【手続補正書】
【提出日】平成19年6月25日(2007.6.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ゲノムＤＮＡの一部分に特異的なプローブを含むアッセイにおいて、溶解組織サンプルから得られた該ゲノムＤＮＡのサンプル中の指定された遺伝子配列を検出する方法において
磁気粒子を用いて前記溶解組織サンプルから前記ゲノムＤＮＡを分離し、前記指定された遺伝子配列を検出する方法。
【請求項２】  前記基材が、光学的に平坦である請求項１記載の方法。
【請求項３】  前記ゲノムＤＮＡの一部分に特異的なプローブがデンドリマーに結合する請求項１記載の方法。
【請求項４】  前記デンドリマーがシアニン３である請求項３記載の方法。
【請求項５】  前記ゲノムＤＮＡを基材に固定する工程を含む請求項１記載の方法。
【請求項６】  遠隔地のユーザーが電子通信リンクを介してスクリーニング検査室にスクリーニングパラメーターを提供し、前記遠隔地のユーザーによりスクリーニング検査室に送られる複数の生物サンプル中のゲノムＤＮＡスクリーニングのサンプル出力リポートを要求及び受信する方法であって、
（ａ）アクセスしたい旨を遠隔地ユーザーからスクリーニング検査室に電子通信リンクを介して送信する工程；
（ｂ）アクセスを可能にする応答を前記スクリーニング検査室から前記遠隔地ユーザーに電子通信リンクを介して受信する工程（前記アクセスを可能にする応答が前記スクリーニングパラメーターを含む）；
（ｃ）前記遠隔地のユーザーがスクリーニングパラメーターを選択して、選択されたスクリーニングパラメーター選択を選択する工程；
（ｄ）遠隔地ユーザーから前記スクリーニング検査室に前記選択されたスクリーニングパラメーター選択を電子通信リンクを介して送信する工程；
（ｅ）複数の生物サンプルを前記遠隔地ユーザーから前記スクリーニング検査室へ輸送する工程、この複数のサンプルの輸送は、複数のウェルプレートの対応するウェルに複数の生物サンプルのそれぞれ１つを配置する工程を含む；及び
（ｆ）前記スクリーニング検査室からの複数の生物サンプルのサンプル出力リポートを前記電子通信リンクを介して前記遠隔地ユーザーが受信する工程；
を含み、前記電子通信リンクがインターネットであることを特徴とする方法。
【請求項７】  前記複数のウェルプレートが９６ウェルプレートである請求項６記載の方法。
【請求項８】  さらに複数の生物サンプルのそれぞれを複数のウェルプレートのウェルと関連づける工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項９】  アクセスを可能にする応答を受信する工程がサンプルの特定及び指定セクションを含む請求項６記載の方法。
【請求項１０】  サンプルの特定及び指定セクションが、複数のウェルを有するウェルプレートを指定し、各ウェルが関連づけされたウェル位置を有する請求項９記載の方法。
【請求項１１】  サンプルの特定及び指定セクションが、複数のウェルのｘ−ｙ位置づけを与え、この位置づけが複数の横列及び複数の縦列を規定する請求項９記載の方法。
【請求項１２】  さらに、複数のウェルのｘ−ｙ位置づけのそれぞれを指定する工程を含む請求項１１記載の方法。
【請求項１３】  アクセスを可能にする応答を受信する工程が、少なくとも１つのスクリーニングパラメーター選択を入力するための作業の調査セクションを含む請求項６記載の方法。
【請求項１４】  さらに、複数のウェルプレート中の複数の生物サンプルのそれぞれを指定する工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項１５】  さらに、複数の生物サンプルのコントロールサンプルを指定する工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項１６】  さらに、複数のウェルプレートのプレートアクセス番号を指定する工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項１７】  さらに、複数の生物サンプルのどのサンプルが複数のウェルプレートの各ウェルに配置されるかを指定する工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項１８】  アクセス要求が、アカウント名及びパスワードを含む請求項６記載の方法。
【請求項１９】  スクリーニングパラメーター選択が試験すべき多数の系統を表示するデータを含む請求項６記載の方法。
【請求項２０】  スクリーニングパラメーター選択が指定されたコントロールを含む請求項６記載の方法。
【請求項２１】  スクリーニングパラメーター選択が指定された遺伝子配列を含む請求項６記載の方法。
【請求項２２】  サンプル出力リポートがスクリーニング結果の絵表示を含む請求項６記載の方法。
【請求項２３】  サンプル出力リポートが指定されたコントロールを含む請求項６記載の方法。
【請求項２４】  サンプル出力リポートが指定されたコントロールと比較した複数の生物サンプルのそれぞれの定量分析を含む請求項６記載の方法。
【請求項２５】  サンプル出力リポートが指定されたコントロールと比較した複数の生物サンプルのそれぞれの定性分析を含む請求項６記載の方法。
【請求項２６】  サンプル出力リポートが複数のウェルプレート中の複数の生物サンプルのそれぞれのウェル位置を含む請求項６記載の方法。
【請求項２７】  サンプル出力リポートが複数の生物サンプルのそれぞれのコピー数を含む請求項６記載の方法。
【請求項２８】  サンプル出力リポートがウェルプレートのアクセス番号を含む請求項６記載の方法。
【請求項２９】  さらに、複数のウェルを有するウェルプレートを遠隔地ユーザーに電子的に示す工程を含み、各ウェルが複数のウェルプレート上の対応するウェルプレート位置を有する、請求項６記載の方法。
【請求項３０】  ウエブサイトと遠隔地ユーザーコンピューター間の電子通信により複数の生物サンプルのためのトランスジェニックまたは標的突然変異誘発スクリーニングを電子的に注文するコンピューターを使用した方法であって、下記の工程を含む方法。
（ａ）遠隔地ユーザーコンピューターからウエブサイトにアカウント名及びパスワードを送信してウエブサイトへのアクセスを得る工程；
（ｂ）遠隔地ユーザーコンピューターでトランスジェニックまたは標的突然変異誘発スクリーニングのための複数の生物サンプルを指定する工程；
（ｃ）遠隔地ユーザーコンピューターで複数のウェル中の複数の生物サンプルの位置を指定する工程；及び
（ｄ）複数の生物サンプルそれぞれについてスクリーニングされる遺伝子配列を指定する工程。
【請求項３１】  さらに以下の工程を含む請求項３０記載の方法。
（ａ）複数のウェル中の複数の生物サンプルの位置を指定する工程の結果をウエブサイトに送信する工程；
（ｂ）複数の生物サンプルの遺伝子配列を指定する工程の結果をウエブサイトに送信する工程；及び
（ｃ）ウェルプレート中の対応する複数の生物サンプルをスクリーニング検査室に輸送する工程。
【請求項３２】  複数の生物サンプル中のゲノムＤＮＡをスクリーニングする方法において、該サンプルが、遠隔地のユーザーによりスクリーニング検査室の最終到着地に送付され、スクリーニングが指定された遺伝子配列について実施され、さらに、前記遠隔地のユーザーがインターネットを介してスクリーニングウエブサイトにスクリーニングパラメーターを提供する方法であって、
（ａ）アクセスを可能にする応答を前記スクリーニングウエブサイトから前記遠隔地ユーザーにインターネットを介して送信する工程、ここで、前記アクセスを可能にする応答が前記スクリーニングパラメーターを含む；
（ｂ）選択されたスクリーニングパラメーター選択を前記遠隔地のユーザーからインターネットを介して受信する工程；
（ｃ）複数のウェルプレート中の複数の生物サンプルを受け取る工程；
（ｄ）選択されたスクリーニングパラメーターに従って前記複数の生物サンプルを試薬を用いてスクリーニングし、スクリーニング結果を得る工程；及び
（ｅ）指定された遺伝子配列についてのスクリーニング結果をインターネットを介して遠隔地のユーザーに送信する工程。
【請求項３３】  ウエブサイトと遠隔地ユーザーコンピューター間の電子通信により複数のウェルプレート中の複数の生物サンプルのトランスジェニックまたは標的突然変異誘発スクリーニングの注文をコンピューターを使用して処理する方法であって、下記の工程を含む方法。
（ａ）遠隔地ユーザーコンピューターからユーザーアカウント名及びパスワードを受信する工程；
（ｂ）該アカウント名及びパスワードの有効性をチェックする工程；
（ｃ）複数の生物サンプルをスクリーニングするための遺伝子配列の指定を遠隔地のユーザーから受信する工程；
（ｄ）トランスジェニックまたは標的突然変異誘発スクリーニングのための複数の生物サンプルの指定を遠隔地ユーザーから受信する工程；及び
（ｅ）複数の生物サンプルのどの指定が複数のウェルプレートのそれぞれに配置されたかを遠隔地ユーザーコンピューターから受信する工程。
【請求項３４】  さらに以下の工程を含む請求項３３記載の方法。
指定された遺伝子配列を調査する工程；及び
指定された遺伝子配列の一部分を標的遺伝子配列として指定する工程。
【請求項３５】  さらに以下の工程を含む請求項３３記載の方法。
標的遺伝子配列をサプライヤーに送信して標的結合プローブを作成する工程；及び
サプライヤーから標的結合プローブを受け取る工程。
【請求項３６】  複数の生物サンプルが１つの遺伝子系統由来のものである請求項３３記載の方法。
【請求項３７】  複数の生物サンプルが複数の遺伝子系統由来のものである請求項３３記載の方法。
【請求項３８】  以下の工程を含むスクリーニング検査室で複数のウェルプレート中の複数の生物サンプルをスクリーニングする方法。
遠隔地のユーザーから、スクリーニングパラメーター選択を含む電子通信を受信する工程；
該スクリーニングパラメーター選択をスクリーニング検査室の検査室情報管理システムに入力する工程；
スクリーニング検査室の複数のウェルプレートを受け入れる工程；及び
スクリーニング検査室で複数の生物サンプルから単離されたゲノムＤＮＡをスクリーニングする工程。