【手続補正書】
【提出日】平成19年2月22日(2007.2.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】【請求項１】  （ａ）配列番号２−１４、２０、２２−３３、３５−４３、４５−４９、５１、５２、５６−６２および８８−１１２に列挙された配列、（ｂ）配列番号２−１４、２０、２２−３３、３５−４３、４５−４９、５１、５２、５６−６２および８８−１１２に列挙された配列の相補体、（ｃ）配列番号２−１４、２０、２２−３３、３５−４３、４５−４９、５１、５２、５６−６２および８８−１１２に列挙された配列の逆相補体、（ｄ）配列番号２−１４、２０、２２−３３、３５−４３、４５−４９、５１、５２、５６−６２および８８−１１２に列挙された配列の逆配列、（ｅ）配列番号２−１４、２０、２２−２３、２５−３３、３５−４２、４５−４９、５６−５９、６２、８８−９９および１０１−１１２に提供された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも６０％ある配列、（ｆ）配列番号２−１４、２０、２２−２３、２５−３３、３５−４９、５２、５６−６１、６２、８８−９９および１０１−１１２に提供された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも７５％ある配列、（ｇ）配列番号２−１４、２０、２２−３３、３５−４９、５１、５２、５６−６１、６２および８８−１１２に提供された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも９０％ある配列からなるグループから選択された配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。【請求項２】  （ａ）配列番号１および３４に列挙された配列、（ｂ）配列番号１および３４に列挙された配列の相補体、（ｃ）配列番号１および３４に列挙された配列の逆相補体、（ｄ）配列番号１および３４に列挙された配列の逆配列、（ｅ）配列番号１および３４に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも４０％ある配列、（ｆ）配列番号１および３４に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも６０％ある配列、（ｇ）配列番号１および３４に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも７５％ある配列、（ｈ）配列番号１および３４に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも９０％ある配列からなるグループから選択された配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。【請求項３】  （ａ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５１−５３、５６、５７、６０、６１および８６に列挙された配列、（ｂ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５１−５３、５６、５７、６０、６１および８６の配列の相補体、（ｃ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５１−５３、５６、５７、６０、６１および８６の配列の逆相補体、（ｄ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５１−５３、５６、５７、６０、６１および８６の配列の逆配列、（ｅ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５２−５３、５６、５７、６１および８６に提供された配列に対しヌクレオチド同一性が少なくとも６０％ある配列、（ｆ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５２−５３、５６、５７、６０、６１および８６に提供された配列に対しヌクレオチド同一性が少なくとも７５％ある配列、（ｇ）配列番号１、２２、２５、２６、２８、３４、３５、３６、４０、４５、４６、５１−５３、５６、５７、６０、６１および８６に提供された配列に対しヌクレオチド同一性が少なくとも９０％ある配列からなるグループから選択されたポリヌクレオチドにエンコードされた、単離されたポリペプチド。【請求項４】  前記ポリペプチドは配列番号６３−７９および８７からなるグループから選択された配列を含む、請求項３に記載の単離されたポリペプチド。【請求項５】  請求項１および２のいずれかに記載のポリヌクレオチドを含む、ＤＮＡコンストラクト。【請求項６】  ５’から３’の方向に、（ａ）プロモーター配列、（ｂ）関心のあるＤＮＡ配列、（ｃ）遺伝子ターミネーション配列を含み、該プロモーター配列は請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む、ＤＮＡコンストラクト。【請求項７】  前記関心のあるＤＮＡ配列は関心のあるポリペプチドをエンコードするオープン・リーディング・フレームを含む、請求項６に記載のＤＮＡコンストラクト。【請求項８】  前記関心のあるＤＮＡ配列は関心のあるポリペプチドをエンコードする遺伝子のノンコーディング領域を含む、請求項６に記載のＤＮＡコンストラクト。【請求項９】  請求項５ないし８のいずれかに記載のＤＮＡコンストラクトを含む、トランスジェニック細胞。【請求項１０】  請求項９に記載のトランスジェニック細胞を含む生物。【請求項１１】  請求項９に記載のトランスジェニック細胞を含む、植物あるいは該植物の部分、零余子または子孫。【請求項１２】  標的生物における遺伝子発現を改変するための方法であって、請求項５ないし８に記載のいずれかのＤＮＡコンストラクトを該標的生物のゲノムに安定的に取り込むことを含む方法。【請求項１３】  前記生物は植物である、請求項１２に記載の方法。【請求項１４】  遺伝子発現が改変された植物を作出するための方法であって、（ａ）トランスジェニック細胞を用意するために、（ｉ）配列番号１−１４、２０、２２−６２、８１−８６および８８−１１２の配列を含むプロモーター配列、（ｉｉ）関心のあるＤＮＡ配列、（ｉｉｉ）遺伝子ターミネーション配列を含むＤＮＡコンストラクトで植物細胞を形質転換すること、（ｂ）得られたトランスジェニック細胞を再生と成熟した植物の成長に導く条件下で培養することを含む、遺伝子発現が改変された植物を作出するための方法。【請求項１５】  標的生物の表現型を改変するための方法であって、（ａ）配列番号１−１４、２０、２２−６２、８１−８６および８８−１１２の配列を含むプロモーター配列、（ｂ）関心のあるＤＮＡ配列、（ｃ）遺伝子ターミネーション配列を含むＤＮＡコンストラクトを該標的生物のゲノムに安定的に取り込むことを含む方法。【請求項１６】  前記標的生物は植物である、請求項１５に記載の方法。【請求項１７】  （ａ）テストされる遺伝子を操作可能に連結した配列番号１−１４、２０、２２−６２、８１−８６および８８−１１２の配列を含むプロモーター配列を含むＤＮＡコンストラクトで植物細胞を形質転換すること、（ｂ）該植物細胞を再生と成熟した植物の成長に導く条件下で培養すること、（ｃ）得られたトランスジェニック植物の表現型を形質転換されなかった植物の表現型と比較することを含む、所望の機能または表現型の原因遺伝子を同定する方法。【請求項１８】  （ａ）配列番号２１に列挙された配列、（ｂ）配列番号２１に列挙された配列の相補体、（ｃ）配列番号２１に列挙された配列の逆相補体、（ｄ）配列番号２１に列挙された配列の逆配列、（ｅ）配列番号２１に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも４０％ある配列、（ｆ）配列番号２１に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも６０％ある配列、（ｇ）配列番号２１に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも７５％ある配列、（ｈ）配列番号２１に列挙された配列に対しコンピューターアルゴリズムＢＬＡＳＴＮを用いて決定されたヌクレオチド同一性が少なくとも９０％ある配列からなるグループから選択された配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。【請求項１９】  請求項１８に記載のオリゴヌクレオチドを含むＤＮＡコンストラクト。【請求項２０】  請求項１９に記載のＤＮＡコンストラクトを含むトランスジェニック細胞。【請求項２１】  標的生物における遺伝子発現を改変するための方法であって、請求項１９に記載のＤＮＡコンストラクトを安定的に該標的生物のゲノムに取り込むことを含む方法。【請求項２２】  配列番号２１の配列を含むポリヌクレオチドの発現を改変するための方法であって、該ポリヌクレオチドから配列番号２１の配列を除去することを含む方法。