【誤訳訂正書】
【提出日】平成19年11月6日(2007.11.6)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
式（Ｉ）及びそれらの塩の２種以上の異なる蛍光染料を含んでなる蛍光染料の整合セット。
【化１】
2005532543.tif 000001
式中、ｎは１、２又は３であって上記染料の各々で異なり、
Ｚ1及びＺ2は独立にフェニル又はナフチル環系を完成するのに必要な炭素原子群を表し、
Ｒ1及びＲ2基の一方は次式の基であり
【化２】
2005532543.tif 000002
（式中、Ｙは標的結合基である。）、
残りのＲ1又はＲ2基は−（ＣＨ2）4−Ｗ又は−（ＣＨ2）r−Ｈから選択され、
Ｒ3基は、Ｒ1又はＲ2のいずれかが−（ＣＨ2）r−Ｈである場合（この場合Ｒ3はＷである。）を除いて、水素であり、
Ｗはスルホン酸及びスルホネートから選択され、
ｐは３〜６の整数であり、
ｑは２又は３となるように選択され、
ｒは１〜５の整数であり、
上記染料の２種類のｎが＋１だけ異なる場合にはその２種類の染料のｐ、ｑ及びｒの１つは−１だけ異なることを特徴とする。
【請求項２】
式（ＩＩ）及びそれらの塩の２種以上の異なる蛍光染料を含んでなる蛍光染料の整合セット。
【化３】
2005532543.tif 000003
式中、ｎは１、２又は３であって上記染料の各々で異なり、
Ｒ1及びＲ2基の一方は次式の基であり
【化４】
2005532543.tif 000004
（式中、Ｙは標的結合基である。）、
残りのＲ1又はＲ2基は−（ＣＨ2）4−Ｗ又は−（ＣＨ2）r−Ｈから選択され、
Ｒ3基は、Ｒ1又はＲ2のいずれかが−（ＣＨ2）r−Ｈである場合（この場合Ｒ3はＷである。）を除いて、水素であり、
Ｗはスルホン酸及びスルホネートから選択され、
ｐは３〜６の整数であり、
ｑは２又は３となるように選択され、
ｒは１〜５の整数であり、
上記染料の２種類のｎが＋１だけ異なる場合にはその２種類の染料のｐ、ｑ及びｒの１つは−１だけ異なることを特徴とする。
【請求項３】
式（Ｉ）又は（ＩＩ）の２種以上の異なる蛍光染料を含み、
ｎが１又は２となるように選択され、
ｐが４又は５となるように選択され、
ｑが２又は３となるように選択され、
ｒが１、２又は３となるように選択される、請求項１又は請求項２記載の整合セット。
【請求項４】
染料セットの各染料における標的結合基Ｙが同一であってマレイミド基及びヨードアセトアミド基から選択される、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載の整合セット。
【請求項５】
染料Ｙの各々がマレイミド基である、請求項４記載の整合セット。
【請求項６】
前記塩がＫ+、Ｎａ+、ＮＨ4+、Ｒ3ＮＨ+及びＲ4Ｎ+（式中、ＲはＣ1〜Ｃ4アルキルである。）から選択される、請求項１乃至請求項５のいずれか１項記載の整合セット。
【請求項７】
以下のセットから選択される、請求項１乃至請求項６のいずれか１項記載の染料の整合セット。
セット１
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−２−［（１Ｅ，３Ｅ）−３−（１−エチル−３，３−ジメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）プロプ−１−エニル］−３，３−ジメチル−３Ｈ−インドリウム（化合物Ｉ）と、
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−３，３−ジメチル−２−［（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−（１，３，３−トリメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）ペンタ−１，３−ジエニル］−３Ｈ−インドリウム（化合物ＩＩ）、
セット２
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−２−［（１Ｅ，３Ｅ）−３−（１−プロピル−３，３−ジメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）プロプ−１−エニル］−３，３−ジメチル−３Ｈ−インドリウム（化合物ＩＩＩ）と、
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−３，３−ジメチル−２−［（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−（１−エチル−３，３−トリメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）ペンタ−１，３−ジエニル］−３Ｈ−インドリウム（化合物ＩＶ）、
セット３
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−２−［（１Ｅ，３Ｅ）−３−（１−エチル−３，３−ジメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）プロプ−１−エニル］−３，３−ジメチル−３Ｈ−インドリウム（化合物Ｉ）と、
１−（５−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソペンチル）−３，３−ジメチル−２−［（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−（１−エチル−３，３−トリメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）ペンタ−１，３−ジエニル］−３Ｈ−インドリウム（化合物Ｖ）、
セット４
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−２−［（１Ｅ，３Ｅ）−３−（３，３−ジメチル（１−スルホ−ブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）プロプ−１−エニル］−３，３−ジメチル−３Ｈ−インドリウム（化合物ＶＩ）と、
１−（５−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソペンチル）−３，３−ジメチル−２−［（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−（３，３−ジメチル−（１−スルホ−ブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）ペンタ−１，３−ジエニル］−３Ｈ−インドリウム（化合物ＶＩＩ）、
セット５
１−（６−｛［３−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）プロピル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−２−［（１Ｅ，３Ｅ）−３−（１−エチル−３，３−ジメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）プロプ−１−エニル］−３，３−ジメチル−３Ｈ−インドリウム（化合物ＶＩＩＩ）と、
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−３，３−ジメチル−２−［（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−（１−エチル−３，３−トリメチル−５−スルホ−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）ペンタ−１，３−ジエニル］−３Ｈ−インドリウム（化合物ＩＶ）、及び
セット６
１−（６−｛［３−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）プロピル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−２−［（１Ｅ，３Ｅ）−３−（３，３−ジメチル（１−スルホ−ブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）プロプ−１−エニル］−３，３−ジメチル−３Ｈ−インドリウム（化合物ＩＸ）と、
１−（６−｛［２−（２，５−ジオキソ−２，５−ジヒドロ−１Ｈ−ピロール−１−イル）エチル］アミノ｝−６−オキソヘキシル）−３，３−ジメチル−２−［（１Ｅ，３Ｅ，５Ｅ）−５−（３，３−ジメチル−（１−スルホ−ブチル）−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドール−２−イリデン）ペンタ−１，３−ジエニル］−３Ｈ−インドリウム（化合物Ｘ）。
【請求項８】
試料中のタンパク質の混合物を標識する方法であって、タンパク質の各々が１以上のシステイン残基を含んでおり、当該方法が、
ｉ）試料を含む水性液体に、タンパク質のシステイン残基と共有結合で反応し得る標的結合基を有する請求項１又は請求項２記載の蛍光染料の整合セットから選択される蛍光染料を添加し、
ii）染料をタンパク質と反応させてタンパク質を染料で標識する
ことを含み、もってタンパク質中の利用可能なシステイン残基すべてを染料で標識する、方法。
【請求項９】
前記シアニン染料がスルホン酸又はスルホネート基を含む、請求項８記載の方法
【請求項１０】
前記標的結合基がマレイミド基及びヨードアセトアミド基から選択される、請求項８又は請求項９記載の方法。
【請求項１１】
工程ｉ）の前に、タンパク質を還元剤で処理する工程をさらに含む、請求項８記載の方法。
【請求項１２】
前記染料がタンパク質５０μｇ当たり染料５〜２００ｎｍｏｌで使用される、請求項８記載の方法。
【請求項１３】
前記標識がｐＨ６．０〜９．０で実施される、請求項８記載の方法。
【請求項１４】
試料中の１種以上のタンパク質を標識する方法であって、当該方法が、
ｉ）該１種以上のタンパク質を含む液体試料に、個々の蛍光染料が次の式（Ｉ）：
【化５】
2005532543.tif 000005
（式中、ｎは１、２又は３であって上記染料の各々で異なり、
Ｚ1及びＺ2は独立にフェニル又はナフチル環系を完成するのに必要な炭素原子群を表し、
Ｒ1及びＲ2基の一方は次式の基であり
【化６】
2005532543.tif 000006
（式中、Ｙは標的結合基である。）、
残りのＲ1又はＲ2基は、−（ＣＨ2）4−Ｗ又は−（ＣＨ2）r−Ｈから選択され、
Ｒ3基は、Ｒ1又はＲ2のいずれかが−（ＣＨ2）r−Ｈである場合（この場合Ｒ3はＷである。）を除いて、水素であり、
Ｗはスルホン酸及びスルホネートから選択され、
ｐは３〜６の整数であり、
ｑは２又は３となるように選択され、
ｒは１〜５の整数である。）及びそれらの塩からなる蛍光染料の整合セットから選択される蛍光染料であって、染料の２種類のｎが＋１だけ異なる場合にはその２種類の染料のｐ、ｑ及びｒの１つは−１だけ異なることを特徴とするものを添加し、
ii）１種以上のタンパク質の標識化に適した条件下で、染料を試料と共にインキュベートすることを含む方法。
【請求項１５】
Ｚ1及びＺ2の各々がフェニル環系を完成するのに必要な炭素原子群を表す、請求項１４記載の方法。
【請求項１６】
ｎが１又は２となるように選択され、
ｐが４又は５となるように選択され、
ｑが２又は３となるように選択され、
ｒが１、２又は３となるように選択される、
請求項１４又は請求項１５記載の方法。
【請求項１７】
前記標的結合基Ｙがマレイミド基及びヨードアセトアミド基から選択される、請求項１４乃至請求項１６のいずれか１項記載の方法。
【請求項１８】
式（Ｉ）及びそれらの塩の２種以上の異なる蛍光染料を含む蛍光染料の整合セットを含んでなるキット。
【化７】
2005532543.tif 000007
式中、ｎは下記染料の各々について異なっており、１、２又は３であり、
Ｚ1及びＺ2は独立にフェニル又はナフチル環系を完成するのに必要な炭素原子群を表し、
Ｒ1及びＲ2基の一方は次式の基であり
【化８】
2005532543.tif 000008
（式中、Ｙは標的結合基である。）、
残りのＲ1又はＲ2基は、−（ＣＨ2）4−Ｗ又は−（ＣＨ2）r−Ｈから選択され、
Ｒ3基は、Ｒ1又はＲ2のいずれかが−（ＣＨ2）r−Ｈである場合（この場合Ｒ3はＷである。）を除いて、水素であり、
Ｗはスルホン酸及びスルホネートから選択され、
ｐは３〜６の整数であり、
ｑは２又は３となるように選択され、
ｒは１〜５の整数であり、
上記染料の２種類のｎが＋１だけ異なる場合にはその２種類の染料のｐ、ｑ及びｒの１つは−１だけ異なることを特徴とする。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３３】
本発明はまた、タンパク質中の利用可能な標的アミノ酸残基すべてを標識し、それによって、標識タンパク質分子の単一集団が本質的に得られるように、蛍光染料でタンパク質を飽和標識する方法も提供するものである。好適には、標的アミノ酸はシステイン残基である。「利用可能」という用語は、アミノ酸残基が反応のために蛍光染料に接近可能であることをいう。利用可能なシステイン残基は接近可能で還元（すなわち、遊離チオール）型でなければならない。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２２】
【表５】
2005532543.tif 000009
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２５】
【表６】
2005532543.tif 000010
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２８】
【表７】
2005532543.tif 000011