(57)【要約】化学式Ｉにおける構造を有する分子化合物、またはそれらの塩を提供し、式中、ｎ１は独立して、０、１、２、または３であり；ｎ２は０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０であり；ｎ３は０、１、２、または３からのものであり；ｎ４は０または１であり；及びｎ５は０、１、２、または３であり；ならびにＸはＯ、Ｎ、またはＳであり；Ｙ、Ｚ、ＸＸ、及びＹＹは同一であり、または異なり、独立して、ＯまたはＳであり；ＺＺは窒素、酸素、硫黄、またはセレンを含み；ならびにＲ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、Ｒ７、Ｒ８、Ｒ９、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２は、本明細書に記載されるようなものである。また方法は、診断試験への適用に提供された分子の合成及び使用のために提供される。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の構造を有する分子、
【化１】
2019536770.tif 000013
またはその塩であって、
式中、ｎ１は独立して、０、１、２、若しくは３であり；
ｎ２は０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、若しくは２０であり；
ｎ３は０、１、２、若しくは３からのものであり；
ｎ４は０若しくは１であり；及び
ｎ５は０、１、２、若しくは３であり；ならびに
ＸはＯ、Ｎ、若しくはＳであり；
Ｙ、Ｚ、ＸＸ、及びＹＹは同一であり、若しくは異なり、独立して、Ｏ若しくはＳであり；
Ｒ１及びＲ２は同一であり、若しくは異なり、独立して水素、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアリール、アルキニル、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、スルホンアミジル、アシル、孤立電子対、若しくは−ＣＯ２Ｒ１３であり、Ｒ１３はアルキル、アルケニル、アリール、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、若しくはアリールシクロアルキルアルキルであり；またはＲ１及びＲ２、及びそれらが結合されるＮは環を形成し；またはＲ１若しくはＲ２はヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー若しくは抗体、若しくはそのフラグメントを含み；
Ｒ３、Ｒ４、Ｒ６、及びＲ７は同一であり、若しくは異なり、独立して水素、ハロ、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアルキル、アリールアルキル、ヒドロキシアリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、シクロアルキル、チオアルキル、セレノアルキル、ヒドロキシアルキル、若しくはアミノ置換アルキルであり；
Ｒ５はアルキル、アルケニル、アルキニル、若しくはアリールであり、水素、ハロ、アルキル、ポリハロアルキル、アルキオキシ、ハロアルコキシ、ポリハロアルコキシ、アルコキシカルボニル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、チオール、アルキルチオ、アルキルカルボニル、アシル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルスルフィニル、スルホンアミド、若しくはスルホニルとすべて任意選択で置換され；
ＮからＺＺへ配向されるＲ８はアルキル、ヘテロアルキル、アミノ置換アルキル、アミノ置換ヘテロアルキル、アミドアルキル、アミドヘテロアルキル、アミノ置換アミドヘテロアルキルであり、アルキル、ヘテロアルキル、アミノ置換アルキル、アミノ置換ヘテロアルキル、アミドアルキル、アミドヘテロアルキル、若しくはアミノ置換アミドヘテロアルキルとそれぞれ任意選択で置換され；またはＲ８は
【化２】
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であり、ｍは１から１００であり、Ｒ１５、Ｒ１６、Ｒ１７、及びＲ１８は同一であり、若しくは異なり、独立して水素、ハロ、アルキル、ヘテロアルキル、アミノ置換アルキル、アミノ置換ヘテロアルキル、アミドアルキル、アミドヘテロアルキル、アミノ置換アミドヘテロアルキルであり；またはＲ８は、
【化３】
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であり、式中、ｎ６及びｎ８は同一であり、若しくは異なり、独立して、１、２、若しくは３であり、ｎ８は１から２０であり；
Ｒ９はアルキル、ヘテロアルキル、ヒドロキシヘテロアルキル、シリルアルキル、シロキシアルキル、シロキシヘテロアルキル、シロキシヒドロキシヘテロアルキルであり、若しくはＲ９はＲ１９−（ＣＨ２）３−Ｓｉ（Ｚ）ｐであることができ、ｐは１から３であり、Ｚはハロ若しくはアルコキシから選択され、Ｒ１９はヒドロキシアルキル若しくはカルバメートから選択され；
Ｒ１０、Ｒ１１、及びＲ１２は同一であり、若しくは異なり、水素若しくはアルキルから独立して選択され；ならびにＲ９は固相に任意選択で結合され；
ＺＺはＮＲ２０、Ｏ、Ｓ、若しくはＳｅであり、Ｒ２０は水素若しくはアルキルであり；ならびに
（＊）は炭素中心であり、前記炭素中心は独立して、不斉中心若しくは非不斉中心であることが可能である；
前記分子またはその塩。
【請求項２】
Ｘは、Ｎであり、Ｒ１及びＲ２は、同一であり、または異なり、水素、アシル、アシルオキシ、ベンジル、トリフェニルメチル、ベンジリデニル、またはｐ−トルエンスルホニルから独立して選択される、請求項１に記載の分子または塩。
【請求項３】
前記固相は、基質、ビーズ、またはクロマトグラフィー用充填剤を含む、請求項１または２に記載の分子または塩。
【請求項４】
Ｒ３及びＲ４のいずれかは、Ｃ１−Ｃ１０アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール側鎖を含む、請求項１から３のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項５】
Ｒ３及びＲ４のいずれかは、約７．３のｐＨで少なくとも部分的にプロトン化される官能基を含む、請求項１から４のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項６】
Ｒ３及びＲ４のいずれかは、約７．３のｐＨで少なくとも部分的に脱プロトン化される官能基を含む、請求項１から４のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項７】
前記側鎖は、アミド、アルコール、またはチオールを含む、請求項４に記載の分子または塩。
【請求項８】
Ｒ３及びＲ４は、水素である、請求項１から３のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項９】
Ｒ６及びＲ７のいずれかは、Ｃ１−Ｃ１０、アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール側鎖を含む、請求項１から８のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項１０】
Ｒ６及びＲ７のいずれかは、約７．３のｐＨで少なくとも部分的にプロトン化される官能基を含む、請求項１から９のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項１１】
Ｒ６及びＲ７のいずれかは、約７．３のｐＨで少なくとも部分的に脱プロトン化される官能基を含む、請求項１から９のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項１２】
前記側鎖は、アミド、アルコール、またはチオールを含む、請求項９に記載の分子または塩。
【請求項１３】
Ｒ６及びＲ７は、水素である、請求項１から８のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項１４】
以下の構造を有する分子、
【化４】
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またはその塩であって、
式中、ｎ１＝１〜１５、及びｎ２＝１〜６；ならびに
Ｒ１及びＲ２は同一であり、若しくは異なり、独立して、水素またはアシルオキシであり；
Ｒ３はアルキル、アルケニル、アルキニル若しくはアリールであり、水素、ハロ、アルキル、ポリハロアルキル、アルキオキシ（ａｌｋｙｏｘｙ）、ハロアルコキシ、ポリハロアルコキシ、アルコキシカルボニル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、チオール、アルキルチオ、アルキルカルボニル、アシル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルスルフィニル、スルホンアミド、若しくはスルホニルから選択される１、２、３、若しくは４基とすべて任意選択で置換され；ならびに
Ｒ４、Ｒ５、及びＲ６は同一であり、若しくは異なり、水素、アルキル、シリル、若しくはシロキシから独立して選択される、
前記分子またはその塩。
【請求項１５】
Ｒ３は、ｐ−フェニルである、請求項１４に記載の分子または塩。
【請求項１６】
Ｒ３は、ｎ−プロピルである、請求項１４に記載の分子または塩。
【請求項１７】
Ｒ１またはＲ２は、ペプチドを含む、請求項１から１６のいずれか１項に記載の分子または塩。
【請求項１８】
前記ペプチドは、２から１００個のアミノ酸を含む、請求項１７に記載の分子または塩。
【請求項１９】
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子または塩を含むアレイ。
【請求項２０】
前記アレイは、１ｃｍ２あたり少なくとも約１０，０００、３００，０００、または１００万個のペプチド特徴を含む、請求項１９に記載のアレイ。
【請求項２１】
結合部分をさらに含む、請求項１９または２０に記載のアレイ。
【請求項２２】
前記結合部分は、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、ポリサッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含む、請求項２１に記載のアレイ。
【請求項２３】
脂肪酸をさらに含む、請求項１９から２２のいずれか１項に記載のアレイ。
【請求項２４】
前記脂肪酸は、フッ素化脂肪酸である、請求項２３に記載のアレイ。
【請求項２５】
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子または塩を基質と会合させることを備える、アレイを作製する方法。
【請求項２６】
前記基質は、Ｓｉ／ＳｉＯ２ウェハである、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記アレイは、１ｃｍ２あたり少なくとも約１０，０００、３００，０００、または１００万個のペプチド特徴を含む、請求項２５または２６に記載の方法。
【請求項２８】
固体支持体を形成する方法であって、
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子と固体支持体を会合させることを備え、前記固体支持体は基質、ビーズ、ポリマー、またはクロマトグラフィー用充填剤である、前記方法。
【請求項２９】
ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを結合するための請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子または塩の使用。
【請求項３０】
抗体またはタンパク質を結合するための、請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子または塩の使用。
【請求項３１】
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子または塩に結合部分を結合させることを備える、方法。
【請求項３２】
前記結合部分を識別することをさらに備える、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記識別は、免疫蛍光アッセイを有する、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記結合部分は、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３５】
前記結合部分は、対象から得られる、請求項３１から３４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３６】
前記対象が疾患または状態を有する尤度を決定することをさらに備える、請求項３１から３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３７】
前記対象は、ヒトである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記疾患または状態は、自己免疫疾患である、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
前記自己免疫疾患は、ループス、潰瘍性大腸炎、クローン病、または関節リウマチである、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記疾患または状態は、感染症である、請求項３７に記載の方法。
【請求項４１】
前記感染症は、細菌性、ウイルス性、真菌性、または寄生虫性である、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記疾患または状態は、がんである、請求項３７に記載の方法。
【請求項４３】
通信媒体を介して結果を通信することをさらに備える、請求項３１から４２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子における結合を開裂することを備える方法。
【請求項４５】
前記結合は、Ｎ−アシルスルホンアミドのＣ−Ｎ結合である、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記開裂は、第一活性化ステップ及び第二開裂ステップを備える、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記第一活性化ステップは、前記Ｎ−アシルスルホンアミドをアルキル化剤によってアルキル化することを備える、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
前記アルキル化剤は、ジアゾ化合物またはハロゲン化アルキルである、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
前記アルキル化剤は、ジアゾメタン、ヨウ化メチル、またはヨードアセトニトリルである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記開裂は、蒸気相開裂反応を有する、請求項４５に記載の方法。
【請求項５１】
前記開裂は、蒸気相アンモニア開裂反応を有する、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子、及び使用のための説明書を含む、キット。
【請求項５３】
請求項１から１８のいずれか１項に記載の分子によってキットを形成することを備える、前記キットを作製する方法。
【請求項５４】
以下の構造を有する化合物、
【化５】
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またはその塩であって、式中、
Ｒ１及びＲ２は同一であり、若しくは異なり、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアリール、アルキニル、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、スルホンアミジル、アシル、孤立電子対、若しくは−ＣＯ２Ｒ６であり、Ｒ６はアルキル、アルケニル、アリール、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、若しくはアリールシクロアルキルアルキルであり；またはＲ１及びＲ２、及びそれらが結合されるＮは環を形成し；
Ｒ３、Ｒ４は同一であり、若しくは異なり、独立して水素、ハロ、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアルキル、アリールアルキル、ヒドロキシアリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、シクロアルキル、チオアルキル、セレノアルキル、ヒドロキシアルキル、若しくはアミノ置換アルキルであり；ならびに
Ｒ５はアルキル、アルケニル、アルキニル若しくはアリールであり、水素、ハロ、アルキル、ポリハロアルキル、アルキオキシ（ａｌｋｙｏｘｙ）、ハロアルコキシ、ポリハロアルコキシ、アルコキシカルボニル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、チオール、アルキルチオ、アルキルカルボニル、アシル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルスルフィニル、スルホンアミド、若しくはスルホニルとそれぞれ任意選択で置換される；
前記化合物またはその塩。
【請求項５５】
Ｒ１及びＲ２は、同一であり、または異なり、独立して、水素、アシル、アシルオキシ、フタルイミジル、ベンジル、トリフェニルメチル、ベンジリデニル、またはｐ−トルエンスルホニルである、請求項５４に記載の化合物または塩。
【請求項５６】
Ｒ３及びＲ４のいずれかは、Ｃ１−Ｃ１０アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール側鎖を含む、請求項５４または５５に記載の化合物または塩。
【請求項５７】
Ｒ３及びＲ４のいずれかは、約７．３のｐＨで少なくとも部分的にプロトン化される官能基を含む、請求項５６に記載の化合物または塩。
【請求項５８】
Ｒ３及びＲ４のいずれかは、約７．３のｐＨで少なくとも部分的に脱プロトン化される官能基を含む、請求項５６に記載の化合物または塩。
【請求項５９】
前記側鎖は、アミド、アルコール、またはチオールを含む、請求項５６に記載の化合物または塩。
【請求項６０】
Ｒ３及びＲ４は、水素である、請求項５４または５５に記載の化合物または塩。
【請求項６１】
以下の構造を含む請求項５４に記載の化合物、
【化６】
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、
【化７】
2019536770.tif 000019
またはその塩。
【請求項６２】
以下の構造を含む、請求項５４に記載の化合物、
【化８】
2019536770.tif 000020
、
【化９】
2019536770.tif 000021
またはその塩。
【請求項６３】
分子を合成する方法であって、
請求項５４から６２のいずれか１項に記載の化合物または塩によって分子を形成することを備え、
ａ．前記化合物を固相上の第一アミノ基にカップリングすること、及び
ｂ．前記化合物を脱保護して第二アミノ基を形成すること、
を備える、前記方法。
【請求項６４】
前記固相は、基質、ビーズ、ポリマー、またはクロマトグラフィー用充填剤を含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記脱保護は、光酸または光酸発生剤を含む、請求項６３または６４に記載の方法。
【請求項６６】
前記脱保護は、光塩基または光塩基発生剤を含む、請求項６３または６４に記載の方法。
【請求項６７】
ステップ（ａ）後で、ステップ（ｂ）前に、アミンキャッピングステップをさらに備え、前記第一アミノ基をキャッピング剤と反応させることを備える、請求項６３から６５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６８】
前記アミンキャッピングステップは、アルキルアミン、アリールアミン、アセトアミド、カルバメート、フタルイミド、エナミン、スルホンアミド、または保護アミノ酸を形成する、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記キャッピング剤は、無水酢酸、アセチルクロライド、フッ化アセチル、またはアシルグリシンである、請求項６７に記載の方法。
【請求項７０】
請求項６３から６９のいずれか１項に記載のプロセスによって作製される分子。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
本出願は、２０１６年１１月９日に出願された米国仮出願第６２／４１９，８６１号の利益を主張し、その全体を本明細書に参照により援用する。
【発明の概要】
【０００２】
本明細書に開示されるのは、以下の構造を有する分子、
【化１】
2019536770.tif 000003
またはその塩であり、
式中、ｎ１は独立して、０、１、２、若しくは３であることが可能であり；
ｎ２は０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、若しくは２０であることが可能であり；
ｎ３は０、１、２、若しくは３からのものであることが可能であり；
ｎ４は０若しくは１であることが可能であり；及び
ｎ５は０、１、２、若しくは３であることが可能であり；ならびに
ＸはＯ、Ｎ、若しくはＳであることが可能であり；
Ｙ、Ｚ、ＸＸ、及びＹＹは同一であることが可能であり、若しくは異なることが可能であり、独立してＯ若しくはＳであり；
Ｒ１及びＲ２は同一であることが可能であり、若しくは異なることが可能であり、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアリール、アルキニル、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、スルホンアミジル、アシル、孤立電子対、若しくは−ＣＯ２Ｒ１３であることが可能であり、Ｒ１３はアルキル、アルケニル、アリール、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、若しくはアリールシクロアルキルアルキルであることが可能であり；またはＲ１及びＲ２、及びそれらが結合されることが可能であるＮは環を形成し；またはＲ１若しくはＲ２はヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー若しくは抗体、若しくはそのフラグメントを含むことが可能であり；
Ｒ３、Ｒ４、Ｒ６、及びＲ７は同一であり、若しくは異なり、独立して、水素、ハロ、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアルキル、アリールアルキル、ヒドロキシアリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、シクロアルキル、チオアルキル、セレノアルキル、ヒドロキシアルキル、若しくはアミノ置換アルキルであることが可能であり；
Ｒ５はアルキル、アルケニル、アルキニル、若しくはアリールであることが可能であり、水素、ハロ、アルキル、ポリハロアルキル、アルキオキシ（ａｌｋｙｏｘｙ）、ハロアルコキシ、ポリハロアルコキシ、アルコキシカルボニル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、チオール、アルキルチオ、アルキルカルボニル、アシル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルスルフィニル、スルホンアミド、若しくはスルホニルとすべて任意選択で置換されることが可能であり；
ＮからＺＺに配向されるＲ８はアルキル、ヘテロアルキル、アミノ置換アルキル、アミノ置換ヘテロアルキル、アミドアルキル、アミドヘテロアルキル、アミノ置換アミドヘテロアルキルであることが可能であり、アルキル、ヘテロアルキル、アミノ置換アルキル、アミノ置換ヘテロアルキル、アミドアルキル、アミドヘテロアルキル、若しくはアミノ置換アミドヘテロアルキルとそれぞれ任意選択で置換され；またはＲ８は
【化２】
2019536770.tif 000004
であり、ｍは１から１００であり、Ｒ１５、Ｒ１６、Ｒ１７、及びＲ１８は同一であることが可能であり、若しくは異なることが可能であり、独立して、水素、ハロ、アルキル、ヘテロアルキル、アミノ置換アルキル、アミノ置換ヘテロアルキル、アミドアルキル、アミドヘテロアルキル、アミノ置換アミドヘテロアルキルであり；またはＲ８は、
【化３】
2019536770.tif 000005
であることが可能であり、
式中、ｎ６及びｎ８は同一であることが可能であり、若しくは異なることが可能であり、独立して、１、２、若しくは３であることが可能であり、ｎ８は１から２０であることが可能であり；
Ｒ９はアルキル、ヘテロアルキル、ヒドロキシヘテロアルキル、シリルアルキル、シロキシアルキル（ｓｉｌｏｘｙａｌｋｙｌ）、シロキシヘテロアルキル、シロキシヒドロキシヘテロアルキルであることが可能であり、若しくはＲ９はＲ１９−（ＣＨ２）３−Ｓｉ（Ｚ）ｐであることが可能であり、ｐは１から３であることが可能であり、Ｚはハロ若しくはアルコキシから選択されることが可能であり、またＲ１９はヒドロキシアルキル若しくはカルバメートから選択されることが可能であり；
Ｒ１０、Ｒ１１、及びＲ１２は同一であり、若しくは異なり、水素若しくはアルキルから独立して選択されることが可能であり；ならびにＲ９は固相へ任意選択で結合されることが可能であり；
ＺＺはＮＲ２０、Ｏ、Ｓ、若しくはＳｅであり、Ｒ２０は水素若しくはアルキルであることが可能であり；ならびに
（＊）は炭素中心であり、この炭素中心は独立して、不斉中心若しくは非不斉中心であることが可能である。
【０００３】
いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、ＸはＮであることが可能であり、Ｒ１及びＲ２は同一であることが可能であり、または異なることが可能であり、水素、アシル、アシルオキシ、ベンジル、トリフェニルメチル、ベンジリデニル、またはｐ−トルエンスルホニルから独立して選択されることが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、固相は基質、ビーズ、またはクロマトグラフィー用充填剤を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４のいずれかはＣ１−Ｃ１０アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール側鎖を含むことが可能である。１つの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４のいずれかは約７．３のｐＨで少なくとも部分的にプロトン化される官能基を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４のいずれかは約７．３のｐＨで少なくとも部分的に脱プロトン化される官能基を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの塩類または分子類であり、この側鎖はアミド、アルコール、またはチオールを含むことが可能である。１つの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４は水素であることが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ６及びＲ７のいずれかはＣ１−Ｃ１０アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール側鎖を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ６及びＲ７のいずれかは約７．３のｐＨで少なくとも部分的にプロトン化される官能基を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ６及びＲ７のいずれかは約７．３のｐＨで少なくとも部分的に脱プロトン化される官能基を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、側鎖はアミド、アルコール、またはチオールを含むことが可能である。いくつかの態様は、構造Ｉの分子類または塩類であり、Ｒ６及びＲ７は水素であることが可能である。
【０００４】
化学式Ｉの分子は、以下の構造を有する分子、
【化４】
2019536770.tif 000006
またはその塩を含み、
式中、ｎ１＝１〜１５及びｎ２＝１〜６；ならびに
Ｒ１及びＲ２は同一であることが可能であり、または異なることが可能であり、独立して、水素またはアシルオキシであり；
Ｒ３はアルキル、アルケニル、アルキニルまたはアリールであることが可能であり、水素、ハロ、アルキル、ポリハロアルキル、アルキオキシ、ハロアルコキシ、ポリハロアルコキシ、アルコキシカルボニル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、チオール、アルキルチオ、アルキルカルボニル、アシル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルスルフィニル、スルホンアミド、またはスルホニルから選択される１、２、３、または４基とすべて任意選択で置換されることが可能であり；ならびに
Ｒ４、Ｒ５、及びＲ６は、同一であることが可能であり、または異なることが可能であり、水素、アルキル、シリル、またはシロキシから独立して選択される。
【０００５】
いくつかの態様は、構造ＩＡの分子類または塩類であり、Ｒ３はｐ−フェニルであることが可能である。いくつかの態様は、構造ＩＡの分子類または塩類であり、Ｒ３はｎ−プロピルであることが可能である。いくつかの態様は、構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類であり、Ｒ１またはＲ２はペプチドを含むことが可能である。いくつかの態様において、構造ＩまたはＩＡの分子または塩は、ペプチドを含むことが可能である。１つの態様において、ペプチドは、２から１００個のアミノ酸を含むことが可能である。
【０００６】
また本明細書に開示されるのは、構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類を含むアレイである。１つの態様において、アレイは、ペプチドを含むことが可能である。１つの態様において、アレイは、１平方センチメートルあたり少なくとも１０，０００個のペプチドを含むことが可能である。１つの態様において、アレイは、１平方センチメートルあたり少なくとも３００，０００個のペプチドを含むことが可能である。１つの態様において、アレイは、１平方センチメートルあたり少なくとも１００万個のペプチドを含むことが可能である。いくつかの態様において、アレイは、結合部分を含むことが可能である。結合部分は、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、ポリサッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含むことが可能である。いくつかの態様において、アレイは、脂肪酸を含むことが可能である。脂肪酸は、フッ素化されることが可能である。また本明細書に開示されるのは、構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類を含むアレイの合成方法である。１つの態様において、アレイを作製することは、構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類を基質と会合させることを備える。基質は、シリコンまたはシリコン酸化物ウェハであることが可能である。１つの態様において、アレイは、１平方センチメートルあたり少なくとも１０，０００個のペプチドを含むことが可能である。１つの態様において、アレイは、１平方センチメートルあたり少なくとも３００，０００個のペプチドを含むことが可能である。１つの態様において、アレイは、１平方センチメートルあたり少なくとも１００万個のペプチドを含むことが可能である。
【０００７】
また本明細書に開示されるのは、方法である。いくつかの態様において、この方法は、固体支持体を形成することを備えることが可能である。固体支持体を形成することは、この固体支持体を構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類と会合させることを備えることが可能である。固体支持体は、基質、ビーズ、ポリマー、またはクロマトグラフィー用充填剤であることが可能である。
【０００８】
また本明細書に開示されるのは、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを結合させるための構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類の使用である。また本明細書に開示されるのは、タンパク質類または抗体類を結合させるための構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類の使用である。また本明細書に開示されるのは、結合部分を構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類に結合させることを備える方法である。いくつかの態様において、この方法は、結合部分を識別することを備えることが可能である。この識別は、免疫蛍光アッセイを有することが可能である。いくつかの態様において、結合部分は、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含むことが可能である。いくつかの態様において、結合部分は、対象から得られることが可能である。いくつかの態様において、この方法は、対象が疾患または状態を含む尤度を決定することを備えることが可能である。対象は、ヒトであることが可能である。いくつかの態様において、疾患または状態は、自己免疫疾患、感染症、またはがんであることが可能である。いくつかの態様において、自己免疫疾患は、ループス、潰瘍性大腸炎、クローン病、または関節リウマチであることが可能である。いくつかの態様において、感染症は、細菌性、ウイルス性、真菌性、または寄生虫性であることが可能である。いくつかの事例において、この方法は、通信媒体を介して結果を通信することをさらに備えることが可能である。
【０００９】
また本明細書に開示されるのは、構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類における結合を開裂することを備える方法である。いくつかの態様において、結合は、Ｎ−アシルスルホンアミドのＣ−Ｎ結合であることが可能である。いくつかの態様において、開裂は、第一活性化ステップ及び第二開裂ステップを備えることが可能である。いくつかの態様において、第一活性化ステップは、Ｎ−アシルスルホンアミドをアルキル化することを備えることが可能である。いくつかの態様において、このアルキル化は、アルキル化剤の使用を備えることが可能である。いくつかの態様において、アルキル化剤は、ジアゾ化合物、またはハロゲン化アルキルであることが可能である。いくつかの態様において、アルキル化剤は、ジアゾメタン、ヨウ化メチル、またはヨードアセトニトリルであることが可能である。いくつかの態様において、この開裂は、蒸気相開裂反応を有することが可能である。いくつかの態様において、この開裂は、蒸気相アンモニア開裂反応を有することが可能である。
【００１０】
また本明細書に開示されるのは、キットである。いくつかの態様において、これらのキットは、構造ＩまたはＩＡの分子類または塩類を含むことが可能である。いくつかの事例において、キットは、使用のための説明書を含むことが可能である。また本明細書に開示されるのは、本明細書に開示されるキットを作製する方法である。
【００１１】
また本明細書に開示されるのは、以下の構造を有する分子、
【化５】
2019536770.tif 000007
またはその塩であり、式中、
Ｒ１及びＲ２は同一であることが可能であり、若しくは異なることが可能であり、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアリール、アルキニル、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、スルホンアミジル、アシル、孤立電子対、若しくは−ＣＯ２Ｒ６であり、Ｒ６はアルキル、アルケニル、アリール、アリールアルキル、アリールアルケニル、ハロアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、若しくはアリールシクロアルキルアルキルであり；またはＲ１及びＲ２、及びそれらが結合されることが可能であるＮは環を形成し；
Ｒ３、Ｒ４は同一であることが可能であり、若しくは異なることが可能であり、独立して、水素、ハロ、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロアルキル、アリールアルキル、ヒドロキシアリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、シクロアルキル、チオアルキル、セレノアルキル、ヒドロキシアルキル、若しくはアミノ置換アルキルであり；ならびに
Ｒ５はアルキル、アルケニル、アルキニル若しくはアリールであることが可能であり、水素、ハロ、アルキル、ポリハロアルキル、アルキオキシ（ａｌｋｙｏｘｙ）、ハロアルコキシ、ポリハロアルコキシ、アルコキシカルボニル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、チオール、アルキルチオ、アルキルカルボニル、アシル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルスルフィニル、スルホンアミド、若しくはスルホニルとそれぞれ任意選択で置換される。
【００１２】
いくつかの態様は、構造ＩＩの分子類または塩類であり、Ｒ１及びＲ２は同一であることが可能であり、または異なることが可能であり、独立して、水素、アシル、アシルオキシ、フタルイミジル、ベンジル、トリフェニルメチル、ベンジリデニル、またはｐ−トルエンスルホニルである。いくつかの態様は、構造ＩＩの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４のいずれかはＣ１−Ｃ１０アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール側鎖を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造ＩＩの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４のいずれかは約７．３のｐＨで少なくとも部分的にプロトン化される官能基を含むことが可能である。いくつかの態様は、構造ＩＩの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４のいずれかは約７．３のｐＨで少なくとも部分的に脱プロトン化される官能基を含むことが可能である。いくつかの態様において、側鎖は、アミド、アルコール、またはチオールを含むことが可能である。いくつかの態様は、構造ＩＩの分子類または塩類であり、Ｒ３及びＲ４は水素であることが可能である。
【００１３】
構造ＩＩの化合物は、以下の構造、
【化６】
2019536770.tif 000008
【化７】
2019536770.tif 000009
またはそれらの塩類を含む。
【００１４】
構造ＩＩの化合物は、以下の構造、
【化８】
2019536770.tif 000010
【化９】
2019536770.tif 000011
またはそれらの塩類を含む。
【００１５】
また本明細書に開示されるのは、分子類を合成する方法である。いくつかの態様において、この方法は、分子類を構造ＩＩＡ、ＩＩＢ、ＩＩＣ、またはＩＩＤの化合物類によって形成することを備えることが可能である。いくつかの態様において、この方法は、構造ＩＩＡ、ＩＩＢ、ＩＩＣ、またはＩＩＤの化合物類を固相上のアミノ基へカップリングすることを備えることが可能である。いくつかの態様において、この方法は、構造ＩＩＡ、ＩＩＢ、ＩＩＣ、またはＩＩＤの化合物類を脱保護し、第二アミノ基を形成することをさらに備えることが可能である。いくつかの態様において、固相は、基質、ビーズ、ポリマー、またはクロマトグラフィー用充填剤であることが可能である。いくつかの態様において、脱保護は、光酸または光酸発生剤を含むことが可能である。いくつかの態様において、脱保護は、光塩基または光塩基発生剤を含むことが可能である。いくつかの態様において、この方法は、アミンキャッピングステップをさらに備えることが可能である。いくつかの態様において、このアミンキャッピングステップは、カップリングステップ後で、脱保護ステップ前に実施されることが可能である。いくつかの態様において、このアミンキャッピングステップは、第一アミノ基をキャッピング剤と反応させることを備えることが可能である。いくつかの態様において、このキャッピングステップは、アルキルアミン、アリールアミン、アセトアミド、カルバメート、フタルイミド、エナミン、スルホンアミド、またはＮ−保護アミノ酸を形成することが可能である。いくつかの態様において、この保護アミノ酸は、Ｎ−アシル保護アミノ酸であることが可能である。いくつかの態様において、保護アミノ酸は、アセチルグリシンであることが可能である。いくつかの態様において、このキャッピング剤は、無水酢酸、アセチルクロライド、フッ化アセチル、またはアシルグリシンであることが可能である。また本明細書に開示されるのは、開示された方法のいずれかのプロセスによって作製される分子類である。
【００１６】
参照による援用
本明細書におけるすべての刊行物、特許、及び特許出願は、参照によりそれらの全体が援用される。本明細書における用語と、援用された参照における用語との間に抵触がある場合には、本明細書における用語を優先する。
【００１７】
本明細書に記述される新規の特徴は、添付の特許請求の範囲に特に記載される。本明細書に記載されるこれらの特徴、及びこれらの特徴の利点のより良い理解は、本明細書に記載されるこれらの特徴の原理を利用した例示的な例を記載する、以下の詳細な説明及び添付図面を参照することによって得られる。
【図面の簡単な説明】
【００１８】
【図１】構造Ｉに従う分子構造を描画する。ＳＣＬ−Ｇｌｙは、ｓａｆｅｔｙ−ｃａｔｃｈ−グリシンである。Ｇｌｙは、グリシンである。ＥＤＢＡは、（エチレンジオキシ）ビス（エチルアミン）である。ＧＰＴＭＳは、３−グリシドキシプロピルトリメトキシシランである。
【００１９】
【図２】構造Ｉに従う分子類の模式的な分子構造を描画する。
【００２０】
【図３】テトラペプチド類のＰＬ８分子：ＨＴ９６０へのステップワイズカップリングについてのＭＡＬＤＩ分析及びカップリング収率を描画する。
【００２１】
【図４】テトラペプチド類のＰＬ８分子：ＨＴ９６３へのステップワイズカップリングについてのＭＡＬＤＩ分析及びカップリング収率を描画する。
【００２２】
【図５】分子を描画する。ｎは、１〜２０であることが可能である。
【００２３】
【図６】分子を描画する。ｎは、１〜２０であることが可能である。
【００２４】
【図７】分子を描画する。ｎは、１〜２０であることが可能である。
【００２５】
【図８】分子を描画する。
【００２６】
【図９】免疫シグネチャリングのための分子アレイの使用を描画する。
【００２７】
【図１０】分子アレイ上での特徴の配置を描画する。
【００２８】
【図１１】基質特性、コーティング組成物、堆積方法、及び分析的特性評価方法を描画する。
【００２９】
【図１２】ペプチド合成のためのスキームを描画する。
【００３０】
【図１３】保護アミノ酸類を描画する。
【００３１】
【図１４】アミノシランコーティング構造を描画する。
【００３２】
【図１５】表面特性制御が重要な理由を描画する。
【００３３】
【図１６】アミノコーティングの厚さ及び水接触角解析を描画する。
【００３４】
【図１７】反応性アミン比重アッセイについてのスキームを描画する。
【００３５】
【図１８】アミノコーティングのアミン比重解析を描画する。
【００３６】
【図１９】アミノコーティングの堆積の平滑度のＡＦＭ解析を描画する。
【００３７】
【図２０】側鎖脱保護についての実験プロセスを描画する。
【００３８】
【図２１】ペプチド合成プロセスの概略を描画する。
【００３９】
【図２２】ペプチド官能基化されたアミノコーティングの厚さ解析を描画する。
【００４０】
【図２３】アミノコーティングの厚さ及びＸＰＳ解析を描画する。
【００４１】
【図２４】ペプチド合成、アミンキャッピング、及びＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析のためのスキームを描画する。
【００４２】
【図２５】ペプチド合成、アミンキャッピング、及びＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析のためのスキームを描画する。
【００４３】
【図２６】アミノコーティングの厚さ解析を描画する。
【００４４】
【図２７】アミノコーティングの厚さ解析を描画する。
【００４５】
【図２８】ＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析用の表面調製のための手順を描画する。
【００４６】
【図２９】アレイコーティングのＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析を描画する。
【００４７】
【図３０】アミノコーティング上で合成されたペプチド類の純度分析を描画する。
【００４８】
【図３１】アレイコーティングのＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析を描画する。
【００４９】
【図３２】アミノコーティング上で合成されたペプチド類の純度分析を描画する。
【００５０】
【図３３】アレイコーティングのＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析を描画する。
【００５１】
【図３４】アミノコーティング上で合成されたペプチド類の純度分析を描画する。
【００５２】
【図３５】アレイコーティングのＭＡＬＤＩ−ＭＳ分析を描画する。
【００５３】
【図３６】アミノコーティング上で合成されたペプチド類の純度分析を描画する。
【００５４】
【図３７】アミノコーティング特性の要約を描画する。
【発明を実施するための形態】
【００５５】
説明のための例示的な適用を参照して、いくつかの態様を以下に説明する。本明細書に記載される特徴の完全な理解を提供するために、多くの特定の詳細、関連性、及び方法を記載することが理解される。当業者は、しかしながら、１つ以上の特定の詳細がなくとも、他の方法であっても、本明細書に記載された特徴を実施することができることを容易に認識する。いくつかの作用が異なる順序で、及び/または他の作用または事象と同時に起こることが可能であるため、本明細書に記載の特徴は、例示された作用または事象の順序に限定されない。さらに、例示された作用または事象のすべては、本明細書に記載の特徴に従った方法を実施するために必要とされるわけではない。
【００５６】
本明細書に使用される用語は、特定の事例を説明する目的のみであり、制限するように意図されるものではない。本明細書で使用されるように、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、文脈が別段に明確に示さない限り、複数形をも含むことが意図される。さらに、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」「有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「有する（ｈａｓ）」、「伴う（ｗｉｔｈ）」、またはそれらの異形が詳細な説明及び／または特許請求の範囲のいずれかで使用される程度に、それらのような用語は、用語「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」と同様の方式で包括的であるように意図される。
【００５７】
「約」または「およそ」という用語は、当業者によって決定されるような特定の値についての許容可能な誤差範囲内であることを意味することができ、値を測定する、または決定する方法、すなわち、測定システムの限界に部分的に依存する。たとえば、「約」は、１以内のまたは１以上の標準偏差を意味することができる。あるいは、「約」は、所与の値の最大２０％、最大１０％、最大５％、または最大１％の範囲を意味することができる。あるいは、特に生物学的システムまたはプロセスに関して、この用語は、値の、５倍以内、より好ましくは２倍以内の桁内を意味することが可能である。別段に記載されない限り、本出願及び特許請求の範囲に特定の値が記載される場合、「約」という用語は、特定の値について許容可能な誤差範囲内にあることを意味するとみなされる。「約」という用語は、当業者によって一般的に理解されるような意味を有する。いくつかの実施形態において、「約」という用語は、±１０％を指す。いくつかの実施形態では、「約」という用語は、±５％を指す。
【００５８】
概要
正確な、または妥当な診断を受けるのに苦労している患者では、自己免疫異常、感染症、及びがんを含む免疫介在性疾患を検出し、診断することは困難である。多くの場合、患者は、密接に関連したこれらの疾患の性質のために他の自己免疫状態と誤診されることが多い。本開示は、１つの態様において、アレイ結合分子ライブラリに結合する末梢血抗体の差次的パターンを明らかにする、化合物、方法、及び装置に関する。患者試料のアレイへの差次的結合は、患者の疾患状態を示す特異的結合パターンまたはシグネチャをもたらす。これらの結合シグネチャは、自己免疫疾患活性、感染症活性、がん活性、及び糖尿病活性を含むが、これらに限定されない、疾患活性を正確に決定する、または診断することが可能である。このような差次的結合活性またはシグネチャの同定は、「免疫シグネチャリング（ｉｍｍｕｎｏｓｉｇｎａｔｕｒｉｎｇ）」と称される。合成ペプチドライブラリは、抗体結合特性評価のために一般に使用されている。しかしながら、タンパク質及びロボット制御によりプリントされたペプチドアレイは、法外な費用がかかり、原位置合成ペプチドアレイは、スケーラビリティの欠如、再現性低下、及び低い作製品質を被る。本明細書の科学技術は、１つの態様において、免疫シグネチャリングアッセイについてのアレイの構成及び使用のために、信頼性のある、低コストのスケーラブルな方法を可能にする。
【００５９】
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される科学技術によって作製される化合物ライブラリを有するアレイは、免疫に基づく診断アッセイ、たとえば、免疫シグネチャアッセイなどのために使用される。１つの態様において、これらのアレイに結合される一滴の血液からの患者の抗体レパートリーを使用して、結合されたアレイの蛍光結合プロファイル画像は、疾患状態を識別し、分類するのに十分な情報を提供する。本明細書に開示されるアレイは、偏光解析法、質量分析法、及び蛍光法を含む直交分析方法を使用して各合成アレイ内に分析測定能力を組み込む。これらの測定は、アレイ合成性能の長期的な定性的かつ定量的評価を可能にする。
【００６０】
いくつかの実施形態において、ペプチドアレイ上で結合する抗体の検出は、本明細書に開示される科学技術によって取り組まれることが可能であるいくつかの課題を提起する。本明細書に開示されるこれらの科学技術は、分子アレイを使用して抗体結合特性を明らかにする２つの潜在的な欠点に対処する。第一に、アレイ上の非特異的抗体結合は、いくつかの実施形態において、ポリエチレングリコールを含む中程度に親水性の単層によって固体支持体をコーティングすることによって最小化される。いくつかの実施形態において、親水性の単層は、均質である。第二に、リンカーを使用して、固体支持体の表面からペプチドを離し、表面へ合成されたライブラリをリンクすることで、妨げられない配向でこのペプチドを抗体へ提示することができる。本明細書に開示されるこれらの科学技術は、これらのようなリンカーを含み、リンカーは、１つの態様において、化合物ライブラリを固体支持体へ接合し、いくつかの態様において、免疫シグネチャリング用のアレイを含む。
【００６１】
リンカーサブユニットの反復カップリングによるリンカー類の合成は、ある一定の官能基がリンカーに取り込まれているときに制限を有する。例として、スルホンアミド類は、ペプチドカップリング反応において反応性低下を示す。リンカー類がスルホンアミド末端サブユニットを含むときに、スルホンアミドの窒素と、リンカーのつぎのサブユニットのカルボン酸との間のこの反応は、緩徐であり、スルホンアミドの並みの反応でさえも達成するために反応時間の増加及び温度上昇を必要とする。残留している未反応スルホンアミド類は、一級アミン類より反応性が低いが、ペプチド合成が進行する場合でも依然として反応性を示す問題を提示する。つぎのカップリングステップにおいて、最初に未反応のスルホンアミド類の望まれていないカップリングは、合成されたリンカー生成物におけるトランケーション及び欠失生成物へ最終的につながる。さらに、反応性低下は、最終合成リンカー生成物の全体的な収率を低下させる。さらに、カップリング反応を完了させるのに必要とされる強力な反応条件を固相の化学的感受性が防ぐため、カップリング反応中のスルホンアミド類の反応性低下は、固相系上で実施されるカップリングの際に悪化する。１つの態様において、本明細書に開示される、標準的なペプチドカップリング条件下でのスルホンアミド反応性低下の問題は、予め会合されたスルホンアミド−アミノビルディングブロックのカップリングによって克服される。１つの態様において、予め会合されたスルホンアミド−アミノビルディングブロックは、第一末端にスルホンアミド官能基、及び第二末端にカルボン酸官能基を含む第一部分を含む。１つの態様において、予め会合されたスルホンアミド−アミノビルディングブロックは、スルホンアミド官能基の窒素へ炭素で共有結合される、第一末端にＣ＝Ｏ官能基、及び第二末端にアミノ基を含有する第二部分を含む。１つの態様において、アミノ基を保護する。１つの態様において、アミノ基をｔｅｒｔ−ブチルカルバメート（Ｂｏｃ）−保護アミンとして、または９−フルオレニルメチルカルバメート（Ｆｍｏｃ）−保護アミンとして保護する。
【００６２】
さらに本明細書に開示されるのは、本明細書に開示される分子を含むアレイである。いくつかの態様において、これらのアレイは、リンカーへ化学的に結合される、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、リピド、リポ−ペプチド、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含む。１つの態様において、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントは、化合物ライブラリを含む。いくつかの実施形態において、アレイは、ペプチドアレイである。いくつかの態様において、ペプチドアレイは、原位置で合成される。
【００６３】
原位置合成ペプチドアレイの主な欠点のうちの１つは、合成ペプチド特徴の純度を直接に測定することができないことである。いくつかの実施形態において、これらの科学技術は、固体支持体から直接に合成ペプチド類の定性的な原位置質量分析を有する。固体支持体と合成ペプチドとの間に気相開裂可能リンカーを組み込むことにより、アレイ特徴から拡散させずにペプチドの切断を行うことによって、質量分析を実施する。ペプチド切断後、マトリックス支援レーザー脱離イオン化（ＭＡＬＤＩ）質量分析を固体支持体上で直接に実施し、薄いエアロゾルマトリックス層を塗布した後、ＭＡＬＤＩレーザーの焦点を個々のペプチド特徴上に合わせ、各合成ペプチドについて質量スペクトルを捕捉する。フォトリソグラフィ合成手法を使用して生成されるペプチドアレイ特徴から定性的な原位置ＭＡＬＤＩ質量スペクトルをも本明細書に開示される方法及び装置に含む。当業者に知られている他の分析をも使用して、本明細書に開示される原位置合成プロセスの忠実度を定量化する、及び／または認めることができる。
【００６４】
１つの態様において、予め会合されたスルホンアミド−アミノビルディングブロックの使用は、溶媒、塩基、及びペプチドカップリング試薬の存在下で固相の表面を加温することと関連する合成リンカーのバックグラウンド自家蛍光を低下させる。１つの態様において、予め会合されたスルホンアミド−アミノビルディングブロックの使用は、ペプチドカップリングに基づくリンカー合成全体の忠実度を上昇させる。１つの態様において、合成リンカーは、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントをさらに含む。１つの態様において、リンカー中へのスルホンアミドの取り込みは、リンカーの開裂を可能にする。１つの態様において、リンカーの開裂は、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントの分析をさらに備える。いくつかの態様において、ペプチドの分析は、液体クロマトグラフィーまたは気体クロマトグラフィーを有することが可能である。いくつかの態様において、この分析は、分光分析または分光測定分析を含む。いくつかの態様において、分光測定分析は、マトリックス支援レーザー脱離イオン化質量分析（ＭＡＬＤＩ）である。１つの態様において、スルホンアミドリンカーの取り込みは、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメント上で保護官能基を開裂する状態へ化学的に安定性である開裂のための部位を提供する。１つの態様において、リンカーは、偏光解析によって解析される。
【００６５】
定義
「付着する」、「結合する」、「カップリングする」、及び「リンクする」という用語は、互換的に使用され、共有結合相互作用（たとえば、化学的カップリングによって）、または非共有結合相互作用（たとえば、イオン性相互作用、疎水性相互作用、水素結合、ハイブリダイゼーションなど）を指す。「特異的な」、「特異的に」、または「特異性」という用語は、第一分子と、複数の他の分子のうちのいずれか１個との間と比較した、第一分子と第二分子との間の、優先的な認識、接触、及び安定した複合体の形成を指す（たとえば、第一分子と、複数の他の分子のいずれか１個との間の、認識、接触、または安定した複合体の形成が実質的にほとんどないから実質的にない）。たとえば、２個の分子を、特異的に付着させる、特異的に結合する、特異的にカップリングする、または特異的にリンクすることができる。さらに「結合すること」は、エピトープと抗体との相互作用などの特異的相互作用、またはそれは、非特異的相互作用を指すことのいずれかを指すことが可能である。
【００６６】
命名法
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「アルキル」は、直鎖炭化水素及び分岐鎖炭化水素の両方を含むことが可能であり、たとえば、これらの炭化水素は、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、ｔ−ブチル、イソブチル、ペンチル、ヘキシル、イソヘキシル、ヘプチル、４，４−ジメチルペンチル、オクチル、２，２，４−トリメチル−ペンチル、ノニル、デシル、ウンデシル、ドデシル、それらのさまざまな分岐鎖異性体、及びハロ（たとえば、Ｆ、Ｂｒ、Ｃｌ若しくはＩ）またはＣＦ３、アルキル、アルコキシ、アリール、アリールオキシ、アリール（アリール）またはジアリール、アリールアルキル、アリールアルキルオキシ、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアルキルアルキルオキシ、アミノ、ヒドロキシル、ヒドロキシアルキル、アシル、ヘテロアリール、ヘテロアリールオキシ、ヘテロアリールアルキル、ヘテロアリールアルコキシ、アリールオキシアルキル、アルキルチオ、アリールアルキルチオ、アリールオキシアリール、アルキルアミド、アルカノイルアミノ、アリールカルボニルアミノ、ニトロ、シアノ、チオール、ハロアルキル（ａｈｌｏａｌｋｙｌ）、トリハロアルキル及び／またはアルキルチオなどの１から４個の置換基を含むこれらのような基と同様のものなどの、直鎖中に、１から２０個の炭素、１から１０個の炭素、または１から８個の炭素を含む。
【００６７】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「シクロアルキル」は、アリールについて記載されるような１または２個の芳香環に縮合されることができる環を形成する合計３から２０個の炭素を含む、単環式アルキル、二環式アルキル（またはビシクロアルキル）及び三環式アルキル（トリシクロアルキル）を含む、１から３個の環を含む、飽和した、または部分的に不飽和な（１または２箇所の二重結合を有する）環式炭化水素基を含むことが可能であり、これらの環式炭化水素基は、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロデシル及びシクロドデシル、シクロヘキセニル、アダマンチル、ならびに同様のものを含み、これらのうちのいずれかは、ハロゲン、アルキル、アルコキシ、ヒドロキシル、アリール、アリールオキシ、アリールアルキル、シクロアルキル、ヒドロキシアルキル（ｈｙｒｏｘｙａｌｋｙｌ）、アルキルアミド、アルカノイルアミノ、オキソ、アシル、アリールカルボニルアミノ、アミノ、ニトロ、シアノ、チオール及び／またはアルキルチオ及び／またはアルキルのための置換基のいずれかなどの、１から４個の置換基と任意選択で置換されることができる。
【００６８】
単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「アルカノイル」は、カルボニル基に連結されるアルキルを指すことが可能である。
【００６９】
別段に示されない限り、それ自体によって、または別の基の部分として、本明細書に使用される用語としての「アルケニル」は、たとえば、直鎖中に２から２０個の炭素の、直鎖または分岐鎖ラジカルを指すことが可能であり、ビニル、２−プロペニル、３−ブテニル、４−ペンテニル、３−ペンテニル、２−ヘキセニル、３−ヘキセニル、２−ヘプテニル、３−ヘプテニル、４−ヘプテニル、３−オクテニル、３−ノネニル、４−デセニル、３−ウンデセニル、４−ドデセニル、４，８，１２−テトラデカトリエニル、及び同様のものなどの、直鎖中に１から６箇所の二重結合を含み、また、１から４個の置換基と、すなわち、ハロゲン、ハロアルキル、アルキル、アルコキシ、アルケニル、アルキニル、アリール、アリールアルキル、シクロアルキル、アミノ、ヒドロキシル、ヘテロアリール、シクロヘテロアルキル、アルカノイルアミノ、アルキルアミド、アリールカルボニル−アミノ、ニトロ、シアノ、チオール、アルキルチオ及び／または本明細書に提示されるアルキル置換基のいずれかと任意選択で置換されることができる。
【００７０】
別段に示されない限り、それ自体によって、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語として「アルキニル」は、直鎖中の２から２０個の炭素の直鎖または分岐鎖ラジカルを指すことが可能であり、２−プロピニル、３−ブチニル、２−ブチニル、４−ペンチニル、２−ヘキシニル、３−ヘキシニル、２−へプチニル、３−へプチニル、４−へプチニル、３−オクテニル、３−ノネニル、４−デセニル、３−ウンデセニル、４−ドデセニル、及び同様のものなどの、直鎖中に１箇所の三重結合を有し、また、１から４個の置換基と、すなわち、ハロゲン、ハロアルキル、アルキル、アルコキシ、アルケニル、アルキニル、アリール、アリールアルキル、シクロアルキル、アミノ、ヘテロアリール、シクロへテロアルキル（ｃｙｃｌｏｈｅｔｅｒｏｌａｌｋｙｌ）、ヒドロキシル、アルカノイルアミノ、アルキルアミド、アリールカルボニルアミノ、ニトロ、シアノ、チオール、及び／または本明細書に提示されるアルキル置換基のいずれかと任意選択で置換されることができる。
【００７１】
単独で、または別の基の部分として本明細書に用いられる用語として「ハロゲン」または「ハロ」は、ＣＦ３と同様に、塩素、臭素、フッ素、及びヨウ素を指すことが可能である。
【００７２】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語として「アリール」は、環部分中に６から１０個の炭素を含む単環式及び二環式芳香族基（フェニル、または１−ナフチル及び２−ナフチルを含むナフチルなど）を指すことが可能であり、炭素環または複素環（アリール環、シクロアルキル環、ヘテロアリール環またはシクロヘテロアルキル環など）に縮合される１から３個の追加の環を任意選択で含むことができ、水素、ハロ、ハロアルキル、アルキル、アルコキシ、ハロアルコキシ、アルケニル、トリフルオロメチル、トリフルオロメトキシ、アルキニル、シクロアルキルアルキル、シクロヘテロアルキル、シクロヘテロアルキルアルキル、アリール、ヘテロアリール、アリールアルキル、アリールオキシ、アリールオキシアルキル、アリールアルコキシ、アリールチオ、アリールアゾ、ヘテロアリールアルキル、ヘテロアリールアルケニル、ヘテロアリールヘテロアリール、ヘテロアリールオキシ、ヒドロキシル、ニトロ、シアノ、アミノ、置換アミノ（ここでアミノは１または２個の置換基（アルキル、アリールまたは定義に言及された他のアリール化合物のいずれかである）を含むことが可能である）、チオール、アルキルチオ、アリールチオ、ヘテロアリールチオ、アリールチオアルキル、アルコキシアリールチオ、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルキルアミノカルボニル、アリールアミノカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルアミノ、アリールスルフィニル、アリールスルフィニルアルキル、アリールスルホニルアミノまたはアリールスルホンアミノカルボニル及び／または本明細書に提示されるアルキル置換基のいずれかから選択される、１、２、または３個の基によって、利用可能な炭素原子を介して任意選択で置換されることができる。
【００７３】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「アミノ置換」は、１から１０個のアミノ基が置換される化学的な基を指すことが可能である。
【００７４】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「アルキルチオ」（「チオアルキル」としても知られている）、または「アリールチオ」（「チオアリール」としても知られている）は、硫黄原子に連結される上記のアルキル基またはアリール基のいずれかを含むことが可能である。
【００７５】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「セレノアルキル（ｓｅｌｅｎｏａｌｋｙｌ）」は、セレン原子に連結される上記のアルキル基のいずれかを含むことが可能である。
【００７６】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「アルキルアミノ」または「アリールアミノ」は、窒素原子に連結される上記のアルキル基またはアリール基のいずれかを含むことが可能である。
【００７７】
別段に示されない限り、本明細書に定義されるような、それ自体によって、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「アシル」は、カルボニル
【化１０】
2019536770.tif 000012
基に連結される有機ラジカルを指すことが可能である。アシル基の例は、アルカノイル、アルケノイル、アロイル、アラルカノイル（ａｒａｌｋａｎｏｙｌ）、ヘテロアロイル、シクロアルカノイル、シクロヘテロアルカノイル及び同様のものなどの、カルボニルに付着するＲ基のいずれかを含む。
【００７８】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「シクロヘテロアルキル」は、可能であれば、任意選択でリンカー（ＣＨ２）ｒ（ｒは１、２、または３である）を介して、炭素原子またはヘテロ原子を介して連結される、窒素、酸素及び／または硫黄などの１から２個のヘテロ原子を含むことが可能である、５員、６員、または７員の飽和した、または部分的に不飽和な環を指すことが可能である。
【００７９】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「ヘテロアリール」は、窒素、酸素または硫黄などの１、２、３または４個のヘテロ原子を含むことが可能である、５員または６員の芳香環を指すことが可能であり、これらのような環は、アリール、シクロアルキル、ヘテロアリールまたはシクロヘテロアルキル環に縮合され、可能なＮ−酸化物を含む。ヘテロアリール基は、アルキルについて上記に提示される置換基のいずれかなどの、１から４個の置換基を任意選択で含むことができる。
【００８０】
別段に示されない限り、単独で、または別の基の部分として、本明細書に用いられる用語としての「ヘテロアルキル」は、窒素、酸素、または硫黄などの１、２、３、または４個のヘテロ原子を含むことが可能である、本明細書に定義されるような、アルキル基を指すことが可能である。ヘテロアルキル基は、アルキルについて上記に提示される置換基のいずれかなどの、１から４個の置換基を任意選択で含むことができる。
【００８１】
化合物のすべての立体異性体は、混合物中か、純粋な形態若しくは実質的に純粋な形態かのいずれか一方で企図される。化合物は、Ｒ置換基のいずれか１個を含む炭素原子のいずれかに不斉炭素中心を有することが可能である。化合物は、光学的に活性、または光学的に不活性のいずれか一方であることが可能である。不斉炭素中心は、独立して、Ｒ−立体配置、またはＳ−立体配置であることが可能である。本明細書に定義されるように、不斉炭素は、不斉中心である炭素である。したがって、構造Ｉ、ＩＡ、またはＩＩの化合物は、エナンチオマー若しくはジアステレオマー形態で、またはそれらの混合物中に存在することが可能である。エナンチオマー混合物は、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％または１００％の不斉収率で存在することが可能である。ジアステレオマー混合物は、１：１、２：１、３：１、４：１、５：１、６：１、７：１、８：１、９：１、１０：１、２０：１、５０：１、１００：１、または５００：１のジアステレオマー比で存在することが可能である。本明細書に開示される分子調製用のプロセスは、出発物質としてラセミ体、エナンチオマーまたはジアステレオマーを利用することが可能である。ジアステレオマーまたはエナンチオマー生成物を調製するときに、それらは、従来の方法によって、たとえば、クロマトグラフィー結晶化または分別再結晶によって分離されることが可能である。
【００８２】
本明細書に使用されるように、ポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、それらのハイブリダイゼーション、またはいずれかのそれらの組み合わせを含む、いずれかの核酸分子型であることが可能である。たとえば、ポリヌクレオチドは、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｒＲＮＡ、またはマイクロＲＮＡであることが可能である。
【００８３】
ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質は、いずれかのそのフラグメント、特に、免疫学的に検出可能なフラグメントを含むように企図されることが可能である。ペプチドは、α−ペプチド、β−ペプチド、またはγ−ペプチドを含むように企図されることが可能である。
【００８４】
支持体／基質／固相
本開示は、固体支持体（固相、基質、または支持体としても知られている）を提供する。支持体または基質の性質及び幾何学的形状は、アレイ型（たとえば、一次元、二次元または三次元）を含む、さまざまな因子に依存することが可能である。一般的に、基質は、いずれかの物質から構成されることが可能であり、この物質は、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントのカップリングを可能にし、固体支持体への、当該ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントをカップリングするために使用される条件下で融解しない、または分解しないものである。固体支持体は、いずれかの物質から構成されることが可能であり、この物質は、標的分析物のカップリング、及び／または１箇所以上の別個の領域及び／または別個の領域内の別個の位置における他の部分のカップリングを可能にするものである。固体支持体は、いずれかの物質から構成されることが可能であり、この物質は、標的分析物を除去することなく、または固体支持体からの部分を結合することなく、洗浄または物理的若しくは化学的操作を可能にするものである。
【００８５】
基質は、アレイの意図された用途に応じて、単体から複合体に及ぶさまざまな配置を取ることができる。したがって、基質は、矩形またはディスク配置などの、全体的なスライドまたはプレート配置を有することが可能である。標準のマイクロプレート配置を使用することが可能である。いくつかの実施形態において、表面は、滑らかである、若しくは実質的に平面である、または沈降若しくは隆起などの不規則さを有することができる。たとえば、本開示の発明の主題の基質は、組換え型ビリオンマイクロスポットのパターンがカップリングされる、または堆積することが可能である、少なくとも１箇所の表面を含むことが可能である。いくつかの例において、基質は、約１０〜２００ｍｍ、４０〜１５０ｍｍ、または７５〜１２５ｍｍの長さ、約１０〜２００ｍｍ、２０〜１２０ｍｍ、または２５〜８０ｍｍの幅、及び約０．０１〜５．０ｍｍ、０．１〜２ｍｍ、または０．２〜１ｍｍの厚さを有する、矩形断面形状を有することができる。
【００８６】
支持体は、有機または無機であること、金属（たとえば、銅若しくは銀）または非金属であること、ポリマーまたは非ポリマーであること、導体である、半導体である、または非導体（絶縁体）であること、反射する、または反射しないこと、多孔質である、または非多孔質であることなどが可能である。上述されるような固体支持体は、いずれかの適切な物質から形成されることが可能であり、この物質は、金属、金属酸化物、半導体、ポリマー（織布、不織布、成形、押出成形、キャストなどを含むいずれかの適切な形態における特に有機ポリマー）、シリコン、酸化シリコン、及びそれらの組成物を含むことが可能である。
【００８７】
基質としての使用のために適切な物質は、ポリカーボネート、金、シリコン、酸化シリコン、酸窒化シリコン、インジウム、酸化タンタル、酸化ニオブ、チタン、酸化チタン、白金、イリジウム、酸化インジウムスズ、ダイヤモンドまたはダイヤモンド様膜、アクリルの、スチレン−メタクリル酸メチル共重合体、エチレン／アクリル酸、アクリロニトリル−ブタジエン−スチレン（ＡＢＳ）、ＡＢＳ／ポリカーボネート、ＡＢＳ／ポリスルホン、ＡＢＳ／ポリ塩化ビニル、エチレンプロピレン、エチレン酢酸ビニル（ＥＶＡ）、ニトロセルロース、ナイロン類（ナイロン６、ナイロン６／６、ナイロン６／６−６、ナイロン６／９、ナイロン６／１０、ナイロン６／１２、ナイロン１１及びナイロン１２を含む）、ポリアクリロニトリル（ＰＡＮ）、ポリアクリレート、ポリカーボネート、ポリブチレンテレフタレート（ＰＢＴ）、ポリ（エチレン）（ＰＥ）（低密度、線形低密度、高密度、架橋された超高分子質量グレードを含む）、ポリ（プロピレン）（ＰＰ）、ポリ（ブタジエン）（ＰＢ）のシス及びトランス異性体、ポリ（イソプレン）のシス及びトランス異性体、ポリエチレンテレフタレート）（ＰＥＴ）、ポリプロピレンホモポリマー、ポリプロピレンコポリマー、ポリスチレン（ＰＳ）（汎用及び高衝撃グレードを含む）、ポリカーボネート（ＰＣ）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン）（ＰＥＣＬ若しくはＰＣＬ）、ポリ（メタクリル酸メチル）（ＰＭＭＡ）及びその相同体、ポリ（アクリル酸メチル）及びその相同体、ポリ（乳酸）（ＰＬＡ）、ポリ（グリコール酸）、ポリオルトエステル類、ポリ（無水物類）、ナイロン、ポリイミド類、ポリジメチルシロキサン（ＰＤＭＳ）、ポリブタジエン（ＰＢ）、ポリビニルアルコール（ＰＶＡ）、ポリアクリルアミド及びその相同体（ポリ（Ｎ−イソプロピルアクリルアミド）など）、含フッ素ポリアクリレート（ＰＦＯＡ）、ポリ（エチレン−ブチレン）（ＰＥＢ）、ポリ（スチレン−アクリロニトリル）（ＳＡＮ）、ポリテトラフルオロエチレン（ＰＴＦＥ）及びその誘導体、ポリオレフィンプラストマー類、フッ化エチレン−プロピレン（ＦＥＰ）、エチレン−テトラフルオロエチレン（ＥＴＦＥ）、パーフルオロアルコキシエチレン（ＰＦＡ）、ポリフッ化ビニル（ＰＶＦ）、ポリフッ化ビニリデン（ＰＶＤＦ）、ポリクロロトリフルオロエチレン（ＰＣＴＦＥ）、ポリエチレン−クロロトリフルオロエチレン（ＥＣＴＦＥ）、スチレン無水マレイン酸（ＳＭＡ）、金属酸化物、ガラス、酸化シリコン、または他の無機若しくは半導体材料（たとえば、窒化シリコン）、化合物半導体（たとえば、匕化ガリウム、及びヒ化インジウムガリウム）、ならびにそれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
【００８８】
周知の固体支持体の例は、ポリプロピレン、ポリスチレン、ポリエチレン、デキストラン、ナイロン、アミラーゼ類、ガラス、天然及び修飾セルロース類（たとえば、ニトロセルロース）、ポリアクリルアミド類、アガロース類（ａｇａｒｏｓｅｓ）及び磁鉄鉱を含む。いくつかの例において、固体支持体は、溶媒に対するその大きな化学的耐性、その機械的安定性、その低い自家蛍光特性、及び容易に官能基化されるその柔軟性のために、シリカまたはガラスであることが可能である。１つの実施形態において、基質は、ガラス、特に、ニトロセルロースによってコーティングされたガラス、さらに特に、ニトロセルロースでコーティングされたスライド（たとえば、ＦＡＳＴスライド）であることが可能である。
【００８９】
いくつかの実施形態において、支持体は、平面であることが可能である。いくつかの例において、支持体は、球状であることが可能である。いくつかの例において、支持体は、ビーズであることが可能である。いくつかの例において、支持体は、磁気を帯びることが可能である。いくつかの例において、磁性固体支持体は、磁鉄鉱、マグへマイト（ｍａｇｈｅｍｉｔｉｔｅ）、ＦｅＰｔ、ＳｒＦｅ、鉄、コバルト、ニッケル、二酸化クロム、フェライト類、またはそれらの混合物を含むことが可能である。いくつかの例において、支持体は、磁性を帯びないことが可能である。いくつかの実施形態において、非磁性固体支持体は、ポリマー、金属、ガラス、合金、鉱物、またはそれらの混合物を含むことが可能である。いくつかの例において、非磁性材料は、磁性固体支持体周囲のコーティングであることが可能である。いくつかの例において、磁性材料は、磁性材料の連続相内に分布することができる。いくつかの実施形態において、固体支持体は、磁性及び非磁性材料を含む。いくつかの例において、固体支持体は、磁性材料及び非磁性材料の組み合わせを含むことが可能である。いくつかの実施形態において、磁性材料は、固体支持体の全組成物の少なくとも約５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、または約８０重量％である。いくつかの実施形態において、ビーズサイズは、非常に大きく、１００〜９００ミクロンほど、またはある場合に、直径３ｍｍまでもあることが可能である。他の実施形態において、ビーズサイズは、１〜１５０ミクロンほどであることが可能である。ビーズの平均粒径は、約２μｍから数ミリメートルの範囲に、たとえば、２μｍ、４μｍ、６μｍ、８μｍ、１０μｍ、２０μｍ、３０μｍ、４０μｍ、５０μｍ、６０μｍ、７０μｍ、８０μｍ、９０μｍ、１００μｍ、１５０μｍ、２００μｍ、３００μｍ、または５００μｍの下限値、及び２０μｍ、３０μｍ、４０μｍ、５０μｍ、６０μｍ、７０μｍ、８０μｍ、９０μｍ、１００μｍ、１５０μｍ、２００μｍ、３００μｍ、５００μｍ、７５０μｍ、１ｍｍ、２ｍｍ、または３ｍｍの上限値を有する範囲内の直径であることが可能である。
【００９０】
いくつかの実施形態において、支持体は、アレイを含むことが可能である。いくつかの実施形態において、このアレイは、標的分析物を含む。いくつかの実施形態において、標的分析物は、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、ポリサッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、標的分析物は、標的分析物のライブラリを含む。
【００９１】
いくつかの実施形態において、アレイは、分子ライブラリを含む。いくつかの実施形態において、アレイは、１ｃｍ２あたり少なくとも約１００、１０００、１０，０００、１００，０００、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０、１０１１、１０１２、１０１３、または１０１４、１０１５個の分子を含むことが可能である。いくつかの実施形態において、分子は、モノマー類の配列を含むことが可能である。いくつかの実施形態において、モノマー類の配列は、アミノ酸類の配列を含むことが可能である。いくつかの実施形態において、特徴は、直径で約０．５ミクロンから約２００ミクロンの基質上の領域であることが可能である。いくつかの実施形態において、アレイは、複数の特徴を有することが可能である。いくつかの実施形態において、特徴間の中心間距離は、約１ミクロンから約３００ミクロンであることが可能である。いくつかの実施形態において、アレイは、１ｃｍ２あたり少なくとも約１，０００、１０，０００、１００，０００、２００，０００、３００，０００、４００，０００、５００，０００、６００，０００、７００，０００、８００，０００、９００，０００、１００万、１５０万、２００万、２５０万、３００万、３５０万、または４００万個の特徴を含むことが可能である。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも約４０％は、異なる。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも約５０％は、異なる。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも約６０％は、異なる。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも約７０％は、異なる。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも約８０％は、異なる。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも約９０％は、異なる。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも５０％は、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、または１００モノマー長である。いくつかの実施形態において、ライブラリ中の分子の少なくとも５０％は、最大３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、または１００モノマー長である。いくつかの実施形態において、ライブラリは、約３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、または１００個のモノマーの中央値のモノマー長を有する。いくつかの実施形態において、アレイは、少なくとも１０，０００、５０，０００、１００，０００、２００，０００、３００，０００、４００，０００、５００，０００、６００，０００、７００，０００、８００，０００、９００，０００、１０６、または１０７個の、配列で異なるライブラリの分子を含むことが可能である。いくつかの実施形態において、アレイ基質は、ウェハ、スライド、及びビーズから選択されることが可能である。いくつかの実施形態において、ライブラリは、原位置合成された化合物ライブラリであることが可能である。いくつかの実施形態において、分子は、ポリヌクレオチド類、ペプチド類、ペプトイド類、またはポリサッカライド類であることが可能である。
【００９２】
結合部分
分析物結合部分は、結合部分（またはドメイン）とも称され、標的分析物へ結合する、領域、分子、ドメイン、部分（ｐｏｒｔｉｏｎ）、フラグメント、または部分（ｍｏｉｅｔｙ）であることが可能である。したがって、結合部分は、所与の標的へ結合する、または特異的に結合する能力を与える。結合部分は、核酸分子であることが可能である、またはタンパク質性であることが可能である。結合部分は、ＲＮＡ、ＤＮＡ、ＲＮＡ−ＤＮＡハイブリッド、小分子（たとえば、薬物または代謝物）、アプタマー類、ポリペプチド類、タンパク質、抗体、ウイルス、ウイルス粒子、細胞、そのフラグメント、及びそれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
【００９３】
いくつかの実施形態において、結合部分は、ポリペプチド、タンパク質、またはいずれかのそのフラグメントであることが可能である。いくつかの実施形態において、ポリペプチドまたはタンパク質は、操作されたまたは組換え型のポリペプチドまたはタンパク質であることが可能である。いくつかの実施形態において、結合部分は、抗体またはそのフラグメントである。抗体は、いずれかのアイソタイプ（たとえば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ及びＩｇＹ）、クラス（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２）、それらのサブクラスまたは修飾型バージョンのものであることが可能である。抗体は、完全な免疫グロブリン、またはそのフラグメントを含むことができる。抗体フラグメントは、抗原などの標的分子に特異的に結合する能力を保持する、抗体の1つ以上のフラグメントを指すことが可能である。
【００９４】
いくつかの実施形態において、結合部分は、アプタマーであることが可能である。アプタマーは、タンパク質などの標的分析物への高い特異性及び親和性で結合する、単離された核酸分子である。アプタマーは、化学接触を提供し、所与の標的に特異的に結合する、ある一定のコンフォメーション（複数可）に保持される三次元構造を含む。いくつかの実施形態において、結合部分は、小分子である。たとえば、小分子は、大環状分子、阻害剤、薬物、または化学物質であることが可能である。いくつかの実施形態において、結合部分は、細胞である。たとえば、結合部分は、不活性細胞、化合物（たとえば、薬物）によって処置された細胞、固定細胞、溶解細胞、またはいずれかのそれらの組み合わせであることが可能である。
【００９５】
検出方法
結合された結合部分を検出する検出方法は、測光手段及び非測光手段を有することが可能である。いくつかの実施形態において、これらのような方法プロセスは、吸光度、蛍光、屈折率、偏光または光散乱を検出し、測定する方法を有する。これらは、これらのようなパラメータを測定する、直接的な、及び／または間接的な手段を有する。蛍光に関わる方法は、ＥＬＩＳＡまたはサンドイッチアッセイなどの免疫学的方法における蛍光タグ付けを有する。屈折率に関わる方法は、表面プラズモン共鳴法（ＳＰＲ）、グレーティングカップリング方法（たとえば、センサユニフォームグレーティングカプラ、波長インタロゲーション光センサ（ＷＩＯＳ）及びチャープトグレーティングカプラ）、共鳴マイナー及び干渉技術を含む。偏光に関わる方法は、偏光解析法を含む。また、光散乱方法を使用することができる。また、タグ付け及び／または分離及び／または検出のための他の手段は、磁気的手段を含むことが可能である。磁気共鳴撮像法（ＭＲＩ）、または気相イオン分光法をすべて使用することができる。
【００９６】
検出の非測光方法は、磁気共鳴撮像法、気相イオン分光法、原子力マイクロスコピー及び多極カップリング共鳴分光法を制限なしに含む。磁気共鳴撮像法（ＭＲＩ）は、分子について微視的な化学的及び物理的情報を取得するために科学者によって使用される、分光技術である核磁気共鳴法（ＮＭＲ）の原理に基づく。気相イオン分光計は、質量分析計、イオンモビリティ質量分析計及び全イオン電流測定装置を含む。
【００９７】
また結合アッセイは、たとえば、本明細書に記載される標的分析物と相互作用する疾患関連抗体（結合部分）を識別するために、有用であることが可能である。たとえば、標的分析物に結合する抗体または他の分子は、結合アッセイ中で識別されることが可能である。結合アッセイは、単離されたポリペプチド類、粗エキス類、または細胞ベースのアッセイ類の使用を含むことが可能であるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、本明細書に記載されるアッセイ類を使用して、ａ）第一疾患または第二疾患を有する対象を識別すること、ｂ）疾患処置の影響を評価すること、及びｃ）疾患の進行を監視することが可能である。
【００９８】
結合アッセイ類は、標的分析物を、結合部分（抗体）を含む試料と接触させること、ならびに分子及び試験剤に十分な時間で結合複合体を形成することを可能にすることを備えることが可能である。形成されるいずれかの結合複合体類を、複数の確立された解析技術のいずれかを使用して検出することが可能である。結合アッセイ類は、非変性ＳＤＳポリアクリルアミドゲル類上の共沈殿または共遊走、ウエスタンブロット類上での共遊走、酵素結合免疫吸着測定（ＥＬＩＳＡ）、放射免疫アッセイ（ＲＩＡ）、免疫放射線アッセイ、蛍光免疫測定、化学発光アッセイ、生物発光アッセイ、蛍光標示式細胞分取（ＦＡＣＳ）、または蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）を測定する方法を含むが、これらに限定されない。
【００９９】
診断
本明細書に開示される方法及び装置を使用して、身体の、またはいくつかの器官の状態における変化を有する、機能の遂行を中断する、または妨げる、及び／または不快感、機能障害、苦痛のような症状、または死でさえもその患者または患者と接触する者に引き起こす、さまざまな疾患または状態についてスクリーニングすることが可能である。疾患または状態は、病気（ｄｉｓｔｅｍｐｅｒ）、病気（ａｉｌｍｅｎｔ）、疾患、障害、病気（ｓｉｃｋｎｅｓｓ）、病気（ｉｌｌｎｅｓｓ）、病気（ｃｏｍｐｌａｉｎ）、相互素因（ｉｎｔｅｒｄｉｓｐｏｓｉｔｉｏｎ）、及び／または虚飾をも含むことが可能である。
【０１００】
たとえば、病気の動物からの結合部分を含む試料は、結合部分のアレイと相互作用する能力について同時にスクリーニングされることが可能である。これらの相互作用は、疾患状態にない、疾患状態中のヒトの症状を提示しない、または疾患状態の症状を提示する個体からの試料の相互作用と比較されることが可能である。たとえば、病気の動物からの試料中の結合部分のレベルは、同時に決定されることが可能である。これらのレベルは、疾患状態にない、疾患状態中のヒトの症状を提示しない、または疾患状態の症状を提示する個体からの試料のレベルと比較されることが可能である。
【０１０１】
本明細書に記載される、方法、キット及び組成物は、医学的診断、創薬、分子生物学、免疫学及び毒性学に使用されることが可能である。アレイは、複数の診断及びスクリーニング用途における大規模結合アッセイ類のために使用されることが可能である。多数の標的分析物（たとえば、タンパク質）のレベルにおける定量変動の多重測定は、数個から多数の異なる標的分析物によって定義されるパターンの認識を可能にする。標的分析物と結合部分との間の多数の相互作用の多重同定は、標的分析物と結合部分との間の数個から多数の異なる相互作用によって定義される結合及び相互作用パターンの認識を可能にする。多くの生理学的パラメータ及び疾患特異的パターンは、同時に評価されることが可能である。１つの実施形態は、生体試料中に存在するタンパク質の分離、同定及び特性評価を伴う。たとえば、疾患試料及び対照試料の比較によって、疾患特異的標的分析物を同定することが可能である。これらの標的分析物は、薬物開発のための標的として、または疾患の分子マーカーとして使用されることが可能である。
【０１０２】
いくつかの実施形態において、方法は、がん、炎症性疾患、免疫疾患、自己免疫疾患、循環器疾患、神経疾患、感染症、代謝疾患、または周産期疾患などの、疾患または状態を診断する、または検出する方法であることが可能である。たとえば、疾患または状態は、腫瘍、新生物、またはがんであることが可能である。がんは、乳癌、卵巣癌、肺癌、結腸癌、過形成性ポリープ、腺腫、大腸癌、高度異形成、軽度異形成、前立腺肥大症、前立腺癌、メラノーマ、膵癌、脳癌(神経膠芽腫などの)、造血器腫瘍、肝細胞癌、子宮頚癌、子宮内膜癌、頭頸部癌、食道癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、腎細胞癌（ＲＣＣ）または胃癌であることが可能であるが、これらに限定されない。大腸癌は、ＣＲＣデュークスＢまたはデュークスＣ−Ｄであることが可能である。造血器腫瘍は、Ｂ細胞性慢性リンパ性白血病、Ｂ細胞性リンパ性ＤＬＢＣＬ、Ｂ細胞性リンパ性ＤＬＢＣＬ胚中心様、Ｂ細胞リンパ性ＤＬＢＣＬ活性化Ｂ細胞様、またはバーキットリンパ腫であることが可能である。また、疾患または状態は、バレット食道などの、前がん性状態であることが可能である。また、疾患または状態は、炎症性疾患、免疫疾患、または自己免疫疾患であることが可能である。たとえば、疾患は、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、クローン病（ＣＤ）、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）、骨盤内炎症、血管炎、乾癬、糖尿病、自己免疫性肝炎、多発性硬化症、重症筋無力症、Ｉ型糖尿病、関節リウマチ、乾癬、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、橋本病、グレーブス病、強直性脊椎炎、シェーグレン疾患、ＣＲＥＳＴ症候群、強皮症、リウマチ性疾患、臓器拒絶反応、原発性硬化性胆管炎、または敗血症であることが可能である。また、疾患または状態は、アテローム動脈硬化症、うっ血性心不全、不安定プラーク、脳卒中、または虚血などの、循環器疾患であることが可能である。循環器疾患または状態は、高血圧、狭窄、血管閉塞または血栓の事象であることが可能である。また疾患または状態は、多発性硬化症（ＭＳ）、パーキンソン病（ＰＤ）、アルツハイマー病（ＡＤ）、統合失調症、双極性障害、うつ状態、自閉症、プリオン病、ピック病、認知症、ハンチントン病（ＨＤ）、ダウン症、脳血管疾患、ラスムッセン脳炎、ウイルス性髄膜炎、精神神経系全身性エリテマトーデス（ＮＰＳＬＥ）、筋萎縮性側索硬化症、クロイツフェルトヤコブ病、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー症候群、伝達性海綿状脳症、虚血再灌流障害（たとえば、脳卒中）、脳外傷、微生物感染症、または慢性疲労症候群などの、神経疾患であることが可能である。また、状態は、線維筋痛症、慢性神経障害性疼痛、または末梢神経障害性疼痛であることが可能である。また、疾患または状態は、細菌性、ウイルス性、または酵母感染などの、感染症であることが可能である。たとえば、疾患または状態は、ウィップル病、プリオン病、硬変症、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌、ＨＩＶ、肝炎、梅毒、髄膜炎、マラリア、結核、またはインフルエンザであることが可能である。また疾患または状態は、周産期若しくは妊娠関連状態（たとえば、妊娠高血圧腎症若しくは早産）、ジカウイルス、デング熱、フラビウイルス、または鉄代謝と関連する代謝疾患若しく���状態などの、代謝疾患若しくは状態であることが可能である。
【０１０３】
いくつかの実施形態において、方法は、自己免疫疾患を診断する、または検出する方法である。いくつかの実施形態において、方法は、疾患若しくは状態、または疾患若しくは状態の進行を決定する方法であることが可能である。免疫系と関連する疾患の非限定的な例は、自己免疫疾患、炎症性疾患、ＨＩＶ、関節リウマチ、Ｉ型糖尿病、全身性エリテマトーデス、強皮症、多発性硬化症、重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、デイジョージ症候群、毛細血管拡張性運動失調症、季節性アレルギー、通年性アレルギー、食物アレルギー、アナフィラキシー、肥満細胞症、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、パーキンソンの、アルツハイマーの、脾機能亢進症、白血球粘着不全症、Ｘ連鎖リンパ増殖性疾患、Ｘ連鎖無ガンマグロブリン血症、選択的免疫グロブリンＡ欠損症、高ＩｇＭ症候群、自己免疫性リンパ増殖症候群、ウィスコット・オルドリッチ症候群、慢性肉芽腫症、分類不能免疫不全症（ＣＶＩＤ）、高免疫グロブリンＥ症候群、橋本病を含むことが可能である。
【０１０４】
キット
また提供されるのは、上記のように、本発明の方法を実施する際の用途を見出すキットである。キットは、本明細書に記載される組成物のうちの１つ以上を含むことが可能である。キットは、少なくとも１個のヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを含むことが可能である。キットは、少なくとも１箇所の結合部分を含むことが可能である。
【０１０５】
キットは、固体支持体を含むことが可能である。いくつかの実施形態において、固体支持体は、構造Ｉの少なくとも１つの分子によってすでに官能基化されている。いくつかの実施形態において、固体支持体は、少なくとも１個のヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントによってすでに官能基化されている。キットは、少なくとも１個のヌクレオシド、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド、ペプトイド、サッカライド、アプタマー、若しくは抗体、またはそのフラグメントを固体支持体へカップリングする試薬を含むことが可能である。
【０１０６】
キット構成要素は、別々の容器中に存在することができ、または１個以上の構成要素は、同一の容器中に存在することができ、これらの容器は、貯蔵容器及び／またはキットを設計するアッセイ中に用いられる容器であることが可能である。
【０１０７】
上述の構成要素に加えて、本発明のキットは、本発明の方法を実施するための説明書をさらに含むことができる。これらの説明書は、適切な媒体または基材（たとえば、情報を印刷する１枚または複数枚の紙）上に印刷された情報などの、さまざまな形態で、本発明のキット中に、キットのパッケージ中に、添付文書などの中に存在することができる。さらに別の手段は、情報を記録している、コンピュータ可読媒体（たとえば、ディスケット、ＣＤなど）である。存在し得るさらに別の手段は、インターネットを介して使用され、離れたサイトで情報にアクセスすることができるウェブサイトアドレスである。
【０１０８】
結果の共有
追加の実施形態は、たとえば、技術者、医師または対象へのアッセイ結果または診断または両方の共有に関する。ある一定の実施形態において、コンピュータは、関心がある当事者ら、たとえば、医者及び彼らの対象への評価または診断または両方の結果を共有するために使用される。いくつかの実施形態において、評価は、結果若しくは診断を共有する国若しくは管轄区と異なる国若しくは管轄区において実施されることが可能である、または結果が分析されることが可能である。いくつかの実施形態において、結合部分若しくは結合シグネチャ、または同定されるシグナルの試験対象における存在または非存在に基づく診断は、診断を取得した後にできるだけ早く対象へ通信されることができる。診断は、対象の処置医によって対象と共有されることができる。あるいは、診断は、電子メールによって試験対象へ送信される、または電話によって対象へ通信されることができる。コンピュータを使用して、診断を電子メールまたは電話によって通信することができる。ある一定の実施形態において、診断検査の結果を含むメッセージは、テレコミュニケーションにおける当業者に周知であるコンピュータのハードウェア及びソフトウェアの組み合わせを使用して自動的に、生成され、対象へ配信されることができる。医療向け通信システムの１例は、米国特許第６，２８３，７６１号に記載されているが、本開示は、この特定の通信システムを利用する方法に限定されない。ある一定の実施形態において、試料のアッセイ、疾患の診断、及び方法結果または診断の共有を含む、すべての、またはいくつかの方法ステップは、多様な（たとえば、外国の）管轄区において実行されることができる。
【０１０９】
他の実施形態
本明細書で使用される節の見出しは、単に構成目的のものであり、記載される発明の主題を限定するものと解釈されるべきではない。
【０１１０】
本明細書に記載される方法及び組成物が本明細書に記載の特定の方法論、プロトコル、構築物、及び試薬に限定されることはなく、したがって、変更されることができることを理解する。本明細書で使用される用語が特定の実施形態のみを記述するために使用されるものであり、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本明細書に記載の方法及び組成物の範囲を限定することを意図するものではないことも理解されるべきである。本開示の好ましい実施形態を示し、本明細書に記載しているが、そのような実施形態が、例示として提供されるにすぎないことは当業者に明らかである。そして、当業者は、本開示から逸脱せずに、数多くの変形、変更及び置換を思いつくであろう。本開示を実施する際には、本明細書に記載されている本開示の実施形態に対するさまざまな代替物を用いてよいことを理解されたい。以下の特許請求の範囲が本開示の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲の方法及び構造ならびにそれらの均等物がそれにより包含されることが意図されている。
【０１１１】
説明のための例示的な適用を参照して、いくつかの態様を説明する。別段に示されない限り、いずれの実施形態も、いずれの他の実施形態と組み合わされることが可能である。本明細書に記載される特徴の完全な理解を提供するために、多くの特定の詳細、関連性、及び方法を記載することが理解される。しかしながら、当業者は、１つ以上の特定の詳細なしに、または他の方法を用いて、本明細書に記載の特徴が実施されうることを容易に認識する。一部の作用は異なる順序で、及び／または他の作用または事象と同時に起こることが可能であるため、本明細書に記載の特徴は、例示された作用または事象の順序に限定されない。さらに、例示された作用または事象のすべては、本明細書に記載の特徴にしたがった方法を実施するために必要とされるわけではない。
【０１１２】
一部の本発明の実施形態は、数値範囲を企図している。範囲が存在するとき、範囲は、その範囲の端点を含む。さらに、その範囲内のすべての下位範囲及び値が、あたかも明確に書き出されているように存在する。「約」または「およそ」という用語は、当業者によって決定されるような特定の値についての許容可能な誤差範囲内であることを意味することができ、値を測定する、または決定する方法、すなわち、測定システムの限界に部分的に依存する。たとえば、「約」は、当該技術分野における慣例に従い、１以内のまたは１以上の標準偏差を意味することができる。あるいは、「約」は、所与の値の最大２０％、最大１０％、最大５％、または最大１％の範囲を意味することができる。あるいは、特に生物学的システムまたはプロセスに関して、用語は、値の５倍以内、または２倍以内の桁内を意味することができる。別段に記載がない限り、本出願及び特許請求の範囲に特定の値が記載される場合、「約」という用語は、特定の値について許容可能な誤差範囲内にあることを意味するとみなされることが可能である。
【実施例】
【０１１３】
実施例１−ＰＬ８リンカー（ＨＴ９６０−９６３）
図１は、分子（ＨＴ９６０）を示す。
【０１１４】
図２は、４個の分子（ＨＴ９６０−ＨＴ９６３）を模式的に示す。
【０１１５】
実施例２−テトラペプチド類のＰＬ８リンカーへの段階的カップリング
実施例１の分子は、アミノ酸に順次カップリングされ、１６個のリンカー結合テトラペプチドを形成した。蒸気相アンモニア開裂及びＭＡＬＤＩ分析は、各カップリングステップ後に実施され、各カップリングステップについて同一性及び収率を評価した。
【０１１６】
図３は、ＨＴ９６０のカップリング配列の結果を示す。第一カップリングステップ後の平均収率は、６４％であった。第二カップリングステップ後の平均収率は、１００％であった。第三カップリングステップ後の平均収率は、１００％であった。第四カップリングステップ後の平均収率は、１００％であった。
【０１１７】
図４は、ＨＴ９６２についてのカップリング配列の結果を示す。第一カップリングステップ後の平均収率は、６２％であった。第二カップリングステップ後の平均収率は、１００％であった。第三カップリングステップ後の平均収率は、１００％であった。第四カップリングステップ後の平均収率は、１００％であった。
【０１１８】
実施例３（机上の）
図５は、分子を示す。
【０１１９】
実施例４（机上の）
図６は、分子を示す。
【０１２０】
実施例５（机上の）
図７は、分子を示す。
【０１２１】
実施例６（机上の）
図８は、分子を示す。
【図１】
2019536770.tif 000022
【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
2019536770.tif 000032
【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
2019536770.tif 000036
【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【図３３】
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【図３４】
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【図３５】
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【図３６】
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【図３７】
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【国際調査報告】
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