【手続補正書】
【提出日】平成19年2月8日(2007.2.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者におけるＳＭＥＩを診断するための方法であって、患者のサンプルにおける遺伝子の調節領域内を含むＳＣＮ１Ａ遺伝子における変化を検出すること、および、その変化が、ＳＭＥＩ関連またはＳＭＥＩ非関連であることが知られているかどうかを確認すること、あるいは、そのいずれかであることが知られていない場合には、その変化がＳＭＥＩ関連の変化であるという可能性を決定することを含む方法。
【請求項２】
変化がＳＭＥＩ関連であることが知られている場合にはＳＭＥＩの蓋然性が高いとする診断を確立することをさらに含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
変化がＳＭＥＩ関連であるとして表３で特定される変化の一つである請求項２に記載の方法。
【請求項４】
変化がＳＭＥＩ非関連である場合にはＳＭＥＩの蓋然性が低いとする診断を確立することを含む請求項１に記載の方法。
【請求項５】
変化がＳＭＥＩ非関連であるとして表３で特定される変化の一つである請求項４に記載の方法。
【請求項６】
変化がＳＭＥＩ関連の変化である可能性が以下のことによって確立される請求項１に記載の方法：
親および／または親類についての遺伝的データを考慮し；そして
変化がデノボ変化であるかまたは遺伝性のものかどうかを確立する。
【請求項７】
変化がタンパク質に対する大きな中断を生ずるかどうかを確立することをさらに含む請求項６に記載の方法。
【請求項８】
変化が短縮突然変異である請求項７に記載の方法。
【請求項９】
遺伝的突然変異の場合にはＳＭＥＩの蓋然性が低いとし、デノボ突然変異の場合にはＳＭＥＩの蓋然性が高いとし、デノボ突然変異がタンパク質に対する大きな中断を生ずる場合にはＳＭＥＩの蓋然性が極めて高いとする診断を確立することを含む請求項６〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
ＳＣＮ１Ａの変化の存在について検査し、かつ、その変化の種類を特定するために１つまたは複数のアッセイを行うことを含む請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
以下の工程を含む請求項１０に記載の方法：
（１）患者のＳＣＮ１Ａ遺伝子における変化の存在について検査するために１つまたは複数のアッセイを行う工程；および、結果がＳＣＮ１Ａ遺伝子における変化の存在を示すならば、
（２）そのＳＣＮ１Ａ変化の種類を特定するために１つまたは複数のアッセイを行う工程。
【請求項１２】
アッセイの一つがＤＮＡハイブリダイゼーションアッセイである請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１３】
ＳＣＮ１Ａ遺伝子プローブ、ＳＣＮ１Ａエキソン特異的プローブまたはＳＣＮ１Ａ対立遺伝子特異的プローブが前記患者から単離されたゲノムＤＮＡにハイブリダイズされる請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
アッセイの一つが高性能液体クロマトグラフィーである請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１５】
アッセイの一つが電気泳動アッセイである請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１６】
検査されるべきサンプルＤＮＡがＳＣＮ１Ａ遺伝子の少なくとも一つのエキソンについて定量的に増幅されて増幅されたフラグメントを生じ、各増幅されたエキソンについての増幅生成物の長さが、野生型ＳＣＮ１Ａ遺伝子が同一のプライマーを用いて増幅された場合に得られる増幅生成物の長さと比較され、それにより増幅されたサンプルエキソンと対応する増幅された野生型エキソンとの間の長さの相違がサンプルＳＣＮ１Ａ遺伝子中の短縮変化の発生を反映する請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１７】
アッセイの一つがＳＣＮ１Ａ対立遺伝子特異的なオリゴヌクレオチドを用いたＤＮＡ増幅を組み入れる請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１８】
アッセイの一つがＳＳＣＰ分析である請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１９】
アッセイの一つがＲＮａｓｅ保護である請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項２０】
アッセイの一つがＤＧＧＥである請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項２１】
アッセイの一つが酵素アッセイである請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項２２】
前記アッセイがＭｕｔＳの使用を組み入れる請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
アッセイの一つが患者のＳＣＮ１Ａタンパク質の電気泳動移動度を試験する請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項２４】
アッセイの一つが免疫アッセイである請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項２５】
アッセイの一つがＤＮＡ配列決定である請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項２６】
以下の工程を含む患者におけるＳＭＥＩを診断するための方法：
患者のサンプルにおける遺伝子の調節領域内を含むＳＣＮ１Ａ遺伝子における変化を検出すること；および
表３に記載されるようなＳＭＥＩ関連の変化が特定されるならＳＭＥＩの蓋然性が高いとする診断を確立するか、または代わりに表３に記載されるようなＳＭＥＩ非関連の変化が特定されるならＳＭＥＩの蓋然性が低いとする診断を確立する。
【請求項２７】
請求項１〜２６のいずれか一項に記載の方法の一以上を行い、達成された診断をＳＭＥＩ患者についての既知の徴候および逆の徴候と相関させることを含むＳＭＥＩ患者のための適切な処置を決定する方法。
【請求項２８】
請求項１〜２６のいずれか一項に記載の方法の一以上を行い、達成された診断をＳＭＥＩ患者についての既知の徴候および逆の徴候と相関させることを含む、薬物処置およびワクチン接種を含むＳＭＥＩ患者の処置から逆の結果が生ずる可能性を決定する方法。
【請求項２９】
哺乳動物の電位依存性ナトリウムチャネルの変化したＳＣＮ１Ａサブユニットをコードする単離された核酸分子であって、前記変化はＳＭＥＩ表現型を生じさせ、配列番号１〜配列番号２５のいずれかに示される配列を有する核酸分子。
【請求項３０】
哺乳動物の電位依存性ナトリウムチャネルの変化したＳＣＮ１Ａサブユニットをコードする単離された核酸分子であって、前記変化は非ＳＭＥＩてんかん表現型を生じさせ、配列番号４９〜配列番号５３のいずれかに示される配列を有する核酸分子。
【請求項３１】
配列番号１〜配列番号２５および配列番号４９〜配列番号５３のいずれか１つに示されるヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子。
【請求項３２】
配列番号１〜配列番号２５および配列番号４９〜配列番号５３のいずれか１つに示されるヌクレオチド配列からなる単離された核酸分子。
【請求項３３】
請求項２９〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子を含む発現ベクター。
【請求項３４】
請求項２９〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子を含む細胞。
【請求項３５】
請求項２９〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子を含む遺伝的に改変された非ヒト動物。
【請求項３６】
動物がラット、マウス、ハムスター、モルモット、ウサギ、イヌ、ネコ、ヤギ、ヒツジ、ブタ並びにサルおよびチンパンジーの如き非ヒト霊長類からなる群から選択される請求項３５に記載の遺伝的に改変された非ヒト動物。
【請求項３７】
哺乳動物の電位依存性ナトリウムチャネルの変化したＳＣＮ１Ａサブユニットである単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、配列番号２６〜配列番号４８のいずれかに示されるアミノ酸配列を有し、かつ、前記変化はＳＭＥＩ表現型を生じさせるポリペプチド。
【請求項３８】
哺乳動物の電位依存性ナトリウムチャネルの変化したＳＣＮ１Ａサブユニットである単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドは、配列番号５４〜配列番号５８のいずれかに示されるアミノ酸配列を有し、かつ、前記変化は非ＳＭＥＩてんかん表現型を生じさせるポリペプチド。
【請求項３９】
配列番号２６〜配列番号４８および配列番号５４〜配列番号５８のいずれか１つに示されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
【請求項４０】
配列番号２６〜配列番号４８および配列番号５４〜配列番号５８のいずれか１つに示されるアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド。
【請求項４１】
請求項３７〜４０のいずれか一項に記載のＳＣＮ１Ａサブユニットを組み入れるナトリウムチャネル。
【請求項４２】
以下の工程を含むポリペプチドの調製方法：
（１）請求項３４に記載の細胞をポリペプチド産生のために効果的な条件下で培養し；そして
（２）ポリペプチドを集める。
【請求項４３】
請求項４２の方法によって調製されるポリペプチド。
【請求項４４】
請求項３７〜４０または４３のいずれか一項に記載の変化されたポリペプチドと、または請求項４１に記載のナトリウムチャネルと免疫学的に反応するが、野生型ナトリウムチャネルとは免疫学的に反応しない抗体。
【請求項４５】
モノクローナル抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体またはＦａｂフラグメント、（Ｆａｂ′）２フラグメント、Ｆｖフラグメント、単鎖抗体及び単一ドメイン抗体を含む抗体フラグメントからなる群から選択される請求項４４に記載の抗体。
【請求項４６】
候補医薬品化合物をスクリーニングするための請求項２９〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子の使用方法。
【請求項４７】
候補医薬品化合物をスクリーニングするための請求項３７〜４０または４３のいずれか一項に記載のポリペプチド、請求項４１に記載のナトリウムチャネル、または請求項４４または４５に記載の抗体の使用方法。
【請求項４８】
候補医薬品化合物をスクリーニングするための請求項３５または３６に記載の遺伝的に改変された非ヒト動物または請求項３４に記載の細胞の使用方法。
【請求項４９】
請求項４６〜４８のいずれか一項に記載の使用方法によって特定された化合物。
【請求項５０】
請求項４９に記載の化合物および医薬的に受容可能なキャリアを含む医薬組成物。
【請求項５１】
ＳＭＥＩを含むてんかんを処置する方法であって、請求項３７〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドの選択的なアンタゴニスト、アゴニストまたは調節剤、または請求項４１に記載のナトリウムチャネルをかかる処置を必要とする患者に投与することを含む方法。
【請求項５２】
ＳＭＥＩを含むてんかんの処置のための医薬の製造における請求項３７〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドの選択的なアンタゴニスト、アゴニストまたは調節剤、または請求項４１に記載のナトリウムチャネルの使用方法。
【請求項５３】
ＳＭＥＩを含むてんかんを処置する方法であって、請求項２９〜３２のいずれか一項に記載された核酸分子の相補体（アンチセンス）であってかつ変化されたＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡとハイブリダイズするＲＮＡ分子をコードする単離された核酸分子をかかる処置を必要とする患者に投与することを含む方法。
【請求項５４】
ＳＭＥＩを含むてんかんの処置のための医薬の製造における請求項２９〜３２のいずれか一項に記載された核酸分子の相補体（アンチセンス）であってかつ変化されたＳＣＮ１ＡポリペプチドをコードするｍＲＮＡとハイブリダイズするＲＮＡ分子をコードする単離された核酸分子の使用方法。
【請求項５５】
請求項４４または４５に記載の抗体を投与することを含む、ＳＭＥＩを含むてんかんを処置する方法。
【請求項５６】
ＳＭＥＩを含むてんかんの処置のための医薬の製造における請求項４４または４５に記載の抗体の使用方法。
【請求項５７】
ＳＭＥＩを含むてんかんを処置する方法であって、請求項４４または４５に記載の抗体を投与すること、請求項３７〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドのアゴニスト、アンダゴニストまたは調節剤、または請求項４１に記載のナトリウムチャネルを投与すること、または請求項２９〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子の相補体であってかつ変化されたＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡとハイブリダイズするＲＮＡ分子をコードするＤＮＡ分子を投与することを、野生型ＳＣＮ１Ａの投与と組み合わせて、かかる処置を必要とする患者に対して行なうことを含む方法。
【請求項５８】
ＳＭＥＩを含むてんかんの処置のための医薬の製造における請求項４４または４５に記載の抗体、請求項３７〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドのアゴニスト、アンダゴニストまたは調節剤、または請求項４１に記載のナトリウムチャネル、または請求項２９〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子の相補体であってかつ変化されたＳＣＮ１Ａタンパク質をコードするｍＲＮＡとハイブリダイズするＲＮＡ分子をコードするＤＮＡ分子の、野生型ＳＣＮ１Ａの使用と組み合わせた使用方法。