【手続補正書】
【提出日】平成19年8月16日(2007.8.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  スピノシンの生合成に関係する酵素活性をコードする少なくとも１個の領域を含んでなる核酸。
【請求項２】  スピノシンの生合成に関係する酵素活性をコードするすべての領域を含んでなる一本鎖または二本鎖状のＤＮＡ断片であることを特徴とする、請求項１記載の核酸。
【請求項３】  （ａ）配列番号１、２、３、４、５、６、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５２または５４に記載の配列、
（ｂ）（ａ）項において定義した配列の全長中で少なくとも１４塩基対の部分配列、
（ｃ）（ａ）項において定義した配列にハイブリダイズする配列、
（ｄ）（ａ）項において定義した配列に少なくとも７０％一致する配列、
（ｅ）（ａ）項において定義した配列に相補的である配列、および
（ｇ）遺伝暗号の縮重のために、（ａ）〜（ｄ）項において定義した配列と同じアミノ酸配列をコードする配列
から選択された少なくとも１個の配列を含んでなる、請求項１記載の核酸。
【請求項４】  請求項１から３までのいずれか記載の少なくとも１個の核酸、サッカロポリスポラ・スピノサ中における請求項１から３までのいずれか記載の核酸の転写を制御する調節領域、または請求項１から３までのいずれかに記載の核酸および少なくとも１個の非相同プロモーターを含んでなるＤＮＡ構築物、を含んでなるベクターであって、ＢＡＣベクター、ＰＡＣベクターまたはＢＡＣまたはＰＡＣベクターに機能的に等価のベクターであることを特徴とする、上記ベクター。
【請求項５】  請求項１から３までのいずれか記載の少なくとも１個の核酸、サッカロポリスポラ・スピノサ中における請求項１から３までのいずれか記載の核酸の転写を制御する調節領域、または請求項１から３までのいずれかに記載の核酸および少なくとも１個の非相同プロモーターを含んでなるＤＮＡ構築物、を含んでなるベクターであって、ファージΦＣ３１組込み機構、ｐＳＡＭ２組込み機構またはミニ−サークル(mini-circle) 組込み機構の関与の下で原核生物のゲノム内に組み込むことができることを特徴とする、上記ベクター。
【請求項６】  請求項１から３までのいずれか記載の少なくとも１個の核酸、サッカロポリスポラ・スピノサ中における請求項１から３までのいずれか記載の核酸の転写を制御する調節領域、または請求項１から３までのいずれかに記載の核酸および少なくとも１個の非相同プロモーターを含んでなるＤＮＡ構築物、を含んでなるベクターであって、ＲｅｃＡ−媒介組換えにより原核生物のゲノム内に組み込むことができることを特徴とする、上記ベクター。
【請求項７】  請求項１から３までのいずれか記載の少なくとも１個の核酸、サッカロポリスポラ・スピノサ中における請求項１から３までのいずれか記載の核酸の転写を制御する調節領域、または請求項１から３までのいずれかに記載の核酸および少なくとも１個の非相同プロモーターを含んでなるＤＮＡ構築物、を含んでなるベクターであって、ＲｅｃＥ−およびＲｅｃＴ−媒介組換えにより原核生物のゲノム内に組み込むことができることを特徴とする、上記ベクター。
【請求項８】  請求項１から３までのいずれか記載の核酸によりコードされるポリペプチド。
【請求項９】  下記の工程
（ａ）請求項１から３までのいずれか記載の核酸の発現を確実化する条件下で、請求項１から３までのいずれか記載の核酸、サッカロポリスポラ・スピノサ中における請求項１から３までのいずれか記載の核酸の転写を制御する調節領域、または請求項１から３までのいずれかに記載の核酸および少なくとも１個の非相同プロモーターを含んでなるＤＮＡ構築物、または上記核酸または上記調節領域または上記ＤＮＡ構築物を含んでなる少なくとも１個のベクター、を含んでなる宿主細胞を培養し、そして
（ｂ）細胞または培地からスピノシン、スピノシン前駆体またはスピノシン誘導体を得る、
を含んでなる、スピノシン、スピノシン前駆体またはスピノシン誘導体を作製するための方法。
【請求項１０】  下記の工程
（ａ）請求項３記載の少なくとも１個のモジュール−コード化核酸配列を、請求項３記載の少なくとも１個の他のモジュール−コード化核酸配列と交換し、または
（ｂ）請求項３記載の少なくとも１個のモジュール−コード化核酸配列を、Ｓ．スピノサからの少なくとも１個の他のモジュール−コード化核酸配列と交換し、または
（ｃ）請求項３記載の少なくとも１個のモジュール−コード化核酸配列を、Ｓ．スピノサ以外の生物体からの少なくとも１個の他のモジュール−コード化核酸配列と交換し、または
（ｄ）請求項３記載の少なくとも１個のドメイン−コード化核酸配列を、請求項３記載の少なくとも１個の他のドメイン−コード化核酸配列と交換し、または
（ｅ）請求項３記載の少なくとも１個のドメイン−コード化核酸配列を、Ｓ．スピノサからの少なくとも１個の他のドメイン−コード化核酸配列と交換し、または
（ｆ）請求項３記載の少なくとも１個のドメイン−コード化核酸配列を、Ｓ．スピノサ以外の生物体からの少なくとも１個の他のドメイン−コード化核酸配列と交換し、または
（ｇ）請求項３記載の第一のアシルトランスフェラーゼ−コード化核酸配列を、請求項３記載の第二のアシルトランスフェラーゼコード化核酸配列と交換し、ここで第二のアシルトランスフェラーゼは第一のアシルトランスフェラーゼのものとは異なる基質特異性を有し、または
（ｈ）請求項３記載の第一のアシルトランスフェラーゼ−コード化核酸配列を、Ｓ．スピノサからの第二のアシルトランスフェラーゼコード化核酸配列と交換し、ここで第二のアシルトランスフェラーゼは第一のアシルトランスフェラーゼのものとは異なる基質特異性を有し、または
（ｉ）請求項３記載の第一のアシルトランスフェラーゼ−コード化核酸配列を、Ｓ．スピノサ以外の生物体からの第二のアシルトランスフェラーゼコード化核酸配列と交換し、ここで第二のアシルトランスフェラーゼは第一のアシルトランスフェラーゼのものとは異なる基質特異性を有し、または
（ｊ）請求項３記載の少なくとも１個のドメイン−コード化核酸配列を欠失させ、または
（ｋ）請求項３記載の少なくとも１個のドメイン−コード化核酸配列を、請求項３記載のモジュールコード化核酸配列中に組込み、または
（ｌ）請求項３記載の少なくとも１個のドメイン−コード化核酸配列を突然変異させ、
そしてスピノシン誘導体またはスピノシン前駆体の合成を可能とする条件下で宿主細胞内に組換え核酸配列を発現することを含んでなる、スピノシン前駆体を含むスピノシン誘導体を作製するための方法。
【請求項１１】  下記の工程
（ａ）配列番号２３、２５、２９、３１、３３、３５および３７記載の核酸を、スピノシンアグリコンもしくはスピノシン１７−シュードアグリコンもしくはポリケチドアグリコンを産生できる宿主細胞内に転移し、または
（ａ１）配列番号２３、２５、２９、３１、３３、３５および３７記載の核酸を、スピノシンアグリコンもしくはスピノシン１７−シュードアグリコンもしくはポリケチドアグリコンを産生できない宿主細胞内に転移しそしてスピノシンアグリコンもしくはスピノシン１７−シュードアグリコンもしくはポリケチドアグリコンを培地内に加え、そして
（ｂ）宿主細胞を活性細胞代謝に導く条件下で培養する、
を含んでなる、スピノシンアグリコンまたはスピノシン１７−シュードアグリコンまたはポリケチドアグリコンにホロサミン糖残基を付加するための方法。
【請求項１２】  下記の工程
（ａ）配列番号７、９、１１、１３、１７および／または１９記載の核酸を、スピノシンアグリコンもしくはスピノシン９−シュードアグリコンもしくはポリケチドアグリコンを産生できる宿主細胞内に転移し、または
（ａ１）配列番号７、９、１１、１３、１７および／または１９記載の核酸を、スピノシンアグリコンもしくはスピノシン９−シュードアグリコンもしくはポリケチドアグリコンを産生できない宿主細胞内に転移しそしてスピノシンアグリコンもしくはスピノシン９−シュードアグリコンもしくはポリケチドアグリコンを培地内に加え、そして
（ｂ）宿主細胞を活性細胞代謝に導く条件下で培養する、
を含んでなる、スピノシンアグリコンまたはスピノシン９−シュードアグリコンまたはポリケチドアグリコンにトリメチルラムノース糖残基を付加するための方法。