【手続補正書】
【提出日】平成19年2月2日(2007.2.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  標的タンパク質のユビキチン化を活性化するための化合物であって、該化合物は：
ａ）ユビキチン化系のＥ３機能的エレメントまたはＥ２機能的エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識エレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該ユビキチン化系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについて少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識エレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合エレメントであって、ここで該標的タンパク質結合エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合エレメント、
を含み、ここで該ユビキチン化認識エレメントは、該標的タンパク質結合エレメントに共有結合している、化合物。
【請求項２】  標的タンパク質のユビキチン化を活性化するための化合物であって、該化合物は：
ａ）ユビキチン化系のＥ３機能的エレメントまたはＥ２機能的エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識ペプチドエレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識ペプチドエレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該ユビキチン化系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについての少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識ペプチドエレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合エレメントであって、ここで該標的タンパク質結合エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合エレメント、
を含み、ここで該ユビキチン化認識ペプチドエレメントは、該標的タンパク質結合エレメントに共有結合している、化合物。
【請求項３】  標的タンパク質のユビキチン化を活性化するための化合物であって、該化合物は：
ａ）ユビキチン化系のＥ３機能的エレメントまたはＥ２機能的エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識エレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そしてユビキチン化系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについて少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識エレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合ペプチドエレメントであって、ここで該標的タンパク質結合ペプチドエレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合ペプチドエレメント、
を含み、ここで該ユビキチン化認識エレメントは、該標的タンパク質結合ペプチドエレメントに共有結合している、化合物。
【請求項４】  標的タンパク質のユビキチン化を活性化するための化合物であって、該化合物は：
ａ）ユビキチン化系のＥ３エレメントまたはＥ２エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識ペプチドエレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識ペプチドエレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該ユビキチン化系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについて少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識ペプチドエレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合ペプチドエレメントであって、ここで該標的タンパク質結合ペプチドエレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合ペプチドエレメント、
を含み、ここで該ユビキチン化認識ペプチドエレメントは、該標的タンパク質結合ペプチドエレメントに共有結合している、化合物。
【請求項５】  前記ユビキチン化認識エレメントが、少なくとも１０3Ｍ-1の親和性および５０と１０，０００との間の分子量を有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項６】  前記標的タンパク質結合エレメントが、５０〜１０，０００の分子量および１０6Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、請求項５に記載の化合物。
【請求項７】  前記ユビキチン化認識エレメントが、少なくとも１０4Ｍ-1の親和性および５０と３，０００との間の分子量を有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項８】  前記標的タンパク質結合エレメントが、５０〜３，０００の分子量および少なくとも１０7Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項９】  前記標的タンパク質結合エレメントが、５０〜３，０００の分子量および１０8Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、請求項５に記載の化合物。
【請求項１０】  前記ユビキチン化認識エレメントが、Ｐｈｅ、Ａｒｇ、Ｌｙｓ、Ｔｒｐ、Ｌｅｕ、Ａｓｎ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、Ｔｙｒ、Ｈｉｓ、Ｇｌｕ、Ｃｙｓ、Ｔｈｒ、Ｓｅｒ、およびＡｌａならびにその酸化された誘導体からなる群より選択される、遊離のアミノ末端を有するアミノ酸を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１１】  前記ユビキチン化認識エレメントが、Ｐｈｅ、Ａｒｇ、Ｌｙｓ、Ａｓｎ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、Ｇｌｕ、およびＣｙｓからなる群より選択されるアミノ酸を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１２】  前記ユビキチン化認識エレメントが、Ａｒｇ、Ｐｈｅ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、およびＧｌｕからなる群より選択されるアミノ酸を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１３】  前記ユビキチン化認識エレメントが、Ａｒｇ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−Ａｌａ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−Ａｌａ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−Ａｌａ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、およびＰｈｅ−Ａｌａ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓからなる群より選択される部分を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１４】  前記ユビキチン化認識エレメントが、Ａｒｇ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ａｒｇ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓからなる群より選択される部分を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１５】  前記認識エレメントが、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−Ｃｙｓ、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−Ｃｙｓからなる群より選択される部分を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１６】  前記ユビキチン化認識エレメントが、ユビキチン化系の認識部位に結合することによってユビキチン化反応を阻害し得る化合物である、請求項１に記載の化合物。
【請求項１７】  前記ユビキチン化認識エレメントが、ユビキチン化系の認識部位と相互作用し得る化合物であって、該認識部位は、Ｎ末端Ｎ−レコグニン、「ｄｅｓｔｒｕｃｔｉｏｎ  ｂｏｘ」すなわちＤボックス、ＰＥＳＴモチーフ、Ｄｅｇ１、Ｄｅｇ２、デルタ（δ）ドメイン、ＷＷドメイン結合ペプチド、およびリン酸化された配列からなる群より選択されたユビキチン化認識シグナルについての認識部位から選択される、請求項１に記載の化合物。
【請求項１８】  前記ユビキチン化認識エレメントが、ユビキチン化系の認識部位に結合することによってユビキチン化反応を阻害し得る化合物であって、該認識部位は、Ｎ末端Ｎ−レコグニン、「ｄｅｓｔｒｕｃｔｉｏｎ  ｂｏｘ」すなわちＤボックス、およびリン酸化された配列からなる群より選択されたユビキチン化認識シグナルについての認識部位から選択される、請求項１７に記載の化合物。
【請求項１９】  前記ユビキチン化認識エレメントが、ユビキチン化系の認識部位に結合することによってユビキチン化反応を阻害し得る化合物であって、ここで該ユビキチン系がＮ末端規則ユビキチン化系である、請求項１に記載の化合物。
【請求項２０】  分解が、ＭＨＣタンパク質上の分解産物の提示の変化を生じる、請求項１に記載の化合物。
【請求項２１】  前記ＭＨＣタンパク質が、ＭＨＣクラスＩおよびＭＨＣクラスＩＩから選択される、請求項２０に記載の化合物。
【請求項２２】  前記化合物が３，０００未満の分子量を有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項２３】  前記ユビキチン化認識エレメントが、Ｎ−リコグニンまたはその等価物と同じユビキチン化認識部位に結合する、請求項１に記載の化合物。
【請求項２４】  真核生物細胞における少なくとも１つの標的タンパク質のレベルおよび／または活性を、該少なくとも１つの標的タンパク質のユビキチン化の調節を介して調節するための組成物であって、該組成物は、以下：
ａ）ユビキチン化系のＥ３エレメントまたはＥ２エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識エレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該ユビキチン系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについて少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識エレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合エレメントであって、ここで該標的タンパク質結合エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合エレメント、
を含む化合物を含み、
ここで該ユビキチン化認識エレメントは、該標的タンパク質結合エレメントに共有結合し、該化合物は該細胞と接触させるのに適している、組成物。
【請求項２５】  前記少なくとも１つの標的タンパク質を調節して生理学的または代謝的変化を生じる、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２６】  前記少なくとも１つの標的タンパク質を調節して薬理学的な変化を生じる、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２７】  前記少なくとも１つの標的タンパク質を調節して疾患を処置する、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２８】  前記細胞との接触が、前記化合物を哺乳動物に投与する工程によって達成される、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２９】  前記少なくとも１つの標的タンパク質が抗原である、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】  前記哺乳動物がヒトである、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３１】  哺乳動物における感染を処置するための組成物であって、該組成物は、該感染を除去および／または減少させるために十分な量の化合物を含み、該化合物は以下：
ａ）ユビキチン化系のＥ３エレメントまたはＥ２エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識エレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該ユビキチン化系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについて少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識エレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合エレメントであって、ここで該標的タンパク質結合エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合エレメント、
を含み、
ここで該ユビキチン化認識エレメントは、該標的タンパク質結合エレメントに共有結合している、組成物。
【請求項３２】  前記感染がウイルス感染である、請求項３１に記載の組成物。
【請求項３３】  前記感染が、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｇ型肝炎ウイルス、ＨＩＶ１、ＨＩＶ２、ヘルペスウイルス、ＣＭＶ、狂犬病ウイルス、ＲＳＶからなる群より選択されるウイルスによって引き起こされる、請求項３１に記載の組成物。
【請求項３４】  前記感染が寄生生物感染によって引き起こされる、請求項３１に記載の組成物。
【請求項３５】  前記感染が真核生物によって引き起こされる、請求項３１に記載の組成物。
【請求項３６】  請求項１に記載される化合物を含む、細胞中でユビキチン化を選択的に標的化する組成物。
【請求項３７】  前記ユビキチン認識エレメントが、Ｎ末端規則についてＥ３によって認識される、請求項３６に記載の組成物。
【請求項３８】  哺乳動物における腫瘍を処置するための組成物であって、該組成物は、該腫瘍のサイズを減少させるために十分な量の化合物を含み、該化合物は以下：
ａ）ユビキチン化系のＥ３エレメントまたはＥ２エレメントのいずれかに結合し得るユビキチン化認識エレメントであって、ここで、該ユビキチン化認識エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該ユビキチン化系の該Ｅ３エレメントおよび／またはＥ２エレメントについて少なくとも１０2Ｍ-1の結合親和性を有する、ユビキチン化認識エレメント；および
ｂ）標的タンパク質に特異的に結合し得る標的タンパク質結合エレメントであって、ここで該標的タンパク質結合エレメントは、３０，０００未満の分子量を有し、そして該標的タンパク質について１０5Ｍ-1より大きい結合親和性を有する、標的タンパク質結合エレメント、
を含み、
ここで該ユビキチン化認識エレメントは、該標的タンパク質結合エレメントに共有結合している、組成物。
【請求項３９】  ユビキチン化認識エレメントに標的タンパク質結合エレメントを共有結合する工程を包含する、標的タンパク質のユビキチン化を活性化するための化合物を生成する方法。
【請求項４０】  前記化合物が前記標的タンパク質に結合するタンパク質のユビキチン化を活性化する、請求項２４に記載の組成物。
【請求項４１】  有効用量の請求項１に記載の化合物を含む、ペストを制御するための組成物。
【請求項４２】  ユビキチン化認識エレメントであって、化合物Ｚ、Ａｒｇ−εＡｈｘ−リンカー、Ａｒｇ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−リンカー、Ａｒｇ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−リンカー、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−リンカー、Ｐｈｅ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−リンカー、Ｐｈｅ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−リンカー、Ａｒｇ−Ａｌａ−εＡｈｘ−リンカー、Ａｒｇ−Ａｌａ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−リンカー、Ａｒｇ−Ａｌａ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−リンカー、Ｐｈｅ−Ａｌａ−εＡｈｘ−リンカー、Ｐｈｅ−Ａｌａ−β−Ａｌａ−εＡｈｘ−リンカー、およびＰｈｅ−Ａｌａ−εＡｈｘ−εＡｈｘ−リンカーからなる群より選択される、少なくとも１つの構造エレメントを含む、ユビキチン認識エレメント。
【請求項４３】  ＬＬＶＲＧＲＴＬＶＶを含む、ユビキチン化認識エレメント。