(57)【要約】  前記抗体またはその断片が、前記抗体またはその断片の少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片との間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含むことを特徴とする抗免疫グロブリン特異的抗体（またはその断片）。  前記抗体またはその断片が、前記抗体またはその断片の少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片との間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含むことを特徴とする抗免疫グロブリン特異的抗体（またはその断片）を精製する方法。  対象に由来する試料中の対象の検体または検体の断片を定量する方法であって、この方法は（ｉ）相当する対象の検体または断片と識別可能な１種以上の対照検体またはその断片の所定量を前記試料に加えること、（ｉｉ）前記試料中の前記対象の検体または断片の相対量と前記対照検体または断片の量を測定すること、および（ｉｉｉ）前記対象の検体または断片の相対量と前記対照検体または断片の相対量を比較して、元の対象の試料中の前記検体または断片の量を定量することを含む。【特許請求の範囲】
【請求項１】
免疫グロブリンを精製または特徴付ける方法であって、
前記免疫グロブリンを含む試料を、少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含む抗体または断片と接触させること、
前記免疫グロブリンを前記抗体または断片と結合させること、
前記抗体または断片に結合させた免疫グロブリンから未結合の材料を洗い落とすこと、および
前記結合させた免疫グロブリンを前記抗体または断片から除去して、精製された免疫グロブリンまたは断片を生成することを含む、方法。
【請求項２】
前記精製された免疫グロブリンを質量分析によって特徴付けることをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含む抗体（または断片）、および１種以上の質量分析基準物質を含む、質量分析に使用する免疫グロブリン精製およびアッセイキット。
【請求項４】
対象に由来する試料中の対象の検体または検体の断片を定量する方法であって、
（ｉ）相当する対象の検体または断片と識別可能な１種以上の対照検体またはその断片の所定量を前記試料に加えること、
（ｉｉ）前記試料中の前記対象の検体または断片の相対量および前記対照検体または断片の量を測定すること、および
（ｉｉｉ）前記対象の検体または断片の相対量を前記対照検体または断片の相対量と比較して、元の対象の試料中の前記検体または断片の量を定量することを含む、方法。
【請求項５】
前記検体は免疫グロブリンまたはその断片である、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
免疫グロブリンまたは断片などの前記対象の検体を定量する前に少なくとも１つの精製工程で精製し、その精製工程前に所定量の免疫グロブリンまたは断片などの対照検体を前記試料に加える、請求項４または５に記載の方法。
【請求項７】
免疫グロブリンまたは断片などの前記対象の検体および対照検体の量は質量分析により決定される、請求項４〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記対象の免疫グロブリンまたは断片は、無傷の免疫グロブリン、重鎖、カッパ軽鎖、ラムダ軽鎖、Ｆｃ断片、またはＦａｂ断片である、請求項４〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記対照免疫グロブリンは、前記対象免疫グロブリンまたはその断片に比べて１種以上の重鎖、カッパ軽鎖、またはラムダ軽鎖のＮ末端またはＣ末端に複数のアミノ酸を含むか、あるいは前記対照タンパク質はモノクローナル抗体またはその断片である、請求項４〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記カッパ軽鎖および／またはラムダ軽鎖は遊離カッパ軽鎖または遊離ラムダ軽鎖である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記複数のアミノ酸は、前記対象の免疫グロブリンまたはその断片に比べて、Ｃ末端にある、請求項９または１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記対照免疫グロブリンは、無傷の免疫グロブリン、遊離カッパ軽鎖、または遊離ラムダ軽鎖のうちの２つ以上を含む、請求項５〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記対象はＢ細胞関連疾患を持つ、上記の請求項のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
質量分析用の試料を調製する方法であって、
（ｉ）免疫グロブリンまたはその断片を含む対象に由来する試料を準備すること、
（ｉｉ）所定の分子量を持つ対照免疫グロブリンまたは断片の所定量を前記試料に加えること、
（ｉｉｉ）少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含む抗免疫グロブリン抗体または断片を用いて、前記対照免疫グロブリンまたは断片を前記免疫グロブリンまたは断片と共に免疫精製により共精製すること、および必要に応じて
（ｉｖ）前記共精製された試料を質量分析標的に配置させることを含む、方法。
【請求項１５】
前記対照免疫グロブリンまたは断片は、質量分析により測定される目的の免疫グロブリンまたは断片よりも高いまたは低い分子量を持つ、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記共精製された試料を含む標的を質量分析にかけて前記試料を分析する工程をさらに含む、請求項１４または１５に記載の方法。
【請求項１７】
少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含む抗体または断片、および免疫グロブリンまたは断片の質量分析標準物質を含む、アッセイキット。
【請求項１８】
質量分析標的を含む、請求項１７に記載のアッセイキット。
【請求項１９】
前記抗体または断片はポリクロナール抗体またはその断片である、請求項１、２または１４〜１６のいずれか一項に記載の方法、あるいは請求項３、１７、または１８に記載のキット。
【請求項２０】
前記抗体またはその断片は、抗遊離軽鎖クラスに特異的、抗重鎖クラスに特異的、抗重鎖サブクラスに特異的、抗重鎖クラス−軽鎖タイプに特異的、または抗軽鎖タイプに特異的である、請求項１〜３または１４〜１９のいずれか一項に記載の方法またはキット。
【請求項２１】
前記抗体またはその断片が、前記抗体またはその断片の少なくとも１つの重鎖またはその断片と少なくとも１つの軽鎖またはその断片の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含むことを特徴とする抗免疫グロブリン特異的抗体（またはその断片）。
【請求項２２】
抗遊離軽鎖に特異的、抗重鎖クラスに特異的、抗重鎖サブクラスに特異的、抗重鎖クラス−軽鎖タイプに特異的、または抗軽鎖タイプに特異的である、請求項２１に記載の抗体または断片。
【請求項２３】
前記架橋はビスマレイミドまたはチオエーテル結合を含む、請求項２１または２２に記載の抗体または断片。
【請求項２４】
支持体に結合させた、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載の抗体または断片。
【請求項２５】
前記抗体または断片は、モノクローナル抗体または断片、もしくはポリクロナール抗体またはその断片である、請求項２１〜２４のいずれか一項に記載の抗体または断片。
【請求項２６】
前記抗体は、抗体の断片であり、Ｆ（ａｂ’）２断片である、請求項２１〜２５のいずれか一項に記載の抗体または断片。
【請求項２７】
１種以上の免疫グロブリンの精製に用いられる請求項２１〜２６のいずれか一項に記載の抗体または断片。
【請求項２８】
Ｂ細胞関連疾患または他の免疫関連疾患を診断あるいは予後診断する方法であって、抗体を用いて免疫グロブリンを精製あるいは特徴付けを行うことを含み、上記請求項のいずれか一項に記載のアッセイキットを使用する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、少なくとも１つの重鎖と少なくとも１つの軽鎖の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含む抗免疫グロブリン特異的抗体（またはその断片）に関する。これらの抗体は、特に試料に由来する免疫グロブリンの単離または精製に有用である。また、質量分析の標準として用いられる試料に組み込むための対照免疫グロブリンも提供される。
【背景技術】
【０００２】
抗体分子（また免疫グロブリンとしても知られている）は二回転対称性を持ち、典型的には２つの同じ重鎖と２つの同じ軽鎖からなる。重鎖と軽鎖はそれぞれ、可変領域と定常領域を含む。重鎖と軽鎖の可変領域が結合して抗原結合部位を形成することで重鎖と軽鎖の両方が抗体分子の抗原結合特異性に寄与している。抗体の塩基性四量体構造は、ジスルフィド結合によって共有結合した２つの重鎖を含む。そしてまた、各重鎖はジスルフィド結合によって軽鎖に結合している。これにより実質的に「Ｙ」形状分子になっている。
【０００３】
重鎖は、抗体に見られる２種類の鎖のうちの大きいほうで、典型的には分子質量が５０，０００〜７７，０００Ｄａである。これに比べて軽鎖はより小さい（２５，０００Ｄａ）。
【０００４】
重鎖には５つの主要なクラスがあり、重鎖の構成要素であるγ、α、μ、δ、およびεがそれぞれＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、およびＩｇＥに対応している。ＩｇＧは正常なヒト血清の主要な免疫グロブリンであり、総免疫グロブリンプールの７０〜７５％を占める。ＩｇＧは二次免疫応答の主要な抗体である。ＩｇＧは、２つの重鎖と２つの軽鎖からなる１個の四量体という形態である。
【０００５】
ＩｇＭは、免疫グロブリンプールの約１０％を占める。ＩｇＭ分子は、Ｊ鎖と共に、５つの基本４鎖構造からなる五量体を形成する。個々の重鎖の分子量は約６５，０００Ｄａであり、分子全体の分子量は約９７０，０００Ｄａである。ＩｇＭは主に血管内プールに閉じ込められており、主要な初期抗体である。
【０００６】
ＩｇＡは、ヒト血清免疫グロブリンプールの１５〜２０％を占める。ＩｇＡの８０％超は、単量体として発生する。しかしながら、ＩｇＡ（分泌性ＩｇＡ）によっては二量体の形態で存在する。
【０００７】
ＩｇＤは総血漿免疫グロブリンの１％未満を占める。ＩｇＤ成熟Ｂ細胞の表面膜で観察される。
【０００８】
ＩｇＥは正常な血清では少ないが、好塩基球およびマスト細胞の表面膜で観察される。ＩｇＥは喘息および花粉症などのアレルギー性疾患と関連付けられる。
【０００９】
これらの主要な５つのクラスに加えて、ＩｇＧには４つのサブクラス（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４）がある。また、ＩｇＡには２つのサブクラス（ＩｇＡ１とＩｇＡ２）がある。
【００１０】
軽鎖には２つの種類、ラムダ（λ）とカッパ（κ）がある。ヒトで産生されるκ分子はλ分子の約２倍多いが、これは哺乳類によってかなり異なる。各鎖は、１個の定常領域と１個の可変領域に折りたたまれた単一ポリペプチド鎖に約２２０アミノ酸を含む。血漿細胞は、κ分子またはλ分子のいずれかを持つ５種の重鎖のうちの１種を産生する。重鎖合成に亘って通常、約４０％の過剰な遊離軽鎖生成物が存在する。軽鎖分子が重鎖分子に結合しない場合、それらは「遊離軽鎖分子」として知られている。κ軽鎖は一般的に単量体として観察される。λ軽鎖は二量体を形成する傾向にある。
【００１１】
抗体産生細胞に関連付けられる増殖性の疾患がいくつか存在する。
【００１２】
そのような増殖性の疾患の多くで、血漿細胞は増殖して同一の血漿細胞の単クローン性腫瘍を形成する。その結果、同一の免疫グロブリンが多量に生成される。これは単クローン性高ガンマグロブリン血症として知られている。
【００１３】
骨髄腫および原発性全身性アミロイドーシス（ＡＬアミロイドーシス）などの疾患はそれぞれ、英国の癌による死亡のうちの約１．５％および０．３％を占める。多発性骨髄腫は、非ホジキンリンパ腫に次いで一般的な血液学的悪性腫瘍の形態である。白色人種集団での罹患率は年間で１００万人に約４０人である。従来、多発性骨髄腫の診断は、骨髄中の過剰なモノクローナル血漿細胞、血清または尿中のモノクローナル免疫グロブリン、および関連する器官や組織の障害（例えば、高カルシウム血症、腎不全、貧血、または骨病変）の存在に基づいている。骨髄の正常な血漿細胞含有量は約１％であるが、多発性骨髄腫では含有量は典型的には１０％超、しばしば３０％超であり、９０％を超える場合もある。
【００１４】
ＡＬアミロイドーシスは、アミロイド堆積物としてモノクローナル遊離軽鎖断片が蓄積するという特徴を持つタンパク質高次構造障害である。典型的には、これらの患者には心不全または腎不全が見られるが、末梢神経や他の器官も関連がある場合がある。
【００１５】
患者の血流、または実際には尿中のモノクローナル免疫グロブリンの存在により同定され得る他の疾患がいくつかある。これらは、形質細胞腫および髄外性形質細胞腫、骨髄の外部に生じ、任意の器官に発生し得る血漿細胞腫瘍を含む。モノクローナルタンパク質が存在する場合、典型的にはＩｇＡである。多発性骨髄腫の証拠があってもなくても多発性孤立性形質細胞腫は起こる場合がある。ヴァルデンストレームマクログロブリン血症は、モノクローナルＩｇＭの生成に関連付けられる低悪性度のリンパ増殖性疾患である。米国では年間約１，５００の新たな症例、英国では３００の新たな症例がある。血清ＩｇＭの定量は、診断と監視の両方で重要である。Ｂ細胞非ホジキンリンパ腫は、英国のすべての癌による死亡のうち約２．６％の原因となっており、標準的な電気泳動法を用いて約１０〜１５％の患者の血清中にモノクローナル免疫グロブリンが同定された。初期の報告には、６０〜７０％の患者の尿中にモノクローナル遊離軽鎖を検出することができることが示されている。Ｂ細胞慢性リンパ球白血病では、遊離軽鎖免疫アッセイによりモノクローナルタンパク質が同定されている。
【００１６】
また、いわゆる意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症（ＭＧＵＳ）という疾患がある。これらは、意義不明の単クローン性高ガンマグロブリン血症である。この用語は、多発性骨髄腫、ＡＬアミロイドーシス、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症などの兆候を持たない個体での無傷のモノクローナル免疫グロブリンの予期しない存在を指す。ＭＧＵＳは、５０歳以上で集団の１％、７０歳以上で３％、８０歳以上で１０％まで見られる場合がある。これらのほとんどはＩｇＧまたはＩｇＭ関連であるが、非常に希にＩｇＡ関連のものや二クローン性のものがある。ＭＧＵＳを持つほとんどの人は関係のない病気で亡くなるが、ＭＧＵＳは悪性単クローン性免疫グロブリン異常症に変形することもある。
【００１７】
上で示した疾患の少なくともいくつかの場合では、異常な濃度のモノクローナル免疫グロブリンまたは遊離軽鎖が見られる。疾患により血漿細胞の異常な複製が行われると、この種の細胞によってより多くの免疫グロブリンが生成されることがあり、「単一クローン」が繁殖して血液中に現れる。
【００１８】
免疫固定電気泳動は、免疫グロブリン分子に対して沈降する抗体を用いる。これにより検査の感度を向上させる一方で、沈降する抗体の存在のためにモノクローナル免疫グロブリンを定量するのには用いることができない。また、免疫固定電気泳動はむしろ行うのが煩雑で解釈が困難な場合がある。多くの臨床実験室では血清タンパク質分離にキャピラリーゾーン電気泳動が用いられ、ほとんどのモノクローナル免疫グロブリンを検出することができる。しかしながら、免疫固定と比較した場合、キャピラリーゾーン電気泳動は５％の試料でモノクローナルタンパク質の検出ができない。これらのいわゆる「偽陰性」の結果は、低濃度のモノクローナルタンパク質を包含している。
【００１９】
総κアッセイおよび総λアッセイが開発されている。しかしながら、総κアッセイおよび総λアッセイはモノクローナル免疫グロブリンまたは遊離軽鎖の検出には感度が低すぎる。これは、このようなアッセイと干渉するポリクロナール結合軽鎖のバックグラウンド濃度が高いためである。
【００２０】
より最近では、遊離κ軽鎖と遊離λ軽鎖を個別に検知する高感度アッセイが開発された。この方法は、遊離κ軽鎖または遊離λ軽鎖のいずれかに対するポリクロナール抗体を用いる。また、ＷＯ９７／１７３７２ではそのような抗体を上昇させる可能性がいくつかの異なる可能な特異性の一つとして述べられている。この文献は、動物を耐性化して、従来の技術で産生することができるのよりもより特異的な所望の抗体を産生させることができる方法を開示している。この遊離軽鎖アッセイは、遊離λ軽鎖または遊離κ軽鎖に結合する抗体を用いる。遊離軽鎖の濃度はネフェロ分析または比濁法により決定される。この方法は、反応槽またはキュベット中の適切な抗体を含む溶液に検査試料を添加することを含む。抗原−抗体反応を進行させながら、キュベットに光線を透過させる。不溶性免疫複合体が形成されるに従ってキュベットを透過した光の散乱が増加する。ネフェロ分析では、入射光から離れた角度で光の強度を測定して光の散乱を監視する。一方、比濁法では、入射光の強度の減少を測定して光の散乱を監視する。まず、一連の既知の抗原（すなわち、遊離κまたは遊離λ）濃度を基準としてアッセイを行って、抗原濃度に対する測定された光の散乱の較正曲線を作成する。
【００２１】
この形態のアッセイは、遊離軽鎖濃度をよく検出することが分かった。さらに、技術の感度も非常に高い。
【００２２】
Ｂ細胞疾患（例えば、多発性骨髄腫）や他の免疫仲介疾患（例えば、腎症）を含む広範囲の疾患において、遊離軽鎖（ＦＬＣ）、重鎖またはサブクラス、重鎖のクラスまたはサブクラスに結合する軽鎖種の量または種類の特性評価は重要である。
【００２３】
ＷＯ２０１５／１５４０５２（その全内容を参照により本明細書に組み込む）には、質量分析（ＭＳ）を用いて免疫グロブリン軽鎖、免疫グロブリン重鎖、またはこれらの混合物を検出する方法が開示されている。免疫グロブリン軽鎖、免疫グロブリン重鎖、またはこれらの混合物を含む試料を免疫精製して、質量分析を行い、試料の質量スペクトルを得る。これを用いて患者に由来する試料中のモノクローナルタンパク質を検出してもよい。また、これを用いてフィンガープリンティング法、アイソタイプの決定、およびモノクローナル抗体のジスルフィド結合の同定を行ってもよい。
【００２４】
ＭＳを用いて、例えば、質量および電荷により試料中のラムダ鎖とカッパ鎖を分離する。また、ＭＳを用いて、例えば、還元剤を用いて重鎖と軽鎖のジスルフィド結合を還元することで免疫グロブリンの重鎖成分を検出してもよい。ＭＳはＷＯ２０１５／１３１１６９（参照によりその全内容を本明細書に組み込む）にも記載されている。
【００２５】
診断手順での試料中の免疫グロブリンの精製には、典型的には、抗全抗体（例えば、抗ＩｇＧ抗体または抗ＩｇＡ抗体）あるいは抗遊離軽鎖抗体（例えば、抗κ軽鎖抗体または抗λ軽鎖抗体）が用いられる。
【００２６】
この技術の問題は、精製される抗体自体に由来する軽鎖または重鎖が、検査試料に放出され得るということである。この汚染は、その後の試料の特性評価の確度に影響を及ぼすことがある。
【００２７】
上で示すように、抗体の重鎖と軽鎖は、通常、ジスルフィド結合を介して結合されている。ジスルフィド結合は比較的弱く、切断して重鎖と軽鎖を互いに放出することができる。
【００２８】
ＷＯ２００６／０９９４８１Ａには、ポリペプチド（例えば、ポリクロナール抗体、モノクローナル抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ）断片、およびＦ（ａｂ’）２断片、一本鎖抗体、ヒト抗体、調和させたまたはキメラ抗体、およびエピトープ結合断片など）を含む広範囲の巨大分子での鎖内および鎖間チオエーテル架橋の使用が記載されている。この文献には、架橋の目的は、抗体または断片の安定性と医薬および機能特性を高めることであると記載されている。特に、その目的は、例えば、異なるモノクローナル抗体（例えば、抗ＲＳＶ抗体を含む抗ウイルス抗原抗体など）の重鎖と軽鎖を架橋することである。抗体の医薬特性を向上させるという目的が述べられている。
【００２９】
ＷＯ００／４４７８８には、向上した治療薬を製造する目的で、チオエーテルを用いて異なる特異性を持つ異なる抗体分子を架橋することが記載されている。同様に、ＷＯ９１／０３４９３には異なる特異性を持つ二重あるいは三重特異性のＦ（ａｂ）３またはＦ（ａｂ）４複合体が示されている。
【００３０】
チオエーテル類は、保存中の治療用抗体で濃度が上昇することが観察されている(Zhang Q et al JBC manuscript (2013) M113.468367)。軽鎖−重鎖ジスルフィド（ＬＣ２１４−ＨＣ２２０）はチオエーテル結合に変換し得る。１種のＩｇＧ１ｋ治療用抗体は、血液中を循環する一方で１日０．１％の率でその位置でチオエーテルに変換することが観察された。また、内在性抗体が健康なヒト対象者で形成されることが観察された。Zhang et alは、試験管内でのチオエーテルの形成を繰り返した。これを用いて、チオエーテル結合の治療用モノクローナル抗体に及ぼす安全性の影響を評価する助けとした。
【発明の概要】
【００３１】
架橋形成を課題と見なしたZhangに対して、本出願人は、使用によっては、架橋された抗体の形成は予期しない利点があり得ることに気づいた。
【００３２】
本出願人は、抗体の精製から汚染（例えば、無傷の免疫グロブリン、Ｆ（ａｂ）断片、またはＦ（ａｂ’）２断片からの遊離軽鎖の放出、あるいはビーズからのナノ物質の放出）の量を低減することには利点があることに気がついた。
【００３３】
本発明は、抗体（またはその断片）の少なくとも１つの重鎖（またはその断片）と少なくとも１つの軽鎖（またはその断片）の間に１つ以上の非ジスルフィド架橋を含む抗免疫グロブリン特異的抗体（またはその断片）を提供する。また、本来の重鎖−軽鎖ジスルフィド架橋に加えて、あるいはそれに代えて隣接する重鎖同士を架橋してもよい。
【００３４】
上記の架橋は、典型的には同じ抗体の鎖同士の分子内架橋である。
【００３５】
この架橋は、典型的にはチオエーテル結合を含む。
【００３６】
チオエーテル架橋は、チオエーテル結合を含む。これは、２つの硫黄による結合ではなく単一の硫黄による結合を持つ抗体の残基間の結合である。これは、チオエーテル架橋は、２つ以上の硫黄原子を含む結合（例えば、当業者には馴染みのあるジスルフィド架橋）を含まないということである。そうではなく、チオエーテル架橋は、巨大分子の残基を架橋する単一の硫黄による結合を含む。また、１つ以上の追加の非硫黄原子がこの結合を形成してもよい。
【００３７】
チオエーテル架橋によって結合される残基は、天然の残基であってもよく、あるいは非天然の残基であってもよい。当業者には自明だが、チオエーテル架橋の形成により、残基から原子が失われる場合がある。例えば、２つのシステイン残基の側鎖間にチオエーテル架橋が形成されると、これら残基から硫黄原子と水素原子が失われることがあるが、得られたチオエーテル架橋は、当業者によりシステイン残基を架橋したと認識される。
【００３８】
チオエーテル架橋は、抗体のいずれか２つの残基を結合してもよい。これらの残基の１つ以上を、例えば、システイン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ヒスチジン、メチオニン、およびチロシンから選択してもよい。これら残基のうちの２つをシステイン、アスパラギン酸、グルタミン酸、ヒスチジン、メチオニン、およびチロシンからなる群より選択してもよい。より典型的には、残基のうちの２つはシステイン残基である。典型的には、重鎖と軽鎖の間は１つのチオエーテル架橋のみである。あるいは、２つ、３つ、あるいはそれ以上のチオエーテル架橋を用いてもよい。また、抗体あるいはその断片の重鎖対は、１つ以上の非ジスルフィド架橋（例えば、チオエーテル結合）により結合されていてもよい。
【００３９】
チオエーテル架橋については、例えば、WO2006/099481、およびZhang et al (2013) J. Biol. Chem. vol 288(23), 16371-8 and Zhang & Flynn (2013) J. Biol. Chem, vol 288(43), 34325-35に記載されており、参照により本明細書に組み込まれる。
【００４０】
ホスフィンや亜リン酸塩を用いてもよい。本明細書で「ホスフィン」は、一般式Ｒ３Ｐ（ここで、Ｐは亜リン酸、Ｒは任意の他の原子である）で表される少なくとも１つの機能単位を含む任意の化合物をいう。亜リン酸塩では、Ｒ位置は具体的には酸素原子で占められる。Ｒ３Ｐ含有化合物は、ジスルフィド結合を攻撃することができる強力な求核剤として作用する。これによりジスルフィドが還元されることがあるが、条件によってはチオエーテル結合が形成されることもある。
【００４１】
そのような化合物としては、
トリス（ジメチルアミノ）ホスフィン(CAS Number 1608-26-0)、
トリス（ジエチルアミノ）ホスフィン(CAS Number 2283-11-6)、
トリメチル亜リン酸(CAS Number 121-45-9)、
トリブチルホスフィン(CAS Number 998-40-3)が挙げられる。
【００４２】
参考文献：Bernardes et al. (2008) Angew. Chem. Int. Ed., vol 47, 2244-2247（参照により本明細書に組み込まれる）
【００４３】
また、架橋は、マレイミド架橋剤など、遊離チオールと反応して抗体分子の鎖を架橋する架橋剤を含んでいてもよい。これにより、WO00/44788に記載されているように、チオール基の側鎖の１つ、さらにはリシンカルボキシル基などの他の部位に結合することができる。
【００４４】
リンカー、特に柔軟性のあるリンカーによって結合された２つの反応性部位を含む二官能架橋剤を用いてもよい。このリンカーは、例えば、置換または非置換のアルキルなどの鎖に共有結合した１つ以上の炭素を含んでいてもよい。このリンカーは、特にＣ１〜Ｃ１０リンカー、最も典型的にはＣ２〜Ｃ６またはＣ３〜Ｃ６リンカーである。本出願人らは、比較的高濃度で架橋されたタンパク質を回収するのにＣ２〜Ｃ６含有架橋剤（例えば、α，α′−ジブロモ−ｍ−キシレン、ＢＭＯＥ（ビスマレイミドエタン）、またはＢＭＢ（ビスマレイミドブタン）など）が特に有用であることを見出した。
ビスマレイミドは、ホモ二官能スルフヒドリル反応性架橋剤である
【００４５】
これは、炭化水素または他のリンカーによって結合された２つのマレイミド基を含む、よく特徴付けられた架橋剤群である。マレイミド基は、ジスルフィドの還元に曝された遊離スルフヒドリル基と自然に反応して、各スルフヒドリルで非還元性チオエーテル結合を形成し、それにより２つのシスチン残基を共有結合により架橋する。
【００４６】
そのような化合物としては、
ビス（マレイミド）エタン(CAS Number 5132-30-9)、
１，４−ビス（マレイミド）ブタン(CAS Number 28537-70-4)が挙げられる。
参考文献：
【００４７】
Auclair et al. (2010) Strategies for stabilizing superoxide dismutase (SOD1), the protein destabilized in the most common form of familial amyotrophic lateral sclerosis. Proc Natl Acad Sci U S A, vol 107(50) - pages 21394-9
【００４８】
Geula at al. (2012) Structure-based analysis of VDAC1 protein: defining oligomer contact sites. J Biol Chem, vol 287(3), 475-85
【００４９】
Kida et al. (2007) Two translocating hydrophilic segments of a nascent chain span the ER membrane during multispanning protein topogenesis. J Cell Biol, vol 171(7) pages 1441-1452（参照により本明細書に組み込まれる）
α，α’−ジブロモ−ｍ−キシレンは使用可能なホモ二官能性スルフヒドリル反応性架橋剤である
【００５０】
ジブロモ−ｍ−キシレン(CAS Number 626-15-3)はハロゲン化ジアルキル化合物群のうちの１つであり、遊離スルフヒドリル基と反応するホモ二官能性架橋剤として作用する。
参考文献：
【００５１】
Jo et al. (2012) Development of α-Helical Calpain Probes by Mimicking a Natural Protein-Protein Interaction J Am Chem Soc., col 134(42) - pages 17704-13（参照により本明細書に組み込まれる）
安定したチオエーテル結合を形成する別のスルフヒドリル反応性架橋化合物
【００５２】
少なくとも６つの分類群の試薬が遊離スルフヒドリルと反応して非還元性共有架橋生成物を生成することが知られている。これら化合物のスルフヒドリル基に対する特異的反応性は様々で、特定の条件で水、アミン、およびカルボキシル基と反応するものもある。また、これら化合物の多くは嵩高いリンカー基を持ち、制限された空間的環境で架橋する能力が限定されていることがある。以下のリストに各分類群からのいくつかの例を示すが、より包括的なリストおよび基準は以下の文献に示されている：
【００５３】
Chemistry of Protein Conjugation and Cross-linking, Wong, S: ISBN 0-8493-5886-8（参照により本明細書に組み込まれる）
【００５４】
ビスマレイミド
ビス（マレイミド）ヘキサン、Ｎ−Ｎ’−Ｍエチレンビスマレイミド、ビス（Ｎ−マレイミドメチル）エーテル、Ｎ，Ｎ’−（１，３−フェニレン）−ビスマレイミド、ビス（Ｎ−マレイミド）−４，４’−ビベンジル、ナフタレン−１，５−ジマレイミド
【００５５】
ハロアセチル誘導体
１，３−ジブロモアセトン、Ｎ，Ｎ’−ビス（ヨードアセチル）ポリメチレンジアミン、Ｎ，Ｎ’−ジ（ブロモアセチル）フェニルヒドラジン、１，２−ジ（ブロモアセチル）アミノ−３−フェニルヒドラジン、γ−（２，４−ジニトロフェニル）−α−ブロモアセチル−Ｌ−ジアミノ酪酸＝ブロモアセチル−ヒドラジド
【００５６】
ジアルキルハロゲン化物
α，α’−ジブロモ−ｐ−キシレンスルホン酸、α，α’−ジヨード−ｐ−キシレンスルホン酸、ジ（２−クロロエチル）スルフィド、トリ（２−クロロエチル）アミン、Ｎ，Ｎ−ビス（β−ブロモエチル）ベンジルアミン
【００５７】
２．４  ｓ−トリアジン
ジクロロ−６−メトキシ−ｓ−トリアジン、２，４，６−トリクロロ−ｓ−トリアジン（シアヌル酸）、２，４−ジクロロ−６−（３’−メチル−４−アミノアニリノ）−ｓ−トリアジン、２，４−ジクロロ−６−アミノ−ｓ−トリアジン
【００５８】
アジリジン
２，４，６−トリ（エチレンイミド）−ｓ−トリアジン、Ｎ，Ｎ’−エチレンイミノイル−１，６−ジアミノヘキサン、トリ［１−（２−メチルアジリジニル）］−ホスフィンオキシド
【００５９】
ビスエポキシド
１，２：３，４−ジエポキシブタン、１，２：５，６−ジエポキシヘキサン、ビス（２，−エポキシプロピル）エーテル、１，４−ブタジオールジグリシドキシエーテル
【００６０】
この架橋は、１つ以上の天然に生じるジスルフィド結合を置換してもよく、あるいはそのジスルフィド結合に加えてこの架橋が形成されていてもよい。
【００６１】
典型的には、抗体の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％が架橋されている。例えば、ビスマレイミドを用いると７０％〜８０％の架橋効果が観察された。架橋された抗体をさらに精製して、例えば、還元剤を加えて残留する未架橋の抗体のジスルフィド結合を壊して、例えばゲル電気泳動法を用いて分離するなどにより、架橋を増やしてもよい。
【００６２】
抗体または断片は、抗遊離軽鎖（例えば、抗カッパ遊離軽鎖または抗ラムダ遊離軽鎖）に特異的、抗重鎖サブクラスに特異的、抗重鎖種に特異的、あるいは抗重鎖クラス−軽鎖種に特異的であってもよい。
【００６３】
重鎖クラスはＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、またはＩｇＥであってもよく、典型的にはＩｇＧあるいはＩｇＡである。
【００６４】
重鎖サブクラスは、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４を含む。
【００６５】
抗体は、種に特異的、例えば、抗ヒト、抗ウマ、抗ヒツジ、あるいは抗ブタであってもよい。抗体は、軟骨魚類、ヒツジ、ヤギ、ウマ、ウサギ、ウシ、ラクダ科の動物（例えば、ラマ）、ラット、またはマウス内で産生されてもよい。
【００６６】
本発明の抗体または断片は特異的に結合する免疫グロブリンである。
【００６７】
典型的には、抗体または断片は支持体に結合させている。これは例えば、抗体または断片の免疫精製など、タンパク質精製の分野で一般に知られている任意の好適なクロマトグラフ用支持体であってもよい。そのような支持体としては、当該分野で一般に知られている磁性ビーズ、アガロース樹脂、および他の支持体が挙げられる。抗体の支持体への共有結合および非共有結合は一般に当該分野で知られている。これは、例えば、抗体表面の遊離アミン基を薬剤（例えば、臭化シアノゲン、Ｎ−ヒドロキシコハク酸イミド（スルホ−ＮＨＳ）、または塩化トレジル）で活性化した支持体と反応させて達成してもよい。スルホ−ＮＨＳを用いてカルボン酸塩基と活性エステル官能基を形成するのに水溶性カルボジイミドＥＤＣを用いてもよい。ビオチン化抗体または支持体の一方を用いて、この支持体または抗体の他方の対応するストレプトアビジン部位に結合させるという使用もまた、当該分野で用いられている。
【００６８】
抗体またはその断片はモノクローナル抗体であってもよい。あるいは、この抗体または断片は、ポリクロナール抗体または断片であってもよい。
【００６９】
異なる特異性を持つ抗体または断片の混合物を提供してもよい。
【００７０】
抗体の断片は、例えば、Ｆ（ａｂ’）２断片であってもよい。
【００７１】
本発明の抗体または断片を１種以上の免疫グロブリンの精製、あるいは質量分析を阻害する可能性のある望ましくないタンパク質の除去に用いてもよい。従って、本発明のさらなる側面は、免疫グロブリンを精製または特徴付ける方法を提供する。この方法は、免疫グロブリンを含む試料を本発明による抗体または断片と接触させて、免疫グロブリンを抗体または断片に結合させること、未結合の材料を上記抗体または断片に結合している免疫グロブリンから洗い落とすこと、および上記抗体または断片から結合した免疫グロブリンを取り出すまたは溶出させて精製免疫グロブリンを生成することを含む。この精製免疫グロブリンは、例えば、質量分析を用いてさらに特徴付けられてもよい。
【００７２】
この試料は、体液または組織の試料であってもよい。これは、例えば、全血、血清、血漿、脳脊髄液、または尿を含む。
【００７３】
また、質量分析に用いられる免疫グロブリンの精製に用いるアッセイキットが提供される。これらは、典型的には本発明による抗体または断片と、１つ以上の質量分析標準物質を含む。そのような標準物質は、質量分析により検出された検体の寸法を示す内部標準物質を提供する。
【００７４】
本出願人はまた、検査対象の試料中で好適な標準物質（本明細書で対照としても知られる）が、免疫グロブリンの内標準物質量を提供すること、この内標準物質量に対して対象の試料に由来する免疫グロブリンの量を定量することができることを認識した。また、定量の前の免疫グロブリンの精製時にこの標準物質を対象に由来する試料中に入れると、精製工程により免疫グロブリンに何らかの変化あるいは損失を考慮にいれることができる。
【００７５】
また、試料中に対照が存在することで、試料を質量分析の標的に配置させた（spotted）際に試料自体によって生じる誤差を除去する助けとなる。例えば、MALDI-TOF MSでは、通常、試料を標的に配置させて乾燥させる。乾燥試料全体にわたる免疫グロブリンの分布は均一ではない。対照が存在することで、確実に、レーザーによってイオン化された際に検査している免疫グロブリンと対照の両方を比較できる試料が、レーザーによってイオン化された領域から取り出される。従来は、コンピュータは中心値のピーク強度を用いていたが、これが不正確さに繋がっていた。上記対照は、そのような不正確さを除去し、免疫グロブリンの定性測定ではなく、定量測定を助ける。
【００７６】
従って、本発明は、対象に由来する試料中の対象の検体または検体の断片を定量する方法を提供する。この方法は、
（ｉ）相当する対象の検体または断片と識別可能な１種以上の対照検体または断片を所定量、前記試料に加えること、
（ｉｉ）前記試料中の前記対象の検体または断片の相対量と前記対照検体または断片の量を測定すること、および
（ｉｉｉ）対象の検体または断片の相対量と対照検体または断片の相対量を比較して元の対象の試料中の検体または断片の量を定量すること、を含む。
【００７７】
２種以上の異なる対照検体を用いてもよい。これらは、目的の検体の定量精度を向上させることができるように異なる濃度であってもよい。
【００７８】
可能性として、検体の定量に用いられる定量技術は、免疫グロブリンおよびそれらの断片の定量で一般に当該分野で知られているいずれかの好適な技術であってもよい。しかしながら、最も典型的なのは、免疫グロブリンまたは断片が検出される。質量分析を用いて検体を測定してもよい。対照検体は、典型的には、質量分析を用いて対象の検体と識別可能である。
【００７９】
対象の試料を次の検体の検出に準備しながら、１つ以上の工程（例えば、精製工程）の前にこの対照検体を内部対照として対象の検体を含む対象に由来する試料に添加してもよい。
【００８０】
これは、例えば、分子量がより高いまたはより低い検体および／または対象のアッセイする検体に対して異なる電荷を持つものを用いる。これは、例えば、免疫グロブリンあるいは免疫グロブリンの断片であってもよい。しかしながら、この検体は、タンパク質、ペプチド、核酸、またはグリコタンパク質を含む可能性のあるいずれかの検体であってもよい。典型的には、分子量は５００Ｄａ超、１００Ｄａ超、１５００Ｄａ超、５ｋＤａ超、最も典型的には１０ｋＤａ超である。対照検体は、異なる電荷または分子量を持たせて対照検体を相当する対象の検体で観察された検体ピークからシフトさせることにより検出可能としてもよい。その結果、対照検体と対象の検体の両方を個別に測定してもよい。
【００８１】
例えば、免疫グロブリンが無傷の免疫グロブリンである場合、対照免疫グロブリンは、この無傷の免疫グロブリンの分子量がより高いまたはより低いものであってもよい。例えば、定量される対象中の免疫グロブリンがラムダ軽鎖またはカッパ軽鎖である場合、このラムダ軽鎖またはカッパ軽鎖の分子量がより高いまたはより低いものを対照に用いる。検出される対照の無傷の免疫グロブリンまたは重鎖は、定量される対象のクラスと同じクラスの免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、またはＩｇＧ）であってもよい。
【００８２】
対照の分子量あるいは電荷がより高いまたはより低いとは、多くのアッセイで、対照検体（例えば、免疫グロブリンまたは断片）の観察される位置が対象の検体または断片に対してシフトしていることを意味する。これにより、例えば、対照のピークまたは位置を個別に決定および測定することができる。試料に加える前に対照検体または断片の量を予め決定して、対象の検体または断片の量を決定して、対照検体または断片の既知の量と比較する場合、対象の検体または断片を定量することができる。ＭＳなど、技術によっては電荷を用いて検体の検出を助けるので、電荷もまた変化させてもよい。
【００８３】
対照は、無傷のモノクローナル免疫グロブリン、重鎖、カッパ軽鎖、ラムダ軽鎖、Ｆｃ断片、またはＦａｂ断片であってもよい。このようなモノクローナルタンパク質は、定義により、単一形態のタンパク質を産生するモノクローナルの細胞に由来するタンパク質である。従って、所定の分子質量を持つこと、質量スペクトログラムで所定のピークで検出されることからこのタンパク質を用いてもよい。患者から検出されたタンパク質が免疫グロブリンまたは免疫グロブリンの断片である場合、これらは本来、多クローン性であってもよい。従って、異なる免疫グロブリンとこれら免疫グロブリンまたは断片の異なる抗原結合領域との間の可変性が高いことから、個々に比較的低濃度で非常に多くの異なる分子質量を持っていてもよい。従って、多クローン性タンパク質の質量分析を行うと、質量分析によって検出された対象に由来するある範囲の異なる寸法の免疫グロブリンが作り出される。所定の寸法のモノクローナルタンパク質または断片を用いると、容易に識別でき、対照として使用できる対象由来のタンパク質の範囲内で所定のピークが生成される。検出されるタンパク質がモノクローナル免疫グロブリンである場合、個々のモノクローナルタンパク質は固有の性質を持っており、対照と容易に識別することができる。
【００８４】
対象は、単クローン性高ガンマグロブリン血症など、形質細胞に関連付けられる病気を持つ患者であってもよい。このような病気としては、ＭＧＵＳ、ＡＬアミロイドーシス、骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、形質細胞腫、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、およびリンパ腫（例えば、Ｂ細胞非ホジキンリンパ腫）が挙げられる。
【００８５】
２種類以上の異なる対照検体を用いて、同じ試料に由来する異なる検体のうちの２種類以上を同時に検出してもよい。
【００８６】
本明細書で用いられるＭＳとしては、例えば、液体クロマトグラフィー質量分析法（ＬＣ−ＭＳ）、マイクロフロー液体クロマトグラフィーエレクトロスプレーイオン化連結四重極飛行時間型質量分析法（マイクロLC-ESI-Q-TOF MS）が挙げられる。これは、例えば、正イオンモードの使用を含んでいてもよい。
【００８７】
あるいは、この質量分析技術は、マトリックス支援レーザー脱離イオン化−飛行時間型質量分析法(MALDI-TOF-MS)を含む。また、オービトラップ質量分析計を用いてもよい。
【００８８】
例えば、対照の分子量または電荷の増加とは、相当する対象の免疫グロブリンまたは断片に比べて、検体（例えば、免疫グロブリンまたは断片）の読み出された質量分析のピークがシフトしていることを意味する。
【００８９】
対照の免疫グロブリンまたは断片は、無傷の免疫グロブリン（１つ以上の軽鎖が１つ以上の重鎖に結合されている）、重鎖、ラムダ軽鎖、またはカッパ軽鎖（例えば、ラムダ遊離軽鎖またはカッパ遊離軽鎖）であってもよい。また、Ｆｃ断片またはＦａｂ断片など、抗体の断片を検出してもよい。
【００９０】
対照検体（例えば、免疫グロブリン）は、検体（例えば、免疫グロブリン）内での１つ以上のアミノ酸の保存的置換により、対象の検体（例えば、免疫グロブリン）に比べて高い分子量を持っていてもよい。
【００９１】
保存的アミノ酸置換の例としては、以下のものが挙げられる。
【表１】
2019509483.tif 000002
【００９２】
このような保存的置換に関連付けられる問題の１つは、保存的置換が、対象の免疫グロブリンの構造と比較すると対照免疫グロブリンの構造に影響を及ぼす可能性があることである。これは、例えば、免疫グロブリンの折りたたみによる、あるいは単に１種以上の異なる側鎖が免疫グロブリン表面のエピトープを形成するタンパク質鎖に付加したためである場合がある。
【００９３】
典型的には、試料に由来する検体（例えば、免疫グロブリン）は、上記のように検体（例えば、免疫グロブリン）のアッセイの前にある程度精製される。
【００９４】
対象に由来する試料は、組織または体液の試料である可能性がある。体液は、例えば、血液、血清、血漿、尿、唾液、または脳脊髄液であってもよい。最も典型的には、試料は血液、血清、または血漿である。生体試料は、検体（例えば、免疫グロブリン）を持つ対象に由来していてもよい。このような対象としては、これらに限定されないが、哺乳類（例えば、ヒト、イヌ、ネコ、霊長類、齧歯類、ブタ、ヒツジ、ウシ、またはウマ）が挙げられる。
【００９５】
試料を処理して、例えば、質量分析技術に干渉する可能性のある成分を除去してもよい。例えば、試料を遠心分離、濾過、またはクロマトグラフィー技術にかけて、複数の細胞、単一の細胞、または組織断片に由来する干渉性成分を除去してもよい。例えば、全血試料を従来の凝固技術で処理して、赤血球、白血球、および血小板を除去してもよい。また、試料からタンパク質を除去してもよい。例えば、血漿試料は、血清タンパク質を従来の試薬（例えば、アセトニトリル、ＫＯＨ、ＮａＯＨ）で沈殿させてもよく、その後必要に応じて試料の遠心分離を行ってもよい。例えば、標準的な方法を用いて免疫グロブリンを試料から単離または試料中に富化してもよい。そのような方法としては、例えば、試料から１種以上の非免疫グロブリン汚染物質を除去することが挙げられる。あるいは、免疫精製、遠心分離、濾過、水濾過、透析、イオン交換クロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィー、タンパク質Ａ／Ｇ親和性クロマトグラフィー、親和性精製、沈殿、ゲル電気泳動法、キャピラリー電気泳動、または化学分留を用いて試料を富化または精製してもよい。
【００９６】
典型的には、これら精製技術の少なくとも１つの前に対照検体を試料に加える。すなわち、例えば、上記の方法で試料内の免疫グロブリンの精製または濃縮を行う前に、対照検体は対象の検体試料に含まれている。すなわち、典型的には、検体（例えば、免疫グロブリン）の検出に用いられる質量分析法（例えば、LC-MS、オービトラップMS、またはMALDI-TOF MS）に加えて前処理技術が用いられる。試料内に対照検体を組み込む利点としては、試料の精製工程を通して対照検体が内部対照として作用することである。既知の量の対照検体または断片を試料に加えて、これを陽性対照として用いて、精製工程がうまく行ったかを確認する、あるいは対象の試料中の検体の精製時に問題が起きたか否かを同定してもよい。
【００９７】
対照免疫グロブリンは典型的には対象の免疫グロブリンの精製工程で用いられるので、例えば、免疫グロブリンまたは断片の鎖に保存されたアミノ酸置換の使用は、対象の免疫グロブリンまたは断片に比べて対照免疫グロブリンまたは断片が精製される態様に影響を及ぼす場合がある。例えば、親和性精製工程（例えば、免疫精製）を用いる場合、免疫グロブリンの構造のわずかな違いが対象の免疫グロブリンと共精製する能力に影響を及ぼすことがある。
【００９８】
従って、最も典型的には、対照免疫グロブリンは、相当する対象免疫グロブリンと比べて、免疫グロブリンのＮ末端、より典型的にはＣ末端に複数の追加のアミノ酸を含む。すなわち、典型的には、相当する対象の免疫グロブリンまたは断片に比べて、５、１０、１５、２０、あるいはそれ以上の追加のアミノ酸が存在しており免疫グロブリンまたは断片の分子量を増加させている。
【００９９】
一態様では、相当する検体（例えば、免疫グロブリンまたは断片）は、検出される試料が無傷の検体（例えば、免疫グロブリン）である場合に対象以外の供給源から精製された無傷の検体（例えば、免疫グロブリン）で分子量または電荷を増加させたものであることを意味する。これは、例えば、多クローン性またはモノクローナル免疫グロブリン、または多クローン性免疫グロブリンであってもよい。例えば、検出される無傷の免疫グロブリンまたは重鎖免疫グロブリンがＩｇＡ、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、またはＩｇＥである場合、対照となる無傷の免疫グロブリンまたは重鎖は、検出される対象の免疫グロブリンまたは重鎖と同じ免疫グロブリン型（すなわち、ＩｇＡ、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、またはＩｇＥ）である。
【０１００】
同様に、試料中でカッパ軽鎖またはラムダ軽鎖を検出する場合、対照免疫グロブリンは、より分子量の高いカッパ軽鎖またはラムダ軽鎖が用いられる。
【０１０１】
追加のアミノ酸または実際は保存されたアミノ酸を含む対照検体は、組み換えにより作製されてもよい。例えば、タンパク質（例えば、免疫グロブリン重鎖または軽鎖）をコードする核酸配列は、Ｎ末端またはＣ末端のコード領域に付加されて、好適な宿主細胞（例えば、原核宿主細胞、より典型的には真核宿主細胞）または無細胞系内で組み換えにより産生されるアミノ酸数を増加させるための複数のコドンを持っていてもよい。このアミノ酸は、例えば、任意の好適な天然または非天然のアミノ酸であってもよいが、典型的には、例えば、ポリアラニンＣまたはＮ末端を形成するアラニンである。
【０１０２】
組み換え抗体または断片の生成は一般に知られている。例えば、Frenzel A. et al (Frontiers in Immunology (2013), 4, Article 217) and Stech M. and Kubick S. (Antibodies (2015), 4, 12-33)（参照により本明細書に組み込まれる）による総説を参照のこと。
【０１０３】
複数の異なる対照検体（例えば、免疫グロブリンまたは断片）を対象由来の試料に加えてもよい。例えば、対象由来の試料は、測定されたカッパ遊離軽鎖とラムダ遊離軽鎖を持っていてもよい。従って、対照免疫グロブリンまたは断片は、対照遊離ラムダ軽鎖と対照遊離カッパ軽鎖を含んでいることがある。同様に、重鎖が無傷の免疫グロブリンまたは重鎖を測定する場合、対照はさらに好適な対照重鎖または対照が無傷の免疫グロブリンを含んでいてもよい。
【０１０４】
あるいは、対照は、アッセイされる免疫グロブリンの部分よりも高いまたは低い所定の分子量のモノクローナル抗体または断片であってもよい。モノクローナル抗体の生成は一般に知られている。例えば、市販のモノクローナル抗体は、その分子量に基づいて選択されて、対照としてもよい。例えば、市販のモノクローナル抗体を調和させてヒト由来の試料に由来する抗体と共精製してもよい。
【０１０５】
この対照を上記の架橋された抗体と共に用いてもよい。
【０１０６】
従って、本発明のさらなる側面は質量分析用に試料を調製する方法を提供し、この方法は、
（ｉ）典型的には免疫グロブリンまたは断片である１種以上の検体を含む対象に由来する試料を準備すること、
（ｉｉ）所定量の１種以上の対照検体またはその断片、典型的には免疫グロブリンまたはその断片を前記試料に加えること、
（ｉｉｉ）上記の架橋された抗体または断片を用いて前記検体（典型的には免疫グロブリンまたは断片）の少なくとも一部を前記対象および対照検体（典型的には免疫グロブリンまたは断片）から共精製すること、および必要に応じて
（ｉｖ）前記共精製された検体（例えば、免疫グロブリンまたは断片）の一部を質量分析標的に配置させること、を含む。
【０１０７】
次いで、質量分析標的を質量分析計に置いて、質量分析計を用いて分析してもよい。この標的は、典型的には試料を置く基板（substrate）である。次いで、試料を質量分析にかけるためにこの基板を質量分析計に置く。
【０１０８】
また、その中に１種以上の対照検体またはその断片を含む質量分析計が提供される。
【０１０９】
試料、質量分析計、免疫グロブリン、および対照は本明細書で規定される通りであってもよい。
【０１１０】
また、本明細書で規定された架橋された抗体または断片と本明細書で規定された対照検体（例えば、免疫グロブリン）または断片を含むアッセイキットが提供される。このキットはさらに、質量分析標的および／または緩衝液を含んでいてもよく、あるいは塩が提供されてもよい。
【０１１１】
また、このアッセイキットの使用を含む質量分析を行う方法が提供される。
【０１１２】
また、本発明の抗体、本発明の方法および／または本発明によるアッセイキットを用いて免疫グロブリンを精製および特徴付けを行うことを含むＢ細胞関連疾患または他の免疫関連疾患を診断する方法が提供される。
【０１１３】
Ｂ細胞関連疾患としては、例えば、完全免疫グロブリン多発性骨髄腫（ＭＭ）、軽鎖ＭＭ、非分泌性ＭＭ、ＡＬアミロイドーシス、軽鎖沈着症、くすぶり型（smouldering）ＭＭ、形質細胞腫、およびＭＧＵＳ（意義不明の単クローン性免疫グロブリン血症）の診断が挙げられる。また、これは、ＷＯ２０１３／０８８１２６に記載された他のＢ細胞悪液質の診断あるいは複数の他の障害（例えば、ＰＴＬＤ）の診断または予後、あるいは癌、糖尿病、心疾患または腎臓疾患の診断または予後（ＷＯ２０１１／０９５８１８、ＷＯ２０１３／０５０７３１、ＥＰ１８７０７１０、ＷＯ２０１１／１０７９６５、参照により本明細書に組み込まれる）に用いてもよい。
【０１１４】
また、患者由来の試料に由来する抗体の同定および特性評価により複数の他の疾患を特徴付けるのに有用である。これら疾患としては、リウマチ性関節炎、セリアック病、グレーブス病、悪性貧血、シェーグレン症候群、および全身性エリテマトーデスが挙げられる。
【０１１５】
ここで、以下の図面を参照して例示目的でのみ、本発明を記載する。
【図面の簡単な説明】
【０１１６】
【図１】図１は、抗遊離カッパＦ（ａｂ’）２抗体断片および抗遊離ラムダＦ（ａｂ’）２抗体断片でのチオエーテル結合の形成を示すクーマシーブルー染色ゲルを示す。Ｆ（ａｂ’）２分子の架橋された軽鎖と重鎖の形成がＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル画像（矢印は約５０ｋＤａを示す）に示されている。架橋の度合いは７日目に高くなっている。
【０１１７】
【図２】図２は、処理済み（チオエーテル結合の形成を誘導するために）および非処理抗遊離カッパＦ（ａｂ’）２断片のクーマシーブルー染色ゲルを示している。（ＮＲ）は非還元試料、（Ｒ）は還元試料を表す。また、各バンドの構造の解釈が示されている。
【０１１８】
【図３】図３は、抗遊離ラムダＦ（ａｂ’）２抗体断片の同様の図を示している。
【０１１９】
【図４】図４は、チオエーテル架橋済みおよび非架橋の抗遊離カッパＦ（ａｂ’）２抗体と抗遊離ラムダＦ（ａｂ’）２抗体の遊離軽鎖（ＦＬＣ）および正常なヒト血清（ＮＨＳ）に対する結合活性を示す。
【０１２０】
【図５】図５は、クーマシーブルー染色ＳＤＳ−ＰＡＧＥを還元して測定された、抗ラムダ全Ｆ（ａｂ’）２抗体のビスマレイミドエタン（ＢＭＯＥ）による架橋を示す。
【０１２１】
【図６】図６は、ビスマレイミドエタン（ＢＭＯＥ）架橋の前後の抗ラムダ全Ｆ（ａｂ’）２抗体のＩｇＧラムダへの結合を示す。
【０１２２】
【図７】図７は、クーマシーブルー染色ＳＤＳ−ＰＡＧＥを還元して測定した２ｍＭのビスマレイミドエタン（ＢＭＯＥ）で架橋された抗遊離ラムダＦ（ａｂ’）２（１０μＭ）と４ｍＭのＢＭＯＥで架橋された抗遊離カッパ全分子（１０μＭ）を示す。還元されたＳＤＳ−ＰＡＧＥレーンの走査濃度測定は、抗遊離ラムダの架橋効率が７０％超、抗遊離カッパの架橋効率が９０％超であることを示している。
【０１２３】
【図８】図８は、カッパ遊離軽鎖に結合する、未処理の抗遊離カッパ全分子とビスマレイミドエタン（ＢＭＯＥ）架橋抗遊離カッパ全分子を示す。また、ＩｇＧ、ＩｇＡ、およびＩｇＭに対する交差反応性が示されている。
【０１２４】
【図９】図９は、ラムダ遊離軽鎖に結合する、未処理の抗遊離ラムダＦ（ａｂ’）２とビスマレイミドエタン（ＢＭＯＥ）架橋抗遊離ラムダＦ（ａｂ’）２を示す。また、ＩｇＧ、ＩｇＡ、およびＩｇＭに対する交差反応性が示されている。
【０１２５】
【図１０】図１０は、予め試料を添加せずに５０ｍＭのトリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）を含む５％酢酸で溶出した抗ＩｇＧ３結合セファロース（黒色の線）とチオエーテル架橋抗ＩｇＧ３結合セファロース（灰色の線）のＭＡＬＤＩ質量スペクトルを示す。ラムダ軽鎖（Ｌ）、カッパ軽鎖（Ｋ）、ＩｇＧ重鎖（Ｇ）、およびＩｇＡ重鎖（Ａ）の質量／電荷の範囲が示されている。
【０１２６】
【図１１】図１１は、高濃度のＩｇＧ３を含むヒト血清でインキュベーションして、５０ｍＭのＴＣＥＰを含む５％酢酸で溶出した後の抗ＩｇＧ３結合セファロース（黒色の線）溶離液とチオエーテル架橋抗ＩｇＧ３結合セファロース（灰色の線）溶離液のＭＡＬＤＩ質量スペクトルを示す。ラムダ軽鎖（Ｌ）、カッパ軽鎖（Ｋ）、ＩｇＧ重鎖（Ｇ）、およびＩｇＡ重鎖（Ａ）の質量／電荷の範囲を示す。
【０１２７】
【図１２】図１２は、予め試料を添加せずに５０ｍＭのＴＣＥＰを含む５％酢酸で溶出した抗遊離カッパ結合セファロース（黒色の線）とＢＭＯＥ架橋抗遊離カッパ結合セファロース（灰色の線）のＭＡＬＤＩ質量スペクトルを示す。
【０１２８】
【図１３】図１３は、予め試料を添加せずに５０ｍＭのＴＣＥＰを含む５％酢酸で溶出した抗遊離ラムダ結合セファロース（黒色の線）とＢＭＯＥ架橋抗遊離ラムダ結合セファロース（灰色の線）のＭＡＬＤＩ質量スペクトルを示す。
【０１２９】
【図１４】図１４は、ラクダ科動物の抗カッパ結合セファロース（Ａ）によりヒト血清から共精製された組み換えカッパ遊離軽鎖（ｒＫａｐｐａ）と内因性ＩｇＧカッパのＭＡＬＤＩ質量スペクトルを示す。（Ｂ）にカッパ軽鎖（ＧＫ）とｒＫａｐｐａの算出ピーク面積、およびＧＫ／ｒＫａｐｐａ比の変動係数が示されている。
【実施例】
【０１３０】
アルカリ処理によるチオエーテル結合の抗体Ｆ（ａｂ’）２断片への導入
【０１３１】
抗体のジスルフィド結合のチオエーテル結合への転換は、温度を上昇させてアルカリ性環境で誘導してもより。そのような結合の形成は、Zhang et al IgG1 Thioether Bond formation in vivo. JBC, 288:16371-16382, 2013. Zhang and Flynn. Cysteine racemization IgG heavy and light chains, JBC, 288:34325-34335, 2013など、一般に当該分野で知られている。
【０１３２】
アルカリ誘導したチオエーテル結合を断片に導入することができるか否かについて知るため商業的に入手可能なFreelite（登録商標）Ｆ（ａｂ’）２抗体を調べた。これらの抗体は、遊離ラムダ軽鎖、遊離カッパ軽鎖のいずれかと結合する。図１〜図４に示されたデータから、５０℃、ｐＨ９で５０ｍＭのグリシン−ＮａＯＨにより処理したＦ（ａｂ’）２断片にチオエーテル架橋を導入することが可能であることが分かる。７日後、未処理のＦ（ａｂ’）２に比べて約２０％の架橋効率が観察された（図１〜図３）。
【０１３３】
抗遊離カッパ抗体および抗遊離ラムダ抗体の結合活性をアルカリ処理の０日と７日後にＥＬＩＳＡによって評価した（図４）。抗体をＥＬＩＳＡプレートに塗布して、精製カッパ軽鎖、精製ラムダ軽鎖、または正常ヒト血清を提示した。ホースラディッシュ（西洋わさび）ペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）に結合した四メチルベンジジン（ＴＭＢ）発色基質と抗軽鎖抗体を用いて４５０ｎｍで吸光度を測定して結合活性を検出した。図４に示すようにＥＬＩＳＡ活性に幾分低下が見られたが、処理された抗体では活性はまだ残存していた。
抗ラムダ全Ｆ（ａｂ’）２断片のビスマレイミドエタン（ＢＭＯＥ）架橋
【０１３４】
抗体鎖をＢＭＯＥにより架橋することができるか否かを調べるため、抗ラムダＦ（ａｂ’）２抗体を調べた。抗ラムダＦ（ａｂ’）２断片を１ｍＭ（ＴＣＥＰ）で還元した。Ｈｉ−Ｔｒａｐ脱塩カラムを用いてＴＣＥＰを除去し、還元した抗ラムダ全Ｆ（ａｂ’）２を１００〜５００倍のモル過剰のＢＭＯＥで架橋して、還元条件下で行ったクーマシーブルー染色ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図５から、５０％超の効率でＢＭＯＥはＦ（ａｂ’）２断片を架橋することができることが分かる。また、得られた抗体鎖架橋は還元条件に耐性があった。
【０１３５】
ＥＬＩＳＡプレートにポリクロナールＩｇＧラムダを塗布して、ＢＭＯＥ処理抗全ラムダＦ（ａｂ’）２または未処理の抗全ラムダＦ（ａｂ’）２をこのプレートに結合させた。抗ヒツジ−ＨＲＰとＴＭＢ基質を用いて、抗全ラムダによる結合活性を光吸光度４５０ｎｍで測定した。５０％超のＢＭＯＥ架橋が形成される条件下（図５）で、抗全ラムダ抗体は７０％を超えるＩｇＧラムダ結合活性を保持していた（図６）。
ＢＭＯＥ架橋抗遊離ラムダおよび抗遊離カッパ抗血清
【０１３６】
ＢＭＯＥ処理により抗体鎖を架橋することができるか否かを調べるため、商業的に入手可能なFreelite（登録商標）抗体を調べた。全分子抗遊離カッパおよびＦ（ａｂ’）２抗遊離ラムダをそれぞれ、１．５ｍＭおよび１．０ｍＭのＴＣＥＰで還元した。Ｈｉ−Ｔｒａｐ脱塩カラムを用いてＴＣＥＰを除去して、抗遊離カッパ抗体と抗遊離ラムダ抗体をそれぞれ、４００倍と２００倍のモル過剰なＢＭＯＥで架橋した。試料を還元条件下で行ったクーマシーブルー染色ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図７に示すように、ＢＭＯＥ架橋効率は、Ｆ（ａｂ’）２または全分子形式のいずれかで抗体の５０％を超えていた。
【０１３７】
ＢＭＯＥ処理抗体と未処理の抗体をＥＬＩＳＡプレートに塗布し、精製した免疫グロブリン（ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭ、遊離カッパ、遊離ラムダ）を提示して、活性ＥＬＩＳＡアッセイを行った。抗軽鎖−ＨＲＰとＴＭＢ基質を用いて４５０ｎｍで吸光度を測定して結合活性を検出した。図８〜図９の結果から、架橋した抗血清は、特異的な抗原結合活性を維持していることが分かる。
チオエーテル架橋はセファロース結合抗ＩｇＧ３抗体を安定させる
【０１３８】
未処理の抗ＩｇＧ３抗体と（アルカリ処理により）チオエーテル架橋した抗ＩｇＧ３抗体をセファロース樹脂に共有結合させ、予め試料を添加せずに５０ｍＭのＴＣＥＰを含む５％酢酸で処理した。溶出した上澄みのMALDI-TOF MSによる分析（図１０）から、チオエーテル架橋した抗体は、未処理の抗体よりも材料の放出が少なく、これにより抗体の安定性が高まっていることが示された。図１１には抗ＩｇＧ３結合活性が示されている。各セファロース樹脂は高濃度のＩｇＧ３を含むヒト血清でインキュベートして、５０ｍＭのＴＣＥＰを含む５％酢酸で溶出した。MALDI-TOF MS分析により、ヒトＩｇＧラムダ鎖に対応するピーク面積によって測定されたように、未処理の抗体に対して同等あるいはより高い結合活性がチオエーテル架橋した抗ＩｇＧ３抗体によって示された。
ＢＭＯＥ架橋は抗遊離カッパ抗体および抗遊離ラムダ抗体を安定化させる
【０１３９】
Freelite（登録商標）抗カッパ抗体と抗ラムダ抗体を未処理のまま、あるいはＢＭＯＥで架橋し、その後ＴＣＥＰで還元し、Ｈｉ−Ｔｒａｐ脱塩カラムで脱塩した。抗体をセファロース樹脂に結合させて、予め試料を添加せずに５０ｍＭのＴＣＥＰを含む５％酢酸で処理した。上澄みをMALDI-TOF MSにより分析した。図１２、図１３に示すように、ＢＭＯＥ架橋抗体から放出されたのは非常にわずかの抗体断片であり、抗体の安定性が実質的に高まったことが示された。
【０１４０】
抗体の安定性が高まると、精製する抗体から材料の交差汚染が低減される。これにより、例えば、患者由来の免疫グロブリン試料を精製および単離するのに用いる際にさらに特性評価工程の確度が向上する。
質量分析により対照検体を対象の検体と識別することができる
【０１４１】
ヒト血清に既知の量の組み換えカッパ軽鎖と既知の質量（対照カッパ鎖）を補充した。ラクダ科動物の抗カッパ抗体に結合させた市販のセファロースを用いて、内因性の対照カッパ鎖を血清から共精製し、溶出した上澄みをMALDI-TOF MSで分析した（図１４）。図１４Ａに示すように、相対分子質量が異なることから、対照カッパ鎖は内因性カッパ鎖と識別可能である。
対照検体を用いて対象の検体についての定量情報を提供することができる
【０１４２】
内因性カッパ鎖と対照カッパ鎖をヒト血清から共精製して、２つの９６標的プレートに配置させ、MALDI-TOF MSにより分析した（図１４Ｂ）。各カッパ鎖に対応するピーク面積を求めて、これを用いて各プレート全体の変動係数（％ＣＶ）と両方のプレートを包含する１９２個の同じ試料の変動係数を算出した。図１４Ｂは、１９２個の同じ試料で内因性カッパに対応するピーク面積が対照カッパピーク面積に対して表されている場合に算出された％ＣＶが１０％未満であることを示している。これは、本発明の実質的な診断可能性を示している。この図は、内部対照検体を用いて、対照検体に対する対象の検体の存在量を決定することができ、従って、対象の検体について定量情報と定性情報を提供することができることを示している。また、この観察から、対照検体を用いて精製手順の結果を検証してもよく、例えば、ＭＡＬＤＩ標的スポットのイオン化が異なるために生じるデータ群の誤差を最少にするのに役立つことが示された。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【国際調査報告】
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