【手続補正書】
【提出日】平成19年7月12日(2007.7.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記の物質：
（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体、および
（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列の少なくとも１０の連続するヌクレオチドを含む、単離された核酸。
【請求項２】
請求項１に記載の組み換え核酸を含む、宿主細胞。
【請求項３】
請求項１に記載の単離された核酸を含む、発現ベクター。
【請求項４】
請求項３に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項５】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、あるいはその相補体またはそのフラグメントが検出可能な標識をさらに含む、ポリヌクレオチド。
【請求項６】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、あるいはその相補体またはそのフラグメントが支持体に結合されている、ポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、あるいはその相補体またはそのフラグメントが、少なくとも部分的に、化学合成により製造される、ポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、あるいはその相補体またはそのフラグメントがアンチセンスフラグメントである、ポリヌクレオチド。
【請求項９】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、あるいはその相補体またはそのフラグメントが１本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項１０】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチド、あるいはその相補体またはそのフラグメントが２本鎖である、ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
少なくとも１５の連続するヌクレオチドを含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１２】
少なくとも２０の連続するヌクレオチドを含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
下記の物質：
（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体、および
（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体
からなる群より選択される、ＤＫＫＬ１配列のオープンリーディングフレーム内にコードされる単離されたポリペプチド。
【請求項１４】
下記の物質：
（ａ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のポリペプチド配列の１０８位および１０９位にわたる少なくとも４つ連続する残基、および
（ｂ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のポリペプチド配列の６１位および６２位にわたる少なくとも４連続残基からなる群より選択される、ＤＫＫＬ１配列のオープンリーディングフレーム内にコードされる、単離されたポリペプチド。
【請求項１５】
請求項１４に記載のポリペプチドであって、
該ポリペプチドが、下記の物質（ａ）および（ｂ）：
（ａ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のポリペプチド配列の１０８位および１０９位にわたる少なくとも４つ連続する残基、および
（ｂ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のポリペプチド配列の６１位および６２位にわたる少なくとも４つの連続残基からなる群より選択されるＤＫＫＬ１ポリペプチドのアミノ酸配列のエピトープのアミノ酸配列
を含む、ポリペプチド。
【請求項１６】
請求項１４に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドまたはそのフラグメントが固体支持体に結合される、ポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１３〜１６のいずれか１項に記載のポリペプチドに結合する単離された抗体またはその抗体結合フラグメント。
【請求項１８】
請求項１７に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体またはそのフラグメントが固体支持体に結合される、抗体またはそのフラグメント。
【請求項１９】
請求項１７に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体がモノクローナル抗体である、抗体またはそのフラグメント。
【請求項２０】
請求項１７に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体がポリクローナル抗体である、抗体またはそのフラグメント。
【請求項２１】
請求項１７に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメントであって、該抗体またはそのフラグメントが検出可能な標識をさらに含む、抗体またはそのフラグメント。
【請求項２２】
請求項１３〜１６のいずれか１項に記載のポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントに結合する単離された抗体であって、以下の工程：
（ｉ）該ポリペプチドまたはその抗原結合フラグメントを含む組成物で非ヒト宿主動物を免疫する工程、および
（ｉｉ）抗原に対する抗体またはその抗原結合フラグメントを発現している該宿主から細胞を採取すること、を包含する方法により製造される、抗体。
【請求項２３】
請求項１９に記載のモノクローナル抗体であって、モノクローナル抗体が、下記の工程：（ａ）モノクローナル抗体を生産できるハイブリドーマを調製する工程；および、
（ｂ）ハイブリドーマによるモノクローナル抗体の生産をもたらす条件下にハイブリドーマを培養する工程、
を包含する方法により製造される、モノクローナル抗体。
【請求項２４】
請求項１９に記載のモノクローナル抗体を生産するハイブリドーマ。
【請求項２５】
請求項１７に記載の抗体であって、抗体がヒト化抗体である、抗体。
【請求項２６】
請求項１７に記載の抗体を含む癌細胞を検出するためのキット。
【請求項２７】
請求項１９に記載のモノクローナル抗体を含む癌細胞を検出するためのキット。
【請求項２８】
被験試料中の癌の存在を診断するためのキットであって、該キットが（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体、および（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体、からなる群より選択されるＤＫＫＬ１ポリヌクレオチド配列に選択的にハイブリダイズするポリヌクレオチドの少なくとも１つを含む、キット。
【請求項２９】
抗癌活性についてスクリーニングする方法であって、
下記の工程（ａ）〜（ｃ）：
（ａ）核酸配列によってコードされるＤＫＫＬ１遺伝子の発現を提供する工程であって、
該核酸配列が、以下の物質（ａ）および（ｂ）：
（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体；および
（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体
からなる群より選択される、工程；
（ｂ）抗癌剤候補に癌細胞から誘導した組織試料を接触させる工程；および、
（ｃ）組織試料中のＤＫＫＬ１ポリヌクレオチドの発現に対する抗癌剤候補の作用をモニタリングする工程、
を包含する、方法。
【請求項３０】
（ｄ）該薬剤候補の非存在下の発現の水準を薬剤候補の存在下の発現の水準と比較する工程をさらに包含する、請求項２９に記載の抗癌活性についてスクリーニングする方法。
【請求項３１】
被験細胞試料中のポリペプチドの発現に関連する癌を検出するための方法であって、
下記の工程：
（ｉ）以下の物質：
（ａ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のポリペプチド配列の１０８位および１０９位にわたる少なくとも４つ連続する残基、および
（ｂ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のポリペプチド配列の６１位および６２位にわたる少なくとも４連続残基からなる群より選択されるＤＫＫＬ１ポリペプチドの少なくとも１つの発現の水準を検出する工程；および、
（ｉｉ）被験試料中のポリペプチドの発現の水準を正常細胞試料中のポリペプチドの発現の水準と比較する工程であって、ここで、正常細胞試料中のポリペプチド発現の水準と相対比較した場合の被験細胞試料中のポリペプチドの発現の改変された水準は被験細胞試料中の癌の存在を示す工程、
を包含する、方法。
【請求項３２】
被験血清試料中の抗体の存在に関連する癌を検出するための方法であって、
下記の工程：
（ｉ）以下の物質：
（ａ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のポリペプチド配列の１０８位および１０９位にわたる少なくとも４つ連続する残基、および
（ｂ）図４Ａ〜４Ｂに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のポリペプチド配列の６１位および６２位にわたる少なくとも４連続残基からなる群より選択されるＤＫＫＬ１ポリペプチドの少なくとも１つの発現の水準を検出することからなる群より選択される抗原ポリペプチドに対する抗体の水準を検出する工程；および、
（ｉｉ）被験試料中の該抗体の発現の水準を対照試料中の該抗体の水準と比較すること、ここで対照試料中の抗体の水準と相対比較した場合の該被験試料中の抗体の改変された水準は被験血清試料中の癌の存在を示す工程、
を包含する、方法。
【請求項３３】
ＤＫＫＬ１タンパク質の活性を調節することができる生物活性剤をスクリーニングするための方法であって、
該タンパク質は、以下の物質：
（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体、および
（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体からなる群より選択される核酸配列を含む核酸によりコードされ、
該方法は、下記工程：
ａ）ＤＫＫＬ１タンパク質と候補生物活性剤を組み合わせる工程；および、
ｂ）タンパク質の生物活性に対する候補薬剤の作用を測定する工程、
を包含する、方法。
【請求項３４】
請求項３３に記載の生物活性剤のスクリーニング方法であって、生物活性剤がＤＫＫＬ１タンパク質の発現に影響する、方法。
【請求項３５】
癌を処置するための組成物であって、
ＤＫＫＬ１タンパク質の阻害剤を含み、
該タンパク質が、以下の物質：
（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体、および
（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体からなる群より選択される核酸配列を含む核酸によりコードされる、
組成物。
【請求項３６】
請求項３５に記載の癌を処置するための組成物であって、ＤＫＫＬ１タンパク質の阻害剤がＤＫＫＬ１タンパク質に結合する、組成物。
【請求項３７】
細胞内のＤＫＫＬ１遺伝子の発現を抑制するための組成物であって：
ＲＮＡ干渉を誘発するために十分な量の、以下の物質：（ａ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ８およびクローン３７９−ＲＳ３のヌクレオチド配列の３２９位および３３０位にわたるヌクレオチドまたはその相補体、および（ｂ）図３Ａ〜３Ｅに示すクローン３７９−Ｒ４、クローン３７９−Ｒ５、クローン３７９−Ｒ２、クローン３７９−ＲＳ７およびクローン３７９−ＲＳ４のヌクレオチド配列の１８８位および１８９位にわたる連続ヌクレオチドまたはその相補体のポリヌクレオチド配列に相当するＤＫＫＬ１ｍＲＮＡにハイブリダイズできる配列を含む２本鎖ＲＮＡ、
を含む、組成物。
【請求項３８】
請求項３７に記載の組成物であって、２本鎖ＲＮＡがトランスフェクション、エレクトロポレーションおよびマイクロインジェクションからなる群より選択される方法により細胞内に導入されるのに適している低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）により提供される、組成物。
【請求項３９】
請求項３７に記載の組成物であって、２本鎖ＲＮＡが発現ベクターにより細胞内に導入されるのに適している低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）により提供される、組成物。