【手続補正書】
【提出日】平成19年2月15日(2007.2.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）  配列番号:1と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600若しくは1700残基の領域にわたって、又は配列番号:1の完全長にわたって、少なくとも80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:3と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200若しくは1250残基の領域にわたって、又は配列番号:3の完全長にわたって、少なくとも55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:5と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800残基の領域にわたって、又は配列番号:5の完全長にわたって、少なくとも65％、66％、67％、68％、69％、0％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:7と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、2100、2200、2300残基の領域にわたって、又は配列番号:7の完全長にわたって、少なくとも95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:9と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600残基の領域にわたって、又は配列番号:9の完全長にわたって、少なくとも60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:11と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700残基の領域にわたって、又は配列番号:11の完全長にわたって、少なくとも50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:13と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1350残基の領域にわたって、又は配列番号:13の完全長にわたって、少なくとも50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:15と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600残基の領域にわたって、又は配列番号:15の完全長にわたって、少なくとも60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:17と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1350残基の領域にわたって、又は配列番号:17の完全長にわたって、少なくとも50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:19と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1650残基の領域にわたって、又は配列番号:19の完全長にわたって、少なくとも80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；
配列番号:21と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400残基の領域にわたって、又は配列番号:21の完全長にわたって、少なくとも95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列；または、
配列番号:23と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1650残基の領域にわたって、又は配列番号:23の完全長にわたって、少なくとも80％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％若しくはそれより高い、または100％の配列同一性を有する核酸配列、
を含む単離、合成又は組換え核酸であって、グルコシダーゼ活性を有する少なくとも1つのポリペプチドをコードし、さらに場合により、前記配列同一性が配列比較アルゴリズムを用いる分析によって、または目視精査によって決定され、
場合により前記配列比較アルゴリズムがBLASTバージョン2.2.2アルゴリズムであり、フィルタリング設定がblastall -p blastp -d “nr pataa” -F Fに設定され、他の全てのオプションが規定値に設定される、前記単離、合成又は組換え核酸；
（ｂ）配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21若しくは配列番号:23に記載の配列又を含む核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列を含む、単離、合成又は組換え核酸であって、場合により、前記ストリンジェントな条件が、2ＸのSSC中で65℃の温度にて15分間の洗浄を含む洗浄工程を含む、前記単離、合成又は組換え核酸；
（ｃ）配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22または配列番号:24に記載の配列を有するポリペプチドをコードする核酸、を含む単離、合成または組換え核酸；
（ｄ）グルコシダーゼをコードする前記(a)、（ｂ）または（ｃ）記載の核酸を含む単離、合成または組換え核酸であって、前記グルコシダーゼがシグナル配列を欠くものである、前記単離、合成または組換え核酸；
（ｅ）グルコシダーゼをコードする前記(a)、（ｂ）、（ｃ）たは（ｄ）記載の核酸を含む単離、合成または組換え核酸であって、前記グルコシダーゼが異種配列を含み、場合により前記異種配列が異種シグナル配列、異種触媒ドメイン（CD）、異種プレプロドメイン、酵素切断部位またはこれらの組み合わせを含み、さらに場合により、前記異種シグナル配列が他のグルコシダーゼまたは非グルコシダーゼ酵素由来である、前記単離、合成または組換え核酸；または、
（ｆ）前記（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）または（ｅ）記載の核酸の配列に相補的な配列を含む核酸を含む単離、合成または組換え核酸であって、
場合により、前記グルコシダーゼ活性がα-グルコシダーゼ活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がアルファ-(1,4)グルコース結合、アルファ-(1,6) グルコース結合、アルファ-(1,2) グルコース結合、アルファ-(1,3)グルコース結合、又はそれらの組合せの加水分解を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性が、デンプン中のグルコシド結合を加水分解してマルトデキストリンの生成を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がマルト-オリゴ糖及び液化デンプンの両者の加水分解を触媒する活性を含み、または、前記α-グルコシダーゼ活性が、1,4-アルファ-D-グルカンヒドロラーゼ活性又は1,6-アルファ-D-グルカンヒドロラーゼ活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がエキソグルコシダーゼ活性を含み、または、前記α-グルコシダーゼ活性がデンプン中のグルコシド結合を加水分解する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性が、デンプンのα-D-グルコース残基への加水分解を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がデンプンの還元末端又は非還元末端からグルコース残基を切断する活性を含み；
場合により、前記グルコシダーゼ活性が熱安定性であり、または37℃から95℃の温度範囲を含む条件下でグルコシダーゼ活性を維持し、または、55℃から85℃、70℃から95℃、又は90℃から95℃の温度範囲を含む条件下でグルコシダーゼ活性を維持し；
場合により、前記グルコシダーゼ活性が耐熱性であり、または、37℃から95℃の範囲の温度に暴露された後でグルコシダーゼ活性を維持し、または、55℃から85℃又は90℃から95℃の範囲の温度に暴露された後でグルコシダーゼ活性を維持する、
前記単離、合成または組換え核酸。
【請求項２】
（ａ）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を同定するための核酸プローブであって、
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21又は配列番号:23記載の配列を含む核酸の少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000またはそれより多い連続する塩基を含み、結合又はハイブリダイゼーションによって前記核酸を同定する前記核酸プローブであって、
場合により、少なくとも10から50、20から60、30から70、40から80、60から100又は50から150の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、前記核酸プローブ；または、
（ｂ）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を同定するための核酸プローブであって、
請求項1記載の核酸の配列の少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000またはそれより多い連続する塩基を含む、
前記核酸プローブ。
【請求項３】
グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を増幅するための増幅プライマー対であって、請求項１記載の核酸の配列又はその部分配列を含む核酸を増幅させることができ、
場合により、前記増幅プライマー対の各メンバーが、請求項１記載の核酸の配列又はその部分配列の少なくとも10から50の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、
前記増幅プライマー対。
【請求項４】
請求項1記載の核酸の配列を含む発現カセット、ベクターまたはクローニングビヒクルであって、
場合により、前記クローニングビヒクルがウイルスベクター、プラスミド、ファージ、ファージミド、コスミド、フォスミド、バクテリオファージまたは人工染色体を含み、場合により、前記ウイルスベクターがアデノウイルスベクター、レトロウイルスベクター又はアデノ随伴ウイルスベクターを含み、場合により前記クローニングビヒクルが細菌の人工染色体（BAC）、プラスミド、バクテリオファージP1-由来ベクター（PAC）、酵母人工染色体（YAC）または哺乳動物人工染色体（MAC）を含み；
場合により、前記核酸がプロモーターに機能可能に連結しており、場合により前記プロモーターは植物プロモーターであり、場合により前記植物プロモーターはジャガイモプロモーター、イネプロモーター、トウモロコシプロモーター、コムギまたはオオムギプロモーターであり、場合により前記プロモーターはアグロバクテリウム・ツメファシエンスT-DNA由来のプロモーターを含み、場合により前記プロモーターは構成的プロモーターであり、場合により前記プロモーターはCaMV35Sプロモーターであり、場合により前記プロモーターは誘導可能プロモーターまたは組織特異的プロモーターであり；
場合により、前記ベクターは植物発現ベクターであり、場合により、前記植物発現ベクターは植物ウイルスを含み、場合により前記組織特異的プロモーターが種-特異的、葉-特異的、根-特異的、茎-特異的または離脱-誘導プロモーターである、
前記発現カセット、ベクターまたはクローニングビヒクル。
【請求項５】
（ａ）請求項1記載の核酸の配列を含む形質転換細胞、または（ｂ）請求項４記載の発現カセット、ベクターまたはクローニングビヒクルを含む形質転換細胞であって、
場合により、細菌細胞、哺乳動物細胞、真菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞または植物細胞であり、場合により前記植物細胞が、ジャガイモ、イネ、トウモロコシ、コムギ、タバコ、またはオオムギ細胞である、
前記（ａ）または（ｂ）の形質転換細胞。
【請求項６】
請求項1記載の核酸の配列を含む、非ヒトトランスジェニック動物であって、場合によりマウス、ヤギ、ウサギ、ヒツジ、ブタ、乳牛、ラットである、前記非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項７】
請求項1記載の核酸の配列を含むトランスジェニック植物またはトランスジェニック植物種子であって、
場合により前記植物は、トウモロコシ、ソルガム、ジャガイモ、トマト、コムギ、ナタネ、アブラナ、ダイズ、イネ、オオムギ、牧草又はタバコであり、
場合により前記植物種子は、トウモロコシ、コムギ、ナタネ、アブラナ、ダイズ、ヤシ、ヒマワリ、ゴマ、イネ、オオムギ、落花生又はタバコの種子である、
前記トランスジェニック植物またはトランスジェニック植物種子。
【請求項８】
請求項1記載の核酸の配列又はその一部分と相補的であるか又は前記核酸又はその一部分とストリンジェントな条件下でハイブリダイズすることができる核酸の配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドであって、場合により、長さが10から50、20から60、30から70、40から80、又は60から100塩基である、前記アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項９】
請求項1記載の核酸の配列の部分配列を含む二本鎖の阻害性RNA（RNAi）分子であって、場合により、長さが15、16、17、18、19、20、21、2、23、24、25、26、27、28、29若しくは30又はそれより長い、前記RNAi分子。
【請求項１０】
（ａ）配列番号:2と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、若しくは550残基の領域にわたって、又は配列番号:2の完全長にわたって少なくとも80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99％、またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:4と少なくとも100、150、200、250、300、350、若しくは400残基の領域にわたって、又は配列番号:4の完全長にわたって少なくとも55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:6と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、若しくは600残基の領域にわたって、又は配列番号:6の完全長にわたって少なくとも65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:8と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、若しくは750残基の領域にわたって、又は配列番号:8の完全長にわたって少なくとも95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:10と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、若しくは500残基の領域にわたって、又は配列番号:10の完全長にわたって少なくとも60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:12と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、若しくは550残基の領域にわたって、又は配列番号:12の完全長にわたって少なくとも50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:14と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、若しくは450残基の領域にわたって、又は配列番号:14の完全長にわたって少なくとも50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:16と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、若しくは500残基の領域にわたって、又は配列番号:16の完全長にわたって少なくとも60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:18と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、若しくは1350残基の領域にわたって、又は配列番号:18の完全長にわたって少なくとも50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77%、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:20と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、若しくは1650残基の領域にわたって、又は配列番号:20の完全長にわたって少なくとも80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、
配列番号:22と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、若しくは1400残基の領域にわたって、又は配列番号:22の完全長にわたって少なくとも95％、96％、97％、98％、、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列、または、
配列番号:24と少なくとも100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、若しくは1650残基の領域にわたって、又は配列番号:24の完全長にわたって少なくとも80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％またはそれより高い、または100％の配列同一性を有する配列
を含む、単離、合成、または組換えポリペプチドであって、場合により前記配列同一性が配列比較アルゴリズムを用いる分析によって、または目視精査によって決定される、前記単離、合成、または組換えポリペプチド；又は
（ｂ）請求項1記載の核酸の配列またはその部分配列によってコードされる、酵素活性を有するポリペプチド、を含む、単離、合成、または組換えポリペプチド；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）記載のポリペプチドであって、シグナル配列を欠く前記ポリペプチド；
（ｄ）異種配列を含む（ａ）、（ｂ）または（ｃ）の単離、合成、または組換えポリペプチドであって、場合により前記異種配列が異種シグナル配列、異種触媒ドメイン（CD）、異種プレプロドメイン、酵素切断部位またはこれらの組み合わせを含み、さらに場合により、前記異種シグナル配列が他のグルコシダーゼまたは非グルコシダーゼ酵素由来であり、
場合により前記ポリペプチドはグルコシダーゼ活性を有し；
場合により、前記グルコシダーゼ活性がα-グルコシダーゼ活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がアルファ-(1,4)グルコース結合、アルファ-(1,6) グルコース結合、アルファ-(1,2) グルコース結合、アルファ-(1,3)グルコース結合、又はそれらの組合せの加水分解を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がアルファ-(1,4)グルコース結合またはアルファ-(1,6) グルコース結合の加水分解を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性が、デンプン中のグルコシド結合を加水分解してマルトデキストリンの生成を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がマルト-オリゴ糖及び液化デンプンの両者の加水分解を触媒する活性を含み、または、前記α-グルコシダーゼ活性が、1,4-アルファ-D-グルカンヒドロラーゼ活性又は1,6-アルファ-D-グルカンヒドロラーゼ活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がエキソグルコシダーゼ活性を含み、または、前記α-グルコシダーゼ活性がデンプン中のグルコシド結合を加水分解する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性が、デンプンのα-D-グルコース残基への加水分解を触媒する活性を含み、または、前記グルコシダーゼ活性がデンプンの還元末端又は非還元末端からグルコース残基を切断する活性を含み；
場合により、前記グルコシダーゼ活性が熱安定性であり、または37℃から95℃の温度範囲を含む条件下でグルコシダーゼ活性を維持し、または、55℃から85℃、70℃から95℃、又は90℃から95℃の温度範囲を含む条件下でグルコシダーゼ活性を維持し；
場合により、前記グルコシダーゼ活性が耐熱性であり、または、37℃から95℃の範囲の温度に暴露された後でグルコシダーゼ活性を維持し、または、55℃から85℃又は90℃から95℃の範囲の温度に暴露された後でグルコシダーゼ活性を維持し、または、前記耐熱性が、上昇温度に加熱した後で37℃におけるグルコシダーゼの比活性の少なくとも半分を維持することを含み、または、前記耐熱性が、上昇温度に加熱した後で37℃においてタンパク質1ミリグラムにつき500から1200ユニットの比活性を維持することを含み；
場合により、シグナル配列を欠くか異種シグナル配列を含み；
場合により、タンパク質1ミリグラムにつき100から1000ユニット、タンパク質1ミリグラムにつき500から750ユニット、タンパク質1ミリグラムにつき500から1200ユニット、又はタンパク質1ミリグラムにつき750から1000ユニットの範囲の比活性を含み；
場合により、少なくとも一つのグリコシル化部位を含み、場合により前記グリコシル化部位はN-結合グリコシル化部位であり、場合により、P. パストリス（pastoris）またはS. ポンベ（pombe）で発現されるとグリコシル化され；
場合により、pH6.5、pH6.0、pH5.5、pH5.0、pH4.5又はpH4.0を含む条件下でグルコシダーゼ活性を維持し、
場合により、pH8.0、pH8.5、pH9、pH9.5、pH10、又はpH10.5を含む条件下でグルコシダーゼ活性を維持する、
前記単離、合成、または組換えポリペプチド。
【請求項１１】
請求項１０記載のポリペプチドの配列またはその部分配列を含む固定化ポリペプチドであって、場合により、細胞、金属、樹脂、ポリマー、セラミック、ガラス、微小電極、グラファイト粒子、ビーズ、ゲル、プレート、アレイまたはキャピラリー管に固定化された、前記固定化ポリペプチド。
【請求項１２】
以下いずれかを含むアレイ：
（ａ）請求項１０記載の固定化ポリペプチド；
（ｂ）請求項1記載の核酸；または
（ｃ）（ａ）および（ｂ）の組み合わせ。
【請求項１３】
請求項１０記載のポリペプチドと特異的に結合する単離、合成または組換え抗体であって、場合により、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体である、前記単離、合成または組換え抗体。
【請求項１４】
請求項１０記載のポリペプチド又はその一部分を含む動物用食品添加物であって、場合により前記ポリペプチドがグリコシル化されている、前記動物用食品添加物。
【請求項１５】
請求項１０記載のポリペプチドを含む食用酵素デリバリーマトリックスであって、場合により前記ポリペプチドがグリコシル化されている、または、耐熱性若しくは熱安定性グルコシダーゼ活性を有する、前記食用酵素デリバリーマトリックス。
【請求項１６】
（a）プロモーターに機能的に連結された核酸を提供する工程であって、前記核酸が請求項1記載の核酸の配列を含む核酸である、前記工程；および、
（b）ポリペプチドの発現を可能にする条件下で工程（a）で提供される核酸を発現させ、それによって組換えポリペプチドを製造する工程、
を含む、組換えポリペプチドを製造する方法であって、
場合により、さらに、工程（a）で提供される核酸で宿主細胞を形質転換し、続いて工程（a）で提供される核酸を発現させ、それによって前記形質転換された細胞で組換えポリペプチドを産生させる工程を含む、
前記組換えポリペプチドを製造する方法。
【請求項１７】
プロセッサーおよびデータ保存装置を含むコンピュータシステムまたはコンピュータ読み出し可能媒体であって、前記データ保存装置またはコンピュータ読み出し可能媒体にはポリペプチド配列又は核酸配列が保存されてあり、前記ポリペプチド配列が請求項１０記載のポリペプチドの配列または請求項1記載の核酸によってコードされるポリペプチドの配列を含み；
場合により、前記コンピュータシステムが配列比較アルゴリズム、及び少なくとも1つの参照配列が保存された保存装置を含み、場合により、前記配列比較アルゴリズムが多型性を表示するコンピュータプログラムを含み；
場合により、さらに前記コンピュータシステムが前記配列内の1つまたは2つ以上の特徴を同定するアイデンティファイアーを含む、前記コンピュタシステムまたはコンピュータ読み出し可能媒体。
【請求項１８】
（ｉ）（ａ）請求項３記載の増幅プライマー対を提供する工程；
（ｂ）環境サンプルから核酸を単離するか、又は前記サンプル内の核酸がハイブリダイゼーションのために前記増幅プライマー対に接近できるように前記環境サンプルを処理する工程；および、
（c）工程（b）の核酸を工程（a）の増幅プライマー対と一緒にして前記環境サンプルの核酸を増幅し、それによって環境サンプルからグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する工程、
を含む、環境サンプルからグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する方法であって、
場合により、増幅プライマー対の各メンバーが、配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23に記載の配列又はその部分配列の少なくとも10から50の連続する塩基を含むオリゴヌクレオチドを含む、
前記環境サンプルからグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する方法；または、
（ii）（a）請求項1記載の核酸の配列又はその部分配列を含むポリヌクレオチドプローブを提供する工程；
（b）環境サンプルから核酸を単離するか、又は前記サンプル内の核酸がハイブリダイゼーションのために工程（ａ）のポリヌクレオチドに接近できるように前記環境サンプルを処理する工程；
（c）工程（b）の単離された核酸又は処理された環境サンプルを工程（ａ）のポリヌクレオチドプローブと一緒にする工程；および、
（d）工程（a）のポリヌクレオチドプローブと特異的にハイブリダイズする核酸を単離し、それによって環境サンプルからグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する工程、
を含む、環境サンプルからグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する方法であって、
場合により、前記環境サンプルが水サンプル、液体サンプル、土壌サンプル、空気サンプルまたは生物学的サンプルを含み、場合により、前記生物学的サンプルが、細菌細胞、原生動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、植物細胞、真菌細胞又は哺乳動物細胞に由来する、
前記環境サンプルからグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸を単離または回収する方法。
【請求項１９】
（a）請求項１記載の核酸の配列を含む鋳型核酸を提供する工程；および、
（b）前記鋳型配列内の1つ又は2つ以上のヌクレオチドを改変、欠失又は付加させて、またはそれらの組み合わせにより前記鋳型核酸の変種を作製する工程、
を含む、グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸の変種を作製する方法であって、
場合により、前記改変、付加又は欠失が、変異性PCR、シャッフリング、オリゴヌクレオチド特異的変異導入、アッセンブリPCR、セクシュアルPCR変異導入、in vivo変異導入、カセット変異導入、再帰的アンサンブル変異導入、エクスポネンシャル変異導入、部位特異的変異導入、遺伝子再アッセンブリ、遺伝子部位飽和変異導入（GSSM）、合成連結再アッセンブリ（SLR）およびそれらの組合せを含む方法によって導入され；
場合により、前記改変、付加または欠失が、組換え、再帰的配列組換え、ホスホチオエート-修飾DNA変異導入、ウラシル含有鋳型変異導入、ギャップ含有二重鎖変異導入、点ミスマッチ修復変異導入、修復欠損宿主株変異導入、化学変異導入、放射性変異導入、欠失変異導入、制限-選択変異導入、制限-精製変異導入、人工遺伝子合成、アンサンブル変異導入、キメラ核酸マルチマー生成およびそれらの組合せを含む方法によって導入され；
場合により、前記鋳型核酸によってコードされるポリペプチドの活性とは変異した若しくは異なる活性または前記ポリペプチドの安定性とは変異した若しくは異なる安定性を有するグルコシダーゼが得られるまで反復され；
場合により、前記核酸の変種によってコードされる変種変種グルコシダーゼポリペプチドが耐熱性であり、上昇した温度に暴露された後である程度の活性を維持し；
場合により、前記核酸の変種によってコードされる変種グルコシダーゼポリペプチドが、鋳型核酸によってコードされるグルコシダーゼと比較してグリコシル化が増加しており； 
場合により、前記核酸の変種によってコードされる変種グルコシダーゼポリペプチドが高温下でグルコシダーゼ活性を有するが、前記鋳型核酸によってコードされるグルコシダーゼは前記高温下で活性をもたず；
場合により、前記鋳型核酸のコドン使用頻度とは異なるコドン使用頻度を示すグルコシダーゼコード配列が得られるまで繰り返し反復され；
場合により、前記鋳型核酸のメッセージ発現レベルまたは安定性レベルより高いまたは低い発現レベル若しくは安定性レベルを有するグルコシダーゼ遺伝子が得られるまで繰り返し反復される、
前記グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドをコードする核酸の変種を作製する方法。
【請求項２０】
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが請求項１０記載のポリペプチド、又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含むポリペプチドである、前記工程；
（b）デンプンを含む組成物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の組成物と前記ポリペプチドがデンプンを加水分解する条件下で接触させる工程、
を含み、
場合により、前記組成物がα-1,4グルコシド結合又はα-1,6-グルコシド結合を含む、
デンプンを加水分解する方法。
【請求項２１】
以下の工程を含む、デンプンを液化する方法又は組成物からデンプンを除去する方法：
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが請求項１０に記載のポリペプチド、又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含むポリペプチドである、前記工程；
（b）デンプンを含む組成物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の組成物と前記ポリペプチドがデンプンを除去又は液化する条件下で接触させる工程。
【請求項２２】
請求項１０に記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含む洗剤組成物であって、前記ポリペプチドがグルコシダーゼ活性を含み、
場合により、前記グルコシダーゼ非表面活性グルコシダーゼ又は表面活性グルコシダーゼであり；
場合により、前記グルコシダーゼが非水性液体組成物、注型成形固体、顆粒形態、粒状形態、圧縮錠剤形態、ゲル、ペースト又はスラリー形態として処方される、
前記洗浄組成物。
【請求項２３】
以下の工程を含む対象物の洗浄方法：
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを含む組成物を提供する工程であって、前記ポリペプチドが、請求項１０に記載のポリペプチド又は請求項1記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）対象物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の対象物と前記組成物が前記対象物を洗浄することができる条件下で接触させる工程。
【請求項２４】
（a）デンプンを含む飼料原料または食品原料を提供する工程であって、前記デンプンがグルコシダーゼ活性を有するポリペプチドによって加水分解することができ、前記ポリペプチドが、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）工程（a）のポリペプチドを前記飼料原料又は食品原料に、デンプンを加水分解して処理食品又は飼料を製造するために十分な時間、十分な量で添加し、それによって動物による消費の前に食品又は飼料中のデンプンを加水分解する工程、
を含み、
場合により、前記前記飼料又は食品がコメ、トウモロコシ、オオムギ、コムギ、豆類又はジャガイモを含む、
動物による消費に先立って飼料又は食品中のデンプンを加水分解する方法。
【請求項２５】
請求項１０記載のポリペプチド、又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む飼料又は食品。
【請求項２６】
デンプン、及び、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含む組成物。
【請求項２７】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む織物。
【請求項２８】
以下の工程を含む織物を脱サイズする方法：
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）織物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の織物と前記グルコシダーゼが前記織物を脱サイズすることができる条件下で接触させる工程。
【請求項２９】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む紙又は紙製品又は紙パルプ。
【請求項３０】
以下の工程を含む紙又は繊維を脱インクする方法：
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）紙又は繊維を含む組成物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の組成物と前記ポリペプチドが前記紙又は繊維を脱インクすることができる条件下で接触させる工程。
【請求項３１】
以下の工程を含むリグノセルロース繊維の処理方法：
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）リグノセルロース繊維を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の繊維と、前記ポリペプチドが前記繊維を処理してそれによって前記繊維の特性を改善することができる条件下で接触させる工程。
【請求項３２】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含む、高マルトース又は高グルコース液若しくはシロップ。
【請求項３３】
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）デンプンを含む組成物を提供する工程；および、
（c）前記工程（a）のポリペプチドが前記工程（b）の組成物を加水分解することができる条件下で工程（a）のポリペプチドを工程（b）の組成物と接触させ、それによって高マルトース又は高グルコースシロップを生成する工程、
を含み、
場合により、前記デンプンがコメ、トウモロコシ、オオムギ、コムギ、豆類、ジャガイモ又はサツマイモに由来する、
高マルトース又は高グルコースシロップを製造する方法。
【請求項３４】
（a）グルコシダーゼ活性を有するポリペプチドを提供する工程であって、前記ポリペプチドが、請求項１０記載のポリペプチド又は請求項1記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドである、前記工程；
（b）デンプンを含む産出流体を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の産出流体と前記グルコシダーゼが前記産出流体中のデンプンを加水分解することができる条件下で接触させ、それによって前記産出流体の密度を低下させて前記産出流体の流れを改善する工程、
を含み、
場合により、前記産出流体が地下層に由来する、
デンプン含有産出流体の流れを改善する方法。
【請求項３５】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含むアンチステーリング組成物。
【請求項３６】
（a）請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドを提供する工程；
（b）デンプンを含む、焼成に用いられる組成物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の組成物と、前記ポリペプチドが焼成に用いられる組成物中のデンプンを加水分解することができる条件下で一緒にし、それによって焼成製品の老化を防ぐ工程を含み、
場合により、前記焼成製品がパン又はパン製品である、
焼成製品の老化を防ぐ方法。
【請求項３７】
（a）請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むポリペプチドを提供する工程；
（b）デンプン又は多糖類を含む、醸造又はアルコール製造に用いられる組成物を提供する工程；および、
（c）工程（a）のポリペプチドを工程（b）の組成物と、前記ポリペプチドが醸造又はアルコール製造で用いられる組成物中のデンプン又は多糖類を加水分解することができる条件下で一緒にする工程を含み、
場合により、前記デンプン又は多糖類を含む組成物がビールである、
醸造又はアルコール製造においてグルコシダーゼを使用する方法。
【請求項３８】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むアルコール飲料。
【請求項３９】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含むビール。
【請求項４０】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含む医薬組成物。
【請求項４１】
（ａ）配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22又は配列番号:24の残基1から16、1から17、1から18、1から19、1から20、1から21、1から22、1から23、1から24、1から25、1から26、1から27、1から28、1から29、1から30、1から31、1から32、又は1から33に記載の配列からなる単離、合成又は組換えシグナル配列；または、
（ｂ）配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22又は配列番号:24の残基1から16、1から17、1から18、1から19、1から20、1から21、1から22、1から23、1から24、1から25、1から26、1から27、1から28、1から29、1から30、1から31、1から32、又は1から33に記載の配列を含む単離、合成又は組換えシグナル配列。
【請求項４２】
請求項１０記載のポリペプチド又は請求項１記載の核酸によってコードされるポリペプチド、を含み、
場合により、歯磨きペースト、歯磨きクリーム、ゲル又は歯磨き粉、オドンティック、口内洗浄液、歯磨き前又は歯磨き後の洗浄製剤、チューインガム、ロゼンジ又はキャンデーを含む、
口腔手入れ用品。