(57)【要約】      （修正有）【課題】  抗酸菌属の細菌を迅速かつ簡便に検出または菌種同定するためのオリゴヌクレオチド、該オリゴヌクレオチドを利用した抗酸菌属細菌の検出方法および検出キットを提供すること。【解決手段】 マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、かつ特定の配列を有する塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法。【選択図】      なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、かつ配列番号１に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法。
【請求項２】
マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号２に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法。
【請求項３】
配列番号３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号３における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法。
【請求項４】
マイコバクテリウム・アビウム菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号４に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・アビウム菌の同定方法。
【請求項５】
マイコバクテリウム・アビウム菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号５に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・アビウム菌の同定方法。
【請求項６】
配列番号６に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号６における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・アビウム菌の同定方法。
【請求項７】
マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号７に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定方法。
【請求項８】
マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号８に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定方法。
【請求項９】
配列番号９に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号９における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定方法。
【請求項１０】
マイコバクテリウム・カンサシイ菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、かつ配列番号２３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定方法。
【請求項１１】
マイコバクテリウム・カンサシイ菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号２４に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定方法。
【請求項１２】
配列番号２５に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号２５における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定方法。
【請求項１３】
核酸増幅反応時の副反応生成物を検出することを特徴とする、請求項１から１２の何れかに記載の方法。
【請求項１４】
核酸増幅反応時の副反応生成物がピロリン酸であることを特徴とする請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
乾式分析素子を用いてピロリン酸の検出を行う、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
配列番号３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号３における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマー。
【請求項１７】
配列番号６に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号６における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・アビウム菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマー。
【請求項１８】
配列番号９に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号９における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマー。
【請求項１９】
配列番号２５に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号２５における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・カンサシイ菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマー。
【請求項２０】
請求項１６から１９の何れかに記載の少なくとも一種の核酸増幅用プライマー、少なくとも一種のデオキシヌクレオシド３リン酸、少なくとも一種のポリメラーゼ、及び乾式分析素子を含む、抗酸菌属検出用キット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、抗酸菌（マイコバクテリウム）属の細菌を迅速かつ簡便に検出または菌種同定するためのオリゴヌクレオチド、該オリゴヌクレオチドを利用した抗酸菌属細菌の検出方法および検出キットに関する
【背景技術】
【０００２】
わが国において、長年、大きな死亡原因の一つであった結核は、生活環境衛生の改善や化学療法の進歩により患者数は激減しているが、現在でも全世界で年間８００万人の患者が発生し、毎年約３００万人が死亡している。また、最近では、免疫を持たない若年層の集団感染や、流行期に結核菌に感染した菌保有者が加齢と体力の低下に伴い、突然、結核を発症するといった問題が懸念されている。また、非定型抗酸菌と称される菌による感染症は増加傾向にあり、特にMycobacterium avium complex(MAC)感染症は、難治性であり、AIDS患者の日和見感染として問題視されている。
【０００３】
それ故、結核症および非定型抗酸菌症の診断及び治療は、臨床上きわめて重要である。ヒト型結核菌（Mycobacterium tuberculosis）は病状が重篤であるが、ストレプトマイシン、リファンピシン、エタンブトール等の抗生物質が有効なため、早期に治療開始する必要がある。感染源が患者であり、飛沫感染等により経気道的に感染するため、流行を抑えるためにも早期の診断は重要である。また、非定型抗酸菌症の病像には特異性がなく、また菌種により化学療法の効果が異なるため、早期の診断および治療が求められている。
【０００４】
従来、結核菌の検査は培養法により行われてきた。一般的には、小川培地で分離培養し、培地上の性状（増殖速度、温度、コロニーの形状や色素産生など）、ナイアシンテスト、硝酸還元試験、耐熱性カタラーゼ試験、ツイーン８０水解試験などの生化学的性状で菌種の同定が行われている。しかし、抗酸菌は増殖が遅く、上記の検査を行うには１ヶ月以上要する。
【０００５】
また、ヒト型結核菌が産生するタンパク質を抗原抗体反応で検出する方法も開発されたが、感度的に問題があるため、菌を培養することが必要であることは変わりなかった。
【０００６】
最近、遺伝子を用いた最近の迅速同定法が開発されており、結核菌および抗酸菌の検出及び同定にも、これらの技術が応用されている。例えば、核酸を用いる菌株の同定キットとして、「アキュプローブ」（極東製薬）、「DDHマイコバクテリウム」（極東製薬）が開発されている。しかしながら、これらのキットは、やはり菌を培養することが必要とされている。
【０００７】
培養を必要としない菌株の同定キットとしては、核酸増幅法を用いた「DNAプローブ『RG』-MTD」（富士レビオ）、「アンプリコアマイコバクテリウム」（ロシュ・ダイアグノスティクス社）などが開発されている。これらのキットを用いれば、喀痰等の臨床検体から約１日で結核菌を検出同定できる。
【０００８】
しかし、これらの遺伝子診断法にも、問題点が存在する。これらのキットは１日で検出同定できるが、実際の臨床の現場を考えると、患者が病院に来訪してから帰るまでの間に結果が出ることが望ましい。具体的には、半日以内と考えられる。それ故、更なる迅速化が必要である。
【０００９】
また、検出系が化学発光であったり、自動機が大掛かりであったりするため、初期の設備投資および１検査あたりのコストがかかりすぎるという問題点もある。そのため、安価に検査を行うことは遺伝子診断法における大きな課題と考えられる。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
本発明の目的は、抗酸菌属の細菌を迅速かつ簡便に検出または菌種同定するためのオリゴヌクレオチド、該オリゴヌクレオチドを利用した抗酸菌属細菌の検出方法および検出キットを提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明者らは、上記課題を解決することを目的として、抗酸菌属の細菌の１６ＳｒＲＮＡ（リポゾーマルＲＮＡ）遺伝子に関して鋭意検討を重ねた結果、抗酸菌属細菌の検出または菌種同定に適した塩基配列を見つけ出し、それを用いた検出法を確立することに成功し、本発明を完成するに至った。
【００１２】
すなわち、本発明によれば、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、かつ配列番号１に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法；マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号２に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法；並びに配列番号３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号３における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定方法が提供される。ここで用いるのに特に好ましい核酸増幅用プライマーは、配列番号１０又は１４に記載の塩基配列からなるプライマーである。
【００１３】
さらに本発明によれば、マイコバクテリウム・アビウム菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号４に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・アビウム菌の同定方法；マイコバクテリウム・アビウム菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号５に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・アビウム菌の同定方法；並びに配列番号６に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号６における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・アビウム菌の同定方法が提供される。ここで用いるのに特に好ましい核酸増幅用プライマーは、配列番号１１、１５、１６又は１７に記載の塩基配列からなるプライマーである。
【００１４】
さらに本発明によれば、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号７に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定方法；マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号８に記載の塩基配列に含まれる少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定方法；並びに配列番号９に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号９における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定方法が提供される。ここで用いるのに特に好ましい核酸増幅用プライマーは、配列番号１２、１８又は１９に記載の塩基配列からなるプライマーである。
【００１５】
さらに本発明によれば、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、かつ配列番号２３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定方法；マイコバクテリウム・カンサシイ菌の１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列中の可変領域に対応する塩基配列から成り、配列番号２４に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも３塩基を３’末端に有する核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定方法；並びに配列番号２５に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号２５における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを用いて核酸増幅反応を行うことを含む、マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定方法が提供される。ここで用いるのに特に好ましい核酸増幅用プライマーは、配列番号２６又は２７に記載の塩基配列からなるプライマーである。
【００１６】
好ましくは、核酸増幅反応時の副反応生成物を検出することができる。
好ましくは、核酸増幅反応時の副反応生成物はピロリン酸である。
好ましくは、乾式分析素子を用いてピロリン酸の検出を行う。
【００１７】
さらに本発明によれば、配列番号３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号３における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマーが提供される。
【００１８】
さらに本発明によれば、配列番号６に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号６における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・アビウム菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマーが提供される。
【００１９】
さらに本発明によれば、配列番号９に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号９における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・イントラセルラー菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマーが提供される。
【００２０】
さらに本発明によれば、配列番号２５に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号２５における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる、マイコバクテリウム・カンサシイ菌を同定するために使用する核酸増幅用プライマーが提供される。
【００２１】
さらに本発明によれば、上記した少なくとも一種の核酸増幅用プライマー、少なくとも一種のデオキシヌクレオシド３リン酸、少なくとも一種のポリメラーゼ、及び乾式分析素子を含む、抗酸菌属検出用キットが提供される。
【発明の効果】
【００２２】
本発明によれば、抗酸菌属の細菌を迅速かつ簡便に検出または菌種同定することが可能になった。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２３】
以下、本発明の実施の形態について詳細に説明する。
本発明の抗酸菌属の検出方法は、各菌種に特異的な配列を３'末端に有するプライマーを用いることを特徴とする。本発明の方法を利用することにより、抗酸菌属を同定することが可能である。本発明の方法の好ましい形態では、各菌に特異的なプライマーを用いて核酸増幅反応を行わせ、その伸長反応の有無を検出する。検出する方法の具体例として、電気泳動、質量分析、液体クロマトグラフィー等の増幅産物を直接測定する方法や、ポリメラーゼ伸長反応の際、生成するピロリン酸を検出する方法が挙げられる。
【００２４】
本発明に係る抗酸菌属の同定方法の第一の好ましい形態を以下に説明する。
菌特異的なプライマーを配列表に示す配列の少なくとも３塩基を３'末端に含むよう設定する。プライマーを２本以上設定する場合、１本がその部位であればよい。そして、上記プライマーを用いてポリメラーゼ伸長反応を行わせる。
【００２５】
実際に伸長反応が起きたか否かは、ピロ燐酸を検出することで行うことが好ましい。より好ましくは、キサントシンまたはイノシン、ピロホスファターゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、キサンチンオキシダーゼ、ペルオキシダーゼ及び発色剤を含有する試薬層を備えることを特徴とするピロ燐酸定量用乾式分析素子を用いて、ピロ燐酸を検出することができる。このようなピロ燐酸定量用乾式分析素子を用いれば、５分で検出することが可能となる。
【００２６】
（Ａ）本発明で用いる核酸増幅用プライマー
本発明において使用する各抗酸菌に特異的と特異的なプライマーは、１６ＳｒＲＮＡ遺伝子配列の中で、各種間の遺伝子配列が異なる可変領域（およそ１３０番目から２００番目）である。本発明で使用するプライマーの好ましい塩基数は５〜６０塩基である。特に好ましくは１５〜４０塩基である。
【００２７】
さらに、本発明で使用するプライマーは、３'末端に各菌種で異なる配列を有するように設計されている。これは、プライマーの起点とする伸長反応がプライマー3'末端と鋳型のマッチングに強く依存することを利用したものである。（Kwok S. et al.:Nucleic  Acids Res 18,999-1005(1990),Huang M.M. et al.:Nucleic Acids Res. 20,4567-4573(1992)）つまり、検体の遺伝子型と一致した場合にのみ伸長反応が起きることを利用し、増幅反応が起きたか否かで細菌の同定を行う方法である。この方法に基づけば、増幅反応で菌種の区別ができ、検出にかける時間は少なくて済む。
【００２８】
本発明で用いることができる核酸増幅用プライマーのさらに好ましい例を以下に記載する。
【００２９】
マイコバクテリウム・ツベルクローシス菌の同定のための核酸増幅用プライマーとしては、配列番号３に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号３における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを使用することが好ましい。このようなプライマーの具体例としては、ataccggataggaccacg（配列番号１０）、taccggataggaccac（配列番号１４）、及びcggataggaccacgggat（配列番号２０）などが挙げられる。
【００３０】
マイコバクテリウム・アビウム菌の同定のための核酸増幅用プライマーとしては、配列番号６に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号６における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを使用することが好ましい。このようなプライマーの具体例としては、ataccggataggacctca （配列番号１１）、ataccggataggacctcaa（配列番号１５）、taccggataggacctca（配列番号１６）、taccggataggacctcaa（配列番号１７）、及びtaccggataggacctcaagac（配列番号２１）などが挙げられる。
【００３１】
マイコバクテリウム・イントラセルラー菌の同定のための核酸増幅用プライマーとしては、配列番号９に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号９における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを使用することが好ましい。このようなプライマーの具体例としては、aataccggataggaccttt（配列番号１２）、ataccggataggaccttta（配列番号１８）、taccggataggaccttta（配列番号１９）、及びataccggataggacctttagg（配列番号２２）などが挙げられる。
【００３２】
マイコバクテリウム・カンサシイ菌の同定のための核酸増幅用プライマーとしては、配列番号２５に記載の塩基配列に含まれる連続する少なくとも１５塩基以上の塩基配列であって、配列番号２５における２６番目の塩基であるＧ以降の３’側の塩基を少なくとも３塩基以上含む塩基配列からなる核酸増幅用プライマーを使用することが好ましい。このようなプライマーの具体例としては、ataccggataggaccacttg（配列番号２６）、及びtaccggataggaccacttg (配列番号２７)などが挙げられる。
【００３３】
１６ＳｒＲＮＡの可変領域を用いた、マイコバクテリウム属の細菌の検出は、例えば、特許第２６７５７２３号に示されている。しかしながら、この方法は、まず、抗酸菌属共通のプライマーで増幅した後、各菌種特異的プローブを用いてハイブリダイゼーションにより検出を行っている。この方法は、増幅と同じ時間が検出でも必要とされるとともに、操作が煩雑である。
【００３４】
（Ｂ）核酸の増幅方法
本発明の方法で行う核酸の増幅には、これまで開発されてきた各種の方法を使用することができる。本発明で用いることができる核酸増幅法としては、ＰＣＲ（特公平４−６７９６０号、特公平４−６７９５７号）、ＬＣＲ（特開平５−２９３４号）、ＳＤＡ（Strand Displacement Amplification：特開平５−１３０８７０号）、ＲＣＡ（Rolling Circle Amplification：Proc.Natl.Acad.Sci, Vol.92, 4641-4645 (1995)）、ＩＣＡＮ（Isothermal and Chimeric primer-initiated Amplification of Nucleic Acids）、ＬＡＭＰ（Loop-Mediated Isothermal Amplification of DNA；Bio Industry, 第１８巻、２号（2001））、ＮＡＳＢＡ（Nucleic acid Sequence-based Amplification method; Nature, 350, 91 (1991)）、及びＴＭＡ（Transcription mediated amplification method; J.Clin Microbiol.第31巻、3270（1993））等が挙げられる。
【００３５】
上記核酸の増幅法で最も一般的で普及している方法はＰＣＲ（ポリメラーゼチェーンリアクション）法である。ＰＣＲ法では、反応液の温度の上げ下げを周期的にコントロールすることにより、変性（核酸断片を２本鎖から１本鎖に変性する工程）→アニーリング（１本鎖に変性した核酸断片にプライマーをハイブイリダイズさせる工程）→ポリメラーゼ（ＴａｑＤＮＡポリメラーゼ）伸長反応→ディネイチャーの周期的な工程を繰り返すことで、ターゲット核酸断片の目的部分を増幅する方法である。最終的に、ターゲット核酸断片の目的部位は初期量の１００万倍にも増幅し得る。
【００３６】
ＬＣＲ（特開平５−２９３４号）は、一本鎖DNAに２本の相補的なオリゴヌクレオチドプローブ鎖をend-to-tailに結合させて、耐熱性リガーゼで２本のオリゴヌクレオチド鎖間のニックを封じる。その結合したＤＮＡ鎖が変性で遊離し、また鋳型となり、増幅するという方法である。プローブ配列を工夫し、増幅が起きたか否かでＳＮＰ判定することができる。また、ＬＣＲを改良して、２つのプライマー間にギャップを設定し、その間をポリメラーゼで埋める方法（Gap-LCR：Nucleic Acids Research、第23巻、4号、675(1995)）も開発されている。
【００３７】
ＳＤＡ（Strand Displacement Amplification：特開平５−１３０８７０号）は、エクソヌクレアーゼを用いたサイクリングアッセイ法であり、ポリメラーゼ伸長反応を利用したターゲット核酸断片の目的部位の増幅法の一つである。この方法は、ターゲット核酸断片の目的部位に特異的にハイブリダイゼーションしたプライマーを起点としたポリメラーゼ伸長反応とともに、５’→３’エクソヌクレアーゼを作用させて、プライマーを逆方向から分解する方法である。分解したプライマーの代わりに新たなプライマーがハイブリダイゼーションし、再度ＤＮＡポリメラーゼによる伸長反応が進行する。このポリメラーゼによる伸長反応と、この先に伸長した鎖を外すエクソヌクレアーゼによる分解反応が順次、周期的に繰り返される。ここで、ポリメラーゼによる伸長反応とエクソヌクレアーゼによる分解反応は等温条件で実施することが可能である。
【００３８】
ＬＡＭＰ法は、近年開発されたターゲット核酸断片の目的部位の増幅法である。この方法は、ターゲット核酸断片の少なくとも６箇所の特定部位を相補的に認識する少なくとも４種のプライマーと、５’→３’方向へのヌクレアーゼ活性がなく、かつ鋳型上の２本鎖ＤＮＡを１本鎖ＤＮＡとして遊離させながら伸長反応を触媒する鎖置換型のＢｓｔＤＮＡポリメラーゼを使用することで、等温条件でターゲット核酸断片の目的部位を、特別な構造として増幅する方法である。
【００３９】
ＩＣＡＮ法も、近年開発されたターゲット核酸断片の目的部位の増幅法である。ＲＮＡ−ＤＮＡキメラプライマー、鎖置換活性と鋳型交換活性を有するＤＮＡポリメラーゼ、ＲＮａｓｅＨを用いる等温の遺伝子増幅法である。キメラプライマーが鋳型と結合した後、ＤＮＡポリメラーゼにより相補鎖が合成される。その後、ＲＮａｓｅＨがキメラプライマー由来のＲＮＡ部分を切断し、切断部分から鎖置換反応と鋳型交換反応を伴った伸長反応が起きるこの反応が繰り返し起こることにより遺伝子が増幅される。
【００４０】
(Ｃ)検出
本発明の方法は、菌種同定を行うことが可能な核酸増幅用プライマーを用いているので、検出手段は、増幅産物量が定量できるものであれば特に制限されない。
【００４１】
検出法としては、電気泳動、液体クロマトグラフィー、質量分析計などの生成産物を直接測定する方法や、あるいはポリメラーゼ反応の結果生じるピロリン酸等を検出する方法も含まれる。定量性を考慮すれば、好ましくはピロリン酸を定量することによる検出法であり、簡便性を考慮すると、乾式分析素子を用いてピロリン酸を定量する方法がさらに好ましい。
【００４２】
従来からピロ燐酸（ＰＰｉ）の検出法としては、式１に示された方法が知られている。この方法では、ピロ燐酸（ＰＰｉ）をスルフリラーゼによりアデノシン３燐酸（ＡＴＰ）に変換し、アデノシン３燐酸がルシフェラーゼによりルシフェリンに作用して生じる発光を検出する。そのため、この方法でピロ燐酸（ＰＰｉ）を検出するには発光を測定できる装置が必要である。
【００４３】
【化１】
2006217909.tif 000002
【００４４】
本発明に適したピロ燐酸の検出方法は式２または式３に示した方法である。式２または式３に示した方法は、ピロ燐酸（ＰＰｉ）をピロホスファターゼで無機燐（Ｐｉ）に変換し、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ（ＰＮＰ）により無機燐（Ｐｉ）をキサントシンまたはイノシンと反応させ、生じたキサンチンまたはヒポキサンチンをキサンチンオキシダーゼ（ＸＯＤ）により酸化して尿酸を生成させ、この酸化過程で生じる過酸化水素（Ｈ2Ｏ2）を用いてペルオキシダーゼ（ＰＯＤ）により発色剤（色素前駆体）を発色させ、これを比色するものである。これら式２または式３に示した方法では結果を比色で検出できるため、目視または簡単な比色測定装置を用いてピロ燐酸（ＰＰｉ）の検出が可能である。
式２及び式３：
【００４５】
【化２】
2006217909.tif 000003
【００４６】
【化３】
2006217909.tif 000004
【００４７】
ピロホスファターゼ（ＥＣ３，６，１，１）プリンヌクレオシドホスホリラーゼ（ＰＮＰ，ＥＣ２．４．２．１）、キサンチンオキシダーゼ（ＸＯＤ，ＥＣ１．２．３．２）及びペルオキシダーゼ（ＰＯＤ，ＥＣ１．１１．１．７）は市販のものを使用することができる。発色剤（すなわち色素前駆体）は、過酸化水素とペルオキシダーゼ（ＰＯＤ）により色素を生成させるものであればよく、例えば、ロイコ色素の酸化によって色素を生成する組成物（例、米国特許４，０８９，７４７等に記載のトリアリールイミダゾールロイコ色素、特開昭５９−１９３３５２号公報（ＥＰ ０１２２６４１Ａ）等に記載のジアリールイミダゾーロイコ色素）；酸化されたときに他の化合物とカップリングにより色素を生成する化合物を含む組成物（例えば４−アミノアンチピリン類とフェノール類又はナフトール類）などを使用することができる。
【００４８】
(Ｄ)乾式分析素子
本発明において使用することのできる乾式分析素子は、一層または複数層の機能層からなる分析素子であって、その少なくとも一層（または複数の層に渡って）に検出試薬を含有させ、層内での反応により生じた生成色素を、分析素子の外から反射光あるいは透過光により比色定量するものである。
【００４９】
このような乾式分析素子を用いて定量分析するには、液体試料を展開層の表面に一定量点着する。展開層で展開された液体試料は試薬層に達し、ここで試薬と反応し、発色する。点着後、乾式分析素子を適当な時間、一定温度に保って（インクベーション）発色反応を充分に進行させた後、例えば透明支持体側から照明光を試薬層に照射し、特定波長域で反射光量を測定して反射光学濃度を求め、予め求めておいた検量線に基づいて定量分析を行う。
【００５０】
乾式分析素子においては、検出を行うまでは乾燥状態で貯蔵・保管されるため、試薬を用時調製する必要がなく、また一般に乾燥状態の方が試薬の安定性が高いことから、試薬溶液を用時調製しなければならないいわゆる湿式法より簡便性、迅速性に優れている。また、微量の液体試料で、精度の高い検査を迅速に行うことができる検査方法としても優れている。
【００５１】
(Ｅ)ピロ燐酸定量用乾式分析素子
本発明で使用することのできるピロ燐酸定量用乾式分析素子は、公知の多種の乾式分析素子と同様の層構成とすることができる。乾式分析素子は、前記（Ｃ）項（検出）における、式２または式３の反応を行うための試薬の他、支持体、展開層、検出層、光遮蔽層、接着層、吸水層、下塗り層その他の層を含む多重層としてもよい。このような乾式分析素子として、例えば特開昭４９−５３８８８号公報（対応米国特許３，９９２，１５８）、特開昭５１−４０１９１号公報（対応米国特許４，０４２，３３５）、及び特開昭５５−１６４３５６号公報（対応米国特許４，２９２，２７２）、特開昭６１−４９５９号公報（対応ＥＰＣ公開特許０１６６３６５Ａ）の各明細書に開示されたものがある。
【００５２】
本発明で用いることができる乾式分析素子としては、ピロ燐酸を無機燐に変換する試薬、および無機燐の量に応じた発色反応を行う試薬群を含有する試薬層を備えるピロ燐酸定量用乾式分析素子が挙げられる。
【００５３】
このピロ燐酸定量用乾式分析素子においては、ピロホスファターゼを用いて酵素的にピロ燐酸（ＰＰｉ）を無機燐（Ｐｉ）に変換するまでは本明細書中上記した通り行うことができ、それ以降は、生化学検査分野で既知の以下に述べる「無機燐の定量法」（及びそれらに用いられる各反応の組み合わせ）を用いることにより、無機燐（Ｐｉ）の量に応じた発色反応を行うことができる。
【００５４】
なお、「無機燐」を表記する場合、燐酸（燐酸イオン）として、「Ｐｉ」と表記する場合と「ＨＰＯ42-、Ｈ2ＰＯ41-」と表記する両方の場合がある。以下に示す反応の例では、「Ｐｉ」として表記するが、同じ反応式に対して「ＨＰＯ42-」と表記する場合もある。
【００５５】
無機燐の定量法としては酵素法と燐モリブテン酸塩法が知られている。以下、無機燐の定量法としての酵素法と燐モリブテン酸塩法について説明する。
【００５６】
Ａ．酵素法
Ｐｉを定量検出するための一連の反応における最後の「呈色反応」に用いる酵素に応じて、ペルオキシダーゼ（ＰＯＤ）を用いる方法とグルコース−６−燐酸デヒドロゲナーゼ（Ｇ６ＰＤＨ）を用いる方法がある。以下、これらの方法の具体例を説明する。
【００５７】
（１）ペルオキシダーゼ（ＰＯＤ）を用いる方法の例
（１−１）
無機燐（Ｐｉ）を、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ（ＰＮＰ）により、イノシンと反応させ、生じたヒポキサンチンをキサンチンオキシダーゼ（ＸＯＤ）により酸化して尿酸を生成する。この酸化過程で生じる過酸化水素（Ｈ2Ｏ2）を用いて、ペルオキシダーゼ（ＰＯＤ）により、４−アミノアンチピリン（４−ＡＡ）とフェノールとを酸化縮合させてキノンイミン色素を形成し、これを比色する。
【００５８】
（１−２）
無機燐（Ｐｉ）、コカルボキシラーゼ（ＴＰＰ）、フラビンアデニンジヌクレオチド（ＦＡＤ）、Ｍｇ2+の存在下で、ピルビン酸をピルビン酸オキシダーゼ（ＰＯＰ）により酸化してアセチル酢酸を生成する。この酸化過程で生じる過酸化水素（Ｈ2Ｏ2）を用いて、上記（１−１）の場合と同様に、ペルオキシダーゼ（ＰＯＤ）により、４−アミノアンチピリン（４−ＡＡ）とフェノールとを酸化縮合させてキノンイミン色素を形成し、これを比色する。
【００５９】
なお、上記の（１−１）および（１−２）における最後の呈色反応は、過酸化水素の検出試薬として既知の「Ｔｒｉｎｄｅｒ試薬」を使用して行うことができる。この反応で、フェノールは「水素供与体」として働く。「水素供与体」として用いるフェノールは古典的で、現在は改良された様々な「水素供与体」が使用されている。このような水素供与体の具体例としては、Ｎ−エチル−Ｎ−スルホプロピル−ｍ−アニリジン、Ｎ−エチル−Ｎ−スルホプロピルアニリン、Ｎ−エチル−Ｎ−スルホプロピル−３，５−ジメトキシアニリン、Ｎ−スルホプロピル−３，５−ジメトキシアニリン、Ｎ−エチル−Ｎ−スルホプロピル−３，５−ジメチルアニリン、Ｎ−エチル−Ｎ−スルホプロピル−ｍ−トルイジン、Ｎ−エチル−Ｎ−（２−ヒドロキシ−３−スルホプロピル）−ｍ−アニリジン、Ｎ−エチル−Ｎ−（２−ヒドロキシ−３−スルホプロピル）アニリン、Ｎ−エチル−Ｎ−（２−ヒドロキシ−３−スルホプロピル）−３，５−ジメトキシアニリン、Ｎ−（２−ヒドロキシ−３−スルホプロピル）−３，５−ジメトキシアニリン、Ｎ−エチル−Ｎ−（２−ヒドロキシ−３−スルホプロピル）−３，５−ジメチルアニリン、Ｎ−エチル−Ｎ−（２−ヒドロキシ−３−スルホプロピル）−ｍ−トルイジン、及びＮ−スルホプロピルアニリンなどが挙げられる。
【００６０】
（２）グルコース−６−燐酸デヒドロゲナーゼ（Ｇ６ＰＤＨ）を用いる方法
（２−１）
無機燐（Ｐｉ）とグリコーゲンとをホスホリラーゼを用いて反応させ、グルコース−１−燐酸（Ｇ−１−Ｐ）を生成させる。生じたグルコース−１−燐酸をホスホグルコムターゼ（ＰＧＭ）により、グルコース−６−燐酸（Ｇ−６−Ｐ）にする。グルコース−６−燐酸とニコチアミドアデニンジヌクレオチド（ＮＡＤ）との存在下、グルコース−６−燐酸デヒドロゲナーゼ（Ｇ６ＰＤＨ）により、ＮＡＤを還元してＮＡＤＨにし、これを比色する。
【００６１】
（２−２）
無機燐（Ｐｉ）とマルトースとをマルトースホスホリラーゼ（ＭＰ）を用いて反応させ、グルコース−１−燐酸（Ｇ−１−Ｐ）を反応させる。以下、上記（２−１）と同様に、生じたグルコース−１−燐酸をホスホグルコムターゼ（ＰＧＭ）により、グルコース−６−燐酸（Ｇ−６−Ｐ）にする。グルコース−６−燐酸とニコチアミドアデニンジヌクレオチド（ＮＡＤ）との存在下、グルコース−６−燐酸デヒドロゲナーゼ（Ｇ６ＰＤＨ）により、ＮＡＤを還元してＮＡＤＨにし、これを比色する。
【００６２】
Ｂ．燐モリブテン酸塩法
酸性下で無機燐（燐酸塩）と水溶性モリブテン酸イオンとを錯化させた「燐モリブテン酸塩（Ｈ3［ＰＯ4Ｍｏ12Ｏ36］）を直接定量する「直接法」と、上記直接法の反応に続いて、還元剤により、Ｍｏ（IV）からＭｏ（III）として、モリブテン青（Ｍｏ（III））を定量する「還元法」とがある。水溶性モリブテン酸イオンの例としては、モリブテン酸アルミニウム、モリブテン酸カドミウム、モリブテン酸カルシウム、モリブテン酸バリウム、モリブテン酸リチウム、モリブテン酸カリウム、モリブテン酸ナトリウム、モリブテン酸アンモニウムなどが挙げられる。還元法で使用される代表的な還元剤の例としては、１，２，４アミノナフトールスルホン酸、硫酸第一鉄アンモニウム、塩化第一鉄、塩化第一スズ−ヒドラジン、硫酸−ｐ−メチルアミノフェノール、Ｎ，Ｎ−ジメチル−フェニレンジアミン、アスコルピン酸、マラカイトグリーンなどが挙げられる。
【００６３】
光透過性水不透過性支持体を用いる場合の乾式分析素子は、実用的に次のような構成を取り得る。ただし、本発明の内容はこれに限定されない。
(１)  支持体上に試薬層を有するもの。
(２)  支持体上に検出層、試薬層をこの順に有するもの。
(３)  支持体上に検出層、光反射層、試薬層をこの順に有するもの。
(４)  支持体上に第２試薬層、光反射層、第１試薬層をこの順に有するもの。
(５)  支持体上に検出層、第２試薬層、光反射層、第１試薬層をこの順に有するもの。
【００６４】
上記（１）ないし（３）において試薬層は異なる複数の層から成ってもよい。例えば第１試薬層には、式２または式３に示すピロホスファターゼ反応に必要な酵素ピロホスファターゼ、ＰＮＰ反応に必要な基質キサントシンまたは基質イノシンと酵素ＰＮＰを、第２試薬層には、式２または式３に示すＸＯＤ反応に必要な酵素ＸＯＤを、そして第３試薬層には、式２または式３に示すＰＯＤ反応に必要な酵素ＰＯＤと発色色素（色素前駆体）を、それぞれ含有させてもよい。あるいは試薬層を２層として、第１試薬層ではピロホスファターゼ反応とＰＮＰ反応を、第２試薬層ではＸＯＤ反応とＰＯＤ反応を進行させてもよい。又は、第１試薬層ではピロホスファターゼ反応とＰＮＰ反応とＸＯＤ反応を、第２試薬層でＰＯＤ反応を進行させてもよい。
【００６５】
なお支持体と試薬層又は検出層との間には吸水層を設けてもよい。また各層の間には濾過層を設けてもよい。また試薬層の上には展開層を設けてもよく、その間に接着層を設けてもよい。
【００６６】
支持体は光不透過性（不透明）、光半透過性（半透明）、光透過性（透明）のいずれのものも用いることができるが、一般的には光透過性で水不透過性の支持体が好ましい。光透過性水不透過性支持体の材料として好ましいものはポリエチレンテレフタレート、ポリスチレンである。親水性層を強固に接着させるため通常、下塗り層を設けるか、親水化処理を施す。
【００６７】
試薬層として多孔性層を用いる場合、その多孔性媒体は繊維質であってもよいし、非繊維質であってもよい。繊維質材料としては、例えば濾紙、不織布、織物布地（例えば平織り布地）、編物布地（例えばトリコット編物布地）、ガラス繊維濾紙等を用いることができる。非繊維質材料としては特開昭４９−５３８８８号公報等に記載の酢酸セルロースなどからなるメンブランフイルター、特開昭４９−５３８８８号公報、特開昭５５−９０８５９号公報（対応米国特許４，２５８，００１）特開昭５８−７０１６３号公報（対応米国特許４，４８６，５３７）等に記載の無機物又は有機物微粒子からなる連続空隙含有粒状構造物層等のいずれでもよい。特開昭６１−４９５９号公報（対応欧州公開ＥＰ ０１６６３６５Ａ）、特開昭６２−１１６２５８号公報、特開昭６２−１３８７５６号公報（対応欧州公開ＥＰ ０２２６４６５Ａ）、特開昭６２−１３８７５７号公報（対応欧州公開ＥＰ ０２２６４６５Ａ）、特開昭６２−１３８７５８号公報（対応欧州公開ＥＰ ０２２６４６５Ａ）等に記載の部分接着された複数の多孔性層の積層物も好適である。
【００６８】
多孔性層は、供給される液体の量にほぼ比例した面積に液体を展開する、いわゆる計量作用を有する展開層であってもよい。展開層としては、これらのうち織物布地、編物布地などが好ましい。織物布地などは特開昭５７−６６３５９号公報に記載されたようなグロー放電処理をしてもよい。展開層には、展開面積、展開速度等を調節するため特開昭６０−２２２７７０号公報（対応：ＥＰ ０１６２３０１Ａ）、特開昭６３−２１９３９７号公報（対応西独特許公開ＤＥ ３７１７９１３Ａ）、特開昭６３−１１２９９９号公報（対応：ＤＥ ３７１７９１３Ａ）、特開昭６２−１８２６５２号公報（対応：ＤＥ ３７１７９１３Ａ）に記載したような親水性高分子あるいは界面活性剤を含有させてもよい。
【００６９】
例えば紙、布、高分子からなる多孔質膜等に本発明の試薬を予め含浸又は塗布した後、支持体上に設けた他の水浸透性層、例えば検出層の上に、特開昭５５−１６４５３５６号公報のような方法で接着させるのも有用な方法である。
【００７０】
こうして作られる試薬層の厚さは特に制限されないが、塗布層として設ける場合には、１μｍ〜５０μｍ程度、好ましくは２μｍ〜３０μｍの範囲が適当である。ラミネートによる積層など、塗布以外の方法による場合、厚さは数十μmから数百μmの範囲で大きく変化し得る。
【００７１】
親水性ポリマーバインダーからなる水浸透性層で試薬層を構成する場合、使用できる親水性ポリマーとしては、例えば、以下のものがある。ゼラチン及びこれらの誘導体（例えばフタル化ゼラチン）、セルロース誘導体（例えばヒドロキシエチルセルロース）、アガロース、アルギン酸ナトリウム、アクリルアミド共重合体やメタアクリルアミド共重合体（例えば、アクリルアミド又はメタアクリルアミドと各種ビニル性モニマーとの共重合体）、ポリヒドロキシエチルメタクリレート、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリアクリル酸ナトリウム、アクリル酸と各種ビニル性モノマーとの共重合体などである。
【００７２】
親水性ポリマーバインダーで構成される試薬層は、特公昭５３−２１６７７号公報（対応米国特許３，９９２，１５８）、特開昭５５−１６４３５６号公報（対応米国特許４，２９２，２７２）、特開昭５４−１０１３９８号公報（対応米国特許４，１３２，５２８）等の明細書に記載の方法に従って本発明の試薬組成物と親水性ポリマーを含む水溶液又は水分散液を支持体又は検出層等の他の層の上に塗布し乾燥することにより設けることができる。親水性ポリマーをバインダーとする試薬層の乾燥時の厚さは約２μｍ〜約５０μｍ、好ましくは約４μｍ〜約３０μｍの範囲、被覆量では約２ｇ／ｍ2〜約５０ｇ／ｍ2、好ましくは約４ｇ／ｍ2〜約３０ｇ／ｍ2の範囲である。
【００７３】
試薬層には式２または式３の試薬組成物の他に、塗布特性、拡散性化合物の拡散性、反応性、保存性等の諸性能の向上を目的として、酵素の活性化剤、補酵素、界面活性剤、ｐＨ緩衝剤組成物、微粉末、酸化防止剤、その他、有機物あるいは無機物からなる各種添加剤を加える事ができる。試薬層に含有させることができる緩衝剤はの例としては、日本化学学会編「化学便覧  基礎」（丸善(株)、１９６６年発行）１３１２−１３２０頁、Ｒ．Ｍ．Ｃ．Ｄａｗｓｏｎ ｅｔ ａｌ編、「Ｄａｔａ ｆｏｒ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ」第２版（Ｏｘｆｏｒｄ ａｔ ｔｈｅ Ｃｌａｒｅｎｄｏｎ Ｐｒｅｓｓ，１９６９年発行）４７６−５０８頁、「Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ」５，４６７−４７７頁（１９６６年）、「Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ」１０４，３００−３１０頁（１９８０年）に記載のｐＨ緩衝剤系がある。ｐＨ緩衝剤系の具体例として硼酸塩を含む緩衝剤；クエン酸又はクエン酸塩を含む緩衝剤；グリシンを含む緩衝剤；ビシン（Ｂｉｃｉｎｅ）を含む緩衝剤；ＨＥＰＥＳを含む緩衝剤；ＭＥＳを含む緩衝剤などのグッド緩衝剤等がある。なお燐酸塩を含む緩衝剤は、ピロ燐酸検出用乾式分析素子に使用することはできない。
【００７４】
本発明で使用することのできる、ピロ燐酸定量用乾式分析素子は前述の諸特許明細書に記載の公知の方法により調製することができる。ピロ燐酸定量用乾式分析素子は一辺約５ｍｍから約３０ｍｍの正方形またはほぼ同サイズの円形等の小片に裁断し、特公昭５７−２８３３３１号公報（対応米国特許４，１６９，７５１）、実開昭５６−１４２４５４号公報（対応米国特許４，３８７，９９０）、特開昭５７−６３４５２号公報、実開昭５８−３２３５０号公報、特表昭５８−５０１１４４号公報（対応国際公:ＷＯ０８３／００３９１）等に記載のスライド枠に収めて化学分析スライドとして用いることが製造，包装，輸送，保存，測定操作等の観点で好ましい。使用目的によっては、長いテープ状でカセットまたはマガジンに収めて用いたり、又は小片を開口のある容器内に収めて用いたり、又は小片を開口カードに貼付または収めて用いたり、あるいは裁断した小片をそのまま用いることなどもできる。
【００７５】
本発明で使用することのできるピロ燐酸定量用乾式分析素子は前述の諸特許明細書等に記載の操作と同様の操作により液体試料中の被検物であるピロ燐酸の定量検出ができる。例えば約２μＬ〜約３０μＬ、好ましくは４μＬ〜１５μＬの範囲の水性液体試料液を試薬層に点着する。点着した分析素子を約２０℃〜約４５℃の範囲の一定温度で、好ましくは約３０℃〜約４０℃の範囲内の一定温度で１〜１０分間インキュベーションする。分析素子内の発色又は変色を光透過性支持体側から反射測光し、予め作成した検量線を用いて比色測定法の原理により検体中のピロ燐酸の量を求めることができる。点着する液体試料の量、インキュベーション時間及び温度を一定にすることにより定量分析を高精度に実施できる。
【００７６】
測定操作は特開昭６０−１２５５４３号公報、特開昭６０−２２０８６２号公報、特開昭６１−２９４３６７号公報、特開昭５８−１６１８６７号公報（対応米国特許４，４２４，１９１）などに記載の化学分析装置により極めて容易な操作で高精度の定量分析を実施できる。なお、目的や必要精度によっては目視により発色の度合いを判定して、半定量的な測定を行ってもよい。
【００７７】
本発明で使用することのできる、ピロ燐酸定量乾式分析素子においては、分析を行うまでは乾燥状態で貯蔵・保管されるため、試薬を用時調製する必要がなく、また一般に乾燥状態の方が試薬の安定性が高いことから、試薬溶液を用時調製しなければならないいわゆる湿式法より簡便性、迅速性に優れている。また、微量の液体試料で、精度の高い検査を迅速に行うことができる検査方法としても優れている。
【００７８】
本発明の第二の形態において使用することのできる無機燐定量用乾式分析素子は、前記のピロ燐酸定量乾式分析素子における試薬層からピロホスファターゼを除くことで調製することができる。また、特開平７−１９７号公報に記載の乾式分析素子を使用することも可能である。無機燐定量用乾式分析素子は、試薬層にピロホスファターゼを含有しない以外は、その層構成、製造方法、使用方法において、前記ピロ燐酸定量乾式分析素子と同様である。
以下の実施例により本発明をさらに詳細に説明する。しかしながら、本発明は実施例によって限定されるものではない。
【実施例】
【００７９】
実施例１：ピロリン酸スライドを用いた抗酸菌属の検出（培養菌株を用いた性能確認）
(１)試料の調製
既に菌種が、Mycobacterium tuberculosis（Mtb）、Mycobacterium avium(Ma)、Mycobacterium intracellulare（Mi）と同定されている培養菌サンプルを準備し、集菌洗浄後、Ｒ．Ｂｏｏｍらの方法（Journal of Clinical Microbiology 28巻3号495頁(1990)）に従って、ゲノムDNAを抽出した。
【００８０】
（２）PCR増幅反応
上記（１）で調製したＤＮＡ溶液を用いて、以下の条件でＰＣＲ増幅反応を行った。
＜プライマ−＞
t2（upper：Ｍtb検出用）：５'-ataccggataggaccacg-３' （配列番号１０）
a2 (upper: Ｍa検出用) ：５'-ataccggataggacctca-３'  （配列番号１１）
i2（upper:Ｍi検出用） : ５'-aataccggataggaccttt-３'（配列番号１２）
M2 (lower:3菌種共通)  ：５'-tgcttcttctccacctacc-３'（配列番号１３）
各菌検出用プライマーと検体を以下の表１に記載の組み合わせでＰＣＲ反応を行った。
【００８１】
【表１】
2006217909.tif 000005
【００８２】
上記、系列１（(1)〜(3)、(5)〜(7)、(9)〜(11)）および系列２（(4)、(8)、(12)）は、以下の表２に示す反応液の組成で、[デネイチャ−：９４℃・１５秒、アニ−リング：６３℃・３０秒、ポリメラ−ゼ伸長反応：７２℃・３０秒]を４０サイクル繰り返すことでＰＣＲ増幅反応を実施した。
【００８３】
【表２】
2006217909.tif 000006
【００８４】
(３)  ピロ燐酸定量用乾式分析素子の作製
ゼラチン下塗層が設けられている厚さ１８０μmの無色透明ポリエチレンテレフタレ−ト（ＰＥＴ）平滑フイルムシ−ト（支持体）上に下記の表３に記載の組成（ａ）の水溶液を、以下の被覆率となるように塗布し、乾燥して試薬層を設けた。
【００８５】
【表３】
2006217909.tif 000007
【００８６】
この試薬層の上に下記の表４に記載の組成（ｂ）の接着層水溶液を以下の被覆率となるように塗布し、乾燥して接着層を設けた。
【００８７】
【表４】
2006217909.tif 000008
【００８８】
次いで接着層の上に３０ｇ／ｍ2の割合で水を全面に供給してゼラチン層を膨潤させ、その上に純ポリエステル製のブロ−ド織物布地をほぼ一様に軽く圧力をかけてラミネートして多孔性展開層を設けた。
【００８９】
次にこの展開層の上から下記の表５に記載の組成（ｃ）の水溶液を以下の被覆率となるようにほぼ均一塗布し、乾燥させ、１３ｍｍ×１４ｍｍに裁断し、プラスチック製マウント材内に収めることで、ピロ燐酸定量用乾式分析素子を作成した。
【００９０】
【表５】
2006217909.tif 000009
【００９１】
(４)  ピロ燐酸定量用分析素子を用いた検出
前記（２）におけるＰＣＲ増幅反応後の溶液をそのまま、上記（３）で製作したピロ燐酸定量用乾式分析素子上に各々２０μＬ点着し、ピロ燐酸定量用乾式分析素子を３７℃にて５分間インキュベ−ション後、波長６５０ｎｍにて支持体側から測定して得られた５分後の反射光学濃度（ＯＤR）、及び、あらかじめ作成してあった反射光学濃度をピロリン酸濃度に読み替える検量線を用いてピロリン酸濃度（ｍＭ）に読み替えた数値を表６に示した。
【００９２】
【表６】
2006217909.tif 000010
【００９３】
表６の下線部分の結果から分かるように、各抗酸菌を検出するプライマーを用いて、各菌由来のゲノムをＰＣＲ増幅反応を行い、そのＰＣＲ増幅反応後の溶液をそのまま用いて、生成したピロ燐酸をピロ燐酸定量用乾式分析素子を用いて反射光学濃度（ＯＤR）として測定することにより、各菌種検出用プライマーからその対応する菌のみを特異的に検出することができた。
【００９４】
実施例２：ピロリン酸スライドを用いた抗酸菌属の検出（培養菌株を用いた性能確認）
（１）試料の調製
既に菌種が、Ｍ．tubeclosis（Mtb）、Ｍ．avium(Ma)、Ｍ.intaracellulare（Mi）、Ｍ．kansasii（Mk）と同定されている培養菌サンプルを準備し、集菌洗浄後、Ｒ．Ｂｏｏｍらの方法（Journal of Clinical Microbiology 28巻3号495頁(1990)）に従って、ゲノムDNAを抽出した。
【００９５】
（２）PCR増幅反応
上記（１）で調製したＤＮＡ溶液を用いて、以下の条件でＰＣＲ増幅反応を行った。
＜プライマー＞
k（upper：Ｍk検出用）：５'- ataccggataggaccacttg -３'（配列番号２６）
M5 (lower)           ：５'- cgtcctgtgcatgtcaaa -３'（配列番号２８）
【００９６】
各菌検出用プライマーと検体を以下の組み合わせでＰＣＲ反応を行った。
【００９７】
【表７】
2006217909.tif 000011
【００９８】
上記、（１）〜（５）は、以下に示す反応液の組成で、[デネイチャ−：９４℃・１５秒、アニ−リング：６３℃・３０秒、ポリメラ−ゼ伸長反応：７２℃・３０秒]を４０サイクル繰り返すことでＰＣＲ増幅反応を実施した。
【００９９】
【表８】
2006217909.tif 000012
【０１００】
(３)  ピロ燐酸定量用乾式分析素子の作製
ゼラチン下塗層が設けられている厚さ１８０μmの無色透明ポリエチレンテレフタレ−ト（ＰＥＴ）平滑フイルムシ−ト（支持体）上に表９記載の組成（ａ）の水溶液を、以下の被覆率となるように塗布し、乾燥して試薬層を設けた。
【０１０１】
【表９】
2006217909.tif 000013
【０１０２】
この試薬層の上に下記の表１０記載の組成（ｂ）の接着層水溶液を以下の被覆率となるように塗布し、乾燥して接着層を設けた。
【０１０３】
【表１０】
2006217909.tif 000014
【０１０４】
次いで接着層の上に３０ｇ／ｍ2の割合で水を全面に供給してゼラチン層を膨潤させ、その上に純ポリエステル製のブロ−ド織物布地をほぼ一様に軽く圧力をかけてラミネートして多孔性展開層を設けた。
【０１０５】
次にこの展開層の上から下記の表１１記載の組成（ｃ）の水溶液を以下の被覆率となるようにほぼ均一塗布し、乾燥させ、１３ｍｍ×１４ｍｍに裁断し、プラスチック製マウント材内に収めることで、ピロ燐酸定量用乾式分析素子を作成した。
【０１０６】
【表１１】
2006217909.tif 000015
【０１０７】
(４)  ピロ燐酸定量用分析素子を用いた検出
前記（２）におけるＰＣＲ増幅反応後の溶液をそのまま、上記（３）で製作したピロ燐酸定量用乾式分析素子上に各々２０μＬ点着し、ピロ燐酸定量用乾式分析素子を３７℃にて５分間インキュベ−ション後、波長６５０ｎｍにて支持体側から測定して得られた５分後の反射光学濃度（ＯＤR）及び、あらかじめ作成してあった反射光学濃度をピロリン酸濃度に読み替える検量線を用いてピロリン酸濃度（ｍＭ）に読み替えた数値を表１２に示した。
【０１０８】
【表１２】
2006217909.tif 000016
【０１０９】
実施例２の結果より、カンサシ菌を検出するプライマーを用いて、各菌由来のゲノムをＰＣＲ増幅反応を行い、そのＰＣＲ増幅反応後の溶液をそのまま用いて、生成したピロ燐酸を、ピロ燐酸定量用乾式分析素子を用いて反射光学濃度（ＯＤR）として測定することで、カンサシ菌種検出用プライマーからカンサシ菌のみを特異的に検出できることがわかる。
【配列表フリーテキスト】
【０１１０】
SEQUENCE LISTING
<110> Fuji Photo Film Co.Ltd.,
<120> A method for detection of Mycobacterium spp and a kit therefor
<130> A51317A
<160> 28
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<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
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gataggacca cgggatgcat gtcttgtggt ggaaagcgct ttag                    44
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<211> 18
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 2
acgggatgca tgtcttgt                                                 18
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<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 3
gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gaccacggga tgcatgtctt gtggtggaaa   60
gcgctttag                                                           69
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<212> DNA
<213> Mycobacterium avium
<400> 4
gataggacct caagacgcat gtcttctggt ggaaagcttt tg                      42
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<211> 42
<212> DNA
<213> Mycobacterium avium
<400> 5
tcaagacgca tgtcttct                                                 18
<210> 6
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<212> DNA
<213> Mycobacterium avium
<400> 6
gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gacctcaaga cgcatgtctt ctggtggaaa   60
gcttttg                                                             67
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<212> DNA
<213> Mycobacterium intracellulare
<400> 7
gataggacct ttaggcgcat gtctttaggt ggaaagcttt tg                      42
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<212> DNA
<213> Mycobacterium intracellulare
<400> 8
tttaggcgca tgtcttta                                                 18
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<212> DNA
<213> Mycobacterium intracellulare
<400> 9
gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gacctttagg cgcatgtctt taggtggaaa   60
gcttttg                                                             67
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<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 10
ataccggata ggaccacg                                                 18
<210> 11
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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ataccggata ggacctca                                                 18
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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aataccggat aggaccttt                                                19
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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tgcttcttct ccacctacc                                                19
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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taccggatag gaccac                                                   16
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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ataccggata ggacctcaa                                                19
<210> 16
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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taccggatag gacctca                                                  17
<210> 17
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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taccggatag gacctcaa                                                 18
<210> 18
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
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ataccggata ggaccttta                                                19
<210> 19
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 19
taccggatag gaccttta                                                 18
<210> 20
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 20
cggataggac cacgggat                                                 18
<210> 21
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 21
taccggatag gacctcaaga c                                             21
<210> 22
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 22
ataccggata ggacctttag g                                             21
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<212> DNA
<213> Mycobacterium kansasii
<400> 23
gataggacca cttggcgcat gccttgtggt ggaaagcttt tgcgg                   45
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<211> 18
<212> DNA
<213> Mycobacterium kansasii
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acttggcgca tgccttgt                                                 18
<210> 25
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<212> DNA
<213> Mycobacterium kansasii
<400> 25
gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gaccacttgg cgcatgcctt gtggtggaaa   60
gcttttgcgg                                                          70
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 26
ataccggata ggaccacttg                                               20
<210> 27
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 27
taccggatag gaccacttg                                                19
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220> 
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
<400> 28
cgtcctgtgc atgtcaaa                                                 18