(57)【要約】  本発明の目的は、野生型の大腸菌の染色体ＤＮＡより１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することができる。【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子（以下、ＮＣ遺伝子という）がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺��子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝���、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU���伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq��伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
［２]fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝子、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
【請求項２】
配列番号１で表される塩基配列中の以下の［１］〜［８３］記載の塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含む染色体ＤＮＡを有する請求項１記載の大腸菌の変異体。
［１］1番〜15298番目で表される塩基配列
［２］16751番〜19620番目で表される塩基配列
［３］20815番〜65857番目で表される塩基配列
［４］78797番〜167400番目で表される塩基配列
［５］173316番〜244300番目で表される塩基配列
［６］253747番〜262299番目で表される塩基配列
［７］387868番〜389474番目で表される塩基配列
［８］404040番〜518365番目で表される塩基配列
［９］533048番〜535840番目で表される塩基配列
［１０］550552番〜564276番目で表される塩基配列
［１１］608455番〜640668番目で表される塩基配列
［１２］659193番〜675439番目で表される塩基配列
［１３］689711番〜729156番目で表される塩基配列
［１４］739930番〜832888番目で表される塩基配列
［１５］848427番〜867974番目で表される塩基配列
［１６］883811番〜891334番目で表される塩基配列
［１７］909717番〜1049224番目で表される塩基配列
［１８］1097358番〜1105534番目で表される塩基配列
［１９］1106991番〜1196528番目で表される塩基配列
［２０］1225485番〜1295721番目で表される塩基配列
［２１］1297023番〜1300822番目で表される塩基配列
［２２］1302896番〜1397636番目で表される塩基配列
［２３］1399079番〜1413662番目で表される塩基配列
［２４］1436899番〜1469664番目で表される塩基配列
［２５］1472404番〜1504839番目で表される塩基配列
［２６］1506619番〜1528866番目で表される塩基配列
［２７］1534766番〜1630050番目で表される塩基配列
［２８］1654610番〜1853604番目で表される塩基配列
［２９］1864144番〜1875287番目で表される塩基配列
［３０］1888500番〜1963662番目で表される塩基配列
［３１］1992215番〜1995800番目で表される塩基配列
［３２］2027349番〜2032587番目で表される塩基配列
［３３］2043516番〜2068287番目で表される塩基配列
［３４］2081066番〜2103531番目で表される塩基配列
［３５］2115204番〜2145402番目で表される塩基配列
［３６］2186995番〜2199807番目で表される塩基配列
［３７］2228990番〜2255033番目で表される塩基配列
［３８］2262631番〜2292234番目で表される塩基配列
［３９］2293834番〜2324498番目で表される塩基配列
［４０］2322075番〜2411311番目で表される塩基配列
［４１］2413007番〜2422503番目で表される塩基配列
［４２］2433238番〜2471990番目で表される塩基配列
［４３］2482140番〜2504213番目で表される塩基配列
［４４］2513697番〜2519690番目で表される塩基配列
［４５］2521089番〜2599856番目で表される塩基配列
［４６］2613439番〜2754814番目で表される塩基配列
［４７］2788619番〜2794311番目で表される塩基配列
［４８］2800029番〜2803445番目で表される塩基配列
［４９］2809286番〜2824451番目で表される塩基配列
［５０］2829399番〜2909409番目で表される塩基配列
［５１］2909710番〜2921193番目で表される塩基配列
［５２］2943639番〜2984497番目で表される塩基配列
［５３］3032267番〜3076223番目で表される塩基配列
［５４］3078056番〜3109245番目で表される塩基配列
［５５］3133480番〜3164769番目で表される塩基配列
［５６］3172082番〜3184621番目で表される塩基配列
［５７］3186056番〜3224889番目で表される塩基配列
［５８］3240401番〜3261074番目で表される塩基配列
［５９］3262220番〜3361080番目で表される塩基配列
［６０］3370892番〜3411501番目で表される塩基配列
［６１］3421222番〜3486426番目で表される塩基配列
［６２］3496906番〜3536155番目で表される塩基配列
［６３］3549687番〜3556477番目で表される塩基配列
［６４］3576239番〜3697304番目で表される塩基配列
［６５］3709527番〜3742812番目で表される塩基配列
［６６］3744293番〜3748980番目で表される塩基配列
［６７］3747997番〜3750486番目で表される塩基配列
［６８］3751906番〜3762908番目で表される塩基配列
［６９］3772817番〜3774086番目で表される塩基配列
［７０］3785257番〜3794687番目で表される塩基配列
［７１］3803459番〜3868134番目で表される塩基配列
［７２］3878460番〜3918087番目で表される塩基配列
［７３］3919815番〜3986454番目で表される塩基配列
［７４］3988342番〜4003004番目で表される塩基配列
［７５］4021347番〜4055371番目で表される塩基配列
［７６］4061466番〜4128290番目で表される塩基配列
［７７］4141016番〜4170562番目で表される塩基配列
［７８］4186909番〜4239493番目で表される塩基配列
［７９］4255871番〜4303000番目で表される塩基配列
［８０］4316735番〜4318540番目で表される塩基配列
［８１］4334946番〜4414758番目で表される塩基配列
［８２］4428378番〜4501437番目で表される塩基配列
［８３］4604873番〜4646332番目で表される塩基配列
【請求項３】
uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、およびybeM遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１または２記載の大腸菌の変異体。
【請求項４】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号塩基番号640669番〜659192番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜３のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項５】
yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、およびygdK遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつchpA遺伝子またはその相同遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する請求項１〜４のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項６】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2921194番〜2943638番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜５のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項７】
araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、およびsetA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜６のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項８】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号65858番〜78796番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜７のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項９】
yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、およびyhfL遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜８のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１０】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4128291番〜4141015番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜９のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１１】
pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、およびyeaA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１０のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１２】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1853605番〜1864143番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１１のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１３】
ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、およびsetC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１２のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１４】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3794688番〜3803458番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１３のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１５】
ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、およびygjV遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１４のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１６】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3224890番〜3240400番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１５のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１７】
yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、およびyhhW遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１６のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１８】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4055372番〜4061465番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１７のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項１９】
yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、およびyeaX遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１８のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項２０】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1875288番〜1888499番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜１９のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項２１】
hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、およびfocB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜２０のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項２２】
配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2599857番〜2613438番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１〜２１のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項２３】
以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］および［３］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子の１０％以下を含み、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、ＮＣ遺伝子がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺��子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝���、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU���伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq��伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝���、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子
【請求項２４】
請求項１〜２３のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体を、以下の［１］〜［５］から選ばれる方法によって改変して得られる大腸菌の変異体。
［１］有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法
［２］有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法
［３］有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法
［４］有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法
［５］野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法
【請求項２５】
大腸菌が大腸菌K-12株、大腸菌B株または大腸菌Ｗ株である、請求項１〜２４のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
【請求項２６】
大腸菌K-12株が大腸菌W3110株（ATCC27325）または大腸菌MG1655株（ATCC47076）である、請求項２５記載の大腸菌の変異体。
【請求項２７】
請求項１〜２６のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体を培地に培養し、該培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造法。
【請求項２８】
有用物質がタンパク質、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および脂質からなる群より選ばれる有用物質である請求項２７に記載の製造法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、野生型の大腸菌より染色体DNAが短い大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法に関する。
【背景技術】
【０００２】
大腸菌の染色体DNAの全塩基配列は明らかになっている（非特許文献１および２）。また、相同組換え手法を用いて、大腸菌の染色体DNA上に存在している任意の遺伝子または染色体上の任意の領域を欠損させる方法は知られている（非特許文献３）。
染色体上の複数の領域が欠損している染色体縮小株としては、708kbpを欠損したMDS43株（非特許文献４）、1377kbpを欠損したΔ16株（非特許文献５）、1027kbpを欠損しているStep28株（特許文献１）が既に知られている。【０００３】
MDS43株は最少培地やLB培地において、親株である野生型大腸菌株MG1655と同等に生育することが知られている。また、Step28株は染色体上に欠損領域を持たない親株W3110red株に比べ、培養終了時の菌体量が増加しており、ATP再生活性が高いことが知られている。さらに、Step28株のスレオニン生合成系遺伝子を強化したStep28T株を用いたスレオニン生産においては、W3110red株を用いた場合に比べスレオニンの生産性が向上する。【０００４】
しかしながら、Δ16株については親株であるMG1655株と比べて生育速度が低下することがわかっている。このように、染色体縮小化株の示す表現型は菌株により異なっており、1000kbpを超える染色体領域の削除が大腸菌の性質をどのように変化させるのかを予測するのは困難であり、染色体DNAの1000kbp以上の領域を欠損した大腸菌が必ずしも有用な特性を示すとはいえない。【０００５】
また1040kbp以上の染色体DNA領域が欠損している大腸菌の変異体および該変異体を用いた有用物質の製造法については知られていない。
【非特許文献１】Science, 277, 1453 (1997)
【非特許文献２】Nucleic Acids Research, 34, 1 (2006)
【非特許文献３】J. Bacteriol., 180, 2063 (1998)
【非特許文献４】Science, 312, 1044 (2006)
【非特許文献５】Mol. Microbiol., 55, 137 (2005)
【特許文献１】WO2006/057341
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明の目的は、染色体ＤＮＡ上の１０４０ｋｂｐ以上の領域が欠損している産業上有用な大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本発明は以下の（１）〜（２８）に関する。
（１）以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子（以下、ＮＣ遺伝子という）がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺��子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝���、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU���伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq��伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝���、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
（２）配列番号１で表される塩基配列中の以下の［１］〜［８３］記載の塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含む染色体ＤＮＡを有する(１)記載の大腸菌の変異体。
［１］1番〜15298番目で表される塩基配列
［２］16751番〜19620番目で表される塩基配列
［３］20815番〜65857番目で表される塩基配列
［４］78797番〜167400番目で表される塩基配列
［５］173316番〜244300番目で表される塩基配列
［６］253747番〜262299番目で表される塩基配列
［７］387868番〜389474番目で表される塩基配列
［８］404040番〜518365番目で表される塩基配列
［９］533048番〜535840番目で表される塩基配列
［１０］550552番〜564276番目で表される塩基配列
［１１］608455番〜640668番目で表される塩基配列
［１２］659193番〜675439番目で表される塩基配列
［１３］689711番〜729156番目で表される塩基配列
［１４］739930番〜832888番目で表される塩基配列
［１５］848427番〜867974番目で表される塩基配列
［１６］883811番〜891334番目で表される塩基配列
［１７］909717番〜1049224番目で表される塩基配列
［１８］1097358番〜1105534番目で表される塩基配列
［１９］1106991番〜1196528番目で表される塩基配列
［２０］1225485番〜1295721番目で表される塩基配列
［２１］1297023番〜1300822番目で表される塩基配列
［２２］1302896番〜1397636番目で表される塩基配列
［２３］1399079番〜1413662番目で表される塩基配列
［２４］1436899番〜1469664番目で表される塩基配列
［２５］1472404番〜1504839番目で表される塩基配列
［２６］1506619番〜1528866番目で表される塩基配列
［２７］1534766番〜1630050番目で表される塩基配列
［２８］1654610番〜1853604番目で表される塩基配列
［２９］1864144番〜1875287番目で表される塩基配列
［３０］1888500番〜1963662番目で表される塩基配列
［３１］1992215番〜1995800番目で表される塩基配列
［３２］2027349番〜2032587番目で表される塩基配列
［３３］2043516番〜2068287番目で表される塩基配列
［３４］2081066番〜2103531番目で表される塩基配列
［３５］2115204番〜2145402番目で表される塩基配列
［３６］2186995番〜2199807番目で表される塩基配列
［３７］2228990番〜2255033番目で表される塩基配列
［３８］2262631番〜2292234番目で表される塩基配列
［３９］2293834番〜2324498番目で表される塩基配列
［４０］2322075番〜2411311番目で表される塩基配列
［４１］2413007番〜2422503番目で表される塩基配列
［４２］2433238番〜2471990番目で表される塩基配列
［４３］2482140番〜2504213番目で表される塩基配列
［４４］2513697番〜2519690番目で表される塩基配列
［４５］2521089番〜2599856番目で表される塩基配列
［４６］2613439番〜2754814番目で表される塩基配列
［４７］2788619番〜2794311番目で表される塩基配列
［４８］2800029番〜2803445番目で表される塩基配列
［４９］2809286番〜2824451番目で表される塩基配列
［５０］2829399番〜2909409番目で表される塩基配列
［５１］2909710番〜2921193番目で表される塩基配列
［５２］2943639番〜2984497番目で表される塩基配列
［５３］3032267番〜3076223番目で表される塩基配列
［５４］3078056番〜3109245番目で表される塩基配列
［５５］3133480番〜3164769番目で表される塩基配列
［５６］3172082番〜3184621番目で表される塩基配列
［５７］3186056番〜3224889番目で表される塩基配列
［５８］3240401番〜3261074番目で表される塩基配列
［５９］3262220番〜3361080番目で表される塩基配列
［６０］3370892番〜3411501番目で表される塩基配列
［６１］3421222番〜3486426番目で表される塩基配列
［６２］3496906番〜3536155番目で表される塩基配列
［６３］3549687番〜3556477番目で表される塩基配列
［６４］3576239番〜3697304番目で表される塩基配列
［６５］3709527番〜3742812番目で表される塩基配列
［６６］3744293番〜3748980番目で表される塩基配列
［６７］3747997番〜3750486番目で表される塩基配列
［６８］3751906番〜3762908番目で表される塩基配列
［６９］3772817番〜3774086番目で表される塩基配列
［７０］3785257番〜3794687番目で表される塩基配列
［７１］3803459番〜3868134番目で表される塩基配列
［７２］3878460番〜3918087番目で表される塩基配列
［７３］3919815番〜3986454番目で表される塩基配列
［７４］3988342番〜4003004番目で表される塩基配列
［７５］4021347番〜4055371番目で表される塩基配列
［７６］4061466番〜4128290番目で表される塩基配列
［７７］4141016番〜4170562番目で表される塩基配列
［７８］4186909番〜4239493番目で表される塩基配列
［７９］4255871番〜4303000番目で表される塩基配列
［８０］4316735番〜4318540番目で表される塩基配列
［８１］4334946番〜4414758番目で表される塩基配列
［８２］4428378番〜4501437番目で表される塩基配列
［８３］4604873番〜4646332番目で表される塩基配列
（３）uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、およびybeM遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）または（２）記載の大腸菌の変異体。【０００８】
（４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号塩基番号640669番〜659192番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（３）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（５）yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、およびygdK遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつchpA遺伝子またはその相同遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する（１）〜（４）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【０００９】
（６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2921194番〜2943638番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（５）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（７）araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、およびsetA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（６）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１０】
（８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号65858番〜78796番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（７）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（９）yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、およびyhfL遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（８）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１１】
（１０）  配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4128291番〜4141015番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（９）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（１１）pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、およびyeaA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１０）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１２】
（１２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1853605番〜1864143番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１１）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（１３）ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、およびsetC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１２）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１３】
（１４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3794688番〜3803458番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１３）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（１５）ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、およびygjV遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１４）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１４】
（１６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3224890番〜3240400番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１５）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（１７）yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、およびyhhW遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１６）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１５】
（１８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4055372番〜4061465番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１７）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（１９）yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、およびyeaX遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１８）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１６】
（２０）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1875288番〜1888499番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（１９）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（２１）hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、およびfocB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（２０）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。【００１７】
（２２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2599857番〜2613438番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）〜（２１）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（２３）以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］および［３］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子の１０％以下を含み、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、ＮＣ遺伝子がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺��子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝���、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU���伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq��伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝���、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子
（２４）（１）〜（２３）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体を、以下の［１］〜［５］から選ばれる方法によって改変して得られる大腸菌の変異体。
［１］有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法、
［２］有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法
［３］有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法
［４］有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法
［５］野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法
（２５）大腸菌が大腸菌K-12株、大腸菌B株または大腸菌Ｗ株である、（１）〜（２４）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（２６）大腸菌K-12株が大腸菌W3110株（ATCC27325）または大腸菌MG1655株（ATCC47076）である、（２５）記載の大腸菌の変異体。
（２７）（１）〜（２６）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体を培地に培養し、該培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造法。
（２８）有用物質がタンパク質、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および脂質からなる群より選ばれる有用物質である（２４）〜（２７）のいずれか１つに記載の製造法。
【発明の効果】
【００１８】
本発明により、一定時間培養後の菌体量が野生型の大腸菌より多い大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１９】
本願明細書中では、野生型の大腸菌とは、自然集団中で最も高頻度にみられる型の大腸菌であればいずれでもよく、例えば大腸菌K-12株に属する大腸菌W3110株(ATCC27325）および大腸菌MG1655株（ATCC47076）、大腸菌B株に属するATCC11303株、大腸菌W株に属するATCC9637株などをあげることができる。
本願明細書中の配列番号１で表される塩基配列は、インターネットサイト、URL::http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nuccore&id=89106884に2007年8月16日付けで登録されている大腸菌W3110株の染色体DNAの全塩基配列である。上記インターネットサイトで表示される塩基配列は、NCBI（National Center for Biothechnology Information） GenBankのAccession No. AC_000091で表される塩基配列である。【００２０】
また、本願明細書中の第１表および第２表においては、上記インターネットサイトで用いられる大腸菌染色体上の各遺伝子名を用いている。
第１表において遺伝子名ykgM(JW5034)で示される遺伝子は、配列番号１の塩基番号311598番から311738番で表される塩基配列からなる遺伝子を、遺伝子名ykgM(JW5035)で示される遺伝子は、配列番号１の塩基番号311738番から312001番で表される塩基配列からなる遺伝子をいい、遺伝子名phnE(JW4064)で示される遺伝子は、塩基番号4327121番から4327489番で表される塩基配列からなる遺伝子を、遺伝子名phnE(JW4065)で示される遺伝子は、配列番号１の塩基番号4327339番から4327959番で表される塩基配列からなる遺伝子をいう。【００２１】
遺伝子を含む染色体ＤＮＡとは、特定の構造遺伝子、プロモーターおよびオペレーターなどの特定の制御機能を有する領域を含む染色体ＤＮＡをいう。
本明細書では、遺伝子を含まない染色体ＤＮＡとは、特定の遺伝子の構造遺伝子の一部または全部を含まない染色体ＤＮＡ、または該遺伝子のプロモーターおよび／またはオペレーターなどの特定の制御機能を有する領域を含まない染色体ＤＮＡをいう。【００２２】
構造遺伝子の一部を含まない染色体ＤＮＡとは、該構造遺伝子の一部を含まず、かつ該構造遺伝子から機能的な蛋白質が転写、発現されないＤＮＡであり、例えば構造遺伝子の５’末端領域が欠損しているため開始コドンが存在しないＤＮＡ、３’末端領域の大半、例えば全体の１０％以上、好ましくは２０％以上、より好ましくは３０％以上、さらに好ましくは４０％以上欠損しているＤＮＡのことである。また、染色体ＤＮＡ上で隣り合う遺伝子の両方を含まない染色体ＤＮＡは、両遺伝子の間に存在する塩基配列からなるＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡであってもよい。【００２３】
相同遺伝子とは、大腸菌種内で遺伝子の塩基配列に配列相同性が認められる遺伝子、または該遺伝子がコードする蛋白質のアミノ酸配列に配列相同性が認められる遺伝子をいう。配列相同性が認められるとは、塩基配列においては８５％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列類似性、アミノ酸配列においては８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列類似性があることをいう。【００２４】
ある特定の一群の遺伝子群またはその相同遺伝子の１０％以下を含む染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体とは、ある一群の遺伝子群より選ばれる遺伝子またはその相同遺伝子の９０％以上を欠失した染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体をいい、好ましくは９５％以上、より好ましくは９８％以上、さらに好ましくは９９％以上を欠失した染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体をいう。【００２５】
配列番号１で表される塩基配列中の特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡに相当するＤＮＡとしては、大腸菌種内で該特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡと含まれている遺伝子の構成、および染色体ＤＮＡ上の位置が実質的に同一のＤＮＡであれば、いずれのＤＮＡであってもよい。ＤＮＡに含まれる遺伝子の構成が実質的に同一とは、該ＤＮＡに含まれる遺伝子が同一かまたは相同遺伝子で構成され、かつ該遺伝子の並びとが同じであることをいい、遺伝子間の塩基配列は相違していてもよい。ただし、該特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡ中に挿入配列がある場合は、該ＤＮＡに相当するＤＮＡ中には該挿入配列はなくてもよい。【００２６】
染色体ＤＮＡ上の位置が実質的に同一とは、大腸菌の染色体ＤＮＡ上のｔｈｒＬ遺伝子の開始コドンのアデニンを１９０番としてｔｈｒＬ遺伝子のコーディング鎖に沿って染色体ＤＮＡの塩基配列に塩基番号を付けたとき、該特定の塩基番号との塩基番号の相違が５０以下、好ましくは３０以下、より好ましくは１０以下、さらに好ましくは５以下であることをいう。ただし、該特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡ中に挿入配列がある場合は、該ＤＮＡに相当するＤＮＡ中には該挿入配列はなくてもよいので、該挿入配列分、さらに塩基番号が相違していてもよい。配列番号１で表される塩基配列中の特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡに相当するＤＮＡとしては、例えば該特定の塩基番号で表される塩基配列と８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列類似性を有するＤＮＡをあげることができる。【００２７】
アミノ酸配列や塩基配列の配列類似性は、Karlin and AltschulによるアルゴリズムBLAST[Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873(1993)]やFASTA[Methods Enzymol., 183, 63 (1990)]を用いて決定することができる。このアルゴリズムBLASTに基づいて、BLASTNやBLASTXとよばれるプログラムが開発されている［J. Mol. Biol., 215, 403(1990)］。BLASTに基づいてBLASTNによって塩基配列を解析する場合には、パラメータは例えばScore＝100、wordlength＝12とする。また、BLASTに基づいてBLASTXによってアミノ酸配列を解析する場合には、パラメータは例えばscore＝50、wordlength＝3とする。BLASTとGapped BLASTプログラムを用いる場合には、各プログラムのデフォルトパラメータを用いる。これらの解析方法の具体的な手法は公知である（http://www.ncbi.nlm.nih.gov.）。
１．本発明の大腸菌の変異体
本発明の大腸菌の変異体としては、
（１）［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、hokC遺伝子、mokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺伝子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝子、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺
伝子、cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝���、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝��、leuU遺伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺���子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、gly
Q遺伝子、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝���、hfq遺伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子
を含み、かつ
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝���、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子
を含まず、かつ野生型の大腸菌より１０４０ｋｂｐ以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、であれば野生型の大腸菌の染色体ＤＮＡ上に存在する上記[２]以外のいずれの遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体でもよく、上記［１］以外のいずれの遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体でもよい。ただし、上記［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子（以下、ＮＣ遺伝子という）がある場合は、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体の染色体ＤＮＡはＮＣ遺伝子を含まなくてもよい。【００２８】
本発明の大腸菌の変異体としては、好ましくは表１および配列番号１で表される塩基配列中の上記［１］の遺伝子の塩基配列からなるＤＮＡまたは該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含み、かつchpA遺伝子の塩基配列からなるＤＮＡまたは該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まず、さらに
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子
の遺伝子の塩基配列からなるＤＮＡまたは該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、さらに好ましくは、
（２）配列番号１で表される塩基配列中の以下の［１］〜［８３］記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
［１］1番〜15298番目で表される塩基配列
［２］16751番〜19620番目で表される塩基配列
［３］20815番〜65857番目で表される塩基配列
［４］78797番〜167400番目で表される塩基配列
［５］173316番〜244300番目で表される塩基配列
［６］253747番〜262299番目で表される塩基配列
［７］387868番〜389474番目で表される塩基配列
［８］404040番〜518365番目で表される塩基配列
［９］533048番〜535840番目で表される塩基配列
［１０］550552番〜564276番目で表される塩基配列
［１１］608455番〜640668番目で表される塩基配列
［１２］659193番〜675439番目で表される塩基配列
［１３］689711番〜729156番目で表される塩基配列
［１４］739930番〜832888番目で表される塩基配列
［１５］848427番〜867974番目で表される塩基配列
［１６］883811番〜891334番目で表される塩基配列
［１７］909717番〜1049224番目で表される塩基配列
［１８］1097358番〜1105534番目で表される塩基配列
［１９］1106991番〜1196528番目で表される塩基配列
［２０］1225485番〜1295721番目で表される塩基配列
［２１］1297023番〜1300822番目で表される塩基配列
［２２］1302896番〜1397636番目で表される塩基配列
［２３］1399079番〜1413662番目で表される塩基配列
［２４］1436899番〜1469664番目で表される塩基配列
［２５］1472404番〜1504839番目で表される塩基配列
［２６］1506619番〜1528866番目で表される塩基配列
［２７］1534766番〜1630050番目で表される塩基配列
［２８］1654610番〜1853604番目で表される塩基配列
［２９］1864144番〜1875287番目で表される塩基配列
［３０］1888500番〜1963662番目で表される塩基配列
［３１］1992215番〜1995800番目で表される塩基配列
［３２］2027349番〜2032587番目で表される塩基配列
［３３］2043516番〜2068287番目で表される塩基配列
［３４］2081066番〜2103531番目で表される塩基配列
［３５］2115204番〜2145402番目で表される塩基配列
［３６］2186995番〜2199807番目で表される塩基配列
［３７］2228990番〜2255033番目で表される塩基配列
［３８］2262631番〜2292234番目で表される塩基配列
［３９］2293834番〜2324498番目で表される塩基配列
［４０］2322075番〜2411311番目で表される塩基配列
［４１］2413007番〜2422503番目で表される塩基配列
［４２］2433238番〜2471990番目で表される塩基配列
［４３］2482140番〜2504213番目で表される塩基配列
［４４］2513697番〜2519690番目で表される塩基配列
［４５］2521089番〜2599856番目で表される塩基配列
［４６］2613439番〜2754814番目で表される塩基配列
［４７］2788619番〜2794311番目で表される塩基配列
［４８］2800029番〜2803445番目で表される塩基配列
［４９］2809286番〜2824451番目で表される塩基配列
［５０］2829399番〜2909409番目で表される塩基配列
［５１］2909710番〜2921193番目で表される塩基配列
［５２］2943639番〜2984497番目で表される塩基配列
［５３］3032267番〜3076223番目で表される塩基配列
［５４］3078056番〜3109245番目で表される塩基配列
［５５］3133480番〜3164769番目で表される塩基配列
［５６］3172082番〜3184621番目で表される塩基配列
［５７］3186056番〜3224889番目で表される塩基配列
［５８］3240401番〜3261074番目で表される塩基配列
［５９］3262220番〜3361080番目で表される塩基配列
［６０］3370892番〜3411501番目で表される塩基配列
［６１］3421222番〜3486426番目で表される塩基配列
［６２］3496906番〜3536155番目で表される塩基配列
［６３］3549687番〜3556477番目で表される塩基配列
［６４］3576239番〜3697304番目で表される塩基配列
［６５］3709527番〜3742812番目で表される塩基配列
［６６］3744293番〜3748980番目で表される塩基配列
［６７］3747997番〜3750486番目で表される塩基配列
［６８］3751906番〜3762908番目で表される塩基配列
［６９］3772817番〜3774086番目で表される塩基配列
［７０］3785257番〜3794687番目で表される塩基配列
［７１］3803459番〜3868134番目で表される塩基配列
［７２］3878460番〜3918087番目で表される塩基配列
［７３］3919815番〜3986454番目で表される塩基配列
［７４］3988342番〜4003004番目で表される塩基配列
［７５］4021347番〜4055371番目で表される塩基配列
［７６］4061466番〜4128290番目で表される塩基配列
［７７］4141016番〜4170562番目で表される塩基配列
［７８］4186909番〜4239493番目で表される塩基配列
［７９］4255871番〜4303000番目で表される塩基配列
［８０］4316735番〜4318540番目で表される塩基配列
［８１］4334946番〜4414758番目で表される塩基配列
［８２］4428378番〜4501437番目で表される塩基配列
［８３］4604873番〜4646332番目で表される塩基配列
またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含む染色体ＤＮＡを有する上記（１）の大腸菌の変異体、
（３）uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、およびybeM遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつchpA遺伝子またはその相同遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する上記（１）または（２）の大腸菌の変異体、
（４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号640669番〜659192番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（３）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（５）yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、およびygdK遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（４）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2921194番〜2943638番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（５）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（７）araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、およびsetA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（６）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号65858番〜78796番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（７）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（９）yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、およびyhfL遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（８）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１０）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4128291番〜4141015番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（９）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１１）pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、およびyeaA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１０）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1853605番〜1864143番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１１）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１３）ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、およびsetC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１２）のいずれか１つ大腸菌の変異体、
（１４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3794688番〜3803458番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１３）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１５）ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、およびygjV遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１４）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3224890番〜3240400番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１５）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１７）yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、およびyhhW遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１６）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4055372番〜4061465番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１７）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１９）yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、およびyeaX遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１８）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（２０）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1875288番〜1888499番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（１９）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（２１）hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、およびfocB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（２０）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（２２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2599857番〜2613438番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）〜（２１）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
をあげることができる。    【００２９】
【表１−１】
2009116566.tif 000002
【００３０】
【表１−２】
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【００３１】
【表１−３】
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【００３２】
【表１−４】
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【００３３】
【表１−５】
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【００３４】
【表１−６】
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【００３５】
【表１−７】
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【００３６】
【表１−８】
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【００３７】
【表１−９】
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【００３８】
【表１−１０】
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【００３９】
【表１−１１】
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【００４０】
【表１−１２】
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【００４１】
【表１−１３】
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【００４２】
【表１−１４】
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【００４３】
【表１−１５】
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【００４４】
【表１−１６】
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【００４５】
【表１−１７】
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【００４６】
【表１−１８】
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【００４７】
【表１−１９】
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【００４８】
【表１−２０】
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【００４９】
【表１−２１】
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【００５０】
【表１−２２】
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【００５１】
【表１−２３】
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【００５２】
【表１−２４】
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【００５３】
【表１−２５】
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【００５４】
【表１−２６】
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【００５５】
【表１−２７】
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【００５６】
【表１−２８】
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【００５７】
【表１−２９】
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【００５８】
【表１−３０】
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【００５９】
【表１−３１】
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【００６０】
【表１−３２】
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【００６１】
【表１−３３】
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【００６２】
【表１−３４】
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【００６３】
【表１−３５】
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【００６４】
【表１−３６】
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【００６５】
【表１−３７】
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【００６６】
【表１−３８】
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【００６７】
【表１−３９】
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【００６８】
【表１−４０】
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【００６９】
【表１−４１】
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【００７０】
【表１−４２】
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【００７１】
【表１−４３】
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【００７２】
【表１−４４】
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【００７３】
【表１−４５】
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【００７４】
【表１−４６】
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【００７５】
【表１−４７】
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【００７６】
【表１−４８】
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【００７７】
【表１−４９】
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【００７８】
【表１−５０】
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【００７９】
【表１−５１】
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【００８０】
【表１−５２】
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【００８１】
【表１−５３】
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【００８２】
【表１−５４】
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【００８３】
【表１−５５】
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【００８４】
【表１−５６】
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【００８５】
【表１−５７】
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【００８６】
【表１−５８】
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【００８７】
【表１−５９】
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【００８８】
【表１−６０】
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【００８９】
【表１−６１】
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【００９０】
【表１−６２】
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【００９１】
【表１−６３】
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【表１−６４】
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【００９３】
【表１−６５】
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【００９４】
【表１−６６】
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【００９５】
【表１−６７】
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【００９６】
【表１−６８】
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【００９７】
【表１−６９】
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【００９８】
【表１−７０】
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【００９９】
【表１−７１】
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【０１００】
【表１−７２】
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【０１０１】
【表１−７３】
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【０１０２】
【表１−７４】
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【０１０３】
【表１−７５】
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【０１０４】
【表１−７６】
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【０１０５】
【表１−７７】
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【０１０６】
【表１−７８】
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【０１０７】
【表１−７９】
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【０１０８】
【表１−８０】
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【０１０９】
【表１−８１】
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【０１１０】
【表１−８２】
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【０１１１】
【表１−８３】
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【０１１２】
【表１−８４】
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【０１１３】
【表１−８５】
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【０１１４】
【表１−８６】
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【０１１５】
【表１−８７】
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【０１１６】
【表１−８８】
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【０１１７】
【表１−８９】
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【０１１８】
【表１−９０】
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【０１１９】
【表１−９１】
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【０１２０】
【表１−９２】
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【０１２１】
【表１−９３】
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【０１２２】
【表１−９４】
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【０１２３】
【表１−９５】
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【０１２４】
【表１−９６】
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【０１２５】
【表１−９７】
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【０１２６】
【表１−９８】
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【０１２７】
【表１−９９】
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【０１２８】
【表１−１００】
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【０１２９】
【表１−１０１】
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【０１３０】
【表１−１０２】
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【０１３１】
【表１−１０３】
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【０１３２】
【表１−１０４】
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【０１３３】
【表１−１０５】
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【０１３４】
【表１−１０６】
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【０１３５】
【表１−１０７】
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【０１３６】
【表１−１０８】
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【０１３７】
【表１−１０９】
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【０１３８】
【表１−１１０】
2009116566.tif 000111
【０１３９】
【表１−１１１】
2009116566.tif 000112
【０１４０】
【表１−１１２】
2009116566.tif 000113
【０１４１】
また、
（２３）（１）の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ（１）の［２］記載の遺伝子および以下の［３］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子の１０％以下を含む染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子
もまた、本発明の大腸菌の変異体である。【０１４２】
さらに、本発明の大腸菌の変異体としては、
（２４）以下の［１］〜［５］から選ばれる方法によって改変して得られる上記（１）〜（２３）のいずれか１つの大腸菌の変異体を、以下の［１］〜［５］から選ばれる方法によって改変して得られる大腸菌の変異体、
［１］有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法
［２］有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法
［３］有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法
［４］有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法
［５］野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法
をあげることができる。【０１４３】
上記（１）〜（２３）の大腸菌の変異体は、有用物質の生合成に直接関与はしないが間接的に該有用物質の生成を抑制している蛋白質をコードする遺伝子の一部または全部が欠損していると考えられる。該変異体および上記（２４）の変異体は有用物質を生産する大腸菌の変異体として有用である。
本発明の大腸菌の変異体は、大腸菌に属していればいずれの大腸菌の変異体であってもよく、好ましくは、大腸菌K-12株、大腸菌Ｂ株および大腸菌Ｗ株の変異体、より好ましくは大腸菌K-12株の変異体、さらに好ましくは大腸菌W3110株（ATCC27325）および大腸菌MG1655株（ATCC47076）の変異体、特に好ましくは大腸菌W3110株（ATCC27325）をあげることができる。
２．本発明の大腸菌の変異体の製造方法
本発明の大腸菌の変異体は、該変異体を取得できる方法であれば、その取得方法に制限はないが、例えば以下に示す大腸菌の染色体ＤＮＡ上の特定の遺伝子またはＤＮＡを欠損させる方法により取得することができる。【０１４４】
大腸菌の染色体ＤＮＡ上の遺伝子またはＤＮＡを欠損させる方法としては、相同組換えを利用した方法をあげることができる。一般的な相同組換えを利用した方法としては、大腸菌の染色体ＤＮＡ上において欠損させたい遺伝子またはＤＮＡの両外側に存在するＤＮＡ断片を、該大腸菌内では自律複製できない薬剤耐性遺伝子を有するプラスミドＤＮＡと連結して作製できる相同組換え用プラスミドを用いる方法をあげることができる。【０１４５】
該相同組換え用プラスミドを常法により大腸菌内に導入した後、薬剤耐性を指標にして相同組換えによって染色体ＤＮＡ上に該相同組換え用プラスミドが組込まれた形質転換株を選択する。得られた形質転換株を該薬剤を含有しない培地で数時間〜1日間培養した後、該薬剤含有寒天培地、および該薬剤非含有寒天培地に塗布し、前者の培地で生育せず、後者の培地で生育できる株を選択することで、染色体ＤＮＡ上において２回目の相同組換えが生じた株を取得することができる。染色体ＤＮＡ上の欠損させたい遺伝子またはＤＮＡが存在していた領域の塩基配列を決定することで、染色体ＤＮＡ上の目的遺伝子またはＤＮＡが欠損したことを確認することができる。【０１４６】
また、複数の遺伝子に効率よく塩基の欠失、置換または付加を導入する相同組換えを利用した方法としては、直鎖ＤＮＡを用いた方法をあげることができる。
具体的には、染色体ＤＮＡ上において欠損させたい遺伝子またはＤＮＡの両外側に存在するＤＮＡ断片を含有する直鎖ＤＮＡを細胞内に取り込ませ、染色体ＤＮＡと導入した直鎖ＤＮＡとの間で相同組換えを起こさせる方法である。本方法は、直鎖ＤＮＡを効率よく取り込む大腸菌であれば、いずれの微生物にも適用でき、好ましくはλファージ由来の組換えタンパク質群（Ｒｅｄ組換え系）を発現している大腸菌をあげることができる。【０１４７】
λＲｅｄ組換え系を発現している大腸菌としては、λＲｅｄ組換え系遺伝子を有するプラスミドＤＮＡであるpKD46［エシェリヒア・コリ ジェネティック ストック センター（米国エール大学）より入手可能］を保有する大腸菌 JM101株等をあげることができる。
相同組換えに用いられるＤＮＡとしては、
（ａ）塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを、薬剤耐性遺伝子の両端に有する直鎖ＤＮＡ、
（ｂ）塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを直接連結した直鎖ＤＮＡ、
（ｃ）塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを、薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子の両端に有する直鎖ＤＮＡ、
（ｄ）上記（ａ）の直鎖ＤＮＡにおいて、薬剤耐性遺伝子と染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡの間に、さらに酵母由来のFlp recombinase［Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 82, 5875 (1985)］が認識する塩基配列を有するＤＮＡ、
をあげることができる。【０１４８】
薬剤耐性遺伝子としては、大腸菌が感受性を示す薬剤に対し、薬剤耐性を付与する薬剤耐性遺伝子であれば、いずれの薬剤耐性遺伝子も使用することができる。該薬剤耐性遺伝子としては、例えば、カナマイシン耐性遺伝子、クロラムフェニコール耐性遺伝子、ゲンタマイシン耐性遺伝子、スペクチノマイシン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子等をあげることができる。【０１４９】
ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子とは、大腸菌で該遺伝子を発現させたとき、一定培養条件下においては、該大腸菌に致死的である遺伝子のことをいい、該遺伝子としては例えば、バチルス属に属する微生物由来のsacB遺伝子［Appl. Environ. Microbiol., 59, 1361-1366（1993）］、およびエシェリヒア属に属する微生物由来のrpsL遺伝子［Genomics, 72, 99-104(2001)］等をあげることができる。【０１５０】
上記の直鎖ＤＮＡの両末端に存在する、染色体ＤＮＡ上の置換または欠失の導入対象となる領域の両端の外側に位置するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡは、直鎖ＤＮＡにおいて、染色体ＤＮＡ上の方向と同じ方向に配置され、その長さは１０ｂｐ〜１００ｂｐ程度が好ましく、２０ｂｐ〜５０ｂｐ程度がより好ましく、３０〜４０ｂｐ程度がさらに好ましい。【０１５１】
酵母由来のFlp recombinaseが認識する塩基配列は、該蛋白質が認識し、相同組換えを触媒する塩基配列であれば、酵母由来のFlp recombinaseが認識し、相同組換えを触媒する塩基配列を有する塩基配列でもよい。
相同性を有するＤＮＡとは、上記直鎖ＤＮＡが、染色体ＤＮＡ上の目的とする領域において、相同組換えが起こる程度の同一性を有するＤＮＡのことであり、具体的な相同性としては、８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは１００％の相同性を有するＤＮＡをあげることができる。【０１５２】
上記塩基配列の相同性は、上記したBLASTやFASTA等のプログラムを用いて決定することができる。
上記直鎖ＤＮＡ断片は、ＰＣＲにより作製することができる。また上記直鎖ＤＮＡを含むＤＮＡをプラスミド上にて構築した後、制限酵素処理にて目的の直鎖ＤＮＡを得ることもできる。【０１５３】
大腸菌の染色体ＤＮＡに塩基の欠失、置換または付加を導入する方法としては、以下の方法１〜４があげられる。
方法１：上記（ａ）または（ｄ）の直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖ＤＮＡが染色体ＤＮＡ上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する方法。
方法２：上記方法１により取得された形質転換株に、塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを直接連結したＤＮＡを導入し、該方法により染色体ＤＮＡ上に挿入された薬剤遺伝子を削除することにより、微生物の染色体ＤＮＡ上の領域を置換または欠失させる方法。
方法３：  
［１］上記（ｃ）の直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖ＤＮＡが染色体ＤＮＡ上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する、
［２］染色体ＤＮＡ上の置換または欠失の対象領域の両端の外側に位置するＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを、染色体ＤＮＡ上における方向と同一の方向で連結したＤＮＡを合成し、上記［１］で得られた形質転換株に導入する、
［３］ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子が発現する条件下において、上記［２］の操作を行った形質転換株を培養し、該培養において生育可能な株を、薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子が染色体ＤＮＡ上から削除された株として選択する方法。
方法４：
［１］上記（ｄ）の直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖ＤＮＡが染色体ＤＮＡ上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する、
［２］上記［１］で得られた形質転換株にFlp recombinase遺伝子発現プラスミドを導入し、該遺伝子を発現させた後、上記［１］で用いた薬剤に感受性である株を取得する方法。【０１５４】
上記方法で用いられる、直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入する方法としては、該微生物へＤＮＡを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、カルシウムイオンを用いる方法［Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 69, 2110 (1972)］、プロトプラスト法（特開昭63-248394）、エレクトロポレーション法［Nucleic Acids Res., 16, 6127 (1988)］等をあげることができる。【０１５５】
方法２または方法３［２］で用いられるＤＮＡにおいて、該ＤＮＡの中央部付近に、染色体ＤＮＡ上に挿入したい任意の遺伝子を組み込こんだＤＮＡを用いることにより、薬剤耐性遺伝子等を削除するのと同時に、任意の遺伝子を染色体ＤＮＡ上に挿入することができる。
上記方法２〜４では、最終的に得られる形質転換株の染色体ＤＮＡ上には薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子等の外来遺伝子を残さない方法であるため、該方法を用いることにより、同一の薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子を用いて、方法２、方法３［１］〜［３］、および方法４［１］［２］の操作を繰り返すことにより、容易に染色体ＤＮＡ上の位置の異なる２以上の領域に遺伝子またはＤＮＡの欠損を有する大腸菌を製造することができる。【０１５６】
上記方法により取得された大腸菌の変異体が、一定時間培養後の菌体量が野生型の大腸菌より多いことは、例えば１％ グルコース、０．６％ リン酸二ナトリウム、０．３％ リン酸二水素カリウム、０．０５％ 塩化ナトリウム、０．１％ 塩化アンモニウム、２ｍｍｏｌ／ｌ 硫酸マグネシウム・七水和物、１０ｍｇ／ｌ  硫酸鉄、１００μｍｏｌ／ｌ 塩化カルシウムの組成からなるＭ９最少培地に、親株に用いた野生型の大腸菌および該変異体をそれぞれ培養し、一定時間毎に培養物の６６０nmの吸収を測定すること、または培地あたりのＡＴＰ量を常法にしたがって測定することなどにより確認することができる。【０１５７】
また、本発明の大腸菌の変異体は、有用物質を生産する能力を有する大腸菌の染色体ＤＮＡ上の遺伝子またはＤＮＡを欠損させる方法、または染色体ＤＮＡ上の遺伝子またはＤＮＡを欠損させた大腸菌に、有用物質の生産性を付与する方法により製造することができる。
有用物質を生産する能力を有する大腸菌は、１種以上の有用物質を生産する能力を有する大腸菌であればいずれの大腸菌であってもよく、該大腸菌としては自然界から分離された株自身が該能力を有する場合は該株そのもの、公知の方法により所望の有用物質を生産する能力を人為的に付与した大腸菌などをあげることができる。【０１５８】
当該公知の方法としては、
（ａ）有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法、
（ｂ）有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法、
（ｃ）有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法、
（ｄ）有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法、および
（ｅ）野生型株に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法、
などをあげることができ、上記公知の方法は単独または組み合わせて用いることができる。【０１５９】
上記（ａ）〜（ｅ）の具体的な方法は、例えば有用物質がアミノ酸である場合については、上記（ａ）の方法に関してはAgric. Biol. Chem., 43, 105-111(1979)、J. Bacteriol.遺伝子、110, 761-763(1972)およびAppl. Microbiol. Biotechnol., 39, 318-323(1993)などに記載されている。上記（ｂ）の方法に関しては、Agric. Biol. Chem., 43, 105-111(1979)およびJ. Bacteriol., 110, 761-763(1972)などに記載されている。上記（ｃ）の方法に関しては、Appl. Microbiol. Biotechnol., 39, 318-323(1993)およびAgric. Biol. Chem., 39, 371-377(1987)などに記載されている。上記（ｄ）の方法に関しては、Appl. Environ. Micribiol., 38, 181-190(1979)およびAgric. Biol. Chem., 42, 1773-1778(1978)などに記載されている。上記（ｅ）の方法に関しては、Agric. Biol. Chem., 36, 1675-1684(1972)、Agric. Biol. Chem., 41, 109-116(1977)、Agric. Biol. Chem. , 37, 2013-2023(1973)およびAgric. Biol. Chem., 51, 2089-2094(1987)などに記載されている。上記文献等を参考に各種アミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物を調製することができる。【０１６０】
さらに上記（ａ）〜（ｅ）のいずれかまたは組み合わせた方法によるアミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物の調製方法については、Biotechnology 2nd ed., Vol.6, Products of Primary Metabolism (VCH Verlagsgesellschaft mbH, Weinheim, 1996)  section 14a, 14bやAdvances in Biochemical Engineering/ Biotechnology 79, 1-35 (2003)、アミノ酸発酵、学会出版センター、相田  浩ら（1986）に多くの例が記載されており、また上記以外にも具体的なアミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物の調製方法は、特開2003-164297、Agric. Biol. Chem., 39, 153-160 (1975)、Agric. Biol. Chem., 39, 1149-1153(1975)、特開昭58-13599、J. Gen. Appl. Microbiol., 4, 272-283(1958)、特開昭63-94985、Agric. Biol. Chem., 37, 2013-2023(1973)、WO97/15673、特開昭56-18596、特開昭56-144092および特表2003-511086など数多くの報告があり、上記文献等を参照することにより１種以上のアミノ酸を生産する能力を有する大腸菌の変異体を調製することができる。その他の有用物質を生産する能力を有する大腸菌もまたアミノ酸を生産する能力を有する大腸菌の変異体の調製方法と同様に、該有用物質の生合成酵素の強化、生合成調節機構および排出機構などの改変により調製することができる。
３．本発明の有用物質の製造方法
本発明の有用物質の製造方法は、本発明の大腸菌の変異体を培地に培養し、培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造方法に関する。【０１６１】
該有用物質としては、本発明の大腸菌の変異体を用いて製造できる有用物質であれば特に限定されないが、例えばタンパク質、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸、脂質などあげることができ、タンパク質としては、イノシンキナーゼ、Glutamate 5-kinase (EC 2.7.2.11)、Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.41)、Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2)、ヒト顆粒球コロニー刺激因子など、ペプチドとしてはグルタチオンなど、アミノ酸としては、Ｌ−アラニン、グリシン、Ｌ−グルタミン、Ｌ−グルタミン酸、Ｌ−アスパラギン、Ｌ−アスパラギン酸、Ｌ−リジン、Ｌ−メチオニン、Ｌ−スレオニン、Ｌ−ロイシン、Ｌ−バリン、Ｌ−イソロイシン、Ｌ−プロリン、Ｌ−ヒスチジン、Ｌ−アルギニン、Ｌ−チロシン、Ｌ−トリプトファン、Ｌ−フェニルアラニン、Ｌ−セリン、Ｌ−システイン、Ｌ−３−ヒドロキシプロリン、Ｌ−４−ヒドロキシプロリンなど、核酸としては、アデノシン三リン酸、イノシン、グアノシン、イノシン酸、グアニル酸など、ビタミンとしては、リボフラビン、チアミン、アスコルビン酸など、糖としては、キシロース、キシリトールなど、脂質としては、EPA(エイコサペンタエン酸)やDHA（ドコサヘキサエン酸）などをあげることができる。
本発明の有用物質の製造方法には、ＡＴＰを必要とする酵素反応を用いた有用物質の製造方法であって、該酵素反応を触媒する酵素タンパク質を本発明の大腸菌の変異体に産生させ、酵素タンパク質が触媒する反応の進行を維持するためのＡＴＰを本発明の大腸菌の変異体から供給する製造方法も含まれる。【０１６２】
本発明の製造法に用いられる大腸菌の変異体の培養は、以下に記載した通常の方法に従って行うことができる。
本発明の製造法に用いられる大腸菌の変異体を培養する培地は、該微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、該微生物の培養を効率的に行える培地であれば天然培地、合成培地のいずれを用いてもよい。【０１６３】
炭素源としては、該微生物が資化し得るものであればよく、グルコース、フラクトース、スクロース、これらを含有する糖蜜、デンプンあるいはデンプン加水分解物等の炭水化物、酢酸、プロピオン酸等の有機酸、エタノール、プロパノール等のアルコール類等を用いることができる。
窒素源としては、アンモニア、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、酢酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機酸または有機酸のアンモニウム塩、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、コーンスチープリカー、カゼイン加水分解物、大豆粕、大豆粕加水分解物、各種発酵菌体、およびその消化物等を用いることができる。【０１６４】
無機塩としては、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウム等を用いることができる。
培養は、振盪培養または深部通気攪拌培養などの好気的条件下で行う。培養温度は15〜40℃がよく、培養時間は、通常 16時間〜7日間である。培養中のpHは3. 0〜9.0に保持することが好ましい。pHの調整は、無機または有機の酸、アルカリ溶液、尿素、炭酸カルシウム、アンモニアなどを用いて行う。【０１６５】
有用物質が菌体外に生成、蓄積した場合には、培養終了後、培養物から菌体などの沈殿物を除去し、イオン交換処理法、濃縮法、塩析法などを併用することにより、培養物から目的する有用物質を単離、精製することができる。
有用物質が、菌体内に生成、蓄積される場合には、培養終了後、培養物から菌体を回収した後、機械的または化学的方法等の適切な方法で破砕する。該菌体破砕液から、イオン交換処理法、濃縮法、塩析法などを併用することにより、該菌体破砕液から目的とする有用物質を単離、精製することができる。
【実施例１】
【０１６６】
（１）染色体縮小化株の作製方法
特開2004-166576およびWO2006/57341に記載の染色体加工方法、すなわちバチルス・サチルス由来のレバンシュークラーゼをコードするsacB遺伝子を用いる方法により、大腸菌K-12系統株W3110株の組換え系がλファージ由来のRed組換え系に置き換わった株であるW3110red株（WO2006/57341）の染色体上の1026.7kbpの領域が欠損したStep28株（WO2006/57341）をもとに、大腸菌W3110株において染色体上の以下の表２に示す遺伝子を含む領域を欠損した染色体縮小化株S1〜S10株を作製した。当該方法では、欠損させたい染色体ＤＮＡ上の領域の両端にある塩基配列に基づきプライマーＤＮＡを設計し、これらのプライマーＤＮＡを用いて染色体ＤＮＡを鋳型としてＰＣＲ反応を利用し増幅されるＤＮＡ断片を用いることにより、染色体ＤＮＡ上の任意の領域を欠損させることができる。
（２）生育試験
次に、W3110red株、染色体縮小化株S28株(WO2006/57341)およびS1〜S10株の生育を比較した。Step28株が染色体ＤＮＡ上で欠失しいる遺伝子群は第２表に示した。【０１６７】
【表２−１】
2009116566.tif 000114
【０１６８】
【表２−２】
2009116566.tif 000115
【０１６９】
【表２−３】
2009116566.tif 000116
【０１７０】
【表２−４】
2009116566.tif 000117
【０１７１】
第２表に記した菌株を使用して生育試験を行った。生育試験は、30mg/lのカナマイシンを含むＬＢ寒天培地(ＬＢ培地［バクトトリプトン（ディフコ社製）１０ｇ／ｌ、酵母エキス（ディフコ社製）１０ｇ／ｌ、塩化ナトリウム５ｇ／ｌ］にバクトアガー（ディフコ社製）15g/lを加えて平板化したもの)上に各菌株を塗布し、37℃にて一晩培養して菌体を得た。ＬＢ寒天培地上に生育した菌体を各少量30mg/lのカナマイシンを含む5mlのＬＢ培地に植菌して37℃にて一晩培養し、培養物を得た。300μlの該培養物を30mlの生育試験培地（11.28g/l  5×M9プレミックス塩、100mM  MOPSバッファー、６％  グルコース、１％  酵母エキス、2mM  MgSO4、0.1mM CaCl2、5mg/l  FeSO4、pH6.8、30mg/lカナマイシン）に植菌し、24時間30℃で振とう培養した。培養後の各染色体縮小化株の濁度を660nmの吸収で測定した。W3110red株の濁度を100としたときの各染色体縮小化株の濁度および各染色体縮小化株の染色体ＤＮＡの総欠失長を第３表に記す。【０１７２】
【表３】
2009116566.tif 000118
【０１７３】
（３）ATP生産活性
W3110red株、Step28株およびS10株のATP生産活性をそれぞれ以下の方法で測定した。各菌株をＬＢ寒天培地に塗布し、30℃にて一晩培養した。ＬＢ寒天培地上に生育した菌体を少量かきとり、3％グルコースを含むＬＢ培地1mlを入れた96穴ディープウェルプレートに植菌し、30℃で24時間培養した。培養後の濁度を590nmの吸収で測定した。また、J. Biomol. Screen., 11, 310 (2006)に記載の方法により、培養液あたりのATP生産活性を測定した。W3110red株の培養液あたりのATP生産活性を100としたときのStep28株およびS10株の培養液あたりのATP生産活性を第４表に示した。S10株では、培養液あたりのATP生産活性が顕著に向上した。【０１７４】
【表４】
2009116566.tif 000119
【実施例２】
【０１７５】
キシリトール生産性株の作製
Step28株ならびにS10株が保持するλRed組換え系を野生型recBCD組換え系に置換した株を以下のように作製した。
λRed系遺伝子群が存在する染色体近傍に位置するygdB遺伝子を特開2004-166576に記載の方法を用いてクロラムフェニコール耐性遺伝子とレバンシュークラーゼ遺伝子を含むDNA断片と置換する。作製した菌株に対して、野生型株から取得したP1ファージでの形質導入を行い、シュークロース耐性株を取得することで、ygdB遺伝子近傍が野生型の染色体断片（recBCD遺伝子群を含む）に置換した株を取得する。Step28株ならびにS10株から作製したrecBCD株をそれぞれS28W株、S10W株と命名した。【０１７６】
次にS28W株ならびにS10W株のlacI遺伝子を以下の方法にて復帰させた。まず特開2004-166576に記載の方法を用いてクロラムフェニコール耐性遺伝子とレバンシュークラーゼ遺伝子を含むDNA断片をW3110red株染色体に挿入すると同時に表１に記載のyafW遺伝子からyahM遺伝子までの領域を欠失させた。この菌株からＰ１ファージを調製し、S28W株ならびにS10W株への形質導入を行い、クロラムフェニコール耐性株を取得することで該マーカー遺伝子近傍のlacI遺伝子が形質導入されたlacI復帰株を取得した。取得したlacI遺伝子復帰株のクロラムフェニコール耐性遺伝子とレバンシュークラーゼ遺伝子を含むマーカー部分を特開2004-166576に記載の方法を用いて除去した。最終的に作製したS28W株およびS10W株由来のlacI遺伝子復帰株を、S28W_lacI株およびS10W_lacI株と命名した。  【０１７７】
次にAppl. Environ. Microbiol., 73, 7657 (2007)に記載の方法を用いて、Ｗ3110株、S28W_lacI株ならびにS10W_lacI株の各菌株にキシリトール生産性遺伝子群を導入し、キシロースからキシリトールへの変換能力を付与した菌株を作製した。作製した各菌株をM9最小培地に、6％グルコース、8％キシロース、１％酵母エキス、0.1mM  IPTG、100mM MOPSバッファーを添加したもの）を含む培地30mlに接種し、300mlバッフル付フラスコで30℃、250rpmで振盪培養した。培養46時間目の培養液中のキシリトール量を測定したところ、W3110株、S28W_lacI株ならびにS10W_lacI株をそれぞれ親株とするキシリトール生産株の培養において、培養液中に14.3、13.5、20.6 g/lのキシリトールが生産されており、S10株由来の株において最もキシリトールの生産性が高かった。
【産業上の利用可能性】
【０１７８】
本発明の大腸菌の変異体を宿主細胞として用いることにより、有用物質を効率よく製造することができる。
【配列表】
2009116566000001.app
【国際調査報告】
2009116566.tif 000120
2009116566.tif 000121
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