(57)【要約】  ポリペプチドを提供する。かかるポリペプチドに結合する抗体又は抗原結合ドメインを提供する。かかるポリペプチドの少なくとも１種類を動物に投与すること、及び腫よう壊死因子（ＴＮＦ）関連アポトーシス誘発リガンド（「ＴＲＡＩＬ」）受容体２（ＴＲ−２）に結合する抗体を動物から得ることを含む、ＴＲ−２に結合する抗体を得る方法も提供する。ＴＲ−２と反応する抗体を提供する。ＴＲ−２と反応する抗体を産生する細胞、ＴＲ−２と反応する抗体を含む薬剤組成物、ＴＲ−２と反応する抗体を用いる方法、及びＴＲ−２と反応する抗体を含むキットも提供する。かかるポリペプチドを投与することによって、抗体とＴＲ−２の結合を低下させる、又は防止する方法も提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲＡＩＬ受容体２（ＴＲ−２）に結合する、単離ポリペプチド
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、及びアミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）。
【請求項２】
抗体重鎖可変領域を含む、請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項３】
抗体重鎖可変領域がヒト抗体重鎖可変領域である、請求項２の単離ポリペプチド。
【請求項４】
抗体重鎖定常領域を更に含む、請求項２の単離ポリペプチド。
【請求項５】
抗体重鎖定常領域がヒト抗体重鎖定常領域である、請求項４の単離ポリペプチド。
【請求項６】
抗体重鎖定常領域を更に含む、請求項３の単離ポリペプチド。
【請求項７】
抗体重鎖定常領域がヒト抗体重鎖定常領域である、請求項６の単離ポリペプチド。
【請求項８】
抗体重鎖可変領域及び重鎖定常領域が、配列番号２；配列番号４、配列番号６；配列番号８、配列番号１０；配列番号１２、配列番号１４；配列番号１６、配列番号１８；配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２又は配列番号３４のアミノ酸配列を含む、請求項７の単離ポリペプチド。
【請求項９】
請求項１のＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも２個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む、請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項１０】
請求項１のＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａを含む、請求項１の単離ポリペプチド。
【請求項１１】
Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ及び単鎖抗体から選択され、請求項１の単離ポリペプチドを含む、抗体断片。
【請求項１２】
以下から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、単離ポリペプチド：
配列番号２のアミノ酸２６から３５、
配列番号２のアミノ酸５０から６６、
配列番号２のアミノ酸９９から１１０、
配列番号４のアミノ酸２６から３７、
配列番号４のアミノ酸５２から６７、
配列番号４のアミノ酸１００から１０９、
配列番号６のアミノ酸２６から３７、
配列番号６のアミノ酸５２から６７、
配列番号６のアミノ酸１００から１０９、
配列番号８のアミノ酸２６から３７、
配列番号８のアミノ酸５２から６７、
配列番号８のアミノ酸１００から１０９、
配列番号１０のアミノ酸２６から３５、
配列番号１０のアミノ酸５０から６６、
配列番号１０のアミノ酸９９から１１０、
配列番号１２のアミノ酸２６から３５、
配列番号１２のアミノ酸５０から６６、
配列番号１２のアミノ酸９９から１１１、
配列番号１４のアミノ酸２６から３５、
配列番号１４のアミノ酸５０から６５、
配列番号１４のアミノ酸９８から１１１、
配列番号１６のアミノ酸２６から３７、
配列番号１６のアミノ酸５２から６７、
配列番号１６のアミノ酸１００から１０９、
配列番号１８のアミノ酸２６から３５、
配列番号１８のアミノ酸５０から６６、
配列番号１８のアミノ酸９９から１０５、
配列番号２０のアミノ酸２６から３５、
配列番号２０のアミノ酸５０から６６、
配列番号２０のアミノ酸９９から１１８、
配列番号２２のアミノ酸２６から３５、
配列番号２２のアミノ酸５０から６６、
配列番号２２のアミノ酸９９から１１８、
配列番号２４のアミノ酸２６から３５、
配列番号２４のアミノ酸５０から６５、
配列番号２４のアミノ酸９８から１０８、
配列番号２６のアミノ酸２６から３５、
配列番号２６のアミノ酸５０から６６、
配列番号２６のアミノ酸９９から１１０、
配列番号２８のアミノ酸２６から３５、
配列番号２８のアミノ酸５０から６６、
配列番号２８のアミノ酸９９から１１７、
配列番号３０のアミノ酸２６から３７、
配列番号３０のアミノ酸５２から６７、
配列番号３０のアミノ酸１００から１１１、
配列番号３２のアミノ酸２６から３７、
配列番号３２のアミノ酸５２から６７、
配列番号３２のアミノ酸１００から１１１、
配列番号３４のアミノ酸２６から３７、
配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び
配列番号３４のアミノ酸１００から１１１。
【請求項１３】
請求項１２の相補性決定領域（ＣＤＲ）の少なくとも２個を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項１４】
請求項１２の相補性決定領域（ＣＤＲ）の少なくとも３個を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項１５】
配列番号２のアミノ酸２６から３５、配列番号２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２のアミノ酸９９から１１０を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項１６】
配列番号４のアミノ酸２６から３７、配列番号４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号４のアミノ酸１００から１０９を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項１７】
配列番号６のアミノ酸２６から３７、配列番号６のアミノ酸５２から６７、及び配列番号６のアミノ酸１００から１０９を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項１８】
配列番号８のアミノ酸２６から３７、配列番号８のアミノ酸５２から６７、及び配列番号８のアミノ酸１００から１０９を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項１９】
配列番号１０のアミノ酸２６から３５、配列番号１０のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１０のアミノ酸９９から１１０を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２０】
配列番号１２のアミノ酸２６から３５、配列番号１２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１２のアミノ酸９９から１１１を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２１】
配列番号１４のアミノ酸２６から３５、配列番号１４のアミノ酸５０から６５、及び配列番号１４のアミノ酸９８から１１１を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２２】
配列番号１６のアミノ酸２６から３７、配列番号１６のアミノ酸５２から６７、及び配列番号１６のアミノ酸１００から１０９を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２３】
配列番号１８のアミノ酸２６から３５、配列番号１８のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１８のアミノ酸９９から１０５を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２４】
配列番号２０のアミノ酸２６から３５、配列番号２０のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２０のアミノ酸９９から１１８を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２５】
配列番号２２のアミノ酸２６から３５、配列番号２２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２２のアミノ酸９９から１１８を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２６】
配列番号２４のアミノ酸２６から３５、配列番号２４のアミノ酸５０から６５、及び配列番号２４のアミノ酸９８から１０８を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２７】
配列番号２６のアミノ酸２６から３５、配列番号２６のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２６のアミノ酸９９から１１０を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２８】
配列番号２８のアミノ酸２６から３５、配列番号２８のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２８のアミノ酸９９から１１７を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項２９】
配列番号３０のアミノ酸２６から３７、配列番号３０のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３０のアミノ酸１００から１１１を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項３０】
配列番号３２のアミノ酸２６から３７、配列番号３２のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３２のアミノ酸１００から１１１を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項３１】
配列番号３４のアミノ酸２６から３７、配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３４のアミノ酸１００から１１１を含む、請求項１２の単離ポリペプチド。
【請求項３２】
ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、単離ポリペプチド
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、及びアミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、及びアミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）。
【請求項３３】
抗体軽鎖可変領域を含む、請求項３２の単離ポリペプチド。
【請求項３４】
抗体軽鎖可変領域がヒト抗体軽鎖可変領域である、請求項３３の単離ポリペプチド。
【請求項３５】
抗体軽鎖定常領域を更に含む、請求項３３の単離ポリペプチド。
【請求項３６】
抗体軽鎖定常領域がヒト抗体軽鎖定常領域である、請求項３５の単離ポリペプチド。
【請求項３７】
抗体軽鎖定常領域を更に含む、請求項３４の単離ポリペプチド。
【請求項３８】
抗体軽鎖定常領域がヒト抗体軽鎖定常領域である、請求項３７の単離ポリペプチド。
【請求項３９】
抗体軽鎖可変領域及び軽鎖定常領域が、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６又は配列番号６８のアミノ酸配列を含む、請求項３８の単離ポリペプチド。
【請求項４０】
請求項３２のＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも２個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む、請求項３２の単離ポリペプチド。
【請求項４１】
請求項３２のＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂを含む、請求項３２の単離ポリペプチド。
【請求項４２】
Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ及び単鎖抗体から選択され、請求項３２の単離ポリペプチドを含む、抗体断片。
【請求項４３】
以下から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、単離ポリペプチド：
配列番号３６のアミノ酸２４から３４、
配列番号３６のアミノ酸５０から５６、
配列番号３６のアミノ酸８９から９７、
配列番号３８のアミノ酸２４から３４、
配列番号３８のアミノ酸５０から５６、
配列番号３８のアミノ酸８９から９７、
配列番号４０のアミノ酸２４から３４、
配列番号４０のアミノ酸５０から５６、
配列番号４０のアミノ酸８９から９７、
配列番号４２のアミノ酸２４から３４、
配列番号４２のアミノ酸５０から５６、
配列番号４２のアミノ酸８９から９７、
配列番号４４のアミノ酸２４から３４、
配列番号４４のアミノ酸５０から５６、
配列番号４４のアミノ酸８９から９７、
配列番号４６のアミノ酸２４から３４、
配列番号４６のアミノ酸５０から５６、
配列番号４６のアミノ酸８９から９７、
配列番号４８のアミノ酸２４から４０、
配列番号４８のアミノ酸５２から６２、
配列番号４８のアミノ酸９５から１０３、
配列番号５０のアミノ酸２４から３９、
配列番号５０のアミノ酸５５から６１、
配列番号５０のアミノ酸９４から１０２、
配列番号５２のアミノ酸２４から４０、
配列番号５２のアミノ酸５６から６２、
配列番号５２のアミノ酸９５から１０３、
配列番号５４のアミノ酸２４から３４、
配列番号５４のアミノ酸５０から５６、
配列番号５４のアミノ酸８９から９７、
配列番号５６のアミノ酸２４から３４、
配列番号５６のアミノ酸５０から５６、
配列番号５６のアミノ酸８９から９７、
配列番号５８のアミノ酸２４から４０、
配列番号５８のアミノ酸５２から６２、
配列番号５８のアミノ酸９５から１０３、
配列番号６０のアミノ酸２４から３４、
配列番号６０のアミノ酸５０から５６、
配列番号６０のアミノ酸８９から９７、
配列番号６２のアミノ酸２４から３４、
配列番号６２のアミノ酸５０から５６、
配列番号６２のアミノ酸８９から９７、
配列番号６４のアミノ酸２４から３５、
配列番号６４のアミノ酸５１から５７、
配列番号６４のアミノ酸９０から８８、
配列番号６６のアミノ酸２４から３４、
配列番号６６のアミノ酸５０から５７、
配列番号６６のアミノ酸８９から９７、
配列番号６８のアミノ酸２４から３４、
配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び
配列番号６８のアミノ酸８９から９７。
【請求項４４】
請求項４３の相補性決定領域（ＣＤＲ）の少なくとも２個を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項４５】
請求項４３の相補性決定領域（ＣＤＲ）の少なくとも３個を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項４６】
配列番号３６の２４から３４、配列番号３６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号３６のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項４７】
配列番号３８のアミノ酸２４から３４、配列番号３８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号３８のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項４８】
配列番号４０のアミノ酸２４から３４、配列番号４０のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４０のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項４９】
配列番号４２のアミノ酸２４から３４、配列番号４２のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４２のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５０】
配列番号４４のアミノ酸２４から３４、配列番号４４のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４４のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５１】
配列番号４６のアミノ酸２４から３４、配列番号４６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４６のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５２】
配列番号４８のアミノ酸２４から４０、配列番号４８のアミノ酸５６から６２、及び配列番号４８のアミノ酸９５から１０３を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５３】
配列番号５０のアミノ酸２４から３９、配列番号５０のアミノ酸５５から６１、及び配列番号５０のアミノ酸９４から１０２を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５４】
配列番号５２のアミノ酸２４から４０、配列番号５２のアミノ酸５６から６２、及び配列番号５２のアミノ酸９５から１０３を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５５】
配列番号５４のアミノ酸２４から３４、配列番号５４のアミノ酸５０から５６、及び配列番号５４のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５６】
配列番号５６のアミノ酸２４から３４、配列番号５６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号５６のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５７】
配列番号５８のアミノ酸２４から４０、配列番号５８のアミノ酸５６から６２、及び配列番号５８のアミノ酸９５から１０３を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５８】
配列番号６０のアミノ酸２４から３４、配列番号６０のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６０のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項５９】
配列番号６２のアミノ酸２４から３４、配列番号６２のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６２のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項６０】
配列番号６４のアミノ酸２４から３５、配列番号６４のアミノ酸５１から５７、及び配列番号６４のアミノ酸９０から８８を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項６１】
配列番号６６のアミノ酸２４から３４、配列番号６６のアミノ酸５０から５７、及び配列番号６６のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項６２】
配列番号６８のアミノ酸２４から３４、配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６８のアミノ酸８９から９７を含む、請求項４３の単離ポリペプチド。
【請求項６３】
ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む、単離ポリヌクレオチド
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、及びアミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、及びアミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、及びアミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）。
【請求項６４】
ポリペプチドをコードする配列が、抗体重鎖可変領域をコードする配列である、請求項６３の単離ポリヌクレオチド。
【請求項６５】
抗体重鎖可変領域をコードする配列が、ヒト抗体重鎖可変領域をコードする配列である、請求項６４の単離ポリヌクレオチド。
【請求項６６】
単離ポリヌクレオチドが単鎖抗体をコードする、請求項６３の単離ポリヌクレオチド。
【請求項６７】
抗体重鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列を更に含む、請求項６４の単離ポリヌクレオチド。
【請求項６８】
抗体重鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列がヒト抗体重鎖定常領域をコードする、請求項６７の単離ポリヌクレオチド。
【請求項６９】
抗体重鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列を更に含む、請求項６５の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７０】
抗体重鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列がヒト抗体重鎖定常領域をコードする、請求項６９の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７１】
単離ポリヌクレオチドが、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２又は配列番号３４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする配列を含む、請求項７０の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７２】
単離ポリヌクレオチドが、配列番号１；配列番号３、配列番号５；配列番号７、配列番号９；配列番号１１、配列番号１３；配列番号１５、配列番号１７；配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１又は配列番号３３のヌクレオチド配列を含む、請求項７０の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７３】
ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む、単離ポリヌクレオチド
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、及びアミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）。
【請求項７４】
ポリペプチドをコードする配列が、抗体軽鎖可変領域をコードする配列である、請求項７３の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７５】
抗体軽鎖可変領域をコードする配列が、ヒト抗体軽鎖可変領域をコードする配列である、請求項７４の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７６】
単離ポリヌクレオチドが単鎖抗体をコードする、請求項７３の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７７】
抗体軽鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列を更に含む、請求項７４の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７８】
抗体軽鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列がヒト抗体軽鎖定常領域をコードする、請求項７７の単離ポリヌクレオチド。
【請求項７９】
抗体軽鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列を更に含む、請求項７５の単離ポリヌクレオチド。
【請求項８０】
抗体軽鎖定常領域をコードするポリヌクレオチド配列がヒト抗体軽鎖定常領域をコードする、請求項７９の単離ポリヌクレオチド。
【請求項８１】
単離ポリヌクレオチドが、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６又は配列番号６８のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする配列を含む、請求項８０の単離ポリヌクレオチド。
【請求項８２】
単離ポリヌクレオチドが、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５又は配列番号６７のヌクレオチド配列を含む、請求項８０の単離ポリヌクレオチド。
【請求項８３】
可変領域と定常領域を含み、
（ｉ）ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、第１のポリペプチド
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、及びアミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、及びアミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）、及び
（ｉｉ）ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、第２のポリペプチド
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、及びアミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、及びアミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、及びアミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）
を含む、単離抗ＴＲ−２抗体。
【請求項８４】
ヒト抗体である、請求項８３の単離抗体。
【請求項８５】
キメラ抗体である、請求項８３の単離抗体。
【請求項８６】
検出可能な標識を更に含む、請求項８５の単離抗体。
【請求項８７】
検出可能な標識が酵素標識、蛍光標識、化学発光標識又は放射性標識である、請求項８６の単離抗体。
【請求項８８】
可変領域と定常領域を含み、
配列番号２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号３６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号３８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４０のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４２のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４４のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５０のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５２のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５４のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６０のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６２のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号３０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６４のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号３２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、又は配列番号３４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド
を含む、単離抗ＴＲ−２抗体。
【請求項８９】
ａ）請求項８３の抗体と試料を混合すること、
ｂ）抗原に結合した抗体を結合しない抗体から分離すること、及び
ｃ）抗原に結合した抗体の有無を検出すること
を含む、試料中のＴＲ−２の有無を検出する方法。
【請求項９０】
酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）を使用する、請求項８９の方法。
【請求項９１】
ａ）請求項８３の抗体と、
ｂ）抗体を検出する試薬と
を含む、試料中のＴＲ−２の有無を検出するキット。
【請求項９２】
ａ）請求項８３の抗体を基体に結合させること、
ｂ）ＴＲ−２を含む試料をａ）の抗体に曝露すること、及び
ｃ）ＴＲ−２を単離すること
を含む、ＴＲ−２を単離する方法。
【請求項９３】
ａ）基体に結合した請求項８３の抗体と、
ｂ）ＴＲ−２を単離するための試薬と
を含む、ＴＲ−２を単離するキット。
【請求項９４】
請求項８３の抗体の治療有効量を患者に投与することを含む、患者における癌を治療する方法。
【請求項９５】
癌が、肝臓癌、脳腫よう、腎癌、結腸直腸癌、肺癌、ひ臓癌、胸腺又は血球の癌（すなわち、白血病）、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、子宮癌、乳癌、すい癌、胃癌、頭頚部へん平上皮癌及びリンパ腫の少なくとも１つから選択される、請求項９４の方法。
【請求項９６】
請求項６３のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
【請求項９７】
請求項７３のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
【請求項９８】
請求項９６又は請求項９７の発現ベクターの少なくとも１種類を含む、細胞。
【請求項９９】
（ａ）ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する第１のポリペプチドをコードする配列を含む、第１のポリヌクレオチド
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、及びアミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、及びアミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、及びアミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）及び
（ｂ）ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する第２のポリペプチドをコードする配列を含む、第２のポリヌクレオチド
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、及びアミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、及びアミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、及びアミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）
を含む、細胞。
【請求項１００】
第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドが別々の発現ベクター中に存在する、請求項９９の細胞。
【請求項１０１】
第１のポリヌクレオチドと第２のポリヌクレオチドが単一の発現ベクター中に存在する、請求項９９の細胞。
【請求項１０２】
細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、請求項９６の発現ベクターを含む細胞中でポリペプチドを産生することを含む、ポリペプチド製造方法。
【請求項１０３】
細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、請求項９７の発現ベクターを含む細胞中でポリペプチドを産生することを含む、ポリペプチド製造方法。
【請求項１０４】
細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させて抗体を産生するのに適切な条件下で、請求項９６の発現ベクター又は請求項９７の発現ベクターを含む細胞中で抗体を産生することを含む、抗ＴＲ−２抗体の製造方法。
【請求項１０５】
請求項９９、請求項１００又は請求項１０１の細胞中で抗体を産生することを含む、抗ＴＲ−２抗体の製造方法。
【請求項１０６】
請求項８３の抗体と、薬剤として許容される担体とを含む、薬剤組成物。
【請求項１０７】
Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体によって特異的に結合されるエピトープと特異的に結合する、単離抗体。
【請求項１０８】
配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項１０９】
配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列から本質的になる、ポリペプチド。
【請求項１１０】
配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列と結合する、抗体又は抗原結合ドメイン。
【請求項１１１】
配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１種類のポリペプチドを動物に投与すること、及びＴＲ−２に結合する抗体を動物から得ることを含む、ＴＲ−２に結合する抗体を得る方法。
【請求項１１２】
配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列を含むポリペプチドを投与することによって、抗体とＴＲ−２の結合を低下させる、又は防止する方法。
【請求項１１３】
配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列からなるポリペプチドを投与することによって、抗体とＴＲ−２の結合を低下させる、又は防止する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
ポリペプチドを提供する。かかるポリペプチドに結合する抗体又は抗原結合ドメインを提供する。かかるポリペプチドの少なくとも１種類を動物に投与すること、及び腫よう壊死因子（ＴＮＦ）関連アポトーシス誘発リガンド（「ＴＲＡＩＬ」）受容体２（ＴＲ−２）に結合する抗体を動物から得ることを含む、ＴＲ−２に結合する抗体を得る方法も提供する。ＴＲ−２と反応する抗体を提供する。ＴＲ−２と反応する抗体を産生する細胞、ＴＲ−２と反応する抗体を含む薬剤組成物、ＴＲ−２と反応する抗体を用いる方法、及びＴＲ−２と反応する抗体を含むキットも提供する。かかるポリペプチドを投与することによって、抗体とＴＲ−２の結合を低下させる、又は防止する方法も提供する。
【背景技術】
【０００２】
ＴＲ−２とそのリガンドＴＲＡＩＬとの相互作用は、アポトーシスの誘発にある役割を果たす（例えば、Ａｌｍａｓａｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｃｙｔｏｋｉｎｅ  ＆  Ｇｒｏｗｔｈ  Ｆａｃｔｏｒ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  １４：  ３３７−３４８（２００３）参照）。Ａｐｏ２リガンドとしても知られるＴＲＡＩＬは、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーの４メンバー（ＴＲＡＩＬ受容体（「ＴＲ」）１から４）、及び関係する可溶性オステオプロテゲリン（ｏｐｓｔｅｏｐｒｏｔｅｇｅｒｉｎ）（「ＯＰＧ」）受容体と相互作用するホモメリックリガンドである。細胞表面のＴＲ−１又はＴＲ−２にＴＲＡＩＬが結合すると、その細胞のアポトーシスが惹起される。ＴＲＡＩＬとＴＲ−１又はＴＲ−２の最初の結合の後、細胞内タンパク質が受容体の細胞内デスドメインに補充されて、シグナル伝達複合体を形成する。ある種の細胞内カスパーゼが複合体に補充され、そこで自己活性化し、更に別のカスパーゼ及び細胞内アポトーシスカスケードを活性化する。ＴＲ−３及びＴＲ−４並びにＯＰＧは、アポトーシスシグナルの伝達を担う細胞内ドメインを欠く。したがって、ＴＲＡＩＬとＴＲ−３、ＴＲ−４又はＯＰＧが結合しても、アポトーシスは起こらない。ＴＲ−３及びＴＲ−４は、「デコイ」受容体とも称され、その過剰発現は、ＴＲＡＩＬによるアポトーシス誘発から細胞を保護することが判明した。ＴＲ−２は、肝臓、脳、乳房、腎臓、結腸、肺、ひ臓、胸腺、末梢血リンパ球、前立腺、精巣、卵巣、子宮、及び胃腸管に沿った種々の組織を含めて、種々の細胞において発現する。（例えば、Ｗａｌｃｚａｋ  ｅｔ  ａｌ．，  ＥＭＢＯ  Ｊ．  １６：  ５３８６−５３９７（１９９７）；  Ｓｐｉｅｒｉｎｇｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ．  Ｃｙｔｏｃｈｅｍ．  ５２：  ８２１−８３１（２００４）参照）。ＴＲＡＩＬ及びＴＲＡＩＬ受容体は広範に発現するが、形質転換細胞においてアポトーシスを誘発するのに最も活性である。（例えば、Ｄａｉｇｌｅ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｗｉｓｓ  Ｍｅｄ．  Ｗｋｌｙ．  １３１：  ２３１−２３７（２００１）参照）。
【発明の開示】
【０００３】
（発明の概要）
ある実施形態においては、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲＡＩＬ受容体２（ＴＲ−２）に結合する、単離ポリペプチドを提供する。
【０００４】
ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。
【０００５】
ある実施形態においては、以下から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、単離ポリペプチドを提供する。
【０００６】
配列番号２のアミノ酸２６から３５、
配列番号２のアミノ酸５０から６６、
配列番号２のアミノ酸９９から１１０、
配列番号４のアミノ酸２６から３７、
配列番号４のアミノ酸５２から６７、
配列番号４のアミノ酸１００から１０９、
配列番号６のアミノ酸２６から３７、
配列番号６のアミノ酸５２から６７、
配列番号６のアミノ酸１００から１０９、
配列番号８のアミノ酸２６から３７、
配列番号８のアミノ酸５２から６７、
配列番号８のアミノ酸１００から１０９、
配列番号１０のアミノ酸２６から３５、
配列番号１０のアミノ酸５０から６６、
配列番号１０のアミノ酸９９から１１０、
配列番号１２のアミノ酸２６から３５、
配列番号１２のアミノ酸５０から６６、
配列番号１２のアミノ酸９９から１１１、
配列番号１４のアミノ酸２６から３５、
配列番号１４のアミノ酸５０から６５、
配列番号１４のアミノ酸９８から１１１、
配列番号１６のアミノ酸２６から３７、
配列番号１６のアミノ酸５２から６７、
配列番号１６のアミノ酸１００から１０９、
配列番号１８のアミノ酸２６から３５、
配列番号１８のアミノ酸５０から６６、
配列番号１８のアミノ酸９９から１０５、
配列番号２０のアミノ酸２６から３５、
配列番号２０のアミノ酸５０から６６、
配列番号２０のアミノ酸９９から１１８、
配列番号２２のアミノ酸２６から３５、
配列番号２２のアミノ酸５０から６６、
配列番号２２のアミノ酸９９から１１８、
配列番号２４のアミノ酸２６から３５、
配列番号２４のアミノ酸５０から６５、
配列番号２４のアミノ酸９８から１０８、
配列番号２６のアミノ酸２６から３５、
配列番号２６のアミノ酸５０から６６、
配列番号２６のアミノ酸９９から１１０、
配列番号２８のアミノ酸２６から３５、
配列番号２８のアミノ酸５０から６６、
配列番号２８のアミノ酸９９から１１７、
配列番号３０のアミノ酸２６から３７、
配列番号３０のアミノ酸５２から６７、
配列番号３０のアミノ酸１００から１１１、
配列番号３２のアミノ酸２６から３７、
配列番号３２のアミノ酸５２から６７、
配列番号３２のアミノ酸１００から１１１、
配列番号３４のアミノ酸２６から３７、
配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び
配列番号３４のアミノ酸１００から１１１。
【０００７】
ある実施形態においては、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲＡＩＬ受容体２（ＴＲ−２）に結合する、単離ポリペプチドを提供する。
【０００８】
ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。
【０００９】
ある実施形態においては、以下から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、単離ポリペプチドを提供する。
【００１０】
配列番号３６のアミノ酸２４から３４、
配列番号３６のアミノ酸５０から５６、
配列番号３６のアミノ酸８９から９７、
配列番号３８のアミノ酸２４から３４、
配列番号３８のアミノ酸５０から５６、
配列番号３８のアミノ酸８９から９７、
配列番号４０のアミノ酸２４から３４、
配列番号４０のアミノ酸５０から５６、
配列番号４０のアミノ酸８９から９７、
配列番号４２のアミノ酸２４から３４、
配列番号４２のアミノ酸５０から５６、
配列番号４２のアミノ酸８９から９７、
配列番号４４のアミノ酸２４から３４、
配列番号４４のアミノ酸５０から５６、
配列番号４４のアミノ酸８９から９７、
配列番号４６のアミノ酸２４から３４、
配列番号４６のアミノ酸５０から５６、
配列番号４６のアミノ酸８９から９７、
配列番号４８のアミノ酸２４から４０、
配列番号４８のアミノ酸５２から６２、
配列番号４８のアミノ酸９５から１０３、
配列番号５０のアミノ酸２４から３９、
配列番号５０のアミノ酸５５から６１、
配列番号５０のアミノ酸９４から１０２、
配列番号５２のアミノ酸２４から４０、
配列番号５２のアミノ酸５６から６２、
配列番号５２のアミノ酸９５から１０３、
配列番号５４のアミノ酸２４から３４、
配列番号５４のアミノ酸５０から５６、
配列番号５４のアミノ酸８９から９７、
配列番号５６のアミノ酸２４から３４、
配列番号５６のアミノ酸５０から５６、
配列番号５６のアミノ酸８９から９７、
配列番号５８のアミノ酸２４から４０、
配列番号５８のアミノ酸５２から６２、
配列番号５８のアミノ酸９５から１０３、
配列番号６０のアミノ酸２４から３４、
配列番号６０のアミノ酸５０から５６、
配列番号６０のアミノ酸８９から９７、
配列番号６２のアミノ酸２４から３４、
配列番号６２のアミノ酸５０から５６、
配列番号６２のアミノ酸８９から９７、
配列番号６４のアミノ酸２４から３５、
配列番号６４のアミノ酸５１から５７、
配列番号６４のアミノ酸９０から８８、
配列番号６６のアミノ酸２４から３４、
配列番号６６のアミノ酸５０から５７、
配列番号６６のアミノ酸８９から９７、
配列番号６８のアミノ酸２４から３４、
配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び
配列番号６８のアミノ酸８９から９７。
【００１１】
ある実施形態においては、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む、単離ポリヌクレオチドを提供する。
【００１２】
ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。
【００１３】
ある実施形態においては、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む、単離ポリヌクレオチドを提供する。
【００１４】
ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。
【００１５】
ある実施形態においては、可変領域及び定常領域を含み、
（ｉ）ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、第１のポリペプチドと、
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）
（ｉｉ）ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、第２のポリペプチドと
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）
を含む、単離抗ＴＲ−２抗体を提供する。
【００１６】
ある実施形態においては、可変領域及び定常領域を含み、
配列番号２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号３６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号３８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４０のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４２のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４４のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号４８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５０のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号１８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５２のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５４のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号５８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６０のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号２８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６２のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号３０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６４のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、配列番号３２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６６のＣＤＲを含む第２のポリペプチド、又は配列番号３４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと配列番号６８のＣＤＲを含む第２のポリペプチド
を含む、単離抗ＴＲ−２抗体を提供する。
【００１７】
ある実施形態においては、
（ａ）ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する第１のポリペプチドをコードする配列を含む、第１のポリヌクレオチドと、
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）
（ｂ）ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する第２のポリペプチドをコードする配列を含む、第２のポリヌクレオチドと
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）
を含む、細胞を提供する。
【００１８】
ある実施形態においては、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体によって特異的に結合されるエピトープと特異的に結合する、単離抗体を提供する。
【００１９】
ある実施形態においては、配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを提供する。
【００２０】
ある実施形態においては、配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列から本質的になるポリペプチドを提供する。
【００２１】
ある実施形態においては、配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列と結合する、抗体又は抗原結合ドメインを提供する。
【００２２】
ある実施形態においては、配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１種類のポリペプチドを動物に投与すること、及びＴＲ−２に結合する抗体を動物から得ることを含む、ＴＲ−２に結合する抗体を得る方法を提供する。
【００２３】
ある実施形態においては、配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列を含むポリペプチドを投与することによって、抗体とＴＲ−２の結合を低下させる、又は防止する方法を提供する。
【００２４】
ある実施形態においては、配列番号９４、配列番号９５及び配列番号９６から選択される少なくとも１個のアミノ酸配列からなるポリペプチドを投与することによって、抗体とＴＲ−２の結合を低下させる、又は防止する方法を提供する。
【００２５】
（図面の説明）
図１は、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するトランスジェニックマウスにおいて、足せき接種（グループ１、２及び３）又は腹腔内注射（グループ４及び５）によって、ＴＲ−２−Ｈｉｓ構築体に対して実施例１で使用した免疫化スケジュールを示す図である。
図２は、実施例１に記載の試験に従って、図１に記載の選択されたマウスから得られたある血液試料の抗原ＴＲ−２に対する反応性を測定するＥＬＩＳＡアッセイの結果を示す図である。
【００２６】
図３は、抗ＴＲ−２抗体Ａの重鎖（配列番号１）及び軽鎖（配列番号３５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ａの重鎖（配列番号２）及び軽鎖（配列番号３６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００２７】
図４は、抗ＴＲ−２抗体Ｂの重鎖（配列番号３）及び軽鎖（配列番号３７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｂの重鎖（配列番号４）及び軽鎖（配列番号３８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００２８】
図５は、抗ＴＲ−２抗体Ｃの重鎖（配列番号５）及び軽鎖（配列番号３９）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｃの重鎖（配列番号６）及び軽鎖（配列番号４０）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００２９】
図６は、抗ＴＲ−２抗体Ｄの重鎖（配列番号７）及び軽鎖（配列番号４１）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｄの重鎖（配列番号８）及び軽鎖（配列番号４２）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３０】
図７は、抗ＴＲ−２抗体Ｅの重鎖（配列番号９）及び軽鎖（配列番号４３）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｅの重鎖（配列番号１０）及び軽鎖（配列番号４４）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３１】
図８は、抗ＴＲ−２抗体Ｆの重鎖（配列番号１１）及び軽鎖（配列番号４５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｆの重鎖（配列番号１２）及び軽鎖（配列番号４６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３２】
図９は、抗ＴＲ−２抗体Ｇの重鎖（配列番号１３）及び軽鎖（配列番号４７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｇの重鎖（配列番号１４）及び軽鎖（配列番号４８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３３】
図１０は、抗ＴＲ−２抗体Ｈの重鎖（配列番号１５）及び軽鎖（配列番号４９）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｈの重鎖（配列番号１６）及び軽鎖（配列番号５０）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３４】
図１１は、抗ＴＲ−２抗体Ｉの重鎖（配列番号１７）及び軽鎖（配列番号５１）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｉの重鎖（配列番号１８）及び軽鎖（配列番号５２）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３５】
図１２は、抗ＴＲ−２抗体Ｊの重鎖（配列番号１９）及び軽鎖（配列番号５３）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｊの重鎖（配列番号２０）及び軽鎖（配列番号５４）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３６】
図１３は、抗ＴＲ−２抗体Ｋの重鎖（配列番号２１）及び軽鎖（配列番号５５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｋの重鎖（配列番号２２）及び軽鎖（配列番号５６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３７】
図１４は、抗ＴＲ−２抗体Ｌの重鎖（配列番号２３）及び軽鎖（配列番号５７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｌの重鎖（配列番号２４）及び軽鎖（配列番号５８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３８】
図１５は、抗ＴＲ−２抗体Ｍの重鎖（配列番号２５）及び軽鎖（配列番号５９）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｍの重鎖（配列番号２６）及び軽鎖（配列番号６０）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００３９】
図１６は、抗ＴＲ−２抗体Ｎの重鎖（配列番号２７）及び軽鎖（配列番号６１）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｎの重鎖（配列番号２８）及び軽鎖（配列番号６２）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００４０】
図１７は、抗ＴＲ−２抗体Ｏの重鎖（配列番号２９）及び軽鎖（配列番号６３）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｏの重鎖（配列番号３０）及び軽鎖（配列番号６４）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００４１】
図１８は、抗ＴＲ−２抗体Ｐの重鎖（配列番号３１）及び軽鎖（配列番号６５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｐの重鎖（配列番号３２）及び軽鎖（配列番号６６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００４２】
図１９は、抗ＴＲ−２抗体Ｑの重鎖（配列番号３３）及び軽鎖（配列番号６７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｑの重鎖（配列番号３４）及び軽鎖（配列番号６８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【００４３】
図２０は抗ＴＲ−２抗体ＡからＱの重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２及び３４）のアラインメントを示す図である。各配列の枠組み領域１から３（ＦＲ１、ＦＲ２及びＦＲ３）及び相補性決定領域１から３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）を示す。
【００４４】
図２１は、抗ＴＲ−２抗体ＡからＱの軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６及び６８）のアラインメントを示す図である。各配列の枠組み領域１から３（ＦＲ１、ＦＲ２及びＦＲ３）及び相補性決定領域１から３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）を示す。
【００４５】
図２２は、実施例５に記載の試験によって、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体を、切断型キメラＮ−アビジンＴＲ−２タンパク質との各々の結合能力に従って、４つの反応グループの１つに分類した表である。
【００４６】
図２３は、実施例６に記載の試験による、エピトープマッピングに使用したヒトＮ−アビジン−ＴＲ−２の１３通りの切り詰めの概略図である。
図２４は、実施例６に記載の試験による、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体と、Ｎ−アビジン−ＴＲ−２切断型との結合を示す棒グラフである。
図２５は、実施例６に記載の試験による、エピトープマッピングに使用したＮ−アビジン−ｃｙｎｏ  ＴＲ−２切断型及びＮ−アビジン−ｃｙｎｏ／ヒトＴＲ−２キメラの概略図である。
図２６は、実施例６に記載の試験による、ヒトＴＲ−２、ｃｙｎｏ  ＴＲ−２（短型）及びマウスＴＲ−２配列のアラインメントである。
図２７は、実施例６に記載の試験による、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体と、Ｎ−アビジン−ＴＲ−２切断型、キメラ及びドメイン置換との結合を示す棒グラフである。
【００４７】
（発明の詳細）
本明細書において使用する項目名は、単なる構成上の目的のために過ぎず、記述する主題を限定するものと解釈すべきではない。特許、特許出願、記事、本及び論文を含めて、ただしこれらだけに限定されない、本願で引用するすべての文献又は文献の一部を、参照によりその全体を本明細書に組込む。
【００４８】
定義
組み換えＤＮＡ、オリゴヌクレオチド合成、並びに組織培養及び形質転換（例えば、電気穿孔法、リポフェクション）には、標準技術を使用することができる。酵素反応及び精製技術は、製造者の仕様書に従って、又は当分野で一般に実施されるとおりに、又は本明細書のとおりに、実施することができる。上記技術及び手順は、一般に、当分野で周知の従来法によって実施することができ、また、本明細書を通して引用及び考察する種々の一般的参考文献及びより具体的な参考文献のように実施することができる。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（２ｄ  ｅｄ．，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，  Ｎ．Ｙ．（１９８９））を参照されたい。特に定義しない限り、本明細書の分析化学、合成有機化学、医薬品化学及び製薬化学に関連して利用する命名法、その実験手順及び技術は、当分野で一般に使用される周知のものである。化学合成、化学分析、調剤、処方、送達、及び患者の治療には、標準技術を使用することができる。
【００４９】
本願では、特段の記載がない限り、単数を使用するときには複数も含む。本願では、特段の記載がない限り、「又は」を使用するときには「及び／又は」を意味する。また、「含めて」という用語、及び「含む」、「含まれる」などの他の形態の使用は、限定的なものではない。また、「要素」、「成分」などの用語は、特段の記載がない限り、１個の単位を含む要素及び成分と、１個を超える亜単位を含む要素及び成分との両方を包含する。
【００５０】
本開示に従って使用する以下の用語は、別段の記載がない限り、以下の意味を有すると理解すべきである。
【００５１】
本明細書では「単離ポリヌクレオチド」という用語は、ゲノム、ｃＤＮＡ、合成由来のポリヌクレオチド、又はこれらの組合せを意味するものとする。その起源によって、「単離ポリヌクレオチド」は、（１）「単離ポリヌクレオチド」が天然に存在するポリヌクレオチドの全部又は一部を伴わず、（２）自然には結合しないポリヌクレオチドと結合し、又は（３）より大きい配列の一部として天然に存在しない。
【００５２】
「ポリヌクレオチド」と「オリゴヌクレオチド」という用語は、区別なく使用され、本明細書では、少なくとも１０塩基長のヌクレオチドの重合体を意味する。ある実施形態においては、塩基は、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、及びヌクレオチドのどちらかのタイプの改変体の少なくとも１個を含み得る。この用語は、一本鎖ＤＮＡ及び二本鎖ＤＮＡを含む。「ポリヌクレオチド」という用語は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５及び６７の１個以上を含む配列も包含する。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、図３−１９に示すヌクレオチド配列と約９０パーセント、約９５パーセント、約９６パーセント、約９７パーセント、約９８パーセント又は約９９パーセント同一であるヌクレオチド配列を有する。ある実施形態においては、本明細書のあるポリペプチドをコードする特定のポリヌクレオチドに相補的であるポリヌクレオチドを提供する。
【００５３】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレ���ニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。
【００５４】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ２ａをコードする配列を含む。ここで、ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在しない。
【００５５】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、アミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含むＣＤＲ３ａをコードする配列を含む。ここで、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。
【００５６】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも２個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａを含むポリペプチドであって、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。
【００５７】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、抗体重鎖可変領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ヒト抗体重鎖可変領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、重鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ヒト重鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２又は配列番号３４のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、非ヒト重鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ヒト以外の種の重鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。
【００５８】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２のアミノ酸２６から３５、配列番号２のアミノ酸５０から６６、配列番号２のアミノ酸９９から１１０、配列番号４のアミノ酸２６から３７、配列番号４のアミノ酸５２から６７、配列番号４のアミノ酸１００から１０９、配列番号６のアミノ酸２６から３７、配列番号６のアミノ酸５２から６７、配列番号６のアミノ酸１００から１０９、配列番号８のアミノ酸２６から３７、配列番号８のアミノ酸５２から６７、配列番号８のアミノ酸１００から１０９、配列番号１０のアミノ酸２６から３５、配列番号１０のアミノ酸５０から６６、配列番号１０のアミノ酸９９から１１０、配列番号１２のアミノ酸２６から３５、配列番号１２のアミノ酸５０から６６、配列番号１２のアミノ酸９９から１１１、配列番号１４のアミノ酸２６から３５、配列番号１４のアミノ酸５０から６５、配列番号１４のアミノ酸９８から１１１、配列番号１６のアミノ酸２６から３７、配列番号１６のアミノ酸５２から６７、配列番号１６のアミノ酸１００から１０９、配列番号１８のアミノ酸２６から３５、配列番号１８のアミノ酸５０から６６、配列番号１８のアミノ酸９９から１０５、配列番号２０のアミノ酸２６から３５、配列番号２０のアミノ酸５０から６６、配列番号２０のアミノ酸９９から１１８、配列番号２２のアミノ酸２６から３５、配列番号２２のアミノ酸５０から６６、配列番号２２のアミノ酸９９から１１８、配列番号２４のアミノ酸２６から３５、配列番号２４のアミノ酸５０から６５、配列番号２４のアミノ酸９８から１０８、配列番号２６のアミノ酸２６から３５、配列番号２６のアミノ酸５０から６６、配列番号２６のアミノ酸９９から１１０、配列番号２８のアミノ酸２６から３５、配列番号２８のアミノ酸５０から６６、配列番号２８のアミノ酸９９から１１７、配列番号３０のアミノ酸２６から３７、配列番号３０のアミノ酸５２から６７、配列番号３０のアミノ酸１００から１１１、配列番号３２のアミノ酸２６から３７、配列番号３２のアミノ酸５２から６７、配列番号３２のアミノ酸１００から１１１、配列番号３４のアミノ酸２６から３７、配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３４のアミノ酸１００から１１１から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２又は３４のＣＤＲの少なくとも２個を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２又は３４のＣＤＲの３個を含むポリペプチドをコードする配列を含む。
【００５９】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２のアミノ酸２６から３５、配列番号２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２のアミノ酸９９から１１０を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号４のアミノ酸２６から３７、配列番号４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号４のアミノ酸１００から１０９を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号６のアミノ酸２６から３７、配列番号６のアミノ酸５２から６７、及び配列番号６のアミノ酸１００から１０９を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号８のアミノ酸２６から３７、配列番号８のアミノ酸５２から６７、及び配列番号８のアミノ酸１００から１０９を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号１０のアミノ酸２６から３５、配列番号１０のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１０のアミノ酸９９から１１０を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号１２のアミノ酸２６から３５、配列番号１２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１２のアミノ酸９９から１１１を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号１４のアミノ酸２６から３５、配列番号１４のアミノ酸５０から６５、及び配列番号１４のアミノ酸９８から１１１を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号１６のアミノ酸２６から３７、配列番号１６のアミノ酸５２から６７、及び配列番号１６のアミノ酸１００から１０９を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号１８のアミノ酸２６から３５、配列番号１８のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１８のアミノ酸９９から１０５を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２０のアミノ酸２６から３５、配列番号２０のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２０のアミノ酸９９から１１８を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２２のアミノ酸２６から３５、配列番号２２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２２のアミノ酸９９から１１８を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２４のアミノ酸２６から３５、配列番号２４のアミノ酸５０から６５、及び配列番号２４のアミノ酸９８から１０８を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２６のアミノ酸２６から３５、配列番号２６のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２６のアミノ酸９９から１１０を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２８のアミノ酸２６から３５、配列番号２８のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２８のアミノ酸９９から１１７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３０のアミノ酸２６から３７、配列番号３０のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３０のアミノ酸１００から１１１を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３２のアミノ酸２６から３７、配列番号３２のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３２のアミノ酸１００から１１１を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３４のアミノ酸２６から３７、配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３４のアミノ酸１００から１１１を含むポリペプチドをコードする配列を含む。
【００６０】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。
【００６１】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも２個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂを含むポリペプチドであって、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。
【００６２】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、抗体軽鎖可変領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ヒト抗体軽鎖可変領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、軽鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ヒト軽鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６又は配列番号６８のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、非ヒト軽鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、ヒト以外の種の軽鎖定常領域を含むポリペプチドをコードする配列を含む。
【００６３】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３６のアミノ酸２４から３４、配列番号３６のアミノ酸５０から５６、配列番号３６のアミノ酸８９から９７、配列番号３８のアミノ酸２４から３４、配列番号３８のアミノ酸５０から５６、配列番号３８のアミノ酸８９から９７、配列番号４０のアミノ酸２４から３４、配列番号４０のアミノ酸５０から５６、配列番号４０のアミノ酸８９から９７、配列番号４２のアミノ酸２４から３４、配列番号４２のアミノ酸５０から５６、配列番号４２のアミノ酸８９から９７、配列番号４４のアミノ酸２４から３４、配列番号４４のアミノ酸５０から５６、配列番号４４のアミノ酸８９から９７、配列番号４６のアミノ酸２４から３４、配列番号４６のアミノ酸５０から５６、配列番号４６のアミノ酸８９から９７、配列番号４８のアミノ酸２４から４０、配列番号４８のアミノ酸５２から６２、配列番号４８のアミノ酸９５から１０３、配列番号５０のアミノ酸２４から３９、配列番号５０のアミノ酸５５から６１、配列番号５０のアミノ酸９４から１０２、配列番号５２のアミノ酸２４から４０、配列番号５２のアミノ酸５６から６２、配列番号５２のアミノ酸９５から１０３、配列番号５４のアミノ酸２４から３４、配列番号５４のアミノ酸５０から５６、配列番号５４のアミノ酸８９から９７、配列番号５６のアミノ酸２４から３４、配列番号５６のアミノ酸５０から５６、配列番号５６のアミノ酸８９から９７、配列番号５８のアミノ酸２４から４０、配列番号５８のアミノ酸５２から６２、配列番号５８のアミノ酸９５から１０３、配列番号６０のアミノ酸２４から３４、配列番号６０のアミノ酸５０から５６、配列番号６０のアミノ酸８９から９７、配列番号６２のアミノ酸２４から３４、配列番号６２のアミノ酸５０から５６、配列番号６２のアミノ酸８９から９７、配列番号６４のアミノ酸２４から３５、配列番号６４のアミノ酸５１から５７、配列番号６４のアミノ酸９０から８８、配列番号６６のアミノ酸２４から３４、配列番号６６のアミノ酸５０から５７、配列番号６６のアミノ酸８９から９７、配列番号６８のアミノ酸２４から３４、配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６８のアミノ酸８９から９７から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４又は６８のＣＤＲの少なくとも２個を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４又は６８のＣＤＲの３個を含むポリペプチドをコードする配列を含む。
【００６４】
ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３６のアミノ酸２４から３４、配列番号３６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号３６のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号３８のアミノ酸２４から３４、配列番号３８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号３８のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号４０のアミノ酸２４から３４、配列番号４０のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４０のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号４２のアミノ酸２４から３４、配列番号４２のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４２のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号４４のアミノ酸２４から３４、配列番号４４のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４４のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号４６のアミノ酸２４から３４、配列番号４６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４６のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号４８のアミノ酸２４から４０、配列番号４８のアミノ酸５６から６２、及び配列番号４８のアミノ酸９５から１０３を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号５０のアミノ酸２４から３９、配列番号５０のアミノ酸５５から６１、及び配列番号５０のアミノ酸９４から１０２を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号５２のアミノ酸２４から４０、配列番号５２のアミノ酸５６から６２、及び配列番号５２のアミノ酸９５から１０３を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号５４の２４から３４、配列番号５４のアミノ酸５０から５６、及び配列番号５４のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号５６のアミノ酸２４から３４、配列番号５６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号５６のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号５８のアミノ酸２４から４０、配列番号５８のアミノ酸５６から６２、及び配列番号５８のアミノ酸９５から１０３を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号６０のアミノ酸２４から３４、配列番号６０のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６０のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号６２のアミノ酸２４から３４、配列番号６２のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６２のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号６４のアミノ酸２４から３５、配列番号６４のアミノ酸５１から５７、及び配列番号６４のアミノ酸９０から８８を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号６６のアミノ酸２４から３４、配列番号６６のアミノ酸５０から５７、及び配列番号６６のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号６８のアミノ酸２４から３４、配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６８のアミノ酸８９から９７を含むポリペプチドをコードする配列を含む。
【００６５】
ある実施形態においては、本願は、抗体重鎖及び軽鎖をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、抗体重鎖可変領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、ヒト抗体重鎖可変領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、抗体軽鎖可変領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、ヒト抗体軽鎖可変領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、抗体重鎖定常領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、ヒト抗体重鎖定常領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、ヒト以外の種の抗体重鎖定常領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、抗体軽鎖定常領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、ヒト抗体軽鎖定常領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、ヒト以外の種の抗体軽鎖定常領域をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。ある実施形態においては、本願は、単鎖抗体をコードするあるポリヌクレオチドを考察する。
【００６６】
ある実施形態においては、これらの抗体重鎖及び軽鎖のポリヌクレオチド及びポリペプチドは、ヒト抗体重鎖及び軽鎖のポリヌクレオチド及びポリペプチドである。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５又は６７のヌクレオチド配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、１個以上のヌクレオチドの１つ以上の欠失、付加及び／又は置換を含むヌクレオチド配列を含む。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６又は６８のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む。ある実施形態においては、相補性決定領域（ＣＤＲ）、例えば、ＣＤＲ１からＣＤＲ３を含む可変領域配列を提供する。ある実施形態においては、可変領域のポリヌクレオチド及びポリペプチドは、ヒト可変領域のポリヌクレオチド及びポリペプチドである。
【００６７】
「天然ヌクレオチド」という用語は、デオキシリボヌクレオチド及びリボヌクレオチドを含む。デオキシリボヌクレオチドとしては、アデノシン、グアニン、シトシン及びチミジンが挙げられるが、これらだけに限定されない。リボヌクレオチドとしては、アデノシン、シトシン、チミジン及びウラシルが挙げられるが、これらだけに限定されない。「修飾ヌクレオチド」という用語は、修飾又は置換された糖類を含むヌクレオチドなどを含むが、これらだけに限定されない。「ポリヌクレオチド結合」という用語は、ホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホロセレノアート、ホスホロジセレノアート、ホスホロアニロチオアート（ｐｈｏｓｐｈｏｒｏａｎｉｌｏｔｈｉｏａｔｅ）、ホスホルアニラダート（ｐｈｏｓｐｈｏｒａｎｉｌａｄａｔｅ）、ホスホロアミダート（ｐｈｏｓｐｈｏｒｏａｍｉｄａｔｅ）などのポリヌクレオチド結合を含むが、これらだけに限定されない。例えば、ＬａＰｌａｎｃｈｅ  ｅｔ  ａｌ．  Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  １４：９０８１（１９８６）；Ｓｔｅｃ  ｅｔ  ａｌ．  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．  Ｓｏｃ．  １０６：６０７７（１９８４）；Ｓｔｅｉｎ  ｅｔ  ａｌ．  Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  １６：３２０９（１９８８）；Ｚｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  Ａｎｔｉ−Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｓｉｇｎ  ６：５３９（１９９１）；Ｚｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ａｎａｌｏｇｕｅｓ：  Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，  ｐｐ．８７−１０８（Ｆ．  Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，  Ｅｄ．，  Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｏｘｆｏｒｄ  Ｅｎｇｌａｎｄ（１９９１））；Ｓｔｅｃ他、米国特許第５，１５１，５１０号；Ｕｈｌｍａｎｎ  ａｎｄ  Ｐｅｙｍａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ９０：５４３（１９９０）を参照されたい。ある実施形態においては、ポリヌクレオチドは検出用標識を含むことができる。
【００６８】
「単離ポリペプチド」という用語は、（１）通常は一緒に存在する少なくとも幾つかのタンパク質を含まないポリペプチド、（２）同じ出所、例えば、同じ種に由来する他のタンパク質を本質的に含まないポリペプチド、（３）異なる種に由来する細胞によって発現されるポリペプチド、又は（４）天然に存在しないポリペプチドを指す。
【００６９】
「ポリペプチド」、「ペプチド」及び「タンパク質」という用語は、本明細書では区別なく使用され、ペプチド結合又は修飾ペプチド結合によって連結された２個以上のアミノ酸のポリマー、すなわち、ペプチドイソスターを指す。これらの用語は、天然アミノ酸を含むアミノ酸ポリマーに適用され、１個以上のアミノ酸残基が非天然アミノ酸、又は天然アミノ酸の化学類似体であるアミノ酸ポリマーに適用される。アミノ酸ポリマーは、翻訳後プロセシングなどの１つ以上の天然プロセスによって修飾された１個以上のアミノ酸残基、及び／又は当分野で公知の１つ以上の化学修飾技術によって修飾された１個以上のアミノ酸残基を含み得る。
【００７０】
基準ポリペプチドの「断片」とは、基準ポリペプチドの任意の部分に由来する連続アミノ酸配列を指す。断片は、基準ポリペプチドの長さよりも短い任意の長さであり得る。
【００７１】
基準ポリペプチドの「変異体」は、基準ポリペプチドに対して１個以上のアミノ酸の置換、欠失又は挿入を含むポリペプチドを指す。ある実施形態においては、基準ポリペプチドの変異体は、変化した翻訳後修飾部位（すなわち、グリコシル化部位）を有する。ある実施形態においては、基準ポリペプチドと基準ポリペプチドの変異体との両方が特異的結合物質である。ある実施形態においては、基準ポリペプチドと基準ポリペプチドの変異体との両方が抗体である。
【００７２】
基準ポリペプチドの変異体としては、グリコシル化変異体が挙げられるが、これだけに限定されない。グリコシル化変異体は、グリコシル化部位の数及び／又はタイプが基準ポリペプチドとは異なる変異体を含む。ある実施形態においては、基準ポリペプチドのグリコシル化変異体は、基準ポリペプチドよりも多い、又は少ないＮ結合グリコシル化部位を含む。ある実施形態においては、Ｎ結合グリコシル化部位は、配列Ａｓｎ−Ｘ−Ｓｅｒ又はＡｓｎ−Ｘ−Ｔｈｒを特徴とする。ここで、Ｘで示されるアミノ酸残基は、プロリン以外の任意のアミノ酸残基であり得る。ある実施形態においては、基準ポリペプチドのグリコシル化変異体は、１個以上のＮ結合グリコシル化部位（典型的には天然のＮ結合グリコシル化部位）が除去され、１個以上の新しいＮ結合部位が生成する、Ｎ結合糖鎖の再配列を含む。
【００７３】
基準ポリペプチドの変異体としては、システイン変異体が挙げられるが、これだけに限定されない。ある実施形態においては、システイン変異体としては、基準ポリペプチドの１個以上のシステイン残基が１個以上の非システイン残基で置換された変異体、及び／又は基準ポリペプチドの１個以上の非システイン残基が１個以上のシステイン残基で置換された変異体が挙げられる。システイン変異体は、ある実施形態においては、例えば不溶性封入体の単離後に、特定のポリペプチドを生物活性高次構造に再び折り畳む必要があるときに、有用であり得る。ある実施形態においては、基準ポリペプチドのシステイン変異体は、基準ポリペプチドよりもシステイン残基が少ない。ある実施形態においては、基準ポリペプチドのシステイン変異体は、不対システインに起因する相互作用を最小化するために偶数のシステインを有する。ある実施形態においては、システイン変異体は、システイン残基が未変性タンパク質よりも多い。
【００７４】
基準ポリペプチドの「誘導体」とは、（１）基準ポリペプチドの１個以上のアミノ酸残基の１つ以上の修飾を含むポリペプチド、及び／又は（２）１個以上のペプチジル結合が１個以上の非ペプチジル結合で置換されたポリペプチド、及び／又は（３）Ｎ末端及び／又はＣ末端が修飾されたポリペプチドを指す。ある種の例示的な修飾としては、アセチル化、アシル化、ＡＤＰリボシル化、アミド化、ビオチン化、フラビンの共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチド又はヌクレオチド誘導体の共有結合、脂質又は脂質誘導体の共有結合、ホスファチジルイノシトール（ｐｈｏｓｐｈｏｔｉｄｙｌｉｎｏｓｉｔｏｌ）の共有結合、架橋、環化、ジスルフィド結合形成、脱メチル、共有結合性架橋の形成、シスチンの形成、ピログルタミン酸の形成、ホルミル化、ガンマ−カルボキシル化、グリコシル化、ＧＰＩアンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、タンパク質分解プロセシング、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、アルギニン化などの転移ＲＮＡによって媒介されるタンパク質へのアミノ酸付加、及びユビキチン化が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、基準ポリペプチドと基準ポリペプチド誘導体の両方が特異的結合物質である。ある実施形態においては、基準ポリペプチドと基準ポリペプチド誘導体の両方が抗体である。
【００７５】
ポリペプチドとしては、翻訳後プロセシングなどの天然プロセスによって、又は当分野で周知の化学修飾技術によって、修飾されたアミノ酸配列が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、修飾は、ペプチド骨格、アミノ酸側鎖、及びアミノ又はカルボキシ末端を含めて、ポリペプチドのどこででも起こり得る。特定のかかる実施形態においては、修飾は、所与のポリペプチド中の幾つかの部位において同じ程度でも、異なる程度でも存在し得る。ある実施形態においては、所与のポリペプチドは、未変性配列の１個以上のアミノ酸の欠失、付加及び／又は置換などの多様な修飾を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは分枝状及び／又は環状であり得る。環式、分枝状及び分枝環式ポリペプチドは、（ユビキチン化を含めて、ただしこれだけに限定されない）翻訳後の天然プロセスから生成し得、又は合成方法によって製造され得る。「ポリペプチド」という用語は、以下に示すように、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される抗体の重鎖及び／又は軽鎖のアミノ酸配列（配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６及び６８参照）を含む配列も包含する。「ポリペプチド」という用語は、１個以上のアミノ酸の１つ以上の欠失、付加及び／又は置換を含む配列も包含する。ある実施形態においては、あるポリペプチド配列は、少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
【００７６】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニ���、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。
【００７７】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも２個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。ある実施形態においては、ポリペプチドは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａを含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。
【００７８】
ある実施形態においては、ポリペプチドは抗体重鎖可変領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドはヒト抗体重鎖可変領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは重鎖定常領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドはヒト重鎖定常領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２又は配列番号３４のアミノ酸配列を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは非ヒト重鎖定常領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、ヒト以外の種の重鎖定常領域を含む。
【００７９】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸２６から３５、配列番号２のアミノ酸５０から６６、配列番号２のアミノ酸９９から１１０、配列番号４のアミノ酸２６から３７、配列番号４のアミノ酸５２から６７、配列番号４のアミノ酸１００から１０９、配列番号６のアミノ酸２６から３７、配列番号６のアミノ酸５２から６７、配列番号６のアミノ酸１００から１０９、配列番号８のアミノ酸２６から３７、配列番号８のアミノ酸５２から６７、配列番号８のアミノ酸１００から１０９、配列番号１０のアミノ酸２６から３５、配列番号１０のアミノ酸５０から６６、配列番号１０のアミノ酸９９から１１０、配列番号１２のアミノ酸２６から３５、配列番号１２のアミノ酸５０から６６、配列番号１２のアミノ酸９９から１１１、配列番号１４のアミノ酸２６から３５、配列番号１４のアミノ酸５０から６５、配列番号１４のアミノ酸９８から１１１、配列番号１６のアミノ酸２６から３７、配列番号１６のアミノ酸５２から６７、配列番号１６のアミノ酸１００から１０９、配列番号１８のアミノ酸２６から３５、配列番号１８のアミノ酸５０から６６、配列番号１８のアミノ酸９９から１０５、配列番号２０のアミノ酸２６から３５、配列番号２０のアミノ酸５０から６６、配列番号２０のアミノ酸９９から１１８、配列番号２２のアミノ酸２６から３５、配列番号２２のアミノ酸５０から６６、配列番号２２のアミノ酸９９から１１８、配列番号２４のアミノ酸２６から３５、配列番号２４のアミノ酸５０から６５、配列番号２４のアミノ酸９８から１０８、配列番号２６のアミノ酸２６から３５、配列番号２６のアミノ酸５０から６６、配列番号２６のアミノ酸９９から１１０、配列番号２８のアミノ酸２６から３５、配列番号２８のアミノ酸５０から６６、配列番号２８のアミノ酸９９から１１７、配列番号３０のアミノ酸２６から３７、配列番号３０のアミノ酸５２から６７、配列番号３０のアミノ酸１００から１１１、配列番号３２のアミノ酸２６から３７、配列番号３２のアミノ酸５２から６７、配列番号３２のアミノ酸１００から１１１、配列番号３４のアミノ酸２６から３７、配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３４のアミノ酸１００から１１１から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２又は３４のＣＤＲの少なくとも２個を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２又は３４のＣＤＲの少なくとも３個を含む。
【００８０】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸２６から３５、配列番号２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２のアミノ酸９９から１１０を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸２６から３７、配列番号４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号４のアミノ酸１００から１０９を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸２６から３７、配列番号６のアミノ酸５２から６７、及び配列番号６のアミノ酸１００から１０９を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号８のアミノ酸２６から３７、配列番号８のアミノ酸５２から６７、及び配列番号８のアミノ酸１００から１０９を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号１０のアミノ酸２６から３５、配列番号１０のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１０のアミノ酸９９から１１０を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号１２のアミノ酸２６から３５、配列番号１２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１２のアミノ酸９９から１１１を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸２６から３５、配列番号１４のアミノ酸５０から６５、及び配列番号１４のアミノ酸９８から１１１を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号１６のアミノ酸２６から３７、配列番号１６のアミノ酸５２から６７、及び配列番号１６のアミノ酸１００から１０９を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号１８のアミノ酸２６から３５、配列番号１８のアミノ酸５０から６６、及び配列番号１８のアミノ酸９９から１０５を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２０のアミノ酸２６から３５、配列番号２０のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２０のアミノ酸９９から１１８を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸２６から３５、配列番号２２のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２２のアミノ酸９９から１１８を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２４のアミノ酸２６から３５、配列番号２４のアミノ酸５０から６５、及び配列番号２４のアミノ酸９８から１０８を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２６のアミノ酸２６から３５、配列番号２６のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２６のアミノ酸９９から１１０を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号２８のアミノ酸２６から３５、配列番号２８のアミノ酸５０から６６、及び配列番号２８のアミノ酸９９から１１７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３０のアミノ酸２６から３７、配列番号３０のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３０のアミノ酸１００から１１１を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３２のアミノ酸２６から３７、配列番号３２のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３２のアミノ酸１００から１１１を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３４のアミノ酸２６から３７、配列番号３４のアミノ酸５２から６７、及び配列番号３４のアミノ酸１００から１１１を含む。
【００８１】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。ここで、ＣＤＲ１ｂはａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、ＣＤＲ２ｂはアミノ酸ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。
【００８２】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも２個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。ある実施形態においては、ポリペプチドは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂを含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する。
【００８３】
ある実施形態においては、ポリペプチドは抗体軽鎖可変領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドはヒト抗体軽鎖可変領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは軽鎖定常領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドはヒト軽鎖定常領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６又は配列番号６８のアミノ酸配列を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは非ヒト軽鎖定常領域を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、ヒト以外の種の軽鎖定常領域を含む。
【００８４】
ある実施形態においては、配列番号３６のアミノ酸２４から３４、配列番号３６のアミノ酸５０から５６、配列番号３６のアミノ酸８９から９７、配列番号３８のアミノ酸２４から３４、配列番号３８のアミノ酸５０から５６、配列番号３８のアミノ酸８９から９７、配列番号４０のアミノ酸２４から３４、配列番号４０のアミノ酸５０から５６、配列番号４０のアミノ酸８９から９７、配列番号４２のアミノ酸２４から３４、配列番号４２のアミノ酸５０から５６、配列番号４２のアミノ酸８９から９７、配列番号４４のアミノ酸２４から３４、配列番号４４のアミノ酸５０から５６、配列番号４４のアミノ酸８９から９７、配列番号４６のアミノ酸２４から３４、配列番号４６のアミノ酸５０から５６、配列番号４６のアミノ酸８９から９７、配列番号４８のアミノ酸２４から４０、配列番号４８のアミノ酸５２から６２、配列番号４８のアミノ酸９５から１０３、配列番号５０のアミノ酸２４から３９、配列番号５０のアミノ酸５５から６１、配列番号５０のアミノ酸９４から１０２、配列番号５２のアミノ酸２４から４０、配列番号５２のアミノ酸５６から６２、配列番号５２のアミノ酸９５から１０３、配列番号５４のアミノ酸２４から３４、配列番号５４のアミノ酸５０から５６、配列番号５４のアミノ酸８９から９７、配列番号５６のアミノ酸２４から３４、配列番号５６のアミノ酸５０から５６、配列番号５６のアミノ酸８９から９７、配列番号５８のアミノ酸２４から４０、配列番号５８のアミノ酸５２から６２、配列番号５８のアミノ酸９５から１０３、配列番号６０のアミノ酸２４から３４、配列番号６０のアミノ酸５０から５６、配列番号６０のアミノ酸８９から９７、配列番号６２のアミノ酸２４から３４、配列番号６２のアミノ酸５０から５６、配列番号６２のアミノ酸８９から９７、配列番号６４のアミノ酸２４から３５、配列番号６４のアミノ酸５１から５７、配列番号６４のアミノ酸９０から８８、配列番号６６のアミノ酸２４から３４、配列番号６６のアミノ酸５０から５７、配列番号６６のアミノ酸８９から９７、配列番号６８のアミノ酸２４から３４、配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６８のアミノ酸８９から９７から選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチド。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６又は６８のＣＤＲの少なくとも２個を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６又は６８のＣＤＲの少なくとも３個を含む。
【００８５】
ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３６のアミノ酸２４から３４、配列番号３６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号３６のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号３８のアミノ酸２４から３４、配列番号３８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号３８のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号４０のアミノ酸２４から３４、配列番号４０のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４０のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号４２のアミノ酸２４から３４、配列番号４２のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４２のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号４４のアミノ酸２４から３４、配列番号４４のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４４のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号４６のアミノ酸２４から３４、配列番号４６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号４６のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号４８のアミノ酸２４から４０、配列番号４８のアミノ酸５６から６２、及び配列番号４８のアミノ酸９５から１０３を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号５０のアミノ酸２４から３９、配列番号５０のアミノ酸５５から６１、及び配列番号５０のアミノ酸９４から１０２を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号５２のアミノ酸２４から４０、配列番号５２のアミノ酸５６から６２、及び配列番号５２のアミノ酸９５から１０３を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号５４のアミノ酸２４から３４、配列番号５４のアミノ酸５０から５６、及び配列番号５４のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号５６のアミノ酸２４から３４、配列番号５６のアミノ酸５０から５６、及び配列番号５６のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号５８のアミノ酸２４から４０、配列番号５８のアミノ酸５６から６２、及び配列番号５８のアミノ酸９５から１０３を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号６０のアミノ酸２４から３４、配列番号６０のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６０のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号６２のアミノ酸２４から３４、配列番号６２のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６２のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号６４のアミノ酸２４から３５、配列番号６４のアミノ酸５１から５７、及び配列番号６４のアミノ酸９０から８８を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号６６のアミノ酸２４から３４、配列番号６６のアミノ酸５０から５７、及び配列番号６６のアミノ酸８９から９７を含む。ある実施形態においては、ポリペプチドは、配列番号６８のアミノ酸２４から３４、配列番号６８のアミノ酸５０から５６、及び配列番号６８のアミノ酸８９から９７を含む。
【００８６】
対象に適用される「天然の」という用語は、対象が天然に存在し得ることを意味する。例えば、天然源から単離することができ、実験室などで人によって意図的に改変されていない、（ウイルスを含めた）生物体中に存在するポリペプチド又はポリヌクレオチドは天然である。
【００８７】
本明細書では「作動可能に結合した」という用語は、意図したように機能し得る関係にある成分を指す。例えば、ポリヌクレオチド配列に関連して、制御配列が機能するのに適合した条件下でコード配列が発現されるように、制御配列とコード配列が互いに関連しているときに、制御配列はコード配列に「作動可能に結合し」得る。
【００８８】
「制御配列」という用語は、制御配列が関連するコード配列の発現及びプロセシングをもたらし得るポリヌクレオチド配列を指す。かかる制御配列の性質は、宿主生物体に応じて異なり得る。原核生物のある例示的な制御配列としては、プロモーター、リボソーム結合部位及び転写終結配列が挙げられるが、これらだけに限定されない。真核生物のある例示的な制御配列としては、プロモーター、エンハンサー及び転写終結配列が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、「制御配列」は、リーダー配列及び／又は融合パートナー配列を含み得る。
【００８９】
ある実施形態においては、第１と第２のポリヌクレオチドコード配列が、単一の隣接ポリペプチドに翻訳され得る単一の隣接ｍＲＮＡに転写されるときに、第１のポリヌクレオチドコード配列は、第２のポリヌクレオチドコード配列に作動可能に結合している。
【００９０】
ポリペプチドに関連して、２個以上のポリペプチドは、各結合ポリペプチドが、意図したように機能し得る場合に、「作動可能に結合し」ている。別のポリペプチドに作動可能に結合したときに意図したように機能し得るポリペプチドは、別のポリペプチドに作動可能に結合していないときには、意図したように機能し得る場合もあれば、し得ない場合もある。例えば、ある実施形態においては、第１のポリペプチドは、結合していないときには、意図したように機能し得ないが、意図したように機能し得るように第２のポリペプチドと結合することによって安定化され得る。或いは、ある実施形態においては、第１のポリペプチドは、結合していないときでも意図したように機能し得るが、第２のポリペプチドに作動可能に結合したときにもその能力を保持し得る。
【００９１】
本明細書では、２個以上のポリペプチドを単一の隣接ポリペプチド配列として翻訳することによって、又は単一の隣接ポリペプチド配列として合成することによって、２個以上のポリペプチドが結合しているときには、２個以上のポリペプチドは「融合されて」いる。ある実施形態においては、２個以上の融合ポリペプチドは、２個以上の作動可能に結合したポリヌクレオチドコード配列からインビボで翻訳され得る。ある実施形態においては、２個以上の融合ポリペプチドは、２個以上の作動可能に結合したポリヌクレオチドコード配列からインビトロで翻訳され得る。
【００９２】
本明細書では、２個以上のポリペプチドは、各結合ポリペプチドが意図したように機能し得る場合に、「作動可能に融合し」ている。
【００９３】
ある実施形態においては、２個以上の異なるポリペプチド単位を含む第１のポリペプチドは、異なるポリペプチド単位の少なくとも１個が第２のポリペプチドに結合している限り、第２のポリペプチドに結合しているとみなす。非限定的例として、ある実施形態においては、（ａ）第２のポリペプチドが抗体の重鎖ポリペプチドの１個に結合している場合、（ｂ）第２のポリペプチドが抗体の軽鎖ポリペプチドの１個に結合している場合、（ｃ）第２のポリペプチドの第１の分子が抗体の重鎖ポリペプチドの１個に結合し、第２のポリペプチドの第２の分子が抗体の軽鎖ポリペプチドの１個に結合している場合、及び（ｄ）第２のポリペプチドの第１と第２の分子が、抗体の第１と第２の重鎖ポリペプチドに結合し、第２のポリペプチドの第３と第４の分子が、抗体の第１と第２の軽鎖ポリペプチドに結合している場合のすべてにおいて、抗体は第２のポリペプチドに結合しているとみなす。
【００９４】
ある実施形態においては、「第２のポリペプチドに結合した第１のポリペプチド」という言葉は、（ａ）第１のポリペプチドの１個の分子のみが、第２のポリペプチドの１個の分子のみに結合している場合、（ｂ）第１のポリペプチドの１個の分子のみが、第２のポリペプチドの１個を超える分子に結合している場合、（ｃ）第１のポリペプチドの１個を超える分子が第２のポリペプチドの１個の分子のみに結合している場合、及び（ｄ）第１のポリペプチドの１個を超える分子が第２のポリペプチドの１個を超える分子に結合している場合を包含する。ある実施形態においては、結合分子が第１のポリペプチドの１個を超える分子と第２のポリペプチドの１個の分子のみとを含むときには、第１のポリペプチドの分子の全部又は一部は、第２のポリペプチドに共有結合又は非共有結合し得る。ある実施形態においては、結合分子が第１のポリペプチドの１個を超える分子を含むときには、第１のポリペプチドの１個以上の分子は、第１のポリペプチドの他の分子に共有結合又は非共有結合し得る。
【００９５】
本明細書では「柔軟なリンカー」とは、その化学構造によって、３次元空間に固定されないと予測される任意のリンカーを指す。当業者は、特定のリンカーが、その意図した状況において柔軟であるかどうかを予測することができる。ある実施形態においては、３個以上のアミノ酸を含むペプチドリンカーは柔軟なリンカーである。
【００９６】
本明細書では、２０種類の従来のアミノ酸及びその略語は、従来の用法に従う。Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ−Ａ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（２ｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，  Ｅ．Ｓ．  Ｇｏｌｕｂ  ａｎｄ  Ｄ．Ｒ．  Ｇｒｅｎ，  Ｅｄｓ．，  Ｓｉｎａｕｅｒ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ，  Ｓｕｎｄｅｒｌａｎｄ，  Ｍａｓｓ．（１９９１））を参照されたい。ある実施形態においては、従来とは異なる１個以上のアミノ酸をポリペプチドに組み入れることができる。「従来とは異なるアミノ酸」という用語は、２０種類の従来のアミノ酸の１つではない任意のアミノ酸を指す。「非天然アミノ酸」という用語は、天然には存在しないアミノ酸を指す。非天然アミノ酸は、従来とは異なるアミノ酸の一サブセットである。従来とは異なるアミノ酸としては、２０種類の従来のアミノ酸の立体異性体（例えば、Ｄ−アミノ酸）、α−，α−二置換アミノ酸などの異常アミノ酸、Ｎ−アルキルアミノ酸、乳酸、ホモセリン、ホモシステイン、４−ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタマート、ε−Ｎ，Ｎ，Ｎ−トリメチルリジン、ε−Ｎ−アセチルリジン、Ｏ−ホスホセリン、Ｎ−アセチルセリン、Ｎ−ホルミルメチオニン、３−メチルヒスチジン、５−ヒドロキシリジン、σ−Ｎ−メチルアルギニン、並びに当分野で公知の他の類似のアミノ酸及びイミノ酸（例えば、４−ヒドロキシプロリン）が挙げられるが、これらだけに限定されない。本明細書で使用するポリペプチド表記では、標準の用法及び慣行に従って、左手方向がアミノ末端方向であり、右手方向がカルボキシ末端方向である。
【００９７】
ある実施形態においては、保存的アミノ酸置換は、従来とは異なる１個以上のアミノ酸残基による置換を含む。ある実施形態においては、従来とは異なるアミノ酸残基は、生物系における合成ではなく、化学ペプチド合成によって組み入れられる。
【００９８】
「酸性残基」という用語は、ポリペプチドの同じ、又は異なる他の２個のアミノ酸残基の間に組み入れられるときに、少なくとも１個の酸性基を含むＤ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。ある実施形態においては、酸性残基は、少なくとも１個の酸性基を含む側鎖を含む。例示的な酸性残基としては、アスパラギン酸（Ｄ）及びグルタミン酸（Ｅ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、酸性残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【００９９】
「芳香族残基」という用語は、少なくとも１個の芳香族基を含むＤ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。ある実施形態においては、芳香族残基は、少なくとも１個の芳香族基を含む側鎖を含む。例示的な芳香族残基としては、フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）及びトリプトファン（Ｗ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、芳香族残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【０１００】
「塩基性残基」という用語は、ポリペプチドの同じ、又は異なる１個以上のアミノ酸残基に隣接して組み入れられるときに、少なくとも１個の塩基性基を含み得る、Ｆ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。ある実施形態においては、塩基性残基は、少なくとも１個の塩基性基を含む側鎖を含む。例示的な塩基性残基としては、ヒスチジン（Ｈ）、リジン（Ｋ）及びアルギニン（Ｒ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、塩基性残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【０１０１】
「中性親水性残基」という用語は、ポリペプチドの同じ、又は異なる１個以上のアミノ酸残基に隣接して組み入れられるときに、少なくとも１個の親水性及び／又は極性基を含むが、酸性基も塩基性基も含まない、Ｄ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。例示的な中性親水性残基としては、アラニン（Ａ）、システイン（Ｃ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）、アスパラギン（Ｎ）及びグルタミン（Ｑ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、中性親水性残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【０１０２】
「親油性残基」及び「Ｌａａ」という用語は、少なくとも１個の無荷電の脂肪族及び／又は芳香族基を有するＤ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。ある実施形態においては、親油性残基は、少なくとも１個の無荷電の脂肪族及び／又は芳香族基を含む側鎖を含む。例示的な親油性側鎖としては、アラニン（Ａ）、フェニルアラニン（Ｆ）、イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、ノルロイシン（Ｎｉｌｅ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）、トリプトファン（Ｗ）及びチロシン（Ｙ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、親油性残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【０１０３】
「両親媒性残基」という用語は、親水性残基とも親油性残基ともなり得るＤ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。例示的な両親媒性残基としては、アラニン（Ａ）が挙げられるが、これだけに限定されない。ある実施形態においては、両親媒性残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【０１０４】
「非機能性残基」という用語は、ポリペプチドの同じ、又は異なる１個以上のアミノ酸残基に隣接して組み入れられるときに、酸性基、塩基性基及び芳香族基を欠く、Ｄ又はＬ型のアミノ酸残基を指す。例示的な非機能性アミノ酸残基としては、メチオニン（Ｍ）、グリシン（Ｇ）、アラニン（Ａ）、バリン（Ｖ）、イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）及びノルロイシン（Ｎｌｅ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、非機能性残基は、従来とは異なるアミノ酸であり得る。
【０１０５】
ある実施形態においては、グリシン（Ｇ）及びプロリン（Ｐ）は、ポリペプチド鎖の配向に影響を及ぼし得るアミノ酸残基と考えられる。
【０１０６】
ある実施形態においては、保存的置換は、一残基タイプのメンバーを同じ残基タイプのメンバーで置換することを含み得る。非限定的例として、ある実施形態においては、保存的置換は、Ｄなどの酸性残基をＥなどの異なる酸性残基で置換することを含み得る。ある実施形態においては、非保存的置換は、一残基タイプのメンバーを異なる残基タイプのメンバーで置換することを含み得る。非限定的例として、ある実施形態においては、非保存的置換は、Ｄなどの酸性残基をＫなどの塩基性残基で置換することを含み得る。ある実施形態においては、システイン残基を別のアミノ酸残基で置換して、ポリペプチド中のその位置とのジスルフィド結合形成を防止する。
【０１０７】
保存的又は非保存的置換の際には、ある実施形態によれば、アミノ酸の疎水性親水性指標を考慮し得る。各アミノ酸は、その疎水性及び電荷特性に基づいて疎水性親水性指標を割り当てられている。２０種類の天然アミノ酸の疎水性親水性指標は、イソロイシン（＋４．５）、バリン（＋４．２）、ロイシン（＋３．８）、フェニルアラニン（＋２．８）、システイン／シスチン（＋２．５）、メチオニン（＋１．９）、アラニン（＋１．８）、グリシン（−０．４）、トレオニン（−０．７）、セリン（−０．８）、トリプトファン（−０．９）、チロシン（−１．３）、プロリン（−１．６）、ヒスチジン（−３．２）、グルタミン酸（−３．５）、グルタミン（−３．５）、アスパラギン酸（−３．５）、アスパラギン（−３．５）、リジン（−３．９）及びアルギニン（−４．５）である。
【０１０８】
相互作用的な生物学的機能をタンパク質に付与する際の疎水性親水性アミノ酸指標の重要性は当分野では理解されている。Ｋｙｔｅ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．，  １５７：１０５−１３１（１９８２）。あるアミノ酸は、類似の疎水性親水性指標又はスコアを有する他のアミノ酸を置換することができ、それでもなお類似の生物活性を保持することが知られている場合もある。疎水性親水性指標に基づいて変化させる際には、ある実施形態においては、疎水性親水性指標が±２以内であるアミノ酸の置換を含む。ある実施形態においては±１以内であるアミノ酸の置換を含み、ある実施形態においては±０．５以内であるアミノ酸の置換を含む。
【０１０９】
類似アミノ酸の置換は、本例のように、特にそれによって産生される生物学的に機能的であるタンパク質又はペプチドを免疫学的実施形態に用いようとする場合には、親水性に基づいて効果的に実施し得ることも当分野では理解されている。ある実施形態においては、その隣接アミノ酸の親水性によって支配される、タンパク質の局所的な最大平均親水性は、その免疫原性及び抗原性、すなわち、ポリペプチドの生物学的特性と相関がある。
【０１１０】
以下の親水性値がこれらのアミノ酸残基に割り当てられている：アルギニン（＋３．０）、リジン（＋３．０）、アスパラギン酸（＋３．０±１）、グルタミン酸（＋３．０±１）、セリン（＋０．３）、アスパラギン（＋０．２）、グルタミン（＋０．２）、グリシン（０）、トレオニン（−０．４）、プロリン（−０．５±１）、アラニン（−０．５）、ヒスチジン（−０．５）、システイン（−１．０）、メチオニン（−１．３）、バリン（−１．５）、ロイシン（−１．８）、イソロイシン（−１．８）、チロシン（−２．３）、フェニルアラニン（−２．５）及びトリプトファン（−３．４）。類似の親水性値に基づいて変化させる際には、ある実施形態においては、親水性値が±２以内であるアミノ酸の置換を含み、ある実施形態においては±１以内であるアミノ酸の置換を含み、ある実施形態においては±０．５以内であるアミノ酸の置換を含む。親水性に基づいて一次アミノ酸配列からエピトープを特定し得る場合もある。これらの領域は「エピトープコア領域」とも記述される。
【０１１１】
例示的なアミノ酸置換を表１に示す。
【０１１２】
【表１】
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【０１１３】
同様に、本明細書では、別段の記載がない限り、一本鎖ポリヌクレオチド配列の左手末端は５’末端であり、二本鎖ポリヌクレオチド配列の左手方向を５’方向と記述する。新生ＲＮＡ転写物の５’から３’の付加方向を、本明細書では転写方向と記述する。ＲＮＡと同じ配列を有し、ＲＮＡ転写物の５’末端に対して５’であるＤＮＡ鎖上の配列領域を「上流配列」と本明細書では記述する。ＲＮＡと同じ配列を有し、ＲＮＡ転写物の３’末端に対して３’であるＤＮＡ鎖上の配列領域を「下流配列」と本明細書では記述する。
【０１１４】
ある実施形態においては、保存的アミノ酸置換は、非天然アミノ酸残基を包含する。非天然アミノ酸残基は、典型的には、生体系における合成ではなく、化学ペプチド合成によって組み入れられる。非天然アミノ酸残基としては、ペプチド模倣物、及びアミノ酸部分の他の逆転又は反転型が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１１５】
当業者は、周知技術を用いて、本明細書の基準ポリペプチドの適切な置換変異体を決定することができるはずである。ある実施形態においては、当業者は、活性に重要ではないと考えられる領域を標的にすることによって、活性を損なわずに変化させることができる適切な分子域を特定することができる。ある実施形態においては、類似のポリペプチド間で保存されている、残基及び分子の一部を特定することができる。ある実施形態においては、抗体のＣＤＲを含めて、ただしこれだけに限定されない、生物活性に重要であり得る領域でも、又は構造上重要であり得る領域でも、生物活性を損なわずに、又はポリペプチド構造に悪影響を及ぼさずに、保存的アミノ酸置換に供し得る。
【０１１６】
また、ある実施形態においては、当業者は、活性及び／又は構造に重要である類似のポリペプチド中の残基を特定する構造−機能研究を再検討することができる。かかる比較を考慮して、ある実施形態においては、類似のポリペプチド中の活性又は構造に重要であるアミノ酸残基に対応するポリペプチド中のアミノ酸残基の重要性を予測することができる。ある実施形態においては、当業者は、かかる予測された重要なアミノ酸残基を化学的に類似したアミノ酸で置換することを選択することができる。
【０１１７】
ある実施形態においては、当業者は、類似のポリペプチドにおいて、その構造に関連した３次元構造及びアミノ酸配列を分析することもできる。かかる情報を考慮して、当業者は、その３次元構造に関して、抗体のアミノ酸残基のアラインメントを予測することができる。ある実施形態においては、当業者は、タンパク質表面に存在すると予測されたアミノ酸残基に過激な変化を起こさないように選択することができる。というのは、かかる残基は、他の分子との重要な相互作用に関与し得るからである。さらに、ある実施形態においては、当業者は、各所望のアミノ酸残基において単一のアミノ酸置換を含む試験変異体を生成させることができる。ある実施形態においては、次いで、当業者に公知の活性アッセイを用いて、変異体をスクリーニングすることができる。例えば、ある実施形態においては、ＴＲ−２との結合能力について、変異体をスクリーニングすることができる。ある実施形態においては、かかる変異体は、適切な変異体についての情報収集に使用することができる。例えば、ある実施形態においては、特定のアミノ酸残基に対する変化が、損なわれた活性、望ましくない低活性、又は不適当な活性をもたらすことを発見した場合には、かかる変化を含む変異体を回避することができる。換言すれば、かかる定常的な実験から収集した情報に基づいて、当業者は、さらなる置換を単独で、又は他の変異と組み合わせて、回避すべきアミノ酸を容易に決定することができる。
【０１１８】
幾つかの科学関係の出版物が二次構造の予測に注力している。Ｍｏｕｌｔ  Ｊ．，  Ｃｕｒｒ．  Ｏｐ．  ｉｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．，  ７（４）：４２２−４２７（１９９６），  Ｃｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，  １３（２）：２２２−２４５（１９７４）；  Ｃｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，  １１３（２）：２１１−２２２（１９７４）；  Ｃｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｄｖ．  Ｅｎｚｙｍｏｌ．  Ｒｅｌａｔ．  Ａｒｅａｓ  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．，  ４７：４５−１４８（１９７８）；  Ｃｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｎｎ．  Ｒｅｖ．  Ｂｉｏｃｈｅｍ．，  ４７：２５１−２７６及びＣｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ｊ．，  ２６：３６７−３８４（１９７９）を参照されたい。さらに、二次構造予測の支援にコンピュータプログラムが現在利用可能である。二次構造を予測する１つの方法は、相同性モデリングに基づくものである。例えば、３０％を超える配列同一性、又は４０％を超える類似度を有する２種類のポリペプチド又はタンパク質は、類似の構造形態を有することが多い。タンパク質構造データベース（ＰＤＢ）の最近の進展によって、ポリペプチド又はタンパク質の構造中の可能な折り畳み数を含めて、二次構造の予測性が向上した。Ｈｏｌｍ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄ．  Ｒｅｓ．，  ２７（１）：２４４−２４７（１９９９）を参照されたい。所与のポリペプチド又はタンパク質中には限定数の折り畳みが存在し、臨界数の構造が解明されると、構造予測は劇的により正確になることが示唆された。例えば、Ｂｒｅｎｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｃｕｒｒ．  Ｏｐ．  Ｓｔｒｕｃｔ．  Ｂｉｏｌ．，  ７（３）：３６９−３７６（１９９７）を参照されたい。
【０１１９】
二次構造を予測する更に別の例示的な方法としては、「スレッディング（ｔｈｒｅａｄｉｎｇ）」（Ｊｏｎｅｓ，  Ｄ．，  Ｃｕｒｒ．  Ｏｐｉｎ．  Ｓｔｒｕｃｔ．  Ｂｉｏｌ．，  ７（３）：３７７−８７（１９９７）；  Ｓｉｐｐｌ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，  ４（１）：１５−１９（１９９６））、「プロファイル分析」（Ｂｏｗｉｅ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｃｉｅｎｃｅ，  ２５３：１６４−１７０（１９９１）；  Ｇｒｉｂｓｋｏｖ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｍｅｔｈ．  Ｅｎｚｙｍ．，  １８３：１４６−１５９（１９９０）；  Ｇｒｉｂｓｋｏｖ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．，  ８４（１３）：４３５５−４３５８（１９８７））及び「進化連鎖」（Ｈｏｌｍ（前掲）（１９９９）及びＢｒｅｎｎｅｒ（前掲）（１９９７））が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１２０】
ある実施形態においては、関係するポリペプチドの同一性及び類似度は、公知の方法によって容易に計算することができる。かかる方法としては、Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，  Ｌｅｓｋ，  Ａ．Ｍ．，  ｅｄ．，  Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９８８）；  Ｂｉｏｃｏｍｐｕｔｉｎｇ：  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ  ａｎｄ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔｓ，  Ｓｍｉｔｈ，  Ｄ．Ｗ．，  ｅｄ．，  Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９９３）；  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄａｔａ，  Ｐａｒｔ  １，  Ｇｒｉｆｆｉｎ，  Ａ．Ｍ．，  ａｎｄ  Ｇｒｉｆｆｉｎ，  Ｈ．Ｇ．，  ｅｄｓ．，  Ｈｕｍａｎａ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｎｅｗ  Ｊｅｒｓｅｙ（１９９４）；  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，  ｖｏｎ  Ｈｅｉｎｊｅ，  Ｇ．，  Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ（１９８７）；  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｐｒｉｍｅｒ，  Ｇｒｉｂｓｋｏｖ，  Ｍ．  ａｎｄ  Ｄｅｖｅｒｅｕｘ，  Ｊ．，  ｅｄｓ．，  Ｍ．  Ｓｔｏｃｋｔｏｎ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９９１）及びＣａｒｉｌｌｏ  ｅｔ  ａｌ．，  ＳＩＡＭ  Ｊ．  Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｍａｔｈ．，  ４８：１０７３（１９８８）の方法が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、ポリペプチドは、図３−１９に示すアミノ酸配列と約９０パーセント、約９５パーセント、約９６パーセント、約９７パーセント、約９８パーセント又は約９９パーセント同一であるアミノ酸配列を有する。
【０１２１】
ある実施形態においては、同一性を求める方法は、試験配列間の最大一致を与えるように設計される。ある実施形態においては、同一性を求める方法は、公的に利用可能なコンピュータプログラムに記述されている。２個の配列間の同一性を求めるあるコンピュータプログラム法としては、ＧＡＰ（Ｄｅｖｅｒｅｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎｕｃｌ．  Ａｃｉｄ．  Ｒｅｓ．，  １２：３８７（１９８４）；  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ，  Ｍａｄｉｓｏｎ，  ＷＩ，  ＢＬＡＳＴＰ，  ＢＬＡＳＴＮ及びＦＡＳＴＡ（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．，  ２１５：４０３−４１０（１９９０））を含めて、ＧＣＧプログラムパッケージが挙げられるが、これらだけに限定されない。ＢＬＡＳＴＸプログラムは、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ）及び他の出所から公的に利用可能である（ＢＬＡＳＴ  Ｍａｎｕａｌ，  Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．  ＮＣＢ／ＮＬＭ／ＮＩＨ  Ｂｅｔｈｅｓｄａ，  ＭＤ  ２０８９４；  Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．（前掲）（１９９０））。ある実施形態においては、当分野で公知であるＳｍｉｔｈ  Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムを用いて同一性を求めることもできる。
【０１２２】
２個のアミノ酸配列を整列させるあるアラインメントスキームは、２個の配列の短い領域のみの一致を生じ得る。この小さな整列領域は、２個の完全長配列間に重要な関係が存在しない場合でも、極めて高い配列同一性を有し得る。したがって、ある実施形態においては、選択したアラインメント法（ＧＡＰプログラム）は、標的ポリペプチドの少なくとも５０個の隣接アミノ酸にわたるアラインメントを生じる。
【０１２３】
例えば、コンピュータアルゴリズムＧＡＰ（Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）を用いて、配列同一性割合を求めようとする２種類のポリペプチドを、それぞれのアミノ酸が最適一致するように整列させる（アルゴリズムによって求められる「一致スパン（ｍａｔｃｈｅｄ  ｓｐａｎ）」）。ある実施形態においては、ギャップ開始ペナルティ（平均対角線の３倍として計算される。「平均対角線」は、使用する比較マトリックスの対角線の平均である。「対角線」は、特定の比較マトリックスによって各完全アミノ酸一致に割り当てられるスコア又は数値である。）及びギャップ伸長ペナルティ（通常はギャップ開始ペナルティの１／１０である。）並びにＰＡＭ  ２５０、ＢＬＯＳＵＭ  ６２などの比較マトリックスをアルゴリズムと併用する。ある実施形態においては、標準比較マトリックスもアルゴリズムによって使用される。例えば、ＰＡＭ  ２５０比較マトリックスについては、Ｄａｙｈｏｆｆ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｔｌａｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，  ５（３）（１９７８）を参照されたい。ＢＬＯＳＵＭ  ６２比較マトリックスについては、Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ  ＵＳＡ，  ８９：１０９１５−１０９１９（１９９２）を参照されたい。
【０１２４】
ある実施形態においては、ポリペプチド配列比較のパラメータとして以下のものが挙げられる。
アルゴリズム：  Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．，  ４８：４４３−４５３（１９７０）、
比較マトリックス：  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ｅｔ  ａｌ．（前掲）（１９９２）のＢＬＯＳＵＭ  ６２、
ギャップペナルティ：  １２
ギャップ長ペナルティ：  ４
類似度のしきい値：  ０
【０１２５】
ある実施形態においては、ＧＡＰプログラムは、上記パラメータを用いると有用であり得る。ある実施形態においては、上記パラメータは、ＧＡＰアルゴリズムを用いたポリペプチド比較のデフォルトパラメータ（末端ギャップに対するペナルティなし。）である。
【０１２６】
ある実施形態によれば、アミノ酸置換は、（１）タンパク質分解に対する感受性を低下させるアミノ酸置換、（２）酸化に対する感受性を低下させるアミノ酸置換、（３）タンパク質複合体を形成するために結合親和性を変えるアミノ酸置換、（４）結合親和性を変えるアミノ酸置換、及び／又は（４）かかるポリペプチドについての他の物理化学的若しくは機能的諸性質を付与若しくは改変するアミノ酸置換である。ある実施形態によれば、単一又は複数のアミノ酸置換（ある実施形態においては、保存的アミノ酸置換）は、（ある実施形態においては、分子間接触を形成するドメインの外側のポリペプチド部分における）天然配列において実施され得る。
【０１２７】
ある実施形態においては、保存的アミノ酸置換は、典型的には、親配列の構造上の特性を実質的に変化させてはいけない（例えば、置換アミノ酸は、親配列中に存在するヘリックスを破壊すべきではなく、親配列を特徴づける他のタイプの二次構造を乱すべきではない。）。当分野で認識されているポリペプチドの二次及び三次構造の例は、例えば、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ（Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，  Ｅｄ．，  Ｗ．Ｈ．  Ｆｒｅｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９８４））；  Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｔｏ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ（Ｃ．  Ｂｒａｎｄｅｎ  ａｎｄ  Ｊ．  Ｔｏｏｚｅ，  ｅｄｓ．，  Ｇａｒｌａｎｄ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎ．Ｙ．（１９９１））及びＴｈｏｒｎｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  Ｎａｔｕｒｅ  ３５４：１０５（１９９１）に記載されている。
【０１２８】
本明細書では「ポリペプチド断片」という用語は、アミノ末端及び／又はカルボキシ末端が欠損しているポリペプチドを指す。ある実施形態においては、断片は、少なくとも５から５００アミノ酸長である。ある実施形態においては、断片は、少なくとも５、６、８、１０、１４、２０、５０、７０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０又は５００アミノ酸長であると理解される。
【０１２９】
ペプチド類似体は、テンプレートペプチドの諸性質と類似した諸性質を有する非ペプチド薬物として、医薬産業に一般に使用されている。これらのタイプの非ペプチド化合物は、「ペプチド模倣物（ｐｅｐｔｉｄｅ  ｍｉｍｅｔｉｃ）」又は「ペプチド模倣物（ｐｅｐｔｉｄｏｍｉｍｅｔｉｃ）」と称する。Ｆａｕｃｈｅｒｅ，  Ｊ．  Ａｄｖ．  Ｄｒｕｇ  Ｒｅｓ．  １５：２９（１９８６）；  Ｖｅｂｅｒ  ａｎｄ  Ｆｒｅｉｄｉｎｇｅｒ  ＴＩＮＳ  ｐ．３９２（１９８５）及びＥｖａｎｓ  ｅｔ  ａｌ．  Ｊ．  Ｍｅｄ．  Ｃｈｅｍ．  ３０：１２２９（１９８７）。かかる化合物は、コンピュータ分子モデリングを用いて開発される。治療に有用であるペプチドに構造的に類似したペプチド模倣物を使用して、類似の治療又は予防効果を得ることができる。一般に、ペプチド模倣物は、ヒト抗体などのパラダイムポリペプチド（すなわち、生化学的性質又は薬理活性を有するポリペプチド）に構造的に類似しているが、当分野で周知の方法によって、−ＣＨ２ＮＨ−、−ＣＨ２Ｓ−、−ＣＨ２−ＣＨ２−、−ＣＨ＝ＣＨ−（シス及びトランス）、−ＣＯＣＨ２−、−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２−及び−ＣＨ２ＳＯ−から選択される結合で置換されていてもよい１個以上のペプチド結合を有する。ある実施形態においては、コンセンサス配列の１個以上のアミノ酸を、同じタイプのＤ−アミノ酸で系統的に置換して（例えば、Ｌ−リジンの代わりにＤ−リジン）、より安定なペプチドを生成し得る。また、コンセンサス配列、又は実質的に同一のコンセンサス配列変化を含む、制約された（ｃｏｎｓｔｒａｉｎｅｄ）ペプチドを、当分野で公知の方法によって（Ｒｉｚｏ  ａｎｄ  Ｇｉｅｒａｓｃｈ  Ａｎｎ．  Ｒｅｖ．  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  ６１：３８７（１９９２））、例えば、これだけに限定されないが、ペプチドを環化する分子内ジスルフィド架橋を形成し得る内部システイン残基を付加することによって、生成することができる。
【０１３０】
「特異的結合物質」という用語は、標的に特異的に結合する天然又は非天然分子を指す。特異的結合物質の例としては、タンパク質、ペプチド、核酸、炭水化物、脂質及び小分子化合物が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、特異的結合物質は抗体である。ある実施形態においては、特異的結合物質は抗原結合領域である。
【０１３１】
「特異的に結合する」という用語は、非標的に結合するよりも高い親和性で標的に結合する、特異的結合物質の能力を指す。ある実施形態においては、特異的結合とは、非標的に対する親和性の少なくとも１０、５０、１００、２５０、５００又は１０００倍の親和性で標的に結合することを指す。ある実施形態においては、親和性は、親和性ＥＬＩＳＡアッセイによって決定される。ある実施形態においては、親和性は、ＢＩＡｃｏｒｅアッセイによって決定される。ある実施形態においては、親和性は、動力学的方法によって決定される。ある実施形態においては、親和性は平衡／溶液法によって決定される。
【０１３２】
「ＴＲ−２に対する特異的結合物質」という用語は、ＴＲ−２の任意の部分と特異的に結合する特異的結合物質を指す。ある実施形態においては、ＴＲ−２に対する特異的結合物質は、ＴＲ−２に対する抗体である。ある実施形態においては、特異的結合物質は抗原結合領域である。
【０１３３】
「抗体」又は「抗体ペプチド」とは、完全抗体又はその断片を指す。ある実施形態においては、抗体断片は、特異的結合について完全抗体と競合する結合断片であり得る。「抗体」という用語は、ポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体も包含する。ある実施形態においては、結合断片は、組み換えＤＮＡ技術によって生成する。ある実施形態においては、結合断片は、完全抗体の酵素的又は化学的切断によって生成する。ある実施形態においては、結合断片は、組み換えＤＮＡ技術によって生成する。結合断片としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ及び単鎖抗体が挙げられるが、これらだけに限定されない。非抗原結合断片としては、Ｆｃ断片が挙げられるが、これだけに限定されない。ある実施形態においては、抗体は、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体によって特異的に結合されるエピトープと特異的に結合する。「抗体」という用語は、別の抗体の可変領域に特異的に結合する抗イディオタイプの抗体も包含する。ある実施形態においては、抗イディオタイプの抗体は、抗ＴＲ−２抗体の可変領域に特異的に結合する。ある実施形態においては、抗イディオタイプの抗体を使用して、試料中の特定の抗ＴＲ−２抗体の存在を検出することができ、又は抗ＴＲ−２抗体の活性を遮断することができる。
【０１３４】
本明細書では「抗ＴＲ−２抗体」という用語は、ＴＲ−２に特異的に結合する抗体を意味する。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、Ａｂ  ＡからＱから選択される少なくとも１種類の抗体が結合するＴＲ−２エピトープに結合する。種々の実施形態においては、ＴＲ−２は、ヒト、カニクイザル、マウス及びウサギを含めて、ただしこれらだけに限定されない任意の種のＴＲ−２であり得る。抗体の特異性を求めるある種のアッセイは、当業者に周知であり、ＥＬＩＳＡ、ＥＬＩＳＰＯＴ、ウエスタンブロット、ＢＩＡｃｏｒｅアッセイ、溶液親和性結合アッセイ、Ｔ細胞同時刺激アッセイ及びＴ細胞遊走アッセイが挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１３５】
本明細書では「単離抗体」という用語は、（１）通常は一緒に存在する少なくとも幾つかのタンパク質を含まない抗体、（２）同じ出所、例えば、同じ種に由来する他のタンパク質を本質的に含まない抗体、（３）異なる種に由来する細胞によって発現される抗体、又は（４）天然に存在しない抗体を意味する。
【０１３６】
「ポリクローナル抗体」という用語は、同じ抗原の異なるエピトープに結合する抗体の不均一混合物を指す。
【０１３７】
「モノクローナル抗体」という用語は、同じ核酸分子によってコードされる抗体の集団を指す。ある実施形態においては、モノクローナル抗体は、単一のハイブリドーマ若しくは他の細胞株によって、又はトランスジェニックほ乳動物によって産生される。モノクローナル抗体は、同じエピトープを典型的には認識する。「モノクローナル」という用語は、抗体を製造する特定の方法に限定されない。
【０１３８】
「ＣＤＲグラフト抗体」という用語は、一抗体由来のＣＤＲが別の抗体の枠組みに挿入された抗体を指す。ある実施形態においては、ＣＤＲが由来する抗体と枠組みが由来する抗体とは異なる種である。ある実施形態においては、ＣＤＲが由来する抗体と枠組みが由来する抗体とは異なるアイソタイプである。
【０１３９】
「多重特異性抗体」という用語は、異なるエピトープに２個以上の可変領域が結合する抗体を指す。エピトープは、同じ標的上にあっても、異なる標的上にあってもよい。ある実施形態においては、多重特異性抗体は、同じ、又は異なる抗原上の２種類のエピトープを認識する「二重特異性抗体」である。
【０１４０】
「触媒抗体」という用語は、１個以上の触媒作用性部分が結合した抗体を指す。ある実施形態においては、触媒抗体は、細胞傷害性部分を含む細胞傷害抗体である。
【０１４１】
「ヒト化抗体」という用語は、抗体枠組み領域の全部又は一部がヒトに由来するが、１個以上のＣＤＲ領域の全部又は一部が別の種、例えばマウスに由来する抗体を指す。
【０１４２】
「ヒト抗体」と「完全ヒト抗体」という用語は、区別なく使用され、ＣＤＲと枠組みの両方が実質的にヒト配列を含む抗体を指す。ある実施形態においては、完全ヒト抗体は、マウス、ラット及びウサギを含めて、ただしこれらだけに限定されない非ヒトほ乳動物において産生される。ある実施形態においては、完全ヒト抗体はハイブリドーマ細胞中で産生される。ある実施形態においては、完全ヒト抗体は組み換え産生される。
【０１４３】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、
（ｉ）ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、第１のポリペプチドと、
（ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、
ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン、グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。）
（ｉｉ）ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合する、第２のポリペプチドと
（ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、
ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、
ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。）
を含む。
【０１４４】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号３６のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号３８のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号４０のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号４２のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号１０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号４４のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号１２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号４６のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号１４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号４８のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号１６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号５０のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号１８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号５２のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号２０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号５４のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号２２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号５６のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号２４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号５８のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号２６の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号６０のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号２８の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号６２のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号３０の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号６４のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号３２の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号６６のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、配列番号３４の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む第１のポリペプチドと、配列番号６８のＣＤＲを含む第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、上記段落［０７９］に示す第１のポリペプチドと上記段落［０８４］に示す第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、上記段落［０８０］に示す第１のポリペプチドと上記段落［０８５］に示す第２のポリペプチドとを含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体はヒト抗体である。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、検出可能な標識を含む。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体はキメラ抗体である。
【０１４５】
「キメラ抗体」とは、別の分子と融合した、例えば、別の第２の種の抗体定常領域と融合した、第１の種の抗体可変領域を有する抗体を指す。例えば、米国特許第４，８１６，５６７号及びＭｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ（ＵＳＡ），  ８１：６８５１−６８５５（１９８５）を参照されたい。ある実施形態においては、第１の種は第２の種とは異なり得る。ある実施形態においては、第１の種は第２の種と同じであり得る。ある実施形態においては、キメラ抗体を、変異誘発又はＣＤＲグラフトによって、抗ＴＲ−２抗体可変領域の公知の配列の一部と一致させ得る。ＣＤＲグラフトは、所望の特異性を有する抗体由来のＣＤＲを別の抗体の枠組み領域（ＦＲ）にグラフトすることを典型的には含む。
【０１４６】
「多重特異性」又は「多官能」抗体以外の二価の抗体は、ある実施形態においては、その結合部位の各々を同一にすると典型的には理解される。
【０１４７】
抗体は、過剰の抗体が、リガンドと結合する受容体の量を（インビトロでの競合結合測定法で測定して）少なくとも約２０％、４０％、６０％、８０％、８５％又はそれを超えて減少させると、リガンドと受容体の接着を実質的に阻害する。
【０１４８】
「エピトープ」という用語は、特異的結合物質が結合し得る分子の一部を指す。例示的なエピトープは、免疫グロブリン及び／又はＴ細胞受容体に特異的に結合し得る任意のポリペプチド決定因子を含み得る。例示的なエピトープ決定因子としては、これらだけに限定されないが、分子の化学的に活性な表面グルーピング（ｇｒｏｕｐｉｎｇ）、例えば、これらだけに限定されないが、アミノ酸、糖側鎖、ホスホリル基及びスルホニル基が挙げられる。ある実施形態においては、エピトープ決定因子は、特定の３次元構造特性、及び／又は特定の帯電特性を有し得る。ある実施形態においては、エピトープは、抗体が結合する抗原領域である。エピトープは、隣接していても、いなくてもよい。ある実施形態においては、エピトープは、抗体の産生に用いられるエピトープに類似した３次元構造を含むが、抗体の産生に用いられるエピトープ中に存在するアミノ酸残基を含まない、又は一部しか含まない点で模倣であり得る。
【０１４９】
「阻害性及び／又は中和性エピトープ」という用語は、特異的結合物質が結合したときに、インビボ、インビトロ及び／又はｉｎ  ｓｉｔｕでの生物活性の低下をもたらすエピトープを指す。ある実施形態においては、中和性エピトープは、標的の生物活性領域上に存在し、又は標的の生物活性領域と関連がある。
【０１５０】
「活性化エピトープ」という用語は、特異的結合物質が結合したときに、インビボ、インビトロ及び／又はｉｎ  ｓｉｔｕでの生物活性の活性化又は維持をもたらすエピトープを指す。ある実施形態においては、活性化エピトープは、標的の生物活性領域上に存在し、又は標的の生物活性領域と関連がある。
【０１５１】
ある実施形態においては、エピトープは、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体によって特異的に結合される。あるかかる実施形態においては、エピトープは実質的に純粋である。あるかかる実施形態においては、エピトープは少なくとも１ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、エピトープは１ｎＭから５ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、エピトープは５ｎＭから１０ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、エピトープは１０ｎＭから１５ｎＭの濃度である。
【０１５２】
ある実施形態においては、抗体は、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体によって特異的に結合されるエピトープであって、実質的に純粋であるエピトープと特異的に結合する。あるかかる実施形態においては、抗体は少なくとも１ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１ｎＭから５ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は５ｎＭから１０ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１０ｎＭから１５ｎＭの濃度である。
【０１５３】
ある実施形態においては、抗体は、成熟ヒトＴＲ−２のアミノ酸１から８５に特異的に結合し、実質的に純粋である。あるかかる実施形態においては、抗体は少なくとも１ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１ｎＭから５ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は５ｎＭから１０ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１０ｎＭから１５ｎＭの濃度である。
【０１５４】
ある実施形態においては、抗体は、エピトープとの結合について、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体と競合する。あるかかる実施形態においては、抗体は実質的に純粋である。あるかかる実施形態においては、抗体は少なくとも１ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１ｎＭから５ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は５ｎＭから１０ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１０ｎＭから１５ｎＭの濃度である。
【０１５５】
ある実施形態においては、抗体は、成熟ヒトＴＲ−２のアミノ酸１から８５との結合について、Ａｂ  Ａ、Ａｂ  Ｂ、Ａｂ  Ｃ、Ａｂ  Ｄ、Ａｂ  Ｅ、Ａｂ  Ｆ、Ａｂ  Ｇ、Ａｂ  Ｈ、Ａｂ  Ｉ、Ａｂ  Ｊ、Ａｂ  Ｋ、Ａｂ  Ｌ、Ａｂ  Ｍ、Ａｂ  Ｎ、Ａｂ  Ｏ、Ａｂ  Ｐ及びＡｂ  Ｑから選択される少なくとも１種類の抗体と競合する。あるかかる実施形態においては、抗体は実質的に純粋である。あるかかる実施形態においては、抗体は少なくとも１ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１ｎＭから５ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は５ｎＭから１０ｎＭの濃度である。あるかかる実施形態においては、抗体は１０ｎＭから１５ｎＭの濃度である。
【０１５６】
「物質（ａｇｅｎｔ）」という用語は、化学物質、化学物質の混合物、生物学的巨大分子、又は生体材料から製造される抽出物を表すのに本明細書では使用される。
【０１５７】
本明細書では「標識」という用語は、検出することができる任意の分子を指す。ある実施形態においては、抗体は、放射性標識アミノ酸の組み入れによって標識し得る。ある実施形態においては、マークされたアビジン（例えば、光学的方法又は比色定量方法によって検出することができる蛍光マーカー又は酵素活性を含むストレプトアビジン）によって検出することができるビオチン部分を抗体に結合させ得る。ある実施形態においては、標識は、目的の抗体に結合する別の試薬に組み入れることができ、又は結合させることができる。ある実施形態においては、標識は、目的の抗体に特異的に結合する抗体に組み入れることができ、又は結合させることができる。ある実施形態においては、標識又はマーカーは、治療にも役立ち得る。ポリペプチド及び糖タンパク質を標識する種々の方法が当分野で公知であり、使用し得る。ある一般クラスの標識としては、酵素標識、蛍光標識、化学発光標識及び放射性標識が挙げられるが、これらだけに限定されない。ポリペプチド用標識のある例としては、放射性同位体又は放射性核種（例えば、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、３５Ｓ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎ、１２５Ｉ、１３１Ｉ）、蛍光標識（例えば、フルオレセインイソチオシアナート（ｉｓｏｔｈｏｃｙａｎａｔｅ）（ＦＩＴＣ）、ローダミン、ランタニドリン光体、フィコエリトリン（ＰＥ））、酵素標識（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ、グルコースオキシダーゼ、グルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ、マレートデヒドロゲナーゼ、ペニシリナーゼ、ルシフェラーゼ）、化学発光標識、ビオチン基、及び二次レポーターによって認識される所定のポリペプチドエピトープ（例えば、ロイシンジッパー対配列、二次抗体に対する結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、標識は、起こり得る立体障害を減少させるために種々の長さのスペーサーアームによって結合している。
【０１５８】
本明細書では「試料」という用語は、生物から、又はかつては生きていたものから得られる任意の量の物質を含むが、これらだけに限定されない。かかる生物としては、ヒト、マウス、サル、ラット、ウサギ及び他の動物が挙げられるが、これらだけに限定されない。かかる物質としては、血液、血清、尿、細胞、器官、組織、骨、骨髄、リンパ節及び皮膚が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１５９】
本明細書では「薬剤又は薬物」という用語は、患者に適切に投与すると、所望の治療効果をもたらし得る化学物質又は組成物を指す。
【０１６０】
本明細書では「調節物質」という用語は、分子の活性又は機能を変化又は変更させる化合物である。例えば、調節物質は、分子のある活性又は機能の程度を、調節物質の非存在下で認められる活性又は機能の程度よりも増加又は減少させ得る。ある実施形態においては、調節物質は、分子の少なくとも１つの活性又は機能の程度を減少させる阻害剤である。分子のある例示的な活性及び機能としては、結合親和性、酵素活性及びシグナル伝達が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある例示的な阻害剤としては、タンパク質、ペプチド、抗体、ペプチボディ（ｐｅｐｔｉｂｏｄｉｅｓ）、炭水化物及び小有機分子が挙げられるが、これらだけに限定されない。例示的なペプチボディは、例えば、国際公開第０１／８３５２５号に記載されている。
【０１６１】
本明細書では「実質的に純粋」とは、目的種が、存在する主な種である（すなわち、組成物中の他の個々の種よりもモル基準で多量である。）ことを意味する。ある実施形態においては、実質的精製画分は、目的種が、存在する全巨大分子種の少なくとも約５０パーセント（モル基準）を構成する組成物である。ある実施形態においては、実質的に純粋な組成物は、組成物中に存在する全巨大分子種の約８０％、８５％、９０％、９５％又は９９％を超える。ある実施形態においては、目的種は、組成物が単一の巨大分子種から本質的になる本質的均一性（ｅｓｓｅｎｔｉａｌ  ｈｏｍｏｇｅｎｅｉｔｙ）にまで精製される（従来の検出方法では組成物中に汚染物質種を検出することができない。）。
【０１６２】
「患者」という用語は、ヒト及び動物対象を含む。
【０１６３】
ある実施形態によれば、抗ＴＲ−２抗体を発現する細胞株を提供する。
【０１６４】
ある実施形態においては、ヒト配列の少なくとも一部と別の種の配列とを含むキメラ抗体を提供する。ある実施形態においては、かかるキメラ抗体は、宿主の抗体配列のない抗体よりも、宿主における免疫応答が減少し得る。例えば、ある場合には、対象となる動物を、特定のヒト疾患に対するモデルとして使用することができる。動物宿主における前記疾患に対する抗体の効果を試験するために、異なる種由来の抗体を使用することができる。しかし、ある場合には、別の種由来のかかる抗体は、宿主動物において抗体自体に対する免疫応答を誘発するおそれがあり、したがってこれらの抗体の評価を妨害し得る。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体のアミノ酸配列の一部を宿主動物由来の抗体アミノ酸配列で置換すると、宿主動物の抗抗体応答の程度が減少し得る。
【０１６５】
ある実施形態においては、キメラ抗体は重鎖及び軽鎖を含み、軽鎖及び重鎖の可変領域は第１の種に由来し、軽鎖及び重鎖の定常領域は第２の種に由来する。ある実施形態においては、抗体重鎖定常領域は、ヒト以外の種の抗体重鎖定常領域である。ある実施形態においては、抗体軽鎖定常領域は、ヒト以外の種の抗体軽鎖定常領域である。ある実施形態においては、抗体重鎖定常領域はヒト抗体重鎖定常領域であり、抗体重鎖可変領域はヒト以外の種の抗体重鎖可変領域である。ある実施形態においては、抗体軽鎖定常領域はヒト抗体軽鎖定常領域であり、抗体軽鎖可変領域はヒト以外の種の抗体軽鎖可変領域である。例示的な抗体定常領域としては、ヒト抗体定常領域、カニクイザル抗体定常領域、マウス抗体定常領域及びウサギ抗体定常領域が挙げられるが、これらだけに限定されない。例示的な抗体可変領域としては、ヒト抗体可変領域、マウス抗体可変領域、ブタ抗体可変領域、モルモット抗体可変領域、カニクイザル抗体可変領域及びウサギ抗体可変領域が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、重鎖及び軽鎖中の可変領域の枠組み領域を、他の抗体配列に由来する枠組み領域で置換し得る。
【０１６６】
ある例示的なキメラ抗体は、当業者に周知の方法によって作製することができる。ある実施形態においては、重鎖可変領域をコードする第１の種のポリヌクレオチドと、重鎖定常領域をコードする第２の種のポリヌクレオチドとを融合することができる。ある実施形態においては、軽鎖可変領域をコードする第１の種のポリヌクレオチドと、軽鎖定常領域をコードする第２の種のヌクレオチド配列とを融合することができる。ある実施形態においては、これらの融合ヌクレオチド配列を、単一の発現ベクター（例えば、プラスミド）又は複数の発現ベクター中の細胞に導入することができる。ある実施形態においては、少なくとも１個の発現ベクターを含む細胞を用いて、ポリペプチドを産生することができる。ある実施形態においては、これらの融合ヌクレオチド配列を、別々の発現ベクター又は単一の発現ベクターに入れて、細胞に導入することができる。ある実施形態においては、宿主細胞は重鎖と軽鎖を発現し、これらを組み合わせて抗体を作製する。ある実施形態においては、少なくとも１個の発現ベクターを含む細胞を用いて、抗体を作製することができる。抗体を作製し、発現させる例示的な方法を以下に考察する。
【０１６７】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体の重鎖及び軽鎖に対する保存的修飾（及びコードヌクレオチドに対する対応する修飾）によって、元の抗体の機能的及び化学的特性に類似した機能的及び化学的特性を有する抗体が作製される。これに対し、ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体の機能的及び／又は化学的特性の実質的な改変は、重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列において、（ａ）置換領域における、例えばシート状若しくはらせん状高次構造としての、分子骨格構造の維持、（ｂ）標的部位における分子の電荷若しくは疎水性の維持、又は（ｃ）側鎖のバルクの維持に対する効果がかなり異なる置換を選択することによって実施することができる。
【０１６８】
（保存的でも非保存的でも）ある所望のアミノ酸置換は、かかる置換が望ましいときに、当業者が決定することができる。ある実施形態においては、アミノ酸置換を利用して、ＴＲ−２に対する抗体の親和性を、又は抗体のエフェクター機能を、増加又は減少させ得る残基など、抗ＴＲ−２抗体の重要な残基を特定することができる。
【０１６９】
ある実施形態においては、疾患の症候の量の減少を測定することによって、抗ＴＲ−２抗体の効果を評価することができる。ある実施形態においては、対象となる疾患を病原体によって引き起こすことができる。ある実施形態においては、動物宿主において、（発癌物質などの）物質の導入、及び遺伝子操作を含めて、他の方法によって、疾患を確立することができる。ある実施形態においては、動物宿主における１つ以上の有害事象を検出することによって、効果を評価することができる。「有害事象」という用語は、抗体を投与しない動物宿主には存在しない抗体を投与した動物宿主における有害反応を含むが、これだけに限定されない。ある実施形態においては、有害事象としては、発熱、抗体に対する免疫応答、炎症、及び／又は動物宿主の死が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１７０】
抗原に特異的な種々の抗体を幾つかの方法で作製することができる。ある実施形態においては、対象となるエピトープを含む抗原を動物宿主（例えば、マウス）に導入して、このエピトープに特異的な抗体を産生することができる。ある場合には、対象となるエピトープに特異的な抗体を、このエピトープに自然に曝露された宿主から採取された生物学的試料から得ることができる。ある場合には、内因性Ｉｇ遺伝子が不活性化されたマウスにヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）遺伝子座を導入することによって、ヒトモノクローナル抗体（ＭＡｂ）を得る機会が得られる。
【０１７１】
天然抗体の構造
天然抗体の構造単位は、４量体を典型的には含む。かかる各４量体は、２組の同一のポリペプチド鎖対で典型的には構成される。各対は１本の完全長「軽」鎖（ある実施形態においては、約２５ｋＤａ）と、１本の完全長「重」鎖（ある実施形態においては、約５０−７０ｋＤａ）とを含む。「重鎖」という用語は、特定の抗原に対する特異性を付与するのに十分な可変領域配列を有する任意のポリペプチドを含む。完全長重鎖は、可変領域ドメインＶＨと、３個の定常領域ドメインＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３を含む。ＶＨドメインはポリペプチドのアミノ末端に存在し、ＣＨ３ドメインはカルボキシ末端に存在する。本明細書では「重鎖」という用語は、完全長抗体重鎖及びその断片を包含する。
【０１７２】
「軽鎖」という用語は、特定の抗原に対する特異性を付与するのに十分な可変領域配列を有する任意のポリペプチドを含む。完全長軽鎖は、可変領域ドメインＶＬと定常領域ドメインＣＬとを含む。重鎖同様、軽鎖の可変領域ドメインは、ポリペプチドのアミノ末端に存在する。本明細書では「軽鎖」という用語は、完全長軽鎖及びその断片を包含する。
【０１７３】
各鎖のアミノ末端部分は、典型的には抗原認識の原因になる、約１００から１１０又はそれを超えるアミノ酸の可変領域（重鎖のＶＨ及び軽鎖のＶＬ）を典型的には含む。各鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能を担い得る定常領域（重鎖のＣＨドメイン及び軽鎖のＣＬ）を典型的には規定する。抗体エフェクター機能は、補体の活性化、及びオプソニン貪食の刺激を含む。ヒト軽鎖は、カッパ及びラムダ軽鎖に典型的には分類される。重鎖は、ミュー、デルタ、ガンマ、アルファ又はイプシロンに典型的には分類され、抗体のアイソタイプをそれぞれＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡ及びＩｇＥとして規定する。ＩｇＧは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４を含めて、ただしこれらだけに限定されない幾つかのサブクラスを有する。ＩｇＭは、ＩｇＭ１及びＩｇＭ２を含めて、ただしこれらだけに限定されない幾つかのサブクラスを有する。同様に、ＩｇＡは、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２を含めて、ただしこれらだけに限定されないサブクラスに細分される。完全長軽鎖及び重鎖内では、典型的には、可変及び定常領域には約１２個以上のアミノ酸の「Ｊ」領域が結合し、重鎖は、更に約１０個のアミノ酸からなる「Ｄ」領域も含む。例えば、Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  Ｃｈ．  ７（Ｐａｕｌ，  Ｗ．，  ｅｄ．，  ２ｎｄ  ｅｄ．  Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｎ．Ｙ．（１９８９））を参照されたい。各軽鎖／重鎖対の可変領域は、抗原結合部位を典型的には形成する。
【０１７４】
可変領域は、相補性決定領域又はＣＤＲとも呼ばれる、３個の超可変領域が結合した、比較的保存された枠組み領域（ＦＲ）の同じ一般構造を典型的には示す。各対の重鎖と軽鎖由来の各ＣＤＲは、特定のエピトープとの結合を可能にし得る枠組み領域によって典型的には整合される。Ｎ末端からＣ末端まで、軽鎖と重鎖の両方の可変領域は、ドメインＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３及びＦＲ４を典型的には含む。各ドメインへのアミノ酸の割当ては、Ｋａｂａｔ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，  Ｂｅｔｈｅｓｄａ，  Ｍｄ．（１９８７  ａｎｄ  １９９１））又はＣｈｏｔｈｉａ  ＆  Ｌｅｓｋ  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  １９６：９０１−９１７（１９８７）；  Ｃｈｏｔｈｉａ  ｅｔ  ａｌ．  Ｎａｔｕｒｅ  ３４２：８７８−８８３（１９８９）の定義に典型的には従う。
【０１７５】
上述したように、抗体断片には幾つかのタイプがある。Ｆａｂ断片は、１本の軽鎖と１本の重鎖のＣＨ１及び可変領域とを含む。Ｆａｂ分子の重鎖は、別の重鎖分子とジスルフィド結合を形成することができない。Ｆａｂ’断片は、１本の軽鎖と１本の重鎖を含み、重鎖は、鎖間ジスルフィド結合が２本の重鎖間に形成されてＦ（ａｂ’）２分子を形成することができるように、ＣＨ１ドメインとＣＨ２ドメインの間に追加の定常領域を含む。Ｆａｂ断片は、Ｆ（ａｂ’）２分子の重鎖の定常領域がＣＨ２ドメインの末端に延びている以外はＦ（ａｂ’）２分子に類似している。Ｆｖ領域は、重鎖と軽鎖の両方の可変領域を含むが、定常領域を欠く。単鎖抗体は、重鎖と軽鎖の可変領域が柔軟なリンカーによって連結されて、抗原結合性領域を形成する単一のポリペプチド鎖を形成したＦｖ分子である。例示的な単鎖抗体は、例えば、国際公開第８８／０１６４９号並びに米国特許第４，９４６，７７８号及び同５，２６０，２０３号に詳細に考察されている。Ｆｃ断片は、重鎖のＣＨ２及びＣＨ３ドメインを含み、鎖間ジスルフィド結合を２本の重鎖間に形成することができるように、ＣＨ１ドメインとＣＨ２ドメインの間に追加の定常領域を含む。
【０１７６】
ある実施形態においては、機能的ドメインＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３及び介在配列は、異なる抗体定常領域を作製するために組み替えることができる。例えば、ある実施形態においては、かかるハイブリッド定常領域は、血清中の半減期、抗体４量体の組立て及び折り畳み、及び／又はエフェクター機能の改善について最適化することができる。ある実施形態においては、定常領域のアミノ酸配列に単一の点変異を導入し、生成した抗体について諸特性、例えば、上記特性の１つ以上が改善されたかどうかを試験することによって、修飾抗体定常領域を作製することができる。
【０１７７】
ある実施形態においては、１アイソタイプの抗体を、アイソタイプスイッチングによって、特定の標的分子に対するその特異性を失わずに、異なるアイソタイプに転化する。アイソタイプスイッチング方法としては、とりわけ、直接組み換え技術（例えば、米国特許第４，８１６，３９７号参照）及び細胞−細胞融合技術（例えば、米国特許第５，９１６，７７１号参照）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、抗体は、上記技術、又は当分野で公知の技術によって、特定の標的分子に対するその特異性を失わずに、（ＩｇＧ２サブクラスからＩｇＧ１、ＩｇＧ３又はＩｇＧ４サブクラスへの転化を含めて、ただしこれらだけに限定されずに）１サブクラスから別のサブクラスに転化することができる。
【０１７８】
二重特異性又は二機能性抗体
二重特異性又は二機能性抗体は、典型的には、２組の異なる重鎖／軽鎖対と２個の異なる結合部位とを有する人工ハイブリッド抗体である。二重特異性抗体は、ハイブリドーマの融合、又はＦａｂ’断片の連結を含めて、ただしこれらだけに限定されない種々の方法によって作製することができる。例えば、Ｓｏｎｇｓｉｖｉｌａｉ  ＆  Ｌａｃｈｍａｎｎ  Ｃｌｉｎ．  Ｅｘｐ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  ７９：３１５−３２１（１９９０）、Ｋｏｓｔｅｌｎｙ  ｅｔ  ａｌ．  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １４８：１５４７−１５５３（１９９２）を参照されたい。
【０１７９】
ある種の抗体調製
ある実施形態においては、抗体は、ハイブリドーマ細胞株以外の細胞株において発現され得る。ある実施形態においては、キメラ抗体を含めて、特定の抗体をコードする配列を、適切なほ乳動物宿主細胞の形質転換に使用することができる。ある実施形態によれば、形質転換は、米国特許第４，３９９，２１６号、同４，９１２，０４０号、同４，７４０，４６１号及び同４，９５９，４５５号によって例示されるように、ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入する任意の公知の方法によって、例えば、ポリヌクレオチドをウイルス（又はウイルスベクター）に入れ、宿主細胞にウイルスを導入することによって、又は当分野で公知の手順を用いてベクターを移入することによって、実施することができる。
【０１８０】
ある実施形態においては、発現ベクターは、本明細書で考察するポリヌクレオチド配列のいずれかを含む。ある実施形態においては、細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、上記発現ベクターのいずれかを含む細胞中でポリペプチドを産生することを含む、ポリペプチド製造方法を提供する。
【０１８１】
ある実施形態においては、発現ベクターは、ＣＤＲ１ａ、ＣＤＲ２ａ及びＣＤＲ３ａから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体軽鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含むポリヌクレオチドを含む。ここで、ＣＤＲ１ａはアミノ酸配列ａ  ｂ  ｃ  ｄ  ｅ  ｆ  ｇ  ｈ  ｉ  ｊ  ｋ  ｌを含み、アミノ酸ａはグリシンであり、アミノ酸ｂはグリシン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｃはセリン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｄはイソロイシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｅはセリン、トレオニン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｆはセリン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン、トレオニン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｇはグリシン、アスパラギン酸又はチロシンから選択され、アミノ酸ｈはグリシン、アスパラギン酸、チロシン、アスパラギン又はセリンから選択され、アミノ酸ｉはチロシン、イソロイシン、ヒスチジン、メチオニン又はトリプトファンから選択され、アミノ酸ｊはアスパラギン、チロシン、ヒスチジン、セリン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｋはトリプトファンであり、又は存在せず、アミノ酸ｌはセリンであり、又は存在せず、ＣＤＲ２ａはアミノ酸配列ｍ  ｎ  ｏ  ｐ  ｑ  ｒ  ｓ  ｔ  ｕ  ｖ  ｗ  ｘ  ｙ  ｚ  ａ’  ｂ’  ｃ’を含み、アミノ酸ｍはトリプトファン、チロシン、ヒスチジン、バリン、グルタミン酸又はセリンから選択され、アミノ酸ｎはメチオニン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｏはアスパラギン、チロシン、セリン、トリプトファン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｐはプロリン、チロシン、セリン、アルギニン、ヒスチジン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｑはアスパラギン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｒはセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｓはアスパラギン酸、セリン、トレオニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｔはアスパラギン、トレオニン、アラニン、イソロイシン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｕはトレオニン、チロシン、ロイシン、リジン、アスパラギン又はイソロイシンから選択され、アミノ酸ｖはグリシン、チロシン、アスパラギン酸又はシステインから選択され、アミノ酸ｗはチロシン又はアスパラギンから選択され、アミノ酸ｘはアラニン又はプロリンから選択され、アミノ酸ｙはグルタミン、セリン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｚはリジン、ロイシン又はセリンから選択され、アミノ酸ａ’はフェニルアラニン、リジン又はバリンから選択され、アミノ酸ｂ’はグルタミン、セリン又はリジンから選択され、アミノ酸ｃ’はグリシンであり、又は存在せず、ＣＤＲ３ａはアミノ酸配列ｄ’  ｅ’  ｆ’  ｇ’  ｈ’  ｉ’  ｊ’  ｋ’  ｌ’  ｍ’  ｎ’  ｏ’  ｐ’  ｑ’  ｒ’  ｓ’  ｔ’  ｕ’  ｖ’  ｗ’を含み、アミノ酸ｄ’はトリプトファン、アスパラギン酸、グリシン、セリン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｅ’はアスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、アルギニン、セリン、バリン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｆ’はヒスチジン、セリン、アラニン、チロシン、プロリン、アスパラギン���グリシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｇ’はチロシン、セリン、アラニン、アルギニン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｈ’はグリシン、アラニン、セリン、アスパラギン、メチオニン、チロシン、トリプトファン、システイン又はアスパラギン酸から選択され、アミノ酸ｉ’はセリン、トリプトファン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、チロシン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｊ’はグリシン、トレオニン、セリン、ロイシン、バリン、アスパラギン、トリプトファン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｋ’はセリン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、トリプトファン、グリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｌ’はヒスチジン、アスパラギン酸、アラニン、トリプトファン、チロシン、セリン、フェニルアラニン、バリン若しくはグリシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ’はフェニルアラニン、チロシン、グルタミン酸、プロリン、アスパラギン酸、システイン、イソロイシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ’はアスパラギン酸、フェニルアラニン、アラニン、ロイシン若しくはセリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ’はチロシン、ロイシン、アスパラギン酸、フェニルアラニン、プロリン若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ’はロイシン、アスパラギン酸若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ’はセリン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｒ’はチロシンであり、又は存在せず、アミノ酸ｓ’はグリシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｔ’はグリシン若しくはメチオニンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｕ’はメチオニン若しくはアスパラギン酸から選択され、又は存在せず、アミノ酸ｖ’はアスパラギン酸若しくはバリンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｗ’はバリンであり、又は存在しない。ある実施形態においては、細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、上記発現ベクターを含む細胞中でポリペプチドを産生することを含む、ポリペプチド製造方法を提供する。
【０１８２】
ある実施形態においては、発現ベクターは、ＣＤＲ１ｂ、ＣＤＲ２ｂ及びＣＤＲ３ｂから選択される少なくとも１個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むポリペプチドであって、抗体重鎖と一緒にＴＲ−２に結合するポリペプチドをコードする配列を含むポリヌクレオチドを含む。ここで、ＣＤＲ１ｂはアミノ酸配列ａ１  ｂ１  ｃ１  ｄ１  ｅ１  ｆ１  ｇ１  ｈ１  ｉ１  ｊ１  ｋ１  ｌ１  ｍ１  ｎ１  ｏ１  ｐ１  ｑ１を含み、アミノ酸ａ１はアルギニン又はリジンから選択され、アミノ酸ｂ１はトレオニン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｃ１はセリンであり、アミノ酸ｄ１はグルタミンであり、アミノ酸ｅ１はセリン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｆ１はイソロイシン、ロイシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｇ１はセリン、ロイシン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｈ１はトレオニン、セリン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン又はチロシンから選択され、アミノ酸ｉ１はチロシン、アルギニン、トリプトファン、アスパラギン酸又はセリンから選択され、ｊ１はロイシン、イソロイシン、アスパラギン、チロシン又はセリンから選択され、アミノ酸ｋ１はアスパラギン、グリシン、バリン、アラニン又はロイシンから選択され、アミノ酸ｌ１はチロシン、アラニン若しくはアスパラギンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｍ１はアスパラギン若しくはリジンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｎ１はチロシン、アスパラギン若しくはイソロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｏ１はロイシン若しくはチロシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｐ１はアスパラギン酸若しくはロイシンから選択され、又は存在せず、アミノ酸ｑ１はバリン、アラニン若しくはトレオニンから選択され、又は存在せず、ＣＤＲ２ｂはアミノ酸配列ｒ１  ｓ１  ｔ１  ｕ１  ｖ１  ｗ１  ｘ１を含み、アミノ酸ｒ１はアラニン、アスパラギン酸、ロイシン、トリプトファン、グリシン又はバリンから選択され、アミノ酸ｓ１はトレオニン、バリン、グリシン又はアラニンから選択され、アミノ酸ｔ１はセリンであり、アミノ酸ｕ１はセリン、アスパラギン又はトレオニンから選択され、アミノ酸ｖ１はロイシン、フェニルアラニン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｗ１はグルタミン、アラニン又はグルタミン酸から選択され、アミノ酸ｘ１はセリン、アルギニン又はトレオニンから選択され、ＣＤＲ３ｂはアミノ酸配列ｙ１  ｚ１  ａ１’  ｂ１’  ｃ１’  ｄ１’  ｅ１’  ｆ１’  ｇ１’を含み、アミノ酸ｙ１はグルタミン、メチオニン、ロイシン又はヒスチジンから選択され、アミノ酸ｚ１はグルタミン又はリジンから選択され、アミノ酸ａ１’はセリン、トレオニン、アラニン、ヒスチジン、チロシン又はフェニルアラニンから選択され、アミノ酸ｂ１’はチロシン、ロイシン、アスパラギン又はグリシンから選択され、アミノ酸ｃ１’はセリン、グルタミン、イソロイシン又はリジンから選択され、アミノ酸ｄ１’はトレオニン、フェニルアラニン、チロシン、アラニン又はセリンから選択され、アミノ酸ｅ１’はプロリンであり、アミノ酸ｆ１’はロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン、セリン又はアルギニンから選択され、アミノ酸ｇ１’はトレオニン又はセリンから選択される。ある実施形態においては、細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、上記発現ベクターを含む細胞中でポリペプチドを産生することを含む、ポリペプチド製造方法を提供する。ある実施形態においては、上記発現ベクターの少なくとも１個を含む細胞を提供する。ある実施形態においては、細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、上記発現ベクターを含む細胞中でポリペプチドを産生することを含む、ポリペプチド製造方法を提供する。
【０１８３】
ある実施形態においては、発現ベクターは抗ＴＲ−２抗体重鎖を発現する。ある実施形態においては、発現ベクターは抗ＴＲ−２抗体軽鎖を発現する。ある実施形態においては、発現ベクターは、抗ＴＲ−２抗体重鎖と抗ＴＲ−２抗体軽鎖の両方を発現する。ある実施形態においては、細胞中に含まれるポリヌクレオチドを発現させてポリペプチドを産生するのに適切な条件下で、本明細書の発現ベクターの少なくとも１個を含む細胞中で抗ＴＲ−２抗体を産生することを含む、抗ＴＲ−２抗体の製造方法を提供する。
【０１８４】
ある実施形態においては、使用される移入手順は、形質転換される宿主に応じて決まり得る。異種ポリヌクレオチドをほ乳動物細胞に導入するある方法は、当分野で公知であり、デキストランによって媒介される移入、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレンによって媒介される移入、原形質体融合、電気穿孔法、リポソーム中へのポリヌクレオチドの封入、及び核へのＤＮＡの直接微量注入が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１８５】
発現用宿主として利用可能なあるほ乳動物細胞株は、当分野で公知であり、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、Ｅ５細胞、ＨｅＬａ細胞、ベビーハムスター腎（ＢＨＫ）細胞、サル腎細胞（ＣＯＳ）、ヒト肝細胞癌細胞（例えば、Ｈｅｐ  Ｇ２）、ＮＳ０細胞、ＳＰ２０細胞、Ｐｅｒ  Ｃ６細胞、２９３細胞、及び幾つかの他の細胞株を含めて、ただしこれらだけに限定されないＡｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）から利用可能な多数の不死化細胞株が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、細胞株は、高い発現レベルを有する細胞株であって、恒常的な抗原結合性を有する抗体を産生する細胞株を決定することによって選択することができる。
【０１８６】
ある実施形態においては、宿主細胞に移入することができるベクターは、抗ＴＲ−２抗体をコードするポリヌクレオチドに作動可能に結合した制御配列を含む。ある実施形態においては、制御配列は、結合したポリヌクレオチドの発現を促進し、結合したポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドの生成をもたらす。ある実施形態においては、ベクターは、宿主細胞における染色体と無関係な複製を可能にするポリヌクレオチド配列も含む。例示的なベクターとしては、プラスミド（例えば、ＢｌｕｅＳｃｒｉｐｔ、ｐｕｃなど）、コスミド及びＹＡＣＳが挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１８７】
ある抗体用途
ある実施形態によれば、抗体は、試料中の特定の抗原を検出するのに有用である。ある実施形態においては、これによって、タンパク質を産生する細胞又は組織を特定することができる。例えば、ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を用いて、試料中のＴＲ−２の存在を検出することができる。ある実施形態においては、試料中のＴＲ−２の有無を検出する方法は、（ａ）抗ＴＲ−２抗体と試料を混合すること、（ｂ）抗原に結合した抗体を結合しない抗体から分離すること、及び（ｃ）抗原に結合した抗体の有無を検出することを含む。
【０１８８】
抗体を用いて抗原の有無を検出することができるアッセイとしては、ＥＬＩＳＡ及びウエスタンブロットが挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を標識することができる。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、抗ＴＲ−２抗体に結合する標識抗体によって検出することができる。ある実施形態においては、試料中のＴＲ−２の有無を検出するキットを提供する。ある実施形態においては、キットは、抗ＴＲ−２抗体と、抗体を検出する試薬とを含む。
【０１８９】
ある実施形態においては、抗体を用いて、タンパク質など、ただしこれだけに限定されない化学成分を実質的に単離することができる。ある実施形態においては、抗体の固定化に用いられる支持材料である「基体」に抗体を結合させる。基体としては、管、プレート（すなわち、マルチウェルプレート）、マイクロビーズなどのビーズ、フィルター、ボール及び膜が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、基体は、ポリカーボネート樹脂、シリコーン樹脂、ナイロン樹脂など、ただしこれらだけに限定されない水不溶性材料からなり得る。アフィニティークロマトグラフィーに用いられる例示的な基体としては、セルロース、アガロース、ポリアクリルアミド、デキストラン、ポリスチレン、ポリビニルアルコール及び多孔質シリカが挙げられるが、これらだけに限定されない。多数の市販クロマトグラフィー基体があり、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ  ２Ｂ、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ  ４Ｂ、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ  ６Ｂ及び他の形式のＳｅｐｈａｒｏｓｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）；Ｂｉｏ−Ｇｅｌ（及びＢｉｏｇｅｌ  Ａ、Ｐ、ＣＭなどの種々の形式のＢｉｏ−Ｇｅｌ）、Ｃｅｌｌｅｘ（及びＣｅｌｌｅｘ  ＡＥ、Ｃｅｌｌｅｘ−ＣＭなどの種々の形式のＣｅｌｌｅｘ）、Ｃｈｒｏｍａｇｅｌ  Ａ、Ｃｈｒｏｍａｇｅｌ  Ｐ及びＥｎｚａｆｉｘ（和光化学工業）が挙げられるが、これらだけに限定されない。抗体アフィニティーカラムの使用は当業者に公知である。ある実施形態においては、ＴＲ−２を単離する方法は、（ａ）ＴＲ−２抗体を基体に結合させること、（ｂ）ＴＲ−２を含む試料を（ａ）の抗体に曝露すること、及び（ｃ）ＴＲ−２を単離することを含む。ある実施形態においては、ＴＲ−２を単離するキットを提供する。ある実施形態においては、キットは、基体に結合した抗ＴＲ−２抗体と、ＴＲ−２を単離するための試薬とを含む。
【０１９０】
本明細書では「アフィニティークロマトグラフィー」という用語は、抗原と抗体、酵素と基質、受容体とリガンドなどの１対の材料間の相互作用（例えば、親和性）を利用して、試料中の目的材料を分離又は精製する方法を意味する。
【０１９１】
ある実施形態においては、特定のタンパク質と結合し、他の結合性化合物との相互作用を遮断する抗体は、治療上の用途を有し得る。本願では、疾患又は症状の治療への抗ＴＲ−２抗体の使用を考察するときには、かかる使用は、抗ＴＲ−２抗体自体、抗ＴＲ−２抗体を含む組成物、及び／又は抗ＴＲ−２抗体と１種類以上の追加の活性成分とを含む併用療法の使用を含み得る。抗ＴＲ−２抗体を用いて疾患又は症状を「治療する」ときには、かかる治療は、疾患又は症状の予防を含んでも、含まなくてもよい。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、ＴＲ−２受容体とそのリガンドＴＲＡＩＬとの相互作用を遮断し得る。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、ＴＲ−２受容体を活性化し得る。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、ＴＲ−２受容体を恒常的に活性化し得る。ＴＲ−２はアポトーシスと関連があるので、ある実施形態においては、細胞死、又は細胞死の予防が望ましい疾患の治療に抗ＴＲ−２抗体を使用することができる。かかる疾患としては、ＴＲ−２を発現する組織に関連した癌、炎症、及びウイルス感染が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１９２】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を単独で投与する。ある実施形態においては、少なくとも１種類の他の治療薬の投与前に抗ＴＲ−２抗体を投与する。ある実施形態においては、少なくとも１種類の他の治療薬の投与と同時に抗ＴＲ−２抗体を投与する。ある実施形態においては、少なくとも１種類の他の治療薬の投与後に抗ＴＲ−２抗体を投与する。例示的な治療薬としては、少なくとも１種類の他の癌治療薬が挙げられるが、これだけに限定されない。例示的な癌治療薬としては、放射線療法及び化学療法が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１９３】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体薬剤組成物は、併用療法において、すなわち、他の薬剤と組み合わせて、投与することができる。ある実施形態においては、併用療法は、少なくとも１種類の血管新生阻害剤と組み合わせて、抗ＴＲ−２抗体を含む。例示的な薬剤としては、インビトロで合成した化学組成物、抗体、抗原結合領域、放射性核種、並びにこれらの組合せ及び複合体が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、薬剤は、作動物質、拮抗物質、アロステリックモジュレーター又は毒素として作用し得る。ある実施形態においては、薬剤は、その標的を阻害又は刺激（例えば、受容体又は酵素の活性化又は阻害）するように作用し、それによって細胞死を促進し、又は細胞増殖を抑止し得る。
【０１９４】
例示的な化学療法による治療薬としては、メクロレタミン、シクロホスファミド、イホスファミド、メルファラン及びクロランブシルを含めて、ただしこれらだけに限定されないナイトロジェンマスタード；カルムスチンＢＣＮＵ、ロムスチン、ＣＣＮＵ及びセムスチン、メチル−ＣＣＮＵを含めて、ただしこれらだけに限定されないニトロソ尿素；Ｔｅｍｏｄａｌ（商標）、テモゾロマイド（ｔｅｍｏｚｏｌａｍｉｄｅ）；トリエチレンメラミン（ｔｈｒｉｅｔｈｙｌｅｎｅｍｅｌａｍｉｎｅ）（ＴＥＭ）、トリエチレン、チオホスホルアミド、チオテパ、ヘキサメチルメラミン（ＨＭＭ）及びアルトレタミンを含めて、ただしこれらだけに限定されないエチレンイミン／メチルメラミン；ブスルファンを含めて、ただしこれだけに限定されないスルホン酸アルキル；ダカルバジン（ＤＴＩＣ）を含めて、ただしこれだけに限定されないトリアジンを含めて、ただしこれだけに限定されないアルキル化剤；メトトレキセート、トリメトレキセートなどの葉酸類似体を含めて、ただしこれらだけに限定されない代謝拮抗剤；５−フルオロウラシル（５ＦＵ）、フルオロデオキシウリジン、ゲムシタビン、シトシンアラビノシド（ＡｒａＣ、シタラビン）、５−アザシチジン及び２，２’−ジフルオロデオキシシチジンを含めて、ただしこれらだけに限定されないピリミジン類似体；６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、アザチオプリン、２’−デオキシコホルマイシン（ペントスタチン）、エリスロヒドロキシノニルアデニン（ＥＨＮＡ）、リン酸フルダラビン、クラドリビン及び２−クロロデオキシアデノシン（２−ＣｄＡ）を含めて、ただしこれらだけに限定されないプリン類似体；パクリタキセルなどの有糸分裂阻害薬を含めて、ただしこれらだけに限定されない天然物；ビンブラスチン（ＶＬＢ）、ビンクリスチン及びビノレルビンを含めて、ただしこれらだけに限定されないビンカアルカロイド；タキソテール；エストラムスチン及びリン酸エストラムスチン；エトポシド及びテニポシドを含めて、ただしこれらだけに限定されないポドフィロトキシン（ｐｐｉｐｏｄｏｐｈｙｌｏｔｏｘｉｎ）；アクチノマイシンＤ、ダウノマイシン、ルビドマイシン、ドキソルビシン、ミトキサントロン、イダルビシン、ブレオマイシン、プリカマイシン、ミトラマイシン、マイトマイシンＣ及びアクチノマイシンを含めて、ただしこれらだけに限定されない抗生物質；Ｌ−アスパラギナーゼを含めて、ただしこれだけに限定されない酵素；インターフェロン−アルファ、ＩＬ−２、Ｇ−ＣＳＦ及びＧＭ−ＣＳＦを含めて、ただしこれらだけに限定されない生体応答調節物質；ドキシサイクリン（ｄｏｘｙｃｙｃｋｉｎｅ）；塩酸イリノテカン；シスプラチン、カルボプラチンなどの白金（ｐｌａｔｉｎｉｕｍ）配位化合物を含めて、ただしこれらだけに限定されない種々の薬剤；ミトキサントロンを含めて、ただしこれらだけに限定されないアントラセンジオン；ヒドロキシ尿素を含めて、ただしこれらだけに限定されない置換尿素；Ｎ−メチルヒドラジン（ＭＩＨ）及びプロカルバジンを含めて、ただしこれらだけに限定されないメチルヒドラジン誘導体；ミトタン（ｏ，ｐ’−ＤＤＤ）及びアミノグルテチミドを含めて、ただしこれらだけに限定されない副腎皮質抑制剤；プレドニゾン及び等価物、デキサメタゾン、アミノグルテチミドなどのアドレノコルチコステロイド拮抗物質を含めて、ただしこれらだけに限定されないホルモン及び拮抗物質；Ｇｅｍｚａｒ（商標）、ゲムシタビン；カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン、酢酸メドロキシプロゲステロン及び酢酸メゲストロールを含めて、ただしこれらだけに限定されないプロゲスチン；ジエチルスチルベストロール及びエチニルエストラジオール等価物を含めて、ただしこれらだけに限定されないエストロゲン；タモキシフェンを含めて、ただしこれらだけに限定されない抗エストロゲン剤；プロピオン酸テストステロン及びフルオキシメステロン／等価物を含めて、ただしこれらだけに限定されないアンドロゲン；フルタミド、性腺刺激ホルモン放出ホルモン類似体及びロイプロリドを含めて、ただしこれらだけに限定されない抗アンドロゲン並びにフルタミドを含めて、ただしこれらだけに限定されない非ステロイド性抗アンドロゲンを含めて、ただしこれだけに限定されない抗腫よう薬が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１９５】
抗ＴＲ−２抗体と一緒に投与することができる例示的な癌療法としては、標的療法が挙げられるが、これだけに限定されない。標的療法の例としては、治療用抗体の使用が挙げられるが、これだけに限定されない。例示的な治療用抗体としては、マウス抗体、マウス−ヒトキメラ抗体、ＣＤＲグラフト抗体、ヒト化抗体及びヒト抗体、並びに抗体ライブラリーをスクリーニングすることによって選択される合成抗体を含めて、ただしこれらだけに限定されない合成抗体が挙げられるが、これらだけに限定されない。例示的な抗体としては、腫よう細胞上に存在する細胞表面タンパク質Ｈｅｒ２、ＣＤＣ２０、ＣＤＣ３３、ムチン様糖タンパク質及び上皮成長因子受容体（ＥＧＦｒ）に結合し、これらのタンパク質を示す（ｄｉｓｐｌａｙ）腫よう細胞に細胞分裂停止及び／又は細胞傷害効果を場合によっては引き起こす抗体が挙げられるが、これらだけに限定されない。例示的な抗体としては、乳癌及び他の形態の癌の治療に使用することができるＨＥＲＣＥＰＴＩＮ（商標）、トラスツヅマブ、非ホジキンリンパ腫及び他の形態の癌の治療に使用することができるＲＩＴＵＸＡＮ（商標）、リツキシマブ、ＺＥＶＡＬＩＮ（商標）、イブリツモマブチウキセタン及びＬＹＭＰＨＯＣＩＤＥ（商標）、エピラツズマブ、慢性骨髄性白血病及び消化管間質腫ようの治療に使用することができるＧＬＥＥＶＥＣ（商標）、メシル酸イマチニブ、並びに非ホジキンリンパ腫の治療に使用することができるＢＥＸＸＡＲ（商標）、ヨウ素１３１トシツモマブも挙げられるが、これらだけに限定されない。ある例示的な抗体としては、ＥＲＢＩＴＵＸ（商標）；ＩＭＣ−Ｃ２２５；Ｉｒｅｓｓａ（商標）；ゲフィチニブ；ＴＡＲＣＥＶＡ（商標）、エルチノリブ（ｅｒｔｉｎｏｌｉｂ）；ＫＤＲ（キナーゼドメイン受容体）阻害剤；抗ＶＥＧＦ抗体及び拮抗物質（例えば、Ａｖａｓｔｉｎ（商標）及びＶＥＧＡＦ−ＴＲＡＰ）；抗ＶＥＧＦ受容体抗体及び抗原結合領域；抗Ａｎｇ−１及びＡｎｇ−２抗体及び抗原結合領域；Ｔｉｅ−２並びに他のＡｎｇ−１及びＡｎｇ−２受容体に対する抗体；Ｔｉｅ−２リガンド；Ｔｉｅ−２キナーゼ阻害剤に対する抗体；並びにＣａｍｐａｔｈ（登録商標）、アレムツズマブも挙げられる。ある実施形態においては、癌治療薬は、ＴＲＡＩＬなどのＴＮＦ関連ポリペプチドを含めて、ただしこれらだけに限定されない、腫よう細胞におけるアポトーシスを選択的に誘発させる他のポリペプチドである。
【０１９６】
ある実施形態においては、リガンドＩＧＦ−１及び／又はＩＧＦ−２とインスリン様成長因子−１受容体（「ＩＧＦ−１Ｒ」）との結合に拮抗し、ＩＧＦ−１Ｒを発現する細胞のアポトーシスを促進する（抗ＩＧＦ−Ｒ１抗体を含めて、ただしこれだけに限定されない）特異的結合物質を、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２を発現する細胞のアポトーシスをアゴナイズ（ａｇｏｎｉｚｅ）し、それによって促進する（ＴＲＡＩＬ及び抗ＴＲ２抗体を含めて、ただしこれらだけに限定されない）特異的結合物質と組み合わせて処方し、又は投与する。例示的な抗ＩＧＦ−１Ｒ抗体は当分野で公知であり、例えば、参照により本明細書に組込む、２００５年１２月２０日に出願された国際公開第２００６／０６９２０２号に開示されている。
【０１９７】
ある実施形態においては、癌治療薬は、血管新生を減少させる血管新生阻害剤である。ある血管新生阻害剤としては、ＥＲＢＩＴＵＸ（商標）、ＩＭＣ−Ｃ２２５；ＫＤＲ（キナーゼドメイン受容体）阻害剤（例えば、キナーゼドメイン受容体に特異的に結合する抗体及び抗原結合領域）；ＡＶＡＳＴＩＮ（商標）、ＶＥＧＦ−ＴＲＡＰ（商標）などの抗ＶＥＧＦ剤（例えば、ＶＥＧＦに特異的に結合する抗体若しくは抗原結合領域、又は可溶性ＶＥＧＦ受容体若しくはそのリガンド結合領域）；抗ＶＥＧＦ受容体剤（例えば、それに特異的に結合する抗体又は抗原結合領域）；ＡＢＸ−ＥＧＦ、パニツムマブ、ＩＲＥＳＳＡ（商標）、ゲフィチニブ、ＴＡＲＣＥＶＡ（商標）、エルロチニブなどのＥＧＦＲ阻害剤（例えば、それに特異的に結合する抗体又は抗原結合領域）、抗Ａｎｇ１及び抗Ａｎｇ２剤（例えば、それに、又はその受容体、例えば、Ｔｉｅ２／Ｔｅｋに特異的に結合する抗体又は抗原結合領域）並びに抗Ｔｉｅ２キナーゼ阻害剤（例えば、それに特異的に結合する抗体又は抗原結合領域）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、薬剤組成物としては、肝細胞増殖因子（ＨＧＦ、散乱因子としても知られる。）の拮抗物質など、増殖因子に特異的に結合し、その活性を阻害する１種類以上の薬剤（例えば、抗体、抗原結合領域又は可溶性受容体）、及び肝細胞増殖因子の受容体「ｃ−ｍｅｔ」に特異的に結合する抗体又は抗原結合領域も挙げることができる。
【０１９８】
例示的な血管新生阻害剤としては、Ｃａｍｐａｔｈ、ＩＬ−８、Ｂ−ＦＧＦ、Ｔｅｋ拮抗物質（Ｃｅｒｅｔｔｉ他、米国特許出願公開第２００３／０１６２７１２号、米国特許第６，４１３，９３２号）；抗ＴＷＥＡＫ剤（例えば、特異的に結合する抗体若しくは抗原結合領域、又は可溶性ＴＷＥＡＫ受容体拮抗物質。例えば、Ｗｉｌｅｙ、米国特許第６，７２７，２２５号参照）；インテグリンとそのリガンドとの結合に拮抗するＡＤＡＭディスインテグリン（ｄｉｓｔｉｎｔｅｇｒｉｎ）ドメイン（Ｆａｎｓｌｏｗ他、米国特許出願公開第２００２／００４２３６８号）；特異的に結合する抗ｅｐｈ受容体及び／又は抗エフリン抗体若しくは抗原結合領域（米国特許第５，９８１，２４５号、同５，７２８，８１３号、同５，９６９，１１０号、同６，５９６，８５２号、同６，２３２，４４７号、同６，０５７，１２４号及びその対応特許群）；抗ＰＤＧＦ−ＢＢ拮抗物質（例えば、特異的に結合する抗体又は抗原結合領域）並びにＰＤＧＦ−ＢＢリガンドに特異的に結合する抗体又は抗原結合領域、及びＰＤＧＦＲキナーゼ阻害剤（例えば、それに特異的に結合する抗体又は抗原結合領域）が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０１９９】
例示的な抗血管新生／抗腫よう剤としては、ＳＤ−７７８４（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ）；シレンギチド（ｃｉｌｅｎｇｉｔｉｄｅ）（Ｍｅｒｃｋ  ＫＧａＡ、ドイツ、ＥＰＯ  ７７０６２２）；ペガプタニブオクタナトリウム（Ｇｉｌｅａｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、ＵＳＡ）；アルファスタチン（Ａｌｐｈａｓｔａｔｉｎ）、（ＢｉｏＡｃｔａ、ＵＫ）；Ｍ−ＰＧＡ、（Ｃｅｌｇｅｎｅ、ＵＳＡ、米国特許第５，７１２，２９１号）；イロマスタット（Ａｒｒｉｖａ、ＵＳＡ、米国特許第５，８９２，１１２号）；エマキサニブ（ｅｍａｘａｎｉｂ）（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ、米国特許第５，７９２，７８３号）；バタラニブ（Ｎｏｖａｒｔｉｓ、スイス）；２−メトキシエストラジオール（ＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；ＴＬＣ  ＥＬＬ−１２（Ｅｌａｎ、アイルランド）；酢酸アネコルタブ（Ａｌｃｏｎ、ＵＳＡ）；アルファ−Ｄ１４８  Ｍａｂ（Ａｍｇｅｎ、ＵＳＡ）；ＣＥＰ−７０５５（Ｃｅｐｈａｌｏｎ、ＵＳＡ）；抗Ｖｎ  Ｍａｂ（Ｃｒｕｃｅｌｌ、オランダ）；ＤＡＣ：抗血管新生（ＣｏｎｊｕＣｈｅｍ、カナダ）；アンギオシジン（Ａｎｇｉｏｃｉｄｉｎ）（ＩｎＫｉｎｅ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ、ＵＳＡ）；ＫＭ−２５５０（協和発酵、日本）；ＳＵ−０８７９（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ）；ＣＧＰ−７９７８７（Ｎｏｖａｒｔｉｓ、スイス、ＥＰ  ９７００７０）；ＡＲＧＥＮＴ  ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（Ａｒｉａｄ、ＵＳＡ）；ＹＩＧＳＲ−Ｓｔｅａｌｔｈ（Ｊｏｈｎｓｏｎ＆  Ｊｏｈｎｓｏｎ、ＵＳＡ）；フィブリノーゲンＥ断片（ＢｉｏＡｃｔａ、ＵＫ）；血管新生阻害剤（Ｔｒｉｇｅｎ、ＵＫ）；ＴＢＣ−１６３５（Ｅｎｃｙｓｉｖｅ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ、ＵＳＡ）；ＳＣ−２３６（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ）；ＡＢＴ−５６７（Ａｂｂｏｔｔ、ＵＳＡ）；メタスタチン（ＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；血管新生阻害剤（Ｔｒｉｐｅｐ、スウェーデン）；マスピン（そーせい、日本）；２−メトキシエストラジオール（Ｏｎｃｏｌｏｇｙ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、ＵＳＡ）；ＥＲ−６８２０３−００（ＩＶＡＸ、ＵＳＡ）；Ｂｅｎｅｆｉｎ（Ｌａｎｅ  Ｌａｂｓ、ＵＳＡ）；Ｔｚ−９３（ツムラ、日本）；ＴＡＮ−１１２０（武田、日本）；ＦＲ−１１１１４２（藤沢、日本、ＪＰ  ０２２３３６１０）；血小板因子４（ＲｅｐｌｉＧｅｎ、ＵＳＡ、ＥＰ  ４０７１２２）；血管内皮増殖因子拮抗物質（Ｂｏｒｅａｎ、デンマーク）；テムシロリムス（ＣＣＩ−７７９）（Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｓｏｕｔｈ  Ｃａｒｏｌｉｎａ、ＵＳＡ）；ベバシズマブ（ｐＩＮＮ）（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ、ＵＳＡ）；血管新生阻害剤（ＳＵＧＥＮ、ＵＳＡ）；ＸＬ  ７８４（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ、ＵＳＡ）；ＸＬ  ６４７（Ｅｘｅｌｉｘｉｓ、ＵＳＡ）；ＭＡｂ、アルファ５ベータ３インテグリン、Ｖｉｔａｘｉｎ及び第二世代Ｖｉｔａｘｉｎ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ、ＵＳＡ及びＭｅｄＩｍｍｕｎｅ、ＵＳＡ）；Ｒｅｔｉｎｏｓｔａｔ（登録商標）遺伝子療法（Ｏｘｆｏｒｄ  ＢｉｏＭｅｄｉｃａ、ＵＫ）；エンザスタウリン塩酸塩（ＵＳＡＮ）（Ｌｉｌｌｙ、ＵＳＡ）；ＣＥＰ  ７０５５（Ｃｅｐｈａｌｏｎ、ＵＳＡ及びＳａｎｏｆｉ−Ｓｙｎｔｈ���ｌａｂｏ、フランス）；ＢＣ  １（Ｇｅｎｏａ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、イタリア）；血管新生阻害剤（Ａｌｃｈｅｍｉａ、オーストラリア）；ＶＥＧＦ拮抗物質（Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ、ＵＳＡ）；ｒＢＰＩ  ２１及びＢＰＩから誘導される抗血管新生剤（ＸＯＭＡ、ＵＳＡ）；ＰＩ  ８８（Ｐｒｏｇｅｎ、オーストラリア）；シレンギチド（ｃｉｌｅｎｇｉｔｉｄｅ）（ｐＩＮＮ）（Ｍｅｒｃｋ  ＫＧａＡ、ドイツ；Ｍｕｎｉｃｈ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ドイツ；Ｓｃｒｉｐｐｓ  Ｃｌｉｎｉｃ  ａｎｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ、ＵＳＡ）；セツキシマブ（ＩＮＮ）（Ａｖｅｎｔｉｓ、フランス）；ＡＶＥ  ８０６２（味の素、日本）；ＡＳ  １４０４（Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、ニュージーランド）；ＳＧ  ２９２（Ｔｅｌｉｏｓ、ＵＳＡ）；エンドスタチン（Ｂｏｓｔｏｎ  Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ  Ｈｏｓｐｉｔａｌ、ＵＳＡ）；２−メトキシエストラジオール（Ｂｏｓｔｏｎ  Ｃｈｉｌｄｒｅｎｓ  Ｈｏｓｐｉｔａｌ、ＵＳＡ）；ＺＤ  ６４７４（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ、ＵＫ）；ＺＤ  ６１２６（Ａｎｇｉｏｇｅｎｅ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ、ＵＫ）；ＰＰＩ  ２４５８（Ｐｒａｅｃｉｓ、ＵＳＡ）；ＡＺＤ  ９９３５（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ、ＵＫ）；ＡＺＤ  ２１７１（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ、ＵＫ）；バタラニブ（ｐＩＮＮ）（Ｎｏｖａｒｔｉｓ、スイス及びＳｃｈｅｒｉｎｇ  ＡＧ、ドイツ）；組織因子経路阻害因子（ＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；ペガプタニブ（Ｐｉｎｎ）（Ｇｉｌｅａｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、ＵＳＡ）；キサントリゾール（Ｙｏｎｓｅｉ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、韓国）；ワクチン、遺伝子ベース、ＶＥＧＦ−２（Ｓｃｒｉｐｐｓ  Ｃｌｉｎｉｃ  ａｎｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ、ＵＳＡ）；ＳＰＶ５．２（Ｓｕｐｒａｔｅｋ、カナダ）；ＳＤＸ  １０３（Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ  ａｔ  Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＵＳＡ）；ＰＸ  ４７８（Ｐｒｏ１Ｘ、ＵＳＡ）；メタスタチン（ＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；トロポニンＩ（Ｈａｒｖａｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；ＳＵ  ６６６８（ＳＵＧＥＮ、ＵＳＡ）；ＯＸＩ  ４５０３（ＯＸｉＧＥＮＥ、ＵＳＡ）；ｏ−グアニジン（Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ、ＵＳＡ）；モツポラミン（ｍｏｔｕｐｏｒａｍｉｎｅ）Ｃ（Ｂｒｉｔｉｓｈ  Ｃｏｌｕｍｂｉａ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、カナダ）；ＣＤＰ  ７９１（Ｃｅｌｌｔｅｃｈ  Ｇｒｏｕｐ、ＵＫ）；アチプリモド（ｐＩＮＮ）（ＧｌａｘｏＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ、ＵＫ）；Ｅ  ７８２０（エーザイ、日本）；ＣＹＣ  ３８１（Ｈａｒｖａｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；ＡＥ  ９４１（Ａｅｔｅｒｎａ、カナダ）；ＦＧＦ２癌ワクチン（ＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；ウロキナーゼプラスミノゲンアクチベーター阻害剤（Ｄｅｎｄｒｅｏｎ、ＵＳＡ）；オグルファニド（ｏｇｌｕｆａｎｉｄｅ）（ｐＩＮＮ）（Ｍｅｌｍｏｔｔｅ、ＵＳＡ）；ＨＩＦ−１アルファ阻害剤（Ｘｅｎｏｖａ、ＵＫ）；ＣＥＰ  ５２１４（Ｃｅｐｈａｌｏｎ、ＵＳＡ）；ＢＡＹ  ＲＥＳ  ２６２２（Ｂａｙｅｒ、ドイツ��；アンギオシジン（Ａｎｇｉｏｃｉｄｉｎ）（ＩｎＫｉｎｅ、ＵＳＡ）；Ａ６（Ａｎｇｓｔｒｏｍ、ＵＳＡ）；ＫＲ  ３１３７２（Ｋｏｒｅａ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、韓国）；ＧＷ  ２２８６（ＧｌａｘｏＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ、ＵＫ）；ＥＨＴ  ０１０１（ＥｘｏｎＨｉｔ、フランス）；ＣＰ  ８６８５９６（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ）；ＣＰ  ５６４９５９（ＯＳＩ、ＵＳＡ）；ＣＰ  ５４７６３２（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ）；７８６０３４（ＧｌａｘｏＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ、ＵＫ）；ＫＲＮ  ６３３（麒麟麦酒、日本）；薬物送達システム、眼内、２−メトキシエストラジオール（ＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；アンジネックス（ａｎｇｉｎｅｘ）（Ｍａａｓｔｒｉｃｈｔ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、オランダ及びＭｉｎｎｅｓｏｔａ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；ＡＢＴ  ５１０（Ａｂｂｏｔｔ、ＵＳＡ）；ＡＡＬ  ９９３（Ｎｏｖａｒｔｉｓ、スイス）；ＶＥＧＩ（ＰｒｏｔｅｏｍＴｅｃｈ、ＵＳＡ）；腫よう壊死因子アルファ阻害剤（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｎ  Ａｇｉｎｇ、ＵＳＡ）；ＳＵ  １１２４８（Ｐｆｉｚｅｒ、ＵＳＡ及びＳＵＧＥＮ  ＵＳＡ）；ＡＢＴ  ５１８（Ａｂｂｏｔｔ、ＵＳＡ）；ＹＨ１６（Ｙａｎｔａｉ  Ｒｏｎｇｃｈａｎｇ、中国）；Ｓ−３ＡＰＧ（Ｂｏｓｔｏｎ  Ｃｈｉｌｄｒｅｎｓ  Ｈｏｓｐｉｔａｌ、ＵＳＡ及びＥｎｔｒｅＭｅｄ、ＵＳＡ）；ＭＡｂ、ＫＤＲ（ＩｍＣｌｏｎｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、ＵＳＡ）；ＭＡｂ、アルファ５ベータ１（Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｄｅｓｉｇｎ、ＵＳＡ）；ＫＤＲキナーゼ阻害剤（Ｃｅｌｌｔｅｃｈ  Ｇｒｏｕｐ、ＵＫ及びＪｏｈｎｓｏｎ＆Ｊｏｈｎｓｏｎ、ＵＳＡ）；ＧＦＢ  １１６（Ｓｏｕｔｈ  Ｆｌｏｒｉｄａ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ及びＹａｌｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；ＣＳ  ７０６（三共、日本）；コンブレタスタチンＡ４プロドラッグ（Ａｒｉｚｏｎａ  Ｓｔａｔｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；コンドロイチン分解酵素ＡＣ（ＩＢＥＸ、カナダ）；ＢＡＹ  ＲＥＳ  ２６９０（Ｂａｙｅｒ、ドイツ）；ＡＧＭ  １４７０（Ｈａｒｖａｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ、武田、日本及びＴＡＰ、ＵＳＡ）；ＡＧ  １３９２５（Ａｇｏｕｒｏｎ、ＵＳＡ）；テトラチオモリブダート（Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｍｉｃｈｉｇａｎ、ＵＳＡ）；ＧＣＳ  １００（Ｗａｙｎｅ  Ｓｔａｔｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；ＣＶ  ２４７（Ｉｖｙ  Ｍｅｄｉｃａｌ、ＵＫ）；ＣＫＤ  ７３２（Ｃｈｏｎｇ  Ｋｕｎ  Ｄａｎｇ、韓国）；ＭＡｂ、血管内皮増殖因子（Ｘｅｎｏｖａ、ＵＫ）；イルソグラジン（ＩＮＮ）（日本新薬、日本）；ＲＧ  １３５７７（Ａｖｅｎｔｉｓ、フランス）；ＷＸ  ３６０（Ｗｉｌｅｘ、ドイツ）；スクアラミン（ｐＩＮＮ）（Ｇｅｎａｅｒａ、ＵＳＡ）；ＲＰＩ  ４６１０（Ｓｉｒｎａ、ＵＳＡ）；ガラクトフカン硫酸塩（Ｍａｒｉｎｏｖａ、オーストラリア）；ヘパラナーゼ阻害剤（ＩｎＳｉｇｈｔ、イスラエル）；ＫＬ  ３１０６（Ｋｏｌｏｎ、韓国）；ホノキオール（Ｅｍｏｒｙ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、ＵＳＡ）；ＺＫ  ＣＤＫ（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ  ＡＧ、ドイツ）；ＺＫ  Ａｎｇｉｏ（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ  ＡＧ、ドイツ���；ＺＫ  ２２９５６１（Ｎｏｖａｒｔｉｓ、スイス及びＳｃｈｅｒｉｎｇ  ＡＧ、ドイツ）；ＸＭＰ  ３００（ＸＯＭＡ、ＵＳＡ）；ＶＧＡ  １１０２（大正、日本）；ＶＥＧＦ受容体モジュレーター（Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅｉａ、ＵＳＡ）；ＶＥ−カドヘリン−２拮抗物質（ＩｍＣｌｏｎｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、ＵＳＡ）；バソスタチン（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ、ＵＳＡ）；ワクチン、Ｆｌｋ−１（ＩｍＣｌｏｎｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、ＵＳＡ）；ＴＺ  ９３（ツムラ、日本）；タムスタチン（Ｂｅｔｈ  Ｉｓｒａｅｌ  Ｈｏｓｐｉｔａｌ、ＵＳＡ）；切断型可溶性ＦＬＴ  １（血管内皮増殖因子受容体１）（Ｍｅｒｃｋ＆Ｃｏ、ＵＳＡ）；Ｔｉｅ−２リガンド（Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ、ＵＳＡ）及びトロンボスポンジン１阻害剤（Ａｌｌｅｇｈｅｎｙ  Ｈｅａｌｔｈ、Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ、ＵＳＡ）が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２００】
ある癌治療薬としては、サリドマイド及びサリドマイド類似体（Ｎ−（２，６−ジオキソ−３−ピペリジル）フタルイミド）；テコガランナトリウム（硫酸化多糖ペプチドグリカン）；Ｖｅｌｃａｄｅ（登録商標）；ボルテゾミブ；ラパマイシン；ＴＡＮ  １１２０（８−アセチル−７，８，９，１０−テトラヒドロ−６，８，１１−トリヒドロキシ−１−メトキシ−１０−［［オクタヒドロ−５−ヒドロキシ−２−（２−ヒドロキシプロピル）−４，１０−ジメチルピラノ［３，４−ｄ］−１，３，６−ジオキサゾシン−８−イル］オキシ］−５，１２−ナフタセンジオン）；ｓｕｒａｄｉｓｔａ（７，７’−［カルボニルビス［イミノ（１−メチル−１Ｈ−ピロール−４，２−ジイル）カルボニルイミノ（１−メチル−１Ｈ−ピロール−４，２−ジイル）カルボニルイミノ］］ビス−１，３−ナフタレンジスルホン酸テトラナトリウム塩）；ＳＵ  ３０２；ＳＵ  ３０１；ＳＵ  １４９８（（Ｅ）−２−シアノ−３−［４−ヒドロキシ−３，５−ビス（１−メチルエチル）フェニル］−Ｎ−（３−フェニルプロピル）−２−プロペンアミド）；ＳＵ  １４３３（４−（６，７−ジメチル−２−キノキサリニル）−１，２−ベンゼンジオール）；ＳＴ  １５１４；ＳＲ  ２５９８９；可溶性Ｔｉｅ−２；ＳＥＲＭ誘導体；Ｐｈａｒｍｏｓ；セマキサニブ（ｐＩＮＮ）（３−［（３，５−ジメチル−１Ｈ−ピロル−２−イル）メチレン］−１，３−ジヒドロ−２Ｈ−インドル−２−オン）；Ｓ  ８３６；ＲＧ  ８８０３；ＲＥＳＴＩＮ；Ｒ  ４４０（３−（１−メチル−１Ｈ−インドル−３−イル）−４−（１−メチル−６−ニトロ−１Ｈ−インドル−３−イル）−１Ｈ−ピロル−２，５−ジオン）；Ｒ  １２３９４２（１−［６−（１，２，４−チアジアゾル−５−イル）−３−ピリダジニル］−Ｎ−［３−（トリフルオロメチル）フェニル］−４−ピペリジンアミン）；プロリルヒドロキシラーゼ阻害剤；進行増加性遺伝子（ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ  ｅｌｅｖａｔｅｄ  ｇｅｎｅｓ）；プリノマスタット（ＩＮＮ）（（Ｓ）−２，２−ジメチル−４−［［ｐ−（４−ピリジルオキシ）フェニル］スルホニル］−３−チオモルホリンカルボヒドロキサム酸）；ＮＶ  １０３０；ＮＭ  ３（８−ヒドロキシ−６−メトキシ−アルファ−メチル−１−オキソ−１Ｈ−２−ベンゾピラン−３−酢酸）；ＮＦ  ６８１；ＮＦ  ０５０；ＭＩＧ；ＭＥＴＨ  ２；ＭＥＴＨ  １；マナサンチンＢ（アルファ−［１−［４−［５−［４−［２−（３，４−ジメトキシフェニル）−２−ヒドロキシ−１−メチルエトキシ］−３−メトキシフェニル］テトラヒドロ−３，４−ジメチル−２−フラニル］−２−メトキシフェノキシ］エチル］−１，３−ベンゾジオキソール−５−メタノール）；ＫＤＲモノクローナル抗体；アルファ５ベータ３インテグリンモノクローナル抗体；ＬＹ  ２９０２９３（２−アミノ−４−（３−ピリジニル）−４Ｈ−ナフト［１，２−ｂ］ピラン−３−カルボニトリル）；ＫＰ  ０２０１４４８；ＫＭ  ２５５０；インテグリン特異的ペプチド；ＩＮＧＮ  ４０１；ＧＹＫＩ  ６６４７５；ＧＹＫＩ  ６６４６２；ｇｒｅｅｎｓｔａｔｉｎ（１０１−３５４−プラスミノゲン（ヒト））；リウマチ様関節炎、前立腺癌、卵巣癌、神経こう腫���エンドスタチン、結腸直腸癌、ＡＴＦ  ＢＴＰＩ、抗血管新生遺伝子、血管新生阻害剤又は血管新生の遺伝子療法；ゼラチナーゼ阻害剤、ＦＲ  １１１１４２（４，５−ジヒドロキシ−２−ヘキセン酸  ５−メトキシ−４−［２−メチル−３−（３−メチル−２−ブテニル）オキシラニル］−１−オキサスピロ［２．５］オクタ−６−イルエステル）；ホルフェニメクス（ｐＩＮＮ）（Ｓ）−アルファ−アミノ−３−ヒドロキシ−４−（ヒドロキシメチル）ベンゼン酢酸）；フィブロネクチン拮抗物質（１−アセチル−Ｌ−プロリル−Ｌ−ヒスチジル−Ｌ−セリル−Ｌ−システイニル−Ｌ−アスパルトアミド）；線維芽細胞成長因子受容体阻害剤；線維芽細胞成長因子拮抗物質；ＦＣＥ  ２７１６４（７，７’−［カルボニルビス［イミノ（１−メチル−１Ｈ−ピロル−４，２−ジイル）カルボニルイミノ（１−メチル−１Ｈ−ピロル−４，２−ジイル）カルボニルイミノ］］ビス−１，３，５−ナフタレントリスルホン酸ヘキサナトリウム塩）；ＦＣＥ  ２６７５２（８，８’−［カルボニルビス［イミノ（１−メチル−１Ｈ−ピロル−４，２−ジイル）カルボニルイミノ（１−メチル−１Ｈ−ピロル−４，２−ジイル）カルボニルイミノ］］ビス−１，３，６−ナフタレントリスルホン酸）；内皮単球活性化ポリペプチドＩＩ；ＶＥＧＦＲアンチセンスオリゴヌクレオチド；抗血管新生及び栄養因子；ＡＮＣＨＯＲ血管新生抑制（ａｎｇｉｏｓｔａｔｉｃ）剤；エンドスタチン；Ｄｅｌ−１血管新生タンパク質；ＣＴ  ３５７７；コントルトロスタチン（ｃｏｎｔｏｒｔｒｏｓｔａｔｉｎ）；ＣＭ  １０１；コンドロイチン分解酵素ＡＣ；ＣＤＰ  ８４５；ＣａｎＳｔａｔｉｎ；ＢＳＴ  ２００２；ＢＳＴ  ２００１；ＢＬＳ  ０５９７；ＢＩＢＦ  １０００；アレスチン；アポミグレン（ａｐｏｍｉｇｒｅｎ）（１３０４−１３８８型ＸＶコラーゲン（ヒト遺伝子ＣＯＬ１５Ａ１アルファ１鎖前駆体））；アンジオインヒビン；ａａＡＴＩＩＩ；Ａ  ３６；９アルファ−フルオロメドロキシプロゲステロンアセタート（（６−アルファ）−１７−（アセチルオキシ）−９−フルオロ−６−メチル−プレグナ−４−エン−３，２０−ジオン）；２−メチル−２−フタルイミジノ−グルタル酸（２−（１，３−ジヒドロ−１−オキソ−２Ｈ−イソインドル−２−イル）−２−メチルペンタンジオン酸）；イットリウム９０標識モノクローナル抗体ＢＣ−１；セマキサニブ（３−（４，５−ジメチルピロル−２−イルメチレン）インドリン−２−オン）（Ｃ１５  Ｈ１４  Ｎ２  Ｏ）；ＰＩ  ８８（ホスホマンノペンタオーススルファート）；Ａｌｖｏｃｉｄｉｂ（４Ｈ−１−ベンゾピラン−４−オン、２−（２−クロロフェニル）−５，７−ジヒドロキシ−８−（３−ヒドロキシ−１−メチル−４−ピペリジニル）−シス−（−）−）（Ｃ２１  Ｈ２０  Ｃｌ  Ｎ  Ｏ５）；Ｅ  ７８２０；ＳＵ  １１２４８（５−［３−フルオロ−２−オキソ−１，２−ジヒドロインドル−（３Ｚ）−イリデンメチル］−２，４−ジメチル−１Ｈ−ピロール−３−カルボン酸（２−ジエチルアミノエチル）アミド）（Ｃ２２  Ｈ２７  Ｆ  Ｎ４  Ｏ２）；スクアラミン（コレスタン−７，２４−ジオール、３−［［３−［（４−アミノブチル）アミノプロピル］アミ���］−，２４−（硫酸水素塩）、（３．ベータ．，５．アルファ．，７．アルファ．）−）（Ｃ３４  Ｈ６５  Ｎ３  Ｏ５  Ｓ）；エリオクロムブラックＴ；ＡＧＭ  １４７０（カルバミン酸、（クロロアセチル）−，５−メトキシ−４−［２−メチル−３−（３−メチル−２−ブテニル）オキシラニル］−１−オキサスピロ［２，５］オクタ−６−イルエステル、［３Ｒ−［３アルファ，４アルファ（２Ｒ，３Ｒ），５ベータ，６ベータ］］）（Ｃ１９  Ｈ２８  Ｃｌ  Ｎ  Ｏ６）；ＡＺＤ  ９９３５；ＢＩＢＦ  １０００；ＡＺＤ  ２１７１；ＡＢＴ  ８２８；ＫＳ−インターロイキン−２；ウテログロビン；Ａ  ６；ＮＳＣ  ６３９３６６（１−［３−（ジエチルアミノ）−２−ヒドロキシプロピルアミノ］−４−（オキシラン（ｏｘｙｒａｎ）−２−イルメチルアミノ）アントラキノンフマラート（ｆｕｍｅｒａｔｅ））（Ｃ２４  Ｈ２９  Ｎ３  Ｏ４  ．  Ｃ４  Ｈ４  Ｏ４）；ＩＳＶ  ６１６；抗ＥＤ−Ｂ融合タンパク質；ＨＵＩ  ７７；トロポニン  Ｉ；ＢＣ−１モノクローナル抗体；ＳＰＶ  ５．２；ＥＲ  ６８２０３；ＣＫＤ  ７３１（３−（３，４，５−トリメトキシフェニル）−２（Ｅ）−プロペン酸（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ，６Ｒ）−４−［２（Ｒ）−メチル−３（Ｒ）−３（Ｒ）−（３−メチル−２−ブテニル）オキシラン−２−イル］−５−メトキシ−１−オキサスピロ［２．５］オクタ−６−イルエステル）（Ｃ２８  Ｈ３８  Ｏ８）；ＩＭＣ−１Ｃ１１；ａａＡＴＩＩＩ；ＳＣ  ７；ＣＭ  １０１；Ａｎｇｉｏｃｏｌ；Ｋｒｉｎｇｌｅ  ５；ＣＫＤ  ７３２（３−［４−［２−（ジメチルアミノ）エトキシ］フェニル］−２（Ｅ）−プロペン酸）（Ｃ２９  Ｈ４１  Ｎ  Ｏ６）；Ｕ  ９９５；Ｃａｎｓｔａｔｉｎ；ＳＱ  ８８５；ＣＴ  ２５８４（１−［１１−（ドデシルアミノ）−１０−ヒドロキシウンデシル］−３，７−ジメチルキサンチン）（Ｃ３０  Ｈ５５  Ｎ５  Ｏ３）；Ｓａｌｍｏｓｉｎ；ＥＭＡＰ  ＩＩ；ＴＸ  １９２０（１−（４−メチルピペラジノ）−２−（２−ニトロ−１Ｈ−１−イミダゾイル）−１−エタノン）（Ｃ１０  Ｈ１５  Ｎ５  Ｏ３）；アルファ−ｖベータ−ｘ阻害剤；ＣＨＩＲ  １１５０９（Ｎ−（１−プロピニル）グリシル−［Ｎ−（２−ナフチル）］グリシル−［Ｎ−（カルバモイルメチル）］グリシンビス（４−メトキシフェニル）メチルアミド）（Ｃ３６  Ｈ３７  Ｎ５  Ｏ６）；ＢＳＴ  ２００２；ＢＳＴ  ２００１；Ｂ  ０８２９；ＦＲ  １１１１４２；４，５−ジヒドロキシ−２（Ｅ）−ヘキセン酸（３Ｒ，４Ｓ，５Ｓ，６Ｒ）−４−［１（Ｒ），２（Ｒ）−エポキシ−１，５−ジメチル−４−ヘキセニル］−５−メトキシ−１−オキサスピロ［２．５］オクタン−６−イルエステル（Ｃ２２  Ｈ３４  Ｏ７）並びにＮ−（４−クロロフェニル）−４−（４−ピリジニルメチル）−１−フタラジンアミン；４−［４−［［［［４−クロロ−３−（トリフルオロメチル）フェニル］アミノ］カルボニル］アミノ］フェノキシ］−Ｎ−メチル−２−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−［２−（ジエチルアミノ）エチル］−５−［（５−フルオロ−１，２−ジヒドロ−２−オキソ−３Ｈ−インドル−３−イリデン）メチル］−２，４−ジメチル−１Ｈ−ピロール−３−カルボキサミド；３−［（４−ブロ��−２，６−ジフルオロフェニル）メトキシ］−５−［［［［４−（１−ピロリジニル）ブチル］アミノ］カルボニル］アミノ］−４−イソチアゾールカルボキサミド；Ｎ−（４−ブロモ−２−フルオロフェニル）−６−メトキシ−７−［（１−メチル−４−ピペリジニル）メトキシ］−４−キナゾリンアミン；３−［５，６，７，１３−テトラヒドロ−９−［（１−メチルエトキシ）メチル］−５−オキソ−１２Ｈ−インデノ［２，１−ａ］ピロロ［３，４−ｃ］カルバゾル−１２−イル］プロピルエステル  Ｎ，Ｎ−ジメチル−グリシン；Ｎ−［５−［［［５−（１，１−ジメチルエチル）−２−オキサゾリル］メチル］チオ］−２−チアゾリル］−４−ピペリジンカルボキサミド；Ｎ−［３−クロロ−４−［（３−フルオロフェニル）メトキシ］フェニル］−６−［５−［［［２−（メチルスルホニル）エチル］アミノ］メチル］−２−フラニル］−４−キナゾリンアミン；４−［（４−メチル−１−ピペラジニル）メチル］−Ｎ−［４−メチル−３−［［４−（３−ピリジニル）−２−ピリミジニル］アミノ］−フェニル］ベンズアミド；Ｎ−（３−クロロ−４−フルオロフェニル）−７−メトキシ−６−［３−（４−モルホリニル）プロポキシ］−４−キナゾリンアミン；Ｎ−（３−エチニルフェニル）−６，７−ビス（２−メトキシエトキシ）−４−キナゾリンアミン；Ｎ−（３−（（（（２Ｒ）−１−メチル−２−ピロリジニル）メチル）オキシ）−５−（トリフルオロメチル）フェニル）−２−（（３−（１，３−オキサゾル−５−イル）フェニル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；２−（（（４−フルオロフェニル）メチル）アミノ）−Ｎ−（３−（（（（２Ｒ）−１−メチル−２−ピロリジニル）メチル）オキシ）−５−（トリフルオロメチル）フェニル）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−［３−（アゼチジン−３−イルメトキシ）−５−トリフルオロメチル−フェニル］−２−（４−フルオロ−ベンジルアミノ）−ニコチンアミド；６−フルオロ−Ｎ−（４−（１−メチルエチル）フェニル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−Ｎ−（３−（（（２Ｓ）−２−ピロリジニルメチル）オキシ）−５−（トリフルオロメチル）フェニル）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（３
−（１，１−ジメチルエチル）−１Ｈ−ピラゾル−５−イル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（３，３−ジメチル−２，３−ジヒドロ−１−ベンゾフラン−６−イル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（３−（（（（２Ｓ）−１−メチル−２−ピロリジニル）メチル）オキシ）−５−（トリフルオロメチル）フェニル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−Ｎ−（３−（（２−（１−ピロリジニル）エチル）オキシ）−４−（トリフルオロメチル）フェニル）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（３，３−ジメチル−２，３−ジヒドロ−１Ｈ−インドル−６−イル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（４−（ペンタフルオロエチル）−３−（（（２Ｓ）−２−ピロリジニルメチル）オキシ）フェニル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（３−（（３−アゼチジニルメチル）オキシ）−５−（トリフルオロメチル）フェニル）−２−（（４−ピリジニルメチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（３−（４−ピペリジニルオキシ）−５−（トリフルオロメチル）フェニル）−２−（（２−（３−ピリジニル）エチル）アミノ）−３−ピリジンカルボキサミド；Ｎ−（４，４−ジメチル−１，２，３，４−テトラヒドロ−イソキノリン−７−イル）−２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）−ニコチンアミド；２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）−Ｎ−［３−（１−メチルピロリジン−２−イルメトキシ）−５−トリフルオロメチル−フェニル］−ニコチンアミド；Ｎ−［１−（２−ジメチルアミノ−アセチル）−３，３−ジメチル−２，３−ジヒドロ−１Ｈ−インドル−６−イル］−２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）−ニコチンアミド；２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）−Ｎ−［３−（ピロリジン−２−イルメトキシ）−５−トリフルオロメチル−フェニル］−ニコチンアミド；Ｎ−（１−アセチル−３，３−ジメチル−２，３−ジヒドロ−１Ｈ−インドル−６−イル）−２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）−ニコチンアミド；Ｎ−（４，４−ジメチル−１−オキソ−１，２，３，４−テトラヒドロ−イソキノリン−７−イル）−２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）−ニコチンアミド；Ｎ−［４−（ｔｅｒｔ−ブチル）−３−（３−ピペリジルプロピル）フェニル］［２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）（３−ピリジル）］カルボキサミド；Ｎ−［５−（ｔｅｒｔ−ブチル）イソオキサゾル−３−イル］［２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）（３−ピリジル）］カルボキサミド；及びＮ−［４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル］［２−（１Ｈ−インダゾル−６−イルアミノ）（３−ピリジル）］カルボキサミド）を含めて、ただしこれらだけに限定されないキナーゼ阻害剤、並びにその各々を参照により本明細書に組込む米国特許第６，２５８，８１２号、同６，２３５，７６４号、同６，６３０，５００号、同６，５１５，００４号、同６，７１３，４８５号、同５，５２１，１８４号、同５，７７０，５９９号、同５，７４７，４９８号、同５，９９０，１４１号、米国特許出願公開第２００３／０１０５０９１号、国際公開第０１／３７８２０号、同０１／３２６５１号、同０２／６８４０６号、同０２／６６４７０号、同０２／５５５０１号、同０４／０５２７９号、同０４／０７４８１号、同０４／０７４５８号、同０４／０９７８４号、同０２／５９１１０号、同９９／４５００９号、同９８／３５９５８号、同００／５９５０９号、同９９／６１４２２号、同００／１２０８９号及び同００／０２８７１号に開示されているキナーゼ阻害剤が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２０１】
ＴＲ−２は、肝臓、脳、腎臓、結腸、乳房、肺、ひ臓、胸腺、末梢血リンパ球、すい臓、前立腺、精巣、卵巣、子宮、及び胃腸管に沿った種々の組織を含めて、種々の細胞において発現する。ＴＲ−２に関係する例示的な癌としては、肝臓癌、脳腫よう、腎癌、乳癌、すい癌、結腸直腸癌、肺癌（小細胞肺癌及び非小細胞肺癌）、ひ臓癌、胸腺又は血球の癌（すなわち、白血病）、前立腺癌、精巣癌、卵巣癌、子宮癌、胃癌、頭頚部へん平上皮癌、黒色腫及びリンパ腫が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２０２】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、単独で、又は少なくとも１種類の追加の癌治療薬と一緒に使用することができる。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を追加の治療薬の治療有効量と併用する。抗ＴＲ−２抗体と一緒に投与することができる例示的な治療薬としては、アンサマイシン（ａｎｉｓａｍｙｃｉｎ）抗生物質のゲルダナマイシンファミリーのメンバー；Ｐｒｏ−ＨＧＦ；ＮＫ２；ｃ−Ｍｅｔペプチド阻害剤；Ｇｒｂ２  Ｓｒｃホモロジー２の拮抗物質；Ｇａｂ１調節物質；ドミナントネガティブＳｒｃ；ワートマニンを含めて、ただしこれらだけに限定されないフォンヒッペル  リンダウ（Ｌａｎｄａｕ）阻害剤；Ｐ１３キナーゼ阻害剤、他の抗受容体療法、抗ＥＧＦｒ、ＣＯＸ−２阻害剤、Ｃｅｌｅｂｒｅｘ（商標）、セレコキシブ、Ｖｉｏｘｘ（商標）、ロフェコキシブ；血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）、ＶＥＧＦ  調節物質、線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ）、ＦＧＦ調節物質、上皮成長因子（ＥＧＦ）；ＥＧＦ調節物質；ケラチノサイト成長因子（ＫＧＦ）、ＫＧＦ関連分子、ＫＧＦ調節物質及びマトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ）調節物質が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２０３】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を特定の治療薬と併用して種々の癌を治療する。ある実施形態においては、症状、及び所望の治療レベルを考慮して、２、３又はそれを超える種類の薬剤を投与することができる。化合物を１種類以上の他の成分と併用する場合には、化合物と１種類以上の他の成分を、（例えば、薬剤形式で）一緒に、別々に、又は逐次的に投与することができる。ある実施形態においては、かかる薬剤を同じ製剤に含めることによって一緒に提供することができる。ある実施形態においては、かかる薬剤と抗ＴＲ−２抗体を同じ製剤に含めることによって一緒に提供することができる。ある実施形態においては、かかる薬剤を別々に調剤し、治療キットに含めることによって一緒に提供することができる。ある実施形態においては、かかる薬剤と抗ＴＲ−２抗体を別々に調剤し、治療キットに含めることによって一緒に提供することができる。ある実施形態においては、かかる薬剤を別々に提供することができる。
【０２０４】
ある実施形態においては、遺伝子療法によって投与するときには、タンパク質薬剤及び／又は抗ＴＲ−２抗体をコードする遺伝子を、同じベクターに含めることができる。ある実施形態においては、タンパク質薬剤及び／又は抗ＴＲ−２抗体をコードする遺伝子を、同じプロモーター領域の制御下に置くことができる。ある実施形態においては、タンパク質薬剤及び／又は抗ＴＲ−２抗体をコードする遺伝子は、別々のベクター中に存在し得る。
【０２０５】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、ペット（イヌ、ネコ、トリ、霊長目など）、家畜（ウマ  ウシ、ヒツジ、ブタ、トリなど）などの非ヒト動物の治療に使用することができる。かかる場合においては、適切な用量は、動物の体重に応じて決定することができる。例えば、ある実施形態においては、０．２−１ｍｇ／ｋｇの用量を使用することができる。ある実施形態においては、用量を動物の表面積に応じて決定することができ、例示的な用量は０．１から２０ｍｇ／ｉｎ２又は５から１２ｍｇ／ｍ２である。イヌ、ネコなどの小動物の場合、ある実施形態においては、適切な用量は０．４ｍｇ／ｋｇである。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を、動物の症状が改善するまで、注射、又は他の適切な経路によって週１回以上投与し、又は無期限に投与することができる。
【０２０６】
上記薬物療法又は併用療法に対する個々の患者の反応は様々であり、医師は、各患者に適切で効果的な薬物の組合せを決定することができると理解される。
【０２０７】
カニクイザルは、ある疾患の有用なモデルである。例示的な疾患としては、移植拒絶症候群及び炎症性腸疾患様疾患が挙げられるが、これらだけに限定されない。カニクイザルヒト疾患モデルにおいてヒトＭＡｂの効力を試験するときには、ある実施形態においては、抗ＴＲ−２  ＭＡｂが、ヒト及びカニクイザルにおいて、類似したレベルでＴＲ−２に結合するかどうかを判定することは有用である。
【０２０８】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、抗ＴＲ−２抗体の全部又は一部と細胞毒性薬とを含む複合分子の一部であり得る。「細胞毒性薬」という用語は、細胞の機能を阻害若しくは阻止する物質、及び／又は細胞死若しくは細胞の破壊を引き起こす物質を指す。この用語は、放射性同位体（例えば、Ｉ１３１、１１２５、Ｙ９０及びＲｅ１８６）、化学療法薬、及び細菌、真菌、植物若しくは動物起源の酵素的に活性な毒素などの毒素、又はその断片を含むが、これらだけに限定されない。例示的な細胞毒性薬としては、アドリアマイシン、ドキソルビシン、５−フルオロウラシル、シトシンアラビノシド（「Ａｒａ−Ｃ」）、シクロホスファミド、チオテパ、タキソテール（ドセタキセル）、ブスルファン、サイトキサン（Ｃｙｔｏｘｉｎ）、タキソール、メトトレキセート、シスプラチン、メルファラン、ビンブラスチン、ブレオマイシン、エトポシド、イホスファミド、マイトマイシンＣ、ミトキサントロン、ビンクリスチン（Ｖｉｎｃｒｅｉｓｔｉｎｅ）、ビノレルビン、カルボプラチン、テニポシド、ダウノマイシン、カルミノマイシン、アミノプテリン、ダクチノマイシン、マイトマイシン、エスペラミシン、メルファラン、及び他の関係するナイトロジェンマスタードが挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２０９】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、抗ＴＲ−２抗体の全部又は一部とプロドラッグとを含む複合分子の一部であり得る。ある実施形態においては、「プロドラッグ」という用語は、薬剤的に活性な物質の前駆体又は誘導体を指す。ある実施形態においては、プロドラッグは、親薬物よりも細胞傷害性が低く、酵素的に活性化又は転化されて、より活性な細胞傷害性の親薬物になることができる。例示的なプロドラッグとしては、ホスファート含有プロドラッグ、チオホスファート含有プロドラッグ、スルファート含有プロドラッグ、ペプチド含有プロドラッグ、Ｄアミノ酸修飾プロドラッグ、グリコシル化プロドラッグ、ベータラクタム含有プロドラッグ、置換されていてもよいフェノキシアセトアミド含有プロドラッグ、及び置換されていてもよいフェニルアセトアミド含有プロドラッグ、５−フルオロシトシン、並びにより活性な、細胞傷害性のない薬物に転化し得る他の５−フルオロウリジンプロドラッグが挙げられるが、これらだけに限定されない。プロドラッグ体に誘導体化し得る細胞毒の例としては、上記細胞毒性薬が挙げられるが、これらだけに限定されない。例えば、米国特許第６，７０２，７０５号を参照されたい。
【０２１０】
ある実施形態においては、抗体複合体は、分子の細胞傷害性部分又はプロドラッグ部分を、患者における特定の細胞集団に向ける分子の抗体部分を有することによって機能する。抗ＴＲ−２抗体の場合には、かかる複合分子を用いて、例えば、ある実施形態においては、癌細胞などの異常増殖性細胞を破壊することができる。
【０２１１】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体の治療有効量を投与することを含む、患者を治療する方法を提供する。ある実施形態においては、抗体複合物の治療有効量を投与することを含む、患者を治療する方法を提供する。ある実施形態においては、上述したように、抗体を少なくとも１種類の追加の治療薬の治療有効量と併用する。
【０２１２】
上述したように、ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、同じ患者に投与する１種類以上の他の薬物と同時に投与することができる。各薬物は、医薬品に適切な投薬計画に従って投与される。かかる治療は、前治療、同時治療、逐次治療及び交互投薬計画を包含する。かかる薬物の追加の例としては、抗ウイルス剤、抗生物質、鎮痛薬、コルチコステロイド、炎症性サイトカインの拮抗物質、ＤＭＡＲＤ、非ステロイド性抗炎症剤、化学療法学、血管新生阻害剤、及び血管新生刺激物質が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２１３】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を別のアポトーシス刺激物質と組み合わせて、種々の医学的障害を治療する。例えば、ある実施形態においては、１個以上の細胞のアポトーシスを刺激する化合物も含む組成物として、抗ＴＲ−２抗体を投与することができる。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体とアポトーシス刺激物質を別々の組成物として投与することができ、同じ経路又は異なる経路で投与することができる。
【０２１４】
ある実施形態においては、薬剤として許容される希釈剤、担体、可溶化剤、乳化剤、防腐剤及び／又はアジュバントと一緒に抗体の治療有効量を含む、薬剤組成物を提供する。
【０２１５】
ある実施形態においては、薬剤として許容される希釈剤、担体、可溶化剤、乳化剤、防腐剤及び／又はアジュバントと一緒に、抗体の治療有効量、及び少なくとも１種類の追加の治療薬の治療有効量を含む、薬剤組成物を提供する。
【０２１６】
ある実施形態においては、許容される製剤材料は、使用する投与量及び濃度においてレシピエントに好ましくは無毒である。ある実施形態においては、本発明の抗体は、参照により本明細書に組込む２００６年６月８日に出願されたＰＣＴ／ＵＳ０６／２２５９９に開示された、緩衝剤のない処方で提供される。
【０２１７】
ある実施形態においては、薬剤組成物は、組成物の、例えば、ｐＨ、モル浸透圧濃度、粘度、透明性、色、等張性、匂い、無菌性、安定性、溶解若しくは放出速度、吸着又は浸透を改変、維持又は保存する製剤材料を含むことができる。ある実施形態においては、適切な製剤材料としては、（グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、リジンなどの）アミノ酸；抗菌剤；（アスコルビン酸、亜硫酸ナトリウム、亜硫酸水素ナトリウムなどの）抗酸化剤；（ホウ酸塩、炭酸水素塩、Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、クエン酸塩、リン酸塩、他の有機酸などの）緩衝剤；（マンニトール、グリシンなどの）充填剤；（エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）などの）キレート化剤；（カフェイン、ポリビニルピロリドン、ベータシクロデキストリン、ヒドロキシプロピルベータシクロデキストリンなどの）錯化剤；充填剤；単糖；二糖及び（グルコース、マンノース、デキストリンなどの）他の炭水化物；（血清アルブミン、ゼラチン、免疫グロブリンなどの）タンパク質；着色剤、香味剤及び希釈剤；乳化剤；（ポリビニルピロリドンなどの）親水性ポリマー；低分子量ポリペプチド；（ナトリウムなどの）塩形成性対イオン；（塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸、過酸化水素などの）防腐剤；（グリセリン、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなどの）溶媒；（マンニトール、ソルビトール）などの糖アルコール；懸濁剤；（ｐｌｕｒｏｎｉｃ、ＰＥＧ、ソルビタンエステル、ポリソルベート２０、ポリソルベート８０などのポリソルベート、トリトン、トロメタミン、レシチン、コレステロール、チロキサポール（ｔｙｌｏｘａｐａｌ）などの）界面活性剤又は湿潤剤；（スクロース、ソルビトールなどの）安定性増強剤；（ハロゲン化アルカリ金属、好ましくは塩化ナトリウム又は塩化カリウム、マンニトールソルビトールなどの）張性増強剤；送達ビヒクル；希釈剤；賦形剤及び／又は薬剤アジュバントが挙げられるが、これらだけに限定されない。（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，  １８ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，  Ａ．Ｒ．  Ｇｅｎｎａｒｏ，  ｅｄ．，  Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙ（１９９０）。
【０２１８】
ある実施形態においては、抗体及び／又は追加の治療用分子は、当分野で公知の半減期延長ビヒクルと結合している。かかるビヒクルとしては、Ｆｃドメイン、ポリエチレングリコール及びデキストランが挙げられるが、これらだけに限定されない。かかるビヒクルは、例えば、米国特許第６，６６０，８４３号及び国際公開第９９／２５０４４号に記載されている。
【０２１９】
ある実施形態においては、最適な薬剤組成物は、例えば、意図する投与経路、送達形式、及び所望の投与量に応じて、当業者が決定する。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（前掲）を参照されたい。ある実施形態においては、かかる組成物は、抗体の物理的状態、安定性、インビボでの放出速度、及びインビボでのクリアランス速度に影響を及ぼし得る。
【０２２０】
ある実施形態においては、薬剤組成物中の主要なビヒクル又は担体は、本質的に水溶性でも非水溶性でもよい。例えば、ある実施形態においては、適切なビヒクル又は担体は、非経口投与用組成物に共通の他の材料を場合によっては補充した、注射用水、生理食塩水溶液又は人工脳脊髄液であり得る。ある実施形態においては、血清アルブミンと混合された中性緩衝食塩水又は食塩水は、更なる例示的なビヒクルである。ある実施形態においては、薬剤組成物は、ｐＨ約７．０−８．５のＴｒｉｓ緩衝剤、又はｐＨ約４．０−５．５の酢酸緩衝剤を含み、ソルビトール、又は適切な代替品を更に含み得る。ある実施形態においては、薬剤組成物は、ｐＨ約４．０−５．５の酢酸緩衝剤、ポリオール（多価アルコール）を含み、場合によっては界面活性剤を含む、水溶液又は液体製剤である。前記組成物は、塩、例えば塩化ナトリウムを含まず、患者にとって等張性である。例示的なポリオールとしては、スクロース、グルコース、ソルビトール及びマンニトールが挙げられるが、これらだけに限定されない。例示的な界面活性剤としてはポリソルベートが挙げられるが、これだけに限定されない。ある実施形態においては、薬剤組成物は、ｐＨ約５．０の酢酸緩衝剤、ソルビトール及びポリソルベートを含む、水溶液又は液体製剤である。前記組成物は、塩、例えば塩化ナトリウムを含まず、患者にとって等張性である。ある例示的な組成物は、例えば米国特許第６，１７１，５８６号に記載されている。追加の薬剤担体としては、石油、動物油、植物油、落花生油、ダイズ油、鉱油、ゴマ油などを含めた油が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、デキストロース及びグリセリン水溶液も、液体担体、特に注射液用担体として使用することができる。ある実施形態においては、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を含む組成物は、所望の純度を有する選択された組成物を、凍結乾燥ケーキ又は水溶液の形の任意に選択される調合剤（ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ  ａｇｅｎｔ）（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（前掲））と混合することによって、貯蔵用に調製することができる。また、ある実施形態においては、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を含む組成物は、適切な賦形剤溶液（例えば、スクロース）を希釈剤として用いて、凍結乾燥物として処方することができる。
【０２２１】
ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、生理的に許容される担体、賦形剤又は希釈剤と併せて精製組み換えタンパク質を含む生理的に許容される組成物の形で投与される。ある実施形態においては、かかる担体は、使用する投与量及び濃度においてレシピエントに無毒である。ある実施形態においては、かかる組成物の調製は、抗ＴＲ−２抗体と、緩衝剤、アスコルビン酸などの抗酸化剤、（１０個未満のアミノ酸を有するポリペプチドなどの）低分子量ポリペプチド、タンパク質、アミノ酸、グルコース、スクロース、デキストリンなどの炭水化物、ＥＤＴＡなどのキレート化剤、グルタチオン及び／又は他の安定剤並びに賦形剤との混合を含み得る。ある実施形態においては、適切な投与量は、標準投薬試験で決定され、選択した投与経路に応じて変わり得る。ある実施形態においては、適切な工業標準に従って、ベンジルアルコールを含めて、ただしこれだけに限定されない防腐剤を添加することもできる。ある実施形態においては、投与の量及び頻度は、治療する疾患の性質及び重症度、所望の応答、患者の年齢及び症状などの要因に基づいて決定することができる。
【０２２２】
ある実施形態においては、薬剤組成物を非経口送達用に選択することができる。薬剤として許容されるある種のかかる組成物の調製は、当分野の技術範囲内である。
【０２２３】
ある実施形態においては、製剤成分は、投与部位に許容される濃度で存在する。ある実施形態においては、緩衝剤を用いて、組成物を生理的ｐＨ、又はそれよりもやや低いｐＨ、典型的には約５から約８のｐＨ範囲内に維持する。
【０２２４】
ある実施形態においては、非経口投与を企図するときには、治療用組成物は、薬剤として許容されるビヒクル中で、追加の治療薬を含み、又は含まず、所望の抗体を含み、発熱物質を含まない、非経口的に許容される水溶液の形であり得る。ある実施形態においては、非経口注射用ビヒクルは無菌蒸留水であり、その中で、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を、適切に保存される無菌等張液として処方する。ある実施形態においては、調製は、デポー注射によってその後送達され得る生成物の制御放出又は持続放出を与え得る、注射用ミクロスフェア、生侵食性（ｂｉｏ−ｅｒｏｄｉｂｌｅ）粒子、（ポリ乳酸、ポリグリコール酸などの）重合体化合物、ビーズ、リポソームなどの薬剤と一緒に所望の分子を処方することを含み得る。ある実施形態においては、ヒアルロン酸も使用することができる。ヒアルロン酸は、循環中の持続期間を延長する効果を有し得る。ある実施形態においては、移植可能な薬物送達装置を用いて、所望の分子を導入することができる。
【０２２５】
ある実施形態においては、薬剤組成物を吸入用に処方することができる。ある実施形態においては、抗体を、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、吸入用乾燥粉末として処方することができる。ある実施形態においては、抗体を含む吸入溶液を、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、エアゾール送達用噴霧剤と一緒に処方することができる。ある実施形態においては、溶液を噴霧することができる。肺投与は、化学修飾タンパク質の肺送達を記載した国際公開第９４／２００６９号に更に記述されている。
【０２２６】
ある実施形態においては、製剤を経口投与し得ることが企図される。ある実施形態においては、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、このように投与される抗体を、錠剤、カプセル剤などの固体剤形の配合に慣習的に使用される担体と一緒に、又は該担体なしで、処方することができる。ある実施形態においては、カプセル剤は、胃腸管中で、生物学的利用能が最大であり、全身に行きわたる前の分解（ｐｒｅ−ｓｙｓｔｅｍｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ）が最小であるときに、製剤の活性部分を放出するように設計することができる。ある実施形態においては、少なくとも１種類の追加の薬剤を加えて、抗体及び／又は任意の追加の治療薬の吸収を促進させることができる。ある実施形態においては、希釈剤、香味剤、低融点ワックス、植物油、潤滑剤、懸濁剤、錠剤崩壊剤及び／又は結合剤を使用することもできる。
【０２２７】
ある実施形態においては、薬剤組成物は、抗体の有効量を、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、錠剤の製造に適切である無毒の賦形剤との混合物として含み得る。ある実施形態においては、錠剤を滅菌水、又は別の適切なビヒクルに溶解することによって、単位用量剤形の液剤を調製することができる。適切な賦形剤としては、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、炭酸水素ナトリウム、ラクトース、リン酸カルシウムなどの不活性希釈剤、デンプン、ゼラチン、アラビアゴムなどの結合剤、及びステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、タルクなどの潤滑剤が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２２８】
少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を持続又は制御送達製剤中に含む製剤を含めて、更なる薬剤組成物が当業者には明白なはずである。ある例示的な持続又は制御送達製剤としては、リポソーム担体、生侵食性微粒子、多孔質ビーズ及びデポー注射が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある製剤を調製するある例示的な技術は当業者に公知である。例えば、薬剤組成物の送達用多孔質重合体微粒子の制御放出を記載した国際公開第９３／１５７２２号を参照されたい。ある実施形態においては、持続放出製剤は、成形物、例えばフィルム又はマイクロカプセルの形の半透性ポリマーマトリックスを含み得る。持続放出マトリックスとしては、ポリエステル、ヒドロゲル、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号及びＥＰ  ０５８，４８１）、Ｌ−グルタミン酸とガンマエチル−Ｌ−グルタマートのコポリマー（Ｓｉｄｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ，  ２２：５４７−５５６（１９８３））、ポリ（メタクリル酸２−ヒドロキシエチル）（Ｌａｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｂｉｏｍｅｄ．  Ｍａｔｅｒ．  Ｒｅｓ．，  １５：１６７−２７７（１９８１）及びＬａｎｇｅｒ，  Ｃｈｅｍ．  Ｔｅｃｈ．，  １２：９８−１０５（１９８２））、エチレン酢酸ビニール（Ｌａｎｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（前掲））及びポリＤ（−）−３−ヒドロキシ酪酸（ＥＰ  １３３，９８８）が挙げられるが、これらだけに限定されない。ある実施形態においては、持続放出組成物はリポソームも含み得る。リポソームは、ある実施形態においては、当分野で公知の幾つかの方法のいずれかによって調製することができる。例えば、Ｅｐｐｓｔｅｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，  ８２：３６８８−３６９２（１９８５）；ＥＰ  ０３６，６７６；ＥＰ  ０８８，０４６及びＥＰ  １４３，９４９を参照されたい。
【０２２９】
ある実施形態においては、インビボでの投与に使用される薬剤組成物は無菌である。ある実施形態においては、インビボでの投与に使用される薬剤組成物は、無菌ろ過膜を通してろ過することによって、滅菌される。ある実施形態においては、組成物を凍結乾燥する場合、無菌ろ過膜による滅菌を凍結乾燥及び再構成の前又は後に実施することができる。ある実施形態においては、非経口投与組成物を凍結乾燥体又は溶液として保存することができる。ある実施形態においては、非経口組成物は、無菌入出口を有する容器、例えば、皮下注射針によって突き刺すことができる栓の付いた静脈注射溶液の袋又はバイアルに一般に入れられる。
【０２３０】
ある実施形態においては、薬剤組成物は、処方後、無菌バイアル中に溶液、懸濁液、ゲル、乳濁液、固体、脱水粉末又は凍結乾燥粉末として保存することができる。ある実施形態においては、かかる製剤は、すぐに使用できる形で、又は投与前に再構成する形（例えば、凍結乾燥体）で、保存することができる。
【０２３１】
ある実施形態においては、単回投与単位を作製するキットを提供する。ある実施形態においては、各キットは、乾燥タンパク質を含む第１の容器と、水溶液製剤を含む第２の容器とを各々含み得る。ある実施形態においては、単一及び／又は複数の部屋を有する充填済みシリンジ（例えば、液体シリンジ及び溶解シリンジ（ｌｙｏｓｙｒｉｎｇｅ））を含むキットが含まれる。
【０２３２】
ある実施形態においては、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を含む薬剤組成物の治療有効量は、例えば、治療内容及び目的によって決まる。したがって、治療に適切な投与レベルが、ある実施形態によれば、送達される分子、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体が用いられている適応症、投与経路、並びに患者のサイズ（体重、体表又は器官のサイズ）及び／又は状態（年齢及び全般的な健康状態）にある程度依存して変化することを当業者は理解されたい。ある実施形態においては、臨床医は、投与量を力価によって決定し（ｔｉｔｅｒ）、投与経路を変更して、最適な治療効果を得ることができる。ある実施形態においては、典型的な投与量は、上記要因に応じて、約０．１μｇ／ｋｇから約１００ｍｇ／ｋｇ又はそれを超える範囲であり得る。ある実施形態においては、投与量は、０．１μｇ／ｋｇから約１００ｍｇ／ｋｇ、１μｇ／ｋｇから約１００ｍｇ／ｋｇ、５μｇ／ｋｇから約１００ｍｇ／ｋｇ、又は０．１ｍｇ／ｋｇから約１００ｍｇ／ｋｇの範囲であり得る。
【０２３３】
ある実施形態においては、投薬頻度は、使用する製剤中の抗体及び／又は任意の追加の治療薬の薬物動態パラメータを考慮する。ある実施形態においては、臨床医は、所望の効果が得られる投与量に達するまで組成物を投与する。ある実施形態においては、したがって、組成物をある期間にわたって１回若しくは２回以上（等量の所望の分子を含んでも、含まなくてもよい。）投与することができ、又は移植装置若しくはカテーテルを介した連続注入として投与することができる。適切な投与量を更に微調整するある方法は、当分野の技術範囲内である。ある実施形態においては、適切な投与量は、適切な用量反応データを用いることによって確認することができる。
【０２３４】
ある実施形態においては、薬剤組成物の投与経路は、公知の方法に従い、例えば、経口であり、静脈内、腹腔内、脳内（実質内）、脳室内、筋肉内、眼内、動脈内、門脈内又は病巣内の経路による注射によるものであり、持続放出システム又は移植装置によるものである。ある実施形態においては、組成物は、大量瞬時投与によって投与することができ、注入によって連続投与することができ、又は移植装置によって投与することができる。
【０２３５】
上述したように、種々の実施形態においては、任意の効果的な投与経路によって抗ＴＲ−２抗体を投与することができる。注射の場合、ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体を、例えば、関節内、静脈内、筋肉内、病巣内、腹腔内、頭蓋内、鼻腔内、吸入又は皮下経路を介して、大量瞬時投与又は連続注入によって投与することができる。例示的な投与方法としては、植込錠からの持続放出、エアゾール吸入、点眼、丸剤、シロップ剤、舐剤及びチューインガムを含めた経口製剤、ローション剤、ゲル剤、噴霧剤、軟膏剤などの局所用製剤、及び他の適切な技術が挙げられるが、これらだけに限定されない。
【０２３６】
ある実施形態においては、吸入投与は、肺疾患の治療に有利である。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体は、抗ＴＲ−２抗体を発現する培養細胞を移植することによって投与することができる。ある実施形態においては、抗ＴＲ−２抗体をコードする１種類以上のベクターをインビボ又は生体外で移入することによって、患者自身の細胞が、産生するように誘導される。ある実施形態においては、このベクターは、例えば、抗ＴＲ−２抗体をコードする、裸のＤＮＡ、若しくはリポソームに封入されたＤＮＡを注射することによって、又は他の移入方法によって、患者の細胞に導入することができる。抗ＴＲ−２抗体を１種類以上の他の生物活性化合物と組み合わせて投与するときには、ある実施形態においては、これらを同じ若しくは異なる経路によって投与することができ、一緒に、別々に、又は逐次的に投与することができる。
【０２３７】
ある実施形態においては、所望の分子が吸収又は封入された膜、スポンジ又は別の適切な材料を移植することによって、組成物を局所投与することができる。ある実施形態においては、移植装置を使用する場合には、任意の適切な組織又は器官に装置を移植することができ、所望の分子を拡散、徐放性ボーラス又は連続投与によって送達することができる。
【０２３８】
ある実施形態においては、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を含む薬剤組成物を生体外で使用することが望ましい場合がある。かかる実施形態においては、少なくとも１種類の追加の治療薬と一緒に、又は該治療薬なしで、抗体を含む薬剤組成物に、患者から取り出した細胞、組織及び／又は器官を曝露した後、細胞、組織及び／又は器官を患者に戻す。
【０２３９】
ある実施形態においては、本明細書の方法などの方法によって、ポリペプチドを発現し、分泌するように遺伝子操作されたある細胞を移植することによって、抗体及び任意の追加の治療薬を送達することができる。ある実施形態においては、かかる細胞は動物又はヒト細胞であり得、自家、異種（ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ）又は異種（ｘｅｎｏｇｅｎｅｉｃ）であり得る。ある実施形態においては、細胞を不死化し得る。ある実施形態においては、免疫応答の機会を減少させるために、細胞を封入して、周囲組織の浸潤を回避し得る。ある実施形態においては、封入材料は、典型的には、タンパク質産物を放出し得るが、患者の免疫系、又は周囲組織からの他の有害因子による細胞の破壊を防止し得る、生体適合性、半透性重合体の封入物又は膜である。
実施例
【０２４０】
（実施例）
【実施例１】
【０２４１】
あるヒトモノクローナル抗体の生成
ヒト抗ＴＲ−２抗体を２つの方法の１つによって作製した。ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するトランスジェニックマウス（Ｘｅｎｏｍｏｕｓｅ（登録商標））をヒトＴＲ−２に曝露した。あるヒト抗ＴＲ−２モノクローナル抗体をこのマウスからハイブリドーマ技術によって作製した。ある別のヒト抗ＴＲ−２モノクローナル抗体をこのマウスからＸｅｎｏＭａｘ技術によって作製した。ＸｅｎｏＭａｘ技術は、選択リンパ球抗体法（「ＳＬＡＭ」）技術を取り入れている（例えば、米国特許第５，６２７，０５２号及びＢａｂｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ９３：７８４３−７８４８（１９９６）参照）。
【０２４２】
ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するトランスジェニックマウスにおけるヒト抗ＴＲ−２モノクローナル抗体の作製に用いた方法は、以下のとおりである。図１に示すように、５グループのマウスをＣ末端ヘキサヒスチジンタグを有する組み換えヒトＴＲ−２（ＴＲ−２−Ｈｉｓ）（成熟アミノ酸配列
【０２４３】
【化１】
2009505676.tif 000003
（配列番号１４０））（Ｇｅｎｂａｎｋ参照番号ＮＭ−００３８４２）で免役した。グループ１、グループ３、グループ４及びグループ５のマウスを、ＩｇＧ２アイソタイプの抗体を産生するように操作した（図２）。グループ２のマウスをＩｇＧ４アイソタイプの抗体を産生するように操作した（図２）。グループ１は７匹のマウス、グループ２は８匹のマウス、グループ３は８匹のマウス、グループ４は１０匹のマウス、及びグループ５は５匹のマウスを含んだ。ＴＲ−２−Ｈｉｓを足せきに注射（１０μｇ／注射）することによって、グループ１、グループ２及びグループ３のマウスを免疫した。一方、ＴＲ−２−Ｈｉｓを腹腔内注射（１０μｇ／注射）することによって、グループ４及びグループ５のマウスを免疫した。０日目に、抗原１０μｇを記載の経路によって投与した。指定間隔で、追加免疫注射をマウスに投与した。グループ１のマウスには、９回の追加免疫注射を５、１１、１４、１８、２４、２８、３４、４２及び４６日目に行った。グループ２及びグループ３のマウスには、７回の追加免疫注射を、グループ２のマウスには３、７、１０、１４、１７、２４及び２７日目に、グループ３のマウスには５、８、１５、２１、２６、３０及び３３日目に行った。グループ４及びグループ５のマウスには５回の追加免疫注射を１４、２８、４２、５６及び７２日目に行った。最初の注射及び各追加免疫注射は各々、アジュバント、Ｔｉｔｅｒｍａｘ  Ｇｏｌｄ（グループ１、２及び３）、ミョウバンゲル（グループ１、２及び３）、完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）（グループ４及び５）、不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）（グループ４及び５）又はダルベッコリン酸緩衝食塩水（Ｄ−ＰＢＳ）（グループ１、２、３、４及び５）と一緒に、ＴＲ−２−Ｈｉｓ  １０μｇを含んだ（図１参照）。３回の注射（グループ４及び５）、４回の注射（グループ１、２及び３）、６回の注射（グループ１及び２）及び１０回の注射（グループ１）後にマウスから採血した。図２に示すように、ＴＲ−２−Ｈｉｓに対する各血液の反応性をＥＬＩＳＡによって評価した。
【０２４４】
ＥＬＩＳＡアッセイを以下のように実施した。マルチウェルプレートを、受動吸着によって終夜４℃で可溶性ＴＲ−２−Ｈｉｓ（０．５μｇ／ｍＬ）で被覆した。被覆されたウェルを洗浄し、乳で３０分間ブロックした。各マウス血清１０μＬを乳４０μＬと混合し、異なるプレートのウェル中で１時間、１．２５時間又は２時間インキュベートした。プレートを水で５回洗浄した。次いで、プレートをヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ特異的西洋ワサビペルオキシダーゼ複合化抗体（Ｐｉｅｒｃｅ）と一緒に最終濃度１μｇ／ｍＬで室温で１時間インキュベートした。プレートを水で５回洗浄した。プレートをＫ  ｂｌｕｅ  ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（Ｎｅｏｇｅｎ）と一緒に３０分間インキュベートした。負の対照は、ＴＲ−２−Ｈｉｓを欠くブランクのウェル、及びＴＲ−２−Ｈｉｓを含むが、抗ＴＲ−２抗体を欠くと予想される未処置のＧ２血清と一緒にインキュベートしたウェルを含んだ。
【０２４５】
ヒト抗ＴＲ−２モノクローナル抗体の作製に用いた方法は以下のとおりであった。ＸｅｎｏＭａｘ技術の場合、免疫化開始後３７日目（グループ３のマウスＭ７１２−７）又は７６日目（グループ４のマウスＭ５６４−１、並びにグループ５のマウスＭ５６４−３、Ｍ５６４−５及びＭ５６３−５に収集した過免疫トランスジェニックマウスから、ＣＤ１９＋Ｂ細胞を単離した。Ｂ細胞を１週間培養して増殖させて、形質細胞に分化させた。分泌された抗体を含む上清を更なる分析のために保存した。各ウェルの形質細胞を１０％ＤＭＳＯ及び９０％ＦＣＳを含む培地中で−８０℃で凍結させた。ハイブリドーマ技術の場合、図１に示すように、残りの過免疫トランスジェニックマウスから得られた細胞を更なる分析のために３１、３７又は４６日目に収集した。
【０２４６】
ＸｅｎｏＭａｘ技術の場合、Ｂ細胞培養から得られた上清をＴＲ−２に対する抗体の存在についてＥＬＩＳＡによってスクリーニングした。以下のように、抗ヒトＩｇＧ抗体検出試薬を用いて、固定化ＴＲ−２−Ｈｉｓとの結合を評価することによって、抗ＴＲ−２抗体を検出した。プレートを、受動吸着によって終夜４℃で可溶性ＴＲ−２−Ｈｉｓ（０．５μｇ／ｍｌ）で被覆した。プレートを水で５回洗浄し、プレート中のウェルを乳で３０分間ブロックした後、個々のハイブリドーマから得られた細胞培養上清１０μＬを乳４０μＬと混合し、異なるプレートのウェル中で１時間、１．２５時間又は２時間インキュベートした。プレートを水で５回洗浄し、ヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ特異的西洋ワサビペルオキシダーゼ（Ｐｉｅｒｃｅ）複合化抗体と一緒に最終濃度１μｇ／ｍＬで室温で１時間インキュベートした。プレートを水で５回洗浄後、プレートをＫ  ｂｌｕｅ  ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（Ｎｅｏｇｅｎ）と一緒に３０分間インキュベートした。負の対照は、ＴＲ−２−Ｈｉｓを欠くブランクのウェル、及び抗ＴＲ−２抗体を欠くと予想される未処置のＧ２血清を用いたウェルを含んだ。陽性試料をＴＲ−２−Ｈｉｓに対して２回目のＥＬＩＳＡによってスクリーニングして、ＴＲ−２に特異的である抗体を産生する細胞の同一性を確認した。
【０２４７】
上で特定した、ＴＲ−２と反応する抗体を、ＷＭ−２６６黒色腫細胞（ＡＴＣＣ  Ｃａｔ．  Ｎｏ．  ＣＲＬ−１６７６）のアポトーシスを誘発する能力について、アポトーシスアッセイによってスクリーニングした。ＷＭ−２６６細胞をマイクロタイタープレート中で、ＡＴＣＣによって推奨される正常な培地中で、４５００細胞／ウェルの密度で終夜培養した。Ｂ細胞培養の場合、抗原特異的Ｂ細胞培養上清又は対照Ｂ細胞培養上清２０μＬを、アポトーシス培地混合物（１μｇ／ｍＬシクロヘキシミド（ＣＨＸ）及び０．５％ウシ胎児血清（「ＦＣＳ」）を含む細胞培地）１８０μＬに添加した。ＷＭ−２６６細胞からの培地を除去し、抗体−アポトーシス培地混合物を細胞に一度に１列添加した。細胞を抗体−アポトーシス培地と一緒に２０時間インキュベートして、アポトーシスさせた。ＤＮＡ結合性蛍光色素ヨウ化プロピジウム（Ｓｉｇｍａ）及びＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ）をそれぞれ最終濃度０．５μｇ／ｍＬ及び２．５μｇ／ｍＬで各ウェルに添加した。Ｈｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２は膜透過性であり、したがって生細胞及び死細胞を標識する。ヨウ化プロピジウムは膜非透過性であり、したがって死細胞のみを標識する。３７℃で１時間後、各ウェルの画像を取り込み、（Ｈｏｅｃｈｓｔ標識の量を評価することによって）細胞の総数、及び（ヨウ化プロピジウム標識の量を評価することによって）死細胞の総数を分析した。アポトーシス率を（ヨウ化プロピジウム陽性細胞／Ｈｏｅｃｈｓｔ陽性細胞）×１００として求めた。
【０２４８】
ＸｅｎｏＭａｘ技術の場合、最高のアポトーシス誘導を示した幾つかのウェルから得られた抗体を、溶血斑形成法を用いた救出のために選択した。ＴＲ−２−Ｈｉｓをビオチン化し、ストレプトアビジン被覆ヒツジ赤血球上にコートした。抗原特異的ウェルに対応する形質細胞を解凍し、補体及びモルモット抗ヒトＩｇＧ促進血清の存在下で、抗原で被覆された赤血球と一緒にインキュベートした。ＴＲ−２−Ｈｉｓに対する抗体を産生する形質細胞は、その周囲のヒツジ赤血球を溶解し、したがって混合物中の抗原特異的形質細胞を特定することが可能であった。これらの形質細胞を単細胞の顕微操作によって混合物から単離した。
【０２４９】
所望の単一形質細胞を単離後、ｍＲＮＡをこれらの細胞から抽出した。重鎖及び軽鎖の可変配列をコードするｍＲＮＡをｃＤＮＡに転化し、ヒトＩｇＧ２及びヒトカッパｍＲＮＡのリーダー配列及び定常領域に特異的である縮重アンチセンスプライマーを用いて、逆転写酵素ＰＣＲによって増幅した。プライマー配列を下記表２に示す。
【０２５０】
【表２】
2009505676.tif 000004
2009505676.tif 000005
2009505676.tif 000006
【０２５１】
プライマーは、重鎖ｃＤＮＡの５’末端（ＢｇＩＩＩ）及び３’末端（Ｘｂａ１）に以下の制限酵素切断部位を導入した。同様に、プライマーは、カッパ鎖ｃＤＮＡの５’末端（ＢｇＩＩＩ）及び３’末端（ＮｈｅＩ）に以下の制限酵素切断部位を導入した。
【０２５２】
可変重鎖ｃＤＮＡアンプリコンを、ＰＣＲ反応中に付加された制限酵素切断部位に適切な制限酵素で消化した。消化産物を、クローニングに適合したオーバーハングを有するＩｇＧ１、ＩｇＧ２及びＩｇＧ４発現ベクターの各々にクローン化した。ＩｇＧ２及びＩｇＧ４発現ベクターをＢａｍＨＩ及びＸｂａＩで消化して、サブクローニングに適合したオーバーハングを作製した。ＩｇＧ１発現構築体をＢａｍＨＩ及びＮｈｅＩで消化して、サブクローニングに適合したオーバーハングを作製した。ＩｇＧ１、ＩｇＧ２及びＩｇＧ４発現ベクターは、ベクターｐｃＤＮＡ３．１＋／Ｈｙｇｒｏ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）のマルチクローニング部位に、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２又はＩｇＧ４の定常ドメインをクローニングすることによって作製された。
【０２５３】
可変軽鎖ｃＤＮＡアンプリコンも、ＰＣＲ反応中に付加された制限酵素切断部位に適切な制限酵素で消化した。消化産物を、ＢａｍＨＩ及びＮｈｅＩで消化したＩｇＫ発現ベクターにクローン化して、サブクローニングに適合したオーバーハングを得た。ＩｇＫ発現ベクターは、ベクターｐｃＤＮＡ４．１＋／Ｎｅｏ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）のマルチクローニング部位にヒトＩｇＫ遺伝子の定常ドメインをクローニングすることによって作製された。
【０２５４】
次いで、重鎖及び軽鎖の発現ベクターを、７０％コンフルエントなヒト胚性腎２９３細胞（ＡＴＣＣ、Ｃａｔ．  Ｎｏ．  ＣＲＬ−１５７３）の６０ｍｍ皿に同時リポフェクション処理した（ｃｏｌｉｐｏｆｅｃｔ）。２４時間、移入細胞は、元の形質細胞と同じ特異性を有する組み換え抗体を分泌した。上清（３ｍＬ）をＨＥＫ  ２９３細胞から収集し、ヒトＩｇＧを特異的に検出するサンドイッチＥＬＩＳＡによって、完全抗体の分泌が実証された。結合プレートと同様に、対照プレートを２ｍｇ／ｍＬヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｈ＋Ｌ  Ｏ／Ｎで被覆した。プレートを水で５回洗浄した。非希釈リポフェクション上清から得られた７ウェルについて、組み換え抗体を１：２滴定した。プレートをｄＨ２Ｏで５回洗浄した。ヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ特異的ＨＲＰ複合化抗体を、分泌及び２つの結合アッセイのために、最終濃度１μｇ／ｍＬで室温で１時間添加した。プレートをｄＨ２Ｏで５回洗浄した。テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）を３０分間添加してプレートを発色させ、１Ｍリン酸を添加してＥＬＩＳＡを停止した。
【０２５５】
上記ＸｅｎｏＭａｘ法に加えて、ハイブリドーマ技術によってある抗体を得た。免疫したマウスを頚椎脱臼によって屠殺し、流入領域リンパ節を収集し、各同齢集団からプールした。ダルベッコ改変イーグル培地（「ＤＭＥＭ」）中で粉砕して組織から細胞を放出させることによって、リンパ球を解離した。回収した血球をＤＭＥＭに懸濁させた。細胞を数え、リンパ球１億個当たりＤＭＥＭ  ０．９ｍＬを細胞ペレットに添加して、細胞を静かに、しかし完全に再懸濁させた。再懸濁細胞を、細胞１億個当たりＣＤ９０＋磁気ビーズ１００μＬと一緒に４℃で１５分間インキュベートした。（最高１０８個の陽性細胞（又は最高２×１０９個の全細胞）を含む）磁気標識細胞懸濁液をＬＳ＋カラムに充填した。カラムをＤＭＥＭで洗浄した。全流出物をＣＤ９０−陰性画分として収集した。この画分は主にＢ細胞を含むと予想された。
【０２５６】
上で得られた、洗浄した濃縮Ｂ細胞と非分泌性骨髄腫Ｐ３Ｘ６３Ａｇ＊．６５３細胞（ＡＴＣＣ（ＣＲＬ  １５８０、例えば、Ｋｅａｒｎｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １２３，  １９７９，  １５４８−１５５０）参照）とを１：１で混合して融合を実施した。細胞混合物を遠心分離によって８００×ｇで静かにペレット化した。細胞から上清を完全に除去した後、細胞をプロナーゼ溶液（ＣａｌＢｉｏｃｈｅｍ；０．５ｍｇ／ｍｌリン酸緩衝食塩水（「ＰＢＳ」）溶液）２から４ｍｌで２分間以下処理した。ウシ胎児血清（「ＦＢＳ」）３から５ｍＬを添加して酵素活性を停止した。電気細胞融合溶液（「ＥＣＦＳ」）（０．３Ｍスクロース、０．１ｍＭ酢酸マグネシウム、０．１ｍＭ酢酸カルシウム）を用いて、懸濁液を総体積４０ｍＬに調節した。上清を遠心分離によって除去し、細胞をＥＣＦＳ  ４０ｍＬに再懸濁させた。この洗浄ステップを繰り返し、細胞をＥＣＦＳ  ４０ｍＬに濃度２×１０６細胞／ｍＬまで再懸濁させた。
【０２５７】
融合発生機（モデルＥＣＭ２００１、Ｇｅｎｅｔｒｏｎｉｃ，  Ｉｎｃ．）を用いて電気細胞融合を実施した。使用した融合チャンバサイズは２．０ｍＬであった。以下の装置設定：アラインメント条件：５０Ｖ、５０秒；膜破壊３０００Ｖ、３０マイクロ秒；融合後保持時間：３秒を用いた。
【０２５８】
電気細胞融合後、細胞懸濁液を融合チャンバから無菌条件下で慎重に取り出した。Ｌ−グルタミン、ペニシリン／ストレプトマイシン、ＯＰＩ（オキサロ酢酸、ピルビン酸、ウシインスリン）及びＩＬ−６（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ  Ｍａｎｎｈｅｉｍ）を補充した、ＤＭＥＭ、（ＪＲＨ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、１５％ＦＢＳ（Ｈｙｃｌｏｎｅ）を含む、同じ体積のハイブリドーマ培地を含む無菌管に細胞懸濁液を移した。細胞を３７℃で１５から３０分間インキュベートし、次いで４００×ｇ（１０００ｒｐｍ）で５分間遠心分離した。少量のハイブリドーマ選択培地（０．５×ヒアルロン酸を補充したハイブリドーマ培地（Ｓｉｇｍａ））に細胞を静かに再懸濁させた。全５×１０６Ｂ細胞／９６ウェルプレート及び２００μＬ／ウェルの最終プレーティング体積に基づいて、更なるハイブリドーマ選択培地で総体積を適切に調節した。細胞を静かに混合し、ピペットで９６ウェルプレートに移し、増殖させた。７又は１０日目に、培地の１／２を除去し、細胞に新しいハイブリドーマ選択培地を補充した。
【０２５９】
培養１４日後、ハイブリドーマ上清をＴＲ２特異的モノクローナル抗体についてＥＬＩＳＡによってスクリーニングした。一次スクリーニングにおいて、ＥＬＩＳＡプレート（Ｆｉｓｈｅｒ、Ｃａｔ．  Ｎｏ．  １２−５６５−１３６）にＴＲ２タンパク質（２μｇ／ｍＬ）のコーティング緩衝剤（０．１Ｍカルボナート緩衝剤、ｐＨ９．６、ＮａＨＣＯ３  ８．４ｇ／Ｌ）溶液５０μＬ／ウェルを塗布し、次いで４℃で終夜インキュベートした。インキュベーション後、プレートを洗浄緩衝剤（０．０５％Ｔｗｅｅｎ  ２０のＰＢＳ溶液）で１回洗浄した。ブロッキング緩衝剤（０．５％ＢＳＡ、０．１％Ｔｗｅｅｎ  ２０、０．０１％チメロサールの１×ＰＢＳ溶液）２００μＬ／ウェルを添加し、プレートを室温で１時間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを洗浄緩衝剤で１回洗浄した。ハイブリドーマ上清並びに正及び負の対照の一定分量（５０μＬ／ウェル）を添加し、プレートを室温で２時間インキュベートした。全体を通して使用した正の対照は過免疫ＸｅｎｏＭｏｕｓｅ動物由来の血清であり、負の対照はＫＬＨ免疫されたＸｅｎｏＭｏｕｓｅ動物由来の血清であった。インキュベーション後、プレートを洗浄緩衝剤で３回洗浄した。検出抗体ヤギ抗ｈｕＩｇＧＦｃ−ＨＲＰ（Ｃａｌｔａｇ  Ｉｎｃ．，  Ｃａｔ．  Ｎｏ．  Ｈ１０５０７、使用濃度は１：２０００希釈であった。）１００μＬ／ウェルを添加し、プレートを室温で１時間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを洗浄緩衝剤で３回洗浄した。ＴＭＢ（ＢｉｏＦＸ  Ｌａｂ．  Ｃａｔ．  Ｎｏ．  ＴＭＳＫ−０１００−０１）１００μｌ／ウェルを添加し、プレートを約１０分間（負の対照ウェルが辛うじて発色し始めるまで）発色させた。次いで、停止溶液（ＴＭＢ  Ｓｔｏｐ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎ（ＢｉｏＦＸ  Ｌａｂ．  Ｃａｔ．  Ｎｏ．  ＳＴＰＲ−０１００−０１）５０μｌ／ウェルを添加し、ＥＬＩＳＡプレートリーダーによって波長４５０ｎｍでプレートを読み取った。
【０２６０】
ハイブリドーマによって産生された抗体を、上記と同じアポトーシスアッセイによって分析した。ＷＭ−２６６細胞をマイクロタイタープレート中の正常な培地中で、４５００細胞／ウェルの密度で終夜培養した。ＦＣＳを含まず、１．８μｇ／ｍＬシクロヘキシミド及び０．９％ＦＣＳを更に含む細胞培地を用いて、２×アポトーシス培地混合物を調製した。別々のマイクロタイタープレートを用いて、アイソタイプが一致する負の対照抗ＫＬＨ抗体と並行して、（２×アポトーシス培地混合物中の）ハイブリドーマ上清１：２を滴定した。培地をＷＭ−２６６細胞から除去し、抗体−アポトーシス培地混合物１００μＬを各細胞含有ウェルに一度に１列添加した。マイクロタイタープレートを２０時間インキュベートして、アポトーシスを起こした。ＤＮＡ結合性蛍光色素ヨウ化プロピジウム（Ｓｉｇｍａ）及びＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ）をそれぞれ最終濃度０．５μｇ／ｍＬ及び２．５μｇ／ｍＬで各ウェルに添加した。３７℃で１時間後、各ウェルの蛍光画像を取り込み、死細胞（ＰＩ）の総数及び細胞（Ｈｏｅｃｈｓｔ）の総数を分析した。アポトーシス率を（ＰＩ陽性細胞／Ｈｏｅｃｈｓｔ陽性細胞）×１００として求めた。
【０２６１】
ＸｅｎｏＭａｘ又はハイブリドーマ法によって、１７種類の抗ＴＲ−２抗体を得た（抗体Ａ−Ｑ）。抗体全部の配列を決定し、重鎖及び軽鎖の可変領域の配列を特定した（図３−１９参照）。１７種類の抗体の重鎖と軽鎖のアラインメントを図２０及び２１に示す。
【０２６２】
ある抗体を、細胞中でアポトーシスを誘発する能力について、上記と類似したアポトーシスアッセイによって試験した。ＷＭ−２６６黒色腫細胞をマイクロタイタープレート中の正常な培地中で、４５００細胞／ウェルの密度で終夜培養した。別個のマイクロタイタープレートにおいて、抗体の最終濃度が０．０００１μｇ／ｍＬから５μｇ／ｍＬの範囲を網羅するように、試験する組み換え抗体、適切な正の対照（Ｍ４１３、重鎖可変配列：
【０２６３】
【化２】
2009505676.tif 000007
（配列番号１４１）及び軽鎖可変配列：
【０２６４】
【化３】
2009505676.tif 000008
（配列番号１４２）を有するマウスＩｇＧ１抗ＴＲ−２抗体）、及びアイソタイプが一致する負の対照抗体（活性を示さなかった抗ＴＲ２抗体候補）を滴定した。最終濃度０．９μｇ／ｍＬのＣＨＸ及び０．４５％ＦＣＳを含むアポトーシス培地中で各抗体を混合した。培地をＷＭ−２６６細胞から除去し、抗体−アポトーシス培地混合物を細胞に添加した。培養２０時間後、細胞をヨウ化プロピジウム（Ｓｉｇｍａ）及びＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ）で染色した。３７℃で１時間後、各ウェルの画像を取り込み、死細胞（ＰＩ）の総数及び細胞（Ｈｏｅｃｈｓｔ）の総数を分析した。アポトーシス率を（ＰＩ陽性細胞／Ｈｏｅｃｈｓｔ陽性細胞）×１００として求めた。Ｍ４１３、又は上記のある抗ＴＲ−２抗体で処理した細胞では、かなりの細胞死が認められた。
【実施例２】
【０２６５】
ＴＲ−２と結合した抗ＴＲ−２抗体の動力学的分析
抗ＴＲ−２抗体ＡからＱとＴＲ−２の結合の動力学をＢｉａｃｏｒｅ（登録商標）２０００装置によって分析した。高密度ヤギ抗ヒト抗体表面を、ＣＭ−５  Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）チップ上に、定常的なアミンカップリングによって調製した。各精製抗ＴＲ−２抗体を、１００μｇ／ｍｌ  ＢＳＡを含むＨＢＳ−Ｐ泳動緩衝剤によって約１μｇ／ｍｌに希釈した。２分間の接触時間及び５分間の洗浄によって、各抗ＴＲ−２抗体を別々の表面に捕捉して、チップ上の抗ＴＲ−２抗体表面を安定化した。
【０２６６】
個々の抗ＴＲ−２抗体と結合したＴＲ−２の動力学を分析するために、（実施例１の）２２６ｎＭ組み換えヒトＴＲ−２−Ｈｉｓを各抗ＴＲ−２表面全体に（ｋｉｎｊｅｃｔによって）２５℃で１分間動力学的に注射し、続いて５分間の解離期間を置いた。抗ＴＲ−２抗体表面全体にわたる、ＴＲ−２を欠く緩衝剤の注射に起因するベースラインのドリフトを、他の表面の各々で観察された結合から減算した。さらに、抗ＴＲ−２抗体と結合したＴＲ−２のデータを、各表面に捕捉されたモノクローナル抗体の量に対して正規化した。各データセットを１：１相互作用モデルに全体的に適合させて、結合動力学を求めた。各抗体に対して得られたｋａ、ｋｄ及びＫｄ値を表３に示す。
【０２６７】
【表３】
2009505676.tif 000009
＊  これらの試料のデータは不均一であり、１：１モデルとの適合が不十分であった。
【実施例３】
【０２６８】
細胞死滅アッセイ
実施例２に記載したあるヒト抗ＴＲ−２抗体を用いて細胞死滅アッセイを実施して、各抗体がアポトーシス及び細胞死を惹起する程度を求めた。あるヒト抗ＴＲ−２抗体、並びにマウス抗ＴＲ−２抗体Ｍ４１２及びＭ４１３を、９６ウェルのタンパク質Ｇ被覆プレート（ｒｅａｃｔｉｎ−ｂｉｎｄ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｇ  ｃｏａｔｅｄ  ｐｌａｔｅｓ、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃａｔ．  Ｎｏ．  １５１３１）の別々のウェルに固定化した。Ｍ４１２は、重鎖可変配列：
【０２６９】
【化４】
2009505676.tif 000010
（配列番号１４３）及び軽鎖可変配列：
【０２７０】
【化５】
2009505676.tif 000011
（配列番号１４４）を有するマウスＩｇＧ１抗ＴＲ−２抗体である。Ｍ４１３は、実施例１で上述したマウスＩｇＧ１抗ＴＲ−２抗体である。各抗体を濃度５０μｇ／ｍｌで第１のウェルに添加し、７個の追加のウェルの各々に１：３×段階希釈した。各抗体希釈を３つ組で実施した。プレートを、使用前に４℃で２４時間インキュベートした。各ウェルを培地（ＲＰＭＩ＋１０％ＦＢＳ）で洗浄後、４つの異なる細胞株の１つを、密度５０，０００細胞／ウェル、総体積２００μＬで各固定化抗体上に蒔いた。試験した細胞株は、ＣＯＬＯ  ２０５細胞（ヒト結腸腺癌）、ＭＤＡ−２３１細胞（ヒト乳癌）、ＷＭ３５細胞（ヒト黒色腫）及びＷＭ７９３細胞（ヒト黒色腫）であった。細胞を３７℃／６％ＣＯ２で２４時間インキュベートし、続いて３Ｈ−チミジンと一緒に６時間インキュベートした。未処理細胞への３Ｈ−チミジン取り込みレベルに対して、処理細胞における３Ｈ−チミジン取り込みレベルを求めることによって、生細胞の割合を評価した。細胞の生存滴定曲線から、処理細胞の生存度を未処理細胞の５０％に減少させる抗体濃度を求めることによって、各抗体のＥＤ５０を導出した。ＣＯＬＯ  ２０５細胞の場合のヒト抗体のＥＤ５０は、０μｇ／ｍｌから３．２５μｇ／ｍｌであった。ＣＯＬＯ  ２０５細胞の場合のマウス抗体Ｍ４１２及びＭ４１３のＥＤ５０は、それぞれ１．８５μｇ／ｍｌ及び０．０７μｇ／ｍｌであった。ＭＤＡ−２３１細胞の場合のヒト抗体のＥＤ５０は、０．０５μｇ／ｍｌから０．５μｇ／ｍｌであった。ＭＤＡ−２３１細胞の場合のマウス抗体Ｍ４１２及びＭ４１３のＥＤ５０は、それぞれ０．６μｇ／ｍｌ及び０．０７μｇ／ｍｌであった。ＷＭ３５細胞の場合のヒト抗体のＥＤ５０は、０．１μｇ／ｍｌから０．６μｇ／ｍｌであった。ＷＭ３５細胞の場合のマウス抗体Ｍ４１２及びＭ４１３のＥＤ５０は、それぞれ１．８５μｇ／ｍｌ及び０．０７μｇ／ｍｌであった。ＷＭ７９３細胞の場合のヒト抗体のＥＤ５０は、０．０２μｇ／ｍｌから０．２μｇ／ｍｌであった。ＷＭ７９３細胞の場合のマウス抗体Ｍ４１２及びＭ４１３のＥＤ５０は、それぞれ１．８５μｇ／ｍｌ及び０．０５μｇ／ｍｌであった。
【実施例４】
【０２７１】
腫よう細胞株におけるヒトＴＲ−２発現
ヒト腫よう細胞株をＴＲ−２の発現についてスクリーニングした。使用した細胞株は、乳癌、中枢神経系腫よう、結腸癌、肝臓癌、肺癌、頚部癌、子宮癌、卵巣癌、すい臓癌、前立腺癌及び腎癌、白血病及び黒色腫由来の細胞などであった。
【０２７２】
ヒト腫よう細胞上のＴＲ−２の発現を細胞アレイによって求めた。手短に述べると、１００  ＭＩ  ＣＢＡ緩衝剤（ＰＢＳ、３％ＦＢＳ、０．０２％アジド）中の４×１０５個の細胞を、２０枚のＶ底９６ウェルプレートのウェルの各々に分配した。ＣＢＡ緩衝剤（１５０μＬ）を各ウェルに添加し、プレートを遠心分離にかけて細胞を沈降させた。培地を廃棄し、１０μｇ／ｍｌの抗体溶液（抗体ＡからＱの１種類）１００μＬを、２％ＰＢＳを含むＰＢＳ（「アッセイ緩衝剤」）に再懸濁させた細胞ペレットに添加した。氷上で２５分間インキュベーション後、細胞をアッセイ緩衝剤で１回洗浄した。二次ヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ特異的西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ、Ｐｉｅｒｃｅ）１００μＬをウェルに添加し、プレートを氷上で２０分間インキュベートした。プレートをアッセイ緩衝剤で２回洗浄し、ＴＭＢ基質（ＺＹＭＥＤ）１００μＬを室温で１０分間添加した。プレートを遠心分離にかけ、停止溶液（ＢｉｏＦＸ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）５０μＬを含む清浄なプレートに各上清５０μＬを移した。光学濃度をＳｐｅｃｔｒａＭａｘ／ｐｌｕｓリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）によって４５０ｎｍで読んだ。アイソタイプ対照抗体から得られた光学濃度値を減算して、データを正規化した。
【０２７３】
乳癌細胞株ＨＳ  ５７８．Ｔ（ＯＤ  ０．１２２）及びＴ−４７Ｄ（ＯＤ  ０．１１２）、結腸癌細胞株ＴＥ  ６７１（ｕ）（ＯＤ  ０．１０９）、ＨＴ−２９（ＯＤ  ０．１９３）、ＳＷ−９４８（ＯＤ  ０．１２２）、ＫＭ−１２（ＯＤ  ０．３５４）及びＨＣＣ−２９９８（ＯＤ  ０．１３３）、肝臓癌細胞株ＮＣＩ−Ｎ８７（ＯＤ  ０．１５４）及びＮＣＩ−ＳＮＵ−５（ＯＤ  ０．１３７）、白血病細胞株ＨＬ−６０（ＯＤ  ０．２３３）及びｈＰＢＭＣ（ＯＤ  ０．１３１）、非小細胞肺癌細胞株ＪＹ（ＯＤ  ０．１１８）、ＣＣＲＦ−ＣＥＭ（ＯＤ  ０．１０６）、ＮＣＩ−Ｈ２１２６（ＯＤ  ０．１０８）及びＮＣＩ−Ｈ４６０（ＯＤ  ０．１２２）、黒色腫細胞株ＳＫ−ｍｅｌ−５（ＯＤ  ０．１３１）、ＬＯＸ  ＩＭＶＩ（ＯＤ  ０．１０２）、ＲＰＭＩ  ７９５１（ＯＤ  ０．１０１）及びＵＡＣＣ−６２（ＯＤ  ０．１２７）、すい臓癌細胞株ＨＰＡＦ  ＩＩ（ＯＤ  ０．１１７）及びＣＡＰＡＮ−１（ＯＤ  ０．１０１）、前立腺癌細胞株ＬＮＣａＰ（ＯＤ  ０．１７４）、並びに腎癌細胞株Ｃａｋｉ−１（ＯＤ  ０．１４８）及びＵＯ−３１（ＯＤ  ０．１０４）を含めて、幾つかの細胞株が、アッセイにおいて０．１を超えるＯＤ４５０を示した。試験した腫よう細胞株のうちＴＲ−２の最大発現は、結腸癌細胞株ＫＭ−１２及びＨＴ−２９並びに白血病細胞株ＨＬ−６０で見られた。試験した中枢神経系、小細胞肝臓、頚部、子宮又は卵巣癌細胞株は、バックグラウンドよりも大きいＯＤ４５０を示した。
【０２７４】
ヒト腫よう細胞株に対するＴＲ−２発現プロファイルを求めるために、上記ヒト腫よう細胞株をマウス抗ＴＲ−２抗体Ｍ４１２を用いて評価した。ヒト腫よう細胞上のＴＲ−２の発現を細胞アレイによって求めた。手短に述べると、１００  ＭＩ  ＣＢＡ緩衝剤（ＰＢＳ、３％ＦＢＳ、０．０２％アジド）中の４×１０５個の細胞を、２０枚のＶ底９６ウェルプレートのウェルの各々に分配した。ＣＢＡ緩衝剤（１５０μＬ）を各ウェルに添加し、プレートを遠心分離にかけて細胞を沈降させた。培地を廃棄し、１０μｇ／ｍｌのマウス抗ＴＲ−２モノクローナル抗体Ｍ４１２  １００μＬを、２％ＰＢＳを含むＰＢＳ（「アッセイ緩衝剤」）に再懸濁させた細胞ペレットに添加した。氷上で２５分間インキュベーション後、細胞をアッセイ緩衝剤で１回洗浄した。二次ヤギ抗マウスＩｇＧ  Ｆｃ特異的西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ、Ｐｉｅｒｃｅ）１００μＬをウェルに添加し、プレートを氷上で２０分間インキュベートした。プレートをアッセイ緩衝剤で２回洗浄し、ＴＭＢ基質（ＺＹＭＥＤ）１００μＬを室温で１０分間添加した。プレートを遠心分離にかけ、停止溶液（ＢｉｏＦＸ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）５０μＬを含む清浄なプレートに各上清５０μＬを移した。光学濃度をＳｐｅｃｔｒａＭａｘ／ｐｌｕｓリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）によって４５０ｎｍで読んだ。アイソタイプ対照抗体から得られた光学濃度値を減算して、データを正規化した。
【０２７５】
細胞株の多くがＴＲ−２を発現した。（ＯＤ４５０ｎｍが０．３を超える）最も高い発現細胞株は、乳癌細胞株ＨＳ  ５７８．Ｔ（ＯＤ  ０．４０３）、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１（ＯＤ  ０．４０８）及びＴ−４７Ｄ（ＯＤ  ０．３６６）、ＣＮＳ癌細胞株ＳＦ−２９５（ＯＤ  ０．３５４）及びＵ２５１（ＯＤ  ０．３２３）、結腸癌細胞株ＨＣＴ−１１６（ＯＤ  ０．４１）、ＨＴ−２９（ＯＤ  ０．８６９）、ＳＷ−７０７（ＯＤ  ０．３２３）、ＳＷ−９４８（ＯＤ  ０．４２３）、ＫＭ−１２（ＯＤ  ０．７７）及びＨＣＣ−２９９８（ＯＤ  ０．６３５）、肝臓癌細胞株ＮＣＩ−ＳＮＵ−１（ＯＤ  ０．３５４）、白血病細胞株Ａ  ６７３（ＯＤ  ０．３４７）、非小細胞肺癌細胞株ＨＯＰ−６２（ＯＤ  ０．３１３）、ＨＯＰ−６２（ＯＤ  ０．４７）、ＮＣＩ−Ｈ２１２６（ＯＤ  ０．５０１）、ＮＣＩ−Ｈ４６０（ＯＤ  ０．３２６）、小細胞肺癌系Ａ５４９（ＯＤ  ０．３８１）、黒色腫細胞株ＬＯＸ  ＩＭＶＩ（ＯＤ  ０．５７３）、ＲＰＭＩ  ７９５１（ＯＤ  ０．３２２）及びＵＡＣＣ−６２（ＯＤ  ０．３１９）、卵巣癌細胞株ＩＧＲＯＶ１（ＯＤ  ０．３１２）、前立腺癌細胞株ＤＵ  １４５（ＯＤ  ０．３７２）、２２Ｒｖ１（ＯＤ  ０．３０１）及びＬＮＣａＰ（ＯＤ  ０．６３）並びに腎癌細胞株Ｃａｋｉ−１（ＯＤ  ０．９３）、Ｃａｋｉ−２（ＯＤ  ０．４４３）、ＳＮ１２Ｃ（ＯＤ  ０．３１３）、ＵＯ−３１（ＯＤ  ０．３３１）などであった。マウス抗ＴＲ−２抗体で処理した腫よう細胞株のうちＴＲ−２の最大発現は、腎癌細胞株Ｃａｋｉ−１並びに結腸癌細胞株ＨＴ−２９及びＫＭ−１２で見られた。
【実施例５】
【０２７６】
抗体交差反応性
他の抗体とＴＲ−２の結合を阻止する、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体の能力を、Ｊｉａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２８８：９１−９８（２００４）のとおりに評価した。Ｌｕｍｉｎｅｘ  １００  Ｕｓｅｒ’ｓ  Ｍａｎｕａｌ、Ｖｅｒｓｉｏｎ  １．７から直接採用したカップリング手順によって、ビーズを抗ヒトＩｇＧ抗体と複合化した。ビーズを活性化した後、製造者の指示に従って、ビーズをＰｈａｒｍｉｎｇｅｎマウス抗ｈＩｇＧ  ｍＡｂと結合させた。２通りの実験を実施した。第１の実験では、被覆ビーズを室温で２時間インキュベートした。第２の実験では、被覆ビーズを４℃で終夜インキュベートした。インキュベーションの最後に、被覆ビーズをブロックし、次いでＣｏｕｌｔｅｒ細胞カウンターによって数えた。複合化ビーズは、すぐに使用するか、又はその後使用するまで４℃で暗所に保存した。
【０２７７】
エピトープの交差反応性に基づく抗ＴＲ−２抗体の分類を以下の段階で実施した。まず、上で得られたビーズ−マウス抗ｈＩｇＧ複合体の各セットを別々に基準抗体（「基準抗体」）と一緒に、回転板上で終夜４℃でインキュベートした。基準抗体を上記抗ＴＲ−２抗体Ａ−Ｑから選択した。抗体捕捉後、各ビーズ−マウス抗ｈＩｇＧ−基準Ａｂ複合体２０００を１つの管に一緒にプールし、次いで９６ウェルプレートの各ウェルにすぐに添加し、吸引した。ＴＲ−２（５０ｎｇ）を各ウェルに添加し、室温で１時間インキュベートした。ウェルを洗浄後、別のヒト抗ＴＲ−２抗体（「プローブ抗体」）１００−５００ｎｇ／ｍＬを各ウェルに添加し、室温で２時間インキュベートした。ウェルを洗浄後、結合したプローブ抗体を、基準抗体の捕捉に用いた同じモノクローナルマウス抗ｈＩｇＧのビオチン化体１μｇ／ｍｌを用いて検出した。ウェルのインキュベーション及び洗浄後、ストレプトアビジン−フィコエリトリン０．５μｇ／ｍｌを添加した。混合物を室温で３０分間インキュベートし、次いでフィコエリトリンシグナルをＬｕｍｉｎｅｘ  １００を用いて検出した。抗原を欠く追加のウェルセットを負の対照として用いて、データ分析を支援した。
【０２７８】
データを二段階プロセスで分析した。第１に、負の対照値を用いてデータを正規化した。第２に、１種類以上の他の抗ＴＲ−２抗体の結合を妨害する能力に従って、抗ＴＲ−２抗体をクラスター分けした。クラスター分析（ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ  ａｎａｌｙｓｉｓ）では、相違マトリックスを正規化強度マトリックスから作成した。ＳＰＬＵＳ  ２０００集積入れ子階層型クラスタリングサブルーチン（ａｇｇｌｏｍｅｒａｔｉｖｅ  ｎｅｓｔｉｎｇ  ｈｉｅｒａｒｃｈｉｃａｌ  ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ  ｓｕｂｒｏｕｔｉｎｅ）とマンハッタン計量を用い、実際の平均相違マトリックスの入力相違マトリックスを用いて、平均相違マトリックスにおける値に基づいて、抗体をクラスター分けした。
【０２７９】
これらの知見に基づいて、抗体を４つの異なるエピトープグループに分けた。いずれの１グループ内でも、グループメンバーの１つとＴＲ−２の結合は、同じグループの別のメンバーとＴＲ−２の結合を阻止する。しかし、例えば、グループ１のメンバーの１つとＴＲ−２の結合は、グループ２、３又は４のメンバーの１つとＴＲ−２の結合を阻止しない。これらのグループを図２２に示す。
【実施例６】
【０２８０】
エピトープマッピング
記載したある抗ＴＲ−２抗体との結合に重要であるＴＲ−２の特定の領域を特定するために、エピトープマッピング試験を実施した。テンプレート源から成熟ＴＲ−２のコード配列（ＭａｃＦａｒｌａｎｅ、１９９７）をＰＣＲ増幅し、ＨｉｎｄＩＩＩ部位に挿入されると、ＴＲ−２配列がアビジン配列のＣ末端に結合するように配向したニワトリアビジン配列を含むｐＣＥＰ４ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）にそれをクローニングすることによって、Ｎ−アビジン−ＴＲ−２構築体を作製した。成熟ＴＲ−２コード配列の順方向プライマーは、
【０２８１】
【化６】
2009505676.tif 000012
（配列番号１４５）であり、逆方向プライマーは、
【０２８２】
【化７】
2009505676.tif 000013
（配列番号１４６）であった。生成したアビジン−ＴＲ−２融合タンパク質のアミノ酸配列は、
【０２８３】
【化８】
2009505676.tif 000014
（配列番号６９）であった。
【０２８４】
Ｎ−アビジンを含む１２種類の分子、及びヒトＴＲ−２の切断型を以下に示すように合成した。３種類の分子は、ヒトＴＲ−２のＣ末端のみが切り詰められ（ＴＲ−２−１からＴＲ−２−３）、９種類の分子は、ヒトＴＲ−２のＮ末端とＣ末端の両方が切り詰められた（ＴＲ−２−４からＴＲ−２−１３）（図２３に模式的に示す。）。ヒトＴＲ−２切断型をコードするポリヌクレオチドを、下記プライマーを用いたＰＣＲ増幅によって調製した。１２種類の分子の各々を形成するために、増幅によって得られた切断型ヒトＴＲ−２を、上記ニワトリアビジン配列を含むｐＣＥＰ４ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）に挿入した。成熟ＴＲ−２のアミノ酸１−４３をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０２８５】
【化９】
2009505676.tif 000015
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０２８６】
【化１０】
2009505676.tif 000016
（配列番号１４７）を用いて増幅した。ＴＲ−２−１のアミノ酸配列は、
【０２８７】
【化１１】
2009505676.tif 000017
（配列番号７０）であった。
【０２８８】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１−８５をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０２８９】
【化１２】
2009505676.tif 000018
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０２９０】
【化１３】
2009505676.tif 000019
（配列番号１４８）を用いて増幅した。ＴＲ−２−２のアミノ酸配列は、
【０２９１】
【化１４】
2009505676.tif 000020
（配列番号７１）であった。
【０２９２】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１−１２６をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０２９３】
【化１５】
2009505676.tif 000021
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０２９４】
【化１６】
2009505676.tif 000022
（配列番号１４９）を用いて増幅した。ＴＲ−２−３のアミノ酸配列は、
【０２９５】
【化１７】
2009505676.tif 000023
（配列番号７２）であった。
【０２９６】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１６−４３をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０２９７】
【化１８】
2009505676.tif 000024
（配列番号１５０）及び逆方向プライマー
【０２９８】
【化１９】
2009505676.tif 000025
（配列番号１４７）を用いて増幅した。ＴＲ−２−４のアミノ酸配列は、
【０２９９】
【化２０】
2009505676.tif 000026
（配列番号７３）であった。
【０３００】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１６−８５をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３０１】
【化２１】
2009505676.tif 000027
（配列番号１５０）及び逆方向プライマー
【０３０２】
【化２２】
2009505676.tif 000028
（配列番号１４８）を用いて増幅した。ＴＲ−２−５のアミノ酸配列は、
【０３０３】
【化２３】
2009505676.tif 000029
（配列番号７４）であった。
【０３０４】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１６−１２６をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３０５】
【化２４】
2009505676.tif 000030
（配列番号１５０）及び逆方向プライマー
【０３０６】
【化２５】
2009505676.tif 000031
（配列番号１４９）を用いて増幅した。ＴＲ−２−６のアミノ酸配列は、
【０３０７】
【化２６】
2009505676.tif 000032
（配列番号７５）であった。
【０３０８】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸４２−８５をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３０９】
【化２７】
2009505676.tif 000033
（配列番号１５１）及び逆方向プライマー
【０３１０】
【化２８】
2009505676.tif 000034
（配列番号１４８）を用いて増幅した。ＴＲ−２−７のアミノ酸配列は、
【０３１１】
【化２９】
2009505676.tif 000035
（配列番号７６）であった。
【０３１２】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸４２−１２６をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３１３】
【化３０】
2009505676.tif 000036
（配列番号１５１）及び逆方向プライマー
【０３１４】
【化３１】
2009505676.tif 000037
（配列番号１４９）を用いて増幅した。ＴＲ−２−９のアミノ酸配列は、
【０３１５】
【化３２】
2009505676.tif 000038
（配列番号７７）であった。
【０３１６】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸８５−１５４をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３１７】
【化３３】
2009505676.tif 000039
（配列番号１５２）及び逆方向プライマー
【０３１８】
【化３４】
2009505676.tif 000040
（配列番号１４６）を用いて増幅した。ＴＲ−２−１０のアミノ酸配列は、
【０３１９】
【化３５】
2009505676.tif 000041
（配列番号７８）であった。
【０３２０】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸４２−１５４をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３２１】
【化３６】
2009505676.tif 000042
（配列番号１５１）及び逆方向プライマー
【０３２２】
【化３７】
2009505676.tif 000043
（配列番号１４６）を用いて増幅した。ＴＲ−２−１１のアミノ酸配列は、
【０３２３】
【化３８】
2009505676.tif 000044
（配列番号７９）であった。
【０３２４】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１６−６６をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３２５】
【化３９】
2009505676.tif 000045
（配列番号１５０）及び逆方向プライマー
【０３２６】
【化４０】
2009505676.tif 000046
（配列番号１５３）を用いて増幅した。ＴＲ−２−１２のアミノ酸配列は、
【０３２７】
【化４１】
2009505676.tif 000047
（配列番号８０）であった。
【０３２８】
成熟ＴＲ−２のアミノ酸１６−７４をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３２９】
【化４２】
2009505676.tif 000048
（配列番号１５０）及び逆方向プライマー
【０３３０】
【化４３】
2009505676.tif 000049
（配列番号１５４）を用いて増幅した。ＴＲ−２−１３のアミノ酸配列は、
【０３３１】
【化４４】
2009505676.tif 000050
（配列番号８１）であった。Ｎ−アビジンを含む４種類の分子、及びカニクイザル由来のＴＲ−２の切断型を以下に示すように合成した。成熟ｃｙｎｏＴＲ−２のアミノ酸１から１３２をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３３２】
【化４５】
2009505676.tif 000051
（配列番号１５５）及び逆方向プライマー
【０３３３】
【化４６】
2009505676.tif 000052
（配列番号１５６）を用いて増幅した。ｃｙｎｏＴＲ−２（短鎖）のアミノ酸配列は、
【０３３４】
【化４７】
2009505676.tif 000053
（配列番号８２）であった。
【０３３５】
成熟ｃｙｎｏＴＲ−２のアミノ酸１から１５４をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３３６】
【化４８】
2009505676.tif 000054
（配列番号１５５）及び逆方向プライマー
【０３３７】
【化４９】
2009505676.tif 000055
（配列番号１５７）を用いて増幅した。ｃｙｎｏＴＲ−２（長鎖）のアミノ酸配列は、
【０３３８】
【化５０】
2009505676.tif 000056
（配列番号８３）であった。
【０３３９】
成熟ｃｙｎｏＴＲ−２のアミノ酸１から８５をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３４０】
【化５１】
2009505676.tif 000057
（配列番号１５５）及び逆方向プライマー
【０３４１】
【化５２】
2009505676.tif 000058
（配列番号１５８）を用いて増幅した。ｃｙｎｏ  １−８５のアミノ酸配列は、
【０３４２】
【化５３】
2009505676.tif 000059
（配列番号８４）であった。
【０３４３】
成熟ｃｙｎｏＴＲ−２のアミノ酸１６から８５をコードするポリヌクレオチドを、順方向プライマー
【０３４４】
【化５４】
2009505676.tif 000060
（配列番号１５９）及び逆方向プライマー
【０３４５】
【化５５】
2009505676.tif 000061
（配列番号１５８）を用いて増幅した。ｃｙｎｏ  １６−８５のアミノ酸配列は、
【０３４６】
【化５６】
2009505676.tif 000062
（配列番号８５）であった。
【０３４７】
図２５に示すように、４種類のＮ−アビジン融合キメラもヒトＴＲ−２及びｃｙｎｏ  ＴＲ−２の異なる部分を用いて作製した。重複末端を有する２種類のＰＣＲ産物を調製し、次いで同じ５’及び３’プライマーを用いて一緒に増幅することによって、各キメラを構築した。キメラの各々を形成するために、次いで、増幅されたポリヌクレオチドを、上記ニワトリアビジン配列を含むｐＣＥＰ４ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）にサブクローニングした。ヒト、ｃｙｎｏ（短鎖）及びマウスＴＲ−２配列のアラインメントを図２６に示す。
【０３４８】
アミノ酸１−１６に対応する成熟ｃｙｎｏ  ＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３４９】
【化５７】
2009505676.tif 000063
（配列番号１５５）及び逆方向プライマー
【０３５０】
【化５８】
2009505676.tif 000064
（配列番号１５９）を用いて増幅し、アミノ酸１７−８５に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３５１】
【化５９】
2009505676.tif 000065
（配列番号１６０）及び逆方向プライマー
【０３５２】
【化６０】
2009505676.tif 000066
（配列番号１４８）を用いて増幅することによって、Ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃１を調製した。ｃｙｎｏとヒトＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ｃｙｎｏ  ＴＲ−２アミノ酸１−１６断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１５５）及びヒトＴＲ−２アミノ酸１７−８５断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１４８）を用いて実施した。ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃１のアミノ酸配列は
【０３５３】
【化６１】
2009505676.tif 000067
（配列番号８６）であった。
【０３５４】
アミノ酸１−１６に対応する成熟ｃｙｎｏ  ＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３５５】
【化６２】
2009505676.tif 000068
（配列番号１５５）及び逆方向プライマー
【０３５６】
【化６３】
2009505676.tif 000069
（配列番号１５９）を用いて増幅し、アミノ酸１７−１５４に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３５７】
【化６４】
2009505676.tif 000070
（配列番号１６０）及び逆方向プライマー
【０３５８】
【化６５】
2009505676.tif 000071
（配列番号１４６）を用いて増幅することによって、Ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃２を調製した。ｃｙｎｏとヒトＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ｃｙｎｏ  ＴＲ−２アミノ酸１−１６断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１５５）及びヒトＴＲ−２アミノ酸１７−１５４断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１４６）を用いて実施した。ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃２のアミノ酸配列は
【０３５９】
【化６６】
2009505676.tif 000072
（配列番号８７）であった。
【０３６０】
アミノ酸１−１６に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３６１】
【化６７】
2009505676.tif 000073
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０３６２】
【化６８】
2009505676.tif 000074
（配列番号１６１）を用いて増幅し、アミノ酸１７−８５に対応する成熟ｃｙｎｏ  ＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３６３】
【化６９】
2009505676.tif 000075
（配列番号１６２）及び逆方向プライマー
【０３６４】
【化７０】
2009505676.tif 000076
（配列番号１５８）を用いて増幅することによって、Ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃３を調製した。ｃｙｎｏとヒトＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ヒトＴＲ−２アミノ酸１−１６断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１４５）及びｃｙｎｏ  ＴＲ−２アミノ酸１７−８５断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１５８）を用いて実施した。ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃３のアミノ酸配列は
【０３６５】
【化７１】
2009505676.tif 000077
（配列番号８８）であった。
【０３６６】
アミノ酸１−１６に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３６７】
【化７２】
2009505676.tif 000078
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０３６８】
【化７３】
2009505676.tif 000079
（配列番号１６１）を用いて増幅し、アミノ酸１７−１５４に対応する成熟ｃｙｎｏ  ＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３６９】
【化７４】
2009505676.tif 000080
（配列番号１６２）及び逆方向プライマー
【０３７０】
【化７５】
2009505676.tif 000081
（配列番号１５７）を用いて増幅することによって、Ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃４を調製した。ｃｙｎｏとヒトＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ヒトＴＲ−２アミノ酸１−１６断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１４５）及びｃｙｎｏ  ＴＲ−２アミノ酸１７−１５４断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１５７）を用いて実施した。ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃４のアミノ酸配列は
【０３７１】
【化７６】
2009505676.tif 000082
（配列番号８９）であった。４種類の追加の修飾ＴＲ−２タンパク質を、Ｎ−アビジン融合において、ヒトＴＲ−２の短鎖領域を対応するマウスＴＲ−２配列で置換することによって構築した。ヒト／マウスＴＲ−２＃１は、アミノ酸１−２２からのマウスＴＲ−２配列、及びアミノ酸２３−１５０からのヒトＴＲ−２配列を含んだ。ヒト／マウスＴＲ−２＃２は、アミノ酸１−２８及び３５−１５０からのヒトＴＲ−２配列、及びアミノ酸２９−３４からのマウスＴＲ−２配列を含んだ。ヒト／マウスＴＲ−２＃３は、アミノ酸１−５３及び６０−１５０からのヒトＴＲ−２配列、及びアミノ酸５４−５９からのマウスＴＲ−２配列を含んだ。ヒト／マウスＴＲ−２＃４は、アミノ酸１−６６及び７６−１５０からのヒトＴＲ−２配列、及びアミノ酸６７−７５からのマウスＴＲ−２配列を含んだ。修飾タンパク質の各々を形成するために、次いで、増幅されたポリヌクレオチドを、上記ニワトリアビジン配列を含むｐＣＥＰ４ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）にサブクローニングした。
【０３７２】
アミノ酸２３−１５０に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３７３】
【化７７】
2009505676.tif 000083
（配列番号１６３）及び逆方向プライマー
【０３７４】
【化７８】
2009505676.tif 000084
（配列番号１６４）を用いて増幅し、アミノ酸１−２２に対応する成熟マウスＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３７５】
【化７９】
2009505676.tif 000085
（配列番号１６５）及び逆方向プライマー
【０３７６】
【化８０】
2009505676.tif 000086
（配列番号１６６）を用いて増幅することによって、ヒト／マウスＴＲ−２＃１を調製した。ヒトとマウスＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、マウスＴＲ−２アミノ酸１−２２断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１６５）及びヒトＴＲ−２アミノ酸２３−１５０断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１６４）を用いて実施した。ヒト／マウスＴＲ−２＃１のアミノ酸配列は
【０３７７】
【化８１】
2009505676.tif 000087
（配列番号９０）であった。
【０３７８】
アミノ酸１−２８に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３７９】
【化８２】
2009505676.tif 000088
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０３８０】
【化８３】
2009505676.tif 000089
（配列番号１６７）を用いて増幅し、アミノ酸３５−１５０に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３８１】
【化８４】
2009505676.tif 000090
（配列番号１６８）及び逆方向プライマー
【０３８２】
【化８５】
2009505676.tif 000091
（配列番号１６４）を用いて増幅し、アミノ酸２９−３４に対応する成熟マウスＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３８３】
【化８６】
2009505676.tif 000092
（配列番号１６９）及び逆方向プライマー
【０３８４】
【化８７】
2009505676.tif 000093
（配列番号１７０）を用いて増幅して、ヒト／マウスＴＲ−２＃２を調製した。ヒトとマウスＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ヒトＴＲ−２アミノ酸１−２８断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１４５）及びヒトＴＲ−２アミノ酸３５−１５０断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１７０）を用いて実施した。ヒト／マウスＴＲ−２＃２のアミノ酸配列は
【０３８５】
【化８８】
2009505676.tif 000094
（配列番号９１）であった。
【０３８６】
アミノ酸１−５３に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３８７】
【化８９】
2009505676.tif 000095
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０３８８】
【化９０】
2009505676.tif 000096
（配列番号１７１）を用いて増幅し、アミノ酸６０−１５４に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３８９】
【化９１】
2009505676.tif 000097
（配列番号１７２）及び逆方向プライマー
【０３９０】
【化９２】
2009505676.tif 000098
（配列番号１７３）を用いて増幅することによって、ヒト／マウスＴＲ−２＃３を調製した。上記プライマーは、アミノ酸５４−５９に対応するマウスＴＲ−２をコードするヌクレオチドを含む。ヒトとマウスＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ヒトＴＲ−２アミノ酸１−５３断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１４５）及びヒトＴＲ−２アミノ酸６０−１５４断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１７３）を用いて実施した。ヒト／マウスＴＲ−２＃３のアミノ酸配列は
【０３９１】
【化９３】
2009505676.tif 000099
（配列番号９２）であった。
【０３９２】
アミノ酸１−６６に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３９３】
【化９４】
2009505676.tif 000100
（配列番号１４５）及び逆方向プライマー
【０３９４】
【化９５】
2009505676.tif 000101
（配列番号１７４）を用いて増幅し、アミノ酸７６−１５４に対応する成熟ヒトＴＲ−２の領域を順方向プライマー
【０３９５】
【化９６】
2009505676.tif 000102
（配列番号１７５）及び逆方向プライマー
【０３９６】
【化９７】
2009505676.tif 000103
（配列番号１７６）を用いて増幅することによって、ヒト／マウスキメラ＃４を調製した。上記プライマーは、アミノ酸６７−７５に対応するマウスＴＲ−２をコードするヌクレオチドを含む。ヒトとマウスＴＲ−２断片の重複ＰＣＲを、ヒトＴＲ−２アミノ酸１−６６断片に対する順方向プライマー、上記（配列番号１４５）及びヒトＴＲ−２アミノ酸７６−１５４断片に対する逆方向プライマー、上記（配列番号１７６）を用いて実施した。ヒト／マウスＴＲ−２＃４のアミノ酸配列は
【０３９７】
【化９８】
2009505676.tif 000104
（配列番号９３）であった。
【０３９８】
通気型Ｔ７５組織培養フラスコ中でヒト２９３Ｔ接着細胞を過渡的に移入することによって、アビジン融合タンパク質を発現させた。細胞を、透析した１０％ＦＢＳ及び１×ｐｅｎ−ｓｔｅｐ−グルタミンを含むＤＭＥＭ中で３７℃、５％ＣＯ２で増殖させ、維持した。移入に備えて、約３×１０６個の２９３Ｔ細胞を、増殖培地１５ｍｌを含む一連の清浄なＴ７５フラスコの各々に接種し、フラスコ全部を終夜約２０時間増殖させた。以下のように、ｐＣＥＰ４−アビジン（Ｎ）−ＴＲ−２構築体の各々を異なる細胞に移入した。ＤＮＡ  １５μｇをＯｐｔｉ−ＭＥＭ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）の存在下でＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ  ２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）７５μＬと混合して、ＤＮＡ−Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ複合体を形成した。複合体を２０分間インキュベートした。インキュベーション期間中に、増殖培地をＴ７５フラスコから吸引し、Ｏｐｔｉ−ＭＥＭ  １５ｍＬで置換した。インキュベーション後、各形質移入複合体を異なるフラスコに接種し、３７℃で４から５時間インキュベートした。インキュベーション期間の最後に、各フラスコのＯｐｔｉ−ＭＥＭ培地を新しい増殖培地で置換した。移入から約４８時間後に、馴化培地を収集し、５０ｍｌ管（Ｆａｌｃｏｎ）に移した。管を２０００×ｇ、４℃で１０分間遠心分離して、細胞及び細胞片を除去し、続いて清浄な５０ｍＬ管に移した。移入ＤＮＡを欠く対照フラスコも同じプロトコルに従って調製し、結合実験用の負の対照馴化培地を得た。
【０３９９】
各Ｎ−アビジン−ＴＲ−２融合タンパク質の濃度を定量ＦＡＣＳアッセイによって求めた。アビジン融合タンパク質を６．７μｍビオチンポリスチレンビーズ（Ｓｐｈｅｒｏｔｅｃｈ，  Ｉｎｃ．）によって捕捉した。各融合タンパク質に対して２つの試料、すなわち、ビーズ懸濁液５μＬ（約３．５×１０５）＋１×馴化培地２０μＬ、及びビーズ懸濁液５μＬ＋１×馴化培地２００μＬを調製した全試料を室温で回転させながら１時間インキュベートした。馴化培地を遠心分離によって各試料から除去し、０．５％ＢＳＡを含むＰＢＳ（ＢＰＢＳ）で洗浄した。アビジンビーズを０．５μｇ／ｍＬヤギＦＩＴＣ−標識抗アビジン抗体（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｓ、Ｂｕｒｌｉｎｇａｍｅ、ＣＡ）のＢＰＢＳ溶液２００μＬで染色した。反応管を箔で覆い、反応を室温で４５分間進行させた。インキュベーション後、ビーズを遠心分離によって再度収集し、ＢＰＢＳで洗浄し、分析用にＢＰＢＳ  ０．５ｍｌに再懸濁させた。ＦＩＴＣ蛍光をＦＡＣＳｃａｎ（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）によって検出した。組み換えアビジンを用いて得られた検量線を用いて、シグナルをタンパク質質量に変換した。
【０４００】
２種類のヒト抗ＴＲ−２抗体と、ヒトＴＲ−２切断型の各々、ヒトＴＲ−２、及びカニクイザル由来のＴＲ−２との結合を評価した。結合アッセイを以下のように実施した。上記ビオチンビーズに、３．５×１０５個のビーズ当たりＮ−アビジンＴＲ−２融合タンパク質の１種類約１００ｎｇを担持し、増殖培地で増量した。ビーズをＦＩＴＣ複合化ヒト抗ＴＲ−２モノクローナル抗体１μｇの０．２ｍＬ  ＢＰＢＳ溶液と混合した。室温で１時間インキュベーション後、ＢＰＢＳ  ３ｍＬを添加し、抗体−ビーズ複合体を７５０×ｇで５分間の遠心分離によって収集した。ペレットをＢＰＢＳ  ３ｍＬで洗浄した。アビジン−ビーズ複合体に結合した抗体をＦＡＣＳ分析によって検出した。各試料について平均蛍光強度を記録した。ＴＲ−２を欠く馴化培地と抗体との結合を負の対照として用いた（「Ｎｅｇ  ＣＭ」）。結果を図２４に示す。
【０４０１】
２種類の抗体の実測結合パターンは類似していた。観測された最強の結合は、正の対照、ヒトＴＲ−２との結合であり、平均蛍光強度は７３４９であった。抗体との（蛍光強度で測定した）観測された結合は、切断型ＴＲ−２−２で６５６１−６６９３であり、切断型ＴＲ−２−３及びＴＲ−２−５で３１５８−３８６６であり、切断型ＴＲ−２−６で１９５９−２２０２であり、切断型ＴＲ−２−１で６６２−７５９であった。抗体とカニクイザル由来の完全長ＴＲ−２との（蛍光強度で測定した）結合は６６６−７６４であった。結合が実験のバックグラウンドと類似したことから判断して、抗体は、マウス若しくはラットＴＲ−２、切断型ＴＲ−２−４、ＴＲ−２−７、ＴＲ−２−９、ＴＲ−２−１０、ＴＲ−２−１１、ＴＲ−２−１２又はＴＲ−２−１３と結合しなかった。
【０４０２】
ＴＲ−２−１は、ＴＲ−２のアミノ酸４３後のＣ末端切断型である。ＴＲ−２−２、−３、−５及び−６はすべて少なくともアミノ酸１６から８５を含む。アミノ酸１から８５の領域全体が存在するときに結合が生じる（ＴＲ−２−２の結果参照）。アミノ酸８６から１２６の付加によって、結合が約１／２に低下した（ＴＲ−２−２とＴＲ−２−３の結果を比較されたい。）。ＴＲ−２−２におけるＴＲ−２のＮ末端のアミノ酸１から１５が存在しないと、結合が約１／２に低下した（ＴＲ−２−２からＴＲ−２−５の結果を比較されたい。）。アミノ酸１から１５が存在せず、かつアミノ酸８６から１２６が付加すると、結合が約１／３に低下した（ＴＲ−２−２からＴＲ−２−６の結果を比較されたい。）。残基４４から８５を除去すると（ＴＲ−２−１）、結合が、ＴＲ−２−２で観測された結合の約１１％に低下した。これらの結果によれば、アミノ酸１から１５（配列番号９４；
【０４０３】
【化９９】
2009505676.tif 000105
）及び４４から８５（配列番号９５；
【０４０４】
【化１００】
2009505676.tif 000106
）の領域中の１個以上の残基が、これら２種類のヒト抗ＴＲ−２抗体及びヒトＴＲ−２の結合に重要である。
【０４０５】
ヒト抗ＴＲ−２抗体と、ｃｙｎｏ  ＴＲ−２切断型の各々、ヒト／ｃｙｎｏキメラ、及びあるマウスＴＲ−２ドメインを含むヒトＴＲ−２との結合も評価した。抗ＴＲ−２抗体は、完全長ヒトＴＲ−２と強力に結合した（蛍光強度（「ＦＩ」）５６８１）。抗ＴＲ−２抗体とｃｙｎｏ  ＴＲ−２の完全長長鎖体との結合は、完全長ヒトＴＲ−２との結合の約１／５（ＦＩ  １５７３）に低下した。ｃｙｎｏ  ＴＲ−２の完全長短鎖体（ＦＩ  ２０９）、並びにｃｙｎｏ  ＴＲ−２切断型１７−１５４（ＦＩ  ５１）、ｃｙｎｏ  １−８５（ＦＩ  １１）及びｃｙｎｏ  １７−８５（ＦＩ  ８）では結合のバックグラウンドレベルのみが観測された。
【０４０６】
あるヒト抗ＴＲ−２抗体とｃｙｎｏ／ヒトＴＲ−２キメラとの結合も評価した（図２７参照）。抗体と４種類のキメラとの観測された結合（ＦＩ）は、以下のとおりである：ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃１：ＦＩ  ５９７７；ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃２：ＦＩ  ４７；ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃３：ＦＩ  １２；ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃４：ＦＩ  １５０７。上述したように、抗体と完全長ヒトＴＲ−２との観測された結合は５６８１であり、一方、抗体と完全長ｃｙｎｏ  ＴＲ−２との結合は１５７３（長鎖型）及び２０９（短鎖型）であった。
【０４０７】
ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃１との抗体結合は、切断型ＴＲ−２−５との抗体結合と類似していたので、アミノ酸１−１６を対応するｃｙｎｏ配列で置換しても、ヒトアミノ酸１７−８５における抗体結合に影響しないことは明白であった。しかし、完全長ヒトＴＲ−２においてアミノ酸１−１６を対応するｃｙｎｏ配列で置換すると（ｃｙｎｏ／ヒト＃２）、結合をかなり阻害し、１−１６の領域の少なくとも１個のアミノ酸がエピトープの一部を形成することが確認された。ｃｙｎｏ／ヒトキメラ＃３及び＃４との結合は、完全長ヒトＴＲ−２との結合からかなり減弱され、ヒト配列のアミノ酸１７−８５が結合に重要であることを示唆している。全体的に見て、ヒト配列（配列番号９６；
【０４０８】
【化１０１】
2009505676.tif 000107
）の１−８５の領域におけるアミノ酸の１個以上がエピトープ結合に関与する。同様に、アミノ酸１−８５の領域における種々のヒト配列を対応するマウス配列で置換すると、抗体結合がかなり減弱され（図２７参照）、この領域の１個以上のアミノ酸がエピトープ結合に関与することが更に確認された。
【図面の簡単な説明】
【０４０９】
【図１】ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するトランスジェニックマウスにおいて、足せき接種（グループ１、２及び３）又は腹腔内注射（グループ４及び５）によって、ＴＲ−２−Ｈｉｓ構築体に対して実施例１で使用した免疫化スケジュールを示す図である。
【図２】実施例１の試験に従って、図１の選択されたマウスから得られたある血液試料の抗原ＴＲ−２に対する反応性を測定するＥＬＩＳＡアッセイの結果を示す図である。
【図３】抗ＴＲ−２抗体Ａの重鎖（配列番号１）及び軽鎖（配列番号３５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ａの重鎖（配列番号２）及び軽鎖（配列番号３６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図４】抗ＴＲ−２抗体Ｂの重鎖（配列番号３）及び軽鎖（配列番号３７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｂの重鎖（配列番号４）及び軽鎖（配列番号３８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図５】抗ＴＲ−２抗体Ｃの重鎖（配列番号５）及び軽鎖（配列番号３９）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｃの重鎖（配列番号６）及び軽鎖（配列番号４０）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図６】抗ＴＲ−２抗体Ｄの重鎖（配列番号７）及び軽鎖（配列番号４１）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｄの重鎖（配列番号８）及び軽鎖（配列番号４２）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図７】抗ＴＲ−２抗体Ｅの重鎖（配列番号９）及び軽鎖（配列番号４３）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｅの重鎖（配列番号１０）及び軽鎖（配列番号４４）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図８】抗ＴＲ−２抗体Ｆの重鎖（配列番号１１）及び軽鎖（配列番号４５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｆの重鎖（配列番号１２）及び軽鎖（配列番号４６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図９】抗ＴＲ−２抗体Ｇの重鎖（配列番号１３）及び軽鎖（配列番号４７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｇの重鎖（配列番号１４）及び軽鎖（配列番号４８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１０】抗ＴＲ−２抗体Ｈの重鎖（配列番号１５）及び軽鎖（配列番号４９）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｈの重鎖（配列番号１６）及び軽鎖（配列番号５０）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１１】抗ＴＲ−２抗体Ｉの重鎖（配列番号１７）及び軽鎖（配列番号５１）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｉの重鎖（配列番号１８）及び軽鎖（配列番号５２）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１２】抗ＴＲ−２抗体Ｊの重鎖（配列番号１９）及び軽鎖（配列番号５３）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｊの重鎖（配列番号２０）及び軽鎖（配列番号５４）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１３】抗ＴＲ−２抗体Ｋの重鎖（配列番号２１）及び軽鎖（配列番号５５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｋの重鎖（配列番号２２）及び軽鎖（配列番号５６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１４】抗ＴＲ−２抗体Ｌの重鎖（配列番号２３）及び軽鎖（配列番号５７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｌの重鎖（配列番号２４）及び軽鎖（配列番号５８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１５】抗ＴＲ−２抗体Ｍの重鎖（配列番号２５）及び軽鎖（配列番号５９）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｍの重鎖（配列番号２６）及び軽鎖（配列番号６０）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１６】抗ＴＲ−２抗体Ｎの重鎖（配列番号２７）及び軽鎖（配列番号６１）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｎの重鎖（配列番号２８）及び軽鎖（配列番号６２）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１７】抗ＴＲ−２抗体Ｏの重鎖（配列番号２９）及び軽鎖（配列番号６３）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｏの重鎖（配列番号３０）及び軽鎖（配列番号６４）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１８】抗ＴＲ−２抗体Ｐの重鎖（配列番号３１）及び軽鎖（配列番号６５）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｐの重鎖（配列番号３２）及び軽鎖（配列番号６６）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図１９】抗ＴＲ−２抗体Ｑの重鎖（配列番号３３）及び軽鎖（配列番号６７）可変領域をコードするヌクレオチド配列、並びに抗ＴＲ−２抗体Ｑの重鎖（配列番号３４）及び軽鎖（配列番号６８）可変領域のアミノ酸配列を示す図である。
【図２０Ａ】抗ＴＲ−２抗体ＡからＱの重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２及び３４）のアラインメントを示す図である。各配列の枠組み領域１から３（ＦＲ１、ＦＲ２及びＦＲ３）及び相補性決定領域１から３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）を示す。
【図２０Ｂ】抗ＴＲ−２抗体ＡからＱの重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２及び３４）のアラインメントを示す図である。各配列の枠組み領域１から３（ＦＲ１、ＦＲ２及びＦＲ３）及び相補性決定領域１から３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）を示す。
【図２１Ａ】抗ＴＲ−２抗体ＡからＱの軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６及び６８）のアラインメントを示す図である。各配列の枠組み領域１から３（ＦＲ１、ＦＲ２及びＦＲ３）及び相補性決定領域１から３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）を示す。
【図２１Ｂ】抗ＴＲ−２抗体ＡからＱの軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６及び６８）のアラインメントを示す図である。各配列の枠組み領域１から３（ＦＲ１、ＦＲ２及びＦＲ３）及び相補性決定領域１から３（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３）を示す。
【図２２】実施例５の試験によって、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体を、切断型キメラＮ−アビジンＴＲ−２タンパク質との各々の結合能力に従って、４つの反応グループの１つに分類した表である。
【図２３】実施例６の試験による、エピトープマッピングに使用したヒトＮ−アビジン−ＴＲ−２の１３通りの切り詰めの概略図である。
【図２４】実施例６の試験による、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体と、Ｎ−アビジン−ＴＲ−２切断型との結合を示す棒グラフである。
【図２５】実施例６の試験による、エピトープマッピングに使用したＮ−アビジン−ｃｙｎｏ  ＴＲ−２切断型及びＮ−アビジン−ｃｙｎｏ／ヒトＴＲ−２キメラの概略図である。
【図２６】実施例６の試験による、ヒトＴＲ−２、ｃｙｎｏ  ＴＲ−２（短型）及びマウスＴＲ−２配列のアラインメントである。
【図２７】実施例６の試験による、ある種のヒト抗ＴＲ−２抗体と、Ｎ−アビジン−ＴＲ−２切断型、キメラ及びドメイン置換との結合を示す棒グラフである。
【図１】
2009505676.tif 000108
【図２】
2009505676.tif 000109
【図３】
2009505676.tif 000110
【図４】
2009505676.tif 000111
【図５】
2009505676.tif 000112
【図６】
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【図７】
2009505676.tif 000114
【図８】
2009505676.tif 000115
【図９】
2009505676.tif 000116
【図１０】
2009505676.tif 000117
【図１１】
2009505676.tif 000118
【図１２】
2009505676.tif 000119
【図１３】
2009505676.tif 000120
【図１４】
2009505676.tif 000121
【図１５】
2009505676.tif 000122
【図１６】
2009505676.tif 000123
【図１７】
2009505676.tif 000124
【図１８】
2009505676.tif 000125
【図１９】
2009505676.tif 000126
【図２０Ａ】
2009505676.tif 000127
【図２０Ｂ】
2009505676.tif 000128
【図２１Ａ】
2009505676.tif 000129
【図２１Ｂ】
2009505676.tif 000130
【図２２】
2009505676.tif 000131
【図２３】
2009505676.tif 000132
【図２４】
2009505676.tif 000133
【図２５】
2009505676.tif 000134
【図２６】
2009505676.tif 000135
【図２７】
2009505676.tif 000136
【配列表】
2009505676000001.app
【国際調査報告】
2009505676.tif 000137
2009505676.tif 000138
2009505676.tif 000139
2009505676.tif 000140
2009505676.tif 000141
2009505676.tif 000142