【手続補正書】
【提出日】平成19年8月29日(2007.8.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
次の式（Ｉ）の化合物。
【化１】
2007510031.tif 000001
式中、
Ｒ3及びＲ4基はＺ1環構造に結合し、Ｒ5及びＲ6基はＺ2環構造に結合し、ｎ＝１、２、又は３であり、
Ｚ1及びＺ2は独立に単環式又は二環式縮合芳香族系を完成するのに必要な炭素原子を表し、
Ｒ1、Ｒ2、Ｒ3、Ｒ4、Ｒ5、Ｒ6及びＲ7基の少なくとも１つは−Ｅ−Ｆ基であり（式中、Ｅは、炭素、窒素及び酸素原子からなる群から選択される原子が１〜２０個連結した鎖を有するスペーサ基であり、Ｆは、スクシンイミジルエステル、スルホ−スクシンイミジルエステル、イソチオシアネート、マレイミド、ハロアセトアミド及びホスホルアミダイトから選択される反応性基である。）、
Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14基の１以上は独立に、−（ＣＨ2）k−Ｗ基から選択され（式中、Ｗは、スルホン酸又はホスホン酸であり、ｋは、１〜１０の整数である）、
Ｒ1及びＲ2基のいずれかが−Ｅ−Ｆ基でない場合、残りのＲ1及びＲ2基は独立に、Ｃ1〜Ｃ6アルキル、非置換ベンジル又はスルホン酸置換ベンジル及び−（ＣＨ2）k−Ｗ基から選択され（式中、Ｗ及びｋは前記で定義した通りである。）、
Ｒ3、Ｒ4、Ｒ5及びＲ6基のいずれかが−Ｅ−Ｆ基でない場合、残りのＲ3、Ｒ4、Ｒ5及びＲ6基は独立に、水素及びスルホン酸から選択され、
Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14のいずれかが−（ＣＨ2）k−Ｗ基でない場合、残りのＲ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14基が独立に、Ｃ1〜Ｃ6アルキルであり、
残りのＲ7基は、水素であり、或いはＲ7の２つが次の基とともに、５又は６個の原子を有する炭化水素環系を形成する。
【化２】
2007510031.tif 000002
【請求項２】
Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14の少なくとも２つが独立に、−（ＣＨ2）k−Ｗ（式中、Ｗ及びｋは前記で定義した通りである。）である、請求項１記載の化合物。
【請求項３】
Ｒ11及びＲ12基の１つ、並びにＲ13及びＲ14基の１つが、−（ＣＨ2）k−Ｗ基（式中、Ｗ及びｋは前記で定義した通りである。）であり、残りのＲ11又はＲ12基及びＲ13又はＲ14基がＣ1〜Ｃ6アルキルである、請求項１記載の化合物。
【請求項４】
Ｗがスルホン酸である、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載の化合物。
【請求項５】
−（ＣＨ2）k−Ｗが−（ＣＨ2）3−ＳＯ3Ｈ及び−（ＣＨ2）4−ＳＯ3Ｈから選択される、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載の化合物。
【請求項６】
Ｚ1及びＺ2がフェニル及びナフチル部分から選択される、請求項１乃至請求項５のいずれか１項記載の化合物。
【請求項７】
Ｆが親和性タグを含む、請求項１乃至請求項６のいずれか１項記載の化合物。
【請求項８】
スペーサ基Ｅが−（ＣＨＲ’）p−Ｑ−（ＣＨＲ’）r−から選択される、請求項１乃至請求項７のいずれか１項記載の化合物。
式中、Ｑは−ＣＨＲ’−、−ＮＲ’−、−Ｏ−、−ＣＲ’＝ＣＲ’−、−Ｃ（Ｏ）−ＮＲ’−及び−Ｃ（Ｏ）−Ｏ−から選択され、Ｒ’は水素又はＣ1〜Ｃ4アルキルであり、ｐは、０〜５であり、ｒは、１〜５である。
【請求項９】
Ｑが−ＣＨＲ’−、−Ｃ（Ｏ）−ＮＨ−及び次式の基から選択される、請求項８記載の化合物。
【化３】
2007510031.tif 000003
式中、Ｒ’は前記で定義した通りである。
【請求項１０】
−Ｅ−Ｆ基がカルボキシペンチル基を含む、請求項１乃至請求項６のいずれか１項記載の化合物。
【請求項１１】
以下のｉ）〜ｖ）から選択される、請求項１乃至請求項１０のいずれか１項記載の化合物。
ｉ）２−｛（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−［１−（５−カルボキシペンチル｝−３−メチル−５−スルホ−３−｛４−スルホブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドル−２−イリデン］ペンタ−１，３−ジエニル｝−１−エチル−３−メチル−３−（４−スルホブチル｝−３Ｈ−インドリウム−５−スルホネート；
ｉｉ）２−｛（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−［１−（５−カルボキシペンチル）−３−メチル−５−スルホ−３−（４−スルホブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドル−２−イリデン］ペンタ−１，３−ジエニル｝−３−メチル−１，３−ビス（４−スルホブチル）−３Ｈ−インドリウム−５−スルホネート；
ｉｉｉ）２−｛（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ，７Ｅ）−７−［１−（５−カルボキシペンチル）−３−メチル−５−スルホ−３−（４−スルホブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン］ヘプタ−１，３，５−トリエニル｝−１−エチル−３−メチル−３−（４−スルホブチル）−３Ｈ−インドリウム−５−スルホネート；
ｉｖ）２−（（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ，７Ｅ）−７−［５−（カルボキシメチル）−３−メチル−１，３−ビス（４−スルホブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン］ヘプタ−１，３，５−トリエニル｝−１−エチル−３−メチル−３−（４−スルホブチル）−３Ｈ−インドリウム−５−スルホネート；及び
ｖ）１−ベンジル−２−｛（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−［１−（５−カルボキシペンチル）−３−メチル−５−スルホ−３−（４−スルホブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドル−２−イリデン］ペンタ−１，３−ジエニル）−３−メチル−３−（４−スルホブチル）−３Ｈ−インドリウム−５−スルホネート
【請求項１２】
請求項１乃至請求項１０のいずれか１項記載の化合物の調製方法であって、
ａ）次の式（Ａ）の第１の中間体化合物
【化４】
2007510031.tif 000004
［式中、Ｚ1、Ｒ1、Ｒ3、Ｒ4、Ｒ11及びＲ12は、前記で定義した通りである。］と、
ｂ）第１の中間体化合物と同じでも異なってもよく、次の式（Ｂ）の第２の中間体化合物
【化５】
2007510031.tif 000005
［式中、Ｚ2、Ｒ2、Ｒ5、Ｒ6、Ｒ13及びＲ14は、前記で定義した通りである。］と、
ｃ）第１の化合物と第２の化合物との結合の形成に適した第３の化合物（Ｃ）とを反応させるステップを含み、
但し、Ｒ1、Ｒ2、Ｒ3、Ｒ4、Ｒ5及びＲ6基のうちの少なくとも１つが、−Ｅ−Ｆ基（式中、Ｅ及びＦは、請求項１で定義した通りである。）であり、Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14基のうちの１以上が独立に、−（ＣＨ2）k−Ｗ基（式中、Ｗは、スルホン酸及びホスホン酸基から選択され、ｋは、１〜１０の整数である）から選択されることを条件とする方法。
【請求項１３】
次式の化合物。
【化６】
2007510031.tif 000006
式中、
Ｒ3及びＲ4基はＺ1環構造に結合し（式中、Ｚ1は前記で定義した通りである。）、
Ｒ1、Ｒ3及びＲ4基の少なくとも１つは−Ｅ−Ｆ基であり（式中、Ｅは及びＦは請求項１で定義した通りである。）、
Ｒ11及びＲ12基の少なくとも１つは、−（ＣＨ2）k−Ｗ基である（式中、Ｗはスルホン酸及びホスホン酸基から選択され、ｋは１〜１０の整数である。）。
【請求項１４】
−（ＣＨ2）k−Ｗが−（ＣＨ2）3−ＳＯ3Ｈ及び−（ＣＨ2）4−ＳＯ3Ｈから選択される、請求項１３記載の化合物。
【請求項１５】
目標成分の標識方法であって、
ｉ）成分を、式（Ｉ）の化合物と接触させるステップと
【化７】
2007510031.tif 000007
［式中、
Ｒ3及びＲ4基はＺ1環構造に結合し、Ｒ5及びＲ6基はＺ2環構造に結合し、ｎ＝１、２、又は３であり、
Ｚ1及びＺ2は独立に、単環式又は二環式縮合芳香族系を完成するのに必要な炭素原子を表し、
Ｒ1、Ｒ2、Ｒ3、Ｒ4、Ｒ5、Ｒ6及びＲ7基の少なくとも１つは−Ｅ−Ｆ基であり（式中、Ｅは、単結合、又は炭素、窒素及び酸素原子からなる群から選択される原子が１〜２０個連結した鎖を有するスペーサ基であり、Ｆは、目標結合基である）、
Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14基の１以上は独立に−（ＣＨ2）k−Ｗ基から選択され（式中、Ｗは、スルホン酸又はホスホン酸であり、ｋは、１〜１０の整数である）、
Ｒ1及びＲ2基のいずれかが−Ｅ−Ｆ基でない場合、残りのＲ1及びＲ2基は独立に、Ｃ1〜Ｃ6アルキル、非置換ベンジル又はスルホン酸置換ベンジル及び−（ＣＨ2）k−Ｗ基から選択され（式中、Ｗ及びｋは前記で定義した通りである。）、
Ｒ3、Ｒ4、Ｒ5及びＲ6基のいずれかが−Ｅ−Ｆ基でない場合、残りのＲ3、Ｒ4、Ｒ5及びＲ6基は独立に、水素及びスルホン酸から選択され、
Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14のいずれかが−（ＣＨ2）k−Ｗ基でない場合、残りのＲ11、Ｒ12、Ｒ13及びＲ14基が独立に、Ｃ1〜Ｃ6アルキルであり、
残りのＲ7基は、水素であり、或いはＲ7の２つが次の基とともに、５又は６個の原子を有する炭化水素環系を形成する
【化８】
2007510031.tif 000008
］、
ｉｉ）蛍光色素を、成分に結合させ、それによって成分を標識するのに適した条件下で成分とインキュベートするステップとを含む方法。
【請求項１６】
前記成分が、抗体、脂質、タンパク質、ペプチド、炭水化物；アミノ、スルフヒドリル、カルボニル、ヒドロキシル及びカルボキシル及びチオホスフェート基のうちの１以上を含む、又はそれを含むように誘導体化されたヌクレオチド；アミノ、スルフヒドリル、カルボニル、ヒドロキシル、カルボキシル及びチオホスフェート基のうちの１以上を含む、又はそれを含むように誘導体化されたオキシ又はデオキシポリ核酸；微生物材料、薬物、ホルモン、細胞、細胞膜、並びに毒素からなる群から選択される、請求項１５記載の方法。