(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中の、以下（ａ）〜（ｃ）：
（ａ）  Ｃ末端から３番目のアミノ酸における、ＥからＮへのアミノ酸置換、
（ｂ）  Ｎ末端アミノ酸における、ＥからＫへのアミノ酸置換、および
（ｃ）  Ｎ末端から３番目のアミノ酸における、ＣからＭへのアミノ酸置換
からなる群より選択される１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列からなる、単離されたペプチド。
【請求項２】
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４のアミノ酸配列からなる、請求項１記載の単離されたペプチド。
【請求項３】
細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４、３５および４１からなる群より選択されるアミノ酸配列中の１個または２個のアミノ酸が置換されているアミノ酸配列を含み、該置換が、
（ａ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４、３５または４１のアミノ酸配列のＮ末端から２番目のアミノ酸の、フェニルアラニン、メチオニン、およびトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸への置換；ならびに
（ｂ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４、３５または４１のアミノ酸配列のＣ末端アミノ酸の、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、およびメチオニンからなる群より選択されるアミノ酸への置換
の一方または両方である、１５アミノ酸未満の単離されたペプチド。
【請求項４】
請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項５】
ＣＴＬを誘導するための組成物であって、請求項１〜３のいずれか一項記載の１つもしくは複数のペプチドまたは請求項４記載の１つもしくは複数のポリヌクレオチドを含む、組成物。
【請求項６】
がんもしくは子宮内膜症の治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防のための薬学的組成物であって、請求項１〜３のいずれか一項記載の１つもしくは複数のペプチドまたは請求項４記載の１つもしくは複数のポリヌクレオチドを含む、薬学的組成物。
【請求項７】
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象に投与するために製剤化される、請求項６記載の薬学的組成物。
【請求項８】
がんまたは子宮内膜症を治療するために製剤化される、請求項６または７記載の薬学的組成物。
【請求項９】
ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導するためのインビトロの方法であって、以下：
（ａ）  ＡＰＣを請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドとインビトロで接触させる段階；および
（ｂ）  請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階
の１つを含む、方法。
【請求項１０】
以下：
（ａ）  ＨＬＡ抗原と請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面上に提示するＡＰＣと、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を共培養する段階；
（ｂ）  ＨＬＡ抗原と請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面上に提示するエキソソームと、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を共培養する段階；および
（ｃ）  請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをＴ細胞に導入する段階
の少なくとも１つを含む方法のいずれかによって、ＣＴＬを誘導するためのインビトロの方法。
【請求項１１】
ＨＬＡ抗原と請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面上に提示する、単離されたＡＰＣ。
【請求項１２】
請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチドを標的とする、単離されたＣＴＬ。
【請求項１３】
対象においてがんまたは子宮内膜症に対する免疫応答を誘導するための組成物であって、請求項１〜３のいずれか一項記載のペプチド、または該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１４】
請求項１〜３のいずれか一項記載の１つもしくは複数のペプチド、または請求項４記載の１つもしくは複数のポリヌクレオチドを含む、抗原提示細胞誘導剤。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、生物科学の分野、より具体的にはがん療法の分野に関する。特に本発明は、がんワクチンとして非常に有効な新規ペプチド、ならびに腫瘍（またはＭＥＬＫの過剰発現に関連する疾患）を治療および予防するための薬物に関する。
優先権
本出願は、２０１０年１月２５日に出願された米国仮出願第６１／２９７，９９６号の恩典を主張し、それらの内容はその全体が、目的を問わず、参照により本明細書に組み入れられる。
【背景技術】
【０００２】
ＣＤ８陽性細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）クラスＩ分子上に見出される腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）由来のエピトープペプチドを認識し、その後、腫瘍細胞を殺傷することが実証されている。ＴＡＡの最初の例としてメラノーマ抗原（ＭＡＧＥ）ファミリーが発見されて以来、他の多くのＴＡＡが、免疫学的アプローチによって主に発見されている（非特許文献１、２）。これらのＴＡＡのうちのいくつかは、現在、免疫療法の標的として臨床開発の過程にある。
【０００３】
有望なＴＡＡは、がん細胞の増殖および生存に不可欠なＴＡＡである。そのようなＴＡＡを免疫療法の標的として用いることにより、療法によって誘発される免疫選択の結果としてのＴＡＡの欠失、突然変異、または下方制御に起因し得るがん細胞の免疫回避の詳述されているリスクが最小限に抑えられ得る。したがって、強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導し得る新規ＴＡＡの同定により、様々な種類のがんに対するペプチドワクチン接種戦略のさらなる開発および臨床研究が保証される（非特許文献３〜１０）。現在までに、これらのＴＡＡ由来ペプチドを用いた試験の臨床報告がいくつか報告されている（非特許文献１１〜１３）。いくつかの成功が見られているが、免疫療法の標的として新規ＴＡＡが依然として必要とされている。
【０００４】
ＭＥＬＫ、母体胚性ロイシンジッパーキナーゼ（ｍａｔｅｒｎａｌ  ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ  ｌｅｕｃｉｎｅ ｚｉｐｐｅｒ  ｋｉｎａｓｅ）は、哺乳動物胚発生に関与するｓｎｆ１／ＡＭＰＫセリン・スレオニンキナーゼファミリーの新規メンバーとして以前に同定された（非特許文献１４）。この遺伝子は、幹細胞の再生（非特許文献１５）、細胞周期の進行（非特許文献１６、１７）、およびｍＲＮＡ前駆体のスプライシング（非特許文献１８）において重要な役割を果たすことが示された。そのために、遺伝子２３，０４０個を含む網羅的ゲノムｃＤＮＡマイクロアレイを用いた遺伝子発現プロファイルによって、本発明者らは、乳がんにおいて上方制御されるＭＥＬＫを同定した（非特許文献１９）。
【０００５】
ＭＥＬＫは、例えば肺がん細胞、膀胱がん細胞、リンパ腫がん細胞、および子宮頸がん細胞といったいくつかのがん細胞において上方制御される。複数のヒト組織およびがん細胞株でのノーザンブロット解析から、ＭＥＬＫは大部分の乳がんおよび乳がん細胞株において非常に高レベルで過剰発現するが、心臓、肝臓、肺、および腎臓などの正常な重要器官では発現しないことが実証された。さらに、ｓｉＲＮＡによるＭＥＬＫ発現の抑制が、ヒト乳がん細胞の増殖をもたらすことが顕著に示された。
ぺプチドの免疫原性を高めるために、ＭＨＣまたはＴ細胞受容体との相互作用に極めて重要であるペプチドのアミノ酸残基を改変することに関する複数の研究が報告されている（非特許文献２０、２１）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００６】
【特許文献１】ＷＯ２００５／０７３３７４
【非特許文献】
【０００７】
【非特許文献１】Boon T, Int J Cancer 1993 May 8, 54(2): 177-80
【非特許文献２】Boon T & van der Bruggen P, J Exp Med 1996 Mar 1, 183(3): 725-9
【非特許文献３】Harris CC, J Natl Cancer Inst 1996 Oct 16, 88(20): 1442-55
【非特許文献４】Butterfield LH et al., Cancer Res 1999 Jul 1, 59(13): 3134-42
【非特許文献５】Vissers JL et al., Cancer Res 1999 Nov 1, 59(21): 5554-9
【非特許文献６】van der Burg SH et al., J Immunol 1996 May 1, 156(9): 3308-14
【非特許文献７】Tanaka F et al., Cancer Res 1997 Oct 15, 57(20): 4465-8
【非特許文献８】Fujie T et al., Int J Cancer 1999 Jan 18, 80(2): 169-72
【非特許文献９】Kikuchi M et al., Int J Cancer 1999 May 5, 81(3): 459-66
【非特許文献１０】Oiso M et al., Int J Cancer 1999 May 5, 81(3): 387-94
【非特許文献１１】Belli F et al., J Clin Oncol 2002 Oct 15, 20(20): 4169-80
【非特許文献１２】Coulie PG et al., Immunol Rev 2002 Oct, 188: 33-42
【非特許文献１３】Rosenberg SA et al., Nat Med 2004 Sep, 10(9): 909-15
【非特許文献１４】Heyer BS et al., Dev Dyn. 1999 Aug 215(4):344-51
【非特許文献１５】Nakano I et al., J Cell Biol. 2005 Aug 1, 170(3):413-27)
【非特許文献１６】Blot J et al., Dev Biol. 2002 Jan 15, 241(2):327-38
【非特許文献１７】Seong HA et al., Biochem J. 2002 Feb 1, 361(Pt 3):597-604
【非特許文献１８】Vulsteke V et al., J Biol Chem. 2004 Mar 5, 279(10):8642-7. Epub 2003 Dec 29
【非特許文献１９】Lin ML et al., Breast Cancer Res. 2007; 9 (1):R17
【非特許文献２０】Valmori D, et al., J Immunol. 1998 Feb 15;160(4):1750-8
【非特許文献２１】Salazar E, et al., Int J Cancer. 2000 Mar 15;85(6):829-38
【発明の概要】
【０００８】
本発明は、免疫療法の適切な標的として役立ち得る新規ペプチドの発見に一部基づいている。ＴＡＡは概して免疫系により「自己」として認識され、したがって免疫原性を有さない場合が多いため、適切な標的を発見することは極めて重要である。ＭＥＬＫ（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７に記載される）（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿０１４７９１  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４６）の遺伝子によってコードされる）が、子宮内膜症、ならびに乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、および小細胞肺がん（ＳＣＬＣ）を含むがこれらに限定されないがんの組織において上方制御されると同定されたことを認識して（ＷＯ２０１０／０１３４８５）、本発明はがん免疫療法の標的としてＭＥＬＫに注目する。
【０００９】
そのために、本発明は、ＭＥＬＫに特異的な細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を誘導する能力を有するＭＥＬＫの特異的改変エピトープペプチドの同定に、少なくとも一部関する。以下に詳述するように、健常ドナーから得られた末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を、改変ＭＥＬＫエピトープペプチド由来のＡ＊２４０２結合候補ペプチド、すなわち野生型ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）を用いて刺激した。その後、各候補ペプチドをパルスしたＨＬＡ−Ａ２４陽性標的細胞に対する特異的細胞傷害性を有するＣＴＬ株を樹立した。まとめると、これらの結果から、これらのペプチドが、ＭＥＬＫを発現する細胞に対して強力かつ特異的な免疫応答を誘導し得るＨＬＡ−Ａ２４拘束性エピトープペプチドであることが実証される。これらの結果から、ＭＥＬＫは免疫原性が強いこと、およびそのエピトープは腫瘍免疫療法の有効な標的であることがさらに実証される。
【００１０】
したがって、ＭＥＬＫ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７）由来の改変エピトープペプチド、具体的には野生型ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）の改変エピトープペプチドの単離されたペプチド、またはＨＬＡ抗原に結合するその免疫学的活性断片を提供することは、本発明の１つの目的である。本ペプチドはＣＴＬ誘導能を有する。したがって、それらは、ＣＴＬをエクスビボで誘導するために用いることができ、または子宮内膜症およびがんに対する免疫応答を誘導するために対象に投与することができ、がんの例には、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。好ましいペプチドはノナペプチドであり、典型的には、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる。これらのうち、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５、４１、および４４の中より選択されるアミノ配列を有するペプチドは、特に強いＣＴＬ誘導能を示し、よって本発明において特に有用である。
本発明はまた、改変ペプチドが元のペプチドの必要な元のＣＴＬ誘導能を保持する限り、１つ、２つ、またはそれ以上のアミノ酸が置換、欠失、または付加されている、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５のアミノ酸配列を有する改変ペプチドも意図する。
【００１１】
さらに、本発明は、本発明のペプチドのいずれかをコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。これらのポリヌクレオチドは、本発明のペプチドのように、ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導するために用いることができ、またはがんに対する免疫応答を誘導するために対象に投与することができる。
対象に投与した場合、本ペプチドは、各ペプチドを標的とするＣＴＬを誘導するように、ＡＰＣの表面上に提示される。したがって、ＣＴＬを誘導する物質であって、本発明の１つもしくは複数のペプチドまたはそのようなペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む物質を提供することは、本発明の１つの目的である。本発明は、本発明のペプチドの１つもしくは複数またはそのようなペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む薬学的物質をさらに意図し、そのような組成物は、子宮内膜症、ならびに乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣを含むがこれらに限定されないがんの治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防に用いることができる。したがって、子宮内膜症もしくはがんの治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防のために製剤化された薬学的な組成物または物質であって、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドのいずれかを含む薬学的な組成物または物質を提供することは、本発明のさらに別の目的である。本ペプチドまたはポリヌクレオチドの代わりに、またはそれに加えて、本物質または本発明の物質の調剤は、有効成分として、本発明のペプチドのいずれかを提示するＡＰＣまたはエキソソームを任意に含んでもよい。
【００１２】
本発明のペプチドおよびポリヌクレオチドを用いて、例えば、対象由来のＡＰＣを本ペプチドと接触させるか、または本ペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入することによって、ＨＬＡ抗原と本ペプチドとの複合体をその表面上に提示するＡＰＣを誘導することができる。そのようなＡＰＣは標的ペプチドに対する高いＣＴＬ誘導能を有し、よってがん免疫療法に有用である。したがって、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導する方法、およびそのような方法によって得られるＡＰＣを提供することは、本発明の別の目的である。
【００１３】
ＣＴＬを誘導する方法であって、ＣＤ８陽性細胞を、本発明のペプチドをその表面上に提示するＡＰＣもしくはエキソソームと共培養する段階、または本ペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子を導入する段階を含む方法を提供することは、本発明のさらなる目的である。本方法によって得られ得るＣＴＬはまた、これらに限定されないが、子宮内膜症、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣなどの、ＭＥＬＫが過剰発現される疾患を治療および／または予防するのにも有用である。したがって、本方法によって得られるＣＴＬを提供することは、本発明の別の目的である。
【００１４】
さらに、がんに対する免疫応答を、それを必要とする対象において誘導する方法であって、改変ＭＥＬＫまたはその免疫学的活性断片、改変ＭＥＬＫまたはその断片をコードするポリヌクレオチド、および改変ＭＥＬＫまたはその断片を提示するエキソソームまたはＡＰＣを含む物質または組成物を対象に投与する段階を含む方法を提供することは、本発明のさらなる目的である。
本発明の適用性は、子宮内膜症およびがんを含む、ＭＥＬＫ過剰発現に関連するか、またはＭＥＬＫ過剰発現から生じるいくつかの疾患のいずれにも及び、がんの例には、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
【００１５】
より具体的には、本発明は以下を提供する：
［１］  ＨＬＡ抗原に結合し、かつ細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列からなるか、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中に１つもしくは複数のアミノ酸置換を含むアミノ酸配列からなる、単離されたペプチド、
［２］  ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である、［１］記載の単離されたペプチド、
［３］  ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中の以下（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）  Ｎ末端アミノ酸、
（ｂ）  Ｎ末端から３番目のアミノ酸、
（ｃ）  Ｃ末端から３番目のアミノ酸、および
（ｄ）  Ｃ末端アミノ酸
からなる群より選択される位置に１つまたは複数のアミノ酸置換を含む、［１］記載の単離されたペプチド、
［４］  ポリペプチドが、以下（ｉ）〜（ｉｖ）：
（ｉ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＮ末端アミノ酸における、ＥからＫまたはＲへのアミノ酸置換、
（ｉｉ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＮ末端から３番目のアミノ酸における、ＣからＥ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｎ、またはＰへのアミノ酸置換、
（ｉｉｉ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＣ末端から３番目のアミノ酸における、ＥからＮまたはＱへのアミノ酸置換、および
（ｉｖ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＣ末端アミノ酸における、ＦからＬへのアミノ酸置換
からなる群より選択される１つまたは複数のアミノ酸置換を含む、［３］記載の単離されたペプチド、
［５］  単一のアミノ酸置換を含む、［４］記載の単離されたペプチド、
［６］  ２つのアミノ酸置換を含む、［４］記載の単離されたペプチド、
［７］  ３つのアミノ酸置換を含む、［４］記載の単離されたペプチド、
［８］  ４つのアミノ酸置換を含む、［４］記載の単離されたペプチド、
［９］  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、［４］〜［５］記載の単離されたペプチド、
［１０］  ＨＬＡ抗原に結合し、かつ細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、１個、２個、または数個のアミノ酸が挿入、置換、欠失、または付加されている、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる、単離されたペプチド、
［１１］  以下の特徴：
（ａ）  Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、およびトリプトファンの群より選択される；ならびに
（ｂ）  Ｃ末端アミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、およびメチオニンの群より選択される
の一方または両方を有する、［１０］記載のペプチド、
［１２］  ［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド、
［１３］  ＣＴＬを誘導するための物質であって、［１］〜［１１］のいずれか一項記載の１つもしくは複数のペプチドまたは［１２］記載の１つもしくは複数のポリヌクレオチドを含む、物質、
［１４］  がんもしくは子宮内膜症の治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防のための薬学的組成物であって、［１］〜［１１］のいずれか一項記載の１つもしくは複数のペプチドまたは［１２］記載の１つもしくは複数のポリヌクレオチドを含む、薬学的組成物、
［１５］  ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象に投与するために製剤化される、［１４］記載の薬学的組成物、
［１６］  がんまたは子宮内膜症を治療するために製剤化される、［１４］または［１５］記載の薬学的組成物、
［１７］  ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導するための方法であって、以下：
（ａ）  ＡＰＣを［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階；および
（ｂ）  ［１］〜［９］のいずれか一項記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階、
の１つを含む、方法、
［１８］  以下：
（ａ）  ＨＬＡ抗原と［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面上に提示するＡＰＣと、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を共培養する段階；
（ｂ）  ＨＬＡ抗原と［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面上に提示するエキソソームと、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を共培養する段階；および
（ｃ）  ［１］〜［９］のいずれか一項記載のペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子をＴ細胞に導入する段階
の少なくとも１つを含む方法のいずれかによって、ＣＴＬを誘導するための方法、
［１９］  ＨＬＡ抗原と［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチドとの複合体をその表面上に提示する単離されたＡＰＣ、
［２０］  ［１７］記載の方法によって誘導される、［１９］記載のＡＰＣ、
［２１］  ［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチドを標的とする単離されたＣＴＬ、
［２２］  ［１８］記載の方法によって誘導される、［２１］記載のＣＴＬ、ならびに
［２３］  対象においてがんまたは子宮内膜症に対する免疫応答を誘導する方法であって、［１］〜［１１］のいずれか一項記載のペプチド、その免疫学的活性断片、または該ペプチドもしくは該断片をコードするポリヌクレオチドを含む組成物を対象に投与する段階を含む、方法。
【００１６】
本発明の前述の概要および以下の詳細な説明はいずれも例示的な態様のものであり、本発明または本発明のその他の代替的な態様を限定するものではないことが理解されるべきである。
上記に加え、本発明のその他の目的および特徴は、添付の図面および実施例と併せて以下の詳細な説明を読むことによって、より十分に明らかになるであろう。しかし、前述の発明の概要および以下の詳細な説明はいずれも例示的な態様であり、本発明または本発明のその他の代替的な態様を限定するものではないことが理解されるべきである。特に、本発明をいくつかの特定の態様を参照して本明細書において説明するが、その説明は本発明を例証するものであり、本発明を限定するものとして構成されていないことが理解されよう。添付の特許請求の範囲によって記載される本発明の精神および範囲から逸脱することなく、当業者は様々な変更および適用に想到することができる。同様に、本発明のその他の目的、特徴、利益、および利点は、本概要および以下に記載する特定の態様から明らかになり、当業者には容易に明白になるであろう。そのような目的、特徴、利益、および利点は、添付の実施例、データ、図面、およびそれらから引き出されるあらゆる妥当な推論と併せて上記から、単独で、または本明細書に組み入れられる参考文献を考慮して、明らかになるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００１７】
本発明の様々な局面および適用は、図面の簡単な説明ならびに本発明の詳細な説明およびその好ましい態様を考慮することで、当業者に明白となるであろう。
【図１】図１は、ＭＥＬＫ由来のペプチドで誘導したドナーＡのＣＴＬにおけるＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイの結果を示す写真を示す。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）  （ｂ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）  （ｄ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−７８  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２１）  （ｅ）で刺激したＣＴＬは、潜在的ＩＦＮ−γ産生能を示した。対照的に、陰性データの典型的な例として、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−９６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２）  （ｃ）で刺激したＣＴＬからは、特異的ＩＦＮ−γ産生は示されなかった。図中、「＋」は、同族ペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【図２】図２は、ＣＴＬ株の樹立の結果を示す折れ線グラフを示す。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）  （ｂ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）  （ｃ）で刺激したＣＴＬ株から、強力なＩＦＮ−γ産生が検出された。図中、「黒菱形」は、同族ペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【図３】図３は、ＣＴＬクローンの樹立の結果を示す折れ線グラフを示す。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ａ）およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）  （ｂ）で刺激したＣＴＬクローンから、強力なＩＦＮ−γ産生が検出された。図中、「黒菱形」は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【図４】図４は、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を外因的に発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性を示す折れ線グラフを示す。ＨＬＡ−Ａ＊２４０２、またはＭＥＬＫ遺伝子の全長をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞を対照として調製した。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）を用いて樹立されたＣＴＬクローンは、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２の両方をトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞（黒菱形）に対して特異的ＣＴＬ活性を示した。一方、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２（白三角）またはＭＥＬＫ（白丸）のいずれかを発現する標的細胞に対して、有意な特異的ＣＴＬ活性は検出されなかった。
【図５Ａ】図５Ａは、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）由来の改変ペプチドで誘導したドナーＢのＣＴＬにおけるＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイの結果を示す写真を示す。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）  （ｂ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）  （ｃ）で刺激したＣＴＬは、四角で示されるように潜在的ＩＦＮ−γ産生能を示した。一方、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ｄ）で刺激したＣＴＬからは、ペプチド特異的ＩＦＮ−γ産生は検出されなかった。図中、「＋」は、同族ペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【図５Ｂ】図５Ｂは、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）由来の改変ペプチドで誘導したドナーＣのＣＴＬにおけるＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイの結果を示す写真を示す。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）  （ａ）で刺激したＣＴＬは、潜在的ＩＦＮ−γ産生能を示した。一方、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ｂ）で刺激したＣＴＬからは、ペプチド特異的ＩＦＮ−γ産生は検出されなかった。図中、「＋」は、同族ペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「−」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したウェル番号＃１４中の細胞を増殖させて、ＣＴＬ株を樹立した。微量なＩＦＮ−γ産生を示した、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したウェル番号＃４中の細胞もまた増殖させた。
【図６】図６ａ〜ｃは、ドナーＢのＰＢＭＣから誘導されたＣＴＬ株の樹立の結果を示す折れ線グラフを示す。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）  （ｂ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）  （ｃ）で刺激したＣＴＬ株から、強力なＩＦＮ−γ産生が検出された。図中、「黒菱形」は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、無関係のＨＩＶペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。図６ｄ〜ｅは、ドナーＣのＰＢＭＣから誘導されたＣＴＬ株の樹立の結果を示す折れ線グラフを示す。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）  （ｄ）で刺激したＣＴＬ株から、ＩＦＮ−γ産生が検出された。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ｅ）で刺激したＰＢＭＣからは、ＣＴＬ株は樹立されなかった。図中、「黒菱形」は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、無関係のＨＩＶペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【図７】図７ａ〜ｃは、ドナーＢのＰＢＭＣから誘導されたＣＴＬクローンの樹立の結果を示す折れ線グラフを示す。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）  （ｂ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）  （ｃ）で刺激したＣＴＬクローンから、強力なＩＦＮ−γ産生が検出された。図中、「黒菱形」は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、無関係のＨＩＶペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。図７ｄは、ドナーＣのＰＢＭＣから誘導されたＣＴＬクローンの樹立の結果を示す折れ線グラフを示す。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したＣＴＬクローンから、強力なＩＦＮ−γ産生が検出された。図中、「黒菱形」は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、無関係のＨＩＶペプチドをパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。
【図８】図８は、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を外因的に発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性を示す折れ線グラフを示す。（ａ）  ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）を用いて樹立されたＣＴＬ株は、ＭＥＬＫを発現するがＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現しない他の細胞株（白丸；Ｔ４７Ｄ、白四角；ＫＰ−１Ｎ）と比較して、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２の両方を発現する腫瘍細胞株（黒菱形；ＫＬＭ−１、黒三角；ＭＤＡ−ＭＢ−４３５Ｓ）に対して特異的ＣＴＬ活性を示した。（ｂ）  抗ＨＬＡクラスＩ  ｍＡｂの処理によるＣＴＬ応答の阻害を示した。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）を用いて樹立されたＣＴＬクローンは、ＫＰ−１Ｎ（白四角）と比較して、ＫＬＭ−１（黒菱形）に対して特異的ＣＴＬ活性を示した。ＫＬＭ−１（黒菱形）に対するＩＦＮ−γ産生は、対照としての標準マウスＩｇＧ（ハイフン）の処理と比較して、抗ＨＬＡクラスＩ  ｍＡｂ（白菱形）の処理によって阻害された。
【図９】図９は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）特異的ＣＴＬクローンの反応性の結果を示す折れ線グラフを示す。図９（ａ）において、「黒菱形」は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）をパルスした標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示し、「白四角」は、いずれのペプチドもパルスしていない標的細胞に対するＩＦＮ−γ産生を示す。図９（ｂ）において、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を両方とも発現する腫瘍細胞株（黒菱形；ＫＬＭ−１）ならびにＭＥＬＫを発現するがＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現しない腫瘍細胞株（白四角；ＫＰ−１Ｎ）に対するＩＦＮ−γ産生。
【発明を実施するための形態】
【００１８】
態様の説明
本発明の態様を実施または試験するにあたって、本明細書に記載の方法および材料と類似のまたは同等のいかなる方法および材料も用いることができるが、好ましい方法、装置、および材料をここに記載する。しかし、本発明の材料および方法について記載する前に、本明細書に記載の特定の大きさ、形状、寸法、材料、方法論、プロトコール等は慣例的な実験法および最適化に応じて変更可能であるため、本発明がこれらに限定されないことが理解されるべきである。本記載に使用する専門用語は特定の型または態様のみを説明する目的のためのものであり、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定することは意図しないことも、また理解されるべきである。
【００１９】
本明細書において言及される各出版物、特許、または特許出願の開示は、その全体が参照により本明細書に明確に組み入れられる。しかし、本明細書中のいかなるものも、本発明が先行発明によりそのような開示に先行する権利を与えられないと承認するものとしては解釈されるべきではない。
別段の定めのない限り、本明細書で使用する技術用語および科学用語はすべて、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されている用語と同じ意味を有する。矛盾する場合には、定義を含め、本明細書が優先される。加えて、材料、方法、および例は、単に例証するためのものであり、限定することは意図しない。
【００２０】
Ｉ．定義
本明細書で用いる「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」という単語は、特に別段の指定のない限り「少なくとも１つ」を意味する。
「ポリペプチド」、「ペプチド」、および「タンパク質」という用語は、本明細書で互換的に用いられ、アミノ酸残基のポリマーを指す。本用語は、１個または複数個のアミノ酸残基が修飾された残基であるか、または対応する天然アミノ酸の人工的な化学的模倣体などの非天然残基であるアミノ酸ポリマー、ならびに天然アミノ酸ポリマーに適用される。
本明細書で時として用いる「オリゴペプチド」という用語は、長さが２０残基またはそれ未満、典型的には１５残基またはそれ未満の本発明のペプチド、および典型的には約８〜約１１残基、しばしば約９または１０残基から構成される本発明のペプチドを指すのに用いられる。
【００２１】
本明細書で用いる「アミノ酸」という用語は、天然アミノ酸および合成アミノ酸、ならびに天然アミノ酸と同様に機能するアミノ酸類似体およびアミノ酸模倣体を指す。アミノ酸は、Ｌ-アミノ酸、またはＤ-アミノ酸のいずれかであり得る。天然アミノ酸とは、遺伝暗号によってコードされるアミノ酸、および細胞内で翻訳後に修飾されたアミノ酸（例えば、ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、およびＯ−ホスホセリン）である。「アミノ酸類似体」という語句は、天然アミノ酸と同じ基本化学構造（水素、カルボキシ基、アミノ基、およびＲ基に結合したα炭素）を有するが、修飾されたＲ基または修飾された骨格を有する化合物（例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニン、スルホキシド、メチオニンメチルスルホニウム）を指す。「アミノ酸模倣体」という語句は、一般的なアミノ酸とは異なる構造を有するが、同様の機能を有する化合物を指す。
【００２２】
アミノ酸は、本明細書において、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ生化学命名法委員会（Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎ）の推奨する、一般に公知の３文字表記または１文字表記により参照されてもよい。
「遺伝子」、「ポリヌクレオチド」、「ヌクレオチド」、および「核酸」という用語は、本明細書において互換的に用いられ、特に別段の指定のない限り、アミノ酸と同様に、一般に受け入れられている１文字コードにより参照される。
【００２３】
「組成物」、「物質」、または「剤」という用語は本明細書で互換的に用いられ、特定量の特定成分を含む生成物、ならびに特定量の特定成分の組み合わせから直接または間接的に生じる任意の生成物を指す。「薬学的組成物」に関するそのような用語は、有効成分と担体を構成する任意の不活性成分とを含む生成物、ならびに任意の２つもしくはそれ以上の成分の組み合わせ、複合体形成、もしくは凝集から、１つもしくは複数の成分の解離から、または１つもしくは複数の成分の他の種類の反応もしくは相互作用から直接または間接的に生じる任意の生成物を包含することが意図される。したがって、本発明との関連において、「薬学的組成物」という用語は、本発明の化合物と薬学的または生理学的に許容される担体とを混合することにより作製される任意の組成物を指す。本明細書で使用する「薬学的に許容される担体」または「生理学的に許容される担体」という語句は、ポリファーマコフォアにスキャフォールドされた対象をある器官または身体の一部から別の器官または身体の一部へ運搬または輸送することに関与する、液体もしくは固体増量剤、希釈剤、賦形剤、溶媒、または封入材料を含むがこれらに限定されない、薬学的または生理学的に許容される材料、組成物、物質、または媒体を意味する。
【００２４】
本明細書における「有効成分」という用語は、生物学的活性または生理的活性のある、剤または組成物中の物質を指す。特に、薬学的な剤または組成物において、「有効成分」とは、目的の薬理学的効果を示す物質を指す。例えば、がんの治療または予防に用いるための薬学的な剤または組成物の場合、剤または組成物中の有効成分は、がん細胞および／または組織に対して直接的または間接的に、少なくとも１つの生物学的作用または生理的作用をもたらし得る。好ましくは、そのような作用には、がん細胞増殖の低下または阻害、がん細胞および／または組織の損傷または殺傷などが含まれ得る。典型的には、有効成分の間接的効果は、がん細胞を認識または殺傷するＣＴＬの誘導である。製剤化される前には、「有効成分」は「バルク」、「原薬」、または「原体」とも称される。
本発明の薬学的な剤または組成物は、特にワクチンとして使用される。本発明との関連において、「ワクチン」という語句（「免疫原性組成物」とも称される）は、動物に接種した際に抗腫瘍免疫を誘導する機能を有する物質を指す。
【００２５】
別段の定めのない限り、「がん」という用語はＭＥＬＫ遺伝子を過剰発現しているがんを指し、その例には、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
別段の定めのない限り、「子宮内膜症」という用語はＭＥＬＫ遺伝子を過剰発現している子宮内膜症を指し、その例には、米国不妊学会修正分類によって分類される子宮内膜症の病期Ｉ（微症）、ＩＩ（軽度）、ＩＩＩ（中等度）、またＩＶ（重度）が含まれるが、これらに限定されない。あるいは、子宮内膜症の例には、ビーチャム分類によって分離される子宮内膜症の病期Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ、またはＩＶが含まれるが、これらに限定されない。
【００２６】
別段の定めのない限り、「細胞傷害性Ｔリンパ球」、「細胞傷害性Ｔ細胞」、および「ＣＴＬ」という用語は本明細書において互換的に用いられ、特に別段の指定のない限り、非自己細胞（例えば、腫瘍細胞、ウイルス感染細胞）を認識し、そのような細胞の死滅を誘導することができるＴリンパ球のサブグループを指す。
別段の定めのない限り、本明細書で用いる「ＨＬＡ−Ａ２４」という用語は、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２などのサブタイプを含むＨＬＡ−Ａ２４タイプを指す。
【００２７】
別段の定めのない限り、本明細書で用いる「キット」という用語は、試薬と他の物質との組み合わせに関して用いられる。本明細書では、キットはマイクロアレイ、チップ、マーカー等を含み得ることが企図される。「キット」という用語は、試薬および／または物質の特定の組み合わせに限定されないことが意図される。
対象または患者との関連において、本明細書で用いる「ＨＬＡ−Ａ２４陽性」という語句は、その対象または患者がＨＬＡ−Ａ２４抗原遺伝子をホモ接合的またはヘテロ接合的に保有し、ＨＬＡ−Ａ２４抗原が対象または患者の細胞においてＨＬＡ抗原として発現していることを指す。
【００２８】
本発明の方法および組成物が、がんまたは子宮内膜症 の「治療」との関連において有用である限り、治療が、ＭＥＬＫ遺伝子の発現の低下、または対象におけるがんもしくは子宮内膜症の、大きさ、広がり、もしくは転移能の減少などの臨床的利点をもたらす場合に、治療は「有効である」と見なされる。治療を予防的に適用する場合、「有効な」とは、治療によって、がんまたは子宮内膜症の形成が遅延されるもしくは妨げられるか、またはがんもしくは他の疾患の臨床症状が妨げられるもしくは緩和されることを意味する。有効性は、ある種の疾患、もしくは特定の腫瘍の種類を診断または治療するための任意の公知の方法と関連して決定される。
【００２９】
本発明の方法および組成物が、疾患、例えばがんまたは子宮内膜症の「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）」との関連において有用である限り、そのような用語は本明細書において互換的に用いられ、疾患による死亡率または罹患率の負荷を軽減させる任意の働きを指す。予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、「第一次、第二次、および第三次の予防レベル」で行われ得る。第一次の予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は疾患の発生を回避するのに対し、第二次および第三次レベルの予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患の進行および症状の出現を予防することに加え、機能を回復させ、かつ疾患関連の合併症を減少させることによって、既存の疾患の悪影響を低下させることを目的とした働きを包含する。あるいは、予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、特定の障害の重症度を軽減すること、例えば腫瘍の増殖および転移を減少させることを目的とした広範囲の予防的療法を含み得る。
【００３０】
本発明との関連において、がんあるいは子宮内膜症の、治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防は、以下の段階、がん細胞の外科的切除、がん性細胞の増殖の阻害、腫瘍の退行または退縮、寛解の誘導およびがんの発生の抑制、腫瘍退縮、ならびに転移の低減または阻害、の１つまたは複数の段階を含んでもよい。がんの効果的な治療および／または予防は、死亡率を減少させ、がんを有する個体の予後を改善し、血中の腫瘍マーカーのレベルを低下させ、かつがんに伴う検出可能な症状を緩和する。例えば、症状の軽減または改善は効果的な治療および／または予防を構成し、１０％、２０％、３０％、もしくはそれ以上の軽減もしくは安定した疾患を含む。
【００３１】
本発明との関連において、「抗体」という用語は、指定のタンパク質またはそのペプチドと特異的に反応する免疫グロブリンおよびその断片を指す。抗体には、ヒト抗体、霊長類化抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、他のタンパク質または放射標識と融合させた抗体、および抗体断片が含まれ得る。さらに、本明細書において抗体は広義で使用され、具体的には完全なモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、少なくとも２つの完全な抗体から形成される多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）を包含し、また所望の生物学的活性を示す限り、抗体断片を包含する。「抗体」は、すべてのクラス（例えば、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭ）を示す。
【００３２】
ＩＩ．ペプチド
ＭＥＬＫ由来の改変ペプチドがＣＴＬによって認識される抗原として機能することを実証するために、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）由来の改変ペプチドを解析して、それらが、通常見られるＨＬＡアリルであるＨＬＡ−Ａ２４拘束性の抗原エピトープであるかどうかを判定した(Date Y et al., Tissue Antigens 47: 93-101, 1996；Kondo A et al., J Immunol 155: 4307-12, 1995；Kubo RT et al., J Immunol 152: 3913-24, 1994)。
野生型ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ）  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）よりも効率的に特異的ＣＴＬを誘導する潜在的能力を有するＭＥＬＫ由来のＨＬＡ−Ａ２４結合改変ペプチドの候補を、ＨＬＡ−Ａ２４に対するそれらの結合親和性に基づいて同定した。すなわち、本発明に従って、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中に１つまたは複数のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む改変ペプチドが提供される。
【００３３】
本発明において、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）の改変ペプチド中のアミノ酸置換の数は、少なくとも１つである。いくつかの態様において、置換の数は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中の以下の位置（ａ）〜（ｄ）における１つ、２つ、３つ、または４つの置換である。
（ａ）  Ｎ末端アミノ酸、
（ｂ）  Ｎ末端から３番目のアミノ酸、
（ｃ）  Ｃ末端から３番目のアミノ酸、および
（ｄ）  Ｃ末端アミノ酸。
【００３４】
ＨＬＡ抗原に対する結合によって提示されるペプチドの配列中の保存残基の位置は既知である(J Immunol 1994, 152: 3913；Immunogenetics 1995, 41: 178；J Immunol 1994, 155: 4307)。保存残基に従って、Ｎ末端から２番目のアミノ酸およびＣ末端のアミノ酸における置換を導入して、ペプチドとのＨＬＡ−Ａ２４結合を維持するかまたは増大させることができる。しかしながら、（ａ）〜（ｄ）として示される位置は、保存残基の位置とは異なる。言い換えれば、本発明は、以前に知られていた保存残基とは異なる置換を備えた、改善されたＣＴＬ誘導能を有する改変ペプチドを提供する。
【００３５】
本発明の１つの態様において、これらの位置における置換は、（ｉ）〜（ｉｖ）からなる群より選択され得る：
（ｉ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＮ末端アミノ酸における、ＥからＫまたはＲへのアミノ酸置換、
（ｉｉ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＮ末端から３番目のアミノ酸における、ＣからＥ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｎ、またはＰへのアミノ酸置換、
（ｉｉｉ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＣ末端から３番目のアミノ酸における、ＥからＮまたはＱへのアミノ酸置換、および
（ｉｖ）  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６のアミノ酸配列中のＣ末端アミノ酸における、ＦからＬへのアミノ酸置換。
【００３６】
ペプチド中の１つ、２つ、またはそれ以上のアミノ酸の改変は、以下に詳述するように、そのペプチドの機能に影響しない。以下のペプチドは、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ）  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）と比較して、より高い結合能を有する候補ペプチドとして同定された：
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｒ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３６）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿９Ｌ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３７）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｅ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３８）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｉ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３９）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｌ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４０）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４２）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｐ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４３）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）、および
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｑ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４５）。
【００３７】
これらのペプチドを負荷した樹状細胞（ＤＣ）によるＴ細胞のインビトロでの刺激後、以下のペプチドを用いてＣＴＬの樹立に成功した：
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、および
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）。
樹立されたこれらのＣＴＬは、各ペプチドをパルスした標的細胞に対して強力な特異的ＣＴＬ活性を示す。本明細書におけるこれらの結果から、前記ペプチドが、ＨＬＡ−Ａ２４拘束性の、ＭＥＬＫの改変エピトープペプチドであることが実証される。
【００３８】
ＭＥＬＫ遺伝子は、子宮内膜症の細胞および組織、ならびに乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣのがんの細胞および組織を含むがこれらに限定されないがんの細胞および組織で過剰発現するが、ほとんどの正常器官では発現しないため、これは免疫療法のための優れた標的である。したがって、本発明は、ＣＴＬに認識されるＭＥＬＫの改変エピトープに対応するノナペプチド（アミノ酸残基９個から構成されるペプチド）を提供する。本発明のノナペプチドの好ましい例には、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５の中より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドが含まれる。
【００３９】
一般的に、Parker KC et al., J Immunol 1994 Jan 1, 152(1): 163-75に記載されているソフトウェアプログラムのような、インターネット上で現在利用可能なソフトウェアプログラムを用いて、インシリコで様々なペプチドとＨＬＡ抗原との間の結合親和性を算出することができる。例えば、Parker KC et al., J Immunol 1994 Jan 1, 152(1): 163-75；およびKuzushima K et al., Blood 2001, 98(6): 1872-81、Larsen MV et al. BMC Bioinformatics. 2007 Oct 31; 8: 424、Buus S et al. Tissue Antigens., 62:378-84, 2003、Nielsen M et al., Protein Sci 2003; 12: 1007-17、およびNielsen M et al. PLoS ONE 2007; 2: e796を参照して記載され、例えばLafuente EM et al., Current Pharmaceutical Design, 2009, 15, 3209-3220に要約されているように、ＨＬＡ抗原との結合親和性を測定することができる。結合親和性を決定する方法は、例えば、Journal of Immunological Methods, 1995, 185: 181-190、およびProtein Science, 2000, 9: 1838-1846に記載されている。よって、そのようなソフトウェアプログラムを使用して、ＨＬＡ抗原との高い結合親和性を有するＭＥＬＫ由来の免疫学的活性断片を選択することができる。したがって、本発明は、そのような公知のプログラムを用いて同定され、ＨＬＡ抗原と結合する、改変ＭＥＬＫ由来の任意の免疫学的活性断片から構成されるペプチドを包含する。
【００４０】
本発明のペプチドは、結果として生じるペプチドがそのＣＴＬ誘導能を保持する限り、付加的なアミノ酸残基を隣接させることができる。本発明のペプチドに隣接する個々のアミノ酸残基は、それらが元のペプチドのＣＴＬ誘導能を損なわない限り、任意の種類のアミノ酸から構成され得る。したがって、本発明は、ＭＥＬＫ由来の改変ペプチドを含み、かつＨＬＡ抗原に対する結合親和性を有するペプチドを包含する。そのようなペプチドは、典型的には約４０アミノ酸未満であり、多くの場合は約２０アミノ酸未満であり、通常は約１５アミノ酸未満である。
【００４１】
一般に、あるペプチド中の１個、２個、またはそれ以上のアミノ酸の改変は該ペプチドの機能に影響を及ぼさず、場合によっては元のタンパク質の所望の機能を増強することさえある。実際に、改変ペプチド（すなわち、元の参照配列と比較して、１個、２個、または数個のアミノ酸残基が改変された（すなわち、置換、欠失、付加、または挿入された）アミノ酸配列から構成されるペプチド）は、元のペプチドの生物学的活性を保持することが知られている（Mark et al., Proc Natl Acad Sci USA 1984, 81: 5662-6；Zoller and Smith, Nucleic Acids Res 1982, 10: 6487-500；Dalbadie-McFarland et al., Proc Natl Acad Sci USA 1982, 79: 6409-13）。したがって、一態様において、本発明のペプチドは、ＣＴＬ誘導能を有し得、かつ１個、２個、またはさらにそれ以上のアミノ酸が付加、挿入、および／または置換されている、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５の中より選択されるアミノ酸配列を有し得る。
【００４２】
当業者は、単一のアミノ酸またはわずかな割合のアミノ酸を変更する、アミノ酸配列に対する個々の付加または置換が、元のアミノ酸配列の特性の保存をもたらす傾向があることを認識する。したがって、それらはしばしば「保存的置換」または「保存的改変」と称され、この場合、タンパク質の変化により、元のタンパク質と類似の機能を有する改変タンパク質が生じる。機能的に類似しているアミノ酸を提示する保存的置換の表は、当技術分野において周知である。保存することが望ましいアミノ酸側鎖の特性の例には、例えば、疎水性アミノ酸（Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｗ、Ｙ、Ｖ）、親水性アミノ酸（Ｒ、Ｄ、Ｎ、Ｃ、Ｅ、Ｑ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｓ、Ｔ）、ならびに以下の官能基または特徴を共通して有する側鎖が含まれる：脂肪族側鎖（Ｇ、Ａ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｐ）；ヒドロキシル基含有側鎖（Ｓ、Ｔ、Ｙ）；硫黄原子含有側鎖（Ｃ、Ｍ）；カルボン酸およびアミド含有側鎖（Ｄ、Ｎ、Ｅ、Ｑ）；塩基含有側鎖（Ｒ、Ｋ、Ｈ）；ならびに芳香族含有側鎖（Ｈ、Ｆ、Ｙ、Ｗ）。加えて、以下の８群はそれぞれ、相互に保存的置換であるとして当技術分野で認められているアミノ酸を含む：
１）アラニン（Ａ）、グリシン（Ｇ）；
２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；
３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；
４）アルギニン（Ｒ）、リジン（Ｋ）；
５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；
６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）；
７）セリン（Ｓ）、スレオニン（Ｔ）；および
８）システイン（Ｃ）、メチオニン（Ｍ）（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  １９８４を参照されたい）。
このような保存的改変ペプチドもまた、本発明のペプチドと見なされる。しかし、本発明のペプチドはこれらに限定されず、得られた改変ペプチドが元のペプチドのＣＴＬ誘導能を保持する限り、非保存的な改変を含み得る。さらに、改変ペプチドは、ＭＥＬＫの多型変異体、種間相同体、および対立遺伝子のＣＴＬ誘導可能なペプチドを排除しない。
【００４３】
より高い結合親和性を達成するために、本発明のペプチドに対してアミノ酸残基を挿入、置換、または付加してもよく、あるいは本発明のペプチドからアミノ酸残基を欠失させてもよい。必要なＣＴＬ誘導能を保持するために、好ましくは少数の（例えば、１個、２個、または数個の）またはわずかな割合のアミノ酸のみを改変（挿入、欠失、付加、および／または置換）する。本明細書において、「数個」という用語は、５個またはそれ未満のアミノ酸、例えば４個、３個、またはそれ未満を意味する。改変されるアミノ酸の割合は、好ましくは２０％もしくはそれ未満、より好ましくは１５％もしくはそれ未満、さらにより好ましくは１０％もしくはそれ未満、または１〜５％である。
【００４４】
さらに、より高い結合親和性を達成するために、本発明のペプチドは、アミノ酸残基を挿入、置換、または付加されることができ、あるいは、アミノ酸残基を欠失してもよい。免疫療法との関連で用いられた場合、本発明のペプチドは、好ましくはＨＬＡ抗原との複合体として、細胞またはエキソソームの表面上に提示されるはずである。天然に提示されるペプチドに加えて、ＨＬＡ抗原への結合によって提示されるペプチドの配列の規則性は既知であることから（J Immunol 1994, 152: 3913；Immunogenetics 1995, 41: 178；J Immunol 1994, 155: 4307）、そのような規則性に基づいた改変を本発明の免疫原性ペプチドに導入することができる。例えば、ＨＬＡ−Ａ２４との結合を高めるためには、Ｎ末端から２番目のアミノ酸をフェニルアラニン、チロシン、メチオニン、もしくはトリプトファンで置換すること、および／またはＣ末端のアミノ酸をフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、もしくはメチオニンで置換することが望ましい可能性がある。したがって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５の中より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯのアミノ酸配列のＮ末端から２番目のアミノ酸がフェニルアラニン、チロシン、メチオニン、もしくはトリプトファンで置換されている、および／またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯのアミノ酸配列のＣ末端がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、もしくはメチオニンで置換されているペプチドが、本発明に包含される。
【００４５】
末端のアミノ酸においてだけでなく、ペプチドの潜在的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）認識部位においても、置換を導入することができる。いくつかの研究は、例えばＣＡＰ１、ｐ５３（２６４−２７２）、Ｈｅｒ−２／ｎｅｕ（３６９−３７７）、またはｇｐ１００（２０９−２１７）など、アミノ酸置換を有するペプチドが元の機能と同等であるかまたはより優れた機能を有し得ることを実証している（Zaremba et al. Cancer Res. 57, 4570-4577, 1997、T. K. Hoffmann et al. J Immunol. (2002) Feb 1;168(3):1338-47.、S. O. Dionne et al. Cancer Immunol immunother. (2003) 52: 199-206、およびS. O. Dionne et al. Cancer Immunology, Immunotherapy (2004) 53, 307-314）。
本発明はまた、記載されたペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に対する１個、２個、または数個のアミノ酸の付加も企図する。高いＨＬＡ抗原結合親和性を有し、かつＣＴＬ誘導能を保持するそのような改変ペプチドもまた、本発明に含まれる。
より高い結合親和性を達成するために、上述のように、ペプチドの、Ｎ末端から２番目のアミノ酸、ならびにＮ末端および／またはＣ末端における改変が報告されているものの、Ｎ末端から７番目のアミノ酸における改変の効果については、未だ明らかになっていないことに留意されたい。
【００４６】
しかし、ペプチド配列が、異なる機能を有する内因性または外因性タンパク質のアミノ酸配列の一部と同一である場合、自己免疫障害および／または特定の物質に対するアレルギー症状などの副作用が誘発される可能性がある。したがって、ペプチドの配列が別のタンパク質のアミノ酸配列と一致する状況を回避するために、利用可能なデータベースを用いて最初に相同性検索を行うことが好ましい。相同性検索から、対象ペプチドと比較して１個または２個のアミノ酸が異なるペプチドでさえも存在しないことが明らかになった場合には、そのような副作用の危険を全く伴うことなしに、ＨＬＡ抗原とのその結合親和性を増大させるため、および／またはそのＣＴＬ誘導能を増大させるために、該対象ペプチドを改変することができる。
【００４７】
上記のようにＨＬＡ抗原に対する高い結合親和性を有するペプチドは、非常に効果的であると予測されるが、高い結合親和性の存在を指標として選択された候補ペプチドを、ＣＴＬ誘導能の有無についてさらに調べる。本明細書において「ＣＴＬ誘導能」という語句は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）上に提示された場合に、ＣＴＬを誘導するペプチドの能力を示す。さらに、「ＣＴＬ誘導能」は、ＣＴＬ活性化を誘導する、ＣＴＬ増殖を誘導する、ＣＴＬによる標的細胞の溶解を促進する、およびＣＴＬのＩＦＮ−γ産生を増加させる、ペプチドの能力を含む。
【００４８】
ＣＴＬ誘導能の確認は、ヒトＭＨＣ抗原を保有するＡＰＣ（例えば、Ｂリンパ球、マクロファージ、および樹状細胞（ＤＣ））、またはより具体的にはヒト末梢血単核白血球由来のＤＣを誘導し、ペプチドで刺激した後、ＣＤ８陽性細胞と混合し、その後、標的細胞に対してＣＴＬによって産生および放出されたＩＦＮ−γを測定することにより達成される。反応系として、ヒトＨＬＡ抗原を発現するように作製されたトランスジェニック動物（例えば、BenMohamed L, Krishnan R, Longmate J, Auge C, Low L, Primus J, Diamond DJ, Hum Immunol 2000 Aug, 61(8): 764-79, Related Articles, Books, Linkout Induction of CTL response by a minimal epitope vaccine in HLA A*0201/DR1 transgenic mice: dependence on HLA class II restricted T(H) responseに記載されているもの）を用いることができる。例えば、標的細胞を５１Ｃｒ等で放射標識することが可能であり、標的細胞から放出された放射能から細胞傷害活性を算出することができる。あるいは、固定化したペプチドを保有するＡＰＣの存在下で、ＣＴＬによって産生および放出されたＩＦＮ−γを測定し、抗ＩＦＮ−γモノクローナル抗体を用いて培地上の阻止帯を可視化することによって、ＣＴＬ誘導能を評価することができる。
上記のようにペプチドのＣＴＬ誘導能を調べた結果、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５によって示されるアミノ酸配列を有するペプチドの中より選択されるノナペプチドが、ＨＬＡに対する高い結合親和性に加えて、特に高いＣＴＬ誘導能を示すことが判明した。したがって、これらのペプチドは本発明の好ましい態様として例示される。
【００４９】
さらに、相同性解析の結果から、これらのペプチドが、他のいかなる公知のヒト遺伝子産物に由来するペプチドとも有意な相同性を有していないことが示された。そのため、免疫療法に用いた場合に未知のまたは望ましくない免疫応答が生じる可能性は低くなっている。したがって、この局面からもまた、これらのペプチドはがんまたは子宮内膜症の患者においてＭＥＬＫに対する免疫を誘発するのに有用である。したがって、本発明のペプチドは、好ましくは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５の中より選択されるアミノ酸配列からなるペプチドである。
【００５０】
上記の改変に加えて、本発明のペプチドは、結果として生じる連結ペプチドが、元のペプチドの必要なＣＴＬ誘導能を保持する限り、他のペプチドに連結させることもできる。他の適切なペプチドの例には、本発明のペプチドまたは他のＴＡＡに由来するＣＴＬ誘導性ペプチドが含まれる。適切なペプチド間のリンカーは当技術分野で周知であり、例えばＡＡＹ（P. M. Daftarian et al., J Trans Med 2007, 5:26）、ＡＡＡ、ＮＫＲＫ（R. P. M. Sutmuller et al., J Immunol. 2000, 165: 5 7308-7315）、またはＫ（S. Ota et al., Can Res. 62, 1471-1476、K. S. Kawamura et al., J Immunol. 2002, 168: 5709-5715）である。
【００５１】
例えば、ＨＬＡクラスＩおよび／またはクラスＩＩを介する免疫応答を増大させるために、ＭＥＬＫではない腫瘍関連抗原ペプチドを実質的に同時に使用することもできる。がん細胞が２種類以上の腫瘍関連遺伝子を発現し得ることは、十分に確立されている。したがって、特定の対象がさらなる腫瘍関連遺伝子を発現するかどうかを判定すること、ならびに続いて本発明によるＭＥＬＫ組成物またはワクチン中に、そのような遺伝子の発現産物に由来するＨＬＡクラスＩおよび／またはＨＬＡクラスＩＩ結合ペプチドを含めることは、当業者の慣例的な実験法の範囲内である。
【００５２】
ＨＬＡクラスＩおよびＨＬＡクラスＩＩ結合ペプチドの例は当業者に公知であり（例えば、Coulie, Stem Cells 13:393-403, 1995を参照されたい）、本明細書に開示したものと同様の様式で本発明において用いることができる。したがって当業者は、１種もしくは複数種のＭＥＬＫペプチドおよび１種もしくは複数種のＭＥＬＫではないペプチドを含むポリペプチド、またはそのようなポリペプチドをコードする核酸を、分子生物学の標準的な手順を用いて容易に調製することができる。
【００５３】
上記の連結ペプチドを本明細書では「ポリトープ」と称し、これはすなわち、様々な配置（例えば、連鎖状、重複）で連結され得る、２つまたはそれ以上の潜在的な免疫原性または免疫応答刺激性ペプチドの群である。ポリトープ（またはポリトープをコードする核酸）を標準的な免疫化プロトコールで例えば動物に投与して、免疫応答の促進、増強、および／または誘発における該ポリトープの有効性を試験することができる。
【００５４】
ペプチドを直接的にまたは隣接配列の使用により連結して、ポリトープを形成することができ、ポリトープのワクチンとしての使用は当技術分野において周知である（例えば、Thomson et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA 92(13):5845-5849, 1995；Gilbert et al., Nature Biotechnol. 15(12):1280-1284, 1997；Thomson et al., J Immunol. 157(2):822-826, 1996；Tarn et al., J Exp. Med. 171(1):299-306, 1990を参照されたい）。様々な数および組み合わせのエピトープを含むポリトープを調製することができ、ＣＴＬによる認識について、および免疫応答の増大における有効性について試験することができる。
【００５５】
上述の本発明のペプチドの改変に加え、記載されたペプチドは、それらが元のペプチドのＣＴＬ誘導能を保持する限り、他の物質にさらに連結させることもできる。例示的な物質には、ペプチド、脂質、糖および糖鎖、アセチル基、天然および合成のポリマー等が含まれる。本発明のペプチドは、修飾によって元のペプチドの生物学的活性が損なわれない限り、糖鎖付加、側鎖酸化、および／またはリン酸化などの修飾を含むことができる。このような種類の修飾は、付加的な機能（例えば、標的化機能および送達機能）を付与すること、および／またはペプチドを安定化することができる。
【００５６】
例えば、ポリペプチドのインビボ安定性を高めるために、Ｄ−アミノ酸、アミノ酸模倣体、または非天然アミノ酸を導入することが当技術分野において公知であり、この概念を本発明のポリペプチドに対して用いることもできる。ポリペプチドの安定性は、いくつかの方法でアッセイすることができる。例えば、ペプチダーゼ、ならびにヒトの血漿および血清などの様々な生物学的媒質を用いて、安定性を試験することができる（例えば、Verhoef et al., Eur J Drug Metab Pharmacokin 1986, 11: 291-302を参照されたい）。
【００５７】
さらに、上述したように、１個、２個、または数個のアミノ酸残基により置換、欠失、または付加されている改変ペプチドの中から、元のペプチドと比較して同じかまたはそれよりも高い活性を有するものをスクリーニングまたは選択することができる。したがって本発明はまた、元のものと比較して同じかまたはそれよりも高い活性を有する改変ペプチドをスクリーニングまたは選択する方法を提供する。例示的な方法は以下の段階を含み得る：
ａ：本発明のペプチドの少なくとも１個のアミノ酸残基を置換、欠失、または付加する段階、
ｂ：ペプチドの活性を測定する段階、および
ｃ：元のものと比較して同じかまたはそれよりも高い活性を有するペプチドを選択する段階。
本明細書において、アッセイされる活性には、ＭＨＣ結合活性、ＡＰＣまたはＣＴＬ誘導能、および細胞傷害活性が含まれ得る。
本明細書において、本発明のペプチドはまた、「ＭＥＬＫペプチド」または「ＭＥＬＫポリペプチド」と記載され得る。
【００５８】
ＩＩＩ．改変ＭＥＬＫペプチドの調製
周知の技法を用いて、本発明のペプチドを調製することができる。例えば、組換えＤＮＡ技術または化学合成を用いて、ペプチドを合成的に調製することができる。本発明のペプチドは、個々に、または２つもしくはそれ以上のペプチドから構成されるより長いポリペプチドとして、合成することができる。その後ペプチドを単離する、すなわち、他の天然の宿主細胞タンパク質およびそれらの断片、または他のいかなる化学物質も実質的に含まないように精製または単離することができる。
本発明のペプチドは、修飾によって元のペプチドの生物学的活性が損なわれない限り、糖鎖付加、側鎖酸化、またはリン酸化などの修飾を含み得る。他の例示的な修飾には、例えばペプチドの血清半減期を延長させるために用いることができる、Ｄ−アミノ酸または他のアミノ酸模倣体の取り込みが含まれる。
【００５９】
本発明のペプチドは、改変によって本明細書に記載の本発明のペプチドの生物学的活性が損なわれない限り、グリコシル化、側鎖の酸化、またはリン酸化などの改変を含んでもよい。他の改変には、例えば本発明のペプチドの血清中半減期を増加させるために、Ｄ−アミノ酸または他のアミノ酸模倣体の取り込みが含まれる。
【００６０】
選択されたアミノ酸配列に基づいた化学合成によって、本発明のペプチドを得ることができる。該合成に適合させることのできる従来のペプチド合成法の例には、以下のものが含まれるが、これらに限定されない：
（ｉ）Peptide Synthesis, Interscience, New York, 1966；
（ｉｉ）The Proteins, Vol. 2, Academic Press, New York, 1976；
（ｉｉｉ）「ペプチド合成」（日本語）, 丸善, 1975；
（ｉｖ）「ペプチド合成の基礎と実験」（日本語）, 丸善, 1985；
（ｖ）「続医薬品の開発」（日本語）, 第１４巻（ペプチド合成）, 広川書店, 1991；
（ｖｉ）ＷＯ９９／６７２８８；および
（ｖｉｉ）Barany G. & Merrifield R.B., Peptides Vol. 2, "Solid Phase Peptide Synthesis", Academic Press, New York, 1980, 100-118。
【００６１】
あるいは、ペプチドを産生するための任意の公知の遺伝子工学的方法を適合させて、本発明のペプチドを得ることもできる（例えば、Morrison J, J Bacteriology 1977, 132: 349-51；Clark-Curtiss & Curtiss, Methods in Enzymology (eds. Wu et al.) 1983, 101: 347-62）。例えば、最初に、目的のペプチドを発現可能な形態で（例えば、プロモーター配列に相当する調節配列の下流に）コードするポリヌクレオチドを有する適切なベクターを調製し、適切な宿主細胞に形質転換する。次いで、該宿主細胞を培養して、関心対象のペプチドを産生させる。インビトロ翻訳系を適合させて、ペプチドをインビトロで作製することもできる。
【００６２】
ＩＶ．ポリヌクレオチド
本発明はまた、前述の本発明のペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを提供する。これらには、天然ＭＥＬＫ遺伝子（ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿０１４７９１（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４６））由来の改変ポリヌクレオチド、およびその保存的に改変されたヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドが含まれる。本明細書において「保存的に改変されたヌクレオチド配列」という語句は、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする配列を指す。遺伝暗号の縮重のため、数多くの機能的に同一の核酸が任意の特定のタンパク質をコードする。例えば、コドンＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、およびＧＣＵはすべて、アミノ酸のアラニンをコードする。したがって、あるコドンによってアラニンが指定される任意の位置において、コードされるポリペプチドを変化させることなく、該コドンを、記載された対応するコドンのいずれかに変更することができる。そのような核酸の変異は「サイレント変異」であり、保存的に改変された変異の一種である。ペプチドをコードする本明細書中のあらゆる核酸配列は、該核酸のあらゆる可能なサイレント変異をも表す。核酸中の各コドン（通常メチオニンに対する唯一のコドンであるＡＵＧ、および通常トリプトファンに対する唯一のコドンであるＴＧＧを除く）を改変して、機能的に同一の分子を得ることができることを、当業者は認識するであろう。したがって、ペプチドをコードする核酸の各サイレント変異は、開示した各配列において非明示的に説明されている。
本発明のポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、およびそれらの誘導体から構成され得る。ＤＮＡはＡ、Ｔ、Ｃ、およびＧなどの塩基から適切に構成され、ＲＮＡではＴはＵに置き換えられる。当業者は、非天然塩基もまたポリヌクレオチドに含まれることを認識する。
【００６３】
本発明のポリヌクレオチドは、介在するアミノ酸配列を間に伴って、または伴わずに、本発明の複数のペプチドをコードし得る。例えば、介在するアミノ酸配列は、ポリヌクレオチドまたは翻訳されたペプチドの切断部位（例えば、酵素認識配列）を提供し得る。さらに、ポリヌクレオチドは、本発明のペプチドをコードするコード配列に対する任意の付加的配列を含み得る。例えば、ポリヌクレオチドは、ペプチドの発現に必要な調節配列を含む組換えポリヌクレオチドであってもよく、またはマーカー遺伝子等を有する発現ベクター（プラスミド）であってもよい。一般に、例えばポリメラーゼおよびエンドヌクレアーゼを用いる従来の組換え技法によりポリヌクレオチドを操作することによって、そのような組換えポリヌクレオチドを調製することができる。
【００６４】
組換え技法および化学合成技法のいずれを用いても、本発明のポリヌクレオチドを作製することができる。例えば、適切なベクターに挿入することによってポリヌクレオチドを作製することができ、これはコンピテント細胞にトランスフェクトした場合に発現され得る。あるいは、ＰＣＲ技法または適切な宿主内での発現を用いて、ポリヌクレオチドを増幅することもできる（例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York, 1989を参照されたい）。あるいは、Beaucage SL & Iyer RP, Tetrahedron 1992, 48: 2223-311；Matthes et al., EMBO J 1984, 3: 801-5に記載されている固相技法を用いて、ポリヌクレオチドを合成することもできる。
【００６５】
Ｖ．エキソソーム
本発明はさらに、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との間に形成された複合体を自身の表面上に提示する、エキソソームと称される細胞内小胞を提供する。エキソソームは、例えば公表特許公報  特表平１１−５１０５０７号およびＷＯ９９／０３４９９に詳述されている方法を用いて調製することができ、治療および／または予防の対象となる患者から得られたＡＰＣを用いて調製することができる。本発明のエキソソームは、本発明のペプチドと同様の様式で、ワクチンとして接種することができる。
【００６６】
複合体中に含まれるＨＬＡ抗原の型は、治療および／または予防を必要とする対象のものと一致しなければならない。例えば日本人集団では、ＨＬＡ−Ａ２４（特にＡ＊２４０２）が広く一般的であり、したがってこれは日本人患者の治療に適していると考えられる。日本人および白人の間で高発現するＡ２４型の使用は、有効な結果を得るのに好ましい。典型的には、クリニックにおいて、治療を必要とする患者のＨＬＡ抗原の型を予め調べることにより、特定の抗原に対して高レベルの結合親和性を有する、または抗原提示によるＣＴＬ誘導能を有するペプチドの適切な選択が可能となる。さらに、高い結合親和性およびＣＴＬ誘導能の両方を有するペプチドを得るために、改変ＭＥＬＫ部分ペプチド、すなわち、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）由来の改変ペプチドのアミノ酸配列に基づいて、１個、２個、または数個のアミノ酸の置換、挿入、および／または付加を行うことができる。
本発明のエキソソームに対してＡ２４型ＨＬＡ抗原を用いる場合、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５のうちのいずれか１つの配列を有するペプチドが使用される。
【００６７】
ＶＩ．抗原提示細胞（ＡＰＣ）
本発明はまた、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの間に形成された複合体を自身の表面上に提示する単離されたＡＰＣを提供する。ＡＰＣは、治療および／または予防の対象となる患者に由来してもよく、かつ単独で、または本発明のペプチド、エキソソーム、もしくはＣＴＬを含む他の薬物と組み合わせて、ワクチンとして投与することができる。
【００６８】
ＡＰＣは特定の種類の細胞に限定されず、これには、リンパ球によって認識されるように自身の細胞表面上にタンパク質性抗原を提示することが知られている樹状細胞（ＤＣ）、ランゲルハンス細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および活性化Ｔ細胞が含まれる。ＤＣは、ＡＰＣの中で最も強力なＣＴＬ誘導作用を有する代表的なＡＰＣであるため、ＤＣは本発明のＡＰＣとして使用される。
例えば、末梢血単球からＤＣを誘導し、次にそれらをインビトロ、エクスビボ、またはインビボで本発明のペプチドと接触させる（で刺激する）ことによって、本発明のＡＰＣを得ることができる。本発明のペプチドを対象に投与する場合、本発明のペプチドを提示するＡＰＣが該対象の体内で誘導される。「ＡＰＣを誘導する」という語句は、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの間に形成された複合体を細胞表面に提示するために、細胞を、本発明のペプチドまたは本発明のペプチドをコードするヌクレオチドと接触させる（で刺激する）ことを含む。したがって、本発明のＡＰＣは、本発明のペプチドを対象に投与した後、該対象からＡＰＣを回収することによって得ることができる。あるいは、本発明のＡＰＣは、対象から回収されたＡＰＣを本発明のペプチドと接触させることによって得ることもできる。
【００６９】
対象においてがんに対する免疫応答を誘導するために、本発明のＡＰＣを単独で、または本発明のペプチド、エキソソーム、もしくはＣＴＬを含む他の薬物と組み合わせて、対象に投与することができる。例えば、エクスビボ投与は以下の段階を含み得る：
ａ：第１の対象からＡＰＣを回収する段階、
ｂ：段階ａのＡＰＣをペプチドと接触させる段階、および
ｃ：段階ｂのＡＰＣを第２の対象に投与する段階。
【００７０】
第１の対象と第２の対象は同一の個体であってもよく、または異なる個体であってもよい。あるいは、本発明によれば、抗原提示細胞を誘導する薬学的組成物を製造するための本発明のペプチドの使用が提供される。加えて、本発明は、抗原提示細胞を誘導する薬学的組成物を製造するための方法または工程を提供する。さらに、本発明はまた、抗原提示細胞を誘導するための本発明のペプチドを提供する。段階ｂによって得られるＡＰＣは、子宮内膜症、またはがん、例として乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣを含むがこれらに限定されないがんを治療および／または予防するためのワクチンとして投与することができる。
【００７１】
本発明はまた、ＡＰＣを誘導するための薬学的組成物を製造するための方法または工程であって、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体とともに混合または製剤化する段階を含む方法も提供する。
本発明の一局面によると、ＡＰＣは高レベルのＣＴＬ誘導能を有する。「高レベルのＣＴＬ誘導能」という用語における高レベルとは、ペプチドと接触させていないＡＰＣ、またはＣＴＬを誘導することができないペプチドと接触させたＡＰＣによるＣＴＬ誘導能のレベルと比較したものである。高レベルのＣＴＬ誘導能を有するそのようなＡＰＣは、上記の方法に加え、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをインビトロでＡＰＣに導入する段階を含む方法によって調製することができる。導入する遺伝子は、ＤＮＡまたはＲＮＡの形態であってよい。導入の方法の例には、特に限定されることなく、リポフェクション、エレクトロポレーション、およびリン酸カルシウム法などの、当分野において従来より実施されている様々な方法が含まれる。より具体的には、Cancer Res 1996, 56: 5672-7；J Immunol 1998, 161: 5607-13;J Exp Med 1996, 184: 465-72；公表特許公報第２０００−５０９２８１号に記載されているように、それを実施することができる。遺伝子をＡＰＣに導入することによって、該遺伝子は細胞内で転写、翻訳等を受け、次いで、得られたタンパク質はＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩによってプロセシングされて、提示経路を経て本発明のペプチドが提示される。
【００７２】
ＶＩＩ．細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）
本発明のペプチドのいずれかに対して誘導されたＣＴＬは、インビボでがん細胞を標的とする免疫応答を増強するため、ペプチド自体と同様の様式でワクチンとして用いることができる。したがって本発明はまた、本発明のペプチドのいずれかによって特異的に誘導または活性化された、単離されたＣＴＬも提供する。
そのようなＣＴＬは、（１）本発明のペプチドを対象に投与し、対象からＣＴＬを回収すること、または（２）対象由来のＡＰＣ、およびＣＤ８陽性細胞、もしくは末梢血単核白血球をインビトロで本発明のペプチドと接触させ（で刺激し）、次にＣＴＬを単離すること、または（３）ＣＤ８陽性細胞もしくは末梢血単核白血球を、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣもしくはエキソソームとインビトロで接触させ、次にＣＴＬを単離すること、または（４）本発明のペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子をＣＴＬに導入することによって得ることができる。前述のＡＰＣおよびエキソソームは上記の方法によって調製することができ、（４）の方法は「ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）」の章において以下に詳述する。
【００７３】
本発明のＣＴＬは、治療および／または予防の対象となる患者に由来してよく、かつ単独で投与すること、または効果を調節する目的で本発明のペプチドもしくはエキソソームを含む他の薬物と組み合わせて投与することができる。得られたＣＴＬは、本発明のペプチド、例えば誘導に用いた同一のペプチドを提示する標的細胞に対して特異的に作用する。標的細胞は、がんまたは子宮内膜症の細胞のようにＭＥＬＫを内因的に発現する細胞、またはＭＥＬＫ遺伝子をトランスフェクトした細胞であってよく、かつ本発明のペプチドによる刺激によって該ペプチドを細胞表面上に提示する細胞もまた、活性化されたＣＴＬの攻撃の標的となり得る。
【００７４】
ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）
本発明はまた、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）のサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードする核酸を含む組成物、およびそれを使用する方法を提供する。ＴＣＲサブユニットは、ＭＥＬＫを発現する腫瘍細胞に対する特異性をＴ細胞に付与するＴＣＲを形成する能力を有する。当技術分野における公知の方法を用いることにより、本発明の１種または複数種のペプチドで誘導されたＣＴＬのＴＣＲサブユニットとしてα鎖およびβ鎖の核酸を同定することができる（ＷＯ２００７／０３２２５５、およびMorgan et al., J Immunol, 171, 3288 (2003)）。例えば、ＴＣＲを解析するためにはＰＣＲ法が好ましい。解析のためのＰＣＲプライマーは、例えば、５'側プライマーとしての５'−Ｒプライマー（５'−ｇｔｃｔａｃｃａｇｇｃａｔｔｃｇｃｔｔｃａｔ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４９）、および３'側プライマーとしての、ＴＣＲα鎖Ｃ領域に特異的な３−ＴＲａ−Ｃプライマー（５'−ｔｃａｇｃｔｇｇａｃｃａｃａｇｃｃｇｃａｇｃｇｔ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５０）、ＴＣＲβ鎖Ｃ１領域に特異的な３−ＴＲｂ−Ｃ１プライマー（５'−ｔｃａｇａａａｔｃｃｔｔｔｃｔｃｔｔｇａｃ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５１）、またはＴＣＲβ鎖Ｃ２領域に特異的な３−ＴＲβ−Ｃ２プライマー（５'−ｃｔａｇｃｃｔｃｔｇｇａａｔｃｃｔｔｔｃｔｃｔｔ−３'）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５２）であってよいが、これらに限定されない。ＴＣＲ誘導体は、改変ＭＥＬＫペプチドを提示する標的細胞と高い結合力で結合することができ、かつ任意で、改変ＭＥＬＫペプチドを提示する標的細胞の効率的な殺傷をインビボおよびインビトロで媒介する。
【００７５】
ＴＣＲサブユニットをコードする核酸を、適切なベクター、例えばレトロウイルスベクターに組み込むことができる。これらのベクターは、当技術分野において周知である。該核酸またはそれらを有用に含むベクターを、Ｔ細胞、例えば患者由来のＴ細胞に導入することができる。有利には、本発明は、患者自身のＴ細胞（または別の哺乳動物のＴ細胞）の迅速な改変により、優れたがん細胞殺傷特性を有する改変Ｔ細胞を迅速かつ容易に作製することを可能にする容易に入手可能な組成物を提供する。
【００７６】
特異的ＴＣＲとは、ＴＣＲがＴ細胞の表面上にある場合に、本発明のペプチドとＨＬＡ分子との複合体を特異的に認識して、標的細胞に対する特異的活性をＴ細胞に付与し得る受容体である。上記複合体の特異的認識は任意の公知の方法によって確認することができ、好ましい方法には、例えば、ＨＬＡ分子および本発明のペプチドを用いるテトラマー解析、ならびにＥＬＩＳＰＯＴアッセイが含まれる。ＥＬＩＳＰＯＴアッセイを行うことにより、細胞表面上にＴＣＲを発現するＴ細胞がそのＴＣＲによって細胞を認識すること、およびシグナルが細胞内で伝達されることを確認することができる。Ｔ細胞表面上に上記の複合体が存在する場合に、該複合体がＴ細胞に細胞傷害活性を付与することができることの確認を、公知の方法によって行うこともできる。好ましい方法には、例えば、ＨＬＡ陽性標的細胞に対する細胞傷害活性の測定、例えばクロム放出アッセイなどが含まれる。
【００７７】
また、本発明は、例えば、ＨＬＡ−Ａ２４との関連においてＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５の改変ＭＥＬＫペプチドと結合するＴＣＲサブユニットポリペプチドをコードする核酸の形質導入によって調製されるＣＴＬも提供する。形質導入されたＣＴＬは、インビボでがん細胞にホーミングすることができ、かつ周知のインビトロ培養法によって増殖させることができる（例えば、Kawakami et al., J Immunol., 142, 3452-3461 (1989)）。本発明のＣＴＬは、治療または予防を必要としている患者におけるがんの療法または予防に有用な免疫原性組成物を形成するために用いることができる（ＷＯ２００６／０３１２２１）。
【００７８】
予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）」は、疾患による死亡率または罹患率の負荷を軽減させる任意の働きを含む。予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、「第一次、第二次、および第三次の予防レベル」で行われ得る。第一次の予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は疾患の発生を回避するのに対し、第二次および第三次レベルの予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、疾患の進行および症状の出現を予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）することに加え、機能を回復させ、かつ疾患関連の合併症を減少させることによって、既存の疾患の悪影響を低下させることを目的とした行為を包含する。あるいは、予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎおよびｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）は、特定の障害の重症度を軽減すること、例えば腫瘍または子宮内膜症の増殖および転移を減少させること、血管新生を減少させることを目的とした広範囲の予防的治療を含む。
【００７９】
がんの予防のための治療、ならびに/または術後のその再発の予防は、以下の段階、がん細胞の外科的切除、がん性細胞の増殖の阻害、腫瘍の退行または退縮、寛解の誘導およびがんの発生の抑制、腫瘍退縮、ならびに転移の低減または阻害の1つまたは複数を含み得る。がんの効果的な治療および/または予防は、死亡率を減少させ、がんを有する個体の予後を改善し、血中の腫瘍マーカーのレベルを低下させ、かつがんに伴う検出可能な症状を緩和する。例えば、症状の軽減または改善は効果的な治療および/または予防を構成し、これは10％、20％、30％、もしくはそれ以上の軽減もしくは安定した疾患を含む。
【００８０】
ＩＸ．薬学的な物質または組成物
ＭＥＬＫの発現は、正常組織と比較して、子宮内膜症、ならびに乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣを含むがんにおいて特異的に上昇するため、本発明のペプチドまたはそのようなペプチドをコードするポリヌクレオチドを、子宮内膜症およびがんまたは腫瘍の治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防に用いることができる。したがって、本発明は、本発明のペプチドまたはそれらのペプチドをコードするポリヌクレオチドの１種または複数種を有効成分として含む、がん、腫瘍、子宮内膜症の治療および／もしくは予防のための、ならびに／または術後のその再発の予防のための薬学的な物質または組成物を提供する。あるいは、薬学的な物質または組成物として用いるために、本発明のペプチドを、前述のエキソソームまたはＡＰＣなどの細胞のいずれかの表面上に発現させることができる。加えて、本発明のペプチドのいずれかを標的とする前述のＣＴＬもまた、本発明の薬学的な物質または組成物の有効成分として用いることができる。
【００８１】
本発明の薬学的な組成物はまた、ワクチンとして使用することができる。本発明の文脈において、「ワクチン」（「免疫原性組成物」とも称される）という語句は、動物に接種した際に抗腫瘍免疫を誘導する機能を有する物質を指す。
本発明の薬学的な組成物は、ヒト、ならびに非限定的にマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ネコ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウシ、ウマ、サル、ヒヒ、およびチンパンジー、特に商業的に重要な動物または家畜を含む任意の他の哺乳動物を含む対象または患者において、がんまたは子宮内膜症を治療および／もしくは予防するため、ならびに／または術後のその再発を予防するために用いることができる。
【００８２】
別の態様において、本発明はまた、がん、腫瘍、または子宮内膜症を治療するための薬学的な組成物または物質の製造における、以下の中より選択される有効成分の使用を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８３】
あるいは、本発明はさらに、がん、腫瘍、または子宮内膜症の治療または予防において用いるための、以下の中より選択される有効成分を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８４】
あるいは、本発明はさらに、がん、腫瘍、または子宮内膜症を治療するための薬学的な組成物または物質を製造するための方法または工程であって、以下の中より選択される有効成分を薬学的にまたは生理学的に許容される担体とともに製剤化する段階を含む方法または工程を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８５】
別の態様において、本発明はまた、がん、腫瘍、または子宮内膜症を治療するための薬学的な組成物または物質を製造するための方法または工程であって、以下の中より選択される有効成分と薬学的にまたは生理学的に許容される担体とを混合する段階を含む方法または工程を提供する：
（ａ）本発明のペプチド；
（ｂ）本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードする核酸；
（ｃ）本発明のペプチドを自身の表面上に提示するＡＰＣまたはエキソソーム；および
（ｄ）本発明の細胞傷害性Ｔ細胞。
【００８６】
あるいは、本発明はまた、ＣＴＬを誘導するための物質を提供し、この物質は、１種もしくは複数種の本発明のペプチドまたは１種もしくは複数種の本発明のポリヌクレオチドからなる。
あるいは、薬学的な組成物または物質または本発明を、がん、腫瘍、または子宮内膜症の予防、および術後のその再発の予防のいずれかまたは両方のために用いてもよい。
【００８７】
本発明の薬学的な物質または組成物は、ワクチンとして使用される。上述したように、本発明との関連において、「ワクチン」（「免疫原性組成物」とも称される）という語句は、動物に接種した際に抗腫瘍免疫を誘導する機能を有する物質を指す。
本発明の薬学的な物質または組成物は、ヒト、ならびに非限定的にマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ネコ、イヌ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウシ、ウマ、サル、ヒヒ、およびチンパンジー、特に商業的に重要な動物または家畜を含む任意の他の哺乳動物を含む対象または患者において、がん、腫瘍、または子宮内膜症を治療および／もしくは予防するため、ならびに／または術後のその再発を予防するために用いることができる。
【００８８】
本発明により、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５のいずれか１つのアミノ酸配列を有するペプチドは、強力かつ特異的な免疫応答を誘導し得るＨＬＡ−Ａ２４拘束性エピトープペプチドまたはその候補であることが見出された。したがって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５〜４５のアミノ酸配列を有するこれらのペプチドのいずれかを含む本発明の薬学的な物質または組成物は、ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４である対象への投与のために特に適している。同じことが、これらのペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチド（すなわち、本発明のポリヌクレオチド）を含む薬学的な物質または組成物にも当てはまる。
【００８９】
本発明の薬学的な物質または組成物によって治療されるがん、腫瘍、または子宮内膜症は、限定的でなく、ＭＥＬＫが関与するあらゆる種類の疾患を含み、これには、子宮内膜症、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるがこれらに限定されない。
【００９０】
本発明の薬学的な物質または組成物は、前述の有効成分に加えて、がん性細胞に対するＣＴＬを誘導する能力を有するその他のペプチド、該その他のペプチドをコードするその他のポリヌクレオチド、該その他のペプチドを提示するその他の細胞等を含み得る。本明細書において、がん性細胞に対するＣＴＬを誘導する能力を有するその他のペプチドは、がん特異的抗原（例えば、同定されたＴＡＡ）によって例示されるが、これに限定されない。
【００９１】
必要に応じて、本発明の薬学的な物質または組成物は、その他の治療物質が、例えば本発明のペプチドのいずれかなどの有効成分の抗腫瘍効果を阻害しない限り、有効成分として該治療物質を任意に含み得る。例えば、製剤は、抗炎症物質、鎮痛剤、化学療法薬等を含み得る。医薬自体にその他の治療物質を含めることに加えて、本発明の医薬を、１つまたは複数のその他の薬理学的物質と連続してまたは同時に投与することもできる。医薬および薬理学的物質の量は、例えば、使用する薬理学的物質の種類、治療する疾患、ならびに投与のスケジュールおよび経路に依存する。本明細書において具体的に言及される成分に加えて、本発明の薬学的な物質または組成物は、対象となる製剤の種類を考慮して、当技術分野において慣例的なその他の物質も含み得ることが理解されるべきである。
【００９２】
本発明の一態様において、本発明の薬学的な物質または組成物を、例えばがんまたは子宮内膜症などの治療されるべき疾患の病態を治療するのに有用な材料を含む製品およびキットに含めることができる。該製品は、ラベルを有する本発明の薬学的な物質または組成物のいずれかの容器を含み得る。適切な容器には、ボトル、バイアル、および試験管が含まれる。該容器は、ガラスまたはプラスチックなどの様々な材料から形成され得る。容器上のラベルには、物質が、疾患の１つまたは複数の状態の治療または予防のために用いられることが示されるべきである。ラベルはまた、投与等に関する指示も示し得る。
【００９３】
本発明の薬学的な物質または組成物を含むキットは、上記の容器に加えて、任意で、薬学的に許容される希釈剤を収容した第２の容器をさらに含み得る。それは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、注射針、シリンジ、および使用説明書を備えた包装封入物を含む、商業上の観点および使用者の観点から望ましいその他の材料をさらに含み得る。
必要に応じて、有効成分を含む１つまたは複数の単位剤形を含み得るパックまたはディスペンサー装置にて、薬学的な物質または組成物を提供することができる。該パックは、例えば、ブリスターパックのように金属ホイルまたはプラスチックホイルを含み得る。パックまたはディスペンサー装置には、投与に関する説明書が添付され得る。
【００９４】
（１）有効成分としてペプチドを含む薬学的な物質または組成物
本発明のペプチドは、薬学的な物質または組成物として直接投与してもよく、または必要であれば、従来の製剤化法によって製剤化してもよい。後者の場合、本発明のペプチドに加えて、薬物に通常用いられる担体、賦形剤等が特に制限なく必要に応じて含まれ得る。そのような担体の例は、滅菌水、生理食塩水、リン酸緩衝液、培養液等である。さらに、薬学的な物質または組成物は、必要に応じて、安定剤、懸濁液、保存剤、界面活性剤等を含み得る。本発明の薬学的な物質または組成物は、抗がん目的に用いることができる。
【００９５】
インビボでＣＴＬを誘導するために、本発明のペプチドを、本発明のペプチドの２つまたはそれ以上で構成される組み合わせとして調製することができる。ペプチドの組み合わせはカクテルの形態をとってもよく、または標準的な技法を用いて互いに結合させてもよい。例えば、ペプチドを化学的に結合させても、または単一の融合ポリペプチド配列として発現させてもよい。組み合わせにおけるペプチドは、同一であってもよく、または異なっていてもよい。本発明のペプチドを投与することにより、ペプチドはＨＬＡ抗原によってＡＰＣ上に高密度で提示され、次いで、提示されたペプチドとＨＬＡ抗原との間に形成された複合体に対して特異的に反応するＣＴＬが誘導される。あるいは、対象由来のＡＰＣ（例えば、ＤＣ）を対象から取り出し、かつその後に本発明のペプチドにより刺激して、本発明のペプチドのいずれかを自身の細胞表面上に提示するＡＰＣを得る。これらのＡＰＣを対象に再度投与し、対象においてＣＴＬを誘導し、結果として腫瘍に関係する内皮に対する攻撃性を増大させることができる。
【００９６】
有効成分として本発明のペプチドを含む、がん、腫瘍、または子宮内膜症の治療および／または予防のための薬学的な物質または組成物は、細胞性免疫を効率的に誘導することが知られているアジュバントもまた含み得る。あるいは、薬学的な物質または組成物は、他の有効成分と共に投与してもよく、または顆粒内へ製剤化することによって投与してもよい。アジュバントとは、免疫学的活性を有するタンパク質と共に（または連続して）投与した場合に、該タンパク質に対する免疫応答を増強する化合物を指す。本明細書において企図されるアジュバントには、文献（Clin Microbiol Rev 1994, 7: 277-89）に記載されているものが含まれる。適切なアジュバントの例には、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、ミョウバン、コレラ毒素、サルモネラ毒素が含まれ得るが、これらに限定されない。
さらに、リポソーム製剤、直径数マイクロメートルのビーズにペプチドが結合している顆粒製剤、およびペプチドに脂質が結合している製剤を好都合に用いてもよい。
【００９７】
本発明の別の態様において、本発明のペプチドはまた、薬学的に許容される塩の形態で投与してもよい。塩の好ましい例には、アルカリ金属との塩、金属との塩、有機塩基との塩、有機酸との塩、および無機酸との塩が含まれる。本明細書で使用する「薬学的に許容される塩」とは、その化合物の生物学的有効性および特性を保持し、かつ塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸などの無機酸または無機塩基との反応によって得られる塩を指す。
【００９８】
いくつかの態様において、本発明の薬学的な物質または組成物は、ＣＴＬを刺激する（ｐｒｉｍｅ）成分をさらに含み得る。脂質は、ウイルス抗原に対してインビボでＣＴＬを刺激し得る物質として同定されている。例えば、パルミチン酸残基をリジン残基のεアミノ基およびαアミノ基に付着させ、次に本発明のペプチドに連結させることができる。次いで、脂質付加したペプチドを、ミセルもしくは粒子の状態で直接投与するか、リポソーム中に取り込ませて投与するか、またはアジュバント中に乳化させて投与することができる。ＣＴＬ応答の脂質による刺激の別の例として、適切なペプチドに共有結合している場合、トリパルミトイル−Ｓ−グリセリルシステイニル−セリル−セリン（Ｐ３ＣＳＳ）などの大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）リポタンパク質を用いてＣＴＬを刺激することができる（例えば、Deres et al., Nature 1989, 342: 561-4を参照されたい）。
【００９９】
投与方法は、経口、皮内、皮下、静脈内注射等、および全身投与または標的部位の近傍への局所投与であってよい。投与は、単回投与によって行うこともできるし、または複数回投与によってブーストすることもできる。本発明のペプチドの用量は、治療される疾患、患者の年齢、体重、投与方法等に応じて適宜調整することができ、これは通常０．００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、例えば０．１ｍｇ〜１０ｍｇであり、数日〜数ヶ月に１度投与することができる。当業者は、適切な用量を適宜選択することができる。
【０１００】
（２）有効成分としてポリヌクレオチドを含む薬学的な物質または組成物
本発明の薬学的な物質または組成物はまた、本明細書に開示するペプチドを発現可能な形態でコードする核酸を含み得る。本明細書において、「発現可能な形態で」という語句は、ポリヌクレオチドが、細胞に導入された場合に、抗腫瘍免疫を誘導するポリペプチドとしてインビボで発現することを意味する。例示的な態様において、関心対象のポリヌクレオチドの核酸配列は、該ポリヌクレオチドの発現に必要な調節エレメントを含む。ポリヌクレオチドには、標的細胞のゲノムへの安定した挿入が達成されるように、必要なものを備えさせることができる（相同組換えカセットベクターの説明に関しては、例えばThomas KR & Capecchi MR, Cell 1987, 51: 503-12を参照されたい）。例えば、Wolff et al., Science 1990, 247: 1465-8；米国特許第５，５８０，８５９号；第５，５８９，４６６号；第５，８０４，５６６号；第５，７３９，１１８号；第５，７３６，５２４号；第５，６７９，６４７号；およびＷＯ９８／０４７２０を参照されたい。ＤＮＡに基づく送達技術の例には、「裸のＤＮＡ」、促進された（ブピバカイン、ポリマー、ペプチド媒介性）送達、カチオン性脂質複合体、および粒子媒介性（「遺伝子銃」）または圧力媒介性の送達が含まれる（例えば、米国特許第５，９２２，６８７号を参照されたい）。
【０１０１】
ウイルスベクターまたは細菌ベクターによって、本発明のペプチドを発現させることもできる。発現ベクターの例には、ワクシニアウイルスまたは鶏痘ウイルスなどの弱毒化ウイルス宿主が含まれる。このアプローチは、例えば、ペプチドをコードするヌクレオチド配列を発現させるためのベクターとして、ワクシニアウイルスの使用を伴う。宿主に導入すると、組換えワクシニアウイルスは免疫原性ペプチドを発現し、それによって免疫応答を誘発する。免疫化プロトコールに有用なワクシニアベクターおよび方法は、例えば米国特許第４，７２２，８４８号に記載されている。別のベクターはＢＣＧ（カルメット・ゲラン桿菌）である。ＢＣＧベクターは、Stover et al., Nature 1991, 351: 456-60に記載されている。治療的な投与または免疫化に有用である多種多様な他のベクター、例えばアデノウイルスベクターおよびアデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、チフス菌（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ  ｔｙｐｈｉ）ベクター、無毒化炭疽毒素ベクター等が明らかである。例えば、Shata et al., Mol Med Today 2000, 6: 66-71；Shedlock et al., J Leukoc Biol 2000, 68: 793-806；Hipp et al., In Vivo 2000, 14: 571-85を参照されたい。
ポリヌクレオチドの対象内への送達は、直接的であってもよく、この場合にはポリヌクレオチドを保有するベクターに対象を直接曝露し、または間接的であってもよく、この場合にはまずインビトロで細胞を関心対象のポリヌクレオチドで形質転換し、次いで該細胞を対象内に移植する。これら２つのアプローチはそれぞれ、インビボおよびエクスビボの遺伝子治療として公知である。
【０１０２】
遺伝子治療の方法の一般的な総説に関しては、Goldspiel et al., Clinical Pharmacy 1993, 12: 488-505；Wu and Wu, Biotherapy 1991, 3: 87-95；Tolstoshev, Ann Rev Pharmacol Toxicol 1993, 33: 573-96；Mulligan, Science 1993, 260: 926-32；Morgan & Anderson, Ann Rev Biochem 1993, 62: 191-217；Trends in Biotechnology 1993, 11(5): 155-215を参照されたい。本発明にも用いることのできる、組換えＤＮＡ技術の分野において一般に公知の方法は、eds. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY, 1993；およびKrieger, Gene Transfer and Expression, A Laboratory Manual, Stockton Press, NY, 1990に記載されている。
【０１０３】
投与方法は、経口、皮内、皮下、静脈内注射等であってよく、全身投与または標的部位の近傍への局所投与が使用される。投与は、単回投与によって行うこともできるし、または複数回投与によってブーストすることもできる。適切な担体中のポリヌクレオチドの用量、または本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドで形質転換された細胞中のポリヌクレオチドの用量は、治療される疾患、患者の年齢、体重、投与方法等に応じて適宜調整することができ、これは通常０．００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、例えば０．１ｍｇ〜１０ｍｇであり、数日に１度〜数ヶ月に１度投与することができる。当業者は、適切な用量を適宜選択することができる。
【０１０４】
Ｘ．ペプチド、エキソソーム、ＡＰＣ、およびＣＴＬを用いる方法
本発明のペプチドおよびポリヌクレオチドを用いて、ＡＰＣおよびＣＴＬを誘導することができる。本発明のエキソソームおよびＡＰＣを用いて、ＣＴＬを誘導することもできる。ペプチド、ポリヌクレオチド、エキソソーム、およびＡＰＣは、ＣＴＬ誘導能を他の化合物が阻害しない限り、該化合物と組み合わせて用いることができる。したがって、前述の本発明の薬学的な物質または組成物のいずれかを用いてＣＴＬを誘導することができる。それに加えて、前記ペプチドおよびポリヌクレオチドを含むものを用いて、以下に説明するように、ＡＰＣを誘導することもできる。
【０１０５】
（１）抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導する方法
本発明は、本発明のペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、高いＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導する方法を提供する。
本発明の方法は、ＡＰＣを本発明のペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階を含む。例えば、ＡＰＣを該ペプチドとエクスビボで接触させる方法は、以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階；および
ｂ：段階ａのＡＰＣを該ペプチドと接触させる段階。
ＡＰＣは特定の種類の細胞に限定されず、リンパ球によって認識されるように自身の細胞表面上にタンパク質性抗原を提示することが知られているＤＣ、ランゲルハンス細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、および活性化Ｔ細胞を含む。ＡＰＣの中で最も強力なＣＴＬ誘導能であることから、好ましくはＤＣを用いることができる。本発明の任意のペプチドを単独で、または本発明の他のペプチドと組み合わせて、段階ｂのペプチドとして用いることができる。
【０１０６】
あるいは、本発明のペプチドを対象に投与して、該ペプチドをインビボでＡＰＣと接触させることができる。その結果、高いＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを該対象の体内で誘導することができる。したがって、本発明はまた、インビボでＡＰＣを誘導するために本発明のペプチドを対象に投与する方法も企図する。本発明のペプチドがインビボで発現してＡＰＣと接触し、結果的に、高いＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣが誘導されるように、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な形態で対象に投与することも可能である。したがって、本発明はまた、インビボでＡＰＣを誘導するために本発明のポリヌクレオチドを対象に投与する方法も企図する。「発現可能な形態」という語句は、上記の「ＩＸ．薬学的な物質（２）ポリヌクレオチドを有効成分として含む薬学的な物質」の章に定義されている。
【０１０７】
さらに、本発明は、ＣＴＬ誘導能を有するＡＰＣを誘導するために、本発明のポリヌクレオチドをＡＰＣに導入することを含む。例えば、本方法は以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階；および
ｂ：本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを導入する段階。
段階ｂは、「ＶＩ．抗原提示細胞」の章に上述したように行うことができる。
【０１０８】
あるいは本発明は、以下の段階のうちの１つを含み得る、ＭＥＬＫに対するＣＴＬ活性を特異的に誘導する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を調製するための方法を提供する：
ａ：ＡＰＣを、本発明のペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階；および
ｂ：本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
【０１０９】
（２）ＣＴＬを誘導する方法
本発明はまた、本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、またはエキソソーム、またはＡＰＣを用いてＣＴＬを誘導する方法を提供する。
【０１１０】
本発明はまた、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットを形成し得るポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いて、ＣＴＬを誘導する方法を提供する。好ましくは、ＣＴＬを誘導するための方法は、以下の中より選択される少なくとも１つの段階を含む：
ａ：ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する抗原提示細胞および／またはエキソソームと、ＣＤ８陽性Ｔ細胞を接触させる段階；ならびに
ｂ：本発明のペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識するＴＣＲサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをＣＤ８陽性細胞に導入する段階。
本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣ、またはエキソソームを対象に投与すると、該対象の体内でＣＴＬが誘導され、がん細胞を標的とする免疫応答の強度が増強される。したがって本発明はまた、ＣＴＬを誘導するために本発明のペプチド、ポリヌクレオチド、ＡＰＣ、またはエキソソームを対象に投与する段階を含む方法も企図する。
【０１１１】
あるいは、それらをエクスビボで用いることによってＣＴＬを誘導することもできる。そのような場合、ＣＴＬの誘導後に活性化ＣＴＬを対象に戻すことができる。例えば、ＣＴＬを誘導するための本発明の方法は以下の段階を含み得る：
ａ：対象からＡＰＣを回収する段階；
ｂ：段階（ａ）のＡＰＣをペプチドと接触させる段階；および
ｃ：段階（ｂ）のＡＰＣをＣＤ８陽性細胞と共培養する段階。
上記の段階（ｃ）においてＣＤ８陽性細胞と共培養するＡＰＣは、「ＶＩ．抗原提示細胞」の章に上述したように、本発明のポリヌクレオチドを含む遺伝子をＡＰＣに導入することによって調製することもできるが、本発明はこれに限定されず、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に効果的に提示するＡＰＣが、本方法に関して使用できる。
【０１１２】
そのようなＡＰＣの代わりに、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエキソソームを用いることもできる。すなわち、本発明はまた、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエキソソームを、ＣＤ８陽性細胞と共培養する方法も企図する。そのようなエキソソームは、「Ｖ．エキソソーム」の章に上述した方法によって調製することができる。
さらに、本発明のペプチドに結合するＴＣＲサブユニットをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子をＣＤ８陽性細胞に導入することによって、ＣＴＬを誘導することができる。そのような形質導入は、「ＶＩＩＩ．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）」の章に上述したように行うことができる。
加えて、本発明は、ＣＴＬを誘導する薬学的な物質または組成物を製造するための方法または過程であって、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体とともに混合または製剤化する段階を含む方法を提供する。
【０１１３】
（３）免疫応答を誘導する方法
さらに本発明は、ＭＥＬＫに関連する疾患に対して免疫応答を誘導するための方法を提供する。適切な疾患には子宮内膜症およびがんが含まれ、その例には、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
本方法は、本発明のペプチドのいずれかまたはそれらをコードするポリヌクレオチドのいずれかを含む物質または組成物を投与する段階を含む。本発明の方法はまた、本発明のペプチドのいずれかを提示するエキソソームまたはＡＰＣの投与も企図する。詳細については、「ＩＸ．薬学的な物質または組成物」の項、特に本発明の薬学的な物質および組成物のワクチンとしての使用について記載している部分を参照されたい。加えて、免疫応答を誘導するために本発明の方法に使用することができるエキソソームおよびＡＰＣは、上記「Ｖ．エキソソーム」、「ＶＩ．抗原提示細胞（ＡＰＣ）」、ならびに「Ｘ．ペプチド、エキソソーム、ＡＰＣ、およびＣＴＬを用いる方法」の（１）および（２）の項において詳述している。
【０１１４】
本発明はまた、免疫応答を誘導する薬学的な物質または組成物を製造するための方法または工程であって、本発明のペプチドを薬学的に許容される担体とともに混合または製剤化する段階を含む方法を提供する。
本方法は、以下を含む本発明のワクチンを投与する段階を含む：
ａ：１種または複数種の本発明のエピトープペプチドまたはその免疫学的に活性な断片；
ｂ：（ａ）のエピトープペプチドまたはその免疫学的に活性な断片をコードする１種または複数種のポリペプチド；
ｃ：１種または複数種の本発明の単離されたＣＴＬ；または
ｄ：１種または複数種の本発明の単離された抗原提示細胞。
【０１１５】
本発明との関連において、ＭＥＬＫを過剰発現する疾患をこれらの有効成分で治療することができる。この疾患の例には、子宮内膜症、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。したがって、有効成分を含むワクチンまたは薬学的組成物を投与する前に、治療すべきがんまたは子宮内膜症の細胞または組織中のＭＥＬＫの発現レベルが同じ器官の正常細胞と比較して増強されているかどうかを確認することが好ましい。したがって１つの態様において、本発明は、ＭＥＬＫを（過剰）発現するがんまたは子宮内膜症を治療するための方法を提供し、該方法は以下の段階を含み得る：
ｉ）治療すべきがんを有する対象から得られたがんもしくは子宮内膜症の細胞または組織中のＭＥＬＫの発現レベルを決定する段階；
ｉｉ）ＭＥＬＫの発現レベルを正常対照と比較する段階；および
ｉｉｉ）上記の（ａ）〜（ｄ）からなる群より選択される少なくとも１つの成分を、正常対照と比較してＭＥＬＫを過剰発現するがんまたは子宮内膜症を有する対象に投与する段階。
あるいは本発明はまた、ＭＥＬＫを過剰発現するがんまたは子宮内膜症を有する対象への投与に使用するための、上記の（ａ）〜（ｄ）からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含むワクチンまたは薬学的組成物を提供する。換言すれば、本発明はさらに、本発明のＭＥＬＫポリペプチドで治療すべき対象を同定するための方法であって、対象由来のがんまたは子宮内膜症の細胞または組織中のＭＥＬＫの発現レベルを決定する段階を含み得、該レベルが、該遺伝子の正常対照レベルと比較して上昇していることにより、該対象が本発明のＭＥＬＫポリペプチドで治療され得るがんまたは子宮内膜症を有していることが示される方法を提供する。本発明のがんまたは子宮内膜症を治療する方法を、以下、より詳細に説明する。
本発明の方法によって治療すべき対象は、好ましくは哺乳動物である。例示的な哺乳動物には、例えばヒト、非ヒト霊長類、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ウマ、およびウシが含まれるが、これらに限定されない。
【０１１６】
本発明によれば、対象から得られたがんもしくは子宮内膜症の細胞または組織中のＭＥＬＫの発現レベルを決定する。発現レベルは、当技術分野で公知の方法を用いて、転写産物レベルで決定することができる。例えば、ＭＥＬＫのｍＲＮＡを、ハイブリダイゼーション法（例えば、ノーザンハイブリダイゼーション）によってプローブを用いて定量することができる。検出は、チップまたはアレイにおいて行うことができる。アレイの使用は、ＭＥＬＫの発現レベルを検出するのに好ましい。当業者は、ＭＥＬＫの配列情報を利用して、そのようなプローブを調製することができる。例えば、ＭＥＬＫのｃＤＮＡをプローブとして用いることができる。必要に応じて、プローブを、色素、蛍光物質、および同位体などの適切な標識で標識してもよく、該遺伝子の発現レベルを、ハイブリダイズした標識の強度として検出してもよい。
さらに、増幅に基づく検出法（例えば、ＲＴ−ＰＣＲ）によりプライマーを用いて、ＭＥＬＫ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４６）の転写産物を定量してもよい。そのようなプライマーはまた、該遺伝子の入手可能な配列情報に基づいて調製してもよい。
【０１１７】
具体的には、本発明の方法に用いられるプローブまたはプライマーは、ストリンジェントな条件下、中程度にストリンジェントな条件下、または低ストリンジェントな条件下で、ＭＥＬＫのｍＲＮＡとハイブリダイズする。本明細書で使用する「ストリンジェントな（ハイブリダイゼーション）条件」という語句は、プローブまたはプライマーがその標的配列とはハイブリダイズするが、その他の配列とはハイブリダイズしない条件を指す。ストリンジェントな条件は配列に依存し、異なる状況下では異なる。より長い配列の特異的ハイブリダイゼーションは、短い配列よりも高い温度で観察される。一般に、ストリンジェントな条件の温度は、所定のイオン強度およびｐＨにおける特定の配列の融解温度（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択する。Ｔｍとは、平衡状態で、標的配列に相補的なプローブの５０％が標的配列とハイブリダイズする（所定のイオン強度、ｐＨ、および核酸濃度における）温度である。標的配列は一般に過剰に存在するため、Ｔｍでは、平衡状態でプローブの５０％が占有される。典型的には、ストリンジェントな条件とは、ｐＨ７．０〜８．３において塩濃度がナトリウムイオン約１．０Ｍ未満、典型的にはナトリウムイオン（または他の塩）約０．０１〜１．０Ｍであり、かつ温度が、短いプローブまたはプライマー（例えば、１０〜５０ヌクレオチド）に関しては少なくとも約３０℃、およびより長いプローブまたはプライマーに関しては少なくとも約６０℃である条件である。ストリンジェントな条件はまた、ホルムアミドなどの不安定化物質の添加によって達成してもよい。
プローブまたはプライマーは特定のサイズのものであってよい。サイズは少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１２ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも３０ヌクレオチドの範囲であってよく、プローブおよびプライマーのサイズは５〜１０ヌクレオチド、１０〜１５ヌクレオチド、１５〜２０ヌクレオチド、２０〜２５ヌクレオチド、および２５〜３０ヌクレオチドの範囲にわたってよい。
【０１１８】
あるいは、本発明の診断のために翻訳産物を検出することができる。例えば、ＭＥＬＫタンパク質（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７）の量を決定することができる。翻訳産物としてタンパク質の量を決定する方法には、タンパク質を特異的に認識する抗体を用いる免疫測定法が含まれる。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであってよい。さらに、断片または改変抗体がＭＥＬＫタンパク質への結合能を保持する限り、抗体の任意の断片または改変物（例えば、キメラ抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ等）を検出に用いることができる。タンパク質を検出するためのこのような種類の抗体を調製する方法は、当技術分野において周知であり、本発明において任意の方法を使用して、そのような抗体およびそれらの等価物を調製することができる。
ＭＥＬＫ遺伝子の発現レベルをその翻訳産物に基づいて検出する別の方法として、ＭＥＬＫタンパク質に対する抗体を用いる免疫組織化学的解析により、染色の強度を測定してもよい。すなわちこの測定では、強力な染色により、該タンパク質の存在／レベルの増加が示され、それと同時にＭＥＬＫ遺伝子の高発現レベルが示される。
がんまたは子宮内膜症の細胞における、例えばＭＥＬＫ遺伝子を含む標的遺伝子の発現レベルは、そのレベルが、標的遺伝子の対照レベル（例えば、正常細胞中のレベル）から例えば１０％、２５％、もしくは５０％上昇するか；または１．１倍超、１．５倍超、２．０倍超、５．０倍超、１０．０倍超、もしくはそれ以上まで上昇する場合に、上昇していると判定され得る。
【０１１９】
対照レベルは、疾患状態（罹患している、または罹患していない）が判明している対象から予め採取し保存しておいた試料を用いることにより、がんまたは子宮内膜症の細胞と同時に決定することができる。加えて、治療すべきがんまたは子宮内膜症を有する器官の罹患していない領域から得られた正常細胞を、正常対照として用いてもよい。あるいは、対照レベルは、疾患状態が判明している対象に由来する試料中のＭＥＬＫ遺伝子の予め決定された発現レベルを解析することによって得られた結果に基づいて、統計的方法により決定してもよい。さらに、対照レベルは、以前に試験された細胞に由来する発現パターンのデータベースに由来し得る。さらに、本発明の一局面によれば、生物学的試料中のＭＥＬＫ遺伝子の発現レベルを、複数の参照試料から決定された複数の対照レベルと比較することもできる。対象由来の生物学的試料の組織型と類似の組織型に由来する参照試料から決定された対照レベルを用いることが好ましい。さらに、疾患状態が判明している集団におけるＭＥＬＫ遺伝子の発現レベルの基準値を用いることが好ましい。基準値は、当技術分野において公知の任意の方法によって得ることができる。例えば、平均値  ＋／−２Ｓ．Ｄ．または平均値  ＋／−３Ｓ．Ｄ．の範囲を、基準値として用いることができる。
【０１２０】
本発明との関連において、罹患していないと判明している生物学的試料から決定された対照レベルは、「正常対照レベル」と称される。一方、対照レベルが罹患している生物学的試料から決定される場合には、これは「罹患対照レベル」と称される。
ＭＥＬＫ遺伝子の発現レベルが正常対照レベルと比較して上昇しているか、または罹患対照レベルと類似している／同等である場合、該対象は治療すべき疾患を有すると診断され得る。
【０１２１】
より具体的には、本発明は、（ｉ）対象が治療すべきがんもしくは子宮内膜症を有するかどうかを診断する方法、および／または（ｉｉ）がんもしくは子宮内膜症治療のための対象を選択する方法を提供し、該方法は以下の段階を含む：
ａ：治療すべきがんまたは子宮内膜症を有する疑いのある対象から得られたがん細胞または組織中のＭＥＬＫの発現レベルを決定する段階；
ｂ：ＭＥＬＫの発現レベルを正常対照レベルと比較する段階；
ｃ：ＭＥＬＫの発現レベルが正常対照レベルと比較して上昇している場合に、該対象を治療すべきがんまたは子宮内膜症を有すると診断する段階；および
ｄ：段階（ｃ）において対象が治療すべきがんまたは子宮内膜症を有すると診断される場合に、がんまたは子宮内膜症治療のために該対象を選択する段階。
【０１２２】
あるいは、そのような方法は以下の段階を含む：
ａ：治療すべきがんを有する疑いのある対象から得られたがんもしくは子宮内膜症の細胞または組織中のＭＥＬＫの発現レベルを決定する段階；
ｂ：ＭＥＬＫの発現レベルを罹患対照レベルと比較する段階；
ｃ：ＭＥＬＫの発現レベルが罹患対照レベルと類似しているか、または同等である場合に、該対象を治療すべきがんもしくは子宮内膜症を有すると診断する段階；および
ｄ：段階（ｃ）において対象が治療すべきがんもしくは子宮内膜症を有すると診断される場合に、がんもしくは子宮内膜症の治療のために該対象を選択する段階。
【０１２３】
本発明はまた、本発明のＭＥＬＫポリペプチドで治療され得る子宮内膜症またはがんに罹患している対象を判定するためのキットを提供し、該キットはまた、がん免疫療法の有効性を評価する、および／またはモニターするのにも有用であり得る。好ましくは、がんには、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。より詳細には、キットは、対象由来のがんまたは子宮内膜症の細胞中のＭＥＬＫ遺伝子の発現を検出するための少なくとも１つの試薬を含むことが好ましく、試薬は以下の群より選択されてもよい：
（ａ）ＭＥＬＫ遺伝子のｍＲＮＡを検出するための試薬；
（ｂ）ＭＥＬＫタンパク質を検出するための試薬；および
（ｃ）ＭＥＬＫタンパク質の生物学的活性を検出するための試薬。
【０１２４】
ＭＥＬＫ遺伝子のｍＲＮＡを検出するのに適した試薬の例には、ＭＥＬＫ  ｍＲＮＡの一部に対する相補的配列を有するオリゴヌクレオチドなどの、ＭＥＬＫ  ｍＲＮＡに特異的に結合するか、またはＭＥＬＫ  ｍＲＮＡを同定する核酸が含まれる。このような種類のオリゴヌクレオチドは、ＭＥＬＫ  ｍＲＮＡに特異的なプライマーおよびプローブによって例証される。このような種類のオリゴヌクレオチドは、当技術分野において周知の方法に基づいて調製することができる。必要に応じて、ＭＥＬＫ  ｍＲＮＡを検出するための試薬を固体基質上に固定化することができる。さらに、ＭＥＬＫ  ｍＲＮＡを検出するための２つ以上の試薬をキット中に含めることもできる。
【０１２５】
一方、ＭＥＬＫタンパク質を検出するのに適した試薬には、ＭＥＬＫタンパク質に対する抗体が含まれる。抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであってよい。さらに、断片または改変抗体がＭＥＬＫタンパク質への結合能を保持する限り、抗体の任意の断片または改変物（例えば、キメラ抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ等）を試薬として用いることもできる。タンパク質を検出するためのこのような種類の抗体を調製する方法は、当技術分野において周知であり、本発明において任意の方法を使用して、そのような抗体およびそれらの等価物を調製することができる。さらに、直接連結技法または間接標識技法により、抗体をシグナル発生分子で標識することができる。標識、および抗体を標識し、標的に対する抗体の結合を検出する方法は当技術分野において周知であり、任意の標識および方法を本発明に使用することができる。さらに、ＭＥＬＫタンパク質を検出するための２つ以上の試薬をキット中に含めることもできる。
【０１２６】
キットは、前述の試薬のうちの２つ以上を含み得る。例えば、がんもしくは子宮内膜症を有さない対象、またはがんもしくは子宮内膜症に罹患している対象から得られた組織試料は、有用な対照試薬として役立ち得る。本発明のキットは、緩衝液、希釈剤、フィルター、注射針、シリンジ、および使用説明書を備えた包装封入物（例えば、文書、テープ、ＣＤ−ＲＯＭ等）を含む、商業上の観点および使用者の観点から望ましいその他の材料をさらに含み得る。これらの試薬等は、ラベルを貼った容器中に保持され得る。適切な容器には、ボトル、バイアル、および試験管が含まれる。該容器は、ガラスまたはプラスチックなどの種々の材料から形成され得る。
【０１２７】
本発明の一態様において、試薬がＭＥＬＫ  ｍＲＮＡに対するプローブである場合には、該試薬を多孔性ストリップなどの固体基質上に固定化して、少なくとも１つの検出部位を形成させることができる。多孔性ストリップの測定または検出領域は、それぞれが核酸（プローブ）を含む複数の部位を含み得る。検査ストリップはまた、陰性および／または陽性対照用の部位を含み得る。あるいは、対照部位は、検査ストリップとは別のストリップ上に位置し得る。任意で、異なる検出部位は異なる量の固定化核酸を含み得る、すなわち、第１検出部位ではより多い量の固定化核酸を、および以降の部位ではより少ない量の固定化核酸を含み得る。試験試料を添加すると、検出可能なシグナルを呈する部位の数により、試料中に存在するＭＥＬＫ  ｍＲＮＡの量の定量的な指標が提供される。検出部位は、適切に検出可能な任意の形状で構成することができ、典型的には、検査ストリップの幅全体にわたるバーまたはドットの形状である。
【０１２８】
本発明のキットは、陽性対照試料またはＭＥＬＫ標準試料をさらに含み得る。本発明の陽性対照試料は、ＭＥＬＫ陽性試料を回収し、次にそれらのＭＥＬＫレベルをアッセイすることによって調製することができる。あるいは、精製ＭＥＬＫタンパク質またはポリヌクレオチドを、ＭＥＬＫを発現しない細胞に添加して、陽性試料またはＭＥＬＫ標準試料を形成してもよい。本発明において、精製ＭＥＬＫは組換えタンパク質であってよい。陽性対照試料のＭＥＬＫレベルは、例えばカットオフ値よりも高い。
一態様において、本発明はさらに、本発明の抗体またはその断片を特異的に認識することができるタンパク質またはその部分タンパク質を含む診断キットを提供する。
【０１２９】
本発明のタンパク質の部分ペプチドの例には、本発明のタンパク質のアミノ酸配列中の少なくとも８個、好ましくは１５個、およびより好ましくは２０個の連続したアミノ酸から構成されるポリペプチドが含まれる。本発明のタンパク質またはペプチド（ポリペプチド）を用いて試料（例えば、血液、組織）中の抗体を検出することにより、がんまたは子宮内膜症を診断することができる。本発明のタンパク質およびペプチドを調製するための方法は、上記の通りである。
抗ＭＥＬＫ抗体の量と、上記のような対応する対照試料中の抗ＭＥＬＫ抗体の量との差を測定することにより、本発明のがんまたは子宮内膜症を診断する方法を実施することができる。対象の細胞または組織が該遺伝子の発現産物（ＭＥＬＫ）に対する抗体を含み、この抗ＭＥＬＫ抗体の量が正常対照中の抗ＭＥＬＫ抗体の量と比較してカットオフ値のレベルよりも高いと判定される場合に、該対象ががんまたは子宮内膜症に罹患していることが疑われる。
【０１３０】
別の態様において、本発明の診断キットは、本発明のペプチドおよびそれに結合しているＨＬＡ分子を含み得る。抗原性ペプチドおよびＨＬＡ分子を使用して抗原特異的ＣＴＬを検出するための方法は、既に確立されている（例えば、Altman JD et al., Science. 1996, 274(5284): 94-6）。したがって、腫瘍抗原特異的ＣＴＬを検出するための検出法に、本発明のペプチドとＨＬＡ分子との複合体を適用することができ、それによってがんの再発および／または転移のより早期の発見が可能になる。さらに、本発明のペプチドを有効成分として含む医薬を適用できる対象を選択するために、または医薬の治療効果を評価するために、これを使用することができる。
詳細には、公知の方法に従って（例えば、Altman JD et al., Science. 1996, 274(5284): 94-6を参照されたい）、放射標識ＨＬＡ分子と本発明のペプチドとのオリゴマー複合体、例えば四量体などを調製することができる。この複合体を用いて、例えば、がんに罹患している疑いのある対象に由来する末梢血リンパ球中の抗原ペプチド特異的ＣＴＬを定量することにより、診断を行うことができる。
【０１３１】
本発明はさらに、本明細書に記載されるペプチドエピトープを用いて、対象の免疫学的応答を評価するための方法または診断用の剤を提供する。本発明の一態様において、本明細書に記載するようなＨＬＡ拘束性ペプチドを、対象の免疫応答を評価または予測するための試薬として用いることができる。評価される免疫応答は、免疫原を免疫担当細胞とインビトロまたはインビボで接触させることにより誘導され得る。好ましい態様において、免疫学的応答を評価するための免疫担当細胞は、末梢血、末梢血リンパ球（ＰＢＬ）、および末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）から選択し得る。そのような免疫担当細胞を回収または単離するための方法は当技術分野において周知である。いくつかの態様においては、ペプチドエピトープを認識して結合する抗原特異的ＣＴＬの産生をもたらし得る任意の物質または組成物を、試薬として用いてもよい。ペプチド試薬を免疫原として使用しなくてもよい。そのような解析に用いられるアッセイ系には、四量体、細胞内リンホカイン染色、およびインターフェロン放出アッセイ、またはＥＬＩＳＰＯＴアッセイなどの比較的最近の技術開発が含まれる。好ましい態様において、ペプチド試薬と接触させる免疫担当細胞は、樹状細胞を含む抗原提示細胞であってよい。
【０１３２】
例えば、本発明のペプチドを、腫瘍細胞抗原または免疫原への曝露後の抗原特異的ＣＴＬの存在について末梢血単核細胞を評価するための四量体染色アッセイにおいて使用してもよい。ＨＬＡ四量体複合体を使用して、抗原特異的ＣＴＬを直接可視化し（例えば、Ogg et al., Science 279: 2103-2106, 1998；およびAltman et al, Science 174: 94-96, 1996を参照されたい）、末梢血単核細胞の試料中の抗原特異的ＣＴＬ集団の頻度を測定することができる。本発明のペプチドを使用する四量体試薬は、以下に記載するように作製することができる。
【０１３３】
ＨＬＡ分子に結合するペプチドは、対応するＨＬＡ重鎖およびβ２−ミクログロブリンの存在下で再び折り畳まれて、３分子複合体を生成する。この複合体において、該重鎖のカルボキシ末端の前もってタンパク質中に作製した部位をビオチン化する。次にストレプトアビジンを該複合体に添加して、３分子複合体およびストレプトアビジンから構成される四量体を形成する。蛍光標識ストレプトアビジンの手法によって、この四量体を使用して、抗原特異的細胞を染色することができる。次いで、この細胞を例えばフローサイトメトリーによって同定することができる。そのような解析を、診断または予後診断目的に使用することができる。この手順によって同定された細胞を治療目的に使用することもできる。
【０１３４】
本発明はまた、本発明のペプチドを含む、免疫リコール応答（例えば、Bertoni et al, J. Clin. Invest. 100: 503-513, 1997、およびPenna et al., J Exp. Med. 174: 1565-1570, 1991を参照されたい）を評価するための試薬を提供する。例えば、治療すべきがんを有する個体からの患者ＰＢＭＣ試料を、特異的ペプチドを用いて抗原特異的ＣＴＬの有無について解析することができる。ＰＢＭＣを培養し、該細胞を本発明のペプチドで刺激することによって、単核細胞を含む血液試料を評価することができる。適切な培養期間後、増殖した細胞集団を例えばＣＴＬ活性について解析することができる。
【０１３５】
本発明のペプチドは、ワクチンの有効性を評価するための試薬として用いることもできる。免疫原をワクチン接種した患者から得られたＰＢＭＣを、例えば上記の方法のいずれかを用いて解析することができる。患者のＨＬＡ型を決定し、該患者に存在する対立遺伝子特異的分子を認識するペプチドエピトープ試薬を解析のために選択する。ワクチンの免疫原性は、ＰＢＭＣ試料中のエピトープ特異的ＣＴＬの存在によって示され得る。本発明のペプチドは、当技術分野で周知の技法を用いて抗体を作製するために使用することもでき（例えば、CURRENT PROTOCOLS IN IMMUNOLOGY, Wiley/Greene, NY；およびAntibodies A Laboratory Manual, Harlow and Lane, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989を参照されたい）、この抗体は、がんもしくは子宮内膜症を診断、検出、またはモニターするための試薬として使用され得る。そのような抗体は、ＨＬＡ分子との関連でペプチドを認識する抗体、すなわちペプチド−ＭＨＣ複合体に結合する抗体を含み得る。
【０１３６】
本発明のペプチドおよび組成物はさらなる用途をいくつか有し、そのうちの一部を本明細書に記載する。例えば、本発明は、ＭＥＬＫ免疫原性ポリペプチドの発現を特徴とする疾患を診断または検出する方法を提供する。これらの方法は、生物学的試料中でのＭＥＬＫ  ＨＬＡ結合ペプチド、またはＭＥＬＫ  ＨＬＡ結合ペプチドとＨＬＡクラスＩ分子との複合体の発現を決定する段階を含む。ペプチドまたはペプチドとＨＬＡクラスＩ分子との複合体の発現は、該ペプチドまたは該複合体の結合パートナーを用いてアッセイすることによって、測定または検出することができる。好ましい態様において、ペプチドまたは複合体の結合パートナーは、該ペプチドを認識してこれに特異的に結合する抗体であってよい。腫瘍または子宮内膜症の生検材料などの生物学的試料中のＭＥＬＫの発現は、ＭＥＬＫプライマーを用いる標準的なＰＣＲ増幅プロトコールによって試験することもできる。腫瘍発現の一例は本明細書に提示されており、ＭＥＬＫ増幅のための例示的な条件およびプライマーのさらなる開示は、ＷＯ２００３／２７３２２に見出すことができる。
【０１３７】
好ましくは診断方法は、対象から単離された生物学的試料をＭＥＬＫ  ＨＬＡ結合ペプチドに特異的な試薬と接触させて、該生物学的試料中のＭＥＬＫ  ＨＬＡ結合ペプチドの存在を検出する段階を含む。本明細書で使用する「接触させる」とは、剤と生物学的試料中に存在するＭＥＬＫ  ＨＬＡ結合ペプチドとの間の特異的相互作用が可能となるように、生物学的試料を、例えば濃度、温度、時間、イオン強度の適切な条件下で、剤に十分に近接させて配置することを意味する。一般に、剤と生物学的試料を接触させるための条件は、分子と生物学的試料中のその同族物（ｃｏｇｎａｔｅ）（例えば、タンパク質とその受容体同族物（ｃｏｇｎａｔｅ）、抗体とそのタンパク質抗原同族物（ｃｏｇｎａｔｅ）、核酸とその相補的配列同族物（ｃｏｇｎａｔｅ））との間の特異的相互作用を促進するための、当業者に公知の条件である。分子とその同族物（ｃｏｇｎａｔｅ）との間の特異的相互作用を促進するための例示的な条件は、Ｌｏｗらに対して発行された米国特許第５，１０８，９２１号に記載されている。
【０１３８】
本発明の診断方法は、インビボおよびインビトロのいずれかまたは両方で行うことができる。したがって、生物学的試料は、本発明においてインビボまたはインビトロに位置し得る。例えば、生物学的試料はインビボの組織であってよく、かつＭＥＬＫ免疫原性ポリペプチドに特異的な剤を用いて、組織中のそのような分子の存在を検出することができる。あるいは、生物学的試料をインビトロで採取または単離することができる（例えば、血液試料、腫瘍生検材料、組織抽出物）。特に好ましい態様において、生物学的試料は細胞を含む試料であってよく、より好ましくは、診断または治療する対象から採取された腫瘍もしくは子宮内膜症の細胞を含む試料であってよい。
【０１３９】
あるいは、フルオレセイン標識ＨＬＡ多量体複合体で染色することによって、抗原特異的Ｔ細胞の直接的な定量を可能にする方法により、診断を行うこともできる（例えば、Altman, J. D. et al., 1996, Science 274: 94；Altman, J. D. et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 10330）。細胞内リンホカイン染色、およびインターフェロン−γ放出アッセイ、またはＥＬＩＳＰＯＴアッセイもまた提供されている。多量体染色、細胞内リンホカイン染色、およびＥＬＩＳＰＯＴアッセイはすべて、より慣例的なアッセイより少なくとも１０倍感度が高いようである（Murali-Krishna, K. et al., 1998, Immunity 8: 177；Lalvani, A. et al., 1997, J. Exp. Med. 186: 859；Dunbar, P. R. et al., 1998, Curr. Biol. 8: 413）。五量体（例えば、ＵＳ２００４−２０９２９５Ａ）、デキストラマー（ｄｅｘｔｒａｍｅｒ）（例えば、ＷＯ０２／０７２６３１）、およびストレプタマー（ｓｔｒｅｐｔａｍｅｒ）（例えば、Nature medicine 6. 631-637 (2002)）を使用することもできる。
例えば、いくつかの態様において、本発明は、本発明のＭＥＬＫペプチドの少なくとも１つを投与された対象の免疫学的応答を診断または評価するための方法を提供し、該方法は以下の段階を含む：
ａ：免疫原を、該免疫原に対して特異的なＣＴＬの誘導に適した条件下で免疫担当細胞と接触させる段階；
ｂ：段階（ａ）で誘導されたＣＴＬの誘導レベルを検出または決定する段階；および
ｃ：対象の免疫学的応答をＣＴＬ誘導レベルと相関させる段階。
【０１４０】
本発明において、免疫原は、（ａ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６、３５〜４５のアミノ酸配列の中より選択されるＭＥＬＫペプチド、そのようなアミノ酸配列を有するペプチド、およびそのようなアミノ酸配列が１個、２個、またはそれ以上のアミノ酸置換によって改変されたペプチドのうち少なくとも１つである。一方、免疫原特異的ＣＴＬの誘導に適した条件は当技術分野において周知である。例えば、免疫担当細胞を、免疫原特異的ＣＴＬを誘導するために免疫原の存在下でインビトロで培養してもよい。免疫原特異的ＣＴＬを誘導する目的で、任意の刺激因子を細胞培養物に添加してもよい。例えば、ＩＬ−２は、ＣＴＬ誘導のための好ましい刺激因子である。
【０１４１】
いくつかの態様において、ペプチドがん療法によって治療される対象の免疫学的応答をモニターまたは評価する段階は、治療前、治療中、および／または治療後に行うことができる。一般に、がん療法プロトコール中、免疫原性ペプチドは、治療される対象に繰り返し投与される。例えば、免疫原性ペプチドを３〜１０週間にわたって毎週投与してもよい。したがって、対象の免疫学的応答は、がん療法プロトコール中に評価またはモニターされ得る。あるいは、がん療法に対する免疫学的応答を評価またはモニターする段階が、療法プロトコールの完了時であってもよい。
本発明によれば、免疫原特異的ＣＴＬの誘導が対照と比較して増強されていることにより、評価または診断される対象が、投与された免疫原に対して免疫学的に応答したことが示される。免疫学的応答を評価するのに適した対照には、例えば、免疫担当細胞をペプチドと接触させていない場合の、またはいかなるＭＥＬＫペプチドとも異なるアミノ酸配列（例えば、ランダムなアミノ酸配列）を有する対照ペプチドと接触させている場合の、ＣＴＬ誘導レベルが含まれる。
【０１４２】
１つの好ましい態様においては、対象に投与された各免疫原間で免疫学的応答を比較することにより、対象の免疫学的応答を配列特異的な様式で評価する。特に、いくつかの種類のＭＥＬＫペプチドについての混合物を対象に投与する場合であっても、免疫学的応答はペプチドに依存して異なる可能性がある。その場合には、各ペプチド間で免疫学的応答を比較することにより、対象がより強い応答を示すペプチドを同定することができる。
【０１４３】
ＸＩ．抗体
本発明はさらに、本発明のペプチドに結合する抗体を提供する。好ましい抗体は本発明のペプチドに特異的に結合し、本発明のペプチドではないものには結合しない（または弱く結合する）。あるいは、抗体は本発明のペプチドおよびその相同体に結合する。本発明のペプチドに対する抗体は、がんまたは子宮内膜症の診断および予後診断のアッセイ、ならびに画像化方法論において使用され得る。同様に、そのような抗体は、ＭＥＬＫががんもしくは子宮内膜症患者において同じく発現または過剰発現する限り、他のがんもしくは子宮内膜症の治療、診断、および／または予後診断において使用され得る。さらに、細胞内で発現する抗体（例えば、一本鎖抗体）は、ＭＥＬＫの発現が関与する子宮内膜症またはがんの治療において治療的に使用することができ、そのようながんの例には、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
【０１４４】
本発明はまた、ＭＥＬＫタンパク質（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４７）、またはその断片であるＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５、４１、４４の中より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドを検出および／または定量するための様々な免疫学的アッセイを提供する。そのようなアッセイは、必要に応じて、ＭＥＬＫタンパク質またはその断片を認識してそれと結合し得る１種または複数種の抗ＭＥＬＫ抗体を含み得る。本発明との関連において、ＭＥＬＫポリペプチドに結合する抗ＭＥＬＫ抗体は、好ましくは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５、４１、４４の中より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドを認識する。抗体の結合特異性は、阻害試験で確認することができる。すなわち、解析される抗体と全長ＭＥＬＫポリペプチドとの間の結合が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５、４１、４４の中より選択されるアミノ酸配列を有する任意の断片ポリペプチドの存在下で阻害される場合、この抗体が該断片に特異的に結合することが示される。本発明との関連において、そのような免疫学的アッセイは、様々な種類の放射免疫測定法、免疫クロマトグラフ技法、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、酵素結合免疫蛍光測定法（ＥＬＩＦＡ）等を含むがこれらに限定されない、当技術分野で周知の様々な免疫学的アッセイ形式の範囲内で行われる。
【０１４５】
本発明の免疫学的であるが非抗体性の関連アッセイには、Ｔ細胞免疫原性アッセイ（阻害性または刺激性）およびＭＨＣ結合アッセイもまた含まれ得る。加えて、ＭＥＬＫを発現するがんまたは子宮内膜症を検出し得る免疫学的画像化法も、本発明によって提供され、これには、本発明の標識抗体を使用する放射性シンチグラフィー画像化法が含まれるが、これに限定されない。そのようなアッセイは、ＭＥＬＫを発現する子宮内膜症またはがんの検出、モニタリング、および予後診断において臨床的に使用することができ、がんの例には、乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣが含まれるが、これらに限定されない。
【０１４６】
本発明はまた、本発明のペプチドに結合する抗体を提供する。本発明の抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体などの任意の形態で用いることができ、これには、ウサギなどの動物を本発明のペプチドで免疫することにより得られる抗血清、すべてのクラスのポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体、ヒト抗体、ならびに遺伝子組換えにより作製されたヒト化抗体が含まれる。
抗体を得るための抗原として用いられる本発明のペプチドは、任意の動物種に由来し得るが、好ましくはヒト、マウス、またはラットなどの哺乳動物、より好ましくはヒトに由来する。ヒト由来のペプチドは、本明細書に開示するヌクレオチド配列またはアミノ酸配列から得ることができる。
本発明によれば、免疫抗原として用いられるペプチドは、完全なタンパク質または該タンパク質の部分ペプチドであってよい。部分ペプチドは、例えば、本発明のペプチドのアミノ（Ｎ）末端断片またはカルボキシ（Ｃ）末端断片を含み得る。
【０１４７】
本明細書では、抗体を、ＭＥＬＫペプチドの全長または断片のいずれかと反応するタンパク質と定義する。好ましい態様において、本発明の抗体は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５、４１、４４の中より選択されるアミノ酸配列を有するＭＥＬＫの断片ペプチドを認識し得る。オリゴペプチドを合成する方法は、当技術分野において周知である。合成後、免疫原として使用する前にペプチドを任意に精製してもよい。本発明において、免疫原性を高めるために、オリゴペプチド（例えば、９ｍｅｒまたは１０ｍｅｒ）を担体と結合または連結させてもよい。担体として、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）が周知である。ＫＬＨとペプチドを結合する方法もまた、当技術分野において周知である。
あるいは、本発明のペプチドまたはその断片をコードする遺伝子を公知の発現ベクターに挿入することができ、次にこれを用いて本明細書に記載のように宿主細胞を形質転換する。所望のペプチドまたはその断片を、任意の標準的な方法により宿主細胞の外部または内部から回収することができ、後にこれを抗原として用いることができる。あるいは、ペプチドを発現する細胞全体もしくはそれらの溶解物、または化学合成したペプチドを抗原として用いてもよい。
【０１４８】
任意の哺乳動物を抗原で免疫することができるが、細胞融合に用いられる親細胞との適合性を考慮に入れることが好ましい。一般に、齧歯目（Ｒｏｄｅｎｔｉａ）科、ウサギ目（Ｌａｇｏｍｏｒｐｈａ）科、または霊長目（Ｐｒｉｍａｔｅ）科の動物を使用することができる。齧歯目科の動物には、例えばマウス、ラット、およびハムスターが含まれる。ウサギ目科の動物には、例えばウサギが含まれる。霊長目科の動物には、例えばカニクイザル（Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）、アカゲザル、マントヒヒ、およびチンパンジーなどの狭鼻下目（Ｃａｔａｒｒｈｉｎｉ）（旧世界ザル）のサルが含まれる。
【０１４９】
動物を抗原で免疫する方法は、当技術分野で公知である。抗原の腹腔内注射または皮下注射は、哺乳動物を免疫するための標準的な方法である。より具体的には、抗原を適量のリン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）、生理食塩水等で希釈し、懸濁させる。必要に応じて、抗原懸濁液を、フロイント完全アジュバントなどの適量の標準的アジュバントと混合し、乳化した後、哺乳動物に投与することができる。その後、適量のフロイント不完全アジュバントと混合した抗原を、４〜２１日ごとに数回投与することが好ましい。免疫化には、適切な担体を用いてもよい。上記のように免疫した後、血清を、所望の抗体の量の増加に関して標準的方法で調べることができる。
【０１５０】
本発明のペプチドに対するポリクローナル抗体は、血清中の所望の抗体の増加に関して調べた免疫後の哺乳動物から血液を回収し、任意の従来法により血液から血清を分離することによって、調製することができる。ポリクローナル抗体はポリクローナル抗体を含む血清を含んでよく、またポリクローナル抗体を含む画分を該血清から単離してもよい。免疫グロブリンＧまたはＭは、本発明のペプチドのみを認識する画分から、例えば、本発明のペプチドを結合させたアフィニティーカラムを用いた上で、この画分をプロテインＡまたはプロテインＧカラムを用いてさらに精製して、調製することができる。
モノクローナル抗体を調製するには、抗原で免疫した哺乳動物から免疫細胞を回収し、上記のように血清中の所望の抗体のレベル上昇について確かめた上で、細胞融合に供する。細胞融合に用いる免疫細胞は、好ましくは脾臓から得ることができる。上記の免疫細胞と融合させる別の好ましい親細胞には、例えば、哺乳動物の骨髄腫細胞、およびより好ましくは薬物による融合細胞の選択のための特性を獲得した骨髄腫細胞が含まれる。
【０１５１】
公知の方法、例えば、Milstein et al.（Galfre and Milstein, Methods Enzymol 73: 3-46 (1981)）の方法に従って、上記の免疫細胞と骨髄腫細胞とを融合させることができる。
細胞融合によって結果として得られたハイブリドーマは、それらをＨＡＴ培地（ヒポキサンチン、アミノプテリン、およびチミジンを含む培地）などの標準的な選択培地中で培養することによって選択することができる。細胞培養は典型的に、ＨＡＴ培地中で、所望のハイブリドーマを除く他のすべての細胞（非融合細胞）が死滅するのに十分な期間である数日間から数週間にわたって継続する。その後、標準的な限界希釈を行い、所望の抗体を産生するハイブリドーマ細胞をスクリーニングおよびクローニングすることができる。
【０１５２】
ハイブリドーマを調製するために非ヒト動物を抗原で免疫する上記の方法に加えて、ＥＢウイルスに感染したリンパ球などのヒトリンパ球を、ペプチド、ペプチドを発現している細胞、またはそれらの溶解物でインビトロにおいて免疫することもできる。次いで、免疫後のリンパ球を、Ｕ２６６などの無限に分裂可能なヒト由来骨髄腫細胞と融合させて、該ペプチドに結合し得る所望のヒト抗体を産生するハイブリドーマを得ることができる（特開昭６３−１７６８８号）。
【０１５３】
続いて、得られたハイブリドーマをマウスの腹腔内に移植し、腹水を抽出する。得られたモノクローナル抗体は、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、プロテインＡもしくはプロテインＧカラム、ＤＥＡＥイオン交換クロマトグラフィー、または本発明のペプチドを結合させたアフィニティーカラムにより精製することができる。本発明の抗体は、本発明のペプチドの精製および検出のためだけでなく、本発明のペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストの候補としても使用することができる。
【０１５４】
あるいは、免疫したリンパ球などの、抗体を産生する免疫細胞をがん遺伝子によって不死化し、モノクローナル抗体の調製に用いることもできる。
このようにして得られるモノクローナル抗体は、遺伝子操作技法を用いて組換えにより調製することもできる（例えば、MacMillan Publishers LTD (1990)により英国で刊行された、Borrebaeck and Larrick, Therapeutic Monoclonal Antibodiesを参照されたい）。例えば、抗体をコードするＤＮＡを、抗体を産生するハイブリドーマまたは免疫化リンパ球などの免疫細胞からクローニングし、適切なベクターに挿入した上で、宿主細胞に導入して、組換え抗体を調製することができる。本発明はまた、上記のようにして調製された組換え抗体を提供する。
【０１５５】
さらに、本発明の抗体は、本発明のペプチドの１種または複数種に結合する限り、抗体の断片または修飾抗体であってもよい。例えば、抗体断片は、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ、またはＨ鎖およびＬ鎖由来のＦｖ断片が適切なリンカーによって連結されている一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）であってよい（Huston et al., Proc Natl Acad Sci USA 85: 5879-83 (1988)）。より具体的には、抗体断片は、抗体をパパインまたはペプシンなどの酵素で処理することにより作製することができる。あるいは、抗体断片をコードする遺伝子を構築し、発現ベクターに挿入し、適切な宿主細胞内で発現させることができる（例えば、Co et al., J Immunol 152: 2968-76 (1994)；Better and Horwitz, Methods Enzymol 178: 476-96 (1989)；Pluckthun and Skerra, Methods Enzymol 178: 497-515 (1989)；Lamoyi, Methods Enzymol 121: 652-63 (1986)；Rousseaux et al., Methods Enzymol 121: 663-9 (1986)；Bird and Walker, Trends Biotechnol 9: 132-7 (1991)を参照されたい）。
抗体は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの様々な分子との結合によって修飾することができる。本発明は、そのような修飾抗体を提供する。修飾抗体は、抗体を化学的に修飾することによって得ることができる。これらの修飾法は、当技術分野で慣例的である。
【０１５６】
あるいは、本発明の抗体は、非ヒト抗体に由来する可変領域とヒト抗体に由来する定常領域との間のキメラ抗体として、または非ヒト抗体に由来する相補性決定領域（ＣＤＲ）と、ヒト抗体に由来するフレームワーク領域（ＦＲ）および定常領域とを含むヒト化抗体として得ることもできる。そのような抗体は、公知の技術に従って調製することができる。ヒト化は、齧歯類のＣＤＲまたはＣＤＲ配列でヒト抗体の対応する配列を置換することによって行うことができる（例えば、Verhoeyen et al., Science 239:1534-1536 (1988)を参照されたい）。したがって、そのようなヒト化抗体は、実質的に完全には満たないヒト可変ドメインが、非ヒト種由来の対応する配列によって置換されたキメラ抗体である。
【０１５７】
ヒトのフレームワーク領域および定常領域に加えて、ヒト可変領域をも含む完全なヒト抗体を用いることもできる。そのような抗体は、当技術分野で公知の様々な技法を用いて作製することができる。例えば、インビトロの方法には、バクテリオファージ上に提示されたヒト抗体断片の組換えライブラリーの使用が含まれる（例えば、Hoogenboom & Winter, J. Mol. Biol. 227: 381 (1991)）。同様に、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を、内因性免疫グロブリン遺伝子が部分的または完全に不活性化されたトランスジェニック動物、例えばマウスに導入することによって、ヒト抗体を作製することもできる。このアプローチは、例えば米国特許第６，１５０，５８４号、第５，５４５，８０７号；第５，５４５，８０６号；第５，５６９，８２５号；第５，６２５，１２６号；第５，６３３，４２５号；第５，６６１，０１６号に記載されている。
【０１５８】
上記のようにして得られた抗体は、均質になるまで精製してもよい。例えば、一般的なタンパク質に対して用いられる分離法および精製法に従って、抗体の分離および精製を行うことができる。例えば、これらに限定されないが、アフィニティークロマトグラフィーなどのカラムクロマトグラフィー、フィルター、限外濾過、塩析、透析、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動、および等電点電気泳動の使用を適切に選択しかつ組み合わせることにより、抗体を分離および単離することができる（Antibodies: A Laboratory Manual. Ed Harlow and David Lane, Cold Spring Harbor Laboratory (1988)）。プロテインＡカラムおよびプロテインＧカラムをアフィニティーカラムとして使用することができる。用いられるべき例示的なプロテインＡカラムには、例えば、Ｈｙｐｅｒ  Ｄ、ＰＯＲＯＳ、およびＳｅｐｈａｒｏｓｅ  Ｆ．Ｆ．（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）が含まれる。
【０１５９】
例示的なクロマトグラフィーには、アフィニティークロマトグラフィー以外に、例えば、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、ゲル濾過、逆相クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィー等が含まれる（Strategies for Protein Purification and Characterization: A Laboratory Course Manual. Ed Daniel R. Marshak et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1996)）。クロマトグラフィー手順は、ＨＰＬＣおよびＦＰＬＣなどの液相クロマトグラフィーによって行うことができる。
例えば、吸光度の測定、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、放射免疫測定法（ＲＩＡ）、および／または免疫蛍光法を用いて、本発明の抗体の抗原結合活性を測定することができる。ＥＬＩＳＡの場合、本発明の抗体をプレート上に固定化し、本発明のペプチドを該プレートに添加し、次に抗体産生細胞の培養上清または精製抗体といった所望の抗体を含む試料を添加する。次いで、一次抗体を認識し、アルカリホスファターゼなどの酵素で標識された二次抗体を添加し、プレートをインキュベートする。続いて洗浄後に、ｐ−ニトロフェニルリン酸などの酵素基質を該プレートに添加し、吸光度を測定して、試料の抗原結合活性を評価する。抗体の結合活性を評価するために、Ｃ末端またはＮ末端断片などのペプチド断片を抗原として用いてもよい。本発明の抗体の活性を評価するために、ＢＩＡｃｏｒｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）を用いてもよい。
【０１６０】
本発明の抗体を本発明のペプチドを含むと考えられる試料に対して曝露し、該抗体と該ペプチドとによって形成される免疫複合体を検出または測定することにより、上記の方法によって本発明のペプチドの検出または測定が可能になる。
本発明によるペプチドを検出または測定する方法はペプチドを特異的に検出または測定することができるため、この方法は、該ペプチドを使用する種々の実験において使用され得る。
【０１６１】
ＸＩＩ．ベクターおよび宿主細胞
本発明はまた、本発明のペプチドをコードするヌクレオチドが導入されたベクターおよび宿主細胞を提供する。本発明のベクターは、宿主細胞中に本発明のヌクレオチド、特にＤＮＡを保持するため、本発明のペプチドを発現させるため、または遺伝子治療用に本発明のヌクレオチドを投与するために使用することができる。
【０１６２】
大腸菌が宿主細胞であり、ベクターを大腸菌（例えば、ＪＭ１０９、ＤＨ５α、ＨＢ１０１、またはＸＬ１Ｂｌｕｅ）内で増幅して大量に生成する場合、ベクターは、大腸菌内で増幅するための「複製起点」と、形質転換された大腸菌を選択するためのマーカー遺伝子（例えば、アンピシリン、テトラサイクリン、カナマイシン、クロラムフェニコール等の薬物によって選択される薬物耐性遺伝子）とを有する必要がある。例えば、Ｍ１３系ベクター、ｐＵＣ系ベクター、ｐＢＲ３２２、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ、ｐＣＲ−Ｓｃｒｉｐｔ等を用いることができる。加えて、ｐＧＥＭ−Ｔ、ｐＤＩＲＥＣＴ、およびｐＴ７もまた上記のベクターと同様に、ｃＤＮＡのサブクローニングおよび抽出に用いることができる。ベクターを本発明のタンパク質の産生に用いる場合には、発現ベクターが使用され得る。
【０１６３】
例えば、大腸菌内で発現させる発現ベクターは、大腸菌内で増幅するために上記の特徴を有する必要がある。ＪＭ１０９、ＤＨ５α、ＨＢ１０１、またはＸＬ１  Ｂｌｕｅなどの大腸菌を宿主細胞として用いる場合、ベクターは、大腸菌内で所望の遺伝子を効率的に発現し得るプロモーター、例えば、ｌａｃＺプロモーター（Ward et al., Nature 341: 544-6 (1989)；FASEB J 6: 2422-7 (1989)）、ａｒａＢプロモーター（Better et al., Science 240: 1041-3 (1988)）、Ｔ７プロモーター等を有する必要がある。この点に関して、例えば、ｐＧＥＸ−５Ｘ−１（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）、「ＱＩＡｅｘｐｒｅｓｓシステム」（Ｑｉａｇｅｎ）、ｐＥＧＦＰ、およびｐＥＴ（この場合、宿主は好ましくはＴ７  ＲＮＡポリメラーゼを発現するＢＬ２１である）を上記のベクターの代わりに用いることができる。さらにベクターは、ペプチド分泌のためのシグナル配列を含んでもよい。ペプチドを大腸菌のペリプラズムに分泌させる例示的なシグナル配列は、ｐｅｌＢシグナル配列（Lei et al., J Bacteriol 169: 4379 (1987)）である。ベクターを標的宿主細胞に導入する手段には、例えば塩化カルシウム法およびエレクトロポレーション法が含まれる。
【０１６４】
大腸菌に加えて、例えば、哺乳動物由来の発現ベクター（例えば、ｐｃＤＮＡ３（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、およびｐＥＧＦ−ＢＯＳ（Nucleic Acids Res 18(17): 5322 (1990)）、ｐＥＦ、ｐＣＤＭ８）、昆虫細胞由来の発現ベクター（例えば、「Ｂａｃ−ｔｏ−ＢＡＣバキュロウイルス発現系」（ＧＩＢＣＯ  ＢＲＬ）、ｐＢａｃＰＡＫ８）、植物由来の発現ベクター（例えば、ｐＭＨ１、ｐＭＨ２）、動物ウイルス由来の発現ベクター（例えば、ｐＨＳＶ、ｐＭＶ、ｐＡｄｅｘＬｃｗ）、レトロウイルス由来の発現ベクター（例えば、ｐＺＩｐｎｅｏ）、酵母由来の発現ベクター（例えば、「ピキア（Ｐｉｃｈｉａ）発現キット」（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ｐＮＶ１１、ＳＰ−Ｑ０１）、および枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）由来の発現ベクター（例えば、ｐＰＬ６０８、ｐＫＴＨ５０）を、本発明のポリペプチドの産生に使用することができる。
【０１６５】
ベクターをＣＨＯ、ＣＯＳ、またはＮＩＨ３Ｔ３細胞などの動物細胞内で発現させるためには、ベクターはこのような細胞における発現に必要なプロモーター、例えば、ＳＶ４０プロモーター（Mulligan et al., Nature 277: 108 (1979)）、ＭＭＬＶ−ＬＴＲプロモーター、ＥＦ１αプロモーター（Mizushima et al., Nucleic Acids Res 18: 5322 (1990)）、ＣＭＶプロモーター等、および好ましくは形質転換体を選択するためのマーカー遺伝子（例えば、薬物（例えば、ネオマイシン、Ｇ４１８）によって選択される薬物耐性遺伝子）を有する必要がある。これらの特徴を有する公知のベクターの例には、例えばｐＭＡＭ、ｐＤＲ２、ｐＢＫ−ＲＳＶ、ｐＢＫ−ＣＭＶ、ｐＯＰＲＳＶ、およびｐＯＰ１３が含まれる。
【０１６６】
以下の実施例は、本発明を説明するため、ならびに本発明の作製および使用において当業者を支援するために提示される。本実施例は、本発明の範囲を別に限定することを決して意図するものではない。
【実施例】
【０１６７】
材料および方法
細胞株
ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）−Ａ＊２４０２陽性Ｂリンパ芽球様細胞株であるＴＩＳＩは、ＩＨＷＧ  Ｃｅｌｌ  ａｎｄ  Ｇｅｎｅ  Ｂａｎｋ（Ｓｅａｔｔｌｅ，  ＷＡ）から購入した。ＣＯＳ７、ＭＤＡ−ＭＢ−４３５Ｓ、およびＴ４７Ｄは、ＡＴＣＣから購入した。ＫＬＭ−１およびＫＰ−１Ｎはそれぞれ、ＲＩＫＥＮ細胞バンクおよびＪＣＲＢ細胞バンクから購入した。
【０１６８】
ＭＥＬＫ由来ペプチドの候補選択
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子と結合するＭＥＬＫ由来の９ｍｅｒおよび１０ｍｅｒペプチドを、結合予測ソフトウエア「ＢＩＭＡＳ」（ｗｗｗ−ｂｉｍａｓ．ｃｉｔ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｍｏｌｂｉｏ／ｈｌａ＿ｂｉｎｄ）を用いて予測した。このアルゴリズムは、Parker KC et al.（J Immunol 1994, 152(1): 163-75）、およびKuzushima K et al.（Blood 2001, 98(6): 1872-81）によって記載されている。ＨＬＡ−Ａ＊２４０２拘束性のＨＩＶペプチド（ＲＹＬＲＱＱＬＬＧＩ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８））を、対照として使用した。これらのペプチドは、Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  Ｉｎｃ．（Ｌｅｗｉｓｖｉｌｌｅ，  ＴＸ）により、標準的な固相合成法によって合成し、逆相高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）によって精製した。該ペプチドの純度（＞９０％）および同一性を、それぞれ分析用ＨＰＬＣおよび質量分析によって決定した。ペプチドをジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）に２０ｍｇ／ｍｌで溶解し、−８０℃で保存した。
【０１６９】
インビトロでのＣＴＬ誘導
単球由来の樹状細胞（ＤＣ）を抗原提示細胞（ＡＰＣ）として用いて、ＨＬＡ上に提示されたペプチドに対する細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答を誘導した。他所に記載されているように、ＤＣをインビトロで作製した（Nakahara S et al., Cancer Res 2003 Jul 15, 63(14): 4112-8）。具体的には、Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐｌａｑｕｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）溶液によって、ドナーＡ、Ｂ、およびＣと命名された３名の健常ドナー（ＨＬＡ−Ａ＊２４０２陽性）から単離した末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を、プラスチック製の組織培養ディッシュ（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）へ付着させることによって分離し、それらを単球画分として濃縮した。２％の加熱非動化した自己血清（ＡＳ）を含むＡＩＭ−Ｖ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中、１０００Ｕ／ｍｌの顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）および１０００Ｕ／ｍｌのインターロイキン（ＩＬ）−４（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）の存在下で、単球が濃縮された集団を培養した。７日間の培養後、サイトカインで誘導したＤＣに、ＡＩＭ−Ｖ培地中で３７℃で３時間、３μｇ／ｍｌのβ２−ミクログロブリンの存在下で２０μｇ／ｍｌの各合成ペプチドをパルスした。作製された細胞は、自身の細胞表面上に、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６、およびＨＬＡクラスＩＩなどのＤＣ関連分子を発現しているようであった（データは示さず）。次いで、ペプチドパルスしたこれらのＤＣをＸ線照射（２０Ｇｙ）により不活化し、ＣＤ８  Ｐｏｓｉｔｉｖｅ  Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ｄｙｎａｌ）を用いた陽性選択によって得られた自己ＣＤ８＋Ｔ細胞と１：２０の比率で混合した。これらの培養物を４８ウェルプレート（Ｃｏｒｎｉｎｇ）中に準備し、各ウェルは、０．５ｍｌのＡＩＭ−Ｖ／２％ＡＳ培地中に、１．５×１０４個のペプチドパルスしたＤＣ、３×１０５個のＣＤ８＋Ｔ細胞、および１０ｎｇ／ｍｌのＩＬ−７（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ）を含んだ。３日後、これらの培養物に、ＩＬ−２（ＣＨＩＲＯＮ）を最終濃度２０ＩＵ／ｍｌまで添加した。７日目および１４日目に、ペプチドパルスした自己ＤＣでＴ細胞をさらに刺激した。
ＤＣは上記と同じ方法によって毎回調製した。２１日目に、３回目のペプチド刺激後、ペプチドパルスしたＡ２４ ＬＣＬ細胞に対してＣＴＬを試験した（Tanaka H et al., Br J Cancer 2001 Jan 5, 84(1): 94-9；Umano Y et al., Br J Cancer 2001 Apr 20, 84(8): 1052-7；Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86；Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9；Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506）。
【０１７０】
ＣＴＬ増殖手順
Ｒｉｄｄｅｌｌら（Walter EA et al., N Engl J Med 1995 Oct 19, 333(16): 1038-44；Riddell SR et al., Nat Med 1996 Feb, 2(2): 216-23）によって記載されている方法と類似の方法を用いて、ＣＴＬを培養下で増殖させた。４０ｎｇ／ｍｌの抗ＣＤ３モノクローナル抗体（Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）の存在下で、ＭＭＣによって不活化した２種類のヒトＢリンパ芽球様細胞株と共に、合計５×１０４個のＣＴＬを２５ｍｌのＡＩＭ−Ｖ／５％ＡＳ培地中に懸濁した。培養開始１日後に、１２０ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２を該培養物に添加した。５、８、および１１日目に、３０ＩＵ／ｍｌのＩＬ−２を含む新たなＡＩＭ−Ｖ／５％ＡＳ培地を、該培養物に供給した（Tanaka H et al., Br J Cancer 2001 Jan 5, 84(1): 94-9；Umano Y et al., Br J Cancer 2001 Apr 20, 84(8): 1052-7；Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86；Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9；Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506）。
【０１７１】
ＣＴＬクローンの樹立
９６丸底マイクロタイタープレート（Ｎａｌｇｅ  Ｎｕｎｃ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ）においてＣＴＬ０．３個、１個、および３個／ウェルとなるように、希釈を行った。ＣＴＬを、１×１０４個細胞／ウェルの２種類のヒトＢリンパ芽球様細胞株、３０ｎｇ／ｍｌの抗ＣＤ３抗体、および１２５Ｕ／ｍｌのＩＬ−２と共に、合計１５０μｌ／ウェルの５％ＡＳ含有ＡＩＭ−Ｖ培地中で培養した。１０日後、５０μｌ／ウェルのＩＬ−２を、ＩＬ−２の最終濃度が１２５Ｕ／ｍｌに到達するように該培地に添加した。１４日目にＣＴＬ活性を試験し、上記と同じ方法を用いてＣＴＬクローンを増殖させた（Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86；Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9；Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506）。
【０１７２】
特異的ＣＴＬ活性
特異的ＣＴＬ活性を調べるために、インターフェロン（ＩＦＮ）−γ酵素結合免疫スポット（ＥＬＩＳＰＯＴ）アッセイおよびＩＦＮ−γ酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を行った。具体的には、ペプチドパルスしたＡ２４ ＬＣＬ（１×１０４個／ウェル）および腫瘍細胞株（５×１０４個／ウェル）を刺激細胞として調製した。４８ウェル中の培養細胞、すなわちＣＴＬ株およびクローンを、応答細胞として使用した。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイおよびＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイは、製造業者の手順に従って行った。
【０１７３】
プラスミドトランスフェクション
標的遺伝子、またはＨＬＡ−Ａ＊２４０２のオープンリーディングフレームをコードするｃＤＮＡをＰＣＲによって増幅した。ＰＣＲ増幅産物をｐＣＡＧＧＳベクターにクローニングした。製造業者の推奨する手順に従ってリポフェクタミン２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、標的遺伝子およびＨＬＡ−Ａ２４陰性細胞株であるＣＯＳ７に該プラスミドをトランスフェクトした。トランスフェクションから２日後、トランスフェクトした細胞をベルセン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて回収し、ＣＴＬ活性アッセイのための刺激細胞（５×１０４個細胞／ウェル）として使用した。
【０１７４】
阻害アッセイ
ＨＬＡ−クラスＩ拘束性のＣＴＬ活性を確認するため、刺激細胞を、１０μｇ／ｍｌの抗ＨＬＡクラスＩモノクローナル抗体Ｗ６／３２（ＢｉｏＬｅｇｅｎｄ）または標準マウスＩｇＧ（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）と共に４℃で３０分間インキュベートした。処理細胞を刺激物質として用いて、ＣＴＬ活性を調べた。
【０１７５】
結果
ＭＥＬＫ由来のＨＬＡ−Ａ２４結合ペプチドの予測
表１Ａおよび１Ｂは、ＭＥＬＫに由来する９ｍｅｒおよび１０ｍｅｒのＨＬＡ−Ａ２４結合ペプチドを、結合親和性の高い順に示す。潜在的なＨＬＡ−Ａ２４結合能を有する合計３４種類のペプチドを選択し、エピトープペプチドを決定するために調べた。
【０１７６】
（表１Ａ）ＭＥＬＫに由来するＨＬＡ−Ａ２４結合９ｍｅｒペプチド
0005884104.tif 000002
【０１７７】
（表１Ｂ）ＭＥＬＫに由来するＨＬＡ−Ａ２４結合１０ｍｅｒペプチド
0005884104.tif 000003
開始位置は、ＭＥＬＫのＮ末端からのアミノ酸残基の数を示す。
結合スコアは「ＢＩＭＡＳ」から導き出している。
【０１７８】
ＨＬＡ−Ａ＊２４０２拘束性のＭＥＬＫ由来の予測ペプチドを用いたＣＴＬの誘導
ＭＥＬＫ由来のペプチドに対するドナーＡのＰＢＭＣ由来のＣＴＬを、「材料および方法」に記載したプロトコールに従って作製した。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって、ペプチド特異的なＣＴＬ活性を測定した（図１）。以下のウェル番号は、対照ウェルと比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した：ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したウェル番号＃２  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）で刺激した＃１および＃３  （ｂ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）で刺激した＃８  （ｄ）、ならびにＭＥＬＫ−Ａ２４−９−７８  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２１）で刺激した＃４  （ｅ）は、対照ウェルと比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。一方、表１に示した他のペプチドはＨＬＡ−Ａ＊２４０２との結合活性を有すると考えられたにもかかわらず、該ペプチドによる刺激によって強力なＩＦＮγ産生は検出され得なかった。例えば、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−９６  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２）で刺激したＣＴＬ応答の典型的な陰性データを図１に示した（ｃ）。結果として、これにより、ＭＥＬＫ由来の４種のペプチドが、強力なＣＴＬを誘導し得るペプチドとしてスクリーニングされたことが示された。
【０１７９】
ＭＥＬＫ特異的ペプチドに対するＣＴＬ株およびＣＴＬクローンの樹立
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したウェル番号＃２、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）で刺激した＃３中の、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって検出されるペプチド特異的ＣＴＬ活性を示した細胞を増殖させ、ＣＴＬ株を樹立した。それらのＣＴＬ株のＣＴＬ活性を、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した（図２）。すべてのＣＴＬ株が、ペプチドをパルスしなかった標的細胞と比較して、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）  （ｂ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）  （ｃ）をパルスした標的細胞に対して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。さらに、「材料および方法」に記載したように、ＣＴＬ株を希釈し培養して、ＣＴＬクローンを樹立した。同族ペプチドをパルスした標的細胞に対するＣＴＬクローンからのＩＦＮ−γ産生を、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した。図３において、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）で刺激したＣＴＬクローンから、強力なＩＦＮ−γ産生が測定された。
【０１８０】
ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）に対して産生された樹立ＣＴＬクローンを、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞を認識するそれらの能力について調べた。ＭＥＬＫの全長およびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を両方ともトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞（ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞の特異的モデル）に対する特異的ＣＴＬ活性を、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したＣＴＬクローンを用いて試験した。ＭＥＬＫの全長またはＨＬＡ−Ａ＊２４０２のいずれかをトランスフェクトしたＣＯＳ７細胞を対照として調製した。図４において、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したＣＴＬクローンは、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−  Ａ＊２４０２を両方とも発現するＣＯＳ７細胞に対して強力なＣＴＬ活性を示した。一方、対照に対して有意な特異的ＣＴＬ活性は検出されなかった。したがって、これらのデータにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）のペプチドが内因的にプロセシングされ、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子と共に標的細胞上に提示され、ＣＴＬによって認識されることが明確に実証された。
【０１８１】
ＨＬＡ−Ａ２４結合ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７改変ペプチドの予測
続いて、本発明者らは、野生型ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ）  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）よりも効率的にＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７特異的ＣＴＬを誘導する潜在的能力を有する、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）からアミノ酸残基を１つ置換する改変ペプチドを調べた。表２は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）の配列が改変された候補ペプチドを、結合親和性の高い順に示す。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）と比較してより高い結合能を有すると予測された合計１１種類のペプチドを選択し、免疫原性を調べた。
【０１８２】
（表２）ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７由来の改変ペプチド
0005884104.tif 000004
結合スコアは「ＢＩＭＡＳ」から導き出している。
【０１８３】
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７由来の改変ペプチドを用いたＣＴＬの誘導
表２中の改変ペプチドに対して反応性のあるＣＴＬを、「材料および方法」に記載したプロトコールに従って作製した。ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって、ペプチド特異的なＣＴＬ活性を測定した。図５Ａは、ドナーＢのＰＢＭＣから誘導されたＣＴＬにおけるＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイの結果を示す。以下のウェル番号は、対照ウェルと比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示した：ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）で刺激したウェル番号＃１、＃３、および＃１２  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）で刺激した＃２  （ｂ）、ならびにＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激した＃１０および＃１２  （ｃ）。一方、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）  （ｄ）で刺激したＰＢＭＣからは、特異的ＩＦＮ−γ産生は検出されなかった。
【０１８４】
別のドナーＣのＰＢＭＣもまた、表２中の改変ペプチドで刺激した。図５Ｂから、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したウェル番号＃１４が、対照と比較して強力なＩＦＮ−γ産生を示したことが示される（ａ）。一方、ドナーＢのＰＢＭＣと同様に、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したＣＴＬ（ｂ）からは、特異的ＩＦＮ−γ産生は検出されなかった。
これらの結果から、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）が、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）と比較して優れた免疫原性を有することが示された。
【０１８５】
ＭＥＬＫ改変ペプチドを用いた刺激によるＣＴＬ株およびＣＴＬクローンの樹立
ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって検出されるペプチド特異的ＣＴＬ活性を示した、ドナーＢ由来の、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）で刺激したウェル番号＃１、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）で刺激した＃２、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激した＃１２の細胞、ならびにドナーＣ由来の、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激した＃１４の細胞、を増殖させて、ＣＴＬ株を樹立した。微量なＩＦＮ−γ産生を示した、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激したウェル番号＃４中の細胞もまた増殖させた。
【０１８６】
それらのＣＴＬ株のＣＴＬ活性を、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した。図６において、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）  （ａ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）  （ｂ）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）  （ｃ）で刺激したドナーＢ由来のＣＴＬ株は、無関係のＨＩＶペプチドをパルスした標的細胞と比較して、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対して強力なＩＦＮ−γ産生を示した。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したドナーＣ由来のＣＴＬ株もまた、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）ペプチド特異的ＩＦＮ−γ産生を示したが（ｄ）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）で刺激して増殖させた細胞は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対してＩＦＮ−γ産生を示さなかった（ｅ）。
【０１８７】
続いて、「材料および方法」に記載したように、限界希釈によってＣＴＬクローンを樹立し、それらＣＴＬクローンのＣＴＬ活性をＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したドナーＢに由来するＣＴＬクローン（図７ａ〜ｃ）、ならびにＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したドナーＣに由来するＣＴＬクローン（図７ｄ）から、無関係のＨＩＶペプチドをパルスした標的細胞と比較して、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）をパルスした標的細胞に対して強力なＩＦＮ−γ産生が検出された。
これら２名のドナーのＣＴＬ誘導の結果をまとめると、これにより、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）が、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿ＷＴ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）と比較して、強力なＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７反応性ＣＴＬを誘導するための優れた免疫原性を有することが実証された。
【０１８８】
ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞に対する特異的ＣＴＬ活性
樹立されたＣＴＬ株およびＣＴＬクローンを、ＭＥＬＫおよびＨＬＡ−Ａ＊２４０２を発現する標的細胞を認識するそれらの能力について調べた。図８ａにおいて、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したＣＴＬ株は、Ｔ４７Ｄ（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４−）およびＫＰ−１Ｎ（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４−）に対してはＣＴＬ活性を示すことなく、腫瘍細胞株ＭＤＡ−ＭＢ−４３５Ｓ（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４＋）およびＫＬＭ−１（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４＋）に対して強力なＣＴＬ活性を示した。このＣＴＬ活性がＨＬＡ−クラスＩ拘束性様式で生じたことを確認するため、ＣＴＬの抗原特異的応答を阻止するために抗ＨＬＡ−クラスＩモノクローナル抗体を用いて、阻害アッセイを行った。図８ｂにおいて、ＫＬＭ−１（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４＋）に対するＣＴＬのＩＦＮ−γ産生は、標準マウスＩｇＧと比較して、抗ＨＬＡ−クラスＩモノクローナル抗体によって完全に阻害された。これらの結果から、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）を用いて誘導されたＣＴＬが、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２分子と共に標的細胞上に天然に提示されたＭＥＬＫエピトープペプチドをＨＬＡ−クラスＩ拘束性様式で認識し得ることが明らかに実証された。典型的な陰性データとして、図９は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）をパルスした標的細胞（ａ）、ならびに腫瘍細胞株ＫＬＭ−１（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４＋）およびＫＰ−１Ｎ（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４−）（ｂ）に対するＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）特異的ＣＴＬクローンのＩＦＮ−γ産生を示す。ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）特異的ＣＴＬクローンは、該ペプチドをパルスした標的細胞を認識する能力を有したが、これは腫瘍細胞株ＫＬＭ−１（ＭＥＬＫ＋、Ａ２４＋）に対してＩＦＮ−γ産生を示さなかった。これらの結果から、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−１９９  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１）は、ＭＥＬＫを発現する腫瘍細胞上に天然に提示されないことが示唆された。
【０１８９】
抗原ペプチドの相同性解析
ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）で刺激したＣＴＬは、有意でかつ特異的なＣＴＬ活性を示した。この結果は、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）の配列が、ヒト免疫系を感作することが知られている他の分子に由来するペプチドと相同的であるという事実に起因する可能性がある。この可能性を排除するため、ＢＬＡＳＴアルゴリズム（ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｂｌａｓｔ／ｂｌａｓｔ．ｃｇｉ）を用いて、これらのペプチド配列をクエリーとして相同性解析を行ったが、有意な相同性を有する配列は認められなかった。相同性解析の結果から、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−１０−６３７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２３）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿１Ｋ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５）、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿３Ｍ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４１）、およびＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）の配列は固有のものであり、したがって、本発明者らの知る限りでは、これらの分子が、ある非関連分子に対して予期しない免疫応答を引き起こす可能性はほとんどないことが示される。
結論として、ＭＥＬＫ由来のＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）の改変配列を有する新規エピトープペプチドが同定された。本明細書に示される結果から、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）からの改変ペプチドであるＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７＿７Ｎ  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４４）が、ＭＥＬＫ−Ａ２４−９−８７  （ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６）と比較して、ＭＥＬＫ発現標的細胞を認識し、強力なＣＴＬ活性を示すＣＴＬを効率的に誘導することが実証された。
【０１９０】
産業上の利用可能性：
本発明は、強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導し、がんを含む幅広い疾患に対する適用性を有する新規ＴＡＡ、特に改変ＭＥＬＫペプチド由来の新規ＴＡＡについて記載する。このようなＴＡＡは、ＭＥＬＫ過剰発現に関連した疾患、例えば子宮内膜症またはがん、より詳細には乳がん、膀胱がん、子宮頸がん、胆管細胞がん、ＣＭＬ、結腸直腸がん、食道がん、胃がん、肝がん、ＮＳＣＬＣ、リンパ腫、骨肉腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、腎がん、およびＳＣＬＣに対するペプチドワクチンとして有用である。
【０１９１】
本明細書において、本発明をその特定の態様に関して詳細に説明しているが、前述の説明は本質的に例示的かつ説明的なものであって、本発明およびその好ましい態様を説明することを意図していることが理解されるべきである。慣例的な実験を通して、当業者は、本発明の精神および範囲から逸脱することなく、様々な変更および改変がその中でなされ得ることを容易に認識するであろう。これらの境域および境界は、添付の特許請求の範囲によって規定される。
【図１】
0005884104.tif 000005
【図２】
0005884104.tif 000006
【図３】
0005884104.tif 000007
【図４】
0005884104.tif 000008
【図５Ａ】
0005884104.tif 000009
【図５Ｂ】
0005884104.tif 000010
【図６】
0005884104.tif 000011
【図７】
0005884104.tif 000012
【図８】
0005884104.tif 000013
【図９】
0005884104.tif 000014
【配列表】
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