(57)【要約】本発明は、凝集剤を使用して水性バイオマスからアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を選択的に精製する方法に関する。実施形態では、凝集剤は、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド（ｐＤＡＤＭＡＣ）である。【選択図】  なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）及び少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスを含有する水性バイオマスから、前記アデノ随伴ウイルスを精製する方法であって、
ａ．前記バイオマスをポリジアリルジアルキルアンモニウム塩に接触させて、凝集体及び清澄化溶液を形成するステップであり、前記凝集体が、前記少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスを含む、ステップと、
ｂ．前記凝集体を前記清澄化溶液から除去するステップと、
ｃ．前記ＡＡＶを前記清澄化溶液からさらに単離するステップと
を含む、方法。
【請求項２】
前記清澄化溶液中のＡＡＶヘルパーウイルスが、著しく減少する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、ポリジアリルジメチルアンモニウム塩である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド（ｐＤＡＤＭＡＣ）である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスが、アデノウイルス、単純ヘルペスウイルス及びバキュロウイルスからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスが、アデノウイルスである、請求項２に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスが、バキュロウイルスである、請求項２に記載の方法。
【請求項８】
前記バイオマスが、細胞ライセートである、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、０．０１％〜０．５％（ｗ／ｖ）の濃度で前記バイオマスに存在する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、０．０２５％、０．０５０％及び０．１％（ｗ／ｖ）からなる群から選択される濃度で前記バイオマスに存在する、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
標的導入遺伝子を含有するアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を単離する方法であって、
ａ．産生細胞に前記ＡＡＶ及びＡＡＶヘルパーウイルスをトランスフェクトして、トランスフェクトされた産生細胞を作製するステップと、
ｂ．前記トランスフェクトされた産生細胞を培養するステップと、
ｃ．前記トランスフェクトされた産生細胞を溶解して、水性バイオマスを創出するステップと、
ｄ．ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を前記バイオマスに導入して、前記ＡＡＶヘルパーウイルスを含む凝集体及び前記ＡＡＶを含む清澄化溶液を作製するステップと、
ｅ．前記清澄化溶液を精製カラムに接触させて、単離されたＡＡＶを作製するステップと
を含む、方法。
【請求項１２】
標的導入遺伝子を含有するアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を単離する方法であって、
ａ．産生細胞に前記ＡＡＶ及びＡＡＶヘルパーウイルスをトランスフェクトして、トランスフェクトされた産生細胞を作製するステップと、
ｂ．前記トランスフェクトされた産生細胞を培養して、水性バイオマスを作製するステップと、
ｃ．ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を前記バイオマスに導入するステップと、
ｄ．前記清澄化溶液を精製カラムで処理して、単離されたＡＡＶを作製するステップと
を含む、方法。
【請求項１３】
前記ＡＡＶヘルパーウイルスが、アデノウイルス、単純ヘルペスウイルス及びバキュロウイルスからなる群から選択される、請求項１１又は１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、ポリジアリルジメチルアンモニウム塩である、請求項１１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド（ｐＤＡＤＭＡＣ）である、請求項１１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記ＡＡＶヘルパーウイルスが、アデノウイルスである、請求項１１〜１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記ＡＡＶヘルパーウイルスが、バキュロウイルスである、請求項１１〜１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記産生細胞株が、ＨｅＬａ細胞株、ＣＨＯ細胞株、ＨＥＫ２９３細胞若しくはスポドプテラ・フルギペルダ（Ｓｆ９）細胞株又は他の任意の産生細胞株である、請求項１１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記産生細胞が、ＨｅＬａ細胞である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記産生細胞が、スポドプテラ・フルギペルダ細胞である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
前記産生細胞をＡＡＶの集合に必要な追加の遺伝子要素に接触させるステップをさらに含む、請求項１１〜２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記遺伝子要素が、ＡＡＶ非構造タンパク質、ＡＡＶ構造タンパク質及び高分子合成に必要な細胞因子からなる群から選択される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記細胞因子が、レプリカーゼ及びカプシドタンパク質をコードする配列である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記ＡＡＶが、導入遺伝子を含む、請求項１１〜２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記導入遺伝子が、遺伝子治療のあらゆる標的からなる群から選択される、請求項２４に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
［発明の分野］
[0001]本発明は、凝集剤を使用してアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を水性バイオマスから選択的に精製する方法に関する。実施形態では、凝集剤は、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド（ｐＤＡＤＭＡＣ）である。
【０００２】
［発明の背景］
[0002]アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）は、分裂細胞及び非分裂細胞に形質導入できる能力、低い免疫原性、並びに広い又は狭い組織特異性のＡＡＶ血清型を生成する能力のため、遺伝子治療においてベクターとして使用されるヘルパーウイルス依存パルボウイルスである。組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターを使用した多くの成功した組織培養及び小動物の試験の中で、臨床試験へ進んだものは殆どなかった。特に大型動物モデル及び毒性の試験における、前臨床効力試験は、研究室及び研究グレードベクターの殆どの中核施設で容易には産生されないベクター量を必要とする。
【０００３】
[0003]ＡＡＶは、臨床試験において安定で効果的な遺伝子導入を示している。ＡＡＶへの関心が高まったことにより、臨床供給のための大規模なベクター産生を改善する必要に迫られている。ＡＡＶ遺伝子治療製品を製造するための最も規模を拡大できる方法の１つは、レプリカーゼ及びカプシドタンパク質をコードする配列等、ＡＡＶの集合に必要な必須遺伝子要素、並びに目的の標的導入遺伝子を産生する組換え産生細胞株を使用することである。これらの遺伝子要素及び目的の導入遺伝子は、許容宿主細胞株に安定にトランスフェクトされている。しかし、ＡＡＶのパッケージング及び放出を誘発するために、Ｅ１、Ｅ２ａ及びＥ４等の領域をコードするＡＡＶヘルパーウイルスが必要とされ、産生細胞株をＡＡＶヘルパーウイルスに感染させる必要がある。このプロセスは非常に頑強であり、標的導入遺伝子を含有する８０％超の完全ＡＡＶカプシドを生成するが、ＡＡＶ製品の安全性、純度及び品質を確保するために、ＡＡＶヘルパーウイルスを後続の精製ステップの間に十分に排除しなければならない。この重要なステップに対処するために、現行の業界基準は、クロマトグラフィー、ウイルス除去フィルター及び熱不活化のそれぞれに又は組合せに依存している。
【０００４】
［発明の概要］
[0004]実施形態では、本発明は、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）及び少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスを含有する水性バイオマスから、前記アデノ随伴ウイルスを精製する方法であって、（ａ）前記バイオマスをポリジアリルジアルキルアンモニウム塩に接触させて、凝集体及び清澄化溶液を形成するステップであり、前記凝集体が、前記少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスを含む、ステップと、（ｂ）前記凝集体を清澄化溶液から除去するステップと、（ｃ）ＡＡＶを清澄化溶液からさらに単離するステップとを含む、方法を提供する。
【０００５】
[0005]実施形態では、本発明は、標的導入遺伝子を含有するアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を単離する方法であって、（ａ）産生細胞にＡＡＶ及びＡＡＶヘルパーウイルスをトランスフェクトして、トランスフェクトされた産生細胞を作製するステップと、（ｂ）前記トランスフェクトされた産生細胞を培養するステップと、（ｃ）前記トランスフェクトされた産生細胞を溶解して、水性バイオマスを創出するステップと、（ｄ）ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を前記バイオマスに導入して、前記ＡＡＶヘルパーウイルスを含む凝集体及びＡＡＶを含む清澄化溶液を作製するステップと、（ｅ）前記清澄化溶液を精製カラムに接触させて、単離されたＡＡＶを作製するステップとを含む、方法をさらに提供する。
【０００６】
[0006]実施形態では、本発明は、標的導入遺伝子を含有するアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を単離する方法であって、（ａ）産生細胞にＡＡＶ及びＡＡＶヘルパーウイルスをトランスフェクトして、トランスフェクトされた産生細胞を作製するステップと、（ｂ）前記トランスフェクトされた産生細胞を培養して、水性バイオマスを作製するステップと、（ｃ）ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を前記バイオマスに導入するステップと、（ｄ）前記清澄化溶液を精製カラムで処理して、単離されたＡＡＶを作製するステップとを含む、方法をさらに提供する。
【図面の簡単な説明】
【０００７】
【図１】ｐＤＡＤＭＡＣを用いない（対照）、クラリソルブ（Ｃｌａｒｉｓｏｌｖｅ）ライセートの分析用ＨＰＬＣクロマトグラフィープロファイルである。Ａｄ５のピークは約１６分の所期の保持時間で検出された。
【図２】クラリソルブライセート（ｐＤＡＤＭＡＣを用いた）の分析用ＨＰＬＣクロマトグラフィープロファイルである。Ａｄ５ウイルスのピークは約１６分の所期の保持時間で検出されなかった。
【図３】０．０１％及び０．０２５％のｐＤＡＤＭＡＣの効果を示す、ライセートの分析用ＨＰＬＣクロマトグラフィープロファイルである。Ａｄ５のピークは、対照試料については、約１６分の所期の保持時間で検出されたが、０．０１％及び０．０２５％のｐＤＡＤＭＡＣで処理した試料については、検出されなかった。
【図４】０．０５％及び０．１％のｐＤＡＤＭＡＣの効果を示す、ライセートの分析用ＨＰＬＣクロマトグラフィープロファイルである。Ａｄ５のピークは、対照試料については、約１６分の所期の保持時間で検出されたが、０．０５％及び０．１％のｐＤＡＤＭＡＣで処理した試料については、検出されなかった。
【発明を実施するための形態】
【０００８】
[0011]本発明は、ＡＡＶウイルス及びＡＡＶヘルパーウイルスを含有する、水性バイオマス中の少なくとも１種のＡＡＶヘルパーウイルスからアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を精製する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、バイオマスを、強カチオン性及び活性化吸着基ラジカル、例えば、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド（ｐＤＡＤＭＡＣ）を含むポリマーに接触させて、ＡＡＶヘルパーウイルスを含有する凝集体を形成するステップと、凝集体を除去して、清澄化溶液を形成するステップとを提供する。凝集体を除去すると、残存する清澄化溶液は、ヘルパーウイルスを実質的に含まないＡＡＶを含有し、次いで、ろ液をクロマトグラフィーに供して、ＡＡＶをさらに単離することができる。
【０００９】
[0012]強カチオン性及び活性化吸着基を含有する種々のポリマーを、本発明に従って、選択的凝集剤として使用することができる。いくつかの実施形態では、ポリマーは、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ポリジアリルジアルキルアンモニウムフルオライド、クロライド又はブロマイドである。いくつかの実施形態では、ポリマーは、ポリジアリルジメチルアンモニウム塩、ポリジアリルジエチルアンモニウム塩又はポリジアリルジプロピルアンモニウム塩、例えば、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド、ポリジアリルジメチルアンモニウムフルオライド又はポリジアリルジメチルアンモニウムブロマイドである。いくつかの実施形態では、ポリマーは、ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライドである。ポリジアリルジメチルアンモニウムクロライド（ｐＤＡＤＭＡＣ）は、高分子量の水溶性ポリカチオンホモポリマーである。ポリマー体は、ＡＡＶの凝集を最小限にしながら、液体中のいかなる浮遊物及び負荷電の水溶物も不安定化及び凝集することができる、強カチオン性及び活性化吸着基ラジカルを含有する。いかなる特定の理論にも拘束されずに、適切な濃度で使用される場合、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ｐＤＡＤＭＡＣは、イオン相互作用の機序（電気的中和及び架橋吸着）によって、負荷電の細胞及び細胞くずをより大きな粒子中に急速に凝集して、効率的で単純な分離及び除去を可能にする。ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ｐＤＡＤＭＡＣは、排水処理、上水処理及び製紙等いくつかの産業において、液体の脱色、並びにシルト、粘土、藻類、細菌及びウイルス等の無機及び有機粒子の凝固及び凝集に有効であることがこれまでに示されてきた。しかし、本発明は、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩が、ＡＡＶを実質的に凝集せずに、他のＡＡＶヘルパーウイルスを選択的に凝集することができることを初めて実証するものであり、これによって、ＡＡＶヘルパーウイルスからＡＡＶを選択的に精製するための方法を提供する。
【００１０】
[0013]様々な濃度のポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を、本発明に従って、使用することができる。実施形態では、バイオマスは細胞ライセートであり、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ｐＤＡＤＭＡＣを約０．０１％〜約０．５％又は約０．０２５％〜約０．１％（ｗ／ｖ）の濃度でバイオマスに添加する。いくつかの実施形態では、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ｐＤＡＤＭＡＣの濃度は、０．０２５％、０．０３％、０．０３５％、０．０４％、０．０５％、０．０７％、０．０８％、０．０９％、０．１％、０．２％、０．３％、０．４％又は０．５％（ｗ／ｖ）である。
【００１１】
[0014]アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）は、小型で複製欠損のエンベロープを有しないディペンドパルボウイルス（Ｄｅｐｅｎｄｏｐａｒｖｏｖｉｒｕｓ）属のウイルスに含まれ、これはさらにパルボウイルス（Ｐａｒｖｏｖｉｒｉｄａｅ）科（パルボウイルス）に属する。いくつかの実施形態では、ＡＡＶは、組換えＡＡＶ（ｒＡＡＶ）である。本出願を通して、ＡＡＶという用語は、適切な場合、ｒＡＡＶに置き換えることができる。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶは、導入遺伝子を含む。ＡＡＶは、増殖に関しては、ＡＡＶヘルパーウイルスに依存する。いくつかの実施形態では、ＡＡＶは活性である。用語「活性」は、播種した場合、力価を形成するＡＡＶの能力を指す。
【００１２】
[0015]ＡＡＶの産生は、ＡＡＶが形質導入ベクターとして使用されたことが初めて報告されて以来、発展してきているが、基本的要件は変わらないままである。現行の全てのＡＡＶ産生方法は、ベクターゲノムに対してトランスに作用する因子の共通セットを必要とする。いくつかの実施形態では、これらの成分は、ＡＡＶ非構造タンパク質、ＡＡＶ構造タンパク質、１セットのヘルパーウイルス遺伝子産物、及びベクターゲノム複製のためのＤＮＡポリメラーゼ成分を含む、高分子合成に必要な細胞因子からなる。ＡＡＶゲノム及びベクターゲノムは共に、通常、末端逆位反復配列（ＩＴＲ）と呼ばれる、分断される末端回文構造を有する直鎖の一本鎖ＤＮＡである。ＩＴＲは、二本鎖形態及び後続の複製からのＡＡＶ  ＤＮＡのレスキューに、パッケージングに、並びにおそらくは、形質導入された細胞中のｖｇの安定化に必要とされる唯一のシスエレメントである。
【００１３】
[0016]ＡＡＶヘルパーウイルスは、哺乳動物細胞におけるＡＡＶの増殖性感染に必要とされる、追加のトランス作用因子をもたらす。いくつかの実施形態では、ＡＡＶヘルパーウイルスは、アデノウイルス、単純ヘルペスウイルス及びバキュロウイルスを含む群から選択される。
【００１４】
[0017]ＡＡＶ感染に必要なアデノウイルス遺伝子産物の同様のセットは、効率的な組換えＡＡＶ（ｒＡＡＶ）産生にも必要とされる。ＡＡＶヘルパーウイルスをもたらすアデノウイルス遺伝子は、Ｅ１ａ、Ｅ１ｂ５５ｋ、Ｅ４ｏｒｆ６、Ｅ２ａ及びＶＡ  ＲＮＡをもたらすことができる。他の細胞遺伝子のプロモーター活性の強化に加えて、Ｅ１Ａは、転写活性因子／抑制タンパク質ＹＹ１の制御においても明確な役割を有する。
【００１５】
[0018]ＡＡＶの産生に種々の細胞を使用することができる。例えば、いくつかの実施形態では、哺乳動物細胞中でＡＡＶを産生することができる。いくつかの実施形態では、昆虫細胞中でＡＡＶを産生することができる。いくつかの実施形態では、ＨｅＬａ細胞中でＡＡＶを産生することができる。いくつかの実施形態では、ＡＡＶ産生に使用される細胞、すなわち「産生細胞」は、ＨｅＬａ細胞、ヒト胎児由来腎臓細胞、例えば、ＨＥＫ２９３及び昆虫細胞、例えば、スポドプテラ・フルギペルダ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ  ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ（Ｓｆ９））細胞である。いくつかの実施形態では、産生細胞は、ＨＥＫ２９３細胞である。いくつかの実施形態では、産生細胞は、Ｓｆ９細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、ＣＨＯ、Ｐｅｒ．Ｃ６を含む、他の任意の種類の哺乳動物細胞であってもよい。いくつかの実施形態では、ヘルパーウイルスを必要とする。
【００１６】
[0019]いくつかの実施形態では、必要なウイルスタンパク質及びウイルスゲノムをコードするプラスミドを化学的にコトランスフェクトした、ＨＥＫ２９３細胞を使用してＡＡＶを産生する。しかし、細胞間伝播が生じないことにより、プラスミドＤＮＡを初めにトランスフェクトした細胞にＡＡＶ産生が制限され、娘細胞が十分なコピー数におそらく維持される。プラスミドが典型的に、哺乳動物細胞中で複製できないため、ｒｅｐ及びｃａｐ遺伝子のコピー数は、幾何級数的に増大することはない。同様に、いくつかの実施形態では、アデノウイルスヘルパー遺伝子を非感染性プラスミドとしてＨＥＫ２９３細胞に導入し、産生中のヘルパー遺伝子量を一定にする。
【００１７】
[0020]ＡＡＶ産生をスケールアップするには、上流の産生プロセスと適合性のある方法で細胞数を増加させる必要がある。ＡＡＶ産生は、接着細胞又は浮遊培養液で一般的に実施される。
【００１８】
[0021]化学的トランスフェクションがベースのプロセスでは、接着細胞がプラスチック製細胞培養皿又はローラーボトルに単層として一般的に増殖される。有効表面積により細胞の最大数が決定し、したがって、産生されるＡＡＶの量が決定する。
【００１９】
[0022]或いは、浮遊培養液は、面積ではなく体積に基づいて細胞増殖を可能にする。接着細胞数の浮遊細胞数に対する換算係数は、いずれかの方式の細胞密度に応じて、約１０〜５０ｃｍ２＝１ｃｍ３となり得る。無機化合物、例えばリン酸カルシウム、若しくは有機化合物、例えばポリエチレンイミン（ＰＥＩ）、又は非化学法、例えば電気穿孔法のいずれかを使用した、ＡＡＶを産生するためのトランスフェクション方法は、接着細胞を使用して、広く記載されてきた。しかし、浮遊細胞では、リン酸カルシウム又はＰＥＩのいずれかを使用したトランスフェクションが、最も一般に使用されている。おそらくは、より複雑な（及び特異的性質の）リン酸カルシウムによるトランスフェクション手順ではなく、市販の単一試薬を使用することの再現性及び信頼性のため、ＰＥＩは多くの場合使用されている。
【００２０】
[0023]いくつかの実施形態では、ＡＡＶヘルパーウイルスは、スポドプテラ・フルギペルダ（Ｓｆ９）細胞でＡＡＶを産生するのに使用されるバキュロウイルス発現ベクターである。最初に、組換えバキュロウイルスは増殖性感染を開始し、続いて、バキュロウイルスの子孫が、培地中のさらなる細胞に二次的に感染し得る。細胞毎に放出された約１００の感染性バキュロウイルス粒子により、細胞培養集団の全体が、最初の感染多重度に応じて、１又は２回の感染サイクルの間に感染することになる。いくつかの実施形態では、Ｓｆ９宿主細胞は、ＨＥＫ２９３細胞よりも一層効率的にベクターＤＮＡを複製する。さらに、バキュロウイルスは、ＡＡＶ構造タンパク質産生、ウイルスの集合及び導入遺伝子のパッケージングに必要な配列を昆虫細胞にもたらすことができる。
【００２１】
[0024]いくつかの実施形態では、Ｓｆ９細胞産生ＡＡＶの物理的、生化学的及び生物学的特性は、Ｓｆ９細胞で産生されたＡＡＶがＨＥＫ２９３細胞で産生されたＡＡＶと等価であることを示す。ベクター由来ゲノムの分析により、最大４．７ｋｂの直鎖の一本鎖ＤＮＡが、効率的にパッケージングされることが実証された。
【００２２】
[0025]大まかに見ると、細胞培養水性バイオマスからのＡＡＶの回収は、（ｉ）必要に応じて、ＡＡＶを細胞から遊離させるステップと、（ｉｉ）他の細胞くず及び培地成分からＡＡＶを分離するステップと、（ｉｉｉ）ＡＡＶを濃縮及び精製するステップとを含む。ＡＡＶカプシドは弾力的で頑強であり、したがって、下流プロセスでは、弾性及び強固でなければ避ける条件、例えば、昇温に対する長期曝露、凍結融解サイクルの反復、酸性条件及び有機溶媒への曝露を利用することができる。しかし、ＡＡＶ回収時、他のウイルス、例えば、ＡＡＶヘルパーウイルスを同時単離しないよう注意が必要である。
【００２３】
[0026]下流プロセスの初期ステップは、細胞培養方式によって部分的に決定される。接着細胞は、ｉｎ  ｓｉｔｕで溶解しても、増殖基質から分離し、凍結融解による溶解によって、機械的均質化又は界面活性剤の使用を介して化学的に、小さな使い捨て容器中で溶解してもよい。大量の浮遊培養液は、界面活性剤、例えば、トリトン（Ｔｒｉｔｏｎ）Ｘ−１００、ツイン（Ｔｗｅｅｎ）２０で処理するか又は機械的装置で均質化してもよい。ヌクレアーゼ処理、例えば、ベンゾナーゼ（ｂｅｎｚｏｎａｓｅ）処理を溶解後に組み込んで、ＤＮＡ夾雑物を低減させ、後続のろ過及びクロマトグラフィーステップを容易にしてもよい。
【００２４】
[0027]Ａｄヘルパーウイルスを使用してＡＡＶを産生する場合のいくつかの実施形態では、細胞溶解後、ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩、例えば、ｐＤＡＤＭＡＣを添加することによって、溶解した細胞バイオマスを凝集することができる。ろ過（大容量には便利）又は遠心分離のいずれかによって、ＡＡＶを清澄化バイオマス溶液に実質的に残しながら、細胞成分の凝集体を除去することができる。いくつかの実施形態では、孔径を徐々に小さくした一連のフィルターを使用して、細胞成分による目詰まりを防ぐ。いくつかの実施形態では、タンジェント流ろ過（ＴＦＦ）を使用する。実施形態では、バイオマスの凝集により形成された凝集体を、ろ過、例えば、クラリソルブによるろ過を使用することによって除去する。凝集剤及び凝集体の殆どが、ろ過によって除去され、残留凝集剤は、後続のクロマトグラフィーステップで除去され得る。実施形態では、本発明のＡＡＶを単離する方法と組み合わせて、バイアソルブ（Ｖｉｒｅｓｏｌｖｅ）等のウイルス除去フィルターを使用する。いくつかの実施形態では、分析技術、例えば、ＨＰＬＣ、ＰＣＲ及び／又はバイオアッセイを使用して、清澄化したバイオマスライセートが、ＡＡＶヘルパーウイルスを本質的に含まないことを検証してもよい。質量分析法等の他のアッセイを使用して、凝集剤が除去されたことを判定してもよい。
【００２５】
[0028]凝集体除去の後、残存するバイオマス、例えば、清澄化溶液中のＡＡＶを、クロマトグラフィーによる精製等の当技術分野で周知の技術を使用して、さらに単離、濃縮及び／又は精製することができる。カプシドは、カチオン及びアニオン交換培地の両方を使用したイオン交換クロマトグラフィーによって、清澄化した細胞ライセートから回収可能である。組換え単鎖抗体で作製した免疫親和性クロマトグラフィー培地は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ６及びＡＡＶ８を含むいくつかのＡＡＶカプシド血清型に結合することが知られている。抗体は、高い特異性及び親和性によりカプシドに結合し得る。サイズ排除クロマトグラフィー、ＩＥＸクロマトグラフィー又は他のクロマトグラフィーを含むがこれらに限定されない「最終精製（ｐｏｌｉｓｈｉｎｇ）」ステップにより、ほぼ均質なＡＡＶ最終産物が作製される。ＴＦＦ濃縮及び無菌ろ過の後、これらの方法により作製されたＡＡＶは、前臨床試験において、及びｃＧＭＰに準拠した実務により、臨床試験において使用することができる。
【００２６】
[0029]いくつかの実施形態では、ポリエチレングリコールを使用して、清澄化溶液からＡＡＶを沈殿させてもよい。低速遠心分離の後、ＡＡＶを含有するペレットをバッファーに再懸濁し、密度勾配遠心法、例えば、塩化セシウム等密度勾配遠心法又はイオジキサノール段階勾配遠心法によってさらに濃縮及び精製してもよい。いくつかの実施形態では、孔径を徐々に小さくした一連のフィルターを使用して目詰まりを防ぎ、ＡＡＶの回収率を増加させる。タンジェント流ろ過（ＴＦＦ）は、ＡＡＶの濃縮に便利な技術であり、バッファーの交換も可能にする。
【００２７】
[0030]いくつかの実施形態では、本発明は、標的導入遺伝子を含有するアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を単離する方法であって、（ａ）ＡＡＶ構造／複製要素、導入遺伝子及びＡＡＶヘルパーウイルス等の産生細胞を生成するのに必要とされるＤＮＡ要素を有するＡＡＶ産生細胞を準備するステップと、（ｂ）前記トランスフェクトされた産生細胞を培養するステップと、（ｃ）前記トランスフェクトされた産生細胞を溶解して、水性バイオマスを創出するステップと、（ｄ）ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を前記バイオマスに導入して、前記ＡＡＶヘルパーウイルスを含む凝集体及びＡＡＶを含む清澄化溶液を作製するステップと、（ｅ）前記清澄化溶液を精製カラムで処理して、単離されたＡＡＶを作製するステップとを含む、方法を対象とする。
【００２８】
[0031]いくつかの実施形態では、本発明は、標的導入遺伝子を含有するアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）を単離する方法であって、（ａ）産生細胞にＡＡＶ及びＡＡＶヘルパーウイルスをトランスフェクトして、トランスフェクトされた産生細胞を作製するステップと、（ｂ）前記トランスフェクトされた産生細胞を培養して、水性バイオマスを作製するステップと、（ｃ）前記トランスフェクトされた産生細胞を溶解して、細胞ライセートを作製するステップであり、細胞ライセートが、前記ＡＡＶヘルパーウイルスを含む凝集体及びＡＡＶを含む清澄化溶液を形成する、ステップと、（ｄ）ポリジアリルジアルキルアンモニウム塩を前記バイオマスに導入するステップと、（ｅ）前記清澄化溶液を精製カラムに接触させて、単離されたＡＡＶを作製するステップとを含む、方法を対象とする。
【００２９】
[0032]本発明を下記の実施例によってさらに説明する。これらの実施例は、本発明の理解に役立つように提供するものであり、本発明の制限として解釈するべきものではない。
【実施例】
【００３０】
[0033]以下、本発明を実施例によって詳細に記載する。しかし、下記の実施例は、本発明をより具体的に説明するために提供するものであり、本発明の範囲を制限するものとして解釈してはならない。
【００３１】
実施例１
実施例１
[0034]ＡＡＶ、ＡＡＶヘルパーウイルス（Ａｄ５）及び細胞成分を含んだ細胞ライセートを含む水性バイオマスからの精製したＡＡＶの単離について以下に記載する。操作上のステップを回避し製品損失を最小限にするために、ｐＤＡＤＭＡＣを使用した生産リアクター中の細胞培養懸濁液の凝集を制御することによって、収集／上流プロセスを最適化すると共に下流のクロマトグラフィーを強化した。
【００３２】
[0035]ＡＡＶ及びＡｄ５ウイルスを含有する細胞ライセートを０．０２５％のｐＤＡＤＭＡＣ（ＥＭＤ  ミリポア（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）、カタログ番号１３７０６９．０１００）で処理した。次いで、クラリソルブ６０フィルターを使用して細胞ライセートをろ過した。図２は、対照と比較した場合、細胞ライセートへｐＤＡＤＭＡＣを添加することによって、ＨＰＣＬによりＡｄ５力価が有意に減少すること、すなわち、ｐＤＡＤＭＡＣで処理した清澄化溶液中にＡｄ５が検出できないことを示す（図１及び２）。
【００３３】
【表１】
2019519213.tif 000002
【００３４】
[0036]これらのデータは、産生細胞株を使用したＡＡＶの生成において等、Ａｄ５ウイルスの排除が望まれる細胞ライセートからＡｄ５ヘルパーウイルスを除去するのにｐＤＡＤＭＡＣが有効であることを示す。
【００３５】
実施例２
[0037]ヘルパーウイルス存在下でのＡＡＶ回収プロセス（力価に悪影響のない）におけるｐＤＡＤＭＡＣ使用の実現可能性をさらに実証するために、ｐＤＡＤＭＡＣを用いる及び用いないＡｄ５を含有する細胞ライセートを既知量のＡＡＶを添加（ｓｐｉｋｉｎｇ）することにより試験した。様々な条件からの細胞ライセートを遠心分離によって清澄化後、無菌ろ過し、次いでＡｄ５（ｑＰＣＲ及びＨＰＬＣ）及びＡＡＶ（ｑＰＣＲ）について試験した。データは、０．０１〜０．１％の濃度のｐＤＡＤＭＡＣによってＡＡＶ力価が影響を受けないことを示す。Ａｄ５では、ＨＰＬＣの結果はＡｄ５が検出されないことを示唆するが、このアッセイはｑＰＣＲほど高感度ではない。ｑＰＣＲの結果は、約２〜３ｌｏｇ低いＡｄ５力価の減少を示した。さらに、使用したｐＤＡＤＭＡＣの量に基づくＡｄ５減少の差も観察された。ＨＰＬＣ及びｑＰＣＲの結果は共に、０．０５％及び０．１％のｐＤＡＤＭＡＣと比較して、０．０１％及び０．０２５％のｐＤＡＤＭＡＣにおいてＡｄ５の排除率が、より高いことを示した。結果を表２に要約する。
【００３６】
【表２】
2019519213.tif 000003
【００３７】
実施例３
[0038]ｐＤＡＤＭＡＣが、ＡＡＶウイルスに概して影響を与えていなかったこと、及び他のプロセスにより、ＡＡＶの収集に使用され得ることを確認するために、バキュロウイルス系システムを使用して生成したＡＡＶについて凝集プロセスを試験した。この場合では、ＡＡＶを昆虫細胞において産生し、ｐＤＡＤＭＡＣを０、０．０２５％、０．０５０％及び０．１％で培養ライセートに添加した。各試料中のＡＡＶをｑＰＣＲによって分析した（表３）。対照試料と、ｐＤＡＤＭＡＣを使用して収集した試料との間で、ＡＡＶ力価の差は予想どおり観察されなかった。
【００３８】
【表３】
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【００３９】
実施例４
[0039]組換えバキュロウイルスを用いたバキュロウイルスシステム（ｒＢＶ）でｐＤＡＤＭＡＣも試験した。０、０．０２５％及び０．１％のｐＤＡＤＭＡＣを用いた培養ライセートを試験した。感染力価アッセイ（ＢａｃＰＡＫ）を使用して、ｐＤＡＤＭＡＣで処理した及び処理しない（標準フィルターを使用して収集した−対照）試料において各試料中の組換えバキュロウイルス（ｒＢＶ）を試験した。結果を表４に要約する。この実験で得られたデータは、収集のためのｐＤＡＤＭＡＣを使用する手順を標準的手順と比較した場合、ｒＢＶ感染力価が影響を受けなかったことを示した。
【００４０】
【表４】
2019519213.tif 000005
【００４１】
[0040]結論として、凝集剤としてｐＤＡＤＭＡＣを使用することによって、標的ＡＡＶ力価に影響を与えることなく、産生細胞株プロセスに使用されるＡｄ５ヘルパーウイルスを安全に除去する（ＨＰＬＣによりＬＯＤを低下させる）ことが可能となったと思われる（表３）。同様に、ｐＤＡＤＭＡＣ凝集剤を使用することによって、ｒＢＶ系システムにおいて産生したＡＡＶの力価もまた、影響を受けない（表４）。
【００４２】
結論
[0100]本明細書に記載の種々の実施形態又は選択肢は全て、任意の及びあらゆる変形において組み合わせることができる。本発明は、本発明のいくつかの実施形態を参照して特に示し説明しているが、それらは限定としてではなく例としてのみ提示されており、形態及び詳細における種々の変更が、本発明の趣旨及び範囲から逸脱することなしに、それらの実施形態においてなされ得ることを当業者は理解するであろう。したがって、本発明の広がり及び範囲は、いかなる上記の例示的実施形態によっても制限されるべきではないが、以下の特許請求の範囲及びこれらの等価物によってのみ定義されるべきである。
【００４３】
[0101]雑誌の論文若しくは抄録、公開された若しくは対応する米国若しくは外国の特許出願、交付済みの若しくは外国の特許、又は他の任意の資料を含む本明細書で引用する全ての資料は、引用した資料に提示される全てのデータ、表、図及び本文を含む全体がそれぞれ参照により本明細書に組み込まれる。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【国際調査報告】
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