(57)【要約】標的化されたＭＵＣ１タンパク質を発現する細胞を標的とし、例えば細胞傷害性Ｔ細胞により、殺滅することができる、ＣＡＲＴｙｒｉｎ組成物を含む、ＭＵＣ１−ＣＡＲ組成物、およびＭＵＣ１タンパク質を標的化するためのこれらの組成物の使用方法が開示される。一局面では、少なくとも１つのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列を含むタンパク質足場が提供され、このタンパク質足場は、ヒトＭＵＣ１の配列に結合することができる。
2019528044.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列
を含むタンパク質足場であって、ヒトＭＵＣ１の配列に結合することができる、タンパク質足場。
【請求項２】
ヒトＭＵＣ１のＣ末端ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ）の配列に結合することができる、請求項１に記載のタンパク質足場。
【請求項３】
ヒトＭＵＣ１−Ｃの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）の配列に結合することができる、請求項１または２に記載のタンパク質足場。
【請求項４】
前記少なくとも１つのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインが、ヒトタンパク質に由来する、請求項１〜３のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項５】
前記ヒトタンパク質が、テネイシン−Ｃである、請求項４に記載のタンパク質足場。
【請求項６】
前記コンセンサス配列が、
ＬＰＡＰＫＮＬＶＶＳＥＶＴＥＤＳＬＲＬＳＷＴＡＰＤＡＡＦＤＳＦＬＩＱＹＱＥＳＥＫＶＧＥＡＩＮＬＴＶＰＧＳＥＲＳＹＤＬＴＧＬＫＰＧＴＥＹＴＶＳＩＹＧＶＫＧＧＨＲＳＮＰＬＳＡＥＦＴＴ（配列番号１）
を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項７】
前記コンセンサス配列が、
（ａ）前記コンセンサス配列の１３〜１６位におけるアミノ酸残基ＴＥＤＳ（配列番号６４）を含む、もしくはそれからなるＡ−Ｂループ、
（ｂ）前記コンセンサス配列の２２〜２８位におけるアミノ酸残基ＴＡＰＤＡＡＦ（配列番号６５）を含む、もしくはそれからなるＢ−Ｃループ、
（ｃ）前記コンセンサス配列の３８〜４３位におけるアミノ酸残基ＳＥＫＶＧＥ（配列番号６６）を含む、もしくはそれからなるＣ−Ｄループ、
（ｄ）前記コンセンサス配列の５１〜５４位におけるアミノ酸残基ＧＳＥＲ（配列番号６７）を含む、もしくはそれからなるＤ−Ｅループ、
（ｅ）前記コンセンサス配列の６０〜６４位におけるアミノ酸残基ＧＬＫＰＧ（配列番号６８）を含む、もしくはそれからなるＥ−Ｆループ、
（ｆ）前記コンセンサス配列の７５〜８１位におけるアミノ酸残基ＫＧＧＨＲＳＮ（配列番号６９）を含む、もしくはそれからなるＦ−Ｇループ、または
（ｇ）（ａ）〜（ｆ）の任意の組み合わせ
の中の１つまたは複数の位置において修飾されている、先行する請求項のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項８】
少なくとも５個のフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列
を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項９】
少なくとも１０個のフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列
を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項１０】
少なくとも１５個のフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列
を含む、先行する請求項のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項１１】
ヒトＭＵＣ１の配列に、１０−９Ｍまたはそれ未満の、１０−１０Ｍまたはそれ未満の、１０−１１Ｍまたはそれ未満の、１０−１２Ｍまたはそれ未満の、１０−１３Ｍまたはそれ未満の、１０−１４Ｍまたはそれ未満の、および１０−１５Ｍまたはそれ未満のＫＤから選択される少なくとも１つのアフィニティーで結合する、先行する請求項のいずれか一項に記載のタンパク質足場。
【請求項１２】
前記ＫＤが、表面プラズモン共鳴により決定される、請求項１１に記載のタンパク質足場。
【請求項１３】
（ａ）抗原認識領域を含むエクトドメインであって、前記抗原認識領域が、先行する請求項のいずれか一項に記載の少なくとも１つのタンパク質足場を含む、エクトドメインと、
（ｂ）膜貫通ドメインと、
（ｃ）少なくとも１つの共刺激ドメインを含むエンドドメインと
を含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）。
【請求項１４】
前記エクトドメインが、シグナルペプチドをさらに含む、請求項１３に記載のＣＡＲ。
【請求項１５】
（ａ）の前記エクトドメインが、前記抗原認識領域と（ｂ）の前記膜貫通ドメインの間にヒンジをさらに含む、請求項１３または１４に記載のＣＡＲ。
【請求項１６】
前記膜貫通ドメインが、ＣＤ８膜貫通ドメインをコードする配列を含む、請求項１３〜１５のいずれか一項に記載のＣＡＲ。
【請求項１７】
前記少なくとも１つの共刺激ドメインが、ＣＤ２８および／または４−１ＢＢ共刺激ドメインを含む、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載のＣＡＲ。
【請求項１８】
前記４−１ＢＢ共刺激ドメインが、前記膜貫通ドメインと前記ＣＤ２８共刺激ドメインの間に位置する、請求項１７に記載のＣＡＲ。
【請求項１９】
請求項１〜１２のいずれか一項に記載のタンパク質足場と、少なくとも１つの薬学的に許容される担体とを含む組成物。
【請求項２０】
請求項１３〜１８のいずれか一項に記載のキメラ抗原受容体と、少なくとも１つの薬学的に許容される担体とを含む組成物。
【請求項２１】
請求項１〜１２のいずれか一項に記載のタンパク質足場を含むトランスポゾン。
【請求項２２】
請求項１３〜１８のいずれか一項に記載のＣＡＲを含むトランスポゾン。
【請求項２３】
前記トランスポゾンが、
（ａ）リガンド結合領域と、
（ｂ）リンカーと、
（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドと
を含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含み、
前記誘導性カスパーゼポリペプチドが非ヒト配列を含まない、請求項２２に記載のトランスポゾン。
【請求項２４】
請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のトランスポゾンを含む組成物。
【請求項２５】
トランスポザーゼ酵素をコードする配列を含むプラスミドをさらに含む、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２６】
トランスポザーゼ酵素をコードする前記配列が、ｍＲＮＡ配列である、請求項２５に記載の組成物。
【請求項２７】
前記トランスポゾンが、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである、請求項２１〜２６のいずれか一項に記載のトランスポゾンまたは組成物。
【請求項２８】
前記トランスポザーゼが、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼである、請求項２５〜２７のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２９】
前記ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼが、配列番号４を含むアミノ酸配列を含む、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
前記ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼが、高活性改変体であり、前記高変異改変体が、配列番号５９の３０、１６５、２８２および５３８位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換を含む、請求項２８または２９に記載の組成物。
【請求項３１】
配列番号５９の３０位における前記アミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｉ３０Ｖ）である、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３２】
配列番号５９の１６５位における前記アミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換（Ｇ１６５Ｓ）である、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３３】
配列番号５９の２８２位における前記アミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｍ２８２Ｖ）である、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３４】
配列番号５９の５３８位における前記アミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換（Ｎ５３８Ｋ）である、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３５】
前記トランスポザーゼが、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼである、請求項２８〜３４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項３６】
前記Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼが、配列番号６０を含むアミノ酸配列を含む、請求項３５に記載の組成物。
【請求項３７】
請求項１〜１８のいずれか一項に記載のＣＡＲを含むベクター。
【請求項３８】
ウイルスベクターである、請求項３７に記載のベクター。
【請求項３９】
前記ウイルスベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルスもしくはこれらの任意の組み合わせから単離された、またはそれに由来する配列を含む、請求項３８に記載のベクター。
【請求項４０】
前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルスから単離された、またはそれに由来する配列を含む、請求項３８または３９に記載のベクター。
【請求項４１】
前記ウイルスベクターが、組換えベクターである、請求項３８〜４０のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項４２】
ナノ粒子ベクターである、請求項３７に記載のベクター。
【請求項４３】
前記ナノ粒子ベクターが、核酸、アミノ酸、ポリマー、ミセル、脂質、有機分子、無機分子またはこれらの任意の組み合わせを含む、請求項４２に記載のベクター。
【請求項４４】
前記ベクターが、
（ａ）リガンド結合領域と、
（ｂ）リンカーと、
（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドと
を含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含み、
前記誘導性カスパーゼポリペプチドが非ヒト配列を含まない、請求項３７〜４３のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項４５】
請求項３７〜４４のいずれか一項に記載のベクターを含む組成物。
【請求項４６】
請求項１〜１２のいずれか一項に記載のタンパク質足場を含む細胞。
【請求項４７】
請求項１３〜１８のいずれか一項に記載のＣＡＲを含む細胞。
【請求項４８】
請求項２１〜３６のいずれか一項に記載のトランスポゾンまたはトランスポザーゼを含む細胞。
【請求項４９】
請求項３７〜４４のいずれか一項に記載のベクターを含む細胞。
【請求項５０】
細胞表面に前記ＣＡＲを発現する、請求項４６〜４９のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項５１】
免疫細胞である、請求項４６〜５０のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項５２】
前記免疫細胞が、Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）様細胞、造血前駆細胞、末梢血（ＰＢ）由来Ｔ細胞または臍帯血（ＵＣＢ）由来Ｔ細胞である、請求項５１に記載の細胞。
【請求項５３】
前記免疫細胞が、Ｔ細胞である、請求項５１に記載の細胞。
【請求項５４】
人工抗原提示細胞である、請求項４６〜５０のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項５５】
腫瘍細胞である、請求項４６〜５０のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項５６】
自己のものである、請求項４６〜５５のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項５７】
同種異系のものである、請求項４６〜５５のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項５８】
請求項４６〜５７のいずれか一項に記載の細胞を含む組成物。
【請求項５９】
請求項１〜１２のいずれか一項に記載のタンパク質足場を作製する方法であって、
（ａ）コンセンサス配列の１つまたは複数のアミノ酸を修飾するステップ、および
（ｂ）ヒトＭＵＣ１の配列に選択的に結合する前記タンパク質足場を選択するステップ
を含む、方法。
【請求項６０】
前記修飾するステップが、部位特異的変異誘発またはランダム変異誘発を含む、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
前記ランダム変異誘発が、エラープローンポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ＤＮＡシャフリングまたはこれらの組み合わせを含む、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
ステップ（ａ）および（ｂ）が、少なくとも１回反復される、請求項５９〜６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６３】
がんの処置を必要とする被験体におけるがんを処置する方法であって、前記被験体に、請求項１９、２０、２４、２５、２６、４５または５８のいずれか一項に記載の組成物を投与するステップを含む、方法。
【請求項６４】
前記被験体に、請求項４８に記載の組成物を投与するステップを含み、ここで細胞または細胞集団が自己のものである、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記被験体に、請求項４８に記載の組成物を投与するステップを含み、ここで細胞または細胞集団が同種異系のものである、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
細胞療法の改変を必要とする被験体における細胞療法を改変する方法であって、前記被験体に、請求項２１〜３６のいずれか一項に記載のトランスポゾンを含む細胞を含む組成物を投与するステップを含み、前記細胞を誘導剤と接触させることにより前記細胞においてアポトーシスを選択的に誘導することができる、方法。
【請求項６７】
細胞療法の改変を必要とする被験体における細胞療法を改変する方法であって、前記被験体に、請求項３７〜４４のいずれか一項に記載のベクターを含む細胞を含む組成物を投与するステップを含み、前記細胞を誘導剤と接触させることにより前記細胞においてアポトーシスを選択的に誘導することができる、方法。
【請求項６８】
前記細胞が、自己のものである、請求項６６または６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記細胞が、同種異系のものである、請求項６６または６７に記載の方法。
【請求項７０】
前記細胞療法が、養子細胞療法である、請求項６６〜６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７１】
前記改変が、前記細胞療法の終了である、請求項６６または６７に記載の方法。
【請求項７２】
前記改変が、前記細胞療法に提供される前記細胞の一部分の枯渇である、請求項６６または６７に記載の方法。
【請求項７３】
前記誘導剤の阻害剤を投与して、前記細胞療法の改変を阻害し、それによって前記細胞療法の機能および／または有効性を回復させるステップをさらに含む、請求項６６または６７に記載の方法。
【請求項７４】
（ａ）抗原認識領域を含むエクトドメインであって、前記抗原認識領域が、ヒトＭＵＣ１の配列に特異的に結合するＣｅｎｔｙｒｉｎ、ＶＨＨおよびｓｃＦｖのうちの少なくとも１つを含む、エクトドメインと、
（ｂ）膜貫通ドメインと、
（ｃ）少なくとも１つの共刺激ドメインを含むエンドドメインと
を含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）。
【請求項７５】
前記抗原認識領域が、少なくとも１つのＣｅｎｔｙｒｉｎを含む、請求項７４に記載のＣＡＲ。
【請求項７６】
前記抗原認識領域が、少なくとも１つのＶＨＨを含む、請求項７４に記載のＣＡＲ。
【請求項７７】
前記抗原認識領域が、少なくとも１つのｓｃＦｖを含む、請求項７４に記載のＣＡＲ。
【請求項７８】
前記エクトドメインが、シグナルペプチドをさらに含む、請求項７４〜７７のいずれか一項に記載のＣＡＲ。
【請求項７９】
（ａ）の前記エクトドメインが、前記抗原認識領域と（ｂ）の前記膜貫通ドメインの間にヒンジをさらに含む、請求項７４〜７８のいずれか一項に記載のＣＡＲ。
【請求項８０】
前記膜貫通ドメインが、ＣＤ８膜貫通ドメインをコードする配列を含む、請求項７４〜７９のいずれか一項に記載のＣＡＲ。
【請求項８１】
前記少なくとも１つの共刺激ドメインが、ＣＤ２８および／または４−１ＢＢ共刺激ドメインを含む、請求項７４〜８０のいずれか一項に記載のＣＡＲ。
【請求項８２】
前記４−１ＢＢ共刺激ドメインが、前記膜貫通ドメインと前記ＣＤ２８共刺激ドメインの間に位置する、請求項８１に記載のＣＡＲ。
【請求項８３】
請求項７４〜８２のいずれか一項に記載のキメラ抗原受容体と、少なくとも１つの薬学的に許容される担体とを含む組成物。
【請求項８４】
請求項６４〜７２のいずれか一項に記載のＣＡＲを含むトランスポゾン。
【請求項８５】
前記トランスポゾンが、
（ａ）リガンド結合領域と、
（ｂ）リンカーと、
（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドと
を含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含み、
前記誘導性カスパーゼポリペプチドが非ヒト配列を含まない、請求項８４に記載のトランスポゾン。
【請求項８６】
請求項８４または８５に記載のトランスポゾンを含む組成物。
【請求項８７】
トランスポザーゼ酵素をコードする配列を含むプラスミドをさらに含む、請求項８６に記載の組成物。
【請求項８８】
トランスポザーゼ酵素をコードする前記配列が、ｍＲＮＡ配列である、請求項８７に記載の組成物。
【請求項８９】
前記トランスポゾンが、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである、請求項８４〜８８のいずれか一項に記載のトランスポゾンまたは組成物。
【請求項９０】
前記トランスポザーゼが、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼである、請求項８７〜８９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項９１】
前記ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼが、配列番号４を含むアミノ酸配列を含む、請求項９０に記載の組成物。
【請求項９２】
前記ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼが、高活性改変体であり、前記高活性改変体が、配列番号５９の３０、１６５、２８２および５３８位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換を含む、請求項９０または９１に記載の組成物。
【請求項９３】
配列番号５９の３０位における前記アミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｉ３０Ｖ）である、請求項９２に記載の組成物。
【請求項９４】
配列番号５９の１６５位における前記アミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換（Ｇ１６５Ｓ）である、請求項９２に記載の組成物。
【請求項９５】
配列番号５９の２８２位における前記アミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｍ２８２Ｖ）である、請求項９２に記載の組成物。
【請求項９６】
配列番号５９の５３８位における前記アミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換（Ｎ５３８Ｋ）である、請求項９２に記載の組成物。
【請求項９７】
前記トランスポザーゼが、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼである、請求項８７〜９６のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項９８】
前記Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼが、配列番号６０を含むアミノ酸配列を含む、請求項９７に記載の組成物。
【請求項９９】
請求項７４〜８２のいずれか一項に記載のＣＡＲを含むベクター。
【請求項１００】
ウイルスベクターである、請求項９９に記載のベクター。
【請求項１０１】
前記ウイルスベクターが、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルスもしくはこれらの任意の組み合わせから単離された、またはそれに由来する配列を含む、請求項１００に記載のベクター。
【請求項１０２】
前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルスから単離された、またはそれに由来する配列を含む、請求項１００または１０１に記載のベクター。
【請求項１０３】
前記ウイルスベクターが、組換えベクターである、請求項１００〜１０２のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項１０４】
ナノ粒子ベクターである、請求項９９に記載のベクター。
【請求項１０５】
前記ナノ粒子ベクターが、核酸、アミノ酸、ポリマー、ミセル、脂質、有機分子、無機分子またはこれらの任意の組み合わせを含む、請求項１０４に記載のベクター。
【請求項１０６】
前記ベクターが、
（ａ）リガンド結合領域と、
（ｂ）リンカーと、
（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドと
を含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含み、
前記誘導性カスパーゼポリペプチドが非ヒト配列を含まない、請求項９９〜１０５のいずれか一項に記載のベクター。
【請求項１０７】
請求項９９〜１０６のいずれか一項に記載のベクターを含む組成物。
【請求項１０８】
請求項７４〜８２のいずれか一項に記載のＣＡＲを含む細胞。
【請求項１０９】
請求項８４〜９２のいずれか一項に記載のトランスポゾンまたはトランスポザーゼを含む細胞。
【請求項１１０】
請求項９９〜１０６のいずれか一項に記載のベクターを含む細胞。
【請求項１１１】
細胞表面に前記ＣＡＲを発現する、請求項１０８〜１１０のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１２】
免疫細胞である、請求項１０８〜１１１のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１３】
前記免疫細胞が、Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）様細胞、造血前駆細胞、末梢血（ＰＢ）由来Ｔ細胞または臍帯血（ＵＣＢ）由来Ｔ細胞である、請求項１１２に記載の細胞。
【請求項１１４】
前記免疫細胞が、Ｔ細胞である、請求項１１２に記載の細胞。
【請求項１１５】
人工抗原提示細胞である、請求項１０８〜１１１のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１６】
腫瘍細胞である、請求項１０８〜１１１のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１７】
自己のものである、請求項１０８〜１１６のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１８】
同種異系のものである、請求項１０８〜１１６のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項１１９】
請求項１０８〜１１８のいずれか一項に記載の細胞を含む組成物。
【請求項１２０】
がんの処置を必要とする被験体におけるがんを処置する方法であって、前記被験体に請求項８３、８６〜９８、１０７または１１９のいずれか一項に記載の組成物を投与するステップを含む、方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
この出願は、２０１６年７月１５日に出願された仮出願ＵＳＳＮ６２／３６２，７４４、２０１６年１０月６日に出願された仮出願ＵＳＳＮ６２／４０５，１７９、および２０１６年１１月１８日に出願された仮出願ＵＳＳＮ６２／４２３，９９１（これら各々の内容は、それらの全体が参考として本明細書に援用される）の利益を特許請求される。
【０００２】
配列表の援用
２０１７年７月１３日に作成した、サイズが９１ＫＢである「ＰＯＴＨ−００５＿００１ＷＯ＿ＳｅｑＬｉｓｔ．ｔｘｔ」という名のテキストファイルの内容は、それら全体が参照により本明細書に援用される。
【０００３】
本開示は、分子生物学に関し、より具体的には、高いアフィニティーおよびアビディティーで標的タンパク質に特異的に結合する足場タンパク質に関する。
【背景技術】
【０００４】
高いアフィニティーおよびアビディティーで特異的標的タンパク質を認識しそれに結合することができる薬剤の発見は、バイオ医薬品業界の焦点となっている。モノクローナル抗体がこの目的のために使用されてきたが、抗体より小さく、より可溶性であり、かつより安定している、より効果的な薬剤が、依然として必要とされている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００５】
本開示は、高いアフィニティーおよびアビディティーで特異的標的タンパク質、好ましくはＭＵＣ１を認識しそれに結合する組成物、およびこれらの組成物の使用方法を提供する。
【０００６】
本開示は、高いアフィニティーおよびアビディティーで特異的標的タンパク質、好ましくはＭＵＣ１を認識しそれに結合するＣｅｎｔｙｒｉｎ組成物、およびこれらの組成物の使用方法を提供する。Ｃｅｎｔｙｒｉｎを本開示のキメラ抗原受容体の抗原認識領域に組み込むことができる。本開示のある特定の好ましい実施形態では、ＭＵＣ１は、ＭＵＣ１  Ｃ末端ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ）である。本開示の組成物は、タンパク質分解性切断およびその後のＮ末端サブユニット放出後に細胞表面に残存するＭＵＣ１−Ｃの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列を特異的に標的とすることができる。
【０００７】
本開示の抗ＭＵＣ１  Ｃｅｎｔｙｒｉｎを含むＣｅｎｔｙｒｉｎ組成物、または抗ＭＵＣ１  Ｃｅｎｔｙｒｉｎを含むＣＡＲ（すなわち、抗ＭＵＣ１  ＣＡＲＴｙｒｉｎ）を、トランスポゾンまたはベクター（例えば、ウイルスベクター）に組み込むことができ、任意選択で細胞に組み込むことができる。本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎ組成物の接触および／または組込みにより修飾された細胞は、ＭＵＣ１発現細胞を特異的に標的とすることができる。本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎ組成物の接触および／または組込みにより修飾される細胞は、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）および細胞傷害性免疫細胞を含むことができるが、これらに限定されない。本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎを含む細胞は、本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎ組成物に接触したものであってもよく、任意選択で、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎをコードする配列の取込みを増加させるようにヌクレオフェクト（ｎｕｃｌｅｏｆｅｃｔ）されたものであってもよい。本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎおよびＣＡＲＴｙｒｉｎは、ＤＮＡ配列、ＲＮＡ配列、またはこれらの組み合わせによりコードされていてもよい。ある特定の実施形態では、本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎ組成物は、任意選択でトランスポゾン配列に組み込まれている、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎをコードするＤＮＡまたはＲＮＡ配列と、任意選択でＲＮＡ配列によりコードされている、トランスポザーゼとを含む。この方法のある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎをコードする配列が２つのシス調節性インスレーターエレメントによって挟まれている、プラスミドＤＮＡトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポゾンがｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである実施形態では、トランスポザーゼは、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポザーゼがＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである実施形態では、トランスポザーゼをコードする配列は、ｍＲＮＡ配列である。
【０００８】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化１】
2019528044.tif 000003
【０００９】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、下記の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である：
【化２】
2019528044.tif 000004
【００１０】
ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの２つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの３つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２および５３８位の各々にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の３０位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の１６５位におけるアミノ酸置換は、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の２８２位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の５３８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である。
【００１１】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、本開示のＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、３０位におけるアミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換であり、１６５位におけるアミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換であり、２８２位におけるアミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換であり、５３８位におけるアミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である、配列番号５９の配列のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい。ある特定の実施形態では、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化３】
2019528044.tif 000005
【００１２】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３、４６、８２、１０３、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２５８、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８６、５０３、５５２、５７０および５９１位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、４６、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８５、５０３、５５２および５７０位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の８２位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１１９位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニ��（Ｆ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８５位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８７位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２００位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０７位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０９位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２２６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２３５位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号５９の２４０位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４１位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４３位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２５８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９��たは配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からバリンへの置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１５位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１９位におけるアミノ酸置換は、スレオニン（Ｔ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２８位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４２１位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４３６位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４７０位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４８５位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５５２位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。
【００１３】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９または配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの２、３、４、５、６つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１９４位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７２位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７５位におけるアミノ酸置換は、リシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０９位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい。ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３７２、３７５および４５０位にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換を含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の４５０位にアスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換を含んでもよい。
【００１４】
本開示は、少なくとも１つのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列を含むタンパク質足場であって、ヒトＭＵＣ１に結合することができるタンパク質足場を提供する。本開示のタンパク質足場のある特定の実施形態では、少なくとも１つのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインは、ヒトタンパク質に由来する。例えば、ヒトタンパク質は、テネイシン−Ｃを含みうる。
【００１５】
本開示のコンセンサス配列は、
【化４】
2019528044.tif 000006
を含んでもよい、それから本質的になってもよい、またはそれからなってもよい。下線付きの配列は、改変体ＦＮ３ドメイン配列を生成するように修飾されていてもよい、機能的ループを表す。本開示の改変体ＦＮ３ドメインは、（ａ）コンセンサス配列の１３〜１６位におけるアミノ酸残基ＴＥＤＳ（配列番号６４）を含む、もしくはそれからなるＡ−Ｂループ、（ｂ）コンセンサス配列の２２〜２８位におけるアミノ酸残基ＴＡＰＤＡＡＦ（配列番号６５）を含む、もしくはそれからなるＢ−Ｃループ、（ｃ）コンセンサス配列の３８〜４３位におけるアミノ酸残基ＳＥＫＶＧＥ（配列番号６６）を含む、もしくはそれからなるＣ−Ｄループ、（ｄ）コンセンサス配列の５１〜５４位におけるアミノ酸残基ＧＳＥＲ（配列番号６７）を含む、もしくはそれからなるＤ−Ｅループ、（ｅ）コンセンサス配列の６０〜６４位におけるアミノ酸残基ＧＬＫＰＧ（配列番号６８）を含む、もしくはそれからなるＥ−Ｆループ、（ｆ）コンセンサス配列の７５〜８１位におけるアミノ酸残基ＫＧＧＨＲＳＮ（配列番号６９）を含む、もしくはそれからなるＦ−Ｇループ、または（ｇ）（ａ）〜（ｆ）の任意の組み合わせの中の１つまたは複数の位置が修飾されているコンセンサス配列を含んでもよい。
【００１６】
本開示のタンパク質足場は、少なくとも５個、少なくとも１０個または少なくとも１５個のフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインのコンセンサス配列を含んでもよい。ある特定の実施形態では、本開示のタンパク質足場は、１５個のフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインを含む。
【００１７】
本開示のタンパク質足場は、２個またはそれより多くのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインであって、各ＦＮ３ドメインの配列が同一である、ＦＮ３ドメインを含んでもよい。本開示のタンパク質足場は、２個またはそれより多くのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインであって、各ＦＮ３ドメインの配列が異なる、ＦＮ３ドメインを含んでもよい。
【００１８】
本開示のタンパク質足場は、２個またはそれより多くのフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）ドメインであって、各ＦＮ３ドメインの配列が、足場中の他のすべてのＦＮ３ドメインと異なる、ＦＮ３ドメインを含んでもよい。
【００１９】
本開示は、高いアフィニティーおよびアビディティーで特異的標的タンパク質、好ましくはＭＵＣ１を認識しそれに結合するＶＨＨ組成物、およびこれらの組成物の使用方法を提供する。ＶＨＨ組成物は、抗ＭＵＣ１抗体の２つの重鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態では、ＶＨＨ組成物は、ＶＨＨの相補性決定領域（ＣＤＲ）がヒト配列である、抗ＭＵＣ１抗体の２つの重鎖可変領域を含む。ＶＨＨ組成物を本開示のキメラ抗原受容体の抗原認識領域に組み込むことができる。本開示のある特定の好ましい実施形態では、ＭＵＣ１は、ＭＵＣ１  Ｃ末端ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ）である。本開示の組成物は、タンパク質分解性切断およびその後のＮ末端サブユニット放出後に細胞表面に残存するＭＵＣ１−Ｃの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列を特異的に標的とすることができる。
【００２０】
本開示の抗ＭＵＣ１  ＶＨＨを含む、または抗ＭＵＣ１  ＶＨＨを含むＣＡＲを含む、ＶＨＨ組成物を、トランスポゾンまたはベクター（例えば、ウイルスベクター）に組み込むことができ、任意選択で細胞に組み込むことができる。本開示のＶＨＨ組成物の接触および／または組込みにより修飾された細胞は、ＭＵＣ１発現細胞を特異的に標的とすることができる。本開示のＶＨＨ組成物の接触および／または組込みにより修飾される細胞は、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）および細胞傷害性免疫細胞を含むことができるが、これらに限定されない。本開示のＶＨＨまたは（ＶＨＨを含む）ＣＡＲを含む細胞は、本開示のＶＨＨまたは（ＶＨＨを含む）ＣＡＲ組成物に接触したものであってもよく、任意選択で、本開示のＶＨＨまたは（ＶＨＨを含む）ＣＡＲ組成物をコードする配列の取込みを増加させるようにヌクレオフェクトされたものであってもよい。本開示のＶＨＨまたは（ＶＨＨを含む）ＣＡＲ組成物は、ＤＮＡ配列、ＲＮＡ配列、またはこれらの組み合わせによりコードされていてもよい。ある特定の実施形態では、本開示のＶＨＨまたは（ＶＨＨを含む）ＣＡＲ組成物は、任意選択でトランスポゾン配列に組み込まれている、ＶＨＨまたは（ＶＨＨを含む）ＣＡＲをコードするＤＮＡまたはＲＮＡ配列と、任意選択でＲＮＡ配列によりコードされている、トランスポザーゼとを含む。この方法のある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ＶＨＨまたはＣＡＲをコードする配列が２つのシス調節性インスレーターエレメントによって挟まれている、プラスミドＤＮＡトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポゾンがｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである実施形態では、トランスポザーゼは、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポザーゼがＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである実施形態では、トランスポザーゼをコードする配列は、ｍＲＮＡ配列である。
【００２１】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化５】
2019528044.tif 000007
【００２２】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、下記の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である：
【化６】
2019528044.tif 000008
【００２３】
ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの２つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの３つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２および５３８位の各々にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の３０位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の１６５位におけるアミノ酸置換は、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の２８２位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の５３８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である。
【００２４】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、本開示のＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、３０位におけるアミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換であり、１６５位におけるアミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換であり、２８２位におけるアミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換であり、５３８位におけるアミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である、配列番号５９の配列のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい。ある特定の実施形態では、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化７】
2019528044.tif 000009
【００２５】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３、４６、８２、１０３、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２５８、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８６、５０３、５５２、５７０および５９１位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、４６、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８５、５０３、５５２および５７０位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の８２位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１１９位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニ��（Ｆ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８５位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８７位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２００位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０７位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０９位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２２６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２３５位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号５９の２４０位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４１位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４３位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２５８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９��たは配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からバリンへの置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１５位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１９位におけるアミノ酸置換は、スレオニン（Ｔ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２８位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４２１位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４３６位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４７０位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４８５位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５５２位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。
【００２６】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９または配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの２、３、４、５、６つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１９４位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７２位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７５位におけるアミノ酸置換は、リシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０９位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい。ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３７２、３７５および４５０位にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換を含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の４５０位にアスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換を含んでもよい。
【００２７】
本開示は、高いアフィニティーおよびアビディティーで特異的標的タンパク質、好ましくはＭＵＣ１を認識しそれに結合するｓｃＦｖ組成物、およびこれらの組成物の使用方法を提供する。ｓｃＦｖ組成物は、抗ＭＵＣ１抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態では、ｓｃＦｖ組成物は、ｓｃＦｖの相補性決定領域（ＣＤＲ）がヒト配列である、抗ＭＵＣ１抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。ｓｃＦｖ組成物を本開示のキメラ抗原受容体の抗原認識領域に組み込むことができる。本開示のある特定の好ましい実施形態では、ＭＵＣ１は、ＭＵＣ１  Ｃ末端ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ）である。本開示の組成物は、タンパク質分解性切断およびその後のＮ末端サブユニット放出後に細胞表面に残存するＭＵＣ１−Ｃの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列を特異的に標的とすることができる。
【００２８】
本開示の抗ＭＵＣ１  ｓｃＦｖを含む、または抗ＭＵＣ１  ｓｃＦｖを含むＣＡＲを含む、ｓｃＦｖ組成物を、トランスポゾンまたはベクター（例えば、ウイルスベクター）に組み込むことができ、任意選択で細胞に組み込むことができる。本開示のｓｃＦｖ組成物の接触および／または組込みにより修飾された細胞は、ＭＵＣ１発現細胞を特異的に標的とすることができる。本開示のｓｃＦｖ組成物の接触および／または組込みにより修飾される細胞は、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）および細胞傷害性免疫細胞を含むが、これらに限定されない。本開示のｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲを含む細胞は、本開示のｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲ組成物に接触したものであってもよく、任意選択で、本開示のｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲ組成物をコードする配列の取込みを増加させるようにヌクレオフェクトされたものであってもよい。本開示のｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲ組成物は、ＤＮＡ配列、ＲＮＡ配列、またはこれらの組み合わせによりコードされていてもよい。ある特定の実施形態では、本開示のｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲ組成物は、任意選択でトランスポゾン配列に組み込まれている、ｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲをコードするＤＮＡまたはＲＮＡ配列と、任意選択でＲＮＡ配列によりコードされている、トランスポザーゼとを含む。この方法のある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ｓｃＦｖまたは（ｓｃＦｖを含む）ＣＡＲをコードする配列が２つのシス調節性インスレーターエレメントによって挟まれている、プラスミドＤＮＡトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポゾンがｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである実施形態では、トランスポザーゼは、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである。
【００２９】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポゾンは、抗原受容体をコードする配列が２つのシス調節性インスレーターエレメントによって挟まれている、プラスミドＤＮＡトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポゾンがｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである実施形態では、トランスポザーゼは、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポザーゼがＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである実施形態では、トランスポザーゼをコードする配列は、ｍＲＮＡ配列である。
【００３０】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化８】
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【００３１】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、下記の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である：
【化９】
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【００３２】
ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの２つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの３つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２および５３８位の各々にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の３０位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の１６５位におけるアミノ酸置換は、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の２８２位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の５３８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である。
【００３３】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、本開示のＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、３０位におけるアミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換であり、１６５位におけるアミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換であり、２８２位におけるアミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換であり、５３８位におけるアミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である、配列番号５９の配列のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい。ある特定の実施形態では、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化１０】
2019528044.tif 000012
【００３４】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３、４６、８２、１０３、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２５８、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８６、５０３、５５２、５７０および５９１位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、４６、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８５、５０３、５５２および５７０位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の８２位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１１９位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニ��（Ｆ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８５位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８７位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２００位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０７位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０９位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２２６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２３５位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号５９の２４０位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４１位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４３位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２５８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９��たは配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からバリンへの置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１５位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１９位におけるアミノ酸置換は、スレオニン（Ｔ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２８位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４２１位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４３６位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４７０位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４８５位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５５２位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。
【００３５】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９または配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの２、３、４、５、６つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１９４位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７２位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７５位におけるアミノ酸置換は、リシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０９位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい。ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３７２、３７５および４５０位にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換を含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の４５０位にアスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換を含んでもよい。
【００３６】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ｂ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ｂ」ＣＡＲは、アミノ酸配列ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＥＳＬＫＬＳＣＥＳＮＥＹＥＦＰＳＨＤＭＳＷＶＲＫＴＰＥＫＲＬＥＬＶＡＡＩＮＳＤＧＧＳＴＹＹＰＤＴＭＥＲＲＦＩＩＳＲＤＮＴＫＫＴＬＹＬＱＭＳＳＬＲＳＥＤＴＡＬＹＹＣＶＲＬＹＹＧＮＶＭＤＹＷＧＱＧＴＳＶＴＶＳＳ（配列番号４）を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列ＤＶＶＭＴＱＴＰＬＳＬＰＶＳＬＧＤＱＡＳＩＳＣＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＹＷＹＬＱＫＰＧＱＳＰＫＬＬＩＹＫＶＳＮＲＦＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＫＩＳＲＶＥＡＥＤＬＧＶＹＦＣＳＱＳＴＨＶＰＬＴＦＧＡＧＴＫＬＥＬＫ（配列番号５）を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００３７】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１１】
2019528044.tif 000013
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００３８】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１２】
2019528044.tif 000014
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００３９】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｋ２Ｂ」ＣＡＲを含みうる。「Ｋ２Ｂ」ＣＡＲは、アミノ酸配列ＱＶＱＬＫＥＳＧＰＧＬＶＡＰＳＱＳＬＳＭＴＣＴＶＳＧＦＳＬＴＴＹＧＶＨＷＶＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＬＶＶＩＷＳＤＧＳＴＴＹＮＳＰＬＫＳＲＬＳＩＳＲＤＮＳＫＳＱＶＦＬＫＭＮＳＬＱＡＤＤＴＡＩＹＹＣＡＫＮＹＬＧＳＬＤＹＷＧＱＧＴＳＶＴＶＳＳ（配列番号８）を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列ＤＶＶＬＴＱＴＰＬＳＬＰＶＳＬＧＤＱＡＳＩＳＣＲＳＳＱＳＬＶＨＮＮＧＤＴＹＬＨＷＹＬＱＫＰＧＱＳＰＫＬＬＩＹＫＶＳＮＲＦＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＦＫＩＳＲＶＥＡＥＤＬＧＶＹＦＣＳＱＴＴＨＶＰＬＴＦＧＡＧＴＫＬＥＬＫ（配列番号９）を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４０】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｋ２Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｋ２Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１３】
2019528044.tif 000015
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４１】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｋ２Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｋ２Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１４】
2019528044.tif 000016
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４２】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｋ２Ａ」ＣＡＲを含みうる。「Ｋ２Ａ」ＣＡＲは、アミノ酸配列ＱＩＱＬＶＱＳＧＰＥＬＫＫＰＧＥＴＶＫＴＳＣＫＡＳＧＹＴＦＴＧＹＳＭＨＷＶＫＱＡＰＧＫＧＬＫＷＭＧＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧＲＦＡＬＳＬＥＴＳＡＳＴＴＹＬＱＩＮＮＬＫＮＥＤＴＡＴＹＦＣＶＲＧＴＧＧＤＤＷＧＱＧＴＴＬＴＶＳＳＡＫＴＴＰ（配列番号１２）を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列ＤＶＶＭＴＱＴＰＬＳＬＰＶＳＬＧＤＱＡＳＩＳＣＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＨＷＹＬＱＫＰＧＱＳＰＫＬＬＩＹＫＶＳＮＲＦＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＫＩＮＲＶＥＡＥＤＬＧＶＹＦＣＳＱＧＴＨＶＰＰＴＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫＲＡＤＡＡＰＴＶ（配列番号１３）を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４３】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｋ２Ａ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｋ２Ａ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１５】
2019528044.tif 000017
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４４】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｋ２Ａ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｋ２Ａ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１６】
2019528044.tif 000018
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４５】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ａ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ａ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化１７】
2019528044.tif 000019
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化１８】
2019528044.tif 000020
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４６】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ａ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ａ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化１９】
2019528044.tif 000021
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４７】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ａ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ａ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化２０】
2019528044.tif 000022
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４８】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ｃ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ｃ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化２１】
2019528044.tif 000023
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化２２】
2019528044.tif 000024
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００４９】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ｃ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ｃ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化２３】
2019528044.tif 000025
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５０】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｆ１Ｃ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｆ１Ｃ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化２４】
2019528044.tif 000026
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５１】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｍ１Ｂ」ＣＡＲを含みうる。「Ｍ１Ｂ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化２５】
2019528044.tif 000027
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化２６】
2019528044.tif 000028
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５２】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｍ１Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｍ１Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化２７】
2019528044.tif 000029
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５３】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｍ１Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｍ１Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化２８】
2019528044.tif 000030
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５４】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｍ１Ａ」ＣＡＲを含みうる。「Ｍ１Ａ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化２９】
2019528044.tif 000031
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化３０】
2019528044.tif 000032
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５５】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｍ１Ａ−ＨＬ」ＣＡＲを含みうる。「Ｍ１Ａ−ＨＬ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化３１】
2019528044.tif 000033
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５６】
本開示のＭＵＣ１  ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、「Ｍ１Ａ−ＬＨ」ＣＡＲを含みうる。「Ｍ１Ａ−ＬＨ」ＣＡＲは、アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化３２】
2019528044.tif 000034
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を含む。
【００５７】
本開示のタンパク質足場は、１０−９Ｍまたはそれ未満の、１０−１０Ｍまたはそれ未満の、１０−１１Ｍまたはそれ未満の、１０−１２Ｍまたはそれ未満の、１０−１３Ｍまたはそれ未満の、１０−１４Ｍまたはそれ未満の、および１０−１５Ｍまたはそれ未満のＫＤから選択される少なくとも１つのアフィニティーで、ヒトＭＵＣ１に結合することができる。ＫＤは、表面プラズモン共鳴を含むがこれに限定されない、いずれの手段により決定してもよい。
【００５８】
本開示は、（ａ）抗原認識領域を含むエクトドメインであって、抗原認識領域が、先行する請求項のいずれか一項に記載の少なくとも１つのタンパク質足場を含む、エクトドメインと、（ｂ）膜貫通ドメインと、（ｃ）少なくとも１つの共刺激ドメインを含むエンドドメインとを含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を提供する。ある特定の実施形態では、エクトドメインは、シグナルペプチドをさらに含んでもよい。あるいは、または加えて、ある特定の実施形態では、エクトドメインは、抗原認識領域と膜貫通ドメインの間にヒンジをさらに含んでもよい。
【００５９】
本開示は、（ａ）抗原認識領域を含むエクトドメインであって、抗原認識領域が、ヒトＭＵＣ１の配列に特異的に結合するＣｅｎｔｙｒｉｎ、ＶＨＨおよびｓｃＦｖのうちの少なくとも１つを含む、エクトドメインと、（ｂ）膜貫通ドメインと、（ｃ）少なくとも１つの共刺激ドメインを含むエンドドメインとを含む、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を提供する。ある特定の実施形態では、抗原認識領域は、少なくとも１つのＣｅｎｔｙｒｉｎを含む。ある特定の実施形態では、抗原認識領域は、少なくとも１つのＶＨＨを含む。ある特定の実施形態では、抗原認識領域は、少なくとも１つのｓｃＦｖを含む。
【００６０】
本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、シグナルペプチドは、ヒトＣＤ２、ＣＤ３δ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、ＣＤ３ζ、ＣＤ４、ＣＤ８α、ＣＤ１９、ＣＤ２８、４−１ＢＢまたはＧＭ−ＣＳＦＲシグナルペプチドをコードする配列を含んでもよい。本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、シグナルペプチドは、ヒトＣＤ８αシグナルペプチドをコードする配列を含んでもよい。ヒトＣＤ８αシグナルペプチドは、ＭＡＬＰＶＴＡＬＬＬＰＬＡＬＬＬＨＡＡＲＰ（配列番号３２）を含むアミノ酸配列を含んでもよい。ヒトＣＤ８αシグナルペプチドは、ＭＡＬＰＶＴＡＬＬＬＰＬＡＬＬＬＨＡＡＲＰ（配列番号３２）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＭＡＬＰＶＴＡＬＬＬＰＬＡＬＬＬＨＡＡＲＰ（配列番号３２）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ヒトＣＤ８αシグナルペプチドは、ａｔｇｇｃａｃｔｇｃｃａｇｔｃａｃｃｇｃｃｃｔｇｃｔｇｃｔｇｃｃｔｃｔｇｇｃｔｃｔｇｃｔｇｃｔｇｃａｃｇｃａｇｃｔａｇａｃｃａを含む核酸配列によりコードされていてもよい。
【００６１】
本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、膜貫通ドメインは、ヒトＣＤ２、ＣＤ３δ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、ＣＤ３ζ、ＣＤ４、ＣＤ８α、ＣＤ１９、ＣＤ２８、４−１ＢＢまたはＧＭ−ＣＳＦＲ膜貫通ドメインをコードする配列を含んでもよい。本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、膜貫通ドメインは、ヒトＣＤ８α膜貫通ドメインをコードする配列を含んでもよい。ＣＤ８α膜貫通ドメインは、ＩＹＩＷＡＰＬＡＧＴＣＧＶＬＬＬＳＬＶＩＴＬＹＣ（配列番号３３）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＩＹＩＷＡＰＬＡＧＴＣＧＶＬＬＬＳＬＶＩＴＬＹＣ（配列番号３３）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＣＤ８α膜貫通ドメインは、ａｔｃｔａｃａｔｔｔｇｇｇｃａｃｃａｃｔｇｇｃｃｇｇｇａｃｃｔｇｔｇｇａｇｔｇｃｔｇｃｔｇｃｔｇａｇｃｃｔｇｇｔｃａｔｃａｃａｃｔｇｔａｃｔｇｃを含む核酸配列によりコードされていてもよい。
【００６２】
本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、エンドドメインは、ヒトＣＤ３ζエンドドメインを含んでもよい。
【００６３】
本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、少なくとも１つの共刺激ドメインは、ヒト４−１ＢＢ、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＭｙＤ８８、ＯＸ−４０細胞内セグメント、またはこれらの任意の組み合わせを含んでもよい。本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、少なくとも１つの共刺激ドメインは、ＣＤ２８および／または４−１ＢＢ共刺激ドメインを含んでもよい。ＣＤ２８共刺激ドメインは、ＲＶＫＦＳＲＳＡＤＡＰＡＹＫＱＧＱＮＱＬＹＮＥＬＮＬＧＲＲＥＥＹＤＶＬＤＫＲＲＧＲＤＰＥＭＧＧＫＰＲＲＫＮＰＱＥＧＬＹＮＥＬＱＫＤＫＭＡＥＡＹＳＥＩＧＭＫＧＥＲＲＲＧＫＧＨＤＧＬＹＱＧＬＳＴＡＴＫＤＴＹＤＡＬＨＭＱＡＬＰＰＲ（配列番号３４）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＲＶＫＦＳＲＳＡＤＡＰＡＹＫＱＧＱＮＱＬＹＮＥＬＮＬＧＲＲＥＥＹＤＶＬＤＫＲＲＧＲＤＰＥＭＧＧＫＰＲＲＫＮＰＱＥＧＬＹＮＥＬＱＫＤＫＭＡＥＡＹＳＥＩＧＭＫＧＥＲＲＲＧＫＧＨＤＧＬＹＱＧＬＳＴＡＴＫＤＴＹＤＡＬＨＭＱＡＬＰＰＲ（配列番号３４）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＣＤ２８共刺激ドメインは、ｃｇｃｇｔｇａａｇｔｔｔａｇｔｃｇａｔｃａｇｃａｇａｔｇｃｃｃｃａｇｃｔｔａｃａａａｃａｇｇｇａｃａｇａａｃｃａｇｃｔｇｔａｔａａｃｇａｇｃｔｇａａｔｃｔｇｇｇｃｃｇｃｃｇａｇａｇｇａａｔａｔｇａｃｇｔｇｃｔｇｇａｔａａｇｃｇｇａｇａｇｇａｃｇｃｇａｃｃｃｃｇａａａｔｇｇｇａｇｇｃａａｇｃｃｃａｇｇｃｇｃａａａａａｃｃｃｔｃａｇｇａａｇｇｃｃｔｇｔａｔａａｃｇａｇｃｔｇｃａｇａａｇｇａｃａａａａｔｇｇｃａｇａａｇｃｃｔａｔｔｃｔｇａｇａｔｃｇｇｃａｔｇａａｇｇｇｇｇａｇｃｇａｃｇｇａｇａｇｇｃａａａｇｇｇｃａｃｇａｔｇｇｇｃｔｇｔａｃｃａｇｇｇａｃｔｇａｇｃａｃｃｇｃｃａｃａａａｇｇａｃａｃｃｔａｔｇａｔｇｃｔｃｔｇｃａｔａｔｇｃａｇｇｃａｃｔｇｃｃｔｃｃａａｇｇ（配列番号３５）を含む核酸配列によりコードされていてもよい。４−１ＢＢ共刺激ドメインは、ＫＲＧＲＫＫＬＬＹＩＦＫＱＰＦＭＲＰＶＱＴＴＱＥＥＤＧＣＳＣＲＦＰＥＥＥＥＧＧＣＥＬ（配列番号３６）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＫＲＧＲＫＫＬＬＹＩＦＫＱＰＦＭＲＰＶＱＴＴＱＥＥＤＧＣＳＣＲＦＰＥＥＥＥＧＧＣＥＬ（配列番号３６）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。４−１ＢＢ共刺激ドメインは、ａａｇａｇａｇｇｃａｇｇａａｇａａａｃｔｇｃｔｇｔａｔａｔｔｔｔｃａａａｃａｇｃｃｃｔｔｃａｔｇｃｇｃｃｃｃｇｔｇｃａｇａｃｔａｃｃｃａｇｇａｇｇａａｇａｃｇｇｇｔｇｃｔｃｃｔｇｔｃｇａｔｔｃｃｃｔｇａｇｇａａｇａｇｇａａｇｇｃｇｇｇｔｇｔｇａｇｃｔｇ（配列番号３７）を含む核酸配列によりコードされていてもよい。４−１ＢＢ共刺激ドメインは、膜貫通ドメインとＣＤ２８共刺激ドメインの間に位置してもよい。
【００６４】
本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、ヒンジは、ヒトＣＤ８α、ＩｇＧ４および／またはＣＤ４配列に由来する配列を含んでもよい。本開示のＣＡＲのある特定の実施形態では、ヒンジは、ヒトＣＤ８α配列に由来する配列を含んでもよい。ヒンジは、ＴＴＴＰＡＰＲＰＰＴＰＡＰＴＩＡＳＱＰＬＳＬＲＰＥＡＣＲＰＡＡＧＧＡＶＨＴＲＧＬＤＦＡＣＤ（配列番号３８）を含むヒトＣＤ８αアミノ酸配列を含んでもよく、またはＴＴＴＰＡＰＲＰＰＴＰＡＰＴＩＡＳＱＰＬＳＬＲＰＥＡＣＲＰＡＡＧＧＡＶＨＴＲＧＬＤＦＡＣＤ（配列番号３８）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ヒトＣＤ８αヒンジアミノ酸配列は、ａｃｔａｃｃａｃａｃｃａｇｃａｃｃｔａｇａｃｃａｃｃａａｃｔｃｃａｇｃｔｃｃａａｃｃａｔｃｇｃｇａｇｔｃａｇｃｃｃｃｔｇａｇｔｃｔｇａｇａｃｃｔｇａｇｇｃｃｔｇｃａｇｇｃｃａｇｃｔｇｃａｇｇａｇｇａｇｃｔｇｔｇｃａｃａｃｃａｇｇｇｇｃｃｔｇｇａｃｔｔｃｇｃｃｔｇｃｇａｃ（配列番号７０）を含む核酸配列によりコードされていてもよい。
【００６５】
本開示は、本開示のタンパク質足場と、少なくとも１つの薬学的に許容される担体とを含む組成物を提供する。
【００６６】
本開示は、本開示のキメラ抗原受容体および少なくとも１つの薬学的に許容される担体を提供する。
【００６７】
本開示は、本開示のタンパク質足場を含むトランスポゾンを提供する。
【００６８】
本開示は、本開示のＣＡＲを含むトランスポゾンを提供する。
【００６９】
本開示のトランスポゾンは、トランスポゾンを発現する細胞の同定、濃縮および／または単離のための選択遺伝子（ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ  ｇｅｎｅ）を含んでもよい。例示的な選択遺伝子は、細胞生存度および生存に不可欠な任意の遺伝子産物（例えば、転写物、タンパク質、酵素）をコードする。例示的な選択遺伝子は、細胞が、選択遺伝子によりコードされている遺伝子産物の非存在下で感受性である（または細胞に対して致死性でありうる）薬物負荷に対する耐性の付与に不可欠な任意の遺伝子産物（例えば、転写物、タンパク質、酵素）をコードする。例示的な選択遺伝子は、選択遺伝子の非存在下での細胞生存度および／または生存に不可欠な１つまたは複数の栄養素を欠いている細胞培地中での生存度および／または生存に不可欠な任意の遺伝子産物（例えば、転写物、タンパク質、酵素）をコードする。例示的な選択遺伝子は、ｎｅｏ（ネオマイシンに対する耐性を付与する）、ＤＨＦＲ（ジヒドロ葉酸レダクターゼをコードし、メトトレキサートに対する耐性を付与する）、ＴＹＭＳ（チミジル酸シンテターゼをコードする）、ＭＧＭＴ（Ｏ（６）−メチルグアニン−ＤＮＡメチルトランスフェラーゼをコードする）、多剤耐性遺伝子（ＭＤＲ１）、ＡＬＤＨ１（アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー、メンバーＡ１をコードする）、ＦＲＡＮＣＦ、ＲＡＤ５１Ｃ（ＲＡＤ５１パラログＣをコードする）、ＧＣＳ（グルコシルセラミドシンターゼをコードする）、およびＮＫＸ２．２（ＮＫ２ホメオボックス２をコードする）を含むが、これらに限定されない。
【００７０】
本開示のトランスポゾンは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）アポトーシス促進性ポリペプチド（ｐｒｏａｐｏｐｔｏｔｉｃ  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）とを含む誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドであって、非ヒト配列を含まない誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、非ヒト配列は、制限部位を含む。ある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、多量体リガンド結合領域であってもよい。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、「ｉＣ９安全スイッチ」と称されることもある。ある特定の実施形態では、本開示のトランスポゾンは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）カスパーゼポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよく、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは非ヒト配列を含まない。ある特定の実施形態では、本開示のトランスポゾンは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）カスパーゼポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよく、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは非ヒト配列を含まない。ある特定の実施形態では、本開示のトランスポゾンは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよく、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは非ヒト配列を含まない。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含むリガンド結合領域のアミノ酸配列は、該配列の３６位に修飾を含んでもよい。修飾は、３６位におけるフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）であってもよい。ある特定の実施形態では、ＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥ（配列番号３９）を含むアミノ酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、ＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴ  ＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧ（配列番��４０）を含む核酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を有するＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含んでもよいリガンド結合領域に特異的な誘導剤は、ＡＰ２０１８７および／またはＡＰ１９０３を含み、これらは両方とも合成薬物である。
【００７１】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、リンカー領域は、ＧＧＧＧＳ（配列番号４１）を含むアミノ酸またはＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣ（配列番号４２）を含む核酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、制限部位を含まない。
【００７２】
本開示の切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、その配列の８７位にアルギニン（Ｒ）を含まないアミノ酸配列によりコードされている。あるいは、または加えて、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、その配列の２８２位にアラニン（Ａ）を含まないアミノ酸配列によりコードされている。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、ＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４３）を含むアミノ酸配列、またはＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４４）を含む核酸配列によりコードされている。
【００７３】
切断型カスパーゼ９ポリペプチドを含む、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのある特定の実施形態では、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥＧＧＧＧＧＳＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４５）を含むアミノ酸配列、またはＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣＧＡＡＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４６）を含む核酸配列によりコードされている。
【００７４】
本開示のトランスポゾンは、例えば、本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎのうちの１つまたは複数と本開示の選択遺伝子との間に位置する、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよい。本開示のトランスポゾンは、例えば、本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎのうちの１つまたは複数と本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドとの間に位置する、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよい。本開示のトランスポゾンは、少なくとも２つの自己切断ペプチド、例えば本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの上流または直ぐ上流に位置する、第１の自己切断ペプチド、および例えば本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの下流または直ぐ上流に位置する、第２の自己切断ペプチドを含んでもよい。
【００７５】
少なくとも１つの自己切断ペプチドは、例えば、Ｔ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチド、Ｅ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチド、Ｆ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチド、Ｐ２Ａペプチド、またはＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドを含んでもよい。Ｔ２Ａペプチドは、ＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ｇｇａｔｃｔｇｇａｇａｇｇｇａａｇｇｇｇａａｇｃｃｔｇｃｔｇａｃｃｔｇｔｇｇａｇａｃｇｔｇｇａｇｇａａａａｃｃｃａｇｇａｃｃａ（配列番号４９）を含む核酸配列を含んでもよい。Ｅ２Ａペプチドは、ＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチドは、ＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｆ２Ａペプチドは、ＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチドは、ＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｐ２Ａペプチドは、ＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドは、ＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。
【００７６】
本開示のトランスポゾンは、第１および第２の自己切断ペプチドであって、例えば本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎのうちの１つまたは複数の上流に位置する、第１の自己切断ペプチド、および例えば本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎのうちの１つまたは複数の下流に位置する、第２の自己切断ペプチドを含んでもよい。第１および／または第２の自己切断ペプチドは、例えば、Ｔ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチド、Ｅ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチド、Ｆ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチド、Ｐ２Ａペプチド、またはＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドを含んでもよい。Ｔ２Ａペプチドは、ＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ｇｇａｔｃｔｇｇａｇａｇｇｇａａｇｇｇｇａａｇｃｃｔｇｃｔｇａｃｃｔｇｔｇｇａｇａｃｇｔｇｇａｇｇａａａａｃｃｃａｇｇａｃｃａ（配列番号４９）を含む核酸配列を含んでもよい。Ｅ２Ａペプチドは、ＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチドは、ＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｆ２Ａペプチドは、ＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチドは、ＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｐ２Ａペプチドは、ＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドは、ＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。
【００７７】
本開示は、本開示のトランスポゾンを含む組成物を提供する。ある特定の実施形態では、組成物は、トランスポザーゼ酵素をコードする配列を含むプラスミドをさらに含むことがある。トランスポザーゼ酵素をコードする配列は、ｍＲＮＡ配列であってもよい。
【００７８】
本開示のトランスポゾンは、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンを含んでもよい。本開示のトランスポザーゼ酵素は、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポザーゼまたは適合性酵素を含んでもよい。特に、トランスポゾンがｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである実施形態では、トランスポザーゼは、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポザーゼがＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである実施形態では、トランスポザーゼをコードする配列は、ｍＲＮＡ配列である。
【００７９】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化３３】
2019528044.tif 000035
【００８０】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、下記の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である：
【化３４】
2019528044.tif 000036
【００８１】
ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの２つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの３つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２および５３８位の各々にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の３０位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の１６５位におけるアミノ酸置換は、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の２８２位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の５３８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である。
【００８２】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、本開示のＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、３０位におけるアミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換であり、１６５位におけるアミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換であり、２８２位におけるアミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換であり、５３８位におけるアミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である、配列番号５９の配列のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい。ある特定の実施形態では、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化３５】
2019528044.tif 000037
【００８３】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３、４６、８２、１０３、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２５８、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８６、５０３、５５２、５７０および５９１位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、４６、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８５、５０３、５５２および５７０位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の８２位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１１９位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニ��（Ｆ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８５位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８７位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２００位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０７位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０９位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２２６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２３５位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号５９の２４０位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４１位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４３位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２５８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９��たは配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からバリンへの置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１５位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１９位におけるアミノ酸置換は、スレオニン（Ｔ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２８位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４２１位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４３６位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４７０位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４８５位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５５２位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。
【００８４】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９または配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの２、３、４、５、６つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１９４位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７２位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７５位におけるアミノ酸置換は、リシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０９位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい。ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３７２、３７５および４５０位にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換を含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の４５０位にアスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換を含んでもよい。
【００８５】
本開示は、本開示のＣＡＲを含むベクターを提供する。ある特定の実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。ベクターは、組換えベクターであってもよい。
【００８６】
本開示のウイルスベクターは、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルスもしくはこれらの任意の組み合わせから単離された配列を含んでもよく、またはこれらのウイルスもしくはそれらの任意の組み合わせに由来する配列を含んでもよい。ウイルスベクターは、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）から単離された配列を含んでもよく、またはＡＡＶに由来する配列を含んでもよい。ウイルスベクターは、組換えＡＡＶ（ｒＡＡＶ）を含んでもよい。本開示の例示的なアデノ随伴ウイルスおよび組換えアデノ随伴ウイルスは、本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎをコードする配列の隣にシスで位置する２つまたはそれより多くの末端逆位配列（ＩＴＲ）を含む。本開示の例示的なアデノ随伴ウイルスおよび組換えアデノ随伴ウイルスは、これらに限定されないが、すべての血清型（例えば、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、およびＡＡＶ９）を含む。本開示の例示的なアデノ随伴ウイルスおよび組換えアデノ随伴ウイルスは、これらに限定されないが、自己相補的なＡＡＶ（ｓｃＡＡＶ）、および１つの血清型のゲノムと別の血清型のカプシドとを含むＡＡＶハイブリッド（例えば、ＡＡＶ２／５、ＡＡＶ−ＤＪおよびＡＡＶ−ＤＪ８）を含む。本開示の例示的なアデノ随伴ウイルスおよび組換えアデノ随伴ウイルスは、これに限定されないが、ｒＡＡＶ−ＬＫ０３を含む。
【００８７】
本開示のウイルスベクターは、選択遺伝子を含んでもよい。選択遺伝子は、細胞生存度および生存に不可欠な遺伝子産物をコードすることができる。選択遺伝子は、選択的細胞培養条件に負荷されたときの細胞生存度および生存に不可欠な遺伝子産物をコードすることができる。選択的細胞培養条件は、細胞生存度または生存に有害な化合物を含むこともあり、遺伝子産物は化合物に対する耐性を付与する。本開示の例示的な選択遺伝子としては、ｎｅｏ（ネオマイシンに対する耐性を付与する）、ＤＨＦＲ（ジヒドロ葉酸レダクターゼをコードし、メトトレキサートに対する耐性を付与する）、ＴＹＭＳ（チミジル酸シンテターゼをコードする）、ＭＧＭＴ（Ｏ（６）−メチルグアニン−ＤＮＡメチルトランスフェラーゼをコードする）、多剤耐性遺伝子（ＭＤＲ１）、ＡＬＤＨ１（アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー、メンバーＡ１をコードする）、ＦＲＡＮＣＦ、ＲＡＤ５１Ｃ（ＲＡＤ５１パラログＣをコードする）、ＧＣＳ（グルコシルセラミドシンターゼをコードする）、ＮＫＸ２．２（ＮＫ２ホメオボックス２をコードする）、またはこれらの任意の組み合わせを挙げることができるが、これらに限定されない。
【００８８】
本開示のウイルスベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）アポトーシス促進性ポリペプチドとを含む誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドであって、非ヒト配列を含まない誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、非ヒト配列は、制限部位を含む。ある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、多量体リガンド結合領域であってもよい。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、「ｉＣ９安全スイッチ」と称されることもある。ある特定の実施形態では、本開示のウイルスベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）カスパーゼポリペプチドとを含む、誘導性カスパーゼポリペプチドであって、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドが非ヒト配列を含まない、誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、本開示のウイルスベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）カスパーゼポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドであって、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドが非ヒト配列を含まない、誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、本開示のウイルスベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドであって、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドが非ヒト配列を含まない、誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよい。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含むリガンド結合領域のアミノ酸配列は、該配列の３６位に修飾を含んでもよい。修飾は、３６位におけるフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）であってもよい。ある特定の実施形態では、ＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥ（配列番号３９）を含むアミノ酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、ＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴ  ＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧ（配列番号４０）を含む核酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を有するＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含んでもよいリガンド結合領域に特異的な誘導剤は、ＡＰ２０１８７および／またはＡＰ１９０３を含み、これらは両方とも合成薬物である。
【００８９】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、リンカー領域は、ＧＧＧＧＳ（配列番号４１）を含むアミノ酸またはＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣ（配列番号４２）を含む核酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、制限部位を含まない。
【００９０】
本開示の切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、その配列の８７位にアルギニン（Ｒ）を含まないアミノ酸配列によりコードされている。あるいは、または加えて、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、その配列の２８２位にアラニン（Ａ）を含まないアミノ酸配列によりコードされている。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、ＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４３）を含むアミノ酸、またはＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４４）を含む核酸配列によりコードされている。
【００９１】
切断型カスパーゼ９ポリペプチドを含む、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのある特定の実施形態では、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥＧＧＧＧＧＳＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４５）を含むアミノ酸配列、またはＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣＧＡＡＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４６）を含む核酸配列によりコードされている。
【００９２】
本開示のウイルスベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよい。一部の実施形態では、ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよく、自己切断ペプチドは、ＣＡＲと選択遺伝子の間に位置する。一部の実施形態では、ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよく、第１の自己切断ペプチドは、ＣＡＲの上流に位置し、第２の自己切断ペプチドは、ＣＡＲの下流に位置する。本開示のウイルスベクターは、例えば、本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎのうちの１つまたは複数と本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドとの間に位置する、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよい。本開示のウイルスベクターは、少なくとも２つの自己切断ペプチド、例えば本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの上流または直ぐ上流に位置する、第１の自己切断ペプチド、および例えば本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの下流または直ぐ上流に位置する、第２の自己切断ペプチドを含んでもよい。自己切断ペプチドは、例えば、Ｔ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチド、Ｅ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチド、Ｆ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチド、Ｐ２Ａペプチド、またはＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドを含んでもよい。Ｔ２Ａペプチドは、ＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ｇｇａｔｃｔｇｇａｇａｇｇｇａａｇｇｇｇａａｇｃｃｔｇｃｔｇａｃｃｔｇｔｇｇａｇａｃｇｔｇｇａｇｇａａａａｃｃｃａｇｇａｃｃａ（配列番号４９）を含む核酸配列を含んでもよい。Ｅ２Ａペプチドは、ＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチドは、ＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｆ２Ａペプチドは、ＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチドは、ＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｐ２Ａペプチドは、ＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドは、ＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。
【００９３】
本開示は、本開示のＣＡＲを含むベクターを提供する。ある特定の実施形態では、ベクターは、ナノ粒子である。本開示の例示的なナノ粒子ベクターは、これらに限定されないが、核酸（例えば、ＲＮＡ、ＤＮＡ、合成ヌクレオチド、修飾ヌクレオチド、もしくはこれらの任意の組み合わせ）、アミノ酸（Ｌ−アミノ酸、Ｄ−アミノ酸、合成アミノ酸、修飾アミノ酸、もしくはこれらの任意の組み合わせ）、ポリマー（例えば、ポリマーソーム（ｐｏｌｙｍｅｒｓｏｍｅ））、ミセル、脂質（例えば、リポソーム）、有機分子（例えば、炭素原子、シート、繊維、チューブ）、無機分子（例えば、リン酸カルシウムもしくは金）またはこれらの任意の組み合わせを含む。ナノ粒子ベクターは、細胞膜を横切って受動的に輸送されることもあり、または能動的に輸送されることもある。
【００９４】
本開示のナノ粒子ベクターは、選択遺伝子を含んでもよい。選択遺伝子は、細胞生存度および生存に不可欠な遺伝子産物をコードすることができる。選択遺伝子は、選択的細胞培養条件に負荷されたときの細胞生存度および生存に不可欠な遺伝子産物をコードすることができる。選択的細胞培養条件は、細胞生存度または生存に有害な化合物を含んでもよく、遺伝子産物は化合物に対する耐性を付与する。本開示の例示的な選択遺伝子は、ｎｅｏ（ネオマイシンに対する耐性を付与する）、ＤＨＦＲ（ジヒドロ葉酸レダクターゼをコードし、メトトレキサートに対する耐性を付与する）、ＴＹＭＳ（チミジル酸シンテターゼをコードする）、ＭＧＭＴ（Ｏ（６）−メチルグアニン−ＤＮＡメチルトランスフェラーゼをコードする）、多剤耐性遺伝子（ＭＤＲ１）、ＡＬＤＨ１（アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー、メンバーＡ１をコードする）、ＦＲＡＮＣＦ、ＲＡＤ５１Ｃ（ＲＡＤ５１パラログＣをコードする）、ＧＣＳ（グルコシルセラミドシンターゼをコードする）、ＮＫＸ２．２（ＮＫ２ホメオボックス２をコードする）、またはこれらの任意の組み合わせを含むが、それらに限定されない。
【００９５】
本開示のナノ粒子ベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）アポトーシス促進性ポリペプチドとを含む誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドであって、非ヒト配列を含まない誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、非ヒト配列は、制限部位を含む。ある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、多量体リガンド結合領域であってもよい。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、「ｉＣ９安全スイッチ」と称されることもある。ある特定の実施形態では、本開示のナノ粒子ベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）カスパーゼポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよく、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは非ヒト配列を含まない。ある特定の実施形態では、本開示のナノ粒子ベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）カスパーゼポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよく、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは非ヒト配列を含まない。ある特定の実施形態では、本開示のナノ粒子ベクターは、（ａ）リガンド結合領域と、（ｂ）リンカーと、（ｃ）切断型カスパーゼ９ポリペプチドとを含む誘導性カスパーゼポリペプチドを含んでもよく、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは非ヒト配列を含まない。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含んでもよい。ある特定の実施形態では、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含むリガンド結合領域のアミノ酸配列は、該配列の３６位に修飾を含んでもよい。修飾は、３６位におけるフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）であってもよい。ある特定の実施形態では、ＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥ（配列番号３９）を含むアミノ酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、ＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴ  ＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧ（配列番号４０）を含む核酸配列によりコードされている���ある特定の実施形態では、３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を有するＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含んでもよいリガンド結合領域に特異的な誘導剤は、ＡＰ２０１８７および／またはＡＰ１９０３を含み、これらは両方とも合成薬物である。
【００９６】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、リンカー領域は、ＧＧＧＧＳ（配列番号４１）を含むアミノ酸またはＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣ（配列番号４２）を含む核酸配列によりコードされている。ある特定の実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、制限部位を含まない。
【００９７】
本開示の切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、その配列の８７位にアルギニン（Ｒ）を含まないアミノ酸配列によりコードされている。あるいは、または加えて、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、その配列の２８２位にアラニン（Ａ）を含まないアミノ酸配列によりコードされている。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性カスパーゼポリペプチドまたは切断型カスパーゼ９ポリペプチドのある特定の実施形態では、切断型カスパーゼ９ポリペプチドは、ＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４３）を含むアミノ酸、またはＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４４）を含む核酸配列によりコードされている。
【００９８】
切断型カスパーゼ９ポリペプチドを含む、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのある特定の実施形態では、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥＧＧＧＧＧＳＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４５）を含むアミノ酸配列、またはＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣＧＡＡＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４６）を含む核酸配列によりコードされている。
【００９９】
本開示のナノ粒子ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよい。一部の実施形態では、ナノ粒子ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよく、自己切断ペプチドは、ＣＡＲとナノ粒子の間に位置する。一部の実施形態では、ナノ粒子ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよく、第１の自己切断ペプチドは、ＣＡＲの上流に位置し、第２の自己切断ペプチドは、ＣＡＲの下流に位置する。一部の実施形態では、ナノ粒子ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよく、第１の自己切断ペプチドは、ＣＡＲとナノ粒子の間に位置し、第２の自己切断ペプチドは、ＣＡＲの下流に位置する。一部の実施形態では、ナノ粒子ベクターは、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよく、第１の自己切断ペプチドは、ＣＡＲとナノ粒子の間に位置し、第２の自己切断ペプチドは、ＣＡＲの下流、例えば、ＣＡＲと選択遺伝子の間に位置する。本開示のナノ粒子ベクターは、例えば、本開示のタンパク質足場、ＶＨＨ、ＣｅｎｔｙｒｉｎまたはＣＡＲＴｙｒｉｎのうちの１つまたは複数と本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドとの間に位置する、少なくとも１つの自己切断ペプチドを含んでもよい。本開示のナノ粒子ベクターは、少なくとも２つの自己切断ペプチド、例えば本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの上流または直ぐ上流に位置する、第１の自己切断ペプチド、および例えば本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの下流または直ぐ上流に位置する、第２の自己切断ペプチドを含んでもよい。自己切断ペプチドは、例えば、Ｔ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチド、Ｅ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチド、Ｆ２Ａペプチド、ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチド、Ｐ２Ａペプチド、またはＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドを含んでもよい。Ｔ２Ａペプチドは、ＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４７）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＥＧＲＧＳＬＬＴＣＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号４８）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｔ２Ａペプチドは、ｇｇａｔｃｔｇｇａｇａｇｇｇａａｇｇｇｇａａｇｃｃｔｇｃｔｇａｃｃｔｇｔｇｇａｇａｃｇｔｇｇａｇｇａａａａｃｃｃａｇｇａｃｃａ（配列番号４９）を含む核酸配列を含んでもよい。Ｅ２Ａペプチドは、ＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５０）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｅ２Ａペプチドは、ＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＱＣＴＮＹＡＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５１）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｆ２Ａペプチドは、ＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５２）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｆ２Ａペプチドは、ＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＶＫＱＴＬＮＦＤＬＬＫＬＡＧＤＶＥＳＮＰＧＰ（配列番号５３）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。Ｐ２Ａペプチドは、ＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５４）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。ＧＳＧ−Ｐ２Ａペプチドは、ＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列を含んでもよく、またはＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５５）を含むアミノ酸配列に対して少なくとも７０％、８０％、９０％、９５％もしくは９９％の同一性を有する配列を含んでもよい。
【０１００】
本開示は、本開示のベクターを含む組成物を提供する。
【０１０１】
本開示は、本開示のタンパク質足場を含む細胞を提供する。
【０１０２】
本開示は、本開示のＣＡＲを含む細胞を提供する。
【０１０３】
本開示は、本開示のトランスポゾンを含む細胞を提供する。
【０１０４】
本開示は、本開示のベクターを含む細胞を提供する。
【０１０５】
ある特定の実施形態では、本開示のＣＡＲ、トランスポゾンまたはベクターを含む細胞は、細胞表面にＣＡＲを発現することができる。細胞は、いずれの型の細胞であってもよい。好ましくは、細胞は、免疫細胞である。免疫細胞は、Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）様細胞（例えば、サイトカイン誘導キラー（ＣＩＫ）細胞）、造血前駆細胞、末梢血（ＰＢ）由来Ｔ細胞または臍帯血（ＵＣＢ）由来Ｔ細胞であってもよい。好ましくは、免疫細胞は、Ｔ細胞である。細胞は、本開示の修飾免疫細胞またはＴ細胞を刺激および増殖するために任意選択で使用されうる人工抗原提示細胞であってもよい。細胞は、人工または修飾抗原提示細胞として任意選択で使用されうる腫瘍細胞であってもよい。
【０１０６】
養子療法に使用されうる本開示の修飾細胞は、自己のものであってもよい。養子療法に使用されうる本開示の修飾細胞は、同種異系のものであってもよい。
【０１０７】
本開示は、本開示のタンパク質足場を作製する方法であって、（ａ）コンセンサス配列の１つまたは複数のアミノ酸を修飾するステップ、および（ｂ）ヒトＭＵＣ１に選択的に結合するタンパク質足場を選択するステップを含む方法を提供する。この方法のある特定の実施形態では、修飾するステップは、部位特異的変異誘発、ランダム変異誘発、またはこれらの組み合わせを含む。ランダム変異誘発は、例えば、エラープローンポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ＤＮＡシャフリング、またはこれらの組み合わせを含みうる。この方法の修飾および選択するステップを、必要に応じて何回でも繰り返してもよい。例えば、本開示のタンパク質足場を、この方法のある特定の実施形態に従って、アフィニティー成熟により同定することができる。
【０１０８】
本開示は、細胞の表面にキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現させる方法であって、（ａ）細胞集団を得るステップ、（ｂ）細胞集団を、本開示のＣＡＲを含む組成物またはＣＡＲをコードする配列を含む組成物に、細胞集団内の少なくとも１つの細胞の細胞膜を横切ってＣＡＲを移入させるのに十分な条件下で接触させることによって、修飾された細胞集団を生成するステップ；（ｃ）修飾された細胞集団を、ＣＡＲをコードする配列の組込みに好適な条件下で、培養するステップ、および（ｄ）細胞表面にＣＡＲを発現する修飾細胞集団の少なくとも１つの細胞を増殖および／または選択するステップを含む方法を提供する。
【０１０９】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、細胞集団は、白血球ならびに／またはＣＤ４＋およびＣＤ８＋白血球を含んでもよい。細胞集団は、ＣＤ４＋白血球とＣＤ８＋白血球を、最適化された比で含んでもよい。ＣＤ４＋白血球  対  ＣＤ８＋白血球の最適化された比は、ｉｎ  ｖｉｖｏには天然に存在しない。細胞集団は、腫瘍細胞を含んでもよい。
【０１１０】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、（ｂ）の細胞集団内の少なくとも１つの細胞の細胞膜を横切ってＣＡＲ、もしくはＣＡＲをコードする配列、トランスポゾン、またはベクターを移入させるのに十分な条件は、指定電圧での１回または複数回の電気パルスの印加、緩衝液、および１つまたは複数の追加因子のうちの少なくとも１つを含んでもよい。ある特定の実施形態では、緩衝液は、ＰＢＳ、ＨＢＳＳ、ＯｐｔｉＭＥＭ、ＢＴＸｐｒｅｓｓ、Ａｍａｘａ  Ｎｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒ、ヒトＴ細胞ヌクレオフェクション緩衝液、またはこれらの任意の組み合わせを含んでもよい。ある特定の実施形態では、１つまたは複数の追加因子は、（ａ）組換えヒトサイトカイン、ケモカイン、インターロイキンまたはこれらの任意の組み合わせ、（ｂ）塩、無機物、代謝物またはこれらの任意の組み合わせ、（ｃ）細胞培地、（ｄ）細胞のＤＮＡ感知、代謝、分化、シグナル伝達、１つもしくは複数のアポトーシス経路またはこれらの組み合わせの阻害剤、および（ｅ）１つまたは複数の核酸を修飾または安定化する試薬を含んでもよい。組換えヒトサイトカイン、ケモカイン、インターロイキンまたはこれらの任意の組み合わせは、ＩＬ２、ＩＬ７、ＩＬ１２、ＩＬ１５、ＩＬ２１、ＩＬ１、ＩＬ３、ＩＬ４、ＩＬ５、ＩＬ６、ＩＬ８、ＣＸＣＬ８、ＩＬ９、ＩＬ１０、ＩＬ１１、ＩＬ１３、ＩＬ１４、ＩＬ１６、ＩＬ１７、ＩＬ１８、ＩＬ１９、ＩＬ２０、ＩＬ２２、ＩＬ２３、ＩＬ２５、ＩＬ２６、ＩＬ２７、ＩＬ２８、ＩＬ２９、ＩＬ３０、ＩＬ３１、ＩＬ３２、ＩＬ３３、ＩＬ３５、ＩＬ３６、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＦＮ−ガンマ、ＩＬ−１アルファ／ＩＬ−１Ｆ１、ＩＬ−１ベータ／ＩＬ−１Ｆ２、ＩＬ−１２  ｐ７０、ＩＬ−１２／ＩＬ−３５  ｐ３５、ＩＬ−１３、ＩＬ−１７／ＩＬ−１７Ａ、ＩＬ−１７Ａ／Ｆヘテロ二量体、ＩＬ−１７Ｆ、ＩＬ−１８／ＩＬ−１Ｆ４、ＩＬ−２３、ＩＬ−２４、ＩＬ−３２、ＩＬ−３２ベータ、ＩＬ−３２ガンマ、ＩＬ−３３、ＬＡＰ（ＴＧＦ−ベータ１）、リンホトキシン−アルファ／ＴＮＦ−ベータ、ＴＧＦ−ベータ、ＴＮＦ−アルファ、ＴＲＡＮＣＥ／ＴＮＦＳＦ１１／ＲＡＮＫ  Ｌまたはこれらの任意の組み合わせを含みうる。塩、無機物、代謝物またはこれらの任意の組み合わせは、ＨＥＰＥＳ、ニコチンアミド、ヘパリン、ピルビン酸ナトリウム、Ｌ−グルタミン、ＭＥＭ非必須アミノ酸溶液、アスコルビン酸、ヌクレオシド、ＦＢＳ／ＦＣＳ、ヒト血清、代用血清、抗生物質、ｐＨ調節剤、アール塩、２−メルカプトエタノール、ヒトトランスフェリン、組換えヒトインスリン、ヒト血清アルブミン、Ｎｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒ  ＰＬＵＳ  Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ、ＫＣＬ、ＭｇＣｌ２、Ｎａ２ＨＰＯ４、ＮＡＨ２ＰＯ４、ラクトビオン酸ナトリウム、マンニトール、コハク酸ナトリウム、塩化ナトリウム、ＣＩＮａ、グルコース、Ｃａ（ＮＯ３）２、Ｔｒｉｓ／ＨＣｌ、Ｋ２ＨＰＯ４、ＫＨ２ＰＯ４、ポリエチレンイミン、ポリエチレングリコール、ポロクサマー１８８、ポロクサマー１８１、ポロクサマー４０７、ポリビニルピロリドン、Ｐｏｐ３１３、クラウン−５、またはこれらの任意の組み合わせを含みうる。細胞培地は、ＰＢＳ、ＨＢＳＳ、ＯｐｔｉＭＥＭ、ＤＭＥＭ、ＲＰＭＩ  １６４０、ＡＩＭ−Ｖ、Ｘ−ＶＩＶＯ  １５、ＣｅｌｌＧｒｏ  ＤＣ培地、ＣＴＳ  ＯｐＴｉｍｉｚｅｒ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘｐａｎｓｉｏｎ  ＳＦＭ、ＴｅｘＭＡＣＳ培地、ＰＲＩＭＥ−ＸＶ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘｐａｎｓｉｏｎ培地、ＩｍｍｕｎｏＣｕｌｔ−ＸＦ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘｐａｎｓｉｏｎ培地またはこれらの任意の組み合わせを含みうる。細胞のＤＮＡ感知、代謝、分化、シグナル伝達、１つもしくは複数のアポトーシス経路またはこれらの組み合わせの阻害剤は、ＴＬＲ９、ＭｙＤ８８、ＩＲＡＫ、ＴＲＡＦ６、ＴＲＡＦ３、ＩＲＦ−７、ＮＦ−ＫＢ、１型インターフェロン、炎症促進性サイトカイン、ｃＧＡＳ、ＳＴＩＮＧ、Ｓｅｃ５、ＴＢＫ１、ＩＲＦ−３、ＲＮＡ  ｐｏｌ  ＩＩＩ、ＲＩＧ−１、ＩＰＳ−１、ＦＡＤＤ、ＲＩＰ１、ＴＲＡＦ３、ＡＩＭ２、ＡＳＣ、カスパーゼ１、Ｐｒｏ−ＩＬ１Ｂ、ＰＩ３Ｋ、Ａｋｔ、Ｗｎｔ３Ａの阻害剤、グリコーゲンシンターゼキナーゼ−３β（ＧＳＫ−３β）の阻害剤（例えば、ＴＷＳ１１９）、またはこれらの任意の組み合わせを含む。そのような阻害剤の例は、バフィロマイシン、クロロキン、キナクリン、ＡＣ−ＹＶＡＤ−ＣＭＫ、Ｚ−ＶＡＤ−ＦＭＫ、Ｚ−ＩＥＴＤ−ＦＭＫまたはこれらの任意の組み合わせを含むことができる。１つまたは複数の核酸を修飾または安定化する試薬は、ｐＨ調整剤、ＤＮＡ結合タンパク質、脂質、リン脂質、ＣａＰＯ４、ＮＬＳ配列を有するもしくは有さない正味中性電荷ＤＮＡ結合ペプチド、ＴＲＥＸ１酵素、またはこれらの任意の組み合わせを含む。
【０１１１】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、ＣＡＲをコードする配列の組込みに好適な条件は、緩衝液および１つまたは複数の追加因子のうちの少なくとも１つを含む。ある特定の実施形態では、緩衝液は、ＰＢＳ、ＨＢＳＳ、ＯｐｔｉＭＥＭ、ＢＴＸｐｒｅｓｓ、Ａｍａｘａ  Ｎｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒ、ヒトＴ細胞ヌクレオフェクション緩衝液、またはこれらの任意の組み合わせを含んでもよい。ある特定の実施形態では、１つまたは複数の追加因子は、（ａ）組換えヒトサイトカイン、ケモカイン、インターロイキンまたはこれらの任意の組み合わせ、（ｂ）塩、無機物、代謝物またはこれらの任意の組み合わせ、（ｃ）細胞培地、（ｄ）細胞のＤＮＡ感知、代謝、分化、シグナル伝達、１つもしくは複数のアポトーシス経路またはこれらの組み合わせの阻害剤、および（ｅ）１つまたは複数の核酸を修飾または安定化する試薬を含んでもよい。組換えヒトサイトカイン、ケモカイン、インターロイキンまたはこれらの任意の組み合わせは、ＩＬ２、ＩＬ７、ＩＬ１２、ＩＬ１５、ＩＬ２１、ＩＬ１、ＩＬ３、ＩＬ４、ＩＬ５、ＩＬ６、ＩＬ８、ＣＸＣＬ８、ＩＬ９、ＩＬ１０、ＩＬ１１、ＩＬ１３、ＩＬ１４、ＩＬ１６、ＩＬ１７、ＩＬ１８、ＩＬ１９、ＩＬ２０、ＩＬ２２、ＩＬ２３、ＩＬ２５、ＩＬ２６、ＩＬ２７、ＩＬ２８、ＩＬ２９、ＩＬ３０、ＩＬ３１、ＩＬ３２、ＩＬ３３、ＩＬ３５、ＩＬ３６、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＦＮ−ガンマ、ＩＬ−１アルファ／ＩＬ−１Ｆ１、ＩＬ−１ベータ／ＩＬ−１Ｆ２、ＩＬ−１２  ｐ７０、ＩＬ−１２／ＩＬ−３５  ｐ３５、ＩＬ−１３、ＩＬ−１７／ＩＬ−１７Ａ、ＩＬ−１７Ａ／Ｆヘテロ二量体、ＩＬ−１７Ｆ、ＩＬ−１８／ＩＬ−１Ｆ４、ＩＬ−２３、ＩＬ−２４、ＩＬ−３２、ＩＬ−３２ベータ、ＩＬ−３２ガンマ、ＩＬ−３３、ＬＡＰ（ＴＧＦ−ベータ１）、リンホトキシン−アルファ／ＴＮＦ−ベータ、ＴＧＦ−ベータ、ＴＮＦ−アルファ、ＴＲＡＮＣＥ／ＴＮＦＳＦ１１／ＲＡＮＫ  Ｌまたはこれらの任意の組み合わせを含んでもよい。塩、無機物、代謝物またはこれらの任意の組み合わせは、ＨＥＰＥＳ、ニコチンアミド、ヘパリン、ピルビン酸ナトリウム、Ｌ−グルタミン、ＭＥＭ非必須アミノ酸溶液、アスコルビン酸、ヌクレオシド、ＦＢＳ／ＦＣＳ、ヒト血清、代用血清、抗生物質、ｐＨ調節剤、アール塩、２−メルカプトエタノール、ヒトトランスフェリン、組換えヒトインスリン、ヒト血清アルブミン、Ｎｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒ  ＰＬＵＳ  Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ、ＫＣＬ、ＭｇＣｌ２、Ｎａ２ＨＰＯ４、ＮＡＨ２ＰＯ４、ラクトビオン酸ナトリウム、マンニトール（Ｍａｎｉｔｏｌ）、コハク酸ナトリウム、塩化ナトリウム、ＣＩＮａ、グルコース、Ｃａ（ＮＯ３）２、Ｔｒｉｓ／ＨＣｌ、Ｋ２ＨＰＯ４、ＫＨ２ＰＯ４、ポリエチレンイミン、ポリエチレングリコール、ポロクサマー１８８、ポロクサマー１８１、ポロクサマー４０７、ポリビニルピロリドン、Ｐｏｐ３１３、クラウン−５、またはこれらの任意の組み合わせを含んでもよい。細胞培地は、ＰＢＳ、ＨＢＳＳ、ＯｐｔｉＭＥＭ、ＤＭＥＭ、ＲＰＭＩ  １６４０、ＡＩＭ−Ｖ、Ｘ−ＶＩＶＯ  １５、ＣｅｌｌＧｒｏ  ＤＣ培地、ＣＴＳ  ＯｐＴｉｍｉｚｅｒ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘ���ａｎｓｉｏｎ  ＳＦＭ、ＴｅｘＭＡＣＳ培地、ＰＲＩＭＥ−ＸＶ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘｐａｎｓｉｏｎ培地、ＩｍｍｕｎｏＣｕｌｔ−ＸＦ  Ｔ  Ｃｅｌｌ  Ｅｘｐａｎｓｉｏｎ培地またはこれらの任意の組み合わせを含んでもよい。細胞のＤＮＡ感知、代謝、分化、シグナル伝達、１つもしくは複数のアポトーシス経路またはこれらの組み合わせの阻害剤は、ＴＬＲ９、ＭｙＤ８８、ＩＲＡＫ、ＴＲＡＦ６、ＴＲＡＦ３、ＩＲＦ−７、ＮＦ−ＫＢ、１型インターフェロン、炎症促進性サイトカイン、ｃＧＡＳ、ＳＴＩＮＧ、Ｓｅｃ５、ＴＢＫ１、ＩＲＦ−３、ＲＮＡ  ｐｏｌ  ＩＩＩ、ＲＩＧ−１、ＩＰＳ−１、ＦＡＤＤ、ＲＩＰ１、ＴＲＡＦ３、ＡＩＭ２、ＡＳＣ、カスパーゼ１、Ｐｒｏ−ＩＬ１Ｂ、ＰＩ３Ｋ、Ａｋｔ、Ｗｎｔ３Ａの阻害剤、グリコーゲンシンターゼキナーゼ−３β（ＧＳＫ−３β）の阻害剤（例えば、ＴＷＳ１１９）、またはこれらの任意の組み合わせを含む。そのような阻害剤の例は、バフィロマイシン、クロロキン、キナクリン、ＡＣ−ＹＶＡＤ−ＣＭＫ、Ｚ−ＶＡＤ−ＦＭＫ、Ｚ−ＩＥＴＤ−ＦＭＫまたはこれらの任意の組み合わせを含むことができる。１つまたは複数の核酸を修飾または安定化する試薬は、ｐＨ調整剤、ＤＮＡ結合タンパク質、脂質、リン脂質、ＣａＰＯ４、ＮＬＳ配列を有するもしくは有さない正味中性電荷ＤＮＡ結合ペプチド、ＴＲＥＸ１酵素、またはこれらの任意の組み合わせを含む。
【０１１２】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、増殖および選択ステップは、逐次的に行われる。増殖を選択の前に行ってもよい。増殖を選択の後に行ってもよく、任意選択で、さらなる（すなわち、第２の）選択を増殖後に行ってもよい。
【０１１３】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、増殖および選択ステップを同時に行ってもよい。
【０１１４】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、増殖は、修飾細胞集団の少なくとも１つの細胞を抗原と接触させてその少なくとも１つの細胞をＣＡＲにより刺激することによって、増殖された細胞集団を生成することを含みうる。抗原を支持体（ｓｕｂｓｔｒａｔｅ）の表面に提示させてもよい。支持体は、これらに限定されないが、表面、ウェル、１個もしくは複数のビーズ、およびマトリクスを含む、いずれの形態を有してもよい。支持体は、常磁性または磁性成分をさらに含んでもよい。ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、磁性ビーズである支持体の表面に抗原を提示させることもあり、その場合、磁石を使用して、磁性ビーズを、修飾および増殖された細胞集団から除去または分離することができる。抗原を細胞または人工抗原提示細胞の表面に提示させてもよい。本開示の人工抗原提示細胞は、腫瘍細胞および幹細胞を含むことができるが、これらに限定されない。
【０１１５】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、トランスポゾンまたはベクターは、選択遺伝子を含み、この場合の選択ステップは、修飾細胞集団の少なくとも１つの細胞を化合物（選択遺伝子は、この化合物に対する耐性を付与するものである）と接触させることによって、選択遺伝子を発現する細胞を、選択を生き抜くものとして同定し、選択遺伝子を発現することができない細胞を、選択ステップを生き抜くことができないものとして同定することを含む。
【０１１６】
ＣＡＲを発現させるこの方法のある特定の実施形態では、増殖および／または選択ステップは、１０〜１４日（端点を含む）の期間、実施してもよい。
【０１１７】
本開示は、本開示の方法の、修飾、増殖および選択された細胞集団を含む組成物を提供する。
【０１１８】
本開示は、それを必要とする被験体におけるがんを処置する方法を提供し、この方法は、被験体に本開示の組成物を投与するステップを含み、ここでＣＡＲは腫瘍細胞上の抗原に特異的に結合する。本開示の修飾細胞または細胞集団を含む組成物を被験体に投与するステップを含む、ある特定の実施形態では、細胞または細胞集団は、自己のものであってもよい。被験体に、本開示の修飾細胞または細胞集団を含む組成物を投与するステップを含む、ある特定の実施形態では、細胞または細胞集団は、同種異系のものであってもよい。
【０１１９】
本開示は、それを必要とする被験体における細胞療法を改変する方法であって、被験体に、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含む組成物のトランスポゾンまたはベクターを含む細胞を含む組成物を投与するステップを含み、細胞と誘導剤を接触させることにより細胞においてアポトーシスを選択的に誘導することができる、方法を提供する。ある特定の実施形態では、細胞は、自己のものである。ある特定の実施形態では、細胞は、同種異系のものである。この方法のある特定の実施形態では、細胞療法は、養子細胞療法である。この方法のある特定の実施形態では、細胞療法の改変は、細胞療法の終了を含む。この方法のある特定の実施形態では、細胞療法の改変は、細胞療法に提供される細胞の一部分の枯渇を含む。ある特定の実施形態では、方法は、細胞療法の改変を阻害するために誘導剤の阻害剤を投与するステップをさらに含み、それによって細胞療法の機能および／または有効性を回復させる。
【０１２０】
本開示の細胞療法を改変する方法を使用して、例えば、回復の徴候、または疾患の重症度／進行を減少させる徴候、疾患寛解／停止の徴候、および／または有害事象の発生に応じて、療法を終了させるまたは減弱することができる。疾患の徴候もしくは症状が再出現する、もしくは重症度において増加する、かつ／または有害事象が解消されれば、誘導剤を阻害することにより本開示の細胞療法を再開することができる。
【図面の簡単な説明】
【０１２１】
【図１】図１は、ＭＵＣ１タンパク質、および具体的には、ＭＵＣ１−ＣのＣ末端の細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）のアミノ酸配列（配列番号３）の模式図である。
【０１２２】
【図２】図２は、ヒトテネイシン（Ｔｅｎａｓｉｎ）の３番目のＦＮ３ドメインのループ構造を示す図である。
【０１２３】
【図３】図３は、ＣＩＳディスプレイ（ｉｓｏｇｅｎｉｃａ．ｃｏｍ／ｐｒｏｐｒｉｅｔａｒｙ−ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ／ｃｉｓ−ｄｉｓｐｌａｙを参照されたい）を使用するＭＵＣ１結合Ｃｅｎｔｙｒｉｎのスクリーニングおよび選択プロセスを示す模式図である。
【０１２４】
【図４】図４は、ベクターＰＢ−ＥＦ１ａのマップである。
【０１２５】
【図５】図５は、初代ヒトＴ細胞のＧＦＰ転位（ヌクレオフェクションの１１日後に分析した）であって、複数のクローニング部位（ＭＣＳ）にＧＦＰが挿入されたＰＢ−ＥＦ１ａを有する初代ヒトＴ細胞（「模擬」）のＧＦＰ転位を、ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）酵素（ｓＢＰｏ）と共送達されたＰＨ−ＥＦ１ａ−ＧＦＰを有する初代ヒトＴ細胞のＧＦＰ転位に対して比較する、一連のグラフである。
【０１２６】
【図６】図６は、本開示の例示的な誘導性切断型カスパーゼ９ポリペプチドを示す模式図である。
【０１２７】
【図７】図７は、ヌクレオフェクション後１２日目の、単独での治療剤（ＣＡＲＴｙｒｉｎ）を発現するように修飾された細胞、または本開示の誘導性カスパーゼポリペプチド（ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼにより細胞に導入されたｉＣ９構築物（「安全スイッチ」としても公知）によりコードされている）と併せてＣＡＲＴｙｒｉｎを発現するように修飾された細胞における、生細胞のエリア（ゲートされた右下象限）からアポトーシス細胞により占有されたエリア（左上象限）に移動する細胞の存在量を、誘導剤（ＡＰ１９０３）の漸増投薬量の関数として示す、一連のフローサイトメトリープロットである。
【０１２８】
【図８】図８は、ヌクレオフェクション後１９日目の、単独で治療剤（ＣＡＲＴｙｒｉｎ）を発現するように修飾された細胞、または本開示の誘導性カスパーゼポリペプチド（ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼにより細胞に導入されたｉＣ９構築物（「安全スイッチ」としても公知）によりコードされている）と併せてＣＡＲＴｙｒｉｎを発現するように修飾された細胞における、生細胞のエリア（ゲートされた右下象限）からアポトーシス細胞により占有されたエリア（左上象限）に移動する細胞の存在量を、誘導剤（ＡＰ１９０３）の漸増投薬量の関数として示す、一連のフローサイトメトリープロットである。
【０１２９】
【図９】図９は、図７（左のグラフ）または図８（右のグラフ）のいずれかに示されている凝集結果の定量を示す１対のグラフである。具体的には、これらのグラフは、１２日目（図７および左のグラフ）または１９日目（図８および右のグラフ）のいずれかにおける細胞生存パーセントに対するｉＣ９安全スイッチの影響を、各々の修飾された細胞型についてｉＣ９スイッチの誘導剤（ＡＰ１９０３）の濃度の関数として示す。
【０１３０】
【図１０】図１０Ａ〜Ｂは、ＭＵＣ１ヘテロ二量体の構造を示す１対の模式図である。パネルＡは、ＳＥＡドメイン（ウニ精子タンパク質、エンテロキナーゼおよびアグリンドメイン）での自己タンパク質分解を経て２つのサブユニットを生成するＭＵＣ１であって、その結果として、２つのサブユニットが安定した非共有結合性ヘテロ二量体を形成する、ＭＵＣ１を示す。ＭＵＣ１−ＮおよびＭＵＣ１−Ｃという名称は、切断後のサブユニットの位置づけを指定するために、およびそれらのサブユニットとギリシャ文字を用いて細分類されている遺伝子アイソフォームとを区別するために、使用されている。パネルＢは、ＭＵＣ１−Ｃサブユニットの詳細を提供するものである。ＭＵＣ１−Ｃ  ５５アミノ酸細胞外ドメインは、Ｎ３６ＬＴ部位である３６位におけるアスパラギン（Ｂ）がグリコシル化されている。ＭＵＣ１−Ｃ  ７２アミノ酸細胞質ドメインは、複数のエフェクターと相互作用し、発がん性形質転換の誘導に十分なものである。Ｋｕｆｅ  ＤＷ、Ｏｎｃｏｇｅｎｅ、３２巻（９号）：１０７３頁から複写した図。
【０１３１】
【図１１】図１１は、ＭＵＣ１−ｓｃＦｖキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）の例示的な構築を示す模式図である。この図に示されているＭＵＣ１−ｓｃＦｖ  ＣＡＲは、
【化３６】
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を含む、アミノ酸配列を有する（下線付きの部分はリンカー配列を示す）。
【０１３２】
【図１２】図１２は、例示的なＭＵＣ１−Ｃ発現対照の構築を示す模式図である。この図に示されているＭＵＣ１−Ｃ構築物は、ＭＡＬＰＶＴＡＬＬＬＰＬＡＬＬＬＨＡＡＲＰＳＶＶＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲＹＮＬＴＩＳＤＶＳＶＳＤＶＰＦＰＦＳＡＱＳＧＡＧＶＰＧＷＧＩＡＬＬＶＬＶＣＶＬＶＡＬＡＩＶＹＬＩＡＬＡＶＣＱＣＲＲＫＮＹＧＱＬＤＩＦＰＡＲＤＴＹＨＰＭＳＥＹＰＴＹＨＴＨＧＲＹＶＰＰＳＳＴＤＲＳＰＹＥＫＶＳＡＧＮＧＧＳＳＬＳＹＴＮＰＡＶＡＡＴＳＡＮＬ（配列番号５７）を含むアミノ酸配列を有する。
【０１３３】
【図１３】図１３Ａは、完全長ＭＵＣ１（ＰＤＢ：２ＡＣＭ）のリボン構造またはＭＵＣ１−Ｃドメインの予測構造を示す１対の模式図である。図１３Ｂは、Ｋ５６２細胞（不死化ヒト慢性骨髄性白血病細胞）、ラージ細胞（がんのモデルとして使用されるヒト造血細胞株）、ＭＵＣ１−Ｃを発現するように修飾されたラージ細胞、活性化Ｔ細胞、およびＲＰＭＩ８２２６細胞（ヒト末梢血Ｂ細胞形質細胞腫／骨髄腫細胞株）を含む、異なる細胞型におけるＭＵＣ１発現を示す、一連のグラフである。Ｋ５６２細胞については、染色対照ピークが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークの左側に現れる。ラージ細胞については、染色対照ピークが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークと重なるが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークがより高い。ＭＵＣ１−Ｃを発現するように修飾されたラージ細胞については、染色対照ピークが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークと重なるが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークがより高い。活性化Ｔ細胞については、染色対照ピークが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークの左側に現れる。ＲＰＭＩ８２２６細胞については、染色対照ピークが、抗ＭＵＣ１−Ｎ  Ａｂピークの左側に現れる。
【０１３４】
【図１４】図１４は、ＭＵＣ１−ｓｃＦｖ  ＣＡＲ機能アッセイを示す図である。Ｘ軸に沿った各ＭＵＣ１−ｓｃＦｖについて、キーに提供されている条件が上にあり、該条件が、左から右に（すなわち、ＭＵＣ１−ｓｃＦｖ、８２２６；８２２６−ＭＵＣ１−Ｃ；Ｋ５６２；Ｋ５６２−ＭＵＣ１−Ｃ；ラージ；ラージ−ＭＵＣ１−Ｃの各々について左から右に）示されている。ＭＵＣ１−ｓｃＦｖ機能は、Ｘ軸に沿ったＭＵＣ１−ｓｃＦｖと接触させた各条件での細胞の脱顆粒の程度により測定される。ＣＤ１０７ａ陽性（ＣＤ１０７ａ＋）である全細胞の百分率として、脱顆粒を測定した。
【０１３５】
【図１５】図１５は、ＭＵＣ１−Ｃ  ｓｃＦｖ−ＣＡＲが異なるエピトープを認識することを実証するグラフおよび表である。Ｘ軸に沿ったＭＵＣ１−ｓｃＦｖと接触させた各条件での細胞の脱顆粒の程度によりＭＵＣ１−Ｃ  ｓｃＦｖ−ＣＡＲ機能を測定した機能アッセイの結果が、このグラフに提供されている。ＣＤ１０７ａ陽性（ＣＤ１０７ａ＋）であった全細胞の百分率として、脱顆粒を測定した。チャートは、機能アッセイ中の各ＭＵＣ１−Ｃ  ｓｃＦｖ−ＣＡＲの相対活性を要約するものである。次のことを含む、いくつかの最初の結論に達することができる：１）Ｆ１Ｃ−ＨＬ  ＣＡＲは、活性化Ｔ細胞上に発現されたものを含む、完全長ＭＵＣ１に対して反応する、２）Ｍ１Ａ−ＬＨ  ＣＡＲは、完全長ＭＵＣ１に対して反応し、より小さい程度に、Ｔ細胞上に発現されたものに対して反応する、および３）Ｋ２Ｂ−ＨＬ  ＣＡＲは、切断されたがシェディングされていないＭＵＣ１−Ｃに対してのみ反応し、完全長ＭＵＣ１に対して反応しない。
【０１３６】
【図１６】図１６は、異なるがん細胞株におけるＭｕｃ１発現を示すグラフである。
【０１３７】
【図１７】図１７は、がん細胞株のパネルに対するＭｕｃ１結合ＣＡＲ−Ｔ細胞の活性の評価結果を示すグラフである。細胞株をＣＡＲ＋（Ｍ１Ａ−ＬＨ；黒棒）または模擬（灰色棒）Ｔ細胞とともに４〜６時間、共培養した。Ｔ細胞による脱顆粒を、ＣＤ１０７ａ（脱顆粒のマーカー；左側の軸）についてのＦＡＣＳ染色により評価した。右側の軸上の細胞株の表面における完全長Ｍｕｃ１（Ｍｕｃ１  ＦＬ）の発現をＭｕｃ１−ＮについてのＦＡＣＳ染色により評価した。データがＭＦＩとして表示されている。加えて、細胞株の各々によるＭｕｃ１−Ｎの細胞培養上清へのシェディングをＥＬＩＳＡにより測定した。それがＭｕｃ１ユニット／ｍｌとして示されている。
【発明を実施するための形態】
【０１３８】
ＭＵＣ１タンパク質を標的とする組成物およびこれらの組成物の使用方法が開示される。本開示のある特定の好ましい実施形態では、ＭＵＣ１は、ＭＵＣ１のＣ末端配列の細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）である。
【０１３９】
ＭＵＣ１タンパク質を標的とするためのＣｅｎｔｙｒｉｎ組成物およびこれらの組成物の使用方法が開示される。本開示のある特定の好ましい実施形態では、ＭＵＣ１は、ＭＵＣ１のＣ末端配列の細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）である。
【０１４０】
本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎは、ＭＵＣに、好ましくはＭＵＣ１のＣ末端部分に特異的に結合する。本開示の方法の好ましい実施形態は、ＭＵＣ１−Ｃ  Ｃｅｎｔｙｒｉｎ結合物質を使用して、細胞傷害性細胞型をＭＵＣ１−Ｃ＋細胞の破壊を媒介するように再指示する（ｒｅｄｉｒｅｃｔ）。
【０１４１】
本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎは、細胞内シグナル伝達ドメインと、膜貫通ドメインと、ヒトＭＵＣ１結合領域を含む細胞外ドメインとを含む、ヒトＭＵＣ１特異的キメラＴ細胞受容体（またはキメラ抗原受容体、ＣＡＲ）ポリペプチドの成分として、使用することができる。ＭＵＣ１結合領域がＣｅｎｔｙｒｉｎであってもよい。結合領域は、ＬＰＡＰＫＮＬＶＶＳＥＶＴＥＤＳＬＲＬＳＷＴＡＰＤＡＡＦＤＳＦＬＩＱＹＱＥＳＥＫＶＧＥＡＩＮＬＴＶＰＧＳＥＲＳＹＤＬＴＧＬＫＰＧＴＥＹＴＶＳＩＹＧＶＫＧＧＨＲＳＮＰＬＳＡＥＦＴＴ（配列番号１）のアミノ酸配列と少なくとも、最大で、または約７０、７５、８０、８５、９０、９５、９６、９７、９８、９９または１００％同一であるアミノ酸配列を含むことができる。
【０１４２】
ＭＵＣ１タンパク質を標的とするためのＶＨＨ組成物およびこれらの組成物の使用方法が開示される。本開示のある特定の好ましい実施形態では、ＭＵＣ１は、ＭＵＣ１のＣ末端配列の細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）である。
【０１４３】
本開示のＶＨＨは、ＭＵＣに、好ましくはＭＵＣ１のＣ末端部分に特異的に結合する。本開示の方法の好ましい実施形態は、ＭＵＣ１−Ｃ  ＶＨＨ結合物質を使用して、細胞傷害性細胞型をＭＵＣ１−Ｃ＋細胞の破壊を媒介するように再指示する。
【０１４４】
本開示のキメラ抗原受容体は、ヒトＣＤ２、ＣＤ３δ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、ＣＤ３ζ、ＣＤ４、ＣＤ８α、ＣＤ１９、ＣＤ２８、４−１ＢＢまたはＧＭ−ＣＳＦＲのシグナルペプチドを含んでもよい。本開示のヒンジ／スペーサードメインは、ヒトＣＤ８α、ＩｇＧ４および／またはＣＤ４のヒンジ／スペーサー／ストーク（ｓｔａｌｋ）を含んでもよい。本開示の細胞内ドメインまたはエンドドメインは、ヒトＣＤ３ζの細胞内シグナル伝達ドメインを含んでもよく、ヒト４−１ＢＢ、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＭｙＤ８８、ＯＸ−４０細胞内セグメント、またはこれらの任意の組み合わせをさらに含んでもよい。例示的な膜貫通ドメインは、ヒトＣＤ２、ＣＤ３δ、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、ＣＤ３ζ、ＣＤ４、ＣＤ８α、ＣＤ１９、ＣＤ２８、４−１ＢＢまたはＧＭ−ＣＳＦＲ膜貫通ドメインを含むが、これらに限定されない。
【０１４５】
本開示は、ヒトＭＵＣ１特異的キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ヒトＭＵＣ１特異的ＣＡＲの作製方法および使用方法を提供する。本開示は、ヒトＭＵＣ１特異的ＣＡＲを含む細胞、またはヒトＭＵＣ１特異的ＣＡＲにより修飾された細胞（組換え細胞）も提供する。本開示のＭＵＣ１特異的ＣＡＲを発現する組換え細胞は、ｉｎ  ｖｉｖｏでの存続および抗腫瘍有効性の改善を示す。本開示のＭＵＣ１特異的ＣＡＲを発現する組換え細胞の抗腫瘍効果は、遺伝子修飾細胞、例えば、ＭＵＣ１に特異的であるようにされた、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）様細胞（例えば、サイトカイン誘導キラー（ＣＩＫ）細胞）、造血前駆細胞、末梢血（ＰＢ）由来Ｔ細胞（Ｇ−ＣＳＦ動員末梢血からのＴ細胞を含む）、臍帯血（ＵＣＢ）由来Ｔ細胞、またはこれらの任意の組み合わせによって、増強することができる。Ｔ細胞特異性は、本開示のＭＵＣ１発現ＣＡＲをコードする発現カセットの電気移入（ｅｌｅｃｔｒｏｔｒａｎｓｆｅｒ）により達成することができる。
【０１４６】
本開示のＭＵＣ１発現ＣＡＲは、１つまたは複数の活性化モチーフ（例えば、エンドドメイン）、例えば、ＣＤ３−ζ由来活性化ドメインを含む、キメラ受容体であってもよい。さらなるＴ細胞活性化モチーフは、４−１ＢＢ、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＭｙＤ８８、ＯＸ−４０を含むが、これらに限定されない。本開示のＴ細胞活性化ドメインは、４−１ＢＢ膜貫通および／または活性化ドメインも含んでもよい。本開示のＭＵＣ１発現ＣＡＲは、ヒト細胞および被験体における発現用にコドン最適化されたコード領域および／または発現カセットを含んでもよい。ＣＡＲ発現カセットは、組換え細胞のエピソームに維持されてもよく、またはゲノムに組み込まれてもよい。発現カセットは、インテグラーゼメカニズム、レトロウイルスなどのウイルスベクター、またはトランスポゾンメカニズムなどの非ウイルスベクターを使用することにより組み込むことができる核酸内に含まれていてもよい。発現カセットをトランスポゾンベースの核酸内に含めてもよい。発現カセットは、非ウイルス遺伝子移入増進のためにトランスポゾンおよびトランスポザーゼを利用する２成分ｐｉｇｇｙＢａｃシステムの一部であってもよい。
【０１４７】
足場タンパク質
本開示のタンパク質足場は、フィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）リピートタンパク質、コード核酸または相補的核酸、ベクター、宿主細胞、組成物、組み合わせ、製剤、デバイス、ならびにそれらの作製および使用方法に基づく。好ましい実施形態では、タンパク質足場は、ヒトテネイシン−Ｃ（本明細書では以降「テネイシン」）からの複数のＦＮ３ドメインのコンセンサス配列からなる。さらなる好ましい実施形態では、本発明のタンパク質足場は、１５個のＦＮ３ドメインのコンセンサス配列である。本開示のタンパク質足場は、様々な分子、例えば、細胞の標的タンパク質に結合するように設計することができる。好ましい実施形態では、本開示のタンパク質足場は、野生型および／もしくは改変体形態のＭＵＣ１のエピトープ、ＭＵＣ１のＣ末端配列、またはその細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）に結合するように設計することができる。
【０１４８】
本開示のタンパク質足場は、さらなる分子または部分、例えば、抗体のＦｃ領域、アルブミン結合ドメイン、または半減期に影響を及ぼすその他の部分を含んでもよい。さらなる実施形態では、本開示のタンパク質足場は、該タンパク質足場をコードしうる核酸分子に結合することができる。
【０１４９】
本開示は、複数のＦＮ３ドメインのコンセンサス配列に基づく少なくとも１つのタンパク質足場を宿主細胞において発現させるための少なくとも１つの方法であって、少なくとも１つのタンパク質足場が検出可能なおよび／または回収可能な量で発現される条件下で、本明細書に記載の宿主細胞を培養するステップを含む方法を提供する。
【０１５０】
本開示は、（ａ）本明細書に記載の複数のＦＮ３ドメインおよび／またはコード核酸のコンセンサス配列に基づくタンパク質足場と、（ｂ）好適なおよび／または薬学的に許容される担体もしくは希釈剤とを含む、少なくとも１つの組成物を提供する。
【０１５１】
本開示は、タンパク質足場のライブラリーを生成する方法であって、タンパク質足場が、フィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）リピートタンパク質、好ましくは、複数のＦＮ３ドメインのコンセンサス配列、より好ましくは、ヒトテネイシンからの複数のＦＮ３ドメインのコンセンサス配列に基づくものである、方法を提供する。ライブラリーは、足場の一部分、例えばループ領域の中の、特定の位置における分子中のアミノ酸またはアミノ酸数を（変異により）変化させることにより足場の逐次的生成を行うことによって、形成される。ライブラリーは、単一ループのアミノ酸組成を変化させることにより、または複数のループをもしくは足場分子のさらなる位置を同時に変化させることにより、生成することができる。変化させるループを、状況に応じて延長または短縮することができる。各位置の可能性のあるすべてのアミノ酸を含むように、またはアミノ酸の設計されたサブセットを含むように、そのようなライブラリーを生成することができる。ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはＣＩＳディスプレイ（ＤＮＡ、ＲＮＡ、リボソームディスプレイなど）、酵母、細菌およびファージディスプレイなどの、ディスプレイによるスクリーニングに、ライブラリーメンバーを使用することができる。
【０１５２】
本開示のタンパク質足場は、ＶＨＨをコードする１つもしくは複数の配列、コード核酸または相補的核酸、ベクター、宿主細胞、組成物、組み合わせ、製剤、デバイス、ならびにそれらの作製および使用方法を含みうる。好ましい実施形態では、タンパク質足場は、ＶＨＨ、完全ヒトＶＨＨ、キメラＶＨＨまたはヒト化ＶＨＨからなる。本開示のタンパク質足場は、様々な分子、例えば、細胞の標的タンパク質に結合するように設計することができる。好ましい実施形態では、本開示のタンパク質足場は、野生型および／もしくは改変体形態のＭＵＣ１のエピトープ、ＭＵＣ１のＣ末端配列、またはその細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）に結合するように設計することができる。
【０１５３】
本開示は、野生型および／もしくは改変体形態のＭＵＣ１のエピトープ、ＭＵＣ１のＣ末端配列、またはその細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）に特異的に結合する、ＶＨＨ、完全ヒトＶＨＨ、キメラＶＨＨまたはヒト化ＶＨＨをコードする１つまたは複数の配列を含むタンパク質足場のライブラリーを生成する方法を提供する。ライブラリーは、足場の一部分、例えば、１つまたは複数の相補性決定領域（ＣＤＲ）、および好ましくは、各可変領域の３番目のＣＤＲの、特定の位置における分子中のアミノ酸またはアミノ酸数を（変異により）変化させることにより足場の逐次的生成を行うことによって、形成される。ライブラリーは、単一ＣＤＲのアミノ酸組成を変化させることにより、または複数のＣＤＲを、もしくは足場分子のさらなる位置（例えば、フレームワーク配列をコードする１つもしくは複数の配列）を、同時に変化させることにより、生成することができる。変化させるＣＤＲおよび／またはフレームワーク配列を、状況に応じて延長または短縮することができる。各位置の可能性のあるすべてのアミノ酸を含むように、またはアミノ酸の設計されたサブセットを含むように、そのようなライブラリーを生成することができる。ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはＣＩＳディスプレイ（ＤＮＡ、ＲＮＡ、リボソームディスプレイなど）、酵母、細菌およびファージディスプレイなどの、ディスプレイによるスクリーニングに、ライブラリーメンバーを使用することができる。
【０１５４】
本開示のタンパク質足場は、還元条件下での安定性、および高濃度での溶解度などの、生物物理的特性の向上を提供し、それらは、Ｅ．Ｃｏｌｉなどの原核細胞系において、酵母などの真核細胞系において、およびウサギ網状赤血球ライセート系などのｉｎ  ｖｉｔｒｏ転写／翻訳系において、発現され、フォールディングされうる。
【０１５５】
本開示は、本発明の足場ライブラリーを標的に対してパニングし、結合物質を検出することにより、特定の標的に結合する足場分子を生成する方法を提供する。他の関連態様では、本開示は、所望の活性を有する、例えば、ある特定のアフィニティーで標的タンパク質に結合することができる、タンパク質足場を生成またはアフィニティー成熟させるために使用することができる、スクリーニング方法を含む。アフィニティー成熟は、ファージディスプレイまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏディスプレイなどのシステムを使用する変異誘発と選択の反復ラウンドにより遂行することができる。このプロセスでの変異誘発は、特定の足場残基に対する部位特異的変異誘発、エラープローンＰＣＲに起因するランダム変異誘発、ＤＮＡシャフリングおよび／またはこれらの技術の組み合わせの結果であることもある。
【０１５６】
本開示は、限定ではないが哺乳動物由来の足場を含む、フィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）リピートタンパク質のコンセンサス配列に基づく単離された、組換えおよび／または合成タンパク質足場、ならびにコンセンサスＦＮ３配列に基づくタンパク質足場をコードする少なくとも１つのポリヌクレオチドを含む組成物およびコード核酸分子を提供する。本開示は、診断および治療組成物、方法およびデバイスを含む、そのような核酸およびタンパク質足場の作製および使用方法を、これらに限定されないが、さらに含む。
【０１５７】
本開示のタンパク質足場は、局所投与、経口投与、または血液脳関門を通過することができること、哺乳動物細胞発現に対して資源に応じてタンパク質の発現増加が可能であるＥ．Ｃｏｌｉにおいて発現させることができること、複数の標的にまたは同じ標的の複数のエピトープに結合する二重特異性またはタンデム分子に操作されることができること、薬物、ポリマーおよびプローブとコンジュゲートさせることができること、高濃度に製剤化することができること、ならびにそのような分子が罹病組織および腫瘍に有効に浸透することができることなどの、従来の治療薬を超える利点をもたらす。
【０１５８】
さらに、タンパク質足場は、抗体の可変領域を模倣する、それらのフォールディング構造（ｆｏｌｄ）に関する抗体の多くの特性を有する。この配向によってＦＮ３ループを抗体相補性決定領域（ＣＤＲ）に同様に曝露することができる。タンパク質足場は、細胞標的に結合することができるはずであり、ある特定の結合または関連特性を改善するようにループを変化させること、例えば、アフィニティー成熟させることができる。
【０１５９】
本開示のタンパク質足場の６つのループのうちの３つは、抗体の相補性決定領域（ＣＤＲ１〜３）、すなわち抗原結合領域に、位相幾何学的に対応するが、残りの３つのループは、抗体ＣＤＲと同様に表面に露出されている。これらのループは、図２に示されているように配列番号１の残基１３〜１６、２２〜２８、３８〜４３、５１〜５４、６０〜６４、および７５〜８１に、またはその辺りにわたる。好ましくは、残基２２〜２８、５１〜５４、および７５〜８１のまたはその辺りのループ領域は、結合特異性およびアフィニティーのために変えられる。これらのループ領域の１つまたは複数を他のループ領域でおよび／またはそれらの配列を骨格部分として維持する他のストランドでランダム化してライブラリーに追加し、特定のタンパク質標的に対して高いアフィニティーを有するライブラリーから強力な結合物質を選択することができる。ループ領域の１つまたは複数は、タンパク質との抗体ＣＤＲ相互作用と同様に標的タンパク質と相互作用することができる。
【０１６０】
本開示の足場は、抗体模倣物を含んでもよい。
【０１６１】
用語「抗体模倣物」は、標的配列に特異的に結合し、天然に存在する抗体とは異なる構造を有する、有機化合物を記述することを意図したものである。抗体模倣物は、タンパク質、核酸、または小分子を含みうる。本開示の抗体模倣物が特異的に結合する標的配列は、抗原でありうる。抗体模倣物は、これらに限定されないが、優れた溶解度、組織浸透、熱および酵素に対する安定性（例えば、酵素的分解に対する耐性）、ならびにより低い生産コストを含む、抗体を超える優れた特性を提供することができる。例示的な抗体模倣物は、アフィボディ（ａｆｆｉｂｏｄｙ）、アフィリン（ａｆｆｌｉｌｉｎ）、アフィマー（ａｆｆｉｍｅｒ）、アフィチン（ａｆｆｉｔｉｎ）、アルファボディ（ａｌｐｈａｂｏｄｙ）、アンチカリン（ａｎｔｉｃａｌｉｎ）、およびアビマー（ａｖｉｍｅｒ）（アビディティー多量体（ａｖｉｄｉｔｙ  ｍｕｌｔｉｍｅｒ）としても公知）、ＤＡＲＰｉｎ（設計されたアンキリンリピートタンパク質）、フィノマー（Ｆｙｎｏｍｅｒ）、クニッツドメインペプチド（Ｋｕｎｉｔｚ  ｄｏｍａｉｎ  ｐｅｐｔｉｄｅ）、およびモノボディ（ｍｏｎｏｂｏｄｙ）を含むが、これらに限定されない。
【０１６２】
本開示のアフィボディ分子は、ジスルフィド架橋が一切ない１つもしくは複数のアルファヘリックスを含む、またはそれからなるタンパク質足場を含む。好ましくは、本開示のアフィボディ分子は、３つのアルファヘリックスを含む、またはそれらからなる。例えば、本開示のアフィボディ分子は、免疫グロブリン結合ドメインを含んでもよい。本開示のアフィボディ分子は、プロテインＡのＺドメインを含んでもよい。
【０１６３】
本開示のアフィリン分子は、例えばガンマ−Ｂクリスタリンまたはユビキチンのいずれかの、露出したアミノ酸の修飾により産生されたタンパク質足場を含む。アフィリン分子は、抗原への抗体のアフィニティーを機能的に模倣するが、構造的には抗体を模倣しない。アフィリンを作製するために使用されるいずれのタンパク質足場においても、正しくフォールディングされたタンパク質分子中の溶媒または可能性のある結合パートナーに接近しやすいアミノ酸は、露出したアミノ酸と見なされる。これらの露出したアミノ酸のいずれか１つまたは複数を、標的配列または抗原に特異的に結合するように修飾することができる。
【０１６４】
本開示のアフィマー分子は、特異的標的配列に対する高アフィニティー結合部位を提供するペプチドループを提示するように操作された高安定性タンパク質を含むタンパク質足場を含む。本開示の例示的なアフィマー分子は、シスタチンタンパク質またはその三次構造に基づくタンパク質足場を含む。本開示の例示的なアフィマー分子は、逆平行ベータシートの頂部に位置するアルファヘリックスを含む共通三次構造を共有しうる。
【０１６５】
本開示のアフィチン分子は、その構造が、例えば、ＤＮＡ結合タンパク質（例えば、ＤＮＡ結合タンパク質Ｓａｃ７ｄ）に由来しうる、人工タンパク質足場を含む。本開示のアフィチンは、標的配列に選択的に結合し、標的配列は、抗原全体であってもよく、またはその一部であってもよい。本開示の例示的なアフィチンは、ＤＮＡ結合タンパク質の結合表面の１つまたは複数のアミノ酸配列をランダム化し、結果として得られたタンパク質をリボソームディスプレイおよび選択に付すことによって、製造される。本開示のアフィチンの標的配列は、例えば、ゲノム内で、またはペプチド、タンパク質、ウイルスもしくは細菌の表面で見いだすことができる。本開示のある特定の実施形態では、アフィチン分子を酵素の特異的阻害剤として使用することができる。本開示のアフィチン分子は、耐熱性タンパク質またはその誘導体を含んでもよい。
【０１６６】
本開示のアルファボディ分子は、細胞浸透アルファボディ（Ｃｅｌｌ−Ｐｅｎｅｔｒａｔｉｎｇ  Ａｌｐｈａｂｏｄｙ）（ＣＰＡＢ）と称されることもある。本開示のアルファボディ分子は、様々な標的配列（抗原を含む）に結合する小型タンパク質（典型的には１０ｋＤａ未満）を含む。アルファボディ分子は、細胞内標的配列に到達することができ、該配列に結合することができる。構造的には、本開示のアルファボディ分子は、一本鎖アルファヘリックス（天然に存在するコイルドコイル構造に類似している）を形成する人工配列を含む。本開示のアルファボディ分子は、標的タンパク質に特異的に結合するように修飾されている１つまたは複数のアミノ酸を含むタンパク質足場を含んでもよい。分子の結合特異性に関係なく、本開示のアルファボディ分子は、正しいフォールディングおよび熱安定性を維持する。
【０１６７】
本開示のアンチカリン分子は、タンパク質または小分子のいずれかにおける標的配列または部位に結合する人工タンパク質を含む。本開示のアンチカリン分子は、ヒトリポカリンに由来する人工タンパク質を含んでもよい。本開示のアンチカリン分子を、例えば、モノクローナル抗体またはそれらの断片の代わりに使用してもよい。アンチカリン分子は、モノクローナル抗体またはそれらの断片より優れた組織浸透および熱安定性を示すことができる。本開示の例示的なアンチカリン分子は、おおよそ２０ｋＤａの質量を有する、約１８０のアミノ酸を含みうる。構造的には、本開示のアンチカリン分子は、ループによりペアごとに接続されている逆平行ベータストランドを含むバレル構造と結合しているアルファヘリックスとを含む。好ましい実施形態では、本開示のアンチカリン分子は、ループによりペアごとに接続されている８つの逆平行ベータストランドを含むバレル構造および結合しているアルファヘリックスを含む。
【０１６８】
本開示のアビマー分子は、標的配列（抗原であってもよい）に特異的に結合する人工タンパク質を含む。本開示のアビマーは、同じ標的内のまたは異なる標的内の複数の結合部位を認識することができる。本開示のアビマーが、１つより多くの標的を認識する場合、アビマーは、二重特異性抗体の機能を模倣する。人工タンパク質アビマーは、各々がおおよそ３０〜３５アミノ酸の２つまたはそれより多くのペプチド配列を含んでもよい。これらのペプチドは、１つまたは複数のリンカーペプチドによって接続されていることもある。アビマーのペプチドの１つまたは複数についてのアミノ酸配列は、膜受容体のＡドメインに由来することもある。アビマーは、ジスルフィド結合および／またはカルシウムを任意選択で含んでもよい、硬い構造を有する。本開示のアビマーは、抗体と比較して高い熱安定性を示すことができる。
【０１６９】
本開示のＤＡＲＰｉｎ（設計されたアンキリンリピートタンパク質）は、標的配列に対して高い特異性および高いアフィニティーを有する、遺伝子操作された、組換えまたはキメラタンパク質を含む。ある特定の実施形態では、本開示のＤＡＲＰｉｎは、アンキリンタンパク質に由来し、任意選択で、アンキリンタンパク質の少なくとも３つのリピートモチーフ（反復構造ユニットとも称される）を含む。アンキリンタンパク質は、高アフィニティータンパク質間相互作用を媒介する。本開示のＤＡＲＰｉｎは、大きい標的相互作用表面を含む。
【０１７０】
本開示のフィノマーは、ヒトＦｙｎ  ＳＨ３ドメインに由来する小型結合タンパク質（約７ｋＤａ）であって、抗体と同等のアフィニティーおよび同等の特異性で標的配列および分子に結合するように操作された小型結合タンパク質を含む。
【０１７１】
本開示のクニッツドメインペプチドは、クニッツドメインを含むタンパク質足場を含む。クニッツドメインは、プロテアーゼ活性を阻害するための活性部位を含む。構造的には、本開示のクニッツドメインは、ジスルフィドに富むアルファ＋ベータフォールディング構造を含む。この構造は、ウシ膵臓トリプシンインヒビターにより例示される。クニッツドメインペプチドは、特異的タンパク質構造を認識し、競合的プロテアーゼ阻害剤として役立つ。本開示のクニッツドメインは、エカランチド（ヒトリポタンパク質関連凝固阻害剤（ＬＡＣＩ）に由来する）を含んでもよい。
【０１７２】
本開示のモノボディは、サイズが一本鎖抗体に匹敵する小型タンパク質（約９４個のアミノ酸を含み、約１０ｋＤａの質量を有する）である。これらの遺伝子操作されたタンパク質は、抗原を含む標的配列に特異的に結合する。本開示のモノボディは、１つまたは複数の別個のタンパク質または標的配列を特異的に標的とすることができる。好ましい実施形態では、本開示のモノボディは、ヒトフィブロネクチンの構造を模倣する、およびより好ましくは、フィブロネクチンの１０番目の細胞外ＩＩＩ型ドメインの構造を模倣する、タンパク質足場を含む。フィブロネクチンの１０番目の細胞外ＩＩＩ型ドメイン、およびそのモノボディ模倣物は、バレルを形成する７つのベータシートを含有し、かつそれぞれの側面に抗体の３つの相補性決定領域（ＣＤＲ）に対応する３つの露出したループを含有する。抗体の可変ドメインの構造とは対照的に、モノボディには、金属イオンのための結合部位が一切なく、中央のジスルフィド結合もない。ループＢＣおよびＦＧを修飾することにより、多重特異性モノボディを最適化することができる。本開示のモノボディは、アドネクチンを含んでもよい。
【０１７３】
そのような方法は、有効量の、少なくとも１つの足場タンパク質を含む組成物または医薬組成物を、症状、効果またはメカニズムのそのようなモジュレーション、処置、緩和、予防または低減を必要とする細胞、組織、器官、動物または患者に投与するステップを含むことができる。有効量は、本明細書に記載されるまたは関連技術分野において公知であるように、公知の方法を使用して行われ、決定されるような、単回（例えば、ボーラス）、複数回もしくは連続投与による約０．００１〜５００ｍｇ／ｋｇの量、または単回、複数回もしくは連続投与により血清中濃度０．０１〜５０００μｇ／ｍｌという血清中濃度を達成するための量、またはこれらのうちの任意の有効な範囲もしくは値を含むことができる。
【０１７４】
キメラ抗原受容体およびＣＡＲＴｙｒｉｎ
本開示は、少なくとも１つのＣｅｎｔｙｒｉｎを含むキメラ抗原受容体を提供する。本開示のキメラ抗原受容体は、１つより多くのＣｅｎｔｙｒｉｎを含んでもよい。例えば、二重特異性ＣＡＲは、２つの異なる抗原に特異的に結合する２つのＣｅｎｔｙｒｉｎを含んでもよい。
【０１７５】
本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎは、抗原に特異的に結合する。抗原に特異的に結合する１つまたは複数のＣｅｎｔｙｒｉｎを含む本開示のキメラ抗原受容体を使用して、細胞（例えば、細胞傷害性免疫細胞）の特異性を特異的抗原へ指向させることができる。
【０１７６】
本開示のＣｅｎｔｙｒｉｎは、ＬＰＡＰＫＮＬＶＶＳＥＶＴＥＤＳＬＲＬＳＷＴＡＰＤＡＡＦＤＳＦＬＩＱＹＱＥＳＥＫＶＧＥＡＩＮＬＴＶＰＧＳＥＲＳＹＤＬＴＧＬＫＰＧＴＥＹＴＶＳＩＹＧＶＫＧＧＨＲＳＮＰＬＳＡＥＦＴＴ（配列番号１）を含むコンセンサス配列を含んでもよい。
【０１７７】
本開示のキメラ抗原受容体は、ヒトＣＤ４、ＣＤ８α、またはＧＭ−ＣＳＦのシグナルペプチドを含んでもよい。本開示のヒンジ／スペーサードメインは、ヒトＣＤ８α、ＩｇＧ４および／またはＣＤ４のヒンジ／スペーサー／ストークを含んでもよい。本開示の細胞内ドメインまたはエンドドメインは、ヒトＣＤ３ζの細胞内シグナル伝達ドメインを含んでもよく、ヒト４−１ＢＢ、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＭｙＤ８８、および／またはＯＸ−４０細胞内セグメントをさらに含んでもよい。例示的な膜貫通ドメインは、ＣＤ８またはＣＤ２８膜貫通ドメインを含むが、これらに限定されない。
【０１７８】
本開示は、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫ様細胞（サイトカイン誘導キラー（ＣＩＫ）細胞を含む）、造血前駆細胞、末梢血（ＰＢ）由来Ｔ細胞（Ｇ−ＣＳＦ動員末梢血からのＴ細胞を含む）、臍帯血（ＵＣＢ）由来Ｔ細胞などの、遺伝子修飾細胞であって、これらの細胞に本開示のＣＡＲおよび／またはＣＡＲＴｙｒｉｎを導入することにより１つまたは複数の抗原に対して特異的であるようにされた、遺伝子修飾細胞を提供する。本開示の細胞は、本開示のＣＡＲまたはＣＡＲＴｙｒｉｎをコードするトランスポゾン、および本開示のトランスポザーゼをコードする配列（好ましくは、本開示のトランスポザーゼをコードする配列はｍＲＮＡ配列である）を含むプラスミドの電気移入により、修飾することができる。
【０１７９】
本開示のトランスポゾンは、組換え／修飾細胞のエピソームに維持されてもよく、またはゲノムに組み込まれてもよい。トランスポゾンは、非ウイルス遺伝子移入増進のためにトランスポゾンおよびトランスポザーゼを利用する２成分ｐｉｇｇｙＢａｃシステムの一部であってもよい。
【０１８０】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポゾンは、抗原受容体をコードする配列が２つのシス調節性インスレーターエレメントによって挟まれている、プラスミドＤＮＡトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、トランスポゾンは、ｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポゾンがｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンである実施形態では、トランスポザーゼは、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである。ある特定の実施形態では、特に、トランスポザーゼがＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＳＰＢ）トランスポザーゼである実施形態では、トランスポザーゼをコードする配列は、ｍＲＮＡ配列である。
【０１８１】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ｐｉｇｇｙＢａｃ（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化３７】
2019528044.tif 000039
【０１８２】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、下記の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である：
【化３８】
2019528044.tif 000040
【０１８３】
ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの２つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２もしくは５３８位のうちの３つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の配列の３０、１６５、２８２および５３８位の各々にアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む、またはそれからなる、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ＰＢ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の３０位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の１６５位におけるアミノ酸置換は、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の２８２位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９の配列の５３８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である。
【０１８４】
本開示の方法のある特定の実施形態では、トランスポザーゼ酵素は、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素である。ある特定の実施形態では、本開示のＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、３０位におけるアミノ酸置換が、イソロイシン（Ｉ）からバリン（Ｖ）への置換であり、１６５位におけるアミノ酸置換が、グリシン（Ｇ）からセリン（Ｓ）への置換であり、２８２位におけるアミノ酸置換が、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換であり、５３８位におけるアミノ酸置換が、アスパラギン（Ｎ）からリシン（Ｋ）への置換である、配列番号５９の配列のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい。ある特定の実施形態では、Ｓｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）（ｓＰＢｏ）トランスポザーゼ酵素は、下記の配列と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％またはこれらの間の任意の百分率において同一のアミノ酸配列を含んでもよい、またはそれからなってもよい：
【化３９】
2019528044.tif 000041
【０１８５】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３、４６、８２、１０３、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２５８、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８６、５０３、５５２、５７０および５９１位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、４６、１１９、１２５、１７７、１８０、１８５、１８７、２００、２０７、２０９、２２６、２３５、２４０、２４１、２４３、２９６、２９８、３１１、３１５、３１９、３２７、３２８、３４０、４２１、４３６、４５６、４７０、４８５、５０３、５５２および５７０位のうちの１つまたは複数にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４６位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の８２位におけるアミノ酸置換は、イソロイシン（Ｉ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１１９位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１２５位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１７７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニ��（Ｆ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８０位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８５位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１８７位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２００位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０７位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２０９位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２２６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２３５位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号５９の２４０位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４１位におけるアミノ酸置換は、フェニルアラニン（Ｆ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２４３位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２５８位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からトリプトファン（Ｗ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９６位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の２９８位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９��たは配列番号６０の３１１位におけるアミノ酸置換は、プロリン（Ｐ）からバリンへの置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１５位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３１９位におけるアミノ酸置換は、スレオニン（Ｔ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２７位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３２８位におけるアミノ酸置換は、チロシン（Ｙ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３４０位におけるアミノ酸置換は、システイン（Ｃ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４２１位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からヒスチジン（Ｈ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４３６位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５６位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からチロシン（Ｙ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４７０位におけるアミノ酸置換は、ロイシン（Ｌ）からフェニルアラニン（Ｆ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４８５位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からロイシン（Ｌ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０３位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からイソロイシン（Ｉ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５５２位におけるアミノ酸置換は、バリン（Ｖ）からリシン（Ｋ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アラニン（Ａ）からスレオニン（Ｔ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５９１位におけるアミノ酸置換は、グルタミン（Ｑ）からアルギニン（Ｒ）への置換である。
【０１８６】
トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの１つもしくは複数にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、本開示の方法のある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９または配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位のうちの２、３、４、５、６つもしくはそれより多くにアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。トランスポザーゼが３０、１６５、２８２および／または５３８位に上記の変異を含む実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、配列番号５９もしくは配列番号６０の配列の１０３、１９４、３７２、３７５、４５０、５０９および５７０位にアミノ酸置換を含んでもよく、またはＳｕｐｅｒ  ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が、そのようなアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１０３位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からプロリン（Ｐ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の１９４位におけるアミノ酸置換は、メチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７２位におけるアミノ酸置換は、アルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の３７５位におけるアミノ酸置換は、リシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の４５０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５０９位におけるアミノ酸置換は、セリン（Ｓ）からグリシン（Ｇ）への置換である。ある特定の実施形態では、配列番号５９または配列番号６０の５７０位におけるアミノ酸置換は、アスパラギン（Ｎ）からセリン（Ｓ）への置換である。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい。ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素が配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換を含んでもよい実施形態を含む、ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９または配列番号６０の配列の３７２、３７５および４５０位にアミノ酸置換をさらに含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換を含んでもよい。ある特定の実施形態では、ｐｉｇｇｙＢａｃ（商標）トランスポザーゼ酵素は、配列番号５９の１９４位にメチオニン（Ｍ）からバリン（Ｖ）への置換、配列番号５９の３７２位にアルギニン（Ｒ）からアラニン（Ａ）への置換、配列番号５９の３７５位にリシン（Ｋ）からアラニン（Ａ）への置換、および配列番号５９の４５０位にアスパラギン酸（Ｄ）からアスパラギン（Ｎ）への置換を含んでもよい。
【０１８７】
足場タンパク質の産生および生成
本開示の少なくとも１つの足場タンパク質を、当技術分野において周知であるような、細胞株、混合細胞株、不死化細胞、または不死化細胞のクローン集団によって、任意選択で産生させることができる。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，  Ｉｎｃ．、ＮＹ、Ｎ．Ｙ．（１９８７〜２００１年）；Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、Ｎ．Ｙ．（１９８９年）；ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ、ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、Ｎ．Ｙ．（１９８９年）；Ｃｏｌｌｉｇａｎら編、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，  Ｉｎｃ．、ＮＹ（１９９４〜２００１年）；Ｃｏｌｌｉｇａｎら、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ、ＮＹ、Ｎ．Ｙ．、（１９９７〜２００１年）を参照されたい。
【０１８８】
足場タンパク質からのアミノ酸を変化、付加および／または欠失させて、免疫原性を低下させることができ、または結合、アフィニティー、会合速度（ｏｎ−ｒａｔｅ）、解離速度（ｏｆｆ−ｒａｔｅ）、アビディティー、特異性、半減期、安定性、溶解度、もしくは当技術分野において公知の任意の他の好適な特性を低下、向上もしくは修飾することができる。
【０１８９】
任意選択で、抗原に対する高いアフィニティーおよび他の有利な生物学的特性を保持した足場タンパク質を操作し得る。この目標を達成するために、足場タンパク質を、任意選択で、親配列および操作された配列の三次元モデルを使用する親配列および様々な概念上操作された産物の分析プロセスにより、調製することができる。三次元モデルは市販されており、当業者に知られている。選択された候補配列のほぼ確実な三次元コンフォメーション構造を図示および表示するコンピュータプログラムであって、可能性のある免疫原性を測定することができるコンピュータプログラムが、利用可能である（例えば、Ｍｏｎｒｏｖｉａ、Ｃａｌｉｆ．のＸｅｎｃｏｒ，Ｉｎｃ．のＩｍｍｕｎｏｆｉｌｔｅｒプログラム）。これらの表示の精査により、候補配列が機能する上での残基の可能性の高い役割の分析、すなわち、その抗原に結合する候補足場タンパク質の能力に影響を与える残基の分析が可能になる。このようにして、残基を、標的抗原に対するアフィニティーなどの所望の特性が達成されるように親配列および参照配列から選択し、組み合わせることができる。あるいは、または上記手順に加えて、他の好適な操作方法を使用することができる。
【０１９０】
足場タンパク質のスクリーニング
類似のタンパク質または断片への特異的結合についてのタンパク質足場のスクリーニングは、ヌクレオチド（ＤＮＡもしくはＲＮＡディスプレイ）またはペプチドディスプレイライブラリー、例えばｉｎ  ｖｉｔｒｏディスプレイを使用して、便利に達成することができる。この方法は、所望の機能または構造を有する個々のメンバーについてペプチドの大きなコレクションをスクリーニングすることを含む。提示されるヌクレオチドまたはペプチド配列は、長さが３〜５０００ヌクレオチドもしくはアミノ酸またはそれより長いこともあり、高頻度に５〜１００アミノ酸長でありえ、多くの場合、約８〜２５アミノ酸長でありうる。ペプチドライブラリーを生成するための直接化学合成法に加えて、いくつかの組換えＤＮＡ法が記載されている。１つのタイプは、バクテリオファージまたは細胞の表面でのペプチド配列の提示を含む。各バクテリオファージまたは細胞は、提示される特定のペプチド配列をコードするヌクレオチド配列を含有する。そのような方法は、ＰＣＴ特許公開第９１／１７２７１号、同第９１／１８９８０号、同第９１／１９８１８号および同第９３／０８２７８号に記載されている。
【０１９１】
ペプチドのライブラリーを生成するための他のシステムは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでの化学合成法と組換え法の両方の態様を有する。ＰＣＴ特許公開第９２／０５２５８号、同第９２／１４８４３号、および同第９６／１９２５６号を参照されたい。米国特許第５，６５８，７５４号および同第５，６４３，７６８号も参照されたい。ペプチドディスプレイライブラリー、ベクター、およびスクリーニングキットは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ（Ｃａｒｌｓｂａｄ、Ｃａｌｉｆ．）およびＣａｍｂｒｉｄｇｅ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅｓｈｉｒｅ、ＵＫ）のような供給業者から市販されている。例えば、Ｅｎｚｏｎに譲渡された米国特許第４，７０４，６９２号、同第４，９３９，６６６号、同第４，９４６，７７８号、同第５，２６０，２０３号、同第５，４５５，０３０号、同第５，５１８，８８９号、同第５，５３４，６２１号、同第５，６５６，７３０号、同第５，７６３，７３３号、同第５，７６７，２６０号、同第５８５６４５６号；Ｄｙａｘに譲渡された同第５，２２３，４０９号、同第５，４０３，４８４号、同第５，５７１，６９８号、同第５，８３７，５００号；Ａｆｆｙｍａｘに譲渡された同第５，４２７，９０８号、同第５，５８０，７１７号；Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓに譲渡された同第５，８８５，７９３号；Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈに譲渡された同第５，７５０，３７３号；Ｘｏｍａに譲渡された同第５，６１８，９２０号、同第５，５９５，８９８号、同第５，５７６，１９５号、同第５，６９８，４３５号、同第５，６９３，４９３号、同第５，６９８，４１７号；Ｃｏｌｌｉｇａｎ、上掲；Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲；またはＳａｍｂｒｏｏｋ、上掲を参照されたい。
【０１９２】
本開示のタンパク質足場は、ヒトまたは他の哺乳動物タンパク質に広範なアフィニティー（ＫＤ）で結合することができる。好ましい実施形態では、本発明の少なくとも１つのタンパク質足場は、表面プラズモン共鳴またはＫｉｎＥｘＡ法によって当業者により実施されるように決定して、高いアフィニティーで、例えば、これらに限定されないが０．１〜９．９（またはこれらの中の任意の範囲もしくは値）×１０−８、１０−９、１０−１０、１０−１１、１０−１２、１０−１３、１０−１４、１０−１５、またはこれらの中の任意の範囲もしくは値などの、約１０−７Ｍであるかまたはそれ未満のＫＤで、標的タンパク質に任意選択で結合することができる。
【０１９３】
任意の好適な方法を使用して、抗原に対するタンパク質足場のアフィニティーまたはアビディティーを実験的に決定することができる。（例えば、Ｂｅｒｚｏｆｓｋｙら、「Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ａｎｔｉｇｅｎ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ」、Ｉｎ  Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、Ｐａｕｌ，  Ｗ．  Ｅ．編、Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ：  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．（１９８４年）；Ｋｕｂｙ、Ｊａｎｉｓ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、Ｗ．Ｈ．  Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ：  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．（１９９２年）；および本明細書に記載の方法を参照されたい）。特定のタンパク質足場−抗原相互作用のアフィニティー測定値は、異なる条件（例えば、塩濃度、ｐＨ）下で測定された場合、変わることがある。したがって、アフィニティーおよび他の抗原結合パラメータ（例えば、ＫＤ、Ｋｏｎ、Ｋｏｆｆ）の測定は、好ましくは、タンパク質足場および抗原の標準化溶液、および本明細書に記載の緩衝液などの標準化緩衝液を用いて行われる。
【０１９４】
競合アッセイを本開示のタンパク質足場に関して行って、どのようなタンパク質、抗体および他のアンタゴニストが標的タンパク質への結合について本発明のタンパク質足場と競合するのか、および／またはエピトープ領域を共有するのかを、決定することができる。これらのアッセイは、当業者には容易に公知であるように、タンパク質上の限られた数の結合部位についてアンタゴニストまたはリガンド間の競合を評価する。タンパク質および／または抗体を競合前または後に固定化または不溶化し、標的タンパク質に結合した試料を、例えば、デカント（タンパク質／抗体を事前に不溶化した場合）により、または遠心分離（タンパク質／抗体を競合反応後に沈殿させた場合）により、非結合試料から分離する。また、競合的結合は、機能が、タンパク質足場の標的タンパク質への結合により変化するのか、またはその結合の欠如により変化するのか、例えば、タンパク質足場分子が、例えば標識の、酵素活性を阻害するのか、または増強するのかによって、決定することができる。当技術分野において周知であるように、ＥＬＩＳＡおよび他の機能アッセイを使用してもよい。
【０１９５】
核酸分子
タンパク質足場をコードする本開示の核酸分子は、ｍＲＮＡ、ｈｎＲＮＡ、ｔＲＮＡもしくは任意の他の形態などの、ＲＮＡの形態であってもよく、またはクローニングにより得られるかもしくは合成により産生されるｃＤＮＡおよびゲノムＤＮＡをこれらに限定されないが含む、ＤＮＡ形態であってもよく、またはそれらの任意の組み合わせであってもよい。ＤＮＡは、三本鎖、二本鎖もしくは一本鎖であってもよく、または任意のこれらの組み合わせであってもよい。ＤＮＡまたはＲＮＡの少なくとも１本の鎖の任意の部分が、センス鎖としても公知のコード鎖であってもよく、またはアンチセンス鎖とも称される非コード鎖であってもよい。
【０１９６】
本開示の単離された核酸分子は、１つまたは複数のイントロンを任意選択で有するオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）、例えば、これに限定されないが、少なくとも１つのタンパク質足場の少なくとも１つの指定部分を含む、核酸分子；標的タンパク質に結合するタンパク質足場またはループ領域についてのコード配列を含む核酸分子；および上記のものとは実質的に異なるヌクレオチド配列を含むが、遺伝コードの縮重に起因して、本明細書に記載されるようなおよび／または当技術分野において公知であるようなタンパク質足場を依然としてコードする核酸分子を含むことができる。もちろん、遺伝コードは、当技術分野において周知である。したがって、本発明の特異的タンパク質足場をコードするそのような縮重核酸改変体を生成することは、当業者には慣例的なことである。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら、上掲を参照のこと、そのような核酸改変体は、本発明に含まれる。
【０１９７】
本明細書で述べられるように、タンパク質足場をコードする核酸を含む本開示の核酸分子は、それ自体でタンパク質足場断片のアミノ酸配列をコードするもの；タンパク質足場全体またはその一部分についてのコード配列；タンパク質足場、断片または一部分についてのコード配列、ならびに転写、スプライシングを含むｍＲＮＡプロセシングおよびポリアデニル化シグナル（例えば、リボソーム結合およびｍＲＮＡの安定化）において役割を果たす転写された非翻訳配列などの、非コード５’および３’配列（しかし、これらに限定されない）を含むさらなる非コード配列とともに、少なくとも１つのイントロンなどの上述のさらなるコード配列を伴う、または伴わない、少なくとも１つのシグナルリーダーまたは融合ペプチドのコード配列などのさらなる配列；さらなる機能性を提供するものなどの、さらなるアミノ酸をコードするさらなるコード配列をコードするものを含むことができるが、これらに限定されない。したがって、タンパク質足場をコードする配列を、タンパク質足場断片または部分を含む融合タンパク質足場の精製を助長するペプチドをコードする配列などの、マーカー配列と、融合させることができる。
【０１９８】
本明細書に記載のポリヌクレオチドに選択的にハイブリダイズするポリヌクレオチド
本開示は、選択的ハイブリダイゼーション条件下で本明細書に開示されるポリヌクレオチドとハイブリダイズする、単離された核酸を提供する。したがって、この実施形態のポリヌクレオチドは、そのようなポリヌクレオチドを含む核酸の単離、検出および／または定量に使用することができる。例えば、本発明のポリヌクレオチドを使用して、寄託ライブラリー内の部分的または完全長クローンを同定すること、単離すること、または増幅させることができる。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、ヒトまたは哺乳動物核酸ライブラリーからのｃＤＮＡから単離された、さもなければそれと相補的な、ゲノムまたはｃＤＮＡ配列である。
【０１９９】
好ましくは、ｃＤＮＡライブラリーは、少なくとも８０％完全長配列、好ましくは少なくとも８５％または９０％完全長配列、およびより好ましくは少なくとも９５％完全長配列を含む。ｃＤＮＡライブラリーを正規化して、稀な配列の表示を増加させることができる。低または中等度ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件は、排他的にではないが、通常は、相補配列に対する配列同一性が低下した配列に関して用いられる。同一性がより高い配列には、任意選択で、中等度および高ストリンジェンシー条件を用いることができる。低ストリンジェンシー条件は、約７０％配列同一性を有する配列の選択的ハイブリダイゼーションを可能にし、オルソロガスまたはパラロガス配列を同定するために用いることができる。
【０２００】
任意選択で、本発明のポリヌクレオチドは、本明細書に記載のポリヌクレオチドによりコードされたタンパク質足場の少なくとも一部分をコードすることになる。本発明のポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質足場をコードするポリヌクレオチドへの選択的ハイブリダイゼーションに用いることができる核酸配列を包含する。例えば、各々全体が参照により本明細書に援用される、Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲、Ｃｏｌｌｉｇａｎ、上掲を参照されたい。
【０２０１】
核酸の構築
本開示の単離された核酸は、当技術分野において周知であるような、（ａ）組換え法、（ｂ）合成技術、（ｃ）精製技術、および／または（ｄ）これらの組み合わせを使用して作製することができる。
【０２０２】
核酸は、本発明のポリヌクレオチドに加えて便利に配列を含んでもよい。例えば、１つまたは複数のエンドヌクレアーゼ制限部位を含むマルチクローニング部位を、ポリヌクレオチドの単離に役立つように核酸に挿入することができる。また、翻訳可能な配列を、本開示の翻訳されたポリヌクレオチドの単離に役立つように挿入することができる。例えば、ヘキサヒスチジンマーカー配列は、本開示のタンパク質を精製するための便利な手段を提供する。コード配列を含まない本開示の核酸は、任意選択で、本開示のポリヌクレオチドのクローニングおよび／または発現のためのベクター、アダプターまたはリンカーである。
【０２０３】
さらなる配列を、そのようなクローニングおよび／または発現配列に、クローニングおよび／または発現におけるそれらの機能を最適化するように、ポリヌクレオチドの単離に役立つように、またはポリヌクレオチドの細胞への導入を改善するように付加させることができる。クローニングベクター、発現ベクター、アダプターおよびリンカーの使用は、当技術分野において周知である。（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲；またはＳａｍｂｒｏｏｋ、上掲を参照されたい）。
【０２０４】
核酸を構築するための組換え法
本開示の単離された核酸組成物、例えば、ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡまたはこれらの任意の組み合わせは、当業者に公知の任意の数のクローニング法を使用して生物学的供給源から得ることができる。一部の実施形態では、ストリンジェントな条件下で本発明のポリヌクレオチドに選択的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブが、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡライブラリー内の所望の配列を同定するために使用される。ＲＮＡの単離、ならびにｃＤＮＡおよびゲノムライブラリーの構築は、当業者に周知である。（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲；またはＳａｍｂｒｏｏｋ、上掲を参照されたい）。
【０２０５】
核酸スクリーニングおよび単離方法
本開示のポリヌクレオチドの配列に基づくプローブを使用して、ｃＤＮＡまたはゲノムライブラリーをスクリーニングすることができる。プローブを使用してゲノムＤＮＡまたはｃＤＮＡ配列とハイブリダイズさせて、同じまたは異なる生物における相同遺伝子を単離することができる。様々な程度のハイブリダイゼーションのストリンジェンシーをアッセイで用いることができること、およびハイブリダイゼーションまたは洗浄媒体がストリンジェントでありうることは、当業者には理解される。ハイブリダイゼーションの条件が、よりストリンジェントになると、二重鎖形成が起こるためのプローブと標的との間に、より大きな程度の相補性が存在するはずである。ストリンジェンシーの程度は、温度、イオン強度、ｐＨ、およびホルムアミドなどの部分的に変性させる溶媒の存在のうちの１つまたは複数により、制御することができる。例えば、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーは、例えば０％〜５０％の範囲内のホルムアミドの濃度の操作によって、反応物溶液の極性を変化させることにより、便利に変えられる。検出可能な結合に求められる相補性（配列同一性）度は、ハイブリダイゼーション媒体および／または洗浄媒体のストリンジェンシーに従って変わることになる。相補性の程度は、最適には１００％、または７０〜１００％、またはこれらの中の任意の範囲もしくは値である。しかし、プローブおよびプライマーの小さい配列差異を、ハイブリダイゼーションおよび／または洗浄媒体のストリンジェンシーを低下させることにより、補償することができることは理解されるべきである。
【０２０６】
ＲＮＡまたはＤＮＡの増幅方法は当技術分野において周知であり、そのような方法を、本明細書で提示される教示およびガイダンスに基づいて、過度の実験なしに本開示に従って使用することができる。
【０２０７】
公知のＤＮＡまたはＲＮＡ増幅方法は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）および関連増幅プロセス（例えば、Ｍｕｌｌｉｓらの米国特許第４，６８３，１９５号、同第４，６８３，２０２号、同第４，８００，１５９号、同第４，９６５，１８８号；Ｔａｂｏｒらの同第４，７９５，６９９号および同第４，９２１，７９４号；Ｉｎｎｉｓの同第５，１４２，０３３号；Ｗｉｌｓｏｎらの同第５，１２２，４６４号；Ｉｎｎｉｓの同第５，０９１，３１０号；Ｇｙｌｌｅｎｓｔｅｎらの同第５，０６６，５８４号；Ｇｅｌｆａｎｄらの同第４，８８９，８１８号；Ｓｉｌｖｅｒらの同第４，９９４，３７０号、Ｂｉｓｗａｓの同第４，７６６，０６７号；Ｒｉｎｇｏｌｄの同第４，６５６，１３４号を参照されたい）、ならびに二本鎖ＤＮＡ合成の鋳型として標的配列に対するアンチセンスＲＮＡを使用するＲＮＡ媒介増幅（商標名ＮＡＳＢＡである、Ｍａｌｅｋらの米国特許第５，１３０，２３８号）を含むが、これらに限定されず、前記参照文献の全内容が参照により本明細書に援用される。（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲；またはＳａｍｂｒｏｏｋ、上掲を参照されたい）。
【０２０８】
例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）技術を使用して、本開示のポリヌクレオチドおよび関連遺伝子の配列を直接ゲノムＤＮＡまたはｃＤＮＡライブラリーから増幅することができる。ＰＣＲおよび他のｉｎ  ｖｉｔｒｏ増幅方法も、例えば、発現させるべきタンパク質をコードする核酸配列のクローニングに、試料中の所望のｍＲＮＡの存在を検出するためのプローブとして使用するための核酸の作製に、核酸シークエンシングに、または他の目的に有用でありうる。ｉｎ  ｖｉｔｒｏ増幅方法による当業者に指示するのに十分な技術の例は、Ｂｅｒｇｅｒ、上掲、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、上掲、およびＡｕｓｕｂｅｌ、上掲、ならびにＭｕｌｌｉｓら、米国特許第４，６８３，２０２号（１９８７年）、およびＩｎｎｉｓら編、ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ．（１９９０年）において見いだされる。ゲノムＰＣＲ増幅用の市販のキットは、当技術分野において公知である。例えば、Ａｄｖａｎｔａｇｅ−ＧＣ  Ｇｅｎｏｍｉｃ  ＰＣＲ  Ｋｉｔ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）を参照されたい。加えて、例えば、Ｔ４遺伝子３２タンパク質（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ  Ｍａｎｎｈｅｉｍ）を使用して、長いＰＣＲ産物の収量を改善することができる。
【０２０９】
核酸を構築するための合成方法
本開示の単離された核酸を、公知の方法による直接化学合成により調製することもできる（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら、上掲を参照されたい）。化学合成は、一般に、一本鎖オリゴヌクレオチドを産生し、その一本鎖オリゴヌクレオチドを、相補配列とのハイブリダイゼーションにより、または鋳型として一本鎖を使用するＤＮＡポリメラーゼを用いる重合により、二本鎖ＤＮＡに変換することができる。ＤＮＡの化学合成を約１００塩基またはそれより多い塩基の配列に限定することができるが、より長い配列を、より短い配列のライゲーションにより得ることができることは、当業者には認識される。
【０２１０】
組換え発現カセット
本開示は、本開示の核酸を含む組換え発現カセットをさらに提供する。本開示の核酸配列、例えば、本開示のタンパク質足場をコードするｃＤＮＡまたはゲノム配列を使用して、少なくとも１つの所望の宿主細胞に導入することができる組換え発現カセットを構築することができる。組換え発現カセットは、所期の宿主細胞におけるポリヌクレオチドの転写を指示する転写開始調節配列に作動可能に連結された本開示のポリヌクレオチドを通常は含むことになる。異種プロモーターと非異種（すなわち、内在性）プロモーターの両方を、本開示の核酸の発現を指示するために用いることができる。
【０２１１】
一部の実施形態では、プロモーター、エンハンサーまたは他のエレメントとして役立つ単離された核酸を、非異種形態の本開示のポリヌクレオチドの適切な位置（イントロンの上流、下流またはイントロン内）に導入して、本開示のポリヌクレオチドの発現を上方制御または下方制御することができる。例えば、内在性プロモーターを、変異、欠失および／または置換によりｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏで変化させることができる。
【０２１２】
ベクターおよび宿主細胞
本開示は、本開示の単離された核酸分子を含むベクター、組換えベクターを用いて遺伝子操作される宿主細胞、および当技術分野において周知であるような組換え技術による少なくとも１つのタンパク質足場の産生にも関する。例えば、各々全体が参照により本明細書に援用される、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、上掲、Ａｕｓｕｂｅｌら、上掲を参照されたい。
【０２１３】
例えば、ＰＢ−ＥＦ１ａベクターを使用してもよい。このベクターのマップは、図４で提供される。このベクターは、次のヌクレオチド配列を含む：
【化４０】
2019528044.tif 000042
【化４１】
2019528044.tif 000043
【０２１４】
ポリヌクレオチドを、任意選択で、宿主内での増殖のための選択可能マーカーを含有するベクターに連結させることができる。一般に、プラスミドベクターは、リン酸カルシウム沈殿物などの沈殿物の中に、または荷電脂質との複合体の中に導入される。ベクターがウイルスである場合、適切なパッケージング細胞株をｉｎ  ｖｉｔｒｏで使用してそのウイルスをパッケージし、その後、宿主細胞に形質導入することができる。
【０２１５】
ＤＮＡインサートは、適切なプロモーターに動作可能に連結させるべきである。発現構築物は、転写開始、終結のための部位、および転写領域内に翻訳のためのリボソーム結合部位をさらに含有することになる。構築物により発現される成熟転写物のコード部分は、好ましくは、翻訳されることになるｍＲＮＡの始点に翻訳開始コドンおよび終点に適切に位置する終結コドン（例えば、ＵＡＡ、ＵＧＡまたはＵＡＧ）を含み、哺乳動物または真核細胞発現には、ＵＡＡおよびＵＡＧが好ましい。
【０２１６】
発現ベクターは、少なくとも１つの選択可能マーカーを含むことが好ましいが、任意選択である。そのようなマーカーは、例えば、これらに限定されないが、アンピシリン、ゼオシン（Ｓｈ  ｂｌａ遺伝子）、ピューロマイシン（ｐａｃ遺伝子）、ハイグロマイシンＢ（ｈｙｇＢ遺伝子）、Ｇ４１８／ジェネティシン（ｎｅｏ遺伝子）、ＤＨＦＲ（ジヒドロ葉酸レダクターゼをコードし、メトトレキサートに対する耐性を付与する）、ミコフェノール酸、またはグルタミンシンテターゼ（ＧＳ、米国特許第５，１２２，４６４号、同第５，７７０，３５９号、同第５，８２７，７３９号）、ブラストサイジン（ｂｓｄ遺伝子）、真核細胞培養のための耐性遺伝子、ならびにＥ．ｃｏｌｉおよび他の細菌もしくは原核生物における培養のためのアンピシリン、ゼオシン（Ｓｈ  ｂｌａ遺伝子）、ピューロマイシン（ｐａｃ遺伝子）、ハイグロマイシンＢ（ｈｙｇＢ遺伝子）、Ｇ４１８／ジェネティシン（ｎｅｏ遺伝子）、カナマイシン、スペクチノマイシン、ストレプトマイシン、カルベニシリン、ブレオマイシン、エリスロマイシン、ポリミキシンＢまたはテトラサイクリン耐性遺伝子を含む（上記特許は、全体が参照により本明細書に援用される）。上記宿主細胞についての適切な培養培地および条件は、当技術分野において公知である。好適なベクターは、当業者には容易にわかる。宿主細胞へのベクター構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、陽イオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染または他の公知の方法により果すことができる。そのような方法は、当技術分野において、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、上掲、１〜４および１６〜１８章；Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲、１、９、１３、１５、１６章に記載されている。
【０２１７】
発現ベクターは、本開示の組成物および方法により修飾された細胞の単離のための少なくとも１つの選択可能な細胞表面マーカーを含むことが好ましいが、任意選択である。本開示の選択可能な細胞表面マーカーは、細胞もしくは細胞のサブセットを細胞の規定された別のサブセットと区別する、表面タンパク質、糖タンパク質、またはタンパク質の群を含む。好ましくは、選択可能な細胞表面マーカーは、本開示の組成物または方法により修飾された細胞を、本開示の組成物または方法により修飾されていない細胞と区別する。そのような細胞表面マーカーは、例えば、これらに限定されないが、「表面抗原分類（ｃｌｕｓｔｅｒ  ｏｆ  ｄｅｓｉｇｎａｔｉｏｎ）」または「分類決定基（ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｄｅｔｅｒｍｉｎａｎｔ）」タンパク質（「ＣＤ」と略記されることが多い）、例えば、切断型または完全長形態のＣＤ１９、ＣＤ２７１、ＣＤ３４、ＣＤ２２、ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＤ５２、またはこれらの任意の組み合わせを含む。細胞表面マーカーは、自殺遺伝子マーカーＲＱＲ８（Ｐｈｉｌｉｐ  Ｂら、Ｂｌｏｏｄ．  ２０１４年８月２１日、１２４巻（８号）１２７７〜８７頁）をさらに含む。
【０２１８】
発現ベクターは、本開示の組成物および方法により修飾された細胞の単離のための少なくとも１つの選択可能な薬物耐性マーカーを含むことが好ましいが、任意選択である。本開示の選択可能な薬物耐性マーカーは、野生型または変異体Ｎｅｏ、ＤＨＦＲ、ＴＹＭＳ、ＦＲＡＮＣＦ、ＲＡＤ５１Ｃ、ＧＣＳ、ＭＤＲ１、ＡＬＤＨ１、ＮＫＸ２．２またはこれらの任意の組み合わせを含むことがある。
【０２１９】
本開示の少なくとも１つのタンパク質足場を、融合タンパク質などの修飾形態で発現させることができ、タンパク質足場は、分泌シグナルだけでなく、さらなる異種機能性領域をも含むことができる。例えば、さらなるアミノ酸の領域、特に、荷電アミノ酸の領域を、タンパク質足場のＮ末端に付加させて、精製中またはその後の取り扱いおよび保管中の宿主細胞における安定性および存続を改善することができる。また、ペプチド部分を本開示のタンパク質足場に付加させて、精製を助長することができる。そのような領域は、タンパク質足場またはその少なくとも１つの断片の最終調製前に除去することができる。そのような方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、上掲、１７．２９〜１７．４２および１８．１〜１８．７４章；Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲、１６、１７および１８章などの、多くの標準的な実験室マニュアルに記載されている。
【０２２０】
当業者は、本開示のタンパク質をコードする核酸の発現に利用可能な多数の発現系を熟知している。あるいは、本開示の核酸を、本開示のタンパク質足場をコードする内在性ＤＮＡを含有する宿主細胞において（操作により）オンにすることにより、宿主細胞において発現させることができる。そのような方法は、例えば、全体が参照により本明細書に援用される米国特許第５，５８０，７３４号、同第５，６４１，６７０号、同第５，７３３，７４６号および同第５，７３３，７６１号に記載されているように、当技術分野において周知である。
【０２２１】
タンパク質足場、それらの指定部分または改変体の産生に有用な実例となる細胞培養物は、当技術分野において公知であるような細菌、酵母および哺乳動物細胞である。哺乳動物細胞系は、細胞の単層の形態であることが多いが、哺乳動物細胞懸濁物またはバイオリアクターを使用することもできる。無傷のグリコシル化タンパク質を発現することができる多数の好適な宿主細胞株が、当技術分野において開発されており、それらは、ＣＯＳ−１（例えば、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １６５０）、ＣＯＳ−７（例えば、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−１６５１）、ＨＥＫ２９３、ＢＨＫ２１（例えば、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−１０）、ＣＨＯ（例えば、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ  １６１０）およびＢＳＣ−１（例えば、ＡＴＣＣ  ＣＲＬ−２６）細胞株、Ｃｏｓ−７細胞、ＣＨＯ細胞、ｈｅｐ  Ｇ２細胞、Ｐ３Ｘ６３Ａｇ８．６５３、ＳＰ２／０−Ａｇ１４、２９３細胞、ＨｅＬａ細胞などを含み、これらは、例えば、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ、Ｍａｎａｓｓａｓ、Ｖａ．（ｗｗｗ．ａｔｃｃ．ｏｒｇ）から容易に入手することができる。好ましい宿主細胞は、骨髄腫およびリンパ腫細胞などの、リンパ系起源の細胞を含む。特に好ましい宿主細胞は、Ｐ３Ｘ６３Ａｇ８．６５３細胞（ＡＴＣＣ受託番号ＣＲＬ−１５８０）およびＳＰ２／０−Ａｇ１４細胞（ＡＴＣＣ受託番号ＣＲＬ−１８５１）である。特に好ましい実施形態では、組換え細胞は、Ｐ３Ｘ６３Ａｂ８．６５３またはＳＰ２／０−Ａｇ１４細胞である。
【０２２２】
これらの細胞の発現ベクターは、これらに限定されないが、複製起点、プロモーター（例えば、後期または早期ＳＶ４０プロモーター、ＣＭＶプロモーター（米国特許第５，１６８，０６２号、同第５，３８５，８３９号）、ＨＳＶ  ｔｋプロモーター、ｐｇｋ（ホスホグリセリン酸キナーゼ）プロモーター、ＥＦ−１アルファプロモーター（米国特許第５，２６６，４９１号）、少なくとも１つのヒトプロモーター）、エンハンサー、および／またはプロセシング情報部位、例えば、リボソーム結合部位、ＲＮＡスプライス部位、ポリアデニル化部位（例えば、ＳＶ４０ラージＴ  ＡｇポリＡ付加部位）、ならびに転写終結配列などの、発現制御配列の１つまたは複数を含むことができる。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら、上掲；Ｓａｍｂｒｏｏｋら、上掲を参照されたい。本発明の核酸またはタンパク質の産生に有用な他の細胞は公知であり、および／またはＡｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ  Ｃａｔａｌｏｇｕｅ  ｏｆ  Ｃｅｌｌ  Ｌｉｎｅｓ  ａｎｄ  Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ（ｗｗｗ．ａｔｃｃ．ｏｒｇ）、もしくは他の公知の供給源もしくは商業的供給源から入手することができる。
【０２２３】
真核宿主細胞が用いられる場合、ポリアデニル化または転写終結配列が通常はベクターに組み込まれる。終結配列の例は、ウシ成長ホルモン遺伝子からのポリアデニル化配列である。転写物の正確なスプライシングのための配列も含めることができる。スプライシング配列の例は、ＳＶ４０からのＶＰ１イントロンである（Ｓｐｒａｇｕｅら、Ｊ．  Ｖｉｒｏｌ．  ４５巻：７７３〜７８１号（１９８３年））。加えて、宿主細胞における複製を制御するための遺伝子配列を、当技術分野において公知であるように、ベクターに組み込むことができる。
【０２２４】
タンパク質足場の精製
タンパク質足場は、これらに限定されないが、プロテインＡ精製、硫酸アンモニウムまたはエタノール沈殿、酸抽出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含む、周知の方法により、組換え細胞培養物から回収することおよび精製することができる。高速液体クロマトグラフィー（「ＨＰＬＣ」）も精製に用いることができる。例えば、各々全体が参照により本明細書に援用される、Ｃｏｌｌｉｇａｎ、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、またはＣｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ、ＮＹ、Ｎ．Ｙ．、（１９９７〜２００１年）、例えば、１、４、６、８、９、１０章を参照されたい。
【０２２５】
本開示のタンパク質足場は、自然精製産物、化学合成手順の産物、および原核生物または真核生物宿主（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、高等植物、昆虫および哺乳動物細胞を含む）から組換え技術により産生された産物を含む。組換え産生手順に用いられる宿主に依存して、本開示のタンパク質足場は、グリコシル化されていてもよく、またはグリコシル化されていなくてもよい。そのような方法は、すべて全体が参照により本明細書に援用される、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、上掲、１７．３７〜１７．４２節；Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲、１０、１２、１３、１６、１８および２０章；Ｃｏｌｌｉｇａｎ、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、上掲、１２〜１４章などの、多くの標準的な実験室マニュアルに記載されている。
【０２２６】
アミノ酸コード
本開示のタンパク質足場を構成するアミノ酸は、略記されることが多い。アミノ酸名は、当技術分野において十分承知されているように、その１文字コード、その３文字コード、名称、または３つのヌクレオチドコドンによりアミノ酸を指定することにより示すことができる（Ａｌｂｅｒｔｓ，  Ｂ．ら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ｔｈｅ  Ｃｅｌｌ、第３版、Ｇａｒｌａｎｄ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，  Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、１９９４年を参照されたい）。本開示のタンパク質足場は、本明細書に明記されるような、自然変異またはヒトによる操作のどちらかからの１つまたは複数のアミノ酸置換、欠失または付加を含むことができる。機能に不可欠である、本開示のタンパク質足場中のアミノ酸は、当技術分野において公知の方法、例えば、部位特異的変異誘発またはアラニンスキャニング変異誘発により、同定することができる（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ、上掲、８章、１５頁；ＣｕｎｎｉｎｇｈａｍおよびＷｅｌｌｓ、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４４巻：１０８１〜１０８５頁（１９８９年））。後述の手順は、分子の残基ごとに単一のアラニン変異を導入する。次いで、結果として得られた変異体分子は、これらに限定されないが少なくとも１つの中和活性などの、生物活性について試験される。タンパク質足場結合にとって重要な部位も、結晶化、核磁気共鳴または光アフィニティー標識（ｐｈｏｔｏａｆｆｉｎｉｔｙ  ｌａｂｅｌｉｎｇ）などの、構造解析により同定することができる（Ｓｍｉｔｈら、Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  ２２４巻：８９９〜９０４頁（１９９２年）およびｄｅ  Ｖｏｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５５巻：３０６〜３１２頁（１９９２年））。
【０２２７】
当業者には理解されるが、本発明は、本開示の少なくとも１つの生物活性タンパク質足場を含む。生物活性タンパク質足場は、天然（非合成）の、内在性のまたは関連するおよび公知のタンパク質足場の比活性の少なくとも２０％、３０％または４０％、および好ましくは少なくとも５０％、６０％または７０％、および最も好ましくは少なくとも８０％、９０％もしくは９５〜９９％のまたはそれより高い、比活性を有する。酵素活性および基質特異性の尺度をアッセイおよび定量する方法は、当業者に周知である。
【０２２８】
別の態様では、本開示は、有機部分の共有結合により修飾される、本明細書に記載のタンパク質足場および断片に関する。そのような修飾は、薬物動態特性が改善された（例えば、ｉｎ  ｖｉｖｏ血清半減期が増加した）タンパク質足場断片を生じさせることができる。有機部分は、直鎖状のもしくは分枝した親水性ポリマー基、脂肪酸基または脂肪酸エステル基でありうる。特定の実施形態では、親水性ポリマー基は、約８００〜約１２０，０００ダルトンの分子量を有することができ、ポリアルカングリコール（例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリプロピレングリコール（ＰＰＧ））、炭水化物ポリマー、アミノ酸ポリマーまたはポリビニルピロリドン、および脂肪酸または脂肪酸エステル基（約８〜約４０個の炭素原子を含むことができる）でありうる。
【０２２９】
本開示の修飾タンパク質足場および断片は、抗体に直接または間接的に共有結合している１つまたは複数の有機部分を含むことができる。本開示のタンパク質足場または断片に結合している各有機部分は、独立して、親水性ポリマー基、脂肪酸基、または脂肪酸エステル基であることができる。本明細書で使用される用語「脂肪酸」は、モノカルボン酸およびジカルボン酸を包含する。「親水性ポリマー基」は、この用語が本明細書で使用される場合、オクタンよりも水においてより可溶性である有機ポリマーを指す。例えば、ポリリシンは、オクタンへの溶解度より水への溶解度のほうが高い。したがって、ポリリシンの共有結合により修飾されたタンパク質足場は、本開示により包含される。本開示のタンパク質足場を修飾するのに好適な親水性ポリマーは、直鎖状であってもよく、または分岐していてもよく、例えば、ポリアルカングリコール（例えば、ＰＥＧ、モノメトキシ−ポリエチレングリコール（ｍＰＥＧ）、ＰＰＧなど）、炭水化物（例えば、デキストラン、セルロース、オリゴ糖類、多糖類など）、親水性アミノ酸のポリマー（例えば、ポリリシン、ポリアルギニン、ポリアスパラギン酸エステル（ｐｏｌｙａｓｐａｒｔａｔｅ）など）、ポリアルカンオキシド（例えば、ポリエチレンオキシド、ポリプロピレンオキシドなど）、およびポリビニルピロリドンを含みうる。好ましくは、本開示のタンパク質足場を修飾する親水性ポリマーは、別々の分子実体として、約８００〜約１５０，０００ダルトンの分子量を有する。例えば、ＰＥＧ５０００およびＰＥＧ２０，０００（ここでの下付文字は、ダルトンでのポリマーの平均分子量である）を使用することができる。親水性ポリマー基は、１〜約６個のアルキル、脂肪酸または脂肪酸エステル基で置換されていてもよい。脂肪酸または脂肪酸エステル基で置換されている親水性ポリマーは、好適な方法を用いることにより調製することができる。例えば、アミン基を含むポリマーを、脂肪酸または脂肪酸エステルのカルボキシレートとカップリングさせ、脂肪酸または脂肪酸エステル上の活性化されたカルボキシレート（例えば、Ｎ，Ｎ−カルボニルジイミダゾールで活性化されたもの）をポリマー上のヒドロキシル基とカップリングさせることができる。
【０２３０】
本開示のタンパク質足場を修飾するのに好適な脂肪酸および脂肪酸エステルは、飽和されていてもよく、または１つもしくは複数の不飽和ユニットを含有してもよい。本開示のタンパク質足場を修飾するのに好適である脂肪酸は、例えば、ｎ−ドデカノエート（Ｃ１２、ラウレート）、ｎ−テトラデカノエート（Ｃ１４、ミリステート）、ｎ−オクタデカノエート（Ｃ１８、ステアレート）、ｎ−エイコサノエート（Ｃ２０、アラキデート）、ｎ−ドコサノエート（Ｃ２２、ベヘネート）、ｎ−トリアコンタノエート（Ｃ３０）、ｎ−テトラコンタノエート（Ｃ４０）、シス−Δ９−オクタデカノエート（Ｃ１８、オレアート）、全シス−Δ５，８，１１，１４−エイコサテトラエノエート（Ｃ２０、アラキドネート）、オクタン二酸、テトラデカン二酸、オクタデカン二酸、ドコサン二酸などを含む。好適な脂肪酸エステルは、直鎖状のまたは分岐した低級アルキル基を含む、ジカルボン酸のモノエステルを含む。低級アルキル基は、１〜約１２個、好ましくは１〜約６個の炭素原子を含むことができる。
【０２３１】
修飾されたタンパク質足場および断片は、好適な方法を使用して、例えば、１つまたは複数の修飾剤との反応により、調製することができる。「修飾剤」は、この用語が本明細書で使用される場合、活性化基を含む好適な有機基（例えば、親水性ポリマー、脂肪酸、脂肪酸エステル）を指す。「活性化基」は、適切な条件下で第２の化学基と反応することによって、修飾剤と第２の化学基の間に共有結合を形成することができる、化学的部分または官能基である。例えば、アミン反応性活性化基は、求電子基、例えば、トシレート、メシレート、ハロ（クロロ、ブロモ、フルオロ、ヨード）、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミジルエステル（ＮＨＳ）などを含む。チオールと反応することができる活性化基は、例えば、マレイミド、ヨードアセチル、アクリロリル、ピリジルジスルフィド、５−チオール−２−ニトロ安息香酸チオール（ＴＮＢ−チオール）などを含む。アルデヒド官能基をアミン含有分子またはヒドラジド含有分子とカップリングさせることができ、アジド基は、三価亜リン酸基と反応してホスホルアミデートまたはホスホルイミド結合を形成することができる。活性化基を分子に導入するための好適な方法は、当技術分野において公知である（例えば、Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ，  Ｇ．  Ｔ．、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ．（１９９６年）を参照されたい）。活性化基は、有機基（例えば、親水性ポリマー、脂肪酸、脂肪酸エステル）に、直接結合させることができ、またはリンカー部分、例えば、１個または複数の炭素原子が、酸素、窒素または硫黄などのヘテロ原子により置換されていてもよい、二価Ｃ１〜Ｃ１２基を介して結合させることができる。好適なリンカー部分は、例えば、テトラエチレングリコール、−（ＣＨ２）３−、−ＮＨ−（ＣＨ２）６−ＮＨ−、−（ＣＨ２）２−ＮＨ−、および−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ−ＮＨ−を含む。リンカー部分を含む修飾剤は、例えば、モノ−Ｂｏｃ−アルキルジアミン（例えば、モノ−Ｂｏｃ−エチレンジアミン、モノ−Ｂｏｃ−ジアミノヘキサン）を１−エチル−３−（３−ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド（ＥＤＣ）の存在下で脂肪酸と反応させて、遊離アミンと脂肪酸カルボキシレート間にアミド結合を形成することにより、産生することができる。Ｂｏｃ保護基を産物からトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）での処理により除去して、第一級アミンを露出させることができ、この第一級アミンを、記載したような別のカルボキシレートとカップリングさせることができ、または無水マレイン酸と反応させ、結果として得られる産物を環化して、脂肪酸の活性化マレイミド誘導体を産生することができる。（例えば、Ｔｈｏｍｐｓｏｎら、ＷＯ９２／１６２２１を参照されたく、この特許文献の全教示は参照により本明細書に援用される）。
【０２３２】
本開示の修飾されたタンパク質足場は、タンパク質足場または断片を修飾剤と反応させることにより産生させることができる。例えば、アミン反応性修飾剤、例えば、ＰＥＧのＮＨＳエステルを用いることにより、部位特異的でない方法で、有機部分をタンパク質足場に結合させることができる。本開示のタンパク質足場の特異的部位に結合している有機部分を含む、修飾されたタンパク質足場および断片は、逆タンパク質分解（ｒｅｖｅｒｓｅ  ｐｒｏｔｅｏｌｙｓｉｓ）（Ｆｉｓｃｈら、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、３巻：１４７〜１５３頁（１９９２年）；Ｗｅｒｌｅｎら、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．、５巻：４１１〜４１７頁（１９９４年）；Ｋｕｍａｒａｎら、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．６巻（１０号）：２２３３〜２２４１頁（１９９７年）；Ｉｔｏｈら、Ｂｉｏｏｒｇ．  Ｃｈｅｍ．、２４巻（１号）：５９〜６８頁（１９９６年）；Ｃａｐｅｌｌａｓら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．  Ｂｉｏｅｎｇ．、５６巻（４号）：４５６〜４６３頁（１９９７年））、およびＨｅｒｍａｎｓｏｎ，  Ｇ．  Ｔ．、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ：Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ．（１９９６年）に記載されている方法などの、好適な方法を使用して調製することができる。
【０２３３】
さらなる治療活性成分を含むタンパク質足場組成物
本発明のタンパク質足場化合物、組成物または組み合わせは、任意の好適な助剤（ａｕｘｉｌｉａｒｙ）、例えば、これらに限定されないが、希釈剤、結合剤、安定剤、緩衝剤、塩、親油性溶媒、保存薬、アジュバントなどのうちの少なくとも１つをさらに含んでもよい。薬学的に許容される助剤が好ましい。そのような滅菌溶液の非限定的な例およびそれらを調製する方法は、当技術分野において周知であり、例えば、Ｇｅｎｎａｒｏ編、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第１８版、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．（Ｅａｓｔｏｎ、Ｐａ．）１９９０年があるが、これに限定される。当技術分野において周知である、または本明細書に記載される、タンパク質足場、断片または改変体組成物の投与方式、溶解度および／または安定性にとって好適である、薬学的に許容される担体は、慣用的に選択することができる。
【０２３４】
本組成物に有用な薬学的賦形剤および添加剤は、これらに限定されないが、単独でまたは組み合わせで１〜９９．９９重量または容量％を含む、単独でまたは組み合わせで存在しうる、タンパク質、ペプチド、アミノ酸、脂質および炭水化物（例えば、単糖、二糖、三糖、四糖およびオリゴ糖；誘導体化された糖、例えば、アルジトール、アルドン酸、エステル化された糖など、ならびに多糖類または糖ポリマーを含む、糖）を含む。例示的なタンパク質賦形剤は、血清アルブミン、例えば、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、組換えヒトアルブミン（ｒＨＡ）、ゼラチン、カゼインなどを含む。緩衝能力の点でも機能することができる代表的なアミノ酸／タンパク質成分は、アラニン、グリシン、アルギニン、ベタイン、ヒスチジン、グルタミン酸、アスパラギン酸、システイン、リシン、ロイシン、イソロイシン、バリン、メチオニン、フェニルアラニン、アスパルテームなどを含む。１つの好ましいアミノ酸は、グリシンである。
【０２３５】
本発明での使用に好適な炭水化物賦形剤は、例えば、単糖類、例えば、フルクトース、マルトース、ガラクトース、グルコース、Ｄ−マンノース、ソルボースなど；二糖類、例えば、ラクトース、スクロース、トレハロース、セロビオースなど；多糖類、例えば、ラフィノース、メレジトース（ｍｅｌｅｚｉｔｏｓｅ）、マルトデキストリン、デキストラン、デンプンなど；ならびにアルジトール、例えば、マンニトール、キシリトール、マルチトール、ラクチトール、キシリトールソルビトール（グルシトール）、ミオイノシトールなどを含む。本発明での使用に好ましい炭水化物賦形剤は、マンニトール、トレハロースおよびラフィノースである。
【０２３６】
タンパク質足場組成物は、緩衝剤またはｐＨ調節剤も含むことができ、通常は、緩衝剤は、有機酸または塩基から調製される塩である。代表的な緩衝剤は、有機酸塩、例えば、クエン酸、アスコルビン酸、グルコン酸、炭酸、酒石酸、コハク酸、酢酸もしくはフタル酸の塩、Ｔｒｉｓ、トロメタミン塩酸塩、またはリン酸緩衝液を含む。本組成物での使用に好ましい緩衝剤は、有機酸塩、例えば、クエン酸塩である。
【０２３７】
加えて、本発明のタンパク質足場組成物は、ポリマー賦形剤／添加剤、例えば、ポリビニルピロリドン、フィコール（ポリマー糖）、デキストレート（ｄｅｘｔｒａｔｅ）（例えば、シクロデキストリン、例えば、２−ヒドロキシプロピル−β−シクロデキストリン）、ポリエチレングリコール、矯味矯臭剤、抗菌剤、甘味料、抗酸化剤、静電防止剤、界面活性剤（例えば、ポリソルベート、例えば「ＴＷＥＥＮ  ２０」および「ＴＷＥＥＮ  ８０」）、脂質（例えば、リン脂質、脂肪酸）、ステロイド（例えば、コレステロール）、およびキレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）を含むことができる。
【０２３８】
本発明によるタンパク質足場、部分または改変体組成物での使用に好適なこれらのおよびさらなる公知の薬学的賦形剤および／または添加剤は、例えば、「Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：  Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ＆  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ」、第１９版、Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｌｉａｍｓ、（１９９５年）に、および「Ｐｈｙｓｉｃｉａｎ’ｓ  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ」、第５２版、Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｅｃｏｎｏｍｉｃｓ、Ｍｏｎｔｖａｌｅ、Ｎ．Ｊ．（１９９８年）に収載されているように、当技術分野において公知であり、前記参考文献の開示は、すべてが参照により本明細書に援用される。好ましい担体または賦形剤材料は、炭水化物（例えば、糖類およびアルジトール）および緩衝剤（例えば、クエン酸塩）またはポリマー作用物質である。例示的な担体分子は、関節内送達に有用でありうる、ムコ多糖類、ヒアルロン酸である。
【０２３９】
製剤
上述のように、本発明は、薬学的に許容される製剤中に少なくとも１つのタンパク質足場を含む、リン酸緩衝液と食塩水または選択された塩を好ましくは含む安定した製剤、ならびに保存薬を含有する保存溶液および製剤、ならびに薬学的または獣医学的使用に好適な複数回使用用保存製剤を提供する。保存製剤は、少なくとも１つの公知保存薬、または任意選択で、水性希釈剤中の少なくとも１つのフェノール、ｍ−クレゾール、ｐ−クレゾール、ｏ−クレゾール、クロロクレゾール、ベンジルアルコール、亜硝酸フェニル水銀、フェノキシエタノール、ホルムアルデヒド、クロロブタノール、塩化マグネシウム（例えば、六水和物）、アルキルパラベン（メチル、エチル、プロピル、ブチルなど）、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、デヒドロ酢酸ナトリウムおよびチメロサール、ポリマーまたはこれらの混合物からなる群より選択されるものを含有する。約０．００１５％、または任意の範囲、値もしくはその中の部分などの、当技術分野において公知であるような任意の好適な濃度または混合物を使用することができる。非限定的な例は、保存薬なし、約０．１〜２％ｍ−クレゾール（例えば、０．２、０．３、０．４、０．５、０．９、１．０％）、約０．１〜３％ベンジルアルコール（例えば、０．５、０．９、１．１、１．５、１．９、２．０、２．５％）、約０．００１〜０．５％チメロサール（例えば、０．００５、０．０１）、約０．００１〜２．０％フェノール（例えば、０．０５、０．２５、０．２８、０．５、０．９、１．０％）、０．０００５〜１．０％アルキルパラベン（例えば、０．０００７５、０．０００９、０．００１、０．００２、０．００５、０．００７５、０．００９、０．０１、０．０２、０．０５、０．０７５、０．０９、０．１、０．２、０．３、０．５、０．７５、０．９、１．０％）などを含む。
【０２４０】
上述のように、本発明は、包装材料と、任意選択で水性希釈剤中の、処方された緩衝剤および／または保存薬を有する少なくとも１つのタンパク質足場の溶液を含む少なくとも１つのバイアルとを含む製造品であって、前記包装材料が、そのような溶液を１、２、３、４、５、６、９、１２、１８、２０、２４、３０、３６、４０、４８、５４、６０、６６、７２時間またはそれより長時間の期間にわたって保持することができることを示すラベルを含む、製造品を提供する。本発明は、包装材料と、凍結乾燥された少なくとも１つのタンパク質足場を含む第１のバイアルと、処方された緩衝剤または保存薬の水性希釈剤を含む第２のバイアルとを含む製造品であって、前記包装材料が、水性希釈剤中の少なくとも１つのタンパク質足場を再構成して、２４時間またはそれより長時間の期間にわたって保持することができる溶液を形成するように患者に指示するラベルを含む、製造品をさらに含む。
【０２４１】
本発明に従って使用される少なくとも１つのタンパク質足場は、哺乳動物細胞またはトランスジェニック調製物からのものを含む、組換え手段により産生させることができ、または本明細書に記載されるような、もしくは当技術分野において公知であるような他の生物学的供給源から精製することができる。
【０２４２】
本発明の製品中の少なくとも１つのタンパク質足場の範囲は、再構成時に得られる量、湿潤／乾燥系での場合、約１．０μｇ／ｍｌ〜約１０００ｍｇ／ｍｌの濃度を含むがより低濃度およびより高濃度が使用可能であり、所期の送達ビヒクルに依存し、例えば、溶液製剤は、経皮パッチ、経肺、経粘膜、または浸透圧もしくはマイクロポンプ法とは異なる。
【０２４３】
好ましくは、水性希釈剤は、任意選択で、薬学的に許容される保存薬をさらに含む。好ましい保存薬は、フェノール、ｍ−クレゾール、ｐ−クレゾール、ｏ−クレゾール、クロロクレゾール、ベンジルアルコール、アルキルパラベン（メチル、エチル、プロピル、ブチルなど）、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、デヒドロ酢酸ナトリウムおよびチメロサール、またはこれらの混合物からなる群より選択されるものを含む。製剤に使用される保存薬の濃度は、抗菌効果を生じさせるのに十分な濃度である。そのような濃度は、選択される保存薬に依存し、当業者によって容易に決定される。
【０２４４】
他の賦形剤、例えば、等張剤（ｉｓｏｔｏｎｉｃｉｔｙ  ａｇｅｎｔ）、緩衝剤、抗酸化剤、および保存向上剤（ｐｒｅｓｅｒｖａｔｉｖｅ  ｅｎｈａｎｃｅｒ）を希釈剤に、任意選択で、および好ましくは、添加することができる。グリセリンなどの等張剤は、公知の濃度で一般に使用される。生理学的に忍容される緩衝剤が、改善されたｐＨ制御を提供するために添加されるのが好ましい。製剤は、約ｐＨ４〜約ｐＨ１０、および約ｐＨ５〜約ｐＨ９の好ましい範囲、および約６．０〜約８．０の最も好ましい範囲などの、広範なｐＨに及びうる。好ましくは、本発明の製剤は、約６．８〜約７．８の間のｐＨを有する。好ましい緩衝剤は、リン酸緩衝液、最も好ましくは、リン酸ナトリウム、特に、リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）を含む。
【０２４５】
他の添加剤、例えば、Ｔｗｅｅｎ  ２０（モノラウリン酸ポリオキシエチレン（２０）ソルビタン）、Ｔｗｅｅｎ  ４０（モノパルミチン酸ポリオキシエチレン（２０）ソルビタン）、Ｔｗｅｅｎ  ８０（モノオレイン酸ポリオキシエチレン（２０）ソルビタン）、Ｐｌｕｒｏｎｉｃ  Ｆ６８（ポリオキシエチレン・ポリプロピレンブロックコポリマー）およびＰＥＧ（ポリエチレングリコール）のような、薬学的に許容される可溶化剤；またはポリソルベート２０もしくは８０またはポロクサマー１８４もしくは１８８、Ｐｌｕｒｏｎｉｃ（登録商標）ポリオール（ｐｏｌｙｌ）、他のブロックコポリマーなどの、非イオン性界面活性剤；ならびにＥＤＴＡおよびＥＧＴＡなどのキレート剤を、任意選択で、凝集を低減させるために製剤または組成物に添加することができる。これらの添加剤は、製剤を投与するためにポンプまたはプラスチック容器が使用される場合、特に有用である。薬学的に許容される界面活性剤の存在は、タンパク質が凝集する傾向を弱める。
【０２４６】
本発明の製剤は、水性希釈剤中において、少なくとも１つのタンパク質足場と、フェノール、ｍ−クレゾール、ｐ−クレゾール、ｏ−クレゾール、クロロクレゾール、ベンジルアルコール、アルキルパラベン（メチル、エチル、プロピル、ブチルなど）、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、デヒドロ酢酸ナトリウムおよびチメロサールまたはこれらの混合物からなる群より選択される保存薬とを混合するステップを含む方法により調製することができる。水性希釈剤中において、少なくとも１つのタンパク質足場と、保存薬とを混合するステップは、従来の溶解および混合手順を使用して行われる。好適な製剤を調製するために、例えば、緩衝溶液中の測定された量の少なくとも１つのタンパク質足場を、緩衝溶液中の所望の保存薬と、所望の濃度のタンパク質および保存薬を提供するのに十分な量で併せる。この方法のバリエーションは、当業者には認識される。例えば、成分が添加される順序、さらなる添加剤が使用されるかどうか、製剤が調製される温度およびｐＨは、すべて、使用される濃度および投与手段に合わせて最適化することができる因子である。
【０２４７】
特許請求される製剤を、患者に、透明溶液として提供することができ、あるいは再構成される凍結乾燥された少なくとも１つのタンパク質足場のバイアルと、水、水性希釈剤中の保存薬および／または賦形剤、好ましくは、リン酸緩衝液および／もしくは食塩水および選択された塩を収容している第２のバイアルを含む、デュアルバイアルとして、提供することができる。単一の溶液バイアルかまたは再構成を必要とするデュアルバイアルを、複数回再使用することができ、そのようなバイアルは、患者の単一または複数の処置サイクルに十分なものでありうるため、現在利用可能な処置レジメンより便利な処置レジメンを提供することができる。
【０２４８】
特許請求される本製造品は、即時から２４時間またはそれより長時間に及ぶ期間にわたる投与に有用である。したがって、今般特許請求される製造品は、患者に有意な利点をもたらす。本発明の製剤は、任意選択で、約２℃〜約４０℃の温度で安全に保管することができ、かつタンパク質の生物活性を長期間保持することができるため、溶液を６、１２、１８、２４、３６、４８、７２もしくは９６時間またはそれより長時間の期間にわたって保持および／または使用することができることを示すパッケージラベルが許容される。保存希釈剤が使用される場合、そのようなラベルは、１〜１２カ月、半年、１年半および／または２年までの使用を含むことができる。
【０２４９】
本発明の少なくとも１つのタンパク質足場の溶液は、水性希釈剤の中の少なくとも１つのタンパク質足場を混合するステップを含む方法により調製することができる。混合するステップは、従来の溶解および混合手順を使用して行われる。好適な希釈剤を調製するために、例えば、水または緩衝液中の測定された量の少なくとも１つのタンパク質足場を、所望の濃度のタンパク質および任意選択で保存薬または緩衝剤を提供するのに十分な量で併せる。この方法のバリエーションは、当業者には認識される。例えば、成分が添加される順序、さらなる添加剤が使用されるかどうか、製剤が調製される温度およびｐＨは、すべて、使用される濃度および投与手段に合わせて最適化することができる因子である。
【０２５０】
特許請求される製品を、患者に、透明溶液として提供することができ、または再構成される凍結乾燥された少なくとも１つのタンパク質足場のバイアルと、水性希釈剤を収容している第２のバイアルを含む、デュアルバイアルとして、提供することができる。単一の溶液バイアルかまたは再構成を必要とするデュアルバイアルを、複数回再使用することができ、そのようなバイアルは、患者の単一または複数の処置サイクルに十分なものでありうるため、現在利用可能な処置レジメンより便利な処置レジメンを提供する。
【０２５１】
薬局、診療所または他のそのような機関および施設に、透明溶液を提供することにより、または再構成される凍結乾燥された少なくとも１つのタンパク質足場のバイアルと、水性希釈剤を収容している第２のバイアルを含む、デュアルバイアルを提供することにより、特許請求される製品を患者に間接的に提供することができる。この場合の透明溶液は、最大１リットルまたはさらにはそれより大きいサイズであってもよく、したがって、大型のリザーバを提供することができ、このリザーバから、少なくとも１つのタンパク質足場溶液のより少ない分量を、より小さいバイアルに移すために１回または複数回取り出すことができ、薬局または診療所によって顧客および／または患者に提供することができる。
【０２５２】
単一バイアルシステムを含む認知されているデバイスは、溶液を送達するためのペン型注射器デバイス、例えば、例えばＢｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ（Ｆｒａｎｋｌｉｎ  Ｌａｋｅｓ、Ｎ．Ｊ．、ｗｗｗ．ｂｅｃｔｏｎｄｉｃｋｅｎｓｏｎ．ｃｏｍ）、Ｄｉｓｅｔｒｏｎｉｃ（Ｂｕｒｇｄｏｒｆ、Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ、ｗｗｗ．ｄｉｓｅｔｒｏｎｉｃ．ｃｏｍ）、Ｂｉｏｊｅｃｔ、Ｐｏｒｔｌａｎｄ、Ｏｒｅｇ．（ｗｗｗ．ｂｉｏｊｅｃｔ．ｃｏｍ）、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｐｒｏｄｕｃｔｓ、Ｗｅｓｔｏｎ  Ｍｅｄｉｃａｌ（Ｐｅｔｅｒｂｏｒｏｕｇｈ、ＵＫ、ｗｗｗ．ｗｅｓｔｏｎ−ｍｅｄｉｃａｌ．ｃｏｍ）、Ｍｅｄｉ−Ｊｅｃｔ  Ｃｏｒｐ（Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ、Ｍｉｎｎ．、ｗｗｗ．ｍｅｄｉｊｅｃｔ．ｃｏｍ）により作製または開発されたような、ＢＤ  Ｐｅｎ、ＢＤ  Ａｕｔｏｊｅｃｔｏｒ（登録商標）、Ｈｕｍａｊｅｃｔ（登録商標）、ＮｏｖｏＰｅｎ（登録商標）、Ｂ−Ｄ（登録商標）Ｐｅｎ、ＡｕｔｏＰｅｎ（登録商標）、およびＯｐｔｉＰｅｎ（登録商標）、ＧｅｎｏｔｒｏｐｉｎＰｅｎ（登録商標）、Ｇｅｎｏｔｒｏｎｏｒｍ  Ｐｅｎ（登録商標）、Ｈｕｍａｔｒｏ  Ｐｅｎ（登録商標）、Ｒｅｃｏ−Ｐｅｎ（登録商標）、Ｒｏｆｅｒｏｎ  Ｐｅｎ（登録商標）、Ｂｉｏｊｅｃｔｏｒ（登録商標）、Ｉｊｅｃｔ（登録商標）、Ｊ−ｔｉｐ  Ｎｅｅｄｌｅ−Ｆｒｅｅ  Ｉｎｊｅｃｔｏｒ（登録商標）、Ｉｎｔｒａｊｅｃｔ（登録商標）、Ｍｅｄｉ−Ｊｅｃｔ（登録商標）、および同様に好適なデバイスを含む。デュアルバイアルシステムを含む認知されているデバイスは、再構成された溶液の送達のためのカートリッジ内で凍結乾燥薬物を再構成するペン型注射器システム、例えば、ＨｕｍａｔｒｏＰｅｎ（登録商標）を含む。好適な他のデバイスの例は、充填済みシリンジ、自動注射器、無針注射器、および無針ＩＶ注入セットを含む。
【０２５３】
今般特許請求される製品は、包装材料を含む。包装材料は、監督機関により求められる情報に加えて、製品を使用することができる条件を提供する。本発明の包装材料は、少なくとも１つのタンパク質足場を水性希釈剤で再構成して溶液を形成するための指示、およびその溶液を２バイアル、湿潤／乾燥、製品については２〜２４時間またはそれより長時間の期間にわたって使用するための指示を患者に提供する。単一バイアルの溶液製品については、ラベルは、そのような溶液を２〜２４時間またはそれより長時間の期間にわたって使用することができることを示す。今般特許請求される製品は、ヒトでの薬学的製品の使用に有用である。
【０２５４】
本発明の製剤は、少なくとも１つのタンパク質足場と選択された緩衝剤、好ましくは、食塩水または選択された塩を含有するリン酸緩衝液とを混合するステップを含む方法により、調製することができる。水性希釈剤中において少なくとも１つのタンパク質足場と緩衝剤とを混合するステップは、従来の溶解および混合手順を使用して行われる。好適な製剤を調製するために、例えば、水または緩衝液中の測定された量の少なくとも１つのタンパク質足場を、水中の所望の緩衝化剤と、所望の濃度のタンパク質および緩衝剤を提供するのに十分な量で併せる。この方法のバリエーションは、当業者には認識される。例えば、成分が添加される順序、さらなる添加剤が使用されるかどうか、製剤が調製される温度およびｐＨは、すべて、使用される濃度および投与手段に合わせて最適化することができる因子である。
【０２５５】
特許請求される安定または保存製剤を、患者に、透明溶液として提供することができ、または再構成される凍結乾燥されたタンパク質足場のバイアルと、水性希釈剤中の保存薬もしくは緩衝剤および賦形剤を収容している第２のバイアルを含む、デュアルバイアルとして、提供することができる。単一溶液バイアルかまたは再構成を必要とするデュアルバイアルを、複数回再使用することができ、そのようなバイアルは、患者の単一または複数の処置サイクルに十分なものでありうるため、現在利用可能な処置レジメンより便利な処置レジメンを提供する。
【０２５６】
タンパク質足場を安定化する他の製剤または方法は、タンパク質足場を含む凍結乾燥粉末の透明溶液以外のものをもたらすことがある。非透明溶液には、微粒子懸濁物を含む製剤もあり、前記微粒子は、可変寸法の構造であって、マイクロスフェア、マイクロ粒子、ナノ粒子、ナノスフェアまたはリポソームとして様々に公知である構造のタンパク質足場を含有する組成物である。活性薬剤を含有する、そのような比較的均一な、本質的に球形の、微粒子製剤は、米国特許第４，５８９，３３０号で教示されているように、活性薬剤およびポリマーを含有する水性相と非水性相を接触させ、その後、非水性相を蒸発させて、水性相からの粒子を合体させることによって形成することができる。多孔質マイクロ粒子は、米国特許第４，８１８，５４２号で教示されているように、連続溶媒に分散された活性薬剤およびポリマーを含有する第１の相を使用し、フリーズドライまたは希釈−抽出−沈殿により懸濁物から前記溶媒を除去して、調製することができる。そのような調製に好ましいポリマーは、ゼラチン  寒天、デンプン、アラビノガラクタン、アルブミン、コラーゲン、ポリグリコール酸、ポリ乳酸（ｐｏｌｙｌａｃｔｉｃ  ａｃｅｄ）、グリコリド−Ｌ（−）ラクチドポリ（イプシロン（ｅｐｉｓｉｌｏｎ）−カプロラクトン）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−乳酸）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−グリコール酸）、ポリ（β−ヒドロキシ酪酸）、ポリエチレンオキシド、ポリエチレン、ポリ（アルキル−２−シアノアクリレート）、ポリ（ヒドロキシエチルメタクリレート）、ポリアミド、ポリ（アミノ酸）、ポリ（２−ヒドロキシエチルＤＬ−アスパルタミド）、ポリ（エステル尿素）、ポリ（Ｌ−フェニルアラニン／エチレングリコール／１，６−ジイソシアナトヘキサン）およびポリ（メチルメタクリレート）からなる群より選択される、天然または合成コポリマーまたはポリマーである。特に好ましいポリマーは、ポリエステル、例えば、ポリグリコール酸、ポリ乳酸、グリコリド−Ｌ（−）ラクチドポリ（イプシロン−カプロラクトン）、ポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−乳酸）、およびポリ（イプシロン−カプロラクトン−ＣＯ−グリコール酸）である。ポリマーおよび／または活性薬剤を溶解するのに有用な溶媒は、水、ヘキサフルオロイソプロパノール、塩化メチレン、テトラヒドロフラン、ヘキサン、ベンゼン、またはヘキサフルオロアセトン・セスキ水和物を含む。活性薬剤含有相を第２の相とともに分散させる方法は、前記第１の相に圧力をかけて強制的にノズルの開口部を通して、液滴の形成を果すことを含みうる。
【０２５７】
乾燥粉末製剤は、凍結乾燥以外の方法、例えば、噴霧乾燥、または蒸発による溶媒抽出による方法、または結晶質組成物の沈殿、それに続いての水性もしくは非水性溶媒を除去する１もしくは複数のステップによる方法の結果として得ることができる。噴霧乾燥タンパク質足場調製物の調製は、米国特許第６，０１９，９６８号で教示されている。タンパク質足場に基づく乾燥粉末組成物は、溶媒中のタンパク質足場および任意選択で賦形剤の溶液またはスラリーを、吸入可能な乾燥粉末をもたらす条件下で噴霧乾燥させることによって生成することができる。溶媒は、容易に乾燥させることができる極性化合物、例えば、水およびエタノールを含むことができる。タンパク質足場の安定性は、酸素の非存在下で、例えば、窒素ブランケットのもとで、または乾燥ガスとして窒素を使用することにより、噴霧乾燥手順を行うことによって、増強することができる。別の比較的乾燥した製剤は、ＷＯ９９１６４１９で教示されているように、ヒドロフルオロアルカン噴霧体を通常は含む懸濁媒体に分散された複数の有孔微細構造の分散物である。安定化した分散物を、定量吸入器を使用して患者の肺に投与することができる。噴霧乾燥された医薬の商業的製造に有用な装置は、Ｂｕｃｈｉ  Ｌｔｄ．またはＮｉｒｏ  Ｃｏｒｐ．により製造されている。
【０２５８】
本明細書に記載の安定または保存製剤または溶液のいずれかにおける少なくとも１つのタンパク質足場は、本発明に従って、様々な送達方法によって、患者に投与することができ、そのような方法は、当技術分野において周知であるような、ＳＣもしくはＩＭ注射、経皮、経肺、経粘膜、インプラント、浸透圧ポンプ、カートリッジ、マイクロポンプ、または当業者に認められている他の手段を含む。
【０２５９】
治療適用
本発明は、当技術分野において公知であるような、または本明細書に記載されるような、細胞、組織、器官、動物または患者における疾患をモジュレートまたは処置する方法であって、本発明の少なくとも１つのタンパク質足場を使用して、例えば、細胞、組織、器官、動物もしくは患者に治療有効量のタンパク質足場を投与して、または細胞、組織、器官、動物もしくは患者を治療有効量のタンパク質足場と接触させて、モジュレートまたは処置する方法も提供する。本発明は、細胞、組織、器官、動物または患者における、これに限定されないが悪性疾患を含む、疾患をモジュレートまたは処置する方法も提供する。
【０２６０】
本発明は、細胞、組織、器官、動物または患者における、これらに限定されないが、白血病、急性白血病、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性リンパ球性白血病、Ｂ細胞、Ｔ細胞またはＦＡＢ  ＡＬＬ、急性骨髄系白血病（ａｃｕｔｅ  ｍｙｅｌｏｉｄ  ｌｅｕｋｅｍｉａ）（ＡＭＬ）、急性骨髄性白血病（ａｃｕｔｅ  ｍｙｅｌｏｇｅｎｏｕｓ  ｌｅｕｋｅｍｉａ）、慢性骨髄球性白血病（ＣＭＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、ヘアリー細胞白血病、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、リンパ腫、ホジキン病、悪性リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、カポジ肉腫、結腸直腸癌、膵臓癌、鼻咽頭癌、悪性組織球増殖症、腫瘍随伴症候群／悪性疾患に伴う高カルシウム血症、固形腫瘍、膀胱がん、乳がん、結腸直腸がん、子宮内膜がん、頭部がん、頸部がん、遺伝性非ポリポーシスがん、ホジキンリンパ腫、肝臓がん、肺がん、非小細胞肺がん、卵巣がん、膵臓がん、前立腺がん、腎細胞癌、精巣がん、腺癌、肉腫、悪性黒色腫、血管腫、転移性疾患、がん関連骨吸収、がん関連骨痛などのうちの少なくとも１つを含む、少なくとも１つの悪性疾患をモジュレートまたは処置する方法も提供する。
【０２６１】
本発明のいずれの方法も、少なくとも１つのタンパク質足場を含む組成物または医薬組成物の有効量を、そのようなモジュレーション、処置または治療を必要とする細胞、組織、器官、動物または患者に投与するステップを含むことができる。そのような方法は、そのような疾患または障害を処置するための共投与（ｃｏ−ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ）または併用療法であって、前記少なくとも１つのタンパク質足場、その指定部分または改変体の投与が、アルキル化剤、有糸分裂阻害剤および放射性薬品のうちの少なくとも１つから選択される少なくとも１つの前に、それと同時に、および／またはその後に投与するステップをさらに含む、共投与または併用療法を任意選択でさらに含むことができる。好適な投薬量は、当技術分野において周知である。例えば、Ｗｅｌｌｓら編、Ｐｈａｒｍａｃｏｔｈｅｒａｐｙ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ、第２版、Ａｐｐｌｅｔｏｎ  ａｎｄ  Ｌａｎｇｅ、Ｓｔａｍｆｏｒｄ、Ｃｏｎｎ．（２０００年）；ＰＤＲ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ、Ｔａｒａｓｃｏｎ  Ｐｏｃｋｅｔ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ  ２０００、豪華版、Ｔａｒａｓｃｏｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、Ｌｏｍａ  Ｌｉｎｄａ、Ｃａｌｉｆ．（２０００年）；Ｎｕｒｓｉｎｇ  ２００１  Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｄｒｕｇｓ、第２１版、Ｓｐｒｉｎｇｈｏｕｓｅ  Ｃｏｒｐ．、Ｓｐｒｉｎｇｈｏｕｓｅ、Ｐａ．、２００１年；Ｈｅａｌｔｈ  Ｐｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌ’ｓ  Ｄｒｕｇ  Ｇｕｉｄｅ  ２００１、Ｓｈａｎｎｏｎ、Ｗｉｌｓｏｎ、Ｓｔａｎｇ編、Ｐｒｅｎｔｉｃｅ−Ｈａｌｌ，  Ｉｎｃ、Ｕｐｐｅｒ  Ｓａｄｄｌｅ  Ｒｉｖｅｒ、Ｎ．Ｊ．を参照されたく、これらの参照文献の各々は、全体が参照により本明細書に援用される。
【０２６２】
好ましい用量は、約０．１〜９９および／もしくは１００〜５００ｍｇ／ｋｇ／投与、またはその任意の範囲、値もしくは部分、あるいは単回もしくは複数回の投与により血清中濃度約０．１〜５０００μｇ／ｍｌという血清中濃度を達成するための用量、またはその任意の範囲、値もしくは部分を任意選択で含むことができる。本発明のタンパク質足場の好ましい投薬量範囲は、患者の体重１ｋｇ当たり約１ｍｇから約３、約６または約１２ｍｇまでである。
【０２６３】
あるいは、投与される投薬量は、特定の薬剤の薬力学的特性、ならびにその投与方式および経路；レシピエントの年齢、健康状態および体重；症状の性質および程度、同時の処置の種類、処置の頻度、ならびに所望される効果などの、公知の因子に依存して変わりうる。通例、活性成分の投薬量は、体重１キログラム当たり約０．１〜１００ミリグラムでありうる。１投与当たりまたは徐放形態で、１キログラムにつき通常は０．１〜５０および好ましくは０．１〜１０ミリグラムが、所望の結果を得るのに有効である。
【０２６４】
非限定的な例として、単回用量、注入用量または反復用量を使用して、１〜４０日目の少なくとも１時点、または代替的にもしくは加えて１〜５２週目の少なくとも１時点、または代替的にもしくは加えて１〜２０年の少なくとも１時点、またはこれらの任意の組み合わせの時点において、１日当たり約０．１〜１００ｍｇ／ｋｇまたはその任意の範囲、値もしくは部分の、本発明の少なくとも１つのタンパク質足場の１回のまたは定期的な投薬量として、ヒトまたは動物の処置を提供することができる。
【０２６５】
内部投与に好適な剤形（組成物）は、一般に、１単位または１容器当たり約０．００１ミリグラム〜約５００ミリグラムの活性成分を含有する。これらの医薬組成物中の活性成分は、通常、組成物の全重量に基づいて約０．５〜９９．９９９重量％の量で存在することになる。
【０２６６】
非経口投与のために、タンパク質足場を、薬学的に許容される非経口用ビヒクルと会合している、またはそれと別々に提供される、溶液、懸濁物、エマルジョン、粒子、粉末または凍結乾燥粉末として、製剤化することができる。そのようなビヒクルの例は、水、食塩水、リンゲル液、デキストロース溶液、および約１〜１０％ヒト血清アルブミンである。リポソームおよび非水性ビヒクル、例えば固定油も、使用することができる。ビヒクルまたは凍結乾燥粉末は、等張性を維持するための添加剤（例えば、塩化ナトリウム、マンニトール）および化学的安定性を維持するための添加剤（例えば、緩衝剤および保存薬）を含有することができる。製剤は、公知のまたは好適な技術により滅菌される。
【０２６７】
好適な医薬担体は、当分野の標準参照テキストであるＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ａ．  Ｏｓｏｌの最新版に記載されている。
【０２６８】
代替的な投与
本発明による少なくとも１つのタンパク質足場の薬学的有効量を投与するために、多くの公知のおよび開発された方式を、本発明に従って使用することができる。経肺投与が下記の説明の中で使用されるが、他の投与方式を本発明に従って好適な結果で使用することができる。ここで説明されるまたは当技術分野において公知の吸入または他の方式による投与に好適な様々なデバイスおよび方法のいずれかを使用して、担体の中の、溶液、エマルジョン、コロイドもしくは懸濁物としての、または乾燥粉末としての、本発明のタンパク質足場を送達することができる。
【０２６９】
非経口製剤および投与
非経口投与用の製剤は、一般的な賦形剤として、滅菌水または食塩水、ポリアルキレングリコール、例えばポリエチレングリコール、植物由来の油、水素化ナフタレンなどを含有することができる。注射用の水性または油性懸濁物は、公知の方法に従って、適切な乳化剤または湿潤剤（ｈｕｍｉｄｉｆｉｅｒ）および懸濁化剤を使用することにより、調製することができる。注射用の薬剤は、水溶液、溶媒中の滅菌注射用溶液または懸濁物などの、非毒性で非経口投与可能な希釈剤でありうる。使用可能なビヒクルまたは溶媒として、水、リンゲル液、等張食塩水などが許容される。通常の溶媒または懸濁溶媒として、滅菌不揮発性油を使用することができる。これらのために、天然または合成または半合成脂肪油または脂肪酸、天然または合成または半合成モノまたはジまたはトリグリセリドを含む、任意の種類の不揮発性油および脂肪酸を使用することができる。非経口投与は当技術分野において公知であり、非経口投与は、これらに限定されないが、従来の注射手段、米国特許第５，８５１，１９８号に記載されているようなガス加圧式無針注射デバイス、および米国特許第５，８３９，４４６号に記載されているようなレーザー穿孔デバイス（ｌａｓｅｒ  ｐｅｒｆｏｒａｔｏｒ  ｄｅｖｉｃｅ）を含み、特許文献は、全体が参照により本明細書に援用される。
【０２７０】
代替的な送達
本発明は、非経口、皮下、筋肉内、静脈内、関節内（ｉｎｔｒａｒｔｉｃｕｌａｒ）、気管支内、腹部内、嚢内、軟骨内、腔内（ｉｎｔｒａｃａｖｉｔａｒｙ）、腔内（ｉｎｔｒａｃｅｌｉａｌ）、小脳内、脳室内、結腸内、頸部内、胃内、肝内、心筋内、骨内、骨盤内、心膜内、腹腔内、胸膜内、前立腺内、肺内、直腸内、腎内、網膜内、脊髄内、滑液包内、胸腔内、子宮内、膀胱内、病巣内、ボーラス、経膣、直腸、頬側、舌下、鼻腔内または経皮手段による、少なくとも１つのタンパク質足場の投与に、さらに関する。少なくとも１つのタンパク質足場組成物は、非経口（皮下、筋肉内もしくは静脈内）または任意の他の投与に使用するために、特に、溶液または懸濁物の形態で調製することができ；経膣または直腸投与の際に使用するために、特に、これらに限定されないがクリームおよび坐剤などの、半固体形態で調製することができ；頬側または舌下投与のために、例えば、これらに限定されないが、錠剤またはカプセルの形態で調製することができ；または鼻腔内使用のために、例えば、これらに限定されないが、粉末、点鼻薬（ｎａｓａｌ  ｄｒｏｐ）またはエアロゾルまたはある特定薬剤の形態で調製することができ；または経皮使用のために、例えば、これらに限定されないが、皮膚構造を修飾するためのもしくは経皮パッチ中の薬物濃度を増加させるためのジメチルスルホキシドなどの化学的促進剤（全体が参照により本明細書に援用される、Ｊｕｎｇｉｎｇｅｒら、「Ｄｒｕｇ  Ｐｅｒｍｅａｔｉｏｎ  Ｅｎｈａｎｃｅｍｅｎｔ」、Ｈｓｉｅｈ，  Ｄ．  Ｓ．編、５９〜９０頁（Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，  Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  １９９４年））を伴う、あるいはタンパク質およびペプチドを含有する製剤の皮膚への塗布（ＷＯ９８／５３８４７）を可能にする、またはエレクトロポレーションなどの、一過性輸送経路を生じさせるための、もしくはイオントフォレーシスなどの、皮膚を通しての荷電薬物の移動を増加させるための電場の印加、またはソノフォレーシスなどの、超音波の適用（米国特許第４，３０９，９８９号および同第４，７６７，４０２号）を可能にする、酸化剤を伴う、ゲル、軟膏、ローション、懸濁物またはパッチ送達システムの形態で調製することができる（上記刊行物および特許は、全体が参照により本明細書に援用される）。
【０２７１】
経肺／経鼻投与
経肺投与のために、好ましくは、少なくとも１つのタンパク質足場組成物は、肺の下気道または洞への到達に有効な粒径で送達される。本発明によれば、少なくとも１つのタンパク質足場を、吸入による治療剤の投与のための当技術分野において公知の様々な吸入または鼻用デバイスのいずれによっても送達することができる。患者の洞または肺胞内にエアロゾル化した製剤を堆積させることができるこれらのデバイスは、定量吸入器、ネブライザー、乾燥粉末発生器、噴霧器などを含む。タンパク質足場の経肺または経鼻投与を導くのに好適な他のデバイスも、当技術分野において公知である。すべてのそのようなデバイスは、エアロゾルでタンパク質足場を調剤するための投与に好適な製剤を使用することができる。そのようなエアロゾルは、溶液（水性および非水性両方）からなってもよく、または固体粒子からなってもよく。
【０２７２】
Ｖｅｎｔｏｌｉｎ定量吸入器のような定量吸入器は、通常は噴霧体ガスを使用し、吸息中に作動する必要がある（例えば、ＷＯ９４／１６９７０、ＷＯ９８／３５８８８を参照されたい）。Ｔｕｒｂｕｈａｌｅｒ（商標）（Ａｓｔｒａ）、Ｒｏｔａｈａｌｅｒ（登録商標）（Ｇｌａｘｏ）、Ｄｉｓｋｕｓ（登録商標）（Ｇｌａｘｏ）、Ｓｐｉｒｏｓ（商標）吸入器（Ｄｕｒａ）、Ｉｎｈａｌｅ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓにより販売されているデバイス、およびＳｐｉｎｈａｌｅｒ（登録商標）粉末吸入器（Ｆｉｓｏｎｓ）のような、乾燥粉末吸入器は、混合粉末の呼吸作動を使用する（全体が参照により本明細書に援用される、米国特許第４，６６８，２１８号  Ａｓｔｒａ、欧州特許第２３７５０７号  Ａｓｔｒａ、ＷＯ９７／２５０８６  Ｇｌａｘｏ、ＷＯ９４／０８５５２  Ｄｕｒａ、米国特許第５，４５８，１３５号  Ｉｎｈａｌｅ、ＷＯ９４／０６４９８  Ｆｉｓｏｎｓ）。ＡＥＲｘ（商標）Ａｒａｄｉｇｍ、Ｕｌｔｒａｖｅｎｔ（登録商標）ネブライザー（Ｍａｌｌｉｎｃｋｒｏｄｔ）、およびＡｃｏｒｎ  ＩＩ（登録商標）ネブライザー（Ｍａｒｑｕｅｓｔ  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｐｒｏｄｕｃｔｓ）（米国特許第５，４０４，８７１号  Ａｒａｄｉｇｍ、ＷＯ９７／２２３７６）のようなネブライザー（上記参照文献は、全体が参照により本明細書に援用される）は、溶液からエアロゾルを生じさせるが、定量吸入器、乾燥粉末吸入器などは、小粒子エアロゾルを発生させる。市販の吸入デバイスのこれらの具体的な例は、本発明の実施に好適な具体的なデバイスの代表であることを意図したものであり、本発明の範囲を限定するものとして意図したものではない。
【０２７３】
好ましくは、少なくとも１つのタンパク質足場を含む組成物は、乾燥粉末吸入器または噴霧器により送達される。本発明の少なくとも１つのタンパク質足場を投与するための吸入デバイスについてのいくつかの望ましい特徴がある。例えば、吸入デバイスによる送達は、有利なことに、信頼性があり、再現性があり、正確である。吸入デバイスは、良好に呼吸できるように、任意選択で、小さい乾燥粒子、例えば、約１０μｍ未満、好ましくは約１〜５μｍの乾燥粒子を送達することができる。
【０２７４】
噴霧剤（ｓｐｒａｙ）としてのタンパク質足場組成物の投与
タンパク質足場組成物を含む噴霧剤は、圧力下で、少なくとも１つのタンパク質足場の懸濁物または溶液を強制的にノズルに通すことにより生じさせることができる。所望のアウトプットおよび粒径を獲得するために、ノズルのサイズおよび構成、印加圧力ならびに液体供給速度を選択することができる。例えば、毛管またはノズルフィードと接続している電場により、エレクトロスプレーを生じさせることができる。有利なことに、噴霧器により送達される少なくとも１つのタンパク質足場組成物の粒子は、約１０μｍ未満の粒径、好ましくは約１μｍ〜約５μｍおよび最も好ましくは約２μｍ〜約３μｍの範囲の粒径を有する。
【０２７５】
噴霧器での使用に好適な少なくとも１つのタンパク質足場組成物の製剤は、通常、水溶液中のタンパク質足場組成物を、溶液１ｍｌ当たり少なくとも１つのタンパク質足場組成物約０．１ｍｇ〜約１００ｍｇ、もしくはｍｇ／ｇｍ、またはその中の任意の範囲、値もしくは部分の濃度で含む。製剤は、賦形剤、緩衝剤、等張剤、保存薬、界面活性剤および好ましくは亜鉛などの、薬剤を含むことができる。製剤は、緩衝剤、還元剤、バルクタンパク質または炭水化物などの、タンパク質足場組成物の安定化のための賦形剤または薬剤も含むことができる。タンパク質足場組成物の製剤化に有用なバルクタンパク質は、アルブミン、プロタミンなどを含む。タンパク質足場組成物の製剤化に有用な典型的な炭水化物は、スクロース、マンニトール、ラクトース、トレハロース、グルコースなどを含む。タンパク質足場組成物製剤は、エアロゾルの形成中の溶液の霧化により引き起こされるタンパク質足場組成物の表面誘起凝集を低減または防止することができる、界面活性剤も含むことができる。ポリオキシエチレン脂肪酸エステルおよびアルコール、ならびにポリオキシエチレンソルビトール脂肪酸エステルなどの、様々な従来の界面活性剤を、用いることができる。量は、一般に、製剤の０．００１〜１４重量％の間の範囲である。本発明のために特に好ましい界面活性剤は、モノオレイン酸ポリオキシエチレンソルビタン、ポリソルベート８０、ポリソルベート２０などである。タンパク質足場などのタンパク質、または指定部分もしくは改変体の製剤のための当技術分野において公知のさらなる薬剤も、製剤に含めることができる。
【０２７６】
ネブライザーによるタンパク質足場組成物の投与
本発明のタンパク質足場組成物を、ジェットネブライザーまたは超音波ネブライザーなどの、ネブライザーにより投与することができる。通常は、ジェットネブライザーの場合、圧縮空気源を使用して、開口部を通して高速空気ジェットを生じさせる。ガスがノズルを越えて膨張すると、低圧領域が作られ、それにより、液体レザバに接続された毛管を通してタンパク質足場組成物の溶液が引っ張られる。毛管からの液体流は、毛管から出ると剪断されて不安定なフィラメントおよび液滴になり、その結果、エアロゾルが生じる。所与のジェットネブライザーから所望の性能特性を獲得するために、様々な構成、流速、およびバッフルのタイプを用いることができる。超音波ネブライザーの場合、高周波電気エネルギーを使用して、通常は圧電変換器を用いて、振動、機械エネルギーを生じさせる。このエネルギーが、タンパク質足場組成物の製剤に、直接、またはカップリング流体を介して伝達され、その結果、タンパク質足場組成物を含むエアロゾルが生じる。有利には、ネブライザーにより送達されるタンパク質足場組成物の粒子は、約１０μｍ未満の粒径、好ましくは約１μｍ〜約５μｍおよび最も好ましくは約２μｍ〜約３μｍの範囲の粒径を有する。
【０２７７】
ジェットまたは超音波のいずれかのネブライザーでの使用に好適な少なくとも１つのタンパク質足場の製剤は、通常は、溶液１ｍｌ当たり約０．１ｍｇ〜約１００ｍｇの濃度の少なくとも１つのタンパク質足場を含む。製剤は、賦形剤、緩衝剤、等張剤、保存薬、界面活性剤および好ましくは亜鉛などの、薬剤を含むことができる。製剤は、緩衝剤、還元剤、バルクタンパク質または炭水化物などの、少なくとも１つのタンパク質足場組成物の安定化のための賦形剤または薬剤も含むことができる。少なくとも１つのタンパク質足場組成物の製剤化に有用なバルクタンパク質は、アルブミン、プロタミンなどを含む。少なくとも１つのタンパク質足場の製剤化に有用な典型的な炭水化物は、スクロース、マンニトール、ラクトース、トレハロース、グルコースなどを含む。少なくとも１つのタンパク質足場製剤は、エアロゾルの形成中の溶液の霧化により引き起こされる少なくとも１つのタンパク質足場の表面誘起凝集を低減または防止することができる、界面活性剤も含むことができる。ポリオキシエチレン脂肪酸エステルおよびアルコール、ならびにポリオキシエチレンソルビタール脂肪酸エステルなどの、様々な従来の界面活性剤を、用いることができる。量は、一般に、製剤の約０．００１〜４重量％の間の範囲である。本発明のために特に好ましい界面活性剤は、モノオレイン酸ポリオキシエチレンソルビタン、ポリソルベート８０、ポリソルベート２０などである。タンパク質足場などのタンパク質の製剤のための当技術分野において公知のさらなる薬剤も、製剤に含めることができる。
【０２７８】
定量吸入器によるタンパク質足場組成物の投与
定量吸入器（ＭＤＩ）では、噴霧体、少なくとも１つのタンパク質足場、および任意の賦形剤または他の添加剤が、液化圧縮ガスを含む混合物として、キャニスターの中に収容されている。計量弁（ｍｅｔｅｒｉｎｇ  ｖａｌｖｅ）の作動により、混合物が、約１０μｍ未満、好ましくは約１μｍ〜約５μｍ、および最も好ましくは約２μｍ〜約３μｍのサイズ範囲の粒子を好ましくは含有するエアロゾルとして、放出される。ジェットミリング、噴霧乾燥、臨界点凝結などを含む、当業者に公知の様々な方法により産生されたタンパク質足場組成物の製剤を用いることによって、所望のエアロゾル粒径を得ることができる。好ましい定量吸入器は、３ＭまたはＧｌａｘｏにより製造されたおよびヒドロフルオロカーボン噴霧体を用いるものを含む。定量吸入器デバイスで使用するための少なくとも１つのタンパク質足場の製剤は、非水性媒体中の懸濁物、例えば、界面活性剤の補助の下、噴霧体に懸濁された懸濁物として少なくとも１つのタンパク質足場を含有する微細に分割された粉末を、通常は含む。噴霧体は、この目的で用いられる任意の従来の材料、例えば、クロロフルオロカーボン、ヒドロクロロフルオロカーボン、ヒドロフルオロカーボン、または炭化水素（トリクロロフルオロメタン、ジクロロジフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタノールおよび１，１，１，２−テトラフルオロエタンを含む）、ＨＦＡ−１３４ａ（ヒドロフルオロアルカン−１３４ａ）、ＨＦＡ−２２７（ヒドロフルオロアルカン−２２７）などでありうる。好ましくは、噴霧体は、ヒドロフルオロカーボンである。例えば、噴霧体中の懸濁物として少なくとも１つのタンパク質足場を安定化するために、または活性薬剤を化学的分解から保護するなどのために、界面活性剤を選択することができる。好適な界面活性剤は、トリオレイン酸ソルビタン、大豆レシチン、オレイン酸などを含む。一部の事例では、エタノールなどの溶媒を使用する溶液エアロゾルが好ましい。タンパク質の製剤のための当技術分野において公知のさらなる薬剤も、製剤に含めることができる。本明細書に記載されないデバイスによる少なくとも１つのタンパク質足場組成物の経肺投与により本発明の方法を達成することができることは、当業者には認識される。
【０２７９】
経口製剤および投与
経口投与用の製剤は、腸壁の透過性を人工的に上昇させるためのアジュバント（例えば、レゾルシノールならびに非イオン性界面活性剤、例えばポリオキシエチレンオレイルエーテルおよびｎ−ヘキサデシルポリエチレンエーテル）の共投与、ならびに酵素的分解を阻害するための酵素阻害剤（例えば、膵臓トリプシンインヒビター、ジイソプロピルフルオロリン酸（ＤＦＦ）およびトラジロール）の共投与に依拠する。経口、頬側、粘膜、経鼻、経肺、経膣、膜貫通または直腸投与が意図された、タンパク質とタンパク質足場と少なくとも２つの界面活性剤の組み合わせとを含む親水性薬剤の送達のための製剤は、米国特許第６，３０９，６６３号で教示されている。経口投与のための固体型の剤形の活性成分化合物を、スクロース、ラクトース、セルロース、マンニトール、トレハロース、ラフィノース、マルチトール、デキストラン、デンプン、寒天、アルギネート、キチン、キトサン、ペクチン、トラガカントゴム、アラビアゴム、ゼラチン、コラーゲン、カゼイン、アルブミン、合成または半合成ポリマー、およびグリセリドを含む、少なくとも１つの添加剤と混合することができる。これらの剤形は、他のタイプの添加剤、例えば、不活性希釈剤、滑沢剤、例えばステアリン酸マグネシウム、パラベン、保存剤、例えばソルビン酸、アスコルビン酸、アルファ−トコフェロール、抗酸化剤、例えばシステイン、崩壊剤、結合剤、増粘剤、緩衝化剤、甘味剤、矯味矯臭剤、芳香剤なども含有することができる。
【０２８０】
錠剤および丸剤を腸溶性コーティング調製物にさらに加工することができる。経口投与用の液体調製物は、医学的使用に許容されうるエマルジョン、シロップ、エリキシル、懸濁物および溶液調製物を含む。これらの調製物は、前記分野で通常使用される不活性希釈剤、例えば水を含有することができる。インスリンおよびヘパリンのための薬物送達システムとしてリポソームも記載されている（米国特許第４，２３９，７５４号）。つい最近、混合アミノ酸の人工ポリマー（プロテイノイド）のマイクロスフェアが医薬品を送達するために使用された（米国特許第４，９２５，６７３号）。さらに、米国特許第５，８７９，６８１号および米国特許第５，８７１，７５３号に記載されている担体化合物であって、生物活性薬剤を経口送達するために使用される担体化合物は、当技術分野において公知である。
【０２８１】
粘膜用製剤および投与
生物活性薬剤を経口投与するための製剤であって、マイクロカプセルを生じさせるように１つまたは複数の生体適合性ポリマーまたはコポリマー賦形剤に、好ましくは、１つの生体分解性ポリマーまたはコポリマーにカプセル化されており、活性薬剤が、結果として生じるマイクロカプセルの適正なサイズのため、動物の、他に「パイエル板」または「ＧＡＬＴ」としても公知の集合リンパ小節に到達し吸収され、胃腸管を通過した薬剤に起因する有効性の損失のない、製剤。同様の集合リンパ小節を、気管支（ｂｒｏｎｃｈｅｉ  ｔｕｂｅ）（ＢＡＬＴ）および大腸において見いだすことができる。上記組織は、一般に粘膜関連リンパ組織（ｍｕｃｏｓａｌｌｙ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｌｙｍｐｈｏｒｅｔｉｃｕｌａｒ  ｔｉｓｓｕｅ）（ＭＡＬＴ）と称される。粘膜表面による吸収のために、少なくとも１つのタンパク質足場を投与する組成物および方法は、複数のサブミクロン粒子を含むエマルジョンと、粘膜付着性高分子と、生理活性ペプチドと、水性連続相とを含み、エマルジョン粒子の粘膜付着を達成することにより粘膜表面による吸収を促進する（米国特許第５，５１４，６７０号）。本発明のエマルジョンの適用に好適な粘膜表面は、角膜、結膜、頬側、舌下、経鼻、経膣、経肺、胃、腸および直腸投与経路を含むことができる。経膣または直腸投与用の製剤、例えば坐剤は、賦形剤として、例えば、ポリアルキレングリコール、ワセリン、カカオ脂などを含有することができる。鼻腔内投与用の製剤は、固体であってもよく、賦形剤として例えばラクトースを含有することができ、または点鼻薬の水性もしくは油性溶液であってもよい。頬側投与のための賦形剤は、糖、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、アルファ化デンプン（ｐｒｅｇｅｌｉｎａｔｉｎｅｄ  ｓｔａｒｃｈ）などを含む（米国特許第５，８４９，６９５号）。
【０２８２】
経皮製剤および投与
経皮投与のために、少なくとも１つのタンパク質足場は、リポソームもしくはポリマーナノ粒子、マイクロ粒子、マイクロカプセルまたはマイクロスフェア（別段の記述がない限り、まとめてマイクロ粒子と称される）などの、送達デバイスにカプセル化される。合成ポリマー、例えば、ポリヒドロキシ酸、例えば、ポリ乳酸、ポリグリコール酸およびこれらのコポリマー、ポリオルトエステル、ポリ無水物、およびポリホスファゼン、ならびに天然ポリマー、例えば、コラーゲン、ポリアミノ酸、アルブミンおよび他のタンパク質、アルギネートおよび他の多糖類、ならびにこれらの組み合わせで作製されたマイクロ粒子を含む、多数の好適なデバイスが公知である（米国特許第５，８１４，５９９号）。
【０２８３】
長期投与および製剤
長期間にわたって、例えば、単回投与から１週間〜１年の期間、本発明の化合物を被験体に送達することが、望ましいこともある。様々な緩徐放出、デポーまたはインプラント剤形を利用することができる。例えば、剤形は、体液への低い溶解度を有する化合物の薬学的に許容される非毒性塩、例えば、（ａ）リン酸、硫酸、クエン酸、酒石酸、タンニン酸、パモ酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンモノもしくはジスルホン酸、ポリガラクツロン酸などの多塩基酸との、酸付加塩（ａｃｉｄ  ａｄｄｉｔｉｏｎ  ｓａｌｔ）；（ｂ）亜鉛、カルシウム、ビスマス、バリウム、マグネシウム、アルミニウム、銅、コバルト、ニッケル、カドミウムなどの多価金属陽イオンとの塩、または例えばＮ，Ｎ’−ジベンジル−エチレンジアミンもしくはエチレンジアミンから形成された、有機陽イオンとの塩；または（ｃ）（ａ）と（ｂ）の組み合わせ、例えば、亜鉛タンニン酸塩を含有することができる。加えて、本発明の化合物または、好ましくは、今述べたものなどの比較的不溶性の塩を、注射に好適なゲル、例えば、モノステアリン酸アルミニウムの、例えばゴマ油とのゲルに、製剤化することができる。特に好ましい塩は、亜鉛塩、亜鉛タンニン酸塩、パモ酸塩などである。注射用の別のタイプの緩徐放出デポー製剤は、例えば米国特許第３，７７３，９１９号に記載されているようなポリ乳酸／ポリグリコール酸ポリマーなどの、緩徐分解性、非毒性、非抗原性ポリマーへのカプセル化のために分散される化合物または塩を含有する。化合物または、好ましくは、上記のものなどの比較的不溶性の塩を、特に動物での使用のために、コレステロールマトリクスシラスティックペレットに製剤化することもできる。さらなる緩徐放出、デポーまたはインプラント製剤、例えば、気体または液体リポソームが、文献で公知である（米国特許第５，７７０，２２２号および「Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ  ａｎｄ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍｓ」、Ｊ．  Ｒ．  Ｒｏｂｉｎｓｏｎ編、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，  Ｉｎｃ．、Ｎ．Ｙ．、１９７８年）。
【０２８４】
ＭＵＣ１
ＭＵＣ１ｎは、上皮細胞により主として発現される、広範にＯ−グリコシル化されているタンパク質である。分泌および膜結合ＭＵＣ１ｎは、毒素、微生物、および外部環境と境界面で発生する他の形態のストレスにより誘導される損傷から上皮細胞の頂端境界を保護する物理的バリアを形成する。膜貫通ＭＵＣ１ｎ  １（ＭＵＣ１）は、細胞の内部に、その細胞質ドメインを通ってシグナルを伝達することもできる。ＭＵＣ１には、ウニ精子タンパク質−エンテロキナーゼ−アグリン（ＳＥＡ）ドメインの存在を除いて、他の膜結合ＭＵＣ１ｎとの配列類似性がない。その点において、ＭＵＣ１は、単一ポリペプチドとして翻訳され、その後、ＳＥＡドメインにおいて自己切断を経る。
【０２８５】
ＭＵＣ１は、がんに関与する。ヒトＭＵＣ１は、ヘテロ二量体糖タンパク質であり、単一ポリペプチドとして翻訳され、小胞体内で切断されてＮおよびＣ末端サブユニット（ＭＵＣ１−ＮおよびＭＵＣ１−Ｃ）になる。ほとんどのヒトの癌に見られる、ＭＵＣ１の異常な過剰発現は、足場非依存性増殖および腫瘍原性を付与する。ＭＵＣ１の過剰発現は、酸化ストレスおよび遺伝毒性抗がん剤により誘導されるアポトーシスに対する耐性を付与する。
【０２８６】
繋留および分泌ＭＵＣ１ｎのファミリーは、上皮細胞表面の保護バリアをもたらす際に機能する。上皮層の損傷に伴って、隣接細胞間のタイトジャンクションが破壊され、細胞がヘレグリン誘導修復プログラムを開始すると極性が失われる。ＭＵＣ１−Ｎは、細胞の内部への環境ストレスシグナルの伝達因子として機能するためのＭＵＣ１−Ｃを残して細胞表面から脱落する。この点において、ＭＵＣ１−Ｃは、ＥｒｂＢ受容体ファミリーのメンバーと細胞表面複合体を形成し、ＭＵＣ１−Ｃは、ヘレグリン刺激に応答して核に標的化される。ＭＵＣ１−Ｃは、ＭＵＣ１細胞質ドメイン（ＣＤ）とカテニンファミリーのメンバーとの間の直接相互作用によってＥｒｂＢ受容体およびＷｎｔシグナル伝達経路を組み込む際にも機能する。ＭＵＣ１−ＣＤは、グリコーゲンシンターゼキナーゼ３β、ｃ−Ｓｒｃ、プロテインキナーゼＣδ、およびｃ−Ａｂｌによりリン酸化される。
【０２８７】
ＭＵＣ１構造
ＭＵＣ１は、正常分泌上皮細胞の頂端境界に発現されるＭＵＣ１ｎ型糖タンパク質である。ＭＵＣ１は、単一ポリペプチドとしての合成および小胞体内での前駆体の２つのサブユニットへの切断後、ヘテロ二量体を形成する。切断は、自己触媒プロセスにより媒介されうる。＞２５０ｋＤａのＭＵＣ１  Ｎ末端（ＭＵＣ１  Ｎ−ｔｅｒまたはＭＵＣ１−Ｎ）サブユニットは、可変数の２０アミノ酸タンデムリピートを含有し、このタンデムリピートは、高度に保存されるバリエーションを伴う不完全なものであり、Ｏ結合グリカンにより修飾されている。ＭＵＣ１−Ｎは、５８アミノ酸の細胞外領域と、２８アミノ酸の膜貫通ドメインと、７２アミノ酸の細胞質ドメイン（ＣＤ）とを含むおおよそ２３ｋＤａのＣ末端サブユニット（ＭＵＣ１  Ｃ−ｔｅｒまたはＭＵＣ１−Ｃ）（図１）との二量体化により、細胞表面に繋留されている。それは、本開示のタンパク質足場が結合する、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤの５８アミノ酸部分（配列番号２のイタリック体部分）である。ヒトＭＵＣ１−Ｃ配列を下に示す：
【化４２】
2019528044.tif 000044
【０２８８】
太字の配列は、ＣＤを示し、下線付き部分は、オリゴマー阻害ペプチドである。正常上皮の癌への形質転換に伴って、ＭＵＣ１は、サイトゾル内でおよび細胞膜全体にわたって異常に過剰発現される。細胞膜結合ＭＵＣ１は、クラスリン媒介エンドサイトーシスによりエンドソームに標的化される。加えて、ＭＵＣ１−ＮではなくＭＵＣ１−Ｃは、核およびミトコンドリアに標的化される。
【０２８９】
ＭＵＣ１機能
ＭＤＣ１−Ｃは、ＥｒｂＢ受容体ファミリーのメンバーと相互作用し、Ｗｎｔエフェクターであるβ−カテニンと相互作用する。上皮増殖因子受容体およびｃ−Ｓｒｃは、ＭＵＣ１細胞質ドメイン（ＭＵＣ１−ＣＤ）をＹ−４６においてリン酸化し、それによって、ＭＵＣ１とβ−カテニンの結合を増加させる。ＭＵＣ１とβ−カテニンの結合もまた、グリコーゲンシンターゼキナーゼ３βおよびプロテインキナーゼＣδによって調節される。ＭＵＣ１は、β−カテニンと核内に共局在し、Ｗｎｔ標的遺伝子の転写を共活性化する。ＭＵＣ１はまた、ｐ５３に直接結合し、ｐ５３標的遺伝子の転写を調節する。ＭＵＣ１−Ｃの過剰発現は、足場非依存性増殖および腫瘍原性を誘導するのに十分なものである。
【０２９０】
ＭＵＣ１「エピトープ」
本開示のタンパク質足場は、「エピトープ」ＭＵＣ１−Ｃ／細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）の１つまたは複数のアミノ酸に選択的に結合することができる。本開示のエピトープは、線形エピトープであってもよく、またはコンフォメーションエピトープであってもよい。本明細書で使用される用語「エピトープ」は、本開示のタンパク質足場が特異的に結合する１つまたは複数のアミノ酸を指すことを意図したものである。本開示のエピトープの１つまたは複数のアミノ酸は、線形に、非線形に、連続的に、または不連続に配列されていることがある。本開示のエピトープは、「コンフォメーション」エピトープであってもよく、これは、タンパク質足場が、エピトープの１つまたは複数のアミノ酸に、該アミノ酸が、正しく折り畳まれたペプチド、タンパク質またはタンパク質複合体のコンフォメーションで提示されたときに、より大きいアフィニティーまたはより大きい選択性で結合することを意味する。ある特定の実施形態では、コンフォメーションエピトープに結合するタンパク質足場は、線形エピトープに結合することができない。
【０２９１】
本開示のタンパク質足場は、ＳＶＶＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲＹＮＬＴＩＳＤＶＳＶＳＤＶＰＦＰＦＳＡＱＳＧＡＧ（配列番号３）のアミノ酸配列により定義されるＭＵＣ１−Ｃ／細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）（図１を参照されたい）の１つまたは複数のアミノ酸に、選択的に結合することができる。あるいは、または加えて、本開示のタンパク質足場は、改変体ＭＵＣ１−Ｃ／細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）の１つまたは複数のアミノ酸に、選択的に結合することができる。本開示の改変体ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤペプチドは、配列番号３に従って番号付けされた、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ−Ｌ６Ａ、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ−Ｌ８Ａ、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ−Ｌ６，８Ａ、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ−Ｑ２３Ｖ、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ−Ｑ２６Ｖ、ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ−Ｎ３６Ａを含むことができるが、これらに限定されない。
【０２９２】
本開示のタンパク質足場は、ＭＵＣ１−Ｃ／細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）に由来する下記のペプチド：
ＳＶＶＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥＴ（「ペプチド１」、配列番号６１）、
ＶＥＴＱＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲＹＮＬＴＩＳＤ（「ペプチド２」、配列番号７１）、または
ＴＩＳＤＶＳＶＳＤＶＰＦＰＦＳＡＱＳＧＡＧ（「ペプチド３」、配列番号７２）
の１つまたは複数のアミノ酸に選択的に結合することができる。
【０２９３】
養子細胞療法としての修飾細胞の注入
本開示は、本開示の１つまたは複数のＣＡＲおよび／またはＣＡＲＴｙｒｉｎを発現する修飾細胞であって、それを必要とする被験体に投与するために選択および／または増殖された修飾細胞を提供する。本開示の修飾細胞は、室温および体温を含む任意の温度で保管するために製剤化することができる。本開示の修飾細胞は、凍結保存およびその後の解凍のために製剤化することができる。本開示の修飾細胞は、滅菌包装からの被験体への直接投与のために薬学的に許容される担体中で製剤化することができる。本開示の修飾細胞は、最低レベルの細胞機能およびＣＡＲ／ＣＡＲＴｙｒｉｎ発現を保証するための細胞生存度および／またはＣＡＲ／ＣＡＲＴｙｒｉｎ発現レベルの指示薬とともに薬学的に許容される担体中で製剤化することができる。本開示の修飾細胞は、さらなる増殖を阻害するためのおよび／または細胞死を防止するための１つまたは複数の試薬とともに処方された密度で薬学的に許容される担体中で製剤化することができる。
【０２９４】
誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、既存の誘導性ポリペプチドより優れている。なぜなら、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのほうが、はるかに免疫原性が低いからである。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、組換えポリペプチドであり、したがって、天然に存在しないが、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを産生するように組み換えられる配列は、宿主ヒト免疫系が「非自己」と認識し、その結果、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含む細胞、または誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドもしくは誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含む細胞を含む組成物を受容する被験体において、免疫応答を誘導する可能性がある、非ヒト配列を含まない。
【０２９５】
本開示は、リガンド結合領域と、リンカーと、アポトーシス促進性ペプチドとを含む、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドであって、非ヒト配列を含まない誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを提供する。ある特定の実施形態では、非ヒト配列は、制限部位を含む。ある特定の実施形態では、アポトーシス促進性ペプチドは、カスパーゼポリペプチドである。ある特定の実施形態では、カスパーゼポリペプチドは、カスパーゼ９ポリペプチドである。ある特定の実施形態では、カスパーゼ９ポリペプチドは、切断型カスパーゼ９ポリペプチドである。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、天然に存在しないものでありうる。
【０２９６】
本開示のカスパーゼポリペプチドは、これらに限定されないが、カスパーゼ１、カスパーゼ２、カスパーゼ３、カスパーゼ４、カスパーゼ５、カスパーゼ６、カスパーゼ７、カスパーゼ８、カスパーゼ９、カスパーゼ１０、カスパーゼ１１、カスパーゼ１２、およびカスパーゼ１４を含む。本開示のカスパーゼポリペプチドは、カスパーゼ２、カスパーゼ３、カスパーゼ６、カスパーゼ７、カスパーゼ８、カスパーゼ９およびカスパーゼ１０を含む、アポトーシスに関連するカスパーゼポリペプチドを含むが、これらに限定されない。本開示のカスパーゼポリペプチドは、カスパーゼ２、カスパーゼ８、カスパーゼ９およびカスパーゼ１０を含む、アポトーシスを開始させるカスパーゼポリペプチドを含むが、これらに限定されない。本開示のカスパーゼポリペプチドには、カスパーゼ３、カスパーゼ６およびカスパーゼ７を含む、アポトーシスを実行するカスパーゼポリペプチドを含むが、これらに限定されない。
【０２９７】
本開示のカスパーゼポリペプチドは、野生型アミノ酸または核酸配列と比較して１つまたは複数の修飾を有するアミノ酸または核酸配列によりコードされていてもよい。本開示のカスパーゼポリペプチドをコードする核酸配列を、コドン最適化することができる。本開示のカスパーゼポリペプチドのアミノ酸および／または核酸配列への１つまたは複数の修飾は、野生型アミノ酸または核酸配列と比較して、本開示のカスパーゼポリペプチドの相互作用、架橋、交差活性化、または活性化を増加させることができる。あるいは、または加えて、本開示のカスパーゼポリペプチドのアミノ酸および／または核酸配列への１つまたは複数の修飾は、野生型アミノ酸または核酸配列と比較して、本開示のカスパーゼポリペプチドの免疫原性を減少させることができる。
【０２９８】
本開示のカスパーゼポリペプチドは、野生型カスパーゼポリペプチドと比較して切断されたものであり得る。例えば、カスパーゼポリペプチドは、本開示の誘導性カスパーゼポリペプチドを含む細胞においてアポトーシスを開始させることに加えて局所炎症応答を活性化する可能性を除去または最小化するために、カスパーゼ活性化および動員ドメイン（ＣＡＲＤ）をコードする配列が除去されるように切断されたものであり得る。本開示のカスパーゼポリペプチドをコードする核酸配列をスプライシングして、野生型カスパーゼポリペプチドと比較して本開示のカスパーゼポリペプチドの改変体アミノ酸配列を形成することができる。本開示のカスパーゼポリペプチドは、組換えおよび／またはキメラ配列によりコードされていてもよい。本開示の組換えおよび／またはキメラカスパーゼポリペプチドは、１つまたは複数の異なるカスパーゼポリペプチドからの配列を含んでもよい。あるいは、または加えて、本開示の組換えおよび／またはキメラカスパーゼポリペプチドは、１種または複数の種からの配列（例えば、ヒト配列および非ヒト配列）を含んでもよい。本開示のカスパーゼポリペプチドは、天然に存在しないものでありうる。
【０２９９】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのリガンド結合領域は、本開示の第１の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドと本開示の第２の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの二量体化であって、アポトーシス促進性ポリペプチドの架橋および細胞におけるアポトーシスの開始を活性化または誘導する二量体化を助長または促進する、いずれのポリペプチド配列を含んでもよい。
【０３００】
リガンド結合（「二量体化」）領域は、天然または非天然リガンド（すなわち、誘導剤）、例えば非天然合成リガンドを使用して誘導が可能になる、いずれのポリペプチドまたはその機能性ドメインを含んでもよい。リガンド結合領域は、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの性質およびリガンド（すなわち、誘導剤）の選択に依存して、細胞膜の内側にあっても、外側にあってもよい。受容体を含む、多種多様なリガンド結合ポリペプチドおよびそれらの機能性ドメインが、公知である。本開示のリガンド結合領域は、受容体からの１つまたは複数の配列を含んでもよい。特に興味深いのは、リガンド（例えば、低分子有機リガンド）が公知であるか、または容易に産生されうる、リガンド結合領域である。これらのリガンド結合領域または受容体は、これらに限定されないが、ＦＫＢＰおよびシクロフィリン受容体、ステロイド受容体、テトラサイクリン受容体などはもちろん、「非天然」受容体も含むことができ、「非天然」受容体は、抗体、特に重鎖または軽鎖サブユニット、それらの変異した配列、確率的手順、コンビナトリアル合成などにより得られるランダムアミノ酸配列から得ることができる。ある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、ＦＫＢＰリガンド結合領域、シクロフィリン受容体リガンド結合領域、ステロイド受容体リガンド結合領域、シクロフィリン受容体リガンド結合領域（ａ  ｃｙｃｌｏｐｈｉｌｉｎ  ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ  ｌｉｇａｎｄ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｒｅｇｉｏｎ）、およびテトラサイクリン受容体リガンド結合領域からなる群より選択される。
【０３０１】
１つまたは複数の受容体ドメインを含むリガンド結合領域は、天然ドメインまたはその切断型活性部分のいずれかとしての、少なくとも約５０アミノ酸、かつ約３５０アミノ酸未満、通例、２００アミノ酸未満でありうる。結合領域は、例えば、小さい（ウイルスベクターでの効率的トランスフェクションを可能にするために、＜２５ｋＤａ）こともあり、単量体であることもあり、非免疫原性であることもあり、二量体化できるように構成されうる、合成により入手可能な、細胞透過性、非毒性リガンドを有することもある。
【０３０２】
１つまたは複数の受容体ドメインを含むリガンド結合領域は、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの設計および適切なリガンド（すなわち、誘導剤）の利用可能性に依存して、細胞内にあることもあり、または細胞外にあることもある。疎水性リガンドについては、結合領域は、膜のどちら側にあってもよいが、親水性リガンド、特にタンパク質リガンドについては、結合領域は、結合に利用可能である形態でリガンドを内在化するための輸送システムがある場合を除き、通常は細胞膜の外側にある。細胞内受容体については、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチド、または誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを含むトランスポゾンもしくはベクターは、受容体ドメイン配列の５’もしくは３’にシグナルペプチドおよび膜貫通ドメインをコードすることもあり、または受容体ドメイン配列の５’に脂質結合シグナル配列を有することもある。受容体ドメインが、シグナルペプチドと膜貫通ドメインの間にある場合、受容体ドメインは、細胞外にある。
【０３０３】
抗体および抗体サブユニット、例えば、重鎖または軽鎖、特に、断片、より特に、可変領域のすべてもしくは一部、または高アフィニティー結合を生じさせるために重鎖と軽鎖の融合体を、本開示のリガンド結合領域として使用することができる。企図される抗体は、免疫応答を誘発せず、一般に、末梢（すなわち、ＣＮＳ／脳領域の外側）で発現されない細胞外ドメインなどの、異所的に発現されたヒト産物であるものを含む。そのような例は、低アフィニティー神経成長因子受容体（ＬＮＧＦＲ）、および胚性表面タンパク質（すなわち、癌胎児抗原）を含むが、これらに限定されない。またさらに、生理的に許容されるハプテン分子に対する抗体を調製し、個々の抗体サブユニットを結合アフィニティーについてスクリーニングすることができる。サブユニットをコードするｃＤＮＡを単離し、定常領域の欠失、可変領域の複数の部分の欠失、可変領域の変異誘発などにより修飾して、リガンドに対する適切なアフィニティーを有する結合タンパク質ドメインを得ることができる。このようにして、ほぼあらゆる生理的に許容されるハプテン化合物を、リガンドとして、またはリガンドのエピトープを得るために、用いることができる。結合領域またはドメインが公知であり、結合のための有用なまたは公知のリガンドがある、天然受容体を、抗体ユニットの代わりに用いることができる。
【０３０４】
受容体を多量体化するために、誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのリガンド結合領域／受容体ドメインのリガンドは、該リガンドが、リガンド受容体領域に各々が結合できる少なくとも２つの結合部位を有することができるという意味で、多量体のもの（すなわち、第１の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのリガンド結合領域に結合することができる第１の結合部位、および第２の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのリガンド結合領域に結合することができる第２の結合部位を有し、第１および第２の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのリガンド結合領域が同一であるかまたは異なる、リガンド）であってもよい。したがって、本明細書で使用される用語「多量体リガンド結合領域」は、多量体リガンドに結合する、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドのリガンド結合領域を指す。本開示の多量体リガンドは、二量体リガンドを含む。本開示の二量体リガンドは、リガンド受容体ドメインに結合することができる２つの結合部位を有することができる。ある特定の実施形態では、本開示の多量体リガンドは、個々の分子が、通常は、少なくとも約１５０Ｄａ、かつ約５ｋＤａ未満、通例、約３ｋＤａ未満である、小さい合成有機分子の二量体またはより高次のオリゴマー、通常は約四量体以下である。合成リガンドと受容体の様々なペアを用いることができる。例えば、天然受容体を含む実施形態では、二量体ＦＫ５０６をＦＫＢＰ１２受容体とともに使用することができ、二量体化シクロスポリンＡをシクロフィリン受容体とともに、二量体化エストロゲンをエストロゲン受容体とともに、二量体化グルココルチコイドをグルココルチコイド受容体とともに、二量体化テトラサイクリンをテトラサイクリン受容体とともに、二量体化ビタミンＤをビタミンＤ受容体とともに、などを使用することができる。あるいは、より高次のリガンド、例えば、三量体のものを使用することができる。非天然受容体、例えば、抗体サブユニット、修飾された抗体サブユニット、可撓性リンカーによって隔てられているタンデムでの重鎖可変領域および軽鎖可変領域からなる一本鎖抗体、または修飾された受容体およびそれらの変異した配列などを含む実施形態のために、多種多様な化合物のいずれを使用してもよい。本開示の多量体リガンドを含むユニットの有意な特徴は、各結合部位が、高いアフィニティーで受容体に結合することができること、および好ましくは、それらのユニットを化学的に二量体化することができることである。また、方法は、リガンドの疎水性／親水性のバランスをとるために利用可能であり、したがって、それらのリガンドは、大半の適用のために、機能的レベルで血清に溶解することができ、さらに原形質膜を通過して拡散することができる。
【０３０５】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの活性化を、例えば、誘導剤により媒介される化学誘導二量体化（ＣＩＤ）によって遂行して、条件付きで制御されるタンパク質またはポリペプチドを産生してもよい。本開示のアポトーシス促進性ポリペプチドは、誘導性であるばかりでなく、これらのポリペプチドの誘導は、不安定な二量体化剤の分解または単量体競合阻害剤の投与に起因して、可逆的でもある。
【０３０６】
ある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、ＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含む。ある特定の実施形態では、リガンド結合領域は、３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を有するＦＫＢＰ１２ポリペプチドを含む。リガンド結合領域が３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を有するＦＫＢＰ１２ポリペプチドを含む、ある特定の実施形態では、誘導剤は、ＡＰ１９０３、合成薬物（ＣＡＳ索引名：２−ピペリジンカルボン酸、１−［（２Ｓ）−１−オキソ−２−（３，４，５−トリメトキシフェニル）ブチル］−，１，２−エタンジイルビス［イミノ（２−オキソ−２，１−エタンジイル）オキシ−３，１−フェニレン［（１Ｒ）−３−（３，４−ジメトキシフェニル）プロピリデン］］エステル、［２Ｓ−［１（Ｒ＊），２Ｒ＊［Ｓ＊［Ｓ＊［１（Ｒ＊），２Ｒ＊］］］］］−（９Ｃｌ）  ＣＡＳ登録番号：１９５５１４−６３−７；分子式：Ｃ７８Ｈ９８Ｎ４Ｏ２０；分子量：１４１１．６５））を含みうる。リガンド結合領域が３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を有するＦＫＢＰ１２ポリペプチドを含む、ある特定の実施形態では、誘導剤は、ＡＰ２０１８７（ＣＡＳ登録番号：１９５５１４−８０−８および分子式：Ｃ８２Ｈ１０７Ｎ５Ｏ２０）を含むことがある。ある特定の実施形態では、誘導剤は、例えばＡＰ１５１０などの、ＡＰ２０１８７類似体である。本明細書で使用される誘導剤ＡＰ２０１８７、ＡＰ１９０３およびＡＰ１５１０は、交換可能に使用されうる。
【０３０７】
ＡＰ１９０３  ＡＰＩは、Ａｌｐｈｏｒａ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｉｎｃ．により製造されており、注射用ＡＰ１９０３薬品は、Ｆｏｒｍａｔｅｃｈ  Ｉｎｃ．により作製されている。これは、非イオン性可溶化剤Ｓｏｌｕｔｏｌ  ＨＳ  １５（２５０ｍｇ／ｍＬ、ＢＡＳＦ）の２５％溶液中のＡＰ１９０３の５ｍｇ／ｍＬ溶液として製剤化される。室温で、この製剤は、透明な、やや黄色い溶液である。冷凍すると、この製剤は、可逆的に相転移を経て、その結果、乳白色の溶液が得られる。この相転移は、再び室温に温めると逆転する。充填量は、３ｍＬガラスバイアルに２．３３ｍＬ（１バイアル当たり合計おおよそ１０ｍｇの注射用ＡＰ１９０３）である。ＡＰ１９０３を投与する必要性を決定する際に、例えば、非ＤＥＨＰ、非エチレンオキシド滅菌注入セットを使用して、ＩＶ注入により２時間にわたって単回固定用量の注射用ＡＰ１９０３（０．４ｍｇ／ｋｇ）を患者に投与することができる。ＡＰ１９０３の用量は、すべての患者について個別に算出され、体重が≧１０％変動しない限り、再計算されない。その算出用量が、注入前に、０．９％生理食塩水中、１００ｍＬで希釈される。ＡＰ１９０３の以前の第Ｉ相研究では、２４名の健常ボランティアが、２時間にわたってＩＶ注入される０．０１、０．０５、０．１、０．５および１．０ｍｇ／ｋｇの用量レベルでの注射用ＡＰ１９０３の単回用量で処置された。ＡＰ１９０３血漿中レベルは、用量に正比例し、平均Ｃｍａｘ値は、０．０１〜１．０ｍｇ／ｋｇ用量範囲にわたりおおよそ１０〜１２７５ｎｇ／ｍＬの範囲であった。初回注入期間後、血中濃度は、急速な分布相を示し、血漿中レベルが、用量後０．５、２および１０時間の時点で、それぞれ最大濃度のおおよそ１８、７および１％に低下した。注射用ＡＰ１９０３は、すべての用量レベルで安全であり、良好に忍容されたことが示され、有利な薬物動態プロファイルを示した。Ｉｕｌｉｕｃｃｉ  Ｊ  Ｄら、Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．  ４１巻：８７０〜９頁、２００１年。
【０３０８】
使用される注射用ＡＰ１９０３の固定用量は、例えば、２時間にわたって静脈内注入される０．４ｍｇ／ｋｇでありうる。ｉｎ  ｖｉｔｒｏで細胞の有効なシグナル伝達に必要なＡＰ１９０３の量は、１０〜１００ｎＭ（１６００Ｄａ  ＭＷ）である。これは、１６〜１６０μｇ／Ｌ、または約０．０１６〜１．６μｇ／ｋｇ（１．６〜１６０μｇ／ｋｇ）に等しい。１ｍｇ／ｋｇまでの用量は、上記のＡＰ１９０３の第Ｉ相研究において良好に忍容された。したがって、０．４ｍｇ／ｋｇは、治療用細胞と組み合わせたこの第Ｉ相研究のＡＰ１９０３についての安全かつ有効な用量でありうる。
【０３０９】
本開示のリガンド結合をコードするアミノ酸および／または核酸配列は、野生型アミノ酸または核酸配列と比較して配列の１つまたは複数の修飾を含有しうる。例えば、本開示のリガンド結合領域をコードするアミノ酸および／または核酸配列は、コドン最適化配列であってもよい。１つまたは複数の修飾は、野生型ポリペプチドと比較して本開示のリガンド結合領域に対するリガンド（例えば、誘導剤）の結合アフィニティーを増加させることができる。あるいは、または加えて、１つまたは複数の修飾は、野生型ポリペプチドと比較して本開示のリガンド結合領域の免疫原性を低下させることができる。本開示のリガンド結合領域および／または本開示の誘導剤は、天然に存在しないものでありうる。
【０３１０】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、リガンド結合領域と、リンカーと、アポトーシス促進性ペプチドとを含み、該誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドは、非ヒト配列を含まない。ある特定の実施形態では、非ヒト配列は、制限部位を含む。リンカーは、アポトーシス促進性ポリペプチドの相互作用および活性化が細胞におけるアポトーシスを開始させるような、アポトーシス促進性ポリペプチドの相互作用、架橋、交差活性化、または活性化を、リガンド結合領域の二量体化時に可能にする、いずれの有機または無機材料を含んでもよい。ある特定の実施形態では、リンカーは、ポリペプチドである。ある特定の実施形態では、リンカーは、Ｇ／Ｓリッチアミノ酸配列を含むポリペプチド（「ＧＳ」リンカー）である。ある特定の実施形態では、リンカーは、アミノ酸配列ＧＧＧＧＳ（配列番号４１）を含むポリペプチドである。好ましい実施形態では、リンカーは、ポリペプチドであり、該ポリペプチドをコードする核酸は、制限エンドヌクレアーゼの制限部位を含有しない。本開示のリンカーは、天然に存在しないものでありうる。
【０３１１】
本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを、細胞において、その細胞における本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの発現を開始および／または調節することができる任意のプロモーターの転写調節下で、発現させることができる。本明細書で使用される用語「プロモーター」は、遺伝子を転写するためのＲＮＡポリメラーゼの最初の結合部位として作用するプロモーターを指す。例えば、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを、哺乳動物細胞において、哺乳動物細胞における本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの発現を開始および／または調節することができる任意のプロモーターの転写調節下で、発現させることができ、そのようなプロモーターは、これらに限定されないが、天然、内在性、外来性および異種プロモーターを含む。好ましい哺乳動物細胞は、ヒト細胞を含む。したがって、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドを、ヒト細胞において、ヒト細胞における本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの発現を開始および／または調節することができる任意のプロモーターの転写調節下で、発現させることができ、そのようなプロモーターは、これらに限定されないが、ヒトプロモーターまたはウイルスプロモーターを含む。ヒト細胞における発現のための例示的なプロモーターは、これらに限定されないが、ヒトサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）前初期遺伝子プロモーター、ＳＶ４０初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスの長い末端反復配列、β−アクチンプロモーター、ラットインスリンプロモーターおよびグリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼプロモーターを含み、これらの各々を使用して、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの高レベルの発現を得ることができる。本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの発現を達成するための、当技術分野において周知である他のウイルスまたは哺乳動物細胞または細菌ファージプロモーターの使用も、企図されるが、ただし、発現レベルが、細胞においてアポトーシスを開始させるのに十分なものであることを条件とする。周知の特性を有するプロモーターを用いることにより、トランスフェクションまたは形質転換後の目的のタンパク質の発現レベルおよび発現パターンを最適化することができる。
【０３１２】
特異的な生理的または合成シグナルに応答して調節されるプロモーターの選択は、本開示の誘導性アポトーシス促進性ポリペプチドの誘導性発現を可能にすることができる。エクジソンシステム（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、Ｃａｌｉｆ．）は、１つのそのようなシステムである。このシステムは、哺乳動物細胞における目的の遺伝子の発現調節を可能にするように設計される。それは、事実上、導入遺伝子の基礎発現レベルを可能にせず、２００倍を超える誘導性（ｉｎｄｕｃｉｂｉｌｉｔｙ）を可能にする、厳密に調節された発現メカニズムからなる。このシステムは、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａのヘテロ二量体エクジソン受容体に基づいており、エクジソンまたは類似体、例えばムリステロン（ｍｕｒｉｓｔｅｒｏｎｅ）Ａが、受容体に結合し、その受容体が、プロモーターを活性化して、下流導入遺伝子の発現をオンにすると、高レベルのｍＲＮＡ転写物が得られる。このシステムでは、ヘテロ二量体受容体の両方の単量体が１つのベクターから構成的に発現されるが、目的の遺伝子発現を駆動するエクジソン応答性プロモーターは、別のプラスミド上にある。したがって、このタイプのシステムの目的のベクターへの操作は、有用でありうる。有用でありうる別の誘導性のシステムは、Ｔｅｔ−Ｏｆｆ（商標）またはＴｅｔ−Ｏｎ（商標）システム（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ、Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ、Ｃａｌｉｆ．）であり、該システムは、元々はＧｏｓｓｅｎおよびＢｕｊａｒｄにより開発された（ＧｏｓｓｅｎおよびＢｕｊａｒｄ、Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ、８９巻：５５４７〜５５５１頁、１９９２年；Ｇｏｓｓｅｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２６８巻：１７６６〜１７６９頁、１９９５年）。このシステムもまた、高レベルの遺伝子発現をテトラサイクリンまたはテトラサイクリン誘導体、例えばドキシサイクリンに応答して調節することができるようにする。Ｔｅｔ−Ｏｎ（商標）システムでは、遺伝子発現は、ドキシサイクリンの存在下でオンにされるが、Ｔｅｔ−Ｏｆｆ（商標）システムでは、遺伝子発現は、ドキシサイクリンの非存在下でオンにされる。これらのシステムは、テトラサイクリンオペレーター配列（テトラサイクリンリプレッサーが結合する）と、テトラサイクリンリプレッサータンパク質という、Ｅ．ｃｏｌｉのテトラサイクリン耐性オペロンに由来する２つの調節エレメントに基づいている。目的の遺伝子は、プラスミド内の、テトラサイクリン応答性エレメントが内部に存在しているプロモーターの後ろにクローニングされる。第２のプラスミドは、Ｔｅｔ−Ｏｆｆ（商標）システム内の、単純ヘルペスウイルスからのＶＰ１６ドメインと野生型テトラサイクリンリプレッサーとで構成されている、テトラサイクリン制御性トランス活性化因子と呼ばれる調節エレメントを含有する。したがって、ドキシサイクリンの非存在下では、転写は、構成的にオンである。Ｔｅｔ−Ｏｎ（商標）システムでは、テトラサイクリンリプレッサーは、野生型でなく、ドキシサイクリンの存在下で転写を活性化する。遺伝子療法ベクター産生のために、産生細胞をテトラサイクリンまたはドキシサイクリンの存在下で増殖させ、毒性である可能性のある導入遺伝子の発現��防止することができるように、しかしベクターが患者に導入されたときには遺伝子発現が構成的にオンになるように、Ｔｅｔ−Ｏｆｆ（商標）システムを使用することができる。
【０３１３】
一部の状況では、遺伝子療法ベクターにおける導入遺伝子の発現を調節することが望ましい。例えば、様々な活性強度を有する異なるウイルスプロモーターが、所望の発現レベルに依存して利用される。哺乳動物細胞では、ＣＭＶ前初期プロモーターが、強力な転写活性化をもたらすために使用されることが多い。ＣＭＶプロモーターは、Ｄｏｎｎｅｌｌｙ，  Ｊ．  Ｊ．ら、１９９７年、Ａｎｎｕ．  Ｒｅｖ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １５巻：６１７〜４８頁において総説されている。あまり強力ではないＣＭＶプロモーターの修飾バージョンも、導入遺伝子の発現レベル低下が所望される場合に使用されてきた。造血細胞における導入遺伝子の発現が所望される場合、ＭＬＶまたはＭＭＴＶからのＬＴＲなどのレトロウイルスプロモーターが、使用されることが多い。所望される効果に依存して使用される他のウイルスプロモーターは、ＳＶ４０、ＲＳＶ  ＬＴＲ、ＨＩＶ−１およびＨＩＶ−２  ＬＴＲ、アデノウイルスプロモーター、例えばＥ１Ａ、Ｅ２ＡもしくはＭＬＰ領域からのもの、ＡＡＶ  ＬＴＲ、ＨＳＶ−ＴＫ、ならびにトリ肉腫ウイルスを含む。
【０３１４】
他の例では、発生上調節されている、および特定の分化した細胞において活性であるプロモーターが、選択されることもある。したがって、例えば、プロモーターは、多能性幹細胞では活性でなくてもよいが、例えば、その多能性幹細胞が、より成熟した細胞に分化した場合には、そのプロモーターは活性化されうる。
【０３１５】
同様に、非標的化組織に対する潜在的毒性または望ましくない効果を低下させるために、組織特異的プロモーターが、特異的組織または細胞における転写を果すために使用される。これらのプロモーターは、ＣＭＶプロモーターなどのより強力なプロモーターと比較して低減された発現をもたらしうるが、より限られた発現および免疫原性も、もたらしうる（Ｂｏｊａｋ，  Ａ．ら、２００２年、Ｖａｃｃｉｎｅ．  ２０巻：１９７５〜７９頁；Ｃａｚｅａｕｘ．，  Ｎ．ら、２００２年、Ｖａｃｃｉｎｅ  ２０巻：３３２２〜３１頁）。例えば、組織特異的プロモーター、例えばＰＳＡ関連プロモーターもしくは前立腺特異的腺性カリクレイン、または筋肉クレアチンキナーゼ遺伝子を、必要に応じて使用することができる。
【０３１６】
組織特異的または分化特異的プロモーターの例は、以下のもの：Ｂ２９（Ｂ細胞）、ＣＤ１４（単核球細胞）、ＣＤ４３（白血球および血小板）、ＣＤ４５（造血細胞）、ＣＤ６８（マクロファージ）、デスミン（筋肉）、エラスターゼ−１（膵腺房細胞）、エンドグリン（内皮細胞）、フィブロネクチン（分化している細胞、治癒している組織）、およびＦｌｔ−１（内皮細胞）、ＧＦＡＰ（アストロサイト）を含むが、これらに限定されない。
【０３１７】
ある特定の適応症では、遺伝子療法ベクターの投与後、特定の時点で転写を活性化することが望ましい。これは、ホルモンまたはサイトカイン調節可能であるもののようなプロモーターを用いて行われる。使用することができるサイトカインおよび炎症性タンパク質応答性プロモーターは、ＫおよびＴキニノーゲン（Ｋａｇｅｙａｍａら、（１９８７年）Ｊ．  Ｂｉｏｌ．  Ｃｈｅｍ．、２６２巻、２３４５〜２３５１頁）、ｃ−ｆｏｓ、ＴＮＦ−アルファ、Ｃ反応性タンパク質（Ａｒｃｏｎｅら、（１９８８年）Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、１６巻（８号）、３１９５〜３２０７頁）、ハプトグロビン（Ｏｌｉｖｉｅｒｏら、（１９８７年）ＥＭＢＯ  Ｊ．、６巻、１９０５〜１９１２頁）、血清アミロイドＡ２、Ｃ／ＥＢＰアルファ、ＩＬ−１、ＩＬ−６（ＰｏｌｉおよびＣｏｒｔｅｓｅ、（１９８９年）Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔ’ｌ  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ、８６巻、８２０２〜８２０６頁）、補体Ｃ３（Ｗｉｌｓｏｎら、（１９９０年）Ｍｏｌ．  Ｃｅｌｌ．  Ｂｉｏｌ．、６１８１〜６１９１頁）、ＩＬ−８、アルファ１酸性糖タンパク質（ＰｒｏｗｓｅおよびＢａｕｍａｎｎ、（１９８８年）Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ、８巻、４２〜５１頁）、アルファ１アンチトリプシン、リポタンパク質リパーゼ（Ｚｅｃｈｎｅｒら、Ｍｏｌ．  Ｃｅｌｌ．  Ｂｉｏｌ．、２３９４〜２４０１頁、１９８８年）、アンジオテンシノーゲン（Ｒｏｎら、（１９９１年）Ｍｏｌ．  Ｃｅｌｌ．  Ｂｉｏｌ．、２８８７〜２８９５頁）、フィブリノーゲン、ｃ−ｊｕｎ（ホルボールエステル、ＴＮＦ−アルファ、ＵＶ照射、レチノイン酸、および過酸化水素により誘導可能）、コラゲナーゼ（ホルボールエステルおよびレチノイン酸により誘導される）、メタロチオネイン（重金属およびグルココルチコイド誘導性）、ストロメリシン（ホルボールエステル、インターロイキン−１およびＥＧＦにより誘導可能）、アルファ２マクログロブリンおよびアルファ１アンチキモトリプシンを含む。他のプロモーターは、例えば、ＳＶ４０、ＭＭＴＶ、ヒト免疫不全ウイルス（ＭＶ）、モロニーウイルス、ＡＬＶ、エプスタイン・バーウイルス、ラウス肉腫ウイルス、ヒトアクチン、ミオシン、ヘモグロビン、およびクレアチンを含む。
【０３１８】
単独でのまたは別のものとの組み合わせでの上記プロモーターのいずれかが、所望される作用に依存して有用でありうると、予想される。プロモーター、および他の調節エレメントは、それらが所望の細胞または組織において機能的であるように選択される。加えて、プロモーターのこのリストを徹底的なものとも限定的なものとも見なすべきではなく、他のプロモーターが、本明細書で開示されるプロモーターおよび方法とともに使用される。
【実施例】
【０３１９】
（実施例１：ＭＵＣ１結合Ｃｅｎｔｙｒｉｎの生成）
本開示のＭＵＣ１結合タンパク質足場（Ｃｅｎｔｙｒｉｎとも称される）を、ＭＵＣ１−Ｃ／細胞外ドメイン（ＭＵＣ１−Ｃ／ＥＣＤ）を含む、好ましい標的であるＭＵＣ１に特異的に結合するように、生成することができる。
【０３２０】
本開示のＭＵＣ１結合Ｃｅｎｔｙｒｉｎは、Ｃｉｓディスプレイプロトコールを使用して同定および／または単離することができる。ＲｅｐＡタンパク質のＤＮＡ結合特性に基づき、ＣＩＳディスプレイは、提示されるライブラリーメンバーの各々と、そのメンバーをコードする二本鎖ＤＮＡ（ｄｓＤＮＡ）鋳型との間の動作可能な連結によってポリペプチドライブラリーのパニングを助長する。典型的なライブラリーは、約１０１３のメンバーを有しうる。Ｃｉｓディスプレイは、無細胞系であることが多い。ｄｓＤＮＡ鋳型を使用するため、産物回収およびライブラリー構築をＰＣＲに基づく戦略により遂行することができる。候補ＭＵＣ１結合Ｃｅｎｔｙｒｉｎをアフィニティー選択によりパニングする。溶離された複合体を単純ＰＣＲにより再生する。
【０３２１】
この方法の概要については、図３（およびｉｓｏｇｅｎｉｃａ．ｃｏｍ）を参照されたい。Ｄｉｅｍら、２０１４年  ＰＥＤＳ  ２７巻、４１９〜４２９頁も参照されたい（この内容は、それら全体が参照により援用される）。
【０３２２】
標的の検証およびパニング
標的の検証：Ｐｏｓｅｉｄａにより提供された標的材料（Ｍｕｃ１−Ｃ融合タンパク質）をプルダウン実験で試験して、パニング手順におけるそれらの有用性を検証する。
【０３２３】
ｉｎ  ｖｉｔｒｏビオチン化Ｍｕｃ１−Ｃ−Ａｖｉｔａｇ融合タンパク質については、試料を、ストレプトアビジンまたはニュートラアビジンでコーティングされた磁性ビーズとともにインキュベートする。次いで、ビーズを磁石によって反応から取り出し、洗浄する。インキュベーション前の試料、ビーズインキュベーション後の上清、およびビーズ上に固定化された材料という、３タイプの試料を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析によって比較する。試薬の予測分子量（ＭＷ）に対応するバンドが、すべての試料において検出できるはずである。上清試料のタンパク質含有量（バンド強度）の低減は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ試料ローディング緩衝液中で煮沸することによって磁性ビーズから取り出される正確なＭＷのタンパク質の増加と一致するはずである。
【０３２４】
ＭＵＣ１−Ｃ−Ｆｃ融合タンパク質については、ビオチン化試薬の基質に対する比を変えてアミン反応性化学（非部位特異的）によってタンパク質をビオチン化する。クエンチし、過剰なビオチン化試薬を除去した後、上記の実験に類似した磁性ビーズプルダウン実験を使用して、反応のビオチン化効率を確認する。
【０３２５】
【表１】
2019528044.tif 000045
【０３２６】
【化４３】
2019528044.tif 000046
【０３２７】
２つの陽性ｓｃＦｖ対照は、タンパク質精製および検出タグを有する、可溶性組換えタンパク質を含む。ｓｃＦｖを使用して、細胞結合実験において対照ＥＣＤ−タグ融合タンパク質および参照を適格とする（ｑｕａｌｉｆｙ）。
【０３２８】
ＭＵＣ１−Ｃトランスフェクト細胞株を、マッチするＭＵＣ１−Ｃ陰性宿主細胞対照とともに、上述のｓｃＦｖのさらなる品質管理（ＱＣ）に、ならびに細胞膜提示Ｍｕｃ１−Ｃに対して組換えタンパク質結合Ｃｅｎｔｙｒｉｎの反応性を確認するための手段に、使用する。ＭＵＣ１−Ｃトランスフェクト細胞株およびマッチするＭＵＣ１−Ｃ陰性宿主細胞対照株を、下で説明するような使用のために増殖し、貯蔵（保管）する。
【０３２９】
組換えタンパク質でのｓｃＦｖの検証：プレートまたはビーズ上に直接固定化されているまたはストレプトアビジン捕捉によって固定化されている抗原形態両方へのｓｃＦｖの結合を試験することにより、ＭＵＣ１−Ｃ融合タンパク質およびｓｃＦｖを互いに対して品質管理する。ＥＬＩＳＡに基づく方法（抗３×ＦＬＡＧ−ＨＲＰ抗体コンジュゲート、発色基質検出）またはＦＡＣＳに基づく方法（抗３×ＦＬＡＧ−ＦＩＴＣ抗体直接検出）をプレートまたはビーズについてそれぞれ使用して、結合を検出する。
【０３３０】
組換え細胞株でのｓｃＦｖの検証：ＭＵＣ１−Ｃ陽性および陰性細胞をｓｃＦｖとともにインキュベートする。洗浄ステップ後、細胞を、直接検出のために抗３×ＦＬＡＧ−ＦＩＴＣ抗体とともにインキュベートし、フローサイトメーターを使用して分析する。結果に依存して、一方または両方のｓｃＦｖを、後続のＣｅｎｔｙｒｉｎ細胞結合スクリーニングにおいて陽性対照として使用する。
ベンチマークｓｃＦｖ：Ｅ．ｃｏｌｉ宿主、ペリプラズムでの産生、修飾なし、可溶性形態として産生される。
【０３３１】
パニング：ＣｅｎｔｙｒｉｎライブラリーＤＮＡを、適切な条件下、２４回までの選択のキャンペーン（ｃａｍｐａｉｇｎ）において、５ラウンドのＣＩＳディスプレイパニングに付す。選択は、ブロッキング剤としてヘパリンを用いるおよび用いない両方での、両方のＭＵＣ１−Ｃ標的形式の使用を構成する。
【０３３２】
一次スクリーニング
単一濃度結合ＥＬＩＳＡによるヒットの同定
クローンアウト（ｃｌｏｎｅ  ｏｕｔ）：ＣＩＳディスプレイ選択の産物をＰＣＲにより増幅し、発現ベクターにクローニングし、Ｅ．ｃｏｌｉに形質転換する。産生されたクローンを９６ウェルプレート（キャンペーン規模に依存して１選択アウトプット当たり少なくとも１プレート）に採取する。
【０３３３】
一次スクリーニング：単一濃度結合ＥＬＩＳＡを使用して陽性ヒットを同定する。クローンを増殖させ、発現させ、細菌を溶解する。溶解物をひとまとめにして希釈し、ＥＬＩＳＡにより標的抗原への結合についてスクリーニングする。バックグラウンドより有意なシグナルを提示するクローンを候補として選択する。
【０３３４】
シークエンシング：一次候補をシークエンシングし、データを多様性について分析して、配列ファミリーおよび／または反復クローンを同定する。
【０３３５】
二次スクリーニング：二次ＥＬＩＳＡスクリーニングは、代替標的形式（ＭＵＣ１−Ｃ−Ａｖｉｔａｇ選択クローン対ＭＵＣ１−Ｃ−Ｆｃ、またはその逆も同様）への特異性／結合を試験するために、適切でありうる。
【０３３６】
単一濃度細胞結合（ＦＡＣＳ）による関連Ａｇ結合クローンの同定
三次スクリーニング：ＣＡＲＴｙｒｉｎ機能スクリーニングの最初の代替物として、膜提示形態のＭＵＣ１−Ｃへの組換えタンパク質結合物質の到達可能性を、ＦＡＣＳを使用して確認する。ＭＵＣ１−Ｃがトランスフェクトされた宿主細胞または対照宿主細胞をＥＬＩＳＡにおいてＣｅｎｔｙｒｉｎ結合組換えタンパク質の単一希釈物とともにインキュベートする。ｓｃＦｖの細胞への結合を、二次抗３×ＦＬＡＧ−ＦＩＴＣコンジュゲートとのインキュベーション、続いてのフローサイトメーターでの分析により検出する。前の手順でトランスフェクト細胞に選択的に結合すると決定された一方または両方のｓｃＦｖは、陽性対照としての役割を果すことができる。
【０３３７】
会合／解離速度パニングおよびスクリーニング
パニング：以前のスクリーニングラウンドの結果および必要とされる所望のアフィニティーに依存して、さらなるパニングラウンドを行ってもよい。これらのさらなるパニングラウンドは、アフィニティーをより緩徐な解離速度にさせるために非固定化抗原を組み込む洗浄ステップを含む場合がある。
【０３３８】
スクリーニング：スクリーニング、シークエンシング、二次スクリーニング、および一次スクリーニングと同等の三次スクリーニング（必要に応じて）を、例えば、少なくとも９ラウンドのパニングおよびスクリーニングにわたって反復することができる。
【０３３９】
生物物理学的分析
生物物理学的分析：Ｃｅｎｔｙｒｉｎ材料の小規模なプレートベースのＨｉｓタグアフィニティー精製を可能にするために、抗原選択１回当たり９６までの固有ヒットを再整列（ｒｅ−ａｒｒａｙ）させ、再増殖させてもよい。精製された材料をサイズ排除クロマトグラフィーに付して、どの候補が単量体（非凝集）タンパク質として挙動するかを決定することになる。
【０３４０】
アフィニティーの順位付け：候補クローンの解離速度を、ＦｏｒｔｅＢｉｏ  Ｏｃｔｅｔ  Ｒｅｄシステムを使用してＢＬＩ（バイオレイヤー干渉法（Ｂｉｏ−Ｌａｙｅｒ  Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｍｅｔｒｙ））により分析する。これらの結果により、候補を解離速度によって順位付けすることができる。
【０３４１】
細胞結合アフィニティーの決定：ＦＡＣＳでの全用量設定細胞結合（ｆｕｌｌ  ｄｏｓｅ−ｔｉｔｒａｔｉｏｎ  ｃｅｌｌ  ｂｉｎｄｉｎｇ）を使用して、細胞結合に基づいて候補を順位付けする。これにより、細胞表面で発現された天然抗原への用量依存性結合が確認され、見掛けのＫｄ値が得られることになる。これを遂行するために、１０〜２０の候補クローンについてのタンパク質を５０ｍＬ規模で産生し、Ｈｉｓタグアフィニティークロマトグラフィーにより精製する。タンパク質濃度が分かっている希釈系列を使用してＦＡＣＳにより用量応答曲線を生成して、標的細胞への候補の結合を順位付けする。
【０３４２】
組換え標的アフィニティーの決定
固定化組換えタンパク質標的に対するＢＬＩを使用して、選ばれた候補Ｃｅｎｔｙｒｉｎについて最終的な結合アフィニティー定数を生成する。データは、候補Ｃｅｎｔｙｒｉｎとそれらが選択された対象である組換え標的との間の結合強度の尺度である、解離速度（ｋｄ）およびＫｄ値を提供する。
【０３４３】
（実施例２：ヒト汎Ｔ細胞へｐｉｇｇｙＢａｃにより組み込まれたｉＣ９安全スイッチの発現および機能）
Ａｍａｘａ  ４Ｄヌクレオフェクターを使用して、４つのｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンのうちの１つをヒト汎Ｔ細胞にヌクレオフェクトした。「模擬」条件を受ける修飾Ｔ細胞には、空のｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンをヌクレオフェクトした。修飾Ｔ細胞は、治療剤（ＣＡＲＴｙｒｉｎをコードする配列）のみを含有するｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾン、または組み込まれているｉＣ９配列と治療剤（ＣＡＲＴｙｒｉｎをコードする配列）とを含有するｐｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンのいずれかを受けた。
【０３４４】
図６は、リガンド結合領域と、リンカーと、切断型カスパーゼ９ポリペプチドとを含有するｉＣ９安全スイッチの模式図を提供するものである。具体的には、ｉＣ９ポリペプチドは、３６位にフェニルアラニン（Ｆ）からバリン（Ｖ）への置換（Ｆ３６Ｖ）を含むＦＫ５０６結合タンパク質１２（ＦＫＢＰ１２）ポリペプチドを含む、リガンド結合領域を含有する。ｉＣ９ポリペプチドのＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＶＱＶＥＴＩＳＰＧＤＧＲＴＦＰＫＲＧＱＴＣＶＶＨＹＴＧＭＬＥＤＧＫＫＶＤＳＳＲＤＲＮＫＰＦＫＦＭＬＧＫＱＥＶＩＲＧＷＥＥＧＶＡＱＭＳＶＧＱＲＡＫＬＴＩＳＰＤＹＡＹＧＡＴＧＨＰＧＩＩＰＰＨＡＴＬＶＦＤＶＥＬＬＫＬＥ（配列番号３９）を含むアミノ酸配列によりコードされる。ｉＣ９ポリペプチドのＦＫＢＰ１２ポリペプチドは、ＧＧＧＧＴＣＣＡＧＧＴＣＧＡＧＡＣＴＡＴＴＴＣＡＣＣＡＧＧＧＧＡＴＧＧＧＣＧＡＡＣＡＴＴＴＣＣＡＡＡＡＡＧＧＧＧＣＣＡＧＡＣＴＴＧＣＧＴＣＧＴＧＣＡＴＴＡＣＡＣＣＧＧＧＡＴＧＣＴＧＧＡＧＧＡＣＧＧＧＡＡＧＡＡＡＧＴＧＧＡＣＡＧＣＴＣＣＡＧＧＧＡＴＣＧＣＡＡＣＡＡＧＣＣＣＴＴＣＡＡＧＴＴＣＡＴＧＣＴＧＧＧＡＡＡＧＣＡＧＧＡＡＧＴＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＴＧＧＧＡＧＧＡＡＧＧＣＧＴＧＧＣＡＣＡＧＡＴＧＴＣＡＧＴＣＧＧＣＣＡＧＣＧＧＧＣＣＡＡＡＣＴＧＡＣＣＡＴＴＡＧＣＣＣＴＧＡＣＴＡＣＧＣＴＴＡＴＧＧＡＧＣＡＡＣＡＧＧＣＣＡＣＣＣＡＧＧＧＡＴＣＡＴＴＣＣＣＣＣＴＣＡＴＧＣＣＡＣＣＣＴＧＧＴＣＴＴＣＧＡＴ  ＧＴＧＧＡＡＣＴＧＣＴＧＡＡＧＣＴＧＧＡＧ（配列番号４０）を含む核酸配列によりコードされる。ｉＣ９ポリペプチドのリンカー領域は、ＧＧＧＧＳ（配列番号４１）を含むアミノ酸、およびＧＧＡＧＧＡＧＧＡＧＧＡＴＣＣ（配列番号４２）を含む核酸配列によりコードされる。ｉＣ９ポリペプチドの切断型カスパーゼ９をコードする核酸配列は、ＧＦＧＤＶＧＡＬＥＳＬＲＧＮＡＤＬＡＹＩＳＬＭＥＰＣＧＨＣＬＩＩＮＮＶＮＦＣＲＥＳＧＬＲＴＲＴＧＳＮＩＤＣＥＫＬＲＲＲＦＳＳＬＨＦＭＶＥＶＫＧＤＬＴＡＫＫＭＶＬＡＬＬＥＬＡＱＱＤＨＧＡＬＤＣＣＶＶＶＩＬＳＨＧＣＱＡＳＨＬＱＦＰＧＡＶＹＧＴＤＧＣＰＶＳＶＥＫＩＶＮＩＦＮＧＴＳＣＰＳＬＧＧＫＰＫＬＦＦＩＱＡＣＧＧＥＱＫＤＨＧＦＥＶＡＳＴＳＰＥＤＥＳＰＧＳＮＰＥＰＤＡＴＰＦＱＥＧＬＲＴＦＤＱＬＤＡＩＳＳＬＰＴＰＳＤＩＦＶＳＹＳＴＦＰＧＦＶＳＷＲＤＰＫＳＧＳＷＹＶＥＴＬＤＤＩＦＥＱＷＡＨＳＥＤＬＱＳＬＬＬＲＶＡＮＡＶＳＶＫＧＩＹＫＱＭＰＧＣＮＦＬＲＫＫＬＦＦＫＴＳ（配列番号４３）を含むアミノ酸によりコードされる。ｉＣ９ポリペプチドの切断型カスパーゼ９をコードする核酸配列は、ＴＴＴＧＧＧＧＡＣＧＴＧＧＧＧＧＣＣＣＴＧＧＡＧＴＣＴＣＴＧＣＧＡＧＧＡＡＡＴＧＣＣＧＡＴＣＴＧＧＣＴＴＡＣＡＴＣＣＴＧＡＧＣＡＴＧＧＡＡＣＣＣＴＧＣＧＧＣＣＡＣＴＧＴＣＴＧＡＴＣＡＴＴＡＡＣＡＡＴＧＴＧＡＡＣＴＴＣＴＧＣＡＧＡＧＡＡＡＧＣＧＧＡＣＴＧＣＧＡＡＣＡＣＧＧＡＣＴＧＧＣＴＣＣＡＡＴＡＴＴＧＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＡＧＧＴＴＣＴＣＴＡＧＴＣＴＧＣＡＣＴＴＴＡＴＧＧＴＣＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＧＧＧＡＴＣＴＧＡＣＣＧＣＣ���ＡＧＡＡＡＡＴＧＧＴＧＣＴＧＧＣＣＣＴＧＣＴＧＧＡＧＣＴＧＧＣＴＣＡＧＣＡＧＧＡＣＣＡＴＧＧＡＧＣＴＣＴＧＧＡＴＴＧＣＴＧＣＧＴＧＧＴＣＧＴＧＡＴＣＣＴＧＴＣＣＣＡＣＧＧＧＴＧＣＣＡＧＧＣＴＴＣＴＣＡＴＣＴＧＣＡＧＴＴＣＣＣＣＧＧＡＧＣＡＧＴＧＴＡＣＧＧＡＡＣＡＧＡＣＧＧＣＴＧＴＣＣＴＧＴＣＡＧＣＧＴＧＧＡＧＡＡＧＡＴＣＧＴＣＡＡＣＡＴＣＴＴＣＡＡＣＧＧＣＡＣＴＴＣＴＴＧＣＣＣＴＡＧＴＣＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＧＣＣＡＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＴＣＣＡＧＧＣＣＴＧＴＧＧＣＧＧＧＧＡＡＣＡＧＡＡＡＧＡＴＣＡＣＧＧＣＴＴＣＧＡＧＧＴＧＧＣＣＡＧＣＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＡＧＧＡＣＧＡＡＴＣＡＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＡＣＣＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＴＧＣＡＡＣＴＣＣＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＧＡＣＣＴＴＴＧＡＣＣＡＧＣＴＧＧＡＴＧＣＴＡＴＣＴＣＡＡＧＣＣＴＧＣＣＣＡＣＴＣＣＴＡＧＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＧＴＧＴＣＴＴＡＣＡＧＴＡＣＣＴＴＣＣＣＡＧＧＣＴＴＴＧＴＣＴＣＡＴＧＧＣＧＣＧＡＴＣＣＣＡＡＧＴＣＡＧＧＧＡＧＣＴＧＧＴＡＣＧＴＧＧＡＧＡＣＡＣＴＧＧＡＣＧＡＣＡＴＣＴＴＴＧＡＡＣＡＧＴＧＧＧＣＣＣＡＴＴＣＡＧＡＧＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＧＴＧＧＣＡＡＡＣＧＣＴＧＴＣＴＣＴＧＴＧＡＡＧＧＧＣＡＴＣＴＡＣＡＡＡＣＡＧＡＴＧＣＣＣＧＧＧＴＧＣＴＴＣＡＡＴＴＴＴＣＴＧＡＧＡＡＡＧＡＡＡＣＴＧＴＴＣＴＴＴＡＡＧＡＣＴＴＣＣ（配列番号４４）を含む核酸配列によりコードされる。
【０３４５】
ｉＣ９安全スイッチを試験するために、４つの修飾されたＴ細胞の各々を、０、０．１ｎＭ、１ｎＭ、１０ｎＭ、１００ｎＭ、または１０００ｎＭのＡＰ１９０３（ＡＰ１９０３は誘導剤）とともに２４時間インキュベートした。蛍光インターカレーターである７−アミノアクチノマイシンＤ（７−ＡＡＤ）を、アポトーシスを受ける細胞のマーカーとして使用して、フローサイトメトリーにより、生存度を評価した。
【０３４６】
細胞生存度は、１２日目に評価した（図７を参照されたい）。データは、ｉＣ９構築物を含有する細胞における誘導剤の濃度増加に伴って右下から左上象限への細胞集団のシフトを示すが、この効果は、ｉＣ９構築物を欠く細胞（ＣＡＲＴｙｒｉｎのみを受けたもの）では観察されず、これらの細胞は、誘導剤の濃度に関係なく、これら２つのエリア間に均等に分布している。さらに、細胞生存度を１９日目に評価した（図７を参照されたい）。データは、図８（ヌクレオフェクション後１２日目）に示されているのと同じ傾向を見せるが、左上象限への集団のシフトは、このより遅い時点（ヌクレオフェクション後１９日目）でのほうが顕著である。
【０３４７】
凝集結果の定量を行った。それを図９に提供する。この図９は、１２日目（図７および左のグラフ）または１９日目（図８および右のグラフ）のいずれかにおける細胞生存パーセントに対するｉＣ９安全スイッチの有意な影響を、各々の修飾された細胞型についてｉＣ９スイッチの誘導剤（ＡＰ１９０３）の濃度の関数として示す。ｉＣ９安全スイッチの存在は、大多数の細胞において１２日目までにアポトーシスを誘導し、その効果は、１９日目までによりいっそう著しくなる。
【０３４８】
この研究の結果は、ｉＣ９安全スイッチが、誘導剤（例えば、ＡＰ１９０３）と接触すると活性細胞の除去に極めて有効であることを示す。なぜなら、ＡＰ１９０３は、本研究の最低濃度（０．１ｎＭ）ででさえアポトーシスを誘導するからである。さらに、ｉＣ９安全スイッチをトリシストロン性ベクターの一部として機能的に発現させることができる。
【０３４９】
（実施例３：ＭＵＣ１−ｓｃＦｖ  ＣＡＲの生成および機能）
ＭＵＣ１のエピトープに特異的に結合する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有するキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を生成した。例示的なＭＵＣ１−ｓｃＦｖ  ＣＡＲの図を図１１に示す。
【０３５０】
アミノ酸配列ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＥＳＬＫＬＳＣＥＳＮＥＹＥＦＰＳＨＤＭＳＷＶＲＫＴＰＥＫＲＬＥＬＶＡＡＩＮＳＤＧＧＳＴＹＹＰＤＴＭＥＲＲＦＩＩＳＲＤＮＴＫＫＴＬＹＬＱＭＳＳＬＲＳＥＤＴＡＬＹＹＣＶＲＬＹＹＧＮＶＭＤＹＷＧＱＧＴＳＶＴＶＳＳ（配列番号４）を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列ＤＶＶＭＴＱＴＰＬＳＬＰＶＳＬＧＤＱＡＳＩＳＣＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＹＷＹＬＱＫＰＧＱＳＰＫＬＬＩＹＫＶＳＮＲＦＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＫＩＳＲＶＥＡＥＤＬＧＶＹＦＣＳＱＳＴＨＶＰＬＴＦＧＡＧＴＫＬＥＬＫ（配列番号５）を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ｂ」ＣＡＲを生成した。
【０３５１】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化４４】
2019528044.tif 000047
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３５２】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化４５】
2019528044.tif 000048
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３５３】
アミノ酸配列ＱＶＱＬＫＥＳＧＰＧＬＶＡＰＳＱＳＬＳＭＴＣＴＶＳＧＦＳＬＴＴＹＧＶＨＷＶＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＬＶＶＩＷＳＤＧＳＴＴＹＮＳＰＬＫＳＲＬＳＩＳＲＤＮＳＫＳＱＶＦＬＫＭＮＳＬＱＡＤＤＴＡＩＹＹＣＡＫＮＹＬＧＳＬＤＹＷＧＱＧＴＳＶＴＶＳＳ（配列番号８）を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列ＤＶＶＬＴＱＴＰＬＳＬＰＶＳＬＧＤＱＡＳＩＳＣＲＳＳＱＳＬＶＨＮＮＧＤＴＹＬＨＷＹＬＱＫＰＧＱＳＰＫＬＬＩＹＫＶＳＮＲＦＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＦＫＩＳＲＶＥＡＥＤＬＧＶＹＦＣＳＱＴＴＨＶＰＬＴＦＧＡＧＴＫＬＥＬＫ（配列番号９）を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｋ２Ｂ」ＣＡＲを生成した。
【０３５４】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化４６】
2019528044.tif 000049
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｋ２Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３５５】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化４７】
2019528044.tif 000050
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｋ２Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３５６】
アミノ酸配列ＱＩＱＬＶＱＳＧＰＥＬＫＫＰＧＥＴＶＫＴＳＣＫＡＳＧＹＴＦＴＧＹＳＭＨＷＶＫＱＡＰＧＫＧＬＫＷＭＧＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧＲＦＡＬＳＬＥＴＳＡＳＴＴＹＬＱＩＮＮＬＫＮＥＤＴＡＴＹＦＣＶＲＧＴＧＧＤＤＷＧＱＧＴＴＬＴＶＳＳＡＫＴＴＰ（配列番号１２）を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列ＤＶＶＭＴＱＴＰＬＳＬＰＶＳＬＧＤＱＡＳＩＳＣＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＨＷＹＬＱＫＰＧＱＳＰＫＬＬＩＹＫＶＳＮＲＦＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＫＩＮＲＶＥＡＥＤＬＧＶＹＦＣＳＱＧＴＨＶＰＰＴＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫＲＡＤＡＡＰＴＶ（配列番号１３）を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｋ２Ａ」ＣＡＲを生成した。
【０３５７】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化４８】
2019528044.tif 000051
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｋ２Ａ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３５８】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化４９】
2019528044.tif 000052
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｋ２Ａ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３５９】
アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化５０】
2019528044.tif 000053
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化５１】
2019528044.tif 000054
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ａ」ＣＡＲを生成した。
【０３６０】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化５２】
2019528044.tif 000055
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ａ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３６１】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化５３】
2019528044.tif 000056
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ａ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３６２】
アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化５４】
2019528044.tif 000057
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化５５】
2019528044.tif 000058
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ｃ」ＣＡＲを生成した。
【０３６３】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化５６】
2019528044.tif 000059
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ｃ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３６４】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化５７】
2019528044.tif 000060
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｆ１Ｃ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３６５】
アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化５８】
2019528044.tif 000061
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化５９】
2019528044.tif 000062
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｍ１Ｂ」ＣＡＲを生成した。
【０３６６】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化６０】
2019528044.tif 000063
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｍ１Ｂ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３６７】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化６１】
2019528044.tif 000064
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｍ１Ｂ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３６８】
アミノ酸配列（ＣＤＲ配列は、太字かつ下線付きである）
【化６２】
2019528044.tif 000065
を含む重鎖可変領域と、アミノ酸配列
【化６３】
2019528044.tif 000066
を含む軽鎖可変領域とを有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｍ１Ａ」ＣＡＲを生成した。
【０３６９】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、重鎖可変領域を含む配列と軽鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化６４】
2019528044.tif 000067
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｍ１Ａ−ＨＬ」ＣＡＲを生成した。
【０３７０】
アミノ酸配列（配列中の下線付きのアミノ酸は、軽鎖可変領域を含む配列と重鎖可変領域を含む配列との間のリンカーを構成する）
【化６５】
2019528044.tif 000068
を有する一本鎖抗体を含む抗原認識領域を有する「Ｍ１Ａ−ＬＨ」ＣＡＲを生成した。
【０３７１】
最初の研究として、ＭＵＣ１発現を異なる細胞型において評価した（図１３を参照されたい）。この研究に含めた細胞：Ｋ５６２細胞（不死化ヒト慢性骨髄性白血病細胞）、ラージ細胞（がんのモデルとして使用されるヒト造血細胞株）、ＭＵＣ１−Ｃを発現するように修飾されたラージ細胞、活性化Ｔ細胞、およびＲＰＭＩ８２２６細胞（ヒト末梢血Ｂ細胞形質細胞腫／骨髄腫細胞株）。これらの細胞の各々におけるＭＵＣ１発現を、抗ＭＵＣ１−Ｎ抗体での染色により評価した。
【０３７２】
この実施例に記載のＭＵＣ１−ｓｃＦｖ  ＣＡＲの各々の機能を、Ｋ５６２細胞、ラージ細胞およびＲＰＭＩ８２２６細胞（「８２２６」）細胞において、非修飾条件で、またはＭＵＣ１構築物（完全長またはＭＵＣ１−Ｃのいずれか）をトランスフェクトして修飾Ｋ５６２細胞、修飾ラージ細胞および修飾８２２６細胞を生成した後に、アッセイした。ＭＵＣ１−ｓｖＦｃ  ＣＡＲの各々についての機能を、各細胞型を脱顆粒させるＣＡＲの能力により測定した。脱顆粒は、ＣＤ１１７ａを発現する全細胞のパーセント（ＣＤ１１７ａ＋細胞の百分率）により測定した。
【０３７３】
Ｆ１Ｃ−ＨＬ、Ｍ１Ａ−ＬＨおよびＫ２Ｂ−ＨＬ  ＭＵＣ１−ｓｃＦｖ  ＣＡＲをさらに試験して、エピトープ結合を決定した。図１５に示されているように、Ｆ１Ｃ−ＨＬは、非修飾細胞、完全長ＭＵＣ１を受けた細胞、および細胞外ＭＵＣ１−Ｃ構築物を受けた細胞に結合する。Ｍ１Ａ−ＬＨは、完全長ＭＵＣ１に特異的に結合する。Ｋ２Ｂ−ＨＬは、細胞外ＭＵＣ１−Ｃ構築物に特異的に結合する。
【０３７４】
参照による組み入れ
あらゆる相互参照または関連特許または出願を含む、本明細書に引用したすべての文献は、明確な除外または別段の限定がない限り、その全体がここに参照により本明細書に援用される。いずれの文献の引用も、それが、本明細書で開示または特許請求するいずれかの発明に対する先行技術であることを認めるものではなく、それが、単独でまたはいずれかの他の参照文献（単数もしくは複数）との組み合わせで、いずれかのそのような発明を教示、提案または開示していることを認めるものでもない。さらに、本書における用語のいずれかの意味または定義が、参照により援用される文献における同じ用語のいずれかの意味または定義と矛盾する場合には、本書における用語に割り当てられた意味または定義が優先するものとする。
【０３７５】
他の実施形態
本開示の特定の実施形態を例証し、説明してきたが、本開示の趣旨および範囲を逸脱することなく、様々な他の変更および修飾を行うことができる。添付の特許請求の範囲の範囲は、本開示の範囲内であるすべてのそのような変更および修飾を含む。
【図１】
2019528044.tif 000069
【図２】
2019528044.tif 000070
【図３】
2019528044.tif 000071
【図４】
2019528044.tif 000072
【図５】
2019528044.tif 000073
【図６】
2019528044.tif 000074
【図７】
2019528044.tif 000075
【図８】
2019528044.tif 000076
【図９】
2019528044.tif 000077
【図１０】
2019528044.tif 000078
【図１１】
2019528044.tif 000079
【図１２】
2019528044.tif 000080
【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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