【手続補正書】
【提出日】平成19年9月3日(2007.9.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
(i)配列番号1のヌクレオチド1018〜1046；および
(ii)配列番号1のヌクレオチド1676〜1718
の配列を有するイントロンを含む単離された遺伝子。
【請求項２】
請求項1に記載の遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに相補的な単離されたポリヌクレオチド。
【請求項３】
以下よりなる群から選択されるポリヌクレオチド：
a)配列番号2を含むポリヌクレオチド；
b)配列番号52を含むポリヌクレオチド；
c)配列番号54を含むポリヌクレオチド；
d)配列番号55を含むポリヌクレオチド；
e)(a)〜(d)のいずれかと個々に比較して少なくとも1つの多型性変化を含む(a)〜(d)のいずれかの対立遺伝子変異体であって、ここで、該多型性変化は、以下に示すUBP8rp関連2対立遺伝子マーカー番号1〜96よりなる群から選択され；
f)(a)〜(e)のいずれかに相補的なポリヌクレオチド。
【表１】
2007503839.tif 000001
【表２】
2007503839.tif 000002
【表３】
2007503839.tif 000003
【請求項４】
請求項1〜3のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドによりコードされる単離されたポリペプチド。
【請求項５】
以下よりなる群：
a)配列番号3を含むポリペプチド；
b)配列番号3の少なくとも470個のアミノ酸の範囲を含むポリペプチド；
c)配列番号3の少なくとも15個のアミノ酸の範囲を含むポリペプチドであって、ここで該範囲は、配列番号3のアミノ酸467〜482内にあり；
d)(a)〜(c)のいずれかと個々に比較して少なくとも1つの多型性変化を含む(a)〜(c)のいずれかの対立遺伝子変異体であって、ここで該多型性変化は、請求項3に示す表のUBP8rp関連2対立遺伝子マーカーを含むコドンによりコードされ；
e)該アミノ酸配列は、(a)〜(c)の配列の少なくとも1つと少なくとも95％、96％、97％、98％、または99％の同一性を有する、(a)〜(c)のいずれかのムテイン；
f)高ストリンジェント条件下で(a)〜(c)のいずれかをコードするDNA配列の相補体にハイブリダイズする核酸によりコードされる、(a)〜(c)のいずれかのムテイン；および
g)アミノ酸配列中の変化は、(a)〜(c)中のアミノ酸配列の保存的アミノ酸置換である、(a)〜(c)のいずれかのムテイン、
から選択される請求項4に記載のポリペプチド。
【請求項６】
以下よりなる群：
a)配列番号53を含むポリペプチド；
b)配列番号53の少なくとも470個のアミノ酸の範囲を含むポリペプチド；
c)配列番号53の少なくとも15個のアミノ酸の範囲を含むポリペプチドであって、ここで該範囲は、配列番号53のアミノ酸467〜485内にあり；
d)アミノ酸配列は(a)〜(c)中の配列の少なくとも1つと少なくとも95％、96％、97％、98％、または99％の同一性を有する、(a)〜(c)のいずれかのムテイン；
e)高ストリンジェント条件下で(a)〜(c)のいずれかをコードするDNA配列の相補体にハイブリダイズする核酸によりコードされる、(a)〜(c)のいずれかのムテイン；および
f)該アミノ酸配列中の任意の変化は、(a)〜(c)中のアミノ酸配列の保存的アミノ酸置換である、(a)〜(c)のいずれかのムテイン、
から選択される請求項4に記載のポリペプチド。
【請求項７】
以下よりなる群：
a)配列番号56を含むポリペプチド；
b)配列番号56の少なくとも270個のアミノ酸の範囲を含むポリペプチド；
c)配列番号56の少なくとも15個のアミノ酸の範囲を含むポリペプチドであって、ここで該範囲は、配列番号56のアミノ酸266と267を含み；
d)該アミノ酸配列は(a)〜(c)中の配列の少なくとも1つと少なくとも95％、96％、97％、98％、または99％の同一性を有する、(a)〜(c)のいずれかのムテイン；
e)高ストリンジェント条件下で(a)〜(c)のいずれかをコードするDNA配列の相補体にハイブリダイズする核酸によりコードされる、(a)〜(c)のいずれかのムテイン；および
f)該アミノ酸配列中の任意の変化は、(a)〜(c)中のアミノ酸配列の保存的アミノ酸置換である、(a)〜(c)のいずれかのムテイン、
から選択される請求項4に記載のポリペプチド。
【請求項８】
請求項1または2に記載の遺伝子を含む発現ベクター。
【請求項９】
請求項3または4に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
【請求項１０】
該ポリヌクレオチドは請求項5〜7のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードする、請求項8または9に記載の発現ベクター。
【請求項１１】
該ベクターは遺伝子治療ベクターである、請求項8〜10のいずれか１項に記載の発現ベクター。
【請求項１２】
請求項8〜10のいずれか１項に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１３】
該宿主細胞内で請求項4または5に記載のポリペプチドの産生に適した条件下で請求項12に記載の宿主細胞を培養する工程を含む、ポリペプチドの作成方法。
【請求項１４】
該ポリペプチドを培養物から精製する工程をさらに含む、請求項13に記載の方法。
【請求項１５】
該ポリペプチドを医薬組成物に製剤化する工程をさらに含む、請求項14に記載の方法。
【請求項１６】
請求項4に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項１７】
天然の結合パートナーをスクリーニングするための標的としての、請求項4〜7のいずれか１項に記載のポリペプチドの使用。
【請求項１８】
候補調節物質をスクリーニングするための標的としての、請求項4〜7のいずれか１項に記載のポリペプチドの使用。
【請求項１９】
該候補調節物質は、天然のリガンド、小分子、アプタマー、アンチセンスmRNA、低分子干渉RNA、および抗体よりなる群から選択される、請求項18に記載の使用。
【請求項２０】
該調節物質は慢性炎症性疾患の治療用の候補薬物である、請求項18または19に記載の使用。
【請求項２１】
請求項4〜7のいずれか１項に記載のポリペプチドの活性は、請求項4〜7のいずれか１項に記載のポリペプチドの存在下でUBP8の脱ユビキチン化活性を測定することにより評価される、請求項18〜20のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２２】
慢性炎症性疾患の治療用の医薬を調製するための、請求項4〜7のいずれか１項に記載のポリペプチドの調節物質の使用。
【請求項２３】
該調節物質は該慢性炎症性疾患用の公知の薬物と組合せて使用される、請求項22に記載の使用。
【請求項２４】
該慢性炎症性疾患は乾癬である、請求項20〜23のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２５】
該候補調節物質はUBP8rpアンタゴニストである、請求項20〜24のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２６】
乾癬の動物モデルに調節物質を投与することを含んでなる、乾癬の治療用の請求項4〜7のいずれか１項の記載のポリペプチドの調節物質の効力を評価する方法であって、該調節物質が該動物モデルの乾癬の代表的特徴を緩和するという測定は、該調節物質が乾癬の治療用の薬物であることを示す方法。
【請求項２７】
該代表的特徴は乾癬部位と重症度指数スコアである、請求項26に記載の方法。
【請求項２８】
乾癬部位と重症度指数スコア（PASI75）の75％以上の改善は、該調節物質が乾癬の治療用の薬物であることを示す、請求項27に記載の方法。
【請求項２９】
該動物モデルはSCID-huマウスである、請求項26〜28のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
2対立遺伝子マーカーと慢性炎症性疾患との間の有意な相関の有無を調べるための少なくとも1つのUBP8rp関連2対立遺伝子マーカーの使用であって、該UBP8rp関連2対立遺伝子マーカーは、請求項3の表に記載の2対立遺伝子マーカー番号1、2、4、6、7、10、12〜19、21〜30、31〜35、および37〜96よりなる群から選択される使用。
【請求項３１】
該慢性炎症性疾患は乾癬である、請求項30に記載の使用。
【請求項３２】
個体が慢性炎症性疾患に罹っているかまたは罹るリスクがあるかどうかを診断するための、請求項3の表に記載の2対立遺伝子マーカー番号1、2、4、6、7、10、12〜19、21〜30、31〜35、および37〜96よりなる群から選択される少なくとも1つのUBP8rp関連2対立遺伝子マーカーの使用。
【請求項３３】
該個体中の対立遺伝子A9の存在は、該個体が慢性炎症性疾患に罹っているかまたは罹るリスクがあることを示す、請求項32に記載の使用。
【請求項３４】
該慢性炎症性疾患は乾癬である、請求項32または33に記載の使用。
【請求項３５】
以下の工程：
a)生物学的試料から核酸を単離する工程；および
b)請求項3の表に記載の2対立遺伝子マーカー番号1、2、4、6、7、10、12〜19、21〜30、31〜35、および37〜96よりなる群から選択される1つ以上のUBP8rp関連2対立遺伝子マーカーに存在するヌクレオチドを検出する工程、
を含む遺伝子型判定法。
【請求項３６】
該生物学的試料は単一の個体から由来する、請求項35に記載の方法。
【請求項３７】
該2対立遺伝子マーカーでのヌクレオチドの同一性は、該個体のゲノム中に存在する該2対立遺伝子マーカーの両方のコピーについて測定される、請求項36に記載の方法。
【請求項３８】
該測定は微量配列決定法により行われる、請求項35〜37のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
2対立遺伝子マーカーを含む配列の部分を該測定工程の前に増幅することをさらに含む、請求項35〜38のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４０】
該増幅はPCRにより行われる、請求項39に記載の方法。
【請求項４１】
遺伝子型判定工程の結果を、慢性炎症性疾患に罹るリスクに関連付ける工程をさらに含む、請求項35〜40のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
該個体中の対立遺伝子A9の存在は、該個体が該慢性炎症性疾患に罹っているかまたは罹るリスクがあることを示す、請求項36〜41のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
該慢性炎症性疾患は乾癬である、請求項42に記載の方法。