【手続補正書】
【提出日】平成19年9月11日(2007.9.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２の約１〜約１６９のアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２の約２〜約１６９のアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；および
（ｄ）（ａ）、（ｂ）または（ｃ）のヌクレオチド配列のいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群から選択される配列に少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項２】  単離された核酸分子であって、該核酸分子は、請求項１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）または（ｄ）のヌクレオチド配列に同一なヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドに、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含み、ここで、該ポリヌクレオチドは、Ａ残基のみまたはＴ残基のみからなるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドには、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズしない、単離された核酸分子。
【請求項３】  請求項１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）または（ｄ）のアミノ酸配列を有するエンドカインαポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項４】  請求項３に記載の単離された核酸分子であって、該核酸分子が、以下：
配列番号２の約４４〜約１５８のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約４４〜約５４のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約５７〜約６８のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約６９〜約７８のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約９４〜約１０５のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約１０８〜約１３２のアミノ酸残基を含むポリペプチド；および、配列番号２の約１４８〜約１５８のアミノ酸残基を含むポリペプチド、
からなる群から選択されるエンドカインαポリペプチドのエピトープ保有部分をコードする、
単離された核酸分子。
【請求項５】  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号１に示される配列のフラグメントのヌクレオチド配列であって、ここで、該フラグメントが、配列番号１由来の少なくとも５０個連続したヌクレオチドを含み、ただし、該単離された核酸分子は、配列番号１のヌクレオチド２６で開始しかつヌクレオチド４７６で終止するフラグメントまたは配列番号１のヌクレオチド２６で開始しかつヌクレオチド４７６で終止するフラグメントのサブフラグメントではない、ヌクレオチド配列；および
（ｂ）（ａ）のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列：からなる群より選択される配列を有するポリヌクレオチドを含む、
単離された核酸分子。
【請求項６】  組換えベクターを作製する方法であって、請求項１に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入する工程を包含する、方法。
【請求項７】  請求項６に記載の方法によって生成された、組換えベクター。
【請求項８】  組換え宿主細胞を作製する方法であって、請求項７に記載の組換えベクターを宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。
【請求項９】  請求項８に記載の方法によって生成された、組換え宿主細胞。
【請求項１０】  エンドカインαポリペプチドを生成するための組換え方法であって、該ポリペプチドが発現されるような条件下で、請求項９に記載の組換え宿主細胞を培養する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
【請求項１１】  単離されたエンドカインαポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２の約１〜約１６９のアミノ酸；
（ｂ）配列番号２の約２〜約１６９のアミノ酸；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するエンドカインαポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｄ）（ａ）、（ｂ）または（ｃ）に記載のいずれか１つのポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列、
からなる群より選択される配列に少なくとも９５％同一なアミノ酸配列を有する、単離されたエンドカインαポリペプチド。
【請求項１２】  エンドカインαのエピトープ保有部分を含む、請求項１１に記載の単離されたポリペプチドであって、ここで、該部分が、以下：
配列番号２の約４４〜約１５８のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約４４〜約５４のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約５７〜約６８のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約６９〜約７８のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約９４〜約１０５のアミノ酸残基を含むポリペプチド；配列番号２の約１０８〜約１３２のアミノ酸残基を含むポリペプチド；および、配列番号２の約１４８〜約１５８のアミノ酸残基を含むポリペプチド、
からなる群から選択される、
単離されたポリペプチド。
【請求項１３】  組換え宿主細胞中で産生されるか、または組換え宿主細胞中に含まれる、請求項１１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項１４】  前記組換え宿主細胞が哺乳動物細胞である、請求項１３に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項１５】  エンドカインαポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子であって、ここで、１〜５０個の保存的アミノ酸置換以外は、該ポリペプチドが、以下：
（ａ）配列番号２の約１〜約１６９のアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２の約２〜約１６９のアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；および、
（ｄ）（ａ）、（ｂ）または（ｃ）に記載のヌクレオチド配列のいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列を有する、
単離された核酸分子。
【請求項１６】  単離されたエンドカインαポリペプチドであって、ここで
、１〜５０個の保存的アミノ酸置換以外は、該ポリペプチドが、以下：
（ａ）配列番号２の約１〜約１６９のアミノ酸；
（ｂ）配列番号２の約２〜約１６９のアミノ酸；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するエンドカインαポリペプチドのアミノ酸配列；および
（ｄ）（ａ）、（ｂ）または（ｃ）に記載のいずれか１つのポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列、
からなる群より選択される配列を有する、
単離されたエンドカインαポリペプチド。
【請求項１７】  請求項１１に記載のエンドカインαポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体または抗体フラグメント。
【請求項１８】  減少したレベルのエンドカインα活性を必要とする個体を処置するための方法であって、該方法が、請求項１７に記載の単離された抗体または抗体フラグメントを含む組成物を該個体に投与する工程を包含する、方法。
【請求項１９】  以下からなる群より選択される障害を有する個体を処置する方法であって：
ＡＩＤＳ、慢性リンパ球障害、分類不能型免疫不全、腫瘍、寄生虫病、自己免疫疾患、狼瘡、関節炎、特発性血小板減少性紫斑病、多発性硬化症、慢性炎症、急性炎症、急性同種移植拒絶、対宿主性移植片病、移植拒絶、胎児吸収、糞便性腹膜炎、皮膚アレルギー、腸疾患、創傷、敗血症、ＡＬＬ、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、慢性リンパ性白血病、形質細胞腫、多発性骨髄腫、バーキットリンパ腫、ＥＢＶ−形質転換疾患、慢性骨髄性白血病、慢性高ガンマグロブリン血症、自己免疫血液障害、多発性軟骨炎、強皮症、ヴェーゲナー肉芽腫症、皮膚筋炎、活動性慢性肝炎、重症筋無力症、乾癬、スティーヴンズ−ジョンソン症候群、特発性スプルー、自己免疫甲状腺炎、特発性アディソン病、白斑、グルテン過敏性腸症、自己免疫好中球減少症、尋常性天疱瘡、グッドパスチャー病、水疱性類天疱瘡、円板状狼瘡、デンスデポジット病、内分泌性眼障害、ＩＢＤ、喘息、グレーヴズ病、類肉腫症、肝硬変症、若年性糖尿病、インシュリン依存性糖尿病、ブドウ膜炎、自己免疫胃炎、リンパ球減少症、結節性多発性動脈炎、シェーグレン症候群、ベーチェット病、橋本病、原発性粘液水腫、多発性筋炎、混合結合組織病、乾性角結膜炎、春季カタル、間質性肺線維症、糸球体腎炎、肝炎、自己免疫溶血性貧血、接触過敏疾患、一相性ＥＡＥ、ＳＣＩＤＳ、アルツハイマー病、パーキンソン病および原発性側索硬化症；
ここで、該方法が、以下；
（ａ）請求項１１に記載のポリペプチド；および
（ｂ）請求項１６に記載のポリペプチド、
からなる群より選択されるエンドカインαポリペプチドの治療有効量を該個体に投与する工程を包含する、
方法。
【請求項２０】  以下からなる群より選択される障害を有する個体を処置する方法であって：
自己免疫疾患、珪肺症、類肉腫症、特発性肺線維症、特発性好酸球増加症候群、エンドトキシンショック、アテローム性動脈硬化症、ヒスタミン媒介アレルギー反応、ＩｇＥ媒介アレルギー反応、慢性炎症、急性炎症、慢性関節リウマチ、再生不良性貧血、骨髄異形成症候群、および創傷；
ここで、該方法が、エンドカインαアンタゴニストの治療有効量を該個体に投与する工程を包含する、
方法。
【請求項２１】  個体における骨形成の調節のため、個体における骨形成に関連する障害の予防もしくは処置のため、または個体における骨折の予防もしくは処置のための薬学的組成物の調製のための、核酸分子または核酸分子の相補鎖または該核酸分子によってコードされるポリペプチドの使用であって、該核酸分子は、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸１〜１７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号２のアミノ酸１８〜４３を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号２のアミノ酸４４〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号２のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）（ａ）〜（ｈ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列に少なくとも９５％同一であって、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；
（ｊ）（ａ）〜（ｈ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を有しかつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；および
（ｋ）ストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｈ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列もしくはその相補体にハイブリダイズし、かつ、エンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、使用。
【請求項２２】  個体における骨形成の調節のため、個体における骨形成に関連する障害の予防もしくは処置のため、または個体における骨折の予防もしくは処置のための薬学的組成物の調製のための抗体または抗体フラグメントの使用であって、該抗体または抗体フラグメントは、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸１〜１７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号２のアミノ酸１８〜４３を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号２のアミノ酸４４〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号２のアミノ酸４４〜１５８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号２のアミノ酸５７〜６８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）配列番号２のアミノ酸６９〜７８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｊ）配列番号２のアミノ酸９４〜１０５を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｋ）配列番号２のアミノ酸１０８〜１３２を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｌ）配列番号２のアミノ酸１４８〜１５８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｍ）配列番号２のアミノ酸４４〜５４を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｎ）配列番号２のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｏ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｐ）（ａ）〜（ｏ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列に少なくとも９５％同一であって、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；
（ｑ）（ａ）〜（ｏ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を有しかつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；および
（ｒ）ストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｏ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列もしくはその相補体にハイブリダイズし、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列
からなる群より選択されるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドに特異的に結合し得る、使用。
【請求項２３】  前記骨形成の調節が、骨再吸収の調節である、請求項２１または２２に記載の使用。
【請求項２４】  前記障害が、骨再吸収に関連する、請求項２１または２２に記載の使用。
【請求項２５】  前記障害が骨粗しょう症である、請求項２１または２２に記載の使用。
【請求項２６】  前記個体がヒトである、請求項２１〜２５のいずれか１項に記載の使用。
【請求項２７】  個体における骨形成の調節のため、個体における骨形成に関連する障害の予防もしくは処置のため、または個体における骨折の予防もしくは処置のための、有効量の核酸分子または核酸分子の相補鎖または該核酸分子によってコードされるポリペプチドの使用であって、該核酸分子は、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸１〜１７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号２のアミノ酸１８〜４３を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号２のアミノ酸４４〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号２のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）（ａ）〜（ｈ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列に少なくとも９５％同一であって、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；
（ｊ）（ａ）〜（ｈ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を有しかつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；および
（ｋ）ストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｈ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列もしくはその相補体にハイブリダイズし、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、使用。
【請求項２８】  個体における骨形成の調節のため、個体における骨形成に関連する予防もしくは処置のため、または個体における骨折の予防もしくは処置のための、有効量の抗体または抗体フラグメントの使用であって、該抗体または抗体フラグメントは、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸１〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸２〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）配列番号２のアミノ酸１〜１７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）配列番号２のアミノ酸１８〜４３を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）配列番号２のアミノ酸４４〜１６９を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）配列番号２のアミノ酸４４〜１５８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）配列番号２のアミノ酸５７〜６８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）配列番号２のアミノ酸６９〜７８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｊ）配列番号２のアミノ酸９４〜１０５を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｋ）配列番号２のアミノ酸１０８〜１３２を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｌ）配列番号２のアミノ酸１４８〜１５８を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｍ）配列番号２のアミノ酸４４〜５４を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｎ）配列番号２のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｏ）ＡＴＣＣ受託番号９７６４０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列のうちの３０個以上連続したアミノ酸を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｐ）（ａ）〜（ｏ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列に少なくとも９５％同一であって、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；
（ｑ）（ａ）〜（ｏ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を有しかつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列；および
（ｒ）ストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｏ）のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列もしくはその相補体にハイブリダイズし、かつエンドカインα活性を有するポリペプチドをコードする、ヌクレオチド配列
からなる群より選択されるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドに特異的に結合し得る、使用。
【請求項２９】  前記骨形成の調節が、骨再吸収の調節である、請求項２７または２８に記載の使用。
【請求項３０】  前記障害が、骨再吸収に関連する、請求項２７または２８に記載の使用。
【請求項３１】  前記障害が骨粗しょう症である、請求項２７または２８に記載の使用。
【請求項３２】  前記個体がヒトである、請求項２７〜３１のいずれか１項に記載の使用。