【手続補正書】
【提出日】平成19年4月10日(2007.4.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  酵素の活性部位に好適なアミノ酸配列モチーフを決定する方法であって、下記を含む当該方法：
ａ）その酵素を、固定した非縮重位置に活性サブユニットを含む、方向付けられた縮重ペプチドライブラリーと、その活性サブユニットのその酵素の活性部位との相互作用を可能にする条件下で接触させ
ｂ）その酵素を、この方向付けられた縮重ペプチドライブラリー内のペプチドと結合させ；
ｃ）未結合ペプチドの集団をペプチド／酵素複合体から分離し；
ｄ）この酵素から、結合ペプチドを遊離させ；
ｅ）結合ペプチドの集団のアミノ酸配列を決定し；そして
ｆ）この酵素の活性部位の好適アミノ酸配列モチーフを、結合ペプチド集団中の各縮重位置における異なるアミノ酸残基の相対的豊富さに基づいて決定する。
【請求項２】  方向付けられた縮重ペプチドライブラリーが、可溶性合成ペプチドライブラリーである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】  方向付けられた縮重ペプチドライブラリーが、固体支持体に結合されたライブラリーである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】  方向付けられた縮重ペプチドライブラリーが、下記式を含むペプチドを含む、請求項１に記載の方法：
【化１】
2002541817.tif 000001
(式中、Ｙａａは、酵素の活性部位の一部分と共有結合性の付加物又は強く結合した付加物の一つを形成することのできる活性サブユニットであり、Ｘａａは、任意のアミノ酸又はアミノ酸類似体であり、且つｎ及びｍは、０以上１０以下の整数であり、ｍとｎの合計は、少なくとも２である)。
【請求項５】  方向付けられた縮重ペプチドライブラリーのペプチドの固定された非縮重位置の活性サブユニットが、それらのペプチド中の唯一の活性サブユニットである、請求項１に記載の方法。
【請求項６】  酵素がプロテアーゼであり、方向付けられた縮重ペプチドライブラリーが下記式を含むペプチドを含む、請求項１に記載の方法：
【化２】
2002541817.tif 000002
(式中、Ｙａａは、親核試薬と共有結合性付加物又はきつく結合した付加物の一つを形成することのできる官能基を含む活性サブユニットであり、Ｘａａは、任意のアミノ酸又はアミノ酸類似体であり、且つｎ及びｍは、０以上１０以下の整数であり、ｍとｎの合計は、少なくとも２である)。
【請求項７】  Ｙａａが、アルデヒド、ホウ素酸、ハロメチルケトン、トリフルオロメチルケトン、アルファ−ケトカルボン酸誘導体及びホスホン酸官能基よりなる群から選択する官能基を含む、請求項６に記載の方法。
【請求項８】  酵素が、プロテアーゼである、請求項４に記載の方法。
【請求項９】  方向付けられた縮重ペプチドライブラリーが、下記式を含むペプチドを含む、請求項１に記載の方法：
【化３】
2002541817.tif 000003
(式中、
Ｙａａは、酵素の活性部位の一部分と共有結合性の付加物又はきつく結合した付加物の一つを形成することのできる活性サブユニットであり、
Ｘａａは、任意のアミノ酸又はアミノ酸類似体であり、
ｎ及びｍは、０以上１０以下の整数であって、ｍとｎの合計は、少なくとも２であり、
Ｚ1は、水素又は式(Ｘａａ)aを有するペプチド(式中、Ｘａａは、任意の非縮重アミノ酸又はアミノ酸類似体であり、ａは、１以上１５以下の整数である)であり、そして
Ｚ2は、水素又は式(Ｘａａ)bを有するペプチド(式中、Ｘａａは、任意の非縮重アミノ酸又はアミノ酸類似体であり、ｂは、１以上１５以下の整数である)である)。
【請求項１０】  ａ及びｂが、１以上１０以下の整数である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】  ａ及びｂが、１以上５以下の整数である、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】  方向付けられた縮重ペプチドライブラリーが、下記式を含むペプチドを含む、請求項１に記載の方法：
【化４】
2002541817.tif 000004
(式中、Ｘａａ1は、各出現につき独立に、任意のアミノ酸又はアミノ酸類似体を表し、ｎは、０〜２０の整数であり、Ｙａａは、酵素の活性部位の一部分と共有結合性の付加物又はきつく結合した付加物の一つを形成することのできる活性サブユニットである)。
【請求項１３】  ｎが、０〜１０の整数である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】  活性サブユニットが、酵素の活性部位の一部分と少なくとも一つの共有結合性の又はきつく結合した複合体を形成する、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】  酵素が、タンパク質ホスファターゼである、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】  酵素の活性部位のための好適アミノ酸配列モチーフを、各縮重位置での各アミノ酸残基(Ｘａａ)についての相対的豊富さ(ＲＡ)値を計算すること及び縮重位置で、好適アミノ酸配列モチーフにおける縮重位置に対応する位置における含有につき、１．０より大きい相対的豊富さの値を有するアミノ酸残基を選択することにより決定し、ＲＡが、下記式により決定される、請求項１に記載の方法：
【数１】
ＲＡ＝選択したペプチド集団中のＸａａの量
方向付けられた縮重ペプチドライブラリー中のＸａａの量。
【請求項１８】  請求項１に記載の方法により決定したアミノ酸配列モチーフを含むペプチド。
【請求項１９】  請求項１８に記載のアミノ酸配列モチーフ又はその模倣物を含む医薬製剤。
【請求項２０】  酵素の活性を阻害する方法であって、その酵素を、請求項１８に記載の好適アミノ酸配列モチーフを含むインヒビターと接触させることを含む、当該方法。
【請求項２１】  酵素の基質であるタンパク質であって、請求項１８に記載の好適アミノ酸配列モチーフを含む、当該タンパク質。
【請求項２２】  酵素のインヒビターを製造する方法であって、
請求項１に記載の方法により、酵素のアミノ酸配列モチーフを決定し、そして
該好適アミノ酸配列モチーフに対応するペプチド模倣物を製造する
ことを含む、上記の方法。
【請求項２３】  ライブラリーが、下記の式Ｉの構造を有する活性サブユニットを含む、請求項１に記載の方法：
【化５】
2002541817.tif 000005
(式中、
Ｗは、ＢＹ1Ｙ2、ペルハロアルキル(例えば、ペルフルオロアルキル)、又はＣ(＝Ｏ)Ｒ5を表し
Ｒ1は、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基若しくはアミノ酸類似体、又はＣ末端に結合したペプチド若しくはペプチド類似体、又は
【化６】
2002541817.tif 000006
を表し；
Ｒ2は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＯＨ、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−(ＣＨ2)m−Ｒ7；
Ｒ3及びＲ4は、それぞれ、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＯＨ、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＳＨ、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、アミノ酸又はアミノ酸類似体のα−炭素に結合した側鎖、
【化７】
2002541817.tif 000007
を表し
又は、Ｒ2とＲ3は、一緒に、環構造中に４〜８原子を有する環を完成することができ、
又は、Ｒ2とＲ3が、一緒に環を形成しない場合には、Ｒ3とＲ4は、一緒に、環構造中に３〜８原子を有する環を完成することができ、
Ｙ1とＹ2は、独立に又は一緒に、ヒドロキシル、又はヒドロキシル基に加水分解され得る基であって、Ｙ1とＹ2が環構造中に５〜８原子を有する環により繋がれた環状誘導体を含み、又はＹ1とＹ2は、アミノ酸残基のアミノ基への結合を表し、
Ｒ5は、Ｈ、ハロメチル、トリフルオロメチル、アミド、エステル、ケトン、カルボキシル、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＯＨ、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＳＨ、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−ＣＨ2Ｏ−Ｒ10、
Ｒ6は、水素、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＯＨ、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＳＨ、−(ＣＨ2)m−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、
【化８】
2002541817.tif 000008
Ｒ7は、アリール、シクロアルキル、シクロアルケニル又はヘテロ環を表し；
Ｒ8とＲ9は、各々独立に、水素、アルキル、アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−Ｃ(＝Ｏ)−アルキル、−Ｃ(＝Ｏ)−アルケニル、−Ｃ(＝Ｏ)−アルキニル、−Ｃ(＝Ｏ)−(ＣＨ2)m−Ｒ7を表し、
又は、Ｒ8とＲ9は、それらが付着しているＮ原子と一緒に、環構造中に４〜８原子を有するヘテロ環を完成し；
Ｒ10は、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基若しくはアミノ酸類似体、又はＣ末端に結合したペプチド若しくはペプチド類似体、
【化９】
2002541817.tif 000009
を表し
ｍは、０又は１〜８の範囲の整数であり；そして
ｎは、１〜８の範囲の整数である)。
【請求項２４】  Ｗが、ホウ素酸、アルデヒド、ペルハロアルキル若しくはペルフルオロアルキル、トリフルオロメチルケトン、ハロメチルケトン、アルファ−ケトエステル、アルファ−ジケトン、アルファ−ケトアミド又はアルファ−ケト酸を表す、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】  Ｒ2及びＲ4が、共にＨを表し、Ｒ3が、化合物ライブラリー中で、各出現につき独立に、天然のアミノ酸側鎖を表す、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】  Ｗが、ＢＹ1Ｙ2を表し、Ｙ1とＹ2が、独立に又は共に、ヒドロキシル、又はＹ1とＹ2が環構造中に５〜８炭素を有する環により繋がれた環状誘導体を含む、ヒドロキシル基に加水分解され得る基である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】  Ｒ1がＣ末端に結合されたアミノ酸残基又はアミノ酸類似体を表し且つＲ2がＨを表す、請求項２３に記載の方法。
【請求項２８】  ライブラリーが、下記の一般式ＩＩで表される複数のインヒビターを含む、請求項１に記載の方法：
【化１０】
2002541817.tif 000010
(式中、
Ｒ1は、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基若しくはアミノ酸類似体、又はＣ末端に結合したペプチド若しくはペプチド類似体、又は
【化１１】
2002541817.tif 000011
を表し；
Ｒ2は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＯＨ、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−(ＣＨ2)m−Ｒ7；
Ｒ3及びＲ4は、それぞれ、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＯＨ、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＳＨ、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、アミノ酸又はアミノ酸類似体のα−炭素に結合した側鎖、
【化１２】
2002541817.tif 000012
を表し
又は、Ｒ2とＲ3は、一緒に、環構造中に４〜８原子を有する環を完成することができ、
又は、Ｒ2とＲ3が、一緒に環を形成しない場合には、Ｒ3とＲ4は、一緒に、環構造中に３〜８原子を有する環を完成することができ、
Ｒ11は、各出現につき独立に、水素、アルキル、若しくは製薬上許容し得る塩を表し、又は両Ｒ11は、それらが付着しているＯ−Ｂ−Ｏ原子と一緒に、環構造中に５〜８原子を有するヘテロ環を完成する)。
【請求項２９】  Ｒ11が、両出現において、Ｈを表す、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】  Ｒ1が、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基又はアミノ酸類似体を表し且つＲ2がＨである、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】  ペプチドライブラリーが、下記の一般式ＩＩＩにより表されるインヒビターを含む、請求項１に記載の方法：
【化１３】
2002541817.tif 000013
(式中、
Ｒ1は、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基若しくはアミノ酸類似体、又はＣ末端に結合したペプチド若しくはペプチド類似体、又は
【化１４】
2002541817.tif 000014
を表し；
Ｒ2は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＯＨ、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−(ＣＨ2)m−Ｒ7；
Ｒ3及びＲ4は、それぞれ、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＯＨ、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＳＨ、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、アミノ酸又はアミノ酸類似体のα−炭素に結合した側鎖、
【化１５】
2002541817.tif 000015
を表し
又は、Ｒ2とＲ3は、一緒に、環構造中に４〜８原子を有する環を完成することができ、
又は、Ｒ2とＲ3が、一緒に環を形成しない場合には、Ｒ3とＲ4は、一緒に、環構造中に３〜８原子を有する環を完成することができる)。
【請求項３２】  Ｒ1が、Ｃ末端に結合したアミン酸残基を表し且つＲ2がＨである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】  ペプチドライブラリーが、下記の一般式ＩＩＩａにより表されるインヒビターを含む、請求項１に記載の方法：
【化１６】
2002541817.tif 000016
(式中、
Ｒ1は、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基若しくはアミノ酸類似体、又はＣ末端に結合したペプチド若しくはペプチド類似体、又は
【化１７】
2002541817.tif 000017
を表し；
Ｒ2は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＯＨ、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−(ＣＨ2)m−Ｒ7；
Ｒ3及びＲ4は、それぞれ、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＯＨ、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＳＨ、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、アミノ酸又はアミノ酸類似体のα−炭素に結合した側鎖、
【化１８】
2002541817.tif 000018
を表し
又は、Ｒ2とＲ3は、一緒に、環構造中に４〜８原子を有する環を完成することができ、
又は、Ｒ2とＲ3が、一緒に環を形成しない場合には、Ｒ3とＲ4は、一緒に、環構造中に３〜８原子を有する環を完成することができ、そして
Ｒ5は、ハロメチル、トリフルオロメチル、アミド、エステル、ケトン又はカルボキシルを表す)。
【請求項３４】  Ｒ1が、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基又はアミノ酸類似体を表し且つＲ2がＨである、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】  ペプチドライブラリーが、下記の一般式ＩＶにより表される化合物を含む、請求項１に記載の方法：
【化１９】
2002541817.tif 000019
(式中、
Ｒ1は、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基若しくはアミノ酸類似体、又はＣ末端に結合したペプチド若しくはペプチド類似体、又は
【化２０】
2002541817.tif 000020
を表し；
Ｒ2は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)m−ＯＨ、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルケニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｏ−Ｃ(＝Ｏ)−(ＣＨ2)m−Ｒ7；
Ｒ3及びＲ4は、それぞれ、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＯＨ、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｏ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−(ＣＨ2)n−ＳＨ、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルケニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−アルキニル、−(ＣＨ2)n−Ｓ−(ＣＨ2)m−Ｒ7、アミノ酸又はアミノ酸類似体のα−炭素に結合した側鎖、
【化２１】
2002541817.tif 000021
を表し
又は、Ｒ2とＲ3は、一緒に、環構造中に４〜８原子を有する環を完成することができ、
又は、Ｒ2とＲ3が、一緒に環を形成しない場合には、Ｒ3とＲ4は、一緒に、環構造中に３〜８原子を有する環を完成することができ、そして
Ｘ1、Ｘ2及びＸ3は、各々、水素又はハロゲンを表す)。
【請求項３６】  Ｒ1が、Ｃ末端に結合したアミノ酸残基を表し且つＲ2がＨである、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】  Ｘ1、Ｘ2及びＸ3が、各々独立に、Ｈ、Ｃｌ、Ｂｒ若しくはＩを表し、又はＸ1、Ｘ2及びＸ3が、すべて、Ｆを表す、請求項３５に記載の方法。
【請求項３８】  ライブラリーが、下記の一般式Ｖにより表される活性サブユニットを含む、請求項１に記載の方法：
【化２２】
2002541817.tif 000022
(式中、
Ｙ’は、フェニル部分のメタ、オルト又はパラ位の一つにある置換基を表し、Ｙ’は、下記の一般式により与えられるボロノであり
【化２３】
2002541817.tif 000023
又は、下記の一般式により与えられるホスホノであり
【化２４】
2002541817.tif 000024
(ここに、Ｒ15及びＲ16は、各々独立に、水素、低級アルキル、若しくは製薬上許容し得る塩を表し、又はＲ15及びＲ16は、それらが付着しているＯ−Ｂ−Ｏ若しくはＯ−Ｐ−Ｏ原子と一緒に、環構造中に５〜８原子を有するヘテロ環を完成する)；
Ｒ’14は、存在しないか又は残りの環位置にある少なくとも一つの置換基を表し、該置換基は、ハロゲン、低級アルキル、低級アルコキシ、ヒドロキシル、アミノ、ニトロ、チオール、アミン、イミン、アミド、カルボニル、カルボキシル、シリル、エーテル、チオエーテル、スルホニル、セレノエーテル、ケトン、アルデヒド、エステル又は−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−ＣＦ3、−ＣＮ等から選択され；
Ｍは、各出現につき独立に、置換された又はされてないメチレン基を表し；
Ｘ8及びＸ9は、各々独立に、メチレン、エチレン、アセチレン、アミン、カルボニル、ホスホニル、硫黄、酸素又はセレンを表し；
Ｒ’17は、存在しないか又は水素、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヒドロキシル、アミノ、ニトロ、チオール、アミン、イミン、アミド、ホスホリル、ホスホネート、ホスフィン、カルボニル、カルボキシル、シリル、エーテル、チオエーテル、スルホニル、セレノエーテル、ケトン、アルデヒド、エステル若しくは−(ＣＨ2)m−Ｒ7を表し、又はＲ’17は、アミノ酸残基若しくはＸ8で縮合したペプチドを表し；
Ｒ’3は、存在しないか又は水素、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヒドロキシル、アミノ、ニトロ、チオール、アミン、イミン、アミド、ホスホリル、ホスホネート、ホスフィン、カルボニル、カルボキシル、シリル、エーテル、チオエーテル、スルホニル、セレノエーテル、ケトン、アルデヒド、エステル若しくは−(ＣＨ2)m−Ｒ7を表し、又はＲ’3は、アミノ酸残基若しくはＸ9で縮合したペプチドを表し；
Ｒ7は、アリール、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロ環又は多環を表し；
ｍは、０又は１〜８の範囲の整数であり；そして
ｎは、１、２又は３である)。
【請求項３９】  ライブラリーが、下記の式ＶＩの残基を有する活性サブユニットを含む、請求項１に記載の方法：
【化２５】
2002541817.tif 000025
(式中、
Ｙ’は、フェニル部分のメタ、オルト又はパラ位の一つにある置換基を表し、Ｙ’は、下記の一般式により与えられるボロノであり
【化２６】
2002541817.tif 000026
又は、下記の一般式により与えられるホスホノであり
【化２７】
2002541817.tif 000027
(ここに、Ｒ15及びＲ16は、各々独立に、水素、低級アルキル、若しくは製薬上許容し得る塩を表し、又はＲ15及びＲ16は、それらが付着しているＯ−Ｂ−Ｏ若しくはＯ−Ｐ−Ｏ原子と一緒に、環構造中に５〜８原子を有するヘテロ環を完成する)；
Ｒ’14は、存在しないか又は残りの環位置にある少なくとも一つの置換基を表し、該置換基は、ハロゲン、低級アルキル、低級アルコキシ、ヒドロキシル、アミノ、ニトロ、チオール、アミン、イミン、アミド、カルボニル、カルボキシル、シリル、エーテル、チオエーテル、スルホニル、セレノエーテル、ケトン、アルデヒド、エステル又は−(ＣＨ2)m−Ｒ7、−ＣＦ3、−ＣＮ等から選択され；
Ｍは、各出現につき独立に、置換された又はされてないメチレン基を表し；
Ｘ8及びＸ9は、各々独立に、メチレン、エチレン、アセチレン、アミン、カルボニル、ホスホニル、硫黄、酸素又はセレンを表し；
Ｒ’17は、存在しないか又は水素、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヒドロキシル、アミノ、ニトロ、チオール、アミン、イミン、アミド、ホスホリル、ホスホネート、ホスフィン、カルボニル、カルボキシル、シリル、エーテル、チオエーテル、スルホニル、セレノエーテル、ケトン、アルデヒド、エステル若しくは−(ＣＨ2)m−Ｒ7を表し、又はＲ’17は、アミノ酸残基若しくはＸ8で縮合したペプチドを表し；
Ｒ’3は、存在しないか又は水素、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヒドロキシル、アミノ、ニトロ、チオール、アミン、イミン、アミド、ホスホリル、ホスホネート、ホスフィン、カルボニル、カルボキシル、シリル、エーテル、チオエーテル、スルホニル、セレノエーテル、ケトン、アルデヒド、エステル若しくは−(ＣＨ2)m−Ｒ7を表し、又はＲ’3は、アミノ酸残基若しくはＸ9で縮合したペプチドを表し；
Ｒ7は、アリール、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロ環又は多環を表し；
ｍは、０又は１〜８の範囲の整数であり；
ｊは、０〜３の整数であり、そして
Ｒ’10は、Ｈ、ＯＨ、ＮＨ2、ハロゲン又は低級アルキルであり、好ましくはＨ又はＭｅである)。