(57)【要約】  本発明は、凝固因子が半減期を延長したポリペプチドに融合しており、両者がタンパク質分解によって切断可能なリンカーペプチドによって連結された治療用融合タンパク質に関する。このようなリンカーが切断されると、半減期を延長したポリペプチドによって引き起こされるあらゆる活性を弱める立体障害から凝固因子が開放され、それによって、凝固関連の分析で試験すると高いモル比活性度を有する融合タンパク質の生成が可能になる。さらに、このようなリンカーは切断可能であるということによって、ペプチドリンカーのタンパク質分解的切断後に不活性化および／または除去の速度を、それに対応するアミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された治療用融合タンパク質と比較して強化することが可能になる。
2009539391.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
治療用融合タンパク質であって
ａ）凝固因子、その変異体または誘導体、
ｂ）アルブミン（それらの変異体および誘導体を含む）、アルブミンファミリーのポリペプチド（それらの変異体および誘導体を含む）、および、抗原結合ドメインを有さない免疫グロブリン（それらの変異体および誘導体を含む）からなる群より選択された半減期を延長したポリペプチド、および、
ｃ）凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカー、
を含み、
ここにおいて該ペプチドリンカーは、凝固に関与するプロテアーゼによって切断することができるか、または、凝固酵素によって活性化され、さらに、そのような場合において、少なくとも１種の凝固関連の分析において、該治療用融合タンパク質は、アミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された各治療用融合タンパク質と比較して、高いモル比活性度を有する、上記タンパク質。
【請求項２】
治療用融合タンパク質であって、
ａ）凝固因子、その変異体または誘導体、
ｂ）アルブミン（それらの変異体および誘導体を含む）、アルブミンファミリーのポリペプチド（それらの変異体および誘導体を含む）、および、抗原結合ドメインを有さない免疫グロブリン（それらの変異体および誘導体を含む）からなる群より選択された半減期を延長したポリペプチド、および、
ｃ）凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカー、
を含み、
ここにおいて該ペプチドリンカーは、凝固に関与するプロテアーゼによって切断することができるか、または、凝固酵素によって活性化され、さらに、そのような場合において、該治療用融合タンパク質は、アミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された各治療用融合タンパク質と比較して、凝固に関連する様式で該ペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後に、活性化された凝固因子の高い不活性化速度を示す、上記タンパク質。
【請求項３】
治療用融合タンパク質であって、
ａ）凝固因子、その変異体または誘導体、
ｂ）アルブミン（それらの変異体および誘導体を含む）、アルブミンファミリーのポリペプチド（それらの変異体および誘導体を含む）、および、抗原結合ドメインを有さない免疫グロブリン（それらの変異体および誘導体を含む）からなる群より選択された半減期を延長したポリペプチド、および、
ｃ）凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカー、
を含み、
ここにおいて該ペプチドリンカーは、凝固に関与するプロテアーゼによって切断することができるか、または、凝固酵素によって活性化され、さらに、そのような場合において、該治療用融合タンパク質は、アミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された各治療用融合タンパク質と比較して、凝固に関連する様式で該ペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後に、活性化された凝固因子の高い除去速度を示す、上記タンパク質。
【請求項４】
融合タンパク質は、半減期を延長したポリペプチドに融合していない各凝固因子のインビボでの回復と比較して、より高いインビボでの回復を示す、請求項１〜３のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項５】
融合タンパク質は、半減期を延長したポリペプチドに融合していない各凝固因子の血漿半減期と比較して、長い血漿半減期を示す、請求項１〜４のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項６】
凝固因子は、ビタミンＫ依存性凝固因子である、請求項１〜５のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項７】
凝固因子は、ＦＶＩＩａ、または、ＦＩＸである、請求項１〜６のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項８】
半減期を延長したポリペプチドは、抗原結合ドメインを含まない免疫グロブリン、または、それらのフラグメントもしくは誘導体である、請求項１〜７のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項９】
リンカーは、ＦＸＩａ、および／または、ＦＶＩＩａ／ＴＦによって切断することができる、請求項１〜８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１０】
利用可能な様々な凝固関連の分析のうち少なくとも１種において、治療用融合タンパク質の凝固に関連するモル比活性度は、アミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された治療用融合タンパク質の場合の活性と比較して少なくとも２５％高い、請求項１〜９のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１１】
凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカーを切断した後の該凝固因子の不活性化速度は、それに相当するアミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された治療用融合タンパク質における凝固因子の不活性化速度と比較して少なくとも１０％高い、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１２】
凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカーを切断した後の該凝固因子の除去速度は、それに相当するアミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された治療用融合タンパク質における凝固因子の除去速度と比較して少なくとも１０％高い、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１３】
リンカーは、凝固因子を活性化するプロテアーゼまたはプロテアーゼ群によって切断することができる、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１４】
プロテアーゼまたはプロテアーゼ群によるリンカー切断の速度は、凝固因子の活性化の速度の３倍を超えて遅延しない、請求項１３に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１５】
リンカーは、凝固因子の関与によって活性化されるプロテアーゼまたはプロテアーゼ群によって切断することができる、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１６】
リンカーは、ＦＸＩａおよび／またはＦＶＩＩａ／ＴＦによって切断することができ、凝固因子は、ＦＩＸである、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１７】
リンカーは、ＦＸａおよび／またはＦＶＩＩａ／ＴＦによって切断することができ、凝固因子は、ＦＶＩＩａである、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１８】
リンカーは、表３ａおよび３ｂの群より選択された配列を含む、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項１９】
医薬物質として使用するための、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質。
【請求項２０】
請求項１〜１８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項２１】
請求項２０に記載の核酸を含むプラスミドまたはベクター。
【請求項２２】
発現ベクターである、請求項２１に記載のプラスミドまたはベクター。
【請求項２３】
ベクターは、ヒトの遺伝子治療に使用するためのトランスファーベクターである、請求項２２に記載のプラスミドまたはベクター。
【請求項２４】
請求項２０に記載のポリヌクレオチド、または、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のプラスミドまたはベクターを含む宿主細胞。
【請求項２５】
請求項２４に記載の宿主細胞を、治療用融合タンパク質が発現されるような条件下で培養することを含む、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質の製造方法。
【請求項２６】
宿主細胞または培地から治療用融合タンパク質を回収することをさらに含む、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
請求項１〜１８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質、請求項２０に記載のポリヌクレオチド、または、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のプラスミドまたはベクターを含む医薬組成物。
【請求項２８】
血液凝固障害を治療または予防するための医薬品を製造するための、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質、請求項２０に記載のポリヌクレオチド、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のプラスミドまたはベクター、または、請求項２４に記載の宿主細胞の使用。
【請求項２９】
血液凝固障害は、血友病Ｂである、請求項２８に記載の使用。
【請求項３０】
血液凝固障害は、ＦＶＩＩおよび／またはＦＶｌｌａの欠乏症である、請求項２８に記載の使用。
【請求項３１】
血液凝固障害は、血友病Ａである、請求項２８に記載の使用。
【請求項３２】
治療は、ヒトの遺伝子治療を含む、請求項２８〜３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３３】
凝血促進性の特性を有する医薬品を製造するための、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の治療用融合タンパク質、請求項２０に記載のポリヌクレオチド、請求項２１〜２３のいずれか一項に記載のプラスミドまたはベクター、または、請求項２３に記載の宿主細胞の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
序論
本発明は、それらの改変されていない元の治療用ポリペプチドと比較して高い半減期を有する改変された治療用融合タンパク質の分野に関する。本発明は、具体的には、タンパク質分解によって切断可能なリンカーペプチドによって連結された、半減期を延長したポリペプチド（ＨＬＥＰ）に融合した凝固因子に関する。このようなリンカーが切断されると、ＨＬＥＰによって引き起こされるあらゆる活性を弱める立体障害から治療用ポリペプチドが放出され、それによって、凝固因子の高いモル比活性度を保持する融合タンパク質の生成が可能になる。治療用融合タンパク質が酵素原である場合、対応するプロテアーゼに晒された際に、インビボでのそれらの活性化と実質的に同時に治療用ポリペプチドを放出するようなリンカーが特に好ましい。本発明のその他の形態は、凝固因子が活性化されて、ペプチドリンカーが、凝固に関連する様式でタンパク質分解によって切断されると、それに対応する切断可能なリンカーを有さない融合タンパク質と比較してより速い所定の凝固因子の不活性化速度を示すこと、および／または、凝固因子が活性化されて、ペプチドリンカーが、凝固に関連する様式でタンパク質分解によって切断されると、それに対応する切断可能なリンカーを有さない融合タンパク質と比較してより速い所定の凝固因子の除去速度を示すことである。
【０００２】
本発明の概念は、ヒトビタミンＫ依存性ポリペプチドの第ＩＸ因子、第ＶＩＩ因子および第ＶＩＩａ因子によって具体的に実証されるが、このような概念はまた、その他の凝固因子にも応用することができる。切断可能なリンカーペプチドで治療用ポリペプチドに連結されていればどのような半減期を延長したポリペプチド（ＨＬＥＰ）でもよいが、好ましいＨＬＥＰは、アルブミンまたは免疫グロブリン、または、それらから誘導されたフラグメント、例えば抗原結合ドメインを含まないＦｃフラグメントである。本発明はまた、切断可能な介在ペプチドリンカーをコードするオリゴヌクレオチドで連結された、ヒト血清アルブミンのようなＨＬＥＰをコードするｃＤＮＡに遺伝学的に融合した治療用ポリペプチドおよびそれらの誘導体をコードするｃＤＮＡ配列に関する。このようなコードされた誘導体は、それらの切断不可能な等価物と比較して、増加した改善された半減期、および、高いモル比活性度を示す。本発明はまた、このようなｃＤＮＡ配列を含む組換え発現ベクター、このような組換え発現ベクターで形質転換した宿主細胞、未改変であるが改善された半減期を有する野生型治療用ポリペプチドに匹敵する生物活性を有する組換えポリペプチドおよび誘導体に関する。本発明はまた、このような組換えタンパク質、および、それらの誘導体の製造方法に関する。本発明はまた、インビボでの半減期を高めるのに有用な、このような改変されたＤＮＡ配列を含むヒトの遺伝子治療に使用するためのトランスファーベクターも包含する。
【背景技術】
【０００３】
数種の組換え治療用ポリペプチドが、ヒトにおける治療および予防的な用途で市販されている。患者は、一般的に、組換えの活性成分の特異的な作用機序によって利益を得るが、それらの費用がかかり複雑な製造工程のために、それらの利用可能性が限定されるという不利益を被ることが多い。このような状況は、このような生成物の必要な用量または投与頻度を低減させることによって改善することができる。投与頻度を減らせば、患者にとっての利便性を改善することができ、従って、治療をより受け入れやすくすることができる。投与後のインビボでの半減期を高める目的を達成するためのいくつかの解決法が説明されている。近年提唱されている解決法としては、融合タンパク質の形成が挙げられ、特に短いインビボでの半減期を有するポリペプチドの場合、ＨＬＥＰに融合させることによって有意に半減期を高めることができる。
【０００４】
Ｂａｌｌａｎｃｅ等（ＷＯ０１／７９２７１）は、ヒト血清アルブミンに融合させると、インビボでの機能的な半減期を高め、貯蔵寿命を延長すると予想される多数の様々な治療用ポリペプチドの融合ポリペプチドを説明している。可能性のある融合のパートナーの長い一覧が説明されているが、これらのポリペプチドのほとんど全てに関して、それぞれのアルブミン融合タンパク質が実際に生物活性を保持し、改善された特性を有するという実験データを示していない。実施例として示されている治療用ポリペプチドの一覧のなかでも特に、第ＩＸ因子、および、第ＦＶＩＩ／ＦＶＩＩａ因子が挙げられている。また、アルブミンとＦＩＸまたはＦＶＩＩ／ＦＶＩＩａとの間にペプチドリンカーが存在するＦＩＸおよびＦＶＩＩ／ＦＶＩＩａの融合体も説明されている。しかしながら、切断可能なリンカーペプチドの使用は示唆されていない。
【０００５】
Ｓｈｅｆｆｉｅｌｄ等（Ｓｈｅｆｆｉｅｌｄ  Ｗ．Ｐ．等（２００４），Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．１２６：５６５〜５７３）は、マウスのＦＩＸ、８個のアミノ酸からなるリンカー（ＧＰＧ4ＴＭ）、マウスのアルブミン、および、２２個のアミノ酸からなるペプチドタグで構成されているマウス第ＩＸ因子アルブミン融合タンパク質、さらに加えて、ヒト第ＩＸ因子、７個のアミノ酸からなるリンカー（Ｇ6Ｖ）、および、ヒトアルブミンで構成されているヒト第ＩＸ因子アルブミン融合タンパク質を記載している。１段階のＦＩＸ依存性の凝固分析を用いたところ、マウスのＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質（ＭＦＵＳＴ）、および、ヒトＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質（ＨＦＵＳ）のモル比活性度は、それらの融合していない等価物の比活性度よりも少なくとも２〜３倍低く、この作用は少なくとも部分的に、ＦＸＩａによるより遅いタンパク質分解による活性化プロセスによるものである。Ｓｈｅｆｆｉｅｌｄは、ＦＩＸとアルブミンとの間の切断可能なリンカーを使用していないし、または、それらの使用を示唆もしていない。
【０００６】
数種の特許出願では、治療用ポリペプチドのインビボでの半減期を延長させるための、治療用ポリペプチドの免疫グロブリンの定常領域への融合が説明されている。ＷＯ２００２／０４５９８、ＷＯ２００３／０５９９３５、ＷＯ２００４／０８１０５３、ＷＯ２００４／１０１７４０、および、ＷＯ２００５／００１０２５には、治療用ポリペプチド部分に関する実施例としてＦＩＸが記載されている。また後者の２つの特許出願は、免疫グロブリンの定常領域に融合したＦＶＩＩ／ＦＶＩＩａも説明しており、融合タンパク質のホモ二量体は、単量体／二量体からなる融合タンパク質と比較して低い凝固活性を有することを見出している。ここでも、切断可能なリンカーペプチドの使用は示唆されていない。
【０００７】
ＷＯ９１／０９１２５において、血液凝固カスケードのプロテアーゼによって切断することができるリンカーで連結した融合タンパク質が開示されているが、この融合タンパク質は、線維素溶解性または抗血栓性のタンパク質を含むものに限定される。
【０００８】
ＷＯ０３／０６８９３４において、少なくとも１つの第一の構成分子、少なくとも１つのリンカー、および、少なくとも１つの第二の分子で構成されるキメラ分子が説明されており、ここにおいて上記リンカーは、第一の構成分子と第二の構成分子との間に天然に存在しないリンケージおよび切断部位を生産する酵素切断部位を含み、さらにこの切断部位でキメラ分子が切断されると、構成分子のうち少なくとも一方が機能的に活性になる。切断するためのプロテアーゼは、トロンビンのような凝固因子であり得る。その他のたくさんのものなかでも特に説明されている構成分子は、ＦＩＸ、および、ＦＶＩＩａである。しかしながら、本発明の治療用融合タンパク質は開示されていないし、さらに、開示された本発明の治療用融合タンパク質の改善された特性、例えば、切断可能なリンカーを有さない治療用タンパク質と比較して高いモル比活性度、高い不活性化および／または除去速度も開示されていない。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】
長い半減期を有する凝固因子が、医療的に非常に必要である。従来技術において、凝固因子を半減期を延長したポリペプチドに融合させることによって、この目的が達成されることが示されている。しかしながら、凝固中に、酵素原のタンパク質分解的切断（例えばＦＩＸ）、または、すでにタンパク質分解によって第二のポリペプチドに「予め」活性化された因子との接触（例えば、ＦＶＩＩａの組織因子への結合）のいずれかによって一度凝固因子が活性化されると、ＦＶＩＩａのような野生型の凝固因子に関するケースですでに報告されているように、それにより血栓性合併症が生じるために、凝固因子は、現在活性化された凝固因子の長い半減期を維持するには不適切になり（Ａｌｅｄｏｒｔ  Ｌ．Ｍ．，Ｊ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｈａｅｍｏｓｔ  ２（１０）：１７００〜１７０８（２００４））、活性化された因子が高い半減期を有するかどうかにさらに高い相関が生じるものと予想される。従って、本発明の目的の１つは、活性化後、または、補因子が利用可能性になった後でも、未改変の凝固因子の半減期に匹敵する半減期を有する、寿命が長い凝固因子を提供することである。
【００１０】
従来技術で説明されているような、さらに実施例６および７でも示されているような半減期を延長したポリペプチドへ凝固因子を融合させると、一般的に、融合した凝固因子のモル比活性度が低くなるという問題が生じる。本発明のその他の形態は、それに対応する切断可能なリンカーを有さない治療用融合タンパク質と比較して、延長された半減期を有し、高いモル比活性度を示す凝固因子を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
従って本発明は：
ａ）凝固因子、その変異体または誘導体、
ｂ）アルブミン（それらの変異体および誘導体を含む）、アルブミンファミリーのポリペプチド（それらの変異体および誘導体を含む）、および、免疫グロブリン（それらの変異体および誘導体を含む）からなる群より選択された半減期を延長したポリペプチド、および、
ｃ）凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカー、
含む治療用融合タンパク質に関し；
ここにおいて該ペプチドリンカーは、凝固に関与するプロテアーゼによって切断することができるか、または、凝固酵素によって活性化することができ、および、該治療用融合タンパク質は、アミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された各治療用融合タンパク質と比較して：
ｉ）少なくとも１種の凝固関連の分析において、高いモル比活性度、および／または
ｉｉ）凝固に関連する様式で該ペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後の、活性化された凝固因子の高い不活性化速度、および／または
ｉｉｉ）凝固に関連する様式で該ペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後の、活性化された凝固因子の高い除去速度、
を示す。
【００１２】
このような切断可能なリンカーのために、凝固に関連する様式でペプチドリンカーを切断した後に、凝固因子の挙動が天然型の融合していない因子の挙動によりいっそう近くなり、さらに、潜在的なプロトロンビンの作用による活性因子の延長された半減期を示さなくなる。
【００１３】
本発明の意味において、凝固に関連する様式でのタンパク質分解的切断とは、少なくとも１種の凝固因子または凝固補因子の活性化の結果として起こるあらゆるタンパク質分解的切断のことである。
【００１４】
用語「凝固に関連する様式でペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後に活性化された凝固因子」は、本発明の意味において、凝固因子が、リンカーペプチドのタンパク質分解的切断とほぼ平行して活性化されるか、または、リンカーペプチドのタンパク質分解的切断の前に凝固因子がすでに活性化されているかのいずれかを意味する。活性化は、例えば、凝固因子のタンパク質分解的切断によって生じるものでもよいし、または、補因子に結合することによって生じるものでもよい。
【００１５】
本発明のさらなる形態は：
ａ）凝固因子、その変異体または誘導体、
ｂ）アルブミン（それらの変異体および誘導体を含む）、アルブミンファミリーのポリペプチド（それらの変異体および誘導体を含む）、および、免疫グロブリン（それらの変異体および誘導体を含む）からなる群より選択された半減期を延長したポリペプチド、および、
ｃ）凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカー、
含む治療用融合タンパク質を提供することであり；
ここにおいて該ペプチドリンカーは、凝固に関与するプロテアーゼによって切断することができるか、または、凝固酵素によって活性化することができ、および、該治療用融合タンパク質は、アミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結された各治療用融合タンパク質と比較して：
ｉ）少なくとも１種の凝固関連の分析において、高いモル比活性度、および／または
ｉｉ）凝固に関連する様式で該ペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後の、活性化された凝固因子の高い不活性化速度、および／または
ｉｉｉ）凝固に関連する様式で該ペプチドリンカーがタンパク質分解によって切断された後の、活性化された凝固因子の高い除去速度、
を有し、さらに、未改変の凝固因子のインビボでの回復と比較して強化されたインビボでの回復、
を示す。
【００１６】
好ましくは、未改変の凝固因子と比較して、少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２５％、最も好ましくは４０％またはそれ以上に強化されたインビボでの回復を示す治療用融合タンパク質である。
【００１７】
好ましい凝固因子は、ビタミンＫ依存性凝固因子、ならびに、それらのフラグメントおよび変異体である。さらにより好ましくは、ＦＶＩＩａおよびＦＩＸ、ならびに、それらのフラグメントおよび変異体である。
【００１８】
好ましいＨＬＥＰは、アルブミン、および、それらのフラグメントまたは変異体、並びに、免疫グロブリン（それらのフラグメントおよび変異体を含む）である。
【００１９】
その他の好ましい実施態様において、リンカー領域は、発現された融合タンパク質の新抗原性の特性（ヒトタンパク質中には存在しない治療用抗原に含まれるペプチドが出現することによって、潜在的に免疫原性の新規のエピトープが形成されること）の危険が低減されると予想される、投与しようとする治療用ポリペプチドまたはそれらの変異体の配列を含む。さらにこのような治療用タンパク質が酵素原である（例えば、タンパク質分解による活性化を必要とする）ような場合においても、ペプチドリンカー切断の速度は、酵素原の凝固に関連する活性化の速度をよりいっそう密接に反映すると予想される。従って、このような好ましい実施態様において、酵素原およびそれに相当するリンカーが活性化され、それぞれ匹敵する速度で切断される。この理由のために、本発明はまた、具体的には、酵素原とＨＬＥＰとの融合タンパク質にも関し、ここにおいて関連するプロテアーゼによるリンカー切断の速度は、酵素原活性化の速度の３倍と遅延せず、最も好ましくは２倍と遅延しない。
【００２０】
さらなる実施態様において、リンカーペプチドは、１種より多くのプロテアーゼのための切断部位を含む。これは、異なるプロテアーゼでも同じ位置で切断することができるリンカーペプチド、または、２種またはそれ以上の異なる切断部位を提供するリンカーペプチドのいずれかによって達成できる。これは、酵素活性を達成するために、治療用融合タンパク質をタンパク質分解的切断によって活性化しなければならない場合、および、この活性化工程に異なるプロテアーゼが寄与する可能性がある場合において有利な環境となることがある。これは、例えば、ＦＩＸが活性化されると、ＦＸＩａまたはＦＶＩＩａ／組織因子（ＴＦ）のいずれかによって達成することができる場合である。
【００２１】
本発明の好ましい実施態様は、リンカーがプロテアーゼによって切断され、凝固因子を活性化することができる治療用融合タンパク質であり、それによって、リンカー切断が、凝固が起こる部位における凝固因子の活性化に確実に関連付けられるようになる。
【００２２】
本発明に係るその他の好ましい治療用融合タンパク質は、リンカーが、治療用融合タンパク質の一部である凝固因子によって切断することができる治療用融合タンパク質であり、このような場合、このような凝固因子が一度活性化されると、融合タンパク質の切断も、凝固に関する事象と確実に関連するようになる。
【００２３】
本発明に係るその他の好ましい治療用融合タンパク質は、リンカーが、そのものが治療用融合タンパク質の一部である凝固因子の活性によって直接的または間接的に活性化されるプロテアーゼによって切断することができる治療用融合タンパク質であり、このような場合、融合タンパク質の切断も、凝固に関する事象と確実に関連するようになる。
【００２４】
最も好ましい治療用融合タンパク質の１つのクラスは、リンカーが、ＦＸＩａおよび／またはＦＶＩＩａ／ＴＦによって切断することができ、凝固因子がＦＩＸである治療用融合タンパク質である。
【００２５】
本発明の要点は、ビタミンＫ依存性ポリペプチド第ＩＸ因子、切断可能なリンカー、および、ＨＬＥＰとしてアルブミン、加えて、それに対応するｃＤＮＡ配列によって具体的に実証される。本発明はまた、タンパク質分解によって活性化することができる、または、その他の酵素原またはポリペプチドの活性化に関与するその他のあらゆる凝固因子をコードするｃＤＮＡ配列に関する。これらのｃＤＮＡは、ヒト血清アルブミンまたはその他のＨＬＥＰをコードするｃＤＮＡ配列に遺伝学的に融合しており、介在する切断可能なペプチドリンカーをコードするオリゴヌクレオチドで連結されている。発現された治療用融合タンパク質は、それらの切断不可能な等価物と比較して高いモル比活性度を示す。本発明はまた、このような融合したｃＤＮＡ配列を含む組換え発現ベクター、このような組換え発現ベクターで形質転換した宿主細胞、未改変の野生型治療用ポリペプチドにほぼ匹敵する生物活性を有するが、改善されたインビボでの半減期を有する組換え治療用融合タンパク質および誘導体に関する。本発明はまた、このような組換えポリペプチド、および、それらの誘導体の製造方法に関する。本発明はまた、インビボでの生成物レベルを高めるのに有用な、このような改変されたＤＮＡ配列を含むヒトの遺伝子治療に使用するためのトランスファーベクターも包含する。
【００２６】
本発明に係る好ましい治療用融合タンパク質は、少なくとも１種の凝固関連の分析において、モル比活性度を有する治療用融合タンパク質であり、具体的には、切断可能なリンカーを有さない治療用融合タンパク質の場合の活性と比較して少なくとも２５％高いモル比活性度を有する治療用融合タンパク質である。より好ましくは、利用可能な様々な凝固関連の分析のうち少なくとも１種において、モル比活性度が少なくとも５０％高い治療用融合タンパク質であり、さらにより好ましくは、モル比活性度が少なくとも１００％高い治療用融合タンパク質である。
【００２７】
本発明のさらなる好ましい実施態様は、凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカーを切断した後の活性化された凝固因子の不活性化速度が、それに相当する切断可能なリンカーを有さない治療用融合タンパク質における活性化された凝固因子の不活性化速度と比較して少なくとも１０％高い治療用融合タンパク質である。より好ましくは、不活性化速度が少なくとも２５％高い治療用融合タンパク質であり、さらにより好ましくは、不活性化速度が少なくとも５０％高い治療用融合タンパク質である。
【００２８】
本発明のさらなる好ましい実施態様は、凝固因子と半減期を延長したポリペプチドとを連結するペプチドリンカーを切断した後の凝固因子の除去速度が、それに相当する切断可能なリンカーを有さない治療用融合タンパク質における凝固因子の除去速度と比較して少なくとも１０％高い治療用融合タンパク質である。より好ましくは、除去速度が少なくとも２５％高い治療用融合タンパク質であり、さらにより好ましくは、除去速度が少なくとも５０％高い治療用融合タンパク質である。
【００２９】
発明の詳細な説明
ビタミンＫ依存性ポリペプチド
ビタミンＫ依存性ポリペプチドは、治療用ポリペプチドの１つの群として、肝臓で補因子としてビタミンＫを用いて酵素的にγ−カルボキシル化されるポリペプチドである。このようなビタミンＫ依存性ポリペプチドは、例えば、第ＩＩ因子、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子、第Ｘ因子、プロテインＣ、プロテインＳ、ＧＡＳ６、および、プロテインＺである。
【００３０】
ヒトＦＩＸ
ヒトＦＩＸは、ビタミンＫ依存性ポリペプチド群の１メンバーとして、５７ｋＤａの分子量を有する単鎖糖タンパク質であり、これは、肝細胞によって、４１５個のアミノ酸からなる不活性な酵素原として血流に分泌される。これは、ポリペプチドのＮ末端のＧｌａ−ドメインに局在している１２個のγ−カルボキシ−グルタミン酸残基を含む。Ｇｌａ残基は、それらの生合成のためにビタミンＫを必要とする。Ｇｌａドメインに続いて、２種の上皮増殖因子ドメイン、活性化ペプチド、および、トリプシン型セリンプロテアーゼドメインがある。ＦＩＸのさらなる翻訳後修飾としては、水酸化（Ａｓｐ６４）、Ｎ−（Ａｓｎ１５７およびＡｓｎ１６７）、加えてＯ型の糖付加（Ｓｅｒ５３、Ｓｅｒ６１、Ｔｈｒ１５９、Ｔｈｒ１６９、および、Ｔｈｒ１７２）、硫酸化（Ｔｙｒ１５５）、および、リン酸化（Ｓｅｒ１５８）が挙げられる。
【００３１】
ＦＩＸは、Ａｒｇ１４５〜Ａｌａ１４６、および、Ａｒｇ１８０〜Ｖａｌ１８１での活性化ペプチドのタンパク質分解によってその活性型である第ＩＸａ因子に変換され、それにより、２種のポリペプチド鎖、Ｎ末端軽鎖（１８ｋＤａ）、および、Ｃ末端重鎖（２８ｋＤａ）の形成が起こるが、これらは、１個のジスルフィド架橋によって結合される。第ＩＸ因子の活性化による切断は、インビトロで、例えば第ＸＩａ因子、または、第ＶＩＩａ因子／ＴＦによって達成できる。第ＩＸ因子は、ヒト血漿中に５〜１０μｇ／ｍｌの濃度で存在する。ヒトにおける第ＩＸ因子の末梢血漿における半減期は、約１５〜１８時間であることが見出された（Ｗｈｉｔｅ  ＧＣ等．１９９７．Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ｆａｃｔｏｒ  ＩＸ．Ｔｈｒｏｍｂ  Ｈａｅｍｏｓｔ．７８：２６１〜２６５；Ｅｗｅｎｓｔｅｉｎ  ＢＭ等．２００２．Ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ｐｌａｓｍａ−ｄｅｒｉｖｅｄ  ａｎｄ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  Ｆ  ＩＸ  ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅｓ  ｉｎ  ｐｒｅｖｉｏｕｓｌｙ  ｔｒｅａｔｅｄ  ｐａｔｉｅｎｔｓ  ｗｉｔｈ  ｍｏｄｅｒａｔｅ  ｏｒ  ｓｅｖｅｒｅ  ｈｅｍｏｐｈｉｌｉａ  Ｂ．Ｔｒａｎｓｆｕｓｉｏｎ  ４２：１９０〜１９７）。
【００３２】
血友病Ｂは、第ＩＸ因子が機能しないか、または、失われることによって引き起こされるものであり、これは、血漿由来の第ＩＸ因子の濃縮物、または、第ＩＸ因子の組換え型で治療される。血友病Ｂ患者は、自然出血を回避するために第ＩＸ因子の予防的な投与を少なくとも２週に１度受けることが多いため、適用された第ＩＸ因子製品の半減期を長くすることによって投与間のインターバルを長くすることが望ましい。血漿中半減期の改善は、患者に有意な利点をもたらすと予想される。これまで血漿中半減期が改善された第ＩＸ因子の医薬配合物は市販されていないし、インビボでの長い半減期を有し、さらに、凝固関連の分析においてほとんど不変のモル比活性度を有するＦＩＸ変異体を示す何らのデータも公開されていない。従って、インビボでより長い機能的な半減期を有する第ＩＸ因子の形態を開発する医療上多大な必要性がそれでもなお存在する。
【００３３】
第ＶＩＩ因子および第ＶＩＩａ因子
ＦＶＩＩは、５０ｋＤａの分子量を有する単鎖糖タンパク質であり、これは、肝細胞によって、４０６個のアミノ酸からなる不活性な酵素原として血流に分泌される。ＦＶＩＩは、Ａｒｇ１５２〜Ｉｌｅ１５３における単一のペプチド結合のタンパク質分解によってその活性型である第ＶＩＩａ因子に変換され、それにより、２種のポリペプチド鎖、Ｎ末端軽鎖（２４ｋＤａ）、および、Ｃ末端重鎖（２８ｋＤａ）の形成が起こるが、これらは、１個のジスルフィド架橋によって結合される。その他のビタミンＫ依存性凝固因子とは異なり、活性化ペプチドは、活性化中に切断されない。第ＶＩＩ因子の活性化による切断は、インビトロにおいて、例えば、第Ｘａ因子、第ＩＸａ因子、第ＶＩＩａ因子、第ＸＩＩａ因子、第７因子活性化プロテアーゼ（ＦＳＡＰ）、および、トロンビンによって達成できる。Ｍｏｌｌｅｒｕｐ等．（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｅｎｇ．（１９９５）４８：５０１〜５０５）は、いくつかの切断は、Ａｒｇ２９０および／またはＡｒｇ３１５で重鎖でも起こることを報告している。
【００３４】
第ＶＩＩ因子は、血漿中に５００ｎｇ／ｍｌの濃度で存在する。活性化された第ＶＩＩａ因子としては、約１％または５ｎｇ／ｍｌの第ＶＩＩ因子が存在する。第ＶＩＩ因子の末梢血漿における半減期は、約４時間であり、第ＶＩＩａ因子の末梢血漿における半減期は約２時間であることがわかっている。
【００３５】
超生理学的な濃度の第ＶＩＩａ因子を投与することによって、第ＶＩＩＩａ因子および第ＩＸａ因子への必要性が回避され止血を達成することができる。第ＶＩＩ因子に関するｃＤＮＡのクローニング（ＵＳ４,７８４,９５０）は、活性化された第ＶＩＩ因子を製薬として開発することを可能にしている。第ＶＩＩａ因子の投与は、１９８８年に初めて成功している。その後継続的に、第ＶＩＩａ因子に関する指標の数が徐々に増えてきており、これは、第ＶＩＩａ因子が出血を止めることができる万能な止血剤になる可能性を示している（Ｅｒｈａｒｄｔｓｅｎ，２００２）。しかしながら、約２時間という第ＶＩＩａ因子の短い末梢における半減期、および、インビボでの低い回復は、その適用を制限している。従って、改善された半減期を有するが、その一方で凝固開始後のモル比活性度、不活性化速度、および／または、除去速度をほとんど犠牲にしない第ＶＩＩａ因子の形態を開発する医療上多大な必要性がそれでもなお存在する。
【００３６】
治療用融合タンパク質
「治療用融合タンパク質」とは、本発明の意味において、ヒトまたは動物に投与されると、予防または治療効果を引き起こすことができる、半減期を延長したポリペプチドに融合した凝固因子のことである。これらの治療用融合タンパク質は、静脈内、筋肉内、経口、外用、非経口またはその他の経路によってヒトまたは動物に投与することができる。包含される治療用融合タンパク質の特定のクラス、すなわち本発明の実施例に記載されているタンパク質のクラスは、例えばアルブミンおよび免疫グロブリン、ならびにそれらのフラグメントまたは誘導体のような半減期を延長したポリペプチドに連結した、例えばビタミンＫ依存性ポリペプチドのような凝固因子である。「治療用融合タンパク質」という表現は、「融合タンパク質」と交換可能に用いられる。
【００３７】
半減期を延長したポリペプチド（ＨＬＥＰ）
半減期を延長したポリペプチド（ＨＬＥＰ）の例として、アルブミン、アルブミンファミリーのメンバー、および、免疫グロブリン、並びに、それらのフラグメントまたは誘導体が上述されている。用語「ヒト血清アルブミン」（ＨＳＡ）および「ヒトアルブミン」（ＨＡ）は、本願において交換可能に用いられる。用語「アルブミン」および「血清アルブミン」は広範であり、ヒト血清アルブミン（およびそれらのフラグメントおよび変異体）、加えてその他の種由来のアルブミン（およびそれらのフラグメントおよび変異体）を包含する。
【００３８】
本明細書で用いられる「アルブミン」は、集合的に、アルブミンの１種またはそれ以上の機能的な活性（例えば生物活性）を有するアルブミンのポリペプチドもしくはアミノ酸配列、または、アルブミンのフラグメントもしくは変異体を意味する。具体的に言えば、「アルブミン」は、ヒトアルブミン、または、それらのフラグメントを意味し、特に、本明細書の配列番号１で示されるようなヒトアルブミンの成熟型またはその他の脊椎動物由来のアルブミンもしくはそのフラグメント、または、これらの分子の類似体もしくは変異体またはそれらのフラグメントを意味する。
【００３９】
アルブミン融合タンパク質のアルブミン部分は、上述のようなＨＡ配列の全長を含んでもよいし、または、治療活性を安定化すること、または、治療活性を長くすることが可能な１種またはそれ以上のそれらのフラグメントを含んでいてもよい。このようなフラグメントは、長さが１０個またはそれより多くのアミノ酸で構成であってもよいし、または、ＨＡ配列由来の約１５、２０、２５、３０、５０個またはそれより多くの隣接したアミノ酸を含んでいてもよいし、または、ＨＡの特定のドメインの一部または全部を含んでいてもよい。
【００４０】
本発明のアルブミン融合タンパク質のアルブミン部分は、正常なＨＡの、天然または人工のいずれかの変異体であってもよい。また本発明の融合タンパク質の治療用ポリペプチド部分は、本明細書において説明されているような対応する治療用ポリペプチドの変異体であってもよい。用語「変異体」は、挿入、欠失および置換を含み、これらは、保存的または非保存的のいずれでもよいし、天然または人工のいずれでもよいが、このような変化によって、治療用ポリペプチドの治療活性を付与する活性部位または活性ドメインは実質的に変更されないこととする。
【００４１】
具体的には、本発明のアルブミン融合タンパク質は、ヒトアルブミン、および、ヒトアルブミンのフラグメントの天然に存在する多型変異体を含んでいてもよい。このようなアルブミンは、あらゆる脊椎動物から誘導することができ、特にあらゆる哺乳動物、例えばヒト、ウシ、ヒツジ、または、ブタから誘導することができる。非哺乳動物のアルブミンとしては、これらに限定されないが、雌鶏、および、サケが挙げられる。アルブミンが連結されたポリペプチドのアルブミン部分は、治療用ポリペプチド部分とは異なる動物由来でもよい。
【００４２】
一般的に言えば、アルブミンフラグメントまたは変異体は、少なくとも１０個、好ましくは少なくとも４０個、最も好ましくは７０個より多いアミノ酸の長さを有すると予想される。アルブミン変異体は、好ましくは、少なくとも１つのアルブミンのドメイン全体、または、前記ドメインのフラグメント、例えばドメイン１（配列番号１のアミノ酸１〜１９４）、２（配列番号１のアミノ酸１９５〜３８７）、３（配列番号１のアミノ酸３８８〜５８５）、１＋２（配列番号１の１〜３８７）、２＋３（配列番号１の１９５〜５８５）、または、１＋３（配列番号１のアミノ酸１〜１９４＋配列番号１のアミノ酸３８８〜５８５）からなるものでもよいし、またあるいは、それらを含むものでもよい。各ドメインそのものは、残基Ｌｙｓ１０６〜Ｇｌｕ１１９、Ｇｌｕ２９２〜Ｖａｌ３１５、および、Ｇｌｕ４９２〜Ａｌａ５１１を含むフレキシブルなサブドメイン間のリンカー領域を介して、２つの相同サブドメイン、すなわち１〜１０５、１２０〜１９４、１９５〜２９１、３１６〜３８７、３８８〜４９１、および、５１２〜５８５で構成されている。
【００４３】
本発明のアルブミン融合タンパク質のアルブミン部分は、ＨＡまたはそれらの保存的な改変体の少なくとも１つのサブドメインもしくはドメインを含んでもよい。
【００４４】
治療用融合タンパク質の血漿中半減期が、融合していない凝固因子と比較して少なくとも２５％延長されるのであれば、あらゆるアルブミンのフラグメントおよび変異体が凝固因子の融合パートナーとして本発明に包含される。
【００４５】
アルブミンの他にも、アルファ−フェトプロテイン、アルブミンファミリーのその他のメンバーが特許請求され、結合した治療用ポリペプチドのインビボでの半減期を延長することができる（ＷＯ２００５／０２４０４４）。進化的に関連する血清輸送タンパク質であるアルブミンのタンパク質ファミリーは、アルブミン、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ；ＢｅａｔｔｉｅおよびＤｕｇａｉｃｚｙｋ  １９８２．Ｇｅｎｅ  ２０：４１５〜４２２）、アファミン（ａｆａｍｉｎ）（ＡＦＭ；Ｌｉｃｈｅｎｓｔｅｉｎ等．１９９４．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６９：１８１４９〜１８１５４）、および、ビタミンＤ結合タンパク質（ＤＢＰ；ＣｏｏｋｅおよびＤａｖｉｄ  １９８５．Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．７６：２４２０〜２４２４）からなる。それらの遺伝子は、ヒト、マウスおよびラットにおいて同じ染色体領域にマッピングされる構造的および機能的な類似性を有する多重遺伝子クラスターを示す。アルブミンファミリーメンバーの構造的な類似性は、ＨＬＥＰとしてのそれらの有用性を示唆している。従って、本発明のその他の目的は、このようなアルブミンファミリーメンバー、それらのフラグメントおよび変異体を、ＨＬＥＰとして使用することである。用語「変異体」は、挿入、欠失および置換を含み、これらは、望ましい機能が示されるのであれば保存的または非保存的のいずれでもよい。
【００４６】
アルブミンファミリーメンバーは、タンパク質ＡＦＰ、ＡＦＭ、および、ＤＢＰそれぞれのタンパク質の全長を含んでもよいし、または、治療活性を安定化することができる、または、治療活性を長くすることができる１種またはそれ以上のそれらのフラグメントを含んでいてもよい。このようなフラグメントは、１０個またはそれ以上のアミノ酸長さを有していてもよいし、または、それぞれのタンパク質配列の約１５、２０、２５、３０、５０個またはそれより以上の隣接したアミノ酸を含んでいてもよいし、または、ＨＬＥＰフラグメントが、融合していない凝固因子と比較して少なくとも２５％の半減期の延長を提供するのであれば、それぞれのタンパク質の特定のドメインの一部または全部を含んでいてもよい。本発明の治療用融合タンパク質のアルブミンファミリーメンバーは、ＡＦＰ、ＡＦＭ、および、ＤＢＰの天然に存在する多型変異体を含んでいてもよい。
【００４７】
また、ＨＬＥＰフラグメントが、融合していない凝固因子と比較して少なくとも２５％の半減期の延長を提供するのであれば、ＩｇＧおよびＩｇＧフラグメントをＨＬＥＰとして用いてもよい。治療用ポリペプチド部分は、融合タンパク質の高いモル比活性度を可能にする切断可能なリンカーを介して、ＩｇＧまたはＩｇＧフラグメントに連結される。第ＶＩＩ／ＶＩＩａ因子、および、第ＩＸ因子ＩｇＧ融合分子に関する例は、例えば、ＷＯ２００５／００１０２５（参照によりその全体を本発明に加入させる）で確認できる。これは、すなわち、２つの第ＶＩＩ因子（第ＶＩＩａ因子）分子と２つのＦｃ分子とで構成されるホモ二量体、および、１つの第ＦＶＩＩ（ＦＶＩＩａ）分子および２つのＦｃ分子で構成される単量体／二量体ハイブリッドを開示しており、この単量体／二量体は、ホモ二量体よりも約４倍大きい凝固活性を示す。本発明のリンカー配列は、例えばＦＸＩａ、ＦＸａまたはＦＩＸａのような凝固カスケードのプロテアーゼによって切断されると第ＦＶＩＩ（ＦＶＩＩａ）分子を放出し、それにより、コンストラクトの凝固活性、および、特に上記ホモ二量体の凝固活を、上記単量体／二量体に匹敵する活性レベルに、または、それよりもさらに高いレベルに高めることができる。配列番号９３に、切断可能なリンカーを含むＦＩＸ−Ｆｃ融合タンパク質の代表例を示す。表３ａおよび３ｂで示されるような切断可能なリンカーは、このケースに応用することもできる。
【００４８】
本発明は、具体的には、凝固因子またはそれらのフラグメントもしくは変異体を、ＨＬＥＰまたはそれらのフラグメントもしくは変異体のＮまたはＣ末端に連結させることを含む融合タンパク質に関し、このようなタンパク質において、介在する切断可能なペプチドリンカーは、治療用ポリペプチドとＨＬＥＰとの間に導入されることによって、形成された融合タンパク質が、ＨＬＥＰと連結していない凝固因子と比較してインビボで長い半減期を有するようになり、さらに、融合タンパク質が、利用可能な様々な凝固関連の分析のうち少なくとも１種において、それに対応する切断不可能なリンカーを含む融合タンパク質と比較して少なくとも２５％高いモル比活性度を有するようになる。
【００４９】
本願で用いられている「凝固因子」は、これらに限定されないが、第ＩＸ因子、第ＶＩＩ因子、第ＶＩＩＩ因子、フォン−ウィルブランド因子、第Ｖ因子、第Ｘ因子、第ＸＩ因子、第ＸＩＩ因子、第ＸＩＩＩ因子、第Ｉ因子、第ＩＩ因子（プロトロンビン）、プロテインＣ、プロテインＳ、ＧＡＳ６、または、プロテインＺ、加えてそれらの活性型からなるポリペプチドが挙げられる。さらに、有用な治療用ポリペプチドは、野生型ポリペプチドである場合もあり、または、突然変異を含むもの場合もある。糖付加またはその他の翻訳後修飾の程度および位置は、選択された宿主細胞、および、宿主細胞の環境の性質に応じて様々であってよい。特定のアミノ酸配列に言及される場合、このような配列の翻訳後修飾は、本願に包含される。
【００５０】
上記の定義内の「凝固因子」は、あらゆる天然の多型を含む天然のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。また「凝固因子」は、実質的にポリペプチドがそれぞれの治療用ポリペプチドの活性を保持しているのであれば、わずかに改変されたアミノ酸配列を有するポリペプチドも含み、例えば、末端のアミノ酸の欠失または付加を含む改変されたＮ末端またはＣ末端を有するポリペプチドが挙げられる。包含される変異体は、野生型の配列とは１またはそれ以上のアミノ酸残基において異なる。このような差の例としては、Ｎおよび／またはＣ末端における１個またはそれ以上のアミノ酸残基（例えば、好ましくは１〜３０個のアミノ酸残基）のトランケーション、または、Ｎおよび／またはＣ末端における１個またはそれ以上の追加の残基の付加、加えて、保存的アミノ酸置換、すなわち類似の特徴を有するアミノ酸グループ（例えば（１）小さいアミノ酸、（２）酸性アミノ酸、（３）極性アミノ酸、（４）塩基性アミノ酸、（５）疎水性アミノ酸、および、（６）芳香族アミノ酸）内で行われる置換が挙げられる。以下の表に、このような保存的置換の例を示す。
【００５１】
【表１】
2009539391.tif 000003
【００５２】
本発明の融合タンパク質のインビボでの半減期は、通常は終末における半減期またはβ半減期として決定され、これらは一般的に、融合していないポリペプチドのインビボでの半減期よりも少なくとも約２５％、好ましくは少なくとも約５０％、および、より好ましくは１００％よりも長い。
【００５３】
本発明の融合タンパク質は、それに対応する切断可能なリンカーを有さない融合タンパク質と比較して、少なくとも２５％、好ましくは少なくとも５０％、より好ましくは少なくとも１００％高いモル比活性度を有する。
【００５４】
これに関して、モル比活性度（または、本明細書において具体的に考慮されているように、凝固に関連するモル比活性度）は、対象の治療用ポリペプチドまたは治療用融合タンパク質の１モル（または、例えば１ナノモル）当たりの示された活性と定義される。モル比活性度を計算することによって、研究されるポリペプチドの異なる分子量または光学密度の影響を受けない異なるコンストラクトの活性を直接的に比較することが可能になる。モル比活性度は、以下の表２でＦＩＸおよびＦＩＸ−ＨＳＡ融合タンパク質について例示されているようにして計算してもよい。
【００５５】
【表２】
2009539391.tif 000004
【００５６】
凝固に関連するモル比活性度を決定するために、凝固プロセスに関連する酵素活性または補因子活性を決定することによるあらゆる分析が使用可能である。
【００５７】
従って、「凝固関連の分析」は、本発明の意味において、凝固プロセスに関連する酵素活性または補因子活性を決定するあらゆる分析か、または、固有の、または、固有でない凝固カスケードのいずれかが活性化されているのかを決定することができるあらゆる分析のことである。従って「凝固関連の」分析は、直接的な凝固分析でもよく、例えば、ａＰＴＴ、ＰＴ、または、トロンビン生成分析が挙げられる。しかしながら、例えば、特定の凝固因子に適用される発色分析のようなその他の分析も含まれる。このような分析または対応する試薬の例としては、パトロムチン（Ｐａｔｈｒｏｍｔｉｎ(R)）ＳＬ（ａＰＴＴ分析，デイド・ベーリング（Ｄａｄｅ  Ｂｅｈｒｉｎｇ））、または、対応する凝固因子が欠乏した血漿（デイド・ベーリング）と共に、トロンボレル（Ｔｈｒｏｍｂｏｒｅｌ（Ｒ））Ｓ（プロトロンビン時間の分析，デイド・ベーリング）、例えば凝固因子が欠乏した血漿を用いたトロンビン生成分析キット（テクノクローン（Ｔｅｃｈｎｏｃｌｏｎｅ），トロンビンスコープ（Ｔｈｒｏｍｂｉｎｏｓｃｏｐｅ））、発色分析、例えばバイオフェン（Ｂｉｏｐｈｅｎ）の第ＩＸ因子（ハイフェン・バイオメド（Ｈｙｐｈｅｎ  ＢｉｏＭｅｄ））、スタクロット（Ｓｔａｃｌｏｔ（Ｒ））ＦＶＩＩａ−ｒＴＦ（ロシュ・ダイアグノスティックス社（Ｒｏｃｈｅ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ  ＧｍｂＨ））、コーテスト（Ｃｏａｔｅｓｔ（Ｒ））第ＶＩＩＩ因子：Ｃ／４（クロモジェニックス（Ｃｈｒｏｍｏｇｅｎｉｘ））、または、その他のものが挙げられる。
【００５８】
本発明の目的のために、上記の分析、または、等価な凝固関連の分析のいずれか１種において増加がみられれば、モル比活性度の増加が示されるとみなされる。例えば、２５％の増加は、上記分析または等価な分析のいずれかにおいて２５％の増加がみられたことを意味する。
【００５９】
治療用融合タンパク質が本発明の範囲内に入るかどうかを決定するために、これらのタンパク質のモル比活性度を比較するための標準は、それぞれの凝固因子とそれぞれのＨＬＥＰとがアミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーで連結されているコンストラクトである。
【００６０】
ＦＩＸの場合、ａＰＴＴ分析が、凝固活性の決定に用いられることが多い。このような凝固分析（ａＰＴＴ分析）は、実施例５でより詳細に説明されている。しかしながら、その他の凝固関連の分析または分析原理も、ＦＩＸに関するモル比活性度を決定するのに適用することができる。
【００６１】
組換え治療用ポリペプチド薬物は一般的に費用がかかるものであり、全ての国々にとってこのような薬物に基づいた多大な費用を要する治療を行う余裕があるわけではない。このような薬物のインビボでの回復を増加させることによって、これらの製品をより安価に使用できるようにし、より多くの患者がそれらによって利益を得るようにすることができる。本発明の融合タンパク質の場合、インビボでの回復の増加も望ましい利点となり得る。「インビボでの回復」は、本発明の意味において、製品投与の直後に血液または血漿中に見出される製品の量を意味する。従って、インビボでの回復を検出するためには、一般的に、製品投与の数分（例えば、５または１５分）後の血漿の含量が決定される。
【００６２】
活性化されていない凝固因子に関して、高いインビボでの回復および長い半減期を示すことが望ましいが、プロトロンビンの危険性を回避するために、それらを活性化した後、またはそれらの補因子を活性化した後に、凝固因子の半減期を制限することが有利である。従って、凝固プロセスが開始した後に、活性な凝固因子の半減期は、再度減少すると予
想される。これは、凝固に関連する様式で不活性化を強化すること、または、凝固因子を除去することのいずれかによって達成することができる。
【００６３】
本発明に係る不活性化は、例えば、凝固因子とそれに対応する凝固因子の阻害剤との複合体形成によって、または、例えばＦＶＩＩＩおよびＦＶの場合において知られているようなさらなるタンパク質分解的切断によって引き起こされる可能性がある治療用ポリペプチドの活性の減少を意味する。
【００６４】
活性化された治療用融合タンパク質の不活性化速度は、例えば、阻害剤との反応によって、または、タンパク質分解による不活性化によって活性が減少する速度と定義される。不活性化速度は、活性化された凝固因子のモル比活性度を、生理学的な量のこの凝固因子の阻害剤の存在下で時間に対して追跡することによって測定することもできる。あるいは、不活性化速度は、活性化された製品を動物に投与して、その後、活性および抗原分析を用いて血漿サンプルを適切な時間枠で試験することによって決定してもよい。
【００６５】
治療用融合タンパク質に関して、これらのタンパク質が本発明の範囲内であるかどうかの決定が必要な場合、これらの治療用タンパク質の不活性化速度を比較するための標準は、それぞれの凝固因子とそれぞれのＨＬＥＰとがアミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーを介して連結しているコンストラクトである。
【００６６】
活性化された治療用融合タンパク質の除去速度は、ヒトまたは動物の循環系からポリペプチドが除去される速度と定義される。除去速度は、静脈内投与後の活性化された治療用融合タンパク質の薬物動態を測定することによって決定してもよい。循環系からの直接の除去による除去は、抗原分析を用いて決定することができる。加えて、特定の除去および不活性化速度は、活性分析を用いて決定することができる。
【００６７】
治療用融合タンパク質に関して、これらのタンパク質が本発明の範囲内であるかどうかの決定が必要な場合、これらのタンパク質の除去速度を比較するための標準は、それぞれの凝固因子とそれぞれのＨＬＥＰとがアミノ酸配列ＧＧＧＧＧＧＶを有する切断不可能なリンカーを介して連結しているコンストラクトである。
【００６８】
本発明によれば、治療用ポリペプチド部分は、切断可能なペプチドリンカーを介してＨＬＥＰ部分と結合する。このようなリンカーは非免疫原性であると予想され、プロテアーゼによって切断できる程十分にフレキシブルであると予想される。融合タンパク質が酵素原である場合、このようなリンカーの切断は、融合タンパク質内の治療用ポリペプチドの活性化と同程度に迅速に行われると予想される。
【００６９】
切断可能なリンカーは、好ましくは、以下から誘導された配列を含む：
ａ）治療用ポリペプチドの活性化中にタンパク質分解によって切断されるタンパク質分解的切断部位を含む場合、それ自身が投与される治療用ポリペプチド、
ｂ）この治療用ポリペプチドの基質ポリペプチド、または、
ｃ）治療用ポリペプチドの直接的または間接的な関与によって活性化または形成された、プロテアーゼによって切断される基質ポリペプチド。
【００７０】
より好ましい実施態様において、リンカー領域は、発現された融合タンパク質の新抗原性の特性の危険を減少させると予想される、適用しようとする治療用ポリペプチドの配列を含む。また、治療用タンパク質が酵素原である場合（例えば、タンパク質分解によって活性化される必要がある場合）において、ペプチドリンカーの切断速度は、酵素原の凝固に関連する活性化速度の影響をより強く受けると予想される。
【００７１】
その他の好ましい実施態様において、治療用ポリペプチドは、ＦＩＸ酵素原であり、ＨＬＥＰは、アルブミンである。この場合において、リンカー配列は、ＦＩＸの活性化領域の配列、ＦＸまたはＦＶＩＩのようなＦＩＸのいずれかの基質の切断領域、または、ＦＩＸａがその活性化に関与するプロテアーゼによって切断されるあらゆる基質ポリペプチドの切断領域から誘導されたものいずれかである。
【００７２】
特に好ましい実施態様において、リンカーペプチドは、ＦＩＸそれ自身から誘導される。その他の好ましい実施態様において、リンカーペプチドは、ＦＸまたはＦＶＩＩから誘導される。その他の好ましい実施態様において、リンカー配列は、ＦＸＩａまたはＦＶＩＩａ／ＴＦによって切断することができる２つの切断配列、２つのＦＩＸの生理的に適切な活性化因子を含む。
【００７３】
治療用ポリペプチド、切断可能なリンカー、および、ＨＬＥＰの典型的な組み合わせとしては、これらに限定されないが、表３ａおよび３ｂで列挙したコンストラクトが挙げられる：
【００７４】
【表３】
2009539391.tif 000005
【００７５】
【表４】
2009539391.tif 000006
【００７６】
ＦＩＸ活性化ペプチドのＮ末端領域から誘導されたリンカーの場合において、天然の多型Ｔ１４８−Ａ１４８に従って、その配列は、この位置にＴの代わりにＡを含むことができる。
【００７７】
【表５】
2009539391.tif 000007
【００７８】
また、表３ａおよび３ｂに記載のリンカーを切断するプロテアーゼまたはプロテアーゼ群によって、または、上記で定義されたタイプのプロテアーゼによってなお切断可能なリンカーであれば、説明されているリンカーの変異体およびフラグメントも本発明に包含される。用語「変異体」は、挿入、欠失および置換を含み、保存的または非保存的のいずれでもよい。
【００７９】
上述の切断配列、および、それらの変異体のその他の組み合わせも、本発明に含まれるものとする。
【００８０】
その他の実施態様において、ペプチドリンカーの翻訳後修飾パターンを変化させるアミノ酸置換が含まれる。これらは、例えば、グリコシル化、硫酸化またはリン酸化されるアミノ酸の置換であり得る。
【００８１】
本発明のその他の実施態様において、治療用ポリペプチドとＨＬＥＰ部分との間のペプチドリンカーは、翻訳後修飾を付加するためのコンセンサス部位を含む。好ましくは、このような修飾は、糖付加部位からなる。より好ましくは、このような修飾は、Ａｓｎ−Ｘ−Ｓｅｒ／Ｔｈｒ構造の少なくとも１つのＮ−糖付加部位からなっており、ここにおいてＸは、プロリン以外のあらゆるアミノ酸を意味する。さらにより好ましくは、このようなＮ−糖付加部位は、ペプチドリンカーのアミノおよび／またはカルボキシ末端の近傍に挿入され、このようにして、治療用ポリペプチド部分がペプチドリンカーに移行した配列、または、ペプチドリンカーがアルブミン部分の配列に移行した配列において発生する可能性があるネオエピトープを保護することができる。
【００８２】
図１：インビトロでの、ＦＸＩａ：融合タンパク質が約１：５００のモル比での、ＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のＦＸＩａでの３７℃における活性化である。切断不可能なリンカーを有する１つの融合タンパク質（１４７８／７９７）、および、切断可能なリンカーを有する２つの融合タンパク質（１０８８／７９７、および、１０８９／７９７）を用いた。サンプルを還元条件下でＳＤＳ−ＰＡＧＥによって解析し、続いてクーマシーブルーで染色した。
図２：活性化されていない融合タンパク質と比較した、切断可能なリンカーを有する、および、それらを有さない、活性化されたｒｅｃＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の薬物動態である。
図３：活性化されたｒｅｃＦＩＸまたはＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のＡＴによる不活性化である。１２０分後に、非活性化部分のトロンボプラスチン時間の分析を用いて残留したＦＩＸ活性を決定した。
【図面の簡単な説明】
【００８３】
【図１】インビトロでの、ＦＸＩａ：融合タンパク質が約１：５００のモル比での、ＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のＦＸＩａでの３７℃における活性化である。
【図２】活性化されていない融合タンパク質と比較した、切断可能なリンカーを有する、および、それらを有さない、活性化されたｒｅｃＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の薬物動態である。
【図３】活性化されたｒｅｃＦＩＸまたはＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のＡＴによる不活性化である。
【実施例】
【００８４】
実施例１：ＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質をコードするｃＤＮＡの生成
第ＩＸ因子のコード配列を、ＰＣＲで、ヒト肝臓ｃＤＮＡライブラリー（ＰｒｏＱｕｅｓｔ，インビトロジェン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ））から、プライマーＷｅ１４０３およびＷｅ１４０４（配列番号５および６）を用いて増幅した。プライマーＷｅ１４０５およびＷｅ１４０６（配列番号７および８）を用いた２回目のＰＣＲサイクルの後に、得られたフラグメントを、ｐＣＲ４ＴＯＰＯ（インビトロジェン）にクローニングした。続いて、ＦＩＸのｃＤＮＡを、ＥｃｏＲＩフラグメントとして、予め内部のＸｈｏＩ部位を除去したｐＩＲＥＳｐｕｒｏ３（ＢＤバイオサイエンス（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ））のＥｃｏＲＩ部位に移した。得られたプラスミドをｐＦＩＸ−４９６と名付け、これを第ＩＸ因子野生型用の発現ベクターとした。
【００８５】
アルブミン融合コンストラクトを生成するために、ＦＩＸのｃＤＮＡをＰＣＲで、停止コドンを欠失させてその代わりにＸｈｏＩ部位を導入したプライマーＷｅ２６１０およびＷｅ２６１１（配列番号９および１０）を用いて標準条件下で再度増幅した。得られたＦＩＸフラグメントを制限エンドヌクレアーゼＥｃｏＲＩおよびＸｈｏＩで消化し、以下で説明するようにして、ＥｃｏＲＩ／ＢａｍＨ１で消化したｐＩＲＥＳｐｕｒｏ３に、１種のＸｈｏＩ／ＢａｍＨ１で消化したリンカーフラグメントと共にライゲーションした。
【００８６】
内部の切断部位を有さない２種の異なるグリシン／セリンリンカーフラグメントを作製した：オリゴヌクレオチドＷｅ２１４８およびＷｅ２１５０（配列番号１１および１２）を、等モル濃度（１０ｐｍｏｌ）で、標準的なＰＣＲ条件下でアニールし、充填して、２分間のＰＣＲプロトコールを用いて増幅した。初回の９４℃での変性、それに続いて、９４℃で１５秒の変性、５５℃で１５秒のアニーリング、および、７２℃で１５秒の伸長を７サイクル、および、仕上げに７２℃で５分間の伸長工程を行った。オリゴヌクレオチドＷｅ２１５６、および、Ｗｅ２１５７（配列番号１３および１４）を用いて同じ手法を行った。得られたリンカーフラグメントを、制限エンドヌクレアーゼＸｈｏＩおよびＢａｍＨ１で消化し、上記で説明したライゲーション反応で別々に使用した。このようにして得られたプラスミドは、ＦＩＸに関するコード配列、および、グリシン／セリンリンカーのＣ末端の伸長を含む。
【００８７】
ＦＩＸの活性化部位から誘導された２種の異なる切断可能なリンカーフラグメントを作製した：オリゴヌクレオチドＷｅ２３３５およびＷｅ２３３６（配列番号１５および１６）は、ＦＩＸ軽鎖／活性化ペプチドの境界領域の活性化された切断部位を含み、これらをアニールし、充填し、上述のようにして増幅した。得られたリンカーフラグメントを制限エンドヌクレアーゼＸｈｏＩおよびＢａｍＨ１で消化し、上記で説明したライゲーション反応で使用した。このようにして得られたプラスミドは、ＦＩＸに関するコード配列、および、切断可能なＦＩＸ配列（配列番号２のアミノ酸１３６〜１５４）のＣ末端の伸長を含む。それに続く、オリゴヌクレオチドＷｅ２６３６およびＷｅ２６３７（配列番号１７および１８）を用いた市販の変異誘発キット（クイックチェンジ（ＱｕｉｃｋＣｈａｎｇｅ）ＸＬ部位特異的変異誘発キット，ストラタジーン（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ））での、部位特異的変異誘発反応において、ＸｈｏＩ部位を欠失させた。
【００８８】
ＦＩＸから誘導された第二の切断可能なリンカーフラグメントを生成するために、リンカー構築用のオリゴヌクレオチドＷｅ２３３７およびＷｅ２３３８（配列番号１９および２０）を用いて同じ手法を行った。得られたリンカーフラグメントを制限エンドヌクレアーゼＸｈｏＩおよびＢａｍＨ１で消化し、上記で説明したライゲーション反応で使用した。このようにして得られたプラスミドは、ＦＩＸに関するコード配列、および、ＦＩＸ活性化ペプチド／重鎖の境界領域（配列番号２のアミノ酸１７３〜１８６）の活性化された切断部位から誘導された切断可能なＦＩＸ配列のＣ末端の伸長を含む。上述のようにＸｈｏＩ部位を欠失させるために、オリゴヌクレオチドＷｅ２６３８およびＷｅ２６３９（配列番号２１および２２）を用いた。
【００８９】
次のクローニング工程で、上記で生成したプラスミドをＢａｍＨ１で消化し、成熟ヒトアルブミンのｃＤＮＡを含むＢａｍＨ１フラグメントを挿入した。このフラグメントを、アルブミンのｃＤＮＡ配列でのＰＣＲによって、プライマーＷｅ１８６２およびＷｅ１９０２（配列番号２３および２４）を用いて、標準条件下で生成させた。
【００９０】
切断不可能なグリシン／セリンリンカーを有する最終的なプラスミドを、それぞれｐＦＩＸ−９８０（配列番号３０）、および、ｐＦＩＸ−９８６（配列番号３１）と名付けた。ＦＩＸ配列から誘導された切断可能なリンカーを有する最終的なプラスミドを、それぞれｐＦＩＸ−１０８８（配列番号４０）、および、ｐＦＩＸ−１０８９（配列番号４９）と名付けた。以下で、それらのリンカー配列、および、Ｃ末端のＦＩＸ、および、Ｎ末端のアルブミン配列を概説する。リンカー内のタンパク質分解的切断部位は、矢印で示し、ＦＩＸから誘導されたリンカー配列は、下線で示した。
【００９１】
【化１】
2009539391.tif 000008
【００９２】
ＣＨＯ細胞中で発現させるために、ＦＩＸアルブミン融合タンパク質に関するコード配列を、それぞれベクターｐＩＲＥＳｎｅｏ３（ＢＤバイオサイエンス）、または、ｐｃＤＮＡ３．１（インビトロジェン）に移した。
【００９３】
ＦＩＸを発現する細胞中でのプロペプチドの効率的なプロセシングのためには、大量のフューリンの共発現が必要である（Ｗａｓｌｅｙ  ＬＣ等．１９９３．ＰＡＣＥ／Ｆｕｒｉｎ  ｃａｎ  ｐｒｏｃｅｓｓ  ｔｈｅ  ｖｉｔａｍｉｎ  Ｋ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｐｒｏ−ｆａｃｔｏｒ  ＩＸ  ｐｒｅｃｕｒｓｏｒ  ｗｉｔｈｉｎ  ｔｈｅ  ｓｅｃｒｅｔｏｒｙ  ｐａｔｈｗａｙ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：８４５８〜８４６５）。フューリンを、プライマーＷｅ１７９１およびＷｅ１７９２（配列番号２５および２６）を用いて肝臓のｃＤＮＡライブラリー（アンビオン（Ａｍｂｉｏｎ））から増幅した。プライマーＷｅ１８０８およびＷｅ１８０９（配列番号２７および２８）を用いた２回目のＰＣＲサイクルによって、カルボキシ末端膜貫通ドメイン（ＴＭ）が欠失しており、停止コドンが導入されたフューリンフラグメントが得られた；このフラグメントを、ｐＣＲ４ＴＯＰＯ（インビトロジェン）にクローニングした。続いて、フューリン(ＴＭｃＤＮＡを、ＥｃｏＲＩ／ＮｏｔＩフラグメントとして、予め内部のＸｈｏＩ部位を欠失させたｐＩＲＥＳｐｕｒｏ３（ＢＤバイオサイエンス）のＥｃｏＲＩ／ＮｏｔＩ部位に移した。得られたプラスミドをｐＦｕ−７９７と名付けた。このプラスミドを、全てのＦＩＸコンストラクトで、１：５（ｐＦｕ−７９７：ｐＦＩＸ−ｘｘｘ）のモル比でコトランスフェクションした。ｐＦｕ−７９７によってコードされた分泌されたフューリンのアミノ酸配列は、配列番号２９として示される。
【００９４】
実施例２：ＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のトランスフェクションおよび発現
プラスミドをＥ．ｃｏｌｉのＴＯＰ１０（インビトロジェン）中で増殖させ、標準的なプロトコール（キアゲン（Ｑｉａｇｅｎ））を用いて精製した。ＨＥＫ−２９３細胞をリポフェクトアミン２０００試薬（インビトロジェン）を用いてトランスフェクションし、無血清培地（インビトロジェン２９３エキスプレス（Ｅｘｐｒｅｓｓ））中で、５０ｎｇ／ｍｌのビタミンＫ、および、４μｇ／ｍｌのピューロマイシンの存在下で増殖させた。トランスフェクションした細胞群をＴ−フラスコを介してローラーボトルまたは小規模の発酵槽に散布し、そこから上清を精製するために回収した。
【００９５】
あるいは、ＣＨＯＫ１またはＤＧ４４細胞（インビトロジェン）をリポフェクトアミン２０００試薬（インビトロジェン）を用いてトランスフェクションし、無血清培地（インビトロジェンＣＤ−ＣＨＯ）中で、５０ｎｇ／ｍｌのビタミンＫ、および、５００〜７５０ｎｇ／ｍｌのゲネチシンの存在下で増殖させた。高発現のクローンを選択し、Ｔ−フラスコを介してローラーボトルまたは小規模の発酵槽に散布し、そこから上清を精製するために回収した。
【００９６】
実施例３：ＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の精製
ＦＩＸまたはＦＩＸアルブミン融合タンパク質を含む細胞培養の回収物を、５０ｍＭのトリス×ＨＣｌ／１００ｍＭのＮａＣｌ緩衝液（ｐＨ８．０）で予め平衡化したＱ−セファロースＦＦカラムに適用した。その後、カラムを２００ｍＭのＮａＣｌを含む平衡緩衝液で洗浄した。結合したＦＩＸまたはＦＩＸ融合タンパク質の溶出を、基剤として５０ｍＭのトリス×ＨＣｌ／２００ｍＭのＮａＣｌ緩衝液（ｐＨ８．０）を用いた塩の濃度勾配によって達成した。溶出液を、ヒドロキシルアパタイト樹脂でのカラムクロマトグラフィーによってさらに精製した。この目的のために、Ｑ−セファロースＦＦカラムの溶出液を、５０ｍＭのトリス×ＨＣｌ／１００ｍＭのＮａＣｌ緩衝液（ｐＨ７．２）で平衡化したヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーカラムにローディングした。カラムを同じ緩衝液で洗浄し、ｐＨ７．２でのリン酸カリウムの濃度勾配を用いてＦＩＸまたはＦＩＸ−ＨＳＡを溶出させた。溶出液を透析して塩濃度を低くし、生化学解析、加えて薬物動態学的なパラメーターの決定に用いた。実施例５で説明されているようにしてＦＩＸ抗原および活性を決定した。
【００９７】
実施例４：ＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の代替の精製スキーム
実施例３で説明されているように、ＦＩＸまたはＦＩＸアルブミン融合タンパク質を含む細胞培養の回収物を、Ｑ−セファロースＦＦでのクロマトグラフィーで精製した。Ｑ−セファロースの溶出液を、ヘパリン−フラクトゲル（Ｆｒａｃｔｏｇｅｌ）カラムでのクロマトグラフィーによってさらに精製した。この目的のために、５０ｍＭのトリス×ＨＣｌ、５０ｍＭのＮａＣｌ（ｐＨ８．０）緩衝液（ＥＰ）を用いてヘパリン−フラクトゲルカラムを平衡化し、Ｑ−セファロースＦＦ溶出液を適用して、このカラムを７５ｍＭのＮａＣｌを含む平衡緩衝液で洗浄した。ＦＩＸまたはＦＩＸアルブミン融合タンパク質をそれぞれ、３００ｍＭのＮａＣｌに調節したＥＰを用いて溶出させた。
【００９８】
ヘパリン−フラクトゲル溶出液を、実施例３で説明されているようにヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーカラムでのクロマトグラフィーによってさらに精製した。精製したそれぞれのＦＩＸ、ＦＩＸアルブミン融合タンパク質の濃縮物に、実施例５に従ってＦＩＸ活性および抗原決定を行い、さらなるインビトロでおよびインビボでの調査で特徴付けた。
【００９９】
実施例５：ＦＩＸ活性および抗原の決定
ＦＩＸ活性を、市販のａＰＴＴ試薬（パトロムチンＳＬおよびＦＩＸ欠乏血漿，デイド・ベーリング）を用いて凝固（ｃｌｏｔｔｉｎｇ）または凝固（ｃｏａｇｕｌａｔｉｏｎ）活性（ＦＩＸ：Ｃ）として決定した。世界保健機構の国際的なＦＩＸ濃縮物標準（ＷＨＯ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＦＩＸｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅ  Ｓｔａｎｄａｒｄ）（９６／８５４）を較正した内部二次標準（ｓｕｂｓｔａｎｄａｒｄ）を参照として用いた。
【０１００】
ＦＩＸ抗原（ＦＩＸ：Ａｇ）を、当業者既知の標準的なプロトコールに従ってＥＬＩＳＡによって決定した。簡単に言えば、マイクロタイタープレートを、１００μＬ／ウェルのキャプチャー抗体（ＦＩＸのＥＬＩＳＡ用の１：２００の一対の抗体であるセダレーン（Ｃｅｄａｒｌａｎｅ），ただしその他の適切な抗体源も適用可能）と周囲温度で一晩インキュベートした。プレートを洗浄緩衝液Ｂ（シグマ（Ｓｉｇｍａ）Ｐ３５６３）で３回洗浄した後、各ウェルを、ブロッキング緩衝液Ｃ（シグマＰ３６８８）２００μＬと周囲温度で１時間インキュベートした。さらに３回の緩衝液Ｂでの洗浄工程の後、緩衝液Ｂでの試験サンプルの連続希釈液、加えて、緩衝液Ｂでの二次標準（ＳＨＰ）の連続希釈液（１ウェル当たりの量：１００μＬ）を周囲温度で２時間インキュベートした。緩衝液Ｂで３回洗浄工程を行った後、緩衝液Ｂ中の検出抗体（ＦＩＸのＥＬＩＳＡ用の一対の抗体であるペルオキシダーゼで標識されたセダレーン）の１：２００希釈液１００μＬを各ウェルに添加し、周囲温度でさらに２時間インキュベートした。緩衝液Ｂで３回洗浄工程を行った後、基質溶液（ＴＭＢ，デイド・ベーリング，ＯＵＶＦ）を１ウェルあたり１００μＬで添加し、暗所で、周囲温度で３０分間インキュベートした。希釈していない停止溶液（デイド・ベーリング，ＯＳＦＡ）１００μＬを添加してサンプルを適切なマイクロプレートリーダーを４５０ｎｍの波長で読み取るために準備した。次に試験サンプルの濃度を、参照として標準ヒト血漿を用いた標準曲線によって計算した。
【０１０１】
実施例６：細胞培養上清中の様々なＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のＦＩＸ−活性／ＦＩＸ−抗原の比率の比較
異なるリンカーペプチドを含むＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質をコードするＤＮＡコンストラクトでトランスフェクションされたＨＥＫ細胞の細胞培養上清を、上述のようなＦＩＸ活性および抗原試験で処理した（実施例５を参照）。ＦＩＸ：ＣのＦＩＸ：Ａｇに対する比率を計算したところ、異なるコンストラクトのモル比活性度に正比例する尺度が示された。
【０１０２】
表４に示した結果によれば、切断可能なリンカーをＦＩＸ−ＨＳＡ分子に導入すると、活性／抗原の比率において増加がみられたことが示される。またそれによれば、切断可能なリンカーペプチドは、明らかに高い活性／抗原の比率が提供されるように、２個より多いアミノ酸の長さを有するべきであるということも示される。
【０１０３】
【表６】
2009539391.tif 000009
【０１０４】
実施例７：ラットまたはウサギにおけるモル比活性度、インビボでの終末半減期、および、インビボでの回復に関するＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の比較
精製した組換え野生型ＦＩＸ（ｒＦＩＸ４９６／７９７）、および、ＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質（ｒＦＩＸ９８０／７９７、ｒＦＩＸ９８６／７９７、ｒＦＩＸ−１０８８／７９７、および、ｒＦＩＸ１０８９／７９７）を上述のような凝固分析でＦＩＸ活性に関して試験した。平行して、タンパク質濃度の尺度として、２８０および３２０ｎｍでの光学密度の差を決定した（ＯＤ２８０〜３２０）。ＯＤ２８０〜３２０での活性の比率を計算し、モル光学密度に基づいてモル比活性度を計算した。以下の表５に結果を要約する。
【０１０５】
【表７】
2009539391.tif 000010
【０１０６】
表５にまとめた結果を考察すると、驚くべきことに、本発明に従って生成した２種のコンストラクトは、切断不可能なリンカーを有する融合タンパク質と比較して極めて高いモル比活性度を示す。加えて、これらのコンストラクトのモル比活性度は、野生型ｒＦＩＸと比較してわずかしか減少しなかった。
【０１０７】
第ＸＩａ因子（ＦＸＩａ）によるタンパク質分解的切断反応のインビトロでの調査から、切断可能なリンカーを含むＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質（例えばコンストラクト番号１０８８／７９７、または、１０８９／７９７）が活性化さると、平行して、リンカーが切断されてアルブミン部分の放出が起こることが確認された（図１）。切断不可能なリンカーを有する融合タンパク質は、それに相当するアルブミン部分の放出を示さなかった。
【０１０８】
ＦＶＩＩａの場合において、組織因子の存在下でプロテアーゼで切断したところ、切断可能なリンカーを含むＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質１０８８／７９７または１０８９／７９７も、ＦＩＸ活性化ペプチドの放出と平行してアルブミン部分の放出を示した（データ示さず）。
【０１０９】
１モル当たりの凝固活性の決定に加えて、上述のポリペプチド番号４９６／７９７、９８０／７９７、９８６／７９７、１０８８／７９７および１０８９／７９７を、麻酔したＣＤ／ルイスラット（物質１種あたり６匹のラット）、および／または、ウサギ（物質１種あたり４匹のウサギ）に５０ＩＵ／ｋｇ体重の用量で静脈内投与した。試験物質投与前に血液サンプルを採取し、さらに試験物質投与の５分後から開始して適切なインターバルで採取した。その後ＦＩＸ抗原含量をヒト第ＩＸ因子に特異的なＥＬＩＳＡ分析で定量した（上記を参照）。それぞれの群の平均値を用いて、インビボでの５分後の回復を計算した。式ｔ1/2＝ｌｎ２／ｋ（式中ｋは、一様目盛で対数目盛および時間にＦＩＸ：Ａｇレベルをプロットして得られた回帰線の傾きである）に従って、除去のベータ相のタイムポイント（終末半減期）を用いて各タンパク質の半減期を計算した。
【０１１０】
表６に、計算したインビボでの半減期を要約する。ラット、加えてウサギにおいて、ＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のインビボでの半減期は、社内で製造された融合していない野生型組換えＦＩＸと比較して、または、市販の組換えＦＩＸ製品であるＢｅｎｅＦＩＸ(R)と比較して有意に高いことが確認された。ＢｅｎｅＦＩＸ(R)と比較したアルブミン融合タンパク質のインビボでの半減期は、用いられた動物種またはコンストラクトに応じて約２００〜４００％長かった（表６）。
【０１１１】
インビボでの回復を評価するために、静脈内投与後（ｔ＝５分間）のそれらの最大濃度で血漿１ｍＬごとに測定されたＦＩＸ抗原レベルを測定したところ、適用された生成物の１ｋｇ当たりの量と相関を示した。あるいは、輸注後５分に決定された抗原レベル（ＩＵ／ｍＬ）と、１００％回復した場合に予想される理論上の生成物レベル（１ｋｇ当たりの適用した生成物を、推定の血漿体積４０ｍＬ／ｋｇで割った値）とを比較することによってパーセンテージを計算した。ＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質のインビボでの回復（ＩＶＲ）は、ｒＦＩＸ（４９６／７９７）、または、ＢｅｎｅＦＩＸ(R)のインビトロでの回復よりも有意に高かった（表７）。
【０１１２】
【表８】
2009539391.tif 000011
【０１１３】
【表９】
2009539391.tif 000012
【０１１４】
実施例８：インビトロでの、切断可能なリンカーを有する／有さないＦＩＸアルブミン融合タンパク質（１０８８／７９７および９８０／７９７）の活性化、および、ラットにおける薬物動態の決定
ＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質およびｒｅｃＦＩＸを、市販の第ＸＩａ因子（コルディア（Ｋｏｒｄｉａ））を用いてインビトロで活性化した。簡単に言えば、同一なモル量のＦＩＸまたはＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質（３．０×１０-6ｍｏｌ／Ｌ）を、ｐＨ６．８に緩衝化したＦＸＩａ（１．９×１０-8ｍｏｌ／Ｌ）、および、ＣａＣｌ2（１，５ｍｍｏｌ／Ｌ）を含む溶液中で、３７℃で活性化した。ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより示された通り完全に活性化させた後に、ＦＸＩａの量に基づいて５倍の過剰なモル量のＣ１−阻害剤（ベリナートＰ（Ｂｅｒｉｎｅｒｔ  Ｐ））を添加することによって反応を止めた。薬物動態学的な調査を開始するまでサンプルを−７０℃より低温で凍結保存した。
【０１１５】
活性化されたＦＩＸおよびＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の薬物動態学的な調査を実施例７で説明されているようにしてラットで行い、その結果を活性化されていない融合タンパク質に関する薬物動態学的な結果と比較した。
【０１１６】
活性化された融合タンパク質は、活性化されていない分子と比較して有意に減少した半減期、加えて、ＡＵＣを示したことがわかった（図２）。活性化すると、切断可能なリンカーを有するＦＩＸ−融合タンパク質（１０８８／７９７）は、活性化されたｒｅｃＦＩＸ（ＢｅｎｅＦＩＸ）に極めて類似した薬物動態学的な挙動を示したが、それに対して活性化された切断不可能なリンカーを有する融合タンパク質（９８０／７９７）は、切断可能なリンカーを有する活性化された融合タンパク質１０８８／７９７と比較して、より長い初期の半減期、加えて終末半減期を示した。従って、この結果から、切断可能なリンカーは、活性化後に凝固因子の除去を高めることが明らかに示され、従って、延長された半減期を有する、トロンボゲンを形成する可能性がある活性化された融合タンパク質の蓄積が回避される。
【０１１７】
実施例９：アンチトロンビンＩＩＩ（ＡＴ）によって活性化された凝固因子の不活性化速度に関して、切断可能なリンカーを有する／有さないＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質の比較
切断可能なリンカーを含む（１０８８／７９７）、および、含まない（９８０／７９７）ＦＩＸ融合タンパク質を、実施例８で説明されているようにＦＸＩａとインキュベートすることによって活性化した。活性化された因子を、ＡＴと１２０分間インキュベートし、残留したＦＩＸａ活性を、ＳｃｈｎｉｔｇｅｒおよびＧｒｏｓｓに従って、手動式のＦＩＸ凝固分析方法を用いて活性化せずに（ｎａＰＴＴ、以下を参照）決定した。コントロールサンプルとして、同量のＡＴの存在下で活性化されたＦＩＸ−アルブミン融合タンパク質を用いた（ただしインキュベートせず）。
【０１１８】
活性化されていない部分トロンボプラスチン時間の分析（ｎａＰＴＴ）の補助によって、デイド・ベーリング製のＦＩＸが欠乏した血漿を用いてＦＩＸ活性を決定した。Ｈｉｓ、Ｇｌｙ、スクロースおよびトゥイーン（Ｔｗｅｅｎ）８０を含む緩衝液（ｐＨ６．８）でサンプルを予め希釈した。全体の決定は、ＳｃｈｎｉｔｇｅｒおよびＧｒｏｓｓに従って血液凝固測定装置を用いて行われた。ＦＩＸが欠乏した血漿０．１ｍｌ、サンプル０．１ｍｌ、および、０．１％リン脂質０．１ｍｌ（ローヌ・プーラン−ナッターマン（Ｒｈｏｎｅ−Ｐｏｕｌｅｎｃ−Ｎａｔｔｅｒｍａｎｎ），１％ＨＳＡが補足されたイミダゾール緩衝液で予め１：３に希釈した）の混合物を３７℃で２分間インキュベートした。０．０２５ｍｏｌ／ｌのＣａＣｌ2溶液０．１ｍｌを添加することによって凝固反応を開始させ、凝固時間を決定した。
【０１１９】
図３は、それに相当する不活性化実験の結果を示す。切断可能なリンカーを有する融合タンパク質（１０８８／７９７）の場合において、凝固時間が２１０秒から５４０秒に増加（２．５７倍）したことから、ＡＴによるＦＩＸａ活性の不活性化プロセスが促進されたことが実証され、それに対して、切断不可能なリンカーを有する融合タンパク質（９８０／７９７）では１９６秒から４１１秒しか増加を示しさなかった（２．１０倍）。恐らく、切断不可能なリンカーを有する融合タンパク質の場合、アルブミン残基は、ＡＴ依存性の不活性化プロセスに空間配置的に影響を与えるが、それに対して切断可能なリンカーを有する融合タンパク質の場合では、アルブミン残基は切断されて、ＡＴによる不活性化が促進されると予想される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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