(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
RNA分子を含む水疱性口内炎ウイルスであって、該RNA分子が、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含む、水疱性口内炎ウイルス。
【請求項２】
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、請求項1記載のウイルス。
【請求項３】
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、請求項1記載のウイルス。
【請求項４】
哺乳動物細胞に感染すると、IFNポリペプチドを発現する、請求項1記載のウイルス。
【請求項５】
哺乳動物細胞に感染すると、NISポリペプチドを発現する、請求項1記載のウイルス。
【請求項６】
RNA分子を含む水疱性口内炎ウイルスを含む組成物であって、該RNA分子が、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含む、組成物。
【請求項７】
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、請求項6記載の組成物。
【請求項８】
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、請求項6記載の組成物。
【請求項９】
前記ウイルスが哺乳動物細胞に感染するとIFNポリペプチドを発現する、請求項6記載の組成物。
【請求項１０】
前記ウイルスが哺乳動物細胞に感染するとNISポリペプチドを発現する、請求項6記載の組成物。
【請求項１１】
3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含む核酸鎖を含む、核酸分子。
【請求項１２】
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、請求項11記載の核酸分子。
【請求項１３】
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、請求項11記載の核酸分子。
【請求項１４】
水疱性口内炎ウイルスを含む、哺乳動物における癌を治療するための薬学的組成物であって、該水疱性口内炎ウイルスが、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むRNA分子を含む、薬学的組成物。
【請求項１５】
水疱性口内炎ウイルスを含む、哺乳動物内の癌細胞数を低減するための薬学的組成物であって、該水疱性口内炎ウイルスが、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むRNA分子を含む、薬学的組成物。
【請求項１６】
前記哺乳動物がヒトである、請求項14または15記載の薬学的組成物。
【請求項１７】
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、請求項14または15記載の薬学的組成物。
【請求項１８】
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、請求項14または15記載の薬学的組成物。
【請求項１９】
水疱性口内炎ウイルスを含む、哺乳動物における腫瘍の退縮を誘導するための薬学的組成物であって、該水疱性口内炎ウイルスが、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むRNA分子を含む、薬学的組成物。
【請求項２０】
該哺乳動物がヒトである、請求項19記載の薬学的組成物。
【請求項２１】
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、請求項19記載の薬学的組成物。
【請求項２２】
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、請求項19記載の薬学的組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、2010年9月2日に提出された米国特許仮出願第61/379,644号の恩典を主張する。前述の出願の内容は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる。
【０００２】
連邦政府助成研究に関する声明
本発明は、米国国立衛生研究所によって与えられた助成金番号CA129966の下で米国政府の支援を受けてなされた。米国政府は本発明において一定の権利を有する。
【０００３】
1．技術分野
本文書は、水疱性口内炎ウイルスの作製および使用に関係する方法および材料に関する。たとえば、本文書は、水疱性口内炎ウイルス、核酸分子、水疱性口内炎ウイルスを作製する方法、および癌を処置するために水疱性口内炎ウイルスを用いる方法に関する。
【背景技術】
【０００４】
2．背景情報
水疱性口内炎ウイルス（VSV）は、ラブドウイルス科のメンバーである。VSVゲノムは、5つの主要なポリペプチド、すなわちヌクレオカプシド（N）ポリペプチド、リンタンパク質（P）ポリペプチド、マトリクス（M）ポリペプチド、糖タンパク質（G）ポリペプチド、およびウイルスポリメラーゼ（L）ポリペプチドをコードする、単一分子のネガティブセンスRNAである。
【発明の概要】
【０００５】
概要
本文書は、水疱性口内炎ウイルスに関する方法および材料を提供する。たとえば、本文書は、水疱性口内炎ウイルス、VSVポリペプチドをコードする核酸分子、水疱性口内炎ウイルスを作製する方法、および癌を処置するために水疱性口内炎ウイルスを用いる方法を提供する。
【０００６】
本明細書において用いられる水疱性口内炎ウイルスは、VSV Nポリペプチド、VSV Pポリペプチド、VSV Mポリペプチド、VSV Gポリペプチド、VSV Lポリペプチド、インターフェロン（IFN）ポリペプチド（たとえば、ヒトIFN-βポリペプチド）、およびヨウ化ナトリウム共輸送体（NIS）ポリペプチド（たとえば、ヒトNISポリペプチド）をコードする核酸分子を有するように設計することができる。IFNポリペプチドをコードする核酸を、VSV Mポリペプチドをコードする核酸と、VSV Gポリペプチドをコードする核酸とのあいだに配置することができる。そのような位置により、ウイルスは、非癌様組織における生得の抗ウイルス免疫応答を活性化するために有効である量のIFNポリペプチドを発現させることができ、このように癌細胞における効率的なウイルス複製を妨害することなく、可能性があるウイルス毒性を軽減することができる。NISポリペプチドをコードする核酸は、VSV GポリペプチドとVSV Lポリペプチドをコードする核酸のあいだに配置することができる。そのような位置により、ウイルスは、（a）感染した細胞においてヨウ化物を選択的に蓄積させるために有効であり、それによって放射性同位元素を用いるウイルス分布のイメージングおよび感染した癌細胞を標的とする放射線療法の両方が可能となる量、および（b）感染した細胞に対して毒性となるほど多くはない量の、NISポリペプチドを発現させることができる。水疱性口内炎ウイルスのゲノムにおいて、VSV Mポリペプチドをコードする核酸とVSV Gポリペプチドをコードする核酸のあいだにIFNポリペプチドをコードする核酸を配置すること、およびVSV GポリペプチドとVSV Lポリペプチドをコードする核酸のあいだにNISポリペプチドをコードする核酸を配置することにより、生存して、複製および拡散能を有し、適切なレベルの機能的IFNポリペプチドを発現し、かつイメージングおよび放射線ウイルス療法の両方のために放射性ヨウ素を取り込むのに適切なレベルの機能的NISポリペプチドを発現させる、水疱性口内炎ウイルスを得ることができる。
【０００７】
いくつかの場合において、本文書は、RNA分子を含む水疱性口内炎ウイルスを特徴とする。RNA分子は、3'から5'方向にVSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むまたはそれらから本質的になる。IFNポリペプチドは、ヒトIFNβポリペプチドでありうる。NISポリペプチドは、ヒトNISポリペプチドでありうる。ウイルスが哺乳動物細胞に感染すると、ウイルスはIFNポリペプチドを発現することができる。ウイルスが哺乳動物細胞に感染すると、ウイルスはNISポリペプチドを発現することができる。
【０００８】
もう1つの局面において、本文書は、RNA分子を含む水疱性口内炎ウイルスを含むまたはそれから本質的になる組成物を特徴とする。RNA分子は、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むまたはそれらから本質的になる。IFNポリペプチドは、ヒトIFNβポリペプチドでありうる。NISポリペプチドは、ヒトNISポリペプチドでありうる。ウイルスが哺乳動物細胞に感染すると、ウイルスはIFNポリペプチドを発現することができる。ウイルスが哺乳動物細胞に感染すると、ウイルスはNISポリペプチドを発現することができる。
【０００９】
もう1つの局面において、本文書は、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むまたはそれらから本質的になる核酸鎖を含む核酸分子を特徴とする。IFNポリペプチドは、ヒトIFNβポリペプチドでありうる。NISポリペプチドは、ヒトNISポリペプチドでありうる。
【００１０】
もう1つの局面において、本文書は癌を処置する方法を特徴とする。方法は、癌細胞を含む哺乳動物に、水疱性口内炎ウイルスを含む組成物を投与する段階を含むまたはそれから本質的になる。水疱性口内炎ウイルスは、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むまたはそれらから本質的になるRNA分子を含み、哺乳動物への組成物の投与は、水疱性口内炎ウイルスが癌細胞に感染して感染癌細胞を形成する条件下で行われ、感染癌細胞はIFNポリペプチドおよびNISポリペプチドを発現し、ならびに哺乳動物内の癌細胞数は投与後に低減される。哺乳動物はヒトでありうる。IFNポリペプチドは、ヒトIFNβポリペプチドでありうる。NISポリペプチドは、ヒトNISポリペプチドでありうる。
【００１１】
もう1つの局面において、本文書は、哺乳動物における腫瘍の退縮を誘導する方法を特徴とする。方法は、腫瘍を含む哺乳動物に水疱性口内炎ウイルスを含む組成物を投与する段階を含むまたはそれから本質的になる。水疱性口内炎ウイルスは、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むまたはそれらから本質的になるRNA分子を含み、哺乳動物への組成物の投与は、水疱性口内炎ウイルスが腫瘍の腫瘍細胞に感染して、感染腫瘍細胞を形成する条件下で行われ、感染腫瘍細胞はIFNポリペプチドおよびNISポリペプチドを発現する。哺乳動物はヒトでありうる。IFNポリペプチドは、ヒトIFNβポリペプチドでありうる。NISポリペプチドは、ヒトNISポリペプチドでありうる。
【００１２】
特記されない限り、本明細書において用いられる全ての科学技術用語は、本発明が属する当業者によって一般的に理解される意味と同じ意味を有する。本明細書において記述される方法および材料と類似または同等の方法および材料を本発明の実践において用いることができるが、適した方法および材料を以下に記述する。本明細書において言及した全ての刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は、その全内容が参照により本明細書に組み入れられる。矛盾する場合は、定義を含め、本明細書が優先するであろう。さらに、材料、方法、および実施例は説明する目的に限られ、制限すると意図されない。
【００１３】
[本発明1001]
RNA分子を含む水疱性口内炎ウイルスであって、該RNA分子が、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含む、水疱性口内炎ウイルス。
[本発明1002]
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、本発明1001のウイルス。
[本発明1003]
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、本発明1001のウイルス。
[本発明1004]
哺乳動物細胞に感染すると、IFNポリペプチドを発現する、本発明1001のウイルス。
[本発明1005]
哺乳動物細胞に感染すると、NISポリペプチドを発現する、本発明1001のウイルス。
[本発明1006]
RNA分子を含む水疱性口内炎ウイルスを含む組成物であって、該RNA分子が、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含む、組成物。
[本発明1007]
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、本発明1006の組成物。
[本発明1008]
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、本発明1006の組成物。
[本発明1009]
前記ウイルスが哺乳動物細胞に感染するとIFNポリペプチドを発現する、本発明1006の組成物。
[本発明1010]
前記ウイルスが哺乳動物細胞に感染するとNISポリペプチドを発現する、本発明1006の組成物。
[本発明1011]
3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含む核酸鎖を含む、核酸分子。
[本発明1012]
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、本発明1011の核酸分子。
[本発明1013]
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、本発明1011の核酸分子。
[本発明1014]
水疱性口内炎ウイルスを含む組成物を、癌細胞を含む哺乳動物に投与する段階を含み、該水疱性口内炎ウイルスが、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むRNA分子を含み、該組成物の該哺乳動物への投与が、該水疱性口内炎ウイルスが該癌細胞に感染して感染癌細胞を形成する条件下で行われ、該感染癌細胞がIFNポリペプチドおよびNISポリペプチドを発現し、かつ該哺乳動物内の癌細胞数が該投与後に低減する、癌を処置する方法。
[本発明1015]
前記哺乳動物がヒトである、本発明1014の方法。
[本発明1016]
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、本発明1014の方法。
[本発明1017]
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、本発明1014の方法。
[本発明1018]
水疱性口内炎ウイルスを含む組成物を、腫瘍を含む哺乳動物に投与する段階を含み、該水疱性口内炎ウイルスが、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を含むRNA分子を含み、該組成物の該哺乳動物への投与が、該水疱性口内炎ウイルスが該腫瘍の腫瘍細胞に感染して感染腫瘍細胞を形成する条件下で行われ、該感染腫瘍細胞がIFNポリペプチドおよびNISポリペプチドを発現する、哺乳動物における腫瘍の退縮を誘導する方法。
[本発明1019]
該哺乳動物がヒトである、本発明1018の方法。
[本発明1020]
IFNポリペプチドがヒトIFNβポリペプチドである、本発明1018の方法。
[本発明1021]
NISポリペプチドがヒトNISポリペプチドである、本発明1018の方法。
本発明の1つまたは複数の態様の詳細を、添付の図面および以下の説明に記載する。本発明の他の特徴、目的、および長所は、説明および添付の図面、ならびに添付の特許請求の範囲から明らかとなるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】図1Aは、IFNポリペプチド（たとえば、ヒトまたはマウスIFNβポリペプチド）をコードする核酸と、NISポリペプチド（たとえば、ヒトNISポリペプチド）をコードする核酸とを含む例示的な水疱性口内炎ウイルスのゲノム配置の概略図である。図1Bは、MOI 1.0で感染させたBHK細胞を用いて測定した、緑色蛍光タンパク質（GFP）ポリペプチドをコードする核酸を含む水疱性口内炎ウイルス（VSV-GFP；（●））、VSV-mIFN-NIS（■）、またはVSV-hIFN-NIS（◆）のウイルス力価をプロットするグラフである。図1Cは、NIS阻害剤であるKCL04の存在下（＋inh）または非存在下でVSV-mIFN-NISまたはVSV-hIFN-NISを感染させた細胞の放射性ヨウ化物取り込みをプロットするグラフである。VSV-GFPを対照として用いた。図1Dは、モック感染細胞またはVSV-mIFN-NIS（VmN）もしくはVSV-hIFN-NIS（VhN）を感染させた細胞の、ELISAによって測定したマウスまたはヒトIFNβの分泌レベルをプロットする棒グラフを含む。図1Eは、100 U/mlマウスIFNβによって細胞を12時間前処置した後、VSV-GFP（MOI 1.0）を感染させることによって評価した、B-16マウス黒色腫細胞と比較した5TGM1およびMPC-11マウス骨髄腫細胞のIFN反応性をプロットする棒グラフを含む。図1Fは、感染後48時間でMTTアッセイによって評価した生存細胞の増殖結果をプロットするグラフを含む（無処置細胞の％としてプロットする）。5TGM1およびMPC-11腫瘍崩壊を、VSV-mIFN-NISまたはVSV-hIFN-NIS（MOI 1.0）の感染後、12時間間隔でMTTアッセイによって細胞生存率を測定することによってモニタリングした。
【図２】図2Aは、VSV-mIFN-NISまたはVSV-mIFNのいずれかを感染させて、48時間のあいだモニタリングしたBHK細胞からのIFNポリペプチド放出レベルをプロットするグラフである。上清中のマウスIFNポリペプチドレベルを、マウスIFNポリペプチド発現レベルを検出するように設計されたELISAを用いて測定した。図2Bは、VSV-mIFN-NISまたはVSV-mIFNのいずれかを表記の時間（時間）感染させたBHK細胞によるI-125取り込みレベルをプロットするグラフである。
【図３】静脈内に投与したVSV-IFN-NISの腫瘍内拡散のモニタリング結果を含む。皮下に同系の5TGM1骨髄腫腫瘍を有する雌性の6〜10週齢C57Bl6/KaLwRijマウスを、PBS（対照）100μLまたは1×108TCID50 VSV-mIFN-NISの1回静脈内（IV）用量によって処置した。（A）0.5 ｍCi Tc-99mの投与後のSPECT-CTイメージングを、処置後に24時間間隔で行った。腫瘍特異的Tc-99m取り込みをPBS処置マウス（n＝2）およびVSV-mIFN-NIS処置マウス（n＝5）において定量した。（B）SPECT-CTイメージング後に腫瘍を採取することによって、腫瘍内ウイルス分布をモニタリングして、オートラジオグラフィーによる隣接する腫瘍部分の結果分析およびIFを行った。IFは、24時間の期間での、VSV抗原（赤色に染色）、およびTUNEL染色により細胞死が進行しつつある細胞（緑色に染色）を検出するために用いられた。（C）腫瘍内VSVおよびTUNELを、n＝3個（72時間でn＝2）の腫瘍から4つの画像を用いて、ImageJソフトウェアを用いて定量し、腫瘍面積の百分率として示した。処置後24から48時間のあいだに、t-検定（それぞれ、P＝0.0455およびP＝0.0163）を用いて、VSV（+）およびTUNEL（+）の両方に有意な増加が認められた。
【図４】静脈内送達後の腫瘍内ウイルス流入、拡散、および腫瘍崩壊の結果を含む。（A）VSV-mIFN-NISの静脈内投与後（i）6時間、（ii）12時間、（iii）18時間、および（iv〜vi）24時間目に、5TGM1腫瘍を採取してIFによって分析すると、VSV感染細胞（緑色に染色）およびCD31染色（赤色に染色）により腫瘍血管が示された。倍率100倍。（B）（i）VSV感染腫瘍細胞（緑色に染色）および（ii）ヘキスト染色核（青色に染色）を有する細胞死が進行しつつあるTUNEL陽性細胞（緑色に染色）の近位に無傷の腫瘍血管（赤色に染色）が存在することを示す、処置した腫瘍の高倍率視野。（C）6時間間隔で採取した腫瘍からの腫瘍内病巣（n＝8）を、ImageJソフトウェアを用いて測定して、平均直径を経時的にプロットした。直径の成長の有意性をt-検定により測定して、P値をグラフの上部に沿って示す。直径を用いて平均病巣体積を経時的に測定した。（D）VSV-mIFN-NIS処置後48時間での腫瘍の画像を用いて、細胞死の前に各感染ラウンドで感染した細胞約10個の平均値を得るために感染細胞の生存している環状端を定量した。
【図５】ウイルス分布（左上）をモニタリングするための全身SPECT-CTイメージング、放射性同位元素取り込みの特異的領域を示すための腫瘍オートラジオグラフィー（右上）、ならびに腫瘍内VSV染色に対応するNIS発現領域を示すための抗VSVおよびDAPI染色（下）を行った同じマウスからの腫瘍の一連の3枚の画像を含む。
【図６】全身投与したVSV-IFN-NISの強力な治療効能を証明する結果を含む。皮下5TGM1腫瘍を有するマウスを、PBS、VSV-mIFN-NIS、またはVSV-hIFN-NISの1回静脈内用量によって処置した。（A）経時的な腫瘍体積を計算するために、連続的なキャリパーによる測定によって腫瘍の負荷量を測定した。（B）腫瘍の反応を、腫瘍の進行、退縮、または再発を伴う退縮に分類した。腫瘍が退縮したマウスの比率としての再発率の統計学的差を、フィッシャー正確確率検定により測定したところ、VSV-hIFN-NIS処置マウスでは、VSV-mIFN-NIS処置マウスと比較して腫瘍再発率が有意に高いことが示した（P＝0.009）。（C）VSV中和抗体の生成を、処置後最初の5日間でn＝2（PBS処置）およびn＝3（VSV-IFN-NIS処置）マウスの血清中で測定して、500 TCID50 VSVによる感染から保護する最小希釈倍率としてプロットした。
【図７】免疫に仲介される腫瘍細胞の消失が、腫瘍の再発を防止することを証明する結果を含む。（A）ELISAによって測定した、PBS、VSV-mIFN-NIS、またはVSV-hIFN-NISの静脈内投与によって処置した皮下5TGM1腫瘍を有するマウス血清中のマウスIFNβの定量。（B）VSV-mIFN-NIS処置に反応して完全な腫瘍退縮を示したマウス、および週齢をマッチさせたナイーブ同系マウス（各n＝6）に、5TGM1細胞1×107個を皮下に接種して、接種後21日までの腫瘍の発生を示す。（C）腫瘍（5TGM1細胞5×106個の右脇腹への皮下投与）の移植の1日後または5日前にVSV感染5TGM1細胞を皮下に1回投与した（MOI 10でVSV-mIFN-NISを感染させた5TGM1細胞1×107個を左脇腹に移植した）免疫療法の効能。ログランク生存分析比較により、（-5）日目でのワクチン接種は、非ワクチン接種マウスと比較して腫瘍移植後のマウスの生存を延長する（P＝0.0253）ことが判明した。（D）皮下5TGM1腫瘍を有するマウスを、CD4+またはCD8+ T細胞を枯渇させる抗体の存在下または非存在下で、（i）PBS、（ii）VSV-mIFN-NISまたは（iii）VSV-mIFN-NISの1回静脈内用量によって処置した。腫瘍の負荷量を連続的なキャリパーによる測定によって測定した。（E）図7Dに記述したマウスに関する腫瘍の反応を、進行、退縮、または退縮＋再発に分類した。再発率を、フィッシャー正確確率検定によって比較したところ、VSV-mIFN-NIS＋T細胞枯渇は、VSV-mIFN-NIS処置単独（P＝0.0498）と比較して高い腫瘍再発率を示すことが示された。
【図８】図8AおよびBは、腫瘍内感染病巣の詳細な免疫蛍光画像である。5TGM1腫瘍を、静脈内VSV-mIFN-NIS感染後24時間で採取して、OCT中で凍結して切片を作製した。VSV（赤色に染色）、TUNEL染色による死につつある細胞（緑色に染色）、およびヘキスト染色による腫瘍細胞核（青色に染色）を検出するためにIFを行った。VSV感染のほぼ球状の明確な腫瘍内病巣は、細胞死が進行しつつあるVSV感染細胞の中心領域、および周縁部での感染した生存細胞の環状端を含む。
【図９Ａ】機能的なNIS活性がVSV感染した生存細胞の領域に限定されることを証明する画像を含む。5TGM1腫瘍を、VSV-IFN-NIS注射後48時間に採取して、切片を作製した。隣接切片を、（i）オートラジオグラフィー、（ii）倍率20倍で示されるIF、および（iii）倍率100倍で示されるIFに供して、VSV（赤色に染色）およびTUNEL染色による死につつある細胞（緑色に染色）を検出した。
【図９Ｂ】機能的なNIS活性がVSV感染した生存細胞の領域に限定されることを証明する画像を含む。5TGM1腫瘍を、VSV-IFN-NIS注射後72時間に採取して、切片を作製した。隣接切片を、（i）オートラジオグラフィー、（ii）倍率20倍で示されるIF、および（iii）倍率100倍で示されるIFに供して、VSV（赤色に染色）およびTUNEL染色による死につつある細胞（緑色に染色）を検出した。
【図１０】挿入されたトランスジーンを含む水疱性口内炎ウイルスの例示的な遺伝子内領域のダイヤグラムである。トランスジーンは、転写に関係するウイルス性の開始配列および終止配列に隣接する。IFN核酸を、VSV MおよびG核酸配列のあいだに遺伝子工学により作製されたNotIクローニング部位に挿入する。NIS核酸を、VSV GおよびL核酸配列のあいだに遺伝子工学により作製されたXhoIおよびNheI制限部位に挿入する。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
詳細な説明
本文書は、水疱性口内炎ウイルスに関連する方法および材料を提供する。たとえば、本文書は、水疱性口内炎ウイルス、VSVポリペプチドをコードする核酸分子、水疱性口内炎ウイルスを作製する方法、および癌を処置するために水疱性口内炎ウイルスを用いる方法を提供する。
【００１６】
本明細書において記述される水疱性口内炎ウイルスは、VSV Nポリペプチド、VSV Pポリペプチド、VSV Mポリペプチド、VSV Gポリペプチド、VSV Lポリペプチド、IFNポリペプチド、およびNISポリペプチドをコードする核酸分子を有するように設計することができる。水疱性口内炎ウイルスに関連して本明細書において記述される配列は、水疱性口内炎ウイルスのネガティブセンスゲノムの生成を可能にするウイルスゲノムのポジティブセンスcDNAをコードするプラスミドに組み入れられると認識されるであろう。このように、たとえばVSVポリペプチドをコードする核酸配列は、そのポリペプチドをコードする（たとえば、直接翻訳を介して）ポジティブセンス転写物の鋳型であるRNA配列を意味することができると認識されるであろう。
【００１７】
IFNポリペプチドをコードする核酸を、VSV Mポリペプチドをコードする核酸の下流に配置することができる（図1A）。たとえば、IFNポリペプチドをコードする核酸を、VSV Mポリペプチドをコードする核酸とVSV Gポリペプチドをコードする核酸のあいだに配置することができる。そのような位置により、非癌様組織における生得の抗ウイルス免疫応答を活性化するために有効である量のIFNポリペプチドをウイルスに発現させることができ、したがって、癌細胞における効率的なウイルス複製を妨害することなく、可能性があるウイルスの毒性を軽減することができる。
【００１８】
IFNポリペプチドをコードする任意の適切な核酸を、水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができる。たとえば、IFNβポリペプチドをコードする核酸を、水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができる。水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができるIFNβポリペプチドをコードする核酸の例には、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_002176.2（GI番号50593016）に記載される核酸配列のヒトIFNβポリペプチドをコードする核酸、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_010510.1（GI番号6754303）、BC119395.1（GI番号111601321）、またはBC119397.1（GI番号111601034）に記載される核酸配列のマウスIFNβポリペプチドをコードする核酸、およびGenBank（登録商標）アクセッション番号NM_019127.1（GI番号9506800）に記載される核酸配列のラットIFNβポリペプチドをコードする核酸が挙げられるがこれらに限定されるわけではない。
【００１９】
NISポリペプチドをコードする核酸を、VSV Gポリペプチドをコードする核酸の下流に配置することができる（図1A）。たとえば、NISポリペプチドをコードする核酸を、VSV Gポリペプチドをコードする核酸と、VSV Lポリペプチドをコードする核酸のあいだに配置することができる。そのような位置により、（a）感染細胞においてヨウ化物を選択的に蓄積させるために有効であり、それによって放射性同位元素を用いるウイルス分布のイメージングおよび感染した癌細胞を標的とする放射線療法の両方が可能となる量、ならびに（b）感染した細胞に対して毒性となるほど多くはない量のNISポリペプチドをウイルスに発現させることができる。
【００２０】
NISポリペプチドをコードする任意の適切な核酸を水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができる。たとえば、ヒトNISポリペプチドをコードする核酸を、水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができる。水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができるNISポリペプチドをコードする核酸の例には、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_000453.2（GI番号164663746）、BC105049.1（GI番号85397913）、またはBC105047.1（GI番号85397519）に記載される核酸配列のヒトNISポリペプチドをコードする核酸、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_053248.2（GI番号162138896）、AF380353.1（GI番号14290144）、またはAF235001.1（GI番号12642413）に記載される核酸配列のマウスNISポリペプチドをコードする核酸、GenBank（登録商標）アクセッション番号XM_524154（GI番号114676080）に記載される核酸配列のチンパンジーNISポリペプチドをコードする核酸、GenBank（登録商標）アクセッション番号XM_541946（GI番号73986161）に記載される核酸配列のイヌNISポリペプチドをコードする核酸、GenBank（登録商標）アクセッション番号XM_581578（GI番号297466916）に記載される核酸配列のウシNISポリペプチドをコードする核酸、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_214410（GI番号47523871）に記載される核酸配列のブタNISポリペプチドをコードする核酸、およびGenBank（登録商標）アクセッション番号NM_052983（GI番号158138504）に記載される核酸配列のラットNISポリペプチドをコードする核酸が挙げられるがこれらに限定されるわけではない。
【００２１】
水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入される核酸（たとえば、NISポリペプチドをコードする核酸および／またはIFNポリペプチドをコードする核酸）を、ウイルスポリメラーゼによる挿入された核酸配列の転写にとって必要な遺伝子転写開始および終止コードを含むウイルス遺伝子内領域に隣接させることができる。そのようなウイルス遺伝子内領域の例には、図10に記載される領域が挙げられるがこれらに限定されるわけではない。
【００２２】
VSV Nポリペプチド、VSV Pポリペプチド、VSV Mポリペプチド、VSV Gポリペプチド、およびVSV Lポリペプチドをコードする本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスの核酸配列は、GenBank（登録商標）アクセッション番号 NC_001560（GI番号9627229）に記載されるVSVインド株に由来することができ、またはVSVニュージャージー株に由来することができる。
【００２３】
1つの局面において、本文書は、3'から5'方向に、VSV Nポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、IFNポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、NISポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードするポジティブセンス転写物の鋳型である核酸配列を有する核酸分子（たとえば、RNA分子）を含む水疱性口内炎ウイルスを提供する。そのような水疱性口内炎ウイルスは、細胞（たとえば、癌細胞）に感染することができ、感染細胞によるIFNポリペプチドおよびNISポリペプチドの発現を指示することができる。
【００２４】
任意の適切な方法を用いて、核酸（たとえば、IFNポリペプチドをコードする核酸および／またはNISポリペプチドをコードする核酸）を水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができる。たとえば、他書で記述される方法（Obuchi et al., J. Virol, 77(16):8843-56 (2003)); Goel et al., Blood, 110(7):2342-50 (2007)); and Kelly et al., J. Virol, 84(3): 1550-62 (2010)）を用いて、核酸を水疱性口内炎ウイルスのゲノムに挿入することができる。任意の適切な方法を用いて、本明細書において記述される核酸分子を含む水疱性口内炎ウイルスを同定することができる。そのような方法は、PCRならびにノザンおよびサザン分析などの核酸ハイブリダイゼーション技術を含むがこれらに限定されるわけではない。いくつかの場合において、免疫組織化学および生化学技術を用いて、特定の核酸分子によってコードされるポリペプチドの発現を検出することによって、水疱性口内炎ウイルスが、その特定の核酸分子を含むか否かを判定することができる。
【００２５】
もう1つの局面において、本文書は、VSV Nポリペプチド、VSV Pポリペプチド、VSV Mポリペプチド、IFNポリペプチド、VSV Gポリペプチド、NISポリペプチド、およびVSV Lポリペプチドをコードする核酸分子を提供する。たとえば、本明細書において提供される核酸分子は、VSV Nポリペプチドをコードする核酸配列、VSV Pポリペプチドをコードする核酸配列、VSV Mポリペプチドをコードする核酸配列、IFNポリペプチドをコードする核酸配列、VSV Gポリペプチドをコードする核酸配列、NISポリペプチドをコードする核酸配列、およびVSV Lポリペプチドをコードする核酸配列を含む1つの核酸分子でありうる。
【００２６】
本明細書において用いられる「核酸」という用語は、RNA（たとえば、ウイルスRNA）と、cDNA、ゲノムDNA、および合成（たとえば、化学合成）DNAを含むDNAの両方を包含する。核酸は、二本鎖または一本鎖でありうる。一本鎖核酸は、センス鎖またはアンチセンス鎖でありうる。さらに、核酸は、環状または直線状でありうる。
【００２７】
本文書はまた、癌を処置する（たとえば、腫瘍の大きさを低減させる、腫瘍の成長を阻害する、または生存している腫瘍細胞の数を低減させる）方法を提供する。たとえば、本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスを、腫瘍の大きさを低減させるために、癌細胞または腫瘍の成長を阻害するために、および／または哺乳動物内での生存している癌細胞数を低減させるために、癌を有する哺乳動物に投与することができる。本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、そのウイルスの利用可能なコピー数を典型的に少なくとも2倍（たとえば、5倍から10倍、50倍から100倍、500倍から1,000倍、またはさらに5,000倍から10,000倍まで）増加させるために、宿主細胞において繁殖させることができる。いくつかの場合において、本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、標準的な細胞培養培地（たとえば、5〜10％ウシ胎児血清を添加したDMEMまたはRPMI1640において37℃で5％CO2中）において所望の濃度が得られるまで拡大させることができる。ウイルス力価は典型的に、細胞（たとえば、BHK-21細胞）を培養物に接種することによってアッセイされる。
【００２８】
本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、たとえば、癌細胞群（たとえば腫瘍）に直接注射することによって、または癌細胞に静脈内送達することによって、癌患者に投与することができる。本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、骨髄腫（たとえば、多発性骨髄腫）、黒色腫、神経膠腫、リンパ腫、中皮腫、ならびに肺、脳、胃、結腸、直腸、腎臓、前立腺、卵巣、乳腺、膵臓、肝臓、および頭頚部の癌が挙げられるがこれらに限定されるわけではない異なるタイプの癌を処置するために用いることができる。
【００２９】
本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、生物学的に適合性の溶液または薬学的に許容される送達媒体において、癌細胞群に直接（たとえば、腫瘍内）または全身（たとえば、静脈内）投与することによって、患者に投与することができる。適切な薬学的製剤は、部分的に、使用および、経皮または注射などの侵入経路に依存する。そのような剤形は、組成物または製剤が標的細胞（すなわち、ウイルスが送達されることが望ましい細胞）に到達するのをまたはその効果を発揮するのを妨害してはならない。たとえば、血流に注射される薬理学的組成物は、可溶性であるべきである。
【００３０】
投与される用量は、患者によって異なるが（たとえば、腫瘍の大きさに応じて）、有効量は、任意の有害な副作用が存在するか否かと共に癌細胞の成長が低減されるか否かに関してモニタリングしながら、安全であることが証明されているウイルス濃度を下限として設定して、1012 pfuまでの高用量まで用量を増加させることによって決定することができる。治療的有効量は典型的に、癌細胞数または腫瘍の大きさの少なくとも10％の低減を提供する。用量漸増試験を用いて、所定のウイルス処置に関して所望の効果を得ることができる（たとえば、Nies and Spielberg, "Principles of Therapeutics," In Goodman & Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, eds. Hardman, et al., McGraw-Hill, NY, 1996, pp 43-62を参照されたい）。
【００３１】
本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、たとえば、約103 pfuから約1012 pfu（たとえば、約105 pfuから約1012 pfu、約106 pfuから約1011 pfu、または約106 pfuから約1010 pfu）の範囲の用量で送達することができる。治療的有効量を、反復用量で提供することができる。反復投与は、臨床症状もしくは腫瘍の大きさの観察またはモニタリングアッセイにより、癌細胞群もしくは腫瘍が縮小を停止しているか、または腫瘍がなおも存在しているがウイルス活性の程度が低下していることが示される場合に適切である。反復用量は、初回に用いられた経路と同じ経路によって、またはもう1つの経路によって投与することができる。治療的有効量は、いくつかの個別の用量で送達することができ（たとえば、数日または数週間離して）、かつ1つの態様において、1回から約12回の用量が提供される。または、本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスの治療的有効量を、徐放性製剤によって送達することができる。いくつかの場合において、本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、癌細胞内でのウイルスの複製および拡散を促進する薬理物質またはウイルス毒性から非癌細胞を保護する物質と共に送達することができる。そのような物質の例は、他書で記述されている（Alvarez-Breckenridge et al., Chem. Rev., 109(7):3125-40 (2009)）。
【００３２】
本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスは、徐放性を提供するデバイスを用いて投与することができる。水疱性口内炎ウイルスの徐放性製剤は、たとえばポリマー賦形剤（たとえば、膨張可能または非膨張可能ゲルまたはコラーゲン）を含むことができる。水疱性口内炎ウイルスの治療的有効量を、ポリマー賦形剤内で提供することができ、賦形剤／ウイルス組成物は、癌細胞の部位に（たとえば、腫瘍の近位にまたは腫瘍内に）移植される。体液の作用は賦形剤を徐々に溶解して、一定時間のあいだウイルスの有効量を徐々に放出する。または徐放性デバイスは、一連の活性層とスペーサー層の交互層を含むことができる。そのようなデバイスの各活性層は、典型的に、賦形剤に包埋されたウイルス用量を含む一方、各スペーサー層は、賦形剤のみまたは低濃度の（すなわち、有効量より低い）ウイルスを含む。デバイスの各連続層が溶解すると、ウイルスのパルス用量が送達される。スペーサー層の大きさ／処方により投与間隔が決定され、用いられる治療レジメンに従って最適化される。
【００３３】
本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスを、直接投与することができる。たとえば、ウイルスを、皮膚を通して触診可能な腫瘍（たとえば、乳癌腫瘍）に直接注射することができる。そのような方法において、超音波による誘導も同様に用いることができる。または、ウイルスの直接投与は、カテーテル線または他の医療用アクセスデバイスを介して達成することができ、かつ癌細胞群の位置を特定するためにイメージングシステムと共に用いることができる。この方法により、移植可能な投与デバイスは典型的に、医療用アクセスデバイスに挿入されたガイドワイヤを用いて癌細胞群の近位に配置される。本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスの有効量を、露出した手術野において見ることができる癌細胞群に直接投与することができる。
【００３４】
いくつかの場合において、本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスを、全身に送達することができる。たとえば、全身送達は、注射を介して、または剤の多数回用量を投与するために設計された静脈内送達デバイスを介して静脈内に達することができる。そのようなデバイスには、翼付静注針、末梢静脈カテーテル、ミッドラインカテーテル、末梢穿刺中心静脈カテーテル、および外科的に留置されたカテーテルまたはポートが挙げられるがこれらに限定されるわけではない。
【００３５】
本明細書において提供される水疱性口内炎ウイルスによる治療の経過は、臨床症状の変化を評価することによって、または癌細胞数もしくは腫瘍の大きさを直接モニタリングすることによって、モニタリングすることができる。固形腫瘍の場合、ウイルス処置の有効性は、処置の前後での腫瘍の大きさまたは重量を測定することによって評価することができる。腫瘍の大きさは、直接（たとえば、キャリパーを用いて）、またはイメージング技術（たとえば、X-線、磁気共鳴イメージング、またはコンピューター断層撮影）を用いることによって、または非イメージング光学データ（たとえば、スペクトルデータ）の評価から測定することができる。癌細胞群（たとえば、白血病細胞）の場合、ウイルス処置の有効性は、処置の前後での患者の血液中の白血病細胞の絶対数を測定することによって決定することができる。ウイルス処置の有効性はまた、癌特異的抗原のレベルをモニタリングすることによっても評価することができる。癌特異的抗原には、たとえば癌胎児抗原（CEA）、前立腺特異抗原（PSA）、前立腺酸ホスファターゼ（PAP）、CA125、α-フェトプロテイン（AFP）、糖質抗原15-3、および糖質抗原19-4が挙げられる。
【００３６】
本発明はさらに、以下の実施例において説明されるが、これらは添付の特許請求の範囲において記述される本発明の範囲を制限しない。
【実施例】
【００３７】
実施例1−IFNポリペプチドおよび／またはNISポリペプチドを発現する水疱性口内炎ウイルスを用いる1回投与静脈内ウイルス療法は、腫瘍崩壊性の腫瘍減量および残留疾患の免疫療法による根絶を仲介する
マウスIFNβポリペプチドを発現するように設計された水疱性口内炎ウイルス（VSV-mIFN）ならびにマウスIFNβポリペプチドおよびヒトNISポリペプチドの両方を発現するように設計された水疱性口内炎ウイルス（VSV-mIFN-NIS；図1A）を、他書（Obuchi et al., J. Virol., 77(16):8843-56 (2003)); Goel et al., Blood, 110(7):2342-50 (2007)); Kelly et al., J. Virol, 84(3): 1550-62 (2010); and Lawson et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA, 92(10):4477-81 (1995) Erratum in: Proc. Natl Acad. Sci. USA, 92(19): 9009 (1995)）で記述された方法と類似の方法を用いて作製した。同様に、ヒトIFNβポリペプチドおよびヒトNISポリペプチドを発現するように設計された水疱性口内炎ウイルス（VSV-hIFN-NIS；図1A）も作製した。簡単に説明すると、所望のトランスジーンの核酸配列を、PCRを用いて特異的制限部位によって生成した。トランスジーンを、5'から3'方向にVSVゲノムのポジティブ鎖をコードするプラスミドの特異的挿入部位に挿入した。改変プラスミドを拡大させて、必要なT7ポリメラーゼをコードするワクシニアウイルスによる感染ならびにVSVウイルスタンパク質N、P、およびLのトランスフェクションによって感染ウイルスを回収した。これによって、感染性ビリオンに構築されるネガティブセンスウイルスゲノムを生成することができる必要なウイルスポリペプチドの産生が可能となった。回収したウイルスを増幅して、感染用量を適切な培養細胞株（たとえば、BHK-21細胞）において測定した。これらの水疱性口内炎ウイルスを作製するために用いたマウスIFNβポリペプチドの核酸配列は、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_010510.1（GI番号6754303）に記載される。これらの水疱性口内炎ウイルスを作製するために用いたヒトIFNβポリペプチドの核酸配列は、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_002176.2（GI番号50593016）に記載される。これらの水疱性口内炎ウイルスを作製するために用いたヒトNISポリペプチドの核酸配列は、GenBank（登録商標）アクセッション番号NM_000453.2（GI番号164663746）に記載される。
【００３８】
ヒトNISポリペプチドをコードする核酸を、VSV Gポリペプチドをコードする核酸の上流に挿入した場合には、機能的ビリオンは生成されなかった。この理由は、細胞が生存してウイルス繁殖を可能にするためにはNIS発現レベルが高すぎたように思われるためである。NISポリペプチドをコードする核酸をVSV Gポリペプチドをコードする核酸の下流に挿入すると、より低い量のNISポリペプチドが産生されて、それによって効率的なウイルス繁殖のみならず、感染細胞における機能的ヨウ化物取り込みにとって十分な量のNISポリペプチドが可能となったことにより、機能的NIS発現ビリオンが生成された（図2B）。
【００３９】
VSV Mポリペプチドをコードする核酸と、VSV Gポリペプチドをコードする核酸のあいだにIFNポリペプチドをコードする核酸を挿入すると、細胞に感染して、感染細胞の上清において観察されるIFNポリペプチド発現レベルの有意な増加を生じるウイルスが得られた（図2A）。VSV-IFN-NISウイルスは、インビトロで感染細胞において効率的に複製することができ、同様に、感染細胞の放射性ヨウ化物取り込み能によって示されるように、高レベルの機能的NISを発現することが可能であった（図2B）。
【００４０】
2つのVSV-IFN-NISウイルスの精製保存株を、BHK（ハムスター）細胞において滴定して（図1B）、細胞上清を採取して、ウイルスによってコードされたIFNβの分泌を確認した。高濃度のヒトまたはマウスIFNβが、VSV-hIFN-NISおよびVSV-mIFN-NISをそれぞれ感染させたBHK細胞の上清に検出され（図1D）、放射性ヨウ素の取り込み試験により、ウイルス感染細胞における放射活性ヨウ素の過塩素酸塩感受性（すなわち、NIS仲介性）濃度が確認され（図1C）、この濃度は高多重度の感染後24時間で最大に達した。
【００４１】
5TGM1およびMPC-11マウス骨髄腫細胞株が免疫コンピテント同系マウスにおいて皮下または正常位の腫瘍を信頼可能に形成することから、VSV-IFN-NISウイルスのインビボ活性を評価するために、これらのマウス骨髄腫細胞株を選択した（Lichty et al., Hum. Gene Ther., 15:821-831 (2004) and Turner et al., Human Gene Therapy, 9: 1121-1130 (1998)）。いずれの株も、VSV-IFN-NIS感染に対して感受性であることが確認され（図1E）、機能的なNIS発現、IFNβ放出、およびその後の殺細胞が得られた。静脈内に投与したVSV-IFN-NISウイルスが、腫瘍血管から滲出して、腫瘍の実質内に拡散することができるか否かを判定するために、皮下5TGM1またはMPC-11腫瘍を同系マウスにおいて成長させ（直径約5 mm）、108 TCID50 VSV-IFN-NISウイルスの1回静脈内用量を投与し、かつウイルスがコードするNIS発現の生体分布を、トレーサーとして99mTcO4（半減期6時間）を用いるSPECT/CTイメージングによって非侵襲的に毎日モニタリングした（図3A）。これらのトレーサー取り込み試験により、ウイルスが、腫瘍血管から効率よく滲出することが示され、ウイルスが皮下腫瘍の中で急速に拡散している可能性があることを示唆した。
【００４２】
ウイルスが実際に腫瘍実質内で複製および拡散していることを確認するために、VSV-IFN-NISウイルス投与後24、48、および72時間目でSPECT/CTイメージングの直後に、選択した腫瘍を採取して、（i）生存しているNIS発現腫瘍細胞を検出するためのオートラジオグラフィー、（ii）VSV抗原を検出するための免疫蛍光（IF）、および（iii）死細胞または死につつある細胞を同定するためのTUNEL染色に供した。図3Bに示されるデータを注意深く分析すると、中心の腫瘍細胞はアポトーシスが進行しつつあるが、周辺部の細胞は生存したままで（同様に図8を参照されたい）、NISを発現し（図5）、および99mTc04を濃縮する（図9）、ほぼ球状の大きなVSV感染域が存在することが示された。IFおよびTUNELデータの定量的分析により、ウイルス投与後24時間から48時間のあいだにウイルス感染細胞およびアポトーシス細胞数の有意な増加が示された（図3C）。感染後72時間までに、拡大しつつあるVSV感染域は、大部分が癒合して、広範囲の腫瘍の破壊が起こった（図3Bおよび図8）。
【００４３】
ウイルス投与後最初の24時間のあいだの非常に初期の時点におけるウイルス拡散の動態を特徴決定するために、さらに実験を行った（図4A）。ウイルスのIV投与6時間後に採取して、VSVおよびCD31陽性血管の両方に関して染色した腫瘍切片の分析により、ほとんどが腫瘍血管付近に存在する個々の散乱したVSV感染細胞が明らかとなった。12時間までに、ウイルス感染細胞の小さい集塊を見ることができ、18時間までにそれらは有意に成長して、24時間までにそれらは、中心部でアポトーシスが進行しつつあり周辺部が生存している、という既に記述された典型的な外観を示した。これらの二重CD31/VSV染色切片の分析（図4A、パネルi〜vi）により、図4Bにおいて高倍率で示されるように、腫瘍血管の内側に並ぶ内皮細胞が、VSV感染腫瘍細胞によって完全に取り囲まれた場合でさえ、VSV感染に屈しなかったことが示された。6、12、18、および24時間の時点での感染中心の平均直径（横切る細胞数として測定）をプロットすることにより（図4C）、ウイルスが一定の速度で遠心状に拡散して、拡大しつつある球体中の細胞の各連続層に感染するにはおよそ2時間を要するように思われた。それゆえ、各感染中心への新しい細胞の累増速度は、感染が進行すると増加して、ウイルス送達後24時間までに各中心は細胞およそ10,000個を含むと推定された。
【００４４】
インビボにおける感染腫瘍細胞の感染から死滅までのおよその時間を決定するために、腫瘍内感染の進行しつつある端部の生存しているVSV感染（すなわち、TUNEL陰性、VSV陽性）細胞の環状端の平均直径は、およそ細胞10個であると測定された（図4D）。このように、ウイルスは遠心状に拡散して、ウイルスが隣接する細胞に移行するにはおよそ2時間を要したが（図4C）、細胞死は、感染細胞の環状端が細胞10個分の直径に進行するまで起こらなかった（図4D）。これらの知見を併せると、感染細胞がアポトーシスとなるにはおよそ20時間を要すると結論された。
【００４５】
ウイルスの効率的な滲出および急速な腫瘍内拡散が腫瘍の退縮に関連するか否かを判定するために、5TGM1皮下腫瘍を有するさらなる群のC57KaLwRijマウスを、108 TCID50 VSV-IFN-NISの1回静脈内用量によって処置して、毎日の健康状態のチェックおよび腫瘍の測定によって長期間追跡した。腫瘍は、VSV-mIFN-NISおよびVSV-hIFN-NIS処置動物の大多数において急速に退縮した（図6A）。時に見られる非常に早期の死亡は神経毒性に関連しておらず、公式には証明されていないが、急速な腫瘍溶解症候群によると思われた。興味深いことに、ウイルス療法の投与後2または3週間目に、VSV-hIFN-NIS処置によって処置した動物のほとんどにおいて腫瘍の再発が認められたが、これにより、VSV-mIFN-NISによって処置した動物では認められず（図6Aおよび6B）、ウイルスによってコードされるマウスIFNβは、この同系の免疫コンピテントマウスモデルにおいて残留疾患の完全な根絶に至る機構を活性化できるが、ヒトIFNβは活性化できないことを示唆した。マウスの全てがその時点までに高い力価の抗VSV抗体を有したことから（図6C）、再発した腫瘍をVSV-IFN-NISによって再度処置することは試みなかった。
【００４６】
ウイルス処置動物における血清IFNβレベルの測定により、ウイルスにコードされるこのサイトカインが、ウイルス投与後初期の時点でウイルス感染腫瘍細胞によって血流に放出されることが示された（図7A）。インターフェロンβの抗腫瘍作用は、腫瘍細胞増殖の直接阻害、ナチュラルキラー細胞活性化、抗血管新生、および抗腫瘍T細胞応答の増強を含む。しかし、インビトロでの5TGM1およびMPC11骨髄腫細胞の増殖は、高濃度のIFNβであっても有害な影響を受けなかった（図1F）。その上、ウイルス処置腫瘍のCD31またはCD3染色切片の分析では、抗血管新生活性の阻害のいかなる証拠も、または宿主Tリンパ球による腫瘍浸潤のいかなる証拠も認められなかった（図4B）。しかし、その腫瘍が再発しなかったウイルス処置動物は、5TGM1腫瘍細胞による再接種に対して抵抗性であることが見いだされ（図7B）、マウスが5TGM1特異的抗腫瘍免疫を発達させたことを示している。同系のVSV感染骨髄腫細胞が、特異的抗骨髄腫免疫応答を誘発できるか否かを判定するために、同系のマウスを、皮下腫瘍細胞移植の1日後または5日前にVSV感染5TGM1細胞107個の1回皮下注射によって免疫した。腫瘍の成長は遅れ、それによって腫瘍接種の5日前に免疫したマウスでは生存の有意な増強が得られ（図7C）、VSV感染腫瘍細胞が、適度の抗腫瘍免疫応答を誘発したことを示している。しかし、VSV感染腫瘍細胞ワクチンは、小さくとも確立された腫瘍を有するマウスでは検出可能な抗腫瘍活性を示さず、抗腫瘍免疫が、疾患負荷量が最小である状況に限って有効であることを示唆した。
【００４７】
VSV-mIFN-NIS処置マウスにおける腫瘍再発率がより低いことが、抗腫瘍T細胞応答を増強するウイルスにコードされるIFNβに起因するか否かを判定するために、抗CD4および抗CD8抗体のカクテルを用いて、T細胞を枯渇させた。腫瘍は、T細胞の枯渇状態によらず、静脈内VSV-mIFN-NIS治療に等しく良好に反応したが、腫瘍の再発率は、T細胞枯渇マウスにおいて有意に高かった（図7Dおよび7E）。これらの結果は、VSV-mIFN-NISによる腫瘍溶解性の減量後の残留腫瘍細胞の根絶が、ウイルスにコードされるマウスIFNβによってその増幅が刺激される腫瘍特異的T細胞によって仲介されたことを示している。
【００４８】
Goelらの参考文献（Blood, 110(7):2342-50 (2007)）において記述され、免疫コンピテント5TGM1同系多発性骨髄腫マウスモデル（C57Bl/KalwRijHsd）において弱い腫瘍溶解効能を示したVSV-Δ51-NISウイルスと比較すると、VSV-IFNおよびVSV-IFN-NISウイルスは、非常に優れた複製動態を示した。さらに、VSVΔ51-NISウイルスと比較すると、VSV-IFN-NISウイルスは、インビトロでより高いNISポリペプチド発現を誘導した。インビボ治療試験により、VSV-IFNおよびVSV-IFN-NISウイルスの各々の1回静脈内用量が、皮下または正常位の5TGM1骨髄腫腫瘍を有する免疫コンピテントマウスの腫瘍の退縮を促進して、生存を有意に延長することが証明された。VSV-IFN-NISウイルスによって処置したマウスにおいて行ったTc-99mイメージング試験は、腫瘍特異的ウイルスNISポリペプチド発現および腫瘍内ウイルス拡散と同時に増加する放射性同位元素取り込みを示した。さらに、VSV-IFNおよびVSV-IFN-NISウイルスによる処置後に神経毒性は示されなかった。これらの結果は、VSV-IFN-NISウイルスを、ウイルス生体分布の非侵襲的イメージングおよび放射線ウイルス療法のために放射性同位元素と組み合わせることができる、癌（たとえば、多発性骨髄腫）のための治療物質として用いることができることを示している。
【００４９】
本明細書において提供される結果は、ヒトIFNβおよびヒトNISをコードする水疱性口内炎ウイルスが、多発性骨髄腫の免疫コンピテントマウスモデルにおいてインビボで腫瘍溶解効能を示すことを証明している。全身投与されたウイルスは、腫瘍において複製することができ、機能的NISポリペプチドの十分なレベルを発現して、腫瘍溶解活性を発揮して腫瘍の退縮を誘導して生存を改善し、およびVSV-Δ51-NISウイルスと比較して優れたNIS発現および腫瘍溶解活性を示すことができた。
【００５０】
細胞培養およびウイルス
細胞株を、10％ウシ胎児血清（FBS）、100 U/mLペニシリンおよび100 mg/mLストレプトマイシンを添加した培地において培養した。American Type cell culture（ATCC）から得たBHK-21およびMPC-11細胞を、ダルベッコ改変イーグル培地（DMEM）において成長させた。5TGM1細胞を、Dr. Babatunde Oyajobi（UT Health Sciences Center, San Antonio, TX）から得て、イスコブ改変ダルベッコ培地（IMDM）において成長させた。B-16マウス黒色腫細胞は、R. Vileから得て、DMEMにおいて成長させた。細胞株は全て、マイコプラズマ混入に関して試験陰性であった。
【００５１】
VSVポジティブ鎖アンチゲノムを含むpVSV-XN2プラスミド内、機能的トランスジーン発現にとって必要な推定VSV遺伝子間配列（TATG(A)7CTAACAG）の後に続くM/GおよびG/L遺伝子接合部に、制限部位を遺伝子工学により作製した（Schnell et al., J. Virol., 70:2318-2323 (1996)）。マウスIFNβ、ヒトIFNβ、およびNIS遺伝子をコードするcDNAに隣接する制限部位を、PCRによって生成した。マウスまたはヒトIFNβを1つのNotI部位（M/G接合部）に組み入れて、NISをXhoIおよびNheI部位（G/L接合部）に組み入れて、VSV-IFN-NISプラスミドを生成した。VSV-IFN-NISウイルスを、他書で記述される方法（Whelan et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92:8388-8392 (1995)）を用いてレスキューした。次にウイルスをBHK-21細胞において増幅させて、細胞上清の濾過によって精製し、10％w/vスクロース中での遠心分離によって沈降させた。連続希釈したウイルス保存株を用いて、感染後のウイルス力価をBHK-21細胞において測定して、Spearman and Karberの式を用いて決定した組織培養感染量（TCID50）を測定した。
【００５２】
インビトロでのウイルス特徴決定
BHK-21細胞の感染（MOI 1.0、37℃で1時間）後の上清中のウイルス力価を測定した。インビトロの放射性ヨウ化物の取り込みを測定するために、細胞を、放射標識NaI（1×105 cpmのI125）の存在下で、+/-100 μM過塩素酸カリウム（KClO4）の存在下または非存在下で、10 mM HEPES（N-2-ヒドロキシエチルピペラジン-N'-2-エタンスルホン酸、pH 7.3）を添加したハンクス緩衝塩類溶液（HBSS）中でインキュベートした。感染細胞の上清中のIFNβ分泌を、マウスまたはヒトIFNβ（PBL Interferonsource）に対する酵素免疫測定法（ELISA）を用いて決定した。IFN反応性を比較するために、細胞を100 U/mLマウスIFNβと共に12時間プレインキュベートした後、VSV-GFPを感染させた。生存細胞の増殖を、MTTアッセイ（ATCC）によって評価した。VSV-IFN-NIS（MOI 1.0）による5TGM1およびMPC-11の殺細胞を、MTTアッセイによって感染後の明記された時点で同様にモニタリングして、無処置細胞の百分率として示した。
【００５３】
インビボ試験
5TGM1またはMPC-11マウス骨髄腫細胞5×106個を、6〜10週齢の同系雌性C57Bl6/KaLwRij（Harlan, Netherlands）またはBalb/cマウス（Taconic）の右脇腹皮下にそれぞれ移植した。腫瘍の負荷量を、キャリパーによる連続測定によって測定した。マウスに、VSV-IFN-NIS 1×108個/0.1 mLまたは同量のPBSの1回静脈内用量を尾静脈注射により投与した。0.5 mCi  Tc-99mの腹腔内（IP）投与後にSPECT-CTイメージングを行って、他書で記述されているように定量した（Penheiter et al., AJR Am. J. Roentgenol., 195:341-349 (2010)）。
【００５４】
高解像度腫瘍分析
24時間間隔で採取した腫瘍を切片作製のためにOCT中で凍結した。腫瘍切片を、オートラジオグラフィーによって、ならびに（i）Mayo Clinicのウイルスベクター製造研究室内で生成されたポリクローナルウサギ抗VSVの後にAlexa標識抗ウサギIgG二次抗体（Invitrogen, Molecular Probes）を用いたVSV抗原に関する免疫蛍光（IF）によって、（ii）TUNEL染色（DeadEnd（商標）Fluorometric TUNEL kit, Promega）による細胞死に関する免疫蛍光によって、および（iii）ヘキスト33342（Invitrogen）を用いた細胞核に関する免疫蛍光によって、分析した。画像の定量を、VSV-mIFN-NIS処置腫瘍n＝3個（処置後72時間での腫瘍n＝2個を除く）からの4つの無作為な画像について、ImageJソフトウェアを用いて行い、腫瘍面積の百分率としてVSVまたはTUNEL（+）領域を得た。6時間間隔で得た腫瘍のIF分析により、VSV抗原が検出され、およびラット抗マウスCD31抗体（BD Pharmingen）を用いて腫瘍血管が検出された。腫瘍内病巣の大きさを、腫瘍2個から病巣7〜8個を測定すること、および直径を腫瘍細胞の大きさの平均値（個々の細胞50個の直径測定に基づいて）によって除することによって定量して、多数の細胞における病巣直径を得た。ほぼ球状の病巣の体積を、式v＝4/3(π*r3)を用いて推定した。生存しているVSV感染細胞の環状端の幅の平均値も同様に、VSV-IFN-NIS投与後48時間で採取した腫瘍n＝3個のIF画像から定量した。
【００５５】
免疫コンピテントマウスにおける免疫研究
抗ウイルス抗体の生成を測定するために、熱不活化血清の連続2倍希釈液を、500 TCID50 VSV-GFPと共にプレインキュベートした後、これを用いてBHK-21細胞に感染させた。VSVにCPEを誘導させる最小血清希釈をプロットした。血清中のインビボIFNβ分泌を、ELISAによって測定した。5TGM1ワクチン接種を、VSV-mIFN-NIS感染細胞（MOI 10.0）1×107個を、同系マウスの左脇腹に皮下注射することによって投与した。C57Bl6/KaLwRijマウスにおいて、抗CD4および抗CD8抗体を1週間に3回腹腔内投与（各50μg）した後、毎週の維持用量を投与することによりT細胞枯渇試験を行った。
【００５６】
統計学的方法
データの視覚的表示を用いて、域外値または正規範囲からの実質的な逸脱に関して評価して、記述されている場合にはt-検定を利用した。全ての場合において、多数の比較に関して補正されない両側のP-値を提供した。生存の差に関する比較を、カプランマイヤー生存曲線からログランク検定を用いて行った。動物試験において腫瘍再発率を比較する場合、試料規模が小さいことからフィッシャー正確確率検定を利用した。
【００５７】
他の態様
本発明は、その詳細な説明と共に記述してきたが、前述の説明は、本発明を説明するためであり、添付の特許請求の範囲の範囲によって定義される本発明の範囲を制限すると意図されないと理解されるべきである。他の局面、長所、および変更は添付の特許請求の範囲の範囲内である。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図１０】
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【配列表】
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