【手続補正書】
【提出日】平成18年12月18日(2006.12.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
動物を悪性腫瘍から守るためのワクチンの調製における組成物の使用方法であって、
上記組成物は、
（ａ）酵母媒体と、
（ｂ）上記酵母媒体によって発現される融合タンパク質とを含み、
上記融合タンパク質は、
（ｉ）少なくともひとつの癌抗原と、
（ｉｉ）下記第１または第２の群から選択されるタンパク質とを含み、
第１の群は、上記癌抗原のＮ末端に結合したペプチドを含み、
上記ペプチドは、上記癌抗原とは非相同的な、少なくとも二つのアミノ酸残基から構成されており、
また、上記ペプチドは、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであり、
上記融合タンパク質の第１位置のアミノ酸残基は、メチオニンであり、
上記融合タンパク質の第２位置のアミノ酸残基は、グリシンでもプロリンでもなく、
上記融合タンパク質の第２〜６位置のアミノ酸残基は、いずれもメチオニンではなく、
上記融合タンパク質の第２〜５位置のアミノ酸残基は、いずれもリジンでもアルギニンでもなく、
第２の群は、上記癌抗原のＮ末端に結合した酵母タンパク質を含み、
上記酵母タンパク質は、約２〜約２００の、酵母の内在性タンパク質のアミノ酸から構成されており、
また、上記酵母タンパク質は、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであることを特徴とする、組成物の使用方法。
【請求項２】
動物を脳腫瘍または肺癌から守るためのワクチンを調製するための組成物の使用方法であって、
上記組成物は、酵母媒体と少なくともひとつの癌抗原とを含み、上記動物の呼吸管へ投与されるように処方されることを特徴とする、組成物の使用方法。
【請求項３】
動物において、抗原特異的体液性免疫反応または抗原特異的細胞性免疫反応を誘発するためのワクチンを調製するための組成物の使用方法であって、
上記組成物には、
（ａ）酵母媒体と、
（ｂ）上記酵母媒体によって発現される融合タンパク質とが含まれており、
上記融合タンパク質には、
（ｉ）少なくともひとつの抗原と、
（ｉｉ）下記第１または第２の群から選択されるタンパク質とを含み、
第１の群は、上記抗原のＮ末端に結合したペプチドを含み、
上記ペプチドは、上記抗原とは非相同的な、少なくとも二つのアミノ酸残基から構成されており、
上記ペプチドは、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであり、
上記融合タンパク質の第１位置のアミノ酸残基は、メチオニンであり、
上記融合タンパク質の第２位置のアミノ酸残基は、グリシンでもプロリンでもなく、
上記融合タンパク質の第２〜６位置のアミノ酸残基は、いずれもメチオニンではなく、
上記融合タンパク質の第２〜５位置のアミノ酸残基は、いずれもリジンでもアルギニンでもなく、
第２の群は、上記抗原のＮ末端に結合した酵母タンパク質を含み、
上記酵母タンパク質は、約２〜約２００の、内在性の酵母タンパク質のアミノ酸から構成されており、
上記酵母タンパク質は、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであることを特徴とする、組成物の使用方法。
【請求項４】
悪性腫瘍を有する患者であって、安定した混合骨髄キメリズムの定着に有効である、骨髄非切除の幹細胞移植による治療を受けた患者を治療するためのワクチンを調製するための組成物の使用方法であって、
上記幹細胞が、同種のドナーから提供され、
上記同種のドナーから得られたリンパ球が上記患者に投与され、
上記組成物は、酵母媒体と少なくともひとつの癌抗原とを含んでいることを特徴とする、組成物の使用方法。
【請求項５】
上記酵母媒体は、融合タンパク質である癌抗原を発現しており、
上記融合タンパク質は、
（ａ）少なくともひとつの癌抗原と、
（ｂ）上記癌抗原のＮ末端に結合したペプチドとを含んでおり、
上記ペプチドは、上記癌抗原とは非相同的な、少なくとも二つのアミノ酸残基から構成されており、
また、上記ペプチドは、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであり、
上記融合タンパク質の第１位置のアミノ酸残基は、メチオニンであり、
上記融合タンパク質の第２位置のアミノ酸残基は、グリシンでもプロリンでもなく、
上記融合タンパク質の第２〜６位置のアミノ酸残基は、いずれもメチオニンではなく、
上記融合タンパク質の第２〜５位置のアミノ酸残基は、いずれもリジンでもアルギニンでもないことを特徴とする請求項２または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項６】
上記ペプチドは、少なくとも２〜６つの、上記癌抗原とは非相同的なアミノ酸残基から構成されていることを特徴とする請求項１、３または５に記載の、組成物の使用方法。
【請求項７】
上記ペプチドは、Ｍ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６というアミノ酸配列を有しており、
上記配列において、
Ｘ２は、グリシン、プロリン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ３は、メチオニン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ４は、メチオニン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ５は、メチオニン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ６は、メチオニンを除くあらゆるアミノ酸であることを特徴とする請求項１、３または５に記載の、組成物の使用方法。
【請求項８】
上記Ｘ６は、プロリンであることを特徴とする請求項７に記載の、組成物の使用方法。
【請求項９】
上記ペプチドは、Ｍ−Ａ−Ｄ−Ｅ−Ａ−Ｐ（配列番号１）というアミノ酸配列を含んでいることを特徴とする請求項１、３または５に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１０】
上記酵母媒体は融合タンパク質である上記癌抗原を発現しており、
上記融合タンパク質は、
（ａ）少なくともひとつの癌抗原と、
（ｂ）上記癌抗原のＮ末端に結合した酵母タンパク質とを含んでおり、
上記酵母タンパク質は、約２〜約２００の、内在性の酵母タンパク質のアミノ酸から構成されており、
上記酵母タンパク質は、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであることを特徴とする請求項２または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１１】
上記酵母タンパク質は、上記融合タンパク質の同定および精製を行うための抗体エピトープを含んでいることを特徴とする請求項１、３または１０に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１２】
上記抗原は、少なくとも二つまたはそれ以上の癌抗原が含まれている融合タンパク質であることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１３】
上記抗原には、ひとつまたはそれ以上の癌抗原の免疫原性領域が少なくともひとつまたはそれ以上含まれていることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１４】
上記ワクチンは、少なくとも２つの癌抗原を含んでいることを特徴とする請求項２または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１５】
上記抗原は、黒皮腫、扁平上皮癌、乳癌、頭頚部癌、甲状腺癌、軟部組織肉腫、骨肉腫、精巣癌、前立腺癌、卵巣癌、膀胱癌、皮膚癌、脳腫瘍、脈管腫、血管肉腫、肥胖細胞腫、原発性肝癌、肺癌、膵臓癌、消化器癌、腎細胞癌、造血性腫瘍形成、および、これらの転移癌、を含む群より選択される悪性腫瘍に関連した癌抗原であることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１６】
上記抗原は、ｒａｓ遺伝子によりコードされた野生型または変異型のタンパク質であることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１７】
上記抗原は、Ｋ−ｒａｓ、Ｎ−ｒａｓ、Ｈ−ｒａｓ遺伝子を含む群より選択されたｒａｓ遺伝子によってコードされている、野生型または変異型のタンパク質であることを特徴とする請求項１６に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１８】
上記ｒａｓ遺伝子は、ひとつまたは複数の変異を有するＲａｓタンパク質をコードしていることを特徴とする請求項１６に記載の、組成物の使用方法。
【請求項１９】
上記抗原は、野生型Ｒａｓタンパク質の、少なくとも５〜９つの連続したアミノ酸残基の断片を含んでおり、
上記断片は、野生型Ｒａｓタンパク質の第１２、１３、５９、６１位置に相当するアミノ酸残基のいずれかを含んでおり、
また、上記第１２、１３、５９、６１位置のアミノ酸残基は、野生型Ｒａｓタンパク質から変異していることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２０】
上記抗原は、複数の領域を含む融合タンパク質構造物より構成されており、
上記複数の領域のそれぞれは、腫瘍性タンパク質由来のペプチドより構成されており、
上記ペプチドは、上記腫瘍性タンパク質に見られる変異アミノ酸とその両側のアミノ酸とを含む、少なくとも４アミノ酸残基を備えており、
上記変異は、造腫瘍性に関連するものであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２１】
上記融合タンパク質構造物は、他の変異した癌抗原とフレームを合わせて融合した、少なくともひとつのペプチドから構成されており、
上記ペプチドは、
（ａ）少なくとも配列番号３の配列の第８〜１６位置の配列を含んでおり、配列番号３の配列の第１２位置に相当するアミノ酸残基が、配列番号３の配列と比較して変異しているペプチドと、
（ｂ）少なくとも、配列番号３の配列の第９〜１７位置の配列を含んでおり、配列番号３の配列の第１３位置に相当するアミノ酸残基が、配列番号３の配列と比較して変異しているペプチドと、
（ｃ）少なくとも、配列番号３の配列の第５５〜６３位置の配列を含んでおり、配列番号３の配列の第５９位置に相当するアミノ酸残基が、配列番号３の配列と比較して変異しているペプチドと、
（ｄ）少なくとも、配列番号３の配列の第５７〜６５位置の配列を含んでおり、配列番号３の配列の第６１位置に相当するアミノ酸残基が、配列番号３の配列と比較して変異しているペプチドと、を含む群より選択されることを特徴とする請求項２０に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２２】
上記変異した癌抗原は、野生型Ｒａｓタンパク質の配列と比較して、少なくともひとつの変異を有するＲａｓタンパク質であることを特徴とする請求項２１に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２３】
上記酵母媒体は、全酵母、酵母スフェロプラスト、酵母細胞質体、酵母形骸、酵母亜細胞膜抽出物またはその画分、を含む群より選択されることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２４】
上記酵母媒体の調製に用いられる酵母細胞または酵母スフェロプラストは、上記癌抗原をコードする組換え核酸分子によって形質転換されており、その結果、上記酵母細胞または上記酵母スフェロプラストによって、上記癌抗原が組換え技術的に発現されることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２５】
上記組換え癌抗原を発現する上記酵母細胞または上記酵母スフェロプラストは、酵母細胞質体、酵母形骸、酵母亜細胞膜抽出物またはその画分、を含む酵母媒体の作成に利用されることを特徴とする請求項２４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２６】
上記酵母媒体は非病原性の酵母由来であることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２７】
上記酵母媒体は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅ属、Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅ属、Ｋｌｕｖｅｒｏｍｙｃｅ属、Ｈａｎｓｅｎｕｌａ属、Ｃａｎｄｉｄａ属、Ｐｉｃｈｉａ属を含む群より選択された酵母由来のものであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２８】
Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅ属は、Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項２９】
上記ワクチンは、呼吸管へ投与されるため、経鼻投与によって投与されるため、気管内投与によって投与されるため、または非経口の投与経路から投与されるために処方されるものであることを特徴とする請求項１、３または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３０】
上記ワクチンは、さらに、樹状細胞またはマクロファージを含んでおり、
上記融合タンパク質を発現する上記酵母媒体は、生体外で、上記樹状細胞または上記マクロファージへと送達され、
上記癌抗原を発現する上記酵母媒体を含有する、上記樹状細胞または上記マクロファージは、上記動物へと投与されることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３１】
上記樹状細胞または上記酵母媒体には、付加的に遊離抗原が含まれていることを特徴とする請求項３０に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３２】
上記ワクチンは、治療用ワクチンとして投与されるため、または予防的ワクチンとして投与されるために処方されるものであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３３】
上記動物は、脳腫瘍、肺癌、乳癌、黒皮腫、および腎臓癌を含む群より選択される癌を有しているか、上記癌を発生する虞があるものであることを特徴とする請求項１、３または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３４】
上記ワクチンは、上記動物から癌が外科的切除された後に投与されるものであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３５】
上記ワクチンは、上記動物の癌の外科的切除の後、および、骨髄非切除の同種幹細胞移植の後に投与されるものであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３６】
上記ワクチンは、上記動物の癌の外科的切除の後、骨髄非切除の同種幹細胞移植の後、および、同種ドナーのリンパ球の注入の後に投与されるものであることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１項に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３７】
上記酵母媒体の細胞内に、上記癌抗原が充填されることを特徴とする請求項２または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３８】
上記癌抗原は、共有結合または非共有結合によって上記酵母媒体へと付着されることを特徴とする請求項２または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項３９】
上記酵母媒体および上記癌抗原は、攪拌されることによって組み合わせられることを特徴とする請求項２または４に記載の、組成物の使用方法。
【請求項４０】
上記脳腫瘍は、原発性の脳腫瘍、多形性神経膠芽腫および異なる器官からの転移癌を含む群から選択されることを特徴とする請求項２に記載の、組成物の使用方法。
【請求項４１】
上記肺癌は、原発性の肺癌、非小細胞癌、小細胞癌、腺癌および異なる器官からの転移癌を含む群から選択されることを特徴とする請求項２に記載の、組成物の使用方法。
【請求項４２】
上記抗原は、ウイルス抗原、過剰発現した哺乳動物の細胞表面分子、細菌性抗原、真菌性抗原、原虫抗原、蠕虫抗原、外寄生体抗原、癌抗原、ひとつまたはそれ以上の変異アミノ酸を有する哺乳動物細胞分子、哺乳動物細胞で出生前または新生期に一般的に発現されるタンパク質、疫学的因子（ウイルスなど）の挿入により発現が誘導されるタンパク質、遺伝子転座によって発現が誘導されるタンパク質、制御配列の変異によって発現が誘導されるタンパク質、を含む群から選択されることを特徴とする請求項３に記載の、組成物の使用方法。
【請求項４３】
ワクチンであって、
上記ワクチンには、
（ａ）酵母媒体と、
（ｂ）上記酵母媒体によって発現される融合タンパク質とが含まれており、
上記融合タンパク質には、
（ｉ）少なくともひとつの癌抗原と、
（ｉｉ）下記第１または第２の群から選択されるタンパク質とを含み、
第１の群は、上記癌抗原のＮ末端に結合したペプチドを含み、
上記ペプチドは、上記癌抗原とは非相同的な、少なくとも二つのアミノ酸残基から構成されており、
上記ペプチドは、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであり、
上記融合タンパク質の第１位置のアミノ酸残基は、メチオニンであり、
上記融合タンパク質の第２位置のアミノ酸残基は、グリシンでもプロリンでもなく、
上記融合タンパク質の第２〜６位置のアミノ酸残基は、いずれもメチオニンではなく、
上記融合タンパク質の第２〜５位置のアミノ酸残基は、いずれもリジンでもアルギニンでもなく、
第２の群は、上記癌抗原のＮ末端に結合した酵母タンパク質を含み、
上記酵母タンパク質は、約２〜約２００の、内在性酵母タンパク質のアミノ酸から構成されており、
上記ペプチドは、上記酵母媒体における上記融合タンパク質の発現を安定化させるものであるか、または、発現した上記融合タンパク質の翻訳後修飾を防止するものであることを特徴とするワクチン。
【請求項４４】
上記ペプチドは、少なくとも６つの、上記癌抗原とは非相同的なアミノ酸残基から構成されていることを特徴とする請求項４３に記載のワクチン。
【請求項４５】
上記ペプチドは、Ｍ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６というアミノ酸配列を有しており、
上記配列において、
Ｘ２は、グリシン、プロリン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ３は、メチオニン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ４は、メチオニン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ５は、メチオニン、リジン、アルギニンを除くあらゆるアミノ酸であり、
Ｘ６は、メチオニンを除くあらゆるアミノ酸であることを特徴とする請求項４３に記載のワクチン。
【請求項４６】
Ｘ６は、プロリンであることを特徴とする請求項４５に記載のワクチン。
【請求項４７】
上記ペプチドは、Ｍ−Ａ−Ｄ−Ｅ−Ａ−Ｐ（配列番号１）というアミノ酸配列を含んでいることを特徴とする請求項４５に記載のワクチン。
【請求項４８】
上記抗原は、ウイルス抗原、哺乳動物の細胞表面分子、細菌性抗原、真菌性抗原、原虫抗原、蠕虫抗原、外寄生体抗原、癌抗原、ひとつまたはそれ以上の変異アミノ酸を有する哺乳動物細胞分子、哺乳動物細胞で出生前または新生期に一般的に発現されるタンパク質、疫学的因子（ウイルスなど）の挿入により発現が誘導されるタンパク質、遺伝子転座によって発現が誘導されるタンパク質、制御配列の変異によって発現が誘導されるタンパク質、を含む群から選択されることを特徴とする請求項４３に記載のワクチン。
【請求項４９】
上記酵母タンパク質には、上記融合タンパク質の同定および精製を行うための抗体エピトープが含まれていることを特徴とする請求項４３に記載のワクチン。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】発明の名称
【補正方法】変更
【補正の内容】
【発明の名称】組成物の使用方法およびワクチン