【手続補正書】
【提出日】平成19年9月12日(2007.9.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  少なくとも108の親和性でHER−２の細胞外ドメインECDに結合する、配列番号１の配列から取られる50〜79個のアミノ酸を有する単離されたポリペプチド。
【請求項２】  前記単離されたポリペプチドが、69〜79個の長さのアミノ酸である請求項１記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３】  配列番号１において、
（ａ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｂ）位置２でのXaaがSerであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｃ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがProであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｄ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがLeuであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｅ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがGlnであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｆ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがLeuであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｇ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがAla、Val及びGlu間から選択されで、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｈ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがIleであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｉ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがArgであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｊ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがLeuであり、そして位置73でのXaaがAspであり；
（ｋ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがProであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAsnであり；そして
（ｌ）位置２でのXaaがThrであり、位置５でのXaaがLeuであり、位置６でのXaaがLeuであり、位置16でのXaaがLeuであり、位置18でのXaaがMetであり、位置21でのXaaがGlyであり、位置36でのXaaがLeuであり、位置54でのXaaがProであり、位置64でのXaaがProであり、そして位置73でのXaaがAsnである単離されたポリペプチド間から選択される請求項１記載の単離されたポリペプチド。
【請求項４】  C末端の79個のアミノ酸が存在し、そして少なくとも3個のN-結合されたグリコシル化部位が存在する、配列番号2の配列から取られる80〜419個のアミノ酸を有する単離され、そしてグリコシル化されたポリペプチド。
【請求項５】  前記単離されたポチペプチドが、350〜419個の長さのアミノ酸であり、そして4個のN-結合されたグリコシル化部位が存在する請求項４記載の単離され、そしてグリコシル化されたポリペプチド。
【請求項６】  配列番号２において、
（ａ）位置324でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｂ）位置342でのXaaがSerであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｃ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがProであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｄ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがLeuであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｅ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがGlnであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｆ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがLeuであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｇ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがAla、Val及びGlu間から選択されで、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｈ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがIleであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｉ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがArgであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｊ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがLeuであり、そして位置413でのXaaがAspであり；
（ｋ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがProであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAsnであり；そして
（ｌ）位置342でのXaaがThrであり、位置345でのXaaがLeuであり、位置346でのXaaがLeuであり、位置356でのXaaがLeuであり、位置358でのXaaがMetであり、位置361でのXaaがGlyであり、位置376でのXaaがLeuであり、位置394でのXaaがProであり、位置404でのXaaがProであり、そして位置413でのXaaがAsnである単離されたポリペプチド間から選択される請求項４記載の単離されたポリペプチド。
【請求項７】  請求項１〜６のいずれか１項記載のポリペプチドを、発現に基づいてコードする単離されたDNA配列。
【請求項８】  請求項１又は４記載のポリペプチドを、発現に基づいてコードするDNA配列を有する発現ベクターを含んで成るトランスフェクトされた細胞。
【請求項９】  HER−２の過剰発現により特徴づけられる固形腫瘍を処理するための薬剤の製造のためへの剤の使用であって、前記剤が、(ａ)請求項１記載のポリペプチド；（ｂ）請求項４記載のポリペプチド；（ｃ）（ａ）及び（ｂ）の組合せ；及び（ｄ）（ａ）及び/又は（ｂ）、及びHER-2の細胞外ドメイン（ECD）に結合するモノクローナル抗体の組合せ間から選択されることを特徴とする使用。
【請求項１０】  HER−２の過剰発現により特徴づけられる固形腫瘍を処理するためへの剤の使用であって、前記剤が、(ａ)請求項１記載のポリペプチド；（ｂ）請求項４記載のポリペプチド；（ｃ）（ａ）及び（ｂ）の組合せ；及び（ｄ）（ａ）及び/又は（ｂ）、及びHER-2の細胞外ドメイン（ECD）に結合するモノクローナル抗体の組合せ間から選択されることを特徴とする使用。
【請求項１１】  HER−２を過剰発現する固形腫瘍が、乳癌、小細胞肺癌、卵巣癌及び結腸癌から成る群から選択される請求項９又は10記載の使用。
【請求項１２】  前記剤が、配列番号１の配列から取られる50〜79個のアミノ酸を有する単離されたポリペプチドである請求項９又は10記載の使用。
【請求項１３】  前記剤が、配列番号１の配列から取られる50〜79個のアミノ酸を有する単離されたポリペプチド、及びHER−２のECDに結合するモノクローナル抗体の組合せである請求項９又は10記載の使用。
【請求項１４】  (ａ)請求項１記載のポリペプチド；（ｂ）請求項４記載のポリペプチド；（ｃ）前記（ａ）及び（ｂ）の組合せ；及び（ｄ）前記（ａ）及び/又は（ｂ）、及びHER-2の細胞外ドメイン（ECD）に結合するモノクローナル抗体の組合せ、から選択される剤、及び医薬的に許容できるキャリヤーを含んで成る、HER-2を過剰発現する固形腫瘍を処理するための医薬組成物。
【請求項１５】  前記剤が、配列番号１の配列から取られる50〜79個のアミノ酸を有する単離されたポリペプチドである請求項14記載の医薬組成物。
【請求項１６】  前記剤が、配列番号１の配列から取られる50〜79個のアミノ酸を有する単離されたポリペプチド、及びHER−２の細胞外ドメインECEに結合するモノクローナル抗体の組み合わせである請求項15記載の医薬組成物。
【請求項１７】  HER−２の過剰発現により特徴づけられる固形腫瘍組織に治療剤を標的化するための方法であって、請求項１又は２記載の単離されたポリペプチドに、前記治療剤を結合することを含んで成る方法。
【請求項１８】  HER-2を過剰発現する腫瘍についての腫瘍処理の予後を決定するための方法であって、血液、血清、水、リンパ、唾液、腫瘍組織及びそれらの組合せ間から選択された体液のサンプルにおいて、ELISA、免疫沈澱、免疫組織化学及びウェスターン分析から選択された抗体に基づくアッセイを用いて、十分にグリコシル化される場合、68kDaである請求項４記載のポリペプチドの量を測定することを含んで成る方法。
【請求項１９】  サンプルにおけるp185HER−２ ECDの量を測定することをさらに含んで成る請求項18記載の方法。
【請求項２０】  グリコシル化される場合、68kDaである請求項４記載のポリペプチドの量と、p185HER−２の量との間の比較を決定することをさらに含んで成り、それにより、グリコシル化される場合、68kDaである請求項４記載のポリペプチドのp185HER-2に対する比率が高いほど、患者の予後が良好である請求項19記載の方法。
【請求項２１】  配列番号11で示されるアミノ酸配列を含んで成る単離されたポリペプチド。
【請求項２２】  配列番号12で示されるアミノ酸配列を含んで成る単離されたポリペプチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１６】
配列番号１における可変性アミノ酸位置に対する特定のアミノ酸変化（図８の最も共通するDNA配列に対しての）は、次の通りである：変異体１、Xaa(2)（Thr→Ser）；変異体２、Xaa(5)(Leu→Pro); 変異体３、Xaa(6)(Pro→Leu): 変異体４、Xaa(16)(Leu→Gln)；変異体５、Xaa(18)(Met→Leu); 変異体６、Xaa(21)(Gly→  )；変異体７、Xaa(36)(Leu→Ile)；変異体８、Xaa(54)(Pro→Arg)：変異体９、Xaa(64)(Pro→Leu); 及び変異体10、Xaa(73)(Asp→Asn)。同じ置換が、配列番号２におけるその対応する可変性アミノ酸位置に適用される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2002534995000001.app