【手続補正書】
【提出日】平成19年10月10日(2007.10.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）対象における表６から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）対照または参照基準における該表６から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｉｉ）該第１の値と第２の値との間に差異があるか否かを比較すること、
を含む、対象における冠動脈疾患の素因を同定または予測する方法。
【請求項２】
該対照または参照基準が、冠動脈疾患のない対象または対象群から決定される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
第１の値が第２の値より高いことが、冠動脈疾患の存在または予測を示すものである、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項４】
冠動脈疾患の存在の予測が、少なくとも５０％の確率である、請求項１ないし請求項３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
第１の値が、第２の値より少なくとも２０％高い、請求項１ないし請求項４のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
（ｉ）受託コードで：ＢＧ５３７１９０、Ｌ３７０３３、ＡＬ５８１７６８、ＡＦ０５５０００、ＮＭ０２５２４１、ＡＦ１５１０７４、ＡＦ２７９３７２およびＢＦ４３２４７８（表６）または、
（ｉｉ）配列番号で：配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８（表７）
からなる遺伝子群から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
表９のＰＭＳ２Ｌ５（配列番号９）、ＲＸＲＡ（配列番号１０）、ＧＣＮ５Ｌ１（配列番号１１）、ＣＡＢＩＮ１（配列番号１２）、ＬＧＡＬＳ９（配列番号１３）、ＣＥＢＰＡ（配列番号１４）、ＬＲＲＮ４（配列番号１５）、ＳＴＸＢＰ２（配列番号１６）、ＳＨ３ＢＰ２（配列番号１７）、ＲＮＦ２４（配列番号１８）、ＰＬＡＵＲ（配列番号１９）、ＲＩＳ１（配列番号２０）、ＡＤＤ１（配列番号２１）、ＧＰＳＭ３（配列番号２２）、ＢＣ００２９４２（配列番号２３）、ＴＮＦＲＳＦ５（配列番号２４）、Ｎ４ＢＰ１（配列番号２５）、ＦＬＪ１２４３８（配列番号２６）およびＭＭＰ２４（配列番号２７）からなる遺伝子群から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
表１０のＰＴＰ４Ａ１（配列番号２８）、ＰＡＦＡＨ１Ｂ１（配列番号２９）、ＳＯＸ４（配列番号３０）、ＡＳＮＡ１（配列番号３１）、ＭＡＮ２Ａ２（配列番号３２）、ＮＦＹＣ（配列番号３３）、ＮＯＴＣＨ２（配列番号３４）、ＨＤＡＣ５（配列番号３５）、ＨＣＦＣ１（配列番号３６）、ＮＦＸ１（配列番号３７）、ＣＲＳＰ２（配列番号３８）、ＩＣＡＭ１（配列番号３９）、ＰＳＧ３（配列番号４０）、ＳＴＣ２（配列番号４１）およびＳＥＭＡ３Ｃ（配列番号４２）からなる遺伝子群から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
表７の遺伝子から選択される少なくとも１種の遺伝子並びに／または表９および／もしくは表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
（ａ）対象における表１１から選択される１種またはそれ以上のペプチドのレベルを決定し、第１の値を提供すること、
（ｂ）対照または参照基準における該表１１から選択される１種またはそれ以上のペプチドのレベルを決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｃ）該第１の値と第２の値の間に差異があるか否かを比較すること、
を含む、対象における冠動脈疾患（ＣＡＤ）を同定または予測する方法。
【請求項１１】
表１１の疾患＞対照のペプチドについて、または、表１１の疾患で支配的であるペプチドについて、比較したペプチドレベルが冠動脈疾患の同定または予測において上昇している、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
表１１の対照＞疾患のペプチドについて、または、表１１の対照で支配的であるペプチドについて、比較したペプチドレベルが冠動脈疾患の同定または予測において低下している、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
（ａ）対象における表１１から選択される１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第１の値を提供すること、
（ｂ）対照または参照基準における該表１１から選択される１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｃ）該第１の値と第２の値の間に差異があるか否かを決定すること、
を含み、第１の値における表１１の１種またはそれ以上の疾患＞対照のペプチドおよび／または疾患で支配的なペプチドのペプチドレベルの上昇、および／または、第１の値における表１１の１種またはそれ以上の対照＞疾患および／または対照で支配的なペプチドのペプチドレベルの低下、および、第１の値における表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルの上昇が、冠動脈疾患の同定または予測である、
請求項１ないし請求項１２のいずれかに記載の方法。
【請求項１４】
表７の配列番号１に相当する少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項６、請求項９または請求項１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
表７から選択される少なくとも２種ないし８種の配列の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項６、請求項９、請求項１３または請求項１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
表７から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項６、請求項９、または請求項１３ないし請求項１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
表７から選択される８種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項６、請求項９、または請求項１３ないし請求項１６のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
表９の配列番号９に相当する少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項７、請求項９または請求項１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
表９から選択される少なくとも２種ないし１９種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項７、請求項９、請求項１３または請求項１８のいずれかに記載の方法。
【請求項２０】
表９から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項７、請求項９、請求項１３、請求項１８または請求項１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２１】
表９から選択される１９種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項７、請求項９、請求項１３、請求項１８ないし請求項２０のいずれかに記載の方法。
【請求項２２】
表１０の配列番号２８に相当する少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項８、請求項９または請求項１３のいずれかに記載の方法。
【請求項２３】
表１０から選択される少なくとも２種ないし１５種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項８、請求項９、請求項１３または請求項２２のいずれかに記載の方法。
【請求項２４】
表１０から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項８、請求項９、請求項１３、請求項２２または請求項２３のいずれかに記載の方法。
【請求項２５】
表１０から選択される１５種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項１ないし請求項５、請求項８、請求項９、請求項１３、請求項２２ないし請求項２４のいずれかに記載の方法。
【請求項２６】
表１１から選択される複数のペプチドのペプチドレベルを決定する、請求項１０ないし請求項１３のいずれかに記載の方法。
【請求項２７】
表１１から選択される全てのペプチドのペプチドレベルを決定する、請求項１０ないし請求項１３または請求項２６のいずれかに記載の方法。
【請求項２８】
該ペプチドレベルが、血液、血漿または血清サンプルで決定される、請求項１０ないし請求項１３、請求項２６または請求項２７のいずれかに記載の方法。
【請求項２９】
遺伝子発現レベルの決定が、タンパク質発現産物を測定することを含む、請求項１ないし請求項９または請求項１３ないし請求項２８のいずれかに記載の方法。
【請求項３０】
該タンパク質発現産物の量および／またはペプチドの量を、該タンパク質に特異的に結合する抗体、抗体誘導体または抗体フラグメントを使用して検出する、請求項１０ないし請求項１３または請求項２９のいずれかに記載の方法。
【請求項３１】
遺伝子発現レベルの決定が、該遺伝子の転写されたポリヌクレオチドの遺伝子発現を測定することを含む、請求項１ないし請求項９または請求項１３ないし請求項２８のいずれかに記載の方法。
【請求項３２】
該転写されたポリヌクレオチドがｍＲＮＡまたはｃＤＮＡである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
発現レベルが、マイクロアレイ分析、ノザンブロット分析、逆転写ＰＣＲまたはＲＴ−ＰＣＲにより検出される、請求項３１または請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
該遺伝子発現レベルおよび／またはペプチドレベルが、血液、血清、血漿、リンパ、尿、涙、唾液、脳脊髄液、白血球サンプルまたは組織サンプルの群から選択されるサンプルにおいてエクスビボで測定される、請求項１ないし請求項３３のいずれかに記載の方法。
【請求項３５】
該方法がＣＡＤ指数の測定をさらに含む、請求項１ないし請求項３４のいずれかに記載の方法。
【請求項３６】
２３ないし１００のＣＡＤ指数が、冠動脈疾患の存在または素因の可能性を示すものである、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
（ｉ）該対象における表６または表７の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを処置前に決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）（ｉ）と同じ少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを処置後に決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｉｉ）該対象の処置前および処置後の遺伝子発現レベルの差異を比較すること、
を含む、冠動脈疾患を有すると同定された対象を、処置の前後にモニタリングする方法。
【請求項３８】
（ｉ）該対象における表９または表１０の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを処置前に決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）（ｉ）と同じ少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを処置後に決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｉｉ）第１の値を第２の値と比較すること、
を含む、冠動脈疾患を有すると同定された対象を、処置の前後にモニタリングする方法。
【請求項３９】
（ｉ）該対象における表７から選択される少なくとも１種の遺伝子および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを処置前に決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）（ｉ）と同じ遺伝子の遺伝子発現レベルを処置後に決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｉｉ）第１の値を第２の値と比較することにより、該対象の処置前および処置後の遺伝子発現レベルの差異を決定すること、
を含む、冠動脈疾患を有すると同定された対象を、処置の前後にモニタリングする方法。
【請求項４０】
（ｉ）該対象における表１１から選択される１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび表６および／または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを処置前に決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）（ｉ）と同じ少なくとも１種の遺伝子の１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび遺伝子発現レベルを処置後に決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｉｉ）第１の値を第２の値と比較することにより、該対象の処置前および処置後の１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび遺伝子発現レベルの差異を決定すること、
を含む、冠動脈疾患を有すると同定された対象を、処置の前後にモニタリングする方法。
【請求項４１】
（ｉｖ）該対象における冠動脈疾患の処置の効力に対応する、遺伝子発現レベルおよび／またはペプチドのレベルの差異を決定すること、
をさらに含む、請求項３７ないし請求項４０のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４２】
処置に対する正の応答が、遺伝子発現レベルの第２の値が第１の値より低い場合に測定される、請求項３７ないし請求項４１のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４３】
表１１の１種またはそれ以上の疾患＞対照および／または疾患で支配的なペプチドについての第２の値のペプチドレベルの低下；および／または、表１１の１種またはそれ以上の対照＞疾患および／または対照で支配的なペプチドについての第２の値のペプチドレベルの上昇、および／または、第２の値における表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルの低下が、処置に対する正の応答を示すものである、請求項４０または請求項４１に記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４４】
少なくとも配列番号１の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３７、請求項３９ないし請求項４３のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４５】
表７の複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３７、請求項３９ないし請求項４４のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４６】
表７に列挙される８種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３７、請求項３９ないし請求項４５のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４７】
少なくとも表９の配列番号９の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４８】
表９から選択される少なくとも２種ないし１９種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３または請求項４７のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項４９】
表９から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３、請求項４７または請求項４８のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５０】
表９から選択される１９種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３または請求項４７ないし請求項４９のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５１】
少なくとも表１０の配列番号２８の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５２】
表１０から選択される少なくとも２種ないし１５種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３または請求項５１のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５３】
表１０から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３、請求項５１または請求項５２のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５４】
表１０から選択される１５種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項３８ないし請求項４３または請求項５１ないし請求項５３のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５５】
表１１の複数のペプチドのレベルおよび表６および／または表７および／または表９および／または表１０の遺伝子から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項４０ないし請求項４３のいずれかに記載の対象のモニタリング方法。
【請求項５６】
（ｉ）表６または表７の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを最初の時点で決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）表６または表７の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを最初の時点の後の時点で決定し、第２の値を提供すること、
（ｉｉｉ）第１の値の遺伝子発現レベルの第２の値に対する差異を比較すること、ここで、第２の値におけるより高い遺伝子発現レベルは、冠動脈疾患の重篤さの上昇を示すものである、
を含む、冠動脈疾患の進行または重篤さをモニタリングする方法。
【請求項５７】
（ｉ）表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定すること、
（ｉｉ）（ｉ）と同じ少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを最初の時点の後の時点で決定し、第２の値を提供すること、
（ｉｉｉ）第１の値の遺伝子発現レベルの第２の値に対する差異を比較すること、ここで、第２の値におけるより高い遺伝子発現レベルは、冠動脈疾患の重篤さの上昇を示すものである、
を含む、冠動脈疾患の進行または重篤さをモニタリングする方法。
【請求項５８】
第２の値におけるより低い遺伝子発現レベルが、冠動脈疾患の重篤さの低下を示すものである、請求項５６または請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
（ｉ）表１１から選択される１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび表６および／または表７および／または表９および／または表１０からの少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを最初の時点で決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉ）（ｉ）と同じ１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを最初の時点の後の時点で決定し、第２の値を提供すること、
（ｉｉｉ）第１の値の１種またはそれ以上のペプチドおよび遺伝子発現のレベルの第２の値に対する差異を比較すること、ここで、第２の値における表１１の１種またはそれ以上の疾患＞対照および／または疾患で支配的なペプチドのより高いレベル、または、対照＞疾患のペプチドまたは対照で支配的なペプチドのより低いレベル、および、第２の値における表６および／または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子のより高い発現レベルは、冠動脈疾患の重篤さの上昇を示すものである、
を含む、冠動脈疾患の進行または重篤さをモニタリングする方法。
【請求項６０】
（ｉ）表６または表７から選択される遺伝子を発現する能力のある細胞または細胞のサンプルを、候補作用物質とエクスビボで接触させること、
（ｉｉ）該表６または表７の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉｉ）同じ表６または表７の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを、候補作用物質の非存在下の細胞または細胞のサンプルで決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｖ）第１の値を第２の値と比較すること、ここで、遺伝子発現レベルの差異は、冠動脈疾患の処置に使用される能力を潜在的に有する作用物質を示すものである、
を含む、冠動脈疾患の処置で使用するための候補作用物質のスクリーニング方法。
【請求項６１】
（ｉ）表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子を発現する能力のある細胞または細胞のサンプルを、候補作用物質とエクスビボで接触させること、
（ｉｉ）（ｉ）の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉｉ）（ｉ）および（ｉｉ）の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを、候補作用物質の非存在下の細胞または細胞のサンプルで決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｖ）第１の値を第２の値と比較すること、ここで、遺伝子発現レベルの差異は、冠動脈疾患の処置に使用される能力を潜在的に有する作用物質を示すものである、
を含む、冠動脈疾患の処置で使用するための候補作用物質のスクリーニング方法。
【請求項６２】
第１の値が第２の値より低いとき、候補作用物質の存在下での遺伝子発現レベルの低下が決定され、冠動脈疾患の処置に使用される能力を潜在的に有する作用物質を示すものである、請求項６０または請求項６１に記載のスクリーニング方法。
【請求項６３】
（ｉ）表１１から選択される少なくとも１種のペプチドを産生する能力のある、かつ、表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子を発現する能力のある細胞または細胞のサンプルを、候補作用物質とエクスビボで接触させること、
（ｉｉ）（ｉ）の１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび（ｉ）の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定し、第１の値を提供すること、
（ｉｉｉ）（ｉ）の１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび（ｉ）の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを、候補作用物質の非存在下の細胞または細胞のサンプルで決定し、第２の値を提供すること、および、
（ｉｖ）第１の値を第２の値と比較すること、ここで、１種またはそれ以上のペプチドのレベルおよび少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルの差異は、冠動脈疾患の処置に使用される能力を潜在的に有する作用物質を示すものである、
を含む、冠動脈疾患の処置で使用するための候補作用物質のスクリーニング方法。
【請求項６４】
第２の値と比較したとき、第１の値における少なくとも１種の表１１の疾患＞対照のペプチドおよび／または疾患で支配的なペプチドのより低いレベル、および／または、第１の値における少なくとも１種の対照＞疾患および／または対照で支配的なペプチドのより高いレベル、および、第１の値における表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子のより低いレベルは、冠動脈疾患の処置に使用される能力を潜在的に有する作用物質を示すものである、請求項６３に記載のスクリーニング方法。
【請求項６５】
少なくとも配列番号１の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６０ないし請求項６４のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項６６】
表７から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６０ないし請求項６５のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項６７】
表７から選択される８種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６０ないし請求項６６のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項６８】
少なくとも表９の配列番号９の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６１ないし請求項６４のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項６９】
表９から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６１ないし請求項６４または請求項６８のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項７０】
表９から選択される１９種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６１ないし請求項６４、請求項６８または請求項６９のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項７１】
少なくとも表１０の配列番号２８の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６１ないし請求項６４のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項７２】
表１０から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６１ないし請求項６４または請求項７１のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項７３】
表１０から選択される１５種全ての遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６１ないし請求項６４、請求項７１または請求項７２のいずれかに記載のスクリーニング方法。
【請求項７４】
表１１の複数のペプチドのレベルおよび表６、表７、表９および／または表１０から選択される複数の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定する、請求項６３または請求項６４に記載のスクリーニング方法。
【請求項７５】
表６または表７の少なくとも１種の遺伝子または遺伝子発現産物の遺伝子発現、合成または活性のレベルの低下を誘導できる作用物質の有効量を、対象に投与することを含む、冠動脈疾患の処置または予防方法。
【請求項７６】
表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子または遺伝子発現産物の遺伝子発現、合成または活性のレベルの低下を誘導できる作用物質の有効量を、対象に投与することを含む、冠動脈疾患の処置または予防方法。
【請求項７７】
表１１の少なくとも１種の疾患＞対照および／または疾患で支配的なペプチドのレベルの低下、および／または、少なくとも１種の対照＞疾患および／または対照で支配的なペプチドのレベルの上昇、および／または、表６および／または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子または遺伝子発現産物の遺伝子発現、合成または活性の低下を誘導できる作用物質の有効量を、対象に投与することを含む、冠動脈疾患の処置または予防方法。
【請求項７８】
該作用物質が、アンチセンスオリゴヌクレオチド、二本鎖ＲＮＡ、リボザイム、低分子、抗体または抗体フラグメントからなる群から選択される、請求項７５ないし請求項７７のいずれかに記載の方法。
【請求項７９】
表６または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子または遺伝子発現産物の遺伝子発現、合成または活性のレベルの低下を誘導できる有効量の作用物質を含む冠動脈疾患の処置または予防用の医薬の製造方法。
【請求項８０】
表６または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子または遺伝子発現産物の遺伝子発現、合成または活性のレベルの低下を誘導できる有効量の作用物質を含む物質の、冠動脈疾患の処置または予防用の医薬の製造における使用。
【請求項８１】
表１１の少なくとも１種の疾患＞対照および／または疾患で支配的なペプチドのレベルの低下、および／または、少なくとも１種の対照＞疾患および／または対照で支配的なペプチドのレベルの上昇、および／または、表６または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子または遺伝子発現産物の遺伝子発現、合成または活性の低下を誘導できる有効量の作用物質を含む物質の冠動脈疾患の処置または予防用の医薬の製造における使用。
【請求項８２】
（ｉ）表６または表７の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定するための指示書、および、
（ｉｉ）表６または表７の少なくとも１種の遺伝子についての、正常な対象または冠動脈疾患のない対象に由来する対照または参照基準の遺伝子発現レベル、
を含む、対象における冠動脈疾患の素因を同定または予測するためのキット。
【請求項８３】
（ｉ）表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定するための指示書、
（ｉｉ）（ｉ）の遺伝子についての、正常な対象または冠動脈疾患のない対象に由来する対照または参照基準の遺伝子発現レベル、
を含む、対象における冠動脈疾患の素因を同定または予測するためのキット。
【請求項８４】
表６および／または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子によりコードされるポリペプチドに結合する能力のある抗体、抗体誘導体または抗体フラグメントがさらに提供される、請求項８２ないし請求項８３のいずれかに記載のキット。
【請求項８５】
（ａ）表１１の少なくとも１種のペプチドのペプチドレベルを決定するための指示書、および、
（ｂ）表１１の少なくとも１種のペプチドについての、正常な対象または冠動脈疾患のない対象に由来する対照または参照基準のペプチドレベル、
を含む、対象における冠動脈疾患を同定または予測するためのキット。
【請求項８６】
（ｃ）該表１１の少なくとも１種のペプチドに結合する抗体、
をさらに含む、請求項８５に記載のキット。
【請求項８７】
（ａ）表１１の少なくとも１種のペプチドのペプチドレベルを決定するための、そして、表６および／または表７および／または表９および／または表１０から選択される少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定するための、指示書、および、
（ｂ）（ｉ）の表１１の少なくとも１種のペプチドについての、そして表６および／または表７および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子の遺伝子発現レベルを決定するための、正常な対象または冠動脈疾患のない対象に由来する対照または参照基準のペプチドレベル、
を含む、対象における冠動脈疾患を同定または予測するためのキット。
【請求項８８】
（ｃ）該表１１の少なくとも１種のペプチドに結合する抗体、および、表６および／または表７、および／または表９および／または表１０の少なくとも１種の遺伝子にコードされるポリペプチドに結合する能力のある、さらなる抗体、抗体誘導体または抗体フラグメント、
をさらに含む、請求項８７に記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２６】
本発明のまた別の実施態様では、ＣＡＤ指数を測定し得、２３ないし１００のＣＡＤ指数は、冠動脈疾患が存在する可能性を示すものである。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５１】
表６および／または表７および／または表９および／または表１０の１種またはそれ以上の遺伝子の遺伝子発現、および／または表１１のペプチドレベルの多重の決定、並びに、遺伝子発現またはペプチド存在量の経時変化の決定を成すことができ、それは、疾患の進行または疾患の処置をモニターするのに使用できる。例えば、遺伝子発現／ペプチド存在量を、第１の時間に決定し、再度第２の時間に決定し得る。かかる態様では、第１の時間から第２の時間への遺伝子発現および／またはペプチドレベルの上昇は、冠動脈疾患の診断であり得る。同様に、第１の時間から第２の時間への遺伝子発現および／またはペプチドレベルの低下は、特定の冠動脈疾患の処置タイプに対する対象の応答性を示すものであり得る。さらに、１種またはそれ以上の遺伝子の遺伝子発現の変化は、冠動脈疾患の重篤さおよび将来的な有害事象に関連し得る。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８７】
血液サンプル採取
クエン酸塩、リン酸塩およびデキストロースを含有する２０ｍＬのチューブに、血液１００ｍＬの１つのアリコートを男性の疾患のある患者から収集し、血液２００ｍｌ（２ｘ１００ｍＬアリコート）を、男性の対照の対象から収集する。女性から２ｘ１０ｍＬチューブの血液を採る。収集プロセスの始めからチューブを２５℃の水浴に置くことにより、外界温度への温度低下を加速する。収集終了後、チューブを冷却し、温度を１時間かけて段々と２０−２２℃に低下させる。白血球細胞および血小板の減少（１ｘ１０６／ユニットより少ない）を、血液を標準的重力フィルターに通すことにより、室温での濾過で系統的に実施する。標準的なやり方でバッグを遠心分離する。