【手続補正書】
【提出日】平成18年12月26日(2006.12.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ＨＩＶ  ｇａｇポリペプチドを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む発現カセットであって、ここで、該ｇａｇポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号２０に対して少なくとも９０％の同一性を有する、少なくとも６０のヌクレオチドの連続する配列を含む、発現カセット。
【請求項２】  ＨＩＶ  ｇａｇポリペプチドを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む発現カセットであって、ここで、該ｇａｇポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、Ｘの連続するヌクレオチドを含み、ここで、（ｉ）該Ｘの連続する配列が、配列番号２０のＹの連続するヌクレオチドに対して少なくとも９０％の同一性を有し、（ｉｉ）ＸがＹと等しく、そして（ｉｉｉ）Ｘが６０ヌクレオチドである、発現カセット。
【請求項３】  ＨＩＶ  ｇａｇポリペプチドを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む、請求項１または２のいずれかに記載の発現カセットであって、ここで該ｇａｇポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号９として示される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項４】  請求項１または２のいずれかに記載の発現カセットであって、ここで、ＨＩＶ  ｇａｇポリペプチドを含むポリペプチドをコードする前記ポリヌクレオチド配列が、配列番号４として示される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項５】  前記ポリヌクレオチド配列が、ＨＩＶプロテアーゼポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列をさらにコードする、請求項１〜４のいずれか１項に記載の発現カセット。
【請求項６】  請求項５に記載の発現カセットであって、ここで、前記ＨＩＶプロテアーゼポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、配列番号５、配列番号７８および配列番号７９からなる群より選択される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項７】  前記ポリヌクレオチド配列が、ＨＩＶ逆転写酵素ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の発現カセット。
【請求項８】  請求項７に記載の発現カセットであって、前記ＨＩＶ逆転写酵素ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、配列番号８０〜８４からなる群より選択される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項９】  前記ポリヌクレオチド配列が、ＨＩＶ  ｔａｔポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１〜８のいずれか１項に記載の発現カセット。
【請求項１０】  請求項９に記載の発現カセットであって、ここで、前記ＨＩＶ  ｔａｔポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、配列番号８６〜８９からなる群より選択される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項１１】  請求項１〜１０のいずれか１項に記載の発現カセットであって、前記ポリヌクレオチド配列が、ＨＩＶポリメラーゼポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列をさらに含み、ここで、該ＨＩＶポリメラーゼポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、配列番号６として示される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項１２】  請求項１〜１１のいずれか１項に記載の発現カセットであって、ここで、前記ポリヌクレオチド配列が、ＨＩＶポリメラーゼポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列をさらに含み、ここで、（ｉ）該ＨＩＶポリメラーゼポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、配列番号４として示される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含み、そして（ｉｉ）該配列が逆転写酵素およびインテグラーゼに対応するコード領域の欠失により改変されている、発現カセット。
【請求項１３】  前記ポリヌクレオチド配列が、Ｔヘルパー細胞およびＣＴＬエピトープを保つ、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の発現カセット。
【請求項１４】  請求項１〜１３のいずれか１項に記載の発現カセットであって、ここで前記ポリヌクレオチド配列が、ＨＣＶコアポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列をさらに含み、ここで、該ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、配列番号７として示される配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、発現カセット。
【請求項１５】  ＨＩＶ  ｅｎｖポリペプチドを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む発現カセットであって、ここで該ＨＩＶ  ｅｎｖポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号７１（図５８）または配列番号７２（図５９）に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する少なくとも１４４のヌクレオチドの連続する配列を含む、発現カセット。
【請求項１６】  ＨＩＶ  Ｅｎｖポリペプチドを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む発現カセットであって、ここで、該Ｅｎｖポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、（Ａ）Ｘの連続するヌクレオチドであって、ここで（ｉ）該Ｘの連続するヌクレオチドが、配列番号７１のＹの連続するヌクレオチドに対して少なくとも９０％の同一性を有し、（ｉｉ）ＸがＹと等しく、そして（ｉｉｉ）Ｘが１４４ヌクレオチドである、ヌクレオチド；または（Ｂ）Ｘの連続するヌクレオチドであって、ここで（ｉ）該Ｘの連続するヌクレオチドが、配列番号７２のＹの連続するヌクレオチドに対して少なくとも９０％の同一性を有し、（ｉｉ）ＸはＹと等しく、そして（ｉｉｉ）Ｘは１４４ヌクレオチドである、ヌクレオチドを含む、発現カセット。
【請求項１７】  前記ｅｎｖポリペプチドが、Ｖ１領域に隣接する配列をさらに含むが、該Ｖ１領域自体に欠失を有する、請求項１５または１６に記載の発現カセット。
【請求項１８】  前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号６５（図５２）として示される配列を含む、請求項１５または１６のいずれかに記載の発現カセット。
【請求項１９】  前記ｅｎｖポリペプチドが、Ｖ２領域に隣接する配列をさらに含むが、該Ｖ２領域自体に欠失を有する、請求項１５または１６のいずれかに記載の発現カセット。
【請求項２０】  前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号６０（図４７）および配列番号６６（図５３）からなる群より選択される、請求項１９に記載の発現カセット。
【請求項２１】  請求項１９に記載の発現カセットであって、ここで前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号３４（図２０のｇｐ１２０）；配列番号３７（図２４）；配列番号４０（図２７）；配列番号４３（図３０）；配列番号４６（図３３）；配列番号４９（図３６）；および配列番号７６（図６４）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項２２】  前記ｅｎｖポリペプチドが、Ｖ１／Ｖ２領域に隣接する配列をさらにコードするが、該Ｖ１／Ｖ２領域において欠失を有する、請求項１５または１６のいずれかに記載の発現カセット。
【請求項２３】  請求項２２に記載の発現カセットであって、前記ｅｎｖポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号５９（図４６）；配列番号６１（図４８）；配列番号６７（図５４）；および配列番号７５（図６３）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項２４】  請求項２２に記載の発現カセットであって、前記ｅｎｖポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号３５（図２１）；配列番号３８（図２５のｇｐ１４０）；配列番号４１（図２８）；配列番号４４（図３１）；配列番号４７（図３４）および配列番号５０（図３７）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項２５】  前記ｅｎｖポリペプチドが、ｇｐ１４０ポリペプチドのｇｐ１２０ポリペプチドおよびｇｐ４１ポリペプチドへの切断を妨げる、変異した切断部位を有する、請求項１５または１６のいずれかに記載の発現カセット。
【請求項２６】  請求項２５に記載の発現カセットであって、ここで、前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号５７（図４４）；配列番号６１（図４８）；配列番号６３（図５０）；配列番号３９（図２６）；配列番号４０（図２７）；配列番号４１（図２８）；配列番号４２（図２９）；配列番号４３（図３０）；配列番号４４（図３１）；配列番号４５（図３２）；配列番号４６（図３３）；配列番号４７（図３４）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項２７】  前記ｅｎｖポリペプチドが、ｇｐ１６０  ｅｎｖポリペプチドまたはその免疫原性フラグメントをコードする、請求項１５または１６に記載の発現カセット。
【請求項２８】  請求項２７に記載の発現カセットであって、前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号６４（図５１）；配列番号６５（図５２）；配列番号６６（図５３）；配列番号６７（図５４）；配列番号６８（図５５）；配列番号７５（図６３）；配列番号７３（図６１）；配列番号４８（図３５）；配列番号４９（図３６）；配列番号５０（図３７）；配列番号７６（図６４）；および配列番号７４（図６２）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項２９】  前記ｅｎｖポリペプチドが、ｇｐ１４０  ｅｎｖポリペプチドまたはその免疫原性フラグメントをコードする、請求項１５または１６のいずれかに記載の発現カセット。
【請求項３０】  請求項２９に記載の発現カセットであって、ここで前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号５６（図４３）；配列番号５７（図４４）；配列番号５８（図４５）；配列番号５９（図４６）；配列番号６０（図４７）；配列番号６１（図４８）；配列番号６２（図４９）；配列番号６３（図５０）；配列番号３６（図２３）；配列番号３７（図２４）；配列番号３８（図２５）；配列番号３９（図２６）；配列番号４０（図２７）；配列番号４１（図２８）；配列番号４２（図２９）；配列番号４３（図３０）；配列番号４４（図３１）；配列番号４５（図３２）；配列番号４６（図３３）；および配列番号４７（図３４）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項３１】  前記ｅｎｖポリペプチドが、ｇｐ１２０  ｅｎｖポリペプチドまたはその免疫原性フラグメントをコードする、請求項１４または１５のいずれかに記載の発現カセット。
【請求項３２】  請求項３１に記載の発現カセットであって、前記ｅｎｖポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号５４（図４１）；配列番号５５（図４２）；配列番号３３（図１９）；配列番号３４（図２０）；および配列番号３５（図２１）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項３３】  請求項１４または１５に記載の発現カセットであって、前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、配列番号５５（図４２のｇｐ１２０）；配列番号６２（図４９）；配列番号６３（図５０）；および配列番号６８（図５５）からなる群より選択される、発現カセット。
【請求項３４】  選択された宿主細胞中で使用するための組換え発現系であって、請求項１〜３３のいずれかに記載の発現カセットを含み、そしてここで、前記ポリヌクレオチド配列が、該選択された宿主細胞における発現と適合性の制御エレメントに制御可能に連結されている、組換え発現系。
【請求項３５】  請求項３４に記載の組換え発現系であって、前記制御エレメントが、転写プロモーター、転写エンハンサーエレメント、転写終結シグナル、ポリアデニル化配列、翻訳開始の最適化のための配列、および翻訳終結配列からなる群より選択される、組換え発現系。
【請求項３６】  前記転写プロモーターが、ＣＭＶ、ＣＭＶ＋イントロンＡ、ＳＶ４０、ＲＳＶ、ＨＩＶ  Ｌｔｒ、ＭＭＬＶ−ｌｔｒ、およびメタロチオネインからなる群より選択される、請求項３５に記載の組換え発現系。
【請求項３７】  請求項１〜３３のいずれかに記載の発現カセットを含む細胞であって、前記ポリヌクレオチド配列が、選択された細胞における発現と適合性の制御エレメントに作動可能に連結されている、細胞。
【請求項３８】  前記細胞が哺乳動物細胞である、請求項３７に記載の細胞。
【請求項３９】  前記細胞が、ＢＨＫ、ＶＥＲＯ、ＨＴ１０８０、２９３、ＲＤ、ＣＯＳ−７、およびＣＨＯ細胞からなる群より選択される、請求項３８に記載の細胞。
【請求項４０】  前記細胞がＣＨＯ細胞である、請求項３９に記載の細胞。
【請求項４１】  前記細胞が、昆虫細胞、細菌細胞、酵母細胞、植物細胞、初代細胞、不死化細胞、腫瘍由来細胞、マクロファージ、単球、樹上細胞、Ｂ細胞、Ｔ細胞、幹細胞、および前駆細胞からなる群より選択される、請求項３７に記載の細胞。
【請求項４２】  請求項１〜３３のいずれかに記載の発現カセットを含む発現ベクターでトランスフェクトした適切な宿主細胞を含む、レンチウイルスベクターをパッケージングするために有用な細胞株であって、そしてここで、前記ポリヌクレオチド配列が、該宿主細胞における発現と適合性の制御エレメントに作動可能に連結されている、細胞株。
【請求項４３】  適切な宿主細胞が、請求項１〜１４のいずれかに記載の発現カセットを含む発現ベクターでトランスフェクトされている、請求項４２に記載の細胞株。
【請求項４４】  適切な宿主細胞が、請求項１〜４に記載の発現カセットを含む発現ベクターでトランスフェクトされている、請求項４２に記載の細胞株。
【請求項４５】  適切な宿主細胞が、請求項１５〜３７に記載の発現カセットを含む発現ベクターでトランスフェクトされている、請求項４２に記載の細胞株。
【請求項４６】  被験体において使用するための遺伝子送達ベクターであって、ここで該ベクターが、請求項１〜３３のいずれかに記載の発現カセットを含み、そしてここで前記ポリヌクレオチド配列が、該被験体における発現と適合性の制御エレメントに作動可能に連結されている、遺伝子送達ベクター。
【請求項４７】  前記遺伝子送達ベクターが、非ウイルスベクター、ウイルスベクターおよび細菌プラスミドベクターからなる群より選択される、請求項４６に記載の遺伝子送達ベクター。
【請求項４８】  レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アルファウイルスベクターおよびポックスウイルス由来ベクターからなる群より選択される、請求項４７に記載のウイルスベクター。
【請求項４９】  前記ベクターが、真核生物層状ベクター開始系を含む、請求項４８に記載のアルファウイルスベクター。
【請求項５０】  前記ポックスウイルス由来ベクターが、ワクシニアウイルスである、請求項４８に記載のポックスウイルスベクター。
【請求項５１】  前記ベクターが粒子キャリアと会合している、請求項４６〜５０のいずれか１項に記載の遺伝子送達ビヒクル。
【請求項５２】  前記ベクターが、リポソーム調製物中にカプセル化されている、請求項４６〜５１のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項５３】  請求項１〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットを含む免疫応答を刺激するための組成物。
【請求項５４】  被験体における免疫応答を誘導するための医薬品の製造における請求項１〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットの使用。
【請求項５５】  請求項１〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットにより発現されるポリペプチドを生成する方法であって、該方法は、該ポリペプチドの発現を生じる条件下で宿主細胞を培養する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
【請求項５６】  被験体における免疫応答を誘導するための医薬品の製造における、請求項５５に記載の方法から回収されたポリペプチドの使用。
【請求項５７】  アジュバントをさらに含む、請求項５６に記載のポリペプチドの使用。
【請求項５８】  免疫応答を刺激するための請求項１〜３３のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド配列であって、該ポリヌクレオチド配列が、被験体の組織へ直接導入された場合に、ＨＩＶポリペプチドを作動可能にコードする、使用。
【請求項５９】  前記ポリヌクレオチド配列が、遺伝子送達ベクターにより組織へ導入される、請求項５８に記載のポリヌクレオチド配列。
【請求項６０】  被験体における免疫応答を誘導するための、請求項１〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットを含む組成物。
【請求項６１】  前記免疫応答が液性免疫応答である、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６２】  前記免疫応答が細胞性免疫応答である、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６３】  被験体における免疫応答を刺激するための組成物であって、該組成物は請求項１〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットを含み、該組成物は感作工程において被験体に投与されるのに適し、請求項１〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットを含む該第２の組成物と組み合せてブースト工程において該被験体に投与されるのに適する、組成物。
【請求項６４】  前記組成物または前記第２の組成物が、アジュバントをさらに含む、請求項６３に記載の組成物。
【請求項６５】  前記組成物および前記第２の組成物が、アジュバントをさらに含む、請求項６３に記載の組成物。
【請求項６６】  請求項１〜４のいずれかに記載の発現カセットのうちの少なくとも１つによりコードされるさらなるｇａｇポリペプチドをさらに含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６７】  請求項１５〜３７のいずれかに記載の発現カセットのうちの少なくとも１つによりコードされるさらなるｅｎｖポリペプチドをさらに含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６８】  免疫応答を誘導するための薬学的組成物であって、該組成物は、被験体に対する同時刺激または連続刺激に適する、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のｇａｇポリペプチドをコードする発現カセット、および請求項１５〜３３にいずれか１項に記載のｅｎｖポリペプチドをコードする発現カセットを含む、組成物。
【請求項６９】  前記被験体に対する、請求項１５〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットの投与が、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の発現カセットの投与の後に行われる、請求項６８に記載の薬学的組成物。
【請求項７０】  前記被験体に対する、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の発現カセットの投与が、請求項１５〜３３のいずれか１項に記載の発現カセットの投与後に行われる、請求項６８に記載の薬学的組成物。
【請求項７１】  ＨＩＶの処置において使用するための、請求項６０〜６７のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項７２】  アジュバントをさらに含む、請求項６０〜６７のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項７３】  ウイルス様粒子（ＶＬＰ）を生成するための方法であって、該方法は、請求項３７〜４２に記載の細胞を、該ＶＬＰを生成するための条件下でインキュベートする工程を包含する、方法。
【請求項７４】  ウイルス様粒子（ＶＬＰ）の組成物を生成するための方法であって、該方法は、（ａ）請求項３７〜４２に記載の細胞を、該ＶＬＰを生成するための条件下でインキュベートする工程；および（ｂ）該ＶＬＰを実質的に精製して、ＶＬＰの組成物を生成する工程を包含する、方法。