(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列：ＢＡＺＧＲＧＧＲＳＺＺＧＧＧＧＺＺＺＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号３）からなるβ−ＮＧＦと結合するアプタマー；
配列中、ＢはＣ、Ｇ又はＺから選択され、ＲはＡ又はＧから独立して選択され、ＳはＣ又はＧから選択され、ＤはＡ、Ｇ又はＺから選択され、Ｚは下記式Ｕ’又はＣ’で示されるＣ−５改変ピリミジンから独立して選択される。
【化１】
0006012591.tif 000022
〔式中、ｎは０〜３の数を示し、Ｒ’は以下の基：
【化２】
0006012591.tif 000023
（式中、Ｒ''''は、分岐鎖又は直鎖低級（Ｃ１〜Ｃ２０）アルキル、ハロゲン原子（Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ又はＩ）、ニトリル（ＣＮ）、ボロン酸（ＢＯ2Ｈ2）、カルボン酸（ＣＯＯＨ）、カルボン酸エステル（ＣＯＯＲ''）、一級アミド（ＣＯＮＨ2）、二級アミド（ＣＯＮＨＲ''）、三級アミド（ＣＯＮＲ''Ｒ'''）、スルホンアミド（ＳＯ2ＮＨ2）、Ｎ−アルキルスルホンアミド（ＳＯＮＨＲ''）からなる群から選択される基を示す。
ここで、Ｒ''、Ｒ'''は、分岐鎖又は直鎖低級（Ｃ１〜Ｃ２）アルキル、フェニル（Ｃ6Ｈ5）、Ｒ''''置換フェニル環（Ｒ''''Ｃ6Ｈ4）（ここで、Ｒ''''は上述の通り）、カルボン酸（ＣＯＯＨ）、カルボン酸エステル（ＣＯＯＲ'''''）（ここで、Ｒ'''''は分岐鎖又は直鎖低級（Ｃ１〜Ｃ２０）アルキル及びシクロアルキル（この場合、Ｒ''＝Ｒ'''＝（ＣＨ2）n）（ｎ＝２〜１０）からなる群から独立して選択されるものを示し、＊は（ＣＨ２）ｎ基にＲ’基が付加する位置を示す。）を示す。〕
【請求項２】
Ｃ−５改変ピリミジンは、５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＢｎｄＵ）、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ｉＢｕｄＵ）、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＴｒｐｄＵ）及び５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＮａｐｄＵ）から成る群から選択される、請求項１に記載のアプタマー。
【請求項３】
Ｃ−５改変ピリミジンは５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＢｎｄＵ）である、請求項２に記載のアプタマー。
【請求項４】
配列番号１、２、９〜４３から成る群から選択される配列からなる、β−ＮＧＦと結合するアプタマー。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本開示は、一般には核酸の分野に関し、より詳細には、神経成長因子（より具体的には、神経成長因子のβサブユニット（「β−ＮＧＦ」））に結合可能であり、掻痒症、掻痒状態、及び／又はβ−ＮＧＦが関係している他の疾患や病態を予防、治療又は改善するための治療剤として有用なアプタマーに関する。本開示は更に、β−ＮＧＦに結合可能なアプタマーを投与するための物質及び方法に関する。
【０００２】
＜関連出願＞
本願は、２０１０年４月１２日出願の米国仮特許出願第６１／３２３，１４５号の利益を主張するものであり、該出願の全内容を本明細書の一部を構成するものとしてここに援用する。
【０００３】
２０１１年４月１日作成の配列表「Ｓｅｑｕｅｎｃｅ＿ｌｉｓｔｉｎｇ＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」（サイズ：１２６キロバイト）の全内容を本明細書の一部を構成するものとしてここに援用する。
【背景技術】
【０００４】
以下の説明は本開示に関連する情報の概要を提供するものであり、本明細書に提供された情報や引用された刊行物のいずれもが本開示の先行技術であることを認めるものではない。
【０００５】
激しい掻痒感は、毎日何百万もの人々の生活の質に悪影響を及ぼす。激しい掻痒感は、疥癬や湿疹、乾燥症、乾癬、じん麻疹等の掻痒性皮膚状態や、慢性肝疾患や腎疾患、リンパ腫等の全身状態を含む種々の健康状態に関係することがある。同様に、疼痛もよくあることであり、医者を訪れる主な一理由である。疼痛は、種々の傷害や病態に関係することがあり、急性疼痛を治療できない場合には、慢性的な疼痛の問題を招くと共に、免疫疾患や代謝疾患を招くことがある。掻痒症及び／又は疼痛に苦しんでいる個人の生活の質を低下させるのに加え、医療費予算、特に掻痒性皮膚状態や慢性疼痛障害に関連する予算にも大きな影響を及ぼす。掻痒症及び／又は疼痛の管理や治療に対して現在行われている試みは不十分であることが広く認識されている。
【０００６】
神経生理学的研究によって、掻痒経路が疼痛経路と比べて独特であることが確認されている。痒覚は、痛覚を処理する侵害受容器とは異なる専用のＣニューロン（Ｃ線維）によって認識され、伝達される（非特許文献１）。次に、当該専用のＣニューロンは、掻痒刺激を視床に突出した特殊な脊髄後角ニューロンクラスに伝達する（非特許文献２）。末梢神経末端には特殊な掻痒受容体はないと考えられており、掻痒Ｃニューロンの特異性はその掻痒経路への脊髄結合に基づく。掻痒感と疼痛では脳活性化パターンに違いが見られ、例えば、頭頂葉の視床皮質や体性感覚皮質の検出可能な活性化は痒覚には見られない（非特許文献３）。
【０００７】
疼痛は通常、急性又は慢性に分類される。急性疼痛は一般に組織損傷に対する応答であり、短期間であることを特徴とし、最初の損傷の治癒によって消散する。慢性疼痛は持続的であり、外傷性事象とは明らかに関連しない場合がある。疼痛はその機構的な起点に基づいて更に分類することができ、侵害受容性疼痛と非侵害受容性疼痛が挙げられる。侵害受容性疼痛は、特定の刺激（傷害や炎症、化学品等）によって活性化される特定の受容体（侵害受容性受容体）が介在する。侵害受容性疼痛は更に体細胞性又は内臓性に分類することができる。体細胞性疼痛は皮膚や筋肉、関節、骨、靱帯等の組織で生じる。体細胞疼痛は一般に鋭く、局在する。現在行われている治療としては、オピオイドや非ステロイド性抗炎症薬（ＮＳＡＩＤＳ）の使用が挙げられる。内臓性疼痛は内部臓器で生じる。この場合、疼痛はあまり局在しないことが多く、通常はオピオイドで治療する。
【０００８】
非侵害受容性疼痛は更に神経障害性又は交感神経性に分類することができる。神経障害性疼痛は末梢神経系又は中枢神経系で生じる場合がある。神経障害性疼痛は変性病態、炎症又は感染症に関係することがある。この種の疼痛は過敏症（痛覚過敏）をもたらし、激痛（shooting）や灼熱痛（burning）と称されることが多い。治療オプションとしては、Ｎ−メチル−Ｄ−アスパラギン酸（ＮＭＤＡ）拮抗剤や抗不整脈剤、抗痙攣剤、抗鬱剤が挙げられる。神経障害性疼痛は従来の鎮痛剤に抵抗性であることが多い。交感神経性疼痛は交感神経系で生じると共に、末梢神経系や中枢神経系でも生じ、通常はある種の傷害に関連する。傷害部位では過敏性の高まりや体温異常が見られることがある。治療には通常、交感神経遮断剤や血管拡張剤、抗痙攣剤、抗不整脈剤、抗鬱剤を含む多剤レジメンを用いる。
【０００９】
オピオイド鎮痛剤を用いた通常の長期間に亘る疼痛の治療は、潜在的な中毒や副作用、耐性、オピオイドへの依存性が懸念されるため推奨されない。オピオイドの副作用としては、悪心や嘔吐、便秘、呼吸抑制等を挙げることができる。現在では多くの治療が行われているが、有効性に欠け、重篤な副作用が生じ、薬物送達方法が疼痛管理に十分に役立つことはない。これらの問題は、より良い疼痛管理用治療剤の必要性を後押しする。
【００１０】
掻痒感と疼痛は明らかに異なる感覚であるが、掻痒感と疼痛との間には重要な相互作用がある。引っ掻きによる痛覚によって掻痒感を抑えることができることはよく知られている。しかし、オピオイド等の鎮痛剤は痛覚を抑えるように作用することによって、実際には痒覚を高める場合がある。このように、幾つかの疼痛治療剤は掻痒症状を悪化させることがあり、このことは、掻痒症と疼痛の両方を治療する可能性を有するより良い治療剤の必要性を更に後押しする。
【００１１】
神経成長因子（ＮＧＦ）は、神経栄養性サイトカイン又はニューロトロフィンのファミリーの１種である。ニューロトロフィンは、細胞生存、分化及びアポトーシスを制御することによって末梢神経系及び中枢神経系の両方の発達や維持において重要な役割を果たす。これらの神経系機能に加えて、ＮＧＦは、ヒスタミンの放出、マスト細胞の産生及びＢリンパ球の成長や分化を高めることも分かっている。また、ＮＧＦは、ある脂質メディエーターの好塩基球産生を調節することも分かっている。好中球のアポトーシスがＮＧＦによって抑制されることもある。これらの因子の全ては、免疫系及び神経系におけるＮＧＦの役割を示唆している。
【００１２】
ＮＧＦβ鎖（β−ＮＧＦ）はＮＧＦの神経成長刺激活性に単独で関与する。細胞においてはβ−ＮＧＦは二量体として存在し、神経細胞及び非神経細胞における２種の細胞表面受容体と結合する。該タンパク質の三次構造は３個のシスチンジスルフィドと２個の逆平行β鎖に基づく。ヒト、マウス及びラットタンパク質のアミノ酸相同性は約９０％である。全てのニューロトロフィンと同様に、β−ＮＧＦはｎＭ親和性でｐ７５細胞受容体と結合する。また、β−ＮＧＦはｐＭ親和性でチロシンキナーゼ受容体（Ｔｒｋ）の１種（特にＴｒｋＡ）とも結合する。ｐ７５受容体との反応によって細胞死が誘導される場合がある一方、ＴｒｋＡとの結合によって細胞生存が促進される。β−ＮＧＦがＴｒｋＡと結合することによって、該受容体及び内部細胞性タンパク質のリン酸化がもたらされる。β−ＮＧＦは受容体介在エンドサイトーシスによって内部に取り入れられる。Ｔｒｋ受容体は種々の非神経性組織に存在する。
【００１３】
皮膚でケラチノサイトから放出される神経成長因子（ＮＧＦ）は、皮膚神経密度を上昇させ、特に神経線維の発芽を促進して形態に影響を及ぼす主要メディエーターの１種である（非特許文献１）。慢性掻痒症の患者は皮内神経線維密度が高いことが分かっている。また、ＮＧＦは、特にＮＧＦの受容体であるチロシンキナーゼＴｒｋＡを誘発して末梢ニューロンの感度を高めることが分かっている（非特許文献２）。
【００１４】
掻痒症及び疼痛を仲介するＮＧＦの重要性は、掻痒症及び疼痛の両方の兆候を示し得るアトピー性病態において測定されるＮＧＦ濃度が高いことによって示される。アトピー性皮膚炎の患者は血清ＮＧＦレベルが非常に高いが、これは病態の重症度と正の相関を示す。接触性皮膚炎の患者は局所ＮＧＦ濃度が高く、結節性痒疹の患者もＮＧＦレベル及びＴｒｋＡ活性化レベルが高い（非特許文献１）。
【００１５】
アトピー性皮膚炎のマウスモデルにおいて腹腔内注射で全身投与された抗ＮＧＦ抗体の症状に対する作用について研究し、その結果から、「抗ＮＧＦ抗体は、ＮＧＦの神経系末梢への作用をブロックし、上皮神経支配、皮膚炎及び引っ掻き行動を抑制する」ことが示唆されている（非特許文献４）。しかし、その研究から、抗ＮＧＦ抗体によって血清ＮＧＦレベルは変化せず、試験した皮膚領域のＮＧＦ濃度は低下せず、引っ掻き行動は完全には抑制されなかったことが分かった。従って、アトピー性皮膚炎に伴う掻痒感をより完全に抑制又は除去する必要性は依然として残っている。
【００１６】
多くのエビデンスによって、ＮＧＦがある疼痛状態のメディエーターとして機能することが分かっている。抗ＮＧＦ抗体によって、持続性の熱的及び化学的鎮痛作用が得られると共に、カラギーナン誘導による炎症から生じる痛覚過敏をブロックすることができることが分かっている（非特許文献５）。ＮＧＦの生物活性を遮断するための小分子ＮＧＦ受容体拮抗剤に関する研究によって、神経障害性及び炎症性の疼痛状態に対する鎮痛作用が示された（非特許文献６）。Owolabiらの研究においては、小分子ＮＧＦ活性阻害剤の鎮痛作用は、投与経路に応じ、モルヒネに比べて低い場合がある。モルヒネ等のオピオイドは多くの望ましくない副作用を有するため、効果的な投与を柔軟に行うことができ、ＮＧＦ介在の種々の疼痛状態において鎮痛をもたらす必要性が依然として残っている。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【００１７】
【非特許文献１】Schmelz、Neurosci.Biobehav. Rev.doi:10.1016/j.neubiorev.2008.12.004,2009
【非特許文献２】Stander and Schmelz,Eur.J.Pain 10:473,2006
【非特許文献３】Yosipovitch et al.,Lancet 361:690,2003
【非特許文献４】Takano et al., J.Pharmacol.Sci.99:277:284,2005
【非特許文献５】McMahon et al., Nat.Med.1:774,1995
【非特許文献６】Owolabi et al., J.Pharmacol.Exp.Ther.289:1271,1999
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題及び課題を解決するための手段】
【００１８】
本開示は、神経成長因子のβサブユニットと結合する種々のアプタマー（本明細書においては個々に「β−ＮＧＦアプタマー」と称する）を提供すると共に、そのようなβ−ＮＧＦアプタマーを用いてβ−ＮＧＦ介在疾患及び障害を治療するための方法（例えば、疼痛や掻痒症、掻痒状態の治療）を提供する。β−ＮＧＦアプタマー又はその薬学的に許容し得る塩と少なくとも１種の薬学的に許容し得る担体とを含む医薬組成物又は医薬製剤も包含される。
【００１９】
本開示に係る組成物は、任意の適切な薬学的に許容し得る投与形態に調製することができる。本明細書に記載の処方及び用量は、疼痛や掻痒症、掻痒状態等の種々の病態の治療において臨床有効性を最大限にすると同時に、副作用を抑制又は最小限にするよう設計される。
【００２０】
本開示は、β−ＮＧＦ介在の疾患又は病態を予防、治療又は改善するための方法であって、脊椎動物（具体的には哺乳動物、より具体的にはヒト）にβ−ＮＧＦアプタマー又はβ−ＮＧＦアプタマーの医薬組成物を投与することを含む方法を更に提供する。具体的には、本開示は、疼痛、掻痒症及び掻痒状態を予防、治療又は改善するための方法を提供する。幾つかの態様においては、β−ＮＧＦ介在の疾患又は病態は、ある段階でβ−ＮＧＦ活性が直接的又は間接的に掻痒症を引き起こし得る疾患又は病態である。幾つかの実施形態においては、治療、予防又は改善対象の疾患又は病態は皮膚炎又は湿疹である。他の実施形態においては、治療、予防又は改善対象の疾患又は病態はアトピー性皮膚炎である。
【００２１】
一実施形態においては、治療効果（例えば、疼痛、掻痒症及び掻痒状態の治療、予防又は改善）は、治療対象患者へのβ−ＮＧＦアプタマーの送達方法に関わらず、該アプタマーがβ−ＮＧＦに曝露され、結合できるように該アプタマーを投与することによって得ることができる。関連する一実施形態においては、治療効果は、β−ＮＧＦアプタマーがβ−ＮＧＦに曝露され、結合してβ−ＮＧＦの種々の細胞受容体の一以上へのβ−ＮＧＦの結合が防止又は抑制されるように該アプタマーを投与することによって得ることができる。一実施形態においては、細胞受容体はｐ７５である。他の実施形態においては、細胞受容体はＴｒｋ受容体である。更に他の実施形態においては、細胞受容体はＴｒｋＡである。更に他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーによって、β−ＮＧＦ受容体及び他の内部細胞性タンパク質のリン酸化が防止されるか、又はそのレベルが低下する。
【００２２】
提供される方法は、β−ＮＧＦアプタマーを一以上の二次的活性剤と共に投与することを包含する。この投与は逐次的に行ってもよく、配合組成物で行ってもよい。
【００２３】
本開示は、他の態様において、β−ＮＧＦを含む疑いのあるサンプルにβ−ＮＧＦアプタマーを接触させることを含むインビトロ診断方法を提供する。本開示は、他の態様において、適切に標識したβ−ＮＧＦアプタマーを用意することと、β−ＮＧＦ介在疾患又は障害を有する疑いのある個体に該アプタマーを注入することと、該個体の健康状態を診断又は評価する目的で標識アプタマーを検出することとを含むインビボ診断方法を提供する。用いる標識は使用する画像診断法に応じて選択する。
【図面の簡単な説明】
【００２４】
【図１】図１は、ランダムライブラリー（○）と比較したアプタマー２４２６−６６（■）（配列番号１）の結合曲線を示したもの。
【図２Ａ】図２Ａは、アプタマー２４２６−６６（配列番号１）について４５４配列決定を用いて同定したアプタマーコンセンサス配列を示したもの。
【図２Ｂ】図２Ｂは、アプタマー２４２６−６６（配列番号１）について４５４配列決定を用いて同定したアプタマーコンセンサス配列を示したもの。
【図３】図３は、β−ＮＧＦアプタマーに対する二量体化戦略＃１を示したもの。
【図４】図４は、β−ＮＧＦアプタマーに対する二量体化戦略＃２を示したもの。
【図５】図５は、実施例４に記載の神経突起成長アッセイにて試験した、種々のアプタマーがヒトβ−ＮＧＦ誘導ＰＣ１２細胞分化を阻害する能力をグラフに示したもの。
【図６】図６は、実施例４に記載のように測定した、アプタマー２４２６−６６（■）（配列番号１）とその切断型変異体２４２６−６６−５０（○）（配列番号２）によるβ−ＮＧＦ介在神経突起成長の阻害をアプタマー濃度の関数としてグラフに示したもの。
【図７】図７は、アプタマー２４２６−６６（配列番号１）と切断型変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）及び２４２６−６６−５３（配列番号４３）によるヒトβ−ＮＧＦ、マウスβ−ＮＧＦ及びラットβ−ＮＧＦ介在神経突起成長の阻害をグラフに示したもの。３種のアプタマーは全て、ヒトβ−ＮＧＦの場合とほぼ同等にマウスβ−ＮＧＦを効果的に阻害したが、ラットβ−ＮＧＦを阻害する程度は低かった。
【図８】図８は、アプタマー２４２６−６６（配列番号１）と切断型変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）及び２４２６−６６−３（配列番号５）を用いたＴｒｋＡリン酸化アッセイの結果をグラフに示したもの。
【図９】図９は、マウス及びラットβ−ＮＧＦを用いた切断型アプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２）に関するＴｒｋＡリン酸化アッセイをグラフに示したもの。
【図１０Ａ】図１０Ａは、本明細書に記載のアプタマーの調製に用いたＣ−５ピリミジン改変を示したもの。
【図１０Ｂ】図１０Ａ中のＲ’基を示す。式中、Ｒ''''は、分岐鎖又は直鎖低級アルキル（Ｃ１〜Ｃ２０）、ハロゲン（Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、Ｉ）、ニトリル（ＣＮ）、ボロン酸（ＢＯ2Ｈ2）、カルボン酸（ＣＯＯＨ）、カルボン酸エステル（ＣＯＯＲ''）、一級アミド（ＣＯＮＨ2）、二級アミド（ＣＯＮＨＲ''）、三級アミド（ＣＯＮＲ''Ｒ'''）、スルホンアミド（ＳＯ2ＮＨ2）、Ｎ−アルキルスルホンアミド（ＳＯＮＨＲ''）からなる群から選択される基（ここで、Ｒ''、Ｒ'''は、分岐鎖又は直鎖低級アルキル（Ｃ１〜Ｃ２）、フェニル（Ｃ6Ｈ5）、Ｒ''''置換フェニル環（Ｒ''''Ｃ6Ｈ4）（ここで、Ｒ''''は上述の通り）、カルボン酸（ＣＯＯＨ）、カルボン酸エステル（ＣＯＯＲ'''''）（ここで、Ｒ'''''は分岐鎖又は直鎖低級アルキル（Ｃ１〜Ｃ２０））及びシクロアルキル（この場合、Ｒ''＝Ｒ'''＝（ＣＨ2）n）（ｎ＝２〜１０）からなる群から独立して選択されるもの）。
【図１１】図１１は、実施例５に記載のように、アプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２）で処理した疾患マウス（●）では４週間に亘って引っ掻き頻度が低下したが、未処理マウス（■）又は親水性軟膏（ＨＯ）で処理したマウス（▲）では低下しなかったことをグラフに示したもの。ｔ検定によって、アプタマー処理と未処理との間（＊）又はアプタマー処理とＨＯ処理との間（＃）には統計的有意差（ｐ＜０．０５）が確認された。
【図１２】図１２は、実施例５に記載のように、アプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２）で処理した疾患マウス（●）では４週間に亘って臨床的皮膚状態スコアが低下したが、未処理マウス（■）又はＨＯで処理したマウス（▲）では低下しなかったことをグラフに示したもの。ｔ検定によって、アプタマー処理と未処理との間（＊）又はアプタマー処理とＨＯ処理との間（＃）には統計的有意差（ｐ＜０．０５）が確認された。
【発明を実施するための形態】
【００２５】
以下、本発明の代表的な実施形態について詳細に説明する。列挙した実施形態と共に本発明の説明を行うが、本発明がこれらの実施形態に限定されないことは理解されよう。逆に、本発明は、請求項によって規定される本発明の範囲内に含まれ得る全ての代替物、変形物及び等価物を網羅することとする。
【００２６】
当業者であれば、本明細書に記載のものと類似又は等価な多くの方法や物質を本発明の実施に用いることができ、また、それらが本発明の範囲内にあることは理解するであろう。本発明は記載された方法や物質に決して限定されない。
【００２７】
特に明記しない限り、本明細書で用いる技術科学用語は、本発明が属する技術分野における通常の知識を有する者が一般に理解する意味と同じ意味を有する。本明細書に記載された内容と類似又は等価な方法、装置及び物質のいずれもが本発明を実施又は試験するために用いられるが、好ましい方法、装置及び物質を以下に記載する。
【００２８】
本開示に引用した全ての刊行物、公開特許文献及び特許出願は、本発明が属する技術分野における技術レベルを示す。本明細書に引用した全ての刊行物、公開特許文献及び特許出願は本明細書の一部を構成するものとしてここに援用するが、この際、各々の刊行物、公開特許文献又は特許出願は具体的且つ個別に援用されるものとして示した。
【００２９】
本開示（添付した請求の範囲を含む）においては、特に文脈にて明確に定められない限り、単数形「a」、「an」及び「the」は、複数形の言及も包含し、「少なくとも一」や「一又はそれ以上」と交換可能に用いる。従って、「an aptamer」はアプタマーの混合物等を包含する。
【００３０】
本明細書で用いる「約」とは、数値が関する項目の基本機能が変わらないような数値の僅かな変化又は変動を示す。
【００３１】
本明細書において複数の項目について言及する際に用いる「各」とは、該項目の少なくとも２個を意味するものとする。複数を構成する項目の全てが関連する更なる限定を満たす必要はない。
【００３２】
本明細書において「含む」に関して用いる次の各表現「comprises」、「comprising」、「includes」、「including」、「contains」、「containing」及びそれらのいずれの変形も非排他的な包含を網羅することとし、一要素又は要素のリストを含むプロセス、方法、プロダクト・バイ・プロセス又は組成物は、これらの要素のみを含むのではなく、明確に列挙されていない他の要素又はこのようなプロセス、方法、プロダクト・バイ・プロセス又は組成物に固有の他の要素を含んでいてもよい。
【００３３】
本明細書で用いる「ヌクレオチド」とは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド又はその改変体を意味すると共に、その類似体をも意味する。ヌクレオチドとしては、プリン類（例えば、アデニンやヒポキサンチン、グアニン及びその誘導体や類似体）及びピリミジン類（例えば、シトシンやウラシル、チミン及びその誘導体や類似体）を含む種が挙げられる。
【００３４】
本明細書で交換可能に用いる「核酸」、「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」とは、ヌクレオチドのポリマーを意味し、その例としては、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッド、及びこの種の核酸、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドの改変体が挙げられるが、ヌクレオチドユニットへの任意位置での種々の構成要素や部分の付着も包含される。「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」及び「核酸」には二本鎖分子や一本鎖分子が含まれると共に、三重らせん分子も含まれる。「核酸」、「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」は「アプタマー」よりも広義の用語であるため、「核酸」、「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」には、アプタマーであるヌクレオチドポリマーが含まれるが、「核酸」、「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」はアプタマーに限定されない。
【００３５】
本明細書において、オリゴヌクレオチドに関して用いる「改変する（modify）」、「改変された（modified）」、「改変（modification）」及びその如何なる変形も、オリゴヌクレオチドの４種の構成ヌクレオチド塩基（即ち、Ａ、Ｇ、Ｔ／Ｕ及びＣ）の少なくとも１種が天然ヌクレオチドの類似体又はエステルであることを意味する。幾つかの実施形態においては、改変ヌクレオチドはオリゴヌクレオチドに対するヌクレアーゼ耐性を与える。Ｃ−５位に置換を有するピリミジンは改変ヌクレオチドの一例である。改変としては、骨格改変やメチル化、イソ塩基であるイソシチジンやイソグアニジン等の通常とは異なる塩基対形成の組み合わせ等を挙げることができる。また、改変としては、キャッピング等の３’改変や５’改変を挙げることもできる。他の改変としては、天然ヌクレオチドの一以上と類似体との置換や、ヌクレオチド間改変、例えば、非電荷連結（例えば、ホスホン酸メチルやホスホトリエステル、ホスホアミデート、カルバメート等）による改変や電荷連結（例えば、ホスホロチオエートやホスホロジチオエート等）による改変、介入物（例えば、アクリジンやソラレン等）による改変、キレート剤（例えば、金属や放射性金属、ホウ素、酸化性金属等）を含む改変、アルキル化剤を含む改変、改変連結（例えば、αアノマー核酸等）による改変を挙げることができる。更に、ヌクレオチドの糖に通常存在する水酸基のいずれも、ホスホン酸基又はリン酸基によって置換してもよく、標準保護基によって保護してもよく、又は活性化して更なるヌクレオチド又は固体支持体に更に連結するように調製してもよい。５’末端及び３’末端ＯＨ基はリン酸化してもよく、アミン、炭素原子数が約１〜約２０の有機キャップ基部分、約１０〜約８０ｋＤａのポリエチレングリコール（ＰＥＧ）ポリマー（一実施形態）、約２０〜約６０ｋＤａのＰＥＧポリマー（他の実施形態）又は他の親水性や疎水性の生物学的又は合成ポリマーで置換してもよい。一実施形態においては、改変はピリミジンのＣ−５位の改変である。これらの改変は、Ｃ−５位における直接的なアミド連結又は他の連結によって行うことができる。
【００３６】
また、ポリヌクレオチドには、当該技術分野で通常知られているリボース又はデオキシリボース糖の類似体（例えば、２’−Ｏ−メチル−、２’−Ｏ−アリル、２’−フルオロ−又は２’−アジド−リボース）や炭素環糖類似体、α−アノマー糖、アラビノースやキシロース、リキソース等のエピマー糖、ピラノース糖、フラノース糖、セドヘプツロース、非環式類似体、メチルリボシド等の脱塩基ヌクレオシド類似体を含むこともできる。上述のように、一以上のホスホジエステル連結を他の連結基で置換することができる。このような他の連結基としては、Ｐ（Ｏ）Ｓ（「チオエート」）、Ｐ（Ｓ）Ｓ（「ジチオエート」）、（Ｏ）ＮＲ2（「アミデート」）、Ｐ（Ｏ）Ｒ、Ｐ（Ｏ）ＯＲ’、ＣＯ又はＣＨ2（「ホルムアセタール」）（Ｒ又はＲ’はそれぞれ単独でＨ、又はエーテル（−Ｏ−）連結、アリール、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルケニル又はアラルキルを含んでいてもよい置換又は非置換アルキル（１〜２０Ｃ）である）によってリン酸が置換される実施形態が挙げられる。ポリヌクレオチド内の全ての連結が同一である必要はない。糖類、プリン類及びピリミジン類の類似体の置換は、例えば、ポリアミド骨格等の他の骨格構造の場合と同様に、最終製品を設計する上で有利とすることができる。
【００３７】
本明細書で用いる「Ｃ−５改変ピリミジン」とは、Ｃ−５位で改変されたピリミジンを意味し、その例として図１０に記載のものが挙げられるが、これらに限定されない。Ｃ−５改変ピリミジンの例としては、米国特許第５，７１９，２７３号及び第５，９４５，５２７号に記載のものが挙げられると共に、２００９年１１月２５日出願の米国仮特許出願第６１／２６４，５４５号（発明の名称「ヌクレアーゼ耐性オリゴヌクレオチド」）に記載のものが挙げられる。Ｃ−５改変の例としては、下に示すベンジルカルボキシアミド（或いはベンジルアミノカルボニル）（Ｂｎ）、ナフチルメチルカルボキシアミド（或いはナフチルメチルアミノカルボニル）（Ｎａｐ）、トリプトアミノカルボキシアミド（或いはトリプトアミノカルボニル）（Ｔｒｐ）及びイソブチルカルボキシアミド（或いはイソブチルアミノカルボニル）（ｉＢｕ）から独立して選択される置換基によるＣ−５位でのデオキシウリジンの置換が挙げられる。
【００３８】
【化１】
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【００３９】
また、Ｃ−５改変ピリミジンの化学的改変は、単独であっても任意の組み合わせにおいても、２’−位糖改変、環外アミンにおける改変、及び４−チオウリジンの置換等と組み合わせることもできる。
【００４０】
代表的なＣ−５改変ピリミジンとしては、５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＢｎｄＵ）や５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ｉＢｕｄＵ）、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＴｒｐｄＵ）、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−［１−（３−トリメチルアンモニウム）プロピル］カルボキシアミド）−２’−デオキシウリジンクロリド、５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＮａｐｄＵ）、５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−［１−（２，３−ジヒドロキシプロピル）］カルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン）が挙げられる。
【００４１】
ヌクレオチド構造に対する改変があるとすれば、ポリマーの構築前又は構築後に行うことができる。一連のヌクレオチドを非ヌクレオチド成分によって中断することができる。例えば、標識成分との接合によって、ポリヌクレオチドを重合後に更に改変することができる。
【００４２】
本明細書において核酸の改変を説明する際に用いる「少なくとも１種のピリミジン」とは、核酸内の１種、数種又は全てのピリミジンを意味するが、これは、核酸内のＣ、Ｔ又はＵのいずれか又は全てが改変される場合もあり、改変されない場合もあることを示す。
【００４３】
本明細書においては、「核酸リガンド」、「アプタマー」及び「クローン」は交換可能に用い、標的分子に対して所望の作用を有する非天然の核酸を意味する。所望の作用としては、標的に結合させることや標的を触媒的に変化させること、標的又は標的の機能活性を改変又は変化させるように標的と反応させること、標的に共有結合させること（自殺阻害剤と同様）、標的と他の分子との反応を促進することが挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態においては、該作用は標的分子に対する特定の結合親和性であり、このような標的分子は、ワトソン／クリック塩基対形成や三重らせん形成とは無関係のメカニズムによって核酸リガンドに結合するポリヌクレオチド以外の三次元化学構造であり、この場合、アプタマーは、標的分子によって結合される公知の生理学的機能を有する核酸ではない。所定の標的に対するアプタマーとしては、核酸の候補混合物から同定される核酸（即ち、アプタマーは標的のリガンドである）が挙げられるが、この同定は、（ａ）候補混合物を標的に接触させる（即ち、候補混合物中で標的に対する親和性が他の核酸に比べて高い核酸を候補混合物の残りから分離することができる）ことと、（ｂ）親和性の高い核酸を候補混合物の残りから分離することと、（ｃ）親和性の高い核酸を増幅してリガンドリッチの核酸混合物を得て、標的分子のアプタマーを同定することとを含む方法によって行う。親和性相互作用が程度の問題であることは認識されているが、本文脈においては、アプタマーのその標的に対する「特異的な結合親和性」とは、アプタマーが通常は、混合物やサンプル中の他の非標的成分に結合するのに比べて遥かに高い親和性で標的に結合することを意味する。「アプタマー」又は「核酸リガンド」は、特定のヌクレオチド配列を有する１種の核酸分子のコピーの１セットである。アプタマーは任意の適切な数のヌクレオチドを含むことができる。「複数のアプタマー」は一を超える該分子のセットを意味する。異なるアプタマーが有するヌクレオチドの数は同一でもよく、異なっていてもよい。アプタマーは、ＤＮＡやＲＮＡであってもよく、一本鎖や二本鎖であってもよく、二本鎖領域又は三本鎖領域を含んでいてもよい。
【００４４】
本明細書において、「タンパク質」は「ペプチド」、「ポリペプチド」又は「ペプチド断片」と同義的に用いる。「精製された」ポリペプチド、タンパク質、ペプチド又はペプチド断片は、細胞物質や細胞、組織又はアミノ酸配列を得る無細胞源に由来する他の混入タンパク質を実質的に含まず、また、化学的前駆体や化学合成の際の他の化学品を実質的に含まない。
【００４５】
本明細書で用いる「調節する」とは、ペプチドやポリペプチドのレベルを上昇又は低下させて変えること、又は、ペプチドやポリペプチドの安定性や活性を上昇又は低下させて変えることを意味する。「阻害する」とは、ペプチドやポリペプチドのレベルを低下させること、又は、ペプチドやポリペプチドの安定性や活性を低下させることを意味する。本明細書に記載のように、調節又は阻害対象のタンパク質はβ−ＮＧＦである。
【００４６】
本明細書で用いる「生物活性」とは、生理学的又は病態生理学的プロセスに影響を及ぼし得る一以上の細胞又は細胞外プロセスに対する作用（例えば、結合やシグナリング等による）を示す。
【００４７】
本明細書で用いる「神経成長因子」、「ＮＧＦ」及び「β−ＮＧＦ」とは、神経成長因子及びＮＧＦ活性の少なくとも一部を保持するその変異体のβサブユニットを意味する。本明細書において、ＮＧＦは全ての哺乳動物種（ヒトやイヌ、ネコ、マウス、霊長類、ウマ、ウシを含む）の天然配列ＮＧＦを包含する。
【００４８】
本明細書で用いる「ＮＧＦ受容体」とは、ＮＧＦによって結合又は活性化されるポリペプチドを意味する。ＮＧＦ受容体としては、任意の哺乳動物種（例えば、ヒトやイヌ、ネコ、マウス、ウマ、霊長類、ウシが挙げられるが、これらに限定されない）のＴｒｋＡ受容体やｐ７５受容体が挙げられる。
【００４９】
「β−ＮＧＦアプタマー」は、β−ＮＧＦに結合してその活性を改変することが可能なアプタマーである。本明細書で用いる「β−ＮＧＦアプタマー」とは、β−ＮＧＦに結合し、及び／又はβ−ＮＧＦ生物活性及び／又はＮＧＦシグナリングによって仲介される下流経路を阻害することが可能なアプタマーを意味する。
【００５０】
本明細書で用いる「β−ＮＧＦ介在による疾患又は病態」とは、β−ＮＧＦ活性によって疾患プロセスのある段階で直接的又は間接的に疼痛や掻痒症が引き起こされることがある疾患や病態を意味し、その例としては、表７に記載の疾患や病態のいずれかが挙げられる。従って、β−ＮＧＦアプタマーを用いた治療によって、このような疾患や病態におけるβ−ＮＧＦ活性に起因する疼痛や掻痒症が阻害される。β−ＮＧＦに対するアプタマーは更に、β−ＮＧＦのその受容体の一以上への結合をブロックすることができる。
【００５１】
本明細書で用いる「疼痛」とは、急性疼痛、慢性疼痛、侵害受容性疼痛、内臓疼痛、体細胞性疼痛、非侵害受容性疼痛、神経障害性疼痛、交感神経性疼痛、又はβ−ＮＧＦ介在炎症プロセスに関する疼痛を意味する。
【００５２】
「掻痒症」とは、掻痒性疼痛の軽度の感覚から強い感覚まで至る掻痒感を意味する。掻痒感は主な皮膚疾患に付随することもあり、全身性疾患の症状であることもある（唯一の症状の場合もある）。掻痒感が最も激しくなり得る皮膚疾患としては、特に、疥癬やシラミ症、昆虫刺咬症、乾燥症、じん麻疹、アトピー性皮膚炎、接触性皮膚炎、扁平苔癬、汗疹、疱疹状皮膚炎が挙げられる。掻痒症の全身的原因としては、慢性肝疾患や慢性腎疾患、リンパ腫が挙げられる。
【００５３】
「皮膚障害」及び「皮膚疾患」とは、皮膚に影響を及ぼしたり、皮膚に関与する如何なる疾患や病態をも意味し、例えば、アトピー性皮膚炎や魚鱗癬、乾皮症、脂漏性皮膚炎、アレルギー性接触皮膚炎、脱毛症、天疱瘡、疱疹状皮膚炎、乾癬、カンジダ症、挫瘡、皮膚糸状菌症、おむつ皮膚炎、乳痂、湿疹、鉤虫症、また、例えば、創傷や火傷、便失禁、尿失禁に由来する皮膚損傷等の皮膚状態が挙げられる。
【００５４】
本明細書で用いる「薬学的に許容し得る」とは、動物（より具体的にはヒト）における使用に関して、連邦政府や州政府の規制当局によって認可されているか、又は米国薬局方や他の一般に認められた薬局方に記載されていることを意味する。「担体」とは、治療剤の投与に用いる希釈剤、アジュバント、賦形剤又は媒体を意味し、例えば、水や油等の滅菌液体が挙げられるが、これらに限定されない。
【００５５】
β−ＮＧＦアプタマーの「薬学的に許容し得る塩」又は「塩」は、イオン結合を含み、通常は個体への投与に適した酸又は塩基と開示化合物とを反応させて製造する、開示化合物の生成物である。薬学的に許容し得る塩としては、塩酸塩や臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩、硫酸水素塩、アルキルスルホン酸塩、アリールスルホン酸塩、アリールアルキルスルホン酸塩、酢酸塩、安息香酸塩、クエン酸塩、マレイン酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、乳酸塩、酒石酸塩等の酸付加塩、ＬｉやＮａ、Ｋ等のアルカリ金属カチオン、ＭｇやＣａ等のアルカリ土類金属塩、有機アミン塩を挙げることができるが、これらに限定されない。
【００５６】
「医薬組成物」は、個体への投与に適した形態でβ−ＮＧＦアプタマーを含む処方である。医薬組成物は通常、その所期の投与経路に対応するように処方される。投与経路の例としては、経口投与や非経口投与、例えば、静脈内投与や皮内投与、皮下投与、吸入投与、局所投与、経皮投与、経粘膜投与、直腸投与が挙げられるが、これらに限定されない。
【００５７】
本明細書で用いる「治療有効量」は通常、本明細書に記載の予防、抑制又は治療対象の障害や病態の少なくとも一症状を改善するのに必要な量を意味する。本開示に係るβ−ＮＧＦアプタマーに関して「治療有効量」を用いる場合には、このような治療を必要とする相当数の個体に該アプタマーを投与した際に特定の薬理学的応答をもたらすアプタマー用量を意味する。特定の例において特定の個体に投与するアプタマーの治療有効量は、当業者がその用量を治療有効量であると考えた場合であっても、本明細書に記載の病態／疾患を治療する上で必ずしも有効ではないことを強調しておく。
【００５８】
ＳＥＬＥＸ法
本明細書においては、「ＳＥＬＥＸ」と「ＳＥＬＥＸプロセス」は交換可能に用い、通常は、（１）標的分子と望ましく相互作用する（例えば、タンパク質と高親和性で結合する）核酸の選択と（２）選択した核酸の増幅との組み合わせを意味する。ＳＥＬＥＸプロセスを用いて、特定の標的分子やバイオマーカーに対して高親和性を有するアプタマーを同定することができる。
【００５９】
ＳＥＬＥＸは通常、核酸の候補混合物を調製することと、候補混合物を所望の標的分子に結合させて親和性複合体を形成することと、親和性複合体を未結合の候補核酸から分離することと、核酸を親和性複合体から分離して単離することと、核酸を精製することと、特定のアプタマー配列を同定することとを含む。該プロセスには複数のラウンドを設けて選択したアプタマーの親和性を更に高めることができる。該プロセスにはその一以上の時点に増幅段階を設けることができる。例えば、米国特許第５，４７５，０９６号（発明の名称「核酸リガンド」）を参照のこと。ＳＥＬＥＸプロセスを用いて、標的と共有結合するアプタマー及び標的と非共有結合するアプタマーを作出することができる。例えば、米国特許第５，７０５，３３７号（発明の名称「指数関数的富化による核酸リガンドの系統的進化：Ｃｈｅｍｉ−ＳＥＬＥＸ」）を参照のこと。
【００６０】
ＳＥＬＥＸプロセスを用いて、アプタマーの特性の改善（例えば、インビボ安定性や送達特性の改善）をもたらす改変ヌクレオチドを含む高親和性アプタマーを同定することができる。このような改変の例としては、リボース及び／又はリン酸及び／又は塩基位置における化学的置換が挙げられる。改変ヌクレオチドを含むＳＥＬＥＸプロセス同定アプタマーは米国特許第５，６６０，９８５号（発明の名称「改変ヌクレオチドを含む高親和性核酸リガンド」）に記載されており、該特許には、ピリミジンの５’位及び２’位で化学的に改変されたヌクレオチド誘導体を含むオリゴヌクレオチドが記載されている。米国特許第５，５８０，７３７号（上述参照）には、２’−アミノ（２’−ＮＨ2）、２’−フルオロ（２’−Ｆ）及び／又は２’−Ｏ−メチル（２’−ＯＭｅ）で改変された一以上のヌクレオチドを含む高特異性のアプタマーが記載されている。また、米国特許公開第２００９００９８５４９号（発明の名称「ＳＥＬＥＸ及び光ＳＥＬＥＸ」）も参照のこと（該特許公開には、物理的及び化学的特性が高められた核酸ライブラリーとそのＳＥＬＥＸ及び光ＳＥＬＥＸにおける使用が記載されている）。
【００６１】
２００９年１１月２５日出願の米国仮特許出願第６１／２６４，５４５号（発明の名称「ヌクレアーゼ耐性オリゴヌクレオチド」）には、ヌクレアーゼ耐性が改善されたオリゴヌクレオチドを製造するための方法が記載されている。ヌクレアーゼ耐性オリゴヌクレオチドには、図１０に記載の基から選択される基によってＣ−５位で改変された少なくとも１種のピリミジンが含まれる。種々の実施形態においては、改変としては、上述のベンジルカルボキシアミド（Ｂｎ）、ナフチルメチルカルボキシアミド（Ｎａｐ）、トリプトアミノカルボキシアミド（Ｔｒｐ）及びイソブチルカルボキシアミドから独立して選択される置換基によるＣ−５位でのデオキシウリジンの置換が挙げられる。
【００６２】
また、ＳＥＬＥＸを用いて、所望のオフ速度特性を有するアプタマーを同定することもできる。米国特許公開第２００９０００４６６７号（発明の名称「オフ速度が改善されたアプタマーを作出するための方法」）を参照のこと（該特許公開には、標的分子に結合することが可能なアプタマーを作出するための改良ＳＥＬＥＸ法が記載されている）。それぞれの標的分子からの解離速度が低いアプタマー及びフォトアプタマーを製造するための方法が記載されている。該方法は、候補混合物を標的分子に接触させることと、核酸−標的複合体を形成させることと、低オフ速度富化プロセスを行うこととを含み、高解離速度の核酸−標的複合体は解離して再編成しないが、低解離速度の複合体はそのまま残る。更に、該方法では、候補核酸混合物の作出に改変ヌクレオチドを用いて、オフ速度性能が改善されたアプタマーを作出する（米国特許公開第２００９００９８５４９号（発明の名称「ＳＥＬＥＸ及び光ＳＥＬＥＸ」）を参照）。
【００６３】
本明細書において「標的」又は「標的分子」は、核酸が所望に作用し得る如何なる化合物をも意味する。標的分子としては、タンパク質やペプチド、核酸、炭水化物、脂質、多糖、糖タンパク質、ホルモン、受容体、抗原、抗体、ウイルス、病原体、有害物質、基質、代謝物、遷移状態類似体、補因子、阻害剤、薬物、色素、栄養素、成長因子、細胞、組織、上述のものの任意の一部や断片等を挙げることができるが、これらに限定されない。事実上、如何なる化学的又は生物学的エフェクターをも適切な標的とすることができる。如何なるサイズの分子も標的とすることができる。また、標的を所定の方法で改変して、標的と核酸との相互作用の可能性や強度を高めることもできる。また、標的には特定の化合物や分子の僅かな変化が含まれることもあり、例えば、タンパク質の場合には、アミノ酸配列やジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、また、標識成分との接合等の他の操作や改変における僅かな変化が挙げられるが、これらは実質的には分子の同一性を変えない。「標的分子」又は「標的」は、アプタマーに結合可能な分子又は多分子構造の１種のコピーの１セットである。「複数の標的分子」又は「複数の標的」とは、一を超える該分子のセットを意味する。標的がペプチドであるＳＥＬＥＸプロセスの実施形態は米国特許第６，３７６，１９０号（発明の名称「精製タンパク質を用いない改変ＳＥＬＥＸプロセス」）に記載されている。本例においては、標的はβ−ＮＧＦである。
【００６４】
アプタマー
本開示に係るアプタマーは、実施例１に記載のオフ速度が低いアプタマーを同定するための改良ＳＥＬＥＸ法を用いて同定したが、そこには、β−ＮＧＦに対するＤＮＡアプタマーを選択し製造するための代表的な方法が記載されている。選択プロセスで用いたβ−ＮＧＦの形態は組換えヒトタンパク質であり、分子量が１３．２ｋＤの該タンパク質の単量体として単離した。溶液中で該単量体は二量体を形成する。この方法を用いて、β−ＮＧＦに対するＤＮＡアプタマー（「アプタマー２４２６−６６」と称する（配列番号１））を同定した。
【００６５】
アプタマー２４２６−６６（配列番号１）を用いて研究を行い、実施例２に記載のように、β−ＮＧＦに対して強い親和性を維持するのに必要な最小配列長を確認した。配列長を最小限にすることによって、化学プロセスにおけるアプタマー合成の再現性を高めることができ、経皮吸着や医薬製剤への配合を行い易くすることができる。切断の研究によって、β−ＮＧＦに対する強いバインダーでもある多数の切断型配列を有するアプタマー（Ｋｄ値が最大で約３０ｎＭ）が同定された。これらの配列には、配列番号１、２、９〜４４及び１４９（表３及び４）が含まれる。特に、β−ＮＧＦに対するアプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２、表４）、即ち、Ｋｄが１．４ｎＭの２８ｍｅｒが同定された。
【００６６】
２４２６−６６（配列番号１）を選択した配列プールに対して更なる配列決定研究を行った。４５４配列決定を配列決定方法として用いた。これは、並行パイロシークエンス法を用いる大規模の高スループット方法である。この方法によって、偏りのないサンプル調製や非常に正確な配列解析が行える。この方法においては、ビオチン化ＤＮＡ断片をストレプトアビジンビーズに捕捉した後、ＰＣＲで増幅する。非ビオチン化鎖をビーズから遊離し、一本鎖鋳型ＤＮＡライブラリーとして用いる。このライブラリーはＰＣＲで増幅する。各ビーズにはＤＮＡ断片の増幅されたクローンコピーが含まれる。その後、このビーズライブラリーは酵素的配列決定プロセスで用いる。配列決定データを用いて、β−ＮＧＦアプタマーに対するコンセンサス配列を同定した。更に、実施例３に記載のヌクレオチド置換研究によって、該コンセンサス配列の９個のＢｎｄＵ位置の内、７個がβ−ＮＧＦ結合に望ましく、２個のＢｎｄＵ位置が結合活性を失うことなくｄＴで置換できることが見出された。該コンセンサス配列を図２Ａに示すと共に、２４２６−６６（配列番号１）アプタマーに対する各位置におけるヌクレオチド頻度を図で表す。図２Ａに示すように、コンセンサス配列は、ＢＡＺＧＲＧＧＲＳＺＷＧＧＧＧＺＺＷＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号４５）である（配列中、ＢはＡ以外の任意のヌクレオチドから選択され、ＲはＡ又はＧから独立して選択され、ＳはＣ又はＧから選択され、ＷはＺ又はＴから独立して選択され、ＤはＣ以外の任意のヌクレオチドから選択され、Ｚは改変ヌクレオチド（具体的には改変ピリミジン）から独立して選択される）。
【００６７】
一態様においては、ＢはＣ、Ｇ又はＺから選択され、ＤはＡ、Ｇ又はＺから選択され、Ｒ、Ｓ、Ｗ及びＺは上述の通りである。
【００６８】
他の態様においては、コンセンサス配列はＢＡＺＧＲＧＧＲＳＺＺＧＧＧＧＺＺＺＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号３）である（配列中、Ｂ、Ｒ、Ｓ、Ｄ及びＺは上述の通りである）。
【００６９】
幾つかの実施形態においては、Ｚは改変ウリジンである。他の実施形態においては、Ｚは上述のＣ−５改変ピリミジンである。更に他の実施形態においては、Ｚは、５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＢｎｄＵ）、５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ｉＢｕｄＵ）、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−イソブチルカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＴｒｐｄＵ）、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−トリプトアミノカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン、５−（Ｎ−［１−（３−トリメチルアンモニウム）プロピル］カルボキシアミド）−２’−デオキシウリジンクロリド、５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＮａｐｄＵ）、５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−Ｏ−メチルウリジン、５−（Ｎ−ナフチルメチルカルボキシアミド）−２’−フルオロウリジン及び５−（Ｎ−［１−（２，３−ジヒドロキシプロピル）］カルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン）から成る群から独立して選択されるＣ−５改変ピリミジンである。他の実施形態においては、Ｚは５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド）−２’−デオキシウリジン（ＢｎｄＵ）である。これらのヌクレオチド改変のいずれも、β−ＮＧＦに対する高親和性結合を促進し、低オフ速度を得る上で同等に有効であることが見込まれる。
【００７０】
本明細書において一連の関連核酸に関して用いる「コンセンサス配列」とは、一連の関連核酸を集約的な数理解析及び／又は配列解析に付した際に該配列の各位置における最も一般的な塩基の選択を反映するヌクレオチド配列を意味する。
【００７１】
本開示は、ＳＥＬＥＸ法によって同定され、表３及び４に記載のβ−ＮＧＦアプタマー（配列番号１、２、９〜４４及び１４９）を提供する。記載されたアプタマーのいずれかと実質的に相同であって、β−ＮＧＦに結合する能力が表３及び４に記載のアプタマーの群（配列番号１、２、９〜４４及び１４９）から選択されるアプタマーと実質的に同等であるβ−ＮＧＦに対するアプタマーも本開示に包含される。更に、本開示で同定されたアプタマーと実質的に同じ構造を有し、β−ＮＧＦに結合する能力が表３及び４に記載のアプタマーの群（配列番号１、２、９〜４４及び１４９）から選択されるアプタマーと実質的に同等であるβ−ＮＧＦに対するアプタマーも本開示に包含される。
【００７２】
本開示は、その一態様において、β−ＮＧＦに特異的に結合し、一次核酸配列を含むアプタマーを提供する。一実施形態においては、一次核酸配列は配列番号１、２、９〜４４及び１４９から選択される。他の実施形態においては、一次核酸配列は、配列番号１、２、９〜４４及び１４９から選択される一次核酸配列に対して少なくとも約７５％同一、少なくとも約８０％同一、少なくとも約８５％同一、少なくとも約９０％同一、又は少なくとも約９５％同一であるように選択される。
【００７３】
二以上の核酸配列の文脈における「配列同一性」、「パーセント配列同一性」、「パーセント同一性」、「％同一」、「％同一性」及びそれらの変形は交換可能に用い、配列比較アルゴリズムや目視検査によって最大の一致を比較した際に、特定の割合で同一ヌクレオチドを有するか又は同一である二以上の配列又はサブ配列を意味する。配列を比較する際には、通常、１個の配列を試験配列の比較に用いる参照配列とする。配列比較アルゴリズムを用いる場合、試験配列と参照配列をコンピュータに入力し、必要に応じてサブ配列座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。その際、配列比較アルゴリズムは指定プログラムパラメータに基づき、参照配列に対して試験配列のパーセント配列同一性を算出する。比較のための最適な配列アラインメントは、例えば、スミス（Smith）及びウォーターマン（Waterman）、Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２，１９８１の局所相同性アルゴリズム、ニードルマン（Needleman）及びウンシュ（Wunsch）、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３，１９７０の相同性アラインメントアルゴリズム、パーソン（Pearson）及びリップマン（Lipman）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：２４４４，１９８８の類似性探索法、これらのアルゴリズムのコンピュータ実装（ウィスコンシン・ジェネティクス・ソフトウェア・パッケージ、ジェネティクス・コンピュータ・グループ（ウィスコンシン州マディソン、５７５  サイエンス  Ｄｒ．）のＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ及びＴＦＡＳＴＡ）、又は目視検査（一般にはアウスベル（Ausubel），Ｆ．Ｍ．ら、分子生物学における現在のプロトコル、グリーン・パブリッシングＡｓｓｏｃ．及びウィリー−インターサイエンス（１９８７）出版を参照）によって実施することができる。
【００７４】
パーセント配列同一性を確認するのに適したアルゴリズムの一例は、基本的局所アラインメント探索ツール（以下「ＢＬＡＳＴ」と称する）に用いるアルゴリズムである（例えば、アルトシュル（Altschul）ら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０，１９９０及びアルトシュル（Altschul）ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１５：３３８９−３４０２，１９９７を参照）。ＢＬＡＳＴ解析を行うためのソフトウェアは、国立生物工学情報センター（以下「ＮＣＢＩ」と称する）から公的に入手可能である。ＮＣＢＩから入手可能なソフトウェア（例えば、（ヌクレオチド配列用）ＢＬＡＳＴＮ）によって配列同一性を確認するのに用いるデフォルトパラメータは、マクギニス（McGinnis）ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，３２：Ｗ２０−Ｗ２５，２００４に記載されている。
【００７５】
本明細書において、核酸（例えば、β−ＮＧＦアプタマー）（その配列は参照ヌクレオチド配列に対して少なくとも、例えば、約９５％同一である）のパーセント同一性について説明する場合には、該核酸の配列は、参照核酸配列の１００個のヌクレオチドについて最大５箇所の変異が核酸配列に含まれ得ること以外、参照配列と同一であることとする。換言すると、所望の核酸配列（その配列は参照核酸配列と少なくとも約９５％同一である）を得るためには、参照配列のヌクレオチドの最大５％を欠失又は他のヌクレオチドで置換することができるか、又は、参照配列のヌクレオチド総数の最大５％に相当する数のヌクレオチドを参照配列に挿入することができる（本明細書では「挿入」と称する）。所望の配列を得るためのこのような参照配列の変異は、参照ヌクレオチド配列の５’又は３’末端位置で行なってもよく、又は、これらの末端位置間のどこでも、参照配列のヌクレオチド中で個々に分散させるか、参照配列内の一以上の近接グループで分散させてもよい。参照（クエリー）配列は、配列番号１、２、９〜４４及び１４９に示す全ヌクレオチド配列のいずれか１配列でもよく、これらの配列のいずれかの断片であってもよい。
【００７６】
一態様においては、配列番号４５又は配列番号３のコンセンサス配列の各々を改変して少なくとも１個の挿入を含めることができる。一実施形態においては、配列番号４５又は配列番号３のコンセンサス配列を改変して、１個のヌクレオチド（Ｎ）がコンセンサス配列の塩基９と塩基１０との間に挿入されるようにする。他の実施形態においては、配列番号４５又は配列番号３のコンセンサス配列を改変して、１個のヌクレオチド（Ｎ）がコンセンサス配列の塩基１５と塩基１６との間に挿入されるようにする。他の実施形態においては、配列番号４５又は配列番号３のコンセンサス配列を改変して、１個のヌクレオチド（Ｎ）がコンセンサス配列の塩基９と塩基１０との間に挿入され、更なるヌクレオチド（Ｎ）がコンセンサス配列の塩基１５と塩基１６との間に挿入されるようにする。これらの実施形態は次の通りである。
ＢＡＺＧＲＧＧＲＳＮ(0-1)ＺＷＧＧＧＧＮ(0-1)ＺＺＷＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号１５４）
ＢＡＺＧＲＧＧＲＳＮ(0-1)ＺＺＧＧＧＧＮ(0-1)ＺＺＺＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号１５５）
（配列中、Ｂ、Ｒ、Ｓ、Ｄ及びＺは上述の通りであり、Ｎは天然ヌクレオチド又は改変ヌクレオチド（Ａ、Ｃ、Ｇ又はＴ）から独立して選択される。）
【００７７】
本開示は、その他の態様において、β−ＮＧＦとの結合の際にβ−ＮＧＦの機能を調節するβ−ＮＧＦアプタマーを提供する。種々の実施形態においては、該アプタマーはインビボでβ−ＮＧＦの機能を調節する。種々の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の近接ヌクレオチドと同一である一連の近接ヌクレオチドを含む。種々の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマー内の一連の近接ヌクレオチドに含まれるヌクレオチドと同一である同数のヌクレオチドが配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の近接ヌクレオチド内に存在する。種々の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマー内の一連の近接ヌクレオチドは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の約４〜約３０個の近接ヌクレオチドと同一である一連の約４〜約３０個の近接ヌクレオチドを含む。一例示的実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の３０個の近接ヌクレオチドと同一である一連の３０個の近接ヌクレオチドを含む。他の例示的実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の２０個の近接ヌクレオチドと同一である一連の２０個の近接ヌクレオチドを含む。更に他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の８個の近接ヌクレオチドと同一である一連の８個の近接ヌクレオチドを含む。更に他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに含まれる一連の４個の近接ヌクレオチドと同一である一連の４個の近接ヌクレオチドを含む。
【００７８】
一実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは配列番号１である。他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは配列番号２である。更に他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは配列番号３のコンセンサス配列に由来する。他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは配列番号９〜４４及び１４９のいずれかである。一実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかと少なくとも約９５％同一、少なくとも約９０％同一、少なくとも約８５％同一、少なくとも約８０％同一、又は少なくとも約７５％同一である。他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９のいずれかに由来する配列とこれらのいずれかの断片とを含む。
【００７９】
β−ＮＧＦアプタマーは、β−ＮＧＦ結合領域に加えて、任意数のヌクレオチドを含むことができる。種々の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、最大約１００個のヌクレオチド、最大約９５個のヌクレオチド、最大約９０個のヌクレオチド、最大約８５個のヌクレオチド、最大約８０個のヌクレオチド、最大約７５個のヌクレオチド、最大約７０個のヌクレオチド、最大約６５個のヌクレオチド、最大約６０個のヌクレオチド、最大約５５個のヌクレオチド、最大約５０個のヌクレオチド、最大約４５個のヌクレオチド、最大約４０個のヌクレオチド、最大約３５個のヌクレオチド、最大約３０個のヌクレオチド、最大約２５個のヌクレオチド、又は最大約２０個のヌクレオチドを含むことができる。
【００８０】
更なる他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９から成る群から選択されるアプタマーと同様の結合特性を有すると共に、β−ＮＧＦ関連の疼痛や掻痒症及び掻痒状態を治療する能力を有するアプタマーから選択される。
【００８１】
β−ＮＧＦアプタマーは、β−ＮＧＦに対して任意の適切な解離定数（Ｋd）を有するように選択することができる。一例示的実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーはβ−ＮＧＦに対する解離定数（Ｋd）が約１０ｎＭ以下である。他の例示的実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーはβ−ＮＧＦに対する解離定数（Ｋd）が約１５ｎＭ以下である。更に他の例示的実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーはβ−ＮＧＦに対する解離定数（Ｋd）が約２０ｎＭ以下である。更に他の例示的実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーはβ−ＮＧＦに対する解離定数（Ｋd）が約２５ｎＭ以下である。適切な解離定数は、多点滴定を用いた結合アッセイを行い、実施例１で後述する式：ｙ＝（最大−最小）（タンパク質）／（Ｋd＋タンパク質）＋最小に当てはめて決定する。解離定数の決定は測定を行う条件に大きく依存するため、これらの数字は平衡時間等の因子に対して大きく変わり得ることは理解されたい。他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは、配列番号１、２、９〜４４及び１４９から選択されるアプタマーのＫd以下のＫdを有するアプタマーである。
【００８２】
アプタマー２４２６−６６（配列番号１）はβ−ＮＧＦ単量体と１：１の化学量論比で結合する。β−ＮＧＦは標的受容体との反応に必要な堅固なホモ二量体を形成するため、２４２６−６６アプタマーの二量体や他の多量体を用いてβ−ＮＧＦ活性をより効率よく阻害することができる。従って、他の実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーは上述の配列の任意の組み合わせの多量体である。図３及び４は、２４２６−６６アプタマーの二量体化への可能なアプローチを示す。β−ＮＧＦに対する適切な結合特性を有する如何なるアプタマー配列にも同じ戦略を適用することができる。また、同様のアプローチを用いて、望み通りに多くのアプタマー配列のコピーを有する多量体アプタマーを作出することもできる。この場合、切断型アプタマーの２４２６−６６−５０（配列番号２）配列を用いるが、全長２４２６−６６配列を用いることもできる。図３は、新しいアプタマー配列の２セクション間にリンカーとして一以上のヘキサエチレングリコール（ＨＥＧ）又は脱塩基糖リン酸を有する、２個の２４２６−６６配列の頭尾構築物を示す。図４は、リンカーとしてヘキサエチレングリコール（ＨＥＧ）又は脱塩基糖リン酸を含んでいてもよい分岐ホスホルアミダイトを用いた２４２６−６６配列の二量体化を示す。
【００８３】
β−ＮＧＦアプタマーを含む医薬組成物
本開示は、少なくとも１種のβ−ＮＧＦに対するアプタマーと、少なくとも１種の薬学的に許容し得る担体とを含む医薬組成物を包含する。適切な担体は、リッピンコット、ウィリアムス＆ウィルキンス出版の「レミントン：薬学の科学及び実施、第２１版」に記載されているが、この内容を本明細書の一部を構成するものとしてここに援用する。少なくとも１種のβ−ＮＧＦに対するアプタマーと、少なくとも１種の薬学的に許容し得る担体とを含む医薬組成物は、β−ＮＧＦ阻害剤ではない一以上の活性剤を更に含むことができる。
【００８４】
本明細書に記載のアプタマーは任意の薬学的に許容し得る投与形態に用いることができ、その例としては、注射可能な投与形態や液体分散剤、ゲル、エアロゾル、軟膏、クリーム、凍結乾燥製剤、乾燥散剤、錠剤、カプセル、徐放性製剤、即溶解製剤、遅延放出製剤、持続放出製剤、パルス放出製剤、即放性製剤と徐放性製剤の混合物等が挙げられるが、これらに限定されない。具体的には、本明細書に記載のアプタマーの処方は、（ａ）経口投与、肺投与、静脈内投与、動脈内投与、髄腔内投与、関節内投与、直腸投与、眼投与、結腸投与、非経口投与、嚢内投与、膣内投与、腹腔内投与、局所投与、口腔内投与、経鼻投与及び外用投与のいずれかから選択される投与に対して、（ｂ）液体分散剤、ゲル、エアロゾル、軟膏、クリーム、錠剤、サシェ剤及びカプセルのいずれかから選択される投与形態に、（ｃ）凍結乾燥製剤、乾燥散剤、即溶解製剤、徐放性製剤、遅延放出製剤、持続放出製剤、パルス放出製剤及び即放性製剤と徐放性製剤の混合物のいずれかから選択される投与形態に、又は（ｄ）これらの組み合わせのいずれかで行うことができる。
【００８５】
非経口投与、皮内投与又は皮下投与に用いる溶液剤や懸濁剤は、次の成分、（１）注射用水や生理食塩水溶液、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール、他の合成溶媒等の滅菌希釈剤、（２）ベンジルアルコールやメチルパラベン等の抗菌剤、（３）アスコルビン酸や重亜硫酸ナトリウム等の抗酸化剤、（４）エチレンジアミン四酢酸等のキレート剤、（５）酢酸塩やクエン酸塩、リン酸塩等のバッファー、及び（５）塩化ナトリウムやデキストロース等の浸透圧調整剤の一以上を含むことができる。ｐＨの調整は、塩酸や水酸化ナトリウム等の酸や塩基で行うことができる。非経口製剤は、アンプルや使い捨てシリンジ、ガラス又はプラスチック製の複数回投与バイアルに封入することができる。
【００８６】
注射での使用に適した医薬組成物は、滅菌注射用溶液剤や分散剤を即時調製するための滅菌水溶液（即ち、水溶性）や分散剤、滅菌散剤を含むことができる。静脈内投与の場合、適切な担体としては、生理食塩水や制菌水、クレモフォアＥＬ（ＢＡＳＦ、ニュージャージー州パーシッパニー）、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、組成物は滅菌されており、容易に注射ができるように液体である必要がある。医薬組成物は、製造及び貯蔵条件下で安定である必要があり、バクテリアや菌類等の微生物の汚染作用に対して保護される必要がある。本明細書で用いる「安定である」とは、患者への投与に適した状態を維持していることを意味する。
【００８７】
担体は溶媒又は分散媒とすることができるが、例えば、水やエタノール、ポリオール（例えば、グリセロールやプロピレングリコール、液体ポリエチレングリコール等）、それらの適切な混合物が挙げられる。適切な流動性は、例えば、レシチン等のコーティングを用い、分散剤の場合には必要な粒径を維持し、また、界面活性剤を用いることによって維持することができる。微生物の作用は、種々の抗菌剤や抗真菌剤（例えば、パラベンやクロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサール等）によって防止することができる。多くの場合、組成物に等張剤、例えば、糖、マンニトールやソルビトール等の多価アルコール、塩化ナトリウム等の無機塩を配合することが好ましい。注射用組成物に吸収を遅らせる剤（例えば、モノステアリン酸アルミニウムやゼラチン）を配合することによって該組成物の吸収を持続させることができる。
【００８８】
滅菌注射用溶液剤は、適切な溶媒に必要量の活性試薬（例えば、β−ＮＧＦアプタマー）を、必要に応じて上に列挙した成分の１種又はその組み合わせと共に配合した後、濾過滅菌を行なって調製する。通常、分散剤の調製は、塩基性分散媒及び他の必要な成分を含む滅菌媒体に少なくとも１種のβ−ＮＧＦアプタマーを配合して行う。滅菌注射用溶液剤を調製するための滅菌散剤の場合、調製方法の例としては真空乾燥や凍結乾燥が挙げられるが、いずれによっても、先に滅菌濾過した溶液からβ−ＮＧＦアプタマーと更なる所望の成分の散剤が得られる。
【００８９】
経口組成物は通常、不活性な希釈剤又は食用担体を含む。経口組成物は、例えば、ゼラチンカプセルに封入したり、錠剤に圧縮することができる。治療用の経口投与を目的とする場合、β−ＮＧＦアプタマーに賦形剤を配合し、錠剤、トローチ又はカプセルの形態で用いることができる。また、経口組成物は液体担体によって調製してマウスウォッシュとして用いることもできるが、その際、液体担体中の化合物は口に含まれ、口の中で回された後、吐き出されるか又は飲み込まれる。薬学的に適合し得る結合剤及び／又はアジュバント物質を組成物の一部として配合することができる。
【００９０】
吸入による投与の場合、化合物は、適切な噴霧剤（例えば、二酸化炭素等のガスや噴霧液、適切な装置からの乾燥粉末）を含む加圧容器又はディスペンサーからエアロゾルスプレーの形態で送達される。経粘膜投与や経皮投与の場合、浸透対象のバリアに適した浸透剤を製剤に用いる。このような浸透剤は当該技術分野では通常知られているが、例えば、経粘膜投与の場合には、洗浄剤や胆汁酸塩、フシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与は、経鼻スプレーや坐剤を用いて行うことができる。経皮投与の場合、活性試薬を当該技術分野で通常知られている軟膏、サルヴェ、ゲル又はクリームに処方する。また、試薬を坐剤（例えば、カカオバターや他のグリセリド等の従来の坐剤基剤を用いる）又は直腸送達用停留浣腸の形態に調製することもできる。
【００９１】
一実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーを外用投与用に処方する。本明細書で用いる「外用投与」とは、β−ＮＧＦアプタマーを含む製剤を動物の皮膚（表皮）の全体又は一部に直接又は他の方法で接触させて動物にβ−ＮＧＦアプタマーを送達することを意味する。この用語は幾つかの投与経路を包含し、その例としては、外用投与や経皮投与が挙げられるが、これらに限定されない。通常、このような投与形態には、標的組織や標的層への効率的な送達が要求される。一態様においては、β−ＮＧＦアプタマーを表皮及び真皮に浸透させ、最終的には全身へ送達させる手段として外用投与を用いる。他の態様においては、動物の表皮や真皮又はその特定の層にβ−ＮＧＦアプタマーを選択的に送達する手段として外用投与を用いる。
【００９２】
外用投与の場合、β−ＮＧＦアプタマーを薬学的に許容し得る軟膏やクリーム、ローション、眼軟膏、点眼剤、点耳剤、含浸包帯及びエアロゾル、薬用散剤、薬用粘着剤、フォームに処方することができ、また、適切な従来の添加剤や賦形剤（例えば、薬物浸透を補助する防腐剤や溶媒、軟膏やゲル、クリームにおける軟化剤）を配合することができる。また、このような外用製剤には、適合性の従来の担体（例えば、ローション用のエタノールやオレイルアルコール）を配合することもできる。該担体は製剤の約１重量％〜約９８重量％を占めることができ、より一般には、該担体は製剤の最大約８０重量％を占める。アプタマーの外用送達用の特定の製剤は、米国特許第６，８４１，５３９号及び米国特許公開第２００５００９６２８７号に記載されている。外用製剤で送達する用量は継続送達モードに合うように決める。
【００９３】
一実施形態においては、体外へ急速に排出されることを防ぐ担体を用いてβ−ＮＧＦアプタマーを調製する。例えば、インプラントやマイクロカプセル化送達システムを含む徐放性製剤を用いることができる。エチレン酢酸ビニルやポリアンヒドリド、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、ポリ乳酸等の生分解性、生体適合性ポリマーを用いることができる。このような製剤を調製するための方法は当業者には明らかである。また、材料は、アルザ社やノヴァ・ファーマシューティカルズ社から購入することもできる。
【００９４】
リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体により感染細胞に標的化されたリポソームを含む）を薬学的に許容し得る担体として用いることもできる。例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載のような当業者に公知の方法に従ってこれらを調製することができる。
【００９５】
更に、必要に応じてβ−ＮＧＦアプタマーの懸濁剤を油状注射懸濁剤として調製することができる。適切な親油性溶媒又は媒体としては、ゴマ油等の脂肪油や、オレイン酸エチルやトリグリセリド、リポソーム等の合成脂肪酸エステルが挙げられる。非脂質ポリカチオン性アミノポリマーを送達用に用いることもできる。必要に応じて、懸濁剤には、適切な安定剤、又は化合物の溶解性を高め、高濃度溶液の調製を可能にする剤を配合することもできる。
【００９６】
ある場合には、投与を容易に行い用量を均一にするために、用量単位形態の経口組成物又は非経口的組成物を処方することは特に有利となり得る。本明細書で用いる用量単位形態は、治療対象のための単位用量として適した物理的に独立した単位を意味し、各々の単位は、必要とされる薬学的担体と共に所望の治療効果が生じるように算出された所定量のβ−ＮＧＦアプタマーを含む。本明細書に記載のβ−ＮＧＦアプタマーの用量単位形態の仕様は、特定のβ−ＮＧＦアプタマーの特性や達成すべき特定の治療効果、また、個体の治療のために活性剤を調合する際の当該技術分野に固有の制限に直接的に左右される。
【００９７】
少なくとも１種のβ−ＮＧＦアプタマーを含む医薬組成物は一以上の医薬賦形剤を含むことができる。このような賦形剤の例としては、結合剤や充填剤、潤滑剤、懸濁剤、甘味料、香味料、防腐剤、バッファー、湿潤剤、崩壊剤、発泡剤及び他の賦形剤が挙げられるが、これらに限定されない。このような賦形剤は当該技術分野で公知である。賦形剤の例としては、（１）結合剤、例えば、種々のセルロースや架橋ポリビニルピロリドン、微結晶セルロース（例えば、アヴィセル（登録商標）ＰＨ１０１やアヴィセル（登録商標）ＰＨ１０２）、ケイ化微結晶セルロース（プロソルブＳＭＣＣTM）、トラガカントゴム、ゼラチン、（２）充填剤、例えば、種々のデンプンやラクトース、ラクトース一水和物、無水ラクトース、（３）崩壊剤、例えば、アルギン酸やプリモゲル、コーンスターチ、低架橋ポリビニルピロリドン、ジャガイモデンプン、トウモロコシデンプン、加工デンプン、クロスカルメロースナトリウム、クロス−ポビドン、デンプングリコール酸ナトリウム、及びこれらの混合物、（４）圧縮対象の粉末の流動性に作用する剤を含む潤滑剤、例えば、ステアリン酸マグネシウムやコロイド状二酸化ケイ素（例えば、アエロジル（登録商標）２００）、タルク、ステアリン酸、ステアリン酸カルシウム、シリカゲル、（５）流動促進剤、例えば、コロイド状二酸化ケイ素、（６）防腐剤、例えば、ソルビン酸カリウムやメチルパラベン、プロピルパラベン、安息香酸及びその塩、パラヒドロキシ安息香酸の他のエステル（例えば、ブチルパラベン）、アルコール（例えば、エチルアルコールやベンジルアルコール）、フェノール化合物（例えば、フェノール）、四級化合物（例えば、塩化ベンザルコニウム）、（７）希釈剤、例えば、薬学的に許容し得る不活性充填剤、例えば、微結晶セルロースやラクトース、リン酸水素カルシウム、糖類、及び／又は上述のいずれかの混合物、希釈剤の例としては、微結晶セルロース（例えば、アヴィセル（登録商標）ＰＨ１０１やアヴィセル（登録商標）ＰＨ１０２）、ラクトース（例えば、ラクトース一水和物や無水ラクトース、ファーマトース（登録商標）ＤＣＬ２１）、リン酸水素カルシウム（例えば、エンコンプレス（登録商標））、マンニトール、デンプン、ソルビトール、スクロース、グルコースが挙げられる、（８）甘味料、例えば、任意の天然又は人工甘味料（例えば、スクロースやサッカリンスクロース、キシリトール、サッカリンナトリウム、シクラメート、アスパルテーム、アセスルファム）、（９）香味料、例えば、ペパーミントやサリチル酸メチル、オレンジ香味料、マグナスイート（マフコ（MAFCO）の登録商標）、バブルガムフレーバー、フルーツフレーバー等、（１０）発泡剤、例えば、発泡性カップル（例えば、有機酸や炭酸塩、重炭酸塩）が挙げられる。適切な有機酸としては、例えば、クエン酸や酒石酸、リンゴ酸、フマル酸、アジピン酸、コハク酸、アルギン酸、及びこれらの無水物や酸性塩が挙げられる。適切な炭酸塩や重炭酸塩としては、例えば、炭酸ナトリウムや重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウム、グリシン炭酸ナトリウム、炭酸Ｌ−リジン、炭酸アルギニンが挙げられる。或いは、発泡性カップルの重炭酸ナトリウム成分のみが存在してもよい。
【００９８】
種々の実施形態においては、本明細書に記載の製剤は実質的に純粋である。本明細書で用いる「実質的に純粋」とは、活性成分（β−ＮＧＦアプタマー）が主な存在種である（即ち、モルベースで組成物中の他の各種に比べて多い）ことを意味する。一実施形態においては、実質的な精製画分は、活性成分が存在する全ての高分子種の少なくとも約５０％（モルベース）である組成物である。通常、実質的に純粋な組成物は、該組成物に存在する全ての高分子種の約８０％超を含む。種々の実施形態においては、実質的に純粋な組成物は、該組成物に存在する全ての高分子種の少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、又は少なくとも約９９％を含む。種々の実施形態においては、活性成分を精製して本質的に均質化する（従来の検出方法では組成物中の混入種を検出できない）、即ち、組成物は本質的に単一高分子種で構成される。
【００９９】
β−ＮＧＦアプタマー組成物を含むキット
本開示は、本明細書に記載のβ−ＮＧＦアプタマーのいずれかを含むキットを提供する。該キットは、例えば、（１）少なくとも１種のβ−ＮＧＦアプタマーと、（２）少なくとも１種の薬学的に許容し得る担体（例えば、溶媒や溶液）を含むことができる。必要に応じて、更なるキット成分には、例えば、（１）本明細書で特定された薬学的に許容し得る賦形剤のいずれか（例えば、安定剤やバッファー等）、（２）キット成分を保持、及び／又は混合するための少なくとも１種の容器、バイアル又は同様の装置、及び（３）送達装置が含まれる。
【０１００】
治療方法
本開示は、β−ＮＧＦアプタマーを用いて病状を予防又は治療（例えば、一以上の症状を改善）する方法を提供する。該方法は、β−ＮＧＦアプタマーの治療有効量をそれを必要とする患者に投与することを含む。また、記載のアプタマーを予防的治療に用いることもできる。幾つかの実施形態においては、β−ＮＧＦアプタマーを外用的に投与する。
【０１０１】
治療方法に用いるβ−ＮＧＦアプタマーは、（１）本明細書に記載の方法で調製した新規なβ−ＮＧＦアプタマー、その薬学的に許容し得る塩、又はそのプロドラッグとすることができる。
【０１０２】
個体又は患者は任意の動物（飼育動物、家畜動物や野生動物）とすることができる（例えば、ネコやイヌ、ウマ、ブタ、ウシが挙げられるが、これらに限定されない）が、好ましくはヒト患者である。本明細書においては、「患者」、「個体」及び「対象」は交換可能に用いることができる。
【０１０３】
本明細書で用いる「治療する」は、疾患、病態又は障害の治療を目的とした患者の管理やケアを示し、β−ＮＧＦアプタマーを投与して疾患、病態又は障害の症状や合併症の発生を予防する、疾患、病態又は障害の症状や合併症を軽減する、又は患者における疾患、病態又は障害の存在を排除することを包含する。より具体的には、「治療する」は、疾患（障害）状態、疾患進行、疾患原因物質（例えば、細菌やウイルス）又は他の異常状態の少なくとも１種の有害な徴候や作用を逆転させる、減弱する、軽減する、最小限に抑える、抑制する、又は食い止めることを包含する。治療は通常、症状及び／又は病態が改善する限り継続する。
【０１０４】
種々の実施形態においては、開示された組成物（外用製剤を含む）と方法を用いて皮膚炎（発赤や浮腫、滲出、痂皮、鱗屑、（ある場合には）小水疱によって特徴付けられる皮膚の表在性炎症や発疹を特徴とすることが多い）を治療する。掻痒症（掻痒感）は皮膚炎において共通である。「湿疹」は皮膚炎と交換可能に用いることが多い。皮膚炎や湿疹の例としては、例えば、アトピー性皮膚炎（乳児性湿疹や曲げ湿疹とも称する）や接触性皮膚炎（アレルギー性や刺激性を含む）、乾燥性湿疹（皮脂欠乏性湿疹や亀裂性湿疹、冬の痒み、冬季掻痒症とも称する）、剥離性皮膚炎、手足皮膚炎、神経皮膚炎（例えば、慢性単純性苔癬）、脂漏性皮膚炎（新生児頭部皮膚炎、頭部粃糠疹）、円板状湿疹（貨幣状湿疹や滲出性湿疹、微生物湿疹とも称する）、発汗障害、静脈性湿疹（重力湿疹、うっ滞性皮膚炎、結節状湿疹うっ滞性皮膚炎、疱疹状皮膚炎（デューリング病）、自家感作性皮膚炎（イド反応や自己感作とも称する）、セルカリア皮膚炎（例えば、スイマーズイッチ又はダックイッチ）、ウルシオール誘発接触性皮膚炎（ウルシ皮膚炎とも称される（例えば、ウルシやツタウルシ、ヌルデ））、日光皮膚炎、主婦湿疹が挙げられる。
【０１０５】
一実施形態においては、開示された化合物、その薬学的に許容し得る塩又はそのプロドラッグの投与を、掻痒感を改善又は根絶する他の治療と組み合わせることができる。開示されたβ−ＮＧＦアプタマーを含む組成物は、例えば、一を超えるアプタマー（例えば、ＩｇＥ、ＩＬ−６、及び／又はＰＡＲ２アプタマー及びβ−ＮＧＦアプタマー）を含むことができる。幾つかの例においては、一以上のアプタマーを含むβ−ＮＧＦアプタマー組成物を他の有用な鎮痒組成物（例えば、抗ヒスタミン剤や鎮痛剤、抗コリン剤、非ステロイド性抗炎症薬、ステロイド剤、抗酸化剤、ビタミン剤、ロイコトリエン改質剤、インターロイキン拮抗剤、マスト細胞阻害剤、抗ＩｇＥ抗体、選択的セロトニン再取り込み阻害剤、５−ヒドロキシトリプタミン受容体拮抗剤、抗生剤、カルシニューリン阻害剤、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤、ガバペンチン、ナロキソン（これらにおいて、活性成分は遊離形態又は薬学的に許容し得る塩の形態で存在する））及び必要に応じて少なくとも１種の薬学的に許容し得る担体と組み合わせて投与し、全身投与又は外用投与を同時に、別々に又は逐次的に行う。一般に、このような組み合わせに用いる公知の治療剤の現在入手可能な投与形態は適切である。
【０１０６】
「併用療法」（又は「共同療法」）は、β−ＮＧＦアプタマー組成物と特定の治療レジメンの一部としての少なくとも１種の第２の剤とを投与することを包含し、これらの治療剤の相互作用による有益な効果を得ることを意図している。この併用による有益な効果としては、治療剤の併用に起因する薬物動態的な相互作用や薬力学的な相互作用が挙げられるが、これらに限定されない。これらの治療剤の併用投与は通常、所定の期間（通常は、選択した組み合わせに応じて分単位、時間単位、日単位又は週単位）に亘って行う。
【０１０７】
「併用療法」は、偶然に且つ任意に本開示に係る組み合わせをもたらす別々の単独療法の一部としてこれらの治療剤の二以上を投与することを包含することを意図する場合もあるが、通常は意図しない。「併用療法」は、これらの治療剤を逐次的に投与すること（即ち、各治療剤を異なる時間に投与すること）を包含すると共に、これらの治療剤又はその少なくとも２種を実質的に同時に投与することを包含することを意図する。実質的な同時投与は、例えば、各治療剤の比率を固定した単一用量又は複数の単一用量（治療剤の各々に対応）を対象に投与して行うことができる。
【０１０８】
β−ＮＧＦアプタマーを用いた投与レジメンは、種々の因子、例えば、患者のタイプや種、年齢、重量、性別、病状、治療対象の病態の重篤度、投与経路、患者の腎機能や肝機能、及び用いる特定のβ−ＮＧＦアプタマー又はその塩に応じて選択する。病態の進行を防止、阻止又は停止させるのに必要な組成物の有効量は、通常の技能を有する医師や獣医であれば容易に決定し、処方することができる。
【０１０９】
通常、用量（即ち、治療有効量）は、１日当たり約１μｇ〜約１００ｍｇ／治療する対象の体重（ｋｇ）である。
【０１１０】
有効性
実施例４では、種々のβ−ＮＧＦアプタマーやその切断型変異体がヒトβ−ＮＧＦ介在の神経突起成長を阻害する能力（図５〜７）及びβ−ＮＧＦによるＴｒｋＡリン酸化を阻害する能力（図８及び９）について説明する。
【０１１１】
実施例５では、疾患マウスへのアプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２）の投与によって引っ掻き頻度を低下させ、臨床的皮膚状態を改善する上でのβ−ＮＧＦアプタマーの有効性について説明する。図１１に示すように、アプタマー２４２６−６６−５０で処理したマウス（●）の場合、１４日目〜２８日目に引っ掻き頻度は確実に低下したが、それに対し、未処理マウス（■）や親水性軟膏（ＨＯ）で処理したマウス（▲）の場合、変化が見られなかったことが分かる。同様に、図１２に示すように、アプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２）で処理した疾患マウス（●）の場合、臨床的皮膚状態は４週間に亘って改善したが、引っ掻き頻度と同様に、未処理マウス（■）やＨＯ処理マウス（▲）の場合、改善が見られなかったことが分かる。
【０１１２】
以下に記載の実施例は単に説明目的のためであり、添付した請求項によって定義される本発明の範囲を限定することを意図していない。本明細書に記載の全ての実施例は、当業者によく知られている通常の標準的な技法を用いて行った。以下の実施例に記載の通常の分子生物学的技法は、標準的な実験室マニュアル、例えば、サンブルック（Sambrook）ら、分子クローニング：実験室マニュアル第３版、コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、ニューヨーク州コールド・スプリング・ハーバー（２００１）に記載されたように行うことができる。
【実施例】
【０１１３】
実施例１．アプタマー選択及び配列
Ａ．候補混合物の調製
表１に示すビオチン化ｓｓＤＮＡ鋳型にアニールしたＤＮＡプライマーのポリメラーゼ伸長によって、部分ランダム化ｓｓＤＮＡオリゴヌクレオチドの候補混合物を調製した。候補混合物には、ｄＡＴＰ、ｄＧＴＰ、ｄＣＴＰ及びＢｎｄＵＴＰ（５−（Ｎ−ベンジルカルボキシアミド−２’−デオキシウリジントリホスフェート）を含む４０ヌクレオチドランダム化カセットが含まれていた。
【０１１４】
特有の発色団であるニトロアジドアニリン（ＡＮＡ、配列中ではＸ）を５’末端に有するプライマー１（配列番号１６５）（４．８ｎｍｏｌ）と、２個のビオチン残基（配列中ではＢ’）及び４０個のランダム化位置（Ａ、Ｃ、Ｇ又はＴ）（配列中ではＮ）を有する鋳型１（配列番号４６）（４ｎｍｏｌ）とを１×ＫＯＤ  ＤＮＡポリメラーゼバッファー（ノバジェン）（１００μＬ）中で混合し、９５℃まで８分間加熱し、氷上で冷却した。１×ＫＯＤ  ＤＮＡポリメラーゼバッファー、ＫＯＤ  ＸＬ  ＤＮＡポリメラーゼ（０．１２５Ｕ／μＬ）及びｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ及びＢｎｄＵＴＰ（各０．５ｍＭ）を含む伸長反応物（４００μＬ）にプライマー−鋳型混合物（１００μＬ）を添加し、７０℃で３０分間インキュベートした。鋳型鎖ビオチンによる二本鎖生成物の捕捉は、ストレプトアビジンコートの磁気ビーズ（マグナバインド・ストレプトアビジン、ピアース、０．０５％トゥイーン２０含有３Ｍ  ＮａＣｌ中５ｍｇ／ｍＬ）（１ｍＬ）を添加し、混合しながら２５℃で１０分間インキュベートして行った。ＳＢ１７Ｔバッファー（４０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．５、１２５ｍＭ  ＮａＣｌ、５ｍＭ  ＫＣｌ、５ｍＭ  ＭｇＣｌ2、０．０５％トゥイーン２０）（０．７５ｍＬ）でビーズを３回洗浄した。２０ｍＭ  ＮａＯＨ（１．２ｍＬ）でビーズからアプタマー鎖を溶出させ、８０ｍＭ  ＨＣｌ（０．３ｍＬ）で中和し、１Ｍ  ＨＥＰＥＳ（ｐＨ７．５）（１５μＬ）で緩衝した。候補混合物をセントリコン３０で約０．２ｍＬまで濃縮し、ＵＶ吸光度分光法によって定量した。
【０１１５】
【表１】
0006012591.tif 000003
【０１１６】
Ｂ．標的タンパク質の調製
非タグ化ヒトβ−ＮＧＦ（Ｒ＆Ｄシステムズ）のビオチン化は、ＮＨＳ−ＰＥＯ４−ビオチン（ピアース）をリジン残基に共有結合して行った。セファデックスＧ−２５マイクロスピンカラムを用いてタンパク質（５０μＬ中３００ｐｍｏｌ）をＳＢ１７Ｔ中に交換した。ＮＨＳ−ＰＥＯ４−ビオチンを１．５ｍＭ添加し、反応物を４℃で１６時間インキュベートした。セファデックスＧ−２５マイクロスピンカラムを用いて未反応ＮＨＳ−ＰＥＯ４−ビオチンを除去した。
【０１１７】
Ｃ．標的タンパク質の固定化
ＳＥＬＥＸのラウンド１において、ＭｙＯｎｅ−ＳＡ常磁性ビーズ（ＭｙＯｎｅ  ＳＡ、インビトロジェン、以下「ＳＡビーズ」と称する）に標的タンパク質を固定化した。０．５ｍＬのＳＢ１７Ｔ中でβ−ＮＧＦを０．２ｍｇ／ｍＬまで希釈し、０．５ｍＬのＳＡビーズ（２０ｍＭ  ＮａＯＨで２回、ＳＢ１７Ｔで１回予備洗浄済）に添加した。混合物を２５℃で３０分間回転させ、使用するまで４℃で保存した。
【０１１８】
Ｄ．低オフ速度富化プロセス及び光架橋によるアプタマー選択
候補混合物を用い、標的タンパク質を有するサンプル（シグナル（Ｓ））と標的タンパク質を有しないサンプル（バックグラウンド（Ｂ））との結合を比較して選択を行った。最初の３ラウンドは親和性に関する選択（光架橋なし）によって行い、第２及び第３ラウンドでは低オフ速度富化プロセスを行った。ラウンド４〜ラウンド９では低オフ速度富化プロセスと光架橋の両方を行った。
【０１１９】
各サンプルに関しては、１０〜２０ｐｍｏｌの候補混合物（第１ラウンドでは５６ｐｍｏｌ）と５６ｐｍｏｌの逆方向プライマーを用いてＳＢ１７Ｔ中で９０μＬのＤＮＡ混合物を調製した。サンプルを９５℃まで３分間加熱し、０．１℃／秒の速度で３７℃まで冷却した。サンプルを１０μＬのタンパク質競合混合物（ＳＢ１７Ｔ中０．１％ＨＳＡ、１０μＭカゼイン、及び１０μＭプロトロンビン）と混合し、０．５ｍｇのＳＡビーズに添加し、混合しながら３７℃で５分間インキュベートした。磁気分離によってビーズを除去した。
【０１２０】
１０μＬの標的タンパク質（ＳＢ１７Ｔ中０．５μＭ）又はＳＢ１７Ｔを４０μＬのＤＮＡ混合物に添加し、３７℃で３０分間インキュベートして結合反応を行った。低オフ速度富化プロセスは３種類の方法で用いた。ラウンド２及び３においては、９５０μＬのＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）を添加してサンプルを２０倍に希釈し、３７℃で１５分間インキュベートした後、複合体を捕捉した。ラウンド４及び５においては、９５０μＬのＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）を添加してサンプルを２０倍に希釈し、３７℃で３０分間インキュベートした後、架橋を行った。ラウンド６及び７においては、９５０μＬのＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）を添加してサンプルを２０倍に希釈した。５０μＬの各希釈サンプルを９５０μＬの１０ｍＭデキストラン硫酸（５ｋＤａ）含有ＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）に移して再度希釈し、全部で４００倍希釈を行い、３７℃で６０分間インキュベートした後、架橋を行った。ラウンド８及び９においては、９５０μＬのＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）を添加してサンプルを２０倍に希釈し、５０μＬの各希釈サンプルを９５０μＬのＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）に移して再度希釈し、全部で４００倍希釈を行った。最後に、５０μＬの各４００倍希釈サンプルを９５０μＬの１０ｍＭデキストラン硫酸（５ｋＤａ）含有ＳＢ１７Ｔ（３７℃まで予備加熱）に移して再度希釈し、全部で８０００倍希釈を行い、３７℃で６０分間インキュベートした後、架橋を行った。光架橋を用いた際には、低オフ速度富化プロセス後の結合反応物（１ｍＬ）に４７０ｎｍのＬＥＤアレイで上方から６０秒間照射した後、複合体を捕捉した。
【０１２１】
タンパク質ビオチンによるＳＡビーズへの複合体の捕捉は、０．２５ｍｇのＭｙＯｎｅ−ＳＡビーズ（インビトロジェン）を添加し、混合しながら２５℃で１５分間インキュベートして行った。ビーズをＳＢ１７Ｔで５回洗浄して遊離ＤＮＡを除去した。特に明記しない限り、洗浄はいずれの場合も、ビーズを１００μＬの洗浄溶液に再懸濁させ、２５℃で３０秒間混合し、ビーズを磁石で分離し、洗浄溶液を除去して行った。８５μＬの２０ｍＭ  ＮａＯＨを添加し、混合しながら３７℃で１分間インキュベートしてアプタマー鎖をビーズから溶出させた。磁気分離後、８０μＬのアプタマー溶出物を新しいチューブに移し、２０μＬの８０ｍＭ  ＨＣｌで中和し、１μＬの０．５Ｍトリス−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）で緩衝した。
【０１２２】
光選択を用いた際には、複合体を上述のように捕捉し、ビーズの洗浄を０．０５％トゥイーン２０含有４Ｍグアニジン−ＨＣｌで１回（５０℃、１０分間）、２０ｍＭ  ＮａＯＨで１回（２５℃、２分間）、ＳＢ１７Ｔで２回、１６ｍＭ  ＮａＣｌで１回行なって未架橋ＤＮＡを除去した。架橋ＤＮＡはビーズ表面から除去せずに増幅段階で用いた。
【０１２３】
Ｅ．アプタマー増幅及び精製
選択したアプタマーＤＮＡをＱＰＣＲによって増幅し、定量した。４８μＬのＤＮＡを１２μＬのＱＰＣＲ混合物（５×ＫＯＤ  ＤＮＡポリメラーゼバッファー、２５ｍＭ  ＭｇＣｌ2、１０μＭ順方向ＰＣＲプライマー（プライマー２、配列番号４７）、１０μＭのビオチン化逆方向ＰＣＲプライマー（プライマー３、配列番号４８）、５×ＳＹＢＲグリーンＩ、０．１２５Ｕ／μＬのＫＯＤ  ＸＬ  ＤＮＡポリメラーゼ、及び各１ｍＭのｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ及びｄＴＴＰ）に添加し、次のプロトコル：９９．９℃で１５秒間、５５℃で１０秒間、６８℃で３０分間（１サイクル）、９９．９℃で１５秒間、７２℃で１分間（３０サイクル）によってバイオ−ラッドＭｙＩＱ  ＱＰＣＲ機器で熱サイクルを行った。該機器のソフトウェアによって定量化を行い、標的タンパク質の有無に関わらず、選択したＤＮＡのコピー数を比較してシグナル／バックグラウンド比を求めた。
【０１２４】
光選択を用いた際には、ビーズ表面でのプライマー伸長によって選択ＤＮＡのｃＤＮＡコピーを調製した。洗浄したビーズを２０μＬのｃＤＮＡ伸長混合物（５μＭの非ビオチン化逆方向ＰＣＲプライマー（プライマー４、配列番号１６９）を含むプライマー伸長バッファー、各０．５ｍＭのｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ及びｄＴＴＰ、及び０．１２５Ｕ／μＬのＫＯＤ  ＸＬ  ＤＮＡポリメラーゼ）に再懸濁させ、混合しながら６８℃で３０分間インキュベートした。ビーズをＳＢ１７Ｔで３回洗浄し、８５μＬの２０ｍＭ  ＮａＯＨを添加し、混合しながら３７℃で１分間インキュベートしてビーズからｃＤＮＡ鎖を溶出させた。磁気分離後、８０μＬのアプタマー溶出物を新しいチューブに移し、２０μＬの８０ｍＭ  ＨＣｌで中和し、１μＬの０．５Ｍトリス−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）で緩衝した。ｃＤＮＡは、９９．９℃で１５秒間、７２℃で１分間（３０サイクル）によって上述のようにＱＰＣＲで増幅し、定量した。
【０１２５】
増幅後、ビオチン化アンチセンス鎖によってＰＣＲ産物をＳＡビーズに捕捉した。１．２５ｍＬのＳＡビーズ（１０ｍｇ／ｍＬ）を０．５ｍＬの２０ｍＭ  ＮａＯＨで２回、０．５ｍＬのＳＢ１７Ｔで１回洗浄し、１．２５ｍＬの３Ｍ  ＮａＣｌ＋０．０５％トゥイーンに再懸濁させ、４℃で保存した。２５μＬのＳＡビーズ（３Ｍ  ＮａＣｌＴ中１０ｍｇ／ｍＬ）を５０μＬの二本鎖ＱＰＣＲ産物に添加し、混合しながら２５℃で５分間インキュベートした。ビーズをＳＢ１７Ｔで１回洗浄し、２００μＬの２０ｍＭ  ＮａＯＨを添加し、混合しながら３７℃で１分間インキュベートしてビーズから「センス」鎖を溶出させた。溶出した鎖を廃棄し、ビーズをＳＢ１７Ｔで３回、１６ｍＭ  ＮａＣｌで１回洗浄した。
【０１２６】
固定化アンチセンス鎖からのプライマー伸長によりＡＮＡ発色団を用いてアプタマーセンス鎖を調製した。ビーズを２０μＬのプライマー伸長反応混合物（１×プライマー伸長バッファー、１．５ｍＭ  ＭｇＣｌ2、５μＭの５’ＡＮＡ発色団含有順方向プライマー（プライマー１、配列番号１６５）、各０．５ｍＭのｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ及びＢｎｄＵＴＰ、及び０．１２５Ｕ／μＬのＫＯＤ  ＸＬ  ＤＮＡポリメラーゼ）に再懸濁させ、混合しながら６８℃で３０分間インキュベートした。ビーズをＳＢ１７Ｔで３回洗浄し、８５μＬの２０ｍＭ  ＮａＯＨを添加し、混合しながら３７℃で１分間インキュベートしてビーズからアプタマー鎖を溶出させた。磁気分離後、８０μＬのアプタマー溶出物を新しいチューブに移し、２０μＬの８０ｍＭ  ＨＣｌで中和し、５μＬの０．１Ｍ  ＨＥＰＥＳ（ｐＨ７．５）で緩衝した。
【０１２７】
Ｆ．選択ストリンジェンシー及びフィードバック
選択段階における標的タンパク質の相対濃度は、以下のようにＳ／Ｂ比（シグナルＳ及びバックグラウンドＢは上述のセクションＤで定義）に呼応して各ラウンドで低下した。
Ｓ／Ｂ＜１０の場合、［Ｐ］(i+1)＝［Ｐ］i
１０≦Ｓ／Ｂ＜１００の場合、［Ｐ］(i+1)＝［Ｐ］i／３．２
Ｓ／Ｂ≧１００の場合、［Ｐ］(i+1)＝［Ｐ］i／１０
（式中、［Ｐ］＝タンパク質濃度、ｉ＝現ラウンド数）
【０１２８】
各選択ラウンド後、富化ＤＮＡ混合物の収束状態を確認した。１０μＬの二本鎖ＱＰＣＲ産物を１×ＳＹＢＲグリーンＩ含有４ｍＭ  ＭｇＣｌ2で２００μＬまで希釈した。サンプルを７５μＬのシリコンオイルで覆い、二本鎖オリゴヌクレオチドの複合混合物のハイブリダイゼーション時間を測定するＣ0ｔ解析を用いて収束について解析した。サンプルに対し、次のプロトコル：９８℃で１分間、８５℃で１分間（３サイクル）、９３℃で１分間、８５℃で１５分間（１サイクル）によって熱サイクルを行った。８５℃で１５分間の際に、蛍光画像を５秒間隔で測定した。蛍光強度を対数（時間）の関数としてプロットし、各ＳＥＬＥＸラウンドにおけるハイブリダイゼーション速度の上昇（配列収束を示す）を観察した。
【０１２９】
Ｇ．クローンスクリーニングプロセス及びアプタマー同定
ＳＥＬＥＸの９ラウンド後の収束したプールをクローン化し、配列決定を行った。選択したＤＮＡを非ビオチン化ＳＥＬＥＸプライマーでＰＣＲ増幅してＡＧＣＴ  ＤＮＡを作出し、ＱＩＡクイック９６ＰＣＲ精製キット（カタログ番号：２８１８１）を用いて精製し、ストラタジーンＰＣＲ−スクリプトクローニングキット（カタログ番号：２１１１８９）を製造業者のプロトコル通りに用いて精製インサートをクローン化した。連結したＳＥＬＥＸプールを配列決定ベンダー（コージェニクス、テキサス州ヒューストン）に送付し、形質転換、９６ウェルプレート内への配列、ＤＮＡ調製及び配列決定を行った。約４２個のクローンの配列を得て、局所アラインメントアルゴリズムを用いて配列数／コピー数を決定し、共通収束パターンを特定するカスタムソフトウェアによって収束についての解析を行った。プール内で表示／コピー数が最も高い配列と共通結合モチーフに収束した配列を下流スクリーニング用に選択した。更なる解析用に６個の配列を選択し、コージェニクスから入手したプラスミドＤＮＡをＰＣＲ増幅用鋳型として用いて酵素的に調製した。
【０１３０】
Ｈ．平衡結合定数（Ｋd）の測定
６個の選択した配列の平衡結合定数を親和性アッセイによって測定した。放射標識ＤＮＡをＳＢ１７Ｔ−０．００２（０．００２％まで低下させたトゥイーン２０含有のＳＢ１７Ｔ）中、９５℃で３分間加熱し、３７℃までゆっくりと冷却した。ＳＢ１７Ｔ−０．００２中で低濃度の放射標識ＤＮＡ（約１×１０-11Ｍ）を種々の濃度の標的タンパク質（１×１０-7Ｍ〜１×１０-12Ｍ）と混合し、３７℃で３０分間インキュベートして複合体を形成した。各反応物の一部をナイロン膜に移し、乾燥させて各反応物中の総カウントを求めた。複合体をＺＯＲＢＡＸ樹脂（アジレント）に捕捉し、真空下でマルチスクリーンＨＶプレート（ミリポア）を通過させ、２００μＬのＳＢ１７Ｔ−０．００２バッファーで洗浄してタンパク質結合複合体を未結合ＤＮＡから分離した。ナイロン膜とマルチスクリーンＨＶプレートのホスホイメージングを行い、フジＦＬＡ−３０００を用いて各サンプル中の放射活性量を定量した。捕捉ＤＮＡの割合をタンパク質濃度（Ｐt）の関数としてプロットし、平衡結合定数（Ｋd）をｙ＝（最大−最小）（Ｐt）／（Ｋd＋Ｐt）＋最小を用いて求めた。クローン２４２６−６６（配列番号１、表３に記載）（７６ｍｅｒ、Ｋd＝５×１０-9Ｍ）を更なる特徴付け用のリードクローンとして選択した（図１参照）。
【０１３１】
Ｉ．ＳＥＬＥＸプールの大規模配列決定
２４２６−６６アプタマーファミリー内の配列をより十分に評価するため、４５４パイロシークエンス技術を用いて富化プールの配列決定を行った。プールＤＮＡを上述の４５４プライマーで増幅し、シークアル標準化プレート（インビトロジェン、カタログ番号Ａ１０５１０−０１）を用いてＰＣＲ産物を精製し、標準化した。溶出物をゲル泳動し、各アンプリコンのサイズと純度を確認した。精製ＰＣＲ産物の配列決定は、コロラド大学健康科学センター（コロラド州オーロラ）の４５４パイロシークエンス施設で行った。
【０１３２】
ＣＬＵＳＴＡＬ解析によって４５４配列を２４２６−６６と比較した。全部で１１６５個のマルチコピー配列の内、１６５個の配列は２４２６−６６と同様のパターンを有していた。これらの配列における５’配列共有性に基づき、該配列を３群に分けた。配列の中間領域は３群全てに保存されていた。全ての配列について、２４２６−６６の各位置におけるパーセント同一性は図２Ｂに記載のように算出した。表２には、２４２６−６６アプタマー配列ファミリーの代表的な多数の配列（配列中、Ｚ’はＢｎｄＵを表す）を記載する。
【０１３３】
【表２−１】
0006012591.tif 000004
【０１３４】
【表２−２】
0006012591.tif 000005
【０１３５】
【表２−３】
0006012591.tif 000006
【０１３６】
【表２−４】
0006012591.tif 000007
【０１３７】
【表２−５】
0006012591.tif 000008
【０１３８】
これに基づき、上述のように、β−ＮＧＦへの結合用コンセンサス配列が次の配列：
ＢＡＺＧＲＧＧＲＳＺＺＧＧＧＧＺＺＺＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号３）（配列中、Ｂ、Ｚ、Ｒ及びＳは上述の通り）であることを確認した。コンセンサス配列は２８ヌクレオチド長であるが、表２に記載の多数の配列はこのコンセンサス配列において一塩基挿入を有していた。図２Ｂに示すように、約９１％の配列は位置１２で欠失を有していたが、約７％の配列はこの位置でＧ又はＺを有しており、また、約９５％は位置１９で欠失を有していたが、約３％はこの位置でＧを有していた。この知見から、β−ＮＧＦコンセンサス配列（配列番号３）における挿入は幾つかの位置で許容的であり、これらの挿入はβ−ＮＧＦアプタマーを不活化しないことが示唆される。
【０１３９】
実施例２．配列切断研究
β−ＮＧＦアプタマー２４２６−６６（配列番号１）は７６ヌクレオチド長（Ｋd＝５×１０-9Ｍ）である。最も効率よく化学合成を行うには、最小の高親和性アプタマー配列を特定し、該アプタマーをできるだけ小さいサイズに切断することが重要である。他の利点は、組織浸透が高まり、インビボでヌクレアーゼ活性に対する安定性が高まることである。
【０１４０】
結合親和性を保持するアプタマー２４２６−６６（配列番号１）の最小領域を特定するために、２４２６−６６に存在する可能な全ての近接５０ヌクレオチド長配列を示す一連の切断型変異体を合成した。変異体の配列を表３に記載するが、Ｚ’はＢｎｄＵを表し、ＴはｄＴを表す。上述の親和性結合アッセイによりβ−ＮＧＦへの親和性に関して変異体を試験した。
【０１４１】
【表３−１】
0006012591.tif 000009
【０１４２】
【表３−２】
0006012591.tif 000010
【０１４３】
変異体２４２６−６６−２（配列番号４）、２４２６−６６−３（配列番号５）、２４２６−６６−４（配列番号６）、２４２６−６６−５（配列番号７）及び２４２６−６６−６（配列番号８）を除き、全ての変異体でβ−ＮＧＦ結合活性が保持されたが、これは、２４２６−６６の５’末端の２６ヌクレオチド（位置１〜２６）と３’末端の２１ヌクレオチド（位置５６〜７６）はβ−ＮＧＦの結合に必要ではなく、残りの２９のヌクレオチド要素（位置２７〜５５）の全部又は一部で十分となり得ることを示唆する。この仮説については、２４２６−６６（配列番号１）の第２の一連の変異体を合成し、その結合親和性を測定して試験した。該変異体の配列を表４に記載するが、配列中、Ｚ’はＢｎｄＵを表し、ＴはｄＴを表す。変異体２４２６−６６−５６（配列番号１５０）、２４２６−６６−５７（配列番号１５１）、２４２６−６６−５８（配列番号１５２）及び２４２６−６６−５９（配列番号１５３）を除き、全ての変異体でβ−ＮＧＦ結合活性が保持された。変異体２４２６−６６−５５（配列番号１４９）（２５ｍｅｒ）は、全長アプタマー２４２６−６６（配列番号１）と同等のβ−ＮＧＦ結合親和性を有する最も短い配列であった。変異体２４２６−６６−５４（配列番号４４）（２６ｍｅｒ）のβ−ＮＧＦに対する親和性は、全長アプタマー２４２６−６６（配列番号１）に比べて僅かに高かったため、更なる最適化のために選択した。
【０１４４】
【表４】
0006012591.tif 000011
【０１４５】
実施例３．望ましいＢｎｄＵ位置の決定
ＢｎｄＵのｄＴへの２６ｍｅｒ単一置換
アプタマー２４２６−６６−５４（配列番号４４）の２６個のヌクレオチドの内の９個はＢｎｄＵである。どのＢｎｄＵ位置が結合に関与しているか確認するため、２４２６−６６−５４の９種の変異体（各変異体は、９個のＢｎｄＵ位置の内の１個において単一ｄＴ置換を含む）を合成し、β−ＮＧＦ親和性を測定した。該変異体の配列を表５に記載するが、配列中、Ｚ’はＢｎｄＵを表し、ＴはｄＴを表す。
【０１４６】
【表５】
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【０１４７】
位置９でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−６８、配列番号１５８）及び位置１６でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−７１、配列番号１６１）の場合、未置換（全てＢｎｄＵ）のアプタマー２４２６−６６−５４（配列番号４４）と比べてβ−ＮＧＦに対する親和性の損失は見られなかった。位置１でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−６６、配列番号１５６）、位置８でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−６７、配列番号１５７）及び位置１４でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−６９、配列番号１５９）の場合、親和性の一部損失が見られ、位置１５でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−７０、配列番号１６０）、位置２２でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−７２、配列番号１６２）、位置２３でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−７３、配列番号１６３）及び位置２５でのｄＴによるＢｎｄＵの置換（変異体２４２６−６６−７４、配列番号１６４）の場合、親和性の完全な損失が見られた。これらの結果から、位置１、８、１４、１５、２２、２３及び２５で改変されたウリジン残基はβ−ＮＧＦ結合親和性を最大にする上で望ましいことが分かる。
【０１４８】
位置９及び位置１６のＢｎｄＵをｄＴで置換した２４２６−６６（配列番号１）の切断型変異体を合成し、β−ＮＧＦに対する親和性に関して試験した。配列を表６に記載するが、配列中、Ｚ’はＢｎｄＵを表し、ＴはｄＴを表す。２個の位置でＢｎｄＵをｄＴで置換した場合、３種の変異体のいずれにおいても、未置換の対照と比べて親和性の損失は見られなかった。
【０１４９】
【表６】
0006012591.tif 000013
【０１５０】
これらの結果（図２Ａに要約）に基づき、β−ＮＧＦへ結合させるためのコンセンサス配列（配列番号３）を次のように改変し、２個の位置でＢｎｄＵをｄＴで置換する能力を反映させた。
ＢＡＺＧＲＧＧＲＳＺＷＧＧＧＧＺＺＷＡＤＣＣＧＺＺＲＺＧ（配列番号４５）（配列中、Ｚ、Ｒ、Ｓ、Ｚ及びＷは上述の通りである）。
【０１５１】
実施例４．細胞アッセイ
β−ＮＧＦアプタマー２４２６−６６（配列番号１）と２４２６−６６の切断型変異体を２種のインビトロ細胞アッセイによりβ−ＮＧＦ活性阻害についてスクリーニングした。ラット褐色細胞腫由来の癌細胞株であって、ニューロン分化のモデルであるＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ由来のＣＲＬ−１７２１）は、ニューロン表現型の誘導によりβ−ＮＧＦに応答する。この応答の２種の発現は、膜結合ＴｒｋＡのリン酸化と神経突起の伸長である。β−ＮＧＦ刺激によるＰＣ１２細胞のＴｒｋＡリン酸化と神経突起成長を阻害する能力についてアプタマーを試験した。
【０１５２】
神経突起成長アッセイ
ＰＣ１２細胞を６０ｍｍディッシュに薄く蒔き、一晩プレートに付着させた。ＰＣ１２細胞は通常の高血清成長培地では分化しないため、付着させた後、通常の成長培地を低血清培地（ＬＳＭ）で置換した。β−ＮＧＦ（１００ｎｇ／ｍＬ）とアプタマー（１００ｎＭ）をＬＳＭ中で予備混合し、１時間平衡化させた後、プレートに添加して最終濃度が１０ｎｇ／ｍＬのβ−ＮＧＦ（０．３８ｎＭ）及び１０ｎＭアプタマーとした。細胞を３日間インキュベートさせ、３日目に培地、β−ＮＧＦ及びアプタマーを元の通りに置換した。５日目に、細胞の画像を位相差顕微鏡で取得し、イメージＪ用ニューロンＪプラグイン（ＮＩＨプログラム）を用いて神経突起長を測定した。神経突起長／細胞を算出し、（神経突起成長に対する）非アプタマー対照サンプルの値１００に対して標準化した。
【０１５３】
アプタマーがヒトβ−ＮＧＦ誘導ＰＣ１２細胞分化を阻害する能力を神経突起成長アッセイによって試験した。３’末端に反転ｄＴアミダイト（３’−ｉｄＴ）を有するアプタマーを合成し、培地内に存在する３’−５’エキソヌクレアーゼへの耐性を得た（図５参照）。
【０１５４】
アプタマー２４２６−６６（配列番号１）と切断型変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）は、β−ＮＧＦ誘導による神経突起成長を効果的に阻害した。変異体２４２６−６６−５３（配列番号４３）、２４２６−６６−５４（配列番号４４）及び２４２６−６６−５５（配列番号１４９）は、β−ＮＧＦ介在の神経突起成長の阻害に関して、２４２６−６６−５０と比べて効果的ではなかったが、これは、阻害を最大にするには２８ヌクレオチドの最小アプタマー長が必要であることを示す。また、２４２６−６６−５０の位置１１及び位置１８のＢｎｄＵ残基をｄＴ残基で置換した変異体２４２６−６６−７５（配列番号１６６）も、β−ＮＧＦ介在の神経突起成長をブロックする上で効果的ではなかった。β−ＮＧＦに対する親和性が低い５０ｍｅｒの変異体２４２６−６６−３（配列番号５）はβ−ＮＧＦ介在の神経突起成長を殆ど阻害しなかった。
【０１５５】
β−ＮＧＦ介在の神経突起成長を阻害するアプタマーの有効性は、アプタマー濃度を０．５ｎＭ〜８．０ｎＭとした際の相対神経突起成長を測定し、非線形曲線フィット（可変勾配を有するシグモイド用量応答）を用いて最大半量の阻害濃度（ＩＣ50）を算出して求めた（図６参照）。このアッセイにおいて、アプタマー２４２６−６６（配列番号１）はＩＣ50＝２×１０-9Ｍを示し、切断型変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）はＩＣ50＝１×１０-9Ｍを示した。
【０１５６】
アプタマー２４２６−６６（配列番号１）と切断型変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）及び２４２６−６６−５３（配列番号４３）をマウスβ−ＮＧＦ及びラットβ−ＮＧＦの阻害について神経突起成長アッセイで試験した。これら３種は全て、ヒトβ−ＮＧＦの場合とほぼ同等にマウスβ−ＮＧＦを効果的に阻害したが、ラットβ−ＮＧＦを阻害する程度は低かった（図７参照）。
【０１５７】
ＴｒｋＡリン酸化アッセイ
【０１５８】
β−ＮＧＦはＰＣ１２細胞表面でＴｒｋＡ受容体と結合し、該受容体の二量体化及び自己リン酸化を誘導する。ＴｒｋＡリン酸化アッセイでは、アプタマーで予備平衡化したβ−ＮＧＦによる処理１０分後のＴｒｋＡのリン酸化状態を調べる。神経突起成長アッセイはターミナルアッセイ（即ち、β−ＮＧＦ刺激の終点を調べる）であるのに対し、ＴｒｋＡのリン酸化アッセイは、β−ＮＧＦ刺激後の即時のシグナリング事象のスナップショットである。
【０１５９】
ＰＣ１２細胞を１００ｍｍプレートに播種し、一晩付着させた。付着後、培地をＬＳＭに交換した。細胞をＬＳＭに一晩放置した後、β−ＮＧＦ単独（最終濃度：１０ｎｇ／ｍＬ又は０．３８ｎＭ）、β−ＮＧＦ＋ＴｒｋＡのリン酸化阻害剤Ｋ２５２ａ（０．２μＭ）及びアプタマー（最終濃度：１０ｎＭ）で予備平衡化したβ−ＮＧＦで１０分間処理した。細胞を回収し、溶解し、全Ｔｒｋ抗体（ＴｒｋＡはＰＣ１２細胞中で発現する唯一のＴｒＫ受容体である）を用いてＴｒｋＡを透明化ライセートから免疫沈降させた。免疫沈降物をＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルで泳動し、ＰＶＤＦ膜上にエレクトロブロットし、ホスホチロシン抗体でプローブしてリン酸化ＴｒｋＡを定量する。ブロットをストリッピングし、ＴｒｋＡ抗体でプローブして全ＴｒｋＡを定量した。各サンプルについて％ＴｒｋＡリン酸化（リン酸化ＴｒｋＡ／全ＴｒｋＡの比率）を算出し、非アプタマー対照の値１００に対して標準化した。結果を図８に示す。
【０１６０】
アプタマー２４２４−６６（配列番号１）と切断型変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）及び２４２６−６６−３（配列番号５）をヒトβ−ＮＧＦによるＴｒｋＡリン酸化の阻害について試験した。アプタマー２４２４−６６と切断型変異体２４２６−６６−５０は、β−ＮＧＦによって誘導されるＴｒｋＡ受容体のリン酸化を効果的に阻害した。β−ＮＧＦに対する親和性が低い５０ｍｅｒの変異体２４２６−６６−３は、β−ＮＧＦによるＴｒｋＡリン酸化を殆ど阻害しなかった。
【０１６１】
ＴｒｋＡリン酸化アッセイにより、マウスβ−ＮＧＦ及びラットβ−ＮＧＦの阻害について変異体２４２６−６６−５０（配列番号２）を試験した。結果を図９に示す。変異体２４２６−６６−５０は、マウスβ−ＮＧＦ誘導ＴｒｋＡリン酸化とラットβ−ＮＧＦ誘導ＴｒｋＡリン酸化の両方を効果的に阻害した。
【０１６２】
実施例５．マウスモデル系におけるアトピー性皮膚炎のアプタマー処理
非滅菌の（通常の）環境で飼育された近交系ＮＣ／ＮｇａＴｎｄマウスは、ヒトのアトピー性皮膚炎病変と同様の皮膚病変を自然に発症するため、アトピー性皮膚炎の治療を検討するための確立モデルである（マツダら、Ｉｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４６１，１９９７）。アトピー性皮膚炎の臨床症状をＮＧＦ中和アプタマーが抑制又は除去する能力をこのマウスモデルにおいてインビボで評価するため、次の研究を設計した。
【０１６３】
ＮＣ／ＮｇａＴｎｄマウスを非空調の通常の環境下（２０〜２６℃）、１２時間の昼／夜サイクルで維持し、標準的な食餌及び水に自由にアクセスさせた。軽度の皮膚病変が現れた８〜１０週齢のマウス（疾患表現型） をこの研究で用いた。特定病原体フリー（ＳＰＦ）の条件下で維持し、アトピー性皮膚炎の臨床徴候や症状を示さないＮＣ／ＮｇａＴｎｄマウス（非疾患表現型）を対照として用いた。
【０１６４】
親水性軟膏（ＨＯ）を日本薬局方に従って調製した（２５％白色ワセリン、２０％ステアリルアルコール、１２％プロピレングリコール、４％ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油６０、１％モノステアリン酸グリセリル、０．１％パラヒドロキシ安息香酸メチル、０．１％パラヒドロキシ安息香酸プロピル）。ＨＯでのアプタマーの調製は、２０ｇのＨＯを８５℃の水浴にて融解させ、２０ｇの２％アプタマー水溶液を添加し、冷却するまで氷冷水浴にて混合して行った。
【０１６５】
マウスを４グループに分けた。皮膚炎を有する未処理のマウス７匹をグループ１とした。皮膚炎を有し、ＨＯで処理したマウス７匹をグループ２とした。皮膚炎を有し、３’−ｉｄＴ（ＨＯ中１％ｗ／ｖ）含有アプタマー２４２６−６６−５０（配列番号２）で処理したマウス７匹をグループ３とした。未処理の通常のＳＰＦマウス７匹をグループ４とした。グループ２及び３のマウスの処理は、１００ｍｇのサンプルを背側患部に４週間（１日１回）塗布して行った。４週間で各週に１回（０日目、７日目、１４日目、２１日目、２８日目）、マウスの引っ掻き行動及び臨床的皮膚状態スコアを定量化した。
【０１６６】
自発的引っ掻き行動は、スクラバ−リアル（SCLABA-Real）システム（実験動物用引っ掻きカウンティング、ノベルテック社、神戸市）（ハットリら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８４：２７２９，２０１０）を用いて定量化した。測定３０分前にマウスをスクラバ機器に入れて新しい環境に適応させた後、観察チャンバ内で引っ掻き数を１時間計測した。一連の引っ掻き行動（即ち、後足を頭、顔又は背中に伸ばすことから足を戻すまでの行動）を１回の引っ掻きとして計測した。
【０１６７】
臨床的皮膚状態スコアは、マツダら、Ｉｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４６１，１９９７に記載の基準に従って求めた。観察項目は、１）掻痒症／掻痒感、２）紅斑／出血、３）浮腫、４）剥脱／糜爛、及び５）鱗屑／乾燥とした。各観察項目のスコアは、０（なし）、１（軽度）、２（中程度）及び３（重度）とした。臨床的皮膚状態スコアは、５個の観察項目スコアの合計とした。
【０１６８】
図１１は、各処理グループにおける引っ掻き頻度の変化（標準誤差バー付き平均値でプロット）を示す。グループ３（アプタマー処理）においては引っ掻き頻度は１４日目〜２８日目に確実に低下したが、グループ１（処理なし）及びグループ２（ＨＯ処理）においては２８日間に亘って頻度に変化は見られなかった。グループ４（通常のＳＰＦマウス）の引っ掻き頻度は非常に低かった（データは図示せず）。図１２は、各処理グループにおける臨床的皮膚状態スコアの変化（標準誤差バー付き平均値でプロット）を示す。グループ３（アプタマー処理）においては皮膚状態スコアは１４日目〜２８日目に確実に低下したが、グループ１（処理なし）及びグループ２（ＨＯ処理）においては２８日間に亘って変化は見られなかった。グループ４（通常のＳＰＦマウス）の皮膚状態スコアは非常に低かった（データは図示せず）。
【０１６９】
上述の実施形態及び実施例は単なる例示に過ぎないとする。特定の実施形態や実施例、特定の実施形態又は実施例の要素も請求の範囲のいずれかの重要、必要又は本質的な要素や特徴として解釈すべきではない。また、「本質的な」又は「重要な」と明記されない限り、本明細書に記載のどの要素も添付された請求の範囲を実施する上で必要ではない。添付の請求の範囲で定義された本発明の範囲から逸脱せずに、開示された実施形態に対して種々の修正や改変、代替及び他の変更を行うことができる。図及び実施例を含む明細書は、限定的ではなく例示的と見なすべきであり、また、そのような全ての変更や代替は、本発明の範囲に含まれるものとする。従って、本発明の範囲は、上述の実施例ではなく添付した請求の範囲及びその法的等価物によって決定すべきである。例えば、方法又はプロセスの請求項のいずれかに記載の段階は如何なる実行可能な順序で行うこともでき、実施形態、実施例又は請求の範囲のいずれかに記載の順序に限定されない。
【０１７０】
【表７−１】
0006012591.tif 000014
【０１７１】
【表７−２】
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【０１７２】
【表７−３】
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【０１７３】
【表７−４】
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【０１７４】
【表７−５】
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【０１７５】
【表７−６】
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【０１７６】
【表７−７】
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【０１７７】
【表７−８】
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【図１】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
0006012591.tif 000032
【図９】
0006012591.tif 000033
【図１０Ａ】
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【図１０Ｂ】
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【図１１】
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【図１２】
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【配列表】
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