【手続補正書】
【提出日】平成18年12月11日(2006.12.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞のインフルエンザウイルス感染に関係するポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子。
【請求項２】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項１に記載の核酸分子。
【請求項３】
前記ポリペプチドはインフルエンザウイルスのポリペプチドである請求項１に記載の核酸分子。
【請求項４】
前記ポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項３に記載の核酸分子。
【請求項５】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項３に記載の核酸分子。
【請求項６】
前記ポリペプチドは宿主細胞のポリペプチドである請求項１に記載の核酸分子。
【請求項７】
前記宿主細胞のポリペプチドはシアル酸受容体である請求項６に記載の核酸分子。
【請求項８】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項１に記載の核酸分子。
【請求項９】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項１に記載の核酸分子。
【請求項１０】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項１に記載の核酸分子。
【請求項１１】
検出可能な標識をさらに含む請求項１に記載の核酸分子。
【請求項１２】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項１に記載の核酸分子。
【請求項１３】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項１に記載の核酸分子。
【請求項１４】
インフルエンザウイルス感染を阻害することができる分子を作製する方法であって、以下のステップを含む方法：
（ａ）複数の核酸分子を、細胞のインフルエンザウイルス感染に関係するポリペプチドと接触させること；
（ｂ）前記ポリペプチドと特異的に結合することができる少なくとも１つの核酸分子を前記複数の核酸分子から同定すること；および
（ｃ）前記ポリペプチドと結合することができる少なくとも１つの核酸分子を単離し、それにより、インフルエンザウイルス感染を阻害することができる分子を作製すること。
【請求項１５】
前記ポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記複数の核酸分子は一本鎖である請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
前記複数の核酸分子はＤＮＡ分子である請求項１４に記載の方法。
【請求項１８】
前記複数の核酸分子はＲＮＡ分子である請求項１４に記載の方法。
【請求項１９】
前記複数の核酸分子の各々は検出可能な標識をさらに含む請求項１４に記載の方法。
【請求項２０】
前記複数の核酸分子の各々は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項１４に記載の方法。
【請求項２１】
前記複数の核酸分子は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項１４に記載の方法。
【請求項２２】
ステップ（ａ）に先だって、コンビナトリアル合成法を使用して前記複数の核酸分子を作製することをさらに含む請求項１４に記載の方法。
【請求項２３】
ステップ（ａ）の前、またはステップ（ｃ）の後で、前記複数の核酸分子を修飾することをさらに含む請求項１４に記載の方法。
【請求項２４】
ステップ（ａ）〜ステップ（ｃ）を繰り返すことをさらに含む請求項１４に記載の方法。
【請求項２５】
細胞のインフルエンザウイルス感染に関係するポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子と、生理学的に許容され得るキャリアとを含む医薬組成物。
【請求項２６】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項２７】
前記ポリペプチドはインフルエンザウイルスのポリペプチドである請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項２８】
前記ポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項２７に記載の医薬組成物。
【請求項２９】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項２７に記載の医薬組成物。
【請求項３０】
前記ポリペプチドは宿主細胞のポリペプチドである請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３１】
前記宿主細胞のポリペプチドはシアル酸受容体である請求項３０に記載の医薬組成物。
【請求項３２】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３３】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３４】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３５】
検出可能な標識をさらに含む請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３６】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３７】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３８】
さらに薬剤を含む請求項２５に記載の医薬組成物。
【請求項３９】
包装材と、前記包装材に含有される、インフルエンザ感染を処置または防止するために特定された医薬組成物とを含む製造物であって、前記医薬組成物は、細胞のインフルエンザウイルス感染に関係するポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子を有効成分として含む製造物。
【請求項４０】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項３９に記載の製造物。
【請求項４１】
前記ポリペプチドはインフルエンザウイルスのポリペプチドである請求項３９に記載の製造物。
【請求項４２】
前記ポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項４１に記載の製造物。
【請求項４３】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項４１に記載の製造物。
【請求項４４】
前記ポリペプチドは宿主細胞のポリペプチドである請求項３９に記載の製造物。
【請求項４５】
前記宿主細胞のポリペプチドはシアル酸受容体である請求項４４に記載の製造物。
【請求項４６】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項３９に記載の製造物。
【請求項４７】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項３９に記載の製造物。
【請求項４８】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項３９に記載の製造物。
【請求項４９】
検出可能な標識をさらに含む請求項３９に記載の製造物。
【請求項５０】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項３９に記載の製造物。
【請求項５１】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項３９に記載の製造物。
【請求項５２】
前記医薬組成物はさらに薬剤を含む請求項３９に記載の製造物。
【請求項５３】
前記薬剤は、免疫調節剤、抗生物質、抗ウイルス剤、アンチセンス分子およびリボザイムからなる群から選択される請求項５２に記載の製造物。
【請求項５４】
インフルエンザウイルス感染を処置または防止する方法であって、その必要性のある対象に、細胞のインフルエンザウイルス感染に関係するポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子の治療効果的な量を与え、それにより、インフルエンザウイルス感染を処置または防止することを含む方法。
【請求項５５】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
前記ポリペプチドはインフルエンザウイルスのポリペプチドである請求項５４に記載の方法。
【請求項５７】
前記ポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項５６に記載の方法。
【請求項５９】
前記ポリペプチドは宿主細胞のポリペプチドである請求項５４に記載の方法。
【請求項６０】
前記宿主細胞のポリペプチドはシアル酸受容体である請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項５４に記載の方法。
【請求項６２】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項５４に記載の方法。
【請求項６３】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項５４に記載の方法。
【請求項６４】
前記核酸分子は検出可能な標識をさらに含む請求項５４に記載の方法。
【請求項６５】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項５４に記載の方法。
【請求項６６】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項５４に記載の方法。
【請求項６７】
前記核酸分子を与えることに先立って、前記核酸分子を与えることと同時に、又は前記核酸分子を与えることの後に抗ウイルス剤を与えることをさらに含む請求項５４に記載の方法。
【請求項６８】
前記与えることは、（ｉ）前記核酸分子の投与；および／または（ｉｉ）前記核酸分子を発現するポリヌクレオチドを投与することによって行われる請求項５４に記載の方法。
【請求項６９】
生物学的サンプルにおけるインフルエンザウイルスを同定する方法であって、以下のステップを含む方法：
（ａ）生物学的サンプルを、インフルエンザウイルスのポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子と接触させること；および
（ｂ）生物学的サンプル中の前記インフルエンザウイルスポリペプチドに結合した前記核酸分子を検出し、それにより、インフルエンザ感染を同定すること。
【請求項７０】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
前記インフルエンザウイルスのポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項６９に記載の方法。
【請求項７２】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項６９に記載の方法。
【請求項７３】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項６９に記載の方法。
【請求項７４】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項６９に記載の方法。
【請求項７５】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項６９に記載の方法。
【請求項７６】
前記核酸分子は検出可能な標識をさらに含む請求項６９に記載の方法。
【請求項７７】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項６９に記載の方法。
【請求項７８】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項６９に記載の方法。
【請求項７９】
抗ウイルス剤をインフルエンザウイルス感染組織に標的化する方法であって、その必要性のある対象に、インフルエンザウイルスのポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子にコンジュゲート化された抗ウイルス剤の治療効果的な量を投与し、それにより、抗ウイルス剤をインフルエンザ感染組織に標的化することを含む方法。
【請求項８０】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項７９に記載の方法。
【請求項８１】
前記インフルエンザウイルスのポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項７９に記載の方法。
【請求項８２】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項７９に記載の方法。
【請求項８３】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項７９に記載の方法。
【請求項８４】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項７９に記載の方法。
【請求項８５】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項７９に記載の方法。
【請求項８６】
前記核酸分子は検出可能な標識をさらに含む請求項７９に記載の方法。
【請求項８７】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項７９に記載の方法。
【請求項８８】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項７９に記載の方法。
【請求項８９】
細胞のインフルエンザウイルス感染に関係するポリペプチドと特異的に結合することができるポリヌクレオチド配列を含む核酸分子にコンジュゲート化された抗ウイルス剤を含む組成物。
【請求項９０】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１１および配列番号１２からなる群から選択される請求項８９に記載の組成物。
【請求項９１】
前記ポリペプチドはインフルエンザウイルスのポリペプチドである請求項８９に記載の組成物。
【請求項９２】
前記ポリペプチドは、血球凝集素、ノイラミニダーゼ、ＲＮＡ指向ＲＮＡポリメラーゼコアタンパク質、Ｍ１マトリックスタンパク質、Ｍ２マトリックスタンパク質およびＮＳタンパク質からなる群から選択される請求項９１に記載の組成物。
【請求項９３】
前記ポリヌクレオチド配列は、配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される血球凝集素の領域と結合することができる請求項９１に記載の組成物。
【請求項９４】
前記ポリペプチドは宿主細胞のポリペプチドである請求項８９に記載の組成物。
【請求項９５】
前記宿主細胞のポリペプチドはシアル酸受容体である請求項９４に記載の組成物。
【請求項９６】
前記ポリヌクレオチド配列は一本鎖である請求項８９に記載の組成物。
【請求項９７】
前記ポリヌクレオチド配列はＤＮＡである請求項８９に記載の組成物。
【請求項９８】
前記ポリヌクレオチド配列はＲＮＡである請求項８９に記載の組成物。
【請求項９９】
検出可能な標識をさらに含む請求項８９に記載の組成物。
【請求項１００】
前記ポリヌクレオチド配列は２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチドを含む請求項８９に記載の組成物。
【請求項１０１】
前記ポリヌクレオチド配列は１０ヌクレオチド〜３５ヌクレオチドの間の長さを有するポリヌクレオチド配列から選択される請求項８９に記載の組成物。
【請求項１０２】
インフルエンザウイルスに対するワクチン接種のために有用なポリペプチドであって、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含む（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）ポリペプチド。
【請求項１０３】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１０２に記載のポリペプチド。
【請求項１０４】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１０２に記載のポリペプチド。
【請求項１０５】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１０２に記載のポリペプチド。
【請求項１０６】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１０２に記載のポリペプチド。
【請求項１０７】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１０２に記載のポリペプチド。
【請求項１０８】
ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）と、医薬的に許容され得るキャリアまたは希釈剤とを含む医薬組成物。
【請求項１０９】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１０】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１１】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１２】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１３】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１４】
ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）を特異的に認識する抗原結合部位を含む抗体または抗体フラグメント。
【請求項１１５】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１１４に記載の抗体または抗体フラグメント。
【請求項１１６】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１１４に記載の抗体または抗体フラグメント。
【請求項１１７】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１１４に記載の抗体または抗体フラグメント。
【請求項１１８】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１１４に記載の抗体または抗体フラグメント。
【請求項１１９】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１１４に記載の抗体または抗体フラグメント。
【請求項１２０】
固体支持体に取り付けられている請求項１１４に記載の抗体または抗体フラグメント。
【請求項１２１】
ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）をコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２２】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１２１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２３】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１２１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２４】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１２１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２５】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１２１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２６】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１２１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２７】
請求項１２１の単離されたポリヌクレオチドを含む核酸構築物。
【請求項１２８】
請求項１２７の核酸構築物を含む宿主細胞。
【請求項１２９】
ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）をコードするポリヌクレオチドと、医薬的に許容され得るキャリアまたは希釈剤とを含む医薬組成物。
【請求項１３０】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１２９に記載の医薬組成物。
【請求項１３１】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１２９に記載の医薬組成物。
【請求項１３２】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１２９に記載の医薬組成物。
【請求項１３３】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１２９に記載の医薬組成物。
【請求項１３４】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１２９に記載の医薬組成物。
【請求項１３５】
インフルエンザウイルス感染を処置または防止する方法であって、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）の治療効果的な量を、その必要性のある対象に与えることを含む方法。
【請求項１３６】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３７】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３８】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３９】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１３５に記載の方法。
【請求項１４０】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１３５に記載の方法。
【請求項１４１】
前記与えることは、（ｉ）前記ポリペプチドの投与；および／または（ｉｉ）前記ポリペプチドをコードする発現可能なポリヌクレオチドを投与することによって行われる請求項１３５に記載の方法。
【請求項１４２】
インフルエンザウイルス感染を処置または防止する方法であって、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）を特異的に認識する抗原結合部位を含む抗体または抗体フラグメントの治療効果的な量を、その必要性のある対象に与えることを含む方法。
【請求項１４３】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４４】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４５】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４６】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４７】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４８】
前記与えることは、（ｉ）前記抗体または抗体フラグメントの投与；および／または（ｉｉ）前記抗体または抗体フラグメントをコードする発現可能なポリヌクレオチドを投与することによって行われる請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４９】
生物学的サンプルにおけるインフルエンザウイルスを同定する方法であって、以下のステップを含む方法：
（ａ）生物学的サンプルを、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズムを利用するＷｉｓｃｏｎｓｉｎ配列分析パッケージのＢｅｓｔＦｉｔソフトウエアを使用して決定されたとき（この場合、ギャップ生成ペナルティーが８に等しく、ギャップ伸長ペナルティーが２に等しい）、配列番号１３に対して少なくとも６０％の相同性であるアミノ酸配列を含むポリペプチド（ただし、このポリペプチドはインフルエンザウイルスのＨＡ２ドメインを含まない）を特異的に認識する抗原結合部位を含む抗体または抗体フラグメントと接触させること；および
（ｂ）生物学的サンプルにおける前記抗体または抗体フラグメントを含む免疫複合体を検出し、それにより、生物学的サンプルにおけるインフルエンザウイルスを同定すること。
【請求項１５０】
前記ポリペプチドは配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１４９に記載の方法。
【請求項１５１】
前記アミノ酸配列は配列番号１３〜配列番号１５に示される通りである請求項１４９に記載の方法。
【請求項１５２】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置９１〜２６１によって規定される請求項１４９に記載の方法。
【請求項１５３】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２６１によって規定される請求項１４９に記載の方法。
【請求項１５４】
前記アミノ酸配列は配列番号１のアミノ酸位置１１６〜２４５によって規定される請求項１４９に記載の方法。
【請求項１５５】
前記抗体または抗体フラグメントはさらに標識を含む請求項１４９に記載の方法。
【請求項１５６】
前記免疫複合体を検出することは、ステップ（ｂ）の後で標識の強度を定量することによって行われる請求項１５５に記載の方法。
【請求項１５７】
配列番号１１または配列番号１２に示されるような核酸分子。