【手続補正書】
【提出日】平成19年3月16日(2007.3.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ種ではない植物のゲノムＤＮＡ配列に由来するセントロメアを含む、組換えＤＮＡ構築物であって、ここで該セントロメアは、反復ヌクレオチド配列のｎ個のコピーを含み、ｎは少なくとも２である、組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２】  Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ細胞ではない植物のゲノムＤＮＡ配列に由来するセントロメアを含む組換えＤＮＡ構築物であって、ここで該セントロメアは、反復ヌクレオチド配列のｎ個のコピーを含み、ｎは少なくとも２である、組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３】  前記セントロメアは、野菜作物植物のゲノムＤＮＡ配列に由来する、請求項１または２に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項４】  前記セントロメアは、果物およびつる植物のゲノムＤＮＡ配列に由来する、請求項１又は２に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項５】  前記セントロメアは、畑作物植物のゲノムＤＮＡ配列に由来する、請求項１または２に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項６】  ｎは少なくとも１５である、請求項１〜５のいずれか１項に記載のＤＮＡ構築物。
【請求項７】  ｎは少なくとも５０である、請求項１〜５のいずれか１項に記載のＤＮＡ構築物。
【請求項８】  ｎは１０００未満である、請求項１〜５のいずれか１項に記載のＤＮＡ構築物。
【請求項９】  ｎが約１００〜約５０，０００である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１０】  テロメアをさらに含む、請求項１〜９のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１１】  自律複製配列（ＡＲＳ）をさらに含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１２】  部位特異的組換えのための部位をさらに含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１３】  選択マーカー遺伝子またはスクリーニングマーカー遺伝子をさらに含む、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１４】  前記選択マーカー遺伝子またはスクリーニングマーカー遺伝子が細菌または酵母のいずれかにおいて機能する、請求項１３に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１５】  前記選択マーカー遺伝子またはスクリーニングマーカー遺伝子が植物において機能する、請求項１３に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１６】  構造遺伝子をさらに含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１７】  第２の構造遺伝子をさらに含む、請求項１６に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１８】  少なくとも３つの異なる構造遺伝子を含む、請求項１６に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項１９】  少なくとも１０個の異なる構造遺伝子を含む、請求項１６に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２０】  前記構造遺伝子が、抗生物質耐性遺伝子、除草剤耐性遺伝子、窒素固定遺伝子、植物病原体防御遺伝子、植物ストレス誘導性遺伝子、毒素遺伝子、レセプター遺伝子、リガンド遺伝子、種子貯蔵遺伝子、ホルモン遺伝子、酵素遺伝子、インターロイキン遺伝子、凝固因子遺伝子、サイトカイン遺伝子、抗体遺伝子、または増殖因子遺伝子からなる群より選択される、請求項１６〜１９に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２１】  前記酵素遺伝子は、バイオレメディエーションにおける使用のための生化学的廃棄物を代謝することに関与する酵素をコードする遺伝子、二次植物代謝物を生成する経路を改変するための酵素をコードする遺伝子、薬剤を生成する酵素をコードする遺伝子、植物の栄養含有量を改善する酵素をコードする遺伝子、ビタミン合成に関与する酵素をコードする遺伝子、炭水化物もしくはデンプンの合成に関与する酵素をコードする遺伝子、ミネラル蓄積またはアベイラビリティに影響する酵素をコードする遺伝子、フィターゼをコードする遺伝子、脂肪酸もしくは油の合成に関与する酵素をコードする遺伝子、化合物もしくはプラスチックの合成に関与する酵素をコードする遺伝子、燃料の合成に関与する酵素をコードする遺伝子、芳香の合成に関与する酵素をコードする遺伝子からなる群より選択される、請求項２０に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２２】  ウイルス、細菌、真菌、もしくは線虫に対する耐性を付加するタンパク質をコードする構造遺伝子を含む、請求項１６〜２１のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２３】  乾燥、熱、寒冷、凍結、過剰の湿度、もしくは塩ストレスに対する抵抗性を付加するタンパク質をコードする構造遺伝子を含む、請求項１６〜２１のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２４】  フォスフィノスリシン耐性遺伝子である構造遺伝子を含む、請求項１６〜２３のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２５】  グリフォセート耐性遺伝子である構造遺伝子を含む、請求項１６〜２４のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２６】  前記グリフォセート耐性遺伝子はＥＰＳＰ合成酵素である、請求項２５に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２７】  Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ毒素遺伝子である構造遺伝子を含む、請求項１６〜２６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２８】  前記構築物が１つ以上の前記構造遺伝子を発現し得る、請求項１６〜２７のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項２９】  前記構築物は、植物において前記構造遺伝子を発現し得る、請求項２８に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３０】  前記構造遺伝子は、植物細胞において機能する異種調節配列に作動可能に連結されている、請求項２８に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３１】  構造遺伝子が植物プロモーターに作動可能に連結されている、請求項２８に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３２】  前記構築物が複製起点を含む、請求項２８に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３３】  前記複製起点が細菌もしくは酵母のいずれかにおいて機能する、請求項３２に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３４】  前記複製起点が植物において機能する、請求項３２に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３５】  別個の染色体として維持され得、該染色体は娘細胞に安定に分離する、請求項１〜３４のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３６】  ミニ染色体ベクターである、請求項１〜３４のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項３７】  少なくとも２つの異なる農学形質と関連する複数の構造遺伝子を含み、ここで前記ミニ染色体は、植物細胞における有糸分裂および減数分裂を介して安定に分離する、請求項３６に記載のミニ染色体ベクター。
【請求項３８】  請求項１〜５６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３６または３７に記載のミニ染色体ベクターを含む細胞。
【請求項３９】  前記細胞が植物細胞である、請求項３８に記載の細胞。
【請求項４０】  前記植物細胞が双子葉植物由来である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４１】  前記双子葉植物がタバコ、トマト、ジャガイモ、テンサイ、エンドウ、ニンジン、カリフラワー、ブロッコリー、ダイズ、カノラ、ヒマワリ、アルファルファ、もしくはワタからなる群より選択される、請求項４０に記載の細胞。
【請求項４２】  前記植物細胞が単子葉植物由来である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４３】  前記単子葉植物が、コムギ、トウモロコシ、ライムギ、イネ、シバ、カラスムギ、オオムギ、ソルガム、キビもしくはサトウキビからなる群より選択される、請求項４２に記載の細胞。
【請求項４４】  前記植物細胞は野菜作物植物細胞である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４５】  前記植物細胞は果実またはつる作物の植物細胞である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４６】  前記植物細胞は、畑作物植物細胞である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４７】  前記植物細胞は、商業的な作物植物細胞である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４８】  （ｉ）植物細胞ゲノムに組み込まれず、（ｉｉ）ミニ染色体内の少なくとも１つの構造遺伝子と関連する植物細胞に変化した表現型を付与するミニ染色体を含む、請求項３８〜４７のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物。
【請求項４９】  前記構造遺伝子は前記植物に対して外因性である、請求項４８に記載の細胞。
【請求項５０】  前記構造遺伝子は、前記植物細胞に対してネイティブである、請求項４８に記載の細胞。
【請求項５１】  トランスジェニック植物細胞を調製する方法であって、出発植物細胞を、請求項１〜３６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３７もしくは３８に記載のミニ染色体ベクターと接触させ、それによって該出発植物細胞が、該組換えＤＮＡ構築物またはミニ染色体ベクターで形質転換される工程を包含する、方法。
【請求項５２】  前記トランスジェニック植物細胞は、野菜作物植物細胞である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】  前記トランスジェニック植物細胞は、果実またはつる作物の植物細胞である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５４】  前記トランスジェニック植物細胞は、畑作物植物細胞である、請求項５１に記載の方法。
【請求項５５】  請求項５１に記載の方法によって調製される、細胞。
【請求項５６】  請求項３８〜５０のいずれか１項に記載の細胞を含む、植物組織または植物部分。
【請求項５７】  請求項１〜３６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３７もしくは３８に記載のミニ染色体ベクターを含む植物を提供する方法であって、請求項３８〜５０のいずれか１項に記載の細胞から植物を再生させる工程を包含する、方法。
【請求項５８】  請求項１〜３６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３７もしくは３８に記載のミニ染色体ベクターを含む植物。
【請求項５９】  請求項３８〜５０のいずれか１項に記載の細胞を含む、植物。
【請求項６０】  双子葉植物としてさらに定義される、請求項５８または５９に記載の植物。
【請求項６１】  前記双子葉植物が、タバコ、トマト、ジャガイモ、テンサイ、エンドウ、ニンジン、カリフラワー、ブロッコリー、ダイズ、カノラ、ヒマワリ、アルファルファまたはワタからなる群より選択される、請求項６０に記載の植物。
【請求項６２】  単子葉植物としてさらに定義される、請求項５８〜６１のいずれか１項に記載の植物。
【請求項６３】  前記単子葉植物が、コムギ、トウモロコシ、ライムギ、イネ、シバ、カラスムギ、オオムギ、ソルガム、キビまたはサトウキビからなる群より選択される、請求項６２に記載の植物。
【請求項６４】  請求項１〜３６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３７もしくは３８に記載のミニ染色体ベクターを含む、種子。
【請求項６５】  請求項３８〜５０のいずれか１項に記載の細胞を含む、種子。
【請求項６６】  請求項５１に記載の方法によって生成される細胞を含む、種子。
【請求項６７】  請求項５８〜６３のいずれか１項に記載の植物の種子または子孫を生成する方法であって、該方法は、
請求項１〜３６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３７もしくは３８に記載のミニ染色体ベクターを含む第一の植物と、第二の植物とを交配する工程、および
該交配から種子もしくは子孫を得る工程、
を包含する、方法。
【請求項６８】  前記第二の植物は、セントロメアを含む組換えＤＮＡ構築物もミニ染色体ベクターも含まない、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】  請求項６７または６８に記載の方法によって生成される子孫。
【請求項７０】  請求項１〜３６のいずれか１項に記載の組換えＤＮＡ構築物または請求項３７もしくは３８に記載のミニ染色体ベクターを含む植物子孫であって、ここで該植物子孫は、請求項５８〜６３のいずれか１項に記載の植物の育種の結果である、植物子孫。
【請求項７１】
請求項６９または７０に記載の子孫を生長させる工程、および
該子孫から組織を取り出す工程、
を包含する、植物組織を生成する方法。
【請求項７２】
請求項５８〜６３のいずれか１項に記載の植物または請求項６７または７０に記載の子孫を生長させる工程、および
該植物から種子を回収する工程、
を包含する、方法。
【請求項７３】
請求項５８〜６３のいずれか１項に記載の植物または請求項６７もしくは７０に記載の植物子孫を使用する方法であって、該方法は、該植物を生長させて、前記ミニ染色体の構造遺伝子によってコードされる組換えタンパク質を生成する工程を包含する、方法。
【請求項７４】
前記植物を採取または処理する工程、および該植物から前記組換えタンパク質を抽出する工程をさらに包含する、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
前記組換えタンパク質が薬剤である、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
前記植物は変化した食品を生成する、請求項７３に記載の方法。
【請求項７７】
前記組換えタンパク質は酵素である、請求項７３に記載の方法。
【請求項７８】  ミニ染色体ベクターを産生する方法であって、以下：
（ａ）第１のベクターおよび第２のベクターを得る工程であって、該第１のベクターまたは該第２のベクターが選択マーカーまたはスクリーニングマーカー、複製起点、テロメア、およびＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ種ではない植物のゲノムＤＮＡ配列に由来するセントロメアを含み、ここで該セントロメアは、反復ヌクレオチド配列のｎ個のコピーを含み、ｎは少なくとも２であり、そしてここで該第１のベクターおよび該第２のベクターは部位特異的組換えのための部位を含む、工程；および
（ｂ）該第１のベクターと該第２のベクターを接触させて、該第１のベクター上の該部位特異的組換えのための部位と該第２のベクター上の該部位特異的組換えのための部位との間で部位特異的組換えを生じさせて、該選択マーカーまたはスクリーニングマーカー、該複製起点、該テロメアおよび該セントロメアを含む、ミニ染色体ベクターを作製する、工程
を包含する方法。
【請求項７９】  前記接触させる工程が植物細胞において行われる、請求項７８に記載の方法。
【請求項８０】  前記接触させる工程が、リコンビナーゼの存在下でなされる、請求項７９に記載の方法。
【請求項８１】  前記リコンビナーゼがＣｒｅ、Ｆｌｐ、Ｇｉｎ、Ｐｉｎ、Ｓｒｅ、ｐｉｎＤ、Ｉｎｔ−Ｂ１３、およびＲからなる群より選択される、請求項７８〜８０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８２】  前記第１のベクターまたは前記第２のベクターが、Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ媒介性形質転換のためのボーダー配列を含む、請求項７８〜８１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８３】  作物の農学特性を改善するための方法であって、該方法は、
（ａ）該作物と、ミニ染色体を含むトランスジェニック作物とを交配する工程であって、ここで該ミニ染色体は、商業的に望ましい形質をコードする遺伝子、ならびに（ｉ）商業的作物に由来し、かつ（ｉｉ）娘細胞に分離することができるセントロメア関連配列を含む、工程、ならびに
（ｂ）該種子が、該ミニ染色体を含む改善された作物を生成するように交配することによって生成された種子を発芽させる工程であって、ここで該改善された作物は、改善された農学特性を示す、工程、
を包含する、方法。
【請求項８４】
商業的に望ましい形質を有する植物の種子を生成する方法であって、該方法は、
（ａ）作物と、ミニ染色体を含むトランスジェニック作物とを交配する工程であって、ここで該ミニ染色体は、該商業的に望ましい形質をコードする遺伝子、ならびに（ｉ）商業的作物に由来し、かつ（ｉｉ）娘細胞に分離することができるセントロメア関連配列を含む、工程、ならびに
（ｂ）該交配によって生成される種子を回収する工程であって、該種子が、該商業的に望ましい形質を有する植物を生成し得る、工程、
を包含する、方法。
【請求項８５】
商業的に望ましい形質を有する植物についての種子を生成する方法であって、該方法は、
（ａ）ミニ染色体を含むトランスジェニック作物を自己受精させる工程であって、ここで該ミニ染色体は、該商業的に望ましい形質をコードする遺伝子、ならびに（ｉ）商業的植物に由来しかつ（ｉｉ）娘細胞に分離することができる、工程、ならびに
（ｂ）該自己受精によって生成される種子を回収する工程であって、ここで該種子は、該商業的に望ましい形質を有する植物を生成することができる、工程、
を包含する、方法。