【手続補正書】
【提出日】平成19年6月15日(2007.6.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
（ａ）核酸をオリゴヌクレオチドが付着している基板と接触させるステップであって、前記オリゴヌクレオチドは一対の電極の間に配置され、前記オリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は基板上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｂ）基板に結合された前記核酸を第１種類のナノ粒子と接触させるステップであって、前記ナノ粒子は導電性であり、前記ナノ粒子には１または複数の種類のオリゴヌクレオチドが付着しており、少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、前記接触はナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
（ｃ）導電率の変化を検出するステップと、から成る方法。
【請求項２】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に配置された複数対の電極を有し、複数対の電極の各々の対の間では、ある種類のオリゴヌクレオチドが基板に付着している、請求項１に記載の方法。
【請求項３】ナノ粒子は金属から形成されている、請求項１に記載の方法。
【請求項４】ナノ粒子は金または銀から形成されている、請求項１に記載の方法。
【請求項５】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項１に記載の方法。
【請求項６】（ｄ）基板に結合された第１種類のナノ粒子を第２種類のナノ粒子と接触させるステップであって、前記ナノ粒子は導電性であり、前記ナノ粒子にはオリゴヌクレオチドが付着しており、第２種類のナノ粒子上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドは、第１種類のナノ粒子上の１種類のオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有し、前記接触は、第１と第２種類のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｅ）導電率の変化を検出するステップと、をさらに含む請求項１に記載の方法。
【請求項７】第１種類のナノ粒子上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドは、第２種類のナノ粒子上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有し、前記方法は、
（ｆ）基板に結合された第２種類のナノ粒子を第１種類のナノ粒子と接触させるステップであって、前記接触は第１と第２種類のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｇ）導電率の変化を検出するステップと、をさらに含む請求項６に記載の方法。
【請求項８】ステップ（ｄ）またはステップ（ｄ）と（ｆ）を１回または複数回繰り返し、導電率の変化を検出する、請求項７に記載の方法。
【請求項９】（ｄ）基板に結合された第１種類のナノ粒子をオリゴヌクレオチドが付着している凝集体プローブと接触させるステップであって、凝集体プローブのナノ粒子は導電性であり、凝集体プローブ上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドは、第１種類のナノ粒子上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有し、前記接触は、凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドを第１種類のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｅ）導電率の変化を検出するステップと、をさらに含む請求項１に記載の方法。
【請求項１０】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
（ａ）核酸をオリゴヌクレオチドが付着している基板と接触させるステップであって、前記オリゴヌクレオチドは一対の電極の間に配置され、前記オリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は基板上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｂ）基板に結合された前記核酸をオリゴヌクレオチドが付着している凝集体プローブと接触させるステップであって、凝集体プローブ上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドは、前記核酸の第２部分の配列に対して相補的な配列を有し、凝集体プローブのナノｆ粒子は導電性であり、前記接触は、凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
（ｃ）導電率の変化を検出するステップと、から成る方法。
【請求項１１】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に配置された複数対の電極を有し、複数対の電極の各々の対の間では、１種類のオリゴヌクレオチドが基板に付着している、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】少なくとも一対の電極が付着している基板を備え、前記電極の間ではオリゴヌクレオチドが基板に付着しており、オリゴヌクレオチドは検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有する、核酸を検出するキット。
【請求項１３】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に配置された複数対の電極を有し、複数対の電極の各々の対の間では、１種類のオリゴヌクレオチドが基板に付着しており、各種類のオリゴヌクレオチドは検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有する、請求項１２に記載のキット。
【請求項１４】（ａ）第１種類のナノ粒子が入った容器であって、前記ナノ粒子は導電性であり、前記ナノ粒子には１または複数の種類のオリゴヌクレオチドが付着しており、少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドは、検出すべき核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有する容器、
（ｂ）第１種類のナノ粒子が入った容器であって、前記ナノ粒子は導電性であり、前記ナノ粒子には１または複数の種類のオリゴヌクレオチドが付着しており、前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、検出すべき核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有する容器、および
第２種類のナノ粒子が入った容器であって、前記ナノ粒子は導電性であり、前記ナノ粒子にはオリゴヌクレオチドが付着しており、第２種類のナノ粒子上の前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、第１種類のナノ粒子上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有する容器、
（ｃ）第１種類のナノ粒子が入った容器であって、前記ナノ粒子は導電性であり、前記ナノ粒子には１または複数の種類のオリゴヌクレオチドが付着しており、前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、検出すべき核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有する容器、および
オリゴヌクレオチドが付着している凝集体プローブが入った容器であって、凝集体プローブのナノ粒子は導電性であり、凝集体プローブ上の前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、第１種類のナノ粒子上の少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有する容器、または
（ｄ）オリゴヌクレオチドが付着している凝集体プローブが入った容器であって、凝集体プローブ上の前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、検出すべき核酸の第２部分の配列に対して相補的な配列を有し、凝集体プローブのナノ粒子は導電性の容器、をさらに備えた請求項１２または１３に記載のキット。
【請求項１５】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
第１種類のナノ粒子が付着している基板を用意するステップであって、前記ナノ粒子にはオリゴヌクレオチドが付着しており、前記オリゴヌクレオチドは検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するステップと、
前記ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で前記核酸を基板に付着している前記ナノ粒子と接触させるステップと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブを用意するステップであって、凝集体プローブのナノ粒子は、ナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの少なくとも１種類のナノ粒子には、前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着しているステップと、
凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で、基板に結合された前記核酸を、凝集体プローブと接触させるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
から成る方法。
【請求項１６】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のナノ粒子を有する、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
オリゴヌクレオチドが付着している基板を用意するステップであって、前記オリゴヌクレオチドは検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するステップと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブを用意するステップであって、前記凝集体プローブの前記ナノ粒子は、ナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着しているステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
前記核酸を凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドおよび基板上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で、前記核酸、基板、および凝集体プローブを接触させるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、
から成る方法。
【請求項１８】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】前記核酸が基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸を基板と接触させ、その後、前記核酸が凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように基板に結合された前記核酸を凝集体プローブと接触させる、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】前記核酸が凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸を凝集体プローブと接触させ、その後、前記核酸が基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように凝集体プローブに結合された前記核酸を基板と接触させる、請求項１７に記載の方法。
【請求項２１】前記核酸を凝集体プローブおよび基板と同時に接触させる、請求項１７に記載の方法。
【請求項２２】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
オリゴヌクレオチドが付着している基板を用意するステップと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブを用意するステップであって、凝集体プローブのナノ粒子は、ナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの少なくとも１種類のナノ粒子には、検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着しているステップと、
少なくとも２種類のオリゴヌクレオチドが付着しているある種類のナノ粒子を用意するステップであって、第１種類のオリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、第２種類のオリゴヌクレオチドは基板に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の少なくとも一部に対して相補的な配列を有するステップと、
前記核酸、凝集体プローブ、ナノ粒子、および基板を接触させるステップであって、前記接触は、前記核酸を凝集体プローブおよびナノ粒子上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせると共にナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを基板上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
から成る方法。
【請求項２３】前記核酸が凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドおよびナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸を凝集体プローブおよびナノ粒子と接触させ、その後、ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドが基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように凝集体プローブおよびナノ粒子に結合された前記核酸を基板と接触させる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】前記核酸が凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸を凝集体プローブと接触させ、その後、前記核酸がナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように凝集体プローブに結合された前記核酸をナノ粒子と接触させ、その後、ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドが基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように凝集体プローブおよびナノ粒子に結合された前記核酸を基板と接触させる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】前記核酸が凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸を凝集体プローブと接触させ、ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドが基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするようにナノ粒子を基板と接触させ、その後、前記核酸がナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように、凝集体プローブに結合された前記核酸を基板に結合されたナノ粒子と接触させる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２７】基板は透明な基板または不透明な白色基板である、請求項１５〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】検出可能な変化は基板上における暗色領域の形成である、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】凝集体プローブのナノ粒子は金から形成される、請求項１５〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項１５〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】検出可能な変化は光学式スキャナで観察される、請求項１５〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】前記スキャナは平台型スキャナである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】前記スキャナをグレースケール測定値を計算可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、グレースケール測定値を計算して検出した核酸の定量的測定を提供する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】前記スキャナを基板の画像を提供可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、該画像を用いて核酸の存在、核酸の量、またはその両方の定性的決定を行う、請求項３１に記載の方法。
【請求項３５】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
検出すべき核酸をオリゴヌクレオチドが付着している基板と接触させるステップであって、前記オリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は、基板上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
基板に結合された前記核酸をオリゴヌクレオチドが付着しているリポソームと接触させるステップであって、前記オリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の一部に対して相補的な配列を有し、前記接触は、リポソーム上のオリゴヌクレオチドを前記核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブを用意するステップであって、凝集体プローブのナノ粒子は、ナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、ナノ粒子に付着していない側の端部に疎水基を有するオリゴヌクレオチドが付着しているステップと、
疎水性相互作用の結果として凝集体プローブ上のオリゴヌクレオチドがリポソームに有効に付着される条件下で、基板に結合されたリポソームを凝集体プローブと接触させるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項３６】凝集体プローブのナノ粒子は金から形成される、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】基板を銀染料と接触させて検出可能な変化を生じさせる、請求項３５に記載の方法。
【請求項３８】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項３５に記載の方法。
【請求項３９】検出可能な変化は光学式スキャナで観察される、請求項３５〜３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
オリゴヌクレオチドが付着している基板を用意するステップであって、前記オリゴヌクレオチドは検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するステップと、
少なくとも２種類のナノ粒子を有するコアプローブを用意するステップであって、各種類のナノ粒子には少なくとも１種類の他の種類のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドに対して相補的なオリゴヌクレオチドが付着しており、凝集体プローブのナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドがハイブリダイゼーションしたした結果互いに結合するステップと、
２種類のオリゴヌクレオチドが付着しているある種類のナノ粒子を用意するステップであって、第１種類のオリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、第２種類のオリゴヌクレオチドはコアプローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の一部に対して相補的な配列を有するステップと、
前記核酸、ナノ粒子、基板、およびコアプローブを、前記核酸をナノ粒子上のオリゴヌクレオチドおよび基板上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせると共にナノ粒子上のオリゴヌクレオチドをコアプローブ上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で接触させるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項４１】前記核酸が基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸を基板と接触させ、その後、前記核酸がナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように基板に結合された前記核酸をナノ粒子と接触させ、コアプローブ上のオリゴヌクレオチドがナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸に結合されたナノ粒子をコアプローブと接触させる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】前記核酸がナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸をナノ粒子と接触させ、その後、前記核酸が基板上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするようにナノ粒子に結合された前記核酸を基板と接触させ、コアプローブ上のオリゴヌクレオチドがナノ粒子上のオリゴヌクレオチドとハイブリダイズするように前記核酸に結合されたナノ粒子をコアプローブと接触させる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
オリゴヌクレオチドが付着している基板を用意するステップであって、オリゴヌクレオチドは検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するステップと、
少なくとも２種類のナノ粒子を有するコアプローブを用意するステップであって、各種類のナノ粒子には少なくとも１種類の他の種類のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドに対して相補的なオリゴヌクレオチドが付着しており、凝集体プローブのナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドがハイブリダイゼーションしたした結果互いに結合するステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列とコアプローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の一部に対して相補的な配列とを有する、ある種類の連結オリゴヌクレオチドを用意するステップと、
前記核酸、連結オリゴヌクレオチド、基板、およびコアプローブを、前記核酸を連結オリゴヌクレオチドおよび基板上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせると共にハイブリダイゼーション連結オリゴヌクレオチド上のオリゴヌクレオチドをコアプローブ上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で接触させるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項４４】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項４０または４３に記載の方法。
【請求項４５】基板は透明な基板または不透明な白色基板である、請求項４０または４３に記載の方法。
【請求項４６】検出可能な変化は基板上における暗色領域の形成である、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】コアプローブのナノ粒子は金から形成される、請求項４０または４３に記載の方法。
【請求項４８】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項４０または４３に記載の方法。
【請求項４９】検出可能な変化は光学式スキャナで観察される、請求項４０または４３に記載の方法。
【請求項５０】キットであって、
基板と、該基板にはナノ粒子が付着され、該ナノ粒子には核酸の第１部分の配列に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着していることと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブが入った第１の容器と、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着していることと
を備えたキット。
【請求項５１】キットであって、
基板と、該基板にはオリゴヌクレオチドが付着され、該オリゴヌクレオチドは核酸の第１部分の配列に対して相補的な配列を有することと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブが入った第１の容器と、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着していることと
を備えたキット。
【請求項５２】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項５１に記載のキット。  
【請求項５３】キットであって、
基板と、該基板にはオリゴヌクレオチドが付着され、該オリゴヌクレオチドは核酸の第１部分の配列に対して相補的な配列を有することと、
１または複数の種類のオリゴヌクレオチドが付着しているナノ粒子が入った第１の容器と、前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有することと、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブが入った第２の容器と、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、第１の容器内のナノ粒子上の１種類のオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着していることと
を備えたキット。
【請求項５４】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項５３に記載のキット。
【請求項５５】キットであって、
オリゴヌクレオチドが付着している基板と、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブが入った第１の容器と、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着していることと
少なくとも２種類のオリゴヌクレオチドが付着しているナノ粒子が入った第２の容器と、第１種類のオリゴヌクレオチドは核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、第２種類のオリゴヌクレオチドは基板に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の少なくとも一部に対して相補的な配列を有することと、
を備えたキット。
【請求項５６】キットであって、
基板と、該基板にはオリゴヌクレオチドが付着され、該オリゴヌクレオチドは核酸の第１部分の配列に対して相補的な配列を有することと、
核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着しているリポソームが入った第１の容器と、
オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有する凝集体プローブが入った第２の容器と、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、ナノ粒子に付着していない側の端部に疎水基を有するオリゴヌクレオチドが付着していることと、
を備えたキット。
【請求項５７】基板は透明な基板または不透明な白色基板である、請求項５０〜５６のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５８】凝集体プローブのナノ粒子は金から形成される、請求項５０〜５６のいずれか一項に記載のキット。
【請求項５９】凝集体プローブが入った容器を備えたキットであって、凝集体プローブはオリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有し、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、核酸の配列の一部に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着している、キット。
【請求項６０】凝集体プローブが入った容器を備えたキットであって、凝集体プローブはオリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有し、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、ナノ粒子に付着していない側の端部に疎水基を有するオリゴヌクレオチドが付着している、キット。
【請求項６１】凝集体プローブであって、該凝集体プローブはオリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有し、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には核酸の配列の一部に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着している、凝集体プローブ。
【請求項６２】２種類のオリゴヌクレオチドが各々に対して付着している２種類のナノ粒子を有し、各種類のナノ粒子に付着している第１種類のオリゴヌクレオチドは、核酸の配列の一部に対して相補的な配列を有し、第１種類のナノ粒子に付着している第２種類のオリゴヌクレオチドは、第２種類のナノ粒子に付着している第２種類のオリゴヌクレオチドの配列の少なくとも一部に対して相補的な配列を有する、請求項６１に記載の凝集体プローブ。
【請求項６３】オリゴヌクレオチドが付着している３種類のナノ粒子を有し、第１種類のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドは、第２種類のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの少なくとも一部に対して相補的な配列を有し、第２種類のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドは、第１種類のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の少なくとも一部に対して相補的な配列を有し、第３種類のナノ粒子には２種類のオリゴヌクレオチドが付着しており、第１種類のオリゴヌクレオチドは核酸の配列の一部に対して相補的な配列を有し、第２種類のオリゴヌクレオチドは第１または第２種類のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の少なくとも一部に対して相補的な配列を有する、請求項６２に記載の凝集体プローブ。
【請求項６４】凝集体プローブであって、該凝集体プローブはオリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有し、該凝集体プローブの該ナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合し、凝集体プローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子には、ナノ粒子に付着していない側の端部に疎水基を有するオリゴヌクレオチドが付着している、凝集体プローブ。
【請求項６５】コアプローブが入った容器を備えたキットであって、コアプローブはオリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有し、コアプローブのナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合する、キット。
【請求項６６】検出すべき核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドが付着している基板をさらに備えた、請求項６５に記載のキット。
【請求項６７】２種類のオリゴヌクレオチドが付着しているある種類のナノ粒子が入った容器をさらに備え、第１種類のオリゴヌクレオチドは核酸の第２部分に対して相補的な配列を有し、第２種類のオリゴヌクレオチドはコアプローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の一部に対して相補的な配列を有する、請求項６５または６６に記載のキット。
【請求項６８】核酸の第２部分に対して相補的な配列とコアプローブの前記種類のうちの少なくとも１つのナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列の一部に対して相補的な配列とを有するある種類の連結オリゴヌクレオチドが入った容器をさらに備えた、請求項６５または６６に記載のキット。
【請求項６９】オリゴヌクレオチドが付着している少なくとも２種類のナノ粒子を有するコアプローブであって、コアプローブのナノ粒子はナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの一部がハイブリダイゼーションした結果互いに結合する、コアプローブ。
【請求項７０】オリゴヌクレオチドを荷電ナノ粒子に結合させて、該オリゴヌクレオチドが１０ピコモル／ｃｍ2以上の表面密度でナノ粒子の表面に存在する安定なナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を生成する方法であって、
ナノ粒子に結合可能な官能基を有する部分が共有結合されたオリゴヌクレオチドを用意するステップと、
少なくともオリゴヌクレオチドの一部がナノ粒子に結合するのに十分な時間の間、オリゴヌクレオチドとナノ粒子を水中で接触させるステップと、
少なくとも１つの塩を水に加えて、オリゴヌクレオチドのナノ粒子に対する静電引力または斥力とオリゴヌクレオチドの互いに対する静電的斥力とに少なくとも部分的に打ち勝つのに十分な大きさのイオン強度を有する塩溶液を生成するステップと、
十分な追加のオリゴヌクレオチドがナノ粒子に結合してナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を生成するのに十分な時間の間、オリゴヌクレオチドとナノ粒子を前記塩溶液で接触させるステップと、から成る方法。
【請求項７１】ナノ粒子は金属ナノ粒子または半導体ナノ粒子である、請求項７０に記載の方法。
【請求項７２】ナノ粒子は金ナノ粒子である、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】ナノ粒子に結合可能官能基を有する該部分はアルカンチオールである、請求項７０に記載の方法。
【請求項７４】すべての塩が１回の追加作業で水に加えられる、請求項７０に記載の方法。
【請求項７５】塩が経時的に徐々に加えられる、請求項７０に記載の方法。
【請求項７６】塩が、塩化ナトリウム、塩化マグネシウム、塩化カリウム、アンモニウム、塩化物、酢酸ナトリウム、酢酸アンモニウム、２以上の上記塩の組み合わせ、リン酸緩衝液中の上記塩の１つ、およびリン酸緩衝液中の２以上の上記塩の組み合わせから成る群より選択される、請求項７０に記載の方法。
【請求項７７】塩はリン酸緩衝液中の塩化ナトリウムである、請求項７６に記載の方法。
【請求項７８】オリゴヌクレオチドオリゴヌクレオチドが１５ピコモル／ｃｍ2以上の表面密度でナノ粒子の表面に存在するナノ粒子−オリゴヌクレオチド
共役体が生成される、請求項７０に記載の方法。
【請求項７９】オリゴヌクレオチドが約１５ピコモル／ｃｍ2〜約４０ピコモル／ｃｍ2の表面密度でナノ粒子の表面に存在する、請求項７８に記載の方法
。
【請求項８０】オリゴヌクレオチドが約１５ピコモル／ｃｍ2〜約２５ピコモル／ｃｍ2の表面密度でナノ粒子の表面に存在する、請求項７８に記載の方法
。
【請求項８１】オリゴヌクレオチドが付着しているナノ粒子であるナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体であって、オリゴヌクレオチドの少なくとも一部は核酸または他のオリゴヌクレオチドの配列の少なくとも一つの部分に対して相補的な配列を有し、該オリゴヌクレオチドは少なくとも１０ピコモル／ｃｍ2の表面密度でナノ粒子の表面に存在する、ナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体。
【請求項８２】オリゴヌクレオチドが１５ピコモル／ｃｍ2以上の表面密度でナノ粒子の表面に存在する、請求項８１に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体。
【請求項８３】オリゴヌクレオチドが約１５ピコモル／ｃｍ2〜約４０ピコモル／ｃｍ2の表面密度でナノ粒子の表面に存在する、請求項８２に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体。
【請求項８４】ナノ粒子が金属ナノ粒子または半導体ナノ粒子である、請求項８１に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体。
【請求項８５】ナノ粒子が金ナノ粒子である、請求項８４に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体。
【請求項８６】核酸を検出する方法であって、
ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で、核酸を少なくとも１種類の請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体と、接触させるステップと、
ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドの核酸とのハイブリダイゼーションによって起こった検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項８７】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
ある種類の請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を用意するステップであって、各ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドは、核酸の少なくとも２つの部分の配列に対して相補的な配列を有するステップと、
ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを核酸の２つ以上の部分と有効にハイブリダイズさせる条件下で核酸と共役体を接触させるステップと、
ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドの核酸とのハイブリダイゼーションによって起こった検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項８８】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
核酸を少なくとも２種類の請求項８１〜８３のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体と接触させるステップであって、第１種類の共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドは、核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有し、第２種類の共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドは、核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は、ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドの核酸とのハイブリダイゼーションによって起こった検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項８９】接触条件には、凍結と解凍が含まれる、請求項８８に記載の方法。
【請求項９０】接触条件には加熱が含まれる、請求項８８に記載の方法。
【請求項９１】検出可能な変化は固体表面上で観察される、請求項８８に記載の方法。
【請求項９２】検出可能な変化は肉眼で観察可能な色の変化である、請求項８８に記載の方法。
【請求項９３】色の変化は固体表面上で観察される、請求項９２に記載の方法。
【請求項９４】ナノ粒子は金属ナノ粒子または半導体ナノ粒子である、請求項８８に記載の方法。
【請求項９５】ナノ粒子は金ナノ粒子である、請求項８８に記載の方法。
【請求項９６】ナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの、ナノ粒子に付着していない側の端部が、ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドが核酸とハイブリダイズすると検出可能な変化を起こす分子により標識される、請求項８８に記載の方法。
【請求項９７】ナノ粒子が金属または半導体ナノ粒子であり、ナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドが蛍光分子により標識される、請求項９６に記載の方法。
【請求項９８】  核酸が第１部分と第２部分の間に位置する第３部分を有し、ナノ粒子上のオリゴヌクレオチドの配列は、核酸のこの第３部分に対して相補的な配列は有さず、
核酸を核酸のこの第３部分に対して相補的な配列を有するフィラーオリゴヌクレオチドとさらに接触させ、前記接触は、フィラーオリゴヌクレオチドを核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で起こる、請求項８８に記載の方法。
【請求項９９】核酸はウイルスＲＮＡ、ウイルスＤＮＡ、疾患関連遺伝子、細菌ＤＮＡ、または真菌ＤＮＡである、請求項８８に記載の方法。
【請求項１００】核酸は合成ＤＮＡ、合成ＲＮＡ、構造的に修飾された天然ＲＮＡ、構造的に修飾された合成ＲＮＡ、構造的に修飾された天然ＤＮＡ、構造的に修飾された合成ＤＮＡ、またはポリメラーゼ連鎖反応増幅法の産物である、請求項８８に記載の方法。
【請求項１０１】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
（ａ）核酸をオリゴヌクレオチはドが付着している基板と接触させるステップであって、オリゴヌクレオチド前記核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は、基板上のオリゴヌクレオチドを前記核酸に有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｂ）基板に結合された前記核酸を、請求項８１〜８３のいずれか１項に記載の第１種類のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体と接触させるステップであって、共役体のナノ粒子に付着している前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドを前記核酸に有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｃ）検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項１０２】（ｄ）基板に結合された第１種類のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を、請求項８１〜８３のいずれか１項に記載の第２種類のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体と接触させるステップと、第２種類の共役体のナノ粒子に付着している前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、第１種類の共役体のナノ粒子に付着している前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有し、前記接触はナノ粒子第１および第２種類の共役体に付着しているオリゴヌクレオチドを有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｅ）検出可能な変化を観察するステップと、をさらに含む請求項１０１に記載の方法。
【請求項１０３】第１種類の共役体のナノ粒子上の前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、第２種類の共役体のナノ粒子上の前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有し、前記方法は、
（ｆ）基板に結合された第２種類の共役体を第１種類の共役体と接触させるステップであって、前記接触は第１および第２種類の共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｇ）検出可能な変化を観察するステップと、をさらに含む
請求項１０２に記載の方法。
【請求項１０４】ステップ（ｄ）またはステップ（ｄ）と（ｆ）を１回または複数回繰り返し、検出可能な変化を観察する、請求項１０３に記載の方法。
【請求項１０５】（ｄ）少なくとも２つの部分を含むある配列を有するある種の結合オリゴヌクレオチドを用意するステップであって、第１部分は第１種類の共役体のナノ粒子に付着している前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドに対して相補的であるステップと、
（ｅ）結合オリゴヌクレオチドを基板に結合された第１種類の共役体と接触させるステップであって、前記接触は結合オリゴヌクレオチドを第１種類の共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｆ）請求項８１〜８３のいずれか１項に記載の第２種類のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を用意するステップであって、第２種類の共役体のナノ粒子に付着している前記種類のうちの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、結合オリゴヌクレオチドの配列の第２部分に対して相補的な配列を有するステップと、
（ｇ）基板に結合された結合オリゴヌクレオチドを第２種類の共役体と接触させるステップであって、前記接触は第２種類の共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドを結合オリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｈ）検出可能な変化を観察するステップと、をさらに含む請求項１０１に記載の方法。
【請求項１０６】（ｉ）基板に結合された第２種類の共役体を結合オリゴヌクレオチドと接触させるステップであって、前記接触は結合オリゴヌクレオチドを第２種類の共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
（ｊ）基板に結合された結合オリゴヌクレオチドを第１種類の共役体と接触させるステップであって、前記接触は第１種類の共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドが結合オリゴヌクレオチドと有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと
（ｋ）検出可能な変化を観察するステップと、をさらに含む請求項１０５に記載の方法。
【請求項１０７】ステップ（ｅ）と（ｇ）またはステップ（ｅ）、（ｇ）、（ｉ）と（ｌ）を１回または複数回繰り返し、検出可能な変化を観察する、請求項１０６に記載の方法。
【請求項１０８】基板は透明な基板または不透明な白色基板である、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１０９】検出可能な変化は基板上における暗色領域の形成である、請求項１０８に記載の方法。
【請求項１１０】共役体のナノ粒子は金属ナノ粒子または半導体ナノ粒子である、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１１】共役体のナノ粒子は金または銀から形成される、請求項１１０に記載の方法。
【請求項１１２】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板上に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１３】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１４】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項１１２に記載の方法。
【請求項１１５】検出可能な変化は光学式スキャナで観察される、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１６】前記スキャナは平台型スキャナである、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１７】前記スキャナをグレースケール測定値を計算可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、グレースケール測定値を計算して検出した核酸の定量的測定を提供する、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１８】前記スキャナを基板の画像を提供可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、該画像を用いて核酸の存在、核酸の量、またはその両方の定性的決定を行う、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１１９】基板に付着しているオリゴヌクレオチドは２つの電極間に配置され、共役体のナノ粒子は導電体の材料から形成され、検出可能な変化は導電率の変化である、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１２０】電極は金から形成され、ナノ粒子は金から形成される、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２１】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項１１９に記載の方法。
【請求項１２２】基板にアレイ状に付着している複数のオリゴヌクレオチドの各々は、２つの電極間に配置され、ナノ粒子は導電体の材料から形成され、検出可能な変化は導電率の変化である、請求項１１２に記載の方法。
【請求項１２３】電極は金から形成され、ナノ粒子は金から形成される、請求項１２２に記載の方法。
【請求項１２４】基板を銀染料と接触させて導電率の変化を生じさせる、請求項１２２に記載の方法。
【請求項１２５】請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体が入った容器を備えたキット。
【請求項１２６】少なくとも２つの部分を有する核酸を検出する方法であって、
検出すべき核酸をオリゴヌクレオチドが付着している基板と接触させるステップであって、前記オリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第１部分に対して相補的な配列を有し、前記接触は基板上のオリゴヌクレオチドを前記核酸に有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
基板に結合された前記核酸をオリゴヌクレオチドが付着しているある種のナノ粒子と接触させるステップであって、前記オリゴヌクレオチドは前記核酸の配列の第２部分に対して相補的な配列を有し、前記接触はナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを前記核酸に有効にハイブリダイズさせる条件下で起こるステップと、
前記オリゴヌクレオチドは、段階的な熟成処理であって、（ｉ）前記オリゴヌクレオチドと水溶液中のナノ粒子とを、同オリゴヌクレオチドの幾らかが同ナノ粒子と結合するのに十分な期間の間、接触させる工程と、（ｉｉ）前記水溶液に少なくとも一つの塩を加え、同オリゴヌクレオチドの互いの静電斥力を低減するのに十分なイオン強度の塩溶液を作製する工程と、（ｉｉｉ）前記オリゴヌクレオチドと前記ナノ粒子とを、更なるオリゴヌクレオチドが前記ナノ粒子と結合することを可能にする更なる期間の間、前記塩溶液中にて接触させる工程と、からなる熟成処理にて前記ナノ粒子に付着されることと、
基板を銀染料と接触させて検出可能な変化を生じさせるステップと、
検出可能な変化を観察するステップと、から成る方法。
【請求項１２７】前記基板は、１つの核酸中の複数部分の検出、複数の異なる核酸の検出、またはそれらの両方の検出を可能にするようアレイ状に基板に付着している複数種類のオリゴヌクレオチドを有する、請求項１２６に記載の方法。
【請求項１２８】検出可能な変化は光学式スキャナで観察される、請求項１２６または１２７に記載の方法。
【請求項１２９】前記スキャナは平台型スキャナである、請求項１２６または１２７に記載の方法。
【請求項１３０】前記スキャナをグレースケール測定値を計算可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、グレースケール測定値を計算して検出した核酸の定量的測定を提供する、請求項１２６または１２７に記載の方法。
【請求項１３１】前記スキャナを基板の画像を提供可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、該画像を用いて核酸の存在、核酸の量、またはその両方の定性的決定を行う、請求項１２６または１２７に記載の方法。
【請求項１３２】ナノ粒子が貴金属から形成される、請求項１２６または１２７に記載の方法。
【請求項１３３】ナノ粒子が金または銀から形成される、請求項１３２に記載の方法。
【請求項１３４】基板上で行われる核酸の検出方法であって、光学式スキャナにより核酸の存在、量、またはその両方を検出するステップから成る方法。
【請求項１３５】前記スキャナは平台型スキャナである、請求項１３４に記載の方法。
【請求項１３６】前記スキャナをグレースケール測定値を計算可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、グレースケール測定値を計算して検出した核酸の定量的測定を提供する、請求項１３４に記載の方法。
【請求項１３７】前記スキャナを基板の画像を提供可能なソフトウェアを搭載したコンピュータに連結し、該画像を用いて核酸の存在、核酸の量、またはその両方の定性的決定を行う、請求項１３４に記載の方法。
【請求項１３８】ナノファブリケーションの方法であって、
選択配列を有する少なくとも１種類の連結オリゴヌクレオチドを用意するステップであって、各種類の連結オリゴヌクレオチドの前記選択配列は少なくとも２つの部分を有するステップと、
１または複数の種類の請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を用意するステップであって、前記種類の共役体の各々のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドは、連結オリゴヌクレオチドの一部の配列に対して相補的な配列を有するステップと、
共役体のナノ粒子がオリゴヌクレオチドコネクタにより一緒に纏められた所望のナノ材料またはナノ構造が形成されるように、共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドを連結オリゴヌクレオチドに有効にハイブリダイズさせる条件下で連結オリゴヌクレオチドと共役体を接触させるステップと、から成る方法。
【請求項１３９】ナノファブリケーションの方法であって、
少なくとも２種類の請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を用意するステップと、
所望のナノ材料またはナノ構造が形成されるように、第１および第２種類の共役体を、共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを互いに有効にハイブリダイズさせる条件下で接触させるステップと、から成り、
第１種類の共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドは、第２種類の共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドの配列に対して相補的な配列を有し、
第２種類の共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドは、第１種類の共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドに対して相補的な配列を有する、方法。
【請求項１４０】請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を構成するナノ材料またはナノ構造であって、ナノ粒子はオリゴヌクレオチドコネクタにより一緒に纏められる、ナノ材料またはナノ構造。
【請求項１４１】少なくとも２つの部分を有する選択核酸を他の核酸から分離する方法であって、
２種類以上の請求項８１〜８５のいずれか１項に記載のナノ粒子−オリゴヌクレオチド共役体を用意するステップであって、前記種類の各々の共役体のナノ粒子に付着しているオリゴヌクレオチドは、選択核酸の前記部分の１つの配列に対して相補的な配列を有するステップと、
選択核酸とハイブリダイズした共役体が凝集して沈殿するように、共役体のナノ粒子上のオリゴヌクレオチドを選択核酸と有効にハイブリダイズさせる条件下で、核酸と共役体を接触させるステップと、から成る方法。