(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
ジオマテリアル中の炭酸カルシウム濃度を上昇させる方法であって、
前記ジオマテリアル内に既に存在する常在尿素溶解微生物の成長および前記常在尿素溶解微生物による炭酸カルシウムの産生を促進する工程を有し、
前記促進する工程は、
前記ジオマテリアルに、栄養源、尿素およびカルシウムイオン源を添加する工程であって、これにより前記常在尿素溶解微生物による前記ジオマテリアル中の炭酸カルシウムの産生を促進させる、前記添加する工程によるものである、
方法。
【請求項２】
請求項１記載の方法において、前記栄養源を添加する工程は、前記尿素を添加する工程および前記カルシウムイオン源を添加する工程に先立って実行されるものである方法。
【請求項３】
請求項１記載の方法において、前記栄養源を添加する工程は、前記尿素を添加する工程と実質的に同時に実行されるものである方法。
【請求項４】
請求項３記載の方法において、前記カルシウムイオン源を添加する工程は、前記栄養源および前記尿素を添加する工程と実質的に同時に実行されるものである方法。
【請求項５】
請求項１記載の方法において、前記微生物によって産生される前記炭酸カルシウムは、カルサイトである方法。
【請求項６】
請求項１記載の方法において、前記栄養源、前記尿素、及び前記カルシウム源のうちの１若しくはそれ以上は、前記ジオマテリアルに多数回添加されるものである方法。
【請求項７】
請求項１記載の方法において、前記ジオマテリアルは、土壌と岩とから成る群から選択されるものである方法。
【請求項８】
請求項１記載の方法において、外因性の微生物は、前記ジオマテリアルに意図的には添加されないものである方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は尿素を加水分解する微生物を用いたジオマテリアルのセメント形成の分野に関するものである。
【背景技術】
【０００２】
セメント結合は多孔質マテリアルの隙間に溶解鉱物成分が沈着・堆積し、結合マテリアルを形成すべくマテリアルを互いに固着させる一連の作用である。実際には、セメント結合は砂岩と石灰岩のような堆積岩が形成される地質学的プロセスである。砂岩と石灰岩は主にカルサイトセメントの析出を介し形成される。
【０００３】
カルサイトは可溶性が低く最も安定した炭酸カルシウムの多形である。炭酸カルシウムのその他の多形はアナゴライトとバテライトである。炭酸カルシウムの過飽和状態の溶液は準安定性の多形バテライトに自発的に転移する不安定なアモルファス炭酸カルシウムとし析出する。バテライトからカルサイトへの転移は水の存在下で急速に起こり、ほぼすべてのバテライトが２４時間以内にカルサイトに転移する。土壌中、カルサイトは隣接した土壌粒との隙間を埋め、固化した砂または砂岩を形成すべく土壌粒子とともに固化する。土壌粒子とともに固化することに加え、炭酸カルシウムの微粒子は土壌マトリクスにおける隙間を減らし土壌のせん断に対する抵抗性を増加させる。
【０００４】
土壌中に天然に存在する多くの微生物、特にＢａｃｉｌｌｕｓ属、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ属、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ属、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ属、およびＤｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ属のようなＢａｃｉｌｌａｃａｅ科のバクテリアは水の存在下で尿素（ＮＨ２）２ＣＯを以下の反応によりアンモニウムと炭酸イオンに加水分解することができる。
【０００５】
（ＮＨ２）２ＣＯ  ＋  ２Ｈ２Ｏ  →  ２ＮＨ４−  ＋  ＣＯ３２−
ＮＨ４＋イオンの生成は局所ｐＨを上昇させ、カルシウムイオンの存在下、核生成部位を利用し、炭酸イオンはカルシウムイオンと自発的に反応し、以下の反応により炭酸カルシウムを形成する。
【０００６】
Ｃａ２＋  ＋  ＣＯ３２−  →  ＣａＣＯ３
炭酸カルシウムが自発的にともに土壌粒子を固化する安定な多形カルサイトを形成するため、微生物セメント結合は多岐に渡る用途に有用であると考えられてきた。Ｋｕｃｈａｒｓｋｉは米国特許出願第２００８／０２４５２７２号において微生物バイオセメンテーションが組み立て、安定化、および擁壁、堤防、およびトンネルの補強などの土木工学への応用に、液状化の恐れがある地震多発地帯において安定化させる砂として、採掘により破壊された地面に支持体を提供するため、尾鉱ダムの強度を増し侵食を防ぐため、および塵粒子を固着させるため、といったような鉱業への応用、道路および滑走路のような「即席の」舗道をつくるといったような建築業への応用、風化するモルタルおよび石造建築の保存、修復、および強化といったような修復工事への応用、重金属、繊維、および放射性元素などの汚染物質の安定化や除去、および侵食の抑制のような環境分野での応用、および固化したバイオフィルターへのバクテリアの固定化を含むフィルターの作成といったような他の用途に利用可能であることを開示している。
【０００７】
Ｋｕｃｈａｒｓｋｉは岩、砂、土、または粘土といったスターティングマテリアルと特定量の（１）ウレアーゼを産生する外因性の微生物、（２）尿素、および（３）カルシウムイオンを混合することによりセメントを形成する方法について開示している。しかしながら、Ｋｕｃｈａｒｓｋｉの方法にはいくつかの不利な点が存在し、Ｋｕｃｈａｒｓｋｉの応用法でいくつかにおいては対処がなされている。
【０００８】
不利な点の一つとして、上記の３つの構成成分をスターティングマテリアルに注入するとカルサイト形成はそのような状況において急速に起こることにより、カルサイト形成とその結果生じるセメント結合がスターティングマテリアルに３つの成分を注入したポイント、またはそれに近い部位に集中して起こる傾向があるということがある。この問題に関してはＷｈｉｆｆｉｎらが「Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  Ｃａｒｂｏｎａｔｅ  Ｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ  ａｓ  ａ  Ｓｏｉｌ  Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ」Ｇｅｏｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｊｏｕｒｎａｌ、２４：４１７〜４２３（２００７）において考察している。Ｋｕｃｈａｒｓｋｉ応用法の共同発明者の一人でもあるＷｈｉｆｆｉｎは薬剤とバクテリアの同時の注入がカルサイトの急速な生成の原因となり、注入ポイント近位で系が目詰まりする結果となることを開示している。Ｗｈｉｆｆｉｎはバクテリアおよび薬剤がマテリアルの目詰まりを起こすことなくスターティングマテリアルに注入可能となるプロセスを開示している。しかしながら４２０ページの表５において、Ｗｈｉｆｆｉｎは５９．２ｋｇ  ＣａＣＯ３／ｍ３の平均カラム量が得られたのにもかかわらず、注入点から１００ｃｍの地点で平均の２倍以上の値でカラム中の炭酸カルシウムの分布が非常に不均一であったことを示している。このように、例え目詰まりが回避されたとしてもＷｈｉｆｆｉｎの方法ではスターティングマテリアルの至る所でカルサイトが不均等に分布するという結果となり、よって、スターティングマテリアルのあらゆる部位で不均等な強化がなされるという結果となる。
【０００９】
Ｋｕｃｈａｒｓｋｉの方法の２つ目の不利な点はＫｕｃｈａｒｓｋｉにより００７２項に考察がなされているスターティングマテリアルへの添加後に生じる微生物のロスである。Ｋｕｃｈａｒｓｋｉはこの問題はセメント結合に先立ちスターティングマテリアルに微生物を定着させることにより対処可能であることを開示している。このように００７２項に述べられているようにＫｕｃｈａｒｓｋｉの方法には（１）スターティングマテリアルに微生物を添加すること、（２）スターティングマテリアルに微生物を定着させること、および（３）その後、尿素とカルシウムイオンとともに定着させた微生物を加えスターティングマテリアルと混合するという逐次段階が含まれる。
【００１０】
Ｋｕｃｈａｒｓｋｉ法の３つ目の不利な点として必然的にＫｕｃｈａｒｓｋｉの方法では利用する微生物種の数に限りがあり、通常は一種類の微生物種のみを利用する事にある。土壌のような自然環境には複雑な生態学的な枠組みの中に数多くの微生物種が存在する。１種類または数種のみの微生物培養の注入は注入以前に存在した生態学的な枠組みを崩壊させることとなる。さらにはスターティングマテリアルに注入した微生物は局所環境に適応している既存の生物に対しその生存競争面において不利な立場にあり、結果として注入微生物の大部分が失われることとなる。
その上、異なる微生物は異なる至適ｐＨ値でカルサイトを生産することができるため、ｐＨおよび他の環境因子はスターティングマテリアルに注入される特定の微生物によって至適化がなされる必要がある。
Ｋｕｃｈａｒｓｋのこれらの不利な点は多くの応用において実用的ではない方法であることを開示している。したがって、先行技術の不利な点を克服する微生物バイオセメンテーション法の開発が必須である。
この出願の発明に関連する先行技術文献情報としては、以下のものがある（国際出願日以降国際段階で引用された文献及び他国に国内移行した際に引用された文献を含む）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１１】
【特許文献１】  米国特許出願公開第２００８／０２４５２７２号明細書
【特許文献２】  国際公開第２００８／１２０９７９号
【非特許文献】
【００１２】
【非特許文献１】  ＦＵＪＩＴＡ，Ｙ，ｅｔ  ａｌ，"Ｃａｌｃｉｕｍ  ｃａｒｂｏｎａｔ  ｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｕｒｅｏｌｙｔｉｃ  ｓｕｂｓｕｒｆａｃｅ  ｂａｃｔｅｒｉａ，"Ｇｅｏｍｉｃｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｊｏｕｒｎａｌ，１７：３０５−３１８（２０００）
【非特許文献２】  ＦＵＪＩＴＡ，Ｙ，ｅｔ  ａｌ，"Ｓｔｉｍｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｕｒｅａ  ｈｙｄｒｏｌｙｓｉｓ  ｉｎ  ｇｒｏｕｎｄｗａｔｅｒ  ｔｏ  ｅｎｈａｎｃｅ  ｃａｌｃｉｔｅ  ｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ，"Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｓｃｉ．Ｔｅｃｈｎｏｌ．，４２：３０２５−３０３２（２００８）
【非特許文献３】  ＤｅＪＯＮＧ，ＪＴ，ｅｔ  ａｌ，"Ｍｉｃｒｏｂｉａｌｌｙ  ｉｎｄｕｃｅｄ  ｃｅｍｅｎｔａｔｉｏｎ  ｔｏ  ｃｏｎｔｒｏｌ  ｓａｎｄ  ｒｅｓｐｏｎｓｅ  ｔｏ  ｕｎｄｒａｉｎｅｄ  ｓｈｅａｒ，"Ｊ．Ｇｅｏｔｅｃｈｎｉｃａｌ  ａｎｄ  Ｇｅｏｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，１３２（１１）：１３８１−１３９２（２００６）
【非特許文献４】  ＷＨＩＦＦＥＮ，ＶＳ，ｅｔ  ａｌ，"Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｃａｒｂｏｎａｔｅ  ｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ  ａｓ  ａ  ｓｏｉｌ  ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ  ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ，"Ｇｅｏｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｊｏｕｒｎａｌ，２４：４１７−４２３（２００７）
【非特許文献５】  ＳＴＯＣＫＳ−ＦＩＳＣＨＥＲ，Ｓ，ｅｔ  ａｌ，"Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  ｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ  ｏｆ  ＣａＣ０３，"Ｓｏｉｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，３１：１５６３−１５７１（１９９９）
【非特許文献６】  ＶＡＮ  ＰＡＡＳＳＥＮ，ＬＡ，ｅｔ  ａｌ，"Ｓｃａｌｅ  ｕｐ  ｏｆ  ＢｉｏＧｒｏｕｔ：ａ  ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  ｇｒｏｕｎｄ  ｒｅｉｎｆｏｒｃｅｍｅｎｔ  ｍｅｔｈｏｄ，"Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  １７ｔｈ  Ｉｎｔｌ  Ｃｏｎｆ．ｏｎ  Ｓｏｉｌ  Ｍｅｃｈｓ．ａｎｄ  Ｇｅｏｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｅｎｇ．（２００９）
【非特許文献７】  ＣＯＬＷＥＬＬ，ＦＳ，ｅｔ  ａｌ，"Ｍｉｃｒｏｂｉａｌｌｙ  ｍｅｄｉａｔｅｄ．．．"，Ｃｈａｐｔｅｒ  ６，ｐａｇｅｓ  １１７−１３７  ｉｎ  ＳＵＢＳＵＲＦＡＣＥ  ＣＯＮＴＡＭＩＮＡＴＩＯＮ  ＲＥＭＥＤＩＡＴＩＯＮ，  ＡＣＳ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ，Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ（２００５）
【非特許文献８】  ＷＨＩＦＦＥＮ，ＶＳ，"Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ＣａＣ０３  ｐｒｅｃｉｐｉｔａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｂｉｏｃｅｍｅｎｔ，"Ｄｏｃｔｏｒａｌ  Ｔｈｅｓｉｓ，Ｍｕｒｄｏｃｈ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｐｅｒｔｈ，Ｗｅｓｔｅｒｎ  Ａｕｓｔｒａｌｉａ（２００４）
【非特許文献９】  ＲＯＤＲＩＧＵＥＺ  ＮＡＶＡＲＯ，Ｃ．，"Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｏｒｎａｍｅｎｔａｌ  Ｓｔｏｎｅ  ｂｙ  Ｍｙｘｏｃｌｃｃｕｓ  ｘａｎｔｈｕｓ−ｌｎｄｕｃｅｄ  Ｃａｒｂｏｎａｔｅ  Ｂｉｏｍｉｎｅｒａｌｉｚａｔｉｏｎ，"Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．，６９（４）：２１８２−２１９３（２００３）
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１３】
事実上、土壌と岩のような全てのジオマテリアル、または帯水層にあるような天然水に存在するバクテリアのような常在尿素加水分解微生物を利用した実社会での応用を実用的で有用にすることが可能な微生物バイオセメンテーションのプロセスは予期せず発見された。このように、一実施形態では、本発明はジオマテリアルにおいて炭酸カルシウム濃度を増加させる方法である。本方法の本実施形態によると、ジオマテリアル中の炭酸カルシウム濃度はジオマテリアル中の尿素溶解微生物の成長を促進させること、およびジオマテリアル中の尿素溶解微生物に尿素とカルシウムイオン源を供給することにより増加する。尿素は尿素溶解微生物によりアンモニウムと炭酸イオンに転換され、そして、その炭酸イオンは炭酸カルシウムを形成するためカルシウムイオンと結合する。
【００１４】
好ましい実施形態においてはジオマテリアルにおける微生物の成長はジオマテリアルに高尿素濃度および高ｐＨの状況下において生存可能な微生物の成長を支える栄養源を添加することにより促進される。この成長はジオマテリアルに炭素源と常在のアルカリ性耐性の尿素溶解微生物の成長を促す尿素の添加により促進される。ジオマテリアル中の微生物による炭酸カルシウムの産生はカルシウムイオン源を土壌に添加する事により促進され、ジオマテリアルをセメント結合させるのに働くカルサイトを自発的に形成する。この方法では外因性の尿素加水分解微生物がジオマテリアルに添加されないことが望ましい。外因性の微生物の添加がなされない事で故意にジオマテリアルに添加する生物の影響に言及する事ができるようになる。微生物はあらゆる場所に存在するため、例えばジオマテリアルを用い働く作業員個人の手に存在するような外因性の微生物はジオマテリアルに不注意に添加される可能性があるものと理解されている。そのような不慮の外因性微生物の添加は回避が不可能ではなくとも困難である汚染物質として考えられており、したがってジオマテリアルに添加するまたは添加しない外因性の微生物について言及する場合、外因性の微生物の意図的な添加のみが検討される。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
「ジオマテリアル」という用語は地質学的に由来した材料を意味し、例として土壌と岩が含まれる。
【００１６】
「反応物」という用語は本方法に従いジオマテリアルに添加される材料を個別または全体的に指すのに用いられる。
【００１７】
「常在」という用語は微生物がその地域、または環境が起源である事、およびそこに生息している事、または自然に発生する事を意味し、その地域や環境に外部から添加された微生物を除く。ただし十分に時間的な隔たりがある過去においてその地域や環境に外部から加えられその地域や環境に適応したような微生物はこれに含まれない。利用のために、微生物が少なくとも一週間前に添加されるならば、その微生物は常在であると考える。同様に、一週間以内に加えられた場合、外因性のものとして考える。
【００１８】
本発明を実施する場合、外因性の微生物がジオマテリアルに添加されないことが好ましが、本方法の各段階が実行される限りは、本方法の各段階を実施する事に加え、外因性の微生物の利用する事は本方法の範囲内であると考える。
【００１９】
ジオマテリアルの微生物はカルサイト以外の炭酸カルシウム形態を通常直接産生するが、そのような炭酸カルシウムのその他の形態は間接的であれ直接的であれ、水の存在下、約６０℃以下の周囲温度で自発的にカルサイトに変わる。したがって、特に明記しない限りまたは前後関係に必要とされない限りここに用いられる「炭酸カルシウム」と「カルサイト」という用語は土壌中の微生物により生産された産物に言及するものである。
【００２０】
今回開示される方法は先行技術の不利な点の多くを克服するものである。本方法はバクテリアがカルシウムと尿素源とともに注入される時、迅速なカルサイトの産生により生じる先行技術の方法に付随する注入箇所での目詰まりの問題を回避する。本方法は同様に注入箇所またはその近位におけるカルサイトの迅速な産生によるジオマテリアル中でのカルサイト産物の不均等配分の問題もまた回避する。目詰まりおよび不均一なカルサイト産物の問題はバクテリアの均一な移送および土壌表面へのバクテリアの付着に関する問題に関連する。細胞表面の特性、キャリアー溶液のイオン強度、流量、ファンデルワールス力、および土壌マトリクスでの土壌の隙間の形状などを含んだ多くの要因がバクテリアの移送から土壌粒子への付着にまで影響を及ぼす。加えて、本方法ではジオマテリアルの中で保護されなければならない単一、またはそれ以上の選択された外因性の微生物の成長を必要としないため、本方法に必要な薬剤を混合する前にジオマテリアルに微生物を定着させておく必要がない。有限数の微生物種が用いられる先行技術とは対照的に、本方法のもうひとつの長所は数多くの多様な尿素加水分解微生物種が利用される点にある。したがって本方法では単一または数種の特定の微生物種が好むよう環境を操作する必要がない。また、本方法において用いる微生物集団は常在のものであるため、本方法で使用する微生物は局所環境に適しており、既にジオマテリアルに存在する微生物に関して競争面において不利な立場にはない。
【００２１】
既存の方法に内在する不利な点を克服することに加え、本方法はバイオセメントの形成において単純でより強固な方法を提供するものである。本方法はどのようなジオマテリアルにおいても施行することが可能であり、微生物の培養を必要とせず、施行前にジオマテリアルに微生物を定着させるようなステップを要しない。
【００２２】
本方法において利用される栄養源はエネルギーと炭素源、望ましくは微量ミネラル源とビタミン源を微生物に提供する、任意の化合物や化合物の組み合わせである。適した栄養源の例とし単糖類と、二糖類と、オリゴ糖類と、でんぷんとセルロースのような多糖類などの炭水化物、有機酸、または脂肪族化合物と、芳香族化合物と、アミノ酸などのようなそれらの塩類、カザミノ酸、脂肪族化合物と芳香族炭化水素などの炭化水素、脂肪酸またはケト酸とヒドロキシ酸のような置換酸、グリセロールとマンニトールのような糖アルコール、クエン酸のような多重官能性酸、ピリジン、プリン、ピリミジン、バイオマス加水分解物、糖液、イースト抽出物、トウモロコシ浸出液、ペプトン、トリプトン、ソイトン、養分培養液と乳清のような産業廃棄物が挙げられる。適した栄養源は糖液である。その他、好ましい栄養源として酢酸ナトリウムのような酢酸塩がある。特に好ましい実施形態として、糖液と酢酸塩が栄養源として組み合わせて使用される。
【００２３】
本方法で利用されるカルシウム源はジオマテリアルへの添加、またはジオマテリアルに存在する微生物の反応により得られる任意のカルシウムイオン源である。従って、カルシウム源はカルシウム塩のようなカルシウムイオンの無機または有機の任意のカルシウム源である可能性がある。好ましいカルシウム源は塩化カルシウムである。他の好ましいカルシウム源としては硝酸カルシウムがある。
【００２４】
尿素は様々な形態で提供される。できれば尿素は水溶液として提供されるのが望ましい。
【００２５】
水存在下においてバテライト型炭酸カルシウムのカルサイトへの転移が生じるが、ジオマテリアルに元々含まれるような少しの水でも十分であるためジオマテリアルに水を加える必要がない。しかしながら必要に応じ、水が添加される可能性がある。例えば本方法で利用される反応物を供給するための移送媒体としてそのような水が添加される可能性がある。
【００２６】
本方法で用いられる互いに連結した細孔、または破砕構造を持ち、その中に尿素を加水分解することができる微生物集団を含むジオマテリアルは多様に提供される可能性がある。例えばジオマテリアルは岩、陸源性、化学的・生化学的、または有機的な堆積岩のような典型的な堆積岩である可能性がある。本方法において好ましい堆積岩の例として礫岩と、角礫岩と、砂岩と、シルト岩と、頁岩と、石灰岩と、石膏と、苦灰岩と亜炭とが含まれる。岩に変わるものまたは岩と組み合わせた他の例として、ジオマテリアルが層を成していない未固結、または部分的に固結した（例えば泥炭のような有機物を含有または含有しない、砂利と、砂と、沈泥と、粘土）土壌のような多孔性媒体、または堆積物である可能性がある。本方法のジオマテリアルはまた破砕火成または変成岩である可能性もある。互いにつながった細孔を持つ火山岩もまた本方法のジオマテリアルとして使用される可能性がある。
【００２７】
上記に挙げた様なジオマテリアルには多種多様な適切な微生物が含まれるため、ジオマテリアルに存在する可能性のある特定の微生物の固有性を同定することは必要ではない。しかしながら、特定のジオマテリアルに存在する可能性のある特定の微生物を記述することが有用となる可能性がある。ウレアーゼはアンモニアまたは窒素化合物の濃度に関係なく発現するため、本発明の方法に好ましい微生物は構成的にウレアーゼを発現する可能性がある。そのような生物にはＳｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａｐａｓｔｅｕｒｉｉ、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａｕｒｅａｅ、およびＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａのようなバクテリアが含まれる。本発明の方法に適切な他の微生物は尿素が存在する条件下のみでウレアーゼを発現する微生物である。尿素が存在する条件下のみでウレアーゼを発現するバクテリアの例としてＰｒｏｔｅｕｓ  ｖｕｌｇａｒｉｓがある。ジオマテリアルにはこれまで単離または特性が明らかにされていない尿素を加水分解することが可能な多くのバクテリアが存在するため、ここで記載した生物はその例となる。ジオマテリアルに存在する他の多くの既知の微生物属、およびこれまで知られてさえいないおそらくは同様の尿素加水分解能を有する系統発生上の微生物群は本方法で用いられる好ましい常在の微生物の中に本質的に含まれる。
【００２８】
ジオマテリアルに尿素を加水分解する微生物が含まれるかどうかを同定するのに適した様々な試験が存在する。そのような試験のひとつはＣＬＯテスト（カンピロバクター様菌テスト（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ−ｌｉｋｅ  ｏｒｇａｎｉｓｍ  ｔｅｓｔ））として知られている迅速ウレアーゼテストであり、Ｈｅｌｏｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉの迅速な診断方法として医学分野で利用されているものである。テストの原理はＨ．ｐｙｌｏｒｉが持つ尿素からアンモニアと重炭酸塩への転移を触媒するウレアーゼ酵素の分泌能を利用したものである。テストはジオマテリアルのサンプルを尿素とフェノールレッドなどのｐＨに対し敏感な指示薬を含む培地に静置することにより行う。もしサンプルがウレアーゼを含むのであれば培地中の尿素はアンモニアに変化し、培地のｐＨを上昇させ黄色（陰性）から赤色（陽性）に試料の色が変化する。
【００２９】
本方法に従い反応物は同時にまたは順番に添加される可能性がある。好ましい実施形態において、本方法はジオマテリアルで微生物の成長を促す栄養源の添加によりジオマテリアルを強化した「富化段階」を用いる。必要に応じ、ジオマテリアルにおいて尿素溶解微生物の成長を特に促進させるため富化段階の間に尿素が添加される可能性がある。選択的に富化段階においてカルシウムイオン源を添加する、または添加しない可能性がある。ジオマテリアルに添加する栄養源の濃度はジオマテリアル中で微生物の成長を促進させるのに十分である濃度であり、添加した特定の栄養源に主に依存し変化する。糖液が栄養源として利用される場合、糖液の好ましい濃度は栄養源容量に対し約０．００５容量％〜０．０５容量％の間であると考えられる。しかしながら添加された糖液の濃度がジオマテリアルの微生物の成長を促進させるのに十分であるならば、濃度がそれよりも低いまたは高い糖液がジオマテリアルに添加される可能性がある。同様に、酢酸ナトリウム濃度の好ましい範囲は１０ｍＭ〜１５０ｍＭである。しかしながら糖液と同様にそれより低いまたは高い濃度の酢酸ナトリウムが利用される可能性がある。
【００３０】
上記のように尿素は栄養分とともに添加される可能性がある。尿素が富化段階の間に添加される場合、以降の処理段階の間に追加の尿素を添加する必要がない可能性がある。尿素が富化段階において含まれたかどうかに関係なく、尿素を富化段階に続く「処理段階」において添加することが好ましい。処理段階において尿素は望ましくは添加栄養分とともにジオマテリアルに添加される。アンモニアを産生する尿素の加水分解はｐＨを上昇させ、高濃度の尿素またはアンモニア存在下、または高いｐＨにおいては生育しないバクテリアの成長を妨げる。ジオマテリアルに添加される尿素の濃度はジオマテリアルのセメント結合に必要とされる程度を産生するのに十分な炭酸塩を産生するのに十分である位の濃度である。ジオマテリアルに添加する尿素濃度の好ましい範囲は２５０ｍＭ〜２ｍＭの間である。尿素濃度が２５０ｍＭより低く、たとえば５０ｍＭと同程度、またはそれ以下で用いられる可能性がある。しかしながら目的値までのｐＨ上昇および炭酸イオンの産生は遅くなる。例えば最高２０００ｍＭまたはそれ以上のような２ｍＭ以上の尿素濃度もまた利用される可能性がある。好ましい尿素濃度は２５０ｍＭ〜３３３ｍＭの間である。
【００３１】
処理段階の一部において、炭酸カルシウムを形成させるため、カルシウムイオン源を尿素と同時、または尿素に続き添加し、尿素の加水分解の結果産生される炭酸イオンと反応させる。添加するカルシウムイオン濃度は変わる可能性があり、より低い濃度であればセメント結合のプロセスはより遅いものとなり、より高濃度であればセメント結合のプロセスはより早まる結果となる。少なくともカルシウムイオン濃度が約１０ｍＭとなるようカルシウムイオン源を添加する。カルシウムイオンの至適濃度は尿素濃度より高くないが、必要に応じそれ以上となる可能性がある。例えばジオマテリアルに添加されるカルシウムイオン濃度が最高２０００ｍＭまたはそれ以上となる可能性がある。至適カルシウムイオン濃度は約２５０ｍＭである。望ましくは尿素と、栄養素と、カルシウムイオンとのうちの１若しくはそれ以上、ジオマテリアルに添加する事によって処理段階を繰り返し追加して実施される可能性があり、高いｐＨにおいて生き残ることができる尿素溶解バクテリアをさらに選択する。
【００３２】
必須ではないが、尿素と、栄養源と、カルシウムイオンとのうちの１若しくはそれ以上添加することにより、２回またはそれ以上、望ましくは５回以上、より望ましくは１０回、処理段階が反復して実施されることが望ましい。これらの反応物の少なくとも２つ、望ましくは３つ全ての反応物がそれぞれの繰り返しにおいて添加されるのが最も理想的である。継続的な繰り返しでより早くｐＨが上昇する事が明らかとなっており、ジオマテリアル内の微生物集団がますます独占的に尿素溶解性の高ｐＨ環境下で生存可能な微生物構成となることが考えられる。さらに反復処理を追加することでますますカルサイトが産生され、ジオマテリアルのセメント結合の性質が高められる。
【００３３】
本方法の好ましい実施形態が連続した富化段階および処理段階を含む事を述べたが、本方法で富化段階および処理段階を切り離した段階とする必要はない。必要に応じ、尿素溶解微生物の成長を促進させ、尿素溶解微生物に尿素を加水分解させ、炭酸イオンを産生させ、炭酸カルシウムを形成させるため炭酸イオンをカルシウムイオンと結合させるため、栄養源と、尿素源と、カルシウム源とがジオマテリアルに添加される可能性がある。必須ではないが、尿素と、栄養源と、カルシウムイオンとのうちの１若しくはそれ以上の添加の切り返しが２回またはそれ以上、望ましくは５回以上、より望ましくは１０回、反復して実施されることが望ましい。これらの反応物の少なくとも２つ、望ましくは３つ全ての反応物がそれぞれの繰り返しにおいて添加されるのが最も理想的である。
【００３４】
ジオマテリアル内の微生物を利用可能にする反応物として、その反応物はジオマテリアルに任意の方法で添加される可能性がある。例えば反応物が、例えば水溶液のようなものの中でジオマテリアルの中若しくは上にフラッシング、若しくは注入することにより、またはジオマテリアルの上若しくは中に反応物を噴霧、滴下、若しくは散水するといったような方法により圧力下で添加される可能性がある。
【００３５】
本発明を下記の非限定的な実施例でさらに説明する。以下に記述する全ての濃度は特に明記のない限り％ｗ／ｗとする。
【００３６】
実施例１−土壌サンプルからのＣａＣＯ３の析出
土壌サンプルはステンレス製オーガーを用いワシントン州のＬｏｗｅｒダムの約５マイル南にあるＳｎａｋｅ川の岸から３０ｃｍ、６０ｃｍ、９０ｃｍ、および１５０ｃｍの深さより収集した。収集したサンプルは漏出を防止するため底は密閉されているが上部は空気にさらされるままとなる３０ｍｌのベクトン・ディッキンソンシリンジに直接入れた。サンプルは氷上でアイダホ州、Ｍｏｓｃｏｗのアイダホ大学環境バイオテクノロジー研究所に輸送した。全てのサンプルは地下水面下から収集し、初期ｐＨ値および温度測定はＡｃｏｒｎ（登録商標）ｐＨ６シリーズメーター（Ｏａｋｔｏｎ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ社、イリノイ州、Ｖｅｒｎｏｎ  Ｈｉｌｌｓ）を用い行った。サンプルは処理を開始するまで４℃で保存し、収集から１４時間以内に処理した。水は土壌サンプルを収集した場所の隣接した地域のＳｎａｋｅ川から収集し、輸送のため氷上で保存し、使用する間４℃で保存した。
【００３７】
土壌サンプルはｐＨ７．０で蒸留水１リットルあたり１．０％糖液（Ｇｒａｎｍａ’ｓ  Ｍｏｌａｓｓｅｓ、亜硫酸塩無添加、Ｍｏｔｔｓ  ＵＳＡ社、ニューヨーク州、Ｒｙｅ  Ｂｒｏｏｋ）と１７０ｍＭ酢酸ナトリウム（ＣＨ３ＣＯＯＮａ・３Ｈ２Ｏ）（Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｏｒｇａｎｉｃｓ社、オハイオ州、Ｃｌｅｖｅｌａｎｄ）との組み合わせの炭素栄養源とさらに２５０ｍＭ尿素（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社、マサチューセッツ州、Ｗａｌｔｈａｍ）と２５０ｍＭ  ＣａＣｌ２・２Ｈ２Ｏ（試薬、ＥＭＤ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ社、ニュージャージー州、Ｇｉｂｂｓｔｏｗｎ）と、１２．２ｍＭ  ＮＨ４Ｃｌ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社）と、０．１ｇ  Ｂａｃｔｏイースト抽出物（Ｂａｃｔｏ  Ｄｉｃｋｅｎｓｏｎ社、ニュージャージー州、Ｆｒａｎｋｌｉｎ  Ｌａｋｅｓ）とを含む富化培溶液で７日間処理し、続いてｐＨ７．０で蒸留水１リットルあたり５０ｍＭ酢酸ナトリウムと、５０ｍＭ  ＣａＣｌ２と、３３３ｍＭ尿素と、１２．２ｍＭ  ＮＨ４Ｃｌと、０．１ｇイースト抽出物とを含むバイオミネラル化した培地で７２時間間隔を空け７日間で３回処理した。
【００３８】
ネガティブコントロールは同時に処理した。コントロールサンプルはｐＨ７．４で蒸留水１リットルあたり８ｇのＮａＣｌ、０．２ｇのＫＣｌ、１．４４ｇのＮａ２ＨＰＯを含む滅菌リン酸緩衝食塩水で処理した。
【００３９】
その後、ＣａＣＯ３のパーセンテージを下記のように決定した。各々の深度から収集した無処理の土壌サンプルを含むコントロールシリンジと下記の処理を施した処理シリンジは有機物および不完全に化学結合した炭酸カルシウムを除去するため約５細孔容積の５０ｍＭ  ＮａＣｌで洗い流した。各カラムの表層から約５ｍｍの土壌を除去し、土壌表面において析出し、蓄積している可能性のある炭酸塩を取り除くべく破棄した。それから土壌サンプルをオーブンに入れ１２１℃で２４時間乾燥させ、重さを量り、炭酸カルシウムを溶解させるため約５細孔容積の１Ｍ  ＨＣｌで洗い流し、その後ナノピュア水で洗浄し、再度２４時間乾燥させた。土壌サンプルを再度計量し、質量の違いは処理サンプルの炭酸カルシウムの質量に起因するものであった。
【００４０】
処理を行ったサンプルのＣａＣＯ３の平均濃度は２．８％ｗ／ｗであった。
【００４１】
実施例２−低濃度の添加栄養分を用いた土壌サンプルからのＣａＣＯ３の析出
０．１％糖液と５０ｍＭ酢酸ナトリウムの組み合わせを炭素栄養源とし処理した土壌サンプルを使用した事以外、実施例１において行った実験を繰り返し行った。処理を行ったサンプルのＣａＣＯ３の平均濃度は２．２％ｗ／ｗであった。
【００４２】
実施例３−単一炭素源を用いた土壌サンプルからのＣａＣＯ３の析出
糖液を欠き、１５０ｍＭ酢酸ナトリウムのみを炭素栄養源として用い処理した土壌サンプルを使用した事以外、実施例１において行った実験を繰り返し行った。処理を行ったサンプルのＣａＣＯ３の平均濃度は１．８％ｗ／ｗであった。
【００４３】
実施例４−単一炭素源を用いた土壌サンプルからのＣａＣＯ３の析出
酢酸ナトリウムを欠き、０．５％糖液のみを炭素栄養源として用い処理した土壌サンプルを使用した事以外、実施例１において行った実験を繰り返し行った。処理を行ったサンプルのＣａＣＯ３の平均濃度は０．９２％ｗ／ｗであった。特定の栄養源または栄養源の組み合わせが本方法を最適化するため利用される可能性があるが、実施例１から４の研究は本方法がジオマテリアルの中の微生物により利用可能などのような栄養源を使用してもうまく実施することができることを示す。
【００４４】
実施例５−様々な濃度のカルシウムイオンを用いた土壌サンプルからのＣａＣＯ３の析出
実施例１の研究をＳｎａｋｅ川の岸から地下水面下４６ｃｍと、９０ｃｍと、１５０ｃｍとの深度で収集した土壌サンプルを用い繰り返し行った。ｐＨ７．０で蒸留水１リットルあたり５０ｍＭまたは２５０ｍＭのＣａＣｌ２と、０．５％糖液と、１７０ｍＭ酢酸ナトリウムと、３３３ｍＭ尿素と、１２．２ｍＭ  ＮＨ４Ｃｌと０．１ｇ  Ｂａｃｔｏイースト抽出物との組み合わせを含む約１．０５の細孔容積の富化培地を７２時間各カラムに添加した。その後、約１．０５の細孔容積のｐＨ７．０で蒸留水１リットルあたり５０ｍＭまたは２５０ｍＭのＣａＣｌ２、１７０ｍＭ酢酸ナトリウム、３３３ｍＭ尿素、１２．２ｍＭ  ＮＨ４Ｃｌと０．１ｇイースト抽出物を含むバイオミネラル化した培地により１から３日間間隔を空け７回処理した。
【００４５】
ネガティブコントロールは同時に処理した。コントロールカラムは５０または２５０ｍＭ  ＣａＣｌ２のいずれかを含むが尿素を欠く約１．０５の細孔容積の富化培地で処理した。追加のネガティブコントロールとして約１．０５の細孔容積のＳｎａｋｅ川から採取した水で処理し、他のサンプルと同じ方法で処理した。
各々のサンプルのＣａＣＯ３のパーセンテージはそれから実施例１と同様に測定した。結果を下の表１に示した。
【００４６】
【表１】
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【００４７】
表１に示すように、より高いカルシウム濃度を培地に用いれば本方法に従い処理した土壌サンプルにおいてより多いカルサイトを産生した。尿素を省く事以外、本方法に従い処理したサンプルと同様の方法で処理したコントロール土壌サンプルではカルサイトまたは炭酸カルシウムの他の形態は検出されなかった。カルサイトまたは他の形態の炭酸カルシウムはＳｎａｋｅ川から収集した水においても検出されなかった。炭酸カルシウムは尿素と塩化カルシウムを含んだ培地で処理した常在の微生物を含む土壌を含むカラムでのみで検出され、よって、カルサイトが処理前の土壌に既に存在していた可能性、または、微生物の尿素加水分解以外の他のいくつかのプロセスにより析出した可能性が除外された。
【００４８】
上記の発明の様々な変更形態が当事者によりなされるのは明らかである。そのような変更形態は続く請求項の範囲内に含まれるよう意図されている。