【手続補正書】
【提出日】平成19年9月14日(2007.9.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１の鎖中に配列された複数の第１のペプチドモノマー単位および第２の鎖中に配列された複数の第２のペプチドモノマー単位を含むタンパク質構造体であって、前記第１及び第２のモノマー単位は７残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇ）及び／又は１１残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇｈｉｊｋ）を含み、少なくとも１対の対応する第１及び第２のモノマー単位上の位置「ａ」のアスパラギン、アルギニン、リジンまたはその他の相補的残基の対によって、前記第１及び第２の鎖が互い違いの平行へテロ二量体超らせん構造を確実に形成することを特徴とする、タンパク質構造体。
【請求項２】
前記第１の鎖中の第１のペプチドモノマー単位は前記第２の鎖中の対応する第２のペプチドモノマー単位を超えて前記両鎖の方向に伸びることを特徴とする、請求項１に記載のタンパク質構造体。
【請求項３】
第１のペプチドモノマー単位の少なくとも１つの荷電アミノ酸残基は第２のペプチドモノマー単位の逆荷電アミノ酸残基を引き付けるよう配列される、請求項１または２に記載のタンパク質構造体。
【請求項４】
前記荷電アミノ酸残基は、前記第２の鎖中の対応する第２のペプチドモノマー単位を超えて延びる第１のペプチドモノマー単位の末端部分に存在する、請求項３に記載のタンパク質構造体。
【請求項５】
少なくとも１つの鎖はそれぞれ第１のまたは第２のペプチドモノマー単位だけからなる、請求項１〜４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項６】
前記第１及び第２のモノマー単位の、残りの位置「ａ」の１又は複数は疎水性の残基である、請求項１〜５のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項７】
前記疎水性の残基がイソロイシンまたはバリンから選択される、請求項６に記載のタンパク質構造体。
【請求項８】
前記第１及び第２のモノマー単位の、１又は複数の位置「ｄ」にロイシンを有することを特徴とする、請求項１〜７のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項９】
それぞれのモノマー単位の位置「ｇ」および「ｅ」に逆荷電残基またはそうでなければ相補的残基を有する、請求項１〜８のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項１０】
前記逆荷電残基はグルタミン酸およびリジン残基またはアルギニンおよびアスパラギン酸残基、あるいはこれらのアミノ酸残基の合成誘導体である、請求項９に記載のタンパク質構造体。
【請求項１１】
前記構造は対応する第１のおよび第２のペプチドモノマー単位により提供されるアスパラギン、アルギニン、リジンまたはその他の相補的残基の対により安定化される、請求項１〜１０のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項１２】
管状構造を形成するよう配列される、請求項１〜１１のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項１３】
前記反復モチーフは配列中の２又はそれ以上のアミノ酸位置によりオフセットされ、それにより前記ペプチドモノマー単位が円筒体を形成する、請求項１２に記載のタンパク質構造体。
【請求項１４】
前記第１のおよび第２のペプチドモノマー単位は以下の配列
ａ）KIAALKQKIASLKQEIDALEYENDALEQ（ＳＡＦ−ｐ１）および
ｂ）KIRALKAKNAHLKQEIAALEQEIAALEQ（ＳＡＦ−ｐ２）をそれぞれ有するか、または
ｃ）KIAALKQKIAALKQEIDALEYENDALEQ（ＳＡＦ−ｐ１Ａ）および
ｄ）KIRALKWKNAHLKQEIAALEQEIAALEQ（ＳＡＦ−ｐ２Ｃ）をそれぞれ有するか、または
ｅ）KIAALKQKIASLKQEIDALEYENDALEQ（ＳＡＦ−ｐ１Ｃ）および
ｆ）KIRALKWKNAHLKQEIAALEQEIAALEQ（ＳＡＦ−ｐ２Ｃ）をそれぞれ有する、請求項１〜１３のいずれか一項に記載のタンパク質構造体。
【請求項１５】
以下の配列
ａ）KIAALKQKIASLKQEIDALEYENDALEQ（ＳＡＦ−ｐ１）、
ｂ）KIRALKAKNAHLKQEIAALEQEIAALEQ（ＳＡＦ−ｐ２）、
ｃ）KIAALKQKIAALKQEIDALEYENDALEQ（ＳＡＦ−ｐ１Ａ）、
ｄ）KIRALKWKNAHLKQEIAALEQEIAALEQ（ＳＡＦ−ｐ２Ｃ）および
ｅ）KIAALKQKIASLKQEIDALEYENDALEQ（ＳＡＦ−ｐ１Ｃ）
から選択されるアミノ配列を有する、タンパク質構造体の調製に用いるためのペプチドモノマー単位。
【請求項１６】
少なくとも１つのアミノ酸残基が誘導体化される、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体又は請求項１５に記載のペプチドモノマー単位。
【請求項１７】
２又はそれ以上の、請求項１〜１１のいずれか一項に記載のタンパク質構造体を含み、それらは同時に結合してＴ字型複合構造を形成することを特徴とする、分枝自己集合繊維。
【請求項１８】
前記タンパク質構造体の少なくとも１つは、１又は複数の中央システイン残基を含み、かつ少なくとも１つの残りのタンパク質構造体は末端システイン残基を含む、請求項１７に記載の分枝自己集合繊維。
【請求項１９】
タンパク質構造体の製造方法であって、会合して請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体を形成する第１及び第２のモノマー単位の混合物を提供することを含
み、第１及び第２のモノマー単位は７残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇ）及び／又は１１残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇｈｉｊｋ）を含むことを特徴とする、方法。
【請求項２０】
前記タンパク質構造体は誘導体化される、請求項１９記載の方法。
【請求項２１】
前記タンパク質構造体は架橋により安定化される、請求項１９または２０に記載の方法。
【請求項２２】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体の会合により生成されるタンパク質繊維。
【請求項２３】
タンパク質構造体の製造のためのキットであって、会合して請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体または請求項２２記載のタンパク質繊維を形成する第１のおよび第２のペプチドモノマー単位を含み、第１のおよび第２のモノマー単位は７残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇ）及び／又は１１残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇｈｉｊｋ）を含むことを特徴とする、キット。
【請求項２４】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体または請求項２２記載のタンパク質繊維を含む二次元グリッド。
【請求項２５】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体または請求項２２記載のタンパク質繊維を含む三次元マトリックス。
【請求項２６】
溶液中で集合するよう配列される請求項２５に記載のマトリックス。
【請求項２７】
前記タンパク質構造体に１又は複数の結合剤が融合され、１又は複数の結合剤は１又は複数の標的存在物に対する強い親和力が生じるように配列される、請求項２５または２６記載のマトリックス。
【請求項２８】
１又は複数の標的存在物を結合するよう配列される、請求項２５〜２７のいずれか一項に記載のマトリックス。
【請求項２９】
ウイルスを結合するよう配列される、請求項２５〜２７のいずれか一項に記載のマトリックス。
【請求項３０】
第１のおよび第２の、それぞれ異なるモノマー単位の混合物が提供され、第１のおよび第２のモノマー単位は７残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇ）及び／又は１１残基反復モチーフ（ａｂｃｄｅｆｇｈｉｊｋ）を含み、それらは会合して請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体を複数形成し、それらのタンパク質構造体は会合して三次元マトリックスを形成する、請求項２５〜２９のいずれか一項に記載のマトリックスの形成方法。
【請求項３１】
前記マトリックスはインシトゥで形成される請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
合成ポリマーの製造を制御する方法であって、該ポリマーと共に、請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体を集合させることを含む方法。
【請求項３３】
前記タンパク質構造体は前記ポリマーの合成後に除去される、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のタンパク質構造体を含む、原子間力顕微鏡に用いるためのチップ。