７２のいずれか１項に記載の方法。
７４．  第３の溶媒系は第２の溶媒系よりも極性が小さい、実施形態１〜７３のいずれか１項に記載の方法。
７５．  第３の溶媒系は第２の溶媒系と同じである、実施形態１〜７４のいずれか１項に記載の方法。
７６．  グラジエントは精製媒体からホスホラミダイト溶出するために使用される、実施形態１〜７５のいずれか１項に記載の方法。
７７．  グラジエント溶出の開始時の溶媒系は、平衡化終了時の第２の溶媒系と同じである、実施形態１〜７６のいずれか１項に記載の方法。
７８．  精製媒体はシリカゲルである、実施形態１〜７７のいずれか１項に記載の方法。
７９．  精製媒体は５０マイクロメータ以上の粒子径を有するシリカゲルである、実施形態１〜７８のいずれか１項に記載の方法。
８０．  精製媒体は５０マイクロメータの粒子径を有するシリカゲルである、実施形態１〜７９のいずれか１項に記載の方法。
８１．  第１の溶媒系は塩基を含む、実施形態１〜８０のいずれか１項に記載の方法。
８２．  第３の溶媒系は塩基、エチルアセテート、及びヘキサンを含む、実施形態１〜８１のいずれか１項に記載の方法。
８３．  塩基はトリエチルアミンである、実施形態１〜８２のいずれか１項に記載の方法。
８４．  塩基は最大５０体積％である、実施形態１〜８３のいずれか１項に記載の方法。
８５．  塩基は５体積％である、実施形態１〜８４のいずれか１項に記載の方法。
８６．  精製媒体を用いるホスホラミダイトのクロマトグラフィー精製を含む、実施形態１〜８５のいずれか１項に記載の方法。
８７．  室温よりも高い温度において精製媒体を用いるホスホラミダイトのクロマトグラフィー精製を含む、実施形態１〜８６のいずれか１項に記載の方法。
８８．  室温よりも低い温度において精製媒体を用いるホスホラミダイトのクロマトグラフィー精製を含む、実施形態１〜８７のいずれか１項に記載の方法。
８９．  
ａ）実施形態１〜８８のいずれか１項に記載の工程ａ）により前処理された精製媒体と、
ｂ）ホスホラミダイトと、を含む組成物。
９０．  不活性化された精製媒体はシリカゲルである、実施形態８９に記載の組成物。
９１．  
ａ）実施形態１〜９０のいずれか１項に記載の工程ａ）により前処理されたシリカと、
ｂ）ホスホラミダイトと、を含む組成物。
９２．  前処理された精製媒体は、吸湿性溶媒系で前処理されたシリカゲルである、実施形態８９〜９１のいずれか１項に記載の組成物。
９３．  吸湿性溶媒系は吸湿性溶媒系又は実施形態１〜９２のいずれか１項に記載の第１の溶媒系である、実施形態９２のいずれか１項に記載の組成物。
９４．  精製媒体を第２の溶媒系で平衡化される、実施形態８９〜９１のいずれか１項に記載の組成物。
９５．  ホスホラミダイトはヌクレオシドホスホラミダイトである、実施形態１〜９４のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
９６．  ホスホラミダイトは式ＩＩ：
【化４９】
2019510087.tif 000055
（式中、
ＢＡは、Ｒであるか、又は３〜３０員脂環式環、６〜３０員アリール環、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリル、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、天然核酸塩基部分、並びに修飾された核酸塩基部分、から選択される置換されていてもよい基であり；
ＳＵは、糖部分、修飾された糖部分、−Ｌ−Ｏ−、又は、
【化５０】
2019510087.tif 000056
であり、ＳＵは酸素原子を介して式Ｉ中のリン原子に結合し；
Ｌは、共有結合であるか、又はＣ１−３０脂肪族、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族基、から選択される二価の、置換されていてもよい、直鎖状若しくは分枝状の基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、独立して置き換えられていてもよく；
Ｒ５ｓは、Ｒ’又は−ＯＲ’であり；
Ｒ２ｓは、−Ｆ、−ＣＮ、−Ｎ３、−ＮＯ、−ＮＯ２、−Ｒ’−ＯＲ’、−ＳＲ’、−Ｎ（Ｒ’）２、−Ｌ−Ｒ’、−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’、−Ｏ−Ｌ−ＳＲ’、若しくは−Ｏ−Ｌ−Ｎ（Ｒ’）２であり、又は、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４若しくはＣ５とを結合するＬであり；
−Ｃｙ−は、３〜３０員カルボシクリレン、６〜３０員アリーレン、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリーレン、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリレン、から選択される置換されていてもよい二価の環であり；
Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３のそれぞれは、独立してＲ’である、又はＲ１、Ｒ２及びＲ３の２つ若しくは３つは、それらの介在する原子と一緒になって、：を形成し；
【化５１】
2019510087.tif 000057
環Ａは、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環であり；
それぞれのＲｓは独立してＲ’又は−Ｌ−Ｒ’であり；
ｔは０〜５であり；
それぞれのＲ’は独立して−Ｒ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ、−ＣＯ２Ｒ、若しくは−ＳＯ２Ｒである、又は：
２つ以上のＲ’は、それらの介在する原子と一緒になって、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環を形成し；
各Ｒは、独立して、水素であるか、又は、Ｃ１−３０脂肪族、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族、６−３０員アリール環酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員複素環式環、から選択される置換されていてもよい基である）の構造を有する、実施形態１〜９５のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
９７．  いくつかの実施形態では、ＢＡは、３〜３０員脂環式環、６〜３０員アリール環、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリル、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、天然核酸塩基部分、及び修飾された核酸塩基部分、から選択される置換されていてもよい基である、実施形態８８に記載の方法又は組成物。
９８．  ホスホラミダイトは式ＩＩ：
【化５２】
2019510087.tif 000058
（式中、
ＢＡは、Ｃ１−３０脂環式、Ｃ６−３０アリール、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ３−３０ヘテロシクリル、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ５−３０ヘテロアリール環、天然核酸塩基部分、並びに修飾された核酸塩基部分、から選択される置換されていてもよい基であり；
ＳＵは、−Ｌ−Ｏ−、又は
【化５３】
2019510087.tif 000059
であり、ＳＵは酸素原子を介して式Ｉのリン原子に結合し；
Ｌは、共有結合であるか、又はＣ１−３０脂肪族、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族基、から選択される二価の、置換されていてもよい、直鎖状若しくは分枝状の基であり、ここで、１つ若しくは複数のメチレン単位は、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン、Ｃ１−６アルケニレン、−Ｃ≡Ｃ−、−Ｃ（Ｒ’）２−、−Ｃｙ−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｎ（Ｒ’）−、−Ｃ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｓ）−、−Ｃ（ＮＲ’）−、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｃ（Ｏ）Ｏ−、−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ’）−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）２−、−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒ’）−、−Ｎ（Ｒ’）Ｓ（Ｏ）２−、−ＳＣ（Ｏ）−、−Ｃ（Ｏ）Ｓ−、−ＯＣ（Ｏ）−、又は−Ｃ（Ｏ）Ｏ−で、独立して置き換えられていてもよく；
Ｒ５ｓは、Ｒ’又は−ＯＲ’であり；
Ｒ２ｓは、−Ｆ、−ＣＮ、−Ｎ３、−ＮＯ、−ＮＯ２、−Ｒ’−ＯＲ’、−ＳＲ’、−Ｎ（Ｒ’）２、−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’、−Ｏ−Ｌ−ＳＲ’、若しくは−Ｏ−Ｌ−Ｎ（Ｒ’）２であり、又は、Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、若しくはＣ５とを結合するＬであり；
−Ｃｙ−は、３〜３０員カルボシクリレン、６〜３０員アリーレン、酸素、窒素、及び硫黄から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリーレン、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員ヘテロシクリレン、から選択される置換されていてもよい二価の環であり；
Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３のそれぞれは、独立してＲ’である、又はＲ１、Ｒ２及びＲ３の２つ若しくは３つは、それらの介在する原子と一緒になって、：を形成し；
【化５４】
2019510087.tif 000060
環Ａは、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい多価の単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環であり；
それぞれのＲｓは独立してＲ’又は−Ｌ−Ｒ’であり；
ｔは０〜５であり；
それぞれのＲ’は独立して−Ｒ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ、−ＣＯ２Ｒ、若しくは−ＳＯ２Ｒである、又は：
２つ以上のＲ’は、それらの介在する原子と一緒になって、介在する原子に加えて、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される０〜１０個のヘテロ原子を有する、置換されていてもよい単環式、二環式、若しくは多環式の、飽和、部分不飽和、又はアリール３〜３０員環を形成し；
各Ｒは、独立して、水素であるか、又は、Ｃ１−３０脂肪族、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有するＣ１−３０ヘテロ脂肪族、Ｃ６−３０アリール、酸素、窒素、硫黄、リン、及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する５〜３０員ヘテロアリール環、並びに、酸素、窒素、硫黄、リン及びケイ素から独立して選択される１〜１０個のヘテロ原子を有する３〜３０員複素環式環、から選択される置換されていてもよい基である）の構造を有する、実施形態１〜９７のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
９９．  いくつかの実施形態では、ＢＡは、Ｃ１−３０脂環式、Ｃ６−３０アリール、Ｃ３−３０ヘテロシクリル、Ｃ５−３０ヘテロアリール、及び天然核酸塩基部分から選択される置換されていてもよい基である、実施形態９６〜９８のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１００．  ＢＡは、置換されていてもよい基であり、この基は、
【化５５】
2019510087.tif 000061
2019510087.tif 000062
から−Ｈを除去することによって形成される、実施形態９６〜９８のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０１．  ＢＡは置換されていてもよい基であり、この基は、
【化５６】
2019510087.tif 000063
2019510087.tif 000064
から選択される、実施形態１００に記載の方法又は組成物。
１０２．  ＢＡは置換されていてもよいグアニン残基であり、そのＯ６は保護されていない、実施形態９６〜９９のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０３．  ＢＡは修飾された塩基である、実施形態９６〜９９のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０４．  ＳＵは修飾された又は未修飾の糖部分である、実施形態９６〜１０３のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０５．  ＳＵは−Ｌ−Ｏ−である、実施形態９６〜１０４のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０６．  ＳＵは−Ｌ−Ｏ−であり、Ｌは１個の酸素原子を有する、置換されていてもよい５〜１０員ヘテロシクリレンである、実施形態９６〜１０５のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０７．  ＳＵは−Ｌ−Ｏ−であり、Ｌは１個の酸素原子を有する、置換されていてもよい５員ヘテロシクリレンである、実施形態９６〜１０６のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０８．  ＳＵは−Ｌ−Ｏ−であり、Ｌは２個の酸素原子を有する、置換されていてもよい７〜１０員二環式ヘテロシクリレンである、実施形態９６〜１０６のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１０９．  ＳＵは
【化５７】
2019510087.tif 000065
である、実施形態９６〜１０６のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１０．  Ｒ５ｓは−ＯＲ’である、実施形態１０９に記載の方法又は組成物。
１１１．  Ｒ５ｓは−ＯＤＭＴｒである、実施形態１０９〜１１０のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１２．  Ｒ２ｓは−Ｈである、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１３．  Ｒ２ｓは−Ｆである、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１４．  Ｒ２ｓは−ＯＲ’である、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１５．  Ｒ２ｓは−Ｏ−Ｌ−ＯＲ’である、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１６．  Ｒ２ｓは−ＯＭｅである、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１７．  Ｒ２ｓは−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＭｅである、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１８．  Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４又はＣ５とを結合するＬである、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１１９．  Ｒ２ｓは、Ｃ２とＣ４とを結合するＬである、実施形態１０９〜１１１のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１２０．  Ｌは（Ｃ２）−Ｏ−（置換されていてもよいメチレン）−である、実施形態１１８又は１１９に記載の方法又は組成物。
１２１．  Ｌは（Ｃ２）−Ｏ−（置換されていてもよいメチレン）−であり、メチレン基はエチレンで置換されている、実施形態１２０に記載の方法又は組成物。
１２２．  メチレン基の炭素原子はＳである、実施形態１２１に記載の方法又は組成物。
１２３．  メチレン基の炭素原子はＲである、実施形態１２１に記載の方法又は組成物。
１２４．  Ｒ２及びＲ３は、介在する窒素原子と一緒になって
【化５８】
2019510087.tif 000066
を形成する、実施形態９６〜１２３のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１２５．  Ｒ１、並びにＲ２及びＲ３のうちの１つは、それらの介在する窒素、リン及び酸素原子と一緒になって
【化５９】
2019510087.tif 000067
を形成する、実施形態９６〜１２３のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１２６．  Ｒ１、Ｒ２、及びＲ３は、それらの介在する窒素、リン及び酸素原子と一緒に、なって
【化６０】
2019510087.tif 000068
を形成する、実施形態９６〜１２３のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１２７．  環Ａは、
【化６１】
2019510087.tif 000069
の骨格構造を有する環系を含む、実施形態１２５又は１２６に記載の方法又は組成物。
１２８．  環Ａは、
【化６２】
2019510087.tif 000070
の骨格構造を有する環系を含む、実施形態１２６又は１２７に記載の方法又は組成物。
１２９．  ｔは０である、実施形態９６〜１２８のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３０．  ｔは１〜５である、実施形態９６〜１２８のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３１．  １つのＲｓはＲ’又は−Ｌ−Ｒ’であり、−Ｌ−は二価の置換されていてもよいＣ１−３０ヘテロ脂肪族基である、実施形態９６〜１２８のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３２．  １つのＲｓは−ＣＨ２Ｓｉ（Ｐｈ）２ＣＨ３である、実施形態９６〜１２８のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３３．
【化６３】
2019510087.tif 000071
は１つ又は複数のキラル要素を含み、非対称である、実施形態９６〜１３２のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３４．  オリゴヌクレオチド合成において使用される場合、ホスホラミダイトは、任意に、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％を超える収率と共に、新たに形成されたＰキラル中心では、約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％より大きいジアステレオ選択性をもたらすことができる、実施形態９６〜１３３のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３５．  オリゴヌクレオチド合成方法は、国際公開第／２０１１／００５７６１号、国際公開第／２０１３／０１２７５８号、国際公開第／２０１４／０１２０８１号、国際公開第／２０１５／１０７４２５号、国際公開第／２０１０／０６４１４６号、国際公開第／２０１４／０１０２５０号、国際公開第／２０１１／１０８６８２号、国際公開第／２０１２／０３９４４８号、又は国際公開第／２０１２／０７３８５７号に記載されるものである、実施形態１３４に記載の方法又は組成物。
１３６．  
【化６４】
2019510087.tif 000072
は
【化６５】
2019510087.tif 000073
である、実施形態９６〜１３４のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３７．
【化６６】
2019510087.tif 000074
は
【化６７】
2019510087.tif 000075
である、実施形態９６〜１３４のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３８．  ホスホラミダイトは、国際公開第／２０１１／００５７６１号、国際公開第／２０１３／０１２７５８号、国際公開第／２０１４／０１２０８１号、国際公開第／２０１５／１０７４２５号、国際公開第／２０１０／０６４１４６号、国際公開第／２０１４／０１０２５０号、国際公開第／２０１１／１０８６８２号、国際公開第／２０１２／０３９４４８号、又は国際公開第／２０１２／０７３８５７号に記載されるものである、実施形態１〜１３７のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１３９．  ホスホラミダイトは、、１３７
【化６８】
2019510087.tif 000076
2019510087.tif 000077
から選択される、実施形態１〜１３７のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１４０．  ホスホラミダイトは表１から選択される、実施形態１〜１３７のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１４１．  
【化６９】
2019510087.tif 000078
は
2019510087.tif 000079
である、実施形態９６〜１３２のいずれか１項に記載の方法又は組成物。
１４２．  実施形態１〜１４１のいずれか１項に記載の方法を含む、オリゴヌクレオチドを調製する方法。
１４３．  実施形態１〜１４２のいずれか１項に記載の組成物を提供することを含む、オリゴヌクレオチドを調製する方法。
１４４．  オリゴヌクレオチドを調製する方法は、国際公開第／２０１１／００５７６１号、国際公開第／２０１３／０１２７５８号、国際公開第／２０１４／０１２０８１号、国際公開第／２０１５／１０７４２５号、国際公開第／２０１０／０６４１４６号、国際公開第／２０１４／０１０２５０号、国際公開第／２０１１／１０８６８２号、国際公開第／２０１２／０３９４４８、又は国際公開第／２０１２／０７３８５７号に記載されるものである、実施形態１４２又は１４３に記載の方法。
【実施例】
【０１９０】
非限定的な例を以下に示す。当業者であれば、本明細書に例示するように、別のホスホラミダイトも、同様に大幅に改善された収率及び／又は純度で調製及び精製することができることを認識する。
【化７０】
2019510087.tif 000080
【０１９１】
（Ｓ）−２−（メチルジフェニルシリル）−１−（（Ｓ）−ピロリジン−２−イル）エタノール１（２８．３ｇ、９１．０ｍｍｏｌ）を無水トルエン（１１０ｍＬ）を用いて共沸蒸発により乾燥させ、高真空下で一晩放置した。無水トルエン（１５０ｍＬ）に溶解したこの乾燥した１（２８．３ｇ、９１．０ｍｍｏｌ）及び４−メチルモルホリン（１８．５９ｇ、１８４ｍｍｏｌ）の溶液を、無水トルエン（８０ｍＬ）に溶解したトリクロロホスフィンの氷冷溶液（１２．６ｇ、８．０ｍＬ、９２ｍｍｏｌ）にカニューレを介してアルゴン下で添加し、反応混合物を０℃で４０分間撹拌した。反応混合物を室温（ｒｔ）まで加温して１時間撹拌した後、白色沈殿物を、Ｓｃｈｌｅｎｋエアフリーフィルター管を用いて、真空下で、アルゴンで逆流させて濾過した。溶媒を２５℃で真空下で除去し、このようにして得られた粗製半固体を高真空下で１２時間乾燥させ、更に精製することなく次の合成の工程で使用した。
【化７１】
2019510087.tif 000081
【０１９２】
ヌクレオシド５’−ＤＭＴ−ｄＡ（Ｎ６−Ｂｚ）、３、（４０ｇ、６０．８ｍｍｏｌ）を最初に無水ピリジン（６０ｍＬ）、次いで無水トルエン（１１０ｍＬ）で共沸蒸発により乾燥させ、高真空下で２４時間乾燥させた。この乾燥させた化合物をＴＨＦ（１４０ｍＬ）に溶解し、続いてトリエチルアミン（３０．８ｇ、４２．４ｍＬ、３０４ｍｍｏｌ）を添加し、次いでＩＰＡ／ドライアイスバスを用いて−７８℃に冷却した。（上記のようにして得られた）粗製化合物２のＴＨＦ溶液（８０ｍＬ）をカニューレを介して１５分間かけて添加し、次いでその混合物を室温まで徐々に加温した。ｒｔで１時間後、ＴＬＣは、ＳＭの生成物への完全な変換を示した。混合物を０℃で冷却し、次いでＣＨＣｌ３（８００ｍＬ）を加え、続いて飽和ＮａＨＣＯ３（４００ｍＬ）を加えた。有機層を分離し、飽和ＮａＨＣＯ３（２×４００ｍＬ）で洗浄した。合わせた水層をＣＨＣｌ３（２００ｍＬ）で抽出し、そして飽和ＮａＨＣＯ３（２００ｍＬ）で洗浄した。合わせたＣＨＣｌ３抽出物を無水Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、揮発性物質をロータリーエバポレーターで２５℃で除去して淡黄色固体を得た。７１ｇの粗製化合物４。
【０１９３】
精製方法
【０１９４】
上記粗製物質を、前処理したシリカゲルカラム、又は前処理していないシリカゲルカラムのいずれかを使用して、Ｔｅｌｅｄｙｎｅ製のＣｏｍｂｉｆｌａｓｈ機器で精製した。いずれの場合も、分離方法以外のすべての特徴は同一であった。
【０１９５】
前処理していないシリカカラムを用いた精製
【０１９６】
３．０ｇの粗製化合物４を、メチレンクロライド：５％Ｅｔ３Ｎを含むヘキサンが２：１（体積：体積）の混合物中に溶解し、次いで５％のＥｔ３Ｎを含有する２０％ヘキサン／ＥｔＯＡｃの５カラム容量で平衡化した２４ｇのシリカカラム上へ充填した。試料をカラム上に充填した後、クロマトグラム（図１）に示すように５％Ｅｔ３Ｎを含む２０〜８０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサンのグラジエントを用いて精製プロセスを実行した。ＴＬＣによって均一であった画分、図１に示す１４−２２、を一緒にプールし、揮発性物質をロータリーエバポレーターで除去し、残留溶媒を高真空下で１８時間かけて除去して、無色の白色固体を得た（純粋な化合物４の収率＝１．３ｇ、５６％）。いくつかの実施形態では、初期の画分は非極性の不純物を示したが、後の画分は分解を示した。特定の理論に拘束される意図はないが、場合によっては、分解はホスホラミダイト基での変換に起因する。
【０１９７】
前処理したシリカカラムを用いることによる精製
【０１９８】
５カラム体積の５％Ｅｔ３Ｎを含む２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサンで平衡化する前に、２４ｇのシリカゲルカラムを５カラム容量のメタノールで溶出することにより最初に前処理した以外は、今回の前処理しない方法について記載された正確な方法に従った。この場合、画分１５〜２３のプール及び蒸発から生じる無色の白色固体も同様に得られた（純粋な化合物４の収率＝２．０ｇ、８３％）。いくつかの実施形態では、前処理された精製媒体は、実施例によって示されるように、より良好な分離、良好なピーク形状及び／又は少ないテーリングを提供する。
【０１９９】
生成物はＣＤＣｌ３中に記録した３１Ｐ−ＮＭＲにより確認され、いずれの方法でも同じであった。３１Ｐ−ＮＭＲ：δ１５１．１４．
【０２００】
本開示に記載された技術に従って、多様な置換基を有する多くの実施例のホスホラミダイト（例えば、表１に記載されているもの）がうまく調製され、精製され、高い収率及び／又は純度を提供する。本開示に記載されているように、提供される技術は、とりわけ、溶出効率を改善し及び／又は分解を減少若しくは排除させることができる。実施例によって示されるように、Ｏ６−保護されていないグアニン残基を含むホスホラミダイトは、うまく精製され、高い収率及び純度を提供した。
【０２０１】
本開示に記載されているように、別の吸湿性溶媒を本開示に従って利用し、著しく改善された収率及び／又は純度を達成することができる。いくつかの実施形態では、アセトニトリルは、本明細書に記載の実施例の場合と同様にメタノールに利用され、収率及び／又は純度の大幅な改善をもたした。いくつかの実施形態では、エチルアセテートは、本明細書に記載の実施例の場合と同様にメタノールに利用され、収率及び／又は純度の大幅な改善をもたした。
【０２０２】
本明細書に示されるように、提供される技術は、従来技術と比較して驚くほどより高い収率及び／又は純度を提供する。とりわけ、提供される技術は、精製中のホスホラミダイトの分解を抑制するのに意外にも有効である。
【０２０３】
本開示のいくつかの実施形態を本明細書に記載し例示したが、当業者は、本明細書に記載の機能を実行し、並びに／若しくは結果及び／若しくは利点の１つ又は複数を得るための様々な別の手段並びに／又は構造を容易に想像するであろう。そして、このような変形及び／又は修正の各々は、本開示の範囲内にあるとみなされる。より一般的には、当業者は、本明細書に記載される全てのパラメータ、寸法、材料、及び構成が例示的であることを意味し、実際のパラメータ、寸法、材料、及び／又は構成は、本開示の教示が使用される特定の用途又は用途に依存することを容易に認識するであろう。当業者は、日常的な実験のみで、本明細書に記載される開示の特定の実施形態に対する多くの均等物を認識する、又は確認することができるであろう。したがって、前述の実施形態は単なる例として提示され、添付の特許請求の範囲及びそれと等価なものの範囲内で、本開示は、具体的に記載され請求される以外の方法で実施されてもよい。本開示は、本明細書に記載の個々の特徴、システム、物品、材料、キット、及び／又は方法をに関する。更に、２つ以上のこのような特徴、システム、物品、キット、及び／又は方法の任意の組み合わせは、このような特徴、システム、物品、材料、キット、及び／又は方法が相互に矛盾しない場合、本開示の範囲内に含まれる。
【図１】
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【図２】
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【国際調査報告】
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