【手続補正書】
【提出日】平成19年10月25日(2007.10.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
医薬開発用候補として化合物を同定するビジネス方法であって、
（ａ）化合物を１またはそれ以上の試験動物に投与し、
（ｂ）試験動物からの臓器において化合物の投与により誘導された遺伝子発現パターンを入手し、そして
（ｃ）インビボでの化合物の機能を同定する
ことから成り、インビボでの化合物の機能を同定することにより、化合物が医薬開発用の候補であるか否かが示される方法。
【請求項２】
遺伝子発現パターンを入手する段階が、さらに試験動物の遺伝子発現パターンと対照遺伝子発現パターンとの比較を含む、請求項１記載の方法。
【請求項３】
化合物の正体が投与者には知られていない、請求項１または２記載の方法。
【請求項４】
化合物の機能が投与者には知られていない、請求項１〜３のいずれか１項記載の方法。
【請求項５】
化合物がタンパク質またはペプチドである、請求項１〜４のいずれか１項記載の方法。
【請求項６】
投与が化合物の直接投与である、請求項１〜５のいずれか１項記載の方法。
【請求項７】
投与が化合物の間接投与である、請求項１〜５のいずれか１項記載の方法。
【請求項８】
試験動物が、マウス、ラットおよびサルから成る群から選択される、請求項１〜７のいずれか１項記載の方法。
【請求項９】
試験動物が、マウスおよびサルの両方またはラットおよびサルの両方のいずれかから成る、請求項１〜８のいずれか１項記載の方法。
【請求項１０】
遺伝子発現パターンの入手が、生物全体にわたる遺伝子発現プロファイリングによるものである、請求項１〜９のいずれか１項記載の方法。
【請求項１１】
試験動物がマウスであり、少なくとも２５臓器の遺伝子発現パターンが入手される、請求項１〜１０のいずれか１項記載の方法。
【請求項１２】
試験動物がサルであり、少なくとも１２０臓器の遺伝子発現パターンが入手される、請求項１〜１０のいずれか１項記載の方法。
【請求項１３】
試験動物の遺伝子発現パターンの比較が、多数の標的および適応症(indications)の解析を含む、請求項１〜１２のいずれか１項記載の方法。
【請求項１４】
試験動物の遺伝子発現パターンの比較が、ゲノムデータベースからの情報の統合を含む、請求項１〜１３のいずれか１項記載の方法。
【請求項１５】
化合物の機能の同定が、値が、系統的に実験ノイズが高い低発現範囲にある遺伝子をさらなる分析から排除する初段階を含む、請求項１〜１４のいずれか１項記載の方法。
【請求項１６】
化合物の機能の同定が、２成分誤差モデルに基いた処置および未処置群間で値が異なる遺伝子を同定する閾値ｔ−検定ｐ−値の選択段階を含む、請求項１〜１５のいずれか１項記載の方法。
【請求項１７】
医薬開発用候補としての化合物の同定システムであって、
（ａ）試験動物から得られた臓器において化合物の投与により誘導された遺伝子発現パターンを入手する装置（上記遺伝子発現パターンはデジタル方式で記憶装置に記憶される）；
（ｂ）（ｉ）試験動物と同一または異なる予め測定された遺伝子組成を有し、（ii）対照条件および／または試験化合物と類似した化合物による処置に曝露された動物の記憶された遺伝子発現パターンを含むデータベース；
（ｃ）集められた遺伝子発現パターンを、記憶されている遺伝子発現パターンと比較し、相関関係の有無を決定する手段；および
（ｄ）インビボでの化合物の機能を同定することにより、化合物が医薬開発用候補であるか否かが示される、相関関係の有無に基いて試験化合物の機能を測定する手段
を含むシステム。
【請求項１８】
調節が解除された新脈管形成と関連した病気の処置で使用される医薬の製造のためのポリペプチドの使用であって、
（ａ）線維芽細胞増殖因子２３（ＦＧＦ−２３）（配列番号１）またはＦＧＦ−２３のフラグメント；
（ｂ）（ａ）のポリペプチドのいずれか一つのアミノ酸配列と少なくとも５０％の同一性パーセンテージを有する生物活性ポリペプチド；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリペプチドのいずれか一つの生物活性変異型
から成る群から選択されるポリペプチドの使用。
【請求項１９】
調節が解除された新脈管形成と関連した病気が、網膜症、加齢性黄斑変性、血管芽細胞腫、血管腫および腫瘍から成る群から選択される、請求項１８記載のポリペプチドの使用。
【請求項２０】
調節が解除された新脈管形成と関連した病気が網膜症である、請求項１８または１９記載のポリペプチドの使用。
【請求項２１】
細胞増殖性疾患の処置で使用される医薬の製造を目的とする、請求項１８の（ａ）、（ｂ）または（ｃ）群のいずれか一つに記載されたポリペプチドの使用。
【請求項２２】
細胞増殖性疾患が、慢性または急性腎疾患、動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症、乾癬、子宮内膜症、糖尿病、慢性喘息および癌から成る群から選択される、請求項２１記載のポリペプチドの使用。
【請求項２３】
細胞増殖性疾患が癌である、請求項２１または２２記載のポリペプチドの使用。
【請求項２４】
ポリペプチドが、配列番号３とストリンジェント条件下でハイブリダイゼーションする核酸によりコード化される、請求項１８〜２３のいずれか１項記載のポリペプチドの使用。
【請求項２５】
ポリペプチドが、ＦＧＦ−２３のＣ−末端フラグメントを含む、請求項１８〜２４のいずれか１項記載のポリペプチドの使用。
【請求項２６】
ポリペプチドが、ＦＧＦ−２３のＣ−末端の少なくとも１５アミノ酸を含む、請求項２５記載のポリペプチドの使用。
【請求項２７】
ポリペプチドが配列番号２のアミノ酸配列を有する、請求項２５または２６記載のポリペプチドの使用。
【請求項２８】
ポリペプチドが、配列番号４とストリンジェント条件下でハイブリダイゼーションする核酸によりコード化される、請求項２５〜２６のいずれか１項記載のポリペプチドの使用。
【請求項２９】
調節が解除された新脈管形成と関連した病気の処置方法であって、病気に罹患したヒトを含む哺乳類にポリペプチドの有効量を投与することを含み、ポリペプチドが、
（ａ）線維芽細胞増殖因子２３（ＦＧＦ−２３）（配列番号１）またはＦＧＦ−２３のフラグメント；
（ｂ）（ａ）のポリペプチドのいずれか一つのアミノ酸配列と少なくとも５０％の同一性パーセンテージを有する生物活性ポリペプチド；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリペプチドのいずれか一つの生物活性変異型
から成る群から選択されるものである方法。
【請求項３０】
調節が解除された新脈管形成と関連した病気が、網膜症、加齢性黄斑変性、血管芽細胞腫、血管腫および腫瘍から成る群から選択される、請求項２９記載の方法。
【請求項３１】
調節が解除された新脈管形成と関連した病気が網膜症である、請求項２９または３０記載の方法。
【請求項３２】
細胞増殖性疾患の処置方法であって、疾患に罹患したヒトを含む哺乳類に、請求項２９記載の（ａ）、（ｂ）または（ｃ）群のいずれか一つに記載されたポリペプチドの有効量を投与することを含む方法。
【請求項３３】
細胞増殖性疾患が、慢性または急性腎疾患、動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症、乾癬、子宮内膜症、糖尿病、慢性喘息および癌から成る群から選択される、請求項３２記載の方法。
【請求項３４】
細胞増殖性疾患が癌である、請求項３２または３３記載の方法。
【請求項３５】
ポリペプチドの有効量が静脈内、筋肉内、皮下、経口または局所経路により投与される、請求項２９〜３４のいずれかに記載の病気または疾患の処置方法。
【請求項３６】
ポリペプチドが、配列番号３とストリンジェント条件下でハイブリダイゼーションする核酸によりコード化される、請求項２９〜３５のいずれか１項記載の病気または疾患の処置方法。
【請求項３７】
ポリペプチドがＦＧＦ−２３のＣ−末端フラグメントを含む、請求項２９〜３６のいずれかに記載の病気または疾患の処置方法。
【請求項３８】
ポリペプチドが、ＦＧＦ−２３のＣ−末端の少なくとも１５アミノ酸を含む、請求項３７記載の病気または疾患の処置方法。
【請求項３９】
ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸配列を有する、請求項３７または３８記載の病気または疾患の処置方法。
【請求項４０】
ポリペプチドが、配列番号４とストリンジェント条件下でハイブリダイゼーションする核酸によりコード化される、請求項３７〜３９のいずれか１項記載の病気または疾患の処置方法。
【請求項４１】
請求項１８、および２４〜２８記載のポリペプチドおよび医薬上許容される担体を含む、調節が解除された新脈管形成と関連した病気で使用される医薬組成物。
【請求項４２】
請求項１８、および２４〜２８記載のポリペプチドおよび医薬上許容される担体を含む、細胞増殖性疾患で使用される医薬組成物。