(57)【要約】本発明は、ワクチン組成物およびかかる組成物を産生する方法を提供する。本発明の他の実施形態は、病原体感染症を処置する方法、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法、およびそれを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するための方法を含む。さらなる実施形態では、本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法、病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させる方法、およびそれを必要とする被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させる方法を含む。新規足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体組成物、ならびにそれらの使用もまた、本明細書で提供される。【特許請求の範囲】
【請求項１】
オプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物と被験体において免疫細胞を動員することが可能なバイオ薬剤とを含む、ワクチン組成物。
【請求項２】
前記バイオ薬剤が、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３】
前記バイオ薬剤がアジュバントを含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４】
前記アジュバントが、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド、アジュバント６５、リポバント、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される、請求項３に記載のワクチン組成物。
【請求項５】
前記レクチン結合病原体構築物が、レクチン、レクチンの一部分、操作されたレクチンまたはその一部分を含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項６】
前記レクチンがコレクチンである、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項７】
前記レクチンがフィコリンである、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項８】
前記レクチンがマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項９】
前記レクチンが、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８を含む、請求項８に記載のワクチン組成物。
【請求項１０】
前記レクチンが、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含む、請求項８に記載のワクチン組成物。
【請求項１１】
前記マンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）が、前記病原体に結合することが可能である、請求項８に記載のワクチン組成物。
【請求項１２】
前記レクチンがサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）を含む、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項１３】
前記サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）が、前記病原体に結合することが可能である、請求項１２に記載のワクチン組成物。
【請求項１４】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、免疫グロブリン（ＩｇＧ）Ｆｃ部分をさらに含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項１５】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、固体支持体をさらに含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項１６】
前記固体支持体が、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される、請求項１５に記載のワクチン組成物。
【請求項１７】
前記固体支持体が磁性ビーズである、請求項１６に記載のワクチン組成物。
【請求項１８】
前記病原体が、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で前記固体支持体上に存在する、請求項１５に記載のワクチン組成物。
【請求項１９】
前記病原体が、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項２０】
前記細菌が、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群からなる群より選択される、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２１】
前記細菌が、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌である、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２２】
前記抗生物質耐性細菌または前記多剤耐性細菌が、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される、請求項２１に記載のワクチン組成物。
【請求項２３】
前記真菌が、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）からなる群より選択される、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２４】
前記ウイルスが、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、ＨＩＶ、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）およびジカウイルスからなる群より選択される、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２５】
前記寄生生物が、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａからなる群より選択される、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２６】
前記病原体が、前記感染性微生物の細胞壁構成要素を含む、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２７】
前記病原体が、前記感染性微生物細胞全体を含む、請求項１９に記載のワクチン組成物。
【請求項２８】
前記病原体がマイコプラズマである、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項２９】
前記マイコプラズマが、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅからなる群より選択される、請求項２８に記載のワクチン組成物。
【請求項３０】
前記病原体が、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３１】
前記ＰＡＭＰが、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および前記病原体から放出される構成要素からなる群より選択される、請求項３０に記載のワクチン組成物。
【請求項３２】
前記病原体から放出される前記構成要素が、毒素を含む、請求項３１に記載のワクチン組成物。
【請求項３３】
前記毒素が、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される、請求項３２に記載のワクチン組成物。
【請求項３４】
前記病原体が、被験体に由来する試料中にある、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３５】
前記試料が、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液試料および涙試料からなる群より選択される、請求項３４に記載のワクチン組成物。
【請求項３６】
前記病原体が、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３７】
前記病原体が合成病原体である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３８】
前記病原体が中和される、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項３９】
前記病原体が、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される、請求項３８に記載のワクチン組成物。
【請求項４０】
前記病原体が、中和後に非感染性である、請求項３９に記載のワクチン組成物。
【請求項４１】
前記免疫細胞が抗原提示細胞である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４２】
前記免疫細胞が、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される、請求項４１に記載のワクチン組成物。
【請求項４３】
少なくとも２つの異なる型の病原体を含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４４】
異なる種の病原体に対して標的化することが可能である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４５】
被験体における移植に適切である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４６】
皮下移植に適切である、請求項４５に記載のワクチン組成物。
【請求項４７】
被験体における注射に適切である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４８】
被験体における経口投与に適切である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項４９】
丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である、請求項４８に記載のワクチン組成物。
【請求項５０】
凍結乾燥される、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項５１】
約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する、請求項５０に記載のワクチン組成物。
【請求項５２】
室温において貯蔵されることが可能である、請求項５０に記載のワクチン組成物。
【請求項５３】
前記被験体が哺乳動物である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項５４】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項５３に記載のワクチン組成物。
【請求項５５】
前記哺乳動物がヒトである、請求項５４に記載のワクチン組成物。
【請求項５６】
生体材料を含む足場であって、前記被験体において前記免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場をさらに含む、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項５７】
前記生体材料が、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される、請求項５６に記載のワクチン組成物。
【請求項５８】
前記生体材料が、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される、請求項５７に記載のワクチン組成物。
【請求項５９】
病原体感染症の処置を必要とする被験体において病原体感染症を処置する方法であって、請求項１から５８のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記病原体感染症を処置するステップを含む、方法。
【請求項６０】
病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法であって、請求項１から５８のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記病原体感染症に対して前記被験体をワクチン接種するステップを含む、方法。
【請求項６１】
抗生物質耐性細菌感染症の処置を必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法であって、請求項１から５８のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む、方法。
【請求項６２】
前記ワクチン組成物が、前記被験体における前記抗生物質耐性細菌に対して特異的である、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法であって、請求項１から５８のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記病原体のレベルを減少させるステップを含む、方法。
【請求項６４】
前記病原体のレベルが、前記被験体の臓器において減少される、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記臓器が、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法であって、請求項１から５８のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体の生存率を増加させるステップを含む、方法。
【請求項６７】
前記被験体が哺乳動物である、請求項５９から６６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６８】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記哺乳動物がヒトである、請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
前記感染症が急性感染症である、請求項５９から６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７１】
前記感染症が慢性感染症である、請求項５９から６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７２】
ワクチンを産生する方法であって、
病原体またはその断片を含む試料を、オプソニンまたはレクチンと接触させるステップであって、前記オプソニンまたは前記レクチンが、前記試料中の前記病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；
前記試料から前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を、被験体において免疫細胞を動員することが可能なバイオ薬剤と組み合わせ、それによって、前記ワクチンを産生するステップ
を含む、方法。
【請求項７３】
前記病原体が被験体に由来する、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
前記病原体が、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む、請求項７２に記載の方法。
【請求項７５】
前記ＰＡＭＰが、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および前記病原体から放出される構成要素からなる群より選択される、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
前記病原体が、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する、請求項７２に記載の方法。
【請求項７７】
前記病原体が合成病原体である、請求項７２に記載の方法。
【請求項７８】
前記バイオ薬剤がアジュバントを含む、請求項７２に記載の方法。
【請求項７９】
生体材料を含む足場であって、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場；および
オプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物
を含む、ワクチン組成物。
【請求項８０】
前記生体材料が、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項８１】
前記生体材料が、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項８２】
前記足場がバイオ薬剤をさらに含む、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項８３】
前記バイオ薬剤が、前記被験体において前記免疫細胞を動員することが可能である、請求項８２に記載のワクチン組成物。
【請求項８４】
前記バイオ薬剤が、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される、請求項８３に記載のワクチン組成物。
【請求項８５】
前記バイオ薬剤がアジュバントを含む、請求項８３に記載のワクチン組成物。
【請求項８６】
前記アジュバントが、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド、アジュバント６５、リポバント、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される、請求項８５に記載のワクチン組成物。
【請求項８７】
前記アジュバントが顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）である、請求項８６に記載のワクチン組成物。
【請求項８８】
前記アジュバントがポリエチレンイミン（ＰＥＩ）−ＣｐＧ−ＯＤＮ配列を含む、請求項８６に記載のワクチン組成物。
【請求項８９】
前記レクチン結合病原体構築物が、レクチン、レクチンの一部分、操作されたレクチンまたはその一部分を含む、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項９０】
前記レクチンがコレクチンである、請求項８９に記載のワクチン組成物。
【請求項９１】
前記レクチンがフィコリンである、請求項８９に記載のワクチン組成物。
【請求項９２】
前記レクチンがマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である、請求項８９に記載のワクチン組成物。
【請求項９３】
前記レクチンが、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８を含む、請求項９２に記載のワクチン組成物。
【請求項９４】
前記レクチンが、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含む、請求項９２に記載のワクチン組成物。
【請求項９５】
前記マンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）が、前記病原体に結合することが可能である、請求項９２に記載のワクチン組成物。
【請求項９６】
前記レクチンがサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）を含む、請求項８９に記載のワクチン組成物。
【請求項９７】
前記サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）が、前記病原体に結合することが可能である、請求項９６に記載のワクチン組成物。
【請求項９８】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、免疫グロブリン（ＩｇＧ）Ｆｃ部分をさらに含む、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項９９】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、固体支持体をさらに含む、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１００】
前記固体支持体が、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される、請求項９９に記載のワクチン組成物。
【請求項１０１】
前記固体支持体が磁性ビーズである、請求項１００に記載のワクチン組成物。
【請求項１０２】
前記病原体が、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で前記固体支持体上に存在する、請求項９９に記載のワクチン組成物。
【請求項１０３】
前記病原体が、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１０４】
前記細菌が、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群からなる群より選択される、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１０５】
前記細菌が、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌である、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１０６】
前記抗生物質耐性細菌または前記多剤耐性細菌が、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される、請求項１０５に記載のワクチン組成物。
【請求項１０７】
前記真菌が、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）からなる群より選択される、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１０８】
前記ウイルスが、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、ＨＩＶ、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）およびジカウイルスからなる群より選択される、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１０９】
前記寄生生物が、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａからなる群より選択される、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１１０】
前記病原体が、前記感染性微生物の細胞膜構成要素を含む、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１１１】
前記病原体が、前記感染性微生物から単離された細胞全体を含む、請求項１０３に記載のワクチン組成物。
【請求項１１２】
前記病原体がマイコプラズマである、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１１３】
前記マイコプラズマが、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅからなる群より選択される、請求項１１２に記載のワクチン組成物。
【請求項１１４】
前記病原体が、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１１５】
前記ＰＡＭＰが、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および前記病原体から放出される構成要素からなる群より選択される、請求項１１４に記載のワクチン組成物。
【請求項１１６】
前記病原体から放出される前記構成要素が、毒素を含む、請求項１１５に記載のワクチン組成物。
【請求項１１７】
前記毒素が、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される、請求項１１６に記載のワクチン組成物。
【請求項１１８】
前記病原体が、被験体に由来する試料中にある、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１１９】
前記試料が、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液試料および涙試料からなる群より選択される、請求項１１８に記載のワクチン組成物。
【請求項１２０】
前記病原体が、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１２１】
前記病原体が合成病原体である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１２２】
前記病原体が中和される、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１２３】
前記病原体が、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される、請求項１２２に記載のワクチン組成物。
【請求項１２４】
前記病原体が、中和後に非感染性である、請求項１２３に記載のワクチン組成物。
【請求項１２５】
前記免疫細胞が抗原提示細胞である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１２６】
前記免疫細胞が、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される、請求項１２５に記載のワクチン組成物。
【請求項１２７】
少なくとも２つの異なる型の病原体を含む、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１２８】
異なる種の病原体に対して標的化することが可能である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１２９】
被験体における移植に適切である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３０】
皮下移植に適切である、請求項１２９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３１】
被験体における注射に適切である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３２】
被験体における経口投与に適切である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３３】
丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である、請求項１３２に記載のワクチン組成物。
【請求項１３４】
凍結乾燥される、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３５】
約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する、請求項１３４に記載のワクチン組成物。
【請求項１３６】
室温において貯蔵されることが可能である、請求項１３４に記載のワクチン組成物。
【請求項１３７】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を固定化すること、および前記足場からの前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物の漏出を防止することが可能である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３８】
前記被験体が哺乳動物である、請求項７９に記載のワクチン組成物。
【請求項１３９】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項１３８に記載のワクチン組成物。
【請求項１４０】
前記哺乳動物がヒトである、請求項１３９に記載のワクチン組成物。
【請求項１４１】
生体材料を含み、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な安定な足場組成物であって、前記足場が凍結乾燥され、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する、足場組成物。
【請求項１４２】
前記生体材料が、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１４３】
前記生体材料が、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される、請求項１４２に記載の足場組成物。
【請求項１４４】
前記足場がバイオ薬剤をさらに含む、請求項１４３に記載の足場組成物。
【請求項１４５】
前記バイオ薬剤が、前記被験体において前記免疫細胞を動員することが可能である、請求項１４４に記載の足場組成物。
【請求項１４６】
前記バイオ薬剤が、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される、請求項１４５に記載の足場組成物。
【請求項１４７】
前記バイオ薬剤がアジュバントを含む、請求項１４５に記載の足場組成物。
【請求項１４８】
前記アジュバントが、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド、アジュバント６５、リポバント、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される、請求項１４７に記載の足場組成物。
【請求項１４９】
前記アジュバントが顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を含む、請求項１４８に記載の足場組成物。
【請求項１５０】
前記アジュバントがポリエチレンイミン（ＰＥＩ）−ＣｐＧ−ＯＤＮ配列を含む、請求項１４８に記載の足場組成物。
【請求項１５１】
前記免疫細胞が抗原提示細胞である、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１５２】
前記免疫細胞が、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される、請求項１５１に記載の足場組成物。
【請求項１５３】
被験体における移植に適切である、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１５４】
皮下移植に適切である、請求項１５３に記載の足場組成物。
【請求項１５５】
被験体における注射に適切である、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１５６】
被験体における経口投与に適切である、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１５７】
丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である、請求項１５６に記載の足場組成物。
【請求項１５８】
前記被験体が哺乳動物である、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１５９】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項１５８に記載の足場組成物。
【請求項１６０】
前記哺乳動物がヒトである、請求項１５９に記載の足場組成物。
【請求項１６１】
室温において貯蔵されることが可能である、請求項１４１に記載の足場組成物。
【請求項１６２】
オプソニンに結合した、被験体に由来する病原体またはその断片を含む、安定なオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物であって、凍結乾燥され、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する、オプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６３】
レクチンまたはレクチンの一部分、操作されたレクチンまたはその一部分を含む、請求項１６２に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６４】
前記レクチンがコレクチンである、請求項１６３に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６５】
前記レクチンがフィコリンである、請求項１６３に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６６】
前記レクチンがマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である、請求項１６３に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６７】
前記レクチンが、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８を含む、請求項１６６に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６８】
前記レクチンが、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含む、請求項１６６に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１６９】
前記マンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）が、前記病原体に結合することが可能である、請求項１６６に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７０】
前記レクチンがサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）を含む、請求項１６３に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７１】
前記サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）が、前記病原体に結合することが可能である、請求項１７０に記載のレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７２】
免疫グロブリン（ＩｇＧ）Ｆｃ部分を含む、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７３】
固体支持体をさらに含む、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７４】
前記固体支持体が、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される、請求項１７３に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７５】
前記固体支持体が磁性ビーズである、請求項１７４に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７６】
前記病原体が、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で前記固体支持体上に存在する、請求項１７３に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７７】
前記病原体が、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７８】
前記細菌が、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群からなる群より選択される、請求項１７７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１７９】
前記細菌が、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌である、請求項１７８に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８０】
前記抗生物質耐性細菌または前記多剤耐性細菌が、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される、請求項１７９に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８１】
前記真菌が、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）からなる群より選択される、請求項１７７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８２】
前記ウイルスが、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、ＨＩＶ、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）およびジカウイルスからなる群より選択される、請求項１７７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８３】
前記寄生生物が、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａからなる群より選択される、請求項１７７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８４】
前記病原体が、前記感染性微生物の細胞膜構成要素を含む、請求項１７７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８５】
前記病原体が、前記感染性微生物から単離された細胞全体を含む、請求項１７７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８６】
前記病原体がマイコプラズマである、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８７】
前記マイコプラズマが、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅからなる群より選択される、請求項１８６に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８８】
前記病原体が、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１８９】
前記ＰＡＭＰが、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および前記病原体から放出される構成要素からなる群より選択される、請求項１８８に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９０】
前記病原体から放出される前記構成要素が、毒素を含む、請求項１８９に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９１】
前記毒素が、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される、請求項１９０に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９２】
前記病原体が、被験体に由来する試料中にある、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９３】
前記試料が、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液試料および涙試料からなる群より選択される、請求項１９２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９４】
前記病原体が、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９５】
前記病原体が合成病原体である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物。
【請求項１９６】
前記病原体が中和される、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９７】
前記病原体が、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される、請求項１９６に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９８】
前記病原体が、中和後に非感染性である、請求項１９７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項１９９】
少なくとも２種の病原体を含む、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項２００】
少なくとも３種の病原体を含む、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項２０１】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、被験体における移植に適切である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物。
【請求項２０２】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、被験体における注射に適切である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物。
【請求項２０３】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、被験体における経口投与に適切である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物。
【請求項２０４】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である、請求項２０３に記載のオプソニン結合病原体構築物。
【請求項２０５】
室温において貯蔵されることが可能である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項２０６】
前記被験体が哺乳動物である、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項２０７】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項２０６に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項２０８】
前記哺乳動物がヒトである、請求項２０７に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物。
【請求項２０９】
病原体感染症の処置を必要とする被験体において病原体感染症を処置する方法であって、請求項７９から１４０のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記病原体感染症を処置するステップを含む、方法。
【請求項２１０】
病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法であって、請求項７９から１４０のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記病原体感染症に対して前記被験体をワクチン接種するステップを含む、方法。
【請求項２１１】
抗生物質耐性細菌感染症の処置を必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法であって、請求項７９から１４０のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む、方法。
【請求項２１２】
前記ワクチン組成物が、前記被験体における前記抗生物質耐性細菌に対して特異的である、請求項２１１に記載の方法。
【請求項２１３】
病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法であって、請求項７９から１４０のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記病原体のレベルを減少させるステップを含む、方法。
【請求項２１４】
前記病原体のレベルが、前記被験体の臓器において減少される、請求項２１３に記載の方法。
【請求項２１５】
前記臓器が、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される、請求項２１４に記載の方法。
【請求項２１６】
病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法であって、請求項７９から１４０のいずれか一項に記載のワクチン組成物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体の生存率を増加させるステップを含む、方法。
【請求項２１７】
前記被験体が哺乳動物である、請求項２０９から２１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１８】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項２１７に記載の方法。
【請求項２１９】
前記哺乳動物がヒトである、請求項２１８に記載の方法。
【請求項２２０】
前記感染症が急性感染症である、請求項２０９から２１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２１】
前記感染症が慢性感染症である、請求項２０９から２１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２２】
病原体感染症の処置を必要とする被験体において病原体感染症を処置する方法であって、請求項１４１に記載の足場組成物および請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記病原体感染症を処置するステップを含む、方法。
【請求項２２３】
病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法であって、請求項１４１に記載の足場組成物および請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を前記被験体に投与し、それによって、前記病原体感染症に対して前記被験体をワクチン接種するステップを含む、方法。
【請求項２２４】
抗生物質耐性細菌感染症の処置を必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法であって、請求項１４１に記載の足場組成物および請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む、方法。
【請求項２２５】
前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、前記被験体における前記抗生物質耐性細菌に対して特異的である、請求項２２４に記載の方法。
【請求項２２６】
病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法であって、請求項１４１に記載の足場組成物および請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体において前記病原体のレベルを減少させるステップを含む、方法
【請求項２２７】
前記病原体のレベルが、前記被験体の臓器において減少される、請求項２２６に記載の方法。
【請求項２２８】
前記臓器が、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される、請求項２２７に記載の方法。
【請求項２２９】
病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法であって、請求項１４１に記載の足場組成物および請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を前記被験体に投与し、それによって、前記被験体の生存率を増加させるステップを含む、方法。
【請求項２３０】
請求項１４１に記載の足場組成物と請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物とが、前記被験体に同時に投与される、請求項２２２から２２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３１】
請求項１４１に記載の足場組成物が、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物の前に前記被験体に投与される、請求項２２２から２２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３２】
請求項１４１に記載の足場組成物が、請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物の後に前記被験体に投与される、請求項２２２から２２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３３】
前記被験体が哺乳動物である、請求項２２２から２３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３４】
前記哺乳動物が、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される、請求項２３３に記載の方法。
【請求項２３５】
前記哺乳動物がヒトである、請求項２３４に記載の方法。
【請求項２３６】
前記感染症が急性感染症である、請求項２２２から２３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３７】
前記感染症が慢性感染症である、請求項２２２から２３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３８】
ワクチンを産生する方法であって、
病原体またはその断片を含む試料を、オプソニンまたはレクチンと接触させるステップであって、前記オプソニンまたは前記レクチンが、前記試料中の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；
前記試料から前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および
単離された前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を足場と組み合わせ、それによって、前記ワクチンを産生するステップ
を含む、方法。
【請求項２３９】
前記病原体が被験体に由来する、請求項２３８に記載の方法。
【請求項２４０】
前記病原体が、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する、請求項２３８に記載の方法。
【請求項２４１】
前記病原体が合成病原体である、請求項２３８に記載の方法。
【請求項２４２】
前記病原体が、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む、請求項２３８に記載の方法。
【請求項２４３】
前記ＰＡＭＰが、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および前記病原体から放出される構成要素からなる群より選択される、請求項２４２に記載の方法。
【請求項２４４】
ワクチンを産生する方法であって、
オプソニンまたはレクチンを被験体に投与するステップであって、前記オプソニンまたは前記レクチンが、前記被験体由来の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；
前記被験体から前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および
単離された前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を足場と組み合わせ、それによって、前記ワクチンを産生するステップ
を含む、方法。
【請求項２４５】
病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するためのキットであって、
請求項１から５８のいずれか一項に記載のワクチン組成物；および
前記ワクチンを前記被験体に投与するための指示
を含む、キット。
【請求項２４６】
病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するためのキットであって、
請求項７９から１４０のいずれか一項に記載のワクチン組成物；および
前記ワクチンを前記被験体に投与するための指示
を含む、キット。
【請求項２４７】
前記ワクチン組成物が、無菌容器中に事前包装される、請求項２４５または２４６に記載のキット。
【請求項２４８】
請求項１４１に記載の足場組成物、
請求項１６２に記載のオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物、ならびに
前記足場組成物および前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物を前記被験体に投与するための指示
を含む、キット。
【請求項２４９】
前記足場組成物および前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、無菌容器中に事前包装される、請求項２４８に記載のキット。
【請求項２５０】
前記足場組成物および前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、異なる無菌容器中に事前包装される、請求項２４９に記載のキット。
【請求項２５１】
前記足場組成物および前記オプソニン結合病原体構築物または前記レクチン結合病原体構築物が、同じ無菌容器中に事前包装される、請求項２４９に記載のキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本願は、２０１６年５月３１日に出願された米国仮出願第６２／３４３，４４８号、および２０１６年２月１６日に出願された米国仮出願第６２／２９５，７１１号の優先権の利益を主張する。上記出願の各々の内容全体が、参照によって本明細書中に組み込まれる。
【０００２】
政府援助
本発明は、ＤＡＲＰＡ  Ｎ６６００１−１１−１−４１８０のもとの政府援助により行われた。政府は、本発明において特定の権利を有する。
【背景技術】
【０００３】
感染性疾患は、生体に侵入しそこで拡大増殖する、ウイルス、細菌、真菌などの病原性微生物によって引き起こされる。感染性疾患を処置するための一般的な戦略には、かかる感染症に罹患している患者またはかかる感染症に罹患する傾向がある患者への、抗ウイルス剤もしくは抗生物質などの抗菌性薬物の投与、またはワクチン接種などの免疫療法の使用が含まれる。
【０００４】
しかし、一部の場合には、病原性微生物は、既存の抗菌性薬物の使用によっては容易に根絶できない。なぜなら、これらの微生物が、薬物に対する耐性を獲得し得るか、または薬物が、患者に対して変動する程度までの望ましくない副作用をもたらし得るからである。結果として、公知の抗生物質および抗ウイルス剤は、それらの抗菌活性、身体における挙動、安全性、または薬物耐性微生物を抑制する能力に関して完全に満足のいくものではなかった。ワクチンは、病原体に対する免疫を安全に発達させることを補助するように、身体の天然の防御と連携することによって、感染症の危険性を低減させる。ワクチンは、公衆衛生のために利用可能な最も強力なツールとみなされてきたが、感染性疾患を処置または予防するためのワクチンに関連するある特定の制限が存在する。例えば、病原体感染症に対するワクチンの開発は通常、病原体の同定または単離を必要とする。具体的な病原体が未知である場合または病原体の単離が大きな困難をもたらす場合、ワクチンの調製は大きな課題であり、かなり長い時間がかかる可能性がある。さらに、病原体の抗原性は容易に変更され、異なる表面抗原を有する複数の株を有する病原体について、ワクチン株と感染株との間の抗原構造における不一致は大きな問題である。投与されたワクチンとは異なる株が感染性疾患を引き起こす場合、ワクチン接種は無効になる。さらに、病原体漏出がある特定のワクチンにおいて観察されており、被験体内で望ましくない副作用および広範な炎症を引き起こす。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００５】
結果として、感染性疾患は、世界中で、主要な公衆衛生上の脅威、ならびに病気、身体障害および死亡の主要原因であり続けている。したがって、感染性疾患を処置するための新規治療戦略およびワクチンの開発に対する、現在進行中の満たされていない要求がなおも存在している。
【０００６】
本発明は、オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたレクチンまたはその断片を使用して単離された病原体または病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）が、感染性疾患の処置のための機能的ワクチンを生成するために使用され得るという発見に、少なくとも一部基づく。特に、本発明者らは、生物活性剤、例えば、アジュバントおよび／または足場と組み合わせた場合、操作されたレクチンを使用して単離された病原体または病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）が、高い効力の病原体ワクチンの迅速な創出を可能にすることを、驚くべきことに発見した（図１）。動物をワクチン接種するために使用する場合、単一用量のこれらのワクチンは、ワクチン接種された動物において顕著に低減された病原体力価を生じ、致死用量の細菌による動物の感染後の顕著に延長された生存時間を生じた。実際に、実施例１に示すように、単一用量の本発明のワクチン組成物は、９０日間の期間にわたる細菌チャレンジから、ワクチン接種したマウスを保護できる。さらに、オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたレクチンまたはその断片は、ワクチン組成物における使用のために病原体を単離し、病原体を免疫細胞に提示して免疫応答を開始させるように機能するだけでなく、病原体を固定化するためのアンカー構造としても機能し、そうして、ワクチン組成物からの病原体の漏出を防止し、病原体漏出を現在経験しているあらゆる望ましくない副作用を防止する。
【０００７】
本発明のワクチン組成物は、既存のワクチンを超えるさらなる改善を有する。例えば、本発明のワクチン組成物は、公知のおよび未知の両方の病原体、他の生体液（biological  fluid）内に存在する病原体、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物中に存在する病原体を含む、感染性疾患を有する患者由来の血液試料中を循環する病原体の、迅速かつ直接的な単離を可能にする。特許請求されるワクチン組成物は、単離および精製が困難な病原体に対しても使用され得る。病原体が被験体から単離されると、ワクチン組成物は、世界中のどこでも素早く簡便な様式で容易に調製され得、時宜を得た様式で、例えば１日以内に、患者にとって利用可能であり得る。さらに、特許請求されるワクチン組成物を使用するワクチン接種は、ワクチン組成物の有効性を損なうことなく、より制御され、局在化された安全な様式で行われ得る。特許請求されるワクチンの改善された安定性は、これらのワクチンを携帯可能にし、冷蔵の必要なしに室温での長期貯蔵に使用されるのを可能にする。さらに、ワクチン組成物は、１つよりも多い型の病原体が組成物中に含まれる場合には、多価ワクチンであり得、所与の病原体の異なる種または株に対してワクチン接種するためにも使用され得る。さらに、ワクチン組成物は、移植される場合、ワクチン接種後に被験体から容易に除去され得る。例えば、過度の免疫応答または望ましくない副作用がワクチン接種後に開始される場合、移植されたワクチン組成物は、被験体から容易に除去され得る。対照的に、現在の既存のワクチンは、被験体中にいったん導入されると除去できない。これらの改善は、現在の病原体ワクチンの主な制限を回避し、例えば、発展途上国の集団について、特に流行の期間の間、公衆にとって大きな関心事であり、または容易に入手可能なワクチンが高度に所望される軍事使用にとって大きな価値がある。実際、貯蔵および取り扱いが容易なだけでなく、より安全でより制御された様式で投与され得、長期保護効果を付与し得る、機能的で高度に安定なワクチンを迅速に創出する能力は、本発明のワクチン組成物を、既存のワクチンを超えて顕著に有利なものにする。
【０００８】
したがって、一態様では、本発明は、ワクチン組成物を提供する。ワクチン組成物は、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物と被験体において免疫細胞を動員することが可能なバイオ薬剤（bioagent）とを含む。
【０００９】
一部の実施形態では、バイオ薬剤は、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。
【００１０】
一部の実施形態では、バイオ薬剤はアジュバントを含む。他の実施形態では、アジュバントは、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石（calcium  phosphate  hydroxide）、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド（montanide）、アジュバント６５、リポバント（lipovant）、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、免疫抑制性分子に対する抗体（例えば、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータに対する抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。
【００１１】
一部の実施形態では、レクチン結合病原体構築物は、レクチン、レクチンの一部分、操作されたレクチンまたはその一部分を含む。一部の実施形態では、レクチンはコレクチンである。他の実施形態では、レクチンはフィコリン（ficollin）である。一部の実施形態では、レクチンはマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である。他の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８を含む。さらに別の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含む。一部の実施形態では、マンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）は、病原体に結合することが可能である。一部の実施形態では、レクチンはサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）を含む。他の実施形態では、サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、病原体に結合することが可能である。
【００１２】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、免疫グロブリン（ＩｇＧ）Ｆｃ部分をさらに含む。
【００１３】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、固体支持体（solid  substrate）をさらに含む。他の実施形態では、固体支持体は、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される。一部の実施形態では、固体支持体は磁性ビーズである。他の実施形態では、病原体は、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で固体支持体上に存在する。
【００１４】
一部の実施形態では、病原体は、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である。
【００１５】
一部の実施形態では、細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群からなる群より選択される。
【００１６】
一部の実施形態では、細菌は抗生物質耐性細菌である。一部の実施形態では、細菌は多剤耐性細菌である。他の実施形態では、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される。
【００１７】
一部の実施形態では、真菌は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）からなる群より選択される。
【００１８】
一部の実施形態では、ウイルスは、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＩＶ、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）およびジカ（Zica）ウイルスからなる群より選択される。
【００１９】
一部の実施形態では、寄生生物は、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａからなる群より選択される。
【００２０】
一部の実施形態では、病原体は、感染性微生物の細胞壁構成要素を含む。他の実施形態では、病原体は、感染性微生物細胞全体を含む。一部の実施形態では、感染性微生物の細胞壁構成要素は、グリコシル化される。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノシル化される。一部の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）である。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、ホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）である。
【００２１】
一部の実施形態では、病原体はマイコプラズマである。他の実施形態では、マイコプラズマは、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅからなる群より選択される。
【００２２】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。他の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【００２３】
一部の実施形態では、病原体から放出される構成要素は、毒素を含む。他の実施形態では、毒素は、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される。
【００２４】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する試料中にある。他の実施形態では、試料は、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液（joint  fluid）試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液（bronchial  fluid）試料および涙試料からなる群より選択される。
【００２５】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。一部の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【００２６】
一部の実施形態では、病原体は中和される。他の実施形態では、病原体は、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル（bead  mill）、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される。一部の実施形態では、病原体は、中和後に非感染性である。
【００２７】
一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。他の実施形態では、免疫細胞は、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される。
【００２８】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも２つの異なる型の病原体を含む。他の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも３つの異なる型の病原体を含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、異なる種の病原体に対して標的化することが可能である。
【００２９】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における移植に適切である。他の実施形態では、ワクチン組成物は、皮下移植に適切である。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における注射に適切である。他の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における経口投与に適切である。別の実施形態では、ワクチン組成物は、丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤（chewable）、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である。
【００３０】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、凍結乾燥される。他の実施形態では、ワクチン組成物は、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも１年間の貯蔵寿命を有する。他の実施形態では、ワクチン組成物は、室温において貯蔵されることが可能である。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、携帯可能である。
【００３１】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【００３２】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、生体材料を含む足場であって、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場をさらに含む。
【００３３】
一部の実施形態では、生体材料は、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）（poly(N-vinyl  pyrolidone)）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（poly  e-carpolactone）（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸（pectinic  acid）；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される。他の実施形態では、生体材料は、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ（mesoporous  silica）、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される。
【００３４】
一態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症を処置する方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症を処置するステップを含む。
【００３５】
別の態様では、本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するステップを含む。
【００３６】
一態様では、本発明は、それを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における抗生物質耐性細菌に対して特異的である。
【００３７】
別の態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体のレベルを減少させるステップを含む。
【００３８】
一部の実施形態では、病原体のレベルは、被験体の臓器において減少される。他の実施形態では、臓器は、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される。
【００３９】
一態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体の生存率を増加させるステップを含む。
【００４０】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【００４１】
一部の実施形態では、感染症は急性感染症である。他の実施形態では、感染症は慢性感染症である。
【００４２】
さらなる態様では、本発明は、ワクチンを産生する方法を提供する。これらの方法は、病原体またはその断片を含む試料を、オプソニンまたはレクチンと接触させるステップであって、オプソニンまたはレクチンが、試料中の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；試料からオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を単離するステップ；およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を、被験体において免疫細胞を動員することが可能なバイオ薬剤と組み合わせ、それによって、ワクチンを産生するステップを含む。
【００４３】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する。他の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。一部の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【００４４】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。他の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【００４５】
一部の実施形態では、バイオ薬剤はアジュバントを含む。
【００４６】
本発明は、生体材料を含む足場であって、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場と；オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物とを含むワクチン組成物もまた提供する。
【００４７】
一部の実施形態では、生体材料は、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される。他の実施形態では、生体材料は、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される。
【００４８】
一部の実施形態では、足場は、バイオ薬剤をさらに含む。他の実施形態では、バイオ薬剤は、被験体において免疫細胞を動員することが可能である。
【００４９】
一部の実施形態では、バイオ薬剤は、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。
【００５０】
一部の実施形態では、バイオ薬剤はアジュバントを含む。他の実施形態では、アジュバントは、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石（calcium  phosphate  hydroxide）、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド（montanide）、アジュバント６５、リポバント（lipovant）、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、免疫抑制性分子に対する抗体（例えば、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータに対する抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。
【００５１】
一部の実施形態では、レクチン結合病原体構築物は、レクチン、レクチンの一部分、操作されたレクチンまたはその一部分を含む。一部の実施形態では、レクチンはコレクチンである。他の実施形態では、レクチンはフィコリン（ficollin）である。一部の実施形態では、レクチンはマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である。他の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８を含む。さらに別の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含む。一部の実施形態では、マンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）は、病原体に結合することが可能である。一部の実施形態では、レクチンは表面タンパク質Ｄ（ＳＰＤ）である。他の実施形態では、表面タンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、病原体に結合することが可能である。
【００５２】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、免疫グロブリン（ＩｇＧ）Ｆｃ部分をさらに含む。
【００５３】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、固体支持体（solid  substrate）をさらに含む。他の実施形態では、固体支持体は、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される。一部の実施形態では、固体支持体は磁性ビーズである。他の実施形態では、病原体は、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で固体支持体上に存在する。
【００５４】
一部の実施形態では、病原体は、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である。
【００５５】
一部の実施形態では、細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群からなる群より選択される。
【００５６】
一部の実施形態では、細菌は抗生物質耐性細菌である。一部の実施形態では、細菌は多剤耐性細菌である。他の実施形態では、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される。
【００５７】
一部の実施形態では、真菌は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）からなる群より選択される。
【００５８】
一部の実施形態では、ウイルスは、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＩＶ、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）およびジカ（Zica）ウイルスからなる群より選択される。
【００５９】
一部の実施形態では、寄生生物は、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａからなる群より選択される。
【００６０】
一部の実施形態では、病原体は、感染性微生物の細胞壁構成要素を含む。他の実施形態では、病原体は、感染性微生物細胞全体を含む。一部の実施形態では、感染性微生物の細胞壁構成要素は、グリコシル化される。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノシル化される。一部の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）である。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、ホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）である。
【００６１】
一部の実施形態では、病原体は、感染性微生物の細胞壁構成要素を含む。他の実施形態では、病原体は、感染性微生物細胞全体を含む。一部の実施形態では、感染性微生物の細胞壁構成要素は、グリコシル化される。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノシル化される。一部の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）である。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、ホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）である。
【００６２】
一部の実施形態では、病原体はマイコプラズマである。他の実施形態では、マイコプラズマは、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅからなる群より選択される。
【００６３】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。他の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【００６４】
一部の実施形態では、病原体から放出される構成要素は、毒素を含む。他の実施形態では、毒素は、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される。
【００６５】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する試料中にある。他の実施形態では、試料は、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液（joint  fluid）試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液（bronchial  fluid）試料および涙試料からなる群より選択される。
【００６６】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。一部の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【００６７】
一部の実施形態では、病原体は中和される。他の実施形態では、病原体は、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル（bead  mill）、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される。一部の実施形態では、病原体は、中和後に非感染性である。
【００６８】
一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。他の実施形態では、免疫細胞は、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される。
【００６９】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも２つの異なる型の病原体を含む。他の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも３つの異なる型の病原体を含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、異なる種の病原体に対して標的化することが可能である。
【００７０】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における移植に適切である。他の実施形態では、ワクチン組成物は、皮下移植に適切である。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における注射に適切である。他の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における経口投与に適切である。別の実施形態では、ワクチン組成物は、丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤（chewable）、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である。
【００７１】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、凍結乾燥される。他の実施形態では、ワクチン組成物は、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも１年間の貯蔵寿命を有する。他の実施形態では、ワクチン組成物は、室温において貯蔵されることが可能である。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、携帯可能である。
【００７２】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を固定化すること、および足場からのオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物の漏出を防止することが可能である。
【００７３】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【００７４】
一態様では、本発明は、安定な足場組成物を提供する。安定な足場組成物は、生体材料を含み、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能であり、足場は、凍結乾燥され、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。
【００７５】
一部の実施形態では、生体材料は、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）（poly(N-vinyl  pyrolidone)）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（poly  e-carpolactone）（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸（pectinic  acid）；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される。他の実施形態では、生体材料は、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ（mesoporous  silica）、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される。
【００７６】
一部の実施形態では、足場は、バイオ薬剤をさらに含む。一部の実施形態では、バイオ薬剤は、被験体において免疫細胞を動員することが可能である。
【００７７】
一部の実施形態では、バイオ薬剤は、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。
【００７８】
一部の実施形態では、バイオ薬剤はアジュバントを含む。他の実施形態では、アジュバントは、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石（calcium  phosphate  hydroxide）、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド（montanide）、アジュバント６５、リポバント（lipovant）、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、免疫抑制性分子に対する抗体（例えば、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータに対する抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。ある特定の実施形態では、アジュバントは、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を含む。ある特定の実施形態では、アジュバントは、ポリエチレンイミン（polyehylenimine）（ＰＥＩ）−ＣｐＧ−ＯＤＮ配列を含む。
【００７９】
一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。他の実施形態では、免疫細胞は、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される。
【００８０】
一部の実施形態では、足場組成物は、被験体における移植に適切である。他の実施形態では、足場組成物は、皮下移植に適切である。一部の実施形態では、足場組成物は、被験体における注射に適切である。他の実施形態では、足場組成物は、被験体における経口投与に適切である。一部の実施形態では、足場組成物は、丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である。
【００８１】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【００８２】
一部の実施形態では、足場組成物は、室温において貯蔵されることが可能である。一部の実施形態では、足場組成物は、携帯可能である。
【００８３】
別の態様では、本発明は、生体材料を含み、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場組成物を提供し、足場は固体支持体を含み、固体支持体は、病原体の付着に適切である。
【００８４】
一部の実施形態では、固体支持体は、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される。一部の実施形態では、固体支持体は磁性ビーズである。他の実施形態では、病原体は、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で固体支持体上に存在する。
【００８５】
一部の実施形態では、生体材料は、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）（poly(N-vinyl  pyrolidone)）、ポリ（乳酸）、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（poly  e-carpolactone）（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸（pectinic  acid）；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せからなる群より選択される。他の実施形態では、生体材料は、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ（mesoporous  silica）、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される。
【００８６】
一部の実施形態では、足場は、バイオ薬剤をさらに含む。一部の実施形態では、バイオ薬剤は、被験体において免疫細胞を動員することが可能である。
【００８７】
一部の実施形態では、バイオ薬剤は、インターロイキン（ＩＬ）−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）−アルファ、インターフェロン（ＩＦＮ）−ガンマ、ＩＦＮ−アルファ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、Ｆｍｓ関連チロシンキナーゼリガンド（ＦＴＬ）−３リガンド、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、Ｍ−ＳＣＦ、ＭＩＦ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ３、ＩＣＡＭ、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。
【００８８】
一部の実施形態では、バイオ薬剤はアジュバントを含む。他の実施形態では、アジュバントは、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＭＦ５９、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、水酸化燐灰石、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ＦＩＡ、モンタニド、アジュバント６５、リポバント、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、免疫抑制性分子に対する抗体（例えば、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータに対する抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト）、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０およびＨｓｐ９０からなる群より選択される。ある特定の実施形態では、アジュバントは、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を含む。ある特定の実施形態では、アジュバントは、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）−ＣｐＧ−ＯＤＮ配列を含む。
【００８９】
一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。他の実施形態では、免疫細胞は、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される。
【００９０】
一部の実施形態では、足場組成物は、被験体における移植に適切である。他の実施形態では、足場組成物は、皮下移植に適切である。一部の実施形態では、足場組成物は、被験体における注射に適切である。他の実施形態では、足場組成物は、被験体における経口投与に適切である。一部の実施形態では、足場組成物は、丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である。
【００９１】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【００９２】
一部の実施形態では、足場組成物は、凍結乾燥される。他の実施形態では、足場組成物は、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。一部の実施形態では、足場組成物は、少なくとも１年間の貯蔵寿命を有する。他の実施形態では、足場組成物は、室温において貯蔵されることが可能である。一部の実施形態では、足場組成物は、携帯可能である。
【００９３】
一部の実施形態では、病原体は、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である。
【００９４】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。他の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【００９５】
一部の実施形態では、病原体から放出される構成要素は、毒素を含む。他の実施形態では、毒素は、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される。
【００９６】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する試料中にある。他の実施形態では、試料は、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液試料および涙試料からなる群より選択される。
【００９７】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。一部の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【００９８】
一態様では、本発明は、被験体に由来する病原体またはその断片を結合するのに適切な組換えオプソニンまたはレクチンを提供し、オプソニンまたはレクチンは、肺サーファクタントを含む。一部の実施形態では、肺サーファクタントはサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）である。
【００９９】
別の態様では、本発明は、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を提供する。オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、オプソニンまたはレクチンに結合した、被験体に由来する病原体またはその断片を含み、オプソニンまたはレクチンは、肺サーファクタントを含む。一部の実施形態では、肺サーファクタントはサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）である。
【０１００】
別の態様では、本発明は、安定なオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を提供する。安定なオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、オプソニンに結合した、被験体に由来する病原体またはその断片を含み、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、凍結乾燥され、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。
【０１０１】
一部の実施形態では、レクチン結合病原体構築物は、レクチン、またはレクチンの一部分、操作されたレクチン（lection）またはその一部分を含む。一部の実施形態では、レクチンはコレクチンである。他の実施形態では、レクチンはフィコリン（ficollin）である。一部の実施形態では、レクチンはマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である。他の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８を含む。さらに別の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含む。一部の実施形態では、マンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）は、病原体に結合することが可能である。一部の実施形態では、レクチンは表面タンパク質Ｄ（ＳＰＤ）である。他の実施形態では、表面タンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、病原体に結合することが可能である。
【０１０２】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、免疫グロブリン（ＩｇＧ）Ｆｃ部分をさらに含む。
【０１０３】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、固体支持体（solid  substrate）をさらに含む。他の実施形態では、固体支持体は、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスからなる群より選択される。一部の実施形態では、固体支持体は磁性ビーズである。他の実施形態では、病原体は、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量で固体支持体上に存在する。
【０１０４】
一部の実施形態では、病原体は、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である。
【０１０５】
一部の実施形態では、細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群からなる群より選択される。
【０１０６】
一部の実施形態では、細菌は抗生物質耐性細菌である。一部の実施形態では、細菌は多剤耐性細菌である。他の実施形態では、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される。
【０１０７】
一部の実施形態では、真菌は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）からなる群より選択される。
【０１０８】
一部の実施形態では、ウイルスは、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＩＶ、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）およびジカ（Zica）ウイルスからなる群より選択される。
【０１０９】
一部の実施形態では、寄生生物は、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａからなる群より選択される。
【０１１０】
一部の実施形態では、病原体はマイコプラズマである。他の実施形態では、マイコプラズマは、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅからなる群より選択される。
【０１１１】
一部の実施形態では、病原体は、感染性微生物の細胞壁構成要素を含む。他の実施形態では、病原体は、感染性微生物細胞全体を含む。一部の実施形態では、感染性微生物の細胞壁構成要素は、グリコシル化される。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノシル化される。一部の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）である。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、ホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）である。
【０１１２】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。他の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【０１１３】
一部の実施形態では、病原体から放出される構成要素は、毒素を含む。他の実施形態では、毒素は、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される。
【０１１４】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する試料中にある。他の実施形態では、試料は、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液（joint  fluid）試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液（bronchial  fluid）試料および涙試料からなる群より選択される。
【０１１５】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。一部の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【０１１６】
一部の実施形態では、病原体は中和される。他の実施形態では、病原体は、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル（bead  mill）、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される。一部の実施形態では、病原体は、中和後に非感染性である。
【０１１７】
一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。他の実施形態では、免疫細胞は、樹状細胞、マクロファージ、Ｔ細胞およびＢ細胞からなる群より選択される。
【０１１８】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、少なくとも２つの異なる型の病原体を含む。他の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、少なくとも３つの異なる型の病原体を含む。一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、異なる種の病原体に対して標的化することが可能である。
【０１１９】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体における移植に適切である。他の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、皮下移植に適切である。一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体における注射に適切である。他の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体における経口投与に適切である。別の実施形態では、ワクチン組成物は、丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態である。
【０１２０】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、凍結乾燥される。他の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、少なくとも１年間の貯蔵寿命を有する。他の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、室温において貯蔵されることが可能である。一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、携帯可能である。
【０１２１】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【０１２２】
本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症を処置する方法もまた提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症を処置するステップを含む。
【０１２３】
一態様では、本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するステップを含む。
【０１２４】
別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における抗生物質耐性細菌に対して特異的である。
【０１２５】
一態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体のレベルを減少させるステップを含む。
【０１２６】
一部の実施形態では、病原体のレベルは、被験体の臓器において減少される。一部の実施形態では、臓器は、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される。
【０１２７】
一態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体の生存率を増加させるステップを含む。
【０１２８】
別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させるステップを含む。
【０１２９】
さらに別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本発明のワクチン組成物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させるステップを含む。
【０１３０】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【０１３１】
一部の実施形態では、感染症は急性感染症である。他の実施形態では、感染症は慢性感染症である。
【０１３２】
一態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症を処置する方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症を処置するステップを含む。
【０１３３】
別の態様では、本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するステップを含む。
【０１３４】
一態様では、本発明は、それを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む。一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体における抗生物質耐性細菌に対して特異的である。
【０１３５】
別の態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体のレベルを減少させるステップを含む。
【０１３６】
一部の実施形態では、病原体のレベルは、被験体の臓器において減少される。一部の実施形態では、臓器は、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される。
【０１３７】
一態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、被験体の生存率を増加させるステップを含む。
【０１３８】
別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させるステップを含む。
【０１３９】
さらに別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本発明の足場組成物および本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させるステップを含む。
【０１４０】
一部の実施形態では、本発明の足場組成物と本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物とは、被験体に同時に投与される。他の実施形態では、本発明の足場組成物は、本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物の前に被験体に投与される。さらに別の実施形態では、本発明の足場組成物は、本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物の後に被験体に投与される。
【０１４１】
一部の実施形態では、被験体は哺乳動物である。他の実施形態では、哺乳動物は、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットからなる群より選択される。一部の実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【０１４２】
一部の実施形態では、感染症は急性感染症である。他の実施形態では、感染症は慢性感染症である。
【０１４３】
一態様では、本発明は、ワクチンを産生する方法を提供する。これらの方法は、病原体またはその断片を含む試料を、オプソニンまたはレクチンと接触させるステップであって、オプソニンまたはレクチンが、試料中の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；試料からオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および単離されたオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を足場と組み合わせ、それによって、ワクチンを産生するステップを含む。
【０１４４】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する。一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。一部の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【０１４５】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。一部の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【０１４６】
一部の実施形態では、病原体は、感染性微生物の細胞壁構成要素を含む。他の実施形態では、病原体は、感染性微生物細胞全体を含む。一部の実施形態では、感染性微生物の細胞壁構成要素は、グリコシル化される。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノシル化される。一部の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）である。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、ホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）である。
【０１４７】
別の態様では、本発明は、ワクチンを産生する方法を提供する。これらの方法は、オプソニンまたはレクチンを被験体に投与するステップであって、オプソニンまたはレクチンが、被験体由来の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；被験体からオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および単離されたオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を足場と組み合わせ、それによって、ワクチンを産生するステップを含む。
【０１４８】
一態様では、本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するためのキットを提供する。これらのキットは、本発明のワクチン組成物；およびワクチンを被験体に投与するための指示を含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、無菌容器中に事前包装される。
【０１４９】
別の態様では、本発明は、キットを提供する。これらのキットは、本発明の足場組成物；本発明のオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物、ならびに足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与するための指示を含む。
【０１５０】
一部の実施形態では、足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、無菌容器中に事前包装される。他の実施形態では、足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、異なる無菌容器中に事前包装される。ある特定の実施形態では、足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、同じ無菌容器中に事前包装される。
【０１５１】
本発明は、特許請求の範囲に記載される発明の範囲を限定しない、以下の図面および詳細な説明によって例示される。
【図面の簡単な説明】
【０１５２】
【図１】図１は、本発明の全体的な病原体ワクチンの概念を示す。
【０１５３】
【図２】図２は、真菌ＭＢＬ標的であるマンナンを使用して作成したＦｃＭＢＬ  ＥＬＩＳＡ検量線を示す。具体的には、１μＭのＦｃＭＢＬコーティングした超常磁性粒子を使用して、緩衝液またはドナー全血のいずれか中のマンナンを捕捉した。マンナンの段階希釈物を、示された溶液に添加し、ＦｃＭＢＬビーズと混合し、ＥＬＩＳＡによってアッセイし、試験試料からの病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）の定量化のための曲線を生成するために使用した。
【０１５４】
【図３】図３は、滴定された抗生物質処理されたＲＳ２１８溶液からの、ＦｃＭＢＬビーズ上の捕捉されたＲＳ２１８断片の定量化を示す。捕捉されたＲＳ２１８断片を、ＦｃＭＢＬ  ＥＬＩＳＡによって生成した検量線を使用して、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）として定量化した。
【０１５５】
【図４】図４は、ＦｃＭＢＬビーズによって捕捉されたＲＳ２１８  ＰＡＭＰのＦｃＭＢＬ  ＥＬＩＳＡによる定量化、およびＦｃＭＢＬとＲＳ２１８  ＰＡＭＰとの間の特異的カルシウム依存的結合を示す。
【０１５６】
【図５Ａ】図５Ａ〜５Ｃは、本発明の病原体ワクチンの画像を示す。図５Ａは、ワクチンが、捕捉された抗生物質処理されたＲＳ２１８病原性Ｅ．ｃｏｌｉでコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＰＬＧ足場を含むことを示す。図５Ｂは、ＰＬＧ足場中に取り込まれた捕捉されたＥ．ｃｏｌｉ  ＰＡＭＰを有するＦｃＭＢＬビーズのＳＥＭ画像である。ＦｃＭＢＬビーズ（１ミクロン）は、ＰＬＧ足場中の穴および空洞の至るところに、明らかに目に見えて分散される。図５Ｃは、ＦｃＭＢＬビーズなしの対照足場のＳＥＭ画像である。
【図５ＢＣ】図５Ａ〜５Ｃは、本発明の病原体ワクチンの画像を示す。図５Ａは、ワクチンが、捕捉された抗生物質処理されたＲＳ２１８病原性Ｅ．ｃｏｌｉでコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＰＬＧ足場を含むことを示す。図５Ｂは、ＰＬＧ足場中に取り込まれた捕捉されたＥ．ｃｏｌｉ  ＰＡＭＰを有するＦｃＭＢＬビーズのＳＥＭ画像である。ＦｃＭＢＬビーズ（１ミクロン）は、ＰＬＧ足場中の穴および空洞の至るところに、明らかに目に見えて分散される。図５Ｃは、ＦｃＭＢＬビーズなしの対照足場のＳＥＭ画像である。
【０１５７】
【図６】図６は、致死用量のＲＳ２１８Ｅ．ｃｏｌｉ細菌による感染の際の、ワクチン接種したマウスの生存曲線を示す。マウスに、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片を含むＰＬＧワクチン足場を３週間にわたって皮下移植した。マウスに、致死用量のＲＳ２１８を２１日目に腹腔内感染させた。マウスの生存を４８時間モニタリングし、マウスを、臨床状態が要求する場合にはより早期に、人道的に屠殺した。ワクチン接種した動物は、顕著に延長された生存時間を示した。ＲＳ２１８でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンは、４８時間の研究の最後まで、１０匹のマウスのうち９匹を保護したが、ＰＬＧ足場単独、または動員およびアジュバント因子なしのＦｃＭＢＬビーズ／ＲＳ２１８溶解物を有するＰＬＧは、保護しなかった。処置群（ｎ＝１０）。
【０１５８】
【図７】図７Ａおよび７Ｂは、それぞれ、致死用量のＲＳ２１８細菌による処置の際の、ワクチン接種したマウスの総臓器病原体計数および個々の臓器病原体計数を示す。マウスに、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片を含むＰＬＧワクチン足場を、３週間にわたって皮下移植した。マウスに、２１日目に致死用量のＲＳ２１８を腹腔内感染させた。臓器培養物を、無菌様式で収集し、機械的破壊によって加工処理し、プレーティングして、臓器中の病原体の力価を決定した。病原体力価における有意な低減が、ワクチン接種した動物において観察された。処置群（ｎ＝１０）。病原体負荷は、２．５〜３．５ｌｏｇ低減した（ｐ＝０．００２１〜０．００５７）。
【０１５９】
【図８】図８は、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片またはＲＳ２１８溶解物全体のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場でワクチン接種したマウスの生存曲線を示す。マウスに、ＰＬＧワクチン足場（ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧを有する）またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片もしくはＲＳ２１８溶解物全体のいずれかを含む足場を２１日間にわたって皮下移植し、次いで、致死用量未満のＲＳ２１８細菌で腹腔内チャレンジした。ワクチン接種したマウスの生存をモニタリングした。ワクチン接種した動物は、顕著に延長された生存時間を示した。
【０１６０】
【図９】図９は、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片またはＲＳ２１８溶解物全体のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場でワクチン接種したマウスの個々の臓器病原体計数を示す。マウスに、ＰＬＧワクチン足場（ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧを有する）またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片もしくはＲＳ２１８溶解物全体のいずれかを含む足場を２１日間にわたって皮下移植し、次いで、致死用量未満のＲＳ２１８細菌で腹腔内チャレンジした。臓器培養物を、無菌様式で収集し、機械的破壊によって加工処理し、プレーティングして、各個々の臓器中の病原体の力価を決定した。臓器培養物は、ワクチン接種した動物において病原体力価の有意な低減を示した。
【０１６１】
【図１０】図１０Ａ〜Ｃは、スクロースの浸出の間の、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片またはＲＳ２１８溶解物全体のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場からのＣｐＧ、ＧＭ−ＣＳＦおよびＥ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８内毒素漏出の量のｉｎ  ｖｉｔｒｏ定量化を示す。偽足場、ビーズなしのもの（溶解物のみ）、または溶解物を有するビーズ間を比較した場合、ＣｐＧ含量（図１０Ａ）およびＧＭ−ＣＳＦ含量（図１０Ｂ）について、有意な差異は観察されなかった。しかし、有意な内毒素漏出が、ＲＳ２１８溶解物全体を含むＰＬＧワクチン足場において観察され、一方で、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片を含むＰＬＧワクチン足場は、内毒素の最小の漏出を実証した（図１０Ｃ）。
【０１６２】
【図１１】図１１Ａ〜Ｃは、ワクチン接種マウスの全身状態を示す、ワクチン移植の部位において撮影した画像である。マウスに、ＰＬＧワクチン足場（ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧを有する）またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片もしくはＲＳ２１８溶解物全体のいずれかを含む足場を２１日間にわたって皮下移植し、次いで、致死用量未満のＲＳ２１８細菌で腹腔内チャレンジした。偽足場を受けているマウスは、免疫反応の徴候を有さず（図１１Ａ）、ワクチン足場は、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片を含むＰＬＧワクチン足場を受けているマウスにおいて大部分はインタクトであった（図１１Ｂ）。しかし、ＲＳ２１８溶解物全体を含むＰＬＧワクチン足場を受けているマウスは、大きい膿瘍の形成を伴う望ましくない副作用を経験した（図１１Ｃ）。
【０１６３】
【図１２Ａ】図１２Ａ〜１２Ｂは、感染症ワクチンテクノロジーの交差反応性を示す。図１２Ａは、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８溶解物のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場でワクチン接種したマウスの生存曲線を示す。マウスに、ＰＬＧワクチン足場（ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧを有する）またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物もしくはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８溶解物のいずれかを含む足場を２１日間にわたって皮下移植し、次いで、致死用量のＲＳ２１８細菌で腹腔内チャレンジした。ワクチン接種したマウスの生存をモニタリングした。ＲＳ２１８溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジから１００％のマウスを保護し、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧのワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジ（２０時間の時点でＬＤ９０）から７８％のマウスを保護した。ＧＭＣＳＦ動員およびＣｐＧアジュバントのみを有するＰＬＧ足場（ＦｃＭＢＬビーズおよびＲＳ２１８溶解物を有さない）は、９６時間の時点で２０％の動物しか保護しなかった。Ｅ．ｃｌｏａｃａｅおよびＥ．ｃｏｌｉは共に、腸内細菌科目のメンバーである。図１２Ｂは、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８溶解物のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場を有するマウスの個々の臓器病原体計数を示す。臓器培養物を、無菌様式で収集し、機械的破壊によって加工処理し、プレーティングして、各個々の臓器中の病原体の力価を決定した。臓器培養物は、ワクチン接種した動物における病原体力価の低減を示した。
【図１２Ｂ】図１２Ａ〜１２Ｂは、感染症ワクチンテクノロジーの交差反応性を示す。図１２Ａは、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８溶解物のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場でワクチン接種したマウスの生存曲線を示す。マウスに、ＰＬＧワクチン足場（ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧを有する）またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物もしくはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８溶解物のいずれかを含む足場を２１日間にわたって皮下移植し、次いで、致死用量のＲＳ２１８細菌で腹腔内チャレンジした。ワクチン接種したマウスの生存をモニタリングした。ＲＳ２１８溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジから１００％のマウスを保護し、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧのワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジ（２０時間の時点でＬＤ９０）から７８％のマウスを保護した。ＧＭＣＳＦ動員およびＣｐＧアジュバントのみを有するＰＬＧ足場（ＦｃＭＢＬビーズおよびＲＳ２１８溶解物を有さない）は、９６時間の時点で２０％の動物しか保護しなかった。Ｅ．ｃｌｏａｃａｅおよびＥ．ｃｏｌｉは共に、腸内細菌科目のメンバーである。図１２Ｂは、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物またはＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８溶解物のいずれかを含むＰＬＧワクチン足場を有するマウスの個々の臓器病原体計数を示す。臓器培養物を、無菌様式で収集し、機械的破壊によって加工処理し、プレーティングして、各個々の臓器中の病原体の力価を決定した。臓器培養物は、ワクチン接種した動物における病原体力価の低減を示した。
【０１６４】
【図１３】図１３は、異なる足場を有するワクチン組成物についての用量応答研究を示す。具体的には、ＦｃＭＢＬビーズを有するＭＰＳ足場およびＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンを、異なる用量のＥ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８溶解物でコーティングした。１５ＰＡＭＰ単位を有するワクチンは、２１日間のチャレンジからマウスの９０％を保護したが、３ＰＡＭＰ単位を有するワクチンは、７０％しか保護しなかった。ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧおよび１５ＰＡＭＰでコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＰＬＧワクチン足場を受けている全てのマウスは、チャレンジを生存した。
【０１６５】
【図１４】図１４は、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８溶解物を含むＭＰＳワクチン足場でワクチン接種したマウスの生存曲線を示す。Ｅ．ｃｏｌｉ（ＲＳ２１８）溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＭＰＳ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジから９０％のマウスを保護した（ｎ＝１２）。偽ＭＰＳ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧでワクチン接種したマウスは、そのうち５０％のみがＲＳ２１８チャレンジを生存した（ｎ＝６）。
【０１６６】
【図１５】図１５Ａ〜１５Ｂは、感染症ワクチンテクノロジーの単一移植用量の長期効果を示す。図１５Ａは、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンが、２１日、６０日および９０日の時点における（ブースト）ＲＳ２１８チャレンジにもかかわらず、９６日間よりも長きにわたって、マウスの１００％を保護したことを示す。図１５Ｂは、ＲＳ２１８細菌の追加のチャレンジ用量の使用を示し、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンが、９６日間よりも長きにわたって、マウスの７５％を保護したことを示す。
【０１６７】
【図１６】図１６は、ＰＬＧ足場およびＭＰＳ足場の両方を用いた密な細胞浸潤を示す組織学画像である。
【０１６８】
【図１７】図１７Ａ〜１７Ｂは、感染症ワクチンテクノロジーの長期抗体媒介性保護効果を示し、具体的には、図１７Ａは、９０日間の期間にわたるＲＳ２１８細菌に対する長期ＩｇＧ力価を示す。
【０１６９】
【図１８】図１８は、結核におけるＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ（ＭＴｂ）へのＦｃＭＢＬの結合、および結核を処置するための感染症ワクチンテクノロジーの潜在的使用を示す。具体的には、ＦｃＭＢＬは、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ（ＭＴｂ）細胞壁のマンノシル化された構成要素、例えば、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）およびホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）に結合できる。
【０１７０】
【図１９】図１９は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）に対する感染症ワクチンテクノロジーの抗体媒介性効果を示す。マウスを、単一用量の、ＬＡＭ溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＭＰＳ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧでワクチン接種した場合、ＬＡＭ特異的ＩｇＧの力価は、ワクチン接種前のナイーブ動物よりも、２〜３ｌｏｇ増加した（ｐ＝＜．００１）。
【０１７１】
【図２０】図２０は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）に対する細胞媒介性抗ＬＡＭ応答を示す。具体的には、図２０は、ＦｃＭＢＬビーズおよびＭＴｂ  ＰＡＭＰを含むＰＬＧ足場中の浸潤細胞のＦＡＣＳ分析を示す。対照足場（偽）は、浸潤細胞をほとんど示さなかったが、樹状細胞、マクロファージおよびＣＤ４＋Ｔ細胞は、試験足場（Ｖａｘ）において有意に増加した。
【０１７２】
【図２１Ａ】図２１Ａ〜２１Ｂは、ＦｃＭＢＬが複数の病原体属を捕捉する能力を示す。図２１Ａは、グラム陰性細菌（Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８）、グラム陽性（ＭＲＳＡ、ＬＡＭ）、真菌（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）、ウイルス（ＨＩＶ  ｇｐ１２０）および寄生生物（Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ  ｖａｇｉｎａｌｉｓ）由来の異なる量のＰＡＭＰを、ＦｃＭＢＬビーズでコーティングしたことを示す。図２１Ｂは、ワクチン接種によるマウスにおける増加した抗体力価を示す。マウスを、単一用量の、グラム陰性細菌（Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８）、グラム陽性（ＭＲＳＡ、ＬＡＭ）、真菌（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）、ウイルス（ＨＩＶ  ｇｐ１２０）および寄生生物（Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ  ｖａｇｉｎａｌｉｓ）由来の試料でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＭＰＳ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧでワクチン接種した。ＬＡＭ特異的ＩｇＧの力価は、全ての場合において、ワクチン接種前のナイーブ動物を超えて増加した。
【図２１Ｂ】図２１Ａ〜２１Ｂは、ＦｃＭＢＬが複数の病原体属を捕捉する能力を示す。図２１Ａは、グラム陰性細菌（Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８）、グラム陽性（ＭＲＳＡ、ＬＡＭ）、真菌（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）、ウイルス（ＨＩＶ  ｇｐ１２０）および寄生生物（Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ  ｖａｇｉｎａｌｉｓ）由来の異なる量のＰＡＭＰを、ＦｃＭＢＬビーズでコーティングしたことを示す。図２１Ｂは、ワクチン接種によるマウスにおける増加した抗体力価を示す。マウスを、単一用量の、グラム陰性細菌（Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８）、グラム陽性（ＭＲＳＡ、ＬＡＭ）、真菌（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）、ウイルス（ＨＩＶ  ｇｐ１２０）および寄生生物（Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ  ｖａｇｉｎａｌｉｓ）由来の試料でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＭＰＳ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧでワクチン接種した。ＬＡＭ特異的ＩｇＧの力価は、全ての場合において、ワクチン接種前のナイーブ動物を超えて増加した。
【０１７３】
【図２２】図２２は、ワクチン中に取り込まれたＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ溶解物に対する細胞媒介性抗Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ応答を示す。具体的には、図２２は、ワクチン接種した動物の脾臓中の浸潤細胞のＦＡＣＳ分析を示す。対照脾臓（ナイーブ）は、ワクチン接種した動物群の脾臓よりも少ない、浸潤ＣＤ４＋Ｔ細胞およびＣＤ１１ｃ細胞を示した。
【０１７４】
【図２３】図２３は、代替的レクチンであるサーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）を含むワクチン組成物でワクチン接種したマウスにおいて生成された抗体力価を示す。サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、ＭＢＬと関連する別のコレクチン（コラーゲン領域を有するＣ型レクチン）である。ＦｃＭＢＬに対して７７％のタンパク質配列同一性を有するＦｃＳＰＤを生成した。ＦｃＳＰＤは、ＲＳ２１８  Ｅ．ｃｏｌｉを結合することができることが示された。抗体媒介性免疫反応は、ＦｃＳＰＤ捕捉されたＲＳ２１８をＭＰＳ足場中に取り込み、マウスをワクチン接種するために使用した場合に惹起された。増加した抗体力価が、ワクチン接種していない対照と比較した場合に、ワクチン接種したマウスにおいて観察された。
【発明を実施するための形態】
【０１７５】
本発明は、オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたレクチンまたはその断片を使用して単離された病原体または病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）が、感染性疾患の処置のための機能的ワクチンを生成するために使用され得るという発見に、少なくとも一部基づく。特に、本発明者らは、生物活性剤、例えば、アジュバントおよび／または足場と組み合わせた場合、操作されたレクチンを使用して単離された病原体または病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）が、高い効力の病原体ワクチンの迅速な創出を可能にすることを、驚くべきことに発見した（図１）。動物をワクチン接種するために使用する場合、単一用量のこれらのワクチンは、ワクチン接種された動物において顕著に低減された病原体力価を生じ、致死用量の細菌による動物の感染後の顕著に延長された生存時間を生じた。実際に、実施例１に示すように、単一用量の本発明のワクチン組成物は、９０日間の期間にわたる細菌チャレンジから、ワクチン接種したマウスを保護できる。さらに、オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたレクチンまたはその断片は、ワクチン組成物における使用のために病原体を単離し、病原体を免疫細胞に提示して免疫応答を開始させるように機能するだけでなく、病原体を固定化するためのアンカー構造としても機能し、そうして、ワクチン組成物からの病原体の漏出を防止し、病原体漏出を現在経験しているあらゆる望ましくない副作用を防止する。
【０１７６】
本発明のワクチン組成物は、既存のワクチンを超えるさらなる改善を有する。例えば、本発明のワクチン組成物は、公知のおよび未知の両方の病原体、他の生体液内に存在する病原体、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物中に存在する病原体を含む、感染性疾患を有する患者由来の血液試料中を循環する病原体の、迅速かつ直接的な単離を可能にする。特許請求されるワクチン組成物は、単離および精製が困難な病原体に対しても使用され得る。病原体が被験体から単離されると、ワクチン組成物は、世界中のどこでも素早く簡便な様式で容易に調製され得、時宜を得た様式で、例えば１日以内に、患者にとって利用可能であり得る。さらに、特許請求されるワクチン組成物を使用するワクチン接種は、ワクチン組成物の有効性を損なうことなく、より制御され、局在化された安全な様式で行われ得る。特許請求されるワクチンの改善された安定性は、これらのワクチンを携帯可能にし、冷蔵の必要なしに室温での長期貯蔵に使用されるのを可能にする。さらに、ワクチン組成物は、１つよりも多い型の病原体が組成物中に含まれる場合には、多価ワクチンであり得、所与の病原体の異なる種または株に対してワクチン接種するためにも使用され得る。さらに、ワクチン組成物は、移植される場合、ワクチン接種後に被験体から容易に除去され得る。例えば、過度の免疫応答または望ましくない副作用がワクチン接種後に開始される場合、移植されたワクチン組成物は、被験体から容易に除去され得る。対照的に、現在の既存のワクチンは、被験体中にいったん注射されると除去できない。これらの改善は、現在の病原体ワクチンの主な制限を回避し、例えば、発展途上国の集団について、特に流行の期間の間、公衆にとって大きな関心事であり、または容易に入手可能なワクチンが高度に所望される軍事使用にとって大きな価値がある。実際、貯蔵および取り扱いが容易なだけでなく、より安全でより制御された様式で投与され得、長期保護効果を付与し得る、機能的で高度に安定なワクチンを迅速に創出する能力は、本発明のワクチン組成物を、既存のワクチンを超えて顕著に有利なものにする。
【０１７７】
したがって、本発明は、ワクチン組成物およびかかる組成物を産生する方法を提供する。本発明の他の実施形態は、病原体感染症を処置する方法、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法、およびそれを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するための方法を含む。さらなる実施形態では、本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法、病原体感染症と関連する疼痛を低減させる方法、およびそれを必要とする被験体において病原体感染症と関連する窮迫を低減させる方法を含む。新規足場組成物および病原体組成物、ならびにそれらの使用もまた、本明細書で提供される。
【０１７８】
Ｉ．定義
本発明がより容易に理解できるように、ある特定の用語を最初に定義する。さらに、パラメーターのある値が列挙されようと値の範囲が列挙されようと、列挙された値の中間の値および範囲もまた本発明の一部であることが意図されることに留意すべきである。
【０１７９】
以下の説明において、説明を目的として、具体的な数、材料および構成が、本発明の完全な理解を提供するために示される。しかし、本発明がこれらの具体的な詳細なしに実施され得ることは、当業者に明らかである。一部の例では、周知の特色は、本発明を曖昧にしないように、割愛または単純化され得る。さらに、「一実施形態」または「ある実施形態」などの語句に対する本明細書中の言及は、その実施形態と併せて記載される特定の特色、構造または特徴が、本発明の少なくとも１つの実施形態中に含まれることを意味する。本明細書の種々の場所における「一実施形態では」などの語句の出現は、全てが同じ実施形態に言及するわけでは必ずしもない。
【０１８０】
冠詞「１つの（a）」および「１つの（an）」は、その冠詞の文法的対象のうち１つまたは１つよりも多く（即ち、少なくとも１つ）を指すために本明細書で使用される。例として、「１つの（an）要素」は、１つの要素または１つよりも多い要素を意味する。
【０１８１】
用語「含む（comprising）」または「含む（comprises）」は、本発明にとって必須の組成物、方法およびそのそれぞれの構成要素（複数可）に言及して本明細書で使用されるが、必須かどうかにかかわらず、特定されていない要素を含むことに関して開かれている。
【０１８２】
用語「〜からなる」とは、その実施形態の説明において列挙されていない任意の要素を排除する、本明細書に記載される組成物、方法およびそのそれぞれの構成要素を指す。
【０１８３】
用語「ワクチン」には、本明細書で使用する場合、引き続く感染症に対してより良く応答できるように免疫系を刺激する免疫原性決定基（immunogenic  determinant）を含む任意の組成物が含まれる。ワクチンは通常、免疫原性決定基、例えば抗原、およびアジュバントを含み、このアジュバントは、その免疫原性決定基に対する免疫応答を非特異的に増強するように機能する。現在産生されているワクチンは、体液性免疫系、即ち、抗体依存的免疫応答を優勢に活性化する。他のワクチンは、標的化された病原体を死滅させることが可能な細胞傷害性Ｔリンパ球を含む細胞媒介性免疫系を活性化することに焦点を当てている。
【０１８４】
用語「オプソニン」とは、本明細書で使用する場合、病原体細胞の表面分子、例えば、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を認識し、それによって、例えば、補体攻撃および食作用による破壊のために、結合した病原体細胞をマークし標的化する任意のタンパク質またはその断片を指す。一部の実施形態では、オプソニンは、天然のオプソニン、例えば、抗原曝露に応答してＢ細胞によって生成される抗体、生得免疫応答の一部である補体タンパク質、または非自己もしくは変更された自己分子パターンを同定すること、外来微生物もしくは変更された／死細胞をコーティングすること、および食作用もしくは補体攻撃によるそれらに対する好中球反応性を増強することが可能な可溶性免疫パターン認識タンパク質である（Litvackら、２０１０年、Innate  Immunity  １６巻（３号）：１９１〜２００頁）。可溶性免疫パターン認識タンパク質の例には、コレクチン、フィコリン、ペントラキシン、ｓＣＤ１４、ＭＦＧ−Ｅ８、天然のＩｇＭおよびＣ１ｑが含まれ得るがこれらに限定されない。
【０１８５】
用語「レクチン」とは、本明細書で使用する場合、炭水化物構造、例えば、病原体上の炭水化物構造または病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）と関連する炭水化物構造を結合することが可能な任意のタンパク質またはその断片を指す。レクチンには、天然に存在するレクチンまたは操作されたレクチンの両方、例えば、操作されたマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）、サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）、またはそれらの断片が含まれる。例えば、操作されたマンノース結合性レクチンには、ヒトＩｇＧのＦｃ部分に対して下流に融合された、ＭＢＬの炭水化物認識ドメイン、例えば、ＭＢＬのネックおよびレクチンドメイン、例えば、ＭＢＬのアミノ酸残基８１〜２２８またはＭＢＬのアミノ酸残基１１１〜２２８が含まれる。
【０１８６】
用語「病原体」とは、本明細書で使用する場合、被験体において感染性疾患を誘導することが可能な任意の病原体または病原体断片を指す。一部の実施形態では、病原体は、細菌、真菌、ウイルスおよび寄生生物からなる群より選択される感染性微生物またはその断片である。病原体は、感染性病原体細胞全体または病原体細胞の一部、例えば、感染性微生物の細胞壁構成要素を含み得る。一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、例えば、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、または病原体から放出される構成要素を含む。用語「病原体」には、マイコプラズマ、または病原体から放出される毒素もまた含まれる。本発明のワクチン組成物における使用のための病原体は、ワクチンが投与される被験体、例えば哺乳動物の種、または密接に関連した種において、疾患または感染症を引き起こす。例えば、病原体は、この病原体を含むワクチンを受ける同じ被験体から単離され得る。あるいは、病原体は、病原体感染症を有する１人／匹の被験体から単離され得、病原体を含むワクチン組成物は、同じ病原体感染症を有する異なる被験体に投与される。ワクチン組成物における使用のための病原体はまた、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来し得、あるいは病原体は合成病原体であり得る。
【０１８７】
用語「病原体関連分子パターン」または「ＰＡＭＰ」とは、本明細書で使用する場合、「非自己」、例えば感染病原体から「自己」を識別するように、標的化された宿主細胞を指示し、生得免疫と関連するシグナルを促進する、微生物の任意の構成要素を指す。例示的なＰＡＭＰには、病原体断片；病原体デブリ；ＤＮＡ（例えば、非メチル化ＣｐＧモチーフ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）および５’−三リン酸ＲＮＡが含まれる病原体核酸；病原体リポタンパク質；病原体表面糖タンパク質；病原体膜構成要素、例えば、ペプチドグリカン、グリコシルホスファチジルイノシトール；ならびに病原体から放出される構成要素、例えば、病原体から放出される毒素が含まれ得るがこれらに限定されない。一部の実施形態では、毒素は、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される。
【０１８８】
用語「バイオ薬剤」とは、本明細書で使用する場合、被験体において免疫細胞を動員することが可能な任意の薬剤を指す。バイオ薬剤は、天然に存在する、合成産生された、または組換え産生された化合物であり得る。特許請求される本発明のワクチン組成物における使用に適切なバイオ薬剤には、アジュバント；サイトカイン、例えば、ＩＬ−Ｉ、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、インターフェロン−γ（γ−ＩＦＮ）、ＩＦＮ−α、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）；または増殖因子、例えば、トランスフォーミング増殖因子−α（ＴＧＦ−α）、ＴＧＦ−β、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）、神経成長因子（ＮＦＧ）、ニューロトロフィン、上皮増殖因子（ＥＧＦ）、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）、インスリン様増殖因子（ＩＧＦ）、肝細胞増殖因子（ＨＧＦ）、エリスロポエチン（ＥＰＯ）、トロンボポエチン（ＴＰＯ）、ミオスタチン（ＧＤＦ−８）、増殖分化因子−９（ＧＤＦ−９）、酸性線維芽細胞増殖因子（ａＦＧＦまたはＦＧＦ−１）もしくは塩基性線維芽細胞増殖因子（ｂＦＧＦまたはＦＧＦ−２）が含まれる。
【０１８９】
用語「アジュバント」とは、本明細書で使用する場合、抗原に対する免疫応答を刺激するためにワクチンに添加され得る化合物を指す。アジュバントは、高度に精製された抗原または組換え抗原の免疫原性を増強し得る。アジュバントは、防御免疫に必要な抗原の量または免疫化の回数を低減させ得る。例えば、アジュバントは、より多量の抗体を産生するように、抗体分泌性Ｂ細胞を活性化し得る。あるいは、アジュバントは、抗原のためのデポーとして作用でき、免疫応答を最大化するのを補助し得るより長い期間にわたって抗原を提示でき、より長く持続する保護を提供できる。アジュバントは、特定の型の免疫系細胞へと免疫応答を改変するのを補助することによって、例えば、ワクチンの目的に依存して、抗体分泌性Ｂ細胞の代わりにＴ細胞を活性化することによって、ワクチンの有効性を増強するためにも使用され得る。
【０１９０】
用語「足場」とは、本明細書で使用する場合、生体材料を含み、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な任意の構造を指す。足場は、オプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物またはバイオ薬剤がその上またはその中に会合または付着できる物理的構造を提供する。オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体への送達または投与のために足場内に被包され得、したがって、ワクチン組成物からの病原体のあらゆる望ましくない漏出を防止する。足場は、毒性でも免疫原性でもない生体適合性材料を含む。本明細書で使用する場合、用語「生体適合性材料」とは、被験体の生物学的組織中に移植されるまたは被験体の生物学的組織に隣接して配置される場合に、経時的に、顕著な免疫応答もしくは有害な組織反応、例えば、毒性反応もしくは顕著な刺激を感知できるほどには悪化させず、それを誘導しない、または血液と接触した場合に凝血もしくは血液凝固を誘導しない、任意の材料を指す。
【０１９１】
用語「免疫細胞」とは、本明細書で使用する場合、感染性疾患および外来侵入物の両方に対して身体を保護するように機能する、免疫系の任意の細胞を指す。例示的な免疫細胞には、Ｔ細胞、Ｂ細胞、抗原提示細胞、樹状細胞、マクロファージ、顆粒球、単球、好中球およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。
【０１９２】
用語「抗原提示細胞」とは、本明細書で使用する場合、その表面上に抗原をディスプレイすることが可能な任意の細胞を指す。抗原提示細胞は、抗原をペプチド断片へとプロセシングし、それらを、免疫系のＴ細胞に対して細胞表面上に提示する。抗原提示細胞は、種々の組織型において見出され得る。マクロファージ、Ｂ細胞および樹状細胞が含まれる古典的な抗原提示細胞は、ＭＨＣクラスＩＩ分子と会合して、外来抗原をヘルパーＴ細胞に提示する。他の細胞型ではあるが、例えば、ＭＨＣクラスＩＩ分子を発現し得るマスト細胞、好塩基球、好酸球およびグループ３生得リンパ球細胞（ＩＬＣ３）もまた、抗原提示細胞として機能し得る（KambayashiおよびLaufer、２０１４年、Nature  Reviews  Immunology  １４巻、７１９〜７３０頁）。抗原提示細胞には、典型的にはＭＣＨクラスＩ分子を使用して、内因性ペプチドを細胞傷害性Ｔ細胞に対して細胞表面上にディスプレイすることが可能な任意の細胞、例えば有核細胞もまた含まれ得る。ＭＨＣファミリーのタンパク質に加えて、抗原提示は、ＡＰＣおよびＴ細胞の両方の表面上の他の特殊化したシグナル伝達分子に依存する。
【０１９３】
用語「凍結乾燥」とは、本明細書で使用する場合、組成物、例えば、本発明のワクチン組成物、足場組成物および／またはオプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物を保存するため、あるいは組成物を貯蔵および輸送にとってより簡便なものにするために使用される、脱水プロセスを指す。フリーズドライは、組成物を凍結させ、次いで、組成物中の凍結した水を固相から気相に直接昇華させるために周辺の圧力を低減させることによって働く。一部の実施形態では、凍結乾燥は、特許請求される本発明のワクチン組成物の安定性を増加させ、それによって、ワクチン組成物を携帯可能にし、冷蔵の必要なしに室温で貯蔵されるのを可能にする。
【０１９４】
疾患または障害、例えば、病原体によって引き起こされる感染性疾患の「処置」、「予防」または「好転（amelioration）」とは、かかる疾患または障害の発症を遅延させるまたは予防すること、かかる疾患もしくは障害、例えば病原体感染症と関連する状態の進行、増悪もしくは悪化、またはその進行もしくは重症度を逆転、軽減、好転、阻害、緩徐化または停止させることを意味する。一実施形態では、疾患もしくは障害、例えば病原体感染症の症状、または病原体感染症と関連する疼痛および窮迫は、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％または少なくとも９５％軽減される。
【０１９５】
本明細書で使用する場合、「被験体」とは、ヒトまたは動物を意味する。動物は、脊椎動物、例えば、霊長類、げっ歯類、飼育動物または狩猟動物であり得る。霊長類には、チンパンジー、カニクイザル、クモザルおよびマカク、例えば、アカゲザルが含まれる。げっ歯類には、マウス、ラット、ウッドチャック、フェレット、ウサギおよびハムスターが含まれる。飼育動物および狩猟動物には、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、鳥類、ウマ、ブタ、シカ、バイソン、水牛、両生類、爬虫類、ネコ科（feline）種、例えば、イエネコ、イヌ科（canine）種、例えば、イヌ、キツネ、オオカミ、トリ種、例えば、ニワトリ、エミュー、ダチョウ、ならびに魚類、例えば、マス、ナマズおよびサケが含まれる。ある特定の実施形態では、被験体は、生涯にわたる保護が本発明によるワクチン接種後に惹起される、胚または胎仔である。
【０１９６】
ある特定の実施形態では、被験体は、哺乳動物、例えば霊長類、例えばヒトである。用語「患者」および「被験体」は、本明細書で相互交換可能に使用される。好ましくは、被験体は哺乳動物である。哺乳動物は、ヒト、非ヒト霊長類、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、鳥類、爬虫類、両生類、魚類またはウシであり得る。ヒト以外の哺乳動物は、感染性疾患または他の関連の病理の動物モデルを示す被験体として有利に使用され得る。被験体は、雄性または雌性であり得る。被験体は、成体、青年期または小児であり得る。被験体は、感染性疾患、もしくは病原体感染症と関連する疾患および状態に罹患しているまたはそれを発症する危険性を有すると以前に診断されたまたはそのように同定された被験体であり得る。
【０１９７】
ＩＩ．本発明のワクチン組成物
本発明は、感染性疾患の予防および処置に適切なワクチン組成物を提供する。ワクチン組成物は、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物と被験体において免疫細胞を動員することが可能なバイオ薬剤とを含む。
【０１９８】
本発明のワクチン組成物は、特異的抗原、例えば、オプソニン結合病原体構築物の形態でまたはレクチン結合病原体構築物の形態で提示される病原体を用いて免疫細胞を活性化し、細胞をプライムし、それによって、望ましくない病原体に対する免疫防御および破壊を増強するように調整される。ワクチン組成物は、適切な免疫細胞、例えば、マクロファージ、Ｔ細胞、Ｂ細胞、ナチュラルキラー細胞および樹状細胞を誘引する。
【０１９９】
被験体において感染性疾患を誘導することが可能な任意の病原体または病原体断片が、本発明のワクチン組成物において使用され得る。一部の実施形態では、病原体は、感染性病原体細胞全体、または感染性微生物の任意の細胞断片、例えば、感染性微生物の細胞壁構成要素の両方を含む、感染性微生物である。他の実施形態では、病原体は、病原体放出材料、病原体デブリ、病原体毒素または病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。一部の実施形態では、感染性微生物の細胞壁構成要素は、グリコシル化される。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノシル化される。一部の実施形態では、細胞壁構成要素は、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）である。他の実施形態では、細胞壁構成要素は、ホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）である。
【０２００】
ワクチン組成物における使用に適切な病原体の例には、細菌、ウイルス、ウイロイド、マイコプラズマ、寄生生物、真菌またはそれらの断片が含まれるがこれらに限定されない。細菌は、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ属、Ａｅｒｏｂａｃｔｅｒ属、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ属、Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｓ属、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ属、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ属、Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ属、Ｓｈｉｇｅｌｌａ属、Ｂａｃｉｌｌｕｓ属、Ｈｅｌｉｂａｃｔｅｒ属、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ属、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ属、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ属、Ｙｅｒｓｉｎｉａ属、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ属；Ｂｏｒｄｅｔｅｌｉａ属、Ｂｒｕｃｅｌｉａ属、Ｖｉｂｒｉｏ属、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ属、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ属、Ｓｃｈｉｓｏｓｔｏｍａ属またはＣａｎｄｉｄａ属のメンバーであり得る。例示的な細菌には、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ  ｃｅｐａｃｉａ、Ｂａｃｔｅｒｉｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ  ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  ｉｎｆ  ｂ、Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ  ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｅｓ、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ、ｐａｒａｔｙｐｈｉ、ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ  ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ  ｍａｌｔｏｐｈｉｌｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃ．ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐｐ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃｉｕｍ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｒｉｕｍ  ａｖｉｕｍ、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍ．ｌｅｐｒａｅ、Ｎｏｃａｒｄｉａ  ｆａｒｃｉｎｉｃａ、Ｐ．ａｃｎｅｓ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ、メチシリン感受性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＳＳＡ）、メチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ、Ｓｔｒｅｐ  Ａ群、Ｓｔｒｅｐ  Ｂ群（ａｇａｌａｃｔｉａｅ）およびＳｔｒｅｐ  Ｃ群もまた含まれ得るがこれらに限定されない。
【０２０１】
一部の実施形態では、細菌は抗生物質耐性細菌である。一部の実施形態では、細菌は多剤耐性細菌である。他の実施形態では、抗生物質耐性細菌または多剤耐性細菌は、Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ  ｂａｕｍａｎｉｉ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ  ｏｘｙｔｏｃａ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ（ＭＤＲ／ＣＲＥ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｃ．ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）およびメチシリン耐性Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ（ＭＲＳＡ）からなる群より選択される。
【０２０２】
任意の真菌が、本発明のワクチン組成物において使用され得る。例示的な真菌には、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ、Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ、ｇｌａｂｒａｔａ、ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ、ｋｒｕｓｅｉ、ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ、ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ  ｓｐｐ．、Ｍｕｃｏｒ  ｓｐｐ．、ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＰｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ  ｊｉｒｏｖｅｃｉｉ（ｃａｒｉｎｉｉ）が含まれ得るがこれらに限定されない。
【０２０３】
本発明のワクチン組成物における使用のための例示的なウイルスには、インフルエンザウイルス、デングウイルス、エボラウイルス、ＥＢＶ、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、ＨＳＶ  １、ＨＳＶ  ２、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、インフルエンザＡウイルス、マールブルグウイルス、ヒト呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ、ウエストナイルウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、ヒトライノウイルス（ＨＲＶ）、ジカウイルス、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１およびＨＩＶ−２）、ヒトＴ細胞白血病ウイルス（ＨＴＬＶ）、灰白髄炎ウイルス、ポックスウイルス、麻疹ウイルス、アルボ（arbor）ウイルス、コクサッキーウイルス、ヘルペスウイルス、ハンタウイルス、バキュロウイルス、ムンプスウイルス、サーコウイルス、ウィチャイウイルス（vichaivirus）、アレナウイルス、ロタウイルス、サイトメガロウイルス、トリ白血病肉腫ウイルス（ＡＬＶ）、マウス白血病ウイルス（ＭＬＶ）、ネコ白血病ウイルス（ＦｅＬＶ）、サル肉腫ウイルス（ＳＩＳ）、マウス乳癌ウイルス（ＭＭＴＶ）、マソン・ファイザー・サルウイルス（ＭＰＭＶ）、サルＡＩＤＳウイルス（ＳＲＶ）、サルＴ細胞白血病ウイルス（ＳＵＮ）、ウシ白血病ウイルス（ＢＬＶ）、サル免疫不全ウイルス（ＳＩＶ）、ネコ免疫不全ウイルス（ＦＴＶ）、ビスナ・マエディウイルス（ＶＭＶ）、ウマ伝染性貧血ウイルス（ＥＩＡＶ）およびヤギ関節炎脳炎ウイルス（ＣＡＥＶ）が含まれ得るがこれらに限定されない。
【０２０４】
本発明のワクチン組成物における使用のための例示的な寄生生物には、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、Ｍａｌａｒｉａ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、ＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓおよびＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａが含まれ得るがこれらに限定されない。本発明のワクチン組成物における使用のための例示的なマイコプラズマには、Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓおよびＭ．ｏｒａｌｅが含まれ得るがこれらに限定されない。
【０２０５】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。用語「病原体関連分子パターン」とは、本明細書で使用する場合、宿主において生得免疫系の細胞によって認識される微生物の任意の構成要素を指す（Tangら、２０１２年、Immunol  Rev.、２４９巻（１号）：１５８〜１７５頁およびSangiulianoら、２０１４年、Mediators  of  Inflammation、Article  ID  821043）。具体的には、ＰＡＭＰは、多様な生物中に存在するが、宿主中には存在しないので、宿主細胞において特異的受容体によって認識される外因性危険シグナルを提供し、病原体の存在に対して宿主免疫系に警告し、それによって、免疫を促進する。
【０２０６】
例示的なＰＡＭＰには、病原体断片；病原体デブリ；ＤＮＡ（例えば、非メチル化ＣｐＧモチーフ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）および５’−三リン酸ＲＮＡが含まれる病原体核酸；病原体リポタンパク質；病原体表面糖タンパク質；病原体膜構成要素、例えば、ペプチドグリカン、グリコシルホスファチジルイノシトール；ならびに病原体から放出される構成要素、例えば、病原体から放出される毒素が含まれ得るがこれらに限定されない。一部の実施形態では、毒素は、内毒素、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、リポタイコ酸（ＬＴＡ）、壁タイコ酸（ＷＴＡ）およびリシンからなる群より選択される。
【０２０７】
ＰＡＭＰは、パターン認識受容体（ＰＲＲ）、例えば、Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）および他のＰＲＲ、例えば、レチノイン酸誘導性遺伝子Ｉ（ＲＩＧ−Ｉ）様受容体（ＲＬＲ）、ＡＩＭ２様受容体（ＡＬＲ）、およびヌクレオチド結合性オリゴマー化ドメイン（ＮＯＤ）様受容体（ＮＬＲ）によって認識され得る。ＰＡＭＰの認識後、細胞表面、細胞質および／または細胞内小胞に局在化した、活性化されたＴＬＲおよび他のＰＲＲは、微生物感染症の存在を示すシグナルを宿主に提供し、アダプター分子、キナーゼ、ならびに転写因子、例えば、核因子−κＢ（ＮＦ−κＢ）、アクチベータータンパク質−１（ＡＰ−１）およびＩＦＮ調節因子（ＩＲＦ）が含まれる多数の細胞内シグナル伝達経路を活性化することによって、炎症促進応答および抗菌応答を誘発する。ＰＡＭＰ誘導性シグナル伝達経路は最終的に、遺伝子発現の活性化、ならびに微生物を感知することによって侵入してくる病原体に対する適応免疫応答を指示する、サイトカイン、ケモカイン、細胞接着分子および免疫受容体が含まれる広範な分子の合成を生じる。
【０２０８】
有効量の病原体または病原体断片が、ワクチン組成物中に含められるべきである。病原体または病原体断片の有効量は、本発明のワクチン組成物の病原体または病原体断片のうち１つまたは複数に対して指向される免疫応答、例えば、抗体分泌性Ｂ細胞または細胞傷害性Ｔ細胞媒介性の免疫応答を生じさせるのに十分な量である。本発明のワクチン組成物が免疫応答を惹起する能力は、当業者にとって利用可能な任意の慣用的な方法を使用して決定され得る。一部の実施形態では、各組成物の有効量は、被験体において、例えば、混合リンパ球Ｔ細胞アッセイによって測定される細胞傷害性Ｔ細胞応答を生じさせるのに十分な量である。
【０２０９】
一部の実施形態では、病原体または病原体断片は、約１ｐｇ〜約１０００μｇの量でワクチン組成物中に存在する。一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１μｇ〜１００μｇ、１μｇ〜２００μｇ、１μｇ〜３００μｇ、１μｇ〜４００μｇ、１μｇ〜５００μｇ、１μｇ〜６００μｇ、１μｇ〜７００μｇ、１μｇ〜８００μｇまたは１μｇ〜９００μｇである。一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１μｇ〜１０μｇ、１μｇ〜２０μｇ、１μｇ〜３０μｇ、１μｇ〜４０μｇ、１μｇ〜５０μｇ、１μｇ〜６０μｇ、１μｇ〜７０μｇ、１μｇ〜８０μｇまたは１μｇ〜９０μｇである。一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１ｐｇ〜１００μｇ、１ｐｇ〜９０μｇ、１ｐｇ〜８０μｇ、１ｐｇ〜７０μｇ、１ｐｇ〜６０μｇ、１ｐｇ〜５０μｇ、１ｐｇ〜４０μｇ、１ｐｇ〜３０μｇ、１ｐｇ〜２０μｇまたは１ｐｇ〜１０μｇである。他の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１０ｐｇ〜１μｇ、２０ｐｇ〜１μｇ、３０ｐｇ〜１μｇ、４０ｐｇ〜１μｇ、５０ｐｇ〜１μｇ、６０ｐｇ〜１μｇ、７０ｐｇ〜１μｇ、８０ｐｇ〜１μｇ、９０ｐｇ〜１μｇ、１００ｐｇ〜１μｇまたは１０００ｐｇ〜１μｇである。
【０２１０】
本発明のワクチン組成物における使用のための病原体は、中和される。例えば、病原体は、抗生物質、紫外光、音波破砕、マイクロ波、ビーズミル、ｘ線、オートクレーブ、照射または機械的破壊による処理によって中和される。病原体は、中和後に非感染性になる。ワクチン組成物における非感染性病原体の使用は有益であり、病原体毒素によって経験される潜在的に重症の副作用を低減させ得る。
【０２１１】
本発明のワクチン組成物は、一価または多価のワクチンを創出するために、１つまたは複数の型の病原体を含み得る。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、１つの型の病原体を含む。他の実施形態では、ワクチン組成物は、複数の型の病原体、例えば、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９または１０の異なる型の病原体、例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１〜４、１〜５、２〜５、２〜１０、３〜６、３〜１０または５〜１０の異なる型の病原体を含む。
【０２１２】
本発明のワクチン組成物は、所与の病原体の種を越えてワクチン接種するためにも使用され得る。例えば、１つの特定の種または株の病原体を含む特許請求されるワクチン組成物は、その病原体の複数の関連の種または株に対してワクチン接種するために使用され得る。所与の病原体について種を越えてワクチン接種する能力は、特に、異なる表面抗原を有する複数の種または株を有する病原体について、特に有利である。そのような病原体について、ワクチン株と感染株との間の抗原構造における不一致は、通常は大きな問題である。例えば、ワクチン株とは異なる病原体株が感染性疾患を引き起こす場合、ワクチン接種は無効になる。しかし、これは、特定の病原体の複数の種を標的化するそれらの優れた能力を考慮すると、特許請求されるワクチン組成物では問題にならない。
【０２１３】
本発明のワクチン組成物における使用のために適切な病原体は、任意の供給源から取得され得る。例えば、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する試料から直接単離され得る。一部の実施形態では、病原体は、病原体を含むワクチンを受ける同じ被験体から単離される。他の実施形態では、病原体は、病原体感染症を有する１人／匹の被験体から単離され、病原体を含むワクチン組成物は、同じまたは類似の病原体感染症を有する異なる被験体に投与される。例えば、病原体は、ヒト被験体から単離され得、同じ病原体またはその病原体の関連の種に感染した異なるヒト被験体に投与され得る。あるいは、病原体は、被験体、例えば動物から単離され得、同じ病原体またはその病原体の関連の種に感染した異なる被験体、例えばヒトに投与され得る。
【０２１４】
病原体単離に適切な試料の例には、血液試料、血漿試料、血清試料、血液培養試料、脳脊髄液試料、滑液試料、尿試料、精液試料、唾液試料、痰試料、気管支液試料および涙試料が含まれるがこれらに限定されない。
【０２１５】
あるいは、ワクチン組成物における使用に適切な病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来し得る。別の実施形態では、病原体は合成病原体であり得る。
【０２１６】
ワクチン組成物における使用のための病原体は、当該分野で公知の方法を使用して単離される。一部の実施形態では、病原体は、オプソニンまたはレクチンを使用して試料から単離され、ワクチン組成物中にオプソニン結合病原体構築物またはレクチン結合病原体構築物の形態で提示される。
【０２１７】
実施例１で実証されるように、レクチンを使用して単離された病原体断片は、微生物溶解物、例えば細菌溶解物の直接的な使用を超える予想外の利点を実証する。細菌溶解物およびレクチン捕捉された細菌断片の両方が、機能的ワクチン組成物を生成し、細菌感染症の致死チャレンジからマウスを保護するために使用され得るが、ワクチン組成物における細菌溶解物の直接的な使用は、溶解物の浸出および投与の部位における膿瘍の形成などの望ましくない副作用と関連した。したがって、レクチンまたはオプソニンは、ワクチン組成物における使用のための病原体を単離し、長期免疫応答を誘発するために病原体を免疫細胞に提示するように機能するだけでなく、病原体を固定化するためのアンカー構造としても機能し、それによって、ワクチン組成物からの病原体の漏出を防止する。
【０２１８】
レクチンまたはオプソニンを使用する病原体の直接的単離は、例えば、特定の病原体もしくは病原体断片、例えばＬＰＳが精製が困難な場合、または病原体が未知であるもしくは培養が困難な場合、さらなる利益を付与し、微生物溶解物中へのレクチンまたはオプソニンの添加は、所望の病原体の単離を促進し、それによって、ワクチン組成物において使用され得るオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する。
【０２１９】
本発明のワクチン組成物における使用のために適切なオプソニンには、病原体細胞の表面分子、例えば、病原体関連分子パターンを認識でき、それによって、補体攻撃および食作用による破壊のために、オプソニン結合病原体細胞を標的化する任意のタンパク質またはその断片が含まれる。
【０２２０】
一部の実施形態では、オプソニン結合病原体構築物中のオプソニンは、天然のオプソニンまたはその一部分、例えば、抗原曝露に応答してＢ細胞によって生成される抗体、生得免疫応答の一部である補体タンパク質、または非自己もしくは変更された自己分子パターンを同定すること、外来微生物もしくは変更された／死細胞をコーティングすること、および食作用もしくは補体攻撃によるそれらに対する好中球反応性を増強することが可能な可溶性免疫パターン認識タンパク質である（Litvackら、２０１０年、Innate  Immunity  １６巻（３号）：１９１〜２００頁）。典型的には、外来病原体は、その表面上に分子の変更されたアレイをディスプレイする。例えば、外来微生物の細胞表面は、宿主細胞由来のものとは異なる脂質、細胞内糖タンパク質および核酸（例えば、ＤＮＡ）を含み、またはそれらへのアクセスを可能にする場合が多い。これらの細胞表面パターンは、認識された細胞を死滅のためにマークし標的化するオプソニン分子のためのシグナルとみなされる。同様に、アポトーシスなどのプログラム細胞死プロセスもまた、細胞内構成要素を含む細胞表面ブレブを生成する。これらのブレブは、有効なクリアランスまたはシグナル伝達のために容易に放出される。細胞死の後期段階の間、オプソニン分子のためのシグナルとして作用する可溶性構成要素、例えば、ｌｙｓｏＰＣおよびヌクレオチドもまた、放出される（Litvackら、２０１０年、Innate  Immunity  １６巻（３号）：１９１〜２００頁）。可溶性免疫パターン認識タンパク質の例には、これらの特異的分子パターンの一部を有効に同定できる、コレクチン、フィコリン、ペントラキシン、ｓＣＤ１４、ＭＦＧ−Ｅ８、天然のＩｇＭおよびＣ１ｑが含まれ得るがこれらに限定されない。
【０２２１】
操作されたオプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたマンノース結合性レクチン、サーファクタントタンパク質Ｄ、またはそれらの断片もまた、本発明のワクチン組成物において使用され得る。遺伝子操作、ならびに定向進化（direct  evolution）および選択戦略の使用により、天然のオプソニンまたはレクチンの改変バージョンが操作され得る。かかる操作されたオプソニンまたはレクチン分子は、感染性疾患を有する患者の処置および診断のために、病原体を結合し、またはワクチン組成物における使用のための特定の病原体種を同定するために使用され得る。
【０２２２】
一部の実施形態では、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、レクチン、レクチンの一部分、操作されたレクチンまたはその一部分を含む。一部の実施形態では、レクチンはコレクチン（collecin）である。他の実施形態では、レクチンはフィコリンである。
【０２２３】
一部の実施形態では、レクチンは、肺サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）を含む。他の実施形態では、サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、病原体に結合することが可能である。脂質とタンパク質との複雑な混合物である肺サーファクタントは、肺機能にとって重要である。肺サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、肺中のサーファクタントのレベルを調節し、宿主防御タンパク質として作用するので、肺の免疫および炎症調節において重要な役割を有する。
【０２２４】
一部の実施形態では、レクチンはマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）である。ＭＢＬは、マンノース、Ｎ−アセチルグルコサミン（ＮＡＧ）含有炭水化物、および多くの微生物病原体の表面上に存在する種々の他の炭水化物に結合する血清レクチンである。ＭＢＬ（マンノース結合性またはマンナン結合性タンパク質、ＭＢＰとも呼ばれる）は、３つまたはそれよりも多い３２ｋＤａモノマーからアセンブルされたポリマー性タンパク質である。各モノマーは、Ｎ末端システインリッチ領域、コラーゲン様ｇｌｙ−Ｘ−Ｙ領域、ネック領域および炭水化物認識ドメインを有する。より高い分子量のポリマーのアセンブリは、３２ｋＤａモノマーのトリマーの形成で始まる；次いで、これらのトリマーは、３〜６セットのトリマーの、より高い分子量のポリマーへと自己アセンブリする。
【０２２５】
ＭＢＬは、微生物病原体のオプソニン化において、ならびに補体の活性化（レクチン経路を介する）および凝固において重要な構成要素である。オプソニン化は、標的細胞へのタンパク質の結合、および次いで、マクロファージおよび好中球などの食作用性細胞による取込みおよび破壊のためのこれらの細胞の標的化である。このオプソニン化は、ＭＢＬの小さいシステイン−リッチＮ末端ドメイン、ならびにＭＢＬ媒介性のレクチン補体経路活性化によって標的細胞表面上に沈着したＣ３ｂによって媒介されるようである。レクチン経路を介した補体の活性化では、微生物および特殊化したタンパク質、即ち、ＭＡＳＰ−１（マンナン結合性レクチン関連セリンプロテアーゼ）およびＭＡＳＰ−２は、結合したＭＢＬと相互作用し、抗体の非存在下で補体を活性化する（MatsushitaおよびFujita、１９９２年、J.  Exp.  Med.  １７６巻（５号）：１４９７〜１５０２頁；Thielら、１９９７年、Nature  ３８６巻：５０６〜５１０頁）。より高い分子量のＭＢＬ複合体（５〜６リピートの機能的ＭＢＬトリマー）は、このレクチン経路を介した補体の強力なアクチベーターであり、このとき、ＭＡＳＰ２は補体を活性化するようであり、ＭＡＳＰ１は凝固を活性化する。より小さい複合体（３〜４リピートのＭＢＬトリマー単位）は、凝固の最も強力なアクチベーターである（Krarupら、２００７年  PLoS  One、２巻（７号）、ｅ６２３頁）。
【０２２６】
ＭＢＬは、本明細書に記載されるワクチン組成物における使用のための優れた選択である；しかし、野生型ＭＢＬは、治療的ワクチン機能に干渉し得るまたはそれを複雑にし得る食作用、血液凝固および補体を活性化できる複数の機能的ドメインを有するので、インタクトな分子は、全血の存在下では典型的には使用されない。ＭＢＬのこの特徴は、本明細書で提供されるその病原体結合機能とは別であり得る。より具体的には、ＭＢＬは、Ｎ末端からＣ末端へと、４つの部分を含む：マクロファージ結合および／またはＭＡＳＰ結合に関与し得る本質的に未知の機能の小さいＮ末端ドメイン；ＭＡＳＰ結合および高次オリゴマー化にも関与し得るコラーゲンセグメント；トリマー化に十分なアルファ−ヘリックス「ネック」セグメント；および直接的病原体結合を媒介するＣ末端の炭水化物認識レクチンドメイン。レクチンドメインは、病原体の単離のために本発明に有用である。一部の実施形態では、レクチンは、ＭＢＬのネックおよびレクチンドメインを含む。例えば、レクチンは、ＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基８１〜２２８またはＭＢＬ（配列番号１）のアミノ酸残基１１１〜２２８を含み得る。例えば、米国特許第９，１５０，６３１号を参照のこと。上述の特許の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２２７】
レクチン、例えばＭＢＬの結合特徴は、変更された結合特異性に向かう定向進化によって操作され得る。ＭＢＬは、限定されたセットの糖または他の分子特色に結合するように改変され得、その結果、改変されたＭＢＬは、選択されたセットの微生物に結合して、病原体クラス捕捉のためのより特異的な能力を提供する。例えば、操作されたＭＢＬは、ある特定の病原体クラス、例えば、１つもしくは複数の細菌種、例えば、グラム陰性細菌もしくはグラム陽性細菌；１つもしくは複数のウイルス種；１つもしくは複数の真菌種；または１つもしくは複数の原生生物種を捕捉することが可能であり得る。
【０２２８】
例えば、本発明のワクチン組成物における使用のための操作されたレクチン、例えばＭＢＬは、糖と複合体化したＭＢＬの原子構造を調べ、次いで、糖特異的様式で接触する適切なアミノ酸を変異させることによって生成され得、その結果、特有の接触が失われ、または特定の型の立体障害が創出される。例えば、ラットＭＢＬの三次元構造は、高マンノースオリゴ糖と、Ｎ−アセチルグルコサミンと、およびメチル化フコースとの複合体中で解析されてきた。Ｈｉｓ１８９ＶａｌおよびＩｌｅ２０７Ｖａｌは、改変が特異性を変更する置換の例である。
【０２２９】
定向進化戦略が、特定の型の病原体、例えば、酵母、グラム陽性細菌、グラム陰性、コアグラーゼ陰性および好気性細菌への特異的結合を有するＭＢＬバリアントを選択するために、ＭＢＬに適用され得る。特定の特異性を有するＭＢＬの誘導体は、当該分野で公知の任意の方法、例えば、標準的なファージディスプレイ戦略によって単離され得る。最初に、ＭＢＬバリアントのセットが、ファージミドベクターから発現され得る；次いで、目的の標的（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）へのこのライブラリーの結合、および１または２ラウンドの選択が実施され得る。引き続いて、関連標的（例えば、Ｃａｎｄｉｄａ）に対する１ラウンドの陰性選択が行われ、結合できないファージミドを採取する。次いで、陽性および陰性選択のこれらのサイクルは、概して標的に結合し、かつ非標的には結合しないファージの集団が生成されるまで反復される。この方法は、それに対する示差的結合が所望される微生物株、例えば、所与の抗生物質に対して耐性および感受性である細菌の任意の対に適用され得る。
【０２３０】
ＭＢＬは、Ｃ型（カルシウム依存的）レクチンスーパーファミリー中のコレクチンのクラスに属し、それの他のメンバー、例えば、サーファクタントタンパク質Ａ、サーファクタントタンパク質Ｄ、ＣＬ−Ｌ１およびＣＬ−Ｐ１は、本発明のワクチン組成物における使用のための操作されたレクチンの構築のために有用であり得る。他の可能なレクチンには、補体のレクチン経路を活性化し、ＭＡＳＰタンパク質を結合することもできるフィコリンが含まれる。フィコリンタンパク質は、ＭＢＬと関連するが、異なるより限定的な特異性を有する。本明細書に記載されるワクチン組成物に関して、１つの選択肢は、上記ＭＢＬのレクチンドメインに対応する、フィコリンのレクチンドメインを使用することである。別のアプローチは、ハイブリッド特異性を有し得るハイブリッド分子を創出するために、ＭＢＬと１つまたは複数のフィコリンとの間でのセグメントまたは個々のアミノ酸の「シャッフリング」を使用することである。上記定向進化および選択アプローチは、クラス、サブクラスおよび種特異性を提供する操作されたタンパク質を生成するためにも、潜在的に使用され得る。
【０２３１】
オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたＭＢＬまたはＳＰＤは、免疫グロブリンＦｃ部分をさらに含み得る。例えば、ＭＢＬのネックおよびレクチンドメインは、ヒトＩｇＧのＦｃ部分に対して下流に融合され得る。Ｆｃ部分は、ブドウ球菌プロテインＡを含むいくつかのＦｃ受容体に対する結合部位を含む、ＩｇＧ  ＦｃドメインのＣＨ２−ＣＨ３界面を含み得る。使用の際に、Ｆｃ部分はダイマー化し、ＭＢＬレクチンによるモノマー性糖への結合の結合力親和性を強化する。さらに、組換えレクチンのｎ結合型グリコシル化が除去され得る。例えば、ＭＢＬのネックおよびレクチンドメイン、例えば、ＭＢＬのアミノ酸残基８１〜２２８がＩｇＧのＦｃ部分と融合される場合、得られた融合タンパク質のグリコシル化は、この特定のＦｃＭＢＬ構築物中のアミノ酸８２に対応する、抗体中のＫａｂａｔシステムのアミノ酸番号付けにおける残基２９７においてアスパラギンからアスパラギン酸へとアミノ酸を変化させること（Ｎ２９７Ｄ）によって、除去され得る。
【０２３２】
オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたＭＢＬまたはＳＰＤは、固体支持体をさらに含み得る。融合ＭＢＬレクチン−ＦｃまたはＳＰＤ−Ｆｃタンパク質の付着のための任意の固体支持体が、本発明のワクチン組成物において使用され得る。固体支持体は、免疫細胞への病原体の長期提示を促進し得る。固体支持体の例には、ビーズ、例えば、磁性ビーズ、マイクロ多孔性メンブレン、中空繊維リアクター、血液濾過メンブレンおよび血流デバイスが含まれ得るがこれらに限定されない。
【０２３３】
一部の実施形態では、固体支持体は、ビーズ、例えば磁性ビーズ、または他の構造化された材料を含み得、これらは次いで、試料（血液などの生体液またはｉｎ  ｖｉｔｒｏ病原体培養物、および上記のような任意の他の試料を含む）から病原体を引き出し、生きた病原体を含む病原体を濃縮および収集する。あるいは、固体支持体は、中空繊維リアクターまたは任意の他の血液濾過メンブレンもしくは血流デバイス（例えば、単純な透析チューブ）、または生物学的病原体を選択的に結合し隔離するための他の樹脂、繊維もしくはシートを含み得る。
【０２３４】
ビーズ、例えば磁性ビーズは、球状、棒状、楕円形、円柱状、ディスクなどが含まれるがこれらに限定されない任意の形状のものであり得る。一部の実施形態では、ビーズ、例えば、真球形状（true  spherical  shape）および画定された表面化学を有する磁性ビーズが、化学的凝集および非特異的結合を最小化するために使用される。本明細書で使用する場合、用語「磁性ビーズ」とは、磁場勾配によって誘引もしくは反発される、またはゼロではない磁化率を有する、ナノまたはマイクロスケールの粒子を指す。磁性ビーズは、常磁性または超常磁性であり得る。一部の実施形態では、磁性ビーズは超常磁性である。磁性ビーズは、磁性粒子とも呼ばれる。一部の実施形態では、ポリマーシェルを有する磁性ビーズが、鉄への曝露から病原体を保護するために使用される。例えば、ポリマーコーティングされた磁性ビーズが、鉄への曝露から病原体を保護するために使用され得る。
【０２３５】
ビーズ、例えば磁性ビーズは、直径が１ｎｍ〜１ｍｍの範囲であり得る。例えば、ビーズ、例えば磁性ビーズは、直径が約５０ｎｍ、直径が約１２８ｎｍ、直径が約５００ｎｍ、直径が約１μｍ、直径が約２５０ｎｍ〜約２５０μｍ、直径が０．１μｍ〜１００μｍ、直径が０．１μｍ〜５０μｍ、または直径が０．１μｍ〜１０μｍである。一部の実施形態では、磁性ビーズは、磁性ナノ粒子または磁性マイクロ粒子である。磁性ナノ粒子は、磁場または磁場勾配を使用して操作され得るナノ粒子のクラスである。かかる粒子は一般に、鉄、ニッケルまたはコバルトなどの磁性元素からなる。磁性ナノ粒子は周知であり、それらの調製のための方法は、当該分野で記載されている。例えば、米国特許第６，８７８，４４５号；同第５，５４３，１５８号；同第５，５７８，３２５号；同第６，６７６，７２９号；同第６，０４５，９２５号；および同第７，４６２，４４６号；ならびに米国特許出願公開第２００５／００２５９７１号；同第２００５／０２００４３８号；同第２００５／０２０１９４１号；同第２００５／０２７１７４５号；同第２００６／０２２８５５１号；同第２００６／０２３３７１２号；同第２００７／０１６６６２３２号；および同第２００７／０２６４１９９号を参照のこと。上述の特許および特許出願の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２３６】
親和性分子に結合することが可能な官能基ありまたはなしの、本発明のワクチン組成物における使用のための磁性ビーズが、容易にかつ広範に商業的に入手可能である。適切な磁性ビーズは、Ｄｙｎａｌ  Ｉｎｃ．（Ｌａｋｅ  Ｓｕｃｃｅｓｓ、ＮＹ）；ＰｅｒＳｅｐｔｉｖｅ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ、ＭＡ）；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐ．（Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）；Ｃｏｒｔｅｘ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｉｎｃ．（Ｓａｎ  Ｌｅａｎｄｒｏ、ＣＡ）；およびＢａｎｇｓ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ（Ｆｉｓｈｅｒｓ、ＩＮ）などから市販されている。特定の実施形態では、磁性粒子は、ＭｙＯｎｅ（商標）Ｄｙｎａｂｅａｄｓ（登録商標）磁性ビーズ（Ｄｙｎａｌ  Ｉｎｃ．）である。
【０２３７】
オプソニンまたはレクチン、例えば、操作されたオプソニンまたはレクチンは、ペプチドを他の分子とコンジュゲートするための当該分野で周知の方法によって、固体支持体とコンジュゲートされ得る。例えば、Hermanson、Bioconjugate  Techniques（第２版、Academic  Press（２００８年））およびNiemeyr、Bioconjugation  Protocols:  Strategies  &  Methods、Methods  In  Molecular  Biology（Humana  Press、２００４年）は、ペプチドを他の分子にコンジュゲートするためのいくつかの方法および技術を提供する。
【０２３８】
あるいは、固体支持体の表面は、オプソニンまたはレクチンと選択的に結合する結合分子を含むように官能化され得る。これらの結合分子は、親和性分子とも呼ばれる。結合分子は、固体支持体の表面上に共有結合的にまたは非共有結合的に結合され得る。本明細書で使用する場合、用語「結合分子」または「親和性分子」とは、本明細書に記載される操作されたオプソニンまたはレクチンを特異的に結合することが可能な任意の分子を指す。結合分子の代表的な例には、抗体、抗原、タンパク質、ペプチド、核酸（ＤＮＡ、ＲＮＡ、ＰＮＡ、およびそれらの混合物であるまたはヌクレオチド誘導体もしくはアナログを含む核酸）；受容体分子、例えば、インスリン受容体；受容体に対するリガンド（例えば、インスリン受容体に対するインスリン）；および別の分子に対する親和性を有する、生物学的、化学的、ポリマー性または他の分子、例えば、ビオチンおよびアビジンが含まれるがこれらに限定されない。
【０２３９】
結合分子は、当業者に公知の種々の方法のうちいずれかを使用して、固体支持体の表面にコンジュゲートされ得る。結合分子は、固体支持体の表面に、共有結合的にまたは非共有結合的にカップリングまたはコンジュゲートされ得る。結合分子と表面との間の共有結合は、リンカーによっても媒介され得る。結合分子と表面との間の非共有結合は、イオン性相互作用、ファンデルワールス相互作用、双極子−双極子相互作用、水素結合、静電相互作用および／または形状認識相互作用に基づき得る。
【０２４０】
本発明のワクチン組成物は、１つまたは複数のバイオ薬剤を含む。本明細書で使用する場合、用語「バイオ薬剤」とは、被験体において免疫細胞を動員することが可能な任意の薬剤を指す。バイオ薬剤は、天然に存在する、合成産生された、または組換え化合物であり得る。特許請求される本発明のワクチン組成物における使用に適切なバイオ薬剤には、アジュバント；サイトカイン、例えば、ＩＬ−Ｉ、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、インターフェロン−γ（γ−ＩＦＮ）、ＩＦＮ−α、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）；または増殖因子、例えば、トランスフォーミング増殖因子−α（ＴＧＦ−α）、ＴＧＦ−β、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）、神経成長因子（ＮＦＧ）、ニューロトロフィン、上皮増殖因子（ＥＧＦ）、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）、インスリン様増殖因子（ＩＧＦ）、肝細胞増殖因子（ＨＧＦ）、エリスロポエチン（ＥＰＯ）、トロンボポエチン（ＴＰＯ）、ミオスタチン（ＧＤＦ−８）、増殖分化因子−９（ＧＤＦ−９）、酸性線維芽細胞増殖因子（ａＦＧＦまたはＦＧＦ−１）もしくは塩基性線維芽細胞増殖因子（ｂＦＧＦまたはＦＧＦ−２）が含まれる。
【０２４１】
本発明に従って有用な適切なバイオ薬剤には、ＤＮＡ分子、ＲＮＡ分子、アンチセンス核酸、リボザイム、プラスミド、発現ベクター、マーカータンパク質、転写因子または伸長因子、細胞周期制御タンパク質、キナーゼ、ホスファターゼ、ＤＮＡ修復タンパク質、癌遺伝子、腫瘍抑制因子、血管新生タンパク質、抗血管新生タンパク質、細胞表面受容体、アクセサリーシグナル伝達分子、輸送タンパク質、酵素、抗細菌剤、抗ウイルス剤、抗原、免疫原、アポトーシス誘導剤、抗アポトーシス剤、細胞毒、および免疫抑制に対する抗体（例えば、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータ抗体またはアンタゴニストおよびアデノシン（Ａ２ａＲ）アンタゴニスト）が含まれるがこれらに限定されない。
【０２４２】
本発明における使用に適切なバイオ薬剤には、増殖因子、ホルモン、神経伝達物質、神経伝達物質または増殖因子受容体、インターフェロン、インターロイキン、ケモカイン、サイトカイン、コロニー刺激因子、走化性因子、ＭＭＰ感受性基質、細胞外マトリックス構成要素もまた含まれ得るがこれらに限定されない。例示的なバイオ薬剤には、成長ホルモン、副甲状腺ホルモン（ＰＴＨ）、骨形成タンパク質（ＢＭＰ）、トランスフォーミング増殖因子−α（ＴＧＦ−α）、ＴＧＦ−β、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、神経成長因子（ＮＦＧ）、ニューロトロフィン、上皮増殖因子（ＥＧＦ）、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）、インスリン様増殖因子（ＩＧＦ）、血管内皮細胞増殖因子（ＶＥＧＦ）、肝細胞増殖因子（ＨＧＦ）、エリスロポエチン（ＥＰＯ）、トロンボポエチン（ＴＰＯ）、ミオスタチン（ＧＤＦ−８）、増殖分化因子−９（ＧＤＦ−９）、酸性線維芽細胞増殖因子（ａＦＧＦまたはＦＧＦ−１）、塩基性線維芽細胞増殖因子（ｂＦＧＦまたはＦＧＦ−２）、インターフェロン−γ（γ−ＩＦＮ）、ＩＦＮ−α、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）、フィブリン、コラーゲン、フィブロネクチン、ビトロネクチン、ヒアルロン酸、ＲＧＤ含有ペプチドまたはポリペプチド、ＩＬ−Ｉ、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＦＬＴ−３リガンドおよびＣＤ４０リガンドが含まれるがこれらに限定されない。上述のタンパク質のいずれかのスプライスバリアント、および細胞の機能を変更するために有利に使用され得るそれらの小分子アゴニストまたはアンタゴニストもまた、本明細書で企図される。
【０２４３】
一部の実施形態では、バイオ薬剤は、１つまたは複数のアジュバントを含む。アジュバントは、抗原に対する特異的免疫応答を増強する化合物である。アジュバントは、標的抗原に対する免疫系の応答を刺激するために、ワクチンに添加される。アジュバントは、高度に精製された抗原または組換え抗原の免疫原性を増強し得る。アジュバントは、防御免疫に必要な抗原の量または免疫化の回数を低減させ得る。例えば、アジュバントは、より多量の抗体を産生するように、抗体分泌性Ｂ細胞を活性化し得る。あるいは、アジュバントは、抗原のためのデポーとして作用でき、免疫応答を最大化するのを補助し得るより長い期間にわたって抗原を提示でき、より長く持続する保護を提供できる。アジュバントは、特定の型の免疫系細胞へと免疫応答を改変するのを補助することによって、例えば、ワクチンの目的に依存して、抗体分泌性Ｂ細胞の代わりにＴ細胞を活性化することによって、ワクチンの有効性を増強するためにも使用され得る。アジュバントは、免疫化した動物からの抗体の産生においても使用される（Petrovskyら、２００２年、Immunology  and  Cell  Biology  ８２巻：４８８〜４９６頁）。
【０２４４】
アジュバントは、それらの供給源、作用機構または物理化学的特性に従って分類され得る。例えば、アジュバントは、３つの群に分類され得る：（ｉ）抗原に対する免疫応答を増加させる物質である活性な免疫賦活薬；（ｉｉ）Ｔ細胞の補助を提供する免疫原性タンパク質である担体；および（ｉｉｉ）抗原のためのマトリックスとして機能する油エマルジョンまたはリポソームであり、免疫応答を刺激するビヒクルアジュバント（Edelman  R.  １９９２年、AIDS  Res.  Hum.  Retroviruses  ８巻：１４０９〜１１頁）。代替的なアジュバント分類は、投与経路、即ち、粘膜か非経口かに従って、アジュバントを分ける。第３の分類は、ミョウバン塩および他の鉱物アジュバント；張力活性剤（tensoactive  agent）；細菌誘導体；ビヒクルおよび緩徐放出材料またはサイトカインへと、アジュバントを分ける（Byarsら、１９９０年、Laboratory  Methods  in  Immunology:３９〜５１頁）。第４の分類は、以下の群へとアジュバントを分ける：ゲルベースのアジュバント、張力活性剤、細菌産物、油エマルジョン、粒状アジュバント、融合タンパク質またはリポペプチド（Jennings  Rら、１９９８年、Dev.  Biol.  Stand、９２巻：１９〜２８頁）。
【０２４５】
本発明のワクチン組成物は、１つまたは複数のアジュバントを含み得る。本明細書における使用に適切なアジュバントには、鉱物塩ベースのアジュバント、例えば、ミョウバンベースのアジュバント、カルシウムベースのアジュバント、鉄ベースのアジュバント、ジルコニウムベースのアジュバント；粒状アジュバント；粘膜アジュバント；張力活性アジュバント；細菌由来アジュバント；油ベースのアジュバント；サイトカイン、リポソームアジュバント、ポリマー性ミクロスフェアアジュバント、炭水化物アジュバントが含まれるがこれらに限定されない。
【０２４６】
例示的なアジュバントには、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、リン酸カルシウム、Ｑｕｉｌ  Ａ、Ｑｕｉｌ  Ａ由来サポニンＱＳ−２１または他の型のサポニン、Ｄｅｔｏｘ、ＩＳＣＯＭ、グラム陰性細菌の細胞壁ペプチドグリカンまたはリポポリサッカリド、トレハロースジミコレート、細菌核酸、例えば、ＣｐＧモチーフを含むＤＮＡ、ＦＩＡ、モンタニド、アジュバント６５、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、リポバント、インターフェロン、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＳＴＩＮＧ、Ｔｏｌｌ様受容体リガンド、ＣＤ４０Ｌ、オボアルブミン（ＯＶＡ）、モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）、ポリ（Ｉ：Ｃ）、ＬＰＳ（またはＭＰＬＡ）とＯｘＰＡＰＣとの組合せ、ＭＦ５９、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＭＤＰ）、ポリ（ＤＬ−ラクチド−コグリコリド）ミクロスフェア、パラフィン油、スクアレン、ビロソーム、ガンマイヌリン、グルカン、デキストラン、レンチナン、グルコマンナンおよびガラクトマンナン、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）、損傷関連分子パターン分子（ＤＡＭＰ）、免疫抑制性分子に対する抗体（例えば、トランスフォーミング増殖因子（ＴＧＦ）−ベータに対する抗体またはアンタゴニスト、Ａ２ａＲアンタゴニスト）、フロイント完全アジュバント、フロイント不完全アジュバント、リポポリサッカリド（ＬＰＳ）、Ｆａｓリガンド、Ｔｒａｉｌ、リンホタクチン、マンナン（Ｍ−ＦＰ）、ＡＰＧ−２、Ｈｓｐ７０ならびにＨｓｐ９０が含まれるがこれらに限定されない。
【０２４７】
アジュバントは、いくつもの送達系、例えば、鉱物塩、表面活性剤、合成マイクロ粒子、水中油エマルジョン、免疫賦活性複合体、リポソーム、ビロソームおよびウイルス様粒子を含み得る。アジュバントは、免疫応答の１つまたは複数の増強物質、例えば、微生物誘導体（例えば、細菌産物、毒素、例えば、コレラ毒素およびＥ．ｃｏｌｉ由来の熱不安定性毒素、脂質、リポタンパク質、核酸、ペプチドグリカン（peptidogylcan）、炭水化物、ペプチド）、細胞、サイトカイン（例えば、樹状細胞、ＩＬ−１２およびＧＭ−ＣＳＦ）、ホルモンならびに小分子をさらに含み得る。本発明における使用に適切なアジュバントには、油ベースのアジュバント（例えば、フロイントアジュバント）、ＣｐＧオリゴヌクレオチド、アルミニウム塩アジュバント、カルシウム塩アジュバント、エマルジョンおよび界面活性剤ベースの製剤（例えば、ＭＦ５９、ＡＳ０２、モンタニド、ＩＳＡ−５１、ＩＳＡ−７２０およびＱＡ２１）が含まれるがこれらに限定されない。ワクチンアジュバントにおける改善の総説については、Pashineら  ２００５年、Nature  Med.  １１巻（４号）：Ｓ６３〜Ｓ６８頁を参照のこと。
【０２４８】
一実施形態では、アジュバントは、１つもしくは複数のｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニストを含むまたはそれらからなる。一実施形態では、ＴＬＲアゴニストは、トリアシル化リポペプチド（グラム陽性細菌）、ペプチドグリカン（グラム陽性細菌）、細菌リポタンパク質、リポタイコ酸、ＬＰＳ（Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｓ  ｇｉｎｇｉｖａｌｉｓ、Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａ  ｉｎｔｅｒｒｏｇａｎｓ）、ＧＰＩ−アンカータンパク質（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａ  ｃｒｕｚｉ）、ナイセリアポリン、血球凝集素（ＭＶ）、ホスホリポマンナン（phospholipomannan）（カンジダ属）、ＬＡＭ（マイコバクテリア）、ｓｓＲＮＡウイルス（ＷＮＶ）、ｄｓＲＮＡウイルス（ＲＳＶ、ＭＣＭＶ）、ＬＰＳ（グラム陰性細菌）、Ｆ−タンパク質（ＲＳＶ）、マンナン（カンジダ属）、グリコイノシトールリン脂質（glycoinositolphospholipid）（トリパノソーマ属）、エンベロープタンパク質（ＲＳＶおよびＭＭＴＶ）、フラジェリン（有鞭毛細菌）、フェノール可溶性モジュリン（modulin）（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）、ジアシル化リポペプチド（マイコプラスマ属）、ＬＴＡ（連鎖球菌属）、ザイモサン（サッカロミセス属）、ウイルスｓｓＲＮＡ（インフルエンザ、ＶＳＶ、ＨＩＶ、ＨＣＶ）、ＲＮＡウイルス由来のｓｓＲＮＡ、ｄｓＤＮＡウイルス（ＨＳＶ、ＭＣＭＶ）、ヘモゾイン（プラスモディウム属）および非メチル化ＣｐＧ  ＤＮＡ（細菌およびウイルス）からなる群より選択される病原体関連アゴニストである。一実施形態では、ＴＬＲアゴニストは、Ｐａｍ３Ｃｙｓ、ＣＦＡ、ＭＡＬＰ２、Ｐａｍ２Ｃｙｓ、ＦＳＬ−１、Ｈｉｂ−ＯＭＰＣ、ポリＩ：Ｃ；ポリＡ：Ｕ、ＡＧＰ、ＭＰＬ  Ａ、ＲＣ−５２９、ＭＤＦ２Ｐ、ＣＦＡ、フラジェリン（fiagellin）、ＭＡＬＰ−２、Ｐａｍ２Ｃｙｓ、ＦＳＬ−１、グアノシンアナログ、イミダゾキノリン（例えば、イミキモド、Ａｌｄａｒａ（登録商標）Ｒ８４８、ｅｓｉｑｕｉｍｏｄ（登録商標））、ロキソリビン、イミダゾキノリン、ロキソリビン、ｓｓＰｏｌｙＵ、３Ｍ−０１２およびＣｐＧ−オリゴヌクレオチドからなる群より選択される合成リガンドである。
【０２４９】
一部の実施形態では、アジュバントは、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を含む。顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）は、マクロファージ、Ｔ細胞、マスト細胞、内皮細胞および線維芽細胞によって分泌されるタンパク質である。具体的には、ＧＭ−ＣＳＦは、白血球増殖因子として機能するサイトカインである。ＧＭ−ＣＳＦは、幹細胞を刺激して、顆粒球および単球を産生する。単球は血流から出て組織中に遊走し、引き続いてマクロファージへと成熟する。ＧＭ−ＣＳＦは、抗原提示細胞を動員およびプログラムする能力もまた有する。
【０２５０】
ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、内因性供給源から単離され得、またはｉｎ  ｖｉｖｏもしくはｉｎ  ｖｉｔｒｏで合成され得る。内因性ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、健康なヒト組織から単離される。合成ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、宿主生物または細胞、例えば、哺乳動物または培養ヒト細胞株中への鋳型ＤＮＡのトランスフェクションまたは形質転換後に合成される。あるいは、合成ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）または当該分野で周知の他の方法によって合成される（Sambrook,  J.ら、Molecular  Cloning:  A  Laboratory  Manual.  Cold  Spring  Harbor  Laboratory  Press、NY、第１、２、３巻（１９８９年）、上述の刊行物の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる）。
【０２５１】
ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｖｏのタンパク質安定性を増加させるために改変され得る。あるいは、ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、免疫原性がより高くまたはより低くなるように操作される。ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、組換えである。あるいは、ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドは、哺乳動物ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドのヒト化誘導体である。ＧＭ−ＣＳＦポリペプチドが由来する例示的な哺乳動物種には、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、ヤギ、鳥類、ネコ、イヌ、サルまたは霊長類が含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、ＧＭ−ＣＳＦは、組換えヒトタンパク質（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ、カタログ番号３００−０３）である。他の実施形態では、ＧＭ−ＣＳＦは、組換えネズミ（マウス）タンパク質（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ、カタログ番号３１５−０３）である。さらに別の実施形態では、ＧＭ−ＣＳＦは、組換えマウスタンパク質のヒト化誘導体である。
【０２５２】
一部の実施形態では、アジュバントは、シトシン−グアノシン（ＣｐＧ）オリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列を含み、例えば、アジュバントは、ＣｐＧジヌクレオチドまたはＣｐＧオリゴヌクレオチドを含む。ＣｐＧ部位は、その長さに沿った塩基の直鎖配列中で、システインヌクレオチドがグアニンヌクレオチドの隣に存在するデオキシリボ核酸の領域である（「ｐ」は、それらの間のリン酸結合を示し、それらをシトシン−グアニン相補的塩基対合から識別する）。ＣｐＧ部位は、遺伝子発現をサイレンシングするために細胞が使用するいくつかの内因性機構のうちの１つであるＤＮＡメチル化において、中心的な役割を果たす。プロモーターエレメント内のＣｐＧ部位のメチル化は、遺伝子サイレンシングをもたらし得る。細菌ＤＮＡにおいて見出されるＣｐＧ−ＯＤＮ配列は、抗原提示細胞、例えば樹状細胞の活性化を刺激して特異的Ｔ細胞応答をもたらす、強力な免疫調節剤である。
【０２５３】
本発明のワクチン組成物における使用のためのＣｐＧオリゴヌクレオチドは、内因性供給源から単離され得、またはｉｎ  ｖｉｖｏもしくはｉｎ  ｖｉｔｒｏで合成され得る。内因性ＣｐＧオリゴヌクレオチドの例示的な供給源には、微生物、細菌、真菌、原生生物、ウイルス、カビまたは寄生生物が含まれるがこれらに限定されない。合成ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、宿主生物中への鋳型ＤＮＡのトランスフェクションまたは形質転換後に合成される。あるいは、合成ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）または当該分野で周知の他の方法によって合成される。
【０２５４】
ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、樹状細胞による細胞取込みのために提示される。一実施形態では、ネイキッドＣｐＧオリゴヌクレオチドが、本発明のワクチン組成物において使用される。用語「ネイキッド」は、さらなる置換基を有さない単離された内因性または合成ポリヌクレオチド（もしくはオリゴヌクレオチド）を記述するために使用される。別の実施形態では、ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、細胞取込みの効率を増加させるために、１つまたは複数の化合物に結合される。あるいは、またはさらに、ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、ワクチン組成物および／または樹状細胞内でのオリゴヌクレオチドの安定性を増加させるために、１つまたは複数の化合物に結合される。
【０２５５】
ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、細胞取込み前に凝縮される。一部の実施形態では、ＣｐＧオリゴヌクレオチドは、樹状細胞中への細胞取込みの効率を増加させるカチオン性ポリマーであるポリエチレンイミン（polyethylimine）（ＰＥＩ）を使用して凝縮される。アミン−リッチポリカチオンであるＰＥＩは、ＤＮＡホスフェート基との会合を介してプラスミドＤＮＡを凝縮し、細胞膜会合および細胞中へのＤＮＡ取込みを促進する、小さい正に荷電した凝縮物を生じる（Godbeyら、１９９９年、Proc  Natl  Acad  Sci  USA、９６巻（９号）：５１７７〜８１頁）。
【０２５６】
一部の実施形態では、バイオ薬剤、例えばアジュバントは、固体支持体、例えば、ビーズに連結される。バイオ薬剤は、タンパク質またはペプチドを他の分子とコンジュゲートするための当業者に公知の種々の方法のうちいずれかを使用して、固体支持体の表面にコンジュゲートされ得る。例えば、Hermanson、Bioconjugate  Techniques（第２版、Academic  Press（２００８年））およびNiemeyr、Bioconjugation  Protocols:  Strategies  &  Methods、Methods  In  Molecular  Biology（Humana  Press、２００４年）は、ペプチドを他の分子にコンジュゲートするためのいくつかの方法および技術を提供する。バイオ薬剤は、固体支持体の表面に、共有結合的にまたは非共有結合的にカップリングまたはコンジュゲートされ得る。バイオ薬剤と表面との間の共有結合は、リンカーによっても媒介され得る。バイオ薬剤と表面との間の非共有結合は、イオン性相互作用、ファンデルワールス相互作用、双極子−双極子相互作用、水素結合、静電相互作用および／または形状認識相互作用に基づき得る。
【０２５７】
本発明のワクチン組成物中のバイオ薬剤は、被験体において免疫細胞を動員および／または活性化することが可能である。免疫細胞とは、感染性疾患および外来侵入物の両方に対して身体を保護するように機能する、免疫系の任意の細胞を指す。例示的な免疫細胞には、Ｔ細胞、Ｂ細胞、抗原提示細胞、樹状細胞、マクロファージ、顆粒球、単球、好中球およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が含まれるがこれらに限定されない。
【０２５８】
一部の実施形態では、免疫細胞は抗原提示細胞である。アクセサリー細胞としても公知の抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、それらの表面上に主要組織適合複合体（ＭＨＣ）と複合体化した抗原をディスプレイする細胞である。抗原提示細胞は、抗原をプロセシングし、それらを、免疫系のＴ細胞に提示する。抗原提示細胞は、種々の組織型において見出され得る。マクロファージ、Ｂ細胞および樹状細胞が含まれる古典的な抗原提示細胞は、ＭＨＣクラスＩＩ分子と会合して、外来抗原をヘルパーＴ細胞に提示する。他の細胞型ではあるが、例えば、ＭＨＣクラスＩＩ分子を発現し得るマスト細胞、好塩基球、好酸球およびグループ３生得リンパ球細胞（ＩＬＣ３）もまた、抗原提示細胞として機能し得る（KambayashiおよびLaufer、２０１４年、Nature  Reviews  Immunology  １４巻、７１９〜７３０頁）。抗原提示細胞には、典型的にはＭＨＣクラスＩ分子を使用して、内因性ペプチドを細胞傷害性Ｔ細胞に対して細胞表面上にディスプレイすることが可能な任意の細胞、例えば有核細胞もまた含まれ得る。ＭＨＣファミリーのタンパク質に加えて、抗原提示は、ＡＰＣおよびＴ細胞の両方の表面上の他の特殊化したシグナル伝達分子に依存する。
【０２５９】
抗原提示細胞は、食作用（マクロファージおよび樹状細胞）または受容体媒介性エンドサイトーシス（Ｂ細胞）のいずれかによって抗原を内在化し、抗原をペプチド断片へとプロセシングし、次いで、クラスＩＩ  ＭＨＣ分子に結合したペプチドをそれらの膜上にディスプレイするにあたり、非常に効率的である。Ｔ細胞は、抗原提示細胞の膜上の抗原−クラスＩＩ  ＭＨＣ分子複合体を認識し、それと相互作用する。次いで、さらなる共刺激シグナルが抗原提示細胞によって生成され、Ｔ細胞の活性化をもたらす。共刺激分子およびＭＨＣクラスＩＩの発現は、専門のＡＰＣの決定的な特色である。
【０２６０】
細胞傷害性Ｔ細胞およびヘルパーＴ細胞の両方の機能がＡＰＣに依存するので、抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、有効な適応免疫応答にとって重要である。抗原提示は、適応免疫の特異性を可能にし、細胞内病原体および細胞外病原体の両方に対する免疫応答に寄与し得る。
【０２６１】
本発明のワクチン組成物は、生体材料を含む足場であって、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場をさらに含み得る。したがって、本発明は、生体材料を含む足場であって、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能な足場と；オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物とを含むワクチン組成物もまた提供する。足場は、オプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物またはバイオ薬剤がその上またはその中に会合または付着できる物理的構造を提供する。オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体への送達または投与のために足場内に被包され得、したがって、ワクチン組成物からの病原体のあらゆる望ましくない漏出を防止する。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、本明細書に記載される１つまたは複数のバイオ薬剤をさらに含む。バイオ薬剤は、被験体において免疫細胞を動員および／または活性化することが可能である。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を含む。他の実施形態では、ワクチン組成物は、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列を含む。さらに別の実施形態では、ワクチン組成物は、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）とシトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列との組合せを含む。
【０２６２】
足場は、毒性でも免疫原性でもない生体適合性材料を含む。本明細書で使用する場合、用語「生体適合性材料」とは、被験体の生物学的組織中に移植されるまたは被験体の生物学的組織に隣接して配置される場合に、経時的に、顕著な免疫応答もしくは有害な組織反応、例えば、毒性反応もしくは顕著な刺激を感知できるほどには悪化させず、それを誘導しない、または血液と接触した場合に凝血もしくは血液凝固を誘導しない、任意の材料を指す。
【０２６３】
足場は、身体中で生分解性であり得る。一部の実施形態では、足場組成物は、温度、ｐＨ、水和状態および空隙率、架橋密度、型、および主鎖連結の化学または分解に対する主鎖連結の感受性からなる群より選択される物理的パラメーターに基づいて、所定の速度で分解し、または化学的ポリマーの比率に基づいて所定の速度で分解する。例えば、ラクチドのみから構成される高分子量ポリマーは、数年間、例えば、１〜２年間の期間にわたって分解するが、ラクチドおよびグリコリドの５０：５０混合物から構成される低分子量ポリマーは、数週間、例えば、１、２、３、４、６、１０週間のうちに分解する。高分子量の高グルロン酸アルギネートから構成される、カルシウム架橋されたゲルは、数カ月間（１、２、４、６、８、１０、１２カ月間）〜数年間（１、２、５年間）にわたってｉｎ  ｖｉｖｏで分解するが、低分子量アルギネートおよび／または部分的に酸化されたアルギネートから構成されるゲルは、数週間のうちに分解する。
【０２６４】
本発明における足場としての使用に適切な例示的な生体材料には、グリコサミノグリカン、絹、フィブリン、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリアクリルアミド、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、（ＰＧＡ）、ポリ乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、ポリｅ−カプロラクトン（ＰＣＬ）、ポリエチレンオキシド、ポリフマル酸プロピレン（ＰＰＦ）、ポリアクリル酸（ＰＡＡ）、ポリヒドロキシ酪酸、加水分解されたポリアクリロニトリル、ポリメタクリル酸、ポリエチレンアミン、アルギン酸のエステル；ペクチン酸；およびアルギネート、完全にまたは部分的に酸化されたアルギネート、ヒアルロン酸、カルボキシメチルセルロース、ヘパリン、ヘパリン硫酸、キトサン、カルボキシメチルキトサン、キチン、プルラン、ゲラン、キサンタン、コラーゲン、ゼラチン、カルボキシメチルデンプン、カルボキシメチルデキストラン、コンドロイチン硫酸、カチオン性グアー、カチオン性デンプン、ならびにそれらの組合せが含まれる。ある特定の実施形態では、生体材料は、ポリ（Ｌ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド）酸（ＰＬＧＡ）、メソ多孔性シリカ、クリオゲル、およびそれらの組合せからなる群より選択される。
【０２６５】
一部の実施形態では、足場は、マクロ多孔性ポリ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド（ＰＬＧ）を含む。ＰＬＧ足場を含むワクチン組成物は、被験体中のまたは被験体上の標的部位への投与後、ある期間にわたって、例えば、次の数日間または数週間にわたって、被包された組成物、例えば、オプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物またはバイオ薬剤を徐々に足場から放出することが可能である。したがって、被包された病原体を足場から放出する速度は、時間的な様式で調節され得る。結果として、ワクチン組成物中の病原体によって惹起される免疫応答もまた、時間により制御され得る。
【０２６６】
一部の実施形態では、足場は、メソ多孔性シリカ（ＭＰＳ）を含む。他の実施形態では、足場は、クリオゲルを含む。例えば、国際特許出願公開番号ＷＯ２０１２／１４９３５８Ａ１を参照のこと。上述の特許出願の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２６７】
一部の実施形態では、足場は、非生分解性材料を含む、または身体中での分解に対して耐性である。比較的不変の（分解耐性）足場組成物は、金属ならびにある種のポリマー、例えば、絹およびプラスチックを含む。
【０２６８】
一部の実施形態では、足場、例えばヒドロゲルは、改変された生体材料を含み、例えば、生体材料上の部位は、官能基、例えば、メタクリル酸基（メタクリレート（ＭＡ））またはアクリル酸基（アクリレート）で改変される。メタクリル化の程度は、１％から９０％まで変動され得る。９０％を超えると、化学的改変は、ポリマー水−溶解度の溶解度を低減させ得る。例示的な改変されたヒドロゲルは、ＭＡ−アルギネート（メタクリル化されたアルギネート）またはＭＡ−ゼラチンである。ＭＡ−アルギネートまたはＭＡ−ゼラチンの場合、５０％は、アルギネートまたはゼラチンのメタクリル化の程度に対応する。これは、ひとつおきの反復単位がメタクリル化された基を含むことを意味する。
【０２６９】
本発明の足場における使用のための生体材料は、メタクリル化された基の代わりにアクリル化された基でも改変され得る。したがって、生成物は、アクリル化されたポリマーと呼ばれる。メタクリル化（またはアクリル化）の程度は、ほとんどのポリマーについて変動し得る。さらに、アルギネートまたはゼラチンは、クリック（click）−アルギネートまたはクリック−ゼラチンクリオゲルを生成するためにクリック部分で改変され得（例えば、国際特許出願公開番号ＷＯ２０１５１５４０７８を参照のこと。上述の特許出願の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる）、さらに、クリックアルギネートは、生分解性クリックアルギネートクリオゲルを生成するために、クリックコンジュゲーションの前にアルデヒドを排除するために、酸化され得、アンモニアボランまたは亜塩素酸ナトリウムのいずれかを使用してさらに処理され得る（例えば、国際特許出願番号ＰＣＴ／ＵＳ１６／０５８８６６を参照のこと。上述の特許出願の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる）。
【０２７０】
本発明の足場は、外部表面を含み得る。あるいは、またはさらに、足場は、内部表面を含み得る。本発明の足場の外部または内部表面は、中実または多孔性であり得る。足場の孔サイズは、直径が、約１０ｎｍ未満、約１００ｎｍ〜２０μｍの間、または約２０μｍより大きい、例えば、最大で１０００μｍであり１０００μｍを含むであり得る。例えば、孔は、ナノ多孔性、マイクロ多孔性またはマクロ多孔性であり得る。例えば、ナノ孔の直径は、約１０ｎｍ未満である；マイクロ孔は、直径が約１００μｍ〜２０μｍの範囲であり；マクロ孔は、約２０μｍよりも大きい、例えば、約１００μｍよりも大きい、例えば、約４００μｍよりも大きい、例えば、６００μｍよりも大きいまたは８００μｍよりも大きい。
【０２７１】
一部の実施形態では、本発明の足場は、種々の幾何学的形状（例えば、ディスク、ビーズ、ペレット）、ニッチ、平面状の層（例えば、薄いシート）で組織化される。例えば、直径が約０．１〜２００ミリメートル、例えば、５、１０、２０、４０、５０ミリメートルのディスクが、皮下移植され得る。ディスクは、０．１〜１０ミリメートル、例えば、１、２、５ミリメートルの厚さを有し得る。ディスクは、患者への投与のために、容易に圧縮または凍結乾燥される。皮下投与のための例示的なディスクは、以下の寸法を有する：直径が８ミリメートルおよび厚さが１ミリメートル。一部の実施形態では、足場は、複数の構成要素を含み得る。多構成要素の足場は、任意選択で、その各々が異なる物理的品質、例えば、ポリマーの百分率、ポリマーの架橋の百分率、ヒドロゲルの化学的組成、孔サイズ、空隙率、および孔構造、剛性、靱性、延性、粘弾性によって特徴付けられる同心性層、ならびに／または医薬組成物で構築される。
【０２７２】
一部の実施形態では、足場は、本明細書に記載される１つまたは複数のバイオ薬剤をさらに含む。一部の実施形態では、バイオ薬剤は、足場または足場内の固体構造、例えばビーズに共有結合され、バイオ薬剤を、足場もしくは足場内の固体構造、例えばビーズ中にまたはその上に相対的に固定化して維持する。他の実施形態では、バイオ薬剤は、足場と非共有結合的に会合する。非共有結合には、静電、水素、ファンデルワールスおよび疎水性相互作用が含まれる。一部の実施形態では、足場は、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を含む。他の実施形態では、足場は、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）配列を含む。ある特定の実施形態では、足場は、ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧ−ＯＤＮの両方を含む。
【０２７３】
バイオ薬剤は、表面吸収、物理的固定化を含む当該分野で公知の方法を使用して、例えば、足場材料中に物質を捕捉するために相変化を使用して、足場に添加される。例えば、バイオ薬剤、例えば増殖因子は、水性相または液相中にある間は足場と混合され、環境条件（例えば、ｐＨ、温度、イオン濃度）が変化した後、液体はゲル化または凝固し、それによってバイオ薬剤を捕捉する。あるいは、例えば、アルキル化剤またはアシル化剤を使用する共有結合的カップリングが、規定されたコンフォメーションにある足場上でのバイオ薬剤の安定な長期提示を提供するために使用される。かかる物質の共有結合的カップリングのための例示的な試薬は、以下の表に提供される。バイオ薬剤、例えばタンパク質またはペプチドを足場ポリマーにカップリングするためのアプローチは、HiranoおよびMooney、２００５年、Advanced  Materials、１６巻（１号）：１７〜２５頁で考察されている。他の有用な結合化学には、Hermanson、１９９６年、Bioconjugate  Techniques、１５２〜１８５頁で考察されるものもまた含まれる。
【表Ａ】
2019508418.tif 000002
【０２７４】
足場は、当該分野で公知の方法、例えば、射出成形、事前形成された構造の凍結乾燥、印刷、自己アセンブリ、位相反転、溶媒キャスティング、溶融加工、ガス発泡化、繊維形成／加工、粒状物浸出（particulate  leaching）またはそれらの組合せを使用して、アセンブルされる。次いで、アセンブルされた足場は、本発明のワクチン組成物を調製するために使用される。
【０２７５】
一部の実施形態では、足場は、移植に適切である。例えば、足場は、ポリ−ラクチド−ｃｏ−グリコリド（ＰＬＧ）を使用して調製される。ＰＬＧ足場を含むワクチン組成物は、移植される場合、ワクチン接種後に被験体から容易に除去され得る。例えば、あまりに強い免疫応答または望ましくない副作用がワクチン接種後に開始される場合、移植されたワクチン組成物は、被験体から除去され得る。一部の実施形態では、足場は、注射に適切である。例えば、足場は、マクロ多孔性足場として身体の外側で創出される。孔は崩壊し、ゲルは非常に小さくなり、針を通り抜けることができるので、足場は身体中に注射され得る。例えば、ＷＯ１２／１４９３５８；およびBencherifら  Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA  １０９巻．４８号（２０１２年）：１９５９０〜５頁を参照のこと。上述の参考文献の各々の全内容は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２７６】
本発明のワクチン組成物は、１つの型の病原体を含み得、または複数の型の病原体、例えば、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０もしくはそれよりも多くの型の病原体を含み得る。ワクチン組成物は、本明細書に記載される、抗原を認識し、抗原提示を増強するように免疫細胞をプログラムする、１つまたは複数の型のアジュバントもまた含み得る。
【０２７７】
本発明のワクチン組成物は、全身投与、例えば、経腸投与（例えば、経口、頬側、舌下もしくは直腸）または非経口投与（例えば、静脈内、動脈内、骨内、筋肉内、脳内、脳室内、髄腔内もしくは皮下（subcutaneously））され得る。本発明のワクチン組成物の投与の他の適切な様式には、皮下（hypodermal）、腹腔内、眼内、鼻腔内、経皮（transdermal）（例えば、皮膚パッチを介して）、硬膜外、頭蓋内、経皮（percutaneous）、腟内、子宮内、硝子体内もしくは経粘膜投与、または注射もしくは移植を介した投与が含まれる。
【０２７８】
実施例に示されるように、本明細書に記載されるワクチン組成物によれば、マウスにおけるワクチン組成物の皮下移植または注射は、致死用量の細菌感染症からマウスを首尾よく保護した。具体的には、本発明のワクチン組成物で免疫化したマウスは、対照マウスと比較した場合、顕著に延長された生存時間および種々の臓器における病原体の顕著に低減された力価を示した。したがって、一部の実施形態では、ワクチン組成物は、移植、例えば、皮下移植に適切である。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における注射に適切である。ある特定の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における経口投与に適切である。例えば、ワクチン組成物は、経口投与のための丸剤、錠剤、カプセル、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末、エマルジョンまたは水溶液の形態であり得る。
【０２７９】
本発明のワクチン組成物は、ほんの１回の単一の投与が、標的化された病原体に対する持続性の免疫応答、例えば、抗体媒介性および／または細胞媒介性免疫応答を惹起するのに十分であるという点で、既存のワクチンを超える明確な利点を有する。実際、実施例１に示されるように、単一用量の本発明のワクチン組成物は、少なくとも９０日間の期間にわたる細菌チャレンジから、ワクチン接種したマウスを保護できる。
【０２８０】
さらに、ワクチン組成物は、移植後に被験体から容易に除去され得るという点で、当該分野で利用可能なワクチンを超える、別の顕著な利点を付与する。例えば、あまりに強い免疫応答または望ましくない副作用が、被験体がワクチン組成物を受けた後に開始される場合、ワクチン組成物、例えばＰＬＧ足場ワクチン組成物は、被験体から容易に除去され得る。対照的に、現在の既存のワクチンは、いったん被験体に注射されると除去できない。
【０２８１】
本発明のワクチン組成物は、高度に安定であり、携帯可能であり、冷蔵の必要なしに室温において貯蔵されることが可能である。凍結乾燥すると、ワクチン組成物は、約１日〜約１年間、例えば、約１０日間〜約１年間、約３０日間〜約１年間、約２カ月間〜約１年間、約３カ月間〜約１年間、約４カ月間〜約１年間、約５カ月間〜約１年間、約６カ月間〜約１年間、約７カ月間〜約１年間、約８カ月間〜約１年間、約９カ月間〜約１年間、約１０カ月間〜約１年間の貯蔵寿命を有し得る。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、少なくとも１年間、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０年間の貯蔵寿命を有する。
【０２８２】
本発明のワクチン組成物は、公知のおよび未知の両方の病原体、他の生体液内に存在する病原体、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物中に存在する病原体を含む、感染性疾患を有する患者由来の血液試料中を循環する病原体の、迅速かつ直接的な単離を可能にし、したがって、従来の抗生物質治療と比較して、免疫応答を大きく増加させる。特許請求されるワクチン組成物は、単離および精製が困難な病原体に対しても使用され得る。本発明のワクチン組成物は、既存のワクチンを超えるさらなる改善もまた有する。例えば、特許請求されるワクチン組成物を使用するワクチン接種は、ワクチン組成物の有効性を損なうことなく、より制御され、局在化されたより安全な様式で行われ得る。特許請求されるワクチンの改善された安定性は、これらのワクチンを携帯可能にし、冷蔵の必要なしに室温での長期貯蔵に使用されるのを可能にする。さらに、ワクチン組成物は、１つよりも多い型の病原体が組成物中に含まれる場合には、多価ワクチンであり得、所与の病原体の異なる種または株に対してワクチン接種するためにも使用され得る。これらの改善は、現在の病原体ワクチンの主要な制限を回避し、例えば、発展途上国の集団について、特に流行の期間の間、公衆にとって大きな関心事であり、または容易に入手可能なワクチンが高度に所望される軍事使用にとって大きな価値がある。例えば、病原体は、感染性疾患を有するまたは感染性疾患を有する危険性がある被験体、例えばヒトから、操作されたレクチン、例えば、操作されたＭＢＬを使用して、直接的かつ迅速に単離され得、抗生物質処理によって中和され得、足場組成物、例えばＰＬＧ足場中に取り込まれ得、次いで、感染性疾患を処置するために、同じヒト被験体に戻して投与または異なるヒト被験体に投与され得る。あるいは、ワクチン組成物は、凍結乾燥され得、約１日〜約１年間にわたって室温で貯蔵され得、次いで、ワクチン組成物内の病原体または病原体断片に対する免疫応答を誘導するために被験体に投与され、それによって、感染性疾患を処置し得る。特に、感染性疾患を処置するためまたは感染性病原体の伝播を予防するための輪状ワクチン接種（ring  vaccination）が高度に所望される場合、これは非常に有益である。本発明のワクチン組成物は、容易に入手可能になり得、次いで、感染個体、または感染群と接触するもしくは感染する危険性がある任意の他の個体に投与され得る。
【０２８３】
本発明は、安定な足場組成物もまた提供する。安定な足場組成物は、生体材料を含み、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能であり、足場は、凍結乾燥され、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。
【０２８４】
別の態様では、本発明は、安定なオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を提供する。オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、オプソニンまたはレクチンに結合した、被験体に由来する病原体またはその断片を含み、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、凍結乾燥され、約３０日間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。
【０２８５】
さらに別の態様では、本発明は、足場組成物を提供する。足場組成物は、生体材料を含み、被験体において免疫細胞を動員し活性化することが可能であり、足場は、固体支持体、例えばビーズ、例えば磁性ビーズを含み、固体支持体は、病原体の付着に適切である。本発明の足場組成物は、安定であり、例えば、戦争の間または大流行の間に容易に入手可能であり得る。本明細書に記載される、被験体において感染性疾患を誘導することが可能な任意の病原体または病原体断片は、ワクチン組成物を生成するために、本発明の足場組成物中に導入され得る。病原体または病原体断片は、例えば、被験体、例えばヒトの試料から、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物から単離されると、本発明の足場組成物中に導入され得、次いで、足場組成物中に取り込まれ得、次いで、感染性疾患を処置するために被験体に投与され得る。これらの足場組成物は、例えば、流行の期間の間、非常に有用であり高度に望ましく、または容易に入手可能なワクチンが高度に所望される軍事使用にとって大きな価値がある。
【０２８６】
ＩＩＩ．製剤
本発明のワクチン組成物は、種々の疾患、例えば、感染性疾患の処置および予防を目的として、直接使用され得る。本発明のワクチン組成物は、１つまたは複数の生理的に許容される担体または賦形剤を使用して製剤化され得る。例えば、組成物が液体として製剤化される場合、これは、無菌食塩水、デキストロース溶液、もしくは緩衝溶液、または他の薬学的に許容される無菌流体を含み得る。一部の実施形態では、製剤は、皮内（intradermal）または皮下投与のためである。一部の実施形態では、製剤は、吸入または送気（口または鼻のいずれかを介した）のためである。一部の実施形態では、製剤は、経口、頬側、非経口、腟または直腸投与のためである。用語非経口には、本明細書で使用する場合、皮下、皮内（intracutaneous）、静脈内、筋肉内、関節内、動脈内、滑液包内、胸骨内、髄腔内、病変内および頭蓋内の注射または注入技術が含まれる。一部の実施形態では、製剤は、移植のためである。
【０２８７】
好ましくは、ワクチン組成物は、貯蔵および輸送の間のオプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物またはバイオ薬剤の増加した化学的安定性を提供するために製剤化される。例えば、一実施形態では、製剤は、タンパク質のオリゴマー化または凝集を防止するまたは低減させる。別の例では、製剤は、アミノ酸残基の酸化を防止するまたは低減させる。製剤は、凍結乾燥された製剤または液体製剤であり得る。凍結乾燥された製剤は、約１日〜約１年間、例えば、約１０日間〜約１年間、約３０日間〜約１年間、約２カ月間〜約１年間、約３カ月間〜約１年間、約４カ月間〜約１年間、約５カ月間〜約１年間、約６カ月間〜約１年間、約７カ月間〜約１年間、約８カ月間〜約１年間、約９カ月間〜約１年間、約１０カ月間〜約１年間の貯蔵寿命を有する。一部の実施形態では、製剤は、少なくとも１年間、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０年間の貯蔵寿命を有する。
【０２８８】
一部の実施形態では、ワクチン組成物は、注射のために製剤化される。ある特定の実施形態では、ワクチン組成物は、混入する細胞材料、化学物質、ウイルスまたは毒素を実質的に含まない、無菌の凍結乾燥された製剤である。特定の実施形態では、注射のための製剤は、無菌の単一の投薬容器中で提供される。製剤は、添加された防腐剤を含んでも含まなくてもよい。液体製剤は、油性または水性ビヒクル中の懸濁物、溶液またはエマルジョンのような形態を取り得、懸濁剤、安定化剤および／または分散剤などの製剤化剤（formulatory  agent）を含み得る。
【０２８９】
一実施形態では、製剤はリポソームを含む。一実施形態では、本発明のワクチン組成物は、感染性疾患の処置のために使用される１つまたは複数の他の治療剤と共に製剤化される。
【０２９０】
本発明のワクチン組成物は、医薬組成物として製剤化され得、１つまたは複数の薬学的に許容される担体、添加剤またはビヒクルを含み得る。一実施形態では、１つまたは複数の薬学的に許容される担体、添加剤またはビヒクルは、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、自己乳化型薬物送達系（ＳＥＤＤＳ）、例えば、ｄ−Ｉ−トコフェロールポリエチレングリコール１０００スクシネート、医薬投薬形態において使用される界面活性剤、例えば、Ｔｗｅｅｎまたは他の類似のポリマー性送達マトリックス、血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミン、緩衝物質、例えば、リン酸塩、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩または電解質、例えば、硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロースベースの物質、ポリエチレングリコール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン−ポリオキシプロピレン−ブロックポリマー、ポリエチレングリコールおよび羊毛脂からなる群より選択される。シクロデキストリンもまた、本明細書に記載される製剤の化合物の送達を増強するために有利に使用され得る。本発明のワクチン組成物は、製剤化された化合物またはその送達形態の安定性を増強するために、薬学的に許容される酸、塩基または緩衝液もまた含み得る。
【０２９１】
一部の実施形態では、本発明のワクチン組成物は、吸入および／または経鼻投与のための溶液または粉末の形態である。かかる組成物は、適切な分散剤または湿潤剤（例えば、Ｔｗｅｅｎ  ８０など）および懸濁剤を使用して、当該分野で公知の技術に従って製剤化され得る。無菌の注射可能な調製物はまた、非毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の無菌の注射可能な溶液または懸濁物、例えば、１，３−ブタンジオール中の溶液であり得る。使用され得る許容されるビヒクルおよび溶媒のうちでは、マンニトール、水、リンゲル溶液および等張塩化ナトリウム溶液である。さらに、無菌の不揮発性油は、溶媒または懸濁媒として、従来から使用されている。この目的のために、合成モノグリセリドまたはジグリセリドが含まれる任意の無刺激の（bland）不揮発性油が使用され得る。脂肪酸、例えば、オレイン酸およびそのグリセリド誘導体は、注射剤の調製において有用である。これらの油溶液または懸濁物は、エマルジョンおよび／または懸濁物などの薬学的に許容される投薬形態の製剤化において一般に使用される、長鎖アルコール希釈剤もしくは分散剤、またはカルボキシメチルセルロースもしくは類似の分散剤もまた含み得る。薬学的に許容される固体、液体または他の投薬形態の製造において一般に使用される、他の一般に使用される界面活性剤、例えば、ＴｗｅｅｎもしくはＳｐａｎおよび／または他の類似の乳化剤もしくはバイオアベイラビリティ増強剤もまた、製剤化を目的として使用され得る。
【０２９２】
一部の実施形態では、本発明のワクチン組成物は、固体薬物、例えば、丸剤、錠剤、顆粒、軟質ゲル、チュアブル剤、粉末およびカプセル；液体薬物、例えば、エマルジョンならびに水性の懸濁物、分散物および溶液；吸入剤および凍結乾燥された薬物が含まれるがこれらに限定されない、経口的に許容される投薬形態の形態である。経口使用のための錠剤の場合、一般に使用される担体には、ラクトースおよびトウモロコシデンプンが含まれる。ステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤もまた、典型的には添加される。カプセル形態での経口投与のために、有用な希釈剤には、ラクトースおよび乾燥トウモロコシデンプンが含まれる。水性懸濁物および／またはエマルジョンが経口投与される場合、活性成分は、乳化剤および／または懸濁剤と組み合わせて、油相中に懸濁または溶解され得る。所望の場合、ある特定の甘味剤および／または矯味矯臭剤および／または着色剤が添加され得る。これらの薬物は、従来の薬学的実施によって調製され得る。
【０２９３】
ＩＶ．本発明の方法
本発明のワクチン組成物は、種々の疾患、例えば、感染性疾患の予防および処置に有用である。本明細書に提示される実施例に示されるように、本発明のワクチン組成物、例えば、ＰＬＧまたはＭＰＳ足場内にＣｐＧおよびＧＭ−ＣＳＦアジュバントと共にレクチン結合病原体構築物を含むワクチンによるマウスの免疫化は、致死用量の細菌からマウスを首尾よく保護し、対照と比較した場合、ワクチン接種したマウスにおいて、顕著に延長された生存時間および種々の臓器における病原体の低減された力価を生じる。
【０２９４】
したがって、本発明は、一態様では、それを必要とする被験体において病原体感染症を処置するための方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、被験体において病原体感染症を処置するステップを含む。
【０２９５】
別の態様では、本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するステップを含む。
【０２９６】
本発明は、それを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法もまた提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における抗生物質耐性細菌に対して特異的である。
【０２９７】
本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法をさらに提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、被験体において病原体のレベルを減少させるステップを含む。一部の実施形態では、病原体のレベルは、被験体の臓器において減少される。一部の実施形態では、臓器は、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される。
【０２９８】
別の態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、被験体の生存率を増加させるステップを含む。
【０２９９】
一態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させるステップを含む。
【０３００】
別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載されるワクチン組成物を投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させるステップを含む。
【０３０１】
一部の実施形態では、被験体は、感染性疾患に罹患している、または感染性疾患を有する危険性がある。感染性疾患は、病原性微生物、例えば、細菌、ウイルス、寄生生物または真菌によって引き起こされる。これらの疾患は、ある人から別の人へと、直接的または間接的に伝播し得る。感染性疾患は、動物からヒトへも伝染し得る。
【０３０２】
本発明のワクチン組成物で予防的または治療的に処置され得る感染性疾患には、結核、麻疹（measles）、髄膜炎菌性髄膜炎、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、チクングニア、マラリア、プラーク（plaque）、ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、肺炎、ライノウイルス疾患、春夏髄膜脳炎（ＳＳＭＥ）、風疹、灰白髄炎、狂犬病、Ａ型肝炎、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、Ｅ型肝炎、ブルーリ潰瘍、エボラウイルス疾患、黄熱病、デング疾患、トラコーマ、シャーガス病、インフルエンザ、天然痘、トリインフルエンザ、コレラ、地中海熱、波状熱、マルタ熱、伝染性流産（contagious  abortion）、動物間流行性流産（epizootic  abortion）、バング病、サルモネラ食中毒、腸パラチフス（enteric  paratyphosis）、細菌性赤痢、仮性結核症、ペスト、伝染性熱（pestilential  fever）、Ｖｉｂｒｉｏ、旋回病（Circling  disease）、ワイル病、出血性黄疸（Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａ  ｉｃｔｅｒｏｈａｅｍｏｒｒｈａｇｉａｅ）、カニコラ熱（Ｌ．ｃａｎｉｃｏｌａ）、酪農従事者熱（dairy  worker  fever）（Ｌ．ｈａｒｄｊｏ）、回帰熱、ダニ媒介性回帰熱、スピロヘータ性熱（spirochetal  fever）、浮浪者熱（vagabond  fever）、飢餓熱（famine  fever）、ライム関節炎、バンウォース症候群（Bannworth's  syndrome）、ダニ媒介性髄膜多発神経炎（tick-borne  meningopolyneuritis）、慢性遊走性紅斑、ビブリオ症、大腸菌症（Colibacteriosis）、colitoxe  ia、白痢（white  scour）、ブタの腸浮腫、腸パラチフス、ブドウ球菌性食事性中毒症（alimentary  toxicosis）、ブドウ球菌性胃腸炎、イヌコロナウイルス（ＣＣＶ）またはイヌパルボウイルス腸炎、ネコ伝染性腹膜炎ウイルス、伝染性胃腸炎（ＴＧＥ）ウイルス、ハガーマン・レッドマウス病（Hagerman  Redmouth  Disease）（ＥＲＭＤ）、伝染性造血器壊死症（ＩＨＮ）、ブタＡｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ）胸膜肺炎、ハンセン病、ストレプトトリックス症（Streptotrichosis）、ヒツジの真菌性皮膚炎（Mycotic  Dermatitis）、偽鼻疽（Pseudoglanders）、ウィットモア病（Whitmore's  disease）、フランシス病（Francis'  disease）、アブ熱（deer-fly  fever）、ウサギ熱、大原病（O'Hara  disease）、ストレプトバシラス熱（Streptobacillary  fever）、ヘーヴァヒル熱（Haverhill  fever）、流行性関節炎紅斑（epidemic  arthritic  erythema）、鼡毒、輸送熱（Shipping  or  transport  fever）、出血性敗血症、オルニトーシス、オウム病、クラミジア症、北アメリカブラストミセス症、シカゴ病、ギルクリスト病、ネコひっかき病、良性リンパ細網内症、良性非細菌性リンパ節炎、杆菌性血管腫症状、細菌性肝臓紫斑病、不明熱（Query  fever）、バルカンインフルエンザ（Balkan  influenza）、バルカンインフルエンザ（Balkan  grippe）、屠殺場熱（abattoir  fever）、ダニ媒介性熱、肺リケッチア症（pneumorickettsiosis）、アメリカダニチフス、ダニ媒介性発疹チフス（Tick-borne  Typhus  Fever）、リケッチア痘症、キューガーデンズ紅斑熱（Kew  Gardens  Spotted  Fever）、ノミ媒介性発疹チフス、地方病性発疹チフス（Endemic  Typhus  Fever）、都市チフス、白癬（Ringworm）、皮膚糸状菌症、白癬（Tinea）、白癬症（Trichophytosis）、微胞子虫症（Microsporosis）、いんきんたむし、みずむし、Ｓｐｏｒｏｔｈｒｉｘ  ｓｃｈｅｎｃｋｉｉ、二形性真菌、クリプトコッカス症およびヒストプラスマ症、良性表皮性サル痘（Benign  Epidermal  Monkeypox）、ＢＥＭＰ、サルヘルペスウイルス、サルＢ病（Simian  B  Disease）、Ｃ型嗜眠性脳炎、黄熱病、黒色嘔吐（Black  Vomit）、ハンタウイルス肺症候群、韓国型出血熱、流行性腎症、流行性出血熱、出血性腎症性腎炎（Hemorrhagic  Nephrosonephritis）、リンパ球性脈絡髄膜炎、カリフォルニア脳炎／ラクロス脳炎、アフリカ出血熱、ミドリザル病（Green  or  Vervet  Monkey  Disease）、恐水病、リッサ、感染性肝炎、流行性肝炎、流行性黄疸、麻疹（Rubeola）、麻疹（Morbilli）、ブタおよびウマインフルエンザ、家禽ペスト（Fowl  Plague）、ニューカッスル病、ピロプラズマ症、トキソプラズマ症、アフリカ睡眠病、ガンビアトリパノソーマ症、ローデシアトリパノソーマ症、シャーガス病、シャーガス・マッツァ病（Chagas-Mazza  Disease）、南アメリカトリパノソーマ症、Ｅｎｔａｍｏｅｂａ  ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃａ、バランチジウム腸炎、クリプトスポリジウム症、ジアルジア鞭毛虫症、微胞子虫症（Microsporidiosis）、アニサキス症、旋毛虫症、住血線虫症、好酸球性髄膜炎または髄膜脳炎（Ａ．ｃａｎｔｏｎｅｎｓｉｓ）、腹部住血線虫症（abdominal  angiostrongylosis）（Ａ．ｃｏｓｔａｒｉｃｅｎｓｉｓ）、鉤虫症（Uncinariasis）、アメリカ鉤虫症、鉤虫症（Hookworm  Disease）、毛頭虫症、糸状虫症（Brugiasis）、トキソカラ症、腸結節虫症、糞線虫症、毛様線虫症、回虫症、裂頭条虫症、孤虫症、包虫症（Hydatidosis）、包虫症（Hydatid  Disease）、Ｅｃｈｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｒａｎｕｌｏｓｕｓ、嚢胞性包虫症（Cystic  hydatid  disease）、条虫症、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａなどが含まれるがこれらに限定されない。
【０３０３】
感染性病原体によって引き起こされる悪性疾患もまた、本発明のワクチン組成物を使用して処置され得る。かかる疾患の例には、ＥＢＶによって引き起こされるバーキットリンパ腫、ラウスレトロウイルスによって引き起こされるラウス肉腫、ヘルペスウイルス８型によって引き起こされるカポジ肉腫、ＨＴＬＶ−Ｉレトロウイルスによって引き起こされる成人Ｔ細胞白血病、またはＨＴＬＶ−ＪＪによって引き起こされるヘアリー細胞白血病、ならびに感染性因子およびウイルスによって引き起こされる多くの他の腫瘍および白血病が含まれるがこれらに限定されない。
【０３０４】
さらに、未知の病原体によって引き起こされる疾患、特に、悪性疾患または免疫学的疾患は、本発明のワクチン組成物を使用して処置または予防され得る。これらの疾患の非限定的な例は、白血病、例えば、急性白血病、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、例えば、骨髄芽球性、前骨髄球性、骨髄単球性、単球性、赤白血病、慢性白血病、例えば、慢性骨髄性白血病または顆粒球性白血病、慢性リンパ性白血病、真性赤血球増加症、セザリー細胞白血病（Sezary  cell  leukemia）、リンパ腫、ホジキン病、非ホジキン病、多発性骨髄腫、ワルデンストレーム高ガンマグロブリン血症、重鎖病、固形腫瘍、例えば、肉腫および癌腫、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫（endotheliosarcoma）、リンパ管肉腫、カポジ肉腫、リンパ管内皮肉腫（lymphangioendotheliosarcoma）、滑膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、膵がん、乳がん、卵巣がん、前立腺がん、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、ヘパトーマ、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胎生期癌、ウィルムス腫瘍、子宮頸がん、子宮がん、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経腫瘍、乏突起神経膠腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽腫、網膜芽細胞腫、菌状息肉症またはパジェット様細網症を含む。
【０３０５】
一部の実施形態では、本発明の方法によって処置可能な感染性疾患は、慢性感染性疾患である。一部の実施形態では、本発明の方法によって処置可能な感染性疾患は、急性感染性疾患である。
【０３０６】
本発明の方法は、別々に、または治療レジメンもしくは組合せ治療の一部として、ワクチン組成物を投与するステップを含み得る。用語「投与する（administer）」、「投与すること（administering）」または「投与」とは、本明細書で使用する場合、形態にかかわらず、本発明のワクチン組成物を移植、吸収、摂取、注射または吸入することを指す。一部の実施形態では、単回投与の本発明のワクチン組成物が、本明細書に記載される方法にとって十分である。単一用量の本発明のワクチン組成物は、感染病原体に対する持続性の免疫応答、例えば、抗体媒介性および／または細胞媒介性免疫応答を生じ得る。他の実施形態では、ワクチン組成物は、例えばプライム−ブースト戦略で、複数回の投与で投与され得る。一部の実施形態では、先のプライミング免疫化で与えられる同じワクチンが、引き続くブースト免疫化に使用される。他の実施形態では、プライム−ブーストは、同じ抗原を含む異なる型のワクチンを用いて実施され得る。一部の実施形態では、本発明のワクチン組成物が時間ゼロにおいて投与され、第２の本発明のワクチン組成物が、一定期間、例えば、１０〜３０日間、１０〜６０日間または１０〜１００日間の後に投与される。
【０３０７】
現在開発されているワクチンは通常、ワクチンが成功するために、複数回の免疫化を必要とする。小児科集団について、誕生後の最初の６カ月の間に３回与えられ、その後１歳時に４回目の用量が与えられ、４歳と６歳との間に最後のブーストが与えられるジフテリア・破傷風・百日咳（ＤＴＰ）ワクチンの場合のように、最大で５回の免疫化が必要とされ得る。さらに、人の一生を通じて１０年毎のブーストが推奨される破傷風・ジフテリア（Ｔｄ）ワクチンなど、ワクチンの一部は、完全な免疫化シリーズを既に受けた成人においてさえもさらなるブーストを必要とする。複数回の免疫化（即ち、「プライム−ブースト」）が最も首尾よいワクチンについても重要であることが、十分に受け入れられている。この原理は、弱毒生ワクチン（例えば、経口ポリオワクチン）、不活化ワクチン（例えば、Ａ型肝炎ワクチン）、組換えタンパク質サブユニットワクチン（例えば、Ｂ型肝炎ワクチン）および多糖ワクチン（例えば、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ  Ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ  ｂ型ワクチン）に当てはまる。しかし、本発明のワクチン組成物は、ほんの１回の単一の投与が、本明細書に記載される方法にとって十分であるという点で、既存のワクチンを超える明確な利点を有する。実際、実施例１に示されるように、単一用量の本発明のワクチン組成物は、長期免疫応答を首尾よく付与し、９０日間の期間にわたる細菌チャレンジから、ワクチン接種したマウスを保護する。
【０３０８】
一部の実施形態では、１つまたは複数の本発明のワクチン組成物が、１つまたは複数の部位において被験体に投与される。好ましくは、各部位は、リンパ節またはリンパ節の群に流れる。一部の実施形態では、部位は、右腕、左腕、右大腿、左大腿、右肩、左肩、右胸、左胸、腹部、右臀部および左臀部からなる群より選択される。一部の実施形態では、部位は、扁桃、咽頭扁桃、虫垂およびパイエル板からなる群より選択されるリンパ組織の非被包性クラスターである、またはそれに流れる。一部の実施形態では、本発明のワクチン組成物は、脾臓に流れる部位に投与される。
【０３０９】
投与の任意の適切な経路、例えば、皮内（intradermal）、皮下、静脈内、筋肉内または粘膜が、本発明の方法によって包含される。粘膜経路の投与には、経口、直腸、腟および経鼻投与が含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、経皮、皮内、皮下、経口、直腸、腟で、または吸入によって投与される。他の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体中に移植される。
【０３１０】
ワクチン組成物が足場の形態である場合、被験体をワクチン接種する方法は、被験体において足場組成物を注射または移植するステップ、好ましくは皮下移植するステップを含む。ある特定の実施形態では、被験体をワクチン接種する方法は、被験体の解剖学的構造の１つまたは複数の領域において足場ワクチン組成物を移植または注射するステップを含み得る。
【０３１１】
本明細書に開示される方法は、広範な被験体に適用され得る。一部の実施形態では、被験体は、哺乳動物、例えば、ヒト、胚、ウマ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、魚類、両生類、爬虫類、ヤギ、鳥類、サル、マウス、ウサギおよびラットである。他の実施形態では、被験体はヒトである。ある特定の実施形態では、被験体は胚である。
【０３１２】
用語「処置する（treat）」または「処置すること（treating）」とは、本明細書で使用する場合、被験体が罹患している感染性疾患または状態を部分的または完全に軽減、阻害、好転および／または救済することを指す。一部の例では、処置は、被験体が疼痛または窮迫などを罹患している感染性疾患または状態の、継続した非存在を生じ得る。
【０３１３】
一部の例では、処置方法は、被験体が罹患している感染性疾患または状態の予防または処置に必要とされる、単一の投与、複数回の投与および反復投与を含み得る。一部の場合、処置方法は、処置前、処置の間および／または処置後に、被験体における疾患のレベルを評価するステップを含み得る。一部の例では、処置は、被験体における疾患のレベルの減少が検出されるまで、継続し得る。
【０３１４】
本明細書の方法は、所望のまたは記載された効果、例えば、被験体からの感染性病原体の排除を達成するための、有効量のワクチン組成物の投与を含み、それによって、感染性疾患を処置する。任意の特定の患者についての具体的な投薬量および処置レジメンは、使用される具体的な化合物の活性、年齢、体重、全体的な健康状態、性別、食餌、投与の時間、排泄の速度、薬物の組合せ、疾患、状態または症状の重症度および過程、疾患、状態または症状に対する患者の素因、ならびに処置をする医師の判断を含む種々の因子に依存する。
【０３１５】
投与後、被験体は、感染性疾患のレベルを検出、評価または決定するために評価され得る。一部の例では、処置は、被験体における感染性疾患のレベルの変化、例えば低減が検出されるまで、継続し得る。
【０３１６】
患者の状態の改善、例えば、被験体における疾患のレベルの変化、例えば減少の際に、維持用量の本発明のワクチン組成物が、必要に応じて投与され得る。引き続いて、投薬量もしくは投与の頻度またはそれら両方が、改善された状態が保持されるレベルまで、症状の関数として低減され得る。しかし、患者は、疾患症状の任意の再発の際に、長期の間欠的処置を必要とし得る。
【０３１７】
一部の実施形態では、本発明のワクチン組成物の有効量は、感染性疾患もしくは状態を有する被験体においてその感染性疾患もしくは状態の重症度を低減させるのに十分な量、またはその１つもしくは複数の症状の重症度を低減もしくは好転させるのに十分な量、または感染性疾患もしくは状態の進行を予防するのに十分な量、または本発明のワクチン組成物と同時発生的に、その前にもしくはその後に投与される別の治療もしくは治療剤の治療効果（複数可）を増強もしくは改善するのに十分な量である。
【０３１８】
感染性疾患の症状は、当業者に周知である。感染性疾患の例示的な徴候および症状には、発熱、下痢、疲労、筋痛、咳、鼻水、充血した目および涙目、疼痛、窮迫、食欲の喪失、悪心、腹部不快感、脱力、体重減少、ならびに発疹が含まれるがこれらに限定されない。
【０３１９】
一部の実施形態では、本発明のワクチン組成物の有効量は、本発明のワクチン組成物の病原体または病原体断片のうち１つまたは複数に対する抗体分泌性Ｂ細胞または細胞傷害性Ｔ細胞媒介性の免疫応答を生じさせるのに十分な量である。本発明のワクチン組成物が免疫応答を惹起する能力は、当業者にとって利用可能な任意の慣用的な方法を使用して決定され得る。一部の実施形態では、各組成物の有効量は、被験体において、例えば、混合リンパ球Ｔ細胞アッセイによって測定される細胞傷害性Ｔ細胞応答を生じさせるのに十分な量である。
【０３２０】
一部の実施形態では、被験体に投与される、または被験体の特定の部位において投与されるワクチン組成物の有効量は、１ピコグラム〜１０００マイクログラムの、組成物の１つまたは複数の病原体または病原体断片を送達する量である。
【０３２１】
一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、約１ｐｇ〜約１０００μｇである。一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１μｇ〜１００μｇ、１μｇ〜２００μｇ、１μｇ〜３００μｇ、１μｇ〜４００μｇ、１μｇ〜５００μｇ、１μｇ〜６００μｇ、１μｇ〜７００μｇ、１μｇ〜８００μｇまたは１μｇ〜９００μｇである。一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１μｇ〜１０μｇ、１μｇ〜２０μｇ、１μｇ〜３０μｇ、１μｇ〜４０μｇ、１μｇ〜５０μｇ、１μｇ〜６０μｇ、１μｇ〜７０μｇ、１μｇ〜８０μｇまたは１μｇ〜９０μｇである。一部の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１ｐｇ〜１００μｇ、１ｐｇ〜９０μｇ、１ｐｇ〜８０μｇ、１ｐｇ〜７０μｇ、１ｐｇ〜６０μｇ、１ｐｇ〜５０μｇ、１ｐｇ〜４０μｇ、１ｐｇ〜３０μｇ、１ｐｇ〜２０μｇまたは１ｐｇ〜１０μｇである。他の実施形態では、病原体または病原体断片の量は、１０ｐｇ〜１μｇ、２０ｐｇ〜１μｇ、３０ｐｇ〜１μｇ、４０ｐｇ〜１μｇ、５０ｐｇ〜１μｇ、６０ｐｇ〜１μｇ、７０ｐｇ〜１μｇ、８０ｐｇ〜１μｇ、９０ｐｇ〜１μｇ、１００ｐｇ〜１μｇ、１０００ｐｇ〜１μｇである。
【０３２２】
本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症を処置するための方法もまた提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、被験体において病原体感染症を処置するステップを含む。
【０３２３】
別の態様では、本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種する方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するステップを含む。
【０３２４】
一態様では、本発明は、それを必要とする被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置する方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、被験体において抗生物質耐性細菌感染症を処置するステップを含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、被験体における抗生物質耐性細菌に対して特異的である。
【０３２５】
別の態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体において病原体のレベルを減少させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、被験体において病原体のレベルを減少させるステップを含む。一部の実施形態では、病原体のレベルは、被験体の臓器において減少される。一部の実施形態では、臓器は、肺、肝臓、腎臓および脾臓からなる群より選択される。
【０３２６】
一態様では、本発明は、病原体感染症を有する被験体の生存率を増加させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、被験体の生存率を増加させるステップを含む。
【０３２７】
別の態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する窮迫のレベルを低減させるステップを含む。
【０３２８】
さらなる態様では、本発明は、それを必要とする被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させる方法を提供する。これらの方法は、本明細書に記載される足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を投与し、それによって、被験体において病原体感染症と関連する疼痛のレベルを低減させるステップを含む。
【０３２９】
一部の実施形態では、足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物は、被験体に同時に投与される。他の実施形態では、足場組成物は、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物とは別に、例えば、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物の前または後に、被験体に投与される。
【０３３０】
本発明は、ワクチンを産生する方法もまた提供する。これらの方法は、病原体またはその断片を含む試料を、オプソニンまたはレクチンと接触させるステップであって、オプソニンまたはレクチンが、試料中の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；試料からオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を単離するステップ；およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を、被験体において免疫細胞を動員することが可能なバイオ薬剤と組み合わせ、それによって、ワクチンを産生するステップを含む。
【０３３１】
別の態様では、本発明は、ワクチンを産生する方法であって、病原体またはその断片を含む試料を、オプソニンまたはレクチンと接触させるステップであって、オプソニンまたはレクチンが、試料中の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；試料からオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および単離されたオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を足場と組み合わせ、それによって、ワクチンを産生するステップを含む方法を提供する。
【０３３２】
さらに別の態様では、本発明は、ワクチンを産生する方法であって、オプソニンまたはレクチンを被験体に投与するステップであって、オプソニンまたはレクチンが、被験体由来の病原体またはその断片に結合することが可能であり、それによって、オプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を形成する、ステップ；被験体からオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を単離するステップ；および単離されたオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を足場と組み合わせ、それによって、ワクチンを産生するステップを含む方法を提供する。
【０３３３】
一部の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｖｏの被験体に由来する。他の実施形態では、病原体は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物、微生物溶解物、粗製溶解物または精製された溶解物に由来する。ある特定の実施形態では、病原体は合成病原体である。
【０３３４】
一部の実施形態では、病原体は、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を含む。一部の実施形態では、ＰＡＭＰは、病原体断片、病原体デブリ、病原体核酸、病原体リポタンパク質、病原体表面糖タンパク質、病原体膜構成要素、および病原体から放出される構成要素からなる群より選択される。
【０３３５】
Ｖ．キット
本発明は、病原体感染症に対して被験体をワクチン接種するためのキットもまた提供する。かかるキットは、本明細書に記載される組成物を含み得る。かかるキットはまた、本明細書に記載される方法の遂行を促進し得る。
【０３３６】
一態様では、キットは、本発明のワクチン組成物およびワクチン組成物を被験体に投与するための指示を含む。一部の実施形態では、ワクチン組成物は、無菌容器中に事前包装される。
【０３３７】
別の態様では、キットは、本発明の足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物、ならびに足場組成物およびオプソニン結合またはレクチン結合病原体構築物を被験体に投与するための指示を含む。一部の実施形態では、足場組成物またはオプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物は、無菌容器中に事前包装される。足場組成物またはオプソニン結合もしくはレクチン結合病原体構築物は、異なる無菌容器中または同じ無菌容器中に事前包装され得る。
【０３３８】
各容器中の組成物は、例えば、無菌食塩水、デキストロース溶液もしくは緩衝溶液、または他の薬学的に許容される無菌流体と組み合わせた、薬学的に許容される溶液の形態であり得る。あるいは、組成物は、凍結乾燥または乾燥され得る。キットは、任意選択で、注射目的のために溶液を形成するために組成物を再構成するために、別々の容器中に、好ましくは無菌の、薬学的に許容される溶液（例えば、食塩水、デキストロース溶液など）をさらに含む。
【０３３９】
本発明のキットは、本発明の方法を実施するために有用なさらなる構成要素を任意選択で含み得る。キットは、好ましくは無菌形態で包装された、投与のための１つもしくは複数の再利用可能なもしくは使い捨てのデバイス（複数可）（例えば、シリンジ、針、ディスペンシングペン（dispensing  pen））、および／または包装されたアルコールパッドを含み得る。
【０３４０】
ある特定の実施形態では、キットには、本発明の方法の遂行を記載する指示材料が提供され得る。キットは、臨床医または患者によるワクチン組成物の投与または送達のための指示を含み得る。別の実施形態では、キットは、ワクチン組成物の適切な貯蔵および取り扱いのための指示を含み得る。
【０３４１】
本発明は、決して限定を意図しない以下の実施例によってさらに示される。本発明を通じて引用された全ての参考文献、特許および公開された特許出願の全内容ならびに図面は、本明細書で参照によって本明細書に組み込まれる。
【実施例】
【０３４２】
（実施例１  感染症ワクチン研究）
ＦｃＭＢＬビーズの調製
磁性ＦｃＭＢＬビーズを使用して、病原体または病原体断片、例えば、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を捕捉した。簡潔に述べると、１μＭのストレプトアビジンコーティングした超常磁性ビーズ（Ｄｙｎａｌ、Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を、ＦｃＭＢＬとカップリングさせた。ＦｃＭＢＬは、操作されたアミノ−オキシビオチン部位を有する、ヒトＩｇＧのＦｃ領域に融合されたマンノース結合性レクチン（ＭＢＬ）の炭水化物認識ドメイン（ＣＲＤ）からなる、操作されたレクチンである。ＦｃＭＢＬ融合タンパク質を、ＦｃＭＢＬのＦｃ領域の末端のアミノ−オキシビオチンを使用して、ビーズ上に配向させた。５００ｎｍ  Ａｄｅｍｔｅｃｈ超常磁性ビーズなどの他のビーズは、ＦｃＭＢＬへのカップリングについて試験されており、病原体または病原体断片の捕捉のために使用されている。ストレプトアビジンなしのビーズへのＦｃＭＢＬの直接的カップリングもまた試験し、病原体捕捉に役立つことが示された。ワクチン生成に使用されるビーズの最終濃度は、５ｍｇ／ｍＬであった。
【０３４３】
病原体試料の調製
ワクチンのための病原体は、任意の感染症から単離され得る。例えば、病原体は、ＰＡＭＰ調製のために培養され得る。あるいは、ＰＡＭＰは、血液試料から直接捕捉され得る。本研究の実験は、小児脊髄膜炎から単離された病原性ＲＳ２１８  Ｅ．ｃｏｌｉのＭＤＲ株を使用して実施した。ＲＳ２１８は、血清型Ｏ１８ａｃ：Ｈ７：Ｋ１を有する。
【０３４４】
ＲＳ２１８  Ｅ．ｃｏｌｉを、０．５ＭｃＦ（１ｅ８ＣＦＵ／ｍＬ）になるまで、１０％グルコースを補充したＲＰＭＩ培地中で増殖させた。ＦｃＭＢＬ捕捉に干渉し得るまたはワクチン生成を損ない得る酵母抽出物および他の構成要素を回避するために、ＲＰＭＩ培地を使用した。十分な細菌（各足場について最低でも１ｍＬの細菌溶液）を、１ｍｇ／ｍＬのセフェピム（Cefipime）および５００μｇ／ｍＬのアミカシンで２４時間処理した。細菌の完全な死滅を、終夜プレーティングすることによって確認し、ここで０ＣＦＵを検出した。
【０３４５】
ＲＳ２１８の細胞壁病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）を、バイオ脾臓（biospleen）透析様治療デバイスと組み合わせて、ＦｃＭＢＬでコーティングした磁性オプソニンを使用して捕捉した。次いで、捕捉されたＲＳ２１８を、ｉｎ  ｖｉｖｏマウスモデル研究のために、ＣｐＧおよびＧＭ−ＣＳＦアジュバントの存在下または非存在下でＰＬＧＡ足場を使用する治療的ワクチン中に含めた。
【０３４６】
ＦｃＭＢＬによって捕捉されたＰＡＭＰは、ＲＳ２１８の炭水化物含有膜構成要素または断片、例えば、ブレブ、小胞またはＬＰＳであった。ＦｃＭＢＬによって捕捉されたＰＡＭＰを定量化するために、検量線を、真菌ＭＢＬ標的であるマンナンを使用して生成した（図２）。簡潔に述べると、１μＭのＦｃＭＢＬでコーティングした超常磁性ビーズを使用して、緩衝液またはドナー全血のいずれか中のマンナンを捕捉した。マンナンの段階希釈物を、ＦｃＭＢＬビーズと混合し、ＥＬＩＳＡによって定量化した。ＲＳ２１８細胞壁断片を、検量線の補間によって、ＭＢＬ結合病原体関連分子パターン（ｍＰＡＭＰ）として定量化した（図３）。ＲＳ２１８細菌について、２５μＬ／ｍＬのビーズ上の１５ｎｇ／ｍＬのＰＡＭＰを、引き続くワクチン生成のために選択した。
【０３４７】
ＦｃＭＢＬ−ＲＳ２１８  ＰＡＭＰビーズの調製
抗生物質処理したＲＳ２１８細菌のＰＡＭＰ定量化に基づいて、２５０μｌのビーズ（５ｍｇ／ｍＬ）を、１０ｍＬの希釈された死滅細菌溶液（１５ｎｇ／ｍＬのＰＡＭＰと等価）に添加し、２０分間インキュベートした。ビーズを、磁気によって除去し、ＴＢＳＴ  ５ｍＭ  Ｃａ＋＋中で一回洗浄し、ワクチン生成のために１０ｍＬのＴＢＳＴ  ５ｍＭ  Ｃａ＋＋中に再懸濁した。生細菌の非存在を、プレーティングすることによって再確認した（０ＣＦＵ）。試料を−８０℃で貯蔵した。
【０３４８】
捕捉されたＲＳ２１８細胞壁断片の量を、ＦｃＭＢＬ  ＥＬＩＳＡを使用して、ＭＢＬ結合病原体関連分子パターン（ｍＰＡＭＰ）として定量化した（図４）。捕捉前および捕捉後の抗生物質処理したＲＳ２１８溶液をスクリーニングして、ＲＳ２１８中のｍＰＡＭＰの量がＦｃＭＢＬビーズによる処理の際と同じかどうかを決定した。１００μＬのＲＳ２１８試料を試験した。図４に示されるように、ＦｃＭＢＬビーズによって捕捉されたＲＳ２１８は、ビーズなしの対照（ＲＳ２１８ビーズ前試料）と比較した場合、類似の量のｍＰＡＭＰを有した。
【０３４９】
ＥＤＴＡ対照を、ｍＰＡＭＰとＦｃＭＢＬビーズとの間の特異的結合を示唆する、ＦｃＭＢＬビーズによるｍＰＡＭＰ捕捉のカルシウム依存性を実証するために含めた。内毒素捕捉もまた、捕捉前および捕捉後の抗生物質処理したＲＳ２１８溶液の比較によって定量化した（表１）。
【表１】
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【０３５０】
ＰＬＧ足場およびＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８を使用したワクチンデバイスの調製
研究で使用したワクチンデバイスは、ＷＤＶＡＸ臨床試験に基づいて標準的なＰＬＧ黒色腫足場のために開発されたプロトコールに従って製造した。ＦｃＭＢＬビーズを、黒色腫腫瘍溶解物の取込みと同様に、足場中に取り込んだ。
【０３５１】
本研究で使用したＰＬＧスフェアは、３０μｍのポリ（乳酸−ｃｏ−グリコール酸）（ＰＬＧＡ）スフェアであった。対照偽デバイスのために、１８０ｍｇのブランクＰＬＧスフェアを、１．３ｇのふるいにかけたスクロース（２５０〜４００μｍ）と混合した。得られた混合物を秤量し、等量を、１０個の対照偽デバイスの製造を可能にするために量り分けた。
【０３５２】
ビーズ／病原体デバイス（ＰＬＧ足場およびＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８）のために、１８０ｍｇのブランクＰＬＧスフェアを、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８細胞壁断片の懸濁物１０ｍｌに添加し、完全に混合し、凍結させ、およそ７日間凍結乾燥させた。凍結乾燥した粉末（３０４ｍｇ）を、１．３ｇのふるいにかけたスクロース（２５０〜４００μｍ）と混合した。得られた混合物を秤量し、等量を、１０個のビーズ／病原体デバイスの製造を可能にするために量り分けた。
【０３５３】
完全ワクチン組成物のために、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）を有する１８０ｍｇのＰＬＧスフェアを、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８細胞壁断片の懸濁物１０ｍｌに添加し、完全に混合し、凍結させ、およそ７日間凍結乾燥させた。凍結乾燥した粉末（３１０ｍｇ）を、１．３ｇのふるいにかけたスクロース（２５０〜４００μｍ）および３００ｍｇのＣｐＧと混合した。ＣｐＧを、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）を使用して凝縮した。得られた混合物を秤量し、等量を、１０個のワクチン組成物の製造を可能にするために量り分けた。
【０３５４】
ワクチン組成物を作製するために、適切な量の凍結乾燥した粉末を、８ｍｍ直径のダイ中に配置し、液圧プレスを使用して１５００ｐｓｉの下で形成した。形成されたら、組成物を、８００ｐｓｉのＣＯ２への終夜曝露によって圧力チャンバー中で発泡させ、その後迅速に圧力開放した。全ての組成物を、動物移植の用意ができるまで、−２０℃で貯蔵した。
【０３５５】
ＰＬＧ足場およびＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅを使用したワクチンデバイスの調製
Ｅ．ｃｌｏａｃａｅの調製を、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８について上記で列挙したものと同じ方法を使用して実施した。簡潔に述べると、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅを、１ｅ８ＣＦＵ／ｍＬになるまで増殖させ、セフェピム（１ｍｇ／ｍＬ）およびアミカシン（５００μｇ／ｍＬ）で処理し、病原体の完全な死を、プレーティングすることによって確認する。ＰＡＭＰを、１μＭのＦｃＭＢＬビーズを使用して捕捉し、ＦｃＭＢＬ  ＥＬＬｅｃＳＡによって定量化する（Cartwrightら  EBioMedicine  ９巻（２０１６年）２１７〜２２７頁）。次いで、ＰＡＭＰを含むビーズを、ＰＬＧ足場中に取り込む。
【０３５６】
ＰＬＧＡワクチン足場の製造のために、被包されたＧＭ−ＣＳＦ（９μｇ）を含むＰＬＧミクロスフェア１８ｍｇを、１５ＰＡＭＰを含む溶液と、均一な粉末が達成されるまで混合し、次いで、液体Ｎ２を使用して凍結させ、１００ミリトール未満で終夜凍結乾燥させた。得られた粉末を、デバイス圧縮および高圧ＣＯ２発泡（７〜９００ＰＳＩ）の前に、３０ｍｇのＣｐＧおよび１３０ｍｇのスクロースと完全に混合した。得られたデバイスを、移植前に３時間にわたってＷＦＩ中で浸出させた。
【０３５７】
ＭＰＳ足場およびＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８を使用したワクチンデバイスの調製
ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８ビーズの調製は、上記と同じである。ＭＰＳワクチン足場の製造のために、３μｇのＧＭ−ＣＳＦ、１０ｍｇのＣｐＧ、および１５ＰＡＭＰを含む溶液を、１０ｍｇのＭＰＳ上にロードし、回転ミキサーを使用して室温で終夜、しっかりと混合した。次いで、ＭＰＳを凍結乾燥させ、注射前に注射用水（ＷＦＩ）中で再構成した。
【０３５８】
ＰＬＧ足場ワクチン接種は、致死的なＲＳ２１８感染症からマウスを保護する
ワクチン組成物の有効性を研究するために、マウスを、ワクチン組成物で最初に免疫化し、次いで、致死用量未満のＲＳ２１８細菌でチャレンジした。具体的には、磁性ＦｃＭＢＬビーズを使用して捕捉されたＲＳ２１８を、ＣｐＧおよびＧＭ−ＣＳＦアジュバントと共にＰＬＧ足場中に取り込んで、完全ワクチン組成物を生成した（図５Ａ〜５Ｂ）。ＦｃＭＢＬビーズは、ＰＬＧ足場中の穴および空洞の至るところに、明らかに目に見えて分散された（図５Ｂ）。次いで、ワクチン組成物を、マウス中に皮下移植した。足場単独を含む偽デバイスを、陰性対照として使用した。ＦｃＭＢＬビーズによって捕捉されたＲＳ２１８がいずれのアジュバントもなしにＰＬＧ足場中に取り込まれたビーズ／病原体デバイスもまた、アッセイに含めた。１０匹のマウスを各処置群に含めた。
【０３５９】
免疫化の２１日後、マウスを、４８時間にわたる腹腔内注射による高いが致死用量未満のＲＳ２１８（マウス１匹当たり５ｅ６ＣＦＵ）でチャレンジした。マウスを、感染の１２時間後または臨床状態が要求する場合にはそれよりも早く、人道的に屠殺した。人道的エンドポイントは、臨床スコアが２／５に低下したとき、または動物が回復しなかったとき、もしくは看護によって軽減されない重症の疼痛および窮迫を経験したときに発生した。
【０３６０】
生存曲線アッセイ
生存率を、ＲＳ２１８感染マウスにおいてモニタリングした。図６に実証されるように、完全ワクチン組成物（ＦｃＭＢＬビーズ捕捉されたＲＳ２１８およびＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧを有するＰＬＧ足場）およびビーズ／病原体デバイス（ＦｃＭＢＬビーズ捕捉されたＲＳ２１８を有するがＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧを有さないＰＬＧ足場）で処置したマウスは、偽デバイス（足場単独）で処置したマウスよりも長い生存時間を経験した。完全ワクチン組成物で免疫化した場合、１０匹のマウスのうち９匹が、４８時間後に生存した。比較として、偽デバイスを受けているマウスの５０％が、致死用量未満のＲＳ２１８細菌による注射の約１０時間後に死亡し、ビーズ／病原体デバイスで免疫化したマウスの半分が、２０時間後に死亡した。これらの結果は、ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧなどのアジュバントの添加が、ワクチン組成物の有効性を増強し、増加した生存時間を生じたこと、ならびにＦｃＭＢＬ捕捉された病原体およびアジュバントの両方が保護的ワクチン接種に必要であったことを示唆した。
【０３６１】
臓器病原体計数
ＲＳ２１８感染マウスにおける選択された臓器内の病原体負荷を定量化するために、臓器培養物を、無菌様式で収集し、機械的破壊によって加工処理し、プレーティングした。簡潔に述べると、無菌様式で回収した臓器を、ビーズミルチューブに添加した。１ｍＬの無菌食塩水を、ビーズおよび臓器を含む各チューブに添加した。各チューブを秤量し、各チューブを、１秒当たり３０回の頻度で５分間ビーズミルした。液化した臓器を、１：１００および１：１０，０００に滴定した。未希釈、１：１００および１：１０，０００の臓器試料を、ヒツジ血液寒天上にらせん状にプレーティングし、３７℃で終夜増殖させ、病原体負荷を決定した。感染マウスにおける臓器病原体計数は、表２に記載した。図７Ａは、病原体の全体的力価が、完全ワクチン組成物を受けているマウスにおいて２．５〜３．５ｌｏｇ有意に低減されたが（ｐ＝０．００２１〜０．００５７）、ビーズ／病原体デバイスおよび偽対照を受けているマウスについては統計的に有意な差異が観察されなかったことを実証している。同様の結果が、個々の臓器中の病原体負荷について観察された。図７Ｂに実証されるように、肺、肝臓、腎臓および脾臓中のＲＳ２１８のレベルは全て、完全ワクチン組成物（ＦｃＭＢＬビーズ捕捉されたＲＳ２１８およびＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧを有するＰＬＧ足場）を受けているマウスにおいて有意により低かったが、ビーズ／病原体デバイスを受けているマウスは、対照マウスと類似のレベルの病原体を有し、これは、ＧＭ−ＣＳＦおよびＣｐＧなどのアジュバントの添加が、ワクチン組成物の有効性を増強し、保護的ワクチン接種に必要であったことをさらに示唆している。
【表２】
2019508418.tif 000004
【０３６２】
ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８を用いたワクチンとＲＳ２１８溶解物を用いたワクチンとの間の比較
完全ワクチン組成物の観察された保護効果が、ＦｃＭＢＬビーズなしにＲＳ２１８の溶解物で再現できるかどうかを決定するために、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片またはＲＳ２１８溶解物全体単独のいずれかを含む、ＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦを有するＰＬＧワクチン足場を調製した。
【０３６３】
マウスを、３つの処置群に分け、ＰＬＧ足場を２１日間にわたって皮下移植した。群１（ｎ＝１０）は偽デバイス（足場およびＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦ）を受け、群２（ｎ＝１０）は、捕捉されたＲＳ２１８断片を有するＦｃＭＢＬビーズを含む、ＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦを有する足場を受け、群３（ｎ＝１０）は、ＲＳ２１８溶解物全体を含む、ＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦを有する足場を受けた。同量のＲＳ２１８を、群２および３において使用した。
【０３６４】
免疫化の２１日後、マウスを、腹腔内注射による致死用量のＲＳ２１８（２０時間の時点で９０％致死用量（ＬＤ９０）を有する）でチャレンジし、４８時間追跡した。図８に示されるように、群２および群３のワクチン組成物を受けているマウスは共に、ＲＳ２１８感染症に対して保護され、偽対照を受けているマウスと比較した場合、延長された生存時間を有した。群２のワクチン組成物を受けている１０匹のマウスのうち９匹、および群３ワクチン組成物を受けている１０匹のマウスのうち１０匹が生存したが、偽対照を受けている１０匹のマウスのうち９匹は、過剰な疼痛および苦痛を回避するために、約１２時間の時点において安楽死させた。
【０３６５】
臓器病原体計数からの結果は、捕捉されたＲＳ２１８断片（群２）またはＲＳ２１８溶解物全体（群３）のいずれかを有するＦｃＭＢＬビーズを含むワクチン組成物が、ＲＳ２１８感染症からマウスを保護するのに有効であったことをさらに示唆した。図９は、群２および群３のワクチン組成物を受けているマウスが共に、偽ワクチン接種した群１のマウスよりも、臓器中に有意に少ない病原体を有したことを実証した。群２のマウスについて、ＣＦＵ／ｇ力価は、肺、腎臓、脾臓において４〜６ｌｏｇ低下し、肝臓において約２ｌｏｇ低下した。群３のマウスについて、ＣＦＵ／ｇ力価は、肺、肝臓、腎臓および脾臓において３〜４ｌｏｇ低下した。したがって、大部分の臓器、即ち、肺、腎臓および脾臓におけるＲＳ２１８のレベルは、肝臓を唯一の例外として、群３のマウスと比較した場合、群２からのワクチン接種したマウスにおいてさらに低減された。
【０３６６】
これらの結果は、細菌溶解物およびＦｃＭＢＬビーズ捕捉された細菌断片の両方が、機能的ワクチン組成物を生成するため、および感染の致死チャレンジからマウスを保護するために、ＰＬＧ足場と組み合わせて使用され得ることを示している。しかし、浸出する溶解物および膿瘍の形成などの副作用は観察されなかったので、ＦｃＭＢＬビーズ捕捉された病原体断片を有するワクチン組成物は、細菌溶解物の直接的使用を超える顕著な利点を示した。
【０３６７】
図１０Ｃに示されるように、有意な内毒素漏出が、ＲＳ２１８溶解物全体を含むＰＬＧワクチン足場を移植したマウス（群３）において観察されたが、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片を含むＰＬＧワクチン足場は、かかる漏出を実証しなかった（群２）。さらに、４８時間の屠殺の時点で、大きい膿瘍の形成が、群３のマウスにおいて足場の周囲で観察され、この足場は、癒着から分離できなかった（図１１Ｃ）。対照的に、群２のマウス中のワクチン組成物は、腐食の徴候をほとんど伴わずに、大部分はインタクトできれいであり（図１１Ｂ）、群１の対照マウスは、免疫反応の徴候がないインタクトな足場を有した（図１１Ａ）。ワクチン接種の２８日後、偽ワクチン（群１）、および捕捉されたＲＳ２１８断片を有するＦｃＭＢＬビーズを含むワクチン組成物（群２）はなおも存在したが、ＲＳ２１８溶解物がＰＬＧ足場中に直接取り込まれた場合（群３）、強い局所的炎症反応が存在し、足場は分解し、これらのマウスは、ワクチン部位において膿瘍を有した。
【０３６８】
ＰＬＧワクチン足場からのＣｐＧおよびＧＭ−ＣＳＦ漏出のレベルもまた定量化し、３つの処置群間で比較した。図１０Ａおよび１０Ｂは、ＣｐＧおよびＧＭ−ＣＳＦ漏出について有意な差異が観察されなかったことを実証した。
【０３６９】
したがって、細菌溶解物およびＦｃＭＢＬビーズ捕捉された細菌断片を含むワクチン組成物は共に、細菌感染症の致死チャレンジからマウスを保護することが示されたが、ＦｃＭＢＬビーズ捕捉された病原体断片を有するワクチン組成物は、ワクチン組成物の有効性を損なうことのない、より安全でより制御された局在化された選択肢を提示した。
【０３７０】
ＦｃＭＢＬ捕捉された病原体を有するワクチン組成物の交差反応性
本発明のワクチン組成物が異なる種の病原体に対して使用できるかどうかを決定するために、ＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦおよびＦｃＭＢＬ捕捉されたＥ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物を含むＰＬＧワクチン足場を、上記で列挙したものと同じ方法を使用して調製した。簡潔に述べると、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅを、１ｅ８ＣＦＵ／ｍＬになるまで増殖させ、セフェピム（１ｍｇ／ｍＬ）およびアミカシン（５００μｇ／ｍＬ）で処理し、病原体の完全な死を、プレーティングすることによって確認する。ＰＡＭＰを、１μＭのＦｃＭＢＬビーズを使用して捕捉し、ＦｃＭＢＬ  ＥＬＬｅｃＳＡによって定量化する。次いで、ＰＡＭＰを含むビーズを、ＰＬＧ足場中に取り込む。
【０３７１】
マウスを、腹腔内注射による致死用量のＲＳ２１８（２０時間の時点でＬＤ９０を有する）でチャレンジした。Ｅ．ｃｌｏａｃａｅおよびＥ．ｃｏｌｉは共に、腸内細菌科目のメンバーである。図１２Ａに示されるように、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧの予防的ワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジから７８％のマウスを保護したが、ＧＭ−ＣＳＦ動員およびＣｐＧアジュバントのみを有するＰＬＧ足場（ＦｃＭＢＬビーズおよび細菌溶解物なし）は、９６時間の時点で２０％の動物しか保護しなかった。ＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧおよびＲＳ２１８溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＰＬＧ足場のワクチンは、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジから１００％のマウスを保護した。
【０３７２】
さらに、図１２Ｂは、病原体計数が、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧのワクチンを受けているマウスにおいて低減されたことを示した。
【０３７３】
これらの結果は、本発明のワクチン組成物が、所与の病原体の異なる種または株に対して標的化することが可能であり、したがって、既存のワクチンを超える顕著な利点を付与することが可能であることを実証している。
【０３７４】
ワクチン組成物の単一移植用量の長期効果
本発明のワクチン組成物が病原体に対する長期保護効果を付与できるかどうかを決定するために、マウスを、１日目に、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを有するＰＬＧ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧワクチン組成物で最初に免疫化し、２１日目に致死用量未満のＲＳ２１８細菌（２０時間の時点でＬＤ９０）でチャレンジし、６０日目および９０日目に再チャレンジした。図１５Ａに示されるように、ワクチン組成物を受けている全てのマウスは、９０日間よりも長く生存したが、対照マウスは、２１日目のＲＳ２１８チャレンジの直後に死亡した。これらの結果は、ワクチン組成物が、感染病原体に対する長期保護効果を生じることが可能であり、単一用量のワクチン組成物が、少なくとも９０日間にわたって感染被験体を保護できることを実証している。
【０３７５】
ワクチン組成物の持続性の効果を確認するために、マウスを１日目にワクチン接種し、次いで、９０日目に、８時間の時点で９０％致死投薬量のより高いＲＳ２１８用量でチャレンジした。図１５Ｂは、ＰＬＧワクチン組成物を受けているマウスの７５％が、ＲＳ２１８チャレンジの後、１２０日間よりも長く生存したが、対照マウスがチャレンジの直後に死亡したことを示した。
【０３７６】
ＭＰＳ足場ワクチン接種は、致死的なＲＳ２１８感染からマウスを保護する
メソ多孔性シリカ（ＭＰＳ）足場を含むワクチン組成物を生成した。ＭＰＳベースのワクチン組成物の有効性を研究するために、マウスを、ワクチン組成物で最初に免疫化し、次いで、致死用量未満のＲＳ２１８細菌（３６時間の時点でＬＤ１００）でチャレンジした。具体的には、ＦｃＭＢＬ捕捉されたＲＳ２１８断片を、ＣｐＧおよびＧＭ−ＣＳＦアジュバントを有するＭＰＳ足場中に取り込んで、完全ワクチン組成物を生成した。次いで、ワクチン組成物をマウスに注射した。異なる用量の捕捉された病原体（３ＰＡＭＰ単位および１５ＰＡＭＰ単位）を、ＦｃＭＢＬビーズ上にコーティングし、次いで、ＭＰＳ−ＧＭＣＳＦ／ＣｐＧ足場中に取り込んだ。１５ＰＡＭＰ単位のＲＳ２１８もまた、対照としてＰＬＧ足場中に取り込んだ。
【０３７７】
図１３に示されるように、ＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧおよび１５ＰＡＭＰ単位を含むＭＰＳ足場は、２１日間のチャレンジからマウスの９０％を保護したが、３ＰＡＭＰ単位を含むＭＰＳ足場は、７０％しか保護しなかった。ＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧおよび１５ＰＡＭＰでコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＰＬＧ足場を受けている全てのマウスも、チャレンジを生存した。
【０３７８】
別のセットのＭＰＳベースのワクチンを、異なる病原体投薬量（７．５ＰＡＭＰ単位）を用いて調製した。図１４は、ＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧおよび７．５ＰＡＭＰ単位を含むＭＰＳワクチンが、９６時間の研究の最後まで、ＲＳ２１８チャレンジ（１０時間の時点でＬＤ９０）から９０％のマウスを保護したことを示している（ｎ＝１２）。しかし、偽ワクチンでワクチン接種したマウスは、５０％しか細菌チャレンジを生存しなかった（ｎ＝６）。
【０３７９】
結論として、これらの結果は、ＦｃＭＢＬ捕捉された病原体をロードし、ＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦなどのアジュバントをロードしたＰＬＧまたはＭＰＳ足場が、有効なワクチン組成物として機能でき、致死的な細菌感染症からマウスを保護できたことを実証した。これらのワクチン組成物で免疫化したマウスは、有意に延長された生存時間およびより低い臓器病原体計数を示した。ＦｃＭＢＬビーズ捕捉された病原体または病原体関連分子パターンを、ワクチン足場、例えば、ＰＬＧまたはＭＰＳ足場と組み合わせる能力は、感染性疾患の処置において大いに役立ち得る、全ての型の病原体に対する高い効力の病原体ワクチンの創出を可能にする。さらに、非感染性ワクチンの使用およびワクチン組成物からの病原体の漏出を防止する能力は、病原体毒素の漏出によって経験される重症の副作用を大きく低減させ、したがって、より安全でより制御されたワクチン組成物を生じる。さらに、本発明のワクチン組成物は、所与の病原体の異なる種または株に対して標的化すること、および感染病原体に対する長期保護効果を生じることが可能である。実際、単一用量の本発明のワクチン組成物は、９０日間の期間にわたって、ワクチン接種したマウスを細菌チャレンジから保護できる。
【０３８０】
これらのワクチン組成物および方法は、免疫の生成のために特定の病原体をｉｎ  ｖｉｖｏで標的化する能力を実証し、明確な保護的免疫応答を生じたので、これらの結果は臨床的に重要であった。
【０３８１】
（実施例２  ワクチン組成物の機構的分析）
さらなる実験を実施して、ワクチン組成物（ＦｃＭＢＬ捕捉された病原体をロードし、ＣｐＧ／ＧＭ−ＣＳＦなどのアジュバントをロードした、ＰＬＧまたはＭＰＳ足場）に関与する免疫応答の種類を決定した。具体的には、アッセイを実施して、本発明のワクチン組成物が細胞媒介性応答を媒介するか抗体媒介性応答を媒介するかを決定した。ＲＳ２１８感染に応答した、選択されたサイトカインのレベルならびに特異的ＩｇＧ、例えば、ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａのレベルにおける変化を、ワクチン接種した動物において測定した。サイトカインのレベルにおける主要な変化は、ワクチン組成物が細胞媒介性応答を介して主に作用することを示すが、ＩｇＧレベルにおける顕著な変化は、抗体媒介性応答を示唆する。
【０３８２】
組織学研究を実施して、本発明のワクチン組成物が感染病原体に対する細胞媒介性免疫応答を惹起することが可能かどうかを決定した。マウスに、ＦｃＭＢＬビーズ捕捉されたＲＳ２１８およびＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧを有するＰＬＧ足場を移植したか、またはＦｃＭＢＬビーズ捕捉されたＲＳ２１８およびＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧを有するＭＰＳ足場を注射した。偽および完全ワクチンを含んだ移植部位を、外植し、包埋し、切片化し、ヘマトキシリンエオシンで染色して、浸潤免疫細胞を同定した。図１６に示されるように、対照ＰＬＧ偽デバイスでは細胞は蓄積しなかったが、密な細胞浸潤が、ＰＬＧ足場およびＭＰＳ足場の両方で観察され、これは、細胞媒介性応答がこれらのワクチン組成物によって開始されたことを示唆している。
【０３８３】
ワクチン組成物が感染病原体に対する抗体媒介性免疫応答を媒介するかどうかを決定するために、ＩｇＧレベルを測定した。この分析は、抗ＲＳ２１８  ＰＡＭＰ  ＩｇＧおよびＩｇＭ抗体を検出する血清ＥＬＩＳＡを使用して実施した。９６ウェルのマイクロプレートを、ＲＳ２１８溶解物でコーティングし、ブロッキングし、プレートを洗浄する。試料を、１０３〜１０６の間で希釈し、次いで、室温でインキュベートする。ＨＲＰヤギ抗マウスＩｇＧ二次抗体コンジュゲートとのインキュベーションの前に、プレートを吸引および洗浄する。最後に、ＴＭＢ基質を添加して酵素反応を引き起こし、インキュベートする。次いで、試料を、４５０ｎｍの波長で分光光度計を使用して分析する。次いで、段階希釈物の結果が、抗体力価を確立するための慣習として使用される、０．５ＡＵにおける光学密度を決定するために計算され得る。図１７Ａは、ＩｇＧ力価が、ワクチン組成物を受けているマウスにおいて有意に増加し、ＩｇＧレベルにおける増加が約９０日間の期間にわたって持続したことを示している。図１７Ｂは、ナイーブマウスと比較した場合、抗体力価が、ワクチン接種の２１日後に＞１ｌｏｇ増加したこともまた示しており、これは、長期抗体媒介性免疫応答がこれらのワクチン組成物によって惹起されたことをさらに示唆している。
【０３８４】
（実施例３  ワクチン接種は、複数の病原体感染症に対して保護する）
ワクチン接種は、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ感染症からマウスを保護する
結核（ＴＢ）は、細菌Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ（ＭＴｂ）によって引き起こされる感染性疾患である。結核は一般に、肺に影響するが、身体の他の部分にも影響し得る。ほとんどのＴＢ感染症は症状を有さない；この場合、これは潜伏結核として公知である。潜伏感染症の約１０％が、未処置のままの場合、感染者の約半分を殺す活動性疾患へと進行する。ＦｃＭＢＬは、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ（ＭＴｂ）細胞壁のマンノシル化された構成要素、例えば、マンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）およびホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）に結合できる（図１８）。
【０３８５】
本発明のワクチン組成物が結核に対して保護するために使用され得るかどうかを決定するために、マウスを、単一用量の、ＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧおよびマンノースでキャップされたリポアラビノマンナン（ＭａｎＬＡＭ）溶解物でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＭＰＳベースのワクチン組成物で免疫化した。図１９は、単一用量のワクチン組成物が、ワクチン接種前のナイーブ動物よりも、ＬＡＭ特異的ＩｇＧの力価を約２〜３ｌｏｇ増加させたことを示している（ｐ＝＜．００１）。さらに、マクロファージ、ＣＤ４＋Ｔ細胞および樹状細胞の量における有意な増加もまた、ＭＰＳ足場内で観察され（図２０）、これは、ワクチン接種したマウスにおいて細胞媒介性抗ＬＡＭ免疫応答もまた生じたことを実証している。ＦＡＣＳ分析のために細胞を調製するために、感染症ワクチン足場由来の単細胞懸濁物を、コラゲナーゼＩＶ（１ｍｇ／ｍｌ）中で３７℃で２０分間消化し、その後、７０μｍメッシュを介して濾過することすることによって調製した。細胞ゲーティングのための脾臓対照を、７０μｍメッシュを介してすりつぶし、赤血球をＡＣＫ緩衝液（１５０ｍＭ  ＮＨ４Ｃｌ、１ｍＭ  ＫＨＣＯ３、Ｎａ２ＥＤＴＡ  ０．１ｍＭ）で溶解した。細胞を、Ｆｃブロック（抗マウスＣＤ１６／３２）で処理し、ＣＤ３ｅに対する抗体（ＰＥ、ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、ＣＤ４に対する抗体（ＰＥＣＹ７、ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、ＣＤ８に対する抗体（ＦＩＴＣ、ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）で染色した。フローサイトメトリーデータを、ＦｌｏｗＪｏ（Ｔｒｅｅ  Ｓｔａｒ）を使用して分析した。足場中のＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の数を、フロー分析からの細胞密度と組み合わせて血球計数器を使用することによって決定した。
【０３８６】
これらのデータは、本発明のワクチン組成物が、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓを標的化することが可能であり、したがって、結核を処置することにおいて大きな可能性を有することを実証している。
【０３８７】
ワクチン接種は、他の病原体に対して保護する
ＦｃＭＢＬは、複数の病原体属を捕捉することが可能であるので、さらなる病原体、例えば、グラム陰性細菌（Ｅ．ｃｏｌｉ  ＲＳ２１８）、グラム陽性（ＭＲＳＡ）ＬＡＭ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ細胞壁構成要素）、真菌（Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓ）、ウイルス（ＨＩＶ  ｇｐ１２０抗原）および寄生生物（Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ  ｖａｇｉｎａｌｉｓ抗原）に対するワクチン組成物を生成した。
【０３８８】
各生存病原体を、適切な抗生物質で処理する。ＭＲＳＡは、セフェピム（１ｍｇ／ｍＬ）およびバンコマイシン（５００μｇ／ｍＬ）を使用して死滅させ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓは、アンホテリシンＢ（１ｍｇ／ｍＬ）を使用して死滅させる。ＦｃＭＢＬ捕捉された病原体／抗原でコーティングしたビーズの調製は、セクション：病原体およびＦｃＭＢＬ−ＲＳ２１８  ＰＡＭＰビーズの調製、に上記したものと同じである。
【０３８９】
図２１Ａは、ＦｃＭＢＬビーズを、ワクチン調製のための異なる量の病原体断片でコーティングしたことを示している。次いで、マウスを、単一用量の、ＧＭ−ＣＳＦ／ＣｐＧおよび感染性微生物由来の試料でコーティングしたＦｃＭＢＬビーズを含むＭＰＳベースのワクチン組成物でワクチン接種した。図２１Ｂは、ＬＡＭ特異的ＩｇＧの力価が、全ての場合において、ワクチン接種前のナイーブ動物を超えて増加したことを示しており、これは、ワクチン組成物が、複数の病原体種を標的化し、それに対する免疫応答を媒介するために適切であったことを実証している。
【０３９０】
抗体媒介性免疫応答に加えて、ワクチン組成物は、標的化された病原体に対する細胞媒介性免疫応答を惹起することができた。ワクチン接種した動物の脾臓中の浸潤細胞のＦＡＣＳ分析は、ワクチン中に取り込まれたＴｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ溶解物に対する細胞媒介性抗Ｔｒｉｃｈｏｍｏｎａｓ応答を実証した（図２２）。対照脾臓（ナイーブ）は、ワクチン接種した動物群よりも少ない、浸潤ＣＤ４＋Ｔ細胞およびＣＤ１１ｃ細胞を示した。
【０３９１】
（実施例４  ＦｃＳＰＤ捕捉されたＲＳ２１８を有するＭＰＳ足場ワクチン接種）
代替的レクチンを使用して、病原体を捕捉した。脂質とタンパク質との複雑な混合物である肺サーファクタントは、肺機能にとって必須である。サーファクタントタンパク質Ｄ（ＳＰＤ）は、ＭＢＬと関連する別のコレクチン（コラーゲン領域を有するＣ型レクチン）である。ＳＰＤは、肺の宿主防御において重要な役割を有する。ＦｃＭＢＬに対して７７％のタンパク質配列同一性を有するＦｃＳＰＤ融合タンパク質を生成した。ＦｃＳＰＤ捕捉されたＲＳ２１８ビーズの調製は、上記と同様である。
【０３９２】
図２３に示されるように、ＦｃＳＰＤは、ＲＳ２１８  Ｅ．ｃｏｌｉを結合することができ、ＭＰＳ足場中に取り込まれた場合、ＦｃＳＰＤ捕捉されたＲＳ２１８もまた、ワクチン接種したマウスにおいて免疫反応を開始した。増加した抗体力価が、ワクチン接種したマウスにおいて観察され、これは、ＦｃＳＰＤ捕捉された病原体を含むワクチン組成物もまた、感染病原体に対する免疫応答を媒介することが可能であったことを実証している。
【０３９３】
均等物
当業者は、単なる慣用的実験を使用して、本明細書に記載される発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を認識し、またはそれを確認することができる。かかる均等物は、以下の特許請求の範囲によって包含されることが意図される。本出願を通じて引用した全ての参考文献、特許および公開された特許出願の内容は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５Ａ】
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【図５ＢＣ】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１Ａ】
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【図２１Ｂ】
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【図２２】
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【図２３】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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