(57)【要約】  外因性物質、酵素活性、および薬物活性を調節するための組成物、例えば、医薬組成物、栄養組成物、医療用食品、および食品成分、ならびにそれらの使用方法が提供される。【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象における薬物活性を増大させる方法であって、
ａ）前記対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）前記対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、前記グリカン組成物の投与時に、前記対象は、前記投与されたグリカン組成物の存在下で治療効果を提供する薬物のレベルを含むこと；
ｃ）薬物を投与するが、前記薬物の投与時に、前記対象は前記対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、前記グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）前記対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、薬物を投与するが、対象は、例えば前記薬物の活性を増大させるために、前記グリカン組成物を必要としていると決定されていること；または
ｅ）前記対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、前記対象に前記薬物および前記グリカン組成物を投与するが、前記薬物および前記グリカン組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）前記グリカン調製物中のグリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）前記グリカン調製物中のグリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）前記グリカン調製物のグリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；あるいは、
ｉｘ）前記グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせであり；かつ
前記薬物は、
ｖ）強心配糖体；
ｖｉ）スルホンアミド；
ｖｉｉ）ヌクレオシドアナログ；または
ｖｉｉｉ）アミノサリチル酸塩
を含む、あるいは
前記薬物は、
−非ステロイド性抗炎症（ＮＳＡＩＤ）薬；
−化学療法薬、または、一般に、標的細胞（例えば、癌細胞）に対し増殖抑制効果のある薬物；
−抗生物質もしくは抗菌剤；
−抗真菌剤；
−抗寄生虫剤、例えば、抗線虫薬；
−ホルモン；
−鎮静剤；
−心臓治療薬；
−高血圧治療薬；
−コロニー刺激因子；
−ドーパミン；
−オピオイド受容体作動薬；
−スタチン；
−中枢神経系興奮薬；
−増感剤／放射線治療剤；
−麻薬性鎮痛剤；
−催眠薬；
−制酸剤；
−鎮痛剤；
−ウリカーゼ阻害剤；
−抗精神病薬；または
−緩下剤；または神経栄養因子、例えば、抗痙攣薬
である方法。
【請求項２】
ａを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ｂを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
ｃを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
ｄを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
ｅを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記薬物活性は参照レベルに対して増大する、例えば、参照レベル、例えば、予め選択したレベル、前記グリカン組成物投与時のベースラインレベル、または前記グリカン組成物が投与されなかった場合に見られるであろうレベルに対して増大する、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記薬物は、強心配糖体、例えば、ジゴキシン、ジギトキシン、コンバラトキシン、アンチアリン、またはオレアンドリンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記薬物は、スルホンアミド（サルファ剤）、例えば、抗微生物剤、例えば、スルファフラゾール、スルファセタミド、スルファジアジン、スルファジミジン、スルファフラゾール（スルフイソキサゾール）、スルフイソミジン（スルファイソジミジン）、スルファドキシン、スルファメトキサゾール、スルファモキソール、スルファニトラン、スルファジメトキシン、スルファメトキシピリダジン、スルファメトキシジアジン、スルファドキシン、スルファメトピラジン、またはテレフチルを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記薬物は、スルホンアミド、例えば、スルホニル尿素、例えば、アセトヘキサミド、カルブタミド、クロルプロタミド、グリベンクラミド（グリブリド）、グリボルヌリド、グリクラジド、グリクロピラミド、グリメピリド、グリピジド、グリキドン、グリソキセピド、トラザミド、またはトルブタミドを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記薬物は、スルホンアミド、例えば、利尿剤、例えば、アセタゾールアミド、ブメタニド、クロルタリドン、クロパミド、フロセミド、ヒドロクロロチアジド、インダパミド、メフルシド、メトラゾン、またはキシパミドを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記薬物は、スルホンアミド、例えば、鎮痙剤、例えば、エトキシゾラミド、スルチアム、トピラメート、またはゾニサミドを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記薬物は、スルホンアミドは、例えば、抗レトロウイルス薬、例えば、アンプレナビル（もしくは、他のＨＩＶプロテアーゼ阻害薬）、ダルナビル、デラビルジン（もしくは、他の非ヌクレオシド逆転写酵素阻害薬）、ホスアンプレナビル、またはチプラナビルを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記薬物は、スルホンアミド、例えば、Ｃ型肝炎抗ウイルス薬、例えば、アスナプレビル（もしくは、他のＮＳ３／４Ａプロテアーゼ阻害薬）、ベクラブビル（もしくは、他のＮＳ５Ｂ  ＲＮＡポリメラーゼ阻害薬）、ダサブビル、グラゾプレビル、パリタプレビル、またはシメプレビルを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記薬物は、スルホンアミド（サルファ剤）、例えば、アプリコキシブ（ＣＯＸ−２阻害薬）、ボセンタン（エンドセリン受容体拮抗薬）、ブリンゾラミド（緑内障に対する炭酸脱水酵素阻害薬）、セレコキシブ（ＣＯＸ−２阻害薬）、ドフェチリド（クラスＩＩＩ抗不整脈薬）、ドルゾラミド（抗緑内障炭酸脱水酵素阻害薬）、ドロネダロン（クラスＩＩＩ抗不整脈薬）、イブチリド（クラスＩＩＩ抗不整脈薬）、パレコキシブ（ＣＯＸ−２阻害薬）、プロベネシド（尿酸尿症）、ソタロール（β遮断薬）、スルファサラジン（抗炎症剤およびＤＭＡＲＤ）、スマトリプタン（抗片頭痛トリプタン）、タムスロシン（α遮断薬）、またはウデナフィル（ＰＤＥ５阻害薬）を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記薬物は、ヌクレオシドアナログ、例えば、ａ）デオキシアデノシンアナログ：例えば、ジダノシン（ｄｄＩ）（ＨＩＶ）、ビダラビン（抗ウイルス薬）；ｂ）アデノシンアナログ：ＢＣＸ４４３０（エボラ）；ｃ）デオキシシチジンアナログ：シタラビン（化学療法）、ゲムシタビン（化学療法）、エムトリシタビン（ＦＴＣ）（ＨＩＶ）、ラミブジン（３ＴＣ）（ＨＩＶ、Ｂ型肝炎）、ザルシタビン（ｄｄＣ）（ＨＩＶ）；ｄ）グアノシンおよびデオキシグアノシンアナログ：アバカビル（ＨＩＶ）、アシクロビル、エンテカビル（Ｂ型肝炎）；ｅ）チミジンおよびデオキシチミジンアナログ：スタブジン（ｄ４Ｔ）、テルビブジン（Ｂ型肝炎）、ジドブジン（アジドチミジンもしくはＡＺＴ）（ＨＩＶ）；ｆ）デオキシウリジンアナログ：イドクスウリジン、トリフルリジン；ｇ）ピリミジンアナログ：５−フルオロウラシル（５ＦＵ）、フロクスウリジン（ＦＵＤＲ）、シタラビン（シトシンアラビノシド）、６−アザウラシル（６−ＡＵ）；またはｈ）プリンアナログ：アザチオプリン、メルカプトプリン、チオプリン、フルダラビン、ペントスタチンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記薬物は、アミノサリチル酸塩、例えば、４−アミノサリチル酸、バルサラジド、オルサラジン、スルファサラジン、またはメサラジン（５−アミノサリチル酸）を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記薬物は、非ステロイド性抗炎症（ＮＳＡＩＤ）薬、例えば、５−アミノサリチル酸およびその誘導体、例えば、バルサラジド、オルサラジン、スルファサラジン（アミノサリチル酸系抗炎症薬）、ジクロフェナク、インドシン、インドメタシン、ケトプロフェン、またはスリンダクを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記薬物は、化学療法薬、または、一般に、標的細胞（例えば、癌細胞）に対し増殖抑制効果のある薬物、例えば、５−フルオロウラシルおよびメトトレキサート（代謝拮抗薬、抗腫瘍薬、および癌用免疫抑制剤）、またはイリノテカン（ＳＮ−３８Ｇ）を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記薬物は、抗生物質または抗菌剤、例えば、ベンジルペニシリン、クロラムフェニコール、メトロニダゾール、プロントシル、ネオプロントシル、またはスルファピリジンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記薬物は、抗ウイルス剤、例えば、ＢＩＬＲ  ３５５、ソリブジン、またはデレオブビルを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記薬物は、抗真菌剤、例えば、フルシトシン（５−ＦＣ）を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記薬物は、抗寄生虫剤、例えば抗線虫薬、例えば、レバミソールを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記薬物は、ホルモン、例えば、カルシトニンまたはインスリンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記薬物は、鎮静剤、例えば、クロナゼパムを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
前記薬物は、心臓治療薬または高血圧治療薬、例えば、強心配糖体、例えば、ジゴキシン、三硝酸グリセリン、または二硝酸イソソルビドを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記薬物は、コロニー刺激因子、例えば、エルトロンボパグを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記薬物は、ドーパミン、例えば、レボドパを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記薬物は、オピオイド受容体作動薬、例えば、ロペラミドを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記薬物は、スタチン、例えば、ロバスタチンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
前記薬物は、中枢神経系興奮薬、例えば、メタンフェタミンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４５】
前記薬物は、増感剤または放射線治療剤、例えば、ミソニダゾールを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４６】
前記薬物は、麻薬性鎮痛剤、例えば、モルヒネを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
前記薬物は、催眠薬、例えば、ニトラゼパムを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
前記薬物は、制酸剤またはプロトンポンプ阻害薬、例えば、ニザチジン、ラニチジン、またはオメプラゾールを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４９】
前記薬物は、鎮痛剤、例えば、フェナセチンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
前記薬物は、ウリカーゼ阻害剤、例えば、オキソン酸カリウムを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５１】
前記薬物は、抗精神病薬、例えば、リスペリドンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５２】
前記薬物は、緩下剤、例えば、センノシド（センナグリコシド）またはピコスルファートナトリウムを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５３】
前記薬物は、スルホンアミド、例えば、スクシニルサルファチアゾール、スルファピリジン、またはスルファサラジンを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５４】
前記薬物は、神経栄養因子、例えば、抗痙攣薬、例えば、ゾニサミドを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５５】
前記薬物は、参照用量、例えば、グリカン組成物を投与されない対象に投与される薬物用量、または監督官庁、例えば、ＦＤＡ（ＵＳＡ）もしくはＥＭＡ（ＥＵ）もしくはＰＭＤＡ（日本）によって承認された用量と比較してより高用量で投与される請求項１〜５４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５６】
前記対象における、例えば、前記対象の消化管における微生物、または微生物分類群の存在率を、参照レベル、例えば、ベースラインレベル、前記グリカン組成物の投与前のレベル、または、前記グリカン組成物が投与されなかった場合のレベルと比べ、例えば、少なくとも２５％（例えば、少なくとも２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、１０００倍もしくはそれ以上）変化させる、例えば、増加または減少させることを含む、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５７】
前記対象における、例えば、前記対象のＧＩ管における基質量、代謝産物、または酵素活性の生成物を、参照レベル、例えば、ベースラインレベル、前記グリカン組成物の投与前のレベル、または、前記グリカン組成物が投与されなかった場合のレベルと比べ、例えば、少なくとも２５％（例えば、少なくとも２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、１０００倍もしくはそれ以上）変化させる、例えば、増加または減少させることを含む、請求項１〜５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５８】
前記薬物または薬物代謝産物を調節、（ｉ）ヒドロキシル化、（ｉｉ）メチル化、（ｉｉｉ）スルホン化、（ｉｖ）加水分解、（ｖ）酸化、（ｖｉ）還元、（ｖｉｉ）芳香族化、（ｖｉｉｉ）アルキル化、（ｉｘ）アシル化、（ｘ）リン酸化、（ｘｉ）グリコシル化、（ｘｉｉ）硫酸化、および／または（ｘｉｉｉ）ニトロシル化することを含む、請求項１〜５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５９】
前記対象は、ヒト対象である、請求項１〜５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６０】
前記ヒト対象の前記消化管における酵素活性を調節することを含む、請求項１〜５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６１】
前記グリカン組成物は、ポリフェノールをさらに含む、請求項１〜６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６２】
前記グリカン組成物は、プロバイオティクス細菌またはその調製物をさらに含む、請求項１〜６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６３】
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項１〜６２のいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ａ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｂ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｃ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｄ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項１〜６３Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｅ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項１〜６３Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｆ)
ｉ）グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含み；かつ
ｉｉ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約３〜２５である、
請求項１〜６３のいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｇ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項１〜６３Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｈ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項１〜６３Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｉ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項１〜６３Ｈのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｊ)
前記グリカン調製物は、１，６グリコシド結合を１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％含む、請求項１〜６３Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｋ)
前記グリカン調製物は、１，６グリコシド結合を２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％含む、請求項１〜６３Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｌ)
前記グリカン調製物は、１，６グリコシド結合を３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％含む、請求項１〜６３Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｍ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％含む、請求項１〜６３Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｎ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％含む、請求項１〜６３Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｏ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％含む、請求項１〜６３Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｐ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項１〜６３Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｑ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約７０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項１〜６３Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｒ)
前記グリカン調製物は、少なくとも５０％の食物繊維含量を有する、請求項１〜６３Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｓ)
前記グリカン調製物は、少なくとも７０％の食物繊維含量を有する、請求項１〜６３Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｔ)
前記グリカンポリマーは、分岐していない（平均分岐度は０である）、請求項１〜６３Ｓのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｕ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０１〜０．６である、請求項１〜６３Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｖ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０５〜０．５または０．１５〜０．４である、請求項１〜６３Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｗ)
前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、または約１３〜２５である、請求項１〜６３Ｖのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｘ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合のみを含む、請求項１〜６３Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｙ)
前記グリカンポリマーは、ベータ−グリコシド結合のみを含む、請求項１〜６３Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３Ｚ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合およびベータ−グリコシド結合の両方を含む、請求項１〜６３Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＡＡ)
前記グリカン調製物の前記グリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約０．８：１〜約５：１である、請求項１〜６３Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＢＢ)
前記グリカン調製物の前記グリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約１：１〜約３：１または約３：２〜約３：１である、請求項１〜６３Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＣＣ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＤＤ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＥＥ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＦＦ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項１〜６３ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＧＧ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項１〜６３ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
(請求項６３ＨＨ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項１〜６３ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
【請求項６４】
前記グリカン組成物は、ＦＯＳに置き換えられる、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
前記グリカン組成物は、ラクツロースに置き換えられる、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６６】
摂取物質、例えば、食品、栄養補助食品、または医療食品中の物質、例えば、植物エストロゲンまたはポリフェノールの、対象、例えばヒト対象における活性を増大させる方法であって、
ａ）前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの、前記対象における活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの、前記対象における活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、前記グリカン組成物の投与時に、前記対象は、前記投与されたグリカン組成物の存在下で、前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの活性の増大、例えば有益な増大を提供するレベルの前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールを含むこと；
ｃ）前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールを投与するが、その摂取物質の投与時に、前記対象は、前記対象における摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、前記グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールを投与するが、対象は、前記グリカン組成物を必要としていると決定されていること；あるいは
ｅ）前記摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノール、および前記グリカン組成物を、前記対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、前記対象に投与するが、前記薬物および前記グリカン組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）前記グリカン調製物の前記グリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；あるいは
ｉｘ）グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である方法。
【請求項６７】
ａ）を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
ｂ）を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項６９】
ｃ）を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７０】
ｄ）を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７１】
ｅ）を含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項７２】
投与は、自己投与を含む、請求項６６〜７１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７３】
前記摂取物質は、植物エストロゲンまたはポリフェノールを含む、請求項６６〜７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
前記植物エストロゲンまたはポリフェノールは、イソフラボンまたはクメスタン、例えば、ゲニステインおよびダイゼイン、リグナン、エラジタンニンを含む、請求項６６〜７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７４のいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ａ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５のいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｂ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｃ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｄ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｅ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｆ)
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含み；かつ
ｉｉ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約３〜２５である、
請求項６６〜７５のいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｇ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項６６〜７５Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｈ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項６６〜７５Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｉ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項６６〜７５Ｈのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｊ)
前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｋ)
前記グリカン調製物は、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｌ)
前記グリカン調製物は、３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｍ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％含む、請求項６６〜７５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｎ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％含む、請求項６６〜７５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｏ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％含む、請求項６６〜７５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｐ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項６６〜７５Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｑ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約７０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項６６〜７５Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｒ)
前記グリカン調製物は、少なくとも５０％の食物繊維含量を有する、請求項６６〜７５Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｓ)
前記グリカン調製物は、少なくとも７０％の食物繊維含量を有する、請求項６６〜７５Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｔ)
前記グリカンポリマーは、分岐していない（平均分岐度は０である）、請求項６６〜７５Ｓのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｕ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０１〜０．６である、請求項６６〜７５Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｖ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０５〜０．５または０．１５〜０．４である、請求項６６〜７５Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｗ)
前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、または約１３〜２５である、請求項６６〜７５Ｖのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｘ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合のみを含む、請求項６６〜７５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｙ)
前記グリカンポリマーは、ベータ−グリコシド結合のみを含む、請求項６６〜７５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５Ｚ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合およびベータ−グリコシド結合の両方を含む、請求項６６〜７５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＡＡ)
前記グリカン調製物のグリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約０．８：１〜約５：１である、請求項６６〜７５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＢＢ)
前記グリカン調製物の前記グリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約１：１〜約３：１または約３：２〜約３：１である、請求項６６〜７５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＣＣ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＤＤ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＥＥ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＦＦ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項６６〜７５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＧＧ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
(請求項７５ＨＨ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項６６〜７５ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
【請求項７６】
摂取物質、例えば、食品、栄養補助食品、または医療食品中の物質、例えば、複素環式アミン（ＨＣＡ）または多環芳香族炭化水素（ＰＡＨ）の、対象、例えばヒト対象における毒性活性を低減させる方法であって、
ａ）前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの、前記対象における毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの、前記対象における毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、前記グリカン組成物の投与時に、前記対象は、前記投与されたグリカン組成物の存在下で、前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの毒性活性の低減、例えば有益な低減を提供するレベルの前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨを含むこと；
ｃ）前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨを投与するが、前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの投与時に、前記対象は、前記対象における摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間、前記グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨを投与するが、対象は、前記グリカン組成物を必要としていると決定されていること；あるいは
ｅ）前記対象に前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨ、および前記グリカン組成物を、前記対象における前記摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間投与するが、前記薬物および前記摂取物質、例えば
ＨＣＡまたはＰＡＨ組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）グリカン調製物のグリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；あるいは
ｉｘ）グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である
方法。
【請求項７７】
ａ）を含む、請求項７６に記載の方法。
【請求項７８】
ｂ）を含む、請求項７６に記載の方法。
【請求項７９】
ｃ）を含む、請求項７６に記載の方法。
【請求項８０】
ｄ）を含む、請求項７６に記載の方法。
【請求項８１】
ｅ）を含む、請求項７６に記載の方法。
【請求項８２】
投与は、自己投与を含む、請求項７６〜８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８３】
前記食品は、筋肉、例えば、ＨＣＡまたはＰＡＨを生成するのに十分に高い温度で調理された牛肉、豚肉、魚肉または鶏肉を含む、請求項７６〜８２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８４】
前記摂取物質は、ＨＣＡまたはＰＡＨを含む、請求項７６〜８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８５】
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８４のいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ａ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８４のいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｂ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８５Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｃ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８５Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｄ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｅ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｆ)
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含み；かつ
ｉｉ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約３〜２５である、
請求項７６〜８５のいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｇ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項７６〜８５Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｈ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項７６〜８５Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｉ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項７６〜８５Ｈのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｊ)
前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｋ)
前記グリカン調製物は、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｌ)
前記グリカン調製物は、３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｍ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％含む、請求項７６〜８５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｎ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％含む、請求項７６〜８５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｏ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％含む、請求項７６〜８５Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｐ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項７６〜８５Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｑ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約７０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項７６〜８５Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｒ)
前記グリカン調製物は、少なくとも５０％の食物繊維含量を有する、請求項７６〜８５Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｓ)
前記グリカン調製物は、少なくとも７０％の食物繊維含量を有する、請求項７６〜８５Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｔ)
前記グリカンポリマーは、分岐していない（平均分岐度は０である）、請求項７６〜８５Ｓのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｕ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０１〜０．６である、請求項７６〜８５Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｖ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０５〜０．５または０．１５〜０．４である、請求項７６〜８５Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｗ)
前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、または約１３〜２５である、請求項７６〜８５Ｖのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｘ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合のみを含む、請求項７６〜８５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｙ)
前記グリカンポリマーは、ベータ−グリコシド結合のみを含む、請求項７６〜８５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５Ｚ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合およびベータ−グリコシド結合の両方を含む、請求項７６〜８５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＡＡ)
前記グリカン調製物のグリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約０．８：１〜約５：１である、請求項７６〜８５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＢＢ)
前記グリカン調製物の前記グリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約１：１〜約３：１または約３：２〜約３：１である、請求項７６〜８５Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＣＣ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＤＤ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＥＥ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＦＦ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノース、またはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項７６〜８５ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＧＧ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
(請求項８５ＨＨ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項７６〜８５ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
（ｉ）対象の外因性物質の処理を調節する（処理の調節）方法、または
（ｉｉ）対象の消化管における酵素活性を調節する（活性の調節）方法
であって、
ａ）前記対象における処理の調節または活性の調節を行うのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）前記対象における処理の調節または活性の調節を行うのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、前記グリカン組成物の投与時に、前記対象は、前記外因性物質または酵素を含むこと；
ｃ）前記外因性物質を投与するが、前記外因性物質の投与時に、前記対象は、前記対象における前記外因性物質の処理の調節に有効な量で、かつ十分な時間、前記グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）前記外因性物質を投与するが、対象は、グリカン組成物を必要としていると決定されていること；あるいは
ｅ）前記対象に前記外因性物質および前記グリカン組成物を、前記対象における処理の調節または活性の調節に有効な量で、かつ十分な時間投与するが、前記外因性物質および前記グリカン組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）前記グリカン調製物の前記グリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；あるいは
ｉｘ）前記グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である
方法。
【請求項８７】
ａ）を含む、請求項８６に記載の方法。
【請求項８８】
ｂ）を含む、請求項８６に記載の方法。
【請求項８９】
ｃ）を含む、請求項８６に記載の方法。
【請求項９０】
ｄ）を含む、請求項８６に記載の方法。
【請求項９１】
ｅ）を含む、請求項８６に記載の方法。
【請求項９２】
前記外因性物質は、参照用量、例えば、前記グリカン組成物を投与されない対象に投与される外因性物質の用量、または前記グリカン組成物を投与される前に対象に投与された外因性物質の用量と比較してより高用量で投与される請求項８６〜９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９３】
前記外因性物質は、参照用量、例えば、前記グリカン組成物を投与されない対象に投与される外因性物質の用量、または前記グリカン組成物を投与される前に対象に投与された外因性物質の用量と比較してより低用量で投与される請求項８６〜９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９４】
前記対象における、例えば、前記対象の消化管における微生物、または微生物分類群の存在率を、参照レベル、例えば、ベースラインレベル、前記グリカン組成物の投与前のレベル、または、前記グリカン組成物が投与されなかった場合のレベルと比べ、例えば、少なくとも２５％（例えば、少なくとも２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、１０００倍もしくはそれ以上）変化させる、例えば、増加または減少させることを含む、請求項８６〜９３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９５】
前記対象における、例えば、前記対象のＧＩ管における前記酵素活性の基質、代謝産物または生成物の量を、参照レベル、例えば、ベースラインレベル、前記グリカン組成物の投与前のレベル、または、前記グリカン組成物が投与されなかった場合のレベルと比べ、例えば、少なくとも２５％（例えば、少なくとも２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、１０００倍もしくはそれ以上）変化させる、例えば、増加または減少させることを含む、請求項８６〜９４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９６】
外因性物質を調節、（ｉ）ヒドロキシル化、（ｉｉ）メチル化、（ｉｉｉ）スルホン化、（ｉｖ）加水分解、（ｖ）酸化、（ｖｉ）還元、（ｖｉｉ）芳香族化、（ｖｉｉｉ）アルキル化、（ｉｘ）アシル化、（ｘ）リン酸化、（ｘｉ）グリコシル化、（ｘｉｉ）硫酸化、および／または（ｘｉｉｉ）ニトロシル化することを含む、請求項８６〜９５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９７】
前記対象は、ヒト対象である、請求項８６〜９６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９８】
前記ヒト対象の前記消化管における酵素活性を調節することを含む、請求項８６〜９７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９９】
前記グリカン組成物は、ポリフェノールをさらに含む、請求項８６〜９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１００】
前記グリカン組成物は、プロバイオティクス細菌またはその調製物をさらに含む、請求項８６〜９９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０１】
前記酵素は、（ｉ）オキシドレダクターゼ（ＥＣ１）（例えば、デヒドロゲナーゼ、オキシダーゼ、カタラーゼ）、（ｉｉ）トランスフェラーゼ（ＥＣ２）（例えば、アミノトランスフェラーゼ、ペプチジルトランスフェラーゼ、グリコシルトランスフェラーゼ）、（ｉｉｉ）ヒドロラーゼ（ＥＣ３）（例えば、レダクターゼ（例えば、金属レダクターゼ）、アロマターゼ／シクラーゼ、ホスホリラーゼ、グリコシダーゼ、セルラーゼ、アミラーゼ、ウレアーゼ、リパーゼ、プロテアーゼ、ペプチダーゼ、マンナナーゼ、プルラナーゼ、キシラナーゼ）、（ｉｖ）リアーゼ（ＥＣ４）（例えば、ペクチン酸塩リアーゼ）、（ｖ）イソメラーゼ（ＥＣ５）（例えば、エピメラーゼ、ムターゼ）、（ｖｉ）リガーゼ（ＥＣ６）（例えば、シンターゼ）、（ｖｉｉ）アゾレダクターゼ（例えば、アリールアミンＮ−アセチルトランスフェラーゼ）、（ｖｉｉｉ）ベータ−グルクロニダーゼ（例えばウリジン二リン酸（ＵＤＰ）−グルクロノシルトランスフェラーゼ）、および／または（ｉｘ）カルボキシルエステラーゼから選択される、請求項８６〜１００のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０２】
前記酵素は、哺乳動物（例えば、ヒト）酵素である、請求項８６〜１０２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０３】
前記酵素は、微生物（例えば、細菌）酵素である、請求項８６〜１０２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０４】
前記酵素活性を、例えば、参照レベル（例えば、前記グリカン組成物の投与前に前記対象に生じる処理のレベル）に対し、例えば、少なくとも２５％（例えば、少なくとも２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、１０００倍もしくはそれ以上）増加させることを含む、請求項８６〜１０３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０５】
前記酵素活性を、例えば、参照レベル（例えば、前記グリカン組成物の投与前に前記対象に生じる処理のレベル）に対し、例えば、少なくとも２５％（例えば、少なくとも２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、１００％、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、１０００倍もしくはそれ以上）減少させることを含む、請求項８６〜１０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０６】
前記外因性物質は、乳化剤、ゲル形成剤、またはサポニン、例えばグリシルリジンを含む、請求項８６〜１０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０７】
前記外因性物質は、医薬剤、食事成分、食品、食品添加物、薬物添加物、または環境毒素を含む、請求項８６〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０８】
前記外因性物質は、アレルゲンを含む、請求項８６〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０９】
前記対象は、外因性物質に曝露されたか、曝露されているか、または曝露される、請求項８６〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１０】
前記外因性物質は、経口投与または経鼻投与される、請求項８６〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１１】
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１０のいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ａ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１のいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｂ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｃ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１Ａのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｄ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｅ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１Ｃのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｆ)
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含み；かつ
ｉｉ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約３〜２５である、
請求項８６〜１１１のいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｇ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項８６〜１１１Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｈ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項８６〜１１１Ｆのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｉ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも６０％は、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する、請求項８６〜１１１Ｈのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｊ)
前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｋ)
前記グリカン調製物は、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｌ)
前記グリカン調製物は、３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％の１，６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｍ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％含む、請求項８６〜１１１Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｎ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％含む、請求項８６〜１１１Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｏ)
前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合をそれぞれ１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％含む、請求項８６〜１１１Ｉのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｐ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項８６〜１１１Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｑ)
前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約７０Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する、請求項８６〜１１１Ｏのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｒ)
前記グリカン調製物は、少なくとも５０％の食物繊維含量を有する、請求項８６〜１１１Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｓ)
前記グリカン調製物は、少なくとも７０％の食物繊維含量を有する、請求項８６〜１１１Ｑのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｔ)
前記グリカンポリマーは、分岐していない（平均分岐度は０である）、請求項８６〜１１１Ｓのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｕ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０１〜０．６である、請求項８６〜１１１Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｖ)
前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０．０５〜０．５または０．１５〜０．４である、請求項８６〜１１１Ｔのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｗ)
前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、または約１３〜２５である、請求項８６〜１１１Ｖのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｘ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合のみを含む、請求項８６〜１１１Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｙ)
前記グリカンポリマーは、ベータ−グリコシド結合のみを含む、請求項８６〜１１１Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１Ｚ)
前記グリカンポリマーは、アルファ−グリコシド結合およびベータ−グリコシド結合の両方を含む、請求項８６〜１１１Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＡＡ)
前記グリカン調製物のグリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約０．８：１〜約５：１である、請求項８６〜１１１Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＢＢ)
前記グリカン調製物の前記グリカンポリマーに存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、約１：１〜約３：１または約３：２〜約３：１である、請求項８６〜１１１Ｗのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＣＣ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも２種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＤＤ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースおよびラムノースのうちの少なくとも３種の別個のグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＥＥ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコースまたはラムノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＦＦ)
前記グリカン組成物は、グルコース、ガラクトース、マンノースまたはアラビノースのグリカン単位の１種以上からなるグリカンポリマーを含む、請求項８６〜１１１ＢＢのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＧＧ)
前記グリコシド結合の少なくとも２つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
(請求項１１１ＨＨ)
前記グリコシド結合の少なくとも３つは、独立して、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合を含む、請求項８６〜１１１ＦＦのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１２】
対象の治療レジメンを特定または選択する方法であって、
ｉ）前記対象における細菌分類群もしくは微生物代謝産物の存在もしくはレベル、または酵素活性の値を取得すること；
ｉｉ）前記値に応じて、前記対象を治療するためのグリカン組成物を含む治療を選択すること；および
ｉｉｉ）前記対象を治療するのに有効な量で、かつ十分な時間、前記グリカン組成物を投与すること
を含み、
ｉ）前記グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）前記グリカン調製物中の前記グリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）前記グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）前記グリカン調製物の前記グリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）前記グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）前記グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）前記グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；あるいは
ｉｘ）前記グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である
方法。
【請求項１１３】
本明細書に開示のグリカン組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本願は、２０１６年７月１３日に出願された米国特許出願第６２／３６１，９９８号の優先権を主張するものであり、その全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
ヒトの健康の維持または回復は、効果的な処置の選択肢がないことに起因する多くの課題に直面している。新規治療法および処置計画が引き続き必要とされている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００３】
例えば、薬物、薬物代謝産物、薬物添加物、食品、食品添加物、アレルゲン、毒素または毒物などの外因性物質の処理は、対象において、哺乳動物機械および／または微生物機械により行われ得る。場合によっては、外因性物質の処理は、例えば、対象の腸内の微生物などの、対象の微生物成分によって媒介され得る。例えば、外因性物質の、微生物媒処理などの処理を調節することによって、外因性物質またはその処理形態の対象に対する影響を変えることができる。
【０００４】
本明細書に記載の方法、組成物、キットなどは、微生物（例えば、腸内微生物）が対象、例えばヒト対象における外因性基質の処理を媒介する方法をグリカン組成物が変えることができるという発見に少なくとも部分的に基づいている。一実施形態では、グリカン組成物は、微生物、例えば細菌分類群の数または存在率を増加または減少させることによって、微生物媒介処理を調節する。一実施形態では、グリカン組成物は、微生物の成分または産物、例えば微生物によって作られる酵素または代謝産物の活性またはレベルを増加または低下させることによって、微生物媒介処理を調節する。一実施形態では、グリカン組成物は、微生物の活性を変化させる酵素または他の微生物タンパク質（例えば、代謝経路などの経路の、１つまたは複数のタンパク質成分）の転写を増加または減少させる。
【０００５】
一態様では、本発明は、対象における薬物活性を増大させる方法であって、
ａ）対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、そのグリカン組成物の投与時に、対象は、投与されたグリカン組成物の存在下で治療効果を提供するレベルの薬物を含むこと；
ｃ）薬物を投与するが、その薬物の投与時に、対象は対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、薬物を投与するが、対象は、例えばその薬物活性を増大させるために、グリカン組成物を必要としていると決定されていること；または
ｅ）対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、対象に薬物およびグリカン組成物を投与するが、その薬物およびグリカン組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）グリカン調製物のグリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）グリカン調製物は、１，６グリコシド結合を１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉ）グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；
ｉｘ）グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；あるいは
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせであり；かつ
薬物は、
ｉ）強心配糖体；
ｉｉ）スルホンアミド；
ｉｉｉ）ヌクレオシドアナログ；または
ｉｖ）アミノサリチル酸塩
を含む、あるいは
薬物は、
−非ステロイド性抗炎症（ＮＳＡＩＤ）薬；
−化学療法薬、または、一般に、標的細胞（例えば、癌細胞）に対し増殖抑制効果のある薬物；
−抗生物質もしくは抗菌剤；
−抗真菌剤；
−抗寄生虫剤、例えば、抗線虫薬；
−ホルモン；
−鎮静剤；
−心臓治療薬；
−高血圧治療薬；
−コロニー刺激因子；
−ドーパミン；
−オピオイド受容体作動薬；
−スタチン；
−中枢神経系興奮薬；
−増感剤／放射線治療剤；
−麻薬性鎮痛剤；
−催眠薬；
−制酸剤；
−鎮痛剤；
−ウリカーゼ阻害剤；
−抗精神病薬；
−緩下剤；または
−神経栄養因子、例えば、抗痙攣薬である
方法を特徴とする。
【０００６】
別の態様では、本発明は、摂取物質、例えば、食品、栄養補助食品、または医療食品中の物質、例えば、植物エストロゲンまたはポリフェノールの、対象、例えばヒト対象における活性を増大させる方法であって、
ａ）摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの、対象における活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの、対象における活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、そのグリカン組成物の投与時に、対象は、その投与されたグリカン組成物の存在下で、摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの活性の増大、例えば有益な増大を提供するレベルの摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールを含むこと；
ｃ）摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールを投与するが、その摂取物質の投与時に、対象は、対象における摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールの活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノールを投与するが、対象は、グリカン組成物を必要としていると決定されていること；あるいは
ｅ）摂取物質、例えば植物エストロゲンまたはポリフェノール、およびグリカン組成物を、対象における薬物活性を増大させるのに有効な量で、かつ十分な時間、対象に投与するが、その薬物およびグリカン組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）グリカン調製物のグリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；
ｉｘ）グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；あるいは
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である
方法を特徴とする。
【０００７】
別の態様では、本発明は、摂取物質、例えば、食品、栄養補助食品、または医療食品中の物質、例えば、複素環式アミン（ＨＣＡ）または多環芳香族炭化水素（ＰＡＨ）の、対象、例えばヒト対象における毒性活性を低減させる方法であって、
ａ）摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの、対象における毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの、対象における毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、そのグリカン組成物の投与時に、対象は、その投与されたグリカン組成物の存在下で、摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの毒性活性の低減、例えば有益な低減を提供するレベルの摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨを含むこと；
ｃ）摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨを投与するが、その摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの投与時に、対象は、対象における摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨを投与するが、対象は、グリカン組成物を必要としていると決定されていること；あるいは
ｅ）対象に摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨ、およびグリカン組成物を、対象における摂取物質、例えばＨＣＡまたはＰＡＨの毒性活性を低減させるのに有効な量で、かつ十分な時間投与するが、その薬物および摂取物質、例えば、ＨＣＡまたはＰＡＨ組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）グリカン調製物のグリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；
ｉｘ）グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；あるいは
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である
方法を特徴とする。
【０００８】
別の態様では、本発明は、
（ｉ）対象における外因性物質の処理を調節する（処理の調節）方法、または
（ｉｉ）対象の消化管における酵素活性を調節する（活性の調節）方法
であって、
ａ）対象における処理の調節または活性の調節に有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与すること；
ｂ）対象における処理の調節または活性の調節に有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を投与するが、そのグリカン組成物の投与時に、対象は、外因性物質または酵素を含むこと；
ｃ）外因性物質を投与するが、その外因性物質の投与時に、対象は、対象における外因性物質の処理の調節に有効な量で、かつ十分な時間、グリカン組成物を既に投与されていること；
ｄ）外因性物質を投与するが、対象は、グリカン組成物を必要としていると決定されていること；あるいは
ｅ）対象における処理の調節または活性の調節に有効な量で、かつ十分な時間、対象に外因性物質およびグリカン組成物を投与するが、その外因性物質およびグリカン組成物の投与は重なり合っていること
を含み、
ｉ）グリカン調製物は、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースのグリカン単位を含むグリカンポリマーを含む；
ｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの平均分岐度（ＤＢ）は、０、０．０１〜０．６、０．０５〜０．５、０．１〜０．４、または０．１５〜０．４である；
ｉｉｉ）グリカン調製物中のグリカンポリマーの少なくとも５０％（少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、もしくは８５％、または５０％未満）は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位、少なくとも３および１０未満のグリカン単位、少なくとも５および２５未満のグリカン単位、または少なくとも１０および３５未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する；
ｉｖ）グリカン調製物の平均ＤＰ（平均ＤＰ）は、約５〜８、約８〜１３、約１３〜２５、約５〜１５、約５〜２０、または約５〜１５である；
ｖ）グリカン調製物のグリカンポリマー中に存在するアルファ−グリコシド結合とベータ−グリコシド結合の比は、０、または約０．８：１〜約５：１、約１：１〜約５：１、約１：１〜約３：１、約３：２〜約２：１、もしくは約３：２〜約３：１である；
ｖｉ）グリカン調製物は、１５ｍｏｌ％〜７５ｍｏｌ％（２０ｍｏｌ％〜６０ｍｏｌ％、２５ｍｏｌ％〜５０ｍｏｌ％、または３０ｍｏｌ％〜４５ｍｏｌ％）の１，６グリコシド結合を含む；
ｖｉｉ）グリカン調製物は、１，２グリコシド結合、１，３グリコシド結合および１，４グリコシド結合の少なくとも１つ、２つまたは３つをそれぞれ１ｍｏｌ％〜４０ｍｏｌ％（１ｍｏｌ％〜３０ｍｏｌ％、５ｍｏｌ％〜２５ｍｏｌ％、１０ｍｏｌ％〜２０ｍｏｌ％）含む；
ｖｉｉｉ）グリカン調製物は、２３℃で少なくとも約５０（少なくとも約６０、７０、少なくとも約７５、または５０未満）Ｂｒｉｘの水中最終溶解限度を有する；
ｉｘ）グリカン調製物は、少なくとも５０％（少なくとも６０％、７０％、８０％、もしくは少なくとも９０％、または５０％未満）の食物繊維含量を有する；あるいは
ｘ）ｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）、ｖｉ）、ｖｉｉ）、ｖｉｉｉ）、およびｉｘ）の２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、または９つのいずれかの組み合わせ
である
方法を特徴とする。
【０００９】
別の態様では、本発明は、本明細書中に開示のグリカン組成物を特徴とする。
【００１０】
一実施形態では、グリカン組成物は、微生物（例えば腸内微生物）が宿主の処理を媒介する、例えば、外因性物質に作用する微生物実体、例えば酵素の産生、レベル、構造、分布、効果、または活性を媒介する方法を変化させる。
【００１１】
一実施形態では、グリカン組成物は、微生物（例えば腸内微生物）が、例えば対象の腸内の、微生物の数または存在率を増加または減少させることによって処理を媒介する方法を変化させる。一実施形態では、微生物、例えば細菌分類群の数または存在率の増加または減少は、外因性物質に作用する、例えば酵素の処理活性の増大または低減と関連している。一実施形態では、微生物実体、例えば酵素は、外因性化合物、例えば、薬物、薬物代謝産物、薬物添加物、食品、食品添加物、アレルゲン、毒素または毒物の処理を変化させる。
【００１２】
一実施形態では、微生物は、対象によって作られた宿主の成分、例えば酵素（哺乳動物の酵素など）の産生、レベル、構造、分布、または活性の変化を媒介する。一実施形態では、宿主実体、例えば酵素は、外因性化合物、例えば、薬物、薬物代謝産物、薬物添加物、食品、食品添加物、アレルゲン、毒素または毒物の処理を変化させる。
【００１３】
本明細書に記載の方法は、外因性物質と組み合わせて、予め選択された特性、例えば、ｉ）外因性物質を（例えば、微生物の増殖を増加または減少させることによって）変化させる微生物、例えば腸内微生物の数または存在率（相対存在度）を変化させる能力、ｉｉ）微生物、例えば腸内微生物の、外因性物質を（例えば、微生物中の微生物酵素の転写レベル／発現レベルを変化させることによって）変化させる処理活性（例えば、微生物酵素の形態の）を提供する能力、または（ｉｉｉ）微生物、例えば腸内微生物の、宿主対象の応答を調節する（例えば、外因性物質を（例えば、微生物により代謝産物を変化させるか、もしくは出力を伝達することによって）変化させる宿主の処理活性（例えば、宿主酵素の形態の）を増加または減少させる）能力を有するグリカン組成物を投与することを提供する。
【００１４】
いくつかの実施形態では、微生物によって提供される酵素は、外因性化合物を、例えば直接、変化させる（例えば、産生、レベル、構造、分布、効果、および／または活性を変化させる）。いくつかの実施形態では、微生物によって提供される酵素は、外因性化合物を、例えば間接的に、変化させる（例えば、産生、レベル、構造、分布、効果、および／または活性を変化させる）。例えば、酵素は、外因性化合物を変化させる代謝産物を生成するか、または外因性化合物を変化させるように宿主の処理を媒介する。例えば、外因性化合物を間接的に変化させる微生物によって提供される酵素は、宿主酵素と競合する代謝産物を生成し、宿主酵素が外因性化合物と相互作用する方法を変え、それにより外因性化合物を変化させることができる。別の例では、外因性化合物を間接的に変化させる微生物によって提供される酵素は、外因性化合物を処理する（例えば代謝する）宿主酵素を活性化または阻害することができる。実施形態では、微生物の数もしくは存在率（例えば相対存在度）の増加もしくは減少、または酵素活性を提供するその能力は、外因性物質と相互作用する酵素の活性の増加または減少と関連する。一実施形態では、酵素の外因性物質、例えば薬物との相互作用は、例えば、活性型（活性化型）もしくはそのバイオアベイラビリティのレベルを上昇させるか、または不活性型（不活性化型）のレベル、もしくは（例えば、（例えば宿主酵素もしくは微生物酵素による）薬物代謝によって生成される）有毒な中間体のレベルを低下させ、これにより、宿主に対する薬物のその後の効果（例えば、治療効果）を調節することによって、薬物の効果を最適化することができる。一実施形態では、酵素の外因性物質、例えば、毒素または毒物との相互作用は、対象の身体からより迅速に排泄される非毒性または毒性のより少ない形態または中間体への処理を増加させることによって（例えば、溶解性を高める、反応性を低下させるなど）、対象に対する有害な影響を軽減することができる。
【００１５】
一実施形態では、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）種、エンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）および／またはラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）種の増殖を促進するグリカン組成物は、スルファサラジンと組み合わせて、対象、例えば、関節リウマチ患者に投与される。プロドラッグのスルファサラジンの５−アミノサリチル酸への変換を、例えば、微生物アゾレダクターゼのレベルまたは活性を増加させ、それにより５−アミノサリチル酸のレベルを増加させることによって、増加させるのに有効な量でスルファサラジンを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法（例えば、関節リウマチの治療方法）が提供される。例えば、表１、第３列を参照されたい。
【００１６】
一実施形態では、腸内微生物（例えば、好気性腸内細菌、もしくはクロストリジウム・パーフリンジェンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ）などの嫌気性菌の増殖を減少させる、または、例えば、チロシン由来の、ｐ−クレゾールを生成する酵素の産生を減少させるグリカン組成物は、アセトアミノフェン／パラセタモールと組み合わせて投与される。例えば、ＳＩＬＴ１Ａ１の基質としてアセトアミノフェンと競合するｐ−クレゾールのレベルを減少させ、それによってアセトアミノフェン／パラセタモールの宿主代謝に対するｐ−クレゾールの干渉を減少させることによって、アセトアミノフェン／パラセタモールによる薬物性毒性を減少させ、かつ／またはアセトアミノフェン／パラセタモール（例えば、アセトアミノフェン／パラセタモール）の活性を増大させるのに有効な量で、アセトアミノフェン／パラセタモールを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法が提供される。一実施形態では、病原性のフィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）（例えば、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ））、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、および／またはフソバクテリウム門（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）の増殖を阻害するグリカン組成物は、チロシンおよび／またはフェニルアラニンと組み合わせて、対象、例えば、疼痛、発熱、または薬物性毒性（例えば、アセトアミノフェンからの）を有する対象に投与される。例えば、基質をｐ−クレゾールに代謝する微生物酵素のレベルまたは活性を低下させることによって、ｐ−クレゾールのレベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第８列を参照されたい。
【００１７】
一実施形態では、腸内微生物（例えば、プロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、またはアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ））の増殖を促進するグリカン組成物は、イリノテカンと組み合わせて、対象、例えば、癌、例えば、大腸癌を有する対象に投与される。例えば、微生物ベータ−グルクロニダーゼのレベルまたは活性を減少させることによって、イリノテカン（例えば、ＳＮ−３８グルコロニドなど）の有毒な中間体のレベルを減少させるのに有効な量でイリノテカンを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法（例えば、癌の治療方法）が提供される。一実施形態では、イリノテカン治療と関連する副作用、例えば、骨髄機能抑制、下痢、好中球減少を治療する方法が提供される。例えば、表１、第５列を参照されたい。
【００１８】
一実施形態では、エゲセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）、例えば、ＤＳＭ２２４３株の増殖を促進するグリカン組成物は、ジゴキシンと組み合わせて、患者、例えば、心臓病または心疾患、例えば、心不整脈または心不全を有する患者に投与される。例えば、微生物細菌レダクターゼのレベルまたは活性を減少させることによって、薬物活性を増大させるのに有効な量で、ジゴキシンを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法（例えば、心臓病または心疾患の治療方法）が提供される。例えば、表１、第７列を参照されたい。
【００１９】
一実施形態では、エンテロコッカス・フェシウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ）、ラクトバチルス・ムコサエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｕｃｏｓａｅ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種、またはエゲセラ属（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ）種の増殖を促進するグリカン組成物は、植物エストロゲン（例えば、イソフラボンまたはリグナン）、例えば、例えば、ダイジンなどのグリコシドイソフラボンと組み合わせて、対象、例えば、乳癌を有する、または乳癌リスクのある対象に投与される。例えば、グリコシド結合の開裂およびα，β−不飽和ケトンの還元を触媒する微生物細菌レダクターゼのレベルまたは活性を増大させることによって、エクオルのレベルを増大させるのに有効な量でダイジンを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法（例えば、乳癌の治療方法）が提供される。例えば、表１、第１４列を参照されたい。
【００２０】
一実施形態では、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、および／またはフィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）の増殖を促進するグリカン組成物は、植物エストロゲン（例えば、イソフラボンまたはリグナン）、例えば、例えば、ダイジンなどのグリコシドイソフラボンと組み合わせて、患者、例えば、乳癌患者または乳癌リスクのある患者に投与される。植物エストロゲンの、エストロゲン受容体に結合する分子への代謝を増強させる微生物酵素のレベルまたは活性を増大させるのに有効な量で植物エストロゲンを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法（例えば、乳癌の治療方法）が提供される。例えば、表１、第１３列を参照されたい。
【００２１】
一実施形態では、ｕｉｄＡ遺伝子を有する細菌、例えば大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）の増殖を阻害または低減するグリカン組成物は、（例えば、肉を焼いたときに生成される）複素環式アミン（例えば、２−アミノ−３−メチルイミダゾ［４，５−ｆ］キノロン（ＩＱ）、２−アミノ−１−メチル−６−フェニルイミダゾ［４，５−ｂ］ピリジン（ＰｈＩＰ）、２−アミノ−３，８−ジメチルイミダゾ［４，５−ｆ］−キノキサリン（ＭｅＩＱｘ））と組み合わせて、対象、例えば、癌のリスクを有する対象に投与される。例えば、微生物ベータ−グルクロニダーゼのレベルまたは活性を低下させることによって、毒性化合物、例えば、発癌性物質のレベルを減少させるのに有効な量で、（例えば、焼けた肉の成分として）複素環式アミンを投与される（または、投与されようとしている）、例えば食べる（または、食べようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第１６列を参照されたい。
【００２２】
一実施形態では、結腸内の微生物、例えばフィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、プロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）（例えば、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）を含まない）、および／または、コリン利用（ｃｕｔ）遺伝子クラスターを有する細菌の増殖を阻害または低減するグリカン組成物は、コリン含有化合物、例えば、Ｌ−カルニチンと組み合わせて、対象、例えば、高コレステロールまたは心臓病を有するか、またはそのリスクのある対象に投与される。例えば、微生物グリシルラジカル酵素のレベルまたは活性を低減させることによって、トリメチルアミン（ＴＭＡ）のレベルを減少させるのに有効な量で、Ｌ−カルニチンを投与される（または、投与されようとしている）対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第１７列を参照されたい。
【００２３】
一実施形態では、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）（例えば、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ））の増殖を阻害するグリカン組成物は、タウリン抱合胆汁酸（例えば、タウロ−ベータ−ムリコール酸）と組み合わせて、対象、例えば、肥満（例えば、食餌性肥満）の対象に投与される。例えば、微生物胆汁酸塩ヒドロラーゼのレベルまたは活性を低減させることによって、遊離胆汁酸のレベルを減少させ、かつ／または（例えば、油脂を乳化する）タウリン抱合胆汁酸のレベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第１０列を参照されたい。
【００２４】
一実施形態では、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、例えば、ゴルドニバクター属（Ｇｏｒｄｏｎｉｂａｃｔｅｒ）の増殖を阻害するグリカン組成物は、エラジタンニンと組み合わせて、患者に投与される。例えば、エラジタンニンをエラグ酸に加水分解する微生物酵素のレベルまたは活性を増大させることによって、エラジタンニンのレベルを減少させ、かつ／またはエラグ酸のレベルを増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第１１列および第１２列を参照されたい。
【００２５】
一実施形態では、Ｅ．フェカリス（Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ）、Ｅ．レンタ（Ｅ．Ｌｅｎｔａ）、ブラウティア・プロドゥクタ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｐｒｏｄｕｃｔ）、ユウバクテリウム・リモサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ）、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、ラクチノファクター・ロンゴビフォルミス（Ｌａｃｔｏｎｉｆａｃｔｏｒ  ｌｏｎｇｏｖｉｆｏｒｍｉｓ）、クロストリジウム・サッカログミア（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｃｃｈａｒｏｇｕｍｉａ）および／またはＰ．プロドゥクタ（Ｐ．ｐｒｏｄｕｃｔａ）の増殖を促進するグリカン組成物は、リグナン（植物由来）、例えば、ピノレシノール、セコイソラリシレシノールと組み合わせて、対象、例えば、乳癌患者または乳癌リスクのある患者に投与される。例えば、ピノレシノールおよび／またはセコイソラリシレシノールをエンテロジオールおよび／またはエンテロラクトンに代謝する微生物酵素のレベルまたは活性を増大させることによって、エンテロジオールおよび／またはエンテロラクトンのレベルを増大させるのに有効な量で、対象に、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法（例えば、乳癌の治療方法）が提供される。例えば、表１、第１５列を参照されたい。
【００２６】
一実施形態では、エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリネバクテリウム属（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、カンピロバクター属（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）および／またはエシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）の増殖を促進するグリカン組成物は、ノンカロリー人工甘味料、例えば、シクラメート、キシリトール、またはサッカリンと組み合わせて、対象に投与される。例えば、人工甘味料を代謝する微生物酵素のレベルまたは活性を低減させることによって、甘味料の毒性変換産物（例えば、シクラメートの、有毒である可能性のあるシクロヘキシルアミンへの変換）のレベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第１８列を参照されたい。
【００２７】
一実施形態では、腸内微生物、例えばクレブシェラ・テリゲナ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｔｅｒｒｉｇｅｎａ）の増殖を阻害または低減するグリカン組成物は、メラミン、例えば、メラミンを含有する食物または物質と組み合わせて、対象、例えば、腎臓病（例えば、腎不全）を有するか、またはそのリスクのある対象に投与される。例えば、メラミンを代謝する微生物酵素のレベルまたは活性を低減させることによって、シアヌル酸の毒性レベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００２８】
一実施形態では、腸内微生物、例えば、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）の増殖を増大させるグリカン組成物は、抱合型ヒドロキシケイ皮酸エステル（例えば、果物、野菜、穀物およびコーヒーなどの食物に存在する）と組み合わせて、対象、例えば、炎症、例えば、炎症性疾患を有するか、またはそのリスクのある対象に投与される。例えば、抗炎症性物質、ならびに／または高酸化物質のコーヒー酸、フェルラ酸およびｐ−クマル酸を処理する微生物酵素のレベルまたは活性を増大させることによって、これらの物質のレベルを増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００２９】
一実施形態では、微生物の増殖を阻害または低減させるグリカン組成物は、サイカシン（例えば、いくつかの植物中に存在する）と組み合わせて、対象、例えば、癌を有する、または癌リスクのある対象に投与される。例えば、メチルアゾキシメタノール、発癌性物質を処理する微生物酵素のレベルまたは活性を低減させることによって、この物質の毒性レベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００３０】
一実施形態では、微生物の増殖を増大させるグリカン組成物は、アントシアニンと組み合わせて、対象、例えば、癌を有する、または癌リスクのある対象に投与される。例えば、抗癌特性を有するアグリコンを処理する微生物酵素のレベルまたは活性を増大させることによって、この物質のレベルおよび／または活性を増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００３１】
一実施形態では、微生物、例えばオキサロバクター・ホルミゲネス（Ｏｘａｌｏｂａｃｔｅｒ  ｆｏｒｍｉｇｅｎｅｓ）の増殖を増大させるグリカン組成物は、シュウ酸塩と組み合わせて、対象、例えば、腎結石、腎不全、高シュウ酸尿症、および／または心臓伝導障害を有するか、またはそのリスクがある対象に投与される。例えば、シュウ酸塩処理微生物酵素（例えば、シュウ酸：ギ酸対向輸送体、ホルミルＣｏＡトランスフェラーゼ、またはオキサリルＣｏＡデカルボキシラーゼ）のレベルまたは活性を増大させることによって、腎臓毒性と関係するシュウ酸塩のレベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００３２】
一実施形態では、微生物、例えば、宿主ＣＹＰ４５０酵素の発現を上方制御する微生物の増殖を増大させるグリカン組成物は、多環芳香族炭化水素（ＰＡＨ）、例えば、ベンゾ［ａ］ピレン（例えば、いくつかの植物性および動物性食物、例えば、直火で調理した肉に存在する）と組み合わせて、対象、例えば、癌を有する、または癌リスクのある対象に投与される。例えば、適切な微生物酵素のレベルまたは活性を増大させることによって、宿主ＣＹＰ４５０酵素を上方制御し、それによって発癌性ＰＡＨに対する保護を付与するのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００３３】
一実施形態では、微生物、例えば、薬物の代謝に関与する宿主第Ｉ相（ＣＹＰ）および第ＩＩ相薬物代謝酵素（例えば、ＵＧＴ、ＳＵＬＴ）の発現を制御する微生物の増殖を調節するグリカン組成物は、宿主薬物反応を媒介することができる。微生物のレベルまたは活性を調節し、それによって宿主薬物代謝酵素を変化させ、それによって薬物により良好に応答する宿主能力を増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００３４】
一実施形態では、微生物、例えば、ソリブジンの代謝産物、例えば、（Ｅ）−５−（２−ブロモビニル）ウラシル（ＢＶＵ）を生成する微生物の増殖を低減するグリカン組成物は、ソリブジンおよび５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）と組み合わせて、対象、例えばウイルス感染、例えば、帯状疱疹を有するか、またはそのリスクのある対象、例えば、帯状疱疹を有するか、またはそのリスクのある癌患者に投与される。例えば、適切な微生物酵素のレベルまたは活性を調節（増大または低減）することによって、５−ＦＵの毒性レベルを減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。
【００３５】
一実施形態では、腸内細菌、例えば、Ｋ．ニューモニエ（Ｋ．Ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）の増殖を低減するグリカン組成物は、ソリブジンと組み合わせて、対象、例えば、ウイルス感染、例えば、帯状疱疹または水痘帯状疱疹を有するか、またはそのリスクのある対象に投与される。例えば、微生物ホスホリラーゼ、例えば、チミジンホスホリラーゼまたはウリジンホスホリラーゼのレベルまたは活性を低下させることによって、ソリブジンの不活化を減少させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表１、第２５列を参照されたい。
【００３６】
一実施形態では、細菌、例えば、本明細書に記載の細菌、例えば、グラム陰性細菌、例えば、リポ多糖類を産生する細菌の増殖を低減するグリカン組成物は、癌に対するＣｐＧオリゴヌクレオチド免疫療法と組み合わせて、対象、例えば癌を有するか、または癌のリスクがある対象に投与される。例えば、適切な微生物酵素のレベルまたは活性を調節することによって、ＣｐＧオリゴヌクレオチド免疫療法の有効性を増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表３、第２列を参照されたい。
【００３７】
一実施形態では、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、例えば、バクテロイデス・テタイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）および／またはバクテロイデス・フラギリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ）の増殖を低減するグリカン組成物は、細胞傷害性Ｔリンパ球タンパク質４（ＣＴＬＡ４）阻害薬（例えば、抗体）と組み合わせて、対象、例えば、癌を有するか、または癌のリスクがある対象に投与される。例えば、適切な微生物酵素のレベルまたは活性を調節することによって、ＣＴＬＡ４阻害薬の有効性を増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表３、第６列を参照されたい。
【００３８】
一実施形態では、ブドウ球菌属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）の増殖を低減させるグリカン組成物は、例えば、抗炎症薬、例えば、炎症性腸疾患を治療する薬物、例えば、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）阻害薬（例えば、抗体）と組み合わせて、対象、例えば炎症または炎症性疾患、例えば、炎症性腸疾患を有する、またはそのリスクのある対象に投与される。例えば、適切な微生物酵素のレベルまたは活性を調節することによって、抗炎症薬の有効性を増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表３、第７列を参照されたい。
【００３９】
一実施形態では、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）（例えば、バクテロイデス目（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｌｅｓ））、および／または、ルミノコッカス・グナバス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ）などの粘液溶解細菌の増殖を低減するグリカン組成物は、乳化剤、例えば、カルボキシメチルセルロース、ポリソルベート８０と組み合わせて、対象、例えば、炎症、炎症性疾患、またはメタボリック症候群を有する、またはそのリスクのある対象に投与される。例えば、適切な微生物酵素のレベルまたは活性を調節することによって、乳化剤の有効性を増大させるのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を対象に投与することを含む方法が提供される。例えば、表３、第８列を参照されたい。
【００４０】
他の外因性物質、酵素、微生物、および障害の例は、表１、２および３に見出すことができる。
【００４１】
本明細書に記載の方法は、微生物のレベルまたは存在率（相対存在度）を増加させるか、または微生物の、薬物またはプロドラッグの活性型への変換を触媒する酵素を作る能力を増大させるグリカン組成物の投与を含む。
【００４２】
本明細書に記載の方法は、微生物のレベルまたは存在率（相対存在度）を減少させるか、または微生物の、薬物またはプロドラッグの活性型への変換を阻害する酵素を作る能力を低減するグリカン組成物の投与を含む。
【００４３】
本明細書に記載の方法は、微生物のレベルまたは存在率（相対存在度）を減少させるか、または微生物の、薬物またはプロドラッグを望ましくない型、例えば、有毒な中間体／代謝産物へ変換する酵素を作る能力を低減するグリカン組成物の投与を含む。
【００４４】
本明細書に記載の方法は、微生物のレベルまたは存在率（相対存在度）を増加させるか、または薬物またはプロドラッグの望ましくない型、例えば、有毒な中間体／代謝産物への変換を阻害する酵素を作る能力を増大させるグリカン組成物の投与を含む。
【００４５】
グリカン組成物は、本明細書に記載されるように、種々の疾患の治療に有用であり得る。さらに、グリカン組成物は物質、例えば、微生物によって処理される外因性物質と組み合わせて使用することができる。したがって、本明細書においては、外因性物質の処理を調節する組成物および方法、酵素活性を調節する組成物および方法、対象に対する治療を特定／選択する組成物および方法、物質の毒性を低減する組成物および方法、薬物の効果を増大させる組成物および方法、ならびにインビボでの特定の化学的改変または反応を誘発する組成物および方法が提供される。
【図面の簡単な説明】
【００４６】
【図１Ａ】グリカンを介した微生物叢のシフトによる外因性物質の改変を示す一連のグラフ。（＊Ｐ＜０．０５、ウェルチ２標本ｔ検定）。
【図１Ｂ】グリカンを介した微生物叢のシフトによる外因性物質の改変を示す一連のグラフ。（＊Ｐ＜０．０５、ウェルチ２標本ｔ検定）。
【図１Ｃ】グリカンを介した微生物叢のシフトによる外因性物質の改変を示す一連のグラフ。（＊Ｐ＜０．０５、ウェルチ２標本ｔ検定）。
【図２】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、スルファサラジン代謝と関連するバクテロイデス科（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）／バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図３】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、スルファサラジン代謝、ノンカロリー人工甘味料代謝、およびダイジン代謝と関連するエンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図４】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、イリノテカン／ＳＮ−３８グルクロニド代謝、そしてチロシンおよび／またはフェニルアラニン代謝と関連する細菌／フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図５】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、イリノテカン／ＳＮ−３８グルクロニド代謝と関連する細菌／プロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図６】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、イリノテカン／ＳＮ−３８グルクロニド代謝、チロシンおよび／またはフェニルアラニン代謝、そしてエラジタンニン代謝と関連する細菌／アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図７】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、ジゴキシン代謝と関連するエゲセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図８】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、エラジタンニン代謝と関連するコリオバクテリウム科（Ｃｏｒｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ゴルドニバクター属（Ｇｏｒｄｏｎｉｂａｃｔｅｒ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図９】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、植物エストロゲンの代謝、そしてＣｐＧオリゴヌクレオチド免疫療法の代謝と関連する細菌／バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１０】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、ダイジン代謝と関連するビフィドバクテリウム科（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１１】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、リグナン代謝と関連するラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）／ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１２】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、リグナン代謝と関連するエリュシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）／クロストリジウム＿ＸＶＩＩＩ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ＿ＸＶＩＩＩ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１３】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、リグナン代謝と関連するラクチノファクター属（Ｌａｃｔｏｎｉｆａｃｔｏｒ）／ロンゴビフォルミス（ｌｏｎｇｏｖｉｆｏｒｍｉｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１４】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、複素環アミン代謝およびノンカロリー人工甘味料代謝と関連するエンテロバクター科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）／シゲラ属（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１５】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、ソリブジン代謝と関連するエンテロバクター目（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｌｅｓ）／エンテロバクター科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１６】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、細胞障害性Ｔリンパ球タンパク質４（ＣＴＬＡ４）阻害薬代謝と関連するバクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）／ドレイ（ｄｏｒｅｉ）／フラジリス（ｆｒａｇｉｌｉｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１７】本明細書に記載の種々のグリカン組成物、商業的に入手したＦＯＳ、および非添加炭素対照と接触させた１２のヒト糞便培養物（健常対象由来）中の、例えば、乳化剤代謝と関連するルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）微生物の存在度の変化を示す箱ひげ図。
【図１８Ａ】−７日目から６日目までグリカンを強制経口投与したマウスにおける経時的な体重減少のグラフ。マウスには０日目にイリノテカン２００ｍｇ／ｋｇ体重を投与した。
【図１８Ｂ】−７日目から６日目までグリカンを強制経口投与したマウスにおける経時的な体重減少のグラフ。マウスには０日目にイリノテカン２００ｍｇ／ｋｇ体重を投与した。
【発明を実施するための形態】
【００４７】
本明細書には、例えば、薬物、薬物代謝産物、薬物添加物、食品、食品添加物、アレルゲン、毒素または毒物などの外因性物質の処理を調節する方法が記載される。実施形態では、外因性物質の処理、例えば、微生物媒介処理を調節することによって、外因性物質またはその処理された形態の対象に対する影響を変えることができる。さらに、本明細書には、外因性物質の処理を調節するグリカン組成物が記載される。実施形態では、グリカン組成物は、医薬組成物、医療用食品、栄養組成物、および食品成分として提供される。さらに、多くの疾患、障害または病的状態の治療に有効な方法が提供される。
【００４８】
定義
本明細書に使用される場合、「存在度」または「存在率」という用語は、微生物分類群に関する場合、ＧＩ管などの定義された微生物の生態学的地位における、または宿主生物全体（例えば、ヒトまたは動物モデル）における、別の微生物分類群と比較したときの、１つの微生物分類群の存在を指す。
【００４９】
用語が本明細書に使用される場合、「取得する」または「取得すること」は、例えば、値または物理的実体を「直接取得すること」または「間接的に取得すること」によって、値、例えば、数値、または画像、または物理的実体（例えば試料）を入手することを指す。「直接取得すること」は、処理を行って（例えば、合成または分析方法またはプロトコルを行って）、値または物理的実体を得ることを意味する。「間接的に取得すること」とは、値または物理的実体を別の団体または供給元（例えば、物理的実体または値を直接取得した第３者研究所）から受領することを指す。値または物理的実体を直接取得することは、物理的物質の物理的変化または機械もしくはデバイスの使用を含む処理を行うことを含む。値を直接取得することの例は、ヒト対象から試料を得ることを含む。値を直接取得することは、機械もしくはデバイス、例えば、ＮＭＲ分光計を使用して、ＮＭＲスペクトルを得る処理を行うことを含む。
【００５０】
本明細書に使用される場合、「抗体」は最も広い意味で使用され、モノクローナル抗体（完全長または無傷のモノクローナル抗体を含む）、ポリクローナル抗体、多価抗体、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、および抗体フラグメント（それらが所望の活性を示す限り）を含む。
【００５１】
本明細書に使用される場合、「癌」という用語は、自律的に増殖または複製する異常な能力、および増殖性細胞成長を特徴とする（例えば、組織または器官の）異常な状態または様相を有する細胞（細胞群）を指す。本明細書に使用される場合、「癌」は、任意の固形または液性、良性または悪性、非侵襲性または侵襲性の癌または腫瘍、例えば、過形成、新生物、癌腫、肉腫、または造血腫瘍性障害（例えば、白血病）、および前癌性または前癌病変を含む。
【００５２】
本明細書に使用される場合、「併用治療」または「組み合わせて投与される」とは、２つ（またはそれ以上）の異なる薬剤または処置が、特定の疾患または状態のために定義された治療レジメンの一部として対象に投与されることを意味する。治療レジメンは、別個の薬剤の対象への影響が重複するように、各薬剤の投与の用量および周期性を定義する。いくつかの実施形態では、２つ以上の薬剤の送達は同時または一緒であり、薬剤は共に製剤化されてもよい。他の実施形態では、２つ以上の薬剤は、共に製剤化されず、処方されレジメンの一部として逐次的に投与される。いくつかの実施形態では、２つ以上の薬剤または処置との組み合わせ投与は、症状の軽減または当該疾患に関連する他のパラメータの減少が、単独でまたは他の薬剤の不在下で送達される１つの薬剤または処置を用いて観察されるであろうものよりも大きい。２つの処置の効果は、部分的に相加的、完全に相加的、または相加的より大きく（例えば、相乗的）し得る。各治療剤の連続的投与または実質的に同時の投与は、経口経路、静脈内経路、筋肉内経路、および粘膜組織を介した直接吸収を含む任意の適切な経路によって行うことができる。治療剤は、同じ経路または異なる経路によって投与することができる。例えば、組み合わせの第１の治療剤は静脈内注射により投与し、一方、組み合わせの第２の治療剤は経口的に投与し得る。いくつかの実施形態では、併用療法は、２つ（またはそれ以上）の異なる薬剤のうちの１つ（またはそれ以上）の以前の投与に関連する状態に応えて、２つ（またはそれ以上）の異なる薬剤または治療が定義された治療レジメンの一部として対象に投与されることを意味する。例えば、第１の薬剤の投与は対象において望ましくない状態を生じ得、第１の薬剤と、その望ましくない状態に対処する、例えば、望ましくない状態を治療、改善、または緩和する、（一緒にまたは別々に摂取／処方される）第２の（または、さらなる）薬剤とを含む併用療法の投与を促進する。
【００５３】
例えば、グリカンポリマーの種類に関連して、本明細書に使用される場合、「明確に区別できる」は、それが化学的および／または構造的に他と異なることを意味するものとする。例えば、２つの糖が化学的に異なる場合（例えば、フコースおよびキシロース）、または構造的に異なる場合（例えば、環状対非環状、Ｌ体対Ｄ体）、それらは「明確に区別できる」。２つの二量体が同じ２つの単量体からなるが、一方の対がアルファ−１，４結合を含み、他方の対がベータ−１，６結合を含む場合、それらは明確に区別できる。明確に区別できる実体は、当該技術分野で知られている、および／または本明細書に記載される方法によって検出することができる任意の他の適切な別個の特徴または特性を有し得る。
【００５４】
本明細書に使用される場合、「毒素」は、天然に存在するか、または、ヒトによって作られた、例えば、ヒトにより環境へ導入された化合物を指す。毒素の例としては、毒物、環境汚染物質（例えば、トリクロサン、ＴＣＤＤ、殺虫剤、およびヒ素）、キノコの毒、ならびにヘビ毒が挙げられる。本明細書に使用される場合、環境毒素は、環境においてヒトが一般に遭遇する毒素である。
【００５５】
本明細書に使用される場合、「投薬レジメン」、「投与レジメン」、または「治療レジメン」は、治療目標を達成する薬物投与のモダリティである。投薬レジメンは、投与経路、単位用量、投薬頻度、または治療の長さのうちの１つ、２つ、３つ、または４つの定義を含む。
【００５６】
「有効量」および「治療有効量」は、本明細書に使用される場合、所望の効果を提供するのに十分な医薬組成物または薬剤の量を指す。いくつかの実施形態では、医師または他の医療従事者は、適切な量および投与レジメンを決定する。有効量はまた、医学的状態の発症または再発を防ぐ医薬組成物または薬剤の量を指す。
【００５７】
本明細書に使用される場合、「外因性物質」は、生物、細胞組織、または系（例えば、対象）の外から導入される、またはそれらの外で生成される物質を指す。実施形態では、外因性物質は、対象へ、例えば、経口、経鼻、静脈内、筋肉内で導入される。外因性物質は、例えば、対象に天然には存在しない、外来物質を含み得る。外因性物質は、ある種のヒトには天然に存在するが、例えば、すべてのヒトには存在しないかもしれない物質を含み得、ある時点においてある種のヒトには天然に存在するが、他のヒトはその生涯を通して存在することはない物質を含み得る。いくつかの実施形態では、外因性物質は、外因性物質の誘導体を、その誘導体が宿主高分子、例えば、タンパク質、脂質、多糖、または核酸の分子に組み込まれていないことを条件として、含む。いくつかの実施形態では、誘導体の分子量は、外因性物質の分子量と５％超、例えば５％超、１０％超、１５％超、または２０％超は異なっていない。一実施形態では、誘導体には、食品または他のエネルギー源、ビタミン、ミネラルなどからの原子を組み込む、通常の代謝産物は含まれない。外因性物質は本明細書においてより詳細に記載される。
【００５８】
本明細書に使用される場合、「グリカン単位」は、本明細書で開示されるグリカンの個々の単位、例えば、グリカンを作る構成要素を指す。
【００５９】
本明細書に使用される場合、「単離された」または「精製された」グリカン組成物（またはその成分）は、実質的に純粋であり、かつ混入物質がなく、例えば、病原体またはそうでなければ、望まれていない生物物質、または毒性またはそうでなければ、望まれていない有機もしくは無機化合物である。いくつかの実施形態では、純粋なまたは単離された化合物、組成物、または調製物は、微量の溶媒および／または塩を含み得る（例えば、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、１０％未満、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％、０．５％未満、または０．１％）。精製された化合物または調製物は、対象となる化合物のｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で少なくとも約６０％（ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で）、少なくとも約７５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％含有する。例えば、精製された（実質的に純粋な）または単離されたグリカン組成物は、ｗ／ｗ、ｗ／ｖ、ｖ／ｖ、またはモル％で、グリカン治療の少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９８％、９９％、９９．５％、９９．８％、９９．９％、または１００％であり（すなわち、いかなる溶媒、例えば、水も含まず、グリカン組成物は溶解され得る）、例えば、製造、抽出／精製および／または処理中に、それらと同時に生じる構成成分から分離される（例えば、グリカン組成物が望ましくない化合物を実質的に含まない）ものである。純度は、任意の適切な標準方法によって、例えば、カラムクロマトグラフィー（例えば、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ））、薄層クロマトグラフィー（ＴＬＣ）、ガスクロマトグラフィー（ＧＣ）、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）、または核磁気共鳴（ＮＭＲ）分光計によって測定され得る。精製されたまたは純度はまた、ヒト対象への投与において安全である、例えば、生存能力のある感染性または毒性薬剤を欠いている、滅菌の度合いも定義し得る。
【００６０】
本明細書に使用される場合、「マイクロバイオーム」は、対象（例えば、ヒト対象）内および上に持続的および一時的の両方で生息する微生物群の遺伝的内容物であり、これには、真核生物、古細菌、細菌、およびウイルス（細菌ウイルス（例えば、ファージ）を含む）が含まれ、「遺伝的内容物」には、ゲノムＤＮＡ、リボソームＲＮＡおよびメッセンジャーＲＮＡ等のＲＮＡ、エピゲノム、プラスミド、および他の種類のゲノム情報のすべてが包含される。いくつかの実施形態では、マイクロバイオームは、具体的には、生態学的地位における微生物群の遺伝子内容物を指す。
【００６１】
「微生物叢」は、本明細書に使用される場合、対象（例えば、ヒト対象）内および上に（持続的および一時的に）生じる微生物群を指し、真核生物、古細菌、細菌、およびウイルス（細菌ウイルス、例えばファージを含む）が包含される。いくつかの実施形態では、微生物叢は、具体的には、生態学的地位における微生物群を指す。
【００６２】
本明細書で使用される「微生物叢を調節する」または「微生物叢の調節」は、微生物叢の状態を変化させることを意味する。微生物叢の状態を変化させることは、微生物叢の構造および／または機能を変化させることを含み得る。微生物叢の構造の変化は、例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、Ｓ状結腸、および／または直腸などのＧＩ管の１つ以上の領域における、例えば、分類群の相対的な構成の変化である。一実施形態では、微生物叢の構造の変化は、分類群の存在度における変化（例えば、他の分類群に対して、または当該調節がなかった場合に観察されるであろうものに対して）を含む。微生物叢の調節はまた、またはそれに加えて、微生物叢における遺伝子発現の変化、遺伝子産物（例えば、ＲＮＡまたはタンパク質）のレベル、または微生物叢の代謝出力の変化などの、微生物叢の機能の変化を含み得る。微生物叢の構造または機能の調節は、さらに、微生物叢またはその機能の変化の結果として、宿主の１つ以上の機能的経路の変化（例えば、遺伝子発現の変化、遺伝子産物のレベル、および／または宿主細胞または宿主プロセスの代謝出力）を誘導し得る。
【００６３】
本明細書に使用される場合、「オリゴ糖」という用語は、複数の（すなわち、２つ以上）共有結合した個々のグリカン単位からなる分子を指す。各グリカン単位は、アルファ配置またはベータ配置のいずれかに存在するグリコシド結合（例えば、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、１−＞５グリコシド結合、または１−＞６グリコシド結合）を介して結合していてもよい。
【００６４】
本明細書に使用される場合、「医薬組成物」または「医薬調製物」は、組成物または調製物であり、薬理学的活性、または疾患の緩和、治療、もしくは予防におけるその他の直接効果、および／または完成した剤形もしくはその製剤化を有する、組成物または調製物であり、かつヒトに使用されるものである。医薬組成物または医薬調製物は、典型的には、適正製造基準（ＧＭＰ）の条件下で生成される。医薬組成物または調製物は、滅菌または非滅菌であり得る。非滅菌である場合、かかる医薬組成物は、微生物学的規格および米国薬局方（ＵＳＰ）またはヨーロッパ薬局方（ＥＰ）において記載される非滅菌薬学的製品のための基準を満たす。医薬組成物は、さらなる活性剤、例えば、さらなる治療剤をさらに含み得るか、またはそれらと共に同時投与され得る。医薬組成物はまた、薬学的に許容される賦形剤、溶媒、担体、フィルタ、またはこれらの任意の組み合わせも含み得る。
【００６５】
本明細書で使用される場合、「多糖」という用語は、共有結合した複数の個々のグリカン単位からなるポリマー分子を意味する。いくつかの実施形態では、多糖はグリカン単位の少なくとも１０またはそれ以上（例えば、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、または少なくとも５０、少なくとも１００、少なくとも２５０、少なくとも５００、または少なくとも１０００グリカン単位）を含む。各グリカン単位は、アルファ配置またはベータ配置のいずれかに存在するグリコシド結合（例えば、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、１−＞５グリコシド結合、および１−＞６グリコシド結合）を介して結合していてもよい。いくつかの実施形態では、多糖は同一の繰り返し単位を有する均質なポリマーである。他の実施形態では、多糖は異なる繰り返し単位を有する不均質なポリマーである。多糖は、さらに、分岐度（ＤＢ、残基あたりの分岐点）または重合度（ＤＰ）により特徴づけることができる。
【００６６】
本明細書に使用される場合、「対象」または「患者」という用語は、一般的に任意のヒト対象を指す。この用語は、特定の年齢または性別を示さない。対象は、妊婦を含み得る。対象は、新生児（早産児、満期新生児）、１歳までの乳児、幼児（例えば、１歳〜１２歳）、十代の若者（例えば、１３〜１９歳）、成人（例えば、２０〜６４歳）、および高齢者（６５歳以上）を含み得る。一般に、対象は宿主とその対応する微生物叢とを含む。
【００６７】
「実質的減少」は、本明細書に使用される場合、５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、９９．９％、または１００％の減少である。
【００６８】
「実質的増加」は、本明細書に使用される場合、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、３５０％、４００％、４５０％、５００％、５５０％、６００％、６５０％、７００％、７５０％、８００％、８５０％、９００％、９５０％、１０００％、または１０００％を超える増加である。
【００６９】
「合成物質」は、本明細書に使用される場合、天然に存在しない、グリカン組成物等の人工の化合物または調製物を指す。一実施形態では、本明細書に記載されるポリマー触媒は、好適な反応条件下、例えば、反応物に添加される個々のグリカン単位からオリゴマーおよびポリマーを作製する重合反応によって、調製物のグリカンを合成するために使用される。いくつかの実施形態では、ポリマー触媒は、加水分解剤として作用し、グリコシド結合を破壊し得る。他の実施形態では、ポリマー触媒は、グリコシド結合を形成し得る。
【００７０】
本明細書に使用される場合、「治療すること」および「治療」という用語は、症状の重症度および／または頻度の減少に影響を及ぼす、症状および／またはその根本原因を解消する、かつ／または損傷の改善もしくは修復を促進する、かつ／または特定の有害な状態、障害、もしくは疾患にかかりやすい、または状態、障害、もしくは疾患を発症するもしくはそれらを発症する危険性がある無症候性対象における有害な状態、障害、もしくは疾患を予防するための、対象（例えば、有害な状態、障害、もしくは疾患を患っている症候性の対象）への薬剤または組成物の投与を指す。
【００７１】
「抗原」という用語は、免疫反応を誘発する物質を指し、通常、これはまた、抗原と抗体の相互作用を証明するために利用可能な多くのインビトロおよびインビボでの免疫学的方法によって、対応する抗体を検出するために使用される物質でもある。同様に、アレルゲンという用語は、抗体を誘導し、抗体と結合する能力を有する抗原を示すために使用されるが、この定義は、アレルゲンがＩｇＥ以外の分類の抗体も誘導し得る可能性を排除しない。
【００７２】
本明細書に使用される場合、「誘導体」は、処理された外因性物質の生成物を指す。誘導体は、本明細書に記載の任意の酵素反応の代謝産物および／または生成物を含み得る。
【００７３】
本明細書に使用される場合、「組み合わせて」投与されるとは、２つ（またはそれ以上）の治療、例えば、本明細書に記載の治療が患者に、例えば、障害／状態を含む患者の病気の過程で、送達されることを意味する。例えば、２つ以上の治療は、対象が障害／状態と診断された後、および障害／状態が治癒するか、もしくは除かれる前、または治療が他の理由で終了する前に送達される。実施形態では、１つの治療の送達は、第２の治療の送達が開始されるとき、まだ行われている。すなわち、投与という点では重なっている。これは、時に、「同時の」または「並行した送達」と称される。他の実施形態では、１つの治療の送達は、他の治療の送達が開始される前に中止される。いずれの場合も、いくつかの実施形態では、治療は、組み合わせ投与のため、より有効である。例えば、第２の治療はより効果的であり、例えば、同等の効果が、より少ない（例えば、より低用量の）第２の治療で見られる、または第２の治療によって、第１の治療を行わずに第２の治療が投与された場合に見られるより、症状がより軽減され、あるいは類似の状況が第１の治療で見られる。いくつかの実施形態では、治療の送達は、症状の軽減または当該障害／状態に関連する他のパラメータの減少が、他の治療の不在下で送達される１つの治療で観察されるであろうものよりも大きい。実施形態では、２つの治療の効果は、部分的に相加的、完全に相加的、または相加的より大きくし得る。実施形態では、送達は、第２の治療が送達されるとき、第１の送達された治療の効果が依然として検出可能であるようであり得る。
【００７４】
「フラクトオリゴ糖」または「ＦＯＳ」は、これらの用語が本明細書に使用される場合、任意選択により末端グルコースを含む、以下の配列からなるフルクトースポリマーを指す：ベータ２，１、ベータ２，６、アルファ１，２およびベータ１，２グリコシド結合の１つ以上からなる（Ｆｒｕ）ｎ−Ｇｌｃ（ここで、ｎは、通常、３〜１０である）。変異体には、主鎖中のフルクトシル単位間のイヌリン型β−１，２およびレバン型β−２，６結合が含まれる。一実施形態では、ＦＯＳは、Ｂ．マセランス（Ｂ．ｍａｃｅｒａｎｓ）、Ｚ．モビリス（Ｚ．ｍｏｂｉｌｉｓ）、Ｌ．ロイテリー（Ｌ．ｒｅｕｔｒｉ）、Ａ．ニガー（Ａ．ｎｉｇｅｒ）、Ａ．ヤポニクス（Ａ．ｊａｐｏｎｉｃａｓ）、Ａ．フェチダス（Ａ．ｆｏｅｔｉｄｕｓ）、Ａ．シドウイイ（Ａ．ｓｙｄｏｗｉ，ｂ）、Ａ．プルランス（Ａ．ｐｕｌｌａｎｓ）、Ｃ．プルプレア（Ｃ．ｐｕｒｐｕｒｅａ）、Ｆ．オキシスポルム（Ｆ．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、Ｐ．シトリヌム（Ｐ．ｃｉｔｒｉｎｕｍ）、Ｐ．フレクエンタンス（Ｐ．ｆｒｅｑｕｅｎｔａｎｓ）、Ｐ．スピヌロサム（Ｐ．ｓｐｉｎｕｌｏｓｕｍ）、Ｐ．ルグロサム（Ｐ．ｒｉｇｕｌｏｓｕｍ）、Ｐ．パラシティカ（Ｐ．ｐａｒａｓｉｔｉｃａ）、Ｓ．ブレビカウリス（Ｓ．ｂｒｅｖｉｃａｕｌｉｓ）、Ｓ．セレビシエ（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、またはＫ．マルキシアヌス（Ｋ．ｍａｒｘｉａｎｕｓ）由来の酵素から作られる。実施形態では、ＦＯＳは、フルクトシルトランスフェラーゼ、β−フルクトフラノシダーゼ（ＥＣ  ３．２．１．２６）、イヌロスクラーゼ（ＥＣ  ２．４．１．９）、レバンスクラーゼ（ＥＣ  ２．４．１．１０）、またはエンドイヌリナーゼの酵素作用によって産生される。
【００７５】
本明細書に使用される場合、「グリカンポリマー調製物」（「グリカンポリマーの調製物」、「グリカン調製物」または「グリカンポリマー」とも呼ばれる）は、所望の効果（例えば、治療効果または調節効果（例えば、外因性物質に関して）、あるいは、有益な効果（例えば、対象の健康に関して））を示すグリカンポリマーを含む調製物である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、１つ以上の天然に存在するオリゴ糖、例えば、グルコオリゴ糖、マンナンオリゴ糖、イヌリン、リクノース、マルトテトラオース、ニゲロテトラオース、ニストース、セセモース（ｓｅｓｅｍｏｓｅ）、スタキオース、イソマルトトリオース、ニゲロトリオース、マルトトリオース、メレジトース、マルトトリオース（ｍａｌｔｏｔｒｉｏｓｅ）、ラフィノース、ケストース、フラクトオリゴ糖、２’−フコシルラクトース、ガラクトオリゴ糖、グリコシル、イドラパリナックス、イソマルトオリゴ糖、マルトデキストリン、キシロオリゴ糖、寒天、アガロース、アルギン酸、アルグロン酸、アルファグルカン、アミロペクチン、アミロース、アラビオキシラン、ベータ−グルカン、カロース、カプシュラン（ｃａｐｓｕｌａｎ）、カラギナン、セロデキストリン、セルリン、セルロース、キチン、キチンナノフィブリル、キチン−グルカン複合体、キトサン、クリソラミナリン、カードラン、シクロデキストリン、アルファ−シクロデキストリン、デキストラン、デキストリン、ジアルデヒドデンプン、フィコール、フルクタン、フコイダン、ガラクトグルコマンナン、ガラクトマンナン、ガラクトサミノガラクタン、ゲランガム、グルカン、グルコマンナン、グルクロノキシラン、グリコカリックス、グリコーゲン、ヘミセルロース、ヒプロメロース、イコデキストリン、ケフィラン、ラミナリン、レンチナン、レバン多糖、リケニン、マンナン、粘液、天然ガム、パラミロン、ペクチン酸、ペクチン、ペンタスターチ、植物グリコーゲン、プルーラン、ポリギーナン、ポリデキストロース、ポルフィラン、プルラン、シゾフィラン（ｓｃｈｉｚｏｐｈｙｌｌａｎ）、セファロース、シニストリン、シゾフィラン（ｓｉｚｏｆｉｒａｎ）、スガマデックス、ウェランガム、キサンタンガム、キシラン、キシログルカン、ザイモサンなどを含有しない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、塩、例えば、薬学的に許容される塩として存在する。いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、ソルビトールを含有しない。いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、クエン酸を含有しない。いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、環状のグリカンを含有しない。
【００７６】
「薬物活性を増加させる」とは、この用語が本明細書に使用される場合、以下のいずれかの１つ以上を指す：ａ）重量、モル、分子数、または投薬単位基準での薬物の治療効果または他の有益な効果を増加させる。例として、Ｘｍｇの薬物の投与は、薬物活性が増加する場合、増加がない場合のＸｍｇの投与よりも大きい活性を有する。メカニズムに束縛されることを望むものではないが、薬物活性の増加は、不活性形態から活性形態への変換の増加、例えば、薬物のプロドラッグへの処理の増加、活性型の薬物の不活性型への変換の減少、活性型の薬物の除去（例えば、排泄による）の減少を含み得る；ｂ）投与することができる薬物の量を、非治療的事象に到達する前に投与することができる量と比べて増加させる。例示的な非治療的事象は、毒性、例えば、薬物の毒性、または薬物の代謝またはオフターゲット活性から生じる種の毒性を含む；ｃ）薬物の効力を増加させる。ここで、薬物の効力とは、例えば、効果、例えば、所望の効果、例えば、例えば、ＧＩ運動の増加、またはコレステロール値の低減を生じる薬物の能力を指す。実施形態では、薬物効力は、形成された薬物−受容体複合体の１単位当たりに生じる生物学的効果の量として表すことができる、薬物の固有活性を含む。薬物のバイオアベイラビリティは、投与後、対象の循環に入り、その結果、効果を引き出すことができる薬物の比率を指す。薬物ポテンシーは、所定の強さの効果を生じるのに必要な薬物の量で表される薬物活性の尺度を指す。薬物効力は、定性的および／または定量的に測定することができる。実施形態では、薬物効力は、薬物が治療しようとする疾患／障害の１つ以上の症状の改善（例えば、消失）を検出することによって測定することができる。実施形態では、薬物効力は、インビトロで、例えば細胞または組織試料、例えば、細胞培養物において、機能的読み出し情報（例えば、タンパク質、例えば、酵素のレベルまたは活性、セカンドメッセンジャーなどの分子の産生、タンパク質のリン酸化などの翻訳後修飾、または遺伝子発現の変化）を、細胞または組織試料と薬物とのインキュベーション後に決定することにより、測定することができる。他の実施形態では、薬物効力は、エクスビボ、またはインビボで、例えば、薬物の投与後、または対象からの試料とのエクスビボでのインキュベーション後に、機能的読み取り情報を決定することにより、測定することができる；ｄ）薬物ポテンシーを増加させる。ここで、薬物ポテンシーは、効果がＥｍａｘ（薬物の最大可能効果）の５０％である薬物の濃度の、薬物のＥＣ５０（半数有効濃度）を決定することにより測定することができる。ＥＣ５０が低いほど、薬物のポテンシーは高い。薬物のＥＣ５０は、標準的な方法、例えば、細胞または組織試料、例えば、細胞培養物における機能的読み出し情報を、薬物の用量を増加させて投与した後に測定することにより、決定することができる；あるいは、ｅ）薬物（バイオ）アベイラビリティを増加させる。ここで、薬物バイオアベイラビリティは、対象の全身循環に到達する薬物（例えば、非改変薬物）の総量に正比例する血漿濃度−時間曲線（ＡＵＣ）下の面積を決定することによって測定することができる。
【００７７】
外因性物質
本明細書に記載の方法は、外因性物質の処理を調節する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、外因性物質の処理を媒介するマイクロバイオームの能力を調節する。外因性物質は、例えば様々な薬剤、例えば、医薬剤、環境毒素または毒物、食事成分、食品添加物、薬物添加物、および／またはアレルゲンを含み得る。
【００７８】
医薬剤は、例えば、タンパク質／ペプチド／ポリペプチド（例えば、抗体分子もしくはその断片）、核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ、および／もしくは阻害性核酸、例えば、ｓｉＲＮＡ、ＲＮＡｉ、ｍｉＲＮＡ）、あるいはその修飾型、または小分子であり得る。
【００７９】
医薬剤には、酵素、受容体、抗体、またはアダプタータンパク質が含まれる。実施形態では、医薬剤は、例えば、本明細書に記載の障害、疾患、または状態を予防または治療するために承認されている、ＦＤＡ認可の薬剤である。
【００８０】
いくつかの実施形態では、医薬剤は、例えば、活性型薬物になるために対象による（例えば、対象中の微生物、例えば、対象中の腸内微生物による）生体内活性化が必要なプロドラッグである。プロドラッグの例は、イリノテカン、プロントジル、またはスルファサラジンである。例えば、プロドラッグは、例えば、プロントジルおよびスルファサラジンのような、アゾ結合を含む。
【００８１】
医薬剤の例示的なクラスには、抗炎症剤、非ステロイド性抗炎症剤（ＮＳＡＩＤ）、スタチン、抗酸化剤、抗微生物剤（例えば抗生物質もしくは抗真菌剤）、がん治療、免疫療法（例えば、癌のための）、抗体療法、タンパク質もしくはペプチド療法、細胞ベースの療法、核酸療法、またはマクロライドが含まれるが、これらに限定されない。
【００８２】
例示的な医薬剤（および、そのいくつかの例示的な処理／代謝形態）には、５−アミノサリチル酸、５−フルオロウラシル、バルサラジド、ベンジルペニシリン、ＢＩＬＲ  ３５５、カルシトニン、クロラムフェニコール、クロナゼパム、デレオブビル、ジクロフェナク（グルクロニド）、ジゴキシン、エルトロンボパグ、フルシトシン、三硝酸グリセリン、グリチルリジン、インドシン（ｎ−オキシド）、インドメタシングルクロニド、インスリン、二硝酸イソルビド、ケトプロフェン（グルクロニド）、レバミゾール、レボドパ、ロペラミド（Ｎ−オキシド）、ロバスタチン、メタンフェタミン、メトトレキサート、メトロニダゾール、ミソニダゾール、モルヒネ（６−グルクロニド）、ネオプロントシル、ニトラゼパム、ニザチジン、オルサラジン、オメプラゾール、ファナセチン、オキソン酸カリウム、プロントシル、ラニチジン、リスペリドン、センノシド、イリノテカン（ＳＮ−３８Ｇ）、ピコスルファートナトリウム、ソリブジン、スクシニルサルファチアゾール、スルファピリジン、スルファサラジン、スルフィンピラゾン、スリンダク、および／またはゾニサミドが含まれる。さらなる例示的な医薬剤は、本明細書に記載される。
【００８３】
例示的な医薬剤（および、そのいくつかの例示的な処理／代謝形態）には、以下のものが含まれる：
ｉ）非ステロイド性抗炎症（ＮＳＡＩＤ）薬、例えば、５−アミノサリチル酸およびその誘導体、例えば、バルサラジド、オルサラジン、スルファサラジン（アミノサリチル酸系抗炎症薬）、ジクロフェナク（＝＞グルクロニド）（疼痛、片頭痛および関節炎用）、インドシン（＝＞Ｎ−オキシド）、インドメタシン（＝＞グルクロニド）、ケトプロフェン（＝＞グルクロニド）（プロピオン酸系）、スリンダクなど  ｉｉ）化学療法薬、例えば、５−フルオロウラシルおよびメトトレキサート（代謝拮抗薬、抗腫瘍薬、および癌用免疫抑制剤）、イリノテカン（ＳＮ−３８Ｇ）（結腸および直腸癌）など
ｉｉｉ）抗生物質／抗菌剤、例えば、ベンジルペニシリン（ペニシリン系抗菌剤）、クロラムフェニコール、メトロニダゾール、プロントシル、ネオプロントシル、スルファピリジンなど
ｉｖ）抗ウイルス剤、例えば、ＢＩＬＲ  ３５５およびソリブジン（ヌクレオシドアナログ／逆転写酵素阻害剤、例えば、ＨＩＶ用）、デレオブビル（Ｃ型肝炎ウイルス用非ヌクレオシドポリメラーゼ阻害薬）など
ｖ）抗真菌剤、例えば、フルシトシン（５−ＦＣ）（ピリミジンアナログ）など
ｖｉ）抗線虫薬（例えば、抗蠕虫薬）、例えば、レバミソール（鉤虫感染症の免疫調節剤）など
ｖｉｉ）ホルモン、例えば、カルシトニン（甲状腺ホルモン、例えば骨粗鬆症、癌関連の骨痛用）、インスリン（血糖値）など
ｖｉｉｉ）鎮静剤、例えば、クロナゼパム（発作、パニック障害および不安に対するベンゾジアゼピン）など
ｉｘ）心臓薬物療法／高血圧薬、例えば、強心配糖体、例えば、ジゴキシン（心不全用抗不整脈剤）、三硝酸グリセリン（心不全および高血圧用）、二硝酸イソソルビド（硝酸イソソルビド）（胸痛（狭心症）用）など
ｘ）コロニー刺激因子、例えば、エルトロンボパグ（血小板減少症および再生不良性貧血に対する骨髄刺激薬）など
ｘｉ）乳化剤／ゲル形成剤、例えば、グリシルリジン（サポニン、例えば、食品および化粧品用）など
ｘｉｉ）ドーパミン、例えば、レボドパ（パーキンソン病およびパーキンソン病様症状のドーパミン前駆体）など
ｘｉｉｉ）オピオイド受容体作動薬、例えば、ロペラミド（＝＞Ｎ−オキシド）（下痢用）
ｘｉｖ）スタチン、例えば、ロバスタチン（高コレステロール値および高トリグリセリド値用）など
ｘｖ）ＣＮＳ刺激剤、例えば、メタンフェタミン（ＡＤＨＤ用および麻薬使用用）など
ｘｖｉ）増感剤／放射線療法剤、例えば、ミソニダゾール（放射線療法において放射線増感剤として作用するニトロイミダゾール）など
ｘｖｉｉ）麻薬性鎮痛剤、例えば、モルヒネ（＝＞６−グルクロニド）など
ｘｖｉｉｉ）催眠薬、例えば、ニトラゼパム（不安、不眠、健忘、抗痙攣薬および骨格筋弛緩薬用のベンゾジアゼピン系）など
ｘｉｘ）制酸剤／プロトンポンプ阻害薬、例えば、ニザチジン、ラニチジンおよびオメプラゾール（Ｈ２拮抗薬）（潰瘍用、胃食道逆流症（ＧＥＲＤ）用）など
ｘｘ）鎮痛剤、例えば、フェナセチン（疼痛緩和）など
ｘｘｉ）ウリカーゼ阻害剤、例えば、オキソン酸カリウム（５−フルオロウラシル誘発性消化管毒性の抑制用）など
ｘｘｉｉ）抗精神病薬、例えば、リスペリドン（統合失調症、双極性障害、および自閉症に起因する興奮性用）など
ｘｘｉｉｉ）緩下剤、例えば、センノシド（センナグリコシド）およびピコスルファートナトリウム（便秘用）など
ｘｘｉｖ）スルホンアミド、例えば、スクシニルサルファチアゾール、スルファピリジン、スルファサラジンなど
ｘｘｖ）抗痙攣薬、例えば、ゾニサミド（発作用、てんかん用）など
ｘｘｖｉ）免疫療法剤、例えば、細胞傷害性Ｔリンパ球関連抗原４（ＣＴＬＡ−４）およびＣｐＧオリゴヌクレオチド（癌用）など。
【００８４】
実施形態では、食事成分は、食事由来で、かつ生物活性を有することができる、例えば、対象の健康および／または疾患に影響を及ぼす可能性がある物質を含み得る。
【００８５】
実施形態では、食物成分は、コーヒー酸、クロロゲン酸、コリン、サイカシン、エラグ酸、ゲニポシド、２−アミノ−３−メチルイミダゾ［４，５−ｆ］キノリン（ＩＱ）、キナ酸、エラジタンニン（例えばプニカラギン、ペドゥンクラジン）、フラボン（例えば、バイカリン、カテキン／エピカテキン、ヘスペリジン、ケルセチン−３−グルコシド）、イソフラボン（例えば、ダイゼイン、ゲニステイン、グリシテイン）、および／またはリグナン（例えば、ピノレシノール、セコイソラリシレジノール）を含む。
【００８６】
実施形態では、食事成分は、ポリフェノール、例えば、本明細書に記載のポリフェノール、例えば、アントシアニンまたはプロアントシアニジンを含む。実施形態では、食事成分は、植物エストロゲン、例えば、本明細書に記載の植物エストロゲン、例えば、イソフラボンまたはリグナンを含む。実施形態では、食事成分は、複素環式アミンを含む。実施形態では、食事成分は、コリン含有化合物、例えば、Ｌ−カルニチンまたはホスファチジルコリンを含む。
【００８７】
食品添加物および／または薬物添加物は、食品および／または薬物に、例えば、貯蔵寿命および／または風味を増強するために、添加される化学薬品を含み得る。このような食品添加物および薬物添加物は、腸内微生物と相互作用し得る。食品添加物の例としては、人工甘味料（例えば、シクラメート、キシリトール、サッカリン）、乳化剤（例えば、カルボキシメチルセルロースもしくはポリソルベート８０）、および／または汚染物質（例えば、メラミン）が挙げられる。食品中のいくつかの汚染物質、例えば、メラミンおよびその処理中間体は有害であり得る。食品添加物および薬物添加物の例としては、アセドベン、シクラメート、ラクチトール、ラクツロース、メラミン、レバウディオサイドａ、および／またはステビオシドが挙げられる。
【００８８】
環境毒素および毒物は、腸内微生物に影響を及ぼし得る、例えば、成長および／または代謝に影響を及ぼし得る化学物質を含み得る。例示的な環境毒素には、ビスフェノールＡ、オキシベンゾン、フッ化物、パラベン、フタル酸塩、ブチル化ヒドロキシアニソール、ペルフルオロオクタン酸、過塩素酸塩、デカブロモジフェニルエーテル、およびアスベストが含まれ得る。
【００８９】
アレルゲンは、抗原に対し異常で激しい免疫応答を生じる抗原の一種であり、通常、身体によって無害であると認識されるべきものである。アレルゲンの例示的なクラスには、動物成分、薬物、食品、昆虫成分、カビ胞子、化学物質、および植物成分が含まれる。例示的な動物成分のアレルゲンには、Ｆｅｌ  ｄ１（ネコ由来）、動物の毛皮、動物の鱗屑、ゴキブリの傘部、羊毛、およびイエダニの排泄物が含まれる。例示的な薬物アレルゲンには、ペニシリン、スルホンアミド、およびサリチル酸塩が含まれる。例示的な食物アレルゲンには、セロリー、セロリアック、トウモロコシ（ｃｏｒｎ）、トウモロコシ（ｍａｉｚｅ）、卵（例えば、卵アルブミン）、果物、マメ科植物（例えば、豆、エンドウ豆、ピーナッツ、大豆）、ミルク、海産物、ゴマ、大豆、木の実（例えば、ペカン、アーモンド）、および小麦が含まれる。例示的な昆虫成分アレルゲンには、ハチ（ｂｅｅ）刺傷毒、ハチ（ｗａｓｐ）刺傷毒、および蚊刺傷が含まれる。例示的な化学アレルゲンには、硫酸ニッケル、ペルーバルサム、フラガンス（ｆｒａｇａｎｃｅ）、クオタニウム−１５、ネオマイシン、ラテックス、および金属が含まれる。例示的な植物成分アレルゲンには、木材、草（例えば、ライグラスまたはチモシーグラス）、雑草（例えば、ブタクサ、オオバコ、イラクサ、シロザ（Ｃｈｅｎｏｐｏｄｉｕｍ  ａｌｂｕｍ）、スイバ、オウシュウヨモギ（Ａｒｔｅｍｉｓｉａ  ｖｕｌｇａｒｉｓ）、および樹木（例えば、カバノキ、ハンノキ、ハシバミ、シデ、トチノキ（Ａｅｓｃｕｌｕｓ）、ヤナギ、プラタナス（Ｐｌａｔａｎｕｓ）、シナノキ（Ｔｉｌｉａ）、オリーブ（Ｏｌｅａ）、ポプラ、アシュ・ジュニパー（Ａｓｈｅ  ｊｕｎｉｐｅｒ）およびシチヨウジュ（Ａｌｓｔｏｎｉａ  ｓｃｈｏｌａｒｉｓ）が含まれる。
【００９０】
外因性物質の処理
化学反応
実施形態では、外因性物質の処理は、外因性物質の誘導体化および／または分解のレベルの調節を含む。一実施形態では、グリカン組成物は、微生物、例えば、腸の微生物の、例えば、外因性物質、例えば、薬物、または薬物の代謝産物もしくは中間体を、処理する、例えば、誘導体化および／または分解する、実体、例えば、酵素を産生する能力を調節する。実施形態では、外因性物質の処理は、代謝（例えば、１つ以上の代謝産物または中間体の、例えば、出発物質としての外因性物質からの生成）を含む。
【００９１】
実施形態では、外因性物質の処理は、加水分解、酸化、還元、芳香族化、アルキル化、アシル化、リン酸化、グリコシル化、硫酸化、および／またはニトロシル化などの反応を含む。一実施形態では、グリカン組成物は、微生物、例えば、腸の微生物の、外因性物質を加水分解、酸化、還元、芳香族化、アルキル化、アシル化、リン酸化、グリコシル化、硫酸化、および／またはニトロシル化を触媒する酵素を産生する能力を調節する。実施形態では、外因性物質は、薬物、薬物代謝産物、薬物添加物、食品、食品添加物、アレルゲン、毒素または毒物である。
【００９２】
実施形態では、処理はインビボで、例えば、宿主、例えば、本明細書に記載の対象で起こる。
【００９３】
本明細書では、インビボ、対象で、外因性物質を（ｉ）ヒドロキシル化、（ｉｉ）メチル化、（ｉｉｉ）スルホン化、（ｉｖ）加水分解、（ｖ）酸化、（ｖｉ）還元、（ｖｉｉ）芳香族化、（ｖｉｉｉ）アルキル化、（ｉｘ）アシル化、（ｘ）リン酸化、（ｘｉ）グリコシル化、（ｘｉｉ）硫酸化、および／または（ｘｉｉｉ）ニトロシル化する方法であって、対象にグリカン組成物を投与することを含む方法が提供される。一実施形態では、グリカン組成物は、マイクロバイオームの微生物、例えば、腸の微生物の、外因性物質をｉ）ヒドロキシル化、（ｉｉ）メチル化、（ｉｉｉ）スルホン化、（ｉｖ）加水分解、（ｖ）酸化、（ｖｉ）還元、（ｖｉｉ）芳香族化、（ｖｉｉｉ）アルキル化、（ｉｘ）アシル化、（ｘ）リン酸化、（ｘｉ）グリコシル化、（ｘｉｉ）硫酸化、および／または（ｘｉｉｉ）ニトロシル化する酵素を産生する能力を調節する。実施形態では、外因性物質は、薬物、薬物代謝産物、薬物添加物、食品、食品添加物、アレルゲン、毒素または毒物である。
【００９４】
いくつかの実施形態では、質量分析、例えば、対象から採取した血液、糞便または尿の試料の質量分析により、外因性物質の改変を検出することができ、かつ／または薬物動態パラメータを決定することができる。いくつかの実施形態では、インビトロ試験により、例えば、単離した外因性物質を基質として用い、かつ、外因性物質をインビトロ、例えば、試験容器内で改変させる、単離した生物学的試料（例えば、糞便スラリーなどの糞便試料）、単離した微生物（例えば、単離した細菌分類群）、および／または単離した酵素もしくは精製した酵素抽出物（例えば、微生物酵素）を用い、任意選択により、適切な溶媒、緩衝液、エネルギー源、および他の好適な反応条件、そして改変を検出するのに好適なアッセイを使用することにより、外因性物質の改変を検出することができ、かつ／または薬物動態パラメータを決定することができる。
【００９５】
実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、微生物、例えば、細菌分類群によって行われる。実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、酵素、例えば、微生物酵素によって行われる。実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、宿主酵素（例えば、非微生物、ヒトまたは哺乳動物の酵素）によって行われる。実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、消化管、例えば、胃、小腸および／または大腸で行われる。実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、小腸の領域（例えば、十二指腸、空腸または回腸）で行われる。実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、大腸の領域（例えば、盲腸、結腸または直腸）で行われる。実施形態では、（ｉ）〜（ｘｉｉｉ）のいずれか１つは、結腸で、実質的に行われる。
【００９６】
処理酵素
実施形態では、外因性物質の処理は、酵素、例えば、微生物（例えば、細菌）酵素、または宿主酵素（例えば、真核生物酵素、例えば、哺乳動物酵素、例えば、ヒト酵素）によって行われる。実施形態では、処理は、誘導体化および／または分解を含む。処理、例えば、誘導体化および／または分解は、本明細書に記載の酵素によって行われ得る。例示的な酵素には、（ｉ）オキシドレダクターゼ（ＥＣ１）（例えば、デヒドロゲナーゼ、オキシダーゼ、カタラーゼ）、（ｉｉ）トランスフェラーゼ（ＥＣ２）（例えば、アミノトランスフェラーゼ、ペプチジルトランスフェラーゼ、グリコシルトランスフェラーゼ）、（ｉｉｉ）ヒドロラーゼ（ＥＣ３）（例えば、レダクターゼ（例えば、金属レダクターゼ）、アロマターゼ／シクラーゼ、ホスホリラーゼ、グリコシダーゼ、セルラーゼ、アミラーゼ、ウレアーゼ、リパーゼ、プロテアーゼ、ペプチダーゼ、マンナナーゼ、プルラナーゼ、キシラナーゼ）、（ｉｖ）リアーゼ（ＥＣ４）（例えば、ペクチン酸塩リアーゼ）、（ｖ）イソメラーゼ（ＥＣ５）（例えば、エピメラーゼ、ムターゼ）、（ｖｉ）リガーゼ（ＥＣ６）（例えば、シンターゼ）、（ｖｉｉ）アゾレダクターゼ（例えば、アリールアミンＮ−アセチルトランスフェラーゼ）、（ｖｉｉｉ）ベータ−グルクロニダーゼ（例えばウリジン二リン酸（ＵＤＰ）−グルクロノシルトランスフェラーゼ）、および／または（ｉｘ）カルボキシルエステラーゼが含まれる。
【００９７】
実施形態では、酵素は、以下のタイプの結合の１つ以上に作用する：（ｉ）エステル結合、（ｉｉ）エーテル結合、（ｉｉｉ）ペプチド結合、（ｉｖ）炭素−窒素結合、例えば、ペプチド結合以外、（ｖ）酸無水物、（ｖｉ）炭素−炭素結合、（ｖｉｉ）ハロゲン化物結合、（ｖｉｉｉ）リン−窒素結合、（ｉｘ）硫黄−窒素結合、（ｘ）炭素−リン結合、（ｘｉ）硫黄−硫黄結合、および／または（ｘｉｉ）炭素−硫黄結合。
【００９８】
実施形態では、酵素は、レダクターゼ、例えば硝酸／亜硝酸／酸化窒素レダクターゼ、ヒ酸レダクターゼ、鉄／第二鉄レダクターゼ、塩素酸レダクターゼ、フマル酸レダクターゼ、アルデヒドレダクターゼ、過酸化物レダクターゼ、ＣＯ２レダクターゼ、モルヒノンレダクターゼ、ＴＭＡＯレダクターゼ、亜硫酸レダクターゼ、ＤＭＳＯレダクターゼ、リボヌクレオチドレダクターゼ、脂肪酸レダクターゼ、キシロースレダクターゼ、チオレドキシンレダクターゼ、クロムレダクターゼ、過塩素酸レダクターゼ、またはジヒドロ葉酸レダクターゼを含む。
【００９９】
実施形態では、酵素は、ヒドロラーゼ、例えばカルボン酸エステルヒドロラーゼ、チオエステルヒドロラーゼ、リン酸モノ（ジ）（トリ）エステルヒドロラーゼ、硫酸エステルヒドロラーゼ、二リン酸モノエステルヒドロラーゼ、リン酸トリエステルヒドロラーゼ、エキソデオキシリボヌクレアーゼ、エキソヌクレアーゼ、エンドデオキシリボヌクレアーゼ、エンドリボヌクレアーゼ、グルコシラーゼ、グリコシダーゼ（Ｏ、ＮまたはＳグリコシダーゼ）、トリアルキルスルホニウムヒドロラーゼ、エーテルヒドロラーゼまたはペプチダーゼを含む。
【０１００】
実施形態では、ペプチダーゼは、α−アミノ−アシルペプチドヒドロラーゼ、ペプチジル−アミノ酸ヒドロラーゼ、ジペプチドヒドロラーゼ、ペプチジルペプチドヒドロラーゼ、アミノペプチダーゼ、ペプチジルアミノ酸ヒドロラーゼ、アシルアミノ酸ヒドロラーゼ、ジペプチダーゼ、ジペプチジルペプチダーゼ、トリペプチジルペプチダーゼ、ペプチジルジペプチダーゼ、セリン型カルボキシペプチダーゼ、メタロカルボキシペプチダーゼ、システイン型カルボキシペプチダーゼ、オメガペプチダーゼ、セリンエンドペプチダーゼ、システインエンドペプチダーゼ、アスパラギン酸エンドペプチダーゼ、メタロエンドペプチダーゼ、トレオニンエンドペプチダーゼ、またはエンドペプチダーゼを含む。
【０１０１】
酵素は、本明細書中、例えば、表１〜６に記載の例示的な細菌分類群のいずれかによって産生され得る。
【０１０２】
実施形態では、酵素は、活性、例えば本明細書中、例えば、表１〜３に記載の基質に対する作用を含む。
【０１０３】
本明細書に記載の方法は、酵素活性、例えば本明細書に記載のグリカン組成物を使用して、微生物または哺乳動物の酵素の活性またはレベルを改変することを含む。一実施形態では、酵素活性の改変は、微生物（例えば、酵素を含むかもしくは酵素を産生することができる微生物、または酵素活性を増加させる実体を産生するかもしくは産生することができる微生物）の数または存在率（相対存在度）の増加による活性の増加であるか、またはそのような増加を含む。一実施形態では、酵素活性の改変は、微生物（例えば、酵素を含むかもしくは酵素を産生することができる微生物、または酵素活性を低下させる実体を産生するかもしくは産生することができる微生物）の数または存在率（相対存在度）の減少による活性の低下であるか、またはそのような低下を含む。
【０１０４】
酵素活性（または酵素の活性）は、酵素のレベル（例えば、発現レベル）、酵素の活性（例えば、比活性）、および／または、酵素、例えば、宿主における酵素のアベイラビリティ／バイオアベイラビリティを含み得る。場合によっては、酵素活性の増加は、例えば、酵素がプロドラッグから活性な薬物形態を生成する場合、または酵素が基質を解毒する場合に所望され得る。実施形態では、方法は、酵素活性を、例えば、参照レベル（例えば、グリカン組成物の投与前に対象に生じる処理のレベル）に対し、例えば、少なくとも５％（例えば、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、もしくは少なくとも１００％）、または少なくとも１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、少なくとも１０００倍もしくはそれ以上）に増加させることを含む。
【０１０５】
場合によっては、酵素活性の低下は、例えば、酵素が毒性の産物、例えば、代謝産物もしくは中間体を作り出す場合、あるいは酵素が活性な薬物形態を、それがより迅速に除去（例えば、排泄）されるように変えるか、さもなければそのバイオアベイラビリティを減少させる場合に所望され得る。実施形態では、処理（例えば、物質の処理量および／または物質の処理速度）を、例えば、参照レベル（例えば、グリカン組成物の投与前に対象に生じる処理のレベル）に対し、例えば、少なくとも５％（例えば、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、もしくは少なくとも９９％）、または少なくとも１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、少なくとも１０００倍もしくはそれ以上）減少させることを含む。
【０１０６】
外因性物質を処理する細菌分類群
実施形態では、外因性物質は、細菌、例えば、細菌分類群、例えば、細菌分類群によって産生される酵素によって処理される。実施形態では、外因性物質は、細菌分類群によって代謝される。実施形態では、処理は、対象に対して毒性のある外因性物質またはその誘導体／代謝産物／中間体の量を減少させることを含む。
【０１０７】
実施形態では、処理は、毒性誘導体の排泄を増加させる、例えば、毒性誘導体の合成を減少させることを含む。
【０１０８】
外因性物質を処理することができる例示的な細菌分類群には、例えば、本明細書中、例えば、表１〜６に記載のものが含まれる。
【０１０９】
実施形態では、本明細書に記載の方法は、処理（例えば、物質の処理量および／または物質の処理速度）を、例えば、参照レベル（例えば、グリカン組成物の投与前に対象に生じる処理のレベル）に対し、少なくとも５％（例えば、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、もしくは少なくとも１００％）、または少なくとも１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、少なくとも１０００倍もしくはそれ以上）に増加させることを含む。
【０１１０】
実施形態では、本明細書に記載の方法は、処理（例えば、物質の処理量および／または物質の処理速度）を、例えば、参照レベル（例えば、グリカン組成物の投与前に対象に生じる処理のレベル）に対し、少なくとも５％、（例えば、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、もしくは少なくとも９９％）、または少なくとも１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、少なくとも１０００倍もしくはそれ以上）減少させることを含む。
【０１１１】
標的とする／処理する腸の面積
実施形態では、外因性物質は、消化管（例えば、胃、小腸および／または大腸）に、存在し、通過し、かつ／または向かう。実施形態では、外因性物質は、小腸の領域（例えば、十二指腸、空腸または回腸）に、存在し、通過し、かつ／または向かう。実施形態では、外因性物質は、大腸の領域（例えば、盲腸、結腸または直腸）に、存在し、通過し、かつ／または向かう。実施形態では、外因性物質は、結腸に、存在し、通過し、かつ／または向かう。実施形態では、外因性物質は、対象の全身に存在する（例えば、対象の循環に、存在し、通過し、かつ／または向かう）。実施形態では、外因性物質は、対象に局所的に、例えば、臓器（例えば、肝臓または腎臓）内に蓄積する。
【０１１２】
実施形態では、外因性物質は、消化器（例えば、胃、小腸および／または大腸）、例えば、小腸の領域（例えば、十二指腸、空腸または回腸）、あるいは大腸の領域（例えば、盲腸、結腸または直腸）で、（例えば、本明細書中に記載のように）処理される。実施形態では、外因性物質は、結腸において、（例えば、本明細書中に記載のように）処理される。
【０１１３】
例示的な処理および効果
表１、２、３、４、５および６は、例示的な処理酵素、例示的な外因性物質、例示的な細菌分類群、外因性物質に対する酵素の作用の例、および／または本明細書に記載のグリカン組成物が酵素および／または分類群に対して有し得る効果の例を含む。これらの効果には、所望の効果、例えば、薬物効力の増加（例えば、外因性物質が薬物を含む場合）、および／または薬物毒性減少、および／または毒性を有する代謝産物／物質への曝露の減少が含まれる。
【０１１４】
【表１】
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【０１１５】
【表２】
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【０１１６】
【表３】
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【０１１７】
【表４】
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【０１１８】
【表５】
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【０１１９】
【表６】
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【０１２０】
【表７】
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【０１２１】
【表８】
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【０１２２】
【表９】
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【０１２３】
【表１０】
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【０１２４】
【表１１】
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【０１２５】
【表１２】
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【０１２６】
【表１３】
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【０１２７】
【表１４】
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【０１２８】
薬物の毒性／効力に影響する方法
細菌分類群は、（例えば、細菌酵素を使用して）物質、例えば、薬物を処理して、毒性化合物／分子を生成または放出することができる。細菌分類群はまた、（例えば、細菌酵素を使用して）毒性物質を、毒性がより少なくなるように処理することができ、例えば、細菌分類群は毒性物質を解毒することができる。他の例では、細菌分類群は、（例えば、細菌酵素を使用して）物質、例えば、プロドラッグを処理して活性形態に変換し、例えば、それによってその効力を増加させることができる。さらに他の例では、細菌分類群は、（例えば、細菌酵素を使用して）物質、例えば、薬物、例えば活性薬物形態を、活性が低下するか、もしくは活性がなくなるように処理することができる。外因性物質に対する微生物分類群および微生物活性を調節する方法であって、外因性物質に対する微生物分類群および／または微生物活性を調節するのに有効な量で、本明細書に記載のグリカン組成物を投与することを含む方法が、本明細書において提供される。本明細書に記載の組成物および方法は、薬物などの物質の毒性が低減され、かつ／または薬物の効力が増大するように、１つ以上の細菌分類群および／または１つ以上の細菌酵素を調節することができる。例えば、本明細書に記載の組成物および方法は、毒性化合物／分子を生成または放出する細菌分類群のレベルを低下（および／または細菌酵素の活性を低下）させることができる。いくつかの例では、本明細書に記載の組成物および方法は、物質を解毒する細菌分類群のレベルを増加（および／または細菌酵素の活性を増加）させることができる。他の例では、本明細書に記載の組成物および方法は、薬物の効力を増加させる、例えば、プロドラッグを活性形態に変換する細菌分類群のレベルを増加（および／または細菌酵素の活性を増加）させることができる。さらに他の例では、本明細書に記載の組成物および方法は、薬物を不活化するか、または薬物をより活性の低い（例えば、活性のない）形態に変換する細菌分類群のレベルを減少（および／または細菌酵素の活性を低下）させることができる。
【０１２９】
本明細書においては、ヒト対象における薬物毒性を低減する方法が提供される。実施形態では、この方法は、グリカン組成物を、薬物の毒性を低減するのに有効な量で対象に投与することを含む。実施形態では、対象は、薬物（例えば、毒性に関係する薬物）が以前に投与されたか、投与中であるか、または投与されることになっている。実施形態では、グリカン組成物は、対象の薬物毒性（および関連する症状、例えば、細胞毒性、下痢、便秘、悪心、めまい、体重減少など）を減少させる（例えば、参照レベル、例えば、グリカン組成物の投与前の対象における薬物毒性と比較して）のに十分な量および／または時間で投与される。実施形態では、本方法は、さらに、薬物を対象に、例えばグリカン組成物と組み合わせて投与することを含む。実施形態では、薬物毒性は、参照レベル（例えば、グリカン組成物の投与前の対象おける薬物毒性）と比べ、少なくとも５％（例えば、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９８％、もしくは少なくとも９９％）、または少なくとも１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、５０倍、１００倍、２５０倍、５００倍、少なくとも１０００倍もしくはそれ以上）減少する。
【０１３０】
薬物毒性とは、対象への薬物の投与から生じる、対象における１つ以上の副作用を指す。副作用は不快（例えば、細胞毒性、下痢、便秘、悪心、めまい、体重減少などの症状）から、場合によっては死に及び得る。薬物毒性は、オフターゲット活性、オンターゲット毒性、薬物の毒性を有する代謝産物または中間体への処理、対象にとって不適切な用量（例えば、高過ぎる用量）、薬物の長期使用、および／または薬物と第２の薬物もしくは物質との相互作用を含む多くの原因から生じ得る。薬物の毒性は、年齢、既存の状態、遺伝的構成、および／または他の薬物もしくはその代謝産物の対象における存在を含む多くの因子に依存する。機構的には、薬物毒性は、薬物の毒性を有する代謝産物または中間体の産生、オンターゲット副作用（例えば、薬物は正しい標的／受容体に結合するが、不適切な濃度で提供され、最適以下の動態を示し、かつ／または間違った症状のために使用される）、またはオフターゲット副作用（例えば、薬物は間違った標的／受容体に結合する）に起因し得る。
【０１３１】
薬物毒性は、定性的および／または定量的に測定することができる。実施形態では、薬物毒性を測定する方法（例えば、定量的方法）は、宿主細胞、例えば、消化管またはその一部を覆う宿主細胞のアポトーシスおよび／または壊死を検出する試験（例えば、インビトロ試験）を含む。実施形態では、細胞におけるアポトーシスおよび／または壊死の存在は、薬物に毒性があることを示す。実施形態では、細胞におけるアポトーシスおよび／または壊死の程度がより小さい（例えば、アポトーシス／壊死細胞がより少ない）ことは、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物による治療前と比較して、薬物毒性が減少していることを示す。
【０１３２】
実施形態では、薬物毒性を測定する方法（例えば、定量的方法）は、対象からの試料（例えば、糞便試料）における特定の微生物分類群（例えば、本明細書に記載の微生物分類群）の数または存在率を測定することを含み得る。実施形態では、微生物分類群の存在度の低下（例えば、減少）、および／または微生物分類群の多様性の低下（例えば、減少）は、例えば、薬剤による治療前と比較した細胞毒性を示している。実施形態では、微生物分類群の存在度の増加および／または微生物分類群の多様性の増加は、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物による治療前と比較して、薬物毒性が減少していることを示している。
【０１３３】
実施形態では、薬物毒性を測定するための方法は、対象、例えば、対象からの試料における損傷に対する応答を示す、１つ以上の炎症マーカーおよび／または他のバイオマーカーのレベルを測定することを含み得る。炎症マーカーおよび／または他のバイオマーカーのレベルは、標準的な方法を用いて測定することができる。実施形態では、炎症マーカーは１つ以上の炎症性サイトカイン、例えば、ＴＮＦ−α、ＩＬ−１、ＩＬ−６、および／またはＩＬ−１０を含む。
【０１３４】
実施形態では、薬物毒性を測定するための定性的方法は、対象における薬物毒性の１つ以上の症状、例えば、便秘、下痢、炎症、および／または嘔吐を検出することを含み得る。
【０１３５】
グリカン組成物を対象に投与することを含む、対象における薬物の効力、ポテンシー、および／またはバイオアベイラビリティを増加させる方法もまた、本明細書において提供される。実施形態では、対象は、薬物が以前に投与されたか、投与中であるか、または投与されることになっている。実施形態では、グリカン組成物は、対象における薬物の効力、ポテンシー、および／またはバイオアベイラビリティを増加させる（例えば、参照レベル、例えば、グリカン組成物の投与前の対象における薬物毒性と比較して）のに有効な量および／または十分な時間で投与される。
【０１３６】
薬物効力は、効果、例えば、所望の効果、例えば、ＧＩ運動の増加、またはコレステロール値の低減をもたらす薬物の能力を指す。実施形態では、薬物効力は、形成された薬物−受容体複合体の１単位当たりに生じる生物学的効果の量として表すことができる、薬物の固有活性を含む。薬物のバイオアベイラビリティは、投与後、対象の循環に入り、その結果、効果を引き出すことができる薬物の比率を指す。薬物ポテンシーは、所定の強さの効果を生じるのに必要な薬物の量で表される薬物活性の尺度を指す。
【０１３７】
薬物効力は、定性的および／または定量的に測定することができる。実施形態では、薬物効力は、薬物が治療しようとする疾患／障害の１つ以上の症状の改善（例えば、消失、またはより緩和な形態）を検出することによって測定することができる。実施形態では、薬物効力は、インビトロで、例えば細胞または組織試料、例えば、細胞培養物において、機能的読み出し情報（例えば、タンパク質、例えば、酵素のレベルまたは活性、セカンドメッセンジャーなどの分子の産生、タンパク質のリン酸化などの翻訳後修飾、または遺伝子発現の変化）を、細胞または組織試料と薬物とのインキュベーション後に決定することにより、測定することができる。他の実施形態では、薬物効力は、エクスビボ、またはインビボで、例えば、薬物の投与後、または対象からの試料（例えば、糞便試料）とのエクスビボでのインキュベーション後に、機能的読み取り情報を決定することにより、測定することができる。
【０１３８】
薬物ポテンシーは、効果がＥｍａｘ（薬物の最大可能効果）の５０％である薬物の濃度の、薬物のＥＣ５０（半数有効濃度）を決定することによって測定することができる。ＥＣ５０が低いほど、薬物のポテンシーは高い。薬物のＥＣ５０は、標準的な方法、例えば、細胞または組織試料、例えば、細胞培養物における機能的読み出し情報を、薬物の用量を増加させて投与した後に測定することにより、決定することができる。
【０１３９】
薬物のバイオアベイラビリティは、対象の全身循環に到達する薬物（例えば、非改変薬物）の総量に正比例する血漿濃度−時間曲線（ＡＵＣ）下の面積を決定することによって測定することができる。
【０１４０】
いくつかの実施形態では、組成物および方法は、表１、２、または３に記載される１つ以上の所望の効果を達成し得る。実施形態では、方法は、表１、２、もしくは３、または表４、５、もしくは６に記載される酵素の活性および／または微生物のレベルを調節することを含む。実施形態では、方法は例えば、本明細書、例えば、表１、２、または３に記載の外因性物質を投与された、投与中である、または投与されるであろう対象に組成物を投与することを含む。
【０１４１】
また、本明細書においては、対象の治療レジメンを特定または選択する方法も提供される。実施形態では、この方法は、ａ）対象における細菌分類群もしくは微生物代謝産物の存在もしくはレベル、または酵素活性の値を取得すること；ｂ）その値に応じて、対象を治療するためのグリカン組成物を選択すること；ならびに、ｃ）対象を治療するのに有効な量および／または十分な時間、グリカン組成物を投与することを含む。
【０１４２】
実施形態では、この方法は、さらに、工程（ａ）の前に、外因性物質、例えば、環境毒素もしくは毒物、医薬剤もしくは医薬品、食事成分、食品添加物、または薬物添加物が投与された、投与されている、または投与される対象を選択する工程を含む。
【０１４３】
本明細書に記載のグリカン組成物を使用して治療する対象を選択する方法もまた、本明細書において提供される。実施形態では、対象は、外因性物質、例えば、本明細書に記載の外因性物質への曝露に基づいて選択される。実施形態では、対象は、外因性物質（例えば、環境毒素もしくは毒物、医薬剤もしくは医薬品、食事成分、食品添加物、薬物添加物）が投与された（曝露もしくは接触した）、投与されている（曝露もしくは接触している）、または投与される（曝露もしくは接触する）場合、治療のために選択される。実施形態では、外因性物質はアレルゲンを含む。他の実施形態では、対象は、疾患／状態、例えば、免疫疾患、感染症、代謝疾患、神経変性疾患、癌、アレルギー、または、疾患もしくは障害を発症する前状態または素因を含む他の疾患または障害または有害な状態を有する場合に選択される。実施形態では、対象は、酵素活性（例えば、酵素レベルおよび／もしくは酵素比活性）、例えば、微生物酵素活性が欠損している（例えば、欠損していると決定された）場合に選択される。実施形態では、対象は、過剰量の酵素および／または過剰活性酵素、例えば、微生物酵素を有する（例えば、有すると決定された）場合に選択される。実施形態では、酵素は、本明細書中、例えば、表１、２または３に記載の酵素である。実施形態では、酵素は活性を有する酵素、または本明細書中、例えば、本明細書の「外因性物質の処理」の項に記載される反応を触媒する酵素である。実施形態では、対象は、微生物分類群が不足している（例えば、不足していると決定された）場合に選択される。実施形態では、対象は、微生物分類群が過剰である（例えば、過剰であると決定された）場合に選択される。実施形態では、細菌分類群は、有益な細菌分類群、例えば、表１、２、３および４〜６に従ってレベルの増加が望まれる細菌分類群を含む。実施形態では、細菌分類群は、有害な細菌分類群、例えば、表１、２、３および４〜６に従ってレベルの減少が望まれる細菌分類群を含む。
【０１４４】
グリカンポリマー組成物およびその製造
グリカン組成物は、本明細書中に記載されるグリカン、食物繊維、例えば、ＦＯＳ（フルクトオリゴ糖）、その他の糖類（例えばモノマー、ダイマー、例えば、ラクツロース（ｌａｃｔｕｌｏｓｅ）など）、および糖アルコール、ならびに、任意選択により、他の成分、例えば、ポリフェノール、脂肪酸、ペプチド、微量栄養素など、例えば、国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット、“ＭＩＣＲＯＢＩＯＭＥ  ＲＥＧＵＬＡＴＯＲＳ  ＡＮＤ  ＲＥＬＡＴＥＤ  ＵＳＥＳ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載されるもの、および細菌などの微生物を含み得る。
【０１４５】
国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、“ＧＬＹＣＡＮ  ＴＨＥＲＡＰＥＵＴＩＣＳ  ＡＮＤ  ＲＥＬＡＴＥＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＴＨＥＲＥＯＦ”および国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット“ＧＬＹＣＡＮ  ＴＨＥＲＡＰＥＵＴＩＣＳ  ＡＮＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＯＦ  ＴＲＥＡＴＭＥＮＴ”（これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載されるグリカン調製物は、本明細書に記載の方法および組成物に好適である。
【０１４６】
グリカンを含む調製物は、非酵素触媒、例えば、国際公開第２０１２／１１８７６７号パンフレット、“ＰＯＬＹＭＥＲＩＣ  ＡＣＩＤ  ＣＡＴＡＬＹＳＴＳ  ＡＮＤ  ＵＳＥＳ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載のポリマー触媒、または他の好適な方法によって生成することができる。本明細書に記載されるポリマー触媒および固体担持触媒を調製する方法は、国際公開第２０１４／０３１９５６号パンフレット、“ＰＯＬＹＭＥＲＩＣ  ＡＮＤ  ＳＯＬＩＤ−ＳＵＰＰＯＲＴＥＤ  ＣＡＴＡＬＹＳＴＳ、ＡＮＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＯＦ  ＤＩＧＥＳＴＩＮＧ  ＣＥＬＬＵＬＯＳＩＣ  ＭＡＴＥＲＩＡＬＳ  ＵＳＩＮＧ  ＳＵＣＨ  ＣＡＴＡＬＹＳＴＳ”中に見出すことができる。例えば、国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレット、“ＯＬＩＧＯＳＡＣＣＨＡＲＩＤＥ  ＣＯＭＰＯＳＩＴＩＯＮＳ  ＡＮＤ  ＭＥＴＨＯＤＳ  ＦＯＲ  ＰＲＯＤＵＣＩＮＧ  ＴＨＥＲＥＯＦ”に記載されているような触媒を使用することによって生成されるグリカンは、本明細書に記載の方法および組成物に好適である。すべての特許出願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０１４７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、グリカンポリマーの生成に好適な条件下でグリコシダーゼ酵素分子を用いて作製される。
【０１４８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、固相オリゴ糖合成により、例えば、グリカンポリマー合成を達成する種々の保護基を用いて、作製される。例示的な方法は、“Ｓｏｌｉｄ−Ｐｈａｓｅ  Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ａｎｄ  Ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌ  Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｌｉｂｒａｒｉｅｓ”，Ｐｅｔｅｒ  Ｈ．Ｓｅｅｂｅｒｇｅｒ  ａｎｄ  Ｗｉｌｍ−Ｃｈｒｉｓｔｉａｎ  Ｈａａｓｅ，Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ，２０００；および“Ｏｐｐｏｒｔｕｎｉｔｉｅｓ  ａｎｄ  ｃｈａｌｌｅｎｇｅｓ  ｉｎ  ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ  ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ  ａｎｄ  ｇｌｙｃｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  ｒｅｓｅａｒｃｈ”，Ｔｈｏｍａｓ  Ｊ．Ｂｏｌｔｊｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ  Ｃｈｅｍ．２００９  Ｎｏｖｅｍｂｅｒ  １；１（８）：６１１−６２２に記載されている。
【０１４９】
グリカン調製物特性
グリカンは、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレットおよび国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット（これらはそれぞれ、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載される特徴および特性の１つ以上、ならびに本明細書に記載の特徴および特性を有し得る。
【０１５０】
本明細書に記載の方法によって製造されるグリカンポリマーは、オリゴ糖を含み得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーはホモオリゴ糖（または、ホモグリカン）を含み、ここで、ポリマー中のすべての単糖は同じ型である。
【０１５１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーはヘテロオリゴ糖（または、ヘテログリカン）を含み、このポリマー中には複数の型の単糖が存在する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、本明細書に記載の特性のうちの１つ以上を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、本明細書に記載のバルク特性のうちの１つ以上を有する。
【０１５２】
重合度（ＤＰ）
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、例えば、本明細書中に記載される方法を用いて製造されるが、それらは、多分散系であり、ある範囲の重合度を示す。
【０１５３】
任意選択により、調製物は、例えば、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９８％超の短い（ＤＰが約１〜２）、中等度（ＤＰが約３〜１０）、長い（ＤＰが約１１〜１８）、または非常に長い（ＤＰが＞１８）種を表すように分画してもよい。一実施形態では、約３〜１０のＤＰを有する少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％の中等度の長さの種を含む多分散の分画グリカンポリマー調製物が提供される。一実施形態では、約１１〜１８のＤＰを有する少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％の長尺の種を含む多分散の分画グリカンポリマー調製物が提供される。一実施形態では、約１８〜３０のＤＰを有する少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％の超長尺の種を含む多分散の分画グリカンポリマー調製物が提供される。
【０１５４】
任意選択により、調製物は、例えば、調製物中に６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９８％超の短い（ＤＰが約１〜２）、または中等度（ＤＰが約３〜１０）のグリカンを表すように分画してもよい。代替として、または分画に加えて、小さなＤＰ画分（例えば、モノマーおよびダイマー）は、例えば、これらの糖を分解するのに適した酵母を用いて、酵素による発酵に供される。一実施形態では、約３〜１０のＤＰを有するグリカンを少なくとも８５％、９０％、または少なくとも９５％含む、多分散の分画グリカンポリマー調製物が、本明細書に記載の方法を用いて調製される。
【０１５５】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーの約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、少なくともＤＰ３、ＤＰ４、ＤＰ５、ＤＰ６またはＤＰ７のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーの約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、約ＤＰ３〜約ＤＰ１０、約ＤＰ３〜約ＤＰ８、約ＤＰ３〜約ＤＰ６、約ＤＰ３〜約ＤＰ５、約ＤＰ３〜約ＤＰ４、約ＤＰ２〜約ＤＰ４、約ＤＰ２〜約ＤＰ５、約ＤＰ２〜約ＤＰ６、約ＤＰ２〜約ＤＰ８、または約ＤＰ２〜約ＤＰ１０のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーの１％未満、２％、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、または５０％未満は、ＤＰ２以下のＤＰを有する。
【０１５６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、２〜２５、３〜２５、４〜２５、５〜２５、６〜２５、７〜２５、８〜２５、９〜２５、１０〜２５、２〜３０、３〜３０、４〜３０、５〜３０、６〜３０、７〜３０、８〜３０、９〜３０、または１０〜３０のＤＰを有する。一実施形態では、グリカンポリマー調製物は、少なくとも３および３０未満のグリカン単位の重合度（ＤＰ）を有する。
【０１５７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、５以上３０未満のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、８以上３０未満のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、１０以上３０未満のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、３、４、５、６、７、８と１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０の間のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９と２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０の間のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、３、４、５、６、７、８、９、１０と２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８の間のグリカン単位のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、少なくとも２のＤＰを有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、少なくとも３のＤＰを有する。
【０１５８】
平均ＤＰ
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、約ＤＰ２、ＤＰ３、ＤＰ４、ＤＰ５、ＤＰ６、ＤＰ７、ＤＰ８、またはＤＰ９の平均重合度（平均ＤＰ）を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、約２〜約１０、約２〜約８、約２〜約６、約２〜約４、約３〜約１０、約３〜約８、約３〜約６、または約３〜約４の平均重合度（平均ＤＰ）を有する。
【０１５９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、約ＤＰ５、ＤＰ６、ＤＰ７、ＤＰ８、ＤＰ９、ＤＰ１０、ＤＰ１１、またはＤＰ１２の平均重合度（平均ＤＰ）を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物の平均ＤＰは、約ＤＰ５〜ＤＰ１０、約ＤＰ６〜ＤＰ１０、約ＤＰ６〜ＤＰ１２、約ＤＰ６〜ＤＰ１４、約ＤＰ８〜ＤＰ１２、約ＤＰ８〜ＤＰ１４、約ＤＰ８〜ＤＰ１６、約ＤＰ１０〜ＤＰ１６、約ＤＰ１０〜ＤＰ１８、約ＤＰ４〜ＤＰ１８、約ＤＰ６〜ＤＰ１８、または約ＤＰ８〜ＤＰ１８である。
【０１６０】
平均分子量
いくつかの実施形態では、調製物のグリカンポリマーの約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または約９７％は、約２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、９００、９５０、１０００、１０５０、１１００、１１５０、１２００、１２５０、１３００、１３５０、１４００、１４５０、１５００、１５５０、１６００、１６５０、１７００、１７５０、１８００ｇ／ｍｏｌで、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１１００、１２００、１３００、１４００、１５００、１６００、１７００、１８００、１９００、２０００、２１００、２２００、２３００、２４００、２５００、２６００、２７００、２８００、２９００、３０００、３１００、３２００、３３００、３４００、３５００、３６００、３７００、３８００、３９００、４０００、４１００、４２００、４３００、４４００、４５００、４６００、４７００、４８００、４９００、および５０００ｇ／ｍｏｌ未満の平均分子量を有する。
【０１６１】
分岐度（ＤＢ）
いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、構造が直鎖状から分枝状まで様々である。分岐グリカンは、分岐を形成するように、アルファまたはベータグリコシド結合を介して連結している少なくとも１つのグリカンサブユニットを含み得る。分岐率または分岐度（ＤＢ）は、調製物のグリカンポリマーがグリカンポリマー中に少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、または少なくとも約６つの分岐点を含むように変化し得る。いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーは非分岐である（ＤＢ＝０）。
【０１６２】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物（例えば、オリゴまたは多糖類）は、線形から高度分岐の構造に及ぶ。非分岐グリカンは、アルファ結合のみまたはベータ結合のみを含有し得る。非分岐グリカンは、少なくとも１つのアルファ結合および少なくとも１つのベータ結合を含有し得る。分岐グリカンは、アルファグリコシド結合またはベータグリコシド結合を介して結合して、分岐を形成する少なくとも１つのグリカン単位を含有し得る。分岐速度または分岐度（ＤＢ）は、変化し得、そのため、約２番目、３番目、４番目、５番目、６番目、７番目、８番目、９番目、１０番目、１５番目、２０番目、２５番目、３０番目、３５番目、４０番目、４５番目、５０番目、６０番目、または７０番目毎の単位は、少なくとも１つの分岐点を含む。例えば、動物グリコーゲンは、ほぼ１０毎の単位に分岐点を含有する。
【０１６３】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その調製物は、分岐グリカンの混合物を含み、その平均分岐度（ＤＢ、１残基あたりの分岐点）は、０、０．０１．０．０２、０．０３、０．０４、０．０５、０．０６、０．０７、０．０８、０．０９、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、０．９５、０．９９、１、または２である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、少なくとも０．０１、０．０５、０．１、０．２、０．３、または少なくとも０．４である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、約０．０１〜０．１、０．０１〜０．２、０．０１〜０．３、０．０１〜０．４、０．０１〜０．５、０．０１〜０．６、または約０．０１〜０．７である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、約０．０５〜０．１、０．０５〜０．２、０．０５〜０．３、０．０５〜０．４、０．０５〜０．５、０．０５〜０．６、または約０．０５〜０．７である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、０ではない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度は、０．１以上０．４未満でも、０．２以上０．４未満でもない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、直鎖状グリカンを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、分岐またはブランチオンブランチ（ｂｒａｎｃｈ−ｏｎ−ｂｒａｎｃｈ）構造を示すグリカンを含む。
【０１６４】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物が提供され、その平均分岐度（ＤＢ）は、０ではなく、少なくとも０．０１、０．０５、０．１、または少なくとも０．２であるか、あるいは約０．０１〜約０．２または約０．０５〜０．１の範囲である。
【０１６５】
グリコシド結合およびグリコシド連結
グリカンポリマーの調製物中に見出される個々のグリカンサブユニット間の連結には、アルファ１−＞２、アルファ１−＞３、アルファ１−＞４、アルファ１−＞５、アルファ１−＞６、アルファ２−＞１、アルファ２−＞３、アルファ２−＞４、アルファ２−＞６、ベータ１−＞２、ベータ１−＞３、ベータ１−＞４、ベータ１−＞５、ベータ１−＞６、ベータ２−＞１、ベータ２−＞３、ベータ２−＞４、およびベータ２−＞６が含まれ得る。
【０１６６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、アルファ連結のみを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、ベータ連結のみを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、アルファ連結およびベータ連結の混合物を含む。
【０１６７】
いくつかの実施形態では、調製物中のアルファグリコシド結合：ベータグリコシド結合の比は、約１：１、２：１、３：１、４：１、または５：１である。いくつかの実施形態では、調製物中のベータグリコシド結合：アルファグリコシド結合の比は、約１：１、２：１、３：１、４：１、または５：１である。
【０１６８】
いくつかの実施形態では、調製物中のアルファグリコシド結合：ベータグリコシド結合の比は、約０．１：１、０．２：１、０．３：１、０．４：１、０．５：１、０．６：１、０．７：１、０．８：１、０．９：１、１：１、１．２：１、１．５：１、１．７：１、２：１、２．２：１、２．５：１、２．７：１、３：１、４：１、５：１、６：１、７：１、８：１、９：１、または約１０：１である。
【０１６９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーは、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、１−＞５グリコシド結合および１−＞６グリコシド結合からなる群から選択されるアルファグリコシド結合およびベータグリコシド結合の両方を含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、少なくとも２つ、または少なくとも３つの、アルファおよびベータ１−＞２グリコシド結合、アルファおよびベータ１−＞３グリコシド結合、アルファおよびベータ１−＞４グリコシド結合、アルファおよびベータ１−＞５グリコシド結合、ならびに／またはアルファおよびベータ１−＞６グリコシド結合を含む。
【０１７０】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーは、実質的にすべてアルファ配置またはベータ配置のグリカンサブユニットを含み、任意選択的に、それぞれ他の配置を約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、または２０％含む。
【０１７１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、アルファグリコシド結合を有する少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、少なくとも９９．９％、またはさらに１００％のグリカンを含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、ベータグリコシド結合を有する少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、少なくとも９９．９％、またはさらに１００％のグリカンを含む。いくつかの実施形態では、グリコシド結合を有する少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または少なくとも８５％のグリカンはアルファグリコシド結合であり、グリコシド結合を有する少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または少なくとも８５％のグリカンはベータグリコシド結合であり、アルファグリコシド結合およびベータグリコシド結合の割合は、１００％を超えない、グリカンポリマーの調製物が提供される。
【０１７２】
いくつかの実施形態では、グリカングリコシド結合の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、少なくとも９９．９％、またはさらに１００％は、１−＞２グリコシド結合、１−＞３グリコシド結合、１−＞４グリコシド結合、および１−＞６グリコシド結合のうちの１つ以上である、グリカンポリマーの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、グリカングリコシド結合の各々の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、少なくとも２０％、または２５％は、１−＞２、１−＞３、１−＞４、および１−＞６グリコシド結合である、グリカンポリマーの調製物が提供される。任意に、グリカンポリマーの調製物は、アルファ２−＞１、アルファ２−＞３、アルファ２−＞４、アルファ２−＞６、ベータ２−＞１、ベータ２−＞３、ベータ２−＞４、およびベータ２−＞６グリコシド結合からなる群から選択されるグリカングリコシド結合の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または少なくとも８５％をさらに含む。
【０１７３】
いくつかの実施形態では、グリカン調製物のグリカンポリマーは、アルファ１−＞２およびアルファ１−＞３、アルファ１−＞２およびアルファ１−＞４、アルファ１−＞２およびアルファ１−＞６、アルファ１−＞２およびベータ１−＞２、アルファ１−＞２およびベータ１−＞３、アルファ１−＞２およびベータ１−＞４、アルファ１−＞２およびベータ１−＞６、アルファ１−＞３およびアルファ１−＞４、アルファ１−＞３およびアルファ１−＞６、アルファ１−＞３およびベータ１−＞２、アルファ１−＞３およびベータ１−＞３、アルファ１−＞３およびベータ１−＞４、アルファ１−＞３およびベータ１−＞６、アルファ１−＞４およびアルファ１−＞６、アルファ１−＞４およびベータ１−＞２、アルファ１−＞４およびベータ１−＞３、アルファ１−＞４およびベータ１−＞４、アルファ１−＞４およびベータ１−＞６、アルファ１−＞６およびベータ１−＞２、アルファ１−＞６およびベータ１−＞３、アルファ１−＞６およびベータ１−＞４、アルファ１−＞６およびベータ１−＞６、ベータ１−＞２およびベータ１−＞３、ベータ１−＞２およびベータ１−＞４、ベータ１−＞２およびベータ１−＞６、ベータ１−＞３およびベータ１−＞４、ベータ１−＞３およびベータ１−＞６、ならびにベータ１−＞４およびベータ１−＞６からなる群から選択される少なくとも２つのグリコシド結合を含む。
【０１７４】
Ｌ型およびＤ型
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがＬ型の糖であるグリカンポリマーの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがＤ型の糖であるグリカンの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、グリカンサブユニットが天然に存在するか、またはより一般的である（例えば、Ｄ−グルコース、Ｄ−キシロース、Ｌ−アラビノース）Ｌ型またはＤ型の糖であるグリカンの調製物が提供される。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物（例えば、オリゴ糖および多糖）は、グリカンサブユニットのＬ型およびＤ型の所望の混合物、例えば、Ｌ型対Ｄ型またはＤ型対Ｌ型が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５などの所望の比の混合物を含む。
【０１７６】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、グリカンユニットのＬ型およびＤ型の所望の混合物、例えば、Ｌ型対Ｄ型またはＤ型対Ｌ型が１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８、１：９、１：１０、１：１２、１：１４、１：１６、１：１８、１：２０、１：２５、１：３０、１：３５、１：４０、１：４５、１：５０、１：５５、１：６０、１：６５、１：７０、１：７５、１：８０、１：８５、１：９０、１：１００、１：１５０などの所望の比の混合物を含む。
【０１７７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、実質的にすべてＬ型またはＤ型のグリカンサブユニットを有するグリカンを含み、任意選択的に、それぞれ他の型を約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、または２０％含む。
【０１７８】
グリカン単位の内容
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットが、テトロース、ペントース、ヘキソース、またはヘプトースであるグリカンポリマーの調製物が提供される。任意選択的に、グリカンポリマー調製物のグリカンの形成に関与するグリカンサブユニットは変化する。単糖グリカンサブユニットの例には、グルコース、ガラクトース、およびフルクトースなどのヘキソース、およびキシロースなどのペントースが含まれる。単糖類は、一般に、化学式：Ｃｘ（Ｈ２Ｏ）ｙ（ここで、通常、ｘ≧３である）を有する。単糖類は、それらが含有する炭素原子の数ｘによって分類することができる：例えば、ジオース（２）、トリオース（３）、テトロース（４）、ペントース（５）、ヘキソース（６）およびヘプトース（７）。単糖グリカンサブユニットは、非環式（開鎖）形態で存在し得る。同じ分子グラフを有する開鎖の単糖類は、２つ以上の立体異性体として存在し得る。単糖類はまた、カルボニル基と同じ分子のヒドロキシルのうちの１つとの間で求核付加反応を介して環状形態で存在し得る。反応物は、１個の架橋酸素原子によって閉口している炭素原子の環を形成する。これらの環状形態では、環は、通常、５個の原子（フラノース）または６個の原子（ピラノース）を有する。
【０１７９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、異なる単糖グリカンサブユニットの所望の混合物、例えば、ジオース（２）、トリオース（３）、テトロース（４）、ペントース（５）、ヘキソース（６）、またはヘプトース（７）の混合物を含む。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物のグリカンポリマーは、ペントース（５）およびヘキソース（６）の所望の混合物を含む。
【０１８０】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、２つ、３つ、４つ、または５つの異なるグリカンサブユニットの所望の混合物、例えば、ｉ）グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、およびラムノースから選択される単糖類から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｉｉ）アカルビオシン、ｎ−アセチルラクトサミン、アロラクトース、セロビオース、キトビオース、ガラクトース−アルファ−１，３−ガラクトース、ゲンチオビオース、イソマルト、イソマルトース、イソマルツロース、コージビオース、ラクチトール、ラクトビオン酸、ラクトース、ラクツロース、ラミナリビオース、マルチトール、マルトース、マンノビオース、メリビオース、メリビウロース、ネオヘスペリドース、ニゲロース、ロビノース、ルチノース、サンブビオース、ソホロース、スクラロース、スクロース、スクロース酢酸イソ酪酸エステル、オクタアセチルスクロース、トレハロース、ツラノース、ビシアノース、およびキシロビオースから選択される二糖類から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｉｉｉ）アカルボース、Ｎ−アセチルエマンノサミン、Ｎ−アセチルムラミン酸、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルエタロサミヌロニン酸（ａｃｅｔｙｌｅｔａｌｏｓａｍｉｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、アラビノピラノシル−Ｎ−メチル−Ｎ−ニトロソ尿素、Ｄ−フルクトース−Ｌ−ヒスチジン、Ｎ−グリコリルノイラミン酸、ケトサミン、キダマイシン、マンノサミン、１Ｂ−メチルセレノ−Ｎ−アセチル−Ｄ−ガラクトサミン、ムラミン酸、ムラミルジペプチド、ホスホリボシールアミン、ＰＵＧＮＡｃ、シアリル−Ｌｅｗｉｓ  Ａ、シアリル−Ｌｅｗｉｓ  Ｘ、バリダマイシン、ボグリボース、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎ−アセチルグルコミサン、アスパルチルグルコサミン、バシリチオール、ダウノサミン、デソサミン、フルクトサミン、ガラクトサミン、グルコサミン、メグルミン、およびペロサミンから選択されるアミノ糖から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｉｖ）１−５−アヒドログルシトール、クラジノース、コリトース、２−デオキシ−Ｄ−グルコース、３−デオキシグルカソン、デオキシリボース、ジデオキシヌクレオチド、ジギタロース、フルデオオキシグルコース、サルメントース、およびスルホキノボースから選択されるデオキシ糖から選択される１つ以上のグリカンサブユニット；ｖ）カスタノスペルミン、１−デオキシノジリマイシン、イミノ糖、ミグリトール、ミグルスタット、およびスワインソニンから選択されるイミノ糖から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、Ｎ−アセチルノイラミン酸、Ｎ−アセチルタロサムヌロニン酸（ａｃｅｔｙｌｔａｌｏｓａｍｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、アルダル酸、アルドン酸、３−デオキシ−Ｄ−マンノ−オクト−２−ウロソニック酸、グルクロン酸、グルコサミンウロニック酸、グリセリン酸、Ｎ−グリコリルノイラミン酸、イズロン酸、イソサッカリン酸、パンガミン酸、シアル酸、トレオン酸、ウロソニック酸、ウロニック酸、キシロン酸、グルコン酸、アスコルビン酸、ケトデオキシオクツロソニック酸、ガラクツロン酸、ガラクトサミ���ロン酸、マンヌロン酸、マンノサミヌロン酸、酒石酸、粘液酸、糖酸、乳酸、シュウ酸、コハク酸、ヘキサン酸、フマル酸、マレイン酸、酪酸、クエン酸、グルコサミン酸、リンゴ酸、スクシンアミド酸、セバシン酸、およびカプリン酸から選択される糖酸から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ｖｉ）ギ酸、酢酸、プロピオン酸、ブチル酸、イソブチル酸、吉草酸、およびイソ吉草酸から選択される短鎖脂肪酸から選択される１つ以上のグリカンサブユニット、ならびにｖｉｉ）メタノール、エチレングリコール、グリセロール、エリトリトール、トレイトール、アラビトール、リビトール、キシリトール、マンニトール、ソルビトール、ガラクチトール、イジトール、ボレミトール、フシトール、イノシトール、マルトトリイトール、マルトテトライトール、およびポリグリシトールから選択される糖アルコールから選択される１つ以上のグリカンサブユニットの混合物を含む。
【０１８１】
例示的なグリカンは、モノマーが構成する物質の割合を反映する１００の中からの数に従って、単量体の糖成分を表す３文字コードによって記載されている。それ故に、「ｇｌｕ１００」は、１００％のＤ−グルコース（グリカン単位）の入力から生成されるグリカンに属し、「ｇｌｕ５０ｇａｌ５０」は、５０％のＤ−グルコースおよび５０％のＤ−ガラクトース（グリカン単位）の入力から、またはあるいは、ラクトース二量体（グリカン単位）の入力から生成されるグリカンに属するものとみなす。本明細書に使用される場合、ｘｙｌ＝Ｄ−キシロース、ａｒａ＝Ｌ−アラビノース、ｇａｌ＝Ｄ−ガラクトース、ｇｌｕ＝Ｄ−グルコース、ｒｈａ＝Ｌ−ラムノース、ｆｕｃ＝Ｌ−フコース、ｍａｎ＝Ｄ−マンノース、ｓｏｒ＝Ｄ−ソルビトール、ｇｌｙ＝Ｄ−グリセロール、ｎｅｕ＝ＮＡｃ−ノイラミン酸。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から選択される１つのグリカン単位Ａを含み、グリカン単位Ａは、１００％のグリカン単位の入力を含む。例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ホモグリカンｘｙｌ１００、ｒｈａ１００、ａｒａ１００、ｇａｌ１００、ｇｌｕ１００、およびｍａｎ１００から選択される。いくつかの実施形態では、グリカン調製物は、ホモグリカンｆｕｃ１００およびｆｒｕ１００から選択される。
【０１８３】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される２つのグリカン単位ＡおよびＢの混合物を含み、ＡおよびＢは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じかまたは異なる群から選択され得、かつＡおよびＢは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡおよび９９〜１％のＢの範囲）で選択され得る。
【０１８４】
例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ヘテログリカンａｒａ５０ｇａｌ５０、ａｒａ５０ｇａｌ５０、ｘｙｌ７５ｇａｌ２５、ａｒａ８０ｘｙｌ２０、ａｒａ６０ｘｙｌ４０、ａｒａ５０ｘｙｌ５０、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｍａｎ８０ｇｌｕ２０、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｘｙｌ７５ａｒａ２５、ｇａｌ７５ｘｙｌ２５、Ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｇａｌ７５ｘｙｌ２５、Ｍａｎ６６ｇａｌ３３、Ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ８０ｇａｌ２０、ｇｌｕ６０ｇａｌ４０、ｇｌｕ４０ｇａｌ６０、ｇｌｕ２０ｇａｌ８０、ｇａｌ８０ｍａｎ２０、ｇａｌ６０ｍａｎ４０、ｇａｌ４０ｍａｎ６０、ｇｌｕ８０ｘｙｌ２０、ｇｌｕ６０ｘｙｌ４０、ｇｌｕ４０ｘｙｌ６０、ｇｌｕ２０ｘｙｌ８０、ｇｌｕ８０ａｒａ２０、ｇｌｕ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ４０ａｒａ６０、ｇｌｕ２０ａｒａ８０、ｇａｌ８０ｘｙｌ２０、ｇａｌ６０ｘｙｌ４０、ｇａｌ４０ｘｙｌ６０、ｇａｌ２０ｘｙｌ８０、ｇａｌ８０ａｒａ２０、ｇａｌ６０ａｒａ４０、ｇａｌ４０ａｒａ６０、ｇａｌ２０ａｒａ８０、ｍａｎ８０ｘｙｌ２０、ｍａｎ６０ｘｙｌ４０、ｍａｎ４０ｘｙｌ６０、ｍａｎ２０ｘｙｌ８０、ｍａｎ８０ａｒａ２０、ｍａｎ６０ａｒａ４０、ｍａｎ４０ａｒａ６０、ｍａｎ２０ａｒａ８０、ｘｙｌ８０ａｒａ２０、ｘｙｌ６０ａｒａ４０、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、およびｍａｎ６２ｇｌｕ３８から選択される。
【０１８５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される３つのグリカン単位Ａ、Ｂ、およびＣの混合物を含み、Ａ、Ｂ、およびＣは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じまたは異なる群から選択され得、Ａ、Ｂ、およびＣは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡ、１〜９９％のＢ、および１〜９９％のＣの範囲）で選択され得る。
【０１８６】
例えば、いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、ヘテログリカンｘｙｌ７５ｇｌｕ１２ｇａｌ１２、ｘｙｌ３３ｇｌｕ３３ｇａｌ３３、ｘｙｌ７５ｇｌｕ１２ｇａｌ１２、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｎｍａｎ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｘｙｌ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ｘｙｌ３３、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、Ｇｌｕ３３Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３、Ｇｌｕ３３Ｍａｎ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３、Ｇａｌ３３Ｍａｎ３３Ａｒａ３３、Ｇａｌ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｍａｎ３３Ｘｙｌ３３Ａｒａ３３、Ｇｌｕ９０Ｇａｌ５Ｍａｎ５、Ｇｌｕ８０Ｇａｌ１０Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ６０Ｇａｌ２０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ３０Ｍａｎ３０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ４０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ４５Ｍａｎ４５、Ｇｌｕ５Ｇａｌ９０Ｍａｎ５、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ８０Ｍａｎ１０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ６０Ｍａｎ２０、Ｇｌｕ３０Ｇａｌ４０Ｍａｎ３０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ２０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ４５Ｇａｌ１０Ｍａｎ４５、Ｇｌｕ５Ｇａｌ５Ｍａｎ９０、Ｇｌｕ１０Ｇａｌ１０Ｍａｎ８０、Ｇｌｕ２０Ｇａｌ２０Ｍａｎ６０、Ｇｌｕ３０Ｇａｌ３０Ｍａｎ４０、Ｇｌｕ４０Ｇａｌ４０Ｍａｎ２０、およびＧｌｕ４５Ｇａｌ４５Ｍａｎ１０から選択される。
【０１８７】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される４つのグリカン単位Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤの混合物を含み、Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じまたは異なる群から選択され得、Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＤは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡ、１〜９９％のＢ、１〜９９％のＣ、および１〜９９％のＤの範囲）で選択され得る。
【０１８８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、上のｉ）〜ｖｉｉ）から独立して選択される５つのグリカン単位Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥの混合物を含み、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥは、ｉ）〜ｖｉｉ）の同じまたは異なる群から選択され得、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥは、任意の所望の比率（例えば、１００％を超えない、１〜９９％のＡ、１〜９９％のＢ、１〜９９％のＣ、１〜９９％のＤ、および１〜９９％のＥの範囲）で選択され得る。
【０１８９】
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットが、グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、およびラムノースからなる群から選択される、グリカンポリマーの調製物が提供される。
【０１９０】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、例えば、グルコースおよびガラクトース、グルコースおよびアラビノース、グルコースおよびマンノース、グルコースおよびフルクトース、グルコースおよびキシロース、グルコースおよびフコース、グルコースおよびラムノース、ガラクトースおよびアラビノース、ガラクトースおよびマンノース、ガラクトースおよびフルクトース、ガラクトースおよびキシロース、ガラクトースおよびフコース、ならびにガラクトースおよびラムノース、アラビノースおよびマンノース、アラビノースおよびフルクトース、アラビノースおよびキシロース、アラビノースおよびフコース、ならびにアラビノースおよびラムノース、マンノースおよびフルクトース、マンノースおよびキシロース、マンノースおよびフコース、ならびにマンノースおよびラムノース、フルクトースおよびキシロース、フルクトースおよびフコース、ならびにフルクトースおよびラムノース、キシロースおよびフコース、キシロースおよびラムノース、ならびにフコースおよびラムノースなどの混合物のような、２つの異なる単糖グリカンサブユニットの所望の混合物を、例えば、１：１、１：２、１：３、１：４、または１：５の比率またはそれらの逆比率で、または、１：１、１：２、１：３、１：４、１：５、１：６、１：７、１：８、１：９、１：１０、１：１２、１：１４、１：１６、１：１８、１：２０、１：２５、１：３０、１：３５、１：４０、１：４５、１：５０、１：５５、１：６０、１：６５、１：７０、１：７５、１：８０、１：８５、１：９０、または１：１００の比率またはそれらの逆比率で含む。
【０１９１】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、３つの異なる単糖グリカンサブユニットの所望の混合物、例えば、グルコース含有グリカン調製物については、グルコース、ガラクトース、およびアラビノース；グルコース、ガラクトース、およびマンノース；グルコース、ガラクトース、およびフルクトース；グルコース、ガラクトース、およびキシロース；グルコース、ガラクトース、およびフコース、グルコース、ガラクトース、およびラムノース；グルコース、アラビノース、およびマンノース；グルコース、アラビノース、およびフルクトース；グルコース、アラビノース、およびキシロース；グルコース、アラビノース、およびフコース；グルコース、アラビノース、およびラムノース；グルコース、マンノース、およびフルクトース；グルコース、マンノース、およびキシロース；グルコース、マンノース、およびフコース；グルコース、マンノース  ラムノース；グルコース、フルクトース、およびキシロース；グルコース、フルクトース、およびフコース；グルコース、フルクトース、およびラムノース；グルコース、フコース、およびラムノースなどの混合物等を、例えば、１：１：１、１：２：１、１：３：１、１：４：１、１：５：１、１：１：２、１：２：２、１：３：２、１：４：２、１：１：３、１：２：３、１：３：３、１：１：４、１：２：４、１：１：５、１：２：５等の比率、または、１：１：１、１：２：１、１：３：１、１：４：１、１：５：１、１：６：１、１：７：１、１：８：１、１：９：１、１：１０：１、１：１２：１、１：１４：１、１：１６：１、１：１８：１、１：２０：１、１：１：２、１：２：２、１：３：２、１：４：２、１：５：２、１：６：２、１：７：２、１：８：２、１：９：２、１：１０：２、１：１：３、１：２：３、１：３：３、１：４：３、１：５：３、１：６：３、１：７：３、１：８：３、１：９：３、１：１０：３、１：１：４、１：２：４、１：３：４、１：４：４、１：５：４、１：６：４、１：７：４、１：８：４、１：９：４、１：１０：４、１：１：５、１：２：５、１：３：５、１：４：５、１：５：５、１：６：５、１：７：５、１：８：５、１：９：５、１：１０：５等の比率で含む。
【０１９２】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、Ｎ−アセチルガラクトサミンまたはＮ−アセチルグルコサミンを含まない。いくつかの実施形態では、グリカンの調製物は、シアル酸を含まない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、脂質および脂肪酸を含まない。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、アミノ酸を含まない。
【０１９３】
フラノ―ス：ピラノース
いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがフラノ―ス糖であるグリカンポリマーの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、少なくとも１つのグリカンサブユニットがピラノース糖であるグリカンの調製物が提供される。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーは、フラノ―ス糖およびピラノース糖の混合物を含む。いくつかの実施形態では、調製物中のフラノース糖：ピラノース糖の比率は、約０．１：１、０．２：１、０．３：１、０．４：１、０．５：１、０．６：１、０．７：１、０．８：１、０．９：１、１：１、１．２：１、１．５：１、１．７：１、２：１、２．２：１、２．５：１、２．７：１、３：１、４：１、５：１、もしくは約６：１であり、または調製物中のフラノース糖：ピラノース糖の比率は、約７：１、８：１、９：１、もしくは約１０：１である。
【０１９４】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、実質的にすべてフラノース糖またはピラノース糖を含み、任意選択的に、それぞれ他の糖を約１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、または２０％含む。
【０１９５】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、実質的にすべてピラノース糖を含み、調製物中のフラノース型のグリカン単位は約０．１％、０２％、０．５％、１％、２％、３％、４％未満、または５％未満である。いくつかの実施形態では、調製物中の単量体グリカン単位の３％、２％未満、または１％未満が、フラノース型である。
【０１９６】
塩
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、例えば、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩、メタンスルファート、酢酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、リンゴ酸塩、クエン酸塩、コハク酸塩、乳酸塩、グルコン酸塩、ピルビン酸塩、フマル酸塩、プロピオン酸塩、アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩、安息香酸塩など塩の形態（例えば、薬学的に許容される塩の形態）で存在する１つのグリカンサブユニットまたは複数のグリカンサブユニットを含む。
【０１９７】
誘導体化
必要に応じて、グリカンの単糖類またはオリゴ糖グリカンサブユニットは、さらに置換または誘導体化され、例えば、ヒドロキシル基は、エーテル化またはエステル化され得る。例えば、グリカン（例えば、オリゴまたは多糖類）は、修飾サッカリド単位、例えば、ヒドロキシル基が除去される２’−デオキシリボース、ヒドロキシル基がフッ素と置換される２’−フルオロリボース、またはＮ−アセチルグルコサミン、グルコース（例えば、２’−フルオロリボース、デオキシリボース、およびヘキソース）の窒素含有形態を含有し得る。置換度（ＤＳ、１グリコシル単位当たりのヒドロキシル基の平均数）は、１、２、もしくは３、または別の好適なＤＳであり得る。いくつかの実施形態では、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のグリカンサブユニットが、置換または誘導体化される。いくつかの実施形態では、置換度は、例えば、ある特定の割合では誘導体化されず、１のＤＳを示し、２のＤＳを示し、３のＤＳを示す、サブユニット間で変動する。任意の望ましい混合物を生成することができ、例えば、０〜９９％のサブユニットは、誘導体化されず、０〜９９％のサブユニットは、１のＤＳを示し、０〜９９％のサブユニットは、２のＤＳを示し、０〜９９％のサブユニットは、３のＤＳを示し、合計で１００％になる。置換度は、グリコシル部分に添加される置換基（モル置換（ＭＳ））のモルの平均数を調整することによって制御され得る。グリカンのオリゴ糖または多糖鎖の長さに沿った置換基の分布は、反応条件、試薬のタイプ、および置換の範囲を調整することによって制御され得る。いくつかの実施形態では、単量体のサブユニットは、酢酸エステル、硫酸半エステル、リン酸エステル、またはピルビル環状アセタール基のうちの１つ以上と置換される。
【０１９８】
溶解度
いくつかの実施形態では、調製物中のグリカンポリマーは、高溶解性である。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、２３℃で明らかな固化または結晶化を行わずに（最終溶解限度）、少なくとも５５Ｂｒｉｘ、６５Ｂｒｉｘ、６０Ｂｒｉｘ、６５Ｂｒｉｘ、７０Ｂｒｉｘ、７５Ｂｒｉｘ、８０Ｂｒｉｘ、または少なくとも８５Ｂｒｉｘまで濃縮され得る。いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は、２３℃で明らかな固化または結晶化を行わずに（最終溶解限度）、少なくとも約０．５ｇ／ｍｌ、１ｇ／ｍｌ、１．５ｇ／ｍｌ、２ｇ／ｍｌ、２．５ｇ／ｍｌ、３ｇ／ｍｌ、３．５ｇ／ｍｌ、または少なくとも４ｇ／ｍｌまで濃縮され得る。
【０１９９】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物（例えばオリゴ糖）は、分岐しており、例えば、少なくとも０．０１、０．０５、または０．１の平均ＤＢを有し、かつ、２３℃で少なくとも約７０Ｂｒｉｘ、７５Ｂｒｉｘ、８０Ｂｒｉｘ、または少なくとも約８５Ｂｒｉｘの水中に最終溶解限度を有するか、または少なくとも約１ｇ／ｍｌ、２ｇ／ｍｌ、または少なくとも約３ｇ／ｍｌである。
【０２００】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、脱イオン水中、または好適な緩衝液中、例えば、リン酸緩衝生理食塩水、ｐＨ７．４、または類似の生理学的ｐＨ中、２０℃で、少なくとも０．００１ｇ／Ｌ、０．００５ｇ／Ｌ、０．０１ｇ／Ｌ、０．０５ｇ／Ｌ、０．１ｇ／Ｌ、０．２ｇ／Ｌ、０．３ｇ／Ｌ、０．４ｇ／Ｌ、０．５ｇ／Ｌ、０．６ｇ／Ｌ、０．７ｇ／Ｌ、０．８ｇ／Ｌ、０．９ｇ／Ｌ、１ｇ／Ｌ、５ｇ／Ｌ、１０ｇ／Ｌ、２０ｇ／Ｌ、３０ｇ／Ｌ、４０ｇ／Ｌ、５０ｇ／Ｌ、１００ｇ／Ｌ、２００ｇ／Ｌ、３００ｇ／Ｌ、４００ｇ／Ｌ、５００ｇ／Ｌ、６００ｇ／Ｌ、７００ｇ／Ｌ、８００ｇ／Ｌ、９００ｇ／Ｌ、１０００ｇ／Ｌの最終溶解限度を有する。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、５０％超、６０％超、７０％超、８０％超、９０％超、９５％超、９６％超、９７％超、９８％超、９９％超、または９９．５％を超える溶解性があり、脱イオン水中、または好適な緩衝液中、例えば、リン酸緩衝生理食塩水、ｐＨ７．４、または類似の生理学的ｐＨ中、２０℃で、０．００１ｇ／Ｌ、０．００５ｇ／Ｌ、０．０１ｇ／Ｌ、０．０５ｇ／Ｌ、０．１ｇ／Ｌ、０．２ｇ／Ｌ、０．３ｇ／Ｌ、０．４ｇ／Ｌ、０．５ｇ／Ｌ、０．６ｇ／Ｌ、０．７ｇ／Ｌ、０．８ｇ／Ｌ、０．９ｇ／Ｌ、１ｇ／Ｌ、５ｇ／Ｌ、１０ｇ／Ｌ、２０ｇ／Ｌ、３０ｇ／Ｌ、４０ｇ／Ｌ、５０ｇ／Ｌ、１００ｇ／Ｌ、２００ｇ／Ｌ、３００ｇ／Ｌ、４００ｇ／Ｌ、５００ｇ／Ｌ、６００ｇ／Ｌ、７００ｇ／Ｌ、８００ｇ／Ｌ、９００ｇ／Ｌ、１０００ｇ／Ｌを超える濃度で観察される沈殿物を有しない。
【０２０１】
甘味度
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、所望の甘味度を有する。例えば、スクロース（テーブルシュガー）は、プロトタイプの甘味物質である。溶液中のスクロースは、１の甘味知覚評価を有し、他の物質は、これと比較して評価される（例えば、フルクトースは、スクロースの甘味の１．７倍で評価される）。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物の甘味は、スクロースと比較して、０．１〜５００，０００の範囲に及ぶ。いくつかの実施形態では、相対的甘味は、スクロースと比較して、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、９００、９５０、１０００、２０００、３０００、４０００、５０００、６０００、７０００、８０００、９０００、１００００、２５０００、５００００、７５０００、１０００００、１５００００、２０００００、２５００００、３０００００、３５００００、４００００、４５００００、５０００００、または５００，０００超である（スクロースが１と得点される）。いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物は、軽度に甘さ、または甘さと苦味の両方がある。
【０２０２】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマーの調製物、例えば、実質的に、ＤＰ２＋またはＤＰ３＋である調製物（例えば、ＤＰ２＋またはＤＰ３＋の少なくとも８０％、９０％、または少なくとも９５％、または分画化された調製物）は、実質的に、甘さとして感知できず、相対的な甘味は、スクロースと比較して、約０、０．０００１、０．００１、０．００５、０．０１、０．０５、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７または約０．８である（スクロースが１と得点される）。
【０２０３】
グリカンポリマー調製物は、任意の好適な方法、例えば、参照により本明細書に組み込まれる国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、国際公開第２０１６／００７７７８号パンフレット、および国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレットに記載の方法によってものを含む好適な方法によって特徴付けることができる。
【０２０４】
実施形態では、グリカン組成物およびグリカン調製物は、以下の特性（バルク特性を含む）の１つ以上（例えば、２つ、３つ、４つ、５つ、６つもしくはそれ以上）を含み得る：
ａ）グルコース、ガラクトース、アラビノース、マンノース、フルクトース、キシロース、フコース、またはラムノースの少なくとも１つを含むグリカンポリマー、
ｂ）高重合度（ＤＰ）、例えば、ポリマーの少なくとも約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９８％、９９％は、ＤＰが約３０〜１００，０００、約３０〜５０，０００、約３０〜１０，０００、約３０〜５，０００、約３０〜１，０００、約３０〜５００、約３０〜２００、約３０〜１００、または約３〜５０の範囲である、
ｃ）低重合度、例えば、ポリマーの少なくとも約５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９８％、９９％は、ＤＰが約２〜２９、約２〜２５、約２〜２０、約２〜１５、約２〜１０、約２〜８、約２〜６、約３〜８、または約４〜８の範囲である、
ｄ）例えば、２０℃、水中で、約１００〜１０，０００ｍＰａｓ、１００〜５，０００ｍＰａｓ、１００〜１，０００ｍＰａｓ、１００〜５００ｍＰａｓの範囲である高粘度、
ｅ）例えば、２０℃、水中で、約１〜９９ｍＰａｓ、１〜５０ｍＰａｓ、１〜１０ｍＰａｓ、１〜５ｍＰａｓ、２５〜７５ｍＰａｓ、または１０〜５０ｍＰａｓの範囲である低粘度、
ｆ）２３℃で少なくとも約６０、７０、または少なくとも約７５Ｂｒｉｘの水中における高い最終溶解限度、
ｇ）２３℃で５、１０、２０、３０、４０、５０Ｂｒｉｘ未満の低い水中最終溶解限度、または不溶性（０．１Ｂｒｉｘ未満）、
ｈ）約０．１ｃａｌ／ｇ〜３ｃａｌ／ｇ、０．１ｃａｌ／ｇ〜２ｃａｌ／ｇ、０．１ｃａｌ／ｇ〜１．５ｃａｌ／ｇ、０．１ｃａｌ／ｇ〜１ｃａｌ／ｇ、０．１ｃａｌ／ｇ〜０．５ｃａｌ／ｇのカロリー値、
ｉ）ノンカロリー値（例えば、約０ｃａｌ／ｇ〜０．０９ｃａｌ／ｇ、０ｃａｌ／ｇ〜０．０５ｃａｌ／ｇ、または約０ｃａｌ／ｇ〜０．０１ｃａｌ／ｇ、
ｊ）低消化度、グリカンポリマーの約３０％、２０％、１０％、５％、１％、０．５％未満が、ヒトグルコシラーゼ（例えば、アルファ−アミラーゼ）によって消化可能である、
ｋ）高消化度、グリカンポリマーの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％が、ヒトグルコシラーゼ（例えば、アルファ−アミラーゼ）によって消化可能である、
ｌ）低発酵度、グリカンポリマーの約４０％、３０％、２０％、１０％、５％、１％、０．５％未満が、ヒト（例えば、結腸の）微生物群または単一細菌株により発酵可能である、
ｍ）高発酵度、グリカンポリマーの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％が、ヒト（例えば、結腸の）微生物群または単一細菌株により発酵可能である、
ｎ）遅い発酵速度、グリカンポリマーの約０．５％、１％、２％、５％、１０％、または１５％未満が、ヒト（例えば、結腸の）微生物群または単一細菌株により１２〜２４時間で発酵する、
ｏ）速い発酵速度、グリカンポリマーの少なくとも約１５％、２０％、３０％、４０％、または５０％が、ヒト（例えば、結腸の）微生物群または単一細菌株により１２〜２４時間で発酵する、
ｐ）消化器の高い耐性度（例えば、対象が、高い１日服用量、例えば、少なくとも約５ｇ／日、１０ｇ／日、１５ｇ／日、２０ｇ／日、３０ｇ／日、４０ｇ／日、５０ｇ／日、６０ｇ／日、または７０ｇ／日を、膨満感、過剰なガス、ＧＩの不快感、下痢、便秘などの実質的な副作用を生じることなく、許容する）。
【０２０５】
本明細書に記載のグリカン組成物は、１つ以上の糖および／または糖アルコールを含み得る。組成物は、単糖（例えば、単糖、二糖、三糖、四糖または五糖）、糖アルコール、またはそれらの任意の組み合わせを含み得る。いくつかの実施形態では、組成物は、代謝可能な糖または代謝可能な糖アルコールを含み、糖または糖アルコールは、宿主の消化管において代謝される。国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット（これは参照により本明細書に組み込まれる）に開示される糖および糖アルコールは、本明細書に記載される方法および組成物における使用に好適である。実施形態では、本明細書中に記載の組成物、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物は、例えば、本明細書、および参照により本明細書に組み込まれる国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット、および表７に記載されるような、ポリフェノール、脂肪酸（例えば、短鎖脂肪酸）、アミノ酸、ペプチド、および微量栄養素を含み得る。
【０２０６】
【表１５】
2019527213.tif 000016
【０２０７】
【表１６】
2019527213.tif 000017
【０２０８】
プロバイオティクス
実施形態では、本明細書中に記載の組成物、例えば本明細書に記載のグリカン組成物は、共生もしくはプロバイオティクス細菌分類群、例えば、表４〜６に記載されている細菌、および一般に安全と認められる（ＧＲＡＳ）細菌、または既知の共生もしくはプロバイオティクス微生物を含み得る。実施形態では、本明細書に記載の組成物、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物は、表１〜３に記載の細菌分類群を含み得る。いくつかの実施形態では、プロバイオティクスもしくは共生細菌分類群（またはその調製物）は、グリカン調製物を受容する対象に投与され得る。
【０２０９】
いくつかの実施形態では、組成物は、少なくとも約１％（ｗ／ｗ）のプロバイオティクスもしくは共生細菌またはその組み合わせ（例えば、少なくとも約２％、約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％、もしくはそれ以上）をさらに含む。
【０２１０】
プロバイオティクス微生物はまた、グリカン組成物中に含まれてもよいし、本明細書に記載されるグリカン組成物と組み合わせて使用されてもよい。プロバイオティクス微生物は、プロバイオティクスとも呼ばれる。プロバイオティクスには、発酵中にプロバイオティクス微生物によって生成される代謝産物が含まれ得る。これらの代謝産物は、発酵培地、例えば、宿主生物（例えば、対象）に放出され得、または微生物内に保存され得る。プロバイオティクス微生物には、例えば、治療用量で投与された場合に、宿主動物に有益な機能を果たす、細菌、細菌ホモジネート、細菌タンパク質、細菌抽出物、細菌発酵上清、およびそれらの組み合わせが含まれる。
【０２１１】
有用なプロバイオティック微生物には、少なくとも１つの乳酸および／または酢酸および／またはプロピオン酸を産生する細菌、例えば、グルコースおよびラクトースなどの炭水化物を分解することによって乳酸および／または酢酸および／またはプロピオン酸を産生する微生物が含まれる。好ましくは、プロバイオティクス微生物は乳酸菌である。実施形態では、乳酸菌には、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、リューコノストック属（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ）、ペディオコッカス属（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、およびビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）の菌が含まれる。好適なプロバイオティクス微生物にはまた、宿主の腸内微生物バランスを改善することによって宿主に有益な影響を与える他の微生物、例えば、以下に限定はされないが、サッカロミセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、デバリオミセス属（Ｄｅｂａｒｏｍｙｃｅｓ）、カンジダ属（Ｃａｎｄｉｄａ）、ピチア属（Ｐｉｃｈｉａ）、およびトルロプシス属（Ｔｏｒｕｌｏｐｓｉｓ）などの酵母、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、リゾプス属（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ）、ムコール属（Ｍｕｃｏｒ）、およびペニシリウム属（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、およびトルロプシス属（Ｔｏｒｕｌｏｐｓｉｓ）などのカビ、ならびに、以下に限定はされないが、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、メリソコッカス属（Ｍｅｌｉｓｓｃｏｃｃｕｓ）、プロピオニバクテリウム属（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、ペディオコッカス属（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）、ミクロコッカス属（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ）、リューコノストック属（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ）、ワイセラ属（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ）、アエロコッカス属（Ａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）およびオエノコッカス属（Ｏｅｎｏｃｏｃｃｕｓ）などの他の細菌、そしてこれらの組み合わせが含まれ得る。
【０２１２】
本明細書における開示において有用な乳酸菌の非限定的な例には、ストレプトコッカス・ラクティス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・クレモリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ストレプトコッカス・ジアセチラクティス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｄｉａｃｅｔｙｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ブルガリカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ヘルベティカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・ビフィダス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｉｆｉｄｕｓ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌａｃｔｉｓ）、ラクトバチルス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトバチルス・ラムノーサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・デルブレッキィ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｌｂｒｕｅｋｉｉ）、ラクトバチルス・サーモフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ファーメンティイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔｉｉ）、ラクトバチルス・サリバリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐａｒａｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・ブレビス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｒｅｖｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、ビフィドバクテリウム・インファンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ビフィダム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍ）、ビフィドバクテリウム・アニマーリス（Ｂｉｆｉｄｏｂｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ラクティス（Ｂｉｆｉｄｏｂｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ブレーベ（Ｂｉｆｉｄｏｂｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ）、ビフィドバクテリウム・アドレスセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂｃｔｅｒｉｕｍ  ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）およびペディオコッカス・セレビシアエ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、ならびにこれらの組み合わせ、特に、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）およびその組み合わせの菌株が含まれる。
【０２１３】
本開示において特に有用なプロバイオティクス微生物は、（ヒト投与のために）ヒト起源のもの（または、プロバイオティクス微生物が投与される哺乳動物起源のもの）であり、宿主に対して非病原性であり、技術的プロセスに耐え（すなわち、処理中および送達手段中で生存および活性を維持することができ）、胃内酸度および胆汁毒性に対して抵抗性があり、腸上皮組織に付着し、消化管にコロニーを形成する能力を有し、抗微生物物質を産生し、宿主における免疫応答を調節し、かつ代謝活性（例えば、コレステロール同化、ラクターゼ活性、ビタミン産生）に影響を及ぼすものが含まれる。
【０２１４】
プロバイオティクス微生物は、単一の株または複数の株の組み合わせとしてグリカン調製物に含まれ得、ここで、プロバイオティクス微生物の用量中の細菌の総数は、１用量あたり、約１×１０３〜約１×１０１４、または約１×１０〜約１×１０１２、または約１×１０７〜約１×１０１１ＣＦＵである。
【０２１５】
プロバイオティクス微生物は、生きているが、「仮死」または傾眠状態にある間に、グリカン調製物に組み込むことができる。一旦凍結乾燥されると、プロバイオティクス微生物の生培養物は、培養物を再び生き返らせる水分への曝露を最小限に抑えるように取り扱われる。なぜなら、一旦生き返らせると、培養物は高水分の環境または培地中ですぐに培養されない限り、高い罹患率を経験し得るからである。さらに、培養物は、高温（特に、湿気の存在下）に曝露される可能性を低減して罹患率を減少させるように取り扱われる。
【０２１６】
プロバイオティクス微生物は、乾燥した粉末の形態で使用することができる。プロバイオティクス微生物はまた、グリカン調製物で、またはグリカン調製物と同時に、または異なる時間に投与される別個のグリカン調製物で投与することができる。
【０２１７】
プロバイオティクスの例には、以下に限定はされないが、腸内病原体を阻害することが報告されている有機酸（乳酸および酢酸）、過酸化水素、およびバクテリオシンを産生することによって腸内微生物叢の健全なバランスを維持すると考えられているラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）またはビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）由来のものなどの、結腸を酸性化するものが含まれる。
【０２１８】
使用可能な他のラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）の細菌には、以下に限定はされないが、Ｌ．クリスパータス（Ｌ．Ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、Ｌ．カゼイ（Ｌ．ｃａｓｅｉ）、Ｌ．ラムノーサス（Ｌ．ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、Ｌ．ロイテリー（Ｌ．ｒｅｕｔｅｒｉ）、Ｌ．ファーメンタム（Ｌ．ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、Ｌ．プランタルム（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．スポロゲネス（Ｌ．ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ）、およびＬ．ブルガリカス（Ｌ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）が含まれる。グリカン組成物に好適な他のプロバイオティクス細菌には、ビフィドバクテリウム・ラクティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｉｓ）、Ｂ．アニマーリス（Ｂ．ａｎｉｍａｌｉｓ）、Ｂ．ビフィダム（Ｂ．ｂｉｆｉｄｕｍ）、Ｂ．ロングム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）、Ｂ．アドレスセンティス（Ｂ．ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、およびＢ．インファンティス（Ｂ．ｉｎｆａｎｔｉｓ）が含まれる。
【０２１９】
実施形態では、本明細書に記載の組成物において、および／または組成物と組み合わせて使用することができる共生微生物分類群は、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロコッカス属（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）（例えば、ビフィドバクテリウム・ラクティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｉｓ、）、Ｂ．アニマーリス（Ｂ．ａｎｉｍａｌｉｓ）、Ｂ．ビフィダム（Ｂ．ｂｉｆｉｄｕｍ）、Ｂ．ロングム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）、Ｂ．アドレスセンティス（Ｂ．ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、Ｂ．ブレーベ（Ｂ．ｂｒｅｖｅ）、およびＢ．インファンティス（Ｂ．ｉｎｆａｎｔｉｓ））、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリネバクテリウム属（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィネゴルディア属（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）（例えば、Ｌ．アシドフィラス（Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．ヘルベティカス（Ｌ．ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ）、Ｌ．ビフィダス（Ｌ．ｂｉｆｉｄｕｓ）、Ｌ．ラクティス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ）、Ｌ．ファーメンティイ（Ｌ．ｆｅｒｍｅｎｔｉｉ）、Ｌ．サリバリウス（Ｌ．ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、Ｌ．パラカゼイ（Ｌ．ｐａｒａｃａｓｅｉ）、Ｌ．ブレビス（Ｌ．ｂｒｅｖｉｓ）、Ｌ．デルブレッキィ（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｋｉｉ）、Ｌ．サーモフィラス（Ｌ．ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｅｓ）、Ｌ．クリスパータス（Ｌ．ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、Ｌ．カゼイ（Ｌ．ｃａｓｅｉ）、Ｌ．ラムノーサス（Ｌ．ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、Ｌ．ロイテリー（Ｌ．ｒｅｕｔｅｒｉ）、Ｌ．ファーメンタム（Ｌ．ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、Ｌ．プランタルム（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．スポロゲネス（Ｌ．ｓｐｏｒｏｇｅｎｅ）およびＬ．ブルガリカス（Ｌ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ））、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトニフィラス属（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ブドウ球菌属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ならびに／またはストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）（例えば、Ｓ．ラクティス（Ｓ．ｌａｃｔｉｓ）、Ｓ．クレモリス（Ｓ．ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、Ｓ．ジアセチラクティス（Ｓ．ｄｉａｃｅｔｙｌａｃｔｉｓ）、Ｓ．サーモフィラス（Ｓ．ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｅｓ））を含む。
【０２２０】
実施形態では、本明細書に記載の組成物において、および／または組成物と組み合わせて使用することができる共生細菌分類群、例えば、ＧＲＡＳ株は、バチルス・コアグランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｏａｇｕｌａｎｓ）ＧＢＩ−３０、６０８６；ビフィドバクテリウム・アニマーリス  亜種  ラクティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ  ｓｕｂｓｐ．Ｌａｃｔｉｓ）ＢＢ−１２；ビフィドバクテリウム・ブレーベ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ）ヤクルト；ビフィドバクテリウム・インファンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｎｆａｎｔｉｓ）３５６２４；ビフィドバクテリウム・アニマーリス  亜種  ラクティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｎｉｍａｌｉｓ  ｓｕｂｓｐ．Ｌａｃｔｉｓ）ＵＮＯ  １９（ＤＲ１０）；ビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）ＢＢ５３６；大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）Ｍ−１７；大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）Ｎｉｓｓｌｅ  １９１７；ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）ＤＤＳ−１；ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）ＬＡ−５；ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）ＮＣＦＭ；ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）ＤＮ  １１４−００１｛ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）Ｉｍｍｕｎｉｔａｓ／Ｄｅｆｅｎｓｉｓ）；ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）ＣＲＬ４３１；ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）Ｆ１９；ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐａｒａｃａｓｅｉ）Ｓｔｌ  ｌ（またはＮＣＣ２４６１）；ラクトバチルス・ジョンソニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ）Ｌａｉ（ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）ＬＣＩ、ラクトバチルス・ジョンソニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ）ＮＣＣ５３３））；ラクトバチルス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔｉｓ）Ｌ１Ａ；ラクトバチルス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ）２９９Ｖ；ラクトバチルス・ロイテリー（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ）ＡＴＴＣ  ５５７３０（ラクトバチルス・ロイテリー（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ）ＳＤ２１１２）；ラクトバチルス・ラムノーサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）ＡＴＣＣ  ５３０１３；ラクトバチルス・ラムノーサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）ＬＢ２１；サッカロミセス・セレビシアエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）｛ブラウディ（ｂｏｕｌａｒｄｉｉ））ｌｙｏ；ラクトバチルス・ラムノーサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）ＧＲ−１およびラクトバチルス・ロイテリー（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉ）ＲＣ−１４の混合物；ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）ＮＣＦＭおよびビフィドバクテリウム・ラクティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｉｓ）ＢＢ−１２もしくはＢＬ−０４の混合物；ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）ＣＬ１２８５およびラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）の混合物；およびラクトバチルス・ヘルベティカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ）Ｒ００５２、ラクトバチルス・ラムノーサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）Ｒ００１１、および／もしくはラクトバチルス・ラムノーサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）ＧＧ（ＬＧＧ）の混合物を含む。
【０２２１】
シンバイオティクス
本明細書では、微生物の組み合わせ（例えば、細菌分類群）が、例えば、その微生物が増殖の基質として利用することができる、本明細書に開示のグリカン組成物と共に提供される。外因的に導入された微生物、例えば、表１〜表３に記載されているものなどは、多くの有益な効果を提供することができる。これは、（グリカンを用いて）微生物の増殖を促進し、それによって微生物がコロニー形成部位で他の細菌を成長させることによって起こり得る。
【０２２２】
本明細書で提供される方法は、１つ以上（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上など）の細菌分類群、例えば、表１〜３または表４〜６に列挙されるような細菌分類群を、グリカン組成物と組み合わせて対象に投与することを含む。このような組み合わせは、特定の細菌分類群を増加、抑制、および／または改変し得る。本明細書においては、本明細書に記載の外因性物質の処理を調節する方法であって、１つ以上（例えば、１つ以上、２つ以上、３つ以上、４つ以上など）の細菌分類群を、本明細書に方法が提供される。対象には、抗生物質を服用した、服用している、または服用しようとしている対象が含まれ得る。対象には、抗生物質を服用していない、または服用したことがない対象が含まれ得る。
【０２２３】
プレバイオティクス
いくつかの実施形態では、グリカン組成物はプレバイオティクス物質を含む。いくつかの実施形態では、プレバイオティクスは、グリカン調製物を受容する対象に投与され得る。プレバイオティクスは、摂取されると、腸内の限られた数の常在細菌の好ましい増殖または活性を選択的に刺激することによって、宿主に有益な生理学的効果をもたらし得る、宿主に実質的に消化されない物質である（Ｇｉｂｓｏｎ  Ｇ  Ｒ，Ｒｏｂｅｒｆｒｏｉｄ  Ｍ  Ｂ．Ｊ  Ｎｕｔｒ．（１９９５）１２５：１４０１−１２．）。食物繊維またはプレバイオティクスオリゴ糖（例えば、結晶性セルロース、コムギふすま、オートムギふすま、トウモロコシ繊維、ダイズ繊維、ビート繊維など）などのプレバイオティクスは、さらに、発酵可能な量の炭水化物を細菌に供給し、それらの微生物集団（例えば、乳酸菌とビフィズス菌）の消化管内のレベルを増加させることによって、腸内でのプロバイオティクス細菌および／または共生細菌の増殖を促進し得る。
【０２２４】
プレバイオティクスとしては、様々なガラクタンおよび炭水化物系ガム、例えば、オオバコ、グアー、カラギーン、ジェラン、ラクツロース、およびコンニャク等が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、プレバイオティクスは、ガラクトオリゴ糖（ＧＯＳ）、ラクツロース、ラフィノース、スタキオース、ラクトスクロース、フルクト−オリゴ糖（ＦＯＳ、例えば、オリゴフルクトースまたはオリゴフルクタン）、イヌリン、イソマルト−オリゴ糖、キシロ−オリゴ糖（ＸＯＳ）、パラチノースオリゴ糖、イソマルトースオリゴ糖（ＩＭＯＳ）、トランスガラクトシル化オリゴ糖（例えば、トランスガラクト−オリゴ糖）、トランスガラクトシル化二糖類、大豆オリゴ糖（例えば、大豆オリゴ糖）、キトサンオリゴ糖（チオセス）、ゲンチオオリゴ糖、大豆およびペクチン性オリゴ糖、グルコオリゴ糖、ペクチンオリゴ糖、パラチノース重縮合物、ジフルクトース無水物ＩＩＩ、ソルビトール、マルチトール、ラクチトール、ポリオール、ポリデキストロース、直鎖および分岐鎖デキストラン、プララン（ｐｕｌｌａｌａｎ）、ヘミセルロース、還元パラチノース、セルロース、ベータ−グルコース、ベータ−ガラクトース、ベータ−フルクトース、ベルバスコース、ガラクチノール、キシラン、イヌリン、キトサン、ベータ−グルカン、グアーガム、アラビアゴム、ペクチン、高アルギン酸ナトリウム、およびラムダカラゲナン、またはこれらの混合物のうち１つ以上を含む。
【０２２５】
プレバイオティクスは、特定の食品、例えば、チコリー根、キクイモ、タンポポの若葉、ニンニク、リーク、タマネギ、アスパラガス、コムギふすま、小麦粉、バナナ、ミルク、ヨーグルト、モロコシ、ゴボウ、ブロッコリー、芽キャベツ、キャベツ、カリフラワー、カラードグリーン、ケール、ラディシュ、およびルタバガ、およびミソに見出すことができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のマイクロバイオーム調節剤は、プレバイオティクスに富む食品を含む食事と共に対象に投与される。可溶性および不溶性繊維の好適な供給源は、商業的に入手可能である。
【０２２６】
いくつかの実施形態では、グリカン組成物は、少なくとも約１％（ｗ／ｗ）のプレバイオティクス物質（例えば、少なくとも約２％、約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％、もしくはそれ以上）を含む。実施形態では、グリカン組成物は、ＦＯＳを含む。実施形態では、グリカン組成物は、ラクツロースを含む。
【０２２７】
細菌集団の変化は、「プレバイオティック指数」によって測定することができる。プレバイオティクス指数は、ビフィズス菌、真正細菌および乳酸菌の増殖速度の増加を正の効果とみなし、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、バクテリオデス（ｂａｃｔｅｒｉｏｄｅｓ）、硫酸塩還元細菌、および大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）の増加を負の効果とみなす。プレバイオティクス指数（ＰＩ）は、（ビフィズス菌／全細菌）＋（乳酸菌／全細菌）−（バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）／全細菌）−（クロストリジウム菌／全細菌）の合計をいう（Ｐａｌｆｒａｍａｎ  ｅｔ  ａｌ，２００３，Ｌｅｔｔ  Ａｐｐｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  ３７：２８１−２８４を参照）。実施形態では、対象へのグリカン組成物の投与は、プレバイオティクス指数の増加をもたらし得る。対象へのグリカン組成物の投与は、以下の増加をもたらし得る：バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、乳酸菌、クリステンセネラ・ミヌタ（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａ  ｍｉｎｕｔａ）、またはクリステンセネラ科（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）。
【０２２８】
いくつかの実施形態では、グリカン組成物は、抗生物質、抗真菌剤、抗ウイルス剤、または抗炎症剤（例えば、サイトカイン、ホルモンなど）を含む。
【０２２９】
いくつかの実施形態では、グリカン組成物は、薬物などの第２の治療剤またはその調製物をさらに含む。
【０２３０】
例えば、第２の治療剤は抗癌剤である。抗癌剤の例には、チェックポイント阻害剤（例えば、抗ＰＤ−１、抗ＰＤ−Ｌ１、抗ＣＴＬＡ４、抗ＴＩＭ−３、抗ＬＡＧ−３など）、ワクチン（例えば、自己癌ワクチン、同種癌ワクチン、新抗原癌ワクチン、共有抗原癌ワクチン（例えば、ＮＹ−ＥＳＯ−１）、標的キナーゼ阻害剤（例えば、メシル酸イマチニブ、イブルチニブ、ネラチニブ、パルポシクリブ、エルロチニブ、ラパチニブなど）、抗体（例えば、ベバシズマブ、トラスツズマブ、リツキシマブ、セツキシマブなど）、化学療法薬（例えば、イリノテカン、５−フルオロウラシル、レナリドミド、カペシタビン、ドセタキセルなど）、抗体−薬物複合体（例えば、トラスツズマブ  エムタンシン）、および本明細書の他の箇所で言及する他の抗癌薬が含まれる。
【０２３１】
例えば、第２の治療剤は、疼痛管理薬である。いくつかの実施形態では、疼痛管理薬は、例えば、コデイン、フェンタニル、ヒドロコドン、ヒドロコドン／アセトアミノフェン、ヒドロモルホン、メペリジン、メタドン、モルヒネ、オキシコドン、オキシコドンおよびアセトアミノフェン、またはオキシコドンおよびナロキソンなどのオピオイドである。他の実施形態では、疼痛管理薬は、例えば、アセトアミノフェン、またはアスピリンおよびイブプロフェンなどの非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤ）などの非オピオイドである。
【０２３２】
例えば、第２の治療剤は、強心配糖体、スルホンアミド（サルファ剤）、ヌクレオシドアナログ、またはアミノサリチル酸塩である。
【０２３３】
いくつかの実施形態では、強心配糖体は、ジゴキシン、ジギトキシン、コンバラトキシン、アンチアリン、またはオレアンドリンである。
【０２３４】
いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、抗微生物剤、例えば、短時間作用型抗微生物剤、例えば、スルファフラゾール、スルファセタミド、スルファジアジン、スルファジミジン、スルファフラゾール（スルフイソキサゾール）、スルフイソミジン（スルファイソジミジン）である。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、抗微生物剤、例えば、中間時間作用型微生物、例えば、スルファドキシン、スルファメトキサゾール、スルファモキソール、またはスルファニトランである。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、抗微生物剤、例えば、長時間作用型抗微生物剤、例えば、スルファジメトキシン、スルファメトキシピリダジン、またはスルファメトキシジアジンである。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、抗微生物剤、例えば、超長時間作用型抗微生物剤、例えば、スルファドキシン、スルファメトピラジン、またはテレフチルである。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、スルホニル尿素、例えば、抗糖尿病薬、例えば、アセトヘキサミド、カルブタミド、クロルプロタミド、グリベンクラミド（グリブリド）、グリボルヌリド、グリクラジド、グリクロピラミド、グリメピリド、グリピジド、グリキドン、グリソキセピド、トラザミド、またはトルブタミドである。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、利尿剤、例えば、アセタゾールアミド、ブメタニド、クロルタリドン、クロパミド、フロセミド、ヒドロクロロチアジド、インダパミド、メフルシド、メトラゾン、またはキシパミドである。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、鎮痙剤、例えば、エトキシゾラミド、スルチアム、トピラメート、またはゾニサミドである。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、抗レトロウイルス薬、例えば、アンプレナビル（ＨＩＶプロテアーゼ阻害薬）、ダルナビル（ＨＩＶプロテアーゼ阻害薬）、デラビルジン（非ヌクレオシド逆転写酵素阻害薬）、ホスアンプレナビル（ＨＩＶプロテアーゼ阻害薬）、またはチプラナビル（ＨＩＶプロテアーゼ阻害薬）である。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、Ｃ型肝炎抗ウイルス薬、例えば、アスナプレビル（ＮＳ３／４Ａプロテアーゼ阻害薬）、ベクラブビル（ＮＳ５Ｂ  ＲＮＡポリメラーゼ阻害薬）、ダサブビル（ＮＳ５Ｂ  ＲＮＡポリメラーゼ阻害薬）、グラゾプレビル（ＮＳ３／４Ａプロテアーゼ阻害薬）、パリタプレビル（ＮＳ３／４Ａプロテアーゼ阻害薬）、またはシメプレビル（ＮＳ３／４Ａプロテアーゼ阻害薬）である。いくつかの実施形態では、スルホンアミド（サルファ剤）は、例えば、アプリコキシブ（ＣＯＸ−２阻害薬）、ボセンタン（エンドセリン受容体拮抗薬）、ブリンゾラミド（緑内障に対する炭酸脱水酵素阻害薬）、セレコキシブ（ＣＯＸ−２阻害薬）、ドフェチリド（クラスＩＩＩ抗不整脈薬）、ドルゾラミド（抗緑内障炭酸脱水酵素阻害薬）、ドロネダロン（クラスＩＩＩ抗不整脈薬）、イブチリド（クラスＩＩＩ抗不整脈薬）、パレコキシブ（ＣＯＸ−２阻害薬）、プロベネシド（尿酸尿症）、ソタロール（β遮断薬）、スルファサラジン（抗炎症薬およびＤＭＡＲＤ）、スマトリプタン（抗片頭痛トリプタン）、タムスロシン（α遮断薬）またはウデナフィル（ＰＤＥ５阻害薬）である。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、デオキシアデノシンアナログ、例えば、ジダノシン（ｄｄＩ）（ＨＩＶ）またはビダラビン（抗ウイルス薬）である。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、アデノシンアナログ（例えば、ＢＣＸ４４３０（エボラ））である。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、デオキシシチジンアナログ、例えば、シタラビン（化学療法）、ゲムシタビン（化学療法）、エムトリシタビン（ＦＴＣ）（ＨＩＶ）、ラミブジン（３ＴＣ）（ＨＩＶ、Ｂ型肝炎）、またはザルシタビン（ｄｄＣ）（ＨＩＶ）である。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、グアノシンまたはデオキシグアノシンアナログ、例えば、アバカビル（ＨＩＶ）、アシクロビル、またはエンテカビル（Ｂ型肝炎）である。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、チミジンまたはデオキシチミジンアナログ、例えば、スタブジン（ｄ４Ｔ）、テルビブジン（Ｂ型肝炎）、またはジドブジン（アジドチミジンもしくはＡＺＴ）（ＨＩＶ）である。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、デオキシウリジンアナログ、例えば、イドクスウリジンまたはトリフルリジンである。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、ピリミジンアナログ、例えば、５−フルオロウラシル（５ＦＵ）、シタラビン（シトシンアラビノシド）、または６−アザウラシル（６−ＡＵ）である。いくつかの実施形態では、ヌクレオシドアナログは、プリンアナログ、例えば、アザチオプリン、メルカプトプリン、チオプリン、フルダラビン、またはペントスタチンである。いくつかの実施形態では、アミノサリチル酸塩は、４−アミノサリチル酸、バルサラジド、オルサラジン、スルファサラジン、またはメサラジン（５−アミノサリチル酸）である。
【０２３６】
例えば、第２の治療剤は、抗増殖剤、抗新生物薬、または抗腫瘍剤もしくは抗腫瘍治療である。いくつかの実施形態では、このような薬物または治療には、化学療法薬、例えば、細胞毒性薬（例えば、アルキル化剤、代謝拮抗薬、抗腫瘍抗生物質、トポイソメラーゼ阻害薬、有糸分裂阻害薬、コルチコステロイド）；チロシンキナーゼ阻害薬およびプロテアソーム阻害薬などの癌増殖阻害薬；Ｌ−アスパラギナーゼおよびボルテゾミブ（Ｖｅｌｃａｄｅ（登録商標））、抗癌剤、例えば、チェックポイント阻害剤（例えば、抗ＰＤ−１、抗ＰＤ−Ｌ１、抗ＣＴＬＡ４、抗ＴＩＭ−３、抗ＬＡＧ−３など）などの他の化学薬物；ワクチン（例えば、自己癌ワクチン、同種癌ワクチン、新抗原癌ワクチン、共有抗原癌ワクチン（例えば、ＮＹ−ＥＳＯ−１）など）；標的キナーゼ阻害剤（例えば、メシル酸イマチニブ、イブルチニブ、ネラチニブ、パルポシクリブ、エルロチニブ、ラパチニブなど）；または抗体（例えば、ベバシズマブ、トラスツズマブ、リツキシマブ、セツキシマブなど）が含まれる。ホルモン療法（または、抗ホルモン療法）は、例えば、ホルモン感受性癌に使用され得る。
【０２３７】
例えば、第２の治療剤は、下痢を誘発することが知られている薬物、または便秘を誘発することが知られている薬物である。いくつかの実施形態では、下痢を誘発することが知られている薬物には、５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）、メトトレキサート、イリノテカン、タキサン、モノクローナル抗体、およびホルモン剤が含まれる。いくつかの実施形態では、便秘を誘発することが知られている薬物には、ビンカアルカロイド、白金（例えば、シスプラチン）、サリドマイドおよびホルモン剤が含まれる。
【０２３８】
医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、食品成分、および単位剤形
本明細書においては、グリカン組成物を含む医薬組成物が提供される。さらに、本明細書においては、グリカン組成物を含む医療用食品が提供される。またさらに、本明細書においては、グリカン組成物を含む栄養補助食品が提供される。またさらに、本明細書においては、グリカン組成物を含む食品成分が提供される。
【０２３９】
任意選択的に、組成物は、以下のうちの１つ以上を含む：ｉ）例えば、食物繊維などのプレバイオティクス物質；ｉｉ）例えば、プロバイオティクス細菌などの細菌分類群；ｉｉｉ）例えば、ビタミン、ミネラルまたはポリフェノール化合物などの微量栄養素；ｉｖ）例えば、抗癌剤、疼痛管理薬、治療の副作用を管理する薬物、代謝を管理する薬物、抗炎症薬、または抗微生物剤。
【０２４０】
本明細書中に記載される方法および組成物における使用に好適な医薬組成物、医療用食品、栄養補助食品、および単位剤形は、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、および国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット（これらは、参照により本明細書に組み込まれる）に見出すことができる。
【０２４１】
いくつかの実施形態では、グリカン組成物はプレバイオティクス物質を含有しない。いくつかの実施形態では、グリカン組成物はプロバイオティクス細菌を含有しない。
【０２４２】
いくつかの実施形態では、グリカン組成物は、本明細書に記載のグリカン調製物の１つ以上を含む。
【０２４３】
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物は、任意の好適な剤形、例えば、経鼻、経口、直腸または胃内投与用に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるグリカンポリマー調製物は、経腸投与用に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるグリカンポリマー調製物は、経管栄養（経鼻胃管、経口胃管または胃管栄養）用に製剤化され得る。本明細書に記載の剤形は、当業者に知られている方法を用いて製造することができる。
【０２４４】
剤形は、例えば、液体（洗浄／すすぎ）、ゲル、クリーム、軟膏、粉末、錠剤、丸剤、カプセル剤、保管所、使い捨てアプリケータ、または医療デバイス（例えば、シリンジ）の形態で、グリカンポリマー調製物を入れる任意の個々の容器などのパケットであってよい。例えば、グリカンポリマー調製物の単位剤形を含む容器、およびそのようなグリカンポリマーの使用説明書を含むラベルなどの製品も提供される。
【０２４５】
経口的に使用できる組成物の形態には、錠剤、ゼラチン製の押し込み型カプセル剤、ならびにゼラチンおよび可塑剤（例えば、グリセロールまたはソルビトール）製の軟質密封カプセル剤が含まれる。錠剤は、場合により１つ以上の副成分と共に、圧縮または成形によって製造することができる。圧縮錠剤は、粉末または顆粒などの自由流動形態の活性成分を、任意選択により、結合剤（例えば、ポビドン、ゼラチン、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、不活性希釈剤、防腐剤、酸化防止剤、崩壊剤（例えば、デンプングリコール酸ナトリウム、架橋ポビドン、架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム）、または滑沢剤、界面活性剤もしくは分散剤と混合して、好適な機械で圧縮することにより調製することができる。成形錠剤は、不活性な液体希釈剤で湿らせた粉末化合物の混合物を好適な機械で成形することによって製造することができる。錠剤は、任意選択により、コーティングまたは刻み目を付けることができ、その中の活性成分の徐放または制御放出を提供するように製剤化することができる。錠剤は、任意選択により、腸の一部（例えば、結腸、腸管下部）における放出を提供するために、腸溶コーティングを設けることができる。経口投与のためのすべての製剤は、そのような投与に好適な用量であり得る。押し込み型カプセルは、活性成分を、ラクトースなどのフィラー、澱粉などの結合剤および／またはタルクもしくはステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤、および任意選択により安定剤と混合して含有することができる。軟カプセル剤では、活性化合物および／または他の薬剤（例えば、プレバイオティクスまたはプロバイオティクス）は、脂肪油、流動パラフィン、または液体ポリエチレングリコールなどの好適な液体に溶解または懸濁することができる。さらに、安定剤を添加することができる。糖衣錠コアは好適なコーティングを備える。この目的のために、濃縮された糖溶液が使用され得、これは、任意選択により、アラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポールゲル、ポリエチレングリコール、または二酸化チタン、ラッカー溶液、および好適な有機溶媒または溶媒混合物を含み得る。活性化合物用量の異なる組み合わせを識別するため、または特徴付けるために、錠剤または糖衣錠コーティングに、染料または色素を添加することができる。
【０２４６】
経口使用のための製剤はまた、活性成分が不活性な固体希釈剤、例えば炭酸カルシウム、リン酸カルシウムまたはカオリンと混合される硬質ゼラチンカプセルとして、あるいは活性成分がポリエチレングリコールなどの水溶性担体、または油媒体、例えばピーナッツ油、流動パラフィンもしくはオリーブ油と混合される軟質ゼラチンカプセルとして提供され得る。
【０２４７】
一実施形態では、提供されるグリカンポリマー調製物は、ソフトゲル製剤を含む。ソフトゲルは、液体充填物を取り囲むゼラチンベースのシェルを含むことができる。シェルは、ゼラチン、可塑剤（例えば、グリセリンおよび／またはソルビトール）、改質剤、水、着色剤、酸化防止剤、または香料から作ることができる。シェルは、デンプンまたはカラゲナンで作ることができる。外層は腸溶コーティングすることができる。一実施形態では、ソフトゲル製剤は、水または油溶性充填溶液、またはゼラチン層によって覆われた組成物の懸濁液を含むことができる。
【０２４８】
経口使用のための固体製剤は、腸溶コーティングを含み得、これはグリカンポリマー調製物が消化系で吸収される位置を制御し得る。例えば、腸溶コーティングは、グリカンポリマー調製物が胃内で溶解せず、むしろ小腸に移動し、そこで溶解するように設計することができる。腸溶コーティングは、低ｐＨ（例えば、胃内など）で安定であり、より高いｐＨ（例えば、小腸内）で溶解することができる。腸溶コーティングに使用できる材料には、例えば、アルギン酸、酢酸フタル酸セルロース、プラスチック、蝋、シェラック、および脂肪酸（例えば、ステアリン酸、パルミチン酸）が含まれる。
【０２４９】
経口使用のための製剤はまた、液体剤形で提供され得る。液体調製物は例えば、水性または油性の懸濁液、溶液、エマルション、シロップまたはエリキシルの形態であり得るか、または使用前に水または他の好適なビヒクルで再構成する乾燥製品として提供され得る。このような液体調製物は、懸濁化剤、例えば、ソルビトール、メチルセルロース、グルコースシロップ、ゼラチン、ヒドロキシエチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ステアリン酸アルミニウムゲルまたは水素化食用脂；乳化剤、例えば、レシチン、モノオレイン酸ソルビタン、アカシアゴム；非水性ビヒクル（食用脂を含むことができる）、例えば、アーモンド油、油性エステル（グリセリン、プロピレングリコール、またはエチルアルコールなど）；保存料、例えば、ｐ−ヒドキシ安息香酸メチルもしくはｐ−ヒドキシ安息香酸プロピル、またはソルビン酸、および、必要に応じて、従来の香味剤または着色剤を含有することができる。いくつかの実施形態では、液体製剤は、例えば、溶液中水および／または懸濁形態の薬剤；ならびに、ポリエトキシル化ヒマシ油、アルコール、および／またはポリオキシエチル化モノオレイン酸ソルビタンを含むビヒクルを、香味料と共に、または香味料なしで含み得る。各剤形は、有効量のグリカンポリマーを含んでもよく、また、任意選択により、従来の賦形剤、ビヒクル、充填剤、結合剤、崩壊剤、ｐＨ調整物質、緩衝剤、溶媒、可溶化剤、甘味料、着色剤、および投与のための医薬剤形に含めることができる任意の他の不活性薬剤などの薬学的に不活性な薬剤を含んでもよい。このようなビヒクルおよび添加剤の例は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１７ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ（１９８５）に見出すことができる。
【０２５０】
本明細書に提供される医薬組成物は、単位剤形または複数回投与剤形であり得る。単位剤形は、本明細書に使用される場合、それを必要とするヒトへの投与に好適な物理的に別々の単位を指す。一実施形態では、単位剤形は、パッケージ内に提供される。各単位用量は、所望の治療効果を生じさせるのに十分な所定の数量の有効成分を、他の薬学的担体または賦形剤と共に含み得る。単位剤形の例としては、アンプル、シリンジ、および個別にパッケージ化された錠剤およびカプセルが挙げられるが、これらに限定されない。単位剤形は、その一部を、またはその複数を投与することができる。複数回投与剤形は、単一の容器内に同一の単位投与剤形が複数個パッケージ化されたものであり、区分された単位剤形として投与することができる。複数回投与剤形の例としては、バイアル、錠剤もしくはカプセルの瓶、または数パイントもしくは数ガロンの瓶が挙げられるが、これらに限定されない。別の実施形態では、複数回投与剤形は、異なる薬学的活性薬剤を含む。例えば、グリカンポリマーを含む組成物を含む第１の投与エレメントと、プレバイオティクス、治療剤および／またはプロバイオティクスを含む第２の投与エレメント（これらは、改変放出形態であり得る）とを含む複数回投与剤形が提供され得る。この例では、一対の投与エレメントが単一の単位投与量を構成し得る。一実施形態では、複数の単位投与量を含み、各単位はグリカンポリマー調製物を含む組成物を含む第１の投与エレメントと、プロバイオティクス、医薬剤、プレバイオティクス、またはこれらの組み合わせを含む第２の投与エレメント（これらは、改変放出形態であり得る）とを含むキットが提供される。別の実施形態では、キットは一組の説明書をさらに含む。
【０２５１】
いくつかの実施形態では、単位剤形は、約１ｍｇ〜約１００ｇのグリカンポリマー調製物（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマー）を含む。例えば、単位剤形は、約５０ｍｇ〜約５０ｇ、約５００ｍｇ〜約５０ｇ、約５ｇ〜約５０ｇ、約１００ｍｇ〜約１００ｇ、約１ｇ〜約１００ｇ、約１０ｇ〜約１００ｇ、約１ｇ〜約１０ｇ、約１ｇ〜約２０ｇ、約１ｇ〜約３０ｇ、約１ｇ〜約４０ｇ、約１ｇ〜約５０ｇ、約１ｇ〜約６０ｇ、約１ｇ〜約７０ｇ、約１ｇ〜約８０ｇ、約１ｇ〜約９０ｇ、約１ｇ〜約１００ｇ、約１ｇ〜約１５０ｇ、約１ｇ〜約２００ｇのグリカンポリマーを含み得る。
【０２５２】
他の実施形態では、単位剤形は、約０．００１ｍＬ〜約１０００ｍＬのグリカンポリマー（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマー）を含む。例えば、単位剤形は、約０．００１ｍＬ〜約９５０ｍＬ、約０．００５ｍＬ〜約９００ｍＬ、約０．０１ｍＬ〜約８５０ｍＬ、約０．０５ｍＬ〜約８００ｍＬ、約０．０７５ｍＬ〜約７５０ｍＬ、約０．１ｍＬ〜約７００ｍＬ、約０．２５ｍＬ〜約６５０ｍＬ、約０．５ｍＬ〜約６００ｍＬ、約０．７５ｍＬ〜約５５０ｍＬ、約１ｍＬ〜約５００ｍＬ、約２．５ｍＬ〜約４５０ｍＬ、約５ｍＬ〜約４００ｍＬ、約７．５ｍＬ〜約３５０ｍＬ、約１０ｍＬ〜約３００ｍＬ、約１２．５ｍＬ〜約２５０ｍＬ、約１５ｍＬ〜約２００ｍＬ、約１７．５ｍＬ〜約１５０ｍＬ、約２０ｍＬ〜約１００ｍＬ、または約２５ｍＬ〜約７５ｍＬのグリカンポリマーを含む。
【０２５３】
特定の実施形態では、単位剤形は、約０．００１ｍＬ〜約１０ｍＬ、約０．００５ｍＬ〜約７．５ｍＬ、約０．０１ｍＬ〜約５ｍＬ、約０．０５ｍＬ〜約２．５ｍＬ、約０．１ｍＬ〜約１ｍＬ、約０．２５ｍＬ〜約１ｍＬ、または約０．５ｍＬ〜約１ｍＬのグリカンポリマーを含む。他の実施形態では、単位剤形は、約０．０１ｍＬ〜約１０ｍＬ、約０．０２５ｍＬ〜約７．５ｍＬ、約０．０５ｍＬ〜約５ｍＬ、または約０．１ｍＬ〜約２．５ｍＬのグリカンポリマーを含む。他の実施形態では、単位剤形は、約０．１ｍＬ〜約１０ｍＬ、約０．２５ｍＬ〜約７．５ｍＬ、約０．５ｍＬ〜約５ｍＬ、約０．５ｍＬ〜約２．５ｍＬ、または約０．５ｍＬ〜約１ｍＬのグリカンポリマーを含む。
【０２５４】
いくつかの実施形態では、単位剤形、例えば、錠剤、カプセル剤（例えば、硬カプセル剤、押し込み型カプセル剤、もしくは軟カプセル剤）、またはソフトゲル剤は、約０．１インチ〜約１．５インチ（例えば、約０．５インチおよび約１インチ）、または約５ｍｍ〜約５０ｍｍ（例えば、約１０ｍｍ〜約２５ｍｍ）の長さを有する。いくつかの実施形態では、単位剤形、例えば、錠剤、カプセル剤（例えば、硬カプセル剤、押し込み型カプセル剤、もしくは軟カプセル剤）、またはソフトゲル剤は、約０．０５インチ〜約１インチ（例えば、約０．１インチ〜約０．５インチ）、または約１ｍｍ〜約２５ｍｍ（例えば、約５ｍｍ〜約１０ｍｍ）の外径を有する。
【０２５５】
グリカンポリマーの各単位剤形は、約０．０１ｋｃａｌ〜約１０００ｋｃａｌのカロリー値を有し得る。例えば、単位剤形は、約０．０１ｋｃａｌ〜約１００ｋｃａｌ、約０．０５ｋｃａｌ〜約５０ｋｃａｌ、約０．１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．２５ｋｃａｌ〜約２．５ｋｃａｌ、約０．５ｋｃａｌ〜約５ｋｃａｌ、約０．７５ｋｃａｌ〜約７．５ｋｃａｌ、約１ｋｃａｌ〜１０ｋｃａｌ、約５ｋｃａｌ〜約５０ｋｃａｌ、または約１０ｋｃａｌ〜約１００ｋｃａｌのカロリー値を有し得る。特定の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、１０ｋｃａｌ〜約５００ｋｃａｌのカロリー値を有する。特定の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、１ｋｃａｌ〜約１００ｋｃａｌのカロリー値を有する。特定の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、０．１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌのカロリー値を有する。
【０２５６】
さらに他の実施形態では、単位剤形は、約０．００１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．００５ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．０１ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．０２５ｋｃａｌ〜約２５ｋｃａｌ、約０．０５ｋｃａｌ〜約５０ｋｃａｌ、約０．０７５ｋｃａｌ〜約７５ｋｃａｌ、約０．１ｋｃａｌ〜１００ｋｃａｌ、約０．２５ｋｃａｌ〜約１０ｋｃａｌ、約０．５ｋｃａｌ〜約５ｋｃａｌ、約０．２５ｋｃａｌ〜約２５ｋｃａｌ、または約０．１ｋｃａｌ〜約１ｋｃａｌのカロリー値を有し得る。
【０２５７】
グリカンポリマーの単位剤形は、水溶液（例えば、水、ミルク、ジュースなど）に溶解するように製剤化され得、飲料、シロップ、溶液、または懸濁液として経口投与される。例えば、グリカンポリマーの単位剤形は、経口投与前に水溶液に溶解するように製剤化された、キューブ、パケット、トローチ、丸薬、錠剤、カプセル、キャンディ、粉末、エリキシル、または濃縮シロップを含み得る。他の実施形態では、グリカンポリマーの単位剤形は、経口投与の際に生体内で、例えば、対象の口、胃、腸または結腸で溶解するように製剤化された、キューブ、パケット、トローチ、丸薬、錠剤、カプセル、キャンディ、粉末、エリキシル、または濃縮シロップを含み得る。
【０２５８】
いくつかの実施形態では、グリカンポリマー調製物は腸内投与される。これには、経口投与、または経口チューブもしくは経鼻チューブ（経鼻胃管、経鼻空腸管、経口胃管または経口空腸管を含む）による投与が優先的に含まれる。他の実施形態では、投与には、直腸投与（注腸、坐薬、または結腸内視鏡を含む）を含む。
【０２５９】
本明細書に記載の剤形は、当業者に知られている方法を用いて製造することができる。例えば、錠剤の製造では、例えば、高剪断造粒法、低剪断造粒法、流動床造粒法を使用して、または直接圧縮のためにブレンドすることによって、有効量のプレバイオティクスを１つ以上の賦形剤または添加剤中に均一に分散させることができる。賦形剤および添加剤としては、希釈剤、結合剤、崩壊剤、分散剤、滑沢剤、流動促進剤、安定剤、界面活性剤、接着防止剤、吸着剤、甘味料、および着色剤、またはそれらの組み合わせが含まれる。充填剤とも呼ばれる希釈剤は、圧縮のために実用的なサイズが提供されるように、錠剤の嵩を増加させるために使用することができる。希釈剤の非限定的な例には、ラクトース、セルロース、微結晶性セルロース、マンニトール、乾燥デンプン、加水分解デンプン、粉末糖、タルク、塩化ナトリウム、二酸化ケイ素、酸化チタン、リン酸二カルシウム二水和物、硫酸カルシウム、炭酸カルシウム、アルミナおよびカオリンが含まれる。結合剤は、錠剤製剤に凝集性を付与することができ、圧縮後に錠剤が無傷のままであるのを助けるために使用することができる。好適な結合剤の非限定的な例としては、デンプン（コーンスターチおよびアルファ化デンプンを含む）、ゼラチン、糖（例えば、グルコース、デキストロース、スクロース、ラクトースおよびソルビトール）、セルロース、ポリエチレングリコール、アルギン酸、デキストリン、カゼイン、メチルセルロース、蝋、天然および合成ゴム、例えば、アカシアゴム、トラガカントゴム、アルギン酸ナトリウム、アラビアゴム、キサンタンゴム、ならびにポリメタクリル酸、ポリビニルアルコール、ヒドロキシプロピルセルロース、およびポリビニルピロリドンなどの合成ポリマーが含まれる。滑沢剤はまた、錠剤の製造を容易にすることができ、その非限定的な例には、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸、ベヘン酸グリセリル、およびポリエチレングリコールが挙げられる。崩壊剤は、投与後の錠剤の崩壊を促進することができ、その非限定的な例には、デンプン、アルギン酸、例えば架橋ポリビニルピロリドンなどの架橋ポリマー、例えば、架橋ポリビニルピロリドン、クロスカルメロースナトリウム、グリコール酸デンプンカリウムまたはグリコール酸デンプンナトリウム、クレイ、セルロース（例えば、カルボキシメチルセルロース（例えば、カルボキシメチルセルロース（ＣＭＣ）、ＣＭＣ−Ｎａ、ＣＭＣ−Ｃａ））、デンプン、ゴムなどが含まれる。好適な流動促進剤の非限定的な例には、二酸化ケイ素、タルク等が含まれる。安定剤は、酸化反応を含む、薬物分解反応を阻害するまたは遅延させることができる。界面活性剤も含めることができ、陰イオン性、陽イオン性、両性、または非イオン性であり得る。例示的な甘味料には、ステビア抽出物、アスパルテーム、スクロース、アリテーム、サッカリン等が含まれ得る。必要に応じて、錠剤は、ｐＨ緩衝剤、保存料、例えば、酸化防止剤、湿潤剤、または乳化剤、可溶化剤、コーティング剤、香味剤（例えば、ミント、チェリー、アニス、モモ、アプリコット、甘草、ラズベリー、バニラ）等の非毒性補助物質も含み得る。さらなる賦形剤および添加剤には、酢酸アルミニウム、ベンジルアルコール、ブチルパラベン、ブチル化ヒドロキシトルエン、カルシウム二ナトリウムＥＤＴＡ、リン酸水素カルシウム二水和物、二塩基性リン酸カルシウム、三塩基性リン酸カルシウム、カンデリラ蝋、カルナウバ蝋、水素化ヒマシ油、塩化セチルピリジン、クエン酸、コロイド状二酸化ケイ素、コポリビドン、トウモロコシデンプン、システインＨＣｌ、ジメチコン、リン酸水素二ナトリウム、エリトロシンナトリウム、エチルセルロース、ゼラチン、グリセリン、モノオレイン酸グリセリル、モノステアリン酸グリセリル、グリシン、ＨＰＭＣフタレート（ｐｔｈａｌａｔｅ）、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシルプロピルメチルセルロース、ヒプロメロース、赤色酸化鉄もしくは酸化第二鉄、黄色酸化鉄、酸化鉄もしくは酸化第二鉄、炭酸マグネシウム、酸化マグネシウム、ステアリン酸マグネシウム、メチオニン、メタクリル酸コポリマー、メチルパラベン、ケイ化微結晶セルロース、鉱油、リン酸、普通リン酸カルシウム、無水リン酸カルシウム、ポラキサマー４０７、ポラキサマー１８８、普通ポラキサマー、ポリエチレンオキシド、ポリオキシ１４０ステアレート、ポリソルベート８０、炭酸水素カリウム、ソルビン酸ナトリウム、ジャガイモデンプン、ポビドン、プロピレングリコール、プロピレンパラベン、プロピルパラベン、レチニルパルミテート、サッカリンナトリウム、セレン、シリカ、シリカゲル、ヒュームドシリカ、安息香酸ナトリウム、炭酸ナトリウム、クエン酸ナトリウム二水和物、クロスメロースナトリウム、ラウリン硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、プロピオン酸ナトリウム、ナトリウムデンプン、グリコール酸ナトリウムデンプン、ステアリルフマル酸ナトリウム、ソルビン酸、ソルビトール、モノオレイン酸ソルビタン、アルファ化デンプン、コハク酸、トリアセチン、クエン酸トリエチル、植物ステアリン、ビタミンＡ、ビタミンＥ、ビタミンＣ、またはこれらの組み合わせが含まれ得る。これらの賦形剤および添加剤の量は、他の構成成分との関係、および調合および生成方法の特性に基づいて適切に選択され得る。
【０２６０】
有効量のグリカンポリマー調製物の即時放出製剤は、薬学的活性剤の迅速な放出（投与後１分〜１時間など）を可能にする賦形剤の１つ以上の組み合わせを含み得る。制御放出製剤（持続放出（ＳＲ）、長時間放出（ＥＲ、ＸＲ、またはＸＬ）、逐次継続放出（ｔｉｍｅ−ｒｅｌｅａｓｅ）もしくは時限放出（ｔｉｍｅｄ−ｒｅｌｅａｓｅ）、制御放出（ＣＲ）、または継続放出とも称される）とは、剤形が対象に投与された後の特定の所望の時点での、剤形からのグリカンポリマーの調製物の放出のことを指す。
【０２６１】
一実施形態では、制御放出剤形はその放出を開始し、その放出を長期間にわたって続ける。放出は、ほぼ即時的に開始し得るか、または持続的であり得る。放出は、一定であり得、経時的に増加または減少し得、パルス状であり得、継続的もしくは間欠的等であり得る。一実施形態では、制御放出剤形は、薬剤が長期間にわたって所望のプロファイルに従って放出される、組成物または剤形からの薬物の放出を指す。一態様では、制御放出は、放出がある期間の後に起こる所望のプロファイルに従って薬剤が放出される、組成物または剤形からの薬物の遅延放出を指す。
【０２６２】
本明細書で提供される化合物の投与に好適な薬学的担体またはビヒクルには、特定の投与モードに好適であると当業者に知られているようなすべての担体が含まれる。さらに、本組成物は、所望の作用を損なわない１つ以上の構成成分、または所望の作用を補うかもしくは別の作用を有する構成成分を含むことができる。
【０２６３】
さらなる態様では、剤形は、発泡性剤形であり得る。発泡性とは、剤形が水および唾液を含む液体と混合された場合に、気体を発生させることを意味する。ある種の発泡性薬剤（または発泡性カップル）は、発泡性崩壊剤の水または口腔内の唾液との曝露に際して起こる化学反応によって気体を発生させる。この反応は、可溶性酸性源と一炭酸アルカリまたは炭酸アルカリの源との反応の結果であり得る。これらの２つの一般的化合物の反応により、水または唾液との接触に際して二酸化炭素ガスが生じる。発泡性カップルは（または、個々の酸および塩基は個別に）、早過ぎる反応を防ぐために溶媒保護コーティングまたは腸溶コーティングでコーティングすることができる。このようなカップルはまた、予め凍結乾燥した粒子（例えば、グリカンポリマー）と混合することもできる。酸源は、ヒトが摂取しても安全なものであればよく、一般に、例えば、クエン酸、酒石酸、アマリン酸、フメル酸、アジピン酸、コハク酸などの、食用酸、酸およびヒドライト制酸剤を含むことができる。炭酸塩源には、乾燥固体炭酸塩および炭酸水素塩、例えば、炭酸水素ナトリウム、炭酸ナトリウム、炭酸水素カリウムおよび炭酸カリウム、炭酸マグネシウムなどが含まれる。酸素または他のガスを発生し、ヒトが摂取しても安全である反応物も含まれる。一実施形態では、クエン酸および炭酸水素ナトリウムが使用される。
【０２６４】
別の態様では、剤形は、ロリポップまたはロゼンジ等のキャンディ形態（例えば、基材）であり得る。一実施形態では、グリカンポリマーの有効量をキャンディ基材中に分散させる。一実施形態では、キャンディ基材は、１種以上の糖（デキストロースまたはスクロース等）を含む。別の実施形態では、キャンディ基材は糖を含まない基材である。特定のキャンディ基材の選択には幅広いバリエーションがある。従来の甘味料（例えば、スクロース）、糖尿病患者の使用に適する糖アルコール（例えば、ソルビトールもしくはマンニトール）、または他の甘味料（例えば、本明細書に記載される甘味料）は、使用され得る。キャンディ基材は、非常に軟質で迅速に溶解するものでもよく、または硬質でより緩徐に溶解するものであり得る。様々な形態は、異なる状況での利点を有するであろう。
【０２６５】
有効量のグリカンポリマーを含むキャンディ塊（ｃａｎｄｙ  ｍａｓｓ）組成物は、それを必要とする対象に対して経口投与し、キャンディ塊が溶解し飲み込まれるにつれて有効量のグリカンポリマーが対象の口腔内に放出されるようにすることができる。それを必要とする対象には、ヒトの成人または子供が含まれる。
【０２６６】
本明細書に記載される剤形はまた、高圧均質化、湿式もしくは乾式ボールミル粉砕、または小粒子沈殿（例えば、ｎＧｉｍａｔ’ｓ  ＮａｎｏＳｐｒａｙ）を含むがこれらに限定されない、様々な方法によって製造される薬学的粒子の形態をとることもできる。好適な粉末製剤を作製するのに有用な他の方法は、有効成分および賦形剤の溶液を調製し、その後に沈殿、濾過、および微粉化を行うこと、またはその後に凍結乾燥による溶液の除去を行い、その後に粉末を所望の粒径に微粉化することである。一実施形態では、薬学的粒子は、３〜１０００ミクロン、例えば、最大で３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、９００、９５０、１０００ミクロンの最終サイズを有する。別の実施形態では、薬学的粒子は、１０〜５００ミクロンの最終サイズを有する。別の実施形態では、薬学的粒子は、５０〜６００ミクロンの最終サイズを有する。別の実施形態では、薬学的粒子は、１００〜８００ミクロンの最終サイズを有する。
【０２６７】
別の態様では、本開示は、グリカンポリマー（例えば、本明細書に記載のグリカンポリマー）を提供すること；グリカンポリマーを単位剤形（例えば、本明細書に記載の単位剤形）に製剤化すること；単位剤形をパッケージ化すること；パッケージ化した包装された単位剤形にラベル付けすること、および／またはパッケージ化され、かつラベル付けされた単位剤形を販売するか、もしくは販売に供することを含む、本明細書に記載の単位剤形を作製する方法を提供する。
【０２６８】
本明細書に記載される単位剤形もまた、処理され得る。一実施形態では、この処理は、剤形を医薬組成物に処理すること、例えば、第２の構成成分、例えば、賦形剤または緩衝液で製剤化し、混合すること；より少量もしくは多量のアリコートを分割すること；容器、例えば、気密性または液密性容器に廃棄すること；パッケージ化すること；ラベルを一体化させること；異なる場所に出荷または移動すること、のうちの１つ以上を含む。一実施形態では、この処理は、分類すること、選択すること、許容もしくは廃棄すること、放出もしくは保留すること、医薬組成物に処理すること、異なる場所に出荷もしくは移動すること、製剤化すること、ラベル付けすること、パッケージ化すること、商取引に放出すること、または販売もしくは販売に供すること、所定の閾値を満たすかどうかに応じて異なること、のうちの１つ以上を含む。いくつかの実施形態では、処理した剤形は、本明細書に記載されるグリカンポリマーを含む。
【０２６９】
いくつかの実施形態では、この処理は、剤形を医薬組成物に処理すること、例えば、第２の構成成分、例えば、賦形剤または緩衝剤と製剤化し、混合すること；より少量もしくはより多量のアリコートに分割すること；容器、例えば、気密性または液密性容器に処理すること；パッケージ化すること；ラベルと関連付けること；異なる場所に出荷または移動させること、のうちの１つ以上を含む。一実施形態では、この処理は、分類すること、選択すること、許容もしくは廃棄すること、放出もしくは保留すること、医薬組成物に処理すること、異なる場所に出荷もしくは移動させること、製剤化すること、ラベル付けすること、パッケージ化すること、商取引に放出すること、または販売するかもしくは販売に供すること、決定に応じること、のうちの１つ以上を含む。
【０２７０】
別の実施形態では、グリカンポリマー調製物を含む経口剤形が提供され、経口剤形はシロップである。シロップは、約１％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、または８５％の固体を含み得る。シロップは、約１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、または５０％の液体、例えば、水を含み得る。固体は、グリカンポリマー調製物を含み得る。固体は、例えば、約１〜９６％、１０〜９６％、２０〜９６％、３０〜９６％、４０〜９６％、５０〜９６％、６０〜９６％、７０〜９６％、８０〜９６％、または９０〜９６％のグリカンポリマー調製物であり得る。別の実施形態では、グリカンポリマー調製物は、粘性流体として製剤化される。
【０２７１】
一実施形態では、本組成物は、発泡成分、中和成分、または水不溶性食物繊維を含む。発泡成分は、炭酸水素ナトリウム、炭酸ナトリウム、および炭酸カルシウムからなる群から選択される少なくとも１つのメンバーであり得る。一実施形態では、中和成分は、クエン酸、Ｌ−酒石酸、フマル酸、Ｌ−アスコルビン酸、ＤＬ−リンゴ酸、酢酸、乳酸、および無水クエン酸からなる群から選択される少なくとも１つのメンバーであり得る。一実施形態では、水不溶性食物繊維は、結晶性セルロース、コムギふすま、オートムギふすま、トウモロコシ繊維、ダイズ繊維、およびビート繊維からなる群から選択される少なくとも１つのメンバーであり得る。製剤は、スクロース脂肪酸エステル、粉末糖、フルーツジュース粉末、および／または香味材料を含むことができる。
【０２７２】
いくつかの実施形態では、剤形は、小腸または大腸などのＧＩ管の特定の領域においてグリカンポリマー調製物を含む医薬組成物を放出するように製剤化される。いくつかの実施形態では、剤形は、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、Ｓ字結腸および／または直腸などのＧＩ管の特定の領域においてグリカンポリマー調製物を含む医薬組成物を放出するように製剤化される。
【０２７３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、酵素応答性送達システムである。例えば、トリプシン応答性ポリマーは、トリプシンによって分解されるペプチドによって架橋されるヒドロゲルを使用して作製され得る。トリプシンは小腸で活性である。トリプシン応答性送達システムは、グリカンポリマー調製物の小腸への送達を標的にするために使用され得る。別の例では、アルブミンで架橋されたポリ（ビニルピロリドン）からなる酵素消化性ヒドロゲルがペプシンの存在下で分解される。
【０２７４】
いくつかの実施形態において、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、ＧＩ管の特定の部位での長期の保持を可能にする送達デバイスである。例えば、胃保持性送達システムは、胃へのグリカンポリマー調製物の長期放出を可能にする。胃保持性送達は、胃または上部小腸の細菌を調節するグリカンポリマー調製物に使用され得る。
【０２７５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、胃の粘膜表面に付着する粘膜付着性送達システムである。それらは、通常、多数の水素結合基を有するポリマー、例えば、架橋ポリアクリル酸、カルボキシメチルセルロースナトリウム、アルギン酸ナトリウム、カラギナン、Ｃａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐ、またはチオール化ポリカルボフィルから構成される。
【０２７６】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、胃においてサイズが急速に大きくなる膨張送達システムであり、これは、幽門の通過を遅らせる。このようなシステムは、胃内で広がるシステムを含む。例えば、四面体、環、円板などの幾何学的形状は、ゼラチンカプセルに詰め込むことができる。カプセルが溶解すると、形状は広がる。このシステムは、１つ以上の侵食性ポリマー（例えば、ヒドロキシプロピルセルロース）、１種以上の非侵食性ポリマー（例えば、ポリオレフィン、ポリアミド、ポリウレタン）から構成され得る。その後、グリカンポリマーがポリマーマトリックス内に分散され得る。保持時間は、ポリマーのブレンドによって微調整することができる。あるいは、胃の酸性ｐＨで安定であるが、さらにＧＩ管に沿った中性／アルカリ性条件で溶解する弾性ポリマーから作製されたデバイスが使用され得る。このようなポリマー製剤は、デバイスが胃を出るときの腸閉塞を防止することができる。例えば、ポリ（アクリロイル６−アミノカプロン酸）（ＰＡ６ＡＣＡ）およびポリ（メタクリル酸−コ−エチルアクリレート）（ＥＵＤＲＡＧＩＴ  Ｌ  １００−５５）からなる、カルボキシル基間の水素結合によって架橋された超分子ポリマーゲルもまた使用され得る。他のシステムには、コラーゲンスポンジなどの膨潤性賦形剤が含まれる。例えば、ヒドロゲルマトリックス（例えば、膨潤性コア：ポリビニルピロリドンＸＬ、Ｃａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐ、炭酸カルシウム）は、胃で２〜５０倍に膨潤する。超多孔質ヒドロゲル複合材料は、数分で元の体積の数百倍に膨潤する。いくつかのシステム、例えば、親水性の膜に囲まれた二酸化炭素を発生する膨張可能なシステムは、膨張を達成するためにガス発生を利用する。
【０２７７】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、密度制御送達システムである。これらのシステムは、胃液中で浮遊または沈降するように設計され、これは、それらの胃からの排出を遅らせる。例えば、高密度システムは、デバイスを幽門の下、胃の底部に沈ませ、これにより胃を空にすることを回避する。他のシステムは、低密度／フローティングシステムである。そのようなデバイスは、例えば、中空チャンバ内に閉じ込められた空気を含むか、または脂肪、油、または発泡体粉末などの低密度材料を包含し得る。低密度は、例えば膨潤によって達成され得、例えば、ヒドロコロイド含有カプセルは胃液と接触すると溶解し、ヒドロコロイドが膨潤して粘液体を形成する。別のポリマーには、キトサン、アルギン酸ナトリウム、およびモノオレイン酸グリセロールマトリックスが含まれる。低密度は、ガスの発生によって達成され得る。例えば、炭酸塩、および任意選択によりクエン酸を充填した錠剤は、酸性水性媒体と接触後に二酸化炭素を発生する。発生した二酸化炭素は、ゲル化ヒドロコロイド内に捕捉され、システムを浮遊させる。ヒドロコロイドには、ヒドロキシプロピルメチルセルロースおよびＣａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐが含まれる。
【０２７８】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、小腸または大腸においてデバイスを保持するための設計を使用する。デバイスの位置特異性は、特定のトリガ方法、例えば、ｐＨ、酵素などによって提供される。これらには、粘膜接着のために設計されたシステムが含まれ、またマイクロニードルピルも含まれる。マイクロニードルピルは、ｐＨ応答性コーティングに封入された、マイクロニードルが添加された薬物リザーバを含む。ピルがＧＩ管内の所望の位置に到達し、コーティングが溶解すると、マイクロニードルが、ピルをＧＩ管の内層に付着させる。他の実施形態では、マイクロニードルピルは、クエン酸および炭酸水素ナトリウムがそれぞれ充填された２つの化学的区画からなるカプセルを含む。ピルが消化器系で溶解するにつれて、２つの物質間の障壁が侵食され、それらが混合し、糖からなるマイクロニードルをカプセルの外層を通して小腸の内層に押し込む化学反応を生じさせる。糖のニードルは、糖が吸収されるにつれて、近くの血管に送達される薬物で満たされ得る。
【０２７９】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、ｐＨ感受性ポリマーコーティングを使用する。例えば、ｐＨ依存性ポリマー（二相または三相）は、低いｐＨレベルで不溶であり得（例えば、胃における酸耐性、ｐＨ１〜２の胃において耐酸性である）、ｐＨが、例えば、十二指腸で約５．５〜６．２、上行結腸で約ｐＨ５．７、盲腸で約ｐＨ６．４、横行結腸で約ｐＨ６．６、下行結腸で約ｐＨ７．０、回腸で約ｐＨ７．２〜７．５、または遠位小腸で約ｐＨ７．５に上昇すると、溶解性が増大する。一例では、において、ＴＡＲＧＩＴＴＭ技術は、消化（ＧＩ）管におけるグリカンポリマー調製物の部位特異的送達のために使用され得る。このシステムは、末端回腸および結腸を標的にするために、射出成形デンプンカプセル上にｐＨ感受性コーティングを使用する。
【０２８０】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、遅延放出システムまたは時間制御放出システムである。このようなシステムは、通常、ｐＨ感受性および時間放出機能と組み合わせることができる腸溶コーティングを使用する。例えば、３つの構成要素：グリカンポリマー含有コア錠（急速放出機能）、プレスコーティングされた膨潤性疎水性ポリマー層（例えば、ヒドロキシプロピルセルロース層（ＨＰＣ）、および時間放出機能からなるＥＴＰ（腸溶コーティングされた時間放出プレスコート）錠剤が使用され得る。遅滞期の持続時間は、ポリマー層および腸溶コーティング層（耐酸性機能）の重量または組成によって制御することができる。
【０２８１】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるグリカンポリマー調製物のための剤形は、錠剤およびカプセルのＥｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）腸溶コーティングを使用する。他の好適な合成ポリマーには、シェラック、エチルセルロース、酢酸フタル酸セルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリ酢酸ビニルフタレート、およびポリ−γ−グルタミン酸（γ−ＰＧＡ）などのポリグルタミン酸コーティングが含まれる。これらのコーティングは、粘膜接着性およびｐＨ依存性放出戦略の両方を組み合わせる。結腸標的送達を増強するために、Ｅｕｄｒａｇｉｔｓ（登録商標）は、それらが可溶性であるｐＨを変化させる種々の側鎖基組成を有するメタクリルコポリマーである。例えば、Ｅｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）被覆システムでは、胃（例えば、ｐＨ１．４）および小腸（例えば、ｐＨ６．３）において有意な薬物放出は生じず、一方、回盲部、ｐＨ７．８で、有意な薬物放出が見られる。
【０２８２】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、多糖ベース送達システムなどの、微生物トリガーシステムである。多糖ベース送達システムは、生分解性で粘膜接着性のポリマーコーティング、例えば、キトサンおよびペクチンからなるコーティングを含む。他の好適な天然ポリマーには、例えば、グアーガム、イヌリン、シクロデキストリン、デキストラン、アミラーゼ、コンドロチン硫酸、ローカストビーンガムが含まれる。これらの送達システムは、グリカンポリマー調製物の小腸への送達を標的にするために使用され得る。グアーガム、キサンタンガム、キトサン、アルギン酸塩などの天然に存在する多糖類によるコーティングは、結腸の腸内微生物叢、例えば、キシロシダーゼ、アラビノシダーゼ、ガラクトシダーゼなどの酵素によって分解される。例えば、ＣＯＤＥＳＴＭ技術を使用して、グリカンポリマー調製物を送達することができる。このシステムは、多糖類コーティングをｐＨ感受性コーティングと組み合わせる。いくつかの実施形態では、この系は、以下の３層のポリマーコーティングでコーティングされたコア錠剤からなる：外側コーティングは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｌから構成される。このコーティングは十二指腸で溶解し、次のコーティングを露出させる。次のコーティングは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｅから構成される。この層は、内部コアに存在するラクツロースの放出を可能にする。ラクツロースは、Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｅ層が溶解する周囲ｐＨを低下させる短鎖脂肪酸に代謝される。Ｅｕｄｒａｇｉｔ  Ｅの溶解は、グリカンポリマーの露出をもたらす。結腸に存在する細菌は、コア錠剤から放出される多糖類の分解に関与する。多糖類の分解は、錠剤を取り囲む内容物のｐＨを低下させる有機酸の形成をもたらし得る。
【０２８３】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、圧力制御送達システムである。このシステムは、小腸よりも結腸でより高い圧力に遭遇するという事実を利用する。例えば、水に不溶のエチルセルロースシステムでは、結腸の内腔内の圧力の結果として、水不溶性ポリマーカプセルの崩壊後に、グリカンポリマーの放出が生じる。放出プロフィールは、エチルセルロースの厚さ、カプセルのサイズおよび／またはカプセルの密度を変化させることによって調節することができる。
【０２８４】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、脈動性結腸標的デリバリーシステムである。例えば、このシステムは、パルシンキャップ（ｐｕｌｓｉｎｃａｐ）システムであり得る。使用されるカプセルは、グリカンポリマーの放出を制御するカプセル内に配置されるプラグを含む。膨潤性ヒドロゲル（例えば、ヒドロキシルプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）、ポリメチルメタクリレートまたはポリ酢酸ビニル）が、薬物内容物を密封する。カプセルが流体と接触すると、プラグがカプセルから押し出され、グリカンポリマーが放出される。放出プロフィールは、プラグとカプセル本体との交差する長さおよび／または交点を変化させることによって制御することができる。別のシステムはポートシステムである。カプセル本体は、半透膜に包まれる。不溶性プラグは、浸透圧活性剤およびグリカンポリマーからなる。カプセルが流体と接触すると、半透膜が流体を流入させ、カプセル本体内の圧力を高める。これにより、プラグが押し出され、グリカンポリマーが放出される。
【０２８５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、浸透圧制御結腸標的デリバリーシステムである。例示的なシステム、ＯＲＯＳ−ＣＴは、硬ゼラチンカプセルに封入された浸透圧ユニット（５または６プッシュプルユニットまで）からなる。プッシュプルユニットは、外側の腸の不透過性膜および内側の半透膜で二層化される。プッシュプルの内部の中央部分は、薬物層およびプッシュ層からなる。グリカンポリマーは、半透膜を通して放出される。プッシュプルユニットを取り囲むカプセル本体は、投与直後に溶解する。ＧＩ管では、腸不透過性膜が水の吸収を妨げる。腸溶コーティングは、小腸（より高いｐＨ、＞７）で溶解し、水は半透膜を通ってユニットに入り、プッシュ層を膨潤させ、グリカンポリマーを外に押し出す。
【０２８６】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、回盲弁に到達する直前にグリカンポリマーを放出するために使用することができる「スマートピル」である。
【０２８７】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物のための剤形は、直腸投与製剤である。例えば、浣腸は、液体製剤のグリカンポリマー調製物を直腸に導入する。投与される容量は、通常、１０ｍＬ未満である。坐剤は、グリカンポリマー調製物を直腸に導入する。坐薬は直腸に挿入されると溶融または溶解し、グリカンポリマーを放出する固体剤形である。坐薬製剤の一般的な賦形剤には、ココアバター、ポリエチレングリコール、および寒天が含まれる。
【０２８８】
剤形
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物は、任意の好適な剤形、例えば、経口または経腸投与用に製剤化することができ、あるいは、注射用に製剤化することができる。本明細書中に記載される方法および組成物における使用に好適な剤形は、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、および国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレットに見出すことができ、これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０２８９】
本明細書に記載の剤形は、当業者に知られている方法を用いて製造することができる。剤形は、任意の投与経路、例えば、経口または非経口、例えば、静脈内、筋肉内、皮下、眼窩内、被膜内、腹腔内、直腸内、大槽内、腫瘍内、血管内、皮内、または皮膚による受動的吸収もしくは促進的吸収に好適であり得る。
【０２９０】
剤形は、例えば、液体（洗浄／すすぎ）、固体、ゲル、クリーム、軟膏、粉末、錠剤、丸剤、カプセル、トローチ、坐薬、保管所、使い捨てアプリケータ、ソフトゲル、または医療デバイス（例えば、シリンジ）の形態で、グリカン組成物を入れる任意の個々の容器などのパケットであってよい。例えば、グリカン組成物の単位剤形を含む容器、およびそのようなグリカン組成物の使用説明書を含むラベルなどの製品も提供される。
【０２９１】
本明細書に提供される組成物は、単位剤形または複数回投与剤形であり得る。単位剤形は、本明細書に使用される場合、それを必要とするヒトへの投与に好適な物理的に別々の単位を指す。一実施形態では、単位剤形は、パッケージで提供される。各単位用量は、所望の治療効果を生じさせるのに十分な所定量の有効成分を、他の薬学的担体または賦形剤とともに含み得る。単位剤形の例には、アンプル、シリンジ、ならびに個別にパッケージ化された錠剤およびカプセルが含まれる。単位剤形は、その一部を、またはその複数を投与することができる。複数回投与剤形は、単一の容器内に同一の単位投与剤形が複数個パッケージ化されたものであり、区分された単位剤形で投与することができる。
【０２９２】
キット
キットも企図される。例えば、キットは、単位剤形のグリカンポリマー調製物、および胃腸の障害または状態の治療におけるグリカンポリマーの使用説明書を含むパッケージ挿入物を含み得る。キットは、グリカンポリマー調製物を、それを必要としている対象による使用に好適なパッケージ化で含む。本明細書に記載の組成物のいずれも、キットの形態でパッケージ化することができる。キットは、治療の全過程または治療の過程の一部に十分な量のグリカンポリマー調製物（任意選択により、さらに、プレバイオティクス物質、プロバイオティクス細菌、および／または第２の治療剤）を含有し得る。グリカンポリマー調製物の投与量は個々にパッケージ化され得るか、またはグリカンポリマー調製物はバルクで、またはそれらの組み合わせで提供され得る。したがって、一実施形態では、キットは、好適なパッケージ化において、治療レジメンにおける投与ポイントに対応する個々の用量のグリカンポリマー調製物を提供し、この用量は１つ以上のパケットにパッケージ化される。
【０２９３】
一実施形態では、グリカンポリマー調製物は、単一の容器に、または２つ、３つ、４つ、５つ、もしくは５つを超える容器にバルクで提供され得る。例えば、各容器は、１ヶ月間実施される治療プログラムの特定の週に十分なグリカンポリマー調製物を含有し得る。複数のバルク容器が提供される場合、治療期間の全部または一部に十分なグリカンポリマー調製物を提供するために、バルク容器は好適にはまとめてパッケージ化することができる。これらの１つまたは複数の容器は、それを必要とする対象、または、例えば投与スケジュールなどの治療プロトコルを行う医師に有用な情報を示すラベルを付けることができる。
【０２９４】
グリカンポリマー調製物は、本明細書に記載されるように、プロバイオティクス細菌、プレバイオティクス物質または他の物質などの他の好適な物質と共にパッケージ化することができる。他の物質は、グリカンポリマー調製物とは別個にパッケージ化するか、またはグリカンポリマー調製物と混合するか、またはそれらの組み合わせとすることができる。したがって、一実施形態では、キットには、治療の過程または治療の過程の一部で使用することが意図されているすべての成分、例えば、グリカンポリマー調製物、および、任意選択により、緩衝剤、賦形剤など、プロバイオティクス、プレバイオティクス、またはポリマー剤を含有する剤形が含まれる。一実施形態では、グリカンポリマー調製物は、１つのパッケージまたは一組のパッケージでパッケージ化され、プロバイオティクス細菌、プレバイオティクス、および治療剤などの追加成分は、グリカンポリマー調製物とは別個にパッケージ化される。
【０２９５】
キットは、資料、例えば、取扱説明書、予想される結果、証言、説明、警告、臨床データ、医療従事者のための情報等をさらに含み得る。一実施形態では、キットは、このキットが医療従事者の指示の下でのみ使用されることを示すラベルまたは他の情報を含む。容器は、匙、シリンジ、ボトル、カップ、アプリケータ、または他の測定もしくは給仕するデバイスをさらに含み得る。
【０２９６】
医療用食品
医療用食品として製剤化されたグリカンポリマーの調製物もまた、本明細書において提供される。本明細書に記載のグリカンポリマー調製物はいずれも、グリカンポリマー調製物を含む医療用食品および医薬組成物として処方され得る。
【０２９７】
医療用食品は、希少医薬品法（Ｏｒｐｈａｎ  Ｄｒｕｇ  Ａｃｔ）（２１Ｕ．Ｓ．Ｃ．３６０ｅｅ（ｂ）（３））第５条（ｂ）（３）に定義されている。医療用食品は、例えば、医師による、医学的管理下で、摂取（経口摂取）または経腸投与（例えば、栄養補給／経鼻胃管）されるように処方される。それは、例えば、ディスバイオシスまたはＧＩ管疾患などの疾患または状態の特定の食事管理を目的としている。本明細書に使用される場合、医療用食品は、症状を管理し、または疾患もしくは状態のリスクを低減するために、全体的な食事の一部として医師によって単に推奨される食品は含まない。グリカンポリマーの調製物を含む医療用食品は、合成食品（例えば、経口摂取またはチューブによる経腸栄養補給による患者への部分的または全体的な栄養補給のために処方されるような処方製品および／または加工製品）であり、天然の状態で使用される天然に存在する食品ではない。
【０２９８】
いくつかの実施形態では、対象は、通常の食品または特定の栄養素を摂取し、消化し、吸収し、または代謝する能力が限られているか、または損なわれている。他の実施形態では、対象は、他の特別な医学的に決定された栄養要求を有し、通常の食事のみを変えてもその栄養管理を達成することができない。グリカンポリマーの調製物を含む医療用食品は、それを必要とする対象に、医学的管理下（これは、現在関与し進行中であってよい）で投与され、そして、通常、対象は、医療用食品の使用についての指示を受ける。医療用食品は、１つ以上の食品添加物、着色添加物、ＧＲＡＳ賦形剤、および医療用食品に好適なその他の薬剤または物質を含み得る。医療用食品調製物は、栄養的に完全な処方であっても不完全な処方であってもよい。
【０２９９】
栄養補助食品
本明細書中に記載のグリカンポリマー調製物はいずれも、例えば、本明細書中に記載される方法において使用するための、栄養補助食品として処方され得る。栄養補助食品は、１９９４年のダイエタリーサプリメント健康教育法（Ｄｉｅｔａｒｙ  Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ  Ａｃｔ）（ＤＳＨＥＡ）によって規制されている。栄養補助食品は、食事を補うことを目的とした「食事成分」を含有する経口摂取製品である。これらの製品における「食事成分」は、本明細書に記載のグリカンポリマー調製物に加えて、ビタミン、ミネラル、ハーブまたは他の植物、アミノ酸、ならびに酵素、器官組織、腺、および代謝産物などの物質のうちの１つ以上を含み得る。栄養補助食品はまた、抽出物または濃縮物であり得、例えば、錠剤、カプセル、ソフトゲル、ゲルキャップ、液体、または粉末などの多くの形態で見出され得る。それらはまた棒などの他の形態であり得るが、その場合、そのラベル上の情報は、その製品を従来の食品、または食事の単独の品目として表してはならない。ＤＳＨＥＡは、すべての栄養補助食品が一般的な食品としてではなく、栄養補助食品としてラベル付けされることを要求する。
【０３００】
食品成分
本明細書に記載のグリカンポリマー調製物はいずれも、例えば、本明細書に記載される方法において使用するための、食品成分または食品添加物として処方され得る。食品成分は、一般に安全と認められる（ＧＲＡＳ）か、ＦＤＡの認可を必要とし得る。グリカンポリマー調製物は、任意の所望の食品、例えば、飲料（例えば、フルーツジュース）、乳製品（例えば、ミルク、ヨーグルト、チーズ）、シリアル（任意の穀物製品）、パン、スプレッドなどに添加することができる。
【０３０１】
グリカン調製物は、食品として処方され得る。連邦食品・医薬品・化粧品法（Ｆｅｄｅｒａｌ  Ｆｏｏｄ，Ｄｒｕｇ  ａｎｄ  Ｃｏｓｍｅｔｉｃ  Ａｃｔ）（２１Ｕ．Ｓ．Ｃ．第３２１条（ａ）（ｆ））に定義される「食品」という用語は、ヒトまたは他の動物用の食品または飲料に使用される物品、チューインガム、およびそのような物品の成分に使用される物品を指す。食品は、摂取（経口摂取）されるように処方される。食品は、グリカン調製物に加えて、１つ以上の食品添加物、着色添加物、ＧＲＡＳ賦形剤、および食品に好適なその他の薬剤または物質を含み得る。食品調製物は、栄養的に完全な処方であっても不完全な処方であってもよい。
【０３０２】
微生物分類群の調節方法
本明細書において提供される化合物および組成物は、対象の微生物叢に存在する細菌分類群（例えば、１、２、３、４、５またはそれ以上の分類群）を調節する方法において使用され得る。いくつかの実施形態では、調節は、微生物叢の構造の変化、例えば、分類群の相対組成の変化、または分類群の相対存在度の変化（例えば、他の分類群に対して、または当該調節が無かった場合に観察されるであろうものに対して）を含む。他の実施形態では、調節は、微生物叢の機能の変化、例えば、遺伝子発現の変化、遺伝子産物（例えば、ＲＮＡもしくはタンパク質）のレベルの変化、または微生物叢の代謝出力の変化、あるいは、宿主の機能的経路の変化（例えば、遺伝子発現の変化、遺伝子産物のレベルの変化、または宿主細胞もしくは宿主処理の微生物叢の代謝出力の変化）を含み得る。国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレットおよび国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレットに開示される微生物分類群の調節方法（これらは参照により本明細書に組み込まれる）は、本明細書に記載の方法における使用に好適である。
【０３０３】
本明細書に記載の方法は、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を分類群の調節に有効な量で含む、本明細書に記載の組成物を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、組成物が投与され、増加が少なくとも５％、１０％、２５％、５０％、７５％、１００％、２５０％、５００％、７５０％の増加、または少なくとも１０００％の増加であり得る場合、細菌分類群の存在度は他の分類群と比較して（または、ある時点から別の時点までと比較して）増加し得る。組成物が投与され、減少が少なくとも５％、１０％、２５％５０％、７５％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の減少、または少なくとも９９．９％の減少であり得る場合、細菌分類群の存在度はまた、他の分類群と比較して（または、ある時点から別の時点までと比較して）減少し得る。組成物の投与により、対象の胃腸微生物叢における所望の、および／または非所望の細菌分類群の存在度を調節することができる。
【０３０４】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、例えば、ＧＩ管で見出すことができる、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、オドリバクター属（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ）、パラバクテロイデス属（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、アリスティペス属（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、オシロスピラ属（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ）およびサブドリグラヌルム属（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）に属するものなどの１種以上の細菌の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、例えば、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロフィルム属（Ａｎａｅｒｏｆｉｌｕｍ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブチリビブリオ属（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ファスコラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）およびストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）の１種以上の細菌、ならびに／またはアッカーマンシア・ムニシフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｎｉｃｉｐｈｉｌｉａ）種、クリステンセネラ・ミヌタ（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａ  ｍｉｎｕｔａ）種、クロストリジウム・コッコイデス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ）種、クロストリジウム・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ）種、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）種、ディアリスター・インビサス（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ  ｉｎｖｉｓｕｓ）種、ユウバクテリウム・レクタル（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌ）種、ユウバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ）種、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕ��  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）種、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）種およびストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）種の１種以上の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３０５】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）（エリュシペロトリクス綱（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ））、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）（クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ））、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、アグリゲイティバクター属（Ａｇｇｒｅｇａｔｉｂａｃｔｅｒ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）（ペプトストレプトコッカス科（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃａｖｅａｅ））、パラバクテロイデス属（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）およびエンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）から選択される少なくとも２つの細菌分類群の増殖を調節（例えば、増加または減少）する。
【０３０６】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、例えば、ＧＩ管に見出すことができる、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、オドリバクター属（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ）、パラバクテロイデス属（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、アリスティペス属（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、オシロスピラ属（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ）およびサブドリグラヌルム属（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）に属するものなどの、ＧＩ管に存在する１つ以上の細菌分類群の増殖を調節（例えば、増加または減少）する。いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、健康な胃腸状態に関係すると考えられるものなどの１種以上の細菌分類群、例えば、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロフィルム属（Ａｎａｅｒｏｆｉｌｕｍ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブチリビブリオ属（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ファスコラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）およびストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）の１種以上、ならびに／またはアッカーマンシア・ムニシフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｎｉｃｉｐｈｉｌｉａ）種、クリステンセネラ・ミヌタ（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａ  ｍｉｎｕｔａ）種、クロストリジウム・コッコイデス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ）種、クロストリジウム・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ）種、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）種、ディアリスター・インビサス（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ  ｉｎｖｉｓｕｓ）種、ユウバクテリウム・レクタル（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌ）種、ユウバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ��種、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）種、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）種およびストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）種の１種以上の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、ウェルコミクロビウム門（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）の分類群、例えば、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）の分類群などの、１つ以上の細菌分類群の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３０７】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、主に小腸に存在する１つ以上の細菌分類群の増殖を調節（例えば、増加または減少）する。例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、例えば、小腸に主に存在する１つ以上（２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の細菌分類群、例えば、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）（バチルス綱（Ｂａｃｉｌｌｉ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ））、およびプロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）（アルファプロテオバクテリア綱（Ａｌｐｈａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、ベータプロテオバクテリア綱（Ｂｅｔａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ））を調節する。いくつかの実施形態では、例えば、本明細書中に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、以下の属から選択される、小腸に主に存在する１つ以上（２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の細菌分類群を調節する：クリオコーラ属（Ｃｒｙｏｃｏｌａ）、マイコバクテリウム属（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ツリシバクター属（Ｔｕｒｉｃｉｂａｃｔｅｒ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ホールデマニア属（Ｈｏｌｄｅｍａｎｉａ）、シュードラミバクター属（Ｐｓｅｕｄｏｒａｍｉｂａｃｔｅｒ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、アグロバクテリウム属（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、スフィンゴモナス属（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ）、アクロモバクター属（Ａｃｈｒｏｍｏｂａｃｔｅｒ）、バークホリデリア属（Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ）およびラルストニア属（Ｒａｌｓｔｏｎｉａ）。
【０３０８】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、大腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、例えば、大腸に主に存在する１つ以上（２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の細菌分類群、例えば、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）（クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ））、ウェルコミクロビウム綱（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）、およびプロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）（デルタプロテオバクテリア綱（Ｄｅｌｔａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ））を調節する。いくつかの実施形態では、例えば、本明細書中に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、以下の属から選択される、大腸に主に存在する１つ以上（２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の細菌分類群を調節する：バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブチリシモナス属（Ｂｕｔｙｒｉｃｉｍｏｎａｓ）、オドリバクター属（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ）、パラバクテロイデス属（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、アナエロツルンカス属（Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ）、ファストラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ビロフィラ属（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ）およびアッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）。
【０３０９】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、盲腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群、例えば、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、バチルス綱（Ｂａｃｉｌｌｉ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、モリクテス綱（Ｍｏｌｌｉｃｕｔｅｓ）、アルファプロテオバクテリア綱（Ａｌｐｈａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびウェルコミクロビウム綱（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３１０】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、上行結腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群、例えば、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、バチルス綱（Ｂａｃｉｌｌｉ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、フソバクテリウム門（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）、ベータプロテオバクテリア綱（Ｂｅｔａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、デルタ／イプシロンプロテオバクテリア綱（Ｄｅｌｔａ／Ｅｐｓｉｌｏｎ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、ガンマプロテオバクテリア綱（Ｇａｍｍａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびウェルコミクロビウム綱（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３１１】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、横行結腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群、例えば、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、モリクテス綱（Ｍｏｌｌｉｃｕｔｅｓ）、フソバクテリウム門（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびガンマプロテオバクテリア綱（Ｇａｍｍａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３１２】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、下行結腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群、例えば、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、モリクテス綱（Ｍｏｌｌｉｃｕｔｅｓ）、フソバクテリウム門（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）、デルタ／イプシロンプロテオバクテリア綱（Ｄｅｌｔａ／Ｅｐｓｉｌｏｎ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびウェルコミクロビウム綱（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３１３】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、Ｓ字結腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群、例えば、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、バチルス綱（Ｂａｃｉｌｌｉ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、モリクテス綱（Ｍｏｌｌｉｃｕｔｅｓ）、アルファプロテオバクテリア綱（Ａｌｐｈａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、ベータプロテオバクテリア綱（Ｂｅｔａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびウェルコミクロビウム綱（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３１４】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、直腸に主に存在する１つ以上の細菌分類群、例えば、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、クロストリジウム綱（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａ）、モリクテス綱（Ｍｏｌｌｉｃｕｔｅｓ）、アルファプロテオバクテリア綱（Ａｌｐｈａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、ガンマプロテオバクテリア綱（Ｇａｍｍａ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびウェルコミクロビウム綱（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）の増殖を調節する（例えば、増加または減少させる）。
【０３１５】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、例えば、アリスティペス属（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロフィルム属（Ａｎａｅｒｏｆｉｌｕｍ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブチリビブリオ属（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、オドリバクター属（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ）、オシロスピラ属（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａ）、パラバクテロイデス属（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ファスコラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）およびストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）およびサブドリグラヌラム属（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）などの属の１種以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の細菌分類群の増殖を調節する（例えば、刺激／増加または抑制／減少させる）。
【０３１６】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、アッカーマンシア属（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アナエロフィルム属（Ａｎａｅｒｏｆｉｌｕｍ）、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブチリビブリオ属（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コプロコッカス属（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、ディアリスター属（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）、フソバクテリウム属（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ユウバクテリウム属（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム属（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクノスピラ属（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）、ラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ファスコラークトバクテリウム属（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ペプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトストレプトコッカス属（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテーラ属（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ロゼブリア属（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）およびストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ならびにアッカーマンシア・ムニシフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｎｉｃｉｐｈｉｌｉａ）種、クリステンセネラ・ミヌタ（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａ  ｍｉｎｕｔａ）種、クロストリジウム・コッコイデス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃｏｃｃｏｉｄｅｓ）種、クロストリジウム・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｅｐｔｕｍ）種、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）種、ディアリスター・インビサス（Ｄｉａｌｉｓｔｅｒ  ｉｎｖｉｓｕｓ）種、ユウバクテリウム・レクタル（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌ）種、ユウバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｌｉｇｅｎｓ）種、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）およびストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）の１種以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の微生物分類群の増殖を調節する（例えば、刺激／増加または抑制／減少させる）。
【０３１７】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、表１〜３または表４〜６に列挙された細菌分類群の１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の増殖（および総数）を調節する（例えば、実質的に増加または実質的に減少させる）（または、全（胃腸）コミュニティにおける相対的な表現／存在度を実質的に増加または実質的に減少させる）。
【０３１８】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、表１〜３または表４〜６に列挙された細菌分類群の１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の増殖、例えば、総数、または、全（胃腸）コミュニティにおける相対的な表現／存在度を実質的に増加させる。
【０３１９】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、表１〜３または表４〜６に列挙された細菌分類群の１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の増殖、例えば、総数、または、全（胃腸）コミュニティにおける相対的な表現／存在度を実質的に減少させる。
【０３２０】
いくつかの実施形態では、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を含む、本明細書に記載の組成物は、表１〜３または表４〜６に列挙された細菌分類群の１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上）の増殖、例えば、総数、または、全（胃腸）コミュニティにおける相対的な表現／存在度を実質的に増加および減少させる。
【０３２１】
特定の実施形態では、特定の細菌分類群の比率またはそれらの相対存在度はシフトさせることができる。そのようなシフトは、グリカン医薬組成物の投与前に対象に存在する比率に対して、またはグリカン医薬組成物を摂取していない対照群に対して測定することができる。
【０３２２】
微生物集団のプロテオーム解析
グリカン組成物の調製は、例えば、表１〜３に記載の外因性物質の処理に関連する微生物タンパク質、例えば、酵素の発現を調節するそれらの能力に基づいて選択され得る。微生物集団のプロテオーム解析に好適な方法は、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレットおよび国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット（これらは参照により本明細書に組み込まれる）に見出すことができる。いくつかの実施形態では、プロテオーム解析は、例えば、Ｃｏｒｄｗｅｌｌ，Ｅｘｐｌｏｒｉｎｇ  ａｎｄ  ｅｘｐｌｏｒｉｔｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｐｒｏｔｅｏｍｅｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，２００４，２６６：１１５に記載されるプロトコルに従って実施することができる。
【０３２３】
微生物（例えば、細菌）成分の同定
例えば、ＧＩ管においてインビボで生じる、本明細書に記載のグリカン組成物による、微生物の（例えば、分類群の表現／存在度の）調節は、当該技術分野で知られ、かつ本明細書に記載される多くの方法を用いて分析することができる。好適な方法は、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレットおよび国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット（これらは参照により本明細書に組み込まれる）に見出すことができる。いくつかの実施形態では、定量ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）は、グリカン組成物がＧＩ管における細菌集団のシフトをもたらし得るか否かを決定する方法として使用し得る。
【０３２４】
いくつかの実施形態では、微生物成分は、微生物１６Ｓ小サブユニットリボソームＲＮＡ遺伝子（１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子）のＤＮＡ配列を特徴付けることによって同定され得る。他の実施形態では、微生物組成は、ヌクレオチドマーカーまたは遺伝子、特に高度に保存された遺伝子（例えば、「ハウスキーピング」遺伝子）、もしくはそれらの組合せを特徴付けることによって、または、全ゲノムショットガンシーケンス法（ＷＧＳ）によって同定され得る。
【０３２５】
対象への投与
本明細書に記載されるグリカン組成物、医薬組成物および治療剤は、例えば、経口または非経口、例えば、静脈内、筋肉内、皮下、眼窩内、被膜内、腹腔内、直腸内、大槽内、腫瘍内、血管内、皮内、または皮膚による受動的吸収もしくは促進的吸収を含む、様々な経路により（例えば、全身的に、または局所的に）それを必要とする対象に投与することができる。治療剤は、病的状態の部位に局所的に、例えば、腫瘍を供給する血管へ、静脈内投与または動脈内投与することができる。いくつかの実施形態では、グリカン組成物は腸内投与される。これには、経口投与、または口腔チューブもしくは鼻腔チューブ（経鼻胃管、経鼻空腸管、経口胃管または経口空腸管を含む）による投与が含まれる。他の実施形態では、投与には、直腸投与（注腸、坐薬、または結腸内視鏡を含む）を含む。本明細書に記載される方法および組成物における使用に好適な対象への投与方法は、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、および国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレットに見出すことができ、これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０３２６】
有効化合物および医薬剤、例えば、プレバイオティクス物質、プロバイオティクス細菌または薬物は、別々に、例えば、グリカン組成物の投与前、投与と同時に、または投与後に、グリカン組成物の医薬組成物または医療用食品または栄養補助食品の一部として（例えば、共配合物として）でなく投与され得る。いくつかの実施形態では、グリカン組成物の調製物を含む医薬組成物または医療用食品は、医師または他の医療従事者によって決定され得るような、推奨された、または規定の食事、例えば、プロバイオティクスおよび／またはプレバイオティクス含有食品に富む食事と組み合わせて投与される。
【０３２７】
治療方法
グリカン組成物、例えば、本明細書に記載のグリカン組成物を、必要としている対象に投与することを含む、疾患、障害、状態、または病的状態を治療する方法が、本明細書において提供される。本明細書に記載の任意の方法で使用するための外因性物質（例えば、医薬剤）もまた、本明細書において提供される。外因性物質はグリカン組成物を含む組成物に含めることができ、または別々に投与／処方することができる。実施形態では、医薬剤は、本明細書に記載の疾患、障害、状態、または病的状態を治療するために使用される。
【０３２８】
本明細書に記載の方法および組成物で治療することができる疾患および障害は、国際公開第２０１６／１２２８８９号パンフレット、国際公開第２０１６／１７２６５７号パンフレット、および国際公開第２０１６／１７２６５８号パンフレット（これらは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）に見出すことができる。例示的な疾患、障害、状態、または病的状態には、増殖性疾患（例えば、癌）、ディスバイオシス、感染症、代謝疾患、神経変性疾患、アレルギーなどを含み得るが、これらに限定されない。
【０３２９】
本明細書に記載の方法で治療することができる疾患、障害、および状態には、疼痛、片頭痛、関節炎、癌、結腸および直腸癌、細菌感染症、ウイルス感染症、ＨＩＶ、肝炎、Ｃ型肝炎、真菌感染症、線虫感染症、鉤虫感染症、骨粗鬆症、癌に関連する疼痛、糖尿病、血糖不均衡、発作、パニック障害、不安、心疾患、心不全、不整脈、高血圧、扁桃炎、胸痛、血小板減少症、再生不良性貧血、パーキンソン病およびパーキンソン様症状、下痢、高コレステロール値および高トリグリセリド値、ＡＤＨＤ、レクリエーショナルドラッグの使用、不眠症、潰瘍、胃食道逆流性疾患（ＧＥＲＤ）、胸焼け、薬物毒性（例えば、５−フルオロウラシル誘発性胃腸毒性、統合失調症、双極性障害、自閉症により引き起こされる過敏症、便秘、てんかんが含まれる。
【０３３０】
いくつかの実施形態において、グリカン組成物を含む医薬組成物は、その投与が症状を誘発する、（例えば、抗癌）薬物の投与、または非薬物（例えば、抗癌）治療の前、同時、または後に投与される。
【０３３１】
一実施形態では、対象における薬物治療（例えば、抗癌剤治療）の毒性を低下させる方法が提供される。この方法は、ａ）薬物治療を受けた対象に、グリカン組成物を含む医薬組成物を投与すること；ｂ）グリカン組成物を含む医薬組成物で治療された対象に薬物治療を施すこと；またはｃ）対象に、グリカン組成物を含む医薬組成物を投与し、かつ薬物治療を施し、それによって対象を治療することを含む。いくつかの実施形態では、毒性は用量制限毒性である。いくつかの実施形態では、本方法は、薬物治療、例えば、抗癌剤治療に対する対象の耐性を増加させる。
【０３３２】
いくつかの実施形態では、用量制限毒性は、対象が薬物の最大有効用量で治療されることを妨げる。用量制限毒性の一例として、化学療法薬イリノテカンおよび５−フルオロウラシルによって下痢が引き起こされ得る。いくつかの実施形態では、グリカン組成物は、用量制限毒性を治療するために、例えば、対象が耐え得る用量を増加させるために投与される。いくつかの実施形態において、忍容性は、それぞれの有効な薬物用量に関連する１つ以上の消化異常を制限することによって増加する。
【０３３３】
本明細書に引用または参照したすべての刊行物、特許、および特許出願は、それぞれ個々の刊行物または特許文献が参照により組み込まれることが具体的かつ個々に示されたのと同程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
【実施例】
【０３３４】
本発明は、以下の実施例によってさらに例示される。実施例は、例示の目的のみで提供され、決して本発明の範囲または内容を限定すると考えられるべきではない。本発明の実践は、別記されない限り、当技術分野の技術内の、タンパク質化学、生物化学、組換えＤＮＡ技術、および薬理学の従来の方法が用いられるであろう。かかる技術は、文献内に十分に説明される。例えば、Ｔ．Ｅ．Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ（Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ，１９９３）、Ｇｒｅｅｎ＆Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，４ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，２０１２）、Ｃｏｌｏｗｉｃｋ＆Ｋａｐｌａｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ）、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，２２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｐｒｅｓｓ，２０１２）、Ｓｕｎｄｂｅｒｇ＆Ｃａｒｅｙ，Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ：Ｐａｒｔｓ  Ａ  ａｎｄ  Ｂ，５ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，２００７）を参照のこと。
【０３３５】
実施例１：エクスビボでの微生物集団に対するグリカンの効果
グリカンの所望の組成を決定するために、細菌培養物を候補グリカンの存在下で増殖させ、それらの増殖、コミュニティ組成（例えば、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列決定による）、代謝産物の産生、および表現型またはトランスクリプトーム特性のアッセイを行った。所望のグリカンを、細菌培養物内で所望の特性を誘発するそれらの能力に基づいて選択した。細菌培養物には、単一培養物、混合培養物、ヒトまたは実験動物モデルから単離された培養物、ヒトまたは実験動物モデルから単離され、単離物または単離物群が添加された培養物、あるいはヒトまたは実験動物モデルから単離され、一群の種が枯渇した（例えば、抗生物質の適用によって）培養物が含まれる。このアッセイは、抗生物質または他の試験化合物の存在下で行うことができる。インビトロアッセイから得られた結果を、ヒトをグリカンで処理した後、または実験動物にグリカンを投与した後に得られた結果と比較して、結果のインビトロ−インビボの相関関係を確立する。
【０３３６】
実施例２：いくつかのグリカン上でのベータ−グルクロニダーゼ関連株、非関連株、および他の腸共生株の増殖
種々の細菌株（消化管の共生株を含む）の、増殖基質として異なるグリカンを利用する能力を評価するインビトロでのアッセイを実施した。このアッセイは、選択されたグリカンの、ベータ−グルクロニダーゼ産生に関連する微生物叢、ベータ−グルクロニダーゼ産生に関連しない微生物叢、および他の腸共生株の増殖を促進する能力を評価するように設計された。ラクトバチルス・ガセリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉ）を好気的に取り扱い、他のすべての細菌株を、パラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、すべての工程で取り扱った。チャンバは最初に、水素５％、二酸化炭素５％および窒素９０％からなる嫌気性ガス混合物でパージすることによって嫌気性にし、その後、この同じ嫌気性ガス混合物を使用して嫌気性状態に維持した。酸素の存在下で色が変化するＯｘｏｉｄ嫌気性インジケーターストリップを用いてチャンバの嫌気性を毎日確認した。すべての培養培地、アッセイプレート、他の試薬およびプラスチック消耗品を、細菌と接触する前に２４〜４８時間、嫌気性チャンバ内で予め還元した。グリカンｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｇａｌ１００、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｇｌｕ１００、ｍａｎ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｍａｎ６６ｇａｌ３３、ｘｙｌ７５ａｒａ２５、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０およびｇｌｕ６０ｍａｎ４０、市販の対照、ＦＯＳ（Ｎｕｔｒａｆｌｏｒａ  ＦＯＳ；ＮＯＷ  Ｆｏｏｄｓ、Ｂｌｏｏｍｉｎｇｄａｌｅ  ＩＬ）、ならびにデキストロースを、水中５％ｗ／ｖに調製し、濾過滅菌し、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０アッセイプレートに添加し、アッセイにおいて最終濃度０．５％ｗ／ｖとし、各グリカンは２〜４つの隣接しないウェルでアッセイし、デキストロースと水を陽性対照および陰性対照として供給した。
【０３３７】
細菌分離株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）およびＬｅｉｂｎｉｚ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ＤＳＭＺ−Ｇｅｒｍａｎ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（ＤＳＭＺ）から得た。ルミノコッカス・オベウム（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ）ＡＴＣＣ  ２９７１４「ＲＯＢ．７４」株、バクテロイデス・カカエ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃａｃｃａｅ）ＡＴＣＣ  ４３１８５「ＢＣＡ．２６」株、バクテロイデス・シータイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）ＡＴＣＣ  ２９７４１「ＢＴＨ．８」株、バクテロイデス・セルロシリティカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｓｉｌｙｔｉｃｕｓ）  ＤＳＭ１４８３８「ＢＣＥ．７１」株、パラバクテロイデス・ディスタソニス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）ＡＴＣＣ  ８５０３「ＰＤＩ．６」株、バクテロイデス・ブルガータス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｖｕｌｇａｔｕｓ）ＡＴＣＣ  ８４８２「ＢＶＵ．１０」株、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）ＡＴＣＣ  ３５７０４「ＣＳＣ．３２」株、ドレア・フォルミシゲネランス（Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）ＡＴＣＣ  ２７７５５「ＤＦＯ．３６」株およびビフィズス菌ビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）ＡＴＣＣ  １５７０７「ＢＬＯ．１６」株およびビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）ＤＳＭ  ２００８８「ＢＬＯ．８３」株の培養物を、牛赤身挽肉、カゼインの酵素消化物、酵母エキス、リン酸カリウム、デキストロース、システイン、ヘミンおよびビタミンＫ１を含む予め還元された濃縮培地、Ｃｈｏｐｐｅｄ  Ｍｅｅｔ  Ｇｌｕｃｏｓｅブロス（ＣＭＧ、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、３７℃で１８〜４８時間、嫌気的に増殖させた。ラクトバチルス・ガセリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉ）ＡＴＣＣ  ３３３２３「ＬＧＡ．４４」の培養物を、ＣＭＧ中、３７℃で１８〜４８時間、好気的に増殖させた。製造業者のプロトコルに従ってＧｅｎ５  ２．０  Ａｌｌ−Ｉｎ−Ｏｎｅ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ  Ｓｏｆｔｗａｒｅを備えたＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  ２プレートリーダーを使用して、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０ポリスチレン９６ウェル平底アッセイプレートにおいて６００ｎＭ（ＯＤ６００）での各培養物の光学密度を測定し、糖を含まずに調製した規定培地および半規定培地において最終的にＯＤ６００  ０．０１まで細胞を希釈することによって、接種物を調製した。Ｂ．ブルガータス（Ｂ．Ｖｕｌｇａｔｕｓ）、Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．Ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、Ｐ．ディスタソニス（Ｐ．Ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）およびＢ．ロングム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）分離株を、０〜５％（ｖ／ｖ）ＣＭＧを添加した、９００ｍｇ／Ｌ塩化ナトリウム、２６ｍｇ／Ｌ塩化カルシウム二水和物、２０ｍｇ／Ｌ塩化マグネシウム六水和物、１０ｍｇ／Ｌ塩化マンガン四水和物、４０ｍｇ／Ｌ硫酸アンモニウム、４ｍｇ／Ｌ硫酸鉄七水和物、１ｍｇ／Ｌ塩化コバルト六水和物、３００ｍｇ／Ｌ第二リン酸カリウム、１．５ｇ／Ｌ第二リン酸ナトリウム、５ｇ／Ｌ炭酸水素ナトリウム、０．１２５ｍｇ／Ｌビオチン、１ｍｇ／Ｌピリドキシン、１ｍ／Ｌパントテン酸塩、７５ｍｇ／Ｌヒスチジン、７５ｍｇ／Ｌグリシン、７５ｍｇ／Ｌトリプトファン、１５０ｍｇ／Ｌアルギニン、１５０ｍｇ／Ｌメチオニン、１５０ｍｇ／Ｌトレオニン、２２５ｍｇ／Ｌバリン、２２５ｍｇ／Ｌイソロイシン、３００ｍｇ／Ｌロイシン、４００ｍｇ／Ｌシステイン、および４５０ｍｇ／Ｌプロリン（Ｔｈｅｒｉｏｔ  ＣＭ  ｅｔ  ａｌ．Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ．２０１４；５：３１１４）中で試験した。Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、Ｂ．カカエ（Ｂ．ｃａｃｃａｅ）およびＢ．セルロシリティカス（Ｂ．ｃｅｌｌｕｌｏｓｙｌｉｔｉｃｕｓ）を、１００ｍＭリン酸カリウム緩衝液（ｐＨ７．２）、１５ｍＭ塩化ナトリウム、８．５ｍＭ硫酸アンモニウム、４ｍＭ  Ｌ−システイン、１．９μＭヘマチン、２００μＭ  Ｌ−ヒスチジン、１００μＭ塩化マグネシウム、１．４μＭ硫酸鉄七水和物、５０μＭ塩化カルシウム、１μｇ／ｍＬビタミンＫ３および５ｎｇ／ｍＬビタミンＢ１２（Ｍａｒｔｅｎｓ  ＥＣ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｅｌｌ  Ｈｏｓｔ  ＆  Ｍｉｃｒｏｂｅ  ２００８；４，４４７−４５７）中で試験した。Ｌ．ガセリ（Ｌ．ｇａｓｓｅｒｉ）、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）およびＲ．オベウム（Ｒ．ｏｂｅｕｍ）を、０〜５％ＣＭＧを添加した、１０ｇ／Ｌトリプトンペプトン、５ｇ／Ｌ酵母エキス、０．５ｇ／Ｌ  Ｌ−システイン塩酸塩、０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液ｐＨ７．２、１μｇ／ｍＬビタミンＫ３、０．０８％ｗ／ｖ塩化カルシウム、０．４μｇ／ｍＬ硫酸鉄七水和物、１μｇ／ｍＬレサズリン、１．２μｇ／ｍＬヘマチン、０．２ｍＭヒスチジン、０．０５％Ｔｗｅｅｎ  ８０、０．５％肉エキス（Ｓｉｇｍａ）、１％微量ミネラル補給剤（ＡＴＣＣ）、１％ビタミン補給剤（ＡＴＣＣ）、０．０１７％ｖ／ｖ酢酸、０．００１％ｖ／ｖイソ吉草酸、０．２％ｖ／ｖプロピオン酸および０．２％ｖ／ｖ  Ｎ−酪酸（Ｒｏｍａｎｏ  ＫＡ  ｅｔ  ａｌ．ｍＢｉｏ  ２０１５；６（２）：ｅ０２４８１−１４）中で試験した。細菌を、９６ウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり２００μＬの最終容量の、グリカンａｒａ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇａｌ１００、ｇｌｕ１００、ｘｙｌ１００、ａｒａ１００、ａｒａ６０ｘｙｌ４０、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｍａｎ１００、ｘｙｌ７５ａｒａ２５、市販のＦＯＳおよびデキストロースに、３７℃で、１８〜４８時間、嫌気的に曝露した。インキュベーション時間の終わりに、各分離株についてのＯＤ６００測定値を、製造業者の仕様書に従って、Ｇｅｎ５  ２．０ソフトウェア付きのＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ２リーダーを用いて得た。
【０３３８】
著しく異なるＯＤ６００範囲内で増殖する菌株によるグリカン利用の比較を容易にするために、試験グリカン上の分離株のＯＤ６００読み出し値を、０．５％ｗ／ｖデキストロースを添加した培地中の単離物の平均ＯＤ６００で除算することによって、測定値を正規化した。表８に、得られた結果を要約する。
【０３３９】
【表１７】
2019527213.tif 000018
【０３４０】
Ｌ．ガセリ（Ｌ．Ｇａｓｓｅｒｉ）、Ｒ．オベウム（Ｒ．ｏｂｅｕｍ）およびＢ．ロングム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）は、報告されているβ−グルクロニダーゼ産生菌と同じ種または属に属し、したがって、β−グルクロニダーゼ産生と関連している（Ｒｕｓｓｅｌｌ，Ｗ．Ｍ．ａｎｄ  Ｋｌａｅｎｈａｍｍｅｒ，Ｔ．Ｒ．Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｃｌｏｎｉｎｇ  ｏｆ  ｇｕｓＡ，ｅｎｃｏｄｉｎｇ  ａ  ｎｅｗ  β−ｇｌｕｃｕｒｏｎｉｄａｓｅ  ｆｒｏｍ  Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉ  ＡＤＨ．Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２００１；Ｂｅａｕｄ  ｅｔ  ａｌ，Ｇｅｎｅｔｉｃ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  β−ｇｌｕｃｕｒｏｎｉｄａｓｅ  ｅｎｚｙｍｅ  ｆｒｏｍ  ａ  ｈｕｍａｎ  ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ，Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ２００５；Ｒｏｙ，Ｄ  ＆  Ｗａｒｄ，Ｐ．Ｒａｐｉｄ  ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｅｎｔｉｕｍ  ｂｙ  ｅｎｚｙｍａｔｉｃ  ｈｙｄｒｏｌｙｓｉｓ  ｏｆ  β−ｇｌｕｃｕｒｏｎｉｄｅ  ｓｕｂｓｔｒａｔｅｓ．Ｊ  Ｆｏｏｄ  Ｐｒｏｔｅｃｔ．１９９２．）。Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）およびＢ．ブルガータス（Ｂ．ｖｕｌｇａｔｕｓ）は、インビトロでは、検出可能なβ−グルクロニダーゼ活性がないと報告されており（Ｄａｂｅｋ  ｅｔ  ａｌ，Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ  ｏｆ  β−ｇｌｕｃｏｓｉｄａｓｅ  ａｃｔｉｖｉｔｙ  ａｎｄ  ｏｆ  β−ｇｌｕｃｕｒｏｎｉｄａｓｅ  ｇｅｎｅ  ｇｕｓ  ｉｎ  ｈｕｍａｎ  ｃｏｌｏｎｉｃ  ｂａｃｔｅｒｉａ．ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  Ｅｃｏｌ  ２００８）、ドレア属（Ｄｏｒｅａ）種、例えば、Ｄ．フォルミシゲネランス（Ｄ．Ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）のＮＣＢＩタンパク質データベースには、β−グルクロニダーゼは存在しない。したがって、これらの３つの単離物は、β−グルクロニダーゼ産生には関連しないと考えられる。
【０３４１】
このアッセイでは、多くのグリカンが非β−グルクロニダーゼ関連株および他の腸共生株の増殖をβ−グルクロニダーゼ関連株よりも良好に支持し、β−グルクロニダーゼ関連株には比較的低い平均正規化増殖値をもたらした。
【０３４２】
このアッセイでは、Ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３およびｇａｌ１００は、β−グルクロニダーゼ関連株のいずれの増殖も支持しなかったが、５〜６の非β−グルクロニダーゼ関連株および他の腸共生株の増殖を支持し、平均正規化増殖値は０．１５を超えた。このアッセイでは、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｍａｎ８０ｇｌｕ２０、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｇｌｕ１００、ｍａｎ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、およびｍａｎ６６ｇａｌ３３は、非β−グルクロニダーゼ関連株、Ｂ．シータイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、および１〜３の他の腸共生株で少なくとも０．３の正規化増殖値を支持し、一方、それらは、β−グルクロニダーゼ産生菌の増殖に対する支持は比較的弱いか、または全くなく、平均正規化増殖値は、Ｌ．ガセリ（Ｌ．ｇａｓｓｅｒｉ）で＜０．３、Ｒ．オベウム（Ｒ．ｏｂｅｕｍ）およびＢ．ロングム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）で＜０．１５であった。
【０３４３】
細菌性β−グルクロニダーゼは、いくつかの薬物の毒性と関連している。例えば、腸内の微生物性β−グルクロニダーゼは、癌の薬物イリノテカンの非毒性形態を、腸上皮細胞に対して毒性を示す形態に変換する（Ｓｐａｎｏｇｉａｎｎｏｐｏｕｌｏｓ  Ｐ．ｅｔ  ａｌ．Ｔｈｅ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｐｈａｒｍａｃｉｓｔｓ  ｗｉｔｈｉｎ  ｕｓ：ａ  ｍｅｔａｇｅｎｏｍｉｃｓ  ｖｉｅｗ  ｏｆ  ｘｅｎｏｂｉｏｔｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ．Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ｖｏｌ  １４，Ｍａｙ  ２０１６）。非β−グルクロニダーゼ関連株の増殖を選択的に支持するグリカンを、イリノテカン化学療法を受けている患者に投与することにより、腸内のβ−グルクロニダーゼ産生株の相対存在度を減少させ、それによってイリノテカン関連下痢を減少させることができる。
【０３４４】
【表１８】
2019527213.tif 000019
【０３４５】
【表１９】
2019527213.tif 000020
【０３４６】
実施例３：植物エストロゲン代謝に関連する細菌のグリカン支持増殖
胃腸管の共生株を含む種々の細菌株の、増殖基質として異なるグリカンを利用する能力を評価するインビトロのアッセイを実施した。このアッセイは、選択されたグリカンの、乳癌に対する予防効果に関連している植物エストロゲン代謝に関連する微生物叢の増殖を促進する能力を評価するように設計された。細菌株を、パラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、すべての工程で取り扱った。チャンバは最初に、水素５％、二酸化炭素５％および窒素９０％からなる嫌気性ガス混合物でパージすることによって嫌気性にし、その後、この同じ嫌気性ガス混合物を使用して嫌気性状態に維持した。酸素の存在下で色が変化するＯｘｏｉｄ嫌気性インジケーターストリップを用いてチャンバの嫌気性を毎日確認した。すべての培養培地、アッセイプレート、他の試薬およびプラスチック消耗品を、細菌と接触する前に２４〜４８時間、嫌気性チャンバ内で予め還元した。グリカンｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ１００、ｇａｌ１００、ｍａｎ８０ｇｌｕ２０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｍａｎ６６ｇａｌ３３、ｍａｎ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｘｙｌ７５ａｒａ２５およびｘｙｌ１００を、水中５％ｗ／ｖで調製し、濾過滅菌し、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０アッセイプレートに添加して、アッセイにおいて最終濃度０．５％ｗ／ｖとし、各グリカンは２つの隣接しないウェルでアッセイし、デキストロースおよび水を陽性対照および陰性対照として供給した。
【０３４７】
細菌分離株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）およびＬｅｉｂｎｉｚ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ＤＳＭＺ−Ｇｅｒｍａｎ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ  ａｎｄ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（ＤＳＭＺ）から得た。ブラウティア・プロドゥクタ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｐｒｏｄｕｃｔａ）ＡＴＣＣ  ２７３４０「ＢＰＲ．２２」株、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）ＡＴＣＣ  ３５７０４「ＣＳＣ．３２」株、エンテロコッカス・フェシウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ）ＡＴＣＣ  ７００２２１「ＥＦＭ．６６」株、ならびにビフィズス菌ビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）ＡＴＣＣ  １５７０７「ＢＬＯ．１６」株およびビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）ＤＳＭ  ２００８８「ＢＬＯ．８３」株の培養物を、牛赤身挽肉、カゼインの酵素消化物、酵母エキス、リン酸カリウム、デキストロース、システイン、ヘミンおよびビタミンＫ１を含む予め還元された濃縮培地、Ｃｈｏｐｐｅｄ  Ｍｅｅｔ  Ｇｌｕｃｏｓｅブロス（ＣＭＧ、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中、３７℃で１８〜４８時間、嫌気的に増殖させた。製造業者のプロトコルに従ってＧｅｎ５  ２．０  Ａｌｌ−Ｉｎ−Ｏｎｅ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ  Ｓｏｆｔｗａｒｅを備えたＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  ２プレートリーダーを使用して、Ｃｏｓｔａｒ  ３３７０ポリスチレン９６ウェル平底アッセイプレートにおいて６００ｎＭ（ＯＤ６００）での各培養物の光学密度を測定し、糖を含まずに調製した規定培地および半規定培地において最終的にＯＤ６００  ０．０１まで細胞を希釈することによって、接種物を調製した。Ｂ．プロドゥクタ（Ｂ．Ｐｒｏｄｕｃｔａ）、Ｅ．フェシウム（Ｅ．ｆａｅｃｉｕｍ）、およびＢ．ロングム（Ｂ．ｌｏｎｇｕｍ）分離株を、０〜５％（ｖ／ｖ）ＣＭＧを添加した、９００ｍｇ／Ｌ塩化ナトリウム、２６ｍｇ／Ｌ塩化カルシウム二水和物、２０ｍｇ／Ｌ塩化マグネシウム六水和物、１０ｍｇ／Ｌ塩化マンガン四水和物、４０ｍｇ／Ｌ硫酸アンモニウム、４ｍｇ／Ｌ硫酸鉄七水和物、１ｍｇ／Ｌ塩化コバルト六水和物、３００ｍｇ／Ｌリン酸カリウム二塩基、１．５ｇ／Ｌリン酸ナトリウム二塩基、５ｇ／Ｌ炭酸水素ナトリウム、０．１２５ｍｇ／Ｌビオチン、１ｍｇ／Ｌピリドキシン、１ｍ／Ｌパントテン酸塩、７５ｍｇ／Ｌヒスチジン、７５ｍｇ／Ｌグリシン、７５ｍｇ／Ｌトリプトファン、１５０ｍｇ／Ｌアルギニン、１５０ｍｇ／Ｌメチオニン、１５０ｍｇ／Ｌトレオニン、２２５ｍｇ／Ｌバリン、２２５ｍｇ／Ｌイソロイシン、３００ｍｇ／Ｌロイシン、４００ｍｇ／Ｌシステイン、および４５０ｍｇ／Ｌプロリン（Ｔｈｅｒｉｏｔ  ＣＭ  ｅｔ  ａｌ．Ｎａｔ  Ｃｏｍｍｕｎ．２０１４；５：３１１４）中で試験した。Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）を、１０ｇ／Ｌトリプトンペプトン、５ｇ／Ｌ酵母エキス、０．５ｇ／Ｌ  Ｌ−システイン塩酸塩、０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液ｐＨ７．２、１μｇ／ｍＬビタミンＫ３、０．０８％ｗ／ｖ塩化カルシウム、０．４μｇ／ｍＬ硫酸鉄七水和物、１μｇ／ｍＬレサズリン、１．２μｇ／ｍＬヘマチン、０．２ｍＭヒスチジン、０．０５％Ｔｗｅｅｎ  ８０、０．５％肉エキス（Ｓｉｇｍａ）、１％微量ミネラル補給剤（ＡＴＣＣ）、１％ビタミン補給剤（ＡＴＣＣ）、０．０１７％ｖ／ｖ酢酸、０．００１％ｖ／ｖイソ吉草酸、０．２％ｖ／ｖプロピオン酸および０．２％ｖ／ｖ  Ｎ−酪酸（Ｒｏｍａｎｏ  ＫＡ  ｅｔ  ａｌ．ｍＢｉｏ  ２０１５；６（２）：ｅ０２４８１−１４）中で試験した。細菌を、９６ウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり２００μＬの最終容量の、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ１００、ｇａｌ１００、ｍａｎ８０ｇｌｕ２０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｍａｎ６６ｇａｌ３３、ｍａｎ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｘｙｌ７５ａｒａ２５、ｘｙｌ１００およびデキストロースに、３７℃で、１８〜４８時間、嫌気的に曝露した。インキュベーション時間の終わりに、各分離株についてのＯＤ６００測定値を、製造業者の仕様書に従って、Ｇｅｎ５  ２．０ソフトウェア付きのＢｉｏｔｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ２リーダーを用いて得た。著しく異なるＯＤ６００範囲内で増殖する菌株によるグリカン利用の比較を容易にするために、試験グリカン上の分離株のＯＤ６００読み出し値を、０．５％ｗ／ｖデキストロースを添加した培地中の単離物の平均ＯＤ６００で除算することによって、測定値を正規化した。表１１に、得られた結果を要約する。
【０３４８】
【表２０】
2019527213.tif 000021
【０３４９】
【表２１】
2019527213.tif 000022
【０３５０】
ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）の菌種およびＥ．フェシウム（Ｅ．ｆａｅｃｉｕｍ）は、植物エストロゲンのダイジン（イソフラボン）を同程度に代謝することが報告されている。Ｂ．プロドゥクタ（Ｂ．Ｐｒｏｄｕｃｔａ）、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、および、エンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）は、植物エストロゲンの異なるクラスである植物リグナンをエンテロジオールおよびエンテロラクトンに代謝することが報告されている（Ｓｐａｎｏｇｉａｎｎｏｐｏｕｌｏｓ  Ｐ．ｅｔ  ａｌ．Ｔｈｅ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｐｈａｒｍａｃｉｓｔｓ  ｗｉｔｈｉｎ  ｕｓ：ａ  ｍｅｔａｇｅｎｏｍｉｃｓ  ｖｉｅｗ  ｏｆ  ｘｅｎｏｂｉｏｔｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ．Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ｖｏｌ  １４，Ｍａｙ  ２０１６）。したがって、Ｂ．ロングム（Ｂ．Ｌｏｎｇｕｍ）、Ｂ．プロドゥクタ（Ｂ．Ｐｒｏｄｕｃｔａ）、Ｃ．シンデンス（Ｃ．ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、およびＥ．フェカリス（Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ）は、植物エストロゲンの代謝と関連している。
【０３５１】
このアッセイにおいて、異なるグリカンは、植物エストロゲン代謝に関連する異なる数のこれらの細菌株の異なるレベルの増殖を支持した。このアッセイにおいて、ｇｌｕ８０ｍａｎ２０、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０およびｇｌｕ１００は、５菌株のうちの４〜５の増殖を支持し、少なくとも０．１５の平均正規化増殖値をもたらした。このアッセイにおいて、Ｇｌｕ１００およびｇａｌ１００は、３菌株の増殖を支持し、平均正規化増殖値は少なくとも０．１５であった。このアッセイにおいて、Ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｆｕｃ３３、ｍａｎ６０ｇｌｕ４０、ｍａｎ８０ｇａｌ２０、ｍａｎ６６ｇａｌ３３、ｍａｎ１００およびｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９は、２菌株の増殖を支持し、このアッセイにおいて、ｘｙｌ７５ａｒａ２５およびｘｙｌ１００は、１菌株の増殖を支持した。
【０３５２】
植物リグナンおよびイソフラボンなどの植物エストロゲンの、腸内細菌によるエストロゲン受容体に結合する分子への代謝は、乳癌に対する予防効果を有し得る（Ｍａｂｒｏｏｋ，Ｈ．Ｂ  ｅｔ  ａｌ．Ｌｉｇｎａｎ  ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｇｕｔ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｌｏｗｅｒｓ  ｔｕｍｏｒ  ｂｕｒｄｅｎ  ｉｎ  ａ  ｇｎｏｔｏｂｉｏｔｉｃ  ｒａｔ  ｍｏｄｅｌ  ｏｆ  ｂｒｅａｓｔ  ｃａｎｃｅｒ．Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ  ３３，２０３−２０８（２０１２））。したがって、植物エストロゲン代謝に関連する細菌種の増殖を促進するグリカンの投与は、ヒトにおける乳癌および／または他の型の癌に対する予防効果を誘発し得る。
【０３５３】
【表２２】
2019527213.tif 000023
【０３５４】
実施例４：微生物叢による外因性物質の改変
ＭｅｔａｂｏｌｏｎのＬＣ−ＭＳベースのＤｉｓｃｏｖｅｒｙＨＤ４プラットフォームを使用して、高脂肪食（Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｄｉｅｔｓ  Ｄ１２４９２）、または高脂肪食＋グリカンを与えたマウスからの盲腸内容物３０〜５０ｍｇに対して、非標的化メタボロミクスを実施した。
【０３５５】
飲料水中に１％のｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９を添加して微生物叢によって改変された３種の外因性物質、エンテロラクトン、スタキドリン、およびキナ酸を同定した。図１Ａ、１Ｂ、および１Ｃを参照のこと。
【０３５６】
食餌中に存在する植物リグニン前駆体から腸内細菌の作用によって形成される哺乳類リグニンであるエンテロラクトンは、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９で治療した動物において増加した。エンテロラクトンは、ヒトにおいて有益な健康効果を有し得ると考えられる。エンテロラクトンの減少は、多くのヒトの病理と関連している。例えば、２型糖尿病を有する個体は、健常対照と比較した場合、尿中エンテロラクトンの有意な減少を有することが実証されている（Ｓｕｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ，２０１４）。エンテロラクトンの投与により実験的乳癌の増殖が阻害または遅延されることが示されているので、エンテロラクトンはいくつかの抗発癌作用を有することも示されている（Ｓａａｒｉｎｅｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ  ＆  Ｆｏｏｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２０１３）。疫学研究では、乳がん患者では健常対照群と比較してエンテロラクトンの濃度が低いことが観察されており、このことはエンテロラクトンが抗発癌性を有することを示唆している可能性がある。エンテロラクトンおよびリグナンはまた、心血管疾患を予防し得る。
【０３５７】
さらに、スタキドリンは、飲料水中に１％のｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９の添加によって減少した。スタキドリンはプロリンベタインとも呼ばれる。プロリンベタインは、多くの柑橘類の食品に存在するグリシンベタインアナログである。スタキドリンは、食餌における柑橘類摂取のマーカーであることが示されている（Ｇｕｅｒｔｉｎ  ｅｔ  ａｌ．ＡＪＣＮ，２０１４）。ヒト尿中のプロリンベタインのレベルの上昇は、柑橘類の果実およびジュースの摂取後に見出される。
【０３５８】
さらに、キナ酸は、ｇｌｕ１００またはｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９を高脂肪食に添加すると増加することがわかった。キナ酸は、多くの微生物の炭素源として利用される豊富な植物生成物である（Ｔｅｒａｍｏｔｏ，ｅｔ  ａｌ．，
Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．，２００９）。これらのデータは、微生物分類群（例えば、ヒト対象の消化管に存在するものなど）による種々の外因性物質の微生物代謝回転が、（本明細書中に記載されるような）グリカン組成物を対象に、対象における外因性物質のレベルを調節（増加または減少）するのに有効な量で投与することによって調節され得ることを示唆している。
【０３５９】
実施例５：イリノテカン毒性の減少／予防のためのグリカンによるヒト対象およびマウスモデルの消化管におけるベータ−グルクロニダーゼレベルの調節
組織学的または細胞学的に確認された結腸直腸腺癌の患者を、ＦＯＬＦＩＲＩ［フォリン酸（ロイコボリン）４００ｍｇ／ｍ２を静脈（ＩＶ）により、１日目；５−ＦＵ  ４００ｍｇ／ｍ２、ＩＶ注射、１日目、続いて２．４ｇ／ｍ２をＩＶで４６時間かけて、１日目から３日目に亘って；イリノテカン１８０ｍｇ／ｍ２をＩＶで、１日目に］からなる化学療法レジメンの投与前１週間、グリカン治療またはプラセボを受ける群に無作為に割り付ける。一次治療の転帰は、ＦＯＬＦＩＲＩレジメンの翌週にグレード２以上の下痢を発現したグリカンまたはプラセボの投与を受けた患者の割合とする。第１の二次転帰は、ＦＯＬＦＩＲＩレジメンの翌週にグレード３以上の下痢を発現したグリカンまたはプラセボの投与を受けた患者の割合とする。第２の二次転帰は、ＦＯＬＦＩＲＩレジメンの翌週に下痢止め治療（ロペラミドなど）を必要としたグリカンまたはプラセボの投与を受けた患者の割合とする。グリカン治療により、β−グルクロニダーゼを発現する細菌と比較して、β−グルクロニダーゼを発現しない細菌の患者の消化管における増殖が増加すると予想され、したがって、イリノテカン（ＳＮ３８）の毒性代謝産物を活性化し得る消化管におけるβ−グルクロニダーゼ酵素の濃度が相対的に減少するであろう。例えば、グリカン１は、腸共生細菌株のＢＴＨ．８、ＢＶＵ．１０、およびＤＦＯ．３６の増殖を増加させ、ＬＧＡ．４４、ＲＯＢ．７４、ＢＬＯ．１６、およびＢＬＯ．８３の増殖を増加させないと予想される（実施例２および表８を参照のこと）。
【０３６０】
イリノテカン化学療法を用いるマウスモデルにおける化学療法誘発毒性に対するグリカンの効果を解明するために、概念実証実験を行った。
【０３６１】
この研究では、１５０匹の雄のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）を無作為に、７群は１群当たり１３匹のマウス、３群は１８匹のマウス、１群は５匹のマウスを選び、群で飼育した。マウスは到着後５日間順化させた。５匹のマウスからなる１群にイリノテカンを投与した。すべてのマウスに特別な食餌を与え、−７日目から毎日の体重をモニターした。
【０３６２】
マウスは、１４日間、脱イオン水またはグリカン組成物を強制経口投与された。−６日目から、グリカン治療群の動物は、６ｇ／ｋｇ／日のグリカン組成物またはＦＯＳによる強制経口投与による治療を開始し、グリカンによる治療を７日目まで継続した。この同じ期間中、対照群の動物に水を与えた。すべての群（イリノテカンを投与しない対照群を除く）に、０日目にイリノテカンを２５０ｍｇ／ｋｇの用量で単回投与により腹腔内注射した。一過性の下痢を予防するために、イリノテカン投与時に、アトロピンを０．０３ｍｇ／ｋｇで皮下注射した。
【０３６３】
毎日、マウスの体重を測定し、生存をモニターした。−１日目に、１６Ｓシークエンシングおよび短鎖脂肪酸評価のために、４群からの５匹のマウスを安楽死させ、盲腸および結腸内容物を回収した。−６、−１、１、３、５および７日目に糞便を採取し、−８０℃で保存した。７日目に、残りの動物を安楽死させて、血液および組織を採取した。図１８Ａおよび１８Ｂは、ＦＯＳ、Ｇｌｕ５０Ｇａｌ５０、またはＧａｌ１００を与えたマウスが、グリカン組成物を与えなかったマウスよりも、実験期間中の体重の減少が少なかったことを示す。体重減少の低下は、動物がより健康であり、イリノテカン代謝により受けた毒性が少なかったことの証しである。これらのデータは、グリカンが、動物における外因性物質の微生物処理により毒性を有するイリノテカン産物／中間体の生成を制限し（上記のように）、それによって薬物の全体的な毒性を制限するような方法で、動物における微生物コミュニティをシフトし得ることを示唆している。
【０３６４】
実施例６：乳癌の治療のためのグリカンによる植物エストロゲン代謝関連細菌の調節
植物リグナンおよびイソフラボンなどの植物エストロゲンの、腸内細菌によるエストロゲン受容体に結合する分子への代謝は、乳癌に対する予防効果を有し得る（Ｍａｂｒｏｏｋ，Ｈ．Ｂ  ｅｔ  ａｌ．Ｌｉｇｎｉｎ  ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｇｕｔ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｌｏｗｅｒｓ  ｔｕｍｏｒ  ｂｕｒｄｅｎ  ｉｎ  ａ  ｇｎｏｔｏｂｉｏｔｉｃ  ｒａｔ  ｍｏｄｅｌ  ｏｆ  ｂｒｅａｓｔ  ｃａｎｃｅｒ．Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ  ３３，２０３−２０８（２０１２））。グリカンの投与は、ＢＰＲ．２２およびＥＦＭ．６６などの植物エストロゲン代謝関連細菌の相対的増殖を増加させ（実施例３および表１１を参照のこと）、したがって、ヒトにおける植物エストロゲンの濃度を増加させ、乳癌および／または他のタイプの癌に対する保護効果を誘発する。乳がんのリスクが高い女性を、グリカン治療またはプラセボを１２ヶ月間受ける群に無作為に割り付ける。選定基準は、ｉ）５年ゲイルリスク＞１．７％、ｉｉ）既知のＢＲＣＡ１／ＢＲＣＡ２遺伝子変異保因者、ｉｉｉ）遺伝性乳癌と一致する家族歴、ｉｖ）異型増殖症または上皮内小葉癌（ＬＣＩＳ）を示す事前生検、またはｖ）浸潤性乳癌または非浸潤性乳管癌（ＤＣＩＳ）の既往歴のいずれかであり、タモキシフェン／アロマターゼ阻害剤を含む標準治療を完了しているか、またはタモキシフェン／アロマターゼ阻害剤で治療されないであろう。グリカンまたはプラセボ治療の１年後に、ｉ）プラセボ（微結晶セルロース）と比較して、グリカンを毎日補給した高リスク女性または浸潤性乳癌またはＤＣＩＳを有する女性の磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）体積（３次元マンモグラフィー密度と同等）の減少、ｉｉ）プラセボと比較して、グリカン治療をした乳房上皮細胞の、それぞれＫｉ６７およびカスパーゼ３染色によって測定される細胞増殖およびアポトーシスの減少、ｉｉｉ）プラセボと比較して、グリカンで治療された女性におけるエストロゲン受容体アルファ（ＥＲアルファ）およびＥＲベータの中間分子マーカー発現の減少、について患者を評価する。
【０３６５】
実施例７：２型糖尿病の治療のためのグリカンによる植物エストロゲン代謝関連細菌の調節
マイクロバイオームは、２型糖尿病の発症および進行に影響を及ぼす。２型糖尿病の患者は、尿によって測定される微生物代謝物循環のレベルが変化することがわかっている。例えば、微生物により産生されたリグナンエンテロラクトンの濃度は、２型糖尿病のリスクと逆相関する（Ｓｕｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ  ３７．５（２０１４）：１２８７−９５）。エンテロラクトンなどの分子の濃度を増加させることにより、２型糖尿病患者の転帰を改善することができる。図６に示すように、グリカンはマウスの食餌由来のエンテロラクトンの産生を増加させることができる。
【０３６６】
２型糖尿病の患者をグリカンで治療することにより、循環中のエンテロラクトンの濃度を、プラセボ対照治療と比較して増加させることができる。患者は、以下の基準のうちの少なくとも１つに基づいて含まれる：１）グルコース濃度の上昇（空腹時血糖値≧７．０ｍｍｏｌ／Ｌ、ランダム血糖値≧１１．１ｍｍｏｌ／Ｌ、または経口グルコース負荷後の血糖値≧１１．１ｍｍｏｌ／Ｌ）および糖尿病に関連する少なくとも１つの症状；２）症状はないが、２回の別々のときのグルコース濃度の上昇；あるいは３）インスリンまたは経口血糖降下薬による治療。患者をグリカンまたはプラセボ対照で６ヶ月間治療する。６ヶ月の終わりに、グリカン治療は、エレクトロスプレーイオン化ｏｒｂｉｒａｐ液体クロマトグラフィー−質量分析法によって評価されるように、患者の尿中のエンテロラクトンの濃度を、プラセボと比較して増加させると予想される。さらに、６ヶ月の終わりに、グリカン治療は、プラセボで治療された患者と比較して、空腹時血糖値または経口負荷後の血糖値を減少させると予想される。
【０３６７】
実施例８：実施例９〜２１のプロトコル
実施例９〜２１を、以下のプロトコルに従って実施した：
エクスビボアッセイは、微生物の複雑なコミュニティを調節するためにグリカンを使用できるか否か、また、グリカンが複数（１２人）の対象から得られたコミュニティにわたって一貫した効果を生じたか否かを決定するように設計された。糞便試料およびスラリーをパラジウム触媒を特徴とする嫌気性チャンバ（ＡＳ−５８０、Ａｎａｅｒｏｂｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）中で取り扱った。グリカンａｒａ１００、ｇａｌ１００、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇｌｕ１００、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３Ａｒａ３３、ｍａｎ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ならびに市販のグリカンのラクツロース（Ａｌｆａ  Ａｅｓａｒ）およびＦＯＳ（Ｎｕｔｒａｆｌｏｒａ  ＦＯＳ；ＮＯＷ  Ｆｏｏｄｓ、Ｂｌｏｏｍｉｎｇｄａｌｅ  ＩＬ）を、この試験に含めた。１２人の対象から得られた糞便試料供与物を−８０℃で保存した。作業ストックを調製するために、糞便試料を嫌気性チャンバに移し、解凍した。糞便サンプルを、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）ｐＨ７．４（Ｐ０２６１、Ｔｅｋｎｏｖａ  Ｉｎｃ．、Ｈｏｌｌｉｓｔｅｒ、ＣＡ））中、２０％ｗ／ｖに調製し、１５％グリセロール、−８０℃で保存した。２０％ｗ／ｖ糞便スラリー＋１５％グリセロールを２，０００×ｇで遠心分離し、上清を除去し、ペレットをＰＢＳ  ｐＨ７．４に懸濁し、１％ｗ／ｖ糞便スラリーとした。調製した１％ｗ／ｖ糞便スラリーを、９６ウェルディープウェルマイクロプレート中、最終濃度０．５％ｗ／ｖ、１ウェル当たり５００μＬの最終容量の試験したグリカンに、３７℃で１８時間、嫌気的に曝露した。ゲノムＤＮＡを糞便試料から抽出し、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の可変領域４を増幅して配列を決定した（Ｅａｒｔｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌ  ｗｗｗ．ｅａｒｔｈｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ．ｏｒｇ／ｅｍｐ−ｓｔａｎｄａｒｄ−ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ／１６ｓ／およびＣａｐｏｒａｓｏ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ．２０１２．Ｕｌｔｒａ−ｈｉｇｈ−ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｎ  ｔｈｅ  Ｉｌｌｕｍｉｎａ  ＨｉＳｅｑ  ａｎｄ  ＭｉＳｅｑ  ｐｌａｔｆｏｒｍｓ．ＩＳＭＥ  Ｊ．）。操作的分類単位（ＯＴＵ）を、１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列を９７％の同一性で整列させることによって形成した。微生物コミュニティを、ＵｎｉＦｒａｃ距離メトリック（Ｌｏｚｕｐｏｎｅ  Ｃ．ｅｔ  ａｌ．，Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｄｅｃｅｍｂｅｒ  ２００５  ｖｏｌ．７１  ｎｏ．１２  ８２２８−８２３５）を用いて互いに比較した。
【０３６８】
実施例９：グリカンによる強心配糖体（例えば、ジゴキシン）代謝関連細菌の調節
腸内放線菌のエガセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）は、心臓病薬ジゴキシンを不活性化することが以前に示されている（例えば、Ｈａｉｓｅｒ  ｅｔ  ａｌ．２０１４．Ｇｕｔ  Ｍｉｃｒｏｂｅｓ：５（２）：２３３−２３８を参照のこと）。ジゴキシン不活化との関連は、心臓グリコシドレダクターゼ（ｃｇｒ）オペロンを保有するエガセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）株に限定されるが、ジゴキシン治療中の患者におけるエガセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）レベルの抑制はジゴキシン薬の不活化を防止または減少させる可能性がある。
【０３６９】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがエガセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）のレベルを有意に低下させることを示した（図９）。グリカン調製物を含む試料はすべて、接種後４５時間で対照と比較した場合、エガセラ・レンタ（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｌｅｎｔａ）の相対組成の統計的に有意な（ウィルコクソンの順位和検定−ｐ値＜０．０５）減少を示した。４種類のグリカンは、また、天然に存在するフルクトースオリゴ糖（ＦＯＳ）よりも高い減少を示した。
【０３７０】
実施例１０：グリカンによるスルホンアミド（例えば、スルファサラジン）代謝関連細菌の調節
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）種、エンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）およびラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）種に見出される微生物アゾレダクターゼは、関節リウマチの治療に用いられるスルファサラジンを活性型に変換することが知られている。微生物アゾレダクターゼを発現する微生物のレベルまたは活性を増加させることにより、スルファサラジンによる治療の有効性を高め得る。
【０３７１】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがバクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）種、およびエンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）のレベルを有意に増加させることを示した（図２および３）。
【０３７２】
このアッセイでは、ｍａｎ１００、ｇｌｕ１００、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ａｒａ１００、ＦＯＳ、ｇａｌ１００、およびｇｌｕ６０ｍａｎ４０が、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）種および／またはエンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）のレベルを増加させるようであった。さらに、ｍａｎ１００がラクトバチルス属（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）種のレベルを増加させた。
【０３７３】
実施例１１：グリカンによるＳＮ−３８グルクロニド代謝関連細菌の調節
プロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、およびアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）に見出される微生物ベータ−グルクロニダーゼは、癌（例えば、結腸直腸癌）の治療に用いられ、下痢の副作用を有するＳＮ−３８グルクロニドを、糖部分を除去することによって改変し、腸上皮細胞に対して毒性を示す化合物を生成することが知られている。微生物ベータ−グルクロニダーゼを発現する微生物のレベルまたは活性を減少させることにより、ＳＮ−３８グルクロニジン治療の有効性を増加させ、かつ／または副作用を減少／防止し得る。
【０３７４】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがフィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、プロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、およびアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）のレベルを有意に減少させることを示した（図４〜６）。
【０３７５】
このアッセイでは、ｍａｎ１００、ｇａｌ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｇｌｕ１００、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ラクツロース、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ＦＯＳ、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、およびａｒａ１００が、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、プロテオバクテリア門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、および／またはアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）のレベルを減少させるようであった。
【０３７６】
実施例１２：グリカンによるＮＳＡＩＤ（例えば、チロシンおよびフェニルアラニン）代謝関連細菌の調節
フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）（例えば、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ））、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、および／またはフソバクテリウム門（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ）に見出される微生物酵素は、チロシンおよび／またはフェニルアラニンを、ＳＵＬＴ１Ａ１に対しアセトアミノフェンと競合するｐ−クレゾールに変化させることが知られている。前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を減少させることにより、アセトアミノフェンの有効性を増加させ、かつ／または薬物性毒性を減少させ得る。
【０３７７】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがフィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、およびアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）のレベルを有意に減少させることを示した（図４および６）。
【０３７８】
このアッセイでは、ｍａｎ１００、ｇａｌ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、およびｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３が、フィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、および／またはアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）のレベルを減少させるようであった。
【０３７９】
実施例１３：グリカンによるポリフェノール（例えば、エラジタンニン）代謝関連細菌の調節
アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびコリオバクテリウム科（Ｃｏｒｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ゴルドニバクター属（Ｇｏｒｄｏｎｉｂａｃｔｅｒ）に見出される微生物酵素は、エラジタンニンをエラグ酸に加水分解することが知られている。
【０３８０】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがアクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびコリオバクテリウム科（Ｃｏｒｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ゴルドニバクター属（Ｇｏｒｄｏｎｉｂａｃｔｅｒ）のレベルを有意に減少させることを示した（図６および８）。このアッセイでは、ｍａｎ１００、ｇａｌ１００、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ１００、ラクツロース、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ＦＯＳ、およびａｒａ１００が、アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）および／またはコリオバクテリウム科（Ｃｏｒｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ゴルドニバクター属（Ｇｏｒｄｏｎｉｂａｃｔｅｒ）のレベルを減少させるようであった。
【０３８１】
実施例１４：グリカンによる植物エストロゲン代謝関連細菌の調節
アクチノバクテリア門（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、およびフィルミクテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）に見出される微生物酵素は、植物エストロゲンを、エストロゲン受容体に結合し、乳癌に対する予防効果を有し得る分子に代謝することが知られている。前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を増加させることにより、癌、例えば、乳癌に対する予防効果を有し得、または癌、例えば、乳癌を治療し得る。
【０３８２】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがバクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）のレベルを有意に増加させることを示した（図９）。
【０３８３】
このアッセイではｇａｌ１００、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｍａｎ１００、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇｌｕ１００、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、およびｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３が、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）のレベルを増加させるようであった。
【０３８４】
実施例１５：グリカンによるポリフェノール／イソフラボン（例えば、ダイゼイン）代謝関連細菌の調節
エンテロコッカス・フェシウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ）、ラクトバチルス・ムコサエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｕｃｏｓａｅ）、ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種、およびエゲセラ属（Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ）種に見出される微生物酵素は、ダイジンを、エストロゲン受容体−ベータに結合し、乳癌のリスク／発症の低減に関連し得るエクオルに代謝することが知られている。前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を増加させることにより、癌、例えば、乳癌に対する予防効果を増大させ得、または癌、例えば、乳癌を治療し得る。
【０３８５】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがエンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、およびビフィドバクテリウム科（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）のレベルを有意に増加させることを示した（図３および１０）。
【０３８６】
このアッセイでは、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｍａｎ１００、ＦＯＳ、およびラクツロースが、エンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、および／またはビフィドバクテリウム科（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／ビフィドバクテリウム属（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）のレベルを増加させるようであった。
【０３８７】
実施例１６：グリカンによる植物エストロゲン／ポリフェノール（例えば、リグナン）代謝関連細菌の調節
Ｅ．フェカリス（Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ）、Ｅ．レンタ（Ｅ．Ｌｅｎｔａ）、ブラウティア・プロドゥクタ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｐｒｏｄｕｃｔ）、ユウバクテリウム・リモサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ）、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、ラクチノファクター・ロンゴビフォルミス（Ｌａｃｔｏｎｉｆａｃｔｏｒ  ｌｏｎｇｏｖｉｆｏｒｍｉｓ）、クロストリジウム・サッカログミア（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓａｃｃｈａｒｏｇｕｍｉａ）およびＰ．プロドゥクタ（Ｐ．ｐｒｏｄｕｃｔ）に見出される微生物酵素は、リグナン、例えば、ピノレジノールおよびセコイソラリシレシノールを、乳癌を予防し得るエンテロジオールおよびエンテロラクトンに代謝することが知られている。前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を増加させることにより、癌、例えば、乳癌に対する予防効果を増大させ得、または癌、例えば、乳癌を治療し得る。
【０３８８】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）／ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、エリュシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）／クロストリジウム＿ＸＶＩＩＩ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ＿ＸＶＩＩＩ）、および／またはラクチノファクター属（Ｌａｃｔｏｎｉｆａｃｔｏｒ）／ロンゴビフォルミス（ｌｏｎｇｏｖｉｆｏｒｍｉｓ）のレベルを有意に増大させることを示した（図１１〜１３）。
【０３８９】
このアッセイでは、ｇｌｕ１００、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ａｒａ１００、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、およびｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４が、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）／ブラウティア属（Ｂｌａｕｔｉａ）、エリュシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）／クロストリジウム＿ＸＶＩＩＩ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ＿ＸＶＩＩＩ）、および／またはラクチノファクター属（Ｌａｃｔｏｎｉｆａｃｔｏｒ）／ロンゴビフォルミス（ｌｏｎｇｏｖｉｆｏｒｍｉｓ）のレベルを増大させるようであった。
【０３９０】
実施例１７：グリカンによる複素環式アミン（ＨＣＡ）／多環芳香族炭化水素（ＰＡＨ）代謝関連細菌の調節
ｕｉｄＡ遺伝子を保有する細菌（例えば、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）に見出される微生物ベータ−グルクロニダーゼは、グルクロン酸抱合基質、例えば、（肝臓のグルクロン酸抱合によって解毒されている）複素環アミンを、複合体を除去して毒性化合物を生成することにより活性化することが知られている。微生物ベータ−グルクロニダーゼを発現する微生物のレベルまたは活性を減少させることにより、毒性、例えば、発癌性の化合物の生成を減少させ得、これは癌の予防効果があり得る。
【０３９１】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンが腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）／シゲラ属（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）の微生物のレベルを有意に減少させることを示した（図１４）。
【０３９２】
このアッセイでは、ａｒａ１００、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｍａｎ１００、ＦＯＳ、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇａｌ１００、ラクツロース、ｇｌｕ１００、およびｇｌｕ５０ｇａｌ５０が、腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）／シゲラ属（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）の微生物のレベルを減少させるようであった。
【０３９３】
実施例１８：グリカンによるノンカロリー人工甘味料代謝関連細菌の調節
エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリネバクテリウム属（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、カンピロバクター属（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、およびエシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）に見出される微生物酵素は、甘味料を毒性のあり得る化合物に変換する、例えば、チクロを、毒性のあり得るシクロヘキシルアミンに変換することが知られている。
前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を減少させることにより、毒性化合物の生成を減少させ得る。
【０３９４】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがエンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、および腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）／シゲラ属（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）の微生物のレベルを有意に減少させることを示した（図３および１４）。
【０３９５】
このアッセイでは、ａｒａ１００、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｍａｎ１００、ＦＯＳ、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇａｌ１００、ラクツロース、ｇｌｕ１００、およびｇｌｕ５０ｇａｌ５０が、エンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／エンテロコッカス属（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、および／または腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）／エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）／シゲラ属（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）の微生物のレベルを減少させるようであった。
【０３９６】
実施例１９：グリカンによるヌクレオシドアナログ（例えば、ソリブジン）代謝関連細菌の調節
腸内細菌、例えば、Ｋ．ニューモニエ（Ｋ．Ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）に見出される微生物ホスホリラーゼ（例えばチミジンホスホリラーゼ、またはウリジンホスホリラーゼ）は、ソリブジンを脱グリコシル化し、それを不活性化することが知られている。ソリブジンは、ウイルス感染症（例えば、単純ヘルペスウイルス１型および水痘帯状疱疹ウイルス）の治療に使用される。前記微生物ホスホリラーゼを発現する微生物のレベルまたは活性を減少させることにより、ソリブジンの不活性化を減少させ、ウイルス感染症に対するソリブジン治療の有効性を増加させ得る。
【０３９７】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがエンテロバクター目（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｌｅｓ）／腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）の微生物のレベルを有意に減少させることを示した（図１５）。
【０３９８】
このアッセイでは、ａｒａ１００、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ＦＯＳ、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｍａｎ１００、ｇａｌ１００、ｇｌｕ１００、ラクツロース、およびｇｌｕ５０ｇａｌ５０が、エンテロバクター目（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｌｅｓ）／腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）の微生物のレベルを減少させるようであった。
【０３９９】
実施例２０：グリカンによる免疫療法抗原（例えば、ＣＴＬＡ４阻害剤）代謝関連細菌の調節
バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、例えば、バクテロイデス・シータイオタミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）および／またはバクテロイデス・フラジリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ）は、免疫療法抗原を改変することが知られている。前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を増加させることにより、例えば、癌治療に対する、ＣＴＬＡ４阻害剤の有効性を増大させ得る。  
【０４００】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがバクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）／ドレイ（ｄｏｒｅｉ）／フラジリス（ｆｒａｇｉｌｉｓ）およびバクテロイデス科（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）／バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）の微生物のレベルを有意に増加させることを示した（図１６および２）。
【０４０１】
このアッセイでは、ｍａｎ７２ｇａｌ２５、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｍａｎ１００、ｇｌｕ１００、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ａｒａ１００、ＦＯＳ、ｇａｌ１００、およびｇｌｕ６０ｍａｎ４０が、バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）／ドレイ（ｄｏｒｅｉ）／フラジリス（ｆｒａｇｉｌｉｓ）およびバクテロイデス科（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）／バクテロイデス属（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）の微生物のレベルを増加させるようであった。
【０４０２】
実施例２１：グリカンによる薬物添加剤（例えば、乳化剤）代謝関連細菌の調節
バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）（例えば、バクテロイデス目（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｌｅｓ））、およびルミノコッカス・グナバス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ）などの粘液溶解性細菌に見出される微生物酵素は、乳化剤に対する代謝反応および炎症反応を引き起こすことが知られている。前記微生物酵素を発現する微生物のレベルまたは活性を減少させることにより、乳化剤、例えば、カルボキシメチルセルロースまたはポリソルベート８０の有効性を増大させ、例えば、代謝症候群および／または炎症のリスク／発症を減少させ得る。
【０４０３】
エクスビボアッセイは、いくつかのグリカンがルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）の微生物のレベルを有意に減少させることを示した（図１７）。
【０４０４】
このアッセイでは、ａｒａ１００、ラクツロース、ｇａｌ３３ｍａｎ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ６０ｍａｎ４０、ｍａｎ１００、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ａｒａ３３、ｇｌｕ３３ｇａｌ３３ｍａｎ３４、ｍａｎ７５ｇａｌ２５、ｇｌｕ５０ｇａｌ５０、ｍａｎ５２ｇｌｕ２９ｇａｌ１９、ｇａｌ１００、およびｇｌｕ１００がルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）／ルミノコッカス属（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）の微生物のレベルを減少させるようであった。
【０４０５】
同等物および範囲
本願は、様々な交付済み特許、公開された特許出願、学術論文、および他の刊行物を指し、これらはそれぞれ参照によりその全体が本明細書に組み込まれ、かつ、参照により、言及するすべての頁、項または主題の形態で本明細書に組み込まれる。組み込まれた参照文献のうちの何らかと本出願との間で矛盾がある場合、本出願が制御するものとする。さらに、先行技術に含まれる本発明の任意の特定の実施形態は特許請求の範囲のうちのいずれか１つ以上から明確に排除され得る。かかる実施形態は、当業者には公知であると見なされるため、排除が本明細書に明確に記述されない場合であっても除外され得る。本発明の任意の特定の実施形態は、先行技術の存在に関連しているかどうかであっても、何らかの理由で、いかなる特許請求の範囲からも除外され得る。
【０４０６】
当業者は、単なる通常の実験を用いて、本明細書に記載される特定の実施形態の多くの同等物を認識し、または解明することができるであろう。本明細書に記載される本発明の実施形態の範囲は、添付の特許請求の範囲に記述されるが、上の発明の詳細な説明、図面、または実施例に限定されることは意図されない。当業者は、この説明への様々な変更および修正が、以下の特許請求の範囲に定義されるように、本発明の精神または範囲から逸脱することなくなされ得ることが理解されよう。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８Ａ】
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【図１８Ｂ】
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【国際調査報告】
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