【手続補正書】
【提出日】平成19年8月20日(2007.8.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  微生物の培養中の気泡形成を減少させるための方法であって、
前記微生物が培養中の気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドを基本量産生しないように前記微生物を改変するステップと、
適切な培養条件下で前記微生物を培養するステップを含み、
前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドが両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドでありリポペプチドまたはリポタンパク質を含まないことを特徴とする方法。
【請求項２】  気泡形成に関係がある前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドがヒドロフォビンまたはヒドロフォビン様分子であることを特徴とする、請求項１に記載の方法。
【請求項３】  前記ヒドロフォビンがＴｒｉｃｈｏｄｅｒｍａのＨＦＢＩおよび／またはＨＦＢＩＩであることを特徴とする、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】  前記改変が微生物の遺伝学的改変を含むことを特徴とする、請求項１から３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】  前記遺伝学的改変が気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドの産生を調節するタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドをコードしているＤＮＡ配列の遺伝学的改変を含むことを特徴とする、請求項４に記載の方法。
【請求項６】  前記遺伝学的改変が気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドをコードしている遺伝子の調節領域の遺伝学的改変を含むことを特徴とする、請求項４に記載の方法。
【請求項７】  前記遺伝学的改変が気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドをコードしているＤＮＡ配列の遺伝学的改変を含むことを特徴とする、請求項４に記載の方法。
【請求項８】  前記遺伝学的改変が気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドをコードしているＤＮＡ配列の不活性化を含むことを特徴とする、請求項７に記載の方法。
【請求項９】  前記遺伝学的改変が気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドをコードしているＤＮＡ配列の欠失を含むことを特徴とする、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】  微生物を培養することによって産物を産生させるための方法であって、
前記微生物が培養中の気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドを基本量産生しないように前記微生物を改変するステップと、
適切な培養条件下で前記微生物を培養するステップと、
前記培養からの前記産生物を回収するステップを含み、
前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドが両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドでありリポペプチドまたはリポタンパク質を含まないことを特徴とする方法。
【請求項１１】  産生物がタンパク質または代謝産物またはバイオマスであることを特徴とする、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】  それが組換え産物であることを特徴とする、請求項１０に記載の産生物。
【請求項１３】  改変されていない産生宿主菌株の培養中に少なくとも１つの、気泡形成に関係がある両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドを基本量産生しないように前記宿主菌株を遺伝学的に改変すること、および前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドが両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドでありリポペプチドまたはリポタンパク質を含まないことを特徴とする、産生宿主菌株。
【請求項１４】  気泡形成に関係がある前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドがヒドロフォビンまたはヒドロフォビン様分子であることを特徴とする、請求項１３に記載の産生宿主菌株。
【請求項１５】  前記菌株が真菌の菌株であることを特徴とする、請求項１３または１４に記載の産生宿主菌株。
【請求項１６】  前記宿主菌株がＴｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ菌株であることを特徴とする、請求項１５に記載の産生宿主菌株。
【請求項１７】  前記タンパク質がＴｒｉｃｈｏｄｅｒｍａのＨＦＢＩまたはＨＦＢＩＩまたは両方であることを特徴とする、請求項１６に記載の宿主菌株。
【請求項１８】  前記宿主菌株が細菌性の菌株であることを特徴とする、請求項１３または１４に記載の宿主菌株。
【請求項１９】  前記菌株がＢａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ．菌株、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ  ｓｐｐ．菌株またはＥ．ｃｏｌｉ菌株であることを特徴とする、請求項１８に記載の宿主菌株。
【請求項２０】  改変されていない産生宿主菌株の培養中の気泡形成に関係がある少なくとも１つのタンパク質またはポリペプチドまたはペプチドを基本量産生しないように前記宿主菌株を遺伝学的に改変し、目的の産物を産生することができるように改変したこと、および前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドが両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドでありリポペプチドまたはリポタンパク質を含まないことを特徴とする、産生宿主菌株。
【請求項２１】  前記宿主菌株が少なくとも１つの両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドを基本量産生しないように改変され、目的の産物を産生する能力が向上していること、および前記タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドが両親媒性または疎水性タンパク質またはポリペプチドまたはペプチドでありリポペプチドまたはリポタンパク質を含まないことを特徴とする、産生宿主菌株。
【請求項２２】  前記宿主菌株が改変されて目的の産物を産生することができることを特徴とする、請求項２１に記載の宿主菌株。
【請求項２３】  前記菌株が真菌の菌株であることを特徴とする、請求項２０から２２のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項２４】  前記宿主菌株がＴｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ菌株であることを特徴とする、請求項２０から２３のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項２５】  前記ヒドロホビンがＴｒｉｃｈｏｄｅｒｍａのＨＦＢＩまたはＨＦＢＩＩであることを特徴とする、請求項２０から２４のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項２６】  前記微生物菌株が細菌性菌株であることを特徴とする、請求項２０から２２のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項２７】  前記微生物菌株がＢａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ．菌株、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ  ｓｐｐ．菌株またはＥ．ｃｏｌｉ菌株であることを特徴とする、請求項２６に記載の宿主菌株。
【請求項２８】  前記当該の産生物がタンパク質または代謝産物またはバイオマスであることを特徴とする、請求項２０から２７のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項２９】  前記当該の産生物が組換え産生物であることを特徴とする、請求項２０から２７のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項３０】  前記宿主菌株が遺伝学的に改変されて、ヒドロフォビンと融合される当該の分子を含む融合分子を産生することができることを特徴とする、請求項２０から２９のいずれか一項に記載の宿主菌株。
【請求項３１】  より多量の当該の産生物を産生させるための方法であって、
請求項２０から３０のいずれか一項に記載の産生宿主菌株を培養するステップと、
前記培養からの前記産生物を回収するステップを含むことを特徴とする方法。