(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
４５℃〜６５℃の嫌気環境下で、寄託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２１７８で寄託されている高温性の嫌気性セルロース分解菌であるクロストリジウム  クラリフラバム（Clostridium clariflavum）ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させることを特徴とするセルロース分解処理方法。
【請求項２】
前記高温性のメタン生成菌は、高温性の水素資化性メタン生成菌である請求項１に記載のセルロース分解処理方法。
【請求項３】
請求項１または２に記載の方法を実施してメタンガス含有バイオガスを発生させる工程と、前記メタンガス含有バイオガスを回収する工程とを有することを特徴とするバイオガス回収方法。
【請求項４】
寄託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２１７８で寄託されている高温性の嫌気性セルロース分解菌であるクロストリジウム  クラリフラバム（Clostridium clariflavum）ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体として含むことを特徴とするセルロース分解処理用組成物。
【請求項５】
前記高温性のメタン生成菌は、高温性の水素資化性メタン生成菌である請求項４に記載のセルロース分解処理用組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、新規嫌気性セルロース分解菌及びこれを用いたセルロース分解処理方法に関する。さらに詳述すると、本発明は、セルロース分解処理に用いて好適な新規嫌気性セルロース分解菌と、この新規嫌気性セルロース分解菌を利用してセルロース分解処理を高効率に実施するのに好適な方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
嫌気性セルロース分解菌としては、例えば以下の高温性の嫌気性セルロース分解菌が知られている。
・Clostridium caenicola NBRC 102590株（非特許文献１を参照）
・Clostridium clariflavum NBRC 101661株（非特許文献１を参照）
・Clostridium thermocellum NBRC 103400株（非特許文献２を参照）
・Clostridium straminisolvens NBRC 103399株（非特許文献３を参照）
【０００３】
嫌気性のセルロース分解菌を利用してセルロース系廃棄物の分解処理を行う場合、培養環境を好気性に維持するためのエアレーション設備を必要としないことから、好気性のセルロース分解菌を利用する場合と比較してランニングコストの面で有利である。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００４】
【非特許文献１】Shiratori H, et al.：Int J Syst Evol Microbiol. 59: 1764−1770 (2010)
【非特許文献２】Viljoen JA, et al.：J Agric Sci. 16: 1−17 (1926)
【非特許文献３】Kato S, et al.：Int J Syst Evol Microbiol. 54: 2043−2047 (2004)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
しかしながら、現在知られている嫌気性セルロース分解菌は、セルロース分解処理能力がそれほど高いものとは言えず、より高いセルロース分解処理能力を有する嫌気性セルロース分解菌の探索・単離が望まれていた。
【０００７】
そこで、本発明は、従来の嫌気性セルロース分解菌よりも高いセルロース分解処理能力を発揮することのできる新規な嫌気性セルロース分解菌を利用したセルロース分解処理方法を提供することを目的とする。
【０００８】
また、本発明は、上記新規な嫌気性セルロース分解菌を利用したセルロース分解処理用組成物を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
かかる課題を解決するため、本願発明者等が鋭意探索を行った結果、安定したガス生成が見られる通電型高温メタン発酵槽にて採取した汚泥（沼の底泥由来）から、従来の高温性の嫌気性セルロース分解菌よりもセルロース分解処理能力が顕著に高い新規な高温性の嫌気性セルロース分解菌（クロストリジウム  クラリフラバム（Clostridium clariflavum）ＣＬ−１株）の単離に成功した。そして、本願発明者等は、この新規な高温性の嫌気性セルロース分解菌（以下、単にＣＬ−１株と呼ぶこともある）を用いることによって、従来の高温性の嫌気性セルロース分解菌を用いた場合よりも、セルロース分解処理を効率よく行うことが可能であることを確認した。
【００１０】
さらに、本願発明者等は、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力をさらに向上させるべく、鋭意研究を重ねた。その結果、ＣＬ−１株を高温性の水素資化性メタン生成菌と共に培養しながらセルロース分解処理を行うことで、ＣＬ−１株を単独で培養しながらセルロース分解処理を行う場合と比較して、セルロース分解処理速度を大幅に高められることを知見するに至った。しかも、この場合には、水素資化性メタン生成菌のメタン生成能力が発揮されて、セルロースをメタンガスに変換して回収できることを知見するに至った。つまり、処分に苦慮しているセルロース系廃棄物をメタンガスという有用なエネルギーに変換して回収できることを知見するに至った。
【００１１】
本願発明者等は、上記知見に基づき、さらに種々検討を重ね、本発明を完成するに至った。
【００１４】
即ち、本発明のセルロース分解処理方法は、４５℃〜６５℃の嫌気環境下で、寄託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２１７８で寄託されている高温性の嫌気性セルロース分解菌であるクロストリジウム  クラリフラバム（Clostridium clariflavum）ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させるようにしている。この場合、高温性のメタン生成菌は、高温性の水素資化性メタン生成菌であることが好ましい。
【００１５】
また、本発明のバイオガス回収方法は、本発明のセルロース分解処理方法を実施してメタンガス含有バイオガスを発生させる工程と、メタンガス含有バイオガスを回収する工程とを有するようにしている。
【００１７】
次に、本発明のセルロース分解処理用組成物は、上記ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体として含むものとしている。この場合、高温性のメタン生成菌は、高温性の水素資化性メタン生成菌であることが好ましい。
【発明の効果】
【００２０】
本発明のセルロース分解処理方法によれば、４５℃〜６５℃の嫌気環境下で、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させるようにしているので、４５℃〜６５℃の嫌気環境下で、ＣＬ−１株にセルロースまたはセルロース含有物を接触させるセルロース分解処理方法よりも、ＣＬ−１株によるセルロース分解処理能力を向上させて、セルロースまたはセルロースを含む食品廃棄物や農作物非食用部等といったセルロース含有物をさらに効率よく分解処理することが可能となる。
【００２１】
また、本発明のバイオガス回収方法によれば、本発明のセルロース分解処理方法を実施してメタンガス含有バイオガスを発生させる工程と、メタンガス含有バイオガスを回収する工程とを有するようにしているので、セルロースまたはセルロースを含む食品廃棄物や農作物非食用部等といったセルロース含有物をメタンガスという有用なエネルギーに変換して回収することができる。したがって、処分に苦慮しているセルロース系廃棄物等を資源として有効利用することが可能となる。
【００２３】
次に、本発明のセルロース分解処理用組成物によれば、上記ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体として含むものとしているので、これを４５℃〜６５℃の嫌気環境下で、セルロースまたはセルロース含有物と接触させることで、上記ＣＬ−１株を主体として含むセルロース分解処理用組成物よりもセルロースまたはセルロース含有物をさらに効率よく分解処理することが可能となる。
【図面の簡単な説明】
【００２４】
【図１】種々のセルロース系有機物を用いた際のＣＬ−１株の菌数の経時変化を示す図である。
【図２】種々の高温性の嫌気性セルロース分解菌を用いた際の菌数の経時変化を示す図である。
【図３】種々の高温性の嫌気性セルロース分解菌を用いた際の懸濁物質量（ＳＳ）の経時変化を示す図である。
【図４】実施例において使用した培養装置の概略図である。
【図５】共培養した場合と単菌培養した場合のＣＬ−１株とＭｔ株の菌体密度の変遷を示す図である。
【図６】ＳＳ除去率について、共培養した場合と単菌培養した場合の結果を比較した図である。
【図７】発生ガス量と組成について、共培養した場合と単菌培養した場合の結果を比較した図である。
【図８】Ｓ−ＴＯＣについて、共培養した場合と単菌培養した場合の結果を比較した図である。
【図９】ＶＦＡｓについて、共培養した場合と単菌培養した場合の結果を比較した図である。
【図１０】嫌気性セルロース分解菌の推定される代謝経路を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２５】
以下、本発明を実施するための形態について、図面に基づいて詳細に説明する。
【００２６】
＜新規嫌気性セルロース分解菌＞
本発明の新規嫌気性セルロース分解菌は、独立行政法人  産業技術総合研究所  特許生物寄託センターに、２０１１年１０月４日付けで、寄託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２１７８として寄託されているクロストリジウム  クラリフラバム（Clostridium clariflavum）ＣＬ−１株である。
【００２７】
ＣＬ−１株は、０．７〜０．９μｍ×３．０〜１０μｍの桿菌であり、グラム陰性菌であり、芽胞形成能を有し、コロニー色調が淡黄色であるという形態学的特徴を有している。
【００２８】
また、ＣＬ−１株の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列（配列表の配列番号１を参照）は、Clostridium clariflavum EBR45株（DSM19732株）の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列と、９９．９％の相同性を示したものの、Clostridium clariflavum EBR45株（DSM19732株）とオリジナルの株が同一であるClostridium clariflavum NBRC 101661株（非特許文献１）と比較して、圧倒的に優れた増殖能力及びセルロース分解処理能力を有していることが本願発明者等の実験により確認されている。つまり、ＣＬ−１株は、１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列については従来の嫌気性セルロース分解菌と近似したものであるが、増殖能力とセルロース分解能力から見れば全く異なるものである。つまり、ＣＬ−１株は、１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列からは計れない従来菌との大きな機能的差異を有している。
【００２９】
ＣＬ−１株は、具体的には、以下に示す増殖能力及びセルロース分解処理能力を有している。
・比増殖速度        ：１．２８／日以上（標品セルロース使用）
・最大到達菌体濃度  ：２．６７×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬ（標品セルロース使用）
・セルロース分解速度：７．１７×１０−１０ｇ／Ｌ／ｃｅｌｌｓ／日以上
【００３０】
このように、ＣＬ−１株は、従来の高温性の嫌気性セルロース分解菌と比較して、圧倒的に優れた増殖能力及びセルロース分解処理能力を有している。さらには、セロビオース、濾紙、稲藁、植物残渣を対象とした分解処理試験においても、良好な分解処理能力を発揮することが本願発明者等の実験により確かめられている。このことから、セルロース単体の分解処理は勿論のこと、稲藁等の藁や植物残渣等の農作物非食用部、生ごみなどの食品廃棄物、紙ごみ、廃木材等といったセルロース含有物全般の分解処理に極めて好適且つ有用な微生物である。尚、我が国においては、農作物非食用部が未利用バイオマスとして多量に残存している状況にあり、今後も増え続けるものと考えられる。ＣＬ−１株は、セルロースを多く含むこのような未利用バイオマスを効率よく分解処理するために極めて好適且つ有用な微生物である。
【００３１】
ＣＬ−１株は、以下に説明する第一の実施形態にかかるセルロース分解処理方法に利用することによって、セルロースまたはセルロース含有物を効率よく分解処理することができる。また、第二の実施形態にかかるセルロース分解処理方法に利用することによって、セルロースまたはセルロース含有物をさらに効率よく分解処理することができる。
【００３２】
＜第一の実施形態＞
第一の実施形態にかかるセルロース分解処理方法は、ＣＬ−１株にセルロースまたはセルロース含有物を接触させることによって、セルロースまたはセルロース含有物を分解処理するようにしている。
【００３３】
ＣＬ−１株にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる方法としては、例えば、高温性の嫌気性セルロース分解菌に必要な栄養源、微量元素、ビタミン類等を含む培養液中でＣＬ−１株を培養し、セルロースまたはセルロース含有物を培養液に懸濁させて処理する方法が挙げられる。この場合、セルロースまたはセルロース含有物を培養液に懸濁させて処理することができ、セルロースまたはセルロース含有物とＣＬ−１株とを接触させ易いという利点がある。但し、ＣＬ−１株にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる方法は、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力を阻害しない限り、特に限定されるものではない。例えば寒天培地等の固体培地や汚泥等を用いてＣＬ−１株を培養し、この固体培地や汚泥等とセルロースまたはセルロース含有物とを接触させるようにしてもよい。また、ＣＬ−１株を含む培養液をセルロースまたはセルロース含有物に散布して含浸等させることにより、セルロース分解処理を行うようにしてもよい。
【００３４】
また、ＣＬ−１株にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる環境は、４５℃〜６５℃の嫌気性環境とすることが好ましい。これにより、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力を発揮させることができる。また、セルロース含有物に室温程度の温度では固化してしまうような油脂等が含まれている場合に、これを溶解させて、セルロースとＣＬ−１株との接触面積を高めることができ、セルロースをより効率よく分解することが可能となる。ここで、ＣＬ−１株にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる環境の温度は、５０℃〜６０℃とすることがより好適であり、５３℃〜５７℃とすることがさらに好適であり、５５℃とすることが最も好適である。この場合には、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力をさらに発揮させやすいものとできる。また、嫌気性環境の形成方法は特に限定されるものではなく、例えば環境中に二酸化炭素や水素、不活性ガス等を一種以上導入して形成するようにしてもよいし、環境を外部から遮蔽して密閉して好気性微生物等に酸素を消費させることによって形成するようにしてもよい。
【００３５】
＜第二の実施形態＞
第二の実施形態にかかるセルロース分解処理方法は、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させることによって、セルロースまたはセルロース含有物を分解処理するようにしている。
【００３６】
第二の実施形態にかかるセルロース分解処理方法における、「ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群」とは、最も好ましくは、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌のみからなる微生物群であるが、ＣＬ−１株のセルロース分解能力と高温性のメタン生成菌のメタン生成能力を実質的に阻害することのない範囲で他の微生物を一種または二種以上含む微生物群としても構わない。
【００３７】
また、ＣＬ−１株とメタン生成菌の菌数比については、複数の菌を同時に培養する際の常識的な菌数比とすればよく、例えば、一方の菌の菌数が他方の菌の菌数の１００倍以下、好適には１０倍以下、より好適には同じ桁数とすればよいが、これらに限定されるものではない。
【００３８】
高温性のメタン生成菌としては、水素資化能を有し、４５℃〜６５℃の嫌気環境下にてメタン生成能力を発揮することのできる公知または新規の水素資化性メタン生成菌、または、酢酸等の資化能を有し、４５℃〜６５℃の嫌気環境下にてメタン生成能力を発揮することのできる公知または新規の酢酸資化性メタン生成菌等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。また、メタン生成菌は、一種のみならず二種以上を併用するようにしてもよい。例えば、二種以上の水素資化性メタン生成菌を併用するようにしてもよいし、二種以上の酢酸資化性メタン生成菌を併用するようにしてもよい。また、一種以上の水素資化性メタン生成菌と一種以上の酢酸資化性メタン生成菌とを併用するようにしてもよい。
【００３９】
高温性のメタン生成菌を具体的に例示すると、高温性の水素資化性メタン生成菌であるメタノサーモバクター（Methanothermobacter）属の微生物、高温性の酢酸資化性メタン生成菌であるメタノサルシナ（Methanosarcina）属の微生物等が挙げられ、特に高温性の水素資化性メタン生成菌の使用が好適であり、メタノサーモバクター  サームオートトロフィカス（Methanothermobacter thermautotrophicus）の使用がより好適であるが、これらに限定されるものではない。
【００４０】
ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる方法としては、例えば、高温性の嫌気性セルロース分解菌と高温性のメタン生成菌に必要な栄養源、微量元素、ビタミン類等を含む培養液中でＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを培養し、セルロースまたはセルロース含有物を培養液に懸濁させて処理する方法が挙げられる。この場合、セルロースまたはセルロース含有物を培養液に懸濁させて処理することができ、セルロースまたはセルロース含有物とＣＬ−１株とを接触させ易いものとできると共に、ＣＬ−１株によるセルロースまたはセルロース含有物の分解物（水素、低級脂肪酸類（例えば酢酸）等）と高温性のメタン生成菌とを接触させ易いものとできる。但し、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる方法は、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力及び高温性のメタン生成菌のメタン生成能力を阻害しない限り、特に限定されるものではない。例えば寒天培地等の固体培地や汚泥等を用いてＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを培養し、この固体培地や汚泥等とセルロースまたはセルロース含有物とを接触させるようにしてもよい。また、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを含む培養液をセルロースまたはセルロース含有物に散布して含浸等させることにより、セルロース分解処理を行うようにしてもよい。さらに、ＣＬ−１株を含む環境や処理設備に高温性のメタン生成菌を添加して、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌を主体とする微生物群の培養環境を形成するようにしてもよいし、高温性のメタン生成菌を含む環境や処理設備にＣＬ−１株を添加して、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群の培養環境を形成するようにしてもよい。これらの場合にも、ＣＬ−１株を含む環境や処理設備、高温性のメタン生成菌を含む環境や処理設備に、優れたセルロース分解処理能力を付与して、効率よくセルロースまたはセルロース含有物を分解処理することが可能となる。
【００４１】
また、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる環境は、４５℃〜６５℃の嫌気性環境とすることが好ましい。これにより、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力を発揮させることができると共に、高温性のメタン生成菌のメタン生成能力を発揮させることができる。また、セルロース含有物に室温程度の温度では固化してしまうような油脂等が含まれている場合に、これを溶解させて、セルロースとＣＬ−１株との接触面積を高めることができ、セルロースをより効率よく分解することが可能となる。ここで、高温性のメタン生成菌として高温性の水素資化性メタン生成菌であるメタノサーモバクター  サームオートトロフィカス（Methanothermobacter thermautotrophicus）を用いる場合には、ＣＬ−１株とメタノサーモバクター  サームオートトロフィカス（Methanothermobacter thermautotrophicus）とを主体とする微生物群にセルロースまたはセルロース含有物を接触させる環境の温度は、５０℃〜６０℃とすることがより好適であり、５３℃〜５７℃とすることがさらに好適であり、５５℃とすることが最も好適である。この場合には、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力をさらに発揮させ易いものとできると共に、メタノサーモバクター  サームオートトロフィカス（Methanothermobacter thermautotrophicus）のメタン生成能力をさらに発揮させ易いものとできる。また、嫌気性環境の形成方法は特に限定されるものではなく、例えば環境中に二酸化炭素や水素、不活性ガス等を一種以上導入して形成するようにしてもよいし、環境を外部から遮蔽して密閉して好気性微生物等に酸素を消費させることによって形成するようにしてもよい。
【００４２】
尚、本発明の第二のセルロース分解処理方法においては、高温性のメタン生成菌を用いていることから、ＣＬ−１株によりセルロースが分解された結果として生じる水素、酢酸等の低級脂肪酸類を高温性のメタン生成菌が消費（資化）して、メタンガス含有バイオガスが生成される。したがって、セルロースをメタンガスに変換してエネルギーとして回収することが可能となる。
【００４３】
＜第三の実施形態＞
上述した第一の実施形態にかかるセルロース分解処理方法及び第二の実施形態にかかるセルロース分解処理方法は、例えば以下に説明するセルロース分解処理用組成物を用いることで、容易に実施することができる。
【００４４】
本発明の第一のセルロース分解処理用組成物は、ＣＬ−１株を主体として含むものであり、その形態は特に限定されない。例えば、生育に必要な栄養源や微量元素、ビタミン類等を含む培養液等に、ＣＬ−１株が添加された溶剤、凍結保存品、フリーズドライ品等、種々の形態にて本発明の第一のセルロース分解処理用組成物を提供することができる。尚、本発明の第一のセルロース分解処理用組成物においては、含有微生物を全てＣＬ−１株とすることが好適であるが、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力を阻害しない範囲で、他の微生物を一種または二種以上含むものとしても構わない。
【００４５】
本発明の第一のセルロース分解処理用組成物を、セルロースまたはセルロース含有物を分解処理するための環境に投入したり、あるいはセルロースまたはセルロース含有物に直接散布することで、本発明の第一のセルロース分解処理方法を実施して、セルロースまたはセルロース含有物を効率よく分解処理することができる。
【００４６】
次に、本発明の第二のセルロース分解処理用組成物は、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とを主体として含むものであり、その形態は特に限定されない。例えば、生育に必要な栄養源や微量元素、ビタミン類等を含む培養液等に、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌とが添加された溶剤、凍結保存品、フリーズドライ品等、種々の形態にて本発明の第二のセルロース分解処理用組成物を提供することができる。尚、本発明の第二のセルロース分解処理用組成物においては、含有微生物を全てＣＬ−１株及び高温性のメタン生成菌とすることが好適であるが、ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力及び高温性のメタン生成菌のメタン生成能力を阻害しない範囲で、他の微生物を一種または二種以上含むものとしても構わない。
【００４７】
本発明の第二のセルロース分解処理用組成物を、セルロースまたはセルロース含有物を分解処理するための環境に投入したり、あるいはセルロースまたはセルロース含有物に直接散布することで、本発明の第二のセルロース分解処理方法を実施して、セルロースまたはセルロース含有物を効率よく分解処理しながら、メタンガス含有バイオガスを生成させることが可能となる。
【００４８】
上述の形態は本発明の好適な形態の一例ではあるがこれに限定されるものではなく本発明の要旨を逸脱しない範囲において種々変形実施可能である。例えば、本発明においては、ＣＬ−１株と高温性のメタン生成菌の他に、これらの能力を実質的に阻害しない範囲で、他の微生物を添加して、セルロース分解能力以外の他の能力を付加するようにしてもよい。例えば、セルロース系廃棄物に含まれ得るセルロース以外の物質を良好に分解ないしは変換処理し得る他の微生物を一種または二種以上添加するようにしてもよい。
【実施例】
【００４９】
以下に本発明の実施例を説明するが、本発明はこれら実施例に限られるものではない。
【００５０】
（実施例１）
本願発明者等が取得した新規嫌気性セルロース分解菌について、そのセルロース分解処理能力について検討した。
【００５１】
（１）新規嫌気性セルロース分解菌
本願発明者等は、通電型高温メタン発酵槽の汚泥（沼の汚泥由来）から高温性の嫌気性セルロース分解菌を新規に単離・取得した。尚、通電型高温メタン発酵槽とは、作用極、対極及び参照電極をメタン発酵液に浸漬し、作用極の電位を３電極方式で還元電位に制御しながら５５℃で運転しているメタン発酵槽である。
【００５２】
尚、本願発明者等が新規に単離・取得したこの新規微生物の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列を配列表の配列番号１に示す。相同性検索の結果、この新規微生物は、Clostridium clariflavum EBR45株（DSM19732株）と９９．９％の相同性を示した。このことから、この新規微生物をClostridium clariflavumと同定し、ＣＬ−１株と名付けた。尚、塩基配列解析及び相同性検索については、以下の参考文献１及び２に記載された手法に基づき、ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ／ＤＤＢＪのデータベースを用いてＢＬＡＳＴ（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi）により実施した（参考文献１：Lane, D. J.: 16S/23S rRNA sequencing. p.115−175. In Stackebrandt, E. and Goodfellow, M. (eds.), Nucleic acid techniques in bacterial systematics. John Wiley & Sons, New York (1991).、参考文献２：Takai, K. and Horikoshi, K.: Rapid detection and quatification of members of archaeal community by quantitative PCR using fluorogenic probes. Appl. Environ. Microbiol., 66, 5066−5072 (2000).）。
【００５３】
ＣＬ−１株は、独立行政法人  産業技術総合研究所  特許生物寄託センターに２０１１年１０月４日付けで寄託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−２２１７８として寄託されている。
【００５４】
尚、ＣＬ−１株は、以下の形態学的特徴を有していた。
＜ＣＬ−１株の形態学的特徴＞
・培養至適温度  ：５５℃
・細胞形態      ：桿菌（０．７〜０．９μｍ×３．０〜１０μｍ）
・グラム染色    ：陰性
・芽胞形成      ：あり
・コロニー色調  ：淡黄色
【００５５】
（２）ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力についての検証
まず、種々のセルロース系有機物を用いた際のＣＬ−１株の菌数の経時変化について検討した。
【００５６】
１０ｇ／Ｌの種々の有機物を加えた表１に示す組成の液体培地１０ｍＬを２０ｍＬ容のガラスバイアル瓶に収容し、ＣＬ−１株を７．５×１０５ｃｅｌｌｓ／ｍＬとなるように添加して、５５℃で嫌気的（Ｎ２：ＣＯ２＝８０：２０）に７日間の回分培養を行い、経時的に試料を採取して菌数計測を実施した。菌数計測は、サンプリングした培養液を顕微鏡観察（×４００、ニコン）により実施した。尚、表１中、ＤＭＳＺとはDeutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturenの略である。
【００５７】
【表１】
0005996231.tif 000002
【００５８】
添加した有機物は、以下の通りとした。
＜セルロース系有機物＞
・標品セルロース（微結晶品、アルファエイサー）
・標品セロビオース（Ｄ（＋）−セロビオース、Ｗａｋｏ）
・ろ紙（アドバンテック、ｔｙｐｅ５Ａ、２０ｍｍ×２０ｍｍ）
・稲わら
・トマト残渣（トマトの葉と茎を乾燥したもの）
＜その他の有機物＞
・酵母エキス（Ｂａｃｔｏ）
・グルコース（Ｄ（＋）−グルコース、Ｗａｋｏ）
【００５９】
結果を図１に示す。セルロース系有機物ではない酵母エキス及びグルコースを用いた場合には、菌数の増加は見られなかったが、セルロース系有機物である標品セルロース、標品セロビオース、ろ紙、稲わら、トマト残渣を用いた場合には、時間と共に菌数の増加が見られた。尚、標品セルロース、標品セロビオース、ろ紙、稲わらを用いた場合の最終到達菌数は７．３×１０８〜９．７×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬであった。トマト残渣を用いた場合には、１．０×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬと若干低下したものの、ＣＬ−１株がセルロース系有機物を利用して良好に増殖することが判明した。
【００６０】
次に、以下に示す公知の高温性の嫌気性セルロース分解菌と、ＣＬ−１株の能力を比較する試験を実施した。具体的には、１０ｇ／Ｌの標品セルロースを加えた表１に示す液体培地を１０ｍＬ入れた２０ｍＬ容のバイアル瓶に、以下に示す４種の標準株と、ＣＬ−１株を７．５×１０５ｃｅｌｌｓ／ｍＬとなるようにそれぞれ添加して、５５℃で嫌気的（Ｎ２：ＣＯ２＝８０：２０）に３０日間の回分培養を行った。経時的に試料を採取して、菌数計測と液体培地中の懸濁物質量（ＳＳ）測定を実施した。
【００６１】
＜標準株＞
・Clostridium caenicola NBRC 102590株
・Clostridium clariflavum NBRC 101661株
・Clostridium thermocellum NBRC 103400株
・Clostridium straminisolvens NBRC 103399株
【００６２】
菌数の経時変化を図２に示す。いずれの菌株においても、最初は時間の経過に伴って菌数が増加し、１０日目以降はほぼ一定値となった。３０日後の菌数を比較すると、ＣＬ−１株では４．９×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬ、Clostridium straminisolvens NBRC 103399株では２．２×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬであったが、他の菌株では、１．７×１０７〜４．３×１０７ｃｅｌｌｓ／ｍＬと菌数が一桁少なかった。これらの結果から、ＣＬ−１株とClostridium straminisolvens NBRC 103399株では、他の高温性の嫌気性セルロース分解菌と比較して、良好な増殖を示すことが明らかとなった。
【００６３】
次に、固形性セルロース濃度と相関を持つＳＳ濃度の経時変化を図３に示す。Clostridium caenicola NBRC 102590株、Clostridium clariflavum NBRC 101661株、Clostridium thermocellum NBRC 103400株では、３０日後のＳＳ除去率は５．７〜１７．４％と低く、Clostridium straminisolvens NBRC 103399株では６６．６％であったが、ＣＬ−１株については９５．９％と際だって高い値となった。また、菌数の増加傾向とＳＳ除去率の傾向は一致していた。
【００６４】
以上の結果から、ＣＬ−１株は、従来の高温性の嫌気性セルロース分解菌と比較して際立って優れたセルロース分解能力を有していることが明らかとなった。
【００６５】
（実施例２）
ＣＬ−１株のセルロース分解処理能力について、高温性のメタン生成菌との共培養環境下において検討を行った。
【００６６】
１．培養試験方法
（１）高温性のメタン生成菌
本実施例では、高温性のメタン生成菌として、高温性の水素資化性メタン生成菌であるメタノサーモバクター  サームオートトロフィカス（Methanothermobacter thermautotrophicus）（以下、Ｍｔ株と呼ぶ）を用いた。Ｍｔ株は、文部科学省の国際バイオリソースプロジェクトを通じて独立行政法人理化学研究所バイオリソースセンターから入手した（ＪＣＭ１００４４）。
【００６７】
（２）培地
ＣＬ−１株の単菌培養、及びＣＬ−１株とＭｔ株の共培養には、以下に示す組成を有する液体培地を用いた。尚、ろ紙は、２０ｍｍ×２０ｍｍにカットして使用した。
【００６８】
＜液体培地の組成（蒸留水１Ｌ中の組成）＞
・ＫＨ２ＰＯ４  ：０．４ｇ
・Ｋ２ＨＰＯ４  ：０．３５ｇ
・ＭｇＣｌ・６Ｈ２Ｏ  ：０．１ｇ
・ＣａＣｌ２・２Ｈ２Ｏ  ：０．１ｇ
・ＮＨ４Ｃｌ  ：１．０ｇ
・ＮａＣｌ  ：０．２ｇ
・酵母エキス（Ｂａｃｔｏ）  ：２．０ｇ
・ろ紙（アドバンテック、ｔｙｐｅ５Ａ）  ：１０ｇ
・レザズリン  ：１．０ｍｇ
・微量元素溶液（ＤＳＭＺ  １４１  ｍｅｄｉｕｍ）  ：１０ｍＬ
・ビタミン溶液（ＤＳＭＺ  １４１  ｍｅｄｉｕｍ）  ：１ｍＬ
・ＮａＨＣＯ３  ：６ｇ
・システイン−ＨＣｌ・Ｈ２Ｏ  ：０．５ｇ
・Ｎａ２Ｓ・９Ｈ２Ｏ：  ０．５ｇ
ｐＨ  ７．８
※ＤＭＳＺ：Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen
【００６９】
（３）培養装置
培養試験に使用した培養装置を図４に示す。図４に示す培養装置１は、大まかには、培養容器２、培養容器２の蓋３、撹拌子４、ＯＲＰ電極５、ガスバッグ（アルミニウムガスバッグ、ＧＬサイエンス、１．０Ｌ）６により構成した。培養容器２には、培養容器２内に収容される培養液７をサンプリングするためのサンプリングポート８を設けた。また、蓋３の上部はシリコーンゴム３ａで構成した。ＯＲＰ電極５はその先端が培養液に浸されるように、シリコーンゴム３ａに突き刺して配置した。また、ガスバッグ６の管６ａは、培養容器２内のヘッドスペースに滞留するガスが管６ａを介してガスバッグ６に導かれるように、シリコーンゴム３ａに突き刺して配置した。このように構成することで、培養容器２のヘッドスペース内に発生・滞留するガスを漏れ出させることなくガスバッグ６に回収できるようにした。尚、培養装置１を構成する各部材は滅菌処理してから用いた。また、培養容器２への培養液７（微生物を含む液体培地）の収容、及び各部材の組み付け作業は、嫌気性で無菌のＮ２−ＣＯ２混合ガス（Ｎ２：ＣＯ２＝８０：２０）のバブリング環境下にあるクリーンベンチ内にて実施し、培養試験開始時の培養容器２内のヘッドスペースのガス雰囲気を、Ｎ２：ＣＯ２＝８０：２０とした。培養液７の温度と撹拌子４の回転は、加熱マグネチックスターラー（RT 15 Power、IKA（登録商標）Japan K.K.）を用いて５５℃、１００ｒｐｍに制御した。
【００７０】
（４）培養試験
ＣＬ−１株とＭｔ株の共培養試験、及び比較試験としてＣＬ−１株の単菌培養試験を三連で実施した。尚、菌株の初期添加量はそれぞれ以下の通りとした。
・共培養：ＣＬ−１株：Ｍｔ株＝３：１
（７．２×１０５ｃｅｌｌｓ／ｍＬ：２．４×１０５ｃｅｌｌｓ／ｍＬ）
・単菌培養：ＣＬ−１株＝７．２×１０５ｃｅｌｌｓ／ｍＬ
【００７１】
尚、培養液（液体培地）量は２５０ｍＬ、培養温度は５５℃、マグネチックスターラー４の回転数は１００ｒｐｍとした。培養試験は６０時間実施し、１２時間毎に培養液をサンプリングポート８からサンプリングして各種解析に供した。
【００７２】
２．培養試験結果
（１）菌体密度の変遷
１２時間毎にサンプリングした培養液の全菌数を顕微鏡観察（×４００、ニコン）してカウントし、単菌培養試験については、その結果からＣＬ−１株の菌体密度を算出した。共培養試験については、蛍光顕微鏡（オリンパス、ｍｏｄｅｌ  ＢＸ６０Ｆ−３）を用いて、コエンザイムＦ４２０からの自己蛍光と４’、６−ジアミノ−２−フェニルインドールによって染色された細胞からの蛍光の比からＭｔ株の菌数を決定し、全菌数とＭｔ株の菌数から、ＣＬ−１株の菌数（菌体密度）を算出した。これらの結果をプロットして培養試験中の菌体密度の変遷について検討した。結果を図５に示す。
【００７３】
また、６０時間後の各菌株の菌体密度を以下に示す。
＜共培養試験＞
・ＣＬ−１株：２．１×１０９ｃｅｌｌｓ／ｍＬ
・Ｍｔ株    ：５．１×１０６ｃｅｌｌｓ／ｍＬ
＜単菌培養試験＞
・ＣＬ−１株：７．９×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬ
【００７４】
ＣＬ−１株の増殖傾向は、２４時間後までは共培養及び単菌培養ともに同様であったが、その後の増殖傾向には大きな差が見られた。６０時間後で比較すると、共培養した場合の菌体密度は、単菌培養した場合の菌体密度より約２．７倍大きかった。
【００７５】
一方、Ｍｔ株については、ＣＬ−１株のような増殖挙動は示さなかった。
【００７６】
これらの結果から、高温性の嫌気性セルロース分解菌であるＣＬ−１株と高温性の水素資化性メタン生成菌であるＭｔ株とを共培養することによって、ＣＬ−１株の増殖を促進できることが明らかとなった。
【００７７】
（２）ＳＳ（懸濁物質）測定によるセルロース分解量の比較
６０時間後にサンプリングした培養液のＳＳ濃度から、セルロース分解（ろ紙分解）の割合を算出した。具体的には、サンプリングした培養液（懸濁液）をガラス繊維フィルター（０．４５μｍ）で濾過した後、１０５℃で１２０分間乾燥し、ＳＳの乾燥重量を測定して懸濁液のＳＳ濃度を算出し、この算出結果とイニシャルの懸濁液濃度（１０ｇ／Ｌ）から、ＳＳ除去率を算出した。結果を図６に示す。
【００７８】
ＳＳ除去率は、共培養で７３．０％、単菌培養で２８．１％となった。このことから、高温性の嫌気性セルロース分解菌であるＣＬ−１株と高温性の水素資化性メタン生成菌であるＭｔ株とを共培養することによって、ＣＬ−１株によるセルロース分解を促進できることが明らかとなった。
【００７９】
（３）発生したガス量と組成の比較
６０時間後のガスバッグ内のガス量と組成を測定し、共培養試験と単菌培養試験における差異を比較検討した。ガスバッグ内のガス量は水上置換法により測定した（２５℃）。ガス組成（ＣＨ４、ＣＯ２、Ｈ２）は、熱伝導率検出器を備えたガスクロマトグラフ（ＧＣ３９０Ｂ、ＧＬサイエンス）と活性炭が充填されたステンレス鋼カラム（３０／６０メッシュ、ＧＬサイエンス）を用いて測定した。尚、ＣＨ４、ＣＯ２、Ｈ２のイニシャル量は、０ｍＬ／Ｌ、１３ｍＬ／Ｌ、０ｍＬ／Ｌであったことから、ＣＯ２に関しては、最終的な発生量からイニシャル量を差し引いた。結果を図７に示す。
【００８０】
セルロースの分解量と相関があると考えられるＣＯ２の量は、共培養時に増加した。また、共培養の場合にのみ、高温性の水素資化性メタン生成菌であるＭｔ株の存在によって、ＣＨ４の発生が確認された。これらのことから、高温性の嫌気性セルロース分解菌であるＣＬ−１株と高温性の水素資化性メタン生成菌であるＭｔ株とを共培養することによって、ＣＬ−１株によるセルロース分解を促進できると共に、分解産物の一部をメタンガスとして回収できることが明らかとなった。
【００８１】
（４）ＴＯＣとＶＦＡｓ濃度の変遷
１２時間後、３６時間後及び６０時間後にサンプリングした培養液のＳ−ＴＯＣ（可溶性全炭素量）とＶＦＡｓ（揮発性低級脂肪酸）の濃度を測定し、培養試験中におけるこれらの濃度の変遷について検討した。Ｓ−ＴＯＣはＴＯＣアナライザー（ＴＮＣ−６０００、東レ）により測定した。ＶＦＡはＴＳＫｇｅｌ  ＯＡｐａｋ−ＡとＯＡｐａｋ−Ｐ（東ソー）を用いた高速液体クロマトグラフィー（ＧＬ−７４００、ＧＬサイエンス）により測定した。尚、Ｓ−ＴＯＣのイニシャル濃度は７４６ｍｇ−Ｃ／Ｌであり、ＶＦＡｓのイニシャル濃度は０ｍＭであった。Ｓ−ＴＯＣの測定結果を図８に示し、ＶＦＡｓの測定結果を図９に示す。
【００８２】
また、６０時間後のＳ−ＴＯＣ濃度とＶＦＡｓ濃度を以下に示す。
＜Ｓ−ＴＯＣ＞
・共培養  ：３７３４ｍｇ−Ｃ／Ｌ
・単菌培養：２０４１ｍｇ−Ｃ／Ｌ
＜ＶＦＡｓ＞
・共培養  ：４４．４ｍＭ
・単菌培養：２０．６ｍＭ
【００８３】
３６時間後及び６０時間後において、Ｓ−ＴＯＣ濃度とＶＦＡｓ濃度ともに、共培養時の方が増加した。Ｓ−ＴＯＣとＶＦＡｓはＣＬ−１によるセルロース分解の産物であることから、この結果は、上記（１）〜（３）の結果と一致するリーズナブルなものであった。
【００８４】
（５）炭素収支の検討
６０時間後の共培養、単菌培養における炭素収支を算出した。結果を表２に示す。
【００８５】
【表２】
0005996231.tif 000003
【００８６】
表２において、不溶性炭素量は、ＳＳ濃度にろ紙の炭素量（４４％）を掛けることで算出した。
【００８７】
表２に示される結果から、炭素収支はほぼ１００％であることが確認でき、本実施例における試験の妥当性が確認できた。
【００８８】
（６）共培養によるセルロース分解の高効率化の機構に関する検討
表３に、６０時間後にサンプリングした培養液のＶＦＡｓ（酢酸、乳酸、プロピオン酸）の濃度と、エタノール濃度を示す。エタノール濃度は、エタノールアッセイ  Ｆ−キット（ロシュ）を用いて決定した。
【００８９】
【表３】
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【００９０】
表３に示される結果から、共培養を行うことで単菌培養よりもエタノール濃度が有意に減少し、酢酸濃度が有意に増加することが明らかとなった（ｐ＜０．０５）。
【００９１】
（６）の検討により得られた結果と、（１）〜（５）の検討により得られた結果から総合的に推察され得る事項について、図１０に基づいて以下に説明する。
【００９２】
まず、培養液中のセルロースは、ＣＬ−１株によって産生される細胞外セルラーゼによってセロビオースに分解されているものと考えられる（参考文献３：Demain, A. L., Newcomb, M., Wu, and J. H.: Cellulase, clostridia, and ethanol, Microbiol. Mol. Biol. Rev., 69, 124−154 (2006)、参考文献４：Shiratori, H., Sasaya, K., Ohiwa, H., Ikeno, H., Ayame, S., Kataoka, N., Miya, A., Beppu, T., and Ueda, K.: Clostridium clariflavum sp. nov. and Clostridium caenicola sp. nov., moderately thermophilic, cellulose−/cellobiose−digesting bacteria isolated from methanogenic sludge, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 59, 1764−1770 (2009)）。続いて、セロビオースは細胞内に輸送され、グルコースに分解される。グルコースはさらに分解され、数種の発酵がＣＬ−１株内で進行するものと考えられる。ここで、乳酸生産経路、コハク酸を経由するプロピオン酸生産経路、及びエタノール生産経路においては、還元型のピリジンヌクレオチド類（ＮＡＤＨ及びＮＡＤＰＨ）とフラビン−アデニンジヌクレオチド（ＦＡＤＨ２）の再酸化が必要とされる。一方で、図１０中、黒塗り矢印で示した酢酸生産経路においては、このような再酸化は必要とされない。仮に、Ｈ２を生産する微生物中に存在するヒドロゲナーゼが、低分圧Ｈ２下において、還元型ピリジンヌクレオチド類の還元力からのＨ２生成を触媒する場合には、発酵経路のシフトが起こり得ると考えられる。したがって、共培養における水素資化性メタン生成菌によるＨ２の消費によって、乳酸、プロピオン酸及びエタノールの生産経路における反応を減退させ、その結果としてＡＴＰ生産に関与する酢酸生産経路における反応が相対的に促進されたものと考えられる。
【００９３】
実際に、表３に示される結果からも、共培養を行うことで単菌培養よりもエタノール濃度が有意に減少し、酢酸濃度が有意に増加することが明らかとなっている。したがって、共培養によるＣＬ−１株の増殖の向上及びセルロース分解速度の向上は、ＡＴＰ生産の促進によって引き起こされているものと考えられる。
【００９４】
尚、この現象は、水素資化性メタン生成菌以外のメタン生成菌、例えば酢酸資化性メタン生成菌を共培養に用いた場合にも、酢酸生産経路の最終生成物である酢酸の消費を促進して、酢酸生産経路における反応を促進し、ＡＴＰ生産が促されて、水素資化性メタン生成菌を用いた場合と同様の効果が奏され得るものと考えられる。
【００９５】
尚、実施例１に示す実験結果から、ＣＬ−１株の能力を具体的に数値で示すと以下のようになる。
＜比増殖速度＞
１．２８／日（図２の２４〜４８時間の菌数の差から算出、４８〜７２時間の場合の比増殖速度は２．３０／日）
＜最大到達菌体密度＞
２．６７×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬ（図２の７２時間後の値）
＜セルロース分解速度＞
１．９４×１０−９ｇ／Ｌ／ｃｅｌｌｓ／日（図３の０〜１８日目のＳＳ濃度の減少速度。但し、０〜９日目で計算すると２．００×１０−９ｇ／Ｌ／ｃｅｌｌｓ／日、９〜１８日目で計算すると７．１７×１０−１０ｇ／Ｌ／ｃｅｌｌｓ／日）
【００９６】
したがって、ＣＬ−１株以外の嫌気性セルロース分解菌を用いた場合であっても、その比増殖速度が１．２８／日以上であり、最大到達菌体密度が２．６７×１０８ｃｅｌｌｓ／ｍＬ以上であり、セルロース分解速度が７．１７×１０−１０ｇ／Ｌ／ｃｅｌｌｓ／日以上（より好適には１．９４×１０−９ｇ／Ｌ／ｃｅｌｌｓ／日以上）である嫌気性セルロース分解菌を、メタン生成菌と併用することによって、ＣＬ−１株を用いた場合と同等ないしはそれ以上の優れたセルロース分解処理能力が得られるものと考えられる。
【図１】
0005996231.tif 000005
【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
0005996231.tif 000011
【図８】
0005996231.tif 000012
【図９】
0005996231.tif 000013
【図１０】
0005996231.tif 000014
【配列表】
0005996231000001.app