(57)【要約】  本発明は、ＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）によってペプチド抗原として認識され、ＣＴＬに誘導される腫瘍細胞の溶解および／またはアポトーシスを誘発する特定のメラノーマ関連オリゴペプチドに関する。本発明はまた、癌治療におけるこれらのメラノーマ関連オリゴペプチドの使用に関する。【選択図】  なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
免疫原は９〜約１５残基長のペプチドであり、配列番号２、３、６、７、８、９、１０、１１、１２、１、４および５から選択されるアミノ酸配列を含み、該免疫原はメラノーマに特異的なＨＬＡによって制限されるＣＴＬ応答を誘発し、該ペプチドは基礎となる腫瘍抗原の全長配列には対応していない、メラノーマに特異的な免疫原。
【請求項２】
該免疫原が９〜１１残基長である請求項１記載の免疫原。
【請求項３】
該免疫原が配列番号２、３、６、７、８、９、１０、１１、１２、１、４および５のペプチドの１つと同一である請求項１記載の免疫原。
【請求項４】
該免疫原のアミノ酸配列はアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、逆位によって、および／または該配列の１つ以上のアミノ酸の化学的または物理的修飾によって誘導化が可能であり、該アミノ酸配列は配列番号１〜１２のペプチドの１つのアミノ酸配列に機能的に同等であり、該免疫原はＣＤ８陽性ＣＴＬに対するエピトープであり、腫瘍細胞に対するＣＤ８陽性ＣＴＬの免疫応答を誘発可能であり、該免疫応答はＭＨＣクラスＩ、対立遺伝子変異体ＡまたはＢの分子群のヒト白血球抗原に制限されている請求項１〜３のいずれかに記載の免疫原。
【請求項５】
‐ＮＨ‐ＣＯ‐結合または‐ＣＯ‐ＮＨ‐ペプチド結合の代わりに他の非ペプチド結合で設計され、請求項１〜４のいずれかに記載の免疫原に対応することを特徴とする、レトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチド。
【請求項６】
請求項１〜５のいずれかに記載の免疫原またはレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチド、ＨＬＡ分子の重鎖および自由リンカーからなり、該免疫原またはレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチドがＨＬＡ分子のペプチド結合溝を占有するように設計された融合タンパク質。
【請求項７】
請求項１〜４のいずれかに記載の免疫原または請求項６記載の融合タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項１〜４のいずれかに記載の少なくとも１つの免疫原および／または請求項５記載の少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項６記載の融合タンパク質および／または請求項７記載のポリヌクレオチドを含み、任意にそれぞれ許容可能な担体および賦形剤と共に含む組成物であることを特徴とする、Ｔ細胞、特にＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球をインビボまたはインビトロで活性化する医薬組成物。
【請求項９】
請求項７記載の少なくとも１つ以上のポリヌクレオチドを含み、自己、同種、異種または微生物起源の細胞において発現可能な組換えＤＮＡまたはＲＮＡベクター分子。
【請求項１０】
請求項７記載のポリヌクレオチドまたは請求項９のベクター分子を含む宿主細胞。
【請求項１１】
各免疫原に対する、あるいは各免疫原とＨＬＡとの複合体に対するポリクローナル、モノクローナルまたは組換え抗体を産生するための、請求項１〜４のいずれかに記載の少なくとも１つの免疫原および／または請求項５記載のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項７記載の融合タンパク質の使用。
【請求項１２】
請求項１〜４のいずれかに記載の少なくとも１つの免疫原および／または請求項５記載のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項７記載の融合タンパク質と、あるいは各免疫原とＨＬＡとの複合体と特異的に反応する抗体。
【請求項１３】
各免疫原に対するポリクローナルまたはモノクローナルまたは組換えＴ細胞受容体またはそれらと機能的に同等の分子を生産するための、請求項１〜４のいずれかに記載の少なくとも１つの免疫原および／または請求項５記載のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項７記載の融合タンパク質の使用。
【請求項１４】
請求項１〜４のいずれかに記載の少なくとも１つの免疫原および／または請求項５記載のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項７記載の融合タンパク質と特異的に反応するＴ細胞受容体またはそれと機能的に同等の分子。
【請求項１５】
請求項１４記載のＴ細胞受容体をコードするポリヌクレオチド。
【請求項１６】
請求項１４記載のＴ細胞受容体を発現する発現ベクター。
【請求項１７】
請求項１５記載のポリヌクレオチドまたは請求項１６記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１８】
少なくとも１つの免疫原および／または少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または少なくとも１つの融合タンパク質および／または少なくとも１つのポリヌクレオチドおよび／または少なくとも１つのＴ細胞受容体および／または少なくとも１つのベクター分子および／または少なくとも１つの宿主細胞および／または前記請求項のいずれかに記載の少なくとも１つの抗体を含み、任意に好適な添加剤および賦形剤と共に含む医薬組成物であることを特徴とする、請求項１〜４のいずれかに記載の免疫原の１つに関連する疾患治療用医薬組成物。
【請求項１９】
Ｔ細胞、特にＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球の活性化および機能状態を検出および／または影響および／または生成および／または増加および／または制御するための診断剤および／または治療剤および／または予防剤を生産するための、請求項１〜４のいずれかに記載の免疫原および／または請求項５記載のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項７記載の融合タンパク質の使用。
【請求項２０】
腫瘍治療または腫瘍形成予防処置に関連する免疫反応を誘発するための請求項１〜４のいずれかに記載の免疫原および／または請求項５記載のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または請求項７記載の融合タンパク質の使用。
【請求項２１】
前記請求項のいずれかに記載の少なくとも１つの免疫原および／または少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または少なくとも１つの融合タンパク質および／または少なくとも１つのポリヌクレオチドおよび／または少なくとも１つのＴ細胞受容体および／または少なくとも１つのベクター分子および／または少なくとも１つの宿主細胞および／または少なくとも１つの抗体の治療有効量を投与し、それにより治療効果を達成することを含む、メラノーマ患者の治療方法。
【請求項２２】
請求項１〜４のいずれかに記載のメラノーマに特異的な免疫原の応答誘発量を投与することを含む、メラノーマに特異的なＣＴＬ応答を誘発する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）によってペプチド抗原として認識され、ＣＴＬが誘導する腫瘍細胞の溶解および／またはアポトーシスを誘発する特定のメラノーマ関連オリゴペプチドに関する。本発明はまた、癌治療におけるこれらのメラノーマ関連オリゴペプチドの使用に関する。
【背景技術】
【０００２】
ＣＤ８陽性ＣＴＬは細胞免疫系のエフェクター細胞である。それらの機能は、感染または変性した内在細胞を特異的に排除することにある。とりわけＣＴＬは、クラスＩ主要組織適合複合体（ＭＨＣ）に結合し、変性細胞の表面に提示されている腫瘍特異性または腫瘍関連性ペプチド抗原（ＴＡＡ）を認識する。ＭＨＣクラスＩ分子に関してペプチド抗原は、ＣＴＬの特定の膜結合Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）により認識される。認識後、ＣＴＬは標的細胞を溶解し、および／または標的細胞のプログラム細胞死（アポトーシス）を誘導するか、またはサイトカインを放出して、関連した細胞は死滅する。本発明は、ヒト主要組織適合複合体（ＭＨＣ）クラスＩの分子への結合能を有するこれらの腫瘍関連ペプチドに関連する。このようなペプチドは、例えば腫瘍疾患の免疫療法で使用する。
【０００３】
免疫系を経て腫瘍細胞を排除する際、免疫系の成分による腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）の認識は優れた役割を担っている。この機序は、腫瘍細胞と正常細胞間には質的または量的差異があるという前提条件に基づいている。抗腫瘍応答を誘発するため、腫瘍細胞は、腫瘍を排除するに十分な免疫学的応答が起こる抗原を発現する必要がある。
【０００４】
細胞傷害性Ｔ細胞によりこのような免疫反応を誘起するため、外来タンパク質／ペプチドをＴ細胞に提示しなければならない。ＭＨＣ分子によりこれらを細胞表面に提示すれば、Ｔ細胞はペプチドフラグメントとしての抗原のみを認識する。これらＭＨＣ分子（「主要組織適合複合体」）は、細胞内で通常ペプチドに結合し、ペプチドを細胞表面へ輸送するペプチド受容体である。ペプチドとＭＨＣ分子のこの複合体はＴ細胞により認識可能である。ヒトＭＨＣ分子はまた、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）とも称する。
【０００５】
ＭＨＣ分子には２つのクラスがある：ＭＨＣクラスＩ分子はほとんどの有核細胞に見られ、内在タンパク質のタンパク質分解により形成されるペプチドを提示する。ＭＨＣクラスＩＩ分子はプロフェッショナル抗原提示細胞（ＡＰＣ）においてのみ見られ、エンドサイトーシスの間、ＡＰＣに受け取られ処理される外来タンパク質のペプチドを提示する。ペプチドおよびＭＨＣクラスＩの複合体は、ＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球に認識され、ペプチドおよびＭＨＣクラスＩＩの複合体は、ＣＤ４ヘルパーＴ細胞に認識される。
【０００６】
細胞性免疫応答を誘起することが可能なペプチドについて、そのペプチドはＭＨＣ分子に結合する必要がある。この過程はＭＨＣ分子の対立遺伝子およびペプチドのアミノ酸配列に依存している。ＭＨＣクラスＩ結合ペプチドは通常８〜１２残基長であり、その配列中に、ＭＨＣ分子の対応する結合溝と相互に作用する２つの保存残基（「アンカー」）を含んでいる。
【０００７】
腫瘍由来ペプチドに対して有効なＣＴＬ応答を開始することが可能な免疫系にとって、そのペプチドは、腫瘍細胞によって発現する特定のＭＨＣクラスＩ分子に単に結合可能であるというだけでなく、特定のＴ細胞受容体（ＴＣＲ、「Ｔ細胞受容体」）でＴ細胞に認識される必要がある。
腫瘍ワクチンを開発する主な目的は、ＣＤ８＋ＣＴＬに認識される腫瘍関連抗原の同定および性質決定である。
【０００８】
腫瘍特異性細胞傷害性Ｔリンパ球により認識される抗原またはそのエピトープはそれぞれ、酵素、受容体、転写因子等の全クラスのタンパク質由来の分子であり得る。他の重要なクラスの腫瘍関連抗原は、例えば多様な腫瘍タイプおよび健常精巣組織で発現するＣＴ（「癌精巣」）抗原といった組織特異的構造体である。
【０００９】
ＭＨＣクラスＩ分子に関して腫瘍細胞表面に提示される腫瘍関連ペプチド抗原には、例えば、ＭＡＧＥ‐３ではＷＯ９５／２５７３９Ａ１（特許文献１）；メラノーマおよびチロシナーゼではＵＳ６，６６０，２７６（特許文献２）ならびにメラノーマおよびｇｐ１００ではＥＰ０  ６６８  ３５０  Ｂ１（特許文献３）の記述が挙げられる。
【００１０】
したがってＴＡＡは腫瘍ワクチンの開発の出発点を意味する。ＴＡＡを同定および性質決定する方法は、一方では患者で事前に誘導されたＣＴＬの使用に基づいているか、あるいは腫瘍と正常組織間の差次的転写プロファイルの作成に基づいている。
【００１１】
ワクチン接種研究はこれまで、癌タイプ／生殖細胞系およびメラノソームタンパク質のカテゴリーから数種の腫瘍関連抗原を使用することに限定されていた。腫瘍組織で高頻度に発現し、集団内で高頻度に発生するＨＬＡ対立遺伝子中で提示される抗原が主に使用される。研究中治療を受ける患者がワクチン抗原に対して免疫応答可能であるかはまた、調査しなかった（例えばRosenberg, YangおよびRestifo Nat Med 10:909, 2004（非特許文献１）を参照）。
【００１２】
しかしながら、この戦略は腫瘍組織と生体自身の免疫系間の相互作用の、推定される基本的特性を考慮していないものである。集団全体において、伝染性で生命を脅かす感染での選択過程で、免疫応答のための優性抗原（ｄｏｍｉｎａｎｔ  ａｎｔｉｇｅｎ）および優先的（ｐｒｅｆｅｒｅｎｔｉａｌ）ＨＬＡ制限分子は認識可能となり、感染の克服およびその後の耐久性のある保護に本質的に寄与する。このような一定で、しかも反復的に観察可能な反応パターンは悪性腫瘍との相互作用において予期されないものである。この原因は：
‐腫瘍での遺伝的および後成的事象に起因する、悪性腫瘍の（同様の組織学的起源でさえ）個体間で多様な抗原表現型、
‐ＨＬＡ対立遺伝子の明白な多型、
‐特定のエピトープに反応する個々のＴ細胞レパートリーの能力にある。
【００１３】
数十種の腫瘍ペプチド抗原がＴ細胞に認識されることが知られている（例えばhttp://www.cancerimmunity.org/peptidedatabase）。しかし、これらは患者の抗腫瘍Ｔ細胞応答を立証するには確かに不十分である。本発明者らが説明したモデルにおいて、既知のペプチドに向けられていた抗腫瘍Ｔ細胞クローンは最大で１１％であった。それに代わりそれらは、個々に特異的に突然変異したペプチド、または患者自身のＨＬＡ対立遺伝子を経て提示された構造的に正常な腫瘍関連抗原の未知のペプチドを認識した。このことから、ヒト抗腫瘍Ｔ細胞レパートリーの組成物では個体間差が大きいことが分かる。
【特許文献１】国際公開第９５／２５７３９号パンフレット
【特許文献２】米国特許第６，６６０，２７６号明細書
【特許文献３】欧州特許第０  ６６８  ３５０号明細書
【非特許文献１】Rosenberg, YangおよびRestifo Nat Med 10:909, 2004
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１４】
この背景技術に対して、本発明の目的は、ヒト主要組織適合複合体（ＭＨＣ）クラスＩ分子に結合可能である免疫原性ペプチドの新規なアミノ酸配列を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１５】
第一の態様では、この目的は、メラノーマ特異性免疫原、特に単離した形態による発明にしたがって解決するものであり、この免疫原は９〜約１５残基長のペプチドで、配列番号１〜１２、さらに特定すると配列番号２、３および６〜１２より選択されたアミノ酸配列から成り、ここでは、基礎となる腫瘍抗原の全長配列にペプチドが応答しないのであれば、免疫原はメラノーマ特異性ＨＬＡ制限ＣＴＬ応答を誘発する。
【００１６】
２名のメラノーマ患者（Ｄ０５‐ＧＳおよびＤ１４‐ＳＪＲと称する）における本発明の範囲内では、１２種の新規なエピトープ（免疫原性ペプチド）を、癌／生殖細胞系（＝ＣＧ）およびメラノソームタンパク質のカテゴリーの既知の腫瘍抗原から同定する。ここでは前記エピトープは、患者の血液由来の腫瘍反応性ＣＤ８＋Ｔ細胞に、それ自身の腫瘍細胞上で、また前記患者に存在するＨＬＡクラスＩ対立遺伝子に関連して認識される。２種の突然変異抗原は、腫瘍特異的「ミスセンス」変異で遺伝子にコードされたことが分かった。突然変異の結果として、個々の患者のＴ細胞に認識される免疫原性ペプチドが産生される。以下の表１ではペプチドが収載されており、これらは最低濃度のＴ細胞、ならびにペプチドが提示されるためのＨＬＡ対立遺伝子に認識される。
【００１７】
本発明の範囲内では、用語「免疫原」、「免疫原性オリゴペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」は同じ意味として使用される。
【００１８】
本発明にしたがって同定された免疫原は、ペプチド配列ＷＱＹＦＦＰＶＩＦ（配列番号１；ＨＬＡ‐Ｃｗ＊０２０２０２制限）；ＫＲＣＦＰＶＩＦＧＫ（配列番号２；ＨＬＡ‐Ｂ＊２７０５０２制限）；ＫＶＤＥＬＡＨＦＬ（配列番号３；ＨＬＡ‐Ｃｗ＊０５０１制限）；ＮＭＶＰＦＦＰＰＶ（配列番号４；ＨＬＡ‐Ａ＊０２０１０１制限）；ＭＰＲＥＤＡＨＦＩＹ（配列番号５；ＨＬＡ‐Ｂ＊５１０１０１制限）；ＬＹＰＥＷＴＥＡＱＲ（配列番号６；ＨＬＡ‐Ａ＊２４０２０１０１制限）；ＫＹＫＤＹＦＰＶＩ（配列番号７；ＨＬＡ‐Ｃｗ＊０７０２またはＨＬＡ‐Ａ＊２４０２０１０１制限）；ＡＳＳＡＳＳＴＬＹＬ（配列番号８；ＨＬＡ‐Ｃｗ＊１５０２０１制限）、ＳＳＡＳＳＴＬＹＬ（配列番号９；ＨＬＡ‐Ｃｗ＊１５０２０１制限）およびＶＰＳＧＶＩＰＮＬ（配列番号１３；ＨＬＡ‐Ｂ＊０７０２０１制限）から成る。本発明にしたがって、野生型配列と比較して、変異した２種のＴＡＡエピトープも同定し（下線の変異アミノ酸）、すなわちＬＲＴＫＶＹＡＥＬ（配列番号１０；ＨＬＡ−Ｂ＊２７０５０２制限）およびＹＰＰＰＰＰＡＬＬ（配列番号１１；ＨＬＡ‐Ｂ＊５１０１０１制限）であった。
【００１９】
免疫原／オリゴペプチドを用いて、本発明にしたがって細胞傷害性Ｔ細胞を生成することが可能であり、これは本発明の免疫原／オリゴペプチドを発現する腫瘍細胞に対する抗原特異的ＭＨＣ制限細胞傷害性活性を起こし、その腫瘍細胞を破壊するものである。
【００２０】
したがってこれらのペプチドは、腫瘍患者に頻繁に見られる免疫反応の抑制が解除可能である有効な腫瘍治療の可能性を開拓するものである。
【００２１】
実施態様に示すように、本発明者らは、細胞傷害性Ｔ細胞が本発明に記載のオリゴペプチドに対して非常に有効に産生され、対応するＴＡＡを産生してそれを細胞表面に運ぶＭＨＣクラスＩ制限的方式で腫瘍細胞を死滅させることを首尾よく立証している。ＭＨＣクラスＩ分子を介して、これらの腫瘍細胞は自身で産生した全タンパク質のフラグメントを提示する。ペプチドを経てＴ細胞をあらかじめ活性化し、ＭＨＣクラスＩ分子によって提示されたペプチドを、細胞傷害性Ｔ細胞がここで認識すれば、Ｔ細胞は腫瘍細胞を死滅させる。したがってＴＡＡ発現細胞のＭＨＣクラスＩ分子により提示されたペプチドは、対応するＴＡＡを産生する腫瘍に対する免疫反応を特異的に誘発する有利な能力を呈する。
【００２２】
本発明において、本発明による免疫原は９〜１１残基長であることが好ましい。配列番号１〜１２のさらなるアミノ酸の「中核領域」にはＮおよび／またはＣ末端が存在し得る。これらのさらなるアミノ酸は対応するＴＡＡの元の配列から選択されることが好ましいが、他の既知の２０アミノ酸から選択することも可能である。したがって、ペプチドの長さは５００、４００、３００、２００、１００または５０アミノ酸であることが好ましいが、対応するＴＡＡの全体配列に対応しているわけではない（例えばＭＡＧＥ、ｇｐ１００等にも言えることである。表１を参照）。これらの拡張されたペプチドは特に細胞の外部負荷に適しており、（この理論に束縛されるわけではないが）さらに提示に対して処理される。ペプチドの長さは９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０アミノ酸であることがより好ましい。このような拡張された免疫原はまた、本発明による用語「オリゴペプチド」により構成される。
【００２３】
本発明はまた、前述したオリゴペプチドの１つおよび他のペプチドまたはタンパク質から成る融合タンパク質に関しており、それは診断剤または治療剤または予防剤としての使用に、あるいは一般的に配列番号１〜１２に見られるオリゴペプチドの１つを認識するＴ細胞の検出および／または操作に適している。例えば融合タンパク質は、ＨＳＡ、コラーゲンまたは他のタンパク質および本発明の１つ以上のオリゴペプチドといった担体タンパク質から成ることが可能である。これらの融合はまた、アミノ酸カセットとして本発明に記載の１つ以上のエピトープも含む。この融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは本発明の対象でもある。
【００２４】
配列番号１〜１２のペプチドの形態を修飾すると、目的の免疫応答も可能となる。
【００２５】
本発明の用語では、「修飾」は、ペプチドの任意の化学的、酵素的または他の修飾を意味する。このことは、ペプチドの産生中またはその後にすでに起こり得ることであり、個々のアミノ酸残基の除去または付加、個々のアミノ酸残基の置換、または特定の化学基の結合を介した個々のアミノ酸残基の化学的修飾によっても起こり得る。
【００２６】
本発明のさらなる態様は本発明に記載の免疫原に関しており、該免疫原はアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、逆位、および／またはその１つ以上のアミノ酸の化学的または物理的修飾により誘導可能であるアミノ酸配列を有し、前記アミノ酸配列は配列番号１〜１２のペプチドの１つのアミノ酸配列に対する機能的な同等物を表しており、前記免疫原はＣＤ８陽性ＣＴＬに対するエピトープであり、腫瘍細胞に対するＣＤ８陽性ＣＴＬの免疫応答を誘導することに適しており、前記免疫応答は、分子群ＭＨＣクラスＩ、変異型対立遺伝子ＡまたはＢのヒト白血球抗原に制限されている。本発明のさらなる態様は、請求項１〜４のいずれか１項記載の免疫原に対応しているという特徴を有するレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチドに関しており、‐ＣＯ‐ＮＨ‐ペプチド結合に代わり、‐ＮＨ‐ＣＯ‐結合または他の非ペプチド結合が形成される（例えばMeziere C, Viguier M, Dumortier H, Lo-Man R, Leclerc C, Guillet JG, Briand JP, Muller S. In vivo T helper cell response to retro-inverse peptidomimetics. J Immunol. 1997 Oct 1;159(7):3230-7.）。
【００２７】
免疫原は本発明にしたがう免疫原であることが特に好ましく、該免疫原は配列番号１〜１２のペプチドの１つと同一である。
【００２８】
本発明はまた、上述のオリゴペプチドの１つ、ＨＬＡ分子の重鎖および柔軟なリンカーから成ることが好ましく、オリゴペプチドがＨＬＡ分子のペプチド結合溝を占めるように構成される（それぞれ、占めるのに適した、または占めることが可能な、または可能ならしめられた）方式で設計されている融合タンパク質に関しており、融合タンパク質は診断剤または治療剤または予防剤としての使用に、あるいは一般的に配列番号１〜１２に配置されているオリゴペプチドの１つを認識するＴ細胞の検出および／または操作に適している。この融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは本発明の対象でもある。
【００２９】
さらなる好ましい実施態様において、本発明は、本発明にしたがう少なくとも１つの免疫原をコードする配列セグメントを含むヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドに関している。それ以外に、核酸は、ペプチドに対応する核酸配列を発現するのに必要なさらなる配列を任意に含む。使用の核酸は、細胞中のペプチドに対応する核酸配列の発現を可能にするのに適したベクターに含まれることは可能である。
【００３０】
このような核酸は、ペプチドより化学的に安定していて感受性が低いという利点を有する。したがって操作はペプチドの場合よりも簡便であり、核酸の保存に対する適合性はほとんど無限である。それらは化学的におよび／または分子生物学的に非常に費用効率が高く、非限定的な量で原則的に産生可能である。核酸を含むベクターのように、発現に必要な核酸配列は、これにより、核酸を介した細胞発現系を使用することで、非常に費用効率的に大量のペプチドを産生することができる利点を有する。
【００３１】
しかしながら、核酸は、対応するペプチドを自身で産生する方式で抗原提示細胞、特に樹状細胞を形質転換し、またその後ＭＨＣＩ分子により、それらを細胞傷害性Ｔ細胞またはその前駆細胞に提示することにも使用可能である。このことには、抗原提示細胞による対応するペプチドの提示は、外部からのみ提供されたペプチドを提示する場合より長期間持続するという利点がある。
【００３２】
本発明のさらなる態様は、Ｔ細胞、特にＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球のインビボまたはインビトロでの活性のための医薬組成物であり、これは、本発明にしたがう少なくとも１つの免疫原および／または本発明にしたがう少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または本発明にしたがう少なくとも１つの融合タンパク質および／または本発明にしたがう少なくとも１つのポリヌクレオチドを含み、任意に許容できる担体および賦形剤も含む。
【００３３】
その上、本発明のさらなる態様は、本発明にしたがう少なくとも１つ以上のポリヌクレオチドを含み、自己、同種、異種または微生物学的起源の細胞に発現し得る組換えＤＮＡまたはＲＮＡベクター分子である。本発明のさらなる態様は、このようなポリヌクレオチドまたはこのようなベクター分子を含んでいる個々の宿主細胞である。
【００３４】
本発明のさらなる態様は、ＭＨＣＩに制限された免疫応答を有効に誘発する量で、本発明にしたがうペプチドまたは本発明にしたがう核酸を含む医薬組成物に関する。
【００３５】
このために、該ペプチドおよび／または核酸は適当な通常の生薬として調製可能である。ペプチドの場合、これは例えば、ワクチン接種に通常使用されるアジュバントを含む製剤であり得る。核酸の場合、リポソームまたは小胞を有する製剤も可能である。適当な医薬製剤を使用することにより、初めはそれらを培養し、ペプチドまたは核酸での処理後、患者にそれらを投与するために、あらかじめ抗原提示細胞またはその前駆細胞を抽出する必要なく、生体を直接処理することが可能である。適当な医薬製剤を用いて、腫瘍は予防接種という形で治療し得る。
【００３６】
本発明のさらなる態様は、遺伝子治療との関連において、本発明にしたがう核酸の使用に関する。
【００３７】
ここで、遺伝子治療は、あらかじめ治療対象の生体から採取した抗原提示細胞、特に樹状細胞またはその前駆細胞を上述のように形質転換した形で行うことが可能であり、形質転換後に体に再投与することを目的としている。すでに述べたとおり、ペプチドの使用と比較して、提示期間が長いという利点がある。
【００３８】
他の可能性は、核酸を生体に誘導することであり、核酸が、抗原提示細胞、特に樹状細胞に選択的に受け取られ発現される方式で行われる。この応用の利点は、投与は別として、抽出した樹状細胞またはその前駆細胞の培養および選択的複製などの手段は追加する必要がないことである。
【００３９】
本発明はまた、細胞のインビトロでの形質転換または形質移入のための本発明にしたがう核酸の使用に関する。核酸のインビトロでの使用の利点は、例えば、細胞内への核酸の取り込みをかなり促進および改善するがインビボでは使用できないエレクトロポレーションなどの工程および／またはリン酸カルシウムやＤＥＡＥデキストランなどの補助剤が使用可能であるということである。
【００４０】
すでに述べたとおり、抗原提示細胞、特に樹状細胞は、例えば患者由来のその前駆細胞から得て、その後患者へ再誘導するなどの処理が可能である。
【００４１】
本発明の他の態様は、本発明にしたがう少なくとも１つのペプチドまたは核酸を使用し、腫瘍治療または腫瘍予防処置に関する免疫反応を誘発することである。ここでの利点は、腫瘍疾患において高頻度に見られる免疫抑制およびＴＡＡへの耐性は、本発明にしたがうペプチドおよび核酸を使用することによって修復可能であるという事実である。腫瘍治療を確立することに加えて、本発明にしたがう使用も採用可能である。
【００４２】
予防的治療は、例えば、遺伝的に素因があるか、あるいはすでに以前腫瘍を発症したことから腫瘍発生のリスクが多い人に主に有益であると思われる。
【００４３】
さらなる開発では、本発明にしたがう少なくとも１つのペプチドまたは核酸は抗原提示細胞、特に樹状細胞と共にインキュベートし、その後初めて、抗原提示細胞またはその前駆体が事前に抽出された生体に誘導される。
【００４４】
本方法の利点は、この方式で免疫反応を誘発した場合、免疫反応の強弱が変動するアジュバントと共にペプチドを注入した場合と比較して成功がより確実で制御可能になるということである。しかし、特に腫瘍治療の場合、効果のない治療で貴重な時間を失うことのないように免疫反応を誘導する場合、成功を常に確実にしなければならない。
【００４５】
本発明にしたがうオリゴペプチド（配列番号１〜１２およびその誘導体）はメラノーマ患者の活性的で受動的な免疫化に使用可能であり、配列番号１〜１２の対応するエピトープは特定の細胞傷害性Ｔリンパ球の誘導、生成および増加をもたらすために提示される。該Ｔリンパ球は個々の患者の腫瘍細胞を特異的に死滅させ、それによってどのような治癒でも媒介し、および／または支持することが可能である。
【００４６】
配列番号１〜１２のオリゴペプチドおよびレトロ逆位ペプチドまたはそれらから得られた擬ペプチドの誘導体は、関連した元のオリゴペプチド自体と比較して、（配列番号１〜１２のオリゴペプチドに対する）機能的自己寛容の可能性をＴ細胞レベルで回避できるという利点を有する。その反面、いくつかの正常組織での（低）発現に起因するオリゴペプチドは、ある状況では、関連生物（患者生体）のいわゆる寛容原であり、生物自体の（患者自体の）ＣＴＬに関して免疫原性はなく、これらのオリゴペプチド（配列番号１〜１２の）誘導体は概して、抗原として認識され、ＣＴＬの活性化および増加を誘導する。これらの誘導体誘導ＣＴＬは概して、関連した野生型配列、配列番号１〜１２との高い交差反応性を有し、結果として、その表面上のＨＬＡとの関連において配列番号１〜１２を提示するこのような（腫瘍）細胞の溶解および／またはアポトーシスも誘導する。
【００４７】
配列番号１〜１２のオリゴペプチドの誘導体は、他の哺乳動物または脊椎動物、例えばマウス由来の配列番号１〜１２の相同体において自然発生することが特に好ましい。配列番号１〜１２の（タンパク質）およびペプチド相同体ならびにそれらをコードする核酸は、生物から比較的簡単に、すなわち直接、従来の単離法で得ることが可能である。
【００４８】
オリゴペプチド配列番号１〜１２およびその誘導体ならびにレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチドは従来のペプチド合成法により産生可能であり、これらのオリゴペチドをコードするヌクレオチド配列は、公知の化学的および分子生物学的方法で得ることが可能である。
【００４９】
上記の、本発明にしたがうオリゴペプチド、ＨＬＡ分子の柔軟なリンカーおよび重鎖で、すなわちオリゴペプチドがＨＬＡ分子のペプチド結合溝を占めることが可能なように（それぞれ、行い得る位置で、あるいは好適な位置で）行う方式で、融合タンパク質を産生することも可能である。これらの融合タンパク質およびそれらをコードするポリヌクレオチドは診断剤、治療剤または予防剤（の活性物質）として特に適しており、あるいは一般的に、配列番号１〜１２に配置されたオリゴペプチドの１つを認識するＴ細胞の検出および／または操作に適している。
【００５０】
本発明にしたがうオリゴペプチド（配列番号１〜１２およびそれらの誘導体）、ならびにレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチドおよび上述の融合タンパク質は、患者のＴリンパ球のインビボ誘導にも、患者に本来備わっているか、または適合しない個々の反応性Ｔリンパ球のインビトロ誘導および増加にも適している。
【００５１】
患者のＴリンパ球のインビボ誘導および増加のために、様々な方法、例えば（ａ）本発明にしたがうオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つまたは両方の１つ以上の誘導体および／またはレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または上述した融合生成物を、ペプチド単独またはアジュバントまたはサイトカインと併用して、あるいはリポソームなどの好適な放出系中で注入する方法、（ｂ）少なくとも本発明にしたがうオリゴペプチドの１つ以上またはその誘導体および／またはレトロ逆位ペプチドの１つもしくは擬ペプチドおよび／または融合タンパク質の１つをコードする核酸を‐単独で、あるいは混合して、あるいはウイルスまたは非ウイルスベクターの形態で、あるいは陽イオン性脂質や陽イオン性ポリマーなどの放出系と共に注入する方法、（ｃ）自己、同種異系、異種または微生物学的起源の細胞に、本発明にしたがうオリゴペプチドまたはその誘導体またはそれに類似したレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチドを負荷する方法、（ｄ）自己、同種異系、異種または微生物学的起源の細胞に本発明にしたがうオリゴペプチドまたは他の種の相同体を、結果的にオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つもしくは両方の誘導体が関連した細胞上に提示されるように、負荷する方法、あるいは（ｅ）自己、同種異系、異種または微生物学的起源の細胞を、少なくとも本発明にしたがうオリゴペプチドもしくはその誘導体またはそれ由来のレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドまたは上述の融合タンパク質をコードする核酸で（「単独」で、あるいは混合して、あるいはウイルスまたは非ウイルスベクターの形態で）形質移入または感染させる方法、が考えられる。
【００５２】
インビトロでの誘導および増加の場合、インビトロで得たＴリンパ球はその後、点滴または注射または類似の工程により患者に投与する。
【００５３】
したがって本発明は、本発明にしたがうオリゴペプチド、および／またはその誘導体、および／またはそれに類似したレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチド、および／または上述の融合タンパク質、および／または少なくとも本発明にしたがうオリゴペプチドをコードする少なくとも１つのポリヌクレオチド、および／またはＴ細胞、特にＣＤ８陽性ＣＴＬの活性化および機能的状態を検出および／または影響および／または生成および／または増加および／または制御するための共有結合または非共有結合および／または予防剤および／または治療剤（特にワクチン）を使用して、少なくとも１つのこのような本発明にしたがうオリゴペプチドまたはレトロ逆位ペプチドまたは擬ペプチドが結合する診断剤、特にＭＨＣ四量体またはＭＨＣ二量体または他の構造を産生するためのオリゴペプチドの１つまたは両方の誘導体、の使用にも関する。
【００５４】
治療剤および／または予防剤として、特にワクチンまたは輸液の注射が考えられ、活性薬としてこれらは（ａ）本発明にしたがうオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの少なくとも１つの誘導体および／またはこれらのオリゴペプチドもしくはその誘導体の１つに類似した少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または少なくとも１つの上述の融合タンパク質を含み、および／または（ｂ）本発明にしたがうオリゴペプチドをコードする核酸または少なくともこれらのオリゴペプチドの１つの誘導体を含み、および／または（ｃ）特異的にオリゴペプチドおよび／またはその誘導体に向けられた、および／またはこれらのオリゴペプチドまたはこれらのオリゴペプチドの誘導体の１つに類似したレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドに向けられたインビトロ産生Ｔリンパ球を含む。
【００５５】
少なくとも配列番号１〜１２のオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つの少なくとも１つの誘導体をコードする１つ以上のポリヌクレオチドを含み、自己、同種異系、異種または微生物学的起源の細胞でそれぞれ転写または発現し得る組換えＤＮＡまたはＲＮＡベクター分子は、診断剤または治療剤または予防剤をも生成することに特に適している。したがって本発明は組換えＤＮＡまたはＲＮＡベクター分子およびこのベクター分子を含む宿主細胞も含む。
【００５６】
本発明にしたがって、診断剤または治療剤または予防剤として、あるいは一般的にＴＡＡを過剰発現する個々の細胞を検出および／または操作するために、ポリクローナル、モノクローナルまたは組換え抗体が使用可能であり、これらは配列番号１〜１２のオリゴペプチドに対しておよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つの誘導体に対しておよび／またはこれらのオリゴペプチドまたはその誘導体の１つに類似しているレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドに対しておよび／または上述の融合生成物に対して向けられているか、あるいはそれぞれ、個々のオリゴペプチドの１つおよび／またはその誘導体および／またはレトロ逆位ペプチドおよび／またはその擬ペプチドとＨＬＡとの複合体と反応する。
【００５７】
配列番号１〜１２のオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの誘導体および／またはこれらのオリゴペプチドの１つまたはこれらのオリゴペプチドの誘導体に類似したレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドあるいは比較的本発明にしたがうこのようなオリゴペプチドまたはレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドに対するポリクローナル、モノクローナルまたは組換え抗体を産生する融合タンパク質、ならびに個々の抗体自体を使用することも本発明の一部を形成している。
【００５８】
本発明にしたがって、診断剤または治療剤または予防剤として、あるいは一般的にＴＡＡを過剰発現する個々の細胞を検出および／または操作するために、ポリクローナル、モノクローナルまたは組換えＨＬＡ制限Ｔ細胞受容体またはそれと機能的に同等の分子が使用可能であり、これらは配列番号１〜１２のオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つの誘導体および／またはこれらに類似したレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または上述の融合生成物に特異的である。Ｔ細胞受容体またはそれと機能的に同等の分子は自己、同種異系または異種起源であり得る。
【００５９】
したがって、以下もまた、本発明の一部を形成する：上述の、配列番号１〜１２のオリゴペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つの誘導体および／またはこれらに類似したレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドの使用、あるいは、配列番号１〜１１の少なくとも１つのオリゴペプチドおよび／または本発明にしたがうこのようなオリゴペプチドまたはレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチド、関連のＴ細胞受容体自体およびそれと機能的に同等の分子に対する特異性を有するポリクローナル、モノクローナルまたは組換えＨＬＡ制限Ｔ細胞受容体またはそれと機能的に同等の分子を産生するためのこれらのオリゴペプチドの誘導体をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチド、ならびにこれらのＴ細胞受容体またはこれと機能的に同等の分子をコードするポリヌクレオチド、これらのＴ細胞受容体またはこれと機能的に同等の分子を発現する能力がある発現ベクターならびに対応する宿主細胞の使用。
【００６０】
本発明はまたＴ細胞、特にＣＤ８陽性ＣＴＬのインビボまたはインビトロでの活性のための試薬にも関しており、その試薬は特徴として、配列番号１〜１２のオリドペプチドおよび／またはこれらのオリゴペプチドの１つの少なくとも１つの誘導体および／またはこれらに類似した少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドまたは上述の少なくとも１つの融合タンパク質を使用し、および／または少なくともオリゴペプチドまたはその誘導体をコードする少なくとも１つのポリヌクレオチドを使用し、および／または対応するＴＡＡタンパク質または他の種のその相同体を使用して産生される。これらの試薬は、特に治療剤、とりわけワクチン全般であり得る。
【００６１】
本発明のさらなる態様は、本発明に記載の配列番号１〜１２の免疫原と関連する疾患、特にメラノーマを治療するための医薬組成物であり、該医薬組成物は特徴として、少なくとも１つの免疫原および／または少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または少なくとも１つの融合タンパク質および／または少なくとも１つのポリヌクレオチドおよび／または少なくとも１つのＴ細胞受容体および／または少なくとも１つのベクターモジュールおよび／または少なくとも１つの宿主細胞および／または少なくとも１つの本発明にしたがう抗体を含み、任意に好適な添加剤および賦形剤も含む。
【００６２】
また、本発明のさらなる態様は、Ｔ細胞、特にＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔ細胞の活性化および機能的状態を検出および／または影響および／または生成および／または増加および／または制御するための診断剤および／または治療剤および／または予防剤を生成するための本発明にしたがう免疫原および／または本発明にしたがうレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または本発明にしたがう融合タンパク質の使用に関する。
【００６３】
本発明のいっそうさらなる態様は、腫瘍治療または腫瘍形成を防ぐ処理に関連する免疫反応を誘発するための、本発明にしたがう少なくとも１つの免疫原および／または本発明にしたがうレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または本発明にしたがう融合タンパク質の使用に関する。
【００６４】
最終的に、本発明はメラノーマ患者を治療する方法に関しており、該方法は、治療有効量の、少なくとも１つの免疫原および／または少なくとも１つのレトロ逆位ペプチドもしくは擬ペプチドおよび／または少なくとも１つの融合タンパク質および／または少なくとも１つのポリヌクレオチドおよび／または少なくとも１つのＴ細胞受容体および／または少なくとも１つのベクター分子および／または少なくとも１つの宿主細胞および／または少なくとも１つの本発明の抗体を、それにより治療効果が得られる量で投与することを含む。他の態様はメラノーマ特異的ＣＴＬ応答を誘発する方法であり、これは本発明にしたがう応答を誘発する量のメラノーマ特異性免疫原を投与することを含んでおり、任意に上述の賦形剤を併用することもある。
【００６５】
本発明にしたがうさらに定義された免疫原の提供は、より多くの患者で治療的ワクチン接種研究を行うことを可能にする。このことに関し、個々に関連した抗原を含有させる機会は増えつつある。
【００６６】
前述の特性と明細書に記述された以下の特性は、本発明の範囲から逸脱することなく、それぞれ示された併用のみならず他の併用または単独でも使用可能であることは理解されている。
【発明を実施するための最良の形態】
【００６７】
本発明はここに、実施態様の例および添付図面の参照を用いて以下詳細に説明するが、これらに限定されるわけではない。
【００６８】
メラノーマ患者Ｄ０５‐ＧＳおよびＤ１４‐ＳＪＲにおける本発明にしたがうＴ細胞認識抗原
【表１】
2009511424.tif 000002
【実施例】
【００６９】
本発明にしたがうメラノーマペプチド抗原の同定を可能にする方法論的手技は以下に記述する。添付図面も参照のこと。
【００７０】
安定的に成長するメラノーマ細胞系を患者Ｄ０５‐ＧＳおよびＤ１４‐ＳＪＲの腫瘍から樹立した。また、数年間、オーストラリアのブリズベンでワクチン接種研究に参加したこれらの患者から血液を採取した。図１では、ワクチン接種の過程、血液採取の時点ならびに患者Ｄ０５‐ＧＳの腫瘍反応性ＭＬＴＣおよびＴ細胞クローンの起源が図式的に示されている。それに類似して対応する工程を患者モデルＤ１４‐ＳＪＲにも行った（図示せず）。
【００７１】
ブリズベンで、これらの血液試料からリンパ球を単離し、低温保存した。本発明を支持するものとして、ブリュッセルのLudwig Institute for Cancer Research（ＬＩＣＲと省略）のPierre van der Bruggen教授は、癌／生殖細胞系（ＣＧ）カテゴリーおよびメラニン細胞分化抗原カテゴリー中の合計３１個の抗原をコードする発現プラスミド中のｃＤＮＡクローンのパネルを作成した（表２）。
【００７２】
患者Ｄ０５‐ＧＳのメラノーマ系から、本発明者らはＲＴ‐ＰＣＲを用いて、ＨＬＡ対立遺伝子、ＨＬＡ‐Ａ＊０２０１０１、ＨＬＡ‐Ｂ＊２７０５０２、ＨＬＡ‐Ｂ＊４４０２０１０１、ＨＬＡ‐Ｃｗ＊０５０１、ＨＬＡ‐Ｃｗ＊０２０２０２をクローン化し、患者Ｄ１４‐ＳＪＲのメラノーマ系から、ＨＬＡ対立遺伝子、ＨＬＡ‐Ａ＊０３０１０１、ＨＬＡ‐Ａ＊２４０２０１０１、ＨＬＡ‐Ｂ＊０７０２０１、ＨＬＡ‐Ｂ＊５１０１０１およびＨＬＡ‐Ｃｗ＊１５０２０１をクローン化した。患者Ｄ１４‐ＳＪＲの対立遺伝子、ＨＬＡ‐Ｃｗ＊０７０２もまた協力という形で本発明者らは入手することができた。両者のメラノーマ系から、ｃＤＮＡバンクをｐｃＤＮＡ３．１で構築した。
【００７３】
腫瘍反応性ＭＬＴＣによる候補抗原の試験
【表２】
2009511424.tif 000003
【００７４】
いわゆるリンパ球／腫瘍細胞混合培養（ＭＬＴＣ）において、血液リンパ球を同一のドナー起源の個々の（自己の）腫瘍細胞で刺激した（図２）。
【００７５】
それにより応答系リンパ球において腫瘍特異性Ｔ細胞が増加した。各患者モデルにおいて、数年の研究から血液リンパ球により数種のこのようなＭＬＴＣ応答系集団が産生され、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を事前除去した後に様々な時点で低温保存した（図２）。低温保存に先立って、それらを自己メラノーマ細胞および自己ＥＢＶ形質転換Ｂ細胞の認識について調査した。また、ＭＬＴＣ応答系の優先的ＨＬＡ制限は、腫瘍細胞認識をＨＬＡ群特異性抗体で遮断することで判定した（図示せず）。
【００７６】
様々な時点で低温保存したＭＬＴＣ集団を、既知のメラノーマ関連抗原に対する反応性の「パネルテスト」で調査した。このため、前述の抗原をコードする発現プラスミドを、ＣＯＳ‐７細胞または２９３Ｔ細胞中の両患者の各ＨＬＡ対立遺伝子で形質移入した（表２）。形質移入体はその後、インターフェロン‐ガンマＥＬＩＳＰＯＴアッセイで、ＭＬＴＣ応答系による認識について試験した。図３には、患者モデルＤ０５‐ＧＳのＭＬＴＣ３．２（図３Ａ）の、ならびに患者モデルＤ１４‐ＳＪＲのＭＬＴＣ４．１（図３Ｂ）の試験例がそれぞれ示されている。本発明者らは以下の未知の抗原‐ＨＬＡ複合体に対するＴ細胞反応性を総括的に判定した（表２も参照）：
【００７７】
患者（モデル）Ｄ０５‐ＧＳ：
チロシナーゼ／ＨＬＡ‐Ｃｗ５；ＭＡＧＥ‐Ａ３／ＨＬＡ‐Ｃｗ２；ＭＡＧＥ‐Ａ６／ＨＬＡ‐Ｃｗ２；ＭＡＧＥ‐Ａ４／ＨＬＡ‐Ｂ２７およびＭＡＧＥ‐Ａ４／ＨＬＡ‐Ｃｗ５
【００７８】
患者（モデル）Ｄ１４‐ＳＪＲ：
メラン‐Ａ／ＨＬＡ−Ｂ５１；ｇｐ１００／ＨＬＡ‐Ａ２４；ＭＡＧＥ‐Ａ３／ＨＬＡ‐Ａ２４；ＭＡＧＥ‐Ａ６／ＨＬＡ‐Ａ２４；ＭＡＧＥ‐Ｃ２／ＨＬＡ‐Ａ２４；ＭＡＧＥ‐Ｃ２／ＨＬＡ−Ｂ７；ＭＡＧＥ‐Ｃ２／ＨＬＡ‐Ｃｗ７およびＭＡＧＥ‐Ｃ２／ＨＬＡ‐Ｃｗ１５
【００７９】
次の工程では、これらの抗原に対するペプチドコード遺伝子領域を同定した。このため、抗原コードｃＤＮＡはＰＣＲにより断片化し、該フラグメントを発現ベクター中で再度クローン化し、ＣＯＳ‐７または２９３Ｔ細胞中へそれぞれの提示ＨＬＡ対立遺伝子を同時形質移入し、ＭＬＴＣ集団またはＴ細胞クローンによる認識についてＩＦＮ‐γ‐ＥＬＩＳＰＯＴ試験で試験した。認識されたフラグメントをさらに裁断し、認識されたペプチドのＣ末端が同定されるまで試験した。図４には例として、患者モデルＤ０５‐ＧＳのＭＡＧＥ‐Ａ４／ＨＬＡ‐Ｃｗ５ペプチドの同定を示してある。数字はｃＤＮＡフラグメントにコードされたアミノ酸中のポリペプチド鎖の長さを示している。ペプチドは３工程（Ｉ〜ＩＩＩ）で同定された。第１の８つのフラグメントの試験から、ペプチドコード領域はアミノ酸８６と１２６間にあることが結論付けられた（Ｉ）。第２の試験では、認識されたペプチドのＣ末端は必ずアミノ酸１１６〜１２６間にあることが分かった（ＩＩ）。１つのアミノ酸によりＣ末端で連続的に裁断したポリペプチドをコードしたフラグメントの試験の結果として、認識されたペプチドのＣ末端はアミノ酸１２１と判定した（ＩＩＩ）。Ｃ末端ペプチドを正確に位置測定した後、９および１０アミノ酸長の最後のペプチドを合成し、Ｔ細胞による認識について調査した。表１にこの方式で同定されたペプチドを示す。
【００８０】
ＭＬＴＣ応答系の抗腫瘍反応性は既知のメラノーマ関連抗原に対する反応性の合計を上回っていた。ＭＬＴＣ集団を限界希釈法でクローン化し、メラノーマ細胞は認識するが公知の抗原は全く認識しない細胞傷害性Ｔ細胞クローンを選択した。
【００８１】
このようなクローンを、新規の抗原を探索するｃＤＮＡバンクスクリーニングのために選択した。ｃＤＮＡライブラリーを各１００個のｃＤＮＡクローンのプール（１００プール）群に分けた。このような１００プール群の中の２０００個からプラスミドを抽出した。ｃＤＮＡプール群は、ＣＯＳ‐７および／または２９３Ｔ細胞中の個々のモデル系の各ＨＬＡ‐ｃＤＮＡで同時形質移入し、形質移入体を、Ｔ細胞による認識についてＩＦＮ‐γ‐ＥＬＩＳＰＯＴアッセイで試験した。陽性１００プール群から、抗原コードｃＤＮＡをクローン化した。該クローンの挿入の配列決定を行った。比較のため、データベースの配列、ならびにＲＴ‐ＰＣＲにより作製した両患者の自己ＥＢＶ‐Ｂ‐形質転換Ｂ細胞由来の相同ｃＤＮＡ配列を使用した。
【００８２】
２つの抗原（モデルＤ１４‐ＳＪＲのＮ‐ＷＡＳＰおよびモデルＤ０５のＣＣＴ６Ａ（ＴＣＰ２０はＣＣＴ６Ａと同義語である））で、腫瘍特異的点突然変異が見られた。これらの変異を含み、利用可能なペプチドアルゴリズムにしたがった提示ＨＬＡ対立遺伝子に結合する合成ペプチドを合成し、Ｔ細胞認識について調査した。両ケースで突然変異ペプチドが認識されるが、相同非突然変異ペプチド（ＣＣＴ６Ａ、図５）は認識されず、野生型ペプチドの認識は変異型（Ｎ‐ＷＡＳＰ、図６Ｂ）と比較して１０００倍低頻度である。したがって腫瘍特異的新規突然変異により免疫原性ペプチドが生成された。これまで、他のメラノーマもＮ‐ＷＡＳＰおよびＣＣＴ６Ａの突然変異を示すかは不明であった。バンクスクリーニング中に見られる他の抗原、ＴＲＰ‐２は、Ｔ細胞抗原としても知られている構造的に正常なメラノソーム分化抗原に対応している。ｃＤＮＡ断片化を介して、本発明者らは、ＨＬＡ‐Ａ２、白人集団に最も一般的なＨＬＡクラスＩ対立遺伝子に提示される新規のペプチドを見出した（表１を参照）。
【００８３】
図５には、いわゆるクロム遊離試験における患者モデルＤ０５‐ＧＳから得た全抗原の認識をまとめてある。放射性５１Ｃｒを用いてクロム酸化した患者のＢ細胞を、１０３nmol/lから１０−４nmol/lの濃度の指定のペプチドで滴定により添加し、ペプチド反応性Ｔ細胞クローンと４時間共インキュベートした。Ｔ細胞が該ペプチドを認識するとＢ細胞が溶解し、それによって細胞からクロムが放出し、その放出を細胞上清から判定した（灰色部分のＫは対照を含んでいる；中黒の丸はペプチドのないＢ細胞の認識を示す；三角は自己クロム酸化メラノーマ細胞を示す；Ｅ：Ｔ＝標的細胞に対するエフェクター細胞の割合）。
【００８４】
図６Ａおよび６Ｂには、ＩＦＮ‐γＥＬＩＳＰＯＴアッセイにおける患者モデルＤ１４‐ＳＪＲから得た抗原の認識をまとめてある。ここで、個々のＨＬＡ‐ｃＤＮＡを形質移入した自己Ｂ細胞またはＣＯＳ‐７または２９３Ｔ細胞も抗原提示細胞として働く。これらは指定のペプチドを添加し、Ｔ細胞と２０時間共インキュベートした。これらの試験で該ペプチドもまた滴定した（６Ａの灰色部分のＫは対照を含んでいる：中黒の丸はペプチドのないＢ細胞の認識を示す；三角はＤ１４メラノーマ細胞の認識を示す。）。
【００８５】
参考文献：
T. Wolfel, A. Van Pel, E. De Plaen, C. Lurquin, J. Maryanski and T. Boon. Immunogenic (tum-) variants obtained by mutagenesis of mouse mastocytoma P815. VIII. Detection of stable transfectants expressing a tum- antigen with a cytolytic T cell stimulation assay. Immunogenetics 26: 178-187, 1987. 
T. Wolfel, E. Klehmann, C. Muller, K.-H. Schutt, K.-H. Meyer zum Buschenfelde and A. Knuth. Lysis of human melanoma cells by autologous cytolytic T cell (CTL) clones: Identification of HLA-A2 as a restriction element for three different antigens. J. Exp. Med. 170 :797-810, 1989. 
V. Brichard, A. Van Pel, T. Wolfel, C. Wolfel, E. de Plaen, B. Leth?, P. Coulie, and T. Boon. The tyrosinase gene codes for an antigen recognized by autologous cytolytic T lymphocytes on HLA-A2 melanomas. J. Exp. Med. 178: 489-495, 1993.
T. Wolfel, A. Van Pel, V. Brichard, J. Schneider, B. Seliger, K.-H. Meyer zum Buschenfelde, and T. Boon. Two tyrosinase nonapeptides recognized on HLA-A2 melanomas by autologous cytolytic T lymphocytes. Eur. J. Immunol. 24:759-764, 1994. 
P. Coulie, V. Brichard, A. Van Pel, T. Wolfel, J. Schneider, C. Traversari, S. Mattei, E. De Plaen, C. Lurquin, J.-P. Szikora, J.-C. Renauld, and T. Boon. A new gene coding for a differentiation antigen recognized by autologous cytolytic T lymphocytes on HLA-A2 melanomas. J. Exp. Med. 180:35-42, 1994. 
T. Wolfel, M. Hauer, J. Schneider, M. Serrano, C. Wolfel, E. Klehmann-Hieb, E. De Plaen, T.Hankeln, K.-H. Meyer zum Buschenfelde, and D. Beach. A p16INK4a-insensitive CDK4 mutant targeted by cytolytic T lymphocytes in a human melanoma. Science 269:1281-1284, 1995. 
V. G. Brichard, J. Herman, A. Van Pel, C. Wildman, B. Gaugler, T. Wolfel, T. Boon, and B. Leth?. A tyrosinase peptide presented by HLA-B44 is recognized by autologous cytolytic T lymphocytes. Eur. J. Immunol. 26:224-230, 1996.
W. Herr, J. Schneider, A.W. Lohse, K.-H. Meyer zum Buschenfelde, and T. Wolfel. Detection and quantification of blood-derived T lymphocytes secreting tumor necrosis factor alpha in response to HLA-A2.1-binding melanoma and viral peptide antigens. J.Immunol. Methods 191:131-142, 1996. 
W. Herr, B. Linn, N. Leister, E. Wandel, K.-H. Meyer zum Buschenfelde, and T. Wolfel. The use of computer-assisted video image analysis for the quantification of CD8+ T lymphocytes producing tumor necrosis factor a spots in response to peptide antigens. J. Immunol. Methods 203:141-152, 1997. 
J. Schneider, V. Brichard, T. Boon, K.-H. Meyer zum Buschenfelde, and T. Wolfel. Overlapping peptides of melanocyte differentiation antigen Melan-A/MART-1 recognized byautologous cytolytic T lymphocytes in association with HLA-B45.1 and HLA-A2.1. Int. J. Cancer 75:451-458, 1998. 
S. Morel, A. Ooms, A. Van Pel, T. Wolfel, V. Brichard, P. van der Bruggen, B. Van den Eynde and G. Degiovanni. A new tyrosinase peptide presented by HLA-B35 is recognized on a human melanoma by autologous cytotoxic T lymphocytes. Int. J. Cancer 83:755-759, 1999. 
C.Wolfel, I.Drexler, A. Van Pel, T. Thres, N. Leister, W. Herr, G. Sutter, C. Huber and T. Wolfel. Transporter (TAP)- and proteasome-independent presentation of a melanoma-associated tyrosinase epitope. Int. J. Cancer 88:432-438, 2000. 
C.M.Britten, R.G.Meyer, T.Kreer, I.Drexler, T.Wolfel, W.Herr. The use of HLA-A*0201-transfected K562 as standard antigen-presenting cells for CD8(+) T lymphocytes in IFN-gamma ELISPOT assays. J. Immunol. Methods 259:95-110, 2002. 
R.Konopitzky, U.Konig, R.G.Meyer, W.Sommergruber, T.Wolfel, and T.Schweighoffer. Identification of HLA-A*0201-restricted T cell epitopes derived from the novel overexpressed tumor antigen CLCA2. J. Immunol., 169:540-547, 2002. 
C.M.Britten, R.G.Meyer, N.Frankenberg, C.Huber. T.Wolfel. The use of clonal mRNA as antigenic format for the detection of antigen-specific T lymphocytes in IFN-gamma ELISPOT assays. J. Immunol. Methods, 287:125-136, 2004. 
A.Dorrschuck, A.Schmidt, E. Schnurer, M. Gluckmann, C.Albrecht, C.Wolfel, V.Lennerz, A.Lifke, C.Di Natale, E.Ranieri, L.Gesualdo, C.Huber, M.Karas, T.Wolfel, and W.Herr. CD8+ cytotoxic T lymphocytes isolated from allogeneic healthy donors recognize HLA-class Ia/Ib-associated renal carcinoma antigens with ubiquitous or restricted tissue expression. Blood, 104:2591-2599, 2004. 
Y.Zhang. Z.Sun. H.Nicolay, R.G.Meyer, N.Renkvist, V.Stroobant, J.Corthals, J.Carrasco, A.M.Eggermont, M.Marchand, K.Thielemans, T.Wolfel, T.Boon, P.van der Bruggen. Monitoring of anti-vaccine CD4 T cell frequencies in melanoma patients vaccianted with a MAGE-3 protein. J. Immunol. 174:2404-2411, 2005. 
R.G.Meyer, C.M.Britten, U.Siepmann, B.Petzold, T.A.Sagban, H.A.Lehr, B. Weigle, M.Schmitz, L.Mateo, B.Schmidt, H.Bernhard, T.Jakob, R.Hein, G.Schuler, B.Schuler-Thurner, S.N. Wagner, I.Drexler, G.Sutter, N.Arndtz, P.Chaplin, A.Enk, C.Huber, and T.Wolfel. A phase I vaccination study with tyrosinase in patients with stage II melanoma using recombinant modified vaccinia virus Ankara (MVA-hTyr). Cancer Immunol. Immunother. 54:453-467, 2005. 
C.M.Britten, R.G.Meyer, C.Graf, C.Huber, T.Wolfel. Identification of T cell epitopes by the use of rapidly generated mRNA fragments. J. Immunol. Methods 299:165-175, 2005.
【図面の簡単な説明】
【００８６】
【図１】ワクチン接種の過程、血液採取の時点ならびに患者Ｄ０５‐ＧＳの腫瘍反応性ＭＬＴＣおよびＴ細胞クローンの起源が図式的に示されている。
【図２】リンパ球／腫瘍細胞混合培養（ＭＬＴＣ）において、血液リンパ球を同一のドナー起源の個々の（自己の）腫瘍細胞で刺激した。それにより応答系リンパ球において腫瘍特異性Ｔ細胞が増加した。各患者モデルにおいて、数年の研究から血液リンパ球により数種のこのようなＭＬＴＣ応答系集団が産生され、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を事前除去した後に様々な時点で低温保存した。
【図３Ａ】患者モデルＤ０５‐ＧＳのＭＬＴＣ３．２（図３Ａ）の試験例。
【図３Ｂ】患者モデルＤ１４‐ＳＪＲのＭＬＴＣ４．１（図３Ｂ）の試験例。
【図４】図４には、患者モデルＤ０５‐ＧＳのＭＡＧＥ‐Ａ４／ＨＬＡ‐Ｃｗ５ペプチドの同定を示してある。
【図５】図５には、いわゆるクロム遊離試験における患者モデルＤ０５‐ＧＳから得た全抗原の認識をまとめてある。
【図６Ａ】図６Ａおよび６Ｂには、ＩＦＮ‐γＥＬＩＳＰＯＴアッセイにおける患者モデルＤ１４‐ＳＪＲから得た抗原の認識をまとめてある。
【図６Ｂ】図６Ａおよび６Ｂには、ＩＦＮ‐γＥＬＩＳＰＯＴアッセイにおける患者モデルＤ１４‐ＳＪＲから得た抗原の認識をまとめてある。
【図１】
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【図２】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図４】
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【図５】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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