【手続補正書】
【提出日】平成19年11月6日(2007.11.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーに属する単離されたタンパク質もしくはその免疫原性活性のあるペプチドフラグメント、または、
該タンパク質もしくは該ペプチドフラグメントをコードする核酸
を含む、医薬として使用するためのワクチン組成物。
【請求項２】
前記ワクチン組成物は、癌患者に投与される場合、癌疾患に対する免疫応答を誘発し得る、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記ワクチン組成物は、Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーのメンバーが発現される癌患者に投与される場合、癌疾患に対する免疫応答を誘発し得る、請求項１に記載の組成物。
【請求項４】
前記タンパク質が、Ｂｃｌ−２ファミリーの抗アポトーシス性のメンバーからなる群より選択される、請求項１〜３のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項５】
前記タンパク質が、Ｂｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ、Ｍｃｌ−１、Ｂｆｌ−１／Ａ１、Ｂｃｌ−ｂ、Ｂｃｌ２−Ｌ−１０、およびＢｃｌ−ＸＬからなる群より選択される、請求項１〜３のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項６】
前記タンパク質が、Ｂａｘ、Ｂｏｋ／Ｍｔｄ、Ｂａｄ、Ｂｉｋ／Ｎｂｋ，Ｂｉｄ、Ｈｒｋ／ＤＰ５、Ｂｉｍ、Ｎｏｘａ、Ｂｍｆ、およびＰＵＭＡ／ｂｂｃ３からなる群より選択される、請求項１〜３のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項７】
前記タンパク質がＢｃｌ−２である、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項８】
前記タンパク質がＢｃｌ−ＸＬである、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項９】
前記タンパク質がＭｃｌ−１である、請求項５に記載のワクチン組成物。
【請求項１０】
癌の予防または処置において医薬として使用するための、Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーに属するタンパク質に由来する単離された免疫原性活性のあるペプチドフラグメント。
【請求項１１】
前記タンパク質が、Ｂｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ、Ｍｃｌ−１、Ｂｆｌ−１／Ａ１、Ｂｃｌ−ｂ、Ｂｃｌ２−Ｌ−１０、およびＢｃｌ−ＸＬからなる群より選択される、請求項１０に記載のペプチドフラグメント。
【請求項１２】
前記タンパク質が、Ｂａｘ、Ｂｏｋ／Ｍｔｄ、Ｂａｄ、Ｂｉｋ／Ｎｂｋ、Ｂｉｄ、Ｈｒｋ／ＤＰ５、Ｂｉｍ、Ｎｏｘａ、Ｂｍｆ、およびＰＵＭＡ／ｂｂｃ３からなる群より選択される、請求項１０に記載のペプチドフラグメント。
【請求項１３】
前記タンパク質がＢｃｌ−２である、請求項１１に記載のペプチドフラグメント。
【請求項１４】
前記タンパク質がＢｃｌ−ＸＬである、請求項１１に記載のペプチドフラグメント。
【請求項１５】
前記タンパク質がＭｃｌ−１である、請求項１１に記載のペプチドフラグメント。
【請求項１６】
癌患者において細胞性免疫応答を誘発し得る、請求項１０〜１５のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項１７】
以下の特徴：
（ｉ）クラスＩ  ＨＬＡ分子の最大回復量の半分を回復し得るペプチドの量（Ｃ５０値）によって測定される親和性で制限される、クラスＩ  ＨＬＡ分子に結合する能力、であって、該Ｃ５０値は、本明細書中に記載されるアセンブリ結合アッセイによって決定した場合に、最大５０μＭである、能力
（ｉｉ）ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した場合に１０４個のＰＢＬあたり少なくとも１個の頻度で、癌患者のＰＢＬ集団中にＩＦＮ−γを産生する細胞を誘発する能力、および／または
（ｉｉｉ）エピトープペプチドと反応するＣＴＬを、腫瘍組織中においてインサイチュで検出する能力
のうちの少なくとも１つを有するＭＨＣ  クラスＩ制限ペプチドである、請求項１０〜１６のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項１８】
最大３０μＭであるＣ５０値を有する、請求項１７に記載のペプチドフラグメント。
【請求項１９】
最大２０μＭであるＣ５０値を有する、請求項１７に記載のペプチドフラグメント。
【請求項２０】
ＭＨＣクラスＩ  ＨＬＡ−Ａ分子によって制限される、請求項１７に記載のペプチドフラグメント。
【請求項２１】
ＨＬＡ−Ａ１、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａ３、ＨＬＡ−Ａ１１、およびＨＬＡ−Ａ２４からなる群より選択されるＭＨＣクラスＩ  ＨＬＡ種によって制限される、請求項２０に記載のペプチドフラグメント。
【請求項２２】
ＨＬＡ−Ａ２によって制限される、請求項１７に記載のペプチドフラグメント。
【請求項２３】
ＡＬＶＧＡＣＩＴＬ（配列番号１）、ＡＬＳＰＶＰＰＶＶ（配列番号２）、ＳＬＡＬＶＧＡＣＩ（配列番号３）、ＫＴＬＬＳＬＡＬＶ（配列番号４）、ＬＬＳＬＡＬＶＧＡ（配列番号５）、ＷＬＳＬＫＴＬＬＳＬ（配列番号６）、ＡＡＡＧＰＡＬＳＰＶ（配列番号７）、ＰＬＦＤＦＳＷＬＳＬ（配列番号８）、ＦＴＡＲＧＲＦＡＴＶ（配列番号９）、ＹＬＮＲＨＬＨＴＷＩ（配列番号１０）、ＮＩＡＬＷＭＴＥＹＬ（配列番号１１）からなる群より選択される配列を含む、請求項１０〜１１、および１６〜１９のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項２４】
前記ペプチドが、ＴＡＹＱＳＦＥＱＶ（配列番号４３）、ＹＬＮＤＨＬＥＰＷＩ（配列番号４２）、ＲＩＡＡＷＭＡＴＹＬ（配列番号４５）、ＷＭＡＴＹＬＮＤＨＬ（配列番号４６）、ＶＬＶＳＲＩＡＡＷＭ（配列番号４８）およびＶＡＦＦＳＦＧＧＡＬ（配列番号４９）からなる群より選択される配列を含む、請求項１０〜１１、および１６〜１９のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項２５】
前記ペプチドが、配列ＲＩＡＡＷＭＡＴＹ（配列番号５０）を含む、請求項１０〜１１、および１６〜１９のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項２６】
前記ペプチドが、ＲＬＬＦＦＡＰＴＲ（配列番号５５）およびＲＴＫＲＤＷＬＶＫ（配列番号５６）からなる群より選択される配列を含む、請求項１０〜１１、および１６〜１９のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項２７】
前記ペプチドが、ＰＡＥＥＥＥＤＤＬＹ（配列番号５８）およびＱＳＬＥＩＩＳＲＹ（配列番号６０）からなる群より選択される配列を含む、請求項１０〜１１、および１６〜１９のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項２８】
前記ペプチドが、ＲＬＫＲＤＷＬＶＫ（配列番号６２）、ＱＳＤＥＩＩＳＲＹ（配列番号６３）、およびＱＳＥＥＩＩＳＲＹ（配列番号６４）からなる群より選択される、請求項１０〜１１、および１６〜１９のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項２９】
ＭＨＣクラスＩ  ＨＬＡ−Ｂ分子によって制限される、請求項１７に記載のペプチドフラグメント。
【請求項３０】
ＨＬＡ−Ｂ７、ＨＬＡ−Ｂ３５、ＨＬＡ−Ｂ４４、ＨＬＡ−Ｂ８、ＨＬＡ−Ｂ１５、ＨＬＡ−Ｂ２７、およびＨＬＡ−Ｂ５１からなる群より選択されるＭＨＣクラスＩ  ＨＬＡ−Ｂ種によって制限される、請求項２９に記載のペプチドフラグメント。
【請求項３１】
最大２０個のアミノ酸残基を含む、請求項１０〜３０のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項３２】
最大１５個のアミノ酸残基を含む、請求項３１に記載のペプチドフラグメント。
【請求項３３】
ノナペプチドまたはデカペプチドである、請求項３２に記載のペプチドフラグメント。
【請求項３４】
哺乳動物種から単離されたかまたは哺乳動物種に由来する天然の配列である、請求項１０〜３３のいずれかに記載のタンパク質またはペプチドフラグメント。
【請求項３５】
前記タンパク質がヒトタンパク質である、請求項１０〜３４のいずれかに記載のタンパク質またはペプチドフラグメント。
【請求項３６】
少なくとも１つのアミノ酸残基の置換、欠失、または付加によって天然のＢｃｌ−２タンパク質ファミリーのメンバーの配列から誘導される、請求項１０〜３３のいずれかに記載のタンパク質またはペプチドフラグメント。
【請求項３７】
各々の特定のＨＬＡ対立遺伝子について、以下の表に示されるアミノ酸残基のいずれかを含む、請求項１０〜３６のいずれかに記載のペプチドフラグメント：
【表１−１】
2007511547.tif 000001
【表１−２】
2007511547.tif 000002
【表１−３】
2007511547.tif 000003
【表１−４】
2007511547.tif 000004
。
【請求項３８】
１０４個のＰＢＬあたり少なくとも１０個の頻度で癌患者のＰＢＬ集団中にＩＮＦ−γを産生する細胞を誘発することができる、請求項１０〜３７のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項３９】
Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーに属するタンパク質が発現される癌疾患を有する患者のＰＢＬ集団においてＩＦＮ−γを産生する細胞を誘発し得る、請求項１０〜３８のいずれかに記載のペプチドフラグメント。
【請求項４０】
前記癌疾患が、慢性リンパ性白血病および慢性骨髄性白血病を含む造血器悪性腫瘍、黒色腫、乳癌、子宮頸部癌、卵巣癌、肺癌、結腸癌、膵臓癌、ならびに前立腺癌からなる群より選択される、請求項３９に記載のペプチドフラグメント。
【請求項４１】
請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドフラグメントを含む、請求項１〜９のいず
れかに記載のワクチン組成物。
【請求項４２】
請求項２９に記載のペプチドフラグメントと組み合わせて請求項１８に記載のペプチドフラグメントを含む、請求項４１に記載のワクチン組成物。
【請求項４３】
前記ワクチンが、ワクチン接種した患者において癌細胞に対して細胞傷害性作用を有するエフェクターＴ細胞の産生を誘発する、請求項１〜９、および４１〜４２のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項４４】
Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーには属さないか、またはＢｃｌ−２タンパク質ファミリーには由来しないタンパク質またはペプチドフラグメントから選択される免疫原性タンパク質またはペプチドフラグメントをさらに含む、請求項１〜９、および４１〜４３のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項４５】
前記Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーには属さないかまたはＢｃｌ−２タンパク質ファミリーには由来しないタンパク質またはペプチドフラグメントが、細胞のアポトーシスの調節に関係するタンパク質、またはそれに由来するペプチドフラグメントである、請求項４４に記載のワクチン組成物。
【請求項４６】
前記Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーには属さないかまたはＢｃｌ−２タンパク質ファミリーには由来しないタンパク質またはペプチドフラグメントから選択される免疫原性タンパク質またはペプチドフラグメントが、サービビンまたはそのペプチドフラグメントである、請求項４４に記載のワクチン組成物。
【請求項４７】
前記Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーには属さないかまたはＢｃｌ−２タンパク質ファミリーには由来しないタンパク質またはペプチドフラグメントから選択される免疫原性タンパク質またはペプチドフラグメントが、ＭＬ−ＩＡＰまたはそのペプチドフラグメントである、請求項４４に記載のワクチン組成物。
【請求項４８】
アジュバントを含む、請求項１〜９、および４１〜４７のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項４９】
前記アジュバントが、細菌ＤＮＡベースのアジュバント、油／界面活性剤ベースのアジュバント、ウイルスｄｓＲＮＡベースのアジュバント、およびイミダゾキニリンからなる群より選択される、請求項４８に記載のワクチン組成物。
【請求項５０】
前記ワクチン組成物が、タンパク質もしくはペプチドフラグメントまたは核酸を含む抗原提示細胞を含む、請求項１〜９、および４１〜４９のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項５１】
前記抗原提示細胞が樹状細胞である、請求項５０に記載のワクチン組成物。
【請求項５２】
前記組成物がリポソームを含む、請求項１〜９、および４１〜５１のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項５３】
前記核酸が請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドをコードする、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項５４】
前記核酸がベクター中に含まれる、請求項１および５３のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項５５】
前記ベクターがウイルスベクターおよび細菌ベクターからなる群より選択される、請求項５４に記載のワクチン組成物。
【請求項５６】
前記ベクターが、Ｔ細胞刺激ポリペプチドをコードする核酸をさらに含む、請求項５４〜５５のいずれかに記載のワクチン組成物。
【請求項５７】
前記Ｔ細胞刺激ポリペプチドが、Ｂ７．１、ＩＣＡＭ−１、およびＬＦＡ−３からなる群より選択される、請求項５６に記載のワクチン組成物。
【請求項５８】
請求項１〜９、および４１〜５７のいずれかに記載のワクチン組成物と、さらなる抗癌剤とを含む、キット。
【請求項５９】
前記抗癌剤が抗体である、請求項５８に記載のキット。
【請求項６０】
前記抗癌剤がサイトカインである、請求項５９に記載のキット。
【請求項６１】
癌患者における、ＰＢＬ中または腫瘍組織中でのＢｃｌ−２タンパク質ファミリーのメンバーと反応性のＴ細胞の存在をエキソビボまたはインサイチュで診断するための組成物であって、請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドフラグメントを含む、組成物。
【請求項６２】
癌患者における、ＰＢＬ中または腫瘍組織中でのＢｃｌ−２タンパク質ファミリーのメンバーと反応性のＴ細胞の存在をエキソビボまたはインサイチュで診断するための診断キットであって、請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドフラグメントを含む、診断キット。
【請求項６３】
請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドフラグメントと、クラスＩ  ＨＬＡ分子またはそのような分子のフラグメントとの複合体。
【請求項６４】
モノマーである、請求項６３に記載の複合体。
【請求項６５】
マルチマーである、請求項６３に記載の複合体。
【請求項６６】
癌患者においてＴ細胞と反応性のＢｃｌ−２タンパク質ファミリーのメンバーの存在を検出する方法であって、該方法は、腫瘍組織または血液サンプルを請求項６３に記載の複合体と接触させる工程、および該組織または該血液細胞に対する該複合体の結合を検出する工程を包含する、方法。
【請求項６７】
請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドフラグメントに特異的に結合し得る、分子。
【請求項６８】
抗体またはそのフラグメントである、請求項６７に記載の分子。
【請求項６９】
前記分子がＴ細胞レセプターである、請求項６７に記載の分子。
【請求項７０】
請求項６７または６９に記載の分子の結合をブロックし得る、分子。
【請求項７１】
癌疾患の処置または予防のための医薬の製造における、請求項１０〜４０のいずれかに記載のペプチドフラグメント、または請求項１〜９および４１〜５７のいずれかに記載のワクチン組成物の使用。
【請求項７２】
前記処置される疾患が、Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーのメンバーが発現される癌疾患である、請求項７１に記載の使用。
【請求項７３】
前記癌疾患が、慢性リンパ性白血病および慢性骨髄性白血病を含む造血器悪性腫瘍、黒色腫、乳癌、子宮頸部癌、卵巣癌、肺癌、結腸癌、膵臓癌、ならびに前立腺癌からなる群より選択される、請求項７１〜７２のいずれかに記載の使用。
【請求項７４】
さらなる癌の処置と併用される、請求項７１〜７３のいずれかに記載の使用。
【請求項７５】
前記さらなる処置が、化学療法、放射線治療、免疫賦活性物質での処置、遺伝子治療、抗体での処置、および樹状細胞を用いる処置からなる群より選択される、請求項７４に記載の使用。
【請求項７６】
免疫をモニタリングする方法であって、該方法は、以下の工程：
ｉ）個体から血液サンプルを提供する工程、
ｉｉ）Ｂｃｌ−２タンパク質ファミリーに属するタンパク質またはそのペプチドフラグメントを提供する工程、
ｉｉｉ）該血液サンプルが、該タンパク質またはペプチドに特異的に結合する抗体またはＴ細胞レセプターを含むＴ細胞を含むかどうかを決定する工程、
ｉｖ）それによって、該個体において該タンパク質またはペプチドに対する免疫応答が惹起されているかどうかを決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項７７】
前記ペプチドフラグメントがいずれかの請求項に記載のペプチドフラグメントである、請求項７６に記載の方法。
【請求項７８】
請求項６９に記載のＴ細胞レセプターを含む、単離されたＴ細胞。