(57)【要約】  本発明は、インフルエンザワクチン、特に鳥インフルエンザワクチン（ＡＩＶ）に関するものである。本発明は、特異的な相同性を有し、ワクチン組成物を調製するのに用いられる公知のＨＡ１ポリペプチドを発現するトランスジェニック植物細胞を調製するための方法、ならびに個々の動物、哺乳動物またはヒトにおける感染防御免疫を誘導するための方法を含む。【特許請求の範囲】
【請求項１】
動物またはヒトにおける鳥インフルエンザウイルス（ＡＩＶ）株に対する免疫防御応答を誘導する方法であって；
ａ）植物細胞において、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドを含むＤＮＡ配列を発現させ；
ｂ）前記植物細胞で発現される公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドを用いてワクチン組成物を調製し；次いで、
ｃ）前記ワクチン組成物を動物またはヒトに投与して、感染防御免疫応答を前記動物またはヒトにおいて誘導すること
を含む方法。
【請求項２】
植物で作成されたＡＩＶワクチンを調製するための方法であって；
ａ）植物細胞を、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む組み換えベクターで形質転換させ；
ｂ）前記植物細胞を該公知のポリペプチドの発現に適切な条件下で培養し；
ｃ）該公知のポリペプチドを回収し；次いで
ｄ）該公知のポリペプチドを医薬上許容される賦形剤および希釈剤と混合すること
を含む方法。
【請求項３】
誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のヘマグルチニン１（ＨＡ１）可変領域ポリペプチドを含む植物で作成されたＡＩＶワクチンであって、該植物で作成されたワクチンの動物またはヒトへの投与が、前記約７０％から約９０％相同性である誘発株に対する前記動物またはヒトの感染防御免疫応答を誘発する、植物で作成されたＡＩＶワクチン。
【請求項４】
前記公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドが、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに少なくとも７０％の相同性であって、８７．０％、８６．５％、８６．０％、８５．５％、８５．０％、８４．５％、８４．０％、８３．５％、８３．０％、８２．５％、８２．０％、８１．５％、８１．０％、８０．５％、８０．０％、７９．５％、７９．０％、７８．５％、７８．０％、７７．５％、７７．０％、７６．５％、７６．０％、７５．５％、７５．０％、７４．５％、７４．０％、７３．５％、７３．０％、７２．５％、７２．０％、７１．５％または７１．０％より低い相同性を有する、請求項１または２記載の方法。
【請求項５】
前記公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドが、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％ないし約７１．０％、７１．５％、７２．０％、７２．５％、７３．０％、７３．５％、７４．０％、７４．５％、７５．０％、７５．５％、７６．０％、７６．５％、７７．０％、７７．５％、７８．０％、７８．５％、７９．０％、７９．５％、８０．０％、８０．５％、８１．０％、８１．５％、８２．０％、８２．５％、８３．０％、８３．５％、８４．０％、８４．５％、８５．０％、８５．５％、８６．０％、８６．５％または８７．０％の間の相同性を有する、請求項１または２記載の方法。
【請求項６】
前記公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドが、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに７０％ないし７１．０％、７１．５％、７２．０％、７２．５％、７３．０％、７３．５％、７４．０％、７４．５％、７５．０％、７５．５％、７６．０％、７６．５％、７７．０％、７７．５％、７８．０％、７８．５％、７９．０％、７９．５％、８０．０％、８０．５％、８１．０％、８１．５％、８２．０％、８２．５％、８３．０％、８３．５％、８４．０％、８４．５％、８５．０％、８５．５％、８６．０％、８６．５％または８７．０％の間の相同性を有する、請求項１または２記載の方法。
【請求項７】
前記公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドが、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに少なくとも７０％の相同性であって、８７．０％、８６．５％、８６．０％、８５．５％、８５．０％、８４．５％、８４．０％、８３．５％、８３．０％、８２．５％、８２．０％、８１．５％、８１．０％、８０．５％、８０．０％、７９．５％、７９．０％、７８．５％、７８．０％、７７．５％、７７．０％、７６．５％、７６．０％、７５．５％、７５．０％、７４．５％、７４．０％、７３．５％、７３．０％、７２．５％、７２．０％、７１．５％または７１．０％より低い相同性を有する、請求項３記載の植物で作成されたＡＩＶワクチン。
【請求項８】
前記公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドが、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％ないし約７１．０％、７１．５％、７２．０％、７２．５％、７３．０％、７３．５％、７４．０％、７４．５％、７５．０％、７５．５％、７６．０％、７６．５％、７７．０％、７７．５％、７８．０％、７８．５％、７９．０％、７９．５％、８０．０％、８０．５％、８１．０％、８１．５％、８２．０％、８２．５％、８３．０％、８３．５％、８４．０％、８４．５％、８５．０％、８５．５％、８６．０％、８６．５％または８７．０％の間の相同性を有する、請求項３記載の植物で作成されたＡＩＶワクチン。
【請求項９】
前記公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドが、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに７０％ないし７１．０％、７１．５％、７２．０％、７２．５％、７３．０％、７３．５％、７４．０％、７４．５％、７５．０％、７５．５％、７６．０％、７６．５％、７７．０％、７７．５％、７８．０％、７８．５％、７９．０％、７９．５％、８０．０％、８０．５％、８１．０％、８１．５％、８２．０％、８２．５％、８３．０％、８３．５％、８４．０％、８４．５％、８５．０％、８５．５％、８６．０％、８６．５％または８７．０％の間の相同性を有する、請求項３記載の植物で作成されたＡＩＶワクチン。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２００６年４月２１日付提出の米国仮出願第60/793,804号の利益を主張し、全ての図面、表およびアミノ酸もしくは核酸配列を含むその全体を出典明示により本明細書に援用する。
【背景技術】
【０００２】
ベトナムＨ５Ｎ１株由来のヘマグルチニン（ＨＡ）について公表された配列の最近の研究は、これらの高い病原性株がこれまで観察されたものよりより可変的であることを示す。それゆえ、誘発株に対して９０％より低い相同性を有するワクチンが症状をコントロールするか、または流出を減少させるのに有効であることは期待されていなかった。
【０００３】
我々は、完全アミノ酸配列の公表記録を検討し、Ｈ５血清型におけるヘマグルチニン（ＨＡ）ウイルスタンパク質のＨＡ１フラグメントの配列相同性が、アミノ酸レベルにおいて、シチメンチョウウィスコンシン（Ｔｕｒｋｅｙ  Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ）６８株に対して１００から８３％の相同性であることを見出した。Ｓｗａｙｎｅｒらによる最近の文献（Vet Micro, 2000, 74:165-172）では、鶏痘により運搬されるＨＡに基づいたＡＩＶワクチンが、免疫ワクチンと比較して８７％またはそれ以上のアミノ酸相同性を有するＨＡ１を含有したＡＩＶ株を用いた異型誘発実験において、感染を予防できることが示された。著者らは、「病原性ＨＡ１に対して９０％未満の相同性を有するワクチンが、ＡＩ誘発における不合理な減少または気道からのウイルス流出の減少を引き起こす可能性が最も高い。」と結論付ける。
【０００４】
本発明の簡単な要約
本発明は、動物または人において鳥インフルエンザウイルス（ＡＩＶ）株に対する免疫感染防御応答を誘導する方法であって；
ａ）植物細胞において、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドを含む核酸配列を発現させ；
ｂ）前記植物細胞で発現された公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドを用いてワクチン組成物を調製し、次いで；
ｃ）前記ウイルス組成物を動物またはヒトに投与して、感染防御免疫を前記動物またはヒトにおいて誘導すること
を含む方法を提供する。
【０００５】
本発明は、さらに、前記方法を実施するためのベクター、宿主細胞、および新規ワクチン組成物を提供する。かかるワクチン組成物は、動物または人に投与される場合、誘発株と比較して９０％より低い相同性レベルで感染防御免疫を提供する植物で作成された公知のＨＡ１ポリペプチド配列を含む。
【０００６】
配列の簡単な説明
インフルエンザＡ／シチメンチョウ／ウィスコンシン／６８配列の鳥インフルエンザＨＡタンパク質が以下に示される。このＨＡタンパク質は、５６８アミノ酸を含み、シグナルペプチド（アミノ酸１−１６）；フラグメントＨ１の可変先端領域（アミノ酸１７−３２３［本明細書ではＨＡ１とも称される］）；フラグメントＨ２の定常基部領域（アミノ酸３２４−５２７）；膜貫通ドメイン（アミノ酸５２８−５５７）；および細胞内チオエステル脂質フラグメント（アミノ酸５５８−５６８）を含む５個の異なるドメインを示す。
【０００７】
全長配列および上記の同定されたフラグメントは以下に示される：
全長鳥インフルエンザＨＡタンパク質（配列番号：１）：
MERIVIALAIISVVKGDQICIGYHANNSTKQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKEHNGKLCSLKGVRPLILKDCSVAGWLLGNPMCDEFLNVPEWSYIVEKDNPTNGLCYPGDFNDYEELKYLMSNTNHFEKIQIIPRNSWSNHDASSGVSSACPYNGRSSFFRNVVWLIKKSNAYPTIKRTYNNTNVEDLLILWGIHHPNDAAEQTELYQNSNTYVSVGTSTLNQRSIPEIATRPKVNGQSGRIEFFWTILRPNDAISFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSAIMRSELEYGNCDTKCQTPVGAINSSMPFHNVHPLTIGECPKYVKSDKLVLATGLRNVPQRETRGLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGITNKVNSIIDKMNTQFEAVGKEFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSYVKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTYDYPQYSEESRLNREEIDGVKLESMGTYQILSIYSTVASSLALAIMVAGLSF WMCSNGSLQCRICI；
シグナルペプチド（配列番号：２）：MERIVIALAIISVVKG；
Ｈ１可変先端領域フラグメント（ＨＡ１）（配列番号：３）：
DQICIGYHANNSTKQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKEHNGKLCSLKGVRPLILKDCSVAGWLLGNPMCDEFLNVPEWSYIVEKDNPTNGLCYPGDFNDYEELKYLMSNTNHFEKIQIIPRNSWSNHDASSGVSSACPYNGRSSFFRNVVWLIKKSNAYPTIKRTYNNTNVEDLLILWGIHHPNDAAEQTELYQNSNTYVSVGTSTLNQRSIPEIATRPKVNGQSGRIEFFWTILRPNDAISFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSAIMRSELEYGNCDTKCQTPVGAINSSMPFHNVHPLTIGECPKYVKSDKLVLATGLRNVPQRETR；
Ｈ２基部定常フラグメント（配列番号：４）：
GLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGITNKVNSIIDKMNTQFEAVGKEFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSYVKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTYDYPQYSEESRLNREEIDGVKLESMGTY；
膜貫通アンカー（配列番号：５）：QILSIYSTVASSLALAIMVAGLSFWMCS；および
細胞内チオエステル脂質フラグメント（配列番号：６）：NGSLQCRICI。
【０００８】
別の鳥インフルエンザＨＡタンパク質配列、Ａ／マガモ（Ｍａｌｌａｒｄ  Ｄｕｃｋ）／ペンシルバニア／１０２１８／８４（Ｈ５Ｎ２；受託番号ＡＡＦ０４７２０）が以下に示される。全長配列および上記の同定されたフラグメントが以下に示される：
全長ＨＡタンパク質（配列番号：７）：
MERIVIALAIISVVKGDQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKEHNGKLCSLKGVRPLILKDCSVAGWLLGNPMCDEFLNVPEWSYIVEKDNPVNGLCYPGDFNDYEELKHLMSSTNHFEKIQIIPRSSWSNHDASSGVSSACPYNGRSSFFRNVVWLIKKNNAYPTIKRTYNNTNVEDLLILWGIHHPNDATEQTKLYQNSNTYVSVGTSTLNQRSIPEIATRPKVNGQSGRMEFFWTILRPNDAISFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSAIMKSELEYGNCNTKCQTPVGAINSSMPFHNVHPLTIGECPKYVKSDKLVLATGLRNVPQRETRGLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGITNKVNSIIDKMNTQFEVVGKEFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVRNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTYDYPQYSEESRLNREEIDGVKLESMGTYQILSIYSTVASSLALAIMVAGLSFWMCSNGSLQCRICI；
シグナルペプチド（配列番号：８）：MERIVIALAIISVVKG；
Ｈ１可変先端領域フラグメント（ＨＡ１）（配列番号：９）：
DQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKEHNGKLCSLKGVRPLILKDCSVAGWLLGNPMCDEFLNVPEWSYIVEKDNPVNGLCYPGDFNDYEELKHLMSSTNHFEKIQIIPRSSWSNHDASSGVSSACPYNGRSSFFRNVVWLIKKNNAYPTIKRTYNNTNVEDLLILWGIHHPNDATEQTKLYQNSNTYVSVGTSTLNQRSIPEIATRPKVNGQSGRMEFFWTILRPNDAISFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSAIMKSELEYGNCNTKCQTPVGAINSSMPFHNVHPLTIGECPKYVKSDKLVLATGLRNVPQRETR；
Ｈ２基部定常フラグメント（配列番号：１０）：
GLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGITNKVNSIIDKMNTQFEVVGKEFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFH
DSNVRNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDNECMESVRNGTY；
膜貫通アンカー（配列番号：１１）：QILSIYSTVASSLALAIMVAGLSF；および
細胞内チオエステル脂質フラグメント（配列番号：１２）：NGSLQCRICI。
【０００９】
発明の詳細な開示
従来のワクチンに対する期待は、それらがワクチンを調製するのに用いられるポリペプチド配列と比較して９０％から１００％相同であるインフルエンザ株由来の感染からの保護を提供することである。植物で作成されたワクチンの場合、約７０％から約９０％の間の相同性を有するより広い範囲のインフルエンザ株をコントロールする予想外の特性は、結果としてより異なるインフルエンザ型をコントロールし、ワクチンの効果を改善させる能力を生じる。
【００１０】
植物で作成されたワクチンのサブユニット抗原は、それらが植物の膜の細胞マトリックスおよび炭水化物成分に組み込まれてアジュバント特性が提供されることから、慣用的に調製されたサブユニット抗原より優れていると考えられる。植物で作成された抗原はまた、非植物で作成された抗原と比較してユニークな植物炭水化物糖鎖付加パターンを含む。
【００１１】
かかる植物のグリカン構造が干渉効果の増大に寄与し、植物細胞または植物細胞マトリックス成分から完全に精製されていない抗原の使用がまた、本明細書で開示されるＨＡ１ポリペプチドに約９０％から約７０％の間の相同性を有するＡＩＶによる感染から個体を保護する能力に一部関連すると考えられる。認識されるごとく、約７０．０％および約９０．０％の間の相同性のパーセンテージが、特に本発明により意図される。それゆえ、公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドは、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに少なくとも７０％の相同性であって、Ｙ％より低い相同性を有することができ、ここで、Ｙは、８７．０％、８６．５％、８６．０％、８５．５％、８５．０％、８４．５％、８４．０％、８３．５％、８３．０％、８２．５％、８２．０％、８１．５％、８１．０％、８０．５％、８０．０％、７９．５％、７９．０％、７８．５％、７８．０％、７７．５％、７７．０％、７６．５％、７６．０％、７５．５％、７５．０％、７４．５％、７４．０％、７３．５％、７３．０％、７２．５％、７２．０％、７１．５％または７１．０％から選択される。代替的に、公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドは、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに７０％ないし７１．０％、７１．５％、７２．０％、７２．５％、７３．０％、７３．５％、７４．０％、７４．５％、７５．０％、７５．５％、７６．０％、７６．５％、７７．０％、７７．５％、７８．０％、７８．５％、７９．０％、７９．５％、８０．０％、８０．５％、８１．０％、８１．５％、８２．０％、８２．５％、８３．０％、８３．５％、８４．０％、８４．５％、８５．０％、８５．５％、８６．０％、８６．５％または８７．０％の相同性を有することができる。
【００１２】
本発明によるＨＡ１ポリペプチドは、出典明示により全体を本明細書に援用するUS 2004/0268442およびWO 2004/098533に記載されるごとく、それらの発現系から完全にまたは部分的に精製することができる。それゆえ、部分的に精製されたＨＡ１ポリペプチドは、ポリペプチドが作成された植物細胞発現系の様々な部分または一部を含む組成物中に存在することができる。例えば、植物発現系がＨＡ１ポリペプチドの生成に用いられる場合、本明細書で同定された精製ＨＡ１ポリペプチドを含む組成物は、植物細胞成分（例、細胞壁、植物細胞膜の細胞マトリックスおよび炭水化物、等）または植物細胞マトリックス成分を含むことができる
【００１３】
単離された植物破砕物（ｈｏｍｏｇｅｎａｔｅｓ）中の組み換え植物で作成された抗原は、細胞壁物質、小分子炭水化物、膜、脂質成分、タンパク質、核酸ならびに小分子生合成中間体および二次代謝物を含むが、これらだけに限定されない様々な植物構成要素を含んでもよい。かかる植物で作成されたワクチン調製物は、従来の方法で均一になるまで精製または調製された同一の抗原より一般的により高い力価を伴う免疫応答を活性化する。製剤化された粗物質または従来法により調製されたワクチン抗原と比較して、製剤化され、濃縮された植物細胞生成抗原により抗体陽転を引き起こす予想外のより高い応答は、抗原の免疫系細胞への独特な提示ならびに処理、製剤化および保存中の抗原の改善された安定性によると考えられる。
【００１４】
抗原活性における植物マトリックスまたは構成成分の相乗またはアジュバント様効果は、植物発現様式に独特な特性である。この改善された特性は、より低い用量の抗原を投与する能力を提供し、病気の誘発からのより良好な保護を提供する。
【００１５】
本明細書に記載される調製物中に含まれる植物で作成された抗原および植物細胞マトリックスは、特異的に標的とする専門の抗原提示細胞（ＡＰＣ）により、動物の細胞性および液性免疫応答において有意な効果を示すと考えられる。この特異的な標的化は、植物マトリックスおよび／または植物で作成された抗原、特に、直接的にＡＰＣ上のマンノース受容体および関連するＣ−型レクチン受容体を伴う植物糖鎖付加抗原の相互作用を介して起きる。これらのＡＰＣは、それらの表面上の他の受容体（例えば、クラスＩＩ主要組織適合性複合体）を介して、免疫系の他の成分に対してこれらの抗原を処理し、提示することができ、液性および細胞性の両方を介在する免疫応答を促進できる。クラス１および２のＴヘルパー（Ｔｈ）細胞の増殖は、植物細胞マトリックスの不可欠な部分としておよび／または植物糖鎖付加抗原として提示される際に、直接ＡＰＣ細胞と相互作用できる抗原により大きく促進される。それらのＭＲまたは関連するレクチン受容体を介したこれらのＡＰＣとの標的とする相互作用は、強力な細胞性および液性免疫応答に関連する。ＣＤ８＋Ｔ細胞免疫に付随する細胞性免疫は、生きた弱毒化病原体でワクチン接種されることによってのみ活性化される。この免疫は、リーシュマニア種およびウイルスのごとく細胞内病原体のコントロールに重要な要件である（D. M. Pardoll, Nat Med. 1998. 4, 525-531）。
【００１６】
多数の公知ＨＡポリペプチドの可変領域のアミノ酸位置は、配列番号：１および配列番号：７のＨＡ１領域のアミノ酸位置と異なる；しかしながら、かかる領域は、当業者によって容易に理解することができる（例えば、全体を本明細書に援用するDe BK; Brownlee GG; Kendal AP; Shaw MW.  1988, Nucleic Acids Res., 16, 4181-4182を参照）。自然感染において、不活性なＨＡは、気管支上皮細胞により分泌される１つまたはそれ以上のトリプシン様、アルギニン特異的エンドプロテアーゼにより細胞外でＨＡ１およびＨＡ２へと成熟する。このプロセスに関して同定された１つのプロテアーゼがトリプターゼクララである。宿主生物への感染の程度はＨＡにより調べられる。インフルエンザウイルスは、分極した上皮細胞（気管支上皮細胞）の先端表面から肺の内腔へ流出し、それゆえ通常肺に向かう（ｐｎｅｕｍｏｔｒｏｐｉｃ）。ＨＡ１フラグメントは、細胞表面上のシアル酸含有受容体に結合し、細胞へのウイルス粒子の結合を引き起こす。それはまた、宿主範囲の制限および病原性の決定において主要な役割を担う。ＨＡ１フラグメントは、クラスＩウイルス融合タンパク質であり、取り込まれたウイルス粒子の膜とエンドソーム膜との融合を介在することによるウイルスの細胞質への侵入に関連する。エンドソームにおける低ｐＨは、ＨＡ２において不可逆的な構造変化を誘導し、融合疎水性ペプチドを解離する。数種の三量体は、適合な融合細孔を形成するために必要とされる。
【００１７】
用語「鳥インフルエンザウイルスに相同な」または「鳥インフルエンザウイルス株に相同な」は、植物で作成されたサブユニットワクチン抗原のアミノ酸配列に対して約７０％から約９０％の配列相同性を示す相同なまたは関連したＨＡ１ポリペプチドを示す鳥インフルエンザウイルス（もしくは株）として理解されるものとする。
【００１８】
ワクチンがインフルエンザの異型株による感染からの防御に対して有しうるスペクトル活性を調べるために、アミノ酸配列相同性の比較が行われる。この相同性解析は、アミノ酸１７から３２３までの配列を用いて、Ｈ１の可変先端フラグメントの相同性をＢＬＡＳＴ解析により比較することで行われる。ｂｌａｓｔ解析は以下のとおりに行われる：ＮＣＢＩ非重複タンパク質データベースは、ｎｒ．ｇｚ．としてｆｔｐサイト（ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/FASTA）からＬｉｎｕｘ（Red Hat Enterprise Linux 3.2）またはＵＮＩＸ（Solaris 8）のどちらかを実行するコンピュータにダウンロードされる。圧縮されているこのファイルは、実用的なｇｕｎｚｉｐで圧縮されておらず、ＢＬＡＳＴ設定を搭載するプログラムフォーマットｄｂと一緒にＢＬＡＳＴの使用用に初期化される。初期化されたｎｒデータベースに対するクエリー配列のｂｌａｓｔｐ検索（ＵＮＩＸにおけるバージョン２．２．４またはＬｉｎｕｘにおけるバージョン２．２．１３）は、ウェブインターフェイスを通して、あるいは探索が５００以上の有意なヒット（ウェブ制限）をリターンするかどうかによるコマンドライン上およびＢＬＡＳＴ解析後の構文解析上のいずれかでＢＬＡＳＴプログラムのローカルインスタンス（ｌｏｃａｌ  ｉｎｓｔａｎｃｅ）を用いて行われる。配列データベースにおけるインフルエンザウイルスの登録数は現在、数千のタンパク質が存在する。
【００１９】
その結果の解析は、対照配列に対して統計的に有意な相同性を有する配列を報告する。統計的な有意性は、用いられるマトリックスのスコアおよび選択される期待値、ならびにギャップ（ｇａｐ）を開いて拡張するコスト、ならびにミスマッチに対するペナルティのごときパラメーターの設定に依存する。用いられるパラメーターは、ＢＬＡＳＴプログラムの初期設定パラメーターであった。
【００２０】
本明細書に記載される公知のＨＡ１フラグメントを含むポリペプチドはまた、１つまたはそれ以上の異種性ポリペプチド配列、例えば、本発明のポリペプチド精製を容易にするタグ（例えば、出典明示により本明細書に全体を援用する、U.S. Patent No. 6,342,362；それぞれを出典明示により本明細書に全体を援用する、Altendorf et al. [1999-WWW, 2000] “Structure and Function of the Fo Complex of the ATP Synthase from Escherichia Coli,” J. of Experimental Biology 203:19-28, The Co. of Biologists, Ltd., G.B.； Baneyx [1999] “Recombinant Protein Expression in Escherichia coli,” Biotechnology 10:411 21, Elsevier Science Ltd.； Eihauer et al. [2001] “The FLAGＴＭ Peptide, a Versatile Fusion Tag for the Purification of Recombinant Proteins,” J. Biochem Biophys Methods 49:455 65； Jones et al. [1995] J. Chromatography 707:3 22； Jones et al. [1995] “Current Trends in Molecular Recognition and Bioseparation,” J. of Chromatography A. 707:3 22, Elsevier Science B.V.； Margolin [2000] “Green Fluorescent Protein as a Reporter for Macromolecular Localization in Bacterial Cells,” Methods 20:62 72, Academic Press； Puig et al. [2001] “The Tandem Affinity Purification (TAP) Method:  A General Procedure of Protein Complex Purification,” Methods 24:218 29, Academic Press； Sassenfeld [1990] “Engineering Proteins for Purification,” TibTech 8:88 93； Sheibani [1999] “Prokaryotic Gene Fusion Expression Systems and Their Use in Structural and Functional Studies of Proteins,” Prep. Biochem. & Biotechnol. 29(1):77 90, Marcel Dekker, Inc.； Skerra et al. [1999] “Applications of a Peptide Ligand for Streptavidin:  the Strep-tag”, Biomolecular Engineering 16:79-86, Elsevier Science, B.V.； Smith [1998] “Cookbook for Eukaryotic Protein Expression:  Yeast, Insect, and Plant Expression Systems,” The Scientist 12(22):20； Smyth et al. [2000] “Eukaryotic Expression and Purification of Recombinant Extracellular Matrix Proteins Carrying the Strep II Tag”, Methods in Molecular Biology, 139:49-57； Unger [1997] “Show Me the Money:  Prokaryotic Expression Vectors and Purification Systems,” The Scientist 11(17):20を参照）、あるいはＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ（カリフォルニア州、ラホーヤ）、ＮＯＶＡＧＥＮ（ウィスコンシン州、マディソン）、ＱＩＡＧＥＮ社（カリフォルニア州、バレンシア）、またはＩｎＶｉｔｒｏｇｅｎ（カリフォルニア州、サンディエゴ）のごとき製造業者から市販されているタグに結合されうる。例えば、異種性配列は、リボソーム結合およびｍＲＮＡの安定性のごとく転写およびｍＲＮＡプロセッシングにおいて役割を果たしうる転写、非翻訳の配列を含む。異種性配列は、代替的に、さらなる機能を提供する付加コーディング配列を含んでもよい。それゆえ、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、結合されたポリペプチドの精製または検出を容易にするペプチドをコードする配列のごときタグ配列に結合されていてもよい。本発明のこの態様の一定の具体例では、タグアミノ酸配列は、ｐＱＥベクター（ＱＩＡＧＥＮ）、または多くのさらに市販されているベクターのいずれかで提供されるタグのごとき、ヘキサ−ヒスチジンペプチドである。例えば、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の利便的な精製を提供する（その出典明示により全体を援用して開示する、Gentz et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA Feb; 86(3):821-4を参照）。本発明のポリペプチドはまた、免疫グロブリン（ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、ＩｇＭ）の定常領域、またはその部分（ＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３、その全体のドメインと一部の両方を含むそれらの���ずれかの組み合わせ）と結合されてキメラポリペプチドを生じてもよい。これらの融合タンパク質は精製を容易にし、インビボにおける半減期の上昇を示す。他の具体例では、本明細書に記載され、用いられるＨＡポリペプチドは、アジュバント活性を有する異種性ポリペプチド配列（ポリペプチドアジュバント）に結合されうる。かかるポリペプチドの非限定的な例は、熱ショックタンパク質（ｈｓｐ）を含む（例えば、出典明示により本明細書に全体を援用する米国特許第６，５２４，８２５号を参照）。
【００２１】
前記組成物の調製に有用なアジュバントまたは免疫促進成分は、アルミニウム塩、ミネラルオイル、マイコバクテリア産物（例、フロインド完全または不完全アジュバント）、あるいはケージ状構造上で数種のタンパク質の提示のためのビヒクルを提供する植物グリコシドサポニン、コレステロールおよびホスファチジルコリンの混合物のごときビヒクルを含むが、これらだけに限定されない。本明細書では、アジュバントは、免疫原または抗原に対する免疫応答を増強し、増加させ、調節し、または高める物質である。アジュバントは、典型的に、液性および細胞性免疫応答の両方を高めるが、一方の存在しない中でどちらかに対する応答の上昇もまたアジュバントの定義を満たす。さらに、アジュバントおよびそれらの使用は、免疫学者に周知であり、典型的には、免疫原の用量が限られる時、免疫原の免疫原性が乏しい時、または投与経路が準最適である時に免疫応答を高めるために用いられる。それゆえ、用語「アジュバント量」は、所定の免疫原または抗原に対する免疫応答を高めることができるアジュバントの量である。「アジュバント量」に同等な量は変動し、免疫原の性質、投与される免疫原の量、宿主種、投与経路、および免疫原を投与するためのプロトコルを含むが、これらだけに限定されない種々の因子に依存する。「アジュバント量」は、個々の状況に応じて一般的な手法により容易に定量することができる。このことは十分に当業者の範囲内であり、典型的には、投与される免疫原およびアジュバントの様々な量に対する通常用量応答測定の使用に用いる。応答は、酵素免疫吸着測定法、放射性免疫アッセイ、赤血球凝集アッセイ、およびこれらに類似する方法を用いて、免疫原に対して上昇された血清抗体力価または細胞介在応答を調べることにより測定される。
【００２２】
ワクチンおよびワクチン接種は、宿主に、免疫原性調製物、免疫因子の免疫防御粒子、または免疫原性調製物、あるいは非病原性形態またその一部を接種することであって、宿主免疫系が活性化し、引き続き生じる病原体への曝露に対する宿主応答に付随した後の望ましくない病状を予防または弱毒化させるように接種することにより病原に対する防御を提供するための手段として定義される。本発明において、本発明の組成物によるワクチンは、死亡もしくは死および気道からのウイルス流出における減少を生じる。
【００２３】
投与または投与するとは、人を含む動物の体への物質の誘導として定義され、経口、鼻腔内、眼内、直腸内、膣内および非経口の経路を含む。組成物は、皮下（ＳＱ）、筋肉内（ＩＭ）、静脈内（ＩＶ）、腹腔内（ＩＰ）、皮内（ＩＤ）を含むが、これらだけに限定されないいずれかの投与経路を介して、鼻腔、眼もしくは口腔粘膜を介して（ＩＮ）、または経口的に、単独または他の治療剤との組み合わせで投与されてもよい。
【００２４】
本発明はまた、公知の単離された組み換えおよび／または精製ポリヌクレオチド配列であって：
ａ）誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列；
ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドに相補的であるポリヌクレオチド；
ｃ）（ａ）または（ｂ）に記載されるようなポリヌクレオチド配列を含む遺伝学的な構築物；
ｄ）（ａ）、（ｂ）または（ｃ）に記載されるようなポリヌクレオチドまたは遺伝学的な構築物を含むベクター；あるいは
ｅ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）または（ｄ）に記載されるようなポリヌクレオチド、遺伝学的な構築物、またはベクターを含む宿主細胞
を含むポリヌクレオチド配列の使用方法を提供する。
【００２５】
用語「ヌクレオチド配列」、「ポリヌクレオチド」または「核酸」は、相互に同じ意味で用いることができ、本発明において、二本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＤＮＡまたは前記ＤＮＡの転写産物（例、ＲＮＡ分子）のうちのいずれかを意味することと理解される。本発明は、自然環境または自然状態におけるポリヌクレオチド配列に関連しないとも理解されるべきである。本発明の核酸、ポリヌクレオチド、もしくはヌクレオチド配列は、イオン交換クロマトグラフィー、分子サイズ排除クロマトグラフィー、または増幅、減法ハイブリダイゼーション、クローニング、サブクローニングもしくは化学合成のごとき遺伝学的技術方法により、あるいはこれらの遺伝学的技術方法の組み合わせを含むが、これらだけに限定されない分離方法により、単離、精製（または部分的に精製）することができる。
【００２６】
タンパク質および核酸配列の両方の相同性は、当業者間で公知であり、公的にアクセス可能なデータベース（例えば、ワールドワイドウェブサイト：ebi.ac.uk/fasta33/index.html (European Biotechnology Institute)；またはncbi.nlm.nih.gov/BLAST/（National Center for Biotechnology Information））で利用できるいずれかの種類の配列比較アルゴリズムおよびプログラムを用いて調査されてもよい。かかるアルゴリズムおよびプログラムは、ＴＢＬＡＳＴＮ、ＢＬＡＳＴＰ、ＦＡＳＴＡ、ＴＦＡＳＴＡ、およびＣＬＵＳＴＡＬＷを含むが、これらの手段に限定されない（Pearson and Lipman, 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85(8):2444-2448; Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol., 215(3):403-410; Thompson et al., 1994, Nucleic Acids Res., 22(2):4673-4680; Higgins et al., 1996, Methods Enzymol., 266:383-402; Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol., 215(3):403-410; Altschul et al., 1993, Nature Genetics, 3:266-272）。配列比較は、典型的に、製造業者により提供される初期設定パラメーターを用いて、あるいは出典明示により全体を本明細書に援用する上記に同定される引用文献に記載されるパラメーターを用いて行われる。
【００２７】
本明細書で用いられるごとく、「相補的な」ポリヌクレオチド配列は、一般に、二本鎖核酸分子（ＤＮＡ−ＤＮＡ、ＤＮＡ−ＲＮＡ、またはＲＮＡ−ＲＮＡ）において特定のプリンおよび特定のピリミジンの間の水素結合から生じる配列を意味する。主な特異的対合は、グアニンとシトシン、およびアデニンとチミンもしくはウラシルである。「相補的な」ポリヌクレオチド配列はまた、「アンチセンス」ポリヌクレオチド配列または「アンチセンス」と称されてもよい。
【００２８】
配列相同性および配列同一性はまた、高ストリンジェント、中ストリンジェント、および／または低ストリンジェントな条件下におけるハイブリダイゼーション実験により調べることができる。ハイブリダイゼーションのストリンジェントな各種の程度を用いることができる。条件が厳密であるほど、二本鎖の形成のためのより高い相補性が必要とされる。条件の厳密さは、温度、プローブ濃度、プローブの大きさ、イオン強度、時間、およびこれらに類似する条件により調整することができる。好ましくは、ハイブリダイゼーションは、例えば、Keller, G.H., M.M. Manak (1987) DNA Probes, Stockton Press, New York, NY., pp. 169-170に記載されるごとく当該技術分野で周知な技術により、低、中、または高ストリンジェントな条件下において行われる。
【００２９】
例えば、サザンブロットにおける固定化されたＤＮＡと３２Ｐ−標識遺伝子特異的なプローブとのハイブリダイゼーションは、一般的な方法により実施することができる（Maniatis et al., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York）。一般に、ハイブリダイゼーションおよび後の洗浄は、例示されるポリヌクレオチド配列に対して相同性を有する標的配列の検出を可能とする中から高ストリンジェントな条件下で行うことができる。二本鎖ＤＮＡ遺伝子プローブでは、ハイブリダイゼーションは、６ＸＳＳＰＥ、５Ｘデンハート溶液、０．１％ＳＤＳ、０．１ｍｇ／ｍｌ変性ＤＮＡ中において、ＤＮＡハイブリッドの融点（Ｔｍ）より２０−２５℃低い温度で一晩行われうる。融点は、以下の式により記載される（Beltz et al., 1983, Methods of Enzymology, R. Wu, L. Grossman and K. Moldave, eds. Academic Press, New York, 100:266-285）。
【００３０】
Ｔｍ＝８１．５℃＋１６．６Ｌｏｇ［Ｎａ＋］＋０．４１（％Ｇ＋Ｃ）−０．６１（％ホルムアミド）−６００／塩基対における二本鎖の大きさ。
【００３１】
洗浄は、典型的に以下のとおりに行われる：
（１）１ＸＳＳＰＥ、０．１％ＳＤＳ中において室温で１５分間を２回（低ストリンジェントな洗浄）；
（２）０．２ＸＳＳＰＥ、０．１％ＳＤＳ中においてＴｍ−２０℃で１５分間を１回（中ストリンジェントな洗浄）。
【００３２】
オリゴヌクレオチドプローブでは、ハイブリダイゼーションは、６ＸＳＳＰＥ、５Ｘデンハート溶液、０．１％ＳＤＳ、０．１ｍｇ／ｍｌ変性ＤＮＡ中において、ハイブリッドの融点（Ｔｍ）より１０−２０℃低い温度で一晩行うことができる。オリゴヌクレオチドプローブのＴｍは以下の式により調べることができる：
Ｔｍ（℃）＝２（Ｔ／Ａ塩基対数）＋４（Ｇ／Ｃ塩基対数）（Suggs  et al., 1981, ICN-UCLA Symp. Dev. Biol. Using Purified Genes, D.D. Brown, ed., Academic Press, New York, 23:683-693）
【００３３】
洗浄は、以下のとおりに行うことができる：
（１）１ＸＳＳＰＥ、０．１％ＳＤＳ中において室温で１５分間を２回（低ストリンジェントな洗浄）；
（２）１ＸＳＳＰＥ、０．１％ＳＤＳ中においてハイブリダイゼーション温度で１５分間を１回（中ストリンジェントな洗浄）。
【００３４】
一般に、塩および／または温度は、ストリンジェントを変化させるために変えることができる。標識されたＤＮＡフラグメント＞７０または同等の塩基長と一緒に、以下の条件を用いることができる：
低：    １または２ＸＳＳＰＥ、室温
低：    １または２ＸＳＳＰＥ、４２℃
中：    ０．２Ｘまたは１ＸＳＳＰＥ、６５℃
高：    ０．１ＸＳＳＰＥ、６５℃。
【００３５】
別の非限定的な例によると、高ストリンジェントな条件を用いる手順はまた、以下のとおりに行うことができる：ＤＮＡを含むフィルターのプレ−ハイブリダイゼーションは、６ＸＳＳＣ、５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ＝７．５）、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．０２％  ＰＶＰ、０．０２％  フィコール、０．０２％  ＢＳＡ、および５００μｇ／ｍｌ変性サケ精子ＤＮＡからなる緩衝液中において６５℃で８時間から一晩の間行われる。フィルターは、１００μｇ／ｍｌ変性サケ精子ＤＮＡおよび５−２０ｘ１０６ｃｐｍの３２Ｐ−標識プローブを含むプレ−ハイブリダイゼーション混合物中において、６５℃、好ましくはハイブリダイゼーション温度で４８時間ハイブリダイズされる。代替的に、ハイブリダイゼーション工程は、ＳＳＣ緩衝液、０．１５Ｍ  ＮａＣｌおよび０．０５Ｍ  Ｎａクエン酸に相当する１ＸＳＳＣの存在下において６５℃で実施することができる。続いて、フィルターの洗浄は、２ＸＳＳＣ、０．０１％  ＰＶＰ、０．０１％  フィコール、および０．０１％  ＢＳＡを含む溶液中において３７℃で１時間行われ、次いで０．１ＸＳＳＣ中において５０℃で４５分間洗浄することができる。代替的に、フィルターの洗浄は、２ＸＳＳＣおよび０．１％  ＳＤＳ、または０．５ＸＳＳＣおよび０．１％  ＳＤＳ、または０．１ＸＳＳＣおよび０．１％  ＳＤＳを含む溶液中において６８℃で１５分の間隔で行うことができる。洗浄工程後、ハイブリダイズされたプローブは、オートラジオグラフィーにより検出できる。用いられうる高ストリンジェントな他の条件は、当該技術分野で周知であり、その全体を本明細書に援用するSambrook et al., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Press, N.Y., pp. 9.47-9.57；およびAusubel et al., 1989, Current Protocols in Molecular Biology, Green Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y.中で引用されるごとくである。
【００３６】
中ストリンジェントな条件を用いる手順の別の非限定的な例は、以下のとおりである：ＤＮＡを含むフィルターがプレ−ハイブリダイズされ、次いで５ＸＳＳＣ緩衝液および標識プローブの存在下において６０℃の温度でハイブリダイズされる。次いで、フィルターの洗浄は、２ＸＳＳＣを含む溶液中において５０℃で行われ、ハイブリダイズされたプローブはオートラジオグラフィーにより検出される。用いられうる中ストリンジェントな他の条件は、当該技術分野で周知であり、その全体を本明細書に援用するSambrook et al., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Press, N.Y., pp. 9.47-9.57；およびAusubel et al., 1989, Current Protocols in Molecular Biology, Green Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y.中で引用されるごとくである。
【００３７】
二本鎖の形成および安定性は、ハイブリッドの二本鎖間の実質的な相補性に依存し、上に記載されるごとく、ある程度のミスマッチは許容されうる。それゆえ、本発明のプローブ配列は、記載される配列の変異（単一および複数の両方）、欠失、挿入、およびそれらの組み合わせを含み、前記変異、挿入および欠失は、目的の標的ポリヌクレオチドとの安定なハイブリッドの形成を許容する。変異、挿入および欠失は、多くの方法で所定のポリヌクレオチド配列において生成することができ、これらの方法は当業者に知られている。他の方法が将来周知になってもよい。
【００３８】
制限酵素を目的ＤＮＡ配列の機能的なフラグメントを得るために用いることができることは、当該技術分野において周知である。例えば、Ｂａｌ３１エクソヌクレアーゼは、ＤＮＡの時間制御制限消化（一般的に「ｅｒａｓｅ−ａ−ｂａｓｅ」法と称される）に利便的に用いることができる。例えば、Maniatis et al., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York; Wei et al., 1983, J. Biol. Chem., 258:13006-13512を参照。
【００３９】
本発明はまた、ａ）誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドを含む（またはからなる）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む遺伝学的な構築物を提供する。本発明の遺伝学的な構築物はまた、プロモーターおよびエンハンサーのごとき付加的な調節エレメント、ならびに任意選択的に選択マーカーを含む。
【００４０】
本明細書に記載されるごとき遺伝学的構築物を含むベクターまたは発現カセット、あるいは調節エレメントに作動可能に連結された上に記載されるごとくポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明の範囲内である。ベクターおよび発現カセットもまた、付加的な転写制御配列を含んでもよい。ベクターおよび発現カセットは、さらに選択マーカーを含んでもよい。発現カセットは、生物に共形質転換されるように、調節エレメントに作動可能に連結された少なくとも１つの付加的な遺伝子を含んでもよい。代替的に、付加的な遺伝子および調節エレメントは、複数の発現カセット上において提供することができる。かかる発現カセットは、調節領域の転写調節下にある本発明の配列の挿入のための複数の制限酵素部位とともに提供される。発現カセットは、さらに調節エレメントに作動可能に連結された選択マーカー遺伝子を含んでもよい。
【００４１】
発現カセットは、転写の５’−３’方向において、転写および翻訳開始領域、本発明のＤＮＡ配列、ならびに転写および翻訳終結領域を含む。転写開始領域、プロモーターは、宿主細胞に内在性もしくは類似性であってもよく、あるいは外因性もしくは異種性であってもよい。さらに、プロモーターは、自然配列または代替的に合成配列であってもよい。「外因性」であるとは、転写開始領域が、転写開始領域が導入された本来の植物で見出されないことを意味する。本明細書で用いられるごとく、キメラ遺伝子は、コーディング配列に異種性である転写開始領域に作動可能に連結されたコーディング配列を含む。
【００４２】
本発明の別の態様は、本明細書中で教示されるポリヌクレオチド配列のクローニングおよび／または発現のためのベクターを提供する。ワクチンベクターを含む本発明のベクターはまた、一定の宿主細胞における前記ヌクレオチド配列を発現および／または分泌させるのに必須なエレメントを含むことができる。ベクターは、プロモーター、翻訳の開始もしくは終結用シグナル、ならびに転写調節のための適切な領域を含むことができる。一定の具体例において、ベクターは、宿主細胞内において安定に維持され得、任意選択的に、翻訳されたタンパク質の分泌の方向付けを行うシグナル配列を含むことができる。これらの異なるエレメントは、使用される宿主細胞により選択される。ベクターは、宿主ゲノムに組み込まれ得、あるいは、任意選択的に、自律的に複製するベクターに組み込まれうる。
【００４３】
本発明はまた、ポリペプチドの発現を可能にする条件下において、本発明のポリヌクレオチドで形質転換された宿主細胞の培養を含む、本明細書に開示されるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドの発現、ならびに、任意選択的に、発現されたポリペプチドを回収することを提供する。
【００４４】
開示されたポリヌクレオチド配列はまた、タンパク質またはペプチドが組み換えＤＮＡ分子で形質転換された宿主で発現されうるように、第２の核酸配列により調節されうる。例えば、タンパク質またはペプチドの発現は、当該技術分野において知られるいずれかのプロモーター／エンハンサーにより制御されてもよい。発現を制御するために用いられ得るプロモーターは、ＣＭＶ−ＩＥプロモーター、ＳＶ４０初期プロモーター領域（Bernoist and Chambon, 1981, Nature 290:304-310）、ラウス肉腫ウイルスの３’末端反復配列に含まれるプロモーター（Yamamoto, et al., 1980, Cell, 22:787-797）、単純ヘルペスチミジンキナーゼプロモーター（Wagner et al., 1981, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 78:1441-1445）、メタロチオネイン遺伝子の調節配列（Brinster et al., 1982, Nature, 296:39-42）；β−ラクタマーゼプロモーターのごときプロモーターを含む原核生物ベクター（Villa-Kamaroff, et al., 1978, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 75:3727-3731）、またはｔａｃプロモーター（DeBoer, et al., 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 80:21-25）；Scientific American, 1980, 242:74-94中の“Useful proteins from recombinant bacteria”も参照のこと；ノパリン合成酵素プロモーター領域（Herrera-Estrella et al., 1983, Nature, 303:209-213）またはカリフラワーモザイクウイルス３５Ｓ  ＲＮＡプロモーター（Gardner, et al., 1981, Nucl. Acids Res., 9:2871）を含む植物発現ベクター、および光合成酵素リブロース二リン酸カルボキシラーゼのプロモーター（Herrera-Estrella et al., 1984, Nature, 310:115-120）；Ｇａｌ４プロモーター、ＡＤＣ（アルコール脱水素酵素）プロモーター、ＰＧＫ（ホスホグリセリン酸キナーゼ）プロモーター、および／またはアルカリホスファターゼプロモーターのごとき酵母または真菌由来のプロモーターエレメントを含むが、これらだけに限定されない。
【００４５】
本発明によるベクターは、例えば、プラスミドまたはウイルス起源のベクターである。特定の具体例において、ベクターは、開示されたポリヌクレオチド配列内に含まれるタンパク質もしくはペプチドをコードする核酸配列に作動可能に連結されたプロモーター、１つ以上の複製開始点、ならびに、任意選択的に、１つ以上の選択マーカー（例、抗生物質耐性遺伝子）を含んで用いられる。発現ベクターは、望ましい宿主細胞における遺伝子発現を含む、遺伝子発現を制御する調節配列を含む。本発明のポリペプチドの発現のための典型的なベクターは、ｐＥＴ型プラスミドベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ）もしくはｐＢＡＤプラスミドベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）または以下の実施例で提供されるベクターを含む。さらに、本発明によるベクターは、本発明のポリヌクレオチド配列をクローン化または発現させるために宿主細胞を形質転換するのに有用である。
【００４６】
トランスジェニック植物
前記組成物または免疫プロトコルの産生に有用なポリペプチドは、誘発株ＨＡ１可変領域ポリペプチドに約７０％から約９０％の間の相同性を有する公知のＨＡ１可変領域ポリペプチドを含むか（またはからなる）ポリペプチドを発現するように遺伝学的に設計されたトランスジェニック植物細胞に由来しうるか、得ることができる。
【００４７】
トランスジェニック植物は、本明細書において、形質転換された植物細胞またはプロトプラストに由来する、植物細胞培養物、植物細胞株、植物組織培養物、下等植物、コケ植物、単子葉植物、双子葉植物、またはそれらの子孫であって、形質転換された植物のゲノムが、元々の同一種のトランスジェニックでない植物細胞に存在しない、研究室の技術により導入された外因性ＤＮＡを含むものとして定義される。用語「トランスジェニック植物」および「形質転換された植物」は、当該技術分野において、ＤＮＡが外因性ＤＮＡ分子を含む植物を定義する同義語として用いられることもある。トランスジェニック植物および形質転換植物は、さらに、米国特許第５，５５０，３６０号；第５，８４６，７９５号；第４，８８５，２４８号；第５，１７３，４１０号；第５，６０２，２４２号；第５，６２７，０６０号；第５，８０４，４３９号；ＷＯ０５／０４９８３９；ＷＯ０３／０２０９３８；ＷＯ０２／１０１００６；ＷＯ０２／１０１０６０；ＷＯ０２／０９６１９２；ＷＯ０２／０８８３６９；ＷＯ０２／０８３８６；ＷＯ０２／２９０６８；ＷＯ０２／４６４４０；およびＷＯ０２／０６８６６４に記載されるごとく、ゲノムが安定に形質転換されないか、組み換えウイルスベクターを一過的に発現する方法および植物を含む。
【００４８】
植物において免疫防御抗原を発現させるための遺伝子カセットの構築は、Sambrook et al. (1989)；およびAusubel et al., (1987) Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, New York, NYに記載されるごとく、周知な方法を用いて容易に行われる。本発明はまた、免疫防御抗原をコードする開示された配列と相同な実質的な配列を有するＤＮＡ配列を含み、それらは発現において開示された効果を示すことができる。本出願で用いられるように、用語「相同な実質的な配列」は、（ＤＮＡまたはＲＮＡの場合には）ヌクレオチド配列または（タンパク質またはポリペプチドの場合には）アミノ酸配列が、別のヌクレオチドまたはアミノ酸配列と実質的、機能的または構造的に同等であることを示すのに用いられる。相同な実質的な配列を有する配列間の機能的または構造的な相違は、些細なことであり；すなわち、それらは、本出願で示されるように機能する配列の能力に影響しない。本明細書で開示される配列と相同な実質的な配列を有する配列は、通常、変異のごとき開示された配列の変異型であり、合成配列であってもよい。
【００４９】
本発明の構築物を調製する際に、正しい方向で、かつ適切に正しい読み枠でＤＮＡ配列を提供するように、様々なＤＮＡフラグメントが操作されてもよい。アダプターまたはリンカーは、ＤＮＡフラグメントを繋ぐために用いられてもよく、あるいは他の操作は、利便的な制限酵素部位、過剰なＤＮＡの除去、制限酵素部位の除去、またはそれらに類似することを提供することに関連していてもよい。
【００５０】
様々な工程を行う際に、クローニングは、後に望ましい宿主細胞への導入用の目的のプロモーター／遺伝子を含むベクターを増幅させるために用いられる。多種多様なクローングベクターが利用でき、クローニングベクターは、Ｅ．ｃｏｌｉで機能する複製系および形質転換された細胞の選択が可能なマーカーを含む。具体的なベクターは、ｐＢＲ３２２、ｐＵＣシリーズ、ｐＡＣＹＣ１８４、Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔシリーズ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）などを含む。それゆえ、配列が適切な制限酵素部位でベクターに挿入され、生じたプラスミドがＥ．ｃｏｌｉ宿主（例、Ｅ．ｃｏｌｉ株ＨＢ１０１、ＪＭ１０１およびＤＨ５α）に形質転換するのに用いられ、Ｅ．ｃｏｌｉが適切な培地で増殖され、細胞が回収され、溶解され、次いでプラスミドが回収されてもよい。解析は、配列解析、制限酵素解析、電気泳動、またはそれらに類似する解析であってもよい。各操作後、最終構築物に用いられるＤＮＡ配列は、切断され、隣の配列に繋がれてもよく、部分的な構築物の各々が同一または異なるプラスミドにクローン化されてもよい。
【００５１】
ベクターは、植物細胞の形質転換に利用可能であるか、または容易に調製することができる。一般に、プラスミドまたはウイルスベクターは、一定の宿主における異種性ＤＮＡ配列の維持および発現の両方に必須な全てのＤＮＡ制御配列を含むべきである。かかる制御配列は、一般的に、翻訳開始シグナルコドン、翻訳終結コドンをコードするリーダー配列およびＤＮＡ配列、ならびにメッセンジャーＲＮＡプロセッシングを制御する３’ＵＴＲシグナルをコードするＤＮＡ配列を含む。いずれかの特定な種における発現を最適化するための適切なエレメントの選択は、この開示の教示により当該分野における一般的な技術的事項である。最終的に、ベクターは、望ましくは、ベクターを含む宿主細胞の同定を可能にする表現型の特性を提供できるマーカー遺伝子を有するべきである。
【００５２】
植物細胞に挿入された外因性コーディング配列の活性は、挿入部位に隣接する内在性植物ＤＮＡの作用に依存する。一般に、異種性遺伝子の挿入は、いずれの形質転換技術を用いて無作為であるようだが；現在、植物細胞へのＤＮＡの部位特異的組み換えを用いて植物を産生するための技術が存在する（ＷＯ９１／０９９５７を参照）。プロモーターの制御における望ましい配列または配列の発現を生じるいずれかの方法または方法の組み合わせが好ましい。
【００５３】
本発明は、植物細胞を形質転換させるいずれかの特定の方法に限定されない。植物細胞にＤＮＡを導入するための技術は、当業者に周知である。植物細胞に外因性ＤＮＡを送達するための４つの基本的な方法が報告されている。化学的方法（Graham and van der Eb, Virology, 54(02):536-539, 1973；Zatloukal, Wagner, Cotten, Phillips, Plank, Steinlein, Curiel, Birnstiel, Ann. N.Y. Acad. Sci., 660:136-153, 1992）；マイクロインジェクション（Capecchi, Cell, 1980, 22(2):479-488）、エレクトロポレーション（Wong and Neumann, 1982, Biochim. Biophys. Res. Commun., 107(2):584-587；Fromm, Taylor, Walbot, 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82(17):5824-5828；U.S. Pat. No. 5,384,253）および遺伝子ガン（Johnston and Tang, 1994, Methods Cell. Biol., 43(A):353-365；Fynan, Webster, Fuller, Haynes, Santoro, Robinson, 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90(24):11478-11482）を含む物理的方法；ウイルス法（Clapp, 1993, Clin. Perinatol., 20(1):155-168；Lu, Xiao, Clapp, Li, Broxmeyer, 1993, J. Exp. Med., 178(6):2089-2096；Eglitis and Anderson, 1988, Biotechniques, 6(7):608-614；Eglitis, Kantoff, Kohn, Karson, Moen, Lothrop, Blaese, Anderson, 1988, Avd. Exp. Med. Biol., 241:19-27）；ならびに受容体介在法（Curiel, Agarwal, Wagner, Cotten, 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88(19):8850-8854；Curiel, Wagner, Cotten, Birnstiel, Agarwal, Li, Loechel, Hu, 1992, Hum. Gen. Ther., 3(2):147-154；Wagner et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89 (13):6099-6103）。
【００５４】
エレクトロポレーションによるＤＮＡの植物細胞への導入は当業者に周知である。ペクチン分解酵素のごとき植物細胞壁分解酵素は、受容細胞を未処理細胞よりエレクトロポレーションによる形質転換に対してより感受性とするのに用いられる。エレクトロポレーションによる形質転換をもたらすために、細胞の懸濁培養液、または胚発生カルス、または未熟胚のごとき脆弱な組織あるいは他の構築された組織を用いてもよい。一般に、調節された手段におけるペクチン分解酵素または機械的損傷により標的植物物質である細胞壁を部分的に分解することが必要である。このように処理された植物物質は、エレクトロポレーションによる外因性ＤＮＡを受け入れる用意ができている。
【００５５】
外因性形質転換ＤＮＡを植物細胞に送達するための別の方法は、微粒子照射（ｂｏｍｂａｒｄｍｅｎｔ）によるものである。この方法において、微粒子は、外因性ＤＮＡによりコートされ、推進力により細胞に送達される。かかる微粒子は、典型的には、タングステン、金、プラチナ、および同様の金属からなる。微粒子照射の利点は、プロトプラストの単離（Cristou et al., 1988, Plant Physiol., 87:671-674）もアグロバクテリウム感染に対する感受性も必要とされない点である。加速（ａｃｃｅｌｅｒａｔｉｏｎ）によりトウモロコシ細胞にＤＮＡを送達するための方法の例示的な具体例は、Ｂｉｏｌｉｓｔｉｃ  Ｐａｒｔｉｃｌｅ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍであり、これは、懸濁状態で培養したトウモロコシ細胞で覆われたフィルター表面上にスクリーンを通じてＤＮＡまたは細胞でコートされた粒子を推進するのに用いることができる。前記スクリーンは、粒子が大きな凝集体中の受容細胞に送達されないように粒子を散布する。前記照射において、懸濁状態の細胞は、好ましくはフィルター上または固体培地上で濃縮される。代替的に、未熟胚または他の標的細胞は、固体培地上で準備されてもよい。照射形質転換において、前照射培養条件および照射パラメーターを最適化することにより安定な形質転換体の最大数を得てもよい。照射のための物理学的および生物学的パラメーターの両方は、この技術において重要である。物理学的な因子は、ＤＮＡ／微粒子の沈殿物を操作することに関するものまたは微粒子のどちらの飛行（ｆｌｉｇｈｔ）および速度に影響するものである。生物学的な因子は、照射前および直後における細胞の操作、照射に伴う外傷の軽減を補助する標的細胞の浸透圧調節、ならびに直鎖状ＤＮＡまたは無傷のスーパーコイル状プラスミドのごとき形質転換ＤＮＡの形状に関する全ての工程を含む。
【００５６】
アグロバクテリウム介在導入は、プロトプラストから無傷な植物を再生する必要がある場合を除いて、外因性ＤＮＡが全植物組織に導入されうるため、植物細胞へ外因性ＤＮＡを導入するための広範囲に適用可能なシステムである。植物細胞にＤＮＡを導入するためのアグロバクテリウム介在植物組み込みベクターの使用は、当該技術分野でよく知られている。例えば、Fraley et al., 1985, Biotechnology, 3:629;  Rogers et al., 1987, Meth. in Enzymol., 153:253-277に記載される方法を参照。さらに、Ｔｉ−ＤＮＡの組み込みは、ほとんど再構築を生じない比較的正確なプロセスである。導入されるＤＮＡの領域は、境界配列により定められ、介在するＤＮＡは、通常、Spielmann et al., 1986, Mol. Gen. Genet., 205:34；Jorgensen et al., 1987, Mol. Gen. Genet., 207:471に記載されるごとき植物ゲノムに挿入される。
【００５７】
最新のアグロバクテリウム形質転換ベクターは、アグロバクテリウムと同様にＥ．ｃｏｌｉにおいて複製することができ、利便的な操作が可能である。さらに、アグロバクテリウム介在遺伝子導入用ベクターにおける最近の技術進歩は、ベクターにおける遺伝子および制限酵素部位の構成を改善することにより、様々なタンパク質またはポリペプチドを発現できるベクターの構築を容易にした。挿入されたポリペプチドをコードする遺伝子の直接発現のためのプロモーターおよびポリアデニル化部位に隣接する利便的な多リンカー領域は、本発明の目的に適する。加えて、連結（ａｒｍｅｄ）および連結されていない（ｄｉｓａｒｍｅｄ）Ｔｉ遺伝子の両方を含むアグロバクテリウムは、形質転換に用いることができる。
【００５８】
植物プロトプラストの形質転換は、リン酸カルシウム沈殿、ポリエチレングリコール処理、エレクトロポレーション、およびこれらの処理の組み合わせに基づく方法を用いて行うことができる（例、Potrykus et al., 1985, Mol. Gen. Genet., 199:183；Marcotte et al., 1988, Nature, 335:454を参照）。これらの系の異なる植物種への適用は、プロトプラストから特定の種を再生する能力に依存する。
【００５９】
一度植物細胞が形質転換され、選択され、抗原発現を確認されると、いくつかの例では、稔性植物全体を再生することが可能である。このことは、選択される植物種に大きく依存する。多くの植物種を再生するための方法は、文献に報告され、当業者によく知られている。本発明の実施に関して、一般的に長期の再生工程を避けることにより急速に培養させ、成長させることができる植物細胞株を形質転換することが好ましい。さらに、植物細胞培養の使用は、屋外の農場生産を回避し、遺伝子エスケープと食物汚染の機会を大いに減らす。ＮＴ−１およびＢＹ−２（An, G., 1985, Plant Physiol., 79:568-570）のごときタバコの懸濁細胞培養は、これらの株が培養中に操作するのに特に適し、容易に形質転換され、安定に組み込まれたイベント（ｅｖｅｎｔ）を提供し、凍結保存に適することから好ましい。
【００６０】
タバコ懸濁細胞株、ＮＴ−１は、本発明の実施に適する。ＮＴ−１細胞は元々、タバコＢＹ−２（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ  Ｌ．ｃｖ．  ｂｒｉｇｈｔ  ｙｅｌｌｏｗ  ２）から開発された。ＮＴ−１細胞株は広く使用され、容易に利用可能である；しかし、いずれのタバコ懸濁細胞株であっても本発明に適合する。下記の実施例の使用に適するＮＴ−１細胞は、アメリカンタイプカルチャーコレクションから受託番号ＡＴＣＣ第７４８４０号で入手できる。また、出典明示により全体を本明細書に援用する米国特許第６，１４０，０７５号を参照のこと。
【００６１】
研究室規模の振蘯フラスコから何千リットルのバイオリアクター容器までの範囲の多くの植物細胞培養技術および系は、植物細胞培養の技術において公表され、よく知られている。例えば、Fischer, R. et al, 1999, Biotechnol. Appl. Biochem., 30, 109-112およびDoran, P., 2000, Current Opinions in Biotechnology, 11:199-204を参照。形質転換された植物細胞が望ましい量まで培養された後、それらは回収され、穏やかに洗浄され、破砕に適した緩衝液中に置かれる。多くの異なる緩衝液が本発明に適合する。一般に、緩衝液は、中和ｐＨ値またはその近似値の等張緩衝塩水溶液であって、膜を可溶化するのに用いられ得る粗い界面活性剤を含まない。好ましい緩衝液は、１ｍＭ  ＥＤＴＡを含むダルベッコリン酸緩衝食塩水およびＰＢＳを含む。
【００６２】
一の具体例では、細胞は、超音波処理により破砕することができる。洗浄された細胞は、約０．０１ｇｍ／ｍｌから約５．０ｇｍ／ｍｌの範囲、好ましくは約０．１ｇｍ／ｍｌから約０．５ｇｍ／ｍｌまで（緩衝液の体積あたりの洗浄された湿重量細胞）の範囲で緩衝液中に置かれる。多くの市販されている破砕機器は本発明に適合し、破砕の時間は約５から約２０秒、好ましくは約１５から約２０秒の範囲である。結果物は、数ミクロンから数百ミクロンの大きさの範囲であり、ＨＡ１ポリペプチドまたはその免疫原性フラグメントを露出していてもよい。
【００６３】
用語「含む」、「からなる」および「必須としてなる」は、それらの一般的な意味に従って定義される。前記用語は、各用語に関する特定の意味を付随させるために、本出願を通して相互に置き換えられてもよい。用語「単離」または「生物学的に純粋」は、その自然状態で見出されるごとく物質を通常伴う構成要素から物質が実質的または本質的に解離されることを意味する。それゆえ、本発明による単離ペプチドは、好ましくは、それらの生体内の環境でペプチドに通常付随する物質を含まない。
【００６４】
本明細書で参照されるか、または引用される全ての特許、特許出願、および刊行物は、本明細書の明白な教示に矛盾しない程度に、全ての図および表を含む全体を出典明示により援用される。本明細書に記載される実施例および具体例は例示のためのみであり、それを踏まえて様々な改良または変化が当業者により推定され、本出願の精神と範囲および添付の特許請求の範囲内に含まれることが理解されるべきである。さらに、本明細書で開示される発明またはその具体例のいずれかの構成要素または限定は、いずれかのおよび／または全ての他の構成要素または限定（個々にまたはいずれかの組み合わせで）、あるいは本明細書で開示される他のいずれかの発明またはその具体例と結びつくことができ、全てのかかる組み合わせは、それに限定されることなく本発明の範囲内として考慮される。
【００６５】
本明細書は、鳥インフルエンザの可変性異型株の従来調製されたワクチンよりより広い交叉防御を記載する一方、本明細書に記載される植物で作成されたワクチンの構成基盤および概念は、それらの抗原性決定因子を変化させる能力を有する他の病原体により引き起こされる疾病を制御することに適用できる。
【００６６】
本明細書で参照されるか、または引用される全ての特許、特許出願、仮出願、および刊行物は、本明細書の明白な教示に矛盾しない程度に、全ての図および表を含む全体を出典明示により援用される。
【００６７】
以下は、本発明を実施するための手順を例示する実施例である。これらの実施例は限定するものとして解釈されるべきではない。特に記載がない限り、全ての百分率は重量であり、全ての溶媒混合物の比率は容量である。
【００６８】
実施例１−マウスの異種性誘発における植物細胞生成Ｈ５の防御効果
異種性（＜９０％相同性）誘発に対して防御するための植物細胞で生成された鳥インフルエンザウイルス（ＡＩＶ）Ｈ５抗原の能力を確認し、さらに理解するために、マウスワクチンおよびＡＩＶ誘発実験を行った。出典明示により全体を本明細書に援用する米国特許第７，１３２，２９１号の教示に実質的に従って、ＡＩＶのシチメンチョウウィスコンシン６８株のＨ５抗原遺伝子を植物コドンに最適化し、ＮＴ−１植物細胞に形質転換させ、培養した。
【００６９】
細胞溶解
Ｈ５抗原を発現するように形質転換されたＮＴ−１植物細胞を、２００ｍＭ  Ｔｒｉｓ  ｐＨ８、５ｍＭ  ＥＤＴＡ  ｐＨ８、２ｍＭ  ジチオスレイトールおよび２％  デオキシコール酸（Ｄｏｃ）Ｎａ中で（氷上でＢｉｏｓｐｅｃ（登録商標）ビーズ撹拌器を用いて）１００ｇの一定分量に溶解させた。溶解物を４℃で一晩撹拌させてＨ５抽出を助長し、遠心分離、続いてろ過（０．４５μｍ）により清澄し、さらに下記のとおりに精製した。一部をＨ５用に定量化し、凍結乾燥させ、−２０℃で保存した。
【００７０】
Ｍａｂクロマトグラフィー
精製されたバルクＨ５抗原を、溶解した形質転換ＮＴ−１植物細胞から下記のとおりに調製した。上記で調製された植物細胞溶解物をＭｉｌｌｉ−Ｑ（登録商標）水で４から１倍に希釈してＤｃｏ濃度を０．５％まで下げた。希釈した植物細胞溶解物を、約１２５ｍｌ  Ｈ５  Ｍａｂを５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ  ｐＨ８で溶出したアフィニティーカラムに通した。カラムを５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ  ｐＨ８でベースラインまで洗浄し、結合したタンパク質を５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ  ｐＨ８、２Ｍ  ＮａＳＣＮで溶出した。溶出したＨ５タンパク質を凍結乾燥の前に２倍量の１０．５ｍＭ重炭酸アンモニウム（揮発性緩衝液）に対して透析を行った。
【００７１】
抗原の調製
１．実験ワクチン：約１２９．５μｇのＨ５抗原を含む凍結乾燥された形質転換ＮＴ−１細胞溶解ケークを３．５ｍｌの蒸留水を用いて再水和させ、３７μｇ／ｍｌのバルクＨ５抗原保存溶液の濃度を有する植物細胞溶解保存溶液を得た。バルクＨ５抗原保存溶液を６０００ＸＧで２０分間の遠心分離、次いで０．２２ミクロンフィルターを通す滅菌ろ過により清澄化させた。次に、この滅菌ろ過されたバルクＨ５抗原を最終的な実験ワクチン集合物のために保持した。
【００７２】
２．精製ワクチン：Ｍａｂクロマトグラフィーにより精製されたＨ５抗原の凍結乾燥されたバイアルを用いて精製ワクチンを調製した。凍結乾燥されたバイアルの各々は、５００μｇのＨ５抗原を含有した。各バイアルを５ｍｌの滅菌水で再水和させて１００μｇ／ｍｌの最終濃度を得た。この物質は清澄または滅菌ろ過を必要とせず、次いでこれを最終的な精製ワクチン集合物用に保持した。
【００７３】
３．ＮＴ−１ブランク対照：形質転換されていないＮＴ−１植物細胞を、Ｈ５抗原を発現する形質転換ＮＴ−１細胞の代わりに用いることを除いて、上記実験ワクチン（１）で用いられるごとく同一の手順を用いてＮＴ−１ブランク対照を調製した。
【００７４】
製剤
最終ワクチンの各々を以下の手順を用いて２６．７ｎｇ／ｍｌの最終的なＨ５濃度とした。実験ワクチン抗原、精製ワクチン抗原またはＮＴ−１ブランク対照溶解物を滅菌済みの５０ｍｌ円錐底遠心分離チューブに添加した。滅菌ろ過されたＱｕｉｌ  Ａ  保存（滅菌水中に５０ｍｇ／ｍｌ、デンマークのＢｒｅｎｎｔａｇ）溶液の必要量を、４０μｇ／用量の最終濃度までチューブに添加し、滅菌ローター固定子型ホモジェナイザーを用いて１分間混合させた。コレステロール保存溶液（ＥｔＯＨ中に１８ｍｇ／ｍｌ）の必要量を１０μｇ／用量の最終濃度までチューブに添加し、滅菌ローター固定子型ホモジェナイザーを用いて１分間混合させた。レシチンおよびアクリルポリマーの前もって調製し、オートクレーブをかけた混合物の必要容量（３：２  レシチン：カルボポル）を、１ｍｇ／用量の最終濃度まで添加し、１分間ホモジェナイズした。滅菌水の必要量をチューブに添加し、混合させた。
【００７５】
次いで、集めたワクチンを滅菌血清バイアルに無菌的に移し、密封し、標識した。集めたワクチンのバイアルを、臨床的な治験実験施設で必要とされて輸送されるまで４℃で保存した。
【００７６】
ワクチン
６５匹のＢＡＬＢ／ｃマウス（雌；５−６週齢）を表１に記載されるごとく処理グループ１、処理グループ２、処理グループ３または処理グループ４に割り当てた。実験日０、１４および２１において、マウスを表１に記載されるごとく１５０μｌ用量の処方された処置でワクチン接種した。ワクチンを皮下投与した。グループ４のマウスにはワクチン接種しなかった。
【００７７】
ワクチン接種後解析
３５日目に、全てのマウスをＡＢＳＬ３施設に移動させ、１週間新しい施設に慣れさせた。４２日目に、グループ１、グループ２およびグループ３の各々から５匹のマウスを無作為に選択し、鎮静状態で放血させた。血液を血清に処理し、血清学的分析用に≦−２０℃で保存した。さらに、４２日目に、グループ１、グループ２およびグループ３の各々から残りの１５匹のマウスを、５０μＬの約１．５ｘ１０３のＴＣＩＤ５０鳥インフルエンザウイルスＡ／ベトナム／１２０３／０４で誘発した。グループ４の５匹のマウスをリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）で偽誘発させた。全ての誘発をケタミンによる麻酔状態下で行った。
【００７８】
実験４５日目に、グループ１から５匹のマウス、グループ２から５匹のマウス、グループ３から５匹のマウスおよびグループ４（５匹のマウス）の全マウスを解剖し、肺および脳を取り出した。肺および脳をホモジェナイズし、ＴＣＩＤ５０定量により生存ウイルスを試験した。
【００７９】
グループ１、グループ２およびグループ３における残り１０匹のマウスを、実験５６日目の終結まで疾患の臨床的徴候についてモニターした。
【００８０】
血清学的分析
ＡＩＶのシチメンチョウウィスコンシン６８株に対する赤血球凝集抑制およびＡ／ベトナム／１２０３／０４に対する血清中和を、実験４２日目のグループ１および２のマウスから採血した血液において行った。
【００８１】
血球凝集抑制アッセイ
赤血球凝集抑制（ＨＡＩ）血清学的アッセイを、尿膜腔液中で調製された不活性化ＡＩＶのシチメンチョウウィスコンシン６８株に対して４２日目に採取された血清サンプルについて行った。不活性化されたウイルスを希釈して５０μｌあたり８から１６の間の赤血球凝集（ＨＡ）単位にした。血清サンプルをＰＢＳで２倍連続希釈した。希釈血清サンプルに同体積の希釈ウイルスを添加した。次いで、血清−ウイルス混合物を室温で６０分間インキュベートした。ニワトリ赤血球（ｃＲＢＣ）の１％溶液を血清−ウイルス混合物に添加し、２−７℃で２４時間インキュベートした。次に、プレートを赤血球凝集（陽性結果）またはペレット状のｃＲＢＣ（陰性結果）について視覚的に検査した。ＨＡＩ力価は、ｃＲＢＣの赤血球凝集を生じるウイルスの能力を抑制できる血清の逆希釈を表す。
【００８２】
血清中和アッセイ
血清中和アッセイをＡＢＳＬ−３実験室で行った。中和用量５０力価（ＮＤ５０）を、下記のとおり血清サンプルについて調べた。各サンプルの連続２倍希釈液を、イーグル最小必須培地（ＥＭＥＭ）を用いて調製した。鳥インフルエンザウイルス（ベトナム／１２０３／０４）を希釈血清サンプルに添加し、この混合物を３７℃で１時間インキュベートした。次いで、ＭＤＣＫ細胞で少なくとも９０％コンフルエント（ｃｏｎｆｌｕｅｎｔ）である９６ウェルプレートを、ハンクス平衡塩溶液（ＨＢＳＳ）で洗い、ウェルを１００μｌの各血清ウイルス希釈液で５倍量において接種した。次に、プレートを加湿インキュベーター中において約３７℃および５％  ＣＯ２で９６±６時間インキュベートした。プレートを細胞変性効果（ＣＰＥ）について顕微鏡下で認定した。ＮＤ５０を、接種したウェルの５０％におけるＣＰＥ非存在を生じる希釈率として示し、スピアマンカルバー（ｓｐｅａｒｍａｎ  Ｋａｒｂｅｒ）法を用いて算出した。
【００８３】
肺および脳由来の生存可能なウイルス力価
グループ１、２および３の各々における５匹のマウスに由来する脳および肺をＣＭＦ−ＰＢＳ中に取り出し、ホモジェナイズした。ホモジェナイズ物を微量遠心器チューブに分注し、≦−７０℃で保存した。脳および肺のホモジェナイズサンプルをＴＣＩＤ５０を用いて生存ウイルスについて試験した。肺および脳を取り出し、１％  抗生物質（ペニシリンおよびストレプトマイシン）と一緒に調製した１ｍｌのリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）中で≦−７０℃中に無傷で凍結した。解凍後、肺および脳をホモジェナイズし、サンプルを組織培養感染量５０（ＴＣＩＤ５０）により生存ウイルスについて試験した。簡潔に説明すると、各サンプルの連続５倍希釈を、ＥＭＥＭを用いて調製した。希釈シリーズもまた、陽性対照サンプル（ＰＣ、公知のＴＣＩＤ５０力価を有する陽性サンプル）および陰性対照サンプル（ＮＣ、ウイルス未処理である）について調製した。次いで、ＭＤＣＫ細胞で少なくとも９０％コンフルエント（ｃｏｎｆｌｕｅｎｔ）である９６ウェルプレートを、ハンクス平衡塩溶液（ＨＢＳＳ）で洗い、ウェルを１００μｌの各血清ウイルス希釈液で５倍量において接種した。次に、一連の少なくとも５つの細胞培養コントロール（ＣＣ）ウェルを１００ｍｌ  ＥＭＥＭで接種した。続いて、ＰＣおよびＮＣサンプルの希釈シリーズを、別々の９６ウェルプレート上に５倍量で接種した。陽性および陰性対照プレートの両方は各々、最低５つのＣＣウェルを含有した。次いで、プレートを加湿インキュベーター中において約３７℃および５％  ＣＯ２で９６±６時間インキュベートした。プレートを細胞変性効果（ＣＰＥ）について顕微鏡下で技術者により認定した。有効と認められるアッセイのためには、混入（ｃｏｎｔａｍｉｎａｔｉｏｎ）があり得ず、各プレート上の少なくとも５つのＣＣウェルが健常なコンフルエント（＞８０％）の単層であることが必要とされた。ＴＣＩＤ５０は、接種されたウェルの５０％のＣＰＥを生じる希釈率であり、スピアマンカルバー（ｓｐｅａｒｍａｎ  Ｋａｒｂｅｒ）法を用いて算出された。
【００８４】
結果
グループ１、グループ２およびグループ３の各々に由来する５匹のマウスを、血清学的検査のために出血させた。血清学的結果（赤血球凝集抑制および血清中和）を表２に示す。グループ１（実験ワクチン）に由来する５匹のマウスのうちの５匹は、赤血球凝集抑制血清学（ＨＡＩ）により証明されるごとく（ワクチン中におけるＨ５抗原に相同である）シチメンチョウウィスコンシン６８に対する抗体を発生させた。グループ１の幾何平均力価（ＧＭＴ）は３８８であった。グループ２（精製ワクチン）に由来する５匹のマウスのうちの３匹は、ＨＡＩ力価が上昇した。グループ２のＧＭＴは６０．７であった。
【００８５】
グループ３（ＮＴ−１ブランク対照）に由来する５匹のマウスは、シチメンチョウウィスコンシン６８に対するＨＡＩ抗体を発生させなかった。グループ１（実験ワクチン）に由来する５匹のうちの３匹は、血清中和血清学（ＳＮ）により証明されるごとく、（ワクチン中のＨＡに相同性のある）ベトナム／１２０３／０４に対する抗体を発生させた。グループ１の幾何平均力価（ＧＭＴ）は３４．０であった。グループ２に由来する５匹のうちの１匹は、ＳＮ力価（ＧＭＴ＝３．１）を発生させ、グループ３に由来する５匹のうちのいずれもがベトナム／１２０３／０４に対するＳＮ抗体を発生させなかった。
【００８６】
生存可能な鳥インフルエンザウイルスを、実験４５日目（誘発３日後）におけるグループ１、２、３および４の各々に由来する５匹のマウスの肺および脳から単離した。グループ４の５匹のマウス全てを、上記のごとく屠殺し、それゆえ表４に記載されていない。ウイルス単離の結果を表３に表す。４つのグループ全てにおいて、脳組織から生存ウイルスを単離できなかった。グループ１（実験ワクチン）では、５匹のマウスのうちの１匹は、無菌の肺組織を示した（ウイルスを単離できなかった）。グループ１マウスの肺に由来する生存ウイルスのＧＭＴは、３．３１ｘ１０３ＴＣＩＤ５０／ｍＬであった。グループ２（精製ワクチン）マウスでは、５匹のマウスのうちの５匹から生存ウイルスを単離できた。グループ２のマウスの肺に由来する生存ウイルスのＧＭＴは、２．１９ｘ１０４ＴＣＩＤ５０／ｍｌであった。グループ３（ＮＴ−１ブランク対照）のマウスは、グループ１のマウスより、肺組織における生存する鳥インフルエンザウイルスの１ログ（ｌｏｇ）より大きい値を示した。グループ３では、５匹のマウスのうちの５匹が陽性単離を示し、該グループのＧＭＴは、８．７２ｘ１０４ＴＣＩＤ５０／ｍｌであった。グループ４（非ワクチンおよびＰＢＳのみによる誘発）のマウスは、肺組織からのウイルス単離を示さなかった。
【００８７】
グループ１、グループ２およびグループ３の各々における１０匹のマウスを、誘発の日（４２日）から誘発２週間後（５６日）まで臨床的にモニターした。表４は、グループ１、グループ２およびグループ３の誘発後の死亡日を示す。実験の生活相の終結（実験日５６；誘発１４日後）までに、グループ１（実験ワクチン）における１００％のマウスが誘発に対して生き残った。グループ２（精製ワクチン）では、１０％のマウスが誘発に対して生き残った。グループ３（ブランク対照）では、１００％のマウスが誘発で死亡した。
【００８８】
【表１】
2009535306.tif 000002
【００８９】
【表２】
2009535306.tif 000003
* HAI GMT計算値<8を７として表した
** SN GMT計算値0を１として表した
【００９０】
【表３】
2009535306.tif 000004
【００９１】
【表４】
2009535306.tif 000005
【００９２】
本明細書で記載される実施例および具体例は、例示の目的のみであって、その目的における様々な修飾または変化が当業者によって推測され、それは本出願の精神および範囲ならびに添付の特許請求の範囲内に含まれることが理解されるべきである。さらに、本明細書中に記載されるいずれかの発明またはその具体例のいずれかの構成要素および限定は、本明細書中で開示されるいずれかのおよび／または全ての他の構成要素または限定（個別にまたはいずれかの組み合わせで）あるいはいずれか他の発明またはその具体例と組み合わせることができ、かかる組み合わせの全ては、それらに限定されることなく本発明の範囲内と意図される。
【手続補正書】
【提出日】平成20年12月17日(2008.12.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
2009535306000001.app
【国際調査報告】
2009535306.tif 000006
2009535306.tif 000007