【手続補正書】
【提出日】平成18年12月21日(2006.12.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
−試料スライドを担持するためのキャリアステージと、
−前記試料スライドを照明するための光源と、前記試料スライドは試料のアレイを含み、
−前記試料スライドの連続した部分が前記光源によって照明されるように、前記キャリアステージ及びそれに担持された前記試料スライドを動かすための駆動手段と、
−使用の際に、前記試料スライドを通って伝達され前記試料スライドから出る前記光源からの光線に対してずれた角度で前記試料スライドから出る光線の前記連続した部分のみを実質的に捉えるように配置されて、前記試料スライドまたは試料のアレイの画像に再構築されるように配列された一連の部分的な画像を生成するデジタル光学カメラシステムと、
を具備する画像形成装置。
【請求項２】
前記光源は実質的に狭いビームを発するように配列された線状光源であり、それによって、照明される前記試料スライドの連続した部分は帯状部分であり、それによって、前記一連の部分的な画像は線状画像である請求項１記載の画像形成装置。
【請求項３】
前記デジタル光学カメラシステムは、使用の際に、前記試料スライド上の試料の前記アレイで回折されるかまたは他のやり方で屈折される光線のみを実質的に受け取るように、配置される請求項１または２に記載の画像形成装置。
【請求項４】
前記デジタルカメラシステムは、前記試料アレイによって回折されないかまたは他のやり方で屈折されない光線が、前記カメラシステムによって捉えられることを防止するために、弁別手段を含む請求項１乃至３のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項５】
前記弁別手段は、ずれた角度で前記試料スライドから出る回折したかまたは他のやり方で屈折した光線を、前記カメラシステムの画像形成レンズへ向けて方向づけるように位置決めされた少なくとも１つのリフレクタを含む請求項４記載の画像形成装置。
【請求項６】
前記デジタル光学カメラシステムは、線状画像を検知することができるラインスキャン可能カメラを含む請求項４または５に記載の画像形成装置。
【請求項７】
前記デジタル光学カメラシステムは、使用の際に、前記試料スライド上の蛍光マーカーから発した光線を捉えるように、配置される請求項１乃至６のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項８】
前記デジタル光学カメラシステムは、少なくとも２つのモードで操作するように配列され、すなわち、前記試料スライドの試料の前記アレイで回折したかまたは他のやり方で屈折した光線が前記カメラによって捉えられる回折または屈折モードと、試料の前記アレイ上の蛍光マーカーから発した光線が捉えられる蛍光モードと、である請求項１乃至７のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項９】
前記デジタル光学カメラシステムは、前記駆動手段がキャリアステージを第１の方向に動かすときに前記屈折または回折モードで操作するように配列され、前記駆動手段が前記キャリアステージを第２の方向に動かすときに前記蛍光モードで操作するように配列される請求項８記載の画像形成装置。
【請求項１０】
前記光学カメラシステムは、スペクトルの可視部分および不可視部分の両方で光線を検出するように配列される請求項１乃至９のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項１１】
前記試料は、前記試料スライド上の結合パートナーに結合した細胞を含む請求項１乃至１０のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項１２】
前記画像形成装置は、使用の際に前記キャリアステージが中に位置する試料採取コンパートメントと、電気構成要素コンパートメントと、を具備し、前記電気構成要素コンパートメントは、前記試料採取コンパートメントから流体封止され、それによって、使用の際に、前記電気構成要素コンパートメント内部の構成要素が前記試料採取コンパートメントから流体汚染されることは妨げられ、前記キャリアステージは、使用の際に、前記試料スライドからこぼれた流体を集めるために前記試料スライドの下に配置されたトレイ要素を含む請求項１乃至１１のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項１３】
前記画像形成装置は、外部基準データベース、外部保存データベース、外部ＰＣ、および、外部プリンタの少なくとも１つを含むグループの装置へインタフェースするためのインタフェースユニットを含む請求項１乃至１２のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項１４】
前記ラインスキャン可能カメラは、１ピクセルの幅を有する線状画像を走査するように適合されたラインスキャンカメラである請求項６記載の画像形成装置。
【請求項１５】
前記部分的な画像および前記再構築された画像は、暗視野画像である請求項１乃至１４のいずれか１項に記載の画像形成装置。
【請求項１６】
比較目的のために、請求項１乃至１５のいずれか１項に記載の画像形成装置と、試料の前記アレイを表す画像強度値を提供するために前記試料スライドまたは試料のアレイの画像を処理するためのプロセッサ手段と、を含む画像形成システム。
【請求項１７】
前記プロセッサ手段は、前記スライド上の各試料を位置づけるために且つ各試料の強度をスケールするために、前記スライド上の公知の基準試料を使用することによって、前記画像を標準化するように配列される請求項１６記載のシステム。
【請求項１８】
前記プロセッサ手段は、公知の基準試料に基づいて基準マトリックスまたはグリッドを加えることによって各試料を位置づけるように配列され、スケールの範囲を制定するために基準試料を使用して前記グリッドの各方形内に前記試料の強度をスケールするように配列され、前記画像から標準化強度値を生成するようにさらに配列される請求項１６または１７に記載のシステム。
【請求項１９】
試料スライド上の試料を表す画像を導き出す方法であって、
−試料のアレイを含む試料スライドを提供するステップと、
−前記試料スライドをキャリアステージに装填するステップと、
−前記試料スライドの少なくとも一部を照明するステップと、
−前記試料スライドの連続した部分が光源によって照明されるように、前記キャリアステージ及び前記試料スライドを動かすステップと、
−前記試料スライドから出る光線の連続した回折または屈折部分のみを実質的に捉えて、試料の前記アレイの画像に再構築されるように配列された一連の部分的な画像を生成するステップと、
を含む方法。
【請求項２０】
照明される前記試料スライドの連続した部分は、線状光源を使用することによって照明される帯状部分であり、それによって、前記一連の部分的な画像は、線状画像として捉えられる請求項１９記載の方法。
【請求項２１】
前記試料スライド上の試料によってまたはそこで、回折したかまたは他のやり方で屈折した光線のみを実質的に捉えるステップを含む請求項１９または２０記載の方法。
【請求項２２】
前記試料は、前記試料スライド上の結合パートナーに結合した細胞を含む請求項１９乃至２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２３】
前記試料スライド上の蛍光マーカーから発した光線を捉えるステップを含む請求項１９乃至２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
回折または屈折モードで発した光線と、前記蛍光マーカーから蛍光モードで発した光線と、の両方を捉えるステップを含む請求項２３記載の方法。
【請求項２５】
第１の通過で前記回折または屈折モードで発した光線を捉え、第２の通過で前記蛍光モードで発した光線を捉えるステップを含む請求項２４記載の方法。
【請求項２６】
前記第１の通過は第１の方向であり、前記第２の通過は第２の方向である請求項２５記載の方法。
【請求項２７】
前記試料の生物学的状態および／または強度スケーリングを示すために、基準試料で回折したかまたは他のやり方で屈折した光線が、前記画像を導き出す間に捉えられるようなやり方で配置された基準試料を使用するステップをさらに含む請求項１９乃至２６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
前記基準試料は基準試料結合パートナーであり、前記試料は細胞状結合事象である請求項２７記載の方法。
【請求項２９】
分子プロファイルシグネチャのライブラリに匹敵する分子プロファイルに到達するために、前記再構築された画像を処理するステップを含む請求項１９乃至２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
各試料用に画像強度値を生成するステップと、輪郭線内の画像物体を識別する画像強度の輪郭マップを生成するステップと、前記物体上に仮想グリッドを配置するステップと、を含む請求項２９記載の方法。
【請求項３１】
前記画像のねじれを補正するステップと、高められたグリッドを獲得するステップと、前記高められたグリッドからＸ−Ｙ座標を計算するステップと、を含む請求項３０記載の方法。
【請求項３２】
各試料用に平均補正強度を計算し、それによって、同一試料の少なくとも２つのセットが前記スライド上に設けられるステップと、基準試料および複製試料に基づいて各試料に関連した強度データを標準化するステップと、を含む請求項３０または３１記載の方法。
【請求項３３】
添付の図面を参照して実質的に本願に述べられた画像形成装置。
【請求項３４】
添付の図面を参照して実質的に本願に述べられた画像形成システム。
【請求項３５】
添付の図面を参照して実質的に本願に述べられた、試料スライド上の試料を表す画像を導き出す方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００４】
本発明の第１の態様によると、下記を具備する画像形成装置が設けられる。すなわち、  −試料スライドを担持するためのキャリアステージと、
−試料スライドを照明するための光源と、上記試料スライドは試料のアレイを含み、
−試料スライドの連続した部分が光源によって照明されるように、キャリアステージ及びそれに担持された試料スライドを動かすための駆動手段と、
−使用の際に、試料スライドを通って伝達され、試料スライドから出る光源からの光線に対してずれた角度で試料スライドから出る光線の上記連続した部分のみを実質的に捉えるように配置されて、試料スライドまたは試料のアレイの画像に再構築されるように配列された一連の部分的な画像を生成するデジタル光学カメラシステムと、である。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
本発明は、試料スライド上の試料を表す画像を導き出す方法をさらに提供し、この方法は、
−試料のアレイを含む試料スライドを提供するステップと、
−試料スライドをキャリアステージに装填するステップと、
−試料スライドの少なくとも一部を照明するステップと、
−試料スライドの連続した部分が光源によって照明されるように、キャリアステージ及び試料スライドを動かすステップと、
−試料スライドから出る光線の連続した回折または屈折部分のみを実質的に捉えて、試料のアレイの画像に再構築されるように配列された一連の部分的な画像を生成するステップと、
を含む。