(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下：
（ａ）配列番号１、７、１３、１９，２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列； 
（ｂ）配列番号１、７、１３、１９，２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列において、１から数個のアミノ酸が欠失、置換、または付加されたアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列；あるいは
（ｃ）配列番号１、７、１３、１９，２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列と９０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列、
のいずれかのアミノ酸配列において、配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基が、芳香族アミノ酸以外から選ばれるアミノ酸に置換されているアミノ酸配列を含む、変異型エンドグルカナーゼ。
【請求項２】
配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換されている、請求項１に記載の変異型エンドグルカナーゼ。
【請求項３】
配列番号２、８、１４、２０、２６、３２または３８で示されるアミノ酸配列を含む、請求項１または２に記載の変異型エンドグルカナーゼ。
【請求項４】
請求項１〜３のいずれか１項に記載の変異型エンドグルカナーゼをコードするＤＮＡ。
【請求項５】
配列番号４、１０、１６、２２、２８、３４または４０で示される塩基配列を含む、請求項４に記載のＤＮＡ。
【請求項６】
請求項４または５に記載のＤＮＡを含む、発現ベクター。
【請求項７】
請求項６に記載の発現ベクターを用いた形質転換により作製された、形質転換細胞。
【請求項８】
（１）請求項７に記載の形質転換細胞を培養する工程；および
（２）該形質転換細胞により生産された変異型エンドグルカナーゼを精製する工程を含む、変異型エンドグルカナーゼの製造方法。
【請求項９】
請求項１〜３のいずれか１項に記載の変異型エンドグルカナーゼおよび／または請求項７に記載の形質転換細胞の処理物を含む、バイオマス分解用組成物。
【請求項１０】
セルロース含有バイオマス懸濁液に、請求項９に記載のバイオマス分解用組成物を添加して加水分解することを含む、セルロース由来バイオマスより糖液を製造する方法。
【請求項１１】
さらに、糸状菌由来セルラーゼを添加することを含む、請求項１０に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、新規な変異型エンドグルカナーゼに関する。
【背景技術】
【０００２】
近年、化石資源枯渇や地球温暖化といった問題を受け、再生可能且つカーボンニュートラルな資源であるセルロースからエタノールや化成品原料を製造することが強く望まれている。【０００３】
セルロースは、草本系植物、木本系植物中に多く含まれ、これら植物を総称してセルロース系バイオマスと呼ぶ。セルロース系バイオマスの細胞壁は主に、セルロース、ヘミセルロース、リグニンから構成されている。セルロースはグルコース分子がβ-１，４結合した直鎖状多糖、ヘミセルロースはキシログルカン、キシラン、マンナンなどの多糖、リグニンは複雑な構造を持つ芳香族系の高分子化合物で、細胞壁中でセルロース、ヘミセルロースと絡み合って三次元網目構造を形成している。【０００４】
セルロース系バイオマスからエタノールや化成品原料を製造するには、微生物が発酵可能な単糖まで分解する「糖化」と呼ばれる工程が必要となる。代表的な糖化法として、酸処理法、酵素処理法が挙げられるが、酸処理法は大量の廃液を伴い環境負荷が高いことから、現在ではセルラーゼを利用して温和な条件で反応を行う酵素処理法が開発の主流となっている。【０００５】
セルラーゼはセルロース加水分解酵素の総称であり、基質特異性の違いからセロビオヒドロラーゼ、エンドグルカナーゼ、β―グルコシダーゼの３種に分類される。これらが協奏的に作用することでセルロースの加水分解は進行すると考えられている。【０００６】
セルラーゼを用いてセルロース系バイオマスを糖化する場合、基質阻害、生成物阻害、非特異的吸着など様々な要因により活性が阻害される。加えて、リグニン由来の芳香族化合物によりエンドグルカナーゼなどのセルラーゼは活性が阻害されてしまうことが知られている(非特許文献１〜３)。しかしながらその阻害機構に関しては未だ不明である。【０００７】
好熱性菌、又は超好熱性菌が生産する酵素は、安定性が高く、高温条件においても長期間活性を保持することができるため、産業用酵素としての適用が検討されている。これまでにセルロース分解性好熱性菌、又は超好熱性菌が生産するセルラーゼに関しても研究が為されており、それらが有するセルラーゼ遺伝子の多くはエンドグルカナーゼをコードすることが明らかとなっている。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００８】
【非特許文献１】Vohra, R.Mら、Biotechnol. Bioeng., 22, 1497-1500(1980)
【非特許文献２】Paul, S.Sら、Lett. Appl. Microbiol., 36, 377-381(2003)
【非特許文献３】Ximenes, Eら、Enzym Microb Tech., 46,170-176(2010)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】
これまで、セルラーゼを用いてセルロース系バイオマスを糖化する場合、リグニン由来の芳香族化合物によりエンドグルカナーゼなどのセルラーゼは活性が阻害されてしまうことが知られていた。本発明は、リグニン由来の芳香族化合物による活性阻害が大幅に低減された変異型エンドグルカナーゼを提供するものである。また、本発明は、セルロース、特にリグニンを含有したセルロース系バイオマスを加水分解して糖液を製造する方法において、分解効率の高い酵素組成物を用いる製造方法を提供するものである。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本発明者らは、上記の目的を達成すべく、好熱性菌由来エンドグルカナーゼの特定箇所にアミノ酸変異を導入し、その機能が改良された性質を有する変異型エンドグルカナーゼの取得に成功した。詳細には、発明者らは、野生型である親エンドグルカナーゼの三次元構造に着目し、タンパク質結晶構造解析により、親エンドグルカナーゼとリグニン由来芳香族化合物の複合体構造形成に関わるアミノ酸を特定し、当該アミノ酸に対して選択的に変異を加えることにより、リグニン由来の芳香族化合物による活性阻害が大幅に低減されたエンドグルカナーゼの取得に成功した。【００１１】
すなわち、本発明は以下の構成からなる。【００１２】
［１］  好熱性菌由来のエンドグルカナーゼのアミノ酸配列において、配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基が、芳香族アミノ酸以外から選ばれるアミノ酸に置換されているアミノ酸配列を含む、変異型エンドグルカナーゼ。【００１３】
［２］  好熱性菌由来のエンドグルカナーゼのアミノ酸配列が、以下：
（ａ）配列番号１、７、１３、１９、２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列； 
（ｂ）配列番号１、７、１３、１９、２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列において、１から数個のアミノ酸が欠失、置換、または付加されたアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列；あるいは
（ｃ）配列番号１、７、１３、１９、２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列と９０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列、
のいずれかのアミノ酸配列を含む、［１］の変異型エンドグルカナーゼ。【００１４】
［３］  配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換されている、［１］または［２］の変異型エンドグルカナーゼ。【００１５】
［４］  配列番号２、８、１４、２０、２６、３２または３８で示されるアミノ酸配列を含む、［１］〜［３］のいずれかの変異型エンドグルカナーゼ。【００１６】
［５］  ［１］〜［４］のいずれかの変異型エンドグルカナーゼをコードするＤＮＡ。【００１７】
［６］  配列番号４、１０、１６、２２、２８、３４または４０で示される塩基配列を含む、［５］のＤＮＡ。【００１８】
［７］  ［５］または［６］のＤＮＡを含む、発現ベクター。【００１９】
［８］  ［７］の発現ベクターを用いた形質転換により作製された、形質転換細胞。【００２０】
［９］  （１）［８］の形質転換細胞を培養する工程；および
（２）該形質転換細胞により生産された変異型エンドグルカナーゼを精製する工程を含む、変異型エンドグルカナーゼの製造方法。【００２１】
［１０］  ［１］〜［４］のいずれかの変異型エンドグルカナーゼおよび／または［８］の形質転換細胞の処理物を含む、バイオマス分解用組成物。【００２２】
［１１］  セルロース含有バイオマス懸濁液に、［１０］のバイオマス分解用組成物を添加して加水分解することを含む、セルロース由来バイオマスより糖液を製造する方法。【００２３】
［１２］  さらに、糸状菌由来セルラーゼを添加することを含む、［１１］の方法。【００２４】
本明細書は本願の優先権の基礎である日本国特許出願2011-193279号の明細書および／または図面に記載される内容を包含する。
【発明の効果】
【００２５】
本発明の変異型エンドグルカナーゼは、リグニン由来の芳香族化合物による活性阻害が大幅に低減されている。そのため、セルロース、特にリグニンを含有したセルロース系バイオマスを加水分解して糖液を製造するにあたり、リグノセルロースを高効率で分解することが可能なため、酵素組成物として用いることにより効率よく糖液を製造することができる。
【図面の簡単な説明】
【００２６】
【図１−１】実施例１における、配列番号１のパイロコッカス・ホリコシ由来エンドグルカナーゼ（ＥＧＰｈ）と好熱性菌由来エンドグルカナーゼのアラインメントを示す図である。配列番号１における位置２７３のトリプトファンを下線で示した。
【図１−２】図１−１の続き
【図１−３】図１−２の続き
【図１−４】図１−３の続き
【発明を実施するための形態】
【００２７】
以下に、本発明を詳細に説明する。
【００２８】
本発明は、リグニン由来の芳香族化合物による活性阻害が、親エンドグルカナーゼと比較して、大幅に低減されている変異型エンドグルカナーゼに関する。
【００２９】
本明細書においてリグニン由来の芳香族化合物とは、リグニンの前駆物質で一般にモノリグノールと称される芳香族化合物、およびその生合成経路に存在する芳香族化合物、およびセルロース系バイオマスを分解して得られるものであれば特に限定されず、一種類以上の混合物であってもよい。モノリグノールと称される芳香族化合物、およびその生合成経路に存在する芳香族化合物としては、例えば、コニフェリルアルコール、シナピルアルコール、ｐ−クマリルアルコール、フェニルアラニン、ケイ皮酸、ｐ−クマル酸、カフェー酸、５−ヒドロキシフェルラ酸、シナップ酸、ｐ−クマロイルコエンザイムエー、カフェオイルコエンザイムエー、フェルロイルコエンザイムエー、５−ヒドロキシフェルロイルコエンザイムエー、シナポイルコエンザイムエー、ｐ−クマリルアルデヒド、カフェイルアルデヒド、５−ヒドロキシコニフェリルアルデヒド、シナピルアルデヒド、カフェイルアルコール、５−ヒドロキシコニフェリルアルコール、５−デヒドロシキミ酸、シキミ酸、シキミ酸−５−リン酸、３−エノールピルビルシキミ酸−５−リン酸、コリスミン酸、プリフェン酸、フェニルピルビン酸、ｐ−ヒドロキシフェニルピルビン酸、チロシン、シナップアルデヒド、などが挙げられる。セルロース系バイオマスを分解して得られるものとしては、例えば、シリンガアルデヒド、ｐ−ヒドロキシベンズアルデヒド、５−ホルミルバニリン、バニリン酸、シリンガ酸、５−ホルミルバニリン酸、５−カルボキシバニリン、アセトグアイアコン、グアイアコール、バニリルアルコール、ジヒドロコニフェリルアルコール、シリンガアルデヒド、５−ヒドロキシルメチルバニリン、１−グアイアシル−１−ブテン−３−オン、ｐ−メトキシアゾベンゼン、安息香酸、ｐ−ヒドロキシ安息香酸、ｏ−フタール酸、テレフタール酸、イソフタール酸、トリメチルガルス酸、バニロイルギ酸、ヘミメリット酸、トリメリット酸、イソヘミピン酸、トリメジチン酸、プレニット酸、ピロメリット酸、メロファン酸、ベンゼンペンタカルボン酸、ベンゼンヘキサカルボン酸、デヒドロジバニリン酸、４，４´−ジヒドロキシ−３,３´−ジメトキシカルコン、４,４´−ジヒドロキシ−３,３´−ジメトキシベンジル、ジグアイアシルグリコール酸、４,４´−ジヒドロキシ−３,３´−ジメトキシベンゾフェノン、ジホルミルジヒドロキシ−ジメトキシ−ジエチルスチルベン、ベラトルム酸、イソヘミピン酸、メタヘミピン酸、ヘミピン酸、ベンゼンポリカルボン酸、シナピン酸、フルフラール、ヒドロキシメチルフルフラール、フェルラアミド、クマルアミド、などが挙げられ、好ましくはフェルラ酸、バニリン、コニフェリルアルデヒドが挙げられる。
【００３０】
本明細書において、「エンドグルカナーゼ」は、セルロースなどのβ−１，４−グリコシル結合を加水分解して、グルコース、セロビオース、セロオリゴ糖などを生成する酵素である。ＥＣ番号：ＥＣ ３．２．１．４として、エンドグルカナーゼに帰属される酵素群が記載されているが、本発明ではＥＣ番号においてエンドグルカナーゼに帰属されないものの、上記エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質もエンドグルカナーゼに含まれるとする。例えば、キシラナーゼ、キシログルカナーゼ、マンナナーゼ、キチナーゼ、キトサナーゼ、ガラクタナーゼ、などが挙げられる。
【００３１】
本明細書において、親エンドグルカナーゼとは、変異を導入する前のアミノ酸配列を有するエンドグルカナーゼであり、上記エンドグルカナーゼ活性を示すものである。本明細書において、「親エンドグルカナーゼ」を「野生型」と記載する場合がある。この場合、「親エンドグルカナーゼ」および「野生型」なる記載は互換的に使用される。本発明において、「親エンドグルカナーゼ」は好熱性菌由来であることが好ましい。
【００３２】
本明細書における好熱性菌とは、５０℃以上で生育可能な微生物群の総称であり、また特に超好熱性菌とは８０℃以上で生育可能な微生物群のことを指す。該好熱性菌としてはパイロコッカス属（Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ）、イグニスファエラ属（Ｉｇｎｉｓｐｈａｅｒａ）、スタフィロサーマス属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｔｈｅｒｍｕｓ）、アシドサーマス属（Ａｃｉｄｔｈｅｒｍｕｓ）、スピロヘータ属（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔａ）、スルホロバス属（Ｓｕｌｆｏｌｏｂｕｓ）、サーモプラズマ属（Ｔｈｅｒｍｏｐｌａｓｍａ）、カルディバーガ属（Ｃａｌｄｉｖｉｒｇａ）、サーモスファエラ属（Ｔｈｅｒｍｏｓｐｈａｅｒａ）、ピクロフィラス（Ｐｉｃｒｏｐｈｉｌｕｓ）属、フェルビドバクテリウム属（Ｆｅｒｖｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、などを例示することができる。
【００３３】
好熱性菌由来エンドグルカナーゼは公知であり、例えばＧｅｎＢａｎｋなどにAAQ31833などとして登録されており、本発明においてはこれらを、「親エンドグルカナーゼ」として利用することができる。本発明において好ましくは、親エンドグルカナーゼは配列番号１、７、１３、１９、２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列を含む。当該親エンドグルカナーゼには、配列番号１、７、１３、１９、２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列において１もしくは複数個または１もしくは数個のアミノ酸の欠失、置換、付加又は挿入を有し、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質も含まれる。ここで「１もしくは数個」の範囲は特には限定されないが、例えば、１０個以内、さらに好ましくは５個以内、特に好ましくは４個以内、あるいは１個又は２個である。
【００３４】
また、本発明において、親エンドグルカナーゼには、配列番号１、７、１３、１９、２５、３１または３７で示されるアミノ酸配列とＢＬＡＳＴ（Ｂａｓｉｃ  Ｌｏｃａｌ  Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ  Ｔｏｏｌ  ａｔ  ｔｈｅ  Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）（米国国立生物学情報センターの基本ローカルアラインメント検索ツール））等（例えば、デフォルトすなわち初期設定のパラメータ）を用いて計算したときに、９０％、９５％、９９％、またはそれ以上の同一性を有するアミノ酸配列を含み、好ましくは当該アミノ酸列からなり、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質も含まれる。
【００３５】
ここで、「同一性」とは、２つのアミノ酸配列にギャップを導入して、またはギャップを導入しないで整列させた場合の、最適なアライメントにおいて、オーバーラップする全アミノ酸残基に対する同一アミノ酸および類似アミノ酸残基の割合（パーセンテージ）を意味する。同一性は、当業者に周知の方法、配列解析ソフトウェア等（例えばＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡなどの公知のアルゴリズム）を使用して求めることができる。「エンドグルカナーゼ活性」とは上に定義したとおりであり、当該活性の測定は、例えば５０ｍＭ 酢酸-酢酸ナトリウム緩衝液（ｐＨ５．２）に溶解したリン酸膨潤セルロースの基質溶液に酵素液を添加し、３０〜８５℃で１時間反応後、必要によりｐＨを変化させるなどして反応を停止させた後、グルコース定量キットを用いて、反応液中のグルコース濃度を定量することによって行うことができる。
【００３６】
本発明における「変異型エンドグルカナーゼ」とは、上記親エンドグルカナーゼのアミノ酸配列において、配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基が、芳香族アミノ酸以外から選ばれるアミノ酸に置換されており、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質を意味する。
【００３７】
下記実施例にて詳述するとおり、本発明者らは結晶構造解析により、親エンドグルカナーゼのアミノ酸配列、すなわち配列番号１で示されるアミノ酸配列において（配列番号１で示されるアミノ酸配列は、１９個のトリプトファン、２０個のフェニルアラニン、１１個のヒスチジン、２３個のタイロシン、という計７３個の芳香族アミノ酸残を含んで成る）、活性部位近傍に位置する２７３番目のトリプトファンがコニフェリルアルデヒドと疎水性相互作用を形成していることを明らかにした。すなわち、このアミノ酸は活性部位近傍においてリグニン由来芳香族化合物と疎水性相互作用を形成しており、エンドグルカナーゼの基質であるセルロースの加水分解反応の阻害に強く関与しているアミノ酸であることがわかった。本発明におけるエンドグルカナーゼへの変異導入の目的は、活性阻害に関与するこの疎水性相互作用を破壊することにあり、その結果、活性部位近傍においてリグニン由来芳香族化合物の取り込みが抑制されることにある。
【００３８】
ここで「配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」とは、上記親エンドグルカナーゼのアミノ酸配列と配列番号１のアミノ酸配列の立体構造を比較した場合に、前記好熱性菌由来エンドグルカナーゼのアミノ酸配列において、配列番号１のアミノ酸配列における２７３番目のトリプトファンと同様の位置に存在し、リグニン由来芳香族化合物との疎水性相互作用の形成に関与しているアミノ酸を意味する。「配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」のアミノ酸種は、トリプトファンであることが好ましい。
【００３９】
「配列番号１のアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」の決定方法としては、以下の手順１）〜３）で実施することができる。
【００４０】
手順１）配列番号１記載のＰｙｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｈｏｒｉｋｏｓｈｉｉ由来エンドグルカナーゼ(以下、「ＥＧＰｈ」と記載する)のアミノ酸配列において、開始メチオニンを位置１と定義する。以降のアミノ酸配列については、位置２、３、４．．．と順次番号付けをし、２７３番目に該当するトリプトファンを配列番号１における２７３番目のトリプトファンと定義する。
【００４１】
手順２）次に、親エンドグルカナーゼのアミノ酸配列において配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸を決定する。当該相当するアミノ酸の位置は、親エンドグルカナーゼのアミノ酸配列、特に活性部位近傍のアミノ酸配列を配列番号１のアミノ酸配列と整列させることによって明らかにすることができる。このような操作はアミノ酸配列のアラインメントと呼ばれる。アライメントツールとしては、ＣｌｕｓｔａｌＷなどの多数の良く知られたソフトウェアを用い、デフォルトのパラメータを用いておこなう。当業者は異なる長さのアミノ酸配列の間で、アラインメントにより、親エンドグルカナーゼにおける配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸の位置を明らかにすることができる。
【００４２】
手順３）上記アライメント解析で、配列番号１で表されるアミノ酸の２７３番目のトリプトファンに相当する箇所に位置するアミノ酸を、上記親エンドグルカナーゼにおける上記「配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」とする。
【００４３】
上記親エンドグルカナーゼにおいて、上記「配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」以外の位置にアミノ酸の欠失、付加、あるいは挿入などの変異を伴うときには、Ｎ末端からカウントした「配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」の位置が２７３番目ではない場合がある。このような場合においても、上記方法により決定された「配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸」を芳香族アミノ酸以外のアミノ酸に置換して、本発明による変異型エンドグルカナーゼとする。
【００４４】
本発明における、芳香族アミノ酸以外から選ばれるアミノ酸としては、トリプトファン、タイロシン、フェニルアラニン、ヒスチジンといった芳香族アミノ酸残基を除く任意のアミノ酸であればいずれも用いることができる。置換することができるアミノ酸残基としては、例えば、リジン（Ｌｙｓ）、アルギニン（Ａｒｇ）、ヒスチジン（Ｈｉｓ）、グルタミン酸（Ｇｌｕ）、アスパラギン酸（Ａｓｐ）、バリン（Ｖａｌ）、イソロイシン（Ｉｌｅ）、スレオニン（Ｔｈｒ）、セリン（Ｓｅｒ）、システイン（Ｃｙｓ）、メチオニン（Ｍｅｔ）、グルタミン（Ｇｌｎ）、アスパラギン（Ａｓｎ）、グリシン（Ｇｌｙ）、ロイシン（Ｌｅｕ）、好ましくはアラニン（Ａｌａ）が挙げられる。また、上記配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸を人為的に欠失させた結果、エンドグルカナーゼ活性を保持したタンパク質として製造することができれば、当該配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸を人為的に欠失させてもよいものとする。
【００４５】
特に好ましくは、本発明の変異型βグルコシダーゼは、配列番号２、８、１４、２０、２６、３２、または３８で示されるアミノ酸配列を含む。
【００４６】
本発明の変異型βグルコシダーゼは当業者に公知である手法を用いて製造することができる。例えば、親エンドグルカナーゼのアミノ酸配列をコードする遺伝子に変異を導入することによって、変異型エンドグルカナーゼをコードする変異遺伝子を作製し、当該変異遺伝子を適当な宿主を用いて発現させることによって製造することができる。ここで「遺伝子」にはＤＮＡ、ＲＮＡ、ＤＮＡ／ＲＮＡハイブリッドを含む核酸が含まれる。
【００４７】
変異型エンドグルカナーゼをコードする変異遺伝子は、当業者に公知である変異導入法を用いて作製することができる。
【００４８】
親エンドグルカナーゼとして例えば、ＥＧＰｈを用いて変異型エンドグルカナーゼを作製する場合、ＥＧＰｈをコードする遺伝子はパイロコッカス・ホリコシ（Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｈｏｒｉｋｏｓｈｉｉ、登録番号ＪＣＭ９９７４、ＪＣＭ微生物株カタログ第７版、１９９９年１月発行）の細胞からクローニングすることができる。
【００４９】
またＥＧＰｈと立体構造が類似している他のエンドグルカナーゼを親エンドグルカナーゼとして、変異型エンドグルカナーゼを作製する場合、当該親エンドグルカナーゼ遺伝子は当該エンドグルカナーゼタンパク質を生産する微生物等（例えば、イグニスファエラ・アグレガンス（Ｉｇｎｉｓｐｈａｅｒａ  ａｇｇｒｅｇａｎｓ）、スタフィロサーマス・ヘレニカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｔｈｅｒｍｕｓ  ｈｅｌｌｅｎｉｃｕｓ）、パイロコッカス・アビシ（Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ  ａｂｙｓｓｉ）、アシドサーマス・セルロリティクス（Ａｃｉｄｔｈｅｒｍｕｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、スピロヘータ・サーモフィラ（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ）など）の細胞からクローニングすることができる。
【００５０】
親エンドグルカナーゼをコードする遺伝子は、これらエンドグルカナーゼを保有する微生物より公知の方法に準じてＤＮＡを単離し、ＰＣＲ等の手法によってＤＮＡ増幅させることで取得することができる。例えば、パイロコッカス・ホリコシ培養後、ＢＬＡＳＴ探索法を使用して、遺伝子配列からパイロコッカス・ホリコシのエンドグルカナーゼ配列に類似し、本酵素活性を示すと思われる遺伝子（例えば配列番号１）を、ＰＣＲ反応で増幅し抽出して得られる。
【００５１】
上記のエンドグルカナーゼ産生菌から得られる親エンドグルカナーゼ遺伝子に対し、所定の部位に人為的に変異を起こさせ、変異型エンドグルカナーゼ遺伝子を調製する。リグニン由来の芳香族化合物による活性阻害が低減された変異型エンドグルカナーゼ遺伝子を調製する場合、上記配列番号１で表されるアミノ酸配列の２７３番目のトリプトファンに相当するアミノ酸を置換するように親エンドグルカナーゼに対して人為的に変異を起こさせる。
【００５２】
遺伝子の目的部位に変異を起こす部位特異的変異導入法としては、従来の慣用的に用いられているＰＣＲ法によりおこなうことができる。
【００５３】
上記のようにして調製した変異型エンドグルカナーゼをコードする遺伝子を、制限酵素およびＤＮＡリガーゼを用いて、適当な発現ベクター中のプロモーター下流に連結することにより、該遺伝子を含む発現ベクターを製造することができる。発現ベクターとしては、細菌プラスミド、酵母プラスミド、ファージＤＮＡ（ラムダファージなど）、レトロウイルス、バキュロウイルス、ワクシニアウイルス、アデノウイルス等のウイルスＤＮＡ、ＳＶ４０の誘導体など、植物細胞用のベクターとしてのアグロバクテリウムなどが挙げられるが、宿主細胞において複製および生存可能である限り他のいかなるベクターも用いることができる。例えば、宿主が大腸菌である場合、ｐＵＣ、ｐＥＴ、ｐＢＡＤなどを例示することができる。また、宿主が酵母である場合、ｐＰｉｎｋ-ＨＣ、ｐＰｉｎｋ-ＬＣ、ｐＰｉｎｋα-ＨＣ、ｐＰｉｃＺ、ｐＰｉｃα、ｐＰｉｃ６、ｐＰｉｃ６α、ｐＦＬＤ１、ｐＦＬＤ１α、ｐＧＡＰＺ、ｐＧＡＰＺα、ｐＰｉｃ９Ｋ、ｐＰｉｃ９などが挙げられる。
【００５４】
プロモーターとしては、遺伝子の発現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであればいかなるものでもよい。例えば、宿主が大腸菌である場合、ｌａｃプロモーター、Ｔｒｐプロモーター、ＰＬプロモーター、ＰＲプロモーター等が、酵母である場合、ＡＯＸ１プロモーター、ＴＥＦ１プロモーター、ＡＤＥ２プロモーター、ＣＹＣ１プロモーター、ＧＡＬ−Ｌ１プロモーターなどが挙げられる。
【００５５】
本発明において用いる宿主細胞としては、大腸菌、バクテリア細胞、酵母細胞、真菌細胞、昆虫細胞、植物細胞、動物細胞などが好ましい。酵母細胞としては、例えば、ピキア属（Ｐｉｃｈｉａ）、サッカロマイセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、シゾサッカロマイセス属（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）などが挙げられる。真菌細胞としては、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、トリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）などが挙げられる。昆虫細胞としてはＳｆ９など、植物細胞としては双子葉植物など、動物細胞としては、ＣＨＯ、ＨｅＬａ、ＨＥＫ２９３などが挙げられる。
【００５６】
形質転換または、トランスフェクションは、リン酸カルシウム法、電気穿孔法などの公知の方法で行うことができる。本発明の変異型エンドグルカナーゼは、上記のように形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞においてプロモーターの制御下にて発現させ、産生物を回収して得ることができる。発現に際しては、形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞を適切な細胞密度まで増殖または成長させた後、温度シフトまたはイソプロピル-１-チオ-β-Ｄ-ガラクトシド（ＩＰＴＧ）添加などの化学的誘発手段によってプロモーターを誘発させ、細胞をさらに一定期間培養する。
【００５７】
変異型エンドグルカナーゼが細胞外に排出される場合には、培地から直接に、また細胞外に存在する場合には、超音波破砕や機械的破砕などの物理的手段もしくは細胞溶解剤などの化学的手段によって、細胞を破壊した後に変異型エンドグルカナーゼを精製する。変異型エンドグルカナーゼは、組換え細胞の培地から、硫酸アンモニウムもしくはエタノール沈殿、酸抽出、陰イオンもしくは陽イオン交換クロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、電気泳動などの技術を組み合わせて、部分的にまたは完全に精製することができる。
【００５８】
本発明の変異型エンドグルカナーゼは、親エンドグルカナーゼと比較して、リグニン由来の芳香族化合物による活性阻害を大幅に低減させることができる。したがって、本発明の変異型エンドグルカナーゼはリグニン由来の芳香族化合物の存在下にて、親エンドグルカナーゼと比較して、およそ２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、１１倍、１２倍、１３倍、１４倍、１５倍またはそれ以上のエンドグルカナーゼ活性を有する。
【００５９】
本発明の変異型エンドグルカナーゼは、精製されたものであっても、粗精製されたものであっても良い。
【００６０】
また、本発明の変異型エンドグルカナーゼは、固相に固定化されていても良い。固相としては例えば、ポリアクリルアミドゲル、ポリスチレン樹脂、多孔性ガラス、金属酸化物などが挙げられる（特にこれらに限定されない）。本発明の変異型エンドグルカナーゼを固相に固定することによって、連続反復使用が可能となる点において有利である。
【００６１】
さらに、上記変異型エンドグルカナーゼをコードする遺伝子を用いて形質転換した細胞の処理物も、粗精製された変異型エンドグルカナーゼとして利用することができる。当該「形質転換した細胞の処理物」には、固相に固定化した形質転換細胞、ならびに形質転換細胞の死菌、破砕物、およびそれらを固相に固定化したものなどが含まれる。
【００６２】
本発明の変異型エンドグルカナーゼは、セルラーゼと混合することで、バイオマス分解用酵素組成物としてセルロース含有バイオマスの加水分解に使用することができる。ここでいうセルラーゼとは、セルロースを分解する活性を有する酵素であれば特に限定されず、一種類以上の混合物であってもよい。このような酵素としては、例えばセルラーゼ、ヘミセルラーゼ、セロビオハイドラーゼ、エンドグルカナーゼ、エキソグルカナーゼ、β―グルコシダーゼ、キシラナーゼ、マンナナーゼ、キシログルカナーゼ、キチナーゼ、キトサナーゼ、ガラクタナーゼなどが挙げられる。好ましくは、セルラーゼは糸状菌由来セルラーゼである。
【００６３】
糸状菌セルラーゼを生産する微生物として、トリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、セルロモナス属（Ｃｅｌｌｕｌｏｍｏｎａｓ）、クロストリジウム属（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、ストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）、フミコラ属（Ｈｕｍｉｃｏｌａ）、アクレモニウム属（Ａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ）、イルペックス属（Ｉｒｐｅｘ）、ムコール属（Ｍｕｃｏｒ）、タラロマイセス属（Ｔａｌａｒｏｍｙｃｅｓ）、などの微生物を挙げることができる。これら微生物は、培養液中にセルラーゼを産生するために、その培養液を未精製の糸状菌セルラーゼとしてそのまま使用してもよいし、また培養液を精製し、製剤化したものを糸状菌セルラーゼ混合物として使用してもよい。前記培養液より、糸状菌セルラーゼ混合物を精製し、製剤化したものとして使用する場合、プロテアーゼ阻害剤、分散剤、溶解促進剤、安定化剤など、酵素以外の物質を添加したものを、セルラーゼ製剤として使用してもよい。
【００６４】
本発明で使用する糸状菌由来セルラーゼは、トリコデルマ属由来セルラーゼであることが好ましい。トリコデルマ属由来セルラーゼは、セルロースを分解する活性を有する酵素であれば特に限定されず、一種類以上の混合物であってもよい。このような酵素としては、例えばセルラーゼ、ヘミセルラーゼ、セロビオハイドラーゼ、エンドグルカナーゼ、エキソグルカナーゼ、β―グルコシダーゼ、キシラナーゼ、マンナナーゼ、キシログルカナーゼ、キチナーゼ、キトサナーゼ、ガラクタナーゼなどが挙げられる。こうしたトリコデルマ属のうち、より好ましくは、トリコデルマ・リーセイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ）由来のセルラーゼ混合物である。トリコデルマ・リーセイ由来のセルラーゼ混合物としては、トリコデルマ・リーセイＡＴＣＣ６６５８９（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＡＴＣＣ６８５８９）、トリコデルマ・リーセイＱＭ９４１４（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＱＭ９４１４）、トリコデルマ・リーセイＱＭ９１２３（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＱＭ９１２３）、トリコデルマ・リーセイＲｕｔＣ−３０（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＲｕｔＣ−３０）、トリコデルマ・リーセイＰＣ３-７（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＰＣ３−７）、トリコデルマ・リーセイＣＬ-８４７（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＣＬ−８４７）、トリコデルマ・リーセイＭＣＧ７７（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＭＣＧ７７）、トリコデルマ・リーセイＭＣＧ８０（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ  ＭＣＧ８０）、トリコデルマ・ビリデＱＭ９１２３（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｖｉｒｉｄｅ  ＱＭ９１２３）に由来するセルラーゼ混合物が挙げられる。また、前記トリコデルマ属に由来し、変異剤あるいは紫外線照射などで変異処理を施し、セルラーゼ生産性が向上した変異株であってもよい。
【００６５】
上記のようにして取得された変異型エンドグルカナーゼは、単独またはセルラーゼと組み合わせることで、食品、飼料、洗剤、セルロース含有織物の処理、セルロース系バイオマスからの糖液の製造、に用いることができる。
【００６６】
前記食品、及び飼料は、本発明の変異型エンドグルカナーゼを少なくとも含み、必要に応じて更にその他の成分を含んでなる。前記食品、及び飼料における、本発明の変異型エンドグルカナーゼの含有量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記食品、及び飼料の製造方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記食品、及び飼料は、本発明の変異型エンドグルカナーゼを含むため、例えば、食品、及び飼料に含まれるセルロースなどを分解することができ、消化を効率よくすることができる。
【００６７】
前記洗剤における、変異型エンドグルカナーゼの含有量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記洗剤の製造方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。前記洗剤は、本発明の変異型エンドグルカナーゼを含むため、例えば、洗浄対象物のセルロース繊維に詰まった汚れを効率よく取り除くことができる。
【００６８】
前記セルロース含有織物の処理方法は、本発明の変異型エンドグルカナーゼを用いて、セルロース含有織物を処理すること（処理工程）を含み、必要に応じて更にその他の工程を含む。前記セルロース含有織物としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、ジーンズが挙げられる。また、前記処理工程における、本発明の変異型エンドグルカナーゼの使用量、温度、時間などは、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。例えば、本発明のセルロース含有織物の処理方法で、前記ジーンズを処理することで、例えば、ストーンウォッシング加工などを行うことができる。
【００６９】
本発明におけるセルロース含有バイオマスとは、少なくともセルロースを含むものであれば限定されない。具体的には、バガス、コーンストーバー、コーンコブ、スイッチグラス、稲藁、麦藁、樹木、木材、廃建材、新聞紙、古紙、パルプなどである。これらセルロース含有バイオマスは、高分子芳香族化合物リグニンやヘミセルロースなどの不純物が含まれているが、前処理として、酸、アルカリ、加圧熱水などを用いて、リグニンやヘミセルロースを部分的に分解したセルロース含有バイオマスを、セルロースとして利用してもよい。
【００７０】
本発明におけるセルロース含有バイオマス懸濁液とは、上述したセルロース含有バイオマスを固形分濃度０．１〜３０％で含むものである。懸濁に使用する溶媒としては特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
【００７１】
本発明でいう「添加」とは、変異型エンドグルカナーゼ、形質転換した細胞の処理物、セルラーゼなどを該セルロース含有バイオマス懸濁液に加えることを意味する。添加量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、例えば前記セルロース含有バイオマス１ｇに対して、０．００１ｍｇ〜１００ｍｇが好ましく、０．０１〜１０ｍｇがより好ましく、０．１〜１ｍｇが特に好ましい。
【００７２】
糖液の製造におけるセルロース含有バイオマス懸濁液の酵素処理における温度としては、特に制限はなく、反応温度３０〜１００℃が好ましく、４０〜９０℃がより好ましく、５０〜８０℃が特に好ましい。処理ｐＨとしては、特に制限はなく、ｐＨ２〜８が好ましく、ｐＨ３〜７がより好ましく、ｐＨ４〜６が特に好ましい。セルロース含有バイオマス固形分濃度は、固形分濃度０．１〜３０％が好ましい。
【００７３】
該範囲に設定することにより、本発明のバイオマス分解用酵素組成物の分解効率を最大限発揮することができる。この酵素処理は、バッチ式で行っても、連続式で行ってもよい。こうした酵素処理によって得られた加水分解物は、グルコース、キシロースなどの単糖成分を含むため、エタノール、乳酸などの原料糖として使用することが可能である。
【実施例】
【００７４】
以下に、実施例を挙げて本発明を具体的に説明する。ただし、本発明はこれらに限定されるものではない。【００７５】
（実施例１）好熱性菌由来エンドグルカナーゼにおける２７３番目のアミノ酸残基の決定
ＥＧＰｈのアミノ酸配列と同一性の高い好熱性菌由来エンドグルカナーゼを探索するため、ＢＬＡＳＴ検索をおこなった。【００７６】
ＢＬＡＳＴ検索をおこなうため、配列番号１をクエリーとしてＰｒｏｔｅｉｎ  ＢＬＡＳＴを利用した。その結果、ＥＧＰｈと７５％以上の同一性を示す好熱性菌由来エンドグルカナーゼとして、配列番号７記載のイグニスファエラ・アグレガンス（Ｉｇｎｉｓｐｈａｅｒａ  ａｇｇｒｅｇａｎｓ）由来エンドグルカナーゼ１（ＥＧＩａ１）、配列番号１３記載のイグニスファエラ・アグレガンス（Ｉｇｎｉｓｐｈａｅｒａ  ａｇｇｒｅｇａｎｓ）由来エンドグルカナーゼ２（ＥＧＩａ２）、配列番号１９記載のスタフィロサーマス・ヘレニカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｔｈｅｒｍｕｓ  ｈｅｌｌｅｎｉｃｕｓ）由来エンドグルカナーゼ（ＥＧＳｈ）、配列番号２５記載のパイロコッカス・アビシ（Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ  ａｂｙｓｓｉ）由来エンドグルカナーゼ（ＥＧＰａ）、配列番号３１記載のアシドサーマス・セルロリティクス（Ａｃｉｄｔｈｅｒｍｕｓ  ｃｅｌｌｕｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）由来エンドグルカナーゼ（ＥＧＡｃ）、配列番号３７記載のスピロヘータ・サーモフィラ（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ）由来エンドグルカナーゼ（ＥＧＳｔ）が該当することを確認した。【００７７】
ＥＧＰｈと配列番号７、１３、１９、２５、３１、３７記載の好熱性菌由来エンドグルカナーゼのアラインメントをおこなうため、当該業者によく知られたソフトウェアである、ＣｌｕｓｔａｌＷを用いてアラインメントを実施した。その結果、配列番号１で表されるアミノ酸の位置２７３のトリプトファンと相同な箇所に位置するアミノ酸を、配列番号７、１３、１９、２５、３１、３７記載の好熱性菌由来エンドグルカナーゼにおける位置２７３と決定し、図１−１〜１−４に下線で示した。【００７８】
（参考例１）親エンドグルカナーゼの調製
ＥＧＰｈ、ＥＧＩａ１、ＥＧＩａ２、ＥＧＳｈ、ＥＧＰａ、ＥＧＡｃ、ＥＧＳｔ遺伝子は、それぞれ配列番号１、７、１３、１９、２５、３１、３７記載の遺伝子を全合成し、ｐＥＴ１１ｄのＮｃｏＩおよびＢａｍＨＩにＤＮＡ  Ｌｉｇａｔｉｏｎ  Ｋｉｔ＜Ｍｉｇｈｔｙ  Ｍｉｘ＞（タカラバイオ）を使用して連結し、ＪＭ１０９（タカラバイオ）に形質転換した。スクリーニングはアンピシリンを抗生物質として含むＬＢ寒天培地を用いて行った。形質転換されたＪＭ１０９株より、作製したベクターｐＥＴ-ＥＧＰｈ、ＥＧＩａ１、ＥＧＩａ２、ＥＧＳｈ、ＥＧＰａ、ＥＧＡｃ、ＥＧＳｔをミニプレップキット(キアゲン)により単離し、塩基配列解析を行った。ｐＥＴ-ＥＧＰｈ、ＥＧＩａ１、ＥＧＩａ２、ＥＧＳｈ、ＥＧＰａ、ＥＧＡｃ、ＥＧＳｔは、発現用大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ株に形質転換し、ＢＬ２１-ＰｆｕＢＧＬ株を作製した。ＢＬ２１-ＰｆｕＢＧＬ株を、アンピシリン含有ＬＢ培地１０ｍＬに植菌し、３７℃で一晩振とう培養（前培養）を行った。本培養として、アンピシリン含有ＬＢ培地１Ｌに、前培養で得られた菌体を植菌し、波長６００ ｎｍでの吸光度ＯＤ６００が０．６となるまで振とう培養を行った。その後、最終濃度が０．５ｍＭになるようにイソプロピル-１-チオ-β-Ｄ-ガラクトシド（ＩＰＴＧ）を加え、さらに２５℃で一晩培養した。培養後、菌体を遠心分離により回収し、 ５０ｍＭ リン酸カリウム緩衝液（ｐＨ７．０）に再懸濁した。この溶液を氷冷しながら、超音波破砕を行い、その上清を無細胞抽出液として遠心分離により回収した。得られた無細胞抽出液を、８５℃で１５分保温し、該エンドグルカナーゼ以外の大腸菌に由来するタンパク質を凝集沈殿した。遠心分離により沈殿物を除去し、上清を分画分子量１００００の再生セルロース製透析膜（スペクトラム・ラボラトリーズ製）を使用して、５０ｍＭ 酢酸緩衝液（ｐＨ５．０）に透析した。得られたタンパク質溶液を、野生型のＥＧＰｈ、ＥＧＩａ１、ＥＧＩａ２、ＥＧＳｈ、ＥＧＰａ、ＥＧＡｃ、ＥＧＳｔとして使用した。【００７９】
（実施例２）変異型エンドグルカナーゼの調製
本発明の変異型エンドグルカナーゼは、表１に示すプライマー対を使用し、以下の手法で作製した。
【表１】
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【００８０】
配列番号１で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号５および６の塩基配列で示されるオリゴヌクレオチドを使用して部位突然変異法を用いて変異型ＥＧＰｈ（配列番号２）を作製した。また同様に、配列番号７で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号１１および１２の塩基配列で示されるオリゴヌクレオチドを使用して変異型ＥｇＩａ１（配列番号８）、配列番号１３で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号１７および１８を使用して変異型ＥｇＩａ２（配列番号１４）、配列番号１９で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号２３および２４を使用して変異型ＥＧＳｈ（配列番号２０）、配列番号２５で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号２９および３０を使用して変異型ＥＧＰａ（配列番号２６）、配列番号３１で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号３５および３６を使用して変異型ＥＧＡｃ（配列番号３２）、配列番号３７で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号４１および４２を使用して変異型ＥＧＳｔ（配列番号３８）を作製した。得られた遺伝子のシークエンスを確認後、参考例１記載の手順で大腸菌にて発現を実施した。ＥＧＰｈ変異体、ＥＧＩａ１変異体、ＥＧＩａ２変異体、ＥＧＳｈ変異体、ＥＧＰａ変異体、ＥＧＡｃ変異体、ＥＧＳｔ変異体は、大腸菌において全て異種タンパク質として発現可能であることが確認できた。【００８１】
（参考例２）リン酸膨潤セルロースの調製
エンドグルカナーゼの加水分解活性を測定する際に基質として使用するリン酸膨潤セルロースは、Ｗａｌｓｅｔｈ （１９７１） Ｔａｐｐｉ ３５：２２８（１９７１）及びＷｏｏｄ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ．１２１：３５３（１９７１）に記載の方法に従って、アビセル（Ａｖｉｃｅｌ）から調製した。この物質を緩衝液及び水を用いて希釈して２重量％混合物を得て、酢酸ナトリウムの最終濃度が５０ｍＭ、ｐＨ５．２ になるようにした。これをリン酸膨潤セルロースとして、以下の実施例に使用した。【００８２】
（実施例３）変異体のリン酸膨潤セルロース分解活性
実施例２で得られた変異体と、参考例１で調製した親エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロース分解活性を以下実験にて比較した。基質に１％リン酸膨潤セルロース／５０ｍＭ酢酸緩衝液（ｐＨ５．２）を用い、それぞれ参考例１、実施例２で調製した酵素を終濃度０．５μＭで添加し、５０℃で１時間酵素反応をおこなった。上記反応条件下における親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を１００％として、各変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表２に示す。
【表２】
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【００８３】
５０℃においては、親エンドグルカナーゼ及び各変異体で活性に差が無いことを確認した。【００８４】
（実施例４）リグニン由来の芳香族化合物による阻害実験１
コニフェリルアルデヒド存在下における、野生型及び変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。基質に１％リン酸膨潤セルロース／５０ｍＭ酢酸緩衝液（ｐＨ５．２）を用い、コニフェリルアルデヒド（シグマアルドリッチ）を終濃度０、５、１０、１５ｍＭになるように添加し、それぞれ参考例１、実施例２で調製した酵素を終濃度０．５μＭで添加後、５０℃で１時間酵素反応をおこなった。添加濃度０ｍＭにおいて親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を１００％として、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表３に示す。
【表３】
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【００８５】
各変異体において活性阻害が大幅に低減されていることを確認した。【００８６】
（実施例５）リグニン由来の芳香族化合物による阻害実験２
バニリン存在下における、野生型及び変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。基質に１％リン酸膨潤セルロース／５０ｍＭ酢酸緩衝液（ｐＨ５．２）を用い、バニリン（シグマアルドリッチ）を終濃度０、５、１０、１５ｍＭになるように添加し、それぞれ参考例１、実施例２で調製した酵素を終濃度０．５μＭで添加後、５０℃で１時間酵素反応をおこなった。添加濃度０ｍＭにおいて親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を１００％として、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表４に示す。
【表４】
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【００８７】
各変異体において活性阻害が大幅に低減されていることを確認した。【００８８】
（実施例５）リグニン由来の芳香族化合物による阻害実験３
フェルラ酸存在下における、野生型及び変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。基質に１％リン酸膨潤セルロース／５０ｍＭ酢酸緩衝液（ｐＨ５．２）を用い、フェルラ酸（シグマアルドリッチ）を終濃度０、５、１０、１５ｍＭになるように添加し、それぞれ参考例１、実施例２で調製した酵素を終濃度０．５μＭで添加後、５０℃で１時間酵素反応をおこなった。添加濃度０ｍＭにおいて親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を１００％として、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表５に示す。
【表５】
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【００８９】
各変異体において活性阻害が大幅に低減されていることを確認した。【００９０】
（参考例３）リグノセルロースの調製
エンドグルカナーゼの加水分解活性を測定する際に基質として使用するリン酸膨潤セルロース１〜３を以下のように調製した。【００９１】
１．リグノセルロース１の調製（アンモニア処理）
セルロースとして、稲藁を使用した。前記セルロースを小型反応器（耐圧硝子工業製、ＴＶＳ−Ｎ２  ３０ｍｌ）に投入し、液体窒素で冷却した。この反応器にアンモニアガスを流入し、試料を完全に液体アンモニアに浸漬させた。リアクターの蓋を閉め、室温で１５分ほど放置した。次いで、１５０℃のオイルバス中にて１時間処理した。処理後、反応器をオイルバスから取り出し、ドラフト中で直ちにアンモニアガスをリーク後、さらに真空ポンプで反応器内を１０Ｐａまで真空引きし乾燥させた。これをリグノセルロース１として以下の実施例に使用した。【００９２】
２．リグノセルロース２の調製（希硫酸処理）
セルロースとして、稲藁を使用した。セルロースを硫酸１％水溶液に浸し、１５０℃で３０分オートクレーブ処理（日東高圧製）した。処理後、固液分離を行い、硫酸水溶液（以下、希硫酸処理液）と硫酸処理セルロースに分離した。次に硫酸処理セルロースと固形分濃度が１０重量％となるように希硫酸処理液と攪拌混合した後、水酸化ナトリウムによって、ｐＨを５付近に調製した。これをリグノセルロース２として以下の実施例に使用した。【００９３】
３．リグノセルロース３の調製（水熱処理）
セルロースとして、稲藁を使用した。前記セルロースを水に浸し、撹拌しながら１８０℃で２０分間オートクレーブ処理（日東高圧株式会社製）した。その際の圧力は１０ＭＰａであった。処理後は溶液成分（以下、水熱処理液）と処理バイオマス成分に遠心分離（３０００Ｇ）を用いて固液分離した。この処理バイオマス成分をリグノセルロース３として以下の実施例に使用した。【００９４】
（実施例６）糸状菌由来セルラーゼ混合物と変異型エンドグルカナーゼからなる酵素組成物を用いたリグノセルロースの糖化１
リグノセルロース基質に該酵素組成物を作用させた場合のグルコース生成量の変化を比較した。５０ｍＭ酢酸緩衝液（ｐＨ５．２）に５重量％のリグノセルロース１〜３（参考例３で調製）を懸濁したものを基質とした。反応は５０℃において２４時間まで行い、適宜サンプリングして生成したグルコース濃度の測定を行った。糸状菌由来セルラーゼ混合物としては、市販のトリコデルマ・リーセイ由来セルラーゼ（セルクラスト、シグマ）を用いた。エンドグルカナーゼとしては、実施例２で調製した変異型エンドグルカナーゼと参考例１で調製した野生型エンドグルカナーゼをそれぞれ用いた。酵素添加量は、セルラーゼ１．０ｍｇ／ｍＬ、エンドグルカナーゼ０．１ｍｇ／ｍＬ（セルラーゼの１／１０量）である。表６、７、８にそれぞれリグノセルロース１、２、３から反応２４時間後に生成したグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を比較した。
【表６】
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【表７】
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【表８】
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【００９５】
野生型エンドグルカナーゼと変異型エンドグルカナーゼを用いた場合を比較すると、リグノセルロース１〜３いずれにおいても、反応２４時間後におけるグルコース生成量は、変異型エンドグルカナーゼは野生型エンドグルカナーゼの約１．４倍と大幅に上昇した。【００９６】
（参考例４）トリコデルマ属由来セルラーゼの調製
トリコデルマ属由来セルラーゼを以下の方法で調製した。【００９７】
１．前培養
コーンスティップリカー２．５％（ｗ／ｖｏｌ）、グルコース２％（ｗ／ｖｏｌ）、酒石酸アンモニウム０．３７％（ｗ／ｖｏｌ）、硫酸アンモニウム０．１４％（ｗ／ｖｏｌ）、リン酸二水素カリウム０．２％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化カルシウム二水和物０．０３％（ｗ／ｖｏｌ）、硫酸マグネシウム七水和物０．０３％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化亜鉛０．０２％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化鉄（ＩＩＩ）六水和物０．０１％（ｗ／ｖｏｌ）、硫酸銅（ＩＩ）五水和物０．００４％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化マンガン四水和物  ０．０００８％（ｗ／ｖｏｌ）、ホウ酸０．０００６％（ｗ／ｖｏｌ）、七モリブデン酸六アンモニウム四水和物０．００２６％（ｗ／ｖｏｌ）となるよう蒸留水に添加し、１００ｍＬを５００ｍＬバッフル付き三角フラスコに張り込み、１２１℃で１５分間オートクレーブ滅菌した。放冷後、これとは別にそれぞれ１２１℃で１５分間オートクレーブ滅菌したＰＥ−ＭとＴｗｅｅｎ８０をそれぞれ０．１％添加した。この前培養培地にトリコデルマ・リーセイＡＴＣＣ６６５８９（Ｔｒｉｃｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ ＡＴＣＣ６６５８９）の胞子を、１×１０７個／ｍｌ培地になるように植菌し、２８℃、７２時間、１８０ｒｐｍで振とう培養し、前培養とした（振とう装置：ＴＡＩＴＥＣ社製  ＢＩＯ−ＳＨＡＫＥＲ  ＢＲ−４０ＬＦ）。【００９８】
２．本培養
コーンスティップリカー２．５％（ｗ／ｖｏｌ）、グルコース２％（ｗ／ｖｏｌ）、セルロース（アビセル）１０％（ｗ／ｖｏｌ）、酒石酸アンモニウム０．３７％（ｗ／ｖｏｌ）、硫酸アンモニウム０．１４％（ｗ／ｖｏｌ）、リン酸二水素カリウム０．２％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化カルシウム二水和物０．０３％（ｗ／ｖｏｌ）、硫酸マグネシウム七水和物０．０３％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化亜鉛０．０２％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化鉄（ＩＩＩ）六水和物０．０１％（ｗ／ｖｏｌ）、硫酸銅（ＩＩ）五水和物０．００４％（ｗ／ｖｏｌ）、塩化マンガン四水和物０．０００８％（ｗ／ｖｏｌ）、ホウ酸０．０００６％（ｗ／ｖｏｌ）、七モリブデン酸六アンモニウム四水和物０．００２６％（ｗ／ｖｏｌ）となるよう蒸留水に添加し、２．５Ｌを５Ｌ容撹拌ジャー（ＡＢＬＥ社製  ＤＰＣ−２Ａ）容器に張り込み、１２１℃で１５分間オートクレーブ滅菌した。放冷後、これとは別にそれぞれ１２１℃で１５分間オートクレーブ滅菌したＰＥ−ＭとＴｗｅｅｎ８０をそれぞれ０．１％添加し、あらかじめ前記の方法にて液体培地で前培養したトリコデルマ・リーセイＡＴＣＣ６６５８９（Ｔｒｉｃｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ ＡＴＣＣ６６５８９）を２５０ｍＬ接種した。その後、２８℃、９６時間、３００ｒｐｍ、通気量１ｖｖｍにて培養を行い、遠心分離後、上清を膜濾過（ミリポア社製  ステリカップ−ＧＶ  材質：ＰＶＤＦ）した。【００９９】
（実施例７）糸状菌由来セルラーゼ混合物と変異型エンドグルカナーゼからなる酵素組成物を用いたリグノセルロースの糖化２
参考例３で調製したリグノセルロース１〜３を基質とし、参考例４で調製したトリコデルマ・リーセイ培養液を糸状菌由来セルラーゼ混合物として使用し、酵素添加量をセルラーゼ１．０ｍｇ／ｍＬ、β―グルコシダーゼ０．１ｍｇ／ｍＬ（セルラーゼの１／１０量）、β―グルコシダーゼ（Ｎｏｖｏｚｙｍｅ１８８）０．０１ｍｇ／ｍＬ（セルラーゼの１／１００量）とした以外は、実施例６と同様にしてリグノセルロース１〜３の加水分解を実施した。【０１００】
表９、１０、１１にそれぞれリグノセルロース１、２、３から反応２４時間後に生成したグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を比較した。
【表９】
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【表１０】
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【表１１】
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【０１０１】
野生型エンドグルカナーゼと変異型エンドグルカナーゼを用いた場合を比較すると、リグノセルロース１〜３いずれにおいても、反応２４時間後におけるグルコース生成量は、変異型エンドグルカナーゼは野生型エンドグルカナーゼの約１．４倍と大幅に上昇した。実施例６のような市販のセルラーゼだけでなく、トリコデルマ・リーセイ培養液を用いても変異導入における効果があることが判明した。【０１０２】
（比較例１）変異型エンドグルカナーゼの作製
比較例として、２７３番目のトリプトファンを別の芳香族アミノ酸へ置換した変異体の作製を表１２のプライマーを使用して行った。
【表１２】
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【０１０３】
配列番号１で示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子に対して、配列番号４３および４４の塩基配列で示されるオリゴヌクレオチドを使用して部位突然変異法を用いてＥＧＰｈ（Ｗ２７３Ｙ）（２７３番目トリプトファンをチロシンに置換：配列番号４９）を作製した。また同様に、配列番号４５および４６で示されるオリゴヌクレオチドを使用して、ＥＧＰｈ（Ｗ２７３Ｆ）（７３番目トリプトファンをフェニルアラニンに置換：配列番号５０）、配列番号４７および４８で示されるオリゴヌクレオチドを使用して、ＥＧＰｈ（Ｗ２７３Ｈ）（７３番目トリプトファンをヒスチジンに置換：配列番号５１）、をそれぞれ作製した。これらの変異体は、大腸菌において全て異種タンパク質として発現可能であることが確認できた。【０１０４】
（比較例２）変異体のリン酸膨潤セルロース分解活性
比較例１で得られた変異体を実施例３と同様の手法で活性を比較した。上記反応条件下における親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度（ｇ／Ｌ）を１００％として、各変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表１３に示す。
【表１３】
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【０１０５】
５０℃においては、親エンドグルカナーゼ及び各変異体で活性に差が無いことを確認した。【０１０６】
（比較例３）リグニン由来の芳香族化合物による阻害実験
コニフェリルアルデヒド存在下における、野生型及び比較例１の変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。実験は実施例４と同じ手順で行い、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表１４に示す。
【表１４】
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【０１０７】
トリプトファンと同じ芳香族アミノ酸への置換を行った比較例１の変異体では、野生型に対して活性阻害が改善されていないことを確認した。すなわち、２７３番目のトリプトファンは、芳香族アミノ酸以外のアミノ酸への置換が必要であることが判明した。
【産業上の利用可能性】
【０１０８】
本発明における変異型エンドグルカナーゼは、リグノセルロースを投下することによる糖液の製造に使用できる。リグノセルロース分解効率を向上させる効果により、酵素コストを大幅に削減することが可能であるため、産業上非常に有益である。【０１０９】
本明細書で引用した全ての刊行物、特許および特許出願をそのまま参考として本明細書にとり入れるものとする。
【図１−１】
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【図１−２】
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【図１−３】
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【図１−４】
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【配列表】
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