【手続補正書】
【提出日】平成19年4月3日(2007.4.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  下記式の化合物。
【化１】
2002542365.tif 000001
（式中、Y1は、下記からなる群より選択され：
【化２】
2002542365.tif 000002
（式中、R9、R9’、R10及びR10’は、各々独立して、C1-C30アルキル、及びヘテロ原子で置換されたC1-C30アルキル（式中、ヘテロ原子は、O、N又はSである。）からなる群より選択される。）
R1、R2、R3、及びR4は、各々独立して、水素、C1-C6アルキル基、スルホニル、カルボキシル、ヒドロキシル、置換アミン及び４級アミンからなる群より選択される親水性置換基を有するC0-C4アルキル基からなる群より選択され；及び
R11は、下記からなる群より選択される。
【化３】
2002542365.tif 000003
（式中、R13、R'13、R"13及びR"'13は、各々独立して、C1-C30アルキルであり、Qはイオウ、窒素-水素又は酸素であり、Xはハロゲンであり、並びにYはハロゲンである。）
【請求項２】  R11が、脱保護剤と反応し、チオール、アミン及びヒドロキシルからなる群より選択される反応性基を生成する、請求項１記載の化合物。
【請求項３】  R13が、2個よりも多い炭素原子を含む、請求項１記載の化合物。
【請求項４】  R1-R4、R9、R9'、R10及びR10’の少なくとも2個の隣接するR基が融合して環構造を形成している、請求項１記載の化合物。
【請求項５】  R1-R4、R9、R9'、R10及びR10’の少なくとも1個が、親水性置換基を有するC0-C4アルキル基である、請求項１記載の化合物。
【請求項６】  下記式の化合物：
【化４】
2002542365.tif 000004
（式中、Y1は、下記からなる群より選択され：
【化５】
2002542365.tif 000005
（式中、R9及びR10は、各々独立して、C1-C30アルキル、ヘテロ原子で置換されたC1-C30アルキル（式中、ヘテロ原子はO、N又はSである。）からなる群より選択される。）
R1、R2、R3、及びR4は、各々独立して、水素、C1-C6アルキル基、スルホネート、カルボキシレート、ヒドロキシル、置換アミン及び４級アミンからなる群より選択される親水性置換基を有するC0-C4アルキル基からなる群より選択され；及び
R11は、R14SH、R14NH2及びR140Hからなる群より選択される（式中、R14は、C3-C30アルキル、及びフェニル、ヒドロキシル、スルホニル、又はハロゲン原子もしくはヘテロ原子で置換されたフェニルを有するC3-C30アルキルである。）。
【請求項７】  R1-R4、R9、R9'、R10及びR10’の少なくとも1個が、親水性置換基を有するC0-C4アルキル基である、請求項６記載の化合物。
【請求項８】  R1-R4、R9、R9'、R10及びR10’の少なくとも2個の隣接R基が融合して環構造を形成している、請求項６記載の化合物。
【請求項９】  窒素を含むヘテロ環式化合物と二官能性炭化水素のXR13Q部分（式中、Xは、塩素、臭素又はヨウ素であり、R13はC1-C30アルキルであり、かつQはイオウ、窒素又は酸素である。）とを反応させることを含む、請求項１記載の化合物(1)の調製法。
【請求項１０】  前記Qがイオウである、請求項９記載の方法。
【請求項１１】  前記二官能性炭化水素がチオール、アミン又はアルコールである、請求項９記載の方法。
【請求項１２】  前記二官能性炭化水素がQの保護された置換基を含む、請求項９記載の方法。
【請求項１３】  下記式の化合物：
【化６】
2002542365.tif 000006
（式中、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7及びR8は、各々独立して、水素、C1-C6アルキル基、スルホネート、カルボキシレート、ヒドロキシル、置換アミン及び４級アミンからなる群より選択される親水性置換基を有するC0-C4アルキル基からなる群より選択され；
Y1及びY2は、各々独立して、下記からなる群より選択され；
【化７】
2002542365.tif 000007
（式中、R9、R9’、R10及びR10’は、各々独立して、C1-C6アルキル、及びヘテロ原子で置換されたC1-C6アルキル（式中、ヘテロ原子は、O、N又はSである。）からなる群より選択される。）；
R11及びR12は、各々独立して、C1-C30アルキル、フェニル置換されたC1-C30、下記からなる群より選択される保護された置換基を有するC1-C30からなる群より選択され；
【化８】
2002542365.tif 000008
（式中、R13、R'13、R"13及びR"'13は、各々独立して、C1-C30アルキルであり、Qはイオウ、窒素又は酸素であり、Xはハロゲンであり、並びにYはハロゲンであり、かつR11及びR12の少なくとも1個は保護された置換基を有するC1-C30である。）；及び
Lは、メチン、C1-C30アルキル置換基を有するメチン基、並びにフェニル、ヒドロキシル、スルホニル、ハロゲン原子、ヘテロ原子で置換されたフェニル、及びC1-C4アルコキシ基で置換されたC1-C30アルキル基を有するメチン基からなる群より選択され、かつnは、1、2、3又はそれ以上である。）。
【請求項１４】  R1-R12、R'9及びR10'の少なくとも一つは、親水性置換基を有するC0-C4アルキル基である、請求項13記載の化合物。
【請求項１５】  R1-R8、R9、R9’、R10及びR10’の少なくとも2個の隣接するR基が融合して環構造を形成している、請求項13記載の化合物。
【請求項１６】  R11及びR12の両方は、保護された置換基を有するC1-C30である、請求項13記載の化合物。
【請求項１７】  R11及びR12の1個のみが、保護された置換基を有するC1-C30である、請求項13記載の化合物。
【請求項１８】  保護された置換基が、脱保護剤と反応し、チオール、アミン及びヒドロキシルからなる群より選択される反応性基を生成する、請求項13記載の化合物。
【請求項１９】  下記式の化合物：
【化９】
2002542365.tif 000009
（式中、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7及びR8は、各々独立して、水素、C1-C6アルキル基、スルホネート、カルボキシレート、ヒドロキシル、置換アミン及び４級アミンからなる群より選択される親水性置換基を有するC0-C4アルキル基からなる群より選択され、その結果R1-R12、R9’及びR10’の少なくとも1個が、親水性置換基を有するC0-C4アルキル基であり；
Y1及びY2は、各々独立して、下記からなる群より選択され；
【化１０】
2002542365.tif 000010
（式中、R9、R9’、R10及びR10’は、各々独立して、C1-C6アルキル、ヘテロ原子で置換されたC1-C6アルキル（式中、ヘテロ原子は、O、N又はSである。）からなる群より選択される。）；及び
R11及びR12は、各々独立して、R14H、及び求核性置換基：R14SH、R14NH2及びR14OHからなる群より選択され（式中、R14は、C3-C30アルキル、並びにフェニル、ヒドロキシル、スルホニルもしくはハロゲン原子又はヘテロ原子で置換されたフェニルを有するC3-C30アルキルからなる群より選択される。）；及び
Lは、メチン、C1-C30アルキル置換基を有するメチン基、並びにフェニル、ヒドロキシル、スルホニル、ハロゲン原子、ヘテロ原子で置換されたフェニル、及びC1-C4アルコキシ基で置換されたC1-C30アルキル基を有するメチン基からなる群より選択され、かつnは、1、2、3又はそれ以上である。）。
【請求項２０】  R1-R8、R9、R9'、R10及びR10'の少なくとも2個の隣接するR基が融合して環構造を形成している、請求項19記載の化合物。
【請求項２１】  R11及びR12が両方共求核性置換基である、請求項19記載の化合物。
【請求項２２】  R11及びR12の一方のみが求核置換基である、請求項19記載の化合物。
【請求項２３】  請求項13又は19記載の化合物(2)の調製法であって、化合物(1)を、トリアルキルオルトホルメート、ジアルキルアミド、トリアルコキシアルケン、及びC3-C12ビスアルデヒドからなる群より選択される分子と反応させる工程を含み、ここで該アルキル基及びアルコキシ基は、独立してC1-C6であり、かつアルケンは塩基の存在下ではC3又はC5であり、かつアルコールの存在下ではC3-C12ビスアルデヒドである、前記調製法。
【請求項２４】  塩基が、ピリジン、C1-C4アルコキシド及びC1-C4モルホリン、ピペリジン、t-ブチルアミン、トリエチルアミン、及びアミンからなる群より選択される、請求項23記載の方法。
【請求項２５】  請求項13記載の化合物を標的分子にカップリングさせる方法であって、前記化合物(2)（式中R11又はR12はヘテロ原子を有する保護された置換基を含む。）を、脱保護剤と反応させる工程（ここでヘテロ原子がイオウ、窒素及び酸素からなる群より選択される）；及び
該化合物(2)の求核付加反応を受けやすい部分を含む標的分子を導入する工程を含む、前記方法。
【請求項２６】  請求項19記載の化合物を標的分子にカップリングさせる方法であって、前記化合物(2)（式中R11又はR12はアミン又はヒドロキシルを含む。）を、該化合物(2)の求核付加反応を受けやすい部分を含む該標的分子と反応させる工程を含む、前記方法。
【請求項２７】  請求項19記載の化合物を標的分子にカップリングさせる方法であって、前記化合物(2)（式中R11又はR12はチオールを含む。）を、該化合物(2)の求核付加反応を受けやすい部分を含む該標的分子と反応させる工程を含む、前記方法。
【請求項２８】  前記標的分子が、有機分子、ポリマー、ケイ素質(silaceous)物質、天然及び合成の：脂質ベシクル、ペプチド、核酸、ヌクレオチド、ヌクレオシド、DNA、RNA、タンパク質、炭水化物、オリゴ糖、多糖、抗体、細胞レセプター、抗原、ハプテン、レクチン、アビジン、ストレプトアビジン、リンホカイン、ホルモン、代謝産物、毒素、ウイルス粒子、細菌、真菌成分、好酸球、真核細胞、及びそれらの誘導体からなる群より選択される、請求項25記載の方法。
【請求項２９】  請求項13又は19記載の化合物(2)の蛍光色素としての使用。
【請求項３０】  標的分子を標識するための請求項13又は19記載の化合物(2)の使用。
【請求項３１】  有効成分としての請求項13又は19記載の化合物(2)を、色素又はハプテンとして使用するための指示と共に含む市販用パッケージ。
【請求項３２】  前記標的分子が、有機分子、ポリマー、ケイ素質物質、天然及び合成の：脂質ベシクル、ペプチド、核酸、ヌクレオチド、ヌクレオシド、DNA、RNA、タンパク質、炭水化物、オリゴ糖、多糖、抗体、細胞レセプター、抗原、ハプテン、レクチン、アビジン、ストレプトアビジン、リンホカイン、ホルモン、代謝産物、毒素、ウイルス粒子、細菌、真菌成分、好酸球、真核細胞、及びそれらの誘導体からなる群より選択される、請求項26記載の方法。
【請求項３３】  保護された置換基を有するC1-C30がイオウ含有部分である、請求項17記載の化合物。
【請求項３４】  保護されたC1-C30の保護された置換基を含まないR11又はR12基が、C1-C30アルキルである、請求項17記載の化合物。
【請求項３５】  R11又はR12の一方がR14SHであり、R11又はR12の他方がR14Hである、請求項19記載の化合物。
【請求項３６】  置換基を有するインドール核を含む化合物であって、インドールの1-7位の置換基が、各々独立して、水素及びC1-C30アルキルからなる群より選択され、ここで1-7位の置換基の少なくとも1個がC1-C30アルキルであり、かつ1-7位の置換基の少なくとも1個がフェニル、ヒドロキシル、カルボキシル、スルホニル、アミン、チオール、もしくはハロゲン原子、又はヘテロ原子で置換されたフェニルを有するC1-C30アルキルである前記化合物。
【請求項３７】  インドール2位の置換基がメチルであり、並びにインドール1位の置換基が、C1-C30アルキル及びフェニル、ヒドロキシル、カルボキシル、スルホニル、アミン、チオール、もしくはハロゲン原子、又はヘテロ原子で置換されたフェニルを有するC1-C30アルキルであり、かつ3-7位の置換基の少なくとも1個がC0-C30アルキルであるような、請求項36記載の化合物。