(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現するヒト細胞集団においてＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法であって、
ａ）ヒト多能性幹細胞を培養する工程と、
ｂ）前記多能性幹細胞を、胚体内胚葉系（definitive endoderm lineage）に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程と、
ｃ）前記胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程であって、前記胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を分化させるために用いる培地に、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチンＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加する工程と、
ｄ）前記膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、前記膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程と、
を含む、方法。
【請求項２】
前記膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を分化させるために用いる培地が、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチンＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加される、請求項１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願の相互参照）
本出願は、米国特許仮出願第６１／２８９，６９２号（２００９年１２月２３日出願）の利益を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、多能性幹細胞からのインスリン産生細胞への分化を促進させるための方法を提供する。具体的には本発明は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団において、ＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法を提供する。
【背景技術】
【０００３】
Ｉ型糖尿病の細胞置換療法の進歩及び移植可能なランゲルハンス島の不足により、生着に適したインスリン産生細胞すなわちβ細胞の供給源の開発に注目が集まっている。１つの手法は、例えば、胚性幹細胞のような多能性幹細胞から機能性のβ細胞を生成することである。
【０００４】
脊椎動物の胚発生中、多能性細胞は、原腸形成として公知のプロセスにより３つの胚葉（外胚葉、中胚葉、及び内胚葉）を含む細胞のグループを生じる。例えば、甲状腺、胸腺、膵臓、腸、及び肝臓などの組織は、内胚葉から中間ステージを経て発達する。このプロセスにおける中間ステージは、胚体内胚葉（definitive endoderm）の形成である。胚体内胚葉細胞はＨＮＦ３  β、ＧＡＴＡ４、ＭＩＸＬ１、ＣＸＣＲ４及びＳＯＸ１７などの多数のマーカーを発現する。
【０００５】
膵臓の形成は、胚体内胚葉が膵臓内胚葉へと分化させることにより生じる。膵臓内胚葉の細胞は膵臓−十二指腸ホメオボックス遺伝子、ＰＤＸ１を発現する。ＰＤＸ１が存在しない場合、膵臓は、腹側芽及び背側芽の形成より先に発達が進行しない。したがって、ＰＤＸ１の発現は、膵臓器官形成において重要な工程として特徴付けられる。成熟した膵臓は、他の細胞型間で外分泌組織及び内分泌組織を含有する。外分泌組織及び内分泌組織は、膵臓内胚葉の分化によって生じる。
【０００６】
島細胞の特徴を保持する細胞がマウスの胚細胞からｉｎ  ｖｉｔｒｏで誘導されたことが報告されている。例えば、Ｌｕｍｅｌｓｋｙら（Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２９２：１３８９，２００１）は、膵島と同様のインスリン分泌構造へのマウスの胚性幹細胞の分化を報告している。Ｓｏｒｉａら（Ｄｉａｂｅｔｅｓ  ４９：１５７，２０００）は、ストレプトゾトシン誘発糖尿病のマウスに移植したとき、マウスの胚性幹細胞から誘導されたインスリン分泌細胞が血糖を正常化することを報告している。
【０００７】
一例において、Ｈｏｒｉら（ＰＮＡＳ  ９９：１６１０５，２００２）は、ホスホイノシチド３−キナーゼ（ＬＹ２９４００２）の阻害剤でマウス胚性幹細胞を処理することにより、β細胞に類似した細胞が生じたことを開示している。
【０００８】
他の例では、Ｂｌｙｓｚｃｚｕｋら（ＰＮＡＳ  １００：９９８，２００３）が、Ｐａｘ４を構成的に発現するマウス胚性幹細胞からのインスリン産生細胞の生成を報告している。
【０００９】
Ｍｉｃａｌｌｅｆらは、レチノイン酸が、胚性幹細胞のＰＤＸ１陽性膵臓内胚葉の形成に対する関与を制御できることを報告している。レチノイン酸は、胚における原腸形成の終了時に該当する期間中、胚性幹細胞分化の４日目に培養液に添加すると、ＰＤＸ１発現の誘導に最も効果的である（Ｄｉａｂｅｔｅｓ  ５４：３０１，２００５）。
【００１０】
Ｍｉｙａｚａｋｉらは、Ｐｄｘ１を過剰発現するマウス胚性幹細胞株を報告している。この結果は、外因性のＰｄｘ１発現が、得られた分化細胞内でインスリン、ソマトスタチン、グルコキナーゼ、ニューロゲニン３、ｐ４８、Ｐａｘ６、及びＨＮＦ６の発現を明らかに増加させたことを示している（Ｄｉａｂｅｔｅｓ  ５３：１０３０，２００４）。
【００１１】
Ｓｋｏｕｄｙらは、マウス胚性幹細胞内で、アクチビンＡ（ＴＧＦβスーパーファミリーのメンバー）が、膵臓外分泌遺伝子（ｐ４８及びアミラーゼ）、並びに内分泌遺伝子（Ｐｄｘ１、インスリン及びグルカゴン）の発現を上方制御することを報告している。最大の効果は、１ｎＭアクチビンＡを使用した場合に認められた。Ｓｋｏｕｄｙらはまた、インスリン及びＰｄｘ１  ｍＲＮＡの発現レベルはレチノイン酸により影響されなかったが、３ｎＭのＦＧＦ７による処理によりＰｄｘ１の転写レベルが増加したことも観察している（Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．３７９：７４９，２００４）。
【００１２】
Ｓｈｉｒａｋｉらは、ＰＤＸ１陽性細胞への胚性幹細胞の分化を特異的に増加させる増殖因子の効果を研究した。Ｓｈｉｒａｋｉらは、ＴＧＦβ２によってＰＤＸ１陽性細胞がより高い比率で再現性よく得られたことを観察している（Ｇｅｎｅｓ  Ｃｅｌｌｓ．２００５  Ｊｕｎ；１０（６）：５０３〜１６．）。
【００１３】
Ｇｏｒｄｏｎらは、血清の非存在下、かつアクチビンとＷｎｔシグナル伝達阻害剤の存在下での、マウス胚性幹細胞からの短尾奇形［陽性］／ＨＮＦ−３  β［陽性］内胚葉細胞への誘導を示した（米国特許第２００６／０００３４４６（Ａ１）号）。
【００１４】
Ｇｏｒｄｏｎら（ＰＮＡＳ，Ｖｏｌ  １０３，１６８０６ページ，２００６）は、「Ｗｎｔ及びＴＧＦ−β／ｎｏｄａｌ／アクチビンの同時シグナル伝達が前原始線条の形成には必要であった」と述べている。
【００１５】
しかしながら、胚性幹細胞発達のマウスモデルは、例えば、ヒトなどのより高等な哺乳動物における発達プログラムを正確には模倣しない恐れがある。
【００１６】
Ｔｈｏｍｓｏｎらは、ヒト胚盤胞から胚性幹細胞を単離した（Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８２：１１４，１９９８）。同時に、Ｇｅａｒｈａｒｔ及び共同研究者は、胎児生殖腺組織から、ヒト胚生殖（ｈＥＧ）細胞株を誘導した（Ｓｈａｍｂｌｏｔｔら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９５：１３７２６、１９９８年）。白血病抑制因子（ＬＩＦ）と共に培養することだけで分化を簡単に阻止し得るマウス胚性幹細胞とは異なり、ヒト胚性幹細胞は、非常に特殊な条件下で維持する必要がある（米国特許第６，２００，８０６号、国際公開第９９／２０７４１号；同第０１／５１６１６号）。
【００１７】
Ｄ’Ａｍｏｕｒらは、高濃度のアクチビン及び低濃度の血清の存在下で、ヒト胚性幹細胞由来の胚体内胚葉の濃縮化された培養物が調製されたことを述べている（Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２００５）。これらの細胞を、マウスの腎臓被膜下に移植することにより、内胚葉性器官の特徴の一部を有するより成熟した細胞への分化が得られた。ヒト胚性幹細胞由来の胚体内胚葉細胞は、ＦＧＦ−１０の添加後、ＰＤＸ１陽性細胞に更に分化させることができる（米国特許出願公開第２００５／０２６６５５４（Ａ１）号）。
【００１８】
Ｄ’Ａｍｏｕｒら（Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ−２４，１３９２〜１４０１（２００６））は、「我々は、ヒト胚性幹細胞（ｈＥＳ）を、インスリン、グルカゴン、ソマトスタチン、膵臓ポリペプチド及びグレリンといった膵臓ホルモンを合成可能な内分泌細胞へと転換させる分化プロセスを開発した。このプロセスは、胚体内胚葉、腸管内胚葉、膵臓内胚葉及び内分泌前駆体が、内分泌ホルモンを発現する細胞へと向かう段階に類似した段階を介して細胞を指向させることにより、ｉｎ  ｖｉｖｏでの膵臓器官形成を模倣する。」と述べている。
【００１９】
別の例において、Ｆｉｓｋらは、ヒト胚性幹細胞から膵島細胞を産生するシステムを報告している（米国特許出願公開第２００６／００４０３８７（Ａ１）号）。この場合、分化経路は３つのステージに分割された。先ず、ヒト胚性幹細胞を、酪酸ナトリウムとアクチビンＡの組み合わせを用いて内胚葉に分化させた。次に細胞をノギンなどのＴＧＦβアンタゴニストとＥＧＦ又はベータセルリンの組み合わせと培養してＰＤＸ１陽性細胞を生成する。最終分化は、ニコチンアミドにより誘導した。
【００２０】
一例において、Ｂｅｎｖｅｎｉｓｔｒｙらは、「我々は、ＰＤＸ１の過剰発現が、膵臓に多く見られる遺伝子の発現を上昇させたことを結論付ける。インスリン発現の誘導には、ｉｎ  ｖｉｖｏでのみ存在する更なるシグナルを必要とする可能性がある。」と述べている（Ｂｅｎｖｅｎｉｓｔｒｙら、Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２００６；２４：１９２３〜１９３０）。
【００２１】
他の例では、Ｇｒａｐｉｎ−Ｂｏｔｔｏｎらは次のように記載している：「Ｎｇｎ３を初期活性化させると、ほぼ例外なくグルカゴン［陽性］細胞を誘導し、膵臓前駆細胞プールを消費した。Ｅ１１．５からＰＤＸ−１前駆細胞はコンピテントになり、インスリン［陽性］でＰＰ［陽性］の細胞へと分化させた」（Ｊｏｈａｎｓｓｏｎ  ＫＡら、Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ  Ｃｅｌｌ  １２，４５７〜４６５，Ｍａｒｃｈ  ２００７）。
【００２２】
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞でＮＧＮ３が発現すると、インスリンを発現する細胞へと更に分化させるための細胞能力が低下する恐れがある。これまでの研究により、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞のうち、ＮＧＮ３を発現する細胞は、更なる分化を受けた際に、インスリンを発現する細胞よりも、グルカゴンを発現する細胞を産生しやすいということが示されている。しかしながら、ＮＧＮ３発現は、膵内分泌細胞又は膵内分泌前駆細胞（例えばグルカゴン又はインスリンを発現する細胞を形成することのできる細胞）の形成に必要とされる。したがって、膵内分泌前駆細胞の最終的な運命をインスリンを発現する細胞へと誘導するにあたり、ＮＧＮ３の一時的な制御が重要である。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００２３】
したがって、インスリンを発現する細胞へと分化させる可能性を維持する一方で、現在の臨床上のニーズに対処するよう拡張できる、多能性幹細胞株を確立するための条件を開発する有意な必要性が今尚存在する。本発明は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞においてＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法を提供することにより、ヒト胚性幹細胞からインスリン発現細胞への分化効率を改善させるという代替アプローチを用いる。
【課題を解決するための手段】
【００２４】
一実施形態では、本発明は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団においてＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法を提供し、この方法は、
ａ）多能性幹細胞を培養する工程と、
ｂ）多能性幹細胞を、胚体内胚葉系（definitive endoderm lineage）に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程と、
ｃ）胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程であって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を分化させるために用いる培地に、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加する工程と、
ｄ）膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程と、を含む。
【００２５】
一実施形態では、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を分化させるために用いる培地には、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加される。
【発明を実施するための形態】
【００２６】
開示を明確にするため、及び限定ではなく、本発明の「発明を実施するための形態」を、本発明の特定の特徴、実施形態又は応用を説明若しくは図示した以下の小項目に分ける。
【００２７】
定義
幹細胞は、単一の細胞レベルにおいて自己再生及び分化させて、自己再生前駆細胞、非再生前駆細胞、及び最終分化細胞を含む、後代細胞を生成する、能力で定義される未分化細胞である。幹細胞は、複数の胚葉（内胚葉、中胚葉及び外胚葉）から様々な細胞系の機能的細胞へとｉｎ  ｖｉｔｒｏで分化させる能力、並びに移植後に複数の胚葉の組織を生じ、及び胚盤胞への注入後、全部ではないとしても大部分の組織に実質的に寄与する能力によっても特徴付けられる。
【００２８】
幹細胞は、発生能によって、（１）全胚及び胚体外細胞型を生じる能力を意味する全能性、（２）全胚細胞型を生じる能力を意味する多能性、（３）細胞系統の小集合を生じるが、全て特定の組織、器官又は生理的システム内で生じる能力を意味する多能性（例えば、造血幹細胞（ＨＳＣ）は、ＨＳＣ（自己複製）、血液細胞に限定された寡能性前駆細胞、並びに血液の通常の構成要素である全細胞型及び要素（例えば、血小板）を含む子孫を産生できる）、（４）多能性幹細胞と比較して、より限定された細胞系統の小集合を生じる能力を意味する寡能性、並びに（５）１つの細胞系統（例えば、精子形成幹細胞）を生じる能力を意味する単能性に分類される。
【００２９】
分化は、非特殊化（「未確定」）又は低特殊化細胞が、例えば、神経細胞又は筋細胞などの特殊化細胞の特徴を獲得するプロセスである。分化細胞又は分化を誘導された細胞は、細胞系内でより特殊化した（「確定した」）状況を呈している細胞である。分化プロセスに適用された際の用語「確定した」は、通常の環境下で特定の細胞型又は細胞型の小集合への分化を続け、かつ通常の環境下で異なる細胞型に分化させたり、又は低分化細胞型に戻ることができない地点まで、分化経路において進行した細胞を指す。脱分化は、細胞が細胞系内で低特殊化（又は確定）した状況に戻るプロセスを指す。本明細書で使用するとき、細胞系は、細胞の遺伝、すなわちその細胞がどの細胞から来たか、またどの細胞を生じ得るかを規定する。細胞系は、細胞を発生及び分化の遺伝的スキーム内に配置する。系特異的なマーカーは、対象とする系の細胞の表現型に特異的に関連した特徴を指し、未確定の細胞の対象とする系への分化を評価する際に使用可能である。
【００３０】
本明細書で使用するとき、「胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞」又は「ステージ１細胞」又は「ステージ１」とは、以下のマーカーの少なくとも１つを意味する：ＳＯＸ１７、ＧＡＴＡ４、ＨＮＦ３  β、ＧＳＣ、ＣＥＲ１、Ｎｏｄａｌ、ＦＧＦ８、短尾奇形、Ｍｉｘ−様ホメオボックスタンパク質（Mix-like homeobox protein）、ＦＧＦ４  ＣＤ４８、ｅｏｍｅｓｏｄｅｒｍｉｎ（ＥＯＭＥＳ）、ＤＫＫ４、ＦＧＦ１７、ＧＡＴＡ６、ＣＸＣＲ４、Ｃ−Ｋｉｔ、ＣＤ９９、又はＯＴＸ２。胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞には、原始線条前駆体細胞、原始線条細胞、中内胚葉細胞及び胚体内胚葉細胞が挙げられる。
【００３１】
本明細書で使用するとき、「膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞」とは、以下のマーカー、すなわち、ＰＤＸ１、ＨＮＦ１  β、ＰＴＦ１  α、ＨＮＦ６、ＮＫＸ６．１、又はＨＢ９のうちの少なくとも１つを発現する細胞を指す。膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞には、膵臓内胚葉細胞、原腸管細胞、後部前腸細胞が挙げられる。
【００３２】
本明細書で使用するとき、「胚体内胚葉」は、原腸形成中、胚盤葉上層から生じ、胃腸管及びその誘導体を形成する細胞の特徴を保持する細胞を指す。胚体内胚葉細胞は、ＨＮＦ３  β、ＧＡＴＡ４、ＳＯＸ１７、ケルベロス、ＯＴＸ２、グースコイド、Ｃ−Ｋｉｔ、ＣＤ９９、及びＭＩＸＬ１のマーカーを発現する。
【００３３】
本明細書で使用するとき、「マーカー」は、対象とする細胞で差異的に発現される核酸又はポリペプチド分子である。この文脈において、差次的な発現は、陽性マーカーの発現レベルの上昇、及び陰性マーカーのレベルの減少を意味する。マーカー核酸又はポリペプチドの検出可能なレベルは、他の細胞と比較して対象とする細胞内で充分高いか又は低く、そのため当該技術分野において既知の多様な方法のいずれかを使用して、対象とする細胞を他の細胞から識別及び区別することができる。
【００３４】
本明細書で言うところの「膵臓内分泌細胞」又は「膵臓ホルモン発現細胞」とは、以下のホルモン、すなわちインスリン、グルカゴン、ソマトスタチン、及び膵臓ポリペプチドの内の少なくとも１つを発現することが可能な細胞を指して言う。
【００３５】
多能性幹細胞の単離、増殖及び培養
多能性幹細胞の特徴付け
多能性幹細胞は、ステージ特異的胚抗原（ＳＳＥＡ）３及び４、並びにＴｒａ−１−６０及びＴｒａ−１−８１と呼ばれる抗体によって検出可能なマーカーのうちの１つ以上を発現する（Ｔｈｏｍｓｏｎら，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８２：１１４５，１９９８）。多能性幹細胞をｉｎ  ｖｉｔｒｏで分化させると、ＳＳＥＡ−４、Ｔｒａ−１−６０、及びＴｒａ−１−８１（存在する場合）の発現が減少し、ＳＳＥＡ−１の発現が上昇する。未分化の多能性幹細胞は通常アルカリホスファターゼ活性を有し、細胞を４％パラホルムアルデヒドで固定した後、製造業者（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｂｕｒｌｉｎｇａｍｅ  Ｃａｌｉｆ．）の説明書に従ってＶｅｃｔｏｒ  Ｒｅｄを基質として発生させることによって検出可能である。未分化の多能性幹細胞は、ＯＣＴ４及びＴＥＲＴも通常発現し、ＲＴ−ＰＣＲにより検出される。
【００３６】
増殖した多能性幹細胞の他の望ましい表現型は、３つの全胚葉：内胚葉、中胚葉、及び外胚葉組織の細胞に分化させる可能性があることである。多能性幹細胞の多能性は、例えば、細胞を重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）マウスに注入し、形成される奇形腫を４％パラホルムアルデヒドで固定し、次いでこれを３つの胚細胞層由来の細胞種の根拠について組織学的に調べることによって確認することができる。あるいは、胚様体を形成させ、この胚様体を３つの胚葉に関連したマーカーの存在に関して評価することにより、多能性を決定してもよい。
【００３７】
増殖した多能性幹細胞株を、標準的なＧバンド法を使用して核型決定し、確立された対応する霊長類種の核型と比較してもよい。細胞が正倍数体であり、全ヒト染色体が存在し、かつ著しく変更されてはいないことを意味する、「正常な核型」を有する細胞を獲得することが望ましい。
【００３８】
多能性幹細胞源
使用が可能な多能性幹細胞の種類としては、妊娠期間中の任意の時期（必ずしもではないが、通常は妊娠約１０〜１２週よりも前）に採取した前胚性組織（例えば胚盤胞など）、胚性組織、胎児組織などの、妊娠後に形成される組織に由来する多能性細胞の株化細胞系が挙げられる。非限定的な例は、例えばヒト胚幹細胞株Ｈ１、Ｈ７、及びＨ９（ＷｉＣｅｌｌ）などのヒト胚幹細胞又はヒト胚生殖細胞の確立株である。それらの細胞の最初の樹立又は安定化中に本開示の組成物を使用することも想定され、その場合、供給源となる細胞は、供給源となる組織から直接採取した一次多能性細胞であろう。フィーダー細胞の不在下で既に培養された多能性幹細胞集団から採取した細胞も好適である。例えば、ＢＧ０１ｖ（ＢｒｅｓａＧｅｎ（Ａｔｈｅｎｓ，ＧＡ））などの変異ヒト胚性幹細胞株も好適である。
【００３９】
一実施形態では、ヒト胚性幹細胞はＴｈｏｍｓｏｎらにより説明されているように調製される（米国特許第５，８４３，７８０号；Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８２：１１４５，１９９８；Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐ．Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．３８：１３３  ｆｆ．，１９９８；Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９２：７８４４，１９９５）。
【００４０】
多能性幹細胞の培養
一実施形態では、多能性幹細胞は、典型的にはフィーダー細胞の層上で培養され、このフィーダー細胞は、多能性幹細胞を様々な方法で支持する。あるいは、多能性幹細胞を、フィーダー細胞を本質的に含まないにも関わらず、細胞を実質的に分化させることなく多能性幹細胞の増殖を支持するような培養システム中で培養する。フィーダー細胞不含培養における多能性幹細胞の、分化を伴わない増殖は、あらかじめ他の細胞種を培養することにより馴化培地を使用して支持される。あるいはフィーダー細胞不含培養における多能性幹細胞の分化を伴わない増殖は、合成培地を使用して支持される。
【００４１】
例えば、Ｒｅｕｂｉｎｏｆｆら（Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １８：３９９〜４０４（２０００））及びＴｈｏｍｐｓｏｎら（Ｓｃｉｅｎｃｅ  ６  Ｎｏｖｅｍｂｅｒ  １９９８：Ｖｏｌ．２８２．ｎｏ．５３９１，ｐｐ．１１４５〜１１４７）は、マウス胚性線維芽細胞フィーダー細胞層を用いるヒト胚盤胞からの多能性幹細胞株の培養を開示している。
【００４２】
Ｒｉｃｈａｒｄｓら（Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２１：５４６〜５５６，２００３）は、１１種類の異なるヒトの成人、胎児、及び新生児フィーダー細胞層についてヒト多能性幹細胞の培養を支持する能力の評価を行っている。Ｒｉｃｈａｒｄｓらは、「成人の皮膚線維芽フィーダー細胞上で培養したヒト胚性幹細胞系は、ヒト胚性幹細胞の形態を有し、多能性を維持する」と述べている。
【００４３】
米国特許出願公開第２００２００７２１１７号は、フィーダーを含まない培養において霊長類の多能性幹細胞の増殖を支持する培地を生成する細胞系を開示している。使用される細胞系は、胚性組織から得られるか又は胚性幹細胞から分化させた間葉系かつ線維芽細胞様の細胞系である。米国特許出願公開第２００２００７２１１７号は、また、この細胞系の１次フィーダー細胞層としての使用も開示している。
【００４４】
別の例において、Ｗａｎｇら（Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２３：１２２１〜１２２７、２００５年）は、ヒト胚幹細胞由来のフィーダー細胞層上でのヒト多能性幹細胞の長期間増殖のための方法を開示している。
【００４５】
別の例として、ストイコビッチら（Ｓｔｏｊｋｏｖｉｃ  ｅｔ  ａｌ．Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２００５  ２３：３０６〜３１４，２００５）は、ヒト胚性幹細胞の自然分化により誘導されたフィーダー細胞システムを開示している。
【００４６】
更なる別の例で、Ｍｉｙａｍｏｔｏら（Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２２：４３３〜４４０，２００４）は、ヒトの胎盤から得られたフィーダー細胞の供給源を開示している。
【００４７】
Ａｍｉｔら（Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ  ６８：２１５０〜２１５６，２００３）は、ヒト包皮に由来するフィーダー細胞層を開示している。
【００４８】
別の例で、Ｉｎｚｕｎｚａら（Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２３：５４４〜５４９，２００５）は、ヒトの出生直後産児の包皮線維芽細胞からのフィーダー細胞層を開示している。
【００４９】
米国特許第６６４２０４８号は、フィーダーを含まない培養における霊長類の多能性幹（ｐＰＳ）細胞の増殖を支持する培地、及びこうした培地の製造に有用な細胞系を開示している。米国特許第６６４２０４８号は、「本発明は、胚性組織から得られるかあるいは胚性幹細胞から分化させた間葉系かつ線維芽細胞様の細胞系を含む。本開示では、こうした細胞系を誘導し、培地を調整し、この馴化培地を用いて幹細胞を増殖させるための方法を説明及び図示する」と述べている。
【００５０】
別の例で、国際公開第２００５０１４７９９号は、哺乳動物細胞の維持、増殖及び分化のための馴化培地を開示している。国際公開特許第２００５０１４７９９号は、「本発明に従って製造される培地は、マウス細胞、特にＭＭＨ（Ｍｅｔマウス肝細胞）と称される分化及び不死化したトランスジェニック肝細胞の細胞分泌活性によって馴化される」と述べている。
【００５１】
別の例として、Ｘｕら（Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２２：９７２〜９８０，２００４）は、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素を過剰発現するように遺伝子改変されたヒト胚性幹細胞由来細胞から得られた馴化培地を開示している。
【００５２】
別の例で、米国特許出願公開第２００７００１００１１号は、多能性幹細胞を維持するための合成培地を開示している。
【００５３】
代替的な培養システムは、胚性幹細胞の増殖を促進することが可能な増殖因子を追加された無血清培地を使用する。例えば、Ｃｈｅｏｎら（Ｂｉｏ  Ｒｅｐｒｏｄ  ＤＯＩ：１０．１０９５／ｂｉｏｌｒｅｐｒｏｄ．１０５．０４６８７０，Ｏｃｔｏｂｅｒ  １９，２００５）は、胚性幹細胞の自己再生の誘発が可能な異なる増殖因子を追加された非馴化血清補充（ＳＲ）培地中に胚性幹細胞が維持されている、フィーダー細胞を含まずかつ血清を含まない培養システムを開示している。
【００５４】
別の例において、Ｌｅｖｅｎｓｔｅｉｎら（Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２４：５６８〜５７４，２００６）は、線維芽細胞又は馴化培地の非存在下で、ｂＦＧＦを追加された培地を使用して、胚幹細胞を長期間培養する方法を開示している。
【００５５】
別の例において、米国特許出願公開第２００５０１４８０７０号は、血清及び繊維芽細胞フィーダー細胞方法を含まない合成培地中でのヒト胚幹細胞の培養方法を開示し、同方法は、アルブミン、アミノ酸、ビタミン、無機物、少なくとも１つのトランスフェリン又はトランスフェリン代替物、少なくとも１つのインスリン又はインスリン代替物を含有する培地中で細胞を培養し、この培地は、本質的に哺乳動物胎児血清を含有せず、線維芽細胞増殖因子シグナル伝達受容体を活性化できる少なくとも約１００ｎｇ／ｍＬの線維芽細胞増殖因子を含有し、増殖因子は、線維芽細胞フィーダー層のみでなく他の源からも供給され、培地はフィーダー細胞又は馴化培地なしで、未分化状態の幹細胞の増殖を支持した。
【００５６】
別の例で、米国特許出願公開第２００５０２３３４４６号は、未分化の霊長類始原幹細胞などの幹細胞の培養に有用な合成培地を開示している。溶液では、培地は培養されている幹細胞と比較して実質的に等張である。所定の培養において、特定の培地は、基本培地及び実質的に未分化の始原幹細胞の増殖の支持に必要な量のｂＦＧＦ、インスリン、及びアスコルビン酸を含有する。
【００５７】
別の例として、米国特許第６８００４８０号は、「一実施形態では、実質的に未分化状態の霊長類由来の始原幹細胞を増殖させるための細胞培地であって、霊長類由来の始原幹細胞の増殖を支持する上で効果的な低浸透圧、低エンドトキシンの基本培地を含む細胞培地を提供する。この基本培地は、霊長類由来の始原幹細胞の増殖を支持する上で効果的な栄養素血清、並びにフィーダー細胞及びフィーダー細胞から誘導される細胞外支持体成分からなる群から選択される支持体と組み合わされる。培地は更に、非必須アミノ酸、抗酸化剤、並びにヌクレオシド及びピルビン酸塩からなる群から選択される第１の増殖因子を含む。」と述べている。
【００５８】
別の例として、米国特許出願公開第２００５０２４４９６２号は、「一態様において、本発明は霊長類胚性幹細胞の培養方法を提供する。１つの方法は、哺乳動物の胎児血清を本質的に含まない（好ましくはあらゆる動物の血清をも本質的に含まない）培地中で、線維芽フィーダー細胞層以外の供給源から供給される線維芽細胞増殖因子の存在下で、幹細胞を培養する。好ましい形態では、十分な量の線維芽増殖因子を添加することによって、幹細胞の培養を維持するために従来必要とされていた線維芽フィーダー細胞層の必要性がなくなる。
【００５９】
更なる例において、国際公開第２００５０６５３５４号は、フィーダー及び血清を本質的に含まない合成等張培地を開示しており、この培地は、ａ．基本培地と、ｂ．実質的に未分化の哺乳類幹細胞の増殖を支持するのに十分な量のｂＦＧＦと、ｃ．実質的に未分化の哺乳類幹細胞の増殖を支持するのに十分な量のインスリンと、ｄ．実質的に未分化の哺乳類幹細胞の増殖を支持するのに十分な量のアスコルビン酸と、を含む。
【００６０】
別の例で、国際公開第２００５０８６８４５号は、細胞を未分化な状態に維持するのに充分な量の、トランスフォーミング増殖因子β（ＴＧＦ−β）ファミリータンパク質の構成員、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）ファミリータンパク質の構成員、又はニコチンアミド（ＮＩＣ）に、所望の結果を得るのに充分な時間幹細胞を曝露することを含む、未分化の幹細胞を維持するための方法を開示している。
【００６１】
多能性幹細胞は、好適な培養基材上に播くことができる。一実施形態では、好適な培養基材は、例えば基底膜から作製されたもの、又は接着分子受容体−リガンド結合の一部を形成し得るものなどの細胞外マトリックス成分である。一実施形態では、好適な培養基質は、ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｅｎｓｏｎ）である。ＭＡＴＲＩＧＥＬ（登録商標）は、Ｅｎｇｅｌｂｒｅｔｈ−Ｈｏｌｍ  Ｓｗａｒｍ腫瘍細胞由来の可溶性製剤であって、室温でゲル化して再構成基底膜を形成する。
【００６２】
他の細胞外マトリックス成分及び成分混合物は代替物として好適である。これには、増殖させる細胞型に応じて、ラミニン、フィブロネクチン、プロテオグリカン、エンタクチン、ヘパラン硫塩、及び同様物を単独で又は様々な組み合わせで挙げてもよい。
【００６３】
多能性幹細胞は、細胞の生存、増殖、及び所望の特徴の維持を促進する培地の存在下で、基材上に好適に分布させることで播いてもよい。これら全ての特徴は、播種分布に細心の注意を払うことから利益が得られ、かつ当業者により容易に決定可能である。
【００６４】
好適な培地は、以下の成分、すなわち例えばダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）、Ｇｉｂｃｏ  ＃  １１９６５−０９２；ノックアウトダルベッコ改変イーグル培地（ＫＯ  ＤＭＥＭ）、Ｇｉｂｃｏ  ＃  １０８２９−０１８；ハムＦ１２／５０％  ＤＭＥＭ基本培地；２００ｍＭ  Ｌ−グルタミン、Ｇｉｂｃｏ  ＃  １５０３９−０２７；非必須アミノ酸溶液、Ｇｉｂｃｏ  ＃  １１１４０−０５０；β−メルカプトエタノール、Ｓｉｇｍａ  ＃  Ｍ７５２２；ヒト組み換え塩基性繊維芽細胞増殖因子（ｂＦＧＦ）、Ｇｉｂｃｏ  ＃  １３２５６−０２９等から調製することもできる。
【００６５】
ＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１発現が増加した膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団の形成
一実施形態では、本発明は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団においてＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法を提供し、この方法は、
ａ）多能性幹細胞を培養する工程と、
ｂ）多能性幹細胞を、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程と、
ｃ）胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程であって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞の分化させるために用いる培地に、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加する工程と、
ｄ）膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させる工程と、を含む。
【００６６】
胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞への多能性幹細胞の分化
胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞の形成は、以下の特定のプロトコルの前後に、マーカーの存在に関して試験することにより決定され得る。多能性幹細胞は、一般にこのようなマーカーを発現しない。したがって、多能性細胞の分化は、細胞がそれらの発現を開始した際に検出される。
【００６７】
多能性幹細胞は、当該技術分野のいかなる方法、又は本発明で提案されるいかなる方法によって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させてもよい。
【００６８】
例えば、多能性幹細胞は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２３，１５３４〜１５４１（２００５）に開示される方法に従って胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００６９】
例えば、多能性幹細胞は、Ｓｈｉｎｏｚａｋｉら、Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  １３１，１６５１〜１６６２（２００４）により開示される方法に従って、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００７０】
例えば、多能性幹細胞は、ＭｃＬｅａｎら、Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ  ２５，２９〜３８（２００７）により開示される方法に従って、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００７１】
例えば、多能性幹細胞は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２４，１３９２〜１４０１（２００６）に開示される方法に従って胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００７２】
例えば、多能性幹細胞は、アクチビンＡを含む培地中、血清の非存在下で多能性幹細胞を培養し、次いで細胞をアクチビンＡ及び血清と培養し、次いで細胞をアクチビンＡ及び異なる濃度の血清と培養することによって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。この方法の一例は、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２３，１５３４〜１５４１（２００５）に開示されている。
【００７３】
例えば、多能性幹細胞は、アクチビンＡを含む培地中、血清の非存在下で多能性幹細胞を培養し、次いで細胞をアクチビンＡと、別の濃度の血清の存在下で培養することによって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。この方法の例は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（２００５）に開示されている。
【００７４】
例えば、多能性幹細胞は、アクチビンＡ及びＷｎｔリガンドを含む培地中、血清の非存在下で多能性幹細胞を培養し、次いでＷｎｔリガンドを除去し、細胞をアクチビンＡと、血清の存在下で培養することによって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。この方法の例は、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２４，１３９２〜１４０１（２００６）に開示されている。
【００７５】
例えば、多能性幹細胞は、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された米国特許出願第１１／７３６，９０８号に開示される方法に従って、多能性幹細胞を処理することによって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００７６】
例えば、多能性幹細胞は、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された米国特許出願第１１／７７９，３１１号に開示される方法に従って、多能性幹細胞を処理することによって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００７７】
例えば、多能性幹細胞は、米国特許出願第６０／９９０，５２９号に開示される方法に従って多能性幹細胞を処理することによって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させることができる。
【００７８】
例えば、多能性幹細胞は、米国特許出願第６１／０７６，８８９号に開示される方法に従って、多能性幹細胞を処理することによって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させることができる。
【００７９】
例えば、多能性幹細胞は、米国特許出願第６１／０７６，９００号に開示される方法に従って多能性幹細胞を処理することによって胚体内胚葉系統に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させることができる。
【００８０】
例えば、多能性幹細胞は、米国特許出願第６１／０７６，９０８号に開示される方法に従って多能性幹細胞を処理することによって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させることができる。
【００８１】
例えば、多能性幹細胞は、米国特許出願第６１／０７６，９１５号に開示される方法に従って多能性幹細胞を処理することによって胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させることができる。
【００８２】
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞への、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞の分化
胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、当該技術分野の任意の方法、又は本発明で提案する任意の方法により、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させ得る。
【００８３】
例えば、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２４：１３９２〜１４０１，２００６に開示されている方法に従って、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させ得る。
【００８４】
例えば、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、線維芽細胞増殖因子及びヘッジホッグシグナル伝達経路阻害剤ＫＡＡＤ−シクロパミンで処理した後、線維芽細胞増殖因子及びＫＡＡＤ−シクロパミンを含有する培地を除去し、続いて細胞をレチノイン酸、線維芽細胞増殖因子及びＫＡＡＤ−シクロパミンを含有する培地中で培養することにより、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。この方法の例は、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２４，１３９２〜１４０１（２００６）に開示されている。
【００８５】
本発明の一態様では、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された米国特許出願第１１／７３６，９０８号に従って、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞をレチノイン酸及び少なくとも１種類の線維芽細胞増殖因子で所定の時間処理することによって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に更に分化させる。
【００８６】
本発明の一態様では、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された米国特許出願第１１／７７９，３１１号に従って、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞をレチノイン酸及び少なくとも１種類の線維芽細胞増殖因子で所定の時間処理することによって、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に更に分化させる。
【００８７】
本発明の１つの態様では、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を米国特許出願第６０／９９０，５２９号に記載の方法に従って処理することにより、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を更に分化させる。
【００８８】
分化効率は、処理した細胞集団を、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞により発現されたタンパク質マーカーを特異的に認識する薬剤（抗体など）に曝露することにより測定することができる。
【００８９】
培養又は単離された細胞中のタンパク質及び核酸マーカーの発現を評価する方法は、当該技術分野において標準技術である。これらには、定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、ノーザンブロット、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａｕｓｕｂｅｌら編、２００１  ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ）参照）、並びにイムノアッセイ、例えば切片材料の免疫組織化学的分析、ウェスタンブロッティング、及び完全細胞で利用できるマーカーについての例えばフローサイトメトリー分析（ＦＡＣＳ）（例えば、Ｈａｒｌｏｗ及びＬａｎｅ、Ｕｓｉｎｇ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ：Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９８）参照）が挙げられる。
【００９０】
多能性幹細胞の特徴は当業者に周知であり、多能性幹細胞の更なる特徴は、継続して同定されている。例えば多能性幹細胞マーカーとしては、以下のもののうちの一つ以上の発現が含まれる：ＡＢＣＧ２、ｃｒｉｐｔｏ、ＦＯＸＤ３、ＣＯＮＮＥＸＩＮ４３、ＣＯＮＮＥＸＩＮ４５、ＯＣＴ４、ＳＯＸ２、Ｎａｎｏｇ、ｈＴＥＲＴ、ＵＴＦ１、ＺＦＰ４２、ＳＳＥＡ−３、ＳＳＥＡ−４、Ｔｒａ  １−６０、又はＴｒａ  １−８１。
【００９１】
多能性幹細胞を本発明の方法で処理した後、処理した細胞集団を、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞により発現される、例えばＣＸＣＲ４などのタンパク質マーカーを特異的に認識する薬剤（抗体など）に曝露することにより、分化させた細胞を精製することができる。
【００９２】
本発明での使用に好適な多能性幹細胞としては、例えばヒト胚性幹細胞株Ｈ９（ＮＩＨ  ｃｏｄｅ：ＷＡ０９）、ヒト胚性幹細胞株Ｈ１（ＮＩＨ  ｃｏｄｅ：ＷＡ０１）、ヒト胚性幹細胞株Ｈ７（ＮＩＨ  ｃｏｄｅ：ＷＡ０７）、及びヒト胚性幹細胞株ＳＡ００２（Ｃｅｌｌａｒｔｉｓ，Ｓｗｅｄｅｎ）が挙げられる。多能性細胞に特徴的な以下のマ−カー、すなわち、ＡＢＣＧ２、ｃｒｉｐｔｏ、ＣＤ９、ＦＯＸＤ３、ＣＯＮＮＥＸＩＮ４３、ＣＯＮＮＥＸＩＮ４５、ＯＣＴ４、ＳＯＸ２、Ｎａｎｏｇ、ｈＴＥＲＴ、ＵＴＦ−１、ＺＦＰ４２、ＳＳＥＡ−３、ＳＳＥＡ−４、Ｔｒａ  １−６０及びＴｒａ  １−８１のうちの少なくとも１つを発現する細胞も本発明での使用に適している。
【００９３】
胚体内胚葉系に特徴的なマーカーは、ＳＯＸ１７、ＧＡＴＡ４、ＨＮＦ３  β、ＧＳＣ、ＣＥＲ１、Ｎｏｄａｌ、ＦＧＦ８、短尾奇形、Ｍｉｘ様ホメオボックスタンパク質、ＦＧＦ４  ＣＤ４８、エオメソダーミン（ＥＯＭＥＳ）、ＤＫＫ４、ＦＧＦ１７、ＧＡＴＡ６、ＣＸＣＲ４、Ｃ−Ｋｉｔ、ＣＤ９９、及びＯＴＸ２からなる群から選択される。本発明での使用に好適なのは、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーのうちの少なくとも１つを発現する細胞である。本発明の一態様で、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、原始線条前駆体細胞である。別の態様で、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、中内胚葉細胞である。別の態様で、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、胚体内胚葉細胞である。
【００９４】
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーは、ＰＤＸ１、ＨＮＦ１  β、ＰＴＦ１  α、ＨＮＦ６、ＨＢ９及びＰＲＯＸ１からなる群から選択される。本発明での使用に好適なのは、膵臓内胚葉系の特徴を示す少なくとも１つのマーカーを発現する細胞である。本発明の一態様において、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、膵臓内胚葉細胞である。
【００９５】
一実施形態では、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞に更に分化させる。本発明は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団において、ＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法を提供する。
【００９６】
膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団におけるＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現の増加は、胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物で処理することによって達成できる。あるいは、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団におけるＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現の増加は、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物で処理することによって達成できる。
【００９７】
胚体内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞がＸ、Ｙ、及びＺからなる群から選択される化合物で処理される場合、細胞は、これらの細胞を、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させるのに用いられる培地に、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加することにより処理される。
【００９８】
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞がＸ、Ｙ、及びＺからなる群から選択される化合物で処理される場合、細胞は、これらの細胞を膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させるのに用いられる培地に、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加することにより処理される。
【００９９】
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞の、ＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１発現が増加した膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞への分化
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、当該技術分野の任意の方法、又は本発明で提案する任意の方法により、膵内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと分化させ得る。
【０１００】
例えば、本発明の方法に従って得られる膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、エキセンディン４を含有している培地で培養し、次にエキセンディン４を含有している培地を除去し、続いて細胞をエキセンディン１、ＩＧＦ−１及びＨＧＦを含有している培地で培養することにより、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。この方法の例は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２００６に開示されている。
【０１０１】
例えば、本発明の方法に従って得られる、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、ＤＡＰＴ（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，ＭＯ）及びエキセンディン４を含有している培地で培養することにより、膵内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。この方法の例は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２００６に開示されている。
【０１０２】
例えば、本発明の方法に従って得られる膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、エキセンディン４を含有している培地で培養することにより、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。この方法の例は、Ｄ’Ａｍｏｕｒら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２００６に開示されている。
【０１０３】
例えば、本発明の方法に従って得られる膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された、米国特許出願第１１／７３６，９０８号に開示された方法に従って、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞をノッチシグナル伝達経路を阻害する因子で処理することにより、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。
【０１０４】
例えば、本発明の方法に従って得られる膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された、米国特許出願第１１／７７９，３１１号に開示された方法に従って、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞をノッチシグナル伝達経路を阻害する因子で処理することにより、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。
【０１０５】
例えば、本発明の方法に従って得られる膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された、米国特許出願第６０／９５３，１７８号に開示された方法に従って、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞をノッチシグナル伝達経路を阻害する因子で処理することにより、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。
【０１０６】
例えば、本発明の方法に従って得られる膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、ＬｉｆｅＳｃａｎ，Ｉｎｃ．に譲渡された、米国特許出願第６０／９９０，５２９号に開示された方法に従って、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞をノッチシグナル伝達経路を阻害する因子で処理することにより、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞へと更に分化させる。
【０１０７】
膵臓内分泌系に特徴的なマーカーは、ＮＧＮ３、ＮＥＵＲＯＤ、ＩＳＬ１、ＰＤＸ１、ＮＫＸ６．１、ＰＡＸ４、ＮＧＮ３、及びＰＴＦ−１  αからなる群から選択される。一実施形態では、膵内分泌細胞は、以下のホルモンの少なくとも１つを発現することができる：インスリン、グルカゴン、ソマトスタチン、及び膵臓ポリペプチド。本発明で使用するのに好適なのは、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを少なくとも１つ発現する細胞である。本発明の一態様において、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、膵臓内分泌細胞である。膵臓内分泌細胞は、膵臓ホルモン発現細胞であってよい。また、膵臓内分泌細胞は膵臓ホルモン分泌細胞であってよい。
【０１０８】
本発明の一態様では、膵内分泌細胞は、β細胞系統に特徴的なマーカーを発現する細胞である。β細胞系に特徴的なマーカーを発現する細胞は、ＰＤＸ１と、以下の転写因子、すなわち、ＮＧＮ３、ＮＫＸ２．２、ＮＫＸ６．１、ＮＥＵＲＯＤ、ＩＳＬ１、ＨＮＦ３  β、ＭＡＦＡ、ＰＡＸ４、及びＰＡＸ６のうちの少なくとも１つを発現する。本発明の一態様では、β細胞系統に特徴的なマーカーを発現する細胞は、β細胞である。
【０１０９】
本発明は、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団において、ＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現を増加させる方法を提供する。
【０１１０】
一実施形態では、膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞集団におけるＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１の発現の増加は、膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現する細胞を、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物で処理することによって達成できる。
【０１１１】
膵臓内胚葉系に特徴的なマーカーを発現するマーカーを発現する細胞が、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物で処理される場合、細胞は、これらの細胞を膵臓内分泌系に特徴的なマーカーを発現する細胞に分化させるのに用いられる培地に、Ｈ−９、Ｈ−８９、ＧＦ  １０９２０３Ｘ、ＨＡ−１００４、ＰＰ２、ＰＰ１、ＬＹ  ２９４００２、ウォルトマニン、ＳＢ−２０３５８０、ＳＢ−２０２１９０、チルホスチン２５、チルホスチン、ＡＧ１４７８、チルホスチン４６、ＧＷ  ５０７４、ケンパウロン、ＨＮＭＰＡ、ＡＧ４９０、Ｙ２７６３２、及びＭＬ−７からなる群から選択される化合物を追加することにより処理される。
【０１１２】
本発明を以下の実施例によって更に説明するが、本発明はこれらの実施例により限定されるものではない。
【実施例】
【０１１３】
（実施例１）
ＮＧＮ３発現を仲介する小分子類似体のスクリーニング
転写因子ＮＧＮ３の発現は、前駆細胞を内分泌細胞である運命へと進行させる間に必要とされる。このプロセスの効率向上が所望の成果である。酵素阻害物質が、分化中に伝達される細胞シグナルを制御でき、ＮＧＮ３などの重要な転写因子の遺伝子発現に直接的又は間接的影響を与えることができると仮定して、小分子化合物のスクリーニングを実施した。
【０１１４】
アッセイ用細胞の調製：増殖因子が少ないＭＡＴＲＩＧＥＬ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ；カタログ＃  ３５６２３１）をコーティングしたディッシュ上のＭＥＦ馴化培地中で、平均４日毎に継代し、ヒト胚幹細胞（Ｈ１ヒト胚幹細胞株）の保存培養を未分化の多能性状態に維持した。継代は、細胞培養物を１ｍｇ／ｍＬディスパーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，カタログ＃：１７１０５−０４１）溶液に３７℃で５〜７分間曝露して、続いて単層をＭＥＦ馴化培地ですすぎ、穏やかにかき取り、細胞クラスターを回収することにより実施した。クラスターを低速度で遠心して細胞ペレットを回収し、残留ディスパーゼを除去した。ルーチンの維持培養では、細胞クラスターを１：３又は１：４の比率で分けた。全てのヒト胚性幹細胞株は５０未満の継代数で維持し、正常な核型について及びマイコプラズマの非存在について、ルーチン的に評価した。小型化アッセイ形式におけるスクリーニングでは、記載するようにディスパーゼ処理した培養液からＨ１ヒト胚幹細胞のクラスターを回収し、１００μＬ／ウェルの容量を用い、増殖因子が少ないＭＡＴＲＩＧＥＬ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ；カタログ＃  ３５６２３１）をコーティングした９６ウェル黒色プレート（Ｐａｃｋａｒｄ  ＶｉｅｗＰｌａｔｅｓ；ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ；カタログ＃６００５１８２）上に１：２（表面積）の比率で均一にまいてプレーティングした。細胞を付着させ、次いで８ｎｇ／ｍＬのｂＦＧＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ２３３−ＦＢ）を追加されたＭＥＦ馴化培地を毎日供給しながら１〜３日経過させ、対数増殖期を回復させた。アッセイの持続時間の間、プレートは加湿したボックス中に３７℃、５％  ＣＯ2で維持した。
【０１１５】
化合物の調製：２種類の市販の小分子キナーゼ阻害剤ライブラリ（ＢｉｏＭｏｌ  Ｉｎｔｌ；カタログ＃２８３２Ａ（Ｖ２．２）及びＥＭＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ：カタログ＃  ５３９７４５）を用いて、スクリーニングを実施した。表１及び表２には、それぞれＢｉｏＭｏｌ及びＥＭＤキナーゼ阻害剤ライブラリの化合物を記載する。これらのライブラリの化合物を、９６ウェルプレートフォーマットで１０ｍＭ原液として利用できるように作製し、１００％  ＤＭＳＯ中に溶解させて、−８０℃で保存した。ライブラリ化合物を、１００％  ＤＭＳＯ（Ｓｉｇｍａ；カタログ＃  Ｄ２６５０）に中間濃度である２．５ｍＭに更に希釈し、更に使用まで−８０℃で保存した。アッセイ当日、化合物をＤＭＥＭ（高グルコース）培地で１：１２．５に希釈し、８％  ＤＭＳＯ中２００μＭの使用原液を得て、続いて、各アッセイ試験ウェル内で、最終濃度２．５μＭの化合物及び０．１％  ＤＭＳＯになるよう、更に１：８０に希釈した。
【０１１６】
分化及びスクリーニングアッセイ：各ウェルから培地を吸引し、新鮮なアリコート（１００μＬ）と交換することで毎日培地供給しながら、分化プロトコルの工程１を三日間にわたって実施した。アッセイ１日目、２％のウシアルブミンフラクションＶ（脂肪酸不含）（ＦＡＦ−ＢＳＡ）（Ｐｒｏｌｉａｎｔ  Ｉｎｃ．；カタログ＃：ＳＫＵ  ６８７００）、１００ｎｇ／ｍＬのアクチビンＡ（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ；カタログ＃１２０−１４）、２０ｎｇ／ｍＬのＷｎｔ３ａ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  １３２４−ＷＮ／ＣＦ）、及び８ｎｇ／ｍＬのｂＦＧＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ２３３−ＦＢ）を含むＲＰＭＩ−１６４０培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃：２２４００）をウェルに供給した。アッセイ２日目及び３日目、Ｗｎｔ３ａを除いた以外は同じ培地をウェルに供給した。全てのウェルを同様に培地供給し、処理した。
【０１１７】
分化プロトコルの工程２を二日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、２％のＦＡＦ  ＢＳＡ、５０ｎｇ／ｍＬのＦＧＦ７（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ；カタログ＃  １００−１９）、及び２５０ｎＭのＫＡＡＤ−シクロパミン（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ；カタログ＃  ２３９８０４）を含有するＤＭＥＭ：Ｆ１２培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １１３３０−０３２）の新鮮なアリコート（１００μＬ）と交換することで、細胞に毎日培地供給した。全てのウェルを同様に培地供給し、処理した。
【０１１８】
分化プロトコルの工程３を四日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、０．１％のＡｌｂｕｍａｘ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃：１１０２０−０２１）、０．５ｘインスリン−トランスフェリン−セレン（ＩＴＳ−Ｘ；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  ５１５０００５６）、５０ｎｇ／ｍＬのＦＧＦ７、１００ｎｇ／ｍＬのノギン（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ３３４４−ＮＧ）、２５０ｎＭのＫＡＡＤ−シクロパミン、２μＭの全トランス型レチノイン酸（ＲＡ）（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ；カタログ＃  Ｒ２６２５）、及び３０ｎｇ／ｍＬのアクチビンＡを追加されたＤＭＥＭ（高グルコース）（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １０５６９）の新鮮なアリコート（２００μＬ）と交換することで、細胞に１日おきに培地供給した。工程３の間、キナーゼ阻害剤の試験サンプルを２枚の別のプレート（プレートＡ及びＢ）の１つ１つのウェルに加え、３枚目のプレート（プレートＣ）は未処理のままとした。各プレートにおいて、任意の試験化合物を含まない同量の０．１％  ＤＭＳＯで合計１６個の対照ウェルを処理した。
【０１１９】
分化プロトコルの工程４を三日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、０．１％のＡｌｂｕｍａｘ、０．５ｘインスリン−トランスフェリン−セレン、１００ｎｇ／ｍＬのノギン、及び１μＭのＡｌｋ  ５阻害剤（Ａｘｘｏｒａ；カタログ＃  ＡＬＸ−２７０−４４５）を追加されたＤＭＥＭ（高グルコース）の新鮮なアリコート（２００μＬ）と交換することで、１日目及び２日目に細胞に培地供給し、３日目は行わなかった。工程４の間、キナーゼ阻害剤の試験サンプルを２枚の別のプレート（プレートＢ及びＣ）の１つ１つのウェルに加え、３枚目のプレート（プレートＡ）は未処理のままとした。各プレートにおいて、任意の試験化合物を含まない同量の０．１％  ＤＭＳＯで合計１６個の対照ウェルを処理した。
【０１２０】
ハイコンテント解析：工程４の終わりに、全てのアッセイプレートから培地を吸引し、続いて、二価カチオンを含まないＰＢＳ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １４１９０）で希釈した４％パラホルムアルデヒド（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ；カタログ＃  １５８１２７）を用いて室温で２０分間固定して、ＰＢＳで１回洗浄した。サンプルウェルを、０．５％のＴｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００（ＶＷＲ；カタログ＃  ＶＷ３９２９−２）を用いて室温で２０分間透過処理し、ＰＢＳで２回洗浄し、ＰＢＳ中５％ロバ血清（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ；カタログ＃  ０１７−０００−１２１）を用いて室温で３０分間ブロッキングした。一次抗体（ヒツジ抗ＮＧＮ３；Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；ＡＦ３４４４）を５％ロバ血清で１：３００に希釈し、室温で１時間各ウェルに加えた。ＰＢＳで２回洗浄後、Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ６４７ロバ抗ヒツジ二次抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ａ２１４４８）を１：１００に希釈し、室温で３０分間各サンプルウェルに加え、その後ＰＢＳで２回洗浄した。核を対比染色するために、４μｇ／ｍＬのＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ｈ３５７０）を室温で１０分間加えた。プレートをＰＢＳで１回洗浄し、撮像のために１００μＬ／ウェルのＰＢＳを残した。
【０１２１】
Ｈｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２及びＡｌｅｘａ  Ｆｌｏｕｒ  ６４７で染色した細胞用にダイクロイック５１００８ｂｓを利用して、ＩＮ  Ｃｅｌｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  １０００（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて撮像を実施した。曝露時間は二次抗体単独で染色した陽性対照ウェルから最適化した。１ウェルあたり１５視野の撮像を得て、バイオアッセイ及び続く染色手順の間の任意の細胞ロスを補正した。ＩＮ  Ｃｅｌｌ  Ｄｅｖｅｌｏｐｅｒ  Ｔｏｏｌｂｏｘ  １．７（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）ソフトウェアを用いて総細胞数及び総ＮＧＮ３強度についての測定値を各ウェルから得た。核の分裂は、グレースケールレベル（ベースライン範囲１００〜３００）と核の大きさに基づいて判定した。総ＮＧＮ３タンパク質発現は、細胞面積によって乗じた細胞の総蛍光値として定義される総強度又は積分強度として記録した。バックグラウンドは、２００〜３５００の間のグレースケール範囲の許容基準に基づいて除去した。総強度データは、各ウェルについての総強度を陽性対照についての平均総強度で除することにより正規化した。
【０１２２】
この１回の実験で６枚のアッセイプレートの処理に用いた２種類のキナーゼ阻害剤ライブラリの組み合わせのスクリーニング結果を表３に示す。示されるデータは、ＤＭＳＯ溶媒のみで処理されたウェルの染色に対する、個々の化合物で処理されたウェルのＮＧＮ３染色の代表的な強度比である。強度比並びにランク順の比較は、工程３のみ若しくは工程４のみの間、又は工程３及び４の両方の間に投与された個々の化合物について示す。溶媒処理対照と比較して強度比＞１．４の化合物を、確認及び更なる評価のためにヒットとタグ付けした。表４にまとめるように、これらの化合物のうち特に興味深いものは、内分泌腺分化中のＮＧＮ３の最適な発現パターンに関与し得る、いくつかの細胞シグナル伝達経路を標的にすると思われる。
【０１２３】
（実施例２）
ＮＫＸ６．１及びＮＧＮ３発現を仲介する小分子類似体のスクリーニング
ＮＧＮ３を伴うＮＫＸ６．１の発現は、前駆細胞を内分泌細胞である運命へと進行させる間に必要とされる。キナーゼ阻害剤のスクリーニングを行い、任意の化合物が分化中の一方又は両方のマーカーの発現を上方制御するどうかを判定した。この実施例では、ＨＤＡＣ阻害剤であるトリコスタチンＡについても分化プロトコルに含め、クロマチン再構築を調節し、場合により遺伝子転写を増強した。
【０１２４】
アッセイ用細胞の調製：増殖因子が少ないＭＡＴＲＩＧＥＬ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ；カタログ＃  ３５６２３１）をコーティングしたディッシュ上のＭＥＦ馴化培地中で、平均４日毎に継代し、ヒト胚幹細胞（Ｈ１ヒト胚幹細胞株）の保存培養を未分化の多能性状態に維持した。継代は、細胞培養物を１ｍｇ／ｍＬディスパーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，カタログ＃：１７１０５−０４１）溶液に３７℃で５〜７分間曝露して、続いて単層をＭＥＦ馴化培地ですすぎ、穏やかにかき取り、細胞クラスターを回収することにより実施した。クラスターを低速度で遠心して細胞ペレットを回収し、残留ディスパーゼを除去した。ルーチンの維持培養では、細胞クラスターを１：３又は１：４の比率で分けた。全てのヒト胚性幹細胞株は５０未満の継代数で維持し、正常な核型について及びマイコプラズマの非存在について、ルーチン的に評価した。小型化アッセイ形式におけるスクリーニングでは、記載するようにディスパーゼ処理した培養液からＨ１ヒト胚幹細胞のクラスターを回収し、１００μＬ／ウェルの容量を用い、増殖因子が少ないＭＡＴＲＩＧＥＬ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ；カタログ＃  ３５６２３１）をコーティングした９６ウェル黒色プレート（Ｐａｃｋａｒｄ  ＶｉｅｗＰｌａｔｅｓ；ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ；カタログ＃６００５１８２）上に１：２（表面積）の比率で均一にまいてプレーティングした。細胞を付着させ、次いで８ｎｇ／ｍＬのｂＦＧＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ２３３−ＦＢ）を追加されたＭＥＦ馴化培地を毎日供給しながら１〜３日経過させ、対数増殖期を回復させた。アッセイの持続時間の間、プレートは加湿したボックス中に３７℃、５％のＣＯ2で維持した。
【０１２５】
化合物の調製：表１に定義される１種類の市販の小分子キナーゼ阻害剤ライブラリ（ＢｉｏＭｏｌ  Ｉｎｔｌ；カタログ＃  ２８３２Ａ（Ｖ２．２）を用いて、スクリーニングを実施した。このライブラリの化合物を、９６ウェルプレートフォーマットで１０ｍＭ原液として利用できるように作製し、１００％  ＤＭＳＯ中に溶解させて、−８０℃で保存した。ライブラリ化合物を、１００％  ＤＭＳＯ（Ｓｉｇｍａ；カタログ＃  Ｄ２６５０）に中間濃度である２．５ｍＭに更に希釈し、更に使用まで−８０℃で保存した。アッセイ当日、化合物をＤＭＥＭ（高グルコース）培地で１：１２．５に希釈し、８％  ＤＭＳＯ中２００μＭの使用原液を得て、続いて、各アッセイ試験ウェル内で、最終濃度２．５μＭの化合物及び０．１％  ＤＭＳＯになるよう、更に１：８０に希釈した。
【０１２６】
分化及びスクリーニングアッセイ：各ウェルから培地を吸引し、新鮮なアリコート（１００μＬ）と交換することで毎日培地供給しながら、分化プロトコルの工程１を三日間にわたって実施した。アッセイ１日目、２％のウシアルブミンフラクションＶ（脂肪酸不含）（ＦＡＦ−ＢＳＡ）（Ｐｒｏｌｉａｎｔ  Ｉｎｃ．；カタログ＃：ＳＫＵ  ６８７００）、１００ｎｇ／ｍＬのアクチビンＡ（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ；カタログ＃１２０−１４）、２０ｎｇ／ｍＬのＷｎｔ３ａ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃１３２４−ＷＮ／ＣＦ）、及び８ｎｇ／ｍＬのｂＦＧＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ２３３−ＦＢ）を含むＲＰＭＩ−１６４０培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃：２２４００）を使用してウェルに供給した。アッセイ２日目及び３日目、Ｗｎｔ３ａを除いた以外は同じ培地をウェルに供給した。全てのウェルを同様に培地供給し、処理した。
【０１２７】
分化プロトコルの工程２を二日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、２％のＦＡＦ  ＢＳＡ、５０ｎｇ／ｍＬのＦＧＦ７（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ；カタログ＃  １００−１９）、及び２５０ｎＭのＫＡＡＤ−シクロパミン（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ；カタログ＃  ２３９８０４）を含有するＤＭＥＭ：Ｆ１２培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １１３３０−０３２）の新鮮なアリコート（１００μＬ）と交換することで、細胞に毎日培地供給した。全てのウェルを同様に培地供給し、処理した。
【０１２８】
分化プロトコルの工程３を五日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、０．１％のＡｌｂｕｍａｘ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃：１１０２０−０２１）、０．５ｘインスリン−トランスフェリン−セレン（ＩＴＳ−Ｘ；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  ５１５０００５６）、５０ｎｇ／ｍＬのＦＧＦ７、１００ｎｇ／ｍＬのノギン（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ３３４４−ＮＧ）、２５０ｎＭのＫＡＡＤ−シクロパミン、２μＭの全トランス型レチノイン酸（ＲＡ）（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ；カタログ＃  Ｒ２６２５）、３０ｎｇ／ｍＬのアクチビンＡ、及び１００ｎＭのトリコスタチンＡ（ＴｓＡ；Ｓｉｇｍａ；カタログ＃  Ｔ８５５２）を追加されたＤＭＥＭ（高グルコース）（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １０５６９）の新鮮なアリコート（２００μＬ）と交換することで、細胞に１日おきに培地供給した。工程３の間、２日目及び４日目に、キナーゼ阻害剤の試験サンプルを１つ１つのウェルに加えた。各プレートにおいて、任意の試験化合物を含まない同量の０．１％  ＤＭＳＯで合計１６個の対照ウェルを処理した。
【０１２９】
分化プロトコルの工程４を三日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、０．１％のＡｌｂｕｍａｘ、０．５ｘインスリン−トランスフェリン−セレン、１００ｎｇ／ｍＬのノギン、１μＭのＡｌｋ  ５阻害剤（Ａｘｘｏｒａ；カタログ＃  ＡＬＸ−２７０−４４５）、及び１μｇ／ｍＬのＤＡＰＴ（Ｓｉｇｍａ；カタログ＃Ｄ５９４２）を追加されたＤＭＥＭ（高グルコース）の新鮮なアリコート（２００μＬ）と交換することで、細胞に毎日培地供給した。工程４の間、１日目にキナーゼ阻害剤の試験サンプルを１００ｎＭのトリコスタチンＡと共に１つ１つのウェルに加え、続いて２日目及び３日目は、培地供給中にキナーゼ阻害剤の試験サンプル及びＴｓＡの両方を除去した。各プレートにおいて、任意の試験化合物を含まない同量の０．１％  ＤＭＳＯで合計１６個の対照ウェルを処理した。
【０１３０】
ハイコンテント解析：工程４の終わりに、全てのウェルから培地を吸引し、続いて、二価カチオンを含まないＰＢＳ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １４１９０）で希釈した４％パラホルムアルデヒド（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ；カタログ＃  １５８１２７）を用いて室温で２０分間固定して、ＰＢＳで１回洗浄した。サンプルウェルを、０．５％のＴｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００（ＶＷＲ；カタログ＃  ＶＷ３９２９−２）を用いて室温で２０分間透過処理し、ＰＢＳで２回洗浄し、ＰＢＳ中５％ロバ血清（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ；カタログ＃  ０１７−０００−１２１）を用いて室温で３０分間ブロッキングした。一次抗体（ヒツジ抗ＮＧＮ３；Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；ＡＦ３４４４、すなわちマウス抗ＮＫＸ６．１；Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｉｏｗａ；カタログ＃Ｆ５５Ａ１２）を５％ロバ血清で希釈し（抗ＮＧＮ３は１：３００、抗ＮＫＸ６．１は１：５００）、室温で１時間各ウェルに加えた。ＰＢＳで２回洗浄後、Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ６４７ロバ抗ヒツジ二次抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ａ２１４４８）及びＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８ロバ抗マウス二次抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ａ２１２０２）を１：１００（両二次抗体とも）に希釈し、室温で３０分間各サンプルウェルに加え、その後ＰＢＳで２回洗浄した。核を対比染色するために、４μｇ／ｍＬのＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ｈ３５７０）を室温で１０分間加えた。プレートをＰＢＳで１回洗浄し、撮像のために１００μＬ／ウェルのＰＢＳを残した。
【０１３１】
Ｈｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２、並びにＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８及びＡｌｅｘａ  Ｆｌｏｕｒ  ６４７で染色した細胞用にダイクロイック５１００８ｂｓを利用して、ＩＮ  Ｃｅｌｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  １０００（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて撮像を実施した。曝露時間は各二次抗体単独で染色した陽性対照ウェルから最適化した。１ウェルあたり１５視野の撮像を得て、バイオアッセイ及び続く染色手順の間の任意の細胞ロスを補正した。ＩＮ  Ｃｅｌｌ  Ｄｅｖｅｌｏｐｅｒ  Ｔｏｏｌｂｏｘ  １．７（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）ソフトウェアを用いて総細胞数及び総ＮＧＮ３又はＮＫＸ６．１強度についての測定値を各ウェルから得た。核の分裂は、グレースケールレベル（ベースライン範囲１００〜３００）と核の大きさに基づいて判定した。総ＮＧＮ３又はＮＫＸ６．１タンパク質発現は、細胞面積によって乗じた細胞の総蛍光値として定義される総強度又は積分強度として記録した。バックグラウンドは、２００〜３５００の間のグレースケール範囲の許容基準に基づいて除去した。総強度データは、各ウェルについての総強度を陽性対照についての平均総強度で除することにより正規化した。
【０１３２】
このスクリーニングの結果を表５、表６、及び表７にまとめる。表５のデータは、ＤＭＳＯのみで処理されたウェルの平均染色に対する、個々の化合物で処理された各ウェルのＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１染色の代表的な比率を示す。また、ＮＧＮ３又はＮＫＸ６．１いずれかのタンパク質発現に対する、各化合物の効果についてのランク順も示す。表６は、ＮＧＮ３及び／又はＮＫＸ６．１発現に対して明白な効果を有する上位１６ヒットについて、ランク順にリストアップしている。表７には、これらのヒット上位に対応する標的及びシグナル伝達経路をまとめる。このスクリーニングで複数ヒットした経路は、内分泌腺の運命決定に重要なこれら２つの転写因子の発現に影響を及ぼすのに非常に有効であると思われる。
【０１３３】
（実施例３）
ＮＧＮ３及びＮＫＸ６．１発現を仲介する小分子類似体の確認
ＮＧＮ３を伴うＮＫＸ６．１の発現は、前駆細胞を内分泌細胞である運命へと進行させる間に必要とされる。キナーゼ阻害剤のスクリーニングを繰り返し、任意の小分子化合物が分化中の一方又は両方のマーカーの発現を上方制御するどうかを判定した。この実施例では、ＨＤＡＣ阻害剤であるトリコスタチンＡについても分化プロトコルに含め、クロマチン再構築を調節し、場合により遺伝子転写を増強した。
【０１３４】
アッセイ用細胞の調製：増殖因子が少ないＭＡＴＲＩＧＥＬ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ；カタログ＃  ３５６２３１）をコーティングしたディッシュ上のＭＥＦ馴化培地中で、平均４日毎に継代し、ヒト胚幹細胞（Ｈ１ヒト胚幹細胞株）の保存培養を未分化の多能性状態に維持した。継代は、細胞培養物を１ｍｇ／ｍＬディスパーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，カタログ＃：１７１０５−０４１）溶液に３７℃で５〜７分間曝露して、続いて単層をＭＥＦ馴化培地ですすぎ、穏やかにかき取り、細胞クラスターを回収することにより実施した。クラスターを低速度で遠心して細胞ペレットを回収し、残留ディスパーゼを除去した。ルーチンの維持培養では、細胞クラスターを１：３又は１：４の比率で分けた。全てのヒト胚性幹細胞株は５０未満の継代数で維持し、正常な核型について及びマイコプラズマの非存在について、ルーチン的に評価した。小型化アッセイ形式におけるスクリーニングでは、記載するようにディスパーゼ処理した培養液からＨ１ヒト胚幹細胞のクラスターを回収し、１００μＬ／ウェルの容量を用い、増殖因子が少ないＭＡＴＲＩＧＥＬ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ；カタログ＃  ３５６２３１）をコーティングした９６ウェル黒色プレート（Ｐａｃｋａｒｄ  ＶｉｅｗＰｌａｔｅｓ；ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ；カタログ＃６００５１８２）上に１：２（表面積）の比率で均一にまいてプレーティングした。細胞を付着させ、次いで８ｎｇ／ｍＬのｂＦＧＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ２３３−ＦＢ）を追加されたＭＥＦ馴化培地を毎日供給しながら１〜３日経過させ、対数増殖期を回復させた。アッセイの持続時間の間、プレートは加湿したボックス中に３７℃、５％  ＣＯ2で維持した。
【０１３５】
化合物の調製：表１に示される１種類の市販の小分子キナーゼ阻害剤ライブラリ（ＢｉｏＭｏｌ  Ｉｎｔｌ；カタログ＃２８３２Ａ（Ｖ２．２）を用いて、確認スクリーニングを実施した。このライブラリから対象とするヒット化合物を、９６ウェルプレートフォーマットで１０ｍＭ原液として利用できるように作製し、１００％  ＤＭＳＯ中に溶解させて、−８０℃で保存した。対象とする個々のライブラリ化合物を、１００％  ＤＭＳＯ（Ｓｉｇｍａ；カタログ＃  Ｄ２６５０）に中間濃度である２．５ｍＭに更に希釈し、更に使用まで−８０℃で保存した。アッセイ当日、これらの対象とする個々の化合物をＤＭＥＭ（高グルコース）培地で１：１２．５に希釈し、８％  ＤＭＳＯ中２００μＭの使用原液を得て、続いて、各アッセイ試験ウェル内で、最終濃度２．５μＭの化合物及び０．１％  ＤＭＳＯになるよう、更に１：８０に希釈した。
【０１３６】
分化及びスクリーニングアッセイ：各ウェルから培地を吸引し、新鮮なアリコート（１００μＬ）と交換することで毎日培地供給しながら、分化プロトコルの工程１を三日間にわたって実施した。アッセイ１日目、２％のウシアルブミンフラクションＶ（脂肪酸不含）（ＦＡＦ−ＢＳＡ）（Ｐｒｏｌｉａｎｔ  Ｉｎｃ．；カタログ＃：ＳＫＵ  ６８７００）、１００ｎｇ／ｍＬのアクチビンＡ（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ；カタログ＃１２０−１４）、２０ｎｇ／ｍＬのＷｎｔ３ａ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃１３２４−ＷＮ／ＣＦ）、及び８ｎｇ／ｍＬのｂＦＧＦ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃２３３−ＦＢ）を含むＲＰＭＩ−１６４０培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃：２２４００）をウェルに供給した。アッセイ２日目及び３日目、Ｗｎｔ３ａを除いた以外は同じ培地をウェルに供給した。全てのウェルを同様に培地供給し、処理した。
【０１３７】
分化プロトコルの工程２を二日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、２％のＦＡＦ  ＢＳＡ、５０ｎｇ／ｍＬのＦＧＦ７（ＰｅｐｒｏＴｅｃｈ；カタログ＃  １００−１９）、及び２５０ｎＭのＫＡＡＤ−シクロパミン（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ；カタログ＃  ２３９８０４）を含有するＤＭＥＭ：Ｆ１２培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １１３３０−０３２）の新鮮なアリコート（１００μＬ）と交換することで、細胞に毎日培地供給した。全てのウェルを同様に培地供給し、処理した。
【０１３８】
分化プロトコルの工程３を四日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、０．１％のＡｌｂｕｍａｘ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃：１１０２０−０２１）、０．５ｘインスリン−トランスフェリン−セレン（ＩＴＳ−Ｘ；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  ５１５０００５６）、５０ｎｇ／ｍＬのＦＧＦ７、１００ｎｇ／ｍＬのノギン（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ＃  ３３４４−ＮＧ）、２５０ｎＭのＫＡＡＤ−シクロパミン、２μＭの全トランス型レチノイン酸（ＲＡ）（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ；カタログ＃  Ｒ２６２５）、及び２０ｎｇ／ｍＬのアクチビンＡを追加されたＤＭＥＭ（高グルコース）（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １０５６９）の新鮮なアリコート（２００μＬ）と交換することで、細胞に１日おきに培地供給した。工程３の間、１日目及び３日目の培地供給時に、キナーゼ阻害剤の３つ組の試験サンプルをウェルに加えた。各プレートにおいて、任意の試験化合物を含まない同量の０．１％  ＤＭＳＯで合計１６個の対照ウェルを処理した。
【０１３９】
分化プロトコルの工程４を四日間にわたって実施した。各ウェルから培地を吸引し、０．１％のＡｌｂｕｍａｘ、０．５ｘインスリン−トランスフェリン−セレン、１００ｎｇ／ｍＬのノギン、及び１μＭのＡｌｋ  ５阻害剤（Ａｘｘｏｒａ；カタログ＃  ＡＬＸ−２７０−４４５）を追加されたＤＭＥＭ（高グルコース）の新鮮なアリコート（２００μＬ）と交換することで、細胞に１日おきに培地供給した。工程４の間、１日目及び３日目の培地供給時に、キナーゼ阻害剤の３つ組の試験サンプルをウェルに加えた。各プレートにおいて、任意の試験化合物を含まない同量の０．１％  ＤＭＳＯで合計１６個の対照ウェルを処理した。
【０１４０】
ハイコンテント解析：工程４の終わりに、全てのウェルから培地を吸引し、続いて、二価カチオンを含まないＰＢＳ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  １４１９０）で希釈した４％パラホルムアルデヒド（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ；カタログ＃  １５８１２７）を用いて室温で２０分間固定して、ＰＢＳで１回洗浄した。サンプルウェルを、０．５％のＴｒｉｔｏｎ  Ｘ−１００（ＶＷＲ；カタログ＃  ＶＷ３９２９−２）を用いて室温で２０分間透過処理し、ＰＢＳで２回洗浄し、ＰＢＳ中５％ロバ血清（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ；カタログ＃  ０１７−０００−１２１）を用いて室温で３０分間ブロッキングした。一次抗体（ヒツジ抗ＮＧＮ３；Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ；ＡＦ３４４４、すなわちマウス抗ＮＫＸ６．１；Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｉｏｗａ；カタログ＃  Ｆ５５Ａ１２）を５％ロバ血清で希釈し（抗ＮＧＮ３は１：３００、抗ＮＫＸ６．１は１：５００）、室温で１時間各ウェルに加えた。ＰＢＳで２回洗浄後、Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ６４７ロバ抗ヒツジ二次抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ａ２１４４８）及びＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８ロバ抗マウス二次抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃  Ａ２１２０２）を１：１００（両二次抗体とも）に希釈し、室温で３０分間各サンプルウェルに加え、その後ＰＢＳで２回洗浄した。核を対比染色するために、４μｇ／ｍＬのＨｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；カタログ＃Ｈ３５７０）を室温で１０分間加えた。プレートをＰＢＳで１回洗浄し、撮像のために１００μＬ／ウェルのＰＢＳを残した。
【０１４１】
Ｈｏｅｃｈｓｔ  ３３３４２、並びにＡｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ４８８及びＡｌｅｘａ  Ｆｌｏｕｒ  ６４７で染色した細胞用にダイクロイック５１００８ｂｓを利用して、ＩＮ  Ｃｅｌｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  １０００（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて撮像を実施した。曝露時間は各二次抗体単独で染色した陽性対照ウェルから最適化した。１ウェルあたり１５視野の撮像を得て、バイオアッセイ及び続く染色手順の間の任意の細胞ロスを補正した。ＩＮ  Ｃｅｌｌ  Ｄｅｖｅｌｏｐｅｒ  Ｔｏｏｌｂｏｘ  １．７（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）ソフトウェアを用いて総細胞数及び総ＮＧＮ３又はＮＫＸ６．１強度についての測定値を各ウェルから得た。核の分裂は、グレースケールレベル（ベースライン範囲１００〜３００）と核の大きさに基づいて判定した。総ＮＧＮ３又はＮＫＸ６．１タンパク質発現は、細胞面積によって乗じた細胞の総蛍光値として定義される総強度又は積分強度として記録した。バックグラウンドは、２００〜３５００の間のグレースケール範囲の許容基準に基づいて除去した。総強度データは、各ウェルについての総強度を陽性対照についての平均総強度で除することにより正規化した。
【０１４２】
これらの試験の結果を表８に示す。２つの化合物（ケンパウロン及びＢＭＬ−２５９）は確認されず、対照処理と比較してＮＧＮ３又はＮＫＸ６．１のいずれかの発現の増強効果は有さなかった。このアッセイにおいて残りの化合物は、一方又は両方の転写因子に対して明白な影響を示し、これにより以前の結果が確認され、これらの関連シグナル伝達経路の重要性が強調された。
【０１４３】
【表１−１】
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【０１４４】
【表１−２】
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【０１４５】
【表１−３】
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【０１４６】
【表１−４】
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【０１４７】
【表２−１】
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【０１４８】
【表２−２】
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【０１４９】
【表２−３】
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【０１５０】
【表２−４】
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【０１５１】
【表３−１】
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【０１５２】
【表３−２】
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【０１５３】
【表３−３】
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【０１５４】
【表３−４】
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【０１５５】
【表３−５】
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【０１５６】
【表３−６】
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【０１５７】
【表３−７】
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【０１５８】
【表４−１】
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【０１５９】
【表４−２】
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【０１６０】
【表４−３】
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【０１６１】
【表５−１】
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【０１６２】
【表５−２】
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【０１６３】
【表５−３】
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【０１６４】
【表５−４】
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【０１６５】
【表６】
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【０１６６】
【表７】
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【０１６７】
【表８】
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【０１６８】
本明細書の全体を通じて引用した刊行物は、その全容を本明細書に援用するものである。以上、本発明の様々な態様を実施例及び好ましい実施形態を参照して説明したが、本発明の範囲は、上記の説明文によってではなく、特許法の原則の下で適宜解釈される以下の「特許請求の範囲」によって定義されるものである点は認識されるであろう。