(57)【要約】【課題】  細胞内寄生細菌であるクラミジアの連続する２回膜貫通領域を有するという特徴を有するＩｎｃ蛋白質群、とくに肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質が抗ガン剤のアポトーシス効果を増強することを示すと共に、抗ガン剤によるガン細胞破壊を促進する化合物の開発等に極めて有効であることを示すことが課題である。【解決手段】  クラミジアは宿主細胞内に感染・増殖もしくは持続感染するために、宿主細胞を制御・利用する巧みな機構を有しており、クラミジアが増殖する場である封入体の形成は特に重要であることに着目した。そこで封入体膜蛋白質が、いずれも２回連続膜貫通領域を有することを見出し、本発明へと至った。【選択図】  図７
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ミトコンドリアに局在しえる、肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質およびアミノ酸配列。
【請求項２】
ミトコンドリアに局在しえる、肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質およびアミノ酸配列の局在に関与する部分配列。
【請求項３】
細胞死の誘導剤の効果を亢進する機能を有する、請求項１に記載の肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質。
【請求項４】
細胞死の誘導剤の効果を亢進する機能を有する、請求項１に記載の肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質およびアミノ酸配列の細胞死の誘導剤の効果を亢進する機能に関与する部分配列。
【請求項５】
抗ガン剤によるガン細胞の消滅を亢進する機能を有する、請求項１に記載の肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質。
【請求項６】
抗ガン剤によるガン細胞の消滅を亢進する機能を有する、請求項１に記載の肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質およびアミノ酸配列の抗ガン剤によるガン細胞の消滅を亢進する機能に関与する部分配列。
【請求項７】
本来のミトコンドリア機能を阻害する機能を有する、請求項１に記載の肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質およびアミノ酸配列の細胞死の誘導剤の効果を亢進する機能に関与する部分配列。
【請求項８】
本来のミトコンドリア機能を阻害する機能を有する、請求項１に記載の肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質の１つ、ＩｎｃＡ２蛋白質およびアミノ酸配列の本来のミトコンドリア機能を阻害する機能に関与する部分配列。
【請求項９】
肺炎クラミジアのゲノムＤＮＡ配列にコードされているアミノ酸配列のうち、情報科学的解析によりＩｎｃＡ２と同様に２回連続膜貫通領域を有することが明らかとなった蛋白質で、肺炎クラミジアの封入体に存在し宿主との相互作用に置いて機能することが強く示唆される肺炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群。
【請求項１０】
ヒトや動物の細胞内骨格蛋白質であるミオシンやカイネシンに類似した構造を持ち、ヒトや動物の細胞内骨格構造の再構成や破壊に関与する、請求項９に記載の肺炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群。
【請求項１１】
高い抗原性を持つことが示されている蛋白質を含み、抗原として有用である、請求項９に記載の肺炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群。
【請求項１２】
性行為感染症クラミジアまたはネコの結膜炎クラミジアのゲノムＤＮＡ配列にコードされているアミノ酸配列のうち、情報科学的解析により肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２と同様に２回連続膜貫通領域を有することが明らかとなった蛋白質で、それぞれのクラミジアの封入体に存在し宿主との相互作用に置いて機能することが強く示唆されるクラミジアのＩｎｃ蛋白質群。
【請求項１３】
ヒトや動物の細胞内骨格蛋白質であるミオシンやカイネシンに類似した構造を持ち、ヒトや動物の細胞内骨格構造の再構成や破壊に関与する、請求項１２に記載の性行為感染症クラミジアまたはネコの結膜炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群。
【請求項１４】
高い抗原性を持つことが示されている蛋白質を含み、抗原として有用である可能性が高い、請求項１２に記載の性行為感染症クラミジアまたはネコの結膜炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群。
【請求項１５】
アポトーシスの促進効果を有する物質を細胞に投与する時、その発現によって顕著なアポトーシス誘導の増強が観察されるという特徴を有する、請求項１から２、請求項９、請求項１２に記載のＩｎｃ蛋白質群およびその機能アミノ酸配列。
【請求項１６】
細胞のアポトーシスを主な抗癌機序とする抗ガン剤の投与に置いて、その発現によって顕著なアポトーシス誘導の増強が観察されるという特徴を有する請求項１から２、請求項２、請求項１２に記載のＩｎｃ蛋白質群及びその機能アミノ酸配列。
【請求項１７】
請求項１から２、請求項９、請求項１２に記載のＩｎｃ蛋白質群およびその機能アミノ酸配列を用いた新規抗ガン剤の開発、既存の抗ガン剤の使用方法改善への利用方法。
【請求項１８】
請求項１から２、請求項９、請求項１２に記載のＩｎｃ蛋白質群およびその機能アミノ酸配列を用いた新規薬理活性剤の開発への利用方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、偏性細胞内寄生性細菌  肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質およびクラミジアのＩｎｃ蛋白質群、およびＩｎｃＡ２蛋白質およびクラミジアのＩｎｃ蛋白質群の新規抗ガン剤の開発、既存の抗ガン剤の使用方法改善への利用および抗ガン剤の効果増強等への利用に関する。
【背景技術】
【０００２】
細胞内寄生細菌であるクラミジアは、宿主である人の細胞動態を制御する豊かな蛋白質酵素群を有しており、いくつかのクラミジア特異的蛋白質が封入体膜上に存在することが知られている。最初に同定された封入体膜上に存在する蛋白質は、Ｃｈｌａｍｙｄｏｐｈｉｌａ  ｐｓｉｔｔａｃｉのＩｎｃＡ蛋白質であった（非特許文献１）。Ｃ．ｐｓｉｔｔａｃｉのＩｎｃＡ蛋白質はｓｅｒｉｎｅ／ｔｈｒｅｏｎｉｎｅ  ｐｈｏｓｐｈｏｐｒｏｔｅｉｎであり、感染細胞のサイトプラズムと接触している（非特許文献２）。ＩｎｃＡホモログをコードしている遺伝子が、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ（非特許文献３）やＣｈｌａｍｙｄｉａ  ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ（非特許文献４）で同定されており、それぞれの蛋白質は封入体膜上に局在している。これらの蛋白質のアミノ酸配列の類似性は２０−２２％程度と低いが、これらの蛋白質は５０―７０アミノ酸の特徴的な疎水性ドメインを有していた。Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓにおいて、ＩｎｃＡ蛋白質は、ｈｏｍｏｔｙｐｉｃ  ｖｅｓｉｃｌｅ  ｆｕｓｉｏｎおよび／または封入体膜のｓｅｐｔａｔｉｏｎに存在していた（非特許文献４）。
【０００３】
クラミジアは、ヒトをはじめとするほ乳類や鳥類を宿主とする偏性細胞内寄生性細菌である。ヒトの肺炎クラミジアでは呼吸器感染症、性感染症クラミジアでは性感染症や結膜炎、人獣共通感染症の原因となるオウム病クラミジアやネコクラミジアではヒトや動物で結膜炎や肺炎の原因となる。さしたる毒素も産生せず、その細胞内増殖も穏やかであることなどから、クラミジア感染は不顕性感染や持続感染に陥ることも多く、肺炎クラミジアの持続感染は動脈硬化症や虚血性心疾患への、性感染症クラミジアでは骨盤内炎や不妊症への進展に深く関与している。
【０００４】
スタウロスポリンはＳｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ  ｓｔａｕｒｏｓｐｏｒｅｕｓから１９７７年に分離されたアルカロイド系化合物で、当初より抗真菌薬から抗高血圧症薬、抗癌治療薬などとして利用が考えられる多彩な生物活性を持つことが知られていた。そのスタウロスポリンの作用機序は蛋白質キナーゼＣ（ＰＫＣ）のＡＴＰ結合部位への強い親和性によるリン酸化活性の阻害であり、細胞プロセスにおけるシグナル伝達を抑制することにある。とくに、ＰＫＣやＮＦ‐ｋＢの機能抑制によるＧ２／Ｍ期における細胞周期停止とｂｃｌ‐２の活性抑制によるアポトーシスの促進が重要である。
【０００５】
一方、抗ガン剤に耐性化したガン細胞は、アポトーシスの抑制に働くｂｃｌ‐２、ＮＦ‐ｋＢ、ＰＫＣ、ｃｙｃｌｉｎＤ１やＥＧＦＲの過剰発現を特徴とする。たとえば、ＥＧＦＲを過剰表現する乳ガン細胞においては、抗乳癌抗有糸分裂薬ビノレルビンとスタウロスポリンの併用は極めて有効であることが知られている。無秩序で爆発的な細胞増殖を特徴とするガン細胞に対して、細胞シグナル伝達の阻害活性をもつスタウロスポリンの効果が認められるのは合理的であるが、実際には正常な細胞プロセスをも阻害する事から、抗ガン剤としての応用は困難であった。
【０００６】
現在、抗ガン作用を維持し正常細胞への副作用をより少なくした数種類の化学合成スタウロスポリン類似化合物が、抗癌剤として臨床試験の段階にある。たとえば、カルフォルニア大デイビス校においてＰｈａｓｅ  ｉ臨床試験が行われている化合物ＵＣＮ０１がある。このスタウロスポリン類似化合物は小細胞肺癌には効果が認められなかったが、非小細胞肺癌の増殖阻害には有効であり、シスプラチンとＵＣＮ０１の混合投与ではシスプラチン単独で期待できる１０倍の効果が得られ、臨床の場での効果が期待されている。
【０００７】
猫クラミジアの新規核酸及び当該核酸を用いたスクリーニング方法に関する特許が出願されている（特許文献１）。
【特許文献１】特願２００４−１８３１３５
【非特許文献１】Ｒｏｃｋｅｙ，Ｄ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．：Ｃｌｏｎｉｎｇ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａ  Ｃｌａｍｙｄｉａ  ｐｓｉｔｔａｃｉ  ｇｅｎｅ  ｃｏｄｉｎｇ  ｆｏｒ  ａ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｌｏｃａｌｉｚｅｄ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｉｎｃｌｕｓｉｏｎ  ｍｅｍｂｒａｎｅ  ｏｆ  ｉｎｆｅｃｔｅｄ  ｃｅｌｌｓ．１９９５  Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１５：６１７‐６２６．
【非特許文献２】Ｒｏｃｋｅｙ，Ｄ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．：Ｃｌａｍｙｄｉａ  ｐｓｉｔｔａｃｉ  ＩｎｃＡ  ｉｓ  ｐｈｏｓｐｈｏｒｙｒａｔｅｄ  ｂｙ  ｔｈｅ  ｈｏｓｔ  ｃｅｌｌ  ａｎｄ  ｉｓ  ｅｘｐｏｓｅｄ  ｏｎ  ｔｈｅ  ｃｙｔｏｐｌａｓｍｉｃ  ｆａｓｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇ  ｉｎｃｌｕｓｉｏｎ．１９９７  Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏ  ｂｉｏｌ．２４：２１７‐２２８．
【非特許文献３】Ｂａｎｎａｎｔｉｎｅ  ｅｔ  ａｌ．：Ｃｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ  ＩｎｃＡ  ｉｓ  ｌｏｃａｌｉｚｅｄ  ｔｏ  ｔｈｅ  ｉｎｃｌｕｓｉｏｎ  ｍｅｍｂｒａｎｅ  ａｎｄ  ｉｓ  ｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄ  ｂｙ  ａｎｔｉｓｅｒａ  ｆｒｏｍ  ｉｎｆｅｃｔｅｄ  ｈｕｍａｎｓ  ａｎｄ  ｐｒｉｍａｔｅｓ．１９９８  Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎｅ．６６：６０１７‐６０２１．
【非特許文献４】Ｂａｎｎａｎｔｉｎｅ  ｅｔ  ａｌ．：Ａ  ｓｅｃｏｎｄａｒｙ  ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ｍｏｔｉｆ  ｐｒｅｄｉｃｔｉｖｅ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ  ｔｏ  ｔｈｅ  ｃｈｌａｍｙｄｉａｌ  ｉｎｃｌｕｓｉｏｎ  ｍｅｍｂｒａｎｅ．２０００  Ｃｅｌｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２：３５‐４７．
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
本発明は、細胞内寄生細菌であるクラミジアの連続する２回膜貫通領域を有するという特徴を有するＩｎｃ蛋白質群、とくに肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質が抗ガン剤のアポトーシス効果を増強することを示すと共に、抗ガン剤によるガン細胞破壊を促進する化合物の開発に、極めて有効であることを示すことが課題である。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
クラミジアは宿主細胞内に感染・増殖もしくは持続感染するために、宿主細胞を制御・利用する巧みな機構を有しており、クラミジアが増殖する場である封入体の形成は特に重要であることに着目した。そこで封入体膜蛋白質が、いずれも２回連続膜貫通領域を有することを見出し、本発明へと至った。
【００１０】
本発明は、偏性細胞内寄生性細菌  肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質に係わるものであり、肺炎クラミジアについて、情報科学的解析により２回連続膜貫通領域を有するという特徴を有するＩｎｃ蛋白質群の中から、機能が全く不明であるが、アミノ酸配列の保存性に着目して選択した肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質に関するものであり、具体例としては、肺炎クラミジアＪ１３８由来のＩｎｃＡ２蛋白質が挙げられる。また、肺炎クラミジアの封入体膜に局在しているＩｎｃＡ２蛋白質に関する。さらに、アポトーシスの促進効果を有する物質を、ＩｎｃＡ２蛋白質を産生している細胞に投与することにより、ＩｎｃＡ２蛋白質に依存する顕著なアポトーシス誘導の増強が観察されるという特徴を有する請求項１から４に記載のＩｎｃＡ２蛋白質、アポトーシスの促進効果を有する物質がスタウロスポリンまたは腫瘍細胞壊死因子（ＴＮＦ‐α）のいずれかである請求項１から５に記載のＩｎｃＡ２蛋白質も含まれる。また、請求項１から６に記載のＩｎｃＡ２蛋白質を用いた新規抗ガン剤の開発、既存の抗ガン剤の使用方法改善への利用に関するものである。
【発明の効果】
【００１１】
本発明によれば、ＩｎｃＡ２遺伝子発現の単独では細胞のアポトーシスは全く起こらず、アポトーシス関連プロテアーゼ活性の上昇も見られなかった。また、細胞増殖の阻害や形態変化も確認されなかった。しかし、アポトーシスの促進効果を持つことが知られているスタウロスポリンや腫瘍細胞壊死因子（ＴＮＦ‐α）をＩｎｃＡ２遺伝子発現細胞に投与したところ、ＩｎｃＡ２遺伝子発現に依存する顕著なアポトーシス誘導の増強がスタウロスポリンとＴＮＦ‐αの両方で確認されたことにより、クラミジア封入体膜蛋白質の有する生物活性の応用は、新規抗ガン剤の開発や既存の抗ガン剤の使用方法の改善に大きな意義を有することを明らかにした。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１２】
クラミジアは宿主細胞内に感染・増殖もしくは持続感染するために、宿主細胞を制御・利用する巧みな機構を有する。クラミジアが増殖する場である封入体の形成は特に重要である（図１）。クラミジアが宿主細胞に食作用的に取り込まれたのち、１０回程度の二分裂増殖する間、クラミジアは積極的に食胞膜に封入体膜蛋白質を導入して自らの増殖環境として封入体膜を樹立させる。この封入体膜はリソソームの結合を抑制し、宿主側からの物質輸送に重要な機能を担う。
【００１３】
同定された封入体膜タンパク質はいずれも２回連続膜貫通領域を有する（図２）。発明者らにより全ゲノムＤＮＡ配列を決定したヒトの肺炎クラミジアと猫クラミジアについて、情報科学的解析により２回連続膜貫通領域を有するＩｎｃ蛋白質群の抽出を行ったところ、肺炎クラミジアで約７０、猫クラミジアで約６０存在していた（図３）。これらＩｎｃ蛋白質群が封入体膜に存在し、宿主のミトコンドリアや細胞内骨格系と相互作用し、宿主を積極的に制御して一種の細胞内小器官を擬態すると考えられる。
【００１４】
実験的に同定されたクラミジアの封入体膜の主要構成蛋白質は２回連続膜貫通領域を有し、情報科学的解析から肺炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群は複数種類存在することが明らかとなった。これらＩｎｃ蛋白質群は封入体膜に存在し、宿主のミトコンドリアや細胞内骨格系と相互作用し、宿主を積極的に制御・利用していると考えられる。その実証として、Ｉｎｃ蛋白質群のなかから、機能が全く不明であるがアミノ酸配列が他のクラミジアに多少の保存が確認できるＩｎｃＡ２遺伝子を選択し、その遺伝子産物の生物活性の検討を行った。
【００１５】
肺炎クラミジアＪ１３８からＩｎｃＡ２遺伝子をＰＣＲにより増幅した後に単離し、ＧＳＴ蛋白質との融合蛋白質として大量調製した。この蛋白質を用いて、ウサギポリクローナル抗体を作成した。このＩｎｃＡ２蛋白質に対する抗体を用いて、肺炎クラミジアのヒト由来の培養細胞への感染下でのＩｎｃＡ２遺伝子産物の局在を観察した。クラミジアの封入体周辺部をリング状に染色する像が得られたことから、情報解析からの予想通り、ＩｎｃＡ２蛋白質はクラミジアの封入体膜に局在することが明らかとなった（図５）。
【００１６】
ＩｎｃＡ２蛋白質は２回連続して膜を貫通する領域以外に、ロイシンジッパー領域を２カ所、ミオシンと部分的に類似する領域をもつ。さらにアミノ末端の構造情報解析から、その蛋白質をヒトの細胞で作らせた時、ミトコンドリアに局在することが示唆されていた。そこで、ＩｎｃＡ２遺伝子発現用ベクターを作成しヒト由来の培養細胞に導入したところ、その局在は予想通りミトコンドリアと重複する領域であった（図６）。ミトコンドリアは５００種以上の蛋白質からなる巨大な細胞内小器官であり、エネルギー産生やビタミン合成などに様々な細胞機能を担う。特に最近では、細胞のアポトーシス制御による生物のホメオスタシスにおいて、重要な役割を担うことが分かってきている。
【００１７】
肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質と部分的に類似する、肺炎クラミジアのＩｎｃＡ１蛋白質が酵母細胞中でその酵母の増殖を阻害することから、ＩｎｃＡ２蛋白質の機能解析の手がかりとしてアポトーシス促進効果について調べた。ＩｎｃＡ２遺伝子発現の単独では細胞のアポトーシスは全く起こらず、アポトーシス関連プロテアーゼ活性の上昇も見られなかった。また、細胞増殖の阻害や形態変化も確認されなかった。しかし、アポトーシスの促進効果を持つことが知られているスタウロスポリンや腫瘍細胞壊死因子（ＴＮＦ‐α）をＩｎｃＡ２遺伝子発現細胞に投与したところ、ＩｎｃＡ２遺伝子発現に依存する顕著なアポトーシス誘導の増強がスタウロスポリン（図７）とＴＮＦ‐α（図８）の両方で確認された。これは、肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質が基本的に細胞にとって無害であるが、潜在的抗ガン剤によるガン細胞破壊を促進することを初めて示した結果である。また、このＩｎｃＡ２蛋白質はクラミジアが有する封入体膜蛋白質の一例にすぎず、肺炎クラミジアやネコクラミジア、性感染症クラミジアなど、これまでゲノム配列が決定されたクラミジアだけでも２００種類もの封入体膜蛋白質群が知られている。つまり、クラミジア封入体膜蛋白質の有する生物活性の応用は、新規抗ガン剤の開発や既存の抗ガン剤の使用方法の改善に知見的基盤として大きな意義を有すると考えられる。
【実施例】
【００１８】
クラミジアが宿主細胞内に感染・増殖もしくは持続感染するためには、封入体の形成が特に重要であることに着目し、封入体膜タンパク質の同定を行なった。同定されたクラミジアの封入体膜の主要構成蛋白質の構造を調べたところ、封入体膜タンパク質は２回連続膜貫通領域を有していることを見出した。そこで、発明者らが全ゲノムＤＮＡ配列を決定したヒトの肺炎クラミジアと猫クラミジアについて、情報科学的解析により２回連続膜貫通領域を有するＩｎｃ蛋白質群の抽出を行った結果から、肺炎クラミジアのＩｎｃ蛋白質群は肺炎クラミジアで約７０種類、ネコクラミジアで約６０種類存在することを明らかにした。これらＩｎｃ蛋白質群は封入体膜に存在し、宿主のミトコンドリアや細胞内骨格系と相互作用し宿主を積極的に制御・利用している。その実証として、Ｉｎｃ蛋白質群のなかから機能が全く不明であるがアミノ酸配列が他のクラミジアに多少の保存が確認できるＩｎｃＡ２遺伝子を選択し、その遺伝子産物の生物活性の検討を行った。ＩｎｃＡ２のアミノ酸配列を、配列表１のＩｎｃＡ２に示した。
【００１９】
肺炎クラミジアJ１３８株からＩｎｃＡ２遺伝子をＰＣＲにより増幅したのち単離し、ＧＳＴ蛋白質との融合蛋白質として大量調製した。この蛋白質を用いてウサギポリクローナル抗体を作成した。このＩｎｃＡ２蛋白質に対する抗体を用いて、肺炎クラミジアのヒト由来の培養細胞への感染下でのＩｎｃＡ２遺伝子産物の局在を観察した。クラミジアの封入体周辺部をリング状に染色する像が得られたことから、情報解析からの予想通りＩｎｃＡ２蛋白質はクラミジアの封入体膜に局在することが明らかとなった。
【００２０】
肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質と部分的に類似する肺炎クラミジアのＩｎｃＡ１蛋白質が酵母細胞中でその酵母の増殖を阻害することから、ＩｎｃＡ２蛋白質の機能解析の手がかりとしてアポトーシス促進効果について調べた。ＩｎｃＡ２遺伝子発現の単独では細胞のアポトーシスは全く起こらず、アポトーシス関連プロテアーゼ活性の上昇も見られなかった。また、細胞増殖の阻害や形態変化も確認されなかった。しかし、アポトーシスの促進効果を持つことが知られているスタウロスポリンや腫瘍細胞壊死因子（ＴＮＦ‐α）をＩｎｃＡ２遺伝子発現細胞に投与したところ、ＩｎｃＡ２遺伝子発現に依存する顕著なアポトーシス誘導の増強がスタウロスポリンとＴＮＦ‐αの両方で確認された。これは肺炎クラミジアのＩｎｃＡ２蛋白質が基本的に細胞にとって無害であるが、潜在的抗ガン剤によるガン細胞破壊を促進することを初めて示した結果である。
【００２１】
肺炎クラミジアが持つ封入体膜蛋白質遺伝子の同定方法および結果について以下に述べる。アミノ酸配列中の疎水領域および膜貫通領域を予測するソフトウエアであるＳＯＳＵＩを用いて、膜貫通領域を持つクラミジアの遺伝子産物を抽出したところ、クラミジアの全遺伝子産物の２５％が膜貫通領域を持つことが予測された。全遺伝子産物数に対する膜貫通領域をもつ遺伝子産物の割合は他の細菌と同様であるが、その貫通回数の分布ではクラミジアには２回のものと７回のものが他の細菌と比較して多いことが明らかとなった。とくに、２回膜貫通領域をもつ遺伝子産物の割合が顕著に高い。一方、封入体膜に局在することが実験的に証明されているクラミジアの蛋白質（封入体膜蛋白質）の特徴として連続する２回膜貫通領域が知られている。その特徴を情報科学的に演繹することにより、肺炎クラミジアには約８０の封入体膜蛋白質をコードする遺伝子の存在が予測された。その約２０％が真核生物型遺伝子として分類されていた遺伝子であり、２回膜貫通領域にこだわらず情報科学的に封入体膜蛋白質遺伝子と同定された遺伝子に類似する真核生物型遺伝子をくわえて、最終的に１０４の遺伝子を情報科学的に予測された封入体膜蛋白質遺伝子と決定した（配列表１）。
【００２２】
全く同様の情報科学的な封入体膜蛋白質遺伝子の同定作業を、ヒトに対して低病原性であるが、猫やイヌに置いては主要な結膜炎の原因クラミジアであるクラミジア・フェリスと、日本を含む先進国に置いては性感染症の第一原因であり発展途上国に置いては失明に至る結膜炎の第一原因であるクラミジア・トラコマティスについて行った。さらに、クラミジア・フェリスとクラミジア・トラコマティスの封入体膜蛋白質遺伝子とされなかった遺伝子の内、肺炎クラミジアの封入体膜蛋白質遺伝子と類似性の高い遺伝子も封入体膜蛋白質遺伝子として決定した。結果、クラミジア・フェリスとクラミジア・トラコマティスの封入体膜蛋白質遺伝子数はそれぞれ７２（配列表２）、４９（配列表３）であった。
【００２３】
宿主の相互作用因子の同定方法および結果について、以下に述べる。肺炎クラミジアの１０７０のＯＲＦのうち、約１００は真核生物のＯＲＦに類似している。そのうち約３０のＯＲＦは転写や複製の制御、細胞内骨格系の再構築などの機能を担うと考えられる。それら肺炎クラミジアの真核生物様遺伝子に相互作用する宿主遺伝子の探索には、宿主と同様に真核生物である酵母を用い、宿主側からは大動脈由来のｃＤＮＡライブラリーを使用した。肺炎クラミジアｓｅｔ遺伝子やｍｐｇ１遺伝子は、肺炎クラミジア自身か宿主のクロマチン構造に関連すると考えられていた。しかし、２ーハイブリッドスクリーニングの結果からは、それらは同一の細胞外マトリックス蛋白質の持つある種のドメインと相互作用することが示された。この場合、ＳＥＴやＭｐｇ１蛋白質の機能はクラミジアの細胞表面に存在し、感染時の定着や細胞からの放出の際に細胞外マトリックスの構造変化を起こすことが考えられる。これはまさにクラミジアによる動脈硬化の進展を理解する上で重要な手がかりを提供するものと考え、研究を進めている。肺炎クラミジアのキネシン／ミオシン類似因子であるＫｈｃタンパク質、さらにキネシン／ミオシン類似因子で封入体膜と構成するタンパク質であるＩｎｃＡ２は、ミトコンドリアに局在するタンパク質と相互作用する可能性が示された。本来クラミジアはエネルギー合成を宿主に依存し、その封入体の周囲に多数のミトコンドリアを集合させる。ＫｈｃやＩｎｃＡ２蛋白質が、ミトコンドリアと封入体を結ぶアンカー蛋白質もしくは物質輸送に関わる因子の１つである可能性がある。さらに、クラミジアの細胞内小器官擬態の中心的な役割を担う可能性もある。
【００２４】
クラミジアが持つ封入体膜蛋白質の抗体作成方法および結果を、以下に示す。ＩｎｃＡ２蛋白質に対する特異的抗体の作成方法は、ＧＳＴ融合したＩｎｃＡ２蛋白質が発現するように構築したベクターを大腸菌の中に導入し、大腸菌にＩｎｃＡ２蛋白質を作らせた。グルタチオンビーズを用いてＧＳＴ融合したＩｎｃＡ２蛋白質を精製し、２羽のウサギに５回にわけて免役し、その後、それらのウサギの全血液を採取して、その血清を抗体として用いた（図９）。抗原として用いた蛋白質は、約１００ｋＤａのＧＳＴと融合したＩｎｃＡ２蛋白質である。作製した抗体を用いて、ＩｎｃＡ２蛋白質の発現解析を、クラミジア感染細胞を用いて行なった。図１０のレーン１および２は、抗原として用いたＧＳＴ融合ＩｎｃＡ２蛋白質を検出している。図１０のレーン１および２のＡとＢのバンドは、それぞれ１００ｋＤａと７５ｋＤａの位置にあり、ウサギの血清中にＩｎｃＡ２蛋白質を検出できるだけの抗体が作成されていることが確認できた。図１０のレーン３−７には、クラミジア感染後０時間、１２時間、３６時間、４８時間、７２時間の細胞をそれぞれ回収し、その抽出液を用いた。３６時間後（図１０のレーン５参照）から、ＩｎｃＡ２蛋白質のバンドはＩｎｃＡ２蛋白質全長の７５ｋＤａと同じ高さにバンドが出現した。図１０のウエスタンブロットの結果から、感染後３６時間以降では、感染細胞中のＩｎｃＡ２蛋白質の確認が可能であった。また、同様の発現解析として、作製した抗体を用いたクラミジア感染細胞の時間ごとの細胞免役染色では、１２時間後の感染細胞でＩｎｃＡ２蛋白質の確認ができた。つまり、ＩｎｃＡ２蛋白質はクラミジア感染後の細胞内で、１２時間後には検出が可能であることが判明した。ＩｎｃＡ２蛋白質は、何か宿主細胞の蛋白質と相互作用している可能性が考えられる。
【００２５】
ＩｎｃＡ２蛋白質の発現の時間的パターンはわかったので、次に、ＩｎｃＡ２蛋白質がクラミジア感染細胞内でどこに局在しているかを調べるため、クラミジア感染後４８時間目の細胞を用いて、細胞の免疫染色を行なった。ＤＡＰＩを用いて核酸染色を行い、大きくて辺縁がクリアな細胞核、および小さくて辺縁がクリアでないクラミジアの封入体を同定した。抗ＩｎｃＡ２抗体を用いて細胞免疫染色すると、リング状の形が見えた。リング状に見えたものは典型的な球状体の辺縁で、クラミジアの封入体の膜表面を染めているものであることがわかった。この結果から、ＩｎｃＡ２蛋白質は封入体の膜表面に存在していることが明らかになった。
【００２６】
クラミジアが持つ封入体膜蛋白質遺伝子のヒト癌細胞での発現方法、および結果を以下に示す。ＦｕＧＥＮＥ  ６（Ｒｏｃｈｅ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いて、ｐＩＮＤ‐ＩｎｃＡ‐ＧＦＰとｐＶｇＲＸＲ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎｅ，ＣＡ）およびｐＩＮＤ‐ＧＦＰとｐＶｇＲＸＲとのそれぞれの組み合わせで、ＨｅＬａ２２９細胞の形質転換により、ＨｅＬａ＋ＩｎｃＡ２およびＨｅＬａ＋ＧＦＰ細胞を作製した。ＩｎｃＡ２遺伝子のインダクションのためには、５００μｇ／ｍｌ  ｇｅｎｅｔｉｃｉｎと２５０μｇ／ｍｌ  ｚｅｏｃｉｎを含む培養液を用いて３７℃、５０％ＣＯ２の条件下で培養し、１日当たり３μＭのｐｏｎａｓｔｅｒｏｎｅで処理した。培養後の細胞の粗抽出液を、ＰＢＳで１：２０００に希釈した抗ＩｎｃＡウサギ血清を用いて、イムノブロッティングにより分析した。ＣＤＰ‐ｓｔａｒでのインキュベーションに続いて、２次抗体をコンジュゲートしたａｌｋａｌｉｎ‐ｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅで処理した後、Ｘ線フィルム上のＩｎｃＡ２蛋白質を検出した。
【００２７】
癌細胞中での遺伝子発現の確認方法および結果を、以下に示す。ＩｎｃＡ２遺伝子のインダクションのために、３μＭのｐｏｎａｓｔｅｒｏｎｅで１日間のインダクションを行なった細胞から調製した細胞粗抽出液を、ＰＢＳで１：２０００に希釈した抗ＩｎｃＡウサギ血清を用いたイミュノブロッティングにより分析した。ａｌｋａｌｉｎ‐ｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅをコンジュゲートさせた２次抗体（Ｒｏｃｈｅ，Ｇｅｒｍａｎｙ）で処理した後に、ＩｎｃＡ２ｐｒｏｔｅｉｎをＸ線フィルム上に検出させた。感染細胞中にＩｎｃＡ２蛋白質が発現しているか否かを決定するため、ウエスタンブロット解析を行なった。図１０に示したように、ＩｎｃＡ２蛋白質は接種後３６時間で検出可能となり、接種後４８−７２時間で最高値に到達した。従ってＩｎｃＡ２蛋白質は、クラミジアの発生サイクルの後期において蓄積することが明らかとなった。免疫蛍光顕微鏡を用いて、感染細胞中のＩｎｃＡ２蛋白質の細胞内局在部位を同定した。他のＩｎｃ蛋白質と同様に、ＩｎｃＡ２蛋白質は封入体の境界領域および封入体の近辺のミトコンドリアに局在していた（図５）。これらの結果から、ＩｎｃＡ２蛋白質は、肺炎クラミジアがミトコンドリアと相互作用する際のアンカー用蛋白質として機能していることが示された。さらにＩｎｃＡ２蛋白質は、ｔｗｏ‐ｈｙｂｒｉｄ  ｓｔｕｄｙの結果から、ミトコンドリアの膜中のＮＡＤＨ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ‐１と直接的に相互作用していると推定された。この結果は、肺炎クラミジアがホスト細胞の代謝システムを利用する際のメカニズムを示している。
【００２８】
方法１による、クラミジア封入体膜蛋白質による癌細胞の細胞死の誘導方法、および結果を以下に示した。３μＭのｐｏｎａｓｔｅｒｏｎｅ  Ａを添加して、ＩｎｃＡ２遺伝子のインダクションを２０時間おこなった後、ＨｅＬａ＋ＩｎｃＡ２細胞およびＨｅＬａ＋ＧＦＰ細胞（５×１０４／ｗｅｌｌ）を、スタウロスポリンで４時間処理して、細胞のアポトーシスを促進させた。アポトーシスを起こした核を染色するため、２μＭのＨｏｅｃｈｓｔ  ３３２５８を含むＰＢＳを細胞に添加して４℃で４５分間反応させた。アポトーシス細胞の計数は、蛍光顕微鏡（ＢＸ５０，Ｏｌｙｍｐｕｓ，Ｊａｐａｎ）を用いた。ランダムに選択した５箇所の領域に対して、２００倍の倍率でアポトーシス細胞の計数を行ない、カウントした細胞総数に対するパーセンテイジで表記した。ＩｎｃＡ２はミトコンドリアと共存しているため（図６）、宿主細胞におけるＩｎｃＡ２の効果を分析することにした。分析すべき機能の一つは、アポトーシスにおけるＩｎｃＡ２の効果である。なぜならば、宿主細胞中でのクラミジアの生存および増殖のためには、クラミジアは宿主細胞のアポトーシスを自らのアドバンテイジにしなければならない。すなわち、クラミジアの成長期における死滅を防御し、成長後には宿主細胞から脱出するために、宿主細胞の細胞死を誘導しなければならない。本発明においては、ＧＦＰまたはＩｎｃＡ２‐ＧＦＰをトランスフェクョンしたＨｅＬａ細胞を、スタウロスポリンまたはＴＮＦ‐αにより刺激した。４−６時間後に、細胞核の染色剤Ｈｏｅｃｈｓｔ  ３３２５８で染色し、クロマチン凝集を測定した。ＩｎｃＡ２‐ＧＦＰを形質転換された細胞は、スタウロスポリンまたはＴＮＦ‐αによりアポトーシスが誘導された時に、コントロールのＧＦＰ形質転換細胞よりも高いアポトーシス速度を示した（図７または図８）。この結果は、ＨｅＬａ細胞において、ＩｎｃＡ２蛋白質がスタウロスポリンまたはＴＮＦ‐αにより誘導されたアポトーシスを増進させていることを示している。
【００２９】
方法２による、クラミジア封入体膜蛋白質による癌細胞の細胞死の誘導方法、および結果を以下に示した。アポトーシス誘導の最後に、ｓｔｉｍｕｌａｔｅｄ細胞とコントロール細胞の両方を、４℃で６０分以上の間、７０％ｅｔｈａｎｏｌで固定した。固定した細胞をＰＢＳで洗浄した後、抗チトクロームｃモノクローナル抗体（Ｒ＆Ｄ  ｓｙｓｔｅｍｓ  Ｉｎｃ．，ＭＮ）で１時間インキュベーションし、その後、Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ５９４  ｇｏａｔ  ａｎｔｉ‐ｍｏｕｓｅ  ＩｇＧ  Ａｂ  （Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅ，ＯＲ）により染色した。２回洗浄後、２μＭ  Ｈｏｅｃｈｓｔ  ３３２５８  ｄｙｅにより４℃、４５分間細胞を染色した。蛍光ラベルしたサンプルは、蛍光顕微鏡により調べた。アポトーシスによるクロマチン凝集および細胞質内へのチトクロームｃのリリースを、４００倍の倍率で計数した。ミトコンドリアからのチトクロームｃのリリースは、アポトーシスのオンとオフを切り替えるセントラルゲートであって、プロアポトーティック蛋白質と特定のクラスのアポトーシス阻害蛋白質の相互作用により調節されている。ＩｎｃＡ２蛋白質の発現によるアポトーシス増強メカニズムを評価するため、スタウロスポリン処理したＧＦＰおよびＩｎｃＡ２‐ＧＦＰをトランスフェクトしたＨｅＬａ細胞を分析した。ＩｎｃＡ２‐ＧＦＰトランスフェクタントの方が、ＧＦＰトランスフェクタントよりもアポトーシスを起こしやすい事がこの条件下でも示されたが、スタウロスポリンにより誘導されたチトクロームｃのリリースはＩｎｃＡ２‐ＧＦＰトランスフェクタントおよびＧＦＰトランスフェクタントの間で意味のある違いはなかった（図１２Ａ）。これらの知見から、ＩｎｃＡ２蛋白質はチトクロームｃリリースの下流においてアポトーシスのパスウェイを昂進させているか、あるいはチトクロームｃリリースとは独立してアポトーシスのパスウェイを昂進させている。
【００３０】
方法３による、クラミジア封入体膜蛋白質による癌細胞の細胞死の誘導方法、および結果を以下に示した。ｐＩＮＤ‐ＧＦＰプラスミドまたはｐＩＮＤ‐ＩｎｃＡ２‐ＧＦＰプラスミドのどちらか一方とｐＶｇＲＸＲプラスミドで形質転換したＨｅＬａ細胞を、６ウェル（３×１０５／ｗｅｌｌ）中にプレーティングし、５％ＣＯ２雰囲気中で、３７℃、１時間培養した後、ＭＥＭ‐ＧＺ中で、３μＭのｐｏｎａｓｔｅｒｏｎｅ  Ａにより刺激を行なった。２０時間の刺激の後、３μＭのｐｏｎａｓｔｅｒｏｎｅ  Ａを含むＭＥＭ‐ＧＺ中で４時間の間スタウロスポリンで処理し、その後に、ｃａｓｐａｓｅ‐３およびｃａｓｐａｓｅ‐９の活性をＣｏｌｏｒｍｅｔｒｉｃ  Ａｃｔｉｖｉｔｙ  ａｓｓａｙ  ｋｉｔ（Ｃｈｅｍｉｃｏｎ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，ＣＡ）により測定した。ｃａｓｐａｓｅ‐３およびｃａｓｐａｓｅ‐９活性の測定は、標識された基質Ａｃ‐ＤＥＶＤ‐ｐＮＡまたはＡｃ‐ＬＥＨＤ‐ｐＮＡから切断されたｃｈｒｏｍｏｐｈｏｒｅ  ｐ‐ｎｉｔｒｏａｎｉｌｉｎｅ（ｐＮＡ）のｓｐｅｃｔｒｏｐｈｏｔｏｍｅｔｒｉｃな検出に基づいている。フリーなｐＮＡの定量は、吸光度計（ＵＶ‐２４００ＰＣ，Ｓｈｉｍａｄｚｕ，Ｊａｐａｎ）を用いて４０５ｎｍで行なった。チトクロームｃのリリースは、ｄＡＴＰの存在下において、ｐｒｏｃａｓｐａｓｅ‐９、Ａｐａｆ‐１およびチトクロームｃからなるａｐｏｐｔｏｓｏｍｅｓの形成によって開始され、ｃａｓｐａｓｅ‐９およびｃａｓｐａｓｅ‐３の活性化の結果、アポトーシスへと導かれる。従って、ｃａｓｐａｓｅ‐３およびｃａｓｐａｓｅ‐９の活性化において、ＩｎｃＡ２蛋白質によりスタウロスポリン誘導性のアポトーシスの効果を調べてみた。その結果、ＩｎｃＡ２‐ＧＦＰ形質転換細胞におけるスタウロスポリン刺激により誘導されたｃａｓｐａｓｅ活性は、ＧＦＰ形質転換細胞に比較して、約２倍も大きい事が示された（図１２Ｂ）。これらの結果は、スタウロスポリン誘導性のアポトーシスの間に、ＩｎｃＡ２蛋白質がｃａｓｐａｓｅ‐９およびｃａｓｐａｓｅ‐３活性を昂進させていることを示しており、さらにｃａｓｐａｓｅによる増強効果がアポトーシスへと導いている。さらにＩｎｃＡ２の発現は、サイトゾルから核内へのＢａｘ局在のトランスファーを伴っていた。この知見は、ＩｎｃＡ２蛋白質がＢａｘを刺激し、ｃａｓｐａｓｅ活性化とアポトーシスのトリガーになっていることを示している。以上の結果から、ＩｎｃＡ２蛋白質は、スタウロスポリン誘導アポトーシスの間に、ｃａｓｐａｓｅ‐３およびｃａｓｐａｓｅ‐９活性を昂進させていることが明らかとなった。
【００３１】
クラミジア封入体膜蛋白質の癌細胞死誘導領域の決定方法および結果について述べる。ＩｎｃＡ２のアポトーシス誘導に寄与する領域を決定するために、ＩｎｃＡ２の全長６５１アミノ酸のうちＮ末から２３１アミノ酸の領域とN末から４８１アミノ酸の領域を、ＩｎｃＡ２の全長と同様にｐＩＮＤベクターに組み込み、ｐＩＮＤ‐ＩｎｃＡ２（Ｎ１‐２３１）‐ＧＦＰとｐＩＮＤ‐ＩｎｃＡ２（Ｎ１‐４８１）‐ＧＦＰを構築した。このベクターをｐＶｇＲＸＲと同時にＨｅＬａ細胞に形質導入して、ＩｎｃＡ２（Ｎ１‐２３１）とＩｎｃＡ２（Ｎ１‐４８１）のアポトーシス、特にｃａｓｐａｓｅ‐９の活性への影響を調べた。形質転換細胞細胞に対するスタウロスポリンの刺激により、ＩｎｃＡ２（Ｎ１‐２３１）とＩｎｃＡ２（Ｎ１‐４８１）はｃａｓｐａｓｅ‐９の活性をコントロールと比べ有意に上昇させることがわかった（図１３）。このことから、ＩｎｃＡ２の全長６５１アミノ酸のうちＮ末から２３１アミノ酸の領域が、スタウロスポリンの刺激に対してアポトーシス誘導を促進することが明らかとなった。
【図面の簡単な説明】
【００３２】
【図１】クラミジアの増殖サイクルを示す図である。
【図２】封入体膜タンパク質（Ｉｎｃ蛋白質群）に特徴的な２回連続膜貫通領域を示す図である。
【図３】封入体膜タンパク質の情報科学的定義の模式図である。
【図４】ＩｎｃＡ２タンパク質および類似タンパク質を示す図である。
【図５】感染細胞でのＩｎｃＡ２蛋白質の局在を示す図である。
【図６】培養細胞中の組換えＩｎｃＡ２蛋白質の局在を示す図である。
【図７】スタウロスポリン投与時の、ＩｎｃＡ２に依存したアポトーシス動態を示す図である。
【図８】ＴＮＦ−α投与時の、ＩｎｃＡ２に依存したアポトーシス動態を示す図である。
【図９】抗体の作成方法を示す図である。
【図１０】作成した抗体を用いた、ウエスタンブロッティングによる感染細胞中のＩｎｃＡ２蛋白質の確認を示す図である。
【図１１】作成した抗体を用いた、ウエスタンブロッティングによるＩｎｃＡ２遺伝子導入細胞中の感染細胞中のＩｎｃＡ２蛋白質の確認を示す図である。
【図１２】ＩｎｃＡ２タンパク質によるスタウロスポリン依存性アポトーシスの促進における分子機能マッピングにおいて、（Ａ）の図はチトクロームｃのリリースは変化しないことを示す図であり、（Ｂ）の図はｃａｓｐａｓｅ‐３およびｃａｓｐａｓｅ‐９活性は有意に上昇することを示す図である。
【図１３】形質転換細胞細胞に対するスタウロスポリンの刺激により、ＩｎｃＡ２（Ｎ１‐２３１）とＩｎｃＡ２（Ｎ１‐４８１）はｃａｓｐａｓｅ‐９の活性をコントロールと比べ有意に上昇させることを示す図である。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成17年11月10日(2005.11.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
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