(57)【要約】  試料に対する励起光の照射方向に対して厚みのある試料が配置されたマイクロアレイを使用する場合でも、試料からの蛍光強度を正確に検出することができる蛍光検出装置を提供することを目的とする。本発明に係る蛍光検出装置(6)は、蛍光物質を含む透光性の試料(4)からの蛍光を検出する蛍光検出装置であって、試料に励起光を照射する励起光照射手段(12)と、試料からの蛍光を検出する検出手段(18)と、試料に対する励起光の照射角を試料の寸法に応じて調整する照射角調整手段(14)と、を備えている。
2013137247.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
蛍光物質を含む透光性の試料からの蛍光を検出する蛍光検出装置であって、
前記試料に励起光を照射する励起光照射手段と、
前記試料からの蛍光を検出する検出手段と、
前記試料に対する励起光の照射角を試料の寸法に応じて調整する照射角調整手段と、
を備えている、
ことを特徴とする蛍光検出装置。
【請求項２】
前記照射角調整手段は、前記試料に対する励起光の照射角θが以下の式を満たすように、前記励起光の照射角を調整する、
請求項１に記載の蛍光検出装置。
【数１】
2013137247.tif 000007
（ここで、ｔは前記試料の厚みであり、ｙは前記試料の幅である。）
【請求項３】
前記照射角調整手段は、前記試料の厚みが０．１〜１ｍｍである場合、前記試料に対する前記励起光の照射角θが１５〜６０°の範囲内となるように、前記励起光の照射角を調整する、
請求項１に記載の蛍光検出装置。
【請求項４】
前記試料から前記検出手段に向かう蛍光の光路上に配置され、前記蛍光を前記検出手段に合焦する集光レンズを備え、
前記励起光照射手段は、前記集光レンズの光軸を中心とした円周上に均等な角度間隔にて配置された複数の励起光照射手段、又は、前記集光レンズの周囲に配置された円環型の励起光照射手段により構成される、請求項１〜３の何れか１項に記載の蛍光検出装置。
【請求項５】
前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記試料が配置されたマイクロアレイとの、前記集光レンズの光軸方向における距離を調整する、焦点調整手段を備えた、請求項４に記載の蛍光検出装置。
【請求項６】
前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記試料が配置されたマイクロアレイとを、前記集光レンズの光軸と直交する方向に相対的に移動させる、検出位置調整手段を備えた、請求項４又は５に記載の蛍光検出装置。
【請求項７】
更に、前記試料を透過する透過光を前記試料に照射する透過光照射手段を備え、
前記検出手段は、前記試料を透過した透過光の光路上に配置され、当該試料を透過した透過光を検出する、
請求項１〜６の何れか１項に記載の蛍光検出装置。
【請求項８】
更に、前記透過光照射手段から出射された透過光を拡散するための拡散板を備え、
前記拡散板は、前記透過光照射手段から前記試料に向かう透過光の光路上に配置される、
請求項７に記載の蛍光検出装置。
【請求項９】
更に、前記透過光照射手段から前記試料に向かう透過光の光路上から前記拡散板を出し入れする拡散板移動手段を備えた、請求項８に記載の蛍光検出装置。
【請求項１０】
請求項１〜９の何れか１項に記載の蛍光検出装置を使用する蛍光検出方法であって、
前記励起光照射手段により励起光を前記試料に照射し、当該試料に含まれる蛍光物質を励起する工程と、
前記励起された蛍光物質から発せられた蛍光を前記検出手段により検出する工程と、を含む、
蛍光検出方法。
【請求項１１】
前記蛍光検出装置は、前記試料から前記検出手段に向かう蛍光の光路上に配置され、前記蛍光を前記検出手段に合焦する集光レンズと、前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記試料が配置されたマイクロアレイとの、前記集光レンズの光軸方向における距離を調整する、焦点調整手段と、を備え、
前記焦点調整手段により、前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記マイクロアレイとの、前記集光レンズの光軸方向における距離を調整して、前記集光レンズの焦点を前記試料に合わせる工程を含み、
前記集光レンズの焦点を前記試料に合わせる工程の後、前記励起光を試料に照射する工程を実行する、請求項１０に記載の蛍光検出方法。
【請求項１２】
前記蛍光検出装置は、前記試料を透過する透過光を前記試料に照射する透過光照射手段を備え、
前記集光レンズの焦点を前記試料に合わせる工程は、
前記透過光照射手段により、透過光を前記試料に照射する工程と、
前記焦点調整手段により、前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記マイクロアレイとの、前記集光レンズの光軸方向における距離を段階的に変化させながら、前記試料を透過した透過光を前記検出手段により検出する工程と、
前記検出手段により検出された透過光の画像に基づき、前記集光レンズの焦点が前記試料に合う位置を判定する工程と、を含む、
請求項１１記載の蛍光検出方法。
【請求項１３】
前記蛍光検出装置は、前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記マイクロアレイとを、前記集光レンズの光軸と直交する方向に相対的に移動させる、検出位置調整手段を備え、
前記蛍光を検出する工程は、
前記検出位置調整手段により、前記集光レンズ及び前記検出手段と、前記マイクロアレイとを、前記集光レンズの光軸と直交する方向に相対的に移動させる工程と、
前記検出位置調整手段による前記移動の度に、前記励起された蛍光物質から発せられた蛍光を検出する工程と、を含む、
請求項１２記載の蛍光検出方法。
【請求項１４】
前記蛍光検出装置は、前記透過光照射手段から出射された透過光を拡散するための拡散板を備え、
前記透過光を前記試料に照射する工程は、前記拡散板を、前記透過光照射手段から前記試料に向かう透過光の光路上に配置する工程を含み、
前記励起光を照射する工程は、前記拡散板を、前記透過光照射手段から前記試料に向かう透過光の光路上から取り除く工程を含む、
請求項１２又は１３に記載の蛍光検出方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、蛍光検出装置及びそれを用いた蛍光検出方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
マイクロアレイとは、検査・実験の対象物を多数固定化しておき、これに対して一度に検査・実験を行うための材料または技術を指す総称である。特に生物学・医学・薬学の方面で、２０世紀末から核酸を対象とするＤＮＡマイクロアレイを中心として開発が進み、利用されるようになってきた。【０００３】
例えば、ＤＮＡマイクロアレイを利用する場合、サンプルからｍＲＮＡを抽出し、逆転写によって合成したｃＤＮＡをビオチン標識して、ＤＮＡマイクロアレイの基板上のＤＮＡとハイブリダイゼーションを行う。そして、ハイブリダイゼーションにより形成された試料に励起光を照射し、試料に含まれる蛍光物質が発する蛍光強度を蛍光顕微鏡や蛍光レーザースキャナー等で検出する。検出された蛍光強度に基づき、ｍＲＮＡの発現量を判定することができる。【０００４】
マイクロアレイに配置された試料に励起光を照射し、試料からの蛍光を検出する蛍光検出装置には、一般的に、同軸落射方式と非同軸落射方式との２種類の方式がある。同軸落射方式では、励起光の光路上に設置された集光レンズを通して試料に励起光を照射し、且つ、励起光によって励起された試料からの蛍光を同じ集光レンズで集光して撮像素子に合焦させる。【０００５】
この同軸落射方式では、励起光が集光レンズを通過する際に発生する集光レンズの自家蛍光によって装置バックグラウンドが上昇するので、試料からの微弱な蛍光を正確に検出することが困難である。【０００６】
そこで、同軸落射方式の欠点を改善した装置として、特許文献１に示すような非同軸落射方式が知られている。特許文献１に記載された装置では、試料に斜め下方から励起光を照射し、この励起光の光軸に重ならないように試料の下方に配置されたレンズにより試料からの蛍光を集光する。この装置では、励起光がレンズを通過しないため、レンズの自家蛍光の発生が防止される。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】特開２００５−６２０２３号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
スライドガラス等の平面基板の表面に試料を配置したマイクロアレイを使用する場合、試料に対する励起光の照射方向に対して試料の厚みが小さいので、特許文献１に記載されたような従来の装置により、励起光を試料中に十分に進入させることができ、試料からの蛍光強度を正確に検出することが可能である。
しかしながら、平板状の部材に形成された貫通孔中に試料が充填されたマイクロアレイ（例えば、三菱レイヨン社製の繊維型ＤＮＡチップ（ジェノパール（登録商標）；特許第４１５０３３０号公報、特許第３６５４８９４号公報等））を使用する場合、励起光の照射方向に対して試料の厚みが大きいので、特許文献１に記載されているような従来の装置では、励起光が試料中に十分に進入せず、試料からの蛍光強度を正確に検出することができない。【０００９】
従って、本発明の主な目的は、試料に対する励起光の照射方向に対して厚みのある試料が配置されたマイクロアレイを使用する場合でも、試料からの蛍光強度を正確に検出することができる蛍光検出装置及び蛍光検出方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
上記の目的を達成するため、本発明の第１発明によれば、蛍光検出装置は、蛍光物質を含む透光性の試料からの蛍光を検出する蛍光検出装置であって、試料に励起光を照射する励起光照射手段と、試料からの蛍光を検出する検出手段と、試料に対する励起光の照射角を試料の寸法に応じて調整する照射角調整手段と、を備えていることを特徴とする。【００１１】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、照射角調整手段は、試料に対する励起光の照射角θが以下の式を満たすように、励起光の照射角を調整する。
【数１】
2013137247.tif 000003
（ここで、ｔは試料の厚みであり、ｙは試料の幅である。）【００１２】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、照射角調整手段は、試料の厚みが０．１〜１ｍｍである場合、試料に対する励起光の照射角θが１５〜６０°の範囲内となるように、励起光の照射角を調整する。【００１３】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、試料から検出手段に向かう蛍光の光路上に配置され、蛍光を検出手段に合焦する集光レンズを備え、励起光照射手段は、集光レンズの光軸を中心とした円周上に均等な角度間隔にて配置された複数の励起光照射手段、又は、集光レンズの周囲に配置された円環型の励起光照射手段により構成される。【００１４】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、集光レンズ及び検出手段と、試料が配置されたマイクロアレイとの、集光レンズの光軸方向における距離を調整する、焦点調整手段を備える。【００１５】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、集光レンズ及び検出手段と、試料が配置されたマイクロアレイとを、集光レンズの光軸と直交する方向に相対的に移動させる、検出位置調整手段を備える。【００１６】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、更に、試料を透過する透過光を試料に照射する透過光照射手段を備え、検出手段は、試料を透過した透過光の光路上に配置され、当該試料を透過した透過光を検出する。【００１７】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、更に、透過光照射手段から出射された透過光を拡散するための拡散板を備え、拡散板は、透過光照射手段から試料に向かう透過光の光路上に配置される。【００１８】
また、本発明の第１発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、更に、透過光照射手段から試料に向かう透過光の光路上から拡散板を出し入れする拡散板移動手段を備える。【００１９】
また、本発明の第２発明によれば、蛍光検出方法は、本発明の第１発明による蛍光検出装置を使用する蛍光検出方法であって、励起光照射手段により励起光を試料に照射し、当該試料に含まれる蛍光物質を励起する工程と、励起された蛍光物質から発せられた蛍光を検出手段により検出する工程と、を含む。【００２０】
また、本発明の第２発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、試料から検出手段に向かう蛍光の光路上に配置され、蛍光を検出手段に合焦する集光レンズと、集光レンズ及び検出手段と、試料が配置されたマイクロアレイとの、集光レンズの光軸方向における距離を調整する、焦点調整手段と、を備え、蛍光検出方法は、焦点調整手段により、集光レンズ及び検出手段と、マイクロアレイとの、集光レンズの光軸方向における距離を調整して、集光レンズの焦点を試料に合わせる工程を含み、集光レンズの焦点を試料に合わせる工程の後、励起光を試料に照射する工程を実行する。【００２１】
また、本発明の第２発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、試料を透過する透過光を試料に照射する透過光照射手段を備え、集光レンズの焦点を試料に合わせる工程は、透過光照射手段により、透過光を試料に照射する工程と、焦点調整手段により、集光レンズ及び検出手段と、マイクロアレイとの、集光レンズの光軸方向における距離を段階的に変化させながら、試料を透過した透過光を検出手段により検出する工程と、検出手段により検出された透過光の画像に基づき、集光レンズの焦点が試料に合う位置を判定する工程と、を含む。【００２２】
また、本発明の第２発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、集光レンズ及び検出手段と、マイクロアレイとを、集光レンズの光軸と直交する方向に相対的に移動させる、検出位置調整手段を備え、蛍光を検出する工程は、検出位置調整手段により、集光レンズ及び検出手段と、マイクロアレイとを、集光レンズの光軸と直交する方向に相対的に移動させる工程と、検出位置調整手段による移動の度に、励起された蛍光物質から発せられた蛍光を検出する工程と、を含む。【００２３】
また、本発明の第２発明において、好ましくは、蛍光検出装置は、透過光照射手段から出射された透過光を拡散するための拡散板を備え、透過光を試料に照射する工程は、拡散板を、透過光照射手段から試料に向かう透過光の光路上に配置する工程を含み、励起光を照射する工程は、拡散板を、透過光照射手段から試料に向かう透過光の光路上から取り除く工程を含む。
【発明の効果】
【００２４】
本発明の蛍光検出装置及び蛍光検出方法によれば、集光レンズの自家蛍光による装置バックグラウンド上昇を抑制することができるとともに、試料に対する励起光の照射方向に対して厚みのある試料が配置されたマイクロアレイを使用する場合でも、試料からの蛍光強度を正確に検出することができる。
【図面の簡単な説明】
【００２５】
【図１】本発明の実施形態による蛍光検出装置に適用されるマイクロアレイの概略的な平面図である。
【図２】本発明の実施形態による蛍光検出装置の構成を示す概略的な図面である。
【図３】本発明の実施形態による蛍光検出装置における、試料に対する励起光の照射角を示す拡大側面図である。
【図４】試料に対する励起光の照射角を２０°とした本発明の実施例１の蛍光検出装置による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。
【図５】試料に対する励起光の照射角を５５°とした本発明の実施例２の蛍光検出装置による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。
【図６】試料に対する励起光の照射角を７０°とした比較例１の蛍光検出装置による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。
【図７】比較例２の、励起光源に高圧水銀ランプを使用した一般的な同軸落射方式の蛍光顕微鏡による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。
【発明を実施するための形態】
【００２６】
（１）マイクロアレイ
まず、図１により、本発明の実施形態の蛍光検出装置に適用されるマイクロアレイの一例について説明する。図１は、本発明の実施形態の蛍光検出装置に適用されるマイクロアレイの概略的な平面図である。なお、適用されるマイクロアレイは、図１のマイクロアレイに制限されるものではなく、厚みのある試料が配置された各種のマイクロアレイを本発明の実施形態の蛍光検出装置に適用できる。
【００２７】
例えば、図１のマイクロアレイ１は、光を透過しない平板状の部材２を有する。この部材２には、部材２の両面間を貫通するように複数の試料４が配置されている。試料４の形状は特に制限されるものではないが、円形断面を有することが好ましい。試料４には、検体とハイブリダイゼーションするプローブとなりうる生態関連物質が固定されている。プローブは、試料４の内部に直接的に、又はゲルを介して間接的に固定されている。部材２の材質は特に限定されないが、例えば、アクリル、ポリカーボネート、ウレタン等の樹脂にカーボンブラックを練り込んだ、光を反射し難く且つ透過し難い材質が好ましい。
【００２８】
プローブの固定に使用されるゲルは特に限定されないが、例えば、アクリルアミド、Ｎ，Ｎ−ジメチルアクリルアミド、Ｎ−イソプロピルアクリルアミド、Ｎ−アクリロイルアミノエトキシエタノール、Ｎ−アクリロイルアミノプロパノール、Ｎ−メチロールアクリルアミド、Ｎ−ビニルピロリドン、ヒドロキシエチルメタクリレート、（メタ）アクリル酸、アリルデキストリン等の単量体の少なくとも一種以上と、メチレンビス（メタ）アクリルアミド、ポリエチレングリコールジ（メタ）アクリレート等の多官能性単量体とを共重合したゲルが挙げられる。その他、マイクロアレイ１に用いることのできるゲルとしては、例えば、アガロース、アルギン酸、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリエチレングリコール等のゲル、又はこれらを架橋したゲルが挙げられる。
【００２９】
このようなマイクロアレイ１は、特開２０００−２７０８７８号公報に記載されたような方法によって製造することが可能である。蛍光検出装置は、１枚のマイクロアレイ１を単独で測定してもよく、あるいは、複数区画に分割された容器（いわゆるウェルプレート）の各区画に配置された複数のマイクロアレイ１を測定してもよい。
【００３０】
（２）蛍光検出装置
次に、図２及び図３を参照して、本発明の好ましい実施形態の蛍光検出装置の構成について説明する。図２は、本発明の実施形態による蛍光検出装置の構成を概略的に示す図面である。
【００３１】
図２に示すように、蛍光検出装置６は、マイクロアレイ１を積載する積載ステージ８を備えている。積載ステージ８の上方には、マイクロアレイ１中のゲルを透過する透過光を照射する透過光照射手段１０が設けられている。また、積載ステージ８の下方には、マイクロアレイ１の斜め下方から励起光を照射する励起光照射手段１２と、マイクロアレイ１の試料４に照射される励起光の照射角を調整する照射角調整手段１４が設けられている。さらに、積載ステージ８の下方には、マイクロアレイ１中のゲルを透過した透過光及びマイクロアレイ１からの蛍光を集光する集光レンズ１６が設けられている。集光レンズ１６は、積載ステージ８上に設置されたマイクロアレイ１の面方向に対して光軸が直交するように配置される。この集光レンズ１６の下方には、集光レンズ１６によって合焦された透過光及び蛍光を検出する検出手段１８が設けられている。検出手段１８は、励起光や外乱光が検出手段１８に入射しないようにするために、マイクロアレイ１中の試料４から発せられる蛍光を透過させ、且つ、蛍光物質を励起させる励起光を透過させない蛍光用フィルター２０を備えている。
【００３２】
透過光照射手段１０、積載ステージ８、集光レンズ１６及び検出手段１８は、この順序にて集光レンズ１６の光軸上に配置される。また、励起光照射手段１２は、励起光の光路に検出手段１８が入らないように、即ち、励起光が集光レンズ１６に直接入射しない位置から、直接的に又は光ファイバー等の導光手段を通して間接的に励起光をマイクロアレイ１に照射するように設置されている。
【００３３】
（２−１）透過光照射手段
透過光照射手段１０は、積載ステージ８上に積載されたマイクロアレイ１の上方から、マイクロアレイ１の表面に対して垂直に透過光を照射できるように、集光レンズ１６の光軸上に配置される。
【００３４】
透過光照射手段１０に用いる光源の種類は特には限定されないが、蛍光用フィルター２０を透過する波長の光を出射可能な光源を使用する。
【００３５】
例えば、試料４が蛍光色素Ｃｙ５（６５０ｎｍの励起光を照射すると、６６０ｎｍの蛍光を発する）を含む場合、この試料４からの蛍光のみを検出手段１８に到達させるため、６５８〜６６５ｎｍの光だけ通過させるような蛍光用フィルター２０を使用する。この場合には、波長が６５８〜６６５ｎｍの光を出射可能な光源を、透過光照射手段１０に使用する。
【００３６】
透過光照射手段１０として使用する光源としては、例えば、ハロゲンランプ、ＬＥＤ、レーザー等を使用することができる。これらの中でも、マイクロアレイ１の試料４全体に透過光を照射可能な、面照射用タイプのＬＥＤが好ましい。
【００３７】
透過光照射手段１０から照射される透過光の強さや、透過光照射手段１０からマイクロアレイ１又は集光レンズ１６までの距離は、集光レンズ１６に透過光を到達させることができるように設定される。
【００３８】
また、必要に応じて、透過光がマイクロアレイ１に到達する際の光量斑を抑えるために、透過光照射手段１０から出射された透過光を拡散する拡散板２２を、透過光照射手段１０とマイクロアレイ１との間に配置してもよい。拡散板２２は、例えば白色のアクリル板や、紙を貼り付けた透明ガラス板等により構成される。
この拡散板２２は、拡散板移動手段２４により支持されている。拡散板移動手段２４は、透過光照射手段１０から試料４に向かう透過光の光路上から拡散板２２を出し入れする。この拡散板移動手段２４は、ロータリーソレノイドやＤＣモータにより構成される。拡散板２２は、減速機構を介して、あるいは直接的に拡散板移動手段２４の駆動軸に連結されており、拡散板移動手段２４の動作に応じて、透過光照射手段１０から試料４に向かう透過光の光路上の位置と、透過光照射手段１０から試料４に向かう透過光の光路から外れた位置との間で、移動可能となっている。
【００３９】
（２−２）積載ステージ
積載ステージ８は、測定対象となるマイクロアレイ１を積載する。積載ステージ８には、透過光や励起光、試料４から発せられる蛍光等を通過させられるように、窓が設けられ、又は、孔が形成されている。積載ステージ８は、複数のマイクロアレイ１を積載してもよい。
【００４０】
積載ステージ８は、集光レンズ１６及び検出手段１８と、マイクロアレイ１とを、集光レンズ１６の光軸と直交する方向に相対的に移動させるための検出位置調整手段２６により支持される。この検出位置調整手段２６は、例えば、顕微鏡用の２軸のＸＹステージ等を利用して構成される。
【００４１】
さらに、積載ステージ８は、集光レンズ１６及び検出手段１８と、マイクロアレイ１との、集光レンズ１６の光軸方向における距離を調整するための焦点調整手段２８により支持される。この焦点調整手段２８は、例えば、顕微鏡用のＺステージ等を利用して構成され、積載ステージ８を集光レンズ１６の光軸に沿って移動させる。
【００４２】
（２−３）励起光照射手段
励起光照射手段１２は、マイクロアレイ１に配置された試料４中の蛍光物質を励起する波長成分の光を出射する。例えば、励起光照射手段１２としては、ＬＥＤ、レーザー、高圧水銀ランプ、キセノン灯、メタルハライド等を使用することができる。さらには、光源からの光をファイバーやレンズ等で導光することにより照射することもできる。この励起光照射手段１２は、照射角調整手段１４により支持されている。
【００４３】
励起光照射手段１２が出射する光の照度分布は、できるだけ均一であることが好ましく、例えばシェーディング補正のような公知の方法により補正することができる。また、励起光照射手段１２が出射する光の強度は、できるだけ強い方が好ましい。
【００４４】
励起光照射手段１２から出射される励起光の波長成分を、試料４中の蛍光物質を励起させる波長成分に限定するため、励起光照射手段１２とマイクロアレイ１との間に励起用フィルター３０が配置される。この励起用フィルター３０は、試料４中の蛍光物質を励起させる波長成分の光だけを透過させ、その他の波長成分の光をカットする。
【００４５】
例えば、蛍光色素としてＣｙ５（６５０ｎｍの励起光を照射すると、６６０ｎｍの蛍光を発する）を使用する場合、励起光のみを試料４に照射するため、波長が６５０ｎｍ前後の光だけを通過させる励起用フィルター３０を使用する。これにより、波長が６６０ｎｍの光がマイクロアレイ１に照射されないようにすることができるので、マイクロアレイ１の表面で反射した波長６６０ｎｍの光が集光レンズ１６に入射してバックグラウンドを上昇させるのを防ぐことができる。
【００４６】
図３は、本発明の実施形態による蛍光検出装置６における、試料４に対する励起光の照射角を示す拡大側面図である。ここで「照射角」とは、積載ステージ８に積載されたマイクロアレイ１の試料４の下面に対する照射角を指す（図３中のθ）。すなわち、試料４の中心軸線と集光レンズ１６の光軸とが合致するように、積載ステージ８の水平面内におけるマイクロアレイ１の位置をセットした状態で、励起光照射手段１２から試料４の下面に照射角θで励起光が照射される。
【００４７】
励起光照射手段１２から試料４に照射される励起光の照射角θは、試料４の下面に対して１５〜６０°の範囲内であることが好ましい。照射角θを１５°以上とすることにより、励起光が集光レンズ１６に遮られたり、励起光照射手段１２と集光レンズ１６が接触したりすることを防止できる。また、照射角θを６０°以下とすることにより、厚みのある試料４に対しても励起光を十分に進入させ、試料４からの蛍光を正確に検出することができる。励起光の照射角θは、１５〜５５°の範囲内であることがより好ましく、１５〜４５°の範囲内であることが更に好ましい。
【００４８】
また、照射角θが以下の式を満たすように、励起光の照射角θを調整してもよい。
【００４９】
【数２】
2013137247.tif 000004
ここで、「ｔ」は試料４の厚み（ｍｍ）、「ｙ」は試料４の長径又は直径（ｍｍ）を表す。試料４の厚みｔは、０．１〜１ｍｍの範囲が好ましい。試料４の厚みｔは、より好ましくは０．１〜０．５ｍｍであり、更に好ましくは０．１〜０．２５ｍｍである。試料４の直径ｙは、上記の好ましい照射角θを実現可能な範囲であれば良い。
【００５０】
励起光照射手段１２から試料４に照射される励起光の照射角θは、照射角調整手段１４により調整される。この照射角調整手段１４は、励起光照射手段１２を、励起光が照射される試料４の下面を中心とした円弧に沿って回転移動させるものであり、例えば、手動又は自動のゴニオステージにより構成される。
この照射角調整手段１４は、上述したように試料４の厚みｔに応じて決定された照射角θを実現するように、手動又は自動により、励起光照射手段１２を回転移動させる。
【００５１】
照射分布を抑えて均一な励起光を試料４に照射するのが好ましいので、複数（２個以上）の励起光照射手段２１を設けることが好ましい。励起光照射手段１２の個数は特に限定されるものではないが、８個より多くしても更なる効果の向上は得られにくいので、２〜８個の励起光照射手段１２を設けることが好ましい。
【００５２】
複数の励起光照射手段１２を用いる場合は、各励起光照射手段１２を、集光レンズ１６の光軸を中心とした円周上に均等に配置することが好ましい。例えば、４個の励起光照射手段１２を配置する場合、集光レンズ１６の光軸を中心とした円周上に、９０°間隔で各励起光照射手段１２を配置する。
【００５３】
また、集光レンズ１６の周囲に円環型の励起光照射手段１２を配置してもよい。円環型の励起光照射手段１２は、例えば、柔軟性を有する円環状の基板に高密度に光源を実装することにより構成される。この場合、円環型の励起光照射手段１２は、円環形状の中心軸線がマイクロアレイ１の面方向と直交するように配置される。照射角調整手段１４は、上述したようにマイクロアレイの厚みｔに応じて決定された照射角θを実現するように、柔軟性を有する円環状の基板の傾斜を変化させる。この円環型の励起光照射手段によっても、試料４に照射される励起光の照射分布を抑えることが可能である。
【００５４】
励起光照射手段１２とマイクロアレイ１との距離は、照射する励起光の強さや励起光照射手段１２の数等に応じて適宜選択することができる。励起光照射手段１２とマイクロアレイ１との距離が近いほど励起光の減衰が小さくなるので、励起光照射手段１２がマイクロアレイ１に近い方が好ましい。しかし、励起光照射手段１２とマイクロアレイ１との距離が近すぎると、集光レンズ１６の視野内に励起光照射手段１２が入ることになるため、励起光照射手段１２が集光レンズ１６の視野内に入らない程度の距離を保つことが好ましい。
【００５５】
（２−４）集光レンズ
集光レンズ１６としては、顕微鏡用の対物レンズ等を使用することができる。マイクロアレイ検出装置１は、試料４から発せられる蛍光の検出に使用されるので、蛍光顕微鏡用に設計された自家蛍光の少ないレンズを集光レンズ１６に使用することが好ましい。
【００５６】
集光レンズ１６の種類は特に限定されるものではないが、励起光照射手段１２から照射された励起光が集光レンズ１６によって遮蔽されることを避けるため、作動距離（マイクロアレイ１に焦点を合わせたときのマイクロアレイ１と集光レンズ１６の先端との距離）が長く、外径の細いレンズを使用することが好ましい。
【００５７】
（２−５）検出手段
検出手段１８としては、ＣＣＤセンサ、ＣＭＯＳセンサ又はラインセンサ等を使用することができる。特に、マイクロアレイ１の試料４から発せられた微弱な蛍光を少ないノイズで検出又は撮像できるように、センサ冷却機能を備えた冷却ＣＣＤカメラを検出手段１８に用いることが好ましい。検出手段１８は、この検出手段１８の光軸が集光レンズ１６の光軸と整合する（光軸上に一直線に配置される）ように、鏡筒（図示せず）と合わせて蛍光検出装置６に組み込まれる。
【００５８】
また、検出手段１８に、マイクロアレイ１の試料４から発せられる蛍光を透過させ、蛍光物質を励起させる励起光を透過させないようにするための蛍光用フィルター２０を配置してもよい。例えば、蛍光色素としてＣｙ５（６５０ｎｍの励起光を照射すると６６０ｎｍの蛍光を発する）を使用する場合、反射した励起光や試料４の外から入ってきた光等が検出手段１８に入らないように、例えば６５８〜６６５ｎｍの光だけ通過させるようなフィルターを蛍光用フィルター２０として使用する。このように蛍光用フィルター２０を使用することにより、蛍光のみが検出手段１８に届くようにすることができる。
【００５９】
検出手段１８によって検出された蛍光（撮像された画像）はパソコン等の演算装置に送られ、任意のアルゴリズムに従って画像解析、データ処理が行われる。データ処理では、マイクロアレイ１の各試料４毎の階調値を数値化してＣＳＶデータ等に出力することが行われる。
【００６０】
（３）マイクロアレイの検出方法
（３−１）マイクロアレイに透過光を照射することによって得られたマイクロアレイの透過光画像からピント位置を調整する工程
マイクロアレイ１を積載ステージ８上にセットし、集光レンズ１６の先端とマイクロアレイ１との距離が集光レンズ１６の作動距離（集光レンズ１６の仕様により既知）となるように、焦点調整手段２８により、集光レンズ１６の光軸に沿って積載ステージ２５を移動させる。その後、拡散板移動手段２４により、透過光照射手段１０から試料４に向かう透過光の光路上に拡散板２２を配置する。次いで、拡散板２２を介して透過光照射手段１０がマイクロアレイ１に透過光を照射している状態で、例えば、積載ステージ８を、集光レンズ１６の光軸に沿って前後１ｍｍの間を０．０５ｍｍピッチで移動させながら、検出手段１８により、マイクロアレイ１の試料４を透過した透過光によるマイクロアレイ１の透過画像を撮像する。そして、最もコントラストが高い（コントラストが極大）透過画像が撮像されたときの積載ステージ２５の位置を、集光レンズ１６の焦点が試料４に合う焦点位置として決定する。この焦点位置で検出された透過光（透過画像）は、演算装置へ送られ、（３−４）にて後述する工程で数値化処理に使用される。
【００６１】
（３−２）マイクロアレイの試料に励起光を照射することにより、試料に結合した蛍光物質を励起する工程
続いて、透過光照射手段１０による透過光の照射を停止し、拡散板移動手段２４により、透過光照射手段１０から試料４に向かう透過光の光路上から拡散板２２を抜去する。次いで、励起光照射手段１２によりマイクロアレイ１の試料４に励起光を照射する。このときの励起光の照射角等の条件は上述した通りである。励起光を試料４に照射することによって、試料４に結合した蛍光物質を励起することができる。
【００６２】
（３−３）励起された試料からの蛍光を検出する工程
励起光照射手段１２により励起光を照射している状態で、検出手段１８により、マイクロアレイ１の試料４による蛍光を検出（蛍光画像を撮像）する。ここで検出した蛍光（撮像した蛍光画像）は演算装置へ送られ、（３−４）にて後述する工程で数値化処理に供される。
【００６３】
（３−４）数値化処理を行う工程
（３−１）にて上述した工程において、透過光は、マイクロアレイ１の試料４の部分のみを透過し、光を透過しない部材２を含むその他の部分を透過しない。従って、（３−１）の工程で得られた透過画像を、任意に設定した閾値に基づいて２値化すると、試料４の部分は“１”、光を透過しない部材２を含むその他の部分は“０”で表現される。この２値化した画像から、各試料４の重心座標を算出し記憶する。
【００６４】
次いで、（３−３）にて上述した工程で得られた蛍光画像において、各試料４の重心座標を中心とする所定半径（マイクロアレイ１の試料４の内径）の円に囲まれた領域の画素の階調値（検出手段１８により検出された光の明るさを示す数値）を測定する。これにより、マイクロアレイ１の試料４の蛍光量が検出される。
【００６５】
（３−５）積載ステージを移動させる工程
積載ステージ８が複数のマイクロアレイ１を積載している場合には、検出位置調整手段２６によって積載ステージ８を移動させることにより、各マイクロアレイ１の試料４から発せられる蛍光を検出する。即ち、上述した各工程により、１つのマイクロアレイ１の試料４から発せられる蛍光を検出した後、検出位置調整手段２６により、集光レンズ１６の光軸と直交する方向に積載ステージ８を移動させ、蛍光の検出が行われていないマイクロアレイ１を集光レンズ１６の光軸上に配置する。そして、上述した各工程により、このマイクロアレイ１の試料４から発せられる蛍光を検出する。このような積載ステージ８の移動とマイクロアレイの試料４から発せられる蛍光の検出とを、積載ステージ８に積載された全てのマイクロアレイ１について繰り返す。
【実施例】
【００６６】
以下、本発明の実施例である。【００６７】
１．マイクロアレイの作製
まず、厚さ０．１ｍｍの多孔板２枚を準備した。この多孔板の中央部には、直径０．３２ｍｍの貫通孔が、０．４２ｍｍの間隔を空けて、５行×５列の格子状に合計２５個配列されている。これらの多孔板の全ての貫通孔に、カーボンブラックで着色したポリカーボネート製中空繊維（外径０．２８ｍｍ、内径０．１８ｍｍ、長さ５００ｍｍ）を通過させた。この中空繊維を通過させた２枚の多孔板を互いから５０ｍｍ離間させ、それらの離間した多孔板間に、カーボンブラックで着色したポリウレタン樹脂を充填することにより、両端に樹脂で固定化されない部分を有する、２０ｍｍ角で長さ５０ｍｍの角柱状の中空繊維配列体を得た。【００６８】
得られた中空繊維配列体中の各中空繊維内に、ジメチルアクリルアミド（３．８質量％）ゲル前駆体溶液と表１に示す濃度比率で希釈・調整したＣｙ５蛍光物質とを混合した溶液を充填し、ゲル前駆体溶液とＣｙ５蛍光物質とを重合させた。その後、ミクロトームにて、中空繊維の軸線方向と直交する方向に沿って、角柱状の中空繊維配列体から厚さ０．２５ｍｍの薄片を切り出すことにより、マイクロアレイ（キャピラリー・アレイ・シート）を得た。得られたマイクロアレイをスライドガラス上に置き、水に浸した状態でカバーガラスをかけて積載ステージ上にセットした。【００６９】
【表１】
2013137247.tif 000005
【００７０】
２．蛍光検出装置構成
図１に示したような蛍光検出装置を、表２に示す部品により構成した。【００７１】
【表２】
2013137247.tif 000006
＜実施例１＞
本実施例１で使用したマイクロアレイは、上述した通り、試料の厚さが０．２５ｍｍ、試料の直径が０．１８ｍｍである。この場合、上述の式（１）によれば、照射角θは約２０°と算出される。そこで、励起光照射手段を、励起光がマイクロアレイの試料の表面に対して２０°の照射角で照射されるように配置した。４個の励起光照射手段を、集光レンズの光軸を中心とした円周上に、９０°間隔で均等に配置した。集光レンズとマイクロアレイとの距離を２１ｍｍとした際に、集光レンズの撮像範囲内の光量分布が中央と周辺で約５％程度の光量差となるようにした。【００７２】
まず、透過光照射手段によりマイクロアレイの試料に透過光のみを照射した状態で、積載ステージを、集光レンズの光軸に沿って前後１ｍｍの間を０．０５ｍｍピッチで移動させながら、検出手段により、マイクロアレイの試料を透過した透過光による透過画像を撮像した。そして、最もコントラストが高い（コントラストが極大）透過画像が撮像されたときの積載ステージの位置をピント位置として決定した。また、このピント位置で撮像された透過画像を、所定の閾値に基づいて２値化し、各試料の重心座標を算出した。【００７３】
図４は、マイクロアレイの試料に対する励起光の照射角を２０°とした本発明の実施例１の蛍光検出装置による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。この図４において、横軸はＣｙ５蛍光物質の濃度比率を示し、縦軸は蛍光検出装置により検出された蛍光量を示す。本実施例１の蛍光検出装置によりマイクロアレイの試料による蛍光を検出した結果、図４に示すように、Ｃｙ５の濃度比率が０．０００３２から１までの範囲全体にわたって、Ｃｙ５の濃度比率と検出された蛍光量との間に高い直線性が得られた。すなわち、実施例１の蛍光検出装置により、試料からの蛍光が非常に正確に検出されたことが分かった。
＜実施例２＞
図５は、マイクロアレイの試料に対する励起光の照射角を５５°とした本発明の実施例２の蛍光検出装置による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。マイクロアレイの試料に対する励起光の照射角を５５°とした以外は、実施例１と同様に実験を行った。この実施例２では、図５に示すように、Ｃｙ５濃度が０．０００３２から１までの範囲全体にわたって、Ｃｙ５の濃度比率と検出された蛍光量との間に高い直線性が得られた。すなわち、実施例２の蛍光検出装置により、試料からの蛍光が非常に正確に検出されたことが分かった。【００７４】
＜比較例１＞
図６は、マイクロアレイの試料に対する励起光の照射角を７０°とした比較例１の蛍光検出装置による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。マイクロアレイの試料に対する励起光の照射角度を７０°とした以外は、実施例１と同様に実験を行った。この比較例１では、図６に示すように、Ｃｙ５濃度が０．００１６から１までの範囲においては、Ｃｙ５の濃度比率と検出された蛍光量との間に直線性が得られたものの、Ｃｙ５濃度が０．００１６以下の範囲ではＣｙ５の濃度比率と検出された蛍光量との間に直線性が得られなかった。すなわち、比較例１の蛍光検出装置では、試料からの蛍光が正確に検出されなかった。【００７５】
＜比較例２＞
図７は、比較例２の、励起光源に高圧水銀ランプを使用した一般的な同軸落射方式の蛍光顕微鏡（ニコン製  ＥＣＬＩＰＳＥ  Ｅ６００）による、マイクロアレイの試料の蛍光量の検出結果を示す線図である。この比較例２では、集光レンズ内の自家蛍光等により装置バックグラウンドが高いため、図７に示すように、Ｃｙ５濃度が０．００１６から１までの範囲においては、Ｃｙ５の濃度比率と検出された蛍光量との間に直線性が得られたものの、Ｃｙ５濃度が０．００１６以下の範囲ではＣｙ５の濃度比率と検出された蛍光量との間に直線性が得られなかった。すなわち、比較例２の蛍光顕微鏡では、試料からの蛍光が正確に検出されなかった。
【符号の説明】
【００７６】
１  マイクロアレイ
２  光を透過しない部材
４  試料
６  蛍光検出装置
８  積載ステージ
１０  透過光照射手段
１２  励起光照射手段
１４  照射角調整手段
１６  集光レンズ
１８  検出手段
２０  蛍光用フィルター
２２  拡散板
２４  拡散板移動手段
２６  検出位置調整手段
２８  焦点調整手段
３０  励起用フィルター
【図１】
2013137247.tif 000008
【図２】
2013137247.tif 000009
【図３】
2013137247.tif 000010
【図４】
2013137247.tif 000011
【図５】
2013137247.tif 000012
【図６】
2013137247.tif 000013
【図７】
2013137247.tif 000014
【国際調査報告】
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2013137247.tif 000016
2013137247.tif 000017
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