【手続補正書】
【提出日】平成19年1月23日(2007.1.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
(a)(i)支持媒体；および(ii)支持媒体により支持される複数の検出可能実体を含有する参照標準またはその平面切片を提供する工程、ここで検出可能実体は細長い経路を有し、所定の量の検出可能実体が参照標準の横断面の規定された領域に存在する；
(b)参照標準、その平面切片、または規定された領域における検出可能実体の存在または量を示す第１の参照シグナルを得る工程；
(c)生物学的試料を提供し、生物学的試料、またはその成分中の検出可能実体の存在または量を示す第２のシグナルを得る工程；および
(d)(c)で得られた第２のシグナルに対して(b)で得られた参照シグナルを比較する工程、
を含む方法。
【請求項２】
参照シグナルが、試料中の検出可能実体の存在、量または濃度を決定するために第２のシグナルと比較される請求項１記載の生物学的試料中の検出可能実体の存在、量または濃度の指標を得る方法。
【請求項３】
参照標準またはその平面切片が、生物学的試料と同じ１以上の工程または条件、好ましくは実質的に全ての工程または条件に曝される請求項１または２記載の方法。
【請求項４】
参照標準またはその平面切片が１つ以上、好ましくは全ての以下の工程：
スライドへの装填、ベーキング、脱パラフィン、再水和、抗原回復、ブロッキング、抗体への曝露、一次抗体への曝露、核酸プローブへの曝露、洗浄、二次抗体−酵素コンジュゲートへの曝露、酵素基質への曝露、色素体基質への曝露および対比染色を通じて処理される請求項１、２または３記載の方法。
【請求項５】
検出可能実体が、ハプテン、生物学的活性な分子、抗原、エピトープ、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、抗体、核酸、ウイルス、ウイルス様粒子、ヌクレオチド、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、修飾デオキシリボヌクレオチド、ヘテロ二重鎖、ナノ粒子、ヌクレオチドの合成アナログ、リボヌクレオチドの合成アナログ、修飾ヌクレオチド、修飾リボヌクレオチド、アミノ酸、アミノ酸アナログ、修飾アミノ酸、修飾アミノ酸アナログ、ステロイド、プロテオグリカン、脂質、炭水化物、色素、診断関連標的：からなる群より選ばれ、好ましくは抗原、エピトープ、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、核酸、または２つ以上もしくは複数の任意の上記のもの、または１以上の上記のものの混合物、融合物、組み合わせもしくはコンジュゲート：からなる群より選ばれる請求項１〜４いずれか記載の方法。
【請求項６】
検出可能実体が任意の１以上のHER2、ER、PR、p16、Ki-67およびEGFRタンパク質、およびそのようなものをコードする核酸を含む請求項１〜５いずれか記載の方法。
【請求項７】
第２の参照標準またはその平面切片を提供する工程、第２の参照標準、その平面切片または規定された領域内の検出可能実体の量を示す第２の参照シグナルを得る工程；および第１の参照シグナルおよび第２の参照シグナルに対して(c)で得られた第２のシグナルを比較する工程をさらに含む請求項１〜６いずれかに記載の方法。
【請求項８】
検出可能実体の存在および／または量が、結合因子、好ましくは標識された結合因子、好ましくは抗体、好ましくは検出可能実体に特異的に結合可能な抗体、DNAまたはRNA等の核酸、好ましくは検出可能実体に特異的に結合可能な核酸、タンパク質核酸(PNA)、色素、特別な染料、ヘマトキシリン-エオシン(H & E)、Gomoriメテナミン銀染料(GMS)、過ヨウ素酸-シッフ(PAS)染料、トリクロムブルー、マッソントリクローム、プルシアンブルー、ギムザ、Diff-Quik、Reticulum、コンゴーレッド、アルシアンブルー、シュタイナー、AFB、PAP、グラム、ムチカルミン、Verhoeff-van Gieson、エラスチカ、カルボールフクシンおよびゴルジ染色からなる群より選ばれる結合因子により明らかになり得る請求項１〜７いずれか記載の方法。
【請求項９】
検出可能なシグナルが：放射線、光学密度、反射率、放射能、蛍光、酵素活性からなる群より選ばれる請求項１〜８いずれか記載の方法。
【請求項１０】
(a)参照標準が長方形の形状であり、検出可能実体が、参照標準の長軸に沿うかもしくは実質的に平行して配置される実質的に直線状のロッドの形態である；もしくは
(b)規定された領域が、類似した量の検出可能実体を好ましくは含有する少なくとも１つの他の参照標準の横断面に存在する；もしくは
(c)検出可能実体が細長い経路に沿って実質的に均一な分布を有する；もしくは
(d)検出可能実体が参照標準の全ての横断する平面切片において実質的に同じ面積、量または濃度で存在する；
または上記の任意の組み合わせ
である請求項１〜９いずれか記載の方法。
【請求項１１】
支持媒体が包埋媒体を含み、検出可能実体が包埋され、包埋媒体が、好ましくは、氷、ワックス、パラフィン、アクリル樹脂、メタクリル酸樹脂、エポキシ、Epon、Araldite、Lowicryl、K4MおよびLR WhiteおよびDurcupanからなる群より選ばれる請求項１〜１０いずれか記載の方法。
【請求項１２】
検出可能実体が、好ましくは、ポリアミド繊維、セルロース繊維、ポリカルバメート繊維、絹繊維、ポリエステル繊維、ナイロン繊維、レーヨン繊維およびそれらの混紡からなる群より選ばれる細長い繊維に付着、好ましくは化学結合している請求項１〜１１いずれか記載の方法。
【請求項１３】
検出可能実体が繊維のコアおよび表面部分の両方で実質的に均一である請求項１２記載の方法。
【請求項１４】
繊維の表面部分の検出可能実体がコア部分よりも大きい量で存在し、好ましくは繊維のコア部分は実質的に検出可能実体を含まない請求項１２記載の方法。
【請求項１５】
検出可能実体が包埋媒体内の細長いチャネルにおいて形成される請求項１〜１１いずれか記載の方法。
【請求項１６】
繊維またはチャネルが、実質的にその全長を横切る均一な横断面領域を有し、好ましくは繊維またはチャネルが約0.5μm〜25μm、好ましくは1.5μm〜15μmの直径を有する請求項１２〜１５いずれか記載の方法。
【請求項１７】
参照標準が、
(a)実質的に平行な方向の、好ましくは一束の２つ以上の直線繊維またはチャネル；または
(b)各々が個々の繊維またはチャネル中もしくはその上に配置されている２つ以上の異なる検出可能実体；または
(c)各々が同じ検出可能実体を含有し、好ましくは各々の上に異なる量の検出可能実体を含有する２つ以上の繊維またはチャネル、；
または上記の任意の組み合わせ
を含有してなる請求項１〜１６いずれか記載の方法。
【請求項１８】
参照標準の平面切片が異なる密度の検出可能実体が存在する複数の領域を含む請求項１〜１７いずれか記載の方法。
【請求項１９】
参照標準の平面切片が、実質的に診断上有意な密度で検出可能実体を含有する第一の領域を含有し、好ましくは検出可能実体を実質的に含有しない繊維またはチャネルを含有する対照をさらに含有する請求項１〜１８いずれか記載の方法。
【請求項２０】
生物学的試料中の検出可能実体の存在または所定の量の検出可能実体の存在が、該試料が採取された生物学的試料または個体における疾患または状態の可能性を示す、個体の疾患または状態の可能性の指標を得るための請求項１〜１９いずれか記載の方法。
【請求項２１】
生物学的試料が、細胞、組織または器官、好ましくは疾患または状態を患うことが疑われる生物の細胞、組織または器官を含む請求項１〜２０いずれか記載の方法。
【請求項２２】
(a)参照標準またはその平面切片を提供する工程、参照標準が、
(i)支持媒体；および
(ii)支持媒体により支持される複数の検出可能実体
を含む；検出可能実体が細長い経路を有する；
所定の量の検出可能実体が参照標準の横断面の規定された領域に存在する；
検出可能実体の検出可能特性が手順の結果として変化する；
(b)参照標準において手順を行う工程；
(c)検出可能実体の検出可能特性における変化を検出する工程
を含む、手順の有効性または首尾を評価する方法。
【請求項２３】
手順が、試料と実質的に並行して参照標準または平面切片において行われる、試料において行われる手順の有効性または首尾を評価するための請求項２２記載の方法。
【請求項２４】
検出可能実体の検出可能特性が首尾よい手順の結果として変化し、検出可能実体の検出可能特性における変化が、手順が首尾よいことを確証するために検出される、請求項２２または２３記載の方法。
【請求項２５】
検出可能実体の検出可能特性が、失敗した手順の結果として変化し、検出可能実体の検出可能特性における変化が、手順が失敗したことを確証するために検出される請求項２２または２３記載の方法。
【請求項２６】
手順が、インサイチュハイブリダイゼーション手順、免疫組織学的手順、脱パラフィン、抗原回復、ブロッキング、内因性ビオチンブロッキング、内因性酵素ブロッキング、洗浄工程、一次抗体等の顕在化因子とのインキュベーション、二次可視化成分とのインキュベーション、色素体染色、染色情報取得および分析からなる群より選ばれる請求項２２〜２５いずれか記載の方法。
【請求項２７】
手順が抗原回復手順であり、検出可能実体の検出可能特性が１つ以上のエピトープのマスキングまたはアンマスキングを含む請求項２２〜２６いずれか記載の方法。
【請求項２８】
参照標準における検出実体が修飾されて、１つ以上のエピトープがマスクされ、そのいくつかまたは全てが首尾よい抗原回復手順においてアンマスクされる請求項２２〜２６いずれか記載の方法。
【請求項２９】
手順が脱パラフィン手順であり、検出可能実体の検出可能特性が、脱パラフィン手順後の参照標準における検出可能実体の存在または量を含む請求項２２〜２６いずれか記載の方法。
【請求項３０】
参照標準中の検出可能実体が、脱パラフィン媒体に可溶性であり、検出可能実体の少なくとも一部、好ましくは全てが首尾よい脱パラフィン手順後に除去される請求項２２〜２６いずれか記載の方法。
【請求項３１】
２つ以上の手順の有効性または首尾が好ましくは並行して評価される請求項２２〜２６いずれか記載の方法。
【請求項３２】
参照標準が、(i)支持媒体；および(ii)支持媒体により支持される複数の検出可能実体を含み；検出可能実体が細長い経路を有し；検出可能実体の所定の量が、参照標準の横断面の規定された領域に存在し、検出可能実体の検出可能特性が手順の結果として変化する、手順を確認するための参照標準の使用。
【請求項３３】
参照標準が抗原回復確証標準、脱パラフィン標準、ブロッキング確証標準、洗浄確証標準、一次抗体確証標準、二次抗体確証標準、較正標準、または診断標準として使用される請求項３２記載の使用。
【請求項３４】
請求項１〜３１いずれか記載の方法において使用するための指示書と共に参照標準またはその平面切片を含有してなり、参照標準が(i)支持媒体；および(ii)支持媒体により支持される複数の検出可能実体を含み；検出可能実体が細長い経路を有し；検出可能実体の所定の量が参照標準の横断面の規定された領域に存在するキット。
【請求項３５】
検出可能実体に特異的に結合することができる結合因子をさらに含有してなり、結合因子が参照標準、その平面切片または規定された領域において検出可能実体の存在または量を示すシグナルを生成する、請求項３４記載のキット。
【請求項３６】
請求項３４または３５記載のキットを含む、生物学的試料において検出可能実体の診断上関連する存在または量を検出するための診断キット。
【請求項３７】
個体の疾患または状態の少なくとも１つの症状を治療または軽減することができ、好ましくは検出可能実体に対する抗体を含む治療剤を伴う請求項３４〜３６いずれか記載のキットまたは診断キット。
【請求項３８】
参照標準に各々由来する２つ以上の平面切片のセットであって、参照標準が(i)支持媒体；および(ii)支持媒体により支持される複数の検出可能実体を含有してなり、検出可能実体が細長い経路を有し；所定の量の検出可能実体が参照標準の横断面の規定された領域において存在し；セットの少なくとも２つの平面切片が異なる量の検出可能実体を各々含有する参照標準に由来する２つ以上の平面切片のセット。
【請求項３９】
検出可能実体を含有する規定された領域を各々含有する２つ以上の平面切片のセットであって、規定された領域における検出可能実体の量がセットの少なくとも２つの平面切片間で異なり、各々の平面切片が(i)支持媒体；および(ii)支持媒体により支持される複数の検出可能実体を含有する参照標準に由来し；検出可能実体が細長い経路を有する、２つ以上の平面切片のセット。