【手続補正書】
【提出日】平成19年10月2日(2007.10.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
サンプル中の核酸の存在または非存在を決定するための方法であって、ここで該方法が、以下：
ａ）非対称のシアニン色素化合物をサンプルと合わせて標識混合物を調製する工程であって、ここで該サンプルが固体または半固体の支持体上に固定化され、そして該非対称のシアニン色素化合物が式    
【化１】
2007507238.tif 000001
を有し；
ここでＸはＯ、Ｓ、またはＣ（ＣＨ３）２であり；
Ｒ１は縮合されたベンゼン、メトキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２およびＲ３は独立してＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ４はＣ１〜Ｃ６アルキルまたはメトキシであり；
ｔは独立して０、１、２、３または４であり；
ｓは独立して０、１、２、３または４であり、そして
ｎは０、１、２または３である工程；
ｂ）該標識混合物を、該非対称のシアニン色素化合物が該核酸と会合して、インキュベートされたサンプルを調製するために十分な時間、インキュベートする工程；
ｃ）該インキュベートされたサンプルに適切な波長を照射して、照射されたサンプルを調製する工程；および
ｄ）該照射されたサンプルを観察する工程であって、それによって該核酸の存在または非存在が決定される工程；
を包含する方法であって、ただし、該支持体がポリマーのゲルである場合、該非対称のシアニン色素化合物はチアゾールオレンジではない、方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法であって、ここで、前記核酸が一本鎖ＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、またはそれらの組み合わせである、方法。
【請求項３】
前記核酸がＤＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記サンプルが固定化される前に、前記非対称のシアニン色素化合物が前記核酸と合わせられる、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
固定化の間に、前記非対称のシアニン色素化合物が前記サンプルと合わせられる、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記核酸が固定化された後に、前記非対称のシアニン色素化合物が前記核酸と合わせられる、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記固体または半固体の支持体が、ポリマーのゲル、膜、アレイ、ガラスビーズ、スライドガラス、またはポリマーの微小粒子である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記固体または半固体の支持体が、アガロースゲルまたはポリアクリルアミドゲルである、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記非対称のシアニン色素化合物が、ポリマーの膜上に固定化される、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
請求項１に記載の方法であって、ここで前記シアニン色素が式
【化２】
2007507238.tif 000002
を有し、そして真核生物細胞中で本質的に非遺伝子毒性であるとして特徴付けられる、方法。
【請求項１１】
前記核酸が、アガロースゲルまたはポリアクリルアミドゲル上に固定化されたＤＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
サンプル中の核酸の存在または非存在を決定するための方法であって、ここで該方法が、以下；
ａ）本質的に非遺伝子毒性であるとして特徴付けられる非対称のシアニン色素化合物をサンプルと合わせて、標識混合物を調製する工程であって、ここで該サンプルは固体または半固体の支持体上に固定化される、工程；
ｂ）該標識混合物を、該色素が該核酸と会合して、インキュベートされたサンプルを調製するために十分な時間、インキュベートする工程；
ｃ）該インキュベートされたサンプルに適切な波長を照射して、照射されたサンプルを調製する工程；および
ｄ）該照射されたサンプルを観察する工程であって、それによって該核酸の存在または非存在が決定される工程；
を包含する方法であって、ただし、該支持体がポリマーのゲルである場合、該シアニン色素化合物はチアゾールオレンジではない、方法。
【請求項１３】
前記シアニン色素化合物が式
【化３】
2007507238.tif 000003
を有する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記シアニン色素が、前記サンプルが固定化される前に前記核酸と合わせられる、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
前記シアニン色素が、固定化の間に前記核酸と合わせられる、請求項１２に記載の方法。
【請求項１６】
前記シアニン色素が、前記サンプルが固定化された後に前記核酸と合わせられる、請求項１２に記載の方法。
【請求項１７】
前記核酸がＤＮＡである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１８】
前記固体または半固体の支持体が、ポリマーのゲル、膜、アレイ、ガラス、およびポリマーの微小粒子である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１９】
前記ポリマーのゲルが、アガロースゲルまたはポリアクリルアミドゲルである、請求項１２に記載の方法。
【請求項２０】
固体または半固体の支持体上の固定化された核酸の存在または非存在を決定するための染色溶液であって、ここで該溶液が以下：
ｅ）式    
【化４】
2007507238.tif 000004
を有する、非対称のシアニン色素化合物であって、
ここでＸはＯ、Ｓ、またはＣ（ＣＨ３）２であり；
Ｒ１は縮合されたベンゼン、メトキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２およびＲ３は独立してＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ４はＣ１〜Ｃ６アルキルまたはメトキシであり；
ｔは独立して０、１、２、３または４であり；
ｓは独立して０、１、２、３または４であり、ならびに
ｎは０、１、２または３である非対称のシアニン色素化合物；ならびに
ａ）トリスホウ酸緩衝液または酢酸トリス緩衝液；
を含む溶液であって、ただし、該シアニン色素化合物がチアゾールオレンジではない、溶液。
【請求項２１】
さらに、ポリマー化されていないアガロースまたはポリアクリルアミドを含む、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２２】
さらに、固体または半固体のマトリックスを含む、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２３】
前記シアニン色素が溶液中にあるか、あるいは固体または半固体のマトリックス上に固定化される、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２４】
前記染色溶液が、約６〜約８のｐＨを有する、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２５】
前記核酸が、一本鎖ＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、またはそれらの組み合わせである、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２６】
前記核酸がＤＮＡである、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２７】
前記シアニン色素が、式
【化５】
2007507238.tif 000005
を有し、そして真核生物細胞中で本質的に非遺伝子毒性であるとして特徴付けられる、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２８】
前記核酸が、アガロースゲルまたはポリアクリルアミドゲル上に固定化されたＤＮＡである、請求項２０に記載の染色溶液。
【請求項２９】
固定化された核酸の存在または非存在を決定するための染色溶液であって、ここで該溶液が以下：
ａ）真核生物細胞中で本質的に非遺伝子毒性であるとして特徴付けられる、非対称のシアニン色素化合物；および
ｂ）酢酸トリス緩衝液、またはトリスホウ酸緩衝液
を含む、染色溶液。
【請求項３０】
さらに、ポリマー化されていないアガロースまたはポリアクリルアミドを含む、請求項２９に記載の染色溶液。
【請求項３１】
さらに、固体または半固体のマトリックスを含む、請求項２９に記載の染色溶液。
【請求項３２】
前記シアニン色素が溶液中にあるか、あるいは固体または半固体のマトリックス上に固定化される、請求項２９に記載の染色溶液。
【請求項３３】
前記シアニン色素が、式
【化６】
2007507238.tif 000006
を有する、請求項２９に記載の染色溶液。
【請求項３４】
前記緩衝液が、約６〜約８のｐＨを有する、請求項２９に記載の染色溶液。
【請求項３５】
前記核酸が一本鎖または二本鎖のＲＮＡまたは一本鎖または二本鎖のＤＮＡ、あるいはそれらの組み合わせである、請求項２９に記載の染色溶液。
【請求項３６】
前記核酸がＤＮＡである、請求項３５に記載の溶液。
【請求項３７】
固体または半固体の支持体上に固定化された核酸の検出のための化合物であって、ここで該化合物が、真核生物細胞中で本質的に非遺伝子毒性であるとして特徴付けられる、非対称のシアニン色素化合物である、化合物。
【請求項３８】
前記化合物が水溶液中にある、請求項３７に記載の化合物。
【請求項３９】
前記化合物が、固体または半固体マトリックス上に固定化されているか、または固体または半固体マトリックス中にある、請求項３７に記載の化合物。
【請求項４０】
前記固体または半固体のマトリックスがアガロースを含む、請求項３９に記載の化合物。
【請求項４１】
前記固体または半固体のマトリックスがポリマーの膜である、請求項３９に記載の化合物。
【請求項４２】
前記シアニン化合物が、式
【化７】
2007507238.tif 000007
を有する、請求項３７に記載の化合物。
【請求項４３】
固定化された核酸を検出するためのキットであって、該キットが以下：
ｆ）式
【化８】
2007507238.tif 000008
を有する化合物であって、
ここでＸはＯ、Ｓ、またはＣ（ＣＨ３）２であり；
Ｒ１は縮合されたベンゼン、メトキシ、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２およびＲ３は独立してＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ４はＣ１〜Ｃ６アルキルまたはメトキシであり；
ｔは独立して０、１、２、３または４であり；
ｓは独立して０、１、２、３または４であり、そして、
ｎは０、１、２または３である化合物；
を備えるキットであって、ただし、該シアニン色素化合物がチアゾールオレンジではない、キット。
【請求項４４】
前記化合物が水溶液中にある、請求項４３に記載のキット。
【請求項４５】
前記水溶液がトリスホウ酸または酢酸トリスを含む、請求項４４に記載のキット。
【請求項４６】
前記化合物がアルコールまたはＤＭＳＯに溶解される、請求項４３に記載のキット。
【請求項４７】
前記化合物が、固体または半固体のマトリックス上に固定化される、請求項４３に記載のキット。
【請求項４８】
前記マトリックスがアガロースを含む、請求項４７に記載のキット。
【請求項４９】
前記マトリックスがポリマーの膜である、請求項４７に記載のキット。
【請求項５０】
前記化合物が
【化９】
2007507238.tif 000009
であり、そして本質的に非遺伝子毒性であるとして特徴付けられる、請求項４３に記載のキット。