【手続補正書】
【提出日】平成19年7月27日(2007.7.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  古細菌MCM並びに少なくとも１の、PCNA、RFC-P38、RFC-P55、RFA、CDC6、FEN-1、dUTPase、リガーゼ、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、及びヘリカーゼ8から成る群から選ばれる古細菌ポリペプチドを含む、核酸ポリメラーゼ反応促進用組成物。
【請求項２】  古細菌CDC6並びに少なくとも１の、PCNA、RFC-P38、RFC-P55、RFA、FEN-1、リガーゼ、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、ヘリカーゼ8、及びdUTPaseから成る群から選ばれる古細菌ポリペプチドを含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項３】  古細菌FEN-1並びに少なくとも１の、PCNA、RFC-P38、RFC-P55、RFA、リガーゼ、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、ヘリカーゼ8、及びdUTPaseから成る群から選ばれる古細菌ポリペプチドを含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項４】  古細菌RFA並びに少なくとも１の、PCNA、RFC-P38、RFC-P55、FEN-1、リガーゼ、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、ヘリカーゼ8及び、dUTPaseから成る群から選ばれる古細菌ポリペプチドを含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項５】  古細菌リガーゼ並びに少なくとも１の、PCNA、RFC-P38、RFC-P55、RFA、CDC6、FEN-1、MCM、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、ヘリカーゼ8、及びdUTPaseから成る群から選ばれる古細菌ポリペプチドを含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項６】  少なくとも１の、MCM、RFA、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、及びヘリカーゼdna2から成る群から選ばれる古細菌補助因子を含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項７】  さらにポリメラーゼを含む、請求項1〜6の何れか一項に記載の組成物。
【請求項８】  古細菌CDC6、古細菌MCM及び少なくとも１のポリメラーゼを含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項９】  古細菌PCNA、古細菌FEN-1及び少なくとも１のポリメラーゼを含む、核酸ポリメラーゼ反応を促進する組成物。
【請求項１０】  前記ポリメラーゼが、耐熱性ポリメラーゼである、請求項7〜9の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１１】  さらに2次ポリメラーゼを含む、請求項7〜9の何れか一項に記載の組成物。
【請求項１２】  前記2次ポリメラーゼが、耐熱性ポリメラーゼである、請求項11に記載の組成物。
【請求項１３】  以下の：（a）図16（配列番号）に記載のヌクレオチド配列、若しくはヌクレオチド7から始まる図16のヌクレオチド配列；（b）図17（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド、若しくはアミノ酸3から始まる図17のアミノ酸配列；又は（c）（a）若しくは（b）のアナログ若しくは縮重変異体を含む古細菌RFAをコードする単離及び精製ポリヌクレオチド。
【請求項１４】  以下の：（a）図45（配列番号）若しくは図55（配列番号）に記載のヌクレオチド配列；（b）図46（配列番号）若しくは図47（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；又は（c）（a）若しくは（b）のアナログ若しくは縮重変異体を含む古細菌MCMをコードする単離及び精製ポリヌクレオチド。
【請求項１５】  古細菌ヘリカーゼをコードする単離及び精製ポリヌクレオチドであって、ここで上記ポリヌクレオチドが以下の：（a）図22（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（b）図29（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（c）図23（配列番 号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（d）図30（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（e）図24（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（f）図31（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（g）図25（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（h）図32（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（i）図26（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（j）図33（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（k）図27（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（l）図34（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（m）図28（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（n）図35（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；（o）図29（配列番号）に記載のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；（p）図36（配列番号）に記載のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；及び（q）（a）〜（p）のアナログ若しくは縮重変異体から成る群から選ばれる、古細菌ヘリカーゼをコードする単離及び精製ポリヌクレオチド。
【請求項１６】  MCM、RFA、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、及びヘリカーゼ7から成る群から選ばれる単離及び精製古細菌ポリペプチド。
【請求項１７】  核酸ポリメラーゼ反応に請求項1〜6及び請求項8の何れか一項に記載の組成物を利用することを含む核酸ポリメラーゼ反応の促進方法。
【請求項１８】  そのポリメラーゼ反応に古細菌MCM、古細菌CDC6、及び古細菌FEN-1から成る群から選ばれる少なくとも1の補助因子を添加することを含む、核酸ポリメラーゼ反応における核酸二重鎖の安定性増加の方法。
【請求項１９】  そのポリメラーゼ反応に古細菌PCNA、並びにMCM、CDC6、FEN-1、RFC-P38、RFC-P55、RFA、dUTPase、リガーゼ、ヘリ カーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、及びヘリカーゼ8から成る群から選ばれる少なくとも1の古細菌ポリペプチドを添加することを含む、核酸ポリメラーゼ反応における核酸二重鎖の安定性増加の方法。
【請求項２０】  そのエキソヌクレアーゼ反応に古細菌PCNA、並びにMCM、CDC6、FEN-1、RFC-P38、RFC-P55、RFA、dUTPase、リガーゼ、ヘリカーゼdna2、ヘリカーゼ2、ヘリカーゼ3、ヘリカーゼ４、ヘリカーゼ5、ヘリカーゼ6、ヘリカーゼ7、及びヘリカーゼ8から成る群から選ばれる少なくとも1の古細菌ポリペプチドを添加することを含む、エキソヌクレアーゼ反応促進の方法。
【請求項２１】  請求項1〜6及び請求項8の何れか一項に記載の組成物を含むキット。
【請求項２２】  請求項13〜15の何れか一項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２３】  以下の：宿主細胞内に請求項22に記載のベクターのポリヌクレオチドを発現させ、そして上記発現ポリペプチドを精製することを含むピロコッカス・フリオサスポリペプチド製造方法。
【請求項２４】  請求項22に記載のベクターを含む宿主細胞。