【手続補正書】
【提出日】平成19年10月29日(2007.10.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体におけるアルツハイマー病の病態を認定するためのデータを収集するための方法であって、以下：
該被験体由来のＣＳＦサンプル中の少なくとも１種類のバイオマーカーを測定する工程であって、該少なくとも１種類のバイオマーカーが、Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））、Ｍ１６２０７．４（膵臓リボヌクレアーゼ）、Ｍ８９３８．５（Ｃ３ａ  ｄｅｓ−Ａｒｇ）、Ｍ３５１３．９（７Ｂ２  ＣＴ断片）、Ｍ８２９１．０（ユビキチン（ＣＴから−３ａａ））、Ｍ９８０２．４（ＥＡ−９２（ＣｈｒＡペプチド））、Ｍ１４０９２．７（グルタチオニル化トランスサイレチンＳ）、Ｍ１３９０４．７（トランスサイレチンＳ−Ｃｙｓ／Ｓ−ＣｙｓＧｌｙ）、Ｍ１２５４５．９、Ｍ８１８３．６（ユビキチン（ＣＴから−４ａａ））、Ｍ５２２７．４、Ｍ３６８７．０（セクレトニューリン（ＣｈｒＣ／ＳＧＩＩペプチド））、Ｍ３９０６．４  バソスタチンＩＩ（ＣｈｒＡペプチド）、Ｍ１４５６５．１（膵臓リボヌクレアーゼ）、Ｍ６５０９．６（クロモグラニンＢペプチド）、Ｍ４３２０．６（Ａ−β  １−４０）、Ｍ７２５８．２（クロモグラニンＢペプチド）、Ｍ２３４７７．４（プロスタグランジン−Ｄシンターゼ）、Ｍ４３５７．０（α−１−アンチキモトリプシンＣＴ断片）、Ｍ７６５３．２（オステオポンチンＣＴ断片）、Ｍ４８１２．５（ＶＧＦ（ＮＣＢＩ）ペプチド）、Ｍ４９８９．４（アセチル化チモシンβ−４）、およびＭ７７１８．８（リン酸化オステオポンチンＣＴ断片）からなる群から選択される、工程、
を包含し、該測定値は、アルツハイマー病の病態と相関関係付けされ得る、方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法であって、前記被験体由来の生体サンプル中の少なくとも１種類のさらなるバイオマーカーを測定する工程をさらに包含し、該少なくとも１種類のさらなるバイオマーカーが、Ｍ６４４６．３（アポリポタンパク質Ｃ−Ｉ）、Ｍ１７３４９．３（アポリポタンパク質Ａ−ＩＩ二量体）、Ｍ６０４６４．７（ヘモペキシン）、Ｍ１１７２５．７（β−２−ミクログロブリン）、Ｍ７８９３６．５（トランスフェリン）、Ｍ１３３４９．５（シスタチンＣ）、Ｍ６６４７９．２（アルブミン）およびＭ８５８５．９（ユビキチン）からなる群から選択される、方法。
【請求項３】
前記少なくとも１種類のバイオマーカーが、Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記少なくとも１種類のバイオマーカーが、Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））を含む、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
少なくとも以下の各バイオマーカー：
Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））、Ｍ１６２０７．４（膵臓リボヌクレアーゼ）、Ｍ８９３８．５（Ｃ３ａ  ｄｅｓ−Ａｒｇ）、Ｍ６４４６．３（アポリポタンパク質Ｃ−Ｉ）、Ｍ１３３４９．５（シスタチンＣ）が、測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
少なくとも以下の各バイオマーカー：
Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））およびＭ６４４６．３（アポリポタンパク質Ｃ−Ｉ）が、測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
少なくとも以下の各バイオマーカー：
Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））およびＭ１６２０７．４（膵臓リボヌクレアーゼ）が、測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記少なくとも１種類のバイオマーカーが、
ＳＥＬＤＩプローブの吸着剤表面上の該バイオマーカーを捕捉し、レーザー脱離イオン化質量分析法によって該捕捉されたバイオマーカーを検出すること
によって測定される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１種類のバイオマーカーが、イムノアッセイにより測定される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記相関関係付けが、ソフトウェア分類アルゴリズムにより実行される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
アルツハイマー病の病態がアルツハイマー病および非痴呆から選択される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記データは、前記病態に基づいて被験体の治療を管理することにおける使用が意図される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
アルツハイマー病の病態がアルツハイマー病、非痴呆、および非アルツハイマー性痴呆から選択される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項１４】
アルツハイマー病の病態がアルツハイマー病および非アルツハイマー性痴呆から選択される、請求項１、２、３または４のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
非アルツハイマー性痴呆がレヴィー小体を伴う痴呆および前頭側頭型痴呆から選択される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記吸着剤が陽イオン交換吸着剤である、請求項８に記載の方法。
【請求項１７】
前記吸着剤が生体特異的吸着剤である、請求項８に記載の方法。
【請求項１８】
前記吸着剤が疎水性吸着剤である、請求項８に記載の方法。
【請求項１９】
前記少なくとも１種類のバイオマーカーが、質量以外の検出手段により測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記少なくとも１種類のバイオマーカーが、イムノアッセイにより測定される、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記測定値がアルツハイマー病と相関する場合に、被験体の治療の管理が、該被験体へのコリンエステラーゼ阻害剤の投与を包含する、請求項１１に記載の方法。
【請求項２２】
被験体の管理の後に前記少なくとも１種類のバイオマーカーを測定する工程、
をさらに包含する、請求項１２に記載の方法。
【請求項２３】
キットであって、以下：
（ａ）固体支持体であって、該固体支持体は、該支持体に付着した少なくとも１種類の捕捉試薬を含み、該捕捉試薬が、Ｍ１２５４５．９（シスタチン（ＮＴから−８ａａ））と結合する、固体支持体、ならびに
（ｂ）被験体におけるアルツハイマー病の病態を認定するために有用な情報を収集するために、該固体支持体を使用してＭ１２５４５．９（シスタチン（ＮＴから−８ａａ））を検出するための、説明書、
を含む、キット。
【請求項２４】
請求項２３に記載のキットであって、
第２の固体支持体、および
被験体におけるアルツハイマー病の病態を認定するために有用な情報を収集するために、該第２の固体支持体を使用するための、説明書、
をさらに含み、該固体支持体は、該支持体に付着した捕捉試薬を含み、該捕捉試薬が、膵臓リボヌクレアーゼ（Ｍ１６２０７．４）、Ｃ３ａ  ｄｅｓ−Ａｒｇ（Ｍ８９３８．５）、シスタチンＣ（Ｍ１３３４９．５）、およびアポリポタンパク質Ｃ−Ｉ（Ｍ６４４６．３）からなる群から選択される少なくとも１種類のさらなるバイオマーカーと結合する、キット。
【請求項２５】
前記捕捉試薬を含む固体支持体が、ＳＥＬＤＩプローブである、請求項２３または２４のいずれかに記載のキット。
【請求項２６】
（ｃ）Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））を含む容器、
をさらに含む、請求項２３または２４のいずれかに記載のキット。
【請求項２７】
前記捕捉試薬が陽イオン交換吸着剤である、請求項２３に記載のキット。
【請求項２８】
（ｃ）陰イオン交換クロマトグラフィー吸着剤、
をさらに含む、請求項２３または２４のいずれかに記載のキット。
【請求項２９】
ソフトウェア製品であって、以下：
ａ．サンプルに起因するデータにアクセスするコードであって、該データは該サンプル中の少なくとも１種類のバイオマーカーの測定値を含み、該バイオマーカーは、Ｍ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））、Ｍ１６２０７．４（膵臓リボヌクレアーゼ）、Ｍ８９３８．５（Ｃ３ａ  ｄｅｓ−Ａｒｇ）、Ｍ３５１３．９（７Ｂ２  ＣＴ断片）、Ｍ８２９１．０（ユビキチン（ＣＴから−３ａａ））、Ｍ９８０２．４（ＥＡ−９２（ＣｈｒＡペプチド））、Ｍ１４０９２．７（グルタチオニル化トランスサイレチンＳ）、Ｍ１３９０４．７（トランスサイレチンＳ−Ｃｙｓ／Ｓ−ＣｙｓＧｌｙ）、Ｍ１２５４５．９、Ｍ８１８３．６（ユビキチン（ＣＴから−４ａａ））、Ｍ５２２７．４、Ｍ３６８７．０（セクレトニューリン（ＣｈｒＣ／ＳＧＩＩペプチド））、Ｍ３９０６．４  バソスタチンＩＩ（ＣｈｒＡペプチド）、Ｍ６５０９．６（クロモグラニンＢペプチド）、Ｍ４３２０．６（Ａ−β  １−４０）、Ｍ７２５８．２（クロモグラニンＢペプチド）、Ｍ２３４７７．４（プロスタグランジン−Ｄシンターゼ）、Ｍ４３５７．０（α−１−アンチキモトリプシンＣＴ断片）、Ｍ７６５３．２（オステオポンチンＣＴ断片）、Ｍ４８１２．５（ＶＧＦ（ＮＣＢＩ）ペプチド）、Ｍ４９８９．４（アセチル化チモシンβ−４）、およびＭ７７１８．８（リン酸化オステオポンチンＣＴ断片）からなる群から選択される、コード；ならびに
ｂ．該サンプルのアルツハイマー病の病態を該測定値の関数として分類する分類アルゴリズムを実行するコード、
を備える、ソフトウェア製品。
【請求項３０】
請求項２９に記載のソフトウェア製品であって、前記分類アルゴリズムが、Ｍ６４４６．３（アポリポタンパク質Ｃ−Ｉ）、Ｍ１７３４９．３（アポリポタンパク質Ａ−ＩＩ二量体）、Ｍ６０４６４．７（ヘモペキシン）、Ｍ１１７２５．７（β−２−ミクログロブリン）、Ｍ７８９３６．５（トランスフェリン）、Ｍ１３３４９．５（シスタチンＣ）、Ｍ６６４７９．２（アルブミン）およびＭ８５８５．９（ユビキチン）からなる群から選択される少なくとも１種類のさらなるバイオマーカーの前記測定値の関数として前記サンプルの前記アルツハイマー病の病態を分類する、ソフトウェア製品。
【請求項３１】
単離された改変シスタチンＣポリペプチドであって、該改変シスタチンＣポリペプチドは配列番号４における下線を付された配列のアミノ酸配列を有する、単離された改変シスタチンＣポリペプチド。
【請求項３２】
被験体のアルツハイマー病の病態を認定するためのデータを収集するための方法であって、以下：
該被験体由来のＣＳＦサンプル中の少なくとも１種類の改変シスタチンＣバイオマーカーを測定する工程であって、該少なくとも１種類の改変シスタチンＣバイオマーカーが配列番号４における下線を付された配列のアミノ酸配列を有する、工程、
を包含し、該測定値は、アルツハイマー病の病態と相関関係付けされ得る、方法。
【請求項３３】
シスタチンＣ（Ｍ１３４１６）を測定する工程をさらに包含する、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
請求項３２に記載の方法であって、前記少なくとも１種類の改変シスタチンＣバイオマーカーは、
ＳＥＬＤＩプローブの吸着剤表面上の該バイオマーカーを捕捉し、レーザー脱離イオン化質量分析法によって該捕捉されたバイオマーカーを検出すること
によって測定される、方法。
【請求項３５】
前記少なくとも１種類の改変シスタチンＣバイオマーカーが、イムノアッセイにより測定される、請求項３２に記載の方法。
【請求項３６】
前記相関関係付けはソフトウェア分類アルゴリズムにより実行される、請求項３２に記載の方法。
【請求項３７】
アルツハイマー病の病態が、アルツハイマー病および非アルツハイマー性痴呆から選択される、請求項３２に記載の方法。
【請求項３８】
前記非アルツハイマー性痴呆が、レヴィー小体痴呆（ＬＢＤ）および前頭側頭型痴呆（ＦＴＤ）からなる群から選択されるメンバーである、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
前記データは、前記病態に基づいて被験体の治療を管理することにおける使用が意図される、請求項３２に記載の方法。
【請求項４０】
前記吸着剤が疎水性吸着剤である、請求項３２に記載の方法。
【請求項４１】
前記吸着剤が生体特異的吸着剤である、請求項３２に記載の方法。
【請求項４２】
前記測定値がアルツハイマー病と相関する場合に、前記被験体の治療の管理が、該被験体へのコリンエステラーゼ阻害剤の投与を包含する、請求項３７に記載の方法。
【請求項４３】
被験体の管理の後に前記少なくとも１種類のバイオマーカーを測定する工程、
をさらに包含する、請求項３９に記載の方法。
【請求項４４】
前記少なくとも１種類の改変シスタチンＣバイオマーカーが、抗体により捕捉される、請求項３２に記載の方法。
【請求項４５】
シスタチンＣ  ΔＮ１−８と相互作用する化合物を同定するための方法であって、
ａ）シスタチンＣ  ΔＮ１−８を試験化合物と接触させる工程、および
ｂ）該試験化合物がシスタチンＣ  ΔＮ１−８と相互作用するか否かを判断する工程、を包含する、方法。
【請求項４６】
細胞中のシスタチンＣの濃度を調節するための組成物であって、
プロテアーゼインヒビター
を含み、該プロテアーゼインヒビターは、Ａｒｇ８とＬｅｕ９との間でのシスタチンＣの切断を防ぐ、組成物。
【請求項４７】
被験体のアルツハイマー病を処置するための組成物であって、
Ａｒｇ８とＬｅｕ９との間でシスタチンＣを切断するプロテアーゼの発現または活性を調節する化合物の治療的有効量
を含む、組成物。
【請求項４８】
被験体の痴呆の病態を認定するためのデータを収集するための方法であって、該痴呆の病態は非痴呆および非アルツハイマー性痴呆から選択され、
該被験体由来の生体サンプル中のＭ１２５４５．９（シスタチン−Ｃ（ＮＴから−８ａａ））を測定する工程、
を包含し、該測定値は、非アルツハイマー性痴呆の病態と相関関係付けされ得る、方法。