(57)【要約】【課題】  化合物抽出装置において、検討対象となる化合物の中から効率良く所望の化合物を抽出する。【解決手段】  化合物抽出部２０に対して、表面プラズモン測定装置４０で測定された、注目するタンパクＵと検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・との間の相互作用を示すデータＥが入力されるとともに、データベース記憶部１０に記憶されたデータＤ１、Ｄ２、Ｄ３・・・の中から１種類以上の参照用のタンパクＴ１およびＴ２と上記検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・との間の相互作用を示すデータＤ１，Ｄ２が入力され、化合物抽出部２０が、上記入力されたデータに基づいて、上記検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・の中から、上記注目するタンパクＵに対して示す相互作用と上記参照用のタンパクＴ１およびＴ２に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する。【選択図】          図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
参照用の２種類以上の生理活性高分子物質のそれぞれと予め定められた２種類以上の検討対象となる化合物との間の相互作用を示す各データを、前記参照用の生理活性高分子物質および検討対象となる化合物に対応付けて記憶する記憶手段と、
注目する生理活性高分子物質と前記検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータが入力されるとともに、前記記憶手段に記憶されたデータの中から１種類以上の前記参照用の生理活性高分子物質と前記検討対象となる各化合物との間の相互作用を示すデータが入力され、前記入力されたデータに基づいて、前記検討対象となる化合物の中から、前記注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と前記参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する抽出手段と、
前記抽出手段による抽出結果を出力する出力手段とを備えたことを特徴とする化合物抽出装置。
【請求項２】
前記相互作用を示すデータが、全反射減衰を利用した測定装置によって得られたものであることを特徴とする請求項１記載の化合物抽出装置。
【請求項３】
前記相互作用が、結合速度定数（Ｋａ）の値の大きさで示されるもの、解離速度定数（Ｋｄ）の値の大きさで示されるもの、解離定数（ＫＤ）の値の大きさで示されるもの、および最大結合量（Ｒｍａｘ）の値の大きさで示されるもののうちの少なくともいずれか１つであることを特徴とする請求項１または２記載の化合物抽出装置。
【請求項４】
参照用の２種類以上の生理活性高分子物質のそれぞれと予め定められた２種類以上の検討対象となる化合物との間の相互作用を示す各データを、前記参照用の生理活性高分子物質および検討対象となる化合物に対応付けて記憶手段に記憶させる手順と、
注目する生理活性高分子物質と前記検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータを入力させる手順と、
前記記憶手段に記憶されたデータの中から１種類以上の前記参照用の生理活性高分子物質と前記検討対象となる各化合物との間の相互作用を示すデータを入力させる手順と、
前記入力されたデータに基づいて、前記検討対象となる化合物の中から、前記注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と前記参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する手順と、
前記差異が存在する化合物を抽出した結果を出力する手順とをコンピュータに実行させるための化合物抽出プログラム。
【請求項５】
前記相互作用を示すデータが、全反射減衰を利用した測定装置によって得られたものであることを特徴とする請求項４記載の化合物抽出プログラム。
【請求項６】
前記相互作用が、結合速度定数（Ｋａ）の値の大きさで示されるもの、解離速度定数（Ｋｄ）の値の大きさで示されるもの、解離定数（ＫＤ）の値の大きさで示されるもの、および最大結合量（Ｒｍａｘ）の値の大きさで示されるもののうちの少なくともいずれか１つであることを特徴とする請求項４または５記載の化合物抽出プログラム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、化合物抽出装置に関し、詳しくは、予め定められた複数の化合物の中から、注目する高分子物質に対して示す相互作用と参照する高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する化合物抽出装置および上記化合物を抽出する手順をコンピュータに実行させるための化合物抽出プログラムに関するものである。
【背景技術】
【０００２】
一般に、医薬品を構成する化合物は、生体内のタンパクと化学的に結合することにより、その機能を果たすものが多い。そのため、医薬品開発において医薬品の候補となる化合物とタンパクとの間の結合の強さを知ることが重要である。特に、医薬品を構成する化合物は、注目するタンパクに対してのみ結合性を持ち、他のタンパクに対しては結合性を持たないことが理想である。すなわち、注目していない他のタンパクに対して結合性を持つことは、いわゆる副作用が生じることになるからである。このように、医薬品開発においては、医薬品の候補となる化合物の中から、注目するタンパクに対してのみ結合性を持つ化合物を抽出するスクリーニングが行なわれている。
【０００３】
上記医薬品の候補となる化合物のスクリーニングに使用される装置には、種々のものがある。例えば、金属表面で光ビームを全反射させて表面プラズモンを発生させたときにこの全反射した光ビーム中に光強度の急激な減衰（全反射減衰）を生じさせる特定の反射角度、すなわち全反射減衰角が上記金属表面近傍の誘電率に応じて変化することを利用した測定装置が知られている。また、上記全反射減衰を利用する類似の測定装置として、例えば非特許文献１の第２１〜２３頁および第２６〜２７頁に記載がある漏洩モード測定装置も知られている。この漏洩モード測定装置は基本的に、プリズム状に形成された誘電体ブロックと、この誘電体ブロックの一面に形成されたクラッド層と、このクラッド層の上に形成されて、試料液に接触させられる光導波層と、光ビームを発生する光源と、上記光ビームを上記誘電体ブロックに対して、該誘電体ブロックとクラッド層との界面で全反射条件が得られるように種々の角度で入射させる光学系と、上記界面で全反射した光ビームの強度を測定して導波モードの励起状態、つまり全反射減衰状態を検出する光検出手段とを備えてなるものである。
【０００４】
さらに、上記表面プラズモンの原理を用いた装置として、例えばビアコア株式会製の装置「ＢＩＡＣＯＲＥ２０００」が知られている（非特許文献２参照）。この装置はタンパクと化合物との間の反応速度論的な解析結果、例えば、化学的な結合反応の速さあるいは化学的な解離反応の速さ等を得ることができるものであり、この装置で得られた解析結果に基づいて化合物の中から医薬品候補となる所望の化合物を抽出することができる。
【０００５】
また、上記装置を利用して医薬品候補となる化合物を抽出した一例として、１つのセンサーチップに２種類のタンパクを固定化し、それぞれのタンパクと３４種類の化合物との間の相互作用等、すなわち、化学的な結合反応の速さ、化学的な結合量、あるいは化学的な解離反応の速さ等を測定して上記医薬品候補となる化合物を絞り込んだ事例が知られている（非特許文献３参照）。
【非特許文献１】「分光研究」第４７巻 第１号（１９９８）
【非特許文献２】生体物質相互作用のリアルタイム解析実験法、永田和宏、半田宏  共編、発行所：シュプリンガー・フェアラーク東京株式会社
【非特許文献３】分析化学Ｖｏｌ．５１、Ｎｏ６、Ｐ.４６１−４６８（２００２）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
しかしながら、例えば、予め定められた多数の化合物の中から医薬品候補となる化合物を抽出するスクリーニングにおいては、実際に参照するタンパクは数百〜数千種類であり、また、検討対象となる化合物は数百万種類である。これに対して、上記従来の装置は、予め記憶された１種類のタンパクと複数の化合物との間のそれぞれの相互作用を、注目する１種類の生理活性高分子物質と複数の上記検討対象となる化合物との間のそれぞれの相互作用に対して比較するものである。ここで、上記装置は、1種類のタンパクと複数の化合物との間の相互作用に関する情報しか記憶することができないようになっているため、この装置を用いて上記多種類のタンパクを参照して医薬品候補となる化合物を抽出しようとすると多大な時間を要し、作業効率が悪いという問題がある。
【０００７】
本発明は、上記事情に鑑みてなされたものであり、検討対象となる化合物の中から効率良く所望の化合物を抽出することができる化合物抽出装置および上記化合物を抽出する手順をコンピュータに実行させるための化合物抽出プログラムを提供することを目的とするものである。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明の化合物抽出装置は、参照用の２種類以上の生理活性高分子物質のそれぞれと予め定められた２種類以上の検討対象となる化合物との間の相互作用を示す各データを、前記参照用の生理活性高分子物質および検討対象となる化合物に対応付けて記憶する記憶手段と、注目する生理活性高分子物質と前記検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータが入力されるとともに、前記記憶手段に記憶されたデータの中から１種類以上の前記参照用の生理活性高分子物質と検討対象となる各化合物との間の相互作用を示すデータが入力され、前記入力されたデータに基づいて、前記検討対象となる化合物の中から、注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と前記参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する抽出手段と、抽出手段による抽出結果を出力する出力手段とを備えたことを特徴とするものである。
【０００９】
本発明の化合物抽出プログラムは、参照用の２種類以上の生理活性高分子物質のそれぞれと予め定められた２種類以上の検討対象となる化合物との間の相互作用を示す各データを、前記参照用の生理活性高分子物質および検討対象となる化合物に対応付けて記憶手段に記憶させる手順と、注目する生理活性高分子物質と前記検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータを入力させる手順と、前記記憶手段に記憶されたデータの中から１種類以上の前記参照用の生理活性高分子物質と前記検討対象となる各化合物との間の相互作用を示すデータを入力させる手順と、前記入力されたデータに基づいて、前記検討対象となる化合物の中から、前記注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と前記参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する手順と、前記差異が存在する化合物を抽出した結果を出力する手順とをコンピュータに実行させるためのものである。
【００１０】
前記生理活性高分子物質とは、日本工業規格（ＪＩＳ）Ｋ３６１１中に「天然高分子」（記号１１００１〜１１０２５）として記載されている各物質、生物学データ大百科事典（朝倉書店）中の「１．生体物質概論」に記載されている糖，アミノ酸、ヌクレオチド、脂質、ヘム、キノン、タンパク質、ＲＮＡ，ＤＮＡ、リン脂質、多糖、バイオサイエンス辞典（朝倉書店）中の「II.生物物質と代謝」に記載されているタンパク質、アミノ酸、核酸、脂質、糖質、酵素のうちのいずれか１つ以上を含むものを意味する。
【００１１】
前記相互作用とは、物理的、化学的、もしくは生化学的な反応における、結合反応の速さ、結合量、または解離反応の速さ、あるいは、上記結合反応の速さ、結合量、および解離反応の速さのうちの２つ以上を組み合わせたものを意味するものである。
【００１２】
本発明の化合物とは２種以上の元素から構成されている分子をいう。本発明では主に分子量５０以上、１００万以下の化合物を対象とするが、分子量がそれ以下およびそれ以上の化合物にも適用し得る。
【００１３】
前記注目する生理活性高分子物質と検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータは記憶手段に記憶されたものであってもよい。
【００１４】
前記相互作用を示すデータは、全反射減衰を利用した測定装置によって得られたものとすることができる。なお、全反射減衰を利用した測定とは、金属表面で光ビームを全反射させて表面プラズモンを発生させたときにこの全反射した光ビーム中に光強度の急激な減衰（全反射減衰）を生じさせる特定の反射角度、すなわち全反射減衰角が上記金属表面近傍の誘電率に応じて変化することを利用して行なわれる測定を意味するものである。
【００１５】
前記相互作用は、結合速度定数（Ｋａ）の値の大きさで示されるもの、解離速度定数（Ｋｄ）の値の大きさで示されるもの、解離定数（ＫＤ）の値の大きさで示されるもの、および最大結合量（Ｒｍａｘ）の値の大きさで示されるもののうちの少なくともいずれか１つとすることができる。
【００１６】
前記結合速度定数Ｋａは、化学的な結合反応の速さを示す値である。
【００１７】
前記解離速度定数Ｋｄは、化学的な解離反応の速さを示す値である。
【００１８】
前記解離定数ＫＤは、上記の解離速度定数Ｋｄを結合速度定数Ｋａで除した値である。すなわち、解離定数ＫＤは、解離定数ＫＤ＝解離速度定数Ｋｄ／結合速度定数Ｋａの式で示される値である。
【００１９】
前記最大結合量Ｒｍａｘは、化合物と生理活性高分子物質との間での、飽和した化学的な結合量を示すものである。
【発明の効果】
【００２０】
本発明の化合物抽出装置および上記化合物を抽出する手順をコンピュータに実行させるための化合物抽出プログラムによれば、参照用の２種類以上の生理活性高分子物質のそれぞれと予め定められた２種類以上の検討対象となる化合物との間の相互作用を示す各データを、前記生理活性高分子物質および検討対象となる化合物に対応付けて記憶手段に記憶させ、注目する生理活性高分子物質と検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータを入力させるとともに、記憶手段に記憶されたデータの中から１種類以上の参照用の生理活性高分子物質と検討対象となる各化合物との間の相互作用を示すデータを入力させ、上記入力させたデータに基づいて、検討対象となる化合物の中から、注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出するようにしたので、従来のように、装置内において、注目する１種類の生理活性高分子物質と装置内に記憶された参照用の他の１種類の生理活性高分子物質との間でのみ比較を行う場合とは異なり、注目する１種類の生理活性高分子物質と装置内に記憶された他の参照用の２種類以上の生理活性高分子物質との間で比較を行うことができる。したがって、従来に比して、検討対象となる化合物の中から、注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する作業の能率を高めることができ、より効率良く所望の上記差異が存在する化合物を抽出することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２１】
以下、本発明の実施の形態について、図面を用いて説明する。図１は本発明の実施の形態による化合物抽出装置の概略構成を示す図、図２はデータベース記憶手段に記憶されたデータの形式を示す図、図３は参照用の生理活性高分子物質および注目する生理活性高分子物質と、検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータの内容を示す図、図４は化合物抽出手段による化合物の抽出結果が表示された様子を示す図である。
【００２２】
上記第１の実施の形態による化合物抽出装置１００は、参照用の２種類以上の生理活性高分子物質であるタンパクＴ１、Ｔ２・・・のそれぞれと予め定められた２種類以上の検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・・との間の相互作用を示す各データを、上記参照用のタンパクＴ１、Ｔ２・・・（以後、まとめてタンパクＴともいう）および検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・・（以後、まとめて化合物Ｊともいう）に対応付けてデータＤ１、Ｄ２・・・（まとめて、データベースＤＢともいう）として記憶するデータベース記憶部１０と、注目する生理活性高分子物質である１種類のタンパクＵと上記検討対象となる化合物Ｊとの間の相互作用を示すデータＥが入力されるとともに、データベース記憶部１０に記憶されたデータＤ１、Ｄ２・・・（の中から１種類以上、ここでは１例として２種類の参照用のタンパクＴ１、Ｔ２のそれぞれと上記検討対象となる各化合物Ｊとの間の相互作用を示すデータＤ１、Ｄ２が入力され、上記入力されたデータＥ，Ｄ１、Ｄ２に基づいて、検討対象となる化合物Ｊの中から、注目するタンパクＵに対して示す相互作用と上記参照用のタンパクＴ１、Ｔ２に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する化合物抽出部２０と、化合物抽出部２０による抽出結果を出力する出力部２１と、出力部２１から出力された結果を表示する表示部２２とを備えている。
【００２３】
なお、化合物抽出部２０は、データベース記憶部１０に記憶されたデータＤ１、Ｄ２・・・の中から、１種類の参照用のタンパク、例えばタンパクＴ１と上記検討対象となる各化合物Ｊ、Ｊ２・・との間の相互作用を示すデータＤ１が入力され、このデータＤ１と上記データＥとに基づいて、検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・・の中から、注目するタンパクＵに対して示す相互作用と上記参照用のタンパクＴ１に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出するものとしてもよい。
【００２４】
さらに、化合物抽出部２０に入力されるデータである上記注目するタンパクと検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータは、データベース記憶部１０に記憶されたデータＤ１、Ｄ２・・・のうちのいずれか１つとしてもよい。
【００２５】
なお、上記相互作用を示すデータＥは、全反射減衰を利用した測定装置である表面プラズモン測定装置４０によって取得されたものである。また、既にデータベース記憶部１０に記憶されている上記各データＤ１、Ｄ２・・・も表面プラズモン測定装置４０によって取得されたものとしてもよい。
【００２６】
参照用のタンパクＴ１、Ｔ２・・・に関する相互作用を示す上記各データＤ１、Ｄ２・・・と、注目するタンパクＵに関する相互作用を示す上記データＥとは同様の形式からなるデータである。図２に示すように、例えば、データＤ１に関して説明すると、タンパクＴ１の名称［Ｔ１］を名称欄Ｌａに示すとともに、予め定められた検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・・のそれぞれの名称［Ｊ１］、［Ｊ２］・・・を行方向に並べ、相互作用を示す項目である結合速度定数Ｋａ、解離速度定数Ｋｄ、解離定数ＫＤ、および最大結合量Ｒｍａｘの少なくとも４項目を列方向に並べたマトリクス状の表中に、上記タンパクＴ１と各化合物Ｊ１、Ｊ２・・・との間の相互作用を示す結合速度定数Ｋａの値［Ｔ１-Ｋａ１］、［Ｔ１-Ｋａ２］・・・、解離速度定数Ｋｄの値［Ｔ１-Ｋｄ１］、［Ｔ１-Ｋｄ２］・・・、解離定数ＫＤの値［Ｔ１-ＫＤ１］、［Ｔ１-ＫＤ２］・・・、および最大結合量Ｒｍａｘの値［Ｔ１-Ｒｍａｘ１］、［Ｔ１-Ｒｍａｘ２］・・・のそれぞれを示すものである。
【００２７】
次に、化合物抽出部２０による化合物抽出の作用について説明する。
【００２８】
図３（ａ）は上記タンパクＵに関するデータＥ、図３（ｂ）は上記タンパクＴ１に関するデータＤ１、図３（ｃ）はタンパクＴ２に関するデータＤ２を示すものであり、図３（ａ）、（ｂ）、（ｃ）中の各結合速度定数Ｋａの値、各解離速度定数Ｋｄの値、各解離定数ＫＤの値のそれぞれは、１例としての比較しやすい数値を与えたものであり、実際の測定で得られた値を示すものではない。なお、ここでは、最大結合量Ｒｍａｘの値等は使用しないので省略し、検討対象となる化合物はＪ１からＪ４のみを示した。
【００２９】
化合物抽出部２０に対してデータベース記憶部１０からデータＤ１、Ｄ２が入力され、表面プラズモン測定装置４０からデータＥが入力されると、化合物抽出部２０は、検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・・の中から、注目するタンパクＵに対して示す相互作用と上記参照用のタンパクＴ１、Ｔ２に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する。すなわち、データＥが示す各結合速度定数Ｋａの値、各解離速度定数Ｋｄの値、各解離定数ＫＤの値と、データＤ１、Ｄ２のそれぞれが示す各結合速度定数Ｋａの値、各解離速度定数Ｋｄの値、各解離定数ＫＤの値との間に差異が存在する化合物を抽出する。
【００３０】
ここでは、参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの結合速度定数Ｋａまたは解離定数ＫＤが大きく、かつ、解離速度定数Ｋｄが小さい化合物を抽出する抽出条件１、および、参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの結合速度定数Ｋａまたは解離定数ＫＤが大きい化合物、または参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの解離速度定数Ｋｄが小さい化合物を抽出する抽出条件２について図３を参照して説明する。
【００３１】
上記抽出条件１の場合について説明する。図３から読み取れるように、参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの結合速度定数Ｋａ、または解離定数ＫＤが大きい化合物は、化合物Ｊ１およびＪ４であり、一方、参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの解離速度定数Ｋｄが小さい化合物は、化合物Ｊ１およびＪ２である。したがって、化合物抽出部２０は、この抽出条件１に適合する化合物として、上記２つの条件を共に満足する化合物Ｊ１を抽出する。
【００３２】
図４（ａ）に示すように、上記化合物抽出部２０によって抽出された抽出結果は出力部２１から出力され表示部２２に表示される。表示部２２では、抽出された化合物の名称［Ｊ１］の表示領域が他の化合物Ｊ２，Ｊ３、Ｊ４の名称の表示領域とは異なる色で表示されるとともに、この化合物の名称［Ｊ１］を示す行において抽出条件１に適合する相互作用を示す項目の領域、ここでは結合速度定数Ｋａ、および解離速度定数Ｋｄを示す領域が他の領域とは異なる色で表示される。
【００３３】
次に、上記抽出条件２について説明する。図３から読み取れるように、参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの結合速度定数Ｋａ、または解離定数ＫＤが大きい化合物は、化合物Ｊ１およびＪ４であり、一方、参照用のタンパクＴ１およびＴ２に比較して、注目するタンパクＵの解離速度定数Ｋｄが小さい化合物は、化合物Ｊ１およびＪ２である。したがって、化合物抽出部２０は、抽出条件２に適合する化合物として、上記２つの条件のいずれかを満足する化合物Ｊ１、Ｊ２およびＪ４を抽出する。
【００３４】
図４（ｂ）に示すように、上記化合物抽出部２０によって抽出された抽出結果は出力部２１から出力され表示部２２に表示される。表示部２２では、抽出された化合物の名称［Ｊ１］、［Ｊ２］、および［Ｊ４］の表示領域が他の化合物Ｊ２の名称の表示領域とは異なる色で表示されるとともに、これらの化合物の名称［Ｊ１］、［Ｊ２］、および［Ｊ４］を示す行において抽出条件２に適合する相互作用を示す項目の領域が他の領域とは異なる色で表示される。すなわち、［Ｊ１］を示す行においては結合速度定数Ｋａ、および解離速度定数Ｋｄ、［Ｊ２］を示す行においては解離速度定数Ｋｄ、［Ｊ４］を示す行においては結合速度定数Ｋａ、および解離定数ＫＤが他の領域とは異なる色で表示される。
【００３５】
上記のように、抽出手段は、２種類以上の参照用の生理活性高分子物質と検討対象となる各化合物との間の相互作用を示すデータが入力され、注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と前記参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出することもできる。このような場合には、複数の各参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用の全てが、注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用とは異なる化合物を、上記差異が存在する化合物として抽出するようにすることができる。
【００３６】
なお、上記相互作用は、結合速度定数（Ｋａ）の値の大きさで示されるもの、解離速度定数（Ｋｄ）の値の大きさで示されるもの、解離定数（ＫＤ）の値の大きさで示されるもの、最大結合量（Ｒｍａｘ）の値の大きさで示されるもののうちの２つ以上の組み合わせによって示されるものとすることもできる。
【００３７】
次に、化合物抽出部２０に対して、表面プラズモン測定装置４０で測定された、注目するタンパクＵと検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・との間の化学的な相互作用を示すデータＥが入力されるとともに、データベース記憶部１０に記憶されたデータＤ１、Ｄ２・・・の中から、１種類の参照用のタンパクＴ１と上記検討対象となる各化合物Ｊ１、Ｊ２・・との間の化学的な相互作用を示すデータＤ１が入力され、この化合物抽出部２０が、上記データＥとデータＤ１とに基づいて、検討対象となる化合物Ｊ１、Ｊ２・・・の中から、注目するタンパクＵに対して示す化学的な相互作用と参照用のタンパクＴ１に対して示す化学的な相互作用との間に差異が存在する化合物を抽出する場合について説明する。
【００３８】
図５（ａ）は上記タンパクＵに関するデータＥ、図５（ｂ）は上記タンパクＴ１に関するデータＤ１を示すものである。なお、上記図５（ａ）、（ｂ）中の各値は、上記と同様に、１例としての比較しやすい数値を与えたものであり、実際の測定で得られた値を示すものではない。
【００３９】
ここでは、参照用のタンパクＴ１に比較して、注目するタンパクＵの最大結合量Ｒｍａｘの値が大きい化合物を抽出する抽出条件３について図５を参照して説明する。
【００４０】
図５から読み取れるように、参照用のタンパクＴ１に比較して、注目するタンパクＵの最大結合量Ｒｍａｘの値が大きい化合物は、化合物Ｊ１およびＪ４である。したがって、化合物抽出部２０は、この抽出条件３に適合する化合物として、上記化合物Ｊ１およびＪ４を抽出する。
【００４１】
図６に示すように、上記化合物抽出部２０によって抽出された抽出結果は出力部２１から出力され表示部２２に表示される。表示部２２では、抽出された化合物の名称［Ｊ１］および［Ｊ４］の表示領域が他の化合物Ｊ２，Ｊ３における名称［Ｊ２］および［Ｊ３］の表示領域とは異なる色で表示されるとともに、この化合物の名称［Ｊ１］および［Ｊ４］を示す行において抽出条件３に適合する相互作用を示す項目の領域、ここでは最大結合量Ｒｍａｘを示す領域が他の領域とは異なる色で表示される。
【００４２】
上記のように、本発明によれば、検討対象となる化合物の中から、注目する生理活性高分子物質に対して示す相互作用と参照用の生理活性高分子物質に対して示す相互作用との間に差異が存在する化合物の抽出を効率良く行うことができる。
【００４３】
なお、上記生理活性高分子物質としては、タンパク、ＤＮＡ、ＲＮＡ、および多糖類のうちのいずれか１つ以上を含むものを採用することができる。
【００４４】
また、上記相互作用は、結合速度定数（Ｋａ）の値の大きさ、解離速度定数（Ｋｄ）の値の大きさ、解離定数（ＫＤ）の値の大きさ、最大結合量（Ｒｍａｘ）の値の大きさで示されるもとしたり、あるいは、上記結合速度定数（Ｋａ）の値の大きさ、解離速度定数（Ｋｄ）の値の大きさ、解離定数（ＫＤ）の値の大きさ、および最大結合量（Ｒｍａｘ）の値の大きさのうちの２つ以上の組み合わせによって示されるものとすることができる。
【００４５】
また、本発明の化合物抽出装置は、全反射減衰を利用した測定により得られた上記相互作用を測定する装置からのデータと、発光測定、蛍光測定、吸光度測定、ＵＶ吸光度測定、時間分解蛍光測定、あるいは、蛍光偏光測定等により得られた上記相互作用を測定する装置からのデータとが記憶手段に記憶されるものとしてもよい。
【００４６】
また、注目する生理活性高分子物質と検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータを、発光測定、蛍光測定、吸光度測定、ＵＶ吸光度測定、時間分解蛍光測定、あるいは、蛍光偏光測定等により得られたものとしてもよい。
【００４７】
なお、上記実施の形態の化合物の抽出方式をコンピュータに実行させるためのプログラムが本発明の化合物抽出プログラムに該当する。
【図面の簡単な説明】
【００４８】
【図１】本発明の実施の形態による化合物抽出装置の概略構成を示す図
【図２】データベース記憶手段に記憶されたデータの形式を示す図
【図３】参照用の生理活性高分子物質および注目する生理活性高分子物質と、検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータの内容を示す図
【図４】化合物の抽出結果が表示された様子を示す図
【図５】参照用の生理活性高分子物質および注目する生理活性高分子物質と、検討対象となる化合物との間の相互作用を示すデータの内容を示す図
【図６】化合物の抽出結果が表示された様子を示す図
【符号の説明】
【００４９】
１０    データベース記憶部
２０    化合物抽出部
２１    出力部
２２    表示部
４０    表面プラズモン測定装置
１００    化合物抽出装置
【図１】
2006090733.tif 000003
【図２】
2006090733.tif 000004
【図３】
2006090733.tif 000005
【図４】
2006090733.tif 000006
【図５】
2006090733.tif 000007
【図６】
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