【手続補正書】
【提出日】平成18年12月21日(2006.12.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  （ａ）配列識別番号４のアミノ酸２０−８３８に少なくとも９５％同一性を持つポリペプチド、および
（ｂ）（ａ）のポリペプチドの活性断片、ここで前記活性断片は少なくとも８０のアミノ酸乃至６８０以下のアミノ酸を含み、前記活性断片は少なくとも１個のコイルドコイル領域または少なくとも１個のヒスチジン三つ組領域を含む活性断片、
より成るグループから選択される部材を含む組成物であって、
前記部材は、前記組成物が哺乳類に投与される時に肺炎連鎖球菌に結合する抗体の産生を引き出すのに有効な量で薬理許容担体に存在することを特徴とする組成物。
【請求項２】  前記パーセント同一性が少なくとも９７％であることを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項３】  前記ポリペプチドが配列識別番号４のアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項４】  前記活性断片が少なくとも１個のコイルドコイル領域および少なくとも１個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項５】  前記活性断片が少なくとも２個のコイルドコイル領域を含むことを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項６】  前記活性断片が少なくとも２個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項７】  前記活性断片が少なくとも５個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項８】  前記活性断片が１個以上のコイルドコイル領域および１個以上のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項９】  前記部材が（ａ）であることを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項１０】  前記部材が（ｂ）であることを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項１１】  前記部材のアミノ酸配列と配列識別番号４のアミノ酸配列との間のいずれかの可変性がコイルドコイル領域またはヒスチジン三つ組領域以外のアミノ酸残基でのみ生じることを特徴とする請求項１記載の組成物。
【請求項１２】  （ａ）図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列に少なくとも９５％の同一性を持つポリペプチド、および
（ｂ）（ａ）のポリペプチドの活性断片、ここで前記活性断片は少なくとも８０のアミノ酸乃至６８０以下のアミノ酸を含み、前記活性断片は少なくとも１個のコイルドコイル領域または少なくとも１個のヒスチジン三つ組領域を含む活性断片、
より成るグループから選択される部材を含むワクチン組成物であって、
前記部材は、前記組成物が哺乳類に投与される時に肺炎連鎖球菌に結合する抗体の産生を引き出すのに有効な量で薬理許容担体に存在することを特徴とする組成物。
【請求項１３】  前記パーセント同一性が少なくとも９７％であることを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項１４】  前記ポリペプチドが図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項１５】  前記活性断片が少なくとも１個のコイルドコイル領域および少なくとも１個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項１６】  前記活性断片が少なくとも２個のコイルドコイル領域を含むことを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項１７】  前記活性断片が少なくとも２個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項１８】  前記活性断片が少なくとも５個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項１９】  前記活性断片が１個以上のコイルドコイル領域および１個以上のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項２０】  前記部材のアミノ酸配列と配列識別番号４のアミノ酸配列との間のいずれかの可変性がコイルドコイル領域またはヒスチジン三つ組領域以外のアミノ酸残基でのみ生じることを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項２１】  前記部材が（ａ）であることを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項２２】  前記部材が（ｂ）であることを特徴とする請求項１２記載の組成物。
【請求項２３】  前記ポリペプチドが残基２０のシスティンで開始するＰｈｔＤの少なくとも８１９アミノ酸残基であることを特徴とする請求項１２記載のワクチン。
【請求項２４】  図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列に少なくとも９５％の同一性を持つアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、前記ポリペプチドが肺炎連鎖球菌に結合する抗体に結合することを特徴とする単離ポリペプチド。
【請求項２５】  前記パーセント同一性が９７％であることを特徴とする請求項２４記載の単離ポリペプチド。
【請求項２６】  前記アミノ酸配列が図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列であることを特徴とする請求項２４記載の組成物。
【請求項２７】  ポリペプチドをコード化するヌクレオチド配列を含有するポリヌクレオチドを含む細胞から前記ポリペプチドを発現することを含むことを特徴とする請求項１または請求項１２記載のポリペプチドを含むポリペプチドを産生する方法。
【請求項２８】  請求項２７記載のベクターで遺伝子操作されたことを特徴とする組換え細胞。
【請求項２９】  組成物が哺乳類に投与される時に肺炎球菌感染を予防し、肺炎連鎖球菌に結合する抗体の産生を引き出すのに有効な量で薬理許容担体に前記ポリペプチドを含有する前記組成物を調製することを特徴とする請求項２４乃至２６のいずれか１項記載の単離ポリペプチドの使用法。
【請求項３０】  組成物が哺乳類に投与される時に肺炎球菌感染を予防し、肺炎連鎖球菌に結合する抗体の産生を引き出すのに有効な量で薬理許容担体に前記単離活性断片を含有する前記組成物を調製することを特徴とする請求項１または１２記載の活性断片の使用法。
【請求項３１】  請求項１記載の部材に結合する少なくとも１個の抗体を含み、前記抗体が薬理許容担体に存在することを特徴とする組成物。
【請求項３２】  肺炎連鎖球菌により生じる感染を処置または予防し、肺炎連鎖球菌により生じる感染を処置または予防するのに十分な量で抗体を薬理許容担体に含有する組成物を調製することを特徴とする請求項３１記載の抗体の使用法。
【請求項３３】  請求項１２記載の部材の結合する少なくとも１個の抗体を含み、前記抗体が薬理許容担体に存在することを特徴とする組成物。
【請求項３４】  肺炎連鎖球菌により生じる感染を処置または予防し、肺炎連鎖球菌により生じる感染を処置または予防するのに十分な量で抗体を薬理許容担体に含有する組成物を調製することを特徴とする請求項３３記載の抗体の使用法。
【請求項３５】  図６のＰｈｔＡ，ＰｈｔＢまたはＰｈｔＥのアミノ酸配列に少なくとも９５％の同一性を持つアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、前記ポリペプチドが肺炎連鎖球菌と結合する抗体に結合することを特徴とする単離ポリペプチド。
【請求項３６】  前記パーセント同一性が９７％であることを特徴とする請求項３５記載の単離ポリペプチド。
【請求項３７】  前記アミノ酸配列が図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列であることを特徴とする請求項３５記載の単離ポリペプチド。
【請求項３８】  組成物が哺乳類に投与される時に肺炎連鎖球菌に結合する抗体の産生を引き出すのに有効な量で請求項３５，３６または３７のいずれか１項記載の単離ポリペプチドを薬理許容担体に含むことを特徴とする組成物。
【請求項３９】  単離活性断片が少なくとも１個のコイルドコイル領域または少なくとも１個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項２４，２５，２６，３５，３６または３７のいずれか１項記載のポリペプチドの単離活性断片。
【請求項４０】  組成物が哺乳類に投与される時に肺炎連鎖球菌に結合する抗体の産生を引き出すのに有効な量で請求項３９記載の単離活性断片を薬理許容担体に含むことを特徴とする組成物。
【請求項４１】  第１および第２ポリペプチドを含むワクチンであって、第１ポリペプチドは配列識別番号４の活性断片を含み、前記活性断片は少なくとも２個のコイルドコイル領域を含むことを特徴とするワクチン。
【請求項４２】  前記第１および前記第２ポリペプチドが融合タンパク質として相互に融合されることを特徴とする請求項４１記載のワクチン。
【請求項４３】  前記第１ポリペプチドが更に少なくとも１個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項４２記載のワクチン。
【請求項４４】  前記第２ポリペプチドが、
（ａ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列に少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｂ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列に少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｃ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｄ）図６のＰｈｔＡのアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｅ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｆ）図６のＰｈｔＢのアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｇ）図６のＰｈｔＢのアミノ酸配列を含むポリペプチド；
より成るグループから選択されることを特徴とする請求項４１記載のワクチン。
【請求項４５】  前記第２ポリペプチドが（ａ）であることを特徴とする請求項４４記載のワクチン。
【請求項４６】  前記第２ポリペプチドが（ｂ）であることを特徴とする請求項４４記載のワクチン。
【請求項４７】  前記第２ポリペプチドが（ｃ）であることを特徴とする請求項４４記載のワクチン。
【請求項４８】  前記第２ポリペプチドが配列識別番号６の活性断片であり、前記活性断片が５個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項４２記載のワクチン。
【請求項４９】  第１および第２ポリペプチドを含むワクチンであって、前記第１ポリペプチドは図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列に少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むことを特徴とするワクチン。
【請求項５０】  前記第１および前記第２ポリペプチドが融合タンパク質として相互に融合されることを特徴とする請求項４９記載のワクチン。
【請求項５１】  前記第１ポリペプチドが図６のＰｈｔＤのアミノ酸配列に少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項４９記載のワクチン。
【請求項５２】  前記第１ポリペプチドが配列識別番号４のアミノ酸残基２０−８３８のアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項４９記載のワクチン。
【請求項５３】  前記第２ポリペプチドが、
（ａ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列に少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｂ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列に少なくとも９７％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｃ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｄ）図６のＰｈｔＡのアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｅ）図６のＰｈｔＥのアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｆ）図６のＰｈｔＢのアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
（ｇ）図６のＰｈｔＢのアミノ酸配列を含むポリペプチド；
より成るグループから選択されることを特徴とする請求項５０記載のワクチン。
【請求項５４】  前記第２ポリペプチドが（ａ）であることを特徴とする請求項５３記載のワクチン。
【請求項５５】  前記第２ポリペプチドが（ｂ）であることを特徴とする請求項５３記載のワクチン。
【請求項５６】  前記第２ポリペプチドが（ｃ）であることを特徴とする請求項５３記載のワクチン。
【請求項５７】  前記第２ポリペプチドが配列識別番号６の活性断片であり、前記活性断片が５個のヒスチジン三つ組領域を含むことを特徴とする請求項５０記載のワクチン。
【請求項５８】  （ａ）請求項２４、２５または２６記載のポリペプチドをコード化するヌクレオチド配列；または
（ｂ）（ａ）の補体
を含むことを特徴とする単離ポリヌクレオチド。
【請求項５９】  （ａ）請求項３５、３６または３７記載のポリペプチドをコード化するヌクレオチド配列；または
（ｂ）（ａ）の補体
を含むことを特徴とする単離ポリヌクレオチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１８】
アミノ酸  83-88,207-212,315-320,560-565,644-649
配列識別番号６のポリペプチドは下記の５個のヒスチジン三つ組残基を含む。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１９】
アミノ酸  83-88,205-210,309-314,396-401,461-469
更に配列識別番号４のポリペプチドは２個のコイルドコイル領域（アミノ酸１３９−１５９とアミノ酸７６９−７９１）を含み、また配列識別番号６のポリペプチドは１個のコイルドコイル領域（アミノ酸１３９−１７２）を含む。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２１】
ＨｘｘＨｘＨ:アミノ酸82-87,208-213,328-333,569-574,653-658
コイルドコイル：アミノ酸137-164,425-453,481-512,743-770
本発明の更なる見地に従って、前記のワクチンは肺炎連鎖球菌により生じる感染を予防しまたは処置する目的で投与される。