【手続補正書】
【提出日】平成19年8月8日(2007.8.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２１、およびそれらの相補体から選択される単離された核酸。
【請求項２】
請求項１に記載の単離された核酸の少なくとも１５の連続する塩基対セグメントを含む単離された核酸フラグメント。
【請求項３】
請求項１に記載の単離された核酸の１５〜３０の連続する塩基対セグメントを含む請求項２の単離された核酸フラグメント。
【請求項４】
請求項２に記載の単離された核酸フラグメントを含むプライマー。
【請求項５】
請求項２に記載の単離された核酸フラグメントを含むプローブ。
【請求項６】
少なくとも１つの好ましいコドンが、前記配列の少なくとも１つのコドンを置き換えている請求項１に記載の単離された核酸。
【請求項７】
請求項１に記載の単離された核酸配列によってコードされる単離されたペプチド。
【請求項８】
前記単離されたペプチドが、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４１、および配列番号４２から選択される請求項７に記載の単離されたペプチド。
【請求項９】
請求項８に記載の単離されたペプチドの少なくとも５つの連続するアミノ酸セグメントを含む単離されたペプチド。
【請求項１０】
請求項８に記載の単離されたペプチドの５〜２０の連続するアミノ酸セグメントを含む請求項９に記載の単離されたペプチド。
【請求項１１】
請求項１に記載の単離された核酸を含む発現ベクターであって、前記核酸が、宿主細胞における前記核酸の発現のための制御要素に作動可能に連結されている発現ベクター。
【請求項１２】
請求項１１に記載の発現ベクターを用いて形質移入される宿主細胞。
【請求項１３】
配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２０、および配列番号２１から選択される核酸配列の逆の相補体の１０〜４０の連続する塩基対セグメントを含むアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
生体試料中の肥満および／または糖尿病関連遺伝子の少なくとも１つの変異体核酸配列の存在を検出するための方法であって、
（ａ）配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２１またはそれらの相補体から選択される単離された核酸を、生体試料の核酸材料とハイブリッド形成させるステップと、
（ｂ）ステップ（ａ）により産生されるハイブリダイゼーション複合体を検出するステップを含み、
ハイブリダイゼーション複合体の存在は、生体試料中の少なくとも１つの変異体核酸配列の存在と相関する、方法。
【請求項１５】
生体試料中の変異体核酸配列のレベルを決定するための方法であって、
（ａ）配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２１、またはそれらの相補体から選択される単離された核酸を、生体試料の核酸材料とハイブリッド形成させるステップと、
（ｂ）ステップ（ａ）によって産生されたハイブリダイゼーション複合体の量を決定するステップと、
（ｃ）ハイブリダイゼーション複合体の量を規格化して、生体試料における変異体核酸配列のレベルを提供するステップを含む方法。
【請求項１６】
第１の生体試料における肥満および／または糖尿病関連遺伝子変異体の核酸配列のレベルと、第２の生体試料における交互スプライシングにより産生される変異体のレベルとの間の比を決定するための方法であって、
（ａ）第１の生体試料における肥満および／または糖尿病関連遺伝子変異体の第１の核酸配列のレベルを決定するステップと、
（ｂ）第２の生体試料における交互スプライシング形の変異体の第２の核酸配列のレベルを決定するステップと、
（ｃ）ステップ（ａ）とステップ（ｂ）で得られたレベルを比較して、比を与えるステップと、を含む方法。
【請求項１７】
第１の生体試料と第２の生体試料が、同一のサンプルである請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
第１の核酸配列と第２の核酸配列が、ｍＲＮＡ転写産物である請求項１６に記載の方法。
【請求項１９】
第１の核酸配列と第２の核酸配列が、核酸チップ上に配置される請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
糖尿病関連タンパク質の受容体に対する、肥満および／または前記糖尿病関連タンパク質の結合親和性に影響を及ぼすことができる化合物の同定のための方法であって、
（ａ）配列番号２４、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４１、および配列番号４２から選択される単離されたペプチドを提供するステップと、
（ｂ）肥満および／または糖尿病関連遺伝子の少なくとも１つの受容体の存在下で、上記の単離されたペプチドと候補化合物を接触させるステップと、
（ｃ）この少なくとも１つの受容体に対する上記の単離されたペプチドの結合に基づいて、候補化合物の効果を決定するステップと、
（ｄ）前記タンパク質の受容体に対する、肥満および／または糖尿病関連タンパク質の結合親和性に影響を及ぼすことができる化合物を選択するステップと、を含む方法。
【請求項２１】
第１の生体試料における肥満および／または糖尿病関連タンパク質変異体のレベルと、第２の生体試料における交互スプライシングによって産生される変異体のレベルとの間の比を決定するための方法であって、
（ａ）第１の生体試料における肥満および／または糖尿病関連遺伝子変異体の第１のアミノ酸配列のレベルを決定するステップと、
（ｂ）第２の生体試料における交互スプライシング形の変異体の第２のアミノ酸配列のレベルを決定するステップと、
（ｃ）ステップ（ａ）とステップ（ｂ）で得られたレベルを比較して、比を与えるステップと、を含む方法。
【請求項２２】
ポリメラーゼ連鎖反応によって、特定の肥満および／または糖尿病関連核酸配列を検出する方法であって、
（ａ）プライマー対を用いて、特定の肥満および／または糖尿病関連核酸配列を増幅するステップと（ここで、少なくとも１つのプライマーは、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２１、およびそれらの相補体から選択される単離された核酸の少なくとも１５の連続する塩基対セグメントを含む）、
（ｂ）ステップ（ａ）の核酸産物を検出するステップと、を含む方法。
【請求項２３】
配列番号：１１のヌクレオチド１１２から４６２までによりコードされる単離されたペプチド。
【請求項２４】
前記単離されたペプチドが配列番号：３２である請求項２３記載の単離されたペプチド。
【請求項２５】
請求項２４記載の単離されたペプチドの少なくとも１０個の連続したアミノ酸セグメントを含む単離されたペプチドであって、前記連続したアミノ酸セグメントが配列番号：３２のアミノ酸３７から１１７までに由来する少なくとも１つの連続したアミノ酸セグメントを含むものである、単離されたペプチド。
【請求項２６】
請求項２４記載の単離されたペプチドの１０ないし２０個の連続したアミノ酸セグメントを含む、請求項２５記載の単離されたペプチド。
【請求項２７】
少なくとも１つの翻訳後修飾を有する請求項２３記載の単離されたペプチド。
【請求項２８】
配列番号：３２の位置２６のアミノ酸がアシル化されている請求項２７記載の単離されたペプチド。
【請求項２９】
配列番号：３２の位置２６のアミノ酸がオクタノイル化されている請求項２８記載の単離されたペプチド。
【請求項３０】
配列番号：３２のアミノ酸２４から５２までからなる請求項２５記載の単離されたペプチド。
【請求項３１】
配列番号：３２の位置２６のアミノ酸がアシル化されている請求項３０記載に単離されたペプチド。
【請求項３２】
配列番号：３２の位置２６のアミノ酸がオクタノイル化されている請求項３１記載に単離されたペプチド。
【請求項３３】
配列番号：３２のアミノ酸２４から４５までからなる請求項３０記載の単離されたペプチド。
【請求項３４】
配列番号：３２の位置２６のアミノ酸がアシル化されている請求項３３記載の単離されたペプチド。
【請求項３５】
配列番号：３２の位置２６のアミノ酸がオクタノイル化されている請求項３４記載の単離されたペプチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１７】
表２
配列番号１〜９  アディポネクチン（Ａｄｉｐｏｎｅｃｔｉｎ）変異体
【表２−１】
2007504825.tif 000001
【表２−２】
2007504825.tif 000002
【表２−３】
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【表２−４】
2007504825.tif 000004
【表２−５】
2007504825.tif 000005
【表２−６】
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【表２−７】
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【表２−８】
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【表２−９】
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【表２−１０】
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【表２−１１】
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【表２−１２】
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【表２−１３】
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【表２−１４】
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【表２−１５】
2007504825.tif 000015
【表２−１６】
2007504825.tif 000016
【表２−１７】
2007504825.tif 000017
【表２−１８】
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【表２−１９】
2007504825.tif 000019
【表２−２０】
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【表２−２１】
2007504825.tif 000021
【表２−２２】
2007504825.tif 000022
【表２−２３】
2007504825.tif 000023
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
2007504825000001.app