【手続補正書】
【提出日】平成19年5月21日(2007.5.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ダニの摂食期のときにダニの唾液腺において誘導されるｃＤＮＡのライブラリーを作製するための方法であって、
ａ）ダニの摂食期のときに誘導されるｍＲＮＡを選択的にクローニングして対応するｃＤＮＡライブラリーを得ること；
ｂ）工程ａ）で得られたライブラリーにおいて同定された少なくとも１つの不完全なｃＤＮＡ配列に対応する全長型ｃＤＮＡをクローニングすること
を含む方法。
【請求項２】  前記ダニがイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】  前記誘導された遺伝子は吸血の遅い摂食期のときに誘導される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】  ａ）非摂食ダニの唾液腺において発現するｍＲＮＡから出発して非誘導ｃＤＮＡを合成すること；
ｂ）摂食させたダニの唾液腺において発現するｍＲＮＡから出発して誘導ｃＤＮＡを合成すること；
ｃ）前記誘導ｃＤＮＡから前記非誘導ｃＤＮＡを除くこと；
ｄ）特異的に誘導されたｃＤＮＡを単離してクローニングし、それによりサブトラクティブライブラリーを得ること；
ｅ）対応する全長型の誘導されたｃＤＮＡを得ること
を含む、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】  ｆ）前記全長型の誘導されたｃＤＮＡ分子を配列決定して、既知のポリペプチド配列およびポリヌクレオチド配列と比較すること
をさらに含む、請求項４に記載の方法。
【請求項６】  全長型ｃＤＮＡライブラリーが調製され、前記サブトラクティブライブラリーから単離された少なくとも１つの不完全なｃＤＮＡによってスクリーニングされる、請求項４および５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】  ａ）前記サブトラクティブライブラリーの多数のクローンを無作為に配列決定すること；
ｂ）それらのＤＮＡ配列およびアミノ酸翻訳配列をＤＮＡデータベースおよびタンパク質データベースと比較すること；
ｃ）明確なファミリー配列を同定すること；
ｄ）それらの対応する全長型ｍＲＮＡ配列を特徴付けること
を含む、請求項４および５のいずれかに記載の方法。
【請求項８】  前記サブトラクティブライブラリーの不均質性が調べられる、請求項４に記載の方法。
【請求項９】  関連するＤＮＡ配列の「誘導」特性が調べられる、請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】  少なくとも１つの全長型誘導ｃＤＮＡが、発現ライブラリーをスクリーニングすることによって得られる、請求項１〜９のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】  摂食させたダニの唾液腺から、特に請求項１〜１０のいずれかに記載される方法によって得られるｃＤＮＡライブラリー。
【請求項１２】  請求項４に記載される方法によって得られるサブトラクティブｃＤＮＡライブラリー。
【請求項１３】  請求項６に記載される方法によって得られる全長型ｃＤＮＡライブラリー。
【請求項１４】  摂食のときに誘導される遺伝子を同定するための、請求項１１〜１３のいずれかに記載されるｃＤＮＡライブラリーの使用方法。
【請求項１５】  請求項１１〜１３のいずれかに記載されるライブラリーに由来するか、または由来し得る核酸。
【請求項１６】  ダニの唾液腺から単離されるか、または単離され得るポリヌクレオチドであって、ダニ唾液腺ポリペプチドおよびそのフラグメントをコードするポリヌクレオチドならびに任意の密接に関連するポリヌクレオチドまたは相補的なポリヌクレオチド。
【請求項１７】  イクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）の唾液腺から単離されるか、または単離され得る、請求項１６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８】  イクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）の唾液腺ｃＤＮＡに対して相補的な、請求項１６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９】  配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９またはそれらの相補的な配列あるいはそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有する、請求項１６〜１８のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２０】  請求項１９に記載されるポリヌクレオチドによってコードされるイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）の唾液腺ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも７５％の同一性を全長について有するポリヌクレオチドをさらに含む、請求項１６〜１９のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２１】  請求項１９に記載されるヌクレオチド配列と少なくとも７５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドをさらに含む、請求項１６〜１９のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２２】  請求項１９に記載されるヌクレオチド配列と少なくとも８０％の同一性を有する、請求項１６〜２１のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２３】  請求項１９に記載されるヌクレオチド配列と少なくとも９０％の同一性を有する、請求項１６〜２１のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２４】  請求項１９に記載されるヌクレオチド配列と少なくとも９５％の同一性を有する、請求項１６〜２１のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２５】  請求項１９に記載されるヌクレオチド配列と少なくとも９８％〜９９％の同一性を有する、請求項１６〜２１のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２６】  請求項１９に記載されるヌクレオチド配列と少なくとも９９％の同一性を有する、請求項１６〜２１のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２７】  請求項１０に記載されるヌクレオチド配列に対して、増幅のために使用され得る条件のもとで、あるいはプローブまたはマーカーとして使用される条件のもとでハイブリダイゼーションするのに十分な同一性を有するヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１６〜２６のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項２８】  請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされる単離されたポリペプチドまたはそのフラグメント。
【請求項２９】  アミノ酸配列が、請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも７５％の同一性を有する、請求項２８に記載のポリペプチド。
【請求項３０】  アミノ酸配列が、請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％の同一性を有する、請求項２８および２９のいずれかに記載のポリペプチド。
【請求項３１】  アミノ酸配列が、請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％の同一性を有する、請求項２８〜３０のいずれかに記載のポリペプチド。
【請求項３２】  アミノ酸配列が、請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも９５％〜９９％の同一性を有する、請求項２８〜３１のいずれかに記載のポリペプチド。
【請求項３３】  「成熟」タンパク質の形態にある、請求項２８〜３２のいずれかに記載されるイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）唾液腺ポリペプチド。
【請求項３４】  より大きなタンパク質の一部としての、請求項２８〜３２のいずれかに記載されるイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）唾液腺ポリペプチド。
【請求項３５】  融合タンパク質の一部としての、請求項２８〜３２のいずれかに記載されるイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）唾液腺ポリペプチド。
【請求項３６】  分泌配列またはリーダー配列、プロ配列、多数のヒスチジン残基などの精製において役に立つ配列、あるいは組換え体生産時の安定性に必要なさらなる配列を含む少なくとも１つのさらなるアミノ酸配列を含む請求項２８〜３５のいずれかに記載のイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）唾液腺ポリペプチド。
【請求項３７】  請求項２８〜３６のいずれかに記載されるポリペプチドの規定された配列およびフラグメントの変化体。
【請求項３８】  基準体と保存的アミノ酸置換により異なる、請求項３７に記載の変化体。
【請求項３９】  少なくとも１つの残基が、同様な特性を有する別の残基で置換されている、請求項３８に記載の変化体。
【請求項４０】  前記置換が、Ａｌａ、Ｖａｌ、ＬｅｕおよびＩｌｅの中で；ＳｅｒおよびＴｈｒの中で；酸性残基のＡｓｐおよびＧｌｕの中で；ＡｓｎおよびＧｌｎの中で；塩基性残基のＬｙｓおよびＡｒｇの中で；芳香族残基のＰｈｅおよびＴｙｒの中で行われる、請求項３９に記載の変化体。
【請求項４１】  数個のアミノ酸が、任意の組み合わせで、置換、欠失または付加されている、請求項３７〜４０のいずれかに記載の変化体。
【請求項４２】  ５個〜１０個のアミノ酸が、任意の組み合わせで、置換、欠失または付加されている、請求項３７〜４１のいずれかに記載の変化体。
【請求項４３】  １個〜５個のアミノ酸が、任意の組み合わせで、置換、欠失または付加されている、請求項３７〜４２のいずれかに記載の変化体。
【請求項４４】  １個〜２個のアミノ酸が、任意の組み合わせで、置換、欠失または付加されている、請求項３７〜４３のいずれかに記載の変化体。
【請求項４５】  イクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）の唾液腺に存在するイクソデス・リシヌス唾液腺ポリペプチドの天然に存在する対立遺伝子変化体である、請求項３７〜４４のいずれかに記載の変化体。
【請求項４６】  ダニ唾液腺ポリペプチドに対する哺乳動物宿主における免疫学的応答を誘導させるための免疫学的組成物またはワクチンであって、
ａ）請求項１５〜２７のいずれかに記載されるダニ唾液腺ｃＤＮＡ；
ｂ）請求項２８〜３６のいずれかに記載されるダニ唾液腺ポリペプチド；
ｃ）成分（ａ）または（ｂ）のエピトープ含有フラグメント、アナログ、外膜小胞または細胞（弱毒化されているかまたは弱毒化されていない）；
ｄ）可能な場合にはキャリア
からなる群の少なくとも１つを含む免疫学的組成物またはワクチン。
【請求項４７】  請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含有する、抗凝固性を有する治療剤。
【請求項４８】  配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９またはそれらの相補的な配列あるいはそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含有する、抗凝固性を有する治療剤。
【請求項４９】  配列番号７、配列番号１６、配列番号２４およびそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含有する、抗凝固性を有する治療剤。
【請求項５０】  請求項１６〜２７のいずれかに記載されるポリヌクレオチドによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含有する、免疫調節性を有する治療剤。
【請求項５１】  配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９またはそれらの相補的な配列あるいはそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含有する、免疫調節性を有する治療剤。
【請求項５２】  配列番号１１、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２８、配列番号２９およびそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる少なくとも１つのポリペプチドを含有する、免疫調節性を有する治療剤。
【請求項５３】  ダニによって運搬される病原体の伝搬を防止するために、単独で使用されるか、または特に請求項４６に記載される抗ダニワクチンと組み合わせて使用される請求項４７〜５２のいずれかに記載される治療剤。
【請求項５４】  配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９またはそれらの相補的な配列あるいはそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列と同一であるか、または実質的に同一であるポリヌクレオチドであって、ダニ（より詳細には、イクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ））の唾液腺ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローンに対するハイブリダイゼーションプローブとして使用されるか、あるいはダニ唾液腺ｃＤＮＡに類似する他の遺伝子のクローンを単離するために使用されるポリヌクレオチド。
【請求項５５】  疾患または疾患に対する罹患性に対する診断キットであって、
（ａ）ダニ唾液腺ポリヌクレオチド、好ましくは、請求項１９に記載される遺伝子配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそのフラグメント；
（ｂ）（ａ）の配列に対して相補的なヌクレオチド配列；
（ｃ）ダニ唾液腺ポリペプチド、好ましくは、請求項１９に記載される遺伝子配列のいずれかによってコードされるポリペプチド、またはそのフラグメント；
（ｄ）ダニ唾液腺ポリペプチドに対する抗体、好ましくは、請求項１９に記載される遺伝子配列のいずれかによってコードされるポリペプチドに対する抗体；または
（ｅ）ダニ唾液腺ポリペプチドに対する抗体を提示するファージ、好ましくは、請求項１９に記載されるｃＤＮＡのいずれかによってコードされるポリペプチドに対する抗体を提示するファージ
を含み、さらに、（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）または（ｅ）は実質的な構成要素を含み得る診断キット。
【請求項５６】  請求項１５〜２７のいずれかに記載される核酸によってコードされるいずれかのポリペプチドに対する抗イクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）ポリペプチド抗体。
【請求項５７】  請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）ポリペプチドを含む免疫化剤。
【請求項５８】  哺乳動物において免疫学的応答を誘導するための方法であって、イクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）および関連する種の吸血時に伝搬し得る細菌およびウイルスから前記動物を保護するために抗体および／またはＴ細胞免疫応答を産生させるのに適切な請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのイクソデス・リシヌス唾液腺ポリペプチド、あるいはそのエピトープ含有フラグメント、アナログ、外膜小胞または細胞（弱毒化されているかまたは弱毒化されていない）を前記哺乳動物に接種することを含む方法。
【請求項５９】  哺乳動物において免疫学的応答を誘導させるための方法であって、疾患（ライム病、ダニ脳炎ウイルス病など）から前記動物を保護するために抗体を産生させるような免疫学的応答を誘導するために、請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのイクソデス・リシヌス（Ｉｘｏｄｅｓ  ｒｉｃｉｎｕｓ）唾液腺ポリペプチドを、イクソデス・リシヌス唾液腺ポリヌクレオチドのインビボでの発現を行わせるベクターを介して送達することを含む方法。
【請求項６０】  請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのポリペプチドを含むベクター。
【請求項６１】  請求項１５〜２７のいずれかに記載される少なくとも１つの核酸を含むベクター。
【請求項６２】  請求項６０および６１のいずれかに記載されるベクターによってトランスフェクションされた細胞株。
【請求項６３】  血液学において使用される医薬剤を製造するための、請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのポリペプチドの使用方法。
【請求項６４】  前記ポリペプチドは、配列番号７、配列番号１６、配列番号２４およびそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによって発現される、請求項６３に記載の使用方法。
【請求項６５】  移植において使用される医薬剤を製造するための、請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのポリペプチドの使用方法。
【請求項６６】  前記ポリペプチドは、配列番号１１、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２８、配列番号２９およびそれらのフラグメントからなる群から選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによって発現される、請求項６３に記載の使用方法。
【請求項６７】  リウマチ学において使用される医薬剤を製造するための、請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのポリペプチドの使用方法。
【請求項６８】  一般的な処置において使用される医薬剤を製造するための、請求項２８〜３６のいずれかに記載される少なくとも１つのポリペプチドの使用方法。
【請求項６９】  請求項のいずれかに記載される抗体を発現するハイブリドーマ細胞株。