【手続補正書】
【提出日】平成19年7月30日(2007.7.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｆｃ領域を含む親ポリペプチドの改変体ポリペプチドであって、該Ｆｃ領域は、好ましい側鎖化学を有する改変された第一のアミノ酸残基と、グリコシル化が減少した第二のアミノ酸残基とを含み、該改変体ポリペプチドは、該親ポリペプチドと比較して減少したエフェクター機能を有する、改変体ポリペプチド。
【請求項２】
Ｆｃ領域を含む親ポリペプチドの改変体ポリペプチドであって、該Ｆｃ領域は、システインチオールを含む好ましい側鎖化学を有する改変された第一のアミノ酸残基と、グリコシル化が減少した第二のアミノ酸残基とを含み、該改変体ポリペプチドは、該親ポリペプチドと比較して減少したエフェクター機能を有する、改変体ポリペプチド。
【請求項３】
Ｆｃ領域を含むポリペプチドであって、該Ｆｃ領域は、好ましい側鎖化学を有する改変された第一のアミノ酸残基と、該第一のアミノ酸残基の改変を伴わないポリペプチドと比較してグリコシル化が減少した第二のアミノ酸残基とを含む、ポリペプチド。
【請求項４】
Ｆｃ領域を含む親ポリペプチドの改変体ポリペプチドであって、該Ｆｃ領域は、改変された第一のアミノ酸残基を含み、該改変された第一のアミノ酸は、第二のアミノ酸におけるグリコシル化の減少が達成されるように空間的に位置し、それによって、該改変体ポリペプチドは、該親ポリペプチドと比較して減少したエフェクター機能を有する、改変体ポリペプチド。
【請求項５】
請求項４に記載のポリペプチドであって、前記改変された第一のアミノ酸は、少なくとも１アミノ酸位置以上、少なくとも２アミノ酸位置以上、少なくとも３アミノ酸位置以上、少なくとも４アミノ酸位置以上、少なくとも５アミノ酸位置以上、少なくとも６アミノ酸位置以上、少なくとも７アミノ酸位置以上、少なくとも８アミノ酸位置以上、少なくとも９アミノ酸位置以上、および少なくとも１０アミノ酸位置以上からなる群より選択される間隔の分、前記第二のアミノ酸から離れて空間的に位置する、ポリペプチド。
【請求項６】
請求項４に記載のポリペプチドであって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、好ましい側鎖化学を有する、ポリペプチド。
【請求項７】
請求項１〜請求項３および請求項６のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記好ましい側鎖化学は、該ポリペプチドが減少したエフェクター機能を示すように、十分に立体的にかさ高い、ポリペプチド。
【請求項８】
請求項７に記載のポリペプチドであって、前記十分に立体的にかさ高い好ましい側鎖化学は、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、Ｇｌｕ、Ｇｌｎ、Ａｒｇ、Ｌｙｓ、Ｍｅｔ、およびＴｙｒからなる群より選択されるアミノ酸残基の側鎖化学である、ポリペプチド。
【請求項９】
請求項１〜請求項３および請求項６のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記好ましい側鎖化学は、該ポリペプチドが減少したエフェクター機能を示すように、十分な静電荷を有す、ポリペプチド。
【請求項１０】
請求項９に記載のポリペプチドであって、前記好ましい側鎖化学は、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、およびＨｉｓからなる群より選択されたアミノ酸残基の側鎖化学である、ポリペプチド。
【請求項１１】
請求項３に記載のポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、減少したエフェクター機能を示す、ポリペプチド。
【請求項１２】
請求項１、請求項２、請求項４、および請求項１１のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記減少したエフェクター機能は、Ｆｃレセプター（ＦｃＲ）に対する減少した結合である、ポリペプチド。
【請求項１３】
請求項１２に記載のポリペプチドであって、前記結合は、約１／１以下、約１／２以下、約１／３以下、約１／４以下、約１／５以下、約１／６以下、約１／７以下、約１／８以下、約１／９以下、約１／１０以下、約１／１５以下、約１／５０以下、および約１／１００以下からなる群より選択される度合いまで減少されている、ポリペプチド。
【請求項１４】
請求項１２に記載のポリペプチドであって、前記Ｆｃレセプター（ＦｃＲ）は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、およびＦｃγＲＩＩＩからなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項１５】
請求項１、請求項２、請求項４、および請求項１１のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記減少したエフェクター機能は、補体タンパク質に対する減少した結合である、ポリペプチド。
【請求項１６】
請求項１５に記載のポリペプチドであって、前記補体タンパク質は、Ｃ１ｑである、ポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１５に記載のポリペプチドであって、前記補体タンパク質に対する減少した結合は、約１／１以下、約１／２以下、約１／３以下、約１／４以下、約１／５以下、約１／６以下、約１／７以下、約１／８以下、約１／９以下、約１／１０以下、および約１／１５以下からなる群より選択される度合いまでである、ポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記第一のアミノ酸残基および第二のアミノ酸残基は、Ｎ結合グリコシル化モチーフの近くかまたはＮ結合グリコシル化モチーフ中にある、ポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１８に記載のポリペプチドであって、前記Ｎ結合グリコシル化モチーフはアミノ酸配列ＮＸＴまたはアミノ酸配列ＮＸＳを含む、ポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１９に記載のポリペプチドであって、前記Ｎ結合グリコシル化モチーフは、アミノ酸配列ＮＸＴを含む、ポリペプチド。
【請求項２１】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記第一のアミノ酸残基は、アミノ酸置換によって改変されている、ポリペプチド。
【請求項２２】
請求項２１に記載のポリペプチドであって、前記アミノ酸置換は、Ｇｌｙ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｈｅ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｔｒｐ、Ｐｒｏ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｔｙｒ、Ｃｙｓ、Ｍｅｔ、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、およびＨｉｓからなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項２３】
請求項２１に記載のポリペプチドであって、前記アミノ酸置換は、非伝統的なアミノ酸残基である、ポリペプチド。
【請求項２４】
請求項１〜請求項３および請求項６のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記好ましい鎖化学を有する第一のアミノ酸残基は、機能的部分に結合され得る、ポリペプチド。
【請求項２５】
請求項２４に記載のポリペプチドであって、前記機能的部分は、遮断部分、検出可能部分、診断部分、および治療部分からなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項２６】
請求項２５に記載のポリペプチドであって、前記遮断部分は、システイン付加体、混合ジスルフィド、ポリエチレングリコール、およびポリエチレングリコールマレイミドからなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項２７】
請求項２５に記載のポリペプチドであって、前記検出可能部分は、蛍光部分および同位体部分からなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項２８】
請求項２５に記載のポリペプチドであって、前記診断剤は、疾患または障害の存在を解明し得る、ポリペプチド。
【請求項２９】
請求項２５に記載のポリペプチドであって、前記治療部分は、抗炎症剤、抗癌剤、抗神経変性剤、および抗感染剤からなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項３０】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記第二のアミノ酸残基は、カバット番号付けによるアミノ酸２９７である、ポリペプチド。
【請求項３１】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、カバット番号付けによるアミノ酸２９９である、ポリペプチド。
【請求項３２】
請求項２１に記載のポリペプチドであって、前記アミノ酸置換は、カバット番号付けによるＴ２９９Ａ、Ｔ２９９Ｎ、Ｔ２９９Ｇ、Ｔ２９９Ｙ、Ｔ２９９Ｃ、Ｔ２９９Ｈ、Ｔ２９９Ｅ、Ｔ２９９Ｄ、Ｔ２９９Ｋ、Ｔ２９９Ｒ、Ｔ２９９Ｇ、Ｔ２９９Ｉ、Ｔ２９９Ｌ、Ｔ２９９Ｍ、Ｔ２９９Ｆ、Ｔ２９９Ｐ、Ｔ２９９ＷおよびＴ２９９Ｖからなる群より選択される、ポリペプチド。
【請求項３３】
請求項３２に記載のポリペプチドであって、前記アミノ酸置換は、Ｔ２９９Ｃである、ポリペプチド。
【請求項３４】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、前記改変された第一のアミノ酸残基においてペグ化されている、ポリペプチド。
【請求項３５】
請求項３４に記載のポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、ＰＥＧ−マレイミドによってペグ化されている、ポリペプチド。
【請求項３６】
請求項１、および請求項３〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、システインまたは混合ジスルフィド付加体によって改変された、システイン残基である、ポリペプチド。
【請求項３７】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、抗体である、ポリペプチド。
【請求項３８】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記Ｆｃ領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４からなる群より選択される抗体から得られる、ポリペプチド。
【請求項３９】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、リガンド、サイトカイン、レセプター、細胞表面抗原、および癌細胞抗原からなる群より選択される抗原に結合する、ポリペプチド。
【請求項４０】
適切な薬学的キャリア中において請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドを含む、組成物。
【請求項４１】
ヒト障害またはヒト疾患を処置または予防するための組成物であって、請求項４０に記載の治療有効量の薬学的組成物を含む、組成物。
【請求項４２】
請求項１〜請求項５のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードする、単離された核酸。
【請求項４３】
請求項４２に記載の核酸であって、前記コードされた第一のアミノ酸残基および第二のアミノ酸残基は、Ｎ結合グリコシル化モチーフの一部である、核酸。
【請求項４４】
請求項４３に記載の核酸であって、前記Ｎ結合グリコシル化モチーフは、アミノ酸配列ＮＸＴまたはアミノ酸配列ＮＸＳを含む、核酸。
【請求項４５】
請求項４２に記載の核酸であって、前記第二のアミノ酸残基は、カバット番号付けによるアミノ酸２９７である、核酸。
【請求項４６】
請求項４２に記載の核酸であって、前記グリコシル化され得る第二のアミノ酸残基は、２９７位にある、核酸。
【請求項４７】
請求項４２に記載の核酸であって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、カバット番号付けによるアミノ酸２９９である、核酸。
【請求項４８】
請求項４２に記載の核酸であって、前記コードされた第一のアミノ酸残基は、アミノ酸置換によって改変されている、核酸。
【請求項４９】
請求項４８に記載の核酸であって、前記アミノ酸置換は、Ｔ２９９Ａ、Ｔ２９９Ｎ、Ｔ２９９Ｇ、Ｔ２９９Ｙ、Ｔ２９９Ｃ、Ｔ２９９Ｈ、Ｔ２９９Ｅ、Ｔ２９９Ｄ、Ｔ２９９Ｋ、Ｔ２９９Ｒ、Ｔ２９９Ｇ、Ｔ２９９Ｉ、Ｔ２９９Ｌ、Ｔ２９９Ｍ、Ｔ２９９Ｆ、Ｔ２９９Ｐ、Ｔ２９９Ｗ、およびＴ２９９Ｖからなる群より選択される、核酸。
【請求項５０】
請求項４９に記載の核酸であって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、Ｔ２９９Ｃである、核酸。
【請求項５１】
請求項４２に記載の核酸であって、前記好ましい側鎖化学を有するコードされた第一のアミノ酸残基は、機能的部分に結合され得る、核酸。
【請求項５２】
請求項４８に記載の核酸であって、前記機能的部分は、遮断部分、検出可能部分、診断部分、および治療部分からなる群より選択される、核酸。
【請求項５３】
請求項４２に記載の核酸であって、前記コードされたポリペプチドが、抗体である、核酸。
【請求項５４】
請求項５３に記載の核酸であって、前記Ｆｃ領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４からなる群より選択される、核酸。
【請求項５５】
請求項４２に記載の核酸であって、前記コードされたポリペプチドは、Ｆｃレセプター（ＦｃＲ）に対する減少した結合を示す、核酸。
【請求項５６】
請求項５５に記載の核酸であって、前記Ｆｃレセプター（ＦｃＲ）は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、およびＦｃγＲＩＩＩからなる群より選択される、核酸。
【請求項５７】
請求項４２に記載の核酸であって、前記コードされたポリペプチドは、補体タンパク質のＣ１ｑに対する減少した結合を示す、核酸。
【請求項５８】
請求項４２に記載の核酸であって、前記コードされたポリペプチドは、リガンド、サイトカイン、レセプター、細胞表面抗原、および癌細胞抗原からなる群より選択される抗原に結合する、核酸。
【請求項５９】
請求項４２に記載の核酸を含む、ベクター。
【請求項６０】
請求項４２に記載の核酸を含む、宿主細胞。
【請求項６１】
抗原結合ポリペプチドを産生するための方法であって、該方法は、請求項６０に記載の宿主細胞を、該宿主細胞によって該ポリペプチドを産生するために適切な条件下で培養する工程を包含する、方法。
【請求項６２】
請求項６１に記載の方法であって、該方法は、前記宿主細胞培養から前記ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
【請求項６３】
Ｆｃ領域中でグリコシル化が減少した改変された抗原結合ポリペプチドを産生する方法であって、該方法は、
元のポリペプチド中の第一のアミノ酸残基と、該元のポリペプチドのＦｃ領域中でグリコシル化され得る第二のアミノ酸残基とを同定する工程であって、該第一のアミノ酸の改変は、第二のアミノ酸におけるグリコシル化を減少する、工程；
アミノ酸をその好ましい側鎖化学に関して選択する工程、および
該好ましい側鎖化学を含むように該第一のアミノ酸残基を改変して、改変されたポリペプチドを産生する工程であって、該Ｆｃ領域の第二のアミノ酸残基のグリコシル化は、該元のポリペプチドと比較して該改変されたポリペプチドにおいて減少される、工程、
を包含する、方法。
【請求項６４】
抗体のエフェクター機能を減少させる方法であって、該方法は、
該抗体のＦｃ領域中の第二のアミノ酸残基のグリコシル化を変更し得る、該抗体中の第一のアミノ酸残基を同定する工程；および
該第一のアミノ酸残基を、改変されていない抗体と比較して該改変されたポリペプチドにおいて該Ｆｃ領域の第二のアミノ酸残基のグリコシル化が減少されるように、かつ該改変されたアミノ酸が好ましい側鎖化学を有するように、改変する工程、
を包含する、方法。
【請求項６５】
請求項６３に記載の方法であって、該方法は、前記改変された抗原結合ポリペプチドが、変更されたエフェクター機能を示すか否かを確定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項６６】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、前記同定する工程は、前記第一のアミノ酸が改変された場合に、前記Ｆｃ領域のアミノ酸の空間的な表示を決定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項６７】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、１つ以上の工程が、コンピューターによって補助される、方法。
【請求項６８】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、前記第一のアミノ酸残基および第二のアミノ酸残基は、グリコシル化モチーフの中にあるかまたはグリコシル化モチーフに近い、方法。
【請求項６９】
請求項６８に記載の方法であって、前記グリコシル化モチーフは、アミノ酸配列ＮＸＴまたはアミノ酸配列ＮＸＳを含む、Ｎ結合グリコシル化モチーフである、方法。
【請求項７０】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、前記第一のアミノ酸残基の改変は、アミノ酸置換、アミノ酸欠失、アミノ酸挿入、およびアミノ酸化学改変からなる群より選択される、方法。
【請求項７１】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、好ましい側鎖化学に関して選択された前記第一のアミノ酸残基は、機能的エフェクター部分に結合され得る、方法。
【請求項７２】
請求項７１に記載の方法であって、前記機能的部分は、システイン付加体、ＰＥＧ−マレイミド、および治療部分からなる群より選択される、方法。
【請求項７３】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、前記第二のアミノ酸残基は、カバット番号付けによるアミノ酸２９７である、方法。
【請求項７４】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、カバット番号付けによるアミノ酸２９９である、方法。
【請求項７５】
請求項７０に記載の方法であって、前記アミノ酸残基置換は、Ｔ２９９Ａ、Ｔ２９９Ｎ、Ｔ２９９Ｇ、Ｔ２９９Ｙ、Ｔ２９９Ｃ、Ｔ２９９Ｈ、Ｔ２９９Ｅ、Ｔ２９９Ｄ、Ｔ２９９Ｋ、Ｔ２９９Ｒ、Ｔ２９９Ｇ、Ｔ２９９Ｉ、Ｔ２９９Ｌ、Ｔ２９９Ｍ、Ｔ２９９Ｆ、Ｔ２９９Ｐ、Ｔ２９９Ｗ、およびＴ２９９Ｖからなる群より選択される、方法。
【請求項７６】
請求項７０に記載の方法であって、前記改変された第一のアミノ酸残基は、Ｔ２９９Ｃである、方法。
【請求項７７】
請求項６３または請求項６４に記載の方法であって、前記ポリペプチドは、変更されたエフェクター機能を示す、方法。
【請求項７８】
請求項７７に記載の方法であって、前記変更されたエフェクター機能は、Ｆｃレセプター（ＦｃＲ）に対する減少した結合である、方法。
【請求項７９】
請求項７８に記載の方法であって、前記Ｆｃレセプター（ＦｃＲ）は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、およびＦｃγＲＩＩＩからなる群より選択される、方法。
【請求項８０】
請求項７８に記載の方法であって、前記変更されたエフェクター機能は、補体タンパク質のＣ１ｑに対する減少した結合である、方法。
【請求項８１】
請求項６３〜請求項８０のいずれか１項に記載の方法によって産生された、ポリペプチド。