【手続補正書】
【提出日】平成18年10月31日(2006.10.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
第二のポリペプチドをコードする核酸とインフレームで融合した、第一のポリペプチドをコードする第一の核酸を含んでなる、ハイブリッド核酸分子であって、
第一のポリペプチドが、
（ａ）  配列番号２；
（ｂ）  （ａ）のポリペプチド由来の少なくとも２０個の連続するアミノ酸を含んでなる免疫原性断片；および
（ｃ）  免疫原性を喪失することなく改変された（ａ）または（ｂ）のポリペプチド、ここで、この改変ポリペプチドは、対応する（ａ）または（ｂ）のポリペプチドとアミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する、
のいずれかから選択され、
第二のポリペプチドが、異種シグナルペプチドであるか、またはアジュバント活性を有するものである、ハイブリッド核酸分子。
【請求項２】
第二のポリペプチドが異種シグナルペプチドである、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項３】
第二のポリペプチドがアジュバント活性を有する、請求項１に記載の核酸分子。
【請求項４】
１以上の発現制御配列に作動可能に連結された、請求項１〜３のいずれか一項に記載の核酸分子。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれか一項に記載の核酸と、医薬上許容される担体とを含んでなる、医薬組成物。
【請求項６】
（ａ）  配列番号２；
（ｂ）  （ａ）のポリペプチド由来の少なくとも２０個の連続するアミノ酸を含んでなる免疫原性断片；および
（ｃ）  免疫原性を喪失することなく改変された（ａ）または（ｂ）のアミノ酸配列、ここでこの改変ポリペプチドは、対応する（ａ）または（ｂ）のポリペプチドとアミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有するものである
のいずれかから選択される、アミノ酸配列と、
異種シグナルペプチドであるか、またはアジュバント活性を有するものである、第二のポリペプチドと
を含んでなる、融合タンパク質。
【請求項７】
第二のポリペプチドが異種シグナルペプチドである、請求項６に記載の融合タンパク質。
【請求項８】
第二のポリペプチドがアジュバント活性を有する、請求項６に記載の融合タンパク質。
【請求項９】
請求項６〜８のいずれか一項に記載の融合タンパク質の製造方法であって、
融合タンパク質をコードする核酸で形質転換された単細胞宿主を培養することを含んでなる、方法。
【請求項１０】
予めポリペプチドで免疫化した哺乳類におけるクラミジア感染を予防または軽減するのに有効な免疫応答を誘導する、請求項６〜８のいずれか一項に記載の融合タンパク質を同定する方法であって、
（ａ）マウスをポリペプチドで免疫化し；さらに
（ｂ）免疫化したマウスにクラミジアを接種し、
ここで、免疫化されていない対照マウスに比べて免疫化したマウスでクラミジア感染が予防されたまたはその重篤度が軽減したポリペプチドまたは融合タンパク質を同定する
工程を含んでなる、方法。
【請求項１１】
下記のプラスミドｐＣＡＩ７６４のエレメントにより特徴づけられる、発現プラスミド。
【化１】
2002541766.tif 000001
【請求項１２】
配列番号３または４の単離された核酸分子。
【請求項１３】
ワクチンでの使用に適した生理学上許容される希釈剤または担体と、下記（ａ）〜（ｄ）のいずれか１つとを含んでなる、ワクチン：
（ａ）  第一のポリペプチドをコードする第一の核酸；
（ｂ）  第一のポリペプチド；
（ｃ）  第一のポリペプチドと、第二のポリペプチドとを含んでなる、融合タンパク質；  または
（ｄ）  第二のポリペプチドをコードする核酸とインフレームで融合した、第一の核酸を含んでなる、ハイブリッド核酸分子、
ここで、前記第一のポリペプチドは、下記からなる群より選択されるものである：
（ｉ）  配列番号１によってコードされる、ポリペプチド；
（ii）  配列番号１に由来する少なくとも３８個の連続するヌクレオチドを含んでなる核酸配列によってコードされる、ポリペプチド；
(iii)   配列が配列番号２に示されたものである、ポリペプチド；
（iv）  配列番号２と、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する、ポリペプチド；
（ｖ）  配列番号１に由来の少なくとも１２個の連続するアミノ酸を含んでなる、免疫原性断片；  および
（vi）  免疫原性を喪失することなく改変された、（ｉ）〜（iv）に記載のポリペプチドもしくは（ｖ）に記載の免疫原性断片、ここで改変ポリペプチドもしくは断片は、対応する（ｉ）〜（iv）のポリペプチドもしくは（ｖ）の免疫原性断片と、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する；  かつ
ここで、第一の核酸は発現する能力のあるものである。
【請求項１４】
第一の核酸と、ワクチンベクターとを含んでなる、請求項１３に記載のワクチンであって、
ここで第一の核酸が、下記（ｉ）〜(vii)からなる群より選択されるものである、ワクチン：
（ｉ）  配列番号１；
（ii）  配列番号１によってコードされるポリペプチドをコードする、核酸配列；
(iii)  （ｉ）および（ii）の核酸配列のいずれか１つに由来する少なくとも３８個の連続するヌクレオチドを含んでなる、核酸配列；
（iv）  配列番号１によってコードされるポリペプチドと、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有するポリペプチドをコードする、核酸配列；
（ｖ）  配列が配列番号２に示されたものであるポリペプチドをコードする、核酸配列；
（vi）  配列番号２に由来の少なくとも１２個の連続するアミノ酸を含んでなる免疫原性断片をコードする、核酸配列；  および
(vii)  免疫原性を喪失することなく改変された、（ｉ）〜（ｖ）に記載のポリペプチドもしくは（vi）に記載の免疫原性断片をコードする核酸配列、ここで、この改変ポリペプチドもしくは断片は、対応する（ｉ）〜（ｖ）のポリペプチドもしくは（vi）の免疫原性断片と、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する。
【請求項１５】
ハイブリッド核酸と、ワクチンベクターとを含んでなる、請求項１３に記載のワクチンであって、
ここでハイブリッド核酸が、下記（ｉ）〜(vii)からなる群より選択される第一の核酸を含んでなる、ワクチン：
（ｉ）  配列番号１；
（ii）  配列番号１によってコードされるポリペプチドをコードする、核酸配列；
(iii)  （ｉ）および（ii）の核酸配列のいずれか１つに由来する少なくとも３８個の連続するヌクレオチドを含んでなる、核酸配列；
（iv）  配列番号１によってコードされるポリペプチドと、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有するポリペプチドをコードする、核酸配列；
（ｖ）  配列が配列番号２に示されたものであるポリペプチドをコードする、核酸配列；
（vi）  配列番号２に由来の少なくとも１２個の連続するアミノ酸を含んでなる免疫原性断片をコードする、核酸配列；  および
(vii)  免疫原性を喪失することなく改変された、（ｉ）〜（ｖ）に記載のポリペプチドもしくは（vi）に記載の免疫原性断片をコードする核酸配列、ここでこの改変ポリペプチドもしくは断片は、対応する（ｉ）〜（ｖ）のポリペプチドもしくは（vi）の免疫原性断片と、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する。
【請求項１６】
第二のポリペプチドが異種シグナルペプチドである、請求項１３〜１５のいずれか一項に記載のワクチン。
【請求項１７】
第二のポリペプチドがアジュバント活性を有する、請求項１３〜１５のいずれか一項に記載のワクチン。
【請求項１８】
第一の核酸が、１以上の発現制御配列に作動可能に連結されてなる、請求項１３〜１７のいずれか一項に記載のワクチン。
【請求項１９】
請求項１４〜１８のいずれか一項に記載のワクチンであって、
第一の核酸が、ポリペプチドとして発現し、かつ、
ワクチンが、第一の核酸によって発現されるポリペプチドに対する免疫応答を増強する付加的なポリペプチドをコードする第二の核酸を含んでなる、前記ワクチン。
【請求項２０】
第二の核酸が付加的なクラミジアポリペプチドをコードしている、請求項１９に記載のワクチン。
【請求項２１】
請求項１３〜２０のいずれか一項に記載のワクチンと、医薬上許容される担体とを含んでなる、医薬組成物。
【請求項２２】
ワクチンが第１のポリペプチドを含んでなる、請求項１３に記載のワクチン。
【請求項２３】
ワクチンが融合タンパク質を含んでなる、請求項１３に記載のワクチン。
【請求項２４】
第二のポリペプチドが異種シグナルペプチドである、請求項２３に記載のワクチン。
【請求項２５】
第二のポリペプチドがアジュバント活性を有する、請求項２３に記載のワクチン。
【請求項２６】
第一のポリペプチドに対する免疫応答を増強する付加的なポリペプチドをさらに含んでなる、請求項２２〜２５のいずれか一項に記載のワクチン。
【請求項２７】
付加的なポリペプチドがクラミジアポリペプチドを含んでなる、請求項２6に記載のワクチン。
【請求項２８】
請求項２２〜２７のいずれか一項に記載のワクチンと、医薬上許容される担体とを含んでなる、医薬組成物。
【請求項２９】
クラミジア感染症を予防または治療するための医薬の製造における、下記（ａ）〜（ｄ）のいずれかの使用：
（ａ）  第一のポリペプチドをコードする第一の核酸；
（ｂ）  第一のポリペプチド；
（ｃ）  第一のポリペプチドと、第二のポリペプチドとを含んでなる、融合タンパク質；  または
（ｄ）  第二のポリペプチドをコードする核酸とインフレームで融合した、第一の核酸を含んでなる、ハイブリッド核酸分子、
ここで、前記第一のポリペプチドは、下記からなる群より選択されるものである：
（ｉ）  配列番号１によってコードされる、ポリペプチド；
（ii）  配列番号１に由来する少なくとも３８個の連続するヌクレオチドを含んでなる核酸配列によってコードされる、ポリペプチド；
(iii)   配列が配列番号２に示されたものである、ポリペプチド；
（iv）  配列番号２と、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する、ポリペプチド；
（ｖ）  配列番号１に由来の少なくとも１２個の連続するアミノ酸を含んでなる、免疫原性断片；  および
（vi）  免疫原性を喪失することなく改変された、（ｉ）〜（iv）に記載のポリペプチドもしくは（ｖ）に記載の免疫原性断片、ここで改変ポリペプチドもしくは断片は、対応する（ｉ）〜（iv）のポリペプチドもしくは（ｖ）の免疫原性断片と、アミノ酸配列において少なくとも７５％の同一性を有する。
【請求項３０】
下記のプラスミドｐＣＡＩ７６４のエレメントにより特徴づけられる発現プラスミドを含んでなる、請求項１３〜２０のいずれか一項に記載のワクチン。
【化２】
2002541766.tif 000002
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
肺炎クラミジア種内の抗原のバリエーションは遺伝情報が不十分であるために十分記載されていないが、バリエーションはトラコーマクラミジアに基づいて存在しているものと予測される。トラコーマクラミジアの血清学的亜型は主要外膜タンパク質（ＭＯＭＰ）における抗原バリエーションに基づいて定義されているが、公表されている肺炎クラミジアＭＯＭＰ遺伝子配列はこの微生物のいくつかの異なる単離物の間ではダリエーションを示していない(Campbell et al (1990) Infection and Immunity 58:93; McCafferty et al (1995) Infection and Immunity 63:2387-9; Gaydos et al. (1992) Infection and Immunity 60(12):5319-5323）。７６ｋＤａの抗原をコードする遺伝子は肺炎クラミジアのただ単一株からクローニングされたものであり、その配列は公開されている(Perez Melgosa et al., Infect. Immun. 1994. 62:880)。９ｋＤａおよび６０ｋＤａのシステイン豊富な外膜タンパク質遺伝子を含むオペロンが記載されている(Watson et al., Nucleic Acids Res (1990) 18:5299; Watson et al., Microbiology (1995) 141:2489)。肺炎クラミジアに対する免疫血清によって認識される多くの抗原は総てのクラミジア間で保存されているが、９８ｋＤＡ、７６ｋＤａおよび他のいくつかのタンパク質は肺炎クラミジア特異的である可能性がある(Perez Melgosa et al., Infect. Immun. 1994. 62:880; Melgosa et al., FEMS Microbiol Lett (1993) 112:119; Campbell et al., J Clin Microbiol (1994) 32:583)。肺炎クラミジア血清型の数および相対頻度の評価、ならびに抗原の定義はまだ可能ではない。肺炎クラミジアＣＷＬ−０２９株の全ゲノム配列はすでに知られており(http://chlamydia-www.berkeley.edu:4231/)、さらなる配列が入手できるので、抗原バリエーションのよりよい理解が得られる。