(57)【要約】【課題】シグナル伝達におけるＧＴＰ結合タンパク質の間の関係を分析可能にする。【解決手段】ＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置は、複数の区画４２を持つ検査床４０と、区画４２に第１、第２のＧＴＰ結合タンパク質を投入する投入器４６と、各区画４２に第１、第２のＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ／ＧＡＰを投入する投入器４８と、各区画４２における第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の濃度を測定する濃度センサ４４と、投入器４６及び投入器４８を制御し、各区画４２に第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、対応するＧＥＦ／ＧＡＰとを所定のシーケンスで投入させるシーケンス制御装置５０と、各区画４２におけるセンサ４４の出力に基づき、投入されたＧＥＦ／ＧＡＰにより活性が制御されるＧＴＰ結合タンパク質と、第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質との間に相互関係が存在するか否かを判定する処理部６２とを含む。【選択図】      図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質またはその組合せの各々と第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の各々との間に、シグナル伝達経路に相当する相互関係が存在するか否かを分析するためのＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置であって、
複数個の反応区画を有する検査床と、
前記複数個の反応区画の各々に、前記第１及び第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の各々の所望量を個別に投入するための第１の投入手段と、
前記複数個の反応区画の各々に、前記第１及び第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の活性化又は不活性化を制御するＧＥＦ又はＧＡＰの所望量を個別に投入するための第２の投入手段と、
前記複数個の反応区画の各々における、前記第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の濃度を測定するための濃度測定手段と、
前記第１の投入手段及び前記第２の投入手段を制御して、前記複数の反応区画の各々に、前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ又はＧＡＰを所定のシーケンスで所望量投入させるためのシーケンス制御手段と、
前記複数個の反応区画の各々において、前記シーケンス制御手段による、前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質の投入、及び前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ又はＧＡＰの投入がなされた時の前記濃度測定手段の出力に基づき、当該反応区画において投入されたＧＥＦ又はＧＡＰにより活性が制御される前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、前記第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質のいずれかとの間に前記相互関係が存在するか否かを判定するための判定手段とを含む、ＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置。
【請求項２】
前記判定手段は、前記複数個の反応区画の各々において、前記シーケンス制御手段による前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質の投入、及び前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ又はＧＡＰの投入がなされたときの、当該ＧＥＦ又はＧＡＰの投入の前後における前記濃度測定手段の出力の変化に基づき、当該反応区画において投入されたＧＥＦ又はＧＡＰにより活性が制御される前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、前記第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質のいずれかとの間に前記相互関係が存在するか否かを判定するための手段を含む、請求項１に記載のＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置。
【請求項３】
前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質又はその組合せと、前記第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質との間に相互関係があると前記判定手段により判定されなかった反応区画について、当該反応区画における前記第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の活性又は不活性を制御するＧＥＦ又はＧＡＰの前記第２の投入手段による投入量を所定の算出式で算出するための手段をさらに含む、請求項１又は請求項２に記載のＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置。
【請求項４】
前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質又はその組合せと、前記第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質との間に相互関係があると前記判定手段により判定されなかった反応区画について、当該反応区画における前記第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質の前記第１の投入手段による投入量を所定の算出式で算出するための手段をさらに含む、請求項１〜請求項３のいずれかに記載のＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
この発明は生体内におけるシグナル伝達機構の分析技術に関し、特に、特定のＧＴＰ（Guanosine  3'-phosphate）結合タンパク質と他のＧＴＰ結合タンパク質との間に、シグナル伝達の経路に相当する所定の関係が存在するか否かを判定するための装置に関する。
【背景技術】
【０００２】
生物細胞内においては、種々の情報が生化学的反応を通じて授受されている。例えば、細胞の受容体が細胞外から受取ったシグナルは、細胞内のシグナル伝達系を介して細胞質又は核に伝達されていく。
【０００３】
こうしたシグナル伝達系で重要な役割を果たしている物質に、ＧＴＰ結合タンパク質がある。ＧＴＰ結合タンパク質は、ＧＴＰ結合型とＧＤＰ結合型と呼ばれる２種類のコンホメーションをとる。ＧＴＰ結合タンパク質は、ＧＴＰ結合型のときに活性を示し、ＧＤＰ結合型のときには不活性となる。ＧＴＰ結合タンパク質が活性を示すと、シグナル伝達経路の下流の標的分子が活性化する。それによりさらに下流の標的分子が活性化する。こうして、種々の分子により情報が伝達されていく。情報が伝達されていく経路をシグナル伝達路と呼ぶ。
【０００４】
ＧＤＰ結合型からＧＴＰ結合型への転換はＧＥＦ（ＧＤＰ−ＧＴＰ交換因子）と呼ばれる因子により促進される。ＧＥＦにも多くの種類があることが知られている。一方、ＧＴＰ結合型からＧＤＰ結合型への転換は、主としてＧＴＰ結合タンパク質に固有のＧＴＰアーゼ活性によりＧＴＰが加水分解することにより生ずるが、ＧＴＰアーゼ活性化タンパク質（ＧＴＰａｓｅ  ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ）によってその転換が促進される。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
ＧＴＰ結合タンパク質には、Ｒｈｏファミリーと呼ばれるものが存在する。Ｒｈｏファミリーは、シグナル伝達の重要な一翼を担っている。
【０００６】
ＲｈｏファミリーのＧＴＰ結合タンパク質を薬剤設計に用いようとする場合、ＲｈｏファミリーのＧＴＰ結合タンパク質から構成されるシグナル伝達経路において、ＧＥＦ／ＧＡＰと対応するＧＴＰ結合タンパク質との間の関係を知ることが重要である。
【０００７】
ところが、細胞をそのまま用いるときには、タンパク質は情報と深く結びついており、どのＧＴＰ結合タンパク質が下流のどのＧＴＰ結合タンパク質の活性を制御しているかを知ることは困難である。
【０００８】
したがってこの発明の目的は、シグナル伝達におけるＧＴＰ結合タンパク質の間の関係を分析することができるＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明に係るＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置は、第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質またはその組合せの各々と第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の各々との間に、シグナル伝達経路に相当する相互関係が存在するか否かを分析するためのＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置であって、複数個の反応区画を有する検査床と、複数個の反応区画の各々に、第１及び第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の各々の所望量を個別に投入するための第１の投入手段と、複数個の反応区画の各々に、第１及び第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の活性化又は不活性化を制御するＧＥＦ又はＧＡＰの所望量を個別に投入するための第２の投入手段と、複数個の反応区画の各々における、第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の濃度を測定するための濃度測定手段と、第１の投入手段及び第２の投入手段を制御して、複数の反応区画の各々に、第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ又はＧＡＰを所定のシーケンスで所望量投入させるためのシーケンス制御手段と、複数個の反応区画の各々において、シーケンス制御手段による、第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質の投入、及び第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ又はＧＡＰの投入がなされた時の濃度測定手段の出力に基づき、当該反応区画において投入されたＧＥＦ又はＧＡＰにより活性が制御される第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質のいずれかとの間に相互関係が存在するか否かを判定するための判定手段とを含む。
【００１０】
好ましくは、判定手段は、複数個の反応区画の各々において、シーケンス制御手段による第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質の投入、及び第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質に対応するＧＥＦ又はＧＡＰの投入がなされたときの、当該ＧＥＦ又はＧＡＰの投入の前後における濃度測定手段の出力の変化に基づき、当該反応区画において投入されたＧＥＦ又はＧＡＰにより活性が制御される第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質と、第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質のいずれかとの間に相互関係が存在するか否かを判定するための手段を含む。
【００１１】
さらに好ましくは、ＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置は、第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質又はその組合せと、第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質との間に相互関係があると判定手段により判定されなかった反応区画について、当該反応区画における第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質の活性又は不活性を制御するＧＥＦ又はＧＡＰの第２の投入手段による投入量を所定の算出式で算出するための手段をさらに含む。
【００１２】
ＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置は、第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質又はその組合せと、第２のグループのＧＴＰ結合タンパク質との間に相互関係があると判定手段により判定されなかった反応区画について、当該反応区画における第１のグループのＧＴＰ結合タンパク質の第１の投入手段による投入量を所定の算出式で算出するための手段をさらに含んでもよい。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１３】
＜第１の実施の形態＞
［構成］
図１に、本発明の一実施の形態に係る相互関係分析装置３０のブロック図を示す。図１を参照して、相互関係分析装置３０は、ＧＴＰ結合タンパク質が投入される複数の反応区画４２を有する検査床４０と、反応区画４２の各々に対し、Ｎ種類のＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の任意の組合せを所望の濃度で投入可能に構成されているＧＴＰ結合タンパク質投入器アレイ４６と、反応区画４２の各々に対し、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１に対応するＧＥＦ／ＧＡＰと、後述するＭ種類のＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１に対応するＧＥＦ／ＧＡＰとを、所望の濃度でかつ所望の組合せで投入可能に構成されているＧＥＦ／ＧＡＰ投入器アレイ４８と、反応区画４２の各々におけるＧＴＰ結合型のＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１の濃度５４を蛍光免疫分析と呼ばれる手法で測定し、濃度信号５６を出力するための複数のＧＴＰ結合タンパク質濃度センサアレイ４４とを含む。
【００１４】
相互関係分析装置３０はさらに、図４を参照して後述するシーケンスに従い、ＧＴＰ結合タンパク質投入器アレイ４６及びＧＥＦ／ＧＡＰ投入器アレイ４８をそれぞれ制御信号５８及び６０により制御して所望の反応区画４２に所望の濃度でかつ所定のシーケンスでＧＴＰ結合タンパク質及びＧＥＦ／ＧＡＰを投入するためのシーケンス制御装置５０と、シーケンス制御装置５０により実行される処理により得られる濃度信号５６（の変化）に基づき、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１とＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１との間の相互関係を特定する処理を実行するための相互関係判定処理部６２と、相互関係判定処理部６２により得られたＧＴＰ結合タンパク質の間の相互関係を格納するための相互関係テーブル５２とを含む。
【００１５】
図２に、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１とＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１との間の関係を模式的に示す。これら二つのタンパク質群の間には、何らかの形でシグナル伝達経路７０が存在すると仮定できるが、その詳細は不明なことが多い。例えばＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０を活性化させるためには、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１のうちどれを活性化させたらよいか、またはどのような組合せを活性化させたらよいかは不明であることが多い。本実施の形態に係る相互関係分析装置３０は、そのような関係を明らかにすることを目的とする。
【００１６】
図３は、図１に示すＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２の構成を示す。図３を参照して、ＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２は、縦軸にＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の可能な組合せをすべて並べ、横軸にはＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１を並べた形をしている。縦軸と横軸との交点に相当する領域には、縦軸のＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の組合せを活性化させることにより、横軸のＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１が活性化されるか否かを示す値（図３では、活性化されるときには「Ｙ」、活性化されないときには「Ｎ」）が格納される。処理の最初にはこれらは全て所定の初期値（例えばヌル）で初期化される。
【００１７】
図４は、図１のシーケンス制御装置５０及び相互関係判定処理部６２が実行するシーケンス制御と相互関係の判定処理とをソフトウェアで実現する場合のコンピュータプログラムのフローチャートを示す。図４を参照して、まずステップ１００では、ステップ１０２〜ステップ１３４までの処理を予め定めるＫ１回実行する。すなわち、ステップ１０２においては、ステップ１０４からステップ１０６の処理を全ての反応区画４２に対して実行する。すなわち、ステップ１０４において、対象のＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の組合せを投入する。全ての反応区画４２に対し対象のＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の組合せを投入したら処理はステップ１０６からステップ１０８に進む。この処理により、全ての反応区画４２が初期化されることになる。
【００１８】
ステップ１０８では、ステップ１１０からステップ１２８の処理を予め定めるＫ２回実行する。
【００１９】
まずステップ１１０では、以下のステップ１１２からステップ１１４までの処理を全ての反応区画４２に対し実行する。すなわち、ステップ１１２では、反応区画４２の各々に投入するＧＥＦ／ＧＡＰの量を、ＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１の各々に対して設定し、反応区画４２に投入する。このときの投入量としては、最初の繰返しでは予め定められたごく少ない量が選択され、２回め以降の繰返しでは、次の式により決定される量が投入される。
【００２０】
【数１】
2006267028.tif 000003
ただしαは区間（−１，１）の範囲でα＝０を除く乱数である。
【００２１】
全ての反応区画４２に対しＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１に対応するＧＥＦ／ＧＡＰが投入されると、制御はステップ１１４を抜け、ステップ１１６に進む。
【００２２】
ステップ１１６では、ステップ１１８及びステップ１２０の処理を全ての反応区画４２に対し実行する。すなわち、ステップ１１８では各反応区画４２に予め割当てられたＸｉの組合せに対応するＧＥＦ／ＧＡＰが、当該反応区画４２に投入される。全ての反応区画４２に対しＧＥＦ／ＧＡＰが投入されると制御はステップ１２０を抜けステップ１２２に進む。
【００２３】
ステップ１２２では、全ての反応区画４２に対し、ステップ１２４〜ステップ１２６の処理を繰返す。すなわち、ステップ１２４において、ＧＥＦ／ＧＡＰの投入前後での活性化されたＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊ（ｊ＝０〜Ｍ−１）の濃度変化を測定する。ステップ１２６では、測定された濃度変化が予め経験的に定めておいたしきい値ＤＴＨを超えたか否かを判定し、超えた場合には当該反応区画に対応するテーブルの項目を「Ｙ」に設定し、以後の処理から当該反応区画を除外する。ステップ１２４及び１２６の処理を全ての反応区画に対し実行し終わると、制御はステップ１２８を抜けステップ１３０に進む。
【００２４】
こうして、ステップ１１０〜ステップ１２８の処理をＫ２回繰返すと、制御はステップ１３２に進む。ステップ１３２では、次のサイクルのＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉ（ｉ＝０〜Ｎ−１）の濃度を以下のランダム差分式で算出し、各反応区画４２に投入する
【００２５】
【数２】
2006267028.tif 000004
ただし、Ｘｉ（ｔ）はｔ番目のサイクルにおける、着目しているＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉの濃度であり、Ｘｉ（ｔ＋１）はステップ１３２で算出される次のｔ＋１番目のサイクルにおけるＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉの投入量、Ｙｊはｔ番目のサイクルの結果得られた着目しているＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊの濃度である。β、γ１及びγ２はそれぞれ、０＜β＜１、γ１＋γ２＜１を満たす経験的に求められる定数である。Ｗｉ（ｔ）は重みを表す乱数である。
【００２６】
このようにランダム差分式を用い、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉ（ｉ＝１〜Ｎ−１）の濃度をランダムに変化させながら上記した処理を繰返すことにより、種々の条件でＧＴＰ結合タンパク質ＸｉとＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊとの関係を調べ、互いに関連があるか否かを高い精度で検出することができる。
【００２７】
ステップ１０２〜ステップ１３４の処理をＫ１回繰返した後、依然としてＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉまたはその組合せとＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊとの間に関係が見出されない場合、ステップ１３６で相互関係テーブル５２の該当フィールドに「Ｎ」を書込み、処理を終了する。
【００２８】
［動作］
上記した相互関係分析装置３０は以下のように動作する。図２を参照して、まず、シグナル伝達経路７０を介して関係があるか否かを調べる対象となるＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１とＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１とを選定する。そして、図１を参照して、ＧＴＰ結合タンパク質投入器アレイ４６にこれらＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１とＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１とを設定し、それぞれ個別に所望量だけ所望の反応区画４２に供給可能とする。同様にＧＥＦ／ＧＡＰ投入器アレイ４８にはこれらＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１とＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１に対応するＧＥＦ／ＧＡＰを設定し、それぞれ個別に所望量だけ所望の反応区画４２に供給可能とする。
【００２９】
相互関係判定処理部６２は、起動されるとＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２の各フィールドにヌルを書込むことでＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２を初期化する。
【００３０】
図４を参照して、ステップ１０２〜ステップ１０６で、反応区画４２の全てに対し、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の組合せをＧＴＰ結合タンパク質投入器アレイ４６により投入する。
【００３１】
続いて、ステップ１１０〜ステップ１１４で、反応区画４２の全てに対し、ＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１の投入量を設定し投入する。ステップ１０８から始まる繰返し処理の１回目では、この投入量は小さな値に設定される。
【００３２】
ステップ１１８において、反応区画４２の全てに対し、当該反応区画４２で調べる対象となるＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉの組合せに対応するＧＥＦ／ＧＡＰを所定量投入する。ステップ１０８から始まる繰返し処理の最初には、この値として予め設定した初期値が使用される。このように、各反応区画４２において、当該区画で調べる対象となるＧＴＰ結合タンパク質Ｘ０〜ＸＮ−１の組合せに対応したＧＥＦ／ＧＡＰを投入すると、もしも図２に示すシグナル伝達経路７０のうち、当該組合せとＧＴＰ結合タンパク質Ｙ０〜ＹＭ−１のうちで調べる対象となっているもの（仮にＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊとする。）との間を結ぶものがあれば、活性化されたＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊの濃度は上昇するであろう。
【００３３】
そこで、ステップ１２２以下では、次の処理を全ての反応区画４２に対し実行する。まず、ステップ１２４で、処理対象の反応区画４２におけるＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊの濃度をＧＴＰ結合タンパク質濃度センサアレイ４４により測定した結果の入力を受ける。測定結果の値がしきい値ＤＴＨより大きければ、シーケンス制御装置５０は、当該反応区画４２で調べる対象となっているＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉまたはそれらの組合せと、ＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊとの間に関連があるものと判定し、ステップ１２６において、相互関係テーブル５２のうち、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉの組合せと、対応するＹｊとの組合せに対応する箇所に「Ｙ」を設定する。またシーケンス制御装置５０は、以後この反応区画４２を処理対象から除外する。
【００３４】
シーケンス制御装置５０及び相互関係判定処理部６２は、ステップ１１０〜ステップ１２８の処理をＫ２回繰返し実行する。その間に、ステップ１２６でＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２のうちで対応関係が見出された部分には「Ｙ」が設定される。
【００３５】
対応関係が見出されないものについては、再度、ステップ１１０〜ステップ１２８の処理が繰返される。この場合、ステップ１１２で設定されるＧＴＰ結合タンパク質ＹｊのＧＥＦ／ＧＡＰの量は、前述した式（１）により算出される。
【００３６】
ステップ１１０〜ステップ１２８の処理をＫ２回繰返しても反応区画４２に対応関係が見出されない場合、制御はステップ１３０を抜け、ステップ１３２に進む。ステップ１３２で、前述した式（２）を用いて新たに投入すべきＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉの量を算出し、ステップ１０４で全ての反応区画４２に当該ＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉの量を投入する。
【００３７】
ステップ１１０〜ステップ１２８の処理をＫ２回繰返してもステップ１２６でテーブルの内容が決定されないようなＧＴＰ結合タンパク質ＸｉとＹｊとの組合せについては、ステップ１３２でＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉについて新たな投入量を決めて、同じ処理をさらにＫ２回繰返す。こうして、Ｋ２回繰返す処理を最大でＫ１回繰返すうちに、ステップ１２６でＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉまたはその組合せとＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊとの間に関連があるものについてはＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２の該当フィールドに「Ｙ」が設定され、上記した処理で互いに関係が存在することが認められない組合せについては、相互関係テーブル５２の該当フィールドに「Ｎ」がステップ１３６で書込まれる。
【００３８】
以上のように本実施の形態によれば、ＧＴＰ結合タンパク質Ｘｉまたはその組合せと、ＧＴＰ結合タンパク質Ｙｊとの間にシグナル伝達経路が存在するか否かが、繰返し処理の中で判定される。したがって、所望のＧＴＰ結合タンパク質を活性化させるために、どのＧＴＰ結合タンパク質を活性化させるべきか、という情報を利用できるようになる。その結果、例えば薬品の設計等を効率的に行なうことが可能になる。
【００３９】
今回開示された実施の形態は単に例示であって、本発明が上記した実施の形態のみに制限されるわけではない。本発明の範囲は、発明の詳細な説明の記載を参酌した上で、特許請求の範囲の各請求項によって示され、そこに記載された文言と均等の意味および範囲内でのすべての変更を含む。
【図面の簡単な説明】
【００４０】
【図１】この発明の一実施の形態に係るＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置３０のブロック図である。
【図２】この発明の一実施の形態に係るＧＴＰ結合タンパク質の相互関係分析装置３０の機能を説明するためのシグナル伝達経路７０の模式図である。
【図３】この発明の一実施の形態に係る相互関係分析装置３０で使用されるＧＴＰ結合タンパク質の相互関係テーブル５２の構成を示す模式図である。
【図４】この発明の一実施の形態に係る相互関係分析装置３０のシーケンス制御装置５０及び相互関係判定処理部６２を実現するコンピュータプログラムの制御構造を示すフローチャートである。
【符号の説明】
【００４１】
３０  相互関係分析装置
４０  検査床
４２  反応区画
４４  ＧＴＰ結合タンパク質濃度センサアレイ
４６  ＧＴＰ結合タンパク質投入器アレイ
４８  ＧＥＦ／ＧＡＰ投入器アレイ
５０  シーケンス制御装置
５２  相互関係テーブル
６２  相互関係判定処理部
７０  シグナル伝達経路
【図１】
2006267028.tif 000005
【図２】
2006267028.tif 000006
【図３】
2006267028.tif 000007
【図４】
2006267028.tif 000008